JP2014522532A - 表現型を示す組み合わせサインのクロスモーダル適用 - Google Patents
表現型を示す組み合わせサインのクロスモーダル適用 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2014522532A JP2014522532A JP2014514167A JP2014514167A JP2014522532A JP 2014522532 A JP2014522532 A JP 2014522532A JP 2014514167 A JP2014514167 A JP 2014514167A JP 2014514167 A JP2014514167 A JP 2014514167A JP 2014522532 A JP2014522532 A JP 2014522532A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- modality
- signature
- feature
- measurement
- data
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/20—Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
Landscapes
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Measuring And Recording Apparatus For Diagnosis (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
- Magnetic Resonance Imaging Apparatus (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
Description
Claims (15)
- 検体の測定によって得られた表現型の複合サインを適合する方法であって、当該方法は、
表現型の複合サインを提供するステップであって、
前記複合サインは、前記検体を第1測定モダリティで測定することによって生成されたA型のデータを含み、
前記A型のデータは、少なくとも1つのモダリティ特徴a1…aqの値を含み、
前記複合サインは、前記検体を第2測定モダリティで測定することによって生成されたB型のデータを含み、
前記B型のデータは、少なくとも1つのモダリティ特徴b1…bkの値を含む、提供ステップと、
モダリティ特徴biの値と、第3測定モダリティを用いて測定されたモダリティ特徴cjの値との間の所定の相関に基づき、前記モダリティ特徴biの値を適合するステップであって、
特徴biは、b1…bkに含まれ、
当該適合により、前記表現型の適合された複合サインが得られる、適合ステップと、
前記適合された複合サインにサイン評価ツールを適用するステップであって、
前記サイン評価ツールは、前記第3測定モダリティを用いて測定されたデータから導き出された、適用ステップと
を含む、方法。 - モダリティ特徴biの値と、前記検体を測定する前記第3測定モダリティを用いて測定されたモダリティ特徴cjの値との間の相関を決定するステップをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記相関は、前記第2モダリティの特徴b1…bkの値が、前記第3測定モダリティの特徴c1…cnに含まれるモダリティ特徴cjの値とどの程度合致又は相関するかを定める、請求項1又は2に記載の方法。
- 前記第2測定モダリティは、第1医療イメージング方式であり、
前記第3測定モダリティは、第2医療イメージング方式である、請求項1乃至3のいずれか一項に記載の方法。 - 前記第2測定モダリティ及び前記第3測定モダリティは、超音波イメージング、ドップラー超音波イメージング、X線イメージング、MRI、PET、PAM(FTG)、BSGI、転写プロファイリング、遺伝子及び/又はノンコーディングRNAプロファイリング、SNP、CNP、プロテオームプロファイリング、DNAメチル化、ヒストンメチル化プロファイリング、アセチル化、リン酸化状態、遺伝子発現プロファイリング、コピー数多型プロファイリング、一塩基多型プロファイリング、ヒストンアセチル化プロファイリング、プロテオミクスプロファイリング、リン酸化状態プロファイリング、及びこれらの任意の組み合わせからなるグループから独立して選択される、請求項1乃至4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記サイン評価ツールの前記適合された複合サインへの適合に基づき、前記表現型の性質に関する結果を算出するステップをさらに含む、請求項1乃至5のいずれか一項に記載の方法。
- 前記相関を決定するステップは、いくつかの特徴b1…bkについて、c1…cn内の少なくとも1つの特徴に対して実施され、
b1…bkから、前記決定された相関がc1…cnのうち少なくとも一つの特徴と合致を示す特徴を選択するステップをさらに含み、前記合致は、所定の閾値より高い、請求項1乃至6のいずれか一項に記載の方法。 - マトリックス要素bcijを有するマッピングマトリックスを提供するステップと、
表現型の複合サインをベクトル形式で提供するステップとをさらに含み、
前記マトリックス要素bcijは、それぞれ特徴biの値と特徴cjの値との間の決定された相関を示す、請求項1乃至7のいずれか一項に記載の方法。 - 前記第1測定モダリティは、臨床病理データを得るための方式である、請求項1乃至8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記A型のデータは臨床病理データであり、
臨床病理データを得るための方式を通じて前記臨床病理データを不変に保つステップをさらに含む、請求項9に記載の方法。 - 前記表現型はがんであり、
前記サイン評価ツールを前記適合された複合サインに適用することによってがんの再発リスクを計算するステップをさらに含む、請求項1乃至10のいずれか一項に記載の方法。 - 前記複合サインは、少なくとも2つの異なる検体測定モダリティによって生成されたデータを含み、前記方法は、前記複合サインを、前記第3測定モダリティによって測定されたデータから得られたサイン評価ツールが利用できるようにする、請求項1乃至11のいずれか一項に記載の方法。
- 検体の測定によって得られた表現型の複合サインを適合するための医療イメージング装置であって、
前記検体を第1測定モダリティで測定することによって生成されたA型のデータを受信する受信部と、
前記検体を第2測定モダリティで測定することによってB型のデータを生成するイメージング装置とを含み、
前記医療イメージング装置は、前記表現型の複合サインを生成し、
前記複合サインは、前記A型のデータ及び前記B型のデータを含み、
前記A型のデータは、モダリティ特徴a1…aqの値を含み、
前記B型のデータは、モダリティ特徴b1…bkの値を含み、
前記医療イメージング装置は、モダリティ特徴biの値と第3測定モダリティを用いて測定されたモダリティ特徴cjの値との間の決定された相関に基づき、前記モダリティ特徴biの値を適合し、
特徴biは、b1…bkに含まれ、
前記医療イメージング装置は、適合された複合サインを生成し、
前記医療イメージング装置は、前記適合された複合サインにサイン評価ツールを適用し、
前記サイン評価ツールは、前記第3測定モダリティによって測定されたデータから導出された、医療撮像装置。 - 検体の測定によって得られた表現型の複合サインを適合するプログラム要素であって、当該プログラム要素は、プロセッサによって実行されている場合、
表現型の複合サインをデータ形式で受信するステップであって、
前記複合サインは、第1検体測定モダリティによって生成されたA型のデータを含み、
前記A型のデータは、モダリティ特徴a1…aqの値を含み、
前記複合サインは、第2検体測定モダリティによって生成されたB型のデータを含み、
前記B型のデータは、モダリティ特徴b1…bkの値を含む、受信ステップと、
b1…bkに含まれる特徴biの値と、第3測定モダリティを用いて測定された特徴cjの値との間の所定の相関に基づき、前記特徴biの値を適合するステップであって、
当該適合により、適合された複合サインが得られる、適合ステップと、
前記適合された複合サインにサイン評価ツールを適用するステップであって、
前記サイン評価ツールは、前記第3測定モダリティを用いて測定されたデータから導き出された、適用ステップと
を実行する、プログラム要素。 - 検体の測定によって得られた表現型の複合サインを適合するプログラム要素を記憶するコンピュータ読み取り可能媒体であって、前記プログラム要素は、プロセッサによって実行されている場合、
表現型の複合サインをデータ形式で受信するステップであって、
前記複合サインは、第1検体測定モダリティによって生成されたA型のデータを含み、
前記A型のデータは、モダリティ特徴a1…aqの値を含み、
前記複合サインは、第2検体測定モダリティによって生成されたB型のデータを含み、
前記B型のデータは、モダリティ特徴b1…bkの値を含む、受信ステップと、
b1…bkに含まれる特徴biの値と、第3測定モダリティを用いて測定された特徴cjの値との間の所定の相関に基づき、前記特徴biの値を適合するステップであって、
当該適合により、適合された複合サインが得られる、適合ステップと、
前記適合された複合サインにサイン評価ツールを適用するステップであって、
前記サイン評価ツールは、前記第3測定モダリティを用いて測定されたデータから導き出された、適用ステップと
を実行する、コンピュータ読み取り可能媒体。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201161493563P | 2011-06-06 | 2011-06-06 | |
US61/493,563 | 2011-06-06 | ||
PCT/IB2012/052551 WO2012168810A2 (en) | 2011-06-06 | 2012-05-22 | Cross-modal application of combination signatures indicative of a phenotype |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2014522532A true JP2014522532A (ja) | 2014-09-04 |
JP6047558B2 JP6047558B2 (ja) | 2016-12-21 |
Family
ID=46321181
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014514167A Expired - Fee Related JP6047558B2 (ja) | 2011-06-06 | 2012-05-22 | 表現型を示す組み合わせサインのクロスモーダル適用 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20140107936A1 (ja) |
EP (1) | EP2718865A2 (ja) |
JP (1) | JP6047558B2 (ja) |
CN (1) | CN103718181B (ja) |
BR (1) | BR112013031048A2 (ja) |
MX (1) | MX2013014196A (ja) |
WO (1) | WO2012168810A2 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2020505659A (ja) * | 2017-11-13 | 2020-02-20 | ザ マルチプル ミエローマ リサーチ ファウンデーション, インコーポレイテッド | 統合された、分子、オーミクス、免疫療法、代謝、エピジェネティック、および臨床のデータベース |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20170150941A1 (en) * | 2014-07-02 | 2017-06-01 | Koninklijke Philips N.V. | Lesion signature to characterize pathology for specific subject |
US20220238208A1 (en) * | 2019-06-21 | 2022-07-28 | West Virginia University | Cardiac ultrasonic fingerprinting: an approach for highthroughput myocardial feature phenotyping |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002230518A (ja) * | 2000-11-29 | 2002-08-16 | Fujitsu Ltd | 診断支援プログラム、診断支援プログラムを記録したコンピュータ読取可能な記録媒体、診断支援装置及び診断支援方法 |
WO2005121784A1 (ja) * | 2004-06-10 | 2005-12-22 | Kurume University | 医用画像処理システム |
JP2006506731A (ja) * | 2002-11-15 | 2006-02-23 | コーニンクレッカ フィリップス エレクトロニクス エヌ ヴィ | 意味的関連性に基づくコンテンツ抽出 |
JP2009268826A (ja) * | 2008-05-09 | 2009-11-19 | Panasonic Corp | 脳波識別方法調整装置および方法 |
JP2011508917A (ja) * | 2007-12-21 | 2011-03-17 | コーニンクレッカ フィリップス エレクトロニクス エヌ ヴィ | クロスモダリティによる事例ベースのコンピュータ支援診断のための方法及びシステム |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20060034508A1 (en) * | 2004-06-07 | 2006-02-16 | Zhou Xiang S | Computer system and method for medical assistance with imaging and genetics information fusion |
US20070130206A1 (en) * | 2005-08-05 | 2007-06-07 | Siemens Corporate Research Inc | System and Method For Integrating Heterogeneous Biomedical Information |
US9858392B2 (en) * | 2008-05-12 | 2018-01-02 | Koninklijke Philips N.V. | Medical analysis system |
-
2012
- 2012-05-22 MX MX2013014196A patent/MX2013014196A/es not_active Application Discontinuation
- 2012-05-22 WO PCT/IB2012/052551 patent/WO2012168810A2/en active Application Filing
- 2012-05-22 EP EP12728798.5A patent/EP2718865A2/en not_active Ceased
- 2012-05-22 US US14/124,076 patent/US20140107936A1/en not_active Abandoned
- 2012-05-22 BR BR112013031048A patent/BR112013031048A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2012-05-22 JP JP2014514167A patent/JP6047558B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2012-05-22 CN CN201280038186.9A patent/CN103718181B/zh not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002230518A (ja) * | 2000-11-29 | 2002-08-16 | Fujitsu Ltd | 診断支援プログラム、診断支援プログラムを記録したコンピュータ読取可能な記録媒体、診断支援装置及び診断支援方法 |
JP2006506731A (ja) * | 2002-11-15 | 2006-02-23 | コーニンクレッカ フィリップス エレクトロニクス エヌ ヴィ | 意味的関連性に基づくコンテンツ抽出 |
WO2005121784A1 (ja) * | 2004-06-10 | 2005-12-22 | Kurume University | 医用画像処理システム |
JP2011508917A (ja) * | 2007-12-21 | 2011-03-17 | コーニンクレッカ フィリップス エレクトロニクス エヌ ヴィ | クロスモダリティによる事例ベースのコンピュータ支援診断のための方法及びシステム |
JP2009268826A (ja) * | 2008-05-09 | 2009-11-19 | Panasonic Corp | 脳波識別方法調整装置および方法 |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2020505659A (ja) * | 2017-11-13 | 2020-02-20 | ザ マルチプル ミエローマ リサーチ ファウンデーション, インコーポレイテッド | 統合された、分子、オーミクス、免疫療法、代謝、エピジェネティック、および臨床のデータベース |
JP7019200B2 (ja) | 2017-11-13 | 2022-02-15 | ザ マルチプル ミエローマ リサーチ ファウンデーション, インコーポレイテッド | 統合された、分子、オーミクス、免疫療法、代謝、エピジェネティック、および臨床のデータベース |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2012168810A2 (en) | 2012-12-13 |
EP2718865A2 (en) | 2014-04-16 |
MX2013014196A (es) | 2014-03-21 |
BR112013031048A2 (pt) | 2016-11-29 |
JP6047558B2 (ja) | 2016-12-21 |
WO2012168810A3 (en) | 2013-02-28 |
CN103718181B (zh) | 2016-12-28 |
US20140107936A1 (en) | 2014-04-17 |
CN103718181A (zh) | 2014-04-09 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Cucchetti et al. | Preoperative prediction of hepatocellular carcinoma tumour grade and micro-vascular invasion by means of artificial neural network: a pilot study | |
US20190267113A1 (en) | Disease affection determination device, disease affection determination method, and disease affection determination program | |
CN104303184B (zh) | 整合医疗成像和活检数据的临床工作站以及使用其的方法 | |
US7881873B2 (en) | Systems and methods for statistical genomic DNA based analysis and evaluation | |
US20170358078A1 (en) | Systems and methods for spatial characterization of image data | |
US20230162515A1 (en) | Assessing heterogeneity of features in digital pathology images using machine learning techniques | |
CN111172279B (zh) | 外周血甲基化基因及idh1联合检测诊断肺癌模型 | |
CN111028223B (zh) | 一种微卫星不稳定肠癌能谱ct碘水图影像组学特征处理方法 | |
KR102044094B1 (ko) | 딥 러닝 기반 유전체 발현량 해석을 통한 암 또는 정상 판별 방법 및 그 장치 | |
JP2017511473A (ja) | 画像を処理して解析するための検査装置 | |
JP6047558B2 (ja) | 表現型を示す組み合わせサインのクロスモーダル適用 | |
JP2020513294A (ja) | 患者の臓器を視覚化する装置及び関連する視覚化方法 | |
CN113611404A (zh) | 一种基于集成学习的血浆样本癌症早筛方法 | |
EP3362925B1 (en) | Systems and methods for generating correct radiological recommendations | |
CN116844685A (zh) | 一种免疫治疗效果评估方法、装置、电子设备及存储介质 | |
Matheson et al. | Simultaneous multifactor Bayesian analysis (SiMBA) of PET time activity curve data | |
Iacucci et al. | Artificial intelligence and endo-histo-omics: new dimensions of precision endoscopy and histology in inflammatory bowel disease | |
EP4071768A1 (en) | Cad device and method for analysing medical images | |
CN111863129A (zh) | 一种脑脊液中突变的检测方法及检测装置 | |
KR20140009854A (ko) | 치료제 선정을 위한 유전 정보의 분석 방법 및 장치 | |
KR20150043790A (ko) | 담도암 진단용 바이오마커의 추출 방법, 이를 위한 컴퓨팅 장치, 담도암 진단용 바이오마커 및 이를 포함하는 담도암 진단 장치 | |
Valdora et al. | Novel imaging techniques and biological methods for breast cancer evaluation: overview and update | |
Sheela et al. | Review on Early Ovarian Carcinoma using Radiomics | |
Chaddad et al. | Radiomics for a Comprehensive Assessment of Glioblastoma Multiforme | |
Kirienko | Imaging Biomarkers: Radiomics and the Use of Artificial Intelligence in Nuclear Oncology |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20150519 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20160520 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20160527 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160824 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20161028 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20161121 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6047558 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |