JP4344858B2 - 細胞内で抗ウイルス性小rna分子を発現させる方法 - Google Patents

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Description

【技術分野】
【0001】
<政府援助>
本発明は、国立衛生研究所(National Institutes of Health)より授与された補助金番号GM39458の下で政府の支援を用いてなされた。合衆国政府は、本発明に一定の権利を有する。
【0002】
<発明の分野>
本発明は、一般に、RNA分子を送達するように、より具体的には遺伝子発現を下方調節または調整するために使用され得る二本鎖RNA分子を送達するように設計されているウイルス構築物を使用して細胞または動物における遺伝子発現を改変する方法に関する。本発明の詳細な態様は、RNA分子を発現するように設計されているウイルス構築物の送達を通じて、病原性ウイルス遺伝子または病原性ウイルスの生活環に必要な遺伝子を下方調節することに関する。
【背景技術】
【0003】
<関連技術の記載>
RNA干渉(RNAi)またはサイレンシングは、近年発見された現象である(A. Fire et al., Nature 391, 806(1998); C. E. Rocheleau et al. Cell 90, 707(1997))。スモール・インターフェリングRNA(small interfering RNAs)(「siRNA」)とは、それらと相同性を示す遺伝子の発現を阻害する二本鎖RNA分子である。siRNAは、様々な培養細胞でならびに無脊椎動物で、特定遺伝子の発現を下方調節するための道具として使用されてきた。そのようなアプローチの多くは、最近概説されている(P. D. Zamore Science 296,1265(2002))。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【0004】
しかし、そのようなアプローチには限界がある。例えば、本明細書中に記載される本発明以前には、RNA干渉を通じて下方調節された特定の遺伝子を有する遺伝子組換え哺乳類の発生を可能にする技法はない。同様に、調節機能を持つ小RNA分子を導入するためのより着実な方法が必要とされている。本明細書中に提供される本発明は、RNAが介在する遺伝子調節の分野でのこれらおよび他の制限に対処する。同じく、ウイルスおよびウイルス感染に伴う疾患の治療のための改善された方法および組成物が必要とされている。
【課題を解決するための手段】
【0005】
本発明は、概して、細胞内でRNA分子(単数または複数)を発現する方法に関する。これらの方法は、多様な細胞型で使用され得る。RNA分子は、様々な目的のために細胞内で発現され得る。例えば、RNA分子は、細胞内でマーカーとなり得、遺伝子発現を調節するためのアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはリボザイムであり得、そしてRNA干渉を通じて遺伝子を下方調節するために役立ち得る。
1態様において、本発明の方法は、ウイルスのゲノム、ウイルスの転写物、またはウイルス複製に必要な宿主細胞遺伝子などの標的核酸とRNA干渉を通じて病原体の生活環の1つまたは複数の態様を阻害する、1つまたは複数のRNA分子の発現による、感染の治療または予防に関する。
【0006】
本発明の別の態様に従って、RNA分子を発現させる方法が提供され、本方法は、パッケージング細胞株をレトロウイルス構築物でトランスフェクトすること、およびパッケージング細胞株から組換えレトロウイルスを回収することを含む。次いで、宿主細胞は組換えレトロウイルスに感染させられる。
【0007】
組換えレトロウイルス構築物は、好ましくは、第一RNAポリメラーゼIIIプロモーター領域、少なくとも1つのRNAコード領域、および少なくとも1つの終結配列を有する。RNAコード領域は、好ましくは、標的核酸内の標的配列と少なくとも約90%同一である配列を含む。標的核酸は、例えば、病原性ウイルスRNAゲノムまたはゲノム転写物の一部分、あるいは病原性ウイルスの生活環に関与する標的細胞遺伝子の一部分など病原体の生活環に必要なものであることが好ましい。
【0008】
1実施形態において、本発明の方法は、病原体の生活環を妨害するために使用される。詳細な実施形態において、本方法は、直接RNAゲノムを標的とすることにより、RNAゲノムを有するウイルス、例えば、レトロウイルス、の生活環を妨害するために使用される。別の実施形態において、個別のウイルス遺伝子の転写物を含むウイルスゲノム転写物が標的となる。本方法はまた、宿主細胞において、宿主細胞内へウイルスが入るのに必要な受容体または補助受容体などのウイルスの生活環に関与する遺伝子を下方調節するために使用され得る。
【0009】
本発明の1態様において、RNAコード領域は、siRNA、好ましくはセンス領域、アンチセンス領域、およびループ領域を有する自己相補的な「ヘアピン」RNA分子をコードする。ループ領域は一般に、約2〜約15ヌクレオチド長の間であり、そしてさらに好適な実施形態において約6〜約9ヌクレオチド長である。ヘアピン分子の二本鎖領域は、標的配列と相同なヌクレオチド配列を含む。ヘアピン分子中の配列は、標的配列と、好ましくは少なくとも約90%同一であり、より好ましくは少なくとも約95%同一であり、さらにより好ましくは少なくとも約99%同一である。
【0010】
別の実施形態において、RNAコード領域は第一RNA分子をコードし、レトロウイルス構築物は第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターおよび第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターに操作可能に連結した第二RNAコード領域を有する。そのような実施形態において、第二RNAコード領域は、第一RNA分子と実質的に相補的なRNA分子をコードする。第一および第二RNAコード領域の発現に際して、二本鎖複合体が細胞内で形成される。
【0011】
さらに別の実施形態において、レトロウイルス構築物は、第一RNAポリメラーゼIIIプロモーターからのRNAコード領域の発現が第一RNA分子の合成をもたらし、かつ第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターからのRNAコード領域の発現が第一RNA分子と実質的に相補的な第二RNA分子の合成をもたらすように、RNAコード領域と操作可能に連結した第二RNAポリメラーゼIIIプロモーター領域を有し得る。そのような1実施形態において、RNAポリメラーゼIIIプロモーターは、終結配列によりRNAコード領域と分離されている。
【0012】
本発明の1実施形態において、標的細胞は胚細胞である。本明細書中に使用されるとおりの胚細胞は、単細胞胚、および初期胚内の胚細胞を含む。本発明の別の実施形態において、標的細胞は胚形成幹細胞である。標的細胞が胚細胞である場合、胚細胞は、組換えレトロウイルスを哺乳類胚細胞の透明帯と細胞膜との間に注入することにより、感染させられ得る。別の実施形態において、胚細胞は、透明帯を除去して、組換えレトロウイルスを含む溶液中で細胞を培養することにより感染させられ得る。そのような実施形態において、透明帯は、酵素的消化により除去され得る。標的細胞が胚細胞または胚形成幹細胞である場合、本発明の方法は、偽妊娠のメスに胚細胞を移植して遺伝子組換え動物を発生させることも含む。そのような様式において、遺伝子組換え動物は、ウイルスなどの特定の病原体に耐性であるように発生し得る。
【0013】
本発明の方法はまた、様々な初代細胞、ex vivo正常細胞または疾患細胞、あるいは様々な組織培養条件に適合した細胞で使用され得る。細胞は、好ましくは、ヒト、マウス、または他の脊椎動物から得られる。細胞は、制限なしに、造血幹細胞または前駆体細胞、中枢神経系細胞、様々な他の組織および器官の再生能力を持つ細胞、樹状細胞ならびに他の発達中および成熟した骨髄細胞、リンパ細胞、および異なる細胞系譜由来の癌細胞を含み得る。
【0014】
別の態様において、本発明は、細胞内でのRNA分子(単数または複数)発現のためのレトロウイルス構築物を提供する。構築物は、好ましくは、RNAポリメラーゼIII(pol III)プロモーターを含む。1実施形態においてレトロウイルス構築物は、RNAポリメラーゼIIIプロモーターと操作可能に連結したRNAコード領域を有する。RNAコード領域の直後にpol IIIターミネーター配列が続き得、pol IIIによるRNA合成の終結を指示する。pol IIIターミネーター配列は一般に、4個またはそれより多くの連続したチミジン(「T」)残基を有する。好適な実施形態において、5個の連続したTのクラスターがターミネーターとして使用され、これによりpol
III転写はDNAテンプレートの二番目または三番目のTで止まり、したがって2個または3個のウリジン(「U」)残基のみがコード配列の3'末端に付加される。様々なpol IIIプロモーターが本発明で使用され得、例えば、ヒトまたはマウス起源のH1 RNA遺伝子またはU6 snRNA遺伝子由来の、あるいは任意の他の種由来のプロモーターフラグメントを含む。また、pol IIIプロモーターは、遍在性または組織特異的様式のいずれかで化学的小分子により誘発される能力などの他の望ましい性質を取り込むように改良/操作され得る。例えば、1つの実施形態において、プロモーターはテトラサイクリンにより活性化されてもよい。別の実施形態において、プロモーターはIPTG(lacI系)により活性化されてもよい。
【0015】
レトロウイルス構築物は、多数のレトロウイルスベクターに基づき得る。好適な実施形態において、レトロウイルス構築物は、5'レンチウイルス末端反復配列(LTR)由来のRおよびU5配列および自己不活性化レンチウイルス3'LTRを有する。別の実施形態において、レトロウイルスベクターは、マウス幹細胞ウイルス(MSCV)に由来する。さらに別の実施形態において、レトロウイルス構築物は、レンチウイルス構築物およびMSCV構築物のハイブリッドである。
【0016】
さらなる実施形態において、RNAコード領域は、センス領域、アンチセンス領域、およびループ領域を有する自己相補的なRNA分子をコードする。そのようなRNA分子は、発現した場合、好ましくは「ヘアピン」構造を形成する。ループ領域は一般に、約2〜約15ヌクレオチド長の間である。好適な実施形態において、ループ領域は6〜9ヌクレオチド長である。本発明のそのような1実施形態において、センス領域およびアンチセンス領域は、約15〜約30ヌクレオチド長の間である。1実施形態において、本発明のこの実施形態のRNAコード領域は、どのような余計な非コードヌクレオチドも5'末端に存在せずにRNAコード配列が正確に発現され得る(すなわち、発現した配列は標的配列と5'末端で同一である)ように、RNAポリメラーゼIIIプロモーターの下流に操作可能に連結される。RNAコード領域の合成は、ターミネーター部位で終了する。好適な1実施形態において、ターミネーターは5個の連続したT残基を有する。
【0017】
本発明の別の態様において、レトロウイルスベクターは複数のRNAコード領域を含み得る。そのような1実施形態において、RNAコード領域は第一RNA分子をコードし、レトロウイルス構築物は、第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターおよび第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターに操作可能に連結された第二RNAコード領域を有する。この実施形態において、第二RNA分子は、発現した時に第一および第二RNA分子が二本鎖構造を形成し得るように、実質的に第一RNA分子と相補的であり得る。RNA複合体の二本鎖領域は、ウイルスゲノム、ウイルスゲノム転写物、または病原性ウイルスの生活環に必要なタンパク質をコードする標的細胞RNAのいずれかの標的領域と少なくとも約90%同一である。本発明の方法はまた、ヘアピン様の自己相補的なRNA分子または他の非ヘアピン分子をコードする複数のRNAコード領域を含む。
【0018】
本発明のさらに別の実施形態において、レトロウイルス構築物は、第一RNAポリメラーゼIIIプロモーターからのRNAコード領域の発現がセンス鎖としての第一RNA分子の合成をもたらし、かつ第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターからのRNAコード領域の発現が第一RNA分子と実質的に相補的であるアンチセンス鎖としての第二RNA分子の合成をもたらすように、反対方向に同じRNAコード領域と操作可能に連結した第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターを有する。そのような実施形態において、両方のRNA分子は、終結配列によりコードされる3’オーバーハングの残基を含んでも良い。1実施形態において、両方のRNAポリメラーゼIIIプロモーターは、終結配列によりRNAコード領域と分離されている。終結配列は5個の連続したT残基を有することが好ましい。
【0019】
本発明の別の態様に従って、5'LTR配列はHIVに由来し得る。レトロウイルス構築物はまた、ウッドチャック肝炎ウイルスエンハンサー要素配列および/またはtRNAアンバー抑制因子配列を有し得る。
【0020】
本発明の1実施形態において、自己不活性化3'LTRはエンハンサー配列が欠失したU3要素であり得る。さらに別の実施形態において、自己不活性化3'LTRは改良HIV3'LTRである。
【0021】
組換えレトロウイルス構築物は、例えば、水泡性口内炎ウイルスエンベロープ糖タンパク質を有するシュードタイプとすることが可能である。
【0022】
本発明の別の態様に従って、ウイルス構築物はまた、目的の遺伝子をコードし得る。目的の遺伝子は、ポリメラーゼIIプロモーターに連結し得る。様々なポリメラーゼIIプロモーターが本発明で使用され得、例えば、CMVプロモーターを含む。選択されるRNAポリメラーゼIIプロモーターは、大部分の組織で発現を駆動する能力がある遍在性プロモーター、例えば、ヒトユビキチン−Cプロモーター、CMVβ−アクチンプロモーター、およびPGKプロモーター、とすることが可能である。RNAポリメラーゼIIプロモーターはまた、組織特異的プロモーターとすることが可能である。そのような構築物はまた、例えば、ポリメラーゼIIプロモーターと操作可能に連結したエンハンサー配列を含み得る。
【0023】
1実施形態において、目的の遺伝子は、ベクターが首尾よくトランスフェクトまたは形質導入されてその配列が発現したことを確認するために使用され得る標識遺伝子またはレポーター遺伝子である。そのような1実施形態において、目的の遺伝子はグリーン蛍光タンパク質などの蛍光レポーター遺伝子である。さらに別の実施形態において、目的の遺伝子は、首尾よく形質導入された細胞を選択するために使用され得る薬物耐性遺伝子である。例えば、薬物耐性遺伝子は、ゼオシン耐性遺伝子(zeo)とすることが可能である。目的の遺伝子はまた、zeo/gfp融合などの薬物耐性遺伝子と蛍光レポーター遺伝子とのハイブリッドとすることが可能である。本発明の別の態様において、目的の遺伝子は、誘導性pol IIIプロモーターの転写活性を調節し得るタンパク質因子をコードする。そのような1実施形態において、目的の遺伝子は、テトラサイクリン応答性pol IIIプロモーターを調節するtetR(tetオペロンのリプレッサー)である。
【0024】
本発明の別の態様は、細胞内でRNA分子(単数または複数)を発現させる方法を提供することである。1実施形態において、パッケージング細胞株は、本発明のレトロウイルス構築物でトランスフェクトされ、組換えレトロウイルス性粒子がパッケージング細胞株から回収され、標的細胞が組換えレトロウイルス粒子に感染させられる。そのような方法に従って、レトロウイルス構築物は、レンチウイルス5'末端反復配列(LTR)、自己不活性化レンチウイルス3'LTR、第一RNAポリメラーゼIIIプロモーター領域、および少なくとも1つのRNAコード領域からのRおよびU5配列を有する。レトロウイルス構築物はまた、RNAコード領域と操作可能に連結した終結配列を有し得る。
【0025】
さらなる態様において、HIV感染を患っている患者を治療する方法が提供される。1実施形態において、CD34−陽性標的細胞が患者から単離される。次いで、標的細胞は、本発明のレトロウイルス構築物でトランスフェクトされたパッケージング細胞株から回収された組換えレトロウイルスに感染させられる。好ましくは、組換えレトロウイルス構築物は、第一RNAポリメラーゼIIIプロモーター領域、少なくとも1つのRNAコード領域、および少なくとも1つの終結配列を含む。1実施形態において、RNAコード領域はHIVゲノムの標的領域、HIVゲノム転写物、またはHIV生活環に関与する細胞遺伝子と少なくとも約90%同一である配列を含む。標的領域は、好ましくは約18〜約23ヌクレオチド長である。
【0026】
1実施形態において、RNAコード領域は、ヘアピンRNA分子をコードする。
【0027】
好適な実施形態において、RNAコード領域は、CCR5遺伝子またはCXCR4遺伝子の標的領域と少なくとも約90%同一である。
【発明を実施するための最良の形態】
【0028】
本発明者らは、目的の導入遺伝子を細胞または動物内へ導入する方法を見出した。この技法は、同時係属中の米国仮特許出願第60/322,031号(2001年9月13日出願)および同時係属中の米国仮特許出願第60/347,782号(2002年1月9日出願)に記載されており、それらの全内容は本明細書中に参照として援用される。
【0029】
他に定義されない限り、本明細書中に使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者により一般的に理解されるとおりの意味を有する。本明細書中に記載されるものと類似、または等価な任意の方法、デバイス、および材料が、本発明の実施で使用され得る。
【0030】
「導入遺伝子」は、任意のヌクレオチド配列、特にヒトの介入により、例えば本発明の方法により、宿主細胞の1つまたは複数の染色体中に結合されたDNA配列を意味する。1実施形態において、導入遺伝子は「RNAコード領域」である。別の実施形態において、導入遺伝子は「目的の遺伝子」を含む。他の実施形態において、導入遺伝子はヌクレオチド配列、好ましくはDNA配列であり得、これは、それが組み込まれている染色体を標識するために使用される。この場合、導入遺伝子は、発現され得るタンパク質をコードする遺伝子を含む必要はない。
【0031】
「目的の遺伝子」は、宿主細胞への組み込みに望ましいタンパク質または他の分子をコードする核酸配列である。1実施形態において、目的の遺伝子は、宿主細胞でその発現が望まれるタンパク質または他の分子をコードする。この実施形態において、目的の遺伝子は一般に、転写調節配列などの、目的の遺伝子の所望の発現を得るために有用な他の配列に操作可能に連結している。
【0032】
「機能的に関連」および「操作可能に連結している」は、制限なしに、プロモーターおよび/またはエンハンサーに関して遺伝子が正しい位置および方向にあり、プロモーターおよび/またはエンハンサーが適切な分子に接触すると遺伝子の発現が影響を受けることを意味する。
【0033】
「RNAコード領域」は、siRNAなどのRNA分子の合成用テンプレートとなり得る核酸である。好ましくは、RNAコード領域はDNA配列である。
【0034】
「スモール・インターフェリングRNA」または「siRNA」は、それが相同性を示す遺伝子の発現を阻害する能力がある二本鎖RNA分子である。遺伝子配列または他のヌクレオチド配列の相同性がある領域は、「標的領域」として既知である。1実施形態において、siRNAは、センス領域、ループ領域、およびセンス領域と相補的なアンチセンス領域を含む「ヘアピン」またはステムループRNA分子であってもよい。他の実施形態において、siRNAは、共有結合しないで会合し二本鎖を形成した2個の別個のRNA分子を含む。
【0035】
用語「動物」は、その最も広義において使用され、哺乳類、鳥類、魚類、爬虫類、および両生類を含む全動物を示す。
【0036】
用語「哺乳類」は、哺乳綱の全構成員を示し、哺乳類として分類される任意の動物を含み、ヒト、家庭および農場の家畜、ならびにマウス、ウサギ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ウシ、および高等霊長類などの動物園、競技用、またはペット用動物が挙げられる。
【0037】
「標的細胞」または「宿主細胞」は、本発明の方法および組成物を使用して形質転換されることになる細胞を意味する。
【0038】
用語「病原性ウイルス」は、動物に感染する能力があるウイルスを示すものとして、本明細書中に使用される。
【0039】
「レトロウイルス」は、RNAゲノムを有するウイルスである。
【0040】
「レンチウイルス」は、***細胞および非***細胞に感染する能力があるレトロウイルス属を示す。レンチウイルスの例のいくつかとして、HIV(ヒト免疫不全ウイルス:HIV−1型、およびHIV−2型を含む)、ヒト後天性免疫不全症候群(AIDS)の病原因子;ヒツジに脳炎(ビスナ) または肺炎(マエディ)を引き起こすビスナ−マエディ(visna-maedi)、ヤギで免疫不全、関節炎、および脳症を引き起こすヤギ関節炎−脳脊髄炎ウイルス;ウマで自己免疫性溶血性貧血および脳症を引き起こすウマ伝染性貧血ウイルス;ネコで免疫不全を引き起こすネコ免疫不全ウイルス(FIV);ウシでリンパ節症、リンパ球増加、およびおそらく中枢神経系の感染を引き起こすウシ免疫不全ウイルス(BIV);ならびに猿人類で免疫不全および脳症を引き起こすサル免疫不全ウイルス(SIV)が挙げられる。
【0041】
本明細書中で使用される「ハイブリッドウイルス」は、1つまたは複数の他のウイルスベクター由来の成分を有するウイルス、非レトロウイルスベクター由来の要素を含むウイルス、例えば、アデノウイルスーレトロウイルスハイブリッドを示す。本明細書中に使用された、レトロウイルス成分を有するハイブリッドベクターは、レトロウイルスの範囲内にあると判断されることになる。
【0042】
レンチウイルスゲノムは一般に、5'末端反復配列(LTR)、gag遺伝子、pol遺伝子、env遺伝子、アクセサリー遺伝子(nef、vif、vpr、vpu)および3'LTRで構成されている。ウイルスLTRは、U3、R、およびU5と呼ばれる3つの領域に分けられる。U3領域は、エンハンサーおよびプロモーター要素を含む。U5領域は、ポリアデニル化シグナルを含む。R(繰返し)領域は、U3領域とU5領域を分断し、R領域の転写配列は、ウイルスRNAの5'末端および3'末端の両方で出現する。例えば、「RNAウイルス:実践的アプローチ(RNA Viruses: A Practical Approach)」(Alan J. Canr., Ed., Oxford University Press, (2000))、O Narayan and Clements J. Gen. Virology 70: 1617-1639 (1989)、Fields et al. Fundamental Virology Raven Press. (1990)、Miyoshi H, Blomer U, Takahashi M, Gage FH, Verma IM. J Virol. 72 (10): 8150-7 (1998)、および米国特許第6,013,516号を参照。
【0043】
レンチウイルスベクターは当該技術分野で既知であり、いくつかは、造血幹細胞をトランスフェクトするために使用されてきている。そのようなベクターは、例えば、以下の文献に見出すことが可能であり、これらは本明細書中に参考として援用される:Evans JT et al. Hum Gene Ther 1999; 10: 1479-1489; Case SS, Price MA, Jordan CT et al. Proc Natl Acad Sci USA 1999; 96: 2988-2993; Uchida N, Sutton RE, Friera AM et al. Proc Natl Acad Sci USA 1998; 95: 11939-11944; Miyoshi H, Smith KA, Mosier DE et al. Science 1999; 283: 682-686; Sutton RE, Wu HT, Rigg R et al. 「ヒト免疫不全ウイルス1型ベクターはヒト造血幹細胞に効果的に形質導入する(Human immunodeficiency virus type 1 vectors efficiently transduce human hematopoietic stem cells)」. J Virol 1998; 72: 5781-5788。
【0044】
「ビリオン」、「ウイルス粒子」、および「レトロウイルス性粒子」は、RNAゲノム、pol遺伝子由来のタンパク質、gag遺伝子由来のタンパク質およびエンベロープ(糖)タンパク質を表す脂質二重層を含む単一のウイルスを示すものとして、本明細書中に使用される。RNAゲノムは通常、組換えRNAゲノムであり、したがって、天然のウイルスゲノムにとって外来性のRNA配列を含み得る。RNAゲノムはまた欠損した内在性ウイルス配列を含み得る。
【0045】
「シュードタイプの」レトロウイルスは、RNAゲノムの由来となるウイルス以外のウイルスに由来するエンベロープタンパク質を有するレトロウイルス性粒子である。エンベロープタンパク質は、別のレトロウイルス由来または非レトロウイルス性ウイルス由来であってもよい。好適なエンベロープタンパク質は、水泡性口内炎(stomatitius)ウイルスG(VSV G)タンパク質である。しかしながら、ヒト感染の可能性を排除するために、ウイルスは代替的に、マウスまたは鳥類など特定の種に感染を限定するエコトロピックエンベロープタンパク質を有するシュードタイプとされ得る。例えば、1実施形態において、突然変異エコトロピックエンベロープタンパク質(エコトロピックエンベロープタンパク質4.17(Powell et al. Nature Biotechnology 18 (12): 1279-1282 (2000))など)が使用される。
【0046】
用語「プロウイルス」は、RNAレトロウイルスのゲノムに相当する、真核生物染色体に存在する二本鎖DNA配列を示すものとして使用される。プロウイルスは、宿主細胞の溶解または破壊を引き起こすことなく、1つの細胞世代から次へと伝達され得る。
【0047】
「自己不活性化3'LTR」は、LTR配列が下流遺伝子の発現を駆動することを防ぐ突然変異、置換、または欠失が含まれる3'末端反復配列(LTR)である。3'LTR由来のU3領域のコピーは、組み込まれたプロウイルスでの両LTRの生成用テンプレートとして作用する。したがって、不活性化欠失または突然変異を持つ3'LTRがプロウイルスの5'LTRとして組み込まれる場合、5'LTRからの転写は不可能である。これは、ウイルスエンハンサー/プロモーターと任意の内部エンハンサー/プロモーターとの間の競合を排除する。自己不活性化3'LTRは、例えば、Zufferey et al. J Virol. 72: 9873-9880 (1998)、Miyoshi et al. J. Virol. 72: 8150-8157 、および Iwakuma et al. Virology 261: 120-132 (1999)に記載される。
【0048】
用語「RNA干渉またはサイレンシング」は、遺伝子発現のRNA媒介型阻害の全ての転写後機構および転写機構、P. D. Zamore Science 296,1265(2002)に記載されるものなどを含むものとして、広く定義される。
【0049】
本明細書中に使用される「実質的な相補性」および「実質的に相補的な」は、2つの核酸が、約15ヌクレオチドを超える領域、より好ましくは約19ヌクレオチドを超える領域にわたり、少なくとも80%相補的、より好ましくは少なくとも90%相補的、そして最も好ましくは少なくとも95%相補的であることを意味する。
【0050】
本発明の1態様において、組換えレトロウイルスは、目的のRNAコード領域を細胞へ、好ましくは哺乳類細胞へ送達するために使用される。細胞は、初代細胞または培養細胞であってもよい。1実施形態において、細胞は卵母細胞または胚細胞、より好ましくは1細胞期胚である。別の実施形態において、細胞は造血幹細胞である。したがって、RNAコード領域および任意の付随する遺伝要素は、宿主細胞のゲノムにプロウイルスとして組み込まれる。標的細胞が胚である場合、細胞は次いで、当該技術分野で既知の方法により、遺伝子組換え動物へ発達させられ得る。
【0051】
RNAコード領域を送達するために使用される組換えレトロウイルスは、好ましくは改良レンチウイルスであり、したがって***細胞および非***細胞の両方に感染することが可能である。組換えレトロウイルスは、好ましくはRNAコード領域を含む改良レンチウイルスゲノムを含む。さらに、改良レンチウイルスゲノムは、好ましくはウイルス複製に必要なタンパク質の内在性遺伝子を欠いており、したがって標的細胞での複製などの望ましくない複製を防ぐ。必要タンパク質は、以下に記載されるように、好ましくは、組換えレトロウイルスの産生の間パッケージング細胞株にトランスで提供される。
【0052】
別の実施形態において、RNAコード領域を送達するために使用される組換えレトロウイルスは、改良モロニーウイルス、例えば、モロニーマウス白血病ウイルスである。さらなる実施形態において、ウイルスはマウス幹細胞ウイルスである(Hawley, R. G., et al. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93: 10297-10302 ; Keller, G., et al. (1998) Blood 92: 877-887; Hawley, R. G., et al. (1994) Gene Ther. 1: 136-138)。組換えレトロウイルスはまた、Choi, JK; Hoanga, N; Vilardi, AM; Conrad, P; Emerson, SG; Gewirtz, AM. (2001)「ハイブリッドHIV/MSCV LTRはヒトCD34+造血細胞におけるレンチウイルスベクターの導入遺伝子発現を高める(Hybrid HIV/MSCV LTR Enhances Transgene Expression of Lentiviral Vectors in Human CD34+ Hematopoietic Cells)」 Stem Cells 19、No. 3, 236-246に記載されるもののようなハイブリッドウイルスであり得る。
【0053】
1実施形態において、導入遺伝子、好ましくはRNAコード領域は、完全なレトロウイルス5'LTRおよび自己不活性化3'LTRを含むウイルス構築物に組込まれる。ウイルス構築物は、好ましくは、ウイルス構築物に基づくウイルスゲノムRNAを所望の宿主特異性を持つウイルス粒子にパッケージングしたパッケージング細胞株に導入される。ウイルス粒子は回収されて宿主細胞に感染させられる。これらの態様のそれぞれが、以下に詳細に記載される。
【0054】
<ウイルス構築物>
ウイルス構築物は、パッケージング細胞での組換えウイルス粒子の産生に必要な配列を含むヌクレオチド配列である。1実施形態において、ウイルス構築物はさらに宿主で目的の遺伝子の所望の発現を可能にする遺伝要素を含む。
【0055】
ウイルス構築物の産生は、当該技術分野で既知の任意の適切な遺伝子工学技法を使用して達成され得、例えば、Sambrook et al. (「分子クローニング:実験室手引書(Molecular Cloning: A Laboratory Manual)」Cold Spring Harbor Laboratory Press, N. Y. (1989))、Coffin et al. (「レトロウイルス(Retroviruses)」Cold Spring Harbor Laboratory Press, N. Y. (1997)) および「RNAウイルス:実践的アプローチ(RNA Viruses : A Practical Approach)」 (Alan J. Cann, Ed., Oxford University Press, (2000))に記載されるように、制限なく、PCR、オリゴヌクレオチド合成、制限エンドヌクレアーゼ消化、ライゲーション、形質転換、プラスミド精製、およびDNA配列決定の標準技法を含む。
【0056】
ウイルス構築物は、任意の既知の生物のゲノムからの配列を組込み得る。配列は、それらの自然の形で組込まれてもよく、また任意の方法で改良されてもよい。例えば、配列は挿入、欠失、または置換を含んでもよい。好適な実施形態において、ウイルス構築物はHIVゲノムまたはSIVゲノムなどのレンチウイルスゲノム由来の配列を含む。別の好適な実施形態において、ウイルス構築物はマウス幹細胞ウイルス(MSCV)の配列を含む。
【0057】
ウイルス構築物は、好ましくは、レンチウイルス、モロニーマウス白血病ウイルス、マウス幹細胞ウイルス、またはそれらのハイブリッドの5'LTRおよび3'LTR由来の配列を含む。1実施形態において、ウイルス構築物は、レンチウイルスの5'LTR由来のRおよびU5配列ならびにレンチウイルス由来の不活性化または自己不活性化3'LTRを含む。LTR配列は、任意の種からの任意のレンチウイルス由来のLTR配列であり得る。例えば、それらは、HIV、SIV、FIVまたはBIV由来のLTR配列であり得る。好ましくは、LTR配列はHIV LTR配列である。ウイルスはまた、MMVまたはMSCV由来の配列を取り込み得る。
【0058】
ウイルス構築物は、好ましくは、不活性化または自己不活性化3'LTRを含む。3'LTRは、当該技術分野で既知の任意の方法により自己不活性化にされ得る。1実施形態において3'LTRのU3要素は、そのエンハンサー配列、好ましくはTATA box、SplおよびNF−kappa B部位の欠失を含む。自己不活性化3'LTRの結果として、宿主細胞ゲノムに組み込まれたプロウイルスは不活性化5'LTRを含むことになる。
【0059】
随意に、レンチウイルス5'LTR由来のU3配列は、ウイルス構築物のプロモーター配列で置換され得る。このことは、パッケージング細胞株から回収されたウイルスの力価を増加させ得る。エンハンサー配列もまた含まれ得る。パッケージング細胞株でのウイルスRNAゲノムの発現を増加させる任意のエンハンサー/プロモーターの組合せが使用され得る。そのような1実施形態においてCMVエンハンサー/プロモーター配列が使用される(米国特許第5,168,062号、Karasuyama et al J. Exp. Med. 169: 13(1989)。
【0060】
ウイルス構築物はまた、導入遺伝子を含む。導入遺伝子は、任意のヌクレオチド配列であり得、プロウイルス用マーカーとして働く配列を含む。好ましくは、導入遺伝子は、1つまたは複数のRNAコード領域および/または1つまたは複数の目的の遺伝子を含む。
【0061】
好適な実施形態において、導入遺伝子は少なくとも1つのRNAコード領域を含む。好ましくは、RNAコード領域は、宿主細胞で所望のRNA分子を発現させるためのテンプレートとして働き得るDNA配列である。1実施形態において、ウイルス構築物は、2つまたはそれより多くのRNAコード領域を含む。
【0062】
ウイルス構築物はまた、好ましくは、少なくとも1つのRNAポリメラーゼIIIプロモーターを含む。RNAポリメラーゼIIIプロモーターは、RNAコード領域と操作可能に連結しており、そして終結配列とも連結し得る。また、1つより多いRNAポリメラーゼIIIプロモーターが組込まれ得る。
【0063】
RNAポリメラーゼIIIプロモーターは、当業者に既知である。RNAポリメラーゼIIIプロモーターの適した範囲は、例えば、Paule and White. Nucleic Acids Research., Vol 28, pp 1283-1298 (2000)に見いだすことが可能であり、これは本明細書中にその全体が参考として援用される。RNAポリメラーゼIIIプロモーターの定義にはまた、RNAポリメラーゼIIIにその下流のRNAコード配列を転写するよう指図し得る任意の合成または操作されたDNAフラグメントも含まれる。さらに、RNAポリメラーゼIII(Pol III)プロモーター、またはウイルスベクターの一部分として使用されるプロモーターが誘導され得る。任意の適した誘導Pol IIIプロモーターが本発明の方法で使用され得る。特に適したPol IIIプロモーターとして、Ohkawa and Taira Human Gene Therapy、Vol. 11, pp 577-585 (2000)ならびに Meissner et al. Nucleic Acids Research, Vol. 29, pp 1672-1682 (2001)に記載されるテトラサイクリン応答性プロモーターが挙げられ、これらは本明細書中に参考として援用される。
【0064】
1実施形態において、ウイルス構築物はさらに、1つまたは複数の標的細胞で望ましく発現されるタンパク質、例えば、レポーターまたはマーカータンパク質、をコードする遺伝子を含む。好ましくは、目的の遺伝子は5'LTR配列と3'LTR配列との間に位置する。さらに、目的の遺伝子は好ましくは、他の遺伝要素、例えば、プロモーターおよび/またはエンハンサーなどといった転写調節配列、と機能的に関連しており、いったん目的の遺伝子が標的細胞ゲノム中に組込まれると特定の様式で目的の遺伝子の発現を調節する。特定の実施形態において、有用な転写調節配列は、時間的かつ空間的の両方で、活性に関して高度に調節されるものである。
【0065】
好ましくは、目的の遺伝子は内部ポリメラーゼIIプロモーター/エンハンサー制御配列と機能的に関連している。「内部」プロモーター/エンハンサーは、ウイルス構築物の5'LTR配列と3'LTR配列との間に位置し、望ましく発現する遺伝子と操作可能に連結したものである。
【0066】
ポリメラーゼIIプロモーター/エンハンサーは、それが機能的に関連している遺伝子の発現を増加させることが既知である任意のプロモーター、エンハンサー、またはプロモーター/エンハンサーの組合せであり得る。「機能的に関連」および「操作可能に連結した」とは、制限なしに、プロモーターおよび/またはエンハンサーに関して導入遺伝子またはRNAコード領域が正しい位置および向きにあり、プロモーターおよび/またはエンハンサーが適切な分子に接触すると遺伝子の発現が影響を受けることを意味する。
【0067】
別の実施形態において、目的の遺伝子は、動物内、またはより具体的にヒト患者内などの異種集団内で、処理された標的細胞の選択的殺傷を可能にするための安全上の注意から含まれる遺伝子である。そのような1実施形態において、目的の遺伝子はチミジンキナーゼ遺伝子(TK)であり、その発現は、標的細胞を薬物ガンシクロビルの作用に感受性にする。
【0068】
また、1つより多い目的の遺伝子が、内部プロモーターと機能的関連に置かれ得る。例えば、マーカータンパク質をコードする遺伝子が、第一目的の遺伝子の後に置かれて所望のタンパク質を発現する細胞の同定を可能にし得る。1実施形態において、蛍光マーカータンパク質、好ましくは緑色蛍光タンパク質(GFP)が、目的の遺伝子とともに構築物中に組込まれる。第二のレポーター遺伝子が含まれる場合、内部リボソーム侵入部位(IRES)配列もまた、好ましくは含まれる(米国特許第4,937,190号)。IRES配列は、レポーター遺伝子の発現を促進し得る。
【0069】
ウイルス構築物はまた、さらなる遺伝要素を含み得る。構築物に含まれ得る要素の型はどのような方法でも制限されず、特定の結果を達成するために当業者により選択される。例えば、標的細胞へのウイルスゲノムの核進入を促進するシグナルが含まれ得る。そのようなシグナルの例は、HIV−1フラップシグナルである。
【0070】
さらに、動物のゲノム中のプロウイルス組み込み部位の特性付けを促進する要素が含まれ得る。例えば、tRNAアンバー抑制因子配列が構築物に含まれ得る。
【0071】
また、構築物は、目的の遺伝子の発現を高めるように設計された1つまたは複数の遺伝要素を含み得る。例えば、ウッドチャック肝炎ウイルス応答要素(WRE)が、構築物中に置かれ得る(Zufferey et al. J. Virol. 74: 3668-3681(1999); Deglon et al. Hum. Gene Ther. 11: 179-190(2000))。
【0072】
ニワトリβ−グロビンインスレーター(Chung et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94: 575-580 (1997))もまた、ウイルス構築物に含まれ得る。この要素は、メチル化およびヘテロクロマチン化効果による標的細胞に組み込まれたプロウイルスのサイレンシングの機会を減少させることが示されている。また、インスレーターは、内在エンハンサー、プロモーター、および外因性遺伝子を、染色体の組み込み部位での周囲のDNAの正または負の位置効果から遮断し得る。
【0073】
任意のさらなる遺伝要素は、好ましくは目的の遺伝子またはRNAコード領域の3’に挿入される。
【0074】
特定の実施形態において、ウイルスベクターは以下を含む:RNA pol IIIプロモーター配列;HIV5' LTR由来のRおよびU5配列;HIV−1フラップシグナル;内在エンハンサー;内在プロモーター;目的の遺伝子;ウッドチャック肝炎ウイルス応答要素;tRNAアンバー抑制因子配列;エンハンサー配列が欠失したU3要素;ニワトリβ−グロビンインスレーター;ならびに3'HIV LTRのRおよびU5配列。
【0075】
ウイルス構築物は、好ましくは、パッケージング細胞株にトランスフェクトされ得るプラスミド中にクローニングされる。好適なプラスミドは、好ましくは、細菌でのプラスミド複製に有用な配列を含む。
【0076】
模範的なレトロウイルス構築物の模式図は、図1Aおよび図1Bに示される。
【0077】
<ウイルスの製造>
そのゲノムは上記に記載されるウイルス構築物のRNA複製物を含む感染性レトロウイルス性粒子を製造するために、当該技術分野で既知の任意の方法が使用され得る。
【0078】
好ましくは、ウイルス構築物はパッケージング細胞株に導入される。パッケージング細胞株は、ウイルス粒子中にウイルスゲノムRNAのパッケージングにトランスで必要なウイルスタンパク質を提供する。パッケージング細胞株は、レトロウイルスタンパク質を発現する能力がある任意の細胞株であり得る。好適なパッケージング細胞株として、293(ATCC CCL X)、HeLa(ATCC CCL 2)、D17(ATCC CCL 183)、MDCK(ATCC CCL 34)、BHK(ATCC CCL−10)、およびCf2Th(ATCC CRL 1430)が挙げられる。最も好適な細胞株は、293細胞株である。
【0079】
パッケージング細胞株は、必要なウイルスタンパク質を安定して発現する。そのようなパッケージング細胞株は、例えば、米国特許第6,218,181号に記載される。あるいは、パッケージング細胞株は、必要なウイルスタンパク質をコードする核酸を含むプラスミドで一時的にトランスフェクトされ得る。
【0080】
1実施形態において、RNAゲノムのパッケージングに必要なウイルスタンパク質を安定して発現するパッケージング細胞株は、上記に記載されるウイルス構築物を含むプラスミドでトランスフェクトされる。
【0081】
別の実施形態において、必要なウイルスタンパク質を安定して発現しないパッケージング細胞株は、Yee et al. (Methods Cell. Biol. 43A, 99-112 (1994))に記載されるように、基本的に2つまたはそれより多くのプラスミドで同時トランスフェクトされる。プラスミドの1つは、RNAコード領域を含むウイルス構築物を含む。他のプラスミドは、細胞が、所望の宿主細胞に感染可能な機能的ウイルスを産生することを可能にするために必要なタンパク質をコードする核酸を含む。
【0082】
パッケージング細胞株は、エンベロープ遺伝子産生物を発現しなくてもよい。この場合、パッケージング細胞株は、ウイルスゲノムを、エンベロープタンパク質を欠いた粒子中にパッケージングする。エンベロープタンパク質は、ウイルス粒子の宿主範囲に一部応答性であるので、ウイルスは、好ましくはシュードタイプである。したがって、パッケージング細胞株は、好ましくは、ウイルスが宿主細胞中へ入ることを許容する膜会合タンパク質をコードする配列を含むプラスミドでトランスフェクトされる。当業者は、使用されることになる宿主細胞に適切なシュードタイプを選択し得るだろう。例えば、1実施形態において、ウイルスは、水泡性口内炎ウイルスエンベロープ糖タンパク質(VSVg)でシュードタイプとなる。特定の宿主範囲を与えることに加えて、このシュードタイプは、ウイルスが非常に高い力価に濃縮されることを許容し得る。ウイルスは、代替的に、マウスまたは鳥類などの特定の種への感染を制限するエコトロピックエンベロープタンパク質でシュードタイプとなり得る。例えば、別の実施形態において、突然変異エコトロピックエンベロープタンパク質(エコトロピックエンベロープタンパク質4.17(Powell et al. Nature Biotechnology 18 (12): 1279-1282(2000))など)が使用される。
【0083】
好適な実施形態において、ウイルスタンパク質を安定して発現しないパッケージング細胞株は、ウイルス構築物と、env、nef、5'LTR、3'LTRおよびvpu配列が削除されたHIV−1パッケージングベクターを含む第二ベクターと、ならびにエンベロープ糖タンパク質をコードする第三ベクターとでトランスフェクトされる。好ましくは、第三ベクターは、VSVgエンベロープ糖タンパク質をコードする。
【0084】
本発明の別の実施形態において、パッケージング細胞のRNA干渉活性は抑制されて、組換えウイルスの産生を改善する。これには、制限なしに、ダイサー(Dicer)、RNA干渉に不可欠であるリボヌクレアーゼのRNase IIIファミリーメンバーを阻害するためのsiRNA分子を発現する構築物の同時トランスフェクションまたは安定なトランスフェクションの使用(Hammond et al. Nat. Rev. Genet. 2: 110-119(2001))が挙げられる。
【0085】
次いで、組換えウイルスは、好ましくはパッケージング細胞から精製され、滴定され、そして所望の濃度に希釈される。
【0086】
<ウイルス送達>
ウイルスは、ウイルスが細胞に感染することを可能にする任意の方法で細胞に送達され得る。好ましくは、ウイルスは細胞膜と接触させられる。ウイルスを哺乳類細胞へ送達する好適な方法は、直接接触を通じてである。
【0087】
1実施形態において、標的細胞は、好ましくは、培養皿でウイルスと接触させられる。ウイルスは培地に懸濁されて培養皿のウェルに加えられ得る。ウイルスを含む培地は、細胞を蒔く前に加えられても、細胞が蒔かれた後に加えられてもよい。好ましくは、生存性を提供するのに、かつ宿主細胞の感染が生じるように培地中のウイルス濃度を適したものにするのに適切な量の培地で、細胞はインキュベートされる。
【0088】
細胞は、好ましくは、ウイルスが細胞に感染することを可能にするのに十分な長さの時間、ウイルスとともにインキュベートされる。好ましくは、細胞は、少なくとも1時間、より好ましくは少なくとも5時間、およびさらにより好ましくは少なくとも10時間ウイルスとともにインキュベートされる。
【0089】
任意のそのような実施形態において、細胞に感染するのに十分な任意の濃度のウイルスが使用され得る。標的細胞が培養されることになっている場合、ウイルス粒子の濃度は、少なくとも1pfu/μl、より好ましくは少なくとも10pfu/μl、さらにより好ましくは少なくとも400pfu/μl、およびさらにより好ましくは少なくとも1×10pfu/μlである。
【0090】
ウイルス感染に続いて、細胞は動物に導入され得る。培養細胞の導入位置は、使用される細胞型に依存する。例えば、細胞が造血細胞である場合、細胞は末梢血流中に導入され得る。動物に導入される細胞は、不都合な免疫応答を回避するため、好ましくはその動物由来の細胞である。同様な免疫構成を持つドナー動物由来である細胞もまた使用され得る。免疫原性応答を回避するように設計されたものを含む他の細胞もまた使用され得る。
【0091】
別の実施形態において、適した量のウイルスが、例えば身体への注射を通じて、直接動物に導入される。そのような1実施形態において、ウイルス粒子は動物の末梢血流に注射される。他の注射位置も適している。ウイルスの型に依存して、導入は他の手段を通じて行われ得、例えば、吸入または上皮組織(例えば、目、口、または皮膚のもの)との直接接触を含む。
【0092】
導入される細胞を取り込む細胞および動物は、例えば、RNAコード領域の組込、組み込まれたRNAコード領域のコピー数、および組み込み位置について、分析され得る。そのような分析は、任意の時点で行われ得、そして当該技術分野で既知の任意の方法により行われ得る。標準方法は、例えば、Hogan et al.(前出)に記載される。
【0093】
上記に開示される細胞の感染方法は、細胞の種特異的特性に依存しない。結果として、それらは容易に哺乳類全種に拡張される。
【0094】
上記に記載されるように、改良レトロウイルスは、広い宿主範囲を与えるためにシュードタイプであり得る。当業者はまた、特定の動物種で目的の遺伝子の所望の発現を達成するための適切な内在プロモーターを認識するだろう。したがって、当業者は、任意の種由来の細胞を感染させる方法を改良させることができるだろう。
【0095】
<標的細胞での遺伝子発現の下方調節>
本明細書中に記載される方法は、細胞でのRNA分子の発現を可能にし、Pol IIプロモーターからは容易に発現され得ないRNA小分子の発現に特に適している。本発明の好適な実施形態に従って、RNA分子は、標的遺伝子の発現を下方調節するために細胞内で発現される。標的遺伝子を下方調節する能力は、特定の遺伝子の生物学的機能を同定することを含む多くの治療および研究用途を有する。本発明の技法および組成物を使用して、細胞培養物でと哺乳類生物での両方で大多数の遺伝子の発現をノックダウン(または下方調節)することが可能になる。詳細には、病原性ウイルスなどの病原体の生活環に必要な標的細胞の遺伝子を下方調節することが望ましい。
【0096】
本発明の好適な実施形態において、RNA発現カセットはPol IIIプロモーターおよびRNAコード領域を含む。RNAコード領域は、好ましくは特定の遺伝子の発現を下方調節する能力があるRNA分子をコードする。コードされるRNA分子は、例えば、下方調節される遺伝子をコードするRNA分子の配列と相補的であり得る。そのような実施形態において、RNA分子は、アンチセンス機構を通じて作用するように設計される。
【0097】
より好適な実施形態は、二本鎖RNA複合体、またはステムループもしくはいわゆる「ヘアピン」構造を有するRNA分子の発現を含む。本明細書中に使用されるとおりの、用語「RNA二本鎖」は、RNA複合体の二本鎖領域およびヘアピンまたはステムループ構造の二本鎖領域の両方を示す。RNAコード領域は、一本鎖RNA、2つまたはそれより多くの相補的一本鎖RNAまたはヘアピン形成RNAをコードし得る。
【0098】
二本鎖RNAは、RNA干渉または抑制と呼ばれるプロセスを通じて、相補配列を有する遺伝子の遺伝子発現を阻害することが示されている(例えば、Hammond et al. Nat. Rev. Genet. 2: 110-119(2001)を参照)。
【0099】
本発明に従って、下方調節される遺伝子の領域に一致するRNA二本鎖またはsiRNAが、細胞で発現される。RNA二本鎖は、下方調節の標的となる遺伝子の配列と、配列が実質的に同一である(典型的には少なくとも約80%同一であり、より典型的には少なくとも約90%同一である)。siRNA二本鎖は、例えば、Bummelkamp et al. Science 296: 550-553(2202)、Caplen et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98: 9742-9747 (2001)、および Paddison et al. Genes & Devel. 16: 948-958(2002)に記載される。
【0100】
RNA二本鎖は一般に、少なくとも約15ヌクレオチド長であり、好ましくは約15〜約30ヌクレオチド長である。生物によっては、RNA二本鎖は著しく長くなり得る。さらに好適な実施形態において、RNA二本鎖は、約19〜22ヌクレオチド長の間である。RNA二本鎖は、好ましくは標的ヌクレオチド配列とその領域を超えて同一である。
【0101】
下方調節されることになる遺伝子が高度に保存されている遺伝子のファミリーである場合、二本鎖領域の配列は、配列の比較により所望の遺伝子のみを標的とするように選択され得る。生物内の相同遺伝子のファミリー間で十分な同一性がある場合、二本鎖領域は、複数の遺伝子を同時に下方調節するように設計され得る。
【0102】
二本鎖RNAは、単一のレトロウイルス構築物由来の細胞で発現され得る。好適な実施形態において、構築物中の単一のRNAコード領域は、センス領域、ループ領域、およびアンチセンス領域を含む自己相補的なヘアピンRNAの発現のテンプレートとしての役目を果たす。この実施形態は図2に例示されており、これはセンス領域110、ループ領域120、アンチセンス領域130、およびターミネーター領域140を有するRNAコード領域に操作可能に連結されたRNA Pol IIIプロモーター100を有するRNA発現カセットの概略図を示す。センス領域110およびアンチセンス領域130は、それぞれ好ましくは約15〜約30ヌクレオチド長である。ループ領域120は、好ましくは約2〜約15ヌクレオチド長であり、より好ましくは約4〜約9ヌクレオチド長である。発現に続いて、センス領域およびアンチセンス領域は二本鎖を形成する。
【0103】
別の実施形態において、レトロウイルス構築物は2つのRNAコード領域を含む。第一コード領域は第一RNAの発現用テンプレートであり、そして第二コード領域は第二RNAの発現用テンプレートである。発現に続いて、第一RNAと第二RNAは二本鎖を形成する。レトロウイルス構築物は、好ましくは、第一RNAコード領域と操作可能に連結した第一Pol IIIプロモーターおよび第二RNAコード領域と操作可能に連結した第二Pol IIIプロモーターも含む。この実施形態は図3に図示されており、第一RNAコード領域110に連結したRNAポリメラーゼIIIプロモーター100および第一ターミネーター配列140、ならびに第二RNAコード領域115に連結した第二RNAポリメラーゼIIIプロモーター105および第二ターミネーター145を有するRNA発現カセットの概略図を示す。
【0104】
本発明のさらに別の実施形態において、レトロウイルス構築物は、第一RNA PolIIIプロモーターからのRNAコード領域の発現がセンス鎖としての第一RNA分子合成をもたらし、かつ第二RNA Pol IIIプロモーターからのRNAコード領域の発現が第一RNA分子と実質的に相補的であるアンチセンス鎖としての第二RNA分子合成をもたらすように、第一RNAコード領域と操作可能に連結した第一RNA Pol IIIプロモーター、および反対方向で同じ第一RNAコード領域と操作可能に連結した第二RNA POL IIIプロモーターを含む。そのような1実施形態において、その両方のRNAポリメラーゼIIIプロモーターは、終結配列、好ましくは5個の連続したT残基を有する終結配列によりRNAコード領域と分断されている。図4は、RNAコード領域110に連結した第一RNAポリメラーゼIIIプロモーター100および第一ターミネーター配列140を有するRNA発現カセットの概略図を示す。発現カセットは、RNAコード領域115(110と逆順で同じ配列)に連結した第二RNAポリメラーゼIIIプロモーター105および第二ターミネーター145を有する。
【0105】
さらなる実施形態において、RNA二本鎖は、2つまたはそれより多くのレトロウイルス構築物を使用して発現される。1実施形態において、第一RNAの発現を指示する第一レトロウイルス構築物が使用され、そして第一RNAと相補的である第二RNAの発現を指示する第二レトロウイルス構築物が使用される。発現に続いて、第一RNAおよび第二RNAは二本鎖領域を形成する。しかしながら、単一のレトロウイルス構築物由来のレトロウイルス性粒子を使用して全二本鎖領域を導入することが好ましい。上記に記載されるように、単一のウイルス構築物から二本鎖RNAを発現する複数の戦略が、図2〜図4に示される。
【0106】
RNA二本鎖は、二本鎖の片側または両側に一本鎖領域が隣接していてもよい。例えば、ヘアピンの場合、一本鎖ループ領域は1つの末端で二本鎖領域と連結する。
【0107】
RNAコード領域は一般に、ターミネーター配列に操作可能に連結している。pol IIIターミネーターは、好ましくは4個またはそれより多くのチミジン(「T」)残基の長さを含む。好適な実施形態において、5個の連続したTのクラスターは、RNAコード領域の直後の下流に連結してターミネーターとしての役割を果たす。そのような構造において、pol III転写はDNAテンプレートの二番目または三番目のTで終了し、したがって2または3個のウリジン(「U」)残基のみがコード配列の3'末端に加えられる。
【0108】
RNAコード領域の配列、およびしたがってRNA二本鎖の配列は、好ましくは、発現が細胞または生物で下方調節されることになる遺伝子の配列と相補的であるように選択される。所定の標的遺伝子のために所定のRNA二本鎖配列で達成される下方調節の程度は、配列により変化するだろう。当業者は、有効な配列を容易に同定し得るだろう。例えば、抑制量を最大にするために、標的細胞を処理する前または遺伝子組換え動物を発生させる前に多数の配列が細胞培養物で試験され得る。RNA干渉に関する配列要件の理解が決定されることで、RNA二本鎖は当業者により選択され得る。
【0109】
<標的細胞におけるウイルス複製および/または遺伝子発現の阻害>
本発明の1態様に従って、標的のRNA二本鎖は、例えば、ウイルスの遺伝子発現、およびウイルス複製に必要な細胞性受容体または補助受容体の発現を含むウイルスの生活環または複製に必要な配列である。本発明の1実施形態において、阻害されることになるウイルスはヒト免疫不全ウイルス(HIV)である。
【0110】
本発明はまた、ウイルス感染している患者を治療する方法を含む。1実施形態において、本方法は、通常のウイルス複製に重要であるヌクレオチドの少なくとも約15〜25ヌクレオチドの領域と、少なくとも90%の相同性を有し、好ましくは同一である少なくとも1つの二本鎖RNAをコードする、組換えレトロウイルス性粒子を有効量患者へ投与することを含む。例えば、二本鎖RNAは、ウイルスゲノム、ウイルス遺伝子転写物、またはウイルスの生活環に必要な患者の細胞性受容体の遺伝子の核酸と相同性を有し得る。
【0111】
1実施形態において、治療されることになる患者は、ヒト免疫不全ウイルスに感染している。組換えウイルス粒子で治療する前に、標的細胞を患者から取り出す。好適な実施形態において、標的細胞は、CD34−陽性造血幹細胞である。そのような幹細胞は、当業者により精製され得る。そのような精製の方法は既知であり、例えば、米国特許第4,965,204号、第4,714,680号、第5,061,620号、第5,643,741号、第5,677,136号、第5,716,827号、第5,750,397号、および第5,759,793号に教示される。そのようなCD34−陽性幹細胞を精製する方法の1つは、末梢血のサンプルを遠心分離して単核球と顆粒球とを分離して蛍光標示式細胞分取法(FACS)により分類することを含む。上記の技法いずれかを通じて分類された細胞は、CD34+細胞に富むものであり得る。特定の実施形態において、細胞は磁気分離技術を通じてCD34+細胞に富むものであり、ミルテンイ・バイオテック(Miltenyi Biotec)から入手可能であるもの、または以下の文献に記載される:Kogler et al. (1998) Bone Marrow Transplant. 21: 233-241; Pasino et al.(2000) Br. J. Haematol. 108: 793-800。単離CD34−陽性幹細胞は、ウイルスゲノム内の1つまたは複数の標的および/またはウイルスの生活環に必要である細胞標的(例えば、病原性ウイルスの進入に必要な受容体または補助受容体を含む)に対する有向の二本鎖RNAをコードするRNAコード領域を有する組換えレトロウイルス性粒子で処理される。処理された幹細胞は、次いで患者に再導入される。
【0112】
本発明の方法は、様々なウイルス性疾患(例えば、ヒト免疫不全ウイルス(HIV−1およびHIV−2)、A型肝炎、B型肝炎、C型肝炎を含む)を治療するために使用され得る。
【0113】
患者にウイルスなどの所望の病原体に対する免疫または耐性増加を与える目的で、抗ウイルス性組換えレトロウイルスで患者を治療することもまた可能である。
【0114】
<細胞性標的>
本発明に従って、当業者は、細胞性成分、RNAまたは病原体の生活環、特にウイルスの生活環に必要な細胞性タンパク質をコードするRNAのいずれかを、標的とし得る。好適な実施形態において、選択される細胞性標的は、正常な細胞増殖および生存に必要であるタンパク質またはRNAではない。ウイルスの生活環を破壊するのに適したタンパク質として、例えば、ウイルス進入に関係する細胞表面受容体(一次受容体および二次受容体の両方を含む)、およびウイルスゲノムの転写に関係する転写因子、宿主染色体への組み込みに関係するタンパク質、およびウイルス遺伝子発現の翻訳または他の調節に関係するタンパク質が挙げられる。
【0115】
細胞内へのウイルス侵入のための受容体として、多数の細胞性タンパク質が既知である。そのような受容体のいくつかは、E. Baranowski、C. M. Ruiz-Jarabo、およびE. Domingoによる論文「ウイルスによる細胞認識の進化(Evolution of Cell Recognition by Viruses)」Science 292: 1102-1105に列挙され、これは本明細書中にその全体が参照により援用される。ウイルスよる認識に関係するいくつかの細胞性受容体は、以下に列挙される:アデノウイルス:CAR、インテグリン、MHC I、ヘパラン硫酸グリコサミノグリカン、シアル酸;サイトメガロウイルス:ヘパラン硫酸グリコサミノグリカン;コクサッキーウイルス:インテグリン、ICAM−1、CAR、MHC I;A型肝炎:マウス様I型内在性膜糖タンパク質;C型肝炎:CD81、低密度リポタンパク質受容体;HIV(レトロウイルス科):CD4、CXCR4、ヘパラン硫酸グリコサミノグリカン;HSV:ヘパラン硫酸グリコサミノグリカン、PVR、HveB、HveC;インフルエンザウイルス:シアル酸;はしか:CD46、CD55;ポリオウイルス、:PVR、HveB、HveC;ヒトパピローマウイルス:インテグリン。当業者は、本発明が現在既知である受容体を使用することに制限されないことを認識するだろう。新規細胞性受容体および補助受容体が発見されると、本発明の方法はそのような配列に応用され得る。
【0116】
<ヒト免疫不全ウイルス(HIV)>
HIVウイルス標的:
本発明の1実施形態において、レトロウイルス構築物は、HIVウイルス性RNAゲノム、すなわちHIVウイルスゲノムの発現領域に対して(例えば、組み込まれたHIVウイルスの9−kb転写物のうち約19〜25ヌクレオチド長の任意の領域、または、HIVの様々なスプライシングmRNA転写物のいずれかに対して)少なくとも90%相同性を有する二本鎖分子をコードするRNAコード領域を有する(Schwartz, S; Felber, BK; Benko, DM; Fenya, EM; Pavlakis, GN.「ヒト免疫不全ウイルス1型の多重スプライシングmRNA種のクローニングおよび機能分析(Cloning and functional analysis of multiply spliced mRNA species of human immunodeficiency virus type 1)」. J. Virol. 1990; 64(6): 2519-29)。HIV転写物中の標的領域は、ウイルス遺伝子(例えば、HIV−1 LTR、vif、nef、およびrevを含む)のいずれかに対応するように選択され得る。別の実施形態において、RNAコード領域は、HIVウイルスの受容体または補助受容体と少なくとも90%相同性を有する二本鎖領域をコードする。例えば、HIVのT細胞侵入の一次受容体はCD4である。好適な実施形態において、補助受容体であるCXCケモカイン受容体4(CXCR4)およびCCケモカイン受容体5(CCR5)は、本発明の方法に従って下方調節される。CXCR4(Feddersppiel et al. Genomics 16: 707-712(1993))は、HIVのT細胞栄養株の主要な補助受容体であるが、一方CCR5(Mummidi et al. J. Biol. Chem. 272: 30662-30671(1997))は、HIVのマクロファージ栄養株の主要な補助受容体である。HIVに対する他の細胞性標的は、HIV生活環に含まれるタンパク質のRNA転写物を含み、シクロフィリン、CRM−1、インポーチン−β、HP68(Zimmerman C, et al.「未成熟HIV−1キャプシドの組立に必要な宿主タンパク質の同定(Identification of a host protein essential for assembly of immature HIV-1 capsids)」. NATURE 415 (6867): 88-92(2002))、および依然として未知の他の細胞性要因が挙げられる。
【0117】
以下の実施例は、例示のみを目的として提供され、いかなる方法でも本発明の範囲を制限することを意図しない。実際、本明細書中に示されまた記載されるものに加えて、本発明の様々な修正が、以下の記載から当業者に明らかになり、そして添付の特許請求の範囲内に該当するだろう。
【0118】
本明細書中で引照される全ての特許および参考文献は、その全体が本明細書により参考として援用される。
【実施例1】
【0119】
この実施例に従って、siRNA発現カセットをHC−FUGWベクターのPacI部位へ挿入することにより、lacZ遺伝子に対するsiRNAレンチウイルス構築物が構築された(図5)。HC−FUGWベクター(配列番号:3)は、形質導入事象を追跡するための、ヒトユビキチンプロモーターにより駆動されるGFP標識遺伝子を含む。このベクターはまた、ウイルス力価を改善するためのHIV DNAフラップ要素、およびウイルス遺伝子の高レベル発現のためのWPREも含む。siRNA発現カセットは、pol IIIプロモーターおよび小ヘアピンRNAコード領域からなり、これにpol IIIターミネーター部位が続く。pol IIIプロモーターは、ヒトH1−RNAプロモーターの−240〜−8領域に由来し、そして7塩基対のリンカー配列を通じて下流のRNAコード領域に接続されて、転写がRNAコード配列の最初のヌクレオチドから正確に開始されることを確実にする。小ヘアピンRNAコード領域は、lacZ遺伝子コード配列のセンス鎖の1915〜1933領域に対応する19個のnt配列、および9個のntループ領域により分断された19個ntの完全な逆相補配列を含む。ターミネーターは、RNAコード配列の直後の下流に連結した5個の連続したチミジン残基からなる。
【実施例2】
【0120】
この実施例は、培養哺乳類細胞へのレトロウイルスベクターの形質導入を実証する(図6)。実施例1に記載される小ヘアピンRNA分子をコードするレトロウイルスベクターを使用して、lacZを発現する培養哺乳類細胞をトランスフェクトし、そして試験遺伝子lacZの発現の著しい減少を引き起こした。lacZ siRNAウイルスを、レトロウイルスベクター、ヘルパーウイルスプラスミド、およびVSVg発現プラスミドの、HEK293細胞への同時トランスフェクションにより産生した。ウイルス粒子を細胞培養物の上清から収穫して、超遠心分離により濃縮した。濃縮ウイルス調製物を使用して、lacZとホタルルシフェラーゼ(Luc)レポーター遺伝子との両方を宿している、マウス胚線維芽細胞(MEF)またはHEK293細胞のいずれかに感染させた。感染を、ウイルス性ベクターの標識遺伝子カセットから発現するGFPシグナルによりモニタリングした。この実験条件下、>98%の試験細胞がGPF+であり、したがって首尾よく形質導入された。lacZおよびLucレポーター遺伝子の発現レベルを、市販のキット(Roche製lacZアッセイキットおよびPromega製Luc)を使用して化学発光アッセイにより測定した。lacZ siRNAウイルスは、lacZの発現のみを阻害し、Lucは阻害しなかった。特異的阻害を、lacZ活性対Luc活性の比により決定した。未感染の親細胞のlacZ/Luc比を、任意に1に設定し、これに応じて感染細胞の値を計算した。図6に示されるとおり、ウイルスのトランスフェクションは、MEK細胞およびHEK293細胞の両方でlacZ遺伝子の発現量の劇的な減少をもたらした。
【0121】
tet−誘導lacZ siRNAレンチウイルスベクターをまた、図8に例示されるようにも調製した。Tetリプレッサー遺伝子(TetR;配列番号:7)の発現が下流のGFPマーカーによりモニタリングされ得るように、それをヒトユビキチンCプロモーターの制御下に置いた。抗lacZ siRNAカセットを、PSEとTATA boxとの間に単一のTetR結合部位(TetO1)を含むヒトU6−プロモーター(−328〜+1)由来のTet−誘導pol IIIプロモーター(配列番号:6)により駆動した。TetRコード配列を、大腸菌のTOP10株由来のゲノムDNAからPCR増幅して、Bgl2−EcoR1フラグメントとしてFUIGWの改良体中にクローニングした。テトラサイクリンの不在下、TetRはプロモーターに結合してその発現は抑制される。テトラサイクリンの添加で、TetRはプロモーターから動いて転写が開始される。
【0122】
Tet−誘導siRNA発現カセットは、ドキシサイクリン処理に応じて遺伝子発現を調節することが可能であった。ウイルスをTet−誘導lacZ−siRNAカセットおよびユビキチンCプロモーター制御下のTetリプレッサーを保有するレトロウイルス構築物から調製し、そしてlacZおよびルシフェラーゼ(293Z+Luc)の両方を発現するHEK293細胞に形質導入するために使用した。形質導入細胞を、48時間10ug/mlドキシサイクリンで処理する(Plus Dox)か、または対照としてドキシサイクリン処理を行わなかった(No Dox)。LacZおよびルシフェラーゼ活性を先の図に記載されるように測定した。相対抑制活性をlacZ対ルシフェラーゼの比として計算し、そしてNoDox対照を任意に1に設定した。図9に見られるとおり、ドキシサイクリンの存在下、lacZ活性の抑制は、顕著に向上した。
【実施例3】
【0123】
この実施例は、レンチウイルスベクターによりコードされるsiRNA分子を発現する遺伝子組換え動物の発生を実証する。実施例1に記載されるlacZ特異的siRNA構築物の発現は、ROSA26+/−マウスでlacZ活性の高度抑制をもたらした。ROSA26+/−動物は、遍在的に発現されるlacZレポーター遺伝子のコピーを1つ保有する。実施例2に記載されるlacZ siRNAウイルス調製物を、ホルモン刺激したC57B1/6メス・ドナー×ROSA26+/+種オスから得られたROSA26+/−単細胞胚の卵黄周囲注射のため使用した。注射単細胞胚を、続いて時期を合わせた偽妊娠メス受容者の卵管へ移した。15.5〜17.5日胚(E15.5〜17.5)の胎児を代理母から取り出した。蛍光顕微鏡下胎児で観測される陽性GFPシグナルにより、成功した遺伝子導入を採点した。胎児の肢組織から調製されたタンパク質抽出物を、使用説明書(Roche)に従ってLacZ化学発光アッセイに使用し、そして組織抽出物のタンパク質濃度をBradfordアッセイ(BioRad)により決定した。LacZ発現レベルは、タンパク質1ugあたりの光単位(LU/ug)として表した。C57B1/6メス×ROSA26+/+オス、およびC57B1/6メス×C57B1/6オスの時期を合わせた交配からのE15.5〜17.5胎児を、それぞれ陽性および陰性対照とした。結果を図7に示す。動物G1〜G4(siRNA構築物をコードするレンチウイルスベクターで治療されたもの)では、未治療の対照動物と比較して、動物はlacZ遺伝子の顕著に減少した発現を示した。
【実施例4】
【0124】
抗ヒトCCR5 siRNAをコードするRNAコード領域を含むレンチウイルス構築物を調製した。図10に例示されるように、ベクターは、HIVベースのレンチウイルスベクター5'LTR、HIVフラップ要素、ヒトU6−RNA Pol IIプロモーター(−328〜+1;配列番号:4)、ヒトCCR5特異的短鎖ヘアピンRNAカセット、内在ユビキチンプロモーター、ユビキチンプロモーターと操作可能に連結したGFP標識遺伝子、WRE調節要素、およびHIVベースの自己不活性化レンチウイルス3'LTRを含む。抗CCR5 siRNAの構造および配列は図10および配列番号:1で提供される。
【0125】
組換えレトロウイルスを、上記に記載されるように、抗CCR5 siRNAベクター構築物から調製した。ヒトMAGI−CCR5細胞(Deng et al., Nature 381: 661 (1996))を、非特異的対照siRNAをコードする組換えウイルスまたはレトロウイルスに感染させ、そしてCCR5の細胞表面発現をフローサイトメトリー分析により測定した。平均蛍光強度により相対的発現レベルを計算した。図11に見られるとおり、抗CCR5 siRNAは、CCR5発現レベルをほぼ完全に減少させたが、非特異的siRNAは発現をまったく抑制しなかった。
【実施例5】
【0126】
図12に例示されるように、レンチウイルスベクターをコードするさらなる抗HIV−1 siRNAを構築した。このベクターは、抗HIV−1 Rev遺伝子特異的短鎖ヘアピンsiRNA(配列番号:2)をコードするRNAコード領域を含む。抗HIV−1
Rev siRNAは、HIV−1のRevコードの8420〜8468領域を標的とした(「NL4−3株のヌクレオチド配位(nucleotide coordinate of NL4-3 strain)」; Salminen et al. Virology 213 : 80-86 (1995))。siRNAコード領域の配列および構造は、同じく図12に例示される。抗HIV−1 Rev siRNAの発現は、ヒトH1−RNA Pol IIIプロモーター(−240〜−9;配列番号:5)により駆動された。
【0127】
抗HIV−1 Rev siRNAの、ヒト細胞でHIV転写を抑制する能力を測定した。HIV−1の転写活性を、基本的にLi et al. J. Virol. 65: 3973(1991))に記載されるとおり、env/nef領域で挿入されたホタルルシフェラーゼレポーター遺伝子の活性に基づいて測定した。
【0128】
上記に記載されるとおり、ベクター構築物から組換えレトロウイルスを調製し、そしてHIV−1を含むヒト細胞をレポーター構築物に感染させるために使用した。形質導入されていない親細胞のルシフェラーゼ活性を任意に1に設定し、これに従って形質導入細胞の相対的HIV転写レベルを計算した。非特異的siRNAを対照として使用した。
【0129】
図13に見られるとおり、HIV−1転写は、抗HIV−1 Rev siRNAコード領域を含む組換えレトロウイルスに感染した細胞で顕著に抑制されたが、一方非特異的siRNAは明らかな効果を有さなかった。
【実施例6】
【0130】
この実施例に従って、siRNA発現カセットをHC−FUGWベクターのPacI部位へ挿入することにより、HIVゲノムに対するsiRNAレンチウイルス構築物を構築した。HC−FUGWベクターは、形質導入事象を追跡するための、ヒトユビキチンプロモーターにより駆動されるGFP標識遺伝子を含む。ベクターはまた、ウイルス力価を改善するためのHIV DNAフラップ要素、およびウイルス遺伝子の高レベル発現のためのWPREも含む。siRNA発現カセットは、pol IIIプロモーターおよび小ヘアピンRNAコード領域からなり、これにpol IIIターミネーター部位が続く。pol IIIプロモーターは、ヒトH1−RNAプロモーターの−240〜−8領域に由来し、7塩基対のリンカー配列を通じて下流のRNAコード領域に接続されて、転写がRNAコード配列の最初のヌクレオチドから正確に開始されることを確実にする。小ヘアピンRNAコード領域は、CCR5コード配列の1つの領域に対応する21個のnt配列、および4個のntループ領域により分断された21個のntの完全な逆相補配列を含む。ターミネーターは、RNAコード配列の直後の下流に連結した5個の連続したチミジン残基からなる。
【0131】
レトロウイルス構築物を使用して、パッケージング細胞株(HEK293細胞)を、ヘルパーウイルスプラスミドおよびVSVg発現プラスミドとともにトランスフェクトする。組換えウイルス粒子が回収される。
【0132】
免疫磁気アプローチを使用して、CD34−陽性造血幹細胞を患者の骨髄から単離する(例えば、Choi et al. (1995) Blood 85: 402-413; Fehse et al. (1997) Human Gene Therapy 8: 1815-1824; Di Nicola et al. (1996) Bone Marrow Transplant. 18: 1117-1121; Servida et al. (1996) Stem Cells 14: 430-438; de Wynter et al. (1995) Stem Cells 13: 524-532; Ye et al. (1996) Bone Marrow Transplant. 18: 997-1008を参照)。細胞を培養して、組換えウイルス粒子で処理する。感染細胞を、GFPの発現に基づいてFACSにより分類する。GFPを発現している細胞を、注射して患者に再導入する。
【実施例7】
【0133】
この実施例に従って、siRNA発現カセットをHC−FUGWベクターのPacI部位に挿入することにより、HIVゲノムに対するsiRNAレンチウイルス構築物を構築する。siRNA発現カセットは、抗HIV−1 Rev遺伝子特異的短鎖ヘアピンsiRNAをコードするRNAコード領域に操作可能に連結したヒトHIプロモーターを含む。siRNA発現カセットはさらに、抗CCR5小ヘアピンRNAに操作可能に連結したpol IIIプロモーターを含む。レトロウイルス構築物は、図14に例示される。
【0134】
レトロウイルス構築物を使用して、パッケージング細胞株(HEK293細胞)を、ヘルパーウイルスプラスミドおよびVSVg発現プラスミドとともにトランスフェクトする。組換えウイルス粒子が回収される。
【0135】
免疫磁気アプローチを使用して、CD34−陽性造血幹細胞を患者の骨髄から単離する(例えば、Choi et al. (1995) Blood 85: 402-413; Fehse et al. (1997) Human Gene Therapy 8: 1815-1824; Di Nicola et al. (1996) Bone Marrow Transplant. 18: 1117-1121; Servida et al. (1996) Stem Cells 14: 430-438; de Wynter et al. (1995) Stem Cells 13: 524-532; Ye et al. (1996) Bone Marrow Transplant. 18: 997-1008を参照)。細胞を培養して、組換えウイルス粒子で処理する。感染細胞を、GFPの発現に基づいてFACSにより分類する。GFPを発現している細胞を、注射して患者に再導入する。
【図面の簡単な説明】
【0136】
【図1A】「RNAカセット」と名付けられたRNA発現のための発現カセットおよび「標識遺伝子」または目的の遺伝子を保有するレトロウイルスベクターの概略図を示す。RNA発現カセットは、レトロウイルス構築物の任意の許容部位で、単一コピーまたは複数のタンデムコピーのいずれかとして埋め込まれ得る。また、図に示されないものの、1個より多いRNA発現カセットがレトロウイルス構築物に存在し得る。
【図1B】RNA発現カセットが標識遺伝子に隣接する、同様な構築物を示す。
【図2】siRNA領域110〜130に連結したRNAポリメラーゼIIIプロモーター100を有し、センス領域110、ループ領域120、およびアンチセンス領域130、およびターミネーター配列140を有するRNA発現カセットの概略図を示す。
【図3】第一RNAコード領域110に連結したRNAポリメラーゼIIIプロモーター100および第一ターミネーター配列140、ならびに第二のRNAコード領域115に連結した第二RNAポリメラーゼIIIプロモーター105および第二ターミネーター145を有するRNA発現カセットの概略図を示す。
【図4】 RNAコード領域110に連結した第一RNAポリメラーゼIIIプロモーター100および第一ターミネーター配列140を有するRNA発現カセットの概略図を示す。発現カセットは、110と逆順で同じ配列のRNAコード領域115に連結した第二RNAポリメラーゼIIIプロモーター105および第二ターミネーター145を有する。
【図5】レンチウイルスベクターをコードするlacZ siRNAの概要説明図である。5'LTR:HIVベースのレンチウイルスベクター5'LTR;F:HIVフラップ要素;pol III:ヒトH1−RNA Pol IIIプロモーター(−240〜−8);siRNA:lacZ特異的小ヘアピンRNAコード領域、その構造ならびに詳細な配列は以下に図示される。UbiC:内在的ヒトユビキチンCプロモーター;GFP:UbiCプロモーターにより駆動されるGFP標識遺伝子。W:ウッドチャックRNA調節要素。3'LTR:HIVベースの自己不活性化レンチウイルス3'LTR。
【図6】レンチウイルスベクターによりコードされたlacZ特異的siRNAは、ウイルスを形質導入された哺乳類細胞で、lacZレポーター遺伝子の発現を効果的に阻害し得る。MEF:マウス胚線維芽細胞;HEK293:ヒト胚腎臓細胞。試験細胞株はいずれもlacZおよびホタルルシフェラーゼレポーター遺伝子を宿し、そしてレポーター遺伝子の発現レベルは、化学発光アッセイにより測定され得る。Ctrl:感染していない親細胞のlacZ活性対Luc活性の比で、任意に1に設定された。形質導入:lacZ対Luc比の減少として計算されたlacZ発現の特異的阻害。
【図7】レンチウイルスベクターによりコードされたlacZ特異的siRNA分子を発現する遺伝子組換え動物は、ROSA26+/−バックグラウンドで遍在性lacZレポーター遺伝子の発現を首尾よく抑制し得る。ROSA1〜6:6つのE17.5 ROSA26+/−胚の肢組織でのlacZ活性で、陽性対照として供される。個々のROSA26+/−胚間のlacZ活性の差異は、可変のタンパク質抽出効率から生じ得る。TG1〜4:ROSA+/−バックグラウンドでlacZ siRNA分子をコードしたレンチウイルスベクターを発現する4つのE17.5遺伝子組み替え胚の肢組織でのlacZ活性。WT1〜6:6つのE17.5 C57B1/6野生型胚の肢組織でのlacZ活性、陰性対照として含まれる。内因性β−ガラクトシダーゼ活性のバックグラウンドレベルは、全般的に1,000LU/ugを下回り、したがってカラムは見えない。
【図8】Tet−誘導lacZ siRNAレンチウイルスベクターの概略説明図を示す。Tetリプレッサー遺伝子(TetR;配列番号:7)は、ヒトユビキチンCプロモーターの制御下にあり、その発現はIRES要素(内部リボソーム侵入部位)とカップリングした下流のGFPマーカーによりモニタリングされ得る。抗lacZ siRNAカセットは、PSEとTATA boxとの間に単一TetR結合部位(TetO1)を含むヒトU6−プロモーター(−328〜+1)由来のTet−誘導pol IIIプロモーター(配列番号:6)により駆動される。テトラサイクリンの不在下、TetRはプロモーターに結合してその発現は抑制される。テトラサイクリンの添加で、TetRはプロモーターから動いて転写が開始される。
【図9】Tet−誘導siRNA発現カセットがドキシサイクリン処理に応じて遺伝子発現を調節し得ることを実証した実験結果を示す。lacZおよびルシフェラーゼ二重発現HEK293細胞(293Z+Luc)に、ユビキチンCプロモーターの制御下にある、Tet−誘導lacZ−siRNAカセットおよびTetリプレッサーを保有するレンチウイルスベクターを形質導入した(図8)。形質導入した細胞を、48時間10ug/mlドキシサイクリンで処理する(Plus Dox)か、または対照としてドキシサイクリン処理を行わなかった(No Dox)。LacZおよびルシフェラーゼ活性を先の図で記載されるように測定した。相対的抑制活性をlacZ対ルシフェラーゼの比として計算し、そしてNo Dox対照を任意に1に設定した。
【図10】抗ヒトCCR5 siRNAコード化レンチウイルスベクターの概要説明図を示す。5'LTR:HIVベースのレンチウイルスベクター5'LTR;F:HIVフラップ要素;ヒトU6−RNA Pol IIIプロモーター(−328〜+1);siRNA:ヒトCCR5特異的短鎖ヘアピンカセット、およびその構造ならびに詳細な配列は以下に図示される。UbiC:内在的ヒトユビキチンCプロモーター;GFP:UbiCプロモーターにより駆動されるGFP標識遺伝子。W:ウッドチャックRNA調節要素。3'LTR:HIVベースの自己不活性化レンチウイルス3'LTR。
【図11】レンチウイルスベクターによりコードされた抗ヒトCCR5特異的siRNAは、形質導入されたヒト細胞におけるCCR5発現を効率的に抑制し得る。形質導入または非形質導入MAGI−CCR5でのCCR5の細胞表面発現(Deng, et al., Nature, 381, 661(1996))を、フローサイトメトリー分析(FACS)で測定し、そして相対的発現レベルを平均蛍光強度により計算した。非特異的siRNAも、対照として含まれた。
【図12】抗HIV−1 siRNAコード化レンチウイルスベクターの概要説明図である。5'LTR:HIVベースのレンチウイルスベクター5'LTR;F:HIVフラップ要素;ヒトH1−RNA Pol IIIプロモーター(−240〜−9);siRNA:HIV−1 Rev遺伝子特異的短鎖ヘアピンカセット、その構造ならびに詳細な配列は以下に図示される。UbiC:内在的ヒトユビキチンCプロモーター;GFP:UbiCプロモーターにより駆動されるGFP標識遺伝子。W:ウッドチャックRNA調節要素。3'LTR:HIVベースの自己不活性化レンチウイルス3'LTR。
【図13】図13は、レンチウイルスベクターによりコードされる抗HIV−1 Rev遺伝子特異的siRNAがヒト細胞におけるHIV転写の発現を効率的に抑制し得ることを表示する。HIV−1ウイルスの転写活性は、env/nef領域に挿入されたホタルルシフェラーゼレポーター遺伝子で測定される(Li, et al J Virol., 65, 3973(1991))。非形質導入親細胞のルシフェラーゼ活性を任意に1に設定し、これに従って形質導入細胞の相対的HIV転写レベルを計算した。非特異的siRNA含有ベクターは対照として含まれた。
【図14】抗HIV Revおよび抗ヒトCCR siRNA発現カセットの両方を保有する二価レトロウイルスベクターの概略図を示す。符号は先の図で記載されるものと同じである。
【配列表】
Figure 0004344858
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Claims (34)

  1. 細胞内におけるRNA分子の発現のためのレトロウイルス構築物であって、
    5'レンチウイルス末端反復配列(LTR)由来のRおよびU5配列、
    自己不活性化レンチウイルス3'LTR、
    第一RNAポリメラーゼIIIプロモーター、および
    前記第一RNAポリメラーゼIIIプロモーターと操作可能に連結した第一RNAコード領域、
    を含み、
    前記第一RNAポリメラーゼIIIプロモーターおよび前記第一RNAコード領域は、5'LTRおよび3'LTRの間に位置し、そして
    前記第一RNAコード領域は、病原性ウイルスゲノム、若しくはゲノム転写物、または病原性ウイルスの生活環に関与する標的細胞遺伝子の標的領域と少なくとも90%同一である配列を含む、
    レトロウイルス構築物
  2. 前記標的領域は、1〜30のヌクレオチド長である、請求項に記載のレトロウイルス構築物
  3. 前記標的領域は、1〜23ヌクレオチド長である、請求項に記載のレトロウイルス構築物
  4. 前記標的領域は、CCR5およびCXCR4からなる群より選択されるヒト遺伝子転写物の領域である、請求項に記載のレトロウイルス構築物
  5. 前記標的領域はヒト免疫不全ウイルス転写物の領域である、請求項に記載のレトロウイルス構築物
  6. 前記病原性ウイルスはヒト免疫不全ウイルスである、請求項1〜3のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物
  7. 前記病原性ウイルスは、C型肝炎ウイルス(HCV)、サイトメガロウイルス(CMV)、単純ヘルペスウイルス(HSV)、インフルエンザウイルス、アデノウイルス、およびポリオウイルスからなる群より選択される、請求項1〜3のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物
  8. 前記第一RNAコード領域は第一RNA分子をコードし、かつ前記レトロウイルス構築物はさらに第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターおよび該第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターと操作可能に連結した第二RNAコード領域を含み、該第二RNAコード領域は前記標的領域で前記第一RNA分子と相補的な第二RNA分子をコードする、請求項1〜7のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物
  9. 前記レトロウイルス構築物は、前記第一RNAポリメラーゼIIIプロモーターからの前記第一RNAコード領域の発現が第一RNA分子の合成をもたらし、かつ第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターからの前記第一RNAコード領域の発現が前記標的領域で前記第一RNA分子と相補的な第二RNA分子の合成をもたらすように、前記第一RNAコード領域と操作可能に連結した第二RNAポリメラーゼIIIプロモーター領域をさらに含む、請求項1〜7のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物
  10. 前記第一RNAコード領域は、センス領域、アンチセンス領域、およびループ領域を有するRNA分子をコードし、かつ前記センス領域は前記アンチセンス領域と相補的である、請求項1〜7のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物
  11. 前記ループ領域は2〜15ヌクレオチド長である、請求項10に記載のレトロウイルス構築物
  12. 前記第一RNAコード領域は、配列番号1の配列と少なくとも90%同一である配列を含む、請求項1に記載のレトロウイルス構築物。
  13. 前記第一RNAコード領域は、配列番号1の配列と少なくとも95%同一である配列を含む、請求項1に記載のレトロウイルス構築物。
  14. 前記第一RNAコード領域は、配列番号1の配列を含む、請求項1に記載のレトロウイルス構築物。
  15. 前記第一RNAコード領域は、配列番号2の配列を含む、請求項1に記載のレトロウイルス構築物。
  16. 第二RNAポリメラーゼIIIプロモーターと操作可能に連結した配列番号2の配列を含むRNAコード領域をさらに含む、請求項1に記載のレトロウイルス構築物。
  17. 少なくとも一つの終結配列をさらに含む、請求項1〜16のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物。
  18. 前記RNAポリメラーゼIIIプロモーターは誘導性である、請求項1〜17のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物。
  19. 前記誘導性プロモーターはテトラサイクリンで活性化される、請求項18に記載のレトロウイルス構築物。
  20. 前記5'LTR配列はHIVに由来する、請求項1〜19のいずれか一項に記載のレトロ
    ウイルス構築物
  21. 前記5'LTR配列はモロニーマウス白血病ウイルスに由来する、請求項1〜19のいず
    れか一項に記載のレトロウイルス構築物
  22. 前記5'LTR配列はマウス幹細胞ウイルス(MSCV)に由来する、請求項1〜19の
    いずれか一項に記載のレトロウイルス構築物
  23. ウッドチャック肝炎ウイルスエンハンサー要素配列を含む、請求項1〜22のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物。
  24. tRNAアンバー抑制配列を含む、請求項1〜23のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物。
  25. 前記自己不活性化レンチウイルス3'LTRは、エンハンサー配列が欠失したU3要素を
    含む、請求項1〜24のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物
  26. 前記自己不活性化3'LTRはHIVに由来する、請求項1〜24のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物。
  27. ッケージング細胞株を請求項1〜26のいずれか一項に記載のレトロウイルス構築物でトランスフェクトする工程、
    前記パッケージング細胞株から組換えレトロウイルスを回収する工程、および、
    標的細胞を前記組換えレトロウイルスに感染させる工程、
    を含む、インビトロで細胞を感染させる方法。
  28. 前記組換えレトロウイルスはシュードタイプである、請求項27に記載の方法
  29. 前記組換えレトロウイルスは水泡性口内炎ウイルスエンベロープ糖タンパク質を有するシュードタイプである、請求項28に記載の方法
  30. 前記パッケージング細胞株はHEK293細胞株である、請求項27〜29のいずれか一項に記載の方法
  31. 前記標的細胞はヒト細胞である、請求項27〜30のいずれか一項に記載の方法。
  32. 前記標的細胞は造血細胞である、請求項31に記載の方法。
  33. 前記標的細胞はCD34−陽性造血細胞である、請求項32に記載の方法。
  34. 前記標的細胞は培養細胞である、請求項27〜33のいずれか一項に記載の方法。
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1993023569A1 (en) * 1992-05-11 1993-11-25 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Method and reagent for inhibiting viral replication
US20030206887A1 (en) * 1992-05-14 2003-11-06 David Morrissey RNA interference mediated inhibition of hepatitis B virus (HBV) using short interfering nucleic acid (siNA)
US5639647A (en) * 1994-03-29 1997-06-17 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. 2'-deoxy-2'alkylnucleotide containing nucleic acid
CA2487328A1 (en) 1998-03-20 1999-09-30 Benitec Australia Ltd. Sirna for control of gene expression
AUPP249298A0 (en) 1998-03-20 1998-04-23 Ag-Gene Australia Limited Synthetic genes and genetic constructs comprising same I
JP2003525017A (ja) * 1998-04-20 2003-08-26 リボザイム・ファーマシューティカルズ・インコーポレーテッド 遺伝子発現を調節しうる新規な化学組成を有する核酸分子
US20040242521A1 (en) * 1999-10-25 2004-12-02 Board Of Regents, The University Of Texas System Thio-siRNA aptamers
US20060172925A1 (en) * 1998-10-26 2006-08-03 Board Of Regents, The University Of Texas System Thio-siRNA aptamers
EP2314700A1 (en) 1999-01-28 2011-04-27 Medical College of Georgia Research Institute, Inc Composition and method for in vivo and in vitro attenuation of gene expression using double stranded RNA
US6423885B1 (en) 1999-08-13 2002-07-23 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organization (Csiro) Methods for obtaining modified phenotypes in plant cells
US20080039414A1 (en) * 2002-02-20 2008-02-14 Sima Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (siNA)
US8273866B2 (en) * 2002-02-20 2012-09-25 Merck Sharp & Dohme Corp. RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (SINA)
WO2002081628A2 (en) * 2001-04-05 2002-10-17 Ribozyme Pharmaceuticals, Incorporated Modulation of gene expression associated with inflammation proliferation and neurite outgrowth, using nucleic acid based technologies
US20050032733A1 (en) * 2001-05-18 2005-02-10 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (SiNA)
US8202979B2 (en) * 2002-02-20 2012-06-19 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid
US7575924B2 (en) 2000-11-13 2009-08-18 Research Development Foundation Methods and compositions relating to improved lentiviral vectors and their applications
CA2369944A1 (en) 2001-01-31 2002-07-31 Nucleonics Inc. Use of post-transcriptional gene silencing for identifying nucleic acid sequences that modulate the function of a cell
US20090299045A1 (en) * 2001-05-18 2009-12-03 Sirna Therapeutics, Inc. RNA Interference Mediated Inhibition Of Interleukin and Interleukin Gene Expression Using Short Interfering Nucleic Acid (siNA)
US20050182007A1 (en) * 2001-05-18 2005-08-18 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of interleukin and interleukin receptor gene expression using short interfering nucleic acid (SINA)
US20060217331A1 (en) * 2001-05-18 2006-09-28 Sirna Therapeutics, Inc. Chemically modified double stranded nucleic acid molecules that mediate RNA interference
US20050176663A1 (en) * 2001-05-18 2005-08-11 Sima Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of protein tyrosine phosphatase type IVA (PRL3) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050187174A1 (en) * 2001-05-18 2005-08-25 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of intercellular adhesion molecule (ICAM) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050164224A1 (en) * 2001-05-18 2005-07-28 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of cyclin D1 gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20040019001A1 (en) * 2002-02-20 2004-01-29 Mcswiggen James A. RNA interference mediated inhibition of protein typrosine phosphatase-1B (PTP-1B) gene expression using short interfering RNA
US20070093437A1 (en) * 2001-05-18 2007-04-26 Sirna Therapeutics, Inc. Rna interference mediated inhibition of xiap gene expression using short interfering nucleic acid (sina)
US20050159382A1 (en) * 2001-05-18 2005-07-21 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of polycomb group protein EZH2 gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050196765A1 (en) * 2001-05-18 2005-09-08 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of checkpoint Kinase-1 (CHK-1) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050287128A1 (en) * 2001-05-18 2005-12-29 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of TGF-beta and TGF-beta receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050159381A1 (en) * 2001-05-18 2005-07-21 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of chromosome translocation gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050164968A1 (en) * 2001-05-18 2005-07-28 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of ADAM33 gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050159380A1 (en) * 2001-05-18 2005-07-21 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of angiopoietin gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20070032441A1 (en) * 2001-05-18 2007-02-08 Sirna Therapeutics, Inc. Rna interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (sina)
US20050176666A1 (en) * 2001-05-18 2005-08-11 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of GPRA and AAA1 gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050176025A1 (en) * 2001-05-18 2005-08-11 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of B-cell CLL/Lymphoma-2 (BCL-2) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050159378A1 (en) * 2001-05-18 2005-07-21 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of Myc and/or Myb gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050191618A1 (en) * 2001-05-18 2005-09-01 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of human immunodeficiency virus (HIV) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20080161256A1 (en) * 2001-05-18 2008-07-03 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050079610A1 (en) * 2001-05-18 2005-04-14 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of Fos gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050119212A1 (en) * 2001-05-18 2005-06-02 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of FAS and FASL gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050196767A1 (en) * 2001-05-18 2005-09-08 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of GRB2 associated binding protein (GAB2) gene expression using short interfering nucleic acis (siNA)
US7517864B2 (en) 2001-05-18 2009-04-14 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of vascular endothelial growth factor and vascular endothelial growth factor receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20060142225A1 (en) * 2001-05-18 2006-06-29 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of cyclin dependent kinase-2 (CDK2) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
EP1627061B1 (en) * 2001-05-18 2009-08-12 Sirna Therapeutics, Inc. RNA INTERFERENCE MEDIATED INHIBITION OF GENE EXPRESSION USING CHEMICALLY MODIFIED SHORT INTERFERING NUCLEIC ACID (siNA)
US20050282188A1 (en) * 2001-05-18 2005-12-22 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20070270579A1 (en) * 2001-05-18 2007-11-22 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US7109165B2 (en) * 2001-05-18 2006-09-19 Sirna Therapeutics, Inc. Conjugates and compositions for cellular delivery
US20050159379A1 (en) * 2001-05-18 2005-07-21 Sirna Therapeutics, Inc RNA interference mediated inhibition of gastric inhibitory polypeptide (GIP) and gastric inhibitory polypeptide receptor (GIPR) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050136436A1 (en) * 2001-05-18 2005-06-23 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of G72 and D-amino acid oxidase (DAAO) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050288242A1 (en) * 2001-05-18 2005-12-29 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of RAS gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050277133A1 (en) * 2001-05-18 2005-12-15 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated treatment of polyglutamine (polyQ) repeat expansion diseases using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050048529A1 (en) * 2002-02-20 2005-03-03 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of intercellular adhesion molecule (ICAM) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050124569A1 (en) * 2001-05-18 2005-06-09 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of CXCR4 gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050233997A1 (en) * 2001-05-18 2005-10-20 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of matrix metalloproteinase 13 (MMP13) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050233344A1 (en) * 2001-05-18 2005-10-20 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of platelet derived growth factor (PDGF) and platelet derived growth factor receptor (PDGFR) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20070042983A1 (en) * 2001-05-18 2007-02-22 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20060211642A1 (en) * 2001-05-18 2006-09-21 Sirna Therapeutics, Inc. RNA inteference mediated inhibition of hepatitis C virus (HVC) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20040198682A1 (en) * 2001-11-30 2004-10-07 Mcswiggen James RNA interference mediated inhibition of placental growth factor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050153914A1 (en) * 2001-05-18 2005-07-14 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of MDR P-glycoprotein gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050143333A1 (en) * 2001-05-18 2005-06-30 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of interleukin and interleukin receptor gene expression using short interfering nucleic acid (SINA)
US20050124566A1 (en) * 2001-05-18 2005-06-09 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of myostatin gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20080188430A1 (en) * 2001-05-18 2008-08-07 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of hypoxia inducible factor 1 (HIF1) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050137155A1 (en) * 2001-05-18 2005-06-23 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated treatment of Parkinson disease using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050222066A1 (en) * 2001-05-18 2005-10-06 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of vascular endothelial growth factor and vascular endothelial growth factor receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050196781A1 (en) * 2001-05-18 2005-09-08 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of STAT3 gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050261219A1 (en) * 2001-05-18 2005-11-24 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of interleukin and interleukin receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20060241075A1 (en) * 2001-05-18 2006-10-26 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of desmoglein gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050164967A1 (en) * 2001-05-18 2005-07-28 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of platelet-derived endothelial cell growth factor (ECGF1) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
EP1390472A4 (en) * 2001-05-29 2004-11-17 Sirna Therapeutics Inc NUCLEIC ACID TREATMENT OF DISEASES OR SIDES RELATED TO RAS, HER2 AND HIV LEVELS
EP1412493B1 (en) 2001-08-02 2011-10-05 Institut Clayton De La Recherche Methods and compositions relating to improved lentiviral vector production systems
WO2003022228A2 (en) * 2001-09-13 2003-03-20 California Institute Of Technology Method for producing transgenic birds and fish
US7737124B2 (en) * 2001-09-13 2010-06-15 California Institute Of Technology Method for expression of small antiviral RNA molecules with reduced cytotoxicity within a cell
DE60233333D1 (de) * 2001-09-13 2009-09-24 California Inst Of Techn Verfahren zur expression von kleinen antiviralen rna-molekülen innerhalb einer zelle
IL161229A0 (en) 2001-10-02 2004-09-27 Inst Clayton De La Rech Methods and compositions relating to restricted expression lentiviral vectors and their applications.
US20070203333A1 (en) * 2001-11-30 2007-08-30 Mcswiggen James RNA interference mediated inhibition of vascular endothelial growth factor and vascular endothelial growth factor receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20040138163A1 (en) * 2002-05-29 2004-07-15 Mcswiggen James RNA interference mediated inhibition of vascular edothelial growth factor and vascular edothelial growth factor receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050075304A1 (en) * 2001-11-30 2005-04-07 Mcswiggen James RNA interference mediated inhibition of vascular endothelial growth factor and vascular endothelial growth factor receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
GB0130955D0 (en) 2001-12-24 2002-02-13 Cancer Res Ventures Expression system
ES2312753T5 (es) 2002-02-14 2012-12-13 City Of Hope Procedimientos para producir moléculas de ARN de interferencia en células de mamífero y usos terapéuticos para tales moléculas
WO2003106476A1 (en) * 2002-02-20 2003-12-24 Sirna Therapeutics, Inc Nucleic acid mediated inhibition of enterococcus infection and cytolysin toxin activity
US9181551B2 (en) 2002-02-20 2015-11-10 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (siNA)
US20050096284A1 (en) * 2002-02-20 2005-05-05 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated treatment of polyglutamine (polyQ) repeat expansion diseases using short interfering nucleic acid (siNA)
US9657294B2 (en) 2002-02-20 2017-05-23 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (siNA)
AU2003224725A1 (en) * 2002-03-20 2003-10-08 Brigham And Women's Hospital, Inc. Hiv therapeutic
US20030180756A1 (en) * 2002-03-21 2003-09-25 Yang Shi Compositions and methods for suppressing eukaryotic gene expression
EP1504126B1 (en) 2002-05-03 2014-02-26 Duke University A method of regulating gene expression
US20040009946A1 (en) * 2002-05-23 2004-01-15 Ceptyr, Inc. Modulation of PTP1B expression and signal transduction by RNA interference
CA2495556A1 (en) * 2002-08-01 2004-02-12 City Of Hope Methods and kits for synthesis of sirna expression cassettes
US20080274989A1 (en) 2002-08-05 2008-11-06 University Of Iowa Research Foundation Rna Interference Suppression of Neurodegenerative Diseases and Methods of Use Thereof
US20050042646A1 (en) 2002-08-05 2005-02-24 Davidson Beverly L. RNA interference suppresion of neurodegenerative diseases and methods of use thereof
US20040241854A1 (en) 2002-08-05 2004-12-02 Davidson Beverly L. siRNA-mediated gene silencing
US20050196862A1 (en) * 2002-08-30 2005-09-08 Wooddell Christine I. DNA cassette for cellular expression of small RNA
US7923547B2 (en) 2002-09-05 2011-04-12 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (siNA)
AU2002951347A0 (en) * 2002-09-09 2002-09-26 Benitec Australia Ltd Genetic silencing
US20040242518A1 (en) * 2002-09-28 2004-12-02 Massachusetts Institute Of Technology Influenza therapeutic
US7422853B1 (en) * 2002-10-04 2008-09-09 Myriad Genetics, Inc. RNA interference using a universal target
US9453251B2 (en) 2002-10-08 2016-09-27 Pfenex Inc. Expression of mammalian proteins in Pseudomonas fluorescens
US20060035344A1 (en) * 2002-10-18 2006-02-16 Pachuk Catherine J Double-stranded rna structures and constructs, and methods for generating and using the same
EP2000160A3 (en) * 2002-10-30 2009-03-11 Gambro Lundia AB Method and apparatuses for determining the efficiency of dialysis
WO2004048583A2 (en) * 2002-11-22 2004-06-10 Institut Clayton De La Recherche Compositions and systems for the regulation of genes
WO2004047764A2 (en) * 2002-11-22 2004-06-10 University Of Massachusetts Modulation of hiv replication by rna interference
US20040248299A1 (en) * 2002-12-27 2004-12-09 Sumedha Jayasena RNA interference
US20070104688A1 (en) 2003-02-13 2007-05-10 City Of Hope Small interfering RNA mediated transcriptional gene silencing in mammalian cells
WO2004092383A2 (en) * 2003-04-15 2004-10-28 Sirna Therapeutics, Inc. RNA INTERFERENCE MEDIATED INHIBITION OF SEVERE ACUTE RESPIRATORY SYNDROME (SARS) VIRUS GENE EXPRESSION USING SHORT INTERFERING NUCLEIC ACID (siNA)
AU2005212433B2 (en) 2003-05-23 2010-12-16 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using multifunctional short interfering nucleic acid (multifunctional sINA)
WO2006031210A1 (en) 2003-05-29 2006-03-23 Board Of Regents, The University Of Texas Systems Jabi as a prognostic marker and a therapeutic target for human cancer
WO2004108897A2 (en) * 2003-06-02 2004-12-16 Cytokinetics, Inc. Sirna libraries
US20050019918A1 (en) * 2003-06-03 2005-01-27 Hidetoshi Sumimoto Treatment of cancer by inhibiting BRAF expression
CN1320113C (zh) * 2003-06-05 2007-06-06 复旦大学 一种利用大肠杆菌发酵制备小干扰rna分子的方法
GB0315401D0 (en) * 2003-07-01 2003-08-06 Roslin Inst Edinburgh Disease resistant transgenic non-human animals
US8106180B2 (en) * 2003-08-07 2012-01-31 Whitehead Institute For Biomedical Research Methods and products for expression of micro RNAs
EP1734811A4 (en) * 2003-11-21 2009-03-25 Revivicor Inc USE OF INTERFERENCE RNA IN TRANSGENIC ANIMAL PRODUCTION
EP2363483A3 (en) 2004-03-05 2014-07-16 Benitec, Inc. Multiple promoter expression cassettes for simultaneous delivery of RNAi agents
US20050233994A1 (en) * 2004-04-16 2005-10-20 Ajamete Kaykas Methods and vectors for expressing siRNA
CA2574953A1 (en) 2004-07-26 2006-02-09 Dow Global Technolgies Inc. Process for improved protein expression by strain engineering
GB0420825D0 (en) * 2004-09-17 2004-10-20 Univ Glasgow Tissue-specific transcription by RNA polymerase III
US8138327B2 (en) * 2004-11-23 2012-03-20 City Of Hope Inducible systems and methods for controlling siRNA expression
US9944713B2 (en) 2004-11-24 2018-04-17 Medicinal Bioconvergence Research Center Antibody specific to the AIMP2-DX2
WO2006084209A2 (en) 2005-02-03 2006-08-10 Benitec, Inc. Rnai expression constructs
WO2006091112A1 (en) * 2005-02-22 2006-08-31 Genesis Reasearch And Development Corporation Limited Compositions for the delivery of rna interference molecules and methods for their use
KR100637925B1 (ko) 2005-03-19 2006-10-24 한양대학교 산학협력단 테트라사이클린 유도성 siRNA 발현 레트로바이러스벡터
WO2006113743A2 (en) * 2005-04-18 2006-10-26 Massachusetts Institute Of Technology Compositions and methods for rna interference with sialidase expression and uses thereof
AU2006252406B2 (en) * 2005-06-01 2012-05-17 California Institute Of Technology Method of targeted gene delivery using viral vectors
WO2007014363A2 (en) * 2005-07-27 2007-02-01 Genentech, Inc. Vectors for inducible expression of hairpin rna and use thereof
US9061058B2 (en) 2006-03-20 2015-06-23 Max-Delbrueck-Centrum Fuer Molekulare Medizin Use of Pol III promoters for controlled expression of therapeutic proteins
EP1908844A1 (en) * 2006-10-02 2008-04-09 Max-Delbrück-Centrum Für Molekulare Medizin Use of pol III promoters for controlled expression of therapeutic proteins
PT2520168E (pt) 2006-07-21 2014-04-29 California Inst Of Techn Administração de gene alvo para vacinação de células dendríticas
US20080213899A1 (en) * 2006-10-12 2008-09-04 University Of Connecticut Rotationally Oscillating Injector
WO2008118844A1 (en) 2007-03-23 2008-10-02 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Methods involving aldose reductase inhibitors
CN101688213A (zh) 2007-04-27 2010-03-31 陶氏环球技术公司 用于快速筛选微生物宿主以鉴定某些在表达异源蛋白质方面具有改善的产量和/或质量的菌株的方法
US9580719B2 (en) 2007-04-27 2017-02-28 Pfenex, Inc. Method for rapidly screening microbial hosts to identify certain strains with improved yield and/or quality in the expression of heterologous proteins
EP2167645A4 (en) * 2007-06-13 2012-04-18 Commw Scient Ind Res Org MODULATION OF PRODUCTION FEATURES AT BIRDS
US11231289B2 (en) * 2008-09-10 2022-01-25 Dominic M. Kotab Systems, methods and computer program products for sharing geographical data
US8829173B2 (en) 2008-09-26 2014-09-09 Tocagen Inc. Recombinant vectors
EA027693B1 (ru) * 2008-09-26 2017-08-31 Токаджен Инк. Рекомбинантный репликационно-компетентный ретровирус с цитозиндезаминазной активностью для генной терапии нарушений клеточной пролиферации
CA2755192C (en) * 2009-03-20 2018-09-11 Sangamo Biosciences, Inc. Modification of cxcr4 using engineered zinc finger proteins
CN103221541B (zh) * 2009-05-28 2017-03-01 库尔纳公司 通过抑制抗病毒基因的天然反义转录物来治疗抗病毒基因相关疾病
PL2456786T5 (pl) 2009-07-24 2017-10-31 Immune Design Corp Wektory lentiwirusowe pseudotypowane glikoproteiną otoczki wirusa sindbis
WO2011130491A2 (en) * 2010-04-14 2011-10-20 Roger Williams Medical Center Methods and compositions for treating hiv
PL3124610T3 (pl) 2010-10-28 2019-09-30 Benitec Biopharma Limited Leczenie hbv
EP3766975A1 (en) 2010-10-29 2021-01-20 Sirna Therapeutics, Inc. Rna interference mediated inhibition of gene expression using short interfering nucleic acid (sina)
US8785177B2 (en) 2011-11-04 2014-07-22 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois, A Body Corporate And Politic Of The State Of Illinois Methods for nano-mechanoporation
US8323662B1 (en) 2012-03-30 2012-12-04 Immune Design Corp. Methods useful for generating highly mannosylated pseudotyped lentiviral vector particles comprising a Vpx protein
EA038702B1 (ru) 2012-03-30 2021-10-07 Иммьюн Дизайн Корп. Лентивирусные векторные частицы, имеющие улучшенную эффективность трансдукции клеток, экспрессирующих dc-sign
US9713635B2 (en) 2012-03-30 2017-07-25 Immune Design Corp. Materials and methods for producing improved lentiviral vector particles
RU2552607C2 (ru) * 2012-09-27 2015-06-10 Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение Науки Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук (Имб Ран) КАССЕТНАЯ ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ, ЭКСПРЕССИРУЮЩАЯ ДВЕ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫЕ siPHK, ЭФФЕКТИВНО АТАКУЮЩИЕ ТРАНСКРИПТЫ ВИЧ-1 СУБТИПА А У БОЛЬНЫХ В РОССИИ, И ОДНУ siPHK, НАПРАВЛЕННУЮ НА мРНК ГЕНА CCR5
RU2552486C2 (ru) * 2013-01-21 2015-06-10 Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение Науки Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук (Имб Ран) КАССЕТНАЯ ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ, ЭКСПРЕССИРУЮЩАЯ ДВЕ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫЕ siPHK, ЭФФЕКТИВНО АТАКУЮЩИЕ ТРАНСКРИПТЫ ВИЧ-1 СУБТИПА А У БОЛЬНЫХ В РОССИИ, НАПРАВЛЕННЫЕ НА мPHK ОБРАТНОЙ ТРАНСКРИТАЗЫ И ИНТЕГРАЗЫ, И ОДНУ siPHK, НАПРАВЛЕННУЮ НА мPHK ГЕНА CCR5
AU2014296059B2 (en) 2013-08-02 2020-12-10 The Regents Of The University Of California Engineering antiviral T cell immunity through stem cells and chimeric antigen receptors
RU2607381C1 (ru) * 2015-06-22 2017-01-10 Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение Науки Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук (Имб Ран) Кассетная генетическая конструкция, экспрессирующая две биологически активные siPHK, эффективно атакующие мишени в мРНК обратной транскриптазы ВИЧ-1 субтипа А у больных в России, и одну siPHK, направленную на мРНК гена CCR5
EA201890640A1 (ru) 2015-09-04 2018-09-28 Токаджен Инк. Рекомбинантные векторы, содержащие пептид 2а
RU2630644C1 (ru) * 2016-10-04 2017-09-11 Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение Науки Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук (Имб Ран) Кассетная генетическая конструкция, экспрессирующая две биологически активные siPHK, эффективно атакующие мишени в мРНК генов vpu и env ВИЧ-1 субтипа А у больных в России, и одну siPHK, направленную на мРНК гена CCR5
WO2019018383A1 (en) 2017-07-18 2019-01-24 Calimmune, Inc. COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING BETA-HEMOGLOBINOPATHIES
US20230036685A1 (en) * 2019-09-29 2023-02-02 John Douglas BURKE Novel Vectors and Uses Thereof
CN111487399B (zh) * 2020-03-26 2021-09-17 湖南师范大学 一种蛋白分子标记在鱼类生殖细胞发育研究中的应用
CN113005223A (zh) * 2020-11-19 2021-06-22 杭州晶佰生物技术有限公司 针对rcr/rcl的数字pcr检测用引物及检测方法
WO2022140371A1 (en) * 2020-12-21 2022-06-30 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Tau biosensor cell lines

Family Cites Families (42)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US2003A (en) * 1841-03-12 Improvement in horizontal windivhlls
US1111111A (en) * 1914-04-15 1914-09-22 George R Warner Holdback.
US4615974A (en) 1981-08-25 1986-10-07 Celltech Limited Yeast expression vectors
US5168062A (en) 1985-01-30 1992-12-01 University Of Iowa Research Foundation Transfer vectors and microorganisms containing human cytomegalovirus immediate-early promoter-regulatory DNA sequence
US5104795A (en) 1985-11-13 1992-04-14 Zoma Corporation Shortened phosphoglycerate kinase promoter
US4937190A (en) 1987-10-15 1990-06-26 Wisconsin Alumni Research Foundation Translation enhancer
JPH025890A (ja) 1988-06-24 1990-01-10 Chemo Sero Therapeut Res Inst ニワトリのβ−アクチンプロモーターを用いたヒトファクター8Cの製造方法
US5258289A (en) * 1990-09-05 1993-11-02 Davis Claude G Method for the selecting of genes encoding catalytic antibodies
US6664107B1 (en) * 1993-05-26 2003-12-16 Ontario Cancer Institute, University Health Network CD45 disrupted nucleic acid
US5859310A (en) * 1993-06-14 1999-01-12 Basf Aktiengesellschaft Mice transgenic for a tetracycline-controlled transcriptional activator
IT1261847B (it) * 1993-09-01 1996-06-03 San Romanello Centro Fond Metodo per marcare cellule eucariote.
US5631359A (en) * 1994-10-11 1997-05-20 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Hairpin ribozymes
US5958713A (en) 1995-01-31 1999-09-28 Novo Nordisk A/S Method of detecting biologically active substances by using green fluorescent protein
US5650309A (en) * 1995-05-16 1997-07-22 The Regents Of The University Of California Viral vectors
GB9510272D0 (en) * 1995-05-22 1995-07-19 Isis Innovation Retroviral vectors
US5883081A (en) * 1995-07-26 1999-03-16 The Regents Of The University Of California Isolation of novel HIV-2 proviruses
US6013516A (en) 1995-10-06 2000-01-11 The Salk Institute For Biological Studies Vector and method of use for nucleic acid delivery to non-dividing cells
US20030143204A1 (en) * 2001-07-27 2003-07-31 Lewis David L. Inhibition of RNA function by delivery of inhibitors to animal cells
US6255071B1 (en) * 1996-09-20 2001-07-03 Cold Spring Harbor Laboratory Mammalian viral vectors and their uses
US5939538A (en) * 1996-10-25 1999-08-17 Immusol Incorporated Methods and compositions for inhibiting HIV infection of cells by cleaving HIV co-receptor RNA
DE19651443A1 (de) * 1996-12-11 1998-06-18 Hoechst Ag Selbstverstärkende, pharmakologisch kontrollierbare Expressionssysteme
WO1999009139A1 (en) * 1997-08-15 1999-02-25 Rubicon Laboratory, Inc. Retrovirus and viral vectors
US6506559B1 (en) * 1997-12-23 2003-01-14 Carnegie Institute Of Washington Genetic inhibition by double-stranded RNA
US6100087A (en) * 1998-03-11 2000-08-08 City Of Hope Ribozymes targeted to human CCR5 mRNA
US6218181B1 (en) 1998-03-18 2001-04-17 The Salk Institute For Biological Studies Retroviral packaging cell line
US6060317A (en) * 1998-08-11 2000-05-09 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Method of transducing mammalian cells, and products related thereto
CA2340335A1 (en) 1998-08-20 2000-03-02 Cell Genesys, Inc. Use of suppressor trna's to regulate cytotoxicity during the production of recombinant gene products
US6274788B1 (en) * 1998-09-23 2001-08-14 International Centre For Genetic Engineering And Biotechnology Bicistronic DNA construct comprising X-myc transgene for use in production of transgenic animal model systems for human hepatocellular carcinoma and transgenic animal model systems so produced
US6606317B1 (en) * 1999-09-09 2003-08-12 Harris Corporation Dual key controlled content addressable memory for accessing packet switch data buffer for multicasting data packets
US6312956B1 (en) * 1999-10-01 2001-11-06 Vanderbilt University Nuclear targeted peptide nucleic acid oligomer
WO2001029059A1 (en) 1999-10-15 2001-04-26 The Ohio State University Research Foundation Methods for analyzing the insertion capabilities of modified group ii introns
US6218186B1 (en) * 1999-11-12 2001-04-17 Trustees Of The University Of Pennsylvania HIV-MSCV hybrid viral vector for gene transfer
US20030084471A1 (en) * 2000-03-16 2003-05-01 David Beach Methods and compositions for RNA interference
EP1390472A4 (en) 2001-05-29 2004-11-17 Sirna Therapeutics Inc NUCLEIC ACID TREATMENT OF DISEASES OR SIDES RELATED TO RAS, HER2 AND HIV LEVELS
AU2002316640C1 (en) * 2001-07-10 2009-01-29 Johnson & Johnson Research Pty Limited Methods for genetic modification of hematopoietic progenitor cells and uses of the modified cells
US20030219823A1 (en) * 2001-09-07 2003-11-27 Alsobrook John P. Therapeutic polypeptides, nucleic acids encoding same, and methods of use
DE60233333D1 (de) * 2001-09-13 2009-09-24 California Inst Of Techn Verfahren zur expression von kleinen antiviralen rna-molekülen innerhalb einer zelle
US7195916B2 (en) * 2001-09-13 2007-03-27 California Institute Of Technology Method for expression of small antiviral RNA molecules within a cell
US7737124B2 (en) * 2001-09-13 2010-06-15 California Institute Of Technology Method for expression of small antiviral RNA molecules with reduced cytotoxicity within a cell
US6585208B1 (en) * 2002-01-25 2003-07-01 Hunter Douglas Inc. Universal bracket for mounting coverings for architectural openings
EP2000160A3 (en) 2002-10-30 2009-03-11 Gambro Lundia AB Method and apparatuses for determining the efficiency of dialysis
US20050221354A1 (en) 2004-02-18 2005-10-06 Wyeth Nucleic acid arrays for monitoring expression profiles of drug target genes

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012017039A2 (en) 2010-08-05 2012-02-09 Danieli & C. Officine Meccaniche S.P.A. Process and apparatus for controlling the flows of liquid metal in a crystallizer for the continuous casting of thin flat slabs
EP2633928A2 (en) 2010-08-05 2013-09-04 DANIELI & C. OFFICINE MECCANICHE S.p.A. Process and apparatus for controlling the flows of liquid metal in a crystallizer for the continuous casting of thin flat slabs

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