HU221603B - CD4-csapdareceptorokat és rokonszerkezetű molekulákat hordozó sejtek és alkalmazásuk - Google Patents
CD4-csapdareceptorokat és rokonszerkezetű molekulákat hordozó sejtek és alkalmazásuk Download PDFInfo
- Publication number
- HU221603B HU221603B HU9700303A HU9700303A HU221603B HU 221603 B HU221603 B HU 221603B HU 9700303 A HU9700303 A HU 9700303A HU 9700303 A HU9700303 A HU 9700303A HU 221603 B HU221603 B HU 221603B
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- cells
- leu
- cell
- lys
- gin
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title description 31
- 108700015048 receptor decoy activity proteins Proteins 0.000 title 1
- 108700010039 chimeric receptor Proteins 0.000 claims abstract description 49
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 47
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 claims abstract description 23
- 208000037357 HIV infectious disease Diseases 0.000 claims abstract description 19
- 208000033519 human immunodeficiency virus infectious disease Diseases 0.000 claims abstract description 19
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims abstract description 19
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims abstract description 10
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 384
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 108
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 claims description 53
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 47
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 47
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims description 20
- 102100025244 T-cell surface glycoprotein CD5 Human genes 0.000 claims description 17
- 101000934341 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD5 Proteins 0.000 claims description 16
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 claims description 7
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 5
- 101000914496 Homo sapiens T-cell antigen CD7 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100027208 T-cell antigen CD7 Human genes 0.000 claims description 3
- 210000004493 neutrocyte Anatomy 0.000 claims description 3
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 3
- 102100031573 Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Human genes 0.000 claims description 2
- 101000777663 Homo sapiens Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Proteins 0.000 claims description 2
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 210000000285 follicular dendritic cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 abstract description 29
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract description 12
- 238000011282 treatment Methods 0.000 abstract description 7
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 abstract description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 2
- 102100029185 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Human genes 0.000 description 117
- 101000917839 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Proteins 0.000 description 114
- 101000917858 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A Proteins 0.000 description 113
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 109
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 109
- 230000001461 cytolytic effect Effects 0.000 description 59
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 55
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 54
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 45
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 44
- 206010057248 Cell death Diseases 0.000 description 42
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 41
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 39
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 37
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 35
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 34
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 33
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 33
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Natural products NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 32
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 31
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 29
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 28
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 28
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 27
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 27
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 27
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 27
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 26
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 26
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 26
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 26
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 26
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 25
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 25
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 24
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 24
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 24
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 23
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 23
- BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N Calcium cation Chemical compound [Ca+2] BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 22
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 22
- 229910001424 calcium ion Inorganic materials 0.000 description 22
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 21
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 20
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 20
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 20
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 20
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 20
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 20
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 18
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 18
- 102000009109 Fc receptors Human genes 0.000 description 17
- 108010087819 Fc receptors Proteins 0.000 description 17
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 17
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 17
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 17
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 17
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 16
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 16
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 16
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 15
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 15
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 15
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 15
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 15
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 15
- 235000002374 tyrosine Nutrition 0.000 description 15
- 102100034349 Integrase Human genes 0.000 description 14
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 14
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 13
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 13
- 101150052863 THY1 gene Proteins 0.000 description 12
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 12
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 12
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 108010041397 CD4 Antigens Proteins 0.000 description 11
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 description 11
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 11
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 11
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 11
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 11
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 11
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 11
- 230000002463 transducing effect Effects 0.000 description 11
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 10
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 10
- 239000011651 chromium Substances 0.000 description 10
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 10
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 10
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 10
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 10
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 9
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 9
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 9
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 9
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 9
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 8
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 description 8
- 206010046865 Vaccinia virus infection Diseases 0.000 description 8
- 230000006870 function Effects 0.000 description 8
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 8
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 8
- 230000004044 response Effects 0.000 description 8
- 208000007089 vaccinia Diseases 0.000 description 8
- 108091008875 B cell receptors Proteins 0.000 description 7
- NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N Glu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 7
- BABSVXFGKFLIGW-UWVGGRQHSA-N Leu-Gly-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N BABSVXFGKFLIGW-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 7
- 108010004729 Phycoerythrin Proteins 0.000 description 7
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 7
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 7
- MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N Ser-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N 0.000 description 7
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 7
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 7
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 7
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 7
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 7
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 7
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 7
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 7
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 6
- UZOVYGYOLBIAJR-UHFFFAOYSA-N 4-isocyanato-4'-methyldiphenylmethane Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1CC1=CC=C(N=C=O)C=C1 UZOVYGYOLBIAJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- UAXIKORUDGGIGA-DCAQKATOSA-N Asp-Pro-Lys Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O UAXIKORUDGGIGA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 6
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 6
- 101710121417 Envelope glycoprotein Proteins 0.000 description 6
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 6
- VMKCPNBBPGGQBJ-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N VMKCPNBBPGGQBJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 6
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 6
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 6
- XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N Leu-Leu-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)N1CCCC1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- QWWPYKKLXWOITQ-VOAKCMCISA-N Leu-Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C QWWPYKKLXWOITQ-VOAKCMCISA-N 0.000 description 6
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 6
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 6
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 6
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 6
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 6
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 6
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 6
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 6
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 6
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 6
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 6
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 6
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 6
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 6
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 6
- XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N (2s)-1-[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 5
- 102000006306 Antigen Receptors Human genes 0.000 description 5
- 108010083359 Antigen Receptors Proteins 0.000 description 5
- PNQWAUXQDBIJDY-GUBZILKMSA-N Arg-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PNQWAUXQDBIJDY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 5
- UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N Asp-Pro Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 5
- KGHLGJAXYSVNJP-WHFBIAKZSA-N Asp-Ser-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O KGHLGJAXYSVNJP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 5
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 5
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 5
- LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N Glu-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 5
- JSLVAHYTAJJEQH-QWRGUYRKSA-N Gly-Ser-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JSLVAHYTAJJEQH-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 5
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 5
- 102220576709 Hemoglobin subunit mu_D15G_mutation Human genes 0.000 description 5
- 108010027412 Histocompatibility Antigens Class II Proteins 0.000 description 5
- 102000018713 Histocompatibility Antigens Class II Human genes 0.000 description 5
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 5
- WUHBLPVELFTPQK-KKUMJFAQSA-N Leu-Tyr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WUHBLPVELFTPQK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 5
- DEFGUIIUYAUEDU-ZPFDUUQYSA-N Lys-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O DEFGUIIUYAUEDU-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 5
- GPJGFSFYBJGYRX-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O GPJGFSFYBJGYRX-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 5
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 5
- YDDDRTIPNTWGIG-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YDDDRTIPNTWGIG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 5
- ZEJBJDHSQPOVJV-UAXMHLISSA-N Thr-Trp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZEJBJDHSQPOVJV-UAXMHLISSA-N 0.000 description 5
- PEVVXUGSAKEPEN-AVGNSLFASA-N Tyr-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PEVVXUGSAKEPEN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 5
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 5
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 5
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 5
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 5
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 5
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 5
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 5
- 108010074027 glycyl-seryl-phenylalanine Proteins 0.000 description 5
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 5
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 5
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 5
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 5
- PNDZEEPOYCVIIY-UHFFFAOYSA-N indo-1 Chemical compound CC1=CC=C(N(CC(O)=O)CC(O)=O)C(OCCOC=2C(=CC=C(C=2)C=2N=C3[CH]C(=CC=C3C=2)C(O)=O)N(CC(O)=O)CC(O)=O)=C1 PNDZEEPOYCVIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 5
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 5
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 5
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 5
- 230000027425 release of sequestered calcium ion into cytosol Effects 0.000 description 5
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 5
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 5
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 5
- PKOHVHWNGUHYRE-ZFWWWQNUSA-N (2s)-1-[2-[[(2s)-2-amino-3-(1h-indol-3-yl)propanoyl]amino]acetyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound O=C([C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O PKOHVHWNGUHYRE-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 4
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 4
- IASNWHAGGYTEKX-IUCAKERBSA-N Arg-Arg-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)NCC(O)=O IASNWHAGGYTEKX-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- MFAMTAVAFBPXDC-LPEHRKFASA-N Arg-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O MFAMTAVAFBPXDC-LPEHRKFASA-N 0.000 description 4
- SSZGOKWBHLOCHK-DCAQKATOSA-N Arg-Lys-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N SSZGOKWBHLOCHK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- FBODFHMLALOPHP-GUBZILKMSA-N Asn-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FBODFHMLALOPHP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N Asp-Ser-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102100027203 B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain Human genes 0.000 description 4
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 4
- VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N Chromium Chemical compound [Cr] VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- MPZWMIIOPAPAKE-BQBZGAKWSA-N Glu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N MPZWMIIOPAPAKE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N Glu-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 4
- YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N Gly-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CN YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- FXGRXIATVXUAHO-WEDXCCLWSA-N Gly-Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCCN FXGRXIATVXUAHO-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 4
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 4
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 4
- 101100005713 Homo sapiens CD4 gene Proteins 0.000 description 4
- 241000713340 Human immunodeficiency virus 2 Species 0.000 description 4
- KIMHKBDJQQYLHU-PEFMBERDSA-N Ile-Glu-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N KIMHKBDJQQYLHU-PEFMBERDSA-N 0.000 description 4
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 description 4
- 208000029462 Immunodeficiency disease Diseases 0.000 description 4
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 4
- KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N L-leucyl-L-phenylalanine Natural products CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N 0.000 description 4
- PIHFVNPEAHFNLN-KKUMJFAQSA-N Leu-Cys-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N PIHFVNPEAHFNLN-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- PWPBLZXWFXJFHE-RHYQMDGZSA-N Leu-Pro-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PWPBLZXWFXJFHE-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 4
- FACUGMGEFUEBTI-SRVKXCTJSA-N Lys-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FACUGMGEFUEBTI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- LUAJJLPHUXPQLH-KKUMJFAQSA-N Lys-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N LUAJJLPHUXPQLH-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- SBSIKVMCCJUCBZ-GUBZILKMSA-N Met-Asn-Arg Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N SBSIKVMCCJUCBZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 4
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N Phe-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N 0.000 description 4
- QEFHBVDWKFFKQI-PMVMPFDFSA-N Phe-His-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O QEFHBVDWKFFKQI-PMVMPFDFSA-N 0.000 description 4
- GLJZDMZJHFXJQG-BZSNNMDCSA-N Phe-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O GLJZDMZJHFXJQG-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 4
- NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N Phe-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N 0.000 description 4
- LGMBKOAPPTYKLC-JYJNAYRXSA-N Pro-Phe-Arg Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(=N)N)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 LGMBKOAPPTYKLC-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 4
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ZOBLBMGJKVJVEV-BZSNNMDCSA-N Tyr-Lys-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O ZOBLBMGJKVJVEV-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 4
- QFXVAFIHVWXXBJ-AVGNSLFASA-N Tyr-Ser-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QFXVAFIHVWXXBJ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 4
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 4
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 4
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 4
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 4
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 4
- 229910052804 chromium Inorganic materials 0.000 description 4
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 4
- 238000002784 cytotoxicity assay Methods 0.000 description 4
- 231100000263 cytotoxicity test Toxicity 0.000 description 4
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 4
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 4
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 4
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 4
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 4
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 4
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 4
- 108010050475 glycyl-leucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 4
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000007813 immunodeficiency Effects 0.000 description 4
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 4
- 108010044056 leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 4
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 4
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 4
- 108010087846 prolyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 4
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 4
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 4
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 4
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 4
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 4
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 4
- 108010045269 tryptophyltryptophan Proteins 0.000 description 4
- 150000003668 tyrosines Chemical class 0.000 description 4
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N Asn-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 3
- QJMCHPGWFZZRID-BQBZGAKWSA-N Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O QJMCHPGWFZZRID-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 3
- 208000003322 Coinfection Diseases 0.000 description 3
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 3
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 3
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- DCBSZJJHOTXMHY-DCAQKATOSA-N Glu-Pro-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DCBSZJJHOTXMHY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- HHSKZJZWQFPSKN-AVGNSLFASA-N Glu-Tyr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HHSKZJZWQFPSKN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- QITBQGJOXQYMOA-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN QITBQGJOXQYMOA-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 3
- NNCSJUBVFBDDLC-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NNCSJUBVFBDDLC-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- MHXKHKWHPNETGG-QWRGUYRKSA-N Gly-Lys-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MHXKHKWHPNETGG-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- TTYVAUJGNMVTRN-GJZGRUSLSA-N Gly-Met-Trp Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)CN TTYVAUJGNMVTRN-GJZGRUSLSA-N 0.000 description 3
- SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N Gly-Ser-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- ZZWUYQXMIFTIIY-WEDXCCLWSA-N Gly-Thr-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ZZWUYQXMIFTIIY-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 3
- 101100334524 Homo sapiens FCGR3B gene Proteins 0.000 description 3
- FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N Ile-Leu-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)O)N FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- 206010062016 Immunosuppression Diseases 0.000 description 3
- WGNOPSQMIQERPK-GARJFASQSA-N Leu-Asn-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N WGNOPSQMIQERPK-GARJFASQSA-N 0.000 description 3
- WGNOPSQMIQERPK-UHFFFAOYSA-N Leu-Asn-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(=O)N)C(=O)N1CCCC1C(=O)O WGNOPSQMIQERPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MYGQXVYRZMKRDB-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN MYGQXVYRZMKRDB-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- MMEDVBWCMGRKKC-GARJFASQSA-N Leu-Asp-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N MMEDVBWCMGRKKC-GARJFASQSA-N 0.000 description 3
- BGZCJDGBBUUBHA-KKUMJFAQSA-N Leu-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BGZCJDGBBUUBHA-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 3
- LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N)O LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N 0.000 description 3
- LSLUTXRANSUGFY-XIRDDKMYSA-N Leu-Trp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O LSLUTXRANSUGFY-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 3
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- JPNRPAJITHRXRH-BQBZGAKWSA-N Lys-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O JPNRPAJITHRXRH-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- DGWXCIORNLWGGG-CIUDSAMLSA-N Lys-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DGWXCIORNLWGGG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- CIOWSLJGLSUOME-BQBZGAKWSA-N Lys-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O CIOWSLJGLSUOME-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- IUWMQCZOTYRXPL-ZPFDUUQYSA-N Lys-Ile-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IUWMQCZOTYRXPL-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 3
- PINHPJWGVBKQII-SRVKXCTJSA-N Lys-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N PINHPJWGVBKQII-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- HVAUKHLDSDDROB-KKUMJFAQSA-N Lys-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HVAUKHLDSDDROB-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- UASDAHIAHBRZQV-YUMQZZPRSA-N Met-Arg Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N UASDAHIAHBRZQV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 3
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 3
- BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N Nalpha-L-Leucyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 3
- BNBBNGZZKQUWCD-IUCAKERBSA-N Pro-Arg-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 BNBBNGZZKQUWCD-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- BRJGUPWVFXKBQI-XUXIUFHCSA-N Pro-Leu-Ile Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O BRJGUPWVFXKBQI-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 3
- LEIKGVHQTKHOLM-IUCAKERBSA-N Pro-Pro-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 LEIKGVHQTKHOLM-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 3
- BTPAWKABYQMKKN-LKXGYXEUSA-N Ser-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O BTPAWKABYQMKKN-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 3
- BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N Ser-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- ZSDXEKUKQAKZFE-XAVMHZPKSA-N Ser-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O ZSDXEKUKQAKZFE-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 3
- 108010092262 T-Cell Antigen Receptors Proteins 0.000 description 3
- RPECVQBNONKZAT-WZLNRYEVSA-N Thr-Tyr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N RPECVQBNONKZAT-WZLNRYEVSA-N 0.000 description 3
- YDTKYBHPRULROG-LTHWPDAASA-N Trp-Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N YDTKYBHPRULROG-LTHWPDAASA-N 0.000 description 3
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 3
- 108010018691 arginyl-threonyl-arginine Proteins 0.000 description 3
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 3
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 description 3
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 3
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 3
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 3
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 description 3
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 3
- 210000003630 histaminocyte Anatomy 0.000 description 3
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 3
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 3
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 3
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 3
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 3
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 3
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 3
- 102220077168 rs775407864 Human genes 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 3
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- 102220467418 Acyl-coenzyme A thioesterase MBLAC2_E61Q_mutation Human genes 0.000 description 2
- XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N Arg-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- COXMUHNBYCVVRG-DCAQKATOSA-N Arg-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O COXMUHNBYCVVRG-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- KMFPQTITXUKJOV-DCAQKATOSA-N Arg-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KMFPQTITXUKJOV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- ICRHGPYYXMWHIE-LPEHRKFASA-N Arg-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O ICRHGPYYXMWHIE-LPEHRKFASA-N 0.000 description 2
- XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N Arg-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N Arg-Thr-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 2
- IBLAOXSULLECQZ-IUKAMOBKSA-N Asn-Ile-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O IBLAOXSULLECQZ-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 2
- WIDVAWAQBRAKTI-YUMQZZPRSA-N Asn-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O WIDVAWAQBRAKTI-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- ZJIFRAPZHAGLGR-MELADBBJSA-N Asn-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)C(=O)O ZJIFRAPZHAGLGR-MELADBBJSA-N 0.000 description 2
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 2
- 210000004366 CD4-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 2
- GEEXORWTBTUOHC-FXQIFTODSA-N Cys-Arg-Ser Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)CN=C(N)N GEEXORWTBTUOHC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- WVLZTXGTNGHPBO-SRVKXCTJSA-N Cys-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WVLZTXGTNGHPBO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- WYVKPHCYMTWUCW-YUPRTTJUSA-N Cys-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O WYVKPHCYMTWUCW-YUPRTTJUSA-N 0.000 description 2
- UGPCUUWZXRMCIJ-KKUMJFAQSA-N Cys-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CS)N UGPCUUWZXRMCIJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 2
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- SNFUTDLOCQQRQD-ZKWXMUAHSA-N Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SNFUTDLOCQQRQD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- QMOSCLNJVKSHHU-YUMQZZPRSA-N Glu-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O QMOSCLNJVKSHHU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- ALMBZBOCGSVSAI-ACZMJKKPSA-N Glu-Ser-Asn Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N ALMBZBOCGSVSAI-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- OCDLPQDYTJPWNG-YUMQZZPRSA-N Gly-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)CN OCDLPQDYTJPWNG-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- JVACNFOPSUPDTK-QWRGUYRKSA-N Gly-Asn-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JVACNFOPSUPDTK-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- DHDOADIPGZTAHT-YUMQZZPRSA-N Gly-Glu-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DHDOADIPGZTAHT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- VAXIVIPMCTYSHI-YUMQZZPRSA-N Gly-His-Asp Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)CN VAXIVIPMCTYSHI-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- UESJMAMHDLEHGM-NHCYSSNCSA-N Gly-Ile-Leu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UESJMAMHDLEHGM-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- PDUHNKAFQXQNLH-ZETCQYMHSA-N Gly-Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)NCC(O)=O PDUHNKAFQXQNLH-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 2
- WDEHMRNSGHVNOH-VHSXEESVSA-N Gly-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CN)C(=O)O WDEHMRNSGHVNOH-VHSXEESVSA-N 0.000 description 2
- NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N Gly-Pro-Gly Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Ser Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- 102220533219 Glycophorin-B_Y51F_mutation Human genes 0.000 description 2
- 102220539814 HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain_Y62S_mutation Human genes 0.000 description 2
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 2
- WSDOHRLQDGAOGU-BQBZGAKWSA-N His-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 WSDOHRLQDGAOGU-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- LSQHWKPPOFDHHZ-YUMQZZPRSA-N His-Asp-Gly Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)NCC(=O)O)N LSQHWKPPOFDHHZ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- YAALVYQFVJNXIV-KKUMJFAQSA-N His-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 YAALVYQFVJNXIV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- LVWIJITYHRZHBO-IXOXFDKPSA-N His-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LVWIJITYHRZHBO-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N Hygromycin-B Natural products OC1C(NC)CC(N)C(O)C1OC1C2OC3(C(C(O)C(O)C(C(N)CO)O3)O)OC2C(O)C(CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000009438 IgE Receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010073816 IgE Receptors Proteins 0.000 description 2
- BGZIJZJBXRVBGJ-SXTJYALSSA-N Ile-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)N BGZIJZJBXRVBGJ-SXTJYALSSA-N 0.000 description 2
- LDRALPZEVHVXEK-KBIXCLLPSA-N Ile-Cys-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N LDRALPZEVHVXEK-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 2
- IOVUXUSIGXCREV-DKIMLUQUSA-N Ile-Leu-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IOVUXUSIGXCREV-DKIMLUQUSA-N 0.000 description 2
- UWBDLNOCIDGPQE-GUBZILKMSA-N Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN UWBDLNOCIDGPQE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- FFAUOCITXBMRBT-YTFOTSKYSA-N Ile-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O FFAUOCITXBMRBT-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 2
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 2
- QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N L-Prolyl-L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- LHSGPCFBGJHPCY-UHFFFAOYSA-N L-leucine-L-tyrosine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 LHSGPCFBGJHPCY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- 108010023244 Lactoperoxidase Proteins 0.000 description 2
- 102000045576 Lactoperoxidases Human genes 0.000 description 2
- VCSBGUACOYUIGD-CIUDSAMLSA-N Leu-Asn-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O VCSBGUACOYUIGD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- KGCLIYGPQXUNLO-IUCAKERBSA-N Leu-Gly-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O KGCLIYGPQXUNLO-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- APFJUBGRZGMQFF-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN APFJUBGRZGMQFF-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N Leu-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N Leu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- JLWZLIQRYCTYBD-IHRRRGAJSA-N Leu-Lys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O JLWZLIQRYCTYBD-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- DRWMRVFCKKXHCH-BZSNNMDCSA-N Leu-Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 DRWMRVFCKKXHCH-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N Leu-Ser-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DAYQSYGBCUKVKT-VOAKCMCISA-N Leu-Thr-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O DAYQSYGBCUKVKT-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000232 Lipid Bilayer Substances 0.000 description 2
- JGAMUXDWYSXYLM-SRVKXCTJSA-N Lys-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O JGAMUXDWYSXYLM-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- ZQCVMVCVPFYXHZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZQCVMVCVPFYXHZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- LMVOVCYVZBBWQB-SRVKXCTJSA-N Lys-Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN LMVOVCYVZBBWQB-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- KWUKZRFFKPLUPE-HJGDQZAQSA-N Lys-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KWUKZRFFKPLUPE-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- PBIPLDMFHAICIP-DCAQKATOSA-N Lys-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PBIPLDMFHAICIP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- NJNRBRKHOWSGMN-SRVKXCTJSA-N Lys-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NJNRBRKHOWSGMN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- OIQSIMFSVLLWBX-VOAKCMCISA-N Lys-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OIQSIMFSVLLWBX-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N Lys-Pro Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 2
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 2
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 2
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 2
- PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N N-L-methionyl-L-tyrosine Natural products CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 2
- 101100342977 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-1 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000609499 Palicourea Species 0.000 description 2
- YTILBRIUASDGBL-BZSNNMDCSA-N Phe-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 YTILBRIUASDGBL-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- 108010047620 Phytohemagglutinins Proteins 0.000 description 2
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 2
- RMODQFBNDDENCP-IHRRRGAJSA-N Pro-Lys-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RMODQFBNDDENCP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- SXJOPONICMGFCR-DCAQKATOSA-N Pro-Ser-Lys Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O SXJOPONICMGFCR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- CNUIHOAISPKQPY-HSHDSVGOSA-N Pro-Thr-Trp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O CNUIHOAISPKQPY-HSHDSVGOSA-N 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N Ser-Asn Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- YMEXHZTVKDAKIY-GHCJXIJMSA-N Ser-Asn-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO)C(O)=O YMEXHZTVKDAKIY-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 2
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- NNFMANHDYSVNIO-DCAQKATOSA-N Ser-Lys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O NNFMANHDYSVNIO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- DINQYZRMXGWWTG-GUBZILKMSA-N Ser-Pro-Pro Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DINQYZRMXGWWTG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- JCLAFVNDBJMLBC-JBDRJPRFSA-N Ser-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JCLAFVNDBJMLBC-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 description 2
- DHPPWTOLRWYIDS-XKBZYTNZSA-N Thr-Cys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DHPPWTOLRWYIDS-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 2
- AYCQVUUPIJHJTA-IXOXFDKPSA-N Thr-His-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AYCQVUUPIJHJTA-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 2
- MEJHFIOYJHTWMK-VOAKCMCISA-N Thr-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O MEJHFIOYJHTWMK-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- REJRKTOJTCPDPO-IRIUXVKKSA-N Thr-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O REJRKTOJTCPDPO-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 2
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 description 2
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- GSCPHMSPGQSZJT-JYBASQMISA-N Trp-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N)O GSCPHMSPGQSZJT-JYBASQMISA-N 0.000 description 2
- HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N Tyr-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CC=C(O)C=C1 HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- KHCSOLAHNLOXJR-BZSNNMDCSA-N Tyr-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KHCSOLAHNLOXJR-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N Tyr-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 2
- 108010003533 Viral Envelope Proteins Proteins 0.000 description 2
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 2
- 238000012761 co-transfection Methods 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- 238000007822 cytometric assay Methods 0.000 description 2
- 230000000120 cytopathologic effect Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 125000002228 disulfide group Chemical group 0.000 description 2
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 2
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 2
- 210000001671 embryonic stem cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000005251 gamma ray Effects 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 2
- 101150106093 gpt gene Proteins 0.000 description 2
- GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N hygromycin B Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](NC)C[C@@H](N)[C@H](O)[C@H]1O[C@H]1[C@H]2O[C@@]3([C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](C(N)CO)O3)O)O[C@H]2[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N 0.000 description 2
- 229940097277 hygromycin b Drugs 0.000 description 2
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 2
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 2
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 2
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 2
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- -1 inositol phosphates Chemical class 0.000 description 2
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 2
- 108010027338 isoleucylcysteine Proteins 0.000 description 2
- 229940057428 lactoperoxidase Drugs 0.000 description 2
- 108010044311 leucyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010012058 leucyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 2
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 description 2
- HPNSFSBZBAHARI-UHFFFAOYSA-N micophenolic acid Natural products OC1=C(CC=C(C)CCC(O)=O)C(OC)=C(C)C2=C1C(=O)OC2 HPNSFSBZBAHARI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 2
- HPNSFSBZBAHARI-RUDMXATFSA-N mycophenolic acid Chemical compound OC1=C(C\C=C(/C)CCC(O)=O)C(OC)=C(C)C2=C1C(=O)OC2 HPNSFSBZBAHARI-RUDMXATFSA-N 0.000 description 2
- 229960000951 mycophenolic acid Drugs 0.000 description 2
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 108700004028 nef Genes Proteins 0.000 description 2
- 101150023385 nef gene Proteins 0.000 description 2
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 2
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 2
- 150000003905 phosphatidylinositols Chemical class 0.000 description 2
- 230000001885 phytohemagglutinin Effects 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 2
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 2
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 2
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 2
- 238000003156 radioimmunoprecipitation Methods 0.000 description 2
- 108010043277 recombinant soluble CD4 Proteins 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 2
- 230000000284 resting effect Effects 0.000 description 2
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 2
- 102220026812 rs63750850 Human genes 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 239000012679 serum free medium Substances 0.000 description 2
- PXLIDIMHPNPGMH-UHFFFAOYSA-N sodium chromate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-][Cr]([O-])(=O)=O PXLIDIMHPNPGMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 2
- 108010000998 wheylin-2 peptide Proteins 0.000 description 2
- SCPRYBYMKVYVND-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[1-(2-amino-4-methylpentanoyl)pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoic acid Chemical compound CC(C)CC(N)C(=O)N1CCCC1C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC(C)C)C(O)=O SCPRYBYMKVYVND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FVFVNNKYKYZTJU-UHFFFAOYSA-N 6-chloro-1,3,5-triazine-2,4-diamine Chemical group NC1=NC(N)=NC(Cl)=N1 FVFVNNKYKYZTJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JAMAWBXXKFGFGX-KZVJFYERSA-N Ala-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JAMAWBXXKFGFGX-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- CXZFXHGJJPVUJE-CIUDSAMLSA-N Ala-Cys-Leu Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N CXZFXHGJJPVUJE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PAIHPOGPJVUFJY-WDSKDSINSA-N Ala-Glu-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O PAIHPOGPJVUFJY-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- YHKANGMVQWRMAP-DCAQKATOSA-N Ala-Leu-Arg Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YHKANGMVQWRMAP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OYJCVIGKMXUVKB-GARJFASQSA-N Ala-Leu-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N OYJCVIGKMXUVKB-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- QRIYOHQJRDHFKF-UWJYBYFXSA-N Ala-Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CC=C(O)C=C1 QRIYOHQJRDHFKF-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 244000144725 Amygdalus communis Species 0.000 description 1
- 235000011437 Amygdalus communis Nutrition 0.000 description 1
- 108020005098 Anticodon Proteins 0.000 description 1
- UXJCMQFPDWCHKX-DCAQKATOSA-N Arg-Arg-Glu Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UXJCMQFPDWCHKX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N Arg-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- GHNDBBVSWOWYII-LPEHRKFASA-N Arg-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O GHNDBBVSWOWYII-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- ZTKHZAXGTFXUDD-VEVYYDQMSA-N Arg-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZTKHZAXGTFXUDD-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- OZNSCVPYWZRQPY-CIUDSAMLSA-N Arg-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OZNSCVPYWZRQPY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HPSVTWMFWCHKFN-GARJFASQSA-N Arg-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O HPSVTWMFWCHKFN-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- RFXXUWGNVRJTNQ-QXEWZRGKSA-N Arg-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N RFXXUWGNVRJTNQ-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- PHHRSPBBQUFULD-UWVGGRQHSA-N Arg-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N PHHRSPBBQUFULD-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- UZGFHWIJWPUPOH-IHRRRGAJSA-N Arg-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N UZGFHWIJWPUPOH-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- AOHKLEBWKMKITA-IHRRRGAJSA-N Arg-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N AOHKLEBWKMKITA-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- FVBZXNSRIDVYJS-AVGNSLFASA-N Arg-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N FVBZXNSRIDVYJS-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- YFHATWYGAAXQCF-JYJNAYRXSA-N Arg-Pro-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 YFHATWYGAAXQCF-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- DDBMKOCQWNFDBH-RHYQMDGZSA-N Arg-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O DDBMKOCQWNFDBH-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- QADCERNTBWTXFV-JSGCOSHPSA-N Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 QADCERNTBWTXFV-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- XYOVHPDDWCEUDY-CIUDSAMLSA-N Asn-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O XYOVHPDDWCEUDY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GXMSVVBIAMWMKO-BQBZGAKWSA-N Asn-Arg-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CCCN=C(N)N GXMSVVBIAMWMKO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KSBHCUSPLWRVEK-ZLUOBGJFSA-N Asn-Asn-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O KSBHCUSPLWRVEK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- PCKRJVZAQZWNKM-WHFBIAKZSA-N Asn-Asn-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O PCKRJVZAQZWNKM-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- IOTKDTZEEBZNCM-UGYAYLCHSA-N Asn-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O IOTKDTZEEBZNCM-UGYAYLCHSA-N 0.000 description 1
- HLTLEIXYIJDFOY-ZLUOBGJFSA-N Asn-Cys-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HLTLEIXYIJDFOY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- ZMWDUIIACVLIHK-GHCJXIJMSA-N Asn-Cys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N ZMWDUIIACVLIHK-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- JREOBWLIZLXRIS-GUBZILKMSA-N Asn-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O JREOBWLIZLXRIS-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N Asn-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OLVIPTLKNSAYRJ-YUMQZZPRSA-N Asn-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(=O)N)N OLVIPTLKNSAYRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- FTCGGKNCJZOPNB-WHFBIAKZSA-N Asn-Gly-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FTCGGKNCJZOPNB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- AITGTTNYKAWKDR-CIUDSAMLSA-N Asn-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AITGTTNYKAWKDR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MQLZLIYPFDIDMZ-HAFWLYHUSA-N Asn-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O MQLZLIYPFDIDMZ-HAFWLYHUSA-N 0.000 description 1
- ALKWEXBKAHPJAQ-NAKRPEOUSA-N Asn-Leu-Asp-Asp Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ALKWEXBKAHPJAQ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- MYCSPQIARXTUTP-SRVKXCTJSA-N Asn-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N MYCSPQIARXTUTP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YVXRYLVELQYAEQ-SRVKXCTJSA-N Asn-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N YVXRYLVELQYAEQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- TZFQICWZWFNIKU-KKUMJFAQSA-N Asn-Leu-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 TZFQICWZWFNIKU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- KHCNTVRVAYCPQE-CIUDSAMLSA-N Asn-Lys-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KHCNTVRVAYCPQE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- COWITDLVHMZSIW-CIUDSAMLSA-N Asn-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O COWITDLVHMZSIW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LSJQOMAZIKQMTJ-SRVKXCTJSA-N Asn-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O LSJQOMAZIKQMTJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- GMUOCGCDOYYWPD-FXQIFTODSA-N Asn-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GMUOCGCDOYYWPD-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VWADICJNCPFKJS-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O VWADICJNCPFKJS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- VBKIFHUVGLOJKT-FKZODXBYSA-N Asn-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O VBKIFHUVGLOJKT-FKZODXBYSA-N 0.000 description 1
- WSOKZUVWBXVJHX-CIUDSAMLSA-N Asp-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WSOKZUVWBXVJHX-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HTOZUYZQPICRAP-BPUTZDHNSA-N Asp-Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N HTOZUYZQPICRAP-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- FANQWNCPNFEPGZ-WHFBIAKZSA-N Asp-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O FANQWNCPNFEPGZ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- VZNOVQKGJQJOCS-SRVKXCTJSA-N Asp-Asp-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O VZNOVQKGJQJOCS-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- VIRHEUMYXXLCBF-WDSKDSINSA-N Asp-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VIRHEUMYXXLCBF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- QCVXMEHGFUMKCO-YUMQZZPRSA-N Asp-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O QCVXMEHGFUMKCO-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N Asp-Ile Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IVPNEDNYYYFAGI-GARJFASQSA-N Asp-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N IVPNEDNYYYFAGI-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- UZFHNLYQWMGUHU-DCAQKATOSA-N Asp-Lys-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O UZFHNLYQWMGUHU-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N Asp-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- NVFSJIXJZCDICF-SRVKXCTJSA-N Asp-Lys-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N NVFSJIXJZCDICF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SAKCBXNPWDRWPE-BQBZGAKWSA-N Asp-Met-Gly Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N SAKCBXNPWDRWPE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- RRUWMFBLFLUZSI-LPEHRKFASA-N Asp-Met-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N RRUWMFBLFLUZSI-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- BWJZSLQJNBSUPM-FXQIFTODSA-N Asp-Pro-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BWJZSLQJNBSUPM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- AHWRSSLYSGLBGD-CIUDSAMLSA-N Asp-Pro-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AHWRSSLYSGLBGD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- CUQDCPXNZPDYFQ-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CUQDCPXNZPDYFQ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- NBKLEMWHDLAUEM-CIUDSAMLSA-N Asp-Ser-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N NBKLEMWHDLAUEM-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- JDDYEZGPYBBPBN-JRQIVUDYSA-N Asp-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O JDDYEZGPYBBPBN-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- YUELDQUPTAYEGM-XIRDDKMYSA-N Asp-Trp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N YUELDQUPTAYEGM-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- XWKPSMRPIKKDDU-RCOVLWMOSA-N Asp-Val-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O XWKPSMRPIKKDDU-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- 101150076489 B gene Proteins 0.000 description 1
- 230000003844 B-cell-activation Effects 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 101100505161 Caenorhabditis elegans mel-32 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100031699 Choline transporter-like protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 240000000491 Corchorus aestuans Species 0.000 description 1
- 235000011777 Corchorus aestuans Nutrition 0.000 description 1
- 235000010862 Corchorus capsularis Nutrition 0.000 description 1
- YMBAVNPKBWHDAW-CIUDSAMLSA-N Cys-Asp-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N YMBAVNPKBWHDAW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OXOQBEVULIBOSH-ZDLURKLDSA-N Cys-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OXOQBEVULIBOSH-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- CUXIOFHFFXNUGG-HTFCKZLJSA-N Cys-Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N CUXIOFHFFXNUGG-HTFCKZLJSA-N 0.000 description 1
- CIVXDCMSSFGWAL-YUMQZZPRSA-N Cys-Lys-Gly Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N CIVXDCMSSFGWAL-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- KSMSFCBQBQPFAD-GUBZILKMSA-N Cys-Pro-Pro Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 KSMSFCBQBQPFAD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N Cys-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- VCPHQVQGVSKDHY-FXQIFTODSA-N Cys-Ser-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O VCPHQVQGVSKDHY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZFHXNNXMNLWKJH-HJPIBITLSA-N Cys-Tyr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O ZFHXNNXMNLWKJH-HJPIBITLSA-N 0.000 description 1
- VXDXZGYXHIADHF-YJRXYDGGSA-N Cys-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VXDXZGYXHIADHF-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- KZZYVYWSXMFYEC-DCAQKATOSA-N Cys-Val-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KZZYVYWSXMFYEC-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 102220501386 Cytohesin-4_Y62F_mutation Human genes 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 206010012289 Dementia Diseases 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 1
- YCAGGFXSFQFVQL-UHFFFAOYSA-N Endothion Chemical compound COC1=COC(CSP(=O)(OC)OC)=CC1=O YCAGGFXSFQFVQL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010060891 General symptom Diseases 0.000 description 1
- FHPXTPQBODWBIY-CIUDSAMLSA-N Glu-Ala-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FHPXTPQBODWBIY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- WOMUDRVDJMHTCV-DCAQKATOSA-N Glu-Arg-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WOMUDRVDJMHTCV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CGYDXNKRIMJMLV-GUBZILKMSA-N Glu-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O CGYDXNKRIMJMLV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- RJONUNZIMUXUOI-GUBZILKMSA-N Glu-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RJONUNZIMUXUOI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N Glu-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- NTBDVNJIWCKURJ-ACZMJKKPSA-N Glu-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NTBDVNJIWCKURJ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- XXCDTYBVGMPIOA-FXQIFTODSA-N Glu-Asp-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XXCDTYBVGMPIOA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DSPQRJXOIXHOHK-WDSKDSINSA-N Glu-Asp-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O DSPQRJXOIXHOHK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- CKOFNWCLWRYUHK-XHNCKOQMSA-N Glu-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O CKOFNWCLWRYUHK-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 1
- LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- HPJLZFTUUJKWAJ-JHEQGTHGSA-N Glu-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HPJLZFTUUJKWAJ-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N Glu-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ILWHFUZZCFYSKT-AVGNSLFASA-N Glu-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ILWHFUZZCFYSKT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HRBYTAIBKPNZKQ-AVGNSLFASA-N Glu-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O HRBYTAIBKPNZKQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZIYGTCDTJJCDDP-JYJNAYRXSA-N Glu-Phe-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N ZIYGTCDTJJCDDP-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- MRWYPDWDZSLWJM-ACZMJKKPSA-N Glu-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MRWYPDWDZSLWJM-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- HMJULNMJWOZNFI-XHNCKOQMSA-N Glu-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O HMJULNMJWOZNFI-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 1
- JWNZHMSRZXXGTM-XKBZYTNZSA-N Glu-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JWNZHMSRZXXGTM-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- GPSHCSTUYOQPAI-JHEQGTHGSA-N Glu-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O GPSHCSTUYOQPAI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N Glu-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- VHPVBPCCWVDGJL-IRIUXVKKSA-N Glu-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O VHPVBPCCWVDGJL-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- BPCLDCNZBUYGOD-BPUTZDHNSA-N Glu-Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 BPCLDCNZBUYGOD-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N Glu-Tyr-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 108010015776 Glucose oxidase Proteins 0.000 description 1
- 239000004366 Glucose oxidase Substances 0.000 description 1
- OCQUNKSFDYDXBG-QXEWZRGKSA-N Gly-Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N OCQUNKSFDYDXBG-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- MFBYPDKTAJXHNI-VKHMYHEASA-N Gly-Cys Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](CS)C([O-])=O MFBYPDKTAJXHNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- JUBDONGMHASUCN-IUCAKERBSA-N Gly-Glu-His Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(O)=O JUBDONGMHASUCN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- BEQGFMIBZFNROK-JGVFFNPUSA-N Gly-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)CN)C(=O)O BEQGFMIBZFNROK-JGVFFNPUSA-N 0.000 description 1
- KMSGYZQRXPUKGI-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O KMSGYZQRXPUKGI-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- XVYKMNXXJXQKME-XEGUGMAKSA-N Gly-Ile-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XVYKMNXXJXQKME-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 1
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- IUZGUFAJDBHQQV-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IUZGUFAJDBHQQV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N Gly-Leu-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- AFWYPMDMDYCKMD-KBPBESRZSA-N Gly-Leu-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 AFWYPMDMDYCKMD-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- CLNSYANKYVMZNM-UWVGGRQHSA-N Gly-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N CLNSYANKYVMZNM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- VLIJYPMATZSOLL-YUMQZZPRSA-N Gly-Lys-Cys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)CN VLIJYPMATZSOLL-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N Gly-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCCN VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- SJLKKOZFHSJJAW-YUMQZZPRSA-N Gly-Met-Glu Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)CN SJLKKOZFHSJJAW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ZWRDOVYMQAAISL-UWVGGRQHSA-N Gly-Met-Lys Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZWRDOVYMQAAISL-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- JPVGHHQGKPQYIL-KBPBESRZSA-N Gly-Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 JPVGHHQGKPQYIL-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N Gly-Thr-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N Gly-Thr-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N 0.000 description 1
- FOKISINOENBSDM-WLTAIBSBSA-N Gly-Thr-Tyr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O FOKISINOENBSDM-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- YGHSQRJSHKYUJY-SCZZXKLOSA-N Gly-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN YGHSQRJSHKYUJY-SCZZXKLOSA-N 0.000 description 1
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010083930 HIV Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000006481 HIV Receptors Human genes 0.000 description 1
- 102100036242 HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain Human genes 0.000 description 1
- SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N Hexa-Ac-myo-Inositol Natural products CC(=O)OC1C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C1OC(C)=O SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100022132 High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit gamma Human genes 0.000 description 1
- 108091010847 High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit gamma Proteins 0.000 description 1
- SOYCWSKCUVDLMC-AVGNSLFASA-N His-Pro-Arg Chemical compound N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(=O)N2CCC[C@H]2C(=O)N[C@@H](CCCNC(=N)N)C(=O)O SOYCWSKCUVDLMC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- LNVILFYCPVOHPV-IHPCNDPISA-N His-Trp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LNVILFYCPVOHPV-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- CSTDQOOBZBAJKE-BWAGICSOSA-N His-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N)O CSTDQOOBZBAJKE-BWAGICSOSA-N 0.000 description 1
- 101100273730 Homo sapiens CD5 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000940912 Homo sapiens Choline transporter-like protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000930801 Homo sapiens HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain Proteins 0.000 description 1
- 241000714259 Human T-lymphotropic virus 2 Species 0.000 description 1
- WKXVAXOSIPTXEC-HAFWLYHUSA-N Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O WKXVAXOSIPTXEC-HAFWLYHUSA-N 0.000 description 1
- KFVUBLZRFSVDGO-BYULHYEWSA-N Ile-Gly-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O KFVUBLZRFSVDGO-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- ODPKZZLRDNXTJZ-WHOFXGATSA-N Ile-Gly-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N ODPKZZLRDNXTJZ-WHOFXGATSA-N 0.000 description 1
- BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)[C@@H](C)CC BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N 0.000 description 1
- TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N Ile-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 1
- AXNGDPAKKCEKGY-QPHKQPEJSA-N Ile-Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N AXNGDPAKKCEKGY-QPHKQPEJSA-N 0.000 description 1
- GAZGFPOZOLEYAJ-YTFOTSKYSA-N Ile-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)N GAZGFPOZOLEYAJ-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 1
- HPCFRQWLTRDGHT-AJNGGQMLSA-N Ile-Leu-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HPCFRQWLTRDGHT-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N Ile-Leu-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- OVDKXUDMKXAZIV-ZPFDUUQYSA-N Ile-Lys-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N OVDKXUDMKXAZIV-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- GVNNAHIRSDRIII-AJNGGQMLSA-N Ile-Lys-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N GVNNAHIRSDRIII-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N Ile-Ser-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- PZWBBXHHUSIGKH-OSUNSFLBSA-N Ile-Thr-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PZWBBXHHUSIGKH-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- KBDIBHQICWDGDL-PPCPHDFISA-N Ile-Thr-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N KBDIBHQICWDGDL-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- WXLYNEHOGRYNFU-URLPEUOOSA-N Ile-Thr-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N WXLYNEHOGRYNFU-URLPEUOOSA-N 0.000 description 1
- BVRPESWOSNFUCJ-LKTVYLICSA-N Ile-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)CC)C(O)=O)=CNC2=C1 BVRPESWOSNFUCJ-LKTVYLICSA-N 0.000 description 1
- PRTZQMBYUZFSFA-XEGUGMAKSA-N Ile-Tyr-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)NCC(=O)O)N PRTZQMBYUZFSFA-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N Indole Chemical compound C1=CC=C2NC=CC2=C1 SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- KKCIOUWDFWQUBT-AWEZNQCLSA-N L-thyronine Chemical compound C1=CC(C[C@H](N)C(O)=O)=CC=C1OC1=CC=C(O)C=C1 KKCIOUWDFWQUBT-AWEZNQCLSA-N 0.000 description 1
- TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N L-tryptophan-L-tyrosine Natural products C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N L-valyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NTRAGDHVSGKUSF-AVGNSLFASA-N Leu-Arg-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NTRAGDHVSGKUSF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- MDVZJYGNAGLPGJ-KKUMJFAQSA-N Leu-Asn-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MDVZJYGNAGLPGJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- FIJMQLGQLBLBOL-HJGDQZAQSA-N Leu-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FIJMQLGQLBLBOL-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N Leu-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N Leu-Asp-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PNUCWVAGVNLUMW-CIUDSAMLSA-N Leu-Cys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PNUCWVAGVNLUMW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- FMEICTQWUKNAGC-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O FMEICTQWUKNAGC-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N Leu-Gly-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N Leu-Gly-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- BTNXKBVLWJBTNR-SRVKXCTJSA-N Leu-His-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BTNXKBVLWJBTNR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CSFVADKICPDRRF-KKUMJFAQSA-N Leu-His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)CC1=CN=CN1 CSFVADKICPDRRF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- MPSBSKHOWJQHBS-IHRRRGAJSA-N Leu-His-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N MPSBSKHOWJQHBS-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N Leu-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- WXUOJXIGOPMDJM-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WXUOJXIGOPMDJM-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- RZXLZBIUTDQHJQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RZXLZBIUTDQHJQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- AUNMOHYWTAPQLA-XUXIUFHCSA-N Leu-Met-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O AUNMOHYWTAPQLA-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- GCXGCIYIHXSKAY-ULQDDVLXSA-N Leu-Phe-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GCXGCIYIHXSKAY-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- MJWVXZABPOKJJF-ACRUOGEOSA-N Leu-Phe-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O MJWVXZABPOKJJF-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N Leu-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- BMVFXOQHDQZAQU-DCAQKATOSA-N Leu-Pro-Asp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N BMVFXOQHDQZAQU-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- RGUXWMDNCPMQFB-YUMQZZPRSA-N Leu-Ser-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O RGUXWMDNCPMQFB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- SBANPBVRHYIMRR-GARJFASQSA-N Leu-Ser-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N SBANPBVRHYIMRR-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LFSQWRSVPNKJGP-WDCWCFNPSA-N Leu-Thr-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LFSQWRSVPNKJGP-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- RNYLNYTYMXACRI-VFAJRCTISA-N Leu-Thr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O RNYLNYTYMXACRI-VFAJRCTISA-N 0.000 description 1
- SUYRAPCRSCCPAK-VFAJRCTISA-N Leu-Trp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SUYRAPCRSCCPAK-VFAJRCTISA-N 0.000 description 1
- SXOFUVGLPHCPRQ-KKUMJFAQSA-N Leu-Tyr-Cys Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O SXOFUVGLPHCPRQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- WFCKERTZVCQXKH-KBPBESRZSA-N Leu-Tyr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(O)=O WFCKERTZVCQXKH-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- JGKHAFUAPZCCDU-BZSNNMDCSA-N Leu-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)CC1=CC=C(O)C=C1 JGKHAFUAPZCCDU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- YQFZRHYZLARWDY-IHRRRGAJSA-N Leu-Val-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YQFZRHYZLARWDY-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 101710122625 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II Proteins 0.000 description 1
- NLOZZWJNIKKYSC-WDSOQIARSA-N Lys-Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 NLOZZWJNIKKYSC-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- DNEJSAIMVANNPA-DCAQKATOSA-N Lys-Asn-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O DNEJSAIMVANNPA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QUYCUALODHJQLK-CIUDSAMLSA-N Lys-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QUYCUALODHJQLK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- AAORVPFVUIHEAB-YUMQZZPRSA-N Lys-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O AAORVPFVUIHEAB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- RDIILCRAWOSDOQ-CIUDSAMLSA-N Lys-Cys-Asp Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N RDIILCRAWOSDOQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- QZONCCHVHCOBSK-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QZONCCHVHCOBSK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- UETQMSASAVBGJY-QWRGUYRKSA-N Lys-Gly-His Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 UETQMSASAVBGJY-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- PBLLTSKBTAHDNA-KBPBESRZSA-N Lys-Gly-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O PBLLTSKBTAHDNA-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- RFQATBGBLDAKGI-VHSXEESVSA-N Lys-Gly-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)CNC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O RFQATBGBLDAKGI-VHSXEESVSA-N 0.000 description 1
- FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- KKFVKBWCXXLKIK-AVGNSLFASA-N Lys-His-Glu Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N KKFVKBWCXXLKIK-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- QBEPTBMRQALPEV-MNXVOIDGSA-N Lys-Ile-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QBEPTBMRQALPEV-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- QKXZCUCBFPEXNK-KKUMJFAQSA-N Lys-Leu-His Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 QKXZCUCBFPEXNK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N Lys-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N Lys-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- XBZOQGHZGQLEQO-IUCAKERBSA-N Lys-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN XBZOQGHZGQLEQO-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- XFOAWKDQMRMCDN-ULQDDVLXSA-N Lys-Phe-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)CC1=CC=CC=C1 XFOAWKDQMRMCDN-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- ODTZHNZPINULEU-KKUMJFAQSA-N Lys-Phe-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N ODTZHNZPINULEU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- BPDXWKVZNCKUGG-BZSNNMDCSA-N Lys-Phe-His Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N BPDXWKVZNCKUGG-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- AFLBTVGQCQLOFJ-AVGNSLFASA-N Lys-Pro-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O AFLBTVGQCQLOFJ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- UQJOKDAYFULYIX-AVGNSLFASA-N Lys-Pro-Pro Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 UQJOKDAYFULYIX-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- YSPZCHGIWAQVKQ-AVGNSLFASA-N Lys-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCCN YSPZCHGIWAQVKQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N Lys-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- UIJVKVHLCQSPOJ-XIRDDKMYSA-N Lys-Ser-Trp Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(O)=O UIJVKVHLCQSPOJ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- DLCAXBGXGOVUCD-PPCPHDFISA-N Lys-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O DLCAXBGXGOVUCD-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- YKBSXQFZWFXFIB-VOAKCMCISA-N Lys-Thr-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O YKBSXQFZWFXFIB-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- CAVRAQIDHUPECU-UVOCVTCTSA-N Lys-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O CAVRAQIDHUPECU-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 1
- GVKINWYYLOLEFQ-XIRDDKMYSA-N Lys-Trp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GVKINWYYLOLEFQ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- 101710155913 Major envelope protein Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N Met-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- PQPMMGQTRQFSDA-SRVKXCTJSA-N Met-Glu-His Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(O)=O PQPMMGQTRQFSDA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N Met-Gly-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- JACAKCWAOHKQBV-UWVGGRQHSA-N Met-Gly-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN JACAKCWAOHKQBV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- RKIIYGUHIQJCBW-SRVKXCTJSA-N Met-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O RKIIYGUHIQJCBW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- AXHNAGAYRGCDLG-UWVGGRQHSA-N Met-Lys-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O AXHNAGAYRGCDLG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- VSJAPSMRFYUOKS-IUCAKERBSA-N Met-Pro-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O VSJAPSMRFYUOKS-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- GWADARYJIJDYRC-XGEHTFHBSA-N Met-Thr-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GWADARYJIJDYRC-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- 101100226902 Mus musculus Fcrlb gene Proteins 0.000 description 1
- 108010066427 N-valyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 108010087066 N2-tryptophyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010047562 NGR peptide Proteins 0.000 description 1
- 102000003729 Neprilysin Human genes 0.000 description 1
- 108090000028 Neprilysin Proteins 0.000 description 1
- 208000012902 Nervous system disease Diseases 0.000 description 1
- 208000025966 Neurological disease Diseases 0.000 description 1
- 108091092724 Noncoding DNA Proteins 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 208000001388 Opportunistic Infections Diseases 0.000 description 1
- 102220520572 Osteoclast-stimulating factor 1_N48S_mutation Human genes 0.000 description 1
- 102000016979 Other receptors Human genes 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 206010033661 Pancytopenia Diseases 0.000 description 1
- 208000009182 Parasitemia Diseases 0.000 description 1
- 208000030852 Parasitic disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037581 Persistent Infection Diseases 0.000 description 1
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 1
- MQWISMJKHOUEMW-ULQDDVLXSA-N Phe-Arg-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MQWISMJKHOUEMW-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- YYRCPTVAPLQRNC-ULQDDVLXSA-N Phe-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 YYRCPTVAPLQRNC-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- UEHNWRNADDPYNK-DLOVCJGASA-N Phe-Cys-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N UEHNWRNADDPYNK-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- FGXIJNMDRCZVDE-KKUMJFAQSA-N Phe-Cys-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N FGXIJNMDRCZVDE-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- HPECNYCQLSVCHH-BZSNNMDCSA-N Phe-Cys-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)C(=O)O)N HPECNYCQLSVCHH-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- WPTYDQPGBMDUBI-QWRGUYRKSA-N Phe-Gly-Asn Chemical compound N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WPTYDQPGBMDUBI-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- HNFUGJUZJRYUHN-JSGCOSHPSA-N Phe-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HNFUGJUZJRYUHN-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N Phe-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- GXDPQJUBLBZKDY-IAVJCBSLSA-N Phe-Ile-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O GXDPQJUBLBZKDY-IAVJCBSLSA-N 0.000 description 1
- SMFGCTXUBWEPKM-KBPBESRZSA-N Phe-Leu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 SMFGCTXUBWEPKM-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- MSHZERMPZKCODG-ACRUOGEOSA-N Phe-Leu-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MSHZERMPZKCODG-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- YCCUXNNKXDGMAM-KKUMJFAQSA-N Phe-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YCCUXNNKXDGMAM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ZUQACJLOHYRVPJ-DKIMLUQUSA-N Phe-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ZUQACJLOHYRVPJ-DKIMLUQUSA-N 0.000 description 1
- JDMKQHSHKJHAHR-UHFFFAOYSA-N Phe-Phe-Leu-Tyr Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)CC1=CC=CC=C1 JDMKQHSHKJHAHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JXQVYPWVGUOIDV-MXAVVETBSA-N Phe-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JXQVYPWVGUOIDV-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- QSWKNJAPHQDAAS-MELADBBJSA-N Phe-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)O QSWKNJAPHQDAAS-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- 101710124413 Portal protein Proteins 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N Pro-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- IHCXPSYCHXFXKT-DCAQKATOSA-N Pro-Arg-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IHCXPSYCHXFXKT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- SMCHPSMKAFIERP-FXQIFTODSA-N Pro-Asn-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 SMCHPSMKAFIERP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- KIPIKSXPPLABPN-CIUDSAMLSA-N Pro-Glu-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 KIPIKSXPPLABPN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NXEYSLRNNPWCRN-SRVKXCTJSA-N Pro-Glu-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NXEYSLRNNPWCRN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- VPEVBAUSTBWQHN-NHCYSSNCSA-N Pro-Glu-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O VPEVBAUSTBWQHN-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- OCYROESYHWUPBP-CIUDSAMLSA-N Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 OCYROESYHWUPBP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KWMUAKQOVYCQJQ-ZPFDUUQYSA-N Pro-Ile-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 KWMUAKQOVYCQJQ-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- MHHQQZIFLWFZGR-DCAQKATOSA-N Pro-Lys-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MHHQQZIFLWFZGR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- PCWLNNZTBJTZRN-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 PCWLNNZTBJTZRN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- FDMKYQQYJKYCLV-GUBZILKMSA-N Pro-Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 FDMKYQQYJKYCLV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- RCYUBVHMVUHEBM-RCWTZXSCSA-N Pro-Pro-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RCYUBVHMVUHEBM-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- BGWKULMLUIUPKY-BQBZGAKWSA-N Pro-Ser-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 BGWKULMLUIUPKY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- LNICFEXCAHIJOR-DCAQKATOSA-N Pro-Ser-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LNICFEXCAHIJOR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N Pro-Thr-Gly Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- FDMCIBSQRKFSTJ-RHYQMDGZSA-N Pro-Thr-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FDMCIBSQRKFSTJ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- SNSYSBUTTJBPDG-OKZBNKHCSA-N Pro-Trp-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)N4CCC[C@@H]4C(=O)O SNSYSBUTTJBPDG-OKZBNKHCSA-N 0.000 description 1
- ZMLRZBWCXPQADC-TUAOUCFPSA-N Pro-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2 ZMLRZBWCXPQADC-TUAOUCFPSA-N 0.000 description 1
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 1
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 1
- 101100260569 Rattus norvegicus Thy1 gene Proteins 0.000 description 1
- RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- NLQUOHDCLSFABG-GUBZILKMSA-N Ser-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NLQUOHDCLSFABG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YUSRGTQIPCJNHQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YUSRGTQIPCJNHQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- QVOGDCQNGLBNCR-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QVOGDCQNGLBNCR-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N Ser-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- VAUMZJHYZQXZBQ-WHFBIAKZSA-N Ser-Asn-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O VAUMZJHYZQXZBQ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- VGNYHOBZJKWRGI-CIUDSAMLSA-N Ser-Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO VGNYHOBZJKWRGI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N Ser-Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- FFOKMZOAVHEWET-IMJSIDKUSA-N Ser-Cys Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O FFOKMZOAVHEWET-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- RNFKSBPHLTZHLU-WHFBIAKZSA-N Ser-Cys-Gly Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(=O)O)N)O RNFKSBPHLTZHLU-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- MOVJSUIKUNCVMG-ZLUOBGJFSA-N Ser-Cys-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)O MOVJSUIKUNCVMG-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N Ser-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- CICQXRWZNVXFCU-SRVKXCTJSA-N Ser-His-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CICQXRWZNVXFCU-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LWMQRHDTXHQQOV-MXAVVETBSA-N Ser-Ile-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O LWMQRHDTXHQQOV-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- UBRMZSHOOIVJPW-SRVKXCTJSA-N Ser-Leu-Lys Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O UBRMZSHOOIVJPW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N Ser-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CO XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FLONGDPORFIVQW-XGEHTFHBSA-N Ser-Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO FLONGDPORFIVQW-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CO OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- AABIBDJHSKIMJK-FXQIFTODSA-N Ser-Ser-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O AABIBDJHSKIMJK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- DYEGLQRVMBWQLD-IXOXFDKPSA-N Ser-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O DYEGLQRVMBWQLD-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- BDMWLJLPPUCLNV-XGEHTFHBSA-N Ser-Thr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O BDMWLJLPPUCLNV-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 1
- 101000874347 Streptococcus agalactiae IgA FC receptor Proteins 0.000 description 1
- 208000000389 T-cell leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000028530 T-cell lymphoblastic leukemia/lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 108700026226 TATA Box Proteins 0.000 description 1
- UTSWGQNAQRIHAI-UNQGMJICSA-N Thr-Arg-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 UTSWGQNAQRIHAI-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- GKMYGVQDGVYCPC-IUKAMOBKSA-N Thr-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N GKMYGVQDGVYCPC-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 1
- JXKMXEBNZCKSDY-JIOCBJNQSA-N Thr-Asp-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O JXKMXEBNZCKSDY-JIOCBJNQSA-N 0.000 description 1
- OHAJHDJOCKKJLV-LKXGYXEUSA-N Thr-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OHAJHDJOCKKJLV-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N Thr-Cys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- SLUWOCTZVGMURC-BFHQHQDPSA-N Thr-Gly-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O SLUWOCTZVGMURC-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 1
- AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N Thr-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- MPUMPERGHHJGRP-WEDXCCLWSA-N Thr-Gly-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MPUMPERGHHJGRP-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N Thr-Gly-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- KRGDDWVBBDLPSJ-CUJWVEQBSA-N Thr-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O KRGDDWVBBDLPSJ-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 1
- SXAGUVRFGJSFKC-ZEILLAHLSA-N Thr-His-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SXAGUVRFGJSFKC-ZEILLAHLSA-N 0.000 description 1
- LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N Thr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 1
- FQPDRTDDEZXCEC-SVSWQMSJSA-N Thr-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FQPDRTDDEZXCEC-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- AMXMBCAXAZUCFA-RHYQMDGZSA-N Thr-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AMXMBCAXAZUCFA-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- RRRRCRYTLZVCEN-HJGDQZAQSA-N Thr-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RRRRCRYTLZVCEN-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- NCXVJIQMWSGRHY-KXNHARMFSA-N Thr-Leu-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O NCXVJIQMWSGRHY-KXNHARMFSA-N 0.000 description 1
- YOOAQCZYZHGUAZ-KATARQTJSA-N Thr-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YOOAQCZYZHGUAZ-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N Thr-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- ZSPQUTWLWGWTPS-HJGDQZAQSA-N Thr-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ZSPQUTWLWGWTPS-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- NQQMWWVVGIXUOX-SVSWQMSJSA-N Thr-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O NQQMWWVVGIXUOX-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N Thr-Ser-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 1
- UMFLBPIPAJMNIM-LYARXQMPSA-N Thr-Trp-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CC3=CC=CC=C3)C(=O)O)N)O UMFLBPIPAJMNIM-LYARXQMPSA-N 0.000 description 1
- BEZTUFWTPVOROW-KJEVXHAQSA-N Thr-Tyr-Arg Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N)O BEZTUFWTPVOROW-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- BZTSQFWJNJYZSX-JRQIVUDYSA-N Thr-Tyr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BZTSQFWJNJYZSX-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- BKIOKSLLAAZYTC-KKHAAJSZSA-N Thr-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BKIOKSLLAAZYTC-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 1
- 101800001690 Transmembrane protein gp41 Proteins 0.000 description 1
- TZNNEYFZZAHLBL-BPUTZDHNSA-N Trp-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O TZNNEYFZZAHLBL-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- YPBYQWFZAAQMGW-XIRDDKMYSA-N Trp-Lys-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N YPBYQWFZAAQMGW-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- QUIXRGCMQOXUSV-SZMVWBNQSA-N Trp-Pro-Pro Chemical compound O=C([C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)N1CCC[C@H]1C(O)=O QUIXRGCMQOXUSV-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- AOLQJUGGZLTUBD-WIRXVTQYSA-N Trp-Trp-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O AOLQJUGGZLTUBD-WIRXVTQYSA-N 0.000 description 1
- DLZKEQQWXODGGZ-KWQFWETISA-N Tyr-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 DLZKEQQWXODGGZ-KWQFWETISA-N 0.000 description 1
- SEFNTZYRPGBDCY-IHRRRGAJSA-N Tyr-Arg-Cys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O SEFNTZYRPGBDCY-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- SCCKSNREWHMKOJ-SRVKXCTJSA-N Tyr-Asn-Ser Chemical compound N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SCCKSNREWHMKOJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- TZXFLDNBYYGLKA-BZSNNMDCSA-N Tyr-Asp-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 TZXFLDNBYYGLKA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- UABYBEBXFFNCIR-YDHLFZDLSA-N Tyr-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O UABYBEBXFFNCIR-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- HKYTWJOWZTWBQB-AVGNSLFASA-N Tyr-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 HKYTWJOWZTWBQB-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- JJNXZIPLIXIGBX-HJPIBITLSA-N Tyr-Ile-Cys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N JJNXZIPLIXIGBX-HJPIBITLSA-N 0.000 description 1
- QSFJHIRIHOJRKS-ULQDDVLXSA-N Tyr-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O QSFJHIRIHOJRKS-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- FASACHWGQBNSRO-ZEWNOJEFSA-N Tyr-Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N FASACHWGQBNSRO-ZEWNOJEFSA-N 0.000 description 1
- YYLHVUCSTXXKBS-IHRRRGAJSA-N Tyr-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYLHVUCSTXXKBS-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ZZDYJFVIKVSUFA-WLTAIBSBSA-N Tyr-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O ZZDYJFVIKVSUFA-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- GPLTZEMVOCZVAV-UFYCRDLUSA-N Tyr-Tyr-Arg Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 GPLTZEMVOCZVAV-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- UUYCNAXCCDNULB-QXEWZRGKSA-N Val-Arg-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O UUYCNAXCCDNULB-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- VVZDBPBZHLQPPB-XVKPBYJWSA-N Val-Glu-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O VVZDBPBZHLQPPB-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- ROLGIBMFNMZANA-GVXVVHGQSA-N Val-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N ROLGIBMFNMZANA-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- BNQVUHQWZGTIBX-IUCAKERBSA-N Val-His Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CN=CN1 BNQVUHQWZGTIBX-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- VXDSPJJQUQDCKH-UKJIMTQDSA-N Val-Ile-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N VXDSPJJQUQDCKH-UKJIMTQDSA-N 0.000 description 1
- OVBMCNDKCWAXMZ-NAKRPEOUSA-N Val-Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N OVBMCNDKCWAXMZ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- MJOUSKQHAIARKI-JYJNAYRXSA-N Val-Phe-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MJOUSKQHAIARKI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- NHXZRXLFOBFMDM-AVGNSLFASA-N Val-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)C(C)C NHXZRXLFOBFMDM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- GBIUHAYJGWVNLN-AEJSXWLSSA-N Val-Ser-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N GBIUHAYJGWVNLN-AEJSXWLSSA-N 0.000 description 1
- GBIUHAYJGWVNLN-UHFFFAOYSA-N Val-Ser-Pro Natural products CC(C)C(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O GBIUHAYJGWVNLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JSOXWWFKRJKTMT-WOPDTQHZSA-N Val-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N JSOXWWFKRJKTMT-WOPDTQHZSA-N 0.000 description 1
- 108010052104 Viral Regulatory and Accessory Proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- YRKCREAYFQTBPV-UHFFFAOYSA-N acetylacetone Chemical compound CC(=O)CC(C)=O YRKCREAYFQTBPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 125000003295 alanine group Chemical class N[C@@H](C)C(=O)* 0.000 description 1
- 235000020224 almond Nutrition 0.000 description 1
- ZVDPYSVOZFINEE-BQBZGAKWSA-N alpha-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O ZVDPYSVOZFINEE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000019552 anatomical structure morphogenesis Effects 0.000 description 1
- 238000004873 anchoring Methods 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 230000010056 antibody-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003782 apoptosis assay Methods 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- 108010052670 arginyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 238000003149 assay kit Methods 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 210000002469 basement membrane Anatomy 0.000 description 1
- 210000003651 basophil Anatomy 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 230000002457 bidirectional effect Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000034303 cell budding Effects 0.000 description 1
- 230000007910 cell fusion Effects 0.000 description 1
- 230000022534 cell killing Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 108091092356 cellular DNA Proteins 0.000 description 1
- 230000007969 cellular immunity Effects 0.000 description 1
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 238000003501 co-culture Methods 0.000 description 1
- 238000011198 co-culture assay Methods 0.000 description 1
- 238000000975 co-precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 108091036078 conserved sequence Proteins 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 229940028617 conventional vaccine Drugs 0.000 description 1
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 1
- 238000004163 cytometry Methods 0.000 description 1
- 208000024389 cytopenia Diseases 0.000 description 1
- 231100000050 cytotoxic potential Toxicity 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000007123 defense Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 230000001066 destructive effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 1
- 230000000528 effect on cytolysis Effects 0.000 description 1
- 108010030074 endodeoxyribonuclease MluI Proteins 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 108010044294 eta-kappa antigen T cell receptor Proteins 0.000 description 1
- DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N ethyl mercaptane Natural products CCS DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 108010006664 gamma-glutamyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 229940116332 glucose oxidase Drugs 0.000 description 1
- 235000019420 glucose oxidase Nutrition 0.000 description 1
- 108010017007 glucose-regulated proteins Proteins 0.000 description 1
- 150000002307 glutamic acids Chemical class 0.000 description 1
- 108010042598 glutamyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010013768 glutamyl-aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 108010020688 glycylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N glycylvaline Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 1
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 description 1
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000777 hematopoietic system Anatomy 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 1
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000004727 humoral immunity Effects 0.000 description 1
- 230000008348 humoral response Effects 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000007124 immune defense Effects 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 239000012133 immunoprecipitate Substances 0.000 description 1
- 230000002637 immunotoxin Effects 0.000 description 1
- 229940051026 immunotoxin Drugs 0.000 description 1
- 239000002596 immunotoxin Substances 0.000 description 1
- 231100000608 immunotoxin Toxicity 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 208000033065 inborn errors of immunity Diseases 0.000 description 1
- 239000012678 infectious agent Substances 0.000 description 1
- 229960000367 inositol Drugs 0.000 description 1
- 230000001163 intracellular calcium accumulation Effects 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000011005 laboratory method Methods 0.000 description 1
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 1
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 1
- 108010051673 leucyl-glycyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010091871 leucylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 1
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 description 1
- 150000002669 lysines Chemical class 0.000 description 1
- 230000002934 lysing effect Effects 0.000 description 1
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 210000004779 membrane envelope Anatomy 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 230000002297 mitogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 239000003068 molecular probe Substances 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 210000005087 mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000036438 mutation frequency Effects 0.000 description 1
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000036963 noncompetitive effect Effects 0.000 description 1
- 238000006384 oligomerization reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003606 oligomerizing effect Effects 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 1
- RJSZPKZQGIKVAU-UXBJKDEOSA-N peptide f Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C(C)C)C(C)C)C1=CC=CC=C1 RJSZPKZQGIKVAU-UXBJKDEOSA-N 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 1
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 208000028529 primary immunodeficiency disease Diseases 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 230000005522 programmed cell death Effects 0.000 description 1
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 108010020755 prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108700042769 prolyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010015796 prolylisoleucine Proteins 0.000 description 1
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 1
- 108020001580 protein domains Proteins 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 210000003370 receptor cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000017610 release of virus from host Effects 0.000 description 1
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 102220162066 rs755988042 Human genes 0.000 description 1
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 1
- CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N scyllo-inosotol Natural products OC1C(O)C(O)C(O)C(O)C1O CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001953 sensory effect Effects 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 125000003607 serino group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000004017 serum-free culture medium Substances 0.000 description 1
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 102000034285 signal transducing proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091006024 signal transducing proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000011125 single therapy Methods 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 238000002798 spectrophotometry method Methods 0.000 description 1
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000010473 stable expression Effects 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 208000010648 susceptibility to HIV infection Diseases 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000017960 syncytium formation Effects 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 108010071097 threonyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 230000002992 thymic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000031998 transcytosis Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 102000035160 transmembrane proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005703 transmembrane proteins Proteins 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
- 239000013638 trimer Substances 0.000 description 1
- 108010044292 tryptophyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 1
- 108010005834 tyrosyl-alanyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 230000007502 viral entry Effects 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
- 230000017613 viral reproduction Effects 0.000 description 1
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 1
- 239000002023 wood Substances 0.000 description 1
- 210000000707 wrist Anatomy 0.000 description 1
- 108010065816 zeta chain antigen T cell receptor Proteins 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/461—Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
- A61K39/4611—T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/464—Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
- A61K39/464838—Viral antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
- A61P31/18—Antivirals for RNA viruses for HIV
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/7051—T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/70514—CD4
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Virology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- AIDS & HIV (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
A találmány tárgyát képezi a CD4 – HIV-fertőzött sejt specifikusfelismerésére képes, de HIV-fertőzést nem közvetítő – fragmensétmagában foglaló extracelluláris részt tartalmazó, a HIV-fertőzött sejtmegsemmisítésére indító szignált a terápiás sejteknek nem továbbító,membránkötött, proteinszerű kimérareceptort expresszáló terápiássejtek alkalmazása emlős HIV-fertőzésének kezelésére alkalmasgyógyászati készítmény előállítására. A találmány szerinti megoldásalkalmas emlősökben HIV-fertőzött sejt elleni celluláris immunreakciószabályozására, s ezáltal a HIV-fertőzés kezelésére. ŕ
Description
A találmány tárgyát képezi a CD4 - HlV-fertőzött sejt specifikus felismerésére képes, de HIV-fertőzést nem közvetítő - fragmensét magában foglaló extracelluláris részt tartalmazó, a HIV-fertőzött sejt megsemmisítésére indító szignált a terápiás sejteknek nem továbbító, membránkötött, proteinszerű kimérareceptort expresszáló terápiás sejtek alkalmazása emlős HIV-fertőzésének kezelésére alkalmas gyógyászati készítmény előállítására.
A találmány szerinti megoldás előnyösen alkalmazható emlősökben HIV-fertőzött sejt elleni celluláris immunreakció szabályozására, s ezáltal a HIV-fertőzés kezelésére.
A T-sejtek - a T-sejt-receptorok révén megvalósuló
- antigénfelismerése számos immunológiai jelenség alapját képezi. A T-sejtek a sejt közvetítette immunitást irányítják, melynek során az immunrendszer sejtjei lebontják az idegen szöveteket vagy a fertőzött sejteket. Különböző T-sejtek léteznek, köztük a „helper” és „szupresszor” sejtek, amelyek módosítják az immunreakciót, valamint a citotoxikus (vagy ,Jciller”) sejtek, amelyek közvetlenül elpusztítják az abnormális sejteket.
A sejtek felületén jelen lévő egyedi antigént felismerő és ahhoz kötődő T-sejt aktiválódik, majd sokszorozódhat, és - amennyiben citotoxikus sejtről van szó elpusztíthatja a megkötött sejtet.
A HÍV és az immunpatogenezis
1984-ben kimutatták, hogy a HIV-vírus az AIDS kórokozója. Azóta az AIDS meghatározását többször megváltoztatták, a tekintetben, hogy a diagnózisban milyen kritériumokat kell figyelembe venni. A diagnosztikai paraméterek változása ellenére az AIDS általános azonosító ismérve a HIV-fertőzés és azt követően a perzisztens szervi tünetek, valamint az AIDS-re jellemző betegségek (mint például a másodlagos fertőzések, daganatok, neurológiai betegségek) kialakulása [Hairison’s Principles of Internál Medicine, 12. kiadás, McGraw Hill (1991)].
A HÍV a lentivíruscsoportba tartozó emberi retrovírus. A négy ismert emberi retrovírus két csoportba tartozik; ezek az emberi T-limfotróp retrovímsok (HTLV1 és HTLV-2), illetve emberi immundeficienciavírusok (HIV-1 és HIV-2). Az előbbiek transzformáló vírusok, míg az utóbbiak citopátiás vírusok.
Az AIDS világszerte leggyakoribb kórokozójaként az HIV-l-et azonosították. A HIV-2 és a HIV-1 közötti szekvenciahomológia körülbelül 40%-os; a HIV-2 közelebbi rokonságban áll a majom-immundeficienciavirusokkal [SIV; lásd Curran és munkatársai: Science 329, 1357 (1985); Weiss és munkatársai: Natúré 324, 572(1986)].
A HÍV a szokásos retrovírusgéneken (env, gag és pol) hat másik gént is tartalmaz, melyek a vírus replikációjában és egyéb biológiai aktivitásaiban játszanak szerepet. Ahogy fentebb említettük, az AIDS általános ismérve az a nagymértékű immunszuppresszió, amely elsősorban a sejt közvetítette immunitást érinti. Az ilyen immunszuppresszió különféle opportunista betegségeket - elsősorban bizonyos fertőzéseket és daganatokat
- eredményez.
Az AIDS esetében az immundefektus fő okaként a thymuseredetű (T-) limfociták alcsoportját képező T4populáció mennyiségi és minőségi hiányosságát azonosították. Fenotípus szinten e sejtcsoportra a CD4 felületi molekula jelenléte jellemző. A CD4-ről kimutatták, hogy a HÍV celluláris receptora [Dalgleish és munkatársai: Natúré 312, 763 (1984)]. Bár a T4-sejt a legfőbb HTV-vel fertőzött sejttípus, bármely - felületén CD4-molekulát expresszáló - emberi sejt képes a HIV-hez kötődni és HIV-vel fertőződni.
A CD4+-T-sejteknek hagyományosan, Jielper”/, Jnducer” szerepet tulajdonítanak [jelezve ezáltal a B-sejtek aktiváló szignáljának biztosításában, illetve a reciprok CD8-markert hordozó T-limfociták citotoxikus/szupresszor sejtekké alakulásának indukálásában betöltött szerepüket; Reinherz és Schlossman: Cell 19, 821 (1980); Goldstein és munkatársai: Immunoi. Rév. 68, 5 (1982)].
A HÍV - a virális burok- („envelope”) proteinben (gpl20) lévő aminosavláncon keresztül - specifikusan és nagy affinitással kötődik a CD4-molekula (N-terminálisához közeli) Vl-régiójának egy részletéhez. A kötődés után a vírus fuzionál a célsejt membránjával és intemalizálódik. Ezután a vírus reverz transzkriptáz* segítségével genomi RNS-ét DNS-sé hja át, amely' beépül a celluláris DNS-be, ahol a sejt további életében „provirus”-ként marad fenn.
A provírus látens állapotban maradhat vagy aktiválódhat, melynek során transzkripcióval mRNS éss genomi RNS jön létre, majd proteinszintézis, összerendeződés, új virion képződése, és a vírusok sejtfelületből történő kisaijadzása („budding”) következik. Bár »pontos mechanizmus, amellyel a vírus sejtpusztulást indu- h kál, nem ismert, úgy véljük, hogy a fő mechanizmus a sejtfelületből történő erőteljes vírussaijadzás, ami a plazmamembrán felszakadásához vezet, és ezáltal? ozmotikus nyomáskülönbséget eredményez.
A fertőzés folyamata során a gazdaszervezet antitesteket fejleszt a vírusproteinek (köztük a gpl20 és gp41 fő burokproteinek) ellen. E humorális immunitás ellenére a betegség előrehalad, ami letális immunszuppressziót eredményez, melynek jellemzői az összetett opportunista fertőzések, a parazitémia, dementia és végül az elhalálozás. Az a tény, hogy a gazda vírusellenes antitestei a betegség előrehaladását nem képesek megállítani, a fertőzés legnyugtalanítóbb és legveszélyesebb vonatkozásainak egyikét reprezentálja, és a hagyományos eljárásokkal végzett vakcinálások esetében mérsékelt eredményességre enged következtetni.
Az immundeficienciavírusok elleni humorális reakció hatékonyságában két tényező játszhat szerepet. Az első, hogy az immundeficienciavírusok (a többi RNSvirushoz, és főleg a retrovirusokhoz hasonlóan) a gazda inununműködésének hatására nagy mutációs gyakoriságot mutatnak. A második, hogy a burok-glikoproteinek nagymértékben glikozilált molekulák, amelyeken kevés olyan epitóp található, amely alkalmas a nagy affinitású antitestkötődésre. A kevéssé antigénhatású virális burok-gtikoproteinek a gazda számára kevés lehetőséget adnak a vírusfertőzés - specifikus antitestek termelése útján történő - leküzdésére.
HU 221 603 Bl
A HIV-vírussal fertőzött sejtek felületükön gpl20glikoproteint expresszálnak. A gpl20 - a vírus nem fertőzött sejtekbe történő behatolásához hasonló reakció révén - a CD4+-sejtek között fúziós eseményeket közvetít, ami rövid életű sokmagvú óriássejtek kialakulását 5 eredményezi. A szincítiumképződés a gpl20-glikoprotein és a CD4-protein közvetlen kölcsönhatásának függvénye [Dalgleish és munkatársai., lásd fentebb; Klatzman és munkatársai: Natúré 312, 763 (1984); McDougal és munkatársai: Science 231, 382 (1986); 10 Sodroski és munkatársai: Natúré 322, 470 (1986); Lifson és munkatársai: Natúré 323, 725 (1986); Sodroski és munkatársai: Natúré 321,412 (1986)].
A gpl20 és a CD4 közötti specifikus komplex képződése egyik bizonyítékát szolgáltatja annak, hogy a 15 CD4-antigént hordozó sejtek vírusfertőzéséért a CD4gpl20 kötődés a felelős [McDougal és munkatársai, lásd fentebb]. Más kutatók kimutatták, hogy a HlV-fertőzésre nem fogékony sejtvonalak az emberi CD4cDNS-sel végzett transzfekció és a cDNS expresszál- 20 tatása után fertőzhetőkké váltak [Maddon és munkatársai: Cell 46, 333 (1986)].
Több kutatócsoport is kidolgozott olyan terápiás programokat, amelyek a vírusadszorpció és a szincítium közvetítette celluláris átvitel gátlására szolgáló passzív 25 ágensként szolubilis CD4 alkalmazásán alapulnak; in vitro sikeresen bizonyították e programok hatékonyságát [Deen és munkatársai: Natúré 331, 82 (1988); Fisher és munkatársai: Natúré 331, 76 (1988); Hussey és munkatársai: Natúré 331, 78 (1988); Smith és munkatársai: 30 Science 238, 1704 (1987); Traunecker és munkatársai: Natúré 331, 84 (1988)]. Később megnövelt felezési idejű és mérsékelt biológiai aktivitású CD4-immunglobulin fúziós proteineket fejlesztettek ki [Capon és munkatársai: Natúré 337, 525 (1989); Traunecker és munkatársai: Na- 35 tűre 339, 68 (1989); Bym és munkatársai: Natúré 344,
667 (1990); Zettlmeissl és munkatársai: DNA Cell Bioi.
9, 347 (1990). Bár a CD4-immunotoxin-konjugátumok vagy fúziós proteinek a fertőzött sejtekkel szemben hatásos in vitro citotoxicitást mutatnak [Chaudhary és mun- 40 katársai: Natúré 335, 369 (1988); Till és munkatársai: Science 242, 1166 (1988)], az immundeficienciaszindróma lappangó sajátossága valószínűtlenné teszi, hogy egyféle kezelés alkalmazásával végzett terápia hatásos legyen a vírusfertőzés leküzdésére, és az idegen fúziós pro- 45 teinek antigénsajátsága valószínűleg korlátozza e proteinek alkalmazhatóságát az ismételt adagolást igénylő kezelésekben. SIV-virussal fertőzött majmokkal végzett kísérletek eredményeként kimutatták, hogy az oldható CD4 - jelentős CD4-citopénia nélküli állatoknak bead- 50 va - képes a SIV-titer csökkentésére és a myeloid potenciál in vitro eljárással mérhető fokozására [Watanabe és munkatársai: Natúré 337, 267 (1989)]. A kezelés megszakítása után a vírusok azonnali megjelenése arra utal, hogy az immunrendszer előrehaladó legyengülésének 55 megakadályozására céljából egész életen keresztül történő adagolás szükséges.
T-sejt- és Fc-receptorok
A T-sejt-antigénreceptor (TCR) leggyakoribb alakjának sejtfelületi expressziójához legalább hat különbö- 60 ző polipeptidlánc együttes expressziójára van szükség [Weiss és munkatársai: J. Exp. Med. 160, 1284 (1984); Orloffhashi és munkatársai: Natúré 316, 606 (1985); Berkhout és munkatársai: J. Bioi. Chem. 263, 8528 (1988); Sussman és munkatársai: Cell 52, 85 (1988)]; ezek az α,/β-antigénkötőláncok, a CD3-komplex három polipeptidje, valamint a ζ-lánc. Ha ezek bármelyike hiányzik, a komplex többi tagjának stabil expressziója nem biztosított. A teljes komplex felületi expressziója szempontjából a korlátozó polipeptid a ζ [Sussman és munkatársai: Cell 52, 85 (1988)], és úgy vélik, hogy a ligandum receptorfelismerése által kiváltott celluláris aktiválóprogramok legalább egy részét közvetíti [Weissmann és munkatársai: EMBO J. 8,
3651 (1989); Frank és munkatársai: Science 249, 174 (1990)]. A 32 kD-os I. típusú membránjhomodimer (ζ) } tartalmaz egy 9 aminosavas extracelluláris domént, amely N-kötött glikán kapcsolódásához nem tartalmaz helyet, és tartalmaz egy - egér esetében 112 aminosavas, ember esetében 113 aminosavas - intracelluláris domént [Weissman és munkatársai: Science 238, 1018 (1988); Weissman és munkatársai: Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 85, 9709 (1988)]. Az antigénreceptort expresszáló sejtekben jelen van a ζ egy izoalakja (η; Baniyash és munkatársai: J. Bioi. Chem. 263, 9874 (1988); Orloff és munkatársai: J. Bioi. Chem. 264,
14812 (1989)], amely egy alternatív mRNS-„splicing” reakcióútból származik. Úgy tartják, hogy a ζ-η hetero- i dimerek inozitol-foszfátok képződését, valamint receptor által beindított programozott sejtpusztulást (más néven apoptózist) közvetítik [Mercep és munkatársai: Science 242, 571 (1988); Mercep és munkatársai: Science 246, 1162(1989)].
Az Fc-receptorral asszociált gamma-lánc - a ζ- és η-lánchoz hasonlóan - egyéb polipeptidekkel együtt sejtfelületi komplexekben expresszálódik, mely polipeptidek közül néhány a ligandumfelismerést közvetíti, míg a többi funkciója ismeretlen. A gamma-lánc homodimer szerkezete és szerveződése nagyon hasonló a ζláncéhoz, és egyaránt részét képezi a hizósejtek/bazofil sejtek felé nagy affinitást mutató IgE-receptomak (FceRI), amely legalább három különböző polipeptidláncból áll [Blank és munkatársai: Natúré 337, 187 (1989); Ra és munkatársai: Natúré 241, 752 (1989], valamint az IgG egyik kis affinitású receptorából, melyet egerekben az FcyRIIa [Ra és munkatársai: J. Bioi. Chem. 264, 15323 (1989)], emberben pedig a makrofágok és a természetes „killer’-sejtek CD16-altípusú expressziós terméke, a CD16ix (transzmembrán CD16) képvisel [Lanier és munkatársai: Natúré 342, 803 (1989); Andersen és munkatársai: Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 87, 2274 (1990)] és egy meghatározatlan funkciójú polipeptidből [Anderson és munkatársai,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 2274 (1990)]. Az utóbbi időben beszámoltak arról, hogy a γ-láncot egy egérT-sejtvonal, a CTL expresszálja, amelyben homodimereket, valamint γ-ζ- és γ-η-heterodimereket képez [Orloff és munkatársai: Natúré 347, 189 (1990)].
Az Fc-receptorok az immunkomplexek fagocitózisát, transzcitózist, valamint antitestfüggő celluláris cito3
HU 221 603 Bl toxicitást közvetítenek [Ravetch és Kinet: Annu. Rév. Immunoi. 9, 457 (1991); Unkeless és munkatársai: Annu. Rév. Immunoi. 6, 251 (1988); Mellman: Curr. Opin. Immunoi. 1, 16 (1988)]. Az utóbbi időben kimutatták, hogy az alacsony affinitású egér-Fc-receptor izoalakok egyike, az FcRylIIBl, az Ig-bevonatú „target”ek „clarthrin” bevonatú üregekbe történő intemalizációját közvetíti, míg egy másik alacsony affinitású receptor, az FcRyinA - a „trigger-molekulák” kis családjának egy vagy több tagjával asszociálódva - ADCC-t közvetít [Miettinen és munkatársai: Cell 58, 317 (1989); Hunziker és Mellman: J. Cell Bioi. 109, 3291 (1989)]. Ezek a „trigger-molekulák” [a T-sejt-receptor (TCR) ζ-lánca, a TCR η-lánca és az Fc-receptor y-lánca] az immunrendszer különböző receptorainak ligandumfelismerő doménjeivel lépnek kölcsönhatásba, és önállóan celluláriseffektor-programokat képesek beindítani, ideértve az aggregációt követő citolízist [Samelson és munkatársai: Cell 43,223 (1985)]; Weissman és munkatársai: Science 239, 1018 (1988); Jin és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 3319 (1990); Blank és munkatársai: Natúré 337, 187 (1989); Lanier és munkatársai: Natúré 342, 803 (1989); Kurosaki és Ravetsh: Natúré 342, 805 (1989); Hibbs és munkatársai: Science 246, 1608 (1989); Anderson és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 2274 (1990); és Irving és Weiss: Cell 64, 891 (1991)].
Az alacsony affinitású egér- és emberi Fc-receptorcsaládok közötti párhuzamok felvázolása során azonban nyilvánvalóvá vált, hogy az emberi FcRylIA és FcRylIC izoalakoknak egerekben nincsenek megfelelőik, s részben emiatt funkciójuk meghatározásra szorul.
Mivel a csak CD4-en alapuló humorális ágensek in vivő alkalmazhatósága korlátozott, egy korábbi munkákban a HÍV elleni celluláris immunitás fokozásának lehetőségét vizsgálták. Olyan kiméraprotein-készítményeket azonosítottak, amelyekben a CD4 extracelluláris doménje T-sejt-receptor, IgG-Fc-receptor vagy Bsejt-receptor szignáltranszdukáló elemek transzmembrán és/vagy intracelluláris doménjeihez vannak fuzionálva [U. S. S. N. 07/847,566 és 07/665,961; melyeket teljes terjedelmükben a kitanítás részének kell tekinteni]. Az extracelluláris CD4-domént tartalmazó kimérákat expresszáló citolitikus T-sejtek a HlV-burokproteineket expresszáló célsejtek hatékony, MHC-fuggetlen elpusztítását eredményezik. E megközelítési mód rendkívül lényeges és új eleme az Fc-receptor (T-sejt-receptor) és a B-sejt-receptor-láncok azonosítása, melyek aggregációja elegendő a celluláris reakció beindításához. E megoldás egyik különösen hasznos megvalósítása a CD4 és a ζ-, η- és γ-lánc alkotta kimérák alkalmazása, melyek a citolitikus T-limfocitákat úgy irányítják, hogy felismeijék és elpusztítsák a HIV-gpl20-at expresszáló sejteket [U. S. S. N. 07/847,566 és 07/665,961; melyeket teljes teijedelmükben a kitanítás részének kell tekinteni].
A találmány tárgyát képezi egy eljárás HIV-vírussal fertőzött sejt elleni celluláris immunreakció szabályozására emlősben. Az eljárás során az emlősnek terápiás sejtek hatásos mennyiségét adjuk be; a terápiás sejtek membránkötött, proteinszerű kimérareceptort expresszálnak, amely receptor tartalmaz (i) egy extracelluláris részt, amely a HIV-vírussal fertőzött sejtek specifikus felismerésére és megkötésére képes, de HlV-fertőzést nem közvetítő CD4-fragmenst tartalmaz; és (ii) egy intracelluláris részt, amely képes a terápiás sejtet a receptor által megkötött, HIV-vírussal fertőzött sejt elpusztítására indukálni.
A találmány tárgyát képezi továbbá egy olyan sejt, amely olyan proteinszerű, membránkötött kimérareceptort expresszál, amely tartalmaz (i) egy extracelluláris részt, amely a HIV-vírussal fertőzött sejtek specifikus felismerésére és megkötésére képes, de HIV-fertőzést nem közvetítő CD4-fragmenst tartalmaz; és (ii) egy intracelluláris részt, amely képes a terápiás sejtet a receptor által megkötött, HIV-vírussal fertőzött sejt elpusztítására indukálni.
Szintén a találmány tárgyát képezi egy eljárás HlVfertőzés kezelésére emlősben, melynek során az emlősnek terápiás sejtek hatásos mennyiségét adjuk be, mely terápiás sejtek membránkötött, proteinszerű kimérareceptort expresszálnak, amely receptor olyan extracelluláris részt tartalmaz, amely a HIV-vírussal fertőzött sejtek specifikus felismerésére és megkötésére képes, de HIV-fertözést nem közvetítő CD4-fragmenst foglal magában.
A találmány tárgyát képezi továbbá egy membránkötött, proteinszerű kimérareceptort expresszáló sejt,* amely receptor olyan extracelluláris részt tartalmaz; amely a HIV-vírussal fertőzött sejtek specifikus felismérésére és megkötésére képes, de HIV-fertőzést nem· közvetítő CD4-fragmenst foglal magában.
A találmány előnyös megvalósítási módjaiban a CD4-fragmens a CD4 1-394. aminosavaiból vagy a CD4 1-200. aminosavaiból álló aminosavszekvenciát tartalmazza; a CD4-fragmenst a 26. ábrán bemutatott CD7-transzmembrándomén vagy az emberi IgGlmolekula 25. ábrán bemutatott „hinge”-(csukló-), CH2és CH3-doménjei választják el az intracelluláris résztől; míg a CD4-fragmenst a terápiás sejttől legalább 48 angström, előnyösen legalább 72 angström távolság választja el. A találmány előnyös megvalósítási módja értelmében a találmány szerinti kimérareceptor intracelluláris része egy T-sejt-receptorprotein (például ζ), egy B-sejt-receptorprotein vagy egy Fc-receptorprotein szignáltranszdukciós része; és a terápiás sejtek a következők lehetnek: (a) T-limfociták; (b) citotoxikus T-limfociták; (c) természetes ,4riller”-sejtek; (d) neutrociták; (e) granulociták; (f) makrofágok; (g) hízósejtek; (h) HeLa-sejtek; vagy (i) embrionális stem-sejtek (ES).
A találmány tárgyát képezi továbbá egy találmány szerinti kimérareceptort kódoló DNS, valamint egy ilyen DNS-t tartalmazó vektor.
Bár a találmány speciális megvalósítási módját a CD4 és a ζ-lánc alkotta kiméra képezi, a találmány szerinti megoldás céljaira az e molekulákéval (például granulocitákban vagy B-limfocitákban) hasonló funkciójú receptorláncok bármelyike alkalmazható. Az immunsejteket beindító, előnyös molekula megkülöntöztető jegyei közé tartozik, hogy önállóan (azaz különálló lánc4
HU 221 603 Bl ként) képes expresszálódni; az extracelluláris CD4doménnel történő fúzió képessége (miáltal olyan kiméra keletkezik, amely egy terápiás sejt felületén helyezkedik el); valamint - célligandummal történő találkozást követő aggregáció hatására - celluláris effek- 5 torprogramok beindításának képessége.
Jelenleg a kimérák immunsejtekbe történő bejuttatásának legelőnyösebb eljárását a génterápia valamelyik formája jelenti. Ha azonban az immunrendszer sejtjeit kimérareceptorokkal úgy állítjuk helyre, hogy a sejte- 10 két megfelelően szolubilizált, tisztított kiméraproteinnel elegyítjük, olyan manipulált sejtpopulációt kapunk, amely képes a HIV-vírussal fertőzött célsejtekre reagálni. Hasonló megoldásokat alkalmaztak például a CD4-molekula - terápiás célból - eritrocitákba történő bevitelére is. Ebben az esetben a manipulált sejtpopuláció nem lehet képes önmegújulásra.
A találmány tárgyát képezik a CD4-fragmensek Tsejt-receptor-, B-sejt-receptor- és Fc-receptor-alegységekkel képzett fúnkcionális és egyszerűsített kimérái, 20 amelyek képesek az immunsejtek vezérlésére, aminek eredményeként azok felismerik és elpusztítják a HIVvirussal fertőzött sejteket A celluláris reakció emlősben történő irányításának eljárása során az emlősnek HIV-vírussal fertőzött sejt felismerésére és elpusztításé- 25 ra képes - terápiás sejtek (például citotoxikus T-limfociták) hatásos mennyiségét adjuk be.
Szintén a találmány tárgyát képezik az olyan kimérareceptor-proteinek, amelyek a citotoxikus T-limfocitákat úgy irányítják, hogy azok felismerjék és elpusztít- 30 sák a HIV-vírussal fertőzött sejteket, a kimérareceptorokat kódoló DNS-t tartalmazó vektorral transzformált gazdasejtek; valamint a kimérareceptorok elleni antitestek.
A találmány fentiekben felsorolt és egyéb - nem 35 korlátozó jellegű - megvalósítási módjai a következő részletes leírás alapján szakember számára érthetőek lesznek.
A találmány szerinti megoldás részletes leírásában különböző, szakember számára ismert eljárásokra hivat- 40 kozunk. Az ilyen ismert eljárásokat leíró publikációkat teljes terjedelmükben a kitanítás részének kell tekinteni.
A rekombináns DNS-technológiát ismertető alapvető munkák közé tartoznak a következők: Watson és munkatársai: „Molecular Biology of the Gene”, 1. és 2. 45 kötet, Benjamin/Cummings Publishing Company, Inc., Menlo Park, CA (1987); Darnell és munkatársai: „Molecular Cell Biology” Sientifíc American Books, Inc.,
New York, NY (1986); Lewin: „Genes II”, John Wiley and Sons, New York, NY (1985); Old és munkatársai: 50 „Principles of Gene Manipulation: An Introduction to Genetíc Engineermg”, 2. kiadás, University of California Press, Berkeley, CA (1981); Maniatis és munkatársai: „Molecular Cloning: A Laboratory Manual”, 2. kiadás, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Har- 55 bor, NY (1989); Ausubel és munkatársai: „Current Protocols in Molecular Biology”, Wiley Press, New York,
NY (1989).
A „klónozás” kifejezésen egy adott gén vagy más DNS-szekvencia vektormolekulába történő inszertálásá- 60 ra in vitro rekombinációs technikák alkalmazását értjük.
A „cDNS” kifejezés egy RNS-függő DNS-polimeráz (reverz transzkriptáz) működése révén RNS-templátról előállított komplementer DNS-t vagy DNS-másolatot jelent.
A „cDNS-könyvtár” kifejezésen cDNS-inszerteket tartalmazó rekombináns DNS-molekulák gyűjteményét égtük, amely cDNS-inszertek mRNS-ről készült DNSkópiákat tartalmaznak, melyeket a sejt a cDNS-könyvtár előállítása során expresszál. Az ilyen cDNS-könyvtárak ismert eljárások alkalmazásával állíthatók élő [lásd például Maniatis és munkatársai; „Molecular Cloning: A Laboratory Manual”, 2. kiadás, Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1989); Ausubel és munkatársai: „Current Protocols in Molecular Biology ’,
Wüey Press, New York, NY (1989)]. A cDNS-könyvtár előállítása során először RNS-t izolálunk egy olyan organizmus sejtjeiből, amelynek genomjából egy adott gént kívánunk klónozni. A találmány szerinti megoldás céljaira előnyösen emlős állatból, elsősorban emberből származó limfocita-sejtvonalakat alkalmazunk. cDNSkönyvtár előállítására vektorként a vacciniavirus WRtörzse alkalmazható előnyösen.
A „vektor” kifejezésen például plazmádból, bakteriofágból, emlős- vagy rovarvírusból származó DNS-molekulát értünk, amelybe DNS-fragmensek inszertálhatók. A vektorok egy vagy több egyedi restrikciós helyet 1 tartalmaznak, és meghatározott gazdában vagy hordozó- i organizmusban önálló replikációra lehetnek képesek^mi- ( által a klónozott szekvencia reprodukálható. Ilyenfor- í mán a „DNS-expressziós vektor” kifejezésen olyan ön- I álló elemet értünk, amely képes egy rekombináns peptid f szintézisének vezérlésére. Az ilyen DNS-expressziós t vektorok közé bakteriális plazmidok, fágok, emlős- és | rovarplazmidok, valamint vírusok tartoznak. i
A „lényegében tiszta” kifejezésen olyan vegyületet *· (például proteint, polipeptidet vagy antitestet) értünk, amely lényegében mentes azoktól a komponensektől, amelyekkel természetes állapotban együtt fordul elő.
Általában egy vegyületre akkor mondjuk, hogy lényegében tiszta, ha a mintában lévő összes anyag legalább 60%-át, előnyösebben legalább 75%-át, és legelőnyösebben legalább 90%-át a kérdéses vegyület teszi ki.
A tisztaság bármilyen alkalmas eljárással mérhető, például oszlopkromatográfiával, poliakrilamid-gélelektroforézissel vagy nagyteljesítményű folyadékkromatográfíával (HPLC). A nukleinsavak esetében a „lényegében tiszta” kifejezés olyan nukleinsavszekvenciát, -szegmenst vagy -fragmenst jelent, amely nem közvetlenül határos (vagyis nem kapcsolódik kovalensen) azokkal a kódolószekvenciákkal, amelyekkel természetes állapotban (vagyis azon organizmus genomjában, amelyből a találmány szerinti DNS származik) közvetlenül szomszédos (5’- és 3’-végen egyaránt).
Egy molekula (például a találmány szerinti cDNSszekvenciák bármelyike) „fragmense” kifejezésen a mo- » lekula - egymással szomszédos nukleotidokból álló alegységét értjük. Egy molekula „analógja” olyan - térmészetes állapotban nem található - molekula, amely
HU 221 603 BI lényegében hasonló a teljes molekulához vagy annak egy fragmenséhez. Egy molekuláról akkor mondjuk, hogy „lényegében hasonló” egy másik molekulához, ha a két molekula aminosavszekvenciája lényegében azonos. Közelebbről, egy „lényegében hasonló” aminosav- 5 szekvencia olyan szekvencia, amely legalább 50%-ban, előnyösen 85%-ban, legelőnyösebben 95%-ban azonos a természetes vagy vonatkoztatási aminosavszekvenciával és/vagy amely a természetes vagy vonatkoztatási aminosavszekvenciától csak konzervatív aminosav- 10 szubsztitúciókban tér el. A lényegében hasonló aminosavszekvenciákat tartalmazó molekulák hasonló biológiai aktivitásúak. Ahogy a leírásban használjuk, egy molekuláról akkor mondjuk, hogy egy másik molekula „kémiai származéka”, ha olyan molekularészeket tártál- 15 máz, amelyek normális esetben nem képezik a molekula részét. Az ilyen molekularészek növelhetik a molekula oldhatóságát, abszorpcióját, biológiai felezési idejét stb., illetve csökkenthetik a molekula toxieitását, megszüntethetik vagy mérsékelhetik a molekula nemkivána- 20 tos mellékhatásait stb. Az ilyen hatásokat eredményező molekularészek leírását lásd például „Remington’s Pharmaceutical Sciences”, 16. kiadás, Mack Publishing Co., Easton, PA (1980).
A találmány szerinti kimérareceptor-gén „funkció- 25 nális származéka” kifejezésen a gén olyan „fragmenseit” vagy „analógjait” értjük, amelyek nukleotidszekvenciájukat tekintve lényegében hasonlóak. A „lényegében hasonló” nukleinsavak lényegében hasonló aminosavszekvenciákat (meghatározásukat lásd fentebb) kó- 30 dóinak, s az ilyen nukleinsavak közé tartoznak azok a nukleinsavszekvenciák is, amelyek megfelelő hibridizációs feltételek mellett képesek a természetes vagy vonatkoztatási nukleinsavszekvenciával hibridizálódni [a megfelelő hibridizációs feltételeket illetően lásd pél- 35 dául Ausubel és munkatársai: „Current Protocols in Molecular Biology”, Wiley Press, New York, NY (1989)].
A „lényegében hasonló” kimérareceptor hasonló aktivitású, mint a „vad típusú” Τ-sejt-, B-sejt- vagy Fc-re- 40 ceptor-kiméra. A származék előnyösebben a vad típusú kimérareceptor aktivitásának 90%-át, még előnyösebben 70%-át, legelőnyösebben 40%-át fejti ki. A funkcionális kimérareceptor-származék aktivitása abban nyilvánul meg, hogy - extracelluláris CD4-részletével - spéci- 45 fikusan kötődik a HIV-vírussal fertőzött sejtekhez, és elpusztítja az ilyen sejteket. Ezen túlmenően, a kimérareceptor a receptort hordozó sejtet nem teszi érzékennyé a HlV-fertőzésre. A kimérareceptor aktivitása a leírásban ismertetett eljárások bármelyikével tesztelhető. 50
A találmány szerinti CD4-kimérareceptort kódoló DNS-szekvencia vagy funkcionális származékai - hagyományos eljárások alkalmazásával (a ligáláshoz szükséges tompa vagy ragadós végek kialakításával, restrikciós enzimes emésztéssel, a nemkívánatos összekapcso- 55 lódások elkerülése érdekében a ragadós végek alkalikus foszfatázos kezeléssel végzett feltöltésével és megfelelő ligázokkal végzett ligálással) - vektorDNS-sel rekombinálhatók. Az ilyen manipulációs technikák jól ismertek [lásd például Maniatis és munkatár- 60 sai: „Molecular Cloning: A Laboratory Manual”, 2. kiadás, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1989)].
Egy nukleinsavmolekuláról (például DNS-ről) akkor mondjuk, hogy egy polipeptid „expresszálására képes”, ha a polipeptidet kódoló nukleotidszekvenciákhoz .működőképesen kapcsolva” olyan nukleotidszekvenciákat tartalmaz, amelyek transzkripciós és transzlációs szabályozó információkat hordoznak. A .működőképes kapcsolódás” kifejezésen a szabályozó DNS-szekvenciák és az expresszálni kívánt DNS-szekvencia olyan kapcsolatát égtük, amely lehetővé teszi a génexpressziót. Az egyes organizmusokban a génexpresszióhoz szükséges szabályozórégiók pontos természete más és más lehet, azonban általános szabály, hogy tartalmazniuk kell egy olyan promoterrégióL amely - prokariótákban - magát a promotert (amely az RNS-transzkripció beindítását vezérli), valamint olyan DNS-szekvenciákat tartalmaz, amelyek RNS-sé átíródva jelzik a proteinszintézis kezdetét.
Az ilyen régiók normális esetben magukban foglalják azokat az 5’-oldali nemkódoló szekvenciákat, amelyek a transzkripció és a transzláció beindításában játszanak szerepet; ezek közé tartozik a „TATA-box”, a „capping”szekvencia, a CAAT-szekvencia és hasonlók.
Kívánt esetben a fentebb leírt eljárásokkal a proteint kódoló géntől 3 ’-irányban lévő nemkódoló régiót kaphatunk, amely fenntartható transzkripciós terminációs szekvenciái számára. Ennek megfelelően a proteint kó- j.
doló DNS-szekvenciával természetes állapotban közvet·5 1 lenül szomszédos 3’-régió fenntartásával biztosíthatók » a transzkripciós terminációs szignálok Amennyibena: | transzkripciós terminációs szignálok működése a gazda- } sejtben nem kielégítő, olyan 3’-régió alkalmazható, i amely a gazdasejtben működőképes. t
Két DNS-szekvenciáról (például egy promoterré- | gióról és egy CD4-kimérareceptort kódoló szekvenciá- r ról) akkor mondjuk hogy működőképesen kapcsolód- r nak, ha a két DNS-szekvencia közötti kötés (1) nem eredményez kereteltolódási („frame-shift”) mutációt;
(2) nem gátolja a promoterrégió kimérareceptor-gén transzkripcióját irányító képességét; vagy (3) nem gátolja a kimérareceptor-gén azon képességét, hogy a promoterrégió irányítása alatt transzkriptálódjon. Egy promoterrégió akkor kapcsolódik működőképesen egy DNSszekvenciához, ha a promoter képes a DNS-szekvencia transzkripciójának beindítására. Ennek megfelelően a protein expresszálása érdekében olyan transzkripciós és transzlációs szignálokra van szükség, amelyeket egy megfelelő gazdasejt felismer.
A találmány szerinti megoldás értelmében a CD4kimérareceptor-proteint (vagy funkcionális származékát) prokarióta vagy eukarióta sejtekben expresszáltatjuk, bár előnyösebb az eukarióta sejtekben (és főleg az emberi limfocitákban) végzett expresszió.
A találmány szerinti antitestek számos eljárással előállíthatok. Például, a kimérát megkötni képes poliklonális antitesteket tartalmazó szérum termelődésének indu- t kálása céljából egy állatnak olyan sejteket adunk be, amelyek a CD4-receptor-kiméraproteint (vagy funkció- r nális származékát) expresszálják.
HU 221 603 Bl
Az egyik előnyös eljárással a találmány szerinti antitestekként monoklonális antitesteket állítunk elő. Az ilyen monoklonális antitestek hibridómatechnika [Kohler és munkatársai: Natúré 256, 495 (1975); Kohler és munkatársai: Eur. J. Immunoi. 6, 511 (1976); Kohler és mun- 5 katársai: Eur. J. Immunoi. 6, 292 (1976); Hammerling és munkatársai: „Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas”, Elsevier, NY, 563. olásd (1981)] alkalmazásával állíthatók elő. Általában az ilyen eljárásokban egy állatot a CD4-kimérareceptor-antigénnel immunizá- 10 lünk, az állatok lépsejtjeit kivonjuk, és alkalmas myeloma-sejtvonallal fuzionáltatjuk. A találmány szerinti megoldás értelmében bármilyen alkalmas myeloma-sejtvonal alkalmazható. A fúzió után a kapott hibridómasejteket szelektív körülmények mellett HAT-tápkö- 15 zegben tartjuk, majd Wands és munkatársai leírása szerint [Gastroenterology 80,225 (1981)] határhigításos eljárással klónozzuk. Az ilyen szelektálással kapott hibridómasejteket a kimérához kötődni képes antitesteket szekretáló kiónok azonosítása céljából teszteljük. 20
A találmány szerinti antitestek lehetnek poliklonális vagy - előnyösen - régióspecifikus poliklonális antitestek is.
A találmány szerinti CD4-kimérareceptor elleni antitestek felhasználhatók a páciensben lévő kimérarecep- 25 tor (vagy kimérareceptort hordozó sejtek) mennyiségének ellenőrzésére. Az ilyen antitestek előnyösen alkalmazhatók a standard immundiagnosztikai vizsgálatokban, mint például az immunometriás vagy „szendvics” típusú vizsgálati eljárásokban (hagyományos szendvics 30 vizsgálati eljárás, fordított szendvics vizsgálati eljárás és szimultán szendvics vizsgálati eljárás). Az elfogadható specifitású, érzékenységű és pontosságú immunvizsgálatok megvalósítása érdekében az antitestek mennyisége és kombinációi elvárható mennyiségű kísérleti 35 munkával meghatározhatók.
Az immunológia alapelveit ismertető források közé tartoznak a következők: Roitt: „Essential Immunology”,
6. kiadás, Blackwell Scientific Publications, Oxford (1988); Kimball: „Introduction to Immunology”, 2. ki- 40 adás, Macmillan Publishing Co., New York (1986); Roitt és munkatársai: „Immunology”, Gower Medical Publishing Ltd., London (1985); Campbell: ,Monoclonal Antibody Technology” in: „Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology” (szerk.: Burdon 45 és munkatársai), 13. kötet, Elsevier, Amsterdam (1984); Klein: „Immunology: The Science of Self-Nonself Discrimination”, John Wiley and Sons, New York (1982); és Kennett fe munkatársai (szeik.):,Monoclonal Antibodies, Hybridoma: A New Dimension In Biolo- 50 gical Analyses”, Plenum Press, New Yoik (1980).
A „detektálás” vagy „kimutatás” kifejezésen egy anyag jelenlétének vagy hiányának, illetve mennyiségének meghatározását értjük. Ennek megfelelően ez a kifejezés egyaránt vonatkozik a találmány szerinti anya- 55 gok, készítmények és eljárások minőségi fe mennyiségi meghatározásokra történő alkalmazására.
A találmány szerinti antitestek és a találmány szerinti, lényegében tisztított antigén ideálisan alkalmazhatók reagenskészlet előállítására. Az ilyen reagenskész- 60 let tartalmaz egy rekeszekre osztott hordozóeszközt, amelyben egymáshoz közel egy vagy több edény, például fiolák, kémcsövek vagy hasonlók helyezkednek el, melyek a vizsgálat végrehajtásához szükséges elemeket elkülönítve tartalmazzák.
A reagenskészlet alkalmazásával számos vizsgálati típus elvégezhető, többek között kompetitív és nem kompetitív vizsgálatok. A találmány szerinti antitestek alkalmazásával végrehajtható vizsgálatok jellemző példái közé tartoznak a radioimmunvizsgálatok (RIA), az enzim-immunvizsgálatok (EIA), az enzimkötött immunadszorbens-vizsgálatok (ELISA), valamint az immunometriás (vagy szendvics) vizsgálatok.
Az „immunometriás” vagy „szendvics típusú” vizsgálati eljárás kifejezéseken a szimultán szendvics típusú, a hagyományos szendvics típusú és a fordított szendvics típusú immunvizsgálati eljárásokat értjük. E kifejezések jelentése szakember számára kézenfekvő. A találmány szerinti antitestek egyéb, jelenleg ismert vagy a jövőben kifejlesztésre kerülő vizsgálati eljárásokban is alkalmazhatók; ezek a megoldások szintén az igényelt oltalmi körbe tartoznak.
A „specifikusan felismeri és megköti” kifejezésen azt értjük, hogy az antitest felismeri fe megköti a kimérareceptor-polipeptidet, azonban egy mintában (például biológiai mintában) lévő egyéb, nem rokon molekulákat nem ismer fel és ezeket nem köti meg.
A „terápiás sejt” kifejezésen olyan sejtet értünk, amely a találmány szerinti CD4-kimérareceptort kódolók génnel van transzformálva, s ezáltal képes felismerni és elpusztítani a HIV-vírussal fertőzött sejteket; az ilyen tó* rápiás sejtek előnyösen a vérképző rendszer sejtjei.
Az „extracelluláris” kifejezésen azt értjük, hogy a molekula legalább egy része a sejt felületén helyezkedik el. Az „intracelluláris” kifejezésen azt értjük, hogy a molekula legalább egy része a terápiás sejt citoplazmájával érintkezik. A „transzmembrán” kifejezésen azt értjük, hogy a molekula legalább egy része átíveli a plazmamembránt. Ahogy a leírásban használjuk, az „extracelluláris rész”,„intracelluláris rész”, illetve „transzmembrán rész” olyan, egymással érintkező aminosavszekvenciákat jelent, amelyek egymással szomszédos sejtkompartmentekbe nyúlnak át.
Az „oligomerizálás” kifejezésen egy molekula más proteinekkel alkotott dimeijeinek, trimeijeinek, tetrameijeinek vagy magasabb rendű oligomerjeinek kialakítását értjük. Az ilyen oligomerek homooligomerek vagy heterooligomerek egyaránt lehetnek. Az „oligomerizáló rész” a molekula azon régiója, amely a komplex- (azaz oligomer-) képződést irányítja.
A „citolitikus” kifejezésen egy sejt (például HIVvírussal fertőzött sejt) vagy egy fertőző anyag (például HIV-vírus) elpusztításának képességét értjük.
Az „immundeficienciavirus” olyan retrovírus, amely vad típusú alakjában képes egy főemlős gazda T4-sejtjeinek megfertőzésére, fe a lentivírus alcsalád morfogenezises és morfológiai tulajdonságait mutatja. »::
Ez a kifejezés magában foglalja a HÍV és SIV összes változatát (HIV-1, HIV-2, SlVmac, SIVagm, SlVmnd, ~
SlVsmm, SlVman, SlVmand és SIVcpz).
HU 221 603 Bl
Az „MHC-fuggetlen” kifejezésen azt értjük, hogy a celluláris citolitikus reakcióhoz a célsejt felületén nincs szükség MHC I. osztályú antigén jelenlétére.
A „funkcionális citolitikus szignáltranszdukáló származék” kifejezésen olyan (fentebb meghatározott) fűnk- 5 cionális származékot értünk, amely a vad típusú molekula biológiai aktivitásának legalább 40%-át, előnyösebben 70%-át, legelőnyösebben legalább 90%-át képes kifejteni. Ahogy a leírásban használjuk, a „funkcionális citolitikus szignáltranszdukáló származék” mű- 10 ködhet közvetlenül, a terápiás sejtet receptorkötött anyag vagy sejt elpusztítására indukálva (például intracelluláris kimérareceptor-rész esetében), illetve működhet közvetett módon, a terápiás sejt citolitikus szignáltranszdukáló proteinjei oligomerizációjának elősegi- 15 tésével (például transzmembrándomén esetében). Az ilyen származékok hatékonysága, például, az itt leírt in vitro vizsgálat alkalmazásával tesztelhető.
A „funkcionális HIV-envelope-kötő származék” kifejezésen olyan (fentebb meghatározott) funkcionális 20 származékot értünk, amely képes bármilyen HlV-burokprotein megkötésére. Az ilyen funkcionális származékok például az itt leírt in vitro vizsgálat alkalmazásával azonosíthatók.
Terápiás alkalmazás 25
A találmány szerinti transzformált sejteket immundeficienciavírus-fertőzés kezelésére alkalmazzuk. Az ilyen transzformált sejtek beadásának jelenlegi eljárásai közé tartozik az adoptív immunterápia és a sejtbeviteli terápia. Ezek az eljárások lehetővé teszik a transz- 30 formált immunrendszeri sejtek vérkeringésbe történő visszajuttatását [Rosenberg: Sci. Am. 62, (1990); Rosenberg és munkatársai: N. Engl. J. Med. 323, 570 (1990)].
A találmány szerinti gyógyászati készítmények bár- 35 milyen állatnak beadhatók, amelyben várható a találmány szerinti vegyületek jótékony hatása. A találmány szerinti gyógyászati készítményeket elsősorban embereknek adjuk be, bár a találmány szerinti megoldást nem kívánjuk csupán ezen alkalmazási területre korlá- 40 tozni.
A következőkben az ábrák rövid leírását ismertetjük.
Az la. ábrán a CD4 (1-369. aminosavak) és különböző receptorláncok (38-41. azonosító számú szekvenciák) közötti fúzió helyén lévő aminosavszekvenciákat 45 mutatjuk be. Az aláhúzott szekvenciák a fúziós konstrukcióhoz alkalmazott BamHI-helyen belüli nukleotidszekvencia által kódolt aminosavakat jelölik. A transzmembrándomén kezdetét függőleges vonallal jelöljük.
A η-szekvencia N-terminálisa azonos a ζ-szekvenciá- 50 val, C-terminálisa azonban eltér attól [Jin és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 3319 (1990)]. Az lb. ábrán a CD4, ϋϋ4:ζ, CD4:y és CD4:q CV1sejtekben mutatott felületi expressziójának áramlási citometriás vizsgálatának eredményét mutatjuk be. A sej- 55 teket CD4-kimérákat vagy CDlőppt expresszáló vírussal fertőztük, és fikoeritrinnel konjugált Leu3A antiCD4 monoklonális antitesttel festettük.
A 2. ábrán a CDI 6™ expresszióját mutatjuk be.
A sűrűn pontozott vonal a csak transzmembrán-CD16- 60 ot (CDIÓjm) expresszáló vírussal végzett fertőzés utáni expressziót, a szaggatott vonal a CD4:y-t expresszáló vírussal, a folytonos vonal pedig a CD4^-t expresszáló vírussal együttesen fertőzött sejtekben megfigyelt expressziót ábrázolja. A ritkán pontozott vond a csak CD4^-val fertőzött, 3G8 anti-CD16 monoklonális antitesttel [Fleit és munkatársai: Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 79, 3275 (1982)] festett sejtekben megfigyelt expressziót mutatja.
A 3. ábrán a CDIŐjm - CDlójM-et, illetve a következő ζ-kimérákat expresszáló vírusokkal együttesen fertőzött sejtekben megfigyelt - felületi expresszióját mutatjuk be: Ο34:ζ (vastag folytonos vonal), Ο)4:ζ C11G (folytonos vonal); ϋ)4:ζ (szaggatott vonal);
Ο34:ζ C11G/D15G (sűrűn pontozott vonal). A ritkán pontozott vonal a csak CDlójM-et expresszáló vírussal fertőzött sejtekben megfigyelt felületi expressziót mutatja. A sejteket 3G8 anti-CD16 monoklonális antitesttel és egér-IgG elleni fikoeritrinnel konjugált Fab’2 kecskeantitestekkel inkubáltuk. A ζ-kimérák expressziójának nagysága a vizsgált mutánsokban lényegében azonos volt, és a CDlöpM-et, illetve a ζ-kimérákat expresszáló vírusokkal végzett együttes fertőzés nem változtatta meg észrevehetően a kimérák felületi expresszióját.
A 4a-4d. ábrákon azt mutatjuk be, hogy egy TRsejtvonalban a mutáns ζ-kimérák keresztkötődése után? növekszik az intracelluláris szabad kalciumionok szint* l je. „Jurkat E6” sejteket [Weiss és munkatársai: J. lm* imunol. 133, 123 (1984)] rekombináns vacciniavírusok- < { kai fertőztünk és áramlási citometriával vizsgáltunk;. |
A bemutatott eredmények a kapuzott („gated”) CD4* j populációra vonatkoznak, igy csak a releváns kiméraproteint expresszáló sejteket vizsgáltuk. Az ibolya flua- | reszcencia kék színű Indo-1 fluoreszcenciához viszonyi- f tott átlagos aránya a populációban lévő intracelluláris f szabad kalciumkoncentrációt tükrözi, a reagáló sejtek ’ százalékos aránya pedig az előre meghatározott küszöbarányt (melyet úgy választottunk meg, hogy a nem kezelt sejtek 10%-a legyen pozitív) meghaladó sejtek arányát mutatja. A 4a. és 4b. ábrán a CD4^-t (folytonos vonal), illetve a CD16^-t (szaggatott vonal) expresszáló fikoeritrinnel konjugált Leu3a anti-CD4 monoklonális antitesttel inkubált, majd egér-IgG elleni kecskeantitesttel keresztkötött - ,Jurkat”-sejtek eredményei láthatók. A pontozott vonal a nem fertőzött sejtek 0KT3 anti-CD3 monoklonális antitestre adott reakcióját mutatja. A 4c. és 4d. ábrán a 034:ζ0150-1 (folytonos vonal), CD4^CllG/D15G-t (szaggatott vonal), illetve CD4: ζCl lG-t expresszáló, Jurkat”-sejtek eredményei láthatók (melyeket a 4a. és 4b. ábrával kapcsolatban leírtak szerint kezeltünk és vizsgáltunk).
Az 5a-5c. ábrákon azt mutatjuk be, hogy a CD4: ζ-,
CD4:y- és CD4:η-receptorok lehetővé teszik, hogy a citolitikus T-limfociták (CTL) elpusztítsák a HIV-1gpl20/41-proteint expresszáló célsejteket. Az 5a. ábrán a sötét körök a gpl20/41-et expresszáló „HeLa”- t sejtekkel inkubált - Ο>4:ζ-ί expresszáló - citolitikus T-limfociták eredményeit; a világos körök a nem fertő- zött „HeLa”-sejtekkel inkubált - CD4^-t expresszáló
HU 221 603 Bl
- citolitikus T-limfociták eredményeit; a sötét négyzetek a gpl20/41-et expresszáló „HeLa”-sejtekkel inkubált, nem fertőzött citolitikus T-limfociták eredményeit; a világos négyzetek pedig a nem fertőzött „HeLa”-sejtekkel inkubált, nem fertőzött citolitikus T-limfociták 5 eredményeit mutatják. Az 5b. ábrán a sötét körök a gpl20/41-et expresszáló ,JHeLa”-sejtekkel inkubált CD4: η-t expresszáló - citolitikus T-limfociták eredményeit; a világos körök a gpl20/41-et expresszáló „HeLa”-sejtekkel inkubált - CD4:y-t expresszáló - 10 citolitikus T-limfociták eredményeit; a négyzetek pedig a gpl20/41-et expresszáló „HeLa”-sejtekkel inkubált Cl 1G/D15G kettős mutáns CD4: ζ-kimérát expresszáló citolitikus T-limfociták eredményeit; a világos négyzetek pedig a nem fertőzött „HeLa”-sejtekkel inkubált, 15 nem fertőzött citolitikus T-limfociták eredményeit mutatják. Az 5c. ábrán az 5b. ábrán bemutatott kísérletben alkalmazott citolitikus T-limfociták CD4-expressziójának áramlási citometriás vizsgálatának eredményeit mutatjuk be. A célsejt: effektor arány korrigálása céljából a 20 CD4-kimérát expresszáló sejtek százalékos arányát úgy határoztuk meg, hogy a meghatározott nagyságú negatív (nem fertőzött) populációt - hisztogramráhelyezés alapján - levontuk. Az 5c. ábrán a nem fertőzött sejtek számára - összehasonlítási célból - önkényes küszöb- 25 értéket határoztunk meg, ami az egyéb sejtpopulációkra durván ugyanazt a pozitív frakciót adja, mint a hisztogramos kivonás.
A 6a. és 6b. ábrán a CD4 által irányított citolízis specifitását mutatjuk be. A 6a. ábrán a sötét körök a 30 CD16PI-t expresszáló HeLa-sejtekkel inkubált, CD4: ζ-t expresszáló CTL-ek eredményeit; a világos körök a gpl20-at expresszáló HeLa-sejtekkel inkubált, CD4-et expresszáló CTL-ek eredményeit; a sötét négyzetek a gpl20/41-et expresszáló HeLa-sejtekkel inkubált, 35 CD16^-t expresszáló CTL-ek eredményeit; a világos négyzetek pedig a gpl20prt expresszáló CTL-ek eredményeit mutatják A 6b. ábrán a sötét körök az MHC11+ osztályú Raji-sejtekkel inkubált, Ο34:ζ-ί expresszáló CTL-ek eredményeit; a világos körök az RJ2.25-sej- 40 tekkel (MHC Π- osztályú Raji-mutáns sejtek) inkubált, nem fertőzött CTL-ek eredményeit; a sötét négyzetek az MHC II+ osztályú Raji-sejtekkel inkubált, nem fertőzött CTL-ek eredményeit, a világos négyzetek pedig az RJ2.25-sejtekkel (MHC Π osztályú Raji-mutáns sej- 45 tek) inkubált, CD4: ζ-t expresszáló CTL-ek eredményeit mutatják. Az ordináta skáláját negatív irányba kiterjesztettük.
A 7a. és 7b. ábrán a CDI 6: ζ-kimérareceptor karakterizálását mutatjuk be. A 7a. ábrán a CD16: ζ fúziós pro- 50 tein sematikus vázlata látható. A monomer CDI 6 foszfatidilinozitolhoz kötött alakjának extracelluláris részét dimer ζ-lánchoz kapcsoltuk (közvetlenül a transzmembrándoménen kívül). Az ábra alján a kapcsoló helyének aminosavszekvenciáját mutatjuk be (42. és 43. azonosí- 55 tó számú szekvencia). A 7b. ábrán a CD16: ζ-kiméra keresztkötődését követő kalciummobilizáció - TCRpozitív vagy TCR-negatív sejtvonalban - áramlási citometriával végzett vizsgálatának eredményeit mutatjuk be. Az ábrán az antitestekkel 0. másodpercben kezelt 60 sejtpopulációkban az ibolya fluoreszcencia kékfluoreszcenciához viszonyított aránya (ami a relatív kalciumionkoncentráció mérőszáma) látható. A sötét négyzetek a Jurkat-sejtek OKT3 anti-CD3 monoklonális antitestre adott reakcióját; a sötét háromszögek a CD16^ REX33A TCR- mutánst keresztkötö - 3G8 antiCD16 monoklonális antitestre adott reakcióját; a világos négyzetek a JRT3.T3.5 Jurkat TCR- mutáns sejtvonalban a keresztkötést képző CD16: ζ-ra adott reakciót; a világos háromszögek Jurkat-sejtekben a keresztkötést képző CD16^-ra adott reakciót; a „+” jelek Jurkat-sejtekben a nem kiméra CD16-ra mutatott reakciót; a pontok pedig a nem kiméra CD16-ra a TCR- REX33Asejtvonalban mutatott reakciót mutatják.
A 8a. és 8b. ábrán a citolitikus potenciál deléciós vizsgálatának eredményeit mutatjuk be. A 8a. ábrán a ζ deléciós végpontjainak elhelyezkedése látható. Az ábrán a ζ mutációit - az általánosan alkalmazott jelölésnek megfelelően - az eredeti aminosav/elhelyezkedés/mutáns aminosav rövidítéssel jelöljük, igy például a ,JD66*” a 66. aszparaginsav tenninációs kodonnal történő helyettesítését jelöli. A 8b. ábrán a deléciót nem tartalmazó CD16^ és a feltűnő ζ-deléciókat tartalmazó CD16 ^-kimérák citolízisvizsgálatban kapott eredményeit mutatjuk be. A CD16 elleni felületi antitestet exp? resszáló hibridómasejteket 51Cr-izotóppal jelöltük, és növekvő számú - CD16^-kimérákat expresszáló rekombináns vacciniavirussal fertőzött - emberi citolitikus T-limfocitával inkubáltuk. A felszabadult 51Crizotóp százalékos arányát az effektor (CTL) célsejtek·* hez (hibridómasejtekhez) viszonyított aránya függvén nyében ábrázoltuk. A sötét körök a CD16^-et exp* resszáló sejtek által közvetített citolízist (mfi=18,7); a sötét négyzetek a €Ο16:ζΑ8ρ66*-1ώηέΓήΐ expresszáló · sejtek által közvetített citolízist (mfi=940,2); a világos négyzetek a CD16: ζΟ1υ60*-1αιηέΓέί expresszáló sejtek által közvetített citolízist (mfi=16,0); a világos körök a CD16: ζΤ)τ51 *-kimérát expresszáló sejtek által közvetített citolízist (mfi=17,4); a sötét háromszögek a CD16^he34*-kimérát expresszáló sejtek által közvetített citolízist (mfi=17,8); a világos háromszögek pedig a nem kiméra CD16-ot expresszáló sejtek által közvetített citolízist (mfi=591) mutatják. Bár ebben a kísérletben a CD16:ζAsp66* expressziója nem volt hozzáigazítva a többi fúziós protein expressziójához, az ugyanezen kísérletben azonos szinten CD16^-t expresszáló sejtek általi citolízis lényegében azonos eredményeket adott, mint a CD16^Asp66-kimérát expresszáló sejtek esetében.
A 9a-9d. ábrákon azt mutatjuk be, hogy a transzmembrán kölcsönhatások lehetőségének megszüntetése egy rövid ζ-szegmenst eredményez, amely képes a citolízis közvetítésére. A 9a. ábrán két- és háromrészes monomer kimérák sematikus rajzai láthatók. Az ábra tetején a 65. aminosavnál hasított CD16 ^-konstrukció látható, amelyből hiányzik a transzmembrán cisztein és aszparaginsav. Lentebb a CD16:CD5^- és a CD16: CD7: ζ-konstrukció, valamint a megfelelő kontrollok láthatók. Az intracelluláris domének aminosavszekvenciái az ábra alján láthatók (45., 46. és 47. azo9
HU 221 603 Bl nősítő számú szekvenciák). A 9b. ábrán a monomer kimérák deléciós mutánsainak citolitikus aktivitását mutatjuk be. Az ábrán a CD16^-t expresszáló sejtek citolitikus aktivitását (sötét körök; mfi=495) a CD16^Asp66*-konstrukciót expresszáló sejtek 5 citolitikus aktivitásával (sötét négyzetek; mfi=527);, illetve a mutáns CD16^CysllGly/Aspl5Gly/Asp66*konstrukciót (üres négyzetek; mfi=338) és a mutáns CD16: ζϋνβΐ lGly/Aspl5Gly/Glu60*-konstrukciót expresszáló sejtek citolitikus aktivitásával (sötét három- 10 szögek; mfi=295) hasonlítjuk össze. A 9c. ábrán a három részből álló fúziós proteinek által közvetített citolitikus aktivitást mutatjuk be. A sötét háromszögek a ϋΟ16:ζΑ8ρ66*-1άιηέΓέΐ expresszáló sejtek; a világos négyzetek a CD16:5: ζ(48-65)-&)η8ίηύα:ίόί exp- 15 resszáló sejtek; a sötét négyzetek a ϋϋ16:7:ζ(48-65)-konstrukciót expresszáló sejtek; az üres háromszögek a CD16:7:4(48-59)-konstrukciót expresszáló sejtek; az üres körök a CD16:5-konstrukciót expresszáló sejtek; a sötét körök pedig a CD16:7- 20 konstrukciót expresszáló sejtek citolitikus aktivitását mutatják. A 9d. ábrán a mutáns és háromrészes kimérák által mutáns TCR~ Jurkat JRT3.T3.5-sejtvonalban kiváltott kalciummobilizációt mutatjuk be. A világos körök a dimer a εθ16:ζΑ8ρ66*Αοη8ΐη±οϊόΐ exp- 25 resszáló sejtek reakcióját; a sötét négyzetek a CD16: ζCysl lGly/Aspl 5/Gly/Asp66*-konstrukciót expresszáló sejtek reakcióját; a világos négyzetek a CD16: ζϋνβΐ lGly/Aspl5/Gly/Glu60*-konstrukciót expresszáló sejtek reakcióját; a sötét háromszögek a 30 CD16:7^(48-65)-konstrukciót expresszáló sejtek reakcióját; a világos háromszögek pedig a CD16^(48-59)-konstrukciót expresszáló sejtek reakcióit mutatják.
A lOa-lOf. ábrákon a 18 aminosavas szignál- 35 transzdukáló motívum egyes aminosavainak aktivitásban betöltött szerepét mutatjuk be. A 10a. és 10b., illetve a 10c. ábrán a C-terminális tirozin (Y62) közelében pontmutációkat hordozó kimérák által közvetített citolitikus aktivitást, illetve kalciumion-mobilizációt mutat- 40 juk be. A 10a. és 10b. ábrán a ϋϋ16:ζ fúziós proteineket nagy, illetve kis mennyiségben expresszáló sejtek esetében kapott eredmények láthatók. A kalciumionmobilizációs, illetve a citolízises vizsgálat eredményeinek ábrázolására azonos jelöléseket alkalmaztunk, me- 45 lyeket az ábrák jobb oldalán tüntettünk fel. A sötét körök a ϋϋ16:ζ-ί expresszáló sejtek (A: mfi=21; B: mfi=376); a sötét négyzetek a CD16:7: ζ(48-65^οη8ίrukciót expresszáló sejtek (A: mfi=31; B: mfi=82); a világos négyzetek a CD16:7: ζ(48-65χ31υ60Ο1η4κ>η8ί- 50 rukciót expresszáló sejtek (A: mfi=33; B: mfi=92); a „+” jelek a CD16:7^(48-65)Asp63Asn-konstrukciót expresszáló sejtek (A: mfi=30; B: mfi=74); a sötét háromszögek a CD16:7: ζ(48-65)Τ)τ62ΡΗβ-1ίοη8ΐη±ωόί expresszáló sejtek (A: mfi=24; B: mfi=88); a világos 55 körök a CD16:7^(48-65)Glu61Gln-konstrukciót expresszáló sejtek (A: mfi=20; B: mfi=62); a világos háromszögek pedig a CD16:7^(48-65)Tyr62Ser-konstrukciót expresszáló sejtek (B: mfi=64) eredményeit mutatják. A lOd. és lOe. ábrán, illetve a lOf. ábrán az N- 60 terminális tirozin (Y51) közelében pontmutációt hordozó kimérák által közvetített citolitikus aktivitást, illetve kalciumion-mobilizációt ábrázoljuk. A kalciumionmobilizációs, illetve a citolízises vizsgálat eredményeinek ábrázolására azonos jelöléseket alkalmaztunk, melyeket az ábrák jobb oldalán tüntettünk fel. A sötét körök a CD16^-t expresszáló sejtek (D: mfi=21,2; E:
mfi=672); a sötét négyzetek a CD16:7: ζ(48-65^οηβΙrukciót expresszáló sejtek (D: mfi=31,3; E: mfi=179);
a sötét háromszögek a CD16:7^(48-65)Asn48Serkonstrukciót expresszáló sejtek (D: mfi=22,4; E:
mfi=209; E: mfi=88); a világos négyzetek a
CD16:7^(48-65)Leu50Ser konstrukciót expresszáló sejtek (D: mfi=25,0; E: mii=142); a világos háromszögek pedig a CD16:7^(48-65)Tyr51Phe-konstrukciót expresszáló sejtek (D: mfí=32,3; E: mfi=294) citolitikus aktivitását mutatják.
A 1 la. és 1 lb. ábrán a ζ-lánc belső ismétlődéseinek egymás alá rendezését („alignment”) és citolízist elősegítő képességük összehasonlítását mutatjuk be. A 1 la. ábrán a ζ intracelluláris doménjének harmadolásával (és a CD16:7-kiméra transzmembrándoménjéhez kapcsolt) kapott kimérák sematikus ábrázolását, valamint az intracelluláris domének szekvenciáit (48., 49. és 50. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be (az azonos aminosavakat bekereteztük, a rokon aminosavakat pedig csillaggal jelöltük). A 1 lb. ábrán a három ζ-aldomén í citolitikus hatását mutatjuk be. A sötét körök a CD16: ζ- 1 kimérát expresszáló sejtek (mfi=476); a sötét négyzetek? I a CD16:7^(33-65)-konstrukciót expresszáló sejtek, j (mfí=68); a világos négyzetek a CD16:7^(71-104)fe J konstrukciót expresszáló sejtek (mfi=114); a sötét há? j romszögek pedig a CD16:7^(104-138)-konstrukciót | expresszáló sejtek (mfi=104) citolitikus aktivitását mu- j tátják. |
A 12. ábrán a CD16:FcRyII-kimérák sematikus áb- , rázolását mutatjuk be. ·
A 13a. és 13b. ábrán a CD4:FcRyII- és CD16:FcRyII-kiméra keresztkötése utáni kalciumionmobilizációt mutatjuk be. A 13 a. ábrán a kalciumérzékeny „Indo-1” fluorofórral jelölt sejtek által kibocsátott ibolyaszínű fluoreszcencia kék színű fluoreszcenciához viszonyított arányát a CD16 extracelluláris dómén antitestekkel megvalósult keresztkötése után eltelt idő függvényében ábrázoljuk. A 13b. ábrán a CD4:FcRyIIkimérákat hordozó sejtek által kibocsátott ibolyaszínű fluoreszcencia kék színű fluoreszcenciához viszonyított aránya - a kimérák antitestekkel létrehozott keresztkötése utáni - növekedésének előzőhöz hasonló vizsgálatát mutatjuk be.
A 14a. és 14b. ábrán a CD4:FcRyII- és CD16:FcRyII-kiméra citolízisvizsgálatának eredményeit mutatjuk be. A 14a. ábrán a CD16: FcRyH-kimérákat expresszáló citotoxikus T-limfociták (effektorsejtek) növekvő mennyiségével kezelt anti-CD16 hibridómasejtek (célsejtek) által felszabadított 51Cr-izotóp százalékos arányát mutatjuk be. A 14b. ábrán a fc
CD4:FcRyII-kimérák által HlV-burok-glikoproteineket expresszáló célsejtekkel szemben közvetített citoto- r xicitás előzőhöz hasonló vizsgálatának eredményeit mu10
HU 221 603 Bl tatjuk be. A 15a-15e. ábrákon az FcRyII-A-farokban lévő - citolízis szempontjából lényeges - aminosavak azonosítását mutatjuk be. A 15a. ábrán a deléciós konstrukciók sematikus rajza látható. A 15b. és 15c. ábrán a CD16: FcRyII-A C-terminális deléciós változatai- 5 nak kalciumion-mobilizációra és citolízisre gyakorolt hatása vizsgálatának eredményeit mutatjuk be. A 15d. és 15e. ábrán a CD16: FcRyII-Α intracelluláris farka Nterminálisán egyre kevesebb aminosavat tartalmazó háromrészes kimérák kalciumion-mobilizációra és cito- 10 lizisre gyakorolt hatása vizsgálatának eredményeit mutatjuk be.
A 16. ábrán a CD3-delta-receptorprotein aminosavszekvenciáját (24. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be; a bekeretezett szekvencia az előnyös cito- 15 litikus szignáltranszdukáló részt jelzi.
A 17. ábrán a T3-gamma-receptorprotein aminosavszekvenciáját (25. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be; a bekeretezett szekvencia az előnyös citolitikus szignáltranszdukáló részt jelzi. 20
A 18. ábrán az mbl-receptorprotein aminosavszekvenciáját (26. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be; a bekeretezett szekvencia az előnyös citolitikus szignáltranszdukáló részt jelzi.
A 19. ábrán a B29-receptorprotein aminosavszek- 25 venciáját (27. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be; a bekeretezett szekvencia az előnyös citolitikus szignáltranszdukáló részt jelzi.
A 20. ábrán a CD4-kimérák sematikus ábrázolását mutatjuk be. A 20a. ábrán a CD4(Dl-D4):Ig:CD7- 30 molekula; a 20b. ábrán a CD4(D1, D2):Ig:CD7-molekula; a 20c. ábrán a CD4(D1-D4):lg:CD7^-molekula; a 20d. ábrán a CD4(D1, D2): lg :CD7: ζ-molekula; a 20e. ábrán pedig a CD4; ζ-molekula látható. Az emberi CD4-molekula - prekurzor 1-394. aminosavainak 35 megfelelő - extracelluláris doménjét korábbi leírás szerint [Zettlemeissl és munkatársai: DNA Cell Bioi. 9,
347 (1990); azzal a különbséggel, hogy a rekombináns vacciniavirusokban az expresszió elősegítése érdekében az emberi Ig-iekombinánsok cDNS-változatát alkalmaz- 40 tűk] egy BamHI-helynél az emberi IgGl csukló(„hinge”), CH1- és CH2-doménjeihez kapcsoltuk.
A CD4-kimérák két domént tartalmazó változatát úgy állítottuk elő, hogy a CD4-prekurzor cDNS (200. aminosavnak megfelelő) egyedi Nhel-helyére egy BamHI- 45 adaptert inszertáltunk. A membránhoz kapcsolódó szekvenciák az emberi membránkötött IgGl első exonjából származó 22 aminosavból, valamint a CD7 146-203. aminosavaiból álltak. A ζ 55-163. aminosavai a négyrészes konstrukciók (20c. és 20d. ábra) „trigger”-motí- 50 vumaként szolgáltak. A ζ-láncot tartalmazó négyrészes konstrukciókban a ζ intracelluláris expresszióját kereskedelmi forgalomban beszerezhető intracelluláris dómén elleni antitesttel (Coulter) igazolták.
A 21. ábrán a HIV-l-burok-glikoproteint exp- 55 resszáló célsejtek - effektormolekulaként különböző CD4-eredetü kimérákat expresszáló - citotoxikus WH3-T-sejt-klón által közvetített citolízisét mutatjuk be. A citotoxicitási vizsgálatokhoz a CD8+ CD4- HLA B44-korlátozott WH3-T-sejtvonalat 10% emberi szé- 60 rummal kiegészített IMDM-tápközegben tartottuk, ahogy azt a leírásban korábban ismertettük. A sejteket gamma-sugárzással (3000 rád) kezelt, B44-et hordozó egymagvú sejtekkel és 1 pg/ml koncentrációjú fítohemagglutminnel (PHA) stimuláltuk. Egy napos stimulálás után a PHA-t friss tápközeg hozzáadásával
0,5 pg/ml koncentrációra hígítottuk, és három nap elteltével a tápközeget teljesen lecseréltük. A sejteket a citotoxicitási vizsgálatban való felhasználás előtt legalább napig szaporítottuk. A sejteket - a vPE16 esetében fentebb leírtak szerint - megfelelő rekombináns vacciniavírusokkal fertőztük. A fertőzési folyamatot komplett tápközegben további 3-4 óra hosszat hagytuk folytatódni, majd a sejteket centrifugálással összegyűjtöttük, és lxl07/ml sűrűségben újraszuszpendáltuk. U aljú mikrotitertálca - egyenként 100 pl komplett tápközeget tartalmazó - üregeibe a sejtszuszpenzió 100100 pl-ét adtuk, és kétszeres hígitású lépésekkel sorozathígítást készítettünk. A spontán krómizotóp-felszabadulás és az összes krómfelvétel mérése céljából mindegyik minta esetében két üregbe nem tettünk limfocitákat. A HeLa-S3-sejteket (HeLa-S3, ATCC) a fentebb leírtak szerint 10 cm-es csészékben vPElő-vacciniavektorral fertőztük. A csészékről - 1 mM EDTA-t tartalmazó foszfátpufferelt sóoldattal (PBS) - leválasztott
106 fertőzött sejtet lecentrifugáltuk és 37 °C-on egy órán át 100 pl 51Cr-nátrium-kromáttal (foszfátpufferelt sóoldatban 1 mCi/ml) újraszuszpendáltuk, majd PBS- 1 sel háromszor mostuk. Minden egyes üreghez a jelölt** 1 célsejtszuszpenzió 100 pl-ét adtuk, és a mikrotitertálcát* ) egy percig 750 χ g-vel centrifugáltuk. A felülúszóból 1
100 pl-es részleteket vettünk ki, és a radioaktivitást* i gamma-sugárszcintíllációs számlálóban mértük. Az e£ 1 fektor: célsejt arányt a sejtek - áramlási citometriával | megállapított - fertőzöttségi arányához korrigáltuk. I
A 22. ábrán a HIV-1 transzfektáns sejtvonalakban } bekövetkező replikációját mutatjuk be. A 293-as embe- ’ ri embrionális vesesejtvonal egy alvonalában olyan sejtvonalakat hoztunk létre, amelyek stabilan expresszálják a vad típusú CD-et és a különböző rekombináns kimérákat. A HIV-1 IIIB-izolátumából körülbelül lOtyml fertőzőképes részecske titerű vírusállományt hoztunk létre (a vírustitert indukátorként emberi C8166 T-sejtvonal alkalmazásával végzett végponthígítási vizsgálattal határoztuk meg). A sejteket 37 °C-on, hozzávetőleg
1-es fertőzési multiplicitással 8-12 óra hosszat fertőztük. A következő napon a sejteket foszfátpufferelt sóoldattal háromszor mostuk, tripszinnel kezeltük, új csészékre szélesztettük, és ezt 0. napnak tekintve a tényé- s szeri felülúszóból a p24-titer meghatározása céljából 3-4 naponként mintákat vettünk. A sejteket 100 pg/ml hígromicin-B-t tartalmazó - friss táptalajjal láttuk el. A tenyészeti felülúszók analízisét hagyományos ELISA-alapú HIV-l-p24-antigénvizsgáló reagenskészlet (Coulter) alkalmazásával, a gyártó útmutatásai szerint végeztük. A bemutatott eredmények két azonos időtartamú független kísérlet eredményeit ábrá- » zolják.
A 23. ábrán a CD4 (CD4 Bam) Dl-D4-doménjei- ~ nek nukleotidszekvenciáját (28. azonosító számú szek11
HU 221 603 Bl vencia) és aminosavszekvenciáját (29. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be.
A 24. ábrán a CD4 (CD4 Nhe) Dl-D2-doménjeinek nukleotidszekvenciáját (30. azonosító számú szekvencia) és aminosavszekvenciáját (31. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be.
A 25. ábrán az emberi IgGl (Igh23 Bam) csukló-, CH2-és CH3-doménjének nukleotidszekvenciáját (32. azonosító számú szekvencia) és aminosavszekvenciáját (33. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be.
A 26. ábrán a CD7 (TM7 Bam Mlu) transzmembrándoménjének nukleotidszekvenciáját (34. azonosító számú szekvencia) és aminosavszekvenciáját (35. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be.
A 27. ábrán a ζ-lánc (Zeta Mlu Nőt) intracelluláris doménjének nukleotidszekvenciáját (36. azonosító számú szekvencia) és aminosavszekvenciáját (37. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be.
A 28. ábrán egy szintetikus α-hélix nukleotidszekvenciáját (51. azonosító számú szekvencia) és aminosavszekvenciáját (52. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be.
1. példa
Emberi IgGl: receptor-kimérák előállítása
A Ch3-dómén szekvenciáit az antitest-mRNS transzmembrán alakjának 3’-végéből származó cDNSfragmenshez kapcsolva az emberi IgGl nehéz láncának szekvenciáit állítottuk elő. A 3’-végi fragmenst szubsztrátként (emberi) mandula-cDNS-könyvtár alkalmazásával végzett polimeráz láncreakcióval kaptuk, melynek során a következő láncindító oligonukleotidokat alkalmaztuk:
CGC GGG GTG ACC GTG CCC TCC AGC AGC TTG GGC (7. azonosító számú szekvencia);
CGC GGG GAT CCG TCG TCC AGA GCC CGT CCA GCT CCC CGT CCT GGG CCT CA (8. azonosító számú szekvencia);
melyek a kívánt DNS-fragmensek 5’-végének, illetve 3’-végének felelnek meg. Az 5’-végi oligonukleotid az emberi IgGl CHl-doménjében lévő szakasszal komplementer, míg a 3’-végi oligonukleotid a transzmembrándomént kódoló szekvenciáktól közvetlenül 5’irányban elhelyezkedő szekvenciával komplementer. A polimeráz láncreakció termékét BstXI és BamHI restrikciós enzimekkel emésztettük, és egy - variábilis és konstans régiókat tartalmazó - félszintetikus IgGlantitestet kódoló gén BstXI- és BamHI-helyei közé ligáltuk. A BstXI-BamHI-fragmens inszertálása után a konstrukció amplifikált részeit - restrikciós fragmenscserével - egészen a CH3-domén Smal-helyéig kicseréltük, miáltal a konstrukcióban csak az Smal-hely és a 3’-végi oligonukleotid közötti szakasz származott a polimeráz láncreakcióból.
Emberi IgGl: ζ-kimérareceptor előállítása érdekében a nehéz lánc génjét (amely BamHI-hellyel végződik) hozzákapcsoltuk a (lentebb leírt) ζ-kiméra BamHIhelyéhez, úgy, hogy az antitestszekvenciák képezzék az extracelluláris részt. A kimérát kódoló plazmiddal transzfektált COS-sejtek áramlási citometriával végzett vizsgálata azt mutatta, hogy egy könnyű lánc cDNS-ét kódoló expressziós plazmiddal végzett kotranszfekció esetén az antitestdeterminánsok jelentős mértékű expressziója következett be, míg a könnyű lánc expressziós plazmidjának hiányában az antitestdeterminánsok mérsékelt expressziója volt megfigyelhető.
A fentebb leírtak szerint, hagyományos molekuláris líthatók elő [pl. η- vagy γ-lánchoz (lásd később) vagy egy T-sejt-receptor vagy Fc-receptor-protein bármilyen szignáltranszdukáló részéhez fuzionált emberi IgGl].
A nehéz és könnyű láncok közös promoter irányítása alatt történő expresszióját elősegítő transzkripciós egység előállítása érdekében nehéz és könnyű láncot kódoló szekvenciákból és a 78 kD-os glükóz által szabályozott proteint (grp78 vagy BiP) kódoló mRNS 5’végi nem transzlálódó részéből egy kétcisztronos mRNS-t kódoló plazmidot állítottunk elő. A grp78szekvenciákat emberi genomi DNS-ből, a következő láncindító oligonukleotidok alkalmazásával, polimeráz láncreakcióval állítottuk elő:
CGC GGG CGG CCG CGA CGC CGG CCA AGA
CAG CAC (9. azonosító számú szekvencia);
CGC GTT GAC GAG CAG CCA GTT GGG CAG
CAG CAG (10. azonosító számú szekvencia).
A fenti oligonukleotidok az amplifikálni kivánt DNSfragmens 5’-, illetve 3’-végének felelnek meg. A polimeráz láncreakciókat 10% dimetil-szulfoxid jelenlétében vé- l geztük. A polimeráz láncreakcióval kapott fragmenst ' I·
Notl-gyel és HincII-vel emésztettük, és az emberi f
IgGl kódolószekvenciájától 3’-irányban lévő NotI- és |
Hpal-helyek közé inszertáltuk. Ezután az emberi IgG í kappa könnyű láncának cDNS-ét - a HincII-hely és a vektor egy másik helyének felhasználásával - a grp78 vezetőszekvenciájától 3’-irányba inszertáltuk,
A kapott expressziós plazmid a következő komponenseket tartalmazta: a félszintetikus nehézlánc-gént, a grp78vezetószekvenciákat, a kappa könnyű lánc cDNS-szekvenciáit, valamint egy SV40-DNS-fragmensből származó poliadenilációs szignálokat. A COS-sejtek fenti expressziós plazmiddal végzett transzfektálása - a csak nehézlánc-determinánsokat kódoló plazmiddal végzett transzfekcióhoz viszonyítva - jelentős mértékben fokozta a nehézlánc-determinánsok expresszióját.
A nehézlánc/receptor kimérát és egy könnyű láncot tartalmazó kétcisztronos gén előállítása céljából az 5’oldali nehézlánc-szekvenciák bármilyen - találmány szerinti - nehézlánc/receptor kiméragénnel helyettesíthetők.
2. példa
CD4-receptor-kimérák előállítása
Emberi ζ-cDNS-t [Weissman és munkatársai:
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 9709 (1988)] és γcDNS-t [Küster és munkatársai: J. Bioi. Chem. 265,
6448 (1990)] HPB-ALL-tumorsejtvonalból [Aruffo és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 8573 (1987)] és emberi természetes „killer”-sejtekből készí- j= tett cDNS-könyvtárból, polimeráz láncreakcióval izoláltunk, míg a η-cDNS-t [Jin és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 3319 (1990)] egér-timuszsejt12
HU 221 603 BI könyvtárból izoláltuk. A ζ-, η- és γ-cDNS-t a CD4 egy génsebészeti módszerekkel manipulált - a transzmembrándoméntől közvetlenül 5’-irányban BamHI-helyet tartalmazó - alakjának extracelluláris doménjéhez kapcsoltuk [Aruffo és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 8573 (1987); Zettlmeissl és munkatársai: DNA Cell Bioi. 9, 347 (1990)], amely a ζ- és η-cDNSben természetes állapotban - a transzmembrándoméntől 5’-irányban néhány nukleotid távolságra - hasonló helyen jelen lévő BamHI-helyhez volt kapcsolva (1., 3., 4. és 6. azonosító számú szekvenciák). A y-lánccal alkotott fúziós protein kialakítása céljából a szekvencia hozzávetőleg ugyanazon helyére egy BamHI-helyet inszertáltunk (1. ábra; 2. és 5. azonosító számú szekvencia). A génfúziókat - szelektálható markéiként E. coli gpt-gént tartalmazó - vacciniavírus expressziós plazmidba vittük be és homológ rekombináció alkalmazásával a vaccinia WR-törzs genomjába inszertáltuk, és mikofenolsawal szaporodásra szelektáltuk [Falkner és munkatársai: J. Virol. 62, 1849 (1988); Boyle és munkatársai: Gene 65, 123 (1988)]. Áramlási citometriás vizsgálattal kimutattuk, hogy a rekombináns vacciniavirusok a sejt felületén 0Ε)4:ζ és a CD4:y fúziós protein bőséges termelődését eredményezik, míg a CD4: η expressziója lényegesen kisebb mértékű (lb. ábra). Ez az utóbbi felismerés összhangban van azzal a cikkel, amelyben leírják, hogy egy η-cDNS expressziós plazmid egérbibridóma-sejtvonalba történő transzfektálása lényegesen kisebb expressziót eredményezett, mint egy hasonló ζ expressziós plazmiddal végzett transzfekció [Clayton és munkatársai: J. Exp. Med. 172, 1243 (1990)]. A rekombináns vacciniavírusokkal fertőzött sejtek immunprecipitációja azt mutatta, hogy a fúziós proteinek - a természetes CD4-antigéntől eltérően kovalens kötésű dimereket alkotnak. A monomer CD4.C, és CD4:y fúziós protein, valamint az eredeti CD4 molekulatömege 63, 55, illetve 53 kD volt. A fúziós proteinek nagyobb molekulatömege nagyjából összhangban van az intracelluláris rész nagyobb hosszúságával, ami a Ο34:ζ esetében 75 aminosawal, a CD4:y esetében pedig 5 aminosawal haladja meg az eredeti CD4 intracelluláris részének hosszát.
3. példa
A CD4-kimérák asszociálódhatnak más receptorláncokkal
Az emberi FcyRIII (CD 16τμ) makrofág/természetes, Jriller”-sejt alakjának transzfektánsokon bekövetkező sejtfelületi expresszióját az egér γ-lánccal [Kurosaki és munkatársai: Natúré 342, 805 (1989)] vagy emberi γ-lánccal [Hibbs és munkatársai: Science 246, 1608 (1989)], valamint emberi ζ-lánccal [Lanier és munkatársai: Natúré 342, 803 (1989)] végzett kotranszfekcióval segítjük elő.
Áz említett hivatkozásokkal összhangban áll, hogy a kimérák expressziója lehetővé tette a CD16tm felületi expresszióját is, ha azt kotranszfekcióval vagy rekombináns vacciniavírusokkal végzett együttes fertőzéssel juttattuk be a célsejtbe (2. ábra). A vizsgált sejtvonalakban a ζ nagyobb mértékben segítette a CD16™ felületi expresszióját, mint a y (2. ábra), míg az eredeti CD4 nem növelte azt.
4. példa
Az Asp-Q-mutánsok nem asszociálódnak az Fc-receptorral
Létező antigén- vagy Fc-receptorokkal nem asszociálódó kimérák létrehozása érdekében olyan mutáns ζ fúziós proteineket állítottunk elő, amelyekből hiányzott a membránban lévő aszparaginsav (Asp) vagy a membránban lévő cisztein (Cys) (vagy mindkettő). Áramlási citometriás vizsgálattal kimutattuk, hogy a különböző mutáns kimérák által biztosított sejtfelületi expresszió intenzitása nem különbözött észrevehetően a nem mutáns kiméra által biztosított expresszió intenzitásától. Ezenfelül, az immunprecipitációs vizsgálatokkal megállapítottuk, hogy a kimérák által biztosított összes expresszió hasonló volt. A várakozásnak megfelelően a membránban lévő ciszteint nem tartalmazó mutáns kimérák nem képeztek diszulfidkötésű dimereket. Az aszparaginsavat nem tartalmazó két mutáns kiméra nem segítette elő a CDIÓjm felületi expresszióját, míg a ciszteint nem, de aszparaginsavat tartalmazó monomer kimérák lehetővé tették a CD16jm együttes expresszióját, de kisebb hatékonysággal, mind az eredeti dimer (3. ábra).
5. példa
A mutáns receptoroknak megmarad a kalciumreakciót beindító képességük
Annak meghatározása érdekében, hogy a fúziós pro-» teinek keresztkötődése - a T-sejt-antigénreceptor esetében megfigyelhetőhöz hasonló módon - lehetővé teszi-e a szabad intracelluláris kalcium felhalmozódását, a .Jurkat E6” emberi T-sejt leukémia-sejtvonal (ATCC ΤΠ3 152; American Type Culture Collection, Rockville, MD) sejtjeit a rekombináns vacciniavírusokkal fertőztük, és az extracelluláris dómén antitesttel bekövetkező keresztkötődése után mértük a citoplazma relatív kalciumkoncentrációját. Az „Indo-1” kalciumérzékeny festékkel [Grynzkiewicz és munkatársai: J. Bioi. Chem. 260, 3340 (1985); Rabinovitch és munkatársai: J. Immunoi. 137, 952 (1986)] töltött sejtekkel áramlási citometriai vizsgálatot végeztünk. A 4a-4d. ábrákon a CD4^val és a ζ Asp- és Cys- mutánsaival fertőzött sejtekkel végzett kalciumáram-kísérletek eredményeit mutatjuk be. A kimérák keresztkötődése reprodukálhatóan fokozta az intracelluláris kalcium koncentrációját. A fertőzött sejtekben a CD4:q és a CD4:y szintén elősegítette az intracelluláris kalcium felhalmozódását. A ,Jurkat”sejtek felületükön kevés CD4-et expresszálnak, azonban az eredeti CD4 keresztkötődése - Ο16:ζ jelenlétében és hiányában egyaránt - nem változtatja meg az intracelluláris kalciumszintet (4a. és 4b. ábra).
6. példa
A CD4.fi-, CD4:x\- és CD4:y-kimérákaHIVgpl20/41-et expresszáló célsejtek citolízisét közvetítik
Annak meghatározása céljából, hogy a kimérareceptorok beindítják-e a citolitikus effektorprogramo13
HU 221 603 Bl kát, a HIV-gpl20/41-komplex CD4 által történő felismerésén alapuló „target:effektor” rendszer modellt hoztunk létre. „HeLa”-sejteket - gpl20/41-et expresszáló - rekombináns vacciniavirusokkal [Chakrabarti és munkatársai: Natúré 320, 535 (1986); Earl és munkatársai: J. Virol. 64, 2448 (1990)] fertőztünk, és a sejteket 5,Cr-izotóppal jelöltük. A jelölt sejteket emberi allospecifikus (CD8+, CD4-) citotoxikus T-limfocita-sejtvonallal inkubáltuk, melyet - ϋΟ4:ζ-, CD4: η-vagy CD4:y-kimérát, vagy a kétszeresen mutáns CD4: ζϋγβΐ lGly: Aspl5Gly-kimérát expresszáló - rekombináns vacciniavirusokkal fertőztünk. Az 5a-5c. ábrákon azt mutatjuk be, hogy a gpl20/41-et expresszáló „HeLa”-sejteket a CD4-kimérákat expresszáló citotoxikus T-limfociták (CTL) specifikusan lizálták. A nem fertőzött ,JHeLa”-sejteket a CD4^-kimérákkal ellátott citotoxikus T-limfociták nem támadták meg, és a gpl20/41-et expresszáló „HeLa”-sejteket a nem fertőzött CTL-ek nem ismerték fel. A különböző kimérák hatékonyságának összehasonlítása céljából a CD4-kimérákat expresszáló CTL-frakció, illetve a gpl20/41-et expresszáló „HeLa”-frakció esetében - áramlási citometriával kapott eredmények alapján - korrigáltuk az effektor: célsejt arányt. Az 5c. ábrán - az 5a. és 5b. ábrán bemutatott citolízises kísérletben alkalmazott - citotoxikus T-limfociták CD4-expressziójának citometriás vizsgálatának eredményeit mutatjuk be. Bár a felületi CD4: ζ átlagos sűrűsége jelentős mértékben meghaladta a CD4:p átlagos sűrűségét, az e kimérákat expresszáló sejtek citolitikus hatékonysága hasonló volt. A gpl20-at expresszáló célsejtek arányának megfelelő korrekcióval a CD4^- és CD4: η-protein által közvetített citolízis hatékonysága hasonló volt a specifikus T-sejt-receptor célsejt:effektor párok esetében leírt legjobb eredményekhez [a Ο34:ζ-ί expresszáló T-sejtek általi 50%-os felszabadítás esetében az átlagos effektor:célsejt arány l,9±0,99 volt (n=10)]. A CD4:y-fuzió kevésbé volt aktív, mint a transzmembrán aszparaginsavat és ciszteint nem tartalmazó CD4: ζ-fuzió, azonban mindkét esetben jelentős mértékű citolizist tapasztaltunk (5b. és 5c. ábra).
Annak ellenőrzése érdekében, hogy a vacciniafertőzés elősegítheti-e a citotoxikus T-limfociták által bekövetkező mesterséges felismerést, a CD16 foszfatidilinozitollal kapcsolt alakját (CD16PI) expresszáló rekombináns vacciniavírussal fertőzött és 51Cr-izotóppal jelölt célsejtekkel, illetve CD16prt vagy CD16^-t expresszáló kontroll rekombináns vírusokkal fertőzött citotoxikus T-limfocitákkal hasonló citolízises kísérleteket végeztünk. A 6a. ábrán látható, hogy a nem CD4kimérákat expresszáló T-sejtek nem ismerik fel az eredeti HeLa-sejteket, illetve a gpl20/41-et expresszáló HeLa-sejteket, és hasonlóan, a CD4-kimérákat expresszáló T-sejtek nem ismerik fel a vacciniavirus által kódolt egyéb felületi proteineket expresszáló HeLasejteket. Ezenfelül, a nem kiméra CD4-et expresszáló citotoxikus T-limfociták nem lizálják jelentős mértékben a gpl20/41-et expresszáló HeLa-sejteket (6a. ábra).
7. példa
Az MHCII. osztályú antigéneket hordozó sejteket a kimérák nem támadják meg
Úgy véljük, hogy a CD4 egy MHC Π. osztályú antigén által expresszált, nem polimorf szekvenciával lép kölcsönhatásba [Gay és munkatársai: Natúré 328, 626 (1987); Sleckman és munkatársai: Natúré 328, 351 (1987)]. Annak ellenére, hogy tisztított proteinek esetében CD4 és MHC II. osztályú antigén közötti specifikus interakcióról nem számoltak be, a CD4-et expresszáló sejtek és az MHC II. osztályú molekulákat expresszáló sejtek között - bizonyos feltételek mellett adhézió mutatható ki [Doyle és munkatársai: Natúré
330, 256 (1987); Clayton és munkatársai: J. Exp. Med.
172, 1243 (1990); Lamarre és munkatársai: Science
245, 743 (1989)]. Következő kísérletünkkel azt vizsgáltuk, hogy az MHC II. osztályú antigéneket hordozó sejtek elpusztítása kimutatható-e. A 6b. ábrán látható, hogy a CD4: ζ a - nagy mennyiségű MHC II. osztályú antigént expresszáló - Raji-B-sejtvonal ellen nem indukál specifikus citolizist. Bár az MHC H~ Raji-sejtvonal [RJ2.2.5; Accola: J. Exp. Med. 157,1053 (1983)] esetében megfigyeltünk némi citolizist (5%-nál kisebb mértékben), ezek a sejtek hasonló érzékenységet mutatnak, mint a nem fertőzött T-sejtekkel inkubált Raji-sejtek.
8. példa
Szekvenciára vonatkozó követelmények a T-sejt-an- f tigén/Fc-receptor-zéta lánc általi citolízis indukció- í jóhoz 5
Bár a CD4 és a ζ-lánc alkotta kimérák képesek a ci- | totoxikus T-limfocitákat (CTL) HIV-gpl20-at exp·* | resszáló célsejtek elpusztítására indukálni, az emberi
T-sejtvonalakba bevitt ζ-kimérák tulajdonságainak egyértelmű összehasonlítása céljából a CD4 alternatíváját kerestük. Az emberi T-sejtvonalak képesek a CD4 expresszálására, ami megnehezíti a kalciummobilizáció típusa vagy mértéke, illetve a különböző kimérák citotoxikus potenciálja közötti kapcsolat specifikus meghatározását. Ennek kiküszöbölése érdekében ζ-láncból és
CDI 6-ból álló kimérákat állítottunk elő, amelyekben a
CD16 extracelluláris doménjét a ζ transzmembrán és intracelluláris szekvenciáihoz vannak kapcsolva (7a. ábra). A fuzionált géneket - szelektálható markerként E. coli gpt-gént hordozó - vacciniavirus expressziós plazmidba foglaltuk, és homológ rekombinációval a vaccinia WR-tÖrzs genomjába inszertáltuk, majd a rekombináns vírusokat mikofenolsav jelenlétében mutatott szaporodásra szelektáltuk [Falkner és
Moss: J. Virol. 62, 1849 (1988); Boyle és Coupar:
Gene 65,123 (1988)].
A rekombináns vacciniavirusokkal T-sejtvonalákat fertőztünk, és az extracelluláris domének antitestekkel létrejött keresztkötése után mértük a citoplazma relatív szabad kalciumion-koncentrációját. Az „Indo-1” festékkel töltött sejtekkel sejtpopuláció szinten spektrofotometriás, az egyes sejtek szintjén pedig áramlási citomet- í riás méréseket végeztünk [Grynkiewicz és munkatársai: J. Bioi. Chem. 260, 3440 (1985); Rabinovitch és <
munkatársai: J. Immunoi. 137, 952 (1986)]. A 7b. áb14
HU 221 603 Bl rán a CD16^ fúziós proteint expresszáló rekombináns vacciniavírusokkal fertőzött Jurkat-sejtvonal sejtjeiből összegyűjtött adatok analízisének eredményeit mutatjuk be. A kimérák keresztkötése reprodukálhatóan fokozta az intracelluláris kalciumion-koncentrációt, míg 5 a nem kiméra CD16-ot expresszáló sejtekkel végzett hasonló kezelés hatástalan (vagy csak kis hatású) volt. Ha a kimérát antigénreceptor nélküli mutáns sejtvonalakban expresszáltuk, mint például a REX33A [Breitmeyer és munkatársai: J. Immunoi. 138, 726 (1987); 10 Sancho és munkatársai: J. Bioi. Chem. 264, 20760 (1989)] vagy a mutáns JRT3.T3.5 Jurkat-sejtvonal [Weiss és munkatársai: J. Immunoi. 135, 123 (1984)], a CD16-antitest keresztkötésére erőteljes reakciót figyeltünk meg. Hasonló adatokat kaptunk a REX20A mutáns sejtvonalra [Breitmeyer és munkatársai, lásd fentebb; Blumberg és munkatársai: J. Bioi. Chem. 265, 14036 (1990)], valamint a laboratóriumunkban létrehozott CD3/TÍ negatív mutáns Jurkat-sejtvonalra.
A CD16^-t expresszáló rekombináns vírusokkal vég- 20 zett fertőzés nem állította helyre az anti-CD3-antitestre adott reakciót, ami azt mutatja, hogy a fúziós protein nem az intracelluláris CD3-komplex-láncok kiszabadításával fejti ki hatását.
A kimérák sejt közvetítette immunitást irányító ké- 25 pességének értékelése céljából citotoxikus T-limfocitákat CD16-kimérákat expresszáló rekombináns vacciniavírusokkal fertőztünk, és a fertőzött T-sejteket membránkötött anti-CD16-antitesteket expresszáló hibridómasejtek specifikus lízisére alkalmaztuk. Ez a vizs- 30 gálát az eredetileg Fc-receptorokat hordozó sejtek effektormechanizmusának vizsgálatára kifejlesztett hibridóma-citotoxicitási vizsgálat [Graziano és Fanger: J. Immunoi. 138, 945 (1987); Graziano és Fanger: J. Immunoi. 139, 35 (1987); Shen és munkatársai: Mól. lm- 35 munol. 26, 959 (1989); Fanger és munkatársai: Immunoi. Today 10, 92 (1989)] kiterjesztett változata.
A 8b. ábrán az látható, hogy a CD16^ citotoxikus Tlimfocitákban lezajló expressziója elősegíti, hogy a CTL-ek elpusztítsák a 3G8 hibridómasejteket (anti- 40 CD16; Fleit és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79, 3275 (1982)], miközben a CD16 foszfatidilinozitol-kötött alakját expresszáló citotoxikus T-limfociták inaktívak. A CD16^-ot hordozó CTL-ek a nem releváns antitestet expresszáló hibridómasejteket nem 45 pusztítják el.
A citolizishez szükséges minimális ζ-szekvenciák azonosítása céljából deléciós mutánsok sorozatát állítottuk elő, melyekben a C-terminálisról a ζ-lánc intracelluláris doménjének (44. azonosító számú szekvencia) egy- 50 re nagyobb részei vannak eltávolítva (8a. ábra). A ζlánc legnagyobb része eltávolítható anélkül, hogy a citolitikus hatást jelentősen károsítanánk; a teljes hosszúságú CD16 ^-kiméra hatékonysága lényegében azonos volt a 65. aminosavig deletált kiméra (CD16: ζΑδρόό*) 55 hatékonyságával (lásd 8b. ábra). A citotoxicitás hasonló csökkenését eredményezte a ζ-lánc 59. aminosaváig végrehajtott deléció (CD16^Glu60*), míg az 50. aminosavig történő deléció némileg kisebb aktivitást eredményezett. Mindazonáltal, az aktivitás teljes megszűnő- 60 sét akkor sem tapasztaltuk, ha az intracelluláris domént csupán három aminosavból álló transzmembránhorgonyra („anchor”) rövidítettük (8b. ábra).
Mivel a ζ egy diszulfidkötésű dimer, a citolitikus aktivitás fennmaradásának egyik magyarázatát az adja, hogy az endogén ζ a deléciós ζ-kimérával heterodimereket képez, helyreállítva ezáltal az aktivitást. Ezen elmélet igazolása céljából a ζ-lánc 11. aszparaginsavát és 15. ciszteinjét glicinnel helyettesítettük (CysllGly/Aspl5Gly), és a következők szerint immunprecipitációt végeztünk Szérummentes DME-tápközegben hozzávetőleg 2xl06 CVl-sejtet egy órán át - legalább 10-es fertőzési multiplicitással (, jnultiplicity of infection”; moi) rekombináns vacciniavirussal fertőztünk. A sejteket a fertőzés után 15 6-8 órával, 1 mM EDTA-t tartalmazó foszfátpufferelt sóoldattal (PBS) leválasztottuk a tálcákról, és felületükön - laktoperoxidáz és hidrogén-peroxid alkalmazásával, Clark és Einfeld eljárásával [„Leukocyte Typing II”, 155. olásd, Springer-Verlag, NY (1986)] 2χ 106 sejtre vonatkoztatva 0,2 mCi 125I-izotóppal jelöltük A jelölt sejteket centrifügálással összegyűjtöttük és a következő összetételű oldatban lizáltuk: 1% NP-40;
0,1% SDS; 0,15 M NaCl; 0,05 M Tris-puffer (pH=8,0);
mM MgCl2; 5 mM KC1; 0,2 M jód-acetamid és 1 mM PMSF. A sejtmagokat centrifugálással eltávolítottuk és a CD16-proteineket - 3G8-antitest [Fleit és munkatársai, lásd fentebb; Medarex] és anti-egér-IgG-agaróz (Cappel, Durham, NC) alkalmazásával - immunprecipitációnak vetettük alá. A mintákat 8%-os poliakrilamid/SDS-gélen, nem redukáló feltételek mellett, vagy más módon, 10%-os gélen, redukáló feltételek mellétt é elektroforizáltuk. Az immunprecipitációs vizsgálat eredményei igazolták hogy a CD16^CysllGly/Aspl5Glykiméra nem diszulfidkötésű dimerként asszociálódik.
A mutáns receptorok citolitikus aktivitását is teszteltük. A 65. aminosavig deletált mutáns kiméra (CD16^CysllGly/Aspl5Gly/Asp66*) a citolízisvizsgálatban - a vizsgálat körülményeitől függően - 2-8szor kisebb aktivitást mutatott, mint a hasonló deletált, de nem mutáns kiméra (CD16: ζΑβρ66·), ami aktivitásban nem különböztethető meg a CD16^-tól (9b. ábra).
A mutáns kimérák aktivitásában megfigyelhető csökkenés hasonlít a hasonló szerkezetű CD4-kimérák (lásd fentebb) aktivitásában tapasztalható csökkenéshez, és valószínű, hogy a ζ-monomerek dimerekhez viszonyított kisebb hatékonyságának tudható be. Ezzel szemben, az 59. aminosavig deletált, Asp-, Cys- mutáns kiméra nem mutat citolitikus aktivitást (lásd 9b. ábra), ami megerősíti azt a hipotézist, hogy az egyéb láncokkal létrejött - a transzmembrán Cys és/vagy Asp által közvetített - asszociáció volt felelős a 65. aminosav előtti aminosavakat is érintő deléciós kimérák citolitikus aktivitásának csekély mértékű fennmaradásáért.
Az áramlási citometriás vizsgálatok azt mutatták, hogy a transzmembrán aszparagint és ciszteint nem tartalmazó deléciós mutánsok TCR- mutáns Jurkat-sejtvonalban keresztkötést képző antitestre reagálva előse- g gíthetik a szabad kalciumion-koncentráció növekedését (9d. ábra). Az eredeti Jurkat-sejtvonalban expresszál- r tatott kimérák esetében is hasonló eredményeket kap15
HU 221 603 Β1 tünk. A CD16^CysllGly/Aspl5Gly/Glu60* esetében a kapott adatok azt bizonyítják, hogy a kalciumérzékenység közvetítésének képessége mutációs szempontból elválasztható a citolízist elősegítő képességtől.
A ζ transzmembrán aminosavainak aktivitást elősegítő esetleges hatásának kiküszöbölése érdekében a ζ-lánc transzmembrán aminosavait és citoplazmikus részének első 17 aminosavát a CD5-, illetve a CD7-antigén transzmembrán aminosavaival, valamint citoplazmikus részének első 14 (CD5), illetve első 17 (CD7) aminosavával helyettesítettük. A három részből álló fúziós proteinek [CD16:5: ζ(48-65) és CD16:7: ζ(48-65)] - az egyszerűbb CD16^-kimérákkal ellentétben - nem képeznek diszulfidkötésű dimereket, mivel ζ-láncuk transzmembrándoménjéből hiányzik a cisztein. Jutkát- és TCR- sejtekben mindkét háromrészes kiméra képes volt mobilizálni a kalciumionokat (9d. ábra), valamint citotoxikus T-limfocitákban citolitikus reakciót indukálni (9c. ábra;, illetve az adatokat nem mutatjuk be), azonban a (ΖΧ)16:7:ζ(48-59) fúziós proteinben a ζ-lánc 59. aminosavig történő lerövidítése megszünteti a fúziós protein azon képességét, hogy TCR- és TCR+ Jurkat-sejtekben kalciumérzékenységet váltson ki, illetve, hogy érett citotoxikus T-limfocitákban citolízist indukáljon (9c. és 9d. ábra;, illetve az adatokat nem mutatjuk be).
A18 aminosavas motívumon belüli aminosavak aktivitásban betöltött szerepének vizsgálata céljából helyspecifikus mutációval számos mutánsváltozatot állítottunk elő, és ezeket - a kimérareceptor kis mennyiségben (10a. és lOd. ábra), illetve nagy mennyiségben (10b. és lOe. ábra) történő expressziója esetében - receptor közvetítette sejtpusztítást közvetítő képességükre vizsgáltuk. A 10a-lOf. ábrákon azt mutatjuk be, hogy - miközben az 59-63. aminosavakat érintő több konzervatív szubsztitúció (azaz a savas aminosavak rokon amidjaikkal, illetve a tirozin fenil-alaninnal történő helyettesítése) a citolitikus hatékonyság mérsékelt csökkentését eredményezte - a mutánsváltozatok általában megtartották kalciummobilizációs képességüket. Ezek az aminosavak együttesen egy lényeges almotivumot képeznek, mivel deléciójuk megszünteti a citolitikus aktivitást. A 62. tirozin fenil-alaninnal vagy szerinnel történő szubsztitúciója mind a citotoxikus, mind a kalciummobilizációs aktivitást megszüntette. A 18 aminosavas szegmens N-terminálisán az 51. tirozin fenilalaninnal végzett szubsztitúciója szintén megszüntette mindkét aktivitást, míg az 50. leucin szerinnel végzett helyettesítése megszüntette a kalciumreakciót, de csak részlegesen károsította a citotoxikus aktivitást. Feltételezzük, hogy a rövid idejű áramlási citometriás vizsgálatban a Leu50Ser-mutáns kalciummobilizációs aktivitásának hiánya nem tükrözi teljes mértékben azon képességét, hogy a hosszabb időtartamú citolízises vizsgálatban az intracelluláris kalciumszint jelentős mértékű növekedését eredményezi. Néhány citolitikus T-sejtvonal esetében azonban kalciumra nem érzékeny citolitikus aktivitásról számoltak be, és nincs kizárva annak lehetősége, hogy az általunk leírt eredmények alapját is hasonló jelenség képezi. A 48. aszparagin szerinnel történő helyettesítése néhány kísérletben részlegesen károsította a citotoxicitást, más kísérletekben azonban alig volt hatása.
A felesleges szekvenciaelemek potenciális szerepének vizsgálata céljából a ζ intracelluláris doménjét három szegmensre osztottuk, amelyek a 33-65., 71-104., illetve 104-138. aminosavakból álltak Mindhárom szegmenst (külön-külön) - a CD7 intracelluláris doménjének alapmembrán-kihorgonyzó szekvenciáitól közvetlenül disztálisan bevitt Mlul-hely segítségével - CD16 .CD7 kimérához kapcsoltuk (lásd később; 11a. ábra). A három elem citolitikus hatékonyságának összehasonlítása azt mutatta, hogy lényegében azonos hatásúak (11b. ábra). Az aminosavszekvenciák összehasonlítása alapján megállapítható, hogy a második szekvencia a tirozinok között 11 aminosavat tartalmaz, míg az első és harmadik szekvencia csak tizet.
Bár a T-sejt-aktiválás folyamatának pontos értékelése még nem történt meg, világos, hogy az antigénreceptor vagy a ζ-lánc intracelluláris szekvenciáit tartalmazó kimérák - aggregációja indítja be a kalciumion-mobilizációt, a citokin- és granulumfelszabadulást, valamint az aktiválás sejtfelületi markereinek megjelenését. A ζ-lánc aktív helye (amely lineáris peptidszakasz feltehetően túl rövid ahhoz, hogy saját enzimatikus aktivitása legyen) a celluláris aktiválás céljából valószínűleg egy - vagy legfeljebb néhány - proteinnel lép kölcsönhatásba. Nyilvánvaló az is, hogy a szabad kalciumionok mobilizációja önmagában nem elég a celluláris aktiváláshoz, mivel a citolízist közvetítő képesség mutációs szempontból elválasztható a kalciumfelhalmozódást közvetítő képességtől.
A ζ-lánc intracelluláris doménjéből származó. 18 aminosav két - nem rokon - protein transzmembrán és intracelluláris doménjéhez történő hozzáadása lehetővé teszi, hogy a kapott kimérák citolitikus aktivitást fejtsenek ki azon célsejtekkel szemben, amelyek hozzákötődnek a fúziós proteinek extracelluláris részéhez. Bár a 18 aminosavas fragmenst hordozó kimérák aktivitása hozzávetőleg nyolcszor kisebb, mint a teljes hosszúságú ζ-láncot tartalmazó kiméráké, a csökkent aktivitás a transzmembrán kölcsönhatások megszűnésének tulajdoníthatók, amelyek normális esetben lehetővé teszik a vad típusú ζ-láncok számára, hogy diszulfidkötésű dimereket képezzenek. A deléciós ζ-láncot tartalmazó konstrukciók, amelyek azonos C-terminálist tartalmaznak, mint a 18 aminosavas motívum, és nem tartalmaznak ciszteint és aszparaginsavat, jellemzően alig mutatnak kisebb aktivitást, mint azok a kimérák, amelyek csak a 18 aminosavas motívumot tartalmazzák.
A citolitikus aktivitásban szerepet játszó elem, amelyre figyelmünket összpontosítottuk, két tirozint tartalmaz, és nem tartalmaz szerint vagy treonint, ami korlátozza a foszforiláció aktivitáshoz való esetleges hozzájárulását. Bármelyik tirozin mutációja megszünteti az aktivitást, és annak ellenére, hogy az előzetes kísérletekben a 18 aminosavas motívumot tartalmazó felületi kiméraantigének keresztkötésképzése után jelentős mértékű tirozinfoszforilációt nem mutattunk ki, az ilyen foszforiláció aktivitásban játszott csekély szerepének le16
HU 221 603 Bl hetőségét nem zárhatjuk ki. A két tirozmnal kapcsolatos hatásokon kívül a 18 aminosavas szakasz N- és Cterminálisán végrehajtott több aminosavszubsztitúció csökkenti az aktivitást (kis receptordenzitásnál).
Több transzmembránprotein (köztük a CD3-delta és -gamma, a felületi IgM-mel asszociált mbl és B29, valamint a nagy affinitású IgE-receptor, az FceRI [Reth: Natúré 338, 383 (1989)] β- és γ-lánca) citoplazmikus doménjében a ζ-lánc aktív motívumához hasonló szekvenciák találhatók. Bár az ilyen szekvenciák funkciója bizonytalan, hatékony expresszió esetében mindegyik képes lehet az önálló T-sejt-aktiválásra, és az ilyen aktivitás magyarázatot adhat a ζ-negatív mutáns sejtvonalban megfigyelhető maradék TCR-érzékenységre [Sussman és munkatársai: Cell 52, 85 (1988)].
A ζ-lánc önmaga három ilyen szekvenciát tartalmaz, melyek egymástól hozzávetőleg azonos távolságban helyezkednek el. Az intracelluláris dómén három részre történő hasítása azt mutatja, hogy mindhárom szekvencia képes citolitikus reakció beindítására. A ηláncból, amely a ζ-lánc egy összeillesztési („splicing”) izoalakja [Jin és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 3319 (1990); Clayton és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 5202 (1991)], hiányzik a harmadik motívum C-terminális fele. Mivel az első motívum C-terminális felének eltávolítása megszünteti az aktivitást, valószínűnek tűnik, hogy a η-lánc biológiai aktivitásának nagyobb hányada az első két motívumnak tulajdonítható. Bár a η-lánc az antigén közvetítette citokinfelszabadítás [Bauer és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 3842 (1991)] és a visszaállított citolízis (lásd fentebb) elősegítésében ugyanolyan aktivitású, mint a ζ-lánc, a η receptorstimuláció hatására nem foszforilálódik [Bauer és munkatársai, lásd fentebb]. Ilyenformán, vagy mindhárom motívum jelenléte szükséges a foszforilációhoz, vagy a harmadik motívum egy meghatározatlan tirozin kináz számára kedvező szubsztrátot képez.
9. példa
Az emberi Fc-receptor által kiváltott citolitikus szignáltranszdukció
A különböző emberi Fc-receptor-altípusok hatásának értékelése céljából olyan kiméramolekulákat állítottunk elő, amelyekben az emberi CD4-, CD5- vagy CD16-antigén extracelluláris doménjét az FcRIIyÁ, -Bl, -B2 vagy -C altípus [nevezéktant lásd: Ravetch és Kínét: Ann. Rév. Immunoi. 9, 457 (1991)] intracelluláris doménjéhez kapcsoltuk Közelebbről, a fentebb leírt FcRILA-, FcRIIBl- és FcRIIB2-izoalakok transzmembrán és citoplazmikus doménjének megfelelő cDNSszekvenciákat a PC23-klőnból vagy - hagyományos eljárásokkal előállított - emberi mandula eredetű cDNSkönyvtárból, a következő szintetikus láncinditó oligonukleotidok alkalmazásával amplifikáltuk:
CCC GGA TCC CAG CAT GGG CAG CTC TT (18. azonosító számú szekvencia; FcRII-A „forward” láncindító);
CGC GGG GCG GCC GCT TTA GTT ATT ACT GTT GAC ATG GTC GTT (19. azonosító számú szekvencia; FcRII-A reverz láncinditó); GCG GGG GGA TCC CAC TGT CCA AGC TCC CAG CTC TTC ACC G (20. azonosító számú szekvencia; FcRII-Bl és FcRII-B2 „forward” láncinditó);
GCG GGG GCG GCC GCC TAA ATA CGG TTC TGG TC (21. azonosító számú szekvencia; FcRIIB1 és FcRII-B2 reverz láncindító).
Ezek a láncindítók BamHl, illetve Notl felismerési helyeket tartalmaznak. Közvetlenül a Notl-hely után antiszensz stopkodon (CTA vagy TTA) található. Mindegyik láncinditó 18, a kívánt fragmensek 5’- vagy 3’végével komplementer nukleotidot tartalmaz. Az FcRIIA-izoalaktól csak a 268. aminosavban eltérő (P helyett L) FcRHyC citoplazmikus doménjének megfelelő cDNS-ffagmenst átfedéses polimeráz láncreakcióval végzett helyspecifikus mutagenezissel, a következő láncindítók alkalmazásával állítottuk elő:
TCA GAA AGA GAC AAC CTG AAG AAA CCA ACA A (22. azonosító számú szekvencia); és TTG TTG GTT TCT TCA GGT TGT GTC TTT CTG A (23. azonosító számú szekvencia).
A polimeráz láncreakcióval kapott fiagmenseket CD 16, illetve CD4 extracelluláris domént kódoló» DNS-t tartalmazó - vacciniavirus expressziós plazmidokba inszertáltuk, majd a timidin-kináz-lókusznál végzett rekombinációval vad típusú vacciniavirusba inszertáltuk, és a vírusokat a kívánt rekombinánsok azonosítása céljából E. coli gpt-gén kointegrációjára szelektál-* tűk. Az izoalakok azonosságát (lásd 12. ábra) didezoxiszekvenálással igazoltuk.
A kimérareceptor-proteinek termelődését immun-> precipitációs vizsgálatokkal is ellenőriztük. Szérum* mentes IMDM-tápközegben hozzávetőleg 107 JRT3.T3.5-sejtet egy órán át rekombináns vacciniavírussal, legalább tízes fertőzési multiplicitással (moi) fertőztünk. A fertőzés után 12 órával a sejteket összegyűjtöttük, és a laktoperoxidáz/glükóz oxidázos eljárással (Clark és Einfeld, lásd fentebb) felületükön - 107 sejtre vonatkoztatva - 0,5 mCi 125I-izotóppal jelöltük. A jelölt sejteket centrifugálással összegyűjtöttük és 1% NP40-et, 0,1 mM MgCl2-ot, 5 mM KCl-ot, 0,2 M jódacetamidot és 1 mM PMSF-et tartalmazó oldatban lizáltuk. A sejtmagokat centrifugálással eltávolítottuk, és a CDI 6 fúziós proteineket 4G8-antitest és anti-egér-IgGagaróz alkalmazásával immunprecipitáltuk. A mintákat redukáló feltételek mellett elektroforizáltuk. Valamennyi immunprecipitált kimérareceptor-molekula molekulatömege azonos volt a várt értékekkel.
A kimérareceptorok citoplazmikus szabad kalciumion-koncentrációt növelő képességének tesztelése céljából a rekombináns vírusokat a (leírásban ismertetett) JRT3.T3.5 TCR- Jurkat-sejtvonal fertőzésére alkalmaztuk, és a receptorok extracelluláris doménjeinek (a leírásban ismertetett) 3G8 vagy Leu-3A monoklonális antitesttel létrejött keresztkötése után a leírásban ismertetett módon mértük a citoplazma szabad kalciumion-koncentrációját. E vizsgálatokkal kimutattuk, hogy az FcRylIA és -C intracelluláris doménje az extracelluláris doménekkel létrejött keresztkötést követően képes volt a citoplazma szabad kalciumion-koncentrá17
HU 221 603 BI dójának növekedését kiváltani, míg az FcRylIBl és -B2 intracelluláris doménje hasonló feltételek mellett inaktív volt (13a. és 13b. ábra). Az FcRylIA CD4-gyel, CD5-tel és CD16-tal alkotott hibridjei a kalciumreakció elősegítését illetően lényegében azonos hatásúak 5 voltak (13a. és 13b. ábra). Az egyéb monocita- vagy limfocita-sejtvonalak szintén képesek voltak az extracelluláris domének keresztkötésképzése által kiváltott szignálra reagálni.
A különböző FcRylI intracelluláris domének citolizis- 10 ben betöltött szerepének vizsgálata céljából emberi citotoxikus T-limfocitákat (CTL-eket) CD16:FcRyIIA-,
-Bl, -B2 és -C-kimérákat expresszáló rekombináns vacciniavirusokkal fertőztünk. A fertőzött sejteket 51Crizotóppal jelölt - CD16 elleni felületi antitestet exp- 15 resszáló - 3G8-10-2-hibridómasejtekkel együtt tenyésztettük. Amennyiben a kiméra CD16 extracelluláris doménje a limfocita-effektorprogram aktiválására képes intracelluláris szegmenshez kapcsolódik, a CD16-kimérát hordozó citotoxikus T-limfociták elpusztítják a hibri- 20 dóma-célsejteket (ezt a citolízisvizsgálatot az alábbiakban ismertetjük részletesen). A 14a. ábrán látható, hogy a CD16:FcRyIIA-t és CD16:FcRyIIC-t expresszáló vacciniavírussal fertőzött CTL-ek képesek a sejtfelületi anti-CD16-antitestet expresszáló célsejtek lizálására, a 25 CD16:FcRyIIBl-et, illetve a CD16:FcRyIIB2-t expresszáló vacciniavírussal fertőzött CTL-ek azonban nem.
Azon lehetőség kizárása érdekében, hogy a specifikus dtolizis valamilyen módon a CD16-résszel létrejött kölcsönhatásnak tulajdonítható, olyan citolízises kísér- 30 leteket végeztünk, amelyekben az FcRII intracelluláris doméneket CD4 extracelluláris doménekhez kapcsoltuk. Ezekben a kísérletekben célsejtként HIVgpl20/41-proteineket expresszáló HeLa-sejteket - pontosabban, a vPE16-vacciniavektorral („National Ins- 35 titute of Allergy and Infections Disease AIDS Depository”, Bethesda, MD) fertőzött HeLa-sejteket alkalmaztunk. A CD16-rendszer esetében tapasztaltakhoz hasonlóan, a HIV-burokproteineket expresszáló célsejtek érzékenyek voltak a CD4:FcRyIIA-kimérát exp- 40 resszáló T-sejtek lizáló hatására, a CD4:FcRyQBl-et vagy CD4:FcRyIIB2-t expresszáló T-sejtekre azonban nem (lásd 14b. ábra).
Az FcRylIA és -C intracelluláris doménje semmilyen más proteinnel (beleértve a kibővített FcRy/TCTÍ^- 45 család tagjait) nem mutat közelebbi szekvenciahomológiát. A citolizis indukciójáért felelős szekvenciaelemek azonosítása érdekében az intracelluláris domént kódoló szekvenciák 5’- és 3’-oldalán deléciókat hoztunk létre (lásd később, illetve 15a. ábra), és az így kapott délé- 50 ciós mutánsokat a leírásban ismertetett kalciumionmobilizációs és citolízises vizsgálatokban értékeltük Azokban a kísérletekben, amelyekben az intracelluláris dómén N-terminábs részét távolítottak el, az FcRylI transzmembrándoménjét a nem rokon CD7-antigén 55 transzmembrándoménjével helyettesítettük, hogy kiküszöböljük a transzmembrándomén által közvetített kölcsönhatások esetleges aktivitást elősegítő hatását.
A 15b. és 15c. ábrán azt mutatjuk be, hogy a 14 Cterminális aminosav (köztük a 298. tirozin) eltávolítása 60 a citolitikus aktivitás teljes megszűnését, illetve a kalciumion-mobilizációs aktivitás jelentős mértékű csökkenését eredményezte. A 282. tirozinig húzódó további deléció azonos fenotípust eredményez (15b. és 15c. ábra). Az intracelluláris dómén N-terminálisától a 268. aminosavig húzódó deléció nem gyakorolt jelentős hatást sem a kalciumprofilra, sem a citolitikus aktivitásra, míg a 275. aminosavig húzódó deléció jelentősen csökkentette a szabad kalciumion-felszabadulás mértékét, a citolízisre azonban alig volt hatása (15d. és 15e. ábra). A 282. aminosavig tartó további deléció olyan FcRyQ-farkakat eredményezett, amelyek sem a kalciumion-mobilizációra, sem a citolizis kiváltására nem voltak képesek (15d. és 15e. ábra). Az e durva mérésekkel meghatározott „aktív elem” viszonylag nagy méretű (36 aminosav), és két - egymástól 16 aminosav távolságra lévő - tirozint tartalmaz.
10. példa
A fertőzést nem segítő CD4-tímérareceptorokat hordozó limfociták által kiváltott citolizis Ahogy azt fentebb leírtuk, génsebészeti módszerek alkalmazásával előállíthatok olyan effektormolekulák, amelyek a citotoxikus T-limfociták citolitikus aktivitását MHC-független módon irányítják. Például, a CD4 extracelluláris doménjéből és ζ-láncból álló kiméra a WH3 citotoxikus T-limfocita-klónban specifikusan? elpusztítja a HIV-1 felületi gpl20-glikoproteinjét hordozó célsejteket. Mivel a CD4-molekula extracelluláris doménje a sejteket érzékennyé teszi a HIV-fertőzésre, a? kimérával ellátott CTL-ek a vírus célsejtjeivé válhatnak, ami csökkenti hatékonyságukat [Dalgleish és munkatársai : Natúré 312, 767 (1984); Klatzmann és munkatársai: Natúré 312, 767 (1984)]. Ennek elkerülése érdekében olyan - CD4-en alapuló - kiméra effektormolekulákat terveztünk, amelyek a HIV-vel fertőzött sejteket specifikusan a citotoxikus T-limfociták célpontjaivá teszik, de a T-limfocitákat nem teszik érzékennyé a HIV-fertőzésre.
Genetikai manipulációval háromrészes fúziós proteint állítottunk elő, melyben a CD4 extracelluláris doménjét (23. ábra) az emberi IgGl nehéz láncának csuklódoménjához, valamint második és harmadik konstans doménjához kapcsoltuk [Zettlemeissl és munkatársai: DNA Cell Bioi. 9, 347 (1990); 25. ábra], amelyeket ebben az esetben az emberi membránkötött IgGl első transzmembrán exonjának egy részéhez kapcsoltunk, amelyet az emberi CD7-antigén egy része követett, amely az egyedüli Ig-szerű dómén és a transzmembrándomént követő „stop-transzfer” szekvencia közötti szekvenciákból állt [Aruffo és Seed: EMBO J. 6, 3313 (1987); 26. ábra]. A CD7-szegmens extracelluláris részének aminosavszekvenciája prolinban gazdag régiót tartalmazott, ami egy nyélszerű struktúrára utal, amely az Ig-szerű domént kiemeli a sejtfelületből [Aruffo és Seed: EMBO J. 6,3313 (1987); 26. ábra], E kiméra és az itt leírt rokon kimérák expresszáltatása érdekében rekombináns vacciniavírusokat állítottunk elő. A rekombináns vacciniavírusokat CV-l-sejtekben homológ rekombinációval állítottuk elő. A CV-l-sejtekikjfl Illlll III ΙΙη»·Β
HU 221 603 Bl ben nagyobb titerű állományok előállítása előtt mindegyik állomány esetében legalább kétszer OKT4-gyel vagy Leu3a-val láthatóvá tettük a plakkokat és plakktisztítást végeztünk.
A három részből álló CD4(Dl-D4):Ig:CD7-ki- 5 méra (20a. ábra) hatékony sejtfelületi expressziót mutatott, ezt a kimérát vacciniaalapú szincítiumképzési vizsgálatban [Lifson és munkatársai: Natúré 323, 725 (1986); Ashom és munkatársai: J. Virol. 64, 2149 (1990)] HIV-receptorként való működési képességére 10 teszteltük. HIV-1 burok-glikoproteint kódoló rekombináns vacciniavírussal (vPE16; Earl és munkatársai: J. Virol. 64, 2448 (1990)] fertőzött HeLa-sejteket CD4gyel, CD4^-val vagy CD4(Dl-D4):Ig:CD7-tel fertőzött HeLa-sejtekkel tenyésztettünk együtt. A 6 cm-es csészékben 50%-os konfluens állapotot elért HeLasejteket (ATCC, Rockville, MD) szérummentes tápközegben egy órán át körülbelül 10-es fertőzési multiplicitással (moi) fertőztük. A sejteket komplett tápközegben 5-6 óra hosszat inkubáltuk, majd 1 mM EDTA-t tártál- 20 mazó foszfátpufferelt sóoldattal (PBS) leválasztottuk.
A burokproteint és a CD4-kimérát expresszáló sejteket 1:1 arányban összekevertük, majd komplett tápközeget tartalmazó 6 cm-es csészékre szélesztettük. A szincítiumokat az együttes tenyésztés után 6-8 órával értékel- 25 tűk és lefényképeztük.
A CD4 és a vPE16 együttes tenyésztése könnyen kimutatható, sokmagvú óriássejtek kialakulását eredményezte. A TCR ζ-láncához fuzionált extracelluláris CD4-domént tartalmazó kiméra (27. ábra; CD4: ζ) szín- 30 tén képes volt a szincítiumok kialakulásának indukálására, míg a CD4(D1 -D4): lg: CD7-et expresszáló sejtek a sejtfúzió semmijeiét nem adták. Egy olyan konstrukciót is teszteltünk, amely a CD4 első és második doménjét (24. ábra) tartalmazta [CD4(D1, D2):Ig:CD7; 35 20b. ábra], mivel egy más összefüggésben a CD4 Nterminális két doménjéről kimutatták, hogy szükségesek a HIV-fertőzéshez [Landau és munkatársai: Natúré 334,
159 (1988)]. Ez a molekula sem volt fogékony a HÍV indukálta szincítiumképződésre. A 125I-izotóppal jelölt 40 szolubilis gpl20-proteinnel végzett kötési vizsgálatok azt mutatták, hogy mind a CD(Dl-D4):Ig:CD7, mind a CD4(D1, D2): lg: CD7 változatlan affinitást mutatott a gpl20 iránt.
Ezt követően azt határoztuk meg, hogy a színei- 45 tiumképzésnek ellenálló kiméramolekulák képesek-e a sejtpusztítás indukálására akkor, ha az itt leírtak szerint „trigger’-molekularésszel látjuk el őket. A ζ intracelluláris doménjét (27. ábra) a CD4(Dl-D4):Ig:CD7 és a CD4(D1, D2):Ig:CD7 3’-végéhez kapcsoltuk, és elő- 50 állítottuk a megfelelő rekombináns vacciniavirusokat.
A kapott konstrukciókat, azaz a CD4(Dl-D4):Ig:CD7^-t (20c. ábra) és a CD4(D1,
D2): lg: CD7: ζ-t (20d. ábra) emberi WH3-CTLklónban expresszáltuk, és a találmányban leírt eljárá- 55 sok alkalmazásával a felületi HIV-burok-glikoproteint expresszáló HeLa-sejtek elpusztítására teszteltük.
A 21. ábrán látható, hogy a ζ-0)4(01-04):^:ΰ07hez vagy CD4(D1, D2):Ig:CD7-hez fuzionált intracelluláris doménje lehetővé teszi a sejtek elpusztítá- 60 sát, ugyanakkor, a ζ-láncot nem tartalmazó konstrukciók nem voltak képesek a citolitíkus aktivitás közvetítésére. A pozitív kontrollként alkalmazott Ο34:ζ valamivel hatékonyabb citotoxicitást közvetített, míg a CD4(D1, D2):Ig:CD7^ kevésbé volt hatásos, mint a CD4(Dl-D4):Ig:CD7:^ (21. ábra). Nyilvánvaló azonban, hogy mind a CD4(D1 -D4): lg :CD7: ζ-kiméra, mind a CD4(D1, D2): lg :CD7: ζ-kiméra képes a felületükön HIV-burokproteineket expresszáló sejtek specifikus elpusztításának közvetítésére. A vacciniavírusalapú vizsgálatban a négyrészes kimérik egyike sem volt képes a szincítiumképződés indukálására. Bebizonyítottuk azt is, hogy a 11a. ábrán bemutatott ζmotívumok közül egy is elég ahhoz, hogy egy
CD4(D1 -D4)-kiméra számára citolitíkus aktivitást biztosítson.
Radioimmunprecipitációs kísérletek alapján megállapítottuk, hogy a fúziós molekulák nagyrészt - ha nem teljesen - dimerek voltak. Ezekben a kísérletekben a CD4(Dl-D4):Ig:CD7^- vagy CD4(D1, D2): lg: CD7: ζ-kimérát expresszáló rekombináns vacciniavírussal fertőzött, metabolikusan jelölt HeLasejtek szolubilizált kivonatának immunprecipitálására protein-A-agarózgyöngyöket alkalmaztunk. Az immunprecipitált anyagot - redukáló és nem redukáló feltételekkel végzett - poliakrilamid-gélelektroforézissel frakcionáltuk. Hozzávetőleg 5xl06 HeLa-S3-sejtet (ATCC CCL-2.2) - a vPE16 esetében leírtak szerint megfeleld vacciniavírus-törzzsel fertőztünk. A sejteket ‘ cisztein- és metioninhiányos tápközegben 200 pCi/ml „Tran35S-Label” jelölőanyaggal (ICN Radiochemicals, Irvine, CA) 6-8 órán át metabolikusan jelöltük, majd, mM EDTA-t tartalmazó foszfátpufferelt sóoldattal leválasztottuk. A sejteket ezután leülepítettük, és 150 mM NaCl-ot, 50 mM Tris-puffert (pH=7,5), 5 mM EDTA-t, 0,5% ΝΡ-40-et, 0,1% SDS-t és 1 mM PMSFet tartalmazó oldatban lizáltuk. A sejtmagvak centrifugálással végzett eltávolítása után minden egyes sejtkivonat egyötödét 4 °C-on két óra hosszat mosott proteinA-val konjugált agarózgyöngyökön adszorbeáltuk. A gyöngyöket 1 % ΝΡ-40-et tartalmazó foszfátpufferelt sóoldatban mostuk és - merkapto-etanol jelenlétében vagy hiányában - SDS-t tartalmazó mintapufferrel eluáltuk. A kísérletek eredményei azt mutatták, hogy nem redukáló feltételek alkalmazásakor az immunprecipitált CD4(Dl-D4):Ig:CD7^- és CD4(D1, D2): lg: CD7: ζ-kimérák többsége a várt molekulatömegű dimerként vándorolt.
A CD4 fúziós molekulákat expresszáló sejtek HIV-fertőzést segítő képességének közvetlen értékelése céljából a CD4(Dl-D4):Ig:CD7- és CD4(D1, D2): lg: CD7-kimérákat expresszáló transzfektánsokkal hosszú időtartamú fertőzési vizsgálatokat végeztünk. A CD4(Dl-D4):Ig:CD7-, CD4(D1, D2):Ig:CD7- és CD4-kimérák stabil transzfektánsait az emberi embrionális veséből származó, könnyen transzfektálható 293as sejtvonal egy alvonalában állítottuk elő. A kiméramolekulákat kétirányú vektorokban szubklónoztuk, amelyekben a higromicin-B gént a herpes simplex vírus timidin-kináz-promotere vezérelte. A 10 cm-es csészé19
HU 221 603 Bl ben 60-70%-os konfluens állapotig szaporított sejteket a kalcium-foszfát alkalmazásával végzett együttes kicsapási eljárás alkalmazásával a plazmid-DNS 10 pg-jával transzfektáltuk. A transzfektálás előtt a plazmidokat az egyetlen Sfil-helynél hasítva linearizáltuk, és a végeket T4-DNS-polimerázzal feltöltöttük. A transzfekció után 24 órával a sejteket négyfelé osztottuk, majd a transzfekció után 48 órával 400 pg/ml higromicin-B-vel (Sigma, St. Louis, MO) szelektáltuk. A sejteket 3-4 naponta higromicint tartalmazó friss tápközeggel láttuk el.
A rezisztens telepeket kivettük, szaporítottuk, és expressziójukat fluoreszceinnel konjugált anti-humánIgG Fc (Organon Teknika, West Chester, PA) vagy az emberi CD4-gyel reaktív Q4120-antitest alkalmazásával végzett indirekt immunfluoreszcenciával, majd áramlási citometriával (Coulter, Hialeah, FL) értékeltük. A vizsgálathoz minden egyes konstrukcióból két független kiónt választottunk ki, melyekben a sejtfelületi CD4 szintje hasonló volt az egyéb sejtvonalakban megfígyelhetőhöz. A 22. ábrán látható, hogy a stabil CD4-transzfektánsokban a p24 a HIV-fertőzés utáni harmadik naptól kimutatható. Ezekben a tenyészetekben a sokmagvú óriássejtek jelenléte és a jellegzetes felfúvódás már a fertőzés utáni 5. napon látható volt. A nem transzfektált eredeti sejtvonalban, illetve a CD4(Dl-D4):Ig:CD7- és CD4(D1, D2):Ig:CD7transzfektánsok izolátumaiban 32 nap elteltével sem volt jelentős p24-szint, és nem voltak láthatók sokmagvú óriássejtek.
A fertőzési vizsgálatok befejezése után a sejteket felületi CD4-expressziójukra vizsgáltuk. A CD4-et expresszáló, fertőzött tenyészetekben a CD4 felületi epitópdenzitás jelentős mértékben csökkent, ami összhangban van a virális leszabályozással, a CD4(Dl-D4):Ig:CD7-et és CD4(D1, D2):Ig:CD7-et expresszáló tenyészetekben azonban a felületi denzitás változatlan maradt. E kísérletek eredményei azt mutatják, hogy előállithatók olyan - a CD4 két apikális doménjét tartalmazó - kiméramolekulák, amelyek a T-sejt-receptor ζ-láncához kapcsolódva képesek a HIV-fertőzött sejtek megcélzására és elpusztítására, azonban nem segítik elő a CD4 közvetítette HIV-fertózést.
További kísérletek eredményei arra utalnak, hogy a HIV-fertőzésnek ellenálló képességet a CD4-molekula extracelluláris doménje és a lipid kettősréteg közötti fizikai távolság biztosítja. Az egyik kísérletben olyan kiméramolekulát állítottunk elő, amely a CD7 „szár” és transzmembrándoménjében deléciót tartalmazott, ami a CD7 transzmembránrégiójából eltávolította a prolinban gazdag régiót. Ha ezt a domént a CD4 extracelluláris doménjéhez fuzionáljuk, megtartotta a CD4molekula extracelluláris doménjét kihorgonyzó képességét (amit a CEM-molekula sejtfelületi expressziója alapján állapítottunk meg). Ennek ellenére a HIVburok-glikoprotein által indukált szincítiumképződéssel szembeni ellenállási képesség megszűnt. Ilyenformán, a CD7-molekula - valószínűleg α-helikális szerkezetű - prolinban gazdag régiójának eltávolítása hatásosan csökkentette a CD4 extracelluláris doménje és a lipid kettősréteg közötti távolságot, és megszűntette a kiméra szincítiumképződéssel szembeni ellenálló képességét.
Egy másik kísérletben bebizonyítottuk, hogy a HÍV indukálta szincitiumképződéssel szembeni ellenállási képesség kialakulhat egy CD4/CD5-kiméra hatására, amelyről korábban leírták, hogy a CD4 extracelluláris doménje számára transzmembránhorgonyként szolgál, de önmagában nem képes a HÍV indukálta szincítiumképződés megakadályozására. Ebben a kísérlet10 ben az emberi IgGI nehéz láncának csukló-, CH2- és CH3-doménjét a CD4/CD5-molekulába inszertáltuk. A kapott kiméra megakadályozta a szincítiumképződést, ami ebben az esetben is arra utal, hogy az immunglobulin-domének által biztosított távolság elegen15 dő a HÍV indukálta szincitiumképződéssel szembeni rezisztencia biztosítására.
Egy harmadik kísérletben egy CD4-domént - változó hosszúságú szintetikus α-hélixek alkalmazásával a sejtmembrántól különböző távolságokban helyeztünk el. Olyan szintetikus oligonukleotidokat alakítottunk ki, amelyekben az egymást felváltva követő lizinek és glutaminsavak között alaninok helyezkednek el (a nukleotid- és aminosavszekvenciát lásd 28. ábra). Korábbi vizsgálatok eredményei azt tanúsítják, hogy az ilyen aminosavszekvenciák nagy gyakorisággal a-helikális szerkezetűek, ami arra utal, hogy az ilyen ismétlődő motívumok α-helikális konformációt vesznek fel, és ha a transzmembrándomén és a CD4 extracelluláris doménje közé ilyen α-hélixeket helyezünk, a CD4 távol' tartható a sejtmembrántól. Az α-helikális szegmenshosszúságának változtatásával - az α-hélix ismert csavarmenet-emelkedése alapján meghatároztuk a > CD4 azon kiemelési távolságát, amely a HIV-vírusok bejutásának megakadályozásához szükséges. Ezeket az eredményeket az 1. táblázatban mutatjuk be.
1. táblázat
Konstrukció | Színei tiumképződés | Thy-1 expresszió |
A)CD4+H+CH3+ CH3+CD7tm+stk | - | - |
B) CD4(D1, D2)+H+CH2+ CH3+CD7tm+stk | + /-<·> | + |
C) CD4+CD7tm+stk | + | + |
D) CD4+CD7tm (hosszú változat) | + | + |
E) CD4+CD7tm (rövid változat) | + | + |
F) CD4+CD5tm | + | + |
G) CD4+CH2+CH3+ CD5tm | - | - |
H) CD4+CH3+CD5tm | - | NM |
I)CD4+CH34tm | + | + |
J) CD4+szintetikus a-hélix (24 angström)+CD34tm | NM | + |
ff
HU 221 603 Bl
1. táblázat (folytatás)
Konstrukció | Színei tiumképződés | Thy-1 expresszió |
K) CD4+szintetikus a-hélix (48 angström)+CD34tm | NM | + /-<»> |
L) CD4+szintetikus a-hélix (72 angström)+CD34tm | NM | - |
NM: nincs meghatározva * Jelentős mértékű csökkentés a szincítiumok vagy a thy-l-et expresszáló sejtek számában.
A táblázatban „CD4” jelentése - ha másképp nem jelezzük - CD4(D1-D4); „H”, „CH2”, illetve „CH3” jelentése az emberi IgGl nehéz láncának csukló-, CH2-, illetve CH3-régiója: „CD7tm+stk” jelentése a CD7 transzmembrán- és „szár” régiója; „CD7tm (hosszú változat)” jelentése a CD7 transzmembránrégiója; „CD7tm (rövid változat)” jelentése a CD7 - prolinban gazdag doménjében a fentebb leírtak szerint deletált - transzmembránrégiója; „CD5tm” jelentése a CD5 transzmembránrégiója; és „CD34tm” jelentése a CD34 transzmembránrégiója. A J)-L) konstrukciók esetében az α-hélixek hosszát angströmben adjuk meg; ezek az értékek azon a tényen alapulnak, hogy az a-hélixben egy csavarmenetet 3,6 aminosav alkot, és a csavarmenet magassága 5,4 angström (ebből egy aminosavra 1,5 angström jut). Ezek szerint, egy 16 aminosavas α-hélix a CD4 extracelluláris doménjét hozzávetőleg 24 angström távolságra emeli ki. A 48 és 72 angströmös α-hélixeket a BstYl-fragmens - a fragmens egyedi BamHI-helyére történő - egymás után konkatemerizációjával állítottuk elő (lásd 28. ábra), majd kiválasztottuk a megfelelő orientációjú kiónokat.
A szincítiumképzést - a vPE-16 vacciniavirus-konstrukcióból származó HIV-l-burok-glikoproteint expresszáló HeLa-sejtek végzett együttes tenyésztési vizsgálatban értékeltük.
A Thy-l-expressziót a következők szerint mértük. A HIV-1 hxb.2-klónja alapján élő retrovírusvektort állítottunk elő. Ebben a vektorban a nem kulcsfontosságú nef-gént a patkány-thy-1 (amely egy hatékonyan expresszált sejtfelületi molekula, amely foszfatidil-inozitol-kötéssel van a membránhoz horgonyozva) kódolószekvenciájával helyettesítettük. Az e molekuláris kiónból (hxb/thy-1) származó vírus fertőzőképes volt, amit citopatológiás hatásai és a fertőzött C8166-sejtek (amely egy emberi CD4+ leukémiás T-sejtvonal) tenyészeti felülúszójában kimutatott p24-termelődés bizonyított. A hxb/thy-l-klón hatására a CD4-gyel átmenetileg transzfektált HeLa-sejtek már a fertőzés után 18 órával thy-l-expresszió jeleit mutatták, ami nef-szerű módon szabályozott mRNS esetében előre várható. A nef-gén által kódolt mRNS-ek virális szabályozóproteineket kódoló mRNS-ek osztályába tartoznak, amelyek többszörös „splicing”-on mennek keresztül, és az általuk kódolt fehérjékből hiányzik a rev-re reagáló elem. Ezek az mRNS-ek korai virális géntermékekként zömmel a citoplazmában halmozódhatnak fel. A thy-l-mRNS-ek esetében azt vártuk, hogy szabályozásuk hasonló módon, azaz a vírus életciklusának korai szakaszában történik. Ez a rendszer - a vírusbehatolás helyett a thy-lexpresszió alkalmazásával - lehetővé teszi a HÍV behatolásának vizsgálatát. Különböző CD4-alapú kimérákat - standard DEAE-dextrán eljárások alkalmazásával átmenetileg HeLa-sejtekbe transzfektáltunk, és a transzfektált sejteket a transzfekció után 48 órán keresztül hxb/thy-1 -vírussal fertőztük, majd a fertőzés után 24-48 órával értékeltük a thy-l-expressziót. Az 1. táblázatban bemutatott eredményeket úgy kaptuk, hogy a fertőzés után 24 órával - kereskedelmi forgalomban beszerezhető Thy-1 monoklonális antitest (Accurate) alkalmazásával - mértük a thy-l-expressziót.
Az 1. táblázat eredményeiből azt a következtetést vonhatjuk le, hogy a HTV-l-fertőzés megakadályozása érdekében a CD4 extracelluláris doménjeinek legalább 48 angström távolságra, előnyösen legalább 72 angström távolságra ki kell nyúlniuk a sejtmembránból.
Az itt leírt általános eljáráshoz hasonlóan olyan HIV-burokproteinek elleni - antitesteken alapuló kimérák állíthatók elő, amelyek a HIV-vírussal fertőzött sejteket célozzák meg. Az ilyen antitestek példáinak leírását lásd Gomy és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, (1989); és Marasco és munkatársat: J. Clin. Invest. 90, 1467 (1992).
11. példa
A sejtmembránból kiálló CD4-molekulák alkalmazása HIV-csaliként
Ahogy azt az előzőekben bebizonyítottuk, a sejtfelületből kiálló CD4-doméneket hordozó sejtek ellenállóak a HIV-fertőzéssel szemben, igy az ilyen sejtek hatásos csapdaként szolgálnak a keringésben lévő HIVvírusok megkötésére, és a HIV-fertőzött páciensekben csökkentik a vírustitert. A CD4-domént előnyösen olyan sejten prezentáljuk, amely természetes állapotban áthalad a nyirokcsomókon; a hasznos gazdasejtek közé tartoznak az immunsejt-„clearance”-ben szerepet játszó sejtek, valamint az összes olyan sejt, amely természetes állapotban jelen van a nyirokcsomó-follikuluszokban. A gazdasejtek konkrét példái közé tartoznak - többek között - a makrofágok, T-sejtek (például ,belper”-T-sejtek), B-sejtek, neutrociták, dendritsejtek és a follikuláris dendritsejtek.
A találmány szerinti eljárásban bármilyen CD4domén (köztük a D1-D4- és Dl, D2-domén) alkalmazható, amely képes a HÍV megkötésére. Néhány (például a fentebb leírt) megvalósítási mód szerint a kiméra intracelluláris és/vagy transzmembrándomén része származhat bármilyen proteinből vagy aminosavszekvenciából.
12. példa
Egyéb T-sejt-receptor- és B-sejt-receptor„ trigger -molekulák
A találmány szerinti egyéb intracelluláris és transzmembrán szignáltranszdukáló domének T-sejt-receptorproteinekből (CD3-delta és T3-gamma), valamint Bsejt-receptorproteinekből (mbl és B29) származhatnak.
HU 221 603 BI
A CD3-delta aminosavszekvenciáját a 16. ábrán (24. azonosító számú szekvencia); a T3-gamma aminosavszekvenciáját a 17. ábrán (25. azonosító számú szekvencia); az mbl aminosavszekvenciáját a 18. ábrán (26. azonosító számú szekvencia); a B29 aminosavszekven- 5 ciáját pedig a 19. ábrán (27. azonosító számú szekvencia) mutatjuk be. Az ábrákon a szekvenciák citolitikus szignáltranszdukcióhoz szükséges (és ennélfogva a találmány szerinti kimérareceptorokban előnyösen alkalmazott) részét bekereteztük. Olyan kimérareceptorokat 10 állítottunk elő, amelyek a fenti proteindoméneket tartalmazzák, és a kapott konstrukciókat a találmány szerinti terápiás eljárásokban alkalmazzuk.
13. példa 15
Kísérleti eljárások
Vaecimafertőzés és radioimmunprecipitáció
Hozzávetőleg 5 χ 106 CVl-sejtet [Friedrich és munkatársai, Oncogene 8, 1673 (1993)] szérummentes DME-tápközegben egy órán át legalább 10-es fertőzési 20 multiplicitással (moi) rekombináns vacciniavirussal fertőztünk. A sejteket a fertőzés után friss tápközegbe helyeztük, és metionin- és dszteinmentes DMEM-tápközegben (Gibco, Grand Island, NY) 200 pCi/ml 3SS-metionin+cisztein jelölőanyaggal („Tran35S-label”; ICN, 25 Costo Mesa, CA) metabolikusan hat óra hosszat jelöltük. Ajelölt sejteket 1 mM EDTA-t tartalmazó PBS-sel leválasztottuk, centrifúgálással összegyűjtöttük, és 1% ΝΡ-40-et, 0,1% SDS-t, 0,15 M NaCl-ot, 0,05 M Trispuffert (pH=8,0), 5 mM EDTA-t és 1 mM PMSF-et tar- 30 talmazó oldatban lizáltuk. A sejtmagokat centrifugálással eltávolítottuk, és a CD4-proteineket OKT4-antitest és antiegér-IgG-agaróz (Cappel, Durham, NC) alkalmazásával immunprecipitáltuk. A mintákat 8%-os SDSpoliakrilamid-géleken, nem redukáló, illetve redukáló 35 feltételekkel elektroforizáltuk. A 35S-izotóppal jelölt mintákat tartalmazó géleket az autoradiográfíás vizsgálat előtt „En3Hance” (New England Nuclear, Boston, MA) alkalmazásával impregnáltuk. A CD16 transzmembrán alakjának (CDIÓjm) elősegített expressziójá- 40 nak mérése céljából a csak CDlójM-domént kódoló vírusokkal fertőzött CVl-sejtekben megfigyelt expressziét a CD16tm^* vagy CDIÓjm :y-kimérát kódoló vírusokkal együttesen fertőzött sejtekben megfigyelt expresszióval hasonlítottuk össze. A fertőzés és hat 45 órás vagy hosszabb időtartamú inkubálás után a sejteket 1 mM EDTA-t tartalmazó PBS-sel leválasztottuk a tálcákról, és a CDló^, illetve a kimérák expresszióját indirekt immunfluoreszcencia-vizsgálattal vagy áramlási citometriával mértük. 50
Kalciumáram-vizsgálat
A Jurkat-E6-sejteket [Weiss és munkatársai: J. Immunoi. 133, 123 (1984)] szérummentes IMDM-tápközegben - 10-es fertőzési multiplicitással - egy órán át rekombináns vacciniavírusokkal fertőztük, majd 55 10% FBS-t tartalmazó IMDM-tápközegben 3-9 óra hosszat inkubáltuk. A sejteket centrifúgálással összegyűjtöttük, és 1 mM „Indo-1” aceto-metoxi-észtert [Grynkiewicz és munkatársai: J. Bioi. Chem. 260,
3340 (1985); Molecular Probes] tartalmazó komplett 60 tápközegben 3 x1ο6 sejt/ml mennyiségben újraszuszpendáltuk, és 37 °C-on 45 percig inkubáltuk. Az „Indol”-gyel jelölt sejteket leülepitettük és 1 χ 10 sejt/ml mennyiségben szérummentes IMDM-tápközegben újraszuszpendáltuk, majd szobahőmérsékleten, sötétben tároltuk. A sejtek szabad kalciumion-tartalmát az ibolya és kék fluoreszcencia - áramlási citometria alkalmazásával történő - egyidejű mérésével határoztuk meg [Rabinovitch és munkatársai: J. Immunoi. 137, 952 (1986)]. A kalciumáram beindítása érdekében a sejtszuszpenzióhoz a 0. percben fíkoeritrinnel (PE) konjugált anti-CD4 Leu-3A-antitestet (1 pg/ml; Becton Dickinson, Lincoln Park, NJ), majd 10 pg/ml konjugálatlan kecske anti-egér-IgG-t; vagy szintén a 0. percben pg/ml koncentrációjú konjugálásán 3G8 (anti-CD16) monoklonális antitestet, majd fíkoeritrinnel konjugált
- egér-IgG-elleni - kecske Fab2’-t adtunk. Az összes sejt jellemzően 40-80%-át kitevő PE-pozitív (fertőzött) sejtpopulációból ibolya/kék kibocsátási hisztogramokat készítettünk. A nem fertőzött sejtekben a Tsejt-antigén-receptor reakciót az OKT3-antitest váltotta ki (keresztkötésképzés nélkül). A CD16-kimérareceptorokkal végzett kísérletekben az alacsonyabb kalciumszint felé (antitest nélkül) alapvonal-eltolódást mutató mintákat kihagytuk a vizsgálatból. A hisztogram adatait a biner adatok - „Write Hand Mán” szoftver (Cooper City, FL) alkalmazásával - ASCD-höz történő konverziójával, majd „FORTRAN”-programkollekcióval í végzett, analízissel értékeltük. Az egységnyi értékre be-' I állított, normalizált kiindulási arány megállapítására,» valamint a nyugalmi köszöbarány (melyet úgy állítat- ( tünk be, hogy a nyugvó populáció 10%-a haladja meg a ;
küszöbszintet) meghatározására a második antitestreagens hozzáadása előtti ibolya/kék emissziós arányt.
használtuk.
Citolízisvizsgálat
A CD8- CD4- HLA-B44-korlátozott WH3-T- f sejtvonalat 10% emberi szérumot és 100 E/ml IL-2-t tartalmazó IMDM-tápközegben tartottuk, és szabályos időközönként perifériás vérből származó, sugáxkezelt (3000 rád) HLA-párosítatlan limfocitákkal és 1 pg/ml koncentrációjú fitohemagglutininnel nem specifikusan, vagy sugárkezelt, B44-et hordozó egymagvú sejtekkel specifikusan stimuláltuk. A nem specifikus stimulálás után egy nappal a fitohemagglutinint friss tápközeg hozzáadásával 0,5 pg/ml koncentrációra hígítottuk, és három nap múlva a tápközeget lecseréltük. Mielőtt a citotoxicitási vizsgálatot elkezdtük volna, a sejteket a fertőzés után legalább 10 napig szaporítottuk. A sejteket szé- = rummentes tápközegben legalább 10-es fertőzési multiplicitással egy óra hosszat rekombináns vacciniavirussal fertőztük, majd komplett tápközegben három óra hosszat inkubáltuk. A sejteket centrifúgálással összegyűjtöttük és 1 χ 107 sejt/ml mennyiségben újraszuszpendáltuk. U aljú mikrotitertálca - egyenként 100 pl komplett tápközeget tartalmazó - üregeibe a kapott sejtszuszpenzió 100-100 pl-ét töltöttük. A sejtszuszpen- g ziókból kétszeres hígítási lépésekkel sorozathígítást készítettünk. A spontán krómizotóp-felszabadulás és az r összes krómfelvétel mérése céljából mindegyik minta
HU 221 603 Bl esetében két üregből kihagytuk a limfocitákat. A HeLaS3-sejtvonalból származó célsejteket 6,0 cm-es vagy 10,0 cm-es csészékben, szérummentes tápközegben hozzávetőleg 10-es fertőzési multiplicitással három órán át fertőztük, majd komplett tápközegben három óra hosszat inkubáltuk. A sejteket ezután 1 mM EDTAt tartalmazó foszfátpufferelt sóoldattal leválasztottuk a csészékről és megszámoltuk. 106 célsejtet - a CD4kimérareceptorokkal végzett kísérletekben HeLa-, Raji vagy RJ2.2.5-sejteket, a CD16-kimérareceptorokkal végzett kísérletekben pedig „3G8 10-2”-sejteket [Shen és munkatársai: Mól. Immunoi. 26, 959 (1989) - lecentrifúgáltunk és 50 μΐ steril 51Cr-nátrium-kromát-oldatban (1 mCi/ml; Dupont, Wilmington, DE) 37 °C-on egy órán át - időnként megkeverve - újraszuszpendáltunk. A sejteket foszfátpufferelt sóoldattal háromszor mostuk, majd a mikrotitertálca mindegyik üregébe a tápközegben 105 sejt/ml mennyiségben újraszuszpendált jelölt sejtek 100 μΐ-ét adtuk. A Raji- és RJ2.2.5sejtek jelölését a HeLa-sejtek esetében leírttal azonos módon végeztük. A mikrotitertálcát 750 x g-vel egy percig centrifugáltuk, és 37 °C-on négy óra hosszat inkubáltuk. Az inkubálás után az egyes üregekben lévő sejteket óvatos pipettázással újraszuszpendáltuk. Az összes beütésszám meghatározása céljából a szuszpenzióból mintát vettünk, és a mikrotitertálcát 750 χ g-vel egy percig centrifugáltuk. A felülúszóból 100 μΐ-es részleteket vettünk, és a beütésszámot gamma-sugárszcintillációs számlálóval számláltuk. A százalékos sejtpusztítást a fertőzött célsejtek áramlási citometriával meghatározott arányának (rendszerint 50-90%) megfelelően korrigáltuk. A fertőzött effektorsejtek esetében az effektor: célsejt arányt a fertőzött sejtek százalékos arányához korrigáltuk (ez az arány a CD4-kimérareceptorokkal végzett kísérletek esetében rendszerint 20-50%, a CD16-kimérareceptorokkal végzett kísérletek esetében pedig 70% feletti).
A ζ-szekvencia in vitro mutagenezise
A ζ-szekvencia 11. és/vagy 15. aminosavába pontmutáció létrehozása céljából a ζ transzmembrándoménjétől 5’-irányban lévő BamHI-helytől kezdődő szintetikus oligonukleotidokat állítottunk elő, amelyek az eredeti ζ-szekvencia 11. ciszteinjét glicinre (C11G); 15. aszparaginsavát glicinre (D15G) vagy egyidejűleg a 11. ciszteint glicinre és a 15. aszparaginsavát glicinre (C11G/D15G) változtatják. Ezeket az oligonukleotidokat mutáns fragmensek előállítása érdekében polimeráz láncreakciókban alkalmaztuk, és a kapott fragmenseket a vad típusú CD4: ζ-konstrukciókba inszertáltuk vissza.
A ζ-láncban deléciók létrehozása érdekében - az 50., 59. vagy 65. aminosav után stopkodon beiktatására tervezett szintetikus láncindító oligonukleotidok alkalmazásával végzett polimeráz láncreakcióval ζ-cDNSszekvenciákat amplifikáltunk. A láncindítók az 5’végtől öt vagy hat nukleotid távolságra Notl-helyet tartalmaztak, rendszerint a CGC GGG CGG CCG CTA (11. azonosító számú) szekvencia formájában, ahol az utolsó három nukleotid a stop-antikodonnak felel meg. A NotI és stop-antikodon szekvenciáit 18 vagy több a fragmens kívánt 3’-végével komplementer nukleotid követi. A kapott kimérákat CD16^Y51*-nak, CD16^E60*-nak, illetve CD16^66*-nak neveztük el. A transzmembrándoméntől és a Notl-helytől 5’irányban lévő BamHI-helyet olyan fragmensek előállítására alkalmaztuk, amelyeket visszajuttattunk a vad típusú CD16 ^-konstrukcióba. A ζ-lánc transzmembrán és membránhoz közeli intracelluláris szekvenciáinak a fentebb leírt Asp- és Cys- CD4: ζ-konstrukció BamHI- és Sacl-emésztésével végzett - felszabadításával, és a kapott fragmens CD16^E60*-, illetve CD16:ζD66*-konstrukcióba történő inszertálásával monomer ζ-kimérákat állítottunk elő.
A háromrészes CD16:7:ζ(48-65)- és CD16:7:^(48-59)-kiméra előállítása
A 0ϋ16:ζΟ66*4οη8ΐη]1κ:ϊό előállítása céljából a ζlánc transzmembrándoménjének és a citoplazmikus dómén következő 17 aminosavának megfelelő ζ-cDNSszekvenciát a CD5 és a CD7 megfelelő transzmembrán és citoplazmikus doménjeit kódoló cDNS-szekvenciával helyettesítettük. A CD5- és CD7-cDNS-fragmenseket BamHI hasítási helyet tartalmazó és a CD5, illetve a CD7 transzmembrándoménjétől közvetlenül 5’-irányban lévő régiónak megfelelő - „forward” láncindító oligonukleotidok, valamint a következő - CD5-, illetve CD7szekvenciákkal és a ζ-szekvenciával átfedő, Sacl-helyet tartalmazó - reverz oligonukleotidok alkalmazásával' végzett polimeráz láncreakcióval állítottuk elő:
CD5:ζ: CGC GGG CTC GTT ATA GAG CTG GTT CTG GCG CTG CTT CTT CTG (12. azonosító számú, szekvencia);
CD7: ζ: CGC GGG GAG CTC GTT ATA GAG CTG GTT TGC CGC CGA ATT CTT ATC CCG (13. azonosító számú szekvencia).
A polimeráz láncreakcióval kapott CD5 és CD7 terméket BamHI-gyel és Sacl-gyel emésztettük, majd BamHI-gyel és Sacl-gyel emésztett CD16^E60* konstrukcióba ligáltuk, és a ζ-szekvencia BamHIhelytől Sacl-helyig terjedő szakaszát a CD7-fragmenssel helyettesítettük. A CD16:CD5- és CD16:CD7konstrukció előállítása érdekében a CD5- és CD7-fragmenst -Notl-helyet, valamint a CDS 416. glutaminja után, illetve a CD7 193. alaninja után stopkodont (UAA) kódoló - láncindító alkalmazásával végzett polimeráz láncreakcióval állítottuk elő. A CD5- és CD7PCR-fragmenst BamHI-gyel és Notl-gyel emésztettük, és a ΰ016:ζΑ8ρ66*^οηδΙη±οίό63 inszertáltuk.
A ζ citolitikus szignáltranszdukáló motívum N-terminális aminosavainak in vitro mutagenezise
A ζ-motívumon belüli Sacl-helytől kezdődő, és az eredeti aminosavszekvencia 48. aszparaginját szerűire (N48S), 50. leucinját szerűire (L50S) és 51. tirozinját fenil-alaninra (Y51F) változtató szintetikus láncindító oligonukleotidokat szintetizáltunk, melyek alkalmazásával polimeráz láncreakciót végeztünk, és a kapott fragmenseket visszajuttattuk a vad típusú CD16:7^(48-65)konstrukcióba.
A ζ citolitikus szignáltranszdukáló motívum C-terminális aminosavainak in vitro mutagenezise
A stopkodontól 3’-irányba lévő Notl-helytől kezdődő, és az eredeti aminosavszekvencia 60. glutaminsavát
HU 221 603 Bl glutaminra (E60Q), 61. glutaminsavát glutaminra (E61Q), 62. tirozinját fenil-alaninra vagy szerinre (Y62F vagy Y62S), 63. aszparaginsavát pedig aszparaginra (D63N) változtató szintetikus láncindító oligonukleotidokat szintetizáltunk, és ezek alkalmazásával poli- 5 meráz láncreakciót végeztünk, majd a kapott ffagmenseket - a BamHI-helytől a Notl-helyig - a vad típusú CD16: ζόό^οηδίηόωίόΐκι szubklónoztuk.
CD16:7:C,(33- 65)-, CD16.7 :^(71-104)- és
CD16:7 :^(104-137)-kimérakonstrukciók 10
A CGC GGG GCG GCC AGG CGT CCT CGC CAG CAC ACA (14. azonosító számú) nukleotidszekvenciát tartalmazó láncinditó oligonukleotid alkalmazásával végzett polimeráz láncreakcióval olyan CD7 transzmembrándomént állítottunk elő, amely a 15 transzmembrán és az intracelluláris dómén közötti kapcsolódásnál Miül- és Notl-helyet tartalmazott. A kapott PCR-fragmenst BamHI-gyel és Notl-gyel emésztettük, majd visszainszertáltuk a CD16:7^(48-65)-konstrukcióba. A ζ-lánc 33-65., 71-104. és 104-137. ami- 20 nosavait kódoló ffagmenseket polimeráz láncreakcióval kaptuk, amihez a „forward” láncindítók 5’-végén lévő Mlul-helyet tartalmazó láncindítót és a reverz láncindítók 5’-végén lévő stopkodont és Notl-helyet tartalmazó láncinditót alkalmaztunk. A restrikciós helyek - 25 a restrikciós enzimes hasítás biztosítása érdekében - a láncinditó 5’-végétől hat nukleotidnyi távolságban helyezkedtek el.
ζ-33: CGC GGG ACG CGT TTC AGC CGT CCT CGC CAG CAC ACA (15. azonosító számú szekven- 30 cia);
ζ-71: CGC GGG ACG CGT GAC CCT GAG ATG GGG GGA AAG (16. azonosító számú szekvencia); ζ-104: CGC GGG ACG CGT ATT GGG ATG AAA GGC GAG CGC (17. azonosító számú szekvencia). 35 Deléciós FcRyllA-mutánsok előállítása
A teljes hosszúságú konstrukciók esetében alkalmazott eljárással azonos módon végzett polimeráz láncreakcióval -C-tenninális szekvenciájukban deléciót hordozó - FcRÜA-mutánsokat állítottunk elő, melyekben a 282. 40 és 298. tirozint kódoló nukleotidokat stopkodonná (TAA) változtattuk Az N-terminális deléciókat úgy hoztuk létre, hogy az intracelluláris dómén egyre kisebb részét kódoló ffagmenseket polimeráz láncreakcióval amplifikáltuk, amihez olyan oligonukleotidokat alkalmaz- 45 tünk, melyek lehetővé tették, hogy a kapott fragmenseket - a CD16 extracelluláris doménjét, az ehhez fuzionált CD7-transzmembrándomént (amely Mlul-helyben végződik) és a transzmembrán és az intracelluláris dómén közötti kapcsolószakaszt kódoló expressziós 50 plazmid Miül- és Noű-helye közé inszertáljuk.
Egyéb megvalósítási módok
A fentebb leírt példákban bemutattuk, hogy a ζ-, τιvagy γ-kimérák aggregációja T-sejtekben elősegíti a citolitikus effektorsejt-reakciót. A ζ, η és γ exp- 55 ressziójának ismert előfordulása (T-limfociták, természetes „killer’-sejtek, bazofil granulociták, makrofágok és hízósejtek) arra utal, hogy konzervált szekvenciamotívumok a vérképzési sejtekre közösen jellemző érzékelő apparátussal lépnek kölcsönhatásba, és a recep- 60 toraggregációs események a gazda immunrendszere védekező mechanizmusának lényeges komponensét közvetítik.
A citolitikus reakció hatása és az MHC Π. osztályú receptorokat hordozó célsejtekre adott reakció hiánya azt bizonyítja, hogy a ζ-, η- vagy γ-láncon alapuló kimérák képezik az alapját az AIDS - adoptiv immunterápia segítségével történő - leküzdésében alkalmazott genetikai beavatkozásnak. Az endogén ζ- és γlánc széles körű elterjedtsége és az a tény, hogy a γlánccal asszociált Fc-receptorok különböző sejttípusokban közvetítenek citotoxicitást [Fanger és munkatársai: Immunoi. Today 10, 92 (1989)], a kimérák expresszálására számos különböző sejttípust tesz alkalmassá. Például, a keringésben nagyon rövid (körülbelül 4 óra) élettartamú neutrofil granulociták a kimérák expresszálását illetően előnyös célsejtek. Nem valószínű, hogy a neutrofil granulociták HIV-vírussal történő fertőzése viruskiszabadulást eredményez, és e sejtek gyakorisága elősegíti a gazda védekezését. Az előnyösen alkalmazható gazdasejtek közé tartoznak az érett Tsejtek is, amelyek alkalmasak a retrovírusok genetikai manipulációjára [Rosengerg: Sci. Am. 262, 62 (1990)]. Rekombináns IL-2 segítségével a T-sejtek tenyészetben viszonylag könnyen szaporíthatok, s az így megnövelt populációk a keringésbe visszajuttatva rendszerint korlátozott élettartamúak [Rosenberg és ;
munkatársai: N. Engl. J. Med. 323, 570 (1990)]. I
Megfelelő feltételek mellett a CD4-kimérákat exp- t resszáló sejtek HIV-felismerése mitogén stimulusokat j kelthet, ami lehetővé teszi, hogy az ilyen sejtpopuláció } dinamikusan reagáljon a vírusfertőzésre. Bár találmá- j nyunkban a fúziós proteinek citolitikus T-limfociták- 1 bán mutatott viselkedésére összpontosítottunk, a kimé- | rák „helper’-limfocitákban történd expressziója a cito- I kinek olyan „HIV-mobilizált” forrását biztosíthatja, f ami megakadályozhatja a „helper’-sejtpopuláció AIDS f esetén megfigyelhető összeomlását. A vírusfertőzéssel szembeni rezisztencia - vírusbehatolási lépéstől eltérő stádiumban történő - kialakításának számos lehetőségének leírásai [Friedman és munkatársai: Natúré 335,
452 (1988); Green és munkatársai: Cell 58, 215 (1989); Malim és munkatársai: Cell 58, 205 (1989);
Trono és munkatársai: Cell 59, 113 (1989); Bionocore és munkatársai: Natúré 345, 625 (1990)] arra utalnak, hogy a vírustermelődés intracelluláris működési helyű, megfelelő anyagok expressziójával történő - megakadályozása céljából CD4-kimérákat hordozó sejtek alakíthatók ki. ;
Az önálló kimérák azon képessége, hogy a T-limfociták számára szignálokat továbbítanak, lehetővé teszi a retrovirusokkal genetikailag manipulált limfociták in vivő szabályozását. A komplementkötő domének eltávolítása érdekében génsebészeti módszerekkel manipulált specifikus IgM-antitestek által közvetített keresztkötési stimulusok elősegíthetik az ilyen limfociták számának in situ növekedését, míg a hasonló specifikus (pél- · dául a kiméraláncban létrehozott aminosawáltozásokat felismerő) IgG-antitestekkel végzett kezelés szelektí- r ven csökkentheti a manipulált populációt Ezen túlme24
HU 221 603 Bl nőén, a CD4 elleni IgM-antitestek a CD4^-kimérákat expresszáló Jurkat-sejtekben a kalciumion-mobilizációhoz a nem igényelnek további keresztkötésképzést.
A sejtpopulációk szabályozásának ismételt, testen kívüli szaporítás igénybevétele nélküli szabályozási képes- 5 sége jelentősen növelheti a génsebészeti módszerekkel manipulált T-sejtekhez ajánlott jelenlegi eljárások alkalmazhatóságát és hatékonyságát.
Bár a találmány szerinti készítményeket és eljárásokat a találmány előnyös megvalósítási módjain keresztül szemléltettük, szakember számára nyilvánvaló, hogy a találmány szerinti megoldás megvalósítási módjaiban különböző változtatások hajthatók végre, anélkül, hogy eltérnénk a találmányi gondolattól. Az ilyen megoldások az igényelt oltalmi körön belül maradnak.
SZEKVENCIALISTA
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 1728 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: kettős
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATGAACCGGC GAGTCCCTTT TAGGCACTTG CTTCTGGTGC TGCAACTGGC GCTCCTCCCA GCAGCCACTC AGGCAAACAA AGTGGTGCTG GGCAAAAAAG GGGATACAGT GGAACTGACC TGTACAGCTT CCCAGAAGAA GAGCATACAA TTCCACTGGA AAAACTCCAA CCAGATAAAG ATTCTGGGAA ATCAGGGCTC CTTCTTAACT AAAGGTCCAT CCAAGCTGAA TGATCGCGCT GACTCAAGAA GAAGCCTTTG GGACCAAGGA AACTTCCCCC TGATCATCAA GAATCTTAAG ATAGAAGACT CAGATACTTA CATCTGTGAA GTGGAGGACC AGAAGGAGGA GGTGCAATTG CTAGTGTTCG GATTGACTGC CAACTCTGAC ACCCACCTGC TTCAGGGGCA GAGCCTGACC CTGACCTTGG AGAGCCCCCC TGGTAGTAGC CCCTCAGTGC AATGTAGGAG TCCAAGGGGT AAAAACATAC AGGGGGGGAA GACCCTCTCC GTGTCTCAGC TGGAGCTCCA GGATAGTGGC ACCTGGACAT GCACTGTCTT GCAGAACCAG AAGAAGGTGG AGTTCAAAAT AGACATCGTG GTGCTAGCTT TCCAGAAGGC CTCCAGCATA GTCTATAAGA AAGAGGGGCA ACAGGTGGAG TTCTCCTTCC CACTCGCCTT TACAGTTGAA AAGCTGACGG GCAGTGGCGA GCTGTGGTGG CAGGCGGAGA GGGCTTCCTC CTCCAAGTCT TGGATCACCT TTGACCTGAA GAACAAGGAA GTGTCTGTAA AACGGGTTAC CCAGGACCCT AAGCTCCAGA TGGGCAAGAA GCTCCCGCTC CACCTCACCC TGCCCCAGGC CTTGCCTCAG TATGCTGGCT CTGGAAACCT CACCCTGGCC CTTGAAGCGA AAACAGGAAA GTTGCATCAG GAAGTGAACC TGGTGGTGAT GAGAGCCACT CAGCTCCAGA AAAATTTGAC CTGTGAGGTG TGGGGACCCA CCTCCCCTAA GCTGATGCTG AGCTTGAAAC TGGAGAACAA GGAGGCAAAG GTCTCGAAGC GGGAGAAGCC GGTGTGGGTG CTGAACCCTG AGGCGGGGAT GTGGCAGTGT CTGCTGAGTG ACTCGGGACA GGTCCTGCTG GAATCCAACA TCAAGGTTCT GCCCACATGG TCCACCCCGG TGCACGCGGA TCCCAAACTC TGCTACTTGC TAGATGGAAT CCTCTTCATC TACGGAGTCA TCATCACAGC CCTGTACCTG AGAGCAAAAT TCAGCAGGAG TGCAGAGACT GCTGCCAACC TGCAGGACCC CAACCAGCTC TACAATGAGC TCAATCTAGG GCGAAGAGAG GAATATGACG TCTTGGAGAA GAAGCGGGCT CGGGATCCAG AGATGGGAGG CAAACAGCAG AGGAGGAGGA ACCCCCAGGA AGGCGTATAC AATGCACTGC AGAAAGACAA GATGCCAGAA GCCTACAGTG AGATCGGCAC AAAAGGCGAG AGGCGGAGAG GCAAGGCGCA CGATGGCCTT TACCAGGACA GCCACTTCCA AGCAGTGCAG TTCGGGAACA GAAGAGAGAG AGAAGGTTCA GAACTCACAA GGACCCTTGG GTTAAGAGCC CGCCCCAAAG GTGAAAGCAC CCAGCAGAGT AGCCAATCCT GTGCCAGCGT CTTCAGCATC CCCACTCTGT GGAGTCCATG GCCACCCAGT AGCAGCTCCC AGCTCTAA
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 1389 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: kettős
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
100
150
200
250
300
350 j
400
450 l
500 1
550 i
600 5
650 |
700 j
750 Ϊ
800 j
850 f
900 I
950 1
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1350
1400
1450
1500
1550 i1600
1650
1700
1728
HU 221 603 Bl
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATGAACCGGG GAGTCCCTTT TAGGCACTTG CTTCTGGTGC TGCAACTGGC 50 GCTCCTCCCA GCAGCCACTC AGGGAAACAA AGTGGTGCTG GGCAAAAAAG 100 GGGATACAGT GGAACTGACC TGTACAGCTT CCCAGAAGAA GAGCATACAA 150 TTCCACTGGA AAAACTCCAA CCAGATAAAG ATTCTGGGAA ATCAGGGCTC 200 CTTCTTAACT AAAGGTCCAT CCAAGCTGAA TGATCGCGCT GACTCAAGAA 250 GAAGCCTTTG GGACCAAGGA AACTTCCCCC TGATCATCAA GAATCTTAAG 300 ATAGAAGACT CAGATACTTA CATCTGTGAA GTGGAGGACC AGAAGGAGGA 350 GGTCCAATTC CTAGTCTTCC GATTGACTCC CAACTCTGAC ACCCACCTGC 400 TTCAGGGGCA GAGCCTGACC CTGACCTTGG AGAGCCCCCC TCGTAGTAGC 450 CCCTCAGTGC AATGTAGGAG TCCAAGGGGT AAAAACATAC AGGGGGGGAA 500 GACCCTCTCC GTGTCTCAGC TGGAGCTCCA GGATAGTGGC ACCTGGACAT 550 GCACTGTCTT GCAGAACCAG AAGAAGGTGG AGTTCAAAAT AGACATCGTG 600 GTGCTAGCTT TCCAGAAGGC CTCCAGCATA GTCTATAAGA AAGAGGGGGA 650 ACAGGTGGAG TTCTCCTTCC CACTCGCCTT TACAGTTGAA AAGCTGACGG 700 GCAGTGGCGA GCTGTGGTGG CAGGCGGAGA GGGCTTCCTC CTCCAAGTCT 750 TGGATCACCT TTGACCTGAA GAACAAGGAA GTGTCTGTAA AACGGGTTAC 800 CCAGGACCCT AAGCTCCAGA TGGGCAAGAA GCTCCCGCTC CACCTCACCC 850 TGCCCCAGGC CTTGCCTCAG TATGCTGGCT CTGGAAACCT CACCCTGGCC 900 CTTGAAGCGA AAACAGGAAA GTTGCATCAG GAAGTGAACC TGGTGGTGAT 950 GAGAGCCACT CAGCTCCAGA AAAATTTGAC CTGTGAGGTG TGGGGACCCA 1000 CCTCCCCTAA GCTGATGCTG AGCTTGAAAC TGGAGAACAA GGAGGCAAAG 1050 GTCTCGAAGC GGGAGAAGCC GGTGTGGGTG CTGAACCCTG AGGCGGGGAT 1100 GTGGCAGTGT CTGCTGAGTG ACTCGGGACA GGTCCTGCTG GAATCCAACA 1150 TCAAGGTTCT GCCCACATGG TCCACCCCGG TGCACGCGGA TCCGCAGCTC 1200 TGCTATATCC TGGATGCCAT CCTGTTTTTG TATGGTATTG TCCTTACCCT 1250 GCTCTACTGT CGACTCAAGA TCCAGGTCCG AAAGGCAGAC ATAGCCAGCC 1300 GTGAGAAATC AGATGCTGTC TACACGGGCC TGAACACCCG GAACCAGGAG 1350 ACATATGAGA CTCTGAAACA TGAGAAACCA CCCCAATAG 1389
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 1599 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: kettős
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATGAACCGGG GAGTCCCTTT TAGGCACTTG CTTCTGGTGC TGCAACTGGC 50
GCTCCTCCCA GCAGCCACTC AGGGAAACAA AGTGGTGCTG GGCAAAAAAG 100
GGGATACAGT GGAACTGACC TGTACAGCTT CCCAGAAGAA GAGCATACAA 150
TTCCACTGGA AAAACTCCAA CCAGATAAAG ATTCTGGGAA ATCAGGCCTC 200
CTTCTTAACT AAAGGTCCAT CCAAGCTGAA TGATCGCGCT GACTCAAGAA 250
GAAGCCTTTG GGACCAAGGA AACTTCCCCC TGATCATCAA GAATCTTAAG 300
ATAGAAGACT CAGATACTTA CATCTGTGAA GTGGAGGACC AGAAGGAGGA 350
GGTGCAATTG CTAGTGTTCG GATTGACTGC CAACTCTGAC ACCCACCTGC 400
TTCAGGGGCA GAGCCTGACC CTGACCTTGG AGAGCCCCCC TGGTAGTAGC 450
CCCTCAGTGC AATGTAGGAG TCCAAGGGGT AAAAACATAC AGGGGGGGAA 500
GACCCTCTCC GTGTCTCAGC TGGAGCTCCA GGATAGTGGC ACCTGGACAT 550
GCACTGTCTT GCAGAACCAG AAGAAGGTGG AGTTCAAAAT AGACATCGTG 600
GTGCTAGCTT TCCAGAAGGC CTCCAGCATA GTCTATAAGA AAGAGGGGGA 650
ACAGGTGGAG TTCTCCTTCC CACTCGCCTT TACAGTTGAA AAGCTGACGG 700
GCAGTGGCGA GCTGTGGTGG CAGGCGGAGA GGGCTTCCTC CTCCAAGTCT 750
TGGATCACCT TTGACCTGAA GAACAAGGAA GTGTCTGTAA AACGGGTTAC 800
CCAGGACCCT AAGCTCCAGA TGGGCAAGAA GCTCCCGCTC CACCTCACCC 850
TGCCCCAGGC CTTGCCTCAG TATGCTGGCT CTGGAAACCT CACCCTGGCC 900
CTTGAAGCGA AAACAGGAAA GTTGCATCAG GAAGTGAACC TGGTGGTGAT 950
CAGAGCCACT CAGCTCCAGA AAAATTTGAC CTGTGAGGTG TGCCGACCCA 1000 g
CCTCCCCTAA GCTGATGCTG AGCTTGAAAC TGGAGAACAA GGAGGCAAAG 1050
GTCTCGAAGC GGGAGAAGCC GGTGTGGGTG CTGAACCCTG AGGCGGGGAT 1100 r
GTGGCAGTGT CTGCTGAGTG ACTCGGGACA GGTCCTGCTG GAATCCAACA 1150
HU 221 603 Bl
TCAAGGTTCT GCCCACATGG TCCACCCCGG TGCACGCGGA TCCCAAACTC 1200 TGCTACCTGC TGGATGGAAT CCTCTTCATC TATGGTGTCA TTCTCACTGC 1250 CTTGTTCCTG AGAGTGAAGT TCAGCAGGAG CGCAGAGCCC CCCGCGTACC 1300 AGCAGGGCCA GAACCAGCTC TATAACGAGC TCAATCTAGG ACGAAGAGAG 1350 GAGTACGATG TTTTGGACAA GAGACGTGGC CGGGACCCTG AGATGGGGGG 1400 AAAGCCGAGA AGGAAGAACC CTCAGGAAGG CCTGTACAAT GAACTGCAGA 1450 AAGATAAGAT GGCGGAGGCC TACAGTGAGA TTGGGATGAA AGGCGAGCGC 1500 CGGAGGGGCA AGGGGCACGA TGGCCTTTAC CAGGGTCTCA GTACAGCCAC 1550 CAAGGACACC TACGACGCCC TTCACATGCA GGCCCTGCCC CCTCGCTAA 1599
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 575 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULÁTÍPUS: fehérje
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Val | Glu | Phe 195 | Lyu | Ile | Asp | Ile | Val 200 | Val | Leu | Al a | Phe | Gin 205 | Lys | Al a | Ser |
Ser | Ile 210 | Val | Tyr | Lys | Lys | Glu 215 | Gly | Glu | Gin | Val | Glu 220 | Phe | Ser | Phe | Pro |
Leu 225 | Al a | Phe | Thr | Val | Glu 230 | Lys | Leu | Thr | Gly | Ser 235 | Gly | Glu | Leu | Trp | Trp 240 |
Gin | Al a | Glu | Arg | Al a 245 | Ser | Ser | Ser | Lys | Ser 250 | Trp | Ile | Thr | Phe | Asp 255 | Leu |
Lys | Asn | Lys | Glu 260 | Val | Ser | Val | Lys | Arg 265 | Val | Thr | Gin | Asp | Pr o 270 | Lys | Leu |
Gin | Met | Gly 275 | Lys | Lys | Leu | Pro | Leu 280 | His | Leu | Thr | Leu | Pro 285 | Gin | Ala | Leu |
Pro | Gin 290 | Tyr | Ala | Gly | Ser | Gly 295 | Asn | Leu | Thr | Leu | Al a 300 | Leu | Glu | Al a | Lys |
Thr 305 | Gly | Lys | Leu | His | Gin 310 | Glu | Val | Asn | Leu | Val 315 | Val | Met | Arg | Al a | Thr 320 |
Gin | Leu | Gin | Lys | Asn 325 | Leu | Thr | Cys | Glu | Val 330 | Trp | Gly | Pro | Thr | Ser 335 | Pro |
Lys | Leu | Me t | Leu 340 | Ser | Leu | Lys | Leu | Glu 345 | Asn | Lys | Glu | Al a | Lys 350 | Val | Ser |
Lys | Arg | Glu 355 | Lys | Pro | Val | Trp | Val 360 | Leu | Asn | Pr o | Glu | Al a 365 | Gly | Met | Trp |
Gin | Cys 370 | Leu | Leu | Ser | Asp | Ser 375 | Gly | Gin | Val | Leu | Leu 380 | Glu | Ser | Asn | Ile |
Lys 385 | Val | Leu | Pro | Thr | Trp 390 | Ser | Thr | Pro | Val | Hi s 395 | Al a | Asp | Pro | Lys | Leu 400 |
Cys | Tyr | Leu | Leu | Asp 405 | Gly | Ile | Leu | Phe | Ile 410 | Tyr | Gly | Val | Ile | Ile 415 | Thr |
Al a | Leu | Tyr | Leu 420 | Arg | Al a | Lys | Phe | Ser 425 | Arg | Ser | Al a | Glu | Thr 430 | Al a | Al a |
Asn | Leu | Gin 435 | Asp | Pro | Asn | Gin | Leu 440 | Tyr | Asn | Glu | Leu | Asn 445 | Leu | Gly | Arg |
Arg | Glu 450 | Glu | Tyr | Asp | Val | Leu 455 | Glu | Lys | Lys | Arg | Al a 460 | Arg | Asp | Pro | Glu |
Me t 465 | Gly | Gly | Lys | Gin | Gin 470 | Arg | Arg | Arg | Asn | Pro 475 | Gin | Glu | Gly | Val | Tyr 480 |
Asn | Ala | Leu | Gin | Lys 485 | Asp | Lys | Me t | Pro | Glu 490 | Ala | Tyr | Ser | Glu | Ile 495 | Gly |
Thr | Lys | Gly | Glu 500 | Arg | Arg | Arg | Gly | Lys 505 | Gly | His | Asp | Gly | Leu 510 | Tyr | Gin |
Asp | Ser | His 515 | Phe | Gin | Ala | Val | Gin 520 | Phe | Gly | Asn | Arg | Arg 525 | Glu | Arg | Glu |
Gly | Se r 530 | Glu | Leu | Thr | Arg | Thr 535 | Leu | Gly | Leu | Arg | Al a 540 | Arg | Pro | Lys | Gly |
HU 221 603 Bl
Glu | Ser | Thr | Gin | Gin | Ser | Ser | Gin | Ser | Cys | Al a | Ser | Val | Phe | Ser | Ile |
555 | 550 | 565 | 560 | ||||||||||||
Pro | Thr | Leu | Trp | Se r | Pro | Trp | Pro | Pro | Ser | Se r | Ser | Ser | Gin | Leu | |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Met | Asn | Arg | Gly | Val | Pro | Phe | Arg | His | Leu | Leu | Leu | Val | Leu | Gin | Leu |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Al a | Leu | Leu | Pro | Al a | Al a | Thr | Gin | Gly | Asn | Lys | Val | Val | Leu | Gly | Lys |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Lys | Gly | Asp | Thr | Val | Glu | Leu | Thr | Cys | Thr | Al a | Ser | Gin | Lys | Lys | Ser |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ile | Gin | Phe | His | Trp | Lys | Asn | Ser | Asn | Gin | Ile | Lys | Ile | Leu | Gly | Asn |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Gin | Gly | Ser | Phe | Leu | Thr | Lys | Gly | Pro | Ser | Lys | Leu | Asn | Asp | Arg | Al a |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Asp | Ser | Arg | Arg | Ser | Leu | Trp | Asp | Gin | Gly | Asn | Phe | Pro | Leu | Ile | Ile |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Lys | Asn | Leu | Lys | Ile | Glu | Asp | Ser | Asp | Thr | Tyr | Ile | Cys | Glu | Val | Glu |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Asp | Gin | Lys | Glu | Glu | Val | Gin | Leu | Leu | Val | Phe | Gly | Leu | Thr | Al a | Asn |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ser | Asp | Thr | His | Leu | Leu | Gin | Gly | Gin | Ser | Leu | Thr | Leu | Thr | Leu | Glu |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ser | Pro | Pro | Gly | Ser | Ser | Pro | Ser | Val | Gin | Cys | Arg | Ser | Pro | Arg | Gly |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Lys | Asn | Ile | Gin | Gly | Gly | Lys | Thr | Leu | Ser | Val | Ser | Gin | Leu | Glu | Leu |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Gin | Asp | Ser | Gly | Thr | Trp | Thr | Cys | Thr | Val | Leu | Gin | Asn | Gin | Lys | Lys |
180 185 190 τ
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: j
HOSSZA: 462 aminosav |
TÍPUSA: aminosav I
TOPOLÓGIÁJA: lineáris | |||||||||||||||
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: | |||||||||||||||
Me t 1 | Asn | Arg | Gly | Val 5 | Pro | Phe | Arg | His | Leu 10 | Leu | Leu | Val | Leu | Gin 15 | Leu |
Al a | Leu | Leu | Pro 20 | Al a | Al a | Thr | Gin | Gly 25 | Asn | Lys | Val | Val | Leu 30 | Gly | Lys |
Lys | Gly | Asp 35 | Thr | Val | Glu | Leu | Thr 40 | Cys | Thr | Al a | Ser | Gin 45 | Lys | Lys | Ser |
Ile | Gin 50 | Phe | His | Trp | Lys | Asn 55 | Ser | Asn | Gin | Ile | Lys 60 | Ile | Leu | Gly | Asn |
Gin 65 | Gly | Ser | Phe | Leu | Thr 70 | Lys | Gly | Pro | Ser | Lys 75 | Leu | Asn | Asp | Arg | Alá 80 |
Asp | Ser | Arg | Arg | Ser 85 | Leu | Trp | Asp | Gin | Gly 90 | Asn | Phe | Pro | Leu | Ile 95 | Ile |
Lys | Asn | Leu | Lys 100 | Ile | Glu | Asp | Ser | Asp 105 | Thr | Tyr | Ile | Cys | Glu 110 | Val | Glu |
Asp | Gin | Lys 115 | Glu | Glu | Val | Gin | Leu 120 | Leu | Val | Phe | Gly | Leu 125 | Thr | Al a | Asn |
Ser | Asp 130 | Thr | His | Leu | Leu | Gin 135 | Gly | Gin | Ser | Leu | Thr 140 | Leu | Thr | Leu | Glu |
Ser 145 | Pro | Pro | Gly | Ser | Ser 150 | Pro | Ser | Val | Gin | Cys 155 | Arg | Ser | Pro | Arg | Gly 160 |
Lys | Asn | Ile | Gin | Gly 165 | Gly | Lys | Thr | Leu | Ser 170 | Val | Ser | Gin | Leu | Glu 175 | Leu |
Gin | Asp | Ser | Gly 180 | Thr | Trp | Thr | Cys | Thr 185 | Val | Leu | Gin | Asn | Gin 190 | Lys | Lys |
Val | Glu | Phe 195 | Lys | Ile | Asp | Ile | Val 200 | Val | Leu | Al a | Phe | Gin 205 | Lys | Alá | Ser |
HU 221 603 Β1
Ser | Ile 210 | Val | Tyr | Lys | Lys Glu 215 | Gly | Glu | Gin | Val | G1 u 220 | Phe | Ser | Phe | Pro | |
Leu | Alá | Phe | Thr | Val | Glu | Lys | Leu | Thr | Gly | Ser | Gly | Glu | Leu | Trp | Trp |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Gin | Al a | Glu | Arg | Al a | Ser | Ser | Ser | Lys | Ser | Trp | Ile | Thr | Phe | Asp | Leu |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Lys | Asn | Lys | Glu | Val | Ser | Val | Lys | Arg | Val | Thr | Gin | Asp | Pro | Lys | Leu |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Gin | Met | Gly | Lys | Lys | Leu | Pro | Leu | His | Leu | Thr | Leu | Pro | Gin | Al a | Leu |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Pro | Gin | Tyr | Al a | Gly | Ser | Gly | Asn | Leu | Thr | Leu | Al a | Leu | Glu | Al a | Lys |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Thr | Gly | Lys | Leu | Hi s | Gin | Glu | Val | Asn | Leu | Val | Val | Met | Arg | Al a | Thr |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Gin | Leu | Gin | Lys | Asn | Leu | Thr | Cys | Glu | Val | Trp | Gly | Pro | Thr | Ser | Pro |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Lys | Leu | Me t | Leu | Se r | Leu | Lys | Leu | Glu | Asn | Lys | Glu | Al a | Lys | Val | Ser |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Lys | Arg | Glu | Lys | Pro | Val | Trp | Val | Leu | Asn | Pro | Glu | Al a | Gly | Met | Trp |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Gin | Cys | Leu | Leu | Ser | Asp | Ser | Gly | Gin | Val | Leu | Leu | Glu | Ser | Asn | Ile |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Lys | Val | Leu | Pro | Thr | Trp | Ser | Thr | Pr o | Val | His | Al a | Asp | Pro | Gin | Leu |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Cys | Tyr | Ile | Leu | Asp | Al a | Ile | Leu | Phe | Leu | Tyr | Gly | Ile | Val | Leu | Thr |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Leu | Leu | Tyr | Cys | Arg | Leu | Lys | Ile | Gin | Val | Arg | Lys | Al a | Asp | I le | Al a |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ser | Arg | Glu | Lys | Ser | Asp | Al a | Val | Tyr | Thr | Gly | Leu | Asn | Thr | Arg | Asn |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Gin | Glu | Thr | Tyr | Glu | Thr | Leu | Lys | His | Glu | Lys | Pro | Pro | Gin | ||
450 | 455 | 460 | 462 |
A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 532 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Asn Arg Gly Val | Pro | Phe | Arg His | Leu 10 | Leu | Leu | Val | Leu | Gin 15 | Leu | |||||
1 | 5 | ||||||||||||||
Alá | Leu | Leu | Pro | Al a | Al a | Thr | Gin | Gly | Asn | Lys | Val | Val | Leu | Gly | Lys |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Lys | Gly | Asp | Thr | Val | Glu | Leu | Thr | Cys | Thr | Al a | Ser | Gin | Lys | Lys | Ser |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ile | Gin | Phe | His | Trp | Lys | Asn | Ser | Asn | Gin | Ile | Lys | Ile | Leu | Gly | Asn |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Gin | Gly | Ser | Phe | Leu | Thr | Lys | Gly | Pro | Ser | Lys | Leu | Asn | Asp | Arg | Alá |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Asp | Ser | Arg | Arg | Ser | Leu | Trp | Asp | Gin | Gly | Asn | Phe | Pro | Leu | Ile | Ile |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Lys | Asn | Leu | Lys | Ile | Glu | Asp | Ser | Asp | Thr | Tyr | Ile | Cys | Glu | Val | Glu |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Asp | Gin | Lys | Glu | Glu | Val | Gin | Leu | Leu | Val | Phe | Gly | Leu | Thr | Alá | Asn |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ser | Asp | Thr | Hi s | Leu | Leu | Gin | Gly | Gin | Ser | Leu | Thr | Leu | Thr | Leu | Glu |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ser | Pro | Pro | Gly | Ser | Ser | Pro | Ser | Val | Gin | Cys | Arg | Ser | Pro | Arg | Gly |
145 | 150 | 155 | 160 |
HU 221 603 Bl
Lys | Asn | Ile | Gin | Gly 165 | Gly | Lys | Thr | Leu | Ser 170 | Val | Ser | Gin | Leu | Glu 175 | Leu |
Gin | Asp | Ser | Gly 180 | Thr | Trp | Thr | Cys | Thr 185 | Val | Leu | Gin | Asn | Gin 190 | Lys | Lys |
Val | Glu | Phe 195 | Lys | Ile | Asp | Ile | Val 200 | Val | Leu | Al a | Phe | Gin 205 | Lys | Alá | Ser |
Ser | Ile 210 | Val | Tyr | Lys | Lys | Glu 215 | Gly | Glu | Gin | Val | Glu 220 | Phe | Ser | Phe | Pro |
Leu 225 | Al a | Phe | Thr | Val | Glu 230 | Lys | Leu | Thr | Gly | Ser 235 | Gly | Glu | Leu | Trp | Trp 240 |
Gin | Al a | Glu | Arg | Alá 245 | Ser | Ser | Ser | Lys | Ser 250 | Trp | Ile | Thr | Phe | Asp 255 | Leu |
Lys | Asn | Lys | Glu 260 | Val | Ser | Val | Lys | Arg 265 | Val | Thr | Gin | Asp | Pr o 270 | Lys | Leu |
Gin | Met | Gly 275 | Lys | Lys | Leu | Pro | Leu 280 | His | Leu | Thr | Leu | Pro 285 | Gin | Al a | Leu |
Pro | Gin 290 | Tyr | Al a | Gly | Ser | Gly 295 | Asn | Leu | Thr | Leu | Al a 300 | Leu | Glu | Alá | Lys |
Thr 305 | Gly | Lys | Leu | His | Gin 310 | Glu | Val | Asn | Leu | Val 315 | Val | Me t | Arg | Al a | Thr 320 |
Gin | Leu | Gin | Lys | Asn 325 | Leu | Thr | Cys | Glu | Val 330 | Trp | Gly | Pro | Thr | Ser 335 | Pro |
Lys | Leu | Met | Leu 340 | Se r | Leu | Lys | Leu | Glu 345 | Asn | Lys | Glu | Al a | Lys 350 | Val | Ser |
Lys | Arg | Glu 355 | Lys | Pro | Val | Trp | Val 360 | Leu | Asn | Pro | Glu | Al a 365 | Gly | Met | Trp |
Gin | Cys 370 | Leu | Leu | Ser | Asp | Ser 375 | Gly | Gin | Val | Leu | Leu 380 | Glu | Ser | Asn | Ile |
Lys 385 | Val | Leu | Pro | Thr | Trp 390 | Ser | Thr | Pr o | Val | His 395 | Al a | Asp | Pro | Lys | Leu 400 |
Cys | Tyr | Leu | Leu | Asp 405 | Gly | Ile | Leu | Phe | Ile 410 | Tyr | Gly | Val | Ile | Leu 415 | Thr |
Al a | Leu | Phe | Leu 420 | Arg | Val | Lys | Phe | Ser 425 | Arg | Ser | Al a | Glu | Pro 430 | Pro | Al a |
Tyr | Gin | Gin 435 | Gly | Gin | Asn | Gin | Leu 440 | Tyr | Asn | Glu | Leu | Asn 445 | Leu | Gly | Arg |
Arg | Glu 450 | Glu | Tyr | Asp | Val | Leu 455 | Asp | Lys | Arg | Arg | Gly 460 | Arg | Asp | Pro | Glu |
Met 465 | Gly | Gly | Lys | Pro | Arg 470 | Arg | Lys | Asn | Pro | Gin 475 | Glu | Gly | Leu | Tyr | Asn 480 |
Glu | Leu | Gin | Lys | Asp 485 | Lye | Me t | Al a | Glu | Al a 490 | Tyr | Ser | Glu | Ile | Gly 495 | Met |
Lys | Gly | Glu | Arg 500 | Arg | Arg | Gly | Lys | Gly 505 | His | Asp | Gly | Leu | Tyr 510 | Gin | Gly |
Leu Leu | Ser Pro | Thr 515 Pro | Al a Arg | Thr | Lys | Asp | Thr 520 | Tyr | Asp | Alá | Leu | His 525 | Me t | Gin | Al a |
530
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: +
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 33 bázis TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: egy TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: ]
CGCGGGGTGA CCGTGCCCTC CAGCAGCTTG GGC 33
A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: Ϊ
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: h
HOSSZA: 50bázis
HU 221 603 Bl
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCGGGGATC CGTCGTCCAG AGCCCGTCCA GCTCCCCGTC A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 33 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCGGGCGGC CGCGACGCCG GCCAAGACAG CAC A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI :
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 33 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: CGCGTTGACG AGCAGCCAGT TGGGCAGCAG CAG All. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 15 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
All. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: CGCGGGCGGC CGCTA
A12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 42 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCGGGCTCG TTATAGAGCT GGTTCTGGCG CTGCTTCTTC
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 48 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCGGGGAGC TCGTTATAGA GCTGGTTTGC GGCCGAATTC
A 14. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 33 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A.,14. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCGGGGCGG CCACGCGTCC TCGCCAGCAC AGA
CTGGGCCTCA 50
TG 42
TTATCCCG 48 }b h
HU 221 603 BI
A 15. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 36 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 15. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCGGGACGC GTTTCAGCCG TCCTCGCCAG CACACA 36
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 33 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCGGGACGC GTGACCCTGA GATGGGGGGA AAG 33
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 33 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCGGGACGC GTATTGGGAT GAAAGGCGAG CGC 33
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 26 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CCCGGATCCC AGCATGGGCA GCTCTT 26
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 42 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGCGGGGCGG CCGCTTTAGT TATTACTGTT GACATGGTCG TT 42
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 40 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GCGGGGGGAT CCCACTGTCC AAGCTCCCAG CTCTTCACCG 40
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 32bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
HU 221 603 Β1
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: GCGGGGGCGG CCGCCTAAAT ACGGTTCTGG TC A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 31 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: TCAGAAAGAG ACAACCTGAA GAAACCAACA A A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 31 bázis
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: TTGTTGGTTT CTTCAGGTTG TGTCTTTCTG A A 24. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 171 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: aminosav
A 24. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: Met Glu His Ser Thr Phe Leu Ser Gly
Ser Gin Val Ser Pro Phe Lys Ile Pro 20 25
Val Phe Val Asn Cys Asn Thr Ser Ile 35 40
Gly Thr Leu Leu Ser Asp Ile Thr Arg 50 55
Leu Asp Pro Arg Gly Ile Tyr Arg Cys 65 70
Asp Lys Glu Ser Thr Val Gin Val His 85
Val Glu Leu Asp Pro Alá Thr Val Alá 100 105
Alá Ile Thr Leu Leu Leu Alá Leu Gly 115 120
Glu Thr Gly Arg Leu Ser Gly Alá Alá 130 135
Asn Asp Gin Val Tyr Gin Pro Leu Arg
145 150
Ser His Leu Gly Gly Asn Trp Alá Arg
165
A 25. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 182 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: aminosav
A 25. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Glu Gin Gly Lys Gly Leu Alá Val
Val | Leu | Alá | Thr | Leu 15 | Leu |
Glu | Glu | Leu | Glu 30 | Asp | Arg |
Trp | Val | Glu 45 | Gly | Thr | Val |
Asp | Leu 60 | Gly | Lys | Arg | Ile |
Gly 75 | Thr | Asp | Ile | Tyr | Lys 80 |
Arg | Me t | Cys | Gin | Ser 95 | Cys |
Ile | Ile | Val | Thr 110 | Asp | Val |
Phe | Cys | Phe 125 | Al a | Gly | Hi s |
Thr | Gin 140 | Al a | Leu | Leu | Arg |
Arg 155 Lys | Asp | Asp | Al a | Gin | Tyr 160 |
Ile Leu Alá Ile Ile Leu 15
HU 221 603 Bl
Leu Gin Gly Thr Leu | Al a | Gin Ser | Ile 25 | Lys Gly Asn Hi s | Leu 30 | Val | Lys | ||||||||
20 | |||||||||||||||
Val | Tyr | Asp | Tyr | Gin | Glu | Asp | Gly | Ser | Val | Leu | Leu | Thr | Cys | Asp | Al a |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Glu | Al a | Lys | Asn | Ile | Thr | Trp | Phe | Lys | Asp | Gly | Lys | Me t | Ile | Gly | Phe |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Leu | Thr | Glu | Asp | Lys | Lys | Lys | Trp | Asn | Leu | Gly | Ser | Asn | Al a | Lys | Asp |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Pro | Arg | Gly | Met | Tyr | Gin | Cys | Lys | Gly | Ser | Gin | Asn | Lys | Ser | Lys | Pro |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Leu | Gin | Val | Tyr | Tyr | Arg | Met | Cys | Gin | Asn | Cys | Ile | Glu | Leu | Asn | Al a |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Al a | Thr | Ile | Ser | Gly | Phe | Leu | Phe | Al a | Glu | Ile | Val | Ser | Ile | Phe | Val |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Leu | Al a | Val | Gly | Val | Tyr | Phe | Ile | Al a | Gly | Gin | Asp | Gly | Val | Arg | Gin |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ser | Arg | Al a | Ser | Asp | Lys | Gin | Thr | Leu | Leu | Pro | Asn | Asp | Gin | Leu | Tyr |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Gin | Pro | Leu | Lys | Asp | Arg | Glu | Asp | Asp | Gin | Tyr | Ser | Hi s | Leu | Gin | Gly |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Asn | Gin | Leu | Arg | Arg | Asn |
180
A 26. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 220 aminosav TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: | lineáris |
MOLEKULATÍPUS: aminosav A 26. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: Met Pro Gly Gly Leu Glu Ala Leu Arg Ala Leu Pro Leu Leu Leu Phe | |
Leu Ser Tyr | 5 10 15 Ala Cys Leu Gly Pro Gly Cys Gin Ala Leu Arg Val Glu |
Gly Gly Pro | 20 25 30 Pro Ser Leu Thr Val Asn Leu Gly Glu Glu Ala Arg Leu |
35 Thr Cys Glu | 40 45 Asn Asn Gly Arg Asn Pro Asn Ile Thr Trp Trp Phe Ser |
50 Leu Gin Ser | 55 60 Asn Ile Thr Trp Pro Pro Val Pro Leu Gly Pro Gly Gin |
65 Gly Thr Thr | 70 75 80 Gly Gin Leu Phe Phe Pro Glu Val Asn Lys Asn Thr Gly |
Ala Cys Thr | 85 90 95 Gly Cys Gin Val Ile Glu Asn Asn Ile Leu Lys Arg Ser |
Cys Gly Thr | 100 105 110 Tyr Leu Arg Val Arg Asn Pro Val Pro Arg Pro Phe Leu |
115 Asp Met Gly | 120 125 Glu Gly Thr Lys Asn Arg Ile Ile Thr Ala Glu Gly Ile |
130 Ile Leu Leu | 135 140 Phe Cys Ala Val Val Pro Gly Thr Leu Leu Leu Phe Arg |
145 Lys Arg Trp | 150 155 160 Gin Asn Glu Lys Phe Gly Val Asp Met Pro Asp Asp Tyr |
Glu Asp Glu | 165 170 175 Asn Leu Tyr Glu Gly Leu Asn Leu Asp Asp Cys Ser Met |
Tyr Glu Asp | 180 185 190 Ile Ser Arg Gly Leu Gin Gly Thr Tyr Gin Asp Val Gly |
195 200 205 Asn Leu His Ile Gly Asp Ala Gin Leu Glu Lys Pro 210 215 220 A 27. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: |
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: p
HOSSZA: 228 aminosav
HU 221 603 Bl
TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: aminosav
Met Alá Thr | Leu | Val 5 | Leu Ser | Ser | Met | Pro 10 | Cya | His | Trp | Leu | Leu 15 | Phe | |||
Leu | Leu | Leu | Leu | Phe | Ser | Gly | Glu | Pro | Val | Pro | Al a | Met | Thr | Ser | Ser |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Asp | Leu | Pro | Leu | Asn | Phe | Gin | Gly | Ser | Pr o | Cys | Ser | Gin | Ile | Trp | Gin |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
His | Pro | Arg | Phe | Al a | Al a | Lys | Lys | Arg | Ser | Ser | Met | Val | Lys | Phe | His |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Cys | Tyr | Thr | Asn | His | Ser | Gly | Alá | Leu | Thr | Trp | Phe | Arg | Lys | Arg | Gly |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Ser | Gin | Gin | Pro | Gin | Glu | Leu | Val | Ser | Glu | Glu | Gly | Arg | Ile | Val | Gin |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Thr | Gin | Asn | Gly | Ser | Val | Tyr | Thr | Leu | Thr | Ile | Gin | Asn | Ile | Gin | Tyr |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Glu | Asp | Asn | Gly | Ile | Tyr | Phe | Cys | Lys | Gin | Lys | Cys | Asp | Ser | Al a | Asn |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
His | Asn | Val | Thr | Asp | Ser | Cys | Gly | Thr | Glu | Leu | Leu | Val | Leu | Gly | Phe |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Se r | Thr | Leu | Asp | Gin | Leu | Lys | Arg | Arg | Asn | Thr | Leu | Lys | Asp | Gly | Ile |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Ile | Leu | Ile | Gin | Thr | Leu | Leu | Ile | Ile | Leu | Phe | Ile | Ile | Val | Pro | Ile |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Phe | Leu | Leu | Leu | Asp | Lys | Asp | Asp | Gly | Lys | Al a | Gly | Met | Glu | Glu | Asp |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Hi s | Thr | Tyr | Glu | Gly | Leu | Asn | Ile | Asp | Gin | Thr | Al a | Thr | Tyr | Glu | Asp |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Ile | Val | Thr | Leu | Arg | Thr | Gly | Glu | Val | Lys | Trp | Ser | Val | Gly | Glu | His |
210 215 220
Pro Gly Gin Glu 225
A 28. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 1304
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 28. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GCCTGTTTGA GAAGCAGCGG GCAAGAAAGA CGCAAGCCCA GAGGCCCTGC 50 CATTTCTGTG GGCTCAGGTC CCTACTGGCT CAGGCCCCTG CCTCCCTCGG 100 CAAGGCCACA ATCAACCGCC GAGTCCCTTT TAGGCACTTG CTTCTGGTGC 150 TGCAACTGGC GCTCCTCCCA GCAGCCACTC AGGGAAACAA AGTGGTGCTG 200 GGCAAAAAAG GGGATACAGT GGAACTGACC TGTACAGCTT CCCAGAAGAA 250 GAGCATACAA TTCCACTGGA AAAACTCCAA CCAGATAAAG ATTCTGGGAA 300 ATCAGGGCTC CTTCTTAACT AAAGGTCCAT CCAAGCTGAA TGATCGCGCT 350 GACTCAAGAA GAAGCCTTTG GGACCAAGGA AACTTCCCCC TGATCATCAA 400 GAATCTTAAG ATAGAAGACT CAGATACTTA CATCTGTGAA GTGGAGGACC 450 AGAAGGAGGA GGTGCAATTG CTAGTGTTCG GATTGACTGC CAACTCTGAC 500 ACCCACCTGC TTCAGCGGCA GAGCCTGACC CTGACCTTGG AGAGCCCCCC 550 TGGTAGTAGC CCCTCAGTGC AATGTAGGAG TCCAAGGGGT AAAAACATAC 600 AGCCCGCGAA GACCCTCTCC GTGTCTCAGC TGGAGCTCCA GGATAGTGGC 650 ACCTGGACAT GCACTGTCTT GCAGAACCAG AAGAAGGTGG AGTTCAAAAT 700 AGACATCGTG GTGCTAGCTT TCCAGAAGGC CTCCAGCATA GTCTATAAGA 750 AAGAGGGGGA ACAGGTGGAG TTCTCCTTCC CACTCGCCTT TACAGTTGAA 800 AAGCTGACGG GCAGTGGCGA GCTGTGGTGG CAGGCGGAGA GGGCTTCCTC 850 CTCCAAGTCT TGGATCACCT TTGACCTGAA GAACAAGGAA GTGTCTGTAA 900 AACGGGTTAC CCAGGACCCT AAGCTCCAGA TGGGCAAGAA GCTCCCGCTC 950
HU 221 603 Bl
CACCTCACCC TGCCCCAGGC CTTGCCTCAG TATGCTGGCT CTGGAAACCT CACCCTGGCC CTTGAAGCGA AAACAGGAAA GTTGCATCAG GAAGTGAACC TCCTOGTGAT CAGACCCACT CAGCTCCAGA AAAATTTGAC CTGTGAGGTG TGGGGACCCA CCTCCCCTAA GCTGATGCTG AGCTTGAAAC TGGAGAACAA GGAGGCAAAG GTCTCGAAGC GGGAGAAGCC GGTGTGGGTG CTGAACCCTG AGGCGGGGAT GTGGCAGTGT CTGCTGAGTG ACTCGGGACA GGTCCTGCTG GAATCCAACA TCAAGGTTCT GCCCACATGG TCCACCCCGG TGCACGCGGA TCCC
A 29. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 398
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: aminosav
A 29. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1304
Met | Asn | Arg | Gly | Val | Pro | Phe | Arg |
Al a | Leu | Leu | Pro 20 | j Al a | Al a | Thr | Gin |
Lys | Gly | Asp 35 | Thr | Val | Glu | Leu | Thr 40 |
lle | Gin 50 | Phe | His | Trp | Lys | Asn 55 | Ser |
Gin 65 | Gly | Ser | Phe | Leu | Thr 70 | Lys | Gly |
Asp | Ser | Arg | Arg | Ser 85 | Leu | Trp | Asp |
Lys | Asn | Leu | Lys 100 | lle | Glu | Asp | Ser |
Asp | Gin | Lys 115 | Glu | Glu | Val | Gin | Leu 120 |
Ser | Asp 130 | Thr | His | Leu | Leu | Gin 135 | Gly |
Ser 145 | Pro | Pro | Gly | Ser | Ser 150 | Pro | Ser |
Lys | Asn | lle | Gin | Gly 165 | Gly | Lys | Thr |
Gin | Asp | Ser | Gly 180 | Thr | Trp | Thr | Cys |
Val | Glu | Phe 195 | Lys | lle | Asp | lle | Val 200 |
Ser | lle 210 | Val | Tyr | Lys | Lys | Glu 215 | Gly |
Leu 225 | Alá | Phe | Thr | Val | Glu 230 | Lys | Leu |
Gin | Al a | Glu | Arg | Al a 245 | Ser | Ser | Ser |
Lys | Asn | Lys | Glu 260 | Val | Ser | Val | Lys |
Gin | Met | Gly 275 | Lys | Lys | Leu | Pro | Leu 280 |
Pro | Gin 290 | Tyr | Al a | Gly | Ser | Gly 295 | Asn |
Thr 305 | Gly | Lys | Leu | Hi s | Gin 310 | Glu | Val |
Gin | Leu | Gin | Lye | Asn 325 | Leu | Thr | Cys |
Lys | Leu | Me t | Leu | Se r | Leu | Lys | Leu |
340
His | Leu 10 | Leu | Leu | Val | Leu | Gin 15 | Leu |
Gly 25 | Asn | Lys | Val | Val | Leu 30 | Gly | Lys |
Cys | Thr | Al a | Ser | Gin 45 | Lys | Lys | Ser |
Asn | Gin | lle | Lys 60 | lle | Leu | Gly | Asn |
Pro | Ser | Lys 75 | Leu | Asn | Asp | Arg | Alá 80 |
Gin | Gly 90 | Asn | Phe | Pro | Leu | lle 95 | lle |
Asp 105 | Thr | Tyr | lle | Cys | Glu 110 | Val | Glu |
Leu | Val | Phe | Gly | Leu 125 | Thr | Alá | Asn |
Gin | Ser | Leu | Thr 140 | Leu | Thr | Leu | Glu |
Val | Gin | Cys 155 | Arg | Ser | Pro | Arg | Gly 160 |
Leu | Ser 170 | Val | Ser | Gin | Leu | Glu 175 | Leu |
Thr 185 | Val | Leu | Gin | Asn | Gin 190 | Lys | Lys |
Val | Leu | Al a | Phe | Gin 205 | Lys | Al a | Ser |
Glu | Gin | Val | Glu 220 | Phe | Ser | Phe | Pro |
Thr | Gly | Ser 235 | Gly | Glu | Leu | Trp | Trp 240 |
Lys | Ser 250 | Trp | lle | Thr | Phe | Asp 255 | Leu |
Arg 265 | Val | Thr | Gin | Asp | Pro 270 | Lys | Leu |
His | Leu | Thr | Leu | Pro 285 | Gin | Al a | Leu |
Leu | Thr | Leu | Alá 300 | Leu | Glu | Al a | Lys |
Asn | Leu | Val 315 | Val | Met | Arg | Al a | Thr 320 |
Glu | Val 330 | Trp | Gly | Pro | Thr | Ser 335 | Pro |
Glu 345 | Asn | Lys | Glu | Al a | Lys 350 | Val | Ser |
fa
HU 221 603 Bl
Lys Arg Glu Lys | Pro Val | Trp | Val 360 | Leu | Asn | Pro | Glu Alá Gly 365 | Me t | Trp | ||||||
355 | |||||||||||||||
Gin | Cys | Leu | Leu | Ser | Asp | Ser | Gly | Gin | Val | Leu | Leu | Glu | Ser | Asn | Ile |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Lys | Val | Leu | Pro | Thr | Trp | Ser | Thr | Pro | Val | Hi s | Al a | Asp | Pro | ||
385 | 390 | 395 |
A 30. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 719
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 30. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GCCTGTTTGA GAAGCAGCGG GCAAGAAAGA CGCAAGCCCA GAGGCCCTGC CATTTCTGTG GGCTCAGGTC CCTACTGGCT CAGGCCCCTG CCTCCCTCGG CAAGGCCACA ATGAACCGGG GAGTCCCTTT TAGGCACTTG CTTCTGGTGC TGCAACTGGC GCTCCTCCCA GCAGCCACTC AGGGAAACAA AGTGGTGCTG GGCAAAAAAG GCGATACAGT GGAACTGACC TGTACAGCTT CCCAGAAGAA GAGCATACAA TTCCACTGGA AAAACTCCAA CCAGATAAAG ATTCTGGGAA ATCAGGGCTC CTTCTTAACT AAAGGTCCAT CCAAGCTGAA TGATCGCGCT GACTCAAGAA GAAGCCTTTG GGACCAAGGA AACTTCCCCC TGATCATCAA GAATCTTAAG ATAGAAGACT CAGATACTTA CATCTGTGAA GTGGAGGACC AGAAGGAGGA GGTGCAATTG CTAGTGTTCG GATTGACTGC CAACTCTGAC ACCCACCTGC TTCAGGGGCA GAGCCTGACC CTGACCTTGG AGAGCCCCCC TGGTAGTAGC CCCTCAGTGC AATGTAGGAG TCCAAGGGGT AAAAACATAC AGGGGGGGAA GACCCTCTCC GTGTCTCAGC TGGAGCTCCA GGATAGTGGC ACCTGGACAT GCACTGTCTT GCAGAACCAG AAGAAGGTGG AGTTCAAAAT AGACATCGTG GTGCTAGCT
A 31. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 203
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS : aminosav
A 31. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met | Asn | Arg | Gly |
Al a | Leu | Leu | Pro 20 |
Lys | Gly | Asp 35 | Thr |
Ile | Gin 50 | Phe | His |
Gin 65 | Gly | Ser | Phe |
Asp | Ser | Arg | Arg |
Lys | Asn | Leu | Lys 100 |
Asp | Gin | Lys 115 | Glu |
Ser | Asp 130 | Thr | His |
Ser 145 | Pro | Pro | Gly |
Lys | Asn | Ile | Gin |
Val 5 | Pro | Phe | Arg |
Al a | Alá | Thr | Gin |
Val | Glu | Leu | Thr 40 |
Trp | Lys | Asn 55 | Ser |
Leu | Thr 70 | Lys | Gly |
Ser 85 | Leu | Trp | Asp |
Ile | Glu | Asp | Ser |
Glu | Val | Gin | Leu 120 |
Leu | Leu | Gin 135 | Gly |
Se r | Ser 150 | Pro | Ser |
Gly 165 | Gly | Lys | Thr |
His | Leu 10 | Leu | Leu |
Gly 25 | Asn | Lys | Val |
Cys | Thr | Al a | Ser |
Asn | Gin | Ile | Lys 60 |
Pro | Ser | Lys 75 | Leu |
Gin | Gly 90 | Asn | Phe |
Asp 105 | Thr | Tyr | Ile |
Leu | Val | Phe | Gly |
Gin | Ser | Leu | Thr 140 |
Val | Gin | Cys 155 | Arg |
Leu | Ser 170 | Val | Ser |
Val | Leu | Gin 15 | Leu |
Val | Leu 30 | Gly | Lys |
Gin | Lys | Lys | Ser |
45 | |||
Ile | Leu | Gly | Asn |
Asn | Asp | Arg | Alá 80 |
Pro | Leu | Ile 95 | Ile |
Cys | Glu 110 | Val | Glu |
Leu | Thr | Al a | Asn |
125 | |||
Leu | Thr | Leu | Glu |
Ser | Pro | Arg | Gly 160 |
Gin | Leu | Glu 175 | Leu |
100
150
200
250
300
350
400
450
500
550 í
600 I
650 i
700 ΐ
719 i
HU 221 603 BI
Gin Asp Ser Gly | Thr Trp Thr Cys | Thr 185 | Val | Leu Gin | Asn Gin Lys Lys 190 | |
180 | ||||||
Val | Glu Phe Lys | Ile Asp Ile Val | Val | Leu | Alá | |
195 | 200 | |||||
A 32. | AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: |
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 768
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 32. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GCTAGCAGAG CCCAAATCTT GTGACAAAAC TCACACATGC CCACCGTGCC 50 CAGCACCTGA ACTCCTGGGG GGACCGTCAG TCTTCCTCTT CCCCCCAAAA 100 CCCAAGGACA CCCTCATGAT CTCCCGGACC CCTGAGGTCA CATGCGTGGT 150 GGTGGACGTG AGCCACGAAG ACCCTGAGGT CAAGTTCAAC TGGTACGTGG 200 ACGGCGTGGA GGTGCATAAT GCCAAGACAA AGCCGCGGGA GGAGCAGTAC 250 AACAGCACGT ACCGGGTGGT CAGCGTCCTC ACCGTCCTGC ACCAGGACTG 300 GCTGAATGGC AAGGAGTACA AGTGCAAGGT CTCCAACAAA GCCCTCCCAG 350 CCCCCATCGA GAAAACCATC TCCAAAGCCA AAGGGCAGCC CCGAGAACCA 400 CAGGTGTACA CCCTGCCCCC ATCCCGGGAT GAGCTGACCA AGAACCAGGT 450 CAGCCTGACC TGCCTGGTCA AAGGCTTCTA TCCCAGCGAC ATCGCCGTGG 500 AGTGGGAGAG CAATGGGCAG CCGGAGAACA ACTACAAGAC CACGCCTCCC 550 GTGCTGGACT CCGACGGCTC CTTCTTCCTC TACAGCAAGC TCACCGTGGA 600 CAAGAGCAGG TGGCAGCAGG GGAACGTCTT CTCATGCTCC GTGATGCATG 650 AGGCTCTGCA CAACCACTAC ACGCAGAAGA GCCTCTCCCT GTCTCCGGGG 700 CTGCAACTGG ACGAGACCTG TGCTGAGGCC CAGGACGGGG AGCTGGACGG 750 GCTCTGGACG ACGGATCC 768
A 33. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 254
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: aminosav
A 33. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Glu 1 | Pro | Lys | Ser | Cys Asp Lys 5 | Thr | His | Thr 10 | Cys | Pro | Pro | Cys | Pro 15 | Al a | ||
Pro | Glu | Leu | Leu | Gly | Gly | Pro | Ser | Val | Phe | Leu | Phe | Pro | Pro | Lys | Pro |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Lys | Asp | Thr | Leu | Met | Ile | Ser | Arg | Thr | Pro | Glu | Val | Thr | Cys | Val | Val |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Val | Asp | Val | Ser | Hi s | Glu | Asp | Pro | Glu | Val | Lys | Phe | Asn | Trp | Tyr | Val |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Asp | Gly | Val | Glu | Val | His | Asn | Alá | Lys | Thr | Lys | Pro | Arg | Glu | Glu | Gin |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Tyr | Asn | Ser | Thr | Tyr | Arg | Val | Val | Ser | Val | Leu | Thr | Val | Leu | His | Gin |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Asp | Trp | Leu | Asn | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys | Cys | Lys | Val | Ser | Asn | Lys | Alá |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Leu | Pro | Alá | Pro | Ile | Glu | Lys | Thr | Ile | Ser | Lys | Al a | Lys | Gly | Gin | Pro |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Arg | Glu | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr | Leu | Pro | Pro | Ser | Arg | Asp | Glu | Leu | Thr |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Lys | Asn | Gin | Val | Ser | Leu | Thr | Cys | Leu | Val | Lys | Gly | Phe | Tyr | Pro | Ser |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Asp | Ile | Alá | Val | Glu | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly | Gin | Pro | Glu | Asn | Asn | Tyr |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Lys | Thr | Thr | Pro | Pro | Val | Leu | Asp | Ser | Asp | Gly | Ser | Phe | Phe | Leu | Tyr |
180 | 185 | 190 |
HU 221 603 Β1
Ser | Lys | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Se r | Arg | Trp | Gin | Gin | Gly | Asn | Val | Phe |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Ser | Cys | Ser | Val | Met | His | Glu | Al a | Leu | His | Asn | His | Tyr | Thr | Gin | Lys |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Leu | Gin | Leu | Asp | Glu | Thr | Cys | Al a | Glu |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Al a | Gin | Asp | Gly | Glu | Leu | Asp | Gly | Leu | Trp | Thr | Thr | Asp | Pro | ||
245 | 250 | ||||||||||||||
A 34. | AZONOSÍT | Ó SZÁMÚ SZEKVENCIA ADA | TAI: |
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 174
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 34. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CCAAGGGCCT CTGCCCTCCC TGCCCCACCG ACAGGCTCCG CCCTCCCTGA 50 CCCGCAGACA GCCTCTGCCC TCCCTGACCC GCCAGCAGCC TCTGCCCTCC 100 CTGCGGCCCT GGCGGTGATC TCCTTCCTCC TCGGGCTGGG CCTGGGGGTG 150 GCGTGTGTGC TGGCGAGGAC GCGT 174
A 35. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 58 bázis
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: aminosav
A 35. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Pro Arg Alá Ser Alá Leu Pro Alá Pro Pro Thr Gly Ser Alá Leu Pro 15 10 15
Asp Pro Gin Thr Alá Ser Alá Leu Pro Asp Pro Pro Alá Alá Ser Alá
25 30
Leu Pro Alá Alá Leu Alá Val Ile Ser Phe Leu Leu Gly Leu Gly Leu
40 45
Gly Val Alá Cys Val Leu Alá Arg Thr Arg
55
A 36. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 345
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: nukleinsav
A 36. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ACGCGTTTCA GCAGGAGCGC AGAGCCCCCC GCGTACCAGC AGGGCCAGAA 50 CCAGCTCTAT AACGAGCTCA ATCTAGGACG AAGAGAGGAG TACGATGTTT 100 TGGACAAGAG ACGTGGCCGG GACCCTGAGA TGGGGGGAAA GCCGAGAAGG 150 AAGAACCCTC AGGAAGGCCT GTACAATGAA CTGCAGAAAG ATAAGATGGC 200 GGAGGCCTAC AGTGAGATTG GGATGAAAGG CGAGCGCCGG AGGGGCAAGG 250 GGCACGATGG CCTTTACCAG GGTCTCAGTA CAGCCACCAA GGACACCTAC 300 GACGCCCTTC ACATGCAGGC CCTGCCCCCT CGCTAAAGCG GCCGC 345
A 37. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 111
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: aminosav
A 37. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Thr Arg Phe Ser Arg Ser Alá Glu Pro Pro Alá Tyr Gin Gin Gly Gin 15 10 15
HU 221 603 Bl
Asn | Gin | Leu | Tyr | Asn | Glu | Leu | Asn | Leu | Gly | Arg | Arg | Glu | Glu | Tyr | Asp |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Val | Leu | Asp | Lys | Arg | Arg | Gly | Arg | Asp | Pro | Glu | Met | Gly | Gly | Lys | Pro |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Arg | Arg | Lys | Asn | Pro | Gin | Glu | Gly | Leu | Tyr | Asn | Glu | Leu | Gin | Lys | Asp |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Lys | Met | Al a | Glu | Alá | Tyr | Ser | Glu | lle | Gly | Me t | Lys | G1 y | Glu | Arg | Arg |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Arg | Gly | Lys | Gly | His | Asp | Gly | Leu | Tyr | Gin | Gly | Leu | Ser | Thr | Al a | Thr |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Lys | Asp | Thr | Tyr | Asp | Al a | Leu | Hi s | Me t | Gin | Al a | Leu | Pro | Pro | Arg | |
100 | 105 | 110 |
A 38. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 16 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 38. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Gin Ser Phe Gly Leu Leu Asp Pro Lys Leu Cys Tyr Leu Leu Asp Gly 1 5 10 15
A 39. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 19 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 39. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Pro Thr Trp Ser Thr Pro Val His Alá Asp Pro Lys Leu Cys Tyr Leu 15 10 15
Leu Asp Gly
A 40. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 12 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 40. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Leu Gly Glu Pro Gin Leu Cys Tyr lle Leu Asp Alá 1 5 10
A 41. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 19 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 41. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Pro Thr Trp Ser Thr Pro Val His Alá Asp Pro Gin Leu Cys Tyr lle 15 10 15
Leu Asp Alá
A 42. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 16 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ : nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
HU 221 603 Bl
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 42. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Gin Ser Phe Gly Leu Leu Asp Pro Lys Leu Cys Tyr 1 5 10
A 43. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 16 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 43. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Phe Ser Pro Pro Gly Alá Asp Pro Lys Leu Cys Tyr 1 5 10
A 44. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 142 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 44. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Leu Leu Asp Gly 15
Leu Leu Asp Gly 15
Gin | Ser | Phe | Gly | Leu | Leu | Asp | Pr o | Lys | Leu | Cys | Tyr | Leu | Leu | Asp | Gly |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Ile | Leu | Phe | Ile | Tyr | Gly | Val | Ile | Leu | Thr | Alá | Leu | Phe | Leu | Arg | Val |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Lys | Phe | Ser | Arg | Ser | Al a | Glu | Pro | Pro | Al a | Tyr | Gin | Gin | Gly | Gin | Asn |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Gin | Leu | Tyr | Asn | Glu | Leu | Asn | Leu | Gly | Arg | Arg | Glu | Glu | Tyr | Asp | Val |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Leu | Asp | Lys | Arg | Arg | Gly | Arg | Asp | Pro | Glu | Met | Gly | Gly | Lys | Pro | Arg |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Arg | Lys | Asn | Pro | Gin | Glu | Gly | Leu | Tyr | Asn | Glu | Leu | Gin | Lys | Asp | Lys |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Met | Alá | Glu | Alá | Tyr | Ser | Glu | Ile | Gly | Me t | Lye | Gly | Glu | Arg | Arg | Arg |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Gly | Lys | Gly | His | Asp | Gly | Leu | Tyr | Gin | Gly | Leu | Ser | Thr | Al a | Thr | Lys |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Asp | Thr | Tyr | Asp | Al a | Leu | Hi s | Met | Gin | Al a | Leu | Pro | Pro | Arg | ||
130 | 135 | 140 |
A 45. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 35 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 45. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Arg | Val | Lys | Phe | Ser | Arg | Ser | Alá | Glu | Pro | Pro | Al a | Tyr | Gin | Gin | Gly |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Gin | Asn | Gin | Leu | Tyr | Asn | Glu | Leu | Asn | Leu | Gly | Arg | Arg | Glu | Glu | Tyr |
20 | 25 | 30 |
Asp Val Leu 35
A 46. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 32 aminosav TÍPUSA: aminosav HÁNY SZÁLÚ: nem releváns TOPOLÓGIÁJA: lineáris
4— jg
HU 221 603 Bl
MOLEKULÁTÍPUS: fehéqe
A 46. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Lys Ls Leu Val Lys Lys Phe Arg Gin Lys Ls Gin Arg Gin Asn Gin 15 10 15
Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu 20 25 30
A 47. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 35 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehéqe
A 47. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Arg | Thr | Gin | lle | Lys | Lys | Leu | Cys | Ser | Trp | Arg | Asp | Lys | Asn | Ser | Al a |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Alá | Asn | Gin | Leu | Tyr | Asn | Glu | Leu | Asn | Leu | Gly | Arg | Arg | Glu | Glu | Tyr |
20 | 25 | 30 |
Asp Val Leu 35
A 48. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 35 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULÁTÍPUS: fehéqe
A 48. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Arg Thr 1 | Arg | Phe | Ser 5 | Arg | Ser | Alá Glu | Pro 10 | Pr o | Alá | Tyr | Gin | Gin 15 | Gly | ||
Gin | Asn | Gin | Leu | Tyr | Asn | Glu | Leu | Asn | Leu | Gly | Arg | Arg | Glu | Glu | Tyr |
20 | 25 | 30 |
Asp Val Leu 35
A 49. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 36 aminosav TÍPUSA: aminosav HÁNY SZÁLÚ: nem releváns TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehéqe
A 49. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Arg | Thr | Arg | Asp | Pro | Glu | Met | Gly | Gly | Lys | Pro | Arg | Arg | Lys | Asn | Pro |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Gin | Glu | Gly | Leu | Tyr | Asn | Glu | Leu | Gin | Lys | Asp | Lys | Met | Alá | Glu | Al a |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Tyr | Ser | Glu | lle |
AZ 50. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 38 aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehéqe
AZ 50. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Arg Thr Arg lle Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His 15 10 15
HU 221 603 Bl
Asp Gly Leu Tyr Gin Gly Leu Ser Thr Alá Thr Lys Asp Thr Tyr Asp 20 25 30
Alá Leu His Met Gin Alá 35
AZ 51. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 63 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: DNS
AZ 51. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GGATCCCAAG GCCAGGCTAA AGCCGAAGCC GCGAAGGCCG AGGCTAAGGC
CGAAGCAGAT 60
CTG 63
AZ 52. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 20aminosav
TÍPUSA: aminosav
HÁNY SZÁLÚ: nem releváns
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehéije
AZ 52. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Asp Pro Lys Alá Glu Alá Lys Alá Glu Alá Lys Alá Glu Alá Lys Alá
5
Glu Alá Asp Leu
Claims (7)
- SZABADALMI IGÉNYPONTOK 301. A CD4 - HIV-fertőzött sejt specifikus felismerésére képes, de HIV-fertózést nem közvetítő - fragmensét magában foglaló extracelluláris részt tartalmazó, a HIV-fertőzött sejt megsemmisítésére indító szignált a 35 terápiás sejteknek nem továbbító, membránkötött, proteinszerű kimérareceptort expresszáló terápiás sejtek alkalmazása emlős HIV-fertőzésének kezelésére alkalmas gyógyászati készítmény előállítására.
- 2. Az 1. igénypont szerinti alkalmazás, ahol a CD4- 40 fragmens a CD41-394. vagy 1-200. aminosavaiból áll.
- 3. Az 1. igénypont szerinti alkalmazás, ahol a kimérareceptorban a CD4-fragmenst a CD7 - 26. ábrán bemutatott - transzmembrándoménje vagy az emberi IgGl-molekula - 25. ábrán bemutatott - csukló- 45 („hinge”), CH2- és CH3-doménje választja el az intracelluláris résztől.
- 4. Az 1. igénypont szerinti alkalmazás, ahol a kimérareceptorban a CD4-fragmens legalább 48 angström vagy legalább 72 angström távolságra van a terápiás sejt membránjától.
- 5. Az 1. igénypont szerinti alkalmazás, ahol a kimérareceptor tartalmazza a CD7 transzmembrán részét, a CD5 transzmembrán részét vagy a CD34 transzmembrán részét.
- 6. Az 1. igénypont szerinti alkalmazás, ahol a kimérareceptorban a CD4-fragmenst egy vagy több a-hélix választja el a terápiás sejt membránjától.
- 7. Az 1. igénypont szerinti alkalmazás, ahol a terápiás sejt T-sejt, B-sejt, neutrocita, dendritsejt vagy follikuláris dendritsejt.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US08/284,391 US5851828A (en) | 1991-03-07 | 1994-08-02 | Targeted cytolysis of HIV-infected cells by chimeric CD4 receptor-bearing cells |
US08/394,388 US6753162B1 (en) | 1991-03-07 | 1995-02-24 | Targeted cytolysis of HIV-infected cells by chimeric CD4 receptor-bearing cells |
PCT/US1995/009468 WO1996003883A1 (en) | 1994-08-02 | 1995-07-26 | Cells bearing cd4 decoy receptors and related molecules and methods |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HUT77253A HUT77253A (hu) | 1998-03-02 |
HU221603B true HU221603B (hu) | 2002-11-28 |
Family
ID=26962581
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9700303A HU221603B (hu) | 1994-08-02 | 1995-07-26 | CD4-csapdareceptorokat és rokonszerkezetű molekulákat hordozó sejtek és alkalmazásuk |
Country Status (22)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0781095B1 (hu) |
JP (1) | JP3832856B2 (hu) |
KR (1) | KR100384249B1 (hu) |
CN (1) | CN1142941C (hu) |
AT (1) | ATE234011T1 (hu) |
AU (1) | AU697489B2 (hu) |
CA (1) | CA2195653C (hu) |
CZ (1) | CZ293943B6 (hu) |
DE (1) | DE69529910T2 (hu) |
DK (1) | DK0781095T3 (hu) |
ES (1) | ES2191058T3 (hu) |
FI (1) | FI119868B (hu) |
HK (1) | HK1002545A1 (hu) |
HU (1) | HU221603B (hu) |
IL (1) | IL114778A (hu) |
MX (1) | MX9700800A (hu) |
NO (1) | NO325081B1 (hu) |
NZ (1) | NZ291017A (hu) |
PL (1) | PL181085B1 (hu) |
PT (1) | PT781095E (hu) |
UA (1) | UA45349C2 (hu) |
WO (1) | WO1996003883A1 (hu) |
Families Citing this family (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6544523B1 (en) | 1996-11-13 | 2003-04-08 | Chiron Corporation | Mutant forms of Fas ligand and uses thereof |
EP2105446B1 (en) * | 1998-09-23 | 2013-08-14 | ZymoGenetics, Inc. | Cytokine receptor zalpha11 |
EP3268394B1 (en) * | 2015-03-13 | 2020-05-27 | University of Maryland, Baltimore | Universal antibody-mediated biosensor |
US10975148B2 (en) | 2015-08-05 | 2021-04-13 | CellabMED Inc. | Chimeric antigen receptors, and T cells in which chimeric antigen receptor is expressed |
BR112018005741A2 (pt) * | 2015-09-22 | 2018-10-09 | Univ Pennsylvania | método de redirecionamento de células t para tratar infecção por hiv |
IL291558B2 (en) * | 2019-09-24 | 2024-03-01 | Univ California | Notch receptors with hinge area |
WO2021061863A1 (en) * | 2019-09-24 | 2021-04-01 | The Regents Of The University Of California | Notch receptors with minimal linker |
CN114728174A (zh) * | 2019-09-24 | 2022-07-08 | 加利福尼亚大学董事会 | 具有异源跨膜结构域的受体 |
US20220348628A1 (en) * | 2019-09-24 | 2022-11-03 | The Regents Of The University Of California | Novel receptors having a fibronectin repeat for ligand-dependent transcriptional regulation |
CN112176037A (zh) * | 2020-09-24 | 2021-01-05 | 深圳普瑞金生物药业有限公司 | 检测car-t细胞目的基因拷贝数的方法、引物对、探针及试剂盒 |
EP4112639A1 (en) * | 2021-07-02 | 2023-01-04 | Universitat de Barcelona | Car t/nk-cells for use in the treatment of invasive fungal infections |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS6463394A (en) * | 1987-09-04 | 1989-03-09 | Kyowa Hakko Kogyo Kk | Novel chimera polypeptide |
PT89484B (pt) * | 1988-01-22 | 1994-03-31 | Gen Hospital Corp | Genes clonados codificadores de proteinas de fusao ig-cd4 e sua utilizacao |
US5851828A (en) * | 1991-03-07 | 1998-12-22 | The General Hospital Corporation | Targeted cytolysis of HIV-infected cells by chimeric CD4 receptor-bearing cells |
NZ241855A (en) * | 1991-03-07 | 1994-04-27 | Gen Hospital Corp | Use of therapeutic cells to obtain cellular response to infection, tumours or autoimmune-generated cells, cells with chimaeric receptors (with binding component and destruction signal), dna encoding the receptor, vectors and antibodies to receptor |
-
1995
- 1995-07-26 KR KR1019970700681A patent/KR100384249B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1995-07-26 DK DK95928152T patent/DK0781095T3/da active
- 1995-07-26 MX MX9700800A patent/MX9700800A/es active IP Right Grant
- 1995-07-26 CA CA2195653A patent/CA2195653C/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-07-26 AU AU32014/95A patent/AU697489B2/en not_active Expired
- 1995-07-26 AT AT95928152T patent/ATE234011T1/de active
- 1995-07-26 DE DE69529910T patent/DE69529910T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1995-07-26 HU HU9700303A patent/HU221603B/hu unknown
- 1995-07-26 JP JP50660096A patent/JP3832856B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1995-07-26 UA UA97020482A patent/UA45349C2/uk unknown
- 1995-07-26 PT PT95928152T patent/PT781095E/pt unknown
- 1995-07-26 CN CNB951951831A patent/CN1142941C/zh not_active Expired - Lifetime
- 1995-07-26 PL PL95318443A patent/PL181085B1/pl unknown
- 1995-07-26 CZ CZ1997264A patent/CZ293943B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1995-07-26 NZ NZ291017A patent/NZ291017A/en not_active IP Right Cessation
- 1995-07-26 EP EP95928152A patent/EP0781095B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-07-26 WO PCT/US1995/009468 patent/WO1996003883A1/en active IP Right Grant
- 1995-07-26 ES ES95928152T patent/ES2191058T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1995-07-30 IL IL114778A patent/IL114778A/en not_active IP Right Cessation
-
1997
- 1997-01-31 FI FI970428A patent/FI119868B/fi not_active IP Right Cessation
- 1997-01-31 NO NO19970440A patent/NO325081B1/no not_active IP Right Cessation
-
1998
- 1998-03-03 HK HK98101624A patent/HK1002545A1/xx not_active IP Right Cessation
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US6284240B1 (en) | Targeted cytolysis of HIV-infected cells by chimeric CD4 receptor-bearing cells | |
US6753162B1 (en) | Targeted cytolysis of HIV-infected cells by chimeric CD4 receptor-bearing cells | |
CA2104957C (en) | Redirection of cellular immunity by receptor chimeras | |
AU708339B2 (en) | Redirection of cellular immunity by receptor chimeras | |
US20040005334A1 (en) | Redirection of cellular immunity by receptor chimeras | |
AU697489B2 (en) | Cells bearing cd4 decoy receptors and related molecules and methods | |
AU724652B2 (en) | Targeted cytolysis of HIV-infected cells by chimeric CD4 receptor-bearing cells | |
RU2173167C2 (ru) | Способ направления клеточного иммунного ответа против вич-инфицированной клетки млекопитающего, белковый мембранносвязанный химерный рецептор, днк | |
MXPA96003384A (es) | Citolisis objetivada de celulas infectadas por hiv mediante celulas portadoras receptoras cd4 quimericas |