ES2231633T3 - Procedimiento para un diagnostico mejorado de las displasias. - Google Patents

Procedimiento para un diagnostico mejorado de las displasias.

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ES2231633T3 ES02024030T ES02024030T ES2231633T3 ES 2231633 T3 ES2231633 T3 ES 2231633T3 ES 02024030 T ES02024030 T ES 02024030T ES 02024030 T ES02024030 T ES 02024030T ES 2231633 T3 ES2231633 T3 ES 2231633T3
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Abstract

Un procedimiento para discriminar las células displásicas que sobreexpresan los productos del gen INK4a de otras células que expresan productos del gen INK4a a un nivel detectable en muestras biológicas, que comprende la determinación en un procedimiento de prueba citológico o histológico de la coexpresión de al menos dos moléculas marcadoras en al menos una sola célula, en el que al menos una molécula marcadora es un producto de expresión codificado por el gen INK4a y al menos otra molécula marcadora es un marcador de proliferación celular, en el que la sobreexpresión de al menos un producto del gen INK4a y la expresión de al menos un marcador de proliferación celular activa a una un nivel detectable en dicha célula única es indicadora del estado displásico de la célula y en el que la sobreexpresión de al menos un producto del gen INK4a y la expresión de al menos un marcador de senescencia, diferenciación celular terminal, apoptosis o detención del ciclo celular a un nivel detectable en dicha célula única es indicadora del estado no displásico de la célula.

Description

Procedimiento para un diagnóstico mejorado de las displasias.
La presente invención se refiere a un procedimiento para un diagnóstico mejorado de las displasias basado en la detección simultánea de productos del gen INK4a y al menos un marcador de proliferación celular. Particularmente la presente invención proporciona un procedimiento para discriminar las células displásicas que sobreexpresan los productos del gen INK4a de las células que sobreexpresan los productos del gen INK4a sin ser displásicas mediante la detección de un marcador adecuado para caracterizar las propiedades de proliferación de las células respectivas. La caracterización de las propiedades de proliferación puede comprender la detección de un marcador o de un conjunto de marcadores característico de la proliferación celular activa y/o un marcador o un conjunto de marcadores característico del retraso o de la interrupción de la proliferación celular. Así, el procedimiento que se presenta en esta solicitud permite un diagnóstico específico de displasia en muestras histológicas y citológicas.
La detección de la sobreexpresión de p16^{INK4a} en las muestras biológicas ha resultado ser un marcador útil para la detección de lesiones anogenitales como carcinoma del cuello uterino (véanse los documentos WO00/01845; Klaes y col., Int. J. Cancer: 92, 276-284 (2001)). El procedimiento que se basa en la tinción inmunoquímica específica de p16^{INK4a} permite la identificación sensible y específica de células displásicas en secciones tisulares y en muestras citológicas.
En los exámenes inmunohistoquímicos de los tejidos, las células displásicas y neoplásicas se pueden teñir usando un procedimiento de tinción mediado por un anticuerpo específico frente a p16^{INK4a}. Así, el diagnóstico histológico de las lesiones neoplásicas se puede basar en un procedimiento de tinción que se basa en un marcador molecular característico de la transformación de las células de las lesiones anogenitales. En estos procedimientos el diagnóstico, tanto si las células son neoplásicas como si no lo son, no se basa sólo en la tinción específica frente a p16^{INK4a}, sino que también se basa en la información histológica.
Esto se debe al hecho de que en aproximadamente el 20-30% de las muestras las células metaplásicas muestran cierto grado de inmunorreactividad a anticuerpos específicos frente a p16^{INK4a}, y así se tiñen durante los procedimientos. A pesar de todo, el patrón de tinción que dan estas células metaplásicas difiere del patrón que se obtiene en las lesiones neoplásicas. Las células metaplásicas dan un patrón de tinción parcheada o focal, mientras que las lesiones neoplásicas dan un patrón de tinción difusa. Además, la intensidad de la tinción de las células metaplásicas es predominantemente menor que la de las células neoplásicas.
Los procedimientos habituales que se usan en pruebas de cribado para la detección temprana de displasias y/o neoplasias no emplean pruebas basadas en la histología, sino que se basan en procedimientos de pruebas citológicos. Especialmente en los casos en los que no se dispone de información histológica sobre la arquitectura de los tejidos, como por ejemplo en los exámenes citológicos, la prueba únicamente de la sobreexpresión de p16^{INK4a} puede dar resultados falsos positivos. Esto se debe al hecho de que las fracciones de células metaplásicas que expresan p16^{INK4a} a niveles elevados detectables pueden no diferenciarse por medio de criterios histológicos.
El porcentaje de células que muestran sobreexpresión de p16^{INK4a} aumenta en el transcurso de la aparición de las displasias. Así, en las etapas neoplásicas o preneoplásicas, cuando en las muestras sólo hay una población escasa de células neoplásicas o preneoplásicas, la inmunorreactividad a p16^{INK4a} puede ser débil. Esta débil inmunorreactividad puede ser aproximadamente del mismo nivel que la que producen las células metaplásicas. En etapas más tardías de las displasias la inmunorreactividad total a p16^{INK4a} es más intensa y de esta manera las lesiones neoplásicas son fácilmente distinguibles de las metaplasias incluso en un formato de prueba citológico. Esto puede dar lugar a casos en los que la presencia de células metaplásicas que expresan p16^{INK4a} puede confundirse con la presencia de células neoplásicas, y de esta manera da lugar a un resultado falso positivo.
Especialmente en pruebas de cribado, en las que es deseable la detección de etapas tempranas de las neoplasias, esta situación es bastante desagradable. Esto es especialmente cierto porque el diagnóstico basado en p16^{INK4a} ha resultado ser una herramienta útil en los exámenes histológicos, y la aplicación de procedimientos de cribado citológicos permitiría mejorar estos procedimientos establecidos.
Para reducir los resultados falsos positivos de las pruebas citológicas y de esta manera mejorar más la fidelidad del diagnóstico mediado por p16^{INK4a} de las lesiones anogenitales, sería deseable un procedimiento para discriminar las metaplasias de las lesiones neoplásicas y displásicas. En las formas de realización que se reivindican en la presente invención se proporciona un procedimiento para discriminar las metaplasias de las lesiones neoplásicas y preneoplásicas.
Para apoyar la discriminación de las metaplasias respecto a las lesiones neoplásicas en los procedimientos de prueba que se basan en la sobreexpresión de p16^{INK4a}, sería deseable un marcador molecular que se expresase en células y tejidos neoplásicos y/o preneoplásicos y que no se expresase simultáneamente con los productos del gen INK4a en una célula metaplásica única.
Los procedimientos que se reivindican en esta invención proporcionan una solución al problema presente en la técnica. En el transcurso de los experimentos que dieron lugar a la presente invención los investigadores han encontrado que una combinación de la detección de la presencia o ausencia y/o del nivel de p16^{INK4a} en combinación con al menos un marcador de proliferación celular como, por ejemplo, Ki67, Ki-S2, mcm5 o mcm2, puede resolver el problema presente en la técnica.
En la técnica se presentan algunos documentos relativos al uso de una combinación de marcadores moleculares para un diagnóstico mejorado de las displasias. En el documento WO0208764 se describe un procedimiento para un diagnóstico mejorado de las neoplasias malignas cervicales usando una combinación de un marcador del VPH y un marcador de proliferación celular o de actividad vírica. p16^{INK4a} se menciona en el contexto de esta invención como marcador de actividad vírica para combinarlo con los marcadores de VPH.
En el documento EP1217377 se describe un procedimiento para la detección automatizada de las neoplasias cervicales malignas mediado por la detección de más de una molécula marcadora. En este documento se presentan algunas combinaciones definidas de marcadores. En este documento no hay descripción sobre la elección de marcadores adecuados para una combinación. El objetivo de la combinación de esta aplicación es mejorar la fidelidad del análisis automatizado de los patrones de tinción en muestras citológicas y biológicas. Este documento menciona la combinación de p16^{INK4a} con otros marcadores tumorales.
El documento WO02059616 prescribe un procedimiento para la detección de trastornos del ciclo celular para un diagnóstico mejorado de las neoplasias cervicales malignas. El documento describe que las células displásicas muestran trastornos del control del ciclo celular y de esta manera se pueden identificar por medio de la detección en las células de proteínas del tipo de la ciclina E junto a sustancias postG1.
Jeffrey Keating, en "22Ki67, Cyclin E, and p16^{INK4a} Are Complimentary Surrogate Biomarkers for Human Papilloma Virus-Related Cervical Neoplasia" (American Journal of Surgical Pathology 25/7):884-891, 2001), describe la complementariedad del uso de p16^{INK4a}, Ki67 y ciclina E en el transcurso del diagnóstico de las displasias cervicales. El documento se refiere a los problemas de cada marcador único en la detección de las displasias y afirma que p16^{INK4a} en combinación con la ciclina E puede ser adecuado para superar los inconvenientes de las moléculas marcadoras aisladas, especialmente cuando se examinan muestras citológicas. No se hace ninguna descripción sobre el uso de p16^{INK4a} junto a un marcador característico de células en proliferación como Ki67. el documento no enseña la combinación de p16^{INK4a} para su uso en procedimientos diagnósticos; además, la descripción se refiere a un uso restringido de Ki67 en el diagnóstico diferencial de las lesiones cervicales y de esta manera se aleja del uso de este marcador en el diagnóstico de las neoplasias cervicales malignas.
En la técnica no hay ninguna descripción que enseñe el uso de una combinación de p16^{INK4a} con un marcador característico de proliferación celular para su uso en un procedimiento diagnóstico para una mejor discriminación de las células no displásicas positivas para p16^{INK4a} de las displasias positivas para p16^{INK4a}. El documento WO02059616 no aporta datos sobre el uso de p16^{INK4a} en la detección de la proliferación de células displásicas. El documento EP1217377 no enseña un objetivo de la combinación de marcadores tumorales en el proceso de detección distinto a la automatización del procedimiento del análisis. No hay ninguna descripción relativa a la ventaja de las combinaciones con fines de discriminación específica como la discriminación de células displásicas de, por ejemplo, células metaplásicas en muestras cervicales.
Los inventores de la presente invención buscaron superar el inconveniente presente en la técnica de que p16^{INK4a}, que se sobreexpresa en varias displasias, también se puede detectar en algunas otras células no displásicas. La discriminación entre células no displásicas positivas para p16^{INK4a} y células displásicas que sobreexpresan p16^{INK4a} se puede basar en las características de proliferación de las células respectivas. En células sometidas a un control normal, p16^{INK4a} inhibe a cdk4 y de esta manera inhibe la proliferación. Por el contrario, en las células displásicas la regulación está alterada. Así, p16^{INK4a}, a pesar de su nivel de expresión anormalmente elevado, no produce inhibición de la proliferación celular.
Los inventores de la presente invención encontraron que las células displásicas se pueden diferenciar de las células que muestran una proliferación celular controlada mediante la detección simultánea de p16^{INK4a} con un marcador característico de la proliferación celular. Debido al hecho de que en las células normales los niveles elevados de p16^{INK4a} inhiben la proliferación celular, las células que sobreexpresan p16^{INK4a} se pueden clasificar como displásicas si muestran características de proliferación celular activa.
La presente invención se refiere a un procedimiento para la discriminación de lesiones neoplásicas, preneoplásicas y/o displásicas de células no displásicas que muestran niveles elevados de p16^{INK4a}, en muestras biológicas en un procedimiento de prueba histológico o citológico basado en la detección de la presencia o ausencia de células que expresan el gen de p16^{INK4a} simultáneamente a marcadores de proliferación celular en dichas muestras biológicas. Marcadores adecuados de proliferación celular pueden ser, por ejemplo, Ki67, Ki-S2, Ki-S5, mcm5 y mcm2. En una forma de realización de la invención las proteínas o el ARNm de los marcadores de proliferación celular pueden actuar como marcador para la discriminación de las metaplasias de las lesiones displásicas tempranas o preneoplásicas en las muestras.
Un aspecto de la presente invención es proporcionar un procedimiento para discriminar las células displásicas que sobreexpresan los productos del gen INK4a de otras células que expresan los productos del gen INK4a a un nivel detectable en muestras biológicas, que comprende la determinación en un procedimiento de prueba citológico o histológico de la coexpresión de al menos dos moléculas marcadoras en al menos una sola célula, en el que al menos una molécula marcadora es un producto de expresión codificado por el gen INK4a y al menos otra molécula marcada es un marcador de proliferación celular, en el que la sobreexpresión de al menos un producto del gen INK4a y la expresión de al menos un marcador de proliferación celular activa a un nivel detectable mediante inmunoquímica en dicha célula única es indicativa del estado displásico de la célula, y en el que la sobreexpresión de al menos un producto del gen INK4a y la expresión de al menos un marcador de senescencia, diferenciación terminal de las células, apoptosis o detención del ciclo celular a un nivel detectable en dicha célula única es indicativo del estado no displásico de la célula.
Un segundo aspecto de la presente invención se relaciona con un kit de prueba para la determinación de displasias en muestras según el procedimiento que se describe en esta solicitud, y que comprende los componentes que se definen en las reivindicaciones del kit.
Durante los experimentos que dieron lugar a la presente invención se encontró que en ciertas circunstancias las células no displásicas pueden mostrar inmunorreactividad a p16^{INK4a}. Los inventores encontraron que estas células que mostraban un control ordenado de la proliferación celular en respuesta a los niveles elevados de los productos del gen INK4a están sometidas a detención del crecimiento. Así, estas células individuales no muestran inmunorreactividad a marcadores de proliferación celular. Por el contrario, las células transformadas que sobreexpresan p16^{INK4a} muestran una alteración de la regulación del control de la proliferación celular y no responden al nivel elevado de p16^{INK4a} mediante detención de la proliferación. Así, estas células displásicas muestran la expresión simultánea de p16^{INK4a} y de marcadores de proliferación celular. Así, los inventores encontraron que la detección simultánea de p16^{INK4a} con marcadores de proliferación celular puede ayudar a discriminar las células displásicas de las células que sobreexpresan p16^{INK4a} y que están en detención del crecimiento, como las células metaplásicas.
El descubrimiento de que la sobreexpresión de p16^{INK4a} en varias displasias también se puede detectar en algunas células no displásicas llevó a los inventores del presente procedimiento a establecer una técnica para discriminar entre células no displásicas positivas a p16^{INK4a} y células displásicas que sobreexpresan p16^{INK4a} basándose en las características de proliferación de las células respectivas. Mientras que en las células que tienen un control normal p16^{INK4a} inhibe a cdk4 y de esta manera inhibe la proliferación celular, esto no es así en las células displásicas. Así, en las células displásicas, a pesar de su elevado nivel de expresión, p16^{INK4a} no produce inhibición de la proliferación celular.
El procedimiento que se describe en esta solicitud se basa en el hecho de que las células displásicas se pueden diferenciar de las células que muestran una proliferación celular con un control normal mediante la detección simultánea de un producto del gen INK4a, como p16^{INK4a}, con un marcador característico de proliferación celular.
El término marcador, así como moléculas marcadoras, en general se usará en esta solicitud para referirse a productos de expresión de genes de marcadores de proliferación, así como a los productos de expresión del gen INK4a.
Las denominaciones que se dan en este texto para los genes se pueden relacionar en parte con los genes o proteínas que se han descubierto en cualquier organismo. En el contexto de la presente invención esta denominación se referirá al homólogo correspondiente de los marcadores citados en el organismo a que se refiere en particular el procedimiento que se describe en esta solicitud. En ciertas formas de realización de la presente invención este organismo es un mamífero, y en una forma de realización puede ser un ser humano. Así, en una forma de realización de la presente invención los marcadores citados serán los homólogos humanos de los que se presentan, de manera respectiva.
Generalmente, en todo el texto el término "marcador de proliferación (celular)" o "marcador de proliferación celular" en sus diversas formas gramaticales se usa para referirse a proteínas y a marcadores de ácidos nucleicos. En el caso de que se use en esta solicitud el nombre de la proteína de un marcador como, por ejemplo, "proteína de replicación", se comprenderá que este uso es una metonimia y que se refiere tanto a la proteína como a las moléculas marcadoras del ácido nucleico que codifica la proteína particular.
Un marcador útil en la presente invención puede ser cualquier molécula que se transcribe a partir de un gen o cualquier molécula que se traduce a partir de un transcrito de este tipo. Así, producto génico, como se usa en el contexto de la presente invención, puede comprender polinucleótidos como, por ejemplo, ADN y ARN, y polipéptidos como proteínas, proteoglucanos, péptidos, etc. Producto(s) de expresión, como se usa en el contexto de la presente invención, comprende cualquier transcrito de un locus génico en dirección anterógrada o inversa, incluyendo cualquier marco de lectura y variante de ayuste. Productos de expresión, como se usa en esta solicitud, comprende cualquier producto alternativo codificado por los ácidos nucleicos de un locus génico particular.
Productos génicos codificados por INK4a, como se usa en la presente invención, será cualquier ARNm transcrito a partir del locus del gen INK4a o cualquier polipéptido traducido desde ese ARNm. En una forma de realización de la invención los productos de expresión codificados por el gen INK4a pueden tener pesos moleculares de aproximadamente 5 a 40 kDa o cualquier valor intermedio, y preferentemente de aproximadamente 10 a 20 kDa o cualquier valor intermedio, y más preferentemente de aproximadamente 14 a aproximadamente 19 kDa o cualquier valor intermedio, respectivamente.
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Los productos génicos de INK4a adecuados para el procedimiento de la presente invención pueden comprender, por ejemplo, productos génicos como, por ejemplo, p16^{INK4a} y p14ARF.
El término "marcador de proliferación (celular)" o "marcador de proliferación celular", como se usa en el contexto de la presente invención, comprenderá cualquier molécula marcadora que se sabe en la técnica que es característica del estado de proliferación de las células. El estado de proliferación puede ser, por ejemplo, un estado de células en proliferación activa, de retraso de la proliferación celular, de detención de la proliferación celular, de células senescentes, de células con diferenciación terminal, de apoptosis, etc. En una forma de realización de la invención el marcador de proliferación celular es una molécula marcadora característica de la proliferación celular activa. En otra forma de realización de la invención la molécula marcadora de proliferación puede ser una molécula característica de células detenidas, con diferenciación terminal, senescentes o apoptóticas.
En ciertas formas de realización los marcadores de proliferación para su uso en el contexto de la presente invención pueden comprender genes que participan en la replicación del ADN como, por ejemplo, proteínas del complejo de preiniciación o de la horquilla de replicación. Esas moléculas pueden comprender, por ejemplo, helicasas como la helicasa eucariótica o proteínas MCM (MCM2, MCM3, MCM4, MCM5, MCM6, MCM7), proteína TP según se describe en los documentos WO0050451 y WO0217947 (también denominada HELAD1, Pomfil2 y Unc-53), cinasas o fosfatasas que participan en el proceso de replicación como, por ejemplo, CDC6, proteín cinasa CDC7, Dbf4, proteín fosfatasa CDC14, CDC45 y MCM10. Además, los marcadores de proliferación pueden comprender proteínas que participan en el proceso de la horquilla de replicación, como por ejemplo PCNA o ADN polimerasa delta, proteína de replicación A (RPA), factor de replicación C (RFC) y FEN1.
En otras formas de realización los marcadores de proliferación pueden comprender moléculas necesarias para el mantenimiento de la proliferación celular como Ki67, Ki-S5 o Ki-S2. En esta forma de realización las proteínas pueden, por ejemplo, estar presentes en todo el ciclo celular. Son útiles para realizar un procedimiento según la presente invención siempre que sean características de la proliferación celular activa y que no se expresen de manera significativa en células en estado de detención del crecimiento, diferenciación terminal, apoptosis o senescencia. Ki67, Ki-S2 y Ki-S5, se referirán a las moléculas marcadoras proteicas detectadas con los anticuerpos respectivos, así como los ácidos nucleicos que codifican estos antígenos.
En otra forma de realización los marcadores de proliferación celular para su uso en un procedimiento según la presente invención pueden ser una molécula marcadora característica del retraso o de la interrupción de la proliferación celular como, por ejemplo, un marcador de senescencia, un marcador de detención del ciclo celular, un marcador característico de células con diferenciación terminal o un marcador de apoptosis. Esas moléculas comprenden, por ejemplo, p21, p27, caspasas, BAD, CD95, ligando fas, proteínas parp, etc.
Discriminación, como se usa en el contexto de la presente invención, comprenderá la evaluación de si se debe clasificar a una muestra de una u otra manera. En una forma de realización de la invención la discriminación se refiere a la evaluación de si un tejido o los componentes del mismo son displásicos o si son no displásicos. Así, la discriminación, como se usa en esta solicitud, es un juicio sobre las propiedades de crecimiento de las células de una muestra biológica.
En una forma de realización de la presente invención la discriminación comprende la detección de la expresión de un producto del gen INK4a simultáneamente con la detección de la expresión de un marcador característico de proliferación celular activa. En este caso las células que coexpresan ambas moléculas marcadoras se deben clasificar como displásicas.
En otra forma de realización de la presente invención la discriminación comprende la detección de un producto del gen INK4a simultáneamente con la detección de la expresión de un marcador característico de detención, interrupción o retraso de la proliferación celular. En este caso las células que coexpresan ambas moléculas marcadoras se deben clasificar como no displásicas.
En ciertas formas de realización de la presente invención será útil detectar la presencia o ausencia y/o el nivel de más de dos moléculas marcadoras. En una forma de realización se detectará un producto de expresión del gen INK4a de manera concertada con dos o más marcadores de proliferación celular. Esto puede ser útil para mejorar la identificación de las propiedades de proliferación de las células que expresan el producto del gen INK4a en las muestras. Algunos marcadores de proliferación están restringidos a fases específicas del ciclo celular o están presentes en una cantidad baja en las células. Debido a este hecho en algunos casos se puede mejorar la detección de las células en proliferación que expresan los productos del gen INK4a mediante la detección de dos o más marcadores de proliferación. En esos casos, por ejemplo, un marcador de proliferación que se expresa durante todo el ciclo proliferativo celular se puede detectar simultáneamente con marcadores que son característicos de fases específicas del ciclo celular. Por ejemplo, se puede detectar Ki67, K1-S5 o Ki-S2 junto a mcm5, mcm2, PCNA, rpA, rfC, etc. En otros casos, por ejemplo, se pueden detectar proteínas que participan en la replicación del ADN junto a Ki67, K1-S5 o Ki-S2. En otro ejemplo se puede detectar Ki67 junto a Ki-S2. Se debe comprender que estos ejemplos pretenden representar posibilidades combinatorias y no serán exhaustivos, de modo que otras combinaciones de marcadores de proliferación también son útiles y adecuadas en la realización de un procedimiento según la presente invención.
Cuando sea necesario, se puede aplicar una combinación de dos o más moléculas marcadoras de proliferación celular a un procedimiento como el que se describe en esta solicitud. En otra forma de realización, se pueden detectar dos o más moléculas marcadoras en grandes periodos del ciclo celular o incluso en todo el ciclo celular o en células en proliferación activa junto a un procedimiento como el que se describe en esta solicitud. Una combinación de más de una molécula marcadora de proliferación celular generalmente puede ser útil para mejorar la sensibilidad de la detección de las características de proliferación de las células.
En ciertas formas de realización de la presente invención una combinación puede comprender además otras moléculas marcadoras como moléculas marcadoras de senescencia, marcadores de células con detención del crecimiento, marcadores de células con diferenciación terminal, marcadores de células apoptóticas, marcadores de infección vírica o de actividad vírica en las células, o proteínas reguladoras del ciclo celular como marcadores. En ciertas formas de realización en conexión con displasias que se asocian a la infección por el VPH, puede ser útil la detección de moléculas marcadoras asociadas al VPH o de marcadores de actividad vírica para la detección de una displasia. Los procedimientos útiles para la detección de la infección por el VPH en las muestras son conocidos a los expertos en la materia. Estos procedimientos pueden comprender procedimientos que emplean sondas específicas para agentes del VPH o pueden emplear reacciones de amplificación de ácidos nucleicos. La detección de una infección vírica se puede realizar simultáneamente o posteriormente a la detección de las moléculas la detección de las moléculas de INK4a y de las moléculas marcadoras de proliferación.
Displásico, como se usa en el contexto de la presente invención, se referirá a displasias desde leves a graves y a sus etapas precursoras, así como a carcinomas como carcinomas in situ o carcinomas invasores y células tumorales diseminadas. Así, displásico, como se usa en esta solicitud, también comprenderá las etapas tempranas y precursoras de displasias y carcinomas.
Las células que sobreexpresan los productos del gen INK4a sin ser displásicas (no displásico, como se usa en esta solicitud), como se menciona en la presente solicitud, pueden, por ejemplo, comprender células metaplásicas, células senescentes, células con diferenciación terminal o células que, en ciertas etapas del ciclo celular, muestran niveles elevados de los productos del gen INK4a. En ciertas células los niveles elevados de productos del gen INK4a pueden producirse incluso como respuesta a señales externas como hormonas, transmisores, etc. En una forma de realización de la presente invención las células no displásicas que sobreexpresan productos del gen INK4a comprenden, por ejemplo, células metaplásicas, células endometriales, etc.
El procedimiento para detectar el nivel de expresión de los productos codificados por el gen INK4a y/o los productos del gen del marcador de proliferación según la presente invención es cualquier procedimiento que puede (pero que no tiene por qué), por ejemplo, estar adaptado para detectar incluso cantidades muy pequeñas de moléculas biológicas específicas en muestras biológicas. La reacción de detección de la presente invención es una detección que se basa en el nivel de ácidos nucleicos o en el nivel de polipéptidos.
Se dice que una molécula marcadora es detectable, como se usa en el contexto de la presente invención, siempre que se pueda detectar el marcador durante el transcurso de un procedimiento adecuado de detección como, por ejemplo, hibridación in situ, tinción inmunoquímica, ensayos de captura de híbridos, etc. Se puede detectar el nivel de expresión de una molécula marcadora usando reacciones indicadoras adecuadas como, por ejemplo, un procedimiento cromógeno o de tinción inmunoquímica basado en fluorescencia o un procedimiento de hibridación in situ para análisis microscópicos o automatizados. Para mejorar la señal indicadora se pueden aplicar procedimientos adecuados conocidos a los expertos en la materia en el transcurso de un procedimiento de la presente invención. Así, se dice que el marcador es detectable cuando la tinción sobrepasa a la tinción basal respectiva que se obtiene de manera inherente en el procedimiento de tinción inmunoquímica, de modo que se producen resultados significativos de tinción.
Las moléculas marcadoras se pueden detectar usando reactivos que reconocen específicamente estas moléculas. La reacción de detección de los productos del gen INK4a y/o de los productos del gen del marcador de proliferación puede comprender una o más reacciones con agentes de detección que reconocen las moléculas marcadoras iniciales o que reconocen las moléculas anteriores que se usaron para reconocer otras moléculas.
En ciertas formas de realización de la presente invención se pueden usar dos o más sondas para la detección de una sola molécula marcadora. Por ejemplo, se pueden usar dos o más agentes de unión diferentes (por ejemplo, anticuerpos) o sondas de oligonucleótidos dirigidas frente a una sola molécula marcadora (por ejemplo, frente a diferentes epítopos o diferentes secuencias) en el transcurso del procedimiento que se describe en la presente solicitud.
La detección de los diferentes productos génicos se puede realizar en un recipiente o contenedor de reacción o en diferentes contenedores simultáneamente o de manera sucesiva. Así, los diferentes productos génicos se pueden detectar simultáneamente en una célula que coexpresa ambos productos. En otros casos, se pueden usar células que coexpresan los productos génicos para la reacción de detección por separado (separada en el espacio o en el tiempo) para detectar cada vez un solo marcador en las células. En otra forma de realización podría haber células que expresan uno o el otro marcador. La detección de las moléculas marcadoras en las diferentes células también se puede realizar simultáneamente o por separado en el tiempo y/o en el espacio.
La reacción de detección además puede comprender una reacción indicadora que indica la presencia o ausencia y/o el nivel de los productos del gen de la molécula marcadora. La reacción indicadora puede ser, por ejemplo, una reacción que produce un compuesto coloreado, una reacción de bioluminiscencia, una reacción de fluorescencia, generalmente una reacción emisora de radiación, etc.
En ciertas formas de realización se pueden reconocer diferentes moléculas marcadoras con agentes que producen diferentes señales indicadoras, de modo que se podrían distinguir las señales que se refieren a las moléculas marcadoras. En una forma de realización preferida de la invención la detección de la expresión de los dos o más productos del gen INK4a y/o de los productos del gen del marcador de proliferación se realiza simultáneamente. En este caso, la reacción indicadora, por ejemplo, puede emplear diferentes marcadores fluorescentes para las diferentes moléculas que se detectan.
Sin embargo, en el contexto de la presente invención no se debe responder necesariamente a si uno u otro del marcador de proliferación y del producto génico del marcador de INK4a se expresa en las células. En ciertas formas de realización la pregunta es si se expresa algún marcador de proliferación y/o producto del gen INK4a. Así, en el transcurso de los experimentos se puede elegir un procedimiento que da la misma señal de fluorescencia como indicación de la presencia de un marcador de proliferación. Este procedimiento es adecuado para mejorar la sensibilidad de la detección de las características de proliferación celular (diferentes marcadores característicos de la proliferación celular activa). Si es necesario se puede aplicar el procedimiento para conseguir una señal detectable para 3, 4 o incluso más moléculas marcadoras características de la proliferación celular. De manera análoga, en ciertas circunstancias puede ocurrir lo mismo con los productos de expresión del gen INK4a. Se debe comprender que en algunas situaciones pueden ser deseables señales de tinción diferentes para diferentes moléculas marcadoras de proliferación. Los procedimientos se pueden aplicar a las necesidades del experimento correspondiente.
En ciertas formas de realización de la presente invención se puede detectar una combinación de uno o más (por ejemplo, dos diferentes) productos del gen INK4a con una combinación de uno o más, por ejemplo un conjunto de 2, un conjunto de 3, un conjunto de 4, un conjunto de 5 o un conjunto de incluso más marcadores de proliferación celular. Si es necesario la detección de las moléculas marcadoras de proliferación celular puede dar sólo una señal indicadora. En otros casos cada marcador único de proliferación celular puede dar una señal indicadora específica o grupos de moléculas marcadoras pueden dar señales indicadoras específicas.
Las señales para la indicación de la presencia de inmunorreactividad pueden ser señales cromógenas producidas por varios procedimientos conocidos en la técnica. Se pueden usar señales fluorescentes de manera alternativa o incluso en combinación. Señales indicadoras adecuadas comprenden marcadores fluorescentes como fluoresceína, rodamina, etc.
Los formatos aplicables a la reacción de detección según la presente invención pueden ser técnicas de inmunotransferencia como inmunotransferencia Western, inmunotransferencia Southern, inmunotransferencia Northern y procedimientos inmunocitoquímicos o inmunohistoquímicos. Las técnicas de inmunotransferencia son conocidas a las personas que tienen conocimientos normales en la materia y se pueden realizar, por ejemplo, como electroinmunotransferencia, inmunotransferencia semiseca, inmunotransferencia al vacío o inmunotransferencia en gota. Los procedimientos de tinción inmunocito/histoquímica son conocidos a los expertos en la materia y pueden comprender la detección mediada por agentes de unión de polipéptidos, así como técnicas de hibridación in situ. Las dos técnicas diferentes se pueden aplicar incluso simultáneamente. En cierta forma de realización se puede usar para la detección la captura de híbridos de ácidos nucleicos. La reacción de amplificación también puede ser aplicable para la detección de, por ejemplo, moléculas de ácidos nucleicos.
En una forma de realización de la invención la detección del nivel de los productos del gen INK4a y/o del gen del marcador de proliferación se realiza mediante la detección de los respectivos ácidos nucleicos (por ejemplo, ARNm) o fragmentos de los mismos presentes en la muestra. Los medios para la detección de moléculas de ácidos nucleicos son conocidos a los expertos en la materia. El procedimiento para la detección de ácidos nucleicos puede, por ejemplo, realizarse mediante una reacción de unión de la molécula que se va a detectar con sondas para ácidos nucleicos complementarios, proteínas con especificidad de unión para los ácidos nucleicos o cualesquiera otras entidades que reconozcan específicamente a dichos ácidos nucleicos y se unan específicamente a ellos. En una forma de realización se pueden usar sondas de hibridación in situ de oligonucleótidos frente a ácidos nucleicos para la detección de los productos o marcadores de expresión.
Las sondas, como se usa en el contexto de la presente invención, pueden ser cualquier agente que se une específicamente a una molécula. El caso de los ácidos nucleicos, una sonda puede ser un oligonucleótido que se hibrida con una secuencia particular. En una forma de realización la sonda puede ser, por ejemplo, un cebador. En el caso de la detección de polipéptidos o proteínas la sonda, como se usa en esta solicitud, puede ser, por ejemplo, un agente de unión como un anticuerpo. En ciertas formas de realización de la presente invención las sondas pueden estar marcadas para su detección. El marcador se puede seleccionar del grupo que comprende un radioisótopo, un compuesto bioluminiscente, un compuesto quimioluminiscente, un compuesto fluorescente, un quelato metálico o un enzima. La sonda se puede aplicar a cualquier procedimiento de detección conocido en la técnica, por ejemplo, en el transcurso de un procedimiento de hibridación in situ, en el transcurso de ensayos de captura de híbridos, en el transcurso de una reacción de tinción inmunoquímica, en el transcurso de técnicas de inmunotransferencia, etc.
Este procedimiento se puede realizar tanto in vitro como directamente in situ, por ejemplo, en el transcurso de una reacción de detección mediante tinción. Otra manera de detectar los ARNm marcadores en una muestra que se realiza con el procedimiento según la presente invención es una reacción de amplificación de los ácidos nucleicos, que se puede realizar de manera cuantitativa como, por ejemplo, la reacción en cadena de la polimerasa. En una forma de realización preferida de la presente invención se puede usar PCR en tiempo real para cuantificar el nivel de ARNm marcadores en muestras de displasias de tumores (células o muestras tisulares).
En otra forma de realización preferida de la invención la detección del nivel de los productos del gen INK4a y/o del gen del marcador de proliferación se realiza determinando el nivel de la expresión de una proteína o de fragmentos de la misma. La determinación del producto del gen del marcador a nivel proteico se puede realizar, por ejemplo, en una reacción que comprende un agente de unión específico para la detección del polipéptido marcador particular.
Los agentes de unión se pueden usar en muchas técnicas de detección diferentes, por ejemplo, en inmunotransferencia Western, ELISA o inmunoprecipitación. Generalmente la detección de polipéptidos basada en agentes de unión se puede realizar también tanto in vitro como directamente in situ, por ejemplo, en el transcurso de una reacción de tinción inmunoquímica. Se puede usar cualquier otro procedimiento para determinar la cantidad de polipéptidos particulares en muestras biológicas según la presente invención.
Los procedimientos inmunocitoquímicos de visualización para su uso en el contexto de la presente invención suelen comprender, por ejemplo, la tinción de preparaciones citológicas o histológicas con colorantes cromógenos o fluorescentes. La tinción puede, por ejemplo, comprender la unión de las moléculas que se van a detectar a un primer agente de unión, que en sí mismo es detectado por un segundo agente de unión, que puede estar marcado. En ciertas formas de realización el primer agente de unión puede ser un ácido nucleico o un agente de unión proteico (por ejemplo, un anticuerpo) y el agente de unión secundario puede ser, por ejemplo, un anticuerpo secundario que reconoce al primer agente de unión.
Se pueden aplicar cualesquiera procedimientos conocidos en la técnica para realizar la tinción citoquímica o histoquímica en el transcurso de un procedimiento de la presente invención.
Los agentes de unión que se usan en el contexto de la presente invención para la detección del nivel de polipéptidos de INK4a como los polipéptidos p16^{INK4a} o p14ARF y los polipéptidos marcadores de proliferación como, por ejemplo, los polipéptidos mcm5, mcm2, Ki67, Ki-S5, PCNA o Ki-S2, pueden comprender anticuerpos y fragmentos de unión a antígenos, anticuerpos híbridos bifuncionales, peptidomiméticos que contienen epítopos mínimos de unión a antígenos, anticulinas (anticalina™), etc.
Se dice que un anticuerpo o un agente de unión a un antígeno reacciona específicamente si reacciona a un nivel detectable con una proteína descrita en esta solicitud, y no reacciona significativamente con otras proteínas. Los anticuerpos que se pueden usar en la presente invención pueden ser anticuerpos monoclonales o policlonales. Como se usa en esta solicitud, el término anticuerpo o anticuerpo monoclonal incluye moléculas intactas, así como fragmentos de anticuerpos. Además, los anticuerpos que se pueden usar en la presente invención incluyen anticuerpos quiméricos, monocatenarios y humanizados.
Según la presente invención, los agentes de unión se pueden usar solos o en combinación. Por medio de una combinación es posible conseguir un mayor grado de sensibilidad. El término anticuerpo, preferentemente, se refiere a anticuerpos que están formados esencialmente por anticuerpos monoclonales mezclados con diferentes especificidades epitópicas, así como preparaciones de anticuerpos monoclonales distintos.
Los anticuerpos monoclonales se hacen a partir de fragmentos que contienen antígenos del polipéptido de la invención usando diversas técnicas conocidas a los que tienen conocimientos ordinarios en la materia; véase, por ejemplo: Harlow y Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. En una de esas técnicas se inyecta inicialmente un inmunógeno que comprende el polipéptido antigénico o una parte sintética del mismo en una amplia variedad de mamíferos (por ejemplo, ratones, ratas, conejos, ovejas y cabras). En esta etapa los polipéptidos de esta invención pueden actuar como inmunógenos sin modificación. De manera alternativa, particularmente para polipéptidos relativamente cortos, se puede desencadenar una respuesta inmunitaria superior si el polipéptido está unido a una proteína transportadora, como albúmina sérica bovina o hemocianina de lapa californiana. El inmunógeno se inyecta en el huésped animal, preferentemente según un régimen predeterminado que incorpora una o más inmunizaciones de refuerzo, y se extrae sangre periódicamente a los animales. Los anticuerpos policlonales específicos de los polipéptidos se pueden purificar posteriormente a partir de dichos antisueros mediante, por ejemplo, cromatografía de afinidad usando el polipéptido unido a un soporte sólido adecuado.
En el contexto de la presente invención no se tiene necesariamente que responder a si se expresa en las células uno u otro marcador de proliferación. En ciertas formas de realización la pregunta principal puede ser si se expresa algún marcador de proliferación. Por eso en el transcurso de los experimentos se eligió un procedimiento que da la misma señal de fluorescencia como indicación de la presencia de un marcador de proliferación. Este procedimiento es adecuado para mejorar la sensibilidad de la detección de las características de proliferación celular. Cuando sea necesario, se puede aplicar el procedimiento para obtener una señal detectable para tres, cuatro o incluso más moléculas marcadoras de las características de la proliferación celular. De manera análoga, en ciertas circunstancias puede ocurrir lo mismo para los productos de expresión del gen INK4a. Se debe comprender que, en caso necesario, pueden ser deseables diferentes señales de tinción para diferentes moléculas marcadoras de proliferación. Los procedimientos se pueden aplicar a las necesidades del experimento correspondiente.
Según la presente invención, los productos del gen INK4a y/o los productos del gen del marcador de proliferación se pueden detectar simultáneamente. En este contexto simultáneamente, según la presente invención, significa literalmente en el mismo instante o en el mismo procedimiento de prueba, en el que las etapas detección aisladas son consecutivas en el tiempo.
El procedimiento de detección según la presente invención puede comprender además un procedimiento de tinción citoquímica que da una tinción cromógena o fluorescente de células o compartimentos celulares. Esos procedimientos de tinción son conocidos a los expertos en la materia y pueden comprender, por ejemplo, tinción de estructuras acidófilas o basófilas o de regiones subcelulares (por ejemplo, núcleo, mitocondrias, aparato de Golgi, citoplasma, etc.) o de moléculas específicas (cromosomas, lípidos, glucoproteínas, polisacáridos, etc.) de las muestras citológicas. También se pueden emplear colorantes fluorescentes como DAPI, quinacrina, cromomicina, etc. Además, se pueden aplicar colorantes cromógenos como Azan, naranja de acridina, hematoxilina, eosina, rojo Sudán, colorantes de tiamina (azul de toluidina, tionina). En otras formas de realización se pueden usar en el transcurso de un procedimiento como el que se describe en esta solicitud procedimientos de tinción como tinción de Papanicolau, tinción de Giemsa, tinción de hematoxilina-eosina, tinción de van Gieson, tinción de Schiff (usando reactivo de Schiff), procedimientos de tinción empleando precipitación de metales (como, por ejemplo, plata en procedimientos de tinción que emplean nitrato de plata) o tinciones insolubles como, por ejemplo, azul de Turnbull (u otros cianuros metálicos insolubles). Se debe comprender que los colorantes y procedimientos de tinción citados son ejemplos de los procedimientos que se pueden aplicar, y que se puede aplicar cualquier otro procedimiento conocido en la técnica a un procedimiento como el que se describe en esta solicitud.
Los procedimientos de tinción pueden producir tinciones cromógenas para el examen con microscopia óptica o tinciones fluorescentes para el examen con microscopia de fluorescencia. En otra forma de realización de la presente invención se pueden usar procedimientos emisores de radiación, procedimientos que emplean sustancias que alteran la transmisión de la radiación u otros medios de contraste para visualizar las condiciones citológicas de una muestra (por ejemplo, la generación de una impresión óptica por medios como generación de imágenes (micro)autorradiográfica o (micro) radiográfica) en un procedimiento según la presente invención.
Todos los procedimientos de tinción y visualización se pueden usar para el análisis no sólo en procedimientos microscópicos sino también en procedimientos de análisis automatizado como citometría de flujo, análisis microscópico automatizado (computarizado o asistido por ordenador) o cualquier otro procedimiento para el análisis de muestras citológicas teñidas.
El análisis de los resultados de la tinción o de la visualización de los diferentes procedimientos se puede realizar en una sola etapa de análisis o en diferentes etapas sucesivas. Por ejemplo, el examen con microscopia óptica de una muestra se puede realizar antes o después del examen con microscopia de fluorescencia de la muestra. En la microscopia de fluorescencia el análisis de diferentes tinciones con diferentes longitudes de onda de excitación se puede realizar de manera simultánea o secuencial. Se pueden emplear otros procedimientos de visualización de manera simultánea o secuencial a los procedimientos que se han citado.
Puede haber varias circunstancias en las que serán adecuadas combinaciones de diferentes procedimientos de tinción. Por ejemplo, en los casos en los que no se pueden conseguir resultados satisfactorios de tinción citológica mediante tinción inmunoquímica, puede ser adecuada la aplicación adicional de técnicas de tinción citológica general.
Una muestra según el procedimiento de la presente invención puede comprender cualquier muestra que comprende células. Las muestras pueden comprender, por ejemplo, secreciones, frotis, líquidos corporales y muestras de células o de tejidos.
En una forma de realización de la presente invención las muestras comprenden células del tracto anogenital, del aparato respiratorio o de la piel y sus anejos. En ciertas formas de realización las células pueden ser células de cuello uterino, vagina, vulva, pene, ano, recto, árbol bronquial, pulmón, peritoneo, espacio peritoneal, espacio nasofaríngeo, cavidad oral o piel. En ciertas formas de realización de la presente invención la muestra puede ser una muestra histológica, una biopsia o una muestra citológica como, por ejemplo, un frotis, un exudado, un lavado, y un líquido corporal que contiene células (esputo, secreción, saliva, etc.). En ciertas formas de realización de la presente invención las muestras pueden comprender células infectadas por el virus del papiloma. En ciertas formas de realización las muestras pueden comprender frotis cervicales, lavados broncoalveolares, etc.
En ciertas formas de realización especiales de la presente invención la muestra se puede preparar como una preparación en monocapa o en capa fina de una muestra citológica. Los procedimientos correspondientes para la preparación de una preparación en monocapa o en capa fina en citología son conocidos a los expertos en la materia. En una forma de realización la preparación puede comprender, por ejemplo, la tecnología ThinPrep. Otros procedimientos comprenden frotis convencionales, o procedimientos que emplean suspensiones de células para la preparación de las muestras citológicas.
La preparación de una muestra puede comprender, por ejemplo, obtener una muestra de un tejido, de un líquido corporal o de células de un paciente. Según la presente invención la preparación de la muestra también puede comprender varias etapas de preparaciones ulteriores de la muestra, como preparación de disecciones, preparación de suspensiones celulares, extensión o aplicación de las células que se van a examinar a portaobjetos microscópicos, preparación de matrices tisulares, aislamiento de polipéptidos o de ácidos nucleicos, preparación de péptidos o ácidos nucleicos de fase sólida fija o preparación de cuentas, membranas o portaobjetos a los que se unen de manera covalente o no covalente las moléculas que se van a determinar.
En ciertas formas de realización de la presente invención el procedimiento se puede realizar de manera automatizada. La automatización del procedimiento se puede conseguir mediante tinción y análisis automatizado de muestras histológicas o citológicas en una superficie sólida mediante procedimientos microscópicos. En otra forma de realización la automatización puede comprender un análisis mediante cítometría de flujo de la tinción de las células en solución.
Las lesiones displásicas a las que se puede aplicar el procedimiento de la presente invención comprenden cualquier lesión displásica caracterizada por sobreexpresión de los productos del gen INK4a como, por ejemplo, p16^{INK4a} o p14ARF. En ciertas formas de realización esas lesiones son displasias asociadas a infecciones por virus del papiloma como, por ejemplo, VPH. En una forma de realización el VPH puede ser un subtipo de VPH de alto riesgo, como VPH16, VPH18, VPH31, VPH33, VPH35, VPH39, VPH45, VPH51, VPH52, VPH56, VPH58, VPH59, VPH66, VPH68, etc. En una forma de realización las lesiones displásicas que se pueden detectar según la presente invención comprenden lesiones anogenitales, lesiones del tracto respiratorio, lesiones de la cabeza y del cuello o lesiones de la piel y de sus anejos. Esas lesiones pueden comprender, por ejemplo, displasias de ano o recto, vulva, vagina, cuello del útero o pene, árbol bronquial, pulmón, cavidad oral o espacio nasofaríngeo.
Otro aspecto de la presente invención es un kit de prueba para realizar el procedimiento según la presente invención. El kit puede ser, por ejemplo, un kit de diagnóstico o un kit de investigación.
Así, un kit de la presente invención comprende al menos una o más sondas para la detección de la presencia o ausencia y/o el nivel de la sobreexpresión de al menos un producto del gen INK4a y al menos un producto de un gen de un marcador de proliferación celular en muestras biológicas, en el que los componentes del kit se proporcionan de tal manera que permiten la detección simultánea de al menos un producto del gen INK4a y al menos un producto de un gen de un marcador de proliferación celular en una sola célula de las muestras y en el que se generan al menos dos señales detectables distinguibles, de las que al menos una señal detectable es indicadora del nivel de expresión de al menos un producto del gen INK4a y al menos otra señal detectable es indicadora del nivel de expresión de al menos un gen de un marcador de proliferación celular.
Los reactivos para la detección de los productos del gen del marcador pueden incluir cualquier agente capaz de unirse a los productos del gen del marcador. Esos reactivos pueden incluir proteínas, polipéptidos, ácidos nucleicos, ácidos nucleicos unidos a péptidos, glucoproteínas, proteoglucanos, polisacáridos y lípidos.
Las muestras del producto del gen INK4a y del producto del gen del marcador de proliferación para realizar un control positivo pueden comprender, por ejemplo, ácidos nucleicos en forma aplicable, como una solución o una sal, péptidos en forma aplicable, muestras de sección de tejidos o células positivas.
En una forma de realización preferida de la invención la detección de los productos del gen del marcador se realiza a nivel de polipéptidos. En esta forma de realización los agentes de unión pueden ser, por ejemplo, anticuerpos específicos de los productos del gen del marcador o de fragmentos del mismo.
En otra forma de realización del kit de prueba la detección de los productos del gen del marcador se realiza a nivel del ácido nucleico. En esta forma de realización de la invención el reactivo para la detección puede ser, por ejemplo, una sonda de ácidos nucleicos o un cebador inverso complementario a dichos ácidos nucleicos indicadores.
Así, el problema a resolver era obtener un procedimiento para discriminar entre células displásicas y otras células que carecían de potencial de crecimiento maligno. El procedimiento se puede aplicar a cualquier etapa de las displasias y puede ser especialmente útil en las etapas tempranas, cuando los procedimientos diagnósticos citológicos que se basan en la sobreexpresión de p16^{INK4a} precisan más información para la identificación de las células metaplásicas.
Además, la presente invención proporciona un kit para realizar el procedimiento según la presente invención.
Breve descripción de los dibujos
Figura 1
Tinción fluorescente de una muestra histológica del cuello del útero
La Figura 1 muestra la tinción de una displasia grave usando anticuerpos dirigidos frente a p16^{INK4a}; para los detalles experimentales, véase el Ejemplo 1; la inmunorreactividad a p16^{INK4a} produce fluorescencia verde. Casi todas las células de la lesión están teñidas positivamente de manera difusa en el citoplasma y en los núcleos.
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Figura 2
Tinción fluorescente de una muestra histológica del cuello del útero
La Figura 2 muestra la tinción de una displasia grave usando anticuerpos dirigidos frente a Ki67; para los detalles experimentales, véase el Ejemplo 1; la inmunorreactividad a Ki67 produce fluorescencia roja. Muchas células de la displasia muestran positividad nuclear para Ki67.
Figura 3
Doble tinción fluorescente de una muestra histológica del cuello del útero
La Figura 3 muestra la tinción de una displasia grave usando anticuerpos dirigidos frente a Ki67 y anticuerpos dirigidos frente a p16^{INK4a}; para los detalles experimentales, véase el Ejemplo 1; la inmunorreactividad a Ki67 produce fluorescencia roja; la inmunorreactividad a p16^{INK4a} produce fluorescencia verde; el solapamiento de la fluorescencia roja y verde produce fluorescencia amarilla. Muchas células de la displasia muestran positividad nuclear para Ki67 además de la positividad para p16^{INK4a}, y de esta manera se produce fluorescencia amarilla.
Figura 4
Tinción fluorescente de una muestra histológica del cuello del útero
La Figura 4 muestra la tinción de una metaplasia escamosa usando anticuerpos dirigidos frente a p16^{INK4a}; para los detalles experimentales, véase el Ejemplo 1; la inmunorreactividad a p16^{INK4a} produce fluorescencia verde; algunas células de la metaplasia se tiñen positivamente de manera difusa en el citoplasma y en los núcleos.
Figura 5
Tinción fluorescente de una muestra histológica del cuello del útero
La Figura 5 muestra la tinción de una metaplasia escamosa usando anticuerpos dirigidos frente a Ki67; para los detalles experimentales, véase el Ejemplo 1; la inmunorreactividad a Ki67 produce fluorescencia roja. Muchas células de la metaplasia escamosa muestran positividad nuclear para Ki67. Las áreas que se han identificado como positivas por la expresión de p16^{INK4a} no muestran tinción positiva para Ki67, lo que indica ausencia de expresión del antígeno en estas áreas.
Figura 6
Doble tinción fluorescente de una muestra histológica del cuello del útero
La Figura 6 muestra la tinción de una displasia grave usando anticuerpos dirigidos frente a Ki67 y anticuerpos dirigidos frente a p16^{INK4a}; para los detalles experimentales, véase el Ejemplo 1; la inmunorreactividad a Ki67 produce fluorescencia roja; la inmunorreactividad a p161^{INK4a} produce fluorescencia verde; el solapamiento de la fluorescencia roja y verde produce fluorescencia amarilla. Las áreas que expresan positivamente p16^{INK4a} no muestran ninguna tinción positiva para Ki67, lo que indica ausencia de expresión del antígeno en estas áreas. Ninguna célula de la muestra da lugar a fluorescencia amarilla.
Los siguientes ejemplos se dan sólo con fines ilustrativos y no pretenden limitar el ámbito de la invención que se describe en esta solicitud. Con el objetivo ilustrativo, los procedimientos que se describen en esta solicitud se ejemplifican usando preparaciones histológicas. Los ejemplos histológicos pretenden juzgar si las células teñidas de una o de otra manera se deben clasificar como displásicas o metaplásicas. Los procedimientos se pueden transferir fácilmente a las muestras citológicas alterando el protocolo de manera adecuada. Estas alteraciones son conocidas a las personas que tienen conocimientos normales de la materia.
Ejemplo 1 Detección mediante inmunofluorescencia de la sobreexpresión de p16^{INK4a} y Ki67 en muestras del cuello uterino (doble tinción)
Secciones de muestras tisulares del cuello del útero fijadas en formalina e incluidas en parafina se tiñeron con inmunofluorescencia usando de anticuerpos específicos para p16^{INK4a} y Ki67.
Las secciones tisulares se rehidrataron mediante incubación en xileno y etanol graduado, y se transfirieron a agua bidestilada. Se realizó la retirada de los antígenos con tampón citrato 10 mM (pH 6,0) para p16^{INK4a} y Ki67. Posteriormente los portaobjetos se calentaron en un baño de agua durante 40 min a 95ºC-98ºC. Se enfriaron los portaobjetos a TA durante 20 min, se transfirieron a tampón de lavado (Tris-HC1 50 mM, NaCl 150 nM, Tween 20/DakoCytomation: nº de código: S3006, al 0,05%).
Para evitar la unión inespecífica del anticuerpo secundario (especie: cabra), las muestras se incubaron con suero de cabra al 10% durante 30 min a TA.
Posteriormente se incubaron los portaobjetos con los anticuerpos primarios, anticuerpo de ratón anti-p16^{INK4a} humano (3,48 \mug/ml) y anticuerpo de conejo anti-Ki67 (1:25) durante 30 min a TA, las preparaciones se lavaron con tampón de lavado y se colocaron en un baño de tampón limpio durante 5 min. Se eliminó el exceso de tampón y cada muestra se cubrió con 200 \mul del reactivo secundario, que contenía anticuerpos de cabra anti-ratón conjugados con AlexaFluor®488 y anticuerpos de cabra anti-conejo conjugados con AlexaFluor®546 y posteriormente se incubó durante 30 min a TA. Los portaobjetos se lavaron dos veces como se ha indicado antes y se montaron directamente con un medio de montaje especial para fluorescencia.
El examen microscópico de los portaobjetos muestra que las células inmunorreactivas a p16^{INK4a} y que también son inmunorreactivas a Ki67 se pueden encontrar sólo en muestras que se pueden identificar microscópicamente como muestras de lesiones displásicas. Las células que se tiñen con la reacción específica para p16^{INK4a}, que se originan en metaplasias, no se tienen por la reacción específica para Ki67. El examen microscópico de la tinción del marcador de proliferación celular muestra que las células metaplásicas que sobreexpresan p16^{INK4a} no son inmunorreactivas con los anticuerpos dirigidos frente a Ki67. Por el contrario, las muestras que contienen áreas de tejido displásico contienen células que son inmunorreactivas a Ki67 y a anticuerpos dirigidos frente a p16^{INK4a}. Por lo tanto, al contrario que en las displasias, en las metaplasias no se pueden teñir doblemente las células usando los anticuerpos específicos de Ki67 y p16^{INK4a}.
Las Figuras 1-6 muestran los resultados de la tinción para una displasia grave del cuello del útero y para una metaplasia escamosa usando anticuerpos dirigidos frente a Ki67 y anticuerpos dirigidos frente a p16^{INK4a}. La inmunorreactividad a Ki67 produce fluorescencia roja, la inmunorreactividad a p161^{INK4a} produce fluorescencia verde y el solapamiento de la fluorescencia roja y verde produce fluorescencia amarilla. En la muestra displásica (figuras 1-3) muchas células de la displasia muestran positividad nuclear para Ki67, además de positividad para p16^{INK4a}, y así producen fluorescencia amarilla (véase la Figura 3). Por el contrario, en la muestra metaplásica (Figuras 4-6) las zonas que expresan positivamente p16^{INK4a} no muestran ninguna tinción positiva para Ki67, lo que indica ausencia de expresión del antígeno en estas zonas. En esta muestra se puede observar la doble tinción (Figura 6), y así ninguna célula de la muestra produce fluorescencia amarilla.
Los resultados muestran que la doble tinción de las células con reactivos específicos para Ki67 permite discriminar las metaplasias que sobreexpresan p16^{INK4a} de las displasias.
Ejemplo 2 Detección de células que coexpresan p14ARF y mcm2 en muestras del cuello del útero mediante hibridación in situ
Se puede analizar semicuantitativamente el nivel de ARNm de p16^{INK4a} y de mcm2 en frotis del cuello del útero en una reacción de tinción in situ. La reacción de tinción se realiza como sigue:
Para la rehidratación, los frotis fijados con aerosol se incuban en EtOH limpio al 50% en un dispositivo basculante. La película de PEG que se produce por el procedimiento de fijación se elimina mediante lavado intensivo. Después, los frotis se lavan con agua bidestilada. Los frotis se incuban con proteinasa K (10 \mug/ml en STF) durante 10 min a 37ºC. Posteriormente los portaobjetos se transfieren a tampón de lavado (STF/Tween20 al 0,1%) y finalmente la zona que contenía las células se rodean con un lápiz lipídico.
La mezcla de hibridación se prepara mezclando 50 \mul de tampón de hibridación para uso inmediato (DAKO A/S, Glostrup, Dinamarca) con aproximadamente 5-10 pmol de las sondas. Las sondas son oligonucleótidos de secuencias complementarias a los respectivos ARNm marcados con biotina y digoxigenina.
La mezcla de hibridación se calienta a 95ºC y posteriormente se equilibra a 37ºC. Después de los procedimientos de ebullición los frotis se incuban cada uno de ellos con 50 \mul de la mezcla de hibridación durante cuatro horas a 42ºC. Las muestras se lavan con volúmenes en exceso de los tampones de lavado dos veces en 2 x CSE a 37ºC durante 15 min y una vez en 1 x CSE a 37ºC durante 15 min. Posteriormente los frotis se lavan dos veces a temperatura ambiente en 2 x CSE. Después de este procedimiento de lavado las disecciones se incuban durante 30 min con tampón de bloqueo (NEN, Blockingbuffer) a temperatura ambiente. Posteriormente se incuba durante una hora con estreptavidina-fosfatasa alcalina diluida al 1:100 (en tampón de bloqueo, véase más arriba) y con anticuerpos monoclonales de ratón anti-digoxigenina marcados con HRP (Molecular Probes). Posteriormente los frotis se lavan dos veces en 1 x STF/TritonX-100 al 0,1% durante 10 min a temperatura ambiente, seguido de una etapa de lavado con 1 x STF y MgCl_{2} 50 mM (pH 9,2) durante 10 min a temperatura ambiente. Posteriormente se realiza la reacción de tinción con ELF 97 fosfato (Molecular Probes) durante 10 s a 7 min a temperatura ambiente. El exceso de sustrato se lava tres veces con 1 x STF/TritonX-100 al 0,1% durante 10 min a temperatura ambiente. En una segunda etapa de tinción la sección se incuba con tiramidas- Alexa-Fluor 594 durante 10 s a 7 min. El exceso de sustrato se lava tres veces con 1 x STF/TritonX-100 al 0,1% durante 10 min a temperatura ambiente. Finalmente los frotis se sumergen en agua destilada y se incluyen con medio de montaje de fluorescencia (DakoCytomation). Posteriormente las disecciones teñidas se pueden analizar mediante microscopia de fluorescencia.
El examen microscópico de los portaobjetos muestra que las células positivas para la expresión de p16^{INK4a} y que también expresan mcm2 sólo se pueden encontrar en muestras que se pueden identificar microscópicamente como muestras de lesiones displásicas. Las células que se tiñen con la reacción específica para p16^{INK4a} y que se pueden identificar como metaplasias no se tiñen con la reacción específica para mcm2. El examen microscópico de la hibridación de ARNm muestra que las células metaplásicas que sobreexpresan p16^{INK4a} no expresan significativamente ARNm de mcm2. por el contrario, las células displásicas se pueden teñir mediante hibridación in situ con sondas específicas de mcm2 y con sondas dirigidas frente a p16^{INK4a}. Por lo tanto, al contrario que en las células displásicas, en las células metaplásicas no se puede observar doble tinción usando las sondas específicas para Ki67 y p16^{INK4a}.
Los resultados muestran que la doble tinción de las células con reactivos específicos para mcm2 permite discriminar las metaplasias que sobreexpresan p16^{INK4a} de las displasias.
Ejemplo 3 Detección con inmunofluorescencia de la sobreexpresión de p16^{INK4a} y Ki-S2 en muestras del cuello del útero (doble tinción)
Las muestras citológicas fijadas con Merckofix® (frotis convencionales y citología basada en líquido (ThinPreps®)) del cuello del útero se tiñeron con inmunofluorescencia usando anticuerpos específicos para p16^{INK4a} y Ki-S2.
Los frotis convencionales y las muestras citológicas basadas en líquido (ThinPreps®) se rehidrataron en etanol (50%) durante 10 min y se transfirieron a agua bidestilada. La recuperación de los antígenos se realizó con tampón citrato 10 mM (pH 6,0) para p161NK4a y Ki67. posteriormente los portaobjetos se calentaron en un baño de agua durante 40 min a 95ºC-98ºC. Los portaobjetos se enfriaron a TA durante 20 min, se transfirieron a tampón de lavado (Tris-HC1 50 mM, NaCl 150 nM, Tween 20/DakoCytomation: nº de código: S3006, al 0,05%) y finalmente las muestras se rodearon con un lápiz lipídico.
Para evitar la unión inespecífica del anticuerpo secundario (especie: cabra), las muestras se incubaron con suero de cabra al 10% durante 30 min a TA.
Posteriormente se incubaron los portaobjetos con los anticuerpos primarios, anticuerpos de ratón anti-p16^{INK4a} humano (clon E6H4) (3,48 \mug/ml) y anticuerpo de conejo anti-Ki67 (1:25) durante 30 min a TA, las preparaciones se lavaron con tampón de lavado y se colocaron en un baño de tampón limpio durante 5 min. Se eliminó el exceso de tampón y cada muestra se cubrió con 200 \mul del reactivo secundario, que contenía anticuerpos de cabra anti-ratón conjugados con AlexaFluor®488 y anticuerpos de cabra anti-conejo conjugados con AlexaFluor®546 y posteriormente se incubó durante 30 min a TA. Los portaobjetos se lavaron dos veces como se ha indicado antes y se montaron directamente con un medio de montaje especial para fluorescencia.
El examen microscópico de los portaobjetos muestra que las células inmunorreactivas a p16^{INK4a} y que también son inmunorreactivas a Ki-S2 se pueden identificar microscópicamente como células displásicas. Las células que se tiñen con la reacción específica para p16^{INK4a}, y que no se tiñen por la reacción específica para Ki-S2, se pueden clasificar por un anatomopatólogo experimentado como metaplásicas o de origen endometrial. El examen microscópico de la tinción del marcador de proliferación celular muestra que las células metaplásicas que sobreexpresan p16^{INK4a} no son inmunorreactivas con los anticuerpos dirigidos frente a Ki-S2. Por el contrario, las células displásicas son inmunorreactivas a Ki-S2 y a anticuerpos dirigidos frente a p16^{INK4a}. Por lo tanto, al contrario que las células displásicas, en las metaplasias no se puede teñir doblemente ninguna célula usando los anticuerpos específicos de Ki-S2 y de p16^{INK4a}.
Los resultados muestran que la doble tinción de las células con reactivos específicos para Ki-S2 permite discriminar las células metaplásicas que sobreexpresan p16^{INK4a} de las células displásicas.
Ejemplo 4 Detección con inmunofluorescencia de la sobreexpresión de p16^{INK4a}, Ki67 y PCNA en muestras de lavado broncoalveolar de individuos con carcinoma microcítico de pulmón diagnosticado (doble tinción)
Las células contenidas en las muestras de lavado broncoalveolar de los pacientes se prepararon según la tecnología ThinPrep. Las muestras citológicas fijadas con Merckofix® de los lavados de los pacientes con carcinoma microcítico de pulmón diagnosticado se tiñeron con inmunofluorescencia usando anticuerpos específicos de p16^{INK4a}, Ki67 y PCNA.
En este experimento se usó un procedimiento que no discrimina entre la tinción que se origina por la inmunorreactividad frente a los dos marcadores de proliferación PCNA y Ki67. En el contexto de la presente invención no es necesario responder a si se expresa uno u otro marcador de proliferación en las células. La pregunta principal es si se expresa algún marcador de proliferación. Por lo tanto, en el transcurso de los experimentos se eligió un procedimiento que da la misma señal fluorescencia como indicación de la presencia de un marcador de proliferación. Este procedimiento es adecuado para mejorar la sensibilidad de la detección de las características de proliferación celular. Cuando sea necesario se puede aplicar el procedimiento para obtener una señal detectable para tres, cuatro o incluso más moléculas marcadoras características de la proliferación celular. De manera análoga, en ciertas circunstancias puede ocurrir lo mismo con los productos de expresión del gen INK4a. Se debe comprender que en algunas situaciones pueden ser deseables señales de tinción diferentes para diferentes moléculas marcadoras de proliferación. Los procedimientos se pueden aplicar a las necesidades del experimento correspondiente.
Las secciones tisulares se rehidrataron mediante incubación en xileno y etanol graduado, y se transfirieron a agua bidestilada. Los frotis convencionales y las muestras citológicas basadas en líquidos (ThinPreps) se rehidrataron en etanol (50%) durante 10 min y se transfirieron a agua bidestilada. Se realizó la retirada de los antígenos con tampón citrato 10 mM (pH 6,0) para p16^{INK4a}, Ki67 y PCNA. Posteriormente los portaobjetos se calentaron en un baño de agua durante 40 min a 95ºC-98ºC. Los portaobjetos se enfriaron a TA durante 20 min, se transfirieron a tampón de lavado (Tris-HC1 50 mM, NaCl 150 nM, Tween 20/DakoCytomation: nº de código: S3006, al 0,05%) y finalmente las muestras se rodearon con un lápiz lipídico.
Para evitar la unión inespecífica del anticuerpo secundario (especie: cabra), las muestras se incubaron con suero de cabra al 10% durante 30 min a TA.
Posteriormente se incubaron los portaobjetos con los anticuerpos primarios, anticuerpos de ratón anti-p16^{INK4a} humano (3,48 \mug/ml), anticuerpos de conejo anti-Ki67 y anticuerpos de conejo anti-PCNA (cada uno de ellos a 1:25) durante 30 min a TA, las preparaciones se lavaron con tampón de lavado y se colocaron en un baño de tampón limpio durante 5 min. Se eliminó el exceso de tampón y cada muestra se cubrió con 200 \mul del reactivo secundario, que contenía anticuerpos de cabra anti-ratón conjugados con AlexaFluor®488 y anticuerpos de cabra anti-conejo conjugados con AlexaFluor®546 y posteriormente se incubó durante 30 min a TA. Los portaobjetos se lavaron dos veces como se ha indicado antes y se montaron directamente con un medio de montaje especial para fluorescencia.
El examen microscópico de los portaobjetos muestra que las células inmunorreactivas a p16^{INK4a} y que también son inmunorreactivas a Ki67 o PCNA se pueden identificar microscópicamente como células de cáncer microcítico de pulmón. Las células que se tiñen con la reacción específica para p16^{INK4a}, que se originan en metaplasias, no se tiñen por la reacción específica para Ki67 y PCNA. El examen microscópico de la tinción del marcador de proliferación celular muestra que las células metaplásicas que sobreexpresan p16^{INK4a} no son inmunorreactivas a los anticuerpos dirigidos frente a Ki67 y PCNA. Por el contrario, las muestras que contienen células displásicas contienen células que son inmunorreactivas a Ki67/PCNA y a anticuerpos dirigidos frente a p16^{INK4a}. Por lo tanto, al contrario que en las displasias, en las metaplasias no se pueden teñir triplemente las células usando los anticuerpos específicos de Ki67, PCNA y p16^{INK4a}.
Los resultados muestran que la triple tinción de las células con reactivos específicos para Ki67/PCNA permite discriminar las metaplasias que sobreexpresan p16^{INK4a} de las displasias.
Ejemplo 5 Detección con citometría de flujo de células displásicas mediante la detección simultánea de ARNm de mcm5, proteína p14ARF y proteína Ki67 en células de origen cervical
Las muestras citológicas (suspensiones celulares en STF, pH 7,4) del cuello del útero se tiñeron con fluorescencia usando anticuerpos específicos para p14ARF y Ki67 y oligosondas para mcm5 y se evaluaron mediante análisis de FACS fluorescente en tres colores.
Las células se centrifugaron, el sobrenadante se decantó y se fijó y permeabilizó con 100 ml de Permeafix (Ortho Diagnostic, Raptan, NJ, EE.UU.) durante una hora a temperatura ambiente. Las células se lavaron en STF estéril a pH 7,4, se granularon y se volvieron a suspender en 100 ml de Permeafix durante una hora a temperatura ambiente. Las células se lavaron en STF estéril a pH 7,4, se granularon y se volvieron a suspender en STF estéril. Se incubaron con anticuerpos anti-p14ARF conjugados con PE y anticuerpos anti-Ki67 conjugados con PE-Cy5 durante una hora a + 4ºC. Las células se lavaron en STF estéril a pH 7,4, se granularon y se volvieron a suspender en 100 ml de Permeafix durante 30 min a temperatura ambiente. Las células se lavaron en STF estéril a pH 7,4, se granularon mediante centrifugación, y posteriormente se lavaron otra vez en 2 x citrato salino estándar (CSE). Después de la centrifugación, el gránulo celular se volvió suspender en solución de hibridación (2 x CSE, formamida al 30%, espermatozoides de salmón sonicados y ADN de transferencia de levadura) que contenía 500 ng de sondas de oligonucleótidos específicas de mcm5 marcadas en los dos extremos con 5-carboxi-fluoresceína. La hibridación intercelular se realizó a 42ºC durante una hora, seguida de lavados sucesivos en 2 x CSE y TritonX-100 al 0,5% y 1 x SCC y TritonX-100 al 0,5% a 42ºC. Para el análisis las células se volvieron a suspender en STF a pH 8,3 y se analizaron en un citómetro de flujo (FACScan, Becton Dickinson, IS). Para cada análisis se recogieron 30.000-100.000 acontecimientos sincronizados. El análisis de los datos se realizó usando CellQuest (Becton Dickinson, IS).
El análisis del citómetro de flujo muestra que las células inmunorreactivas a p14ARF y que también son inmunorreactivas a Ki67 y/o reactivas a las oligosondas de mcm5 sólo se pudieron identificar en muestras de pacientes que tenían lesiones displásicas del cuello del útero. Las muestras de mujeres que no tenían lesiones displásicas no mostraron tinción simultánea de p14ARF con Ki67 ni mcm5. Los resultados muestran que la tinción doble o triple de las células con reactivos específicos para Ki67 y/o mcm5 permite discriminar las células no displásicas que sobreexpresan p14ARF de las células displásicas que sobreexpresan p14ARF.

Claims (38)

1. Un procedimiento para discriminar las células displásicas que sobreexpresan los productos del gen INK4a de otras células que expresan productos del gen INK4a a un nivel detectable en muestras biológicas, que comprende la determinación en un procedimiento de prueba citológico o histológico de la coexpresión de al menos dos moléculas marcadoras en al menos una sola célula, en el que al menos una molécula marcadora es un producto de expresión codificado por el gen INK4a y al menos otra molécula marcadora es un marcador de proliferación celular, en el que la sobreexpresión de al menos un producto del gen INK4a y la expresión de al menos un marcador de proliferación celular activa a una un nivel detectable en dicha célula única es indicadora del estado displásico de la célula y en el que la sobreexpresión de al menos un producto del gen INK4a y la expresión de al menos un marcador de senescencia, diferenciación celular terminal, apoptosis o detención del ciclo celular a un nivel detectable en dicha célula única es indicadora del estado no displásico de la célula.
2. Un procedimiento según la reivindicación 1, en el que se detecta un conjunto de dos o más marcadores de proliferación celular.
3. Un procedimiento según la reivindicación 1 ó 2, en el que al menos un producto del gen INK4a tiene un peso molecular entre 13 y 19 kDa.
4. Un procedimiento según las reivindicaciones 1 a 3, en el que al menos un producto del gen INK4a es seleccionado de un grupo que comprende p16^{INK4a} y p14ARF.
5. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones procedentes, en el que al menos un marcador de proliferación celular se selecciona de un grupo que comprende un marcador de proliferación necesaria para el mantenimiento de la proliferación celular, un marcador de proliferación que participa en la replicación del ADN, un marcador de proliferación que es un miembro de la horquilla de replicación o que la codifica, un marcador de senescencia, un marcador de detención del ciclo celular y un marcador de apoptosis.
6. El procedimiento según la reivindicación 5, en el que el producto génico necesario para el mantenimiento de la proliferación celular es una molécula seleccionada de un grupo que comprende moléculas Ki67, moléculas Ki-S5 y moléculas Ki-S2.
7. El procedimiento según la reivindicación 5, en el que el producto génico que participa en la replicación del ADN se selecciona de un grupo que comprende helicasas o subunidades de las mismas, moléculas del ciclo de división celular (cdc), moléculas fosfatasa y moléculas cinasa.
8. El procedimiento según la reivindicación 7, en el que las helicasas o las subunidades de las mismas se seleccionan de un grupo que comprende MCM2, MCM3, MCM4, MCM5, MCM6, MCM7 y HELAD1.
9. El procedimiento según la reivindicación 7, en el que las moléculas cdc, las cinasas y las fosfatasas se seleccionan de un grupo que comprende proteín cinasa CDC6 y CDC7, Dbf14, proteín fosfatasa CDC14, CDC45 y MCM10.
10. El procedimiento según la reivindicación 5, en el que las moléculas que participan en la horquilla de replicación se seleccionan de un grupo que comprende PCNA y POLD.
11. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en el que el producto génico es un polipéptido o una molécula de ácido nucleico.
12. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que además se detecta al menos otra molécula marcadora para mejorar la evaluación del diagnóstico o del pronóstico.
13. Un procedimiento según la reivindicación 12, en el que la molécula marcadora adicional es al menos otra molécula marcadora de proliferación.
14. Un procedimiento según la reivindicación 12 ó 13, en el que la molécula marcadora adicional se selecciona de un grupo que comprende un marcador de senescencia, un marcador de apoptosis, un marcador de detención del ciclo celular, un marcador de la diferenciación terminal de las células, un marcador de infección vírica, un marcador de actividad vírica, una proteína reguladora del ciclo celular, un producto génico necesario para el mantenimiento de la proliferación celular, un producto génico que participa en la replicación de ADN, un producto génico que es un miembro de la horquilla de replicación.
15. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones precedentes en el que se aplica además un procedimiento de tinción citológica que emplea al menos un colorante que se selecciona de un grupo que comprende DAPI, quinacrina, cromomicina, Azan, naranja de acridina, hematoxilina, eosina, rojo Sudán, azul de toluidina y tionina, o un procedimiento de tinción que se selecciona de un grupo que comprende tinción de Papanicolau, tinción de Giemsa, tinción de hematoxilina-eosina, tinción de van Gieson, tinción de Schiff, tinción con precipitados metálicos, tinción con azul de Turnbull y tinción con cianuros metálicos.
16. El procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que las células displásicas son células de una lesión cancerosa o precancerosa.
17. El procedimiento según la reivindicación 16, en el que las células displásicas son células de una displasia que se asocian a un virus del papiloma.
18. El procedimiento según la reivindicación 17, en el que el virus del papiloma es un virus del papiloma humano de alto riesgo que se selecciona de un grupo que comprende VPH16, VPH18, VPH31, VPH33, VPH35, VPH39, VPH45, VPH51, VPH52, VPH56, VPH58, VPH59, VPH66 y VPH68.
19. El procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 18, en el que la lesión se selecciona de un grupo que comprende una lesión del tracto anogenital, una lesión del aparato respiratorio y una lesión de la piel y de sus anejos.
20. El procedimiento según la reivindicación 17 ó 19, en el que la lesión se selecciona de un grupo que comprende una lesión del cuello del útero, una lesión de la vagina, una lesión de la vulva, una lesión del pene, una lesión del ano, una lesión del recto, una lesión del árbol bronquial, una lesión del pulmón, una lesión del espacio peritoneal, una lesión del espacio nasofaríngeo, una lesión de la cavidad oral o una lesión de la piel.
21. Un procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que la muestra biológica es una muestra que contiene células que se originan en el tracto anogenital, en el aparato respiratorio o en la piel y sus anejos.
22. Un procedimiento según la reivindicación 21, en el que las células son células que se originan en el cuello del útero, la vagina, la vulva, el pene, el ano, el recto, el árbol bronquial, el pulmón, el espacio nasofaríngeo, la cavidad oral o la piel.
23. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que la muestra biológica es una preparación citológica o histológica.
24. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que la detección de los productos del gen INK4a y/o las moléculas marcadoras de proliferación celular se realiza usando al menos una sonda que reconoce específicamente al menos una de las moléculas respectivas que se van a detectar.
25. Un procedimiento según la reivindicación 24, en el que al menos una sonda tiene una marca detectable.
26. Un procedimiento según la reivindicación 25, en el que al menos una marca se selecciona del grupo que comprende un radioisótopo, un compuesto bioluminiscente, un compuesto quimioluminiscente, un compuesto fluorescente, un quelato metálico o un enzima.
27. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 24 a 26, en el que al menos una sonda es una proteína y/o un ácido nucleico.
28. Un procedimiento según la reivindicación 27, en el que al menos una sonda es un anticuerpo dirigido frente a un producto génico codificado por INK4a o un producto de un gen de un marcador de proliferación celular.
29. El procedimiento según la reivindicación 28, que comprende un procedimiento de tinción inmunocitoquímica.
30. El procedimiento según la reivindicación 25 ó 26, en el que al menos una sonda es un ácido nucleico que se hibrida específicamente con un producto del gen INK4a o con un producto de un gen de un marcador de proliferación celular.
31. El procedimiento según la reivindicación 30, que comprende una reacción de hibridación in situ.
32. El procedimiento según la reivindicación 30, que comprende una reacción de amplificación de un ácido nucleico.
33. El procedimiento según la reivindicación 32, en el que la reacción de amplificación de un ácido nucleico es PCR, NASBA o LCR.
34. Un procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que las reacciones de detección que usan sondas de ácidos nucleicos y sondas de polipéptidos se realizan simultáneamente.
35. Un kit para realizar un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, que es un kit de diagnóstico o un kit de investigación, que comprende al menos una o más sondas para la detección de la presencia o ausencia y/o el nivel de la sobreexpresión de al menos un producto del gen INK4a y al menos un producto de un gen de un marcador de proliferación celular en muestras biológicas, en el que los componentes del kit se proporcionan de tal manera que permiten la detección simultánea de al menos un producto del gen INK4a y al menos un producto de un gen de un marcador de proliferación celular en una sola célula de las muestras, y en el que se generan al menos dos señales detectables distinguibles, de las que al menos una señal detectable es indicadora del nivel de expresión de al menos un producto del gen INK4a y al menos otra señal detectable es indicadora del nivel de expresión de al menos un gen de un marcador de proliferación celular.
36. Un kit según la reivindicación 35, en el que los productos del gen INK4a se seleccionan de un grupo que comprende p16^{INK4a} y p14ARF.
37. Un kit según la reivindicación 35 ó 36, en el que los productos del gen del marcador de proliferación celular se seleccionan de un grupo que comprende CDC6, MCM3, MCM3, MCM4, MCMS, MCM6, MCM7, proteín cinasa CDC7, Dbf4, proteín fosfatasa CDC14, CDC45 y MCM10, Ki67, Ki-S2, PCNA y POLD.
38. El kit según las reivindicaciones 35 a 37 que además comprende al menos uno de los siguientes:
a.
Una muestra de p16^{INK4a} para realizar una reacción de un control positivo.
b.
Una muestra de p14ARF para realizar una reacción de un control positivo.
c.
Una muestra de Ki67 para realizar una reacción de un control positivo.
d.
Una muestra de Ki-S2 para realizar una reacción de un control positivo.
e.
Una muestra de MCM5 para realizar una reacción de un control positivo.
f.
Una muestra de MCM2 para realizar una reacción de un control positivo.
g.
Una muestra de PCNA para realizar una reacción de un control positivo.
h.
Reactivos para la detección de la presencia o ausencia y/o el nivel de p16^{INK4a}.
i.
Reactivos para la detección de la presencia o ausencia y/o la el nivel de p14ARF.
j.
Reactivos para la detección de la presencia o ausencia y/o el nivel de Ki67.
k.
Reactivos para la detección de la presencia o ausencia y/o el nivel de Ki-S2.
l.
Reactivos para la detección de la presencia o ausencia y/o el nivel de MCM5.
m.
Reactivos para la detección de la presencia o ausencia y/o la concentración de MCM2.
n.
Reactivos para la detección de la presencia o ausencia y/o el nivel de PCNA.
o.
Una o más muestras de productos del gen INK4a para realizar reacciones de controles positivos.
p.
Una o más muestras de productos de un gen de un marcador de proliferación celular para realizar reacciones de controles positivos.
q.
Uno o más reactivos para la detección de la presencia o ausencia y/o el nivel de otros productos del gen INK4a.
r.
Y uno o más reactivos para la detección de la presencia o ausencia y/o el nivel de otros productos de un gen de un marcador de proliferación celular.
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