JP2002142779A - Recombinant microorganism having action of decreasing malodor - Google Patents

Recombinant microorganism having action of decreasing malodor

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JP2002142779A
JP2002142779A JP2000386115A JP2000386115A JP2002142779A JP 2002142779 A JP2002142779 A JP 2002142779A JP 2000386115 A JP2000386115 A JP 2000386115A JP 2000386115 A JP2000386115 A JP 2000386115A JP 2002142779 A JP2002142779 A JP 2002142779A
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sqr
gene
recombinant microorganism
activity
promoter
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Shigeki Kobayashi
茂樹 小林
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To construct a stable recombinant microorganism by transducing, into a microorganism, a gene capable of degrading hydrogen sulfide that is a typical compound that may cause malodor of feces, and to continuously decrease the malodor of feces by orally administrating the microorganism to an animal to make the microorganism inhabit in its intestine. SOLUTION: The objective recombinant microorganism having an activity of removing hydrogen sulfide was created, wherein sulfide-quinone oxidoreductase gene sqr is operably integrated into a gene region, which does not give any effect to its proliferation by a promoter of Escherichia coli, of the chromosome of E. coli.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、家畜、家禽、ある
いはペットの糞便の悪臭を低減する遺伝子組換え微生物
の作出に関する。より詳しくは、糞便中の悪臭の主要原
因である硫化水素を除去させることにより、糞便の悪臭
を低減し、環境の改善を行う遺伝子組換え微生物の作出
に関する。
[0001] The present invention relates to the production of a genetically modified microorganism that reduces the odor of feces of livestock, poultry, or pets. More specifically, the present invention relates to the production of genetically modified microorganisms that reduce the odor of feces and improve the environment by removing hydrogen sulfide, which is a major cause of odors in feces.

【0002】[0002]

【従来の技術】近年、畜産業界においては、ウシ、ブ
タ、ニワトリ等の家畜や家禽の生産性向上のため、飼育
環境が過密状態になってきている。このような状況下で
は、家畜や家禽の***する糞便による悪臭が生活環境面
から大きな問題となっている。また、近年、ペットブー
ムから、一般家庭では、ペットを室内で飼育することが
盛んに行われるようになってきており、ペットの***す
る糞便の悪臭が問題となっている。
2. Description of the Related Art In recent years, in the livestock industry, the breeding environment has become overcrowded in order to improve the productivity of livestock and poultry such as cattle, pigs and chickens. Under such circumstances, odor caused by feces excreted by livestock and poultry is a serious problem in terms of living environment. In recent years, since the pet boom, in general households, pets have been actively bred indoors, and the odor of feces excreted by pets has become a problem.

【0003】糞便の悪臭の原因となる主要な化合物は、
腸内に生息する有害菌によるタンパクの腐敗発酵などで
生成されるアンモニア、硫化水素、短鎖脂肪酸などであ
る(Shahak,Y.et al.:FEBS Le
tt.,299:127−130,1992)。したが
って、動物の腸内容物中に残留するこれらの化合物を人
為的に分解することができれば、畜産における上記悪臭
を低減化する有力な手段となる。そこで、硫化物−キノ
ン酸化還元酵素(sulfide−quinone o
xidoreductase:SQR)の遺伝子sqr
およびユビキノン−8(UQ−8)遺伝子を大腸菌E.
coliの細胞質中に導入して発現させ、SQR活性硫
化物を高める試みがなされた(Shibata,H.e
t al.:J.Biosci.Bioengin.,
88:244−249,1999)。しかしながら、細
胞内での一連の電子伝達反応を可能とする酵素的条件が
満足されるべきであるという問題が生じた。
[0003] The main compounds responsible for the fecal odor are:
Ammonia, hydrogen sulfide, short-chain fatty acids, and the like produced by spoilage fermentation of proteins by harmful bacteria living in the intestine (Shahak, Y. et al .: FEBS Le).
tt. , 299: 127-130, 1992). Therefore, if these compounds remaining in the intestinal contents of animals can be artificially decomposed, it will be an effective means for reducing the above-mentioned odor in animal husbandry. Thus, sulfide-quinone oxidoreductase (sulfide-quinone o)
xidoreductase (SQR) gene sqr
And the ubiquinone-8 (UQ-8) gene were transformed into E. coli E. coli .
Attempts have been made to increase the SQR active sulfide by introducing it into the E. coli cytoplasm and expressing it (Shibata, He.
t al. : J. Biosci. Bioengin. ,
88: 244-249, 1999). However, a problem has arisen in that enzymatic conditions that allow a series of electron transfer reactions in cells must be satisfied.

【0004】[0004]

【発明が解決しようとする課題】本発明は、糞便の悪臭
の原因となる代表的な化合物であるアンモニア、硫化水
素などを分解する能力をもつ遺伝子を微生物に導入して
安定性のある組換え微生物(以下「組換え体」ともい
う)を構築すること及び該微生物を経口的に動物に与え
て腸内に定住させることにより、糞便の悪臭を永続的に
低減させ、併せて腸内菌叢をも改善することを課題とす
る。
DISCLOSURE OF THE INVENTION The present invention relates to a stable recombinant recombinant gene obtained by introducing a gene capable of decomposing ammonia, hydrogen sulfide, and the like, which are typical compounds that cause odor in feces. By constructing microorganisms (hereinafter also referred to as "recombinants") and orally giving the microorganisms to animals and allowing them to settle in the intestine, the odor of feces is permanently reduced, and the intestinal flora The task is to improve

【0005】[0005]

【課題を解決するための手段】その最初のステップとし
て、動物腸管内に残存する悪臭物質の一つである硫化水
素の除去を試みた。紅色非硫黄細菌の一つであるRho
dobacter capsulatus(Schut
z,M.et al.:J.Biol.Chem.,2
72:9890−9894,1997)由来のsqr遺
伝子を、本発明の組換え体の構築に用いた。R.cap
sulatusから単離したsqr遺伝子は、1,27
5bpのオープンリーデーイングフレームをもち、42
5アミノ酸からなる分子量55kDaのSQRをコード
する(Schuetz,M.etal.:J.Bio
l.Chem.,272:9890−9894,199
717;Schuetz,M.et al.:J.Ba
cteriol.,6516−6523,1999 2
3)。このsqr遺伝子をR.capsulatus
ら単離し、その多数あるいは数個を、大腸菌の細胞質
内、あるいは染色体中にプラスミドベクターを用いて導
入した。
As the first step, an attempt was made to remove hydrogen sulfide, one of the malodorous substances remaining in the animal intestinal tract. Rho , one of the red non-sulfur bacteria
doctor capsulatus (Schut
z, M .; et al. : J. Biol. Chem. , 2
72: 9890-9894, 1997) was used to construct the recombinant of the present invention. R. cap
The sqr gene isolated from Sulatus was 1,27
It has an open reading frame of 5 bp and 42
It encodes an SQR consisting of 5 amino acids and having a molecular weight of 55 kDa (Schuetz, M. et al .: J. Bio).
l. Chem. , 272: 9890-9894, 199.
717; Schuetz, M .; et al. : J. Ba
cterol. , 6516-6523, 1999 2
3). This sqr gene was transformed into R. Capsulatus was isolated, and many or several of them were introduced into the cytoplasm of Escherichia coli or into the chromosome using a plasmid vector.

【0006】その結果、SQR活性は、lacプロモー
ターあるいはtacプロモーターを伴ったsqr遺伝子
を含む組換え体、並びに同様のプロモーターを伴ったs
qr遺伝子2〜3個を染色体中に含む組換え体におい
て、かなり上昇した。これらの組換え体において、ta
cプロモーターによるSQR活性発現は、lacプロモ
ーターのそれより強力であった。硫化物除去度合いは、
SQR酵素活性の上昇に伴い直線的に増加した。この直
線性は、硫化物除去が700n mol/mg菌体タン
パク/分を超えると失われた。同じ反応期間において、
酸素消費量度合もSQR酵素活性の上昇に伴い増加し
た。
[0006] As a result, the SQR activity was increased by the recombinant containing the sqr gene with the lac promoter or the tac promoter, as well as by the sqr gene with the similar promoter.
It was significantly increased in recombinants containing 2-3 qr genes in the chromosome. In these recombinants, ta
SQR activity expression by the c promoter was stronger than that of the lac promoter. The degree of sulfide removal is
It increased linearly with increasing SQR enzyme activity. This linearity was lost when sulfide removal exceeded 700 nmol / mg cell protein / min. During the same reaction period,
Oxygen consumption also increased with increasing SQR enzyme activity.

【0007】これらの結果を総合すると、染色体内にt
acプロモーターを伴って組み込まれた2〜3コピーの
sqr遺伝子が、硫化物除去及び組換え体の生育に対し
て最も好ましいものであった。組換え体を160代まで
培養した結果、染色体内に、lacプロモーターと共に
sqr遺伝子を2コピー組入れた組換え体WL2、3個
組入れた組換え体WL3、並びにtacプロモーターと
共にsqr遺伝子を2個組入れた組換え体WT2は、初
代培養と同様のSQR活性が保持されていた。sqr遺
伝子の組込まれたプラスミドを多数(それぞれ約300
個と20個)含むWL300及びWT20は、SQR活
性が検出限界以下に低下した。
[0007] When these results are combined, t
A few copies of the sqr gene integrated with the ac promoter were most preferred for sulfide removal and recombinant growth. As a result of culturing the recombinant up to 160 generations, a recombinant WL2 in which two copies of the sqr gene were incorporated together with the lac promoter, a recombinant WL3 in which three copies were incorporated, and two sqr genes together with the tac promoter were introduced into the chromosome. The recombinant WT2 had the same SQR activity as that of the primary culture. A large number of plasmids incorporating the sqr gene (each about 300
And WT20), the SQR activity decreased below the detection limit.

【0008】すなわち、本発明は、(1) 単離された
1つ以上の硫化物−キノン酸化還元酵素遺伝子sqrが
微生物の染色体中の生育に影響しない遺伝子領域に該微
生物のプロモーターで作動可能に組込まれた硫化水素除
去活性を有する組換え微生物、(2) 生育に影響しな
い遺伝子領域がLacZ遺伝子である(1)の組換え微
生物、(3) プロモーターがtacプロモーターであ
る(1)の組換え微生物、(4) tacプロモーター
で作動可能な少なくとも2コピーのsqr遺伝子をもつ
(1)または(3)の組換え微生物、(5) sqr遺
伝子が紅色非硫黄細菌由来である(1)の組換え微生
物、(6) 紅色非硫黄細菌がRhodobacter
capsulatusである(5)の組換え微生物、
(7) 微生物が大腸菌W3110株である(1)の組
換え微生物、(8) (1)〜(7)のいずれかの組換
え微生物を有効成分として含む家畜の***糞の悪臭低減
作用を有する飼料、(9) 家畜がブタである(8)の
飼料、(10)家畜の***糞の悪臭を低減する作用を有
する飼料を製造するための(1)〜(8)のいずれかの
組換え微生物の使用、(11) 家畜がブタである(1
0)の使用、からなる。
[0008] That is, the present invention provides (1) one or more isolated sulfide-quinone oxidoreductase genes sqr that can be operable with a promoter of a microorganism at a gene region that does not affect the growth in the chromosome of the microorganism. (2) a recombinant microorganism having a LacZ gene in a gene region that does not affect growth, (3) a recombinant microorganism having a promoter that is a tac promoter, A microorganism, (4) a recombinant microorganism of (1) or (3) having at least two copies of the sqr gene operable by a tac promoter, and (5) a recombinant of (1) wherein the sqr gene is derived from a red non-sulfur bacterium. Microorganisms, (6) Red non-sulfur bacteria are Rhodobacter
the recombinant microorganism of (5), which is capsulatus ;
(7) The recombinant microorganism of (1), wherein the microorganism is Escherichia coli W3110 strain, and (8) an effect of reducing the odor of excreted feces of livestock containing any of the recombinant microorganisms of (1) to (7) as an active ingredient. Feed, (9) the feed of (8), wherein the livestock is a pig, and (10) the recombinant of any one of (1) to (8) for producing a feed having an effect of reducing bad smell of excreted feces of livestock Use of microorganisms, (11) Domestic animals are pigs (1
0).

【0009】[0009]

【発明の実施の形態】本発明に用いるsqr遺伝子を含
む染色体DNAは、SQR活性を示す微生物から、常法
により単離することができる(Shibata,H.e
t al.:J.Biosci.Bioengin.,
88:244−249,1999)。上記微生物として
は、例えば細菌においては、P.denitrific
ans(Schneider,A.and Fried
rich,C.G.FEBSLett.,350:61
−65,1994)、C.vinosum(Reina
rtz,M.et al.:Arch.Microbi
ol.,170:59−68,1998)、C.lim
icola(Shahak,Y.et al.:FEB
S Lett.,299:127−130,1992)
等が挙げられる。
BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION The chromosomal DNA containing the sqr gene used in the present invention can be isolated from a microorganism exhibiting SQR activity by a conventional method (Shibata, He.
t al. : J. Biosci. Bioengin. ,
88: 244-249, 1999). Examples of the microorganisms include, for example, P. denitrific
and (Schneider, A. and Fried
rich, C.E. G. FIG. FEBS Lett. , 350: 61
-65, 1994), C.I. vinosum (Reina
rtz, M .; et al. : Arch. Microbi
ol. , 170: 59-68, 1998), C.I. lim
icola (Shahak, Y. et al .: FEB
S Lett. , 299: 127-130, 1992).
And the like.

【0010】単離したsqr遺伝子を含む染色体DNA
を鋳型としてPCRプライマー反応を行いsqr遺伝子
を増幅する。PCR用のセンス、アンチセンスプライマ
ーの設計は、サブクローニングに便利なように、制限酵
素サイトを付加しておく。
Chromosomal DNA containing the isolated sqr gene
Is used as a template to perform a PCR primer reaction to amplify the sqr gene. For design of sense and antisense primers for PCR, restriction enzyme sites are added in advance for convenient subcloning.

【0011】本発明のsqr遺伝子DNA配列は、一例
として、文献(Schuetz,M.et al.:
J.Biol.Chem.,272:9890−989
4,1997)に示すSQRをコードするDNA配列で
示されるが、このDNA配列と機能的に等価なDNA配
列も本発明に含まれる。“機能的に等価なDNA配列”
という用語は、SQRの生物学的機能、例えば、硫化物
除去活性という機能を有する酵素を発現するDNA配列
を意味する。例えば、SQRの生物学的機能に影響しな
い変異を上記DNA配列に導入することができる。一般
的に、ポリペプチドをコードする核酸配列は、発現産物
の機能に影響を与えずに極めて多様に変更できる。実質
的な相同性(全体の50%を超える相同性を有するアミ
ノ酸配列)を有するアミノ酸配列は、既に同一の機能を
発揮し得ると考えられる。
The DNA sequence of the sqr gene of the present invention is described, for example, in the literature (Schuetz, M. et al .:
J. Biol. Chem. , 272: 9890-989.
4, 1997), and a DNA sequence functionally equivalent to this DNA sequence is also included in the present invention. "Functionally equivalent DNA sequence"
The term refers to a DNA sequence that expresses an enzyme that has the biological function of SQR, for example, sulfide removal activity. For example, mutations that do not affect the biological function of SQR can be introduced into the DNA sequence. Generally, the nucleic acid sequence encoding a polypeptide can vary widely without affecting the function of the expression product. It is thought that an amino acid sequence having substantial homology (an amino acid sequence having a homology of more than 50% of the whole) can already exert the same function.

【0012】近年、インターネット上で、種々の配列を
解析するためのソフトが公開されており、それらを利用
することにより、特定の配列が、機能的に等価であるの
に十分な相同性を有するか否かを予測することが可能と
なってきている。したがって、当業者であれば、sqr
遺伝子の特定の部分を、SQRと機能的に等価な発現産
物を得られるように改変することが可能である。
In recent years, software for analyzing various sequences has been released on the Internet, and by using them, specific sequences have sufficient homology to be functionally equivalent. It has become possible to predict whether or not. Therefore, those skilled in the art will understand that sqr
Certain portions of the gene can be modified to obtain an expression product that is functionally equivalent to SQR.

【0013】本発明の硫化物除去活性を有する微生物
は、SQR活性を有する遺伝子と該遺伝子を作動させる
プロモーターを、該微生物の生育に影響しない染色体中
に含む。受容株の染色体外で複製できないプラスミド
は、それらが宿主染色体と相同配列を有する場合、結果
として、その染色体に再結合することが知られている
(Hamilton,C.M.et al.:J.ba
cteriol,171:4617−4622,198
9)。
[0013] The microorganism having sulfide removal activity of the present invention contains a gene having SQR activity and a promoter that activates the gene in a chromosome that does not affect the growth of the microorganism. Plasmids that cannot replicate outside the chromosome of the recipient strain are known to rejoin the chromosome if they have a homologous sequence to the host chromosome (Hamilton, CM et al .: J. Am. ba
cteriol, 171: 4617-4622,198
9).

【0014】このようなことから、対立する遺伝子変換
とプラスミド除去を選択することが可能な急激な温度変
化に基づく操作が可能な発現ベクターが用いられる。例
えばE.coliのβ−ガラクトシダーゼ遺伝子(La
cZ遺伝子)中にsqr遺伝子を組み込むためのベクタ
ーとして、pBRINT−Ts(Borgne,S.
L.et al.:Gene,223:213−21
9,1998)を用いた場合を例に説明する。これらの
大腸菌への導入は、例えば、Hanahanの方法
(D.Hanahan,J.Mol.Biol.,16
6:557,1983)、あるいはエレクトロポレーシ
ョン法(W.J.Dower,et al.:Nucl
eic Acids Res.,16:6127,19
88)等による。
[0014] In view of the above, an expression vector which can be operated based on a rapid change in temperature and which can select between opposing gene conversion and plasmid removal is used. For example, E. coli β-galactosidase gene (La
As a vector for incorporating the sqr gene into the cZ gene, pBRINT-Ts (Borgne, S.L.
L. et al. : Gene, 223: 213-21
9, 1998) will be described as an example. The introduction into Escherichia coli is performed, for example, by the method of Hanahan (D. Hanahan, J. Mol. Biol., 16).
6: 557, 1983) or electroporation (WJ Dower, et al .: Nucl.
eic Acids Res. , 16: 6127, 19
88).

【0015】このベクターは、LacZ遺伝子、選択マ
ーカー(抗生物質耐性)遺伝子としてカナマイシン遺伝
子(Km)、クロラムフェニコール(Cm)、あるいは
ゲンタマイシン(Gm)、そして温度感受性レプリコン
Ts、及びマルチクローニングサイト(MCS)を含
む。これらのベクターの特徴として、1) 染色体への
組込み場所がLacZ遺伝子中であり、X−Gal及び
IPTGを含む固体培地でのブルーホワイトセレクショ
ンが可能である;2) MCSが抗生物質耐性遺伝子カ
セット(Km、Cm、あるいはGm)に隣接しており、
クローン化された断片の挿入を容易にモニターできる;
3) ベクターのマーカーとしてカルベニシリン(C
b)を有する;4) pBR322のoriのかわり
に、30℃で複製するが37℃では複製できないpSC
101由来の温度感受性(Ts)レプリコンを有する、
等が挙げられる。pBRINT−Ts誘導体中のLac
Z遺伝子断片及びTsレプリコンは、染色体中のLac
Z遺伝子への外来遺伝子組込みを直接選択することを可
能とし、続いて培養温度を44℃に上げることにより、
染色体外のプラスミドを除去できる。
This vector contains the LacZ gene, kanamycin gene (Km), chloramphenicol (Cm) or gentamicin (Gm) as a selectable marker (antibiotic resistance) gene, temperature-sensitive replicon Ts, and a multiple cloning site ( MCS). The characteristics of these vectors are: 1) the integration site into the chromosome is in the LacZ gene, and blue-white selection on a solid medium containing X-Gal and IPTG is possible; 2) MCS is an antibiotic resistance gene cassette ( Km, Cm, or Gm)
The insertion of the cloned fragment can be easily monitored;
3) Carbenicillin (C
4) pSC instead of the ori of pBR322, which replicates at 30 ° C. but cannot replicate at 37 ° C.
Having a temperature sensitive (Ts) replicon from 101,
And the like. Lac in pBRINT-Ts derivative
The Z gene fragment and the Ts replicon are
By allowing direct selection of foreign gene integration into the Z gene, and subsequently increasing the culture temperature to 44 ° C.,
Extrachromosomal plasmids can be removed.

【0016】すなわち、形質転換体は、ベクター部分に
存在するCbに対する耐性、およびLacZ遺伝子中に
挿入された抗生物質(Km、Cm、あるいはGm)に対
する耐性で選択する。X−Gal、IPTG、及び適切
な選択物質(抗生物質)を含むプレート上、44℃でイ
ンキュベーションする。抗生物質耐性の大きな白いコロ
ニーが出現するが、これは、染色体に存在するLacZ
遺伝子中にプラスミドが組込まれたことを示している。
一つの組換え現象においては、LacZ遺伝子中に挿入
された耐性マーカーだけでなくベクター部分でコードさ
れる耐性マーカーにも耐性を示すクローンを産生するの
に対し、対立的な組換え現象においては、LacZ遺伝
子中に挿入された耐性マーカーを示すコロニー産生しか
示さないので、白いコロニーについて、Cbに対する感
受性を調べることが必要である。
That is, transformants are selected based on the resistance to Cb present in the vector portion and the resistance to an antibiotic (Km, Cm or Gm) inserted into the LacZ gene. Incubate at 44 ° C. on a plate containing X-Gal, IPTG, and the appropriate selection agent (antibiotic). Large colonies of antibiotic resistance appear, which are due to the LacZ present on the chromosome.
This indicates that the plasmid was integrated into the gene.
In one recombination event, a clone is produced that is resistant not only to the resistance marker inserted in the LacZ gene but also to the resistance marker encoded in the vector portion, whereas in an allelic recombination event, It is necessary to examine the susceptibility to Cb on white colonies, as they only show colony production showing the resistance marker inserted in the LacZ gene.

【0017】上記で選択したコロニーも、複製可能な許
容温度30℃でCbに対して感受性であり、これは、プ
ラスミドが失われたことを示している。菌体中にこれら
のベクターが存在しないことは、これらのコロニーから
プラスミドを単離し、アガロースゲルで展開しエチジウ
ムブロミド(EtdBr)で染色することにより確認す
ることができる。さらに、sqr遺伝子が、染色体に存
在するLacZ遺伝子へ適切に組込まれたかどうかは、
形質転換体からDNAを抽出し、制限酵素で断片化した
後、電気泳動で分離し、sqr遺伝子プローブを用いた
サザンハイフリダイゼーションで確認することができ
る。
The colonies selected above are also sensitive to Cb at the permissive temperature of 30 ° C., which indicates that the plasmid has been lost. The absence of these vectors in the cells can be confirmed by isolating the plasmid from these colonies, developing on an agarose gel, and staining with ethidium bromide (EtdBr). Furthermore, whether the sqr gene was properly integrated into the LacZ gene present on the chromosome,
DNA can be extracted from the transformant, fragmented with restriction enzymes, separated by electrophoresis, and confirmed by Southern hybridization using an sqr gene probe.

【0018】この発明で用いた相同組換えでは、sqr
遺伝子は、E.coli染色体のlacZ遺伝子に組込
まれたので、染色体に存在するその他の遺伝子の破壊を
避けることができる。さらに、組込まれた遺伝子は安定
的に保持される。形質転換に用いる宿主大腸菌として
は、上記のW3110株の他に、相同組換え遺伝子re
cAをもつrecA1株DH1、DH5、DH10B、
JM109、あるいはXL−Blueを用いてもよい。
In the homologous recombination used in the present invention, sqr
The gene is E. coli. Since it was integrated into the lacZ gene of the E. coli chromosome, the disruption of other genes present on the chromosome can be avoided. Further, the integrated gene is stably retained. As the host E. coli used for the transformation, in addition to the above-mentioned strain W3110, the homologous recombination gene re
recA1 strains DH1, DH5, DH10B with cA,
JM109 or XL-Blue may be used.

【0019】ところで、ヒトや動物の腸内には100
兆、100種に及ぶ腸内菌叢(腸内フローラ)を構成し
ている。しかし、大腸菌は、腸内細菌としては主要なも
のではない。そこで、sqr遺伝子を組込む対象として
腸内常在細菌はより効果的である。ラクトースオペロン
をもつ腸内常在細菌は、本発明のsqr遺伝子組込み対
象の微生物として好適である。制限系の問題があるが原
理的には可能である。したがって本発明の組換え体は、
これらの腸内常在細菌を含む。
By the way, in human and animal intestines, 100
It constitutes trillion and 100 species of intestinal flora (intestinal flora). However, E. coli is not a major intestinal bacterium. Thus, intestinal resident bacteria are more effective as targets for incorporating the sqr gene. Intestinal resident bacteria having a lactose operon are suitable as the microorganisms into which the sqr gene of the present invention is to be integrated. There is a restriction system problem, but it is possible in principle. Therefore, the recombinant of the present invention
Including these intestinal resident bacteria.

【0020】この発明では、複数コピーのsqr遺伝子
の染色体への組込み、SQR活性と硫化物除去との間の
相関、および染色体に組込まれたsqr遺伝子の安定性
が明らかにされた。しかしながら、Km−遺伝子がDN
A配列中に残された。抗生物質に耐性の遺伝子を除くに
は、例えばFRT−組換え酵素(フリッパーゼ)が導入
される組換えシステム(Morales,F.M.et
al.:J.Bacteriol.,181:714
3−7148,1999)を有効に利用することができ
る。
In this invention, the integration of multiple copies of the sqr gene into the chromosome, the correlation between SQR activity and sulfide removal, and the stability of the chromosome-integrated sqr gene have been elucidated. However, the Km-gene is DN
Left in the A sequence. To remove genes resistant to antibiotics, for example, a recombination system (Morales, FM et al.) Into which FRT-recombinase (flippase) is introduced.
al. : J. Bacteriol. , 181: 714
3-7148, 1999) can be effectively used.

【0021】本発明では、腸内内容物に残留する主要な
悪臭物質の一つである硫化水素をターゲットとしたが、
もう一つの主要な悪臭物質あるアンモニアの酸化酵素遺
伝子(amoA、amoB(Mctavish,H.e
t al.:J.Bacteriol.,175:24
36−2444,1993)、amoC(Klotz,
M.G.,et al.:FEMS Microbio
l.Lett.,150:65−73,1997)、h
ao(Sayavedra−soto,L.A.et
al.:J.Bacteriol.,176:504−
510,1994))の組換え体を、本発明の方法に基
づき作出することは、当業者であれば可能である。その
ための技術的修飾は本発明に含まれる。したがって、本
発明はアンモニアの酸化酵素遺伝子を染色体中に含む組
換え体も含む。
In the present invention, hydrogen sulfide which is one of the main malodorous substances remaining in the intestinal contents was targeted.
Another major malodorous substance is the oxidase gene for ammonia (amoA, amoB (Mctavish, He.
t al. : J. Bacteriol. , 175: 24
36-2444, 1993), amoC (Klotz,
M. G. FIG. , Et al. : FEMS Microbio
l. Lett. , 150: 65-73, 1997), h
ao (Sayavedra-soto, LA et al.
al. : J. Bacteriol. , 176: 504-
510, 1994)) can be produced by a person skilled in the art based on the method of the present invention. Technical modifications therefor are included in the present invention. Therefore, the present invention also includes a recombinant containing the oxidase gene for ammonia in the chromosome.

【0022】培養液中の細菌は、常法(例えば、遠心分
離)にしたがって分離・洗浄する。分離した菌体濃縮液
は、大腸菌10〜10/gを含み、飼料に、体重1
kg当たり1日0.1〜10mL、好ましくは1〜4m
L添加する。また、保護剤(例えば、スキムミルク、ラ
クトース、デンプン等)を加えた後、pHを調整し、真
空凍結乾燥機等で水分を4%以下に乾燥した菌体製剤と
して用いてもよい。該製剤は粉状、顆粒状、ペレット
状、あるいはタブレット状とすることができる。
The bacteria in the culture solution are separated and washed according to a conventional method (eg, centrifugation). Separated cells concentrate comprises E. coli 10 7 ~10 9 / g, the feed, body weight
0.1 to 10 mL / kg per day, preferably 1 to 4 m
Add L. Alternatively, after adding a protective agent (for example, skim milk, lactose, starch, etc.), the pH may be adjusted, and the resultant may be used as a cell preparation prepared by drying the water to 4% or less with a vacuum freeze dryer or the like. The preparation can be in the form of powder, granules, pellets, or tablets.

【0023】本発明の組換え菌は、そのまま家畜用飼料
に添加してもよく、あるいは他の栄養源、例えば、オリ
ゴ糖、ゼオライト、カテキン、ポリフェノール等他の消
臭性物質と併用してもよい。
The recombinant bacterium of the present invention may be added to livestock feed as it is, or may be used in combination with other nutrients such as oligosaccharides, zeolites, catechins and polyphenols. Good.

【0024】[0024]

【実施例】以下、実施例により本発明を具体的に説明す
るが、本発明はこれらの実施例に限定されるものではな
い。
EXAMPLES The present invention will be specifically described below with reference to examples, but the present invention is not limited to these examples.

【0025】[実施例1] 染色体組み込みベクターの
構築 全てのプラスミドの構築には、大腸菌E.coli株X
L1Blue−MRF’を使用した。大腸菌はLB培地
で培養し、必要に応じてカルベニシリン(Cb)50μ
g/ml、カナマイシン(Km)30μg/mlを添加
した。
[Example 1] Construction of chromosome integration vector For construction of all plasmids, E. coli E. coli was used . coli strain X
L1Blue-MRF 'was used. Escherichia coli is cultured in LB medium, and if necessary, carbenicillin (Cb) 50 μl is used.
g / ml and 30 μg / ml of kanamycin (Km).

【0026】1)sqr遺伝子の調製 sqr遺伝子は、文献記載の方法(Shibata,
H.et al.:J.Biosci.Bioengi
n.,88:244−249,1999)に従い調製し
た。R.capsulatus DSM155から常法によ
りsqr遺伝子を含む染色体DNAを抽出し、これを鋳
型としてsqr遺伝子をセンスプライマー(配列番号
1)およびアンチセンスプライマー(配列番号2)を用
いてPCRで増幅した。 PCRサイクル 当初 94℃、3分 1cycle 熱変成 98℃、20秒 アニーリング 58℃、1分 DNA合成 68℃、2分 熱変成からDNA合成
までを30 cycle 終了後 72℃、10分 1cycle PCR産物はNde I(開始コドンに存在する)及び
BamHI(アンチセンスプライマーに組み込んであ
る)で切断して、sqr遺伝子断片(1.3kbp)を
得た。
1) Preparation of sqr gene The sqr gene can be prepared by the method described in the literature (Shibata,
H. et al. : J. Biosci. Bioengi
n. , 88: 244-249, 1999). R. A chromosomal DNA containing the sqr gene was extracted from capsulatus DSM155 by a conventional method, and using this as a template, the sqr gene was amplified by PCR using a sense primer (SEQ ID NO: 1) and an antisense primer (SEQ ID NO: 2). PCR cycle Initial 94 ° C, 3 minutes 1 cycle Thermal denaturation 98 ° C, 20 seconds Annealing 58 ° C, 1 minute DNA synthesis 68 ° C, 2 minutes After completion of 30 cycles from thermal denaturation to DNA synthesis 72 ° C, 10 minutes 1 cycle PCR product is Nde Cleavage with I (present at the start codon) and BamHI (incorporated in the antisense primer) gave the sqr gene fragment (1.3 kbp).

【0027】2)lacプロモーター制御下にsqr遺
伝子をもつプラスミドの作製 lacプロモーターをもつプラスミドpKF18(Ha
shimoto,T.,et al.:Gene,16
7:333−334,1995)をNde I及びBa
mHIで切断し、上記sqr遺伝子断片(1.3kb
p)とライゲーションして、lacプロモーターによっ
て発現されるsqr遺伝子を含むプラスミドpFSQを
得た。このpFSQをApaL Iで切断し、T4ポリ
メラーゼで末端を平滑化した後、Sac IまたはXb
a Iで切断して、lacプロモーターの下流にsqr
遺伝子を含むDNA断片(1.7kbp)を得た。プラ
スミドpSTV28(Amersham Pharma
cia Biotech社製)をSac IとSma
Iで切断し、上記DNA断片(1.7kbp)とライゲ
ーションしてプラスミドpV−LSQを得た。このpV
−LSQは、pFSQ由来のlacプロモーターの制御
下にsqr遺伝子を含む。また、pBluescrip
t Sk(+)をSma IとXba Iで切断し、上
記DNA断片(1.7kbp)とライゲーションして、
プラスミドpSc−LSQを得た、このpSc−LSQ
は、pFSQ由来のlacプロモーターの制御下にsq
r遺伝子を含む。
2) Preparation of plasmid having sqr gene under control of lac promoter Plasmid pKF18 (Ha
Shimoto, T .; , Et al. : Gene, 16
7: 333-334, 1995) with Nde I and Ba.
Cleavage with mHI, the sqr gene fragment (1.3 kb)
Ligation with p) resulted in plasmid pFSQ containing the sqr gene expressed by the lac promoter. This pFSQ was digested with ApaL I and blunt-ended with T4 polymerase, followed by Sac I or Xb
aI digestion and sqr downstream of the lac promoter.
A DNA fragment (1.7 kbp) containing the gene was obtained. Plasmid pSTV28 (Amersham Pharma
Cia Biotech) with Sac I and Sma
C. and ligated with the above DNA fragment (1.7 kbp) to obtain plasmid pV-LSQ. This pV
-LSQ contains the sqr gene under the control of the lac promoter from pFSQ. Also, pBluescript
t Sk (+) is digested with Sma I and Xba I, ligated with the above DNA fragment (1.7 kbp),
The plasmid pSc-LSQ was obtained.
Sq under the control of the lac promoter from pFSQ
r gene.

【0028】3)tacプロモータ制御下にsqr遺伝
子をもつプラスミドの作製 tacプロモーターをもつpKK223−3(Amer
sham Pharmacia Biotech社製)
を、EcoR I及びPst Iで切断し、上記sqr
遺伝子断片(1.3kbp)とともに末端をT4ポリメ
ラーゼで平滑化した後、ライゲーションしてプラスミド
pK−TSQを得た。このpK−TSQはtacプロモ
ーターによって発現されるsqr遺伝子を含む。このp
K−TSQをPvu IとBamH Iで切断し、また
pSTV28をSma Iで切断し、T4ポリメラーゼ
で平滑化した後、両者をライゲーションして、プラスミ
ドpV−TSQを得た。このpV−TSQはpK−TS
Q由来のtacプロモーターによって制御されるsqr
遺伝子を含む。
3) Preparation of plasmid having sqr gene under control of tac promoter pKK223-3 (Amer
sham Pharmacia Biotech)
Was digested with EcoR I and Pst I, and the above sqr
After blunt-ending with T4 polymerase together with the gene fragment (1.3 kbp), ligation was performed to obtain plasmid pK-TSQ. This pK-TSQ contains the sqr gene expressed by the tac promoter. This p
K-TSQ was digested with Pvu I and BamHI, and pSTV28 was digested with Sma I, blunted with T4 polymerase, and ligated to obtain plasmid pV-TSQ. This pV-TSQ is pK-TS
Sqr controlled by the tac promoter from Q
Including genes.

【0029】4) 染色体組込みベクター構築sqrを
もつ染色体組込みベクターを構築するため、pSc−L
SQをEco RV及びBamH Iで切断して、lacプロモーター
によって制御されるsqr遺伝子断片(1.7kbp)
を得た。また、pV−TSQをPvu IおよびBam
H Iで切断して、tacプロモーターによって制御さ
れるsqr遺伝子断片(2.5kbp)を得た。これら
のDNA断片1〜3つを、温度感受性複製起点をもつp
INT−Ts/Km(Borgne,S.L.et a
l.:Gene,233:213−219,1998)
のマルチクローニングサイト(MCS)に、multi
pletandem insertion法で導入し
て、lacプロモーターによって制御されるsqr遺伝
子をもつ相同組換え用発現ベクターpINT−LSQ
1、pINT−LSQ2、及びpINT−LSQ3、t
acプロモーターによって制御されるsqr遺伝子をも
つ相同組換え用発現ベクターpINT−TSQ1、及び
pINT−TSQ2を得た(図1)。
4) Construction of Chromosome Integration Vector In order to construct a chromosome integration vector having sqr, pSc-L
SQ is cut with Eco RV and BamHI to obtain a sqr gene fragment (1.7 kbp) controlled by a lac promoter.
Got. Also, pV-TSQ is converted to Pvu I and Bam
Cleavage with HI resulted in a sqr gene fragment (2.5 kbp) controlled by the tac promoter. These DNA fragments 1 to 3 are converted into a p-type having a temperature-sensitive replication origin.
INT-Ts / Km (Borgne, SL et a
l. : Gene, 233: 213-219, 1998).
Multi cloning site (MCS)
pINT-LSQ, an expression vector for homologous recombination having a sqr gene controlled by a lac promoter, introduced by the pletandem insertion method
1, pINT-LSQ2 and pINT-LSQ3, t
Expression vectors pINT-TSQ1 and pINT-TSQ2 for homologous recombination having the sqr gene controlled by the ac promoter were obtained (FIG. 1).

【0030】[実施例2] sqr遺伝子の染色体組込
み体の作製 発現ベクターpINT−LSQ1、pINT−LSQ
2、pINT−LSQ3、pINT−TSQ1、及びp
INT−TSQ2を、大腸菌の野生株に近いとされるW
3110に導入した。W3110は、Davis最少培
地に100mMKNO、1%グリセロール、0.2%
カザミノ酸を添加した培地で窒素ガス下で培養した。W
3110を30℃、40時間培養して、上記ベクターを
もつ菌株を得た。1コロニーを採取し、さらに、2mL
LB培地で30℃、12時間培養した。この培養液を
1,000倍に希釈して(約2×10細胞数/m
L)、X−gal及びIPTGを含むKmプレート上で
44℃、20時間培養した。生じた白色コロニーをKm
プレート上に植え継いだ。これを44℃、4時間培養
後、二重交叉による相同組換えをおこした株を選択する
ため、Cbプレート上に植え継ぎ、Cbに感受性(Cb
)の株を選択した。さらに、この株をKmプレート上
に植え継ぎ、44℃、24時間培養し、sqr遺伝子を
染色体上に含む株を選択した。この株をCbプレート上
に植え継ぎ、菌が生育しないことから、プラスミドを欠
失しているのを確認した。さらに、最終的に得たこれら
の菌株よりDNAを抽出し、PCR DIGプローブ合
成キット及びDIG核酸検出キット(ベーリンガー・マ
ンハイム株式会社)を使用して、サザンハイブリダイゼ
ーション分析を行い、染色体上にsqr遺伝子が組込ま
れていることを確認した。プローブはsqr遺伝子のヌ
クレオチド477〜1149(J.Biol.Che
m.,272:9890−9894,1997のFig
3.のヌクレオチド配列に対応)をDIG(Digox
igenin labelling kit:Boeh
ringer Mannheim Biochemic
a社製)標識した。すなわち、lacプロモーターと、
このプロモーターの下流に1〜3コピーのsqr遺伝子
をもつ組換え体が得られた。これらの組換え体は、それ
ぞれ、WL1、WL2、及びWL3と命名した。また、
tacプロモーターと、このプロモーターの下流に1及
び2コピーのsqrをもつ組換え体が得られた。これら
の組換え体は、それぞれ、WT1、及びWT2と命名し
た。これらの組換え体をX−gal及びIPTGを含む
プレートで、44℃でインキュベーションすると、10
−3の頻度で白い大きなコロニーが出現し、その内の
0.5〜5.0%に相同的組換えが起こっていた。挿入
配列が伸長するにつれ、組換え頻度は減少した。
[Example 2] Preparation of chromosome integration of sqr gene Expression vectors pINT-LSQ1, pINT-LSQ
2, pINT-LSQ3, pINT-TSQ1, and p
INT-TSQ2 was replaced with W which is considered to be close to a wild strain of E. coli.
3110. W3110 is 100 mM KNO 3 , 1% glycerol, 0.2% in Davis minimal medium
The cells were cultured in a medium supplemented with casamino acid under nitrogen gas. W
3110 was cultured at 30 ° C. for 40 hours to obtain a strain having the above vector. Pick one colony and add 2 mL
The cells were cultured in an LB medium at 30 ° C. for 12 hours. This culture solution was diluted 1,000 times (about 2 × 10 6 cells / m
L), cultured on a Km plate containing X-gal and IPTG at 44 ° C. for 20 hours. The resulting white colony is
Planted on a plate. After culturing this at 44 ° C. for 4 hours, in order to select a strain that has undergone homologous recombination by double crossover, it is subcultured on a Cb plate and sensitized to Cb (Cb
The strain of S ) was selected. Further, this strain was subcultured on a Km plate, cultured at 44 ° C. for 24 hours, and a strain containing the sqr gene on the chromosome was selected. This strain was subcultured on a Cb plate, and it was confirmed that the plasmid had been deleted since the bacteria did not grow. Furthermore, DNA was extracted from these finally obtained strains, and subjected to Southern hybridization analysis using a PCR DIG probe synthesis kit and a DIG nucleic acid detection kit (Boehringer Mannheim KK). Has been incorporated. The probe was constructed at nucleotides 477 to 1149 of the sqr gene (J. Biol. Che.
m. , 272: 9890-9894, 1997.
3. Of DIG (Digox)
igenin labelling kit: Boeh
ringer Mannheim Biochemical
a company). That is, the lac promoter,
A recombinant having 1-3 copies of the sqr gene downstream of this promoter was obtained. These recombinants were named WL1, WL2, and WL3, respectively. Also,
A recombinant having the tac promoter and one and two copies of sqr downstream of this promoter was obtained. These recombinants were named WT1 and WT2, respectively. Incubation of these recombinants at 44 ° C. on plates containing X-gal and IPTG resulted in 10
Large white colonies appeared at a frequency of -3, of which 0.5 to 5.0% had homologous recombination. The recombination frequency decreased as the inserted sequence extended.

【0031】[実施例3] 組換え体の増殖 大腸菌W3110染色体中に、lacプロモーターによ
って制御されるsqr遺伝子をもつ組換え体WL1、W
L2、およびWL3の増殖は、染色体中にKmマーカー
のみをもつコントロールの菌株の増殖と類似していた。
生育組換え菌の密度は、与えられた培地および培養条件
では、約6時間後に最大となった(図2)。一方、大腸
菌W3110染色体中に、tacプロモーターによって
制御されるsqr遺伝子をもつ組換え体WT1、および
WT2の増殖は、lacプロモーターの場合と同様にの
傾向を示し、染色体中にKmマーカーのみをもつコント
ロールの菌株の増殖と類似していた(図4)。また、細
胞質中にsqr遺伝子を担うプラスミドpK−TSQを
20〜30個もつ組換え体WT20〜30の増殖は、W
T1、およびWT2、あるいはコントロール菌株と比較
して増殖が遅れた(図4)。
Example 3 Propagation of Recombinants Recombinants WL1, W having the sqr gene controlled by the lac promoter in the Escherichia coli W3110 chromosome
The growth of L2 and WL3 was similar to that of a control strain with only the Km marker in the chromosome.
The density of the growing recombinant bacterium reached a maximum after about 6 hours with the given medium and culture conditions (FIG. 2). On the other hand, the growth of the recombinants WT1 and WT2 having the sqr gene controlled by the tac promoter in the Escherichia coli W3110 chromosome showed the same tendency as in the case of the lac promoter, and the control having the Km marker alone in the chromosome (FIG. 4). In addition, the growth of the recombinants WT20-30 having 20-30 plasmids pK-TSQ carrying the sqr gene in the cytoplasm is due to W
Growth was delayed compared to T1, WT2, or control strains (FIG. 4).

【0032】[実施例4] 組換え体による硫化物除去 SQRの硫化物除去活性測定のため、基質としてNaS
を使用した。反応は、特に記載のない限り25℃で行
い、硫化物の測定はメチレンブルー法(Truepe
r,H.G.and Schlegel,H.G.:A
ntonie van Leeuwen hoek,3
0:225−238,1964)で調べた。反応液の組
成は、20mM Tris−HCl(pH7.5)、
0.5%NaCl、5mM MgCl、1mM Ca
Cl、200μM NaS(基質)とし、菌体を用
いた場合は、1.5mgタンパク/100mLとなるよ
うに、菌体を懸濁した。これらの反応液10mLを30
mL容試験管に採り、ブチルゴム栓で密栓後、試験管を
横に置き、100回転/分で10分振とうした後、Na
Sの添加によって反応を開始した。残余の硫化物は、
ジアミン及びFeCl溶液を添加した2%(CH
OO)Znで固定し、OD670で測定した。硫化物
除去活性は、酸化された硫化物nmol/細胞タンパク
1mg/分)で示した。
Example 4 Sulfide Removal by Recombinant To measure the sulfide removal activity of SQR, NaS was used as a substrate.
2 was used. Reactions were performed at 25 ° C. unless otherwise specified, and sulfide was measured by the methylene blue method (Truepe).
r, H .; G. FIG. and Schlegel, H .; G. FIG. : A
ntonie van Leeuwen hook, 3
0: 225-238, 1964). The composition of the reaction solution was 20 mM Tris-HCl (pH 7.5),
0.5% NaCl, 5 mM MgCl 2 , 1 mM Ca
When Cl 2 and 200 μM Na 2 S (substrate) were used and the cells were used, the cells were suspended at 1.5 mg protein / 100 mL. 10 mL of these reaction solutions are added to 30
After taking the sample in a mL-volume test tube, sealing it tightly with a butyl rubber stopper, placing the test tube aside, shaking it at 100 rpm for 10 minutes,
The reaction was started by the addition of 2S. The remaining sulfide is
2% (CH 3 C) containing diamine and FeCl 3 solution
OO) 2 Zn and measured at OD 670 . The sulfide removal activity was expressed as nmol sulfide oxidized / cell protein 1 mg / min).

【0033】なお、タンパク濃度の測定は、DCタンパ
クアッセイキット(Biolad)を用いて測定した。
菌体タンパク濃度は、Herbertらの方法(Her
bert,D.et al:Methods in M
icrobiology Vol.5B,p209−3
44,Academic Press,New Yor
k,1971)によって菌体を可溶化後、測定した。染
色体中にlacプロモーターによって制御されるsqr
遺伝子1〜3個をもつ組換え体WL2、あるいはWL3
を培養した場合、硫化物除去活性は、培養時間の経過に
伴い、定常期まで増加する傾向を示した(図3)。WL
3の硫化物除去活性は、WL2及びWL1のそれらより
も高かった。およそ10個のpV−LSQを染色体外に
もつWL10の活性は、培養時間に関係なくほとんど一
定の活性を示した。およそ300個のpSc−LSQを
染色体外にもつWL300の活性は、IPTGの添加、
無添加の場合共に、僅かに減少した。WL1、WL2、
WL3,WL10、WL300(IPTG添加)、及び
WL300(IPTG無添加)の硫化物除去が最大とな
る培養時間は、それぞれ、7、6、7、8、4、及び4
時間であり、前記時間における硫化物除去活性は、それ
ぞれ、36、112、141、337、316、及び3
24nmol/mg細胞タンパク/mgであった。WL
3の活性は、細胞質中にsqr遺伝子のマルチコピーを
もつ組換え体の活性のほぼ半分であった。
The protein concentration was measured using a DC protein assay kit (Biolad).
The bacterial protein concentration was determined by the method of Herbert et al. (Her
bert, D .; et al: Methods in M
microbiology Vol. 5B, p209-3
44, Academic Press, New York
k, 1971). Sqr controlled by lac promoter in chromosome
Recombinant WL2 having 1 to 3 genes or WL3
When culturing was carried out, the sulfide removal activity tended to increase until the stationary phase with the lapse of the culturing time (FIG. 3). WL
The sulfide removal activity of 3 was higher than those of WL2 and WL1. The activity of WL10 having about 10 pV-LSQs extrachromosomally showed almost constant activity regardless of the culture time. The activity of WL300, which has about 300 pSc-LSQs extrachromosomally, is due to the addition of IPTG,
There was a slight decrease in both cases where no additive was added. WL1, WL2,
The culture times at which the sulfide removal of WL3, WL10, WL300 (with IPTG added), and WL300 (without IPTG added) were maximized were 7, 6, 7, 8, 4, and 4, respectively.
And the sulfide removal activity at that time was 36, 112, 141, 337, 316, and 3 respectively.
It was 24 nmol / mg cell protein / mg. WL
The activity of 3 was almost half that of the recombinant with multiple copies of the sqr gene in the cytoplasm.

【0034】一方、染色体中に、tacプロモーターに
よって制御されるsqr遺伝子をもつWT1、あるいは
WT2を培養した場合、WT1の硫化物除去活性は、培
養時間の経過に伴いゆるやかに増加する傾向を示した
(図5)。WT2の活性はWT1のそれよりも高かった
が、WT1とは異なり、時間の経過に関係なくほぼ一定
に推移した。およそ10個のpV−TSQをもつWT1
0、及び20〜30個のpK−TSQをもつWT20
は、いずれも培養期間の早いステージで高い硫化物除去
活性を示したが、その後減少し、定常期においてほぼ一
定の活性を示した。WT1、WT2、WT10、WT2
0(IPTG添加)、及びWT20(IPTG無添加)
の硫化物除去活性が最大となる培養時間は、それぞれ、
8、7、2、2、及び3時間であり、前記時間における
硫化物除去活性は、それぞれ、240、310、42
3、394、及び372nmol/mg細胞タンパク/
mgであった。結論として、WT2は、コントロール細
胞の増殖に全く遅れることなく増殖するという点(図
4)、対数増殖期中期におるWT20の硫化物除去活性
のほぼ半分の硫化物除去活性をもつという点、及びsq
r遺伝子のマルチコピーをもつ菌体の定常期における硫
化物除去活性に近い活性をもつという点、から極めて満
足すべきものであった。
On the other hand, when WT1 or WT2 having the sqr gene controlled by the tac promoter in the chromosome was cultured, the sulfide removing activity of WT1 tended to increase gradually with the elapse of the culture time. (FIG. 5). The activity of WT2 was higher than that of WT1, but, unlike WT1, it remained almost constant over time. WT1 with about 10 pV-TSQ
WT20 with 0 and 20-30 pK-TSQs
Showed high sulfide removal activity at an early stage of the culture period, but then decreased and showed almost constant activity in the stationary phase. WT1, WT2, WT10, WT2
0 (with no IPTG) and WT20 (without IPTG)
The culture time at which the sulfide removal activity of
8, 7, 2, 2, and 3 hours, at which time the sulfide removal activity was 240, 310, 42, respectively.
3, 394 and 372 nmol / mg cell protein /
mg. In conclusion, WT2 grows without any delay in the growth of control cells (FIG. 4), has almost half the sulfide removal activity of WT20 in mid-log phase, and sq
This was extremely satisfactory in that cells having multiple copies of the r gene had activities close to the sulfide removal activity in the stationary phase.

【0035】[実施例5] SQR活性と酸素消費量の
関連 1)組換え体粗抽出液の調製 培養液を遠心分離(4,000×g、10分、4℃)し
て得た菌体を、5mMEDTAを含む25mMリン酸緩
衝液、(pH7.4)で1回洗浄後、再度同条件で遠心
分離し、菌体を回収した。回収した菌体を上記緩衝液に
懸濁した後、超音波処理(12秒×2回、30秒間間
隔)し、菌体を粉砕した。SQR活性測定のために、こ
の粉砕液に10%(v/v)Thesitを25μL/
mL加え、氷上で1時間インキュベートしてSQRタン
パクを可溶化した。インキュベーション後、遠心分離
(10,000×g、10分、4℃)して得た上清(粗
抽出液)をSQR活性測定に用いた。
[Example 5] Relationship between SQR activity and oxygen consumption 1) Preparation of crude extract of recombinant cells Cells obtained by centrifuging the culture solution (4,000 xg, 10 minutes, 4 ° C) Was washed once with 25 mM phosphate buffer (pH 7.4) containing 5 mM EDTA, and then centrifuged again under the same conditions to collect cells. After suspending the collected cells in the above buffer, the cells were sonicated (12 seconds × 2 times, 30 seconds apart) to pulverize the cells. For the measurement of SQR activity, 25 μL /% of 10% (v / v)
mL was added and incubated for 1 hour on ice to solubilize the SQR protein. After the incubation, the supernatant (crude extract) obtained by centrifugation (10,000 × g, 10 minutes, 4 ° C.) was used for SQR activity measurement.

【0036】2)SQR活性測定 SQR活性は、SQRによって触媒されるデシル−UQ
の還元割合を、波長275nmで測定した。反応温度は
25℃とし、反応液組成(3mL)は、25mMリン酸
緩衝液(pH6.5)、0.01%Thesit、50
μMデシル−UQ、100μM NaS、及び上記粗
抽出物(10μgタンパク/mL)となるように調製し
た。反応は、NaSの添加によって反応を開始した。
波長275nmの吸収減少量を、デシル−UQのミリモ
ル吸光係数15(Morton,R.A.:Bioch
emistry of Quinones,p23−2
4,1965)より算出した。
2) Measurement of SQR activity The SQR activity is determined by decyl-UQ catalyzed by SQR.
Was measured at a wavelength of 275 nm. The reaction temperature was 25 ° C., and the reaction solution composition (3 mL) was 25 mM phosphate buffer (pH 6.5), 0.01% Thesit, 50%
It was prepared to be μM decyl-UQ, 100 μM Na 2 S, and the above crude extract (10 μg protein / mL). The reaction was started by the addition of Na 2 S.
The amount of decrease in absorption at a wavelength of 275 nm was determined by comparing the decyl-UQ with a molar extinction coefficient of 15 (Morton, RA: Bioch).
emistry of Quinones, p23-2
4, 1965).

【0037】3)硫化物除去に伴う酸素消費度の測定 硫化物除去に伴う酸素消費度を、酸素電極(飯島電子工
業、GU−BM)を用いて測定した。反応液及びNa
S濃度は、硫化物除去活性の測定に用いたものと同じも
のを使用した。ただし、菌体濃度は、0.15mgタン
パク/mLであった。反応液2.2mLを使用した。菌
体を添加後、25℃、10分間保温した後、NaSの
添加により反応を開始した。
3) Measurement of oxygen consumption due to sulfide removal The oxygen consumption due to sulfide removal was measured using an oxygen electrode (Iijima Denshi Kogyo, GU-BM). Reaction solution and Na 2
The same S concentration as that used in the measurement of the sulfide removal activity was used. However, the cell concentration was 0.15 mg protein / mL. 2.2 mL of the reaction solution was used. After adding the cells, the mixture was kept at 25 ° C. for 10 minutes, and then the reaction was started by adding Na 2 S.

【0038】4)SQR活性と酸素消費量 組換え体のSQR活性と硫化物の除去に伴う酸素消費量
との関連を、対数増殖期中期、対数増殖期後期、及び定
常期のそれぞれについて調べた。sqr遺伝子のコピー
数が10及びそれ以下の場合、いずれの増殖期において
も、染色体中に、lacプロモーター、あるいはtac
プロモーターの制御下にあるsqr遺伝子をもつ組換え
体は、sqr遺伝子のコピー数が10及びそれ以下の場
合、SQR活性の増加に伴って酸素消費量が増加した。
すなわち、sqr遺伝子の導入効果がはっきりと認めら
れた。SQR活性は、培養ステージが進むにつれて、一
般的に、その変化幅は減少傾向を示した。酸素消費量も
培養ステージの終末には減少した。酸素消費量は、対数
増殖期中期までは、SQR活性の増加に対して、ほとん
ど直線的に増加した。SQR活性が約700nmol/
mg菌体タンパク質/分以下の場合は、酸素消費量はS
QR活性に比例して増加した。しかしながら、SQR活
性が900nmol/mg菌体タンパク質/分を超える
と、酸素消費量はSQR活性に影響されなくなった(図
6)。この反応において、酸化された硫化物と消費され
た酸素の分子比は、ほぼ、2:1であった。
4) SQR Activity and Oxygen Consumption The relationship between the SQR activity of the recombinant and the oxygen consumption due to the removal of sulfide was examined in each of the middle logarithmic growth phase, the late logarithmic growth phase, and the stationary phase. . When the copy number of the sqr gene is 10 or less, the lac promoter or tac
Recombinants with the sqr gene under the control of the promoter increased oxygen consumption with increasing SQR activity when the copy number of the sqr gene was 10 or less.
That is, the effect of introducing the sqr gene was clearly observed. SQR activity generally showed a decreasing trend as the culture stage progressed. Oxygen consumption also decreased at the end of the culture stage. Oxygen consumption increased almost linearly with increasing SQR activity until mid-log phase. SQR activity is about 700 nmol /
In the case of mg cell protein / min or less, the oxygen consumption is S
Increased in proportion to QR activity. However, when SQR activity exceeded 900 nmol / mg bacterial cell protein / min, oxygen consumption was no longer affected by SQR activity (FIG. 6). In this reaction, the molecular ratio of oxidized sulfide to consumed oxygen was approximately 2: 1.

【0039】[実施例6] 染色体組込み株の安定性 sqr遺伝子を細胞質または染色体の中に導入した組換
え細胞の生存を、非選択培地上で160世代まで調べ
た。sqr遺伝子を染色体にもつ菌株、及びsqr遺伝
子をもつプラスミドを保持する菌株を選択培地で14時
間(WL300、WT20は18時間)培養後の菌液を
“0”世代(t=0)とした。これを10CFU/m
Lになるように非選択培地で調製後、定常期まで培養し
た。この時点で、約20世代培養したことになる。さら
に、このような培養を7回繰り返し、最終的に約160
世代まで培養した。t=0とt=160でのsqr活
性、硫化物除去活性に伴う酸素消費度、及びサザンハイ
ブリダイゼーション分析を行い、組込み株の安定性を調
べた。
Example 6 Stability of Chromosome-Integrated Strains The survival of recombinant cells in which the sqr gene was introduced into the cytoplasm or chromosome was examined on a non-selective medium up to 160 generations. The bacterial solution obtained by culturing the strain having the sqr gene on the chromosome and the strain having the plasmid having the sqr gene in a selective medium for 14 hours (18 hours for WL300 and WT20) was defined as the “0” generation (t = 0). This is 10 3 CFU / m
After being prepared in a non-selective medium so as to be L, the cells were cultured until the stationary phase. At this point, about 20 generations have been cultured. Further, such culture was repeated seven times, and finally, about 160
Cultured to generations. The stability of the integrated strain was examined by performing sqr activity at t = 0 and t = 160, oxygen consumption accompanying sulfide removal activity, and Southern hybridization analysis.

【0040】プラスミドpSc−LSQもつWL30
0、及びpK−TSQをもつWT20細胞は、SQR活
性を失い、硫化物除去活性も検出限界以下に低下した。
染色体中にlacプロモーターの制御下にsqr遺伝子
1コピーをもつWL1、2コピーをもつWL2、3コピ
ーをもつWL3、並びに染色体中にtacプロモーター
の制御下にsqr遺伝子1コピーをもつWT1、2コピ
ーをもつWT2細胞はいずれも、0世代と同程度のSQ
R活性及び硫化物除去活性を保持していた(表1)。上
記160世代の組換え細胞の染色体中のsqr配列は、
サザンブロット法で確認した。
WL30 with plasmid pSc-LSQ
WT20 cells having 0 and pK-TSQ lost the SQR activity, and the sulfide removal activity also fell below the detection limit.
WL1 with one copy of the sqr gene under control of the lac promoter in the chromosome, WL2 with two copies, WL3 with three copies, and WT1 and two copies of the sqr gene with one copy under the control of the tac promoter in the chromosome. WT2 cells have the same SQ as the 0 generation
R activity and sulfide removal activity were retained (Table 1). The sqr sequence in the chromosome of the above-mentioned 160 generation recombinant cells is:
Confirmed by Southern blotting.

【0041】[0041]

【表1】 [Table 1]

【0042】[0042]

【発明の効果】本発明の硫化水素除去活性を有する組換
え体は、家畜の飼料に添加することにより、腸内に残存
し悪臭の主たる原因である硫化水素を除去し、結果、排
泄糞の悪臭を低減化することが期待できる。また、他の
消臭性物質(例えば、オリゴ糖、ゼオライト、カテキン
類等)と併用することにより、さらなる消臭効果が期待
できる。
The recombinant having the activity of removing hydrogen sulfide of the present invention is added to livestock feed to remove hydrogen sulfide, which remains in the intestine and is a main cause of malodor, and as a result, excreted feces It can be expected that odor is reduced. Further, when used in combination with other deodorant substances (for example, oligosaccharides, zeolites, catechins, etc.), a further deodorant effect can be expected.

【0043】[0043]

【配列表】[Sequence list]

【図面の簡単な説明】[Brief description of the drawings]

【図1】 1〜3コピーのsqr遺伝子が大腸菌W31
10株の染色体中に組込みまれたW3110誘導体の構
築を示す図である。sqr遺伝子断片は、EcoR V
(pINT−LSQ1)、BamH I(pINT−L
SQ2)、XbaI(pINT−LSQ3)、EcoR
I(pINT−TSQ1)、あるいはSmaI(pI
NT−TSQ2)消化後、末端をT4ポリメララーゼで
平滑化し、一個ずつ、pINT−Ts/Kmrのマルチ
クローニングサイト(MCS)に導入された。
FIG. 1. 1-3 copies of the sqr gene are found in E. coli W31.
FIG. 3 is a diagram showing the construction of a W3110 derivative integrated into chromosomes of 10 strains. The sqr gene fragment is EcoR V
(PINT-LSQ1), BamHI (pINT-L
SQ2), XbaI (pINT-LSQ3), EcoR
I (pINT-TSQ1) or SmaI (pI
After NT-TSQ2) digestion, the ends were blunted with T4 polymerase and introduced one by one into the multicloning site (MCS) of pINT-Ts / Kmr.

【図2】 lacプロモーター制御下にある数コピーの
sqr遺伝子をもつW3110誘導体の増殖パターンを
示す図である。1mM(最終濃度)のIPTGでsqr
遺伝子の発現を誘導した。コピー数はmanufact
ure’sreport(QIAGENProduct
Guide,1999)から推定した。□:1コピ
ー、●:2コピー、△:3コピー、■:約10コピー、
◆:300〜500コピー、○:300〜500コピー
:培地にIPTGを含まない。
FIG. 2 shows the growth pattern of a W3110 derivative with several copies of the sqr gene under the control of the lac promoter. Sqr with 1 mM (final concentration) IPTG
Gene expression was induced. Copy number is manfactor
ure's report (QIAGENProduct
Guide, 1999). □: 1 copy, ●: 2 copies, △: 3 copies, ■: about 10 copies,
◆: 300-500 copies, ○: 300-500 copies
* . * : The medium does not contain IPTG.

【図3】 lacプロモーター制御下にある数コピーの
sqr遺伝子をもつW3110誘導体全細胞抽出物の硫
化物除去を示す図である。□:1コピー、●:2コピ
ー、△:3コピー、■:約10コピー、◆:300〜5
00コピー、○:300〜500コピー:培地に
IPTGを含まない。
FIG. 3 shows sulfide removal of W3110 derivative whole cell extract with several copies of the sqr gene under the control of the lac promoter. □: 1 copy, ●: 2 copies, △: 3 copies, ■: about 10 copies, ◆: 300-5
00 copies, :: 300 to 500 copies * . * : The medium does not contain IPTG.

【図4】 tacプロモーター制御下にある数コピーの
sqr遺伝子をもつW3110誘導体の増殖パターンを
示す図である。1mM(最終濃度)のIPTGでsqr
遺伝子の発現を誘導した。コピー数はmanufact
ure’sreport(QIAGENProduct
Guide,1999)から推定した。△:1コピ
ー、○:2コピー、□:10コピー、●:20〜30コ
ピー、◆:20〜30コピー:培地にIPTGを
含まない。
FIG. 4 shows the proliferation pattern of a W3110 derivative having several copies of the sqr gene under the control of the tac promoter. Sqr with 1 mM (final concentration) IPTG
Gene expression was induced. Copy number is manfactor
ure's report (QIAGENProduct
Guide, 1999). Δ: 1 copy, ○: 2 copies, □: 10 copies, ●: 20 to 30 copies, Δ: 20 to 30 copies * . * : The medium does not contain IPTG.

【図5】 tacプロモーター制御下にある数コピーの
sqr遺伝子をもつW3110誘導体全抽出物の硫化物
除去を示す図である。△:1コピー、○:2コピー、
□:10コピー、●:20〜30コピー、◆:20〜3
0コピー:培地にIPTGを含まない。
FIG. 5 shows sulfide removal of W3110 derivative whole extract having several copies of sqr gene under the control of tac promoter. △: 1 copy, ○: 2 copies,
□: 10 copies, ●: 20-30 copies, Δ: 20-3
0 copies * . * : The medium does not contain IPTG.

【図6】 SQR酵素活性と全菌体粗抽出物における酸
素消費量との関連を示す図である。低SQR活性は、W
L1,WL2,WL3,WT1およびWT2の各株で得
られた。高SQR活性は、特に対数増殖期後期のWT1
0およびWT20の株で得られた。□:対数増殖期中
期、○:対数増殖期後期、△:定常期。
FIG. 6 is a graph showing the relationship between the SQR enzyme activity and the amount of oxygen consumed in the crude extract of whole cells. Low SQR activity is
L1, WL2, WL3, WT1 and WT2 were obtained. High SQR activity is particularly significant in late log phase WT1
0 and WT20 strains. □: middle logarithmic growth phase, ○: late logarithmic growth phase, Δ: stationary phase.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) // C12N 9/02 C12R 1:01) (C12N 15/09 ZNA (C12N 1/20 E C12R 1:01) C12R 1:19) (C12N 1/20 (C12N 1/21 C12R 1:19) C12R 1:19) (C12N 1/21 C12N 15/00 ZNAA C12R 1:19) C12R 1:01) Fターム(参考) 2B005 EA01 2B150 AA01 AA03 AA05 AA06 AB12 AC01 AC37 DC13 DD11 DH21 4B024 AA10 AA17 BA08 CA03 DA06 EA04 FA02 FA03 FA04 GA11 4B050 CC04 DD02 LL10 4B065 AA01Y AA26X AB01 AC14 BA02 CA28 CA43 CA54 ──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) // C12N 9/02 C12R 1:01) (C12N 15/09 ZNA (C12N 1/20 E C12R 1:01) ) C12R 1:19) (C12N 1/20 (C12N 1/21 C12R 1:19) C12R 1:19) (C12N 1/21 C12N 15/00 ZNAA C12R 1:19) C12R 1:01) F term (reference) ) 2B005 EA01 2B150 AA01 AA03 AA05 AA06 AB12 AC01 AC37 DC13 DD11 DH21 4B024 AA10 AA17 BA08 CA03 DA06 EA04 FA02 FA03 FA04 GA11 4B050 CC04 DD02 LL10 4B065 AA01Y AA26X AB01 AC14 BA02 CA43 CA54

Claims (11)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 単離された1つ以上の硫化物−キノン酸
化還元酵素遺伝子sqrが微生物の染色体中の生育に影
響しない遺伝子領域に該微生物のプロモーターで作動可
能に組込まれた硫化水素除去活性を有する組換え微生
物。
1. A hydrogen sulfide-removing activity in which one or more isolated sulfide-quinone oxidoreductase genes sqr are operably integrated with a promoter of a microorganism in a gene region that does not affect growth in the chromosome of the microorganism. A recombinant microorganism having:
【請求項2】 生育に影響しない遺伝子領域がLacZ
遺伝子である請求項1記載の組換え微生物。
2. A gene region that does not affect growth is LacZ.
The recombinant microorganism according to claim 1, which is a gene.
【請求項3】 プロモーターがtacプロモーターであ
る請求項1記載の組換え微生物。
3. The recombinant microorganism according to claim 1, wherein the promoter is a tac promoter.
【請求項4】 tacプロモーターで作動可能な少なく
とも2コピーのsqr遺伝子をもつ請求項1記載または
3記載の組換え微生物。
4. The recombinant microorganism according to claim 1, which has at least two copies of the sqr gene operable by a tac promoter.
【請求項5】 sqr遺伝子が紅色非硫黄細菌由来であ
る請求項1記載の組換え微生物。
5. The recombinant microorganism according to claim 1, wherein the sqr gene is derived from a red non-sulfur bacterium.
【請求項6】 紅色非硫黄細菌がRhodobacte
capsulatusである請求項5記載の組換え
微生物。
6. The red non-sulfur bacterium is Rhodobacte.
The recombinant microorganism according to claim 5, which is r capsulatus .
【請求項7】 微生物が大腸菌W3110株である請求
項1記載の組換え微生物。
7. The recombinant microorganism according to claim 1, wherein the microorganism is Escherichia coli strain W3110.
【請求項8】 請求項1〜7記載のいずれかの組換え微
生物を有効成分として含む家畜の***糞の悪臭低減作用
を有する飼料。
8. A feed containing the recombinant microorganism according to any one of claims 1 to 7 as an active ingredient and having an action of reducing foul odor of excreted feces of livestock.
【請求項9】 家畜がブタである請求項8記載の飼料。9. The feed according to claim 8, wherein the livestock is a pig. 【請求項10】 家畜の***糞の悪臭を低減する作用を
有する飼料を製造するための請求項1〜8記載のいずれ
かの組換え微生物の使用。
10. Use of the recombinant microorganism according to any one of claims 1 to 8 for producing a feed having an action of reducing malodor of feces excreted by livestock.
【請求項11】 家畜がブタである請求項10記載の使
用。
11. Use according to claim 10, wherein the livestock is a pig.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102643853A (en) * 2012-04-19 2012-08-22 江苏省农业科学院 Sulfide quinone oxidoreductase intestinal tract directed expression vector and cell line thereof
WO2021033590A1 (en) * 2019-08-20 2021-02-25 有正 宮本 Agent for reducing malodor of flatulence and/or stool

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