JP3901684B2 - 神経芽腫の体液による検査方法 - Google Patents
神経芽腫の体液による検査方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP3901684B2 JP3901684B2 JP2003401867A JP2003401867A JP3901684B2 JP 3901684 B2 JP3901684 B2 JP 3901684B2 JP 2003401867 A JP2003401867 A JP 2003401867A JP 2003401867 A JP2003401867 A JP 2003401867A JP 3901684 B2 JP3901684 B2 JP 3901684B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- gene
- mycn
- neuroblastoma
- dna
- ratio
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
Science, 224: 1121-1124, 1984 N. Engl. J. Med., 313: 111-1116, 1985 J. Pediatr. Hematol. Oncol., 19: 93-101, 1997 J. Clin. Oncol., 11: 1466-1477, 1993 Eur. J. Cancer, 33: 2113-2116, 1997 Cancer, 86: 364-372, 1999 Cancer, 51: 2116-2120, 1983 Clin. Cancer Res., 5: 2689-2692, 1999 Clin. Cancer Res., 5: 2297-2303, 1999 Cancer Res., 59: 3251-3256, 1999 Cancer Res., 62: 3646-3648, 2002
被験者由来の体液中に含まれる、MYCN遺伝子およびN- アセチルグルコサミンキナーゼ(NAGK)遺伝子を検出する工程、
該NAGK遺伝子に対する該MYCN遺伝子の量比を算出する工程、ならびに
該量比に基づいて被験者の状態を決定する工程、
を含むことを特徴とする。
被験者は、特に限定されるものではないが、新生児から7歳くらいまでの小児が主な対象であり、思春期から成人までをも対象とする。本発明の決定方法を行なう前に、または本決定方法と同時に他の診断方法により予備的な検査を行なってもよい。
前記工程(1) で検出したMYCN遺伝子(M)および対照遺伝子(N)の量から、M/Nを算出する。例えば、対照遺伝子としてNAGK遺伝子を選択し、MYCN遺伝子の増幅がない場合、血清M/Nは約1.0であり、悪性度の高い進行した神経芽腫の場合、血清M/Nは約100〜800程度までになる。好ましいカットオフ値は、2.0〜2.2である。
本工程において、前記工程(2) で算出した対照遺伝子に対するMYCN遺伝子の量比に基づいて被験者の状態を決定することができる。
本診断方法を用いて、初期のステージの患者の場合でも有意な量のゲノムDNAが体液から検出されうることが実施例により示されている。したがって、本診断方法は、MYCN遺伝子の増幅を有する患者は、初期ステージから進行したステージまでスクリーニングすることができ、一次スクリーニングとして有用である。
本診断方法を用いて、第2染色体数の変動の影響を受けることなく、体液中のDNAにおけるM/N比を評価することにより腫瘍DNAにおけるMYCN遺伝子の増幅を検出することができる。本診断方法を用いることにより、バイオプシまたは腫瘍の切除に先立つ診断時においてMYCN遺伝子のコピー数を予測することが可能になる。
本診断方法を用いて、MYCN遺伝子の増幅を有する同一患者の治療前の体液と治療後の体液とを比較し、治療前におけるM/N比と治療後におけるM/N比とを比較して有意に低下した場合、治療が成功したことを示す。したがって、本診断方法は、神経芽腫の治療成績の判定に使用することができる。
本診断方法を用いて、MYCN遺伝子の増幅を有する治療中の患者を経過観察することができる。治療前のM/N比と対比しながら検査し、値が有意に低下した時点から治療効果を奏していることが示唆される。したがって、本診断方法は、神経芽腫の予後の判定に使用することができる。
本診断方法により初期のステージの患者を検出することができることから、MYCN増幅患者が緩解した後のフォローアップにおいて再発の初期検出にも有用である。
1.試料の調製
京都府立医科大学病院で神経芽腫と診断された53名の患者は、各患者からのインフォームドコンセントを得て本研究で登録されたものである。腫瘍検体は、外科的に切除して直ちに−80℃で保存した。末梢血は、手術前に各患者から採取した。また、血液試料は、15名の非担癌小児からインフォームドコンセントを得て、正常対照物として採取した。血清は、凝固させた後1000gで10分間遠心分離することにより調製し、使用するまで−20℃で保存した。
リアルタイム定量PCRは、ABI Prism(登録商標)5700シークエンスディテクションシステム(Applied Biosystems製)でTaqMan(登録商標)法により行なった。TaqMan(登録商標)ユニバーサルPCRマスターミックス(Applied Biosystems製)、200nmol/lの各プローブ、および100nmol/lのフルオロジェンプローブを含むPCR混合物を用いて、Clin. Chem., 43:752-758, 1997 に記載の方法に準じて行なった。MYCN配列に加えて、染色体2p12に位置するN−アセチルグルコサミンキナーゼ遺伝子(NAGK: GenBank accession No.NM_017567)をシングルコピー対照遺伝子として同時に測定した。
MYCN-forward, 5 ’-GTGCTCTCCAATTCTCGCCT-3 ’(配列番号:2)
MYCN-reverse, 5 ’-GATGGCCTAGAGGAGGGCT-3’ (配列番号:3)
MYCN-probe, 5 ’ FAM-CACTAAAGTTCCTTCCACCCTCTCCT-TAMRA 3 ’ (配列番号:4) 。
NAGK-forward, 5 ’-TGGGCAGACACATCGTAGCA-3 ’(配列番号:5)
NAGK-reverse, 5 ’-CACCTTCACTCCCACCTCAAC-3’(配列番号:6)
NAGK-probe, 5 ’ VIC-TGTTGCCCGAGATTGACCCGGT-TAMRA-3 ’(配列番号:7)。
1.血清DNA中のM/N比を測定することによる腫瘍中のMYCNの状態の予測(図1)
図1は、様々な患者におけるM/N比の分布をグラフ化したものである。MYCNが増幅した神経芽腫患者(平均±SE:300.05±68.25)は、MYCNが増幅していない神経芽腫患者(1.01±0.12、p<0.005)および非担癌患者(0. 99±0. 10,p<0. 005)と比べて血清M/N比が有意に高い。差は、Welchのt−検定で分析した。MYCNが増幅していない神経芽腫患者と非担癌小児との間では、血清M/N比に有意差はなかった(p>0. 5、Studentのt検定による)。カットオフ値2.11は、非担癌の平均+3SDで決定した。MYCNが増幅していない42例の神経芽腫患者のうち5例 (11. 9%)は、前記カットオフ値を若干超える高い血清M/N比であることが明らかになった。
図2では、MYCN増幅患者における血清DNAと腫瘍DNAとの間のM/N比の関係を示し、直線回帰分析により評価した。血清DNAのM/N比と腫瘍DNAのM/N比との間には有意な相関があった(r2 =0. 548、p<0. 001) 。MYCN増幅を有するステージ1患者の血清M/N比は、腫瘍M/N比と比べて相対的に低かった(188. 9対521. 6)。しかしながら、前記血清M/N比は、診断の時点でMYCNが増幅していない患者と区別するには十分高い値であった。
治療開始後に適時複数の時点で血清試料を利用可能な5名の患者(MYCN増幅あり)において、血清M/N比を引き続いて分析した。完全緩解した3名の患者(症例1〜3)において、血清M/N比は正常範囲まで低下し、11年間完全緩解にある1名の患者(症例3)においては、再発を示す有意な上昇もなく一貫して低かった(図3A〜C)。対照的に、完全緩解を達成することに失敗し、その後に腫瘍が治療に耐性を示すようになった1名の患者(症例4)は、血清M/N比が正常範囲まで低下せず、死に至るまで有意な高レベルを保持した(図3D)。
Claims (3)
- 被験者由来の体液中に含まれる、MYCN遺伝子およびN- アセチルグルコサミンキナーゼ(NAGK)遺伝子を検出する工程、
該NAGK遺伝子に対する該MYCN遺伝子の量比を算出する工程、ならびに
該量比に基づいて被験者の状態を決定する工程、
を含むことを特徴とする、神経芽腫の体液による検査方法。 - 前記体液が血清である請求項1に記載の方法。
- 前記検出工程が、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により行われる請求項1または2のいずれかに記載の方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2003401867A JP3901684B2 (ja) | 2003-12-01 | 2003-12-01 | 神経芽腫の体液による検査方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2003401867A JP3901684B2 (ja) | 2003-12-01 | 2003-12-01 | 神経芽腫の体液による検査方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2005160354A JP2005160354A (ja) | 2005-06-23 |
JP3901684B2 true JP3901684B2 (ja) | 2007-04-04 |
Family
ID=34725653
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2003401867A Expired - Fee Related JP3901684B2 (ja) | 2003-12-01 | 2003-12-01 | 神経芽腫の体液による検査方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP3901684B2 (ja) |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2007074707A1 (ja) * | 2005-12-26 | 2007-07-05 | Riken | ARID3bを標的とした神経芽腫の治療剤 |
JP2009005621A (ja) * | 2007-06-28 | 2009-01-15 | Fujifilm Corp | 神経芽腫の悪性度を含めた検出方法、及び抑制方法 |
JP2010099039A (ja) * | 2008-10-27 | 2010-05-06 | Fujifilm Corp | 神経芽腫の検出方法 |
JP2013138613A (ja) * | 2010-04-06 | 2013-07-18 | Kyoto Prefectural Public Univ Corp | 血液由来検体を用いた神経芽腫の遺伝子異常検出方法 |
-
2003
- 2003-12-01 JP JP2003401867A patent/JP3901684B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2005160354A (ja) | 2005-06-23 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN109825586B (zh) | 用于肺癌检测的DNA甲基化qPCR试剂盒及使用方法 | |
JP6864089B2 (ja) | 進行性胃癌患者の手術後の予後または抗癌剤適合性予測システム | |
CN106662543B (zh) | 肺癌患者中的非侵入性基因突变检测 | |
JP6606554B2 (ja) | Y染色体のメチル化部位を前立腺ガンの診断用マーカとする使用 | |
KR20100016525A (ko) | 녹내장 진행 리스크의 판정 방법 | |
WO2017112738A1 (en) | Methods for measuring microsatellite instability | |
JP3901684B2 (ja) | 神経芽腫の体液による検査方法 | |
CN101883864B (zh) | 用在癌症检测中的约12317-16254残基之间的线粒体dna缺失 | |
US20220340977A1 (en) | Kits and methods for testing for lunch cancer risks, and diagnosis of disease and disease risk | |
KR20210069431A (ko) | 백혈병 진단용 프라이머 세트 및 이를 이용한 백혈병 진단 방법 | |
KR102553088B1 (ko) | 막성사구체신염 진단용 바이오마커 조성물 및 이의 용도 | |
KR102498098B1 (ko) | 특발성 신증후군 진단용 바이오마커 조성물 및 이의 용도 | |
CN102690881B (zh) | 用于快速恒温基因突变检测的聚合酶链反应方法 | |
WO2022210783A1 (ja) | 甲状腺濾胞癌特異的マーカー | |
WO2022019326A1 (ja) | 脳腫瘍の検出を補助する方法 | |
US20240150849A1 (en) | MicroRNAs AS BIOMAKERS FOR THE IN VITRO DIAGNOSIS OF GLIOMA | |
KR101365810B1 (ko) | Gus-bcr-abl 융합 유전자를 포함한 정량분석용 표준 플라스미드 및 이를 이용한 bcr-abl 유전자의 정량분석 방법 | |
WO2022014670A1 (ja) | 膵臓がんのバイオマーカーとしてのマイクロrnaの使用 | |
US9512484B2 (en) | Methods for determining a prognosis for survival for a patient with breast cancer | |
CN106834491B (zh) | 乳腺癌预后相关基因突变检测试剂盒及其使用方法 | |
CN106520957B (zh) | Dhrs7易感snp位点检测试剂及其制备的试剂盒 | |
KR20240006745A (ko) | 지방간 질환 진단용 바이오마커 조성물 및 이의 용도 | |
Wong et al. | microRNA and mRNA expression networks in Duchenne muscular dystrophy | |
Sasayama et al. | PATH-44. MULTIPLE BIOMARKER ALGORITHM BASED ON CXCL13, IL-10, IL-2 RECEPTOR, AND β2-MICROGLOBULIN IN CEREBROSPINAL FLUID TO DIAGNOSE CENTRAL NERVOUS SYSTEM LYMPHOMA | |
KR101325322B1 (ko) | Bcr-bcr-abl 융합 유전자를 포함한 정량분석용 표준 플라스미드 및 이를 이용한 bcr-abl 유전자의 정량분석 방법 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20060203 |
|
A871 | Explanation of circumstances concerning accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A871 Effective date: 20060616 |
|
A975 | Report on accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971005 Effective date: 20060705 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20060727 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20060920 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20061218 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20061226 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 3901684 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20100112 Year of fee payment: 3 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20130112 Year of fee payment: 6 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20130112 Year of fee payment: 6 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20160112 Year of fee payment: 9 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |