JP6038936B2 - Csfにおけるsod1の代謝 - Google Patents
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Description
本発明は、少なくとも部分的に、国立衛生研究所からの資金、認可番号T35 DK074375を用いて行われた。従って、米国政府は本発明において一定の権利を有し得る。
本発明は、神経性および神経変性疾患、障害および関連する過程の診断および治療のための方法に関する。本発明はまた、in vivoで対象における中枢神経系由来の生体分子の代謝を測定する方法に関する。
本出願書類は、カラーで作成された少なくとも一つの写真を含む。カラー写真を有するこの特許出願公報のコピーは、請求および必要な手数料の支払いに応じて特許庁により提供されるであろう。
本発明は、SOD1の合成速度およびクリアランス速度を決定することに関する。また、治療が神経性および神経変性疾患に関連するCNSでのSOD1の産生またはクリアランス速度に影響を及ぼしているかどうかを評価するための方法を提供する。本発明の有用性は、治療がSOD1の合成またはクリアランス速度を変化させるかどうかを判定し得るという点で、当業者にとって明らかであろう。最終的に、この方法は、神経性および神経変性疾患の出現のための予測試験を提供し、より正確な診断のための方法、およびかかる疾患の進行をモニタリングする手段を提供し得る。
本発明は、SOD1のin vivo代謝を測定するための方法を提供する。この方法を用いることにより、当業者は、特定の疾患状態におけるSOD1の代謝(合成およびクリアランス)における可能な変化を研究することができる。加えて、本発明は、対象における疾患修飾性治療の薬力学的効果の測定を可能にする。
スーパーオキシドジスムターゼ1(SOD1)の遺伝子における変異は、優性遺伝性筋萎縮性側索硬化症(ALS)症例の20%を説明する。これらの遺伝的変異は、最終的に毒性を有するタンパク質を生産する。現在、家族性ALSのために利用可能な治療は無いが、SOD1産生を阻害することが、毒性タンパク質の産生および疾患進行を制限し得ると考えられている。いくつかの治療は、脳および脊髄におけるSOD1タンパク質レベルを低下させることに焦点を当てる。脳および脊髄における減少したSOD1は、脳脊髄液(CSF)における減少したSOD1に反映される。それゆえ、CSF SOD1は、SOD1合成を低減させるのに治療有効性のバイオマーカーとして用いられ得る。
いくつかの異なる部分を用いてSOD1を標識してもよい。一般的に言えば、本発明の方法において典型的に利用される2種類の標識部分は、放射性同位体および非放射性(安定)同位体である。好ましい実施形態では、非放射性同位体が用いられ、質量分析法によって測定され得る。好ましい安定同位体には、重水素2H、13C、15N,17または18O,33,34,または36Sが含まれるが、一般的な天然型において見られるよりも多いまたは少ない中性子によって原子の質量を変化させる多数の他の安定同位体も有効であることが認識される。適した標識は、一般に、質量分析計において検出することができるように研究対象のSOD1の質量を変化させる。一実施形態では、標識された部分は非放射性同位体(例えば、13C)を含むアミノ酸である。別の実施形態では、測定される生体分子は核酸であり、標識された部分は非放射性同位体(例えば、15N)を含むヌクレオシド三リン酸である。あるいは、放射性同位体を用いてもよく、標識された生体分子は質量分析計によるだけでなくシンチレーションカウンターで測定してもよい。一以上の標識された部分が同時にまたは順番に用いられてもよい。
標識された部分はいくつかの方法によって対象に投与することができる。投与の適した方法には、静脈内、動脈内、皮下、腹腔内、筋肉内、または経口が含まれる。好ましい実施形態では、標識された部分は標識されたアミノ酸であり、標識されたアミノ酸は、静脈内注入によって投与される。別の実施形態では、標識されたアミノ酸は経口的に摂取されてもよい。
発明の方法は、標識されたSOD1のin vivo代謝を決定できるように、対象から生体試料を得ることを提供する。適した生体試料は、SOD1が検出され得る体液または組織を含むが、これらに限定されない。例えば、一実施形態では、体液は脳脊髄液(CSF)である。別の実施形態では、生体試料は組織試料である。生体試料の種類ごとに、当業者であれば、組織中のSOD1の半減期が、試料収集時間を選択するために決定されるべきであることを認識できる。
本発明は、生体試料中の標識SOD1の量および非標識SOD1の量の検出を用いて、非標識SOD1に対する標識生体分子の比率を決定し得る。一般に、非標識SOD1に対する標識SOD1の比率は、SOD1の代謝に直接比例する。標識SOD1および非標識SOD1の検出に適した方法は、研究対象のSOD1の形態およびそれを標識するために用いられた標識された部分の種類に応じて、変わり得るおよび変わるであろう。対象の生体分子がタンパク質であり、標識された部分が非放射性に標識されたアミノ酸である場合、検出の方法は、典型的には、非標識タンパク質に対する標識タンパク質の質量の変化を検出するのに十分に高感度であるべきである。好ましい実施形態では、質量分析法を用いて、標識SOD1および非標識SOD1の間の質量の違いを検出する。一実施形態では、ガスクロマトグラフィー質量分析法が用いられる。代替的な実施形態では、MALDI−TOF質量分析法が用いられる。好ましい実施形態では、高分解能タンデム質量分析法が用いられる。
標識SOD1および非標識SOD1の量が生体試料において検出されると、標識された生体分子の比率または割合を決定することができる。対象の生体分子がタンパク質であり、標識SOD1および非標識SOD1の量が生体試料において測定された場合、次いで、非標識タンパク質に対する標識タンパク質の比率を算出することができる。タンパク質代謝(合成速度、クリアランス速度、遅延時間(lag time)、半減期、等)が、経時的に非標識タンパク質に対する標識タンパク質の比率から算出することができる。これらのパラメータを算出するための適した方法は多数存在する。本発明は、標識タンパク質(またはペプチド)および非標識タンパク質(またはペプチド)の同時測定を可能にし、その結果、非標識タンパク質に対する標識タンパク質の比率ならびに他の算出を得ることができる。当業者であれば、本発明の方法で用いてもよい標識化の一次速度論モデルを熟知していると考えられる。例えば、分画合成速度(FSR)を算出することができる。FSRは、前駆体の濃縮度(enrichment)で割った、非標識タンパク質に対する標識タンパク質の増加の初速度に等しい。同様に、分画クリアランス速度(FCR)を算出することができる。また、遅延時間および同位体トレーサー定常状態などの他のパラメータを決定し、タンパク質の代謝および生理機能の測定値として用いることもできる。また、データに対してモデル化を行い、複数のコンパートメントモデルに適合させて、コンパートメント間の移動を推定してもよい。もちろん、選択される数学的モデル化の種類は、個々のタンパク質合成およびクリアランスのパラメータ(例えば、1−プール、マルチプール、定常状態、非定常状態、コンパートメントモデル化、等)に依存すると考えられる。
本発明は、SOD1を測定する、または、対象における中枢神経系由来タンパク質のin vivo代謝を測定することにより、SOD1に関連する神経性または神経変性疾患の進行または治療をモニタリングするためのキットを提供する。一般に、キットは、標識されたアミノ酸、標識されたアミノ酸を投与するための手段、経時的に生体試料を収集するための手段、および非標識SOD1に対する標識SOD1の比率を検出し、決定して、その結果、代謝指標(metabolic index)を算出し得るための使用説明書、を含む。代謝指標は、次いで、正常で健康な個体の代謝指標と比較してもよく、または前の時点で生成した同一対象からの代謝指標と比較してもよい。好ましい実施形態では、キットは13C6−ロイシンまたは13C6−フェニルアラニンを含み、標識されるタンパク質はSOD1であり、評価される疾患はALSである。
特に定義しない限り、本明細書で用いられる全ての技術および科学用語は、一般的に、本発明が属する分野の当業者によって理解されている意味を有する。以下の参考文献は、本発明で用いられる用語の多くの一般的定義を当業者に提供する:Singleton et al., Dictionary of Microbiology and Molecular Biology (2nd ed. 1994); The Cambridge Dictionary of Science and Technology (Walker ed., 1988); The Glossary of Genetics, 5th Ed., R. Rieger et al. (eds.), Springer Verlag (1991); and Hale & Marham, The Harper Collins Dictionary of Biology (1991)。本明細書で用いる場合、以下の用語は、特に断りのない限り、それらに帰する意味を有する。
ヒトSOD1 WTを過剰発現するトランスジェニックラットに、新規の食事にラットを順応させるために、13C−ロイシンでの標識の前に、2週間、ロイシンのない餌を与えた。この馴化期間中、通常の12C−ロイシン(100mg/日)が、スクロースでわずかに甘くした飲料水に提供された。馴化期間の後、飲料水を13C−ロイシン(100mg/日)と交換し、動物を標識した。図1Aおよび1Bに示されるデータは、7日間の標識期間が脳および肝臓に十分なSOD1標識をもたらすことを示す。7日間の標識期間後、通常の12C−ロイシンで動物を追跡し、その後、動物を特定の時点で屠殺し、PBS/ヘパリンで灌流し、かつ脳、脊髄、肝臓および腎臓を採取し、液体窒素中で瞬間冷凍し、−80℃で保存した。
図1Cに見られるように、二つの異なる組織(脳および肝臓)からのSOD1をヒトSOD1 WTを過剰発現するトランスジェニックラットから免疫沈降し、消化し、かつ解析した。組織特異的な違いが脳と肝臓の間に存在することは、データから明らかである。具体的には、脳は、肝臓の60%の速度でSOD1を合成する。FSRおよびFCRが本質的に連結し、タンパク質の定常状態レベルを維持するので、脳および肝臓におけるSOD1 WTの半減期は、それぞれ29.3および17.4日と推定することができる。脳に関する長い半減期は、トランスジェニックマウスの脊髄におけるSOD1−YFP半減期を見た事前の研究と一致している。
ヒトSOD1 G93Aを過剰発現するトランスジェニックラットに、新規の食事にラットを順応させるために、13C−ロイシンでの標識の前に、2週間、ロイシンのない餌を与えた。この馴化期間中、通常の12C−ロイシン(100mg/日)が、スクロースでわずかに甘くした飲料水に提供された。馴化期間の後、飲料水を13C−ロイシン(100mg/日)と交換し、動物を標識した。7日間の標識期間後、通常の12C−ロイシンで動物を追跡し、その後、動物を標識後3日および10日に屠殺し、PBS/ヘパリンで灌流し、かつ脳、脊髄、肝臓および腎臓を採取し、液体窒素中で瞬間冷凍し、−80℃で保存した。
CSF試料が、安定同位体で標識されたアミノ酸(13C6−ロイシン)の投与後の健康なボランティアから以前得られた。簡潔には、参加者は2回のIVと配置された一つの腰椎カテーテルを有した。1回のIVでは、13C6−標識ロイシンが9または12時間注入された。毎時間、血漿およびCSFが、それぞれ、他方のIVおよび腰椎カテーテルを通して得られた。試料は、36時間、1時間の時間間隔で採取された。さらなる詳細は、出典明示により本明細書に組み込まれる、Batemen et. al. Nat. Med. 2006に見出される。
Claims (9)
- 対象におけるSOD1のin vivo代謝を測定するためのin vitroの方法であって、SOD1が中枢神経系において合成され、該方法が:
対象由来の脳脊髄液(CSF)試料中の標識SOD1の量および非標識SOD1の量を質量分析法により検出すること、および非標識SOD1に対する標識SOD1の比率を計算することを含み、
ここで、該CSF試料は、非放射性同位体で標識されたアミノ酸(標識されたアミノ酸)で標識されたSOD1画分および標識されたアミノ酸で標識されていないSOD1画分を含み、かつ該CSF試料は、(i)対象への標識されたアミノ酸の投与開始後20日から35日の間に、あるいは(ii)対象への標識されたアミノ酸の投与開始後2、3、4、または5週間、週一回、得られるものであり;
該標識されたアミノ酸は血液脳関門を通過し、かつSOD1が対象の中枢神経系で合成されるので、SOD1内に取り込むことができるものであり;かつ
非標識SOD1に対する標識SOD1の比率は、対象におけるSOD1の代謝に直接比例するものである、
方法。 - 非放射性同位体が、2H、13C、15N、17O、18O、33S、34S、および36Sからなる群から選択される、請求項1に記載の方法。
- 生体試料から標識SOD1画分および非標識SOD1画分を分離することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 標識SOD1画分および非標識SOD1画分が免疫沈降により分離される、請求項3に記載の方法。
- 対象が齧歯類である、請求項1に記載の方法。
- 対象がヒトである、請求項1に記載の方法。
- 試料が、対象への標識されたアミノ酸の投与開始後20日から35日の間に得られる、請求項1に記載の方法。
- 試料が、対象への標識されたアミノ酸の投与開始後2、3、4、または5週間、週一回得られる、請求項1に記載の方法。
- 試料が、対象への標識されたアミノ酸の投与開始後3、4、または5週間、週一回得られる、請求項1に記載の方法。
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