JP6958817B2 - 抗tmem−180抗体、抗がん剤、及びがんの検査方法 - Google Patents
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Description
そして、TMEM-180に対する抗体を作製し、この抗体が大腸がん細胞に対する殺細胞効果を示すこと、また、従前の大腸がんマーカーよりも特に再発を感度よく検出できることを確認して本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は、
〔1〕抗transmembrane protein 180(TMEM-180)抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含む抗がん剤;
〔2〕抗がん活性を有する物質を結合させた抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含む抗がん剤;
〔3〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:GFSLTRYNVH(配列番号:1);
重鎖CDR2:VIWTGGSTD(配列番号:2);
重鎖CDR3:DLGY(配列番号:3);
軽鎖CDR1:KSSQSLKYRDGKTYLN(配列番号:4);
軽鎖CDR2:QVSKLDS(配列番号:5);及び
軽鎖CDR3:CQGSYSPHT(配列番号:6);
〔4〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:GFSLTSYYMQ(配列番号:7);
重鎖CDR2:FIRSGGSTE(配列番号:8);
重鎖CDR3:AFYGGYYFDY(配列番号:9);
軽鎖CDR1:KASQNVGSNVD(配列番号:10);
軽鎖CDR2:KASNRYT(配列番号:11);及び
軽鎖CDR3:MQSNTKYT(配列番号:12);
〔5〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:GFTFSDYAMA(配列番号:40);
重鎖CDR2:TIIYDGSST(配列番号:41);
重鎖CDR3:HWYWYFDF(配列番号:42);
軽鎖CDR1:LASEGISNDLA(配列番号:43);
軽鎖CDR2:AASRLQD(配列番号:44);及び
軽鎖CDR3:QQSYKYPLT(配列番号:45);
〔6〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:DCALN(配列番号:48);
重鎖CDR2:WINTQTGKPTYADDF(配列番号:49);
重鎖CDR3:EDYGYFDY(配列番号:50);
軽鎖CDR1:QASQNINKFIA(配列番号:51);
軽鎖CDR2:YTSTLVS(配列番号:52);及び
軽鎖CDR3:LQYDNLRT(配列番号:53);
〔7〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:NYGMH(配列番号:56);
重鎖CDR2:SISPSGGSTYYRDSV(配列番号:57);
重鎖CDR3:SASITAYYYVMDA(配列番号:58);
軽鎖CDR1:KASQNVGSNVD(配列番号:59);
軽鎖CDR2:KASNRYT(配列番号:60);及び
軽鎖CDR3:MQSNSYPPT(配列番号:61);
〔8〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:NYWMT(配列番号:64);
重鎖CDR2:SITNTGGSTYYPDSV(配列番号:65);
重鎖CDR3:AGYSSYPDYFDY(配列番号:66);
軽鎖CDR1:KAGQNIYNYLA(配列番号:67);
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:68);及び
軽鎖CDR3:QQYSSGWT(配列番号:69);
〔9〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:DYWVS(配列番号:72);
重鎖CDR2:EIYPNSGATNFNENFK(配列番号:73);
重鎖CDR3:DGTMGIAYYFDY(配列番号:74);
軽鎖CDR1:KASQNINRYLN(配列番号:75);
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:76);及び
軽鎖CDR3:LQHNSWPYT(配列番号:77);
〔10〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:SYDIS(配列番号:80);
重鎖CDR2:AINPGSGGTGYNEKFKGK(配列番号:81);
重鎖CDR3:IHGGYRYWFAY(配列番号:82);
軽鎖CDR1:RASSSVSYMH(配列番号:83);
軽鎖CDR2:DTSKLAS(配列番号:84);及び
軽鎖CDR3:LQRSSYPPT(配列番号:85);
〔11〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:SNGVG(配列番号:88);
重鎖CDR2:TIWTGGGTNYNSGVQS(配列番号:89);
重鎖CDR3:EYMGFDY(配列番号:90);
軽鎖CDR1:KASQNVGINVG(配列番号:91);
軽鎖CDR2:WASNRDT(配列番号:92);及び
軽鎖CDR3:LQHNSYPRT(配列番号:93);
〔12〕前記抗TMEM-180抗体が、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有する、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤:
重鎖CDR1:SNGVG(配列番号:96);
重鎖CDR2:TIWSGGGTNYNSAVQS(配列番号:97);
重鎖CDR3:EEKGFAY(配列番号:98);
軽鎖CDR1:KASQNVGINVG(配列番号:99);
軽鎖CDR2:WASNRDT(配列番号:100);及び
軽鎖CDR3:LQHNSYPRA(配列番号:101);
〔13〕前記抗TMEM-180抗体は、
前記重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3の少なくとも1つに、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含む;又は
前記重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3の少なくとも1つが、前記重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を有する、上記〔3〕から〔12〕のいずれか1項に記載の抗がん剤;
〔14〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:13で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:13で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:13で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖及び/又は、
配列番号:14で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:14で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:14で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔15〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:15で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:15で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:15で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
及び/又は、
配列番号:16で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:16で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:16で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔16〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:46で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:46で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:46で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
及び/又は、
配列番号:47で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:47で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:47で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔17〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:54で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:54で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:54で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
及び/又は、
配列番号:55で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:55で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:55で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔18〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:62で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:62で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:62で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
及び/又は、
配列番号:63で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:63で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:63で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔19〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:70で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:70で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:70で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
及び/又は、
配列番号:71で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:71で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:71で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔20〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:78で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:78で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:78で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
及び/又は、
配列番号:79で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:79で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:79で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔21〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:86で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:86で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:86で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
及び/又は、
配列番号:87で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:87で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:87で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔22〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:94で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:94で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:94で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
及び/又は、
配列番号:95で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:95で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:95で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔23〕前記抗TMEM-180抗体は、
配列番号:102で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:102で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;若しくは、
配列番号:102で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
及び/又は、
配列番号:103で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:103で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;若しくは、
配列番号:103で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記〔1〕又は〔2〕に記載の抗がん剤;
〔24〕前記抗TMEM-180抗体は、
Fc領域に1以上のN-結合型糖鎖が結合し、該N-結合型糖鎖の還元末端のN-アセチルグル
コサミンにフコースが結合していない、上記〔1〕から〔23〕のいずれか1項に記載の抗がん剤;
〔25〕TMEM-180を発現しているがんを対象とする、上記〔1〕から〔24〕のいずれか1項に記載の抗がん剤;
〔26〕大腸がんを対象とする、上記〔1〕から〔24〕のいずれか1項に記載の抗がん剤;
〔27〕配列番号104〜170で表されるアミノ酸配列からなるペプチドを少なくとも1つ含む組成物を用いたがんワクチン療法と併用して投与される、上記〔1〕から〔24〕のいずれか1項に記載の抗がん剤;
〔28〕上記〔3〕から〔24〕のいずれか1項に記載の抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメント;
〔29〕上記〔3〕から〔13〕のいずれか1項に記載の重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3のいずれか1つをコードする核酸;
〔30〕上記〔14〕から〔23〕のいずれか1項に記載の重鎖及び軽鎖のいずれか1つをコードする核酸;
〔31〕上記〔29〕又は〔30〕に記載の核酸を含む発現ベクター;
〔32〕上記〔31〕に記載の発現ベクターを含む形質転換体;
〔33〕上記〔32〕に記載の形質転換体で抗体を発現させる工程と、
前記抗体を回収する工程と、
を含む抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントの製造方法;
〔34〕被検者から採取された試料中のTMEM-180量を測定する工程を含む、がんの検査方法;
〔35〕前記TMEM-180量の測定を、抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントを用いたイムノアッセイで行う、上記〔34〕に記載のがんの検査方法;
〔36〕前記抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントが、上記〔28〕に記載の抗TMEM-180抗体若しくはその抗原結合フラグメントである、上記〔35〕に記載のがんの検査方法;
〔37〕大腸がんを対象とする、上記〔34〕から〔36〕のいずれか1項に記載のがんの検査方法;
〔38〕治療後の再発又は転移の検査に用いられる、上記〔34〕から〔37〕に記載のがんの検査方法;
〔39〕抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントを含むがんの検査用キット;
〔40〕前記抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントが、上記〔28〕に記載の抗TMEM-180抗体若しくはその抗原結合フラグメントである、上記〔39〕に記載のがんの検査用キット;及び
〔41〕大腸がんを対象とする、上記〔39〕又は〔40〕に記載のがんの検査用キットに関する。
〔A17〕被験者から採取された体液試料において、TMEM-180を有するエクソソームの量を検出する工程を含む、がんの検査方法。
〔A18〕上記〔A17〕に記載の方法であって、TMEM-180を有するエクソソームの量を検出する工程が、TMEM-180に結合する抗体又はその抗原結合フラグメントを用いて行われる、方法。
〔A21〕上記〔A18〕に記載の方法であって、TMEM-180を有するエクソソームの量を検出する工程が、上記〔3〕から〔24〕のいずれか1項に記載の抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントを用いて行われる、方法。
〔A22〕がんを有する対象において前記がんを処置することに用いる医薬組成物であって、TMEM-180に結合する抗体を含み、前記対象は、体液試料からTMEM-180が検出された対象である、医薬組成物。
〔A1〕transmembrane protein 180(TMEM-180)に結合する抗体又はその抗原結合フラグメントであって、
[1]重鎖CDR1:NYWMT(配列番号:171);
重鎖CDR2:SITNTGGSTAYPDSV(配列番号:172);及び
重鎖CDR3:AGYSSYPDYFDY(配列番号:173)を含む重鎖可変領域と、
軽鎖CDR1:KAGQNIYNYLA(配列番号:174);
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:175);及び
軽鎖CDR3:QQYSSGWT(配列番号:176)を含む軽鎖可変領域とを含む抗体、または、
[2]TMEM-180に対する結合において上記[1]に記載の抗体と競合する抗体。
〔A2〕重鎖可変領域(配列番号:177)及び軽鎖可変領域(配列番号:178)を含む、上記〔A1〕に記載の抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔A3〕重鎖(配列番号:180)及び軽鎖(配列番号:182)を有する、上記〔A1〕または〔A2〕に記載の抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔A4〕Fc領域に1以上のN-結合型糖鎖が結合し、該N-結合型糖鎖の還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合していない、上記〔A1〕〜〔A3〕のいずれかに記載の抗体。
〔A5〕上記〔A1〕〜〔A4〕のいずれかに記載の抗体を含む、がんを処置することに用いるための医薬組成物。
〔A6〕上記〔A1〕〜〔A4〕のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合フラグメントを含む、がんを診断することに用いるための組成物。
〔A7〕上記〔A1〕〜〔A4〕のいずれかに記載の抗体又は抗原結合フラグメントを含む、がんを診断することに用いるための診断キット。
〔A8〕TMEM-180を発現しているがんを対象とする、上記〔A5〕に記載の医薬組成物。
〔A9〕大腸がんを対象とする、上記〔A5〕に記載の医薬組成物。
〔A10〕上記〔A1〕〜〔A4〕のいずれかに記載の重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3のいずれか1つをコードする核酸。
〔A11〕上記〔A1〕〜〔A4〕のいずれかに記載の重鎖及び軽鎖のいずれか1つをコードする核酸。
〔A12〕上記〔A10〕または〔A11〕に記載の核酸を含む発現ベクター。
〔A13〕上記〔A12〕に記載の発現ベクターを含む形質転換体。
〔A14〕被検者から採取された試料中のTMEM-180量を上記〔A1〕〜〔A4〕のいずれかに記載の抗体又はその抗原結合フラグメントを用いて測定する工程を含む、がんの検査方法。
〔A15〕大腸がんを対象とする、上記〔A14〕に記載のがんの検査方法。
〔A16〕治療後の再発又は転移の検査に用いられる、上記〔A14〕または〔A15〕のがんの検査方法。
〔A19〕上記〔A18〕に記載の方法であって、TMEM-180を有するエクソソームの量を検出する工程が、上記〔A1〕から〔A4〕のいずれか1項に記載の抗体又はその抗原結合フラグメントを用いて行われる、方法。
〔A20〕ステージ1または2のがんを検出する方法であって、被検者から採取された試料中のTMEM-180量を測定する工程を含む、方法。
〔A23〕ステージ1または2のがんを検出するための、上記〔A17〕から〔A19〕のいずれか1項に記載の方法。
〔A24〕がんが、大腸がんである、上記〔A17〕から〔A23〕のいずれか1項に記載の方法。
〔B1〕抗TMEM180抗体と細胞傷害剤との抗体薬物コンジュゲートを含む、がんを処置することに用いるための医薬組成物。
〔B2〕抗TMEM180抗体が、
[1]重鎖CDR1:NYWMT(配列番号:171);
重鎖CDR2:SITNTGGSTAYPDSV(配列番号:172);及び
重鎖CDR3:AGYSSYPDYFDY(配列番号:173)を含む重鎖可変領域と、
軽鎖CDR1:KAGQNIYNYLA(配列番号:174);
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:175);及び
軽鎖CDR3:QQYSSGWT(配列番号:176)を含む軽鎖可変領域とを含む抗体、または、
[2]TMEM-180に対する結合において上記[1]に記載の抗体と競合する抗体
である、上記〔B1〕に記載の医薬組成物。
〔B3〕抗TMEM180抗体が、
重鎖(配列番号:180)及び軽鎖(配列番号:182)を有する、上記〔B2〕に記載の医薬組成物。
〔B4〕抗TMEM180抗体が、
[1]重鎖CDR1:DYWVS(配列番号:72);
重鎖CDR2:EIYPNSGATNFNENFK(配列番号:73);及び
重鎖CDR3:DGTMGIAYYFDY(配列番号:74)を含む重鎖可変領域と、
軽鎖CDR1:KASQNINRYLN(配列番号:75);
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:76);及び
軽鎖CDR3:LQHNSWPYT(配列番号:77)を含む軽鎖可変領域とを含む抗体、または、
[2]TMEM-180に対する結合において上記[1]に記載の抗体と競合する抗体
である、上記〔B1〕に記載の医薬組成物。
〔B5〕抗体と細胞傷害剤とが、開裂性リンカーで連結されている、上記〔B1〕〜〔B4〕のいずれかに記載の医薬組成物。
〔B6〕開裂性リンカーが、体内でペプチダーゼにより開裂するペプチドリンカーであるか、ヒドラゾンリンカーであるか、または、カルバメート結合若しくはエステル結合を含むリンカーである、上記〔B5〕に記載の医薬組成物。
〔B7〕開裂性リンカーが、バリン−シトルリンまたはフェニルアラニン−リジンのジペプチドを含むリンカーである、上記〔B6〕に記載の医薬組成物。
〔B8〕開裂性リンカーが、バリン−シトルリンリンカーである、上記〔B7〕に記載の医薬組成物。
〔B9〕開裂性リンカーが、ポリエチレングリコールブロックとバリン−シトルリンブロックとを含む(例えば、Mal−PEG12−Val−Cit−PABCを含む)、上記〔B8〕に記載の医薬組成物。
〔B10〕細胞傷害剤が、モノメチルアウリスタチンEである、上記〔B1〕〜〔B9〕、特に〔B9〕に記載の医薬組成物。
〔B11〕抗体が上記〔1〕〜〔23〕および〔A1〕に記載のいずれかの抗体である、〔B9〕または〔B10〕に記載の医薬組成物。
〔B12〕抗TMEM180抗体と細胞傷害剤との抗体薬物コンジュゲートを含む、医薬組成物、または
抗TMEM180抗体が、細胞傷害剤と連結した形態である、上記〔A5〕に記載の
がんを処置することに用いるための医薬組成物。
TMEM-180は特定のがんに特異的に発現し、正常組織には発現していないので、本発明に係る抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントを用いるがんの検査方法及び検査用キットによれば、がんの検査を簡便に行うことができる。本発明に係るがんの検査方法及び検査用キットは、従来の大腸がんマーカーに比較して、特にがんの再発を感度よく検出することができる。
また、本発明に係る抗がん活性を有する物質を結合させた抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントを含む抗がん剤によれば、TMEM-180を発現するがん細胞に、その抗がん剤を特異的に送達させることができるので、抗がん活性を有する物質として毒性の強い物質も利用しやすい。
本発明に係る抗がん剤の一態様は、抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含む。
本明細書において抗TMEM-180抗体とは、Transmembrane protein-180(TMEM-180)に結合する抗体をいい、TMEM-180に特異的に結合し得る。本明細書おいて、TMEM-180という場合、どのような動物に由来するTMEM-180であってもよく、また、抗がん剤の標的となり、がんの検査方法の指標となる限り、その変異体であってもよい。TMEM-180の一例として、ヒトTMEM-180のアミノ酸配列を配列番号:17に示す。
可変領域のうち、直接抗原と接触する領域は特に変化が大きく、相補性決定領域(complementarity-determining region: CDR)と呼ばれる。CDR以外の比較的変異の少ない部分をフレームワーク(framework region: FR)と呼ぶ。軽鎖と重鎖の可変領域には、それぞれ3つのCDRが存在し、それぞれN末端側から順に、重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3と呼ばれる。
「ヒト化抗体」とは、非ヒト由来の抗体に特徴的なアミノ酸配列で、ヒト抗体の対応する位置を置換した抗体を意味し、例えば、マウス又はラットを免疫して作製した抗体の重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3を有し、重鎖及び軽鎖のそれぞれ4つのフレームワーク領域(FR)を含むその他のすべての領域がヒト抗体に由来するものが挙げられる。かかる抗体は、CDR移植抗体と呼ばれる場合もある。用語「ヒト化抗体」は、ヒトキメラ抗体を含む場合もある。
「ヒトキメラ抗体」は、非ヒト由来の抗体において、非ヒト由来の抗体の定常領域がヒトの抗体の定常領域に置換されている抗体である。ヒトキメラ抗体では、ADCC活性を高める観点では、例えば、定常領域に用いるヒトの抗体のサブタイプはIgG1とすることができる。
これらのCDRは、後述する実施例に示す98クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:GFSLTRYNVH(配列番号:1)
重鎖CDR2:VIWTGGSTD(配列番号:2)
重鎖CDR3:DLGY(配列番号:3)
軽鎖CDR1:KSSQSLKYRDGKTYLN(配列番号:4)
軽鎖CDR2:QVSKLDS(配列番号:5)
軽鎖CDR3:CQGSYSPHT(配列番号:6)
これらのCDRは、後述する実施例に示す101クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:GFSLTSYYMQ (配列番号:7)
重鎖CDR2:FIRSGGSTE (配列番号:8)
重鎖CDR3:AFYGGYYFDY (配列番号:9)
軽鎖CDR1:KASQNVGSNVD (配列番号:10)
軽鎖CDR2:KASNRYT (配列番号:11)
軽鎖CDR3:MQSNTKYT (配列番号:12)
これらのCDRは、後述する実施例に示す212クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:GFTFSDYAMA(配列番号:40)
重鎖CDR2:TIIYDGSST(配列番号:41)
重鎖CDR3:HWYWYFDF(配列番号:42)
軽鎖CDR1:LASEGISNDLA(配列番号:43)
軽鎖CDR2:AASRLQD(配列番号:44)
軽鎖CDR3:QQSYKYPLT(配列番号:45)
これらのCDRは、後述する実施例に示す129クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:DCALN(配列番号:48)
重鎖CDR2:WINTQTGKPTYADDF(配列番号:49)
重鎖CDR3:EDYGYFDY(配列番号:50)
軽鎖CDR1:QASQNINKFIA(配列番号:51)
軽鎖CDR2:YTSTLVS(配列番号:52)
軽鎖CDR3:LQYDNLRT(配列番号:53)
これらのCDRは、後述する実施例に示す382クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:NYGMH(配列番号:56)
重鎖CDR2:SISPSGGSTYYRDSV(配列番号:57)
重鎖CDR3:SASITAYYYVMDA(配列番号:58)
軽鎖CDR1:KASQNVGSNVD(配列番号:59)
軽鎖CDR2:KASNRYT(配列番号:60)
軽鎖CDR3:MQSNSYPPT(配列番号:61)
これらのCDRは、後述する実施例に示す1361クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:NYWMT(配列番号:64)
重鎖CDR2:SITNTGGSTYYPDSV(配列番号:65)
重鎖CDR3:AGYSSYPDYFDY(配列番号:66)
軽鎖CDR1:KAGQNIYNYLA(配列番号:67)
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:68)
軽鎖CDR3:QQYSSGWT(配列番号:69)
これらのCDRは、後述する実施例に示す669クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:DYWVS(配列番号:72)
重鎖CDR2:EIYPNSGATNFNENFK(配列番号:73)
重鎖CDR3:DGTMGIAYYFDY(配列番号:74)
軽鎖CDR1:KASQNINRYLN(配列番号:75)
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:76)
軽鎖CDR3:LQHNSWPYT(配列番号:77)
本発明に係る抗TMEM-180抗体の一態様は、上記CDRのすべてを有する。本発明に係る抗TMEM-180抗体の一態様は、上記CDRのすべてを有するヒト化抗体である。
これらのCDRは、後述する実施例に示す699クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:SYDIS(配列番号:80)
重鎖CDR2:AINPGSGGTGYNEKFKGK(配列番号:81)
重鎖CDR3:IHGGYRYWFAY(配列番号:82)
軽鎖CDR1:RASSSVSYMH(配列番号:83)
軽鎖CDR2:DTSKLAS(配列番号:84)
軽鎖CDR3:LQRSSYPPT(配列番号:85)
これらのCDRは、後述する実施例に示す1052クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:SNGVG(配列番号:88)
重鎖CDR2:TIWTGGGTNYNSGVQS(配列番号:89)
重鎖CDR3:EYMGFDY(配列番号:90)
軽鎖CDR1:KASQNVGINVG(配列番号:91)
軽鎖CDR2:WASNRDT(配列番号:92)
軽鎖CDR3:LQHNSYPRT(配列番号:93)
これらのCDRは、後述する実施例に示す1105クローン抗TMEM-180抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:SNGVG(配列番号:96)
重鎖CDR2:TIWSGGGTNYNSAVQS(配列番号:97)
重鎖CDR3:EEKGFAY(配列番号:98)
軽鎖CDR1:KASQNVGINVG(配列番号:99)
軽鎖CDR2:WASNRDT(配列番号:100)
軽鎖CDR3:LQHNSYPRA(配列番号:101)
これらのCDRは、後述する実施例に示す1361-5クローン抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:NYWMT(配列番号:171)
重鎖CDR2:SITNTGGSTAYPDSV(配列番号:172)
重鎖CDR3:AGYSSYPDYFDY(配列番号:173)
軽鎖CDR1:KAGQNIYNYLA(配列番号:174)
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:175)
軽鎖CDR3:QQYSSGWT(配列番号:176)
本発明に係る抗TMEM-180抗体の一態様は、この態様における抗体とTMEM-180に対する結合において競合する抗体である。
これらのCDRは、後述する実施例に示す1361-5クローン抗体のCDR配列である。
重鎖CDR1:NYWMT(配列番号:171)
重鎖CDR2:SITNTGGSTAYPDSV(配列番号:172)
重鎖CDR3:AGYSSYPDYFDY(配列番号:173)
軽鎖CDR1:KAGQNIYNYLA(配列番号:174)
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:175)
軽鎖CDR3:QQYSSGWT(配列番号:176)
本発明に係る抗TMEM-180抗体の一態様は、この態様における抗体とTMEM-180に対する結合において競合する抗体である。
本発明に係る抗TMEM-180抗体の一態様は、この態様における抗体とTMEM-180に対する結合において競合する抗体である。
本発明に係る抗TMEM-180抗体の一態様は、この態様における抗体とTMEM-180に対する結合において競合する抗体である。
同一性は、80%以上であって、CDRとしての機能を保持する限り何%であってもよく、例えば85%以上、90%以上、95%以上、98%以上、99%以上とすることができる。
配列番号:13で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:13で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:13で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:13で表されるアミノ酸配列は、98クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:14で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:14で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:14で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:14で表されるアミノ酸配列は、98クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:14で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:14で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:14で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:15で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:15で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:15で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:15で表されるアミノ酸配列は、101クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:16で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:16で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:16で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:16で表されるアミノ酸配列は、101クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:16で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:16で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:16で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:46で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:46で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:46で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:46で表されるアミノ酸配列は、212クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:47で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:47で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:47で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:47で表されるアミノ酸配列は、212クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:47で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:47で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:47で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:54で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:54で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:54で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:54で表されるアミノ酸配列は、129クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:55で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:55で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:55で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:55で表されるアミノ酸配列は、129クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:55で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:55で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:55で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:62で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:62で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:62で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:62で表されるアミノ酸配列は、382クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:63で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:63で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:63で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:63で表されるアミノ酸配列は、382クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:63で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:63で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:63で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:70で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:70で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:70で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:70で表されるアミノ酸配列は、1361クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:71で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:71で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:71で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:71で表されるアミノ酸配列は、1361クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:71で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:71で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:71で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:78で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:78で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:78で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:78で表されるアミノ酸配列は、669クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:79で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:79で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:79で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:79で表されるアミノ酸配列は、669クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:79で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:79で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:79で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:86で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:86で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:86で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:86で表されるアミノ酸配列は、699クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:87で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:87で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:87で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:87で表されるアミノ酸配列は、699クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:87で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:87で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:87で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:94で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:94で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:94で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:94で表されるアミノ酸配列は、1052クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:95で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:95で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:95で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:95で表されるアミノ酸配列は、1052クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:95で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:95で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:95で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:102で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:102で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:102で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:102で表されるアミノ酸配列は、1105クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:103で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:103で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:103で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:103で表されるアミノ酸配列は、1105クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:103で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:103で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:103で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
配列番号:180で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:180で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:180で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖、を含む。
配列番号:180で表されるアミノ酸配列は、1361-5クローン抗TMEM-180抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:182で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:182で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:182で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、を含む。
配列番号:182で表されるアミノ酸配列は、1361-5クローン抗TMEM-180抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列である。
配列番号:182で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖、配列番号:182で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖、又は、配列番号:182で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖と、を含んでいてもよい。
本発明の抗体または本発明の抗体とTMEM-180との結合において競合する抗体において、Fc領域は、1以上のアミノ酸置換を有していてもよい。例えば、重鎖は、特に限定されないが配列番号180の262番目のアミノ酸に対応するアミノ酸においてセリンからアスパラギン酸へのアミノ酸置換、配列番号180の353番目のアミノ酸に対応するアミノ酸においてアラニンからロイシンへのアミノ酸置換、および配列番号180の355番目のアミノ酸に対応するアミノ酸においてイソロイシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換を有する重鎖としてもよい。また、例えば、重鎖は、特に限定されないが配列番号180の262番目のアミノ酸に対応するアミノ酸においてセリンからアスパラギン酸へのアミノ酸置換、配列番号180の355番目のアミノ酸に対応するアミノ酸においてイソロイシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換、および配列番号180の356番目のアミノ酸に対応するグルタミン酸からアラニンへのアミノ酸置換を有する重鎖としてもよい。
例えばIgG抗体のFc領域には、N-結合型糖鎖の結合部位が2ヶ所存在し、この部位に複合型糖鎖が結合している。N-結合型糖鎖とは、Asn-X-Ser/Thr配列のAsnに結合する糖鎖をいい、共通した構造Man3GlcNAc2-Asnを有する。非還元末端の2つのマンノース(Man)に結合する糖鎖の種類により、高マンノース型、混成型、及び複合型等に分類される。
N-結合型糖鎖の還元末端のN-アセチルグルコサミン(GlcNAc)にはフコースが結合しうるが、このフコースが結合していない場合、結合している場合に比較してADCC活性が著しく上昇することが知られている。このことは例えば、国際公開第2002/031140号パンフレットに記載されており、その開示は全体として参照により本明細書に組み込まれる。
ADCC活性が著しく向上することにより、抗体を医薬として用いる場合に投与量を少なくすることができるので、副作用を軽減させることが可能であると共に、治療費も低減させることができる。
担体及び添加物の例としては、水、食塩水、リン酸緩衝液、デキストロース、グリセロール、エタノール等薬学的に許容される有機溶剤、コラーゲン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、カルボキシビニルポリマー、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ポリアクリル酸ナトリウム、アルギン酸ナトリウム、水溶性デキストラン、カルボキシメチルスターチナトリウム、ぺクチン、メチルセルロース、エチルセルロース、キサンタンガム、アラビアゴム、カゼイン、寒天、ポリエチレングリコール、ジグリセリン、グリセリン、プロピレングリコール、ワセリン、パラフィン、ステアリルアルコール、ステアリン酸、ヒト血清アルブミン、マンニトール、ソルビトール、ラクトース、界面活性剤等が挙げられるがこれらに限定されない。
本明細書において「がんワクチン療法」とは、がん抗原を患者に投与して、又は患者由来の免疫細胞を体外においてがん抗原で刺激してから患者に戻すことによって、がん細胞に対する患者自身の免疫力を高めるがんの治療又は予防方法である。がんワクチン療法に用いられるがん抗原の一例として、がん細胞特異的に発現するタンパク質に由来するペプチド(がん抗原由来ペプチド)が用いられる。
これらのペプチドを用いたがんワクチン療法によれば、TMEM-180タンパク質を発現するがん細胞に対するCTLによる攻撃を活性化することができるので、TMEM-180を標的とする本発明に係る抗がん剤と併用することにより、がん細胞を効率よく攻撃することができ、がんを予防又は治療することが可能である。ペプチドを含むがんワクチン組成物は、公知の方法に従って、当業者が調製することができる。
本発明は、本発明に係る抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントをコードする核酸も包含する。核酸は、天然の核酸であっても人工の核酸であってもよく、例えば、DNA、RNA、DNAとRNAのキメラが挙げられるがこれらに限定されない。抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントをコードする核酸の塩基配列は、当業者が公知の方法又はそれに準ずる方法に従って決定することができ、公知の方法又はそれに準ずる方法で調製することができる。
本発明に係る抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントをコードする核酸としては、例えば、98クローン抗TMEM-180抗体の重鎖又は軽鎖をコードするDNAを含む核酸、98クローン抗TMEM-180抗体の重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3のいずれかをコードするDNAを含む核酸、101クローン抗TMEM-180抗体の重鎖又は軽鎖をコードするDNAを含む核酸、101クローン抗TMEM-180抗体の重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3のいずれかをコードするDNAを含む核酸、212クローン抗TMEM-180抗体の重鎖又は軽鎖をコードするDNAを含む核酸、及び、212クローン抗TMEM-180抗体の重鎖CDR1〜3及び軽鎖CDR1〜3のいずれかをコードするDNAを含む核酸が挙げられるがこれらに限定されない。
本発明に係る発現ベクターは、本発明に係る抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントをコードする核酸を含む。発現ベクターは、使用する宿主細胞にあわせて適宜選択することができ、例えば、プラスミド、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター、カリフラワーモザイクウイルスベクターやタバコモザイクウイルスベクターなどの植物ウイルスベクター、コスミド、YAC、EBV由来エピソームなどが挙げられる。これらの発現ベクターには、公知の方法(制限酵素を利用する方法等)で、本発明の抗TMEM-180抗体をコードする核酸を挿入することができる。
本発明に係る形質転換体は、本発明に係るベクターを含む。形質転換体は、本発明のベクターを適切な宿主細胞にトランスフェクトすることによって得ることができる。宿主細胞としては、例えば、哺乳類細胞(CHO細胞、COS細胞、ミエローマ細胞、HeLa細胞、Vero細胞等)、昆虫細胞、植物細胞、真菌細胞(サッカロミセス属、アスペルギルス属等)といった真核細胞や、大腸菌(E.Coli)、枯草菌などの原核細胞を用いることができる。
本発明に係る抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントの製造方法は限定されないが、例えば、抗TMEM-180モノクローナル抗体は、TMEM-180又はその断片で免疫した非ヒト哺乳動物から抗体産生細胞を単離し、これを骨髄腫細胞等と融合させてハイブリドーマを作製し、このハイブリドーマが産生した抗体を精製することによって得ることができる。また、抗TMEM-180ポリクローナル抗体は、TMEM-180又はその断片で免疫した動物の血清から得ることができる。
免疫は、TMEM-180タンパク質を常法に従って動物に免疫することで行うことができる。免疫はまた、TMEM-180タンパク質に代えて、TMEM-180タンパク質を表出したエクソソーム用いて行ってもよい。TMEM-180タンパク質を表出したエクソソームで免疫して得た抗体は、特に限定されないが、TMEM-180タンパク質を表出したエクソソームの検出に適し得る。
単離精製方法としては、例えば、プロテインA等を用いたアフィニティカラム、その他のクロマトグラフィーカラム、フィルター、限外濾過、塩析、透析が挙げられ、これらを適宜組み合わせることができる。
例えば、ヒト型キメラ抗体の場合、マウス抗体を産生するハイブリドーマのmRNAから逆転写酵素によりcDNAを合成し、重鎖可変領域(VH)及び軽鎖可変領域(LH)をPCRでクローニングして配列を解析する。次に、一致率の高い抗体塩基配列から、リーダー配列を含む5'プライマーを作製し、5'プライマーと可変部3'プライマーによって上記cDNAから、シグナル配列から可変領域の3'末端までをPCRでクローニングする。一方で、ヒトIgG1の重鎖及び軽鎖の定常領域をクローニングし、重鎖と軽鎖それぞれについて、マウス抗体由来可変領域と、ヒト抗体由来定常領域とをPCRによるOverlapping Hanging法で連結し、増幅する。得られたDNAを適当なベクターに挿入し、これを形質転換して、ヒト型キメラ抗体を得ることができる。
元の配列において、1又は2個のアミノ酸の欠失、置換又は付加を有するアミノ酸配列からなるCDRや、元の配列にX%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるCDRは、部位特異的変異導入法、ランダム変異導入法、チェーンシャフリング法、CDRウォーキング法などの公知の方法を用いて作製され得る。
これらの方法により、ファージディスプレイ法によってCDRに種々の変異を有する抗体又は抗体断片をファージ表面に提示させ、抗原を使用してスクリーニングすることにより、より親和性が成熟したCDRを得られることが当業者によく知られている(例えば、Wu et al., PNAS, 95:6037-6042(1998); Schier, R. et al., J. Mol. Bio. 263:551-567(1996); Schier, R. et al., J. Mol. Biol. 255:28-43(1996); Yang, W.P. et al., J. Mol. Biol., 254:392-403(1995)。)。本発明は、このような方法で成熟させたCDRを含む抗体も包含する。
具体的には、例えば、本発明に係る抗TMEM-180抗体をコードするDNAを含むベクターを用いて、GDP-フコースの合成に関与する酵素の活性、又はα-1,6-フコシルトランスフェラーゼの活性が低下又は欠失した細胞を形質転換し、得られた形質転換体を培養した後、目的とする抗TMEM-180抗体を精製することによって得ることができる。
GDP-フコースの合成に関与する酵素としては、例えば、GDP-mannose 4,6-dehydratase(GMP)、GDP-keto-6-deoxymannose 3,5-epimerase,4-reductase(Fx)、GDP-beta-L-fucose pyrophosphorylase(GFPP)が挙げられる。
ここで、細胞は特に限定されないが、哺乳動物細胞が好ましく、例えば上記酵素活性を低下又は欠失されたCHO細胞を用いることができる。
上記方法によって得られる抗体組成物は、還元末端のN−アセチルグルコサミンにフコースが結合している抗体を含む場合もあるが、フコースが結合している抗体の割合は、抗体全体の20重量%以下、好ましくは10重量%以下、さらに好ましくは5重量%以下、最も好ましくは3重量%以下である。
この方法によって得られる抗体組成物も、還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合している抗体を含む場合もあるが、フコースが結合している抗体の割合は、抗体全体の20重量%以下、好ましくは10重量%以下、さらに好ましくは5重量%以下、最も好ましくは3重量%以下である。
抗体医薬の薬効メカニズムは、抗体が有する2つの生物活性に基づいている。1つは標的抗原特異的な結合活性であり、結合することによって標的抗原分子の機能を中和する活性である。標的抗原分子の機能の中和はFab領域を介して発揮される。
本発明に係る抗TMEM-180抗体の活性は、以下の方法で測定することができる。
抗体の結合活性は公知の方法、例えば、ELISA(酵素結合免疫吸着検定法)、EIA(酵素免疫測定法)、RIA(放射免疫測定法)、蛍光抗体法、FACS法等で、測定することができる。
ADCC活性とは、標的細胞の細胞表面抗原に本発明の抗体が結合した際、そのFc部分にFcγ受容体保有細胞(エフェクター細胞)がFcγ受容体を介して結合し、標的細胞に障害を与える活性を意味する。
ADCC活性は、TMEM-180を発現している標的細胞とエフェクター細胞と本発明の抗体を混合し、ADCCの程度を測定することによって知ることができる。エフェクター細胞としては、例えば、マウス脾細胞、ヒト末梢血や骨髄から分離した単球核を利用することができる。標的細胞としては、例えばTMEM-180陽性大腸がん粘膜細胞を用いることができる。標的細胞をあらかじめ51Cr等で標識し、これに本発明の抗体を加えてインキュベーションし、その後標的細胞に対して適切な比のエフェクター細胞を加えてインキュベーションを行う。インキュベーション後、上清を採取し、上清中の上記標識をカウントすることにより、測定することが可能である。
CDC活性とは、補体系による細胞障害活性を意味する。
CDC活性は、ADCC活性の試験において、エフェクター細胞に代えて補体を用いることにより測定することができる。
腫瘍増殖抑制活性は、腫瘍モデル動物を利用して測定することができる。例えば、マウスの皮下に腫瘍を移植し、本発明の抗体を投与する。非投与群と投与群における腫瘍組織の体積を比較することにより、腫瘍増殖抑制効果を測定することができる。
なお、本発明の腫瘍増殖抑制活性は、個々の細胞の増殖を抑制する結果生じるものであっても、細胞死を誘導する結果生じるものであってもよい。
本発明の検査方法または検査キットにより検出されるがんは、血液腫瘍以外のがん、例えば、固形がん、例えば、大腸がん、脳腫瘍、胃がん、膵がん、乳がん、前立腺がん、腎がん、および膀胱がんであり得る。上述のとおり、TMEM-180は特定のがん細胞において発現し、正常組織や健常者組織では発現が見られない。従って、本発明に係るがんの検査方法は、被検者から採取された試料中のTMEM-180量を測定する工程を含む。
本明細書において、被検者から採取された試料は、がんの検査に適したあらゆる試料とすることができ、がん種によって当業者が適宜決定し採取することができる。例えば血清、血漿、全血、尿、糞便、体腔液、組織が挙げられるがこれらに限定されない。大腸がんの検査の場合、大腸内視鏡等によって被検者から採取した組織や、大腸内視鏡検査後の洗浄液に含まれる粘膜細胞を試料としてもよい。
本発明に係るがんの検査方法は、がんの診断に用いてもよく、また術後など治療後の経過観察において、再発や転移の確認に用いてもよい。
エクソソームの精製または検出は、周知の技術を用いて行うことができ、特に限定されないが例えば、エクソソームに結合する抗体(例えば、抗CD9抗体、抗CD63抗体または抗CD81抗体)を用いて実施することができる。またTMEM-180の検出またはTMEM-180を含む物質の精製は、本発明の抗TMEM-180抗体を用いて実施することができる。検出に用いる抗体は、ペルオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼなどの酵素並びにラジオアイソトープ、蛍光物質および発光物質などの標識により検出可能に標識した抗体とすることができ、これらの抗体の検出は当業者に周知の方法により行うことができる。また、エクソソーム量および上記規定値は、これらの検出方法による測定値またはこれを標準化した値に基づいて決定することができる。当然、抗TMEM-180抗体でエクソソームを精製し、別の抗TMEM-180抗体でエクソソームを検出することもできる。
TMEM-180は膜タンパク質であることから、市販の細胞溶解バッファー、非イオン性界面活性剤、膜タンパク質可溶化試薬等で処理し、膜タンパク質を可溶化してからその量を測定してもよい。
ーダミン、ダンシルクロリド、フィコエリトリン、テトラメチルローダミンイソチオシアネート、近赤外蛍光材料等の蛍光物質、CLIA法では、ルシフェラーゼ、ルシフェリン、エクオリン等の発光物質で標識した抗体が用いられる。その他、金コロイド、量子ドットなどのナノ粒子で標識した抗体を検出することもできる。
また、イムノアッセイでは、抗TMEM-180抗体をビオチンで標識し、酵素等で標識したアビジン又はストレプトアビジンを結合させて検出することもできる。
ELISA法には競合法とサンドイッチ法がある。競合法では、マイクロプレート等の固相担体に抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントを固定し、試料と酵素標識したTMEM-180を添加して、抗原抗体反応を生じさせる。いったん洗浄した後、酵素基質と反応、発色させ、吸光度を測定する。試料中のTMEM-180が多ければ発色は弱くなり、試料中のTMEM-180が少なければ発色が強くなるので、検量線を用いてTMEM-180量を求めることができる。
サンドイッチ法では、固相担体に抗TMEM-180抗体又はその抗原結合フラグメントを固定し、試料を添加し、反応させた後、さらに酵素で標識した別のエピトープを認識する抗TMEM-180抗体を添加して反応させる。洗浄後、酵素基質と反応、発色させ、吸光度を測定することにより、TMEM-180量を求めることができる。サンドイッチ法では、固相担体に固定した抗体と試料中のTMEM-180を反応させた後、非標識抗体(一次抗体)を添加し、この非標識抗体に対する抗体(二次抗体)を酵素標識してさらに添加してもよい。
酵素基質は、酵素がペルオキシダーゼの場合、3,3'−diaminobenzidine(DAB)、3,3'5,5'−tetramethylbenzidine(TMB)、o−phenylenediamine(OPD)等を用いることができ、アルカリホスファターゼの場合、p−nitropheny phosphate(NPP)等を用いることができる。
あるいは、試料中のTMEM-180抗原をマイクロタイタープレートなどの固相担体に直接固定し、必要なブロッキングを行った後、非標識抗体(一次抗体)を添加し、この非標識抗体に対する抗体(二次抗体)を酵素標識してさらに添加してもよい。
ラテックス粒子に抗TMEM-180抗体を結合させて適宜処理した試料に混合すると、TMEM-180が存在すれば、抗体結合ラテックス粒子が凝集する。そこで、サンプルに近赤外光を照射して、吸光度の測定(比濁法)又は散乱光の測定(比朧法)により凝集塊を定量し、抗原の濃度を求めることができる。
捕捉用抗体と標識抗体は、異なるエピトープを認識する。
このようなキットでは、まず、マイクロタイタープレートに捕捉用抗体を固定し、ここに試料を適宜希釈して添加した後インキュベートし、試料を除去して洗浄する。次に、標識した抗体を添加した後インキュベートし、基質を加えて発色させる。マイクロタイタープレートリーダー等を用いて発色を測定することにより、TMEM-180量を求めることができる。
捕捉用抗体と一次抗体は、異なるエピトープを認識する。
このようなキットでは、まず、マイクロタイタープレートに捕捉用抗体を固定し、ここに試料を適宜希釈して添加した後インキュベートし、試料を除去して洗浄する。続いて、一次抗体を添加してインキュベート及び洗浄を行い、さらに酵素標識した二次抗体を添加してインキュベートを行った後、基質を加えて発色させる。マイクロタイタープレートリーダー等を用いて発色を測定することにより、TMEM-180を求めることができる。二次抗体を用いることにより、反応が増幅され検出感度を高めることができる。
1)DNAマイクロアレイ解析
5種類のヒト大腸がん細胞株(HT29、SW480、LOVO、HCT116、DLD-1)と2種類のヒト健常者由来遊離大腸細胞由来のmRNA各々10μgを使用した。メーカー(Affymetrix)の指示に従いRNAから二本鎖cDNAを経由してビオチン標識されたcRNAを合成した。断片化後に、GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array(Affymetrix)とハイブリダイゼーションを行った。GeneChip Scanner 3000 7G(Affymetrix)を用いてスキャンを行い、CELデータ取得後に統計処理を行い、各サンプルのシグナル値を算出した。5種類のヒト大腸がん細胞株で発現を認め、2種類の健常者大腸細胞で発現を認めなかった大腸がん細胞特異的表面マーカーとしてTMEM-180を選び出した(図1A)。
5人の大腸がん患者手術標本について、隣接正常大腸組織を陰性コントロールとする大腸がん細胞組織サンプルcDNA(Clontech)をABI7500Fast(Applied Biosystems)で解析した。20μLの反応液で、10μL 2X TaqMan Fast Universal PCR Master Mix(Applied Biosystems)、1μL 20X TaqMan Gene Expression Assay(Applied Biosystems)を使用した。また、Fast runでAmpliTaq Gold Enzyme Activation 95度、20秒、40サイクル;Denature 95度、3秒;Anneal/Extend 62度、30秒の条件で行った。7500 Fast System SDS ソフトウエアVer.1.3で解析した。各症例について、正常組織でのRNA量に対する大腸がん組織でのRNA量の比を計算した結果を図1Bに示す。いずれの症例においてもTMEM-180が正常大腸組織に比べて大腸がん組織で強く発現していることを確認した。
大腸がん組織パラフィン切片(Genostaff Co. Ltd.)をキシレンで脱ワックス処理後、エタノール、PBSで水和を行った。切片を4%パラホルムアルデヒド・PBSで15分間固定した。7μg/ml Protreinase K (Roche)を含んだPBSで処理後に、4%パラホルムアルデヒド・PBSで再固定した。0.25%無水酢酸0.1M TrisHCl PH8.0でアセチル化を行った。PBSで洗浄後、エタノールで脱水した。300ng/mlのdigoxigenin標識したTMEM-180のRNAプローブ(475bp, GeneBank登録番号 NM_024789の遺伝子配列1314から1789番目、Genostqaff Co. Ltd.)と60度で16時間のハイブリダイゼーション反応を行った。洗浄後に50μg/ml RNaseA・10mM TrisHCl PH8.0・0.1M NaCl・1mM EDTAで処理した。再洗浄後に、0.5%ブロッキング反応液(Roche)を用いて反応させた後、20%熱処理羊血清(Sigma)添加ブロッキング反応液で1時間反応させた。AP標識抗DIG抗体(Roche)を加え、室温で2時間の反応を行った。洗浄後にNBT/BCIP液(Roche)中で発色を行った。封入後顕微鏡で観察を行った結果を図1C及びDに示す。TMEM-180が5種類の大腸がん組織で全て陽性で、正常大腸粘膜では陰性であることを確かめた。
公的データベースPaxDB; a comprehensive absolute protein abundance database http://pax-db.org/#!home(各タンパク質に特異的なペプチドをLC/MS/MSにより解析することでその発現レベルを測定してある)により、TMEM-180で検索をかけて各正常組織での測定値を調べた。TMEM-180以外に、対照として以下の分子の発現も調べた。
βアクチン(βACT)(ハウスキーピング分子)
Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(GAPDH)(ハウスキーピング分子)
上皮成長因子受容体(EGFR)(抗体医薬の標的分子)
HER2(抗体医薬の標的分子)
がん胎児性抗原(CEA)(代表的な腫瘍マーカー分子)
Excel(2010, Microsoft)ファイルにデータを入力してグラフを作成した結果を図2に示す。TMEM-180は正常にはほとんど発現しておらず(図2A)、感度を上げると血小板での発現がわずかに認められたものの、従来の抗体医薬の標的分子であるEGFRやHER2よりはるかに少なく(図2B)、TMEM-180ががん組織特異的に発現していることが確認された。
1)抗原作製
[PCR反応]
pET21bに組み込まれているtag配列に対して、以下のプライマーを用いてPCR増幅を行った。
使用PCR酵素:PrimeStar HS DNA polymerase (takara R010A)
免疫抗原1 作製用プライマー配列
(i) cagacctgcacctgaacgtggttgagagctgaggaattgacggtcactgagggactgtaatgctgcacttcgc(配列番号:18)
(ii) caaccacgttcaggtgcaggtctgtcttcacgtgctgttgtactggctcgtgttcaagagttcaaactggaggacctg(配列番号:19)
(iii) gagatatacatatgtcggaggtgactcgtagtc(配列番号:20)
(iv) tggtgctcgagaataggctgaacatcaaatg(配列番号:21)
免疫抗原2 作製用プライマー配列
(i) gcgaagtgcagcattacagtccgatcatctgagtctgctgtgcctcttcattgc(配列番号:22)
(ii) caggtcctccagtttgaactcagaagctgcttgcttacgatgattcagcaccaggtcctcgtctac(配列番号:23)
(iii) gagatatacatatgtcggaggtgactcgtagtc(配列番号:24)
(iv) tggtgctcgagaataggctgaacatcaaatg(配列番号:25)
発現用ベクターpET21b及びPCR産物に対し、NdeI(takara)、XhoI(takara)をメーカープロトコールに従い2時間反応させ、1% アガロースゲル電気泳動を行った後、promega wizard SV gal and PCR clean-up systemキットを用いて精製した。
Ligation high(toyobo)を用いて30 min. ベクターとインサートを反応させた。
Competent High DH5α(toyobo)を用いて形質転換させ、LB培地(50 μg/mL)プレートで培養した。
形質転換した大腸菌からプラスミドを抽出し、シーケンス解析を行い目的の配列を確認した。
BL21(DE3)を目的配列が挿入されたプラスミドで形質転換させた。
10 mLのLB培地に植菌し、37℃、16時間培養した培地を1 LのLB培地に移し替え、37℃で培養した。OD 600 nmの値が0.6になったところで、終濃度1 mMになるようにIPTGを添加し、さらに4時間培養した。
菌体破砕した大腸菌の沈殿を50 mM Tris-HCl, 500 mM NaCl, 6 M GdnHClで懸濁し、16時間揺らしたサンプルの上清を回収してニッケルカラムにて精製した。
6 M GdnHClで溶かしているために目的抗原は変性しているので、透析法にてリフォールディング(タンパク質の巻き戻し)を行った。
リフォールディングの条件は次のステップで行った。
(1)50 mM Tris-HCl pH8.5, 500 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 3 M GdnHCl ; 6 h
(2)50 mM Tris-HCl pH8.5, 500 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 2 M GdnHCl ; 6 h
(3) 50 mM Tris-HCl pH8.5, 500 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 1 M GdnHCl ; 12 h
(4) 50 mM Tris-HCl pH8.5, 500 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.5 M GdnHCl ; 12 h
(5) 50 mM Tris-HCl pH8.5, 150 mM NaCl, 50 mM L-Arg ; 6 h
(6) 50 mM Tris-HCl pH8.5, 150 mM NaCl, 50 mM L-Arg ; 6 h
上記のサンプルに対し限外濾過膜(Amicon-Ultra 10K)を用いて50 mM リン酸緩衝液 pH8.0, 500 mM NaClに置換した。
リフォールディングした免疫抗原が立体構造を保持しているのか、確認するために円2色性分散器(日本分光J-725)を用いて理論値に近いヘリックス含量であることを確認した。
PBS で100 μg/mLに希釈した免疫抗原1もしくは免疫抗原2とFreund complete adjuvantとを1:1で混合して調製したエマルジョンをラット(日本SLC、Wister、 メス、 6〜8週令)尾根部両脇に100 μLずつ投与した。免疫12日〜13日後にラット尾静脈から採血し調製した抗血清を用いて免疫抗原を固相としたELISAもしくはDLD-1細胞およびK562細胞に対するフローサイトメトリーで血清抗体価を評価し、細胞融合に用いる個体を選択した。免疫14日後に選択した個体から腸骨リンパ節、鼠径リンパ節、腋下リンパ節および膝下リンパ節を摘出し、PEG法にてリンパ節細胞とマウスミエローマ細胞p3X63と融合した。融合10日〜14日後に培養上清を回収し、フローサイトメトリーにてDLD-1細胞に陽性、K562細胞に陰性を示す抗体産生ハイブリドーマ細胞を選択した。選択した抗体産生ハイブリドーマ細胞は限界希釈法にて単クローン化、樹立した。抗体のアイソタイプはアイソタイプ特異的ELISA(Bethyl)で判定した。
単クローン化されたクローンは、98クローン、101クローン、212クローン(以上IgM抗体)、129クローン、382クローン、1361クローン(以上IgG抗体)、669クローン、699クローン、1052クローン、1105クローン(以上IgM抗体)であった。本明細書では、クローン番号xのクローンから得られる抗体をx抗体と呼ぶことがある。
測定対象とするがん細胞を培地に懸濁し、1×105個/wellとなるようにV底96ウェルプレート(corning)に添加した。プレートを440×g、4℃、3分遠心してから上清を除き、細胞ペレットに抗体産生ハイブリドーマ培養上清もしくは抗体溶液を50 μL/wellで加えて懸濁した。氷上で45分反応させた後、0.1%BSA/2mM EDTA/PBS 200 μL/wellで3回洗浄した。上清を除き、細胞ペレットに二次抗体を50 μL/wellで加えて懸濁した。二次抗体としてAlexaFluor647 Goat anti-Rat IgG(H-L)(Life Technologies)を0.1%BSA/2mM EDTA/PBSで400倍に希釈したものを用いた。氷上で45分反応させた後、0.1%BSA/2mM EDTA/PBS 200 μL/wellで3回洗浄した。上清を除き、細胞ペレットに50 ng/mL Propidium Iodide/0.1%BSA/2mM EDTA/PBSを250 μL/wellで加えて懸濁した。このように染色した細胞をGuava easyCyte 8HT(Merck Millipore)等のフローサイトメーターを用いて測定し、得られたデータをFlowJO(トミーデジタルバイオロジー)で解析した。FACSには大腸がん、脳腫瘍、血液系腫瘍を用いて解析した。
DLD-1細胞を5×103個/wellとなるように96ウェルプレート(Corning、CellBIND)に添加し、2日間培養したものを細胞染色に供した。細胞の固定/透過処理は次のように行った。細胞培養プレートを200 μL/wellのPBSで2回洗浄後、洗浄液を除き、0.1%量のTriton X-100(Wako)を添加した4%パラホルムアルデヒド・りん酸緩衝液(Wako)を氷冷下で100μL/wellで加えて10分間固定した。固定液を除き、PBS 200 μL/wellで一回、1%FBS/PBS 200 μL/wellで一回洗浄し、細胞固定プレートとした。細胞染色は次のように行った。未固定の細胞培養プレートからは培地を、細胞固定プレートからは洗浄液を除き、抗体産生ハイブリドーマ培養上清もしくは抗体希釈液を50 μL/wellで添加した。氷上で1時間反応させた後、PBS 200 μL/wellで1回、1%FBS/PBS 200 μL/wellで2回洗浄した。洗浄液を除き5 μg/mL AlexaFluor647 Goat anti-Rat IgG(H-L) /2 μg/mL Hoechst 33342 /1%FBS/PBSを50 μL/wellで添加した。氷上で1時間反応させた後、PBS 200 μL/wellで2回洗浄した。PBS を50 μL/wellで添加し、ArrayScan(Thermo Scientific)にて測定した。
抗TMEM-180IgM抗体の98、101及び212クローンによる蛍光免疫染色の結果を図4に示す。98クローンは膜中心に染色された。101と212は98クローンよりは蛍光強度が弱く、細胞質も染まった。
1)ノックアウト細胞の作成
[トランスフェクション]
Sigma CRISPR/Cas9 System(HS0000468201) plasmid 2.5 ugを0.5 mLのOpti-MEM(invitrogen)で希釈し、Lipofectionamine LTXを11 uL添加した。室温で静置し30 分後、DLD1細胞(6.25 x 10^5 cells/well 6 wellプレート(corning))に DNA-Lipofection調整液を添加した。
トランスフェクション後に2日間培養した細胞に対してFACSAria セルソーター(BD)を用いてGFP発現細胞のみを取得した。
GFP発現細胞を培養し、GFPの発現が行われなくなったことを確認したのち96ウェルプレートに限外希釈した。細胞のコロニーが単一であったwellに対してPureLink Genomic DNA Mini Kit(Invitrogen)でゲノムを精製し、目的配列を確認することで、ノックアウト細胞を判定した。
フローサイトメトリーの手順は上記3.に準じた。一次抗体とした98クローンラットIgM抗体は、抗体産生ハイブリドーマ培養上清を1 μg/mLに希釈して用いた。陰性コントロールとした356クローンラットIgM抗体産生ハイブリドーマ培養上清を1 μg/mLに希釈して用いた。98クローンラット−ヒトキメラ化抗体はキメラ化抗体定常発現細胞の培養上清を2倍に希釈して用いた。陽性コントロールとしてラット抗ヒトTissue Factor抗体Clone hTF1849、ラット抗ヒトEpCAM抗体Clone B8-4、マウス抗ヒトCD44v6抗体Clone 2F10(MBL)、マウス−ヒトキメラ化抗EGFR抗体(商品名Erbitux)をそれぞれ1 μg/mLに希釈して用いた。それぞれの抗体の希釈にはRPMI/FBS10%を用いた。なおハイブリドーマ培養上清中の抗体濃度はラットIgM特異的ELISA(Bethyl)で測定した。また一次抗体の由来に応じ、二次抗体としてAlexaFluor647 Goat anti-Rat IgG(H-L)、AlexaFluor647 Goat anti-Human IgG (H+L)もしくはAlexaFluor647 Goat anti-Mouse IgG(H+L)(Life Technologies)のいずれかを0.1%BSA/2mM EDTA/PBSで400倍に希釈して用いた。
ハイブリドーマ細胞株から全RNAを抽出し、抗体H鎖の可変領域とL鎖の可変領域のcDNAをSMARTer RACE cDNA増幅キット(takara)を用いて5'末端RACE(rapid amplification of cDNA ends)法を用いて合成した。
合成したcDNAに対し、PCRで増幅し、pUC19(Invitrogen)にクローニングした。H鎖の可変領域及びL鎖の可変領域は後掲表3〜22に示す。
大腸がんホルマリン固定パラフィン切片に対し、抗TMEM-180 IgMラット抗体(98クローン)1μg/mlを反応させた。2次抗体はHRP標識抗ラット抗体を用い、DABで発色させ、ヘマトキシリンで後染色を行なった。結果を図6に示す。大腸がん特異的に染色された。大腸がんの膜だけでなく細胞質も染色された。
DLD-1細胞ならびにK562細胞を1×103個/100 μL/wellで96ウェルプレートに添加し、24時間培養した。96ウェルプレートの各ウェルから培地50 μLを除き、抗体濃度を80 μg/mL、20 μg/mL、5 μg/mLに調製した98クローンラットIgM抗体産生ハイブリドーマ培養上清もしくは101クローンラットIgM抗体産生ハイブリドーマ培養上清を50 μL/well で添加した。なお各培養条件のn数は3とし、対照として培地のみを添加したウェルを用意した。96時間培養後、WST-8(同仁化学、Cell Counting Kit-8)を10 μL/wellで添加し、3時間培養後にマイクロプレートリーダーで450 nmの吸光度を測定した。抗体濃度を横軸として、培地のみを添加したウェルの吸光度を1とした各抗体濃度の吸光度の相対値をプロットした。結果を図7及び8に示す。98クローンも101クローンも大腸がんDLD-1細胞にのみ殺細胞効果を示し、血液腫瘍K562には殺細胞効果を示さなかった。その他の大腸がん細胞のDiFi、Car1、SW480、Colo201にも殺細胞効果を認めた。また、脳腫瘍LN229および乳がんMCF7にも同様な効果を認めた。血液腫瘍以外ではかなりの広汎ながんに効果があると予想される。
1)total RNAの抽出
それぞれの抗体を産生するハイブリドーマからRNeasy Mini Kit (QIAGEN)を用いてtotal RNAを抽出した。
上記で得られたtotal RNAを用いてSMARTer RACE cDNA増幅キット(takara)を用いて5'末端RACE(rapid amplification of cDNA ends)法を用いてcDNAを合成した。
上記のcDNAに対して、PrimeStar HS DNA Polymerase(takara)を用いて目的遺伝子を増幅した。増幅条件はDenature 98℃、10秒;Anneal/Extend 72℃、90秒、5サイクル;Denature 98℃、10秒;Anneal 67℃、5秒;Extend 72℃、90秒、5サイクル;Denature 98℃、10秒;Anneal 62℃、5秒;Extend 72℃、90秒、25サイクルのタッチダウンPCR法を用いた。
PCR装置:Takara PCR Thermal Cycler Dice Gradient
使用したプライマー配列
H鎖用
フォワードプライマー:
CTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT(配列番号:26)
フォワードプライマー:CTAATACGACTCACTATAGGGC(配列番号:27)
リバースプライマー:CCCATGGCCACCARATTCTYATCAGACAG(配列番号:28)
L鎖用
フォワードプライマー:
CTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT(配列番号:29)
フォワードプライマー:CTAATACGACTCACTATAGGGC(配列番号:30)
リバースプライマー:GTTGTTCAWGARGCACACGACTGAGGCA(配列番号:31)
増幅したH鎖及びL鎖のPCR産物をT4 polynucleotide Kinase (takara)を用いてリン酸化した。リン酸化したPCR産物をSmaIサイトで切断したpUC19(invitrogen)にLigation High(TOYOBO)試薬を用いて挿入した。挿入後、DH5α(TOYOBO)に形質転換し、シングルコロニーからプラスミドをPlasmid Mini Kit (QIAGEN)を用いて抽出した。
クローニングしたH鎖、L鎖各々の遺伝子をABI PRISM 3100 Genetic Analyzerを用いて遺伝子の塩基配列を解析した。各クローンのH鎖可変領域及びL鎖可変領域の配列を表3〜22に示す。
98クローン H鎖(配列番号:13)
1)ELISAプロトコール
まず、以下の実施例に用いたELISA法のプロトコールを以下に示す。
(試薬)
以下の試薬を用いた。
96ウェルプレート C8 Maxi breakapart (NUNC #473768)
プレート洗浄液 PBS / 0.05% Tween 20
ブロッキング液 PBS / 1% BSA
抗体希釈液 PBS / 0.05% Tween 20 / 1% BSA
一次抗体 IgM 98(ハイブリドーマ培養上清)
二次抗体 polyclonal rabbit anti-rat immunoglobulins / HRP (Dako #P0450)
発色液 1-Step Slow TMB-ELISA Substrate (Thermo Scientific #34024)
停止液 2N H2SO4
以下の手順にしたがった。
(i) 抗原固相化
50μl/wellの細胞培養液上清もしくはヒト血漿(1/10希釈と1/50希釈)を96ウェルプレートに添加し、4℃で一晩インキュベーションした。
(ii) ブロッキング
200μl/wellのプレート洗浄液により、固相化済みプレートの洗浄を5回繰り返した。200μl/wellブロッキング液でブロッキングし、室温で1時間インキュベーションした。
(iii) 一次抗体反応
200μl/wellのプレート洗浄液により、固相化済みプレートの洗浄を5回繰り返した。100μl/well、10μg/mlのIgM 98抗体液を添加し、室温で1時間インキュベーションした。
(iv) 二次抗体反応
200μl/wellのプレート洗浄液により、固相化済みプレートの洗浄を5回繰り返した。100μl/well、4000倍希釈した二次抗体液を添加し、室温で1時間インキュベーションした。
(v) 発色・停止
200μl/wellのプレート洗浄液により、固相化済みプレートの洗浄を5回繰り返した。100μl/wellの発色液を添加し、室温で15分間インキュベーションした。100μl/wellの停止液を添加した。
(vi) 測定
反応停止後、450 nmの吸光度を測定した。
(TMEM-180強制発現株の作製)
ヒトTMEM180 cDNA (NM_024789.2)を組み込んだplasmid RC219636 (Origen)をリポフェクタミンLTX(インビトロジェン)を用いてDLD1細胞にトランスフェクションを行った。ヒトTMEM180 発現細胞株は600μg/mLジェネティシン(インビトロジェン)で薬剤選択を行い、耐性株を取得した。得られた耐性株に対して限外希釈を行い、各々のシングルクローンに対してFACSを行い抗体の反応を確認した。得られた細胞株はD-MEM (wako), 10% FBS, 1%ペニシリン, ストレプトマイシン, アンホテリシンB (wako), 600 μg/mLジェネティシン(インビトロジェン)で維持培養を行った。
(TMEM-180ノックダウン株の作製)
TMEM180ノックダウン細胞株は、American Type Culture Collection (ATCC,Manassas、VA)から購入した大腸がん細胞株DLD1、HCT116、HCT15、およびColo320それぞれに対して、MISSIONTM shRNA Lentiviral Transduction Particles (Sigma-Aldrich Corporation, St. Louis, MO)を用いて、説明書に従って作製した。TaqMan(R) Gene Expression Assays (Life Technologies Corporation, Carlsbad, CA)を用いて、定量性PCRを行い、TMEM180遺伝子発現の低下(ノックダウン)を確認した。
(がん細胞培養上清中のTMEM-180タンパク質量の測定)
大腸がん細胞DLD-1株のTMEM-180強制発現株、親株、およびTMEM-18ノックダウン株を培養し、ほぼコンフルエント状態になったところで、PBSで洗浄した。無血清DMEM培地に置換して、一晩培養し、翌日に培養上清を回収した。この上清をサンプル抗原として96穴プレートに固相化し、1)の方法でELISAを行なった。また脳腫瘍株LN229でも同様の実験を行なった。
結果を図9に示す。正常(培地のみ)コントロールと比べ、すべてのサンプルでTMEM-180は高値を示した。大腸がんDLD-1においては強制発現株、親株、ノックダウン株の順に高値を示した。脳腫瘍でも高値を示した。
EDTA採血のヒト血漿(ステージIVの4例と正常)を1/10と1/50に希釈後、それをサンプル抗原として96穴プレートに固相化し、1)の方法でELISAを行なった。
結果を図10に示す。正常血漿に比べ、すべての患者サンプルで高値を示した。また、CEA陰性であった患者#2と#4においても、血漿TMEM-180は陽性(正常より高値)を示した。
3)と同様の方法で、ステージIII大腸がん患者の術前術後の血漿につき、TMEM-180タンパク質量を測定した。
結果を図11に示す。すべての患者において、TMEM-180値は、術前に比較して術後に低下した。
結果を図12に示す。ステージIIの患者では、術前CEA値が陰性であるのに対し、TMEM-180は陽性を示した。また、ステージIIIaの患者では、CTで再発が確認された時点でもCEA値は陰性のままであったが、TMEM-180は再上昇していた。
上記実施例で得られたモノクローナル抗体(669抗体、1052抗体、1105抗体および1361抗体)でがんの検出率を試験した。
インバースPCR法を用いて部位特異的な変異を重鎖または軽鎖のCDRに導入し、1361改変クローンを作製した。
具体的には、フォワードプライマー(配列番号:183)及びリバースプライマー(配列番号:184)を用いたインバースPCR法(例えば、Ochman, H. et al., Genetics, 120(3): 621-623, 1988)に基づいてPrimeSTAR Max DNA polymerase (takara, R045A)を用いて1361クローンの重鎖CDR2に位置するチロシンをアラニンに置換するY78Aの1アミノ酸置換を導入した。同様の手法で、他にCDRにアミノ酸点変異を導入した22の1361改変クローンを作製した。例えば、改変体1361-7は、1361抗体の82番目のセリンをアラニン置換するS82Aの1アミノ酸置換を導入したものであり、その際の改変用PCRプライマーはフォワードプライマー(配列番号:185)で、リバースプライマー(配列番号:186)であった。導入後、得られたクローンについて、ABI PRISM 3100 Genetic Analyzerを用いて抗体遺伝子配列と変異導入を確認した。改変クローンでは、上記実施例5の3)に記載の方法に従って、ヒトキメラ抗体を作製した。以下、1361クローンの重鎖CDR2に位置するチロシンをアラニンに置換するY78Aの1アミノ酸置換を導入し、ヒトキメラ化したクローンを「1361-5クローン」と呼び、このクローンから産生される抗体を「1361-5抗体」と呼ぶ。1361-5抗体は、IgG1抗体である。
上記実施例9で作製した大腸がん細胞DLD-1株のTMEM-180強制発現株、親株、およびTMEM-18ノックダウン株を培養し、これらのがん細胞と得られた1361-5抗体との結合性を以下で評価した。陰性対照としてK562細胞を用いた。
1361−5抗体は、IgGのサブクラスから高いADCC活性を有すると考えられる。本実施例では、1361−5抗体のADCC活性を検討した。また、本実施例では、Fc改変体を作製し、当該改変体のADCC活性を検討した。具体的には、以下の通りである。
具体的には、フォワードプライマー(配列番号:A1,B1)及びリバースプライマー(配列番号:A2,B2)を用いたインバースPCR法(例えば、Ochman, H. et al., Genetics, 120(3): 621-623, 1988)に基づいてPrimeSTAR Max DNA polymerase (takara, R045A)を用いて1361-5クローンのFcに位置するS239D/A330L/I332Eの3重アミノ酸置換を導入した。
以下、本改変体を改変体1という。
具体的には、フォワードプライマー(配列番号:187,189または191)及びリバースプライマー(配列番号:188,190および192)を用いたインバースPCR法(例えば、Ochman, H. et al., Genetics, 120(3): 621-623, 1988)に基づいてPrimeSTAR Max DNA polymerase (takara, R045A)を用いて1361-5クローンのFcに位置するS239D/I332E/E333Aの3重アミノ酸置換を導入した。
以下、本改変体を改変体2という。
配列番号:188 (Fc_S239D_Rv) GAAGACGTCCGGTCCCCCCAGGAGTTC
配列番号:189 (Fc_A330L_I332E_Fw) CCACTGCCCGAGGAGAAAACCATCTCC
配列番号:190 (Fc_A330L_I332E_Rv) CTCCTCGGGCAGTGGGAGGGCTTTGTT
配列番号:191 (Fc_I332E_E333A_Fw) CCCGAGGCCAAAACCATCTCCAAAGCC
配列番号:192 (Fc_I332E_E333A_Rv) GGTTTTGGCCTCGGGGGCTGGGAGGGC
ADCC活性は、セツキシマブを陽性対象として、1361−5抗体、改変体1および改変体2について調べた。
具体的には、エフェクター細胞として、TK176V(FcγRIII安定発現ナチュラルキラー細胞株)を用いた。TK176Vは、一般財団法人化学物質評価機構から得た。また、ターゲット細胞としては、DLD-1の野生型細胞を用いた。
TK176Vは10ng/mL IL-2及び10% FBS含有RPMI1640培地で培養した。継代は2〜3日毎に新しい培地に希釈した。継代は2〜3日毎にトリプシン処理で細胞を剥離し、新しい培地に懸濁してディッシュに播種した。
まず、陰性対照として、ターゲット細胞と培地のみで培養した時の51Cr放出量を測定し(Spontaneous release測定という)、陽性対象として、ターゲット細胞に0.1% Triton X-100を添加して全細胞を傷害した時の51Cr放出量を測定した(Max release測定という)。
1)50μCiの51Crで標識したDLD-1 WTを96 well U底プレートに5,000細胞/50μL /wellで添加
2)TK176Vを200,000細胞 50μL/wellで添加(ET比:40)
Spontaneous release測定用well及びMax release測定用wellに培地を50μL/wellで添加
3)最大濃度2,000ng/mL、公比5の希釈系列で7種類の濃度の抗体を100μL/wellで添加
(反応中の抗体最終濃度:0、0.064、0.32、1.6、8、40、200、または1,000ng/mL)
4)Spontaneous release測定wellに培地、Max release測定wellに0.2% Triton X-100を100μL /wellで添加
5)プレートを遠心(250×g、4分)後、37℃で4時間培養
6)プレートを遠心(250×g、4分)
7)上清50μL/wellを測定用チューブに移す
8)ガンマカウンターで各チューブの放射線量(CPM)を測定
9)以下の式から細胞傷害活性及びADCC活性を算出
式1:
細胞傷害活性(%) =( 各チューブ CPM − Spontaneous release CPM平均値 )
÷( Max release CPM平均値 − Spontaneous release CPM平均値 )×100
式2:
ADCC活性(%) = 抗体添加時の細胞傷害活性 − 抗体非添加時の細胞傷害活性
10)解析ソフトPrismを用いて各抗体の50%有効濃度(EC50)を算出
このことから、1361−5抗体およびその改変体は、ADCC活性を有していることが確認された。
本実施例では、マウスゼノグラフトモデル(ヒト大腸がん細胞株DLD−1)を用いてヒトIgG化669抗体の抗腫瘍効果を検証した。
本実施例では、実施例A11で作製した1361-5抗体を用いて大腸がんの免疫組織学染色を行った。
本実施例では、細胞膜タンパク質であるTMEM-180タンパク質ががん細胞からエクソソーム中に放出され、かつ膜タンパク質としてエクソソームに表出されることが明らかとなった。
具体的には、抗TMEM-180抗体を5 μg/mLとなるようにリン酸バッファーで希釈し、96ウェルプレート(Maxisorp #442404、Thermo Fisher co., Ltd.)に50μl/wellで添加した。固相化反応は、室温で2時間もしくは4℃で一晩のインキュベーションして行った。300μl/wellのプレート洗浄液により、固相化済みプレートの洗浄を3回繰り返した。200μl/wellのブロッキング剤(1%BSA/TBS-T)でブロッキングし、室温で1時間もしくは4℃で一晩静置した。ブロッキング剤を除去後、無血清培地で24時間培養したDLD-1細胞野生株培養上清およびTMEM180ノックダウンDLD-1細胞株培養上清、K562細胞培養上清をそれぞれ50μl/wellでプレートに添加し、室温で1時間静置した。なお陰性対照として未使用の無血清培地を用いた。プレート洗浄液により、プレートの洗浄を3回繰り返した後、1%BSA/TBS-Tで5 μg/mLに希釈したビオチン標識抗CD9抗体(156-030、Ancell co., LTD.)を50μl/wellでプレートに添加した。室温で1時間静置後、プレート洗浄液により、プレートの洗浄を3回繰り返した。1%BSA/TBS-Tで5000倍に希釈したStreptavidin-HRP conjugated(SA-5004、Vector Laboratories)を50μl/wellでプレートに添加した。室温で30分静置のうえ、プレート洗浄液によりプレートの洗浄を3回繰り返した後、100μl/wellの発色液を添加し、室温で30分間静置した。30μl/wellの停止液を添加して呈色反応を停止し、プレートリーダーで450 nmの吸光度を測定した。結果は、図18に示される通りであった。
本実施例では、大腸がんの患者血清中に含まれるエクソソームを用いて診断が可能であることを示した。
1361抗体を25mM MES−NaOHで1mg/mLに希釈した。NHS−FGビーズ(多摩川精機、Cat.No.TAS8848N1141)を100μgあたり50μLの25mM MES−NaOHに懸濁し、等容量の抗体溶液と混合し、4℃で30分攪拌することで抗体とNHS−FGビーズとを結合させた。上清を除いてから1Mエタノールアミン(pH8.0)を250μL添加して4℃で一晩ブロッキングした。200μLの10mM HEPES−NaOH(pH7.9)/50mM KCl/1mM EDTA/10% glycerolで3回洗浄し、得られた抗体結合磁気ビーズを200μLの10mM HEPES−NaOH(pH7.9)/50mM KCl/1mM EDTA/10%グリセロールに懸濁して実験に用いた。
2)陽性検体の調製
DLD−1細胞を6.85×106細胞/15cm dishとして一晩培養した。培養上清を除いてからPBS 7mLを添加し、培地成分を洗い出した。PBSでの洗浄を2回行った後、無血清培地を30mL添加し、24時間培養した。得られた無血清培養上清は0.22μmフィルターで濾過してから測定に用いた。
3)TMEM180含有エクソソームの検出
以下の資材を用いた
・96ウェルプレート(Corning Co.,Ltd、Cat.No.3600)
・プレート洗浄液 10mM TBS(pH7.2)/0.1% Tween20/140mM NaCl
・希釈液 10mM TBS(pH7.2)/0.05% Tween20/140mM
NaCl/1% BSA
・検体希釈液 10mM TBS(pH7.2)/0.1% Tween20/140mM NaCl/1% BSA/20μg/mL TRU Block(Meridian Life Science, Inc.、Cat.No. A66800H-0.1)
・ビオチン化抗CD9抗体(Ancell corporation、Cat.No.156-030)
・ストレプトアビジンALP(R&D systems, Inc.、Cat.No.AR001)
・発光基質 ルミパルス基質液(富士レビオ株式会社)
・プレートリーダー Spectra Max Paradigm (MolecuLar Devices, LLC.)
(手順)
以下の手順にしたがった。
(i) 抗体結合磁気ビーズ調製
1361抗体結合磁気ビーズを0.001mg/50μLとなるように希釈液に懸濁した。
(ii) 検体調製
陽性検体および血清検体は検体希釈液で10倍に希釈した。
(iii) 一次反応
1361抗体結合磁気ビーズ懸濁液50μL/well、検体50μL/wellを96ウェルプレートで混合し、30分間プレートミキサーで攪拌、反応させた。
(iv) 標識抗体反応
300μl/wellのプレート洗浄液により、プレートの洗浄を3回繰り返した。ビオチン標識抗体を希釈液で0.3μg/mLに調製し、50μL/wellで添加した。30分間プレートミキサーで攪拌、反応させた。
(v) ストレプトアビジンALP反応
300μl/wellのプレート洗浄液により、プレートの洗浄を3回繰り返した。ストレプトアビジンALPを希釈液で2,000倍に希釈し、50μl/wellで添加した。30分間プレートミキサーで攪拌、反応させた。
(vi)測定
300μl/wellのプレート洗浄液により、プレートの洗浄を3回繰り返した。50μl/wellの発光基質液を添加し、室温で10分間インキュベーションした。プレートリーダーで発光量を測定した。
本実施例では、電子顕微鏡を用いてエクソソーム上のTMEM−180の表出を観察した。
DLD−1細胞、およびTMEM180強制発現DLD−1細胞をそれぞれプラスチックシャーレに撒き、一晩インキュベートした。培養上清を除き、細胞をはがさないようにPBSで2回洗ってから無血清のD−MEM培地と交換した。24時間培養したのち培養上清を回収、0.22μmフィルターで濾過したものをエクソソーム含有無血清培養上清とした。またK562細胞はPBSで三回洗浄したものを無血清のRPMI−1640培地で24時間培養したのち培養上清を回収、0.22μmフィルターで濾過して用いた。エクソソーム含有無血清培養上清を100,000×g、4℃で24時間遠心し得られたペレットをPBSに懸濁したものをエクソソーム濃縮液とした。
支持膜を張ったNiグリットにエクソソーム濃縮液を分散させ、膜に吸着させた。抗TMEN−180抗体クローンの669抗体もしくは抗ヒトCD9抗体(Cosmo bio)をNiグリットに添加し、室温で反応させた。1%BSA/PBSでNiグリッドを洗浄し、続けて金コロイド標識抗マウスIg抗体もしくは金コロイド標識抗ラットIg抗体を添加し、室温で反応させた。PBSで洗浄した後、グルタールアルデヒドで3分間固定した。なおネガティブ染色は2%リンタングステン酸溶液(pH7.0)で行った。固定したNiグリッドは乾燥させてから、透過型電子顕微鏡でエクソソームと抗体との結合を観察した。電子顕微鏡では、金コロイドは黒点として検出される。結果は、図23に示さる通りであった。
上記TMEM-180タンパク質がエクソソーム上に検出されることが分かった後に、実施例3において上記抗原に代えて上記エクソソームを抗原として用いて抗TMEM-180抗体を得た。
1)無血清培養上清の調製
DLD-1細胞TMEM-180過剰発現株を15 cm dish(#430599、Corning Co.,Ltd.)1枚あたり6.75×106 cellsとして、10%FBS含有D-MEM low glucose培地(wako)30 mL中で37℃、5%CO2条件下24時間培養した。培養器から培地を除きPBSで穏やかに洗浄した後、D-MEM low glucose培地を30 mL/dishで添加し、同様に24時間培養した。回収した無血清培養上清を0.22 μmフィルターフラスコでろ過して細胞片などを除去した後、Protease Inhibitor(Wako)を1/1000量加えて4℃で保管した。
2)エクソソーム画分の調製
CHT セラミックハイドロキシアパタイトタイプII(Bio-Rad)を充填させたカラムを30 mMHEPES, 100 mM NaCl pH6.7で平衡化した。無血清培養上清をカラムに添加し、同bufferで洗浄を行い、500 mM KPB pH6.7で溶出した。溶出した溶液を限外濾過を用いて10 mL以下にまで濃縮し、ゲル濾過カラムSuperdex200pg(GE)を用いて分画した。各フラクションに対してTMEM-180陽性過分の測定を行い、ボイド容量にある陽性画分のピークを回収し、TMEM-180含有エクソソームとした(図19参照)。
3)TMEM-180陽性画分の測定
測定サンプルを原液もしくはリン酸バッファーで希釈し、96ウェルプレート(Maxisorp #442404、Thermo Fisher co., Ltd.)に50μl/wellで添加した。固相化反応は室温で2時間とした。300μl/wellのプレート洗浄液により、固相化プレートの洗浄を3回繰り返した。200μl/wellの1%BSA/TBS-Tでブロッキングし、室温で1時間静置した。ブロッキング剤を除去後1%BSA/TBS-T で5 μg/mLに希釈したclone 98抗体を50μl/wellでプレートに添加した。室温で1時間静置後、プレート洗浄液により、プレートの洗浄を3回繰り返した後、1%BSA/TBS-T で10,000倍に希釈したGoat anti rat IgM antibody HRP conjugated(A110-100P、Bethyl laboratories, Inc.)を50μl/wellでプレートに添加した。室温で30分静置のうえ、プレート洗浄液によりプレートの洗浄を3回繰り返した後、100μl/wellの発色液を添加し、室温で20分間静置した。30μl/wellの停止液を添加して呈色反応を停止し、プレートリーダーで450 nmの吸光度を測定した。
4)抗体の作製
TMEM-180含有エクソソームとFreund complete adjuvantとを1:1で混合して調製したエマルジョンをラット(日本SLC、Wister、 メス、 6〜8週令)尾根部両脇に100 μLずつ投与した。免疫14日後に腸骨リンパ節、鼠径リンパ節、腋下リンパ節および膝下リンパ節を摘出し、PEG法にてリンパ節細胞とマウスミエローマ細胞p3X63と融合した。融合10日〜14日後に培養上清を回収し、フローサイトメトリーにてDLD-1細胞に陽性、K562細胞に陰性を示す抗体産生ハイブリドーマ細胞を選択した。またDLD-1細胞TMEM-180過剰発現株、DLD-1細胞TMEM-180ノックダウン株、DLD-1細胞TMEM-180ノックアウト株に対する反応性でスクリーニングを行った。選択した抗体産生ハイブリドーマ細胞は限界希釈法にて単クローン化、樹立した。抗体のアイソタイプはアイソタイプ特異的ELISA(Bethyl)で判定した。
本実施例では、ADCを構築し、大腸がん細胞株への効果を調べた。
(1)リンカーの合成
H-Cit-OH (1.18 g, 6.74 mmol)とNaHCO (566 mg, 6.74 mmol)の水溶液(18 mL)にFmoc-Val-OSu (2.80 g, 6.42 mmol)のN,N−ジメチルホルムアミド(DMF) (18 mL)溶液を加え、さらにテトラヒドロフラン(THF) (9 mL)を加えて、終夜撹拌した。反応を15% クエン酸水溶液(40 mL)により停止させ、水層をAcOEt/i-PrOH (9/1)混合溶液 (100 mL, 20 mL x 2)により抽出した。あわせた有機層を水 (70 mL)で洗浄し、減圧濃縮した。残渣の固体をジエチルエーテルにより洗浄し、ジペプチドFmoc-Val-Cit-OH(3.11 g, 97%)を白色固体として得た。
p−ニトロフェニルカーボネート体 (1.28 g, 1.67 mmol) と1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt) (376 mg, 2.78 mmol) のジメチルホルムアミド(3.4 mL)とピリジン (0.85 mL) の溶液にMMAE (1.00 g, 1.39 mmol) を加えた。24時間後、反応液をSephadex LH20 (溶媒CHCl3:MeOH 1:1)により精製し、Fmoc-Val-Cit-PABC-MMAE (1.44 g, 77%)を得た。
96ウェルプレートに野生型DLD−1細胞を5000細胞/ウェルで播種して37℃で18時間インキュベートした。1回洗浄し、488ラベルした669抗体2μg/ウェル添加し、一定時間(1時間後、3時間後、または6時間後)、37℃でインキュベートした。3回洗浄し、ウサギ抗488抗体を2μg/ウェルの量で添加し、4℃で30分間静置して、細胞膜表面に結合した抗体に由来する蛍光を消光した。3回洗浄した後、4%PFAを100μL/ウェルで添加して、10分間室温で静置した。さらに3回洗浄した後、DAPI(1/500希釈)を100μL/ウェルで添加して、5分間室温で静置した。3回洗浄した後、撮影もしくはArray Scan解析を行った。対照としては、抗EGFR抗体であるセツキシマブ(Erbitux)を用いた。結果は図25に示される通りであった。
SW480細胞を96穴pレートに2×103細胞/ウェルの量で播種した。翌日、MMEA(単剤)、669抗体のADC、およびコントロール抗体のADC(コントロールADC)それぞれをMMAE換算濃度で希釈系列を作製して各ウェルに添加した。3日後、細胞毒性測定試薬であるWST−8を添加して3時間経過後、細胞生存率(%)を観察した。結果は、図26に示される通りであった。
TMEM−180ノックアウトマウスを作製して表現型を観察した。
配列番号:4〜6は、それぞれ98クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:7〜9は、それぞれ101クローンの重鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:10〜12は、それぞれ101クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:13及び14は、それぞれ98クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:15及び16は、それぞれ101クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:17はヒトTMEM-180タンパク質のアミノ酸配列を示す。
配列番号:18〜21は、それぞれ免疫抗原1作製用プライマー(i)〜(iv)を示す。
配列番号:22〜25は、それぞれ免疫抗原2作製用プライマー(i)〜(iv)を示す。
配列番号:26〜31は、抗TMEM-180抗体遺伝子のクローニングに用いたプライマーを示す。
配列番号:40〜42は、それぞれ212クローンの重鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:43〜45は、それぞれ212クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:46及び47は、それぞれ212クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:48〜50は、それぞれ129クローンの重鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:51〜53は、それぞれ129クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:54及び55は、それぞれ129クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:56〜58は、それぞれ382クローンの重鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:59〜61は、それぞれ382クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:62及び63は、それぞれ382クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:64〜66は、それぞれ1361クローンの重鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:67〜69は、それぞれ1361クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:70及び71は、それぞれ1361クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:72〜74は、それぞれ669クローンの重鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:75〜77は、それぞれ669クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:78及び79は、それぞれ669クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:80〜82は、それぞれ699クローンの重鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:83〜85は、それぞれ699クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:86及び87は、それぞれ699クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:88〜90は、それぞれ1052クローンの重鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:91〜93は、それぞれ1052クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:94及び95は、それぞれ1052クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:96〜98は、それぞれ1105クローンの重鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:99〜101は、それぞれ1105クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:102及び103は、それぞれ1105クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:104〜150は、HLAPeptide Binding Predictionsによって予測されたHLA type A2に結合するTMEM-180由来ペプチドのアミノ酸配列を示す。
配列番号:151〜170は、HLAPeptide Binding Predictionsによって予測されたHLA type A24に結合するTMEM-180由来ペプチドのアミノ酸配列を示す。
配列番号:174〜176は、それぞれ1361-5クローンの軽鎖CDR1〜3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:177及び178は、それぞれ1361-5クローンの重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。
配列番号:179及び180は、それぞれ1361-5クローンの重鎖の塩基配列及びアミノ酸配列を示す。
配列番号:181及び182は、それぞれ1361-5クローンの軽鎖の塩基配列及びアミノ酸配列を示す。
配列番号:183および184は、それぞれ1361抗体に対してY79A変異の導入に用いたフォワードプライマー及びリバースプライマーの塩基配列を示す。
配列番号:185および186は、それぞれ1361抗体に対してS82A変異の導入に用いたフォワードプライマー及びリバースプライマーの塩基配列を示す。
配列番号:187〜192は、実施例B11−2に記載される通り、1361抗体のFc領域に部位特異的変異導入するために用いたフォワードプライマーおよびリバースプライマーの核酸配列を示す。
Claims (10)
- がんの検査方法であって、
被験者から採取された体液試料において、TMEM−180を有するエクソソームの量を検出する工程を含む、方法。 - がんが、ステージ1、2、3、および4からなる群から選択されるいずれかのがんである、請求項1に記載の方法。
- がんが、ステージ1または2のがんである、請求項2に記載の方法。
- エクソソームの量が、規定値以上である場合に、被検者ががんを有する可能性があると決定することをさらに含み、規定値が複数の健常者の体液試料中のTMEM−180を有するエクソソーム量の平均以上の値である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- TMEM−180を有するエクソソームの量を検出する工程が、TMEM−180に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて行われる、請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 抗体が、以下のいずれかの抗体である、請求項5に記載の方法:
[1]以下6つのCDRを有する抗体:
重鎖CDR1:DYWVS(配列番号:72);
重鎖CDR2:EIYPNSGATNFNENFK(配列番号:73);
重鎖CDR3:DGTMGIAYYFDY(配列番号:74);
軽鎖CDR1:KASQNINRYLN(配列番号:75);
軽鎖CDR2:NANSLQT(配列番号:76);及び
軽鎖CDR3:LQHNSWPYT(配列番号:77);
[2]以下6つのCDRを有する抗体:
重鎖CDR1:SNGVG(配列番号:88);
重鎖CDR2:TIWTGGGTNYNSGVQS(配列番号:89);
重鎖CDR3:EYMGFDY(配列番号:90);
軽鎖CDR1:KASQNVGINVG(配列番号:91);
軽鎖CDR2:WASNRDT(配列番号:92);及び
軽鎖CDR3:LQHNSYPRT(配列番号:93);ならびに
[3]以下6つのCDRを有する抗体:
重鎖CDR1:SNGVG(配列番号:96);
重鎖CDR2:TIWSGGGTNYNSAVQS(配列番号:97);
重鎖CDR3:EEKGFAY(配列番号:98);
軽鎖CDR1:KASQNVGINVG(配列番号:99);
軽鎖CDR2:WASNRDT(配列番号:100);及び
軽鎖CDR3:LQHNSYPRA(配列番号:101);
[4]TMEM−180との結合に関して上記[1]〜[3]のいずれかに記載の抗体と競合する抗体。 - がんを有する対象において前記がんを処置することに用いる医薬組成物であって、TMEM−180に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを含み、前記対象は、体液試料からTMEM−180を有するエクソソームが検出された対象である、医薬組成物。
- がんを有する対象が、その体液試料中のTMEM−180を有するエクソソームの量が、規定値以上である対象であり、規定値が複数の健常者の体液試料中のTMEM−180を有するエクソソーム量の平均以上の値である、請求項7に記載の医薬組成物。
- TMEM−180を表出する精製されたエクソソームを含む組成物。
- 免疫原として用いられる、請求項9に記載の組成物。
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