JP3203237U - Portable DNA amplification device - Google Patents
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Abstract
【課題】迅速性が要求される検査にも十分に応えられるようにするとともに、検査対象を持ち帰る等の負担を排除し、何時でも何処でも誰でも使用可能にして利便性の大幅な向上を図る携帯用DNA増幅装置を提供する。【解決手段】ケース本体部5m及びこのケース本体部5mを密閉状に閉塞可能な開閉式のケース蓋部5cを有する携帯可能なケース5と、このケース5に収容又は付属する、バッテリ及び/又は電池,外部電源入力部6oの一方又は双方を有する電源機能部と、検査対象となる被検査液に対して最適化した温度変化パターンに係わるパターンデータを取込むデータ取込機能部と、パターンデータを格納するデータ格納部と、データ取込機能部から取込んだパターンデータをデータ格納部に書込処理する書込処理機能部とを備える。【選択図】図2[PROBLEMS] To make it possible to sufficiently respond to an inspection requiring quickness, to eliminate the burden of bringing back the object to be inspected, and to be used by anyone at any time and anywhere, and to greatly improve convenience. A portable DNA amplification device is provided. A portable case 5 having a case body portion 5m and an openable / closable case lid portion 5c capable of sealingly closing the case body portion 5m, and a battery and / or attached to or attached to the case 5. A power supply function unit having one or both of a battery and an external power supply input unit 6o, a data fetching function unit for fetching pattern data relating to a temperature change pattern optimized for a liquid to be inspected, and pattern data And a write processing function unit for writing pattern data fetched from the data fetch function unit into the data storage unit. [Selection] Figure 2
Description
本考案は、被検査液中における病原菌等のDNAを増幅する際に用いて好適な携帯用DNA増幅装置に関する。 The present invention relates to a portable DNA amplification apparatus suitable for use in amplifying DNA such as pathogenic bacteria in a test solution.
一般に、DNAを増幅する手法として、PCR法(ポリメラーゼ連鎖反応法)が知られている。PCR法は、DNA検体に対して当該DNA検体と反応させるプライマ,酵素及びデオキシリボヌクレオシド三リン酸を加え、この反応溶液(被検査液)を、所定の温度変化パターンを有する熱サイクルにより加熱(冷却)するとともに、この熱サイクルを繰り返すことによりDNAを増幅する手法であり、特許文献1には、このようなPCR法を実現する本出願人が既に提案したDNA増幅装置が開示されている。
In general, a PCR method (polymerase chain reaction method) is known as a method for amplifying DNA. In the PCR method, a primer, an enzyme, and deoxyribonucleoside triphosphate to be reacted with the DNA sample are added to the DNA sample, and the reaction solution (test solution) is heated (cooled) by a thermal cycle having a predetermined temperature change pattern. ) And a method of amplifying DNA by repeating this thermal cycle, and
このDNA増幅装置は、DNA検体を含む反応溶液を収容可能なセル部を有する処理ブロックと、この処理ブロックを加熱冷却するペルチェ素子を用いたサーモモジュールと、少なくともサーモモジュールに対する通電制御を行うコントローラを備えるDNA増幅装置であって、処理ブロックを、金属素材による上基板部と金属素材又はセラミックス素材による下基板部を固着してなる基盤部及びこの基盤部に支持されるセル部により構成し、セル部は、上基板部に設けた少なくともセル部を位置決めするセル位置決め部を介して上基板部及び/又は下基板部に固定するとともに、下基板部における少なくともセル部の下方に位置する部位の厚さを1.0〔mm〕以下に選定し、かつ基盤部の下面にサーモモジュールを当接させたものである。 This DNA amplification apparatus includes a processing block having a cell part capable of containing a reaction solution containing a DNA sample, a thermo module using a Peltier element that heats and cools this processing block, and a controller that controls at least energization of the thermo module. A processing block comprising a base part formed by fixing an upper substrate part made of a metal material and a lower substrate part made of a metal material or a ceramic material, and a cell part supported by the base part; The part is fixed to the upper substrate part and / or the lower substrate part via a cell positioning part for positioning at least the cell part provided in the upper substrate part, and the thickness of the part located at least below the cell part in the lower substrate part The thickness is selected to be 1.0 [mm] or less, and the thermo module is brought into contact with the lower surface of the base portion.
ところで、この種のDNA増幅装置は、試料遺伝子を増幅するため、温度,さらし時間及び変換点(変更タイミング)を設定した温度変化パターンを設定回数だけ繰り返す熱サイクルに基づく制御を行うとともに、一回に多数のセル部を処理することができることから、複数の試料遺伝子を同時に処理する際には能率的に行うことができる。一方、温度とさらし時間が未知の遺伝子(厳密には遺伝子とプライマの組合わせ)の場合、最適な温度とさらし時間を見つけるための確認試験も必要となり、この場合には、異なる温度,さらし時間及び繰り返し回数を設定した複数の条件(制御パターン)により試験を行い、この結果を対比して最適な温度条件等を見出している。 By the way, in order to amplify a sample gene, this type of DNA amplifying apparatus performs control based on a thermal cycle in which a temperature change pattern in which temperature, exposure time, and conversion point (change timing) are set is repeated a set number of times. In addition, since a large number of cell portions can be processed, it is possible to efficiently perform a plurality of sample genes simultaneously. On the other hand, in the case of a gene whose temperature and exposure time are unknown (strictly, a combination of gene and primer), a confirmation test is required to find the optimal temperature and exposure time. In this case, different temperatures and exposure times are required. In addition, tests are performed under a plurality of conditions (control patterns) in which the number of repetitions is set, and the optimum temperature conditions and the like are found by comparing the results.
しかし、特許文献1をはじめ、従来のDNA増幅装置では、異なる複数の条件毎に試験を繰り返す必要があるため、膨大な試験時間が必要となり、能率的な試験を行うことができないとともに、異なる時間(時刻)に行うため、外気温等の環境変動や試料の放置時間等が微妙に影響したり極微量の試料調合量が不均一となる不具合を招き、試験結果にバラツキを生じる虞れがあるなど、精密な試験を行うことができない問題があった。なお、これらの問題を解消するには、同一のDNA増幅装置を複数台用意すれば可能であるが、膨大なコストや設置スペースの確保を強いられるとともに、複数のDNA増幅装置間の性能のバラツキ(機差)も無視できない。
However, in the conventional DNA amplification apparatus including
そこで、本出願人は既にこの問題を解決するための熱サイクル処理装置を特許文献2により提案した。この熱サイクル処理装置は、試験結果に無用なバラツキが生じることなく、試験を精密かつ能率的に行うとともに、全体のイニシャルコストの削減,省スペース化及び省エネルギ化を図ることを目的としたものであり、具体的には、被検査液を収容する複数の試験管を熱交換可能に保持する処理ブロックと、この処理ブロックを加熱冷却するペルチェ素子を用いたサーモモジュールと、少なくともサーモモジュールに対して通電制御を行うことにより熱サイクルによる処理を行う制御機能部を備える熱サイクル処理装置を構成するに際し、処理ブロック及びサーモモジュールを有する複数の処理ユニットと、複数の処理ユニットを装填する本体ハウジングと、各処理ユニットのサーモモジュールをそれぞれ独立して作動制御する複数の制御部及びこの制御部を包括的に制御するコントローラを有する制御機能部とを設けたものである。
Therefore, the present applicant has already proposed a thermal cycle processing apparatus for solving this problem according to
しかし、上述した従来の熱サイクル処理装置(DNA増幅装置)は、次のような解決すべき課題も存在した。 However, the above-described conventional thermal cycle processing apparatus (DNA amplification apparatus) has the following problems to be solved.
第一に、加熱や冷却(空冷)を行う機能を備えて構成するため、全体が大型化する。したがって、実験室等に設置する実験装置の一つとして位置付けられ、屋外等での使用は想定していないなど、実用性の観点からは必ずしも十分であるとは言えない。例えば、河川の水質汚染を調査する場合、その河川の場所まで行って河川水を採取し、持ち帰った後、実験室等で検査を行う必要がある。結局、利便性に大きく劣るとともに、迅速な検査が要求される際には十分に対応できない。しかも、持ち帰りに長い時間がかかった場合、水質に変化を生じる虞れもあり、検査の信頼性及び安定性を確保する観点からも難がある。 First, since it is configured with a function of performing heating and cooling (air cooling), the whole size increases. Therefore, it is positioned as one of experimental devices installed in a laboratory or the like, and is not necessarily sufficient from the viewpoint of practicality, such as not intended for outdoor use. For example, when investigating water pollution in a river, it is necessary to go to the location of the river, collect the river water, take it home, and inspect it in a laboratory. In the end, it is very inconvenient, and it is not sufficient when quick inspection is required. In addition, when it takes a long time to take home, there is a possibility that the water quality may change, and it is difficult to ensure the reliability and stability of the inspection.
第二に、この問題を解決するには、従来の熱サイクル処理装置(DNA増幅装置)を携帯可能(屋外使用可能)な形態となるようにサイズダウンを図ればよいが、実用性を考慮した場合、上記の水質汚染調査をはじめ、食中毒菌の調査,農畜産物の異種調査,肉種判定等、様々な用途に対応する必要がある。しかも、この場合、必ずしも実験室等における専門分析官が直接出向いて全ての検査を行うことは容易でない。結局、実用性を実現する場合、だれでも間違いなく使用できること、加熱や冷却(空冷)を長時間継続させるため、電力消費を極力抑制すること、気温,天気及び衝撃等の外乱に影響を受けないことなど、実用性を実現するには様々な課題も存在する。 Secondly, in order to solve this problem, the conventional thermal cycle processing device (DNA amplification device) may be reduced in size so as to be portable (can be used outdoors). In this case, it is necessary to cope with various uses such as the above-mentioned water pollution investigation, investigation of food poisoning bacteria, heterogeneous investigation of agricultural and livestock products, and meat type determination. In addition, in this case, it is not always easy for a specialist analyst in the laboratory or the like to go directly to perform all the tests. After all, when realizing practicality, anyone can use it without fail, and since heating and cooling (air cooling) are continued for a long time, power consumption is suppressed as much as possible, and it is not affected by disturbances such as temperature, weather and shock. There are various problems to realize practicality.
本考案は、このような背景技術に存在する課題を解決した携帯用DNA増幅装置の提供を目的とするものである。 An object of the present invention is to provide a portable DNA amplifying apparatus that solves the problems existing in the background art.
本考案に係る携帯用DNA増幅装置1は、上述した課題を解決するため、被検査液Lを収容する検査チューブC…を熱交換可能に保持する熱交換ユニット2と、検査チューブCを加熱又は冷却するペルチェ素子を用いたサーモモジュール3と、少なくともサーモモジュール3に対して通電制御を行うことにより所定の温度変化パターンTpを有する熱サイクルによる制御を行うコンピュータ機能を有する制御部4を備えるDNA増幅装置を構成するに際して、ケース本体部5m及びこのケース本体部5mを密閉状に閉塞可能な開閉式のケース蓋部5cを有する携帯可能なケース5と、このケース5に収容又は付属する、バッテリ及び/又は電池6b,外部電源入力部6oの一方又は双方を有する電源機能部6と、検査対象となる被検査液Lに対して最適化した温度変化パターンTpに係わるパターンデータDpを取込むデータ取込機能部7と、パターンデータDpを格納するデータ格納部8と、データ取込機能部7から取込んだパターンデータDpをデータ格納部8に書込処理する書込処理機能部9とを具備してなることを特徴とする。
In order to solve the above-described problems, the portable DNA amplifying
この場合、考案の好適な態様により、ケース本体部5mの内部には、内蔵する構成部品類を支持するシャーシ11を配し、このシャーシ11を、ケース本体部5mの内面5miとシャーシ11間に介在させた弾性部材12a…,12b…,12c…により支持することができる。また、ケース本体部5mには、セットした検査チューブC…を覆い又は開放する開閉可能なカバー機能部13を設けることができる。なお、このカバー機構部13には、検査チューブC…の結露を防止するヒータ部14を設けることが望ましい。他方、制御部4には、報知する種類に応じて異なるアラームを発する複数のアラーム機能部15を設けることができるとともに、さらに、通信部17を設け、報知する種類に応じた異なるアラームに係わるアラームデータDaを外部通信機器16に送信し、当該外部通信機器16から当該アラームを出力させることもできる。
In this case, according to a preferred aspect of the invention, a
このような構成を有する本考案に係る携帯用DNA増幅装置1によれば、次のような顕著な効果を奏する。
The portable
(1) ケース本体部5m及びこのケース本体部5mを密閉状に閉塞可能な開閉式のケース蓋部5cを有する携帯可能なケース5,及びこのケース5に収容又は付属する、バッテリ及び/又は電池6b,外部電源入力部6oの一方又は双方を有する電源機能部6を備えるとともに、検査対象となる被検査液Lに対して最適化した温度変化パターンTpに基づく制御を行うことができるため、例えば、河川の水質汚染を調査する場合であっても、採取した河川水(被検査液L)をその場所で検査することができる。したがって、迅速性が要求される検査にも十分に応えることができるとともに、被検査液Lに変化を招く虞れも生じない。しかも、検査対象を持ち帰る等の負担を排除できるため、利便性の大幅な向上に寄与できる。
(1) A
(2) 検査対象となる被検査液Lに対して最適化した温度変化パターンTpを選択できるため、水質汚染調査,食中毒菌の調査,農畜産物の異種調査,肉種判定等、様々な用途に幅広く利用できる。しかも、温度変化パターンTpを選択すれば足りるため、だれでも間違いなく使用できるとともに、使い勝手の向上にも寄与できる。さらに、制御処理系の簡略化を実現できるため、電力消費を抑制し、長時間の検査にも対応できるとともに、省エネルギ性の向上にも寄与できる。 (2) Since the temperature change pattern Tp optimized for the liquid L to be inspected can be selected, it can be used for various purposes such as water pollution investigation, food poisoning bacteria investigation, agricultural animal and animal product heterogeneous investigation, meat species determination, etc. It can be used widely. In addition, since it is sufficient to select the temperature change pattern Tp, anyone can use it without fail, and it can contribute to improvement in usability. Furthermore, since simplification of the control processing system can be realized, power consumption can be suppressed, long-time inspection can be supported, and energy saving can be improved.
(3) 好適な態様により、ケース本体部5mの内部に、内蔵する構成部品類を支持するシャーシ11を配し、このシャーシ11を、ケース本体部5mの内面5miとシャーシ11間に介在させた弾性部材12a…,12b…,12c…により支持するようにすれば、屋外に持ち出し、携帯した場合であっても、外乱による衝撃を吸収し、内蔵する構成部品類を有効に保護できる。
(3) According to a preferred embodiment, the
(4) 好適な態様により、前記ケース本体部5mに、セットした検査チューブC…を覆い又は開放する開閉可能なカバー機能部13を設ければ、このカバー機能部13の断熱作用により、温度変化パターンTpにより制御される温度変化の安定性を高めることができるとともに、検査チューブC…を上から加圧し、検査チューブC…と熱交換ユニット2間の密着性(伝熱性)を高めることができる。
(4) If a
(5) 好適な態様により、カバー機構部13に、検査チューブC…の結露を防止するヒータ部14を設ければ、例えば、外気温が低い場合であっても、ヒータ部14により、熱交換ユニット2から上方へ露出した検査チューブC…の上部を加温できるため、検査チューブC…の結露を防止できる。
(5) According to a preferred embodiment, if the
(6) 好適な態様により、制御部4に、報知する種類に応じて異なるアラームを発する複数のアラーム機能部15を設ければ、温度変化パターンTpを有する熱サイクルによる処理時間が経過する間の使用者による監視を不要にできるため、他の作業を能率的に行うことができる。しかも、検査の失敗やトラブルを回避できるため、検査を効率的かつ確実に行うことができる。 (6) By providing a plurality of alarm function units 15 that emit different alarms according to the type to be notified according to a preferred embodiment, the processing time due to the thermal cycle having the temperature change pattern Tp elapses. Since monitoring by the user can be eliminated, other operations can be performed efficiently. Moreover, since inspection failures and troubles can be avoided, inspection can be performed efficiently and reliably.
(7) 好適な態様により、制御部4に、報知する種類に応じた異なるアラームに係わるアラームデータDa…を外部通信機器16に送信し、当該外部通信機器16から当該アラームを出力させる通信部17を設ければ、温度変化パターンTpを有する熱サイクルによる処理時間の間に、離れた場所で他の作業を行う場合であっても、アラームに基づき確実に対応することができる。
(7) According to a preferred embodiment, the
次に、本考案に係る好適実施形態を挙げ、図面に基づき詳細に説明する。 Next, preferred embodiments according to the present invention will be given and described in detail with reference to the drawings.
まず、本実施形態に係る携帯用DNA増幅装置1の全体構造について、図1〜図7及び図9を参照して説明する。
First, the overall structure of the portable
4はケースであり、図4に示すように、直方体形のケース本体部5m及びこのケース本体部5mの上端開口を密閉状に閉塞可能な開閉式のケース蓋部5cを備える。この場合、ケース蓋部5cの後端部は左右一対のヒンジ部21…を介してケース本体部5mの上端位置における後端部に対して回動自在に結合する。これにより、ケース蓋部5cはヒンジ部21…を支点に回動し、図4に示すように開くことができる。また、図2に示すように、ケース本体部5mの上端面におけるケース蓋部5cが当接する部位には、全周に沿ったパッキン22を配設する。これにより、ケース蓋部5cを閉じた際には、ケース5を密閉することができるため、雨水等の侵入を阻止し、一定の防水性を確保できる。その他、23は持運び用の把手を示すとともに、図示を省略したが、ケース蓋部5cを閉じた際には閉位置でロックするロック機構部を備えている。以上により、携帯可能なケース5が構成される。
Reference numeral 4 denotes a case, which includes a rectangular parallelepiped case
一方、ケース本体部5mの内部には、内蔵する構成部品類を支持するシャーシ11を配設する。このシャーシ11は、底板部11d,この底板部11dの前辺部から上方へ直角に折曲形成した前板部11f及び底板部11dの後辺部から上方へ直角に折曲形成した後板部11rを有するとともに、底板部11dの中間位置から上方に起設し、かつ前側に通気空間11srを確保した仕切プレート11sを有する。そして、シャーシ11を、ケース本体部5mの内部に配設する際には、底板部11dを、ゴムブロックによる複数の衝撃吸収用の弾性部材12a,12a…を介してケース本体部5mの底面(内面5mi)上に載置(取付)するとともに、前板部11fを、ゴムブッシュ等を用いた複数の衝撃吸収用の弾性部材12b,12b…を介してケース本体部5mの前面(内面5mi)に取付け、かつ後板部11rを、ゴムブッシュ等を用いた複数の衝撃吸収用の弾性部材12c,12c…を介してケース本体部5mの後面(内面5mi)に取付ける。また、ケース本体部5mの上端開口は、上面プレート24で覆い、この上面プレート24に、後述する処理室25の上方に位置するチューブセット部25s及び後述する制御室26の上方に位置する操作パネル部26sを設ける。
On the other hand, a
このように、ケース本体部5mの内部に、内蔵する構成部品類を支持するシャーシ11を配し、このシャーシ11を、ケース本体部5mの内面5miとシャーシ11間に介在させた弾性部材12a…,12b…,12c…により支持するようにすれば、屋外に持ち出し、携帯した場合であっても、外乱による衝撃を吸収し、内蔵する構成部品類を有効に保護できる利点がある。
As described above, the
そして、このシャーシ11を利用し、内蔵する各種構成部品類を配設する。この場合、仕切プレート11sに対する一方側の内部空間を処理室25として構成し、他方側の内部空間を制御室26として構成する。
The
まず、処理室25の内部構造について説明する。処理室25の中間部位には、熱交換ユニット2を配設する。例示の熱交換ユニット2は、基本的な機能として、被検査液Lを収容する四つの検査チューブC…を熱交換可能に保持する機能を備える。図5に、熱交換ユニット2の詳細を示す。熱交換ユニット2は、検査チューブC…を保持する四つの保持カップ27…と、この保持カップ27…の底部を固定した熱交換基部28sと、保持カップ27…の上端位置に配した上支持板部28uとを備える。熱交換基部28sは、金属素材により形成した上板部28sa及び下板部28sbを固着して構成する。上板部28saは、厚さを0.2〜0.5〔mm〕程度に選定した銅素材(無酸素銅等)による薄板材により形成し、上板部28saの面内に、四つのカップ固定部28sc…を配列させて設ける。一つのカップ固定部28scは、上板部28saから上方に起立し、保持カップ27…の下部外周面が嵌合(圧入)可能な筒状となるようにバーリング形成する。また、下板部28sbも、厚さを0.2〜0.5〔mm〕程度に選定した銅素材(無酸素銅等)を用いた薄板材により形成し、上板部28saの下面に固着する。上板部28saと下板部28sbの固着は、銀素材を主体としたロー材を用いて接合できる。他方、保持カップ27…の上端位置に配する上支持板部28uは、保持カップ27…の上端外径にほぼ一致する開孔部を有し、この開孔部に、保持カップ27…の上端を嵌合させる。上支持板部28uは断熱性素材により形成することが望ましい。
First, the internal structure of the
保持カップ27は、熱伝導率の比較的高い銅素材(無酸素銅等)による薄板材(厚さ0.2〜0.3〔mm〕程度)をプレス加工により絞り成形し、検査チューブCを収容可能なカップ状に形成する。したがって、保持カップ27の内部形状は、検査チューブCの少なくとも下部形状に一致させる。そして、保持カップ27の下部外周面をカップ固定部28scに圧入して固定する。なお、保持カップ27の下面は下板部28sbの上面に上板部28saと一緒にロー付けしてもよい。各保持カップ27…は、図2に示すように、上面プレート24に開口したチューブセット部25sに対して下方から臨ませる。なお、検査チューブC…には、容積が0.2〜1.5〔ミリリットル〕のポリプロピレン製蓋付容器を用いることができる。
The holding
また、熱交換ユニット2の下面には、検査チューブC…を加熱又は冷却するペルチェ素子を用いたサーモモジュール3を配設する。さらに、サーモモジュール3の下面には、ヒートシンク(放熱器)29を固定する。一方、熱交換ユニット2,サーモモジュール3及びヒートシンク29の後方には、送風機を用いた排気ファン30を配設するとともに、この排気ファン30の後方(送風方向前方)に位置するケース本体部5mの後面に、排気口部31を設ける。
Further, a
他方、熱交換ユニット2の上方、即ち、上面プレート24に開口して設けたチューブセット部25sの上方には、セットした検査チューブC…を覆い又は開放する開閉可能なカバー機能部13を設ける。このようなカバー機能部13を設ければ、カバー機能部13の断熱作用により、温度変化パターンTpにより制御される温度変化の安定性を高めることができるとともに、検査チューブC…を上から加圧し、検査チューブC…と熱交換ユニット2間の密着性(伝熱性)を高めることができる利点がある。この場合、カバー機能部13は、後端側がヒンジ部33により回動可能に支持されたカバー本体部32を備え、このカバー本体部32の下面に、閉位置に変位させた際に上面プレート24に当接(圧接)し、チューブセット部25sの検査チューブC…を覆うことにより密閉するリング状の弾性シーリング部材34を設けるとともに、カバー本体部32の内部には、検査チューブC…の結露を防止するヒータ部(リッドヒータ)14(図1)を内蔵する。このようなヒータ部14を設ければ、例えば、外気温が低い場合であっても、ヒータ部14により、熱交換ユニット2から上方へ露出した検査チューブC…の上部を加温できるため、検査チューブC…の結露を防止できる利点がある。
On the other hand, an openable / closable
次に、制御室26の内部構造について説明する。制御室26には、主要構成部品類となる、コントローラユニット41,このコントローラユニット41の上方に配した操作ユニット42,バッテリ6b,定電流電源部43,過放電保護回路44,カードリーダ45,通信部17及びアラーム発生部47等を備える。操作ユニット42は、表示部42d及び入力部42iを備え、この表示部42d及び入力部42iは、上面プレート24の操作パネル部26sに設けた開口部から露出させるとともに、カードリーダ45のカード挿入口も上面プレート24の操作パネル部26sの後寄りに設けた開口部から露出させる。また、上面プレート24上には、外部電源入力部6oを配設するとともに、この外部電源入力部6oの近傍にはスイッチパネル部48を配設する。
Next, the internal structure of the
さらに、上面プレート24における後側隅部には吸気口部49を設ける。これにより、前述した排気ファン30の作動時には、図3に示す点線矢印Fw…の送風経路が構成される。即ち、外気は、左側に配した吸気口部49から制御室26の内部に流入し、この制御室26の内部における対角線方向に流れた後、仕切プレート11sにおける通気空間11srを通り、処理室25の内部に流入する。そして、この処理室25の内部を流れた後、排気ファン30を介して排気口部31から外部に流出する。このように、ケース本体部5mの内部に対する空冷作用が効果的に行われる。特に、処理室25の内部を空冷することにより、検査チューブC…に対する温度の制御性を高めている。
Further, an
次に、本実施形態に係る携帯用DNA増幅装置1の制御系の機能を含む上述した制御室26における主要構成部品類の詳細について、図1〜図9を参照して説明する。
Next, details of the main components in the
コントローラユニット41は、携帯用DNA増幅装置1の全体の制御を司るコンピュータ機能を備えるとともに、少なくともサーモモジュール3に対して所定の温度変化パターンTpを有する熱サイクルによる制御を行う制御部4を構成する。したがって、制御部4は、図1に示すように、内部メモリ52が付属するマイクロコンピュータ等を用いたコントローラ本体51を備える。内部メモリ52は、データ書込エリア52dとプログラム格納エリア52pを備え、データ書込エリア52dには各種設定データを含むデータ類を書き込むことができるとともに、プログラム格納エリア52pには、制御プログラム及び処理プログラム等の各種プログラム類を格納する。このため、データ書込エリア52dには、上述した温度変化パターンTpに係わるパターンデータDp及び後述するアラームデータDaを書込むことができるとともに、プログラム格納エリア52pには温度変化パターンTpに基づきサーモモジュール3に対する通電制御及び排気ファン30に対する通電制御等を行う制御プログラムPcを格納する。
The
温度変化パターンTpの一例を図9に示す。例示の温度変化パターンTpは、95〔℃〕→57〔℃〕→72〔℃〕の各温度をそれぞれ設定時間だけ維持するパターンであり、この温度変化パターンTpが1サイクル分の熱サイクルとなる。したがって、増幅処理時には、この温度変化パターンTpを予め設定した処理時間(通常、20〔分〕程度)にわたって繰り返す。 An example of the temperature change pattern Tp is shown in FIG. The exemplary temperature change pattern Tp is a pattern in which each temperature of 95 [° C.] → 57 [° C.] → 72 [° C.] is maintained for a set time, and this temperature change pattern Tp is a thermal cycle for one cycle. . Therefore, at the time of amplification processing, this temperature change pattern Tp is repeated over a preset processing time (usually about 20 minutes).
一方、操作ユニット42に備える表示部42dは、液晶ディスプレイ等を用いることにより各種表示を行う機能を備えるとともに、入力部42iには、各種選択スイッチ及び表示ランプ類を備える。また、スイッチパネル部48には、バッテリ6bに対するON/OFFの切換スイッチ6bs,外部電源入力部6oに対するON/OFFの切換スイッチ6osをはじめ、電源スイッチを含むスイッチ類を配する。なお、外部電源入力部6oは一つであってもよいし、二つ以上であってもよい。例示は、カーバッテリとACアダプタの二つの外部電源を入力可能である。バッテリ6bには12〔V〕のリチウムイオン電池(二次電池)を用いる。また、バッテリ6bはケース本体部5mに内蔵させる態様を例示したが、別途外部電源として用意し、電源接続ケーブルを介して供給できるようにしてもよい。これにより、バッテリ6bは、図1に示すように、切換スイッチ6bs及び過放電保護回路44を介して定電流電源部43に電力を供給できるとともに、外部電源入力部6oは切換スイッチ6osを介して定電流電源部43に電力を供給できる。以上により、電源機能部6が構成される。
On the other hand, the
他方、カードリーダ45は、メモリカード91をセットすることにより、メモリカード91に記憶された温度変化パターンTpに係わるパターンデータDpを読取る機能を備える。これにより、読取ったパターンデータDpは、コントロール本体51を介して内部メモリ52のデータ書込エリア52dに書込まれる。この場合、メモリカード91に記憶された温度変化パターンTpに係わるパターンデータDpは、検査対象となる被検査液Lに対して最適化した温度変化パターンTpに対応する。この最適化した温度変化パターンTpは、前述した先行技術である特許文献2(特開2010−051265号公報)で開示される熱サイクル処理装置により得ることができる。
On the other hand, the
図6に、熱サイクル処理装置92と本実施形態に係る携帯用DNA増幅装置1の関係を示す。図6に示す熱サイクル処理装置92を用いることにより、実験室等において、特定の被検査液に対する最適化した温度変化パターンを容易に求めることができる。今、熱サイクル処理装置92に内蔵するメモリに、各種被検査液L…に対する最適化した温度変化パターンTp…が複数のデータベースとして登録されているものとする。この場合、任意の温度変化パターンTpを選択することにより、対応するパターンデータDpをカードリーダ/ライタ93を介してメモリカード91に書込むことができる。メモリカード91は、自由に持ち運びできるため、携帯用DNA増幅装置1に対して、カードリーダ45を介して取込むことができる。また、携帯用DNA増幅装置1と一緒に持ち運ぶことも可能である。
FIG. 6 shows the relationship between the thermal
したがって、携帯用DNA増幅装置1において、カードリーダ45は、検査対象となる被検査液Lに対して最適化した温度変化パターンTpに係わるパターンデータDpを取込むデータ取込機能部7として機能するとともに、内部メモリ52は、パターンデータDpを格納するデータ格納部8として機能する。また、コントローラ本体51は、データ取込機能部7から取込んだパターンデータDpをデータ格納部8に書込処理する書込処理機能部9として機能する。
Therefore, in the portable
さらに、制御部4には、通信部17及びアラーム発生部47を備える。通信部17は、図1に示すように、外部通信機器16に対する通信機能を備える。例示の外部通信機器16は携帯用DNA増幅装置1に付属する専用の通信機器(受信機)として構成し、主に、後述するアラーム出力機能を備える。なお、外部通信機器16は、このような専用の通信機器として構成してもよいし、或いはスマートホンやモバイル機器等の各種外部通信機器を利用してもよい。
Further, the control unit 4 includes a
また、アラーム発生部47は、報知する種類に応じて異なる複数のアラームを発する機能を備え、コントローラ本体51と共にアラーム機能部15を構成する。したがって、アラーム発生部47は、点滅等による発光手段やチャイムやブザー等による発音手段を備えるとともに、コントローラ本体51はアラームに対応する監視機能を備えている。図7に、アラーム機能部15における機能の一例を示す。まず、電源スイッチをONにした時点でコントローラ本体51の監視機能も起動し、電源機能部6が正常に機能しているか否かを判断する(ステップS21,S22)。この際、電圧レベルが正常でない場合には、第一アラームA1を出力させる。次いで、通信部17が正常に機能しているか否かを判断する(ステップS23)。この場合、通信部17から外部通信機器16に対して確認信号を送信し、この確認信号に対する返信信号を正常に受信できるか否かなどにより判断する。この際、正常に通信できない場合には、第二アラームA2を出力させる。
The
以上の判断が正常に行われた場合には、温度変化パターンTpに基づきサーモモジュール3に対する通電制御及び排気ファン30に対する通電制御等を行う制御プログラムPcを起動させる(ステップS24)。また、携帯用DNA増幅装置1の動作中は、各部の断線の有無を監視する(ステップS25)。この際、断線が発生すれば、第三アラームA3を出力させる。この場合、断線には、ペルチェ素子の断線A31,温度センサの断線A32など、複数の異なる監視対象が存在するため、それぞれの断線に対して異なる第三アラームA3を出力させる。さらに、温度異常の有無も監視する(ステップS26)。この際、温度異常が発生すれば、第四アラームA4を出力させる。この場合、温度異常には、加熱温度の異常高温A41,制御温度範囲の外れA42など、複数の異なる監視対象が存在するため、それぞれの温度異常に対して異なる第四アラームA4を出力させる。
When the above determination is normally made, a control program Pc for performing energization control on the
他方、制御プログラムPcの終了、即ち、一連の増幅処理の終了により、第五アラームA5を出力させる。これにより、電源スイッチをOFFにすればよい(ステップS27,S28)。したがって、このようなアラーム機能部15を設ければ、温度変化パターンTpを有する熱サイクルによる、通常、20〔分〕程度の処理時間が経過する間の使用者の監視を不要にできるため、他の作業を能率的に行うことができる。しかも、検査の失敗やトラブルを回避できるため、検査を効率的かつ確実に行うことができる利点がある。なお、各アラームは基本的に異なるが、この場合、アラームが異なるとは、チャイムの音色や発光点滅の間隔など、識別できる程度に異なる各種態様が含まれる。 On the other hand, the fifth alarm A5 is output when the control program Pc ends, that is, when a series of amplification processes ends. Thereby, the power switch may be turned off (steps S27 and S28). Accordingly, if such an alarm function unit 15 is provided, monitoring of the user during the processing time of about 20 [minutes] usually due to the thermal cycle having the temperature change pattern Tp can be made unnecessary. Can be done efficiently. In addition, since inspection failures and troubles can be avoided, there is an advantage that inspection can be performed efficiently and reliably. Each alarm is basically different, but in this case, different alarms include various aspects that are distinguishable to each other, such as a chime tone and a flashing interval.
また、このようなアラームの出力、即ち、アラームに係わるアラームデータDa…は、上述した通信部17を介して外部通信機器16に送信し、当該外部通信機器16から当該アラームを出力させることもできる。このような通信部17を設ければ、温度変化パターンTpを有する熱サイクルによる処理時間の間に、離れた場所で他の作業を行う場合であっても、アラームに基づき確実に対応できる利点がある。その他、図1(図3)において、53は検査チューブC…に対する加熱温度を検出する温度センサを示し、この温度センサ53による検出結果は、コントローラ本体51に付与され、温度に対するフィードバック制御が行われる。
Further, such alarm output, that is, alarm data Da relating to the alarm can be transmitted to the external communication device 16 via the
次に、本実施形態に係る携帯用DNA増幅装置1の使用方法を含む被検査液Lの検査方法の全体手順について、図1〜図10を参照し、主に図8に示すフローチャートに従って説明する。
Next, the entire procedure of the test method of the test liquid L including the method of using the portable
前述したように、図6に示す熱サイクル処理装置92を用いれば、検査対象となる被検査液Lに対して最適化した温度変化パターンTpを見出すことができる。具体的には、魚に関連する病原菌のDNAを最も効果的に増幅できる温度変化パターンTp、或いは食中毒に関連する食中毒菌のDNAを最も効果的に増幅できる温度変化パターン等の様々な用途における温度変化パターンを見出すことができるとともに、多数のパターンデータDp…をデータベースとして登録しておくことができる。
As described above, by using the thermal
今、ある河川において、魚の病気に関連する病原菌が発生しているか否かの調査を行う場合を想定する。この場合、熱サイクル処理装置92に登録されてる多数の温度変化パターンTp…から、その病原菌のDNAを最も効果的に増幅することができる最適化した温度変化パターンTpを選択する(ステップS1)。そして、選択した温度変化パターンTpに対応するパターンデータDpを、カードリーダ/ライタ93を介してメモリカード91に書込む。
Now, suppose that a river is being investigated for the presence of pathogenic bacteria related to fish disease. In this case, an optimized temperature change pattern Tp that can most effectively amplify the DNA of the pathogenic bacterium is selected from a large number of temperature change patterns Tp... Registered in the thermal cycle processing device 92 (step S1). Then, the pattern data Dp corresponding to the selected temperature change pattern Tp is written into the
一方、パターンデータDpを書込んだメモリカード91は、携帯用DNA増幅装置1におけるカードリーダ45にセットし、携帯用DNA増幅装置1に取込むとともに、内部メモリ52に登録する(ステップS2)。なお、以上の取込手順は一例であり、各種態様が考えられる。例えば、複数のパターンデータDp…を一つ又は二つ以上のメモリカード91に書込み、現地まで携帯用DNA増幅装置1と一緒に持参し、その場所で適切なパターンデータDpを選択し、携帯用DNA増幅装置1に対する取込みを行ってもよい。
On the other hand, the
また、調査(検査)に必要な付属品を準備する(ステップS3)。付属品としては、携帯用DNA増幅装置1により増幅処理を行う際に使用する第一酵素液,図10に示す、増幅処理後における検出処理時に使用する第二酵素液KL,試験紙(クロマト濾紙)KP,予備バッテリ等を用意する。
Also, accessories necessary for the investigation (inspection) are prepared (step S3). As an accessory, the first enzyme solution used when the portable
一方、用意した携帯用DNA増幅装置1と付属品は、上述した調査対象となる河川まで持参する(ステップS4)。そして、現地で調査対象の河川水(被検査液L)を検査チューブC…に5〔μl〕採取する(ステップS5)。また、検査チューブC…にPCR法で使用する第一酵素液(5〔μl〕)を添加し、熱交換ユニット2のチューブセット部25sにセットする(ステップS6)。セットが終了したなら、カバー機能部13を閉じ、電源スイッチをONにする(ステップS7)。
On the other hand, the prepared portable
これにより、制御プログラムPcが起動し、前述した温度変化パターンTpに基づく制御が行われることにより、検査対象となる病原菌のDNAに対してPCR法(ポリメラーゼ連鎖反応法)による増幅処理が行われる(ステップS8)。そして、予め設定した処理時間が経過したなら、増幅処理が終了するため、電源スイッチをOFFにする(ステップS9,S10)。 As a result, the control program Pc is activated and the control based on the above-described temperature change pattern Tp is performed, whereby the amplification process by the PCR method (polymerase chain reaction method) is performed on the DNA of the pathogenic bacteria to be examined ( Step S8). Then, when the preset processing time has elapsed, the amplification process ends, so the power switch is turned off (steps S9 and S10).
そして、増幅処理が終了した検査チューブCの中に、図10に示すように、第二酵素液(ラテックス液:50〔μl〕)KLを追加する(ステップS11)。また、試験紙(クロマト濾紙)KPを検査チューブCの中に挿入する(ステップS12)。この試験紙KPには予め複数のバンド(ライン)が印刷されている。非使用状態ではバンドの発色はないが、検査対象となる病原菌のDNAが存在すれば、対応するバンドが発色するため、その有無を判定できる(ステップS13)。 Then, as shown in FIG. 10, the second enzyme solution (latex solution: 50 [μl]) KL is added to the test tube C after the amplification process (step S11). Further, a test paper (chromatographic filter paper) KP is inserted into the inspection tube C (step S12). A plurality of bands (lines) are printed in advance on the test paper KP. In the non-use state, there is no color development of the band, but if the DNA of the pathogenic bacteria to be examined is present, the corresponding band is colored, so the presence or absence can be determined (step S13).
例示の場合、試験紙KPを被検査液Lに漬けることにより液が試験紙KPに吸収され、下から上に上昇する。被検査液Lに漬けてから5〜10〔分〕程度を目処に判定可能である。図10に例示する試験紙KPは、発色後(使用後)の一例を示す。例示の場合、四つのバンドBk…が発色し、四種類の検査対象が存在していることを示している。なお、最上部における二つのバンドBc…は、正常に検査が行われたことを示している。以上により調査は終了する。この際、検査対象の採取から検査終了まで、概ね30〔分〕程度である。 In the example, the test paper KP is immersed in the liquid L to be inspected, so that the liquid is absorbed by the test paper KP and rises from the bottom to the top. It can be determined about 5 to 10 minutes after being immersed in the liquid L to be inspected. The test paper KP illustrated in FIG. 10 shows an example after coloring (after use). In the example, four bands Bk ... are colored, indicating that there are four types of inspection objects. Note that the two bands Bc... At the uppermost part indicate that the inspection was performed normally. This completes the survey. At this time, it is about 30 [min] from the collection of the inspection object to the end of the inspection.
このように、本実施形態に係る携帯用DNA増幅装置1によれば、ケース本体部5m及びこのケース本体部5mを密閉状に閉塞可能な開閉式のケース蓋部5cを有する携帯可能なケース5,及びこのケース5に収容又は付属する、バッテリ及び/又は電池6b,外部電源入力部6oの一方又は双方を有する電源機能部6を備えるとともに、検査対象となる被検査液Lに対して最適化した温度変化パターンTpに基づく制御を行うことができるため、河川の水質汚染を調査する場合であっても、採取した河川水(被検査液L)をその場所で検査することができる。したがって、迅速性が要求される検査にも十分に応えることができるとともに、被検査液Lに変化を招く虞れも生じない。しかも、河川水(検査対象)を持ち帰る等の負担を排除できるため、利便性の大幅な向上に寄与できる。また、検査対象となる被検査液Lに対して最適化した温度変化パターンTpを選択できるため、水質汚染調査,食中毒菌の調査,農畜産物の異種調査,肉種判定等、様々な用途に幅広く利用できる。しかも、温度変化パターンTpを選択すれば足りるため、だれでも間違いなく使用できるとともに、使い勝手の向上にも寄与できる。さらに、制御処理系の簡略化を実現できるため、電力消費を抑制し、長時間の検査にも対応できるとともに、省エネルギ性の向上にも寄与できる。
Thus, according to the portable
以上、好適実施形態について詳細に説明したが、本考案は、このような実施形態に限定されるものではなく、細部の構成,形状,素材,数量等において、本考案の要旨を逸脱しない範囲で、任意に変更,追加,削除することができる。 The preferred embodiment has been described in detail above. However, the present invention is not limited to such an embodiment, and the detailed configuration, shape, material, quantity, and the like are within the scope of the present invention. , Can be changed, added and deleted arbitrarily.
例えば、熱交換ユニット2は、必ずしも例示の形態に限定されるものではなく、特許文献1及び特許文献2に記載する形態を排除するものではない。また、電源機能部6には、バッテリの代わりに一次電池を用いてもよいし、或いはバッテリと一次電池の双方を用いてもよい。特に、バッテリと一次電池の双方を用いる場合、バッテリを主電源とし、一次電池をバッテリ切れの際に用いる予備電源として用いることができる。一方、メモリカード91を例示したが、USBメモリ等の他の各種メディアを利用できるとともに、通信部17を利用して無線により転送する方式であってもよい。また、温度変化パターンTpと制御プログラムPcは、制御プログラムPcを携帯用DNA増幅装置1に格納し、パターンデータDpのみを取込む方式であってもよいし、温度変化パターンTpと制御プログラムPcを組合わせて取込む方式であってもよい。アラーム機能部15におけるアラームの種類は例示であり、様々な種類のアラームを適用可能である。さらに、試験紙KPやこの試験紙KPを用いた検査方法(判定方法)は例示であり、公知の各種手法を用いることができる。
For example, the
本考案に係る携帯用DNA増幅装置は、水質汚染調査をはじめ、食中毒菌の調査,農畜産物の異種調査,肉種判定等、様々な用途における検査対象となるDNAの増幅に利用できる。 The portable DNA amplification device according to the present invention can be used for amplification of DNA to be tested in various applications such as water pollution investigation, food poisoning bacteria investigation, agricultural and livestock product heterogeneous investigation, meat species determination, and the like.
1:携帯用DNA増幅装置,2:熱交換ユニット,3:サーモモジュール,4:制御部,5:ケース,5m:ケース本体部,5mi:ケース本体部の内面,5c:ケース蓋部,6:電源機能部,6b:バッテリ及び/又は電池,6o:外部電源入力部,7:データ取込機能部,8:データ格納部,9:書込処理機能部,11:シャーシ,12a…:弾性部材,12b…:弾性部材,12c…:弾性部材,13:カバー機能部,14:ヒータ部,15:アラーム機能部,16:外部通信機器,17:通信部,L:被検査液,C…:検査チューブ,Tp:温度変化パターン,Dp:パターンデータ,Da:アラームデータ,Zu:低温域,Zd:高温域 1: portable DNA amplification device, 2: heat exchange unit, 3: thermo module, 4: control unit, 5: case, 5m: case body, 5mi: inner surface of case body, 5c: case lid, 6: Power supply function unit, 6b: battery and / or battery, 6o: external power input unit, 7: data capture function unit, 8: data storage unit, 9: write processing function unit, 11: chassis, 12a ...: elastic member , 12b ...: elastic member, 12c ...: elastic member, 13: cover function unit, 14: heater unit, 15: alarm function unit, 16: external communication device, 17: communication unit, L: liquid to be inspected, C ...: Inspection tube, Tp: Temperature change pattern, Dp: Pattern data, Da: Alarm data, Zu: Low temperature range, Zd: High temperature range
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