EP3810805A4 - Procédé de détection et de quantification de modifications génétiques - Google Patents

Procédé de détection et de quantification de modifications génétiques Download PDF

Info

Publication number
EP3810805A4
EP3810805A4 EP19825310.6A EP19825310A EP3810805A4 EP 3810805 A4 EP3810805 A4 EP 3810805A4 EP 19825310 A EP19825310 A EP 19825310A EP 3810805 A4 EP3810805 A4 EP 3810805A4
Authority
EP
European Patent Office
Prior art keywords
quantification
detection
genetic alterations
genetic
alterations
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
EP19825310.6A
Other languages
German (de)
English (en)
Other versions
EP3810805A1 (fr
Inventor
Yukti CHOUDHURY
Hao Chen
Min-Han Tan
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Lucence Life Sciences Pte Ltd
Original Assignee
Lucence Life Sciences Pte Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Lucence Life Sciences Pte Ltd filed Critical Lucence Life Sciences Pte Ltd
Publication of EP3810805A1 publication Critical patent/EP3810805A1/fr
Publication of EP3810805A4 publication Critical patent/EP3810805A4/fr
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6858Allele-specific amplification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6853Nucleic acid amplification reactions using modified primers or templates
    • C12Q1/6855Ligating adaptors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/12Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C12N9/1241Nucleotidyltransferases (2.7.7)
    • C12N9/1252DNA-directed DNA polymerase (2.7.7.7), i.e. DNA replicase

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
EP19825310.6A 2018-06-25 2019-06-25 Procédé de détection et de quantification de modifications génétiques Pending EP3810805A4 (fr)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
SG10201805450Y 2018-06-25
PCT/SG2019/050317 WO2020005159A1 (fr) 2018-06-25 2019-06-25 Procédé de détection et de quantification de modifications génétiques

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EP3810805A1 EP3810805A1 (fr) 2021-04-28
EP3810805A4 true EP3810805A4 (fr) 2022-03-23

Family

ID=68985923

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EP19825310.6A Pending EP3810805A4 (fr) 2018-06-25 2019-06-25 Procédé de détection et de quantification de modifications génétiques

Country Status (4)

Country Link
EP (1) EP3810805A4 (fr)
CN (1) CN112639127A (fr)
SG (1) SG11202012687SA (fr)
WO (1) WO2020005159A1 (fr)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113436679B (zh) * 2020-03-23 2024-05-10 北京合生基因科技有限公司 确定待测核酸样本变异率的方法和***
WO2022025823A1 (fr) * 2020-07-29 2022-02-03 Lucence Life Sciences Pte. Ltd Procédés et kits pour la détection de virus à arn

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011019964A1 (fr) * 2009-08-12 2011-02-17 Nugen Technologies, Inc. Procédés, compositions, et kits pour générer des produits d'acides nucléiques sensiblement dépourvus d'acide nucléique matrice
WO2014093330A1 (fr) * 2012-12-10 2014-06-19 Clearfork Bioscience, Inc. Procédés pour analyse génomique ciblée
WO2015039006A1 (fr) * 2013-09-16 2015-03-19 The General Hospital Corporation Procédés de traitement du cancer
WO2018111835A1 (fr) * 2016-12-12 2018-06-21 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Compositions et procédés pour le codage par code-barres moléculaire de molécules d'adn avant l'enrichissement des mutations et/ou la détection des mutations

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114214314A (zh) * 2014-06-24 2022-03-22 生物辐射实验室股份有限公司 数字式pcr条码化
WO2016081798A1 (fr) * 2014-11-20 2016-05-26 Children's Medical Center Corporation Procédés relatifs à la détection de bris bicaténaires récurrents et non spécifiques dans le génome

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011019964A1 (fr) * 2009-08-12 2011-02-17 Nugen Technologies, Inc. Procédés, compositions, et kits pour générer des produits d'acides nucléiques sensiblement dépourvus d'acide nucléique matrice
WO2014093330A1 (fr) * 2012-12-10 2014-06-19 Clearfork Bioscience, Inc. Procédés pour analyse génomique ciblée
WO2015039006A1 (fr) * 2013-09-16 2015-03-19 The General Hospital Corporation Procédés de traitement du cancer
WO2018111835A1 (fr) * 2016-12-12 2018-06-21 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Compositions et procédés pour le codage par code-barres moléculaire de molécules d'adn avant l'enrichissement des mutations et/ou la détection des mutations

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
QING WANG ET AL: "Targeted sequencing of both DNA strands barcoded and captured individually by RNA probes to identify genome-wide ultra-rare mutations", SCIENTIFIC REPORTS, vol. 7, no. 1, 13 June 2017 (2017-06-13), XP055551336, DOI: 10.1038/s41598-017-03448-8 *
SCOTT R KENNEDY ET AL: "Detecting ultralow-frequency mutations by Duplex Sequencing", NATURE PROTOCOLS, vol. 9, no. 11, 9 October 2014 (2014-10-09), GB, pages 2586 - 2606, XP055745195, ISSN: 1754-2189, DOI: 10.1038/nprot.2014.170 *
See also references of WO2020005159A1 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN112639127A (zh) 2021-04-09
WO2020005159A1 (fr) 2020-01-02
SG11202012687SA (en) 2021-01-28
EP3810805A1 (fr) 2021-04-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
SG11202105109PA (en) Method for detection of rna
EP3759238A4 (fr) Systèmes et procédés de détection d'une maladie résiduelle
EP3677078A4 (fr) Procédé et appareil de configuration de signal de référence
EP3460385A4 (fr) Procédé et appareil de détermination de volume d'objet
EP3902459A4 (fr) Procédé et système pour une quantification automatisée de qualité de signal
EP3761849A4 (fr) Méthode pour détecter et/ou prédire des événements épileptiques
EP3552137A4 (fr) Système et procédés de détection de logiciels malveillants avec chiffrement
EP3899897A4 (fr) Système et procédé d'analyse de comportement d'un conducteur
EP3657154A4 (fr) Procédé et système pour déterminer une intensité de fluorescence d'une image fluorescente
EP3881243A4 (fr) Procédé de détection d'anomalie et système associé
EP3562429A4 (fr) Système et méthode de détermination de caractéristiques structurales d'un objet
EP3752943A4 (fr) Système et procédé de détection de cyberattaque à partir d'un canal latéral
EP3639039A4 (fr) Système et procédé de détection basée sur gmr de biomarqueurs
EP3776465A4 (fr) Système d'inspection de véhicule et procédé associé
IL267885B (en) Methods and systems for calculating the presence of items
EP4078514A4 (fr) Procédé et système de détection de caractéristiques physiques d'objets
EP3756160A4 (fr) Système et procédé de détection rapide d'objets
EP3625360A4 (fr) Méthodes et systèmes de rmn pour une détection rapide d'espèces de candida
EP3649460A4 (fr) Appareil pour optimiser l'inspection de l'extérieur d'un objet cible et procédé associé
EP3438273A4 (fr) Procédé de prédiction de l'effet du daikenchuto et procédé de détermination du dosage du daikenchuto
EP3714397A4 (fr) Procédé et système d'identification de l'authenticité d'un d'objet
EP3652204A4 (fr) Procédé de quantification d'auto-anticorps
EP3949435A4 (fr) Système et procédé de détection de fluides dans l'oreille moyenne
EP3810805A4 (fr) Procédé de détection et de quantification de modifications génétiques
EP3422839A4 (fr) Appareil et procédé de détection d'inclinaison d'objet

Legal Events

Date Code Title Description
STAA Information on the status of an ep patent application or granted ep patent

Free format text: STATUS: THE INTERNATIONAL PUBLICATION HAS BEEN MADE

STAA Information on the status of an ep patent application or granted ep patent

Free format text: STATUS: THE INTERNATIONAL PUBLICATION HAS BEEN MADE

PUAI Public reference made under article 153(3) epc to a published international application that has entered the european phase

Free format text: ORIGINAL CODE: 0009012

STAA Information on the status of an ep patent application or granted ep patent

Free format text: STATUS: REQUEST FOR EXAMINATION WAS MADE

17P Request for examination filed

Effective date: 20201223

AK Designated contracting states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AL AT BE BG CH CY CZ DE DK EE ES FI FR GB GR HR HU IE IS IT LI LT LU LV MC MK MT NL NO PL PT RO RS SE SI SK SM TR

AX Request for extension of the european patent

Extension state: BA ME

DAV Request for validation of the european patent (deleted)
DAX Request for extension of the european patent (deleted)
REG Reference to a national code

Ref country code: HK

Ref legal event code: DE

Ref document number: 40045286

Country of ref document: HK

A4 Supplementary search report drawn up and despatched

Effective date: 20220223

RIC1 Information provided on ipc code assigned before grant

Ipc: C12Q 1/6858 20180101ALI20220217BHEP

Ipc: C12Q 1/6855 20180101ALI20220217BHEP

Ipc: C12Q 1/6869 20180101AFI20220217BHEP