JP4255891B2 - タンパク質の結晶化方法 - Google Patents
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Description
本発明は、上記特徴を有する微量液体秤取構造又は該構造が形成されているチップを用いるタンパク質の結晶化方法である。
上記した特長を有する微量液体秤取構造及びそれを備えたマイクロチップは、タンパク質の結晶化に特に好適に用いることができる。
本明細書において、「濡れにくい(又は相対的に毛管引力が働きにくい)性質」とは、液体が流路Cに引き込まれた時に、そのままの圧力では流路Dを通過する事が出来ず、液体が停止する流路の性質を意味する。
本発明におけるチップの材料は、上記流路構造を実現できる限り、その種類を問わない。材料としては、例えば、ポリジメチルシロキサン(PDMS)、ガラス、シリコン、光反応性樹脂やその他の樹脂、金属、セラミックおよびそれらの組み合わせなどが挙げられる。
また、貼り合わせを必要とせず、上記流体分岐部分と独立流路を一体に形成させる方法も可能である。具体的には、光造形法などの一体成型により閉空間を含む構造を形成することが可能である。
かくして作成されるチップの一辺の長さ、形状、厚みに制限はなく、例えば一辺5mm〜100mmの任意の値に設定することができる。
本発明のうち、請求項1に記載の発明は、
(a)上記流路構造の上記第1の流路にタンパク質溶液もしくは沈殿剤溶液を導入し、前記第1の流路に開口する第3の流路の開口部を介して前記第3の流路に前記タンパク質溶液もしくは沈殿剤溶液が引き込まれた後、前記第1の流路に残存する前記タンパク質溶液もしくは沈殿剤溶液を、前記第3の流路の開口部と接触しない位置まで移動させ、前記第3の流路の容積に応じた体積で作成されたタンパク質溶液もしくは沈殿剤溶液を第4の流路を介して前記第2の流路に流出させる工程と、
(b)第1の流路に沈殿剤溶液もしくはタンパク質溶液を導入し、前記第1の流路に開口する第3の流路の開口部を介して前記第3の流路に前記沈殿剤溶液もしくはタンパク質溶液が引き込まれた後、前記第1の流路に残存する前記沈殿剤溶液もしくはタンパク質溶液を、前記第3の流路の開口部と接触しない位置まで移動させ、前記第3の流路の容積に応じた体積で作成された沈殿剤溶液もしくはタンパク質溶液を第4の流路を介して前記第2の流路に流出させ、タンパク質溶液と沈殿剤溶液とを第2の流路中で接触・合一させる工程と、
(c)第2の流路中で合一させたタンパク質および沈殿剤溶液中からのタンパク質結晶を析出させる工程を含むことを特徴とするタンパク質の結晶化方法である。
また、本発明のうち請求項2に記載の発明は、請求項1に記載の発明において、合一させたタンパク質および沈殿剤溶液中からのタンパク質結晶の析出が、該溶液と離れた流路構造中に沈殿剤溶液が配置されている状態で行われることを特徴とする方法である。この発明において、沈殿剤溶液の配置は、例えば、予め適当な流路、例えば第2の流路に導入して配置しておいてもよいし、タンパク質溶液と沈殿剤溶液とを接触・合一させた後に、沈殿剤溶液を第1の流路に導入し、第3の流路に引き込まれた状態で配置してもよい。
(a)上記微量液体秤取構造の上記第1の流路にタンパク質溶液を導入し、前記第1の流路に開口する第3の流路の開口部を介して前記第3の流路に前記タンパク質溶液が引き込まれた後、前記第1の流路に残存する前記タンパク質溶液を、前記第3の流路の開口部と接触しない位置まで移動させ、前記第3の流路の容積に応じた体積でタンパク質溶液を作成する工程と、
(b)第1の流路に沈殿剤溶液を導入し、タンパク質溶液と沈殿剤溶液とを第3の流路の開口部において接触させ、タンパク質溶液と沈殿剤溶液とを合一させる工程と、
(c)合一させたタンパク質および沈殿剤溶液中からのタンパク質結晶を析出させる工程を含むことを特徴とするタンパク質の結晶化方法である。
この方法においては、第1および/または第3の流路内でタンパク質結晶の析出が起こるので、必要に応じて合一させた溶液を適当な時間静置後、結晶析出の有無を確認する。
参考例1 イオン交換クロマトグラフィーによるタンパク質の分離
図6(a)には、本発明で用いる微量液体秤取構造を備えたマイクロチップ10が示されている。図6(a)に示したマイクロチップ10は、タンパク質の分析に用いるキャピラリーイオン交換クロマトグラフィーのためのマイクロチップであり、サンプルのインジェクション部分に本発明で用いる微量液体秤取構造が備えられている。
図7(a)は、本発明で用いる微量液体秤取構造の別の参考例によるマイクロチップ24の平面図である。図7(a)に示されるマイクロチップ24は、定量的に秤取した2液の混合により最大50種類の反応又は分析を個別的に行うことのできるマイクロチップであり、液体の秤取部分には本発明で用いる微量液体秤取構造が採用されている。図7(a)に示されたマイクロチップ24は最大50種類の反応又は分析を処理するが、これよりも多数の反応又は分析を処理するマイクロチップも当然作製することができる。
図8(a)に示されたマイクロチップ41を用いてタンパク質(グルコースイソメラーゼ)の結晶化を行った。用いたマイクロチップ41の微量液体秤取構造構造部分(b)を拡大したものが図8(b)である。このマイクロチップ41は図7(a)に示されたマイクロチップ24と、形状及び微量液体秤取構造の配設個数を除けば、基本的に概ね同一である。
このマイクロチップに形成されている微量液体秤取構造において、第1液体供給チャネル(第1の流路)33には第1の液体(タンパク質溶液)を秤取するための第1秤取チャネル(第3の流路)36が7つ接続され、その7箇所それぞれに、第1狭隘チャネル(第4の流路)38が接続され、該第1狭隘チャネル38は混合チャネル(第2の流路)34に開口している。7箇所それぞれに形成されている混合チャネル(第2の流路)34には、第2の液体(沈殿剤溶液)を秤取するための、第2液体供給チャネル35、第2秤取チャネル37及び第2狭隘チャネル39よりなる流路構造が接続されている。
次に、上記した過剰のグルコースイソメラーゼ溶液を除去する際の圧力よりもさらに高い陽圧を用いて空気をポート28より第1液体供給チャネル33内に流通させ、秤取されたグルコースイソメラーゼ溶液を混合チャネル34に流出させた。
実施例1と同様のチップを用い、また試薬はすべて実施例1と同一のものを用いて実験を行った。
まず、第1の液体(タンパク質溶液)を秤取するため、ポート28から第1液体供給チャネル33に、陽圧を用いて、水中に20mg/mLの濃度となるように調整したグルコースイソメラーゼ(Hampton Research社 HR7-102)の溶液を充填した。さらに空気を陽圧下で流通させることにより、ポート30を介して第1液体供給チャネル33より過剰のグルコースイソメラーゼ溶液を除去し、第1の液体(タンパク質溶液)を秤取するための第1秤取チャネル36の全7箇所にグルコースイソメラーゼ溶液を秤取した。
次に、100mMの濃度のMESバッファ(PH6.5)中に、PEG8000が10%、MgCl2が200mMになるように調整した沈殿剤溶液を、ポート28から第1液体供給チャネル33に陽圧を用いて充填した。この結果、第1液体供給チャネル33の第1秤取チャネル36の開口部において、グルコースイソメラーゼ溶液と沈殿剤溶液は接触した。
このチップを、実体顕微鏡で観察したところ、グルコースイソメラーゼ溶液と沈殿剤溶液の界面が存在したところ(第1液体供給チャネル33と第1秤取チャネル36との開口部)のグルコースイソメラーゼ溶液側(第1秤取チャネル36)および沈殿剤溶液側(第1液体供給チャネル33側)の液体中に結晶が観察された。特に、沈殿剤側の液体中に結晶が多く観察された。
11 溶離バッファー導入用ポート
12 溶離バッファー導入用ポート
13 ミキサー
14 マイクロチャネル
15 堰き止め部
16 PDMS 平板(上部)
17 PDMS 平板(下部)
18 ポート
19 第1の流路
20 第2の流路
21 第3の流路
22 第4の流路
23 第5の流路
24 50種類の微量2液混合反応用のマイクロチップ
25 上部基板
26 下部基板
27 チャネル
28 第1の液体の入口ポート
29 チャネル
30 第1の液体の出口ポート
31a 第2の液体の入口ポート
31b 第2の液体の出口ポート
32a ポート
32b ポート
33 第1液体供給チャネル
34 混合チャネル
35 第2液体供給チャネル
36 第1秤取チャネル
37 第2秤取チャネル
38 第1狭隘チャネル
39 第2狭隘チャネル
41 タンパク質の結晶化用マイクロチップ
100 液体(サンプル等)
100a 流路C内の液体の下端(流路Aの側)
100b 流路C内の液体の上端(流路Dの側)
200 液体(液クロの移動相等)
aa、aa’ 流路Aの流路壁
bb、bb’ 流路Bの流路壁
c1 流路Cの開口部(流路Aの側)
c2 流路Cの開口部(流路Dの側)
d1 流路Dの開口部(流路Bの側)
e1 流路Eの開口部(流路Dの側)
Claims (3)
- 微量液体秤取構造を用いるタンパク質の結晶化方法であって、
該微量液体秤取構造は、それぞれ所定の方向に延長される第1の流路(流路A)ならびに第2の流路(流路B)と、前記第1の流路(流路A)の流路壁に開口する第3の流路(流路C)と、前記第2の流路(流路B)の流路壁に開口して前記第3の流路(流路C)の一端と前記第2の流路を連結し、前記第3の流路(流路C)よりも相対的に毛管引力が働きにくい性質を有し他の3本の流路より細い第4の流路(流路D)を有し、前記第1の流路に導入された液体が、前記第1の流路の流路壁において開口する前記第3の流路の開口部を介して前記第3の流路内に引き込まれた後、前記第1の流路に残存する前記液体を取り除き、前記第3の流路の容積に応じた体積の液体を秤取することを特徴とし、且つ、
該方法は、
(a)第1の流路にタンパク質溶液もしくは沈殿剤溶液を導入し、前記第1の流路に開口する第3の流路の開口部を介して前記第3の流路に前記タンパク質溶液もしくは沈殿剤溶液が引き込まれた後、前記第1の流路に残存する前記タンパク質溶液もしくは沈殿剤溶液を、前記第3の流路の開口部と接触しない位置まで移動させ、前記第3の流路の容積に応じた体積で作成されたタンパク質溶液もしくは沈殿剤溶液を第4の流路を介して前記第2の流路に流出させる工程と、
(b)第1の流路に沈殿剤溶液もしくはタンパク質溶液を導入し、前記第1の流路に開口する第3の流路の開口部を介して前記第3の流路に前記沈殿剤溶液もしくはタンパク質溶液が引き込まれた後、前記第1の流路に残存する前記沈殿剤溶液もしくはタンパク質溶液を、前記第3の流路の開口部と接触しない位置まで移動させ、前記
第3の流路の容積に応じた体積で作成された沈殿剤溶液もしくはタンパク質溶液を第4の流路を介して前記第2の流路に流出させ、タンパク質溶液と沈殿剤溶液とを第2の流路中で接触・合一させる工程と、
(c)第2の流路中で合一させたタンパク質および沈殿剤溶液中からのタンパク質結晶を析出させる工程を含むことを特徴とする。 - 合一させたタンパク質および沈殿剤溶液中からのタンパク質結晶の析出が、該溶液と離れた流路構造中に沈殿剤溶液が配置されている状態で行われることを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 微量液体秤取構造を用いるタンパク質の結晶化方法であって、
該微量液体秤取構造は、それぞれ所定の方向に延長される第1の流路(流路A)ならびに第2の流路(流路B)と、前記第1の流路(流路A)の流路壁に開口する第3の流路(流路C)と、前記第2の流路(流路B)の流路壁に開口して前記第3の流路(流路C)の一端と前記第2の流路を連結し、前記第3の流路(流路C)よりも相対的に毛管引力が働きにくい性質を有し他の3本の流路より細い第4の流路(流路D)を有し、前記第1の流路に導入された液体が、前記第1の流路の流路壁において開口する前記第3の流路の開口部を介して前記第3の流路内に引き込まれた後、前記第1の流路に残存する前記液体を取り除き、前記第3の流路の容積に応じた体積の液体を秤取することを特徴とし、且つ、
該方法は、
(a)第1の流路にタンパク質溶液を導入し、前記第1の流路に開口する第3の流路の開口部を介して前記第3の流路に前記タンパク質溶液が引き込まれた後、前記第1の流路に残存する前記タンパク質溶液を、前記第3の流路の開口部と接触しない位置まで移動させ、前記第3の流路の容積に応じた体積でタンパク質溶液を作成する工程と、
(b)第1の流路に沈殿剤溶液を導入し、タンパク質溶液と沈殿剤溶液とを第3の流路の開口部において接触させ、タンパク質溶液と沈殿剤溶液とを合一させる工程と、
(c)合一させたタンパク質および沈殿剤溶液中からのタンパク質結晶を析出させる工程を含むことを特徴とする。
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