JP6557520B2 - 顕微鏡システム - Google Patents
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Description
本発明は上述した事情に鑑みてなされたものであって、標本を光軸上から退避させることなくシェーディング補正用の較正データを取得し、シェーディングを除去した画像を簡易に取得することができる顕微鏡システムを提供することを目的としている。
本発明は、標本の像を結像する結像部と、該結像部によって結像された前記標本の像を撮影する撮像部と、該撮像部によって取得された画像から前記標本以外の背景領域を抽出する背景抽出部と、該背景抽出部によって抽出された前記背景領域の輝度分布に基づいて、前記画像に含まれるシェーディングを補正するための較正データを生成する較正データ生成部と、該較正データ生成部によって生成された較正データを用いて前記画像の輝度を補正するシェーディング補正部とを備え、前記較正データ生成部が、前記背景抽出部によって抽出された前記背景領域の輝度分布に基づいて前記画像の全領域の輝度分布を推定し、推定された輝度分布が一様になるように前記画像の各画素用の補正値を算出し、算出された補正値からなる前記較正データを生成する顕微鏡システムを提供する。
この場合に、画像内の背景領域は、背景抽出部による演算処理によって抽出される。したがって、標本を光軸上から退避させることなくシェーディング補正用の較正データを取得し、シェーディングを除去した画像を簡易に取得することができる。
このようにすることで、観察者によって指定された個所と同一または類似の特徴量(例えば、色相、明度、彩度)を有する領域を抽出することによって、画像内から背景領域を精度良く抽出することができる。
標本領域と背景領域との間で異なる特徴量は観察方法に応じて異なる。したがって、観察方法毎に適切な特徴量の範囲を背景抽出条件として対応付けて記憶しておくことによって、観察方法のみに基づいて背景領域を精度良く抽出することができる。
このようにすることで、背景領域のみならず標本領域におけるシェーディングも高精度に除去することができる。
本発明の第1の実施形態に係る顕微鏡システム1について図1から図10を参照して以下に説明する。
本実施形態に係る顕微鏡システム1は、図1に示されるように、標本Sを光学的に観察する顕微鏡本体10と、該顕微鏡本体10によって得られた標本Sの観察像の画像データを取得する撮像部20と、該撮像部20によって取得された画像データを処理する画像処理部30と、表示部40と、入力部50とを備えている。撮像部20、画像処理部30、表示部40および入力部50は、バスを介して相互に通信可能に接続されている。
レボルバ14は、倍率等の特性が異なる複数個の対物レンズ13を保持し、いずれか1個の対物レンズ13を観察光路A内に挿入する。標本Sを透過した光は、観察光路A上の対物レンズ13に入射する。
なお、撮像素子21は、カラー撮像素子に代えて、モノクロ撮像素子であってもよい。
増幅部23は、前置処理部22から入力された電子信号を増幅し、A/D変換部24に出力する。
A/D変換部24は、増幅部23から入力された電気信号を量子化することによって標本Sの観察像の画像データを生成し、生成された画像データを出力する。
R画素の輝度信号レベルの分布を例に説明すると、R画素は、ベイヤー配列において奇数行かつ奇数列に配置されている。
ここで、本実施形態では、R画素がベイヤー配列において奇数行かつ奇数列に配置されている撮像素子を用いることとしているが、例えば偶数行かつ偶数列に配置されている撮像素子を用いてもよい。
図7は、図6の背景領域データからY=9におけるラインの輝度信号レベルの分布を示している。図7の分布において、X=9,13,25,27,31における画素の輝度信号レベルの情報が存在しない。輝度分布推定部32は、これらの画素の輝度信号レベルI1を下式(3)から算出する。式(3)において、x1は標本領域の画素のX座標、x0およびx2は、x1とX軸方向に隣接する2つの背景領域の画素のX座標、I0およびI2は、当該2つの背景領域の画素の輝度信号レベルである。
輝度分布推定部32は、Gr画素、Gb画素、B画素に関しても、R画素と同様の方法を用いて、画像データの撮像領域全域における輝度推定分布を得る。
また、線形補間法以外の補間方法、例えば、ラグランジュ補間法、スプライン補間法、最小二乗法を用いてもよい。また、補間対象の画素の周辺画素の輝度信号レベルに重みを付して補間値を計算してもよい。
顕微鏡本体10による標本Sの観察像の画像データが撮像部20によって取得されると、表示部40に画像が表示される(ステップS1)。操作者は、入力部50の入力デバイスの操作によって、表示部40に表示されている画像内の背景領域の少なくとも1箇所を指定領域として指定する(ステップS2)。ステップS2において指定領域が指定されると、画像処理部30は、撮像部20から受信した画像データを用いて以下のステップS3からS10の処理を実行する。
さらに、本実施形態に係る顕微鏡システム1によれば、操作者が、指定領域として複数箇所指定するのではなく、1箇所指定するといった簡単な操作だけでも、背景領域を抽出することができるという利点がある。
次に、第1の実施形態の変形例に係る顕微鏡システム1’について図11から図16を参照して説明する。
本変形例に係る顕微鏡システム1’は、結像条件を変更可能であり、結像条件毎に較正データを取得および記憶する点で、上述した顕微鏡システム1と異なっている。
本変形例に係る顕微鏡システム1’は、図11に示されるように、制御部60と、記憶部70とをさらに備えている。顕微鏡本体10、撮像部20、画像処理部30、表示部40、入力部50、制御部60および記憶部70は、バスを介して相互に通信可能に接続されている。
結像系変化検出部61は、レボルバ14’から受信する識別コードに基づいて、または、表示部40から受信した結像条件の設定の情報に基づいて、結像系が変更されたことを検出する。結像系変化検出部61は、結像系の変更を検出したときに、これを補正値管理部62に報知する。
なお、制御部60および記憶部70は、画像処理部30と同様に、例えば、コンピュータから構成されている。
本変形例の顕微鏡システム1’のその他の構成は、顕微鏡システム1と同一である。
顕微鏡本体10による標本Sの観察像の画像データが撮像部20によって取得されると、表示部40に画像が表示される(ステップS1)。操作者は、入力部50の入力デバイスの操作によって、画像データの取得に使用された結像条件を設定する(ステップS21)。
次に、本発明の第2の実施形態に係る顕微鏡システム2について図17から図19を参照して説明する。
本実施形態に係る顕微鏡システム2は、図17に示されるように、画像処理部30および制御部60に関して顕微鏡システム1と異なり、操作者によって指定された観察方法に基づいて背景領域を抽出するようになっている。
したがって、本実施形態においては、画像処理部30および制御部60について主に説明し、第1の実施形態と共通するその他の構成については同一符号を付して説明を省略する。
顕微鏡本体10による標本Sの観察像の画像データが撮像部20によって取得されると、表示部40に画像が表示される(ステップS1)。操作者は、入力部50の入力デバイスの操作によって、画像データの取得に使用された観察方法を設定する(ステップS31)。次に、背景抽出条件設定部63によって、設定された観察方法に対応する背景条件が背景抽出条件テーブルの中から選択され、選択された背景条件が背景自動抽出部35に設定される(ステップS32)。
このように、本実施形態に係る顕微鏡システム2によれば、操作者によって指定された観察方法に基づいて、画像全体から背景領域を抽出し、抽出された背景領域の輝度信号レベルの分布に基づいて画像全体の背景信号レベルを推定することができる。これにより、顕微鏡本体10の視野から標本Sを退避させたり、シェーディング補正のための専用の補正標本を準備したりすることなく、簡便かつ高精度に画像内のシェーディングを補正することができるという利点がある。
次に、第2の実施形態の変形例に係る顕微鏡システム2’について図21および図22を参照して説明する。
本変形例に係る顕微鏡システム2’は、制御部60に関して顕微鏡システム2と異なり、結像条件の変更の有無を定期的に判断し、結像条件の変更があった場合には較正データの再取得および更新を自動的に実行するようになっている。したがって、本実施形態においては、制御部60について主に説明し、上述した顕微鏡システム1,1’,2と共通するその他の構成については同一の符号を付して説明を省略する。
本変形例に係る制御部60は、図21に示されるように、結像系変化検出部61と、カウント部64と、補正処理制御部65とをさらに備えている。
結像系変化検出部61は、第1の実施形態と同様にして結像条件の変更の有無を検出する。すなわち、本変形例において、顕微鏡本体10が、図12に示されるレボルバ14’を備えるとともに、表示部40には結像条件設定欄42が表示されている。
撮像部20による画像取得開始後(ステップS41)、撮像部20から画像処理部30へ画像データが出力される度に(ステップS1)、カウント部64によって画像データの出力回数のカウント数が1からNまで1ずつインクリメントされる(ステップS42)。そして、カウント数がNに達する度に(ステップS44のYES)、カウント数がゼロにリセットされる(ステップS45)。
13 対物レンズ(結像部)
20 撮像部
31 背景抽出部
32 輝度分布推定部(較正データ生成部)
33 補正値算出部(較正データ生成部)
34 シェーディング補正部
50 入力部(背景指定部、観察方法入力部)
70 記憶部
S 標本
Claims (3)
- 標本の像を結像する結像部と、
該結像部によって結像された前記標本の像を撮影する撮像部と、
該撮像部によって取得された画像から前記標本以外の背景領域を抽出する背景抽出部と、
該背景抽出部によって抽出された前記背景領域の輝度分布に基づいて、前記画像に含まれるシェーディングを補正するための較正データを生成する較正データ生成部と、
該較正データ生成部によって生成された較正データを用いて前記画像の輝度を補正するシェーディング補正部とを備え、
前記較正データ生成部が、前記背景抽出部によって抽出された前記背景領域の輝度分布に基づいて前記画像の全領域の輝度分布を推定し、推定された輝度分布が一様になるように前記画像の各画素用の補正値を算出し、算出された補正値からなる前記較正データを生成する顕微鏡システム。 - 前記撮像部によって取得された画像内に指定領域を操作者に指定させる背景指定部を備え、
前記背景抽出部が、前記背景指定部によって指定された前記指定領域の色相、明度または彩度からなる特徴量を算出し、算出された特徴量に基づいて前記画像から前記背景領域を抽出する請求項1に記載の顕微鏡システム。 - 観察方法を操作者に入力させる観察方法入力部と、
前記観察方法と前記画像から背景領域を抽出するための背景抽出条件とを対応づけて記憶する記憶部とを備え、
前記背景抽出部が、前記観察方法入力部によって入力された観察方法と対応する背景抽出条件を前記記憶部から読み出し、読み出された背景抽出条件を満足する領域を前記背景領域として前記画像から抽出する請求項1に記載の顕微鏡システム。
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