JP2021515912A - ディジタル病理スキャニング・インターフェースおよびワークフロー - Google Patents
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Abstract
Description
モジュール134を使用する、スキャンイング・インターフェース・アプリケーションにおける目視、あるいは別個の画像目視、注釈付け、および分析ソフトウェア・アプリケーションにおける目視を含む)。
[0119] ある実施形態では、基板上に載せられた生体試料の高解像度スキャンを、スキャニング・デバイスによって取得する方法であって、この方法は、(i)グラフィカル・ユーザ・インターフェース上において、ユーザ構成可能スキャニング設定値に対応する第1ユーザ入力を受け取るステップと、(ii)グラフィカル・ユーザ・インターフェース上において、ユーザ構成可能スキャニング設定値に対応する、受け取った一連のユーザ入力に基づいてスキャニングを開始するための第2ユーザ入力を受け取るステップと、(iii)グラフィカル・ユーザ・インターフェース上に、スキャニング動作ステータス情報、画像データ、およびユーザ構成可能スキャニング設定値の少なくとも一部が入力された1つ以上のプレースホルダの可視化を表示するステップとを含む。ある実施形態では、この方法は、更に、画像データを格納するための第3ユーザ入力を受け取るステップを含む。ある実施形態では、画像データを格納するステップは、更に、格納の前に、画像データの高解像度スキャンを生成するステップを含む。ある実施形態では、この方法は、更に、ユーザ構成可能スキャニング設定値に対応する一連のユーザ入力を見直し、見直した一連のユーザ入力に基づいて画像データを再スキャンするための第4ユーザ入力を受け取るステップを含む。ある実施形態では、1つ以上の選択されたユーザ構成可能スキャニング設定値が、(i)予め計算された対象エリアに対する調節値、および(ii)ユーザ構成可能スキャニング・パラメータを含む。ある実施形態では、予め計算された対象エリアに対する調節が、対象エリアのサイズ変更、対象エリアの再位置付け、焦点の再位置付け、新たな対象エリアの作成、または対象エリアの削除を含む。ある実施形態では、ユーザ構成可能スキャニング・パラメータが、合焦方法、対象エリア決定方法、倍率、合焦レイヤの数、および合焦レイヤの間隔を含む。ある実施形態では、ユーザ構成可能スキャニング・パラメータが、更に、ラベル匿名化機能を含む。
Claims (40)
- 生体試料の高解像度画像を、スライド・スキャニング・デバイスによって取得する方法であって、
複数の重複しないプレースホルダを表示するステップであって、各プレースホルダが、スライド・スキャニング・デバイスに挿入されたスライド・トレーのスライド位置に対応し、各プレースホルダが、画像データを伝えるように構成された第1部分と、1つ以上のデータ・フィールドを伝えるように構成された第2部分とを有する、ステップ(221)と、
複数のプレースホルダの各々の第2部分に、少なくともスキャニング動作ステータス情報を入力するステップ(222)と、
複数のプレースホルダの内少なくとも1つの第1部分に、スライド・トレーの対応するスライド位置に配置された生体試料のプレビュー・スキャン画像を入力するステップ(222)と、
1つ以上の選択されたユーザ・インターフェース・エレメントの選択に対応する入力信号を受け取り、当該入力信号に基づいて、少なくとも1つの高解像度スキャン画像を生成するステップ(225)と、
を含む、方法。 - 請求項1記載の方法において、前記プレビュー・スキャン画像がサムネイル画像である、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法において、前記少なくとも1つの高解像度スキャン画像が、1つ以上の選択されたユーザ構成可能スキャニング設定値に対応する入力信号を受け取り、当該入力信号に基づいて生成される、方法。
- 請求項3記載の方法において、前記1つ以上のユーザ構成可能スキャニング設定値が、(i)予め計算された対象エリアに対する調節、および(ii)構成可能スキャニング・パラメータとを含む、方法。
- 請求項4記載の方法において、予め計算された対象エリアに対する前記調節が、対象エリアのサイズ変更、対象エリアの再位置付け、焦点の再位置付け、新たな対象エリアの作成、および対象エリアの削除の内少なくとも1つを含む、方法。
- 請求項4記載の方法において、前記構成可能スキャニング・パラメータが、合焦方法、AOI検出方法、倍率、合焦レイヤの数、および合焦レイヤの間隔の内少なくとも1つを含む、方法。
- 請求項6記載の方法において、前記構成可能スキャニング・パラメータが、更に、ラベルの匿名化を含む、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法において、スキャニング動作ステータス情報および初期スキャニング・パラメータの双方が、前記複数のプレースホルダの第2部分内に表示される、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法において、前記プレースホルダの第2部分に入力される前記スキャニング動作ステータス情報が、前記スライド・トレーの対応する位置にスライドが存在しないとき、空ステータス・フィールドとなる、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法において、前記複数のプレースホルダの内少なくとも1つの第1部分に入力される前記プレビュー・スキャン画像が、自動的に生成され、前記自動的に生成されたプレビュー・スキャン画像が、予めプログラミングされたスキャニング設定値を使用して取得される、方法。
- 請求項10記載の方法において、前記予めプログラミングされたスキャニング設定値が、合焦方法および対象エリア検出方法の内少なくとも1つを含む、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法において、前記スキャニング動作ステータス情報が、英数字指示、動画、および着色指標の内少なくとも1つを含む、方法。
- 請求項12記載の方法において、前記スライド・スキャナ・デバイスが、複数のステータス指示灯を有する外面パネルを含み、各ステータス指示灯が、前記複数のプレースホルダの内1つに対応し、前記複数のプレースホルダの内任意の個々のプレースホルダに対して表示される着色指標が、対応する個々のステータス指示灯の色と実質的に一致する、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法であって、更に、スライド・ラベル情報を自動的に認識し、前記認識したスライド・ラベル情報を1つ以上のメタデータ・フィールドに入力するステップを含む、方法。
- 請求項14記載の方法において、前記1つ以上のメタデータ・フィールドがDICOM属性である、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法であって、更に、前記複数のプレースホルダの内少なくとも1つの中にある前記プレビュー・スキャン画像が、所定の基準を満たすか否か評価するステップを含み、前記プレビュー・スキャン画像の評価が、焦点品質または画像コントラストについて、前記プレビュー・スキャン画像の少なくとも1つの拡大部分を検討することを含む、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法であって、更に、前記複数のプレースホルダの内少なくとも1つの第1部分に入力された前記プレビュー・スキャン画像の拡大部分のレンダリングを含む、重ね合わせウィンドウを表示するステップを含む、方法。
- 請求項17記載の方法において、前記プレビュー・スキャン画像の拡大部分のレンダリングが、入力デバイスによって選択された画像エリアに対応する、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法であって、更に、前記複数のプレースホルダの内少なくとも1つの第1部分に入力された前記プレビュー・スキャン画像上に対象エリアを重ね合わせるステップを含む、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法において、前記複数のプレースホルダの各々に、前記スライド・トレーの対応するスライド位置における生体試料のプレビュー・スキャン画像を順次入力し、前記スキャン動作ステータス情報をリアル・タイムで更新する、方法。
- 前出の請求項のいずれか1項記載の方法であって、更に、スライド・トレー挿入信号を受け取るステップを含み、前記スライド・トレー挿入信号が、前記スライド・トレー内におけるスライド位置の数の指示を含み、表示される前記複数の重複しないプレースホルダの数が、前記示されたスライド位置の数に基づいて決定される、方法。
- 高解像度画像スキャンを生成するシステム(100)であって、
(i)1つ以上のプロセッサ(102)と、(ii)前記1つ以上のプロセッサ(102)に結合された1つ以上のメモリ(104)とを備え、前記1つ以上のメモリ(104)がコンピュータ実行可能命令を格納し、前記1つ以上のプロセッサによってコンピュータ実行可能命令が実行されると、前記システム(100)に、
(i)複数のスライド位置を有するスライド・トレーの説明図をディスプレイ・デバイス(108)上に表示する動作であって、前記説明図が複数のプレースホルダを含み、各プレースホルダが前記複数のスライド位置の内の1つに対応する、動作と、
(ii)前記複数のプレースホルダの各々に、スキャニング・デバイス(110)から受け取ったスキャン動作ステータス情報を入力する動作と、
(iii) 前記プレースホルダの各々に、前記スキャニング・デバイス(110)から受け取った生体試料のスキャン画像を順次入力する動作と、
(iv)1つ以上の選択されたユーザ構成可能スキャニング設定値に基づいて、前記スライド・トレーの1つ以上のスライド位置に配置された1つ以上の顕微鏡スライドの再スキャニングを実行するための信号を、前記スキャニング・デバイス(110)に送信する動作と、
を含む動作を実行させる、システム(100)。 - 請求項22記載のシステムであって、更に、前記スキャン画像の少なくとも1つの拡大部分を表示する動作を含む、システム。
- 請求項23記載のシステムにおいて、前記拡大部分が、重ね合わされたビューア・ウィンドウ内に表示される、システム。
- 請求項22から24までのいずれか1項記載のシステムにおいて、前記1つ以上の選択されたユーザ構成可能スキャニング設定値が、(i)予め計算された対象エリアに対する調節と、(ii)構成可能スキャニング設定値とを含む、システム。
- 請求項25記載のシステムにおいて、予め計算された対象エリアに対する調節が、対象エリアのサイズ変更、対象エリアの再位置付け、焦点の再位置付け、新たな対象エリアの作成、および対象エリアの削除の内少なくとも1つを含む、システム。
- 請求項26記載のシステムにおいて、前記構成可能スキャニング・パラメータが、合焦方法、AOI検出方法、倍率、合焦レイヤの数、および合焦レイヤの間隔を含む、システム。
- 請求項22から27までのいずれか1項記載のシステムにおいて、前記スキャニング動作ステータス情報が、英数字指示、動画、および着色指標の内少なくとも1つを含む、システム。
- 請求項28記載のシステムにおいて、前記スキャニング・デバイスが、複数のステータス指示灯を有する外面パネルを含み、各ステータス指示灯が、前記複数のプレースホルダの内1つに対応し、前記複数のプレースホルダの内任意の個々のプレースホルダに対して表示される着色指標が、対応する個々のステータス指示灯の色と実質的に一致する、システム。
- 請求項22から29までのいずれか1項記載のシステムであって、更に、前記スキャンされた画像内においてスライド・ラベル情報を自動的に認識し、前記スライド・ラベル情報を1つ以上のメタデータ・フィールドに入力する動作を含む、システム。
- 請求項30記載のシステムにおいて、前記1つ以上のメタデータ・フィールドがDICOM属性である、システム。
- スライド・スキャニング・デバイスによって高解像度画像スキャンを生成するための命令を格納する非一時的コンピュータ読み取り可能媒体であって、
複数の重複しないプレースホルダを表示する命令であって、各プレースホルダがスライド・スキャニング・デバイスに挿入されたスライド・トレーのスライド位置に対応し、各プレースホルダが、画像データを伝えるように構成された第1部分と、1つ以上のデータ・フィールドを伝えるように構成された第2部分とを有する、命令と、
前記複数のプレースホルダの各々の第2部分に、少なくともスキャニング動作ステータス情報を入力する命令と、
前記複数のプレースホルダの内少なくとも1つの第1部分に、前記スライド・トレーの対応するスライド位置に配置された生体試料のプレビュー・スキャン画像を入力する命令と、
を含む、非一時的コンピュータ読み取り可能媒体。 - 請求項32記載の非一時的コンピュータ読み取り可能媒体であって、更に、1つ以上の選択されたユーザ構成可能スキャニング設定値に対応する入力信号を受け取り、当該入力信号に基づいて、少なくとも1つの高解像度スキャン画像を生成する命令を含む、非一時的コンピュータ読み取り可能媒体。
- 請求項32から33までのいずれか1項記載の非一時的コンピュータ読み取り可能媒体において、前記スライド・トレーの前記スライド・スキャニング・デバイスへの挿入時に、スキャニング動作を自動的に開始するための命令を供給する、非一時的コンピュータ読み取り可能媒体。
- 請求項34記載の非一時的コンピュータ読み取り可能媒体において、前記自動的に開始されるスキャニング動作が、プリセット・スキャニング設定値を利用する、非一時的コンピュータ読み取り可能媒体。
- 請求項35記載の非一時的コンピュータ読み取り可能媒体において、前記プリセット・スキャニング設定値が、合焦方法および対象エリア検出方法の内少なくとも1つを含む、非一時的コンピュータ読み取り可能媒体。
- スキャニング・デバイスによって、基板上に載せられた生体試料の高解像度スキャンを取得する方法であって、
グラフィカル・ユーザ・インターフェース上で、ユーザ構成可能スキャニング設定値に対応する第1ユーザ入力を受け取るステップと、
グラフィカル・ユーザ・インターフェース上で、前記ユーザ構成可能スキャニング設定値に対応する、前記受け取った一連のユーザ入力に基づいてスキャニングを開始するための第2ユーザ入力を受け取るステップと、
前記グラフィカル・ユーザ・インターフェース上に、(i)スキャニング動作ステータス情報、(ii)画像データ、および/または(iii)前記ユーザ構成可能スキャニング設定値の少なくとも一部の内1つ以上が入力された1つ以上のプレースホルダの少なくとも可視化を表示するステップと、
を含む、方法。 - 請求項37記載の方法であって、更に、前記画像データを格納するための第3ユーザ入力を受け取るステップを含む、方法。
- 請求項38記載の方法において、前記画像データの格納が、更に、格納の前に、前記画像データの高解像度スキャンを生成するステップを含む、方法。
- 請求項38から39までのいずれか1項記載の方法であって、更に、ユーザ構成可能スキャニング設定値に対応する一連のユーザ・入力を受け取り、当該一連のユーザ入力に基づいて画像データを再スキャンするための第4ユーザ入力を受け取るステップを含む、方法。
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