JP7210355B2 - 細胞観察システム、コロニー生成位置推定方法、推論モデル生成方法、およびプログラム - Google Patents
細胞観察システム、コロニー生成位置推定方法、推論モデル生成方法、およびプログラム Download PDFInfo
- Publication number
- JP7210355B2 JP7210355B2 JP2019060850A JP2019060850A JP7210355B2 JP 7210355 B2 JP7210355 B2 JP 7210355B2 JP 2019060850 A JP2019060850 A JP 2019060850A JP 2019060850 A JP2019060850 A JP 2019060850A JP 7210355 B2 JP7210355 B2 JP 7210355B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- cell
- image
- unit
- cells
- colony
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T7/00—Image analysis
- G06T7/0002—Inspection of images, e.g. flaw detection
- G06T7/0012—Biomedical image inspection
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T1/00—General purpose image data processing
- G06T1/20—Processor architectures; Processor configuration, e.g. pipelining
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T7/00—Image analysis
- G06T7/20—Analysis of motion
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M41/00—Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation
- C12M41/30—Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation of concentration
- C12M41/36—Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation of concentration of biomass, e.g. colony counters or by turbidity measurements
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
- G06T2207/10—Image acquisition modality
- G06T2207/10016—Video; Image sequence
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
- G06T2207/20—Special algorithmic details
- G06T2207/20081—Training; Learning
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
- G06T2207/20—Special algorithmic details
- G06T2207/20084—Artificial neural networks [ANN]
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
- G06T2207/30—Subject of image; Context of image processing
- G06T2207/30004—Biomedical image processing
- G06T2207/30024—Cell structures in vitro; Tissue sections in vitro
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Quality & Reliability (AREA)
- Radiology & Medical Imaging (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Sustainable Development (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Multimedia (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
第3の発明に係る細胞観察システムは、上記第1の発明において、上記撮像部を水平方向に移動させる移動部を有し、上記制御部は、上記推論位置に基づいて、上記撮像部が上記コロニーの中心位置で画像を撮像するように上記移動部を制御する。
第5の発明に係る細胞観察システムは、上記第1の発明において、上記撮像部によって取得された細胞またはコロニーの画像を表示する表示部を有する。
第7の発明に係る細胞観察システムは、上記第1の発明において、細胞画像を教師データとして生成されたコロニー化推論モデルを備えた推論部を更に有し、 上記推論部は、上記撮像部が撮像した画像の入力に基づいて、コロニーが生成する位置を推論し、推論結果を上記推論位置の情報として出力する。
第8の発明に係る細胞観察システムは、上記第7の発明において、上記推論部が、上記画像または上記推論位置の情報に基づき培養の良否の判定結果を出力する。
第9の発明に係る細胞観察システムは、上記第7の発明において、上記コロニー化推論モデルは、細胞培養の様子を時系列で撮像した画像データから得られる情報の履歴を、上記画像データの取得時刻ごとにブロックチェーンのブロック生成処理で管理されることによって生成される。
第10の発明に係る細胞観察システムは、上記第1の発明において、上記推論部が推論した上記推論位置を記録可能である記録部を有する。
第11の発明に係る細胞観察システムは、上記第1の発明において、上記細胞は、多能性幹細胞である。
第12の発明に係る細胞観察システムは、上記第1の発明において、上記コロニーは、複数のiPS細胞が形成したコロニーである。
第13の発明に係る細胞観察システムは、上記第1の発明において、上記撮像部は、水平方向移動可能である。
第14の発明に係る細胞観察システムは、上記第1の発明において、上記コロニーは、上記画像中の複数の細胞の少なくとも一部が凝集して生成又は成長したものである。
第16の発明に係るコロニー生成位置推定方法は、上記第15の発明に係る推論モデル生成方法によって作成したコロニー化推論モデルに、コロニー化前の細胞画像を入力し、上記コロニー化推論モデルを用いた演算処理を実行し、上記コロニーが生成又は成長する位置を推定する。
第17の発明に係るプログラムは、細胞観察システム内に設けられたコンピュータに、撮像部によって取得した細胞の画像を用いて、上記画像中の複数の細胞の位置情報または形状情報からコロニーが生成又は成長する位置を推論し、上記推論位置で撮像を行うように上記撮像部の位置を制御することを実現させる。
Claims (17)
- 撮像部と、
上記撮像部によって取得した複数の細胞の画像に基づいて、上記画像中の複数の細胞の位置情報または形状情報からコロニーが生成又は成長する位置を推論し、推論位置で撮像を行うように上記撮像部の位置を制御する制御部と、
を有することを特徴とする細胞観察システム。 - 上記推論位置が、上記コロニーが生成すると予測される位置であることを特徴とする請求項1に記載の細胞観察システム。
- 上記撮像部を水平方向に移動させる移動部を有し、
上記制御部は、上記推論位置に基づいて、上記撮像部が上記コロニーの中心位置で画像を撮像するように上記移動部を制御することを特徴とする請求項1に記載の細胞観察システム。 - 上記制御部は、上記推論位置上の細胞またはコロニーを所定時間間隔でタイムラプス撮像するように上記撮像部を制御することを特徴とする請求項1または2に記載の細胞観察システム。
- 上記撮像部によって取得された細胞またはコロニーの画像を表示する表示部を有することを特徴とする請求項1に記載の細胞観察システム。
- 上記制御部が、上記撮像部が上記推論位置上で取得した複数の画像を解析し、画像中の細胞数を計測し、上記細胞数の経時変化を上記表示部に出力することを特徴とする請求項5に記載の細胞観察システム。
- 細胞画像を教師データとして生成されたコロニー化推論モデルを備えた推論部を更に有し、
上記推論部は、上記撮像部が撮像した画像の入力に基づいて、コロニーが生成する位置を推論し、推論結果を上記推論位置の情報として出力することを特徴とする請求項1に記載の細胞観察システム。 - 上記推論部が、上記画像または上記推論位置の情報に基づき培養の良否の判定結果を出力することを特徴とする請求項7に記載の細胞観察システム。
- 上記コロニー化推論モデルは、細胞培養の様子を時系列で撮像した画像データから得られる情報の履歴を、上記画像データの取得時刻ごとにブロックチェーンのブロック生成処理で管理されることによって生成されることを特徴とする請求項7に記載の細胞観察システム。
- 上記推論部が推論した上記推論位置を記録可能である記録部を有することを特徴とする請求項1に記載の細胞観察システム。
- 上記細胞は、多能性幹細胞であることを特徴とする請求項1に記載の細胞観察システム
- 上記コロニーは、複数のiPS細胞が形成したコロニーであることを特徴とする請求項1に記載の細胞観察システム。
- 上記撮像部は、水平方向に移動可能であることを特徴とする請求項1に記載の細胞観察システム。
- 上記コロニーは、上記画像中の複数の細胞の少なくとも一部が凝集して生成又は成長したものであることを特徴とする請求項1に記載の細胞観察システム。
- 細胞のコロニー形成に至る細胞培養の様子を時系列で撮像した複数の画像データを取得し、
取得した上記画像データのうち、コロニー化する画像部分をアノテーションとして指定し、このアノテーションで指定した画像データを教師データとし、
上記教師データを用いて、入力をコロニー化前の細胞画像、出力をコロニー化予想位置としたコロニー化推論モデルを生成する、
ことを特徴とする推論モデル生成方法。 - 請求項15に記載の推論モデル生成方法によって作成したコロニー化推論モデルに、コロニー化前の細胞画像を入力し、
上記コロニー化推論モデルを用いた演算処理を実行し、上記コロニーが生成又は成長する位置を推定する、
ことを特徴とするコロニー生成位置推定方法。 - 細胞観察システム内に設けられたコンピュータに、
撮像部によって取得した細胞の画像を用いて、上記画像中の複数の細胞の位置情報または形状情報からコロニーが生成又は成長する位置を推論し、
上記推論位置で撮像を行うように上記撮像部の位置を制御する、
ことを実現させるためのプログラム。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2019060850A JP7210355B2 (ja) | 2019-03-27 | 2019-03-27 | 細胞観察システム、コロニー生成位置推定方法、推論モデル生成方法、およびプログラム |
US16/829,162 US20200311922A1 (en) | 2019-03-27 | 2020-03-25 | Cell observation system and inference model generating method |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2019060850A JP7210355B2 (ja) | 2019-03-27 | 2019-03-27 | 細胞観察システム、コロニー生成位置推定方法、推論モデル生成方法、およびプログラム |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2020156419A JP2020156419A (ja) | 2020-10-01 |
JP2020156419A5 JP2020156419A5 (ja) | 2021-12-23 |
JP7210355B2 true JP7210355B2 (ja) | 2023-01-23 |
Family
ID=72606067
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019060850A Active JP7210355B2 (ja) | 2019-03-27 | 2019-03-27 | 細胞観察システム、コロニー生成位置推定方法、推論モデル生成方法、およびプログラム |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20200311922A1 (ja) |
JP (1) | JP7210355B2 (ja) |
Families Citing this family (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11308121B2 (en) | 2015-11-04 | 2022-04-19 | Thrive Bioscience, Inc. | Method and system for cell operations using a blockchain data network |
JP7210355B2 (ja) * | 2019-03-27 | 2023-01-23 | 株式会社エビデント | 細胞観察システム、コロニー生成位置推定方法、推論モデル生成方法、およびプログラム |
WO2020261555A1 (ja) * | 2019-06-28 | 2020-12-30 | オリンパス株式会社 | 画像生成システムおよび画像生成方法 |
WO2021087227A1 (en) * | 2019-11-01 | 2021-05-06 | Howard Cannon | Method and system for cell operations using a blockchain data network |
WO2023153415A1 (ja) * | 2022-02-08 | 2023-08-17 | テルモ株式会社 | 画像の時間差分によるシート状細胞培養物形成状態検出方法、システム及びコンピュータープログラム |
WO2023153414A1 (ja) * | 2022-02-08 | 2023-08-17 | テルモ株式会社 | シート状細胞培養物のシート化状態を評価するためのシステム、プログラム、方法及びシート状細胞培養物の製造方法 |
JP2024054578A (ja) * | 2022-10-05 | 2024-04-17 | 株式会社アステック | タイムラプス撮影機能付き培養装置および培養方法 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2010022318A (ja) | 2008-07-23 | 2010-02-04 | Nikon Corp | 細胞の状態判別手法及び細胞観察の画像処理装置 |
WO2015193951A1 (ja) | 2014-06-16 | 2015-12-23 | 株式会社ニコン | 観察装置、観察方法、観察システム、そのプログラム、および細胞の製造方法 |
JP2018028593A (ja) | 2016-08-17 | 2018-02-22 | オリンパス株式会社 | 観察装置、観察方法及び観察システム |
WO2018179971A1 (ja) | 2017-03-31 | 2018-10-04 | ソニー株式会社 | 情報処理装置、情報処理方法、プログラム及び観察システム |
JP2019016305A (ja) | 2017-07-10 | 2019-01-31 | ソニー株式会社 | 情報処理装置、情報処理方法、プログラム及び観察システム |
Family Cites Families (21)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7907769B2 (en) * | 2004-05-13 | 2011-03-15 | The Charles Stark Draper Laboratory, Inc. | Image-based methods for measuring global nuclear patterns as epigenetic markers of cell differentiation |
WO2008014340A2 (en) * | 2006-07-25 | 2008-01-31 | University Of Rochester | Prediction and treatment of brain tumor spread using mri and external beam radiation |
JP2009229275A (ja) * | 2008-03-24 | 2009-10-08 | Nikon Corp | 細胞観察画像の画像解析方法、画像処理プログラム及び画像処理装置 |
CN101903532A (zh) * | 2008-03-24 | 2010-12-01 | 株式会社尼康 | 细胞观察的图像解析方法、图像处理程序和图像处理装置 |
JP5202099B2 (ja) * | 2008-05-19 | 2013-06-05 | ラテラルシグナルプロセシング株式会社 | 線分抽出装置 |
JP6071007B2 (ja) * | 2013-08-22 | 2017-02-01 | 富士フイルム株式会社 | 観察画像撮影評価装置および方法並びにプログラム |
AU2016222894A1 (en) * | 2015-02-23 | 2017-08-31 | Cellanyx Diagnostics, Llc | Cell imaging and analysis to differentiate clinically relevant sub-populations of cells |
DK3304037T3 (da) * | 2015-06-02 | 2020-03-02 | Baxalta Inc | Fremgangsmåde til opsamling af cellekolonier |
JP6865507B2 (ja) * | 2016-06-29 | 2021-04-28 | オリンパス株式会社 | 多能性幹細胞の無染色評価支援方法、プログラム、演算装置 |
JP2018022216A (ja) * | 2016-08-01 | 2018-02-08 | ソニー株式会社 | 情報処理装置、情報処理方法、及びプログラム |
WO2018101004A1 (ja) * | 2016-12-01 | 2018-06-07 | 富士フイルム株式会社 | 細胞画像評価装置および細胞画像評価制御プログラム |
ES2848701T3 (es) * | 2016-12-21 | 2021-08-11 | Hoffmann La Roche | Control de la proliferación de células eucariotas |
JP6977293B2 (ja) * | 2017-03-31 | 2021-12-08 | ソニーグループ株式会社 | 情報処理装置、情報処理方法、プログラム及び観察システム |
JP2019016859A (ja) * | 2017-07-04 | 2019-01-31 | オリンパス株式会社 | 観察装置および観察方法 |
WO2019163304A1 (ja) * | 2018-02-22 | 2019-08-29 | 株式会社ニコン | 培養支援装置、観察装置、及びプログラム |
JP7163955B2 (ja) * | 2018-03-08 | 2022-11-01 | 株式会社島津製作所 | 細胞画像解析方法、細胞画像解析装置、及び学習モデル作成方法 |
US11686721B2 (en) * | 2018-03-20 | 2023-06-27 | Shimadzu Corporation | Cell image analysis apparatus, cell image analysis system, method of generating training data, method of generating trained model, training data generation program, and method of producing training data |
US20200058381A1 (en) * | 2018-08-14 | 2020-02-20 | Miteshkumar Ishwarbhai Patel | System and Method for Auditing, Monitoring, Recording, and Executing Healthcare Transactions, Communications, and Decisions |
WO2020188813A1 (ja) * | 2019-03-20 | 2020-09-24 | 株式会社島津製作所 | 細胞解析装置 |
JP7210355B2 (ja) * | 2019-03-27 | 2023-01-23 | 株式会社エビデント | 細胞観察システム、コロニー生成位置推定方法、推論モデル生成方法、およびプログラム |
WO2020261555A1 (ja) * | 2019-06-28 | 2020-12-30 | オリンパス株式会社 | 画像生成システムおよび画像生成方法 |
-
2019
- 2019-03-27 JP JP2019060850A patent/JP7210355B2/ja active Active
-
2020
- 2020-03-25 US US16/829,162 patent/US20200311922A1/en not_active Abandoned
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2010022318A (ja) | 2008-07-23 | 2010-02-04 | Nikon Corp | 細胞の状態判別手法及び細胞観察の画像処理装置 |
WO2015193951A1 (ja) | 2014-06-16 | 2015-12-23 | 株式会社ニコン | 観察装置、観察方法、観察システム、そのプログラム、および細胞の製造方法 |
JP2018028593A (ja) | 2016-08-17 | 2018-02-22 | オリンパス株式会社 | 観察装置、観察方法及び観察システム |
WO2018179971A1 (ja) | 2017-03-31 | 2018-10-04 | ソニー株式会社 | 情報処理装置、情報処理方法、プログラム及び観察システム |
JP2019016305A (ja) | 2017-07-10 | 2019-01-31 | ソニー株式会社 | 情報処理装置、情報処理方法、プログラム及び観察システム |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20200311922A1 (en) | 2020-10-01 |
JP2020156419A (ja) | 2020-10-01 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7210355B2 (ja) | 細胞観察システム、コロニー生成位置推定方法、推論モデル生成方法、およびプログラム | |
US20200364869A1 (en) | Information processing apparatus, information processing method, and program | |
US20210353153A1 (en) | Automatic identification of restorative objects | |
CN106060374A (zh) | 摄影装置、其控制方法以及非暂时性计算机可读记录介质 | |
JP7501993B2 (ja) | 培養支援方法、培養支援装置、観察装置、及びプログラム | |
JP7375886B2 (ja) | 培養支援装置、観察装置、及びプログラム | |
KR20200087310A (ko) | 인공지능 영상판독 딥러닝 학습을 위한 애노테이션 학습데이터 생성과 증강 시스템 및 방법 | |
CN109218605A (zh) | 观察装置、观察方法和存储介质 | |
JP2019032593A (ja) | 撮影システム、撮影装置、および撮影方法 | |
US10798293B2 (en) | Image pickup apparatus and image pickup method | |
JP2020091702A (ja) | 撮像装置および撮像方法 | |
CN108156376A (zh) | 图像采集方法、装置、终端及存储介质 | |
CN107231507A (zh) | 摄像装置和摄像方法 | |
JP2021005846A (ja) | 積層型撮像デバイス、撮像装置、撮像方法、学習方法及び画像読み出し回路 | |
CN106856555B (zh) | 数字图像处理设备及其控制方法 | |
US20220101568A1 (en) | Image generation system, image generation method, and non-transitory computer-readable storage medium | |
JP5905078B2 (ja) | 細胞培養装置、制御装置、及び方法 | |
US20140089846A1 (en) | Information processing apparatus, information processing method, and information processing program | |
KR102413695B1 (ko) | 병변 검출방법 및 이를 위한 치과영상 처리장치 | |
WO2023046630A1 (en) | Surgical microscope system and corresponding system, method and computer program for a surgical microscope system | |
WO2021177142A1 (ja) | 生殖補助医療を支援するための、システム、情報処理装置、サーバ、端末、プログラム、又は方法 | |
US9196038B2 (en) | Recipe based method for time-lapse image analysis | |
JP6946807B2 (ja) | 画像表示装置、プログラム及び制御方法 | |
EP4202523A1 (en) | System, method and computer program for a surgical microscope system and corresponding surgical microscope system | |
JPWO2019225177A1 (ja) | 制御装置、制御方法、およびプログラム |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20211108 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20211108 |
|
A711 | Notification of change in applicant |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A712 Effective date: 20220610 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20220610 |
|
RD02 | Notification of acceptance of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7422 Effective date: 20220829 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20220831 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20220829 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20220927 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20221025 |
|
RD03 | Notification of appointment of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7423 Effective date: 20221202 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20221213 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20230111 |
|
R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 7210355 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |