JP5284958B2 - 前立腺癌と良性前立腺肥大症とを識別する方法 - Google Patents
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Description
(a)工程1 PSAの単離
最初に血清中の免疫グロブリンの除去を行った。4mLのプロテインAアガロース(PIERCE)をディスポーザブルプラスティックカラム(PIERCE)に充填し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を用いて平衡化した。プロテインAアガロース充填カラムに対して、BPHと診断された被験者(T−13)の血清およびPBSの混合物を添加し、2倍のカラムボリューム(CV)のPBSにて洗浄した。この担体に結合しないPSAを含む画分を採取し、最終濃度が1MになるようにNa2SO4を加えた。
工程(a)で得られた乾燥ゲルの入ったチューブに対して、10mMのジチオトレイトール(DTT)および25mMの炭酸水素アンモニウムを含む水溶液(pH8.0)を加え、遮光条件下1時間にわたって56℃で振盪して還元反応を行い、チューブ内の溶液を除去した。チューブに対して55mMのヨードアセトアミドを含む水溶液を加えて、遮光条件下45分間にわたって室温で振盪してアルキル化反応を行い、チューブ内の溶液を除去した。還元およびアルキル化を行ったゲルを、25mMの炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)、およびアセトニトリルで洗浄し、その後、ゲルを乾燥させた。
MALDI用ターゲットプレートの上に、工程2で得られた糖鎖溶液0.5μLを滴下し、風乾させた。次に、ターゲットプレート上に、1−ピレニルジアゾメタン(PDAM、500pmol)のDMSO溶液0.25μLを滴下し、約25分間にわたって40℃に加熱し、乾燥させた。この操作によって、ターゲットプレート上に、PDAMで標識された糖鎖が得られた。
工程3で得られた標識糖鎖を担持したターゲットプレートに対して、2,5−ジヒドロキシ安息香酸(DHBA)の50%アセトニトリル溶液(濃度10mg/mL)0.5μLを滴下し、室温において乾燥させた。
BPHと診断され、匿名化され識別コードを付した3名の被験者の血清(実施例2〜4)、ならびに生検によりPCと診断され、匿名化され識別コードを付した12名の被験者の血清(実施例5〜16)を用いて、実施例1の手順を繰り返した。なお、医療機関の倫理審査を受け承認され、被験者には説明をし同意を得ている。
表1に示したように、PCと診断された被験者の血清に由来する試料は、1.0より大きいフコース非結合糖鎖/フコース結合糖鎖のシグナル強度比Rを示し、フコース非結合糖鎖を多く含有することを見出した。それに対して、BPHと診断された被験者の血清に由来する試料のシグナル強度比Rは1.0以下であった。すなわち、BPHと診断された被験者の血清中には、フコース結合糖鎖がフコース非結合糖鎖よりも多く存在することが初めて明らかになった。
本実施例は、前述の実施例における糖鎖に代えて糖ペプチドを用いることができることを示す例である。
P1B(m/z=2677.2) / P2B(m/z=2531.2)
P1C(m/z=2427.1) / P2C(m/z=2281.0)
P1D(m/z=2386.1) / P2D(m/z=2240.0)
サーモリシンの炭酸水素アンモニウム水溶液に代えて、200ngのエンドプロテイナーゼArg−C(ロシュ・ダイアグノスティックス)を含む緩衝液(50mMのTris−HCl、pH7.6、5mMのDTT、および0.5mMのEDTAを含有する)を用い、ゲル内消化の反応温度を37℃に変更したことを除いて、実施例9の手順を反復した。
BPHまたはPCに罹患している患者の血清から、実施例1にしたがって工程1を実施してPSAを精製し、その後、実施例17または18の手順にしたがって工程2を実施することによって、糖ペプチドを調製することができる。さらに実施例17または18の手順にしたがって工程3および4を実施することによって、フコースの有無に相当する146Daの分子量差を有するフコース非結合糖ペプチド/フコース結合糖ペプチドのピーク対を検出することができる。
実際にPCに罹患している患者(N-46、PSA濃度1.6μg/mL)の血清をもちいて、実施例17の手順にしたがって、ゲル内でサーモリシン処理を行なった。ゲル抽出液を遠心式濃縮機によって乾固させた。得られた固形物を0.8%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、80℃、30分にわたって静置し、脱シアル酸化反応を行った。脱シアル酸化されたサンプルを遠心式濃縮機によって乾固させた。得られた固形物を5%アセトニトリルおよび0.1%トリフルオロ酢酸を含有する水溶液に溶解した。オクタデシル(C18)シリカが充填されたC18チップを用いた反応混合物の吸引および排出を繰り返して、ペプチドを吸着させて糖ペプチド画分を得た。得られた糖ペプチド画分にアセトニトリルを加えて、アセトニトリルの最終濃度を80%になるように調整し、ZIC(登録商標)HILIC固相カラム充填剤(SeQuant)による精製、引き続き工程3および4を実施例17と同様に行なった。その結果、得られたMSスペクトルを図6に示す。フコース非結合糖鎖/フコース結合糖鎖のシグナル強度比は確かに1.0より大きい値を示した。この結果は、糖鎖解析の結果と一致していた。
実施例1の工程1に記載のPSA単離、および工程2に記載のDTTによる還元、ヨードアセトアミドによるアルキル化の工程を実施せずに、市販品PSA(CHEMICON)50ngまたはPSA−ACT複合体(CORTEX BIOCHEM)50ngに対して、10単位のサーモリシン(Calbio)の25mM炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)を直接加えて、18時間にわたって56℃で静置反応させた。
P1B(m/z=2600.1) / P2B(m/z=2454.0)
本実施例は、実施例21と同様に、実施例1の工程1に記載のPSA単離、および工程2に記載のDTTによる還元、ヨードアセトアミドによるアルキル化の工程を実施することなしに、患者血清の分析を行った例である。
Claims (3)
- (1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程と
を含み、該標識化PSA誘導体中のフコース非結合糖鎖のシグナル強度とフコース結合糖鎖のシグナル強度との比が1.0を越える際に前立腺癌であると識別し、1.0以下である際に良性前立腺肥大症であると識別することを特徴とする、前立腺癌と良性前立腺肥大症とを識別する方法。 - 工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖であることを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする請求項1に記載の方法。
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