JP7067588B2 - 情報処理装置、プログラム、情報処理方法及び観察システム - Google Patents
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Description
上記特徴量抽出部は、観察対象物が経時的に撮像された動画像に含まれる撮像時刻が異なる少なくとも二枚の画像から第1の特徴量を抽出し、上記動画像に含まれる少なくとも一枚の画像から第2の特徴量を抽出する。
上記プロット生成部は、上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成する。
上記特徴量抽出部は、上記分析範囲毎に上記第1の特徴量及び上記第2の特徴量を抽出し、
上記プロット生成部は、上記分析範囲毎に上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成してもよい。
上記プロット生成部は、上記第1の動画像から抽出された第1の特徴量及び第2の特徴量と、上記第2の動画像から抽出された第1の特徴量及び第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成してもよい。
上記特徴量抽出部は、観察対象物が経時的に撮像された動画像に含まれる撮像時刻が異なる少なくとも二枚の画像から第1の特徴量を抽出し、上記動画像に含まれる少なくとも一枚の画像から第2の特徴量を抽出する。
上記プロット生成部は、上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成する。
プロット生成部が、上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成する。
上記観察装置は、観察対象物を経時的に撮像し、動画像を生成する。
上記情報処理装置は、上記動画像に含まれる撮像時刻が異なる少なくとも二枚の画像から第1の特徴量を抽出し、上記動画像に含まれる少なくとも一枚の画像から第2の特徴量を抽出する特徴量抽出部と、上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成するプロット生成部とを備える。
図1は、本実施形態に係る観察システム1の構成を示す模式図である。同図に示すように、観察システム1は、撮像装置11及び情報処理装置12を具備する。また、図1には、観察対象物Sを示す。観察対象物Sは、例えば培養容器中で培養されている細胞とすることができるが、生体組織等であってもよく、特に限定されない。
図1に示すように、情報処理装置12は機能的構成として、動画像取得部121、範囲設定部122、特徴量抽出部123、プロット生成部124、ゲーティング部125、解析画像生成部126及び画像出力部127を備える。
上記のような情報処理装置12の機能的構成は、以下に示すハードウェア構成によって実現することが可能である。
図9は、情報処理装置12の動作を示すフローチャートである。
情報処理装置12は、2つ以上の動画像を比較して解析することも可能である。以下、情報処理装置12が解析する動画像を第1動画像及び第2動画像とする。
情報処理装置12は、例えば細胞内輸送の評価に利用することが可能である。図11は、細胞内輸送を示す模式図であり、細胞Cが物質Bを輸送する様子を示す。
観察対象物が経時的に撮像された動画像に含まれる撮像時刻が異なる少なくとも二枚の画像から第1の特徴量を抽出し、上記動画像に含まれる少なくとも一枚の画像から第2の特徴量を抽出する特徴量抽出部と、
上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成するプロット生成部と
を具備する情報処理装置。
上記(1)に記載の情報処理装置であって、
請求項1に記載の情報処理装置であって、
上記特徴量抽出部は、上記動画像に含まれる撮像時刻が異なる少なくとも二枚の画像から上記第2の特徴量を抽出する
情報処理装置。
上記(1)又は(2)に記載の情報処理装置であって、
上記動画像において分析範囲を設定する範囲設定部
をさらに具備し、
上記特徴量抽出部は、上記分析範囲毎に上記第1の特徴量及び上記第2の特徴量を抽出し、
上記プロット生成部は、上記分析範囲毎に上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成する
情報処理装置。
上記(1)から(3)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記プロットに対してゲーティングを行うゲーティング部
をさらに具備する情報処理装置。
上記(1)から(4)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記ゲーティング部によるゲーティングの結果を可視化し、解析画像を生成する解析画像生成部
をさらに具備する情報処理装置。
上記(1)から(5)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記範囲設定部は、上記動画像に対して画像処理を施し、上記画像処理の結果に基づいて上記分析範囲を設定する
情報処理装置。
上記(1)から(6)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記動画像は上記観察対象物が異なる条件で撮像された第1の動画像と第2の動画像を含み、
上記プロット生成部は、上記第1の動画像から抽出された第1の特徴量及び第2の特徴量と、上記第2の動画像から抽出された第1の特徴量及び第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成する
情報処理装置。
上記(1)から(7)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記特徴量抽出部は、上記動画像に対して動き解析処理を施し、上記動き解析処理の結果に基づいて上記第1の特徴量を抽出する
情報処理装置。
観察対象物が経時的に撮像された動画像に含まれる撮像時刻が異なる少なくとも二枚の画像から第1の特徴量を抽出し、上記動画像に含まれる少なくとも一枚の画像から第2の特徴量を抽出する特徴量抽出部と、
上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成するプロット生成部と
として情報処理装置を機能させるプログラム。
特徴量抽出部が、観察対象物が経時的に撮像された動画像に含まれる撮像時刻が異なる少なくとも二枚の画像から第1の特徴量を抽出し、上記動画像に含まれる少なくとも一枚の画像から第2の特徴量を抽出し、
プロット生成部が、上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成する
情報処理方法。
観察対象物を経時的に撮像し、動画像を生成する撮像装置と、
上記動画像に含まれる撮像時刻が異なる少なくとも二枚の画像から第1の特徴量を抽出し、上記動画像に含まれる少なくとも一枚の画像から第2の特徴量を抽出する特徴量抽出部と、上記第1の特徴量と上記第2の特徴量をプロットしたプロット図を生成するプロット生成部とを備える情報処理装置と
を具備する観察システム。
11…撮像装置
12…情報処理装置
121…動画像取得部
122…範囲設定部
123…特徴量抽出部
124…プロット生成部
125…ゲーティング部
126…解析画像生成部
127…画像出力部
128…解析画像生成部
Claims (8)
- 観察対象物を異なる時点で撮像した少なくとも二枚の画像に対して物体検出処理を行い、物体検出処理結果に基づいて分析範囲を設定する範囲設定部と、
前記二枚の画像から、前記分析範囲内において一定以上の動きを有する領域の割合である第1の特徴量と前記分析範囲内において物体が存在する領域の割合である第2の特徴量を抽出する特徴量抽出部と、
前記第1の特徴量と前記第2の特徴量を前記分析範囲毎にプロットしたプロット図を生成するプロット生成部と、
前記二枚の画像のうち少なくとも一枚の画像を用いて、前記プロット図に対して行われたゲーティングに含まれる領域を可視化した解析画像を生成する解析画像生成部と
を具備する情報処理装置。 - 請求項1に記載の情報処理装置であって、
前記観察対象物は、細胞又は生体組織である
情報処理装置。 - 請求項1又は2に記載の情報処理装置であって、
前記解析画像は、前記ゲーティングの結果除外されたプロットに対応する範囲をマスキングされ生成された画像である
情報処理装置。 - 請求項1から3のうちいずれか1項に記載の情報処理装置であって、
前記プロット図に対して前記ゲーティングを行うゲーティング部
を更に具備する情報処理装置。 - 請求項4に記載の情報処理装置であって、
前記ゲーティング部は、前記ゲーティングに含まれるプロットの数を算出する
情報処理装置。 - 観察対象物を異なる時点で撮像した少なくとも二枚の画像に対して物体検出処理を行い、物体検出処理結果に基づいて分析範囲を設定する範囲設定部と、
前記二枚の画像から、前記分析範囲内において一定以上の動きを有する領域の割合である第1の特徴量と前記分析範囲内において物体が存在する領域の割合である第2の特徴量を抽出する特徴量抽出部と、
前記第1の特徴量と前記第2の特徴量を前記分析範囲毎にプロットしたプロット図を生成するプロット生成部と、
前記二枚の画像のうち少なくとも一枚の画像を用いて、前記プロット図に対して行われたゲーティングに含まれる領域を可視化した解析画像を生成する解析画像生成部と
として情報処理装置を機能させるプログラム。 - 範囲設定部が、観察対象物を異なる時点で撮像した少なくとも二枚の画像に対して物体検出処理を行い、物体検出処理結果に基づいて分析範囲を設定し、
特徴量抽出部が、前記二枚の画像から、前記分析範囲内において一定以上の動きを有する領域の割合である第1の特徴量と前記分析範囲内において物体が存在する領域の割合である第2の特徴量を抽出し、
プロット生成部が、前記第1の特徴量と前記第2の特徴量を前記分析範囲毎にプロットしたプロット図を生成するプロット生成部と、
解析画像生成部が、前記二枚の画像のうち少なくとも一枚の画像を用いて、前記プロット図に対して行われたゲーティングに含まれる領域を可視化した解析画像を生成する
情報処理方法。 - 観察対象物を異なる時点で撮像した少なくとも二枚の画像を生成する撮像装置と、
前記二枚の画像に対して物体検出処理を行い、物体検出処理結果に基づいて分析範囲を設定する範囲設定部と、前記二枚の画像から、前記分析範囲内において一定以上の動きを有する領域の割合である第1の特徴量と前記分析範囲内において物体が存在する領域の割合である第2の特徴量を抽出する特徴量抽出部と、前記第1の特徴量と前記第2の特徴量を前記分析範囲毎にプロットしたプロット図を生成するプロット生成部と、前記二枚の画像のうち少なくとも一枚の画像を用いて、前記プロット図に対して行われたゲーティングに含まれる領域を可視化した解析画像を生成する解析画像生成部とを備える情報処理装置と
を具備する観察システム。
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