JP6681625B2 - タンパク質の発現方法 - Google Patents
タンパク質の発現方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6681625B2 JP6681625B2 JP2017525271A JP2017525271A JP6681625B2 JP 6681625 B2 JP6681625 B2 JP 6681625B2 JP 2017525271 A JP2017525271 A JP 2017525271A JP 2017525271 A JP2017525271 A JP 2017525271A JP 6681625 B2 JP6681625 B2 JP 6681625B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- expression
- sequence
- sequence encoding
- peptide tag
- protein
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/70—Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/14—Extraction; Separation; Purification
- C07K1/16—Extraction; Separation; Purification by chromatography
- C07K1/22—Affinity chromatography or related techniques based upon selective absorption processes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
- C12N15/81—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Mycology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Description
以上の成果に基づき、以下の発明が提供される。
[1]大腸菌を利用した発現系又は酵母発現系によって、SK、SKX、SKXX、AKXX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグがN末端に連結したタグ付加タンパク質として目的タンパク質を発現させること、を特徴とする、タンパク質の発現方法。
[2]前記ペプチドタグが、SKI、SKIK、SKKK、SKII、AKIK、AKII又はKKKKのアミノ酸配列からなる、[1]に記載の発現方法。
[3]前記ペプチドタグと、前記目的タンパク質の配列が直結している、[1]又は[2]に記載の発現方法。
[4]前記ペプチドタグと、前記目的タンパク質の配列の間にプロテアーゼ認識配列が介在する、[1]又は[2]に記載の発現方法。
[5]大腸菌を利用した前記発現系が、T7プロモーターを用いた発現系、又は低温発現プロモーターを用いた発現系である、[1]〜[4]のいずれか一項に記載の発現方法。
[6]以下の(1)〜(3)のステップを含む、[1]〜[5]のいずれか一項に記載の発現方法:
(1)前記ペプチドタグがN末端に連結した目的タンパク質をコードする配列を保持する発現ベクターを用意するステップ;
(2)前記発現ベクターを宿主細胞に導入するステップ;及び
(3)前記発現ベクターが導入された形質転換体を培養し、前記目的タンパク質を発現させるステップ。
[7]前記発現ベクターが以下の(a)〜(c)のいずれかの方法で構築される、[6]に記載の発現方法:
(a)前記宿主細胞の発現用ベクターに対して、前記ペプチドタグが連結した目的タンパク質をコードする配列を挿入すること、
(b)前記ペプチドタグをコードする配列を開始コドンの直後に有する前記宿主細胞の発現用ベクターに対して、該配列の下流にインフレームで目的タンパク質をコードする配列を挿入すること、
(c)目的タンパク質をコードする配列を保持する前記宿主細胞の発現用ベクターの開始コドンの直後に、前記ペプチドタグをコードする配列を挿入すること。
[8]大腸菌を利用した前記発現系が、大腸菌由来成分を用いた無細胞タンパク質合成系である、[1]〜[5]のいずれか一項に記載の発現方法。
[9]以下の(i)及び(ii)のステップを含む、[8]に記載の発現方法:
(i)前記ペプチドタグがN末端に連結した目的タンパク質をコードする配列を含む発現用鋳型を用意するステップ;及び
(ii)無細胞タンパク質合成反応を行うステップ。
[10]大腸菌で機能するプロモーター、
リボソーム結合部位、
開始コドン、
該開始コドンの直後に配置された、SK、SKX、SKXX、AKXX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグをコードする配列、及び
該配列の下流に配置されたクローニング部位、
を有する、大腸菌を利用した発現系用の発現ベクター。
[11]酵母で機能するプロモーター、
開始コドン、
該開始コドンの直後に配置された、SK、SKX、SKXX、AKXX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグをコードする配列、及び
該配列の下流に配置されたクローニング部位、
を有する、酵母発現系用の発現ベクター。
[12]ペプチドタグをコードする前記配列と前記クローニング部位が隣接している、[10]又は[11]に記載の発現ベクター。
[13]ペプチドタグをコードする前記配列と前記クローニング部位の間に、プロテアーゼ認識配列をコードする配列が配置されている、[10]又は[11]に記載の発現ベクター。
[14]大腸菌で機能するプロモーター、
リボソーム結合部位、
開始コドン、
該開始コドンの直後に配置された、SK、SKX、SKXX、AKXX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグをコードする配列、及び
該配列の下流に配置された、目的タンパク質をコードする配列、
を有する、大腸菌を利用した発現系用の発現ベクター。
[15]酵母で機能するプロモーター、
開始コドン、
該開始コドンの直後に配置された、SK、SKX、SKXX、AKXX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグをコードする配列、及び
該配列の下流に配置された、目的タンパク質をコードする配列、
を有する、酵母発現系用の発現ベクター。
[16][10]〜[15]のいずれか一項に記載の発現ベクターを含む、目的タンパク質発現用キット。
[17]タンパク質のN末端に連結した前記ペプチドタグを認識する抗体を更に含む、[16]に記載のキット。
[18]前記抗体が不溶性支持体又は磁性体に担持されている、[17]に記載のキット。
[19]前記ペプチドタグをN末端に有するペプチドを更に含む、[16]〜[18]のいずれか一項に記載のキット。
[20]前記ペプチドが、SK、SKX、SKXX、AKXX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなる、[19]に記載のキット。
[21]SK、SKX、SKXX、AKXX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグがN末端に連結した組換えタンパク質。
本発明の第1の局面はタンパク質の発現方法に関する。本発明では大腸菌を利用した発現系又は酵母発現系によって目的タンパク質を発現させる。「大腸菌を利用した発現系」は、宿主として大腸菌を用いた発現系(慣例に従い、「大腸菌発現系」と呼ぶ))と大腸菌由来成分を用いた無細胞タンパク質合成系を包括的に表現する。酵母発現系は、酵母細胞を宿主とした発現系である。
生細胞(大腸菌又は酵母)を用いた発現系では、目的タンパク質をコードする配列を保持する発現ベクターで形質転換した宿主(形質転換体)を培養し、目的タンパク質を発現させる。具体的には、以下のステップ(1)〜(3)によって、目的タンパク質を発現させる。
(1)本発明のペプチドタグがN末端に連結した目的タンパク質をコードする配列を保持する発現ベクターを用意するステップ
(2)前記発現ベクターを宿主細胞に導入するステップ
(3)前記発現ベクターが導入された形質転換体を培養し、前記目的タンパク質を発現させるステップ
(a)大腸菌発現用ベクターに対して、本発明のペプチドタグが連結した目的タンパク質をコードする配列を挿入する方法
(b)本発明のペプチドタグをコードする配列を開始コドンの直後に有する大腸菌発現用ベクターに対して、該配列の下流にインフレームで目的タンパク質をコードする配列を挿入する方法
(c)目的タンパク質をコードする配列を保持する大腸菌発現用ベクターの開始コドンの直後に、本発明のペプチドタグをコードする配列を挿入する方法
(a)酵母発現用ベクターに対して、本発明のペプチドタグが連結した目的タンパク質をコードする配列を挿入する方法
(b)本発明のペプチドタグをコードする配列を開始コドンの直後に有する酵母発現用ベクターに対して、該配列の下流にインフレームで目的タンパク質をコードする配列を挿入する方法
(c)目的タンパク質をコードする配列を保持する酵母発現用ベクターの開始コドンの直後に、本発明のペプチドタグをコードする配列を挿入する方法
本発明の一態様では、大腸菌由来成分を用いた無細胞タンパク質合成系を利用して目的タンパク質を発現させる。無細胞タンパク質合成系とは、生細胞を用いるのではく、生細胞由来の(或いは遺伝子工学的手法で得られた)リボソームや転写・翻訳因子などを用いて、鋳型である核酸からタンパク質をin vitroで合成することをいう。無細胞タンパク質合成系では一般に、細胞破砕液を必要に応じて精製して得られる細胞抽出液が使用される。細胞抽出液には一般に、タンパク質合成に必要なリボソーム、開始因子などの各種因子、tRNAなどの各種酵素が含まれる。タンパク質の合成を行う際には、この細胞抽出液に各種アミノ酸、ATP、GTPなどのエネルギー源、クレアチンリン酸など、タンパク質の合成に必要なその他の物質を添加する。勿論、タンパク質合成の際に、別途用意したリボソームや各種因子、及び/又は各種酵素などを必要に応じて補充してもよい。
本発明の発現方法に用いる発現ベクター(特にクローニング部位を有するもの)は汎用性に優れ、それ自体、有用性及び利用価値が高い。そこで本発明は別の局面として、本発明の発現方法に用いることができる発現ベクターを提供する。本発明の発現ベクターの構成は上記の通りであり、大腸菌発現系、大腸菌由来成分を用いた無細胞タンパク質合成系、又は酵母発現系での目的タンパク質の発現に必要な要素を備える。
本発明の発現方法によれば、特徴的な構造を有する組換えタンパク質、具体的には、本発明のペプチドタグがN末端に連結した組換えタンパク質が得られる。当該組換えタンパク質は、本発明のペプチドタグを利用して検出、精製等が可能であるという利点を有する。従って、それ自体、有用性は高い。上記の通り、本発明の発現方法が適用可能なタンパク質は特に限定されず、様々な目的タンパク質を「ペプチドタグが連結した組換えタンパク質」として取得することが可能である。また、ペプチドタグと目的タンパク質の配列の間にプロテアーゼ認識配列を組み入れておけば、例えば精製処理後、或いは分画ないし分取後にプロテアーゼを作用させ、ペプチドタグ部分を切断(分離)することが可能である。
マウスより取得した抗大腸菌O157の抗体遺伝子を使用し、Fabとして発現させた。なお、Hc、LcのC末端には、それぞれLZA(ロイシンジッパーペプチドA)-HAタグ及びLZB(ロイシンジッパーペプチドB)-Flagタグを連結した形とした。ロイシンジッパーペプチドAとロイシンジッパーペプチドBは高い親和性を持ち、ロイシンジッパーヘテロダイマーを形成する。ロイシンジッパーペプチドAは、ロイシンジッパーを形成できるように7残基毎にロイシンを含む。ロイシンジッパーペプチドBも同様に、7残基毎にロイシンを含む。これらのロイシンは、ロイシンジッパーペプチドAにおけるロイシン(ロイシンジッパーモチーフを構成するもの)に対応するように配置されている。
pET22b-m6FabLZを鋳型として、PCRによりHcおよびLcの開始コドン直後にSKIK配列5’-tctaaaataaaa-3’(配列番号4)を挿入した。詳述すると、aggagatatacatatgtctaaaataaaagaggtccagctg(配列番号16)とGTCATCAAAACATCTTTTATTTTAGACATATGATATCTCCTTCT(配列番号17)のペア及びtaaaataaaagatgttttgatgacccaaac(配列番号18)とTAGACATATGTATATCTCCTTCT(配列番号19)のペアでPCRを行った。DNAポリメラーゼにはKOD plusを使用した。温度プログラムは、94℃で2分保持、94℃で30秒、55℃で30秒及び72℃で4分の処理を25サイクル、72℃で3分保持、とした。得られたPCR産物を精製し、上記同様にGibson assemblyにより連結し環状化した。DH5alphaを形質転換し、100μg/mLアンピシリン含有LB寒天プレート上に生育した形質転換体からプラスミドを調製した。本プラスミドをpET22b-m6Fab-SKIKとした。
ウサギより取得した抗リステリア・モノサイトゲネス(Listeria monocytogenes)の抗体遺伝子No.1、4及び9をscFvとして発現させた。操作方法、処理条件などは上記の実験に準じた。
ロイシンジッパーBをコードする配列を発現させ、タグ付加による発現量の増大効果を調べた。誘導発現条件を37℃で3時間にしたこと以外、上記実験と同様の操作・条件で発現させた。
バクテリオファージカプシド(capsid)タンパク質のリーダー配列由来であるT7タグ配列5’-atggctagcatgactggtggacagcaaatgggt-3’:配列番号20(アミノ酸配列MASMTGGQQMG:配列番号21)と、SKIKの効果を比較した。モデルとして、3種類のウサギ由来scFv(No. 1、4及び9)を用いた。発現は大腸菌Shuffle T7 expressにて行った。発現産物を破砕したものをサンプルとしてSDS-PAGEを行い、タンパク質発現状態を比較した。また、精製したscFvの抗原に対する結合活性をELISAにより評価した。ELISAにおいては、タンパク質量あたりの活性を算出した。
SKIKの効果に関するコドン影響を調べた。上述のSKIKをコードする配列(5’-tctaaaataaaa-3’:配列番号4)と、異なるコドンを採用した配列(5’-tcgaagatcaag-3’ :配列番号5。この配列がコードするペプチドを、便宜上、「SKIK2」と呼ぶ)を比較した。ウサギscFvのNo.1遺伝子をモデルとして、上記実験と同様に発現させ、SDS-PAGEの後にCBB染色し、発現量を比較した(図6)。いずれの塩基配列を用いた場合においても目的タンパク質の発現量が向上していたことから、SKIKをコードする限り、コドンの如何に拘わらず、所望の効果(目的タンパク質の発現量増大)を発揮することを期待できる。
大腸菌の無細胞タンパク質合成系によるSKIKタグ配列の効果を調べた。ウサギ抗リステリア菌のscFvをモデルとした。pET22b-r1scFv-HA及びpET22b-SKIK-r1scFv-HAを鋳型としプライマーatctcgatcccgcgaaattaatacg(配列番号22)とtccggatatagttcctcctttcag(配列番号23)のペアにて増幅し、T7プロモーターとターミネーターをそれぞれ目的遺伝子の上流・下流に含む発現用DNA断片を得た。同様にポジティブコントロールの蛍光タンパク質GFP発現用断片もPCRにて増幅した。得られた約1 kbのPCR産物をカラム精製し、DNA濃度60〜65 ng/μLとした。これを無細胞タンパク質合成系の鋳型とした。ネガティブコントロールは鋳型DNAの代わりにTE緩衝液を添加した。
プロモーターの種類による影響(プロモーター依存性)を調べるために、T7プロモーター制御での発現量と、コールドショックプロモーターcspA制御での発現量を比較した。モデル遺伝子として、SKIKタグなしのときに発現量が低い抗O157マウス抗体(m6FabLZと呼ぶ)を使用した。この遺伝子をpET22b(Novagen;T7プロモーター制御)とpColdI(Takara;cspAプロモーター制御)の開始コドンにあわせてクローニングし、Shuffle T7 express株にて発現させた。誘導培地には100μg/mLのアンピシリンを含むTeriffic Brothを使用した。誘導条件は1 mM IPTG存在下において16℃24時間とした。菌体を遠心分離5000×gにて回収しPBSにて洗浄した。洗浄した菌体を、菌体量をそろえて還元剤入りサンプルバッファーに懸濁し5分間ボイルした後、SDS-PAGE(ゲル濃度12.5%)へ供した。CBB染色によりタンパク質バンドを検出した。
タグ長を削減したときの影響を調べるために、開始コドンと抗リステリア−ウサギ抗体遺伝子(r1scFvと呼ぶ)の間にタグ配列(Sをコードする配列、SKをコードする配列、SKIをコードする配列、又はSKIKをコードする配列)が挿入されたもの(4系列)とタグなしのもの(1系列)の計5系列で比較した。ベクターはpET22bとし、PelBシグナル配列は除去した。発現宿主には上記同様にShuffle T7 expressを使用し、誘導培地には100μg/mLのアンピシリンを含むLB培地を使用した。誘導条件は1 mM IPTG存在下において16℃24時間とした。菌体を遠心分離5000×gにて回収しPBSにて洗浄した。洗浄した菌体を、菌体量を揃えて還元剤入りサンプルバッファーに懸濁し5分間ボイルした後SDS-PAGE(ゲル濃度12.5%)へ供した。CBB染色によりタンパク質バンドを検出した。
モデルとしてNo. 4 ウサギscFv遺伝子を使用し、発現ベクターを低コピープラスミドのpYC2/NTとした。まず、pYC2/NTをTTTTTTCGGTACCAAGCTTAATATTCCC(配列番号24)とTAACTGATCCTAGAGGGCCGCATCATG(配列番号25)のプライマーペアによりPCRを行い直鎖化した。次に、タグなし及びSKIKタグありのNo. 4 scFv遺伝子が挿入された大腸菌発現プラスミドを鋳型とし、それぞれTAAGCTTGGTACCGAAAAAAATGGATGTCGTGATGACCCAGAC(配列番号26)とGGCCCTCTAGGATCAGTTAAGCGTAATCTGGAACATCGTATG(配列番号27)(r4scFv-pYC-R)のペア及びTAAGCTTGGTACCGAAAAAAATGtctaaaataaaaGATGTCGTGATGACC(配列番号28)と上記r4scFv-pYC-Rのペアで増幅した。これらをそれぞれ直鎖化したpYC2/NTとGibson assemblyにより連結し、酵母の発現プラスミドを構築した。
タグ無では発現量の低いウサギscFvをモデルとして使用し、SKIK以外のペプチドタグの効果を調べた。まず、pET22b-r1scFv-HAを鋳型としてプライマーatatgaaaaaaaaaaaagaccctatgctgacc(配列番号41)及びAGGGTCTTTTTTTTTTTTCATATGTATATCTCC(配列番号42)によりPCRをおこない、N末端にKKKK(配列番号35)(コードする塩基配列としてaaaaaaaaaaaa(配列番号40)を使用)を付加した。同様に、atatggcaaaaattaaagaccctatgctgacc(配列番号43)とAGGGTCTTTAATTTTTGCCATATGTATATCTCC(配列番号44)でAKIK(配列番号33)(コードする塩基配列としてgcaaaaattaaa(配列番号38)を使用)、atatgtctaaaaaaaaagaccctatgctgacc(配列番号45)とAGGGTCTTTTTTTTTAGACATATGTATATCTCC(配列番号46)でSKKK(配列番号32)(コードする塩基配列としてtctaaaaaaaaa(配列番号37)を使用)、atatggcaaaaattattgaccctatgctgacc(配列番号47)とAGGGTCAATAATTTTTGCCATATGTATATCTCC(配列番号48)でAKII(配列番号34)(コードする塩基配列としてgcaaaaattatt(配列番号39)を使用)、atatgtctaaaattattgaccctatgctgacc(配列番号49)とAGGGTCAATAATTTTAGACATATGTATATCTCC(配列番号50)でSKII(配列番号31)(コードする塩基配列としてtctaaaattatt(配列番号36)を使用)を付加した。これらのタグを使用し、上記1.の実施例(マウス抗体の発現)と同様に大腸菌細胞内で目的タンパク質を発現させた。尚、この実験では発現にLB培地を用いた。得られた全細胞画分をSDS-PAGEにて分離しCBBにて染色した結果を図12に示す。この結果から、SKXX、AKXX及びKKXXも発現量向上効果があることがわかった。
配列番号6〜19、22〜28、41〜50:人工配列の説明:プライマー
配列番号20、21:人工配列の説明:T7タグ
Claims (20)
- 大腸菌を利用した発現系又は酵母発現系によって、SKX、SKXX、AKX、AKXX、KKX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグがN末端に連結したタグ付加タンパク質として目的タンパク質を発現させる、タンパク質の発現方法であって、
前記ペプチドタグは、目的タンパク質の発現量を増大する機能を有し、且つ、開始コドンに対応するアミノ酸の直後に連結している、タンパク質の発現方法。 - 前記ペプチドタグが、SKI、SKIK、SKKK、SKII、AKIK、AKII又はKKKKのアミノ酸配列からなる、請求項1に記載の発現方法。
- 前記ペプチドタグと、前記目的タンパク質の配列が直結している、請求項1又は2に記載の発現方法。
- 前記ペプチドタグと、前記目的タンパク質の配列の間にプロテアーゼ認識配列が介在する、請求項1又は2に記載の発現方法。
- 大腸菌を利用した前記発現系が、T7プロモーターを用いた発現系、又は低温発現プロモーターを用いた発現系である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の発現方法。
- 以下の(1)〜(3)のステップを含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の発現方法:
(1)前記ペプチドタグがN末端に連結した目的タンパク質をコードする配列を保持する発現ベクターを用意するステップ;
(2)前記発現ベクターを宿主細胞に導入するステップ;及び
(3)前記発現ベクターが導入された形質転換体を培養し、前記目的タンパク質を発現させるステップ。 - 前記発現ベクターが以下の(a)〜(c)のいずれかの方法で構築される、請求項6に記載の発現方法:
(a)前記宿主細胞の発現用ベクターに対して、前記ペプチドタグが連結した目的タンパク質をコードする配列を挿入すること、
(b)前記ペプチドタグをコードする配列を開始コドンの直後に有する前記宿主細胞の発現用ベクターに対して、該配列の下流にインフレームで目的タンパク質をコードする配列を挿入すること、
(c)目的タンパク質をコードする配列を保持する前記宿主細胞の発現用ベクターの開始コドンの直後に、前記ペプチドタグをコードする配列を挿入すること。 - 大腸菌を利用した前記発現系が、大腸菌由来成分を用いた無細胞タンパク質合成系である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の発現方法。
- 以下の(i)及び(ii)のステップを含む、請求項8に記載の発現方法:
(i)前記ペプチドタグがN末端に連結した目的タンパク質をコードする配列を含む発現用鋳型を用意するステップ;及び
(ii)無細胞タンパク質合成反応を行うステップ。 - 大腸菌で機能するプロモーター、
リボソーム結合部位、
開始コドン、
該開始コドンの直後に配置された、SKX、SKXX、AKX、AKXX、KKX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグをコードする配列、及び
該配列の下流に配置されたクローニング部位、
を有し、
前記ペプチドタグをコードする配列は、前記クローニング部位の発現量を増大する機能を有する、大腸菌を利用した発現系用の発現ベクター。 - 酵母で機能するプロモーター、
開始コドン、
該開始コドンの直後に配置された、SKX、SKXX、AKX、AKXX、KKX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグをコードする配列、及び
該配列の下流に配置されたクローニング部位、
を有し、
前記ペプチドタグをコードする配列は、前記クローニング部位の発現量を増大する機能を有する、酵母発現系用の発現ベクター。 - ペプチドタグをコードする前記配列と前記クローニング部位が隣接している、請求項10又は11に記載の発現ベクター。
- ペプチドタグをコードする前記配列と前記クローニング部位の間に、プロテアーゼ認識配列をコードする配列が配置されている、請求項10又は11に記載の発現ベクター。
- 大腸菌で機能するプロモーター、
リボソーム結合部位、
開始コドン、
該開始コドンの直後に配置された、SKX、SKXX、AKX、AKXX、KKX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグをコードする配列、及び
該配列の下流に配置された、目的タンパク質をコードする配列、
を有し、
前記ペプチドタグをコードする配列は、前記目的タンパクをコードする配列の発現量を増大する機能を有する、大腸菌を利用した発現系用の発現ベクター。 - 酵母で機能するプロモーター、
開始コドン、
該開始コドンの直後に配置された、SKX、SKXX、AKX、AKXX、KKX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなるペプチドタグをコードする配列、及び
該配列の下流に配置された、目的タンパク質をコードする配列、
を有し、
前記ペプチドタグをコードする配列は、前記目的タンパクをコードする配列の発現量を増大する機能を有する、酵母発現系用の発現ベクター。 - 請求項10〜15のいずれか一項に記載の発現ベクターを含む、目的タンパク質発現用キット。
- タンパク質のN末端に連結した前記ペプチドタグを認識する抗体を更に含む、請求項16に記載のキット。
- 前記抗体が不溶性支持体又は磁性体に担持されている、請求項17に記載のキット。
- 前記ペプチドタグをN末端に有するペプチドを更に含む、請求項16〜18のいずれか一項に記載のキット。
- 前記ペプチドが、SKX、SKXX、AKX、AKXX、KKX又はKKXXのアミノ酸配列(但し、Xは任意のアミノ酸残基を表す)からなる、請求項19に記載のキット。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2015121443 | 2015-06-16 | ||
JP2015121443 | 2015-06-16 | ||
PCT/JP2016/067853 WO2016204198A1 (ja) | 2015-06-16 | 2016-06-15 | タンパク質の発現方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPWO2016204198A1 JPWO2016204198A1 (ja) | 2018-04-05 |
JP6681625B2 true JP6681625B2 (ja) | 2020-04-15 |
Family
ID=57545319
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017525271A Active JP6681625B2 (ja) | 2015-06-16 | 2016-06-15 | タンパク質の発現方法 |
Country Status (4)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US10975376B2 (ja) |
EP (1) | EP3312278A4 (ja) |
JP (1) | JP6681625B2 (ja) |
WO (1) | WO2016204198A1 (ja) |
Families Citing this family (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2018025826A1 (ja) * | 2016-08-03 | 2018-02-08 | 国立大学法人名古屋大学 | 標識タンパク質を融合した抗体 |
WO2020027237A1 (ja) * | 2018-08-01 | 2020-02-06 | 国立大学法人鹿児島大学 | ペプチド融合タンパク質 |
WO2020204102A1 (ja) * | 2019-04-02 | 2020-10-08 | Spiber株式会社 | 組換えタンパク質の製造方法 |
CN110747212B (zh) * | 2019-11-29 | 2022-05-17 | 怀化学院 | 一种新果胶酶的基因及其蛋白表达、载体和应用 |
US20230365979A1 (en) * | 2020-09-29 | 2023-11-16 | Idemitsu Kosan Co.,Ltd. | Peptide tag and tagged protein including same |
WO2022092132A1 (ja) * | 2020-10-27 | 2022-05-05 | 出光興産株式会社 | ペプチドタグおよびそれを含むタグ付加タンパク質 |
KR20240042497A (ko) | 2021-09-27 | 2024-04-02 | 후지필름 가부시키가이샤 | 폴리펩타이드의 제작 방법, 태그, 발현 벡터, 폴리펩타이드의 평가 방법, 핵산 디스플레이 라이브러리의 제작 방법 및 스크리닝 방법 |
Family Cites Families (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5714575A (en) * | 1989-02-13 | 1998-02-03 | The University Of Medicine And Dentistry Of New Jersey | Nucleic acids sequence, stress-induced proteins and uses thereof |
JP3036775B2 (ja) | 1990-02-07 | 2000-04-24 | 協和醗酵工業株式会社 | r―グルタミルトランスペプチダーゼの製造法 |
JP3373249B2 (ja) | 1993-04-09 | 2003-02-04 | ダイセル化学工業株式会社 | 熱ショック蛋白質遺伝子および熱ショック蛋白質の製造方法 |
JPH0870873A (ja) | 1994-09-07 | 1996-03-19 | Mitsubishi Chem Corp | 新規dna断片 |
US5789228A (en) | 1996-05-22 | 1998-08-04 | Diversa Corporation | Endoglucanases |
ATE529441T1 (de) * | 2005-08-30 | 2011-11-15 | Novo Nordisk As | Expression von proteinen in e.coli |
EP2118121A1 (en) * | 2007-03-01 | 2009-11-18 | Novo Nordisk A/S | Expression of proteins in e. coli |
US8372610B2 (en) | 2010-09-15 | 2013-02-12 | Ls9, Inc. | Production of odd chain fatty acid derivatives in recombinant microbial cells |
WO2012048856A1 (en) | 2010-10-12 | 2012-04-19 | Glucometrix Pvs Gmbh | Proinsulin with helper sequence |
CN102333870B (zh) | 2011-02-16 | 2014-01-29 | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 | 一种提高蛋白表达效率的方法及表达载体 |
-
2016
- 2016-06-15 EP EP16811672.1A patent/EP3312278A4/en active Pending
- 2016-06-15 WO PCT/JP2016/067853 patent/WO2016204198A1/ja active Application Filing
- 2016-06-15 US US15/735,804 patent/US10975376B2/en active Active
- 2016-06-15 JP JP2017525271A patent/JP6681625B2/ja active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20200032275A1 (en) | 2020-01-30 |
EP3312278A1 (en) | 2018-04-25 |
WO2016204198A1 (ja) | 2016-12-22 |
EP3312278A4 (en) | 2018-10-31 |
US10975376B2 (en) | 2021-04-13 |
JPWO2016204198A1 (ja) | 2018-04-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6681625B2 (ja) | タンパク質の発現方法 | |
Khushoo et al. | Optimization of extracellular production of recombinant asparaginase in Escherichia coli in shake-flask and bioreactor | |
JP7246100B2 (ja) | 新規融合タンパク質の調製およびそのタンパク質合成の向上における使用 | |
Peng et al. | A simple cost-effective methodology for large-scale purification of recombinant non-animal collagens | |
AU2020242724B2 (en) | Aminoacyl-tRNA synthetase for efficiently introducing lysine derivative in protein | |
KR101481142B1 (ko) | 코리네박테리아 발현용 합성프로모터 | |
WO2007061136A1 (ja) | 非天然型アミノ酸を組み込んだタンパク質の製造方法 | |
JP2004507270A (ja) | 組換えヒト副甲状腺ホルモンを生産する形質転換酵母及び該ホルモンの生産方法 | |
KR101373297B1 (ko) | 대장균 포스포글리세르산 인산화효소 유전자를 융합 파트너로서 포함하는 발현벡터 | |
RU2144957C1 (ru) | РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pPINS07, КОДИРУЮЩАЯ ГИБРИДНЫЙ ПОЛИПЕПТИД, СОДЕРЖАЩИЙ ПРОИНСУЛИН ЧЕЛОВЕКА, И ШТАММ БАКТЕРИЙ Escherichia coli - ПРОДУЦЕНТ ГИБРИДНОГО ПОЛИПЕПТИДА, СОДЕРЖАЩЕГО ПРОИНСУЛИН ЧЕЛОВЕКА | |
US11261472B2 (en) | Peptide sequence of a guide protein for the production of a peptide of interest, an expression vector, a host cell, and a method for the production of a peptide of interest | |
JP7016552B2 (ja) | 組換えタンパク質の分泌を増加させる方法 | |
CN109136209B (zh) | 肠激酶轻链突变体及其应用 | |
CN113774039B (zh) | 重组型dna聚合酶及其应用 | |
CN114686504B (zh) | Lpp或其突变体作为分子伴侣在大肠杆菌中分泌表达重组蛋白的应用 | |
EP4067492A1 (en) | Polypeptide tag and application thereof in in vitro protein synthesis | |
EP1981978B1 (en) | Affinity polypeptide for purification of recombinant proteins | |
US20060177845A1 (en) | UBP1 protease mutant, and its coding sequence, their application and methods of production | |
RU2302465C2 (ru) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ГЕННО-ИНЖЕНЕРНОГО ГЛЮКАГОНА ЧЕЛОВЕКА, РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pER-Gl, КОДИРУЮЩАЯ ГИБРИДНЫЙ БЕЛОК, СПОСОБНЫЙ К АВТОКАТАЛИТИЧЕСКОМУ РАСЩЕПЛЕНИЮ С ОБРАЗОВАНИЕМ ГЛЮКАГОНА ЧЕЛОВЕКА, И ШТАММ Escherichia coli ER-2566/pER-Gl - ПРОДУЦЕНТ УКАЗАННОГО БЕЛКА | |
KR101505697B1 (ko) | 시스토바이러스 파이12의 외피막 단백질 피9을 융합파트너로 포함하는 막 단백질 발현벡터 및 이를 이용한 막 단백질 제조 방법 | |
KR101646728B1 (ko) | 디제너러시 리프로그래밍을 통한 비천연 단백질 합성 방법 | |
CN118271454A (zh) | 融合蛋白、编码其的核酸及相关的无细胞蛋白质合成 | |
JPWO2004031243A1 (ja) | タンパク質ポリマー及びその製造方法 | |
RU2263147C1 (ru) | РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pHINS05, КОДИРУЮЩАЯ ГИБРИДНЫЙ ПОЛИПЕПТИД, СОДЕРЖАЩИЙ ПРОИНСУЛИН ЧЕЛОВЕКА, КЛЕТКА ESCHERICHIA COLI, ТРАНСФОРМИРОВАННАЯ РЕКОМБИНАНТНОЙ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК pHINS05, И ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI JM109/pHINS05 - ПРОДУЦЕНТ ГИБРИДНОГО ПОЛИПЕПТИДА, СОДЕРЖАЩЕГО ПРОИНСУЛИН ЧЕЛОВЕКА | |
RU2181771C1 (ru) | Рекомбинантная плазмидная днк perpins1, кодирующая аминокислотную последовательность рекомбинантного проинсулина человека, и штамм escherichia coli bl21(de3)/perpins1-продуцент рекомбинантного человеческого проинсулина |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20190514 |
|
A871 | Explanation of circumstances concerning accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A871 Effective date: 20190514 |
|
A975 | Report on accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971005 Effective date: 20190530 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20190605 |
|
RD03 | Notification of appointment of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7423 Effective date: 20190618 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20190712 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20191002 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20191217 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200205 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20200309 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20200316 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6681625 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
S533 | Written request for registration of change of name |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313533 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |