ES2223533T3 - Promotor que permite la expresion de transgenes en toda la planta excepto en la semilla. - Google Patents

Promotor que permite la expresion de transgenes en toda la planta excepto en la semilla.

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ES2223533T3 ES00940461T ES00940461T ES2223533T3 ES 2223533 T3 ES2223533 T3 ES 2223533T3 ES 00940461 T ES00940461 T ES 00940461T ES 00940461 T ES00940461 T ES 00940461T ES 2223533 T3 ES2223533 T3 ES 2223533T3
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Michel Caboche
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Abstract

Secuencia promotora que permite la expresión de un gen de interés en los tejidos de un planta, excepto en la semilla en maduración y en la semilla seca, caracterizada porque comprende una secuencia que presenta por lo menos el 80% de identidad con la secuencia SEC ID Nº 1 del promotor del gen de la FAH de Arabidopsis.

Description

Promotor que permite la expresión de transgenes en toda la planta excepto en la semilla.
La presente invención se refiere al aislamiento y la caracterización de un promotor que permite la expresión de transgenes en la planta adulta, con el fin de mejorar el desarrollo de la planta, sin que el producto de dicho transgen esté presente en la semilla madura y seca. La invención se refiere asimismo a las plantas transgénicas que presentan un gen de interés fusionado con dicha secuencia promotora.
Las técnicas de biología molecular permiten actualmente modificar el patrimonio genético de los vegetales para cambiar sus componentes que controlan la producción, la calidad o la salud. La especificidad de expresión de los transgenes introducidos reside esencialmente en la utilización de unas secuencias promotoras de plantas o de microorganismos. La búsqueda de promotores específicos resulta por lo tanto de una importancia capital para las biotecnologías vegetales. Las semillas constituyen un componente importante de la agricultura, en tanto que simiente, pero asimismo en la alimentación o la industria de transformación. A este respecto, la presencia de proteínas y productos nuevos en la semilla puede causar problemas. Por lo tanto parece, interesante poder disponer de un promotor activo en todos los tejidos vegetativos, pero inoperante en las semillas.
Las características de una semilla dependerán de las interacciones entre la maduración, bajo el control de un programa genético específico, y unas condiciones del entorno que condicionan en gran medida la producción posterior. Sin embargo, los mecanismos reguladores de dichos fenómenos permanecen ampliamente incomprendidos. Existe por lo tanto un interés real en mantener una buena calidad de los lotes de siembras. Ahora bien, el desarrollo de las plantas transgénicas presenta nuevos problemas, principalmente ligados a la expresión de genes heterólogos en las semillas de dichas plantas. En efecto, la presencia de proteínas o polipéptidos en las semillas puede tener unas consecuencias nefastas sobre su capacidad para germinar o sobre su calidad. Además, si la población se familiariza cada vez más con la idea de que las plantas comestibles se pueden modificar genéticamente, unas semillas comestibles que contienen el producto de transgenes podrían no ser aceptadas fácilmente.
Así, el objetivo básico de la presente invención es identificar un promotor que permitiría una expresión fuerte de un transgen en todos los tejidos de las plantas excepto en la semilla.
Con dicho fin, se ha empleado la captura del promotor ("promoter trapping"), una herramienta potente para disecar unos procesos de desarrollo (Topping and Lindsey 1995 para revista). Dicha estrategia se basa en la utilización de un vector de transformación de las plantas que presentan, en uno de sus extremos, un gen marcador (GUS o GFP más frecuentemente) sin promotor. Si la inserción se lleva a cabo en una región codificante y si la secuencia del gen marcador está en fase, se producirá una fusión traduccional entre la proteína endógena y la proteína del gen marcador. Las estrategias de captura del gen presentan una ventaja mayor en relación con la mutagénesis de inserción clásica porque el fenotipo (expresión del gen marcador GUS) es dominante. Dicha dominancia del fenotipo (GUS) permite seguir los alelos mutados en el estado heterocigoto. Esto es muy interesante para el estudio de mutaciones que son letales en el estado heterocigoto. Dicho enfoque permite caracterizar asimismo un gen mediante su expresión.
Se ha descubierto durante la gestación de la presente invención, que una inserción de un gen marcador en el gen codificante para una proteína de tipo "fatty acid hydroxylase" (FAH) de Arabidopsis conduce a una expresión en todos los tejidos de la planta excepto en la semilla. Dicho tipo de promotor presenta un gran interés para unas aplicaciones biotecnológicas. Permite hacer expresar una proteína de interés a partir de la impregnación de todos los tejidos de la planta, con un nivel de expresión elevado, excepto en la semilla. Se puede por lo tanto, por ejemplo, proteger una planta contra numerosos estreses bióticos o abióticos sin modificar el contenido de su semilla. Asimismo se puede hacer expresar una secuencia anti-sentido dirigida contra un gen diana en todos los tejidos excepto en la semilla.
Descripción
De este modo, la presente invención se refiere a una secuencia promotora que permite la expresión de un gen de interés en los tejidos de una planta excepto en la semilla en maduración y en la semilla seca, comprendiendo dicha secuencia una secuencia que presenta por lo menos el 80% de identidad con la secuencia o una porción de la secuencia del promotor del gen de la FAH de Arabidopsis.
Preferentemente, dicha secuencia comprende una secuencia que presenta por lo menos el 80% de identidad con la secuencia o una porción la secuencia SEC ID Nº 1.
Se entiende por "% de identidad" el porcentaje de nucleótidos idénticos que se pueden calcular fácilmente por el experto en la materia utilizando un programa informático de comparación de secuencias tal como el programa DNASIS (Versión 2.5 para Windows; Hitachi Software Engineering Co., Ltd, South San Francisco, CA) utilizando los parámetros estándar descritos en el manual del fabricante, incorporado en la descripción a título de referencia.
Asimismo, en dicho contexto, las secuencias y los porcentajes de identidad se pueden obtener utilizando los recursos informáticos de internet. Se puede citar el programa Blast (www.ncbi.nlm.nih.gov) y el programa FastDB con los parámetros siguientes "Mismatch penalty 1,00; Gap Penalty 1,00; Gap Size Penalty 0,33; joining penalty 30,0". Dichos algoritmos se presentan en el Current Methods in Sequencing and synthesis Methods and Applications, páginas 127-149, 1988, Ala R. Liss, Inc, incorporado en la descripción a título de referencia.
Asimismo se pueden definir las secuencias que presentan el 80% de identidad por ser unas secuencias que se hibridan con la secuencia SEC ID Nº 1 en unas condiciones de astringencia fuertes. Dichas condiciones se presenta en Sambrook et al. Molecular Cloning A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor Press, 1989) en los párrafos 11.1 a 11.61, incorporados en la descripción a título de referencia.
Ventajosamente, la secuencia según la invención presenta la secuencia o una porción de la secuencia SEC ID Nº 1 siguiente:
1
La invención se refiere asimismo a la utilización de una porción de la secuencia SEC ID Nº 1 para la identificación de fragmentos capaces de promover la expresión de un gen de interés en una planta excepto en la semilla. De este modo, es posible definir la región mínima de la secuencia del promotor del gen de la FAH para asegurar una expresión eficaz. En dicho sentido, el promotor se puede modificar mediante la adición de secuencias tales como unos enhancers, mediante deleción de regiones no esenciales y/o no deseadas. El promotor puede comprender unas secuencias sintéticas y/o naturales.
La invención se refiere a un procedimiento que permite el aislamiento y la caracterización del promotor del gen de la FAH en las plantas que comprende las etapas siguientes:
a)
Utilización de un cebador que comprende una secuencia que presenta por lo menos el 80% de identidad con una secuencia que presenta por lo menos 10 nucleótidos consecutivos de la secuencia SEC ID Nº 5 o una secuencia complementaria, un cebador que se hibrida en unas condiciones astringentes fuertes a cualquier secuencia codificante para la SEC ID Nº 4 o una secuencia que presenta por lo menos el 80% de identidad con una secuencia que presenta 10 nucleótidos consecutivos de la secuencia genómica del gen de la FAH de Arabidopsis accesible bajo el número AC003096 o una secuencia complementaria, para el aislamiento y/o la amplificación de la secuencia anterior al extremo 5' del gen de la FAH,
b)
clonación y secuenciación de la secuencia obtenida en la etapa a).
La SEC ID Nº 5 corresponde a la secuencia codificante del gen de la FAH de Arabidopsis:
DEFINICIÓN: ADNc completo de "Arabidopsis thaliana fatty acid hydroxylase FahIp" (FAH 1)
ACCESO : AF021804
ORGANISMO: Arabidopsis thaliana; Eukaryota, Viridiplantae, Streptophyta, Embryophyta, Tracheophyta, Euphyllophytes, Spermatophyta, Magnoliophyta, Eudicotyledons, Rosidae; Brassicales; Brassicaceae.
Referencia: Mitchell, A.G and Martin, C.E, (1997). Fah 1 p, a saccharomyces cerevisiae cytochrome b5 fusion protein, and its Arabidopsis thaliana homolog that lacks the cytochrome b5 domain both function in the alpha-hydroxylation of sphingolipid-associated very long chain fatty acids; J. Biol. Chem. 272 (45), 28281-28288
MEDLINE 98019193
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Asimismo, resulta posible utilizar un cebador que comprende una secuencia que presenta por lo menos el 80% de identidad con una secuencia que presenta por lo menos 10 nucleótidos consecutivos de la secuencia genómica del gen de la FAH de Arabidposis (intrones y exones) accesible por el experto en la materia bajo el número AC003096 o un cebador que se hibrida en unas condiciones astringentes fuertes con toda la secuencia codificante para la SEC ID Nº 4 (Arabidopsis thaliana, fatty acid hydroxylase Fah1p) siguiente:
3
De este modo, la secuencia promotora que permite la expresión de un gen de interés en los tejidos de una planta, excepto en la semilla en maduración y en la semilla seca, se puede caracterizar asimismo porque comprende una secuencia que presenta por lo menos el 80% de identidad con la secuencia o una porción de la secuencia del promotor del gen de la FAH susceptible de ser obtenido a partir del procedimiento descrito anteriormente.
Otro aspecto de la invención conduce a un casete de expresión que presenta una secuencia de interés fusionada con una secuencia que comprende una secuencia promotora tal como se ha definido anteriormente. Dicha secuencia de interés puede codificar para un ARN, una proteína o un polipéptido que protege la planta contra un estrés biótico o abiótico.
El casete puede permitir la co-supresión de la expresión de un gen caracterizado porque dicha secuencia de interés codifica para una proteína o un polipéptido capaz de sustituirse en la función de una proteína o de un polipéptido endógeno. La secuencia de interés puede asimismo codificar para una secuencia antisentido dirigida contra un gen diana. Lo que permite, acoplando con la sobrexpresión ectópica de un gen de interés en las semillas, impedir cualquier expresión de dicho gen en otros tejidos, no siendo expresado el gen antisentido. Esto se ha revelado de gran utilidad en el caso en el que se desee sobreexpresar una proteína en las semillas sin perturbar el desarrollo de otros tejidos de la planta.
El casete según la invención puede comprender además un gen marcador de selección, una secuencia líder que controla el tránsito, la secreción o el marcaje del producto de expresión en diferentes orgánulos, una secuencia señal de la terminación de la transcripción y la traducción.
Se entiende por "gen de interés" o "transgen" en el marco de la invención, un gen principalmente seleccionado de entre los genes que codifican para una proteína o un polipéptido que protege la planta contra un estrés biótico o abiótico, los genes perturbadores que codifican para un producto capaz de sustituirse y/o de inhibir la función o la expresión de un ARNm, de una proteína o de un polipéptido endógeno. Se pueden citar por ejemplo los genes que codifican para unos ribozomas contra unos ARNm endógenos, unos genes cuyo producto de la transcripción es por lo menos complementario en parte con un ARNm endógeno diana (documento EP 240 208 incorporado en la descripción como referencia). Se pueden asimismo citar unos genes, cuyo producto de la transcripción es idéntico o similar a los transcritos de genes endógenos, que son capaces de inhibir por co-supresión la expresión de dichos genes endógenos (Napoli C. et al., 1990, The Plant Cell, 2, 279-289, citado en la descripción como referencia). Es decir, el gen según la invención puede codificar para una enzima implicada en el metabolismo de manera que produce o favorece la biosíntesis de metabolitos, principalmente de metabolitos útiles para la alimentación humana o animal o pudiendo afectar el desarrollo. La secuencia promotora según la invención puede inducir la expresión de un gen extraño y ser utilizada en diferentes tipos de plantas. El término "gen extraño" o "transgen" está asimismo comprendido como definición de cualquier región de ADN codificante o no (proteína, polipéptido, antisentido, ARN catalítico, vírico, etc...). Una proteína de interés para el desarrollo y la producción de la planta se puede producir de forma constitutiva en todos los órganos de la planta utilizando dicho promotor sin que la composición de la semilla se vea afectada. Las proteínas de interés son, de forma no exhaustiva, las que permiten una mejor protección de la planta frente a:
- un estrés biótico: protección contra los patógenos, bacterias, hongos, insectos, nemátodos, parásitos o depredadores, protección contra los virus y patógenos intracelulares, en particular los que no se transmiten mediante las semillas.
- un estrés abiótico: protección contra el calor y el frío, el hielo, el estrés hídrico tal como la sequía o, a la inversa, la anoxia, la polución (ozono, SO2), la fotoinhibición y el estrés luminoso, la lluvia en exceso, la fitorremediación, o el estrés nutricional ocasionado por una carencia o un exceso de un elemento nutritivo (en particular un estrés salino).
Cualquier gen de interés puede ser colocado por lo tanto bajo el control de la secuencia promotora aislada. Para la expresión en las plantas, dicho gen puede presentar asimismo unas secuencias 3' no transcritas que presentan unas señales de poliadenilación activas en las plantas. Dichas secuencias pueden ser, por ejemplo, las que codifican para la parte 3' transcrita no traducida del gen, el ARN 35S del virus del mosaico de la coliflor (35S CaMV) o la región 3' no traducida del gen que codifica la síntesis de la nopalina (NOS) del plásmido Ti de Agrobacterium tumefaciens.
El gen de interés según la invención puede ser asimismo un gen que controla el desarrollo tal como, por ejemplo, un gen implicado en el metabolismo de las hormonas, en la transducción de señales, o en el control del ciclo celular.
Otro aspecto de la invención se refiere a un vector, principalmente un vector plasmídico, que comprende un casete de expresión tal como se ha definido anteriormente.
La invención tiene asimismo como objeto una célula de planta transformada con el casete o con un vector que comprende dicho casete y un conjunto de transformación de planta que comprende dicho casete o dicho vector.
La preparación de los plásmidos, la construcción de los genes quiméricos y de los casetes de expresión, las restricciones del ADN mediante unas endonucleasas, la transformación y la confirmación de las transformaciones se llevan a cabo según los protocolos estándar (Sambrook et al., 1989 Molecular Cloning Manual Cold Spring Harbor Laboratory, incorporados en la descripción como referencia).
La construcción de los vectores utilizables para los experimentos de transformación forma parte de las técnicas de biología molecular conocidas y practicadas de forma rutinaria en dicho campo de aplicaciones.
Un aspecto suplementario de la invención se refiere a un procedimiento para la preparación de plantas transgénicas en las que un gen de interés se expresa en todos los tejidos excepto en la semilla en maduración y en la semilla seca, caracterizado porque comprende las etapas siguientes:
a)
transferencia de un casete o de un vector según la invención en unas células de plantas,
b)
cultivo de las células transformadas obtenidas en la etapa a) de forma que se obtienen dichas plantas transgénicas.
La transferencia del ADN en el interior de las células de la planta, principalmente de las células de albumen o de las células pluripotentes derivadas de embriones inmaduros, se puede llevar a cabo mediante las técnicas estándar (Plant Cell Report, 10, 595, 1992), en particular mediante transferencia vía Agrobacterium (Plant J., 1994 6, 271), mediante electroporación (Nature, 1987, 327, 70), la serporación (Barley Genetics, 1991 VI, 231), mediante polietilenglicol o mediante le método biolístico denominado "gun particule" (Nature, 1987, 327,10). De forma general, para los vectores de transformación vía Agrobacterium (infiltración in planta, Bechtold et al, 1993), los vectores de la transformación presentan unos marcadores de selección, unos extremos de ADN-T, unos sitios de clonaje, unas funciones de replicación, así como otros elementos tan necesarios para una buena transferencia de los transgenes (Bouchez et al., 1993). Las publicaciones mencionadas anteriormente se incorporan en la descripción como referencia.
La presente invención se refiere asimismo a una planta transgénica susceptible de ser obtenida utilizando el procedimiento mencionado anteriormente.
Por "planta susceptible de ser obtenida", se entiende cualquier planta que expresa un transgen en sus tejidos excepto en las semillas maduras y secas, presentando dicha planta un promotor según la invención. Las plantas obtenidas por cualquier procedimiento equivalente que conduce al mismo resultado son asimismo el objeto de la invención. La lista de las plantas en las que dicha secuencia promotora se puede utilizar, incluye más particularmente las plantas que son útiles para cualquier industria. Se puede citar por ejemplo la colza, las crucíferas, el maíz, la soja, el trigo, el girasol, el guisante, las plantas ornamentales, y los árboles.
De este modo, la invención se refiere a una planta, tal como se ha definido anteriormente, que expresa en sus tejidos, excepto en las semillas, un gen cuyo producto (ARN o proteína) protege a la planta contra un estrés biótico o abiótico, una secuencia antisentido dirigida contra un gen diana, una proteína o un polipéptido capaz de ser sustituido en la función de una proteína o de un polipéptido endógeno o una secuencia codificante para una proteína implicada en la biosíntesis de metabolitos o un gen que controla el desarrollo tal como por ejemplo un gen implicado en el metabolismo de las hormonas, en la transducción de las señales, o en el control del ciclo celular. La planta según la invención puede expresar asimismo una proteína de interés bajo el control de un promotor diferente del promotor del gen de la FAH y una secuencia antisentido capaz de inhibir la expresión de dicha proteína de interés bajo el control del promotor del gen de la FAH, de tal modo que el gen de interés sólo se expresa en las semillas.
Las semillas obtenidas a partir de una planta transgénica según la invención, que no contienen por lo tanto el producto de expresión del transgen, están previstos en la presente invención, así como su utilización en cualquier industria.
En lo sucesivo, se hará referencia a las siguientes leyendas de las figuras.
Leyendas
Figura 1
Estructura intro/exón del ARNm del gen de la FAH
Los rectángulos con las rayas representan los intrones.
La escala está presente en la figura.
T29F13 es un bac y TA1234 un ADNc.
Figura 2
Estructura de la región del gen FAH
PFAH upper y A1 representan los cebadores utilizados para secuenciar el promotor.
Los rectángulos con las rayas representan la parte 5' transcrita no traducida. La escala está presente en la figura.
Figura 3
Napa del plásmido pBI 101
Napa del plásmido pBI101 conteniendo el promotor pFAH utilizado.
Ejemplo 1 Clonaje del promotor Materiales y métodos Aislamiento de la región promotora de la FAH
El método utilizado para la extracción del ADN genómico de Arabidopsis se inspira en la descrita por Doyle y Doyle (1990). El principio radica en las propiedades detergentes del bromuro de cetiltrimetiletilamonio (CTAB: Sigma Chemical Co., USA) que permite la desnaturalización específica de las macromoléculas protéicas y polisacarídicas. Se trituran finamente aproximadamente 2 g de material vegetal (plántulas cultivadas in vitro, de 1 a 2 semanas de edad) en el nitrógeno líquido y se transfieren a un tubo de 50 ml de tipo FALCON (Costar, USA) que contiene 7,5 ml de tampón de extracción precalentado a una temperatura de 65ºC. La extracción se lleva a cabo a una temperatura de 65ºC durante 30 minutos, bajo una agitación constante. Las proteínas desnaturalizadas por el \beta-mercaptoetanol y el CTAB del tampón se extraen a continuación en un volumen de cloroformo y posteriormente se eliminan después de la centrifugación (4430 g, 10 min). Los ácidos nucleicos del sobrenadante se precipitan en un volumen de isopropanol en presencia de acetato sódico 3M (1/10, v/v), se centrifugan (7900 g, 10 min) y posteriormente se enjuagan con el etanol al 70%. El depósito se recupera en un tubo Eppendorf en 100 \mul de agua y los ácidos ribonucleicos se eliminan mediante la adición de 3 \mul de RNasa A a 10 mg/ml (Sigma Chemical Co., USA). El ADN se desproteiniza y a continuación se precipita de nuevo en el etanol absoluto. Después de la centrifugación en tubo Eppendorf, el depósito se lava, se seca, se recupera en 50 a 100 \mul de agua y se conserva a una temperatura de -20ºC antes de los análisis.
Amplificación del ADN genómico
Se amplifica la secuencia promotora utilizando la tecnología de PCR que es una técnica conocida (Sambrook et al. 1989). Se han derivado unos cebadores correspondientes a la parte 5'(upper) y la 3'(lower) de la secuencia promotora de la secuencia genómica del BAC T29F13 (AC003096) (ver figura 1). Se ha utilizado un ADN genómico de una línea de tipo salvaje (Ler) como matriz para la amplificación de la parte promotora. Las reacciones de amplificación se han realizado en un termociclador (MJ Research PTC100 - 96), en unos tubos de 0,2 ml (Prolabo) que contienen la mezcla siguiente:
1 \mul (10 ng) ADN, 2 \mul Tampón 10 x (BRL), 2 \mul MgCl2 25 mM, 0,8 \mul dNTP 5 mM, 1 \mul Cebador 1 (10 pmol/\mul), 1 \mul Cebador 2 (10 pmol/\mul), 0,5 \mul (1U) Taq ADN polimerasa (5U/\mul), H2O csp 20 \mul
upper (5' - 3') : TTCATGTTACTCTCTGCTTC (SEC ID Nº 2)
lower (3' - 5') : GGAAAGGAAACAAATACGGATTC (SEC ID Nº 3)
Transformación bacteriana
Los genotipos de las bacterias utilizadas para la realización de los experimentos son:
E.coli cepa DH12S (\phi80 dlacZ \DeltaM15 mcrA \Delta(mrr-hsdRMS-mcrBC) araD139 \Delta(ara,leu)7697 \DeltalacX74 galU galK rpsL deoR nupG recA1/F' proAB + lacIq Z\DeltaM15).
Agrobacterium tumefaciens pmp90C58CE
La transformación de las bacterias (E. coli cepa DH12S) mediante un plásmido recombinado se lleva a cabo por electroporación (Potter, 1993). En una cubeta de electroporación (1 ml, longitud 0,1 cm), se mezclan 2 \mul de la reacción de ligación con 50 \mul de las bacterias descongeladas y mantenidas en hielo. La cubeta se coloca a continuación en un electroporador (Gene Pulser II System: BIO-RAD, FRANCIA) y se aplica una tensión de 1,25 kV durante un tiempo que depende de la resistencia (200 \Omega) y de la capacidad del circuito (25 \muF). Se añade un ml de medio SOC para favorecer el crecimiento de las bacterias y se incuba el conjunto en un tubo de 10 ml durante 2 horas a una temperatura de 37ºC bajo una agitación rotativa (220 rpm). Las bacterias transformadas se extienden posteriormente sobre unas placas que contienen medio LB sólido suplementado con el antibiótico adecuado y se incuban a una temperatura de 37ºC durante toda una noche. La selección de las bacterias transformadas mediante el plásmido pMeca recombinado se lleva a cabo mediante 0,04 mg/ml de ampicilina en presencia de 0,2 mg/ml de X-Gal y de 0,05 mg/ml de IPTG. Para los otros plásmidos recombinados, la selección de las bacterias se lleva a cabo sobre un medio de LB con el antibiótico adecuado a una concentración final de 0,04 mg/ml.
Actividad \beta-glucuronidasa
Para las semillas, se realiza un semillero sobre dos espesores de papel Whatman 1M de 4,7 cm (Maindstone, Inglaterra) impregnado con 2 ml de agua estéril. Después de 48 horas de impregnación en una placa saturada de agua, se raspan las semillas y se colocan en un tubo Eppendorf en el que se añaden 100 \mul de tampón de infiltración (100 mM de Tampón fosfato pH 7,2, 10 mM EDTA, Tritón X100 0,1 v/v) suplementado con X-Gluc (ácido 5-Bromo-4-Cloro-3-indolil-\beta-D-Glucurónico. El X-Gluc se disuelve en DMF (dimetilformamida) a una concentración Stock : 100 \mu (100 mg/100 \mul). El tampón de infiltración se suplementa al 1/100 de forma extemporánea con el stock de X-Gluc. Para el resto de tejidos, las muestras se colocan directamente en el tampón de infiltración y se lleva a cabo a continuación la coloración según el mismo protocolo.
La infiltración se lleva a cabo al vacío (en una campana al vacío):
-
se interrumpe el vacío 2 veces.
-
El vacío se mantiene durante 1 hora, después las muestras se colocan a una temperatura de 37ºC durante la noche.
Resultados
Unos análisis preliminares han indicado que una enzima implicada en el metabolismo de los lípidos (la "Fatty Acid Hydroxilase" : FAH) podría presentar una expresión correspondiente al tipo de promotor que presenta las características buscadas.
La secuencia del gen en cuestión se ha obtenido gracias a las secuencias procedentes de la secuenciación sistemática del genoma de Arabidopsis thaliana y se localiza sobre el BACT29F13. Se ha identificado una secuencia expresada (EST TAI234) en las bases de datos y parece corresponder a una secuencia a lo largo de la longitud del ARNm de la FAH. Esto ha permitido la identificación de la secuencia 5' transcrita no traducida y del emplazamiento previsto de la secuencia promotora. La estructura intrón/exón se ha deducido, a nivel de la parte transcrita no traducida, del alineamiento del BAC con el EST TAI234 (figura 1).
El promotor se ha amplificado mediante PCR a partir del cebador pFAH/upper y el cebador A1, colocado en la parte 5' transcrita no traducida (figura 2). Un estudio de la secuencia ha mostrado que la secuencia amplificada presenta una caja TATA putativa a -100 pb del sitio de iniciación presumida de la transcripción (a partir del ADNc longitud total) y una caja CCAAT a -190 pb de dicho mismo inicio de transcripación. El fragmento de PCR amplificado (932 pb) se ha clonado en un vector pGEM-T (PROMEGA), secuenciado, posteriormente introducido en un vector binario (pBI101, Clontech) que contiene un gen marcador GUS sin promotor (figura 3). Dicha construcción se ha introducido a continuación mediante transformación en planta, mediante Agrobacterium, en unas plantas de tipo salvaje (ecotipo Ws). Se han obtenido trece transformantes primarios, que se han ensayado para su actividad GUS durante su desarrollo.
Ejemplo 2 Expresión del gen marcador bajo el control del promotor del gen de la FAH
La expresión resulta muy marcada a partir de las 20 horas después del inicio de la impregnación del embrión. Durante el desarrollo, la expresión resulta muy fuerte en todos los tejidos, con cierta preferencia por los tejidos vasculares.
Dichos resultados demuestran que la secuencia promotora aislada confiere adecuadamente un perfil de expresión muy específico al gen marcador utilizado (GUS), el promotor es activo a lo largo del desarrollo de la planta, en todos los tejidos ensayados (hojas, flores, tallos, raíces, etc..) excepto en la semilla a lo largo del proceso de maduración (ver tabla I a continuación).
TABLA 1 Perfil de expresión del gen marcador GUS
4
La expresión del marcador confirma la funcionalidad del promotor y su especificidad. Dicho tipo de promotor es por lo tanto de gran interés para unas aplicaciones biotecnológicas, tales como la expresión de una toxina anti-insecto (tipo Bt) en las plantas y la expresión de cualquier transgen que permite mejorar, de forma cuantitativa o cualitativa, el desarrollo y el crecimiento de la planta sin que la proteína codificada por el transgen esté presente en la semilla.
Referencias
Bechtold, N., Ellis J. y Pelletier G. (1993). In planta Agrobacterium mediated gene transfer by infiltration of adult Arabidopsis thaliana plants. C.R. Acad. Sci. Paris, Sciences de la vie; 316: 1194-9.
Bouchez D., Camilleri C. Caboche M. (1993) A binary vector based on Basta resistance for in planta transformation of Arabidopsis thaliana C.R. Acad. Sci. Paris, Sciences de la vie: 316, 1188-1193.
Doyle J.J y Doyle J.L. (1990). Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus; 12: 13-15.
Sambrook J,, Fritsch E.F. y Maniatis T. (1989)., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor N.Y.
<110> INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE - INRA
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<120> PROMOTOR QUE PERMITE LA EXPRESIÓN DE TRANSGENES EN TODA LA PLANTA EXCEPTO EN LA SEMILLA.
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<130> FAH
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<140>
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<141>
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<160> 5
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<170> PatentIn Ver. 2.0
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<210> 1
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<211> 932
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<212> ADN
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<213> Arabidopsis thaliana
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<220>
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<223> promotor de la FAH en Arabidopsis thaliana
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<400> 1
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5
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<210> 2
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador upper
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<400> 2
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\hskip-.1em\dddseqskip
ttcatgttac tctctgcttc
\hfill
20
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<210> 3
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<211> 23
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<212> ADN
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<213> Arabidopsis thaliana
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<220>
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<223> Cebador lower
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<400> 3
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\hskip-.1em\dddseqskip
ggaaaggaaa caaatacgga ttc
\hfill
23
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<210> 4
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<211> 237
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<212> PRT
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<213> Arabidopsis thaliana
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<220>
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<223> fatty acid hydroxylase Fah 1p
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<400> 4
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6
7
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<210> 5
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<211> 714
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<212> ADN
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<213> Arabidopsis thaliana
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<220>
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<223> Secuencia que codifica para la fatty acid hydroxylase Fah 1p
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<400> 5
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Claims (23)

1. Secuencia promotora que permite la expresión de un gen de interés en los tejidos de un planta, excepto en la semilla en maduración y en la semilla seca, caracterizada porque comprende una secuencia que presenta por lo menos el 80% de identidad con la secuencia SEC ID Nº 1 del promotor del gen de la FAH de Arabidopsis.
2. Secuencia según la reivindicación 1, caracterizada porque comprende una secuencia que se hibrida en unas condiciones de astringencia fuertes con la secuencia SEC ID Nº 1.
3. Secuencia según la reivindicación 1, caracterizada porque comprende la secuencia SEC ID Nº 1.
4. Procedimiento que permite el aislamiento y la caracterización del promotor del gen de la FAH en las plantas, que comprende las etapas siguientes:
a)
Utilización de un cebador que comprende una secuencia que presenta por lo menos el 80% de identidad con una secuencia que presenta por lo menos 10 nucleótidos consecutivos de la secuencia SEC ID Nº 5 o una secuencia complementario, un cebador que se hibrida en unas condiciones astringentes fuertes con cualquier secuencia codificante para la SEC ID Nº 4 o una secuencia que presenta por lo menos 80% de identidad con una secuencia que posee por lo menos 10 nucleótidos consecutivos de la secuencia genómica del gen de la FAH de Arabidopsis accesible bajo el número AC003096 o una secuencia complementaria, para el aislamiento y/o la amplificación de la secuencia anterior al extremo 5' del gen de la FAH,
b)
clonación y secuenciación de la secuencia obtenida en la etapa a).
5. Utilización de una secuencia según las reivindicaciones 1 a 3 para la identificación de los fragmentos de la secuencia SEC ID Nº 1, que permite la expresión de un gen de interés en los tejidos de una planta, excepto en la semilla en maduración o en la semilla seca.
6. Casete de expresión, caracterizado porque presenta una secuencia de interés fusionada con una secuencia que comprende una secuencia promotora según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3.
7. Casete de expresión según la reivindicación 6, caracterizado porque dicha secuencia de interés codifica para un ARN, una proteína o un polipéptido que protege a la planta contra un estrés biótico o abiótico, o que está implicado en el desarrollo, principalmente en el metabolismo de las hormonas, en la transducción de las señales, o en el control del ciclo celular.
8. Casete de expresión según la reivindicación 6 que permite la co-supresión de un gen, caracterizado porque dicha secuencia de interés codifica para una proteína o un polipéptido capaz de sustituirse en la función de una proteína o de un polipéptido endógeno.
9. Casete de expresión según la reivindicación 6, caracterizado porque dicha secuencia de interés codifica para una secuencia antisentido dirigida contra un gen diana.
10. Casete de expresión según la reivindicación 6, caracterizado porque dicha secuencia de interés codifica para una enzima implicada en la producción de metabolitos por una planta.
11. Vector que comprende un casete de expresión según cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9.
12. Célula de planta transformada con un casete según cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9 o un vector según la reivindicación 11.
13. Conjunto de transformación de la planta que comprende un casete según cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9 o un vector según la reivindicación 11.
14. Procedimiento para la preparación de plantas transgénicas en las que un gen de interés se expresa en todos los tejidos excepto en la semilla en maduración y en la semilla seca, caracterizado porque comprende las etapas siguientes:
a)
la transferencia de un casete o de un vector según cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9 o de un vector según la reivindicación 11 en unas células de plantas,
b)
el cultivo de las células transformadas obtenidas en la etapa a) de forma que se obtienen dichas plantas transgénicas.
15. Procedimiento según la reivindicación 14, caracterizado porque las células se seleccionan de entre las células embrionarias procedentes de un embrión inmaduro.
16. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 14 y 15, caracterizado porque la transferencia se lleva a cabo utilizando Agrobacterium, preferentemente Agrobacterium tumefaciens.
17. Planta transgénica, caracterizada porque comprende un casete según las reivindicaciones 6 a 10.
18. Planta según la reivindicación 17, caracterizada porque se expresa en sus tejidos, excepto en las semillas maduras y secas, un ARN, una secuencia antisentido dirigida contra un gen diana.
19. Planta según la reivindicación 17, caracterizada porque se expresa en sus tejidos, excepto en las semillas maduras y secas, un ARN, una proteína o un polipéptido capaz de sustituirse en la función de una proteína o de un polipéptido endógeno.
20. Planta según la reivindicación 17, caracterizada porque expresa una proteína de interés bajo el control de un promotor diferente del promotor del gen de la FAH y una secuencia antisentido capaz de inhibir la expresión de dicha proteína de interés bajo el control del promotor del gen de la FAH, de tal modo que la proteína de interés sólo se expresa en las semillas.
21. Planta según la reivindicación 17, caracterizada porque expresa en sus tejidos, excepto en las semillas maduras y secas, una secuencia que codifica para una proteína implicada en la biosíntesis de metabolitos, para una proteína o un polipéptido que protege a la planta contra un estrés biótico o abiótico, una proteína que controla el desarrollo principalmente en el metabolismo de las hormonas, en la transducción de las señales, o en el control del ciclo celular.
22. Planta según cualquiera de las reivindicaciones 17 a 21, caracterizada porque se selecciona de entre la colza, las crucíferas, el maíz, la soja, el trigo, el girasol, el guisante, las plantas ornamentales, y los árboles.
23. Semillas obtenidas a partir de una planta transgénica según cualquiera de las reivindicaciones 17 a 22, caracterizadas porque no contienen el producto de expresión del transgen, comprendiendo dichas semillas un casete según cualquiera de las reivindicaciones 6 a 10 o un vector según la reivindicación 11.
ES00940461T 1999-06-10 2000-06-08 Promotor que permite la expresion de transgenes en toda la planta excepto en la semilla. Expired - Lifetime ES2223533T3 (es)

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Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2275015T3 (es) * 2001-07-13 2007-06-01 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Promotores especificos de tejido vascular.
FR2828210B1 (fr) * 2001-08-01 2004-08-06 Agronomique Inst Nat Rech Acide nucleique regulateur permettant l'expression d'un polynucleotide d'interet specifiquement dans l'endothelium d'une graine de plante, et ses applications
EP2166097B1 (en) * 2004-10-05 2014-08-06 SunGene GmbH Constitutive expression cassettes for regulation of plant expression
US9085774B2 (en) 2005-04-19 2015-07-21 Basf Plant Science Gmbh Methods controlling gene expression
WO2006131490A1 (en) * 2005-06-09 2006-12-14 Basf Plant Science Gmbh Expression cassettes for seed-preferential expression in plants
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Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6310194B1 (en) * 1994-09-26 2001-10-30 Carnegie Institution Of Washington Plant fatty acid hydroxylases
GB9706381D0 (en) * 1997-03-27 1997-05-14 Cambridge Advanced Tech Improvements relating to the specificity of gene expression

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