JP2000513588A - DNA sequences, expression of these DNAs, thermophilic laccase encoded by said DNAs and uses thereof - Google Patents

DNA sequences, expression of these DNAs, thermophilic laccase encoded by said DNAs and uses thereof

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Abstract

(57)【要約】 本発明はDNA配列(SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2)の1つを有し、ラッカーゼ活性を有するタンパク質をコードするDNA配列に関する。また本発明はこれらのDNA配列の発現、前記のDNAにコードされる好熱性ラッカーゼならびにセルロースの脱リグニン、高分子凝集物の解重合、古紙の脱インキ、廃液、特にセルロースの漂白からの廃液中の芳香族化合物の重合、着色剤の酸化および顔料の生成のための着色剤の活性化、ならびに芳香族化合物のカップリング反応もしくは芳香族側鎖の酸化における有機合成でのその使用に関する。   (57) [Summary] The present invention relates to a DNA sequence having one of the DNA sequences (SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2) and encoding a protein having laccase activity. The present invention also relates to the expression of these DNA sequences, the thermophilic laccase encoded by the DNA and the delignification of cellulose, the depolymerization of polymer aggregates, the deinking of waste paper, and the waste liquid, especially the waste liquid from the bleaching of cellulose. To the polymerization of aromatic compounds, the activation of colorants for the oxidation of colorants and the formation of pigments, and their use in organic synthesis in the coupling reaction of aromatic compounds or oxidation of aromatic side chains.

Description

【発明の詳細な説明】 DNA配列、これらのDNAの発現、該DNAによってコードされる好熱性ラッ カーゼならびにその使用 本発明はラッカーゼ活性を有するタンパク質をコードするDNA配列、これら のDNA配列の発現、該DNA配列によってコードされる好熱性ラッカーゼなら びにその使用に関する。 工業的使用に非常に関心を持たれている酵素の種類は、ラッカーゼ酵素(p− ヒドロキシフェノールオキシダーゼ、EC 1.10.3.2)の種類である。 ラッカーゼは“青色銅タンパク質”と称されるファミリーに属し、一般に4個の 銅イオンを有し、これらはタイプ1〜タイプ3を示す3つの銅中心に配置されて いる。ラッカーゼは一般に分泌タンパク質であり、かつ場合により分子量の10 〜45%のグリコシル化含有率を有していることが特徴である。ラッカーゼは酸 化する芳香族化合物に対して非常に広範な基質特異性を有している。この酸化に おいて生ずる電子を使用して酸素を還元する。これにより水が生じる。ホワイト ロットフンギ(white rot fungi)に存在するラッカーゼの機能は就中リグニンの 分解である。これはパルプの脱リグニンに関する製紙工業でのラッカーゼの使用 への関心の理由でもある。 高分子化合物、例えばリグニンの分解の他に、ラッカーゼは、特に芳香族化合 物の重合を触媒することもできる。この例は、植物に存在するラッカーゼに関連 する植物におけるリグニンの生合成である。従って、ラッカーゼの可能な工業的 適用は、例えば廃水処理のあらゆる種類の重合反応が挙げられる。有機化学合成 におけるラッカーゼの使用は、例えば芳香族化合物のカップリング反応もしくは 側鎖酸化においても公知である。しかしながらこれらの多くの可能な適用に関し ては、殆どの公知のラッカーゼが中温性である、すなわち低温至適および限られ た熱安定性を有することである。 ラッカーゼ酵素の工業的使用のための予備条件は、該酵素を廉価な費用で製造 できることである。一般にこのことは組み換え技術によって製造される酵素の使 用によってのみ可能である。種々の原核性および真核性の発現系がタンパク質製 造のために使用可能である。原核性発現系の例はEscerichia.col iおよびBacillus subtilisである。広範に使用される真核性 発現系は哺乳類細胞および昆虫細胞の両者細胞培養系ならびに真核微生物、例え ば酵母もしくは糸状菌である。 WO96/00290号は不完全菌類のサブクラスの糸状菌Polyporu s pinsitusからの5種のラッカーゼ遺伝子を記載している。これらの ラッカーゼ遺伝子の1つ(LCC1)は組み換えタンパク質として製造される。 この酵素の好熱特性は更には調査されていないが、記載されている染髪の目的の ためのLCC1ラッカーゼの使用はこの酵素が中温性特性を有しているというこ とを暗示している。 不完全菌類のサブクラスの糸状菌Scytalidium thermoph ilumからの好熱特性を有する組み換えラッカーゼの製造はWO95/338 37号に記載されている。この酵素がパルプの漂白に適当であるかどうかは知ら れていない。 今までのところ、不完全菌類のサブクラスの糸状菌からの好熱性ラッカーゼを 組み換えタンパク質として製造するための方法は記載されていない。 CA:AN96−203142号は好熱性ラッカーゼの種々の特性を開示して いる。この種のタンパク質のDNAまたはタンパク質配列は開示されていない。 本発明は、ラッカーゼ活性を有するタンパク質をコードし、SEQ ID N O:1の位置76から位置1572を含めた位置までのDNA配列もしくはSE Q ID NO:2の位置76から位置1572を含めた位置までのDNA配列 または前記DNAに80%以上の配列ホモロジーを有しているDNA配列を有す るDNA配列に関する。 SEQ IDNO:1およびSEQ IDNO:2の位置1から位置75まで はタンパク質の分泌のため のシグナル配列をコードするDNA配列を表す。このシグナル配列はタンパク質 分泌のための他の任意のシグナル配列と交換することができる。 新規DNA配列は、例えば不完全菌株Trametes versicolo r TV−1 (DSMZ(Mikroorganismen und Zellkulturen)GmbH(D −38124ブラウンシュヴァイク)に番号DSM11523で寄託)からのク ローニングによって得ることができる。この目的のためにTrametes v ersicolor TV−1から自体公知の方法によって遺伝子バンクを作成 する。 遺伝子バンクにおいて新規DNA配列を単離するために、ラッカーゼ特異的D NA配列を有するDNAプローブを使用する。この種のDNAプローブは、例え ばTrametes versicolor TV−1からのゲノムDNAから のDNAプライマーを使用するPCR反応によって得ることができる。 使用されるプライマーは、有利には14〜27bpの長さを有する縮重(dege netrate)DNA配列であり、これらの配列は公知のラッカーゼ遺伝子との比較 によって得られる。 有利にはプライマーとして適当なDNA切片は確立したDNA切片のオリゴヌ クレオチド合成によって得られる。 新規のラッカーゼ遺伝子は、例えば例1〜5に記載 のように単離できる。 例の方法によって単離されるラッカーゼ遺伝子を当業者に公知の技術、例えば 部位特異的突然変異によって配列中の任意の所望の位置において改変することが できる。従って本発明はラッカーゼ活性を有するタンパク質をコードし、SEQ ID NO:1の位置76から位置1572を含めた位置までのDNA配列も しくはSEQ ID NO:2の位置76から位置1572を含めた位置までの DNA配列または該DNA配列に80%より高い配列ホモロジーを有するDNA 配列を含むDNA配列を含んでいる。 新規DNAを発現するために、後者のものを自体公知の方法において発現ベク ターにクローニングし、このラッカーゼ遺伝子を有する発現ベクターを微生物中 に導入し、該微生物中で発現させる。 発現ベクターは宿主生物のゲノムDNA中に組み込まれ、ゲノムDNAと一緒 に複製されるDNA構成体であってよい。選択的に宿主ゲノムに組み込まれない 自己複製性のDNA構成体、例えばプラスミド、人工染色体または匹敵する染色 体外遺伝因子であってもよい。 適当な発現ベクターは有利には以下の遺伝因子を有するべきである: 宿主生物においてラッカーゼ遺伝子の発現を促進するプロモーター。有利には プロモーターは高い発現効 率を保証できるように強力なプロモーターであるべきである。有利にはプロモー ターはラッカーゼ遺伝子の5’末端に機能的に(functionally)に結合する。 適当かつ有利なプロモーターはtacプロモーター、サブチリシンプロモータ ー、GALプロモーター、TAKAアミラーゼプロモーター、ポリヘドリンプロ モーター、グルコアミラーゼプロモーター、gapDHプロモーターおよびアル コールオキシダーゼプロモーターの群から選択される。 E.coliにおける発現にはtacプロモーターが、Bacillusに おける発現にはサブチリシンプロモーターが、酵母Saccharomyces cerevisiaeにおける発現にはGALプロモーターが、Aspergi llus nigerにおける発現にはTAKAアミラーゼプロモーターが、バ キュロウイルスを感染させた昆虫細胞における発現のためにはポリヘドリンプロ モーターが、またはAspergillus nigerからのグルコアミラー ゼプロモーターもしくは酵母Pichia pastorisからのアルコール オキシダーゼプロモーターが適当かつ有利である。 Aspergillus nigerからのグルコアミラーゼプロモーターま たは酵母Pichia pastorisからのアルコールオキシダーゼプロモ ーターが新規の好熱性ラッカーゼの発現のために特に 適当である。 有利には発現ベクターは、宿主生物に適当な転写終結のためのシグナルおよび 真核生物においては更にポリアデニル化のためのシグナルを有しているべきであ り、これらはラッカーゼ遺伝子の3’末端に機能的に結合するべきである。 有利には発現させたタンパク質は宿主生物によって培地に分泌されるべきであ る。宿主生物による分泌はN−末端シグナル配列によって媒介される。シグナル 配列はラッカーゼ遺伝子中に存在する天然のシグナル配列であるか、または異種 のシグナル配列であり、これらのコード化DNAは発現ベクター中でラッカーゼ 遺伝子の5’末端に機能的に結合する。 以下の分泌タンパク質のシグナル配列が有利である:Klebsiella oxytocaからのα−シクロデキストリングルコシルトランスフェラーゼ、 Bacillus subtilisからのサブチリシン、Saccharom yces cerevisiaeからのα因子、Pichia pastori sからの酸ホスファターゼ、Aspergillus nigerからのα−ア ミラーゼ、Aspergillus nigerもしくはAspergillu s awamoriからのグルコアミラーゼまたはラッカーゼ遺伝子中に天然に 存在するシグナル配列。 特に適当なものはラッカーゼ遺伝子中に天然に存在 するシグナル配列および以下の異種のシグナル配列である:Aspergill us nigerまたはAspergillus awamoriからのグルコ アミラーゼのシグナル配列、Saccharomyces cerevisia eからのα因子のシグナル配列またはPichia pastorisからの酸 ホスファターゼのシグナル配列。 またラッカーゼの分泌は、分泌タンパク質もしくは該タンパク質の分泌される 断片のための遺伝子を発現ベクター中でラッカーゼ遺伝子に機能的に結合させた 融合タンパク質の発現によって達成することができる。この点において特に有利 なものはAspergillus nigerからのグルコアミラーゼのN−末 端断片および好熱性ラッカーゼからなる融合タンパク質の発現である。 更に有利にはグルコアミラーゼとラッカーゼとの結合点は、この結合点のアミ ノ酸配列が宿主細胞の分泌装置におけるプロセシングペプチダーゼのための認識 部位となるように選択され、その際、発現した融合タンパク質は生体内で分解さ れ、ラッカーゼが放出される。 また有利には発現ベクターは選択マーカーのための遺伝子を有する。遺伝子に よってコードされる選択マーカーは宿主生物に抗生物質耐性を付与するか、また は宿主生物の欠陥を補足してもよい。 有利な選択マーカーは抗生物質、例えばアンピシリン、カナマイシン、クロラ ムフェニコール、テトラサイクリン、ハイグロマイシン、ゼオシン(zeocin)も しくはバイアラホス(bialaphos)に耐性を付与する遺伝子である。生育の欠陥 を補足するために有利な選択マーカーは遺伝子、例えばamdS、pyrG、t rpC、His4、niaD、argB、またはhygBである。 選択マーカーとして特に適当なものはamdSおよびpyrG遺伝子ならびに His4遺伝子および抗生物質ゼオシンのための耐性遺伝子である。 更に選択マーカ一遺伝子は1個のDNA分子中にラッカーゼ遺伝子と一緒に存 在するか、またはこれらの2個の遺伝子は異なるDNA分子中に別々に存在して もよい。後者の場合には、両者のDNA分子を一緒に同時形質転換する。 またこのように本発明は新規のDNA配列を有する発現ベクターに関する。 新規の発現ベクターを発現させるための適当かつ有利な微生物は、細菌由来の 微生物、例えばE.coliもしくはBacillus subtilis、真 核生物由来の微生物、例えば属SaccharomycesもしくはPichi aの酵母、あるいは属Aspergillus、Trichoderma、Ne urosporaもしくはSchyzophillum の糸状菌または真核性の細胞培養、例えばバキュロウイルスを感染させた昆虫細 胞である。 特に適当なものは属Aspergillusの糸状菌、例えばAspergi llus nigerもしくはAspergillus awamoriまたは 酵母、例えばSaccharomyces cerevisiaeもしくはPi chia pastorisである。 新規DNAによってコードされるタンパク質は以下の生物化学的特性を有して いる: 該タンパク質はラッカーゼの酵素活性を有している。該酵素活性の至適pHは 酸性の範囲であり、かつpH2.0で最大であり、pH4.0で最大の酵素活性 の半分を有する。45℃およびpH4.5〜6.0の該酵素の安定性は2時間ま での時間で100%である。 45℃およびpH3.0での該酵素の安定性は1時間までの時間で50%であ る。pH4.5での至適温度は70℃である。65〜75℃での酵素活性は依然 として最大活性の80%である。50〜80℃での酵素活性は依然として最大活 性の50%である。pH4.5および温度55℃以下での酵素安定性は2時間ま での時間で90%である。pH4.5および温度65℃での酵素安定性は1時間 までの時間で50%である。 新規のタンパク質はタンパク質配列SEQ ID NO:3を含んでいる。 有利には新規タンパク質を前記の微生物における新規DNA配列の発現によっ て製造する。 有利にはDNAを前記の発現ベクターの1種を使用して微生物中で発現させる 。 このように本発明は新規DNA配列または新規発現ベクターを有する微生物に も関する。 微生物からのタンパク質の分泌を可能にする微生物と発現系との組合せを使用 することが特に有利である。かかる有利な組合せの例は: Aspergillus nigerまたはAspergillus awa moriにおける新規DNA配列を発現するためのグルコアミラーゼプロモータ ーの使用。この発現系において有利に使用される分泌シグナルは好熱性ラッカー ゼ自体のシグナル配列またはグルコアミラーゼ−ラッカーゼ融合タンパク質のグ ルコアミラーゼ部分のシグナル配列である。 Pichia pastorisにおける新規DNA配列を発現するためのア ルコールオキシダーゼプロモーターの使用。この発現系において使用される分泌 シグナルは有利には好熱性ラッカーゼ自体のシグナル配列またはSacchar omyces cerevisiaeからのα因子のシグナル配列またはPic hia pastorisからの酸ホスファターゼの シグナル配列である。 新規のタンパク質はラッカーゼに関する公知の全ての適用に適当である。これ らはパルプの脱リグニンならびに高分子量の凝集物(aggregate)の解重合のため に特に適当である。ラッカーゼは古紙の脱インキ、廃水の処理、特にこの点につ いてはパルプの漂白からのリグニン含有廃水における芳香族化合物の重合におい てもしくは汚染された土壌の解毒における広範な適用において更に使用される。 他の使用範囲は前駆成分との反応によって染料の酸化および染料の活性化をし、 顔料を形成することに関する。有機合成での使用範囲は芳香族化合物のカップリ ング反応または芳香族置換基の酸化を含んでおり、この点については例えばベン ジルアルコールの相応のアルデヒドへの酸化を更なる酸化によるカルボン酸の形 成を回避して実施することを含んでいる。前記の使用において、ラッカーゼは関 連の反応においてそれ自体で、あるいは反応促進メデイエーター(reaction-prom oting mediator)と組み合わせて使用することができる。かかるメディエーター の例はABTSもしくはN−ヒドロキシベンゾトリアゾールである。 このように本発明は、パルプの脱リグニン、高分子量凝集物の解重合、古紙の 脱インキ、廃水、特にパルプの漂白からのリグニン含有廃水中の芳香族化合物の 重合、染料の酸化、もしくは顔料形成のための染料の 活性化のための新規タンパク質の使用、芳香族化合物のカップリング反応もしく は芳香族側鎖の酸化のための有機合成での使用に関する。 前記の使用は新規ラッカーゼをそれ自体もしくは反応促進メディエーターとの 組合せで使用することによって実施できる。 図1はDNAベクターpANlac1Sの構造を示している。 図2はDNAベクターpANlac2Sの構造を示している。 図3はDNAベクターpL512の構造を示している。 図4はDNAベクターpL532の構造を示している。 図5は新規のラッカーゼの活性のpHによる依存を示している。 図6は新規のラッカーゼのpH安定性を示している。 図7は新規のラッカーゼの活性の温度による依存を示している。 図8は新規のラッカーゼの温度安定性を示している。 以下の実施例は本発明を更に詳細に説明している。DNAもしくはRNAの処 理のために実施例中で使用される標準的な方法、例えば制限エンドヌクレアーゼ 、DNAポリメラーゼ、逆転写酵素等による処理、ならびに標準的な方法、例え ば菌の形質転換、サザンおよびノーザン分析、DNA塩基配列決定、放射線標識 およびPCR技術は特に記載がない限り使用されるキットの製造者によって推奨 されるように実施するか、または製造者の説明書を使用できない場合には標準的 な教本から公知の従来の技術に従って実施する。 例1Trametes versicolor TV−1からのcDNAバンクの作 Trametes versicolor TV−1株を使用した。まず麦芽 寒天プレート(3%麦芽抽出物、0.3%ペプトン(大豆ミール)、1.5%寒 天、pH5.0)上の28℃での7日間の培養によってTrametes ve rsicolorから菌糸体を得た。3片を麦芽寒天プレートから採り、これを 使用して500mlエルレンマイヤーフラスコ中の100mlの滅菌麦芽抽出物 培地(3%麦芽抽出物、0.3%ペプトン(大豆ミール)、pH5.0)に植え た。該培養を28℃で100rpmで振盪しながら7日間インキュベートした。 このようにして製造した菌糸体の懸濁液を磁製漏斗で吸引濾過し、0.9%の生 理食塩水で洗浄し、菌糸体を液体窒素中で凍結させ、乳鉢および乳棒を使用して 破砕した。RNAをRNeasyキット(Qiagen)を使用して単離した。 菌 糸体200mgからの収量はRNA100μgであった。 RNA600μgを使用してmRNAを単離した。これはオリゴ−dTセファ ロース(mRNA単離キット、ファルマシア)上でのクロマトグラフィーによっ て実施した。mRNAの収量は26μgであった。単離したmRNA7.25μ gを使用してcDNAを合成した。このためにストラタジーンからのcDNA合 成キットを使用した。分別後に、アガロースゲル電気泳動によってcDNAを0 .8〜2.1kbおよび2.1〜5kbの大きさの範囲で分別した。両画分のc DNAをアガロース(Qiagen ゲル抽出キット)から単離し、単離したc DNAを使用してcDNAバンクを作成した。cDNAバンクはラムダファージ (ストラタジーン、ZAP発現クローニングシステム)において作成した。0. 8〜2.1kbの画分からは4×105ファージ/ベクターDNA(μg)が得 られた。2.1〜5kbの画分からは1×105ファージ/ベクターDNA(μ g)が得られた。得られたファージをE.coli XL Blue MRF’ 株(ストラタジーン)に感染させることによって増幅させた。 例2Trametes versicolorからの染色体遺伝子バンクの作成 Trametes versicolor TV−1 からの菌糸体を例1に記載のように調製した。菌糸体を磁製漏斗で吸引濾過し、 0.9%の生理食塩水で洗浄し、次いで液体窒素中で凍結させ、乳鉢および乳棒 を使用して破砕し、1g部に分けた。破砕した菌糸体の各1g部を滅菌試料容器 中に取り、直ちに抽出溶液(0.1Mトリス塩酸、pH8.0、0.1MEDT A、0.25MのNaCl、0.6mg/mlのプロテアーゼK)5mlおよび ナトリウムラウロイルサルコシンの10%(w/v)溶液0.5mlと混合した 。50℃で少なくとも2時間のインキュベーション後に、混合物を5MのNaC l0.85mlおよび0.7MのNaCl中の10%(w/v)のCTAB溶液 0.7mlと混合し、65℃で30分間インキュベートした。クロロホルム/イ ソアミルアルコール混合物(24:1)7mlの添加後に、混合物を振盪し、遠 心分離によって2相を分離させた。水相を分離し、イソプロパノール0.6容量 部の添加によって染色体DNAが沈殿した。引き続き沈殿したDNAをカラム( Qiagen Genomic Tip)上で精製した。このようにして16g の菌糸体から染色体DNA0.5mgを単離できた。 染色体遺伝子バンクを作成するために、Trametes versicol or TV−1からの染色体DNA90μgをEcoRIで完全に切断し、アガ ロースゲル電気泳動によって分離した。染色体DNA断 片を2〜4kbおよび4〜10kbの大きさの範囲で単離し、それぞれの場合に おいてラムダファージ(ストラタジーン、ZAPクローニングシステム)にクロ ーニングした。2〜4kbのDNA画分からは1×105ファージ/ベクターD NA(μg)が得られ、4〜10kbのDNA画分からは5.4×104ファー ジ/ベクターDNA(μg)が得られた。ファージをE.coli XL−1 Blue MRF’株に感染させることによって増幅させた。 例3Trametes versicolorからのゲノムDNAからのラッカーゼ 特異的DNAプローブの調製 ラッカーゼ遺伝子を単離するためのDNAプローブをT.versicolo rのゲノムDNAからの縮重プライマーでのPCR増幅によって調製した。縮重 プライマーは公知のラッカーゼ遺伝子の配列の比較に基づいて構築された。EM BL遺伝子データバンクに含まれるNeurospora crassa、Co riolus hirsutus、Phlebia radiata、Agar icus bisporusおよび不完全菌類のサブクラスから詳細に分類され ていない糸状菌からのラッカーゼ遺伝子のアミノ酸配列を比較した。配列の比較 によって、全てのラッカーゼで完全に保存されている5〜7アミノ酸長を有する 4種の ペプチドを同定することが可能である。これらのペプチドを、縮重プライマーの 調製のために縮重コドンを考慮してDNAに翻訳し直した。該プライマーは以下 の配列を有する: プライマーCおよびDは5’末端にBamHI開裂部位(下線部)を有し、そ こにその都度適当な縮重ラッカーゼ配列が結合する。 T.versicolorからのゲノムDNAを例2に記載のような振盪フラ スコ培養の菌糸体から単離した。PCR増幅を当業者に公知の方法で実施した。 第1のPCR反応においては、T.versicolorの染色体DNA200 ngを、更にTaqポリメラーゼ1.25U、1.25mMのMgCl2、各4 種のdNTP0.2mM、およびそれぞれの場合にプライマーAおよびB100 ピコモルを含有させて100μlのPCR反応に使用した。必要なPCR生成物 の特異的増幅のための他の条件は:94℃で5分間、その後に94℃で0.5分 間、40℃で1分間および60℃で2.5分間を7サイクル、ならびに94℃で 0.5分間、50℃で1分間および72℃で2.5分間を30サイクルである。 第1のPCR反応からの1μlを、更にTaqポリメラーゼ1.25U、MgC l2 1.25mM、各4種のdNTP0.2mM、それぞれの場合にプライマーCお よびD100ピコモルを含有させて第2のPCR反応に使用した。必要なPCR 生成物の特異的増幅のための更なる条件は:94℃で5分間、その後に94℃で 0.5分間、40℃で1分間および60℃で2.5分間を7サイクル、ならびに 94℃で0.5分間、50℃で1分間および72℃で2.5分間を30サイクル である。約1.1kbのPCR生成物が得られた。PCR生成物をアガロースゲ ル電気泳動によって精製し、制限酵素BamHIで切断し、BamHIで切断し たpUC18ベクター中にクローニングし、E.coliに形質転換した。形質 転換したE.coliの培養からプラスミドを単離した。5’末端および3’末 端のDNA配列分析によってクローニングしたDNA配列がラッカーゼ遺伝子の 断片であることが示された。 ラッカーゼ遺伝子をスクリーニングするためのDNAプローブを調製するため に、ラッカーゼ特異的PCR断片をBamHIでの処理によって切断し、アガロ ース電気泳動によって単離し、α−[32P]−dATP(ランダムプライミング キツト(random priming kit)、ベーリンガーマンハイム)で放射線標識した。 遊離放射能をセファデックスG25(ファルマシア)上でのクロマトグラフィー によって除去した。放射線標識したDNAプローブの特異的活性は1×107c pm/DNA(μg)であった。 例4Trametes versicolor TV−1からのラッカーゼのcDN A遺伝子の単離 例1に記載したTrametes versicolor TV−1からのc DNA遺伝子バンクを使用した。ラッカーゼcDNA遺伝子のためのスクリーニ ングを従来の技術に従って実施した。第1のスクリーニング段階において、まず E.coli XL−1 Blue MRF’の細胞を10個のペトリ皿上で培 養し、次いでペトリ皿1個あたりcDNAバンク(0.8〜2.1kbの画分、 例1参照)の50000ファージを感染させた。37℃での一晩のインキュベー ション後に、新たに形成したファージをナイロンフィルター(ストラタジーン) に移した。次いで該フィルターを、放射線標識したラッカーゼ特異的プローブ( 例3参照)を使用して製造者の説明書に従ってハイブリダイズさせた。ハイブリ ダイゼーション温度は50%のホルムアミドを含有するハイブリダイゼーション 緩衝液中で45℃であった。陽性のクローンを採り、スクリーニング工程の反復 によって精製した。単離の第3段階後に、20個の強力にハイブリダイズするフ ァージクローンを前記のスクリーニングで単離し、インビボ切り出し(in vivo excision)によって製造者(ストラタジーン)のプロトコールに従ってpBK CM Vベクター(ストラタジーン)に再クローニング(reclone)した。制限エンド ヌクレアーゼ消化およびDNA塩基配列決定によるクローンの分析は、DNAレ ベルで実質的に同一の2種のラッカーゼ遺伝子が単離されたことを示した。2種 のクローンの完全なDNA塩基配列決定は、これらがアミノ酸配列において同一 のラッカーゼ遺伝子の対立遺伝子であることを示した。2種のラッカーゼcDN A遺伝子をLac5.5およびLac5.6と呼ぶ。同様に該ラッカーゼcDN A遺伝子を有するプラスミドをpLac5.5およびpLac5.6と呼ぶ。 例5Trametes versicolor TV−1からのラッカーゼの染色体 遺伝子の単離 Trametes versicolor TV−1からの例2に記載される 染色体遺伝子バンク(2〜10kb画分、例2参照)における染色体のラッカー ゼ遺伝子のためのスクリーニングを例4に記載のcDNAクローンのためのスク リーニングと類似に実施した。例3に記載の放射線標識されたラッカーゼ特異的 プローブを再度使用した。ハイブリダイゼーション温度は50%ホルムアミドを 含有するハイブリダイゼーション緩衝液中で45℃であった。スクリーニングに おいて3個の強力にハイブリダイズしたファージクローンを単離し、インビボ切 り出しによって製造者(スト ラタジーン)のプロトコールに従ってpBKCMVベクター(ストラタジーン) に再クローニングした。制限エンドヌクレアーゼでの分析は全ての3クローンは 同一であり、約7kbの長さを有しているという結論を導いた。DNA塩基配列 決定による分析は、全ての3クローンがラツカーゼLac5.6の染色体遺伝子 に相当することを示した。クローンのコーディング領域およびその都度5’およ び3’領域中の約1kbの末端配列の塩基配列決定をした(SEQ ID NO :8)。 例6AspergillusのラッカーゼLac5.5の発現のためのDNA構成体 の調製 Trametes versicolorのラッカーゼLac5.5のcDN Aを、Aspergillusファミリーからの糸状菌に特異的な発現シグナル に機能的に結合させた。Aspergillusからの以下の遺伝子発現エレメ ントを使用した: a)Aspergillus nigerからのグルコアミラーゼ遺伝子(gl aA)のためのプロモーター(J.C.Verdoes,P.J.Punt,J.M.Schrickx,H.M.van Verseveld,A.H.StouthamerおよびC.A.M.J.J.van den Hondel Transgenic Rese arch 2(1993),84-92)。 b)シグナル配列をコードするDNA断片および成熟グルコアミラーゼの断片を 下流に有するglaAプロ モーター。これにKEX2プロテアーゼの開裂部位をコードするDNA配列を結合 させる(M.P.Broekhuijsen,I.E.Mattern,R.Contreras,J.R.Kinghorn,C.A.M. J.J.van den Hondel(1993),J.Biotechnol.31,135-145)。 c)Aspergillus nidulansからのtrpC遺伝子の転写タ ーミネーター(E.J.Mullaney,J.E.Hamer,M.M.YeltonおよびW.E.Timberlake(19 85),Mol.Gen.Genet.199,37-45)。 しかしながらLac5.5cDNAとAspergillusの発現シグナル との機能的結合のためにはまずLac5.5cDNA遺伝子の5’および3’領 域を改変する必要がある。A:ラッカーゼLac5.5cDNAとglaAプロモーターとの結合 更なるプロセシングのために、Lac5.5cDNA遺伝子をベクターpUC 19に再クローニングした。この目的のために、Lac5.5cDNA遺伝子を 例1で得られたpBK CMVベクターからの1.9kbのEcoRI−Xba I断片として単離し、事前にEcoRIおよびXbaIで切断したpUC19ベ クターにサブクローニングした。得られた4.6kbのプラスミドをpLac5 と呼ぶ。 Lac5.5cDNA遺伝子の開始コドンATGの改変のために、プライマー EおよびFを使用した。 プライマーE中の下線部はBspHI開裂部位を示し、プライマーF中の下線 部はSmaIまたはXmaIの開裂部位を示す。 Lac5.5cDNA遺伝子の3’領域の改変のためにプライマーGおよびH を使用した。 プライマーG中の下線部はBbsI開裂部位を示し、プライマーH中の下線部 はAflII開裂部位を示す。 プライマーEおよびFを使用して、PCR反応によってLac5.5cDNA 遺伝子の5’領域において188bpの大きさの断片を増幅した。プライマーG およびHを使用して、Lac5.5cDNA遺伝子の3’領域において110b pの大きさの断片を増幅した。100μlのPCR混合物はその都度Lac5. 5cDNA(pBK CMVベクター中)10ng、Tthポリメラーゼ0.5 U、MgCl21.25mM、各4種のdNTP0.2mMおよびプライマーE およびFのペアまたはプライマーGおよびHのペアのどちらか140ピコモルを 含有する。PCR反応は以下の 条件下で実施する:94℃で5分間、その後に94℃で1分間、50℃で2分間 および72℃で1分間を30サイクル、最後に72℃で7分間。 まずプライマーEおよびFでのPCR反応からのDNA断片をEcoRIおよ びXmaIで切断し、次いでゲル電気泳動で精製し、事前にEcoRIおよびX maIで切断したベクターpLac5にクローニングした。これにより、翻訳の 開始コドンATGにBspHI開裂部位が組み込まれたベクターpLac51が 得られた。 まずプライマーGおよびHでのPCR反応からのDNA断片をEcoRIおよ びXbaIで切断し、次いでゲル電気泳動によって精製し、事前にEcoRIお よびXbaIで切断したpUC19ベクターにクローニングした。約100bp の大きさのインサートを、得られたプラスミドpLT5からBbsIおよびXb aIで切断した。最終的にBbsI−XbaI断片を事前にBbsIおよびXb aIで切断したベクターpLac51にクローニングした。これにより、ラッカ ーゼcDNA遺伝子の3’末端に新規のAflII開裂部位を有するベクターp Lac513が得られた。 改変した5’および3’領域を有するTrametes versicolo rのラッカーゼLac5.5のためのcDNA遺伝子をプラスミドpLac51 3のBspHIによる部分消化によって単離した。これ により、Lac5.5cDNA遺伝子のコーディング領域およびpUC19ベク ターの約1.1kbを有する2.6kbの断片が得られた。この断片を第2段階 でAflIIで切断し、1.5kbの大きさの得られたLac5.5cDNA断 片を単離した。この断片をAspergillus nigerからの4.0k bの大きさの断片、Aspergillus nidulansからのtrpC 転写ターミネーターの0.7kbの大きさの断片およびpUC18ベクターの2 .7kbの大きさの断片を有するベクターpAN52−12からの7.4kbの 大きさのAflII−NcoI断片にライゲーションした。得られた8.8kb の大きさのベクターをpANlac1と呼ぶ。pANlac1においてglaA プロモーター領域はNcoI−BspHI間領域(intersection)を介してラッ カーゼcDNA遺伝子の翻訳開始コドンATGに機能的に結合する。B:N−末端シグナル配列をグルコアミラーゼ断片と交換することによるラッカ ーゼLac5.5cDNAとglaAプロモーターとの結合 成熟ラッカーゼLac5.5のN末端をコードするcDNA遺伝子の領域を改 変するために、プライマーIおよびFを使用した。 プライマーI中の下線部はEcoRV開裂部位を示す。 Lac5.5cDNA遺伝子の3’領域を改変するために、プライマーGおよ びHを使用した(この例のA参照)。 プライマーIおよびFを使用して、PCR反応によってLac5.5cDNA 遺伝子の5’領域において110bpの大きさの断片を増幅した。プライマーG およびHを使用して、Lac5.5cDNA遺伝子の3’領域において110b pの大きさの断片を増幅した。PCR反応はこの例のAに記載のように実施した 。 プライマーIおよびFでのPCR反応からのDNA断片をEcoRIおよびX maIで切断し、次いでゲル電気泳動によって精製し、事前にEcoRIおよび XmaIで切断したベクターpLac5にクローニングした。これにより成熟ラ ッカーゼタンパク質の最初のアミノ酸のためのコドンの前の5’末端にEcoR V開裂部位、その後に配列Ile Ser Lys Arg(SEQ ID N O:14)のアミノ酸のためのコドンが挿入されたベクターpLac52が得ら れた。この配列はKEX2プロテアーゼのための認識部位で ある。ベクターpLac52中のラッカーゼcDNA遺伝子の3’領域をベクタ ーpLac51に関して記載したように改変した。プライマーGおよびHでのP CR反応からの約100bpの大きさのインサートをBbsIおよびXbaIを 使用してプラスミドpLT5から切断し、単離した。最終的にBbsI−Xba I断片を、BbsIおよびXbaIで切断したベクターpLac52にクローニ ングした。これによりラッカーゼcDNA遺伝子の3’末端に新規のAflII 開裂部位を有するベクターpLac523が得られた。 Trametes versicolorのラッカーゼLac5.5のための 改変された5’および3’領域を有するcDNA遺伝子がEcoRVおよびAf 1IIでプラスミドpLac523を切断することによって得られ、得られた1 .5kbの大きさのLac5.5cDNA断片をアガロースゲル電気泳動の後に 単離した。この断片を、ベクターpAN56−9の9.3kbの大きさのAfl II−EcoRV断片にライゲーションした。ベクターpAN56−9は4.0 kbの大きさのAspergillus nigerからのglaAプロモータ ー、その後にAspergillus nigerのglaAグルコアミラーゼ の断片をコードする2.0kbの大きさの断片、KEX2開裂部位の4アミノ酸 をコードする短いDNA切 片、Aspergillus nidulansからの0.7kbの大きさのt rpC転写ターミネーターの断片ならびに2.7kbの大きさのpUC18ベク ターの断片を有する。EcoRVおよびAFlII開裂部位をKEX2開裂部位 の3’に配置した。E.coliへの形質転換によって、10.8kbの大きさ のベクターが得られ、これをpANlac2と呼ぶ。pANlac2において、 成熟ラッカーゼLac5.5のためのcDNAのコーディング領域を、発現の際 にまずシグナル配列を含むグルコアミラーゼの断片、KEX2プロテアーゼのた めの認識配列の断片および完全なラッカーゼLac5.5の断片からなる融合タ ンパク質が生成するようにグルコアミラーゼ遺伝子のコーディング領域に結合し た。分泌の際にこの融合タンパク質はKEX2プロテアーゼによって開裂され、 成熟ラッカーゼが培養上清に分泌された。C:ベクターpANlac1および ANlac2へのamdSおよびpyrG の選択マーカーの組み込み pANlac1およびpANlac2をそれぞれのベクター5μgのNotI による一晩の消化によって直鎖化した。次いで子牛(calf)腸内アルカリ性ホス ファターゼで処理し、フェノール/クロロホルムで抽出し、エタノール沈殿をし た。選択マーカーのための遺伝子amdS(アセトアミダーゼ)およびpyrG (オロチジン−5’−一リン酸デカルボキシラーゼ) をプラスミドpAN52−11に導入し、これからNotIでの消化後に6.4 kbの大きさの断片として前記遺伝子を単離することができた。それぞれの直鎖 化しかつホスファターゼ処理したベクターpANlac1およびpANlac2 の0.2μgを、単離したNotI断片0.6μgにライゲーションし、これを 使用してE.coli JM109を形質転換した。プラスミドDNAをこれら の形質転換からのアンピシリン耐性のコロニーから調製し、NotIで切断し、 アガロースゲル電気泳動によって分析した。ベクターpANlac1での形質転 換からの8個の分析したクローンの6個ならびにベクターpANlac2での形 質転換からの7個の分析したクローンの5個は6.4kbのNotI遺伝子断片 を有していた。選択マーカー遺伝子を有したベクターをpANlac1S(大き さ15.3kb、図1)およびpANlac2S(大きさ17.2kb、図2) と呼ぶ。得られた6個のpANlac1Sクローンの3個は図1に示される望ま しい方向でNotI断片を有し、得られた5個のpANlac2Sクローンの1 個は図2に示される望ましい方向でNotI断片を有していた。 例7Aspergillusの形質転換 Aspergillus nigerのAB1.13株(pyrG-)(W.van Hartingsveldt,I.E.Matter n,C.M.J.van Zeijl,P.H.PouwelsおよびC.A.M.J.J.van den Hondel(1987)Mol.G en.Genet.206,71-75)およびAspergillus awamori(AT CC 11358株)を形質転換のために使用した。Aspergillusの 形質転換を従来の技術に従って実施した(P.J.PuntおよびC.A.J.J.van den Hond el(1992),Meth.Enzymology 216,447-457)。 AspergillusのプロトプラストをNovozym234での菌糸体 の処理によって得た。1個のフラスコからの菌糸体を、新しく製造しかつ濾過滅 菌(sterile-filtred)した、滅菌エルレンマイヤーフラスコ中のOM培地(0 .27M塩化カルシウム、0.6MのNaCl)中の溶解酵素混合物Novoz ym234(ノボノルディスク)の溶液15ml中に懸濁した。酵素溶液中に再 懸濁した菌糸体を30℃で低速(80rpm)で1〜3時間インキュベートした 。インキュベーションの間に、顕微鏡によってプロトプラストの形成を観察した 。自由に移動可能なプロトプラストは通常1時間後に見られる。大量の自由に移 動可能なプロトプラストが得られた後に、これらをガラス濾過器でMiracl oth(Calbiochem)を通して濾過することによって残留している菌 糸体から分離し、慎重にSTC培地(1.2Mソルビトール、50mM塩化カル シウム、35mMのNaCl、10mMトリス塩酸、pH7.5)で洗浄した。 プ ロトプラストを滅菌試料容器中での懸濁液の遠心分離(2000rpm、4℃、 10分間)によって単離し、STC培地で2回洗浄した。プロトプラストの濃度 を計数盤で顕微鏡によって測定した。プロトプラスト懸濁液をプロトプラスト再 生(regeneration)または形質転換に関する実験のために1×108プロトプラ スト/mlの濃度に調整した。 Aspergillus nigerおよびAspergillus awa moriからのプロトプラストをプラスミドpANlac1SおよびpANla c2Sで形質転換した。両者のプラスミドはpyrG遺伝子(オロチジン−5’ −リン酸デカルボキシラーゼをコードする)ならびにamdS遺伝子(アセトア ミダーゼをコードする)を選択マーカーとして有する。プロトプラストの0.1 mlアリコートを容量12mlのインキュベーション容器中でプラスミドDNA 10μgと混合し、氷上で25分間インキュベートした。次いで60%のPEG 4000溶液(60%PEG4000、50mM塩化カルシウム、10mMトリ ス塩酸、pH7.5)1.25mlを混合を繰り返しながら形質転換混合物にゆ っくりと添加した。更に20℃で20分間インキュベートした後に、反応容器を STC培地で満たし、混合し、4℃で10分間遠心分離した。沈殿物を再懸濁し 、ソルビトールで浸透的に安定化した選択培地上にプレーティングした。プレー トを30℃で7日間インキュベートし、コロニーの生育を観察した。幾つかの実 験での形質転換率はAspergillus nigerに関しては1〜5形質 転換体/プラスミドDNA(μg)であり、Aspergillus awam oriに関しては0.1〜0.5形質転換体/プラスミドDNA(μg)であっ た。 形質転換体をアセトアミドを有する選択プレートに移行することによって純化 (purify)した。高いコピー数を有する形質転換体をアクリルアミドを有する選 択プレート上にプレーティングすることによって同定した。アクリルアミドは、 アセトアミドとは反対にamdS遺伝子によってコードされるアセトアミダーゼ 酵素の不良な基質であり、高いコピー数のamdS遺伝子を有する形質転換体の みが生育可能である。ラッカーゼ酵素の機能的な発現を可能にする形質転換体を 、まずマルトデキストリン、glaAプロモーターの発現のインデューサーを有 するプレートに植えかえることによって同定し、28℃で2日間生育させた後に ABTS寒天(McIllvaine緩衝液(pH4.5)中の0.1%ABT S、1%アガロース)で覆った。ラッカーゼを発現する形質転換体は緑色のハロ の形成によって示された。胞子の懸濁液をアクリルアミドプレート上での良好な 生育およびABTSによる活性試験における陽性反応の両方を示した形質転換体 から製造した。 例8AserillusにおけるTrametes versicolorのラッカ ーゼLac5.5の発現 AspergillusにおけるラッカーゼLac5.5の発現を振盪フラス コ規模で調査した。以下の培養培地を使用した:水道水中のマルトデキストリン の5%(w/v)溶液を20分間オートクレーブにかけた。次いで1M硫酸マグ ネシウム1ml、1000×の微量元素溶液0.5ml、50×のAspA溶液 10mlおよび10%(w/v)カザミノ酸5mlを前記のベース培地500m lに添加した。1000×の微量元素溶液は以下の組成を有している:znSO4 ×7H2O2.2g、H3BO31.1g、MnCl2×4H2O0.5g、FeS O4×7H2O0.5g、CoCl2×5H2O0.17g、CuSO4×5H2O0 .16g、Na2MoO4×2H2O0.15gおよびEDTA5gをH2O80m l中に溶解した。50×のAspA溶液は以下の組成を有する:NaNO315 0g、KCl13g、KH2PO438gをH2O500ml中に溶解させ、pH を10MのKOHによって5.5に調整した。この培地にCuSO4×5H2Oを 最終濃度0.5mMで添加した。 発現実験のために、300mlのエルレンマイヤー フラスコ中の培養培地50mlに1×106胞子/mlを植えた。培養を振盪培 養器中で30℃および300rpmで実施した。試料を1週間にわたり毎日採取 し、培養上清中でのラッカーゼ活性を測定した。最大ラッカーゼ活性は60〜1 00時間の間の生育において観測され、これは0.5〜2.5U/mlの間であ った。ラッカーゼ活性を基質ABTS(アッセイにおいて0.1mM)を使用し てMcIllvaine緩衝液(pH4.5)中および37℃で比色法(colori metry)によって測定した。McIllvaine緩衝液は0.2MのNa2HP O4溶液に対する0.1Mクエン酸溶液のpH4.5への滴定によって製造した 。420nmでの吸光度の増加が測定された(ABTSの420nmでの吸光係 数:3.6×1041×モル1×cm-1)。ラッカーゼ活性1Uは1分間あたりで 変換されるABTS基質1マイクロモルとして定義した。 例9Pichia astorisにおけるTrametes versicolo rのラッカーゼLac5.5の発現 Invitrogenから市販されている発現系を関連の発現ベクター(pP IC3およびpPIC9)およびPichia pastoris株(GS11 5およびKM71)と一緒に使用した。Pichia pastorisのGS115株およびKM71株はヒスチジン要求株である。 発現ベクターはPichia pastorisからのアルコールオキシダーゼ 遺伝子AOX1のプロモーターおよびターミネーターを有する。Tramete s versicolorのラッカーゼLac5.5のcDNA遺伝子を前記の 2個の遺伝子調節因子の間にクローニングした。ベクターpPIC9はAOX1 プロモーターの下流にSaccharomyces cerevisiaeから のα因子タンパク質のシグナル配列をコードするDNA配列を有し、その後に認 識配列Glu−Lys−Arg−Glu−Ala−Glu−Ala(SEQ I DNO:15)をコードする短いDNA切片を有する。該ベクターはE.col iでの選択のためにアンピシリン耐性遺伝子を有している。該ベクターはPic hia pastorisでの選択のためにPichia pastorisか らのHIS4遺伝子を有している。A:ラッカーゼLac5.5のシグナル配列を有するラッカーゼLac5.5発 現ベクターの構築 プラスミドpLac5.5ならびにプライマーKおよびLをラッカーゼ遺伝子 の増幅のために使用した。プライマーFおよびGは以下の配列を有している: プライマーKはEcoRI開裂部位(下線部)を有し、その後にラッカーゼL ac5.5のシグナル配列の最初の7アミノ酸に関するDNA配列を有している 。プライマーLはNot開裂部位(下線部)を有し、その後に相補的かつ逆方向 で翻訳の停止コドンならびにラッカーゼLac5.5の最後の7アミノ酸のため のDNA配列を有している。 PCR増幅を当業者に公知の方法で実施した。pLac5.5DNA20ng を、更にVentポリメラーゼ0.5U、1mMのMgCl2、各4種のdNT P0.2mMおよびそれぞれの場合においてプライマーKおよびL100ピコモ ルを含有して50μlのPCR反応において使用した。必要なPCR生成物の特 異的な増幅のための他の条件は:94℃で5分間、その後に94℃で1分間、5 5℃で1分間および72℃で2分間を25サイクルである。予想された1.5k bの大きさのPCR断片が得られた。PCR断片をアガロースゲル電気泳動で精 製し、制限酵素EcoRIおよびNotIで切断し、エタノールで沈殿させ、H2 O中に取った。ベクターpPIC3をEcoRIおよびNotIで切断し、ア ガロースゲル電気泳動によって精製し、単離し、アルカリ性ホスファターゼで処 理 した。次いでフェノール/クロロホルム(比3:1)で抽出し、エタノール沈殿 をした。PCR増幅によって製造したラッカーゼLac5.5のDNA断片を前 記のように製造したpPIC3べクターにライゲーションし、これを使用してE .coli Top10F’細胞(Invitrogen)を形質転換した。プ ラスミドDNAをアンピシリン耐性クローンから単離し、クローニングした1. 5kbのインサートをEcoRIおよびNotIによる制限消化によって同定し た。調査した12個のクローンの内9個が陽性であった。このようにして得られ たべクターをpL512(図3)と呼ぶ。B:Saccharomces cerevisiaeからのα因子のシグナル 配列を有するラッカーゼLac5.5の発現ベクターの構築 プラスミドpLac5.5ならびにプライマーLおよびMを使用してラッカー ゼ遺伝子を増幅した。プライマーMは以下の配列を有している: プライマーMはEcoRI開裂部位(下線部)のための配列、その後にプロセ シングされるラッカーゼLac5.5の推測されるN−末端の最初の9アミノ酸 のためのDNA配列を有している。プロセシングされるラッカーゼLac5.5 のN−末端は他のラッカー ゼ配列との比較によって導いた。 ラッカーゼLac5.5のプロセシングされた形のためのDNA断片をこの例 のAに記載のようにpLac5.5cDNAならびにプライマーLおよびMでの PCR増幅によって製造した。ベクターpPIC9をEcoRIおよびNotI で切断し、この例のAに記載のpPIC3のように製造し、PCR増幅によって 製造したラッカーゼLac5.5のDNA断片にライゲーションし、これを使用 してE.coli Top10F’細胞(Invitrogen)を形質転換し た。プラスミドDNAをアンピシリン耐性クローンから単離し、クローニングし た1.5kbのインサートをEcoRIおよびNotIでの制限消化によって同 定した。調査した12個のクローンの内3個が陽性であった。このようにして得 られたベクターをpL532(図4)と呼ぶ。C:Pichia pastorisの形質転換 まずPichia pastorisのGS115株およびKM71株をYP D培地(1%酵母抽出物、2%ペプトン、2%デキストロース)5mlにおいて 30℃で一晩培養した。前記の前培養0.2ml部を使用して2つの本培養をY PD培地250mlにそれぞれ植え、再び光学密度(OD600nm)が1.3 〜1.5になるまで30℃で一晩培養した。250mlの本培養からの酵母細胞 を遠心分離(1500×g を5分間)し、毎回H2O200mlで2回洗浄し、1Mのソルビトール10m lで1回洗浄し、最終的に1Mのソルビトール0.5ml中に取った。 ベクターpL512またはpL532のプラスミドDNAをStuIまたはN siIのどちらかで直鎖化し、エタノールを使用して沈殿させ、1μlあたりD NA1μgの濃度で水中に取った。形質転換混合物はPichia pasto ris細胞80μlおよび直鎖化したベクターDNA10μgを含有している。 形質転換を1500V、25μFおよび200オーム(バイオラッドのGene Pulser)でのエレクトロポレーションによって実施した。放電時間は約 4.2ミリ秒であった。1Mのソルビトール1mlを形質転換混合物に添加し、 これを氷上で30分間インキュベートし、次いでヒスチジン不含のMDプレート (1.34%YNB、酵母の窒素ベース(nitrogen base)、4× 10-5%ビオチン、1%デキストロース、1.5%寒天)上に0.3mlのアリ コートでプレーティングした。形質転換体は30℃での3〜5日間のインキュベ ーション後に現れた。形質転換体をMDプレート上に2回ストリークすることに よって精製した。ラッカーゼの生産体をMMインディケータープレート(MM ind icator plate)上で同定した。MMインディケータープレートは1.34%YN B、4×10-5%ビオチン、0.5%メタノール、1.5%寒天、1m MABTSおよび0.1mM硫酸銅を含有している。インデューサーのメタノー ルをペトリ皿の蓋に供し、拡散によりコロニーにメタノールが供給されることを 保証するために毎日新しくした。ラッカーゼの生産者は30℃での2〜3日間の インキュベーション後に緑色のハロを形成した。 E:振盪フラスコ中での発現 BMGY培地(1%酵母抽出物、2%ペプトン、0.1Mリン酸カリウム、p H6.0、1.34%YNB、4×10-5%ビオチン、1%グリセロール)50 mlにラッカーゼを生産するPichia pastorisの形質転換体を植 え、振盪機(300rpm)上で28℃で48時間培養した。この前培養からの 細胞を遠心分離(1500×gで10分間)によって単離し、本培養培地(MM Y、1%酵母抽出物、2%ペプトン、1.34%YNB、4×10-5%ビオチン 、3%メタノール)10ml中に懸濁した。MMY培地に0.5mM硫酸銅を供 給し、更に本培養を振盪機上で300rpmおよび室温で培養した。本培養にメ タノール(0.3ml/培地10ml)を24時間間隔で供給した。組み換えラ ッカーゼLac5.5の生産は24時間後に始まった。4U/mlまでの生産率 は本培養開始後190時間で達した。 例10組み換えラッカーゼLac5.5の単離 組み換えラッカーゼLac5.5を例8に記載のように形質転換したAspe rgillus株の振盪フラスコ中での培養によって得た。ラッカーゼLac5 .5を含有する培養上清をクロスフロー濾過によって濃縮した。このために除去 限界(exclusion limit)30kDを有するSartoconマイクロ濾過モジ ュール(micro filtration module)(Sartorius)を使用した。次い で濃縮したラッカーゼLac5.5を凍結乾燥し、20mMリン酸ナトリウム( pH6.0)中に溶解させた。濃縮した組み換えラッカーゼLac5.5の活性 は18.6U/mlであった。 クロスフロー濾過によって濃縮したラッカーゼを20mMビストリス塩酸(p H6.5)に対して透析した。この後に導電率1.5mS/cmが測定された。 次いで透析したラッカーゼを、20mMのビストリス塩酸(pH6.5)(ロー ディングバッフアー)で較正したDEAEセファロース(フアルマシア)のカラ ム上でのクロマトグラフィーを実施した。これらの条件下でラッカーゼはDEA Eセファロースに結合する。ローディングバッファー中の0Mから0.5Mへの NaClの直線のグラジエントでの溶離によって、ラッカーゼ活性は塩濃度0. 15MのNaClで回復した。DEAEセファロースカラムからのラッカーゼ画 分と硫酸アンモニウムとを20%飽和になるまで混合し、かつ酢酸ナトリウム( pH4.5)を混合し(最 終濃度20mM)、pHを酢酸によって4.5に調整した。次いでこのようにし て調製したラッカーゼ画分をローディングバッファー(20mM酢酸ナトリウム (pH4.5)、20%飽和の硫酸アンモニウム)で較正したフェニル−セファ ロース(ファルマシア)のカラム上でのクロマトグラフィーを実施した。これら の条件下でラッカーゼはフェニル−セファロースに結合する。20mM酢酸ナト リウム(pH4.5)中の20〜0%飽和の硫酸アンモニウムの直線のグラジエ ントでの溶離によって、ラッカーゼ活性は硫酸アンモニウム飽和16%で回復し た。ラッカーゼ画分を20mMビストリス塩酸(pH6.5)に対して透析し、 DEAEセファロースへの結合および引き続いて実施する0.3MのNaClで の段階的な溶離によって濃縮した。結合および0.3MのNaClでの溶離はい ずれも20mMのビストリス塩酸(pH6.5)中で実施した。ラッカーゼ活性 は出発材料に対して20%が得られた。単離したラッカーゼをN−末端アミノ酸 配列決定によって分析した。これによって決定された配列: はcDNA配列およびホモロジー比較とから得られる成熟ラッカーゼLac5. 5のN末端一致した。 例11組み換えラッカーゼLac5.5の生物化学的特性 例8に記載のようにAspergillus中で製造される組み換えラッカー ゼLac5.5の至適pHと至適温度ならびにpHと温度の安定性を調査した。 これらの実験のために、組み換えラッカーゼLac5.5の緩衝液を、セファデ ックスG25(ファルマシア、PD10カラム)上でMcIllvaine緩衝 液(pH4.5)に取り替えた。A:至適pH 図5に示される各pH値に適当な緩衝液を、緩衝されないクエン酸ナトリウム およびリン酸ナトリウムの溶液の適当な混合によって製造した。図5から明らか なように、ラッカーゼLac5.5は基質ABTSに対して強酸性域に活性至適 を有する。B:pH安定性 ラッカーゼLac5.5を、pH3.0、4.5および6.0(温度37℃) のMcIllvaine緩衝液中でプレインキュベートした。アリコートを0、 30、60および120分後に取り、McIllvaine緩衝液(pH4.5 )中に希釈し、37℃でラッカーゼ活性を測定した。ラッカーゼ活性はpH4. 5および6.0での前処理によって悪影響を受けなかった。pH3.0でのラッ カーゼの半減期は60および120分の間であった(図6)。C:至適温度 組み換えラッカーゼLac5.5のラッカーゼ活性を図7に示される温度で測 定した。ラッカーゼ活性はMcIllvaine緩衝液(pH4.5)でのAB TSアッセイを使用して測定した。意想外にもこれからラッカーゼLac5.5 の至適温度が70℃であることが判明した。測定されるラッカーゼ活性が最大値 の半分である温度は50℃および80℃であった。D:温度安定性 ラッカーゼLac5.5をMcIllvaine緩衝液(pH4.5)中で4 5、55および65℃でプレインキュベートした。アリコートを0、30、60 および120分後に取り、McIllvaine緩衝液(pH4.5)中に希釈 し、ラッカーゼ活性を37℃で測定した。ラッカーゼ活性は45℃での前処理に よって悪影響を受けなかった。55℃での120分間のプレインキュベーション 後の測定によって80%の活性が依然として残留していることが示された。65 ℃でのラッカーゼの半減期は60分間であった(図8)。 配列表 (1)一般的情報: (i)出願人: (A)名称:Consortium fuer electorochem ische Industrie GmbH (B)町:ツィールシュタットシュトラーセ20 (C)市:ミュンヘン (E)国:ドイツ (F)郵便コード:D−81379 (G)電話:089 748440 (H)テレファックス:089 74844350 (ii)発明の名称:DNA配列、これらのDNAの発現、該DNAによって コードされる好熱性ラッカーゼならびにその使用 (iii)配列の数:19 (iv)コンピューター読み取り可能形: (A)媒体型:フロッピーディスク (B)コンピューター:IBM PC コンパチブル (C)オペレーティングシステム:PC−DOS/MS−DOS (D)ソフトウェア:パテント イン リリース#1.0、バージョン#1 .25(EPO) (2)SEQ ID NO:1に関する情報: (i)配列特徴: (A)長さ:1572塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNAからのmRNA (iii)ハイポセティカル:NO (iii)アンチセンス:NO (vi)起源: (A)生物名:Trametes versicolor (B)株名:TV−1 (vii)直接の起源: (B)クローン:plac55 (xi)配列:SEQ ID NO:1 DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION The DNA sequence, the expression of these DNAs, and the thermophilic Case and its use   The present invention relates to a DNA sequence encoding a protein having laccase activity, Expression of the DNA sequence of And its use.   A class of enzymes of great interest for industrial use is the laccase enzyme (p- Hydroxyphenol oxidase, EC 1.10.3.2). Laccases belong to a family called "blue copper proteins" and generally have four Having copper ions, which are located at three copper centers, indicating type 1 to type 3 I have. Laccase is generally a secreted protein and sometimes has a molecular weight of 10%. It is characterized by having a glycosylation content of ~ 45%. Laccase is an acid It has a very broad substrate specificity for the aromatic compounds to be converted. In this oxidation The resulting oxygen is used to reduce oxygen. This produces water. white The function of laccase present in white rot fungi is Decomposition. This is the use of laccase in the paper industry for delignification of pulp. It is also a reason for interest in.   In addition to the degradation of macromolecular compounds, such as lignin, laccases are particularly useful for aromatic compounds. Can also catalyze the polymerization of the product. This example relates to laccase present in plants Biosynthesis of lignin in growing plants. Therefore, the industrial potential of laccase Applications include, for example, all types of polymerization reactions in wastewater treatment. Organic chemical synthesis The use of laccase in, for example, the coupling reaction of aromatic compounds or It is also known for side chain oxidation. However, regarding these many possible applications Most known laccases are mesophilic, i.e., low temperature optimal and limited. Thermal stability.   Preconditions for the industrial use of laccase enzymes are that they can be produced at low cost What you can do. In general, this means the use of recombinantly produced enzymes. It is only possible depending on the application. Various prokaryotic and eukaryotic expression systems are protein-based It can be used for building. Examples of prokaryotic expression systems are described in Escherichia. col i and Bacillus subtilis. Widely used eukaryotic Expression systems include cell culture systems for both mammalian and insect cells and eukaryotic microorganisms, such as For example, yeast or filamentous fungi.   WO 96/00290 is a subclass of the incomplete fungi, the filamentous fungus Polyporu. Five laccase genes from S. spintus have been described. these One of the laccase genes (LCC1) is produced as a recombinant protein. The thermophilic properties of this enzyme have not been further investigated, but are described for the purpose of hair dyeing. The use of LCC1 laccase for the purpose is that this enzyme has mesophilic properties. Implying that   Filamentous fungus Scytalidium thermophoph of the subclass of incomplete fungi Production of recombinant laccase with thermophilic properties from ilum is described in WO 95/338. No. 37. It is not known whether this enzyme is suitable for pulp bleaching. Not.   So far, thermophilic laccases from filamentous fungi of the subclass of defective fungi have been identified. No method is described for producing it as a recombinant protein.   CA: AN96-203142 discloses various properties of thermophilic laccase I have. No DNA or protein sequence for this type of protein is disclosed.   The present invention encodes a protein having laccase activity and comprises SEQ ID N O: DNA sequence or SE from position 76 of position 1 to position including position 1572 DNA sequence from position 76 to position including position 1572 of Q ID NO: 2 Alternatively, the DNA has a DNA sequence having a sequence homology of 80% or more. DNA sequence.   From position 1 to position 75 of SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2 Is for protein secretion Represents a DNA sequence encoding the signal sequence of This signal sequence is a protein It can be exchanged for any other signal sequence for secretion.   The novel DNA sequence can be found, for example, in the incomplete strain Trametes versicolo. r TV-1 (DSMZ (Mikroorganismen und Zellkulturen) GmbH (D -38124 Braunschweig) (deposited under number DSM11523) Can be obtained by cloning. Trametes v for this purpose Gene bank is prepared from ericolorTV-1 by a method known per se I do.   To isolate new DNA sequences in the gene bank, a laccase-specific D A DNA probe having an NA sequence is used. This type of DNA probe is, for example, From genomic DNA from Trametes versicolor TV-1 Can be obtained by a PCR reaction using the DNA primers.   The primers used are preferably degenerate (dege) having a length of 14 to 27 bp. netrate) DNA sequences, which are compared to known laccase genes Obtained by   Advantageously, DNA sections suitable as primers are oligonucleotides of established DNA sections. Obtained by nucleotide synthesis.   Novel laccase genes are described, for example, in Examples 1-5 Can be isolated as follows.   The laccase gene isolated by the example method can be obtained by techniques known to those skilled in the art, for example, It can be modified at any desired position in the sequence by site-directed mutagenesis. it can. Therefore, the present invention encodes a protein having laccase activity,   The DNA sequence from position 76 to position including position 1572 of ID NO: 1 is also Or from position 76 of SEQ ID NO: 2 to the position including position 1572 DNA sequence or DNA having greater than 80% sequence homology to said DNA sequence DNA sequence containing the sequence.   In order to express novel DNA, the latter is expressed in an expression vector in a manner known per se. The laccase gene and the expression vector containing the laccase gene in a microorganism. And expressed in the microorganism.   The expression vector is integrated into the genomic DNA of the host organism and is DNA constructs that are replicated in Not selectively integrated into host genome Self-replicating DNA constructs, such as plasmids, artificial chromosomes or comparable staining It may be an extracorporeal genetic factor.   A suitable expression vector should advantageously have the following genetic elements:   A promoter that promotes laccase gene expression in the host organism. Advantageously Promoter has high expression efficiency It should be a strong promoter to guarantee the rate. Advantageously promoted Is functionally linked to the 5 'end of the laccase gene.   Suitable and advantageous promoters are tac promoter, subtilisin promoter -, GAL promoter, TAKA amylase promoter, polyhedrin pro Motor, glucoamylase promoter, gapDH promoter and It is selected from the group of call oxidase promoters.     E. FIG. For expression in E. coli, the tac promoter is added to Bacillus. Subtilisin promoter is used for expression in yeast, Saccharomyces yeast cerevisiae is expressed by the GAL promoter, Aspergi For expression in lplus niger, a TAKA amylase promoter is used. Polyhedrin pro for expression in insect cells infected with culovirus Glucoa mirror with motor or from Aspergillus niger Zepromoter or alcohol from the yeast Pichia pastoris Oxidase promoters are suitable and advantageous.   Glucoamylase promoter from Aspergillus niger Or an alcohol oxidase promoter from the yeast Pichia pastoris Especially for the expression of novel thermophilic laccases Appropriate.   Advantageously, the expression vector contains a signal for transcription termination appropriate to the host organism. In eukaryotes, it should also have a signal for polyadenylation. They should be operably linked to the 3 'end of the laccase gene.   Advantageously, the expressed protein should be secreted into the medium by the host organism. You. Secretion by the host organism is mediated by an N-terminal signal sequence. signal The sequence is the natural signal sequence present in the laccase gene or These encoding DNAs are contained in the expression vector Functionally linked to the 5 'end of the gene.   The following secretory protein signal sequences are advantageous: Klebsiella α-cyclodextrin glucosyltransferase from oxytoca, Subtilisin from Bacillus subtilis, Saccharom alpha factor from Yces cerevisiae, Pichia pastori acid phosphatase from Aspergillus niger, α-A from Aspergillus niger Mirase, Aspergillus niger or Aspergillus naturally occurring in the glucoamylase or laccase gene from Sawamori Existing signal sequence.   Particularly suitable are naturally occurring in the laccase gene Signal sequence and the following heterologous signal sequence: Aspergill gluco from Aspergillus awamori or Aspergillus awamori Amylase signal sequence, Saccharomyces cerevisia signal sequence of α-factor from E or acid from Pichia pastoris Phosphatase signal sequence.   Laccase is secreted by secreted proteins or secreted proteins The gene for the fragment was operably linked to the laccase gene in an expression vector This can be achieved by expressing the fusion protein. Particularly advantageous in this regard Is the N-terminal of glucoamylase from Aspergillus niger Expression of a fusion protein consisting of an end fragment and a thermophilic laccase.   More advantageously, the point of attachment of the glucoamylase to the laccase is determined by the Noic acid sequences recognize for processing peptidases in the secretory apparatus of host cells Site, where the expressed fusion protein is degraded in vivo. Laccase is released.   Also advantageously, the expression vector has a gene for a selectable marker. To the gene Thus, the encoded selectable marker confers antibiotic resistance on the host organism, or May complement defects in the host organism.   Advantageous selectable markers include antibiotics such as ampicillin, kanamycin, chlora Mufenicol, tetracycline, hygromycin, zeocin Or a gene that confers resistance to bialaphos. Growth defects Selectable markers that are advantageous for complementing are genes, such as amdS, pyrG, t rpC, His4, niaD, argB, or hygB.   Particularly suitable as selectable markers are the amdS and pyrG genes and It is a resistance gene for the His4 gene and the antibiotic zeocin.   Furthermore, the selection marker gene is present together with the laccase gene in one DNA molecule. Or these two genes are present separately in different DNA molecules Is also good. In the latter case, both DNA molecules are co-transformed together.   Thus, the present invention also relates to an expression vector having a novel DNA sequence.   Suitable and advantageous microorganisms for expressing the novel expression vectors are those derived from bacteria. Microorganisms such as E. E. coli or Bacillus subtilis, true Microorganisms derived from eukaryotes, such as the genus Saccharomyces or Pichi a, or genus Aspergillus, Trichoderma, Ne urospora or Schyzophilum Fungal or eukaryotic cell cultures, such as insect cells infected with baculovirus Vesicles.   Particularly suitable are filamentous fungi of the genus Aspergillus, such as Aspergi lplus niger or Aspergillus awamori or Yeasts such as Saccharomyces cerevisiae or Pi chia pastoris.   The protein encoded by the novel DNA has the following biochemical properties Is:   The protein has laccase enzymatic activity. The optimal pH for the enzyme activity is Maximum enzyme activity in the acidic range and maximum at pH 2.0 and maximum at pH 4.0 Having half of the The stability of the enzyme at 45 ° C and pH 4.5-6.0 is up to 2 hours. Time is 100%.   The stability of the enzyme at 45 ° C. and pH 3.0 is 50% for up to 1 hour. You. The optimum temperature at pH 4.5 is 70 ° C. Enzyme activity at 65-75 ° C is still As 80% of the maximum activity. Enzyme activity at 50-80 ° C is still maximal 50%. Enzyme stability at pH 4.5 and temperatures below 55 ° C is up to 2 hours. Time is 90%. 1 hour enzyme stability at pH 4.5 and 65 ° C Until 50%.   The new protein contains the protein sequence SEQ ID NO: 3.   Advantageously, the novel protein is transformed by the expression of a novel DNA sequence in said microorganism. Manufacturing.   Advantageously, the DNA is expressed in a microorganism using one of the expression vectors described above. .   Thus, the present invention relates to a microorganism having a novel DNA sequence or a novel expression vector. Also concerns.   Uses a combination of microorganism and expression system that allows secretion of proteins from the microorganism It is particularly advantageous to do so. Examples of such advantageous combinations are:   Aspergillus niger or Aspergillus awa Glucoamylase promoter for expressing novel DNA sequences in mori Use. Secretion signals advantageously used in this expression system are thermophilic lacquers The signal sequence of the enzyme itself or the glucoamylase-laccase fusion protein This is the signal sequence of the lecoamylase moiety.   An approach for expressing novel DNA sequences in Pichia pastoris Use of the alcohol oxidase promoter. Secretion used in this expression system The signal is advantageously the signal sequence of the thermophilic laccase itself or Sacchar Omyces cerevisiae α-factor signal sequence or Pic acid phosphatase from H. pastoris Signal sequence.   The novel proteins are suitable for all known applications for laccase. this Et al. For delignification of pulp and depolymerization of high molecular weight aggregates It is particularly suitable for Laccase is used to deink waste paper and treat wastewater, especially in this regard. On the polymerization of aromatic compounds in lignin-containing wastewater from pulp bleaching And further in widespread applications in the detoxification of contaminated soil. Other areas of use include oxidation of the dye and activation of the dye by reaction with the precursor component, It relates to forming pigments. The range of use in organic synthesis is the coupling of aromatic compounds. Reaction or oxidation of aromatic substituents; Carboxylic acid form by further oxidation of the oxidation of zircohol to the corresponding aldehyde This includes avoiding implementation. In said use, laccase is In a series of reactions, by itself or by a reaction-promoter oting mediator). Such mediator Examples are ABTS or N-hydroxybenzotriazole.   Thus, the present invention relates to delignification of pulp, depolymerization of high molecular weight aggregates, Deinking, removal of aromatic compounds in wastewater, especially lignin-containing wastewater from pulp bleaching Dyes for polymerization, oxidation of dyes, or pigment formation Use of novel proteins for activation, coupling reactions of aromatic compounds or Relates to the use in organic synthesis for the oxidation of aromatic side chains.   The use described above allows the novel laccase to interact with itself or with a reaction-promoting mediator. It can be implemented by using in combination.   FIG. 1 shows the structure of the DNA vector pANlac1S.   FIG. 2 shows the structure of the DNA vector pANlac2S.   FIG. 3 shows the structure of the DNA vector pL512.   FIG. 4 shows the structure of the DNA vector pL532.   FIG. 5 shows the dependence of the activity of the novel laccase on pH.   FIG. 6 shows the pH stability of the new laccase.   FIG. 7 shows the temperature dependence of the activity of the novel laccase.   FIG. 8 shows the temperature stability of the new laccase.   The following examples illustrate the invention in more detail. DNA or RNA processing Standard methods used in the examples for the control, such as restriction endonucleases , DNA polymerase, reverse transcriptase, etc., and standard methods, such as Bacterial transformation, Southern and Northern analysis, DNA sequencing, radiolabeling And PCR techniques are recommended by the kit manufacturer used unless otherwise noted Or standard if manufacturer's instructions are not available This is performed according to a conventional technique known from a textbook.   Example 1Creation of cDNA bank from Trametes versicolor TV-1 Success   Trametes versicolor TV-1 strain was used. First malt Agar plate (3% malt extract, 0.3% peptone (soybean meal), 1.5% cold Cultures at 28 ° C. for 7 days on heavens, pH 5.0) Mycelium was obtained from rsiccolor. Take three pieces from a malt agar plate Use 100ml sterile malt extract in 500ml Erlenmeyer flask using Planted in medium (3% malt extract, 0.3% peptone (soybean meal), pH 5.0) Was. The culture was incubated at 28 ° C. with shaking at 100 rpm for 7 days. The suspension of the mycelium thus produced was filtered by suction with a porcelain funnel to give 0.9% Wash with saline, freeze mycelium in liquid nitrogen and use mortar and pestle Crushed. RNA was isolated using the RNeasy kit (Qiagen). Fungus The yield from 200 mg of thread was 100 μg of RNA.   MRNA was isolated using 600 μg of RNA. This is an oligo-dT Sepha Chromatography on Loose (mRNA isolation kit, Pharmacia) It was carried out. The yield of mRNA was 26 μg. 7.25μ of isolated mRNA g was used to synthesize cDNA. For this purpose, cDNA synthesis from Stratagene A kit was used. After separation, the cDNA was reduced to 0 by agarose gel electrophoresis. . The fractions ranged in size from 8 to 2.1 kb and 2.1 to 5 kb. C for both fractions DNA was isolated from agarose (Qiagen gel extraction kit) and the isolated c A cDNA bank was created using the DNA. Lambda phage cDNA bank (Stratagene, ZAP expression cloning system). 0. 4 × 10 from the fraction of 8 to 2.1 kbFivePhage / vector DNA (μg) obtained Was done. 1 × 10 from the fraction of 2.1 to 5 kbFivePhage / vector DNA (μ g) was obtained. The resulting phage was transformed into E. coli. coli XL Blue MRF ' Amplification was achieved by infecting the strain (Stratagene).   Example 2Creation of a chromosome gene bank from Trametes versicolor   Trametes versicolor TV-1 Was prepared as described in Example 1. The mycelium was suction filtered through a porcelain funnel, Wash with 0.9% saline, then freeze in liquid nitrogen, mortar and pestle And divided into 1 g portions. Each 1 g portion of the crushed mycelium is placed in a sterile sample container. And immediately extract solution (0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.1 MEDT) A, 0.25 M NaCl, 0.6 mg / ml protease K) 5 ml and Mixed with 0.5 ml of a 10% (w / v) solution of sodium lauroyl sarcosine . After incubation at 50 ° C. for at least 2 hours, the mixture is washed with 5M NaC 10% (w / v) CTAB solution in 0.85 ml and 0.7 M NaCl Mix with 0.7 ml and incubate at 65 ° C. for 30 minutes. Chloroform / a After addition of 7 ml of the soamyl alcohol mixture (24: 1), the mixture was shaken and centrifuged. The two phases were separated by centrifugation. Separate the aqueous phase, isopropanol 0.6 volume Chromosomal DNA was precipitated by the addition of a part. Subsequently, the precipitated DNA is applied to a column ( Purified on a Qiagen Genomic Tip). 16g in this way 0.5 mg of chromosomal DNA could be isolated from the mycelium.   To create a chromosomal gene bank, Trametes versicol or 90 μg of chromosomal DNA from TV-1 was completely digested with EcoRI and Separated by Rose gel electrophoresis. Chromosomal DNA breaks The pieces were isolated in the size range of 2-4 kb and 4-10 kb, in each case To lambda phage (Stratagene, ZAP cloning system) Learning. From the DNA fraction of 2 to 4 kb, 1 × 105 phage / vector D NA (μg) was obtained. From the DNA fraction of 4 to 10 kb, 5.4 × 10Fourfur Di / vector DNA (μg) was obtained. The phage was transformed into E. coli. coli XL-1 Amplification was achieved by infecting the Blue MRF 'strain.   Example 3Laccase from genomic DNA from Trametes versicolor Preparation of specific DNA probe   A DNA probe for isolating the laccase gene was obtained from T. versicolo r was prepared by PCR amplification with degenerate primers from genomic DNA. Degeneracy Primers were constructed based on a comparison of known laccase gene sequences. EM Neurospora crassa, Co included in BL Gene Data Bank riolus hirsutus, Phlebia radiata, Agar Icus bisporus and subclasses of incomplete fungi The amino acid sequences of the laccase genes from non-filamentous fungi were compared. Compare arrays Has a length of 5-7 amino acids that is completely conserved in all laccases Four kinds It is possible to identify the peptide. These peptides are used as degenerate primers The DNA was retranslated into DNA in consideration of degenerate codons for preparation. The primer is With an array of:  Primers C and D have a BamHI cleavage site (underlined) at the 5 'end, and In each case, an appropriate degenerate laccase sequence binds.   T. Genomic DNA from Versicolor was shaken as described in Example 2. It was isolated from mycelium of Sco culture. PCR amplification was performed by methods known to those skilled in the art. In the first PCR reaction, Versicolor chromosomal DNA 200 ng, plus 1.25 U of Taq polymerase, 1.25 mM MgClTwo, Each 4 0.2 mM of species dNTPs and primers A and B100 in each case Picomoles were included and used in a 100 μl PCR reaction. Required PCR products Other conditions for the specific amplification of are: 5 minutes at 94 ° C, followed by 0.5 minutes at 94 ° C. 7 cycles of 1 minute at 40 ° C. and 2.5 minutes at 60 ° C., and 94 ° C. 30 cycles of 0.5 minutes, 1 minute at 50 ° C and 2.5 minutes at 72 ° C. 1 μl from the first PCR reaction was further added to Taq polymerase 1.25 U, MgC lTwo 1.25 mM, 0.2 mM for each of the four dNTPs, primer C in each case And 100 picomoles of D and used for the second PCR reaction. Required PCR Further conditions for specific amplification of the product are: 94 ° C. for 5 minutes, followed by 94 ° C. 7 cycles of 0.5 minutes, 1 minute at 40 ° C. and 2.5 minutes at 60 ° C., and 30 cycles of 94 ° C for 0.5 minutes, 50 ° C for 1 minute and 72 ° C for 2.5 minutes It is. An approximately 1.1 kb PCR product was obtained. Transfer the PCR product to agarose Purified by electrophoresis, digested with the restriction enzyme BamHI, digested with BamHI. Cloned into the pUC18 vector coli. Trait The converted E. Plasmids were isolated from E. coli cultures. 5 'end and 3' end The DNA sequence cloned by DNA sequence analysis of the end It was shown to be a fragment.   To prepare a DNA probe for screening the laccase gene Next, the laccase-specific PCR fragment was digested by treatment with BamHI, Α- [32P] -dATP (random priming Radiolabeled with a kit (random priming kit, Boehringer Mannheim). Chromatography of free radioactivity on Sephadex G25 (Pharmacia) Removed by The specific activity of the radiolabeled DNA probe is 1 × 107c pm / DNA (μg).   Example 4Laccase cDN from Trametes versicolor TV-1 Isolation of A gene   C from Trametes versicolor TV-1 described in Example 1 DNA gene bank was used. Screeni for laccase cDNA gene Was performed according to conventional techniques. In the first screening stage, E. FIG. E. coli XL-1 Blue MRF 'cells were cultured on 10 Petri dishes. And then a cDNA bank per petri dish (0.8-2.1 kb fraction, 50,000 phages (see Example 1) were infected. Incubation overnight at 37 ° C After the filtration, newly formed phages are filtered with a nylon filter (Stratagene). Moved to The filter is then used to form a radiolabeled laccase-specific probe ( (See Example 3) and hybridized according to the manufacturer's instructions. Hybrid Hybridization containing 50% formamide 45 ° C. in buffer. Take a positive clone and repeat the screening process Purified. After the third stage of isolation, 20 strongly hybridizing Large clones were isolated by the above-described screening and excised in vivo (in vivo excision) according to the manufacturer's (Stratagene) protocol. CM It was recloned (reclone) into a V vector (Stratagene). Restriction end Analysis of the clones by nuclease digestion and DNA sequencing Bells indicated that two substantially identical laccase genes were isolated. 2 types Complete DNA sequencing of the clones indicates that they are identical in amino acid sequence. Laccase gene. Two kinds of laccase cDN The A gene is called Lac5.5 and Lac5.6. Similarly, the laccase cDN Plasmids containing the A gene are called pLac5.5 and pLac5.6.   Example 5Laccase chromosome from Trametes versicolor TV-1 Gene isolation   Described in Example 2 from Trametes versicolor TV-1 Chromosome lacquer in chromosome gene bank (2-10 kb fraction, see Example 2) Screening for the zeogene was performed using the screen for cDNA clones described in Example 4. Performed similarly to leaning. Radiolabeled laccase specific as described in Example 3 The probe was used again. Hybridization temperature is 50% formamide 45 ° C. in the containing hybridization buffer. For screening Three strongly hybridized phage clones were isolated in The manufacturer (strike PBKCMV vector (Stratagene) according to the protocol of (Latagene) Recloned. Analysis with restriction endonuclease revealed that all three clones It was the same and led to the conclusion that it had a length of about 7 kb. DNA base sequence Analysis by determination showed that all three clones had the chromosomal gene of Latcase Lac5.6. Is shown. The coding region of the clone and the 5 'and And the nucleotide sequence of the terminal sequence of about 1 kb in the 3 'region was determined (SEQ ID NO: : 8).   Example 6DNA constructs for expression of Aspergillus laccase Lac5.5 Preparation of   CDN of Laccase Lac 5.5 from Trametes versicolor A is a filamentous fungus-specific expression signal from the Aspergillus family Functionally coupled to The following gene expression elements from Aspergillus Used the following: a) Glucoamylase gene (gl) from Aspergillus niger aA) (J.C.Verdoes, P.J.Punt, J.M.Schrickx, H.M.van)  Verseveld, A.H.Stouthamer and C.A.M.J.J.van den Hondel Transgenic Rese arch 2 (1993), 84-92). b) the DNA fragment encoding the signal sequence and the mature glucoamylase fragment GlaA pro to have downstream motor. A DNA sequence encoding the cleavage site of KEX2 protease was ligated to this. (M.P.Broekhuijsen, I.E.Mattern, R.Contreras, J.R.Kinghorn, C.A.M. J.J.van den Hondel (1993), J.Biotechnol.31, 135-145). c) Transcription of trpC gene from Aspergillus nidulans Terminators (E.J.Mullaney, J.E.Hamer, M.M.Yelton and W.E.Timberlake (19 85), Mol.Gen.Genet.199, 37-45).   However, Lac5.5 cDNA and Aspergillus expression signals First, the 5 'and 3' regions of the Lac5.5 cDNA gene The area needs to be modified.A: Binding of laccase Lac5.5 cDNA with glaA promoter   For further processing, the Lac5.5 cDNA gene was transferred to the vector pUC. 19 and was recloned. For this purpose, the Lac5.5 cDNA gene was 1.9 kb EcoRI-Xba from pBK CMV vector obtained in Example 1 PUC19 vector isolated as an I fragment and previously cut with EcoRI and XbaI. And subcloned into the vector. The resulting 4.6 kb plasmid was cloned into pLac5 Call.   Primers for modification of the start codon ATG of the Lac5.5 cDNA gene E and F were used.  The underlined part in the primer E indicates the BspHI cleavage site, and the underlined part in the primer F The part indicates the cleavage site of SmaI or XmaI.   Primers G and H for modification of the 3 'region of the Lac5.5 cDNA gene It was used.   The underlined part in the primer G indicates the BbsI cleavage site, and the underlined part in the primer H Indicates an AflII cleavage site.   Lac5.5 cDNA by PCR reaction using primers E and F A 188 bp fragment was amplified in the 5 'region of the gene. Primer G And H using the 110b in the 3 'region of the Lac5.5 cDNA gene A fragment of size p was amplified. 100 μl of the PCR mixture was in each case Lac5. 5 ng cDNA (in pBK CMV vector) 10 ng, Tth polymerase 0.5 U, MgClTwo1.25 mM, 0.2 mM each of four dNTPs and primer E And F pairs or primers G and H pairs at 140 pmol contains. The PCR reaction is as follows Performed under conditions: 5 minutes at 94 ° C., then 1 minute at 94 ° C., 2 minutes at 50 ° C. And 30 cycles of 1 minute at 72 ° C, and finally 7 minutes at 72 ° C.   First, the DNA fragment from the PCR reaction with primers E and F was And XmaI, and then purified by gel electrophoresis. It was cloned into the vector pLac5 cut with maI. This allows the translation The vector pLac51 in which the BspHI cleavage site has been incorporated into the start codon ATG is Obtained.   First, the DNA fragment from the PCR reaction with primers G and H was And XbaI, followed by purification by gel electrophoresis, and prior to EcoRI and And cloned into the pUC19 vector cut with XbaI. About 100bp Inserts of size BbsI and Xb from the resulting plasmid pLT5. Cut with aI. Finally, the BbsI-XbaI fragment was previously prepared with BbsI and Xb It was cloned into the vector pLac51 cut with aI. This allows lacquer Vector having a novel AflII cleavage site at the 3 'end of the Lac513 was obtained.   Trametes versicol with modified 5 'and 3' regions r cDNA gene for laccase Lac5.5 3 by partial digestion with BspHI. this The coding region of the Lac5.5 cDNA gene and the pUC19 vector A 2.6 kb fragment with about 1.1 kb of ter was obtained. This fragment is the second stage Digested with AflII and cut the resulting Lac5.5 cDNA of 1.5 kb in size. Pieces were isolated. This fragment was taken from the 4.0 k from Aspergillus niger. b size fragment, trpC from Aspergillus nidulans A 0.7 kb fragment of the transcription terminator and 2 pUC18 vectors . A 7.4 kb fragment from vector pAN52-12 with a 7 kb fragment. Ligation to the large AflII-NcoI fragment. 8.8 kb obtained Is called pANlac1. glaA in pANlac1 The promoter region is ligated through the NcoI-BspHI intersection. Functionally binds to the translation initiation codon ATG of the case cDNA gene.B: lacquer by replacing the N-terminal signal sequence with a glucoamylase fragment Between Lac5.5 cDNA and glaA promoter   The region of the cDNA gene encoding the N-terminus of the mature laccase Lac5.5 was modified. To vary, primers I and F were used.  The underlined portion in Primer I indicates the EcoRV cleavage site.   To modify the 3 'region of the Lac5.5 cDNA gene, primer G and And H (see A in this example).   Lac5.5 cDNA by PCR reaction using primers I and F A 110 bp fragment was amplified in the 5 'region of the gene. Primer G And H using the 110b in the 3 'region of the Lac5.5 cDNA gene A fragment of size p was amplified. PCR reactions were performed as described in A of this example. .   The DNA fragments from the PCR reaction with primers I and F were Cleavage with maI, then purification by gel electrophoresis, prior to EcoRI and It was cloned into the vector pLac5 cut with XmaI. This allows mature la EcoR at the 5 'end before the codon for the first amino acid of the casease protein V cleavage site followed by the sequence Ile Ser Lys Arg (SEQ ID N O: The vector pLac52 into which the codon for the amino acid of 14) was inserted was obtained. Was. This sequence is a recognition site for KEX2 protease is there. The 3 'region of the laccase cDNA gene in the vector pLac52 -Modified as described for pLac51. P with primers G and H Approximately 100 bp inserts from the CR reaction were replaced with BbsI and XbaI. Cleavage and isolation from plasmid pLT5. Finally BbsI-Xba The I fragment was cloned into the vector pLac52 cut with BbsI and XbaI. I did. This allows a new AflII at the 3 'end of the laccase cDNA gene. The vector pLac523 having a cleavage site was obtained.   For Trametes versicolor laccase Lac 5.5 The cDNA gene having the modified 5 'and 3' regions is EcoRV and Af 1II, which was obtained by cutting plasmid pLac523. . A 5 kb Lac5.5 cDNA fragment was obtained after agarose gel electrophoresis. Isolated. This fragment was ligated with the 9.3 kb Afl vector of vector pAN56-9. Ligation to the II-EcoRV fragment. Vector pAN56-9 is 4.0 glaA promoter from Aspergillus niger of kb size -Followed by Aspergillus niger glaA glucoamylase 2.0 kb fragment encoding the above fragment, 4 amino acids at the KEX2 cleavage site Short DNA fragment encoding Piece, 0.7 kb t from Aspergillus nidulans a fragment of the rpC transcription terminator and a 2.7 kb pUC18 vector With a fragment of the EcoRV and AFII cleavage sites are replaced with KEX2 cleavage sites 3 '. E. FIG. 10.8 kb by transformation into E. coli This vector is called pANlac2. In pANlac2, The coding region of the cDNA for the mature laccase Lac5.5 was First, a glucoamylase fragment containing a signal sequence, KEX2 protease Fusion fragment consisting of a fragment of the recognition sequence and a fragment of the complete laccase Lac5.5 It binds to the coding region of the glucoamylase gene so that protein is produced. Was. Upon secretion, this fusion protein is cleaved by KEX2 protease, Mature laccase was secreted into the culture supernatant.C: amdS and pyrG into the vectors pANlac1 and ANlac2 Incorporating Selection Markers   pANlac1 and pANlac2 were combined with 5 μg NotI of each vector. Linearized by overnight digestion with. Then calf intestinal alkaline phos Treat with Phatase, extract with phenol / chloroform, precipitate with ethanol Was. Genes amdS (acetamidase) and pyrG for selectable markers (Orotidine-5'-monophosphate decarboxylase) Was introduced into plasmid pAN52-11 from which 6.4 after digestion with NotI. The gene could be isolated as a fragment of kb in size. Each straight chain And phosphatase treated vectors pANlac1 and pANlac2 Was ligated to 0.6 μg of the isolated NotI fragment, which was Using E. E. coli JM109 was transformed. Plasmid DNA Prepared from ampicillin resistant colonies from the transformation of Analyzed by agarose gel electrophoresis. Transformation with the vector pANlac1 Six of the eight analyzed clones from the exchange as well as the form in the vector pANlac2 Five of the seven analyzed clones from the transversion were a 6.4 kb NotI gene fragment. Had. The vector having the selectable marker gene was replaced with pANlac1S (size 15.3 kb, FIG. 1) and pANlac2S (17.2 kb, FIG. 2). Call. Three of the six pANlac1S clones obtained were the desired ones shown in FIG. Of the resulting 5 pANlac2S clones with the NotI fragment in Individuals had the NotI fragment in the desired orientation shown in FIG. Example 7Transformation of Aspergillus   Aspergillus niger strain AB1.13 (pyrG-) (W.van  Hartingsveldt, I.E.Matter n, C.M.J.van Zeijl, P.H.Pouwels and C.A.M.J.J.J.van den Hondel (1987) Mol.G en.Genet.206, 71-75) and Aspergillus awamori (AT CC 11358 strain) was used for transformation. Aspergillus Transformations were performed according to conventional techniques (P.J.Punt and C.A.J.J.van den Hond el (1992), Meth. Enzymology216, 447-457).   Mycelium of Aspergillus protoplasts in Novozym 234 Obtained by the above treatment. Freshly produce mycelium from one flask and filter out OM medium (sterile-filtred) in a sterile Erlenmeyer flask . Novoz, a lytic enzyme mixture in 27M calcium chloride, 0.6M NaCl) ym234 (Novo Nordisk) in 15 ml. Re-enzyme solution The suspended mycelium was incubated at 30 ° C. at low speed (80 rpm) for 1-3 hours. . Microscopic observation of protoplast formation during incubation . Free-moving protoplasts are usually seen after 1 hour. Mass free movement After mobile protoplasts have been obtained, they are passed through a glass filter to Miracl. bacteria remaining by filtration through oth (Calbiochem) Separate from the filaments and carefully use STC medium (1.2 M sorbitol, 50 mM calcium chloride). Washed with 35 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl, pH 7.5). Step Rotoplasts are centrifuged (2000 rpm, 4 ° C., 10 minutes) and washed twice with STC medium. Protoplast concentration Was measured by microscope on a counter. Protoplast suspension 1 × 10 for experiments on regeneration or transformation8Protopura It was adjusted to a concentration of strike / ml.   Aspergillus niger and Aspergillus awa protoplasts from plasmids pANlac1S and pANla1 Transformed with c2S. Both plasmids contain the pyrG gene (orotidine-5 '). -Phosphate decarboxylase) and the amdS gene (acetoa (Encoding midase) as a selectable marker. Protoplast 0.1 aliquots of plasmid DNA in a 12 ml incubation vessel Mix with 10 μg and incubate on ice for 25 minutes. Then 60% PEG 4000 solution (60% PEG 4000, 50 mM calcium chloride, 10 mM Hydrochloric acid, pH 7.5) while repeatedly mixing 1.25 ml to the transformation mixture. It was added very well. After further incubation at 20 ° C. for 20 minutes, the reaction vessel is removed. Filled with STC medium, mixed and centrifuged at 4 ° C. for 10 minutes. Resuspend the precipitate Were plated on selective media osmotically stabilized with sorbitol. play The colonies were incubated at 30 ° C. for 7 days, and the growth of the colonies was observed. Some fruit The transformation rate in the experiment was 1 to 5 for Aspergillus niger. Transformants / plasmid DNA (μg), Aspergillus awam For ori, 0.1 to 0.5 transformant / plasmid DNA (μg) was used. Was.   Purification by transferring transformants to selection plates with acetamide (Purify). A transformant having a high copy number was selected using acrylamide. Identified by plating on selective plates. Acrylamide is Acetamidase encoded by the amdS gene as opposed to acetamide A transformant that is a poor substrate for the enzyme and has a high copy number of the amdS gene Only can grow. Transformants that enable functional expression of laccase enzymes First, we have inducers for maltodextrin and glaA promoter expression. After growing for 2 days at 28 ° C. 0.1% ABT in ABTS agar (McIllvaine buffer, pH 4.5) S, 1% agarose). Transformants expressing laccase are green halo Indicated by the formation of Transfer the spore suspension to a good plate on an acrylamide plate. Transformant showing both growth and positive response in ABTS activity test Manufactured from.   Example 8Trametes versicolor lacquer in Aserillus Expression of Lac 5.5   Expression of Laccase Lac5.5 in Aspergillus The survey was conducted on a co-scale. The following culture medium was used: maltodextrin in tap water A 5% (w / v) solution of was autoclaved for 20 minutes. Then 1M sulfuric acid mug 1 ml of cesium, 0.5 ml of 1000 × trace element solution, 50 × AspA solution 10 ml and 5 ml of 10% (w / v) casamino acid were added to the base medium 500 m 1. The 1000 × trace element solution has the following composition: znSOFour × 7HTwoO2.2g, HThreeBOThree1.1 g, MnClTwo× 4HTwoO0.5g, FeS OFour× 7HTwoO0.5g, CoClTwo× 5HTwoO 0.17g, CuSOFour× 5HTwoO0 . 16g, NaTwoMoOFour× 2HTwo0.15 g of O and 5 g of EDTATwoO80m dissolved in l. The 50 × AspA solution has the following composition: NaNOThreeFifteen 0 g, KCl 13 g, KHTwoPOFour38 g to HTwoDissolved in 500 ml of O, pH Was adjusted to 5.5 with 10 M KOH. This medium contains CuSOFour× 5HTwoO Added at a final concentration of 0.5 mM.   For expression experiments, 300 ml Erlenmeyer 1 × 10 to 50 ml of culture medium in flask6Spores / ml were planted. Shake the culture The test was performed at 30 ° C. and 300 rpm in a fermentor. Collect samples daily for one week Then, the laccase activity in the culture supernatant was measured. Maximum laccase activity is 60-1 00 growth was observed between 0.5 and 2.5 U / ml. Was. Laccase activity was determined using the substrate ABTS (0.1 mM in the assay). Colorimetric method in McIllveine buffer (pH 4.5) and at 37 ° C. measurement). McIllveine buffer is 0.2 M NaTwoHP OFourPrepared by titration of 0.1 M citric acid solution to pH 4.5 against solution . The increase in absorbance at 420 nm was measured (absorption coefficient at 420 nm for ABTS). Number: 3.6 × 10Four1 x mole1× cm-1). 1U of laccase activity per minute It was defined as 1 micromole of ABTS substrate to be converted.   Example 9Trametes versicolo in Pichia astoris Expression of Laccase Lac5.5   An expression system commercially available from Invitrogen is connected to the relevant expression vector (pP IC3 and pPIC9) and Pichia pastoris strain (GS11 5 and KM71). Pichia Pastoris strains GS115 and KM71 are histidine auxotrophs. The expression vector was alcohol oxidase from Pichia pastoris. It has the promoter and terminator of the gene AOX1. Tramete s versicolor laccase Lac5.5 cDNA gene as described above It was cloned between two gene regulators. The vector pPIC9 is AOX1 From Saccharomyces cerevisiae downstream of the promoter DNA sequence encoding the signal sequence of the α-factor protein of Knowledge sequence Glu-Lys-Arg-Glu-Ala-Glu-Ala (SEQ I It has a short DNA section encoding DNO: 15). The vector is E. coli. col It has an ampicillin resistance gene for selection in i. The vector is Pic Pichia pastoris for selection in H. pastoris Have the HIS4 gene.A: Laccase Lac 5.5 having the signal sequence of Laccase Lac 5.5 Construction of the current vector   Plasmid pLac5.5 and primers K and L were replaced with the laccase gene. Used for amplification. Primers F and G have the following sequences:   Primer K has an EcoRI cleavage site (underlined) followed by laccase L has the DNA sequence for the first 7 amino acids of the ac5.5 signal sequence . Primer L has a Not cleavage site (underlined) followed by a complementary and reverse orientation For the translation stop codon and the last seven amino acids of the laccase Lac 5.5 Has a DNA sequence of   PCR amplification was performed by methods known to those skilled in the art. 20 ng of pLac5.5 DNA With 0.5 U of Vent polymerase, 1 mM MgClTwo, 4 types of dNT each P 0.2 mM and in each case the primers K and L100 picomo And used in a 50 μl PCR reaction. Characteristics of required PCR products Other conditions for differential amplification are: 5 minutes at 94 ° C, followed by 1 minute at 94 ° C. 25 cycles of 1 minute at 5 ° C and 2 minutes at 72 ° C. 1.5k expected A PCR fragment of size b was obtained. The PCR fragment is purified by agarose gel electrophoresis. And cut with restriction enzymes EcoRI and NotI, precipitated with ethanol,Two Taken in O. The vector pPIC3 was cut with EcoRI and NotI, and Purify, isolate, and treat with alkaline phosphatase by garose gel electrophoresis. Reason did. Then, extract with phenol / chloroform (ratio 3: 1) and precipitate with ethanol. Did. The laccase Lac5.5 DNA fragment produced by PCR amplification was Ligation to pPIC3 vector produced as described above and . E. coli Top10F 'cells (Invitrogen) were transformed. Step Rasmid DNA was isolated and cloned from ampicillin resistant clones. A 5 kb insert was identified by restriction digestion with EcoRI and NotI. Was. Nine of the 12 clones examined were positive. Obtained in this way The vector is called pL512 (FIG. 3).B: α-factor signal from Saccharomces cerevisiae Of expression vector for laccase Lac5.5 having sequence   Lacquer using plasmid pLac5.5 and primers L and M The ze gene was amplified. Primer M has the following sequence:   Primer M is the sequence for the EcoRI cleavage site (underlined) followed by the process Putative N-terminal first 9 amino acids of laccase Lac5.5 DNA sequence for Laccase Lac 5.5 to be processed N-terminal is another lacquer Derived by comparison with the sequence.   The DNA fragment for the processed form of Laccase Lac 5.5 PLac5.5 cDNA and primers L and M as described in Produced by PCR amplification. The vector pPIC9 was replaced with EcoRI and NotI. And prepared as in pPIC3 described in A of this example and by PCR amplification Ligation was performed on the prepared DNA fragment of laccase Lac5.5, and this was used. And E. E. coli Top10F 'cells (Invitrogen) Was. Plasmid DNA was isolated from ampicillin resistant clones and cloned. Of the inserted 1.5 kb insert by restriction digestion with EcoRI and NotI. Specified. Three of the twelve clones examined were positive. Gain in this way The resulting vector is called pL532 (FIG. 4).C: Transformation of Pichia pastoris   First, GS115 strain and KM71 strain of Pichia pastoris were converted to YP. In 5 ml of D medium (1% yeast extract, 2% peptone, 2% dextrose) Cultured at 30 ° C. overnight. Using the 0.2 ml portion of the preculture described above, two Each plant was inoculated in 250 ml of PD medium, and the optical density (OD600 nm) was 1.3 again. Cultured overnight at 30 ° C. until に な る 1.5. Yeast cells from 250 ml main culture Is centrifuged (1500 × g For 5 minutes) and HTwoWash twice with 200 ml of O, 10m of 1M sorbitol 1 × and finally taken up in 0.5 ml of 1M sorbitol.   Plasmid DNA of the vector pL512 or pL532 is Linearize with either siI, precipitate using ethanol and add D Taken in water at a concentration of 1 μg NA. The transformation mixture was Pichia pasto Contains 80 μl of ris cells and 10 μg of linearized vector DNA. Transformations were performed at 1500 V, 25 μF and 200 ohms (BioRad Gene).   (Pulser). Discharge time is about 4.2 milliseconds. Adding 1 ml of 1 M sorbitol to the transformation mixture, This is incubated for 30 minutes on ice, then MD plate without histidine (1.34% YNB, yeast nitrogen base, 4 × 10-Five% Biotin, 1% dextrose, 1.5% agar). Plated on coat. Transformants were incubated at 30 ° C for 3-5 days. Appeared after the game. To streak the transformant twice on the MD plate Therefore, it was purified. Laccase producers are transferred to the MM indicator plate (MM ind icator plate). MM indicator plate is 1.34% YN B, 4 × 10-Five% Biotin, 0.5% methanol, 1.5% agar, 1m Contains MABTS and 0.1 mM copper sulfate. Inducer Methaneau The petri dish to the lid of the Petri dish to ensure that methanol is supplied to the colonies by diffusion. New every day to guarantee. Laccase producers can work at 30 ° C for 2-3 days. A green halo formed after the incubation. E:Expression in shake flask   BMGY medium (1% yeast extract, 2% peptone, 0.1 M potassium phosphate, p H6.0, 1.34% YNB, 4 × 10-Five% Biotin, 1% glycerol) 50 ml of a Pichia pastoris transformant producing laccase Then, the cells were cultured at 28 ° C. for 48 hours on a shaker (300 rpm). From this preculture Cells were isolated by centrifugation (1500 × g for 10 minutes) and the main culture medium (MM Y, 1% yeast extract, 2% peptone, 1.34% YNB, 4 × 10-Five% Biotin (3% methanol) in 10 ml. Supply 0.5 mM copper sulfate to MMY medium. The main culture was fed at 300 rpm and room temperature on a shaker. Main culture Tanol (0.3 ml / 10 ml of medium) was supplied at 24 hour intervals. Recombination la Production of the case Lac 5.5 began after 24 hours. Production rate up to 4U / ml Reached 190 hours after the start of the main culture.   Example 10Isolation of recombinant laccase Lac5.5   Aspe transformed with the recombinant laccase Lac5.5 as described in Example 8 It was obtained by culturing the rgillus strain in shake flasks. Laccase Lac5 . The culture supernatant containing 5 was concentrated by cross-flow filtration. Removed for this Sartocon microfiltration module with an exclusion limit of 30 kD A microfiltration module (Sartorius) was used. Next The laccase Lac 5.5 concentrated in the above is freeze-dried, pH 6.0). Activity of concentrated recombinant laccase Lac5.5 Was 18.6 U / ml.   Laccase concentrated by cross-flow filtration was treated with 20 mM bistris-hydrochloric acid (p H6.5). Thereafter, a conductivity of 1.5 mS / cm was measured. The dialyzed laccase was then washed with 20 mM bistris-hydrochloric acid (pH 6.5) (low Color of DEAE Sepharose (Pharmacia) calibrated with Dingbuffer) The chromatography on the system was performed. Under these conditions the laccase is DEA Bind to E Sepharose. 0M to 0.5M in loading buffer By elution with a linear gradient of NaCl, the laccase activity was reduced to a salt concentration of 0.1. Recovered with 15M NaCl. Laccase fraction from DEAE Sepharose column And ammonium sulfate until 20% saturation and sodium acetate ( pH 4.5). (Final concentration 20 mM), pH was adjusted to 4.5 with acetic acid. Then do this The laccase fraction prepared in the above was loaded into a loading buffer (20 mM sodium acetate). (PH 4.5, 20% saturated ammonium sulfate) Chromatography on a column of Loose (Pharmacia) was performed. these Laccase binds to phenyl-Sepharose under the following conditions: 20 mM sodium acetate Linear gradient of 20-0% saturated ammonium sulphate in lithium (pH 4.5) Laccase activity was recovered at 16% saturation with ammonium sulfate. Was. The laccase fraction was dialyzed against 20 mM bistris-HCl (pH 6.5), Binding to DEAE Sepharose and subsequent run with 0.3 M NaCl Was concentrated by stepwise elution. Binding and elution with 0.3 M NaCl The displacement was also performed in 20 mM bistris-hydrochloric acid (pH 6.5). Laccase activity Gave 20% of the starting material. The isolated laccase is converted to the N-terminal amino acid Analyzed by sequencing. The sequence determined by this: Is a mature laccase Lac5. Obtained from cDNA sequence and homology comparisons. 5 N-terminal matches.   Example 11Biochemical properties of the recombinant laccase Lac5.5   Recombinant lacquer produced in Aspergillus as described in Example 8 The optimum pH and temperature and the stability of pH and temperature of ZeLac5.5 were investigated. For these experiments, the buffer of recombinant laccase Lac5.5 was McIllvaine buffer on a X G25 (Pharmacia, PD10 column) The solution (pH 4.5) was replaced.A: Optimum pH   Buffer appropriate for each pH value shown in FIG. And a suitable mixture of sodium phosphate solutions. Clear from FIG. Thus, laccase Lac5.5 is optimally active in the strongly acidic region with respect to the substrate ABTS Having.B: pH stability   Laccase Lac 5.5 was used at pH 3.0, 4.5 and 6.0 (temperature 37 ° C). Pre-incubated in McIllveine buffer. Aliquot 0, Take after 30, 60 and 120 minutes and use McIllveine buffer (pH 4.5). ) And the laccase activity was measured at 37 ° C. Laccase activity is pH 4. Pretreatment with 5 and 6.0 was not adversely affected. pH 3.0 The half-life of the case was between 60 and 120 minutes (FIG. 6).C: Optimum temperature   The laccase activity of the recombinant laccase Lac5.5 was measured at the temperatures shown in FIG. Specified. Laccase activity was determined by AB in McIllveine buffer (pH 4.5). Measured using the TS assay. Surprisingly, Laccase Lac 5.5 Was found to be 70 ° C. Maximum measured laccase activity The temperatures which were half of were 50 ° C and 80 ° C.D: Temperature stability   Laccase Lac 5.5 was added in McIllvine buffer (pH 4.5) for 4 hours. Preincubated at 5, 55 and 65 ° C. Aliquot 0, 30, 60 And after 120 minutes, diluted in McIllveine buffer (pH 4.5) The laccase activity was measured at 37 ° C. Laccase activity for pretreatment at 45 ° C Therefore, it was not adversely affected. Preincubation at 55 ° C for 120 minutes Later measurements showed that 80% of the activity was still retained. 65 The half life of laccase at 60 ° C. was 60 minutes (FIG. 8).   Sequence listing (1) General information:   (I) Applicant:     (A) Name: Consortium fuel electrochem ische Industry GmbH     (B) Town: Zirstadtstrasse 20     (C) City: Munich     (E) Country: Germany     (F) Postal code: D-81379     (G) Telephone: 089 748440     (H) Telefax: 089 74844350   (Ii) Title of the invention: DNA sequences, expression of these DNAs, Coded thermophilic laccase and uses thereof   (Iii) Number of sequences: 19   (Iv) Computer readable form:     (A) Medium type: floppy disk     (B) Computer: IBM PC compatible     (C) Operating system: PC-DOS / MS-DOS     (D) Software: Patent In Release # 1.0, Version # 1 . 25 (EPO) (2) Information on SEQ ID NO: 1:   (I) Sequence characteristics:     (A) Length: 1572 base pairs     (B) type: nucleic acid     (C) Number of chains: single strand     (D) Topology: linear   (Ii) Sequence type: mRNA from cDNA   (Iii) Hypothetical: NO   (Iii) Antisense: NO   (Vi) Origin:     (A) Organism name: Trametes versicolor     (B) Stock name: TV-1   (Vii) immediate origin:     (B) Clone: plac55   (Xi) Sequence: SEQ ID NO: 1

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C12N 1/21 C12N 1/21 5/10 9/02 9/02 5/00 A ──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) C12N 1/21 C12N 1/21 5/10 9/02 9/02 5/00 A

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1.SEQ ID NO:1の位置76から位置1572を含めた位置までの DNA配列もしくはSEQID NO:2の位置76から位置1572を含めた 位置までのDNA配列または前記のDNA配列と80%より高い配列ホモロジー を有するDNA配列を有する、ラッカーゼ活性を有するタンパク質をコードする DNA配列。 2.請求項1記載のDNA配列を有する発現ベクター。 3.付加的に宿主生物でのラッカーゼ遺伝子の発現を媒介するプロモーター、 宿主生物に適当であり、請求項1記載のDNA配列の3’末端に機能的に結合し ている転写終結のためのシグナルを有する請求項2記載の発現ベクター。 4.プロモーターがtacプロモーター、サブチリシンプロモーター、GAL プロモーター、TAKAアミラーゼプロモーター、ポリヘドリンプロモーター、 グルコアミラーゼプロモーター、GAPDHプロモーターおよびアルコールオキ シダーゼプロモーターから選択される、請求項3記載の発現ベクター。 5.付加的にN−末端シグナル配列を有する請求項3または4記載の発現ベク ター。 6.N−末端シグナル配列がラッカーゼ遺伝子中に 存在する天然のシグナル配列であるか、以下の分泌タンパク質:Klebsie lla oxytocaからのα−シクロデキストリングルコシルトランスフェ ラーゼ、Bacillus subtilisからのサブチリシン、Sacch aromyces cerevisiaeからのα因子、Pichia pas torisからの酸ホスファターゼ、Aspergillusnigerからの α−アミラーゼまたはAspergillus nigerもしくはAsper gillus awamoriからのグルコアミラーゼのシグナル配列の群から 選択される、請求項5記載の発現ベクター。 7.分泌タンパク質のための遺伝子またはタンパク質の分泌される断片のため の遺伝子切片がラッカーゼ遺伝子に機能的に結合している請求項5記載の発現ベ クター。 8.請求項1記載のDNA配列または請求項2から7までのいずれか1項記載 の発現ベクターを有している微生物株。 9.タンパク質配列SEQ ID NO:3を有するタンパク質。 10.パルプの脱リグニン、高分子凝集物の解重合、古紙の脱インキ、廃水、 特にパルプ漂白からのリグニン含有廃水中の芳香族化合物の重合、染料の酸化も しくは顔料の形成のための染料の活性化のため、また は芳香族化合物のカップリング反応のための有機合成もしくは芳香族側鎖の酸化 での請求項9記載の使用。[Claims]   1. SEQ ID NO: 1 from position 76 to position including position 1572 Included from position 76 to position 1572 of the DNA sequence or SEQ ID NO: 2 DNA sequence up to the position or sequence homology greater than 80% with said DNA sequence Encodes a protein having laccase activity, having a DNA sequence having DNA sequence.   2. An expression vector having the DNA sequence according to claim 1.   3. A promoter that additionally mediates the expression of the laccase gene in the host organism, 2. Suitable for the host organism and operably linked to the 3 'end of the DNA sequence of claim 1. The expression vector according to claim 2, which has a signal for terminating transcription.   4. Promoter is tac promoter, subtilisin promoter, GAL Promoter, TAKA amylase promoter, polyhedrin promoter, Glucoamylase promoter, GAPDH promoter and alcohol The expression vector according to claim 3, which is selected from a sidase promoter.   5. 5. The expression vector according to claim 3, further comprising an N-terminal signal sequence. Tar.   6. N-terminal signal sequence in laccase gene An existing natural signal sequence or the following secreted protein: Klebsie α-cyclodextrin glucosyl transfer from lla oxytoca Lase, subtilisin from Bacillus subtilis, Sacch alpha factor from aromyces cerevisiae, Pichia pas acid phosphatase from toris, from Aspergillusniger α-amylase or Aspergillus niger or Asper From the group of glucoamylase signal sequences from G. awamori The expression vector according to claim 5, which is selected.   7. For genes or secreted fragments of secreted proteins The expression vector according to claim 5, wherein the gene slice of the present invention is functionally linked to the laccase gene. Doctor.   8. A DNA sequence according to claim 1 or any one of claims 2 to 7. A microorganism strain having the expression vector of (1).   9. A protein having the protein sequence SEQ ID NO: 3.   10. Pulp delignification, depolymerization of polymer aggregates, waste paper deinking, wastewater, In particular, polymerization of aromatic compounds in lignin-containing wastewater from pulp bleaching and oxidation of dyes Or for the activation of dyes for the formation of pigments, Is organic synthesis or aromatic side chain oxidation for the coupling reaction of aromatic compounds The use according to claim 9, wherein
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