JP5921430B2 - 哺乳類細胞の心臓発生能を決定する方法 - Google Patents

哺乳類細胞の心臓発生能を決定する方法 Download PDF

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Description

(関連出願の相互参照)
本出願は、2009年5月20日出願の国際出願番号PCT/US2009/044751について優先権の利益を主張する。先の出願の開示は、本出願の開示の一部とみなされる(また、本出願の開示に参考として援用される)。
本発明は、哺乳類細胞の注射による心疾患の治療に関する。特に、哺乳類細胞の心臓発生能を定量的に評価する方法に関し、これにより、修復を必要とする心臓の修復の成功についての予測可能性を良好にする。また、この心臓発生能の組み換え、及び細胞分化を目的とする処置の心臓発生能を定量的に評価する方法、並びに、処理装置、及び処理装置と結合した1つ又は複数の非神経系プログラムをコード化するメモリーを含むコンピュータ装置に関し、ここで、該プログラムは、処理装置に方法を使用させ、該方法は、CARPIを計算する工程を含む。
患者管理の進歩にも拘らず、心疾患は、世界中で死亡及び罹患の主要原因となっている。高い修復能を有する組織とは対照的に、心臓組織は、非修復性の損傷に対して脆弱である。心疾患に対処するため、細胞ベースの心血管再生医学が今日、臨床現場において求められている。
近年の幹細胞生物学の発展により、現在の実施形式の範囲が、従来の寛解から治療的な修復にまで広がっている。一般的に、臨床上は、幹細胞を不変状態で送達することを基礎としてきた。第一世代の生物製剤は、未処理のヒト幹細胞であり、容易に用いることができる細胞型とされた。数名の個体について、未処理のヒト幹細胞の送達時に、改善を生ずることが示されてきた。ヒトの心臓への未処理細胞の移植の分野における最新技術は、とりわけ、Abdel-Latif A. et al.による概説'Adult bone marrow-derived cells for cardiac repair: a systematic review and meta-analysis.' Arch Intern Med. (2007) 167:989-997.、及びその引用文献中に示された。
臨床的成果を高めるため、患者に注射する前に未処理のヒト幹細胞を心筋系列に誘導する、第二世代の幹細胞治療が開発された。Behfar et al.による総説'Guided stem cell cardiopoietic: Discovery and translation' J. Mol. and Cell. Cardiology (2008) 45: 523-529.において、心臓形成細胞などの心臓前駆細胞を、心臓再生に用いる考えが議論された。
心臓形成細胞は、特有の表現型を有し、Nkx2.5及びMEF2Cポリペプチドが核移行すること、及び検出可能なサルコメアタンパク質が存在しないことを特徴とする。この心臓形成の状態は、中間の細胞表現型、すなわち、心筋系列になりかけているが、まだ完全には分化していない表現型に相当する。サルコメアタンパク質が検出できないレベルであることが、心臓形成細胞の特有の特徴であり、該特徴により、この細胞と、幹細胞に由来し、且つ、Chunhui Xu(米国特許出願公開第2005/0164382号明細書及びLough et al (米国特許出願公開第2002/0061837号明細書)などの他の出願に記載された、収縮性でありサルコメア含有である心筋様細胞とが区別される。
米国特許出願公開第2005/0164382号明細書 米国特許出願公開第2002/0061837号明細書
転写因子に占めるタンパク質量の増加は、細胞質又は核のいずれかにおけるその細胞内局在を示すものではないといえる。Nkx2.5及びMEF2Cポリペプチドの核移行は、心筋系列への関係づけの決定に必要である。このことは、Behfar A. et alらにより説明されている(Derivation of a cardiopoietic population from human mesenchymal stem cells yields cardiac progeny, Nature Clinical Practice, 2006, 3: S78-S82)。核移行は、免疫細胞化学又は免疫組織化学により定量的に観察することができるものの、総タンパク質量を観察するウェスタンブロッティング又は蛍光標識細胞分取(FACS)などの技術は、ポリぺプチドの細胞内分布を定量的に評価するのに適していない。ポリペプチドの細胞内分布の観察は、米国特許出願公開第2008/0019944号明細書に記載されるように、定性的であるだけでなく、産業上の視点から時間がかかり、実施者の技術に依存する。従って、臨床成績、すなわち、これら「第一世代」の未処理の幹細胞及び「第二世代」の誘導された幹細胞の心臓発生能は、注射前に予測することは容易ではなかった。
哺乳類細胞の心臓発生能を定量的に評価する方法は、提案段階に留まっていた。
本発明は、哺乳類細胞の心臓発生能を決定する、かかる予測方法をここに提供し、該方法は、その細胞の遺伝子の発現量を定量する関数としての心臓発生能指数(CARPI)を定量的に評価する工程を含む。本発明は、哺乳類細胞の心臓発生能の組み換え、及び細胞分化を目的とする処置の心臓発生能の定量的評価も行う。
本願明細書中では、特に断らない限り、以下の括弧で示される用語は、下記のように定義する。
細胞の「心臓発生能」とは、その細胞が、心臓細胞、例えば心筋細胞の発生を達成する能力をいう。
「心臓形成細胞」とは、中間の細胞表現型、すなわち、心筋系列になりかけているが、まだ完全には分化していない表現型に相当する。心臓形成細胞は、Nkx2.5及びMEF2Cの核移行と、サルコメアタンパク質が検出できないレベルであることと、を特徴とする(Behfar et al. 'Derivation of a cardiopoietic population from human mesenchymal stem yields progeny', Nature Clin. Pract., Cardiovasc. Med. (2006) 3: S78-S82)。心臓形成細胞は、増殖能を保持する。心臓形成細胞は、例えば、ヒト間葉系幹細胞(Terzic et al. 米国特許出願公開第2008/0019944号明細書)、マウス胚性幹細胞(Behfar et al, 'Cardiopoietic programming of embryonic stem cells for tumour-free heart repair' J Exp Med 2007 204: 405-420)、胚様幹細胞、人工多能性幹細胞、臍帯血細胞、心臓幹細胞等を含む幹細胞、又は(それらの生産がヒト胚の破壊とならない限り)あらゆる他の適した細胞源由来のものを使用できる。
「カクテル」又は「心臓発生性カクテル」とは、少なくとも2つの心臓発生性物質を含有する組成物をいう。
「心臓発生性処置」とは、細胞の心臓発生能を向上させる処置をいう。かかる処置の例としては、上記細胞をカクテルに接触させるが挙げられる。かかるカクテルの例としては、成長因子、サイトカイン、ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも2つの物質が挙げられる。上記少なくとも2つの物質は、BMP-1、BMP-2、BMP-5、BMP-6等の骨形成タンパク質(BMP);上皮増殖因子(EGF);エリスロポエチン(EPO);FGF-1、FGF-4、FGF-5、FGF-12、FGF-13、FGF-15、FGF-20等の線維芽細胞増殖因子(FGF);顆粒球コロニー刺激因子(G-CSF);顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF);増殖分化因子9(GDF-9);肝細胞増殖因子(HGF);IGF-2等のインスリン様成長因子(IGF);ミオスタチン(GDF-8);NT-3, NT-4, NT-1及び神経成長因子(NGF)等のニューロトロフィン;PDGF-β、PDGF-AA、PDGF-BB等の血小板由来増殖因子(PDGF);トロンボポエチン(TPO);トランスフォーミング増殖因子α(TGF-α);TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3等のトランスフォーミング増殖因子β(TGF-β);VEGF-A、VEGF-C等の血管内皮増殖因子(VEGF);TNF α;白血病抑制因子(LIF);インターロイキン6(IL-6);レチノイン酸;ストロマ細胞由来因子1(CSDF-1);脳由来神経栄養因子(BDNF);ペリオスチン;アンジオテンシンII;Flt3リガンド;グリア細胞由来神経栄養因子;ヘパリン;インスリン様増殖因子結合タンパク質3;インスリン様増殖因子結合タンパク質5;インターロイキン3;インターロイキン8;ミッドカイン;プロゲステロン;プトレシン;幹細胞因子;Wnt1;Wnt3a;Wnt5a;カスパーゼ4;ケモカインリガンド1;ケモカインリガンド2;ケモカインリガンド5;ケモカインリガンド7;ケモカインリガンド11;ケモカインリガンド20;ハプトグロビン;レクチン;コレステロール−25−ヒドロキシラーゼ;シンタキシン−8;シンタキシン−11;セルロプラスミン;補体第一成分;補体第三成分;インテグリンα6;リゾリーマル酸リパーゼ1;β−2ミクログロブリン;ユビキチン;マクロファージ遊走阻止因子;コフィリン;シクロフィリンA;FKBP12;NDPK;プロフィリン1;シスタチンC;カルサイクリン;スタニオカルシン-1;PGE-2;mpCCL2;IDO;iNOS;HLA-G5;M-CSF;アンジオポエチン;PIGF;MCP-1;細胞外マトリックス分子;CCL2 (MCP-1);CCL3 (MIP-1α ); CCL4 (MIP-1 β); CCL5(ランテス);CCL7 (MCP-3); CCL20 (MIP-3α ); CCL26(エオタキシン-3);CX3CL1(フラクタルカイン);CXCL5 (ENA-78); CXCL11 (i-TAC); CXCL1 (GROα); CXCL2 (GROβ); CXCL8 (IL-8); CCL10 (IP-10);及びそれらの組み合わせからなる群から選択することができる。
「カクテル誘導細胞」又は「心臓分化に誘導された細胞」とは、カクテルに接触させた細胞をいう。
「分化」とは、特殊化していない細胞がより特殊化した細胞になる工程をいう。
「駆出率」とは、心拍の間に排出される血液の画分を意味する。特に限定がない場合、駆出率という用語は、特に左心室のそれ(左心室駆出率又はLVEF)をいうものとする。
本願明細書に用いられる、単数形「a」、「an」及び「the」は、特に断りのない限り、複数の態様も含む。従って、例えば、「a stem cell」という場合、1つの細胞も、2つ以上の細胞も含み;「an agent」又は「a reagent」という場合、1つの成分又は薬剤も、2つ以上の成分又は薬剤も含み;「the invention」又は「an invention」という場合、1つ又は複数の本発明の態様を含む。
断りのない限り、本願明細書で用いられるあらゆる技術的及び科学的用語は、本発明の属する分野における当業者に共通して理解されるものと同じ意味を有するものとする。本願明細書に記載される方法及び材料に類似するもの又は相当するものは、本発明を実施するために使用可能であるが、適切な方法及び材料については以下に記載する通りである。本願明細書で言及されるあらゆる文献、特許出願、特許、及び他の文献は、参照して取り込まれる。本願明細書の記載は、定義を含めて、矛盾が生じないように調整し得る。加えて、材料、方法、及び実施例は、例示に過ぎず、限定することを目的としない。
本発明は、哺乳類細胞の心臓発生能、又は処置の心臓発生能を決定する方法を提供し、該方法は、その細胞の遺伝子の発現量を定量する関数としての心臓発生能指数(CARPI)を定量的に評価する工程を含む。
好適には、CARPIは、上記細胞の特定の遺伝子のメッセンジャーRNA(mRNA)レベルを定量する関数である。
好適には、少なくとも一つの遺伝子は、Nkx2.5、Tbx5、MEF2C、GATA4、GATA6、Mesp1、FOG1、FOG2、Flk1、これらの哺乳類における相同体、及びこれらの遺伝子の組み合わせからなる群から選択される。細胞は、心臓前駆細胞であってもよい。それらは、体細胞、生殖、臍帯血、心臓前駆、胚、及び/又は遺伝子組み換えされた細胞とすることもできる。
細胞は、一人の個体から採取してもよく、その細胞を心臓発生性処置に供する前後の細胞について、CAPRIを評価してもよい。
別の実施形態では、個体又は個体群の細胞を、別の個体又は個体群と比較して、そのCAPRIを評価する。
特に好適な方法では、CARPIは、mRNAレベルでの遺伝子の発現量を変数として定量する、多変数数式の値である。
前記値、好適には、多項式関数、超越関数、及びこれらの組み合わせからなる群から選択される。
本発明が提供する方法の特定の実施形態では、処置の心臓発生能を定量的に評価するために、CARPIを測定する。
本発明が提供する方法の一つの実施形態によれば、CARPIを心機能のパラメータと関係づけることができる。
本発明は、処理装置、及び処理装置と結合した1つ又は複数のプログラムをコード化するメモリーを含むコンピュータ装置にも関するものであり、ここで、該1つ又は複数のプログラムは、処理装置に方法を実行させ、該方法は、CARPIの計算を包含する。
未処理のヒトMSC(hMSC)及びカクテルで誘導したhMSC(CP−hMSC)の両方について、遺伝子の発現量のmRNAレベルでの定量に基づいて計算したCARPIを、任意単位(AU)でY軸に示し、マウスの梗塞心臓における注射前後のLVEFの変化(ΔEF)を、パーセントでX軸に示した図である。黒色記号は、個々のデータを表し:中抜きの記号は平均のデータ(Avg)を表す。
(実施例1)
骨髄の試料を、虚血性心疾患のために冠動脈バイパス術を受けている患者から収集した。管轄の倫理審査委員会により承認された方法により、患者からインフォームドコンセントを得た。
生の骨髄をプラスチック皿に播種し、12時間後に1回洗浄し、CD34/CD45/CD133マーカーパネルを用いた蛍光標識細胞分取(FACS)での分析により確認しながら接着細胞を選択することによって、間葉系幹細胞を得た。細胞を、5%ヒト血小板溶解液添加DMEM(メイヨークリニック血液バンク、ミネソタ州ロチェスター)中、37℃で、更に培養し、増殖させた。
心臓形成細胞群へと誘導するために、未処理のヒト骨髄由来の骨髄細胞を、TGFβ-1 (2.5 ng/ml)、BMP4 (5 ng/ml)、FGF2 (5 ng/ml)、IGF-1 (50 ng/ml)、アクチビン−A(10 ng/ml)、カルジオトロフィン(1 ng/ml)、α−トロンビン(1 U/ml)、及びカルジオゲノールC (100 nM)からなる心臓発生性カクテルを添加した、血小板溶解液又は血清のいずれかの中で培養した。
本発明は、2以上の遺伝子の発現量をRNAレベルで定量することによって、上記心臓形成細胞群の心臓発生能の定量的評価を可能にする。本発明は、定量的観察の問題、すなわち、転写因子ポリペプチドの細胞内局在の観察に特有の、時間及び実施者の技術への依存の問題を解決する。方法の選択肢の一つとしては、リアルタイム定量逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(qPCR)である。この方法は、オペレーター非依存的であり、参照標準と比較して定量化した結果を、迅速に(1日以内に)提供する。加えて、免疫染色した試料は、一回ごとの蛍光顕微鏡検査による評価を必要とするところ、96穴プレートを用いたqPCRにより、最大48の異なった試料(又は条件)について二重試験を行うことができる。
qPCR用の適切なマーカーを決めるために、心臓形成細胞からmRNAを抽出し、免疫蛍光染色により評価した。
参照標準は、心臓発生性カクテル非存在下で培養した同じバッチに由来する細胞とした。
心臓の転写活性において代表的な、表1に挙げる遺伝子について評価した。
アプライトバイオシステムズ7,900HT配列検出システム(アプライトバイオシステムズ、フォスターシティ、カリフォルニア)と用いて、TaqManPCRキットでqPCRを行った。TaqMan遺伝子発現反応物を、96穴プレートでインキュベートし、三重試験を行った。閾値のサイクル(C)を、蛍光が一定の閾値を越えたときのサイクル数として定義した。TaqManのC値は、2−ΔΔC 法を用いて決定した相対変化倍数に変換し、ハウスキーピング遺伝子の発現、すなわちGAPDH(P/N 435,2662−0506003)に対して標準化した。
処置した細胞についての結果を、対応する参照標準について得られた結果に対して標準化した。
CARPI、すなわち上記細胞の2以上の遺伝子の発現量を定量する関数を、スプレッドシート計算(マイクロソフトExcel 2007(登録商標)、マイクロソフト社)を用いて、Nkx2.5、Tbx-5、MEF2C、GATA-4、GATA-6、MESP-1及びFOG-1のRNAレベルにおける発現量の線形平均として計算した。下記式を用いた:
ここで、「i」は選択した遺伝子を表し、「n」は選択した遺伝子の全ての番号を、最小値を2として表す。特に本実施例では、n=7である。
hMSC由来の心臓形成細胞の心臓発生能を、免疫不全性のヌードマウス(ハーラン、インディアナ州インディアナポリス)で評価した。プロトコルは、管轄の動物実験委員会から承認を得たものである。
心筋梗塞を生じさせた。盲検法に沿って、心筋梗塞の1月後、12.5μlの血小板溶解液無添加の生育培地に懸濁させた、全部で600,000個の生存する未処理のhMSC、又は全部で600,000個の生存するhMSC由来の心臓形成細胞を、顕微鏡で観察しながら、左心室前壁上の心外膜の5箇所の部位に注射した(注射部位当たり2.5μl)。
左心室の機能及び構造を、経胸壁心エコー(Sequoia 512;シーメンス、マルバーン、ピーエー アンド ヴィジュアルソニック インク、トロント、カナダ)により連続的に観察した。左心室駆出率(LVEF、%)を、[(LVVd−LVVs)/LVVd]×100として計算した。ここで、LVVdは、左心室拡張末期容量(μl)であり、LVVsは、左心室収縮末期容量(μl)である。
LVEFの変化(ΔEF)を、細胞注射の1月後に測定したLVEFと、細胞注射前に測定したLVEFとの差として計算した。
図1は、各細胞培養物についてのCARPIを、その各細胞培養物を注射したマウスについての対応するΔEFに対して、プロットしたグラフである。未処理のhMSC(小さな黒色のダイアモンドで示す)は、細胞注射の1月後に心筋の機能が実質的に向上せず(負のΔEF)、概して低いCARPIを示した。生来の再生能を有し、生来の高いCARPI値を有する未処理のhMSCsのバッチがほとんどないことは、注意に値する。未処理のhMSCsの全てのバッチについての平均を、大きな白色の三角で示す。hMSC由来の心臓形成細胞(小さな黒色の四角)は、心筋の機能が堅調に増大し(正のΔEF)、概して高いCARPIを示した。hMSC由来の心臓形成細胞の全てのバッチの平均を、大きな白色の四角で示す。平均は、対応する95%信頼区間と共に表示する。
このように、発明者らは、梗塞心臓において、注射される細胞のCARPIの高さと、注射後の駆出率変化との間に、正の相関関係があることを示した。このように、CARPIは、心臓発生能の予測指数である。
(実施例2)
組換え型のTGFβ-1(2.5 ng/ml)、BMP-4 (5 ng/ml)、アクチビン−A(5 ng/ml)、FGF-2 (10 ng/ml)、α-トロンビン(1 U/ml)、IGF-1 (50 ng/ml)、カルジオトロフィン(1 ng/ml)、及びカルジオゲノールC(100 nM)を組み合わせて用い、これらを含有するカクテルで処理することによって、同様の結果が得られた。
(実施例3)
組換え型のTGFβ-1(2.5 ng/ml)、BMP-4 (5 ng/ml)、アクチビン−A(5 ng/ml)、FGF-2 (10 ng/ml)、α-トロンビン (1 U/ml)、IGF-1 (50 ng/ml)、インターロイキン−6(100ng/ml)及びレチノイン酸(1μM)を組み合わせて用い、これらを含有するカクテルで処理することによって、同様の結果が得られた。
(他の実施形態)
本発明は、その詳細な説明について記載されるが、上記説明は例示を目的としたものであり、添付の請求項の範囲により定められる本発明の範囲を限定するものではない。他の態様、効果、及び変更も、下記の請求項の範囲に含まれる。

Claims (13)

  1. 哺乳類細胞の心臓発生能を決定する方法であって、
    a)前記細胞における、遺伝子の定量された発現量を収集する、ここで前記遺伝子は、Nkx2.5、Tbx5、MEF2C、GATA4、GATA6、Mesp1、及びFOG1(各遺伝子はその相同体であってもよい)である、工程と、
    b)心臓発生能指数(CARPI)を決定する、ここで、心臓発生能指数(CARPI)は、前記細胞の前記遺伝子の定量された発現量の平均として計算される、工程と、
    を含み、
    前記遺伝子の発現量が、メッセンジャーRNA(mRNAs)、機能性RNA、又はこれらの組み合わせのRNA発現量で定量される
    、方法。
  2. 前記機能性RNAが、マイクロRNAsである、請求項1に記載の方法。
  3. 前記細胞は、体細胞、生殖細胞、臍帯血細胞、心臓前駆細胞、胚性細胞、及びこれらのあらゆる組み合わせからなる群から選択される、請求項1又は2に記載の方法。
  4. 前記細胞は、遺伝子組み換えされている、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
  5. 前記細胞は、検出可能なサルコメアタンパク質を有しない、請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
  6. 前記CARPIは、心臓発生性処置の前後の前記細胞について評価される、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
  7. 前記心臓発生性処置は、前記細胞を、細胞の心臓発生能を向上させることができる少なくとも2つの心臓発生性物質を含む組成物に接触させる工程を含む、請求項6に記載の方法。
  8. 前記細胞は、一種類の哺乳類に由来する、請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。
  9. 前記細胞は、哺乳類又は哺乳類群に由来し、該CARPIは、定量され、別の哺乳類又は哺乳類群由来の細胞のCARPIと比較される、請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。
  10. 前記CARPIは、下記式:

    (式中、iは選択した遺伝子を表し、nは選択した遺伝子の全ての番号を表す)
    を用いて、前記2つ以上の遺伝子の発現量の線形平均として計算される、請求項1〜9のいずれか一項に記載の方法。
  11. 前記CARPIは、処置の心臓発生能を定量的に評価するために測定される、請求項1〜10のいずれか一項に記載の方法。
  12. 前記CARPIは、心機能のパラメータと相関を有し、前記心機能のパラメータが心臓の駆出率である、請求項1〜11のいずれか一項に記載の方法。
  13. 処理装置と、該処理装置と組み合されて1つ又は複数の非神経性のネットワークプログラムをコード化するメモリーとを備えるコンピュータ装置であって、
    該プログラムは、
    a)哺乳類細胞における、遺伝子の定量された発現量を収集する、ここで前記遺伝子は、Nkx2.5、Tbx5、MEF2C、GATA4、GATA6、Mesp1、及びFOG1(各遺伝子はその相同体であってもよい)である、工程と、
    b)心臓発生能指数(CARPI)を決定する、ここで、心臓発生能指数(CARPI)は、前記細胞の前記遺伝子の定量された発現量の平均として計算される、工程と、
    c)前記CARPIを表示する工程と、
    を含み、
    前記遺伝子の発現量が、メッセンジャーRNA(mRNAs)、機能性RNA、又はこれらの組み合わせのRNA発現量で定量される、
    方法を前記処理装置に実行させる、コンピュータ装置。
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