JP3469504B2 - マイクロアレイチップ及びそのインデックス方法 - Google Patents

マイクロアレイチップ及びそのインデックス方法

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Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】
【発明の属する技術分野】本発明は、特定のＤＮＡやタ
ンパク質等と特異的にハイブリダイズするＤＮＡなどの
生体高分子を多数スポット配列したマイクロアレイチッ
プ、及びそのマイクロアレイチップを識別するためのイ
ンデックス方法に関する。
【０００２】
【従来の技術】分子生物学の分野では、ＤＮＡやタンパ
ク質などの生体高分子を高密度に固定化したバイオチッ
プに代表されるマイクロアレイチップが近年急速に注目
を集めている。マイクロアレイチップを用いた実験にお
いては、膨大な種類の試料（サンプル）を固定化した支
持体（チップ）を大量に複製し、それぞれのチップ上の
サンプルを、調査対照の試料（ターゲット）と反応させ
る。１回の実験により１チップ上のサンプル間における
反応の違いを、また、条件の異なる実験を繰り返すこと
によって複数チップ間の同じサンプル集合の間における
反応の違いを検出することができる。
【０００３】ところで、マイクロアレイチップを用いた
実験においてはチップ上に固定した膨大な種類のサンプ
ルの情報管理が必要である。マイクロアレイチップの作
成方法としては、ウェルに調整したサンプルをスポッタ
（アレイヤ）を用いてスライドガラス等の支持体上に固
定化する方法と、半導体製造技術を応用して支持体上で
サンプルを合成する方法が実用化されており、何れの方
法においても、マイクロアレイチップ作成時にサンプル
情報（どのサンプルをチップ上のどの位置に固定化する
か）をデータとして用意している。
【０００４】マイクロアレイチップを使った実験では、
実験結果は、チップ上に固定化されたサンプル群中の一
部サンプルの発色として検出される。発色の検出におい
ては、マイクロアレイチップ作成時に用意されたサンプ
ル情報を元に、「どのサンプルがどの位の強度で発色し
ているか」を記録する。そして、サンプル間及びチップ
間における発色したサンプル集合の差を分析することに
より目的とする情報を得る。
【０００５】ところで、マイクロアレイチップ自体の形
状はどれも同じであるため、外観から個々のマイクロア
レイチップを識別することはできず、チップ上に固定化
してあるＤＮＡの種類を判別することもできない。その
ため、図７に示すように、マイクロアレイチップ１００
上のサンプル領域１０１の外側にインデックスとして英
数字や記号を印刷したり、バーコードを付することによ
り、そのマイクロアレイチップに対して使用すべきサン
プル情報を特定する方法が考えられている。
【０００６】
【発明が解決しようとする課題】各マイクロアレイチッ
プに対して使用すべきサンプル情報を特定するためにチ
ップのサンプル領域の外側に英数字や記号を印刷する方
法、あるいはバーコードを印刷する方法は、英数字や記
号あるいはバーコードをチップ上に印刷する（または張
り付ける）ための仕組みが必要である。また、マイクロ
アレイチップの利用に際しては、チップ上に印刷された
文字やバーコード等を読み取って情報処理システムに知
らせる仕組み（もしくは人が入力するインターフェー
ス）を用意する必要がある。そのため、文字あるいはバ
ーコード読取り装置などの装置コストの問題があり、ま
たマニュアル入力の場合には入力間違い等の問題があっ
た。
【０００７】本発明は、このような従来技術の問題点に
鑑み、文字やバーコード等を用いることなく使用すべき
サンプル情報を特定することのできるマイクロアレイチ
ップを提供することを目的とする。本発明は、また、文
字やバーコード読取り装置などサンプル情報読み取り用
の専用装置を必要とすることなくマイクロアレイチップ
に使用すべきサンプル情報を特定することのできるマイ
クロアレイインデックス方法を提供することを目的とす
る。本発明は、さらに、マイクロアレイチップ上のサン
プル情報管理及び実験情報利用を自動化することのでき
るマイクロアレイインデックス方法を提供することを目
的とする。
【０００８】
【課題を解決するための手段】本発明は、マイクロアレ
イチップ上に配置されるスポット（サンプルスポット）
の一部の配列をサンプル情報管理用のインデックス（マ
イクロアレイインデックス）として利用することによ
り、前記目的を達成するものである。本発明において
は、サンプル自身をインデックスとすることにより、マ
イクロアレイチップの読み取り操作において、サンプル
情報と同時にインデックスを取得することが可能であ
り、インデックス読み取りのための特別な装置を用意す
る必要はない。
【０００９】すなわち、本発明によるマイクロアレイチ
ップは、所定の位置関係をもって配置された複数のスポ
ットを備えるマイクロアレイチップにおいて、複数のス
ポットの一部は当該マイクロアレイチップを特定するた
めのインデックス情報を構成するスポットであることを
特徴とする。
【００１０】本発明によるマイクロアレイチップは、ま
た、所定の位置関係をもって配置された複数のサンプル
スポットを備えるマイクロアレイチップにおいて、当該
マイクロアレイチップを特定するインデックス情報を構
成するためのスポットがサンプルスポットと並んで配置
されていることを特徴とする。マイクロアレイインデッ
クスを構成するスポットには、目視可能な色素を予め混
入しておくことにより、実験前のインデックス確認及び
サンプル領域とインデックス領域の位置合わせ、チップ
読取の方向確認を可能とするのが望ましい。
【００１１】ウェルに調整したサンプルをスポッタ（ア
レイヤ）を用いてスライドガラス等の支持体上に固定化
する方法により作成されるマイクロアレイチップの場合
は、予め発光物資の結合したサンプル、もしくは、マイ
クロアレイチップ実験において発光物質のサンプルスポ
ット上への集積が確実であるインデックススポット用サ
ンプルを、スポッタにより固定化する。半導体製造技術
を応用して支持体上でサンプルを合成する方法でマイク
ロアレイチップを作成する場合には、マイクロアレイチ
ップ実験において発光物質のサンプルスポット上への集
積が確実であるサンプルを支持体上に合成する。
【００１２】このように、インデックス情報を構成する
ためのスポットは検出用色素を含有するスポットと含有
しないスポットからなり、検出用色素の含有の有無によ
ってインデックス情報を構成することができる。ハイブ
リダイゼーション反応で蛍光標識等として用いられる検
出用色素は、ハイブリダイゼーション反応前にインデッ
クススポットに予め含有させておいてもよいし、ハイブ
リダイゼーション反応の結果、ターゲットに由来して含
有されるものであってもよい。マイクロアレイインデッ
クスとして固定化するサンプルを、予め検出用色素でラ
ベルしておくことにより、ターゲットとの反応実験前の
マイクロアレイチップにおいても、インデックスの利用
が可能となる。
【００１３】マイクロアレイチップ読取装置によるマイ
クロアレイチップイメージ読取において、マイクロアレ
イチップ上のインデックス情報はサンプル情報と同時に
読み取られる。予め予約した場所にマイクロアレイイン
デックスを用意することにより、反応が終了したマイク
ロアレイチップの読み取りイメージよりマイクロアレイ
インデックスが取得される。
【００１４】本発明によるマイクロアレイチップのイン
デックス方法は、所定の位置関係をもって配置された複
数のスポットを備えるマイクロアレイチップを特定する
ためインデックス方法において、複数のスポットの一部
をインデックスのための情報を保持するために用いるこ
とを特徴とする。
【００１５】本発明によるマイクロアレイチップのイン
デックス方法は、また、所定の位置関係をもって配置さ
れた複数のスポットを備えるマイクロアレイチップを特
定するためインデックス方法において、複数のスポット
の一部をインデックス情報を保持するためのインデック
ススポットとし、インデックススポットに検出用色素が
含有されているか否かを検出してインデックス情報を再
生することを特徴とする。
【００１６】マイクロアレイチップを用いた実験におい
て発色物質のサンプルスポット上への集積が確実である
サンプルを支持体上に固定化、あるいは、合成する方法
では、マイクロアレイインデックスを構成する発色スポ
ットには、一連の実験において調査対象の試料中に確実
に存在する物質（発色色素で標識）と反応する物質、あ
るいは、調査対象の試料中に添加した発色色素で標識し
た物質と反応する物質を支持体上に固定化、または、合
成するすることにより、確実なスポット検出を行う。
【００１７】また、パリティスポットを設定してスポッ
ト検出エラー回避を行うことが可能である。例えば、イ
ンデックス情報の再生に際して、インデックススポット
の検出情報を２次元の行列に再配列し、再配列された２
次元行列の一部のスポット情報をパリティ情報として利
用する。また、必要に応じて、サンプル領域の２ヵ所に
２重化してマイクロアレイインデックスを作成すること
により、スポット検出エラーを回避することも可能であ
る。
【００１８】また、マイクロアレイインデックスをイン
デックスとしたデータベースを構築し、マイクロアレイ
チップの情報（作成日時、マイクロアレイチップ上のス
ポット配置情報、実験条件など）や、チップ上のサンプ
ル情報（サンプルインデックス、実験測定情報など）を
格納する。また、サンプル情報（パブリックデータベー
スへのインデックス、遺伝子名、配列定義機能、遺伝子
配列など）を格納し、サンプルインデックスによってチ
ップ上のサンプル情報とリンクする。そして、マイクロ
アレイチップ読み取りイメージより得られたマイクロア
レイインデックスによりマイクロアレイチップ実体とデ
ータベース中の情報とをリンクすることにより、データ
ベースへの測定情報の自動的な挿入を可能とする。
【００１９】すなわち、サンプル情報レコードとマイク
ロアレイチップマスターレコードとチップ上サンプル情
報レコードとを格納したデータベースを構築する。サン
プル情報レコードにはサンプルインデックスをマスター
インデックスとしてサンプルについての情報が記録さ
れ、マイクロアレイチップマスターレコードにはマイク
ロアレイインデックスをマスターレコードとしてマイク
ロアレイチップについての情報が記録され、チップ上サ
ンプル情報レコードにはマイクロアレイインデックスと
マイクロアレイチップ上のスポット位置と当該位置にス
ポットされたサンプルのサンプルインデックスと当該ス
ポットの測定情報が記録される。マイクロアレイチップ
はインデックススポットに保持されるマイクロアレイイ
ンデックスによりマイクロアレイチップマスターレコー
ドにリンクすると共にチップ上サンプル情報レコードに
リンクし、チップ上サンプル情報レコードはサンプルイ
ンデックスによってサンプル情報レコードにリンクす
る。
【００２０】
【発明の実施の形態】以下、図面を参照して本発明の実
施の形態を説明する。図１は、本発明によるマイクロア
レイインデックスを設けたマイクロアレイチップの一例
を示す概略図である。マイクロアレイチップ１０は、図
１（ａ）に概略を示すように、スライドガラスやナイロ
ン、ニトロセルロースメンブレンなどの支持体（チッ
プ）１１上にサンプル領域１２が設定されている。サン
プル領域１２には、図１（ｂ）に示すように、図示しな
いウェルに調整したＤＮＡやタンパク質などの生体高分
子をスポッタ（アレイヤ）を用いてチップ１１上にスポ
ットする方法により、サンプルスポット１５が２次元ア
レイ状に高密度に形成されたマイクロアレイ１６を有す
る。２次元アレイ状に配列されてマイクロアレイ１６を
構成するサンプルスポット１５の一部は、後述するよう
にマイクロアレイインデックス１７として利用される。
【００２１】図２は、本発明に従って情報量１２８ビッ
トのマイクロアレイインデックス１７を設けたマイクロ
アレイ１６の例を示している。この例では、１ｍｍあた
り４点のスポットで、縦横２０ｍｍのサンプル領域１２
に配置された８１×８１スポットからなるマイクロアレ
イ１６の縦１列をマイクロアレイインデックス１７とし
て利用する。従って、インデックスのために８１個のス
ポットが利用可能であり、各スポットに発光色素又はマ
イクロアレイチップを用いた実験により発光色素の集積
が可能なサンプルを固定化する／しないにより、８１ビ
ットのＯＮ／ＯＦＦ情報を作り出すことができる。そし
て、サンプルの発色に２色の発光色素（例えば、Ｃｙ３
とＣｙ５）を用いることにすると、マイクロアレイチッ
プ読取装置で混在する２色の発光色素由来の発光成分を
分離することが可能であるため、それぞれの色成分に対
して８１個のスポットが利用可能である。結局、この方
法によると、インデックスのために８１×２＝１６２ビ
ットの情報を利用することができる。
【００２２】図３は、図２に示したマイクロアレイ１６
中の８１個のインデックス用スポットとインデックス情
報との間の対応関係の一例を説明する図である。この例
では、８１個のインデックススポットを特定位置のスポ
ットのエラーが検出可能なパリティを効率よく構成する
ために、図３（ａ）に示すように、９×９のグリッド２
３に再配置する。そして、再配置した９×９のグリッド
の右端の縦１列及び下端の横１列をパリティスポット２
７として用い、インデックス情報には残りの部分のスポ
ット２６を宛てる。インデックススポット２６は８×８
＝６４スポット（６４ビット）となる。
【００２３】各スポットは２種類の発光色素Ａ，Ｂによ
って情報が付与されるため、色素Ａによって図３（ｂ）
に示す８×８＝６４スポット（６４ビット）の情報２４
が付与され、色素Ｂによって図３（ｃ）に示す８×８＝
６４スポット（６４ビット）の情報２５が付与されるこ
とになる。ここで、パリティーは、各色素による情報毎
にインデックススポット２６の各列、各行毎に、例えば
スポットのＯＮの数が奇数ならＯＮ、偶数ならＯＦＦと
する。また、右下端の１スポットは、インデックス部分
全体でスポットのＯＮの数が奇数ならＯＮ、偶数ならＯ
ＦＦとする。以上の方法により、信頼性の高い６４ビッ
トのインデックスを構成することが可能であり、２色の
発光色素の利用により１２８ビットのインデックスを構
成することができる。
【００２４】図４は、インデックス用スポットの配置の
他の例を説明する図である。図４（ａ）は、インデック
ススポットをマイクロアレイ１６中に分散配置した例で
ある。この例では、インデックススポットを９個のスポ
ット群４１ａ〜４１ｉに分割して、マイクロアレイ１６
中の既知の位置に分散配置した。スポット群４１ａ〜４
１ｉを配置するマイクロアレイ１６中の場所は、その場
所が既知でさえあれば配置に特に規則性が無くても構わ
ない。これらのスポット群は、図３に示すように再配置
することでインデックス情報を構成する。図４（ｂ）
は、サンプルスポットからなるマイクロアレイ１６の外
側にインデックス用のスポット列４２を設けたものであ
る。インデックス用のスポット列４２は１列とは限らず
複数列設けてもよい。またマイクロアレイ１６の両側に
インデックス用のスポット列を設けてもよい。
【００２５】図４（ｃ）は、インデックススポットの列
を２列設けた例である。マイクロアレイ１６の左端に設
定したインデックススポット列４３ａと中程に設定した
インデックススポット列４３ｂは、足し合わせて１つの
インデックスを構成してもよいし、２つのスポット列４
３ａ，４３ｂに同じ情報を担持させて一方を検証用とし
てもよい。図４（ｄ）は、図４（ｃ）と同様の機能を有
する２列のインデックススポット列４４ａ，４４ｂをマ
イクロアレイ１６の両端に設けた例を示している。
【００２６】図５は、インデックス用スポットの配置の
更に他の例を説明する図である。図５（ａ）及び図５
（ｂ）における例では、円形のマイクロアレイチップ上
の個々のサンプルスポットは同心円状に配置されてお
り、マイクロアレイは全体として円形をなしている。マ
イクロアレイ上の各サンプルスポットは、マイクロアレ
イの中心からの距離（半径）で決定されるレコード５３
と、回転開始位置決定マーカ５２を基準として求められ
る回転角５４により特定可能であり、この様なマイクロ
アレイにおける幾つかのスポットをインデックススポッ
トとすることが可能である。図５（ａ）は、マイクロア
レイ５１ａの一番外側のレコード（レコード０）におけ
る回転角０°〜４５°の間の連続したスポット５５aを
インデックス用スポットとした例を示している。また、
図５（ｂ）は、マイクロアレイ５１ｂの一番外側のレコ
ード０における回転角角０°〜４５°の間の連続したス
ポット５５ｂ、及び回転角９０°〜１３５°の間の連続
したスポット５５ｃをインデックス用スポットとした例
を示している。
【００２７】図５（ｃ）に示した例では、個々のサンプ
ルスポットは、渦巻き状に、渦巻きのスタート位置を決
定するマーカ５７から等間隔に配置され、マイクロアレ
イ５１ｃは全体として円形をなしている。マイクロアレ
イ５１ｃ上の各サンプルスポットは、マーカ５７からの
距離により特定可能であり、この様なマイクロアレイに
おける幾つかのスポットをインデックススポットとする
ことが可能である。図５（ｃ）は、渦巻きのスタート位
置を決定するマーカ５７の直後の複数個のサンプルスポ
ット５８をインデックス用スポットとする例を示してい
る。
【００２８】図６は、マイクロアレイインデックスによ
るマイクロアレイチップとデータベースの情報リンクの
説明図である。マイクロアレイチップ情報データベース
６０中には、マイクロアレイチップ作成に利用可能なサ
ンプルの情報を、サンプルインデックス（i#smpid）を
マスターインデックスとするサンプル情報レコード６３
として格納しておく。サンプル情報レコード６３には、
サンプルの情報として、サンプルの種類に応じて、その
サンプルの情報を持つパブリックデータベース７０への
インデックス（acc#num）、遺伝子名／蛋白質名、生物
学的機能、遺伝子／アミノ酸配列などの情報を格納す
る。
【００２９】マイクロアレイチップ１０を作成するにあ
たり、マイクロアレイインデックス（例えば１２８ビッ
トのユニークな数値）を発行し、マイクロアレイチップ
情報データベース６０中に、マイクロアレイインデック
ス（r#aryid）をマスターインデックスとするマイクロ
アレイチップマスターレコード６１を追加する。マイク
ロアレイチップマスターレコード６１には、作成するマ
イクロアレイチップの情報（作成日付け、コメントな
ど）を格納し、また、後から得られるマイクロアレイチ
ップの実験条件などを格納するためのフィールドを設け
る。加えて、作成するマイクロアレイチップ上に固定化
するサンプルの数だけ、チップ上サンプル情報レコード
６２を生成し、同じマイクロアレイインデックスにより
リンク（６５）する。チップ上サンプル情報レコード６
２には、マイクロアレイチップ上の１サンプルの位置情
報を格納し、また、サンプルインデックスを格納するこ
とでサンプル情報レコードとリンク（６６）する。ま
た、後から得られるマイクロアレイチップ上の１サンプ
ルを対象としたマイクロアレイチップ実験測定情報など
を格納するためのフィールドを設ける。
【００３０】マイクロアレイチップ読取装置により、マ
イクロアレイチップ上に作成されたマイクロアレイイン
デックスと共に得られたマイクロアレイチップ実験結果
は、マイクロアレイインデックスによるリンク（６４）
により特定されたマイクロアレイチップマスターレコー
ド６１、及びマイクロアレイチップマスターレコードに
リンクしたチップ上サンプル情報レコード６２に自動的
に格納することが可能である。
【００３１】データベース６０より実験結果を参照する
際は、チップ上サンプル情報レコード６５にリンクした
サンプル情報レコード６３より、サンプルの詳細な情報
を得ることが可能である。サンプル情報レコード６３
は、マイクロアレイインデックスからは独立であるた
め、複数のマイクロアレイチップマスターレコード６１
より共用可能である。また、サンプル情報レコード６３
に格納されたパブリックデータベースへのインデックス
を介してパブリックデータベースにリンク（６７）し、
パブリックデータベース７０より広範な情報を得ること
が可能である。
【００３２】
【発明の効果】本発明によると、マイクロアレイチップ
利用における情報管理の自動化が可能となる。マイクロ
アレイチップ利用者は、マイクロアレイインデックスに
より、特別な機器を必要とせずに、マイクロアレイチッ
プの実験情報をマイクロアレイチップ作成時に用意され
た情報とリンクさせることが可能となる。
【図面の簡単な説明】
【図１】本発明によるマイクロアレイチップの一例を示
す概略図。
【図２】マイクロアレイインデックスを設けたマイクロ
アレイの例を示す図。
【図３】マイクロアレイ中のインデックス用スポットと
インデックス情報との間の対応関係の一例を説明する
図。
【図４】インデックス用スポットの配置の他の例を説明
する図。
【図５】インデックス用スポットの配置の他の例を説明
する図。
【図６】マイクロアレイインデックスによるマイクロア
レイチップとデータベースの情報リンクを説明する図。
【図７】従来のマイクロアレイインデックスの方法を説
明する図。
【符号の説明】
１０…マイクロアレイチップ、１１…支持体（チッ
プ）、１２…サンプル領域、１５…サンプルスポット、
１６…マイクロアレイ、１７…マイクロアレイインデッ
クス、２３…再配置されたインデックススポット、２４
…色素Ａによるインデックススポット、２５…色素Ｂに
よるインデックススポット、２６…インデックススポッ
ト、２７…パリティスポット、４１ａ〜４１ｉ…分割さ
れたインデックススポットのスポット群、４２…インデ
ックス用のスポット列、４３ａ，４３ｂ…インデックス
スポット列、４４ａ，４４ｂ…インデックススポット
列、５１ａ，５１ｂ…円形（同心円）マイクロアレイ、
５１ｃ…円形（渦巻き）マイクロアレイ、５２…回転開
始位置決定マーカ、５３…レコード０、５４…回転角、
５５ａ，５５ｂ，５５ｃ…インデックススポット列、５
７…渦巻きスタート位置決定マーカ、５８…インデック
ススポット列、６０…マイクロアレイチップ情報データ
ベース、６１…マイクロアレイチップマスターレコー
ド、６２…チップ上サンプル情報レコード、６３…サン
プル情報レコード、６４…マイクロアレイインデックス
によるマイクロアレイチップとマイクロアレイチップマ
スターレコードのリンク、６５…マイクロアレイインデ
ックスによるマイクロアレイチップマスターレコードと
チップ上サンプル情報レコードのリンク、６６…サンプ
ルインデックスによるチップ上サンプル情報レコードと
サンプル情報レコードのリンク、６７…パブリックデー
タベースのインデックスによるサンプル情報レコードと
パブリックデータベースのリンク、７０…パブリックデ
ータベース、１００…マイクロアレイチップ、１０１…
サンプル領域
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 渡辺 敏正 神奈川県横浜市中区尾上町６丁目81番地 日立ソフトウエアエンジニアリング株 式会社内 (72)発明者 吉井 淳治 神奈川県横浜市中区尾上町６丁目81番地 日立ソフトウエアエンジニアリング株 式会社内 (56)参考文献 特開 平11−44647（ＪＰ，Ａ) (58)調査した分野(Int.Cl.7，ＤＢ名) G01N 33/566 C12M 1/00 C12N 15/09 G01N 33/53

Claims (7)

    (57)【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 所定の位置関係をもって配置された複数
    のスポットを備えるマイクロアレイチップにおいて、 前記複数のスポットの一部は当該マイクロアレイチップ
    を特定するためのインデックス情報を構成するスポット
    であることを特徴とするマイクロアレイチップ。
  2. 【請求項２】 所定の位置関係をもって配置された複数
    のサンプルスポットを備えるマイクロアレイチップにお
    いて、 当該マイクロアレイチップを特定するインデックス情報
    を構成するためのスポットが前記サンプルスポットと並
    んで配置されていることを特徴とするマイクロアレイチ
    ップ。
  3. 【請求項３】 請求項１又は２記載のマイクロアレイチ
    ップにおいて、前記インデックス情報を構成するための
    スポットは検出用色素を含有するスポットと含有しない
    スポットからなり、前記検出用色素の含有の有無によっ
    てインデックス情報を構成していることを特徴とするマ
    イクロアレイチップ。
  4. 【請求項４】 所定の位置関係をもって配置された複数
    のスポットを備えるマイクロアレイチップを特定するた
    めのインデックス方法において、 前記複数のスポットの一部をインデックスのための情報
    を保持するために用いることを特徴とするマイクロアレ
    イチップのインデックス方法。
  5. 【請求項５】 所定の位置関係をもって配置された複数
    のスポットを備えるマイクロアレイチップを特定するた
    めのインデックス方法において、 前記複数のスポットの一部をインデックス情報を保持す
    るためのインデックススポットとし、前記インデックス
    スポットに検出用色素が含有されているか否かを検出し
    てインデックス情報を再生することを特徴とするマイク
    ロアレイチップのインデックス方法。
  6. 【請求項６】 請求項５記載のマイクロアレイチップの
    インデックス方法において、インデックス情報の再生に
    際して前記インデックススポットの検出情報を２次元の
    行列に再配列し、再配列された２次元行列の一部のスポ
    ット情報をパリティ情報として利用することを特徴とす
    るマイクロアレイチップのインデックス方法。
  7. 【請求項７】 請求項４，５又は６記載のマイクロアレ
    イチップのインデックス方法において、サンプル情報レ
    コードとマイクロアレイチップマスターレコードとチッ
    プ上サンプル情報レコードとを格納したデータベースを
    構築し、前記サンプル情報レコードにはサンプルインデ
    ックスをマスターインデックスとしてサンプルについて
    の情報を記録し、前記マイクロアレイチップマスターレ
    コードにはマイクロアレイインデックスをマスターレコ
    ードとしてマイクロアレイチップについての情報を記録
    し、前記チップ上サンプル情報レコードにはマイクロア
    レイインデックスとマイクロアレイチップ上のスポット
    位置と当該位置にスポットされたサンプルのサンプルイ
    ンデックスと当該スポットの測定情報を記録し、前記マ
    イクロアレイチップは前記インデックススポットに保持
    されるマイクロアレイインデックスにより前記マイクロ
    アレイチップマスターレコードにリンクすると共に前記
    チップ上サンプル情報レコードにリンクし、前記チップ
    上サンプル情報レコードはサンプルインデックスによっ
    て前記サンプル情報レコードにリンクすることを特徴と
    するマイクロアレイチップのインデックス方法。
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Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE10042797C2 (de) * 2000-08-30 2003-12-04 Basf Lynx Bioscience Ag Analysen-Chip
JP3596868B2 (ja) * 2000-11-24 2004-12-02 キヤノン株式会社 末端標識プローブアレイのプローブの量の評価方法、及び、該標識プローブアレイを用いた標的物質量の評価方法
US7776571B2 (en) * 2000-12-12 2010-08-17 Autogenomics, Inc. Multi-substrate biochip unit
US20030017455A1 (en) * 2001-01-29 2003-01-23 Webb Peter G. Chemical array fabrication with identity map
GB0109746D0 (en) * 2001-04-18 2001-06-13 Scient Generics Ltd Chemical libraries based on coded particles
CN100485032C (zh) 2001-05-11 2009-05-06 松下电器产业株式会社 生物分子基底,使用它的检验和诊断方法及装置
US20030231986A1 (en) * 2002-06-18 2003-12-18 Eastman Kodak Company Micro-array identification means
DE10233212B4 (de) * 2002-07-22 2006-07-06 Siemens Ag Messvorrichtung mit einer Biochip-Anordnung und Verwendung der Vorrichtung für ein Hochdurchsatzanalyseverfahren
US7141414B2 (en) * 2002-09-16 2006-11-28 Hewlett-Packard Development Company, L.P. Biosensor
US20040191815A1 (en) * 2003-01-15 2004-09-30 Motoki Kyo Array having oligonucleotides on a metal substrate
US20040229226A1 (en) * 2003-05-16 2004-11-18 Reddy M. Parameswara Reducing microarray variation with internal reference spots
US20050135964A1 (en) * 2003-12-22 2005-06-23 Ulrich Sieben Carrier medium for analyzing a substance
US20050049796A1 (en) * 2003-09-03 2005-03-03 Webb Peter G. Methods for encoding non-biological information on microarrays
ES2627048T3 (es) 2003-10-24 2017-07-26 Aushon Biosystems, Inc. Aparato y procedimiento para la dispensación de muestras fluidas, semisólidas y sólidas
JPWO2005056145A1 (ja) * 2003-12-12 2007-12-06 株式会社 ウイル・コーポレーション 生物学的チップおよびその利用
KR100624420B1 (ko) * 2004-04-10 2006-09-19 삼성전자주식회사 마이크로어레이에 대한 정보가 스팟의 형태로 저장되어있는 마이크로어레이, 그를 제조하는 방법 및 그를이용하는 방법
CN1280623C (zh) * 2004-07-16 2006-10-18 北京博奥生物芯片有限责任公司 一种用于荧光仪器校准测量的校准基片及其制备方法
JP2006105803A (ja) * 2004-10-06 2006-04-20 Hitachi High-Technologies Corp 生体試料物質の分析方法、分析装置、マイクロアレイ及びイムノアッセイ
DE102004056735A1 (de) 2004-11-09 2006-07-20 Clondiag Chip Technologies Gmbh Vorrichtung für die Durchführung und Analyse von Mikroarray-Experimenten
JP2006201119A (ja) * 2005-01-24 2006-08-03 Olympus Corp 固相担体
JP4654795B2 (ja) * 2005-06-28 2011-03-23 パナソニック株式会社 生体分子検出方法
EP2224227B1 (en) * 2008-01-16 2014-09-03 Nippon Telegraph and Telephone Corporation Surface plasmon resonance measuring device, sample cell, and measuring method
DE102009019476A1 (de) * 2009-05-04 2010-11-11 Biametrics Marken Und Rechte Gmbh Wiedererkennbarer Träger für optische Meßverfahren
WO2013013832A1 (en) * 2011-07-27 2013-01-31 Scienion Ag Labeled device

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE69233087T2 (de) * 1991-11-22 2003-12-24 Affymetrix Inc N D Ges D Staat Verfahren zur Herstellung von Polymerarrays
US5840485A (en) 1993-05-27 1998-11-24 Selectide Corporation Topologically segregated, encoded solid phase libraries
US5677197A (en) * 1994-11-14 1997-10-14 Hewlett-Packard Company Biochemical assay plate and method for making the same
US6660233B1 (en) * 1996-01-16 2003-12-09 Beckman Coulter, Inc. Analytical biochemistry system with robotically carried bioarray
US5763870A (en) * 1996-12-13 1998-06-09 Hewlett-Packard Company Method and system for operating a laser device employing an integral power-regulation sensor
US5812272A (en) * 1997-01-30 1998-09-22 Hewlett-Packard Company Apparatus and method with tiled light source array for integrated assay sensing
US6308170B1 (en) * 1997-07-25 2001-10-23 Affymetrix Inc. Gene expression and evaluation system
US6408308B1 (en) * 1998-01-29 2002-06-18 Incyte Pharmaceuticals, Inc. System and method for generating, analyzing and storing normalized expression datasets from raw expression datasets derived from microarray includes nucleic acid probe sequences
US6349144B1 (en) * 1998-02-07 2002-02-19 Biodiscovery, Inc. Automated DNA array segmentation and analysis
US6284465B1 (en) * 1999-04-15 2001-09-04 Agilent Technologies, Inc. Apparatus, systems and method for locating nucleic acids bound to surfaces
US6471916B1 (en) * 1999-11-09 2002-10-29 Packard Instrument Company Apparatus and method for calibration of a microarray scanning system
US6362004B1 (en) * 1999-11-09 2002-03-26 Packard Biochip Technologies, Llc Apparatus and method for using fiducial marks on a microarray substrate

Also Published As

Publication number Publication date
EP1192276B1 (en) 2005-08-17
WO2000073504A2 (en) 2000-12-07
DE60022043D1 (de) 2005-09-22
WO2000073504A3 (en) 2002-02-07
DE60022043T2 (de) 2006-06-14
US6869763B1 (en) 2005-03-22
EP1192276A2 (en) 2002-04-03
JP2000338110A (ja) 2000-12-08

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