JP2008178362A - 新規癌検出方法、癌検出器具、および癌検出キット - Google Patents
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Abstract
【解決手段】ADAMTS16をコードする遺伝子は癌特異的に発現レベルが高いことを見出した。これらの発現レベルを正常レベルと比較することにより、客観的な癌の検出が可能となる。
【選択図】図1
Description
Kawaguchi H, Ohno S, Miyazaki M, Hashimoto K, Egashira A, Saeki H, Watanabe M, Sugimachi K,「CYFRA 21-1 determination in patients with esophageal squamous cell carcinoma: clinical utility for detection of recurrences」,CANCER, 89(7), 1413-7,2000 Santiago Cal, Alvaro J. Obaya, Maria Llamazares, Cecilia Garabaya, Victor Quesada and Carlos Lopez-Otin, 「Cloning, expression analysis, and structural characterization of seven novel human ADAMTSs, a family of metalloproteinases with disintegrinand thrombospondin-1 domains」, Gene, 283 49-62, 2002 Lara Kevorkian, David A. Young, Clare Darrah, Simon T. Donell, Lee Shepstone, Sarah Porter, Sarah M. V. Brockbank, Dylan R. Edwards, Andrew E. Parker, and Ian M. Clark, 「Expression Profiling of Metalloproteinases and Their Inhibitors in Cartilage」, ARTHRITIS & RHEUMATISM, Vol. 50, 31-141, 2004 Rose K Davidson, Jasmine G Waters, Lara Kevorkian, Clare Darrah, Adele Cooper, Simon T Donell and Ian M Clark, 「Expression profiling of metalloproteinases and their inhibitors in synovium and cartilage」, Arthritis Research & Therapy, 8, R124, 2006
本発明者らは、手術により得られた1例の食道癌において発現している遺伝子をSAGE(Serial analysis of gene expression)法を用いて網羅的に解析し、正常組織における発現レベルと比較することにより、食道癌特異的遺伝子候補を同定した。さらに、これらの候補遺伝子について、手術により得られた食道癌20例(上記1例とは異なるもの)における発現レベルを詳細に解析し、正常組織における発現レベルが低く、食道癌において発現レベルが高いADAMTS16遺伝子を特定した。さらに上記ADAMTS16遺伝子は食道扁平上皮癌においても正常組織と比べて発現レベルが高いことが明らかとなった。
一実施形態において、本発明に係る癌検出方法は、被検体由来の試料において、配列番号1に示される塩基配列またはその部分配列を含むポリヌクレオチドのレベルを測定するポリヌクレオチド測定工程、および上記ポリヌクレオチドのレベルを正常レベルと比較する比較工程を包合するものであれば良い。
他の実施形態において、本発明に係る方法は、被検体由来の試料を用いて癌を検出する方法であって、被検体由来の試料において、配列番号2に示されるアミノ酸配列またはその部分配列からなるポリペプチドのレベルを測定するポリペプチド測定工程、および上記ポリペプチドのレベルを正常レベルと比較する比較工程を包含するものであればよい。
本発明に係る被検体由来の試料の癌診断方法は、以下の(a)または(b)の場合に癌であると判定するものであればよい。
(a)本発明に係る癌検出方法において、配列番号1に示される塩基配列またはその部分配列を含むポリヌクレオチドのレベルが正常レベルの2倍以上である場合
(b)本発明に係る癌検出方法において、配列番号2に示されるアミノ酸配列またはその部分配列を含むポリペプチドのレベルが正常レベルの2倍以上である場合。
本発明に係る被検体由来の試料の癌検出器具は、配列番号1に示される塩基配列またはその部分配列を含むポリヌクレオチドと特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチドが支持体上に固定化されている器具であればよい。
本発明に係る被検体由来の試料の癌検出キットは、配列番号1に示される塩基配列またはその部分配列を含むポリヌクレオチドを備えるものであればよい。配列番号1に示される塩基配列またはその部分配列を含むポリヌクレオチドとしては、例えば、ADAMTS16遺伝子のmRNAのレベルを測定するために使用するプライマーまたはプローブを挙げることができる。
広島大学病院で外科的に切除された食道癌(中分化扁平上皮癌)について、SAGE法を用いて遺伝子発現を網羅的に解析した。
上記ADAMTS16遺伝子のmRNAについて、食道癌におけるレベルをリアルタイムRT−PCR法を用いて測定した。試料として、広島大学病院で外科的に切除された食道癌20例を用いた。また、対照試料として、食道非腫瘍部粘膜20例と正常組織14種類を用いた。
〔実施例1〕と同様に、食道扁平上皮癌10例、および正常食道2例からcDNAを作製した。なお、上記食道扁平上皮癌10例、および正常食道2例は、大分大学付属病院で外科的に切除されたものを用いた。
SCCA1遺伝子のレベルについて、食道癌におけるレベルをリアルタイムRT−PCR法で測定した。プライマー以外の測定条件は〔実施例2〕と同じである。なお、SCCA1遺伝子は従来から用いられている食道癌のマーカーである。また、Forwardプライマーとして、配列番号5で表される塩基配列のプライマーを用いた。また、Reverseプライマーとして、配列番号6で表される塩基配列のプライマーを用いた。
Claims (13)
- 被検体由来の試料において、ADAMTS16遺伝子の発現レベルを測定する測定工程、および
上記ADAMTS16遺伝子の発現レベルを正常レベルと比較する比較工程
を包含することを特徴とする被検体由来の試料の癌検出方法。 - 被検体由来の試料において、配列番号1に示される塩基配列またはその部分配列を含むポリヌクレオチドのレベルを測定するポリヌクレオチド測定工程、および
上記ポリヌクレオチドのレベルを正常レベルと比較する比較工程
を包含することを特徴とする被検体由来の試料の癌検出方法。 - 上記ポリヌクレオチド測定工程において、配列番号3または4に示される塩基配列からなるポリヌクレオチドを使用することを特徴とする請求項2に記載の癌検出方法。
- 被検体由来の試料において、配列番号2に示されるアミノ酸配列またはその部分配列からなるポリペプチドのレベルを測定するポリペプチド測定工程、および
上記ポリペプチドのレベルを正常レベルと比較する比較工程
を包含することを特徴とする被検体由来の試料の癌検出方法。 - 上記ポリペプチド測定工程において、配列番号2に示されるアミノ酸配列またはその部分配列からなるポリペプチドに特異的に結合する抗体を使用することを特徴とする請求項4に記載の癌検出方法。
- 上記癌が食道癌であることを特徴とする請求項1ないし5のいずれか1項に記載の癌検出方法。
- 配列番号1に示される塩基配列またはその部分配列を含むポリヌクレオチドと特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチドが支持体上に固定化されていることを特徴とする被検体由来の試料の癌検出器具。
- 支持体上に固定化されているポリヌクレオチドが、配列番号3または4に示される塩基配列からなるポリヌクレオチドであることを特徴とする請求項7に記載の癌検出器具。
- 配列番号2に示されるアミノ酸配列またはその部分配列からなるポリペプチドに特異的に結合する抗体が支持体上に固定化されていることを特徴とする被検体由来の試料の癌検出器具。
- 配列番号1示される塩基配列またはその部分配列を含むポリヌクレオチドを備えることを特徴とする被検体由来の試料の癌検出キット。
- 上記ポリヌクレオチドが、配列番号3または4に示される塩基配列からなるポリヌクレオチドであることを特徴とする請求項10に記載の癌検出キット。
- 上記ポリヌクレオチドがRT−PCRまたはリアルタイムRT−PCRのプライマーとして用いられることを特徴とする請求項10または11に記載の癌検出キット。
- 配列番号2に示されるアミノ酸配列またはその部分配列からなるポリペプチドに特異的に結合する抗体を備えることを特徴とする被検体由来の試料の癌検出キット。
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Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2011024433A1 (en) * | 2009-08-24 | 2011-03-03 | Oncotherapy Science, Inc. | Lung and esophageal cancer related gene adamts18 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2005005601A2 (en) * | 2003-06-09 | 2005-01-20 | The Regents Of The University Of Michigan | Compositions and methods for treating and diagnosing cancer |
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