JP4836875B2 - 修飾ペプチドの分析方法および装置 - Google Patents
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- 一つないし複数の溶媒を送液可能なポンプと、該ポンプからの送液に対して試料を導入する試料導入部と、その下流側に接続したリン酸化ペプチド捕捉手段と、タンデム分析可能な質量分析装置と、該質量分析装置で計測した2種類のペプチドの分析データを自動格納するデータベースと、前記2種類のペプチドの分析データを照合して判別する判別手段とを具備し、前記試料導入部から質量分析装置までの流路に、前記修飾ペプチド捕捉手段を経由する流路と経由しない流路とに切り替え可能な流路切り替え部を設けた分析装置を用いた分析方法であって、
前記2種類のペプチドの分析データは、前記リン酸化ペプチド捕捉手段を経由したペプチドの分析データと、前記リン酸化ペプチド捕捉手段を経由しないペプチドの分析データであり、
リン酸化ペプチドを含む試料中に存在するリン酸化ペプチドを捕捉し、非リン酸化ペプチドを回収する第1の工程と、
第1の工程により得られた、非リン酸化ペプチドの質量分析を行い、その分析データを前記データベースに格納する第2の工程と、
当初のリン酸化ペプチドを含む試料の質量分析を行い、第2の工程で得られた分析データと照合し、(a)2種類の分析データが一定の誤差範囲内で一致した場合、測定中のペプチドを非リン酸化ペプチドであるとみなしMS n 分析を行わず、(b)2種類の分析データが一定の誤差範囲内で一致しなかった場合、測定中のペプチドをリン酸化ペプチドとみなしてMS n 分析を行う第3の工程
を含むことを特徴とする分析方法。 - 請求項1に記載の分析方法において、質量分析の前にペプチド分離工程を設けたことを特徴とする分析方法。
- 請求項2に記載の分析方法において、前記ペプチド分離工程を液体クロマトグラフィーで行うことを特徴とする分析方法。
- 請求項2に記載の分析方法において、前記ペプチド分離工程を電気泳動法で行うことを特徴とする分析方法。
- 請求項2に記載の分析方法において、前記ペプチド分離工程を、マイクロ流体デバイスを用いて行うことを特徴とする分析方法。
- 請求項2に記載の分析方法において、前記ペプチド分離工程を、分離チップを用いて行うことを特徴とする分析方法。
- 請求項1に記載の分析方法において、前記リン酸化ペプチドの捕捉を酸化チタン担体で行うことを特徴とする分析方法。
- 請求項1に記載の分析方法において、前記リン酸化ペプチドの捕捉を酸化ジルコニウム担体で行うことを特徴とする分析方法。
- 請求項1に記載の分析方法において、リン酸化ペプチドの捕捉を金属イオン固定化アフィニティークロマトグラフィーで行うことを特徴とする分析方法。
- 一つないし複数の溶媒を送液可能なポンプと、該ポンプからの送液に対して試料を導入する試料導入部と、その下流側に接続したリン酸化ペプチド捕捉手段と、タンデム分析可能な質量分析装置と、該質量分析装置で計測した2種類のペプチドの分析データを自動格納するデータベースと、前記2種類のペプチドの分析データを照合して判別する判別手段とを具備し、前記試料導入部から質量分析装置までの流路に、前記修飾ペプチド捕捉手段を経由する流路と経由しない流路とに切り替え可能な流路切り替え部を設けた分析装置を用いた分析方法をコンピュータに実行させるためのプログラムであって、
前記2種類のペプチドの分析データは、前記リン酸化ペプチド捕捉手段を経由したペプチドの分析データと、前記リン酸化ペプチド捕捉手段を経由しないペプチドの分析データであり、
リン酸化ペプチドを含む試料中に存在するリン酸化ペプチドを捕捉し、非リン酸化ペプチドを回収する第1の工程と、
第1の工程により得られた、非リン酸化ペプチドの質量分析を行い、その分析データを前記データベースに格納する第2の工程と、
当初のリン酸化ペプチドを含む試料の質量分析を行い、第2の工程で得られた分析データと照合し、(a)2種類の分析データが一定の誤差範囲内で一致した場合、測定中のペプチドを非リン酸化ペプチドであるとみなしMS n 分析を行わず、(b)2種類の分析データが一定の誤差範囲で内で一致しなかった場合、測定中のペプチドをリン酸化ペプチドとみなしてMS n 分析を行う第3の工程
をコンピュータに実行させるためのプログラム。 - 一つないし複数の溶媒を送液可能なポンプと、該ポンプからの送液に対して試料を導入する試料導入部と、その下流側に接続したリン酸化ペプチド捕捉手段と、タンデム分析可能な質量分析装置と、該質量分析装置で計測した2種類のペプチドの分析データを自動格納するデータベースと、前記2種類のペプチドの分析データを照合して判別する判別手段とを具備し、前記試料導入部から質量分析装置までの流路に、前記修飾ペプチド捕捉手段を経由する流路と経由しない流路とに切り替え可能な流路切り替え部を設けた分析装置を用いた分析方法を機能させるためのプログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体であって、
前記2種類のペプチド野分析データは、前記リン酸化ペプチド捕捉手段を経由したペプチドの分析データと、前記リン酸化ペプチド捕捉手段を経由しないペプチドの分析データであり、
リン酸化ペプチドを含む試料中に存在するリン酸化ペプチドを捕捉し、非リン酸化ペプチドを回収する第1の工程と、
第1の工程により得られた、非リン酸化ペプチドの質量分析を行い、その分析データを前記データベースに格納する第2の工程と、
当初のリン酸化ペプチドを含む試料の質量分析を行い、第2の工程で得られた分析データと照合し、(a)2種類の分析データが一定の誤差範囲内で一致した場合、測定中のペプチドを非リン酸化ペプチドであるとみなしMS n 分析を行わず、(b)2種類の分析データが一定の誤差範囲で内で一致しなかった場合、測定中のペプチドをリン酸化ペプチドとみなしてMS n 分析を行う第3の工程
を機能させるためのプログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体。
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