JP5295317B2 - Sample detection apparatus and sample analyzer including the same - Google Patents

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本発明は、検体中の細胞、微生物、染色体、核酸等のサンプルを、抗原抗体反応や核酸ハイブリダイゼーション反応等の生化学反応を利用して検出するサンプル検出装置と、それを含む検体分析装置に関する。   The present invention relates to a sample detection apparatus that detects a sample of cells, microorganisms, chromosomes, nucleic acids, and the like in a specimen using a biochemical reaction such as an antigen-antibody reaction or a nucleic acid hybridization reaction, and a specimen analysis apparatus including the same. .

血液等の検体を分析する検体分析装置には、抗原抗体反応を利用した免疫学的な方法、例えば、被検出物質と特異的に結合する抗体または抗原等のタンパク質をプローブとして用い、微粒子、ビーズ、またはガラス板等の固相表面に固定して、検体中の被検出物質との抗原抗体反応を行わせるものや、核酸ハイブリダイゼーションを利用した方法、例えば、一本鎖の核酸をプローブとして用い、微粒子、ビーズ、ガラス板等の固相表面に固定して、検体中の被検出物質と核酸ハイブリダイゼーションを行わせるものがある。これらは、酵素、蛍光性物質、または発光性物質等の、検知感度の高い標識物質を担持した特異的な相互作用を有する標識化物質である標識化抗体、標識化抗原、または標識化核酸等を用いて、抗原抗体化合物またはハイブリダイズされた二本鎖の核酸を検出して、被検出物質(サンプル)の有無の検出やその定量を行うものである。   A sample analyzer for analyzing a sample such as blood uses an immunological method utilizing an antigen-antibody reaction, for example, an antibody or a protein such as an antigen that specifically binds to a substance to be detected as a probe. Or a method in which an antigen-antibody reaction with a substance to be detected in a specimen is performed by fixing to a solid surface such as a glass plate, or a method using nucleic acid hybridization, for example, using a single-stranded nucleic acid as a probe Some of them are immobilized on a solid phase surface such as fine particles, beads, glass plates, etc., to allow nucleic acid hybridization with a substance to be detected in a specimen. These are labeled antibodies, labeled antigens, labeled nucleic acids, etc., which are labeled substances having a specific interaction carrying a labeling substance with high detection sensitivity, such as an enzyme, a fluorescent substance, or a luminescent substance. Is used to detect an antigen-antibody compound or a hybridized double-stranded nucleic acid to detect the presence or absence of a substance to be detected (sample) and to quantify it.

これらの技術を発展させたものとして、例えば特許文献1には、互いに異なる塩基配列を有する多数のDNA(デオキシリボ核酸)プローブを、基板上にアレイ状に並べた、いわゆるDNAアレイが開示されている。   As a development of these techniques, for example, Patent Document 1 discloses a so-called DNA array in which a large number of DNA (deoxyribonucleic acid) probes having different base sequences are arranged in an array on a substrate. .

また、非特許文献1には、多種類のタンパク質をメンブレンフィルタ上に並べ、DNAアレイと同様な構成のタンパク質アレイを作製する方法が開示されている。このように、DNAアレイやタンパク質アレイ等を用いることによって、極めて多数の項目の検査を一度に行うことが可能になってきている。   Non-Patent Document 1 discloses a method for preparing a protein array having the same structure as a DNA array by arranging many types of proteins on a membrane filter. As described above, by using a DNA array, a protein array, or the like, it has become possible to inspect a very large number of items at once.

また、様々な検体分析における、検体による汚染の軽減、反応の効率化、装置の小型化、作業の簡便化等の目的で、内部で生化学反応を行わせる使い捨て可能な生化学反応カートリッジが提案されている。例えば、特許文献2においては、DNAアレイを含む生化学反応カートリッジ内に複数のチャンバを配設し、圧力差を利用して溶液を各チャンバへ移動させることにより検体中のDNAの抽出、増幅、またはハイブリダイゼーション等の反応を内部で行わせることが可能な生化学反応カートリッジが開示されている。   In addition, disposable biochemical reaction cartridges that allow biochemical reactions to be performed internally are proposed for the purpose of reducing sample contamination, improving reaction efficiency, miniaturizing equipment, and simplifying operations in various sample analyses. Has been. For example, in Patent Document 2, a plurality of chambers are arranged in a biochemical reaction cartridge including a DNA array, and a solution is moved to each chamber using a pressure difference to extract, amplify DNA in a specimen, Alternatively, a biochemical reaction cartridge capable of performing a reaction such as hybridization inside is disclosed.

そして、このような生化学反応カートリッジ内に外部から溶液を注入する方法としては、外部の電動シリンジポンプや真空ポンプを利用する方法がある。また、生化学反応カートリッジ内部で溶液を移動する方法としては、圧力差以外にも、重力や毛細管現象や電気泳動を利用する方法が知られている。さらに、生化学反応カートリッジの内部に配設できる小型のマイクロポンプとして、特許文献2にはダイアフラムポンプ、特許文献3には発熱素子を利用したポンプ、特許文献4には圧電素子を利用したポンプがそれぞれ開示されている。   As a method for injecting a solution from the outside into such a biochemical reaction cartridge, there is a method using an external electric syringe pump or a vacuum pump. As a method for moving a solution inside a biochemical reaction cartridge, a method using gravity, capillary action or electrophoresis is known in addition to a pressure difference. Further, as micro pumps that can be disposed inside the biochemical reaction cartridge, Patent Document 2 includes a diaphragm pump, Patent Document 3 uses a heat generating element, and Patent Document 4 uses a piezoelectric element. Each is disclosed.

米国特許第5,445,934号明細書US Pat. No. 5,445,934 特表平11−509094号公報Japanese National Patent Publication No. 11-509094 特許第2832117号明細書Japanese Patent No. 2832117 特開2000−274375号公報JP 2000-274375 A アンジェリカ ロイキング(Angelika Lueking)他5名、「プロテイン マイクロアレイズ フォー ジーン エクスプレッション アンド アンチボディ スクリーニング(Protein Microarrays for Gene Expression and Antibody Screening)」、アナリティカル バイオケミストリー(Analytical Biochemistry) Vol.270(1)、アカデミック プレス(Academic Press)、1999年5月15日、p.103〜111Angelika Lueking and five others, “Protein Microarrays for Gene Expression and Antibody Screening”, Analytical Biochemistry Vol.270 (1), Academic Press (Academic Press), May 15, 1999, p.103-111

前記した種類の生化学反応カートリッジを含む検体分析装置においてプローブ検出を行なう際に、被検出物質(サンプル)が生化学反応カートリッジのチャンバの内部に存在するため、生化学反応カートリッジを構成する基板の外側から、この基板を介して被検出物質の検出を行なわなければならない場合がある。例えば、励起レーザー光等の光を被検出物質に照射して光学的な検出を行う場合には、基板の厚さのばらつき(公差)によって、被検出物質に照射される励起レーザー光の合焦位置や、検出器(ディテクター)である光電子倍増管における蛍光の合焦位置がずれることがある。したがって、被検出物質と光学系(特に対物レンズ)の相対位置を、例えば光学的オートフォーカス機構によって適宜に調整する必要がある。   When the probe detection is performed in the sample analyzer including the above-described type of biochemical reaction cartridge, since the substance to be detected (sample) is present inside the chamber of the biochemical reaction cartridge, the substrate constituting the biochemical reaction cartridge In some cases, it is necessary to detect a substance to be detected from the outside through this substrate. For example, when optical detection is performed by irradiating the detection target material with light such as excitation laser light, the focus of the excitation laser light irradiating the detection target due to the variation (tolerance) of the substrate thickness The position and the focus position of the fluorescence in the photomultiplier tube which is a detector (detector) may be shifted. Therefore, it is necessary to appropriately adjust the relative position between the substance to be detected and the optical system (particularly the objective lens), for example, by an optical autofocus mechanism.

ところが、被検出物質が蛍光物質を含む場合には、オートフォーカス動作において照射される励起レーザー光によってこの蛍光物質が褪色してしまい、正確な輝度測定の障害となる。また、オートフォーカス動作、具体的には読み取り、演算、フィードバック等の動作に時間を要するという問題があった。   However, when the substance to be detected includes a fluorescent substance, the fluorescent substance is faded by the excitation laser light irradiated in the autofocus operation, which becomes an obstacle to accurate luminance measurement. In addition, there is a problem that it takes time to perform autofocus operations, specifically, operations such as reading, calculation, and feedback.

本発明の目的は、光学的オートフォーカス動作を必要とせず、容易に精度よくサンプルを光学的に検出可能なサンプル検出装置と、それを含む検体分析装置を提供することにある。   An object of the present invention is to provide a sample detection device capable of optically detecting a sample easily and accurately without requiring an optical autofocus operation, and an analyte analyzer including the sample detection device.

本発明は、透光性を有する基板が生化学反応カートリッジ内に配置され、生化学反応カートリッジ内の基板上のサンプルを、基板を介して光学的に検出するサンプル検出装置において、基板の、サンプルが存在する可能性のある面の反対側の面に対向するように配置され、基板に光を照射し、基板を透過した生化学反応カートリッジ内の光の検出を行う光学系と、予め求められている基板に関する情報に基づいて、基板上のサンプルを検出する領域外の3点を、それぞれ個別に光軸方向あるいは光軸方向を基準線としたチルト方向に沿って移動させ、基板上に光を合焦させるためのチルト動作を行う手段と、を有し、前記3点は前記反対側の面にあり、チルト動作を行う手段は、基板上の前記3点にそれぞれ当接し、前記3点を光軸方向またはチルト方向に沿ってそれぞれ移動させる3本のロッドを有することを特徴とする。 The present invention relates to a sample detection apparatus in which a translucent substrate is disposed in a biochemical reaction cartridge, and a sample on the substrate in the biochemical reaction cartridge is optically detected through the substrate. An optical system that is disposed so as to face the surface opposite to the surface on which the substrate may exist , irradiates the substrate with light, and detects the light in the biochemical reaction cartridge that has passed through the substrate; Based on the information about the substrate, the three points outside the region for detecting the sample on the substrate are individually moved along the optical axis direction or the tilt direction with the optical axis direction as a reference line, and light is projected onto the substrate. have a, and means for performing a tilt operation for focusing, said three points located on the surface of the opposite side, means for performing a tilt operation, contact each of the three points on the substrate, the three-point The optical axis direction also It characterized by having a three rods moving along each tilt direction.

本発明によれば、光学的オートフォーカス動作が不要であるため、オートフォーカス動作時のレーザー照射によるサンプル中の蛍光物質の褪色を防止でき、それによって光学的なサンプル検出の精度が向上する。また、光学的オートフォーカス動作のための読み取り、演算、フィードバックの各処理を省略できるため、動作時間を削減できる。   According to the present invention, since an optical autofocus operation is unnecessary, it is possible to prevent the fluorescent material in the sample from fading due to laser irradiation during the autofocus operation, thereby improving the accuracy of optical sample detection. In addition, since the reading, calculation, and feedback processes for the optical autofocus operation can be omitted, the operation time can be reduced.

本発明の生化学反応カートリッジ内で反応を生じさせるための実験装置の構成を示すブロック図である。It is a block diagram which shows the structure of the experimental apparatus for producing reaction within the biochemical reaction cartridge of this invention. 本発明の生化学反応カートリッジの斜視図である。It is a perspective view of the biochemical reaction cartridge of this invention. 図2に示す生化学反応カートリッジの平面断面図である。FIG. 3 is a plan sectional view of the biochemical reaction cartridge shown in FIG. 2. 図1に示す実験装置における処理工程を示すフローチャートである。It is a flowchart which shows the process process in the experimental apparatus shown in FIG. 図2,3に示す生化学反応カートリッジのチャンバの一部を通る縦断面図である。FIG. 4 is a longitudinal sectional view passing through a part of the chamber of the biochemical reaction cartridge shown in FIGS. 図2,3に示す生化学反応カートリッジの他のチャンバを通る縦断面図である。FIG. 4 is a longitudinal sectional view through another chamber of the biochemical reaction cartridge shown in FIGS. 本発明の第1の実施形態のサンプル検出装置を示す概略図である。It is the schematic which shows the sample detection apparatus of the 1st Embodiment of this invention. 図7に示すサンプル検出装置の要部の平面図である。It is a top view of the principal part of the sample detection apparatus shown in FIG. 図7に示すサンプル検出装置のロッドおよびその駆動系を示す正面図である。It is a front view which shows the rod and its drive system of the sample detection apparatus shown in FIG. 図7に示すサンプル検出装置における検出工程を示すフローチャートである。It is a flowchart which shows the detection process in the sample detection apparatus shown in FIG. 本発明の第2の実施形態のサンプル検出装置を示す概略図である。It is the schematic which shows the sample detection apparatus of the 2nd Embodiment of this invention. 本発明の第3の実施形態のサンプル検出装置を示す概略図である。It is the schematic which shows the sample detection apparatus of the 3rd Embodiment of this invention.

以下、本発明の実施の形態について図面を参照して説明する。   Hereinafter, embodiments of the present invention will be described with reference to the drawings.

[第1の実施形態]
図1は、本発明の第1の実施形態における検体分析装置のうち、検体の生化学反応を行わせるための実験装置を概略的に示している。この実験装置は、本実施形態において反応場となる生化学反応カートリッジ1が載置されるテーブル13を有している。このテーブル13上には、生化学反応カートリッジ1内に電磁力を作用させるための電磁石14と、生化学反応カートリッジ1の温度を制御するためのペルチェ素子15,16が配置されており、これらは実験装置全体を制御する制御部17に接続されている。
[First Embodiment]
FIG. 1 schematically shows an experimental apparatus for performing a biochemical reaction of a sample in the sample analyzer according to the first embodiment of the present invention. This experimental apparatus has a table 13 on which the biochemical reaction cartridge 1 serving as a reaction field in the present embodiment is placed. On the table 13, an electromagnet 14 for applying an electromagnetic force in the biochemical reaction cartridge 1 and Peltier elements 15 and 16 for controlling the temperature of the biochemical reaction cartridge 1 are arranged. It is connected to a control unit 17 that controls the entire experimental apparatus.

テーブル13の両側には、電動シリンジポンプ18,19と、これらのポンプ18,19によって空気を排出または吸引するための出入口であり、それぞれ10個ずつのポンプノズル20,21を有するポンプブロック22,23とが配置されている。電動シリンジポンプ18,19とポンプノズル20,21の間には、図示しない複数の電動切換バルブが配置されている。図示しない電動切換バルブとポンプ18,19は制御部17に接続されている。   On both sides of the table 13, there are electric syringe pumps 18, 19 and pump blocks 22, which are outlets for discharging or sucking air by these pumps 18, 19, each having ten pump nozzles 20, 21. 23 are arranged. A plurality of electric switching valves (not shown) are arranged between the electric syringe pumps 18 and 19 and the pump nozzles 20 and 21. An electric switching valve (not shown) and pumps 18 and 19 are connected to the control unit 17.

制御部17は検査者が入力を行う入力部24に接続されている。この制御部17は、ポンプノズル20,21を1個ずつ独立して開閉して電動シリンジポンプ18,19に対する接続および遮断を制御したり、全てのポンプノズル20,21を同時に開閉するなどの制御を行うことができる。また、制御部17は、電磁石14およびペルチェ素子15,16を適宜に作動させることによって、生化学反応カートリッジ1内での生化学反応を実行させる。   The control unit 17 is connected to an input unit 24 for input by an inspector. The controller 17 controls the connection and disconnection of the electric syringe pumps 18 and 19 by independently opening and closing the pump nozzles 20 and 21 one by one, or opening and closing all the pump nozzles 20 and 21 simultaneously. It can be performed. Further, the controller 17 causes the biochemical reaction in the biochemical reaction cartridge 1 to be executed by appropriately operating the electromagnet 14 and the Peltier elements 15 and 16.

次に、この実験装置における反応場となる生化学反応カートリッジ1について詳細に説明する。   Next, the biochemical reaction cartridge 1 serving as a reaction field in this experimental apparatus will be described in detail.

生化学反応カートリッジ1の本体(筐体)はポリメタクリル酸メチル(PMMA)、アクリルニトリル−ブタジエン−スチレン(ABS)共重合体、ポリスチレン、ポリカーボネート、ポリエステル、ポリ塩化ビニル等の透明または半透明の合成樹脂から構成されている。なお、生化学反応カートリッジ1内の反応物について、光学的な測定を必要としない場合には、本体の材質は透明でなくてもよい。   The body (housing) of the biochemical reaction cartridge 1 is a transparent or translucent synthetic material such as polymethyl methacrylate (PMMA), acrylonitrile-butadiene-styrene (ABS) copolymer, polystyrene, polycarbonate, polyester, polyvinyl chloride, etc. It is made of resin. Note that the material of the main body may not be transparent when the reactant in the biochemical reaction cartridge 1 does not require optical measurement.

図2に示すように、生化学反応カートリッジ1の上部には、注射器等を用いて血液等の検体を注入するための検体入口2aが設けられ、ゴムキャップ2により封止されている。また、生化学反応カートリッジ1の側面には、内部の溶液を移動させるためにノズルを挿入して加圧または減圧を行うための複数のノズル入口3a〜3jが設けられ、ゴムキャップ3により封止されている。カートリッジ1の両面とも同様の構成になっている。   As shown in FIG. 2, a specimen inlet 2 a for injecting a specimen such as blood using a syringe or the like is provided at the top of the biochemical reaction cartridge 1 and sealed with a rubber cap 2. The side surface of the biochemical reaction cartridge 1 is provided with a plurality of nozzle inlets 3a to 3j for inserting and pressurizing or depressurizing the nozzle to move the solution inside, and sealed by the rubber cap 3. Has been. Both sides of the cartridge 1 have the same configuration.

図3は生化学反応カートリッジ1の平面断面図を示している。前記したように片側の側面には10個のノズル入口3a〜3jが設けられ、反対側の側面にも10個のノズル入口3k〜3tが設けられている。各ノズル入口3a〜3tのほとんどは、それぞれの空気が流れる空気流路4a〜4tを介して、溶液を貯蔵する場所または反応を起こす場所であるチャンバ5a〜5tに連通している。つまり、ノズル入口3a〜3jは流路4a〜4jを介してチャンバ5a〜5jに連通し、反対側のノズル入口3k,3l,3m,3o,3r,3tは、それぞれ流路4k,4l,4m,4o,4r,4tを介してチャンバ5k,5l,5m,5o,5r,5tに連通している。ただし、本実施形態では、ノズル入口3n,3p,3q,3sはチャンバに連通しておらず予備になっており、使用されない。   FIG. 3 shows a plan sectional view of the biochemical reaction cartridge 1. As described above, ten nozzle inlets 3a to 3j are provided on one side surface, and ten nozzle inlets 3k to 3t are provided on the opposite side surface. Most of the nozzle inlets 3a to 3t communicate with chambers 5a to 5t, which are places where solutions are stored or where reactions occur, via air flow paths 4a to 4t through which the respective air flows. That is, the nozzle inlets 3a to 3j communicate with the chambers 5a to 5j through the flow paths 4a to 4j, and the nozzle inlets 3k, 3l, 3m, 3o, 3r, and 3t on the opposite side are the flow paths 4k, 4l, and 4m, respectively. , 4o, 4r, 4t communicate with the chambers 5k, 5l, 5m, 5o, 5r, 5t. However, in this embodiment, the nozzle inlets 3n, 3p, 3q, 3s are not communicated with the chamber and are reserved, and are not used.

検体入口2はチャンバ7に連通し、チャンバ7は流路6a,6b,6c,6kを介してチャンバ5a,5b,5c,5kに連通しているとともに、流路10を介してチャンバ8に連通している。チャンバ8は流路6g,6oを介してチャンバ5g,5oに連通しているとともに、流路11を介してチャンバ9に連通している。チャンバ9は流路6h,6i,6j,6r,6tを介してチャンバ5h,5i,5j,5r,5tに連通している。また、流路10は流路6d,6e,6f,6l,6mを介してチャンバ5d,5e,5f,5l,5mに連通している。   The specimen inlet 2 communicates with the chamber 7, and the chamber 7 communicates with the chambers 5 a, 5 b, 5 c, 5 k via the flow paths 6 a, 6 b, 6 c, 6 k and communicates with the chamber 8 via the flow path 10. doing. The chamber 8 communicates with the chambers 5 g and 5 o through the flow paths 6 g and 6 o and also communicates with the chamber 9 through the flow path 11. The chamber 9 communicates with the chambers 5h, 5i, 5j, 5r, and 5t via the flow paths 6h, 6i, 6j, 6r, and 6t. The flow path 10 communicates with the chambers 5d, 5e, 5f, 5l, and 5m via the flow paths 6d, 6e, 6f, 61, and 6m.

また、チャンバ9の底面には角孔が開けられ、この角孔にDNAマイクロアレイ12が、プローブ面を上にしてに貼り付けられている。DNAマイクロアレイ12は、1平方インチ(約645mm2)程度の大きさを持つガラス板(図7に示す基板33)の固相表面に、数十〜数十万種類の異なるDNAプローブ(図8参照)が高密度に並べられたものである。本実施形態では、このDNAマイクロアレイ12を用いて、検体中のDNAとハイブリダイゼーション反応を行わせることによって、一度に数多くの遺伝子を検査できるものである。これらのDNAプローブはマトリックス状に規則正しく並べられており、それぞれのDNAプローブのアドレス(何行・何列と示される位置)を、情報として容易に取り出すことができる。なお、検査の対象となる遺伝子としては、感染症ウィルス、細菌、疾患関連遺伝子、各個人の遺伝子多型等がある。 A square hole is formed in the bottom surface of the chamber 9, and a DNA microarray 12 is attached to the square hole with the probe surface facing upward. The DNA microarray 12 has several tens to hundreds of thousands of different DNA probes (see FIG. 8) on the solid surface of a glass plate (substrate 33 shown in FIG. 7) having a size of about 1 square inch (about 645 mm 2 ). ) Are arranged in high density. In the present embodiment, by using this DNA microarray 12 to perform a hybridization reaction with DNA in a specimen, a large number of genes can be examined at a time. These DNA probes are regularly arranged in a matrix, and addresses (positions indicated by how many rows and columns) of each DNA probe can be easily taken out as information. Examples of genes to be examined include infectious disease viruses, bacteria, disease-related genes, and individual gene polymorphisms.

ここで、本実施形態において検体の処理を行うための、各チャンバ5a〜5tのセッティングの一例を示す。チャンバ5aには、細胞壁を破壊するEDTA(エチレンジアミン四酢酸)を含む第1の溶血剤が、チャンバ5bには、界面活性剤等のタンパク質変性剤を含む第2の溶血剤がそれぞれ収容されている。チャンバ5cには、DNAが吸着するシリカコーティングされた磁性体粒子が収容されている。チャンバ5l、チャンバ5mには、DNAの抽出の際にDNAの精製を行うために用いられる第1、第2の抽出洗浄剤が収容されている。   Here, an example of the setting of the chambers 5a to 5t for processing the specimen in the present embodiment is shown. The chamber 5a contains a first hemolytic agent containing EDTA (ethylenediaminetetraacetic acid) that destroys the cell wall, and the chamber 5b contains a second hemolytic agent containing a protein denaturant such as a surfactant. . The chamber 5c contains silica-coated magnetic particles on which DNA is adsorbed. The chambers 5l and 5m contain first and second extraction detergents used for DNA purification during DNA extraction.

チャンバ5dには、DNAを磁性体粒子から溶出する低濃度塩のバッファからなる溶出液が収容されている。チャンバ5gには、PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)に必要な薬剤、すなわち、プライマ、ポリメラーゼ、dNTP溶液、バッファ、蛍光剤を含むCy3−dUTP(アマシャム バイオサイエンス株式会社製の蛍光標識)等の混合液が収容されている。チャンバ5h,5jには、ハイブリダイゼーションしなかった蛍光標識付きの検体DNAと蛍光標識とを洗浄するための界面活性剤を含む洗浄剤が、チャンバ5iには、DNAマイクロアレイ12を含むチャンバ9内を乾燥させるためのアルコールがそれぞれ収容されている。   The chamber 5d contains an eluate composed of a low-concentration salt buffer that elutes DNA from magnetic particles. The chamber 5g contains a mixture of chemicals necessary for PCR (polymerase chain reaction), ie, Cy3-dUTP (fluorescent label manufactured by Amersham Biosciences) containing primer, polymerase, dNTP solution, buffer, and fluorescent agent. Contained. In chambers 5h and 5j, a cleaning agent containing a fluorescent-labeled sample DNA and a detergent for cleaning the fluorescent label is contained in chamber 5i, and in chamber 5i is contained in chamber 9 containing DNA microarray 12. Alcohol for drying is contained respectively.

なお、チャンバ5eは血液のDNA以外の塵埃を溜めるためのチャンバである。チャンバ5fは、チャンバ5l,5mからの第1、第2の抽出洗浄剤の廃液を溜めるためのチャンバである。チャンバ5rは第1、第2の洗浄剤の廃液を溜めるためのチャンバである。チャンバ5k,5o,5tは、溶液がノズル入口に流れ込まないようにするために設けられたブランクのチャンバである。   The chamber 5e is a chamber for collecting dust other than blood DNA. The chamber 5f is a chamber for storing waste liquids of the first and second extracted cleaning agents from the chambers 5l and 5m. The chamber 5r is a chamber for storing waste liquids of the first and second cleaning agents. The chambers 5k, 5o, and 5t are blank chambers provided to prevent the solution from flowing into the nozzle inlet.

本実施形態では、この生化学反応カートリッジ1に血液等の液体状の検体を注入して、前記した実験装置(図1参照)にセットすることによって、生化学反応カートリッジ1の内部で、DNA等の抽出および増幅を行わせ、増幅された検体DNAと生化学反応カートリッジ1の内部にあるDNAマイクロアレイ12のDNAプローブとの間でハイブリダイゼーションを行わせ、さらに、ハイブリダイゼーションしなかった蛍光標識付きの検体DNAと蛍光標識の洗浄とを行うことができる。   In the present embodiment, a liquid specimen such as blood is injected into the biochemical reaction cartridge 1 and set in the above-described experimental apparatus (see FIG. 1). Extraction and amplification, hybridization between the amplified sample DNA and the DNA probe of the DNA microarray 12 in the biochemical reaction cartridge 1 is carried out, and further, a fluorescence label with a non-hybridization label is attached. The sample DNA and the fluorescent label can be washed.

このような実験装置および生化学反応カートリッジ1を用いて、本実施形態において検体の生化学反応を生化学反応カートリッジ1内にて生じさせる方法について具体的に説明する。   A method for causing a biochemical reaction of a specimen in the biochemical reaction cartridge 1 in the present embodiment using such an experimental apparatus and the biochemical reaction cartridge 1 will be specifically described.

まず、検査者が、検体である血液を収容した注射器の針(図示せず)を、生化学反応カートリッジ1の検体入口2を塞いでいるゴムキャップを貫通させて、注射器内の血液を検体入口2からチャンバ7に注入する。その後に、検査者は生化学反応カートリッジ1をテーブル13上に置く。そして、検査者が、図示しないレバーを操作することにより、ポンプブロック22,23を図1の矢印の方向に移動させると、ポンプノズル20,21が、生化学反応カートリッジ1の両側部のノズル入口3a〜3tに、ゴムキャップ3を貫通して挿入される。   First, an examiner passes a rubber cap that closes the specimen inlet 2 of the biochemical reaction cartridge 1 through a needle (not shown) of a syringe containing blood that is a specimen, so that the blood in the syringe enters the specimen inlet. 2 to chamber 7. Thereafter, the examiner places the biochemical reaction cartridge 1 on the table 13. When the inspector operates the lever (not shown) to move the pump blocks 22 and 23 in the direction of the arrow in FIG. 1, the pump nozzles 20 and 21 are connected to the nozzle inlets on both sides of the biochemical reaction cartridge 1. The rubber cap 3 is inserted through 3a to 3t.

検査者が、入力部24から実験開始の命令を入力すると処理が始まる。図4は生化学反応およびその後処理の手順を説明するフローチャートである。まず、ステップS1で、制御部17が、ポンプノズル20,21を制御してノズル入口3a,3kのみを開にし、電動シリンジポンプ18から空気を噴出し、電動シリンジポンプ19から空気を吸引することによって、チャンバ5a内の第1の溶血剤を血液の入ったチャンバ7に流し込む。このように、ノズル入口3aにポンプノズル20を挿入して空気を噴出して加圧し、ノズル入口3kにポンプノズル21を挿入して空気を吸引して減圧することによって、チャンバ5a内の第1の溶血剤が、血液の入ったチャンバ7内に流れ込む様子が、チャンバ5a,7,5kを通る断面図である図5に示されている。   When the inspector inputs an instruction to start an experiment from the input unit 24, the process starts. FIG. 4 is a flowchart for explaining the procedure of biochemical reaction and subsequent treatment. First, in step S1, the control unit 17 controls the pump nozzles 20 and 21 to open only the nozzle inlets 3a and 3k, ejects air from the electric syringe pump 18, and sucks air from the electric syringe pump 19. Thus, the first hemolytic agent in the chamber 5a is poured into the chamber 7 containing blood. As described above, the pump nozzle 20 is inserted into the nozzle inlet 3a and air is ejected to pressurize, and the pump nozzle 21 is inserted into the nozzle inlet 3k to suck and reduce the pressure of the air in the chamber 5a. 5 is shown in FIG. 5 which is a cross-sectional view through the chambers 5a, 7 and 5k.

本実施形態では、空気の供給および吸引のタイミングをずらすことによって、各チャンバへの加圧および減圧を制御してカートリッジ1内を溶液を円滑に流すことができる。さらに、電動シリンジポンプ19による空気の吸引を、ポンプ18からの空気の開始時からリニアに増加させるなどの細かな制御を行って、溶液をより円滑に流すことも可能である。例えば、溶血剤の粘性や流路の抵抗にもよるが、ステップS1において、電動シリンジポンプ19からの空気の吸引を、電動シリンジポンプ18からの空気の噴出を開始してから10〜200ミリ秒後に開始するように制御すると、流れる溶液の先頭で溶液が飛び出すことがなく、溶液が円滑に流れる。これは、以下の各工程における溶液の移動についても同様である。   In the present embodiment, by shifting the timing of air supply and suction, it is possible to control the pressurization and decompression of each chamber to smoothly flow the solution through the cartridge 1. Furthermore, it is possible to flow the solution more smoothly by performing fine control such as linearly increasing the suction of air by the electric syringe pump 19 from the start of the air from the pump 18. For example, depending on the viscosity of the hemolytic agent and the resistance of the flow path, in step S1, the suction of air from the electric syringe pump 19 is started and the ejection of air from the electric syringe pump 18 is started for 10 to 200 milliseconds. If it controls so that it may start later, a solution will flow smoothly, without a solution jumping out at the head of the flowing solution. The same applies to the movement of the solution in the following steps.

また、電動シリンジポンプ18,19を用いて空気の供給を容易に制御しつつ、ノズル入口3a,3oのみを開にして、電動シリンジポンプ18,19によって空気の噴出および吸引を交互に繰り返して、チャンバ7の溶液を流路10に流し、その後に戻す動作を繰り返して攪拌を行う。あるいは、電動シリンジポンプ19から空気を連続して噴出することによって、気泡を発生させながら攪拌を行う。   In addition, while easily controlling the air supply using the electric syringe pumps 18 and 19, only the nozzle inlets 3 a and 3 o are opened, and the electric syringe pumps 18 and 19 alternately repeat the ejection and suction of air, The operation of flowing the solution in the chamber 7 through the flow path 10 and returning to the flow path 10 is repeated to perform stirring. Alternatively, stirring is performed while bubbles are generated by continuously ejecting air from the electric syringe pump 19.

次に、ステップS2において、ノズル入口3b,3kのみを開にして、ステップS1と同様の原理でチャンバ5b内の第2の溶血剤をチャンバ7に流し込む。さらに、ステップS3において、ノズル入口3c,3kのみを開にして、ステップS1,S2と同様の原理でチャンバ5c内の磁性体粒子をチャンバ7に流し込む。ステップS2,S3のいずれにおいても、ステップS1と同様の攪拌を行う。ステップS3によって、ステップS1,S2において細胞が溶解して得られたDNAが磁性体粒子に付着する。   Next, in step S2, only the nozzle inlets 3b and 3k are opened, and the second hemolytic agent in the chamber 5b is poured into the chamber 7 on the same principle as in step S1. In step S3, only the nozzle inlets 3c and 3k are opened, and the magnetic particles in the chamber 5c are poured into the chamber 7 on the same principle as in steps S1 and S2. In both steps S2 and S3, the same stirring as in step S1 is performed. In step S3, the DNA obtained by cell lysis in steps S1 and S2 adheres to the magnetic particles.

そして、ステップS4で電磁石14をオンにし、ノズル入口3e,3kのみを開にし、電動シリンジポンプ19から空気を噴出し、電動シリンジポンプ18から空気を吸引して、チャンバ7内の溶液をチャンバ5eに移動させる。この移動の際に、磁性体粒子およびDNAを、流路10の電磁石14の上方位置で捕捉する。なお、電動シリンジポンプ18,19による空気の吸引および噴出を交互に繰り返して、溶液をチャンバ7と5eの間を2回往復させることにより、DNAの捕捉効率を向上させている。さらに往復回数を増やせば、捕捉効率を一層高めることができる。ただし、処理時間が余分に掛かることになる。   In step S4, the electromagnet 14 is turned on, only the nozzle inlets 3e and 3k are opened, air is ejected from the electric syringe pump 19, air is sucked from the electric syringe pump 18, and the solution in the chamber 7 is discharged into the chamber 5e. Move to. During this movement, the magnetic particles and DNA are captured at a position above the electromagnet 14 in the flow channel 10. Note that the efficiency of DNA capture is improved by alternately repeating the suction and ejection of air by the electric syringe pumps 18 and 19 to reciprocate the solution between the chambers 7 and 5e twice. If the number of reciprocations is further increased, the capture efficiency can be further increased. However, extra processing time is required.

このように、ステップS1〜S4にて、幅1〜2mm程度で高さ0.2〜1mm程度の小さい流路10上で、流動状態のDNAを、磁性体粒子を利用して極めて効率良く捕捉する。なお、仮に、捕捉ターゲット物質がDNAではなく、RNAまたはタンパク質の場合にも同様に効率の良い捕捉が行える。   As described above, in steps S1 to S4, the DNA in a fluidized state is captured very efficiently using magnetic particles on the small flow path 10 having a width of about 1 to 2 mm and a height of about 0.2 to 1 mm. To do. It should be noted that if the capture target substance is not DNA but RNA or protein, efficient capture can be performed similarly.

次に、ステップS5において電磁石14をオフにし、ノズル入口3f,3lのみを開とし、電動シリンジポンプ19から空気を噴出し、電動シリンジポンプ18から空気を吸引して、チャンバ5l内の第1の抽出洗浄液をチャンバ5fに移動させる。この際に、ステップS4で捕捉された磁性体粒子およびDNAが、抽出洗浄液と共に移動して洗浄が行われる。電磁石14をオンにして、ステップS4と同様の原理で磁性体粒子およびDNAと抽出洗浄液とをチャンバ5l内とチャンバ5fの間を2回往復させることによって、洗浄された磁性体粒子およびDNAを流路10の電磁石14の上方位置に回収し、第1の抽出洗浄液をチャンバ5lに戻す。   Next, in step S5, the electromagnet 14 is turned off, only the nozzle inlets 3f and 3l are opened, the air is ejected from the electric syringe pump 19, the air is sucked from the electric syringe pump 18, and the first in the chamber 5l. The extracted cleaning liquid is moved to the chamber 5f. At this time, the magnetic particles and DNA captured in step S4 move together with the extraction cleaning liquid to perform cleaning. By turning on the electromagnet 14 and reciprocating the magnetic particles and DNA and the extraction cleaning liquid twice in the chamber 5l and the chamber 5f on the same principle as in Step S4, the cleaned magnetic particles and DNA are flowed. It collect | recovers to the upper position of the electromagnet 14 of the path | route 10, and returns a 1st extraction washing | cleaning liquid to the chamber 5l.

ステップS6において、ノズル入口3f,3mのみを開いてステップS5と同様の工程を行い、チャンバ5m内の第2の抽出洗浄液と、磁性体粒子およびDNAとを移動させて、磁性体粒子およびDNAをさらに洗浄してから電磁石14の上方位置に回収し、第2の抽出洗浄液をチャンバ5mに戻す。   In step S6, only the nozzle inlets 3f and 3m are opened and the same process as in step S5 is performed to move the second extraction cleaning liquid in the chamber 5m, the magnetic particles and the DNA, and thereby the magnetic particles and the DNA are moved. Further, after washing, it is collected at a position above the electromagnet 14, and the second extraction washing liquid is returned to the chamber 5m.

続いて、ステップS7において電磁石14をオンにしたまま、ノズル入口3d,3oのみを開にし、電動シリンジポンプ18から空気を噴出し、電動シリンジポンプ19から空気を吸引することにより、チャンバ5d内の溶出液をチャンバ8に移動させる。この溶出液の作用によって、磁性体粒子とDNAが分離し、DNAのみが溶出液とともにチャンバ8に移動し、磁性体粒子は流路10内に残る。このようにして、DNAの抽出および精製が行われる。本実施形態では、抽出洗浄液を収容するチャンバ5l,5mと、洗浄後の廃液を溜めるためのチャンバ5fが用意されているので、カートリッジ1内でDNAの抽出および精製を行うことが可能である。   Subsequently, with the electromagnet 14 turned on in step S7, only the nozzle inlets 3d and 3o are opened, the air is ejected from the electric syringe pump 18, and the air is sucked from the electric syringe pump 19, thereby allowing the inside of the chamber 5d. The eluate is moved to the chamber 8. Due to the action of the eluate, the magnetic particles and DNA are separated, and only the DNA moves to the chamber 8 together with the eluate, and the magnetic particles remain in the flow path 10. In this way, DNA extraction and purification are performed. In this embodiment, the chambers 5l and 5m for storing the extracted cleaning liquid and the chamber 5f for storing the waste liquid after the cleaning are prepared, so that DNA can be extracted and purified in the cartridge 1.

次に、ステップS8において、ノズル入口3g,3oのみを開にし、電動シリンジポンプ18から空気を噴出し、電動シリンジポンプ19から空気を吸引して、チャンバ5g内のPCR用薬剤(例えば、プライマ、ポリメラーゼ、dNTP溶液、バッファ、蛍光標識等の混合液)をチャンバ8に流し込む。さらに、ノズル入口3g,3tのみを開にし、電動シリンジポンプ18,19による空気の噴出および吸引を交互に繰り返し、チャンバ8の溶液を流路11に流して、その後に戻す動作を繰り返して攪拌を行う。そして、ペルチェ素子15を制御して、チャンバ8内の溶液を96℃の温度に10分保持した後に、96℃・10秒、55℃・10秒、72℃・1分のサイクルを30回繰り返してPCRを行い、溶出されたDNAを増幅する。   Next, in step S8, only the nozzle inlets 3g and 3o are opened, the air is ejected from the electric syringe pump 18, the air is sucked from the electric syringe pump 19, and the PCR agent (for example, primer, A mixture of a polymerase, a dNTP solution, a buffer, a fluorescent label, etc.) is poured into the chamber 8. Further, only the nozzle inlets 3g and 3t are opened, and the ejection and suction of air by the electric syringe pumps 18 and 19 are alternately repeated, the solution in the chamber 8 is allowed to flow through the flow path 11, and then the operation of returning to it is repeated for stirring. Do. Then, after controlling the Peltier element 15 and holding the solution in the chamber 8 at a temperature of 96 ° C. for 10 minutes, a cycle of 96 ° C. · 10 seconds, 55 ° C. · 10 seconds, 72 ° C. · 1 minute is repeated 30 times. PCR is performed to amplify the eluted DNA.

ステップS9でノズル入口3g,3tのみを開にし、電動シリンジポンプ18から空気を噴出し、電動シリンジポンプ19から空気を吸引して、チャンバ8内の溶液をチャンバ9に移動させる。さらに、ペルチェ素子16を制御して、チャンバ9内の溶液を45℃で2時間保持し、ハイブリダイゼーションを行わせる。この時、電動シリンジポンプ18,19による空気の噴出および吸引を交互に繰り返して、チャンバ9内の溶液を流路6tに移動し、その後に戻す動作を繰り返して攪拌を行いながら、ハイブリダイゼーションを進める。   In step S 9, only the nozzle inlets 3 g and 3 t are opened, air is ejected from the electric syringe pump 18, air is sucked from the electric syringe pump 19, and the solution in the chamber 8 is moved to the chamber 9. Further, the Peltier element 16 is controlled to hold the solution in the chamber 9 at 45 ° C. for 2 hours to perform hybridization. At this time, the ejection and suction of air by the electric syringe pumps 18 and 19 are alternately repeated, the solution in the chamber 9 is moved to the flow path 6t, and the subsequent return operation is repeated to perform the hybridization while stirring. .

次にステップS10において、同じく45℃に保持したまま、今度はノズル入口3h、3rのみを開にし、電動シリンジポンプ18から空気を噴出し、電動シリンジポンプ19から空気を吸引して、チャンバ9内の溶液をチャンバ5rに移動させるとともに、チャンバ5h内の第1の洗浄液を、チャンバ9を通してチャンバ5rに流し込む。このように、ノズル入口3hにポンプノズル20を挿入して空気を噴出して加圧し、ノズル入口3rにポンプノズル21を挿入して空気を吸引して減圧することによって、チャンバ5h内の第1の洗浄液が、チャンバ9を通してチャンバ5r内に流れ込む様子が、チャンバ5h,9,5rを通る断面図である図6に示されている。電動シリンジポンプ18,19の吸引および噴出を交互に繰り返して、この溶液をチャンバ5h,9,5rの間を2回往復させ、最後にチャンバ5hに戻す。このようにして、ハイブリダイゼーションしなかった蛍光標識付きの検体DNAと蛍光標識とが洗浄される。   Next, in step S10, while maintaining the same at 45 ° C., this time, only the nozzle inlets 3h and 3r are opened, air is ejected from the electric syringe pump 18, and air is sucked from the electric syringe pump 19, The first cleaning liquid in the chamber 5 h is poured into the chamber 5 r through the chamber 9. As described above, the pump nozzle 20 is inserted into the nozzle inlet 3h and air is ejected and pressurized, and the pump nozzle 21 is inserted into the nozzle inlet 3r and the air is sucked and decompressed to thereby reduce the first in the chamber 5h. A state in which the cleaning liquid flows into the chamber 5r through the chamber 9 is shown in FIG. 6 which is a cross-sectional view through the chambers 5h, 9 and 5r. By alternately repeating the suction and ejection of the electric syringe pumps 18 and 19, this solution is reciprocated twice between the chambers 5h, 9, and 5r, and finally returned to the chamber 5h. In this way, the fluorescently labeled sample DNA and the fluorescent label that have not been hybridized are washed.

さらに、ステップS11において、同じく45℃に保持したまま、ノズル入口3j、3rのみを開いて、ステップS10と同様の工程を行い、チャンバ5j内の第2の洗浄液をチャンバ9を通してチャンバ5rに流し込んでDNAの洗浄をさらに行い、最後に溶液をチャンバ5jに戻す。このように本実施形態では、第1、第2の洗浄液を収容するチャンバ5h,5jと、洗浄後の廃液を溜めるためのチャンバ5rが用意されているので、生化学反応カートリッジ1内でDNAマイクロアレイ12の洗浄を行うことが可能である。   Further, in step S11, while maintaining the temperature at 45 ° C., only the nozzle inlets 3j and 3r are opened, the same process as in step S10 is performed, and the second cleaning liquid in the chamber 5j is poured into the chamber 5r through the chamber 9. Further washing of the DNA is performed, and finally the solution is returned to the chamber 5j. As described above, in this embodiment, the chambers 5h and 5j for storing the first and second cleaning liquids and the chamber 5r for storing the waste liquid after the cleaning are prepared. It is possible to perform 12 washings.

ステップS12で、ノズル入口3i,3rのみを開にし、電動シリンジポンプ18から空気を噴出し、電動シリンジポンプ19から空気を吸引して、チャンバ5i内のアルコールを、チャンバ9を通してチャンバ5rに移動させる。その後に、ノズル入口3i,3tのみを開にし、電動シリンジポンプ18から空気を噴出し、電動シリンジポンプ19から空気を吸引してチャンバ9内を乾燥させる。   In step S12, only the nozzle inlets 3i and 3r are opened, air is ejected from the electric syringe pump 18, air is sucked from the electric syringe pump 19, and the alcohol in the chamber 5i is moved through the chamber 9 to the chamber 5r. . Thereafter, only the nozzle inlets 3i and 3t are opened, air is ejected from the electric syringe pump 18, and air is sucked from the electric syringe pump 19 to dry the inside of the chamber 9.

以上述べたステップS1〜S12によって、検体の生化学反応(例えばDNAのハイブリダイゼーション)を生化学反応カートリッジ1内で行わせることができる。   Through the steps S1 to S12 described above, the biochemical reaction (for example, DNA hybridization) of the specimen can be performed in the biochemical reaction cartridge 1.

なお、本実施形態では、ノズル入口3a〜3tがカートリッジ1の2つの面、つまり両側部に集中して設けられているため、電動シリンジポンプ18,19、電動切換バルブ、ポンプノズルを内蔵したポンプブロック22,23等の形状や配置を単純化することができる。さらに、必要なチャンバや流路を確保しながら、ポンプブロック22,23により生化学反応カートリッジ1を同時に挟み込むという単純な動作だけで、ポンプノズル20,21を挿入することができ、ポンプブロック22,23の構成も簡単にすることができる。また、ノズル入口3a〜3tを全て同じ高さに直線的に並ぶように配置することによって、ノズル入口3a〜3tに接続される流路4a〜4tの高さは全て同じになり、流路4a〜4tの作製が容易になる。   In this embodiment, since the nozzle inlets 3a to 3t are concentrated on the two surfaces of the cartridge 1, that is, on both sides, the electric syringe pumps 18 and 19, an electric switching valve, and a pump having a built-in pump nozzle. The shape and arrangement of the blocks 22, 23, etc. can be simplified. Furthermore, the pump nozzles 20 and 21 can be inserted by a simple operation of sandwiching the biochemical reaction cartridge 1 simultaneously by the pump blocks 22 and 23 while securing the necessary chambers and flow paths. The configuration of 23 can also be simplified. Further, by arranging the nozzle inlets 3a to 3t so as to be all linearly arranged at the same height, the heights of the flow paths 4a to 4t connected to the nozzle inlets 3a to 3t are all the same, and the flow path 4a. Production of ˜4t is facilitated.

また、図1に示す実験装置において、n個の生化学反応カートリッジ1を同時に使用できるようにポンプブロック22,23をn倍に長くした構成にすれば、n個の生化学反応カートリッジ1を直列に並べて、n個の生化学反応カートリッジ1のそれぞれに対して必要な工程を同時に行うことができる。したがって、構成は極めて簡単でありながら多数の生化学反応カートリッジにおいて同時に生化学反応を行わせることが可能である。   Further, in the experimental apparatus shown in FIG. 1, if the pump blocks 22 and 23 are made n times longer so that n biochemical reaction cartridges 1 can be used simultaneously, n biochemical reaction cartridges 1 are connected in series. The necessary steps can be simultaneously performed for each of the n biochemical reaction cartridges 1. Therefore, the biochemical reaction can be performed simultaneously in a large number of biochemical reaction cartridges, though the configuration is extremely simple.

以上述べたステップS1〜S12を行って、生化学反応カートリッジ1内で生化学反応を生じさせた後に、検査者が図示しないレバーを操作して、ポンプブロック22,23を生化学反応カートリッジ1から離れる方向に移動させ、ポンプノズル20,21を生化学反応カートリッジ1のノズル入口3a〜3tから外す。そして、検査者はこの生化学反応カートリッジ1を、図7に示すサンプル検出装置にセットして、生化学反応の測定および解析を行う。   After the steps S1 to S12 described above are performed and a biochemical reaction is generated in the biochemical reaction cartridge 1, the inspector operates a lever (not shown) to move the pump blocks 22 and 23 from the biochemical reaction cartridge 1. The pump nozzles 20 and 21 are moved away from the nozzle inlets 3 a to 3 t of the biochemical reaction cartridge 1. Then, the inspector sets the biochemical reaction cartridge 1 in the sample detection device shown in FIG. 7 to measure and analyze the biochemical reaction.

図7は本実施形態のサンプル検出装置の概略図を表したものである。ここでは、図1に示す実験装置と、図7に示すサンプル検出装置を含めて、検体分析装置と総称する。   FIG. 7 shows a schematic diagram of the sample detection apparatus of the present embodiment. Here, the experimental apparatus shown in FIG. 1 and the sample detection apparatus shown in FIG.

このサンプル検出装置のカートリッジ設置部30にはばね31が設けられており、生化学反応カートリッジ1を図7の矢印A方向に付勢している。なお、図7においては、ばね31は、生化学反応カートリッジ1の基板(DNAマイクロアレイ12の基板)33に直接接しているが、生化学反応カートリッジ1内のどこに接していても構わない。そして、矢印A,A’方向に移動可能なロッド32a〜32cの先端が基板33に接触し、ばね31からの力と相まって生化学反応カートリッジ1(基板33)を矢印A,A’方向に移動可能にしている。3本のロッド32a〜32cが存在するため、生化学反応カートリッジ1(基板33)の姿勢は一義的に決定する。ロッド32の先端は表面粗さが小さく、かつ半球状であり、基板33を点支持し、基板33に傷を付け難いようになっている。なお、図7の矢印B方向に生化学反応カートリッジ1を見た図である図8に示されているように、ロッド32が基板33を加圧できるように、生化学反応カートリッジ1には、DNAマイクロアレイ12の領域外かつ基板33の領域内に、ロッド32が挿入されるための穴42が設けられている。   A spring 31 is provided in the cartridge installation part 30 of this sample detection device, and the biochemical reaction cartridge 1 is urged in the direction of arrow A in FIG. In FIG. 7, the spring 31 is in direct contact with the substrate 33 of the biochemical reaction cartridge 1 (substrate of the DNA microarray 12), but may be in contact with any place in the biochemical reaction cartridge 1. Then, the tips of the rods 32a to 32c movable in the directions of arrows A and A ′ contact the substrate 33, and coupled with the force from the spring 31, move the biochemical reaction cartridge 1 (substrate 33) in the directions of arrows A and A ′. It is possible. Since the three rods 32a to 32c exist, the posture of the biochemical reaction cartridge 1 (substrate 33) is uniquely determined. The tip of the rod 32 has a small surface roughness and a hemispherical shape so that the substrate 33 is point-supported and the substrate 33 is hardly damaged. In addition, as shown in FIG. 8, which is a view of the biochemical reaction cartridge 1 in the direction of arrow B in FIG. 7, the biochemical reaction cartridge 1 includes a rod 32 that can pressurize the substrate 33. A hole 42 for inserting the rod 32 is provided outside the region of the DNA microarray 12 and inside the region of the substrate 33.

図9にロッド32の駆動系の詳細を示す。カートリッジ設置部30またはその近傍に駆動モータ45が設けられている。後述するようにロッド32を正確に位置決めするために、駆動モータ45はサーボモータあるいはエンコーダを伴ったステッピングモータであり、駆動モータ制御部47(図7参照)に接続されている。一方、ロッド32にはギア46に噛み合うためのギアが形成されており、駆動モータ45の駆動力は、ギア46を介してロッド32に伝えられる。また、ロッド32には雄ネジが切ってあり、カートリッジ設置部30にはロッド32が回転しながら矢印A,A’方向に移動するための雌ネジが切ってある。そして、駆動モータ45およびギア46は3本のロッド32のそれぞれに対して独立して存在しており、生化学反応カートリッジ1(基板33)のチルト動作および矢印A、A’方向への移動を可能にしている。   FIG. 9 shows details of the drive system of the rod 32. A drive motor 45 is provided at or near the cartridge installation unit 30. As will be described later, in order to accurately position the rod 32, the drive motor 45 is a stepping motor with a servo motor or an encoder, and is connected to the drive motor control unit 47 (see FIG. 7). On the other hand, a gear for meshing with the gear 46 is formed on the rod 32, and the driving force of the driving motor 45 is transmitted to the rod 32 via the gear 46. The rod 32 is externally threaded, and the cartridge mounting portion 30 is internally threaded for moving the rod 32 in the directions of arrows A and A ′ while rotating. The drive motor 45 and the gear 46 exist independently for each of the three rods 32, and the tilting operation of the biochemical reaction cartridge 1 (substrate 33) and the movement in the directions of arrows A and A ′ are performed. It is possible.

図7に示すように、駆動モータ制御部47が接続されているCPU48にバーコードリーダ44が接続されている。このバーコードリーダ44は、生化学反応カートリッジ1に記載されているバーコード43からの情報を読取りCPU48に伝達する。CPU(処理装置)48は、バーコードリーダ44からの情報をもとに駆動モータ45の回転量を決定し、それを駆動モータ制御部47に伝えて駆動モータ45を制御させている。   As shown in FIG. 7, a barcode reader 44 is connected to a CPU 48 to which a drive motor control unit 47 is connected. The bar code reader 44 reads information from the bar code 43 described in the biochemical reaction cartridge 1 and transmits it to the CPU 48. The CPU (processing device) 48 determines the amount of rotation of the drive motor 45 based on information from the barcode reader 44 and transmits it to the drive motor controller 47 to control the drive motor 45.

このサンプル検出装置には、基板33に対向する対物レンズ37と、生化学反応カートリッジ1内のサンプル(検体)中の蛍光物質を励起するためのレーザー光源34と、レーザー光源34からのレーザー光およびサンプルからの蛍光を透過および反射するハーフミラー35と、レーザー光を対物レンズに導く反射鏡36と、レーザー光によって励起され、ハーフミラー35にて反射された蛍光のうちの特定の周波数帯のみを透過させるフィルター38と、フィルター38を透過した光を集光するレンズ39と、レンズ39により集光された光が入射され、その入射光を検出する光電子倍増管40が設けられている。光電子倍増管40はCPU48に接続されている。   In this sample detection device, an objective lens 37 facing the substrate 33, a laser light source 34 for exciting a fluorescent substance in a sample (analyte) in the biochemical reaction cartridge 1, a laser beam from the laser light source 34, and A half mirror 35 that transmits and reflects the fluorescence from the sample, a reflecting mirror 36 that guides the laser light to the objective lens, and only a specific frequency band of the fluorescence excited by the laser light and reflected by the half mirror 35. A filter 38 to be transmitted, a lens 39 for collecting the light transmitted through the filter 38, and a photomultiplier tube 40 for receiving the light collected by the lens 39 and detecting the incident light are provided. The photomultiplier tube 40 is connected to the CPU 48.

カートリッジ設置部30には、基板33上にマトリックス状に配列されたDNAプローブ(DNAマイクロアレイ12)と同じかそれよりも大きい検出窓41が設けられており、反射鏡36および対物レンズ37は、この基板33上のDNAマイクロアレイ12全体をスキャンできるように、不図示の駆動機構によって駆動可能である。   The cartridge installation unit 30 is provided with a detection window 41 that is the same as or larger than the DNA probe (DNA microarray 12) arranged in a matrix on the substrate 33. It can be driven by a drive mechanism (not shown) so that the entire DNA microarray 12 on the substrate 33 can be scanned.

このような構成であるため、レーザー光源34からハーフミラー35および反射鏡36を介して対物レンズ37に入射した平行光(レーザー光)が、対物レンズによって基板33上に合焦する。そして、レーザー光によって励起された蛍光物質から発せられる蛍光が、対物レンズ37によって平行光にされた後、反射鏡36およびハーフミラー35を介してフィルター38に入射し、フィルター38を透過して光電子倍増管40に入射した特定の周波数帯の光が、光電子倍増管40によって検出される。   Due to such a configuration, parallel light (laser light) incident on the objective lens 37 from the laser light source 34 via the half mirror 35 and the reflecting mirror 36 is focused on the substrate 33 by the objective lens. Then, the fluorescence emitted from the fluorescent material excited by the laser light is converted into parallel light by the objective lens 37, then enters the filter 38 through the reflecting mirror 36 and the half mirror 35, passes through the filter 38, and is photoelectron. Light of a specific frequency band incident on the multiplier tube 40 is detected by the photomultiplier tube 40.

ここで、バーコード43に記録される情報について詳説する。本実施形態のように、ロッド32がガラス基板33に直接接する構成の場合には、以下のいずれかの情報をバーコード43に記録することが考えられる。   Here, the information recorded on the barcode 43 will be described in detail. When the rod 32 is in direct contact with the glass substrate 33 as in the present embodiment, it is conceivable to record any of the following information on the barcode 43.

1.基板33の厚さ(サンプル検出装置にセットされる生化学反応カートリッジ1の基板33の材質が常に一定の場合)
2.基板33の厚さと基板33の材質の屈折率(サンプル検出装置にセットされる生化学反応カートリッジ1の基板33の材質が一定でない場合)
3.レーザー光が基板33上のDNAマイクロアレイ12に合焦するために必要な、3本のロッド32a〜32cの矢印A,A’方向への移動量
レーザー光が基板33上のマトリックス状のDNAマイクロアレイ12に合焦するために必要な、3本のロッド32a〜32cの矢印A,A’方向への移動量は、基板33の厚さと基板33の材質の屈折率とから計算される。例えば、基板33の厚さの称呼寸法(予備寸法)が1.000(mm)で、その実測値が1.015(mm)であり、基板33の材質の屈折率が1.46である場合には、ロッド32a〜32cの位置は、称呼寸法の場合よりも(1.015−1.000)/1.46=約0.01(mm)だけA’方向に移動させる必要がある。なお、この計算例は対物レンズ37が平凸レンズの場合であるが、平凸レンズに限定するものではない。基板33の光学系に対する相対移動は、対物レンズ37から基板33へ照射されるレーザー光の光軸方向に沿って行われても、この光軸方向を基準線として所定角度だけ傾いたチルト方向に沿って行われてもよい。
1. The thickness of the substrate 33 (when the material of the substrate 33 of the biochemical reaction cartridge 1 set in the sample detection device is always constant)
2. The thickness of the substrate 33 and the refractive index of the material of the substrate 33 (when the material of the substrate 33 of the biochemical reaction cartridge 1 set in the sample detection device is not constant)
3. Amount of movement of the three rods 32 a to 32 c in the directions of arrows A and A ′ necessary for the laser light to focus on the DNA microarray 12 on the substrate 33. The laser light is a matrix-like DNA microarray 12 on the substrate 33. The amount of movement of the three rods 32a to 32c in the directions of the arrows A and A ′ necessary for focusing on is calculated from the thickness of the substrate 33 and the refractive index of the material of the substrate 33. For example, the nominal dimension (preliminary dimension) of the thickness of the substrate 33 is 1.000 (mm), the measured value is 1.015 (mm), and the refractive index of the material of the substrate 33 is 1.46. Therefore, it is necessary to move the positions of the rods 32a to 32c in the A ′ direction by (1.015−1.000) /1.46=about 0.01 (mm) than in the case of the nominal size. This calculation example is for the case where the objective lens 37 is a plano-convex lens, but is not limited to a plano-convex lens. Even if the relative movement of the substrate 33 with respect to the optical system is performed along the optical axis direction of the laser light irradiated from the objective lens 37 to the substrate 33, the tilt direction is inclined by a predetermined angle with the optical axis direction as a reference line. May be performed along.

本実施形態では、前記した情報のいずれかがバーコード43に記録されている。バーコード43に、基板33の厚さ、または基板33の厚さと基板33の材質の屈折率が記録されている場合には、前記した移動量の計算はCPU48において行なわれる。もちろん、この計算を予め行って求めた移動量をバーコード43に記録しておいても構わない。   In the present embodiment, any of the information described above is recorded on the barcode 43. When the bar code 43 records the thickness of the substrate 33 or the thickness of the substrate 33 and the refractive index of the material of the substrate 33, the CPU 48 calculates the amount of movement described above. Of course, the movement amount obtained by performing this calculation in advance may be recorded in the barcode 43.

このような本実施形態のサンプル検出装置を用いた検出工程について、図10のフローチャートを参照して説明する。生化学反応カートリッジ1をカートリッジ設置部30に設置し、不図示の入力部から動作開始命令を入力すると、ステップS13において、バーコードリーダ44がバーコード43を読み取り、そのバーコード43に記録されている情報をCPU48に伝える。そして、ステップS14において、バーコード43に記録されている情報に基づいてCPU48が駆動モータ45の回転量を決定する。前記したように、バーコード43に基板33の厚さ、または基板33の厚さと基板33の材質の屈折率が記録されている場合には、CPU48がロッド32a〜32cの移動量を計算して、それに基づいて駆動モータ45の回転量を決定する。また、バーコード43にロッド32a〜32cの移動量が記録されている場合には、それに基づいてCPU48が駆動モータ45の回転量を決定する。そして、ステップS15において、駆動モータ45を駆動させる。それにより、基板33上のDNAマイクロアレイ12が、対物レンズ37によるレーザー光の合焦位置に移動する。そこで、S16において、反射鏡36および対物レンズ37がDNAマイクロアレイ12を網羅する領域においてスキャンを行いながら、前記した通りレーザー光源34からのレーザー光の照射と、それに基づく蛍光の、光電子倍増管40による検出とを行うことによって、蛍光物質が付着しているDNAプローブの検出が完了する。   A detection process using such a sample detection apparatus of the present embodiment will be described with reference to the flowchart of FIG. When the biochemical reaction cartridge 1 is installed in the cartridge installation unit 30 and an operation start command is input from an input unit (not shown), the barcode reader 44 reads the barcode 43 and records the barcode 43 in step S13. Information to the CPU 48. In step S <b> 14, the CPU 48 determines the rotation amount of the drive motor 45 based on the information recorded on the barcode 43. As described above, when the barcode 43 records the thickness of the substrate 33 or the thickness of the substrate 33 and the refractive index of the material of the substrate 33, the CPU 48 calculates the movement amount of the rods 32a to 32c. Based on this, the amount of rotation of the drive motor 45 is determined. When the movement amount of the rods 32 a to 32 c is recorded on the barcode 43, the CPU 48 determines the rotation amount of the drive motor 45 based on the movement amount. In step S15, the drive motor 45 is driven. As a result, the DNA microarray 12 on the substrate 33 moves to the focus position of the laser beam by the objective lens 37. Therefore, in S16, while the reflecting mirror 36 and the objective lens 37 perform scanning in the region covering the DNA microarray 12, as described above, the laser light from the laser light source 34 is irradiated and the fluorescence based on it is generated by the photomultiplier tube 40. By performing the detection, the detection of the DNA probe to which the fluorescent substance is attached is completed.

光電子倍増管40が、DNAマイクロアレイ12を構成する、マトリックス状に並んだ様々なDNAプローブのうちのいずれかに蛍光標識が付着していることを検出すると、その検出データがCPU48に送られる。CPU48は、光電子倍増管40からの検出データに基づいて、ステップS1〜S12の処理工程で行われた生化学反応の結果を推定し、その結果を分析することによって、検体中の感染症ウィルス、細菌、疾患関連遺伝子、遺伝子多型等を検出することができる。すなわち、本実施形態では、CPU48が、合焦動作のための基板33と光学系34〜40(特に対物レンズ37)の相対位置の調整のための演算処理を行うのみならず、サンプル検出結果に基づいて検体の分析を行う処理装置としても機能する。ただし、合焦動作のための基板33と光学系34〜40(特に対物レンズ37)の相対位置の調整のための演算処理を行うCPUと、サンプル検出結果に基づく検体分析を行う処理装置とを別々に設けてもよい。   When the photomultiplier tube 40 detects that a fluorescent label is attached to any one of various DNA probes arranged in a matrix that constitute the DNA microarray 12, the detected data is sent to the CPU 48. Based on the detection data from the photomultiplier tube 40, the CPU 48 estimates the result of the biochemical reaction performed in the processing steps of steps S1 to S12, and analyzes the result to thereby infect the infectious disease virus in the sample, Bacteria, disease-related genes, gene polymorphisms, etc. can be detected. That is, in the present embodiment, the CPU 48 not only performs arithmetic processing for adjusting the relative positions of the substrate 33 and the optical systems 34 to 40 (particularly the objective lens 37) for the focusing operation, but also performs the sample detection result. It also functions as a processing device for analyzing a sample based on the sample. However, a CPU that performs arithmetic processing for adjusting the relative positions of the substrate 33 for focusing operation and the optical systems 34 to 40 (particularly the objective lens 37), and a processing device that performs sample analysis based on the sample detection result are provided. It may be provided separately.

本実施形態によれば、予め求められている基板に関する情報(例えば、基板の厚さ、基板の材質の屈折率、ロッドの移動量)にしたがって対物レンズ37と基板33との相対位置を調節することによって、合焦動作が行える。このことは、従来の光学的なオートフォーカス動作が不要であることを意味する。それによって、オートフォーカス動作のためのレーザー光照射によって、DNAプローブに付着した蛍光物質の褪色を防止できる。また、オートフォーカス動作のための読み取り、演算、フィードバックの各処理を省略でき、動作時間を削減できる。さらに、基板33の、DNAマイクロアレイ12の反対側において蛍光を検出する構成の場合にも、基板の厚さの公差による輝度のばらつきを無くすことができる。   According to the present embodiment, the relative position between the objective lens 37 and the substrate 33 is adjusted in accordance with information about the substrate that has been obtained in advance (for example, the thickness of the substrate, the refractive index of the material of the substrate, and the amount of movement of the rod). Thus, a focusing operation can be performed. This means that the conventional optical autofocus operation is unnecessary. Thereby, it is possible to prevent the fluorescent material adhering to the DNA probe from being faded by laser light irradiation for autofocus operation. Also, reading, calculation, and feedback processing for autofocus operation can be omitted, and operation time can be reduced. Further, even in the case where the fluorescence is detected on the opposite side of the substrate 33 from the DNA microarray 12, it is possible to eliminate variations in luminance due to the tolerance of the substrate thickness.

なお、本実施形態では、前記した情報のいずれかをバーコード43に記録し、それをバーコードリーダ44によって読み取る構成であるが、バーコード43およびバーコードリーダ44は2次元バーコードおよびそのリーダでもよい。また、バーコード43およびバーコードリーダ44の代わりにICタグとその読取装置を設けても構わない。さらに、このような情報を、検査者が不図示の入力部から分析の都度入力する構成にしても構わない。   In the present embodiment, any of the information described above is recorded on the barcode 43 and read by the barcode reader 44. However, the barcode 43 and the barcode reader 44 are a two-dimensional barcode and its reader. But you can. Further, instead of the barcode 43 and the barcode reader 44, an IC tag and its reading device may be provided. Further, such an information may be input by an inspector from an input unit (not shown) every time analysis is performed.

[第2の実施形態]
次に、本発明の第2の実施形態を詳細に説明する。
[Second Embodiment]
Next, a second embodiment of the present invention will be described in detail.

本実施形態は、図11に示すように、ロッド32a〜32cが生化学反応カートリッジ1の基板33以外の部位に接する点が、第1の実施形態と異なる。それ以外の点については第1の実施形態と同様であるので説明を省略する。   As shown in FIG. 11, this embodiment is different from the first embodiment in that the rods 32 a to 32 c are in contact with parts other than the substrate 33 of the biochemical reaction cartridge 1. Since other points are the same as those in the first embodiment, description thereof is omitted.

本実施形態は、例えば生化学反応カートリッジ1に穴が空いており、内部のチャンバや流路を構成できない場合に有効である。   This embodiment is effective when, for example, the biochemical reaction cartridge 1 has a hole and an internal chamber or flow path cannot be configured.

本実施形態においては、以下の情報のいずれかがバーコード33に記録される。   In the present embodiment, any of the following information is recorded on the barcode 33.

1.基板33の厚さと、基板33の表面または裏面を基準平面とした時の、生化学反応カートリッジ1におけるロッド32が接する3点のZ座標(サンプル検出装置にセットされる生化学反応カートリッジ1の基板33の材質が常に一定の場合)
2.基板33の厚さと、基板33の材質の屈折率と、基板33の表面または裏面を基準平面とした時の、生化学反応カートリッジ1におけるロッド32が接する3点のZ座標(サンプル検出装置にセットされる生化学反応カートリッジ1の基板33の材質が一定でない場合)
3.レーザー光が基板33上のDNAマイクロアレイ12に合焦するために必要な、3本のロッド32a〜32cの矢印A,A’方向への移動量
レーザー光が基板33上のDNAマイクロアレイ12に合焦するために必要な、3本のロッド32a〜32cの矢印A,A’方向への移動量は、基板33の厚さと、基板33の材質の屈折率と、基板33の表面または裏面を基準平面とした時の、生化学反応カートリッジ1におけるロッド32が接する3点のZ座標とから計算される。例えば、基板33の厚さの称呼寸法(予備寸法)が1.000(mm)で、その実測値が1.015(mm)であり、基板33の材質の屈折率が1.46であり、基準平面のZ座標を4.000mmとした時のロッド32aが接する点のZ座標を4.152mm、ロッド32bが接する点のZ座標を3.983mm、ロッド32cが接する点のZ座標を4.021mmとすると、ロッド32aを(4.152−4.000)−(1.015−1.000)/1.46=0.094(mm)だけA方向に移動させ、ロッド32bを(3.983−4.000)−(1.015−1.000)/1.46=−0.022(mm)だけA方向に、すなわち0.022(mm)だけA’方向に移動させ、ロッド32cを(4.021−4.000)−(1.015−1.000)/1.46=0.004(mm)だけA方向に移動させる必要がある。
1. The three coordinates Z of the biochemical reaction cartridge 1 with which the rod 32 is in contact with the thickness of the substrate 33 and the front or back surface of the substrate 33 as a reference plane (the substrate of the biochemical reaction cartridge 1 set in the sample detection device) (When 33 materials are always constant)
2. The thickness of the substrate 33, the refractive index of the material of the substrate 33, and the Z coordinate of the three points with which the rod 32 of the biochemical reaction cartridge 1 is in contact with the front or back surface of the substrate 33 as a reference plane (set in the sample detection device) (When the material of the substrate 33 of the biochemical reaction cartridge 1 is not constant)
3. The amount of movement of the three rods 32a to 32c in the directions of arrows A and A ′ necessary for focusing the laser light on the DNA microarray 12 on the substrate 33. The laser light is focused on the DNA microarray 12 on the substrate 33. The amount of movement of the three rods 32a to 32c in the directions of the arrows A and A ′ necessary for the purpose is to determine the thickness of the substrate 33, the refractive index of the material of the substrate 33, and the front or back surface of the substrate 33 as a reference plane. Is calculated from the Z coordinates of the three points with which the rod 32 in the biochemical reaction cartridge 1 is in contact. For example, the nominal dimension (preliminary dimension) of the thickness of the substrate 33 is 1.000 (mm), the measured value is 1.015 (mm), and the refractive index of the material of the substrate 33 is 1.46. When the Z coordinate of the reference plane is 4.000 mm, the Z coordinate of the point where the rod 32a touches is 4.152 mm, the Z coordinate of the point where the rod 32b touches is 3.983 mm, and the Z coordinate of the point where the rod 32c touches is 4. Assuming 021 mm, the rod 32a is moved in the A direction by (4.152-4.000)-(1.015-1.000) /1.46=0.094 (mm), and the rod 32b is moved to (3. 983-4.000)-(1.015-1.000) / 1.46 = -0.022 (mm) in the A direction, that is, 0.022 (mm) in the A 'direction, the rod 32c (4.021-4.000)-(1. It is necessary to move in the A direction by (015-1.000) /1.46=0.004 (mm).

説明を繰り返さないが、本実施形態では、第1の実施形態(図10参照)と全く同様の工程を行うことによって、第1の実施形態と同様な効果を得ることができる。   Although the description is not repeated, in this embodiment, the same effect as that of the first embodiment can be obtained by performing the same process as that of the first embodiment (see FIG. 10).

[第3の実施形態]
次に、本発明の第3の実施形態を詳細に説明する。
[Third Embodiment]
Next, a third embodiment of the present invention will be described in detail.

本実施形態は、光学系34〜40と基板33上のDNAマイクロアレイ12との相対位置関係が第1,2の実施形態とは異なる。すなわち、第1,2の実施形態では基板33のDNAマイクロアレイ12と反対側の面からレーザー光(励起光)を照射する構成であるが、本実施形態では、図12に示すように基板33のDNAマイクロアレイ12と対向する位置に配置されている光学系34〜40からレーザー光を照射する構成であり、検出窓41の位置が第1,2の実施形態とは異なる。また、生化学反応カートリッジ1のDNAマイクロアレイ12側の筐体は、少なくともDNAプローブが配列されている範囲において入射光をある程度透過可能な材質、例えばアクリルや石英ガラスによって構成されている。本実施形態は、装置構成の都合上光学系(特に対物レンズ37)をDNAマイクロアレイ12と同じ側に配置することが好ましい場合に有効である。前記した以外の点については第1,2の実施形態と同様であるので説明を省略する。   The present embodiment is different from the first and second embodiments in the relative positional relationship between the optical systems 34 to 40 and the DNA microarray 12 on the substrate 33. That is, in the first and second embodiments, the laser beam (excitation light) is irradiated from the surface of the substrate 33 opposite to the DNA microarray 12, but in this embodiment, as shown in FIG. This is a configuration in which laser light is irradiated from the optical systems 34 to 40 arranged at positions facing the DNA microarray 12, and the position of the detection window 41 is different from those in the first and second embodiments. The casing on the DNA microarray 12 side of the biochemical reaction cartridge 1 is made of a material that can transmit incident light to some extent at least in the range where the DNA probes are arranged, for example, acrylic or quartz glass. This embodiment is effective when it is preferable to place the optical system (particularly the objective lens 37) on the same side as the DNA microarray 12 for the convenience of the apparatus configuration. Since points other than those described above are the same as in the first and second embodiments, description thereof will be omitted.

本実施形態においては、以下の情報のいずれかがバーコード33に記録される。   In the present embodiment, any of the following information is recorded on the barcode 33.

1.チャンバ49内の媒質の厚さと、生化学反応カートリッジ1のDNAプローブが配列された領域の筐体の厚さと、基板33の表面または裏面を基準平面とした時の、生化学反応カートリッジ1におけるロッド32が接する3点のZ座標(サンプル検出装置にセットされる生化学反応カートリッジ1の基板33の材質、チャンバ49内の媒質、生化学反応カートリッジ1のDNAプローブが配列された領域の筐体の材質が常に一定である場合)
2.チャンバ49内の媒質の屈折率および厚さと、基板33の材質の屈折率と、生化学反応カートリッジ1のDNAプローブが配列された領域の筐体の屈折率および厚さと、基板33の表面または裏面を基準平面とした時の、生化学反応カートリッジ1におけるロッド32が接する3点のZ座標(サンプル検出装置にセットされる生化学反応カートリッジ1の基板33の材質、チャンバ49内の媒質、生化学反応カートリッジ1のDNAプローブが配列された領域の筐体の材質が一定でない場合)
3.レーザー光が基板33上のDNAマイクロアレイ12に合焦するために必要な、3本のロッド32a〜32cの矢印A,A’方向への移動量
レーザー光が基板33上のDNAマイクロアレイ12に合焦するために必要な、3本のロッド32a〜32cの矢印A,A’方向への移動量は、基板33の厚さと、基板33の材質の屈折率と、基板33の表面または裏面を基準平面とした時の、生化学反応カートリッジ1におけるロッド32が接する3点のZ座標とから計算される。例えば、チャンバ49内の媒質の厚さの称呼寸法(予備寸法)が1.000(mm)で、その実測値が1.050(mm)で、その屈折率が1.33であり、生化学反応カートリッジ1のDNAプローブが配列された領域の筐体の称呼寸法(予備寸法)が3.000(mm)で、その実測値が2.998(mm)で、その屈折率が1.49であり、基準平面のZ座標を4.000mmとした時のロッド32aが接する点のZ座標を4.152mm、ロッド32bが接する点のZ座標を3.983mm、ロッド32cが接する点のZ座標を4.021mmとすると、ロッド32aを(4.152−4.000)+(1.050−1.000)/1.33+(2.998−3.000)/1.49=0.188(mm)だけA方向に移動させ、ロッド32bを(3.983−4.000)+(1.050−1.000)/1.33+(2.998−3.000)/1.49=0.019(mm)だけA方向に移動させ、ロッド32cを(4.021−4.000)+(1.050−1.000)/1.33+(2.998−3.000)/1.49=0.057(mm)だけA方向に移動させる必要がある。
1. The rod in the biochemical reaction cartridge 1 when the thickness of the medium in the chamber 49, the thickness of the casing in the region where the DNA probes of the biochemical reaction cartridge 1 are arranged, and the front or back surface of the substrate 33 are used as a reference plane Z coordinates of the three points 32 in contact with each other (the material of the substrate 33 of the biochemical reaction cartridge 1 set in the sample detection device, the medium in the chamber 49, and the housing in the region where the DNA probes of the biochemical reaction cartridge 1 are arranged) (If the material is always constant)
2. The refractive index and thickness of the medium in the chamber 49, the refractive index of the material of the substrate 33, the refractive index and thickness of the housing in the region where the DNA probes of the biochemical reaction cartridge 1 are arranged, and the front or back surface of the substrate 33 3 is the Z coordinate (the material of the substrate 33 of the biochemical reaction cartridge 1 set in the sample detection device, the medium in the chamber 49, the biochemistry) at which the rod 32 of the biochemical reaction cartridge 1 contacts the reference plane. (When the material of the housing of the reaction cartridge 1 where the DNA probes are arranged is not constant)
3. The amount of movement of the three rods 32a to 32c in the directions of arrows A and A ′ necessary for focusing the laser light on the DNA microarray 12 on the substrate 33. The laser light is focused on the DNA microarray 12 on the substrate 33. The amount of movement of the three rods 32a to 32c in the directions of the arrows A and A ′ necessary for the purpose is to determine the thickness of the substrate 33, the refractive index of the material of the substrate 33, and the front or back surface of the substrate 33 as a reference plane. Is calculated from the Z coordinates of the three points with which the rod 32 in the biochemical reaction cartridge 1 is in contact. For example, the nominal dimension (preliminary dimension) of the thickness of the medium in the chamber 49 is 1.000 (mm), the measured value is 1.050 (mm), and the refractive index is 1.33. The nominal dimension (preliminary dimension) of the casing of the region where the DNA probes of the reaction cartridge 1 are arranged is 3.000 (mm), the measured value is 2.998 (mm), and the refractive index is 1.49. Yes, when the Z coordinate of the reference plane is 4.000 mm, the Z coordinate of the point where the rod 32a touches is 4.152 mm, the Z coordinate of the point where the rod 32b touches is 3.983 mm, and the Z coordinate of the point where the rod 32c touches If it is 4.021 mm, the rod 32a is (4.152-4.000) + (1.050-1.000) /1.33+ (2.998-3.000) /1.49=0.188 ( mm)) in the A direction and the rod 32 Is moved in the A direction by (3.983-4.000) + (1.050-1.000) /1.33+ (2.998-3.000) /1.49=0.199 (mm). , The rod 32c is (4.021-4.000) + (1.050-1.000) /1.33+ (2.998-3.000) /1.49=0.057 (mm) in the A direction. Need to be moved to.

説明を繰り返さないが、本実施形態では、第1、2の実施形態(図10,11参照)と全く同様の工程を行うことによって、装置構成上の都合により基板33のDNAマイクロアレイ12と対向する位置に光学系(特に対物レンズ37)が構成されている場合においても、第1,2の実施形態と同様な効果を得ることができる。   Although the description is not repeated, in the present embodiment, the same process as in the first and second embodiments (see FIGS. 10 and 11) is performed to face the DNA microarray 12 on the substrate 33 for convenience of the apparatus configuration. Even when the optical system (particularly the objective lens 37) is configured at the position, the same effects as those of the first and second embodiments can be obtained.

1 生化学反応カートリッジ
12 DNAマイクロアレイ
31 バネ(移動手段)
32 ロッド(移動手段)
33 基板
34 レーザー光源(光学系)
35 ハーフミラー(光学系)
36 反射鏡(光学系)
37 対物レンズ(光学系)
38 フィルター(光学系)
39 レンズ(光学系)
40 光電子倍増管(光学系)
43 バーコード(記録部)
44 バーコードリーダ(読み取り部)
45 駆動モータ(移動手段)
46 ギア(移動手段)
47 駆動モータ制御部(移動手段)
48 CPU(処理装置)
1 Biochemical reaction cartridge 12 DNA microarray 31 Spring (moving means)
32 Rod (moving means)
33 Substrate 34 Laser light source (optical system)
35 Half mirror (optical system)
36 Reflector (optical system)
37 Objective lens (optical system)
38 Filter (optical system)
39 Lens (optical system)
40 Photomultiplier tube (optical system)
43 Bar code (recording part)
44 Bar code reader (reading unit)
45 Drive motor (moving means)
46 Gear (moving means)
47 Drive motor controller (moving means)
48 CPU (Processor)

Claims (12)

透光性を有する基板が生化学反応カートリッジ内に配置され、前記生化学反応カートリッジ内の前記基板上のサンプルを、該基板を介して光学的に検出するサンプル検出装置において、
前記基板の、前記サンプルが存在する可能性のある面の反対側の面に対向するように配置され、前記基板に光を照射し、前記基板を透過した前記生化学反応カートリッジ内の光の検出を行う光学系と、
予め求められている前記基板に関する情報に基づいて、前記基板上の前記サンプルを検出する領域外の3点を、それぞれ個別に光軸方向あるいは光軸方向を基準線としたチルト方向に沿って移動させ、前記基板上に光を合焦させるためのチルト動作を行う手段と、を有し、
前記3点は前記反対側の面にあり、
前記チルト動作を行う手段は、前記基板上の前記3点にそれぞれ当接し、前記3点を前記光軸方向または前記チルト方向に沿ってそれぞれ移動させる3本のロッドを有する
ことを特徴とするサンプル検出装置。
In a sample detection apparatus in which a translucent substrate is disposed in a biochemical reaction cartridge, and a sample on the substrate in the biochemical reaction cartridge is optically detected through the substrate ,
Detection of light in the biochemical reaction cartridge that is disposed so as to face the surface of the substrate opposite to the surface on which the sample may exist , irradiates the substrate with light, and transmits the substrate. An optical system for performing
Based on information about the substrate obtained in advance, three points outside the region for detecting the sample on the substrate are individually moved along the optical axis direction or the tilt direction with the optical axis direction as a reference line. It is, have a, and means for performing a tilt operation for focusing the light on the substrate;
The three points are on the opposite surface,
The means for performing the tilting operation includes three rods that respectively contact the three points on the substrate and move the three points along the optical axis direction or the tilt direction, respectively. Detection device.
前記基板に関する情報を入力するための入力部を有する、請求項1に記載のサンプル検出装置。 The sample detection apparatus according to claim 1, further comprising an input unit for inputting information relating to the substrate. 前記基板に関する情報が記録された記録部を有する、請求項1に記載のサンプル検出装置。 The sample detection apparatus according to claim 1, further comprising a recording unit on which information on the substrate is recorded. 前記記録部はバーコードである、請求項に記載のサンプル検出装置。 The sample detection apparatus according to claim 3 , wherein the recording unit is a bar code. 前記記録部はICタグである、請求項に記載のサンプル検出装置。 The sample detection apparatus according to claim 3 , wherein the recording unit is an IC tag. 前記記録部に記録されている前記基板に関する情報を読み取るための読み取り部を有する、請求項3〜5のいずれか1項に記載のサンプル検出装置。 The sample detection apparatus of any one of Claims 3-5 which has a reading part for reading the information regarding the said board | substrate currently recorded on the said recording part. 前記基板に関する情報は該基板の厚さを含む、請求項1〜のいずれか1項に記載のサンプル検出装置。 Information about the substrate comprises a thickness of the substrate, the sample detection apparatus according to any one of claims 1-6. 記基板に関する情報は、該基板の基準平面から、前記生化学反応カートリッジと前記移動手段との接点までの距離を含む、請求項1〜のいずれか1項に記載のサンプル検出装置。 Information about the previous SL substrate from the reference plane of the substrate, including the distance between the biochemical reaction cartridge to the contact point of the moving means, sample detection apparatus according to any one of claims 1-7. 前記基板には複数のDNAプローブが設けられており、該DNAプローブに捕捉された前記サンプルを光学的に検出する、請求項1〜のいずれか1項に記載のサンプル検出装置。 Wherein the substrate is provided with a plurality of DNA probes to detect the sample that is captured in the DNA probe optically, sample detection apparatus according to any one of claims 1-8. 請求項1〜のいずれか1項に記載のサンプル検出装置と、
前記サンプル検出装置による前記サンプルの検出結果に基づいて、前記サンプル検出装置に供給される検体の生化学反応の有無生化学反応状態とのいずれか一方または両方を知ることによって、前記検体を分析する処理装置と
を含む、検体分析装置
The sample detection device according to any one of claims 1 to 9 ,
Based on the sample of the detection result by the sample detector, by knowing either or both of the presence and biochemical reaction state of the biochemical reactions of the sample supplied to the sample detector, analyzing the specimen And a sample analyzer
前記サンプル検出装置の、前記検体が供給される生化学反応カートリッジをセットして、前記検体の生化学反応を行わせるための実験装置をさらに含む、請求項10に記載の検体分析装置。 The sample analyzer according to claim 10 , further comprising an experimental device for setting a biochemical reaction cartridge to which the sample is supplied of the sample detection device to cause a biochemical reaction of the sample. 前記チルト動作を行う手段と対向して前記基板を付勢するための設置部をさらに有する請求項1〜のいずれか1項に記載のサンプル検出装置。 Sample detection apparatus according to any one of claims 1 to 9, further comprising an installation part for biasing the substrate opposite the means for performing the tilt operation.
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