JP2004067657A - Method for photochemical scission of peptide bond and apparatus therefor - Google Patents

Method for photochemical scission of peptide bond and apparatus therefor Download PDF

Info

Publication number
JP2004067657A
JP2004067657A JP2002266125A JP2002266125A JP2004067657A JP 2004067657 A JP2004067657 A JP 2004067657A JP 2002266125 A JP2002266125 A JP 2002266125A JP 2002266125 A JP2002266125 A JP 2002266125A JP 2004067657 A JP2004067657 A JP 2004067657A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
light
organic compound
wavelength
irradiation
bond
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2002266125A
Other languages
Japanese (ja)
Inventor
Hiroya Kondo
近藤 寛也
Kunio Awazu
粟津 邦男
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Individual
Original Assignee
Individual
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Individual filed Critical Individual
Priority to JP2002266125A priority Critical patent/JP2004067657A/en
Publication of JP2004067657A publication Critical patent/JP2004067657A/en
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Landscapes

  • Pyrane Compounds (AREA)
  • Physical Or Chemical Processes And Apparatus (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for realizing the structural change of an organic compound and the formation of a specific decomposition product by light irradiation which has hitherto been impossible without using enzymes, etc., by inducing a chemical reaction using the energy of light irradiation, breaking the bond of the organic compound exclusively in the space restricted to the irradiated position and restricting the breaking bond by selecting the wavelength of the light and provide an apparatus for the method. <P>SOLUTION: A specific bond in an organic compound is specifically broken by using an apparatus capable of radiating light having a sufficient energy density exclusively to a necessary part and irradiating the organic compound with light having wavelength acting exclusively to a specific site in the organic compound molecule, i.e. wavelength resonating with the molecular oscillation of the bond to be broken. <P>COPYRIGHT: (C)2004,JPO

Description

【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、光照射によりペプチド結合及び擬ペプチド結合及び有機化合物内の特定の結合を切断する方法及びそのための装置に関するものである。より詳細には、分子振動に共鳴する赤外光が照射された部位におこる振動励起を利用して分子内の特定部位の結合を切断し、さらに光を照射された場所という空間的に制御された条件下で分子の分解、構造の改変、誘導体の生成を行う方法及びその装置に関する。
【0002】
【従来の技術】有機化合物の結合の切断による分解は、有毒物質の無毒化のみならず、有機化学分析や酵素等の活性制御、さらに医薬品や生理活性物質の生理活性の付与や消失の制御に応用することができる。しかしながら、紫外線等の照射やガス流やイオン等との衝突、触媒等を用いた方法では有機化合物内の結合を非特異的に切断するため、分解生成物の構造を制御できず、元となる物質の構造を推定すること、分解による高次構造変化を制御すること、分解生成物に分子機能を付与すること等はきわめて困難である。さらに条件によっては無機物にまで分解されうる。一方でいわゆる酵素を用いた方法では酵素の性質により切断される結合が特定されるために、元となる基質の選択性や生成物の分子機能を期待できる。しかし酵素には反応条件に制約が多く、真空中や気相中での反応は期待できず、水溶液中の反応においても特定の場所のみの分解等反応という空間的な制御の要求には困難がともない、さらに分解物の造形には利用できない。しかし赤外線レーザー光を用いたコレステロールエステルの選択的分解装置が特許公報第2865655号に開示されており、分子振動と共鳴する波長域の光を用いることで空間選択性と結合部位選択性を併せ持った結合切断とそれに伴う有機化合物の構造変化や生物学的活性等の機能制御が可能であることが期待される。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】発明者らは特定の部位においてのみ有機化合物内の結合の切断をもたらす系として、光の照射によるエネルギーを利用して化学反応を惹起し、光を照射された場所に限定された空間内においてのみ結合の切断をもたらし分解物を生成する方法と装置を提供することを課題とした。
【0004】さらに、照射する光の波長を選択することにより、有機化合物内の特定の結合部位を切断する方法を提供することを課題とした。
【0005】
【課題を解決するための手段】本発明は、十分なエネルギー密度を備えた光を必要な場所のみに照射する装置を用いて、分子内の特定の部位のみに作用する光の波長を選択し使用する有機化合物内の特定の結合を切断する方法並びに装置である。
【0006】電磁波である光を有機化合物の分解に用いるには対象となる化合物が光を吸収することが必要である。紫外から可視領域の光の吸収は結合の電子エネルギー準位間の遷移によるものであり、光を吸収する分子構造部分は発色団と呼ばれている。しかし、発色団は比較的普遍的に存在し特異性が低いため、今日では紫外から可視領域の吸収特性から化合物の種類や構造を分析することは一部の色素等以外については行われず、逆に特異性が低いことを活用して例えばたんぱく質溶液の濃度分析など同種化合物の総量を測定する用途などに多く用いられている。
【0007】同じ電磁波である赤外光の場合は結合の振動励起が起こるエネルギー領域であり、赤外領域における光の吸収は特定の結合の結合角が変化する変角振動や結合距離が変化する伸縮振動という分子振動の励起と関連付けられている。それぞれの結合に由来する振動は基準振動と呼ばれ、ばねと重りの単純なモデルを用いて分子軌道法から求められた結合の強さと結合している原子の換算質量で推定することができる。複数の原子で構成される化合物では、近傍の原子の影響で結合強度が変化することや基準振動の相互作用のためにそれぞれ共鳴振動数が変化する。このため精密な赤外分光分析は有機化合物の構造解析や化合物の種類の同定に用いられている。
【0008】従ってそれぞれの結合の共鳴振動数が異なることを利用して、特定の結合に共鳴する振動数を持つ波長の光を選択的に照射することで分子内の特定の結合部位にのみエネルギーを与えることができる。
【0009】十分な強さをもつ赤外領域の単色光の光源と損失の少ない光学系を用いて、分子振動に共鳴する波長の赤外光を選択的に照射することにより課題を解決することができる。
【0010】
【発明の実施の形態】以下、この発明の実施形態について図面を参照して説明する。光源装置は分子振動に共鳴する波長の赤外光を発生させることができればその形式はどのようなものでも良く、一例としてこの実施形態では自由電子レーザー装置が用いられている。
【0011】図1は実施形態の光化学的有機化合物の結合切断装置の概略図である。光源として用いる自由電子レーザー装置から導かれた平行光線である赤外光1は焦点距離30cmの凹面鏡2により集光され、二次元光学走査装置3に入射し、試料台4上の試料に焦点を結ぶ。二次元光学走査装置3はモーターにより反射鏡の角度を変化させることにより試料台の任意の位置に赤外光を照射することができる。試料台4もモーター駆動により焦点位置の調節及び照射スポット形の選択、そして赤外光照射位置を変えることができる。照射前後の試料の状況は逐次モニターカメラ5により撮影され、テレビジョンモニター6の画面上で確認することができる。さらにモニターカメラ5をMCT赤外線検出器に換装することにより、試料に到達する赤外光のパワーを測定することができる。
【0012】自由電子レーザーは磁界の方向が周期的に反転する周期磁場内を電子ビームが蛇行するときに発生する光を増幅するレーザー装置であり、周期磁場の周期、強度及び電子ビームのエネルギーなどのバラメータを変化させることにより、連続的に波長を変化させることができる。赤外領域においても波長選択の自由度が高くエネルギー密度の高い光源として利用することができる。
【0013】自由電子レーザー装置から得られる赤外光はパルス状であり、高いピークバワーを保ちながらも試料に照射される総エネルギーは小さく抑えることができるため、試料の熱変性などの非特異的な変化を小さくすることできる。今回も用いたレーザー光はパルス幅が10−12秒であり、試料に達する赤外光の平均パワーは10から14mW、ピーク時のパワー密度は焦点位置において約5.0GW/cmに達する。光が単色光でなおかつパルス状であれば他の光源装置であっても良い。
【0014】この実施形態における装置では、反射鏡表面は金コートされており反射による赤外光の損失を小さくしている。さらに凹面鏡2から試料位置までの距離を30cmとして、長距離の光伝送を避けることにより、大気中の水蒸気や二酸化炭素による赤外光の損失を抑えている。
【0015】図1に示す装置では可視光で試料の状態及び照射部位の状況をモニターカメラ5により観察することができ、正確に光路と試料の位置関係を調節することを可能にする。
【0016】
【実施例】本発明はこれらの実施例に限定されるものではないが、上述の装置により、ペプチド結合の切断実験を行った。
【0017】対象試料として用いたローダミン110のベンジロキシカルボニル−L−アルギニン誘導体は次に示すごとく蛍光色素であるローダミン110にL−アルギニンがペプチド結合しアミド体を構成しているときは蛍光を発しないが、ペプチド結合が切断されてローダミン110が遊離するとフルオレセインと同様の強い緑色の蛍光を発する。この試薬は緑色蛍光がペプチド結合切断すなわちたんぱく質の分解を示すことから、たんぱく質分解酵素の活性を測定する用途に多用されている。今回の実験において赤外光照射後に緑色の蛍光を得ることができれば、蛍光色素の骨格を破壊せずにペプチド結合を切断することができた、すなわち光によっても酵素と同様に有機化合物内の選択的な結合の切断を実施できたことがわかる。
【0018】
【化1】

Figure 2004067657
【0019】ローダミン110のベンジロキシカルボニル−L−アルギニン誘導体の赤外吸収スペクトルをFT−IR法によって測定した結果を図2に示す。今回の実験に用いた6.06μm、6.16μm、6.45μmのそれぞれの波長においてほぼ同等の吸光度を示している。アミドIの吸収帯に帰属する波長6.06μm付近の吸収は分子軌道法から求めたれた結果よりペプチド結合近傍の分子振動に由来することが推定されており、この波長によってペプチド結合を選択的に励起できると考えられる。他の化合物を用いて異なる結合を切断するにはその結合部位を振動励起する異なる波長を選択すればよい。
【0020】ローダミン110のベンジロキシカルボニル−L−アルギニン誘導体の結晶を赤外透明性の高いBaF板上に配置し、記述の装置を用いて赤外光を照射した。
【0021】波長6.06μm照射の結果を図3に示す。図3aはフルオレセイン観察条件の蛍光顕微鏡画像であり、図3bは同一部位の白色可視透過光による画像である。赤外光の平均パワーは12mWであり、2秒間総計24mJの照射を行った。照射スポット径は直径約118μmで、図3a及びbの中央部に照射された。照射スポット位置でのピーク時のパワー密度は約5.0GW/cmであった。図3aにおいて蛍光顕微鏡画像であり中央部に飛散したローダミン110に由来する蛍光を確認することができる。周辺部においても散乱光の影響と思われる蛍光がみられる。図3bに見られるようにレーザー光照射により結晶の形態は変化しているが、ペプチド結合が切断されたにもかかわらず蛍光を発するローダミン110骨格は保たれたまま、赤外光照射部位において蛍光色素であるローダミン110が生成されていることがわかった。この結果から波長6.06μmの光はたんばく分解酵素様の作用を持っていると考えられた。
【0022】波長6.16μm照射の結果を図5に示す。図4aは先と同様の蛍光顕微鏡画像であり、図4bは同一部位の白色可視透過光による画像である。赤外光の平均パワーは13mWであり、2秒間総計26mJの照射を行った。照射スポット径は直径約122μmで、同様に図の中央部に照射された。照射スポット位置でのピーク時のパワー密度は約5.1GW/cmであった。図4bの中央部において形態が変型した結晶が照射痕として認められたが、図4aにおいて蛍光は弱く、結晶周囲にも蛍光は認められなかった。したがって波長6.16μmの光はたんばく分解酵素様の作用は持っておらず、0.1μmの波長の違いにおいても、その作用は大きく異なると考えられた。
【0023】波長6.45μm照射の結果を図5に示す。図5aは先と同様の蛍光顕微鏡画像であり、図5bは同一部位の白色可視透過光による画像である。赤外光の平均パワーは10mWであり、2秒間総計20mJの照射を行った。照射スポット径は直径約107μmで、同様に図の中央部に照射された。照射スポット位置でのピーク時のパワー密度は約4.6GW/cmであった。図5bの中央部においてレーザー照射により砕かれた結晶が認められたが、図5aにおいては図4aに見られた蛍光は認められなかった。したがって波長6.45μmの光は非特異的な作用は持っているものの、特定の結合のみを切断するというたんばく分解酵素様の作用は持っていないと考えられた。
【0024】
【発明の効果】この発明においては、有機化合物の分子振動にあわせた選択的励起により、特定の結合を切断し有機化合物の分解、構造改変、誘導体生成ができ、光の照射部位の選択性を用いて光化学反応の空間的な制御ができ、反応も非常に短時間であることや、真空中での反応や選択的蒸散への応用など、酵素などを用いた反応などに比して種々の利点が得られる。
【図面の簡単な説明】
【図1】実施形態の光化学的有機化合物の結合切断装置の概略図である。
【図2】ローダミン110のベンジロキシカルボニル−L−アルギニン誘導体の赤外吸収スペクトルのグラフである。
【図3】波長6.06μm照射部位の顕微鏡写真である。
【図4】波長6.16μm照射部位の顕微鏡写真である。
【図5】波長6.45μm照射部位の顕微鏡写真である。
【符号の説明】
1 自由電子レーザー装置から導かれた平行光線である赤外光
2 集光用凹面鏡
3 二次元光学スキャナ
4 試料台
5 モニターカメラ装置
6 テレビジョンモニター装置[0001]
BACKGROUND OF THE INVENTION 1. Field of the Invention The present invention relates to a method for cleaving peptide bonds and pseudo-peptide bonds and specific bonds in organic compounds by light irradiation, and an apparatus therefor. More specifically, it breaks bonds at specific sites in the molecule by using vibrational excitation that occurs at the site irradiated with infrared light that resonates with molecular vibrations, and is further spatially controlled at the location irradiated with light. The present invention relates to a method and an apparatus for decomposing a molecule, modifying a structure, and producing a derivative under conditions.
[0002]
2. Description of the Related Art Decomposition by breaking the bond of an organic compound is not only for detoxification of toxic substances, but also for control of the activity of organic chemical analysis, enzymes, etc., and control of imparting or eliminating the physiological activity of pharmaceuticals and biologically active substances. Can be applied. However, irradiation with ultraviolet rays or the like, collision with a gas flow or ions, or a method using a catalyst, etc., non-specifically cuts bonds in an organic compound, so that the structure of a decomposition product cannot be controlled and becomes a source. It is extremely difficult to estimate the structure of a substance, control higher-order structural changes due to decomposition, and impart molecular functions to decomposition products. Further, it can be decomposed into inorganic substances depending on conditions. On the other hand, in a method using a so-called enzyme, a bond to be cleaved is specified by the property of the enzyme, so that selectivity of a base substrate and molecular function of a product can be expected. However, there are many restrictions on the reaction conditions of enzymes, and reactions in a vacuum or gas phase cannot be expected. Even in reactions in aqueous solutions, it is difficult to request spatial control such as decomposition at a specific location only. No, it cannot be used for forming decomposed products. However, an apparatus for selectively decomposing cholesterol ester using infrared laser light is disclosed in Japanese Patent Publication No. 2865655, which has both spatial selectivity and binding site selectivity by using light in a wavelength range that resonates with molecular vibration. It is expected that bond breaking and functional control such as structural change and biological activity of the organic compound accompanying the bond breaking are possible.
[0003]
SUMMARY OF THE INVENTION As a system for breaking bonds in an organic compound only at a specific site, the inventors have induced a chemical reaction using the energy of light irradiation, and have been exposed to light. It is an object of the present invention to provide a method and an apparatus for producing a decomposed product by causing a bond to be broken only in a space limited to a place.
Another object of the present invention is to provide a method for cutting a specific binding site in an organic compound by selecting the wavelength of light to be irradiated.
[0005]
SUMMARY OF THE INVENTION The present invention uses an apparatus for irradiating light having a sufficient energy density only to a required place to select a wavelength of light acting only on a specific site in a molecule. A method and an apparatus for breaking a specific bond in an organic compound to be used.
[0006] In order to use light, which is an electromagnetic wave, for decomposing organic compounds, it is necessary that the target compound absorb the light. The absorption of light in the ultraviolet to visible region is due to the transition between the electron energy levels of the bonds, and the molecular structure that absorbs light is called a chromophore. However, since chromophores are relatively ubiquitous and have low specificity, today it is not possible to analyze the type or structure of a compound from the absorption characteristics in the ultraviolet to visible region, except for some dyes, etc. Utilizing its low specificity, it is often used for measuring the total amount of the same kind of compounds such as, for example, concentration analysis of protein solutions.
In the case of infrared light, which is the same electromagnetic wave, it is an energy region in which vibrational excitation of a bond occurs, and light absorption in the infrared region changes a bending angle vibration in which a bond angle of a specific bond changes and a bond distance changes. It is related to the excitation of molecular vibration called stretching vibration. The vibration resulting from each bond is called a reference vibration, and can be estimated from the bond strength determined by the molecular orbital method and the reduced mass of the bonded atoms using a simple model of a spring and a weight. In a compound composed of a plurality of atoms, the resonance frequency changes due to the change in bond strength due to the influence of nearby atoms and the interaction of normal vibration. For this reason, precise infrared spectroscopy is used for structural analysis of organic compounds and identification of types of compounds.
Therefore, utilizing the fact that the resonance frequency of each bond is different, by selectively irradiating light of a wavelength having a frequency which resonates with a specific bond, the energy can be applied only to a specific bond site in the molecule. Can be given.
To solve the problem by selectively irradiating infrared light having a wavelength that resonates with molecular vibration using a light source of monochromatic light in the infrared region having a sufficient intensity and an optical system with low loss. Can be.
[0010]
Embodiments of the present invention will be described below with reference to the drawings. The light source device may be of any type as long as it can generate infrared light having a wavelength that resonates with molecular vibration. For example, in this embodiment, a free electron laser device is used.
FIG. 1 is a schematic view of an apparatus for cutting and binding a photochemical organic compound according to an embodiment. Infrared light 1 which is a parallel light beam guided from a free electron laser device used as a light source is condensed by a concave mirror 2 having a focal length of 30 cm, enters a two-dimensional optical scanning device 3 and focuses on a sample on a sample stage 4. tie. The two-dimensional optical scanning device 3 can irradiate infrared light to an arbitrary position on the sample table by changing the angle of the reflecting mirror by a motor. The sample stage 4 can also adjust the focal position, select the irradiation spot type, and change the infrared light irradiation position by driving a motor. The state of the sample before and after the irradiation is sequentially photographed by the monitor camera 5 and can be confirmed on the screen of the television monitor 6. Further, by replacing the monitor camera 5 with an MCT infrared detector, the power of infrared light reaching the sample can be measured.
A free electron laser is a laser device that amplifies light generated when an electron beam meanders in a periodic magnetic field in which the direction of a magnetic field is periodically reversed. , The wavelength can be continuously changed. It can be used as a light source having a high degree of freedom in wavelength selection and a high energy density even in the infrared region.
[0013] The infrared light obtained from the free electron laser device is pulsed, and the total energy applied to the sample can be kept small while maintaining a high peak power. The change can be reduced. The laser beam used this time also has a pulse width of 10 −12 seconds, the average power of the infrared light reaching the sample is 10 to 14 mW, and the power density at the peak reaches about 5.0 GW / cm 2 at the focal position. Other light source devices may be used as long as the light is monochromatic and pulsed.
In the apparatus of this embodiment, the surface of the reflecting mirror is coated with gold to reduce the loss of infrared light due to reflection. Further, by setting the distance from the concave mirror 2 to the sample position to be 30 cm and avoiding long-distance light transmission, loss of infrared light due to water vapor and carbon dioxide in the atmosphere is suppressed.
In the apparatus shown in FIG. 1, the state of the sample and the state of the irradiated area can be observed with the monitor camera 5 using visible light, and the positional relationship between the optical path and the sample can be accurately adjusted.
[0016]
EXAMPLES Although the present invention is not limited to these examples, an experiment for cleaving peptide bonds was carried out using the above-mentioned apparatus.
The benzyloxycarbonyl-L-arginine derivative of rhodamine 110 used as a target sample emits fluorescence when L-arginine is peptide-bonded to rhodamine 110, which is a fluorescent dye, to form an amide as shown below. However, when the peptide bond is cleaved to release rhodamine 110, it emits the same strong green fluorescence as fluorescein. This reagent is widely used for measuring the activity of a proteolytic enzyme since green fluorescence indicates peptide bond cleavage, that is, degradation of the protein. In this experiment, if green fluorescence could be obtained after irradiation with infrared light, peptide bonds could be cleaved without destroying the skeleton of the fluorescent dye. It can be seen that the typical bond was successfully broken.
[0018]
Embedded image
Figure 2004067657
FIG. 2 shows the results of measuring the infrared absorption spectrum of the benzyloxycarbonyl-L-arginine derivative of rhodamine 110 by the FT-IR method. It shows almost the same absorbance at each wavelength of 6.06 μm, 6.16 μm and 6.45 μm used in this experiment. It is estimated from the results obtained by the molecular orbital method that the absorption near the wavelength of 6.06 μm attributed to the absorption band of amide I is derived from the molecular vibration near the peptide bond. It is thought that it can be excited. In order to cleave a different bond using another compound, a different wavelength that vibrates the binding site may be selected.
A crystal of a benzyloxycarbonyl-L-arginine derivative of rhodamine 110 was placed on a BaF 2 plate having high infrared transparency, and irradiated with infrared light using the apparatus described above.
FIG. 3 shows the result of irradiation at a wavelength of 6.06 μm. FIG. 3A is a fluorescence microscope image under fluorescein observation conditions, and FIG. 3B is an image of the same site with white visible transmitted light. The average power of the infrared light was 12 mW, and irradiation was performed for a total of 24 mJ for 2 seconds. The irradiation spot diameter was about 118 μm and was applied to the center of FIGS. 3A and 3B. The power density at the peak at the irradiation spot position was about 5.0 GW / cm 2 . In FIG. 3a, it is a fluorescence microscope image, and fluorescence derived from rhodamine 110 scattered in the center can be confirmed. Fluorescence, which is considered to be affected by scattered light, is also found in the periphery. As can be seen in FIG. 3b, the morphology of the crystal is changed by the irradiation of the laser beam, but the rhodamine 110 skeleton that emits fluorescence despite the cleavage of the peptide bond is maintained at the site irradiated with the infrared light. It was found that rhodamine 110, which is a pigment, was produced. From these results, it was considered that light having a wavelength of 6.06 μm had an action similar to that of a protease.
FIG. 5 shows the result of irradiation at a wavelength of 6.16 μm. FIG. 4a is the same fluorescence microscope image as before, and FIG. 4b is the image of the same site with white visible transmitted light. The average power of the infrared light was 13 mW, and irradiation was performed for a total of 26 mJ for 2 seconds. The irradiation spot diameter was about 122 μm, and was similarly applied to the center of the figure. The power density at the peak at the irradiation spot position was about 5.1 GW / cm 2 . In the center of FIG. 4b, a crystal whose shape was changed was observed as an irradiation mark, but in FIG. 4a, the fluorescence was weak, and no fluorescence was observed around the crystal. Therefore, it was considered that light having a wavelength of 6.16 μm did not have a proteolytic enzyme-like effect, and the effect was significantly different even at a difference in wavelength of 0.1 μm.
FIG. 5 shows the result of irradiation at a wavelength of 6.45 μm. FIG. 5a is the same fluorescence microscope image as before, and FIG. 5b is the image of the same site with white visible transmitted light. The average power of the infrared light was 10 mW, and irradiation was performed for a total of 20 mJ for 2 seconds. The irradiation spot diameter was about 107 μm, and was similarly applied to the center of the figure. The power density at the peak at the irradiation spot position was about 4.6 GW / cm 2 . Crystals broken by the laser irradiation were observed in the center of FIG. 5B, but the fluorescence shown in FIG. 4A was not observed in FIG. 5A. Therefore, although light having a wavelength of 6.45 μm has a nonspecific action, it is considered that it does not have an action like a protease that cuts only a specific bond.
[0024]
According to the present invention, a specific bond is cleaved by selective excitation in accordance with the molecular vibration of an organic compound, whereby the organic compound can be decomposed, its structure is modified, and its derivative is formed. It is possible to control the photochemical reaction spatially by using it, and the reaction is very short-time. Benefits are obtained.
[Brief description of the drawings]
FIG. 1 is a schematic view of a photochemical organic compound bond breaking device according to an embodiment.
FIG. 2 is a graph of an infrared absorption spectrum of a benzyloxycarbonyl-L-arginine derivative of rhodamine 110.
FIG. 3 is a photomicrograph of a portion irradiated with a wavelength of 6.06 μm.
FIG. 4 is a micrograph of an irradiation site at a wavelength of 6.16 μm.
FIG. 5 is a micrograph of an irradiation site at a wavelength of 6.45 μm.
[Explanation of symbols]
DESCRIPTION OF SYMBOLS 1 Infrared light which is a parallel ray guided from a free electron laser device 2 Condensing concave mirror 3 2D optical scanner 4 Sample stand 5 Monitor camera device 6 Television monitor device

Claims (17)

光を照射することにより行う有機化合物の結合の切断による、有機化合物の分解、構造改変、誘導体生成の方法。A method for decomposing an organic compound, modifying a structure, and forming a derivative by breaking a bond of the organic compound by irradiating light. 請求項1に記載の結合切断を空間的に制御する光走査系並びに集光光学系から成る装置。An apparatus comprising a light scanning system and a light condensing optical system for spatially controlling the disconnection according to claim 1. 光を照射することにより行う有機化合物のペプチド結合及び擬ペプチド結合の切断による、有機化合物の分解、構造改変、誘導体生成の方法。A method for decomposing an organic compound, modifying a structure, and forming a derivative by cleavage of a peptide bond and a pseudo-peptide bond of the organic compound by irradiation with light. ペプチド結合及び擬ペプチド結合を含む複数の結合により構成される有機化合物において、光を照射による作用が特定の結合部位特異的であり、その結果として特定の結合部位のみを切断し特定の産物を得る方法。In an organic compound composed of a plurality of bonds including a peptide bond and a pseudo-peptide bond, the action of irradiation with light is specific to a specific binding site, and as a result, only a specific binding site is cleaved to obtain a specific product Method. ペプチド分子及びその誘導体分子内の分解部位を特定した請求項4に記載の光による分解方法。The method for decomposing by light according to claim 4, wherein a decomposition site within the peptide molecule and its derivative molecule is specified. たんぱく質及びその誘導体分子内の分解部位を特定した請求項4に記載の光による分解方法。The method for decomposing by light according to claim 4, wherein a decomposition site in the molecule of the protein or its derivative is specified. 物質が薬物である分子内の分解部位を特定した請求項4に記載の光による分解方法。The method for decomposing by light according to claim 4, wherein a decomposition site in the molecule in which the substance is a drug is specified. ペプチド分子及びその誘導体における光照射により制御される請求項4に記載の構造変化並びに誘導体の生成方法。5. The method according to claim 4, wherein the peptide molecule and the derivative thereof are controlled by light irradiation. たんぱく質及びその誘導体における、光照射により制御される請求項4に記載の構造変化並びに誘導体の生成方法。The method for producing a structural change and a derivative according to claim 4, wherein the protein and the derivative thereof are controlled by light irradiation. 物質が薬物である光照射により制御される請求項4に記載の構造変化並びに誘導体の生成方法。5. The method according to claim 4, wherein the substance is controlled by light irradiation, which is a drug. 光が赤外光である請求項1及び3〜10に記載の方法。The method according to claims 1 and 3 to 10, wherein the light is infrared light. 光が赤外光である請求項2に記載の装置。3. The device according to claim 2, wherein the light is infrared light. 分子振動に共鳴する波長の光の照射を用いることに特徴を有する、光照射により分子に伝達されるエネルギーの化合物分子内の分布を制御する請求項1に記載の方法。The method according to claim 1, wherein the distribution of energy transmitted to the molecule by the light irradiation in the compound molecule is controlled by using irradiation with light having a wavelength that resonates with molecular vibration. 光の波長が有機化合物の特定の分子振動に共鳴する波長の近傍である請求項1及び3〜11、13のいずれかに記載の方法。The method according to claim 1, wherein the wavelength of the light is near a wavelength that resonates with a specific molecular vibration of the organic compound. 光の波長が有機化合物の特定の分子振動に共鳴する波長の近傍である請求項2に記載の装置。3. The device according to claim 2, wherein the wavelength of the light is near a wavelength that resonates with a specific molecular vibration of the organic compound. ペプチド結合におけるアミドI吸収帯である波長5.9から6.2μm近傍の波長の光を用いた請求項1及び3〜11、13、14のいずれかに記載の方法。The method according to any one of claims 1 and 3 to 11, 13 and 14, wherein light having a wavelength of about 5.9 to 6.2 µm, which is an amide I absorption band in the peptide bond, is used. 光が断続的なパルス光である請求項1及び3〜11、13、14、16のいずれかに記載の方法。The method according to claim 1, wherein the light is an intermittent pulse light.
JP2002266125A 2002-08-07 2002-08-07 Method for photochemical scission of peptide bond and apparatus therefor Pending JP2004067657A (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2002266125A JP2004067657A (en) 2002-08-07 2002-08-07 Method for photochemical scission of peptide bond and apparatus therefor

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2002266125A JP2004067657A (en) 2002-08-07 2002-08-07 Method for photochemical scission of peptide bond and apparatus therefor

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2004067657A true JP2004067657A (en) 2004-03-04

Family

ID=32024730

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2002266125A Pending JP2004067657A (en) 2002-08-07 2002-08-07 Method for photochemical scission of peptide bond and apparatus therefor

Country Status (1)

Country Link
JP (1) JP2004067657A (en)

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006312147A (en) * 2005-05-09 2006-11-16 Toyota Motor Corp Decomposition method and decomposition apparatus of targeted substance
WO2007052778A1 (en) * 2005-11-02 2007-05-10 Buhei Kono Method of promoting reaction of organic substance or inorganic substance
JP5857194B2 (en) * 2013-08-06 2016-02-10 パナソニックIpマネジメント株式会社 Concentrator for photochemical reactor
US9493817B2 (en) 2007-03-05 2016-11-15 Genesis Research Institute, Inc. Decomposition method and decomposition apparatus for nucleic acid polymer
CN113403359A (en) * 2021-06-17 2021-09-17 上海理工大学 Application method of permeable infrared light in biomolecule synthesis

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006312147A (en) * 2005-05-09 2006-11-16 Toyota Motor Corp Decomposition method and decomposition apparatus of targeted substance
US8986510B2 (en) 2005-05-09 2015-03-24 Genesis Research Institute, Inc. Method of decomposing target and decomposition apparatus
WO2007052778A1 (en) * 2005-11-02 2007-05-10 Buhei Kono Method of promoting reaction of organic substance or inorganic substance
US9493817B2 (en) 2007-03-05 2016-11-15 Genesis Research Institute, Inc. Decomposition method and decomposition apparatus for nucleic acid polymer
JP5857194B2 (en) * 2013-08-06 2016-02-10 パナソニックIpマネジメント株式会社 Concentrator for photochemical reactor
JPWO2015019553A1 (en) * 2013-08-06 2017-03-02 パナソニックIpマネジメント株式会社 Concentrator for photochemical reactor
CN113403359A (en) * 2021-06-17 2021-09-17 上海理工大学 Application method of permeable infrared light in biomolecule synthesis

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US9784682B2 (en) Fluorescence microscope in microwave cavity
US6573491B1 (en) Electromagnetic energy driven separation methods
TW200931505A (en) Laser annealing method and device therefor
JP4478184B2 (en) Laser cleaving method and laser processing apparatus
JP4452278B2 (en) Probe device
Wu et al. Dual-band moiré metasurface patches for multifunctional biomedical applications
Cavicchi et al. Single laser pulse effects on suspended-Au-nanoparticle size distributions and morphology
JP2004067657A (en) Method for photochemical scission of peptide bond and apparatus therefor
JP2007301624A (en) Cleaving apparatus and cleaving method
JP2008147643A (en) Beam homogenizer, laser irradiation apparatus, and laser irradiation method
JP2006131443A (en) Method and apparatus for cutting brittle material
JP3020453B2 (en) Light microscope
JP3186567B2 (en) X-ray laser generator and method
EP0878841A3 (en) Method and apparatus for imaging semiconductor devices
JP2002523205A (en) Foam control
JP2001038482A (en) Laser processing method
JP2003167354A (en) Optical fabrication device and optical fabrication method for fabrication of inorganic transparent material by light-patterning
Friedenauer et al. Efficient Synthesis of Submicrometer‐Sized Active Pharmaceuticals by Laser Fragmentation in a Liquid‐Jet Passage Reactor with Minimum Degradation
JP5188172B2 (en) Substance adjustment equipment
CN107790894B (en) A kind of laser cutting system and method
JP4355593B2 (en) Terahertz electromagnetic wave generation irradiation detector
JP2004317646A (en) Microscope
Bajdor et al. Ultraviolet (239 nm) resonance Raman spectroscopy of an enzyme–substrate intermediate of papain
JP3273815B2 (en) Spectrometry
JPH0927484A (en) Monitoring method for etching by-product and its device