ES2230586T3 - Proteina tab1 y asdn que la codifica. - Google Patents
Proteina tab1 y asdn que la codifica.Info
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Abstract
UN ADN QUE CODIFICA PARA LA PROTEINA TAB1 QUE POSEE ACTIVIDAD PARA ACTIVAR EL FACTOR TAK1 EN LA VIA DE SEÑALIZACION DE TGF {BE}, Y QUE POSEE LA SECUENCIA DE AMINOACIDOS DE LA FIG. 1.
Description
Proteína TAB1 y ADN que la codifica.
La presente invención se refiere a un gen que
codifica la proteína TAB1, que forma parte de la vía de transducción
de señal del Factor de Trasformación del Crecimiento \beta
(TGF\beta).
El TGF\beta es un factor multifuncional que
regula varias funciones celulares. Como una de esas funciones, el
TGF-\beta es responsable de la reparación y la
reproducción de tejidos con diversos tipos de lesión.
La producción anormal de
TGF-\beta en casos de lesión crónica, a veces da
como resultado un imbalance entre la reparación y la reproducción de
tejidos, y de este modo una fibrosis patológica. La fibrosis
hepática se conoce como una enfermedad que resulta de un imbalance
en la producción de TGF-\beta. En el hígado, el
TGF-\beta acelera la producción de proteínas de
matriz extracelular, que son responsables de la fibrosis, mientras
que inhibe la síntesis de enzimas catabólicas de las proteínas de
matriz extracelular, e induce los inhibidores de las enzimas
catabólicas, y de esta forma actúa como un factor causal principal
de la fibrosis hepática.
Uno de los miembros conocidos de la vía de
transducción de señal, que pertenece a la superfamilia de
TGF-\beta, es el sistema de Proteínas Quinasa
Quinasa Quinasa Activadas por Mitógeno (MAPKKK).
La vía de MAPK es una vía de transducción de
señal eucariótica conservada, que convierte las señales de receptor
en varias funciones, y el sistema comprende 3 proteínas quinasa
diferentes, específicamente la MAPKKK mencionada previamente, la
MAPKK y la MAPK, siendo la MAPK activada a través de la
fosforilación por MAPKK, y por su parte siendo la MAPKK activada por
la MAPKKK (E. Nishida et al., Trends Biochem. Sci. Vol. 18,
pag. 128 (1993); K.J. Blumer et al, op. cit. Vol. 19, pag.
236 (1994) ; R.J. David, op. cit. Vol. 19, pag. 470 (1994); C.J.
Marchall, Cell, Vol. 80, pag. 179 (1995)).
La TAK1, que es un miembro de la familia de las
MAPKKK, que funciona en las vías de transducción de señal, que
pertenecen a la superfamilia de TGF-\beta, ha sido
identificada por K. Yamaguchi (K. Yamaguchi et al., Science,
Vol. 270, pag. 2008 (1995)).
El TGF-\beta transduce la señal
a través de un complejo heteromérico de receptores de
TGF-\beta de tipo I y de tipo II, que son
proteínas trasmembrana, que comprenden dominios de quinasa
específicos de serina y de treonina citoplasmáticos (J.L. Wrana
et al., Nature, Vol. 370, pag. 341 (1994); D.M. Kingsley
et al., Genes Dev., Vol. 8, pag. 133 (1994)). Sin embargo, se
conoce poco, en el nivel molecular, sobre los mecanismos de
transducción de señal aguas abajo de los receptores de
TGF-\beta, y el gen que codifica la proteína TAB1
no ha sido clonado todavía.
La presente invención puede proporcionar un DNA
aislado que codifica la proteína TAB1, que es un nuevo miembro
descubierto en la vía de transducción de señal del receptor de
TGF-\beta, y un gen que codifica dicha proteína.
La presente invención además proporciona un método de escrutinio
para inhibidores de la vía de transducción de señal de
TGF-\beta. TAB1 se refiere a una proteína que se
une a TAK1) (TAK1 Binding protein).
La presente invención proporciona un DNA aislado
que codifica la proteína TAB1, que tiene la secuencia de aminoácidos
mostrada en la SEQ ID NO: 5, un DNA aislado que codifica una
proteína que tiene la secuencia de aminoácidos mostrada en la SEQ ID
No: 5 modificada por sustitución, supresión y/o adición de uno o más
aminoácidos en la secuencia de aminoácidos mostrada en la SEQ ID NO:
5, y que tiene las propiedades biológicas de la proteína TAB1; una
proteína en la que el aminoácido 52 de la secuencia de aminoácidos
mostrada en la SEQ ID NO: 5 es arginina; un DNA que puede hibridarse
con un DNA que tiene la secuencia de nucleótidos mostrada en la SEQ
ID NO: 1, bajo las condiciones de hibridación de 60ºC, 0,1 x SSC,
dodecil-sulfato sódico al 0,1%, y que tiene las
propiedades biológicas de la proteína TAB1; una proteína que tiene
una secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos de las
posiciones de aminoácidos 21 a 504, de la secuencia de aminoácidos
mostrada en la SEQ ID NO: 5; y un DNA aislado que codifica un
polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos que consiste en 68
aminoácidos de las posiciones de aminoácidos 437 a 504, de la
secuencia de aminoácidos mostrada en la SEQ ID NO: 5.
La presente invención además proporciona un
método para producir cualquiera de las proteínas o polipéptidos
mencionados previamente, que comprende las etapas de, cultivar una
célula hospedante trasformada por un vector de expresión, que
comprende el DNA que codifica la proteína o el polipéptido, y
recuperar la proteína o el polipéptido del cultivo.
La presente invención, todavía proporciona
además, un método para inducir a células de mamífero a producir
cualquiera de las proteínas o polipéptidos mencionados previamente,
que comprende la etapa de introducir el DNA que codifica la proteína
o el polipéptido, en células de mamífero.
La presente invención todavía proporciona además,
un vector de expresión que comprende el DNA, y una célula hospedante
trasformada por el vector de expresión.
La presente invención todavía proporciona además,
un método para el escrutinio de inhibidores de la vía de
transducción de señal de TGF-\beta.
La Figura 1 muestra las regiones de la proteína
TAK1 a las que se une la proteína TAB1. Las áreas sombreadas indican
el dominio catalítico de TAK1.
La Figura 2 muestra la complementación de la
supresión de Stel1, por la co-presencia de TAK1 y
TAB1 en una cepa de supresión de Stel1, en la vía MAPK activada por
feromonas de levaduras.
La Figura 3 muestra los resultados de una
electroforesis en una fotografía, que muestra los resultados de un
experimento in vitro, que indica el reforzamiento de la
actividad de TAK1 por TAB1.
La Figura 4 muestra la secuencia de aminoácidos
de TAB1, con una inserción parcial de la secuencia de TAK1 para
comparación.
La Figura 5 es un diagrama de la electroforesis,
que muestra la expresión del mRNA que codifica TAB1 en varios
órganos y tejidos.
La Figura 6 es un diagrama de un inmunoblot, que
muestra la asociación de TAB1 y TAK1 en células de mamífero.
La Figura 7 contiene un gráfico, que muestra el
aumento de la actividad quinasa de TAK1 por TAB1 en células de
mamífero (arriba), y un diagrama de una trasferencia (blot), que
muestra cantidades de producción comparables de TAK1 y de
KN-MPK2.
La Figura 8 es un gráfico, que muestra el aumento
de expresión de un gen reportero de luciferasa, por la
co-presencia de TAK1 y TAB1 en células de mamífero
estimuladas con TGF-\beta.
La Figura 9 es un gráfico, que muestra la
inhibición de la expresión del gen reportero de luciferasa inducido
por TGF-\beta, por una TAB1 que carece del extremo
C (TAB1 (1-418)).
La proteína TAB1 codificada por un DNA según la
invención, tiene la característica de activar la TAK1, mediante su
unión a TAK1, en la vía de transducción de señal del factor de
trasformación de crecimiento-\beta
(TGF-\beta). Esta y otras características se
describen en detalle en los Ejemplos 2 a 4 y 6 a 10.
La proteína TAB1 codificada por el DNA de la
invención, tiene la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 5),
derivada de la secuencia de nucleótidos del cDNA clonado mediante el
método descrito en los Ejemplos 1 y 5. Sin embargo, es bien conocido
que existen proteínas con actividad biológica, cuya secuencia de
aminoácidos ha sido modificada por una sustitución, supresión y/o
adición de uno o más aminoácidos, y que mantienen las propiedades
biológicas de la proteína natural. De este modo, la presente
invención abarca DNA que codifican proteínas que tienen una
secuencia de aminoácidos modificadas por una sustitución, supresión
y/o adición de uno o más aminoácidos, en la secuencia de aminoácidos
mostrada en la SEQ ID NO: 5, y que tienen las propiedades biológicas
de la proteína TAB1.
Una de sus realizaciones es una proteína en la
que el aminoácido 52 de la secuencia de aminoácidos mostrada en al
SEQ ID NO: 5 es arginina.
También se sabe que una vez que el DNA que
codifica una proteína específica se ha clonado, el DNA puede
utilizarse como una sonda para el escrutinio de una biblioteca de
DNA de órganos o tejidos diferentes del órgano o tejido del que se
ha obtenido la proteína, o de una biblioteca de DNA de otra especie,
para obtener DNA que codifica una proteína con propiedades
biológicas similares, aunque teniendo diferente secuencia de
aminoácidos. Así, la presente invención también abarca proteínas
codificadas por DNA que puede hibridarse con el DNA que tiene la
secuencia de nucleótidos mostrada en la SEQ ID NO: 1, bajo
condiciones de hibridación de 60ºC, 0,1 x SSC,
dodecil-sulfato sódico al 0,1%, y que tiene las
propiedades biológicas de la proteína TAB1.
Un ejemplo de una proteína modificada codificada
por el DNA según la invención, es una proteína que tiene una
secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos de las
posiciones de aminoácidos 21 a 504, de la secuencia de aminoácidos
mostrada en la SEQ ID NO: 5. Este polipéptido tiene las propiedades
de activar la actividad quinasa de TAK1, después de su unión a
TAK1.
Otro ejemplo de una proteína modificada
codificada por el DNA según la invención, es una proteína de fusión
entre la proteína o el polipéptido previamente mencionado y otra
proteína, que tiene una actividad biológica de TAB1.
Las proteínas o polipéptidos codificados por el
DNA de la invención pueden imitar las funciones fisiológicas reales
de TGF-\beta mediante, por ejemplo, activar la
TAK1, que es importante en la vía de transducción de señal de
TGF-\beta, así como inhibir la unión entre TAK1 y
TAB1 mediante su unión a TAK1, y son por lo tanto útiles para
métodos de escrutinio de sustancias que actúan como agonistas o
antagonistas contra la supresión del crecimiento celular, la
inmunosupresión y la diferenciación ósea.
El DNA que codifica una proteína de la invención
es, por ejemplo, el DNA que codifica la secuencia de aminoácidos
mostrada en la SEQ ID NO: 5. Dicho DNA puede obtenerse, por ejemplo,
mediante el método descrito en los Ejemplos 1 y 5, y tiene la
secuencia de nucleótidos mostrada en la SEQ ID NO: 1. Sin embargo,
el DNA que codifica la secuencia de aminoácidos mostrada en la SEQ
ID NO: 5 no necesariamente tiene la secuencia de nucleótidos
mostrada en la SEQ ID NO: 1, ya que puede consistir en otros codones
que codifican los mismos aminoácidos. Por ejemplo, la secuencia de
nucleótidos derivada de seres humanos mostrada en la SEQ ID NO: 1,
puede alterarse para incluir un codón que es traducido eficazmente
en microorganismos tales como bacterias o levaduras, y esto puede
llevarse a cabo utilizando una técnica bien conocida, tal como
mutagénesis específica de lugar con un cebador.
El DNA según la invención, que codifica una
proteína o un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos
modificada por una sustitución, supresión y/o adición de uno o más
aminoácidos en la secuencia de aminoácidos mostrada en la SEQ ID NO:
5, puede prepararse por métodos bien conocidos, tales como
mutagénesis específica de lugar o PCR, utilizando un DNA con la
secuencia de nucleótidos mostrada en la SEQ ID NO: 1 como molde.
Alternativamente, puede obtenerse un DNA que codifica una proteína o
un polipéptido, en el que la secuencia de aminoácidos modificada es
más corta que la proteína natural, por ejemplo, introduciendo un
codón de iniciación de la traslación y/o un codón de terminación de
la traslación en un DNA natural, tal como un cDNA. La introducción
de estos codones puede llevarse a cabo mediante mutagénesis
específica de lugar o PCR. Alternativamente, puede conseguirse
escindiendo un DNA natural, tal como un cDNA, con una enzima de
restricción apropiada, y añadiendo el oligonucleótido deseado si
fuera necesario.
Puede obtenerse un DNA que puede hibridarse con
el DNA que tiene la secuencia de nucleótidos mostrada en la SEQ ID
NO: 1 de la invención, y que codifica una proteína que tiene una
propiedad biológica de TAB1, mediante el escrutinio de una
biblioteca de DNA genómico preparada, por ejemplo, de los diversos
órganos y tejidos mencionados en el Ejemplo 6, incluyendo el
corazón, el cerebro, la placenta, el hígado, el músculo esquelético,
el riñón, el páncreas, el bazo, el timo, la próstata, los
testículos, los ovarios, el intestino delgado, el colon, los
leucocitos de sangre periférica, etc., utilizando la secuencia de
nucleótidos mostrada en la SEQ ID NO: 1 de la invención, o de una de
sus partes, como sonda. La biblioteca de DNA no se limita a una
derivada de seres humanos, y puede derivarse de otros animales,
tales como ratas, ratones, conejos, cabras, ovejas, vacas o
cerdos.
La presente invención también se refiere a un
vector de expresión, que comprende un DNA mencionado previamente y
una célula hospedante trasformada con él. El vector de expresión
diferirá dependiendo de la célula hospedante. Las células
hospedantes utilizadas según la invención, pueden proceder de
organismos procarióticos o eucarióticos. Los organismos
procarióticos utilizados pueden ser bacterias, por ejemplo
microorganismos pertenecientes al género Escherichia, tales
como la Escherichia coli, microorganismos pertenecientes al
género Bacillus tales como el Bacillus subtilis, etc.,
y los organismos eucarióticos pueden ser organismos eucarióticos
inferiores, tales como los hongos filamentosos o las levaduras.
Los hongos filamentosos incluyen microorganismos
pertenecientes al género Aspergillus, tales como el
Aspergillus Níger y el Aspergillus orizae, y
microorganismos pertenecientes al género Penicillium,
mientras que las levaduras pueden ser microorganismos pertenecientes
al género Saccharomyces, tales como el Saccharomyces
cerevisiae.
Los organismos eucarióticos superiores que pueden
utilizarse, incluyen diversas células de animales y plantas, por
ejemplo, células animales inmortalizadas en cultivo, tales como
células COS, células CHO, células NIH3T3, etc. Pueden también
utilizarse células de insecto, tales como Sf9, Sf12, etc.
El vector de expresión de la invención incluye,
además del DNA que codifica una proteína o un polipéptido de la
invención, secuencias de regulación de la expresión, tales como
promotores, que son funcionantes en la célula hospedante.
Promotores para bacterias, por ejemplo, E.
coli, incluyen T3 y T7, mientras que promotores para levaduras
incluyen promotores de genes de enzimas glicolíticas, tales como el
promotor GAL1 y el promotor GAL4. El promotor para células animales
puede ser un promotor viral, tal como el promotor de CMV o el
promotor SV40.
La trasformación de la célula hospedante por un
vector de expresión, el cultivo de la célula hospedante, y la
recolección y la purificación de la proteína o el polipéptido de la
invención del cultivo, pueden conseguirse según métodos
convencionales. Por ejemplo, el aislamiento y la purificación de la
proteína o el polipéptido del cultivo, puede conseguirse utilizando
cualquier medio convencional para aislar y purificar proteínas y
polipéptidos, tales como precipitación con sulfato amónico,
filtración en gel o HPLC de fase inversa, solos o en
combinación.
La presente invención también se refiere a un
método de escrutinio para inhibidores de la vía de transducción de
señal de TGF-\beta. Una muestra que contiene
inhibidores de la vía de transducción de señal de
TGF-\beta se pone en contacto con, o se introduce
en, células que expresan una proteína con una actividad biológica de
TAB1 y TAK1 (K. Yamaguchi et al., Science, Vol. 270, pag.
2008 (1995)), y la actividad de TAK1 es entonces medida. La proteína
o el polipéptido con actividad biológica de TAB1 y TAK1 puede
también fusionarse con otra proteína, y las células que las expresan
pueden ser células de levadura o células de mamífero. Este sistema
de escrutinio puede construirse según el método descrito en los
Ejemplos 1, 2, 3, 4, 7, 8 y 9.
La muestra que contiene inhibidores de la vía de
transducción de señal de TGF-\beta, se pone en
contacto con o se introduce en el sistema de escrutinio construido,
y se mide la actividad quinasa de la TAK1. El método para medir la
actividad quinasa de TAK1 puede ser la medida de la actividad
quinasa de la TAK1 en si misma, o la medida de la actividad quinasa
de la MAPKK o la MAPK, que están aguas abajo de la TAK1 en la vía de
transducción de señal, y que son activadas por la TAK1. La actividad
de un gen diana en la vía de la MAPK, o de un gen reportero bajo el
control del promotor del gen diana, puede también medirse, basándose
en la cantidad de mRNA o forma expresada del gen.
El método de escrutinio de los inhibidores de la
vía de transducción de señal de TGF-\beta según la
invención, permite el escrutinio de sustancias que inhiben la unión
entre TAB1 y TAK1, y puede por lo tanto servir como un medio de
terapia para enfermedades que incluyen la producción anormal de
TGF-\beta.
La presente invención será explicada ahora con
más detalle, a través de los siguientes ejemplos.
El análisis de la vía dependiente de TAK1, que
funciona para la transducción de señal de
TGF-\beta se realizó utilizando un sistema de 2
híbridos en levadura (S. Freids et al., Trend Genet. 10, 286
(1994)), y se visualizó una proteína que tiene interacción directa
con TAK1.
Primero, se construyó un vector de expresión
uniendo el gen de TAK1 y un gen que codifica el dominio de unión a
DNA de LexA. El pLexA-TAK1\Delta contiene la
secuencia de codificación TAK1\DeltaN (K. Yamaguchi et al.,
Science, Vol. 270, pag. 2008 (1995)), insertada en marco en el
pBTM116 (A.B. Vojtek et al., Cell, Vol. 74, pag. 205 (1993)).
Se utilizó un sistema de 2 híbridos en levadura, para identificar
una proteína codificada en una biblioteca de cDNA de cerebro humano,
y que interactúa con TAK1\DeltaN.
Los dos híbridos se expresaron en
Saccharomyces cerevisiae L40
(LYS2:LexA-HIS3), que contenía una construcción
reportera integrada con un lugar de unión para la proteína LexA,
localizado aguas arriba de la región de codificación HIS3 de
levadura. La interacción entre las dos proteínas híbridas produce la
transactivación de la construcción reportera, permitiendo el
crecimiento de la levadura en ausencia de histidina
(SC-His).
La proteína de fusión
LexA-TAK1\DeltaN confiere la expresión de HIS3 en
una cantidad suficiente para permitir el crecimiento, sin requerir
histidina exógena. Sin embargo, puede conseguirse auxotropía de
histidina, cultivando las células en presencia de
3-aminotriazol (3-AT) 40 mM, que es
un inhibidor químico del producto del gen HIS3, imidazol glicerol
deshidrogenasa (G.M. Kishore et al., Annu. Rev. Biochem. Vol.
57, pag. 627 (1988)).
Las levaduras se trasformaron utilizando un
plásmido bait, junto con un plásmido de pez que contiene el clon de
la biblioteca de expresión de cDNA de cerebro humano, unido al gen
que codifica el dominio de activación de GAL4 (GAD). Se obtuvo un
clon positivo de cDNA de TAB1 que codifica la proteína, a partir de
alrededor de 1 x 10^{6} células trasformadas. La proteína de
fusión GAD expresada por este DNA aislado, se denominará de aquí en
adelante como GAD-TAB1.
Una serie de quimeras de supresión de
LexA-TAK1, se analizó mediante el método de 2
híbridos, para determinar el lugar en TAK1 que es responsable de la
interacción con TAB1. Se utilizó un vector de expresión que codifica
la TAK1 completa o su construcción de supresión, fusionada con el
dominio de unión a DNA de LexA, para trasformación simultánea de la
cepa reportera de levadura L40, junto con pGAD-TAB1.
Se preparó el DNA que codifica cada una de las construcciones de
supresión de TAK1, a partir de DNA que codifica la TAK1
completa.
El plásmido pGAD-TAB1 previamente
mencionado, se obtuvo mediante clonación del cDNA de TAB1 en el
lugar EcoR1 de pBS (W.O. Bullock et al., Biotechniques, Vol.
5, pag. 376 (1987)). La interacción entre las proteínas fusionadas
expresadas por este plásmido, se indica por la capacidad de la cepa
de levadura para crecer en una placa de medio
SC-HIS, que contiene 3-AT 40 mM. Los
resultados se muestran en la Figura 1. La parte derecha de este
gráfico indica si la TAK1 o su forma de supresión interactuaban con
TAB1 (+) o no (-). Estos resultados demuestran que la TAB1
interactúa con el dominio N-terminal de la TAK1.
Una proteína que interactúa con TAK1, puede
contener tanto la región de control aguas arriba, y la diana aguas
abajo. Si la TAB1 juega un papel en la activación de la TAK1,
entonces se esperaría que su expresión simultánea influenciara la
actividad de la TAK1 en levaduras. Los presentes inventores han
descrito un sistema para ensayar la actividad de la MAPKKK de
mamíferos, en una vía MAPK inducida por feromonas en una levadura
(K. Yamaguchi et al., Science, Vol. 270, pag. 2008 (1995); K.
Irie et al., Science, Vol. 265, pag. 1716 (1994)). Una forma
activada de la TAK1 (TAK1\DeltaN) puede sustituir la actividad
MAPKKK de Stel1.
Específicamente, la vía MAPK activada por
feromonas, consiste en las quinasas Stel1, Ste7, y Fus3 o Kss1, que
corresponden a MAPKKK, MAPKK y MAPK respectivamente. Estas
proteín-quinasas de levadura actúan secuencialmente
para transducir señales al factor de trascripción Stel2, después de
lo cual Stel2 por su parte activa la trascripción de genes de
apareamiento específico, tales como FUS1 (I. Herskowitz, Cell, Vol.
80, pag. 187 (1995); D.E. Levin et al., Curr. Opin. Cell
Biol., Vol. 7, pag. 197 (1995); J. Schultz et al., Jr. Curr.
Opin. Gene Dev., Nº 5, pag. 31 (1995)).
El gen reportero FUS1p::HIS3 comprende la
secuencia activadora aguas arriba FUS1, ligada al marco de lectura
abierto de HIS3, y la señal de actividad de la cepa
his3\DeltaFUS1p::HIS3 puede monitorizarse por la capacidad de las
células de crecer en medio SC-His (Fenotipo
His^{+})
La cepa
his3\Deltaste11\DeltaFUS1p::HIS3STE7^{P368} (sustitución por
prolina de la serina-368) tiene un fenotipo
His^{-} (K. Irie et al., Science, Vol. 265, pag. 1716
(1994))
La expresión de TAK1\DeltaN en esta cepa
confiere un fenotipo His^{+} (K. Yamaguchi et al., Science,
Vol. 270, pag. 2008 (1995)). De este modo, la forma activada de TAK1
puede sustituir la actividad de Ste11 de una forma dependiente de
Ste7^{P368}. Sin embargo, la expresión de la TAK1 de longitud
completa, no complementa la mutación ste11\Delta, lo que sugiere
que la levadura no tiene el factor de activación putativo para la
TAK1 (K. Yamaguchi et al., Science, Vol. 270, pag. 2008
(1995)).
La construcción GAD-TAB1 se
ensayó para su capacidad de complementar la mutación ste11\Delta,
en presencia de TAK1, utilizando la vía MAPK de levadura.
Específicamente, la cepa de levadura SY1984-P
(his3\Deltaste11\DeltaFUS1p:: HIS3STE7^{P368}), se trasformó
con pNV11-HU11 (TAK1\DeltaN) + pGAD10 (GAD)
(Clontech), pNV11-HU11F (TAK1) + pGAD10,
pNV11-HU11F + pGAD-TAB1 o pNV11 +
pGAD-TAB, y las células trasformadas se sembraron
sobre placas de SC-His y se incubaron a 30ºC.
La cepa previamente mencionada
SY1984-P es SY1984 (his3\Deltaste11FUS1p::HIS3),
trasformada por el plásmido pNC318-p368 que contiene
STE7^{P368}, bajo el control del promotor CYC1 (K. Irie et
al., Science, Vol. 265, pag. 1716 (1994)). Los plásmidos
mencionados previamente pNV11-HU11 y
pNV11-HU11F respectivamente, expresan la forma
acortada TAK1\DeltaAN (aminoácidos 21-579) y la
TAK1 de longitud completa, bajo el control del promotor TDH3 (K.
Yamaguchi et al., Science, Vol. 270, pag. 2008 (1995)).
Los resultados se muestran en la Figura 2. El
panel izquierdo indica si la cepa de levadura ensayada expresaba
TAK1\DeltaAN o TAK1, y si la GAD-TAB1 se expresaba
simultáneamente o no. El panel derecho muestra el crecimiento de las
células sobre las placas de SC-His. Cada uno de los
parches representa los resultados de una trasformación
independiente.
Las células trasformadas simultáneamente con
GAD-TAB1 y TAK1, restauraban el efecto de la
supresión de Stel1. Esto indica que la TAB1 refuerza la función de
TAK1.
Para determinar si la actividad TAK1 está
aumentada en las levaduras que expresan TAB1, se utilizó un vector
de expresión de DNA que contenía TAK1, que portaba el epítopo
C-terminal derivado de hemaglutinina (HA), y un
mutante de TAK1 inactivo catalíticamente [TAK1-K63W,
en la que la lisina en la posición 63 del lugar de unión a ATP está
reemplazada con triptófano (K. Yamaguchi et al., Science,
Vol. 270, pag. 2008 (1995))], para trasformar células de levadura en
ausencia y en presencia del gen TAB1.
La secuencia de DNA que codifica un epítopo
reconocido por el anticuerpo monoclonal específico de HA, 12CA5, se
unió en marco con la secuencia de codificación de TAK1 y con el
extremo C de TAK1-K63W, mediante la reacción en
cadena de la polimerasa (PCR). Todas las construcciones fueron
expresadas por el promotor TDH. El plásmido de expresión de TAB1,
pGAP-HTH9M expresa los 68 aminoácidos
C-terminales. El YEpGAP112 es un plásmido multicopia
TRP1, que contiene el promotor TDH3 [H. Banno et al., Mol.
Cell Biol. 13, 475 (1993)].
Una secuencia que codifica los 68 aminoácidos
C-terminales de TAB1 se amplificó mediante PCR,
utilizando el cebador 5':
5'-GAGAATTCATGCGGCAAAGC-3' (SEQ ID
NO: 2), que contiene el lugar EcoRI y el codón ATG, y el cebador 3':
5'-GGGTCGACTACGGTGC-3' (SEQ ID NO:
3), que contiene el lugar SalI. Un fragmento
EcoRI-SalI de 240 pares de bases, producido por PCR,
se insertó en el hueco EcoRI-SalI del YEpGAP112,
para construir pGAD-HTH9M.
Los resultados se muestran en la Figura 3. Como
se describió previamente, la cepa de levadura SY1984 se trasformó
con el plásmido mencionado anteriormente, que codifica para
TAK1-HA, y el plásmido que codifica
TAK1-K63W, y el vector vacío YEpGAP112(-) o
pGAP-HTH9M, que codifican TAB1, se insertaron
adicionalmente en las células trasformadas. La
TAK1-HA(-) o la
TAK1-K63W-HA(KN) se
inmunoprecipitaron de cada uno de los extractos celulares, y los
inmunoprecipitados se sometieron a ensayos de quinasa in
vitro. Específicamente, 60 ml de cultivo de células de levadura
se dejaron crecer hasta una densidad óptica de 0,8 a 600 nm, y se
preparó un extracto celular con una solución de tampón citolítica
(K. Yamaguchi et al., Science, Vol. 270, pag. 2008 (1995)), y
después se separaron mediante centrifugación a 100.000 g durante 30
minutos.
El sobrenadante se sometió después a
inmunoprecipitación, con un anticuerpo contra HA. Esto es, una parte
(300 \mul) del sobrenadante, se mezcló con 2 \mul de anticuerpo
y 90 \mul de Proteína A-Sepharosa, y el
inmunocomplejo se lavó 3 veces con una solución de tampón
citolítica, y se utilizó para el ensayo de quinasa (K. Yamaguchi et
al., Science, Vol. 270, pag. 2008 (1995)). El análisis de inmunoblot
de cada inmunoprecipitado, con el anticuerpo monoclonal específico
de HA, 12CA5, demostró que se recuperaba aproximadamente la misma
cantidad de TAK1-HA o
TAK1-K63W-HA en cada muestra. Esto
sugiere que la expresión de TAB1 no afecta la cantidad de expresión
de
TAK1.
TAK1.
La TAK1 inmunoprecipitada se analizó, basándose
en la capacidad para activar el recombinante XMEK2 (SEK1), siendo la
actividad del recombinante XMEK2 (SEK1) analizada en base a su
capacidad de fosforilar la (KN)p38 (MPK2) catalíticamente
inactiva (K. Yamaguchi et al., Science, Nº 270, pag. 2008
(1995)). Después de la electroforesis, se detectó la fosforilación
de la (KN)p38 (MPK2) mediante autorradiografía. Ningún
extracto exhibía un valor en el ensayo de quinasa sin el extracto de
la enzima. Este nivel corresponde a la actividad basal de XMEK2. El
experimento se realizó al menos 3 veces, dando los mismos resultados
cada vez.
Los resultados se muestran en la Figura 3. Los
resultados del ensayo de quinasa para TAK1-HA y
TAK1-K36W-TAK1, indican que la TAB1
aumenta la actividad quinasa de la TAK1. El aumento de actividad no
se observó para los inmunocomplejos de las células que expresan
TAK1-K63WKN y TAB1, lo que indica que la actividad
quinasa observada era atribuible a TAK1. Estos resultados demuestran
que la TAB1 activa la actividad quinasa de la TAK1, uniéndose
directamente al dominio catalítico de la TAK1.
Para obtener la secuencia de codificación
completa de la TAB1, se escrutó una biblioteca de riñón humano,
utilizando como sonda la anteriormente mencionada secuencia parcial
de cDNA de TAB1, obtenida del sistema de 2 híbridos en levadura. Dos
clones independientes portaban el cDNA de 3,1 kb, que contiene un
marco de lectura abierto (ORF) único, que comienza en el codón de
metionina inicial, que se corresponde con el consenso Kozak. El
extremo 5' se identificó mediante el método RACE, utilizando
5'-RACE-Ready cDNA (Clontech).
La secuencia de nucleótidos
N-terminal propuesta de la secuencia de codificación
(CCAAATGG), corresponde al consenso Kozak (M. Kozak,
J. Cell Biol. Vol. 108, pag. 229 (1989)), y el codón ATG no está
presente ante él.
La secuencia de nucleótidos de la TAB1, se
determinó mediante el método de terminación de cadena de
didesoxinucleótidos. Se dedujo la secuencia de aminoácidos, a partir
de la secuencia de nucleótidos del cDNA de longitud completa de la
TAB1. Como resultado, se obtuvieron dos clones diferentes, con
citosina y adenina como nucleótido en la posición 185,
respectivamente. El clon con citosina en el nucleótido 185 codifica
serina como aminoácido 52, y el clon con adenina como nucleótido 185
codifica arginina como aminoácido 52.
La secuencia de nucleótidos del clon con citosina
como nucleótido 158 se muestra en la SEQ NO: 1, y su secuencia de
aminoácidos se muestra en la Figura 4 y en la SEQ ID NO: 5. La
secuencia de nucleótidos del clon con adenina como nucleótido 185 se
muestra en la SEQ ID NO: 4, y su secuencia de aminoácidos se muestra
también en la SEQ ID NO: 6.
El cDNA del clon con citosina como nucleótido 185
se subclonó en los lugares EcoRI y SmaI de pBS, para preparar el
plásmido TABI-f-4, mientras que el
cDNA del clon con adenina como nucleótido 185 se subclonó en el
lugar EcoRI de pBS, para preparar el plásmido
pBS-TAB1. La E. coli que contenía el plásmido
pBS-TAB1 se denominó Escherichia coli HB101
(pBS-TAB1), y se depositó en el Instituto Nacional
de la Agencia de Biociencias y Tecnología Humana de Tecnología y
Ciencia Industrial, el 19 de abril de 1996, como FERM
BP-5508. La E. coli que contenía el plásmido
TABI-f-4 se denominó Escherichia
coli DH5\alpha (TABI-f-4), y
se depositó en el Instituto Nacional de la Agencia de Biociencias y
Tecnología Humana de Tecnología y Ciencia Industrial, el 19 de julio
de 1996 como FERM BP-5599.
Los siguientes experimentos se llevaron a cabo
utilizando el clon que tiene la secuencia de nucleótidos mostrada en
la SEQ ID NO: 1.
En la Figura 4, A = Ala, C = Cys, D = Asp, E =
Glu, F = Phe, G = Gly, H = His, I = Ile, K = Lys, L = Leu, M = Met,
N = Asn, P = Pro, Q = Gln, R = Arg, S = Ser, T = Thr, V = Val, W =
Trp e Y = Tyr. Los 68 aminoácidos C-terminales de la
GAD-TAB1, aislados utilizando el sistema de 2
híbridos en levadura, están recuadrados.
La secuencia N-terminal de la
TAK1 está alineada, para mostrar la región con similitud con el
mismo segmento de la TAK1. Los aminoácidos idénticos y conservados
con respecto a los de la TAK1, están marcados con asteriscos y
puntos, respectivamente.
El ORF sugería una proteína de 504 aminoácidos
que tiene un tamaño molecular de 55 kDa, sin clara similitud con
ninguna proteína conocida, y sin ningún motivo que indique una
función biológica.
Los patrones de expresión del mRNA de la TAB1 en
diferentes células humanas, se analizó mediante transferencia
Northern. Blots de tejidos humanos (Clontech), de mRNA aislado de 16
tejidos, se hibridaron con cDNA de TAB1 marcada con ^{32}P, y se
sometieron a autorradiografía. Los resultados se muestran en la
Figura 5. Cada una de las carreras contenía 2 \mug de mRNA. La
sonda se marcó con
[\alpha-^{32}P]-dCTP, utilizando
un Multiprime Labeling Kit (Amersham), y se hidridó como se
describió en H. Shibuya et al., Nature, Vol. 357, pag. 700
(1992). Se detectó un producto principal de trascripción de
alrededor de 3,5 kb en todos los tejidos analizados.
Para confirmar la asociación de la TAB1 y la TAK1
en tejidos de mamíferos, se utilizaron un vector de expresión que
produce TAK1 marcada en el epítopo HA (HA-TAK1) (K.
Yamaguchi et al., Science, Vol. 270, pag. 2008 (1995)), y un
vector de expresión que produce TAB1 marcada en el epítodo Myc
(Myc-TAB1), para transfección transitoria de
osteoblastos murinos MC3T3-E1 (S. Ohta et
al., FEBS Lett., Vol. 314, pag. 356 (1992)). El último plásmido
se obtuvo de la siguiente manera.
El cDNA de TAB1 de longitud completa se subclonó
en el vector pCS2MT, que contiene 6 copias del epítopo Myc
(LEQK-LISEEDLN) (anotación de secuencia de
aminoácidos de una sola letra), reconocido por el anticuerpo
monoclonal específico de Myc, 9E10 (D.L. Turner et al., Genes
Dev., Vol. 8, pag. 1434 (1994)). En el plásmido así obtenido,
pCS2MT-TAB1, la etiqueta del epítopo Myc está ligada
en marco con la secuencia de DNA correspondiente al extremo N de
TAB1. El pCSA2MT-TAB1 se digirió con BamHI y XbaI.
El fragmento se aisló y se insertó en el lugar
EcoRI-XbaI del vector de expresión de mamíferos pEF.
Este plásmido produce la expresión de TAB1, con el promotor del
factor 1\alpha de elongación humano (EF1\alpha).
El extracto celular se sometió a
inmunoprecipitación con el anticuerpo monoclonal específico de HA,
12CA5 (carrera 2 en la Figura 6), el anticuerpo monoclonal
específico de Myc, 9E10 (carrera 3 en la Figura 6), o una IgG no
inmune de control (carrera 4 en la Figura 6). El inmunocomplejo se
lavó y se separó mediante SDS-PAGE, y después se
trasfirió a nitrocelulosa para inmunoblotting, utilizando el
anticuerpo específico de Myc (carreras superiores en la Figura 6) y
el anticuerpo específico de HA (carreras inferiores en la Figura
6).
Los extractos celulares se sometieron
inmediatamente después a análisis de inmunoblot (carrera 1 de la
Figura 6). Como muestra la Figura 6, se detectó una cantidad
considerable de Myc-TAB1 en cada
inmunoprecipitación, indicando que la TAK1 puede ser
inmunoprecipitada con la TAB1. Un experimento de blotting recíproco
de la proteína inmunoprecipitada con el anticuerpo específico de HA,
confirmó la asociación de la TAB1 y la TAK1. Estos experimentos
indican que la TAB1 puede asociarse con la TAK1 en células de
mamífero, al igual que en levaduras.
Se investigó si la sobreexpresión de la TAB1
puede activar la acitividad quinasa de la TAK1. Células
MC3T3-E1 se transfectaron transitoriamente con
HA-TAK1 en presencia (+) o ausencia (-) de
Myc-TAB1. Las células se trataron (+) o no se
trataron (-) con 20 ng/ml de TGF-\beta1 durante
10 minutos, y después se inmunoprecipitó la HA-TAK1
de la forma descrita en el Ejemplo 3, después de lo cual se analizó
la actividad quinasa. Específicamente, una parte del
inmunoprecipitado se utilizó para inmunoblot con anticuerpo
específico de HA. Los resultados se muestran en la Figura 7.
La actividad se da en número de veces de
incremento, relativa a la cantidad de HA-TAK1 de
células no estimuladas, y se expresa como media \pm SEM de al
menos 3 experimentos (gráfico superior en la Figura 7). La
HA-TAK1 no fosforila directamente a la
KH-p38(MPK2) (K. Yamaguchi et al.,
Science, Vol. 270, pag. 2008 (1995)). El panel medio es una
autorradiografía que muestra la fosforilación de
KN-p38(MPK2). El panel inferior muestra un
análisis de inmunoblot de cada uno de los precipitados con el
anticuerpo monoclonal específico de HA 12CA5, en el que se ve que se
recuperaba aproximadamente la misma cantidad de
TAK-HA de cada muestra. Los datos mostrados en los
paneles medio e inferior son de experimentos típicos.
Los ensayos in vitro de la
inmunoprecipitación de TAK1, sugieren que la actividad de la TAK1
estaba estimulada en células transfectadas con la TAB1, incluso en
ausencia de TGF-\beta. La activación de la TAK1
por la sobreexpresión de la TAB1, era comparable a la activación
observada en las células estimuladas con TGF-\beta
que expresaban solamente HA-TAK1.
La TGF-\beta produce un rápido
aumento de la cantidad de mRNA que codifica el inhibidor 1 del
factor de activación del plasminógeno (PAI1) (M. R. Keeton et
al., J. Biol. Chem., Vol. 266, pag. 23048 (1991)). La
sobreexpresión de la forma activada de TAK1 (TAK1\DeltaN), da como
resultado la activación constitutiva de un gen reportero que
contiene el gen de la luciferasa bajo el control del promotor del
gen PAI-1 inducido por TGF-\beta
(K. Yamaguchi et al., Science, Vol. 270, pag. 2008 (1995)).
Investigamos si la sobreexpresión de la TAB1 lleva a la activación
del gen reportero de luciferasa.
Células MvLu se transfectaron transitoriamente
mediante el método del fosfato cálcico (H. Shibuya et al.,
Nature, Vol. 367, pag. 700 (1982)), utilizando un plásmido reportero
p800neoLUC (M. Abe et al., Analyt. Biochem., Vol. 216, pag.
276 (1994)), y el plásmido pEF-TAB1, que expresa
TAB1, o el plásmido de expresión que codifica TAK1 (K. Yamaguchi
et al., Science, Vol 279, pag. 2008 (1995)). El plásmido
pEF-TAB1 contiene la secuencia de codificación
completa de la TAB1, bajo el control del promotor EF1á, y se
construyó escindiendo pEF con EcoRI, e insertando el fragmento EcoRI
del plásmido TABI-f-4.
El plásmido
TABI-f-4 se construyó subclonando el
cDNA de la TAB1 en los lugares EcoRI y SmaI de pBS. Las células se
incubaron durante 20 horas con y sin 30 ng/ml de
TGF-\beta1 humana, se preparó un extracto, y se
analizó la luciferasa (H. Shibuya et al., Mol. Cell Biol.,
Vol. 14, pag. 5812 (1994)). La actividad luciferasa se compensaba
basada en la expresión de \beta-galactosidasa.
Específicamente, la eficiencia de la transfección
se compensaba mediante transfección simultánea con el vector
pX\varepsilonX-\beta-Gal (A.D.
Jonson et al., Gene, Vol. 147, pag. 223 (1994)), en todos los
experimentos de luciferasa reportera. La medida de
\beta-galactosidasa se realizó de acuerdo a las
instrucciones del fabricante (Clontech), utilizando el lisado de
células preparado para la medida de luciferasa. La actividad
luciferasa se dio como número de veces de incremento, con respecto a
la actividad de las células no estimuladas, transfectadas con el
vector. Todas las medidas de transfección y luciferasa se realizaron
al menos 5 veces, con triplicados para cada experimento.
Los resultados se muestran en la Figura 8. Aquí,
KN indica la TAK1-K63W, catalíticamente inactiva.
Los datos se expresan como media \pm SEM de la actividad
luciferasa de triplicados, en un experimento representativo. La
sobreexpresión de ambas, TAK1 y TAB1, inducía la expresión del gen
reportero, incluso en ausencia de TGF-\beta, pero
la sobreexpresión solo de TAK1 o TAB1, no tenía virtualmente ningún
efecto sobre la cantidad constitutiva de actividad luciferasa. Estos
resultados experimentales indican que la TAB1 refuerza la actividad
de la TAK1 en células de mamífero.
Aunque la sobreexpresión de la mutante
TAK1-K63W inhibía la actividad lucíferasa estimulada
por TGF-\beta (K. Yamaguchi et al.,
Science, Vol 270, pag. 2008 (1995)), esto es presumiblemente debido
al secuestro de elementos esenciales en la vía. Por otra parte, la
sobreexpresión de la TAB1 reduce el efecto inhibidor de la
TAK1-K63W, lo que sugiere la posibilidad de que la
TAB1 sea absorbida por la sobreexpresión de la
TAK1-K63W.
Los 68 aminoácidos C-terminales
de la TAB1 [TAB1 (437-504)] eran suficientes para
unirse y activar a la TAK1, lo que sugiere que el dominio
N-terminal de la TAB1 realiza un papel regulador
sobre la función de la TAB1. Para analizar esta posibilidad, se
construyó una forma acortada de TAB1, que carecía del dominio de
unión a la TAK1 C-terminal [TAB1
(1-418)]. Células MvLu se transfectaron
transitoriamente con el reportero p800neoLUC, y con un vector de
expresión que codifica la TAB1 (1-418) o la TAB1
(longitud completa), en las cantidades mostradas en la Figura 8, y
estos se complementaron con el vector de control pEF.
El vector de expresión que codifica la TAB1
(1-418), se construyó de la siguiente manera. El
fragmento EcoRI-HincII de 1,3 kb del plásmido
TABI-f-4 (que contiene la región
N-terminal de TAB1, con los aminoácidos
1-418), se subclonó en el vector pKT10, para
construir pKT10-TAB1 (1-418). El pEF
se escindió con EcoRI y SalI, y el fragmento
EcoRI-SalI de pKT10-TAB1
(1-418) se insertó allí, para construir
pEF-TAB1 (1-418).
A continuación, las células se incubaron durante
20 horas con y sin 30 ng/ml de TGF-\beta1 humana,
y se midió la actividad luciferasa en el lisado celular. Los valores
se expresaron como número de veces de incremento de la inducción en
términos de porcentaje, con respecto a las células de control
transfectadas con pEF. La no inducción de luciferasa con
TGF-\beta (inducción de 1 vez de incremento),
corresponde a 0%. Todas las medidas de transfección y luciferasa se
realizaron al menos 3 veces, y se llevo a cabo una serie de 3 de
cada uno de los experimentos. Los datos se expresan como la media
\pm SEM de las actividades luciferasa de triplicados, en un
experimento representativo.
Los resultados se muestran en la Figura 9. La
sobreexpresión de la TAB1 (1-418) en células MvLu,
suprimía la actividad del gen reportero inducido por estimulación
con TGF-\beta. Por lo tanto, la TAB1
(1-418) actúa como un inhibidor negativo dominante
sobre la expresión de genes inducida por
TGF-\beta. Estos resultados indican que la TAB1
juega un papel en la señalización de
TGF-\beta.
El mecanismo de inducción de la activación de la
TAK1 por TAK1, se cree que es que, la unión de la TAB1 a la TAK1
induce los cambios conformacionales necesarios para la activación.
Como la eliminación de los 20 aminoácidos
N-terminales de la TAK1 produce activación
constitutiva de la proteín-quinasa, esto sugiere que
el dominio N-terminal esconde el dominio catalítico,
inhibiendo de esta forma la actividad quinasa (K. Yamaguchi et
al., Science, Vol. 270, pag. 2008 (1995)). La TAB1 puede
eliminar el domino de control negativo de la TAK1 de su dominio
catalítico. El extremo C de la TAB1, que funciona como el lugar de
unión de la TAK1, contiene una región rica en serina y treonina,
similar a la región encontrada en el extremo N de la TAK1. Por
tanto, la TAB1 es probablemente un factor intermedio de señalización
importante entre el TGF-\beta y la MAPKKK
TAK1.
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: CHUGAI SEIYAKU KABUSHIKI KAISHA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 5-1, UKIMA 5-CHOME
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: KITA-KU
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: TOKIO 115
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: JP
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL (ZIP): NINGUNO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TITULO DE LA INVENCIÓN: LA PROTEÍNA TAB1 Y EL DNA QUE LA CODIFICA
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 6
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- FORMA LEGIBLE EN ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: PC compatible con IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn Release #1,0, Versión #1,25 (EPO)
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- DATOS DE SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- NÚMERO DE SOLICITUD: EP 97302808.7
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: JP 126282/96
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE SOLICITUD: 04-ABRIL-1996
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: JP 300856/96
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE SOLICITUD: 28-OCTUBRE-1996
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- DATOS DE SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: US 08/752891
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE SOLICITUD: 20-NOVIEMBRE-1996
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1560 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE HEBRAS: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1:
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(3) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE HEBRAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico (DNA sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAGAATTCAT GCGGCAAAGC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(4) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 16 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE HEBRAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico (DNA sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGGTCGACTA CGGTGC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(5) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1560 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE HEBRAS: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
(6) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 504 residuos de aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE HEBRAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
(7) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 504 residuos de aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE HEBRAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
Claims (17)
1. Un DNA aislado que codifica la proteína TAB1,
que tiene la secuencia de aminoácidos mostrada en la SEQ ID NO:
5.
2. Un DNA aislado que codifica la proteína TAB1,
que tiene una secuencia de aminoácidos modificada por una
sustitución, supresión y/o adición de uno o más aminoácidos, en la
secuencia de aminoácidos mostrada en la SEQ ID NO: 5, y que se une a
la TAK1.
3. Un DNA aislado que codifica la proteína TAB1,
que tiene una secuencia de aminoácidos modificada por una
sustitución, supresión y/o adición de uno o más aminoácidos, en la
secuencia de aminoácidos mostrada en la SEQ ID NO: 5, y que se une y
activa a la TAK1.
4. Un DNA que puede hibridarse con un DNA que
tiene la secuencia de nucleótidos mostrada en la SEQ ID NO: 1, bajo
condiciones de hibridación de 60ºC, 0,1 x SSC,
dodecil-sulfato sódico al 0,1%, y que codifica una
proteína que se une a la TAK1.
5. Un DNA que puede hibridarse con un DNA que
tiene la secuencia de nucleótidos mostrada en la SEQ ID NO: 1, bajo
condiciones de hibridación de 60ºC, 0,1 x SSC,
dodecil-sulfato sódico al 0,1%, y que codifica una
proteína que se une y activa a la TAK1.
6. Un DNA aislado que codifica un polipéptido que
tiene una secuencia de aminoácidos, que consiste en los aminoácidos
de las posiciones de aminoácidos 21 a 504, de la secuencia de
aminoácidos mostrada en la SEQ ID NO: 5.
7. Un DNA aislado que codifica una proteína que
tiene una secuencia de aminoácidos, que consiste en los 68
aminoácidos de las posiciones de aminoácidos 437 a 504, de la
secuencia de aminoácidos mostrada en la SEQ ID NO: 5.
8. Un DNA aislado, según las reivindicaciones 2 y
3, en el que el aminoácido 52 de la secuencia mostrada en la SEQ ID
NO: 5, es arginina.
9. Un DNA que codifica una proteína de fusión,
que comprende una proteína o polipéptido según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8.
10. Un método para producir una proteína o
polipéptido, que comprende las etapas de:
- cultivar una célula hospedante trasformada por un vector de expresión que comprende DNA, según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9; y
- recuperar dicha proteína o polipéptido del cultivo.
11. Un método según la reivindicación 10, en el
que dicha célula hospedante en una célula de mamífero o una célula
de levadura.
12. Un método para inducir a células de mamífero
a producir una proteína o polipéptido según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 9, que comprende la etapa de introducir el DNA
que codifica dicha proteína o polipéptido dentro de las células de
mamífero, in vitro.
13. La utilización del DNA que codifica la
proteína o polipéptido según una cualquiera de las reivindicaciones
1 a 9, en la fabricación de un agente para inducir a células de
mamífero a producir dicha proteína o polipéptido.
14. Un vector de expresión que comprende el DNA,
según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9.
15. Una célula hospedante trasformada por un
vector de expresión, según la reivindicación 14.
16. Una célula hospedante según la reivindicación
15, en la que dicha célula hospedante es una célula de mamífero o
una célula de levadura.
17. Un método para escrutar inhibidores de las
vías de señalización de TGF-\beta,
caracterizada por (A) poner en contacto una muestra que
contiene inhibidores de la vía de señalización de
TGF-\beta, introduciéndola o no en células que
expresan de forma recombinante una proteína o polipéptido TAB1,
codificada por un DNA según una cualquiera de las reivindicaciones 1
a 8, y la proteína TAK1, y (B) medir la actividad quinasa de la
proteína TAK1.
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