JP2013027387A - Pancreatic cancer biomarker - Google Patents

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Toru Onogawa
徹 小野川
Tomoaki Unno
倫明 海野
Fuyuhiko Motoi
冬彦 元井
Tatsuyuki Takadate
達之 高舘
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide forecast markers of a pancreatic cancer and prognosis such as the specific detection and prognostic forecast of the pancreatic cancer, and a using method of the same.SOLUTION: A protein has been extracted to be solubilized from the pancreatic cancer tissue of good prognosis and bad prognosis, and an FFPE sample of a normal pancreatic duct tissue to be objected, and the total of 1,229 proteins that express in each tissue have been identified by LC/MS/MS. Next, the total 170 proteins have been selected as a pancreatic cancer marker protein candidate by a statistical analysis, a spectrum counting analysis, and a gene ontology analysis, and have been analyzed by an MRM method. The analysis results of the MRM method have been examined closely, and the pancreatic cancer marker proteins of A-C groups have been identified finally. The pancreatic cancer can be detected specifically and the prognosis can be forecasted by using these pancreatic cancer marker proteins.

Description

本発明は、膵臓組織における膵臓癌の有無及び膵臓癌の予後を判定する方法や、該方法に用いるための膵臓癌及び予後の予測マーカー等に関する。   The present invention relates to a method for determining the presence or absence of pancreatic cancer in pancreatic tissue and the prognosis of pancreatic cancer, a pancreatic cancer for use in the method, a prognostic marker for prognosis, and the like.

膵臓は、膵液と呼ばれる消化酵素を含む液体を分泌し、それを膵管により消化管に送り込む外分泌腺であるとともに、膵臓組織に無数に散らばるランゲルハンス島と呼ばれる球状に小さな細胞の集塊がインスリン、グルカゴンなどのホルモンを血液中に分泌する内分泌腺としての機能も有する。独立行政法人国立がん研究センターがん対策情報センターによれば、2009年の日本国内における癌の部位別死亡者数の統計では膵臓癌は第5位であるが、膵臓癌の罹患数は死亡数とほぼ等しく、1993〜1996年の部位別がん患者の5年相対生存率は最も低い。すなわち、膵臓癌は、診断、治療ともに困難で、消化器系悪性腫瘍の中で最も予後不良な癌である。長期生存を得るための唯一の治療法は根治的外科切除であるが、膵臓癌は、早期には自覚症状がなく進行が非常に早いため進行がんで発見されることが多く切除率は約30%にとどまる。また、根治切除後の再発率も極めて高く、切除例の5年生存率は10%程度にすぎない。膵臓癌の予後を改善するためには、早期診断のみならず、手術や化学療法などの有効性を評価した上での的確な治療方針の確立が重要である。   The pancreas is an exocrine gland that secretes a fluid containing a digestive enzyme called pancreatic juice and sends it to the digestive tract through the pancreatic tract, and an agglomeration of small and small cells called Langerhans islands scattered throughout the pancreatic tissue is insulin, glucagon It also functions as an endocrine gland that secretes hormones such as these into the blood. According to the National Cancer Center National Center for Cancer Control Information, according to statistics on the number of deaths by cancer site in Japan in 2009, pancreatic cancer is ranked fifth, but the number of affected pancreatic cancers died Equally equal to the number, the 5-year relative survival rate of cancer patients by site in 1993-1996 is the lowest. That is, pancreatic cancer is difficult to diagnose and treat, and is the most prognostic cancer among digestive malignant tumors. The only treatment to achieve long-term survival is radical surgical resection, but pancreatic cancer is often found in advanced cancer because there is no subjective symptom at an early stage and the resection rate is about 30 Stay at%. In addition, the recurrence rate after radical resection is extremely high, and the 5-year survival rate of resection cases is only about 10%. In order to improve the prognosis of pancreatic cancer, it is important to establish an appropriate treatment policy after evaluating the effectiveness of not only early diagnosis but also surgery and chemotherapy.

現在のところ、膵臓癌の診断用マーカーとして、癌胎児性抗原CEAや糖鎖抗原CA19−9、DUPAN−2、SPan−1等が知られているが、これらはいずれも膵臓癌に特異的なマーカーではなく擬陽性が多い、またその一部は膵臓癌と膵炎とを区別できないものがあるなどにより、膵臓癌の早期診断には有効でないと考えられている(非特許文献1)。実際、CEAは膵臓癌だけでなく、結腸直腸癌、胃癌、胆道癌、乳癌、肺癌、頭部癌、頸部癌を有する患者の血清中でも増加することや(非特許文献2)、初期の癌患者の血清中では増加しないことも報告されている(非特許文献3〜5)。CEAと同様に、CA19−9は、消化系の癌、特に膵臓がんに特異性の高い腫瘍マーカーであり、膵臓癌を特異的に検出するために適当なマーカーとは言えない。膵臓癌発癌過程における詳細な癌関連分子の発現変動に関する検討も行われているが、検体量が少ない場合にmRNAの定量解析がうまくいかないこと、膵臓癌の種類によっては検出できない、あるいは膵臓癌だけでなく膵炎でも検出されるなど、問題があり実用化には至っておらず(非特許文献6、特許文献1〜3)、特許文献4及び5には癌の予後予測のマーカーが記載されているが、特定の癌を判別することはできず、膵臓癌における予後は、生死の結果からの判定を待つのが現状である。以上のように、膵臓癌を特異的に検出するためのマーカーや、膵臓癌の予後を予測するためのマーカーや、まして膵臓癌の検出及び予後予測のためのマーカーは未だ存在しておらず、その開発が急がれている。   At present, carcinoembryonic antigen CEA, sugar chain antigen CA19-9, DUPAN-2, SPan-1, etc. are known as diagnostic markers for pancreatic cancer, all of which are specific for pancreatic cancer. It is thought that it is not effective for early diagnosis of pancreatic cancer because there are many false positives instead of markers, and some of them are indistinguishable from pancreatic cancer and pancreatitis (Non-patent Document 1). In fact, CEA increases not only in pancreatic cancer but also in the serum of patients with colorectal cancer, gastric cancer, biliary tract cancer, breast cancer, lung cancer, head cancer, cervical cancer (non-patent document 2), and early stage cancer. It has also been reported that it does not increase in the serum of patients (Non-Patent Documents 3 to 5). Like CEA, CA19-9 is a tumor marker highly specific for digestive cancers, particularly pancreatic cancer, and is not an appropriate marker for specifically detecting pancreatic cancer. Although detailed studies on the expression variation of cancer-related molecules in the process of carcinogenesis of pancreatic cancer have been conducted, quantitative analysis of mRNA does not work when the amount of specimen is small, it cannot be detected depending on the type of pancreatic cancer, or only pancreatic cancer However, there is a problem that it is detected even in pancreatitis and it has not been put into practical use (Non-patent Document 6, Patent Documents 1 to 3), and Patent Documents 4 and 5 describe markers for predicting cancer prognosis. However, a specific cancer cannot be discriminated, and the prognosis in pancreatic cancer is currently waiting for a determination based on the result of life or death. As described above, a marker for specifically detecting pancreatic cancer, a marker for predicting the prognosis of pancreatic cancer, and a marker for detecting and prognosing pancreatic cancer have not yet existed, Its development is urgent.

他方、ホルマリン固定パラフィン包埋(formalin-fixed paraffin embedded)は、手術等で摘出された組織を保存するための最も一般的な方法であり、多くの病院や研究機関では、病理診断等を行った後のホルマリン固定パラフィン包埋組織(以下、「FFPE組織」という場合がある)が大量に保存されている。これらのFFPE組織は、患者の治療成績・予後等臨床情報が明らかであることから、バイオマーカー検索や創薬ターゲット探索のために非常に有効であると考えられている。しかし、FFPE組織では、ホルマリン固定よって組織内のタンパク質が架橋されているため、タンパク質を抽出することは困難であり、さらに、ホルマリン固定によって高分子が断片化されていることから、FFPE組織を、プロテオーム解析に用いることは不可能であると考えられていた。しかし、ごく最近になり、FFPE組織からのタンパク抽出法が開発され(特許文献6及び7)、FFPE組織を用いたプロテオーム解析が可能になりつつある。   On the other hand, formalin-fixed paraffin embedded is the most common method for preserving tissues removed by surgery, etc., and many hospitals and research institutions conducted pathological diagnosis. Subsequent formalin-fixed paraffin-embedded tissues (hereinafter sometimes referred to as “FFPE tissues”) are stored in large quantities. These FFPE tissues are considered to be very effective for biomarker search and drug discovery target search because clinical information such as treatment results and prognosis of patients is clear. However, in the FFPE tissue, since the protein in the tissue is cross-linked by formalin fixation, it is difficult to extract the protein, and since the polymer is fragmented by formalin fixation, the FFPE tissue is It was considered impossible to use for proteome analysis. However, very recently, protein extraction methods from FFPE tissues have been developed (Patent Documents 6 and 7), and proteome analysis using FFPE tissues is becoming possible.

特表2006−500948号公報JP-T-2006-500948 特表2006−526140号公報JP 2006-526140 A 特表2009−513161号公報Special table 2009-513161 特表2011−516077号公報Special table 2011-516077 gazette 特表2007−532113号公報Special table 2007-532113 gazette 特許第4579234号公報Japanese Patent No. 4579234 特表2010−530980号公報Special table 2010-530980

CLINICIAN, No.476, 104:1118-1123 (1998)CLINICIAN, No.476, 104: 1118-1123 (1998) J. Natl. Cancer Inst. (Bethesda) 57: 11-22 (1976)J. Natl. Cancer Inst. (Bethesda) 57: 11-22 (1976) Dis. Colon. Rectum. 42: 921-929 (1999)Dis. Colon. Rectum. 42: 921-929 (1999) Ann. Surg. 183: 5-9 (1976)Ann. Surg. 183: 5-9 (1976) N. Engl. J. Med. 299: 448-451 (1978)N. Engl. J. Med. 299: 448-451 (1978) 膵臓 25:23-27 (2010)Pancreas 25: 23-27 (2010)

本発明の課題は、膵臓癌の有無を判定し、かつ予後を予測する方法や、膵臓癌マーカーの使用方法を提供することにある。   An object of the present invention is to provide a method for determining the presence or absence of pancreatic cancer and predicting prognosis, and a method for using a pancreatic cancer marker.

本願発明者らは、過去10年間(1998年〜2007年)の浸潤性膵管癌手術症例156症例から、既知の予後因子(ステージ、分化度、術後腫瘍マーカー値、補助化学療法)が同一であるにも関わらず、予後に差がある2群(各4例)を予後良好群、予後不良群として抽出した。正常膵管組織(5例)、並びに予後良好群及び予後不良群の膵臓癌細胞において発現するタンパク質をFFPE組織から抽出し、LC−ESI−MS(エレクトロスプレーイオン化液体クロマトグラフィー質量分析計)で解析し、合計1229種のタンパク質を同定した。予後不良群で同定した924種及び予後良好群で同定した845種の計1099種のタンパク質から比較定量解析(スペクトラルカウント)、統計解析(G検定)、遺伝子オントロジー解析及び文献検索によって、予後不良群で高発現するタンパク質をグループ1、及び予後良好群で高発現するタンパク質をグループ2として計106種、各群53種のタンパク質を分類した。また、64種のタンパク質を正常膵管細胞と膵臓癌細胞で発現に差があるグループ3として分類した。以上のDiscovery stepで得られた計170種類のタンパク質すべてをMRM(Multiple Reaction Monitoring)解析に供し、Validation stepを行った。その結果グループ1の13種、グループ2の4種、グループ3の18種の計35種類のタンパク質を、膵臓癌マーカー候補として同定した。さらに、これら計35種のMRM解析結果を精査し、その結果(1)18種類のタンパク質(FINC_HUMAN、FRIL_HUMAN、K1C10_HUMAN、K2C1_HUMAN、LYSC_HUMAN、PERM_HUMAN、PLBL1_HUMAN、S10A8_HUMAN、S10A9_HUMAN、STML2_HUMAN、TERA_HUMAN、TLN1_HUMAN、TSP1_HUMAN、ANX10_HUMAN、ECH1_HUMAN、OLFM4_HUMAN、EFTU_HUMAN、SERPH_HUMAN)が予後不良の膵臓癌において発現量が高いこと、(2)4種類のタンパク質(ALDH2_HUMAN、GTR1_HUMAN、PLEC1_HUMAN、PUR9_HUMAN)が予後良好の膵臓癌において発現量が高いこと、(3)13種類のタンパク質(ASC_HUMAN、CAP1_HUMAN、CEAM6_HUMAN、CH10_HUMAN、CISY_HUMAN、ERO1A_HUMAN、LG3BP_HUMAN、S100P_HUMAN、S10A6_HUMAN、SH3L3_HUMAN、SSBP_HUMAN、TAGL_HUMAN、VDAC1_HUMAN)が、予後不良及び予後良好の膵臓癌において発現量が高いことを見出し、本発明を完成するに至った。   The present inventors have the same known prognostic factors (stage, degree of differentiation, postoperative tumor marker value, adjuvant chemotherapy) from 156 invasive cases of invasive pancreatic duct cancer in the past 10 years (1998-2007). Nevertheless, two groups (4 cases each) with a different prognosis were extracted as a good prognosis group and a poor prognosis group. Proteins expressed in normal pancreatic duct tissues (5 cases) and pancreatic cancer cells in good and bad prognosis groups were extracted from FFPE tissues and analyzed by LC-ESI-MS (electrospray ionization liquid chromatography mass spectrometer). A total of 1229 proteins were identified. From a total of 1099 proteins, including 924 species identified in the poor prognosis group and 845 species identified in the good prognosis group, the poor prognosis group was obtained by comparative quantitative analysis (spectral count), statistical analysis (G test), gene ontology analysis and literature search. Proteins that are highly expressed in group 1 and proteins that are highly expressed in the group with good prognosis are group 2, and a total of 106 kinds of proteins are classified into 53 groups. In addition, 64 types of proteins were classified as group 3 in which there is a difference in expression between normal pancreatic duct cells and pancreatic cancer cells. All 170 types of proteins obtained in the above discovery step were subjected to MRM (Multiple Reaction Monitoring) analysis, and a validation step was performed. As a result, a total of 35 proteins, 13 types in Group 1, 4 types in Group 2, and 18 types in Group 3, were identified as pancreatic cancer marker candidates. Furthermore, these 35 types of MRM analysis results were examined in detail, and as a result (1) 18 types of proteins (FINC_HUMAN, FRIL_HUMAN, K1C10_HUMAN, K2C1_HUMAN, LYSC_HUMAN, PERM_HUMAN, PLBL1_HUMAN, S10A8HUMAN, PL10) ANX10_HUMAN, ECH1_HUMAN, OLFM4_HUMAN, EFTU_HUMAN, SERPH_HUMAN) are highly expressed in pancreatic cancer with poor prognosis, (2) 4 types of proteins (ALDH2_HUMAN, GTR1_HUMAN_HPU, NPU) That expression level is higher in pancreatic cancer, (3) 13 kinds of proteins (ASC_HUMAN, CAP1_HUMAN, CEAM6_HUMAN, CH10_HUMAN, CISY_HUMAN, ERO1A_HUMAN, LG3BP_HUMAN, S100P_HUMAN, S10A6_HUMAN, SH3L3_HUMAN, SSBP_HUMAN, TAGL_HUMAN, VDAC1_HUMAN) is, poor prognosis and prognostic The present inventors have found that the expression level is high in good pancreatic cancer and have completed the present invention.

すなわち、本発明は、[1]膵臓組織における、膵臓癌の有無を判定し、かつ予後を予測する方法であって、
(a)被験者より採取された判定用試料における、膵臓癌マーカーの発現量を定量する定量工程であって、前記膵臓癌マーカーが以下の各群のマーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNAである定量工程;
[A群マーカータンパク質]
FINC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02751)、FRIL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02792)、K1C10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P13645)、K2C1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P04264)、LYSC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61626)、PERM_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05164)、PLBL1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6P4A8)、S10A8_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05109)、S10A9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P06702)、STML2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJZ1)、TERA_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P55072)、TLN1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9Y490)、TSP1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P07996)、ANX10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJ72)、ECH1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q13011)、OLFM4_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6UX06)、EFTU_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P49411)、SERPH_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P50454)
[B群マーカータンパク質]
ALDH2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05091)、GTR1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P11166)、PLEC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q15149)、PUR9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P31939)
[C群マーカータンパク質]
CH10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61604)、CISY_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号O75390)、ERO1A_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q96HE7)、LG3BP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q08380)、SH3L3_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9H299)、SSBP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q04837)、TAGL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q01995)、VDAC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P21796)
(b)前記判定用試料における前記膵臓癌マーカーの発現量と、対照となる健常試料における前記膵臓癌マーカーの発現量とを比較する比較工程;
(c)発現量の比較結果に基づいて、以下の[i]〜[iii]のいずれかの基準により評
価をする評価工程;
[i]判定用試料におけるA群マーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質又はそれらのタンパク質をコードするmRNAの発現量が、健常試料における発現量と比較して増加している場合、被験者の膵臓組織中に予後不良の膵臓癌組織が存在すると評価する;
[ii]判定用試料におけるB群マーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質又はそれらのタンパク質をコードするmRNAの発現量が、健常試料における発現量と比較して増加している場合、被験者の膵臓組織中に予後良好の膵臓癌組織が存在すると評価する;
[iii]判定用試料におけるC群マーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質又はそれらのタンパク質をコードするmRNAの発現量が、健常試料における発現量と比較して、増加している場合に被験者の膵臓組織中に予後不良又は予後良好の膵臓癌組織が存在すると評価する;
の(a)〜(c)の工程を備えたことを特徴とする方法や、[2][A群マーカータンパク質]に含まれる
[A’群マーカータンパク質]
STML2_HUMAN、ECH1_HUMAN、OLFM4_HUMAN
から選択されることを特徴とする前記[1]記載の方法や、[3]判定用試料が、組織、体液、又は組織の浸漬液であることを特徴とする前記[1]又は[2]記載の方法や、[4]体液が、血液、膵液、リンパ液、胆汁、尿、唾液、汗、***であることを特徴とする前記[3]記載の方法や、[5]定量工程が、液体クロマトグラフィー質量分析法又は免疫学的測定法により、膵臓癌マーカータンパク質の発現量を定量する工程であることを特徴とする前記[1]〜[4]のいずれか記載の方法からなる。
That is, the present invention is [1] a method for determining the presence or absence of pancreatic cancer in pancreatic tissue and predicting prognosis,
(A) a quantitative step of quantifying the expression level of a pancreatic cancer marker in a determination sample collected from a subject, wherein the pancreatic cancer marker is selected from one or more of the following groups of marker proteins: Or a quantification step that is mRNA encoding the proteins;
[Group A marker protein]
FINC_HUMAN (UniProtKB accession number P02751), FRIL_HUMAN (UniProtKB accession number P02792), K1C10_HUMAN (UniProtKB accession number P13645), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number P26275), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number Number P05164), PLBL1_HUMAN (UniProtKB accession number Q6P4A8), S10A8_HUMAN (UniProtKB accession number P05109), S10A9_HUMAN (UniProtKB accession number P067) 2), STML2_HUMAN (UniProtKB accession number Q9UJZ1), TERA_HUMAN (UniProtKB accession number P55072), TLN1_HUMAN (UniProtKB accession number Q9Y490), TSP1_HUMAN10 (uniProTK) UniProtKB accession number Q13011), OLFM4_HUMAN (UniProtKB accession number Q6UX06), EFTU_HUMAN (UniProtKB accession number P49411), SERPH_HUMAN (UniProtKB accession number) 50454)
[Group B marker protein]
ALDH2_HUMAN (UniProtKB accession number P05091), GTR1_HUMAN (UniProtKB accession number P11166), PLEC1_HUMAN (UniProtKB accession number Q15149), PUR9_HUMAN (UniProtKB accession number P319)
[Group C marker protein]
CH10_HUMAN (UniProtKB accession number P61604), CISY_HUMAN (UniProtKB accession number O75390), ERO1A_HUMAN (UniProtKB accession number Q96HE7), LG3BP_HUMAN (UniProtKB accession number Q08380), SH3L3_HUMAN (UniProtKB accession number Q9H299), SSBP_HUMAN (UniProtKB accession Number Q04837), TAGL_HUMAN (UniProtKB accession number Q01995), VDAC1_HUMAN (UniProtKB accession number P21796)
(B) a comparison step of comparing the expression level of the pancreatic cancer marker in the determination sample with the expression level of the pancreatic cancer marker in a healthy sample as a control;
(C) an evaluation step of evaluating according to any of the following criteria [i] to [iii] on the basis of the expression level comparison results;
[I] When the expression level of one or more proteins selected from the group A marker protein in the determination sample or the mRNA encoding the protein is increased compared to the expression level in the healthy sample, the subject Assessing the presence of pancreatic cancer tissue with poor prognosis in
[Ii] When the expression level of one or more proteins selected from the group B marker protein in the determination sample or the mRNA encoding the protein is increased compared to the expression level in the healthy sample, That pancreatic cancer tissue with good prognosis is present in the pancreatic tissue of
[Iii] When the expression level of one or more proteins selected from the group C marker protein in the determination sample or mRNA encoding the protein is increased compared to the expression level in the healthy sample Assess that pancreatic cancer tissue with poor or good prognosis is present in the pancreatic tissue of the subject;
A method comprising the steps of (a) to (c) of [2] [Group A marker protein] [A ′ group marker protein]
STML2_HUMAN, ECH1_HUMAN, OLFM4_HUMAN
[1] or [2], wherein the method according to [1] above, or [3] the determination sample is tissue, body fluid, or tissue immersion liquid The method according to [3], wherein [4] the body fluid is blood, pancreatic juice, lymph fluid, bile, urine, saliva, sweat, semen, or [5] the determination step is a liquid The method according to any one of [1] to [4], which is a step of quantifying the expression level of a pancreatic cancer marker protein by chromatography mass spectrometry or immunological measurement.

また本発明は、[6]
[A群マーカータンパク質]
FINC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02751)、FRIL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02792)、K1C10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P13645)、K2C1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P04264)、LYSC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61626)、PERM_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05164)、PLBL1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6P4A8)、S10A8_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05109)、S10A9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P06702)、STML2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJZ1)、TERA_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P55072)、TLN1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9Y490)、TSP1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P07996)、ANX10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJ72)、ECH1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q13011)、OLFM4_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6UX06)、EFTU_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P49411)、SERPH_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P50454)
[B群マーカータンパク質]
ALDH2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05091)、GTR1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P11166)、PLEC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q15149)、PUR9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P31939
[C群マーカータンパク質]
CH10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61604)、CISY_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号O75390)、ERO1A_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q96HE7)、LG3BP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q08380)、SH3L3_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9H299)、SSBP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q04837)、TAGL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q01995)、VDAC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P21796)
の各群のマーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNAを膵臓癌マーカーとして使用する方法や、[7][A群マーカータンパク質]に含まれる
[A’群マーカータンパク質]
STML2_HUMAN、ECH1_HUMAN、OLFM4_HUMAN
から選択されることを特徴とする前記[6]記載の方法や、[8]膵臓癌マーカーとして使用するための、
[A群マーカータンパク質]
FINC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02751)、FRIL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02792)、K1C10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P13645)、K2C1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P04264)、LYSC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61626)、PERM_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05164)、PLBL1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6P4A8)、S10A8_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05109)、S10A9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P06702)、STML2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJZ1)、TERA_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P55072)、TLN1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9Y490)、TSP1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P07996)、ANX10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJ72)、ECH1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q13011)、OLFM4_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6UX06)、EFTU_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P49411)、SERPH_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P50454)
[B群マーカータンパク質]
ALDH2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05091)、GTR1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P11166)、PLEC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q15149)、PUR9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P31939)
[C群マーカータンパク質]
CH10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61604)、CISY_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号O75390)、ERO1A_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q96HE7)、LG3BP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q08380)、SH3L3_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9H299)、SSBP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q04837)、TAGL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q01995)、VDAC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P21796)
の各群のマーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNAや、[9][A群マーカータンパク質]に含まれる
[A’群マーカータンパク質]
STML2_HUMAN、ECH1_HUMAN、OLFM4_HUMAN
から選択されることを特徴とする前記[8]記載の1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNAからなる。
The present invention also provides [6].
[Group A marker protein]
FINC_HUMAN (UniProtKB accession number P02751), FRIL_HUMAN (UniProtKB accession number P02792), K1C10_HUMAN (UniProtKB accession number P13645), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number P26275), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number Number P05164), PLBL1_HUMAN (UniProtKB accession number Q6P4A8), S10A8_HUMAN (UniProtKB accession number P05109), S10A9_HUMAN (UniProtKB accession number P067) 2), STML2_HUMAN (UniProtKB accession number Q9UJZ1), TERA_HUMAN (UniProtKB accession number P55072), TLN1_HUMAN (UniProtKB accession number Q9Y490), TSP1_HUMAN10 (uniProTK) UniProtKB accession number Q13011), OLFM4_HUMAN (UniProtKB accession number Q6UX06), EFTU_HUMAN (UniProtKB accession number P49411), SERPH_HUMAN (UniProtKB accession number) 50454)
[Group B marker protein]
ALDH2_HUMAN (UniProtKB accession number P05091), GTR1_HUMAN (UniProtKB accession number P11166), PLEC1_HUMAN (UniProtKB accession number Q15149), PUR9_HUMAN (UniProtKB accession number P319)
[Group C marker protein]
CH10_HUMAN (UniProtKB accession number P61604), CISY_HUMAN (UniProtKB accession number O75390), ERO1A_HUMAN (UniProtKB accession number Q96HE7), LG3BP_HUMAN (UniProtKB accession number Q08380), SH3L3_HUMAN (UniProtKB accession number Q9H299), SSBP_HUMAN (UniProtKB accession Number Q04837), TAGL_HUMAN (UniProtKB accession number Q01995), VDAC1_HUMAN (UniProtKB accession number P21796)
Or a method of using one or more proteins selected from the marker proteins of each group or mRNA encoding these proteins as a marker for pancreatic cancer, or [7] [Group A marker protein] [A ′ group Marker protein]
STML2_HUMAN, ECH1_HUMAN, OLFM4_HUMAN
The method according to [6] above, wherein [8] is used as a marker for pancreatic cancer,
[Group A marker protein]
FINC_HUMAN (UniProtKB accession number P02751), FRIL_HUMAN (UniProtKB accession number P02792), K1C10_HUMAN (UniProtKB accession number P13645), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number P26275), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number Number P05164), PLBL1_HUMAN (UniProtKB accession number Q6P4A8), S10A8_HUMAN (UniProtKB accession number P05109), S10A9_HUMAN (UniProtKB accession number P067) 2), STML2_HUMAN (UniProtKB accession number Q9UJZ1), TERA_HUMAN (UniProtKB accession number P55072), TLN1_HUMAN (UniProtKB accession number Q9Y490), TSP1_HUMAN10 (uniProTK) UniProtKB accession number Q13011), OLFM4_HUMAN (UniProtKB accession number Q6UX06), EFTU_HUMAN (UniProtKB accession number P49411), SERPH_HUMAN (UniProtKB accession number) 50454)
[Group B marker protein]
ALDH2_HUMAN (UniProtKB accession number P05091), GTR1_HUMAN (UniProtKB accession number P11166), PLEC1_HUMAN (UniProtKB accession number Q15149), PUR9_HUMAN (UniProtKB accession number P319)
[Group C marker protein]
CH10_HUMAN (UniProtKB accession number P61604), CISY_HUMAN (UniProtKB accession number O75390), ERO1A_HUMAN (UniProtKB accession number Q96HE7), LG3BP_HUMAN (UniProtKB accession number Q08380), SH3L3_HUMAN (UniProtKB accession number Q9H299), SSBP_HUMAN (UniProtKB accession Number Q04837), TAGL_HUMAN (UniProtKB accession number Q01995), VDAC1_HUMAN (UniProtKB accession number P21796)
[1] or two or more proteins selected from the marker proteins of each group, or mRNA encoding these proteins, [9] [Group A marker protein] [A ′ group marker protein]
STML2_HUMAN, ECH1_HUMAN, OLFM4_HUMAN
1 or two or more proteins of the above-mentioned [8], or mRNA encoding these proteins.

本発明によれば、膵臓癌の早期検出を行うことや、膵臓癌の予後を予測することが可能となり、膵臓癌の治療を行う上で極めて有用な情報を提供することができる。   ADVANTAGE OF THE INVENTION According to this invention, it becomes possible to perform early detection of pancreatic cancer and to predict the prognosis of pancreatic cancer, and to provide extremely useful information for treating pancreatic cancer.

解析に使用する予後不良群及び予後良好群のサンプルの選択の方法を示す図である。It is a figure which shows the selection method of the sample of the poor prognosis group used for an analysis, and the sample of a favorable prognosis. 本発明における、実験の概要(ディスカバリーステージ)を示す図である。It is a figure which shows the outline | summary (discovery stage) of experiment in this invention. 本発明における、実験の概要(バリデーションステージ)を示す図である。It is a figure which shows the outline | summary (validation stage) of experiment in this invention. スペクトラルカウントの結果の1例を示す図である。It is a figure which shows an example of the result of a spectral count. 予後不良群で高発現するタンパク質、及び予後良好群で高発現するタンパク質106種をグループ1、2として選択した方法の概略を示す図である。It is a figure which shows the outline of the method which selected the protein highly expressed in a poor prognosis group, and 106 types of proteins highly expressed in a favorable prognosis group as the groups 1 and 2. FIG. 正常膵管組織と膵臓癌組織で発現量に差のあるタンパク質64種をグループ3として選択した方法の概略を示す図である。It is a figure which shows the outline of the method which selected 64 types of proteins which have a difference in expression level with a normal pancreatic duct tissue and a pancreatic cancer tissue as the group 3. 本発明の膵臓癌マーカー候補を選択した方法の概略を示す図である。グループ1〜3のタンパク質を定量MS解析(MRM法)で解析し、正常膵管組織と比較して発現量が高いタンパク質を本発明の膵臓癌マーカー候補とした。It is a figure which shows the outline of the method which selected the pancreatic cancer marker candidate of this invention. Proteins of groups 1 to 3 were analyzed by quantitative MS analysis (MRM method), and proteins with higher expression levels compared to normal pancreatic duct tissues were used as pancreatic cancer marker candidates of the present invention. 定量MS解析(MRM)法結果を精査することにより得た、A群〜C群の膵臓癌マーカータンパク質を示す図である。グラフは、各組織サンプル群におけるA群〜C群のタンパク質発現量のMRM定量値をアクチンベータ(ACTNB_HUMAN)タンパク質のMRM定量値で割った正規化された値の結果の一例を示す。It is a figure which shows the pancreatic cancer marker protein of the A group-C group obtained by examining the quantitative MS analysis (MRM) method result. The graph shows an example of a result of a normalized value obtained by dividing the MRM quantitative value of the protein expression level in each of the tissue sample groups by the MRM quantitative value of the actin beta (ACTNB_HUMAN) protein. 本発明の膵臓癌マーカーのうちA群、すなわち正常膵管組織と比較して予後不良膵臓癌組織において特異的に発現量が高いタンパク質の発現量を示す図である。グラフは左から正常膵管群、予後良好群、予後不良群におけるタンパク質のMRM定量値をアクチンベータ(ACTNB_HUMAN)タンパク質のMRM定量値で割った正規化された値を示す。カッコ書きは、膵臓癌における発現が報告されているタンパク質を表す。It is a figure which shows the expression level of the protein whose expression level is specifically high in a pancreatic cancer tissue with a poor prognosis compared with a group A, ie, a normal pancreatic duct tissue among the pancreatic cancer markers of this invention. The graph shows normalized values obtained by dividing the MRM quantification value of the protein in the normal pancreatic duct group, the good prognosis group, and the poor prognosis group by the MRM quantification value of the actin beta (ACTNB_HUMAN) protein from the left. Parentheses represent proteins that have been reported for expression in pancreatic cancer. 本発明の膵臓癌マーカーのうちB群、すなわち正常膵管組織と比較して予後良好膵臓癌組織において特異的に発現量が高いタンパク質の発現量を示す図である。グラフは左から正常膵管群、予後良好群、予後不良群におけるタンパク質のMRM定量値をアクチンベータ(ACTNB_HUMAN)タンパク質のMRM定量値で割った正規化された値を示す。カッコ書きは、膵臓癌における発現が報告されているタンパク質を表す。It is a figure which shows the expression level of the protein whose expression level is specifically high in a B group among the pancreatic cancer markers of this invention, ie, a pancreatic cancer tissue with favorable prognosis, compared with a normal pancreatic duct tissue. The graph shows normalized values obtained by dividing the MRM quantification value of the protein in the normal pancreatic duct group, the good prognosis group, and the poor prognosis group by the MRM quantification value of the actin beta (ACTNB_HUMAN) protein from the left. Parentheses represent proteins that have been reported for expression in pancreatic cancer. 本発明の膵臓癌マーカーのうちC群、すなわち正常膵管組織と比較して予後不良及び予後良好膵臓癌組織において特異的に発現量が高いタンパク質の発現量を示す図である。グラフは左から正常膵管群、予後良好群、予後不良群におけるタンパク質のMRM定量値をアクチンベータ(ACTNB_HUMAN)タンパク質のMRM定量値で割った正規化された値を示す。取り消し線は、膵臓癌における発現が報告されているタンパク質を表す。It is a figure which shows the expression level of the protein whose expression level is specifically high in the pancreatic cancer marker of this invention compared with a C group, ie, a normal pancreatic duct tissue, in a prognosis poor and a prognosis pancreatic cancer tissue. The graph shows normalized values obtained by dividing the MRM quantification value of the protein in the normal pancreatic duct group, the good prognosis group, and the poor prognosis group by the MRM quantification value of the actin beta (ACTNB_HUMAN) protein from the left. The strikethrough represents a protein that has been reported for expression in pancreatic cancer. 定量MS解析(MRM)法及び免疫組織化学染色(IHC)法により、正常膵管組織、予後不良膵臓癌組織及び予後良好膵臓癌組織における、OLFM4_HUMANの発現量を解析した結果(下段)及び染色した結果(上段)を示す図である。Results of analyzing the expression level of OLFM4_HUMAN (bottom) and staining results in normal pancreatic duct tissue, poor prognosis pancreatic cancer tissue and pancreatic cancer tissue with good prognosis by quantitative MS analysis (MRM) method and immunohistochemical staining (IHC) method It is a figure which shows (upper stage). 定量MS解析(MRM)法及び免疫組織化学染色(IHC)法により、正常膵管組織、予後不良膵臓癌組織及び予後良好膵臓癌組織における、STML2_HUMANの発現量を解析した結果(下段)及び染色した結果(上段)を示す図である。Results of analysis of STML2_HUMAN expression in normal pancreatic duct tissue, poor prognosis pancreatic cancer tissue and pancreatic cancer tissue with good prognosis (lower row) and results of staining by quantitative MS analysis (MRM) method and immunohistochemical staining (IHC) method It is a figure which shows (upper stage). 定量MS解析(MRM)法及び免疫組織化学染色(IHC)法により、正常膵管組織、予後不良膵臓癌組織及び予後良好膵臓癌組織における、ECH1_HUMANの発現量を解析した結果(下段)及び染色した結果(上段)を示す図である。Results of analysis of the expression level of ECH1_HUMAN in normal pancreatic duct tissue, poor prognosis pancreatic cancer tissue, and pancreatic cancer tissue with good prognosis by the quantitative MS analysis (MRM) method and immunohistochemical staining (IHC) method, and the results of staining It is a figure which shows (upper stage). 定量MS解析(MRM)法及び免疫組織化学染色(IHC)法により、正常膵管組織、予後不良膵臓癌組織及び予後良好膵臓癌組織における、ALDH2_HUMANの発現量を解析した結果(下段)及び染色した結果(上段)を示す図である。Results of analysis of the expression level of ALDH2_HUMAN in normal pancreatic duct tissue, pancreatic cancer tissue with poor prognosis and pancreatic cancer tissue with good prognosis (lower row) and results of staining by quantitative MS analysis (MRM) method and immunohistochemical staining (IHC) method It is a figure which shows (upper stage). 3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN[上段左図]、STML2_HUMAN[上段右図]及びECH1_HUMAN[下段左図])の発現が検出された症例(陽性群1[実施例2参照])と検出されなかった症例(陰性群1[実施例2参照])における、膵臓癌治療後の生存率を、カプラン・マイヤー(Kaplan-Meier)法を用いて解析した結果を示す図である。各グラフにおいて陽性群1の結果を実線で示し、陰性群1の結果を点線で示す。横軸は膵臓癌手術後の経過時間(月)を示し、縦軸は生存率(全生存率)を示す。It was detected as a case (positive group 1 [see Example 2]) in which expression of three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN [upper left diagram], STML2_HUMAN [upper right diagram] and ECH1_HUMAN [lower left diagram]) was detected. It is a figure which shows the result of having analyzed the survival rate after a pancreatic cancer treatment in the case which did not exist (negative group 1 [refer Example 2)) using the Kaplan-Meier method. In each graph, the result of the positive group 1 is indicated by a solid line, and the result of the negative group 1 is indicated by a dotted line. The horizontal axis shows the elapsed time (month) after pancreatic cancer surgery, and the vertical axis shows the survival rate (overall survival rate). 3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)すべての発現が検出された症例(陽性群2[実施例2参照])とかかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質のうち少なくとも1のものの発現が検出されなかった症例(陰性群2[実施例2参照])における、膵臓癌治療後の生存率を、カプラン・マイヤー法を用いて解析した結果を示す図である。各グラフにおいて陽性群2の結果は実線で示し、陰性群2の結果は点線で示す。横軸は膵臓癌手術後の経過時間(月)を示し、縦軸は生存率(全生存率)を示す。Cases in which expression of all three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN, and ECH1_HUMAN) were detected (positive group 2 [see Example 2]) and expression of at least one of these three types of pancreatic cancer marker proteins It is a figure which shows the result of having analyzed the survival rate after a pancreatic cancer treatment in the case (negative group 2 [refer Example 2]) which was not detected using the Kaplan-Meier method. In each graph, the result of the positive group 2 is indicated by a solid line, and the result of the negative group 2 is indicated by a dotted line. The horizontal axis shows the elapsed time (month) after pancreatic cancer surgery, and the vertical axis shows the survival rate (overall survival rate). 3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)のうち2以上のものの発現が検出された症例(陽性群3[実施例2参照])とかかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質のうち2以上のものの発現が検出されなかった症例(陰性群3[実施例2参照])における、膵臓癌治療後の生存率を、カプラン・マイヤー法を用いて解析した結果を示す図である。各グラフにおいて陽性群3の結果は実線で示し、陰性群3の結果は点線で示す。横軸は膵臓癌手術後の経過時間(月)を示し、縦軸は生存率(全生存率)を示す。Cases in which expression of two or more of three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN) were detected (positive group 3 [see Example 2]) and two or more of the three types of pancreatic cancer marker proteins It is a figure which shows the result of having analyzed the survival rate after a pancreatic cancer treatment in the case (Negative group 3 [refer Example 2]) by which expression of the thing was not detected using the Kaplan-Meier method. In each graph, the result of positive group 3 is indicated by a solid line, and the result of negative group 3 is indicated by a dotted line. The horizontal axis shows the elapsed time (month) after pancreatic cancer surgery, and the vertical axis shows the survival rate (overall survival rate). 3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)のうち少なくとも1つのものの発現が検出された症例(陽性群4[実施例2参照])とかかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質すべての発現が検出されなかった症例(陰性群4[実施例2参照])における、膵臓癌治療後の生存率を、カプラン・マイヤー法を用いて解析した結果を示す図である。各グラフにおいて陽性群4の結果は実線で示し、陰性群4の結果は点線で示す。横軸は膵臓癌手術後の経過時間(月)を示し、縦軸は生存率(全生存率)を示す。Cases in which expression of at least one of three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN) was detected (positive group 4 [see Example 2]) and expression of all three types of pancreatic cancer marker proteins It is a figure which shows the result of having analyzed the survival rate after a pancreatic cancer treatment in the case (negative group 4 [refer Example 2]) which was not detected using the Kaplan-Meier method. In each graph, the result of the positive group 4 is indicated by a solid line, and the result of the negative group 4 is indicated by a dotted line. The horizontal axis shows the elapsed time (month) after pancreatic cancer surgery, and the vertical axis shows the survival rate (overall survival rate).

本発明は、前記のA群〜C群のマーカータンパク質からなる群から選択される1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNA(以下、これらを総称して「本件マーカー物質」ということがある)を膵臓癌マーカーとして使用する方法に関し、本発明において「膵臓癌マーカー」とは、膵臓癌の有無を判定し、かつ予後良好及び/又は予後不良の予後予測のためのマーカーである。かかる方法には、後述する膵臓癌の有無を判定し、かつ予後良好及び/又は予後不良を予測する方法の他、膵臓癌の有無の判定及び予後予測のためのデータを収集する方法や、膵臓癌治療薬の有効性を判定する方法や、膵臓癌治療薬をスクリーニングする方法が含まれる。収集されたデータは、予後の予測に基づいて膵臓癌の治療法を選択するために利用することもできる。また本発明は、膵臓癌マーカーとして使用するための本件マーカー物質に関する。   The present invention relates to one or more proteins selected from the group consisting of the above-mentioned group A to group C marker proteins, or mRNAs encoding these proteins (hereinafter collectively referred to as “the present marker substances”). In the present invention, the term “pancreatic cancer marker” is a marker for determining the presence or absence of pancreatic cancer and predicting the prognosis of good prognosis and / or poor prognosis. Such methods include a method for determining the presence or absence of pancreatic cancer, which will be described later, and predicting good prognosis and / or poor prognosis, as well as a method for collecting data for determining the presence or absence of pancreatic cancer and predicting prognosis, A method for determining the effectiveness of a cancer therapeutic agent and a method for screening for a pancreatic cancer therapeutic agent are included. The collected data can also be used to select treatments for pancreatic cancer based on prognostic predictions. The present invention also relates to the present marker substance for use as a pancreatic cancer marker.

本発明の膵臓組織における、膵臓癌の有無を判定し、かつ予後を予測する方法としては、(a)被験者より採取された判定用試料における、膵臓癌マーカーの発現量を定量する定量工程であって、前記膵臓癌マーカーが以下の各群のマーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNAである定量工程;(b)前記判定用試料における前記膵臓癌マーカーの発現量と、対照となる健常試料における前記膵臓癌マーカーの発現量とを比較する比較工程;(c)発現量の比較結果に基づいて、以下の[i]〜[iii]のいずれかの基準により評価をする評価工程;を順次含む方法であれば特に制限されないが、判断基準[i]〜[iii]から選択される2以上の評価を組み合わせて総合評価することが好ましい。膵臓癌マーカーとしては、以下A群〜C群のマーカータンパク質を挙げることができ、この中でも[A群マーカータンパク質]に含まれる以下の[A’群マーカータンパク質]から選択されるものを好適に例示することができる。
[A群マーカータンパク質]
FINC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02751)、FRIL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02792)、K1C10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P13645)、K2C1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P04264)、LYSC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61626)、PERM_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05164)、PLBL1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6P4A8)、S10A8_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05109)、S10A9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P06702)、STML2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJZ1)、TERA_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P55072)、TLN1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9Y490)、TSP1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P07996)、ANX10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJ72)、ECH1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q13011)、OLFM4_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6UX06)、EFTU_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P49411)、SERPH_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P50454)
[B群マーカータンパク質]
ALDH2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05091)、GTR1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P11166)、PLEC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q15149)、PUR9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P31939)
[C群マーカータンパク質]
CH10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61604)、CISY_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号O75390)、ERO1A_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q96HE7)、LG3BP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q08380)、SH3L3_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9H299)、SSBP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q04837)、TAGL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q01995)、VDAC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P21796)
[A’群マーカータンパク質]
STML2_HUMAN、ECH1_HUMAN、OLFM4_HUMAN
The method for determining the presence or absence of pancreatic cancer in the pancreatic tissue of the present invention and predicting the prognosis includes (a) a quantitative step of quantifying the expression level of a pancreatic cancer marker in a determination sample collected from a subject. The pancreatic cancer marker is one or more proteins selected from the following groups of marker proteins, or mRNA encoding the proteins; (b) the pancreatic cancer marker in the determination sample; A comparison step of comparing the expression level with the expression level of the pancreatic cancer marker in a healthy sample as a control; (c) based on the comparison result of the expression level, any of the following criteria [i] to [iii] Although it will not restrict | limit especially if it is the method of including the evaluation process of evaluating one by one in order, Comprehensive evaluation combining two or more evaluations selected from criteria [i]-[iii] Rukoto is preferable. Examples of pancreatic cancer markers include the following group A to group C marker proteins. Among them, those selected from the following [A ′ group marker proteins] included in [A group marker proteins] are preferably exemplified. can do.
[Group A marker protein]
FINC_HUMAN (UniProtKB accession number P02751), FRIL_HUMAN (UniProtKB accession number P02792), K1C10_HUMAN (UniProtKB accession number P13645), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number P26275), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number Number P05164), PLBL1_HUMAN (UniProtKB accession number Q6P4A8), S10A8_HUMAN (UniProtKB accession number P05109), S10A9_HUMAN (UniProtKB accession number P067) 2), STML2_HUMAN (UniProtKB accession number Q9UJZ1), TERA_HUMAN (UniProtKB accession number P55072), TLN1_HUMAN (UniProtKB accession number Q9Y490), TSP1_HUMAN10 (uniProTK) UniProtKB accession number Q13011), OLFM4_HUMAN (UniProtKB accession number Q6UX06), EFTU_HUMAN (UniProtKB accession number P49411), SERPH_HUMAN (UniProtKB accession number) 50454)
[Group B marker protein]
ALDH2_HUMAN (UniProtKB accession number P05091), GTR1_HUMAN (UniProtKB accession number P11166), PLEC1_HUMAN (UniProtKB accession number Q15149), PUR9_HUMAN (UniProtKB accession number P319)
[Group C marker protein]
CH10_HUMAN (UniProtKB accession number P61604), CISY_HUMAN (UniProtKB accession number O75390), ERO1A_HUMAN (UniProtKB accession number Q96HE7), LG3BP_HUMAN (UniProtKB accession number Q08380), SH3L3_HUMAN (UniProtKB accession number Q9H299), SSBP_HUMAN (UniProtKB accession Number Q04837), TAGL_HUMAN (UniProtKB accession number Q01995), VDAC1_HUMAN (UniProtKB accession number P21796)
[A 'group marker protein]
STML2_HUMAN, ECH1_HUMAN, OLFM4_HUMAN

上記[A群マーカータンパク質]に含まれる以下の[A’群マーカータンパク質]から選択される膵臓癌マーカーとしては、[A’群マーカータンパク質]から選択される少なくとも1つのものであればよく、例えば[A’群マーカータンパク質]から2以上のものを選択することもでき、2以上を選択する場合の組合せとしては、STML2_HUMANとECH1_HUMANとの組合せや、STML2_HUMANとOLFM4_HUMANとの組合せや、ECH1_HUMANとOLFM4_HUMANとの組合せや、STML2_HUMANとECH1_HUMANとOLFM4_HUMANとの組合せを具体的に挙げることができる。
なお、上記比較工程(b)における対照となる健常試料における前記膵臓癌マーカーの発現量は、サンプルと同時に測定して得られたものでも、サンプル測定とは別途測定された正常膵管組織における膵臓癌マーカーの発現量でもよい。前記膵臓癌の有無を判定するためのデータを収集する方法や膵臓癌治療の予後を予測するためのデータを収集する方法は、上記定量工程(a)と比較工程(b)を実施した後、発現量の比較結果をデータとして収集する工程が含まれる。
The pancreatic cancer marker selected from the following [A ′ group marker protein] included in the above [Group A marker protein] may be at least one selected from [A ′ group marker protein], for example, Two or more proteins can be selected from [A ′ group marker protein]. When two or more proteins are selected, combinations of STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN, combinations of STML2_HUMAN and OLFM4_HUMAN, ECH1_HUMAN and OLFM4_HUMAN, And a combination of STML2_HUMAN, ECH1_HUMAN, and OLFM4_HUMAN can be specifically mentioned.
Note that the expression level of the pancreatic cancer marker in the healthy sample as a control in the comparison step (b) was obtained by measuring at the same time as the sample, but pancreatic cancer in normal pancreatic duct tissue measured separately from the sample measurement The expression level of the marker may be used. The method of collecting data for determining the presence or absence of pancreatic cancer and the method of collecting data for predicting the prognosis of pancreatic cancer treatment are performed after performing the quantification step (a) and the comparison step (b), A step of collecting expression level comparison results as data is included.

[i]〜[iii]の基準は以下の通りである。
[i]判定用試料におけるA群マーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質又はそれらのタンパク質をコードするmRNAの発現量が、健常試料における発現量と比較して増加している場合、被験者の膵臓組織中に予後不良の膵臓癌組織が存在すると評価する。
[ii]判定用試料におけるB群マーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質又はそれらのタンパク質をコードするmRNAの発現量が、健常試料における発現量と比較して増加している場合、被験者の膵臓組織中に予後良好の膵臓癌組織が存在すると評価する。
[iii]判定用試料におけるC群マーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質又はそれらのタンパク質をコードするmRNAの発現量が、健常試料における発現量と比較して、増加している場合に被験者の膵臓組織中に予後不良又は予後良好の膵臓癌組織が存在すると評価する。
The criteria [i] to [iii] are as follows.
[I] When the expression level of one or more proteins selected from the group A marker protein in the determination sample or the mRNA encoding the protein is increased compared to the expression level in the healthy sample, the subject It is evaluated that pancreatic cancer tissue with poor prognosis is present in the pancreatic tissue.
[Ii] When the expression level of one or more proteins selected from the group B marker protein in the determination sample or the mRNA encoding the protein is increased compared to the expression level in the healthy sample, It is evaluated that pancreatic cancer tissue having a good prognosis is present in the pancreatic tissue.
[Iii] When the expression level of one or more proteins selected from the group C marker protein in the determination sample or mRNA encoding the protein is increased compared to the expression level in the healthy sample It is evaluated that pancreatic cancer tissue with poor prognosis or good prognosis is present in the pancreatic tissue of the subject.

本発明の膵臓組織における、膵臓癌治療薬の有効性を判定する方法や膵臓癌治療薬をスクリーニングする方法としては、(A)膵臓癌に罹患したモデル動物に被検薬剤又は被検物質を投与する投与工程;(B)前記モデル動物より採取された判定用試料における、本件マーカー物質のオーソログ(タンパク質やmRNA)の発現量を定量する定量工程:(C)前記判定用試料における本件マーカー物質のオーソログの発現量と、対照となる被検薬剤又は被検物質を未投与の場合における本件マーカー物質のオーソログの発現量とを比較する比較工程;(D)発現量の比較結果に基づいて、前記[i]〜[iii]のいずれかの評価基準により評価する工程;を順次含む方法であれば特に制限されず、A群〜C群の複数の本件マーカー物質のオーソログについて工程(A)〜(D)を行い、[i]〜[iii]から選択される2以上の評価を組み合わせて総合評価することがより好ましい。また、工程(A)において、膵臓癌罹患前の動物に被検薬剤又は被検物質を投与した後、モデル動物に膵臓癌を誘導することにより、膵臓癌予防薬をスクリーニングすることもできる。本件マーカー物質のオーソログ遺伝子の遺伝情報は、EMBL−EBI(http://www.ebi.ac.uk/)やUniProt(http://www.uniprot.org/)、NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)等のデータベースを検索し、適宜入手することができる。   As a method for determining the effectiveness of a therapeutic drug for pancreatic cancer in the pancreatic tissue of the present invention and a method for screening for a therapeutic drug for pancreatic cancer, (A) a test drug or a test substance is administered to a model animal suffering from pancreatic cancer (B) a quantitative step of quantifying the expression level of the orthologue (protein or mRNA) of the marker substance in the determination sample collected from the model animal: (C) the determination of the marker substance in the determination sample A comparison step of comparing the expression level of the ortholog with the expression level of the ortholog of the marker substance in the case where the test drug or test substance as a control has not been administered; (D) based on the comparison result of the expression level, [I] to [iii] are not particularly limited as long as the method includes the step of sequentially evaluating according to any of the evaluation criteria; Perform step (A) ~ (D) for grayed, [i] and more preferably Overall Evaluation - a combination of two or more evaluation selected from [iii]. In addition, in the step (A), after a test drug or test substance is administered to an animal before pancreatic cancer, a pancreatic cancer preventive drug can be screened by inducing pancreatic cancer in the model animal. The genetic information of the ortholog gene of this marker substance is EMBL-EBI (http://www.ebi.ac.uk/), UniProt (http://www.uniprot.org/), NCBI (http: // www .ncbi.nlm.nih.gov /) and other databases can be searched and obtained as appropriate.

上記膵臓癌に罹患したモデル動物としては、膵臓癌を自然に罹患したモデル動物であってもよいし、癌遺伝子の過剰発現や発癌物質で膵臓癌を誘導したモデル動物であってもよく、発癌物質で膵臓癌を誘導したモデル動物としては、例えば発癌物質BOP(N-Nitrosobis (2-oxopropyl) amine)によって膵臓癌を誘導したハムスター(Pour PM, Wilson RB. Experimental tumors of the pancreas.In: Moosa AR, ed. Tumors of the pancreas. Baltimore:Williams and Wilkins, 1980: 37-159.)や、発癌物質azaserine、4-hydroxyaminoquinoline-1-oxide(4−HAQO)等を投与して腺房細胞癌を発生させたラットや、7,12-dimethylbenz (a) anthracene(DMBA)を直接膵内に埋没し、腺癌を発生させて膵臓癌を誘導したラット(林裕造,高橋道人.7膵癌:B.動物.太田邦夫,山本正,杉村隆,菅野晴夫編.癌の科学.第4巻ヒトの癌と動物モデル.東京:南江堂,1979:258-70.)などの膵臓癌モデル動物を挙げることができる。また、癌遺伝子の過剰発現で膵臓癌を誘導したモデル動物としては、例えばヒト変異型K−ras(K−rasV12)遺伝子をコンディショナルに発現するトランスジェニックマウス(WO2009/037950号公報)を挙げることができる。上記モデル動物としてマウス、ラット、ハムスター、モルモット、サル、ウシ、ブタ、ウマ、ウサギ、ヒツジ、ヤギ、ネコ、イヌ等の非ヒト哺乳動物モデルを例示することができる。   The model animal suffering from pancreatic cancer may be a model animal naturally suffering from pancreatic cancer, or may be a model animal in which pancreatic cancer is induced by an overexpression of an oncogene or a carcinogen. Examples of model animals in which pancreatic cancer is induced by a substance include, for example, hamsters (Pour PM, Wilson RB. Experimental tumors of the pancreas. In: Moosa) in which pancreatic cancer is induced by a carcinogen BOP (N-Nitrosobis (2-oxopropyl) amine). AR, ed. Tumors of the pancreas. Baltimore: Williams and Wilkins, 1980: 37-159.) And carcinogens azaserine, 4-hydroxyaminoquinoline-1-oxide (4-HAQO), etc. Rats that had developed, or rats that had 7,12-dimethylbenz (a) anthracene (DMBA) buried directly in the pancreas to develop adenocarcinoma and induced pancreatic cancer (Yuzo Hayashi, Michitaka Takahashi. 7 Pancreatic cancer: B. Animals Ed., Kunio Ota, Tadashi Yamamoto, Takashi Sugimura, Haruo Kanno, Cancer Science. Volume 4 Human cancer and animal models, including pancreatic cancer model animals such as Tokyo: Nanedo, 1979: 258-70. Examples of model animals in which pancreatic cancer is induced by overexpression of an oncogene include, for example, a transgenic mouse (WO2009 / 037950) that conditionally expresses a human mutant K-ras (K-rasV12) gene. Can do. Examples of the model animal include non-human mammal models such as mice, rats, hamsters, guinea pigs, monkeys, cows, pigs, horses, rabbits, sheep, goats, cats and dogs.

本発明の膵臓癌の有無を判定し、かつ予後を予測する方法により、予後不良の膵臓癌の有無や、予後良好の膵臓癌の有無や、予後不良及び予後良好の膵臓癌の有無を判定することができる。ここで、「予後不良の膵臓癌」とは、治療後2年以内の再発及び死亡を意味し、「予後良好の膵臓癌」とは、治療後5年の生存を意味する。   Using the method for determining the presence or absence of pancreatic cancer and predicting the prognosis of the present invention, the presence or absence of pancreatic cancer with a poor prognosis, the presence or absence of pancreatic cancer with a good prognosis, or the presence or absence of pancreatic cancer with a poor prognosis and good prognosis be able to. Here, “pancreatic cancer with poor prognosis” means recurrence and death within 2 years after treatment, and “pancreatic cancer with good prognosis” means survival for 5 years after treatment.

また、膵臓癌としては、膵臓組織にできる癌であればいかなる癌であってもよく、具体的には、膵管に由来し膵管がんや通常型膵癌とも呼ばれる浸潤性膵管癌(invasive ductal carcinoma)、膵内分泌腫瘍、膵管内乳頭粘液性腫瘍(IPMN)、粘液性嚢胞腫瘍(MCN)、腺房細胞癌、Solid-pseudopapillary carcinoma、未分化癌、漿液性嚢胞腺癌、転移性膵癌等を挙げることができ、膵臓癌の約90%以上が膵管がんであることから、好ましくは膵管がんを挙げることができる。   The pancreatic cancer may be any cancer that can be produced in pancreatic tissue. Specifically, it is derived from the pancreatic duct and is also called pancreatic duct cancer or normal pancreatic cancer (invasive ductal carcinoma). Pancreatic endocrine tumor, intraductal papillary mucinous tumor (IPMN), mucinous cystic tumor (MCN), acinar cell carcinoma, solid-pseudopapillary carcinoma, undifferentiated cancer, serous cystadenocarcinoma, metastatic pancreatic cancer, etc. Since about 90% or more of pancreatic cancers are pancreatic duct cancer, preferably, pancreatic duct cancer can be mentioned.

本発明の膵臓癌の有無を判定する方法(治療薬のスクリーニング方法)等に用いる判定用試料としては、被験者(モデル動物)より採取された膵臓由来の細胞、組織、器官等の非液性試料や、血液、膵液、リンパ液、胆汁、尿のほか、唾液、汗、***等の体液や、非液性試料を浸漬させた保存液等の液性試料を例示することができる。例えば上記膵臓組織は、膵臓の組織、膵管、腺房、内分泌腺であるランゲルハンス島等の組織であってもよい。さらに膵臓組織は、被験者より採取された後に、凍結処理が施された凍結組織であっても、病理組織学的処理が施された病理組織であってもよく、前記病理組織としては、ホルマリン固定組織や、ホルマリン固定パラフィン包埋組織等を例示することができる。また、血液、膵液、リンパ液、胆汁、尿、などの液性試料も適宜防腐剤や防カビ剤などを添加することも、特定の成分のみを分離あるいは除去することもできる。さらに液性試料として例示する組織の浸漬液としては、非液性試料を浸漬させた保存液や可溶化液等の溶液を挙げることができ、被験者から採取された膵臓組織を凍結組織とするための上記凍結処理や、病理組織とするための上記病理組織学的処理を施す過程で、一時的または恒久的な保存を目的として膵臓組織を浸漬させた溶液、例えば、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、ホルマリン溶液、アルコール溶液等を例示することができる。   The determination sample used in the method for determining the presence or absence of pancreatic cancer of the present invention (therapeutic drug screening method) or the like is a non-liquid sample such as cells, tissues or organs derived from the pancreas collected from a subject (model animal). In addition to blood, pancreatic juice, lymph fluid, bile, urine, bodily fluids such as saliva, sweat, and semen, and liquid samples such as a preservation solution in which a non-liquid sample is immersed can be exemplified. For example, the pancreatic tissue may be a tissue such as a pancreatic tissue, pancreatic duct, acini, or endangered islets of Langerhans. Furthermore, the pancreatic tissue may be a frozen tissue that has been collected from a subject and then subjected to a freezing treatment, or may be a pathological tissue that has been subjected to a histopathological treatment. Examples include tissues and formalin-fixed paraffin-embedded tissues. Further, liquid samples such as blood, pancreatic juice, lymph fluid, bile and urine can be appropriately added with preservatives and fungicides, or only specific components can be separated or removed. Furthermore, as the tissue immersion liquid exemplified as a liquid sample, a solution such as a preservation solution or a solubilized solution in which a non-liquid sample is immersed can be mentioned, and pancreatic tissue collected from a subject is used as a frozen tissue. Solution in which pancreatic tissue is immersed for the purpose of temporary or permanent preservation in the process of applying the above-mentioned freezing treatment or the above-mentioned histopathological treatment for producing a pathological tissue, for example, physiological saline, phosphate buffer Examples thereof include physiological saline, formalin solution, and alcohol solution.

また、前記判定用試料における、本件マーカー物質の発現量を定量する定量方法としては、膵臓癌マーカータンパク質の一部又は全部、あるいは、膵臓癌マーカータンパク質をコードするmRNAの一部又は全部を、特異的且つ定量的に検出することができる定量方法であればどのような方法であってもよく、具体的には、膵臓癌マーカータンパク質の定量方法として、液体クロマトグラフィー質量分析法や免疫学的測定法を挙げることができ、免疫学的測定法としては、免疫組織化学染色法、ELISA法、EIA法、RIA法、ウエスタンブロット法等を好適に例示することができ、膵臓癌マーカータンパク質をコードするmRNAの定量方法としては、RT−PCR法や、リアルタイムPCR法や、ノーザンブロット法等を好適に例示することができるが、液体クロマトグラフィー質量分析法又は免疫学的測定法であることが特に好ましい。   Further, as a quantification method for quantifying the expression level of the marker substance in the determination sample, part or all of pancreatic cancer marker protein or part or all of mRNA encoding pancreatic cancer marker protein is specifically As long as it can be detected quantitatively and quantitatively, specifically, as a method for quantifying pancreatic cancer marker protein, liquid chromatography mass spectrometry or immunological measurement Examples of the immunological assay include immunohistochemical staining, ELISA, EIA, RIA, Western blot, and the like, and encodes a pancreatic cancer marker protein. Preferred examples of mRNA quantification methods include RT-PCR, real-time PCR, and Northern blot. Although it is Rukoto, particularly preferably liquid chromatography mass spectrometry or immunoassay.

本発明の膵臓癌の有無を判定し、かつ予後を予測する方法に用いる健常試料としては、健常者や非膵臓癌患者由来の上記非液性試料や液性試料、膵臓癌患者由来の当業者が通常用いる基準に照らして明らかにがん化していないと判断される非液性試料等を例示することができる。また、これら健常試料は、採取された後に、前記判定用試料と同様の処理が施された健常試料であることが好ましい。また、比較工程においては、前記判定用試料及び前記健常試料における同一の本件マーカー物質の発現量を、同一の定量方法により定量し、得られた発現量のデータを比較することが好ましい。健常試料における前記膵臓癌マーカーの発現量は、サンプルと同時に測定して得られたものでも、サンプル測定とは別途測定された健常試料における膵臓癌マーカーの発現量でもよい。   Healthy samples used in the method for determining the presence or absence of pancreatic cancer and predicting prognosis of the present invention include the above-mentioned non-liquid samples and liquid samples derived from healthy individuals and non-pancreatic cancer patients, and those skilled in the art derived from pancreatic cancer patients. Can be exemplified by a non-liquid sample or the like that is clearly determined not to be cancerous in light of the standard that is normally used. In addition, these healthy samples are preferably healthy samples that have been collected and then subjected to the same treatment as the determination sample. Further, in the comparison step, it is preferable to quantify the expression level of the same marker substance in the determination sample and the healthy sample by the same quantification method, and compare the obtained expression level data. The expression level of the pancreatic cancer marker in the healthy sample may be obtained by measuring at the same time as the sample, or may be the expression level of the pancreatic cancer marker in the healthy sample measured separately from the sample measurement.

以下、実施例により本発明をより具体的に説明するが、本発明の技術的範囲はこれらの例示に限定されるものではない。   EXAMPLES Hereinafter, although an Example demonstrates this invention more concretely, the technical scope of this invention is not limited to these illustrations.

[サンプル]
過去10年間(1998年〜2007年)に東北大学病院肝胆膵外科にて膵切除を行い、組織学的に浸潤性膵管癌と診断された156症例から、既知の予後因子(組織学的根治度、術後腫瘍マーカー値、術前化学療法の有無、ステージ、分化度、補助化学療法)が同一であるにも関わらず、予後に差がある症例を抽出し、ほぼ5年生存の予後良好群(4例)及び2年以内に再発死亡の予後不良群(4例)に分類した(図1)。表1に予後不良群及び予後良好群の症例背景を示す。
[sample]
From the 156 cases diagnosed as invasive pancreatic duct cancer after histological diagnosis of hepato-biliary-pancreatic surgery at Tohoku University Hospital in the past 10 years (1998-2007), known prognostic factors (histological degree of cure) , Postoperative tumor marker values, presence / absence of preoperative chemotherapy, stage, differentiation degree, adjuvant chemotherapy), but the cases with different prognosis were extracted, and the prognosis group with survival almost 5 years (4 cases) and poor prognosis group (4 cases) of recurrent death within 2 years (FIG. 1). Table 1 shows the case background of the poor prognosis group and the good prognosis group.

これらのFFPE標本(ホルマリン固定パラフィン包埋組織標本)を用いて、膵臓癌及び予後予測のマーカーとなるタンパク質の検索を行った。実験の概要は、図2及び図3に示す通りである。   Using these FFPE specimens (formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens), pancreatic cancer and protein prognostic markers were searched. The outline of the experiment is as shown in FIGS.

[LC/MS/MS解析用サンプルの調製]
1.FFPE組織切片の作製
前記FFPE組織を、ミクロトームを用いて薄切し、10μmの切片を作製した。この切片を、エネルギートランスファーコーティングスライドグラス(DIRECTOR(商標)レーザーマイクロセクションスライド;Expression Pathology社製)のコーティング側に直接のせて伸展させた。キシレン及びエタノール浸潰により組織切片の脱パラフィン処理を行った後に、ヘマトキシリン染色を行い、タンパク質抽出用プレパラートを作製した。
[Preparation of LC / MS / MS analysis sample]
1. Preparation of FFPE tissue section The FFPE tissue was sliced using a microtome to prepare a 10 μm section. The section was stretched directly on the coating side of an energy transfer coated slide glass (DIRECTOR ™ laser microsection slide; manufactured by Expression Pathology). The tissue section was deparaffinized by soaking with xylene and ethanol, and then stained with hematoxylin to prepare a preparation for protein extraction.

2.レーザーマイクロダイセクション
Leica LMD 6000レーザーマイクロダイセクションシステムを用いて、目的とする細胞特異的なダイセクションを行った。Leica LMD 6000レーザーマイクロダイセクションシステムは、重力落下方式により高精度且つ完全なコンタミフリーの条件下で、UVレーザーによるダイセクションが可能なシステムである。かかるレーザーマイクロダイセクションシステムを用いて、前記FFPE組織から膵臓癌組織のみを採取した。
2. Laser microdissection
The cell-specific dissection of interest was performed using a Leica LMD 6000 laser microdissection system. The Leica LMD 6000 laser microdissection system is a system capable of dissection using a UV laser under a highly accurate and completely contamination-free condition by the gravity drop method. Using this laser microdissection system, only pancreatic cancer tissue was collected from the FFPE tissue.

3.タンパク質の可溶化及び断片化
レーザーマイクロダイセクションにより採取された膵臓癌組織を、Liquid Tissue(登録商標)MS Protein Prep Kit(Expression Pathology社製)を用いて処理し、タンパク質を可溶化した。続いて、トリプシンを用いて可溶化タンパク質を断片化した。これらの処理により、30,000個の細胞(厚さ10μmのFFPE切片においては、約2×4mmの範囲に相当する)から、約2〜4μgのタンパク質が得られた。これは、後述のLC/MS/MS解析を、10回行うことができるタンパク質量に相当する。
3. Protein Solubilization and Fragmentation Pancreatic cancer tissue collected by laser microdissection was treated with Liquid Tissue (registered trademark) MS Protein Prep Kit (manufactured by Expression Pathology) to solubilize the protein. Subsequently, the solubilized protein was fragmented using trypsin. These treatments yielded about 2-4 μg of protein from 30,000 cells (corresponding to a range of about 2 × 4 mm for a 10 μm thick FFPE section). This corresponds to the amount of protein that can be subjected to LC / MS / MS analysis described later 10 times.

[膵臓癌マーカータンパク質の検索]
1.LC/MS/MS解析
上記の方法により調製したサンプルを、0.1%TFA/2%Acetonitrile/蒸留水(pH2〜3)で再溶解し、nano flow ESI−イオントラップ型LC/MS(ZAPLOUS Discovery LC/MSシステム)により分析を行った。分析は同一サンプルを3回測定した。LC/MS/MSの条件の詳細は以下の通りである。
Autosampler: HTC−PAL(CTC Analytics社製)
HPLC: Paradigm MS4(Michrom BioResources社製)
Column: MAGIC C18AQ、3μ、100オングストローム、0.1mmIDx15
0mm(Michrom BioResources社製)
Ion source: ADVANCE Nano Spray Source(Michrom BioResources社製)
MS: FinniganLXQ(Thermo Fisher Scientific社製)
A液: 2%アセトニトリル/0.1%ギ酸
B液: 90%アセトニトリル/0.1%ギ酸
Flow rate: 500nL/min
Gradient: 5〜45%B in 100min
EMS voltage:1.4〜1.6kV
Mass range: 450〜2000
[Search for pancreatic cancer marker protein]
1. LC / MS / MS analysis The sample prepared by the above method was redissolved with 0.1% TFA / 2% Acetonitrile / distilled water (pH 2-3), and nanoflow ESI-ion trap LC / MS (ZAPLOUS Discovery) LC / MS system). In the analysis, the same sample was measured three times. Details of the LC / MS / MS conditions are as follows.
Autosampler: HTC-PAL (CTC Analytics)
HPLC: Paradigm MS4 (Michrom BioResources)
Column: MAGIC C18AQ, 3μ, 100Å, 0.1mmID × 15
0mm (made by Michrom BioResources)
Ion source: ADVANCE Nano Spray Source (made by Michrom BioResources)
MS: FinniganLXQ (Thermo Fisher Scientific)
A liquid: 2% acetonitrile / 0.1% formic acid B liquid: 90% acetonitrile / 0.1% formic acid
Flow rate: 500nL / min
Gradient: 5-45% B in 100min
EMS voltage: 1.4-1.6kV
Mass range: 450-2000

2.タンパク質の同定
タンパク質の同定のためのソフトウエアとしてMASCOT(Matrix Science社製)を、データベースとしてSwissProt 57.13を用い、LC/MS/MS解析データよりタンパク質を同定した。3回のLC/MS/MS解析により得られたデータから、それぞれタンパク質をリストアップし、最終的に統合した。その結果、図5に示すように、予後不良群の膵臓癌組織サンプルからは924種類の、予後良好群の膵臓癌組織サンプルからは845種類の、対照となる正常膵管組織からは730種類のタンパク質を同定することができた(膵臓癌組織:1099種類、全体:1229種類)。
2. Protein Identification Using MASCOT (Matrix Science) as software for protein identification and SwissProt 57.13 as a database, proteins were identified from LC / MS / MS analysis data. From the data obtained by three LC / MS / MS analyses, each protein was listed and finally integrated. As a result, as shown in FIG. 5, 924 kinds of proteins from pancreatic cancer tissue samples in the poor prognosis group, 845 kinds from pancreatic cancer tissue samples in the good prognosis group, and 730 kinds of proteins from normal pancreatic duct tissue as a control Could be identified (pancreatic cancer tissue: 1099 types, overall: 1229 types).

3.LC/MS/MSデータの解析
各群でのタンパク質発現を、SCAFFOLDソフトウエア(Matrix Science社製)を用いて解析し、さらに、タンパク質アイソフォーム、サブセットを識別・グループ化し、遺伝子オントロジー解析を行った。具体的には以下のような解析を行った。スペクトラルカウント法(図4):半定量法として下記の計算式を用いた比較定量及び統計検定(G検定)を実施して、群特異的な発現タンパク質の同定を同時に行った。
(1)相対変化量:Abundance ratio for each protein(Rsc)
Rsc=log[(n+f)/(n+f)]+log[(t−n+f)/(t−n+f)]
、n:あるタンパクを同定するのに使用したペプチドの数
、t:タンパク同定に使用したペプチドの総数
f:correction factor=1.25
(2)相対発現量:Normalized Spectral Abundance Factor for each protein(NSAF)
NSAF=[SpC/L]/SUM[SpC/L
SpC:あるタンパクを同定するのに使用したペプチド数
:同定したタンパクのアミノ酸数
(3)スペクトラル・インデックス:Spectral Index for Group Comparison(SpI)
SpI=[SAkav/(SAkav+SBkav)×N /N ]−[SBkav/(SAkav+SBkav)×N
Akav:(A群であるタンパク質kを同定するのに使用したペプチドの総数)/(A群のサンプル数)
Bkav:(B群であるタンパク質kを同定するのに使用したペプチドの総数)/(B群のサンプル数)
、N :ある群の中で該当タンパクが同定されたサンプル数
、N :ある群の中のサンプル数
3. Analysis of LC / MS / MS data Protein expression in each group was analyzed using SCAFFOLD software (Matrix Science), and protein isoforms and subsets were identified and grouped, and gene ontology analysis was performed. . Specifically, the following analysis was performed. Spectral count method (FIG. 4): As a semi-quantitative method, comparative quantification and statistical test (G test) using the following calculation formula were performed, and group-specific expressed proteins were simultaneously identified.
(1) Relative change amount: Abundance ratio for each protein (Rsc)
Rsc = log 2 [(n 2 + f) / (n 1 + f)] + log 2 [(t 1 −n 1 + f) / (t 2 −n 2 + f)]
n 1 , n 2 : number of peptides used to identify a protein t 1 , t 2 : total number of peptides used for protein identification f: correction factor = 1.25
(2) Relative expression level: Normalized Spectral Abundance Factor for each protein (NSAF)
NSAF k = [SpC k / L k ] / SUM [SpC k / L k ]
SpC k : number of peptides used to identify a protein L k : number of amino acids of the identified protein (3) Spectral Index for Group Comparison (SpI)
SpI = [S Akav / (S Akav + S Bkav) × N D A / N T A] - [S Bkav / (S Akav + S Bkav) × N D B / N T B]
S Akav : (total number of peptides used to identify protein k which is group A) / (number of samples in group A)
S Bkav : (total number of peptides used to identify protein k, group B) / (number of samples in group B)
N D A , N D B : number of samples in which the corresponding protein is identified in a certain group N T A , N T B : number of samples in a certain group

4.膵臓癌マーカータンパク質の検索
前記LC/MS/MS解析によって同定されたタンパク質発現量から、前記の相対発現量(NSAF)、相対変化量(Rsc)、スペクトラル・インデックス(SpI)を算出し、かかる値に基づき、以下の方法で予後不良群で高発現するタンパク質をグループ1、予後良好群で高発現するタンパク質をグループ2、正常膵管細胞と膵臓癌細胞で発現に差があるタンパク質をグループ3を抽出した。グループ1及び2は、予後不良群及び予後良好群から検出された1099種のタンパク質から、統計検定(G検定;Sokal, R. R.; Rohlf, F. J. Biometry, 3rd ed.; W. H. Freeman and Company: New York, 1995参照)のG>3.841を基準として計186種を抽出した。続いて、予後不良群ではRsc>1を基準に、予後良好群ではRsc<−1を基準に計163種のタンパク質を抽出し、その中から、各群において4症例中2症例以上で発現しているタンパク質を計120種を抽出した。さらに、遺伝子オントロジー解析及び文献検索から、構造タンパク質やハウスキーピングタンパク質など膵臓癌に特異的でないと考えられるタンパク質を除外することによって、予後不良群及び予後良好群で有意に高発現している計106種、各群53種のタンパク質をグループ1及び2として同定した(図5)。グループ3は、群膵臓癌組織及び正常膵管群で発現が同定された計1229種のタンパク質から、以下の方法で分類した。すなわち、まず予後良好群及び正常膵管群の1025種のタンパク質から統計検定G>3.841を基準として351種のタンパク質を抽出し、次に正常膵管組織と比べ膵臓癌組織において高発現であることを意味するRsc>1に基づき205種を抽出し、さらにSpI<−0.4に基づき138種を抽出した。また、予後不良群及び正常膵管群の1101種のタンパク質から統計検定G>3.841を基準として399種を抽出し、次に正常膵管組織と比べ膵臓癌組織において高発現であることを意味するRsc>1に基づき239種を抽出し、さらにSpI<−0.4に基づき161種を抽出した。これらの計138種及び161種のタンパク質から、さらに遺伝子オントロジー解析及び文献検索から膵臓癌に特異的でないと考えられるタンパク質を除外し、計64種のタンパク質をグループ3として同定した(図6)。
4). Search for pancreatic cancer marker protein From the protein expression level identified by the LC / MS / MS analysis, the relative expression level (NSAF), the relative change amount (Rsc), and the spectral index (SpI) are calculated, and the value is calculated. Based on the above, we extracted group 1 proteins that are highly expressed in the poor prognosis group, group 2 proteins that are highly expressed in the good prognosis group, and group 3 that is differentially expressed in normal pancreatic duct cells and pancreatic cancer cells. did. Groups 1 and 2 were classified into statistical tests (G test; Sokal, RR; Rohlf, FJ Biometry, 3rd ed .; WH Freeman and Company: New York, from 1099 proteins detected from the poor prognosis group and the good prognosis group. A total of 186 species were extracted based on G> 3.841 (see 1995). Subsequently, a total of 163 proteins were extracted based on Rsc> 1 in the poor prognosis group and Rsc <−1 in the good prognosis group, and expressed in 2 or more out of 4 cases in each group. A total of 120 proteins were extracted. Furthermore, by excluding proteins considered not specific to pancreatic cancer, such as structural proteins and housekeeping proteins, from gene ontology analysis and literature search, a total of 106 highly expressed in a poor prognosis group and a good prognosis group. Species, 53 proteins in each group were identified as groups 1 and 2 (FIG. 5). Group 3 was classified by the following method from a total of 1229 proteins whose expression was identified in the group pancreatic cancer tissue and the normal pancreatic duct group. That is, first, 351 proteins were extracted from 1025 proteins in the good prognosis group and normal pancreatic duct group based on the statistical test G> 3.841, and then highly expressed in pancreatic cancer tissue compared to normal pancreatic duct tissue 205 were extracted based on Rsc> 1, meaning 138 were extracted based on SpI <−0.4. It also means that 399 species are extracted from 1101 proteins of poor prognosis group and normal pancreatic duct group based on statistical test G> 3.841, and then higher expression in pancreatic cancer tissue than normal pancreatic duct tissue 239 species were extracted based on Rsc> 1, and 161 species were extracted based on SpI <−0.4. From these 138 and 161 proteins, proteins that were not considered specific for pancreatic cancer were excluded from gene ontology analysis and literature search, and a total of 64 proteins were identified as Group 3 (FIG. 6).

前記までのDiscovery stageで同定された計170種類のタンパク質すべてについて、
β-actinを内部標準として用いて三連四重極型MSを用いた定量MS解析(MRM:Multiple Reaction Monitoring)による定量フォーカスプロテオミクスを実施した(Validation stage)。MRM法においては、ACTBのSRMtransition(488.7/630.3)のピークエリアを適用し、以下の計算式により標準化した。
Normalized peak area = Each of peak area x (500,000 / peak area of 488.7/630.3)
まずMRMによる測定に適したペプチドデザインが可能なタンパク質をグループ1から34種、グループ2から39種、グループ3から50種の、計123種のタンパク質を抽出し、MRMテスト測定を行った。これら計123種類タンパク質は以下の通りである。[グループ1]K1C10_HUMAN、PERM_HUMAN、TRFL_HUMAN、K22E_HUMAN、S10A8_HUMAN、P5CS_HUMAN、TLN1_HUMAN、CAZA1_HUMAN、IF4A3_HUMAN、NNTM_HUMAN、RAB3D_HUMAN、SAP_HUMAN、TSP1_HUMAN、STML2_HUMAN、CO6A3_HUMAN、AP1G1_HUMAN、PSB2_HUMAN、TCPA_HUMAN、THIL_HUMAN、FINC_HUMAN、FRIL_HUMAN、NDKA_HUMAN、S10A9_HUMAN、PSA_HUMAN、PLBL1_HUMAN、K2C1_HUMAN、TERA_HUMAN、LYSC_HUMAN、TCPG_HUMAN、POSTN_HUMAN、COPG_HUMAN、KCRU_HUMAN、QCR1_HUMAN、PP1A_HUMAN
[グループ2]
PLEC1_HUMAN、RAB2A_HUMAN、CALM_HUMAN、ECHB_HUMAN、ECHA_HUMAN、ILEU_HUMAN、NIBL1_HUMAN、LUM_HUMAN、EFHD2_HUMAN、PHB_HUMAN、GSTK1_HUMAN、CAN1_HUMAN、DPYL2_HUMAN、ALDH2_HUMAN、MYOF_HUMAN、RAB14_HUMAN、PGM1_HUMAN、QOR_HUMAN、AHNK_HUMAN、PRELP_HUMAN、RHG01_HUMAN、LC7L2_HUMAN、PUR9_HUMAN、CTNA1_HUMAN、IMMT_HUMAN、VPS35_HUMAN、PML_HUMAN、TALDO_HUMAN、CNDP2_HUMAN、DDX5_HUMAN、NNMT_HUMAN、MDHC_HUMAN、VASP_HUMAN、RCL_HUMAN、FLOT1_HUMAN、GTR1_HUMAN、LMO7_HUMAN、PLIN3_HUMAN、ANXA6_HUMAN
[グループ3]
EFTU_HUMAN、OLFM4_HUMAN、FLNA_HUMAN、RAB5C_HUMAN、SERPH_HUMAN、ETFA_HUMAN、ANX10_HUMAN、CISY_HUMAN、CY1_HUMAN、ROAA_HUMAN、ERO1A_HUMAN、AMPL_HUMAN、S10A6_HUMAN、CAP1_HUMAN、SODM_HUMAN、IDHP_HUMAN、LG3BP_HUMAN、CEAM6_HUMAN、G3BP1_HUMAN、TCPH_HUMAN、COTL1_HUMAN、MDHM_HUMAN、LEG3_HUMAN、SSBP_HUMAN、SQRD_HUMAN、S100P_HUMAN、VINC_HUMAN、ASC_HUMAN、ITB4_HUMAN、TAGL_HUMAN、CYTB_HUMAN、CYC_HUMAN、URP2_HUMAN、UBP5_HUMAN、QCR2_HUMAN、ARPC5_HUMAN、TPD54_HUMAN、PRDX1_HUMAN、CH10_HUMAN、ECH1_HUMAN、CYB5B_HUMAN、A1AG1_HUMAN、ATPD_HUMAN、SH3L3_HUMAN、CKAP4_HUMAN、MOES_HUMAN、EF1B_HUMAN、FCL_HUMAN、SC23B_HUMAN、VDAC1_HUMAN
For all 170 proteins identified in the previous Discovery stage,
Quantitative focus proteomics by quantitative MS analysis (MRM: Multiple Reaction Monitoring) using triple quadrupole MS was performed (validation stage) using β-actin as an internal standard. In the MRM method, the peak area of ACTB SRMtransition (488.7 / 630.3) was applied and standardized by the following calculation formula.
Normalized peak area = Each of peak area x (500,000 / peak area of 488.7 / 630.3)
First, a total of 123 proteins were extracted from groups 1 to 34, group 2 to 39, and group 3 to 50, which were capable of peptide design suitable for MRM measurement, and MRM test measurement was performed. These 123 types of proteins are as follows. [Group 1] K1C10_HUMAN, PERM_HUMAN, TRFL_HUMAN, K22E_HUMAN, S10A8_HUMAN, P5CS_HUMAN, TLN1_HUMAN, CAZA1_HUMAN, IF4A3_HUMAN, NNTM_HUMAN, RAB3D_HUMAN, SAP_HUMAN, TSP1_HUMAN, STML2_HUMAN, CO6A3_HUMAN, AP1G1_HUMAN, PSB2_HUMAN, TCPA_HUMAN, THIL_HUMAN, FINC_HUMAN, FRIL_HUMAN, NDKA_HUMAN, S10A9_HUMAN, PSA_HUMAN, PLBL1_HUMAN, K2C1_HUMAN, TERA_HUMAN, LYSC_HUMAN, TCPG_HUMAN POSTN_HUMAN, COPG_HUMAN, KCRU_HUMAN, QCR1_HUMAN, PP1A_HUMAN
[Group 2]
PLEC1_HUMAN, RAB2A_HUMAN, CALM_HUMAN, ECHB_HUMAN, ECHA_HUMAN, ILEU_HUMAN, NIBL1_HUMAN, LUM_HUMAN, EFHD2_HUMAN, PHB_HUMAN, GSTK1_HUMAN, CAN1_HUMAN, DPYL2_HUMAN, ALDH2_HUMAN, MYOF_HUMAN, RAB14_HUMAN, PGM1_HUMAN, QOR_HUMAN, AHNK_HUMAN, PRELP_HUMAN, RHG01_HUMAN, LC7L2_HUMAN, PUR9_HUMAN, CTNA1_HUMAN, IMMT_HUMAN, VPS35_HUMAN, PML_HUMAN, TALDO_HUMAN, CNDP2_HUMAN, DDX _HUMAN, NNMT_HUMAN, MDHC_HUMAN, VASP_HUMAN, RCL_HUMAN, FLOT1_HUMAN, GTR1_HUMAN, LMO7_HUMAN, PLIN3_HUMAN, ANXA6_HUMAN
[Group 3]
EFTU_HUMAN, OLFM4_HUMAN, FLNA_HUMAN, RAB5C_HUMAN, SERPH_HUMAN, ETFA_HUMAN, ANX10_HUMAN, CISY_HUMAN, CY1_HUMAN, ROAA_HUMAN, ERO1A_HUMAN, AMPL_HUMAN, S10A6_HUMAN, CAP1_HUMAN, SODM_HUMAN, IDHP_HUMAN, LG3BP_HUMAN, CEAM6_HUMAN, G3BP1_HUMAN, TCPH_HUMAN, COTL1_HUMAN, MDHM_HUMAN, LEG3_HUMAN, SSBP_HUMAN, SQRD_HUMAN, S100P_HUMAN, VINC_HUMAN, ASC_HUMAN, ITB4_HUMAN, TAGL_ UMAN, CYTB_HUMAN, CYC_HUMAN, URP2_HUMAN, UBP5_HUMAN, QCR2_HUMAN, ARPC5_HUMAN, TPD54_HUMAN, PRDX1_HUMAN, CH10_HUMAN, ECH1_HUMAN, CYB5B_HUMAN, A1AG1_HUMAN, ATPD_HUMAN, SH3L3_HUMAN, CKAP4_HUMAN, MOES_HUMAN, EF1B_HUMAN, FCL_HUMAN, SC23B_HUMAN, VDAC1_HUMAN

前記MRMテスト測定結果に基づき、グループ1から32種、グループ2から37種、グループ3から42種の、計111の種タンパク質についてMRM本測定を行った。MRM測定結果を解析し、前記のマーカー候補タンパク質の中から、膵臓癌組織における発現量が正常膵管組織と比較して2倍以上ある、グループ1の13種、グループ2の4種、グループ3の18種の計35種類のタンパク質を、膵臓癌マーカー候補として同定した(図7)。これら計35種類タンパク質は以下の通りである。
[グループ1]
FINC_HUMAN、FRIL_HUMAN、K1C10_HUMAN、K2C1_HUMAN、LYSC_HUMAN、PERM_HUMAN、PLBL1_HUMAN、S10A8_HUMAN、S10A9_HUMAN、STML2_HUMAN、TERA_HUMAN、TLN1_HUMAN、TSP1_HUMAN
[グループ2]
ALDH2_HUMAN、GTR1_HUMAN、PLEC1_HUMAN、PUR9_HUMAN
[グループ3]
ANX10_HUMAN、ASC_HUMAN、CAP1_HUMAN、CEAM6_HUMAN、CH10_HUMAN、CISY_HUMAN、ECH1_HUMAN、ERO1A_HUMAN、LG3BP_HUMAN、OLFM4_HUMAN、S100P_HUMAN、S10A6_HUMAN、SERPH_HUMAN、SH3L3_HUMAN、SSBP_HUMAN、TAGL_HUMAN、VDAC1_HUMAN、EFTU_HUMAN
Based on the results of the MRM test measurement, MRM main measurement was performed on a total of 111 seed proteins of Group 1 to 32, Group 2 to 37, and Group 3 to 42. The MRM measurement results were analyzed, and among the above marker candidate proteins, the expression level in pancreatic cancer tissue was more than twice that in normal pancreatic duct tissue, 13 types in Group 1, 4 types in Group 2, and Group 3 A total of 35 proteins of 18 types were identified as pancreatic cancer marker candidates (FIG. 7). These 35 types of proteins are as follows.
[Group 1]
FINC_HUMAN, FRIL_HUMAN, K1C10_HUMAN, K2C1_HUMAN, LYSC_HUMAN, PERM_HUMAN, PLBL1_HUMAN, S10A8_HUMAN, S10A9_HUMAN, SPML2_HUMAN, SPML
[Group 2]
ALDH2_HUMAN, GTR1_HUMAN, PLEC1_HUMAN, PUR9_HUMAN
[Group 3]
ANX10_HUMAN, ASC_HUMAN, CAP1_HUMAN, CEAM6_HUMAN, CH10_HUMAN, CISY_HUMAN, ECH1_HUMAN, ERO1A_HUMAN, LG3BP_HUMAN, OLFM4_HUMAN, S100P_HUMAN, S10A6_HUMAN, SERPH_HUMAN, SH3L3_HUMAN, SSBP_HUMAN, TAGL_HUMAN, VDAC1_HUMAN, EFTU_HUMAN

以上のMRM解析結果を再度精査し、膵臓癌マーカータンパク質を以下のA群〜C群に分類した(図8)。図9〜図11にA群〜C群のタンパク質のMRM法により解析した結果を示す。
A群:予後不良の膵臓癌において特異的に発現量が高いタンパク質であり、膵臓癌かつ予後不良マーカーである(図9)。
FINC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02751)、FRIL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02792)、K1C10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P13645)、K2C1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P04264)、LYSC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61626)、PERM_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05164)、PLBL1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6P4A8)、S10A8_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05109)、S10A9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P06702)、STML2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJZ1)、TERA_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P55072)、TLN1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9Y490)、TSP1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P07996)、ANX10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJ72)、ECH1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q13011)、OLFM4_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6UX06)、EFTU_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P49411)、SERPH_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P50454)
B群:予後良好の膵臓癌において特異的に高発現するタンパク質であり、膵臓癌かつ予後良好マーカーである(図10)。
ALDH2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05091)、GTR1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P11166)、PLEC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q15149)、PUR9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P31939)
C群:予後不良及び予後良好の膵臓癌において特異的に高発現するタンパク質であり、膵臓癌かつ予後不良及び予後良好のマーカーである(図11)。
ASC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9ULZ3)、CAP1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q01518)、CEAM6_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P40199)、CH10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61604)、CISY_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号O75390)、ERO1A_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q96HE7)、LG3BP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q08380)、S100P_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P25815)、S10A6_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P06703)、SH3L3_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9H299)、SSBP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q04837)、TAGL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q01995)、VDAC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P21796)
The above MRM analysis results were examined again, and pancreatic cancer marker proteins were classified into the following groups A to C (FIG. 8). 9 to 11 show the results of analyzing the proteins of Group A to Group C by the MRM method.
Group A: A protein that is specifically expressed in high-prognosis pancreatic cancer, and is a marker for pancreatic cancer and poor prognosis (FIG. 9).
FINC_HUMAN (UniProtKB accession number P02751), FRIL_HUMAN (UniProtKB accession number P02792), K1C10_HUMAN (UniProtKB accession number P13645), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number P26275), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number Number P05164), PLBL1_HUMAN (UniProtKB accession number Q6P4A8), S10A8_HUMAN (UniProtKB accession number P05109), S10A9_HUMAN (UniProtKB accession number P067) 2), STML2_HUMAN (UniProtKB accession number Q9UJZ1), TERA_HUMAN (UniProtKB accession number P55072), TLN1_HUMAN (UniProtKB accession number Q9Y490), TSP1_HUMAN10 (uniProTK) UniProtKB accession number Q13011), OLFM4_HUMAN (UniProtKB accession number Q6UX06), EFTU_HUMAN (UniProtKB accession number P49411), SERPH_HUMAN (UniProtKB accession number) 50454)
Group B: a protein that is specifically highly expressed in pancreatic cancer with good prognosis, and is a pancreatic cancer and good prognosis marker (FIG. 10).
ALDH2_HUMAN (UniProtKB accession number P05091), GTR1_HUMAN (UniProtKB accession number P11166), PLEC1_HUMAN (UniProtKB accession number Q15149), PUR9_HUMAN (UniProtKB accession number P319)
Group C: a protein that is specifically highly expressed in pancreatic cancer with poor prognosis and good prognosis, and is a marker of pancreatic cancer and poor prognosis and good prognosis (FIG. 11).
ASC_HUMAN (UniProtKB accession number Q9ULZ3), CAP1_HUMAN (UniProtKB accession number Q01518), CEAM6_HUMAN (UniProtKB accession number P40199), CH10_HUMAN (UniProTKB accession number P6199, CH10_HUMAN (UniProtKB accession number P6199) Number Q96HE7), LG3BP_HUMAN (UniProtKB accession number Q08380), S100P_HUMAN (UniProtKB accession number P25815), S10A6_HUMAN (UniProtKB accession number P067) 3), SH3L3_HUMAN (UniProtKB accession number Q9H299), SSBP_HUMAN (UniProtKB accession number Q04837), TAGL_HUMAN (UniProtKB accession number Q01995), VDAC1_HUMAN (UniProtKB accession number P21796)

文献検索の結果、上記のA群〜C群のタンパク質のうち、A群のFINC_HUMAN、FRIL_HUMAN、K1C10_HUMAN、K2C1_HUMAN、及びPERM_HUMANや、B群のPLEC1_HUMANや、C群のASC_HUMAN、CAP1_HUMAN、CEAM6_HUMAN、S100P_HUMAN、及びS10A6_HUMANは膵臓癌において高い発現が確認された報告が存在することが確認された。前記A群のタンパク質を「A群マーカータンパク質」、前記B群のタンパク質を「B群マーカータンパク質」、前記C群タンパク質群から膵臓癌において高い発現が確認されているタンパク質を除いたタンパク質群のタンパク質を「C群マーカータンパク質」とした。   As a result of literature search, among the above-mentioned proteins of Group A to Group C, FINC_HUMAN, FRIL_HUMAN, K1C10_HUMAN, K2C1_HUMAN, and PERM_HUMAN of Group A, PLEC1_HUMAN of Group B, ASC_HUMAN_HUMAN, CAP1_UMAN It has been confirmed that there is a report confirming that S10A6_HUMAN is highly expressed in pancreatic cancer. Proteins of the protein group obtained by excluding proteins that have been confirmed to be highly expressed in pancreatic cancer from the group C protein group, wherein the group A protein is “group A marker protein”, the group B protein is “group B marker protein” Was designated as “Group C marker protein”.

5.免疫組織化学染色
上記において同定された、35種類の膵臓癌マーカータンパク質のうち、A群のタンパク質OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN、並びにB群のタンパク質ALDH2_HUMANについて、免疫組織化学染色(IHC)を行った。正常膵管組織、予後良好膵臓癌組織、及び予後不良膵臓癌組織のFFPE組織を抗OLFM4抗体、抗STML2抗体、抗ECH1抗体、及び抗ALDH2抗体を1次抗体として用いて染色し、ENVISIONキット/HRP(DAB)(DAKO社製)を用いて発色させ、観察した。免疫組織化学染色(IHC)の結果及びMRM解析による発現量を図12〜図15に示す。A群のタンパク質OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMANは、定量MS解析(MRM)法による解析結果と同様に、正常膵管組織及び予後良好膵臓癌組織と比較して、予後不良膵臓癌組織において有意に発現が高いことが示された(図12〜14)。またB群のタンパク質ALDH2_HUMANも、定量MS解析(MRM)法による解析結果と同様に、正常膵管組織及び予後不良膵臓癌組織と比較して、予後良好膵臓癌組織において有意に発現が高いことが示された(図15)。
5. Immunohistochemical staining Among the 35 types of pancreatic cancer marker proteins identified above, immunohistochemical staining (IHC) was performed on the group A proteins OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN, and the group B protein ALDH2_HUMAN. FFPE tissues of normal pancreatic duct tissue, pancreatic cancer tissue with good prognosis, and pancreatic cancer tissue with poor prognosis are stained using anti-OLFM4 antibody, anti-STML2 antibody, anti-ECH1 antibody, and anti-ALDH2 antibody as primary antibodies, and ENVISION kit / HRP Color was observed using (DAB) (manufactured by DAKO) and observed. The result of immunohistochemical staining (IHC) and the expression level by MRM analysis are shown in FIGS. Similar to the results of quantitative MS analysis (MRM) analysis, the Group A proteins OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN, and ECH1_HUMAN are significantly expressed in pancreatic cancer tissues with poor prognosis as compared with normal pancreatic duct tissues and pancreatic cancer tissues with good prognosis (FIGS. 12-14). Moreover, the protein ALDH2_HUMAN of group B is also significantly expressed in pancreatic cancer tissues with good prognosis as compared with normal pancreatic duct tissues and pancreatic cancer tissues with poor prognosis, similar to the results of quantitative MS analysis (MRM). (FIG. 15).

[本発明の膵臓癌マーカータンパク質を用いた膵臓癌治療後の生存率の解析]
本発明の膵臓癌マーカータンパク質の発現量と膵臓癌治療後の生存率との関連性について調べた。解析に用いる症例として、図1に示した「術前化学療法の有無:施行せず」96例を選択し、かかる症例の膵臓癌サンプルを上記実施例1に記載の方法で調製し、調製した膵臓癌サンプルにおける3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)の発現量を、上記実施例1に記載の免疫組織化学染色法により検出した。かかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質の発現が検出された癌細胞の割合が、10%以上の症例を陽性群(Positive group)1に分類し、また10%未満の症例を陰性群(Negative group)1に分類し、陽性群1及び陰性群1それぞれにおける膵臓癌手術後の経過時間と生存率(全生存率)との関係を、カプラン・マイヤー法を用いて解析した(図16)。その結果、上記3種類の膵臓癌マーカータンパク質のいずれを用いた場合において、陰性群1よりも陽性群1の方が膵臓癌手術後の生存率が悪く、またその違いには統計学的有意差があることが示された(OLFM4_HUMAN;P=0.0455、STML2_HUMAN;P=0.0410、ECH1_HUMAN;P=0.0232)。この結果から、膵臓組織に含まれる癌細胞中の3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)の発現レベルを検出し、かかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質の発現が検出される癌細胞の割合が多かった場合、膵臓癌治療後の生存率が悪いと予測できることが明らかとなった。
[Analysis of survival rate after treatment of pancreatic cancer using the pancreatic cancer marker protein of the present invention]
The relationship between the expression level of the pancreatic cancer marker protein of the present invention and the survival rate after pancreatic cancer treatment was examined. As cases used for the analysis, 96 cases of “presence / absence of preoperative chemotherapy: not performed” shown in FIG. 1 were selected, and pancreatic cancer samples of such cases were prepared and prepared by the method described in Example 1 above. Expression levels of three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN) in pancreatic cancer samples were detected by the immunohistochemical staining method described in Example 1 above. The proportion of cancer cells in which the expression of these three types of pancreatic cancer marker proteins is detected is classified as positive group 1, and the case of less than 10% is expressed as negative group (Negative group). The relationship between the elapsed time after pancreatic cancer surgery and the survival rate (total survival rate) in each of the positive group 1 and the negative group 1 was analyzed using the Kaplan-Meier method (FIG. 16). As a result, when using any of the above three types of pancreatic cancer marker proteins, the positive group 1 had a worse survival rate after pancreatic cancer surgery than the negative group 1, and the difference was statistically significant. (OLFM4_HUMAN; P = 0.0455, STML2_HUMAN; P = 0.0410, ECH1_HUMAN; P = 0.0232). From this result, the expression level of three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN) in cancer cells contained in the pancreatic tissue is detected, and cancer cells in which the expression of these three types of pancreatic cancer marker proteins are detected. It was clarified that the survival rate after pancreatic cancer treatment can be predicted to be poor when the percentage of the above is high.

次に3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)すべての発現が検出された症例、すなわちかかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質すべてにおいて、陽性群1に分類された症例(n=32)を陽性群2に分類し、それ以外の症例(上記3種類の膵臓癌マーカータンパク質のうち少なくとも1つのものにおいて陰性群1に分類された症例)(n=64)を陰性群2に分類し、陽性群2及び陰性群2それぞれにおける膵臓癌手術後の経過時間と生存率(全生存率)との関係を、カプラン・マイヤー法を用いて解析した(図17)。その結果、陰性群2よりも陽性群2の方が膵臓癌手術後の生存率が悪く、またその違いには統計学的有意差があることが示された(P=0.044)(図17)。この結果から、膵臓組織に含まれる癌細胞中の3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)の発現レベルを検出し、かかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質全ての発現が検出される癌細胞の割合が多かった場合、膵臓癌治療後の生存率が悪いと予測できることが明らかとなった。   Next, cases in which expression of all three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN, and ECH1_HUMAN) were detected, that is, cases classified into positive group 1 in all three types of pancreatic cancer marker proteins (n = 32) Is classified into the positive group 2, and the other cases (cases classified into the negative group 1 in at least one of the three types of pancreatic cancer marker proteins) (n = 64) are classified into the negative group 2. The relationship between the elapsed time after pancreatic cancer surgery and the survival rate (total survival rate) in each of the positive group 2 and the negative group 2 was analyzed using the Kaplan-Meier method (FIG. 17). As a result, it was shown that the positive group 2 had a worse survival rate after pancreatic cancer surgery than the negative group 2, and that the difference had a statistically significant difference (P = 0.044) (FIG. 17). From this result, the expression level of three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN) in cancer cells contained in pancreatic tissue is detected, and the expression of all three types of pancreatic cancer marker proteins is detected. When the percentage of cells was high, it became clear that the survival rate after pancreatic cancer treatment could be predicted to be poor.

また、3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)のうち2以上のものの発現が検出された症例、すなわちかかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質のうち2以上のものにおいて、陽性群1に分類された症例(n=61)を陽性群3に分類し、それ以外の症例(上記3種類の膵臓癌マーカータンパク質のうち2以上のものにおいて陰性群1に分類された症例)(n=35)を陰性群3に分類し、陽性群3及び陰性群3それぞれにおける膵臓癌手術後の経過時間と生存率(全生存率)との関係を、カプラン・マイヤー法を用いて解析した(図18)。その結果、陰性群3よりも陽性群3の方が膵臓癌手術後の生存率が悪く、またその違いには統計学的有意差があることが示された(P=0.0162)。この結果から、膵臓組織に含まれる癌細胞中の3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)の発現レベルを検出し、かかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質のうち任意の2つ以上のものの発現が検出される癌細胞の割合が多かった場合、膵臓癌治療後の生存率が悪いと予測できることが明らかとなった。   In cases where the expression of two or more of the three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN) is detected, that is, in two or more of these three types of pancreatic cancer marker proteins, Classified cases (n = 61) are classified into positive group 3, and other cases (cases classified into negative group 1 in two or more of the above three types of pancreatic cancer marker proteins) (n = 35) ) In the negative group 3, and the relationship between the elapsed time after pancreatic cancer surgery and the survival rate (total survival rate) in each of the positive group 3 and the negative group 3 was analyzed using the Kaplan-Meier method (FIG. 18). ). As a result, it was shown that the survival rate after pancreatic cancer surgery was worse in the positive group 3 than in the negative group 3, and there was a statistically significant difference (P = 0.0162). From these results, the expression levels of three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN) in cancer cells contained in pancreatic tissue were detected, and any two or more of these three types of pancreatic cancer marker proteins were detected. When the percentage of cancer cells in which expression was detected was large, it was revealed that the survival rate after treatment for pancreatic cancer could be predicted to be poor.

さらに、3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)のうち少なくとも1つの発現が検出された症例、すなわちかかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質の少なくとも1つにおいて、陽性群1に分類された症例(n=84)を陽性群4に分類し、それ以外の症例(上記3種類の膵臓癌マーカータンパク質すべてにおいて陰性群1に分類された症例)(n=12)を陰性群4に分類し、陽性群4及び陰性群4それぞれにおける膵臓癌手術後の経過時間と生存率(全生存率)との関係を、カプラン・マイヤー法を用いて解析した(図19)。その結果、陰性群4よりも陽性群4の方が膵臓癌手術後の生存率が悪く、またその違いには統計学的有意差があることが示された(P=0.0124)。この結果から、膵臓組織に含まれる癌細胞中の3種類の膵臓癌マーカータンパク質(OLFM4_HUMAN、STML2_HUMAN及びECH1_HUMAN)の発現レベルを検出し、かかる3種類の膵臓癌マーカータンパク質のうち少なくとも1つのものの発現が検出される癌細胞の割合が多かった場合、膵臓癌治療後の生存率が悪いと予測できることが明らかとなった。   Furthermore, in cases where expression of at least one of the three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN, and ECH1_HUMAN) was detected, that is, at least one of the three types of pancreatic cancer marker proteins, the cells were classified as positive group 1. Cases (n = 84) are classified as positive group 4, and other cases (cases classified as negative group 1 in all three types of pancreatic cancer marker proteins) (n = 12) are classified as negative group 4. The relationship between the elapsed time after pancreatic cancer surgery and the survival rate (overall survival rate) in each of the positive group 4 and the negative group 4 was analyzed using the Kaplan-Meier method (FIG. 19). As a result, it was shown that the survival rate after surgery for pancreatic cancer was worse in the positive group 4 than in the negative group 4, and the difference was statistically significant (P = 0.124). From this result, the expression level of three types of pancreatic cancer marker proteins (OLFM4_HUMAN, STML2_HUMAN and ECH1_HUMAN) in cancer cells contained in the pancreatic tissue was detected, and the expression of at least one of the three types of pancreatic cancer marker proteins was detected. When the ratio of cancer cells detected was large, it became clear that the survival rate after pancreatic cancer treatment could be predicted to be poor.

本発明は、膵臓癌及び膵臓癌予後の予測、検査の分野において好適に利用することができる。   The present invention can be suitably used in the fields of pancreatic cancer and prediction and examination of pancreatic cancer prognosis.

Claims (9)

膵臓組織における、膵臓癌の有無を判定し、かつ予後を予測する方法であって、以下の(a)〜(c)の工程を備えたことを特徴とする方法。
(a)被験者より採取された判定用試料における、膵臓癌マーカーの発現量を定量する定量工程であって、前記膵臓癌マーカーが以下の各群のマーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNAである定量工程;
[A群マーカータンパク質]
FINC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02751)、FRIL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02792)、K1C10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P13645)、K2C1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P04264)、LYSC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61626)、PERM_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05164)、PLBL1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6P4A8)、S10A8_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05109)、S10A9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P06702)、STML2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJZ1)、TERA_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P55072)、TLN1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9Y490)、TSP1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P07996)、ANX10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJ72)、ECH1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q13011)、OLFM4_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6UX06)、EFTU_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P49411)、SERPH_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P50454)
[B群マーカータンパク質]
ALDH2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05091)、GTR1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P11166)、PLEC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q15149)、PUR9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P31939)
[C群マーカータンパク質]
CH10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61604)、CISY_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号O75390)、ERO1A_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q96HE7)、LG3BP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q08380)、SH3L3_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9H299)、SSBP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q04837)、TAGL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q01995)、VDAC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P21796)
(b)前記判定用試料における前記膵臓癌マーカーの発現量と、対照となる健常試料における前記膵臓癌マーカーの発現量とを比較する比較工程;
(c)発現量の比較結果に基づいて、以下の[i]〜[iii]のいずれかの基準により評価をする評価工程;
[i]判定用試料におけるA群マーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質又はそれらのタンパク質をコードするmRNAの発現量が、健常試料における発現量と比較して増加している場合、被験者の膵臓組織中に予後不良の膵臓癌組織が存在すると評価する;
[ii]判定用試料におけるB群マーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質又はそれらのタンパク質をコードするmRNAの発現量が、健常試料における発現量と比較して増加している場合、被験者の膵臓組織中に予後良好の膵臓癌組織が存在すると評価する;
[iii]判定用試料におけるC群マーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質又はそれらのタンパク質をコードするmRNAの発現量が、健常試料における発現量と比較して、増加している場合に被験者の膵臓組織中に予後不良又は予後良好の膵臓癌組織が存在すると評価する;
A method for determining the presence or absence of pancreatic cancer in a pancreatic tissue and predicting the prognosis, comprising the following steps (a) to (c).
(A) a quantitative step of quantifying the expression level of a pancreatic cancer marker in a determination sample collected from a subject, wherein the pancreatic cancer marker is selected from one or more of the following groups of marker proteins: Or a quantification step that is mRNA encoding the proteins;
[Group A marker protein]
FINC_HUMAN (UniProtKB accession number P02751), FRIL_HUMAN (UniProtKB accession number P02792), K1C10_HUMAN (UniProtKB accession number P13645), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number P26275), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number Number P05164), PLBL1_HUMAN (UniProtKB accession number Q6P4A8), S10A8_HUMAN (UniProtKB accession number P05109), S10A9_HUMAN (UniProtKB accession number P067) 2), STML2_HUMAN (UniProtKB accession number Q9UJZ1), TERA_HUMAN (UniProtKB accession number P55072), TLN1_HUMAN (UniProtKB accession number Q9Y490), TSP1_HUMAN10 (uniProTK) UniProtKB accession number Q13011), OLFM4_HUMAN (UniProtKB accession number Q6UX06), EFTU_HUMAN (UniProtKB accession number P49411), SERPH_HUMAN (UniProtKB accession number) 50454)
[Group B marker protein]
ALDH2_HUMAN (UniProtKB accession number P05091), GTR1_HUMAN (UniProtKB accession number P11166), PLEC1_HUMAN (UniProtKB accession number Q15149), PUR9_HUMAN (UniProtKB accession number P319)
[Group C marker protein]
CH10_HUMAN (UniProtKB accession number P61604), CISY_HUMAN (UniProtKB accession number O75390), ERO1A_HUMAN (UniProtKB accession number Q96HE7), LG3BP_HUMAN (UniProtKB accession number Q08380), SH3L3_HUMAN (UniProtKB accession number Q9H299), SSBP_HUMAN (UniProtKB accession Number Q04837), TAGL_HUMAN (UniProtKB accession number Q01995), VDAC1_HUMAN (UniProtKB accession number P21796)
(B) a comparison step of comparing the expression level of the pancreatic cancer marker in the determination sample with the expression level of the pancreatic cancer marker in a healthy sample as a control;
(C) an evaluation step of evaluating according to any of the following criteria [i] to [iii] on the basis of the expression level comparison results;
[I] When the expression level of one or more proteins selected from the group A marker protein in the determination sample or the mRNA encoding the protein is increased compared to the expression level in the healthy sample, the subject Assessing the presence of pancreatic cancer tissue with poor prognosis in
[Ii] When the expression level of one or more proteins selected from the group B marker protein in the determination sample or the mRNA encoding the protein is increased compared to the expression level in the healthy sample, That pancreatic cancer tissue with good prognosis is present in the pancreatic tissue of
[Iii] When the expression level of one or more proteins selected from the group C marker protein in the determination sample or mRNA encoding the protein is increased compared to the expression level in the healthy sample Assess that pancreatic cancer tissue with poor or good prognosis is present in the pancreatic tissue of the subject;
[A群マーカータンパク質]に含まれる以下の[A’群マーカータンパク質]から選択されることを特徴とする請求項1記載の方法。
[A’群マーカータンパク質]
STML2_HUMAN、ECH1_HUMAN、OLFM4_HUMAN
2. The method according to claim 1, wherein the method is selected from the following [Group A ′ marker protein] included in [Group A marker protein].
[A 'group marker protein]
STML2_HUMAN, ECH1_HUMAN, OLFM4_HUMAN
判定用試料が、組織、体液、又は組織の浸漬液であることを特徴とする請求項1又は2記載の方法。   3. The method according to claim 1, wherein the determination sample is a tissue, a body fluid, or a tissue immersion liquid. 体液が、血液、膵液、リンパ液、胆汁、尿、唾液、汗、***であることを特徴とする請求項3記載の方法。   The method according to claim 3, wherein the body fluid is blood, pancreatic juice, lymph fluid, bile, urine, saliva, sweat, or semen. 定量工程が、液体クロマトグラフィー質量分析法又は免疫学的測定法により、膵臓癌マーカータンパク質の発現量を定量する工程であることを特徴とする請求項1〜4のいずれか記載の方法。   The method according to any one of claims 1 to 4, wherein the quantification step is a step of quantifying the expression level of the pancreatic cancer marker protein by liquid chromatography mass spectrometry or immunoassay. 以下の各群のマーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNAを膵臓癌マーカーとして使用する方法。
[A群マーカータンパク質]
FINC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02751)、FRIL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02792)、K1C10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P13645)、K2C1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P04264)、LYSC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61626)、PERM_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05164)、PLBL1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6P4A8)、S10A8_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05109)、S10A9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P06702)、STML2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJZ1)、TERA_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P55072)、TLN1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9Y490)、TSP1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P07996)、ANX10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJ72)、ECH1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q13011)、OLFM4_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6UX06)、EFTU_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P49411)、SERPH_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P50454)
[B群マーカータンパク質]
ALDH2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05091)、GTR1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P11166)、PLEC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q15149)、PUR9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P31939
[C群マーカータンパク質]
CH10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61604)、CISY_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号O75390)、ERO1A_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q96HE7)、LG3BP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q08380)、SH3L3_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9H299)、SSBP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q04837)、TAGL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q01995)、VDAC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P21796)
One or two or more proteins selected from the following marker proteins of each group, or mRNA encoding these proteins, is used as a pancreatic cancer marker.
[Group A marker protein]
FINC_HUMAN (UniProtKB accession number P02751), FRIL_HUMAN (UniProtKB accession number P02792), K1C10_HUMAN (UniProtKB accession number P13645), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number P26275), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number Number P05164), PLBL1_HUMAN (UniProtKB accession number Q6P4A8), S10A8_HUMAN (UniProtKB accession number P05109), S10A9_HUMAN (UniProtKB accession number P067) 2), STML2_HUMAN (UniProtKB accession number Q9UJZ1), TERA_HUMAN (UniProtKB accession number P55072), TLN1_HUMAN (UniProtKB accession number Q9Y490), TSP1_HUMAN10 (uniProTK) UniProtKB accession number Q13011), OLFM4_HUMAN (UniProtKB accession number Q6UX06), EFTU_HUMAN (UniProtKB accession number P49411), SERPH_HUMAN (UniProtKB accession number) 50454)
[Group B marker protein]
ALDH2_HUMAN (UniProtKB accession number P05091), GTR1_HUMAN (UniProtKB accession number P11166), PLEC1_HUMAN (UniProtKB accession number Q15149), PUR9_HUMAN (UniProtKB accession number P319)
[Group C marker protein]
CH10_HUMAN (UniProtKB accession number P61604), CISY_HUMAN (UniProtKB accession number O75390), ERO1A_HUMAN (UniProtKB accession number Q96HE7), LG3BP_HUMAN (UniProtKB accession number Q08380), SH3L3_HUMAN (UniProtKB accession number Q9H299), SSBP_HUMAN (UniProtKB accession Number Q04837), TAGL_HUMAN (UniProtKB accession number Q01995), VDAC1_HUMAN (UniProtKB accession number P21796)
[A群マーカータンパク質]に含まれる以下の[A’群マーカータンパク質]から選択されることを特徴とする請求項6記載の方法。
[A’群マーカータンパク質]
STML2_HUMAN、ECH1_HUMAN、OLFM4_HUMAN
The method according to claim 6, wherein the method is selected from the following [Group A 'marker protein] included in [Group A marker protein].
[A 'group marker protein]
STML2_HUMAN, ECH1_HUMAN, OLFM4_HUMAN
膵臓癌マーカーとして使用するための、以下の各群のマーカータンパク質から選択される1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNA。
[A群マーカータンパク質]
FINC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02751)、FRIL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P02792)、K1C10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P13645)、K2C1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P04264)、LYSC_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61626)、PERM_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05164)、PLBL1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6P4A8)、S10A8_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05109)、S10A9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P06702)、STML2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJZ1)、TERA_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P55072)、TLN1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9Y490)、TSP1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P07996)、ANX10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9UJ72)、ECH1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q13011)、OLFM4_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q6UX06)、EFTU_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P49411)、SERPH_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P50454)
[B群マーカータンパク質]
ALDH2_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P05091)、GTR1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P11166)、PLEC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q15149)、PUR9_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P31939)
[C群マーカータンパク質]
CH10_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P61604)、CISY_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号O75390)、ERO1A_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q96HE7)、LG3BP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q08380)、SH3L3_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q9H299)、SSBP_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q04837)、TAGL_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号Q01995)、VDAC1_HUMAN(UniProtKBアクセッション番号P21796)
One or two or more proteins selected from the following groups of marker proteins or mRNA encoding these proteins for use as a pancreatic cancer marker.
[Group A marker protein]
FINC_HUMAN (UniProtKB accession number P02751), FRIL_HUMAN (UniProtKB accession number P02792), K1C10_HUMAN (UniProtKB accession number P13645), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number P26275), K2C1_HUMAN (UniProtKB accession number Number P05164), PLBL1_HUMAN (UniProtKB accession number Q6P4A8), S10A8_HUMAN (UniProtKB accession number P05109), S10A9_HUMAN (UniProtKB accession number P067) 2), STML2_HUMAN (UniProtKB accession number Q9UJZ1), TERA_HUMAN (UniProtKB accession number P55072), TLN1_HUMAN (UniProtKB accession number Q9Y490), TSP1_HUMAN10 (uniProTK) UniProtKB accession number Q13011), OLFM4_HUMAN (UniProtKB accession number Q6UX06), EFTU_HUMAN (UniProtKB accession number P49411), SERPH_HUMAN (UniProtKB accession number) 50454)
[Group B marker protein]
ALDH2_HUMAN (UniProtKB accession number P05091), GTR1_HUMAN (UniProtKB accession number P11166), PLEC1_HUMAN (UniProtKB accession number Q15149), PUR9_HUMAN (UniProtKB accession number P319)
[Group C marker protein]
CH10_HUMAN (UniProtKB accession number P61604), CISY_HUMAN (UniProtKB accession number O75390), ERO1A_HUMAN (UniProtKB accession number Q96HE7), LG3BP_HUMAN (UniProtKB accession number Q08380), SH3L3_HUMAN (UniProtKB accession number Q9H299), SSBP_HUMAN (UniProtKB accession Number Q04837), TAGL_HUMAN (UniProtKB accession number Q01995), VDAC1_HUMAN (UniProtKB accession number P21796)
[A群マーカータンパク質]に含まれる以下の[A’群マーカータンパク質]から選択されることを特徴とする請求項8記載の1若しくは2以上のタンパク質、又はそれらタンパク質をコードするmRNA。
[A’群マーカータンパク質]
STML2_HUMAN、ECH1_HUMAN、OLFM4_HUMAN
9. One or more proteins according to claim 8, or mRNA encoding these proteins, selected from the following [A 'group marker proteins] included in [Group A marker proteins].
[A 'group marker protein]
STML2_HUMAN, ECH1_HUMAN, OLFM4_HUMAN
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