JP2023075139A - Primate retinal pigment epithelium cell-specific promoter - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、特に網膜色素上皮(RPE)の細胞中で特異的に遺伝子の発現をもたらす核
酸配列に関する。
The present invention particularly relates to nucleic acid sequences that direct gene expression specifically in cells of the retinal pigment epithelium (RPE).
発現目的のため、組換え遺伝子は、通常、標的細胞、細胞集団又は組織中に、異種遺伝
子の転写を可能とする活性発現カセットの環境下のcDNA構築物として形質移入される
。DNA構築物は、シス制御エレメント、例として、エンハンサー、サイレンサー、イン
スレーター及びプロモーター(本明細書においてまとめて「プロモーター」と称される)
における多くのトランス作用性転写因子(TF)の活性を含むプロセスにおける細胞転写
機構により認識される。
For expression purposes, the recombinant gene is usually transfected into target cells, cell populations or tissues as a cDNA construct in the environment of an active expression cassette that allows transcription of the heterologous gene. The DNA construct contains cis-regulatory elements such as enhancers, silencers, insulators and promoters (collectively referred to herein as "promoters").
recognized by the cellular transcription machinery in a process that involves the activity of many trans-acting transcription factors (TFs) in .
遺伝子プロモーターは、それらの調節のレベルの全てに関与し、DNA配列、転写因子
結合及びエピジェネティックな特色の影響を組み込むことにより遺伝子転写における決定
因子として機能する。これらは、例えば、プラスミドベクターによりコードされる導入遺
伝子発現の強度及び前記導入遺伝子が発現される1つ又は複数の細胞タイプを決定する。
Gene promoters are involved in all their levels of regulation and function as determinants in gene transcription by incorporating the influence of DNA sequence, transcription factor binding and epigenetic features. These determine, for example, the strength of transgene expression encoded by the plasmid vector and the cell type or types in which said transgene is expressed.
哺乳動物細胞中の異種遺伝子発現をドライブするために使用される最も一般的なプロモ
ーターは、ヒト及びマウスサイトメガロウイルス(CMV)主要最初期プロモーターであ
る。これらは強力な発現を付与し、いくつかの細胞タイプにおいてロバストであることが
証明されている。他のウイルスプロモーター、例えば、SV40最初期プロモーター及び
ラウス肉腫ウイルス(RSV)ロングターミナルリピート(LTR)プロモーターも発現
カセット中で高頻度で使用される。
The most common promoters used to drive heterologous gene expression in mammalian cells are the human and mouse cytomegalovirus (CMV) major immediate early promoters. They confer strong expression and have proven to be robust in several cell types. Other viral promoters such as the SV40 immediate early promoter and the Rous sarcoma virus (RSV) long terminal repeat (LTR) promoter are also frequently used in expression cassettes.
ウイルスプロモーターの代わりに、細胞プロモーターを使用することもできる。公知の
プロモーターの中には、大量に転写される細胞転写産物、例えば、ベータ-アクチン、伸
長因子1-アルファ(EF-lアルファ)、又はユビキチンをコードするハウスキーピン
グ遺伝子からのものがある。ウイルスプロモーターと比較して、真核生物遺伝子発現は複
雑であり、多くの異なる因子の正確な協調を要求する。
Cellular promoters can also be used instead of viral promoters. Among the known promoters are those from housekeeping genes that encode abundantly transcribed cellular transcripts such as beta-actin, elongation factor 1-alpha (EF-lalpha), or ubiquitin. Compared to viral promoters, eukaryotic gene expression is complex and requires precise coordination of many different factors.
導入遺伝子発現のための内因性調節エレメントの使用に関する態様の1つは、安定なm
RNAの生成であり、発現が、それに応じてトランス作用性転写因子が提供される宿主細
胞の天然環境中で生じ得ることである。真核生物遺伝子の発現は、シス及びトランス作用
性調節エレメントの複雑な機構により制御されるため、ほとんどの細胞プロモーターは、
詳細な機能の特徴付けが欠けている。真核生物プロモーターの一部は、通常、その転写さ
れる配列のすぐ上流に位置し、転写開始点として機能する。コアプロモーターは、転写機
構により認識されるのに十分である転写開始部位(TSS)を直接囲む。近位プロモータ
ーは、コアプロモーターの上流の領域を含み、TSS及び転写調節に要求される他の配列
特色を含有する。転写因子は、プロモーター及びエンハンサー配列中の調節モチーフに結
合し、それにより、ヌクレオソーム構造及び最終的に転写の開始を可能とするその位置を
変更するクロマチン及びヒストン修飾酵素を活性化させることにより配列特異的に作用す
る。機能プロモーターの同定は、主に、関連する上流又は下流のエンハンサーエレメント
の存在に依存的である。
One aspect of using endogenous regulatory elements for transgene expression is stable m
It is the production of RNA that expression can occur in the natural environment of the host cell to which trans-acting transcription factors are provided accordingly. Because eukaryotic gene expression is controlled by a complex mechanism of cis- and trans-acting regulatory elements, most cellular promoters are
Lack of detailed functional characterization. A portion of a eukaryotic promoter is usually located immediately upstream of the transcribed sequence and serves as the initiation point of transcription. The core promoter directly surrounds a transcription start site (TSS) that is sufficient to be recognized by the transcription machinery. A proximal promoter includes regions upstream of the core promoter and contains TSSs and other sequence features required for transcriptional regulation. Transcription factors are sequence-specific by binding to regulatory motifs in promoter and enhancer sequences, thereby activating chromatin and histone modifying enzymes that alter nucleosome structure and, ultimately, its position allowing initiation of transcription. effective. Identification of a functional promoter is primarily dependent on the presence of relevant upstream or downstream enhancer elements.
導入遺伝子発現のための内因性調節エレメントの使用に関する別の重大な態様は、一部
のプロモーターが細胞特異的様式で作用し得、規定のタイプの細胞中で、又はプロモータ
ーに依存して特定のサブセットの細胞中で導入遺伝子の発現をもたらすことである。
Another important aspect regarding the use of endogenous regulatory elements for transgene expression is that some promoters can act in a cell-specific manner, resulting in a particular type of cell in a given type of cell or depending on the promoter. One is to effect expression of the transgene in a subset of cells.
したがって、本発明の1つの課題は、網膜の哺乳動物細胞中で高い発現レベルで、細胞
タイプ特異的様式で組換え遺伝子を発現させるのに好適な新たな配列を得ることである。
One problem of the present invention is therefore to obtain new sequences suitable for expressing recombinant genes in a cell-type-specific manner at high expression levels in mammalian cells of the retina.
このような配列は、神経変性障害、視力回復、創薬、腫瘍療法及び障害の診断の研究の
ための系を開発するための網膜細胞特異的プロモーターについての当分野における必要性
に対処する。
Such sequences address the need in the art for retinal cell-specific promoters to develop systems for the study of neurodegenerative disorders, vision restoration, drug discovery, tumor therapy and diagnosis of disorders.
本発明者らは、目下、国際公開第2015/118507号パンフレットに記載のとお
りネズミモデルにおいて網膜アマクリン細胞中で特異的に遺伝子発現をドライブすること
が公知の人工プロモーターが、霊長類において予想外及び非定型的に全く異なる特異性を
有することを偶然に見出した。霊長類において、このプロモーターは、網膜色素上皮(R
PE)の細胞中の遺伝子発現を特異的にドライブする。この特異性は、例えば、加齢黄斑
変性症、網膜色素変性症、糖尿病性網膜症又は網膜色素上皮肥大症患者の罹患網膜におけ
る網膜色素上皮細胞中の遺伝子発現に対処し、それを標的化するために極端に有用である
。
We now show that an artificial promoter known to drive gene expression specifically in retinal amacrine cells in a murine model, as described in WO2015/118507, unexpectedly and It was found by chance to have atypically quite different specificities. In primates, this promoter is located in the retinal pigment epithelium (R
PE) specifically drives gene expression in cells. This specificity addresses and targets gene expression in retinal pigment epithelial cells in the diseased retina of patients with, for example, age-related macular degeneration, retinitis pigmentosa, diabetic retinopathy or retinal pigment epithelial hypertrophy. extremely useful for
このプロモーターの核酸配列は、
である。
The nucleic acid sequence of this promoter is
is.
したがって、本発明は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中で特異的に外因性遺伝子を発現
させる方法であって、配列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番
号1の前記配列と少なくとも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配
列からなる単離核酸分子を、前記霊長類の網膜色素上皮の細胞に送達するステップを含み
、前記単離核酸分子は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を、前記外
因性遺伝子をコードする核酸配列が前記単離核酸分子に作動可能に結合している場合に特
異的にもたらす方法を提供する。単離核酸分子は、前記単離核酸分子に作動可能に結合し
ている最小プロモーター、例えば、配列番号2の最小プロモーターをさらに含み得る。単
離核酸分子は、発現カセットの一部であり得、それはさらにベクター、例えば、ウイルス
ベクターの一部であり得る。
Accordingly, the present invention provides a method of expressing an exogenous gene specifically in cells of the retinal pigment epithelium of a primate comprising or consisting of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, or said sequence of SEQ ID NO: 1 delivering to cells of the retinal pigment epithelium of the primate an isolated nucleic acid molecule consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp having at least 80% overall identity with A method is provided for specifically effecting expression of an exogenous gene in cells of a pigment epithelium when a nucleic acid sequence encoding said exogenous gene is operably linked to said isolated nucleic acid molecule. An isolated nucleic acid molecule can further comprise a minimal promoter, eg, the minimal promoter of SEQ ID NO:2, operably linked to said isolated nucleic acid molecule. The isolated nucleic acid molecule can be part of an expression cassette, which can further be part of a vector, eg, a viral vector.
本発明はまた、霊長類の網膜色素上皮の細胞中で特異的に外因性遺伝子を発現させるた
めの、配列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列
と少なくとも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離
核酸分子の使用であって、前記単離核酸分子は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性
遺伝子の発現を、前記外因性遺伝子をコードする核酸配列が前記単離核酸分子に作動可能
に結合している場合に特異的にもたらす使用を提供する。この使用において、単離核酸分
子は、最小プロモーター、例えば、配列番号2の最小プロモーターをさらに含み得る。単
離核酸分子は、発現カセットの一部であり得、それはさらにベクター、例えば、ウイルス
ベクターの一部であり得る。
The present invention also comprises or consists of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, or said sequence of SEQ ID NO: 1 and at least 80 Use of an isolated nucleic acid molecule consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp with % overall identity, said isolated nucleic acid molecule inhibiting expression of an exogenous gene in cells of the primate retinal pigment epithelium A use is provided that specifically provides when a nucleic acid sequence encoding a sex gene is operably linked to said isolated nucleic acid molecule. In this use, the isolated nucleic acid molecule can further comprise a minimal promoter, such as the minimal promoter of SEQ ID NO:2. The isolated nucleic acid molecule can be part of an expression cassette, which can further be part of a vector, eg, a viral vector.
本発明は、網膜色素上皮と関連する疾患の治療における使用のための、配列番号1の核
酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列と少なくとも80%の
全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離核酸分子であって、霊
長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を、前記外因性遺伝子をコードする核
酸配列が前記単離核酸分子に作動可能に結合している場合に特異的にもたらす単離核酸分
子をさらに提供する。網膜色素上皮と関連する疾患は、加齢黄斑変性症、網膜色素変性症
、糖尿病性網膜症及び網膜色素上皮肥大症からなる群から選択することができる。
The present invention comprises or consists of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, or has at least 80% overall identity with said sequence of SEQ ID NO: 1, for use in the treatment of diseases associated with the retinal pigment epithelium. An isolated nucleic acid molecule consisting of a 400 bp nucleic acid sequence, wherein the nucleic acid sequence encoding the exogenous gene enables expression of an exogenous gene in cells of the primate retinal pigment epithelium. Further provided is an isolated nucleic acid molecule that specifically confers when bound. Diseases associated with the retinal pigment epithelium can be selected from the group consisting of age-related macular degeneration, retinitis pigmentosa, diabetic retinopathy and retinal pigment epithelial hypertrophy.
配列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記核酸配列
と少なくとも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離
核酸分子であって、遺伝子をコードする前記核酸配列に作動可能に結合している前記遺伝
子の霊長類の網膜色素上皮の細胞中の発現を特異的にもたらす単離核酸分子は、少なくと
も400bp、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なくとも700bp、
少なくとも750bp、少なくとも800bp、少なくとも900bp、少なくとも10
00bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp
、少なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくとも1600bp、少なく
とも1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも
2000bpであり得、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも80%の同一性を有する
。一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp
、少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも800bp、少なくとも9
00bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp
、少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なく
とも1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも19
00bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも
85%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400
bp、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくと
も800bp、少なくとも900bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100b
p、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少な
くとも1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも1
800bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1
の前記核酸配列と少なくとも90%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核
酸配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少な
くとも700bp、少なくとも800bp、少なくとも900bp、少なくとも1000
bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少
なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも
1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも20
00bpであり、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも95%の全体同一性を有する。
一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp、
少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも800bp、少なくとも90
0bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、
少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくと
も1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも190
0bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1と前記核酸配列と少なくとも9
6%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400b
p、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも
800bp、少なくとも900bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp
、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なく
とも1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも18
00bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1の
前記核酸配列と少なくとも97%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核酸
配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なく
とも700bp、少なくとも800bp、少なくとも900bp、少なくとも1000b
p、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少な
くとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも1
700bp、少なくとも1800bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも200
0bpであり、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも98%の全体同一性を有する。一
部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp、少
なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも800bp、少なくとも900
bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、少
なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくとも
1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも1900
bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも99
%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400bp
、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも8
00bp、少なくとも900bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp、
少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なくと
も1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも180
0bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1の前
記核酸配列と100%の全体同一性を有する。
An isolated nucleic acid molecule comprising or consisting of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 or consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp having at least 80% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, said nucleic acid molecule encoding a gene An isolated nucleic acid molecule that specifically confers expression in cells of retinal pigment epithelium of a primate of said gene operably linked to said nucleic acid sequence comprises:
at least 750 bp, at least 800 bp, at least 900 bp, at least 10
00bp, at least 1100bp, at least 1200bp, at least 1300bp
, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1800 bp, at least 1900 bp, or at least 2000 bp, and has at least 80% identity to said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp, at least 500 bp
, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 9
00bp, at least 1000bp, at least 1100bp, at least 1200bp
, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1800 bp, at least 19
00 bp, or at least 2000 bp and has at least 85% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1. In some embodiments, the nucleic acid sequence comprises at least 400
bp, at least 500 bp, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 900 bp, at least 1000 bp, at least 1100 bp
p, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1
800 bp, at least 1900 bp, or at least 2000 bp and SEQ ID NO: 1
has at least 90% overall identity with said nucleic acid sequence of In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp, at least 500 bp, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 900 bp, at least 1000 bp
bp, at least 1100 bp, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1800 bp, at least 1900 bp, or at least 20
00 bp and has at least 95% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1.
In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp, at least 500 bp,
at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 90
0 bp, at least 1000 bp, at least 1100 bp, at least 1200 bp,
at least 1300bp, at least 1400bp, at least 1500bp, at least 1600bp, at least 1700bp, at least 1800bp, at least 190bp
0 bp, or at least 2000 bp, and SEQ ID NO: 1 and said nucleic acid sequence and at least 9
It has 6% overall identity. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400b
p, at least 500bp, at least 600bp, at least 700bp, at least 800bp, at least 900bp, at least 1000bp, at least 1100bp
, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 18
00 bp, at least 1900 bp, or at least 2000 bp, and has at least 97% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400bp, at least 500bp, at least 600bp, at least 700bp, at least 800bp, at least 900bp, at least 1000bp
p, at least 1100 bp, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1
700 bp, at least 1800 bp, at least 1900 bp, or at least 200
0 bp and has at least 98% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp, at least 500 bp, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 900 bp
bp, at least 1000 bp, at least 1100 bp, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1800 bp, at least 1900
bp, or at least 2000 bp and at least 99 with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1
% overall identity. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp
, at least 500 bp, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 8
00bp, at least 900bp, at least 1000bp, at least 1100bp,
at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 180
0 bp, at least 1900 bp, or at least 2000 bp and having 100% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1.
本発明の単離核酸分子は、好ましくは、前記単離核酸分子に作動可能に結合している最
小プロモーター、例えば、SV40最小プロモーター、例えば、SV40最小プロモータ
ー
を含み得る。
An isolated nucleic acid molecule of the invention preferably comprises a minimal promoter, such as an SV40 minimal promoter, such as an SV40 minimal promoter, operably linked to said isolated nucleic acid molecule.
can include
本発明のプロモーターに作動可能に結合させることができる典型的な遺伝子は、光受容
体をコードする遺伝子である。例えば、これは、光感受性分子、例えば、チャネルロドプ
シン又はハロロドプシンであり得る。
A typical gene that can be operably linked to a promoter of the invention is a gene encoding a photoreceptor. For example, it can be a light sensitive molecule such as channelrhodopsin or halorhodopsin.
本発明者らは、目下、国際公開第2015/118507号パンフレットに記載のとお
りネズミモデルにおいて網膜アマクリン細胞中で特異的に遺伝子発現をドライブすること
が公知の人工プロモーターが、霊長類において予想外及び非定型的に全く異なる特異性を
有することを偶然に見出した。霊長類において、このプロモーターは、網膜色素上皮の細
胞中の遺伝子発現を特異的にドライブする。この特異性は、例えば、加齢黄斑変性症、網
膜色素変性症、糖尿病性網膜症又は網膜色素上皮肥大症患者の罹患網膜における網膜色素
上皮細胞中の遺伝子発現に対処し、それを標的化するために極端に有用である。
We now show that an artificial promoter known to drive gene expression specifically in retinal amacrine cells in a murine model, as described in WO2015/118507, unexpectedly and It was found by chance that they atypically have quite different specificities. In primates, this promoter specifically drives gene expression in cells of the retinal pigment epithelium. This specificity addresses and targets gene expression in retinal pigment epithelial cells in the diseased retina of patients with, for example, age-related macular degeneration, retinitis pigmentosa, diabetic retinopathy or retinal pigment epithelial hypertrophy. extremely useful for
このプロモーターの核酸配列は、
である。
The nucleic acid sequence of this promoter is
is.
したがって、本発明は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中で特異的に外因性遺伝子を発現
させる方法であって、配列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番
号1の前記配列と少なくとも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配
列からなる単離核酸分子を、前記霊長類の網膜色素上皮の細胞に送達するステップを含み
、前記単離核酸分子は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を、前記外
因性遺伝子をコードする核酸配列が前記単離核酸分子に作動可能に結合している場合に特
異的にもたらす方法を提供する。単離核酸分子は、最小プロモーター、例えば、配列番号
2の最小プロモーターをさらに含み得る。単離核酸分子は、発現カセットの一部であり得
、それはさらにベクター、例えば、ウイルスベクターの一部であり得る。
Accordingly, the present invention provides a method of expressing an exogenous gene specifically in cells of the retinal pigment epithelium of a primate comprising or consisting of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, or said sequence of SEQ ID NO: 1 delivering to cells of the retinal pigment epithelium of the primate an isolated nucleic acid molecule consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp having at least 80% overall identity with A method is provided for specifically effecting expression of an exogenous gene in cells of a pigment epithelium when a nucleic acid sequence encoding said exogenous gene is operably linked to said isolated nucleic acid molecule. The isolated nucleic acid molecule can further comprise a minimal promoter, eg, the minimal promoter of SEQ ID NO:2. The isolated nucleic acid molecule can be part of an expression cassette, which can further be part of a vector, eg, a viral vector.
本発明はまた、霊長類の網膜色素上皮の細胞中で特異的に外因性遺伝子を発現させるた
めの、配列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列
と少なくとも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離
核酸分子の使用であって、前記単離核酸分子は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性
遺伝子の発現を、前記外因性遺伝子をコードする核酸配列が前記単離核酸分子に作動可能
に結合している場合に特異的にもたらす使用を提供する。この使用において、単離核酸分
子は、最小プロモーター、例えば、配列番号2の最小プロモーターをさらに含み得る。単
離核酸分子は、発現カセットの一部であり得、それはベクター、例えば、ウイルスベクタ
ーの一部であり得る。
The present invention also comprises or consists of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, or said sequence of SEQ ID NO: 1 and at least 80 Use of an isolated nucleic acid molecule consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp with % overall identity, said isolated nucleic acid molecule inhibiting expression of an exogenous gene in cells of the primate retinal pigment epithelium A use is provided that specifically provides when a nucleic acid sequence encoding a sex gene is operably linked to said isolated nucleic acid molecule. In this use, the isolated nucleic acid molecule can further comprise a minimal promoter, such as the minimal promoter of SEQ ID NO:2. An isolated nucleic acid molecule can be part of an expression cassette, which can be part of a vector, eg, a viral vector.
本発明は、網膜色素上皮と関連する疾患の治療における使用のための、配列番号1の核
酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列と少なくとも80%の
全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離核酸分子であって、霊
長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を、前記外因性遺伝子をコードする核
酸配列が前記単離核酸分子に作動可能に結合している場合に特異的にもたらす単離核酸分
子をさらに提供する。網膜色素上皮と関連する疾患は、加齢黄斑変性症、網膜色素変性症
、糖尿病性網膜症及び網膜色素上皮肥大症からなる群から選択することができる。
The present invention comprises or consists of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, or has at least 80% overall identity with said sequence of SEQ ID NO: 1, for use in the treatment of diseases associated with the retinal pigment epithelium. An isolated nucleic acid molecule consisting of a 400 bp nucleic acid sequence, wherein the nucleic acid sequence encoding the exogenous gene enables expression of an exogenous gene in cells of the primate retinal pigment epithelium. Further provided is an isolated nucleic acid molecule that specifically confers when bound. Diseases associated with the retinal pigment epithelium can be selected from the group consisting of age-related macular degeneration, retinitis pigmentosa, diabetic retinopathy and retinal pigment epithelial hypertrophy.
配列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記核酸配列
と少なくとも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離
核酸分子であって、遺伝子をコードする前記核酸配列に作動可能に結合している前記遺伝
子の霊長類の網膜色素上皮の細胞中の発現を特異的にもたらす単離核酸分子は、少なくと
も400bp、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なくとも700bp、
少なくとも750bp、少なくとも800bp、少なくとも900bp、少なくとも10
00bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp
、少なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくとも1600bp、少なく
とも1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも
2000bpであり得、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも80%の同一性を有する
。一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp
、少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも800bp、少なくとも9
00bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp
、少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なく
とも1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも19
00bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも
85%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400
bp、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくと
も800bp、少なくとも900bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100b
p、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少な
くとも1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも1
800bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1
の前記核酸配列と少なくとも90%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核
酸配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少な
くとも700bp、少なくとも800bp、少なくとも900bp、少なくとも1000
bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少
なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも
1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも20
00bpであり、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも95%の全体同一性を有する。
一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp、
少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも800bp、少なくとも90
0bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、
少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくと
も1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも190
0bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも9
6%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400b
p、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも
800bp、少なくとも900bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp
、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なく
とも1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも18
00bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1の
前記核酸配列と少なくとも97%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核酸
配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なく
とも700bp、少なくとも800bp、少なくとも900bp、少なくとも1000b
p、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少な
くとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも1
700bp、少なくとも1800bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも200
0bpであり、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも98%の全体同一性を有する。一
部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400bp、少なくとも500bp、少
なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも800bp、少なくとも900
bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp、少なくとも1200bp、少
なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なくとも1500bp、少なくとも
1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも1800bp、少なくとも1900
bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1の前記核酸配列と少なくとも99
%の全体同一性を有する。一部の実施形態において、核酸配列は、少なくとも400bp
、少なくとも500bp、少なくとも600bp、少なくとも700bp、少なくとも8
00bp、少なくとも900bp、少なくとも1000bp、少なくとも1100bp、
少なくとも1200bp、少なくとも1300bp、少なくとも1400bp、少なくと
も1500bp、少なくとも1600bp、少なくとも1700bp、少なくとも180
0bp、少なくとも1900bp、又は少なくとも2000bpであり、配列番号1の前
記核酸配列と100%の全体同一性を有する。
An isolated nucleic acid molecule comprising or consisting of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 or consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp having at least 80% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, said nucleic acid molecule encoding a gene An isolated nucleic acid molecule that specifically confers expression in cells of retinal pigment epithelium of a primate of said gene operably linked to said nucleic acid sequence comprises:
at least 750 bp, at least 800 bp, at least 900 bp, at least 10
00bp, at least 1100bp, at least 1200bp, at least 1300bp
, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1800 bp, at least 1900 bp, or at least 2000 bp, and has at least 80% identity to said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp, at least 500 bp
, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 9
00bp, at least 1000bp, at least 1100bp, at least 1200bp
, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1800 bp, at least 19
00 bp, or at least 2000 bp and has at least 85% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1. In some embodiments, the nucleic acid sequence comprises at least 400
bp, at least 500 bp, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 900 bp, at least 1000 bp, at least 1100 bp
p, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1
800 bp, at least 1900 bp, or at least 2000 bp and SEQ ID NO: 1
has at least 90% overall identity with said nucleic acid sequence of In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp, at least 500 bp, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 900 bp, at least 1000 bp
bp, at least 1100 bp, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1800 bp, at least 1900 bp, or at least 20
00 bp and has at least 95% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1.
In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp, at least 500 bp,
at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 90
0 bp, at least 1000 bp, at least 1100 bp, at least 1200 bp,
at least 1300bp, at least 1400bp, at least 1500bp, at least 1600bp, at least 1700bp, at least 1800bp, at least 190bp
0 bp, or at least 2000 bp, with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 and at least 9
It has 6% overall identity. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400b
p, at least 500bp, at least 600bp, at least 700bp, at least 800bp, at least 900bp, at least 1000bp, at least 1100bp
, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 18
00 bp, at least 1900 bp, or at least 2000 bp, and has at least 97% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400bp, at least 500bp, at least 600bp, at least 700bp, at least 800bp, at least 900bp, at least 1000bp
p, at least 1100 bp, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1
700 bp, at least 1800 bp, at least 1900 bp, or at least 200
0 bp and has at least 98% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp, at least 500 bp, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 800 bp, at least 900 bp
bp, at least 1000 bp, at least 1100 bp, at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 1800 bp, at least 1900
bp, or at least 2000 bp and at least 99 with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1
% overall identity. In some embodiments, the nucleic acid sequence is at least 400 bp
, at least 500 bp, at least 600 bp, at least 700 bp, at least 8
00bp, at least 900bp, at least 1000bp, at least 1100bp,
at least 1200 bp, at least 1300 bp, at least 1400 bp, at least 1500 bp, at least 1600 bp, at least 1700 bp, at least 180
0 bp, at least 1900 bp, or at least 2000 bp and having 100% overall identity with said nucleic acid sequence of SEQ ID NO:1.
本発明の単離核酸分子は、最小プロモーター、例えば、SV40最小プロモーター、例
えば、SV40最小プロモーター
を含み得る。
An isolated nucleic acid molecule of the invention comprises a minimal promoter, such as an SV40 minimal promoter, such as an SV40 minimal promoter
can include
本発明のプロモーターに作動可能に結合させることができる典型的な遺伝子は、光受容
体をコードする遺伝子である。例えば、これは、光感受性分子、例えば、チャネルロドプ
シン又はハロロドプシンであり得る。
A typical gene that can be operably linked to a promoter of the invention is a gene encoding a photoreceptor. For example, it can be a light sensitive molecule such as channelrhodopsin or halorhodopsin.
本発明のプロモーターを使用する外因性遺伝子の発現は、インビトロ、インビボ又はエ
クスビボで行うことができる。
Expression of exogenous genes using the promoters of the invention can be performed in vitro, in vivo or ex vivo.
本明細書において使用される場合、用語「プロモーター」は、任意のシス調節エレメン
ト、例として、エンハンサー、サイレンサー、インスレーター及びプロモーターを指す。
プロモーターは、転写が必要とされる遺伝子の上流に(5’領域に向かって)一般には位
置するDNAの領域である。プロモーターは、それが制御する遺伝子の適切な活性化又は
抑制を可能とする。本発明の関連において、プロモーターは、それらに作動可能に結合し
ている遺伝子のインターニューロン中の特異的発現をもたらす。「あるタイプの細胞中で
のみの発現」とも称される「特異的発現」は、目的の遺伝子を発現する細胞の少なくとも
75%超が、規定されたタイプ、すなわち、本事例においては網膜色素上皮(RPE)細
胞であることを意味する。
As used herein, the term "promoter" refers to any cis-regulatory element, including enhancers, silencers, insulators and promoters.
A promoter is a region of DNA generally located upstream (towards the 5' region) of a gene whose transcription is required. A promoter allows the proper activation or repression of the gene it controls. In the context of the present invention, promoters provide specific expression in interneurons of genes to which they are operably linked. "Specific expression", also referred to as "expression only in certain types of cells", means that at least more than 75% of the cells expressing the gene of interest are of the defined type, i.e., in this case the retinal pigment epithelium (RPE) cell.
網膜の色素層又は網膜色素上皮(RPE)は、黒色色素としても公知であり、網膜視細
胞に栄養供給する神経感覚網膜のすぐ外側の色素細胞層であり、下層の脈絡膜及び上層の
網膜視細胞に固着している。RPEは、色素顆粒が高密度に充填された六角形の細胞の単
一層から構成される。鋸状縁において、RPEは、毛様体上を通過する膜として続き、虹
彩の後面として続く。これは、拡張器の線維を生成する。この上皮の真下に、神経上皮(
すなわち、桿体視細胞及び錐体視細胞)がRPEと一緒に通る。両方とも、合わせて、胚
の毛様体上皮であると理解される。網膜の前端は虹彩後上皮に続いており、それは虹彩に
入る場合に色素上に重なる。外表面から見る場合、これらの細胞は平滑であり、形状が六
角形である。断面で見る場合、それぞれの細胞は、大型の楕円形の核を含有する外側の非
色素部分及び一連の直線の糸状突起として桿体視細胞間に延びる内側の色素部分からなり
、これは特に眼球が光に曝露される場合である。RPEはいくつかの機能、すなわち、光
吸収、上皮輸送、空間的イオン緩衝、視覚サイクル、食作用、分泌及び免疫調節を有する
。
The pigment layer of the retina or retinal pigment epithelium (RPE), also known as black pigment, is the pigmented cell layer just outside the neurosensory retina that supplies retinal photoreceptors, the underlying choroid and the overlying retinal photoreceptors. stuck to. The RPE is composed of a single layer of hexagonal cells densely packed with pigment granules. At the serrated margin, the RPE continues as a membrane that passes over the ciliary body and continues as the posterior aspect of the iris. This creates dilator fibers. Beneath this epithelium, the neuroepithelium (
ie, rod photoreceptors and cone photoreceptors) pass with the RPE. Both are taken together to be understood as the ciliary epithelium of the embryo. The anterior edge of the retina is followed by the posterior iris epithelium, which overlies the pigment as it enters the iris. When viewed from the outer surface, these cells are smooth and hexagonal in shape. When viewed in cross-section, each cell consists of an outer non-pigmented portion containing a large oval nucleus and an inner pigmented portion that extends between the rod photoreceptors as a series of straight filaments, which are particularly visible in the eyeball. is exposed to light. RPE has several functions: light absorption, epithelial transport, spatial ion buffering, visual cycle, phagocytosis, secretion and immunoregulation.
発現カセットは典型的には、宿主細胞中への発現カセットの侵入及び宿主細胞中の発現
カセットの維持を促進するベクター中に導入される。このようなベクターは一般に使用さ
れており、当業者に周知である。多数のそのようなベクターは、例えば、Invitro
gen、Stratagene、Clontechなどから市販されており、多数のガイ
ド、例えば、Ausubel、Guthrie、Strathem、又はBergerな
どに記載されている(全て前掲)。このようなベクターとしては、典型的には、多重クロ
ーニング部位、及び追加のエレメント、例えば、複製起点、選択マーカー遺伝子(例えば
、LEU2、URA3、TRP1、HIS3、GFP)、セントロメア配列などと共にプ
ロモーター、ポリアデニル化シグナルなどが挙げられる。
The expression cassette is typically introduced into a vector that facilitates entry of the expression cassette into and maintenance of the expression cassette in the host cell. Such vectors are commonly used and well known to those skilled in the art. A number of such vectors are available, for example, in vitro
gen, Stratagene, Clontech, etc., and are described in numerous guides, such as Ausubel, Guthrie, Strathem, or Berger (all supra). Such vectors typically include multiple cloning sites and additional elements such as replication origins, selectable marker genes (e.g., LEU2, URA3, TRP1, HIS3, GFP), promoters, polyadenylation sequences, etc., along with centromere sequences and the like. signal, etc.
ウイルスベクター、例えば、AAV、PRV又はレンチウイルスは、本発明のプロモー
ターを使用して遺伝子を網膜色素上皮細胞に標的化し、送達するのに好適である。
Viral vectors such as AAV, PRV or lentiviruses are suitable for targeting and delivering genes to retinal pigment epithelial cells using the promoters of the invention.
網膜細胞のアウトプットは、電気的方法、例えば、多電極アレイ若しくはパッチクラン
プを使用して、又は視覚的方法、例えば、蛍光の検出を使用して計測することができる。
Retinal cell output can be measured using electrical methods, such as multi-electrode arrays or patch clamps, or using visual methods, such as detection of fluorescence.
本発明の核酸配列を使用する方法であって、本発明のプロモーター下で1つ以上の導入
遺伝子を発現する網膜色素上皮細胞と試験化合物を接触させるステップ、及び前記試験化
合物の存在下で得られた網膜色素上皮細胞の少なくとも1つのアウトプットを、前記試験
化合物の不存在下で得られた同一のアウトプットと比較するステップを含む方法は、RP
E細胞が関与する神経障害又は網膜障害の治療のための治療剤を同定するために使用する
ことができる。
A method of using a nucleic acid sequence of the invention comprising contacting a test compound with retinal pigment epithelial cells expressing one or more transgenes under a promoter of the invention, and comparing at least one output of the retinal pigment epithelial cells obtained from the RP
It can be used to identify therapeutic agents for the treatment of neuropathies or retinopathies involving E cells.
さらに、本発明のプロモーターを使用する方法であって、本発明のプロモーターの制御
下で1つ以上の導入遺伝子を発現する網膜色素上皮細胞を薬剤と接触させるステップ、及
び前記薬剤との接触後に得られた少なくとも1つのアウトプットを、前記薬剤との前記接
触前に得られた同一のアウトプットと比較するステップを含む方法も、視力回復のインビ
トロ試験に使用することができる。
Further, a method of using the promoter of the invention, comprising contacting retinal pigment epithelial cells expressing one or more transgenes under the control of the promoter of the invention with an agent; A method comprising comparing at least one output obtained with the same output obtained prior to said contact with said agent can also be used for in vitro testing of vision recovery.
チャネルロドプシンは、光開閉型イオンチャネルとして機能するオプシンタンパク質の
サブファミリーである。これらは、単細胞緑藻中で感覚光受容器として機能し、走光性、
すなわち、光に応答する運動を制御する。他の生物体の細胞中で発現されると、それらは
、細胞内酸性度、カルシウム流入、電気興奮性、及び他の細胞プロセスを制御するための
光の使用を可能とする。以下の少なくとも3つの「天然」チャネルロドプシン:チャネル
ロドプシン-1(ChR1)、チャネルロドプシン-2(ChR2)、及びボルボックス
チャネルロドプシン(VChR1)が現在公知である。さらに、これらのタンパク質の一
部の改変/改善バージョンも存在する。全ての公知のチャネルロドプシンは非特異的陽イ
オンチャネルであり、H+、Na+、K+、及びCa2+イオンを伝導する。
Channelrhodopsins are a subfamily of opsin proteins that function as light-gated ion channels. They function as sensory photoreceptors in unicellular green algae and are phototactic,
That is, it controls motion in response to light. When expressed in cells of other organisms, they enable the use of light to control intracellular acidity, calcium influx, electrical excitability, and other cellular processes. At least three “natural” channelrhodopsins are currently known: channelrhodopsin-1 (ChR1), channelrhodopsin-2 (ChR2), and Volvox channelrhodopsin (VChR1). Additionally, there are modified/improved versions of some of these proteins. All known channelrhodopsins are non-specific cation channels, conducting H+, Na+, K+, and Ca2+ ions.
ハロロドプシンは、塩化物イオンに特異的な光駆動性イオンポンプであり、好塩菌とし
て公知の系統発生的に古代の「細菌」(古細菌)に見出される。これは、レチニリデンタ
ンパク質ファミリーの7回膜貫通型タンパク質であり、光駆動性プロトンポンプバクテリ
オロドプシンと相同であり、網膜中で光を感知する色素の脊椎動物ロドプシンと三次構造
において類似する(しかし、一次配列構造においては類似しない)。ハロロドプシンは、
光駆動性イオンチャネルのチャネルロドプシンとも配列類似性を共有する。ハロロドプシ
ンは、必須の光異性化可能ビタミンA誘導体オールトランスレチナールを含有する。ハロ
ロドプシンは、結晶構造が公知の数少ない膜タンパク質の1つである。ハロロドプシンア
イソフォームは、好塩菌の複数の種、例として、H.サリナラム(H.salinaru
m)及びN.ファラオニス(N.pharaonis)に見出すことができる。非常に進
行中の研究はこれらの違いを探究中であり、それらを使用して光周期及びポンプ特性を別
個に解析している。バクテリオロドプシンの後に、ハロロドプシンは研究される最良のI
型(微生物)オプシンであり得る。ハロロドプシンレチナール複合体のピーク吸光度は約
570nmである。近年、ハロロドプシンは、オプトジェネティクスにおけるツールとな
っている。青色光活性化イオンチャネルのチャネルロドプシン-2が、青色光の短いパル
スで興奮性細胞(例えば、ニューロン、筋細胞、膵臓細胞、及び免疫細胞)を活性化させ
る能力を開くように、ハロロドプシンは、黄色光の短いパルスで興奮性細胞を静める能力
を開く。このように、ハロロドプシン及びチャネルロドプシンは一緒になって、神経活動
の多色光学的な活性化、鎮静、及び脱同期を可能とし、強力な神経工学のツールボックス
を作出する。
Halorhodopsin is a light-driven ion pump specific for chloride ions and is found in phylogenetically ancient "bacteria" (archaea) known as halophiles. It is a seven-transmembrane protein of the retinylidene protein family, homologous to the light-driven proton-pumping bacteriorhodopsin and similar in tertiary structure to the light-sensing pigment vertebrate rhodopsin in the retina (but , dissimilar in primary sequence structure). Halorhodopsin is
It also shares sequence similarity with the light-driven ion channel channelrhodopsin. Halorhodopsin contains the essential photoisomerizable vitamin A derivative all-trans-retinal. Halorhodopsin is one of the few membrane proteins for which the crystal structure is known. Halorhodopsin isoforms are isolated from multiple species of halophiles, including H. Salinarum (H. salinaru)
m) and N.M. It can be found in N. pharaonis. Much on-going research is exploring these differences and using them to analyze the photoperiod and pump properties separately. After bacteriorhodopsin, halorhodopsin is the best I studied
type (microbial) opsin. The peak absorbance of the halorhodopsin-retinal conjugate is approximately 570 nm. In recent years, halorhodopsin has become a tool in optogenetics. Halorhodopsin opens the ability of the blue-light-activated ion channel channelrhodopsin-2 to activate excitable cells (e.g., neurons, muscle cells, pancreatic cells, and immune cells) with short pulses of blue light. , opens the ability to calm excitable cells with short pulses of yellow light. Halorhodopsin and channelrhodopsin together thus enable polychromatic optical activation, sedation, and desynchronization of neuronal activity, creating a powerful neuroengineering toolbox.
一部の実施形態において、プロモーターは、網膜に標的化されるベクターの一部であり
、前記ベクターは、生存網膜色素上皮細胞中で検出可能な少なくとも1つのレポーター遺
伝子を発現する。このようなレポーター遺伝子は、機能神経回路を示し得る。このような
ベクターの例は、活動センサー又はレインボーウイルス(rainbow virus)
である(Nature Methods 6,127-130(2009))。このよう
なウイルスの例は、脳内で空間的に混ざったニューロン間の接続ニューロンの活動を光学
的にレポートする遺伝子コードされた活動センサーを有する逆行性経シナプス性偽性狂犬
病ウイルス(PRV)である。このような活動センサーは、外因性蛍光活動センサーを発
現する単離経シナプス性ウイルスであり得る。経シナプス性ウイルスは、ラブドウイルス
、例えば、狂犬病ウイルス、又はヘルペスウイルス、例えば、アルファヘルペスウイルス
、例えば、偽性狂犬病ウイルスであり得る。
In some embodiments, the promoter is part of a retina-targeted vector, wherein said vector expresses at least one reporter gene detectable in viable retinal pigment epithelial cells. Such reporter genes can indicate functional neural circuits. Examples of such vectors are activity sensors or rainbow viruses
(Nature Methods 6, 127-130 (2009)). An example of such a virus is the retrograde transsynaptic pseudorabies virus (PRV), which has genetically encoded activity sensors that optically report the activity of connecting neurons between spatially intermingled neurons in the brain. be. Such an activity sensor can be an isolated transsynaptic virus that expresses an exogenous fluorescent activity sensor. The transsynaptic virus may be a rhabdovirus, eg, rabies virus, or a herpesvirus, eg, an alphaherpesvirus, eg, pseudorabies virus.
蛍光外因性活動センサーは、蛍光タンパク質Ca2+センサー、例えば、イエローカメ
レオン、カンガルー、G-CaMP/ペリカン、若しくはTN-L15、又は蛍光タンパ
ク質電圧センサー、例えば、FlaSh、SPARC、若しくはVSP、好ましくは、V
SP1であり得る。
The fluorescent extrinsic activity sensor is a fluorescent protein Ca 2+ sensor, such as yellow chameleon, kangaroo, G-CaMP/pelican, or TN-L15, or a fluorescent protein voltage sensor, such as FlaSh, SPARC, or VSP, preferably V
It can be SP1.
本発明に好適なウイルスベクターは、当分野において周知である。例えば、AAV、P
RV又はレンチウイルスは、遺伝子を標的化し、網膜色素上皮細胞に送達するのに好適で
ある。
Viral vectors suitable for the present invention are well known in the art. For example, AAV, P
RV or lentiviruses are suitable for targeting and delivering genes to retinal pigment epithelial cells.
単離網膜を用いて作業する場合、光受容体に最適なウイルス送達は、網膜の光受容体側
が露出され、したがってより良好に形質移入され得るように神経節細胞側を下方にマウン
トすることにより達成することができる。別の技術は、送達ウイルスが内膜に浸透し得る
ように例えば、剃刀により網膜の内側の制限膜をスライスすることである。さらなる手法
は、網膜を寒天中に埋め込み、前記網膜をスライスし、スライスの側部から送達ウイルス
をアプライすることである。
When working with isolated retinas, optimal viral delivery to photoreceptors is by mounting the ganglion cell side down so that the photoreceptor side of the retina is exposed and thus can be better transfected. can be achieved. Another technique is to slice the inner limiting membrane of the retina, eg with a razor blade, so that the delivered virus can penetrate the inner membrane. A further approach is to embed the retina in agar, slice the retina and apply the delivery virus from the side of the slice.
形質移入された細胞のアウトプットは、周知の方法を使用して、例えば、電気的方法、
例えば、多電極アレイ若しくはパッチクランプを使用して、又は視覚的方法、例えば、蛍
光の検出を使用して計測することができる。一部の場合、内境界膜の顕微手術により内境
界膜が除去される。他の場合、記録は、内境界膜に実施されたスライスを通して達成され
る。
The output of transfected cells can be analyzed using well-known methods, e.g., electrical methods,
For example, it can be measured using a multi-electrode array or patch clamp, or using visual methods such as detection of fluorescence. In some cases, the internal limiting membrane is removed by microsurgery of the internal limiting membrane. In other cases, recording is accomplished through slices performed on the inner limiting membrane.
本発明に使用することができる網膜細胞源は、霊長類である。本発明の一部の実施形態
において、網膜細胞は、ヒト網膜に由来し、又はその中に存在する。他の実施形態におい
て、網膜は、2つの区別される系統、直鼻猿半目及び曲鼻猿半目のいずれかからの別の霊
長類からのものである。ヒト網膜は、前記網膜が角膜の切開後に通常廃棄される角膜バン
クから容易に得ることができる。成人ヒト網膜は大表面(約1100mm2)を有し、し
たがって多数の実験的小領域に容易に分離することができる。さらに、網膜は、シナプス
伝達についての精巧なモデルとして使用することもできる。それというのも、網膜は、脳
の他の部分と同一のシナプスを有するためである。
Sources of retinal cells that can be used in the present invention are primates. In some embodiments of the invention, the retinal cells are derived from or reside within the human retina. In other embodiments, the retina is from another primate from either of the two distinct lineages, Hemiprhines Rhinophytes and Hemiprhines. Human retinas can be readily obtained from corneal banks where the retinas are usually discarded after corneal incision. The adult human retina has a large surface area (approximately 1100 mm 2 ) and can therefore be easily separated into numerous experimental subregions. Additionally, the retina can be used as an elaborate model for synaptic transmission. This is because the retina has the same synapses as the rest of the brain.
本明細書において使用される場合、用語「動物」は、全ての動物を含むように本明細書
において使用される。一部の実施形態において、非ヒト動物は脊椎動物である。動物の例
は、ヒト、マウス、ラット、ウシ、ブタ、ウマ、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、ネコ、イ
ヌなどである。用語「動物」はまた、胚期及び胎生期を含め、全ての発生段階における個
々の動物を含む。「遺伝子改変動物」は、細胞下レベルでの意図的な遺伝子操作、例えば
、標的化組換え、マイクロインジェクション又は組換えウイルスの感染によるものにより
、直接的又は間接的に変更され、又は受け入れられた遺伝子情報を担持する1つ以上の細
胞を含有する任意の動物である。用語「遺伝子改変動物」は、古典的な交雑も体外受精も
包含するものではなく、むしろ、1つ以上の細胞が組換えDNA分子により変更され、又
はそれを受け入れている動物を包含することを意味する。この組換えDNA分子は、規定
の遺伝子座に特異的に標的化され得、染色体内にランダムに組み込まれ得、又はそれは、
染色体外複製DNAであり得る。用語「生殖細胞系列遺伝子改変動物」は、遺伝子変更又
は遺伝子情報が生殖系列細胞中に導入され、それにより、遺伝子情報をその子孫へ伝達す
る能力が付与された遺伝子改変動物を指す。このような子孫が、実際、その変更又は遺伝
子情報の一部又は全部を保有する場合、それらは、同様に遺伝子改変動物である。
As used herein, the term "animal" is used herein to include all animals. In some embodiments, the non-human animal is a vertebrate. Examples of animals are humans, mice, rats, cows, pigs, horses, chickens, ducks, geese, cats, dogs, and the like. The term "animal" also includes individual animals at all stages of development, including embryonic and fetal stages. A "genetically modified animal" is one that has been altered, directly or indirectly, by deliberate genetic manipulation at the subcellular level, e.g., by targeted recombination, microinjection or infection with a recombinant virus, or received Any animal that contains one or more cells that carry genetic information. The term "genetically modified animal" does not include classical crosses or in vitro fertilization, but rather animals in which one or more cells have been altered by, or have received, recombinant DNA molecules. means. This recombinant DNA molecule may be specifically targeted to a defined locus, may integrate randomly into the chromosome, or it may
It may be extrachromosomally replicating DNA. The term "germline genetically modified animal" refers to a genetically modified animal in which a genetic alteration or genetic information has been introduced into germline cells, thereby conferring the ability to transmit the genetic information to its progeny. If such offspring, in fact, carry some or all of the alteration or genetic information, they are also genetically modified animals.
変更又は遺伝子情報は、レシピエントが属する動物の種にとって外来、若しくは特定の
個々のレシピエントにとってのみ外来であり得、又はレシピエントにより既に保有される
遺伝子情報であり得る。その最後の場合、変更され、又は導入された遺伝子は、天然遺伝
子とは異なって発現され得、又は全く発現され得ない。
The alteration or genetic information may be foreign to the species of animal to which the recipient belongs, or foreign only to the particular individual recipient, or may be genetic information already possessed by the recipient. In that last case, the altered or introduced gene may be expressed differently than the native gene, or may not be expressed at all.
標的遺伝子を変更するために使用される遺伝子は広範な技術により得ることができ、そ
れとしては、限定されるものではないが、ゲノム資源からの単離、単離mRNAテンプレ
ートからのcDNAの調製、直接的合成、又はそれらの組合せが挙げられる。
Genes used to alter target genes can be obtained by a wide variety of techniques including, but not limited to, isolation from genomic sources, preparation of cDNA from isolated mRNA templates, Direct synthesis, or combinations thereof are included.
導入遺伝子導入のための標的細胞のタイプは、ES細胞である。ES細胞は、インビト
ロで培養された着床前胚から得ることができ、胚と融合することができる(Evans
et al.(1981),Nature 292:154-156;Bradley
et al.(1984),Nature 309:255-258;Gossler
et al.(1986),Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83:9
065-9069;Robertson et al.(1986),Nature 3
22:445-448;Wood et al.(1993),Proc.Natl.A
cad.Sci.USA 90:4582-4584)。導入遺伝子は、標準的技術、例
えば、エレクトロポレーションを使用するDNA形質移入により、又はレトロウイルス媒
介性形質導入によりES細胞中に効率的に導入することができる。得られた形質転換ES
細胞は、その後、凝集により桑実胚と組み合わせることができ、又は非ヒト動物からの胚
盤胞中に注射することができる。その後、導入ES細胞は胚をコロニー化し、得られたキ
メラ動物の生殖細胞系列に寄与する(Jaenisch(1988),Science
240:1468-1474)。遺伝子標的化された遺伝子改変マウスの生成における遺
伝子標的化されたES細胞の使用は1987年に記載され(Thomas et al.
(1987),Cell 51:503-512)、他箇所で概説されている(Froh
man et al.(1989),Cell 56:145-147;Capecch
i(1989),Trends in Genet.5:70-76;Baribaul
t et al.(1989),Mol.Biol.Med.6:481-492;Wa
gner(1990),EMBO J.9:3025-3032;Bradley et
al.(1992),Bio/Technology 10:534-539)。
A target cell type for transgene transfer is the ES cell. ES cells can be obtained from preimplantation embryos cultured in vitro and fused with embryos (Evans
et al. (1981), Nature 292:154-156;
et al. (1984), Nature 309:255-258;
et al. (1986), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83:9
065-9069; Robertson et al. (1986), Nature 3
22:445-448; Wood et al. (1993), Proc. Natl. A.
cad. Sci. USA 90:4582-4584). Transgenes can be efficiently introduced into ES cells by standard techniques, such as DNA transfection using electroporation, or by retrovirus-mediated transduction. Obtained transformed ES
Cells can then be combined with morulae by agglutination or injected into blastocysts from non-human animals. The introduced ES cells then colonize the embryo and contribute to the germ line of the resulting chimeric animal (Jaenisch (1988), Science
240:1468-1474). The use of gene-targeted ES cells in the generation of gene-targeted, genetically modified mice was described in 1987 (Thomas et al.
(1987), Cell 51:503-512), reviewed elsewhere (Froh
man et al. (1989), Cell 56:145-147;
i (1989), Trends in Genet. 5:70-76; Baribaul
t et al. (1989), Mol. Biol. Med. 6:481-492;
gner (1990), EMBOJ. 9:3025-3032; Bradley et al.
al. (1992), Bio/Technology 10:534-539).
染色体アレル中に特異的変化を挿入するための標的化相同組換えを使用することにより
、任意の遺伝子領域を不活性化させ、又は所望される任意の突然変異に変更する技術が利
用可能である。
Techniques are available to inactivate any genetic region or alter any mutation desired by using targeted homologous recombination to insert specific changes in a chromosomal allele. .
本明細書において使用される場合、「標的化遺伝子」は、ヒトの介入により非ヒト動物
の生殖細胞系列中に導入されるDNA配列であり、それとしては、限定されるものではな
いが、本明細書に記載の方法が挙げられる。本発明の標的化遺伝子としては、同族の内因
性アレルを特異的に変化させるように設計されるDNA配列が挙げられる。
As used herein, a "targeting gene" is a DNA sequence that is introduced into the germline of a non-human animal by human intervention and includes, but is not limited to, Methods described in the specification can be mentioned. Targeting genes of the present invention include DNA sequences designed to specifically alter the cognate endogenous allele.
本発明において、「単離」は、その元の環境(例えば、それが天然に存在する場合、天
然の環境)から取り出された材料を指し、したがって、その天然状態から「人工的に」変
更されている。例えば、単離ポリヌクレオチドは、ベクター若しくは物質の組成物の一部
であり得、又は細胞内に含有され得、依然として「単離」されている。それというのも、
そのベクター、物質の組成物、又は特定の細胞はそのポリヌクレオチドの元の環境ではな
いためである。用語「単離」は、ゲノムライブラリーもcDNAライブラリーも、全細胞
トータルRNA調製物もmRNA調製物も、ゲノムDNA調製物(電気泳動により分離さ
れ、ブロット上に転写されたものを含む)も、剪断された全細胞ゲノムDNA調製物も、
当分野が本発明のポリヌクレオチド/配列の区別される特色を実証していない他の組成物
も指さない。単離DNA分子のさらなる例としては、異種宿主細胞中で維持された組換え
DNA分子又は溶液中の(部分的に、又は実質的に)精製されたDNA分子が挙げられる
。単離RNA分子としては、本発明のDNA分子のインビボ又はインビトロRNA転写産
物が挙げられる。しかしながら、ライブラリーの他のメンバーから単離されていないライ
ブラリー(例えば、ゲノム又はcDNAライブラリー)のメンバーであるクローン中に(
例えば、ライブラリーのそのクローン及び他のメンバーを含有する均質な溶液の形態で)
、あるいは細胞又は細胞溶解物から取り出された染色体(例えば、核型におけるような「
染色体スプレッド」)内に、あるいはランダムに剪断されたゲノムDNAの調製物又は1
つ以上の制限酵素により切断されたゲノムDNAの調製物内に含有される核酸は、この発
明においては、「単離」されていない。本明細書にさらに考察されるとおり、本発明によ
る単離核酸分子は、天然に、組換えにより、又は合成により産生することができる。
In the present invention, "isolated" refers to material that has been removed from its original environment (e.g., the natural environment if it is naturally occurring) and thus has been "artificially" altered from its natural state. ing. For example, an isolated polynucleotide can be part of a vector or composition of matter, or can be contained within a cell and still be "isolated."That's because
This is because the vector, composition of matter, or particular cell is not the original environment of the polynucleotide. The term "isolated" includes neither genomic libraries nor cDNA libraries, whole-cell total RNA preparations or mRNA preparations, and genomic DNA preparations (including those separated by electrophoresis and transcribed onto a blot). , a sheared whole-cell genomic DNA preparation,
It also does not refer to other compositions for which the art has not demonstrated distinct features of the polynucleotides/sequences of the present invention. Further examples of isolated DNA molecules include recombinant DNA molecules maintained in heterologous host cells or purified (partially or substantially) DNA molecules in solution. Isolated RNA molecules include in vivo or in vitro RNA transcripts of the DNA molecules of the present invention. However, in clones that are members of a library (e.g., a genomic or cDNA library) that are not isolated from other members of the library (
e.g. in the form of a homogeneous solution containing that clone and other members of the library)
, or chromosomes removed from cells or cell lysates (e.g., as in karyotypes)
A preparation of randomly sheared genomic DNA within a chromosomal spread") or 1
Nucleic acids contained within a preparation of genomic DNA cut by more than one restriction enzyme are not "isolated" for purposes of this invention. As discussed further herein, an isolated nucleic acid molecule according to the invention can be produced naturally, recombinantly, or synthetically.
「ポリヌクレオチド」は、一本鎖DNA及び二本鎖DNA、一本鎖領域及び二本鎖領域
の混合物であるDNA、一本鎖RNA及び二本鎖RNA、ならびに一本鎖領域及び二本鎖
領域の混合物であるRNA、一本鎖、又はより典型的には二本鎖、又は一本鎖領域及び二
本鎖領域の混合物であり得るDNA及びRNAを含むハイブリッド分子から構成され得る
。さらに、ポリヌクレオチドは、RNA又はDNA又はRNA及びDNAの両方を含む三
本鎖領域から構成され得る。ポリヌクレオチドはまた、1つ以上の改変塩基又は安定性の
ために若しくは他の理由のために改変されたDNA若しくはRNA骨格を含有し得る。「
改変」塩基としては、例えば、トリチル化塩基及び異常塩基、例えば、イノシンが挙げら
れる。種々の改変がDNA及びRNAになされ得;したがって、「ポリヌクレオチド」は
、化学的に、酵素的に、又は代謝的に改変された形態を包含する。
"Polynucleotide" includes single- and double-stranded DNA, DNA that is a mixture of single- and double-stranded regions, single- and double-stranded RNA, and single- and double-stranded regions It may be composed of hybrid molecules comprising DNA and RNA, which may be a mixture of regions, RNA, single-stranded, or more typically double-stranded, or a mixture of single- and double-stranded regions. In addition, polynucleotides can be composed of triple-stranded regions comprising RNA or DNA or both RNA and DNA. Polynucleotides may also contain one or more modified bases or DNA or RNA backbones modified for stability or for other reasons. "
Modified"bases include, for example, tritylated bases and unusual bases such as inosine. Various modifications can be made to DNA and RNA; thus, "polynucleotide" includes chemically, enzymatically, or metabolically modified forms.
表現「ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド」は、そのポリペプチドについての
コード配列のみを含むポリヌクレオチドならびに追加のコード配列及び/又は非コード配
列を含むポリヌクレオチドを包含する。
The phrase "polynucleotide encoding a polypeptide" encompasses a polynucleotide that contains only coding sequences for that polypeptide as well as polynucleotides that contain additional coding and/or non-coding sequences.
「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」は、50%のホルムアミド、5×
SSC(750mMのNaCl、75mMのクエン酸三ナトリウム)、50mMのリン酸
ナトリウム(pH7.6)、5×デンハルト溶液、10%の硫酸デキストラン、及び20
μg/ml変性剪断サケ***DNAを含む溶液中の42℃における一晩のインキュベーシ
ョンとそれに続く約50℃における0.1×SSC中のフィルターの洗浄を指す。ハイブ
リダイゼーション及びシグナル検出のストリンジェンシーの変化は、主に、ホルムアミド
濃度(より低い割合のホルムアミドがストリンジェンシーの低下をもたらす);塩条件、
又は温度の操作を通して達成される。例えば、中程度に高いストリンジェンシー条件とし
ては、6×SSPE(20×SSPE=3MのNaCl;0.2MのNaH2PO4;0
.02MのEDTA、pH7.4)、0.5%のSDS、30%のホルムアミド、100
μg/mlのサケ***ブロッキングDNAを含む溶液中の37℃における一晩のインキュ
ベーションとそれに続く50℃における1×SSPE、0.1%のSDSによる洗浄が挙
げられる。さらに、いっそうより低いストリンジェンシーを達成するため、ストリンジェ
ントなハイブリダイゼーション後に実施される洗浄は、より高い塩濃度(例えば、5×S
SC)において行うことができる。上記の条件における変法は、ハイブリダイゼーション
実験においてバックグラウンドを抑制するために使用される代替ブロッキング試薬の包含
及び/又は置換を通して達成することができる。典型的なブロッキング試薬としては、デ
ンハルト試薬、BLOTTO、ヘパリン、変性サケ***DNA、及び市販の専売配合物が
挙げられる。規定のブロッキング試薬の包含は、適合性についての問題に起因して上記の
ハイブリダイゼーション条件の改変を要求し得る。
"Stringent hybridization conditions" are 50% formamide, 5x
SSC (750 mM NaCl, 75 mM trisodium citrate), 50 mM sodium phosphate (pH 7.6), 5× Denhardt's solution, 10% dextran sulfate, and 20
Refers to overnight incubation at 42°C in a solution containing μg/ml denatured sheared salmon sperm DNA, followed by washing of filters in 0.1 x SSC at approximately 50°C. Changes in the stringency of hybridization and signal detection are primarily due to formamide concentration (lower percentages of formamide result in decreased stringency); salt conditions;
or through manipulation of temperature. For example, moderately high stringency conditions include 6 x SSPE (20 x SSPE = 3 M NaCl; 0.2 M NaH2PO4 ; 0
. 02M EDTA, pH 7.4), 0.5% SDS, 30% formamide, 100
Overnight incubation at 37°C in a solution containing μg/ml salmon sperm blocking DNA followed by washing with 1 x SSPE, 0.1% SDS at 50°C. Furthermore, to achieve even lower stringency, washes performed after stringent hybridization are performed at higher salt concentrations (e.g., 5×S
SC). Variations on the above conditions can be accomplished through the inclusion and/or substitution of alternate blocking reagents used to suppress background in hybridization experiments. Typical blocking reagents include Denhardt's reagent, BLOTTO, heparin, denatured salmon sperm DNA, and commercial proprietary formulations. Inclusion of defined blocking reagents may require modification of the above hybridization conditions due to compatibility issues.
ポリペプチドに言及する場合の用語「断片」、「誘導体」及び「アナログ」は、そのよ
うなポリペプチドと実質的に同一の生物学的機能又は活性のいずれかを保持するポリペプ
チドを意味する。アナログとしては、プロタンパク質部分の開裂により活性化させて活性
成熟ポリペプチドを産生することができるプロタンパク質が挙げられる。
The terms "fragment,""derivative," and "analog," when referring to polypeptides, refer to polypeptides that retain either substantially the same biological function or activity as such polypeptides. Analogs include proproteins that can be activated by cleavage of the proprotein portion to produce an active mature polypeptide.
用語「遺伝子」は、ポリペプチド鎖の産生に関与するDNAのセグメントを意味し;そ
れは、コード領域に先行する領域及びその後に続く領域「リーダー及びトレーラー」なら
びに個々のコードセグメント(エクソン)間の介在配列(イントロン)を含む。
The term "gene" means a segment of DNA involved in the production of a polypeptide chain; it includes regions preceding and following the coding region "leader and trailer" and intervening regions between individual coding segments (exons). Contains sequences (introns).
ポリペプチドは、ペプチド結合により互いに連結しているアミノ酸又は改変ペプチド結
合により互いに連結しているアミノ酸、すなわち、ペプチドイソスターから構成され得、
20個の遺伝子コードアミノ酸以外のアミノ酸を含有し得る。ポリペプチドは、天然プロ
セス、例えば、翻訳後プロセシング、又は当分野において周知の化学修飾技術のいずれか
により修飾することができる。このような修飾は、基礎的な教本及びより詳細なモノグラ
フ、ならびに膨大な研究論文に十分記載されている。修飾は、ポリペプチド中のいずれの
箇所においても生じ得、その箇所としては、ペプチド骨格、アミノ酸側鎖及びアミノ又は
カルボキシル末端が挙げられる。同一のタイプの修飾が、所与のポリペプチド中のいくつ
かの部位において同一又は変動する程度で存在し得ることが認識される。さらに、所与の
ポリペプチドは、多くのタイプの修飾を含有し得る。ポリペプチドは、例えば、ユビキチ
ン化の結果として分枝鎖であり得、それらは分枝を有し、又は分枝を有さない環状であり
得る。環状、分枝鎖、及び分枝鎖環状ポリペプチドは翻訳後の天然プロセスから生じ得、
又は合成方法により作製することができる。修飾としては、限定されるものではないが、
アセチル化、アシル化、ビオチン化、ADP-リボシル化、アミド化、フラビンの共有結
合性付着、ヘム部分の共有結合性付着、ヌクレオチド又はヌクレオチド誘導体の共有結合
性付着、脂質又は脂質誘導体の共有結合性付着、ホスホチジルイノシトール(phosp
hotidylinositol)の共有結合性付着、架橋、環化、公知の保護/ブロッ
キング基による誘導体化、ジスルフィド結合形成、脱メチル化、共有結合性架橋の形成、
システインの形成、ピログルタメートの形成、ホルミル化、ガンマ-カルボキシル化、グ
リコシル化、GPIアンカー形成、ヒドロキシル化、ヨウ素化、抗体分子又は他の細胞リ
ガンドへの結合、メチル化、ミリストイル化、酸化、ペグ化、タンパク質分解プロセシン
グ(例えば、開裂)、リン酸化、プレニル化、ラセミ化、セレノイル化、硫酸化、タンパ
ク質へのアミノ酸のトランスファーRNA媒介付加、例えば、アルギニル化、及びユビキ
チン化が挙げられる(例えば、PROTEINS-STRUCTURE AND MOL
ECULAR PROPERTIES,2nd Ed.,T.E.Creighton,
W.H.Freeman and Company,New York(1993);P
OSTTRANSLATIONAL COVALENT MODIFICATION O
F PROTEINS,B.C.Johnson,Ed.,Academic Pres
s,New York,pgs.I-12(1983);Seifter et al.
,Meth Enzymol 182:626-646(1990);Rattan e
t al.,Ann NY Acad Sci 663:48-62(1992)参照)
。
Polypeptides can be composed of amino acids linked together by peptide bonds or amino acids linked together by modified peptide bonds, i.e., peptide isosteres,
It may contain amino acids other than the 20 gene-encoded amino acids. Polypeptides can be modified either by natural processes, such as post-translational processing, or by chemical modification techniques that are well known in the art. Such modifications are well described in basic textbooks and more detailed monographs, as well as numerous research papers. Modifications can occur anywhere in a polypeptide, including the peptide backbone, the amino acid side-chains and the amino or carboxyl termini. It is recognized that the same type of modification can be present in the same or varying degrees at several sites in a given polypeptide. Also, a given polypeptide may contain many types of modifications. Polypeptides may be branched, for example, as a result of ubiquitination, and they may be unbranched or cyclic. Cyclic, branched, and branched cyclic polypeptides may result from posttranslational natural processes,
Alternatively, it can be produced by a synthetic method. Modifications include, but are not limited to,
Acetylation, acylation, biotinylation, ADP-ribosylation, amidation, covalent attachment of flavins, covalent attachment of heme moieties, covalent attachment of nucleotides or nucleotide derivatives, covalent attachment of lipids or lipid derivatives attachment, phosphotidylinositol (phosp
covalent attachment, cross-linking, cyclization, derivatization with known protecting/blocking groups, disulfide bond formation, demethylation, formation of covalent cross-links,
cysteine formation, pyroglutamate formation, formylation, gamma-carboxylation, glycosylation, GPI anchor formation, hydroxylation, iodination, binding to antibody molecules or other cellular ligands, methylation, myristoylation, oxidation, pegylation conversion, proteolytic processing (e.g., cleavage), phosphorylation, prenylation, racemization, selenoylation, sulfation, transfer RNA-mediated addition of amino acids to proteins, e.g., arginylation, and ubiquitination (e.g., PROTEINS-STRUCTURE AND MOL
ECULAR PROPERTIES, 2nd Ed. , T. E. Creighton,
W. H. Freeman and Company, New York (1993);
OST TRANSLATIONAL COVALENT MODIFICATION O
F PROTEINS, B.F. C. Johnson, Ed. , Academic Press
s, New York, pgs. 1-12 (1983); Seifter et al.
, Meth Enzymol 182:626-646 (1990);
tal. Ann NY Acad Sci 663:48-62 (1992)).
.
「生物学的活性を有する」ポリペプチド断片は、用量依存性を伴い、又は伴わない、特
定の生物学的アッセイにおいて計測される元のポリペプチド、例えば、成熟形態の活性と
類似するが必ずしも同一でなくてもよい活性を示すポリペプチドを指す。用量依存性が存
在する場合、それは、ポリペプチドのそれと同一である必要はなく、むしろ、元のポリペ
プチドと比較して所与の活性において用量依存性と実質的に類似する(すなわち、候補ポ
リペプチドは、元のポリペプチドに対して高い活性又は約25倍以下少ない、一部の実施
形態においては、約10倍以下少ない活性、若しくは約3倍以下少ない活性を示す)。
A polypeptide fragment "having biological activity" is similar, but not necessarily identical, to the activity of the parent polypeptide, e.g., the mature form, measured in a particular biological assay, with or without dose dependence. Refers to a polypeptide that exhibits an activity that does not have to be If a dose dependence exists, it need not be identical to that of the polypeptide, but rather substantially similar to the dose dependence in a given activity compared to the original polypeptide (i.e., the candidate polypeptide The peptide exhibits greater activity or less than about 25-fold, in some embodiments less than about 10-fold, or less than about 3-fold less activity relative to the original polypeptide).
種ホモログは、本明細書に提供される配列から好適なプローブ又はプライマーを作製し
、好適な核酸資源を所望のホモログについてスクリーニングすることにより単離及び同定
することができる。
Species homologs can be isolated and identified by making suitable probes or primers from the sequences provided herein and screening suitable nucleic acid resources for the desired homologs.
「バリアント」は、元のポリヌクレオチド又はポリペプチドとは異なるが、その必須の
特性を保持するポリヌクレオチド又はポリペプチドを指す。一般に、バリアントは、元の
ポリヌクレオチド又はポリペプチドと全体的に密接に類似し、多くの領域において、同一
である。
A "variant" refers to a polynucleotide or polypeptide that differs from an original polynucleotide or polypeptide, but retains essential properties thereof. Generally, variants are generally closely similar to the original polynucleotide or polypeptide, and are, over many regions, identical.
実際問題として、任意の特定の核酸分子又はポリペプチドが、本発明のヌクレオチド配
列と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、9
9%、又は100%同一であるか否かは、慣用的には、公知のコンピュータプログラムを
使用して決定することができる。グローバル配列アラインメントとも称される、クエリ配
列(本発明の配列)と対象配列との間の最良の全体的なマッチを決定するための好ましい
方法は、Brutlagら(Comp.App.Blosci.(1990)6:237
-245)のアルゴリズムに基づくFASTDBコンピュータプログラムを使用して決定
することができる。配列アラインメントにおいて、クエリ配列及び対象配列は両方ともD
NA配列である。RNA配列は、UをTに変換することにより比較することができる。前
記グローバル配列アラインメントの結果は、パーセント同一性におけるものである。パー
セント同一性を計算するためのDNA配列のFASTDBアラインメントに使用される好
ましいパラメータは以下である:行列=ユニタリー、k-タプル=4、ミスマッチペナル
ティ--1、結合ペナルティ--30、ランダム化グループ長=0、カットオフスコア=
l、ギャップペナルティ--5、ギャップサイズペナルティ0.05、ウィンドウサイズ
=500又は対象ヌクレオチド配列の長さのどちらか短い方。対象配列が、内部欠失のた
めではなく5’又は3’欠失に起因してクエリ配列よりも短い場合、その結果を手作業に
より補正しなければならない。これは、FASTDBプログラムが、パーセント同一性を
計算する場合、対象配列の5’及び3’トランケーションを考慮しないためである。クエ
リ配列に対して5’又は3’末端においてトランケートされた対象配列について、パーセ
ント同一性は、クエリ配列の全塩基のパーセントとして、マッチング/アラインメントさ
れていない対象配列の5’及び3’であるクエリ配列の塩基の数を計算することにより補
正される。ヌクレオチドがマッチング/アラインメントされているか否かは、FASTD
B配列アラインメントの結果により決定される。次いで、この割合は、規定のパラメータ
を使用する上記のFASTDBプログラムにより計算されたパーセント同一性から減算さ
れ、最終のパーセント同一性スコアに達する。この補正スコアが、本発明のために使用さ
れるものである。クエリ配列とマッチング/アラインメントされていない、FASTDB
アラインメントによりディスプレイされる対象配列の5’及び3’塩基の外側の塩基のみ
が、パーセント同一性スコアを手作業により調整する目的に計算される。例えば、90塩
基の対象配列は、100塩基のクエリ配列とアラインメントされてパーセント同一性が決
定される。欠失は対象配列の5’末端において生じ、したがって、FASTDBアライン
メントは、5’末端における最初の10塩基のマッチング/アラインメントを示さない。
この10個の損なわれた塩基はその配列の10%(マッチングされていない5’及び3’
末端における塩基の数/クエリ配列中の塩基の総数)に相当し、したがって、10%がF
ASTDBプログラムにより計算されたパーセント同一性スコアから減算される。残りの
90塩基が完全にマッチした場合、最終のパーセント同一性は90%である。別の例にお
いて、90塩基の対象配列が、100塩基のクエリ配列と比較される。この場合、欠失は
内部欠失であるため、クエリとマッチング/アラインメントされていない対象配列の5’
にも3’にも塩基は存在しない。この場合、FASTDBにより計算されたパーセント同
一性は、手作業により補正されない。これにもかかわらず、特定の場合において、全体同
一性は、例えば、配列番号1の配列と少なくともいくらかの程度の類似性を有する配列の
部分のみを指す。換言すると、2000bpのクエリ配列の配列同一性は、配列番号1を
含む配列の一部又はその極めて類似する一部についてのみ計算される。
As a matter of fact, any particular nucleic acid molecule or polypeptide will be at least 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 96%, 97%, 98%, 9
9% or 100% identity can be routinely determined using known computer programs. A preferred method for determining the best overall match between a query sequence (sequence of the invention) and a subject sequence, also called a global sequence alignment, is described by Brutlag et al. (Comp. App. Blosci. (1990)). 6:237
-245) using the FASTDB computer program. In sequence alignments, both the query and subject sequences are D
It is an NA sequence. RNA sequences can be compared by converting U's to T's. The results of said global sequence alignment are in percent identity. Preferred parameters used for FASTDB alignments of DNA sequences to calculate percent identity are: matrix=unitary, k-tuple=4, mismatch penalty--1, join penalty--30, randomization group length. = 0, cutoff score =
l, Gap Penalty −−5, Gap Size Penalty 0.05, Window Size=500 or the length of the subject nucleotide sequence, whichever is less. If the subject sequence is shorter than the query sequence due to 5' or 3' deletions rather than due to internal deletions, the results must be manually corrected. This is because the FASTDB program does not consider 5' and 3' truncations of the subject sequence when calculating percent identity. For a subject sequence truncated at the 5' or 3' end to the query sequence, the percent identity is as a percentage of the total bases of the query sequence 5' and 3' of the unmatched/unaligned subject sequence. Corrected by calculating the number of bases in the sequence. Whether a nucleotide is matched/aligned is determined by FASTD
Determined by the results of the B sequence alignment. This percentage is then subtracted from the percent identity, calculated by the above FASTDB program using the defined parameters, to arrive at a final percent identity score. This corrected score is what is used for the purposes of the present invention. FASTDB not matched/aligned with query sequence
Only bases outside the 5' and 3' bases of the subject sequence displayed by the alignment are calculated for purposes of manually adjusting the percent identity score. For example, a 90 base subject sequence is aligned with a 100 base query sequence to determine percent identity. The deletion occurred at the 5' end of the subject sequence, so the FASTDB alignment shows no match/alignment of the first 10 bases at the 5' end.
The 10 damaged bases represent 10% of the sequence (unmatched 5' and 3'
number of bases at the end/total number of bases in the query sequence), thus 10% F
It is subtracted from the percent identity score calculated by the ASTDB program. If the remaining 90 bases were perfectly matched the final percent identity would be 90%. In another example, a 90 base subject sequence is compared to a 100 base query sequence. In this case, since the deletion is an internal deletion,
There are no bases in either 1 or 3'. In this case, the percent identities calculated by FASTDB are not manually corrected. Notwithstanding this, in certain cases, overall identity refers only to that portion of the sequence that has at least some degree of similarity with, for example, the sequence of SEQ ID NO:1. In other words, the sequence identity of a 2000 bp query sequence is calculated only for a portion of the sequence containing SEQ ID NO: 1 or a highly similar portion thereof.
本発明のクエリアミノ酸配列と少なくとも、例えば95%「同一の」アミノ酸配列を有
するポリペプチドにより、対象ポリペプチドのアミノ酸配列は、対象ポリペプチド配列が
クエリアミノ酸配列のそれぞれの100アミノ酸につき5つまでのアミノ酸変更を含み得
ることを除きクエリ配列と同一であることが意図される。換言すると、クエリアミノ酸配
列と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドを得るため、対象配列中
のアミノ酸残基の5%までを挿入し、欠失し、又は別のアミノ酸と置換することができる
。参照配列のこれらの変更は、参照アミノ酸配列のアミノ若しくはカルボキシ末端位置に
おいて、又はそれらの末端位置の間のいずれの箇所でも、参照配列中の残基の間に個々に
、又は参照配列内の1つ以上の連続する群として散在して生じ得る。
By a polypeptide having an amino acid sequence that is at least, eg, 95% “identical” to a query amino acid sequence of the invention, the amino acid sequence of the subject polypeptide is such that the subject polypeptide sequence has up to 5 amino acids for each 100 amino acids of the query amino acid sequence. It is intended to be identical to the query sequence except that it may contain amino acid changes. In other words, up to 5% of the amino acid residues in the subject sequence can be inserted, deleted, or replaced with another amino acid to obtain a polypeptide having an amino acid sequence that is at least 95% identical to the query amino acid sequence. can. These alterations of the reference sequence may be made at the amino- or carboxy-terminal position of the reference amino acid sequence, or anywhere between those terminal positions, individually between residues in the reference sequence, or at single residues within the reference sequence. May occur interspersed in one or more contiguous groups.
実際問題として、任意の特定のポリペプチドが、例えば、配列に示されるアミノ酸配列
又は寄託DNAクローンによりコードされるアミノ酸配列と少なくとも80%、85%、
90%、92%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一であるか
否かは、慣用的には、公知のコンピュータプログラムを使用して決定することができる。
グローバル配列アラインメントとも称される、クエリ配列(本発明の配列)と対象配列と
の間の最良の全体的なマッチを決定するための好ましい方法は、Brutlagら(Co
mp.App.Biosci.(1990)6:237-245)のアルゴリズムに基づ
くFASTDBコンピュータプログラムを使用して決定することができる。配列アライン
メントにおいて、クエリ配列及び対象配列は両方ともヌクレオチド配列又は両方ともアミ
ノ酸配列のいずれかである。前記グローバル配列アラインメントの結果は、パーセント同
一性におけるものである。FASTDBアミノ酸アラインメントに使用される好ましいパ
ラメータは以下である:行列=PAM0、k-タプル=2、ミスマッチペナルティ--I
、結合ペナルティ=20、ランダム化グループ長=0、カットオフスコア=l、ウィンド
ウサイズ=配列長、ギャップペナルティ--5、ギャップサイズペナルティ--0.05
、ウィンドウサイズ=500又は対象アミノ酸配列の長さのどちらか短い方。対象配列が
、内部欠失のためではなくN又はC末端欠失に起因してクエリ配列よりも短い場合、その
結果を手作業により補正しなければならない。これは、FASTDBプログラムが、グロ
ーバルパーセント同一性を計算する場合、対象配列のN及びC末端トランケーションを考
慮しないためである。クエリ配列に対してN及びC末端においてトランケートされた対象
配列について、パーセント同一性は、クエリ配列の全塩基のパーセントとして、対応する
対象残基とマッチング/アラインメントされていない、対象配列のN及びC末端であるク
エリ配列の残基の数を計算することにより補正される。残基がマッチング/アラインメン
トされているか否かは、FASTDB配列アラインメントの結果により決定される。次い
で、この割合は、規定のパラメータを使用する上記のFASTDBプログラムにより計算
されたパーセント同一性から減算され、最終のパーセント同一性スコアに達する。この最
終パーセント同一性スコアが、本発明のために使用されるものである。クエリ配列とマッ
チング/アラインメントされていない、対象配列のN及びC末端にある残基のみが、パー
セント同一性スコアを手作業により調整する目的に考慮される。それは、対象配列の最も
遠いN及びC末端残基の外側のクエリ残基位置のみである。クエリ配列とマッチング/ア
ラインメントされていない、FASTDBアラインメントにおいてディスプレイされる対
象配列のN及びC末端の外側の残基位置のみが手作業により補正される。他の手作業によ
る補正は、本発明のために行われるべきでない。
As a practical matter, any particular polypeptide will be at least 80%, 85%,
90%, 92%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity can be routinely determined using known computer programs. .
A preferred method for determining the best overall match between a query sequence (sequence of the invention) and a subject sequence, also called a global sequence alignment, is described by Brutlag et al.
mp. App. Biosci. (1990) 6:237-245) using the FASTDB computer program. In a sequence alignment, the query and subject sequences are either both nucleotide sequences or both amino acid sequences. The results of said global sequence alignment are in percent identity. Preferred parameters used for FASTDB amino acid alignments are: matrix=PAM0, k-tuple=2, mismatch penalty--I
, join penalty=20, randomization group length=0, cutoff score=l, window size=sequence length, gap penalty--5, gap size penalty--0.05.
, window size = 500 or the length of the subject amino acid sequence, whichever is shorter. If the subject sequence is shorter than the query sequence due to N- or C-terminal deletions rather than due to internal deletions, the results must be manually corrected. This is because the FASTDB program does not consider N- and C-terminal truncations of the subject sequence when calculating global percent identities. For a subject sequence truncated at the N- and C-termini to the query sequence, percent identity is expressed as a percentage of all bases in the query sequence, N and C of the subject sequence not matched/aligned with the corresponding residue of interest. Corrected by calculating the number of residues in the query sequence that are terminal. Whether or not residues are matched/aligned is determined by the results of the FASTDB sequence alignment. This percentage is then subtracted from the percent identity, calculated by the above FASTDB program using the defined parameters, to arrive at a final percent identity score. This final percent identity score is what is used for the purposes of the present invention. Only residues at the N- and C-termini of the subject sequence that are not matched/aligned with the query sequence are considered for purposes of manually adjusting the percent identity score. That is only query residue positions outside the farthest N- and C-terminal residues of the subject sequence. Only residue positions outside the N- and C-termini of the subject sequence displayed in the FASTDB alignment that are not matched/aligned with the query sequence are manually corrected. No other manual corrections should be made for the present invention.
天然に存在するタンパク質バリアントは、「アレルバリアント」と呼ばれ、生物体の染
色体上の所与の遺伝子座を占める遺伝子のいくつかの代替形態の1つを指す(Genes
11,Lewin,B.,ed.,John Wiley & Sons,New Y
ork(1985))。これらのアレルバリアントは、ポリヌクレオチドレベル及び/又
はポリペプチドレベルのいずれかにおいて変動し得る。あるいは、天然に存在しないバリ
アントは、突然変異誘発技術により、又は直接的合成により産生することができる。
A naturally occurring protein variant is called an "allelic variant" and refers to one of several alternative forms of a gene occupying a given locus on a chromosome of an organism (Genes
11, Lewin, B.; , ed. , John Wiley & Sons, New Y
ork (1985)). These allelic variants can vary at either the polynucleotide level and/or the polypeptide level. Alternatively, non-naturally occurring variants may be produced by mutagenesis techniques or by direct synthesis.
「標識」は、直接的に、又はシグナル産生系の1つ以上の追加のメンバーとの相互作用
を通して、検出可能なシグナルを提供し得る薬剤を指す。直接的に検出可能であり、本発
明において使用することができる標識としては、蛍光標識が挙げられる。具体的なフルオ
ロフォアとしては、フルオレセイン、ローダミン、BODIPY、シアニン色素などが挙
げられる。
"Label" refers to an agent capable of providing a detectable signal either directly or through interaction with one or more additional members of a signal-producing system. Labels that are directly detectable and that can be used in the present invention include fluorescent labels. Specific fluorophores include fluorescein, rhodamine, BODIPY, cyanine dyes, and the like.
「蛍光標識」は、ある波長の光を、別の波長の光により活性化された場合に放射する能
力を有する任意の標識を指す。
"Fluorescent label" refers to any label capable of emitting light of one wavelength when activated by light of another wavelength.
「蛍光」は、蛍光シグナルの任意の検出可能な特徴を指し、それとしては、強度、スペ
クトル、波長、細胞内分布などが挙げられる。
"Fluorescence" refers to any detectable characteristic of a fluorescent signal, including intensity, spectrum, wavelength, subcellular distribution, and the like.
蛍光を「検出すること」は、定性的又は定量的方法を使用して細胞の蛍光を評価するこ
とを指す。本発明の実施形態の一部において、蛍光は、定性的様式で検出される。換言す
れば、組換え融合タンパク質が発現されるか否かを示す蛍光マーカーが存在するか否かで
ある。他の例として、蛍光は、例えば、蛍光強度、スペクトル、又は細胞内分布を計測す
る定量的手段を使用して測定することができ、異なる条件下で得られる値の統計的比較を
可能とする。レベルは、定性的方法、例えば、複数の試料、例えば、蛍光顕微鏡又は他の
光学的検出器(例えば、画像分析システムなど)を使用して検出される試料のヒトによる
目視分析及び比較を使用して測定することもができる。蛍光における「変更」又は「モジ
ュレーション」は、別の条件と比較した特定の条件下での蛍光の強度、細胞内分布、スペ
クトル、波長、又は他の側面における任意の検出可能な差を指す。例えば、「変更」又は
「モジュレーション」は定量的に検出され、その差は統計的に有意な差である。蛍光にお
ける任意の「変更」又は「モジュレーション」は、標準的な機器、例えば、蛍光顕微鏡、
CCD、若しくは任意の他の蛍光検出器を使用して検出することができ、自動システム、
例えば、統合システムを使用して検出することができ、又はヒト観測者による変更の主観
的検出を反映し得る。
"Detecting" fluorescence refers to assessing the fluorescence of cells using qualitative or quantitative methods. In some embodiments of the invention, fluorescence is detected in a qualitative manner. In other words, is there a fluorescent marker that indicates whether the recombinant fusion protein is expressed or not. As another example, fluorescence can be measured using quantitative means that measure, for example, fluorescence intensity, spectra, or intracellular distribution, allowing statistical comparison of values obtained under different conditions. . Levels are determined using qualitative methods, e.g., human visual analysis and comparison of multiple samples, e.g., samples detected using a fluorescence microscope or other optical detectors (e.g., image analysis systems, etc.). can also be measured An "alteration" or "modulation" in fluorescence refers to any detectable difference in intensity, subcellular distribution, spectrum, wavelength, or other aspect of fluorescence under a particular condition compared to another condition. For example, "alteration" or "modulation" is detected quantitatively and the difference is statistically significant. Any "alteration" or "modulation" in fluorescence can be measured using standard equipment, e.g. fluorescence microscopy,
Automated systems that can detect using a CCD, or any other fluorescence detector,
For example, it can be detected using an integrated system, or it can reflect subjective detection of alterations by a human observer.
「緑色蛍光タンパク質」(GFP)は、青色光に曝露された場合に緑色の蛍光を発する
、クラゲのエクオレア・ビクトリア(Aequorea victoria)/エクオレ
ア・エクオレア(Aequorea aequorea)/エクオレア・フォルスカレア
(Aequorea forskalea)から最初に単離された、238アミノ酸(2
6.9kDa)から構成されるタンパク質である。A.ビクトリア(A.victori
a)からのGFPは、395nmの波長におけるメジャー励起ピーク及び475nmにお
けるマイナーピークを有する。この発光ピークは509nmであり、それは、可視スペク
トルの低い方の緑色部分に存在する。ウミシイタケ(レニラ・レニフォルミス(Reni
lla reniformis))からのGFPは、498nmにおける単一のメジャー
励起ピークを有する。広範な使用法の潜在性及び研究者らの発展的要望に起因して、GF
Pの多くの異なる突然変異体が遺伝子操作されている。最初の主要な改善は、Roger
TsienによりNatureにおいて1995年に報告された単一点突然変異(S6
5T)であった。この突然変異は、GFPのスペクトル特徴を大幅に改善し、増加した蛍
光、光安定性及びピーク放射を509nmに保持したままでのメジャー励起ピークの48
8nmへのシフトをもたらした。この足場への37℃フォールディング効率(F64L)
点突然変異体の追加は、増強型GFP(EGFP)を生じさせた。EGFPは、9.13
×10-21m2/分子の光学的断面積としても公知であり、55,000L/(mol
・cm)としても引用される、消衰係数(εと表示される)を有する。十分にフォールデ
ィングしていないペプチドと融合した場合でさえもGFPが迅速にフォールディングし、
成熟するのを可能とする一連の突然変異であるスーパーフォールダー(Superfol
der)GFPが2006年に報告された。
"Green Fluorescent Protein" (GFP) is from the jellyfish Aequorea victoria/Aequorea aequorea/Aequorea forskalea, which fluoresces green when exposed to blue light. The originally isolated 238 amino acids (2
6.9 kDa). A. Victoria (A. victori
GFP from a) has a major excitation peak at a wavelength of 395 nm and a minor peak at 475 nm. This emission peak is at 509 nm, which is in the lower green portion of the visible spectrum. Renilla (Renilla reniformis (Reni
GFP from lla reniformis)) has a single major excitation peak at 498 nm. Due to the potential for widespread use and the evolving needs of researchers, GF
Many different mutants of P have been engineered. The first major improvement is the Roger
A single point mutation (S6
5T). This mutation greatly improved the spectral characteristics of GFP, increasing fluorescence, photostability and 48% of the major excitation peak while retaining peak emission at 509 nm.
resulted in a shift to 8 nm. 37° C. folding efficiency into this scaffold (F64L)
Addition of point mutations gave rise to enhanced GFP (EGFP). EGFP is 9.13
55,000 L /(mol
It has an extinction coefficient (denoted ε), also referred to as .cm). GFP folds rapidly even when fused to poorly folded peptides,
Superfol, a series of mutations that allow it to mature
der) GFP was reported in 2006.
「黄色蛍光タンパク質」(YFP)は、エクオレア・ビクトリア(Aequorea
victoria)に由来する緑色蛍光タンパク質の遺伝子突然変異体である。この励起
ピークは514nmであり、その発光ピークは527nmである。
"Yellow Fluorescent Protein" (YFP) is derived from Aequorea victoria
is a genetic mutant of the green fluorescent protein from S. victoria). Its excitation peak is at 514 nm and its emission peak is at 527 nm.
本明細書において使用される場合、単数形「a」、「an」、及び「the」は、文脈
が明らかに他に記述しない限り、複数の参照対象を含む。
As used herein, the singular forms "a,""an," and "the" include plural references unless the context clearly dictates otherwise.
「ウイルス」は、宿主細胞の外側では成長も繁殖もし得ない超顕微鏡的感染性物質であ
る。それぞれのウイルス粒子、又はビリオンは、キャプシドと呼ばれる保護タンパク質コ
ート内の遺伝子材料、DNA、又はRNAからなる。キャプシド形状は、単純ならせん及
び正二十面体(多面体又はほぼ球形)形態から、尾部又はエンベロープを有するより複雑
な構造まで変動する。ウイルスは、細胞生物形態に感染し、感染される宿主のタイプに応
じて動物、植物及び細菌タイプに分類される。
A "virus" is a submicroscopic infectious agent that cannot grow or reproduce outside a host cell. Each virus particle, or virion, consists of genetic material, DNA or RNA, within a protective protein coat called a capsid. Capsid shapes vary from simple helical and icosahedral (polyhedral or nearly spherical) morphologies to more complex structures with tails or envelopes. Viruses infect cellular organisms and are classified into animal, plant and bacterial types depending on the type of host infected.
本明細書において使用される場合、用語「経シナプス性ウイルス」は、あるニューロン
から別の介在ニューロンにシナプスを通って移動し得るウイルスを指す。このような経シ
ナプス性ウイルスの例は、ラブドウイルス、例えば、狂犬病ウイルス、及びアルファヘル
ペスウイルス、例えば、仮性狂犬病ウイルス又は単純ヘルペスウイルスである。本明細書
において使用される場合、用語「経シナプス性ウイルス」はまた、あるニューロンから別
の介在ニューロンにシナプスを通って移動する能力をそれ自体で有するウイルスのサブユ
ニット及び生物学的ベクター、例えば、そのようなサブユニットを組み込み、あるニュー
ロンから別の介在ニューロンにシナプスを通って移動する能力を実証する改変ウイルスを
包含する。
As used herein, the term "transynaptic virus" refers to a virus that can travel across synapses from one neuron to another interneuron. Examples of such transsynaptic viruses are rhabdoviruses, such as rabies virus, and alphaherpesviruses, such as pseudorabies virus or herpes simplex virus. As used herein, the term "transsynaptic virus" also includes viral subunits and biological vectors that themselves have the ability to trans-synaptically move from one neuron to another interneuron, e.g. , includes modified viruses that incorporate such subunits and demonstrate the ability to trans-synaptically move from one neuron to another interneuron.
経シナプス性移動は、順行性又は逆行性のいずれかであり得る。逆行性移動の間、ウイ
ルスは、シナプス後ニューロンからシナプス前ニューロンに動く。したがって、順行性移
動の間、ウイルスは、シナプス前ニューロンからシナプス後ニューロンに動く。
Transsynaptic transfers can be either anterograde or retrograde. During retrograde migration, the virus moves from postsynaptic neurons to presynaptic neurons. Thus, during anterograde migration, the virus moves from presynaptic neurons to postsynaptic neurons.
ホモログは、共通の祖先を共有するタンパク質を指す。アナログは、共通の祖先を共有
しないが、それらを1つのクラスに含めることにさせるいくつかの(構造的よりむしろ)
機能的な類似性を有する(例えば、トリプシン様セリンプロテイナーゼ及びサブチリシン
は明らかに関連せず、活性部位の外側のそれらの構造は完全に異なるが、それらは、事実
上幾何的に同一の活性部位を有し、したがって、アナログへの収束進化の一例とみなされ
る)。
Homologs refer to proteins that share a common ancestor. Analogs do not share a common ancestor, but some (rather than structural)
have functional similarities (e.g., trypsin-like serine proteinases and subtilisins are apparently unrelated, and although their structures outside the active site are completely different, they share virtually the same active site geometrically). have, and are therefore regarded as an example of convergent evolution to analogues).
ホモログの2つのサブクラスのオルソログ及びパラログが存在する。オルソログは、異
なる種における同一遺伝子である(例えば、シトコム(cytochome)「c」)。
同一生物体における2つの遺伝子は、オルソログであり得ない。パラログは遺伝子重複の
結果である(例えば、ヘモグロビンベータ及びデルタ)。2つの遺伝子/タンパク質が相
同であり、同一生物体内に存在する場合、それらはパラログである。
There are two subclasses of homologues, orthologs and paralogs. Orthologs are the same gene in different species (eg, cytochome "c").
Two genes in the same organism cannot be orthologous. Paralogs are the result of gene duplication (eg hemoglobin beta and delta). Two genes/proteins are paralogs if they are homologous and exist within the same organism.
本明細書において使用される場合、用語「障害」は、不快感、疾患、疾病、臨床病態、
又は病的状態を指す。
As used herein, the term "disorder" includes discomforts, diseases, illnesses, clinical conditions,
Or refers to a pathological condition.
本明細書において使用される場合、用語「薬学的に許容可能な担体」は、活性成分の生
物学的活性の有効性に干渉せず、化学的に不活性であり、それが投与される患者に対して
毒性ではない担体媒体を指す。
As used herein, the term "pharmaceutically acceptable carrier" means a chemically inert carrier that does not interfere with the effectiveness of the biological activity of the active ingredient, and which is administered to the patient to whom it is administered. refers to a carrier medium that is not toxic to
本明細書において使用される場合、用語「薬学的に許容可能な誘導体」は、対象に対し
て比較的無毒である、例えば、本発明のスクリーニングの方法を使用して同定される薬剤
の任意のホモログ、アナログ、又は断片を指す。
As used herein, the term "pharmaceutically acceptable derivative" refers to any derivative of an agent that is relatively non-toxic to a subject, e.g., an agent identified using the screening methods of the present invention. Refers to homologs, analogs, or fragments.
用語「治療剤」は、障害又は障害の合併症の予防又は治療を補助する任意の分子、化合
物、又は治療物を指す。
The term "therapeutic agent" refers to any molecule, compound, or therapeutic that helps prevent or treat a disorder or a complication of a disorder.
適合性医薬担体中に配合されたそのような薬剤を含む組成物は、治療のために調製し、
包装し、ラベル貼付することができる。
Compositions containing such agents formulated in compatible pharmaceutical carriers are prepared for treatment,
It can be packaged and labeled.
複合体が水溶性である場合、それは、適切な緩衝液、例えば、リン酸緩衝生理食塩水又
は他の生理学的に適合性の溶液中で配合することができる。
If the conjugate is water soluble, it can be formulated in a suitable buffer, such as phosphate buffered saline or other physiologically compatible solution.
あるいは、得られた複合体が水性溶媒中で不十分な溶解度を有する場合、それは、非イ
オン性界面活性剤、例えば、Tween、又はポリエチレングリコールと共に配合するこ
とができる。したがって、化合物及び生理学的に許容可能なその溶媒和物は、(口腔又は
鼻腔のいずれかを介する)吸入若しくは吹送による投与又は経口、バッカル、非経口、直
腸投与のために配合することができ、又は腫瘍の場合、固形腫瘍中に直接注射することが
できる。
Alternatively, if the resulting conjugate has insufficient solubility in aqueous solvents, it can be formulated with a nonionic surfactant such as Tween, or polyethylene glycol. Accordingly, the compounds and physiologically acceptable solvates thereof can be formulated for administration by inhalation or insufflation (either through the oral or nasal cavity) or oral, buccal, parenteral, rectal administration, Or in the case of tumors, it can be injected directly into a solid tumor.
経口投与について、医薬製剤は、液体形態、例えば、液剤、シロップ剤若しくは懸濁液
剤であり得、又は使用前の水若しくは他の好適なビヒクルによる再構成のための薬物製品
として提供することができる。このような液体製剤は、薬学的に許容可能な添加剤、例え
ば、懸濁化剤(例えば、ソルビトールシロップ、セルロース誘導体又は水添食用脂);乳
化剤(例えば、レシチン又はアカシアガム);非水性ビヒクル(例えば、アーモンド油、
油性エステル、又は分留植物油);及び保存剤(例えば、メチル若しくはプロピルp-ヒ
ドロキシベンゾエート又はソルビン酸)を用いて慣用の手段により調製することができる
。医薬組成物は、薬学的に許容可能な賦形剤、例えば、結合剤(例えば、アルファ化トウ
モロコシデンプン、ポリビニルピロリドン又はヒドロキシプロピルメチルセルロース);
増量剤(例えば、ラクトース、微結晶性セルロース又はリン酸水素カルシウム);滑沢剤
(例えば、ステアリン酸マグネシウム、タルク又はシリカ);崩壊剤(例えば、ジャガイ
モデンプン又はデンプングリコール酸ナトリウム);又は湿潤剤(例えば、ラウリル硫酸
ナトリウム)を用いて慣用の手段により調製される、例えば、錠剤又はカプセル剤の形態
をとり得る。錠剤は、当分野において周知の方法によりコーティングすることができる。
For oral administration, pharmaceutical formulations can be in liquid form, such as solutions, syrups or suspensions, or can be presented as a drug product for reconstitution with water or other suitable vehicle before use. . Such liquid formulations may contain pharmaceutically acceptable additives such as suspending agents (eg, sorbitol syrup, cellulose derivatives or hydrogenated edible fats); emulsifiers (eg, lecithin or acacia gum); non-aqueous vehicles; (e.g. almond oil,
oily esters, or fractionated vegetable oils); and preservatives such as methyl or propyl p-hydroxybenzoate or sorbic acid by conventional means. The pharmaceutical composition contains a pharmaceutically acceptable excipient such as a binder (e.g. pregelatinized corn starch, polyvinylpyrrolidone or hydroxypropylmethylcellulose);
Bulking agents such as lactose, microcrystalline cellulose or calcium hydrogen phosphate; Lubricants such as magnesium stearate, talc or silica; Disintegrating agents such as potato starch or sodium starch glycolate; or wetting agents. (eg sodium lauryl sulfate) prepared by conventional means, eg in the form of tablets or capsules. Tablets may be coated by methods well known in the art.
経口投与のための製剤は、活性化合物の徐放性を与えるように好適に配合することがで
きる。
Formulations for oral administration may be suitably formulated to give sustained release of the active compound.
吸入による投与のため、本発明による使用のための化合物は、好適な噴射剤、例えば、
ジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン
、二酸化炭素又は他の好適なガスを使用して加圧パック又はネブライザーからのエアロゾ
ルスプレー提供物の形態で簡便に送達される。加圧エアロゾルの場合、投与量単位は、計
量された量を送達するための弁を提供することにより決定することができる。化合物及び
好適な粉末基剤、例えば、ラクトース又はデンプンの粉末混合物を含有する、吸入具又は
吸入器における使用のための例えば、ゼラチンのカプセル剤及びカートリッジを配合する
ことができる。
For administration by inhalation, the compounds for use according to the invention are combined with a suitable propellant, e.g.
Dichlorodifluoromethane, trichlorofluoromethane, dichlorotetrafluoroethane, carbon dioxide or other suitable gas is used, conveniently delivered in the form of an aerosol spray presentation from a pressurized pack or nebulizer. In the case of pressurized aerosols, the dosage unit can be determined by providing a valve to deliver a metered amount. Capsules and cartridges, eg of gelatin, for use in an inhaler or inhaler, containing the compound and a suitable powder mix, eg lactose or starch, may be formulated.
化合物は、注射、例えば、ボーラス注射又は持続注入による非経口投与のために配合す
ることができる。注射用配合物は、添加される保存剤と共に、単位剤形中で、例えば、ア
ンプル中又は複数用量容器中で提供することができる。
The compounds may be formulated for parenteral administration by injection, eg, by bolus injection or continuous infusion. Formulations for injection may be presented in unit dosage form, eg, in ampoules or in multi-dose containers, with an added preservative.
組成物は、油性又は水性ビヒクル中の懸濁液、溶液又はエマルションのような形態をと
り得、配合用薬剤(formulatory agent)、例えば、懸濁化剤、安定剤
及び/又は分散剤を含有し得る。あるいは、活性成分は、使用前の好適なビヒクル、例え
ば、滅菌パイロジェンフリー水による構成のための粉末の形態であり得る。
The compositions may take such forms as suspensions, solutions or emulsions in oily or aqueous vehicles, and contain formulatory agents such as suspending, stabilizing and/or dispersing agents. obtain. Alternatively, the active ingredient may be in powder form for constitution with a suitable vehicle, eg, sterile pyrogen-free water, before use.
化合物は、例えば、局所的適用、例えば、クリーム剤又はローション剤として配合する
こともできる。
The compounds can also be formulated, for example, for topical application, such as creams or lotions.
上記の配合物に加えて、化合物はまた、デポー製剤として配合することができる。この
ような長時間作用性配合物は、埋込(例えば、眼内、皮下又は筋肉内)により、又は眼内
注射により投与することができる。
In addition to the formulations described previously, the compounds may also be formulated as a depot preparation. Such long acting formulations may be administered by implantation (for example intraocularly, subcutaneously or intramuscularly) or by intraocular injection.
したがって、例えば、化合物は、好適なポリマー若しくは疎水性材料と共に(例えば、
許容可能な油中のエマルションとして)、又はイオン交換樹脂と共に、又は難溶性誘導体
、例えば、難溶性塩として配合することができる。リポソーム及びエマルションは、親水
性薬物のための送達ビヒクル又は担体の周知の例である。
Thus, for example, the compound may be combined with a suitable polymer or hydrophobic material (e.g.,
as an emulsion in an acceptable oil), or with ion exchange resins, or as sparingly soluble derivatives, eg, sparingly soluble salts. Liposomes and emulsions are well-known examples of delivery vehicles or carriers for hydrophilic drugs.
組成物は、所望により、活性成分を含有する1つ以上の単位剤形を含有し得るパック又
は分注装置中で提供することができる。パックは、例えば、金属又はプラスチックホイル
、例えば、ブリスターパックを含み得る。パック又は分注装置には、投与についての説明
書を添付することができる。
The compositions may, if desired, be presented in a pack or dispenser device which may contain one or more unit dosage forms containing the active ingredient. The pack may for example comprise metal or plastic foil, such as a blister pack. The pack or dispensing device can be accompanied by instructions for administration.
本発明はまた、本発明の治療レジメンを実施するためのキットを提供する。このような
キットは、1つ以上の容器中で、治療又は予防有効量の組成物を薬学的に許容可能な形態
で含む。
The invention also provides kits for carrying out the therapeutic regimens of the invention. Such kits comprise, in one or more containers, a therapeutically or prophylactically effective amount of the composition in pharmaceutically acceptable form.
キットのバイアル中の組成物は、例えば、滅菌生理食塩水、デキストロース溶液、又は
緩衝溶液、又は他の薬学的に許容可能な滅菌流体との組合せで、薬学的に許容可能な溶液
の形態であり得る。あるいは、複合体は、凍結乾燥又は乾燥させることができ;この場合
、キットは、場合により、容器中で複合体を再構成して注射目的の溶液を形成するための
好ましくは滅菌した薬学的に許容可能な溶液(例えば、生理食塩水、デキストロース溶液
など)をさらに含む。
The compositions in the kit vials are in the form of pharmaceutically acceptable solutions, e.g., in combination with sterile saline, dextrose or buffered solutions, or other pharmaceutically acceptable sterile fluids. obtain. Alternatively, the conjugate can be lyophilized or dried; in this case, the kit optionally includes a preferably sterile pharmaceutical preparation for reconstituting the conjugate in a container to form a solution for injection purposes. Further included are acceptable solutions such as saline, dextrose solution, and the like.
別の実施形態において、キットは、複合体を注射するための、好ましくは無菌形態で包
装された針若しくはシリンジ、及び/又は包装されたアルコールパッドをさらに含む。臨
床医又は患者による組成物の投与についての説明書が場合により含まれる。
In another embodiment, the kit further comprises a needle or syringe, preferably packaged in sterile form, and/or a packaged alcohol pad, for injecting the conjugate. Instructions for administration of the composition by a clinician or patient are optionally included.
特に定義のない限り、本明細書において使用される全ての技術的及び科学的用語は、本
発明が属する分野の当業者により一般に理解されているものと同一の意味を有する。本明
細書に記載のものと類似又は均等の方法及び材料は、本発明の実施又は試験に使用するこ
とができるが、好適な方法及び材料が以下に記載される。矛盾する場合、定義を含む本明
細書が優先される。さらに、材料、方法、及び実施例は説明のためのものにすぎず、限定
的なものではない。
Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention belongs. Although methods and materials similar or equivalent to those described herein can be used in the practice or testing of the present invention, suitable methods and materials are described below. In case of conflict, the present specification, including definitions, will control. In addition, the materials, methods, and examples are illustrative only and not limiting.
遺伝子構築物
本実施例において使用されるプロモーター(964bp;配列番号3)は、配列番号2
の最小プロモーターSV40プロモーターに結合している配列番号1のものからなる。C
hR2-eGFPコード配列をこのプロモーター及び最適化コザック配列(GCCACC
)の直後に挿入し、ウッドチャック肝炎ウイルス転写後調節エレメント(WPRE)及び
SV40ポリアデニル化部位が続いた。2.9E+10GC/mLの力価を有するAAV
血清型2/8を使用して、網膜ニューロンを標的化した。
Genetic Constructs The promoter (964 bp; SEQ ID NO:3) used in this example is SEQ ID NO:2
of SEQ ID NO: 1 bound to the SV40 promoter. C.
The hR2-eGFP coding sequence was combined with this promoter and an optimized Kozak sequence (GCCACC
), followed by the woodchuck hepatitis virus posttranscriptional regulatory element (WPRE) and the SV40 polyadenylation site. AAV with a titer of 2.9E+10 GC/mL
Serotype 2/8 was used to target retinal neurons.
ウイルス形質移入及び組織調製
AAV投与のため、麻酔した動物の眼球をレンズに近い強膜中で鋭利な30ゲージ針に
より穿刺した。2マイクロLのAAV粒子懸濁液をHamiltonシリンジにより網膜
下注射した。3週間後、単離網膜をPBS中4%のPFA中で30分間固定し、次いで洗
浄ステップをPBS中で4℃において行った。全網膜をPBS中10%の正常ロバ血清(
NDS)、1%のBSA、0.5%のTriton X-100により室温において1時
間処理した。PBS中3%のNDS、1%のBSA、0.5%のTriton X-10
0中のモノクローナルラット抗GFP Ab(Molecular Probes In
c.;1:500)及びポリクローナルヤギ抗ChAT(Millipore:1:20
0)による処理を、室温において5日間実施した。二次ロバ抗ラットAlexa Flu
or-488 Ab(Molecular Probes Inc.;1:200)、抗
ヤギAlexa Fluor-633及びヘキストによる処理を2時間行った。切片を洗
浄し、ProLong Gold退色防止試薬(Molecular Probes I
nc.)によりスライドガラス上にマウントし、Zeiss LSM 700 Axio
Imager Z2レーザー走査型共焦点顕微鏡(Carl Zeiss Inc.)
を使用して撮影した。
Viral Transfection and Tissue Preparation For AAV administration, the eyes of anesthetized animals were punctured with a sharp 30-gauge needle in the sclera proximal to the lens. Two microL of AAV particle suspension was injected subretinal by Hamilton syringe. After 3 weeks, isolated retinas were fixed in 4% PFA in PBS for 30 min, followed by a washing step in PBS at 4°C. Whole retinas were treated with 10% normal donkey serum in PBS (
NDS), 1% BSA, 0.5% Triton X-100 for 1 hour at room temperature. 3% NDS, 1% BSA, 0.5% Triton X-10 in PBS
0 monoclonal rat anti-GFP Ab (Molecular Probes In
c. 1:500) and polyclonal goat anti-ChAT (Millipore: 1:20
0) was carried out at room temperature for 5 days. Secondary donkey anti-rat Alexa Flu
Treatment with or-488 Ab (Molecular Probes Inc.; 1:200), anti-goat Alexa Fluor-633 and Hoechst was performed for 2 hours. Sections were washed and treated with ProLong Gold antifade reagent (Molecular Probes I
nc. ) and mounted on a glass slide using a Zeiss LSM 700 Axio
Imager Z2 laser scanning confocal microscope (Carl Zeiss Inc.)
was taken using
ウイルス形質移入及び組織調製
AAV投与のため、麻酔した動物の眼球をレンズに近い強膜中で鋭利な30ゲージ針により穿刺した。2マイクロLのAAV粒子懸濁液をHamiltonシリンジにより網膜下注射した。3週間後、単離網膜をPBS中4%のPFA中で30分間固定し、次いで洗浄ステップをPBS中で4℃において行った。全網膜をPBS中10%の正常ロバ血清(NDS)、1%のBSA、0.5%のTriton X-100により室温において1時間処理した。PBS中3%のNDS、1%のBSA、0.5%のTriton X-100中のモノクローナルラット抗GFP Ab(Molecular Probes Inc.;1:500)及びポリクローナルヤギ抗ChAT(Millipore:1:200)による処理を、室温において5日間実施した。二次ロバ抗ラットAlexa Fluor-488 Ab(Molecular Probes Inc.;1:200)、抗ヤギAlexa Fluor-633及びヘキストによる処理を2時間行った。切片を洗浄し、ProLong Gold退色防止試薬(Molecular Probes Inc.)によりスライドガラス上にマウントし、Zeiss LSM 700 Axio Imager Z2レーザー走査型共焦点顕微鏡(Carl Zeiss Inc.)を使用して撮影した。
以下の態様を包含し得る。
[1] 霊長類の網膜色素上皮の細胞中で特異的に外因性遺伝子を発現させる方法であって、配列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列と少なくとも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離核酸分子を、前記霊長類の前記網膜色素上皮の細胞に送達するステップを含み、前記単離核酸分子は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を、前記外因性遺伝子をコードする核酸配列が前記単離核酸分子に作動可能に結合している場合に特異的にもたらす方法。
[2] 前記単離核酸分子が、最小プロモーター、例えば、配列番号2の最小プロモーターをさらに含む、上記[1]に記載の方法。
[3] 前記単離核酸分子が、発現カセットの一部である、上記[1]又は[2]に記載の方法。
[4] 前記発現カセットが、ベクターの一部である、上記[3]に記載の方法。
[5] 前記ベクターが、ウイルスベクターである、上記[4]に記載の方法。
[6] 霊長類の網膜色素上皮の細胞中で特異的に外因性遺伝子を発現させるための、配列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列と少なくとも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離核酸分子の使用であって、前記単離核酸分子は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を、前記外因性遺伝子をコードする核酸配列が前記単離核酸分子に作動可能に結合している場合に特異的にもたらす使用。
[7] 前記単離核酸分子が、最小プロモーター、例えば、配列番号2の最小プロモーターをさらに含む、上記[6]に記載の使用。
[8] 前記単離核酸分子が、発現カセットの一部である、上記[6]又は[7]に記載の使用。
[9] 前記発現カセットが、ベクターの一部である、上記[8]に記載の使用。
[10] 前記ベクターが、ウイルスベクターである、上記[9]に記載の使用。
[11] 網膜色素上皮と関連する疾患の治療における使用のための、配列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列と少なくとも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離核酸分子であって、霊長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を、前記外因性遺伝子をコードする核酸配列が前記単離核酸分子に作動可能に結合している場合に特異的にもたらす単離核酸分子。
[12] 網膜色素上皮と関連する前記疾患は、加齢黄斑変性症、網膜色素変性症、糖尿病性網膜症及び網膜色素上皮肥大症からなる群から選択される、上記[11]に記載の使用のための単離核酸分子。
Viral Transfection and Tissue Preparation For AAV administration, the eyes of anesthetized animals were punctured with a sharp 30-gauge needle in the sclera proximal to the lens. Two microL of AAV particle suspension was injected subretinal by Hamilton syringe. After 3 weeks, isolated retinas were fixed in 4% PFA in PBS for 30 min, followed by a washing step in PBS at 4°C. Whole retinas were treated with 10% normal donkey serum (NDS), 1% BSA, 0.5% Triton X-100 in PBS for 1 hour at room temperature. Monoclonal rat anti-GFP Ab (Molecular Probes Inc.; 1:500) and polyclonal goat anti-ChAT (Millipore: 1:200) in 3% NDS, 1% BSA, 0.5% Triton X-100 in PBS was carried out at room temperature for 5 days. Treatment with secondary donkey anti-rat Alexa Fluor-488 Ab (Molecular Probes Inc.; 1:200), anti-goat Alexa Fluor-633 and Hoechst was performed for 2 hours. Sections were washed, mounted on glass slides with ProLong Gold antifade reagent (Molecular Probes Inc.), and photographed using a Zeiss LSM 700 Axio Imager Z2 laser scanning confocal microscope (Carl Zeiss Inc.).
The following aspects may be included.
[1] A method of expressing an exogenous gene specifically in cells of the retinal pigment epithelium of a primate comprising or consisting of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, or said sequence of SEQ ID NO: 1 and at least 80 delivering to cells of the retinal pigment epithelium of the primate an isolated nucleic acid molecule consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp having a % overall identity, wherein the isolated nucleic acid molecule is the retinal pigment epithelium of the primate specifically when a nucleic acid sequence encoding said exogenous gene is operably linked to said isolated nucleic acid molecule.
[2] The method of [1] above, wherein the isolated nucleic acid molecule further comprises a minimal promoter, such as the minimal promoter of SEQ ID NO:2.
[3] The method of [1] or [2] above, wherein the isolated nucleic acid molecule is part of an expression cassette.
[4] The method according to [3] above, wherein the expression cassette is part of a vector.
[5] The method of [4] above, wherein the vector is a viral vector.
[6] comprising or consisting of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, or at least 80% of said sequence of SEQ ID NO: 1, for expressing an exogenous gene specifically in cells of the retinal pigment epithelium of primates; Use of an isolated nucleic acid molecule consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp with overall identity, said isolated nucleic acid molecule inhibiting the expression of an exogenous gene in cells of the retinal pigment epithelium of a primate, said exogenous gene is specifically provided when the nucleic acid sequence encoding is operably linked to said isolated nucleic acid molecule.
[7] The use of [6] above, wherein the isolated nucleic acid molecule further comprises a minimal promoter, such as the minimal promoter of SEQ ID NO:2.
[8] The use of [6] or [7] above, wherein the isolated nucleic acid molecule is part of an expression cassette.
[9] The use according to [8] above, wherein the expression cassette is part of a vector.
[10] The use according to [9] above, wherein the vector is a viral vector.
[11] at least 400 bp comprising or consisting of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 or having at least 80% overall identity with said sequence of SEQ ID NO: 1 for use in the treatment of diseases associated with the retinal pigment epithelium wherein the nucleic acid sequence encoding the exogenous gene is operably linked to the isolated nucleic acid molecule to effect expression of an exogenous gene in cells of the primate retinal pigment epithelium An isolated nucleic acid molecule that specifically provides when
[12] The use according to [11] above, wherein the disease associated with the retinal pigment epithelium is selected from the group consisting of age-related macular degeneration, retinitis pigmentosa, diabetic retinopathy and retinal pigment epithelial hypertrophy. isolated nucleic acid molecule for
Claims (12)
列番号1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列と少なく
とも80%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離核酸分子
を、前記霊長類の前記網膜色素上皮の細胞に送達するステップを含み、前記単離核酸分子
は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を、前記外因性遺伝子をコード
する核酸配列が前記単離核酸分子に作動可能に結合している場合に特異的にもたらす方法
。 A method of expressing an exogenous gene specifically in cells of the retinal pigment epithelium of a primate comprising or consisting of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 or at least 80% whole of said sequence of SEQ ID NO: 1 delivering to cells of the retinal pigment epithelium of the primate an isolated nucleic acid molecule consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp with identity, wherein the isolated nucleic acid molecule is present in cells of the retinal pigment epithelium of the primate; specifically when a nucleic acid sequence encoding said exogenous gene is operably linked to said isolated nucleic acid molecule.
らに含む、請求項1に記載の方法。 2. The method of claim 1, wherein said isolated nucleic acid molecule further comprises a minimal promoter, such as the minimal promoter of SEQ ID NO:2.
1の核酸配列を含み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列と少なくとも8
0%の全体同一性を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離核酸分子の使用
であって、前記単離核酸分子は、霊長類の網膜色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を
、前記外因性遺伝子をコードする核酸配列が前記単離核酸分子に作動可能に結合している
場合に特異的にもたらす使用。 comprising or consisting of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, or said sequence of SEQ ID NO: 1 and at least 8, for expressing an exogenous gene specifically in cells of the retinal pigment epithelium of a primate
Use of an isolated nucleic acid molecule consisting of a nucleic acid sequence of at least 400 bp with 0% overall identity, said isolated nucleic acid molecule inhibiting the expression of an exogenous gene in cells of the retinal pigment epithelium of a primate to said A use specifically provided when a nucleic acid sequence encoding an exogenous gene is operably linked to said isolated nucleic acid molecule.
らに含む、請求項6に記載の使用。 7. Use according to claim 6, wherein said isolated nucleic acid molecule further comprises a minimal promoter, such as the minimal promoter of SEQ ID NO:2.
み、若しくはそれからなり、又は配列番号1の前記配列と少なくとも80%の全体同一性
を有する少なくとも400bpの核酸配列からなる単離核酸分子であって、霊長類の網膜
色素上皮の細胞中の外因性遺伝子の発現を、前記外因性遺伝子をコードする核酸配列が前
記単離核酸分子に作動可能に結合している場合に特異的にもたらす単離核酸分子。 A nucleic acid sequence of at least 400 bp comprising or consisting of or having at least 80% overall identity with said sequence of SEQ ID NO: 1 for use in the treatment of diseases associated with the retinal pigment epithelium. wherein the nucleic acid sequence encoding the exogenous gene is operably linked to the isolated nucleic acid molecule for the expression of an exogenous gene in cells of the primate retinal pigment epithelium An isolated nucleic acid molecule that provides a specific case.
症及び網膜色素上皮肥大症からなる群から選択される、請求項11に記載の使用のための
単離核酸分子。 12. A unit for use according to claim 11, wherein said disease associated with retinal pigment epithelium is selected from the group consisting of age-related macular degeneration, retinitis pigmentosa, diabetic retinopathy and retinal pigment epithelial hypertrophy. isolated nucleic acid molecule.
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