JP5902478B2 - BLyS / APRIL heterotrimer levels in serum and use in diagnostic methods - Google Patents

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Description

免疫応答間に生じる細胞間相互作用は、腫瘍壊死因子受容体(TNFR)ファミリーを含む幾つかの細胞表面受容体ファミリーのメンバーによって調節される。TNFRファミリーは多数の膜内在性糖タンパク質受容体から構成され、そのうちの多くはそれぞれのリガンドと協同して異なる造血細胞系統間の相互作用を調節する(Smith 等, The TNF Receptor Superfamily of Cellular and Viral Proteins : Activation, Costimulation and Death, 76 : 959-62, 1994 ; Cosman, Stem Cells 12 : 440-55, 1994)。このファミリーのうちの3つの受容体メンバーは、(1)BCMA、すなわちB細胞成熟抗原(Gras 等, Int. Immunol. 17 : 1093-106, 1995 および Hatzoglou 等, J. Immunol., 165 : 1322-30, 2000)、(2)TACI、すなわち膜貫通活性化因子およびCAML相互作用因子(von Bulow and Bram, Science 228 : 138-41, 1997 および WIPO 公開公報 WO 98/39361)および(3)BLyS/BLyS受容体3(BP3)としても知られているBAFF−R(Thompson 等, Science, 293 : 2108-11, 2001)である。これらの受容体は、TNFリガンド−Bリンパ球刺激因子(BLyS、TALL−1、ztnf4およびTHANKとしても知られているBLyS)(例えば、Shu 等, J. Leukoc. Biol. 65 : 680-683 (1999) 参照)および増殖誘導リガンド(APRIL)(例えば、Hahne 等, J. Exp. Med. 188 : 1185-1190 (1998))の一方または両方に結合することが知られている。具体的には、TACIおよびBCMAはBLySおよびAPRILの両方に結合し、BAFF−RはBLySのみに結合することが知られている。 The cell-cell interactions that occur during the immune response are regulated by several cell surface receptor family members, including the tumor necrosis factor receptor (TNFR) family. The TNFR family consists of a number of integral membrane glycoprotein receptors, many of which cooperate with their respective ligands to regulate interactions between different hematopoietic cell lines (Smith et al., The TNF Receptor Superfamily of Cellular and Viral Proteins : Activation, Costimulation and Death , 76 : 959-62, 1994; Cosman, Stem Cells 12 : 440-55, 1994). Three receptor members of this family are (1) BCMA, a B cell maturation antigen (Gras et al . , Int. Immunol . 17 : 1093-106, 1995 and Hatzoglou et al . , J. Immunol. , 165 : 1322- 30, 2000), (2) TACI, ie transmembrane activator and CAML interacting factor (von Bulow and Bram, Science 228 : 138-41, 1997 and WIPO publication WO 98/39361) and (3) BLyS / BAFF-R (Thompson et al., Science , 293 : 2108-11, 2001), also known as BLyS receptor 3 (BP3). These receptors are TNF ligand-B lymphocyte stimulating factor (BLyS, also known as BLyS, TALL-1, ztnf4 and THANK) (eg Shu et al. , J. Leukoc. Biol. 65 : 680-683 ( 1999)) and growth-inducing ligands (APRIL) (eg Hahne et al . , J. Exp. Med. 188 : 1185-1190 (1998)) are known to bind. Specifically, TACI and BCMA are known to bind to both BLyS and APRIL, and BAFF-R binds to BLyS only.

多数のBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストが、上記ファミリーの受容体メンバーに対するリガンドの結合を遮断し、その結合の効果、例えば、特に限定されるわけではないが、B細胞共刺激、形質芽球および形質細胞の生存、Igクラススイッチ、B細胞抗原提示細胞の機能亢進、悪性B細胞の生存、B−1細胞の機能発達、T−1段階以降のB細胞成長、並びに完全な胚中心形成を阻止するために開発されてきた。これらの分子のうちの幾つかは、APRILに結合し、B細胞およびその他の免疫系の要素に対するAPRILの影響を阻止することもできる(Dillon 等. (2006) Nat. Rev. Drug Dis. 5, 235-246)。BLySおよび/またはAPRILの結合を妨害することによってB細胞の機能に作用する、これまで開発されてきた分子としては、例えば、リンフォスタット(Lymphostat)−B(ベリムマブ(Belimumab))等のBLyS抗体(Baker 等, (2003) Arthritis Rheum, 48, 3253-3265 および WO 02/02641);TACI−Ig等の受容体細胞外ドメイン/Fcドメイン融合タンパク質、例えば、その特定の実施形態であるアタシセプト(atacicept)(米国特許出願第20060034852号)、BAFF−R−Fc(WO 05/0000351)およびBCMA−Ig、または受容体細胞外ドメインを利用したその他の融合タンパク質が挙げられる。別の種類のBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストとしては、BLyS結合能によってBLySの受容体への結合をブロックするその他の分子、例えば、AMG623、受容体抗体、並びにWO 03/035846 および WO 02/16312に開示されたその他の分子が挙げられる。   A number of BLyS and / or APRIL antagonists block the binding of ligands to the above-mentioned family of receptor members and the effects of that binding, such as but not limited to B cell costimulation, plasmablasts and traits Prevents cell survival, Ig class switch, hyperfunction of B cell antigen presenting cells, malignant B cell survival, B-1 cell functional development, B cell growth after T-1 stage, and complete germinal center formation Has been developed for. Some of these molecules can also bind to APRIL and block the effects of APRIL on B cells and other immune system components (Dillon et al. (2006) Nat. Rev. Drug Dis. 5, 235-246). Molecules that have been developed to affect B cell function by interfering with the binding of BLyS and / or APRIL include, for example, BLyS antibodies such as Lymphostat-B (Belimumab) (Baker et al., (2003) Arthritis Rheum, 48, 3253-3265 and WO 02/02641); Receptor extracellular domain / Fc domain fusion proteins such as TACI-Ig, eg, atacicept, a specific embodiment thereof. ) (US Patent Application No. 20060034852), BAFF-R-Fc (WO 05/0000351) and BCMA-Ig, or other fusion proteins utilizing the receptor extracellular domain. Other types of BLyS and / or APRIL antagonists include other molecules that block BLyS binding to the receptor through their ability to bind BLyS, such as AMG623, receptor antibodies, and WO 03/035846 and WO 02/16312 Other molecules disclosed are included.

このリガンド/受容体ファミリーに関する研究中の側面は、これらのリガンドはin vivoにおいてホモ三量体(TNFファミリーリガンドであると予想される)としてだけでなく、化学量論的に未同定のBLyS/APRILヘテロ三量体(HT)としても存在するようであるという事実である。極めて小さな異種サンプルセット(すなわち、異なる6種類の自己免疫疾患と診断された15人の患者)を用いたところ、健常対照と比較して血清中のHTが上昇していたことが、Roschke 等(J. Immunol. 169:4314-4321, 2002)によって報告された。しかしながら、これまで、上昇したHTの存在が任意の特定の自己免疫疾患と関連付けられることはなかったし、上記知見を具体的な疾患の治療方法に適用するために必要な分析が行われることもなく、上記知見が逸話的(anecdotally)なものを超えて、すなわち統計的有意性をもって示されることもなかった。   The aspect under study on this ligand / receptor family is that these ligands are not only in vivo as homotrimers (expected to be TNF family ligands) but also stoichiometrically unidentified BLyS / The fact is that it also appears to exist as an APRIL heterotrimer (HT). The use of a very small heterogeneous sample set (ie, 15 patients diagnosed with 6 different autoimmune diseases) showed an increase in serum HT compared to healthy controls, Roschke et al. ( J. Immunol. 169: 4314-4321, 2002). However, so far, the presence of elevated HT has not been associated with any particular autoimmune disease, and analysis necessary to apply the above findings to specific disease treatment methods may be performed. None of the above findings were more than anecdotally, i.e. with statistical significance.

したがって、HTの生物活性に関する研究、および天然HTレベルを自己免疫患者のホモ三量体BLySおよびAPRILレベルと比較するアッセイの発展に関する技術的必要性は依然として残っている。さらに、このアッセイは、HTの発現パターンの同定を可能とし、これによって全身性エリテマトーデス(SLE)等の自己免疫疾患との統計的関連性を同定することが可能となる。そのような情報は、自己免疫疾患を発症する傾向にある個体や病状が進行している個体を同定するために重要であるとともに、自己免疫疾患のBLySおよび/またはAPRILアンタゴニスト処置に対して好ましい応答を示す個体を同定するために重要である。本発明は、自己免疫疾患と関連するHTレベルを提供することによって、並びに、その発現パターンの存在、すなわち、SLE等の自己免疫疾患に罹患した個体における、健常対照で観察されるレベルと比較して増大した血清中HTレベルを決定する診断検査を提供することによって、上記必要性を解決する。   Thus, there remains a need in the art for studies on HT biological activity and for the development of assays that compare native HT levels with homotrimeric BLyS and APRIL levels in autoimmune patients. In addition, this assay allows the identification of the expression pattern of HT, thereby identifying a statistical association with autoimmune diseases such as systemic lupus erythematosus (SLE). Such information is important for identifying individuals who are prone to develop autoimmune diseases or those whose disease states are progressing, and favorable responses to BLyS and / or APRIL antagonist treatment of autoimmune diseases. It is important to identify individuals who show The present invention provides HT levels associated with autoimmune diseases as well as the presence of its expression pattern, i.e. compared to levels observed in healthy controls in individuals suffering from autoimmune diseases such as SLE. This need is solved by providing a diagnostic test to determine increased serum HT levels.

本発明は、血清およびその他の生体サンプル中のHTレベルをスクリーニングする方法を提供する。上昇したHTレベルはRA等の自己免疫疾患と有意に関連することが示されたので、この測定は診断アッセイとして有用である。そのような診断アッセイは、個体が自己免疫活性と関連する疾患、例えばSLE、に罹患している可能性を予測するのに有用である。本発明はさらに、SLE等の自己免疫疾患に罹患した個体に対する適切な処置を決定する方法を提供する。 The present invention provides a method of screening for HT levels in serum and other biological samples. This measurement is useful as a diagnostic assay because elevated HT levels have been shown to be significantly associated with autoimmune diseases such as RA. Such diagnostic assays, the individual is useful for predicting diseases such SLE, the possibility of suffering from associated with an autoimmune activity. The present invention further provides a method for determining an appropriate treatment for an individual suffering from an autoimmune disease such as SLE.

SLE等の自己免疫活性を示す患者の血清中の高いHTレベルを検出することによって、その疾患の処置に効果的である可能性が高い処置計画を選択することが可能となる。これらの処置計画は、一般的に、単独での、あるいは、別の薬剤、例えば免疫抑制薬(MMFまたはセルセプト(Cellcept)(登録商標)等)またはCD20アンタゴニスト(リツキサン(Rituxan)(登録商標)等)と組み合わせたBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストの使用を含む。   By detecting high HT levels in the serum of patients exhibiting autoimmune activity, such as SLE, it is possible to select a treatment plan that is likely to be effective in treating the disease. These treatment regimens generally include either a single agent or another agent, such as an immunosuppressant (such as MMF or Cellcept®) or a CD20 antagonist (such as Rituxan®) ) In combination with BLyS and / or APRIL antagonists.

本発明はさらに、自己免疫疾患であると新たに臨床的に診断された個体を処置する方法を提供し、この方法は、一般的には、健常対照の血清で観察されるレベルと比較して高い血清中HTレベルを検出すること、および、自己免疫疾患であると臨床的に診断された個体に最も効果的な処置計画を選択することを含む。高い血清中HTレベルの検出は、患者が具体的な薬物処置、特にBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストに対して応答する可能性を予測することも可能とする。本発明はさらに、SLE等の自己免疫疾患の処置の間に患者がBLySおよび/またはAPRILアンタゴニスト(単独、またはその他の薬物と組み合わせたもの)に対して応答する可能性を予測する方法を提供する。   The present invention further provides a method of treating an individual who has been newly clinically diagnosed with an autoimmune disease, generally compared to levels observed in healthy control sera. Detecting high serum HT levels and selecting the most effective treatment regimen for individuals clinically diagnosed with an autoimmune disease. The detection of high serum HT levels also makes it possible to predict the likelihood that a patient will respond to specific drug treatments, particularly BLyS and / or APRIL antagonists. The present invention further provides a method for predicting the likelihood that a patient will respond to BLyS and / or APRIL antagonists (alone or in combination with other drugs) during the treatment of autoimmune diseases such as SLE. .

具体的には、本発明は、個体の血清中の増大したHTレベルを検出する方法であって、生体サンプル中の第一のHTタンパク質レベルを測定すること、第一のレベルを健常個体の生体サンプル中の第二のHTタンパク質レベルと比較すること、および、第一のレベルが第二のレベルと比較して増大しているか否かを決定することを含み、上記増大したHTタンパク質レベルが自己免疫疾患と関連している方法である。本発明において、自己免疫疾患は、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、全身性エリテマトーデス(SLE)、ループス腎炎(LN)、ウェゲナー(Wegener)病、炎症性大腸炎、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、自己免疫性血小板減少症、多発性硬化症、乾癬、IgA腎症、IgM多発性神経障害、重症筋無力症、血管炎、糖尿病、レイノー症候群、シェーグレン症候群および糸球体腎炎からなる群より選択され得る。特に、自己免疫疾患はSLEである。   Specifically, the present invention is a method for detecting an increased HT level in the serum of an individual, comprising measuring a first HT protein level in a biological sample; Comparing the second HT protein level in the sample and determining whether the first level is increased compared to the second level, wherein the increased HT protein level is self It is a method associated with immune diseases. In the present invention, autoimmune diseases are rheumatoid arthritis, juvenile rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), lupus nephritis (LN), Wegener's disease, inflammatory bowel disease, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP). ), Thrombotic thrombocytopenic purpura (TTP), autoimmune thrombocytopenia, multiple sclerosis, psoriasis, IgA nephropathy, IgM multiple neuropathy, myasthenia gravis, vasculitis, diabetes, Raynaud's syndrome, It can be selected from the group consisting of Sjogren's syndrome and glomerulonephritis. In particular, the autoimmune disease is SLE.

本発明はまた、自己免疫疾患であると臨床的に診断された個体を処置する方法であって、自己免疫疾患であると臨床的に診断された個体に由来する生体サンプルを、上昇した血清中HTレベルの存在または不存在について分析すること、ここで、上昇したHTレベルの存在は自己免疫疾患の臨床診断と関連している;および、増大したHTレベルと関連する疾患に罹患していると臨床的に診断された個体に最も効果的な処置計画を選択することを含む方法である。処置計画は、BLySアンタゴニストの投与を含み得る。好ましい実施形態において、上記BLySアンタゴニストは、APRILアンタゴニストでもあり得る。特に、処置計画はHTアンタゴニストの投与を含む。この方法において、自己免疫疾患は、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、全身性エリテマトーデス(SLE)、ループス腎炎(LN)、ウェゲナー病、炎症性大腸炎、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、自己免疫性血小板減少症、多発性硬化症、乾癬、IgA腎症、IgM多発性神経障害、重症筋無力症、血管炎、糖尿病、レイノー症候群、シェーグレン症候群および糸球体腎炎からなる群より選択され得る。特に、自己免疫疾患はSLEである。   The present invention also provides a method of treating an individual clinically diagnosed as having an autoimmune disease, wherein a biological sample derived from an individual clinically diagnosed as having an autoimmune disease is treated with elevated serum. Analyzing for the presence or absence of HT levels, where the presence of elevated HT levels is associated with clinical diagnosis of autoimmune disease; and as suffering from a disease associated with increased HT levels A method comprising selecting the most effective treatment plan for a clinically diagnosed individual. The treatment regimen may include administration of a BLyS antagonist. In a preferred embodiment, the BLyS antagonist can also be an APRIL antagonist. In particular, the treatment regime includes administration of an HT antagonist. In this method, autoimmune diseases are rheumatoid arthritis, juvenile rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), lupus nephritis (LN), Wegener's disease, inflammatory bowel disease, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP), thrombus Thrombocytopenic purpura (TTP), autoimmune thrombocytopenia, multiple sclerosis, psoriasis, IgA nephropathy, IgM multiple neuropathy, myasthenia gravis, vasculitis, diabetes, Raynaud's syndrome, Sjogren's syndrome and It can be selected from the group consisting of glomerulonephritis. In particular, the autoimmune disease is SLE.

本発明はさらに、患者が自己免疫疾患の薬物処置に対して応答する可能性を予測する方法であって、血清中HTレベルを決定することを含み、上昇したHTレベルの存在が、患者が上記疾患の薬物処置に対して応答する可能性の予兆(predictive)である方法である。自己免疫疾患は、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、全身性エリテマトーデス(SLE)、ループス腎炎(LN)、ウェゲナー病、炎症性大腸炎、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、自己免疫性血小板減少症、多発性硬化症、乾癬、IgA腎症、IgM多発性神経障害、重症筋無力症、血管炎、糖尿病、レイノー症候群、シェーグレン症候群および糸球体腎炎からなる群より選択され得る。特に、自己免疫疾患はSLEである。さらに、本発明の方法において、薬物処置は、BLySおよび/またはAPRILアンタゴニストであり得るHTアンタゴニストの投与を含み得る。   The present invention further provides a method for predicting the likelihood that a patient will respond to drug treatment of an autoimmune disease, comprising determining serum HT levels, wherein the presence of elevated HT levels A method that is a predictive of the likelihood of responding to drug treatment of a disease. Autoimmune diseases include rheumatoid arthritis, juvenile rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), lupus nephritis (LN), Wegener's disease, inflammatory bowel disease, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP), thrombotic thrombocytopenia. From purpura (TTP), autoimmune thrombocytopenia, multiple sclerosis, psoriasis, IgA nephropathy, IgM polyneuropathy, myasthenia gravis, vasculitis, diabetes, Raynaud's syndrome, Sjogren's syndrome and glomerulonephritis Can be selected from the group consisting of In particular, the autoimmune disease is SLE. Further, in the methods of the invention, drug treatment can include administration of an HT antagonist, which can be a BLyS and / or APRIL antagonist.

本発明はまた、個体の血清中の増大したHTレベルを検出するin vitro方法であって、個体に由来する試験生体サンプル中のHTレベルを測定すること;そのレベルを健常対照に由来する生体サンプル中のHTレベルと比較すること;および、試験生体サンプル中のHTレベルが対照サンプル中のレベルと比較して増大しているか否かを決定することを含み、上記増大したHTレベルが自己免疫疾患と関連している方法を包含する。この方法において、自己免疫疾患は、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、全身性エリテマトーデス(SLE)、ループス腎炎(LN)、ウェゲナー病、炎症性大腸炎、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、自己免疫性血小板減少症、多発性硬化症、乾癬、IgA腎症、IgM多発性神経障害、重症筋無力症、血管炎、糖尿病、レイノー症候群、シェーグレン症候群および糸球体腎炎からなる群より選択され得る。特に、自己免疫疾患はSLEである。   The present invention is also an in vitro method for detecting increased HT levels in an individual's serum, measuring the HT level in a test biological sample derived from the individual; the level is derived from a healthy control Comparing the HT level in the test sample; and determining whether the HT level in the test biological sample is increased compared to the level in the control sample, wherein the increased HT level is an autoimmune disease. Including methods related to In this method, autoimmune diseases are rheumatoid arthritis, juvenile rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), lupus nephritis (LN), Wegener's disease, inflammatory bowel disease, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP), thrombus Thrombocytopenic purpura (TTP), autoimmune thrombocytopenia, multiple sclerosis, psoriasis, IgA nephropathy, IgM multiple neuropathy, myasthenia gravis, vasculitis, diabetes, Raynaud's syndrome, Sjogren's syndrome and It can be selected from the group consisting of glomerulonephritis. In particular, the autoimmune disease is SLE.

さらなる態様において、本発明は、自己免疫疾患であると臨床的に診断された個体を処置するために最も効果的な処置計画を選択するin vitro方法であって、自己免疫疾患であると臨床的に診断された個体に由来する生体サンプルを、血清中の上昇したHTレベルの存在または不存在についてin vitroで分析することを含み、上記上昇したHTレベルの存在が自己免疫疾患の臨床診断と関連している方法を包含する。この方法において、処置計画はHTアンタゴニストの使用を含み得る。HTアンタゴニストはBLySおよび/またはAPRILでもあり得る。自己免疫疾患は、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、全身性エリテマトーデス(SLE)、ループス腎炎(LN)、ウェゲナー病、炎症性大腸炎、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、自己免疫性血小板減少症、多発性硬化症、乾癬、IgA腎症、IgM多発性神経障害、重症筋無力症、血管炎、糖尿病、レイノー症候群、シェーグレン症候群および糸球体腎炎からなる群より選択され得る。特に、自己免疫疾患はSLEである。   In a further aspect, the present invention provides an in vitro method for selecting the most effective treatment regimen for treating an individual clinically diagnosed as having an autoimmune disease, wherein the Analyzing in vitro for the presence or absence of elevated HT levels in serum, wherein the presence of elevated HT levels is associated with clinical diagnosis of autoimmune disease The method is included. In this method, the treatment plan can include the use of an HT antagonist. The HT antagonist can also be BLyS and / or APRIL. Autoimmune diseases include rheumatoid arthritis, juvenile rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), lupus nephritis (LN), Wegener's disease, inflammatory bowel disease, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP), thrombotic thrombocytopenia. From purpura (TTP), autoimmune thrombocytopenia, multiple sclerosis, psoriasis, IgA nephropathy, IgM polyneuropathy, myasthenia gravis, vasculitis, diabetes, Raynaud's syndrome, Sjogren's syndrome and glomerulonephritis Can be selected from the group consisting of In particular, the autoimmune disease is SLE.

さらに別の態様において、本発明は、患者が自己免疫疾患に対する薬物処置に応答する可能性を予測するin vitro方法であって、患者に由来するサンプル中のHTレベルを決定することを含み、上昇したHTレベルの存在が、患者が上記疾患に対する薬物処置に応答する可能性の予兆である方法を包含する。自己免疫疾患は、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、全身性エリテマトーデス(SLE)、ループス腎炎(LN)、ウェゲナー病、炎症性大腸炎、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、自己免疫性血小板減少症、多発性硬化症、乾癬、IgA腎症、IgM多発性神経障害、重症筋無力症、血管炎、糖尿病、レイノー症候群、シェーグレン症候群および糸球体腎炎からなる群より選択され得る。特に、自己免疫疾患はSLEである。本発明の薬物処置は、HTアンタゴニストを含み得る。HTアンタゴニストはBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストでもあり得る。   In yet another aspect, the invention provides an in vitro method for predicting the likelihood that a patient will respond to drug treatment against an autoimmune disease, comprising determining HT levels in a sample derived from the patient, and increasing Methods in which the presence of an elevated HT level is a predictor of the likelihood that a patient will respond to drug treatment for the disease. Autoimmune diseases include rheumatoid arthritis, juvenile rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), lupus nephritis (LN), Wegener's disease, inflammatory bowel disease, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP), thrombotic thrombocytopenia. From purpura (TTP), autoimmune thrombocytopenia, multiple sclerosis, psoriasis, IgA nephropathy, IgM polyneuropathy, myasthenia gravis, vasculitis, diabetes, Raynaud's syndrome, Sjogren's syndrome and glomerulonephritis Can be selected from the group consisting of In particular, the autoimmune disease is SLE. The drug treatment of the present invention may include an HT antagonist. The HT antagonist can also be a BLyS and / or APRIL antagonist.

本発明はさらに、患者の自己免疫疾患の処置に使用するためのBLySアンタゴニストであって、患者において血清中のHTレベルが上昇したレベルにあるBLySアンタゴニストを包含する。アンタゴニストは、TACI−IgおよびBCMA−Igから選択された受容体細胞外ドメイン/Fcドメイン融合タンパク質でもあり得る。特に、受容体細胞外ドメイン/Fcドメイン融合タンパク質は、アタシセプト(atacicept)等のTACI−Igであり得る。
本発明のこれらの側面およびその他の側面は、以下に詳述された本発明の詳細を読むことよって当業者に明らかとなるであろう。
The invention further encompasses a BLyS antagonist for use in the treatment of a patient's autoimmune disease, wherein the BLyS antagonist is at an elevated level of serum HT in the patient. The antagonist can also be a receptor extracellular domain / Fc domain fusion protein selected from TACI-Ig and BCMA-Ig. In particular, the receptor extracellular domain / Fc domain fusion protein can be a TACI-Ig such as atacicept.
These and other aspects of the invention will be apparent to those of ordinary skill in the art upon reading the details of the invention described in detail below.

図1は、SLEまたはRAと診断された患者群および健常対照群のヘテロ三量体レベルの散布図である。FIG. 1 is a heterotrimer level scatter plot of a group of patients diagnosed with SLE or RA and a healthy control group. 図2は、図1のデータに基づくヘテロ三量体の平均レベルを示す。FIG. 2 shows the average level of heterotrimers based on the data of FIG. 図3は、第二のSLE患者群のヘテロ三量体レベルを示す。FIG. 3 shows the heterotrimeric levels of the second group of SLE patients.

本発明は、血清等の生体サンプル中のHTレベルをスクリーニングする方法、並びに、自己免疫疾患の存在を予測するための、および患者がHTアンタゴニスト処置に対して応答する可能性を予測するための、この情報の使用を提供する。本発明は、自己免疫患者の血清中のHTレベルが統計的に上昇するという知見に基づく。HTアンタゴニスト(BLySおよび/またはAPRILアンタゴニストでもあり得る)は、患者のB細胞等の免疫細胞による自己免疫イムノグロブリンおよびその他の組織破壊性サイトカインの産生を選択的に無効化する。この所見は、その高いレベルがSLE等の自己免疫疾患と関連するHTレベルの増大の存在を検出する診断アッセイの開発を可能とし、また、B細胞等の反応性免疫細胞の作用を無効化する処置方法、すなわちHTアンタゴニスト(BLySおよび/またはAPRILアンタゴニスト)に対して個体が成功裏に応答する可能性の予測を可能とする。   The present invention provides a method for screening for HT levels in a biological sample such as serum, as well as for predicting the presence of an autoimmune disease and for predicting the likelihood that a patient will respond to HT antagonist treatment. Provide use of this information. The present invention is based on the finding that HT levels in the serum of autoimmune patients are statistically elevated. HT antagonists (which may also be BLyS and / or APRIL antagonists) selectively abolish the production of autoimmune immunoglobulins and other tissue destructive cytokines by immune cells such as the patient's B cells. This finding allows the development of diagnostic assays whose high levels detect the presence of increased HT levels associated with autoimmune diseases such as SLE, and negates the action of reactive immune cells such as B cells Allows prediction of the likelihood of an individual's successful response to a treatment method, ie, an HT antagonist (BLyS and / or APRIL antagonist).

以下、本発明について詳述するが、本発明は、記載された特定の実施形態に限定されるものではなく、もちろん変更等が可能であると理解されるべきである。また、本発明の範囲は添付の特許請求の範囲によってのみ制限されるから、本明細書中の用語は特定の実施形態のみを記述する目的で用いられ、限定的な意図はないと理解されるべきである。   Hereinafter, the present invention will be described in detail. However, it should be understood that the present invention is not limited to the specific embodiments described and can be modified. Also, since the scope of the present invention is limited only by the appended claims, the terminology herein is used for the purpose of describing particular embodiments only and is not intended to be limiting. Should.

特に定義しない限り、本明細書中の全ての技術的および科学的用語は、本発明の属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。本発明の実施または試験にあたり、本明細書中に記載したものと類似または同等である、いかなる方法および物質を用いてもよいが、好ましい方法および物質を本明細書に記載する。本明細書中で言及した全ての刊行物は、参照により本明細書に組み込まれ、これによって、言及された刊行物の方法および物質は本明細書に開示および記載される。   Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention belongs. Although any methods and materials similar or equivalent to those described herein can be used in the practice or testing of the present invention, the preferred methods and materials are described herein. All publications mentioned in this specification are herein incorporated by reference, whereby the methods and materials of the publications mentioned are disclosed and described herein.

本明細書および添付の特許請求の範囲において、文脈から明らかに異なると判断されない限り、単数形("a","an" および "the")は複数の指示対象を含む。したがって、例えば、「多型」にはそのような多型の複数が含まれ、「核酸分子」にはそのような核酸分子の複数が含まれ、「方法」には1または2以上の方法、方法工程および当業者に知られた同等物等が含まれる。   In this specification and the appended claims, the singular forms ("a", "an", and "the") include plural referents unless the context clearly dictates otherwise. Thus, for example, “a polymorphism” includes a plurality of such polymorphisms, “a nucleic acid molecule” includes a plurality of such nucleic acid molecules, and “a method” includes one or more methods, Process steps and equivalents known to those skilled in the art are included.

本出願の出願日以前に開示された刊行物についてのみ、本明細書に記載される。本明細書には、先行発明に基づきそのような刊行物に先行する権利が本発明に与えられていないことの承認として解釈されるべき事項はない。さらに、記載された刊行物の日付が現実の公開日と異なる可能性もあるので、個々に確認する必要があるかもしれない。   Only publications disclosed prior to the filing date of the present application are described herein. Nothing in this specification should be construed as an admission that the invention is not entitled to antedate such publication by virtue of prior invention. In addition, the date of publication listed may be different from the actual publication date and may need to be individually verified.

定義
本明細書中の「ヘテロ三量体(HT)」という用語は、3個のリガンドサブユニットの多量体を包含し、各リガンドサブユニットはBLySまたはAPRILであり、少なくとも1個のサブユニットはBLySであり、少なくとも1個のサブユニットはAPRILである。したがって、「HT」には、BLySが2個およびAPRILが1個である分子、並びにAPRILが2個およびBLySが1個である分子が含まれる。
Definitions As used herein, the term “heterotrimer (HT)” encompasses a multimer of three ligand subunits, each ligand subunit being BLyS or APRIL, wherein at least one subunit is BLyS and at least one subunit is APRIL. Thus, “HT” includes molecules with two BLyS and one APRIL, and molecules with two APRIL and one BLyS.

本明細書中の「多型」という用語は、所定領域のヌクレオチドまたはアミノ酸配列における、別の個体の相同領域のヌクレオチドまたはアミノ酸配列と比較した相違、特に、同種の個体間で相違する所定領域のヌクレオチドまたはアミノ酸配列における相違を意味する。多型は、一般的には、参照配列との関連において規定される。多型には、1塩基の相違、2塩基以上の配列相違、1または複数のヌクレオチドの挿入、逆位および欠失;並びに1アミノ酸の相違、2アミノ酸以上の配列相違、1または複数のアミノ酸の挿入、逆位および欠失が含まれる。   As used herein, the term “polymorphism” refers to the difference in nucleotide or amino acid sequence of a given region compared to the nucleotide or amino acid sequence of a homologous region of another individual, in particular of a given region that differs between individuals of the same species. Refers to differences in nucleotide or amino acid sequence. A polymorphism is generally defined in the context of a reference sequence. Polymorphisms include one base difference, two or more base sequence differences, one or more nucleotide insertions, inversions and deletions; and one amino acid difference, two or more amino acid differences, one or more amino acid differences Insertions, inversions and deletions are included.

「ポリヌクレオチド」および「核酸分子」という用語は、本明細書において互換可能に用いられ、いかなる長さのヌクレオチドポリマー形態をも意味する。ポリヌクレオチドには、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチドおよび/またはそれらのアナログが含まれ得る。ヌクレオチドは、いかなる三次元構造を有していてもよく、既知または未知のいかなる機能を発揮してもよい。「ポリヌクレオチド」という用語には、一本鎖、二本鎖および三重らせん分子が含まれる。「オリゴヌクレオチド」は、一般的には、一本鎖または二本鎖DNAである約5個から約100個のヌクレオチドからなるポリヌクレオチドを意味する。しかしながら、本開示の目的の点から、オリゴヌクレオチドの長さの上限はない。オリゴヌクレオチドはオリゴマーまたはオリゴとしても知られており、遺伝子から単離してもよいし、当技術分野で公知の方法によって化学合成してもよい。   The terms “polynucleotide” and “nucleic acid molecule” are used interchangeably herein and mean a nucleotide polymer form of any length. Polynucleotides can include deoxyribonucleotides, ribonucleotides and / or analogs thereof. The nucleotide may have any three-dimensional structure and may perform any known or unknown function. The term “polynucleotide” includes single-stranded, double-stranded and triple helical molecules. "Oligonucleotide" generally refers to a polynucleotide of about 5 to about 100 nucleotides that is single-stranded or double-stranded DNA. However, for the purposes of this disclosure, there is no upper limit on the length of the oligonucleotide. Oligonucleotides are also known as oligomers or oligos and may be isolated from genes or chemically synthesized by methods known in the art.

非限定的なポリヌクレオチドの実施形態は次のとおりである:遺伝子または遺伝子フラグメント、エクソン、イントロン、mRNA、tRNA、rRNA、リボザイム、cDNA、組換えポリヌクレオチド、分岐ポリヌクレオチド、プラスミド、ベクター、任意配列の単離DNA、任意配列の単離RNA、核酸プローブ、およびプライマー。核酸分子には、メチル化核酸分子および核酸分子アナログ等の修飾核酸分子が含まれ得る。プリンおよびピリミジンのアナログは当技術分野で公知である。核酸は天然に存在するもの、例えばDNAまたはRNAであってもよいし、当技術分野で公知の合成アナログであってもよい。このようなアナログは、アッセイ条件下での優れた安定性ゆえ、プローブとして用いることが好ましい。骨格、糖類または複素環塩基の変更等の天然構造の修飾によって、細胞内安定性および結合親和性が増大することが示されている。骨格化学における有用な変更としては、例えば、ホスホロチオエート;2個の非架橋酸素が硫黄で置換されているホスホロジチオエート;ホスホロアミダイト;アルキルホスホトリエステルおよびボラノホスフェートが挙げられる。アキラルなホスフェート誘導体としては、例えば、3'−O−5'−S−ホスホロチオエート、3'−S−5'−O−ホスホロチオエート、3'−CH−5'−O−ホスホネートおよび3'−NH−5'−O−ホスホロアミダイトが挙げられる。ペプチド核酸では、リボースホスホジエステル骨格全体がペプチド結合で置換される。 Non-limiting polynucleotide embodiments are as follows: gene or gene fragment, exon, intron, mRNA, tRNA, rRNA, ribozyme, cDNA, recombinant polynucleotide, branched polynucleotide, plasmid, vector, arbitrary sequence Isolated DNA, any sequence of isolated RNA, nucleic acid probes, and primers. Nucleic acid molecules can include modified nucleic acid molecules such as methylated nucleic acid molecules and nucleic acid molecule analogs. Purine and pyrimidine analogs are known in the art. The nucleic acid may be naturally occurring, such as DNA or RNA, or may be a synthetic analog known in the art. Such analogs are preferably used as probes because of their excellent stability under assay conditions. Modifications to natural structures such as changes in backbone, sugars or heterocyclic bases have been shown to increase intracellular stability and binding affinity. Useful changes in backbone chemistry include, for example, phosphorothioates; phosphorodithioates in which two non-bridging oxygens are replaced with sulfur; phosphoramidites; alkyl phosphotriesters and boranophosphates. Achiral As a phosphate derivative, for example, 3'-O-5'-S- phosphorothioate, 3'-S-5'-O- phosphorothioate, 3'-CH 2 -5'-O- phosphonate and 3'-NH -5'-O-phosphoramidite. In peptide nucleic acids, the entire ribose phosphodiester backbone is replaced with peptide bonds.

糖修飾は、安定性および親和性を向上させるためにも用いられる。天然のβ−アノマーに対して塩基が反転しているα−アノマーを用いてもよい。リボース糖の2'−OHは、2'−O−メチルまたは2'−O−アリル糖を形成するように変更してもよく、これによって親和性を付与することなしに分解に対する抵抗性が付与される。   Sugar modifications are also used to improve stability and affinity. An α-anomer whose base is inverted with respect to the natural β-anomer may be used. The 2′-OH of the ribose sugar may be modified to form 2′-O-methyl or 2′-O-allyl sugar, thereby conferring resistance to degradation without conferring affinity. Is done.

複素環塩基の修飾は、適切な塩基対を維持するものである必要がある。有用な置換としては、例えば、デオキシウリジンを用いたデオキシチミジンの置換、5−メチル−2'−デオキシシチジンおよび5−ブロモ−2'−デオキシシチジンを用いたデオキシシチジンの置換が挙げられる。5−プロピニル−2'−デオキシウリジンおよび5−プロピニル−2'−デオキシシチジンを用いてそれぞれデオキシチミジンおよびデオキシシチジンを置換すると、親和性および生物活性が増大することが示されている。   Heterocyclic base modifications need to maintain appropriate base pairs. Useful substitutions include, for example, substitution of deoxythymidine with deoxyuridine, substitution of deoxycytidine with 5-methyl-2′-deoxycytidine and 5-bromo-2′-deoxycytidine. Substitution of deoxythymidine and deoxycytidine with 5-propynyl-2′-deoxyuridine and 5-propynyl-2′-deoxycytidine, respectively, has been shown to increase affinity and biological activity.

本明細書中で互換可能に用いられる「ポリペプチド」および「タンパク質」という用語は、任意の長さのアミノ酸ポリマー形態を意味し、コードアミノ酸および非コードアミノ酸、化学的または生化学的に修飾または誘導化されたアミノ酸、並びに修飾ペプチド骨格を有するポリペプチドが含まれ得る。この用語には、融合タンパク質、例えば、特に限定されるわけではないが、異種アミノ酸配列を有する融合タンパク質、N末端メチオニン残基を有するまたは有しない異種および同種リーダー配列を有する融合タンパク質;免疫学的に標識されたタンパク質等が含まれる。   The terms “polypeptide” and “protein” as used interchangeably herein refer to amino acid polymer forms of any length, encoded amino acids and non-encoded amino acids, chemically or biochemically modified or Polypeptides having derivatized amino acids as well as modified peptide backbones can be included. The term includes fusion proteins, such as, but not limited to, fusion proteins having heterologous amino acid sequences, fusion proteins having heterologous and homologous leader sequences with or without an N-terminal methionine residue; Includes proteins and the like labeled.

最も広義には、本明細書中の「自己免疫疾患」という用語は、患者の免疫系において1または2以上の自己タンパク質に対する好ましくない免疫応答が生じている疾患を意味する。自己免疫疾患の代表例としては、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、全身性エリテマトーデス(SLE)、ループス腎炎(LN)、ウェゲナー病、炎症性大腸炎、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、自己免疫性血小板減少症、多発性硬化症、乾癬、IgA腎症、IgM多発性神経障害、重症筋無力症、血管炎、糖尿病、レイノー症候群、シェーグレン症候群および糸球体腎炎が挙げられる。   In its broadest sense, the term “autoimmune disease” herein refers to a disease in which an undesired immune response to one or more self proteins occurs in the patient's immune system. Representative examples of autoimmune diseases include rheumatoid arthritis, juvenile rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), lupus nephritis (LN), Wegener's disease, inflammatory bowel disease, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP), thrombus Thrombocytopenic purpura (TTP), autoimmune thrombocytopenia, multiple sclerosis, psoriasis, IgA nephropathy, IgM multiple neuropathy, myasthenia gravis, vasculitis, diabetes, Raynaud's syndrome, Sjogren's syndrome and Examples include glomerulonephritis.

「実質的に単離された」または「単離された」ポリヌクレオチドは、自然界において結び付いている配列を実質的に含まないものである。実質的に含まないとは、自然界において結び付いている物質を少なくとも50%、好ましくは少なくとも70%、さらに好ましくは少なくとも80%、さらに一層好ましくは少なくとも90%含まないことを意味する。また、本明細書中の「単離された」ポリヌクレオチドは、元来または操作によって、(1)自然界において結び付いているポリヌクレオチドの全てまたは一部と結び付いていない、(2)自然界において結び付いているポリヌクレオチド以外のポリヌクレオチドと結び付いている、(3)自然界に存在しない、組換えポリヌクレオチドをも意味する。   A “substantially isolated” or “isolated” polynucleotide is one that is substantially free of naturally associated sequences. Substantially free means that at least 50%, preferably at least 70%, more preferably at least 80%, and even more preferably at least 90% free of naturally associated substances. Also, an “isolated” polynucleotide herein may be (1) not associated with all or part of a polynucleotide associated with nature, or (2) associated with nature, either by nature or by manipulation. It also means (3) a non-naturally occurring recombinant polynucleotide that is associated with a polynucleotide other than the present polynucleotide.

ハイブリダイゼーション反応は、種々の「ストリンジェンシー」の条件下で実施することができる。ハイブリダイゼーション反応のストリンジェンシーを増大させる条件は、当技術分野で広く知られているし、刊行もされている。例えば、Sambrook 等 (1989)を参照。そのような条件(ストリンジェンシーを増大させる条件)の具体例としては、インキュベーション温度が25℃、37℃、50℃および68℃;バッファー濃度が10×SSC、6×SSC、1×SSC、0.1×SSC(ここで、SSCは、0.15M NaClおよび15mM クエン酸バッファー)およびその他のバッファー系を用いた等価条件;ホルムアミド濃度が0%、25%、50%および70%;インキュベーション時間が5分から24時間;1回、2回または3回以上の洗浄工程;洗浄インキュベーション時間が1、2または15分;洗浄液が6×SSC、1×SSC、0.1×SSCまたは脱イオン水という条件が挙げられる。ストリンジェントな条件の具体例としては、50℃以上の温度で、0.1×SSC(9mM NaCl/0.9mM クエン酸ナトリウム)中で行われるハイブリダイゼーションおよび洗浄が挙げられる。   Hybridization reactions can be performed under conditions of various “stringency”. Conditions that increase the stringency of a hybridization reaction are widely known and published in the art. See, for example, Sambrook et al. (1989). Specific examples of such conditions (conditions for increasing stringency) include incubation temperatures of 25 ° C., 37 ° C., 50 ° C. and 68 ° C .; buffer concentrations of 10 × SSC, 6 × SSC, 1 × SSC,. Equivalent conditions with 1 × SSC (where SSC is 0.15 M NaCl and 15 mM citrate buffer) and other buffer systems; formamide concentrations 0%, 25%, 50% and 70%; incubation time 5 Min to 24 hours; one, two or three or more washing steps; washing incubation time 1, 2 or 15 minutes; washing solution is 6 × SSC, 1 × SSC, 0.1 × SSC or deionized water. Can be mentioned. Specific examples of stringent conditions include hybridization and washing performed in 0.1 × SSC (9 mM NaCl / 0.9 mM sodium citrate) at a temperature of 50 ° C. or higher.

「Tm」は、ワトソン−クリック塩基対によって逆平行方向に水素結合で結合した相補鎖からなる二本鎖ポリヌクレオチドの50%が、実験条件下で一本鎖に解離するセ氏温度である。Tmは、標準的な公式に従って予測することができ、公式中、[X+]はカチオン濃度(mol/L)(通常はナトリウムイオンNa+);(%G/C)は二本鎖中の残基総数に対するパーセンテージとして表されたGおよびC残基の数;(%F)は溶液(wt/vol)中のホルムアミドのパーセント;およびLは二本鎖の各鎖中のヌクレオチド数である。 “Tm” is a temperature in Celsius at which 50% of a double-stranded polynucleotide composed of complementary strands bonded by hydrogen bonding in an antiparallel direction by Watson-Crick base pair dissociates into a single strand under experimental conditions. Tm can be predicted according to a standard formula, where [X + ] is the cation concentration (mol / L) (usually sodium ion Na + ); (% G / C) is in the duplex The number of G and C residues expressed as a percentage of the total number of residues; (% F) is the percent formamide in solution (wt / vol); and L is the number of nucleotides in each strand of the duplex.

DNA/DNAおよびDNA/RNAハイブリダイゼーションの両方に関するストリンジェントな条件は、Sambrook 等. Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989 に記載されており、この文献は参照により本明細書に組み込まれる。例えば、Sambrook 等の7.52頁を参照。   Stringent conditions for both DNA / DNA and DNA / RNA hybridization are described in Sambrook et al. Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989. This document is incorporated herein by reference. See, for example, Sambrook et al., Page 7.52.

「宿主細胞」という用語には、任意の組換えベクターまたは本発明の単離されたポリヌクレオチドのレシピエントとなり得るまたはレシピエントとなっている個々の細胞または細胞培養物が含まれる。宿主細胞には、単一の宿主細胞の子孫細胞が含まれ、子孫細胞は、自然的、偶発的、意図的な変異および/または変化によって、例えば形態または総DNA相補性に関して、親細胞と完全に同一ではなくなっていてもよい。宿主細胞には、本発明の組換えベクターまたはポリヌクレオチドをin vivoまたはin vitroでトランスフェクトまたは感染させた細胞が含まれる。本発明の組換えベクターを含む宿主細胞は「組換え宿主細胞」である。   The term “host cell” includes any cell or cell culture that can be or has been a recipient of any recombinant vector or isolated polynucleotide of the present invention. Host cells include progeny cells of a single host cell, and progeny cells are completely intact with the parent cell by natural, accidental, intentional mutation and / or alteration, for example with respect to morphology or total DNA complementation. May not be identical. Host cells include cells transfected or infected in vivo or in vitro with a recombinant vector or polynucleotide of the invention. A host cell comprising a recombinant vector of the present invention is a “recombinant host cell”.

「特異的に結合する」という用語は、抗体の結合の文脈において、特定のポリペプチド、すなわち多型性APRILまたはBLySポリペプチドのエピトープ、に対する抗体の高親和性結合(high avidity and/or high affinity binding)を意味する。特定のAPRILまたはBLySポリペプチドのエピトープに対する抗体の結合は、その他のいかなるエピトープ(対象となる特定のポリペプチドとともに分子中に存在し得るし、対象となる特定のポリペプチドとして同一サンプル中に存在し得る)に対する同一抗体の結合よりも強力であることが好ましく、例えば、抗体が、特定のAPRILまたはBLySエピトープに対して、異なるAPRILまたはBLySエピトープに対してよりも強力に結合する場合、結合条件を調節することにより、抗体は特定のAPRILまたはBLySエピトープに対してほぼ排他的に結合するが、その他のいかなるAPRILまたはBLySエピトープに対してはそうならないようにできる。対象となるポリペプチドに対して特異的に結合する抗体は、その他のポリペプチドに対して弱いが検出可能なレベル(例えば、対象となるポリペプチドに対する結合の10%以下)で結合することができてもよい。そのような弱い結合、すなわちバックグラウンド結合は、例えば適切な対照の使用によって、対象となる化合物またはポリペプチドに対する特異的抗体結合と容易に識別することができる。一般的には、本発明の抗体が107モル/L以上、好ましくは108モル/L以上の結合親和性で特定のAPRILまたはBLySポリペプチドに対して結合することを、本発明の抗体が特定のAPRILまたはBLySポリペプチドに対して特異的に結合するという。一般的には、106モル/リットル以下の結合親和性を有する抗体は、現在の常法において検出可能なレベルで抗原に結合しないため、有用ではない。 The term “specifically binds” refers to high avidity and / or high affinity of an antibody to a specific polypeptide, ie, an epitope of a polymorphic APRIL or BLyS polypeptide, in the context of antibody binding. binding). Antibody binding to a particular APRIL or BLyS polypeptide epitope can be present in the molecule with any other epitope (the particular polypeptide of interest, or in the same sample as the particular polypeptide of interest. It is preferred that the binding conditions be greater if the antibody binds more strongly to a particular APRIL or BLyS epitope than to a different APRIL or BLyS epitope. By modulating, the antibody can bind almost exclusively to a particular APRIL or BLyS epitope, but not to any other APRIL or BLyS epitope. An antibody that specifically binds to a polypeptide of interest can bind to other polypeptides at a weak but detectable level (eg, less than 10% of binding to the polypeptide of interest). May be. Such weak binding, ie background binding, can be readily distinguished from specific antibody binding to the compound or polypeptide of interest, for example by use of appropriate controls. In general, an antibody of the invention binds to a particular APRIL or BLyS polypeptide with a binding affinity of 10 7 mol / L or more, preferably 10 8 mol / L or more. It specifically binds to a specific APRIL or BLyS polypeptide. In general, antibodies having a binding affinity of 10 6 mol / liter or less are not useful because they do not bind antigen at levels detectable in current routine methods.

本明細書中の「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に同種の抗体群から得られた抗体を意味し、その抗体群に含まれる個々の抗体は、自然発生的な若干の変異が生じている可能性を除けば、同一である。   The term “monoclonal antibody” in the present specification means an antibody obtained from a group of substantially the same type of antibodies, and individual antibodies included in the group of antibodies undergo some spontaneous mutations. Except for the possibility of being.

モノクローナル抗体は、単一の抗原部位に対して高度に特異的である。さらに、種々の決定基(エピトープ)に対する種々の抗体を典型的に含む通常の(ポリクローナル)抗体調製物と比較して、各モノクローナル抗体は抗原の単一の決定基に対して特異的である。さらに、その特異性について、モノクローナル抗体は、その他のイムノグロブリンが混入していないハイブリドーマ培養によって合成される点で有利である。「モノクローナル」という修飾語は、実質的に同種の抗体群から得られる抗体の特徴を表すが、特定の方法による抗体の産生が要求されていると解釈されるべきではない。例えば、本発明で用いられるモノクローナル抗体は、Kohler 等, Nature, 256: 495 (1975)に最初に記載されたハイブリドーマ法によって作製してもよいし、組換えDNA法(例えば米国特許第4,816,567号参照)によって作製してもよい。また「モノクローナル抗体」は、例えば、Clackson 等, Nature, 352: 624-628 (1991) および Marks 等, J. Mol. Biol., 222: 581-597 (1991) に記載された方法を用いて、ファージ抗体ライブラリーから単離してもよい。   Monoclonal antibodies are highly specific for a single antigenic site. Furthermore, each monoclonal antibody is specific for a single determinant of the antigen, as compared to conventional (polyclonal) antibody preparations that typically include different antibodies directed against different determinants (epitopes). Furthermore, its specificity is advantageous in that monoclonal antibodies are synthesized by hybridoma cultures that are not contaminated with other immunoglobulins. The modifier “monoclonal” indicates the character of the antibody as being obtained from a group of substantially homogeneous antibodies, but should not be construed as requiring production of the antibody by any particular method. For example, the monoclonal antibody used in the present invention may be prepared by the hybridoma method first described in Kohler et al., Nature, 256: 495 (1975) or by recombinant DNA methods (see, eg, US Pat. No. 4,816,567). ). In addition, the “monoclonal antibody” can be obtained using, for example, the method described in Clackson et al., Nature, 352: 624-628 (1991) and Marks et al., J. Mol. Biol., 222: 581-597 (1991). It may be isolated from a phage antibody library.

本明細書中のモノクローナル抗体には、特に、「キメラ」抗体(イムノグロブリン)、および所望の生物活性を示す限りそのような抗体のフラグメントが含まれ、キメラ抗体においては、重鎖および/または軽鎖の一部が、特定の種に由来する抗体または特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体の対応配列と同一であるか、または相同であり、上記鎖の残部は、別の種に由来する抗体または別の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体の対応配列と同一であるか、または相同である(米国特許第4,816,567号 ; Morrison 等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855 (1984))。キメラ抗体の作製法は当技術分野で公知である。   Monoclonal antibodies herein include, in particular, “chimeric” antibodies (immunoglobulins) and fragments of such antibodies as long as they exhibit the desired biological activity, wherein in chimeric antibodies heavy and / or light A part of the chain is identical or homologous to the corresponding sequence of an antibody from a particular species or an antibody belonging to a particular antibody class or subclass, and the remainder of the chain is an antibody from another species Or identical or homologous to corresponding sequences of antibodies belonging to another antibody class or subclass (US Pat. No. 4,816,567; Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855 (1984) )). Methods for producing chimeric antibodies are known in the art.

非ヒト(例えばマウス)抗体の「ヒト化」形態は、キメライムノグロブリン、イムノグロブリン鎖またはそのフラグメント(例えば、Fv、Fab、Fab'、F(ab')2または抗体のその他の抗原結合配列)であり、非ヒトイムノグロブリンに由来する最小配列を含む。   “Humanized” forms of non-human (eg, murine) antibodies are chimeric immunoglobulins, immunoglobulin chains or fragments thereof (eg, Fv, Fab, Fab ′, F (ab ′) 2 or other antigen binding sequences of an antibody). And contains a minimal sequence derived from non-human immunoglobulin.

ほとんどの場合、ヒト化抗体はヒトイムノグロブリン(レシピエント抗体)であり、レシピエントの相補性決定領域(CDR)に由来する残基が、所望の特異性、親和性および能力(capacity)を有するマウス、ラットまたはウサギ等の非ヒト種(ドナー抗体)のCDRに由来する残基によって置換される。幾つかの場合には、ヒトイムノグロブリンのFvフレームワーク領域(FR)残基が、対応する非ヒト残基で置換される。さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体でも移入(imported)CDRまたはフレームワーク配列でも見られない残基を含んでもよい。これらの修飾は、抗体の能力をさらに向上および最大化させるために行われる。一般的には、ヒト化抗体は、少なくとも1個、典型的には2個の可変領域のうちの実質的に全てを含み、全てまたは実質的に全ての超可変ループは非ヒトイムノグロブリンの超可変ループに対応しており、全てまたは実質的に全てのFR領域はヒトイムノグロブリン配列のFR領域である。但し、FR領域は、結合親和性を向上させる1または2以上のアミノ酸置換を含んでいてもよい。FRにおけるこのような置換アミノ酸の個数は、典型的には、H鎖において6個以下であり、L鎖において3個以下である。ヒト化抗体は、イムノグロブリン定常領域(Fc)、典型的にはヒトイムノグロブリン定常領域の少なくとも一部を含むことが好ましい。さらなる詳細については、Jones 等, Nature, 321: 522-525 (1986); Reichmann 等, Nature, 332: 323-329 (1988); および Presta, Curr. Op. Struct. Biol., 2: 593-596 (1992)を参照のこと。ヒト化抗体には、霊長類化(PRIMATIZED)抗体が含まれ、この抗体の抗原結合領域は、例えばマカクザルを対象とする抗原で免疫することによって作製した抗体に由来する。ヒト化抗体の作製法は当技術分野で公知である。   In most cases, the humanized antibody is a human immunoglobulin (recipient antibody), and residues derived from the recipient's complementarity determining regions (CDRs) have the desired specificity, affinity, and capacity. Substituted by residues derived from the CDRs of a non-human species (donor antibody) such as mouse, rat or rabbit. In some cases, Fv framework region (FR) residues of human immunoglobulin are replaced with corresponding non-human residues. Furthermore, humanized antibodies may comprise residues that are found neither in the recipient antibody nor in the imported CDR or framework sequences. These modifications are made to further refine and maximize antibody performance. In general, a humanized antibody comprises substantially all of at least one, typically two, variable regions, all or substantially all of the hypervariable loops being superhuman non-human immunoglobulin. Corresponding to the variable loop, all or substantially all FR regions are FR regions of human immunoglobulin sequences. However, the FR region may contain one or more amino acid substitutions that improve binding affinity. The number of such substituted amino acids in FR is typically 6 or less in the H chain and 3 or less in the L chain. The humanized antibody preferably comprises at least part of an immunoglobulin constant region (Fc), typically a human immunoglobulin constant region. For further details, see Jones et al., Nature, 321: 522-525 (1986); Reichmann et al., Nature, 332: 323-329 (1988); and Presta, Curr. Op. Struct. Biol., 2: 593-596. (1992). Humanized antibodies include primatized antibodies, and the antigen-binding region of this antibody is derived from an antibody produced by immunization with, for example, a macaque monkey target antigen. Methods for producing humanized antibodies are known in the art.

ヒト化抗体はまた、当技術分野で公知の様々な方法、例えばファージディスプレイライブラリーを用いて作製することもできる(Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227: 381 (1991) ; Marks 等, J. Mol. Biol., 222: 581 (1991))。Cole 等およびBoerner 等の方法も、ヒトモノクローナル抗体の調製に利用することができる(Cole 等, Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985) ; Boerner 等, J. Immunol., 147(1) : 86-95 (1991))。   Humanized antibodies can also be generated using various methods known in the art, such as phage display libraries (Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227: 381 (1991); Marks et al. , J. Mol. Biol., 222: 581 (1991)). The methods of Cole et al. And Boerner et al. Can also be used for the preparation of human monoclonal antibodies (Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985); Boerner et al., J. Immunol., 147 (1): 86-95 (1991)).

本発明の結合性抗体の「機能性フラグメント」は、機能性フラグメントが由来するインタクトな完全鎖分子と実質的に同一の親和性を有し、BLyS、TACI、BAFF−RまたはBCMAに対する結合性を保持するフラグメントであり、本明細書に記載されたin vitroまたはin vivoアッセイで測定されるように、B細胞を枯渇(deplete)させることができる。   A “functional fragment” of a binding antibody of the invention has substantially the same affinity as the intact full-chain molecule from which the functional fragment is derived and exhibits binding properties to BLyS, TACI, BAFF-R or BCMA. A retained fragment that can be used to deplete B cells as measured by the in vitro or in vivo assays described herein.

抗体の「エフェクター機能」は、抗体のFc領域(天然配列Fc領域またはアミノ酸配列変異体Fc領域)に基づく生物活性であり、抗体アイソタイプによって変化する。抗体のエフェクター機能の例としては、Clq結合および補体依存性細胞傷害;Fc受容体結合;抗体依存性細胞介在性細胞傷害(ADCC);食作用:細胞表面受容体(B細胞受容体)のダウンレギュレーション;B細胞活性化が挙げられる。   Antibody “effector functions” are biological activities based on the Fc region (a native sequence Fc region or amino acid sequence variant Fc region) of an antibody, and vary with the antibody isotype. Examples of antibody effector functions include Clq binding and complement dependent cytotoxicity; Fc receptor binding; antibody dependent cell mediated cytotoxicity (ADCC); phagocytosis: cell surface receptors (B cell receptors) Down-regulation; B cell activation.

「抗体依存性細胞介在性細胞傷害」または「ADCC」とは、分泌Igがある細胞傷害性細胞(例えば、ナチュラルキラー(NK)細胞、好中球およびマクロファージ)に存在するFc受容体(FcR)に結合すると、これらの細胞傷害性エフェクター細胞が抗原発現(antigen-bearing)標的細胞に特異的に結合し、細胞傷害性によってその標的細胞を殺すことが可能となる細胞傷害性の形態をいう。抗体は、細胞傷害性細胞を「作動(arm)」させるものであり、殺細胞にとって不可欠である。ADCC、NK細胞を媒介するプライマリー細胞は、FcyRIIIのみを発現する一方、単球はFcyRI、FcyRIIおよびFcyRIIIを発現する。造血細胞でのFcR発現は、Ravetch and Kinet, Ann. Rev. Immunol 9: 457-92 (1991)の464頁の表3に要約されている。対象となる分子のADCC活性を評価するために、in vitro ADCCアッセイ、例えば、米国特許第5,500,362号または第5,821,337号に記載されたアッセイを実施することができる。このようなアッセイに有用なエフェクター細胞としては、例えば、末梢血単核細胞(PBMC)およびナチュラルキラー(NK)細胞が挙げられる。その代わりに、またはそれに加えて、対象となる分子のADCC活性は、in vivoで、例えば、Clynes 等. PNAS (USA) 95: 652-656 (1998)に開示された動物モデルで評価することもできる。   “Antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity” or “ADCC” refers to Fc receptors (FcR) present in cytotoxic cells with secretory Ig, such as natural killer (NK) cells, neutrophils and macrophages. These cytotoxic effector cells are specifically bound to antigen-bearing target cells when bound to, and are cytotoxic forms that allow the target cells to be killed by cytotoxicity. Antibodies “arm” cytotoxic cells and are essential for cell killing. Primary cells that mediate ADCC, NK cells express only FcyRIII, whereas monocytes express FcyRI, FcyRII and FcyRIII. FcR expression in hematopoietic cells is summarized in Table 3 on page 464 of Ravetch and Kinet, Ann. Rev. Immunol 9: 457-92 (1991). To assess the ADCC activity of the molecule of interest, an in vitro ADCC assay can be performed, such as the assay described in US Pat. Nos. 5,500,362 or 5,821,337. Effector cells useful in such assays include, for example, peripheral blood mononuclear cells (PBMC) and natural killer (NK) cells. Alternatively or in addition, the ADCC activity of the molecule of interest can be assessed in vivo, for example in the animal model disclosed in Clynes et al. PNAS (USA) 95: 652-656 (1998). it can.

「補体依存性細胞傷害」または「CDC」とは、補体存在下での標的細胞の溶解をいう。補体活性化の古典的経路は、補体系の第1成分(Clq)が、同種抗原に結合している抗体(適当なサブクラス)に結合することによって開始される。補体活性化を評価するために、CDCアッセイ、例えば、Gazzano- Santoro 等, J. Immunol. Methods 202: 163 (1996)に記載されたCDCアッセイを実施することができる。   “Complement dependent cytotoxicity” or “CDC” refers to lysis of a target cell in the presence of complement. The classical pathway of complement activation is initiated by binding of the first component of the complement system (Clq) to antibodies (appropriate subclasses) that are bound to alloantigens. To assess complement activation, a CDC assay, such as the CDC assay described in Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202: 163 (1996), can be performed.

「単離された」抗体は、自然環境要素から同定され、分離され、および/または回収されたものである。自然環境要素由来の混入物質は、抗体の診断的または治療的使用を妨げるおそれのある物質であり、その具体例としては、酵素、ホルモンおよびその他のタンパク質性または非タンパク質性の溶質が挙げられる。好ましい実施形態において、抗体の精製は(1)ローリー法によって決定された抗体の95重量%を超えるまで、最も好ましくは99重量%を超えるまで、(2)スピニングカップシークエナーター(spinning cup sequenator)を用いて少なくとも15残基のN末端または内部アミノ酸配列が得られるのに十分な程度まで、または(3)クーマシーブルーまたは好ましくは銀染色を用いる還元または非還元条件下のSDS−PAGEによって均質(homogeneity)になるまで行われる。   An “isolated” antibody is one that has been identified, separated, and / or recovered from a natural environmental element. Contaminants derived from natural environmental elements are substances that can interfere with the diagnostic or therapeutic use of antibodies, specific examples of which include enzymes, hormones and other proteinaceous or non-proteinaceous solutes. In a preferred embodiment, the purification of the antibody is (1) greater than 95%, most preferably greater than 99% by weight of the antibody as determined by the Raleigh method, and (2) spinning cup sequenator. To an extent sufficient to obtain an N-terminal or internal amino acid sequence of at least 15 residues, or (3) homogeneous by SDS-PAGE under reducing or non-reducing conditions using Coomassie blue or preferably silver staining It is performed until it becomes (homogeneity).

単離された抗体には、抗体の自然環境の少なくとも1つの成分が存在しない組換え細胞内にin situで存在する抗体が含まれる。しかしながら、通常、単離された抗体は少なくとも1つの精製段階により調製される。   Isolated antibody includes the antibody in situ within recombinant cells in which at least one component of the antibody's natural environment is not present. Ordinarily, however, isolated antibody will be prepared by at least one purification step.

「検出可能に標識された抗体」という用語は、検出可能な標識が結合した抗体(または、APRILポリペプチドもしくはエピトープに対する結合特異性を保持する抗体フラグメント)を意味する。検出可能な標識は、通常、化学結合によって結合させるが、標識がポリペプチドである場合には、その代わりに、遺伝工学的技術によって結合させることができる。検出可能に標識されたタンパク質の作製法は、当技術分野で周知である。検出可能な標識は、当技術分野で公知の様々な標識から選択することができ、その具体例としては、特に限定されるわけではないが、ラジオアイソトープ、フルオロフォア、常磁性標識、酵素(例えば西洋ワサビペルオキシダーゼ)、あるいは検出可能なシグナル(例えば放射能、蛍光、色)を発するか、または標識のその基質への曝露によって検出可能なシグナルを発するその他の分子または化合物が挙げられる。様々な検出可能な標識/基質の組(例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ/ジアミノベンジジン、アビジン/ストレプトアビジン、ルシフェラーゼ/ルシフェリン)、抗体の標識化法および標識抗体の使用法が当技術分野で周知である(例えば、Harlow and Lane, eds. (Antibodies: A Laboratory Manual (1988) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.)参照)。   The term “detectably labeled antibody” means an antibody (or an antibody fragment that retains binding specificity for an APRIL polypeptide or epitope) to which a detectable label is bound. The detectable label is usually attached by chemical linkage, but if the label is a polypeptide, it can instead be attached by genetic engineering techniques. Methods for producing detectably labeled proteins are well known in the art. The detectable label can be selected from a variety of labels known in the art and specific examples include, but are not limited to, radioisotopes, fluorophores, paramagnetic labels, enzymes (eg, Horseradish peroxidase), or other molecules or compounds that emit a detectable signal (eg, radioactivity, fluorescence, color), or that emit a detectable signal upon exposure of the label to its substrate. Various detectable label / substrate pairs (eg, horseradish peroxidase / diaminobenzidine, avidin / streptavidin, luciferase / luciferin), methods for labeling antibodies and using labeled antibodies are well known in the art ( See, for example, Harlow and Lane, eds. (Antibodies: A Laboratory Manual (1988) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY)).

「生体サンプル」は、個体から得られた様々なタイプのサンプルを包含し、診断またはモニタリングアッセイで用いることができる。この定義には、血液および生物起源のその他の液体サンプル、生検標本または組織培養物あるいはそれらに由来する細胞およびその子孫細胞等の固形組織サンプルが含まれる。この定義にはまた、入手後に、例えば、試薬での処理、可溶化、ポリヌクレオチド等のある成分の濃縮等の任意の操作を施したサンプルが含まれる。「生体サンプル」という用語には、臨床サンプルの他、培養細胞、細胞上清、細胞溶解物、血清、血漿、体液および組織サンプルも含まれる。   A “biological sample” encompasses various types of samples obtained from an individual and can be used in a diagnostic or monitoring assay. This definition includes solid tissue samples such as blood and other liquid samples of biological origin, biopsy specimens or tissue culture or cells derived therefrom and progeny cells thereof. This definition also includes samples that have been subjected to any manipulations after acquisition, such as treatment with reagents, solubilization, concentration of certain components such as polynucleotides, and the like. The term “biological sample” includes cultured cells, cell supernatants, cell lysates, serum, plasma, body fluids and tissue samples as well as clinical samples.

本明細書中の「処置」、「処置する」等とは、所望の薬理的および/または生理的効果を得ることを意味する。この効果は、疾患またはその症状を完全にまたは部分的に予防するという予防効果であってもよいし、疾患および/または該疾患に起因する悪影響を部分的にまたは完全に治療するという治療効果であってもよいし、それらの両方であってもよい。本明細書中の「処置」には、哺乳動物、特にヒトにおける疾患の任意の処置が含まれ、(a)疾患に罹患しやすいかもしれないが未だその疾患に罹患していないと診断された被験者が、その疾患に罹患することを予防すること、(b)その疾患を抑制すること、すなわち疾患の進行を抑制すること、および(c)疾患を緩和すること、すなわち疾患を退行させることが含まれる。   In the present specification, “treatment”, “treating” and the like mean obtaining a desired pharmacological and / or physiological effect. This effect may be a preventive effect of completely or partially preventing the disease or its symptoms, or a therapeutic effect of partially or completely treating the disease and / or adverse effects caused by the disease. There may be both of them. “Treatment” herein includes any treatment of a disease in mammals, particularly humans, (a) diagnosed as (a) susceptible to the disease but not yet suffering from the disease Preventing a subject from suffering from the disease; (b) suppressing the disease, ie, suppressing the progression of the disease; and (c) relieving the disease, ie, regressing the disease. included.

「免疫抑制薬」は、免疫系を妨害する任意の分子であり、外来または自己抗原に対する応答を鈍らせる。そのような分子としては、例えば、シクロホスファミド(CYC)およびミコフェノール酸モフェチル(MMF)の2種類が挙げられる。この用語には、免疫系をダウンレギュレートする治療薬として有用な任意の薬物または分子が含まれることが意図される。   An “immunosuppressive drug” is any molecule that interferes with the immune system and blunts the response to foreign or self antigens. Such molecules include, for example, two types: cyclophosphamide (CYC) and mycophenolate mofetil (MMF). The term is intended to include any drug or molecule useful as a therapeutic agent to down regulate the immune system.

「融合タンパク質」および「融合ポリペプチド」とは、互いに共有結合した2つの部分を有するポリペプチドを意味し、各部分は異なる特性を有するポリペプチドである。特性は、生物学的特性、例えば、in vitroまたはin vivoでの活性であり得る。特性はまた、単純な化学的または物理的特性、例えば、標的分子に対する結合、反応の触媒作用等であり得る。2つの部分は、1つのペプチド結合によって直接結合していてもよいし、1または2以上のアミノ酸残基を含むペプチドリンカーを介して結合していてもよい。一般的には、2つの部分およびリンカーは互いにリーディングフレームを構成する。   "Fusion protein" and "fusion polypeptide" mean a polypeptide having two parts covalently linked to each other, each part being a polypeptide having different properties. The property can be a biological property, such as activity in vitro or in vivo. A property can also be a simple chemical or physical property, such as binding to a target molecule, catalysis of a reaction, and the like. The two moieties may be directly linked by a single peptide bond or may be linked via a peptide linker comprising one or more amino acid residues. In general, the two parts and the linker constitute a reading frame for each other.

「複合体」とは、任意のハイブリッド分子をいい、融合タンパク質、および、アミノ酸またはタンパク質部分と非タンパク質部分とを含有する分子が含まれる。複合体は、当技術分野で公知の種々の技術、例えば、組換えDNA技術、固相合成、液相合成、有機化学合成技術またはこれらの技術の組み合わせによって合成することができる。合成法の選択は、合成すべき特定の分子に依存する。例えば、天然の完全な「タンパク質」ではないハイブリッド分子は、組換え技術および液相技術を組み合わせて合成することができる。   “Complex” refers to any hybrid molecule, including fusion proteins, and molecules that contain an amino acid or protein portion and a non-protein portion. The complex can be synthesized by various techniques known in the art, such as recombinant DNA techniques, solid phase synthesis, liquid phase synthesis, organic chemical synthesis techniques, or a combination of these techniques. The choice of synthesis method depends on the particular molecule to be synthesized. For example, hybrid molecules that are not natural, complete “proteins” can be synthesized using a combination of recombinant and liquid phase techniques.

本明細書中の「Fc−融合タンパク質」という用語は、異種タンパク質の結合特異性とイムノグロブリン定常領域のエフェクター機能と組み合わせた抗体様分子を意味する。構造的には、Fc−融合タンパク質は、アミノ酸配列に、抗体の抗原認識および結合部位以外の所望の結合特異性を融合させたもの(すなわち「異種」)と、イムノグロブリン定常領域配列とを含む。Fc−融合タンパク質分子は、典型的には、受容体またはリガンドの少なくとも結合部位を含む隣接(contiguous)アミノ酸配列を含む。Fc−融合タンパク質中のイムノグロブリン定常領域配列は、任意のイムノグロブリン、例えば、IgG−1、IgG−2、IgG−3もしくはIgG−4サブタイプ、IgA(例えばIgA−1およびIgA−2)、IgE、IgDまたはIgMから得ることができる。例えば、本発明における有用な融合タンパク質は、BLyS受容体のBLyS結合部分を含むが、BLyS受容体の膜貫通配列または細胞質側配列を含まないポリペプチドである。一実施形態において、BAFF−R、TACIまたはBCMAの細胞外ドメインは、イムノグロブリン配列の定常領域に融合する。   The term “Fc-fusion protein” herein refers to an antibody-like molecule that combines the binding specificity of a heterologous protein with the effector function of an immunoglobulin constant region. Structurally, an Fc-fusion protein includes an amino acid sequence fused to a desired binding specificity other than the antigen recognition and binding site of an antibody (ie, “heterologous”) and an immunoglobulin constant region sequence. . Fc-fusion protein molecules typically comprise a contiguous amino acid sequence that includes at least the binding site of a receptor or ligand. The immunoglobulin constant region sequences in the Fc-fusion protein can be any immunoglobulin, eg, IgG-1, IgG-2, IgG-3 or IgG-4 subtype, IgA (eg, IgA-1 and IgA-2), It can be obtained from IgE, IgD or IgM. For example, a fusion protein useful in the present invention is a polypeptide that includes a BLyS binding portion of a BLyS receptor, but does not include a transmembrane or cytoplasmic sequence of the BLyS receptor. In one embodiment, the extracellular domain of BAFF-R, TACI or BCMA is fused to a constant region of an immunoglobulin sequence.

本明細書中で互換可能に用いられる「個体」、「被験者」および「患者」とは、哺乳動物、例えば、特に限定されるわけではないが、マウス、サル、ヒト、哺乳類家畜動物、哺乳類娯楽動物(sport animal)および哺乳類ペット等をいう。   As used herein interchangeably, “individual”, “subject” and “patient” are mammals, such as, but not limited to, mice, monkeys, humans, mammalian livestock animals, mammalian entertainment An animal (sport animal) or a mammal pet.

「哺乳動物」という用語は、哺乳動物、例えば、ヒト、家畜動物および動物園動物、娯楽動物またはペット動物(イヌ、ウマ、ネコ、ウシ等)に分類される任意の動物をいう。好ましくは、哺乳動物はヒトである。   The term “mammal” refers to any animal classified as a mammal, eg, humans, farm animals and zoo animals, recreational animals or pet animals (dogs, horses, cats, cows, etc.). Preferably the mammal is a human.

HT(APRILおよびBLySポリペプチド)の検出
本発明は、APRILおよびBLySポリペプチドの分離測定を通じたHTポリペプチドの検出を提供する。「APRILポリペプチド」という用語には、公知のAPRILポリペプチド(例えば、公的に入手可能なGenBank受入番号AF046888)のオープンリーディングフレーム(ORF)によってコードされるアミノ酸配列が含まれ、その具体例としては、完全長の天然ポリペプチドおよびそのフラグメント、特に生物学的に活性なフラグメントおよび/または機能ドメインに対応するフラグメント、例えば、生物学的活性を有する領域またはドメイン等、その抗原フラグメントが挙げられるとともに、対象となるポリペプチドがその他のタンパク質またはその部分に融合したものが挙げられる。APRILポリペプチドのアミノ酸配列は公知である(例えば、Hahne 等, J. Exp. Med. 188:1185-90, 1998 参照)。本発明のAPRILポリペプチドは、様々な供給源、例えばヒト組織またはその他の供給源から単離することができるし、組換え法および/または合成法によって調製することもできる。APRILポリペプチドにおける多型は、一般的には、参照配列と比較して規定される。
Detection of HT (APRIL and BLyS polypeptides) The present invention provides for the detection of HT polypeptides through separation measurements of APRIL and BLyS polypeptides. The term “APRIL polypeptide” includes the amino acid sequence encoded by the open reading frame (ORF) of a known APRIL polypeptide (eg, publicly available GenBank accession number AF046888), as a specific example. Include full-length natural polypeptides and fragments thereof, in particular fragments that correspond to biologically active fragments and / or functional domains, such as antigenic fragments thereof, such as regions or domains with biological activity. , A polypeptide of interest fused to other proteins or parts thereof. The amino acid sequence of the APRIL polypeptide is known (see, eg, Hahne et al . , J. Exp. Med. 188 : 1185-90, 1998). The APRIL polypeptides of the invention can be isolated from a variety of sources, such as human tissue or other sources, or can be prepared by recombinant and / or synthetic methods. A polymorphism in an APRIL polypeptide is generally defined relative to a reference sequence.

「BLySポリペプチド」という用語には、公知のBLySポリペプチド(例えば、公的に入手可能なGenBankまたはその補充機関の受入番号NM 052945 (ヒトBLyS mRNA) またはそのヒト変異体 受入番号003808, 172087, 172088 または 受入番号 033622 (マウス BLyS mRNA))のオープンリーディングフレーム(ORF)によってコードされるアミノ酸配列が含まれ、その具体例としては、完全長の天然ポリペプチドおよびそのフラグメント、特に生物学的に活性なフラグメントおよび/または機能ドメインに対応するフラグメント、例えば、生物学的活性を有する領域またはドメイン等、その抗原フラグメントが挙げられるとともに、対象となるポリペプチドがその他のタンパク質またはその部分に融合したものが挙げられる。BLySポリペプチドのアミノ酸配列は公知である(例えば、Moore 等. Science 285: 260-3, 1999 参照)。本発明のBLySポリペプチドは、様々な供給源、例えばヒト組織またはその他の供給源から単離することができるし、組換え法および/または合成法によって調製することもできる。BLySポリペプチドにおける多型は、一般的には、参照配列と比較して規定される。   The term “BLyS polypeptide” includes known BLyS polypeptides (eg, publicly available GenBank or its replacement accession number NM 052945 (human BLyS mRNA) or human variants thereof accession numbers 003808, 172087, 172088 or accession number 033622 (mouse BLyS mRNA)), which includes the amino acid sequence encoded by the full-length native polypeptide and fragments thereof, particularly biologically active. And / or a fragment corresponding to a functional domain, for example, an antigen fragment thereof, such as a region or domain having biological activity, and a polypeptide of interest fused to another protein or a part thereof Can be mentioned. The amino acid sequence of BLyS polypeptide is known (see, eg, Moore et al. Science 285: 260-3, 1999). The BLyS polypeptides of the invention can be isolated from a variety of sources, such as human tissue or other sources, or can be prepared by recombinant and / or synthetic methods. A polymorphism in a BLyS polypeptide is generally defined relative to a reference sequence.

本明細書中の「多型性APRILポリペプチド」とは、i)天然の多型性APRILポリペプチド、ii)多型性APRILポリペプチドのフラグメント、iii)多型性APRILポリペプチドのポリペプチドアナログ、iv)多型性APRILポリペプチドの変異体、v)多型性APRILポリペプチドの免疫学的に活性なフラグメント、およびvi)多型性APRILポリペプチドを含む融合タンパク質、のアミノ酸配列を有する組換えまたは非組換えポリペプチドのアミノ酸配列を意味する。本発明の多型性APRILポリペプチドは、生体サンプルから、あるいは天然、合成、半合成または組換えの任意の供給源から得ることができる。   As used herein, “polymorphic APRIL polypeptide” refers to i) a natural polymorphic APRIL polypeptide, ii) a fragment of a polymorphic APRIL polypeptide, iii) a polypeptide analog of a polymorphic APRIL polypeptide A set having the amino acid sequence of: iv) a variant of a polymorphic APRIL polypeptide, v) an immunologically active fragment of the polymorphic APRIL polypeptide, and vi) a fusion protein comprising the polymorphic APRIL polypeptide Means the amino acid sequence of a modified or non-recombinant polypeptide. The polymorphic APRIL polypeptides of the invention can be obtained from a biological sample or from any source, natural, synthetic, semi-synthetic or recombinant.

本明細書中の「多型性BLySポリペプチド」とは、i)天然の多型性BLySポリペプチド、ii)多型性BLySポリペプチドのフラグメント、iii)多型性BLySポリペプチドのポリペプチドアナログ、iv)多型性BLySポリペプチドの変異体、v)多型性BLySポリペプチドの免疫学的に活性なフラグメント、およびvi)多型性BLySポリペプチドを含む融合タンパク質、のアミノ酸配列を有する組換えまたは非組換えポリペプチドのアミノ酸配列を意味する。本発明の多型性BLySポリペプチドは、生体サンプルから、あるいは天然、合成、半合成または組換えの任意の供給源から得ることができる。   As used herein, “polymorphic BLyS polypeptide” refers to i) a natural polymorphic BLyS polypeptide, ii) a fragment of the polymorphic BLyS polypeptide, iii) a polypeptide analog of the polymorphic BLyS polypeptide. Iv) a variant of a polymorphic BLyS polypeptide, v) an immunologically active fragment of the polymorphic BLyS polypeptide, and vi) a fusion protein comprising the polymorphic BLyS polypeptide, Means the amino acid sequence of a modified or non-recombinant polypeptide. The polymorphic BLyS polypeptides of the invention can be obtained from a biological sample or from any source, natural, synthetic, semi-synthetic or recombinant.

本明細書中の「BLySポリペプチド」または「APRILポリペプチド」という用語は、少なくとも約5個のアミノ酸、少なくとも約10個のアミノ酸、少なくとも約15個のアミノ酸、少なくとも約25個のアミノ酸、少なくとも約50個のアミノ酸、少なくとも約75個のアミノ酸、少なくとも約100個のアミノ酸、少なくとも約200個のアミノ酸、少なくとも約300個のアミノ酸、少なくとも約400個のアミノ酸から、多型性APRILまたはBLySポリペプチドのポリペプチド全体までを含むポリペプチドを包含する。幾つかの実施形態において、多型性APRILまたはBLySポリペプチドは生物活性を示す。例えば、ポリペプチドは、in vitroアッセイにおいて、B細胞の増殖およびイムノグロブリンの産生を引き起こす。APRILまたはBLySの生物活性に関するその他のアッセイは当技術分野で公知であり、それらを用いて多型性APRILまたはBLySポリペプチドが生物活性を示すか否かを決定することができ、所望により、APRILまたはBLySの生物活性を定量化することができる。APRILまたはBLySの生物学的アッセイは様々な刊行物、例えばMoore 等(前出)に記載されている。   As used herein, the term “BLyS polypeptide” or “APRIL polypeptide” refers to at least about 5 amino acids, at least about 10 amino acids, at least about 15 amino acids, at least about 25 amino acids, at least about A polymorphic APRIL or BLyS polypeptide from 50 amino acids, at least about 75 amino acids, at least about 100 amino acids, at least about 200 amino acids, at least about 300 amino acids, at least about 400 amino acids; Polypeptides including up to the entire polypeptide are included. In some embodiments, the polymorphic APRIL or BLyS polypeptide exhibits biological activity. For example, the polypeptide causes B cell proliferation and immunoglobulin production in an in vitro assay. Other assays for the biological activity of APRIL or BLyS are known in the art and can be used to determine whether a polymorphic APRIL or BLyS polypeptide exhibits biological activity, optionally with APRIL Alternatively, the biological activity of BLyS can be quantified. APRIL or BLyS biological assays are described in various publications such as Moore et al. (Supra).

APRILポリペプチドは、天然供給源からの単離、化学合成による製造、および標準的な組換え技術による産生等の任意の公知の方法またはそれらの方法を組み合わせによって得ることができる。APRILポリペプチドは、アフィニティークロマトグラフィー、例えば、APRILポリペプチドに特異的な抗体を固相支持体に固定化したアフィニティークロマトグラフィーを用いて、生物学的供給源から単離することができる。ポリペプチドは、発現目的に基づき常法に従って原核生物または真核生物中で発現させることができる。タンパク質の大規模な産生においては、単細胞生物、例えばE.coli、B.subtilis、S.cerevisiae等;バキュロウイルスベクターと組み合わせた昆虫細胞;脊椎動物、特に哺乳動物等の高等生物の細胞、例えばCOS7細胞、CHO細胞、HEK293細胞等を発現宿主細胞として用いることができる。場合によっては、遺伝子を真核生物細胞中で発現させることが好ましい。これによって、タンパク質が天然の折り畳みおよび翻訳後修飾といった恩恵を享受する。その後、ポリペプチドは、上述したように、細胞培養上清または細胞溶解物から、アフィニティークロマトグラフィー法またはアニオン交換/サイズ排除クロマトグラフィーを用いて単離することができる。   APRIL polypeptides can be obtained by any known method or combination of methods, such as isolation from natural sources, production by chemical synthesis, and production by standard recombinant techniques. APRIL polypeptides can be isolated from biological sources using affinity chromatography, eg, affinity chromatography in which an antibody specific for APRIL polypeptide is immobilized on a solid support. The polypeptide can be expressed in prokaryotes or eukaryotes according to routine methods based on the purpose of expression. In large-scale production of proteins, unicellular organisms such as E. coli, B. subtilis, S. cerevisiae, etc .; insect cells combined with baculovirus vectors; cells of higher organisms such as vertebrates, particularly mammals, such as COS7 Cells, CHO cells, HEK293 cells and the like can be used as expression host cells. In some cases it is preferred to express the gene in eukaryotic cells. This allows the protein to benefit from natural folding and post-translational modifications. The polypeptide can then be isolated from cell culture supernatant or cell lysate using affinity chromatography methods or anion exchange / size exclusion chromatography as described above.

大量のタンパク質またはそのフラグメントの入手可能性については、発現宿主を用いてタンパク質を常法に従って単離および精製することにより可能となる。細胞溶解物は、発現宿主から調製することができ、細胞溶解物は、HPLC、排除クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、アフィニティークロマトグラフィーまたはその他の精製技術を用いて精製することができる。単離されたタンパク質を用いて抗体を作製することができ、その抗体を用いて標準的なアッセイ系、例えばELISAまたはFACS分析により、そのタンパク質の存在を検出することができる。   The availability of a large amount of protein or a fragment thereof can be obtained by isolating and purifying the protein according to a conventional method using an expression host. Cell lysates can be prepared from expression hosts, and cell lysates can be purified using HPLC, exclusion chromatography, gel electrophoresis, affinity chromatography or other purification techniques. The isolated protein can be used to generate an antibody, which can be used to detect the presence of the protein by standard assay systems, such as ELISA or FACS analysis.

APRILおよびBLySポリペプチドの調製
以下の項で詳述した複数の使用に加え、上述したように、APRIL核酸組成物は全部または一部のAPRILポリペプチドの調製に使用される。ポリヌクレオチド(例えばcDNAまたは完全長遺伝子)は、部分的または完全な遺伝子産物を発現させるために使用される。対象となるポリヌクレオチドを含む構築物は、合成により作製することができる。また、多数のオリゴデオキシリボヌクレオチドからの遺伝子および完全なプラスミドの1段階アセンブリは、例えば、Stemmer 等, Gene (Amsterdam) (1995) 164(1):49-53に記載されている。この方法において、アセンブリPCR(多数のオリゴデオキシリボヌクレオチド(oligo)からの長いDNA配列の合成)が記載されている。この方法は、DNAシャッフリング(Stemmer, Nature (1994) 370:389-391)に基づくものであり、DNAリガーゼに依存せず、その代わりにDNAポリメラーゼに依存しており、アセンブリ工程において次第に長いDNAフラグメントが構築される。適当なポリヌクレオチド構築物は、Sambrook 等, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., (1989) Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N.Y.等に記載された標準的な組換えDNA技術を用いて、米国保健社会福祉省の組換えDNA研究に関する米国国立衛生研究所(NIH)ガイドラインに記載された現行の規制の下で精製される。
Preparation of APRIL and BLyS polypeptides In addition to the multiple uses detailed in the following sections, as described above, APRIL nucleic acid compositions are used for the preparation of all or some APRIL polypeptides. A polynucleotide (eg, cDNA or full-length gene) is used to express a partial or complete gene product. A construct containing the polynucleotide of interest can be made synthetically. Also, one-step assembly of genes from multiple oligodeoxyribonucleotides and complete plasmids is described, for example, in Stemmer et al., Gene (Amsterdam) (1995) 164 (1): 49-53. In this method, assembly PCR (synthesis of long DNA sequences from a large number of oligodeoxyribonucleotides (oligo)) has been described. This method is based on DNA shuffling (Stemmer, Nature (1994) 370: 389-391) and does not rely on DNA ligase, but instead on DNA polymerase, and gradually increases the length of DNA fragments in the assembly process. Is built. Suitable polynucleotide constructs can be prepared using standard recombinant DNA techniques described in Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., (1989) Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY, etc. Purified under current regulations set forth in the National Institutes of Health (NIH) guidelines for recombinant DNA research by the US Department of Health and Human Services.

特に、十分量の活性タンパク質を産生させて効果的な抗体を産生するために、APRILタンパク質またはBLySタンパク質の三量体化の遺伝子工学的手段を提供することが必要である。ZymoZipper配列等のポリペプチドの三量体化の具体例が、米国特許出願番号第11/530,672号およびそこで言及された参照文献に記載されている。このようなタイプのポリペプチド三量体化は、アッセイ(実施例1参照)で用いられるAPRIL/BLyS HT標準タンパク質を産生するのに有用である。   In particular, it is necessary to provide genetic engineering means of trimerization of APRIL protein or BLyS protein in order to produce sufficient amounts of active protein to produce effective antibodies. Specific examples of trimerization of polypeptides such as the ZymoZipper sequence are described in US patent application Ser. No. 11 / 530,672 and references cited therein. This type of polypeptide trimerization is useful for producing the APRIL / BLyS HT standard protein used in the assay (see Example 1).

本発明により提供されるポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド分子は、ベクター中に挿入することにより増幅する。ウイルスおよび非ウイルスベクター、例えばプラスミドが用いられる。プラスミドの選択は、所望の増幅が行われる細胞の種類および増幅の目的に依存する。あるベクターは、所望のDNA配列を多量に増幅および作製するのに有用である。他のベクターは、培養細胞中での発現に適している。さらに他のベクターは、完全な動物またはヒトの細胞中への移行および発現に適している。適当なベクターの選択は、当業者が容易に行い得る。そのような多数のベクターは市販されている。部分的または完全長ポリヌクレオチドは、典型的にはDNAリガーゼによってベクター中の切断された制限酵素部位に結合され、ベクター中に挿入される。また、所望のヌクレオチド配列は、in vivo相同組換えによって挿入され得る。これは、典型的には、所望のヌクレオチド配列の隣接領域において相同領域がベクターに結合することによって達成される。相同領域は、例えば、オリゴヌクレオチドのライゲーションによって、または、相同領域と所望のヌクレオチド配列部分とを含むプライマーを用いたポリメラーゼ連鎖反応によって付加される。   A polynucleotide molecule comprising a polynucleotide sequence provided by the present invention is amplified by insertion into a vector. Viral and non-viral vectors such as plasmids are used. The choice of plasmid depends on the type of cell in which the desired amplification is performed and the purpose of the amplification. Certain vectors are useful for amplifying and making large amounts of desired DNA sequences. Other vectors are suitable for expression in cultured cells. Still other vectors are suitable for transfer and expression into intact animal or human cells. Selection of an appropriate vector can be easily performed by those skilled in the art. Many such vectors are commercially available. Partial or full length polynucleotides are typically ligated to the cleaved restriction enzyme sites in the vector by DNA ligase and inserted into the vector. The desired nucleotide sequence can also be inserted by in vivo homologous recombination. This is typically accomplished by joining a homologous region to the vector in the flanking region of the desired nucleotide sequence. The homologous region is added, for example, by ligation of oligonucleotides or by polymerase chain reaction with primers containing the homologous region and the desired nucleotide sequence portion.

発現に関し、発現カセットまたはシステムを用いることができる。本発明のポリヌクレオチドによってコードされる遺伝子産物は、任意の簡便な発現系、例えば、バクテリア、酵母、昆虫、両生動物および哺乳動物システムにおいて発現される。好適なベクターおよび宿主は、米国特許第5,654,173号に記載されている。発現ベクターにおいて、APRILポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、所望の発現特性が得られるように、適当な調節配列に連結される。調節配列としては、例えば、プロモーター(センス鎖の5'末端またはアンチセンス鎖の3'末端に結合)、エンハンサー、ターミネーター、オペレーター、リプレッサーおよびインデューサーが挙げられる。プロモーターは制御されていても、構成的であってもよい。場合によっては、組織特異的または発達段階特異的プロモーター等の条件付活性プロモーターを用いることが好ましい。これらは、ベクターへの連結に関して上記した技術を用いて、所望のヌクレオチド配列に連結される。当技術分野で知られている任意の技術を用いることができる。つまり、発現ベクターは、転写および翻訳開始領域をもち、誘導的または構成的であってもよく、コード領域が、転写開始領域並びに転写および翻訳終結領域の転写制御下で作動可能に連結されている。これらの制御領域は、APRIL遺伝子に由来する天然のものであってもよいし、外因性供給源に由来するものであってもよい。   For expression, an expression cassette or system can be used. The gene products encoded by the polynucleotides of the invention are expressed in any convenient expression system, such as bacterial, yeast, insect, amphibian and mammalian systems. Suitable vectors and hosts are described in US Pat. No. 5,654,173. In the expression vector, the polynucleotide encoding the APRIL polypeptide is linked to suitable regulatory sequences so that the desired expression characteristics are obtained. Examples of the regulatory sequence include a promoter (bonded to the 5 ′ end of the sense strand or the 3 ′ end of the antisense strand), an enhancer, a terminator, an operator, a repressor, and an inducer. The promoter may be regulated or constitutive. In some cases, it is preferable to use a conditionally active promoter such as a tissue-specific or developmental stage-specific promoter. These are linked to the desired nucleotide sequence using the techniques described above for linkage to vectors. Any technique known in the art can be used. That is, the expression vector has a transcriptional and translational initiation region and may be inducible or constitutive, and the coding region is operably linked under transcriptional control of the transcriptional initiation region and the transcriptional and translational termination region. . These control regions may be naturally derived from the APRIL gene or may be derived from an exogenous source.

発現ベクターは、一般的には、異種タンパク質をコードする核酸配列を挿入するために、プロモーター配列の近くに位置する適当な制限部位を有する。発現宿主中で有効である選択可能なマーカーも存在し得る。発現ベクターは、融合タンパク質の製造のために用いることができ、外因性融合ペプチドによって、付加的な機能性、例えば増大したタンパク質合成、安定性、所定の抗血清やβ−ガラクトシダーゼ等の酵素マーカーとの反応性等が実現可能となる。   Expression vectors generally have suitable restriction sites located near the promoter sequence for inserting nucleic acid sequences encoding heterologous proteins. There may also be selectable markers that are effective in the expression host. The expression vector can be used for the production of a fusion protein, and with exogenous fusion peptides, additional functionality such as increased protein synthesis, stability, enzyme markers such as certain antisera and β-galactosidase and the like. It is possible to achieve the reactivity of

発現カセットは、転写開始領域、遺伝子またはそのフラグメント、および転写終結領域を含むように調製される。特に関心があるのは、通常約8アミノ酸以上の長さ、好ましくは約15アミノ酸以上の長さで、約25アミノ酸以下の長さ、最大で遺伝子の完全なオープンリーディングフレームまでの長さである機能性エピトープまたはドメインの発現を可能とする配列の使用である。DNA導入後、構築物を含む細胞は選択可能なマーカーを用いて選択され、細胞を増殖させた後、発現に用いることができる。   The expression cassette is prepared to include a transcription initiation region, gene or fragment thereof, and transcription termination region. Of particular interest are lengths of usually about 8 amino acids or more, preferably about 15 amino acids or more, about 25 amino acids or less, and up to the full open reading frame of the gene. The use of sequences that allow the expression of functional epitopes or domains. After DNA introduction, cells containing the construct are selected using a selectable marker and can be used for expression after growing the cells.

APRILポリペプチドは、発現の目的に応じて常法に従って原核生物または真核生物中で発現させることができる。タンパク質の大規模な産生において、単細胞生物、例えばE.coli、B.subtilis、S.cerevisiae等;バキュロウイルスベクターと組み合わせた昆虫細胞;脊椎動物、特に哺乳動物等の高等生物の細胞、例えばCOS7細胞、HEK293細胞、CHO細胞、アフリカツメガエル卵母細胞等を発現宿主細胞として用いることができる。場合によっては、多型性APRIL核酸分子を真核生物細胞中で発現させることが好ましい。これによって、多型性APRILタンパク質が天然の折り畳みおよび翻訳後修飾といった恩恵を享受する。また、短いペプチドを実験室で合成することもできる。完全なAPRIL配列のサブセットであるポリペプチドは、機能にとって重要なタンパク質部分を同定および研究するために用いることができる。   The APRIL polypeptide can be expressed in prokaryotes or eukaryotes according to conventional methods depending on the purpose of expression. In large-scale production of proteins, unicellular organisms such as E. coli, B. subtilis, S. cerevisiae etc .; insect cells combined with baculovirus vectors; cells of higher organisms such as vertebrates, especially mammals such as COS7 cells HEK293 cells, CHO cells, Xenopus oocytes, etc. can be used as expression host cells. In some cases it is preferred to express polymorphic APRIL nucleic acid molecules in eukaryotic cells. This allows the polymorphic APRIL protein to benefit from natural folding and post-translational modifications. Short peptides can also be synthesized in the laboratory. Polypeptides that are a subset of the complete APRIL sequence can be used to identify and study protein portions important for function.

対象となる特定の発現系としては、例えば、バクテリア、酵母、昆虫細胞および哺乳動物細胞に基づく発現系が挙げられる。これらの各カテゴリーの代表的な系を以下に示す。   Specific expression systems of interest include expression systems based on bacteria, yeast, insect cells and mammalian cells, for example. A representative system for each of these categories is shown below.

バクテリア:バクテリアにおける発現系としては、例えば、Chang 等, Nature (1978) 275:615 ; Goeddel 等, Nature (1979) 281:544 ; Goeddel 等, Nucleic Acids Res. (1980) 8:4057 ; 欧州特許第0 036,776号 ; 米国特許第4,551,433号 ; DeBoer 等, Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1983) 80:21-25 ; および Siebenlist 等, Cell (1980) 20:269 等に記載されたものが挙げられる。   Bacteria: Examples of bacterial expression systems include Chang et al., Nature (1978) 275: 615; Goeddel et al., Nature (1979) 281: 544; Goeddel et al., Nucleic Acids Res. (1980) 8: 4057; European Patent No. U.S. Pat. No. 4,551,433; DeBoer et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1983) 80: 21-25; and Siebenlist et al., Cell (1980) 20: 269, etc. Is mentioned.

酵母:酵母における発現系としては、例えば、Hinnen 等, Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1978) 75:1929 ; Ito 等, J. Bacteriol. (1983) 153:163 ; Kurtz 等, Mol. Cell. Biol. (1986) 6:142 ; Kunze 等, J. Basic Microbiol. (1985)25:141 ; Gleeson 等, J. Gen. Microbiol. (1986) 132:3459 ; Roggenkamp 等, Mol. Gen. Genet. (1986) 202:302 ; Das 等, J. Bacteriol. (1984) 158:1165 ; De Louvencourt 等, J. Bacteriol. (1983) 154:737 ; Van den Berg 等, Bio/Technology (1990)8:135 ; Kunze 等, J. Basic Microbiol. (1985)25:141 ; Cregg 等, Mol. Cell. Biol. (1985) 5:3376 ; 米国特許第4,837,148号および第4,929,555号 ; Beach and Nurse, Nature (1981) 300:706 ; Davidow等, Curr. Genet. (1985) 10:380 ; Gaillardin 等, Curr. Genet. (1985) 10:49 ; Ballance 等, Biochem. Biophys. Res. Commun. (1983) 112:284-289 ; Tilburn 等, Gene (1983) 26:205-221 ; Yelton 等, Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1984) 81:1470-1474 ; Kelly and Hynes, EMBO J. (1985) 4:475479 ; 欧州特許第0 244,234号 ; および WO 91/00357等に記載されたものが挙げられる。   Yeast: Expression systems in yeast include, for example, Hinnnen et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1978) 75: 1929; Ito et al., J. Bacteriol. (1983) 153: 163; Kurtz et al., Mol. Cell. Biol. (1986) 6: 142; Kunze et al., J. Basic Microbiol. (1985) 25: 141; Gleeson et al., J. Gen. Microbiol. (1986) 132: 3459; Roggenkamp et al., Mol. Gen. Genet. (1986) 202: 302; Das et al., J. Bacteriol. (1984) 158: 1165; De Louvencourt et al., J. Bacteriol. (1983) 154: 737; Van den Berg et al., Bio / Technology (1990) 8 Kunze et al., J. Basic Microbiol. (1985) 25: 141; Cregg et al., Mol. Cell. Biol. (1985) 5: 3376; U.S. Pat.Nos. 4,837,148 and 4,929,555; Beach and Nurse, Nature ( (1981) 300: 706; Davidow et al., Curr. Genet. (1985) 10: 380; Gaillardin et al., Curr. Genet. (1985) 10:49; Ballance et al., Biochem. Biophys. Res. Commun. (1983) 112: 284-289; Tilburn et al., Gene (1983) 26: 205-221; Yelton et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1984) 81: 1470-1474; Kelly and Hynes, EMBO J. (1985) 4: 475479; European Patent No. 0 244,234; And WO 91/00357 and the like include those described.

昆虫細胞:昆虫細胞における異種遺伝子の発現は、米国特許第4,745,051号 ; Friesen 等, "The Regulation of Baculovirus Gene Expression", in: The Molecular Biology Of Baculoviruses (1986) (W. Doerfler, ed.) ; 欧州特許第0 127,839号 ; 欧州特許第0 155,476号 ; および Vlak 等, J. Gen. Virol. (1988) 69:765-776 ; Miller 等, Ann. Rev. Microbiol. (1988) 42:177 ; Carbonell 等, Gene (1988) 73:409 ; Maeda 等, Nature (1985) 315:592-594 ; Lebacq-Verheyden 等, Mol. Cell. Biol. (1988) 8:3129 ; Smith 等, Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1985) 82:8844 ; Miyajima 等, Gene (1987) 58:273 ; および Martin 等, DNA (1988) 7:99 等に記載されるように達成される。多数のバキュロウイルス株および変異体並びに対応する許容昆虫細胞が、Luckow 等, Bio/Technology (1988) 6:47-55, Miller 等, Generic Engineering (1986) 8:277-279, および Maeda 等, Nature (1985) 315:592-594等に記載されている。   Insect cells: Expression of heterologous genes in insect cells is described in US Pat. No. 4,745,051; Friesen et al., “The Regulation of Baculovirus Gene Expression”, in: The Molecular Biology Of Baculoviruses (1986) (W. Doerfler, ed.); Europe Patent 0 127,839; European Patent 0 155,476; and Vlak et al., J. Gen. Virol. (1988) 69: 765-776; Miller et al., Ann. Rev. Microbiol. (1988) 42: 177; Carbonell et al. , Gene (1988) 73: 409; Maeda et al., Nature (1985) 315: 592-594; Lebacq-Verheyden et al., Mol. Cell. Biol. (1988) 8: 3129; Smith et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1985) 82: 8844; Miyajima et al., Gene (1987) 58: 273; and Martin et al., DNA (1988) 7:99 etc. Numerous baculovirus strains and mutants and corresponding permissive insect cells are described in Luckow et al., Bio / Technology (1988) 6: 47-55, Miller et al., Generic Engineering (1986) 8: 277-279, and Maeda et al., Nature (1985) 315: 592-594.

哺乳動物細胞:哺乳動物における発現は、Dijkema 等, EMBO J. (1985) 4:761, Gorman等, Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1982) 79:6777, Boshart 等, Cell (1985) 41:521 および 米国特許第4,399,216 等に記載されるように達成される。哺乳動物における発現のその他の特徴については、Ham and Wallace, Meth. Enz. (1979) 58:44, Barnes and Sato, Anal. Biochem. (1980) 102:255, 米国特許第4,767,704号, 第4,657,866号, 第4,927,762号, 第4,560,655号, WO 90/103430, WO 87/00195, および 米国特許第 RE 30,985号の記載が理解の助けとなる。   Mammalian cells: Expression in mammals is expressed in Dijkema et al., EMBO J. (1985) 4: 761, Gorman et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) (1982) 79: 6777, Boshart et al., Cell (1985 41: 521 and U.S. Pat. No. 4,399,216. For other characteristics of expression in mammals, see Ham and Wallace, Meth.Enz. (1979) 58:44, Barnes and Sato, Anal. Biochem. (1980) 102: 255, U.S. Pat.Nos. 4,767,704, 4,657,866. No. 4,927,762, No. 4,560,655, WO 90/103430, WO 87/00195, and US Pat. No. RE 30,985 are helpful.

上記宿主細胞またはその他の適当な宿主細胞もしくは生物のいずれかを用いて、本発明のポリヌクレオチドまたは核酸を複製および/または発現させることができ、生じた複製核酸、RNA、発現タンパク質またはポリペプチドは、宿主細胞または生物の産物として、本発明の範囲に含まれる。産物は、当技術分野で公知の任意の手段で回収される。   Any of the above host cells or other suitable host cells or organisms can be used to replicate and / or express the polynucleotide or nucleic acid of the present invention, and the resulting replicating nucleic acid, RNA, expressed protein or polypeptide is As a product of a host cell or organism, within the scope of the present invention. The product is recovered by any means known in the art.

選択されたポリヌクレオチドに対応する遺伝子が同定されると、その遺伝子の発現は、その遺伝子が由来する細胞中で調節され得る。例えば、細胞の内因性遺伝子は、該細胞中で少なくとも遺伝子発現が促進されるのに十分な位置にある、該細胞のゲノムに挿入された外因性調節配列によって調節され得る。調節配列は、米国特許第5,641,670号および第5,733,761号(これらの開示は参照により本明細書中に組み込まれる)に記載されるように、相同組換えによってゲノムに組み込まれるように設計することができるし、また、WO 99/15650(この開示は参照により本明細書中に組み込まれる)に記載されるように、非相同組換えによってゲノムに組み込まれるように設計することもできる。本発明には、本明細書中に組み込まれた上記特許文献に記載されるように、コード核酸それ自体の操作を行わないが、その代わりに、既に所望のタンパク質をコードする遺伝子を含む細胞のゲノムに調節配列を組み込むことによってAPRILタンパク質を製造することも包含される。   Once the gene corresponding to the selected polynucleotide is identified, the expression of that gene can be regulated in the cell from which the gene is derived. For example, a cell's endogenous gene can be regulated by an exogenous regulatory sequence inserted into the cell's genome, at least in a location sufficient to promote gene expression in the cell. Regulatory sequences can be designed to integrate into the genome by homologous recombination, as described in US Pat. Nos. 5,641,670 and 5,733,761, the disclosures of which are incorporated herein by reference. It can also be designed to be integrated into the genome by non-homologous recombination, as described in WO 99/15650 (the disclosure of which is incorporated herein by reference). The present invention does not operate on the encoding nucleic acid itself, as described in the above-mentioned patent documents incorporated herein, but instead of cells already containing the gene encoding the desired protein. Also encompassed is the production of APRIL proteins by incorporating regulatory sequences into the genome.

APRILおよびBLySポリペプチドに対して特異的な抗体の調製
本発明はさらに、APRILおよびBLySポリペプチドに対して特異的な抗体、特に単離された抗体の使用を包含する。本発明の抗体は、以下に詳述されるように、様々な診断アッセイに有用である。例えば、抗体は、生体サンプル中のHTレベルを検出および/または測定するために用いることができる。
Preparation of antibodies specific for APRIL and BLyS polypeptides The present invention further encompasses the use of antibodies, in particular isolated antibodies, specific for APRIL and BLyS polypeptides. The antibodies of the present invention are useful in a variety of diagnostic assays, as detailed below. For example, antibodies can be used to detect and / or measure HT levels in a biological sample.

本発明の単離されたAPRILおよびBLySポリペプチドは、抗体の産生に有用である。短いフラグメントは、特定のポリペプチドに対して特異的な抗体を提供し、より長いフラグメントまたは完全なタンパク質は、ポリペプチド表面に対する抗体の産生を可能とする。したがって、本発明の方法では、APRILポリペプチドまたはその抗原フラグメントに特異的に結合する単離抗体を用いることができる。抗体は、野生型または変異型に対して産生されてもよい。抗体は、これらのドメインまたは天然タンパク質に対応する単離ペプチドに対して産生されてもよい。抗体は、任意の哺乳動物種由来のAPRILポリペプチドおよび/またはペプチドフラグメントに対して産生されてもよい。1つの非限定的な具体例において、酵素免疫測定法(ELISA)を用いてAPRILまたはBLySポリペプチドに対する所定のモノクローナル抗体の特異性を決定することができる。   The isolated APRIL and BLyS polypeptides of the present invention are useful for the production of antibodies. Short fragments provide antibodies specific for a particular polypeptide, and longer fragments or complete proteins allow the production of antibodies against the polypeptide surface. Therefore, in the method of the present invention, an isolated antibody that specifically binds to an APRIL polypeptide or an antigen fragment thereof can be used. Antibodies may be raised against wild type or mutant forms. Antibodies may be raised against isolated peptides corresponding to these domains or natural proteins. Antibodies may be raised against APRIL polypeptides and / or peptide fragments from any mammalian species. In one non-limiting example, an enzyme immunoassay (ELISA) can be used to determine the specificity of a given monoclonal antibody for an APRIL or BLyS polypeptide.

APRILおよびBLySポリペプチドは、抗体産生に有用である。短いフラグメントは、特定のポリペプチドに対して特異的な抗体を提供し、より長いフラグメントまたは完全なタンパク質は、ポリペプチド表面に対する抗体の産生を可能とする。本明細書中の「抗体」という用語には、任意のアイソタイプ、抗原に対する特異的結合性を保持する抗体フラグメント(例えば、特に限定されるわけではないが、Fab、Fv、scFvおよびFdフラグメント)、そのような抗体フラグメントを含む融合タンパク質、検出可能に標識された抗体、およびキメラ抗体が含まれる。「抗体特異性」という用語は、抗体−抗原相互作用との関連において当技術分野で十分に理解された用語であり、所定の抗体が所定の抗原に結合するが、関連のない抗原には実質的に結合せず、結合は、抗体によって認識される抗原またはそのエピトープによって阻害され得ることを意味する。特異的抗体結合の決定法は当業者に周知であり、これを用いてAPRILまたはBLySポリペプチドに対する抗体の特異性を決定することができる。   APRIL and BLyS polypeptides are useful for antibody production. Short fragments provide antibodies specific for a particular polypeptide, and longer fragments or complete proteins allow the production of antibodies against the polypeptide surface. As used herein, the term “antibody” includes any isotype, an antibody fragment that retains specific binding to an antigen (eg, without limitation, Fab, Fv, scFv and Fd fragments), Fusion proteins containing such antibody fragments, detectably labeled antibodies, and chimeric antibodies are included. The term “antibody specificity” is a term well understood in the art in the context of antibody-antigen interactions, in which a given antibody binds to a given antigen but is not substantially related to an unrelated antigen. Binding means that it can be inhibited by an antigen recognized by the antibody or an epitope thereof. Methods for determining specific antibody binding are well known to those of skill in the art and can be used to determine the specificity of an antibody for an APRIL or BLyS polypeptide.

抗体は、発現させたポリペプチドまたはタンパク質それ自体を、あるいは、公知の免疫原性担体、例えば、KLH、pre−S HBsAg、その他のウイルスまたは真核生物タンパク質等と複合体化して、免疫原として用いる常法に従って調製される。一連の注射において、好適には様々なアジュバントが用いられる。モノクローナル抗体に関しては、1回または2回以上のブースター注射の後、脾臓を摘出し、細胞融合によってリンパ球を不死化し、次いで高親和性抗体結合性に関するスクリーニングを行う。所望の抗体を産生する不死化細胞、すなわちハイブリドーマを増殖させてもよい。さらなる説明については、Monoclonal Antibodies: A Laboratory Manual, Harlow and Lane eds., Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, N.Y., 1988を参照のこと。所望により、重鎖または軽鎖をコードするmRNAを単離し、E.coli中でのクローニングによって突然変異を生じさせ、重鎖および軽鎖を混合して抗体の親和性をさらに向上させてもよい。また、抗体産生法であるin vivo免疫に代わるものとしては、例えば、通常in vitro親和性成熟とともに行われるファージディスプレイライブラリーへの結合が挙げられる。   The antibody is used as an immunogen by complexing the expressed polypeptide or protein itself or with a known immunogenic carrier such as KLH, pre-SHBsAg, other viruses or eukaryotic proteins, etc. Prepared according to conventional methods used. Various adjuvants are preferably used in the series of injections. For monoclonal antibodies, after one or more booster injections, the spleen is removed, lymphocytes are immortalized by cell fusion, and then screened for high affinity antibody binding. Immortalized cells that produce the desired antibody, ie, hybridomas, may be grown. For further description, see Monoclonal Antibodies: A Laboratory Manual, Harlow and Lane eds., Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, N.Y., 1988. If desired, mRNA encoding the heavy or light chain may be isolated and mutated by cloning in E. coli, and the heavy and light chains may be mixed to further improve antibody affinity. . Moreover, as an alternative to in vivo immunity, which is an antibody production method, for example, binding to a phage display library, which is usually performed together with in vitro affinity maturation, can be mentioned.

抗体は、生体サンプル中のHTの存在を決定および/または測定する診断アッセイで使用するために、直接または間接的に(例えばリンカー分子を介して)固相支持体に結合させてもよい。結合は、一般的には共有結合であるが、それである必要はない。固相支持体としては、例えば、特に限定されるわけではないが、ビーズ(例えば、ポリスチレンビーズ、磁性ビーズ等);プラスチック表面(例えば、ELISAまたはラジオイムノアッセイ(RIA)で典型的に用いられるポリスチレンまたはポリカーボネート製マルチウェルプレート等);シート、例えば、ナイロン、ニトロセルロース等;チップ、例えば、マイクロアレイで用いられるSiO2チップが挙げられる。したがって、本発明はさらに、固相支持体に結合した抗体を含むアッセイ器具(device)を提供する。 The antibody may be bound to a solid support directly or indirectly (eg, via a linker molecule) for use in diagnostic assays to determine and / or measure the presence of HT in a biological sample. The bond is generally a covalent bond, but need not be. Examples of the solid support include, but are not limited to, beads (for example, polystyrene beads, magnetic beads, etc.); plastic surfaces (for example, polystyrene typically used in ELISA or radioimmunoassay (RIA)) Polycarbonate multi-well plates, etc.); sheets, such as nylon, nitrocellulose, etc .; chips, such as SiO 2 chips used in microarrays. Thus, the present invention further provides an assay device comprising an antibody bound to a solid support.

単一の抗体または一連の様々な抗体を用いてアッセイ器具を作製することができる。そのようなアッセイ器具は、当業者に公知の常法に従って作製することができる。抗体は、公知の技術を用いて精製および単離することができ、公知の方法を用いて支持体表面に結合させることができる。これによって生じた抗体結合表面を用いて試験サンプル、例えば生体サンプルをin vitroで検査し、サンプルに1種または2種以上のHT分子が含まれているか否かを決定することができる。例えば、特定のHTエピトープにのみ結合する抗体を器具(material)の表面に結合させることができる。また、特定の抗体を複数用いて配列し、2種以上の異なるHTエピトープに対して特異的な抗体が固相支持体に結合しているアレイを作製することができる。試験サンプルは、器具の表面に結合した抗体と接触させる。特異的結合は、任意の公知の方法を用いて検出することができる。特異的結合が検出されない場合、サンプルに特定のHTエピトープが含まれていないと推測することができる。特異的結合の検出法の1つの非限定的な例として、試験サンプルを、固相支持体に結合した抗体と接触させた後、固相支持体に結合した抗体によって認識されるHTエピトープとは異なるHTエピトープを認識する、検出可能に標識された第二の抗体を加えることが挙げられる。   An assay device can be made using a single antibody or a series of different antibodies. Such assay instruments can be made according to conventional methods known to those skilled in the art. The antibody can be purified and isolated using known techniques and can be bound to the support surface using known methods. The resulting antibody binding surface can be used to inspect a test sample, eg, a biological sample, in vitro to determine whether the sample contains one or more HT molecules. For example, antibodies that bind only to specific HT epitopes can be bound to the surface of the material. In addition, an array in which a plurality of specific antibodies are used and antibodies specific for two or more different HT epitopes are bound to a solid support can be prepared. The test sample is contacted with antibody bound to the surface of the device. Specific binding can be detected using any known method. If no specific binding is detected, it can be assumed that the sample does not contain a particular HT epitope. As one non-limiting example of a specific binding detection method, after contacting a test sample with an antibody bound to a solid support, what is the HT epitope recognized by the antibody bound to the solid support? Adding a detectably labeled second antibody that recognizes a different HT epitope.

本明細書に記載されたHTポリペプチドの検出アッセイにおいては、その他の様々な試薬を用いることができる。これらの試薬としては、例えば、塩、アルブミン等の中立的なタンパク質(neutral protein)、界面活性剤等が挙げられ、これらを用いることにより、タンパク質−タンパク質結合の最適化が容易となる、および/または、非特異的もしくはバックグラウンド相互作用が低減する。アッセイ効率を改善する試薬、例えばプロテアーゼ阻害剤、抗菌剤等を用いてもよい。これらの成分は、必要な結合を生じ得る任意の順序で加えられる。インキュベーションは、適当な任意の温度、典型的には4℃から40℃の間で実施される。インキュベーション時間は最適活性となるように選択されるが、高速ハイスループットスクリーニングを容易にするように最適化されてもよい。典型的には、0.1から1時間の間で十分である。   Various other reagents can be used in the HT polypeptide detection assays described herein. These reagents include, for example, neutral proteins such as salts and albumin, surfactants, and the like, and by using these, protein-protein binding can be easily optimized, and / or Alternatively, non-specific or background interactions are reduced. Reagents that improve assay efficiency, such as protease inhibitors, antibacterial agents and the like, may be used. These components are added in any order that can produce the requisite binding. Incubations are performed at any suitable temperature, typically between 4 ° C and 40 ° C. Incubation times are selected for optimal activity, but may be optimized to facilitate fast, high-throughput screening. Typically between 0.1 and 1 hour is sufficient.

二重特異性抗体は、少なくとも2つの異なるエピトープに対する結合特性を有する抗体である。典型的な二重特異性抗体は、B細胞表面マーカーの2種のエピトープに対して結合することができる。他のそのような抗体は、第一のB細胞マーカーに結合することができるとともに、第二のB細胞表面マーカーにさらに結合することができる。また、抗B細胞マーカー結合アームは、白血球上の引き金分子、例えば、T細胞受容体分子(例えばCD2またはCD3)、または、FcyRI(CD64)、FcyRII(CD32)およびFcyRIII(CD16)等のIgGに対するFc受容体(FcyR)、に結合するアームと連結し、B細胞に細胞防御機構をフォーカスすることができる。また、二重特異性抗体を用いて、細胞毒性薬をB細胞に局在化させることができる。二重特異性抗体は、B細胞マーカー結合アームと、細胞毒性薬(例えば、サポリン、抗インターフェロン、ビンカアルカロイド、リシンA鎖、メトトレキサートまたは放射性同位体ハプテン)に結合するアームとを有する。   Bispecific antibodies are antibodies that have binding properties for at least two different epitopes. A typical bispecific antibody can bind to two epitopes of a B cell surface marker. Other such antibodies can bind to the first B cell marker and can further bind to the second B cell surface marker. In addition, anti-B cell marker binding arms are directed against trigger molecules on leukocytes, such as T cell receptor molecules (eg CD2 or CD3) or IgGs such as FcyRI (CD64), FcyRII (CD32) and FcyRIII (CD16). Linking with an arm that binds to the Fc receptor (FcyR), the cell defense mechanism can be focused on B cells. Bispecific antibodies can also be used to localize cytotoxic drugs to B cells. Bispecific antibodies have a B cell marker binding arm and an arm that binds a cytotoxic agent (eg, saporin, anti-interferon, vinca alkaloid, ricin A chain, methotrexate, or a radioisotope hapten).

二重特異性抗体は、完全長抗体または抗体フラグメント(例えば、F(ab')2 二重特異性抗体)として調製することができる。二重特異性抗体の作製法は当技術分野で公知である。完全長の二重特異性抗体の従来の産生法は、2つの鎖が異なる特異性をもつように2組のイムノグロブリン重鎖−軽鎖対を共発現させることに基づく(Millstein 等, Nature, 305: 537-539 (1983))。   Bispecific antibodies can be prepared as full length antibodies or antibody fragments (eg F (ab ′) 2 bispecific antibodies). Methods for making bispecific antibodies are known in the art. Traditional production of full-length bispecific antibodies is based on the co-expression of two immunoglobulin heavy chain-light chain pairs so that the two chains have different specificities (Millstein et al., Nature, 305: 537-539 (1983)).

イムノグロブリン重鎖および軽鎖の任意の組み合わせにより、これらのハイブリドーマ(クアドローマ)は、10種の抗体分子を含み得る混合物を産生するが、そのうちの1種のみが正確な二重特異性構造を有する。この正確な分子の精製は、通常、アフィニティークロマトグラフィー工程によって行われるが、かなり煩雑であり、産物の収率が低い。類似の方法が、WO 93/08829 および Traunecker 等, EMBO J. , 10: 3655-3659 (1991) に開示されている。   With any combination of immunoglobulin heavy and light chains, these hybridomas (quadromas) produce a mixture that can contain 10 antibody molecules, only one of which has the correct bispecific structure. . This precise purification of the molecule is usually performed by an affinity chromatography step, but is quite cumbersome and the product yield is low. Similar methods are disclosed in WO 93/08829 and Traunecker et al., EMBO J., 10: 3655-3659 (1991).

異なるアプローチでは、所望の結合特異性(抗体−抗原結合部位)を有する抗体可変領域が、イムノグロブリン定常領域配列に融合される。融合において、好ましくは、ヒンジ、CH2およびCH3領域の少なくとも一部を含むイムノグロブリン重鎖定常領域が用いられる。融合体の少なくとも1つに存在する、軽鎖結合に必要な部位を含む第1重鎖定常領域(CH1)を有することが好ましい。イムノグロブリン重鎖融合体および所望によりイムノグロブリン軽鎖をコードするDNAは、別々の発現ベクターに挿入され、適当な宿主生物にコトランスフェクトされる。これによって、実施形態における3つのポリペプチドフラグメントの相互比率の調整を非常に順応性のあるものとすることができ、構築で用いられる不均衡な比率の3つのポリペプチド鎖を最適な収率とすることができる。しかしながら、少なくとも2つのポリペプチド鎖が等しい比率で発現されることによって高収率となる場合、または、その比率に特に有意差がない場合、2つまたは3つ全てのポリペプチド鎖をコードする配列を1つの発現ベクターに挿入することが可能である。   In a different approach, antibody variable regions with the desired binding specificities (antibody-antigen combining sites) are fused to immunoglobulin constant region sequences. In the fusion, preferably an immunoglobulin heavy chain constant region comprising at least part of the hinge, CH2, and CH3 regions is used. It is preferred to have a first heavy chain constant region (CH1) containing the site necessary for light chain binding, present in at least one of the fusions. The immunoglobulin heavy chain fusion and optionally the DNA encoding the immunoglobulin light chain are inserted into separate expression vectors and cotransfected into a suitable host organism. This allows the adjustment of the mutual proportions of the three polypeptide fragments in the embodiment to be very adaptable, so that the unbalanced proportions of the three polypeptide chains used in the construction are optimized and yielded. can do. However, if at least two polypeptide chains are expressed in equal proportions resulting in high yields, or if there is no significant difference in the proportions, the sequences encoding all two or three polypeptide chains Can be inserted into one expression vector.

このアプローチの好ましい実施形態では、二重特異性抗体は、一方のアームにおける第1の結合特異性を有するハイブリッド イムノグロブリン重鎖と、他方のアームにおけるハイブリッド イムノグロブリン重鎖−軽鎖対(第二の結合特異性を実現する)とから構成される。二重特異性分子の半分のみにおけるイムノグロブリン軽鎖の存在によって簡易な分離が実現可能となるため、この非対称構造によって、望ましくないイムノグロブリン鎖の混合物から、所望の二重結合性化合物の分離が実現可能となる。このアプローチは、WO 94/04690に開示されている。二重特異性抗体の生成に関するさらなる詳細については、例えば、Suresh 等, Methods in Enzymology, 121: 210 (1986)を参照のこと。米国特許第5,731,168号に記載された別のアプローチでは、1組の抗体分子間のインターフェイス(interface)を操作し、組換え細胞培養物から回収されるヘテロ二量体の割合を最大化することができる。好ましいインターフェイスは、抗体定常領域のCH3ドメインの少なくとも一部を含む。この方法では、第一の抗体分子のインターフェイスに由来する1または2以上の小さなアミノ酸側鎖が、より大きな側鎖(例えばチロシンまたはトリプトファン)で置換される。大きなアミノ酸側鎖がより小さなアミノ酸側鎖(例えばアラニンまたはスレオニン)と置換されることによって、大きな側鎖と同一または類似のサイズの代償性「キャビティ」(compensatory "cavites")が、第二の抗体分子のインターフェイスに作られる。これにより、ホモ二量体等の望ましくないその他の最終産物を上回るヘテロ二量体の収率増大の機構が実現される。   In a preferred embodiment of this approach, the bispecific antibody comprises a hybrid immunoglobulin heavy chain having a first binding specificity in one arm and a hybrid immunoglobulin heavy chain-light chain pair (second) in the other arm. To achieve the binding specificity of This asymmetric structure allows separation of the desired double-binding compound from a mixture of unwanted immunoglobulin chains, since the presence of an immunoglobulin light chain in only half of the bispecific molecule can be achieved. It becomes feasible. This approach is disclosed in WO 94/04690. For further details regarding the generation of bispecific antibodies see, for example, Suresh et al., Methods in Enzymology, 121: 210 (1986). Another approach described in US Pat. No. 5,731,168 involves manipulating the interface between a set of antibody molecules to maximize the proportion of heterodimers recovered from recombinant cell culture. it can. A preferred interface comprises at least part of the CH3 domain of an antibody constant region. In this method, one or more small amino acid side chains from the interface of the first antibody molecule are replaced with larger side chains (eg tyrosine or tryptophan). By replacing a large amino acid side chain with a smaller amino acid side chain (eg, alanine or threonine), a compensatory "cavites" of the same or similar size as the large side chain may become a second antibody. Made to molecular interface. This provides a mechanism for increased yield of heterodimers over other undesirable end products such as homodimers.

二重特異性抗体としては、例えば、架橋または「ヘテロ複合体(heteroconjugate)」抗体が挙げられる。具体的には、ヘテロ複合体における一方の抗体はアビジンに結合し、他方はビオチンに結合し得る。そのような抗体は、例えば、望ましくない細胞に対して(米国特許第4,676,980号)およびHIV感染の治療のために(WO 91/00360, WO 92/200373およびEP 03089)免疫系細胞を標的化とすることが提案されている。ヘテロ複合体抗体は、任意の適当な架橋法を用いて作製することができる。適当な架橋剤は当技術分野で周知であり、米国特許第4,676,980号に多数の架橋技術とともに開示されている。   Bispecific antibodies include, for example, cross-linked or “heteroconjugate” antibodies. Specifically, one antibody in the heterocomplex can bind to avidin and the other can bind to biotin. Such antibodies, for example, target immune system cells against unwanted cells (US Pat. No. 4,676,980) and for the treatment of HIV infection (WO 91/00360, WO 92/200373 and EP 03089). It has been proposed to do. Heteroconjugate antibodies can be made using any suitable cross-linking method. Suitable crosslinking agents are well known in the art and are disclosed in US Pat. No. 4,676,980 along with a number of crosslinking techniques.

また、抗体フラグメントから二重特異性抗体を生成するための技術が文献に記載されている。例えば、二重特異性抗体は、化学結合を用いて調製することができる。Brennan 等, Science, 229: 81 (1985) には、インタクトな抗体がタンパク質分解的に切断されることによってF(ab')2フラグメントを生成させる方法が記載されている。これらのフラグメントは、ジチオール錯化剤である亜ヒ酸ナトリウムの存在下で還元され、隣接ジチオールを安定化し、分子間ジスルフィド形成を阻害する。次いで、生成したFab'フラグメントは、チオニトロベンゾエート(TNB)誘導体に変換される。次いで、Fab'−TNB誘導体の一部は、メルカプトエチルアミンを用いた還元によってFab'−チオールにさらに変換され、Fab'−TNB誘導体の他部と等モル量で混合され、二重特異性抗体が形成される。産生された二重特異性抗体は、酵素の選択的固定化のための試薬として用いることができる。   Techniques for generating bispecific antibodies from antibody fragments are also described in the literature. For example, bispecific antibodies can be prepared using chemical linkage. Brennan et al., Science, 229: 81 (1985) describes a method in which intact antibodies are proteolytically cleaved to generate F (ab ′) 2 fragments. These fragments are reduced in the presence of the dithiol complexing agent sodium arsenite to stabilize vicinal dithiols and inhibit intermolecular disulfide formation. The resulting Fab ′ fragment is then converted to a thionitrobenzoate (TNB) derivative. A portion of the Fab′-TNB derivative is then further converted to Fab′-thiol by reduction with mercaptoethylamine, mixed in equimolar amounts with the rest of the Fab′-TNB derivative, and the bispecific antibody is It is formed. The produced bispecific antibody can be used as a reagent for selective immobilization of an enzyme.

最近の進展によって、化学的結合によって二重特異性抗体を形成し得るFab'−SHフラグメントをE.coliから直接回収することが容易に実現可能となった。Shalaby 等, J. Exp. Med., 175: 217-225 (1992) には、完全ヒト化二重特異性抗体 F(ab')2分子の産生が記載されている。各Fab'フラグメントは、E.coliから別々に分泌され、in vitroで直接的に化学的結合を施されて二重特異性抗体を形成する。こうして形成された二重特異性抗体は、ErbB2受容体が過剰発現した細胞および正常ヒトT細胞に結合することができるとともに、ヒト乳癌標的に対するヒト細胞傷害性リンパ球の溶解活性を引き起こすことができる。   Recent developments have made it easy to recover directly from E. coli Fab′-SH fragments that can form bispecific antibodies by chemical conjugation. Shalaby et al., J. Exp. Med., 175: 217-225 (1992) describe the production of fully humanized bispecific antibody F (ab ′) 2 molecules. Each Fab ′ fragment is secreted separately from E. coli and directly chemically ligated in vitro to form bispecific antibodies. The bispecific antibody thus formed can bind to cells overexpressing ErbB2 receptor and normal human T cells and can cause lytic activity of human cytotoxic lymphocytes against human breast cancer targets. .

二重特異性抗体フラグメントを組換え細胞培養物から直接的に作製および単離する種々の技術が公知である。例えば、二重特異性抗体は、ロイシンジッパーを用いて産生される(Kostelny 等, J. Immunol., 148 (5): 1547-1553 (1992))。FosおよびJunタンパク質由来のロイシンジッパーペプチドは、遺伝子融合によって2種の抗体のFab部分と結合する。   Various techniques for making and isolating bispecific antibody fragments directly from recombinant cell culture are known. For example, bispecific antibodies are produced using leucine zippers (Kostelny et al., J. Immunol., 148 (5): 1547-1553 (1992)). Leucine zipper peptides derived from Fos and Jun proteins bind to the Fab portions of the two antibodies by gene fusion.

抗体ホモ二量体がヒンジ領域において還元されると、単量体が形成され、次いで再度酸化されると、抗体ヘテロ二量体が形成される。この方法は、抗体ホモ二量体の産生にも用いることができる。   When the antibody homodimer is reduced in the hinge region, a monomer is formed and then reoxidized to form an antibody heterodimer. This method can also be used to produce antibody homodimers.

Hollinger 等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 6444-6448 (1993) に記載された「二機能性抗体(diabody)」技術によって、別のメカニズムによる二重特異性抗体フラグメントの作製が実現可能となった。フラグメントは、リンカーによって軽鎖可変領域(VL)に結合した重鎖可変領域(VH)を含む。リンカーは短すぎるため、同一鎖上における2つの領域間の対形成をなし得ない。したがって、1つのフラグメントのVHおよびVLドメインは、他のフラグメントの相補的なVLおよびVHドメインと対形成させられ、これにより、2つの抗原結合部位が形成される。また、二重特異性抗体フラグメントを作製するための別のストラテジーとして、一本鎖Fv(sFv)二量体の使用が報告されている。Gruber 等, J. Immunology, 152: 5368 (1994)参照。二価以上の抗体も意図されている。例えば、三重特異性抗体を調製することができる(Tuttet 等, J. Immunol. 147: 60(1991))。   Bilingual antibody fragments can be generated by another mechanism by the “diabody” technology described in Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 6444-6448 (1993). It became feasible. The fragment includes a heavy chain variable region (VH) linked to a light chain variable region (VL) by a linker. Because the linker is too short, it cannot pair between two regions on the same strand. Thus, the VH and VL domains of one fragment are paired with the complementary VL and VH domains of the other fragment, thereby forming two antigen binding sites. Also, the use of single chain Fv (sFv) dimers has been reported as another strategy for producing bispecific antibody fragments. See Gruber et al., J. Immunology, 152: 5368 (1994). Bivalent or higher antibodies are also contemplated. For example, trispecific antibodies can be prepared (Tuttet et al., J. Immunol. 147: 60 (1991)).

診断アッセイ
本発明はさらに、生体サンプル中のHT mRNAの存在および/またはレベルを検出する方法、並びに、生体サンプル中のHTポリペプチドの存在および/またはレベルを検出する方法を提供する。
Diagnostic Assays The present invention further provides a method for detecting the presence and / or level of HT mRNA in a biological sample, and a method for detecting the presence and / or level of HT polypeptide in a biological sample.

特に好ましい実施形態では、HT分子のみが検出されるような、サンプル中の各サブユニットの一連の検出を含む。これは、標準的ELISAを適用した方法を用いて行われる。特に、APRILまたはBLySに対する抗体を固定化し(例えば、ビーズに結合させ)、この抗体にサンプルを接触させる。抗体特異的なサブユニトを含む分子は結合する一方、そのサブユニットを含まないホモ三量体は洗い流される。次いで、結合した分子を、第二のサブユニットに対する検出可能な(標識された)抗体(例えばビオチン化)と接触させ、第二のサブユニットをも含む最初に捕捉された分子(HTである分子)が検出される。さらに具体的には、第一の抗体がAPRILに対するものである場合、全てのホモ三量体BLyS分子は最初の工程で洗い流される。これらの分子を、BLySに対して特異的な第二の抗体と接触させると、全てのホモ三量体APRIL分子は結合せずに洗い流される。こうして、残存するシグナルは、サンプル中のHT分子(BLySおよびAPRILの両者を含む)を表示するものである。公知の標準的な2APRIL/1BLyS HT分子が、標準的濃度曲線を描くために用いられ、得られた実験シグナルは、この標準的曲線と比較され、生体サンプル中のHT濃度が測定される。   A particularly preferred embodiment involves a series of detections of each subunit in the sample such that only HT molecules are detected. This is done using a method applying a standard ELISA. In particular, an antibody against APRIL or BLyS is immobilized (eg, bound to a bead) and the sample is contacted with the antibody. Molecules that contain antibody-specific subunits bind, while homotrimers that do not contain that subunit are washed away. The bound molecule is then contacted with a detectable (labeled) antibody to the second subunit (eg, biotinylation) and the first captured molecule (the molecule that is HT) that also contains the second subunit. ) Is detected. More specifically, if the first antibody is against APRIL, all homotrimeric BLyS molecules are washed away in the first step. When these molecules are contacted with a second antibody specific for BLyS, all homotrimeric APRIL molecules are washed away without binding. Thus, the remaining signal is indicative of HT molecules (including both BLyS and APRIL) in the sample. A known standard 2APRIL / 1BLyS HT molecule is used to draw a standard concentration curve and the resulting experimental signal is compared to this standard curve to determine the HT concentration in the biological sample.

その他の実施形態において、個体に由来する生体サンプル中のHT mRNAレベルを検出する方法が提供され、この方法は、個体に由来するポリヌクレオチドサンプルを、HTポリペプチドをコードするmRNAのレベルについて分析することを含む。HT mRNAレベルは、自己免疫疾患と関連し得る。   In other embodiments, a method is provided for detecting HT mRNA levels in a biological sample from an individual, the method analyzing a polynucleotide sample from the individual for the level of mRNA encoding the HT polypeptide. Including that. HT mRNA levels can be associated with autoimmune diseases.

さらに他の実施形態において、生体サンプル中のHTポリペプチドの存在および/またはレベルを検出する方法が提供される。   In yet another embodiment, a method is provided for detecting the presence and / or level of an HT polypeptide in a biological sample.

特定の生体サンプル中のHT核酸分子(例えばHTmRNA)またはHTポリペプチドの発現レベルを決定するための多数の方法を用いることができる。診断は、患者サンプル中の正常または異常HT mRNAの不存在または存在、あるいは変化量を決定する多数の方法によって行われる。例えば、検出は、常法に従って細胞または組織切片を標識抗体で染色することをよって行われる。細胞は透過化され、細胞質分子が染色される。対象となる抗体は、細胞サンプルに加えられ、エピトープに結合するのに十分な時間、通常少なくとも約10分間、インキュベートされる。抗体は、放射性同位体、酵素、蛍光化合物、化学発光化合物または直接的な検出のためのその他の標識で標識することができる。また、二次抗体または試薬を用いてシグナルを増幅することができる。そのような試薬は当技術分野で周知である。例えば、一次抗体にビオチンを結合させ、西洋ワサビペルオキシダーゼ結合アビジンを二次試薬として加える。また、蛍光化合物、例えば、フルオレセイン、ローダミン、テキサスレッド等に結合させた二次抗体を用いることができる。最終的な検出は、ペルオキシダーゼの存在下で色の変化を生じる基質を用いて行われる。抗体結合の不存在または存在は、種々の方法、例えば、解離細胞のフローサイトメトリー、顕微鏡法、ラジオグラフィー、シンチレーション計測等によって決定することができる。また、HTポリペプチドの存在および/またはレベルは、当業者に公知の任意の方法によって検出および/または定量することができる。   A number of methods for determining the expression level of HT nucleic acid molecules (eg, HT mRNA) or HT polypeptides in a particular biological sample can be used. Diagnosis is made by a number of methods that determine the absence or presence, or amount of change, of normal or abnormal HT mRNA in a patient sample. For example, detection is performed by staining a cell or tissue section with a labeled antibody according to a conventional method. Cells are permeabilized and cytoplasmic molecules are stained. The antibody of interest is added to the cell sample and incubated for a time sufficient to bind to the epitope, usually at least about 10 minutes. The antibody can be labeled with a radioisotope, enzyme, fluorescent compound, chemiluminescent compound or other label for direct detection. Alternatively, the signal can be amplified using a secondary antibody or reagent. Such reagents are well known in the art. For example, biotin is bound to the primary antibody, and horseradish peroxidase-conjugated avidin is added as a secondary reagent. Further, a secondary antibody bound to a fluorescent compound such as fluorescein, rhodamine, Texas red, etc. can be used. Final detection is performed with a substrate that produces a color change in the presence of peroxidase. The absence or presence of antibody binding can be determined by various methods such as flow cytometry of dissociated cells, microscopy, radiography, scintillation counting, and the like. Also, the presence and / or level of HT polypeptide can be detected and / or quantified by any method known to those of skill in the art.

さらに、試験は、HT mRNAの発現測定を含み得る。HTコード領域または対照領域中の配列多型が疾患と関連するか否かを決定するために、生化学的研究が実施される。疾患に関連する多型としては、例えば、遺伝子の欠失または切断、発現レベルを変化させる変異、タンパク質活性に影響を与える変異等が挙げられる。   Further, the test can include an expression measurement of HT mRNA. Biochemical studies are performed to determine whether sequence polymorphisms in the HT coding region or control region are associated with the disease. Examples of the polymorphism associated with the disease include gene deletion or truncation, mutation that changes the expression level, mutation that affects protein activity, and the like.

HTの発現レベルに影響を与え得るプロモーターまたはエンハンサー配列の変化は、当技術分野で公知の種々の方法によって、正常対立遺伝子の発現レベルと比較され得る。プロモーターまたはエンハンサー強度を決定する方法としては、例えば、発現された天然タンパク質の定量;β−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、クロラムフェニコール アセチルトランスフェラーゼ等の簡便な定量を実現可能とするリポーター遺伝子と種々の制御要素とのベクターへの挿入等が挙げられる。   Changes in promoter or enhancer sequences that can affect the expression level of HT can be compared to the expression level of the normal allele by various methods known in the art. Methods for determining promoter or enhancer strength include, for example, quantification of expressed natural protein; reporter gene and various control elements that enable simple quantification of β-galactosidase, luciferase, chloramphenicol acetyltransferase, etc. And insertion into a vector.

本発明の診断方法は、HTレベルに主眼があり、典型的には、目的のサンプル中のHT核酸またはタンパク質の存在度を対照値と比較して任意の相対的な相違を決定することが含まれる。この相違は、定性的および/定量的に測定することができ、異常HTレベルの存在または不存在と関係付けられる。サンプル中の核酸の存在度を決定する異なる種々の方法が当業者に公知であり、対象となる特定の方法としては、例えば、Pietu 等, Genome Res. (June 1996) 6: 492-503 ; Zhao et 等, Gene (Apr. 24, 1995) 156: 207-213 ; Soares, Curr. Opin. Biotechnol. (October 1997) 8: 542-546 ; Raval, J. Pharmacol Toxicol Methods (November 1994) 32: 125-127 ; Chalifour 等, Anal. Biochem (Feb. 1, 1994) 216: 299-304 ; Stolz & Tuan, Mol. Biotechnol. (December 19960 6: 225-230 ; Hong 等, Bioscience Reports (1982) 2: 907 ; および McGraw, Anal. Biochem. (1984) 143: 298 に記載されたものが挙げられる。また、対象となる方法は、WO 97/27317に開示されており、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。   The diagnostic methods of the present invention focus on HT levels and typically include comparing the abundance of HT nucleic acids or proteins in a sample of interest to a control value to determine any relative differences. It is. This difference can be measured qualitatively and / or quantitatively and is related to the presence or absence of abnormal HT levels. Various different methods for determining the abundance of nucleic acids in a sample are known to those skilled in the art, and specific methods of interest include, for example, Pietu et al., Genome Res. (June 1996) 6: 492-503; Zhao et al., Gene (Apr. 24, 1995) 156: 207-213; Soares, Curr. Opin. Biotechnol. (October 1997) 8: 542-546; Raval, J. Pharmacol Toxicol Methods (November 1994) 32: 125- 127; Chalifour et al., Anal. Biochem (Feb. 1, 1994) 216: 299-304; Stolz & Tuan, Mol. Biotechnol. (December 19960 6: 225-230; Hong et al., Bioscience Reports (1982) 2: 907; And McGraw, Anal. Biochem. (1984) 143: 298. Also, the subject method is disclosed in WO 97/27317, the disclosure of which is hereby incorporated by reference. It is.

その発現レベルが特定の生理的状態と「相関する」または「関連する」遺伝子について、その発現が生理的状態と統計的に有意な相関を示す遺伝子が意図されている。発現差がある遺伝子の発現レベルと特定の生理的状態の存在または不存在との相関強度は、有意性の統計的検定によって決定することができる。統計的スコアを相関に割り当てる(assign)ことによって、発現差がある遺伝子の発現レベルと特定の生理的状態との相関強度を決定する方法は、Holloway 等. (2002) Nature Genetics Suppl. 32:481-89, Churchill (2002) Nature Genetics Suppl. 32:490-95, Quackenbush (2002) Nature Genetics Suppl. 32: 496-501; Slonim (2002) Nature Genetics Suppl. 32:502-08; and Chuaqui 等. (2002) Nature Genetics Suppl. 32:509-514 に概説されており、各文献はその全体が参照により本明細書に組み込まれる。統計的スコアを用いて、その発現レベルが特定の生理的状態と最も相関性を有する遺伝子を選択することができ、これにより、本発明の方法の診断または予測精度を増大させることができる。   For genes whose expression level is “correlated” or “related” to a particular physiological state, genes whose expression is statistically significant to the physiological state are contemplated. The strength of the correlation between the expression level of genes with differential expression and the presence or absence of a particular physiological state can be determined by statistical testing of significance. A method for determining the strength of correlation between the expression level of a differentially expressed gene and a specific physiological state by assigning a statistical score to the correlation is described by Holloway et al. (2002) Nature Genetics Suppl. 32: 481 -89, Churchill (2002) Nature Genetics Suppl. 32: 490-95, Quackenbush (2002) Nature Genetics Suppl. 32: 496-501; Slonim (2002) Nature Genetics Suppl. 32: 502-08; and Chuaqui et al. 2002) Nature Genetics Suppl. 32: 509-514, each of which is incorporated herein by reference in its entirety. Statistical scores can be used to select genes whose expression levels are most correlated with a particular physiological state, thereby increasing the diagnostic or predictive accuracy of the methods of the invention.

自己免疫疾患の重症度または進行度と関連するさらなる試験を、上述したHT試験と組み合わせることにより、完全な診断または予測結果が実現可能となる。   By combining further tests associated with the severity or progression of autoimmune disease with the HT tests described above, complete diagnostic or predictive results can be achieved.

例えば、米国リウマチ学会は、SLE診断のための11の基準を設定しており、それは皮膚、全身および臨床試験(laboratory test)におけるSLEの臨床スペクトルに及ぶ。これらの基準には、頬部発疹、円板状発疹、光線過敏症、口内炎、関節炎、漿膜炎、腎臓および中枢神経系炎症、血液変化、並びに抗核抗体が含まれる。SLE患者として分類されるためには、患者がこれらの基準のうち4つを満たす必要がある(Tan 等 (1982) Arthritis Rheumatol. 25:1271-1277)。SLEは、通常、検査、例えば、特に限定されるわけではないが、抗核抗体を検出するための血液検査;腎臓機能を評価するための血液および尿検査;SLEと関連することが多い低レベルでの補体の存在を検出するための補体検査;炎症レベルを測定するための沈降率(ESR)またはC反応性タンパク質(CRP);肺障害を評価するためのX線および心臓障害を評価するためのEKG、によって確認される。   For example, the American College of Rheumatology has set eleven criteria for the diagnosis of SLE, which covers the clinical spectrum of SLE in skin, systemic and laboratory tests. These criteria include cheek rashes, discoid rashes, photosensitivity, stomatitis, arthritis, serositis, kidney and central nervous system inflammation, blood changes, and antinuclear antibodies. In order to be classified as a SLE patient, the patient must meet four of these criteria (Tan et al. (1982) Arthritis Rheumatol. 25: 1271-1277). SLE is usually a test, such as, but not limited to, a blood test to detect antinuclear antibodies; a blood and urine test to assess kidney function; a low level often associated with SLE Complement tests to detect the presence of complement in the body; sedimentation rate (ESR) or C-reactive protein (CRP) to measure inflammatory levels; assess X-ray and heart damage to assess lung damage To be confirmed by EKG.

薬物処置の効果のモニタリング
HTタンパク質レベルに対する薬剤(例えば、薬物、化合物)の影響(例えば、転写活性化の調節)のモニタリングは、基本的な薬物のスクリーニングだけではなく、臨床試験にも適用することができる。例えば、本明細書に記載されるスクリーニングアッセイによって決定された薬剤の、HTタンパク質レベルを低減させる効果が、低減したHT遺伝子発現またはタンパク質レベルを示す被験者の臨床試験においてモニタリングされ得る。そのような臨床試験において、HT遺伝子の発現または活性、および、好ましくは、例えばHTタンパク質レベルに関連する疾患に関与するその他の遺伝子の発現または活性を、特定の細胞(本発明の場合にはB細胞)の表現型の「出力(read out)」またはマーカーとして用いることができる。
Monitoring the effects of drug treatments Monitoring the effects of drugs (eg drugs, compounds) on HT protein levels (eg modulation of transcriptional activation) should be applied not only to basic drug screening but also to clinical trials. Can do. For example, the effect of reducing HT protein levels of an agent determined by the screening assays described herein can be monitored in clinical trials of subjects exhibiting reduced HT gene expression or protein levels. In such clinical trials, the expression or activity of the HT gene and, preferably, the expression or activity of other genes involved in diseases associated with, for example, HT protein levels, is measured in particular cells (B in the present invention). Cell) phenotype "read out" or as a marker.

幾つかの実施形態では、本発明は、薬剤(例えば、アゴニスト、アンタゴニスト、ペプチド模倣薬、タンパク質、ペプチド、核酸、小分子またはその他の薬物)による被験者の処置効果をモニタリングする方法を提供する。この方法は、(i)薬剤を投与する前の患者に由来する投与前サンプルを得る工程、(ii)投与前サンプル中のHTタンパク質またはmRNAの発現レベルを検出する工程、(iii)投与後の被験者に由来する1または2以上の投与後サンプルを得る工程、(iv)投与後サンプル中のHTタンパク質またはmRNAの発現または活性レベルを検出する工程、(v)投与前サンプル中のHTタンパク質またはmRNAの発現または活性レベルを、投与後サンプル中のHTタンパク質またはmRNAと比較する工程、および(vi)被験者への薬剤投与を状況に応じて変化させる工程を含む。このような実施形態では、HT発現または活性を、観察可能な表現型応答が存在しない場合でさえ、薬剤の効果の指標として用いることができる。   In some embodiments, the present invention provides a method of monitoring the treatment effect of a subject with an agent (eg, agonist, antagonist, peptidomimetic, protein, peptide, nucleic acid, small molecule or other drug). The method comprises the steps of (i) obtaining a pre-administration sample from a patient prior to administering the drug, (ii) detecting the expression level of HT protein or mRNA in the pre-administration sample, (iii) after administration Obtaining one or more post-administration samples derived from a subject, (iv) detecting the expression or activity level of HT protein or mRNA in the post-administration sample, (v) HT protein or mRNA in the pre-administration sample Comparing the level of expression or activity of HT to the HT protein or mRNA in the post-administration sample, and (vi) changing the administration of the drug to the subject as appropriate. In such embodiments, HT expression or activity can be used as an indicator of the effect of a drug even in the absence of an observable phenotypic response.

異なる組織におけるHTの基本的発現レベルは、特定の多型の存在または不存在について決定された個体に由来する組織サンプルの分析によって決定することができる。任意の適当な方法、例えば、タンパク質定量に関してはELISA、RIA等、mRNA定量に関してはノーザンブロットまたはその他のハイブリダイゼーション分析、定量RT−PCR等を用いることができる。組織特異的発現は、遺伝子型と相関している。   The basic expression level of HT in different tissues can be determined by analysis of tissue samples from individuals determined for the presence or absence of a particular polymorphism. Any suitable method can be used, such as ELISA, RIA, etc. for protein quantification, Northern blot or other hybridization analysis, quantitative RT-PCR, etc. for mRNA quantification. Tissue specific expression correlates with genotype.

修飾因子に応答したHT発現の変化は、候補修飾因子を発現系、例えば、動物、細胞、in vitro転写アッセイ等に投与するまたは結合させることによって決定される。HT転写および/または定常状態mRNAレベルに対する修飾因子の効果が決定される。基本的発現レベルに関しては、組織特異的相互作用が主眼である。相関は、HTレベルに影響を与える発現修飾因子の能力と、所定の多型の存在との間で表される。異なる修飾因子、細胞型等の集団(panel)についてスクリーニングすることにより、多数の異なる条件下での効果を決定することができる。   Changes in HT expression in response to a modifier are determined by administering or binding the candidate modifier to an expression system, such as an animal, cell, in vitro transcription assay, or the like. The effect of the modifier on HT transcription and / or steady state mRNA levels is determined. With respect to basic expression levels, tissue-specific interactions are the focus. A correlation is expressed between the ability of an expression modifier to affect HT levels and the presence of a given polymorphism. By screening for panels of different modifiers, cell types, etc., the effect under a number of different conditions can be determined.

処置方法
本発明は、血清中の増大したHTレベルと関連する症状を有すると臨床的に診断された個体を処置する方法を提供する。この方法は、一般的には、生体サンプルを分析してHTレベルを測定すること、およびそのレベルを健常対照のHTレベルと比較することを含む。次いで、増大したHTレベルと関連する自己免疫疾患等の症状を有すると臨床的に診断された個体に最も効果的な処置計画が選択され、次いで、患者が状況に応じて処置される。本発明はさらに、患者が増大したHTレベルと関連する症状に対する薬物処置に応答する可能性を予測する方法を提供する。この方法は、患者のHT遺伝子の発現を決定することを含み、この方法において、SLE等の自己免疫疾患と関連する増大したHTレベルの存在は、患者がその疾患に対する薬物処置に応答する可能性の予兆である。
Method of Treatment The present invention provides a method of treating an individual clinically diagnosed as having symptoms associated with increased HT levels in serum. This method generally involves analyzing a biological sample to determine HT levels and comparing that level to that of a healthy control. The treatment regimen that is most effective for individuals who are clinically diagnosed as having symptoms such as autoimmune disease associated with increased HT levels is then selected, and the patient is then treated accordingly. The present invention further provides a method for predicting the likelihood that a patient will respond to drug treatment for symptoms associated with increased HT levels. The method includes determining the expression of the patient's HT gene, wherein the presence of increased HT levels associated with an autoimmune disease such as SLE may cause the patient to respond to drug treatment for the disease. It is a sign of.

別の側面において、本発明は、HT発現に関する個体の治療処置を個体の薬物応答に応じて調整(tailoring)する方法を提供する。ファーマコジェノミックスは、臨床医または医師が予防的または治療的処置を、該処置から最も恩恵を受ける患者に対して適用することを可能とするとともに、薬物毒性関連副作用を被るおそれのある患者の処置を避けることを可能とする。   In another aspect, the present invention provides a method of tailoring an individual's therapeutic treatment for HT expression in response to the individual's drug response. Pharmacogenomics allows clinicians or physicians to apply prophylactic or therapeutic treatment to patients who will benefit most from the treatment, as well as for patients who may suffer from drug toxicity-related side effects. Makes it possible to avoid treatment.

自己免疫疾患
以下は、本明細書で開示されたHT測定アッセイの使用が、その処置の助けとなり得る自己免疫疾患の非限定的な例示である。B細胞関連自己免疫疾患、例えば、関節炎(関節リウマチ、若年性関節リウマチ、変形性関節症、乾癬性関節炎)、乾癬、アトピー性皮膚炎等の皮膚炎;慢性自己免疫性蕁麻疹、多発性筋炎/皮膚筋炎、中毒性表皮剥離症、全身性強皮症および硬化症、炎症性大腸炎(IBD)に関連する応答(クローン病、潰瘍性大腸炎)、呼吸窮迫症候群、成人呼吸窮迫症候群(ARDS)、髄膜炎、アレルギー性鼻炎、脳炎、ブドウ膜炎、大腸炎、糸球体腎炎、アレルギー症状、湿疹、喘息、T細胞の浸潤および慢性炎症反応を伴う症状、アテローム性動脈硬化症、自己免疫性心筋炎、白血球接着不全症、全身性エリテマトーデス(SLE)、ループス(例えば、腎炎、非腎性、円板状、脱毛症)、若年型糖尿病、多発性硬化症、アレルギー性脳脊髄炎、サイトカインおよびTリンパ球によって媒介される急性および遅延型過敏症に関連する免疫応答、結核、サルコイドーシス、肉芽腫症(例えばウェゲナー肉芽腫症)、無顆粒球症、血管炎(例えばANCA)、再生不良性貧血、クームス陽性貧血、ダイアモンドブラックファン貧血、免疫溶血性貧血(例えば自己免疫性溶血性貧血(AIHA))、悪性貧血、赤芽球癆(PRCA)、第VIII因子欠乏症、血友病A、自己免疫性好中球減少症、汎血球減少症、白血球減少症、白血球漏出を伴う疾患、CNS炎症性疾患、多臓器不全症候群、重症筋無力症、抗原−抗体複合体が媒介する疾患、抗糸球体基底膜抗体病、抗リン脂質抗体症候群、アレルギー性神経炎、ベーチェット病、キャッスルマン症候群、グッドパスチャー症候群、Lambert-Eaton筋無力症候群、レイノー症候群、シェーグレン症候群、スティーブンス−ジョンソン症候群、固形臓器移植片拒絶反応(例えば高パネル反応性抗体力価のための前処理、組織におけるIgA沈着等)、移植片対宿主病(GVHD)、水疱性類天疱瘡、天疱瘡(例えば、尋常性天疱瘡、落葉状天疱瘡)、自己免疫性多腺性内分泌障害、ライター病、スティフマン症候群、巨細胞性動脈炎、免疫複合体性腎炎、IgA腎症、IgM多発性神経障害またはIgM媒介神経障害、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、自己免疫性血小板減少症、精巣および卵巣の自己免疫疾患(例えば、自己免疫性精巣炎および卵巣炎)、原発性甲状腺機能低下症;自己免疫性内分泌疾患(例えば自己免疫性甲状腺炎)、慢性甲状腺炎(橋本甲状腺炎)、亜急性甲状腺炎、特発性甲状腺機能低下症、アジソン病、グレーブス病、多腺性自己免疫症候群(または多腺性内分泌障害症候群)、インスリン依存性糖尿病(IDDM)とも呼ばれるI型糖尿病およびシーハン症候群;自己免疫性肝炎、リンパ球様間質性肺炎(HIV)、閉塞性細気管支炎(非移植)vsNSIP、ギラン−バレー症候群、大血管の血管炎(例えば、リウマチ性多発筋痛および巨細胞性(高安)動脈炎)、中血管の血管炎(例えば、川崎病および結節性多発動脈炎)、強直性脊椎炎、ベルジェ病(IgA腎症)、急速進行性糸球体腎炎、原発性胆汁性肝硬変症、セリアック病(グルテン性腸症)、クリオグロブリン血症、ALS、および冠動脈疾患。
Autoimmune Diseases The following are non-limiting examples of autoimmune diseases where the use of the HT measurement assay disclosed herein can aid in their treatment. B cell-related autoimmune diseases such as arthritis (rheumatoid arthritis, juvenile rheumatoid arthritis, osteoarthritis, psoriatic arthritis), psoriasis, atopic dermatitis and other dermatitis; chronic autoimmune urticaria, polymyositis / Dermatomyositis, toxic epidermis, systemic scleroderma and sclerosis, inflammatory bowel disease (IBD) related responses (Crohn's disease, ulcerative colitis), respiratory distress syndrome, adult respiratory distress syndrome (ARDS) ), Meningitis, allergic rhinitis, encephalitis, uveitis, colitis, glomerulonephritis, allergic symptoms, eczema, asthma, symptoms involving T cell infiltration and chronic inflammatory reaction, atherosclerosis, autoimmunity Myocarditis, leukocyte adhesion deficiency, systemic lupus erythematosus (SLE), lupus (eg, nephritis, non-renal, discoid, alopecia), juvenile diabetes, multiple sclerosis, allergic encephalomyelitis Immune response associated with acute and delayed hypersensitivity mediated by cytokines and T lymphocytes, tuberculosis, sarcoidosis, granulomatosis (eg Wegener's granulomatosis), agranulocytosis, vasculitis (eg ANCA), poor regeneration Anemia, Coombs-positive anemia, diamond blackfan anemia, immunohemolytic anemia (eg, autoimmune hemolytic anemia (AIHA)), pernicious anemia, erythroblastoma (PRCA), factor VIII deficiency, hemophilia A, Autoimmune neutropenia, pancytopenia, leukopenia, disease with leukocyte leakage, CNS inflammatory disease, multiple organ dysfunction syndrome, myasthenia gravis, antigen-antibody complex mediated disease, anti Glomerular basement membrane antibody disease, antiphospholipid antibody syndrome, allergic neuritis, Behcet's disease, Castleman syndrome, Goodpasture syndrome, Lambert-Eat on myasthenia syndrome, Raynaud's syndrome, Sjogren's syndrome, Stevens-Johnson syndrome, solid organ graft rejection (eg pretreatment for high panel reactive antibody titers, IgA deposition in tissues, etc.), graft-versus-host disease (GVHD), bullous pemphigoid, pemphigus (eg, pemphigus vulgaris, deciduous pemphigus), autoimmune multiglandular endocrine disorder, Reiter's disease, stiff man syndrome, giant cell arteritis, immune complex Nephritis, IgA nephropathy, IgM polyneuropathy or IgM-mediated neuropathy, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP), thrombotic thrombocytopenic purpura (TTP), autoimmune thrombocytopenia, testis and ovary Autoimmune diseases (eg autoimmune orchitis and ovitis), primary hypothyroidism; autoimmune endocrine diseases (eg autoimmune thyroiditis), patience With thyroiditis (Hashimoto thyroiditis), subacute thyroiditis, idiopathic hypothyroidism, Addison's disease, Graves' disease, multigland autoimmune syndrome (or multigland endocrine disorder syndrome), insulin-dependent diabetes mellitus (IDDM) Type I diabetes and Sheehan syndrome; autoimmune hepatitis, lymphoid interstitial pneumonia (HIV), obstructive bronchiolitis (non-transplant) vs NSIP, Guillain-Barre syndrome, macrovascular vasculitis (eg, rheumatic) Polymyalgia and giant cell (Takayasu) arteritis), mesovascular vasculitis (eg Kawasaki disease and nodular polyarteritis), ankylosing spondylitis, Berger's disease (IgA nephropathy), rapidly progressive glomeruli Nephritis, primary biliary cirrhosis, celiac disease (gluten enteropathy), cryoglobulinemia, ALS, and coronary artery disease.

BLySおよび/またはAPRILアンタゴニスト
自己免疫疾患に罹患する患者において高いHTレベルが観察される場合、このことは、患者がBLySおよび/またはAPRILの阻害に対して好ましい応答を示す可能性を示唆する。したがって、本発明はまた、上昇したHTレベルを有する患者における自己免疫疾患の処置に用いられるBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストを含む。以下は、そのような患者を処置するために用いることができるBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストの代表例である。BLySおよび/またはAPRILアンタゴニストとして機能する目的において、いずれかのTNFRファミリー受容体の細胞外ドメインは、一般的にBLySに結合する能力を維持する膜貫通または細胞質ドメインを本質的に含まないポリペプチドである。具体的には、TACIの細胞外ドメインは、TACIポリペプチド配列(配列番号2)の1−154アミノ酸を含み得る。さらに、ECDは、この配列のフラグメントまたは変異体、例えば、von Bulow 等(前出), WO 98/39361, WO 00/40716, WO 01/85782, WO 01/87979, および WO 01/81417に記載されるようなTACIのECD形態であり得る。特に、これらのECD形態は、配列番号2のアミノ酸1−106、配列番号2のアミノ酸1−142、配列番号2のアミノ酸30−154、配列番号2のアミノ酸30−106、配列番号2のアミノ酸30−110、配列番号2のアミノ酸30−119、配列番号2のアミノ酸1−166、配列番号2のアミノ酸1−165、配列番号2のアミノ酸1−114、配列番号2のアミノ酸1−119、配列番号2のアミノ酸1−120、および配列番号2のアミノ酸1−126を含み得る。さらに、TACIのECDは、システインリッチドメインを1つだけ有するそれらの分子を含み得る。
BLyS and / or APRIL antagonists When high HT levels are observed in patients suffering from autoimmune disease, this suggests that patients may respond favorably to inhibition of BLyS and / or APRIL. Thus, the present invention also includes BLyS and / or APRIL antagonists used for the treatment of autoimmune diseases in patients with elevated HT levels. The following are representative examples of BLyS and / or APRIL antagonists that can be used to treat such patients. For purposes of functioning as a BLyS and / or APRIL antagonist, the extracellular domain of any TNFR family receptor is a polypeptide that is essentially free of transmembrane or cytoplasmic domains that generally maintain the ability to bind to BLyS. is there. Specifically, the extracellular domain of TACI can comprise 1-154 amino acids of the TACI polypeptide sequence (SEQ ID NO: 2). In addition, ECD is described in fragments or variants of this sequence, such as von Bulow et al. (Supra), WO 98/39361, WO 00/40716, WO 01/85782, WO 01/87979, and WO 01/81417. It can be the ECD form of TACI. In particular, these ECD forms are amino acids 1-106 of SEQ ID NO: 2, amino acids 1-142 of SEQ ID NO: 2, amino acids 30-154 of SEQ ID NO: 2, amino acids 30-106 of SEQ ID NO: 2, amino acids 30 of SEQ ID NO: 2 -110, amino acids 30-119 of SEQ ID NO: 2, amino acids 1-166 of SEQ ID NO: 2, amino acids 1-165 of SEQ ID NO: 2, amino acids 1-114 of SEQ ID NO: 2, amino acids 1-119 of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 2 amino acids 1-120, and amino acids 1-126 of SEQ ID NO: 2. Furthermore, the TACI ECD may contain those molecules that have only one cysteine-rich domain.

BAFF−RのECD形態としては、例えば、BAFF−Rポリペプチド配列(配列番号4)のアミノ酸1−71を含むECD形態が挙げられる。さらに、ECDは、この配列のフラグメントまたは変異体、例えば、WO 02/24909、WO 03/14294およびWO 02/38766に記載されるようなBAFF−RのECD形態であり得る。特に、これらのECD形態は、配列番号4のアミノ酸1−77、配列番号4のアミノ酸7−77、配列番号4のアミノ酸1−69、配列番号4のアミノ酸7−69、配列番号4のアミノ酸2−62、配列番号4のアミノ酸2−71、配列番号4のアミノ酸1−61、配列番号4のアミノ酸2−63、配列番号4のアミノ酸1−45、配列番号4のアミノ酸1−39、配列番号4のアミノ酸7−39、配列番号4のアミノ酸1−17、配列番号4のアミノ酸39−64、配列番号4のアミノ酸19−35、および配列番号4のアミノ酸17−42を含み得る。さらに、BAFF−RのECDは、システインリッチドメインを有するそれらの分子を含み得る。   Examples of the ECD form of BAFF-R include an ECD form comprising amino acids 1-71 of the BAFF-R polypeptide sequence (SEQ ID NO: 4). Furthermore, the ECD can be a fragment or variant of this sequence, for example the ECD form of BAFF-R as described in WO 02/24909, WO 03/14294 and WO 02/38766. In particular, these ECD forms are amino acids 1-77 of SEQ ID NO: 4, amino acids 7-77 of SEQ ID NO: 4, amino acids 1-69 of SEQ ID NO: 4, amino acids 7-69 of SEQ ID NO: 4, amino acids 2 of SEQ ID NO: 4 -62, amino acids 2-71 of SEQ ID NO: 4, amino acids 1-61 of SEQ ID NO: 4, amino acids 2-63 of SEQ ID NO: 4, amino acids 1-45 of SEQ ID NO: 4, amino acids 1-39 of SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 4 amino acids 7-39, amino acids 1-17 of SEQ ID NO: 4, amino acids 39-64 of SEQ ID NO: 4, amino acids 19-35 of SEQ ID NO: 4, and amino acids 17-42 of SEQ ID NO: 4. Further, the EFF of BAFF-R may include those molecules that have a cysteine rich domain.

BCMAのECD形態としては、例えば、BCMAポリペプチド配列(配列番号6)のアミノ酸1−48を含むものが挙げられる。さらに、ECD形態は、この配列のフラグメントまたは変異体、例えば、WO 00/40716およびWO 05/075511に記載されるようなBCMAのECD形態であり得る。特に、これらのECD形態は、配列番号6のアミノ酸1−150、配列番号6のアミノ酸1−48、配列番号6のアミノ酸1−41、配列番号6のアミノ酸8−41、配列番号6のアミノ酸8−37、配列番号6のアミノ酸8−88、配列番号6のアミノ酸41−88、配列番号6のアミノ酸1−54、配列番号6のアミノ酸4−55、配列番号6のアミノ酸4−51、および配列番号6のアミノ酸21−53を含み得る。さらに、BCMAのECDは、システインリッチドメインの一部分のみを有するそれらの分子を含み得る。   Examples of ECD forms of BCMA include those containing amino acids 1-48 of the BCMA polypeptide sequence (SEQ ID NO: 6). Furthermore, the ECD form may be a fragment or variant of this sequence, for example the ECD form of BCMA as described in WO 00/40716 and WO 05/075511. In particular, these ECD forms are amino acids 1-150 of SEQ ID NO: 6, amino acids 1-48 of SEQ ID NO: 6, amino acids 1-41 of SEQ ID NO: 6, amino acids 8-41 of SEQ ID NO: 6, amino acids 8 of SEQ ID NO: 6 -37, amino acids 8-88 of SEQ ID NO: 6, amino acids 41-88 of SEQ ID NO: 6, amino acids 1-54 of SEQ ID NO: 6, amino acids 4-55 of SEQ ID NO: 6, amino acids 4-51 of SEQ ID NO: 6, and sequences It may comprise amino acids 21-53 of number 6. In addition, the BCMA ECD may include those molecules having only a portion of the cysteine-rich domain.

さらなる実施形態では、BLyS受容体のBLyS結合領域(例えば、BAFF−R、BCMAまたはTACIの細胞外ドメインまたはそのフラグメント)をイムノグロブリン分子のFc部分に融合させることにより、そのin vivoにおける溶解を促進させることができる。一実施形態では、BLySおよび/またはAPRILアンタゴニストは、100nM以下の結合親和性でBLySポリペプチドに結合する。別の実施形態では、BLySおよび/またはAPRILアンタゴニストは、10nM以下の結合親和性でBLySポリペプチドに結合する。さらに別の実施形態では、BLySおよび/またはAPRILアンタゴニストは、1nM以下の結合親和性でBLySポリペプチドに結合する。   In a further embodiment, the BLyS binding region of the BLyS receptor (eg, the extracellular domain of BAFF-R, BCMA or TACI or a fragment thereof) is fused to the Fc portion of an immunoglobulin molecule to facilitate its in vivo lysis. Can be made. In one embodiment, the BLyS and / or APRIL antagonist binds to the BLyS polypeptide with a binding affinity of 100 nM or less. In another embodiment, the BLyS and / or APRIL antagonist binds to the BLyS polypeptide with a binding affinity of 10 nM or less. In yet another embodiment, the BLyS and / or APRIL antagonist binds to a BLyS polypeptide with a binding affinity of 1 nM or less.

別の具体例において、BLySおよび/またはAPRILアンタゴニストには、天然配列またはその変異体ではないBLyS結合ポリペプチドが含まれる。そのようなポリペプチドの幾つかの具体例は、WO 05/000351に記載される式I、式II、式IIIの配列を有するものである。特に、幾つかの結合ポリペプチドとしては、例えば、ECFDLLVRAWVPCSVLK(配列番号13)、ECFDLLVRHWVPCGLLR(配列番号14)、ECFDLLVRRWVPCEMLG(配列番号15)、ECFDLLVRSWVPCHMLR(配列番号16)、ECFDLLVRHWVACGLLR(配列番号17)、または WO 05/000351の図32に列挙された配列が挙げられる。   In another embodiment, BLyS and / or APRIL antagonists include BLyS binding polypeptides that are not native sequences or variants thereof. Some specific examples of such polypeptides are those having the sequences of formula I, formula II, formula III described in WO 05/000351. In particular, some binding polypeptides include, for example, ECFDLLVRAWVPCSVLK (SEQ ID NO: 13), ECFDLLVRHWVPCGLLR (SEQ ID NO: 14), ECFDLLVRRWVPCEMLG (SEQ ID NO: 15), ECFDLLVRSWVPCHMLLR (SEQ ID NO: 16), ECFDLVLRWRW, SEQ ID NO: 16 Listed are the sequences listed in FIG. 32 of 05/000351.

また、BLySおよび/またはAPRILアンタゴニストは、天然配列TACI、BAFF−RまたはBCMAの細胞外ドメインに、そのBLyS結合領域において結合し、BLyS結合をin vitro、in situまたはin vivoで部分的にまたは完全にブロック、阻害または無効化することができる。例えば、そのような間接的なアンタゴニストは、BLySの結合が立体的に妨害されるようにTACIのある領域に結合するTACI抗体である。例えば、アミノ酸72−109または隣接領域における結合は、BLySの結合をブロックすると考えられる。また、アミノ酸82−222の領域で起こると考えられる、この分子に対するAPRILの結合のブロックも有利である。別のBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストは、ヒトBAFF−RのBLySに対する結合が立体的に妨害されるようにBAFF−Rのある領域に結合するBAFF−R抗体である。例えば、アミノ酸23−38もしくはアミノ酸17−42または隣接領域における結合は、BLySの結合をブロックすると考えられる。最後に、さらなる間接的なアンタゴニストは、BLySの結合が立体的に妨害されるようにAPRILのある領域に結合するAPRIL抗体である。例えば、アミノ酸5−43または隣接領域における結合は、BLyS(またはAPRIL)の結合をブロックすると考えられる。   In addition, BLyS and / or APRIL antagonists bind to the extracellular domain of native sequence TACI, BAFF-R or BCMA in their BLyS binding region and partially or completely bind BLyS binding in vitro, in situ or in vivo. Can be blocked, inhibited or disabled. For example, such an indirect antagonist is a TACI antibody that binds to a region of TACI such that BLyS binding is sterically hindered. For example, binding at amino acids 72-109 or adjacent regions is thought to block BLyS binding. Also advantageous is the blocking of APRIL binding to this molecule, which is thought to occur in the region of amino acids 82-222. Another BLyS and / or APRIL antagonist is a BAFF-R antibody that binds to a region of BAFF-R such that the binding of human BAFF-R to BLyS is sterically hindered. For example, binding at amino acids 23-38 or amino acids 17-42 or adjacent regions is believed to block BLyS binding. Finally, an additional indirect antagonist is an APRIL antibody that binds to a region of APRIL such that BLyS binding is sterically hindered. For example, binding at amino acids 5-43 or adjacent regions is thought to block binding of BLyS (or APRIL).

幾つかの実施形態において、本発明のBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストにはBLyS抗体が含まれる。「抗体」という用語は最も広い意味で用いられ、例えば、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ポリエピトープ特異性を有する抗体、一本鎖抗体、および抗体フラグメントが含まれる。幾つかの実施形態では、本発明のポリペプチドは、抗体が結合してTACI、BAFF−RまたはBCMAに対するBLySの結合を阻害することができるように、あるいは、BLySシグナルを阻害することができるように、例えば可変領域またはCDRにおける抗体フレームワークに融合される。本発明のポリペプチドを含む抗体は、キメラ抗体、ヒト化抗体、またはヒト抗体であり得る。本発明のポリペプチドを含む抗体は、抗体フラグメントであり得る。また、本発明の抗体は、本発明のポリペプチドで動物を免疫することにより産生することができる。このように、本発明のポリペプチドに対する抗体が意図されている。   In some embodiments, the BLyS and / or APRIL antagonists of the invention include BLyS antibodies. The term “antibody” is used in the broadest sense and includes, for example, monoclonal antibodies, polyclonal antibodies, antibodies with polyepitope specificity, single chain antibodies, and antibody fragments. In some embodiments, the polypeptides of the invention may allow the antibody to bind and inhibit BLyS binding to TACI, BAFF-R or BCMA, or to inhibit a BLyS signal. For example fused to an antibody framework in the variable region or CDR. An antibody comprising a polypeptide of the invention can be a chimeric antibody, a humanized antibody, or a human antibody. An antibody comprising a polypeptide of the invention can be an antibody fragment. The antibody of the present invention can be produced by immunizing an animal with the polypeptide of the present invention. Thus, antibodies against the polypeptides of the present invention are contemplated.

特に、ヒトBLyS(配列番号8)の残基162−275ならびに/または162、163、206、211、231、233、264および265からなる群より選択されたアミノ酸の隣接アミノ酸を含み、ヒトBLyS(配列番号8)のある領域内に結合する、BLySに対して特異的な抗体が意図されている。抗体の結合によって、1または2以上の受容体に対するBLySの結合が立体的に妨害される。そのような抗体はWO 02/02641およびWO 03/055979に記載されている。特に好ましい抗体は、リンフォスタット(Lymphostat)−B(Baker 等 (2003) Arthritis Rheum, 48, 3253-3265)として記載されるものである。   In particular, it comprises residues 162-275 of human BLyS (SEQ ID NO: 8) and / or contiguous amino acids of amino acids selected from the group consisting of 162, 163, 206, 211, 231, 233, 264 and 265, and human BLyS ( Antibodies specific for BLyS that bind within a region of SEQ ID NO: 8) are contemplated. Antibody binding sterically hinders the binding of BLyS to one or more receptors. Such antibodies are described in WO 02/02641 and WO 03/055979. A particularly preferred antibody is that described as Lymphostat-B (Baker et al. (2003) Arthritis Rheum, 48, 3253-3265).

その他の免疫抑制薬
本発明の方法では、その他の免疫抑制薬を単独であるいはBLySおよび/またはAPRIL阻害剤と組み合わせて使用することが意図される。その他の免疫抑制薬としては、例えば、特に限定されるわけではないが、カルシニューリン阻害剤(例えばシクロスポリンAまたはFK506)、ステロイド(例えばメチルプレドニゾンまたはプレドニゾン)等の免疫抑制薬、または免疫細胞の成長を阻止する免疫抑制薬(例えばラパマイシン)、抗CD40経路阻害剤(例えば、抗CD40抗体、抗CD40リガンド抗体およびCD40経路の小分子阻害剤)、移植サルベージ経路阻害剤(例えばミコフェノール酸モフェチル(MMF))、IL−2受容体アンタゴニスト(例えばホフマン ラ ロッシュ社のZeonpax.COPYRGT.およびノバルティス社のSimulet)またはそのアナログ、シクロホスファミド、サリドマイド、アザチオプリン、モノクローナル抗体(例えば、ダクリズマブ(抗インターロイキン(IL)−2)、インフリキシマブ(抗腫瘍壊死因子)、MEDI−205(抗CD2))、abx−cb1(抗CD147)、およびポリクローナル抗体(例えば、抗胸腺細胞グロブリン)が挙げられる。
Other Immunosuppressive Agents In the methods of the present invention, it is contemplated that other immunosuppressive agents are used alone or in combination with BLyS and / or APRIL inhibitors. Examples of other immunosuppressive drugs include, but are not limited to, immunosuppressive drugs such as calcineurin inhibitors (eg, cyclosporin A or FK506), steroids (eg, methylprednisone or prednisone), or growth of immune cells. Blocking immunosuppressants (eg, rapamycin), anti-CD40 pathway inhibitors (eg, anti-CD40 antibodies, anti-CD40 ligand antibodies and CD40 pathway small molecule inhibitors), transplanted salvage pathway inhibitors (eg, mycophenolate mofetil (MMF)) ), IL-2 receptor antagonists (eg, Hoffman La Roche Zeonpax. COPYRGT. And Novartis Simulet) or analogs thereof, cyclophosphamide, thalidomide, azathioprine, monoclonal antibodies (eg For example, daclizumab (anti-interleukin (IL) -2), infliximab (anti-tumor necrosis factor), MEDI-205 (anti-CD2)), abx-cb1 (anti-CD147), and polyclonal antibodies (eg anti-thymocyte globulin) Is mentioned.

製剤処方
本発明で用いられるBLyS結合抗体等のBLySおよび/またはAPRILアンタゴニストの治療製剤は、所望の精製度を有する抗体を製剤学的に許容し得る任意の担体、賦形剤、安定剤(Remitgtorz's Pharmaceutical Science 16th edition, Osol, A. Ed. (1980))と混合し、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で調製され、保存される。許容し得る担体、賦形剤または安定剤は、用いられる用量および濃度において受容者に無毒であり、例えば、リン酸緩衝液、クエン酸緩衝液およびその他の有機酸緩衝液等の緩衝液;アスコルビン酸およびメチオニン等の抗酸化物質;保存剤(例えば、オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチルまたはベンジルアルコール;メチルまたはプロピルパラベ等のアルキルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3−ペンタノール;およびm−クレゾール);低分子量(約10残基未満)ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチンまたはイムノグロブリン等のタンパク質;ポリビニルピロリドン等の親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニンまたはリジン等のアミノ酸;グルコース、マンノースまたはデキストリン等の単糖類、二糖類およびその他の糖類;EDTA等のキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロースまたはソルビトール等の糖類;ナトリウム等の塩形成対イオン;金属複合体(例えば、Zn−タンパク質複合体);および/またはTWEEN、PLURONICSTMまたはポリエチレングリコール(PEG)等の非イオン性界面活性剤が挙げられる。
Pharmaceutical Formulations The therapeutic formulations of BLyS and / or APRIL antagonists, such as the BLyS binding antibodies used in the present invention, can be any carrier, excipient, stabilizer (Remitgtorz's) that is pharmaceutically acceptable for antibodies with the desired degree of purification. Pharmaceutical Science 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)), prepared and stored in the form of a lyophilized formulation or an aqueous solution. Acceptable carriers, excipients or stabilizers are non-toxic to recipients at the dosages and concentrations used; for example, buffers such as phosphate buffers, citrate buffers and other organic acid buffers; Antioxidants such as acids and methionine; preservatives (eg octadecyldimethylbenzylammonium chloride; hexamethonium chloride; benzalkonium chloride, benzethonium chloride; phenol, butyl or benzyl alcohol; alkyl parabens such as methyl or propyl parabe; catechol; Resorcinol; cyclohexanol; 3-pentanol; and m-cresol); low molecular weight (less than about 10 residues) polypeptide; protein such as serum albumin, gelatin or immunoglobulin; hydrophilic polymer such as polyvinylpyrrolidone; Amino acids such as syn, glutamine, asparagine, histidine, arginine or lysine; monosaccharides such as glucose, mannose or dextrin, disaccharides and other saccharides; chelating agents such as EDTA; sugars such as sucrose, mannitol, trehalose or sorbitol; sodium Non-ionic surfactants such as salt-forming counterions such as; metal complexes (eg, Zn-protein complexes); and / or TWEEN, PLURONICS or polyethylene glycol (PEG).

また、本発明の製剤は、特定の適応症の処置に必要な2以上の活性化合物を含有してもよく、好ましくは、それらは互いに悪影響を及ぼさない補完的な活性を有する。例えば、細胞毒性薬、化学療法薬、サイトカインまたは免疫抑制薬(例えば、T細胞に対して作用する免疫抑制薬(例えばシクロスポリン)またはT細胞に結合する抗体(例えばLFA−1に結合する抗体))をさらに含有することが好ましい場合がある。上記のような他の薬剤の有効量は、製剤中の抗体量、疾患または障害の種類、治療の種類、および上述したその他の因子に依存する。一般的には、本明細書に記載されるのと同一の用量および投与経路で用いられるか、または従来の用量の約1〜99%で用いられる。   The formulations of the present invention may also contain two or more active compounds necessary for the treatment of a particular indication, preferably they have complementary activities that do not adversely affect each other. For example, cytotoxic drugs, chemotherapeutic drugs, cytokines or immunosuppressive drugs (eg, immunosuppressive drugs that act on T cells (eg, cyclosporine) or antibodies that bind to T cells (eg, antibodies that bind to LFA-1)) It may be preferable to further contain. The effective amount of other agents as described above depends on the amount of antibody in the formulation, the type of disease or disorder, the type of treatment, and other factors discussed above. Generally, it is used at the same dose and route of administration as described herein, or at about 1-99% of conventional doses.

また、有効成分は、例えばコアセルベーション法または界面重合によって調製されたマイクロカプセル、例えばヒドロキシメチルセルロースまたはゼラチン−マイクロカプセルおよびポリ(メチルメタクリレート)マイクロカプセルに封入してもよいし、コロイド薬物送達システム(例えば、リポソーム、アルブミン小球体、マイクロエマルション、ナノ粒子およびナノカプセル)またはマクロエマルションに封入してもよい。そのような技術は、Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980) に記載されている。   The active ingredient may also be encapsulated in microcapsules prepared by, for example, coacervation or interfacial polymerization, such as hydroxymethylcellulose or gelatin-microcapsules and poly (methyl methacrylate) microcapsules, or colloid drug delivery systems ( For example, they may be encapsulated in liposomes, albumin microspheres, microemulsions, nanoparticles and nanocapsules) or macroemulsions. Such techniques are described in Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980).

徐放性製剤を調製してもよい。徐放性製剤の好適な例としては、アンタゴニストを含有する固体疎水性ポリマーの半透過性マトリックスが挙げられ、マトリックスは、例えばフィルムまたはマイクロカプセル等の造形品形態である。徐放性マトリックスの例としては、ポリエステル、ヒドロゲル(例えば、ポリ(2−ヒドロキシエチル−メタクリレート)またはポリ(ビニルアルコール))、ポリラクチド(米国特許第3,773,919号)、L−グルタミン酸およびL−グルタミン酸エチルのコポリマー、非分解性エチレンビニルアセテート、LUPRON DEPOT(乳酸−グリコール酸共重合体および酢酸ロイプロリドで構成される注射可能なマイクロスフェア)等の分解性乳酸−グルコール酸共重合体、およびポリ−D−(−)−3−ヒドロキシ酪酸が挙げられる。
in vivo投与に用いられる製剤は滅菌の必要がある。滅菌は、滅菌濾過膜による濾過によって容易に実現される。
Sustained release formulations may be prepared. Suitable examples of sustained release formulations include semi-permeable matrices of solid hydrophobic polymers containing antagonists, where the matrix is in the form of a shaped article such as a film or microcapsule. Examples of sustained release matrices include polyesters, hydrogels (eg, poly (2-hydroxyethyl-methacrylate) or poly (vinyl alcohol)), polylactides (US Pat. No. 3,773,919), L-glutamic acid, and ethyl L-glutamate. Degradable lactic acid-glycolic acid copolymers such as copolymers, non-degradable ethylene vinyl acetate, LUPRON DEPOT (injectable microspheres composed of lactic acid-glycolic acid copolymer and leuprolide acetate), and poly-D- ( -)-3-hydroxybutyric acid.
Formulations used for in vivo administration need to be sterilized. Sterilization is easily achieved by filtration through a sterile filtration membrane.

以下の実施例は、本発明における作製法および使用法に関する開示および記載を当業者に提供するものであるが、本発明者等が本発明であると考えている範囲を限定する意図はないし、以下の実験が実施された全てのまたは唯一の実験であることを表す意図はない。用いられる数値(例えば、量、温度等)に関して正確性を確保するための努力がなされたが、ある程度の実験誤差および偏差が生じる可能性がある。特に示さない限り、部は重量部、分子量は重量平均分子量、温度はセ氏温度、および圧力は大気圧またはその付近である。   The following examples provide those skilled in the art with disclosures and descriptions regarding the methods of making and using them in the present invention, but are not intended to limit the scope of what the inventors regard as the present invention, There is no intent to represent that the following experiment is all or the only experiment performed. Efforts have been made to ensure accuracy with respect to numbers used (eg amounts, temperature, etc.) but some experimental errors and deviations may occur. Unless indicated otherwise, parts are parts by weight, molecular weight is weight average molecular weight, temperature is in degrees Centigrade, and pressure is at or near atmospheric.

実施例1:HTレベル測定アッセイ
試薬:
ビーズに結合した抗APRIL抗体(例えば、BioRad xMap bead 106(Hercules,CA)に結合したZGEN抗APRIL抗体E9617)(クローン319.6.8.5))
ビオチン化抗BLyS抗体(ビオチン化ZGEN 抗BLyS抗体E4731(クローン258.2.1.9.1.3))
ストレプトアビジン−PE(Jackson ImmunoResearch. Labs,Inc(West Grove,PA)#016−110−084)
マルチスクリーンプレート(Millipore(Billerica,MA),MABVN1250)
ELISA B(ELISA C+1%BSA+NaAz)
APRIL/BLySヘテロ三量体 LOT A1642F 標準品(25ng/mL),QC1(7.5ng/mL),およびQC2(500pg/mL)(2APRILサブユニット,1BLySサブユニット)
サンプル
ヒトAB血清(BLySおよびAPRILが低含有量であることについて予めスクリーニングされている)
攪拌器
Example 1: HT level measurement assay reagent:
Anti-APRIL antibody conjugated to beads (eg, ZGEN anti-APRIL antibody E9617 conjugated to BioRad xMap bead 106 (Hercules, CA)) (clone 319.6.8.5))
Biotinylated anti-BLyS antibody (Biotinylated ZGEN anti-BLyS antibody E4731 (clone 258.2.1.9.1.3))
Streptavidin-PE (Jackson ImmunoResearch. Labs, Inc (West Grove, PA) # 016-110-084)
Multi-screen plate (Millipore (Billerica, MA), MABVN1250)
ELISA B (ELISA C + 1% BSA + NaAz)
APRIL / BLyS heterotrimer LOT A1642F standard (25 ng / mL), QC1 (7.5 ng / mL), and QC2 (500 pg / mL) (2APRIL subunit, 1BLyS subunit)
Sample human AB serum (prescreened for low content of BLyS and APRIL)
mixer

1)全ての試薬を室温とする。
2)プレートのブロック:ELSA B100μLを全てのウェルに加え、吸引しながら10分間攪拌する。
3)ビーズを30秒間ボルテックスし、30秒間超音波処理する。
a.添加するビーズ容量の決定:25μL/ウェルのELISA B中の5K ビーズ/ウェル
b.1つのプレート全てに2.5mL+5E5ビーズ
4)全てのウェルについて、1ウェルあたりビーズ混合物25μLを加える。
5)標準品の希釈:A1642F標準品(25ng/mL)をELISA Bで希釈し(1:3で6回)、7段階の希釈系列(25000,8333,2778,926,309,103および34pg/mL)を調製する。
6)A1に25000pg/mL標準品を、B1に8333pg/mL標準品を、25μL加える。
7)A2にQC1を25μL加え、B2にQC2を25μL加える。
8)血清25μLを全ての標準品、バックグラウンドおよびQCウェルに加える。
9)ELISA B 25μLを全てのサンプルウェルおよびバックグラウンドウェルに加える。
10)血清サンプル25μLを各サンプルウェルに加える。*,**
11)プレートを密閉し、ホイルで覆う。600RPM、室温(RT)で60分間攪拌器に設置する。
12)吸引する。プレートをELISA B 2×100μLで洗浄する。
13)1μg/mLの抗体E4731−ビオチンを25μL/ウェル加える。
14)プレートを密閉し、ホイルで覆う。600RPMで60分間、攪拌器に設置する。
15)洗浄および吸引を行うことなく、ELISA Bで希釈したSA−PE(1:100)を25μL/ウェル加える。
16)プレートを密閉し、ホイルで覆う。600RPMで30分間、攪拌器に設置する。
17)吸引する。プレートをELISA B 2×100μLで洗浄する。
18)ELISA Bを110μL/ウェル加える。600RPMで5分間混合する。
19)ルミネックス100を実行する。
1) Bring all reagents to room temperature.
2) Plate block: Add 100 μL of ELSA B to all wells and stir for 10 minutes with aspiration.
3) Vortex the beads for 30 seconds and sonicate for 30 seconds.
a. Determination of added bead volume: 5K beads / well in 25 μL / well ELISA B b. 2.5 mL + 5E5 beads on all plates 4) Add 25 μL of bead mixture per well for all wells.
5) Dilution of standard: A1642F standard (25 ng / mL) was diluted with ELISA B (6 times 1: 3), and 7 dilution series (25000, 8333, 2778, 926, 309, 103 and 34 pg / mL).
6) Add 25 μL of 25000 pg / mL standard to A1 and 8333 pg / mL standard to B1.
7) Add 25 μL of QC1 to A2 and add 25 μL of QC2 to B2.
8) Add 25 μL of serum to all standards, background and QC wells.
9) Add 25 μL of ELISA B to all sample and background wells.
10) Add 25 μL of serum sample to each sample well. *, **
11) Seal the plate and cover with foil. Place in a stirrer at 600 RPM, room temperature (RT) for 60 minutes.
12) Aspirate. Wash plate with 2 × 100 μL of ELISA B.
13) Add 25 μL / well of 1 μg / mL of antibody E4731-biotin.
14) Seal the plate and cover with foil. Place on stirrer at 600 RPM for 60 minutes.
15) Add 25 μL / well of SA-PE (1: 100) diluted in ELISA B without washing and aspiration.
16) Seal the plate and cover with foil. Place in stirrer at 600 RPM for 30 minutes.
17) Aspirate. Wash plate with 2 × 100 μL of ELISA B.
18) Add 110 μL / well of ELISA B. Mix for 5 minutes at 600 RPM.
19) Run Luminex 100.

Figure 0005902478
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サンプルは無希釈(neat)および次の希釈度:1:4、1:8および1:16で処理することが非常に重要である。これは、天然HT複合体の解離を可能とするために必要であるが、血清効果ではない。血清濃度は、サンプルを血清標準品で希釈した希釈系列全体を通じて一定に維持する必要がある。各ウェルに含まれる血清が25μL未満であると、それらのウェルが誤った値を示す可能性がある。   It is very important that samples are processed neat and at the following dilutions: 1: 4, 1: 8 and 1:16. This is necessary to allow dissociation of the natural HT complex, but is not a serum effect. Serum concentration should be kept constant throughout the dilution series in which the sample is diluted with serum standards. If the serum contained in each well is less than 25 μL, the wells may show incorrect values.

Figure 0005902478
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標準品および品質コントロールにおける許容可能な値は、期待値の+/−25%である。アッセイのLODは、無希釈サンプル(100%血清)に対して100pg/mLであると予想される。アッセイは34pg/mL以下で正確に実行する。   Acceptable values for standard products and quality controls are +/− 25% of expected values. The LOD of the assay is expected to be 100 pg / mL for an undiluted sample (100% serum). The assay is performed accurately at 34 pg / mL or less.

このアッセイで用いられる標準品は、2個のAPRILサブユニットおよび1個のBLySサブユニットを含むHTである。この分子が患者血清中にあまり見られない場合、天然HTの絶対値は異なることになるが、この場合、特定の三量体形成に対する任意のバイアスが存在している証拠となる。   The standard used in this assay is HT containing two APRIL subunits and one BLyS subunit. If this molecule is not found in patient sera, the absolute value of native HT will be different, in which case there is evidence that there is an arbitrary bias for specific trimer formation.

実施例2:患者および健常対照の血清中HTの測定
ZymoZipper N末端三量化ドメインは、組換えBLyS/APRILヘテロ三量体(rHT)の産生を可能とし、これを標準品として用いて、実施例1に記載したようなビーズを用いたイムノアッセイを開発し、ヒト血清中の天然HTを定量化した。このアッセイを、BLySおよびAPRIL特異的ELISAとともに用いて、健常対照(HC;n=79)、全身性エリテマトーデス患者(SLE;n=30)および関節リウマチ患者(RA;n=29)に由来する血清中のこれら3つのリガンドを測定した(図1および2参照)。TACIをNFκB/ルシフェラーゼリポーター遺伝子とともにトランスフェクトしたJurkat細胞を用いた4時間のシグナリングアッセイおよび4日間の初代ヒトB細胞増殖アッセイにおいて、rHTの生物活性を、rBLySおよびrAPRILの生物活性と比較した。
Example 2: Measurement of serum HT in patients and healthy controls The ZymoZipper N-terminal trimerization domain allows the production of recombinant BLyS / APRIL heterotrimer (rHT), which is used as a standard. An immunoassay using beads as described in 1 was developed to quantify native HT in human serum. Serum from healthy controls (HC; n = 79), systemic lupus erythematosus (SLE; n = 30) and rheumatoid arthritis patients (RA; n = 29) using this assay with BLyS and APRIL-specific ELISA These three ligands were measured (see FIGS. 1 and 2). The biological activity of rHT was compared to that of rBLyS and rAPRIL in a 4-hour signaling assay using Jurkat cells transfected with TACI with the NFκB / luciferase reporter gene and a 4-day primary human B cell proliferation assay.

HCよりも有意に数多くのSLE患者が、検出可能な血清中HTを有しており(70% vs 14%,p<0.0001,フィッシャーの直接確率検定)、RA患者の24%が検出可能なHTを有していた。この集団において、平均血清HTレベルは、177pg/mL(SLE)、64pg/mL(RA)および66pg/mL(HC)であった。TACI−Jurkatアッセイ(実施例4参照)において、rHTシグナリングは、BLySまたはAPRILのシグナリングと類似している。B細胞アッセイ(実施例3参照)において、rHTは、ホモ三量体リガンドよりも効能の低い誘導因子である(EC50値:BLySについては0.02nM,APRILについては0.17nMおよびrHTについては4.06nM)。これは、おそらく、循環B細胞において、我々のrHTが結合しにくいBAFF−Rが優勢的に発現していることを反映している。これらのアッセイにおいて、アタシセプトおよびBCMA−Igは3リガンド全ての活性を無効化する一方、BAFFR−IgはrHT活性阻害を全くまたはほとんど示さない。我々のデータによって、自己免疫患者において天然HTが上昇していることが確認され、rHTが生物学的に活性であることが示される。天然HTが、そのホモ三量体対応物とは異なる生物学的役割を有するか否かは、まだ決定されていない。アタシセプトは、3リガンド形態全ての生物活性を阻害するから、自己免疫疾患の臨床処置において重要である。   Significantly more SLE patients than HC have detectable serum HT (70% vs 14%, p <0.0001, Fisher's exact test) and 24% of RA patients are detectable HT. In this population, mean serum HT levels were 177 pg / mL (SLE), 64 pg / mL (RA) and 66 pg / mL (HC). In the TACI-Jurkat assay (see Example 4), rHT signaling is similar to BLyS or APRIL signaling. In the B cell assay (see Example 3), rHT is a less potent inducer than homotrimeric ligand (EC50 values: 0.02 nM for BLyS, 0.17 nM for APRIL and 4 for rHT) .06 nM). This probably reflects the predominant expression of BAFF-R, which is difficult for our rHT to bind in circulating B cells. In these assays, atacicept and BCMA-Ig abolish the activity of all three ligands, while BAFFR-Ig shows no or little inhibition of rHT activity. Our data confirms that natural HT is elevated in autoimmune patients, indicating that rHT is biologically active. Whether native HT has a different biological role than its homotrimeric counterpart has not yet been determined. Atacicept is important in clinical treatment of autoimmune diseases because it inhibits the biological activity of all three ligand forms.

72人のSLE患者および42人の健常対照を含むSLE患者の第2群において、BLySおよびAPRILレベルがELISAによって決定された。HTレベルは、ルミネックスによるアッセイを用いて、36人の患者および25人の対照において測定された。HTは、対照よりも患者において数多く検出された(72% vs 32%,χ=0.0019)。 In a second group of SLE patients, including 72 SLE patients and 42 healthy controls, BLyS and APRIL levels were determined by ELISA. HT levels were measured in 36 patients and 25 controls using an assay by Luminex. HT was detected more in patients than in controls (72% vs 32%, χ 2 = 0.0019).

実施例3:B細胞増殖アッセイ
凍結したアフェレーシス処理(apheresed)末梢血単核細胞(PBMC)1×10個を含有するバイアルを、37℃の水浴中ですばやく解凍し、50mL試験管中のB細胞培地25mL(RPMI−1640培地,10%加熱不活性化ウシ胎仔血清,5% L−グルタミン,5%ペニシリン/ストレプトマイシン(Pen/Strep))に再懸濁した。トリパンブルー(GIBCO BRL,Gaithersburg,MD)を用いて細胞の生存率を検査した。次いで、抗CD19でコーティングしたマイクロビーズ(Miltenyi Biotech)を用いた陽性選別によってCD19+ B細胞を単離した。次いで、MACS LSカラム(Miltenyi Biotech)によって被覆細胞を単離した。得られたB細胞を最終濃度1.6×10細胞/mLでB細胞培地中に再懸濁し、96ウェル U底プレート(Falcon,VWR,Seattle,WA)に100μL/ウェルでプレーティングした。HTおよびホモ三量体リガンドを調製し、1000ng/mlから0ng/mlまでの3倍希釈系列の細胞に加えた。最終容量は200μL/ウェルであった。
Example 3 B Cell Proliferation Assay Vials containing 1 × 10 8 frozen apheresed peripheral blood mononuclear cells (PBMC) were quickly thawed in a 37 ° C. water bath and B in a 50 mL tube. Resuspended in 25 mL cell culture medium (RPMI-1640 medium, 10% heat-inactivated fetal bovine serum, 5% L-glutamine, 5% penicillin / streptomycin (Pen / Strep)). Cell viability was examined using trypan blue (GIBCO BRL, Gaithersburg, MD). CD19 + B cells were then isolated by positive sorting using anti-CD19 coated microbeads (Miltenyi Biotech). The coated cells were then isolated by MACS LS column (Miltenyi Biotech). The resulting B cells were resuspended in B cell medium at a final concentration of 1.6 × 10 cells / mL and plated at 100 μL / well in 96 well U-bottom plates (Falcon, VWR, Seattle, WA). HT and homotrimeric ligands were prepared and added to 3-fold dilution series of cells from 1000 ng / ml to 0 ng / ml. The final volume was 200 μL / well.

次いで、細胞を加湿インキュベーター中37℃で72時間インキュベートした。細胞採取の16時間前に、1μCi H チミジンを全てのウェルに加えた。製造者の指示書に従って細胞採取器(Packard)により採取および回収された細胞を96ウェルフィルタープレート(UniFilter GF/C,Packard,Meriden,CT)に入れた。プレートを55℃で20〜30分間乾燥し、ウェルの底を不透明なプレートシーラーでシールした。各ウェルにシンチレーション液(Microscint−O,Packard)を0.25mL加え、トップカウントマイクロプレートシンチレーションカウンター(Packard)を用いてプレートを読み取った。 Cells were then incubated for 72 hours at 37 ° C. in a humidified incubator. Sixteen hours prior to cell harvesting, 1 μCi 3 H thymidine was added to all wells. Cells harvested and collected by a cell harvester (Packard) according to the manufacturer's instructions were placed in a 96 well filter plate (UniFilter GF / C, Packard, Meriden, CT). The plate was dried at 55 ° C. for 20-30 minutes and the bottom of the well was sealed with an opaque plate sealer. 0.25 mL of scintillation fluid (Microscint-O, Packard) was added to each well, and the plate was read using a top count microplate scintillation counter (Packard).

実施例4:TACIトランスフェクトJurkat細胞アッセイ
TACI in vivo バイオアッセイでは、2つのプラスミドがトランスフェクトされたJurkat細胞株(ヒト急性T細胞リンパ球,KZ142,クローン#24)を用いる。まず、NF−κβ/AP−1プロモーターおよびネオマイシン耐性遺伝子の制御下にルシフェラーゼレポーター遺伝子を含有するプラスミドを、細胞株にトランスフェクトした。G418選択の後、適当なクローンを選択した。次いで、この細胞株に、CMVプロモーターおよびピューロマイシン耐性遺伝子の制御下に完全長TACI cDNAを含有するプラスミド(TACI/pZP7P)をトランスフェクトした。ピューロマイシンを用いてクローンを選択し、TACIモノクローナル抗体を用いたフローサイトメトリーによってTACI発現を評価し、アッセイに適切な細胞株を選択した。
Example 4: TACI transfected Jurkat cell assay The TACI in vivo bioassay uses a Jurkat cell line (human acute T cell lymphocyte, KZ142, clone # 24) transfected with two plasmids. First, a cell line was transfected with a plasmid containing a luciferase reporter gene under the control of an NF-κβ / AP-1 promoter and a neomycin resistance gene. Appropriate clones were selected after G418 selection. This cell line was then transfected with a plasmid (TACI / pZP7P) containing full-length TACI cDNA under the control of the CMV promoter and puromycin resistance gene. Clones were selected using puromycin, TACI expression was assessed by flow cytometry using TACI monoclonal antibodies, and appropriate cell lines were selected for the assay.

アッセイは、TACI cDNAから産生する細胞表面TACIに対して試験リガンド(HTまたはホモ三量体BLySもしくはホモ三量体APRIL)が結合することによって引き起こされるルシフェラーゼ遺伝子発現の読み取り(read out)の記録に基づいて行われる。   The assay is a read-out record of luciferase gene expression caused by binding of a test ligand (HT or homotrimeric BLyS or homotrimeric APRIL) to cell surface TACI produced from TACI cDNA. Based on.

フェノールレッドを含まない10%FBS添加RPMI1640培地(Rosewell Park Memorial Institute,Buffalo,NY)中で、トランスフェクトされたJurkat細胞を増殖させた。トランスフェクションの選択試薬であるピューロマイシンを2μg/mL添加した。ピルビン酸ナトリウムおよびL−グルタミンも培地に1%容量で添加した。製造者の指示書に従って、Steady−Gloルシフェラーゼアッセイシステム(Promega,Madison,WI #E2510)の基質およびアッセイ緩衝液を用いた。   Transfected Jurkat cells were grown in RPMI 1640 medium supplemented with 10% FBS without phenol red (Rosewell Park Memorial Institute, Buffalo, NY). Puromycin, a selection reagent for transfection, was added at 2 μg / mL. Sodium pyruvate and L-glutamine were also added to the medium at 1% volume. Substrate and assay buffer of Steady-Glo luciferase assay system (Promega, Madison, WI # E2510) were used according to manufacturer's instructions.

トランスフェクトされたJurkat細胞を1.6×10細胞/mLとなるように培地中に再懸濁し、アッセイを実施した。細胞を白色アッセイプレート上に50μL/ウェルでプレーティングした。ZZ−APRILのサンプルを適切に希釈し、96ウェルプレートに添加した。希釈液を細胞に50μL/ウェルで添加した。プレートを37℃のインキュベーター中で4時間インキュベートした。インキュベーションの間、Steady−GLO緩衝液および基質を室温で平衡化した。4時間のインキュベーションの後、プレートを室温で5分間冷却した。アッセイ緩衝液および基質を混合し、100μL/ウェルで添加した。設定を低にしてプレートを1分間ボルテックスして混合し、次いで室温で10分間インキュベートした。その後、プレートをルミノメーター(積分時間5秒)で読み取った。 The transfected Jurkat cells were resuspended in media to 1.6 × 10 6 cells / mL and the assay was performed. Cells were plated at 50 μL / well on white assay plates. A sample of ZZ-APRIL was diluted appropriately and added to a 96 well plate. Dilution was added to the cells at 50 μL / well. Plates were incubated for 4 hours in a 37 ° C. incubator. During the incubation, Steady-GLO buffer and substrate were equilibrated at room temperature. After 4 hours of incubation, the plates were cooled for 5 minutes at room temperature. Assay buffer and substrate were mixed and added at 100 μL / well. The plate was mixed by vortexing for 1 minute with the setting low and then incubated for 10 minutes at room temperature. The plate was then read with a luminometer (integration time 5 seconds).

Claims (10)

個体の血清中の増大したBLyS/APRILヘテロ三量体(HT)レベルを検出することにより、前記個体が全身性エリテマトーデス(SLE)に罹患している可能性を予測するin vitro方法であって、
(a)前記個体に由来する試験サンプル中のHTレベルを測定すること、ここで、BLyS/APRILヘテロ三量体(HT)レベルの測定が、血清試料を、HTサブユニットの1つに特異的に結合する固定化された抗体と接触させ、次に、結合した分子を、他のHTサブユニットに特異的に結合する検出可能な抗体と接触させることを含み、ここで、両方の抗体への結合は、BLyS/APRILヘテロ三量体(HT)の存在を指示し、
(b)前記レベルを、健常対照に由来するサンプル中のHTレベルと比較すること、および
(c)前記試験生体サンプル中のHTレベルが前記対照サンプル中のレベルと比較して増大しているか否かを決定すること
を含み、
前記増大したHTレベルが全身性エリテマトーデス(SLE)と関連している前記方法。
An in vitro method for predicting the likelihood of an individual suffering from systemic lupus erythematosus (SLE) by detecting increased BLyS / APRIL heterotrimer (HT) levels in the serum of the individual, comprising:
(A) measuring HT levels in a test sample derived from said individual, wherein the measurement of BLyS / APRIL heterotrimer (HT) levels is specific for a serum sample to one of the HT subunits Contacting the immobilized antibody that binds to, and then contacting the bound molecule with a detectable antibody that specifically binds to other HT subunits, wherein Binding indicates the presence of BLyS / APRIL heterotrimer (HT);
(B) comparing the level to an HT level in a sample derived from a healthy control; and (c) whether the HT level in the test biological sample is increased compared to the level in the control sample. Including determining
The method wherein the increased HT level is associated with systemic lupus erythematosus (SLE).
全身性エリテマトーデス(SLE)であると臨床的に診断された個体を処置するために最も効果的な処置計画を選択するin vitro方法であって、ここで、処置計画がBLySおよび/またはAPRILの阻害を含み、
全身性エリテマトーデス(SLE)であると臨床的に診断された個体に由来する生体サンプルを、健常対照に由来するサンプル中のHTレベルと比較して血清中の上昇したBLyS/APRILヘテロ三量体(HT)レベルの存在または不存在についてin vitroで分析すること、ここで、該BLyS/APRILヘテロ三量体(HTレベルの分析が、血清試料を、HTサブユニットの1つに特異的に結合する固定化された抗体と接触させ、次に、結合した分子を、他のHTサブユニットに特異的に結合する検出可能な抗体と接触させることを含み、ここで、両方の抗体への結合は、BLyS/APRILヘテロ三量体(HT)の存在を指示し、および
前記生体サンプル中のHTレベルが前記対照サンプル中のレベルと比較して増大しているときに、HTアンタゴニストの使用を含む処置計画を選択すること、ここで、増大したHTレベルは、個体がBLySおよび/またはAPRILの阻害を含む処置計画に好ましい応答を示すことを指示する
を含む、前記方法。
An in vitro method of selecting the most effective treatment plan for treating an individual clinically diagnosed as systemic lupus erythematosus (SLE), wherein the treatment plan is an inhibition of BLyS and / or APRIL Including
Biological samples from individuals clinically diagnosed as systemic lupus erythematosus (SLE) are compared to elevated HT levels in samples from healthy controls compared to elevated BLyS / APRIL heterotrimers ( Analyzing in vitro for the presence or absence of HT) levels, wherein the analysis of BLyS / APRIL heterotrimer ( HT ) levels specifically binds a serum sample to one of the HT subunits Contacting the immobilized antibody, and then contacting the bound molecule with a detectable antibody that specifically binds to another HT subunit, wherein binding to both antibodies comprises Indicating the presence of a BLyS / APRIL heterotrimer (HT), and HT levels in the biological sample are increased compared to levels in the control sample Selecting a treatment regimen that includes the use of HT antagonists, where increased HT levels indicate that the individual exhibits a favorable response to a treatment regimen that includes inhibition of BLyS and / or APRIL Said method.
前記処置計画がHTアンタゴニストの使用を含む請求項2記載の方法。   3. The method of claim 2, wherein the treatment plan includes the use of an HT antagonist. 前記HTアンタゴニストがBLySアンタゴニストでもある請求項3記載の方法。   4. The method of claim 3, wherein the HT antagonist is also a BLyS antagonist. 前記HTアンタゴニストがAPRILアンタゴニストでもある請求項3記載の方法。   4. The method of claim 3, wherein the HT antagonist is also an APRIL antagonist. 患者が全身性エリテマトーデス(SLE)に対する薬物処置に応答する可能性を予測するin vitro方法であって、ここで、該薬物処置がBLySおよび/またはAPRILの阻害を含み、
(a)前記患者に由来する血清サンプル中のBLyS/APRILヘテロ三量体(HT)レベルを決定すること、ここで、該BLyS/APRILヘテロ三量体(HTレベルの決定が、血清試料を、HTサブユニットの1つに特異的に結合する固定化された抗体と接触させ、次に、結合した分子を、他のHTサブユニットに特異的に結合する検出可能な抗体と接触させることを含み、ここで、両方の抗体への結合は、BLyS/APRILヘテロ三量体(HT)の存在を指示し、
(b)患者血清サンプルに由来するHTレベルを、健常対照に由来する血清サンプル中のHTレベルと比較すること
を含み、ここで、対照サンプルと比較して上昇した、前記患者サンプル中のHTレベルの存在が、前記患者が全身性エリテマトーデス(SLE)に対する薬物処置に応答する可能性の予兆であり、増大したHTレベルは、個体がBLySおよび/またはAPRILの阻害を含む薬物処置に好ましい応答を示すことを指示する、前記方法。
An in vitro method for predicting the likelihood that a patient will respond to drug treatment for systemic lupus erythematosus (SLE), wherein the drug treatment comprises inhibition of BLyS and / or APRIL,
(A) determining a BLyS / APRIL heterotrimer (HT) level in a serum sample from the patient, wherein the determination of the BLyS / APRIL heterotrimer ( HT ) level comprises Contacting an immobilized antibody that specifically binds to one of the HT subunits, and then contacting the bound molecule with a detectable antibody that specifically binds to the other HT subunit. Wherein binding to both antibodies indicates the presence of BLyS / APRIL heterotrimer (HT);
(B) comparing the HT level from the patient serum sample with the HT level in the serum sample from the healthy control, wherein the HT level in the patient sample is increased compared to the control sample Is a predictor of the likelihood that the patient will respond to drug treatment for systemic lupus erythematosus (SLE), and increased HT levels indicate that the individual has a favorable response to drug treatment, including inhibition of BLyS and / or APRIL Said method.
前記決定がルミネックス(登録商標)イムノアッセイを用いて行われる請求項6記載の方法。   The method of claim 6, wherein the determination is performed using a Luminex® immunoassay. 前記薬物処置がHTアンタゴニストを含む請求項6記載の方法。   The method of claim 6, wherein the drug treatment comprises an HT antagonist. 前記HTアンタゴニストがBLySアンタゴニストでもある請求項8記載の方法。   9. The method of claim 8, wherein the HT antagonist is also a BLyS antagonist. 前記HTアンタゴニストがAPRILアンタゴニストでもある請求項8記載の方法。   9. The method of claim 8, wherein the HT antagonist is also an APRIL antagonist.
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