EA040594B1 - OPTIMIZED BISPECIFIC ANTI-CD3 ANTIBODIES AND THEIR APPLICATIONS - Google Patents

OPTIMIZED BISPECIFIC ANTI-CD3 ANTIBODIES AND THEIR APPLICATIONS Download PDF

Info

Publication number
EA040594B1
EA040594B1 EA201890785 EA040594B1 EA 040594 B1 EA040594 B1 EA 040594B1 EA 201890785 EA201890785 EA 201890785 EA 040594 B1 EA040594 B1 EA 040594B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
antigen
binding
antibody
antibodies
amino acid
Prior art date
Application number
EA201890785
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Эрик СМИТ
Лорик АБЕР
Роберт БАББ
Ган ЧЭНЬ
Дуглас МАКДОНАЛД
Original Assignee
Ридженерон Фармасьютикалз, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ридженерон Фармасьютикалз, Инк. filed Critical Ридженерон Фармасьютикалз, Инк.
Publication of EA040594B1 publication Critical patent/EA040594B1/en

Links

Description

Ссылка на перечень последовательностейLink to sequence listing

В данный документ включен посредством ссылки перечень последовательностей, представленный в машиночитаемой форме как файл 10151WO01_ST25.txt, созданный 22 сентября 2016 г., и содержащийThis document incorporates by reference a sequence listing provided in machine-readable form as file 10151WO01_ST25.txt, created on September 22, 2016, and containing

264418 байт.264418 bytes.

Область техникиTechnical field

Изобретение относится к биспецифическим антителам, нацеленным на эффекторный антиген, такой как антиген CD3, и связанный с опухолью антиген, и к способам уничтожения опухолей. В данном изобретении предложены биспецифические антитела, содержащие эффекторное плечо, которое связывается с эффекторным антигеном со слабой аффинностью или с отсутствием детектируемой аффинности связывания, например анти-CD3-антигенсвязывающим плечом, которое связывается с CD3 с KD более чем около 500 нМ, в анализе связывания аффинности in vitro.The invention relates to bispecific antibodies targeting an effector antigen, such as the CD3 antigen and a tumor-associated antigen, and methods for killing tumors. The present invention provides bispecific antibodies comprising an effector arm that binds to an effector antigen with little or no detectable binding affinity, such as an anti-CD3 antigen binding arm that binds to CD3 with a KD greater than about 500 nM, in an affinity binding assay in vitro.

Уровень техникиState of the art

Потенциал терапевтических биспецифических антител (bsAb), в частности, в онкологических иммунотерапиях направлен на объединение нескольких антигенных мишеней, для вызова более надежного врожденного иммунного ответа на нежелательные клетки-мишени или организм.The potential of therapeutic bispecific antibodies (bsAbs), particularly in cancer immunotherapies, is to combine multiple antigenic targets to elicit a more robust innate immune response against unwanted target cells or organisms.

В настоящее время хорошо известно, что для опосредования перенаправленного лизиса bsAb должен сгруппировать целевую клетку непосредственно с инициирующей молекулой на эффекторной клетке, такой как T-клетка. В конструировании bsAb есть много факторов, например размер и состав будут влиять на распределение и стабильность in vivo (Segal, D.M., Weiner, G.J., and Weiner, L.M.. Current Opinion in Immunol. 1999, 11:558-562; Chames, P. and Baty, D. MAbs. 2009, 1(6):539-547). Дифференциальные последствия трудно предсказать в зависимости от подмножества T-клеток, которые срабатывают для ответа, а также состояния стимулируемой T-клетки. Хорошо известно, что bsAb не обеспечивают согласованных результатов (Manzke O., et al. Cancer Immunol. Immunother. 1997, 45:198-202). Например, без адекватного продуцирования цитокинов перекрестное связывание CD3 может индуцировать апоптотический ответ в T-клетке (Noel P.J., Boise L.H., Thompson C.B.: Regulation of T cell activation by CD28 and CTLA4. Adv. Exp. Med. Biol. 1996, 406:209-217). Подмножество T-клеток и состояние дифференцировки таких рекрутированных T-клеток, например наивных T-клеток, важно для эффективности, поскольку наивные T-клетки не могут лизировать клетки-мишени без предварительной активации (такой как перекрестное связывание с TCR в присутствии IL-2).It is now well known that to mediate redirected lysis, a bsAb must group the target cell directly with the initiator molecule on an effector cell, such as a T cell. There are many factors in the construction of bsAbs, for example size and composition will affect in vivo distribution and stability (Segal, D.M., Weiner, G.J., and Weiner, L.M.. Current Opinion in Immunol. 1999, 11:558-562; Chames, P. and Baty, D. MAbs 2009, 1(6):539-547). Differential outcomes are difficult to predict depending on the subset of T cells that fire to respond as well as the state of the stimulated T cell. It is well known that bsAbs do not provide consistent results (Manzke O., et al. Cancer Immunol. Immunother. 1997, 45:198-202). For example, without adequate cytokine production, CD3 cross-linking can induce an apoptotic response in the T cell (Noel P.J., Boise L.H., Thompson C.B.: Regulation of T cell activation by CD28 and CTLA4. Adv. Exp. Med. Biol. 1996, 406:209 -217). The subset of T cells and the state of differentiation of such recruited T cells, e.g., naive T cells, is important for efficiency because naive T cells cannot lyse target cells without prior activation (such as cross-linking to TCR in the presence of IL-2) .

Некоторые биспецифические методы лечения были успешными, однако, как и при многих методах лечения рака, они не обходятся без последствий. Токсичность является основной причиной неудачи среди терапии рака. Хорошо известно, что токсичность так называемых химиотерапевтических препаратов является основной причиной побочных эффектов пациентов и вторичных заболеваний. Акт клеточного уничтожения сам по себе связан с неприятностями для пациента. Множество цитотоксических ответов может быть вызвано путем активации эффекторных клеток, например T-клеток и клеток-мишеней рака, но какой тип ответа наиболее полезен при опухолевой иммунотерапии, еще предстоит выяснить. Предпочтительным будет метод идентификации анти-CD3 антител для использования в биспецифической терапии, имеющей уменьшенные побочные эффекты, при сохранении эффективности и желательных фармакокинетических свойств (PK).Some bispecific therapies have been successful, but as with many cancer treatments, they are not without consequences. Toxicity is a major cause of failure among cancer therapies. It is well known that the toxicity of so-called chemotherapeutic drugs is the main cause of patient side effects and secondary diseases. The act of cellular destruction itself is associated with trouble for the patient. A variety of cytotoxic responses can be elicited by activating effector cells, such as T cells and cancer target cells, but which type of response is most useful in tumor immunotherapy remains to be seen. The preferred method would be to identify anti-CD3 antibodies for use in bispecific therapy having reduced side effects while maintaining efficacy and desirable pharmacokinetic (PK) properties.

Были описаны такие методики, как созревание аффинности, которые на основе соотношения структура/активность (SAR) используют мутагенез для оптимизации антител с увеличенной и улучшенной специфичностью связывания или аффинностью к целевому антигену по сравнению с исходным антителом (см., например, WO 2011/056997, опубликованную 12 мая 2011 г.). Были описаны модифицированные антитела OKT3, способные связываться и взаимодействовать с CD3 с различной степенью аффинности, при этом проявляя активацию T-клеток от умеренной до высокой (US 7820166). Однако способы уменьшения аффинности связывания молекул антитела вблизи или за пределами обнаруживаемого уровня связывания не описаны и не продемонстрировано, что они обладают необходимой эффективностью для уменьшения или подавления опухоли.Techniques such as affinity maturation have been described which use structure/activity ratio (SAR) mutagenesis to optimize antibodies with increased and improved binding specificity or affinity for the target antigen compared to the parent antibody (see e.g. WO 2011/056997 published May 12, 2011). Modified OKT3 antibodies have been described that can bind and interact with CD3 with varying degrees of affinity while exhibiting moderate to high T cell activation (US 7820166). However, methods for reducing the binding affinity of antibody molecules near or beyond the detectable level of binding have not been described or demonstrated to be effective in reducing or suppressing a tumor.

Таким образом, существует потребность в альтернативных биспецифических антигенсвязывающих молекулах, обладающих контролируемой цитотоксичностью и лучшими ФК свойствами. Такая терапия рака будет весьма полезна в терапевтических условиях.Thus, there is a need for alternative bispecific antigen-binding molecules with controlled cytotoxicity and better PK properties. Such cancer therapy would be highly beneficial in therapeutic settings.

Краткое изложение сущности изобретенияBrief summary of the invention

В первом аспекте в данном изобретении предложены антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связывают CD3 человека, имеющие слабую или не обнаруживаемую аффинность с CD3 человека и/или яванского макака. Антитела в соответствии с данным аспектом изобретения пригодны, в частности, для нацеливания на T-клетки, экспрессирующие CD3, и для стимулирования активации T-клеток, например, в условиях, когда лизис, опосредованный T-клетками, является полезным или желательным. Ahtu-CD3 антитела по изобретению или их антигенсвязывающие части могут быть включены как часть биспецифического антитела, которое направляет активацию T-клеток, опосредованную CD3, к конкретным типам клеток, таким как опухолевые клетки или инфекционные агенты.In a first aspect, the invention provides antibodies and antigen-binding fragments thereof that bind human CD3 having little or no detectable affinity for human and/or cynomolgus monkey CD3. The antibodies of this aspect of the invention are particularly useful for targeting CD3-expressing T cells and for stimulating T cell activation, for example, under conditions where T cell-mediated lysis is beneficial or desirable. Ahtu-CD3 antibodies of the invention, or antigen-binding portions thereof, can be incorporated as part of a bispecific antibody that directs CD3-mediated T-cell activation to specific cell types, such as tumor cells or infectious agents.

Типичные анти-CD3 антитела по данному изобретению приведены в табл. 2 и 3 в данном документе. В табл. 2 приведены идентификаторы аминокислотных последовательностей вариабельных областейTypical anti-CD3 antibodies according to this invention are shown in table. 2 and 3 in this document. In table. 2 shows the identifiers of the amino acid sequences of the variable regions

- 1 040594 тяжелой цепи (HCVR), а также области определения комплементарности тяжелой цепи (HCDR1, HCDR2 и HCDR3). В табл. 3 приведены идентификаторы последовательности молекул нуклеиновой кислоты, кодирующих области HCVR, HCDR1, HCDR2 и HCDR3 иллюстративных анти-CD3 антител. В табл. 4 и приведены вариабельные области легкой цепи (LCVR), а также области определения комплементарности (LCDR1, LCDR2 и LCDR3) иллюстративных анти-CD3 антител.- 1 040594 heavy chain (HCVR), as well as regions for determining the complementarity of the heavy chain (HCDR1, HCDR2 and HCDR3). In table. 3 shows the sequence identifiers of nucleic acid molecules encoding the HCVR, HCDR1, HCDR2, and HCDR3 regions of exemplary anti-CD3 antibodies. In table. 4 and shows the light chain variable regions (LCVR) as well as the complementarity detection regions (LCDR1, LCDR2 and LCDR3) of exemplary anti-CD3 antibodies.

Данное изобретение относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим HCVR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из любой из аминокислотных последовательностей HCVR, приведенных в табл. 2, или по существу аналогичных им последовательностей, имеющих по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности.This invention relates to antibodies or antigennegative fragments containing HCVR containing an amino acid sequence selected from any of the HCVR amino acid sequences shown in table. 2 or substantially similar sequences having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.

Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим пару аминокислотных последовательностей HCVR и LCVR (HCVR/LCVR), содержащих любую из аминокислотных последовательностей HCVR, приведенных в табл. 2, в паре с любой из аминокислотных последовательностей LCVR, приведенных в табл. 4, или обычной легкой цепью, полученной из когнатной легкой цепи, тяжелой цепи анти-ТАА или полученной из вариабельной области известного или общедоступного домена легкой цепи, полученного из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием некогнатных тяжелых цепей, т.е. универсальной или обычной легкой цепи. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления данное изобретение относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим пару аминокислотных последовательностей HCVR/LCVR, содержащуюся в любом из иллюстративных анти-CD3 антител, приведенных в табл. 2, в паре с иллюстративными вариабельными областями легкой цепи, приведенными в табл. 4. В некоторых вариантах осуществления пару аминокислотных последовательностей HCVR/LCVR выбирают из группы, состоящей из SEQ ID NO: 10/162 (например, CD3-VH-G2); 18/162 (например, CD3-VH-G3); 26/162 (например, CD3-VH-G4); 34/162 (например, CD3-VH-G5); 42/162 (например, CD3-VH-G8); 50/162 (например, CD3-VH-G9); 58/162 (например, CD3-VH-G10); 66/162 (например, CD3-VH-G11); 74/162 (например, CD3-VH-G12); 82/162 (например, CD3-VH-G13); 90/162 (например, CD3-VH-G14); 98/162 (например, CD3-VH-G15); 106/162 (например, CD3-VH-G16); 114/162 (например, CD3-VH-G17); 122/162 (например, CD3-VH-G18); 130/162 (например, CD3-VH-G19); 138/162 (например, CD3-VH-G20) и 146/162 (например, CD3-VH-G21).This invention also relates to antibodies or their antigennegative fragments containing a pair of amino acid sequences HCVR and LCVR (HCVR/LCVR), containing any of the amino acid sequences of HCVR shown in table. 2, paired with any of the LCVR amino acid sequences shown in table. 4, or a conventional light chain derived from a cognate light chain, an anti-TAA heavy chain, or a variable region derived from a known or publicly available light chain derived light chain domain exhibiting heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-cognate heavy chains, i.e. . universal or conventional light chain. In accordance with some variants of implementation of this invention relates to antibodies or their antigennegative fragments containing the pair of amino acid sequences HCVR/LCVR contained in any of the illustrative anti-CD3 antibodies shown in table. 2, paired with the exemplary light chain variable regions shown in Table 2. 4. In some embodiments, the HCVR/LCVR amino acid sequence pair is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 10/162 (eg, CD3-VH-G2); 18/162 (eg CD3-VH-G3); 26/162 (eg CD3-VH-G4); 34/162 (eg CD3-VH-G5); 42/162 (eg CD3-VH-G8); 50/162 (eg CD3-VH-G9); 58/162 (eg CD3-VH-G10); 66/162 (eg CD3-VH-G11); 74/162 (eg CD3-VH-G12); 82/162 (eg CD3-VH-G13); 90/162 (eg CD3-VH-G14); 98/162 (eg CD3-VH-G15); 106/162 (eg CD3-VH-G16); 114/162 (eg CD3-VH-G17); 122/162 (eg CD3-VH-G18); 130/162 (eg CD3-VH-G19); 138/162 (eg CD3-VH-G20) and 146/162 (eg CD3-VH-G21).

Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR1 тяжелой цепи (HCDR1), содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из любой из аминокислотных последовательностей HCDR1, приведенных в табл. 2, или по существу аналогичных последовательностей, имеющих по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности. Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR1 тяжелой цепи (HCDR1), содержащую аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 178.This invention also relates to antibodies or antigennegative fragments thereof, containing a heavy chain CDR1 (HCDR1) containing an amino acid sequence selected from any of the HCDR1 amino acid sequences shown in table. 2 or substantially similar sequences having at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. This invention also relates to antibodies or antigen-binding fragments thereof, containing a heavy chain CDR1 (HCDR1) containing the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 178.

Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR2 тяжелой цепи (HCDR2), содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из любой из аминокислотных последовательностей HCDR2, приведенных в табл. 2, или по существу аналогичных последовательностей, имеющих по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности. Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR2 тяжелой цепи (HCDR2), содержащую аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 179.This invention also relates to antibodies or antigennegative fragments thereof, containing a heavy chain CDR2 (HCDR2) containing an amino acid sequence selected from any of the HCDR2 amino acid sequences shown in table. 2 or substantially similar sequences having at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. This invention also relates to antibodies or antigen-binding fragments thereof, containing a heavy chain CDR2 (HCDR2) containing the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 179.

Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR3 тяжелой цепи (HCDR3), содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из любой из аминокислотных последовательностей HCDR3, приведенных в табл. 2, или по существу аналогичных последовательностей, имеющих по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности. Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR3 тяжелой цепи (HCDR3), содержащую аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 180.This invention also relates to antibodies or antigennegative fragments thereof, containing a heavy chain CDR3 (HCDR3) containing an amino acid sequence selected from any of the HCDR3 amino acid sequences shown in table. 2 or substantially similar sequences having at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. This invention also relates to antibodies or antigen-binding fragments thereof, containing a heavy chain CDR3 (HCDR3) containing the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 180.

Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR1 легкой цепи (LCDR1), содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из любой из аминокислотных последовательностей LCDR1, приведенных в табл. 4, или по существу аналогичных последовательностей, имеющих по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности. Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR1 легкой цепи (LCDR1), полученную из когнатной легкой цепи, тяжелой цепи анти-TAA или полученную из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием неприродных тяжелых цепей, т.е. универсальную или обычную легкую цепь.This invention also relates to antibodies or antigennegative fragments thereof, containing a light chain CDR1 (LCDR1) containing an amino acid sequence selected from any of the LCDR1 amino acid sequences shown in table. 4 or substantially similar sequences having at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. The invention also relates to antibodies or antigen-binding fragments thereof, comprising a light chain CDR1 (LCDR1) derived from a cognate light chain, an anti-TAA heavy chain, or derived from a light chain exhibiting heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-natural heavy chains, i.e. e. universal or conventional light chain.

Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR2 легкой цепи (LCDR2), содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из любой из аминокислотных последовательностей LCDR2, приведенных в табл. 4, или по существу анало- 2 040594 гичных последовательностей, имеющих по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности. Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR2 легкой цепи (LCDR2), полученную из когнатной легкой цепи, тяжелой цепи анти-ТАА или полученную из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием неприродных тяжелых цепей, т.е. универсальную или обычную легкую цепь.This invention also relates to antibodies or antigennegative fragments thereof, containing a light chain CDR2 (LCDR2) containing an amino acid sequence selected from any of the LCDR2 amino acid sequences shown in table. 4 or substantially similar sequences having at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. The invention also relates to antibodies or antigen-binding fragments thereof comprising a light chain CDR2 (LCDR2) derived from a cognate light chain, an anti-TAA heavy chain, or derived from a light chain exhibiting heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-natural heavy chains, i.e. e. universal or conventional light chain.

Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR3 легкой цепи (LCDR3), содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из любой из аминокислотных последовательностей LCDR3, приведенных в табл. 4, или по существу аналогичных последовательностей, имеющих по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности. Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим CDR3 легкой цепи (LCDR3), полученную из когнатной легкой цепи, тяжелой цепи анти-TAA или полученную из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием неприродных тяжелых цепей, т.е. универсальную или обычную легкую цепь.This invention also relates to antibodies or antigennegative fragments thereof, containing a light chain CDR3 (LCDR3) containing an amino acid sequence selected from any of the LCDR3 amino acid sequences shown in table. 4 or substantially similar sequences having at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. The invention also relates to antibodies or antigen-binding fragments thereof, comprising a light chain CDR3 (LCDR3) derived from a cognate light chain, an anti-TAA heavy chain, or derived from a light chain exhibiting heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-natural heavy chains, i.e. e. universal or conventional light chain.

Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим HCDR3 и пару аминокислотных последовательностей LCDR3 (HCDR3/LCDR3), содержащую любую из аминокислотных последовательностей HCDR3, приведенных в табл. 2, в паре с любой из аминокислотных последовательностей LCDR3 приведенных в табл. 4. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления данное изобретение относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим пару аминокислотных последовательностей HCDR3/LCDR3, содержащуюся в любом из иллюстративных анти-CD3 антител, приведенных в табл. 2. В некоторых вариантах осуществления пару аминокислотных последовательностей HCDR3/LCDR3 выбирают из группы, состоящей из SEQ ID NO: 16/168 (например, CD3-VH-G2); 24/168 (например, CD3-VH-G3); 32/168 (например,This invention also relates to antibodies or antigennegative fragments containing HCDR3 and a pair of LCDR3 amino acid sequences (HCDR3/LCDR3) containing any of the HCDR3 amino acid sequences shown in table. 2, paired with any of the LCDR3 amino acid sequences shown in table. 4. In accordance with some variants of implementation of this invention relates to antibodies or their antigennegative fragments containing a pair of amino acid sequences HCDR3/LCDR3 contained in any of the illustrative anti-CD3 antibodies shown in table. 2. In some embodiments, the HCDR3/LCDR3 amino acid sequence pair is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 16/168 (eg, CD3-VH-G2); 24/168 (eg CD3-VH-G3); 32/168 (for example,

CD3-VH-G4); 40/168 (например, CD3-VH-G5); 48/168 (например, CD3-VH-G8); 56/168 (например,CD3-VH-G4); 40/168 (eg CD3-VH-G5); 48/168 (eg CD3-VH-G8); 56/168 (for example,

CD3-VH-G9); 64/168 (например, CD3-VH-G10); 72/168 (например, CD3-VH-G11); 80/168 (например,CD3-VH-G9); 64/168 (eg CD3-VH-G10); 72/168 (eg CD3-VH-G11); 80/168 (for example,

CD3-VH-G12); 88/168 (например, CD3-VH-G13); 96/168 (например, CD3-VH-G14); 104/168 (например,CD3-VH-G12); 88/168 (eg CD3-VH-G13); 96/168 (eg CD3-VH-G14); 104/168 (for example,

CD3-VH-G15); 112/168 (например, CD3-VH-G16); 120/168 (например, CD3-VH-G17); 128/168 (например, CD3-VH-G18); 136/168 (например, CD3-VH-G19); 144/168 (например, CD3-VH-G20) и 152/168 (например, CD3-VH-G21).CD3-VH-G15); 112/168 (eg CD3-VH-G16); 120/168 (eg CD3-VH-G17); 128/168 (eg CD3-VH-G18); 136/168 (eg CD3-VH-G19); 144/168 (eg CD3-VH-G20) and 152/168 (eg CD3-VH-G21).

Данное изобретение также относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим набор из шести CDR (т.е. HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3), содержащихся в любом из иллюстративных анти-CD3 антител, приведенных в табл. 2 и 4. В некоторых вариантах осуществления набор аминокислотных последовательностей HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 выбирают из группы, состоящей из SEQ ID NO: 12-14-16-164-166-168 (например, CD3-VH-G2); 20-22-24-164-166-168 (например, CD3-VH-G3); 28-30-32-164-166-168 (например, CD3-VH-G4);This invention also relates to antibodies or antigennegative fragments thereof, containing a set of six CDRs (ie HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3) contained in any of the illustrative anti-CD3 antibodies shown in table. 2 and 4. In some embodiments, the set of amino acid sequences HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 12-14-16-164-166-168 (e.g., CD3-VH- G2); 20-22-24-164-166-168 (eg CD3-VH-G3); 28-30-32-164-166-168 (eg CD3-VH-G4);

36-38-40-164-166-168 (например, CD3-VH-G5); 44-46-48-164-166-168 (например, CD3-VH-G8);36-38-40-164-166-168 (eg CD3-VH-G5); 44-46-48-164-166-168 (eg CD3-VH-G8);

52-54-56-164-166-168 (например, CD3-VH-G9); 60-62-64-164-166-168 (например, CD3-VH-G10);52-54-56-164-166-168 (eg CD3-VH-G9); 60-62-64-164-166-168 (eg CD3-VH-G10);

68-70-72-164-166-168 (например, CD3-VH-G11); 76-78-80-164-166-168 (например, CD3-VH-G12);68-70-72-164-166-168 (eg CD3-VH-G11); 76-78-80-164-166-168 (eg CD3-VH-G12);

84-86-88-164-166-168 (например, CD3-VH-G13); 92-94-96-164-166-168 (например, CD3-VH-G14);84-86-88-164-166-168 (for example, CD3-VH-G13); 92-94-96-164-166-168 (eg CD3-VH-G14);

100-102-104-164-166-168 (например, CD3-VH-G15); 108-110-112-164-166-168 (например, CD3-VH-G16); 116-118-120-164-166-168 (например, CD3-VH-G17); 124-126-128-164-166-168 (например, CD3-VH-G18); 132-134-136-164-166-168 (например, CD3-VH- G19); 140-142-144-164-166-168 (например, CD3-VH-G20) и 148-150-152-164-166-168 (например, CD3-VH-G21).100-102-104-164-166-168 (eg CD3-VH-G15); 108-110-112-164-166-168 (eg CD3-VH-G16); 116-118-120-164-166-168 (eg CD3-VH-G17); 124-126-128-164-166-168 (eg CD3-VH-G18); 132-134-136-164-166-168 (eg CD3-VH-G19); 140-142-144-164-166-168 (eg CD3-VH-G20) and 148-150-152-164-166-168 (eg CD3-VH-G21).

В связанном варианте осуществления данное изобретение относится к антителам или их антигенсвязывающим фрагментам, содержащим набор из шести CDR (т.е. HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1LCDR2-LCDR3), содержащихся в паре аминокислотных последовательностей HCVR/LCVR, как определенно любым из иллюстративных анти-CD3 антител, приведенных в табл. 2 и 4. Например, данное изобретение включает антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, содержащие набор аминокислотных последовательностей HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3, содержащийся в паре аминокислотных последовательностей HCVR/LCVR, выбранных из группы, состоящей из SEQ ID NO: 10/162 (например, CD3-VH-G2); 18/162 (например, CD3-VH-G3); 26/162 (например, CD3-VH-G4); 34/162 (например, CD3-VH-G5); 42/162 (например, CD3-VH-G8); 50/162 (например, CD3-VH-G9); 58/162 (например, CD3-VH-G10); 66/162 (например, CD3-VH-G11); 74/162 (например, CD3-VH-G12); 82/162 (например, CD3-VH-G13); 90/162 (например, CD3-VH-G14); 98/162 (например, CD3-VH-G15); 106/162 (например, CD3-VH-G16); 114/162 (например, CD3-VH-G17); 122/162 (например, CD3-VH-G18); 130/162 (например, CD3-VH-G19); 138/162 (например, CD3-VH-G20) и 146/162 (например, CD3-VH-G21).In a related embodiment, the invention relates to antibodies, or antigen-binding fragments thereof, comprising a set of six CDRs (i.e., HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1LCDR2-LCDR3) contained in an HCVR/LCVR amino acid sequence pair, as defined by any of the illustrative anti -CD3 antibodies are given in table. 2 and 4. For example, the invention includes antibodies or antigen-binding fragments thereof comprising the amino acid sequence set HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 contained in the HCVR/LCVR amino acid sequence pair selected from the group consisting of SEQ ID NO: 10/162 (eg CD3-VH-G2); 18/162 (eg CD3-VH-G3); 26/162 (eg CD3-VH-G4); 34/162 (eg CD3-VH-G5); 42/162 (eg CD3-VH-G8); 50/162 (eg CD3-VH-G9); 58/162 (eg CD3-VH-G10); 66/162 (eg CD3-VH-G11); 74/162 (eg CD3-VH-G12); 82/162 (eg CD3-VH-G13); 90/162 (eg CD3-VH-G14); 98/162 (eg CD3-VH-G15); 106/162 (eg CD3-VH-G16); 114/162 (eg CD3-VH-G17); 122/162 (eg CD3-VH-G18); 130/162 (eg CD3-VH-G19); 138/162 (eg CD3-VH-G20) and 146/162 (eg CD3-VH-G21).

Способы и методики идентификации CDR в аминокислотных последовательностях HCVR и LCVR хорошо известны в данной области техники и могут быть использованы для идентификации CDR в указанных аминокислотных последовательностях HCVR и/или LCVR, раскрытых в данном документе. Типичные правила, которые могут использоваться для идентификации границ CDR, включают, например, определение по Kabat, определение по Chothia и определение по AbM. В общем случае определение поMethods and techniques for identifying CDRs in HCVR and LCVR amino acid sequences are well known in the art and can be used to identify CDRs in the HCVR and/or LCVR amino acid sequences disclosed herein. Typical rules that can be used to identify CDR boundaries include, for example, Kabat definition, Chothia definition, and AbM definition. In general, the definition

- 3 040594- 3 040594

Kabat основано на изменчивости последовательности, определение по Chothia основано на местоположении структурных петлевых областей, а определение по AbM является компромиссом между подходами Kabat и Chothia. См., например, Kabat, Sequences of Proteins of Immunological Interest, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991); Al-Lazikani et al., J. Mol. Biol. 273:927-948 (1997); и Martin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86:9268-9272 (1989). Публичные базы данных также доступны для идентификации последовательностей CDR внутри антитела.Kabat is based on sequence variability, the Chothia definition is based on the location of structural loop regions, and the AbM definition is a compromise between the Kabat and Chothia approaches. See, for example, Kabat, Sequences of Proteins of Immunological Interest, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991); Al-Lazikani et al., J. Mol. Biol. 273:927-948 (1997); and Martin et al., Proc. Natl. Acad. sci. USA, 86:9268-9272 (1989). Public databases are also available to identify CDR sequences within an antibody.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим анти-CD3 антитела или их части. Например, данное изобретение относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим любую из аминокислотных последовательностей HCVR, приведенных в табл. 3; в некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотидную последовательность, выбранную из любой из последовательностей нуклеиновых кислот HCVR, приведенных в табл. 3, или по существу аналогичной последовательности, имеющей по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding anti-CD3 antibodies or parts thereof. For example, this invention relates to nucleic acid molecules encoding any of the HCVR amino acid sequences shown in table. 3; in some embodiments, the implementation of the nucleic acid molecule contains a polynucleotide sequence selected from any of the HCVR nucleic acid sequences shown in table. 3, or a substantially similar sequence having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим любую из аминокислотных последовательностей LCVR, приведенных в табл. 4; или LCVR, полученную из когнатной легкой цепи, тяжелой цепи анти-ТАА или полученную из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием неприродных тяжелых цепей, т.е. универсальную или обычную легкую цепь. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотидную последовательность, выбранную из любой из последовательностей нуклеиновых кислот LCVR, приведенных в табл. 5, или по существу аналогичной последовательности, имеющей по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding any of the LCVR amino acid sequences shown in table. 4; or an LCVR derived from a cognate light chain, an anti-TAA heavy chain, or derived from a light chain that exhibits heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-natural heavy chains, ie. universal or conventional light chain. In some embodiments, the implementation of the nucleic acid molecule contains a polynucleotide sequence selected from any of the LCVR nucleic acid sequences shown in table. 5, or a substantially similar sequence having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим любую из аминокислотных последовательностей HCDR1, приведенных в табл. 2; в некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотидную последовательность, выбранную из любой из последовательностей нуклеиновых кислот HCDR1, приведенных в табл. 3, или по существу аналогичной последовательности, имеющей по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding any of the HCDR1 amino acid sequences shown in table. 2; in some embodiments, the nucleic acid molecule contains a polynucleotide sequence selected from any of the HCDR1 nucleic acid sequences shown in Table. 3, or a substantially similar sequence having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим любую из аминокислотных последовательностей HCDR2, приведенных в табл. 2; в некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотидную последовательность, выбранную из любой из последовательностей нуклеиновых кислот HCDR2, приведенных в табл. 3, или по существу аналогичной последовательности, имеющей по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding any of the HCDR2 amino acid sequences shown in table. 2; in some embodiments, the implementation of the nucleic acid molecule contains a polynucleotide sequence selected from any of the HCDR2 nucleic acid sequences shown in table. 3, or a substantially similar sequence having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим любую из аминокислотных последовательностей HCDR3, приведенных в табл. 2; в некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотидную последовательность, выбранную из любой из последовательностей нуклеиновых кислот HCDR3, приведенных в табл. 3, или по существу аналогичной последовательности, имеющей по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding any of the HCDR3 amino acid sequences shown in table. 2; in some embodiments, the nucleic acid molecule contains a polynucleotide sequence selected from any of the HCDR3 nucleic acid sequences shown in Table. 3, or a substantially similar sequence having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим любую из аминокислотных последовательностей LCDR1, приведенных в табл. 4; или LCDR1, полученную из когнатной легкой цепи, тяжелой цепи анти-ТАА или полученную из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием неприродных тяжелых цепей, т.е. универсальную или обычную легкую цепь. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотидную последовательность, выбранную из любой из последовательностей нуклеиновых кислот LCDR1, приведенных в табл. 5, или по существу аналогичной последовательности, имеющей по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding any of the LCDR1 amino acid sequences shown in table. 4; or an LCDR1 derived from a cognate light chain, an anti-TAA heavy chain, or derived from a light chain that exhibits heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-natural heavy chains, ie. universal or conventional light chain. In some embodiments, the nucleic acid molecule contains a polynucleotide sequence selected from any of the LCDR1 nucleic acid sequences shown in Table 1. 5, or a substantially similar sequence having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим любую из аминокислотных последовательностей LCDR2, приведенных в табл. 4; или LCDR2, полученную из когнатной легкой цепи, тяжелой цепи анти-ТАА или полученную из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием неприродных тяжелых цепей, т.е. универсальную или обычную легкую цепь. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотидную последовательность, выбранную из любой из последовательностей нуклеиновых кислот LCDR2, приведенных в табл. 5, или по существу аналогичной последовательности, имеющей по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding any of the LCDR2 amino acid sequences shown in table. 4; or an LCDR2 derived from a cognate light chain, an anti-TAA heavy chain, or derived from a light chain that exhibits heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-natural heavy chains, ie. universal or conventional light chain. In some embodiments, the nucleic acid molecule contains a polynucleotide sequence selected from any of the LCDR2 nucleic acid sequences shown in Table 1. 5, or a substantially similar sequence having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим любую из аминокислотных последовательностей LCDR3, приведенных в табл. 4; или LCDR3, полученную из когнатной легкой цепи анти-ТАА тяжелой цепи или полученную из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием неприродных тяжелых цепей, т.е. универ- 4 040594 сальную или обычную легкую цепь. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотидную последовательность, выбранную из любой из последовательностей нуклеиновых кислот LCDR3, приведенных в табл. 5, или по существу аналогичной последовательности, имеющей по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding any of the LCDR3 amino acid sequences shown in table. 4; or an LCDR3 derived from an anti-TAA heavy chain cognate light chain, or derived from a light chain that exhibits heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-natural heavy chains, ie. 4 040594 universal or conventional light chain. In some embodiments, the nucleic acid molecule contains a polynucleotide sequence selected from any of the LCDR3 nucleic acid sequences shown in Table 1. 5, or a substantially similar sequence having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим HCVR, причем HCVR содержит набор из трех CDR (т.е. HCDR1-HCDR2-HCDR3), при этом набор аминокислотных последовательностей HCDR1-HCDR2-HCDR3 является таким, как определено любым иллюстративным анти-CD3 антителом, приведенным в табл. 2.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding HCVR, and HCVR contains a set of three CDRs (i.e. HCDR1-HCDR2-HCDR3), while the set of amino acid sequences HCDR1-HCDR2-HCDR3 is as defined by any illustrative anti- CD3 antibody shown in table. 2.

В данном изобретении также представлены молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие LCVR, причем LCVR содержит набор из трех CDR (т.е. LCDR1-LCDR2-LCDR3), при этом набор аминокислотных последовательностей LCDR1-LCDR2-LCDR3 является таким, как определено любым из примеров универсального антитела легкой цепи, приведенных в табл. 4; или LCDR1-LCDR2-LCDR3, полученный из когнатной легкой цепи анти-ТАА тяжелой цепи или полученный из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием неприродных тяжелых цепей, т.е. универсальную или обычную легкую цепь.The invention also provides nucleic acid molecules encoding an LCVR, wherein the LCVR contains a set of three CDRs (i.e. LCDR1-LCDR2-LCDR3), wherein the set of amino acid sequences LCDR1-LCDR2-LCDR3 is as defined by any of the examples of the universal light chain antibodies shown in table. 4; or an LCDR1-LCDR2-LCDR3 derived from a cognate anti-TAA heavy chain light chain, or derived from a light chain exhibiting heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-natural heavy chains, i. e. universal or conventional light chain.

Данное изобретение также относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим как HCVR, так и LCVR, причем HCVR содержит аминокислотную последовательность любой из аминокислотных последовательностей HCVR, приведенных в табл. 2, и при этом LCVR содержит аминокислотную последовательность любой из аминокислотных последовательностей LCVR, приведенных в табл. 4; или LCVR получают из когнатной легкой цепи анти-ТАА тяжелой цепи или получают из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким разнообразием неприродных тяжелых цепей, т.е. универсальную или обычную легкую цепь. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотидную последовательность, выбранную из любой из последовательностей нуклеиновых кислот HCVR, приведенных в табл. 2, или по существу аналогичной ей последовательности, имеющей по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности и полинуклеотидной последовательности, выбранной из любой из последовательностей нуклеиновых кислот LCVR, приведенных в табл. 5, или по существу подобную последовательность, имеющую по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичности последовательности. В некоторых вариантах осуществления молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие как HCVR, так и LCVR, являются полностью человеческими последовательностями или получены из последовательностей иммуноглобулина зародышевой линии человека.This invention also relates to nucleic acid molecules encoding both HCVR and LCVR, and HCVR contains the amino acid sequence of any of the HCVR amino acid sequences shown in table. 2, and while LCVR contains the amino acid sequence of any of the amino acid sequences of the LCVR shown in table. 4; or LCVR is derived from a cognate anti-TAA heavy chain light chain, or derived from a light chain that exhibits heterogeneity or the ability to pair with a wide variety of non-natural heavy chains, i. e. universal or conventional light chain. In some embodiments, the implementation of the nucleic acid molecule contains a polynucleotide sequence selected from any of the HCVR nucleic acid sequences shown in table. 2, or a sequence substantially similar thereto, having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity and a polynucleotide sequence selected from any of the LCVR nucleic acid sequences shown in tab. 5, or a substantially similar sequence having at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99% sequence identity. In some embodiments, nucleic acid molecules encoding both HCVR and LCVR are fully human sequences or are derived from human germline immunoglobulin sequences.

Данное изобретение также относится к рекомбинантным экспрессирующим векторам, способным экспрессировать полипептид, содержащий вариабельный участок тяжелой или легкой цепи анти-CD3 антитела. Например, данное изобретение включает рекомбинантные экспрессирующие векторы, содержащие любую из молекул нуклеиновой кислоты, упомянутых выше, т.е. молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие любую из последовательностей HCVR, LCVR и/или CDR, как указано в табл. 2 или 4. Также в объем данного изобретения включены клетки-хозяева, в которые были введены такие векторы, а также способы получения антител или их частей путем культивирования клеток-хозяев в условиях, позволяющих продуцировать антитела или фрагменты антител, и восстановления антител и фрагментов антител, полученных таким образом.The invention also relates to recombinant expression vectors capable of expressing a polypeptide containing the heavy or light chain variable region of an anti-CD3 antibody. For example, this invention includes recombinant expression vectors containing any of the nucleic acid molecules mentioned above, ie. nucleic acid molecules encoding any of the sequences HCVR, LCVR and/or CDR, as indicated in table. 2 or 4. Also included within the scope of this invention are host cells into which such vectors have been introduced, as well as methods for producing antibodies or parts thereof by culturing host cells under conditions that allow the production of antibodies or antibody fragments, and recovering antibodies and antibody fragments. obtained in this way.

Данное изобретение включает анти-CD3 антитела и/или анти-TAA антитела, а также биспецифические анти-CD3/анти-TAA антитела, имеющие модифицированный профиль гликозилирования. В некоторых вариантах осуществления модификация для удаления нежелательных сайтов гликозилирования может быть полезна или антитело, лишенное фукозной части, присутствующей в олигосахаридной цепи, например, для увеличения функции антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC) (см. Shield et al. (2002) JBC 277:26733). В других применениях можно модифицировать галактозилирование, чтобы модифицировать комплементзависимую цитотоксичность (CDC).The present invention includes anti-CD3 antibodies and/or anti-TAA antibodies, as well as anti-CD3/anti-TAA bispecific antibodies having a modified glycosylation profile. In some embodiments, a modification to remove unwanted glycosylation sites may be useful, or an antibody lacking the fucose moiety present in the oligosaccharide chain, for example, to increase the function of antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) (see Shield et al. (2002) JBC 277:26733 ). In other applications, galactosylation can be modified to modify complement dependent cytotoxicity (CDC).

В одном аспекте в изобретении предложена цитотоксическая композиция, содержащая биспецифическую антигенсвязывающую молекулу, которая i) не способна специфически связываться с эффекторной клеткой и ii) специфически связывает целевую опухолевую клетку, причем специфическое связывание измеряется в in vitro FACS анализе связывания или in vitro анализе связывания на основе плазмонного резонанса. В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к цитотоксической композиции, содержащей биспецифическую антигенсвязывающую молекулу, которая не обнаруживает детектируемого связывания с эффекторной клеткой и которая специфически связывается с опухолевой клеткой-мишенью с измеряемой аффинностью связывания, причем значение аффинности связывания измеряется в in vitro FACS анализе связывания или in vitro анализе связывания на основе плазмонного резонанса.In one aspect, the invention provides a cytotoxic composition comprising a bispecific antigen-binding molecule that i) is unable to specifically bind to an effector cell, and ii) specifically binds a target tumor cell, the specific binding being measured in an in vitro FACS binding assay or an in vitro binding assay based on plasmon resonance. In some embodiments, the invention provides a cytotoxic composition comprising a bispecific antigen-binding molecule that exhibits no detectable binding to an effector cell and that specifically binds to a tumor target cell with a measurable binding affinity, wherein the binding affinity value is measured in an in vitro FACS binding assay or in vitro binding assay based on plasmon resonance.

В других вариантах осуществления изобретение относится к цитотоксической композиции, содержащей биспецифическую антигенсвязывающую молекулу, содержащую i) первый антигенсвязывающий фрагмент (Fab1), который не обнаруживает связывания с CD3, и ii) второй антигенсвязывающий фраг- 5 040594 мент (Fab2), который специфически связывается с опухолевой клеткой-мишенью с измеримой аффинностью связывания, причем значение аффинности связывания измеряется в in vitro FACS анализе связывания или in vitro анализе связывания на основе плазмонного резонанса. В некоторых случаях аффинность связывания представляет собой моновалентную аффинность связывания (например, в конструкции биспецифического антитела).In other embodiments, the invention provides a cytotoxic composition comprising a bispecific antigen-binding molecule comprising i) a first antigen-binding fragment (Fab1) that does not bind to CD3, and ii) a second antigen-binding fragment (Fab2) that specifically binds to a tumor target cell with a measurable binding affinity, wherein the binding affinity value is measured in an in vitro FACS binding assay or an in vitro plasmon resonance binding assay. In some instances, the binding affinity is monovalent binding affinity (eg, in a bispecific antibody construct).

В другом аспекте изобретение относится к цитотоксической композиции, содержащей биспецифическую антигенсвязывающую молекулу, которая специфически связывает эффекторную клетку со слабой аффинностью связывания, например, проявляющуюся значением EC50 около или выше чем около 100 нМ, и которая специфически связывает опухолевую клетку-мишень с заметным значением EC50 или высоким значением EC50 с высокой аффинностью, такой как менее 50 нМ, причем значение аффинности связывания EC50 измеряется в in vitro FACS анализе связывания. В некоторых аспектах изобретение относится к цитотоксической композиции, содержащей биспецифическую антигенсвязывающую молекулу, которая специфически связывает эффекторную клетку со значением EC50 выше чем около 500 нМ и которая специфически связывает опухолевую клетку-мишень с заметным значением EC50 или высоким значением EC50 с высокой аффинностью, такой как менее 50 нМ, причем значение аффинности связывания EC50 измеряется в in vitro FACS анализе связывания.In another aspect, the invention relates to a cytotoxic composition comprising a bispecific antigen-binding molecule that specifically binds an effector cell with a low binding affinity, e.g., manifested by an EC50 value of about or greater than about 100 nM, and that specifically binds a target tumor cell with an appreciable EC value. 50 or a high EC 50 value with high affinity, such as less than 50 nM, wherein the EC 50 binding affinity value is measured in an in vitro FACS binding assay. In some aspects, the invention relates to a cytotoxic composition comprising a bispecific antigen binding molecule that specifically binds an effector cell with an EC50 value greater than about 500 nM and that specifically binds a target tumor cell with a marked EC50 value or a high EC50 value with high affinity, such as less than 50 nm, and the value of the binding affinity EC 50 is measured in an in vitro FACS binding assay.

В некоторых примерах биспецифическая антигенсвязывающая молекула содержит Fab1, который специфически связывает CD3 человека с величиной EC50 более чем около 40 нМ или более чем около 100 нМ, более чем около 200 нМ, более чем около 300 нМ, более чем около 400 нМ, более чем около 500 нМ или более чем около 1 мкМ (например, в контексте моновалентного связывания). В некоторых вариантах осуществления биспецифическая антигенсвязывающая молекула содержит Fab2, полученный из второго антитела, которое специфически связывает целевую опухолевую клетку с высокой аффинностью, например, значение EC50 менее чем около 50 нМ, менее чем около 40 нМ, менее чем около 20 нМ, менее чем около 10 нМ или менее чем около 6 нМ (например, в контексте моновалентного связывания). В некоторых случаях Fab1 специфически связывает каждый из CD3 человека и CD3 яванского макака с величиной EC50 более чем около 40 нМ или более чем около 100 нМ, более чем около 200 нМ или более чем около 1 мкМ. В некоторых случаях Fab1 специфически связывает каждый из CD3 человека и CD3 яванского макака со слабой или неизмеримой аффинностью.In some examples, the bispecific antigen binding molecule comprises a Fab1 that specifically binds human CD3 with an EC 50 value of greater than about 40 nM, or greater than about 100 nM, greater than about 200 nM, greater than about 300 nM, greater than about 400 nM, greater than about 500 nm or more than about 1 μm (for example, in the context of monovalent binding). In some embodiments, the bispecific antigen binding molecule comprises a Fab2 derived from a second antibody that specifically binds the target tumor cell with high affinity, e.g., an EC50 value of less than about 50 nM, less than about 40 nM, less than about 20 nM, less than about 10 nM or less than about 6 nM (eg, in the context of monovalent binding). In some instances, Fab1 specifically binds each of human CD3 and cynomolgus CD3 with an EC 50 value of greater than about 40 nM, or greater than about 100 nM, greater than about 200 nM, or greater than about 1 μM. In some instances, Fab1 specifically binds each of human CD3 and cynomolgus monkey CD3 with little or no measurable affinity.

В некоторых вариантах осуществления опухолевая клетка-мишень представляет собой опухолевую клетку человека. В некоторых вариантах осуществления Fab1 (или биспецифическая антигенсвязывающая молекула) индуцирует опосредованный T-клетками лизис опухолевых клеток с величиной EC50, равной менее чем около 1,3 нМ, как измерено в анализе опосредованного T-клетками лизиса опухолевых клеток in vitro.In some embodiments, the target tumor cell is a human tumor cell. In some embodiments, Fab1 (or a bispecific antigen-binding molecule) induces T cell mediated tumor cell lysis with an EC 50 value of less than about 1.3 nM as measured in an in vitro T cell mediated tumor cell lysis assay.

В некоторых применениях Fab1 или биспецифическая антигенсвязывающая молекула специфически связывает CD3 человека с величиной KD более чем около 11 нМ, как измерено в анализе связывания in vitro на основе поверхностного плазмонного резонанса. В других случаях Fab1 или биспецифическая антигенсвязывающая молекула специфически связывает каждый из CD3 человека и CD3 яванского макака с величиной KD более чем около 15 нМ или более чем около 30 нМ, более чем около 60 нМ, более чем около 120 нМ или более чем около 300 нМ, как измерено в анализе связывания in vitro на основе поверхностного плазмонного резонанса. В еще некоторых применениях Fab1 или биспецифическая антигенсвязывающая молекула i) не обнаруживает обнаруживаемого связывания с CD3 человека, как измерено в каждом из анализа связывания in vitro на основе поверхностного плазмонного резонанса и FACS анализа связывания, и ii) индуцирует T-клеточно-опосредованный лизис опухолевых клеток, как измерено в анализе опосредованного T-клетками лизиса опухолевых клеток in vitro.In some applications, Fab1 or a bispecific antigen-binding molecule specifically binds human CD3 with a KD value of greater than about 11 nM, as measured in an in vitro binding assay based on surface plasmon resonance. In other instances, Fab1 or a bispecific antigen-binding molecule specifically binds each of human CD3 and cynomolgus CD3 with a KD value of greater than about 15 nM, or greater than about 30 nM, greater than about 60 nM, greater than about 120 nM, or greater than about 300 nM. , as measured in an in vitro binding assay based on surface plasmon resonance. In some other applications, the Fab1 or bispecific antigen-binding molecule i) exhibits no detectable binding to human CD3 as measured in each of the in vitro binding assays based on surface plasmon resonance and FACS binding assays, and ii) induces T-cell mediated tumor cell lysis , as measured in an in vitro T-cell mediated tumor cell lysis assay.

В некоторых применениях биспецифическая антигенсвязывающая молекула содержит первую тяжелую цепь, содержащую область HCDR1, содержащую аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 12 или 20. В некоторых вариантах осуществления первая тяжелая цепь содержит область HCDR2, содержащую аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 14 или 54. В других вариантах осуществления первая тяжелая цепь содержит область HCDR3, содержащую аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 72, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 112, SEQ ID NO: 120, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 144 или SEQ ID NO: 152. В других применениях первая тяжелая цепь содержит HCVR, содержащую HCDR1-HCDR2-HCDR3, имеющую аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 178-179-180. В других вариантах осуществления первая тяжелая цепь содержит CDR1, содержащую аминокислотные остатки 1-7 SEQ ID NO: 178, CDR2, содержащую аминокислотные остатки 1-7 SEQ ID NO: 179, CDR3, содержащую аминокислотные остатки 4-11 SEQ ID NO: 180.In some applications, the bispecific antigen-binding molecule comprises a first heavy chain containing an HCDR1 region containing the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 12 or 20. In some embodiments, the first heavy chain contains an HCDR2 region containing the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 14 or 54. In other embodiments, the first heavy chain comprises an HCDR3 region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 48 , SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 72, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 112, SEQ ID NO: 120, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 144, or SEQ ID NO: 152. In other uses, the first heavy chain contains an HCVR containing HCDR1-HCDR2-HCDR3 having the amino acid sequences of SEQ ID NO: 178-179-180. In other embodiments, the first heavy chain comprises a CDR1 containing amino acid residues 1-7 of SEQ ID NO: 178, a CDR2 containing amino acid residues 1-7 of SEQ ID NO: 179, a CDR3 containing amino acid residues 4-11 of SEQ ID NO: 180.

В других вариантах осуществления первая тяжелая цепь содержит каркасные области вариабельного домена, имеющие аминокислотную последовательность, выбранную из FR1 (SEQ ID NO: 174), FR2 (SEQ ID NO: 175), FR3 (SEQ ID NO: 176) и FR4 (SEQ ID NO: 177).In other embodiments, the first heavy chain comprises variable domain framework regions having an amino acid sequence selected from FR1 (SEQ ID NO: 174), FR2 (SEQ ID NO: 175), FR3 (SEQ ID NO: 176), and FR4 (SEQ ID NO: 176). NO: 177).

Данное изобретение относится к биспецифическим антигенсвязывающим молекулам, содержащимThis invention relates to bispecific antigen-binding molecules containing

- 6 040594 пару аминокислотных последовательностей HCVR и LCVR Fabl (HCVR/LCVR), выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 10/162; 18/162; 26/162; 34/162; 42/162; 50/162; 58/162; 66/162; 74/162; 82/162;- 6 040594 pair of amino acid sequences HCVR and LCVR Fabl (HCVR/LCVR) selected from the group consisting of SEQ ID NO: 10/162; 18/162; 26/162; 34/162; 42/162; 50/162; 58/162; 66/162; 74/162; 82/162;

90/162; 98/162; 106/162; 114/162; 122/162; 130/162; 138/162; 146/162.90/162; 98/162; 106/162; 114/162; 122/162; 130/162; 138/162; 146/162.

Антитела и антигенсвязывающие фрагменты и их биспецифические антитела были получены путем замены аминокислотных остатков родительского антитела поэтапно на основе различий между последовательностью зародышевой линии и последовательностью родительского антитела. Данное изобретение относится к способу получения цитотоксической композиции, включающему (а) идентификацию аминокислотной последовательности первой тяжелой цепи, полученной из первого антитела, которая специфически связывается с CD3 с высокой аффинностью, например имеет значение EC50 аффинности связывания менее чем около 40 нМ; (b) модифицирование выбранных аминокислотных остатков в вариабельной области тяжелой цепи первого антитела с получением модифицированного антитела; (c) спаривание модифицированного антитела со второй тяжелой цепью, полученной из второго антитела, которое специфически связывает целевой опухолевый антиген для получения биспецифического антитела; (d) тестирование биспецифического антитела в анализе аффинности связывания, и, если аффинность связывания с CD3 имеет значение EC50 более чем около 40 нМ, или более чем около 100 нМ или более чем около 300 нМ или более чем около 500 нМ или не обнаруживаемое связывание, затем (e) получение композиции, содержащей биспецифическое антитело и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель. В дополнение к модификации вариабельной области тяжелой цепи выбранных антител для разработки антигенсвязывающих плеч, обладающих слабой или отсутствующей аффинностью, но специально нацеленным на эффекторную клетку, данное изобретение предоставляет способы для модификации константной области тяжелой цепи (например, домена CH3) каждого связывающего плеча связующая для подготовки и выделения биспецифических антител.Antibodies and antigen-binding fragments and their bispecific antibodies were obtained by replacing the amino acid residues of the parent antibody in steps based on differences between the germline sequence and the sequence of the parent antibody. The present invention relates to a method for preparing a cytotoxic composition comprising (a) identifying the amino acid sequence of a first heavy chain derived from a first antibody that specifically binds to CD3 with high affinity, eg has a binding affinity EC 50 value of less than about 40 nM; (b) modifying selected amino acid residues in the heavy chain variable region of the first antibody to obtain a modified antibody; (c) pairing the modified antibody with a second heavy chain derived from a second antibody that specifically binds the target tumor antigen to produce a bispecific antibody; (d) testing the bispecific antibody in a binding affinity assay, and if the binding affinity for CD3 has an EC 50 value of greater than about 40 nM, or greater than about 100 nM, or greater than about 300 nM, or greater than about 500 nM, or no detectable binding then (e) obtaining a composition containing the bispecific antibody and a pharmaceutically acceptable carrier or diluent. In addition to modifying the heavy chain variable region of selected antibodies to design antigen binding arms having little or no affinity but specifically targeting the effector cell, the present invention provides methods for modifying the heavy chain constant region (e.g., CH3 domain) of each binding arm, a binder to prepare and isolation of bispecific antibodies.

Иллюстративный способ обеспечивает способ получения цитотоксического биспецифического антитела, включающий (a) идентификацию первого антитела человека или его антигенсвязывающего фрагмента, который взаимодействует с эффекторным клеточным антигеном от нескольких видов; (b) идентификацию аминокислотных остатков зародышевой линии вариабельной области тяжелой цепи (HCVR) антитела человека; (c) сравнение аминокислотной последовательности HCVR первого антитела человека с аминокислотной последовательностью соответствующей зародышевой линии HCVR; (d) идентификацию аминокислот в модифицированной области HCVR первого антитела, при этом модифицированная область в первом антителе проявляет по меньшей мере одну аминокислотную модификацию путем замещения, делеции или добавления одного аминокислотного остатка по сравнению с той же областью в зародышевой линии HCVR; (e) продуцирование множества модифицированных антител, каждое из которых содержит по меньшей мере одну модифицированную область HCVR; (f) скрининг каждого из множества модифицированных антител на моновалентную аффинность к антигену эффекторной клетки; (g) выбор тех модифицированных антител, которые проявляют более слабую аффинность связывания или не обнаруживают аффинность связывания с антигеном эффекторной клетки по сравнению с первым антителом; и (h) спаривание выбранного первого антитела со вторым антителом, которое взаимодействует с опухолеассоциированным антигеном с получением цитотоксического биспецифического антитела.An exemplary method provides a method for producing a cytotoxic bispecific antibody, comprising (a) identifying a first human antibody, or antigen-binding fragment thereof, that interacts with an effector cellular antigen from multiple species; (b) identifying the amino acid residues of the germline of the heavy chain variable region (HCVR) of the human antibody; (c) comparing the HCVR amino acid sequence of the first human antibody with the amino acid sequence of the corresponding HCVR germline; (d) identifying amino acids in the modified HCVR region of the first antibody, wherein the modified region in the first antibody exhibits at least one amino acid modification by substitution, deletion, or addition of one amino acid residue compared to the same region in the HCVR germline; (e) producing a plurality of modified antibodies, each containing at least one modified HCVR region; (f) screening each of the plurality of modified antibodies for monovalent affinity for an effector cell antigen; (g) selecting those modified antibodies that exhibit weaker binding affinity or no binding affinity for the effector cell antigen compared to the first antibody; and (h) pairing the selected first antibody with a second antibody that interacts with the tumor associated antigen to produce a cytotoxic bispecific antibody.

В другом аспекте изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей рекомбинантное биспецифическое антитело человека или его фрагмент, который специфически связывает CD3, и фармацевтически приемлемый носитель. В связанном аспекте изобретение относится к композиции, которая представляет собой комбинацию анти-CD3 антитела и второго терапевтического агента. В одном варианте осуществления второй терапевтический агентом представляет собой любой агент, который преимущественно объединяется с анти-CD3 антителом. Типичные агенты, которые могут быть выгодно объединены с анти-CD3 антителом, включают, без ограничения, другие агенты, которые связывают и/или активируют сигналинг CD3 (включая другие антитела или их антигенсвязывающие фрагменты и т.д.) и/или агенты, которые непосредственно не связывают CD3, но тем не менее активируют или стимулируют активацию иммунных клеток. Дополнительные комбинированные способы лечения и совместные препараты, включающие анти-CD3 антитела по данному изобретению, раскрыты в данном документе в другом месте.In another aspect, the invention provides a pharmaceutical composition comprising a recombinant human bispecific antibody or fragment thereof that specifically binds CD3 and a pharmaceutically acceptable carrier. In a related aspect, the invention relates to a composition that is a combination of an anti-CD3 antibody and a second therapeutic agent. In one embodiment, the second therapeutic agent is any agent that preferentially combines with an anti-CD3 antibody. Representative agents that may be advantageously combined with an anti-CD3 antibody include, without limitation, other agents that bind and/or activate CD3 signaling (including other antibodies or antigen-binding fragments thereof, etc.) and/or agents that do not directly bind CD3, but nevertheless activate or stimulate the activation of immune cells. Additional combination therapies and co-formulations comprising the anti-CD3 antibodies of this invention are disclosed elsewhere herein.

В еще одном аспекте изобретение предлагает терапевтические способы стимуляции активации T-клеток с использованием анти-CD3 антитела или антигенсвязывающей части антитела по изобретению, причем терапевтические способы включают введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, содержащей биспецифическое антитело по изобретению или его антигенсвязывающий фрагмент субъекту, нуждающемуся в этом. Нарушение, подвергаемое лечению, представляет собой любое заболевание или состояние, которое улучшается, облегчается, ингибируется или предотвращается посредством цитотоксической терапии, нацеленной на опухолеассоциированный антиген, такое как рак.In yet another aspect, the invention provides therapeutic methods for stimulating T cell activation using an anti-CD3 antibody or an antigen-binding portion of an antibody of the invention, the therapeutic methods comprising administering a therapeutically effective amount of a pharmaceutical composition comprising the bispecific antibody of the invention or an antigen-binding fragment thereof to a subject in need of this. A treated disorder is any disease or condition that is ameliorated, alleviated, inhibited, or prevented by cytotoxic therapy targeting a tumor-associated antigen, such as cancer.

В соответствии с другим аспектом данное изобретение относится к биспецифическим антигенсвязывающим молекулам, которые связывают CD3 и целевой антиген, особенно опухолеассоциированный антиген (TAA).According to another aspect, the present invention relates to bispecific antigen-binding molecules that bind CD3 and a target antigen, especially tumor associated antigen (TAA).

- 7 040594- 7 040594

Данное изобретение также включает применение aHTu-CD3/aHTu-TAA биспецифической антигенсвязывающей молекулы по изобретению при изготовлении лекарственного средства для лечения заболевания или расстройства, связанного с экспрессией TAA или вызванного его экспрессией. Данное изобретение также относится к применению анти-CD3/анти-TAA биспецифической антигенсвязывающей молекулы, проявляющей слабую аффинность к CD3-экспрессирующим эффекторным клеткам и уменьшенный клиренс при изготовлении лекарственного средства для лечения заболевания или расстройства, связанного с или вызванного экспрессией TAA, по сравнению с анти-CD3/анти-TAA биспецифической антигенсвязывающей молекулы, проявляющей, высокую аффинность к CD3-экспрессирующим эффекторным клеткам.The invention also includes the use of the aHTu-CD3/aHTu-TAA bispecific antigen-binding molecule of the invention in the manufacture of a medicament for the treatment of a disease or disorder associated with or caused by TAA expression. The present invention also relates to the use of an anti-CD3/anti-TAA bispecific antigen-binding molecule exhibiting poor affinity for CD3-expressing effector cells and reduced clearance in the manufacture of a medicament for the treatment of a disease or disorder associated with or caused by TAA expression compared to anti -CD3/anti-TAA bispecific antigen-binding molecule showing high affinity for CD3-expressing effector cells.

Другие варианты осуществления станут очевидными из обзора последующего подробного описания.Other embodiments will become apparent from a review of the following detailed description.

Краткое описание фигурBrief description of the figures

На фиг. 1 представлено выравнивание аминокислот следующих последовательностей вариабельной области тяжелой цепи (HCVR) антитела: зародышевая линия hIgHV (SEQ ID NO: 181); CD3-VH-P (SEQ ID NO: 154); CD3-VH-G (SEQ ID NO: 2); CD3-VH-G2 (SEQ ID NO: 10); CD3-VH-G3 (SEQ ID NO: 18); CD3-VH-G4 (SEQ ID NO: 26); CD3-VH-G5 (SEQ ID NO: 34); CD3-VH-G8 (SEQ ID NO: 42); CD3-VH-G9 (SEQ ID NO: 50); CD3-VH-G10 (SEQ ID NO: 58); CD3-VH-G11 (SEQ ID NO: 66); CD3-VH-G12 (SEQ ID NO: 74); CD3-VH-G13 (SEQ ID NO: 82); CD3-VH-G14 (SEQ ID NO: 90); CD3-VH-G15 (SEQ ID NO: 98); CD3-VH-G16 (SEQ ID NO: 106); CD3-VH-G17 (SEQ ID NO: 114); CD3-VH-G18 (SEQ ID NO: 122); CD3-VH-G19 (SEQ ID NO: 130); CD3-VH-G20 (SEQ ID NO: 138) и CD3-VH-G21 (SEQ ID NO: 146). Каждую производную HCVR сравнивают с исходным антителом и аминокислотными остатками зародышевой линии, с прямоугольными блоками, обозначающими мутации в CDR.In FIG. 1 shows the amino acid alignment of the following antibody heavy chain variable region (HCVR) sequences: hIgHV germline (SEQ ID NO: 181); CD3-VH-P (SEQ ID NO: 154); CD3-VH-G (SEQ ID NO: 2); CD3-VH-G2 (SEQ ID NO: 10); CD3-VH-G3 (SEQ ID NO: 18); CD3-VH-G4 (SEQ ID NO: 26); CD3-VH-G5 (SEQ ID NO: 34); CD3-VH-G8 (SEQ ID NO: 42); CD3-VH-G9 (SEQ ID NO: 50); CD3-VH-G10 (SEQ ID NO: 58); CD3-VH-G11 (SEQ ID NO: 66); CD3-VH-G12 (SEQ ID NO: 74); CD3-VH-G13 (SEQ ID NO: 82); CD3-VH-G14 (SEQ ID NO: 90); CD3-VH-G15 (SEQ ID NO: 98); CD3-VH-G16 (SEQ ID NO: 106); CD3-VH-G17 (SEQ ID NO: 114); CD3-VH-G18 (SEQ ID NO: 122); CD3-VH-G19 (SEQ ID NO: 130); CD3-VH-G20 (SEQ ID NO: 138) and CD3-VH-G21 (SEQ ID NO: 146). Each HCVR derivative is compared to the parent antibody and germline amino acid residues, with rectangular boxes representing mutations in the CDR.

На фиг. 2A-2C представлены средние концентрации общего IgG в сыворотке после однократной внутрибрюшинной инъекции 0,4 мг/кг BSMUC16/CD3-001, BSMUC16/CD3-005 и антител изотипического контроля у мышей дикого типа (фиг. 2A), CD3 гуманизированных мышей (фиг. 2B) и MUC16xCD3 гуманизированных мышей (фиг. 2C).In FIG. 2A-2C are mean serum total IgG concentrations after a single intraperitoneal injection of 0.4 mg/kg BSMUC16/CD3-001, BSMUC16/CD3-005, and isotype control antibodies in WT (FIG. 2A), CD3 humanized mice (FIG. .2B) and MUC16xCD3 humanized mice (Fig. 2C).

Подробное описаниеDetailed description

До того, как будет описано данное изобретение, следует понимать, что данное изобретение не ограничивается конкретными способами и описанными экспериментальными условиями, поскольку такие способы и условия могут варьировать. Следует также понимать, что используемая в данном документе терминология предназначена только для описания конкретных вариантов осуществления и не предназначена для ограничения, поскольку объем данного изобретения будет ограничен только прилагаемой формулой изобретения.Before the present invention is described, it should be understood that the present invention is not limited to the particular methods and experimental conditions described, as such methods and conditions may vary. It should also be understood that the terminology used herein is only intended to describe specific embodiments and is not intended to be limiting, as the scope of this invention will only be limited by the appended claims.

Если не указано иное, все технические и научные термины, используемые в данном документе, имеют то же значение, которое обычно понимается специалистом в данной области техники, к которой относится данное изобретение. Используемый в данном документе термин около при использовании в отношении конкретного указанного числового значения означает, что значение может отличаться от указанного значения не более чем на 1%. Например, используемое в данном документе выражение около 100 включает в себя 99 и 101 и все значения между ними (например, 99,1, 99,2, 99,3, 99,4 и т.д.).Unless otherwise indicated, all technical and scientific terms used in this document have the same meaning as generally understood by a person skilled in the art to which this invention pertains. Used in this document, the term about when used in relation to a specific specified numerical value means that the value may differ from the specified value by no more than 1%. For example, the expression about 100 as used herein includes 99 and 101 and all values in between (eg, 99.1, 99.2, 99.3, 99.4, etc.).

Хотя любые способы и материалы, аналогичные или эквивалентные описанным в данном документе, могут быть использованы в практике или испытаниях данного изобретения, далее описаны предпочтительные способы и материалы.While any methods and materials similar or equivalent to those described herein may be used in the practice or testing of this invention, the following describes the preferred methods and materials.

ОпределенияDefinitions

Выражение CD3 относится к антигену, который экспрессируется на T-клетках как часть многомолекулярного рецептора T-клеток (TCR) и который состоит из гомодимера или гетеродимера, образованного из ассоциации двух из четырех рецепторных цепей: CD3-эпсилон, CD3-дельта, CD3-дзета и CD3-гамма.CD3 expression refers to an antigen that is expressed on T cells as part of the multimolecular T cell receptor (TCR) and that consists of a homodimer or heterodimer formed from the association of two of the four receptor chains: CD3 epsilon, CD3 delta, CD3 zeta and CD3 gamma.

CD3-эпсилон человека (hCD3ε) содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 169 (UniProtKB/Swiss-Prot: P07766.2). CD3-дельта человека (hCD3δ)) содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 170 (UniProtKB/Swiss-Prot: P04234.1). Все ссылки на белки, полипептиды и фрагменты белка в данном документе предназначены для обозначения человеческой версии соответствующего белка, полипептида или фрагмента белка, если явно не указано, что они относятся к видам, отличным от человека. Таким образом, выражение CD3 означает CD3 человека, если не указано, что оно относится к видам, отличным от человека, например CD3 мыши, CD3 обезьяны и т.д.Human CD3 epsilon (hCD3ε) contains the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 169 (UniProtKB/Swiss-Prot: P07766.2). Human CD3 delta (hCD3δ)) contains the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 170 (UniProtKB/Swiss-Prot: P04234.1). All references to proteins, polypeptides, and protein fragments herein are intended to refer to the human version of the corresponding protein, polypeptide, or protein fragment, unless explicitly stated to be of a non-human species. Thus, the expression CD3 means human CD3 unless indicated to refer to a non-human species, eg mouse CD3, monkey CD3, etc.

Фраза антитело, которое связывает CD3 или анти-CD3 антитело включает антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые специфически распознают и связываются с одной субъединицей CD3 (например, эпсилон, дельта, гамма или дзета), а также антителам и их антигенсвязывающим фрагментам, которые специфически распознают и связываются с димерным комплексом двух субъединиц CD3 (например, димеры эпсилон/дельта, эпсилон/гамма и дзета/дзета CD3). Антитела и антигенсвязыThe phrase antibody that binds to CD3 or anti-CD3 antibody includes antibodies and their antigen-binding fragments that specifically recognize and bind to one subunit of CD3 (e.g., epsilon, delta, gamma, or zeta), as well as antibodies and their antigen-binding fragments that specifically recognize and bind to a dimeric complex of two CD3 subunits (eg, epsilon/delta, epsilon/gamma, and zeta/zeta CD3 dimers). Antibodies and antigen bonds

- 8 040594 вающие фрагменты по данному изобретению могут связывать растворимый CD3, связанный CD3 и/или клеточную поверхность, экспрессирующую CD3. Растворимый CD3 включает природные белки CD3, а также варианты рекомбинантного белка CD3, такие как, например, мономерные и димерные конструкции CD3, которые не имеют трансмембранного домена или иначе не связаны с клеточной мембраной. Данное изобретение относится к антителам, которые связывают и активируют CD3 человека и яванского макака со слабой или недетектируемой аффинностью связывания. Связывание с CD3 с недетектируемой аффинностью связывания означает, что взаимодействие антитела и/или антигенсвязывающего фрагмента с мишенью CD3 может не поддаваться измерению или обнаружению с помощью известного анализа для определения, такого как FACS анализ связывания (на основе клеток), описанный в данном документе, или анализ связывания на основе поверхностного плазмонного резонанса, описанный в данном документе и хорошо известный в данной области техники. Другие анализы связывания хорошо известны в данной области техники. Антитело и/или антигенсвязывающий фрагмент могут распознавать мишень CD3 посредством очень слабого белок-белкового биохимического взаимодействия, однако определение конкретного значения KD или EC50 не может быть измерено, так как взаимодействие выходит за пределы обнаружения анализа, например не может быть проведено измерение. В другом случае отсутствие определяемой аффинности связывания определяется, если аффинность антитела, соответствующая значению KD, равна или меньше чем в 10 раз ниже, чем неспецифический антиген, такой как БСА, казеин или т.п. Связывание с CD3 со слабой аффинностью связывания включает взаимодействия, в которых измерение аффинности связывания находится на уровне или немного превышает предел обнаружения анализа или эквивалентно аффинности связывания с неспецифическим антигеном.- 8 040594 fragments according to the invention can bind soluble CD3, bound CD3 and/or cell surface expressing CD3. Soluble CD3 includes native CD3 proteins as well as variants of the recombinant CD3 protein, such as, for example, CD3 monomeric and dimeric constructs that lack a transmembrane domain or are not otherwise associated with the cell membrane. The present invention relates to antibodies that bind and activate human and cynomolgus monkey CD3 with weak or undetectable binding affinity. Binding to CD3 with a non-detectable binding affinity means that the interaction of an antibody and/or antigen-binding fragment with a CD3 target may not be measurable or detectable by a known detection assay, such as the FACS binding assay (cell-based) described herein, or the surface plasmon resonance binding assay described herein and well known in the art. Other binding assays are well known in the art. The antibody and/or antigen-binding fragment can recognize the CD3 target through a very weak protein-protein biochemical interaction, but determination of a specific KD or EC50 value cannot be measured because the interaction is beyond the detection of the assay, e.g., cannot be measured. Otherwise, no detectable binding affinity is determined if the affinity of the antibody corresponding to the KD value is equal to or less than 10 times lower than a non-specific antigen such as BSA, casein, or the like. Binding to CD3 with low binding affinity includes interactions in which the measurement of binding affinity is at or slightly above the limit of detection of the assay, or equivalent to the binding affinity for a non-specific antigen.

Выражение CD3, экспрессируемый на поверхности клетки означает один или более белков CD3, которые экспрессируются на поверхности клетки in vitro или in vivo, так что по меньшей мере часть белка CD3 располагается на внеклеточной стороне клеточной мембраны и доступна для антигенсвязывающей части антитела. CD3, экспрессируемый на поверхности клетки включает белки CD3, содержащиеся в контексте функционального рецептора T-клеток в мембране клетки. Выражение CD3, экспрессируемый на поверхности клетки включает белок CD3, экспрессируемый как часть гомодимера или гетеродимера на поверхности клетки (например, димеры CD3 дельта/эпсилон, гамма/эпсилон и дзета/дзета). Выражение CD3, экспрессируемый на поверхности клетки также включает цепь CD3 (например, CD3-дельта, CD3-эпсилон или CD3-гамма), которая экспрессируется сама по себе без других типов цепи CD3 на поверхности клетки. CD3, экспрессируемый на поверхности клетки может содержать или состоять из белка CD3, экспрессируемого на поверхности клетки, которая обычно экспрессирует белок CD3. В качестве альтернативы CD3, экспрессируемый на поверхности клетки может содержать или состоять из белка CD3, экспрессируемого на поверхности клетки, которая обычно не экспрессирует CD3 человека на своей поверхности, но искусственно сконструирована для экспрессии CD3 на ее поверхности.Cell surface expressed CD3 expression means one or more CD3 proteins that are expressed on the cell surface in vitro or in vivo such that at least a portion of the CD3 protein resides on the extracellular side of the cell membrane and is accessible to the antigen-binding portion of the antibody. CD3 expressed on the cell surface includes CD3 proteins contained in the context of a functional T cell receptor in the cell membrane. Cell surface expression of CD3 includes CD3 protein expressed as part of a cell surface homodimer or heterodimer (eg, CD3 delta/epsilon, gamma/epsilon, and zeta/zeta dimers). Expression of CD3 expressed on the cell surface also includes a CD3 chain (eg CD3 delta, CD3 epsilon or CD3 gamma) that is expressed by itself without other types of CD3 chain on the cell surface. CD3 expressed on the cell surface may contain or consist of the CD3 protein expressed on the cell surface, which normally expresses the CD3 protein. Alternatively, cell surface expressed CD3 may comprise or consist of a CD3 protein expressed on the surface of a cell that does not normally express human CD3 on its surface but is artificially engineered to express CD3 on its surface.

К эффекторным клеткам относятся эффекторные T-клетки (T-лимфоциты), например CD4+ T-клетки, CD8+ T-клетки, Th1, Th2 и регуляторные T-клетки (Tregs). Эффекторные клетки могут также включать клетки естественных киллеров (NK), макрофаги, гранулоциты, плазматические клетки или B-клетки (лимфоциты). Понятно, что терапия может опосредовать множество клеточных иммунных реакций или эффекторных функций посредством взаимодействия Ig с эффекторными поверхностными рецепторами, такими как CD3 (рецептор поверхности T-клеток), CD28 (Т-клетки), рецепторы Fcy (FcyRs) (NK-клетки, активированные макрофаги и т.п.). В результате этих взаимодействий активируются эффекторные функции, такие как лизис клеток, активация комплемента, фагоцитоз и опсонизация. Связывание с эффекторной клеткой и клеткой-мишенью опухоли позволяет получить ценный и эффективный дизайн иммунотерапии, который распространяется на лизис опухолевых клеток и индуцирует эндогенные иммунные функции для борьбы с опухолью или раком.Effector cells include effector T cells (T lymphocytes), such as CD4+ T cells, CD8+ T cells, Th1, Th2, and regulatory T cells (Tregs). Effector cells may also include natural killer (NK) cells, macrophages, granulocytes, plasma cells, or B cells (lymphocytes). It is understood that therapy can mediate a variety of cellular immune responses or effector functions through Ig interaction with effector surface receptors such as CD3 (T cell surface receptor), CD28 (T cells), Fcy receptors (FcyRs) (NK cells activated macrophages, etc.). As a result of these interactions, effector functions such as cell lysis, complement activation, phagocytosis, and opsonization are activated. Binding to the tumor effector cell and tumor target cell provides a valuable and effective immunotherapy design that extends to tumor cell lysis and induces endogenous immune functions to fight the tumor or cancer.

Выражение анти-CD3 антитело включает как одновалентные антитела с одной специфичностью, так и биспецифические антитела, содержащие первое плечо, которое связывает CD3, и второе плечо, которое связывает второй (целевой) антиген, в которых плечо анти-CD3 содержит любые последовательностей HCVR/LCVR или CDR, представленные в табл. 2-4 и/или 5 в данном документе. Примеры биспецифических анти-CD3 антител описаны в других местах в данном документе. Термин антигенсвязывающая молекула включает антитела и антигенсвязывающие фрагменты антител, включая, например, биспецифические антитела.The expression of an anti-CD3 antibody includes both monovalent antibodies with one specificity and bispecific antibodies containing a first arm that binds CD3 and a second arm that binds a second (target) antigen, in which the anti-CD3 arm contains any of the HCVR/LCVR sequences or CDR presented in table. 2-4 and/or 5 in this document. Examples of bispecific anti-CD3 antibodies are described elsewhere in this document. The term antigen-binding molecule includes antibodies and antigen-binding fragments of antibodies, including, for example, bispecific antibodies.

Термин антитело включает любую антигенсвязывающую молекулу или молекулярный комплекс, содержащий по меньшей мере одну область определения комплементарности (CDR), которая специфически связывается с определенным антигеном или взаимодействует с ним (например, CD3). Термин антитело включает молекулы иммуноглобулина, содержащие четыре полипептидные цепи, две тяжелые (H) цепи и две легкие (L) цепи, связанные между собой дисульфидными связями, а также их мультимеры (например, IgM). Каждая тяжелая цепь включает вариабельную область тяжелой цепи (сокращенно обозначаемую в данном документе как HCVR или VH) и константную область тяжелой цепи. Константная область тяжелой цепи состоит из трех доменов - CH1, CH2 и CH3. Каждая легкая цепь содержит вариабельный участок легкой цепи (сокращенно обозначенный как LCVR или VL) и константную область легThe term antibody includes any antigen-binding molecule or molecular complex containing at least one complementarity determining region (CDR) that specifically binds to or interacts with a particular antigen (eg, CD3). The term antibody includes immunoglobulin molecules containing four polypeptide chains, two heavy (H) chains and two light (L) chains linked by disulfide bonds, as well as their multimers (eg, IgM). Each heavy chain includes a heavy chain variable region (abbreviated herein as HCVR or VH) and a heavy chain constant region. The heavy chain constant region consists of three domains, CH1, C H 2 and C H 3. Each light chain contains a light chain variable region (abbreviated as LCVR or VL) and a light chain constant region.

- 9 040594 кой цепи. Константная область легкой цепи содержит один домен (CL1). Области VH и VL могут быть далее подразделены на области с гипервариабельностью, называемые областями, определяющими комплементарность (CDR), перемежающиеся с более консервативными областями, называемыми каркасными областями (FR). Каждая VH и VL состоит из трех CDR и четырех FR, расположенных от аминоконца к карбоксильному концу в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. В различных вариантах осуществления изобретения FR анти-CD3 антитела (или его антигенсвязывающей части) могут быть идентичны последовательностям зародышевой линии человека или могут быть модифицированы естественным путем или искусственно. Консенсусная последовательность аминокислот может быть определена на основе параллельного анализа двух или более CDR.- 9 040594 chain. The light chain constant region contains one domain (C L 1). The VH and V L regions can be further subdivided into regions of hypervariability called complementarity determining regions (CDRs) interspersed with more conserved regions called framework regions (FRs). Each VH and V L consists of three CDRs and four FRs arranged from amino to carboxyl in the following order: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. In various embodiments, the FR of an anti-CD3 antibody (or antigen-binding portion thereof) may be identical to human germline sequences, or may be naturally or artificially modified. The consensus amino acid sequence can be determined based on a parallel analysis of two or more CDRs.

Термин антитело также включает антигенсвязывающие фрагменты полных молекул антител. Термины антигенсвязывающая часть антитела, антигенсвязывающий фрагмент антитела и т.п., используемые в данном документе, включают любой природный, ферментативно доступный синтетический или генетически модифицированный полипептид или гликопротеин, который специфически связывает антиген, чтобы образовать комплекс. Антигенсвязывающие фрагменты антитела могут быть получены, например, из полных молекул антител с использованием любых подходящих стандартных методик, таких как протеолитическое расщепление или рекомбинантные методики генной инженерии, включающие манипуляцию и экспрессию ДНК, кодирующей вариабельные и необязательно константные домены антитела. Такая ДНК известна и/или легко доступна, например, из коммерческих источников, библиотек ДНК (включая, например, библиотеки фаговых антител) или может быть синтезирована. ДНК может быть секвенирована и обработана химически или с использованием методик молекулярной биологии, например, для организации одного или более вариабельных и/или константных доменов в подходящую конфигурацию или для введения кодонов, создания остатков цистеина, модификации, добавления или удаления аминокислот и т.д.The term antibody also includes antigen-binding fragments of complete antibody molecules. The terms antigen-binding portion of an antibody, antigen-binding fragment of an antibody, and the like, as used herein, include any naturally occurring, enzymatically available synthetic or genetically modified polypeptide or glycoprotein that specifically binds an antigen to form a complex. Antigen-binding antibody fragments can be generated, for example, from whole antibody molecules using any suitable standard techniques such as proteolytic cleavage or recombinant genetic engineering techniques involving the manipulation and expression of DNA encoding the variable and optionally constant domains of an antibody. Such DNA is known and/or readily available, for example from commercial sources, DNA libraries (including, for example, phage antibody libraries), or can be synthesized. The DNA can be sequenced and processed chemically or using molecular biology techniques, for example, to organize one or more variable and/or constant domains into a suitable configuration, or to introduce codons, create cysteine residues, modify, add or remove amino acids, etc.

Неограничивающие примеры антигенсвязывающих фрагментов включают (i) фрагменты Fab; (ii) фрагменты F(ab')2; (iii) фрагменты Fd; (iv) фрагменты Fv; (v) одноцепочечные молекулы Fv (scFv); (vi) фрагменты dAb и (vii) минимальные единицы распознавания, состоящие из аминокислотных остатков, которые имитируют гипервариабельную область антитела (например, выделенную область определения комплементарности (CDR), такую как CDR3-пептид) или пептид с ограниченной конформационной свободой FR3-CDR3-FR4. Другие сконструированные молекулы, такие как специфичные для домена антитела, однодоменные антитела, антитела с удаленными доменами, химерные антитела, CDR-привитые антитела, диатела, триатела, тетратела, мини-антитела, наночастицы (например, моновалентные наночастицы, двухвалентные наночастицы и т.д.), небольшие модульные иммунофармацевтические препараты (SMIP) и вариабельные акульи домены IgNAR, также включены в выражение антигенсвязывающий фрагмент, используемый в данном документе.Non-limiting examples of antigen-binding fragments include (i) Fab fragments; (ii) F(ab') 2 fragments; (iii) Fd fragments; (iv) Fv fragments; (v) single chain Fv molecules (scFv); (vi) dAb fragments; and (vii) minimal recognition units consisting of amino acid residues that mimic an antibody hypervariable region (e.g., a distinguished complementarity determining region (CDR) such as a CDR3 peptide) or a FR3-CDR3- FR4. Other engineered molecules such as domain specific antibodies, single domain antibodies, domain deleted antibodies, chimeric antibodies, CDR grafted antibodies, diabodies, tribodies, tetrabodies, minibodies, nanoparticles (e.g., monovalent nanoparticles, divalent nanoparticles, etc.) .), small modular immunopharmaceuticals (SMIPs), and shark IgNAR variable domains are also included in the expression antigen-binding fragment used herein.

Антигенсвязывающий фрагмент антитела обычно содержит по меньшей мере один вариабельный домен. Вариабельный домен может иметь любой размер или аминокислотную композицию и, как правило, содержать по меньшей мере один CDR, который примыкает или находится в связке с одной или более последовательностями каркаса. В антигенсвязывающих фрагментах, имеющих домен VH, связанный с доменом VL, домены VH и VL могут быть расположены относительно друг друга в любой подходящей компоновке. Например, вариабельная область может быть димерной и содержать димеры VH-VH, VH-VL или VL-VL. Альтернативно, антигенсвязывающий фрагмент антитела может содержать мономерный домен VH или VL.An antigen binding fragment of an antibody typically contains at least one variable domain. The variable domain may be of any size or amino acid composition and will typically contain at least one CDR that is adjacent to or in association with one or more backbone sequences. In antigen-binding fragments having a V H domain associated with a V L domain, the V H and V L domains may be located relative to each other in any suitable arrangement. For example, the variable region may be dimeric and contain V H -V H , V H -V L or V L -V L dimers. Alternatively, the antigen-binding fragment of an antibody may comprise a V H or V L monomeric domain.

В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий фрагмент антитела может содержать по меньшей мере один вариабельный домен, ковалентно связанный, по меньшей мере, с одним константным доменом. Неограничивающие иллюстративные конфигурации вариабельных и константных доменов, которые могут быть найдены в антигенсвязывающем фрагменте антитела по данному изобретению, включают (i) Vh-Ch1; (ii) Vh-Ch2; (iii) Vh-Ch3; (iv) Vh-Ch1-Ch; (v) Vh-Ch1-Ch2-Ch3; (vi) Vh-Ch2-Ch3; (vii) Vh-Cl; (viii) Vl-Ch1; (ix) Vl-Ch2; (x) Vl-Ch3; (xi) Vl-Ch1-Ch2; (xii) Vl-Ch1-Ch2-Ch3; (xiii) Vl-Ch2Ch3 и (xiv) Vl-Cl. В любой конфигурации вариабельных и константных доменов, включая любую из приведенных выше иллюстративных конфигураций, вариабельные и константные домены могут быть либо напрямую связаны друг с другом либо могут быть связаны посредством полной или частичной шарнирной или линкерной области. Шарнирная область может состоять по меньшей мере из 2 (например, 5, 10, 15, 20, 40, 60 или более) аминокислот, которые приводят к гибкой или полугибкой связи между соседними вариабельными и/или константными доменами в одной полипептидной молекуле. Кроме того, антигенсвязывающий фрагмент антитела по данному изобретению может содержать гомодимер или гетеродимер (или другой мультимер) любой из конфигураций вариабельных и константных доменов, перечисленных выше, в нековалентной связи друг с другом и/или с одним или более мономерными доменами VH или Vl (например, посредством дисульфидной связи(ей)).In some embodiments, an antigen-binding fragment of an antibody may comprise at least one variable domain covalently linked to at least one constant domain. Non-limiting exemplary variable and constant domain configurations that may be found in an antigen-binding fragment of an antibody of the present invention include (i) Vh-Ch1; (ii) Vh-Ch2; (iii) Vh-Ch3; (iv) Vh-Ch1-Ch; (v) Vh-Ch1-Ch2-Ch3; (vi) Vh-Ch2-Ch3; (vii) Vh-Cl; (viii) Vl-Ch1; (ix) Vl-Ch2; (x) Vl-Ch3; (xi) Vl-Ch1-Ch2; (xii) Vl-Ch1-Ch2-Ch3; (xiii) Vl-Ch2C h 3 and (xiv) V l -C l . In any configuration of the variable and constant domains, including any of the above illustrative configurations, the variable and constant domains may either be directly linked to each other or may be linked through a complete or partial hinge or linker region. The hinge region may be at least 2 (eg, 5, 10, 15, 20, 40, 60 or more) amino acids that result in a flexible or semi-flexible bond between adjacent variable and/or constant domains in a single polypeptide molecule. In addition, an antigen-binding fragment of an antibody of the present invention may comprise a homodimer or heterodimer (or other multimer) of any of the variable and constant domain configurations listed above in non-covalent association with each other and/or with one or more VH or V l monomeric domains ( for example, via disulfide bond(s)).

Как и в случае с полными молекулами антител, антигенсвязывающие фрагменты могут быть моноспецифическими или мультиспецифическими (например, биспецифическими).As with full antibody molecules, antigen binding fragments can be monospecific or multispecific (eg, bispecific).

Мультиспецифический антигенсвязывающий фрагмент антитела обычно будет содержать по меньшей мере два разных вариабельных домена, причем каждый вариабельный домен способен специфиче- 10 040594 ски связываться с отдельным антигеном или с другим эпитопом на том же антигене. Любой формат мультиспецифических антител, включая описанные в данном документе иллюстративные форматы биспецифических антител, может быть адаптирован для применения в контексте антигенсвязывающего фрагмента антитела по данному изобретению с использованием обычных методик, доступных в данной области техники.A multispecific antigen-binding fragment of an antibody will typically contain at least two different variable domains, each variable domain being capable of specifically binding to a separate antigen or to a different epitope on the same antigen. Any multispecific antibody format, including the exemplary bispecific antibody formats described herein, can be adapted for use in the context of an antigen-binding fragment of an antibody of this invention using conventional techniques available in the art.

Антитела по данному изобретению могут функционировать через комплементзависимую цитотоксичность (CDC) или антителозависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (АЗКЦ). Комплементзависимая цитотоксичность (CDC) относится к лизису экспрессирующих антиген клеток антителом по изобретению в присутствии комплемента. Антителозависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность (АЗКЦ) относится к реакции, опосредованной клетками, в которой неспецифические цитотоксические клетки, которые экспрессируют Fc-рецепторы (FcR) (например, клетки естественные киллеры (NK), нейтрофилы и макрофаги), распознают связанное антитело на клетке-мишени и, таким образом, приводит к лизису клетки-мишени. CDC и АЗКЦ могут быть измерены с использованием анализов, которые хорошо известны и доступны в данной области техники. (См., например, патенты США № 5500362 и 5821337 и Clynes et al. (1998), Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 95:652-656). Константная область антитела имеет важное значение в способности антитела фиксировать комплемент и опосредовать клеточно-зависимую цитотоксичность. Таким образом, изотип антитела может быть выбран на основе того, желательно ли, чтобы антитело опосредовало цитотоксичность.The antibodies of this invention can function through complement dependent cytotoxicity (CDC) or antibody dependent cell mediated cytotoxicity (ADCC). Complement dependent cytotoxicity (CDC) refers to the lysis of antigen expressing cells by an antibody of the invention in the presence of complement. Antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) refers to a cell-mediated response in which non-specific cytotoxic cells that express Fc receptors (FcRs) (e.g., natural killer (NK) cells, neutrophils, and macrophages) recognize the bound antibody on the cell- target and thus leads to lysis of the target cell. CDC and ADCC can be measured using assays that are well known and available in the art. (See, for example, US Pat. Nos. 5,500,362 and 5,821,337 and Clynes et al. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 95:652-656). The constant region of an antibody is important in the ability of an antibody to fix complement and mediate cell-dependent cytotoxicity. Thus, the antibody isotype can be selected based on whether it is desirable for the antibody to mediate cytotoxicity.

В некоторых вариантах осуществления изобретения анти-CD3 антитела по изобретению (моноспецифическое или биспецифическое) представляют собой антитела человека.In some embodiments, the anti-CD3 antibodies of the invention (monospecific or bispecific) are human antibodies.

Используемый в данном документе термин антитело человека предназначен для включения антител, имеющих вариабельные и константные области, полученные из последовательностей иммуноглобулина зародышевой линии человека. Антитела человека по изобретению могут включать аминокислотные остатки, не кодируемые последовательностями иммуноглобулина человека зародышевой линии (например, мутации, введенные посредством случайного или сайт-специфического мутагенеза in vitro или соматической мутацией in vivo), например, в CDR и, в частности, CDR3. Однако термин антитело человека, используемый в данном документе, не предназначен для включения антител, в которых последовательности CDR получены из зародышевой линии других видов млекопитающих, таких как мышь, были привиты на последовательности каркаса человека.As used herein, the term human antibody is intended to include antibodies having variable and constant regions derived from human germline immunoglobulin sequences. Human antibodies of the invention may include amino acid residues not encoded by germline human immunoglobulin sequences (e.g., mutations introduced by in vitro random or site-directed mutagenesis or in vivo somatic mutation), for example, in CDRs and in particular CDR3. However, the term human antibody as used herein is not intended to include antibodies in which CDR sequences derived from the germline of other mammalian species, such as the mouse, have been grafted onto human scaffold sequences.

Термин рекомбинантное антитело человека предназначен для включения всех антител человека, которые получены, экспрессируются, создаются или выделяются рекомбинантными средствами, такими как антитела, экспрессированные с использованием рекомбинантного экспрессирующего вектора, трансфицированного в клетку-хозяина (описанную далее), антитела, выделенные из рекомбинантной комбинаторной библиотеки антител человека (описанную далее), антитела, выделенные от животного (например, мыши), который является трансгенным для генов иммуноглобулина человека (см., например, Taylor et al. (1992), Nucl. Acids Res. 20:6287-6295) или антитела, полученные, экспрессированные, созданные или выделенные любым другим способом, который включает сплайсинг последовательностей генов иммуноглобулина человека в другие последовательности ДНК. Такие рекомбинантные антитела человека имеют вариабельные и константные области, полученные из последовательностей иммуноглобулинов зародышевой линии человека. Однако в некоторых вариантах осуществления такие рекомбинантные антитела человека подвергаются мутагенезу in vitro (или, когда используется трансгенное животное для человеческих Ig-последовательностей, соматическому мутагенезу in vivo), и, следовательно, аминокислотные последовательности областей VH и VL рекомбинантного антитела представляют собой последовательности, которые, будучи производными и связанными с последовательностями VH и VL зародышевой линии человека, необязательно естественным образом существуют в репертуаре зародышевой линии антитела человека in vivo.The term recombinant human antibody is intended to include all human antibodies that are produced, expressed, generated, or isolated by recombinant means, such as antibodies expressed using a recombinant expression vector transfected into a host cell (described below), antibodies isolated from a recombinant combinatorial library human antibodies (described below), antibodies isolated from an animal (e.g., mouse) that is transgenic for human immunoglobulin genes (see, e.g., Taylor et al. (1992), Nucl. Acids Res. 20:6287-6295) or antibodies produced, expressed, made or isolated by any other method which involves splicing human immunoglobulin gene sequences into other DNA sequences. Such recombinant human antibodies have variable and constant regions derived from human germline immunoglobulin sequences. However, in some embodiments, such human recombinant antibodies undergo in vitro mutagenesis (or, when a transgenic animal for human Ig sequences is used, in vivo somatic mutagenesis), and therefore the amino acid sequences of the VH and V L regions of the recombinant antibody are sequences that , being derived from and related to the human germline VH and V L sequences, do not necessarily naturally exist in the human germline antibody repertoire in vivo.

Антитела человека могут существовать в двух формах, которые связаны с неоднородностью шарнира. В одной форме молекула иммуноглобулина содержит стабильную четырехцепочечную конструкцию, содержащую приблизительно 150-160 кДа, в которой димеры удерживаются вместе межцепочечной дисульфидной связью. Во второй форме димеры не связаны через межцепочечные дисульфидные связи, и образуется молекула около 75-80 кДа, состоящая из ковалентно связанной легкой и тяжелой цепи (полуантитела). Эти формы чрезвычайно трудно отделить даже после аффинной очистки.Human antibodies can exist in two forms that are associated with hinge heterogeneity. In one form, the immunoglobulin molecule contains a stable four-strand construct containing approximately 150-160 kDa, in which the dimers are held together by an interstrand disulfide bond. In the second form, the dimers are not linked through interchain disulfide bonds, and a molecule of about 75-80 kDa is formed, consisting of a covalently linked light and heavy chain (half-antibody). These forms are extremely difficult to separate even after affinity purification.

Частота появления второй формы в различных интактных изотипах IgG обусловлена, но не ограничивается ими, структурными различиями, связанными с изотипом шарнирной области антитела. Единственное замещение аминокислоты в шарнирной области шарнира IgG4 человека может значительно уменьшить появление второй формы (Angal et al. (1993), Molecular Immunology, 30:105) до уровней, обычно наблюдаемых с использованием шарнира IgG1 человека. Данное изобретение охватывает антитела, имеющие одну или более мутаций в шарнирной области, CH2 или CH3, которая может быть желательной, например, в производстве, для улучшения выхода желаемой формы антитела.The frequency of appearance of the second form in various intact IgG isotypes is due to, but not limited to, structural differences associated with the isotype of the hinge region of the antibody. A single amino acid substitution in the hinge region of the human IgG4 hinge can significantly reduce the appearance of the second form (Angal et al. (1993), Molecular Immunology, 30:105) to levels normally seen with the human IgG1 hinge. This invention encompasses antibodies having one or more mutations in the hinge region, CH2 or CH3, which may be desirable, for example in production, to improve the yield of the desired antibody form.

Антитела по изобретению могут представлять собой выделенные антитела. Изолированное антитело, используемое в данном документе, означает антитело, которое было идентифицировано и выделено и/или восстановлено по меньшей мере из одного компонента его естественной среды. Например, ан- 11 040594 титело, которое было выделено или удалено по меньшей мере из одного компонента организма или из ткани или клетки, в которой антитело естественным образом существует или является естественно продуцированным, является выделенным антителом для целей данного изобретения. Выделенное антитело также включает антитело in situ в рекомбинантной клетке. Выделенные антитела представляют собой антитела, которые были подвергнуты по меньшей мере одной стадии очистки или выделения. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления выделенное антитело может быть по существу свободным от другого клеточного материала и/или химических веществ.The antibodies of the invention may be isolated antibodies. An isolated antibody as used herein means an antibody that has been identified and isolated and/or reconstituted from at least one component of its natural environment. For example, an antibody that has been isolated or removed from at least one component of an organism, or from a tissue or cell in which the antibody naturally exists or is naturally produced, is an isolated antibody for the purposes of this invention. An isolated antibody also includes an antibody in situ in a recombinant cell. Isolated antibodies are antibodies that have been subjected to at least one purification or isolation step. In accordance with some embodiments, the isolated antibody may be substantially free of other cellular material and/or chemicals.

Данное изобретение также включает одноплечевые антитела, которые связывают CD3. Фраза одноплечевое антитело означает антигенсвязывающую молекулу, содержащую тяжелую цепь одного антитела и легкую цепь одного антитела. Одноплечевые антитела по данному изобретению могут содержать любую из аминокислотных последовательностей HCVR/LCVR или CDR, указанных в табл. 2 в данном документе.The invention also includes single-armed antibodies that bind CD3. The phrase single-armed antibody means an antigen-binding molecule comprising one antibody heavy chain and one antibody light chain. Single-armed antibodies of the invention may contain any of the HCVR/LCVR or CDR amino acid sequences shown in Table 1. 2 in this document.

Термин эпитоп относится к антигенной детерминанте, которая взаимодействует со специфическим сайтом связывания антигена в вариабельной области молекулы антитела, известной как паратоп. Один антиген может иметь более одного эпитопа. Таким образом, различные антитела могут связываться с различными областями на антигене и могут иметь различные биологические эффекты. Эпитопы могут быть либо конформационными, либо линейными. Конформационный эпитоп продуцируется пространственно сопоставленными аминокислотами из разных сегментов линейной полипептидной цепи. Линейный эпитоп представляет собой тот, что получен смежными аминокислотными остатками в полипептидной цепи. В определенных обстоятельствах эпитоп может содержать фрагменты сахаридов, фосфорильных групп или сульфонильных групп на антигене.The term epitope refers to an antigenic determinant that interacts with a specific antigen binding site in the variable region of an antibody molecule known as a paratope. One antigen may have more than one epitope. Thus, different antibodies may bind to different regions on an antigen and may have different biological effects. Epitopes can be either conformational or linear. A conformational epitope is produced by spatially aligned amino acids from different segments of the linear polypeptide chain. A linear epitope is one obtained by adjacent amino acid residues in a polypeptide chain. In certain circumstances, an epitope may contain fragments of saccharides, phosphoryl groups, or sulfonyl groups on the antigen.

Термин существенная идентичность или по существу идентичный, когда речь идет о нуклеиновой кислоте или ее фрагменте, указывает, что при оптимальном выравнивании с соответствующими нуклеотидными инсерциями или делециями с другой нуклеиновой кислотой (или ее комплементарной цепью) существует идентичность нуклеотидной последовательности по меньшей мере около 95% и более предпочтительно по меньшей мере около 96, 97, 98 или 99% нуклеотидных оснований, как измерено любым известным алгоритмом идентичности последовательности, таким как FASTA, BLAST или Gap, как обсуждается ниже. Молекула нуклеиновой кислоты, имеющая существенную идентичность с эталонной молекулой нуклеиновой кислоты, в некоторых случаях может кодировать полипептид, имеющий такую же или по существу подобную аминокислотную последовательность, что и полипептид, кодируемый эталонной молекулой нуклеиновой кислоты.The term substantial identity or substantially identical, when referring to a nucleic acid or fragment thereof, indicates that, when optimally aligned with the corresponding nucleotide insertions or deletions with another nucleic acid (or its complementary strand), there is a nucleotide sequence identity of at least about 95% and more preferably at least about 96, 97, 98, or 99% nucleotide bases, as measured by any known sequence identity algorithm such as FASTA, BLAST, or Gap, as discussed below. A nucleic acid molecule that has a significant identity with a reference nucleic acid molecule may, in some cases, encode a polypeptide having the same or substantially similar amino acid sequence as the polypeptide encoded by the reference nucleic acid molecule.

В применении к полипептидам термин существенное сходство или по существу аналогичный означает, что две последовательности пептидов при оптимальном выравнивании, таком как программы GAP или BESTFIT с использованием разностных масс по умолчанию, имеют по меньшей мере 95% идентичности последовательности, еще более предпочтительно не менее 98 или 99% идентичности последовательности. Предпочтительно положения остатков, которые не идентичны, отличаются консервативными аминокислотными заменами. Консервативная аминокислотная замена представляет собой ту, в которой аминокислотный остаток замещен другим аминокислотным остатком, имеющим боковую цепь (R-группу) с аналогичными химическими свойствами (например, зарядом или гидрофобностью). В общем, консервативная аминокислотная замена не будет существенно изменять функциональные свойства белка. В случаях, когда две или более аминокислотные последовательности отличаются друг от друга консервативными заменами, процентная идентичность последовательности или степень сходства могут быть скорректированы вверх, чтобы исправить консервативный характер замещения. Средства для осуществления этой регулировки хорошо известны специалистам в данной области техники. См., например, Pearson (1994), Methods Mol. Biol. 24:307-331. Примеры групп аминокислот, имеющих боковые цепи с аналогичными химическими свойствами, включают (1) алифатические боковые цепи: глицин, аланин, валин, лейцин и изолейцин; (2) алифатически-гидроксильные боковые цепи: серин и треонин; (3) амидсодержащие боковые цепи: аспарагин и глутамин; (4) ароматические боковые цепи: фенилаланин, тирозин и триптофан; (5) основные боковые цепи: лизин, аргинин и гистидин; (6) кислотные боковые цепи: аспартат и глутамат и (7) серосодержащие боковые цепи представляют собой цистеин и метионин. Предпочтительными консервативными аминокислотными замещающими группами являются валин-лейцинизолейцин, фенилаланин-тирозин, лизин-аргинин, аланин-валин, глутамат-аспартат и аспарагинглутамин. Альтернативно, консервативная замена представляет собой любое изменение, имеющее положительное значение в матрице логарифмического правдоподобия PAM250, раскрытой в Gonnet et al. (1992), Science, 256:1443-1445. Умеренно консервативной заменой является любое изменение, имеющее неотрицательное значение в матрице логарифмического правдоподобия PAM250.When applied to polypeptides, the term significant similarity or substantially similar means that two peptide sequences when optimally aligned, such as the GAP or BESTFIT programs using default difference masses, have at least 95% sequence identity, even more preferably at least 98 or 99% sequence identity. Preferably, residue positions that are not identical differ by conservative amino acid substitutions. A conservative amino acid substitution is one in which an amino acid residue is replaced by another amino acid residue having a side chain (R group) with similar chemical properties (eg, charge or hydrophobicity). In general, a conservative amino acid substitution will not significantly alter the functional properties of a protein. In cases where two or more amino acid sequences differ from each other by conservative substitutions, the percent sequence identity or degree of similarity may be adjusted upward to correct for the conservative nature of the substitution. Means for effecting this adjustment are well known to those skilled in the art. See, for example, Pearson (1994), Methods Mol. Biol. 24:307-331. Examples of groups of amino acids having side chains with similar chemical properties include (1) aliphatic side chains: glycine, alanine, valine, leucine, and isoleucine; (2) aliphatic hydroxyl side chains: serine and threonine; (3) amide-containing side chains: asparagine and glutamine; (4) aromatic side chains: phenylalanine, tyrosine and tryptophan; (5) main side chains: lysine, arginine and histidine; (6) acidic side chains: aspartate and glutamate; and (7) sulfur-containing side chains are cysteine and methionine. Preferred conservative amino acid substituents are valine-leucine isoleucine, phenylalanine-tyrosine, lysine-arginine, alanine-valine, glutamate-aspartate, and asparaginglutamine. Alternatively, a conservative substitution is any change that has a positive value in the PAM250 log-likelihood matrix disclosed in Gonnet et al. (1992), Science, 256:1443-1445. A moderately conservative replacement is any change that has a non-negative value in the PAM250 log-likelihood matrix.

Сходство последовательностей для полипептидов, которое также упоминается как идентичность последовательности, обычно измеряется с использованием программного обеспечения для анализа последовательности. Программное обеспечение для анализа белка соответствует аналогичным последовательностям, используя меры сходства, назначенные для различных замещений, делеций и других модификаций, включая консервативные аминокислотные замены. Например, программное обеспечение GCG включает такие программы, как Gap и Bestfit, которые могут использоваться с параметрами по умолчаSequence similarity for polypeptides, also referred to as sequence identity, is commonly measured using sequence analysis software. Protein analysis software matches similar sequences using similarity measures assigned to various substitutions, deletions, and other modifications, including conservative amino acid substitutions. For example, the GCG software includes programs such as Gap and Bestfit that can be used with default settings.

- 12 040594 нию для определения гомологии последовательности или идентичности последовательностей между близкими родственными полипептидами, такими как гомологичные полипептиды от разных видов организмов или между белком дикого типа и его мутеином. См., например, GCG версии 6.1. Полипептидные последовательности также можно сравнить с использованием FASTA с применений стандартных или рекомендованных параметров, программы в GCG версии 6.1. FASTA (например, FASTA2 и FASTA3) обеспечивает выравнивание и процентную идентичность последовательностей областей наилучшего перекрытия между поисковыми последовательностями (Pearson (2000) выше). Другим предпочтительным алгоритмом при сравнении последовательности изобретения с базой данных, содержащей большое количество последовательностей от разных организмов, является компьютерная программа BLAST, особенно BLASTP или TBLASTN, с использованием параметров по умолчанию. См., например, Altschul et al. (1990), J. Mol. Biol. 215:403-410 и Altschul et al. (1997), Nucleic Acids Res. 25:3389-402.- 12 040594 to determine sequence homology or sequence identity between closely related polypeptides, such as homologous polypeptides from different species, or between a wild-type protein and its mutein. See, for example, GCG version 6.1. Polypeptide sequences can also be compared using FASTA using the standard or recommended parameters program in GCG version 6.1. FASTA (eg, FASTA2 and FASTA3) provides alignment and percent sequence identity of regions of best overlap between search sequences (Pearson (2000) supra). Another preferred algorithm for comparing a sequence of the invention with a database containing a large number of sequences from different organisms is the BLAST computer program, especially BLASTP or TBLASTN, using default parameters. See, for example, Altschul et al. (1990), J. Mol. Biol. 215:403-410 and Altschul et al. (1997), Nucleic Acids Res. 25:3389-402.

Мутации зародышевой линии.Germline mutations.

Представленные в данном документе анти-CD3 антитела содержат одну или более аминокислотных замен, инсерций и/или делеций в каркасных и/или CDR-областях вариабельных доменов тяжелой цепи по сравнению с соответствующими последовательностями зародышевой линии, из которых были получены антитела.The anti-CD3 antibodies provided herein contain one or more amino acid substitutions, insertions and/or deletions in the framework and/or CDR regions of the heavy chain variable domains compared to the corresponding germline sequences from which the antibodies were derived.

Данное изобретение также включает антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые получены из любой из аминокислотных последовательностей, раскрытых в данном документе, причем одна или более аминокислот в одной или более каркасных и/или CDR-областях является мутированной в соответствующем остатке(ах) последовательности зародышевой линии, из которой было получено антитело, или в соответствующем остатке(ах) другой последовательности зародышевой линии человека или в консервативной аминокислотной замене соответствующего зародышевого остатка(ов) (такие изменения последовательности упоминаются в данном документе в совокупности как зародышевые мутации) и со слабым или отсутствующим детектируемым связыванием с антигеном CD3. Несколько таких иллюстративных антител, которые распознают CD3, описаны в табл. 2 в данном документе.The invention also includes antibodies and antigen-binding fragments thereof that are derived from any of the amino acid sequences disclosed herein, wherein one or more amino acids in one or more framework and/or CDR regions are mutated in the corresponding residue(s) of the germline sequence. from which the antibody was derived, or in the corresponding residue(s) of another human germline sequence, or in a conservative amino acid substitution of the corresponding germline residue(s) (such sequence changes are referred to herein collectively as germline mutations) and with little or no detectable binding to the CD3 antigen. Several such exemplary antibodies that recognize CD3 are described in Table 1. 2 in this document.

Кроме того, антитела по данному изобретению могут содержать любую комбинацию двух или более мутаций зародышевой линии в рамках каркасных и/или CDR-областей, например, где определенные отдельные остатки мутируют в соответствующем остатке определенной последовательности зародышевой линии, в то время как некоторые другие остатки, которые различаются из исходной последовательности зародышевой линии сохраняются или мутируют с соответствующим остатком другой последовательности зародышевой линии. После получения антитела и антигенсвязывающие фрагменты, которые содержат одну или более мутаций зародышевой линии, могут быть испытаны на одно или более желаемых свойств, таких как улучшенная связывающая специфичность, слабая или уменьшенная аффинность связывания, улучшенные или повышенные фармакокинетические свойства, снижение иммуногенности и т.д. Антитела и антигенсвязывающие фрагменты, полученные в этом общем виде, с учетом руководства данного изобретения охватываются в данном изобретении.In addition, the antibodies of this invention may contain any combination of two or more germline mutations within the framework and/or CDR regions, for example, where certain individual residues mutate in the corresponding residue of a particular germline sequence, while some other residues, that differ from the original germline sequence are retained or mutated with the corresponding residue of another germline sequence. Once generated, antibodies and antigen-binding fragments that contain one or more germline mutations can be tested for one or more desired properties such as improved binding specificity, weak or reduced binding affinity, improved or increased pharmacokinetic properties, decreased immunogenicity, etc. . Antibodies and antigen-binding fragments obtained in this general form, subject to the guidance of this invention are covered in this invention.

Данное изобретение также включает анти-CD3 антитела, содержащие варианты любой из аминокислотных последовательностей HCVR, LCVR и/или CDR, описанных в данном документе, имеющих одну или более консервативных замен. Например, данное изобретение включает анти-CD3 антитела, имеющие аминокислотные последовательности HCVR, LCVR и/или CDR, например, с 10 или менее, 8 или менее, 6 или менее, 4 или менее и т.д. консервативными аминокислотными заменами по сравнению с любой из аминокислотных последовательностей HCVR, LCVR и/или CDR, представленных в табл. 2 в данном документе. Антитела и биспецифические антигенсвязывающие молекулы по данному изобретению включают одну или более аминокислотных замен, инсерций и/или делеций в каркасных и/или CDR-областях вариабельных доменов тяжелой и легкой цепей по сравнению с соответствующими последовательностями зародышевой линии, из которых были получены индивидуальные антигенсвязывающие домены, при сохранении или улучшении желаемого обнаруживаемого связывания с антигеном CD3. Консервативная аминокислотная замена представляет собой ту, в которой аминокислотный остаток замещен другим аминокислотным остатком, имеющим боковую цепь (R-группу) с аналогичными химическими свойствами (например, зарядом или гидрофобностью). Как правило, консервативная замена аминокислоты не будет существенно изменять функциональные свойства белка, т.е. аминокислотная замена поддерживает или улучшает желаемую слабую и не обнаруживаемую аффинность связывания в случае анти-CD3-связывающих молекул. Примеры групп аминокислот, имеющих боковые цепи с аналогичными химическими свойствами, включают (1) алифатические боковые цепи: глицин, аланин, валин, лейцин и изолейцин; (2) алифатически-гидроксильные боковые цепи: серин и треонин; (3) амидсодержащие боковые цепи: аспарагин и глутамин; (4) ароматические боковые цепи: фенилаланин, тирозин и триптофан; (5) основные боковые цепи: лизин, аргинин и гистидин; (6) кислотные боковые цепи: аспартат и глутамат и (7) серосодержащие боковые цепи представляют собой цистеин и метионин. Предпочтительными консервативными аминокислотными замещающими группами являются валин-лейцинизолейцин, фенилаланин-тирозин, лизин-аргинин, аланин-валин, глутамат-аспартат и аспарагинглутамин. Альтернативно, консервативная замена представляет собой любое изменение, имеющее положительное значение в матрице логарифмического правдоподобия PAM250, раскрытой в Gonnet et al.The invention also includes anti-CD3 antibodies containing variants of any of the HCVR, LCVR and/or CDR amino acid sequences described herein having one or more conservative substitutions. For example, the invention includes anti-CD3 antibodies having the amino acid sequences of HCVR, LCVR, and/or CDR, e.g., 10 or less, 8 or less, 6 or less, 4 or less, etc. conservative amino acid substitutions compared to any of the amino acid sequences of HCVR, LCVR and/or CDR presented in table. 2 in this document. The antibodies and bispecific antigen-binding molecules of this invention comprise one or more amino acid substitutions, insertions and/or deletions in the framework and/or CDR regions of the heavy and light chain variable domains, as compared to the corresponding germline sequences from which the individual antigen-binding domains were derived, while maintaining or improving the desired detectable binding to the CD3 antigen. A conservative amino acid substitution is one in which an amino acid residue is replaced by another amino acid residue having a side chain (R group) with similar chemical properties (eg, charge or hydrophobicity). As a rule, conservative amino acid substitution will not significantly change the functional properties of the protein, i.e. the amino acid substitution maintains or improves the desired low and undetectable binding affinity for anti-CD3 binding molecules. Examples of groups of amino acids having side chains with similar chemical properties include (1) aliphatic side chains: glycine, alanine, valine, leucine, and isoleucine; (2) aliphatic hydroxyl side chains: serine and threonine; (3) amide-containing side chains: asparagine and glutamine; (4) aromatic side chains: phenylalanine, tyrosine and tryptophan; (5) main side chains: lysine, arginine and histidine; (6) acidic side chains: aspartate and glutamate; and (7) sulfur-containing side chains are cysteine and methionine. Preferred conservative amino acid substituents are valine-leucine isoleucine, phenylalanine-tyrosine, lysine-arginine, alanine-valine, glutamate-aspartate, and asparaginglutamine. Alternatively, a conservative substitution is any change that has a positive value in the PAM250 log-likelihood matrix disclosed in Gonnet et al.

- 13 040594 (1992), Science, 256:1443-1445. Умеренно консервативной заменой является любое изменение, имеющее неотрицательное значение в матрице логарифмического правдоподобия PAM250.- 13 040594 (1992), Science, 256:1443-1445. A moderately conservative replacement is any change that has a non-negative value in the PAM250 log-likelihood matrix.

Данное изобретение также включает антигенсвязывающие молекулы, содержащие антигенсвязывающий домен с HCVR и/или CDR-аминокислотной последовательностью, которая по существу идентична любой из аминокислотных последовательностей HCVR и/или CDR, раскрытых в данном документе, при сохранении или улучшении желаемого слабого сродства к антигену CD3. Термин существенная идентичность или по существу идентичный, когда речь идет об аминокислотной последовательности, означает, что две аминокислотные последовательности при оптимальном выравнивании, таком как программы GAP или BESTFIT с использованием разностных масс по умолчанию, имеют по меньшей мере 95% идентичности последовательности, еще более предпочтительно не менее 98 или 99% идентичности последовательности. Предпочтительно положения остатков, которые не идентичны, отличаются консервативными аминокислотными заменами. В случаях, когда две или более аминокислотные последовательности отличаются друг от друга консервативными заменами, процентная идентичность последовательности или степень сходства могут быть скорректированы вверх, чтобы исправить консервативный характер замещения. Средства для осуществления этой регулировки хорошо известны специалистам в данной области техники. См., например, Pearson (1994), Methods Mol. Biol. 24:307-331.The invention also includes antigen-binding molecules comprising an antigen-binding domain with an HCVR and/or CDR amino acid sequence that is substantially identical to any of the HCVR and/or CDR amino acid sequences disclosed herein, while maintaining or improving the desired low affinity for the CD3 antigen. The term substantial identity, or substantially identical when referring to an amino acid sequence, means that two amino acid sequences when optimally aligned, such as the GAP or BESTFIT programs using the default difference masses, have at least 95% sequence identity, even more preferably at least 98 or 99% sequence identity. Preferably, residue positions that are not identical differ by conservative amino acid substitutions. In cases where two or more amino acid sequences differ from each other by conservative substitutions, the percent sequence identity or degree of similarity may be adjusted upward to correct for the conservative nature of the substitution. Means for effecting this adjustment are well known to those skilled in the art. See, for example, Pearson (1994), Methods Mol. Biol. 24:307-331.

Сходство последовательностей для полипептидов, которое также упоминается как идентичность последовательности, обычно измеряется с использованием программного обеспечения для анализа последовательности. Программное обеспечение для анализа белка соответствует аналогичным последовательностям, используя меры сходства, назначенные для различных замещений, делеций и других модификаций, включая консервативные аминокислотные замены. Например, программное обеспечение GCG включает такие программы, как Gap и Bestfit, которые могут использоваться с параметрами по умолчанию для определения гомологии последовательности или идентичности последовательностей между близкими родственными полипептидами, такими как гомологичные полипептиды от разных видов организмов или между белком дикого типа и его мутеином. См., например, GCG версии 6.1. Полипептидные последовательности также можно сравнить с использованием FASTA с применением стандартных или рекомендованных параметров, программы в GCG версии 6.1. FASTA (например, FASTA2 и FASTA3) обеспечивает выравнивание и процентную идентичность последовательностей областей наилучшего перекрытия между поисковыми последовательностями (Pearson (2000) выше). Другим предпочтительным алгоритмом при сравнении последовательности изобретения с базой данных, содержащей большое количество последовательностей от разных организмов, является компьютерная программа BLAST, особенно BLASTP или TBLASTN, с использованием параметров по умолчанию. См., например, Altschul et al. (1990), J. Mol. Biol. 215:403-410 и Altschul et al. (1997), Nucleic Acids Res. 25:3389-402.Sequence similarity for polypeptides, also referred to as sequence identity, is commonly measured using sequence analysis software. Protein analysis software matches similar sequences using similarity measures assigned to various substitutions, deletions, and other modifications, including conservative amino acid substitutions. For example, the GCG software includes programs such as Gap and Bestfit that can be used with default parameters to determine sequence homology or sequence identity between closely related polypeptides, such as homologous polypeptides from different species, or between a wild-type protein and its mutein. See, for example, GCG version 6.1. Polypeptide sequences can also be compared using FASTA using standard or recommended parameters, the program in GCG version 6.1. FASTA (eg, FASTA2 and FASTA3) provides alignment and percent sequence identity of regions of best overlap between search sequences (Pearson (2000) supra). Another preferred algorithm for comparing a sequence of the invention with a database containing a large number of sequences from different organisms is the BLAST computer program, especially BLASTP or TBLASTN, using default parameters. See, for example, Altschul et al. (1990), J. Mol. Biol. 215:403-410 and Altschul et al. (1997), Nucleic Acids Res. 25:3389-402.

После получения антигенсвязывающие домены, которые содержат одну или более мутаций зародышевой линии, испытывали на снижение аффинности связывания с использованием одного или более анализов in vitro. Хотя антитела, которые распознают конкретный антиген, обычно скринируют путем тестирования на высокую (т.е. сильную) аффинность связывания с антигеном, антитела по данному изобретению проявляют слабое связывание или отсутствие обнаружимого связывания. Биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие один или более антигенсвязывающих доменов, полученных в этом общем способе, также охватываются в рамках данного изобретения и, как было установлено, являются предпочтительными, как терапия опухолей, вызванная авидностью.Once generated, antigen binding domains that contain one or more germline mutations were tested for decreased binding affinity using one or more in vitro assays. Although antibodies that recognize a particular antigen are usually screened for by testing for high (ie, strong) binding affinity for the antigen, the antibodies of this invention show little or no detectable binding. Bispecific antigen-binding molecules containing one or more antigen-binding domains obtained in this general method are also within the scope of this invention and have been found to be preferred as avidity-induced tumor therapy.

Неожиданные преимущества, например улучшенные фармакокинетические свойства и низкая токсичность для пациента, могут быть реализованы из описанных в данном документе способов.Unexpected benefits, such as improved pharmacokinetic properties and low toxicity to the patient, can be realized from the methods described herein.

Связывающие свойства антител.Binding properties of antibodies.

Используемый в данном документе термин связывание в контексте связывания антитела, иммуноглобулина, связывающего фрагмента антитела или Fc-содержащего белка с любым, например с заданным, антигеном, таким как белок клеточной поверхности или его фрагмент, обычно относится к взаимодействию или ассоциации минимум между двумя объектами или молекулярными структурами, такими как взаимодействие антитело-антиген.As used herein, the term binding in the context of the binding of an antibody, immunoglobulin, antibody-binding fragment, or Fc-containing protein to any, for example, a given, antigen, such as a cell surface protein or fragment thereof, generally refers to an interaction or association between at least two entities or molecular structures such as antibody-antigen interaction.

Например, аффинность связывания обычно соответствует значению KD около 10-7 М или менее, например, около 10-8 М или менее, например, около 10-9 М или менее, когда определяется, например, поверхностным плазмонным резонансом (SPR) на приборе Biacore 3000 с использованием антигена в качестве лиганда и антитела, Ig, связывающего антитело фрагмента или Fc-содержащего белка в качестве аналита (или антилиганда). Также широко используются стратегии связывания на основе клеток, такие как анализы связывания с помощью проточной цитометрии (FACS), и данные FACS хорошо коррелируют с другими методами, такими как связывание с радиолигандами и SPR (Benedict, C.A., J. Immunol. Methods. 1997, 201(2):223-31; Geuijen, C.A., et al. J. Immunol. Methods. 2005, 302(1-2):68-77).For example, the binding affinity typically corresponds to a K D value of about 10 -7 M or less, for example, about 10 -8 M or less, for example, about 10 -9 M or less, when determined, for example, by surface plasmon resonance (SPR) on an instrument. Biacore 3000 using antigen as ligand and antibody, Ig, antibody-binding fragment, or Fc-containing protein as analyte (or anti-ligand). Cell-based binding strategies such as flow cytometry (FACS) binding assays are also widely used, and FACS data correlate well with other methods such as radioligand binding and SPR (Benedict, CA, J. Immunol. Methods. 1997, 201(2):223-31; Geuijen, CA, et al J. Immunol Methods 2005, 302(1-2):68-77).

Соответственно, антитело или антигенсвязывающий белок по изобретению могут связываться с предопределенным антигеном или молекулой поверхности клетки (рецептором, таким как CD3), имеющим сродство, соответствующее значению KD, которое по меньшей мере в 10 раз ниже его аффинности связывания с неспецифическим антигеном (например, БСА, казеин). В соответствии с данным изобретением, если аффинность антитела, соответствующая значению KD, равна или менее чем в 10 раз ниже, чемAccordingly, an antibody or antigen-binding protein of the invention can bind to a predetermined antigen or cell surface molecule (a receptor such as CD3) having an affinity corresponding to a K D value that is at least 10 times lower than its binding affinity for a non-specific antigen (e.g., BSA, casein). In accordance with this invention, if the affinity of the antibody corresponding to the K D value is equal to or less than 10 times lower than

- 14 040594 неспецифический антиген, это можно рассматривать как не подлежащее определению связывание, однако такое антитело может быть спаренным со вторым антигенсвязывающим плечом для получения биспецифического антитела по изобретению.- 14 040594 non-specific antigen, this can be considered as non-detectable binding, however, such an antibody can be paired with a second antigen-binding arm to obtain a bispecific antibody of the invention.

Термин KD (M) относится к константе равновесия диссоциации конкретного взаимодействия антитело-антиген или константе равновесия диссоциации антитела или фрагмента связывающего антитело, связывающегося с антигеном. Существует обратная связь между KD и аффинностью связывания, поэтому чем меньше значение KD, тем выше, т.е. сильнее, сродство. Таким образом, термины более высокая аффинность или более сильная аффинность относятся к более высокой способности образовывать взаимодействие и, следовательно, к меньшему значению KD, и, наоборот, термины низкая аффинность или более слабая аффинность относятся к более низкой способности образовывать взаимодействие и, следовательно, большему значению KD. В некоторых случаях более высокая аффинность связывания (или KD) конкретной молекулы (например, антитела) к ее интерактивной молекуле партнеру (например, антиген X) по сравнению с аффинностью связывания молекулы (например, антителом) с другой интерактивной молекулой партнером (например, антиген Y) можно выразить как коэффициент связывания, определяемый делением большего значения KD (более низкой или более слабой аффинности) на меньший KD (более высокую или более сильную аффинность), например, выраженное как 5-кратное или 10-кратное большее связывание в зависимости от обстоятельств. Например, низкая аффинность относится к менее сильному связыванию. В некоторых вариантах осуществления низкая аффинность связывания соответствует большей чем около 1 нМ KD, большей чем около 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или большей чем около 40 нМ KD, причем такие KD аффинности связывания измеряются в анализе in vitro связывания на основе плазмонного резонанса или в анализе чувствительности к биомолекулярному взаимодействию. В некоторых вариантах осуществления низкая аффинность связывания соответствует более чем около 10 нМ EC50, более чем около 15 нМ EC50, 20 нМ EC50, более чем около 25 нМ EC50, 30 нМ EC50, более чем около 35 нМ EC50 или более чем около 40 нМ EC50, причем такое значение аффинности связывания EC50 измеряется в in vitro FACS анализе связывания или эквивалентном анализе связывания на основе клеток. Слабая аффинность относится к слабому связывающему взаимодействию. В некоторых вариантах осуществления слабая аффинность связывания соответствует более чем около 100 нМ KD или EC50, более чем около 200, 300 или более чем около 500 нМ KD или EC50, причем такое значение аффинности связывания KD измеряется в in vitro анализе на основе поверхностного плазмонного резонансного связывания или эквивалентном анализе чувствительности к биомолекулярному взаимодействию, и такое значение аффинности связывания с EC50 измеряют в FACS анализе связывания in vitro или в эквивалентном анализе обнаружения взаимодействия на основе клеток для обнаружения моновалентного связывания. Недетектируемое связывание означает, что аффинность между двумя биомолекулами, например особенно между связывающим плечом моновалентного антитела и его целевым антигеном, превышает пределы обнаружения используемого анализа.The term K D (M) refers to the dissociation equilibrium constant of a particular antibody-antigen interaction or the dissociation equilibrium constant of an antibody or antibody-binding fragment that binds to an antigen. There is an inverse relationship between K D and binding affinity, so the smaller the value of K D , the higher, i.e. stronger, affinity. Thus, the terms higher affinity or stronger affinity refer to a higher ability to form an interaction and therefore a lower K D value, and conversely, the terms low affinity or weaker affinity refer to a lower ability to form an interaction and therefore larger value of K D . In some cases, the higher binding affinity (or K D ) of a particular molecule (for example, an antibody) for its interactive partner molecule (for example, antigen X) compared to the binding affinity of the molecule (for example, antibody) for another interactive partner molecule (for example, antigen Y) can be expressed as a binding ratio, determined by dividing the larger K D value (lower or weaker affinity) by the smaller K D (higher or stronger affinity), for example, expressed as 5-fold or 10-fold greater binding depending on from circumstances. For example, low affinity refers to less strong binding. In some embodiments, low binding affinity corresponds to greater than about 1 nM K D greater than about 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 , 18, 19, 20, 25, 30, 35, or greater than about 40 nM K D , such K D binding affinities being measured in an in vitro plasmon resonance binding assay or a biomolecular interaction sensitivity assay. In some embodiments, low binding affinity corresponds to greater than about 10 nM EC 50 , greater than about 15 nM EC 50 , 20 nM EC 50 , greater than about 25 nM EC 50 , 30 nM EC 50 , greater than about 35 nM EC 50 , or greater than about 40 nM EC 50 , such EC 50 binding affinity value being measured in an in vitro FACS binding assay or equivalent cell-based binding assay. Weak affinity refers to a weak binding interaction. In some embodiments, weak binding affinity corresponds to greater than about 100 nM K D or EC 50 , greater than about 200, 300, or greater than about 500 nM K D or EC 50 , such K D binding affinity value being measured in an in vitro assay for based on surface plasmon resonance binding or an equivalent biomolecular interaction sensitivity assay, and such an EC 50 binding affinity value is measured in an in vitro FACS binding assay or an equivalent cell-based interaction detection assay to detect monovalent binding. Undetectable binding means that the affinity between two biomolecules, for example especially between the binding arm of a monovalent antibody and its target antigen, exceeds the limits of detection of the assay used.

Термин kd (с-1 или 1/s) относится к константе скорости диссоциации конкретного взаимодействия антитело-антиген или константе скорости диссоциации антитела или фрагмента связывающего антитела. Указанное значение также упоминается как значение kf.The term kd (c -1 or 1/s) refers to the dissociation rate constant of a particular antibody-antigen interaction or the dissociation rate constant of an antibody or binding antibody fragment. This value is also referred to as the kf value.

Термин ka (M’1xc’1 или 1/M) относится к константе скорости ассоциации конкретного взаимодействия антитело-антиген или константе скорости ассоциации антитела или фрагмента связывающего антитела.The term ka (M' 1 xc' 1 or 1/M) refers to the association rate constant of a particular antibody-antigen interaction or the association rate constant of an antibody or binding antibody fragment.

Термин ka (M-1 или 1/M) относится к равновесной константе ассоциации конкретного взаимодействия антитело-антиген или равновесной константе ассоциации антитела или фрагмента связывающего антитела. Константа равновесия ассоциации получается путем деления ka на kd.The term ka (M -1 or 1/M) refers to the equilibrium association constant of a particular antibody-antigen interaction or the equilibrium association constant of an antibody or binding antibody fragment. The association equilibrium constant is obtained by dividing k a by k d .

Термин EC50 относится к половине максимальной эффективной концентрации, которая включает концентрацию антитела, которая вызывает ответ на полпути между базовой линией и максимумом после определенного времени воздействия. EC50 по существу представляет концентрацию антитела, при которой наблюдается 50% его максимального эффекта. В некоторых вариантах осуществления значение EC50 равно концентрации антитела по изобретению, которая обеспечивает полумаксимальное связывание с клетками, экспрессирующими CD3 или ассоциированный с опухолью антиген, как определено, например, в FACS анализе связывания.The term EC 50 refers to half the maximum effective concentration, which includes the concentration of an antibody that elicits a response halfway between baseline and maximum after a certain exposure time. EC 50 essentially represents the concentration of an antibody at which 50% of its maximum effect is observed. In some embodiments, the EC 50 value is equal to the concentration of an antibody of the invention that provides half-maximal binding to cells expressing CD3 or tumor associated antigen, as determined, for example, in a FACS binding assay.

Таким образом, сниженное или более слабое связывание наблюдается с увеличенным значением EC50 или половинной максимальной эффективной концентрационной величиной, так что 500 нМ EC50 указывает на более слабую аффинность связывания, чем 50 нМ EC50.Thus, reduced or weaker binding is observed with an increased EC 50 value or half the maximum effective concentration value, such that 500 nM EC 50 indicates weaker binding affinity than 50 nM EC 50 .

В одном варианте осуществления снижение связывания может быть определено как повышенная концентрация EC50 антитела, которая позволяет связываться с полумаксимальным количеством клетокмишеней.In one embodiment, the decrease in binding can be defined as an increased concentration of EC 50 antibodies, which allows you to contact half the maximum number of target cells.

В других экспериментальных измерениях значение EC50 представляет собой концентрацию антитела по изобретению, которая вызывает полумаксимальное истощение клеток-мишеней посредством цитотоксической активности T-клеток. Таким образом, повышенная цитотоксическая активность (например, лизис опухолевых клеток, опосредуемый T-клетками) наблюдается с уменьшением значения EC50 или половиной максимальной эффективной концентрации.In other experimental measurements, the EC 50 value is the concentration of an antibody of the invention that causes half-maximal depletion of target cells via T cell cytotoxic activity. Thus, increased cytotoxic activity (eg, tumor cell lysis mediated by T cells) is observed with a decrease in the EC 50 value or half of the maximum effective concentration.

- 15 040594- 15 040594

Биспецифические антигенсвязывающие молекулы.Bispecific antigen-binding molecules.

Антитела по данному изобретению могут быть биспецифическими или мультиспецифическими. Мультиспецифические антитела могут быть специфическими для одной эффекторной молекулы, такой как CD3, в комбинации с различными эпитопами одного полипептида-мишени или могут содержать антигенсвязывающие домены, специфичные для более чем одного целевого полипептида. См., например, Tutt et al., 1991, J. Immunol. 147:60-69; Kufer et al., 2004, Trends Biotechnol. 22:238-244. Ahtu-CD3 антитела по данному изобретению могут быть связаны или ко-экспрессированы с другой функциональной молекулой, например, с другим пептидом или белком. Например, антитело или его фрагмент могут быть функционально связаны (например, посредством химической связи, генетического синтеза, нековалентной ассоциации или иным образом) с одним или более другим молекулярным объектом, такими как другое антитело или фрагмент антитела для получения биспецифического или мультиспецифического антитела со второй связывающей специфичностью.The antibodies of this invention may be bispecific or multispecific. Multispecific antibodies may be specific for a single effector molecule, such as CD3, in combination with different epitopes of the same target polypeptide, or may contain antigen-binding domains specific for more than one target polypeptide. See, for example, Tutt et al., 1991, J. Immunol. 147:60-69; Kufer et al., 2004, Trends Biotechnol. 22:238-244. The Ahtu-CD3 antibodies of this invention may be linked to or co-expressed with another functional molecule, such as another peptide or protein. For example, an antibody or antibody fragment may be operably linked (e.g., by chemical bonding, genetic synthesis, non-covalent association, or otherwise) to one or more other molecular entities, such as another antibody or antibody fragment, to produce a bispecific or multispecific antibody with a second binding specificity.

Используемое в данном документе выражение анти-CD3 антитело предназначено для включения как моноспецифических анти-CD3 антител, так и биспецифических антител, содержащих CD3-связывающее плечо и второе плечо, которое связывает целевой антиген. Таким образом, данное изобретение включает биспецифические антитела, в которых одно плечо иммуноглобулина связывается с CD3 человека, а другое плечо иммуноглобулина является специфичным для целевого антигена. Целевым антигеном, который связывается с другим плечом биспецифического анти-CD3 антитела, может быть любой антиген, экспрессируемый на или вблизи клетки, ткани, органа, микроорганизма или вируса, против которого требуется целевой иммунный ответ. CD3-связывающее плечо может содержать любую из аминокислотных последовательностей HCVR или CDR, указанных в табл. 2 в данном документе. В некоторых вариантах осуществления CD3-связывающее плечо слабо связывается с CD3 человека и индуцирует активацию T-клеток человека. В других вариантах осуществления CD3-связывающее плечо слабо связывается с CD3 человека и индуцирует опухолеассоциированный антиген-экспрессирующий клеточный лизис в контексте биспецифического или мультиспецифического антитела. В других вариантах осуществления CD3-связывающее плечо связывается или ассоциируется слабо с CD3 человека и яванского макака (обезьяна), но взаимодействие связывания не обнаруживается с помощью анализов in vitro, известных в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления изобретения CD3-связывающее плечо не связывает или ассоциируется с CD3 человека и яванского макака (обезьяна), но биспецифическая молекула все еще вызывает опухолеассоциированный лизис клеток.As used herein, the term anti-CD3 antibody is intended to include both monospecific anti-CD3 antibodies and bispecific antibodies comprising a CD3-binding arm and a second arm that binds the target antigen. Thus, the invention includes bispecific antibodies in which one arm of the immunoglobulin binds to human CD3 and the other arm of the immunoglobulin is specific for the target antigen. The target antigen that binds to the other arm of the bispecific anti-CD3 antibody can be any antigen expressed on or near a cell, tissue, organ, microorganism, or virus against which a targeted immune response is desired. The CD3 binding arm may contain any of the HCVR or CDR amino acid sequences listed in Table 1. 2 in this document. In some embodiments, the CD3 binding arm binds weakly to human CD3 and induces the activation of human T cells. In other embodiments, the CD3-binding arm binds weakly to human CD3 and induces tumor-associated antigen-expressing cell lysis in the context of a bispecific or multispecific antibody. In other embodiments, the CD3 binding arm binds or associates weakly with human and cynomolgus monkey (monkey) CD3, but no binding interaction is detected using in vitro assays known in the art. In some embodiments, the CD3-binding arm does not bind or associate with human and cynomolgus monkey (monkey) CD3, but the bispecific molecule still causes tumor-associated cell lysis.

В контексте биспецифических антител по данном изобретению, в которых одно плечо антитела связывает CD3, а другое плечо связывает целевой антиген, целевой антиген может представлять собой опухолеассоциированный антиген (TAA). Неограничивающие примеры специфических опухолеассоциированных антигенов включают, например, AFP, ALK, белки BAGE, BIRC5 (сурвивин), BIRC7, β-катенин, brc-abl, BRCA1, BORIS, CA9, карбоангидразу IX, каспазу-8, CALR, CCR5, CD19, CD20 (MS4A1), CD22, CD30, CD40, CDK4, CEA, CTLA4, циклин-В1, CYP1B1, EGFR, EGFRvIII, ErbB2/Her2, ErbB3, ErbB4, ETV6-AML, EpCAM, EphA2, Fra-1, FOLR1, белки GAGE (например, GAGE-1, -2), GD2, GD3, GloboH, глипикан-3, GM3, gp100, Her2, HLA/B-raf HLA/k-ras, HLA/MAGE-A3, hTERT, LMP2, белки MAGE (например, MAGE-1, -2, -3, -4, -6 и -12), MART-1, мезотелин, ML-IAP, Muc1, Muc2, Muc3, Muc4, Muc5, Muc16 (CA-125), MUM1, NA17, NY-BR1, NY-BR62, NY-BR85, NY-ESO1, OX40, p15, p53, PAP, PAX3, PAX5, PCTA-1, PLAC1, PRLR, PRAME, PSMA (FOLH1), белки RAGE, Ras, RGS5, Rho, SART-1, SART-3, STEAP1, STEAP2, TAG-72, TGF-β, TMPRSS2, антиген Thompson-nouvelle (Tn), TRP-1, TRP-2, тирозиназу и уроплакин-3.In the context of the bispecific antibodies of the invention, in which one arm of the antibody binds CD3 and the other arm binds the target antigen, the target antigen may be a tumor associated antigen (TAA). Non-limiting examples of specific tumor associated antigens include, for example, AFP, ALK, BAGE proteins, BIRC5 (survivin), BIRC7, β-catenin, brc-abl, BRCA1, BORIS, CA9, carbonic anhydrase IX, caspase-8, CALR, CCR5, CD19, CD20 (MS4A1), CD22, CD30, CD40, CDK4, CEA, CTLA4, cyclin B1, CYP1B1, EGFR, EGFRvIII, ErbB2/Her2, ErbB3, ErbB4, ETV6-AML, EpCAM, EphA2, Fra-1, FOLR1, proteins GAGE (eg, GAGE-1, -2), GD2, GD3, GloboH, glypican-3, GM3, gp100, Her2, HLA/B-raf HLA/k-ras, HLA/MAGE-A3, hTERT, LMP2, proteins MAGE (eg, MAGE-1, -2, -3, -4, -6 and -12), MART-1, mesothelin, ML-IAP, Muc1, Muc2, Muc3, Muc4, Muc5, Muc16 (CA-125) , MUM1, NA17, NY-BR1, NY-BR62, NY-BR85, NY-ESO1, OX40, p15, p53, PAP, PAX3, PAX5, PCTA-1, PLAC1, PRLR, PRAME, PSMA (FOLH1), RAGE proteins , Ras, RGS5, Rho, SART-1, SART-3, STEAP1, STEAP2, TAG-72, TGF-β, TMPRSS2, Thompson-nouvelle antigen (Tn), TRP-1, TRP-2, tyrosinase and uroplakin-3 .

Изобретатели предполагают, что данное изобретение включает многочисленные примеры биспецифических антител, имеющих слабое анти-CD3-связывающее плечо, изготовленных в соответствии с изобретением.The inventors contemplate that the invention includes numerous examples of bispecific antibodies having a weak anti-CD3 binding arm made in accordance with the invention.

Согласно некоторым иллюстративным вариантам осуществления данное изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые специфически связывают CD3 и PSMA. Такие молекулы могут упоминаться в данном документе, как, например, анти-CD3/анти-PSMA, или анtu-CD3xPSMA, или CD3xPSMA биспецифические молекулы и т.д. Используемый в данном документе термин PSMA относится к белку PSMA человека, если не указано, что он относится к видам, отличным от человека (например, PSMA мыши, PSMA обезьяны и т.д.).In some exemplary embodiments, the invention includes bispecific antigen-binding molecules that specifically bind CD3 and PSMA. Such molecules may be referred to herein as, for example, anti-CD3/anti-PSMA or antu-CD3xPSMA or CD3xPSMA bispecific molecules, etc. As used herein, the term PSMA refers to the human PSMA protein unless indicated to refer to a non-human species (eg, mouse PSMA, monkey PSMA, etc.).

Термин PSMA относится к простат-специфическому мембранному антигену, также известному как фолатная гидролаза 1 (FOLH1) (UniProtKB/Swiss-Prot. No. Q04609; SEQ ID NO: 171). PSMA представляет собой интегральный, не шеддируемый (non-shedd) мембранный гликопротеин, который высокоэкспрессирован в эпителиальных клетках предстательной железы и является маркером клеточной поверхности для рака предстательной железы.The term PSMA refers to the prostate-specific membrane antigen, also known as folate hydrolase 1 (FOLH1) (UniProtKB/Swiss-Prot. No. Q04609; SEQ ID NO: 171). PSMA is an integral, non-shedd membrane glycoprotein that is highly expressed in prostate epithelial cells and is a cell surface marker for prostate cancer.

Согласно другим иллюстративным вариантам осуществления данное изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые специфически связывают CD3 и EGFRvIII. Такие молекулы могут упоминаться в данном документе, как, например, анти-CD3/анти-EGFRvШ, или антиCD3xEGFRvIII, или CD3xEGFRvIII биспецифические молекулы и т.д. Термин EGFRvIII относится кIn other exemplary embodiments, the invention includes bispecific antigen-binding molecules that specifically bind CD3 and EGFRvIII. Such molecules may be referred to herein as, for example, anti-CD3/anti-EGFRvIII or anti-CD3xEGFRvIII or CD3xEGFRvIII bispecific molecules, etc. The term EGFRvIII refers to

- 16 040594 белку EGFRvIII человека, если не указано, что он относится к видам, отличным от человека (например,- 16 040594 human EGFRvIII protein, unless stated to be of a non-human species (e.g.,

EGFRvIII мыши, EGFRvIII обезьяны и т.д.).mouse EGFRvIII, monkey EGFRvIII, etc.).

Термин EGFRvIII относится к варианту III класса рецептора эпидермального фактора роста (EGFRvIII, SEQ ID NO: 172), который является наиболее часто встречающимся вариантом EGFR в глиобластоме (Bigner et al., 1990, Cancer Res. 50:8017-8022; Humphrey et al., 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87:4207-4211; Yamazaki et al., 1990, Jap. J. Cancer Res. 81:773-779; Ekstrand et al., 1992, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4309-4313; Wikstrand et al., 1995, Cancer Res. 55:3140-3148 и Frederick et al., 2000, Cancer Res. 60:1383-1387). EGFRvIII характеризуется делецией экзонов 2-7 гена EGFR, что приводит к делеции внутри рамки считывания 801 пары оснований кодирующей области, т.е. делеции 6-273 аминокислотных остатков (в зависимости от количества вычетов зрелых EGFR, см. UniProtKB/Swiss-Prot. No. P00533), а также генерации нового глицина на стыке слияния (Humphrey et al., 1988, Cancer Res. 48:2231-2238; Yamazaki et al., 1990, выше). Было показано, что EGFRvIII обладает лиганд-независимой, слабой, но конститутивно активной киназной активностью, а также повышенной онкогенностью (Nishikawa et al., 1994, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91:7727-7731 и Batra et al., 1995, Cell Growth and Differentiation, 6:1251-1259). В дополнение к глиомам EGFRvIII был обнаружен при проточной и внутрикожной карциноме молочной железы (Wikstrand et al., 1995, Cancer Res. 55:3140-3148), немелкоклеточных карциномах легкого (Garcia de Palazzo et al., 1993, Cancer Res. 53:3217-3220), карциномах яичника (Moscatello et al., 1995, Cancer Res. 55:5536-5539), раке простаты (Olapade-Olaopa et al., 2000, British J. Cancer, 82:186-194) и плоскоклеточной карциноме головы и шеи (Tinhofer et al., 2011, Clin. Cancer Res. 17(15):5197-5204).The term EGFRvIII refers to a class III variant of the epidermal growth factor receptor (EGFRvIII, SEQ ID NO: 172), which is the most frequently occurring EGFR variant in glioblastoma (Bigner et al., 1990, Cancer Res. 50:8017-8022; Humphrey et al ., 1990, Proc Natl Acad Sci USA 87:4207-4211 Yamazaki et al. 1990 Jap J Cancer Res 81:773-779 Ekstrand et al 1992 Proc Natl Acad. Sci. USA, 89:4309-4313; Wikstrand et al., 1995, Cancer Res. 55:3140-3148 and Frederick et al., 2000, Cancer Res. 60:1383-1387). EGFRvIII is characterized by a deletion of exons 2-7 of the EGFR gene, resulting in a deletion within the 801 base pair reading frame of the coding region, i. deletion of 6-273 amino acid residues (depending on the number of mature EGFR subtractions, see UniProtKB/Swiss-Prot. No. P00533), as well as the generation of new glycine at the fusion junction (Humphrey et al., 1988, Cancer Res. 48:2231 -2238; Yamazaki et al., 1990, supra). EGFRvIII has been shown to have ligand-independent, weak but constitutively active kinase activity, as well as increased carcinogenicity (Nishikawa et al., 1994, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91:7727-7731 and Batra et al. , 1995, Cell Growth and Differentiation, 6:1251-1259). In addition to gliomas, EGFRvIII has been found in ductal and intradermal breast carcinomas (Wikstrand et al., 1995, Cancer Res. 55:3140-3148), non-small cell lung carcinomas (Garcia de Palazzo et al., 1993, Cancer Res. 53: 3217-3220), ovarian carcinomas (Moscatello et al., 1995, Cancer Res. 55:5536-5539), prostate cancer (Olapade-Olaopa et al., 2000, British J. Cancer, 82:186-194) and squamous head and neck carcinoma (Tinhofer et al., 2011, Clin. Cancer Res. 17(15):5197-5204).

Согласно еще одним иллюстративным вариантам осуществления данное изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые специфически связывают CD3 и MUC16. Такие молекулы могут упоминаться в данном документе, как, например, анти-CD3/анти-MUC16, или анти-CD3xMUC16, или CD3xMUC16 биспецифические молекулы и т.д. Термин MUC16 относится к белку MUC16 человека, если не указано, что он относится к видам, отличным от человека (например, MUC16 мыши, MUC16 обезьяны и т.д.).In still other exemplary embodiments, the invention includes bispecific antigen-binding molecules that specifically bind CD3 and MUC16. Such molecules may be referred to herein as, for example, anti-CD3/anti-MUC16 or anti-CD3xMUC16 or CD3xMUC16 bispecific molecules, etc. The term MUC16 refers to the human MUC16 protein unless indicated to be of a non-human species (eg, mouse MUC16, monkey MUC16, etc.).

Муцин 16 (MUC16; Справочная последовательность NCBI: NP_078966.2, SEQ ID NO: 173), иначе известный как раковый антиген 125 (CA-125), представляет собой муцин, кодируемый геном MUC16 у людей. Известно, что семейство белков муцина защищает организм от инфекции путем связывания патогена с олигосахаридами во внеклеточном домене, предотвращая образование патогенной формы на поверхности клетки. В течение многих лет сверхэкспрессия MUC16/CA125 использовалась в качестве прогностического и диагностического маркера рака яичника (Yin and Lloyd, 2001, J. Biol. Chem. 276(29), 27371-27375; O'Brien, T.J., et al., 2001, Tumour Biol. 22(6), 348-366; Leggieri, C. et al., 2014, Eur. J. Gynaecol. Oncol. 35 (4), 438-441). Было показано, что MUC16 защищает опухолевые клетки от иммунной системы с его сильно гликозилированным тандемным повторным доменом, который может связываться с галектином-1 (иммунодепрессивным белком) (Seelenmeyer, C., et al., 2003, J. Cell. Sci. 116 (Pt 7):130518; O'Brien, T.J., et al., 2002, Tumour Biol. 23(3), 154-169). Природные киллерные клетки и моноциты не способны атаковать опухолевые клетки, экспрессирующие высокие уровни MUC16. В своей нормальной физиологической роли взаимодействие MUC16-галактин служит барьером для бактериальной и вирусной инфекции, однако считается, что MUC16 является иммунопротекторным в контексте опухолевых клеток, тем самым предотвращая цитолиз раковых клеток (Felder, M. et al., 2014, Molecular Cancer, 13:129). Таким образом, MUC16 является желательной мишенью для иммунотерапевтических биспецифических молекул антител, вводимых для лечения рака яичника путем активации иммунных эффекторных клеток.Mucin 16 (MUC16; NCBI Reference Sequence: NP_078966.2, SEQ ID NO: 173), otherwise known as cancer antigen 125 (CA-125), is a mucin encoded by the MUC16 gene in humans. The mucin family of proteins is known to protect the body from infection by binding the pathogen to oligosaccharides in the extracellular domain, preventing the formation of the pathogenic form on the cell surface. For many years, MUC16/CA125 overexpression has been used as a prognostic and diagnostic marker for ovarian cancer (Yin and Lloyd, 2001, J. Biol. Chem. 276(29), 27371-27375; O'Brien, T.J., et al., 2001 , Tumor Biol 22(6), 348-366; Leggieri, C. et al., 2014, Eur J. Gynaecol Oncol 35(4), 438-441). MUC16 has been shown to protect tumor cells from the immune system with its highly glycosylated tandem repeat domain that can bind to galectin-1 (an immunosuppressive protein) (Seelenmeyer, C., et al., 2003, J. Cell. Sci. 116 ( Pt 7): 130518 O'Brien, T. J., et al., 2002, Tumor Biol 23(3), 154-169. Natural killer cells and monocytes are unable to attack tumor cells expressing high levels of MUC16. In its normal physiological role, the MUC16-galactin interaction serves as a barrier to bacterial and viral infection, however, MUC16 is believed to be immunoprotective in the context of tumor cells, thereby preventing cytolysis of cancer cells (Felder, M. et al., 2014, Molecular Cancer, 13 :129). Thus, MUC16 is a desirable target for immunotherapeutic bispecific antibody molecules administered to treat ovarian cancer by activating immune effector cells.

Согласно еще одним иллюстративным вариантам осуществления данное изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые специфически связывают CD3 и STEAP2. Такие молекулы могут упоминаться в данном документе, как, например, анти-CD3/анти-STEAP2, или анти-CD3xSTEAP2, или CD3xSTEAP2 биспецифические молекулы и т.д. Термин STEAP2 относится к белку STEAP2 человека, если не указано, что он относится к видам, отличным от человека (например, STEAP2 мыши, STEAP2 обезьяны и т.д.). Шестой трансмембранный эпителиальный антиген предстательной железы 2 (STEAP2; UniProtKB/Swiss-Prot: Q8NFT2.3) представляет собой 490-аминокислотный белок, кодируемый геном STEAP2, расположенный в хромосомной области 7q21 у людей.In still other exemplary embodiments, the invention includes bispecific antigen-binding molecules that specifically bind CD3 and STEAP2. Such molecules may be referred to herein as, for example, anti-CD3/anti-STEAP2 or anti-CD3xSTEAP2 or CD3xSTEAP2 bispecific molecules, etc. The term STEAP2 refers to the human STEAP2 protein unless stated to be in a non-human species (eg, mouse STEAP2, monkey STEAP2, etc.). Sixth transmembrane epithelial prostate antigen 2 (STEAP2; UniProtKB/Swiss-Prot: Q8NFT2.3) is a 490-amino acid protein encoded by the STEAP2 gene, located in the chromosomal region 7q21 in humans.

Вышеупомянутые биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые специфически связывают опухолеассоциированный антиген, содержат анти-CD3-антигенсвязывающую молекулу, которая связывается с CD3 со слабой или недетектируемой аффинностью связывания, такой как проявление KD более чем около 100, 300 или 500 нМ, как измерено с помощью in vitro анализа связывания аффинности.The aforementioned bispecific antigen-binding molecules that specifically bind a tumor-associated antigen comprise an anti-CD3 antigen-binding molecule that binds to CD3 with weak or undetectable binding affinity, such as exhibiting a K D of greater than about 100, 300, or 500 nM, as measured by in vitro binding affinity assay.

Используемый в данном документе термин антигенсвязывающая молекула означает белок, полипептид или молекулярный комплекс, содержащий или состоящий по меньшей мере из одной определяющей комплементарность области (CDR), которая одна или в сочетании с одной или более дополнительными CDR и/или каркасными областями (FR) специфически связывается с определенным антигеном. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающая молекула представляет собой антитело илиAs used herein, the term antigen-binding molecule means a protein, polypeptide, or molecular complex containing or consisting of at least one complementarity-determining region (CDR) that alone or in combination with one or more additional CDRs and/or framework regions (FRs) specifically binds to a specific antigen. In some embodiments, the antigen binding molecule is an antibody or

- 17 040594 фрагмент антитела в том виде, в котором данные термины определены в тексте данного документа.- 17 040594 antibody fragment as these terms are defined in the text of this document.

Используемый в данном документе термин биспецифическая антигенсвязывающая молекула означает белок, полипептид или молекулярный комплекс, содержащий по меньшей мере первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен. Каждый антигенсвязывающий домен в биспецифической антигенсвязывающей молекуле содержит по меньшей мере одну CDR, которая сама по себе или в сочетании с одной или более дополнительными CDR и/или FR специфически связывается с определенным антигеном. В контексте данного изобретения первый антигенсвязывающий домен специфически связывает первый антиген (например, CD3), а второй антигенсвязывающий домен специфически связывает второй, отличный антиген (например, PSMA, MUC16, EGFRvIII или STEAP2).As used herein, the term bispecific antigen-binding molecule means a protein, polypeptide, or molecular complex comprising at least a first antigen-binding domain and a second antigen-binding domain. Each antigen-binding domain in a bispecific antigen-binding molecule contains at least one CDR, which alone or in combination with one or more additional CDRs and/or FRs specifically binds to a particular antigen. In the context of this invention, the first antigen-binding domain specifically binds a first antigen (eg, CD3), and the second antigen-binding domain specifically binds a second, different antigen (eg, PSMA, MUC16, EGFRvIII, or STEAP2).

В некоторых иллюстративных вариантах осуществления данного изобретения биспецифическая антигенсвязывающая молекула представляет собой биспецифическое антитело. Каждый антигенсвязывающий домен биспецифического антитела содержит вариабельный домен тяжелой цепи (HCVR) и вариабельный домен легкой цепи (LCVR). В контексте биспецифической антигенсвязывающей молекулы, содержащей первый и второй антигенсвязывающие домены (например, биспецифическое антитело), CDR первого антигенсвязывающего домена могут быть обозначены префиксом A1, a CDR второго антигенсвязывающего домена могут быть обозначены префиксом A2. Таким образом, CDR первого антигенсвязывающего домена могут упоминаться в данном документе как A1-HCDR1, A1-HCDR2 и A1-HCDR3; a CDR второго антигенсвязывающего домена могут упоминаться в данном документе как A2-HCDR1, A2-HCDR2 и A2-HCDR3. Первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен могут быть прямо или косвенно связаны друг с другом с образованием биспецифической антигенсвязывающей молекулы по данному изобретению. Альтернативно, первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен могут быть связаны с отдельным мультимеризующим доменом. Связь одного мультимеризующего домена с другим мультимеризующим доменом облегчает связь между двумя антигенсвязывающими доменами, тем самым образуя биспецифическую антигенсвязывающую молекулу. Используемый в данном документе термин мультимеризующий домен представляет собой любую макромолекулу, белок, полипептид, пептид или аминокислоту, которая обладает способностью связываться со вторым мультимеризующим доменом той же или подобной структуры или конституции. Например, мультимеризирующий домен может представлять собой полипептид, содержащий домен CH3 иммуноглобулина. Неограничивающим примером мультимеризующего компонента является часть Fc иммуноглобулина (содержащая домен CH2-CH3), например домен Fc IgG, выбранного из изотипов IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4, a также любого аллотипа в каждой изотипной группе.In some exemplary embodiments of this invention, the bispecific antigen-binding molecule is a bispecific antibody. Each antigen-binding domain of a bispecific antibody contains a heavy chain variable domain (HCVR) and a light chain variable domain (LCVR). In the context of a bispecific antigen-binding molecule comprising first and second antigen-binding domains (eg, a bispecific antibody), the CDRs of the first antigen-binding domain may be denoted by the prefix A1 and the CDRs of the second antigen-binding domain may be denoted by the prefix A2. Thus, the CDRs of the first antigen-binding domain may be referred to herein as A1-HCDR1, A1-HCDR2 and A1-HCDR3; a CDRs of the second antigen-binding domain may be referred to herein as A2-HCDR1, A2-HCDR2 and A2-HCDR3. The first antigen-binding domain and the second antigen-binding domain can be directly or indirectly linked to each other to form a bispecific antigen-binding molecule of the invention. Alternatively, the first antigen-binding domain and the second antigen-binding domain may be associated with a separate multimerizing domain. Linking one multimerizing domain to another multimerizing domain facilitates communication between the two antigen-binding domains, thereby forming a bispecific antigen-binding molecule. As used herein, the term multimerization domain is any macromolecule, protein, polypeptide, peptide, or amino acid that has the ability to bind to a second multimerization domain of the same or similar structure or constitution. For example, the multimerizing domain may be a polypeptide containing an immunoglobulin C H 3 domain. A non-limiting example of a multimerizing component is the Fc portion of an immunoglobulin (containing a CH2-CH3 domain), such as an IgG Fc domain selected from the IgG1, IgG2, IgG3, and IgG4 isotypes, as well as any allotype within each isotype group.

Биспецифические антигенсвязывающие молекулы по данному изобретению обычно содержат два мультимеризующих домена, например два домена Fc, каждый из которых является индивидуально частью отдельной тяжелой цепи антитела. Первый и второй мультимеризующие домены могут иметь один и тот же изотип IgG, такой как, например, IgG1/IgG1, IgG2/IgG2, IgG4/IgG4. Альтернативно, первый и второй мультимеризующие домены могут иметь различные изотипы IgG, такие как, например, IgG1/IgG2, IgG1/IgG4, IgG2/IgG4 и т.д.The bispecific antigen-binding molecules of this invention typically contain two multimerizing domains, such as two Fc domains, each of which is individually part of a separate antibody heavy chain. The first and second multimerizing domains may be of the same IgG isotype, such as, for example, IgG1/IgG1, IgG2/IgG2, IgG4/IgG4. Alternatively, the first and second multimerizing domains may be of different IgG isotypes, such as, for example, IgG1/IgG2, IgG1/IgG4, IgG2/IgG4, etc.

В некоторых вариантах осуществления мультимеризующий домен представляет собой фрагмент Fc или аминокислотную последовательность длиной от 1 до около 200 аминокислот, содержащую по меньшей мере один остаток цистеина. В других вариантах осуществления мультимеризующий домен представляет собой остаток цистеина или короткий цистеинсодержащий пептид. Другие мультимеризующие домены включают пептиды или полипептиды, содержащие или состоящие из лейциновой молнии, мотива спиральной петли или мотива спиральной катушки.In some embodiments, the multimerization domain is an Fc fragment or an amino acid sequence of 1 to about 200 amino acids in length containing at least one cysteine residue. In other embodiments, the multimerization domain is a cysteine residue or a short cysteine-containing peptide. Other multimerizing domains include peptides or polypeptides containing or consisting of a leucine zipper, a coiled loop motif, or a coiled coil motif.

Для получения биспецифических антигенсвязывающих молекул по данному изобретению можно использовать любой формат или технологию биспецифического антитела. Например, антитело или его фрагмент, обладающие первой антигенсвязывающей специфичностью, могут быть функционально связаны (например, путем химической связи, генетического синтеза, нековалентной ассоциации или иным образом) с одним или более другими молекулярными объектами, такими как другое антитело или фрагмент антитела, обладающие второй антигенсвязывающей специфичностью для получения биспецифической антигенсвязывающей молекулы. Конкретные иллюстративные биспецифические форматы, которые могут использоваться в контексте данного изобретения, включают, без ограничения, например, scFv-основанные или диательные биспецифические форматы, слитые IgG-scFv, двойной вариабельный домен (DVD)-Ig, Quadroma, выступы-во-впадины, общая легкая цепь (например, общая легкая цепь с выступом-во-впадину и т.д.), CrossMab, CrossFab, (SEED) тела, лейциновую молнию, Duobody, IgG1/IgG2, Fab двойного действия (DAF)-IgG и Mab2 биспецифические форматы (см., например, Klein et al. 2012, mAbs, 4:6, 1-11, и ссылки, приведенные в нем, для обзора вышеперечисленных форматов).Any format or technology of a bispecific antibody can be used to make the bispecific antigen-binding molecules of this invention. For example, an antibody or fragment thereof having a first antigen-binding specificity may be operably linked (e.g., by chemical bonding, genetic synthesis, non-covalent association, or otherwise) to one or more other molecular entities, such as another antibody or antibody fragment having a second antigen-binding specificity to obtain a bispecific antigen-binding molecule. Specific exemplary bispecific formats that may be used in the context of the present invention include, without limitation, for example, scFv-based or diary bispecific formats, IgG-scFv fusion, dual variable domain (DVD)-Ig, Quadroma, ridge-in-gap, common light chain (e.g., common lung-in-trough light chain, etc.), CrossMab, CrossFab, (SEED) bodies, leucine zipper, Duobody, IgG1/IgG2, Dual Action Fab (DAF)-IgG, and Mab 2 bispecific formats (see, for example, Klein et al. 2012, mAbs, 4:6, 1-11, and references cited therein for an overview of the above formats).

В контексте биспецифических антигенсвязывающих молекул по данному изобретению мультимеризующие домены, например домены Fc, могут содержать одно или более аминокислотных изменений (например, инсерции, делеции или замены) по сравнению со встречающимися в природе версии домена Fc дикого типа. Например, изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие одну или более модификаций в домене Fc, которая приводит к модифицированному домену Fc, имеющему модифицированное связывание (например, усиленное или уменьшенное) между Fc иIn the context of the bispecific antigen-binding molecules of the invention, multimerizing domains, eg Fc domains, may contain one or more amino acid changes (eg insertions, deletions or substitutions) compared to naturally occurring versions of the wild-type Fc domain. For example, the invention includes bispecific antigen-binding molecules containing one or more modifications in the Fc domain, which results in a modified Fc domain having a modified binding (eg, increased or decreased) between Fc and

- 18 040594- 18 040594

FcRn. В одном варианте осуществления биспецифическая антигенсвязывающая молекула содержит модификацию в области CH2 или CH3, причем модификация увеличивает сродство домена Fc к FcRn в кислой среде (например, в эндосоме, где pH составляет от около 5,5 до около 6,0). Неограничивающие примеры таких модификаций Fc включают, например, модификацию в положении 250 (например, E или Q); 250 и 428 (например, L или F); 252 (например, L/Y/F/W или T), 254 (например, S или T) и 256 (например, S/R/Q/E/D или T); или модификацию в положении 428 и/или 433 (например, L/R/S/P/Q или K) и/или 434 (например, H/F или Y); или модификацию в положении 250 и/или 428; или модификацию в положении 307 или 308 (например, 308F, V308F) и 434. В одном варианте осуществления модификация включает модификации 428L (например, M428L) и 434S (например, N434S); модификации 428L, 259I (например, V259I) и 308F (например, V308F); модификации 433K (например, H433K) и 434 (например, 434Y); модификации 252, 254 и 256 (например, 252Y, 254T и 256E); модификации 250Q и 428L (например, T250Q и M428L) и модификации 307 и/или 308 (например, 308F или 308P).FcRn. In one embodiment, the bispecific antigen binding molecule comprises a modification in the CH2 or CH3 region, wherein the modification increases the affinity of the Fc domain for FcRn in an acidic environment (eg, in the endosome where the pH is about 5.5 to about 6.0). Non-limiting examples of such Fc modifications include, for example, a modification at position 250 (eg, E or Q); 250 and 428 (for example, L or F); 252 (eg L/Y/F/W or T), 254 (eg S or T) and 256 (eg S/R/Q/E/D or T); or a modification at position 428 and/or 433 (eg L/R/S/P/Q or K) and/or 434 (eg H/F or Y); or a modification at position 250 and/or 428; or a modification at position 307 or 308 (eg, 308F, V308F) and 434. In one embodiment, the modification includes modifications 428L (eg, M428L) and 434S (eg, N434S); modifications 428L, 259I (for example, V259I) and 308F (for example, V308F); modifications 433K (for example, H433K) and 434 (for example, 434Y); modifications 252, 254 and 256 (for example, 252Y, 254T and 256E); modifications 250Q and 428L (eg T250Q and M428L) and modifications 307 and/or 308 (eg 308F or 308P).

Данное изобретение также включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие первый домен CH3 и второй домен CH3 Ig, причем первый и второй домены CH3 Ig отличаются друг от друга по меньшей мере одной аминокислотой, и при этом по меньшей мере одно аминокислотное отличие уменьшает связывание биспецифического антитела с белком A по сравнению с биспецифическим антителом, лишенным аминокислотного отличия. В одном варианте осуществления первый домен CH3 Ig связывает белок A, а второй домен CH3 Ig содержит мутацию, которая уменьшает или отменяет связывание с белком A, такую как модификация H95R (посредством нумерации экзонов IMGT, H435R по нумерации EC). Второй CH3 может дополнительно содержать модификацию Y96F (по IMGT; Y436F по EU). Дальнейшие модификации, которые могут быть обнаружены во втором CH3, включают D16E, L18M, N44S, K52N, V57M и V82I (по IMGT; D356E, L358M, N384S, K392N, V397M и V422I по EU) в случае антител IgG1; N44S, K52N и V82I (по IMGT; N384S, K392N и V422I по EU) в случае антител IgG2 и Q15R, N44S, K52N, V57M, R69K, E79Q и V82I (по IMGT; Q355R, N384S, K392N, V397M, R409K, E419Q и V422I по EU) в случае антител IgG4.The invention also includes bispecific antigen-binding molecules comprising a first CH3 domain and a second C H 3 Ig domain, wherein the first and second C H 3 Ig domains differ from each other by at least one amino acid, and wherein at least one amino acid difference reduces binding a bispecific antibody with protein A versus a bispecific antibody lacking the amino acid difference. In one embodiment, the first C H 3 Ig domain binds the A protein and the second Ig C H 3 domain contains a mutation that reduces or abolishes the binding to the A protein, such as an H95R modification (via IMGT exon numbering, H435R by EC numbering). The second CH3 may additionally contain the modification Y96F (by IMGT; Y436F by EU). Further modifications that can be found in the second CH3 include D16E, L18M, N44S, K52N, V57M and V82I (by IMGT; D356E, L358M, N384S, K392N, V397M and V422I by EU) in the case of IgG1 antibodies; N44S, K52N and V82I (by IMGT; N384S, K392N and V422I by EU) for IgG2 and Q15R antibodies, N44S, K52N, V57M, R69K, E79Q and V82I (by IMGT; Q355R, N384S, K392N, V397M, R409K, E419Q and V422I by EU) in the case of IgG4 antibodies.

В некоторых вариантах осуществления домен Fc может быть химерным, объединяющим последовательности Fc, полученные более чем из одного изотипа иммуноглобулина. Например, химерный домен Fc может содержать часть или всю последовательность CH2, полученную из области CH2 IgG1 человека, IgG2 человека или IgG4 человека, и часть или всю последовательность CH3, полученную из IgG1 человека, IgG2 человека или IgG4 человека. Химерный домен Fc также может содержать химерную область шарнира. Например, химерный шарнир может содержать последовательность верхнего шарнира, полученную из шарнирной области IgG1 человека, IgG2 человека или IgG4 человека, в сочетании с нижней петлевой последовательностью, полученной из шарнирной области IgG1 человека, IgG2 человека или IgG4 человека. Конкретный пример химерного домена Fc, который может быть включен в любую из антигенсвязывающих молекул, изложенных в данном документе, включает от N- до C-конца: [CH1 IgG4] [верхний шарнир IgG4] - [нижний шарнир IgG2] - [CH2 IgG4] [CH3 IgG4]. Другой пример химерного домена Fc, который может быть включен в любую из антигенсвязывающих молекул, изложенных в данном документе, включает от N- до C-конца: [CH1 IgG1] - [верхний шарнир IgG1] - [нижний шарнир IgG2] [CH2 IgG4] - [CH3 IgG1]. Эти и другие примеры химерных доменов Fc, которые могут быть включены в любую из антигенсвязывающих молекул по данному изобретению, описаны в международной публикации PCT № WO 2014/121087 A1, опубликованной 7 августа 2014 г., которая включена в данный документ в качестве ссылки во всей своей полноте. Химерные домены Fc, имеющие данные общие структурные механизмы и их варианты, могут изменять связывание рецептора Fc, что, в свою очередь, влияет на функцию эффектора Fc.In some embodiments, the Fc domain may be chimeric, combining Fc sequences derived from more than one immunoglobulin isotype. For example, a chimeric Fc domain may comprise part or all of the CH 2 sequence derived from the CH 2 region of human IgG1, human IgG2, or human IgG4 and part or all of the CH3 sequence derived from human IgG1, human IgG2, or human IgG4. The chimeric Fc domain may also contain a chimeric hinge region. For example, a chimeric hinge may comprise an upper hinge sequence derived from a human IgG1, human IgG2, or human IgG4 hinge region combined with a lower hinge sequence derived from a human IgG1, human IgG2, or human IgG4 hinge region. A specific example of a chimeric Fc domain that can be included in any of the antigen binding molecules set forth herein includes the N- to C-terminus: [ CH 1 IgG4] [upper IgG4 hinge] - [lower IgG2 hinge] - [C H 2 IgG4] [ CH 3 IgG4]. Another example of a chimeric Fc domain that can be included in any of the antigen binding molecules set forth herein includes N- to C-terminus: H 2 IgG4] - [ CH 3 IgG1]. These and other examples of chimeric Fc domains that can be included in any of the antigen binding molecules of this invention are described in PCT International Publication No. WO 2014/121087 A1, published August 7, 2014, which is incorporated herein by reference throughout its completeness. Fc chimeric domains sharing these common structural mechanisms and variants thereof can alter Fc receptor binding, which in turn affects Fc effector function.

В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к тяжелой цепи антитела, в которой константная область тяжелой цепи (CH) содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере на 95%, по меньшей мере на 96%, по меньшей мере на 97%, по меньшей мере на 98%, по меньшей мере на 99% идентичную любой из SEQ ID NO: 182, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 184, SEQ ID NO: 185, SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 190 или SEQ ID NO: 191. В некоторых вариантах осуществления константная область тяжелой цепи (CH) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 182, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 184, SEQ ID NO: 185, SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 190 и SEQ ID NO: 191.In some embodiments, the invention relates to an antibody heavy chain, wherein the heavy chain constant region (CH) contains an amino acid sequence of at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98% at least 99% identical to any of SEQ ID NO: 182, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 184, SEQ ID NO: 185, SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 190, or SEQ ID NO: 191. In some embodiments, the heavy chain constant region ( CH ) comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 182, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 184, SEQ ID NO: 185, SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 190 and SEQ ID NO: 191.

В других вариантах осуществления изобретение относится к тяжелой цепи антитела, в которой домен Fc содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере на 95%, по меньшей мере на 96%, по меньшей мере на 97%, по меньшей мере на 98%, по меньшей мере на 99% идентичную любой из SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193, SEQ ID NO: 194, SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO: 196, SEQ ID NO: 197, SEQ ID NO: 198, SEQ ID NO: 199, SEQ ID NO: 200 или SEQ ID NO: 201. В некоторых вариантах осуществления домен Fc содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193, SEQ ID NO: 194, SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO: 196, SEQ ID NO: 197, SEQ ID NO: 198, SEQ ID NO: 199, SEQ ID NO: 200 и SEQ ID NO: 201.In other embodiments, the invention relates to an antibody heavy chain wherein the Fc domain contains an amino acid sequence of at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, at least 99% identical to any of SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193, SEQ ID NO: 194, SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO: 196, SEQ ID NO: 197, SEQ ID NO: 198, SEQ ID NO : 199, SEQ ID NO: 200, or SEQ ID NO: 201. In some embodiments, the Fc domain comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193, SEQ ID NO: 194, SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO: 196, SEQ ID NO: 197, SEQ ID NO: 198, SEQ ID NO: 199, SEQ ID NO: 200 and SEQ ID NO: 201.

- 19 040594- 19 040594

Другие варианты Fc.Other variants of Fc.

В соответствии с некоторыми вариантами осуществления данного изобретения предусмотрены анTU-CD3 антитела и анти-CD3/анти-TAA биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие домен Fc, содержащий одну или более мутаций, которые усиливают или уменьшают связывание антитела с рецептором FcRn, например, при кислом pH по сравнению с нейтральным pH. Например, данное изобретение включает антитела, содержащие мутацию в области CH2 или CH3 домена Fc, причем мутация(и) увеличивает сродство домена Fc к FcRn в кислой среде (например, в эндосоме, где pH составляет от около 5,5 до около 6,0). Такие мутации могут приводить к увеличению периода полувыведения сыворотки антитела при введении животному. Неограничивающие примеры таких модификаций Fc включают, например, модификацию в положении 250 (например, E или Q); 250 и 428 (например, L или F); 252 (например, L/Y/F/W или T), 254 (например, S или T) и 256 (например, S/R/Q/E/D или T); или модификацию в положении 428 и/или 433 (например, H/L/R/S/P/Q или K) и/или 434 (например, H/F или Y); или модификацию в положении 250 и/или 428; или модификацию в положении 307 или 308 (например, 308F, V308F) и 434. В одном варианте осуществления модификация включает модификации 428L (например, M428L) и 434S (например, N434S); модификации 428L, 259I (например, V259I) и 308F (например, V308F); модификации 433K (например, H433K) и 434 (например, 434Y); модификации 252, 254 и 256 (например, 252Y, 254T и 256E); модификации 250Q и 428L (например, T250Q и M428L) и модификации 307 и/или 308 (например, 308F или 308P).In accordance with some embodiments of the present invention, anti-CD3 antibodies and anti-CD3/anti-TAA bispecific antigen-binding molecules are provided, comprising an Fc domain containing one or more mutations that increase or decrease antibody binding to an FcRn receptor, e.g., at acidic pH. compared to neutral pH. For example, the invention includes antibodies containing a mutation in the C H 2 or CH 3 region of the Fc domain, wherein the mutation(s) increases the affinity of the Fc domain for FcRn in an acidic environment (e.g., in the endosome where the pH is from about 5.5 to about 6.0). Such mutations can lead to an increase in the serum half-life of the antibody when administered to an animal. Non-limiting examples of such Fc modifications include, for example, a modification at position 250 (eg, E or Q); 250 and 428 (for example, L or F); 252 (eg L/Y/F/W or T), 254 (eg S or T) and 256 (eg S/R/Q/E/D or T); or a modification at position 428 and/or 433 (eg H/L/R/S/P/Q or K) and/or 434 (eg H/F or Y); or a modification at position 250 and/or 428; or a modification at position 307 or 308 (eg, 308F, V308F) and 434. In one embodiment, the modification includes modifications 428L (eg, M428L) and 434S (eg, N434S); modifications 428L, 259I (for example, V259I) and 308F (for example, V308F); modifications 433K (for example, H433K) and 434 (for example, 434Y); modifications 252, 254 and 256 (for example, 252Y, 254T and 256E); modifications 250Q and 428L (for example, T250Q and M428L) and modifications 307 and/or 308 (for example, 308F or 308P).

Например, данное изобретение включает анти-CD3 антитела и анти-CD3/анти-TAA биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие домен Fc, содержащий одну или более пар или групп мутаций, выбранных из группы, состоящей из 250Q и 248L (например, T250Q и M248L); 252Y, 254T и 256E (например, M252Y, S254T и T256E); 428L и 434S (например, M428L и N434S) и 433K и 434F (например, H433K и N434F). Все возможные комбинации вышеуказанных доменных мутаций Fc и другие мутации внутри вариабельных доменов антитела, описанные в данном документе, рассматриваются в рамках данного изобретения.For example, this invention includes anti-CD3 antibodies and anti-CD3/anti-TAA bispecific antigen-binding molecules containing an Fc domain containing one or more pairs or groups of mutations selected from the group consisting of 250Q and 248L (for example, T250Q and M248L) ; 252Y, 254T and 256E (eg M252Y, S254T and T256E); 428L and 434S (eg M428L and N434S) and 433K and 434F (eg H433K and N434F). All possible combinations of the above Fc domain mutations and other mutations within the variable domains of an antibody described herein are contemplated within the scope of this invention.

Биологические характеристики антител и биспецифических антигенсвязывающих молекул.Biological characteristics of antibodies and bispecific antigen-binding molecules.

Данное изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы (например, биспецифические антитела), которые способны одновременно связываться с CD3 человека и TAA человека. Согласно некоторым вариантам осуществления биспецифические антигенсвязывающие молекулы по изобретению специфически взаимодействуют с клетками, которые экспрессируют CD3 и/или TAA, такие как PSMA, EGFRvIII или MUC16. Связывающее плечо, которое взаимодействует с клетками, которые экспрессируют CD3, может иметь слабое или недетектируемое связывание, измеренное в подходящем анализе связывания in vitro. Степень, с которой биспецифическая антигенсвязывающая молекула связывает клетки, которые экспрессируют CD3 и/или TAA, может быть оценена с помощью проточной цитометрии (FACS), как показано в примере 4 в данном документе.The invention includes bispecific antigen-binding molecules (eg, bispecific antibodies) that are capable of simultaneously binding to human CD3 and human TAA. In some embodiments, the bispecific antigen-binding molecules of the invention specifically interact with cells that express CD3 and/or TAA, such as PSMA, EGFRvIII, or MUC16. A binding arm that interacts with cells that express CD3 may have weak or undetectable binding as measured in a suitable in vitro binding assay. The extent to which a bispecific antigen binding molecule binds cells that express CD3 and/or TAA can be assessed by flow cytometry (FACS) as shown in Example 4 herein.

Например, данное изобретение включает антитела, антигенсвязывающие фрагменты и их биспецифические антитела, которые специфически связывают линии T-клеток человека, которая экспрессирует CD3, но не TAA (например, Jurkat), T-клетки приматов (например, мононуклеарные клетки периферической крови яванского макака [PBMC]) и/или TAA-экспрессирующие клетки. Данное изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые связывают любую из вышеупомянутых T-клеток и T-клеточных линий с величиной EC50 от около 1,8x10’8 (18 нМ) до около 2,1х10’7 (210 нМ) или более (т.е. более слабую аффинность) и включает биспецифические антитела, для которых EC50 не обнаруживается, как определено с использованием FACS анализа связывания, как указано в примере 4, или, по существу, аналогичного анализа. В некоторых вариантах осуществления антитела, антигенсвязывающие фрагменты и биспецифические антитела по данному изобретению связывают CD3 с EC50, равной более чем около 30 нМ, более чем около 40 нМ, более чем около 45 нМ, более чем около 50 нМ, более чем около 55 нМ, более чем около 60 нМ, более чем около 65 нМ, более чем около 70 нМ, более чем около 75 нМ, по меньшей мере 80 нМ, более чем около 90 нМ, более чем около 100 нМ, более чем около 110 нМ, по меньшей мере 120 нМ, более чем около 130 нМ, более чем около 140 нМ, более чем около 150 нМ, по меньшей мере 160 нМ, более чем около 170 нМ, более чем около 180 нМ, более чем около 190 нМ, более чем около 200 нМ, более чем около 250 нМ, более чем около 300 нМ, более чем около 500 нМ, более чем около 1 мкМ, более чем около 2 мкМ или более чем около 3 мкМ, или недетектируемую аффинность связывания, измеренную с помощью FACS связывания, например, с использованием формата анализа, как определено в примере 4 в данном документе, или, по существу, аналогичного анализа.For example, the invention includes antibodies, antigen-binding fragments, and bispecific antibodies thereof that specifically bind a human T cell line that expresses CD3 but not TAA (e.g., Jurkat), primate T cells (e.g., cynomolgus monkey peripheral blood mononuclear cells [ PBMC]) and/or TAA-expressing cells. This invention includes bispecific antigen-binding molecules that bind any of the aforementioned T cells and T cell lines with an EC 50 value from about 1.8 x 10'8 (18 nM) to about 2.1 x 10' 7 (210 nM) or more (t ie lower affinity) and includes bispecific antibodies for which no EC 50 is detected as determined using a FACS binding assay as described in Example 4 or a substantially similar assay. In some embodiments, the antibodies, antigen binding fragments, and bispecific antibodies of the invention bind CD3 with an EC 50 of greater than about 30 nM, greater than about 40 nM, greater than about 45 nM, greater than about 50 nM, greater than about 55 nM , greater than about 60 nM, greater than about 65 nM, greater than about 70 nM, greater than about 75 nM, at least 80 nM, greater than about 90 nM, greater than about 100 nM, greater than about 110 nM, according to at least 120 nM, greater than about 130 nM, greater than about 140 nM, greater than about 150 nM, at least 160 nM, greater than about 170 nM, greater than about 180 nM, greater than about 190 nM, greater than about 200 nM, greater than about 250 nM, greater than about 300 nM, greater than about 500 nM, greater than about 1 μM, greater than about 2 μM, or greater than about 3 μM, or an undetectable binding affinity as measured by binding FACS, for example, using the analysis format as defined in example 4 herein, or, in essence nature of a similar analysis.

Данное изобретение также включает антитела, антигенсвязывающие фрагменты и его биспецифические антитела, которые связываются с TAA-экспрессирующими клетками и клеточными линиями, такими как PSMA-, EGFRvIII-, STEAP2- и МиС16-экспрессирующими клеточными линиями, причем значение EC50 меньше чем около 100 нМ или даже меньше концентрации, необходимой для связывания (т.е. более сильной аффинности), такой как менее 5,6 нМ (5,6x10’9), как определено с использованием FACS анализа связывания, как указано в примере 4, или, по существу, аналогичного клеточного анализа. ДанThe invention also includes antibodies, antigen-binding fragments, and bispecific antibodies thereof that bind to TAA-expressing cells and cell lines, such as PSMA-, EGFRvIII-, STEAP2-, and MiC16-expressing cell lines, with an EC 50 value of less than about 100 nM. or even less than the concentration required for binding (i.e., stronger affinity), such as less than 5.6 nM (5.6x10'9), as determined using a FACS binding assay as described in Example 4, or, by essentially a similar cellular assay. Dan

- 20 040594 ное изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые связывают любую из вышеупомянутых линий опухолевых клеток со значением EC50, равным менее чем около 50 нМ, менее чем около 45 нМ, менее чем около 40 нМ, менее чем около 35 нМ, менее чем около 30 нМ, менее чем около 25 нМ, менее чем около 20 нМ, менее чем около 15 нМ, менее чем около 10 нМ, менее чем около 6 нМ, менее чем около 5 нМ или менее чем около 1 нМ, например используя вышеупомянутый анализ.The invention includes bispecific antigen binding molecules that bind any of the aforementioned tumor cell lines with an EC 50 value of less than about 50 nM, less than about 45 nM, less than about 40 nM, less than about 35 nM, less than about 30 nM, less than about 25 nM, less than about 20 nM, less than about 15 nM, less than about 10 nM, less than about 6 nM, less than about 5 nM, or less than about 1 nM, e.g. using the above assay .

Данное изобретение включает антитела, антигенсвязывающие фрагменты и биспецифические антитела, которые связывают CD3 человека с низкой, слабой или даже отсутствующей обнаруживаемой аффинностью. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления данное изобретение включает антитела и антигенсвязывающие фрагменты антител, которые связывают CD3 человека (например, при 37°C) с KD более чем около 11 нМ, включает антитела, которые связывают CD3 с KD более чем около 100 или 500 нМ, а также включает антитела, не имеющие обнаруживаемой аффинности связывания, как измерено посредством поверхностного плазмонного резонанса, например, с использованием формата анализа, как определено в примере 5 в данном документе. В некоторых вариантах осуществления антитела или антигенсвязывающие фрагменты по данному изобретению связывают CD3 с KD, равной более чем около 15 нМ, более чем около 20 нМ, более чем около 25 нМ, более чем около 30 нМ, более чем около 35 нМ, более чем около 40 нМ, более чем около 45 нМ, более чем около 50 нМ, более чем около 55 нМ, по меньшей мере 60 нМ, более чем около 65 нМ, более чем около 70 нМ, более чем около 75 нМ, по меньшей мере 80 нМ, более чем около 90 нМ, более чем около 100 нМ, более чем около 110 нМ, по меньшей мере 120 нМ, более чем около 130 нМ, более чем около 140 нМ, более чем около 150 нМ, более чем около 160 нМ, более чем около 170 нМ, более чем около 180 нМ, более чем около 190 нМ, более чем около 200 нМ, более чем около 250 нМ, более чем около 300 нМ, более чем около 1 мкМ, более чем около 2 мкМ или более чем около 3 мкМ, или недетектируемую аффинность связывания, измеренную с анализа на основе поверхностного плазмонного резонанса, например, с использованием формата анализа, как определено в примере 5 в данном документе (например, формат mAb-захвата или захвата антигена), или, по существу, аналогичного анализа.The present invention includes antibodies, antigen-binding fragments, and bispecific antibodies that bind human CD3 with low, weak, or even no detectable affinity. In some embodiments, the invention includes antibodies and antigen-binding antibody fragments that bind human CD3 (e.g., at 37°C) with a KD of greater than about 11 nM, includes antibodies that bind CD3 with a KD of greater than about 100 or 500 nM , and also includes antibodies having no detectable binding affinity as measured by surface plasmon resonance, for example, using the assay format as defined in Example 5 herein. In some embodiments, the antibodies or antigen-binding fragments of this invention bind CD3 with a KD of greater than about 15 nM, greater than about 20 nM, greater than about 25 nM, greater than about 30 nM, greater than about 35 nM, greater than about 40 nM, greater than about 45 nM, greater than about 50 nM, greater than about 55 nM, at least 60 nM, greater than about 65 nM, greater than about 70 nM, greater than about 75 nM, at least 80 nM , greater than about 90 nM, greater than about 100 nM, greater than about 110 nM, at least 120 nM, greater than about 130 nM, greater than about 140 nM, greater than about 150 nM, greater than about 160 nM, greater than greater than about 170 nM, greater than about 180 nM, greater than about 190 nM, greater than about 200 nM, greater than about 250 nM, greater than about 300 nM, greater than about 1 μM, greater than about 2 μM, or greater than about 3 μM, or undetectable binding affinity measured from a surface plasmon resonance assay, e.g. using forms Assay data as defined in Example 5 herein (eg, mAb capture or antigen capture format), or a substantially similar assay.

Данное изобретение включает антитела, антигенсвязывающие фрагменты и биспецифические антитела, которые связывают CD3 обезьяны (яванского макака) с низкой, слабой или даже отсутствующей обнаруживаемой аффинностью. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления данное изобретение включает антитела и антигенсвязывающие фрагменты антител, и их биспецифические антитела, которые связывают CD3 человека (например, при 37°C) с KD более чем около 10 нМ, включает антитела, которые связывают CD3 с KD более чем около 100 или 500 нМ, а также включает антитела, не имеющие обнаруживаемой аффинности связывания, как измерено посредством поверхностного плазмонного резонанса, например, с использованием формата анализа, как определено в примере 5 в данном документе. В некоторых вариантах осуществления антитела или антигенсвязывающие фрагменты по данному изобретению связывают CD3 с KD, равной более чем около 15 нМ, более чем около 20 нМ, более чем около 25 нМ, более чем около 30 нМ, более чем около 35 нМ, более чем около 40 нМ, более чем около 45 нМ, более чем около 50 нМ, более чем около 55 нМ, по меньшей мере 60 нМ, более чем около 65 нМ, более чем около 70 нМ, более чем около 75 нМ, по меньшей мере 80 нМ, более чем около 90 нМ, более чем около 100 нМ, более чем около 110 нМ, по меньшей мере 120 нМ, более чем около 130 нМ, более чем около 140 нМ, более чем около 150 нМ, более чем около 160 нМ, более чем около 170 нМ, более чем около 180 нМ, более чем около 190 нМ, более чем около 200 нМ, более чем около 250 нМ, более чем около 300 нМ, более чем около 1 мкМ, более чем около 2 мкМ или более чем около 3 мкМ, или недетектируемую аффинность связывания, измеренную с помощью анализа на основе поверхностного плазмонного резонанса, например, с использованием формата анализа, как определено в примере 5 в данном документе (например, формат mAb-захвата или захвата антигена), или, по существу, аналогичного анализа.The invention includes antibodies, antigen-binding fragments, and bispecific antibodies that bind monkey (cynomolgus) CD3 with low, weak, or even no detectable affinity. According to some embodiments, the invention includes antibodies and antigen-binding antibody fragments, and bispecific antibodies thereof that bind human CD3 (e.g., at 37°C) with a KD of greater than about 10 nM, includes antibodies that bind CD3 to a KD of greater than about 100 or 500 nM, and also includes antibodies having no detectable binding affinity as measured by surface plasmon resonance, for example, using the assay format as defined in Example 5 herein. In some embodiments, the antibodies or antigen-binding fragments of this invention bind CD3 with a KD of greater than about 15 nM, greater than about 20 nM, greater than about 25 nM, greater than about 30 nM, greater than about 35 nM, greater than about 40 nM, greater than about 45 nM, greater than about 50 nM, greater than about 55 nM, at least 60 nM, greater than about 65 nM, greater than about 70 nM, greater than about 75 nM, at least 80 nM , greater than about 90 nM, greater than about 100 nM, greater than about 110 nM, at least 120 nM, greater than about 130 nM, greater than about 140 nM, greater than about 150 nM, greater than about 160 nM, greater than greater than about 170 nM, greater than about 180 nM, greater than about 190 nM, greater than about 200 nM, greater than about 250 nM, greater than about 300 nM, greater than about 1 μM, greater than about 2 μM, or greater than about 3 μM, or an undetectable binding affinity measured using a surface plasmon resonance assay, e.g. receiving an assay format as defined in Example 5 herein (eg, mAb capture or antigen capture format), or a substantially similar assay.

Данное изобретение включает антитела, антигенсвязывающие фрагменты и биспецифические антитела, которые связывают CD3 человека и индуцируют активацию T-клеток. Например, данное изобретение включает анти-CD3 антитела, которые индуцируют активацию T-клеток человека с величиной EC50 менее чем около 113 пМ, как измерено с помощью анализа активации T-клеток in vitro, например используя формат анализа, как определено в примере 6 в данном документе [например, оценку процентных активированных (CD69+) клеток из общих T-клеток (CD2+) в присутствии анти-CD3 антител], или, по существу, аналогичного анализа, который оценивает T-клетку в их активированном состоянии. В некоторых вариантах осуществления антитела или антигенсвязывающие фрагменты по данному изобретению индуцируют активацию T-клеток человека (например, процент активированных (CD69+) T-клеток] с величиной EC50, равной менее чем около 100 пМ, менее чем около 50 пМ, менее чем около 20 пМ, менее чем около 19 пМ, менее чем около 18 пМ, менее чем около 17 пМ, менее чем около 16 пМ, менее чем около 15 пМ, менее чем около 14 пМ, менее чем около 13 пМ, менее чем около 12 пМ, менее чем около 11 пМ, менее чем около 10 пМ, менее чем около 9 пМ, менее чем около 8 пМ, менее чем около 7 пМ, менее чем около 6 пМ, менее чем около 5 пМ, менее чем около 4 пМ,The present invention includes antibodies, antigen-binding fragments, and bispecific antibodies that bind human CD3 and induce T cell activation. For example, this invention includes anti-CD3 antibodies that induce human T cell activation with an EC 50 value of less than about 113 pM as measured by an in vitro T cell activation assay, e.g. using the assay format as defined in Example 6 in herein [eg, assessment of percent activated (CD69+) cells from total T cells (CD2+) in the presence of anti-CD3 antibodies], or a substantially similar assay that evaluates a T cell in its activated state. In some embodiments, the antibodies or antigen-binding fragments of the invention induce human T cell activation (e.g., percentage of activated (CD69+) T cells) with an EC50 value of less than about 100 pM, less than about 50 pM, less than about 20 less than about 19 pM, less than about 18 pM, less than about 17 pM, less than about 16 pM, less than about 15 pM, less than about 14 pM, less than about 13 pM, less than about 12 pM, less than about 11 pM, less than about 10 pM, less than about 9 pM, less than about 8 pM, less than about 7 pM, less than about 6 pM, less than about 5 pM, less than about 4 pM,

- 21 040594 менее чем около 3 пМ, менее чем около 2 пМ или менее чем около 1 пМ, как измерено с помощью анализа активации T-клеток in vitro, например используя формат анализа, как определено в примере 6 в данном документе, или, по существу, аналогичного анализа. Ahtu-CD3 антитела, которые обладают слабым или недетектируемым связыванием с CD3, обладают способностью индуцировать активацию T-клеток с высокой эффективностью (т.е. пМ-диапазон), несмотря на то, что они имеют слабую или недетектируемую аффинность связывания с CD3, как показано в примере 6 в данном документе.- 21 040594 less than about 3 pM, less than about 2 pM, or less than about 1 pM, as measured by an in vitro T cell activation assay, for example using the assay format as defined in Example 6 herein, or, by essentially a similar analysis. Ahtu-CD3 antibodies that have weak or undetectable binding to CD3 have the ability to induce T cell activation with high efficiency (i.e. pM range) despite having a weak or undetectable binding affinity to CD3, such as shown in example 6 in this document.

Данное изобретение также включает антитела, антигенсвязывающие фрагменты и биспецифические антитела, которые связывают CD3 человека и индуцируют опосредованный T-клетками лизинг опухолевых антиген-экспрессирующих клеток. Например, данное изобретение включает анти-CD3 антитела, которые индуцируют опосредованный T-клетками лизинг опухолевых клеток с EC50, равной менее чем около 1,3 нМ, как измерено в анализе лизиса опухолевых клеток, опосредуемый T-клетками, например, с использованием анализа, как определено в примере 6 в данном документе (например, оценка степени опухолевых антиген-экспрессирующих клеток, таких как экспрессия PSMA, экспрессия EGFRvIII или экспрессия MUC16 клеточное число PBMC человека в присутствии анти-CD3 антител), или, по существу, аналогичного анализа. В некоторых вариантах осуществления антитела или антигенсвязывающие фрагменты по данному изобретению индуцируют T-клеточное опосредованный лизис опухолевых клеток (например, PBMC-опосредованный лизис клеток OVCAR3) со значением EC50, равным менее чем около 1 нМ, менее чем около 400 пМ, менее чем около 250 пМ, менее чем около 100 пМ, менее чем около 50 пМ, менее чем около 40 пМ, менее чем около 30 пМ, менее чем около 20 пМ, менее чем около 10 пМ, менее чем около 9 пМ, менее чем около 8 пМ, менее чем около 7 пМ, менее чем около 6 пМ, менее чем около 5 пМ, менее чем около 4 пМ, менее чем около 3 пМ, менее чем около 2 пМ или менее чем около 1 пМ, как измерено в in vitro анализе лизиса опухолевых опосредованного T-клетками, например, с использованием формата анализа, как определено в примере 6 в данном документе, или, по существу, аналогичного анализа.The invention also includes antibodies, antigen-binding fragments, and bispecific antibodies that bind human CD3 and induce T-cell mediated lysis of tumor antigen-expressing cells. For example, the invention includes anti-CD3 antibodies that induce T-cell mediated lysis of tumor cells with an EC 50 of less than about 1.3 nM as measured in a T-cell mediated tumor cell lysis assay, e.g. , as defined in Example 6 herein (e.g., assessment of the extent of tumor antigen-expressing cells, such as PSMA expression, EGFRvIII expression, or MUC16 expression, human PBMC cell count in the presence of anti-CD3 antibodies), or a substantially similar assay. In some embodiments, the antibodies or antigen-binding fragments of the invention induce T cell mediated tumor cell lysis (e.g., PBMC mediated OVCAR3 cell lysis) with an EC 50 value of less than about 1 nM, less than about 400 pM, less than about 250 pM, less than about 100 pM, less than about 50 pM, less than about 40 pM, less than about 30 pM, less than about 20 pM, less than about 10 pM, less than about 9 pM, less than about 8 pM , less than about 7 pM, less than about 6 pM, less than about 5 pM, less than about 4 pM, less than about 3 pM, less than about 2 pM, or less than about 1 pM, as measured in an in vitro lysis assay tumor-mediated T-cells, for example, using the assay format as defined in Example 6 herein, or a substantially similar assay.

Данное изобретение также включает антитела, антигенсвязывающие фрагменты и биспецифические антитела, которые связывают CD3 с диссоциативным периодом полувыведения (t1/2) менее чем около 10 мин, как измерено посредством поверхностного плазмонного резонанса при 25 или 37°C, например, с использованием формата анализа, как определено в примере 5 данного изобретения, или, по существу, аналогичного анализа. В некоторых вариантах осуществления антитела или антигенсвязывающие фрагменты по данному изобретению связывают CD3 с t1/2 менее чем около 9 мин, менее чем около 8 мин, менее чем около 7 мин, менее чем около 6 мин, менее чем около 5 мин, менее чем около 4 мин, менее чем около 3 мин, менее чем около 2 мин, менее чем около 1,9 мин или менее чем около 1,8 мин или проявляют очень слабое или недетектируемое связывание, как измерено посредством поверхностного плазмонного резонанса при 25 или 37°C, например используя формат анализа, как определено в примере 5 в данном документе (например, формат захвата mAb или антигена), или, по существу, аналогичный анализ.The invention also includes antibodies, antigen-binding fragments, and bispecific antibodies that bind CD3 with a dissociative half-life (t 1/2 ) of less than about 10 minutes, as measured by surface plasmon resonance at 25 or 37°C, for example, using the assay format , as defined in example 5 of the present invention, or essentially a similar analysis. In some embodiments, the antibodies or antigen-binding fragments of the invention bind CD3 to t 1/2 in less than about 9 minutes, less than about 8 minutes, less than about 7 minutes, less than about 6 minutes, less than about 5 minutes, less than about 4 minutes, less than about 3 minutes, less than about 2 minutes, less than about 1.9 minutes, or less than about 1.8 minutes, or exhibit very little or no detectable binding as measured by surface plasmon resonance at 25° or 37° C, for example using the assay format as defined in Example 5 herein (eg, mAb or antigen capture format), or a substantially similar assay.

Анти-CD3/анти-TAA биспецифические антигенсвязывающие молекулы по данному изобретению могут дополнительно демонстрировать одну или более характеристик, выбранных из группы, состоящей из:The anti-CD3/anti-TAA bispecific antigen binding molecules of this invention may further exhibit one or more characteristics selected from the group consisting of:

(а) индуцирования PBMC-пролиферации in vitro;(a) inducing PBMC proliferation in vitro;

(b) активации T-клеток путем индуцирования высвобождения IFN-гамма и регуляции воспаления CD25 в цельной крови человека и (с) индуцирования цитотоксичности, опосредуемой T-клеткой, на анти-TAA-резистентных клеточных линиях.(b) activating T cells by inducing IFN-gamma release and regulating CD25 inflammation in human whole blood, and (c) inducing T cell mediated cytotoxicity in anti-TAA resistant cell lines.

Данное изобретение включает анти-CD3/анти-TAA биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые способны разрушать опухолевые антиген-экспрессирующие клетки у субъекта (см., например, пример 7). Например, в соответствии с некоторыми вариантами осуществления предложены антиCD3/анти-PSMA, анти-CD3/анти-MUC16 или анти-CD3/анти-STEAP2 биспецифические антигенсвязывающие молекулы, причем однократное введение 1, или 10, или 100 мкг биспецифической антигенсвязывающей молекулы субъекту (например, в дозе около 0,1 мг/кг, около 0,08 мг/кг, около 0,06 мг/кг, около 0,04 мг/кг, около 0,04 мг/кг, около 0,02 мг/кг, около 0,01 мг/кг или менее) вызывает снижение количества опухолевых антиген-экспрессирующих клеток у субъекта (например, рост опухоли у субъекта подавляется или ингибируется) ниже определяемых уровней. В некоторых вариантах осуществления однократное введение анти-CD3/анти-PSMA биспецифической антигенсвязывающей молекулы в дозе около 0,4 мг/кг приводит к уменьшению роста опухоли у субъекта, находящегося ниже уровня обнаружения, на около 7 сутки, около 6 сутки, около 5 сутки, около 4 сутки, около 3 сутки, около 2 сутки или около 1 сутки после введения биспецифической антигенсвязывающей молекулы субъекту. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления однократное введение анти-CD3/анти-PSMA биспецифической антигенсвязывающей молекулы по изобретению в дозе, равной по меньшей мере около 0,01 мг/кг, приводит к тому, что количество опухолевых клеток, экспрессирующих PSMA, остается ниже определяемых уровней по меньшей мере до 7 суток, 8 суток, 9 суток, 10 суток, 11 суток, 12 суток, 13 суток, 14 суток, 15 суток, 16 суток, 17 суток и более после введения. Используемое в данном документе выражение ниThis invention includes anti-CD3/anti-TAA bispecific antigen-binding molecules that are capable of destroying tumor antigen-expressing cells in a subject (see, for example, example 7). For example, according to some embodiments, anti-CD3/anti-PSMA, anti-CD3/anti-MUC16, or anti-CD3/anti-STEAP2 bispecific antigen-binding molecules are provided, wherein a single administration of 1 or 10 or 100 μg of the bispecific antigen-binding molecule to a subject ( for example, at a dose of about 0.1 mg/kg, about 0.08 mg/kg, about 0.06 mg/kg, about 0.04 mg/kg, about 0.04 mg/kg, about 0.02 mg/kg kg, about 0.01 mg/kg or less) causes a decrease in the number of tumor antigen-expressing cells in the subject (eg, tumor growth in the subject is suppressed or inhibited) below detectable levels. In some embodiments, a single administration of an anti-CD3/anti-PSMA bispecific antigen-binding molecule at a dose of about 0.4 mg/kg results in a reduction in tumor growth in a subject below the detection level by about day 7, about day 6, about day 5 , about day 4, about day 3, about day 2, or about day 1 after administration of the bispecific antigen-binding molecule to a subject. In some embodiments, a single administration of an anti-CD3/anti-PSMA bispecific antigen-binding molecule of the invention at a dose of at least about 0.01 mg/kg results in the number of PSMA-expressing tumor cells remaining below detectable levels up to at least 7 days, 8 days, 9 days, 10 days, 11 days, 12 days, 13 days, 14 days, 15 days, 16 days, 17 days or more after administration. The expression used in this document is neither

- 22 040594 же детектируемых уровней означает, что никакие опухолевые клетки не могут быть обнаружены прямо или косвенно, при подкожном росте у субъекта, с использованием стандартных приборов и методов измерения, например, как указано в примере 7. В некоторых вариантах осуществления одно введение антиCD3/анти-MUC16 биспецифической антигенсвязывающей молекулы в дозе около 10 мкг приводит к подавлению роста опухоли у субъекта на около 6 сутки и поддерживает подавление опухолей по меньшей мере до 26 суток после введения биспецифической антигенсвязывающей молекулы субъекту. У субъектов, получающих однократное введение анти-CD3/анти-MUC16 биспецифической антигенсвязывающей молекулы в дозе около 10 мкг, по меньшей мере через 7 суток после имплантации опухоли, биспецифическая антигенсвязывающая молекула проявляет эффективность в подавлении роста развившихся опухолей у субъекта на около 26 сутки после имплантации опухоли субъекту. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления однократное введение анти-CD3/анти-MUC16 биспецифической антигенсвязывающей молекулы по изобретению в дозе по меньшей мере около 0,1 мг/кг ингибирует рост опухолевых клеток, экспрессирующих MUC16, по меньшей мере на около 7 суток, 8 суток, 9 суток, 10 суток, 11 суток, 12 суток, 13 суток, 14 суток, 15 суток, 16 суток, 17 суток, 18 суток, 19 суток, 20 суток и более после введения биспецифической молекулы. См., например, пример 8.- 22 040594 same detectable levels means that no tumor cells can be detected directly or indirectly, when growing subcutaneously in a subject, using standard instruments and measurement methods, for example, as described in example 7. In some embodiments, a single administration of antiCD3/ anti-MUC16 of the bispecific antigen-binding molecule at a dose of about 10 μg results in suppression of tumor growth in the subject by about 6 days and maintains tumor suppression for at least 26 days after administration of the bispecific antigen-binding molecule to the subject. In subjects receiving a single administration of an anti-CD3/anti-MUC16 bispecific antigen-binding molecule at a dose of about 10 μg at least 7 days after tumor implantation, the bispecific antigen-binding molecule is effective in inhibiting the growth of established tumors in the subject at about 26 days after implantation. subject's tumors. In some embodiments, a single administration of an anti-CD3/anti-MUC16 bispecific antigen-binding molecule of the invention at a dose of at least about 0.1 mg/kg inhibits the growth of MUC16-expressing tumor cells for at least about 7 days, 8 days , 9 days, 10 days, 11 days, 12 days, 13 days, 14 days, 15 days, 16 days, 17 days, 18 days, 19 days, 20 days or more after administration of the bispecific molecule. See, for example, example 8.

В некоторых вариантах осуществления однократное введение анти-CD3/анти-STEAP2 биспецифической антигенсвязывающей молекулы в дозе около 0,1 или 0,01 мг/кг поддерживает подавление роста опухоли по меньшей мере до 46 суток после введения биспецифической антигенсвязывающей молекулы и опухоли субъекту. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления однократное введение анти-CD3/анти-STEAP2 биспецифической антигенсвязывающей молекулы по изобретению в дозе, равной по меньшей мере около 0,1 мг/кг, около 0,08 мг/кг, около 0,06 мг/кг, около 0,05 мг/кг, около 0,04 мг/кг, около 0,03 мг/кг, около 0,02 мг/кг, около 0,01 мг/кг или менее ингибирует рост STEAP2экспрессирующих опухолевых клеток в течение по меньшей мере около 20 суток, 30 суток, 35 суток, 40 суток, 45 суток и более после введения биспецифической молекулы. См., например, пример 10.In some embodiments, a single administration of the anti-CD3/anti-STEAP2 bispecific antigen binding molecule at a dose of about 0.1 or 0.01 mg/kg maintains tumor growth suppression for at least 46 days after administration of the bispecific antigen binding molecule and tumor to the subject. In some embodiments, a single administration of an anti-CD3/anti-STEAP2 bispecific antigen-binding molecule of the invention at a dose of at least about 0.1 mg/kg, about 0.08 mg/kg, about 0.06 mg/kg , about 0.05 mg/kg, about 0.04 mg/kg, about 0.03 mg/kg, about 0.02 mg/kg, about 0.01 mg/kg or less inhibits the growth of STEAP2-expressing tumor cells for up to at least about 20 days, 30 days, 35 days, 40 days, 45 days or more after administration of the bispecific molecule. See, for example, example 10.

В других вариантах осуществления анти-CD3/анти-TAA биспецифические антигенсвязывающие молекулы, имеющие целевое CD3-связывающее плечо, имеющее слабую аффинность связывания с эффекторными клетками, демонстрируют снижение скорости элиминации лекарственного средства по сравнению с биспецифическими антителами, содержащими одно и то же анти-TAA-связывающее плечо и сильное CD3-связывание, введенное в фармакокинетическом исследовании in vivo. Результаты демонстрируют, что биспецифические молекулы, содержащие более слабое связывание плеча с плечом, нацеливающим на CD3, могут проявлять благоприятные уровни воздействия лекарственного средства (AUClast) и профили элиминации лекарственных средств (клиренс антител). См., например, пример 9.In other embodiments, anti-CD3/anti-TAA bispecific antigen-binding molecules having a target CD3-binding arm having low binding affinity for effector cells exhibit a reduced rate of drug elimination compared to bispecific antibodies containing the same anti-TAA. -binding arm and strong CD3 binding introduced in an in vivo pharmacokinetic study. The results demonstrate that bispecific molecules containing weaker arm binding to the CD3 targeting arm may exhibit favorable drug exposure levels (AUC last ) and drug elimination profiles (antibody clearance). See, for example, example 9.

В данном изобретении предложены анти-CD3/анти-PSMA, анти-CD3/анти-MUC16 и антиCD3/анти-STEAP2 биспецифические антигенсвязывающие молекулы (т.е. анти-CD3/анти-TAA биспецифические антигенсвязывающие молекулы), которые проявляют одну или более характеристик, выбранных из группы, состоящей из:The present invention provides anti-CD3/anti-PSMA, anti-CD3/anti-MUC16, and anti-CD3/anti-STEAP2 bispecific antigen-binding molecules (i.e., anti-CD3/anti-TAA bispecific antigen-binding molecules) that exhibit one or more characteristics selected from the group consisting of:

(a) ингибирования роста опухоли у иммунокомпрометированных мышей, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека;(a) inhibition of tumor growth in immunocompromised mice bearing human prostate cancer xenografts;

(b) ингибирования роста опухоли у иммунокомпрометированных мышей, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека;(b) inhibition of tumor growth in immunocompromised mice bearing human prostate cancer xenografts;

(c) подавления роста опухоли развившихся опухолей у мышей с ослабленным иммунитетом, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека; и (d) снижение роста опухоли у развившихся опухолей у иммунокомпрометированных мышей, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека (см., например, примеры 7, 8 и 10).(c) inhibition of tumor growth of established tumors in immunocompromised mice bearing human prostate cancer xenografts; and (d) reducing tumor growth in established tumors in immunocompromised mice bearing human prostate cancer xenografts (see, for example, Examples 7, 8 and 10).

В данном изобретении также представлены биспецифические анти-CD3 /анти-PSMA, анти-CD3/анти-MUC16 и анти-CD3/анти-STEAP2 антитела (т.е. биспецифические анти-CD3/анти-TAA антитела), содержащие i) первую тяжелую цепь, направленную на эффекторную T-клетку (т.е. CD3); и ii) вторую тяжелую цепь, направленную на целевую опухолевую клетку, причем биспецифические антитела проявляют слабое связывание или недетектируемое связывание с эффекторными клетками и проявляют подавление роста опухоли и снижение клиренса антител (т.е. устранение) из организма по сравнению с биспецифическими антителами, которые проявляют сильное связывание с эффекторными клетками.The present invention also provides anti-CD3/anti-PSMA, anti-CD3/anti-MUC16, and anti-CD3/anti-STEAP2 bispecific antibodies (i.e., anti-CD3/anti-TAA bispecific antibodies) containing i) the first a heavy chain directed to an effector T cell (ie, CD3); and ii) a second heavy chain directed to the target tumor cell, wherein the bispecific antibodies exhibit weak or undetectable binding to effector cells and exhibit suppression of tumor growth and reduced antibody clearance (i.e. elimination) from the body compared to bispecific antibodies that show strong binding to effector cells.

Картирование эпитопов и связанные с ними технологии.Epitope mapping and related technologies.

Эпитоп на CD3, с которым связываются антигенсвязывающие молекулы данного изобретения, может состоять из одной непрерывной последовательности 3 или более (например, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более) аминокислот белка CD3. Альтернативно, эпитоп может состоять из множества несмежных аминокислот (или аминокислотных последовательностей) CD3. Антитела по изобретению могут взаимодействовать с аминокислотами, содержащимися в одной цепи CD3 (например, CD3-эпсилон, CD3-дельта или CD3-гамма), или могут взаимодействовать с аминокислотами на двух или более различных цепях CD3. Используемый в данном документе термин эпитоп относится к антигенной детерминанте, которая взаимодействует со специфическим сайтом связывания антигена в вариабельной области молекулы антитела, известной как паратоп. Один антиген может иметь более одногоThe epitope on CD3 to which the antigen-binding molecules of the present invention bind may consist of a single contiguous sequence of 3 or more (e.g., 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 or more) amino acids of the CD3 protein. Alternatively, an epitope may be composed of a plurality of non-contiguous amino acids (or amino acid sequences) of CD3. Antibodies of the invention may interact with amino acids contained on a single CD3 chain (eg, CD3 epsilon, CD3 delta, or CD3 gamma) or may interact with amino acids on two or more different CD3 chains. As used herein, the term epitope refers to an antigenic determinant that interacts with a specific antigen binding site in the variable region of an antibody molecule known as a paratope. One antigen can have more than one

- 23 040594 эпитопа. Таким образом, различные антитела могут связываться с различными областями на антигене и могут иметь различные биологические эффекты. Эпитопы могут быть либо конформационными, либо линейными. Конформационный эпитоп продуцируется пространственно сопоставленными аминокислотами из разных сегментов линейной полипептидной цепи. Линейный эпитоп представляет собой тот, что получен смежными аминокислотными остатками в полипептидной цепи. В определенных обстоятельствах эпитоп может содержать фрагменты сахаридов, фосфорильных групп или сульфонильных групп на антигене.- 23 040594 epitopes. Thus, different antibodies may bind to different regions on an antigen and may have different biological effects. Epitopes can be either conformational or linear. A conformational epitope is produced by spatially aligned amino acids from different segments of the linear polypeptide chain. A linear epitope is one obtained by adjacent amino acid residues in a polypeptide chain. In certain circumstances, an epitope may contain fragments of saccharides, phosphoryl groups, or sulfonyl groups on the antigen.

Различные методики, известные специалистам в данной области техники, могут быть использованы для определения того, взаимодействует ли антигенсвязывающий домен антитела с одной или более аминокислотами внутри полипептида или белка. Иллюстративные методики включают, например, стандартный эпитоп перекрестный конкурентный анализ, такой как описанный в Antibodies, Harlow and Lane (Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harb., NY), мутационный анализ аланинового сканирования, анализ пептидных блотов (Reineke, 2004, Methods Mol. Biol. 248:443-463) и анализ расщепления пептида. Кроме того, могут быть использованы такие методы, как удаление эпитопа, экстракция эпитопов и химическая модификация антигенов (Tomer, 2000, Protein Science, 9:487-496). Другим методом, который может быть использован для идентификации аминокислот внутри полипептида, с которым взаимодействует антигенсвязывающий домен антитела, является водород-дейтериевый обмен, обнаруженный с помощью масс-спектрометрии. В общем, метод водород-дейтериевого обмена включает мечение дейтерием представляющего интерес белка с последующим связыванием антитела с меченым дейтерием белком. Затем комплекс белок/антитело переносят в воду, чтобы можно было осуществлять обмен водорода с дейтерием во всех остатках, за исключением остатков, защищенных антителом (которые остаются мечеными дейтерием). После диссоциации антитела целевой белок подвергают расщеплению протеазы и анализу масс-спектрометрии, тем самым выявляя меченые дейтерием остатки, которые соответствуют конкретным аминокислотам, с которыми взаимодействует антитело. См., например, Ehring (1999), Analytical Biochemistry, 267(2):252-259; Engen and Smith (2001), Anal. Chem. 73:256A-265A. Рентгеновская кристаллография комплекса антиген/антитело также может быть использована для целей картирования эпитопов.Various techniques known to those skilled in the art can be used to determine if the antigen-binding domain of an antibody interacts with one or more amino acids within a polypeptide or protein. Illustrative techniques include, for example, standard epitope cross-competition assays such as those described in Antibodies, Harlow and Lane (Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harb., NY), alanine scan mutation analysis, peptide blot analysis (Reineke, 2004, Methods Mol Biol 248:443-463) and peptide digestion analysis. In addition, methods such as epitope removal, epitope extraction, and chemical modification of antigens can be used (Tomer, 2000, Protein Science, 9:487-496). Another method that can be used to identify amino acids within a polypeptide with which an antigen-binding domain of an antibody interacts is hydrogen-deuterium exchange, detected by mass spectrometry. In general, the hydrogen-deuterium exchange method involves labeling the protein of interest with deuterium and then binding the antibody to the deuterium labeled protein. The protein/antibody complex is then transferred to water so that hydrogen can be exchanged with deuterium in all residues, except for residues protected by the antibody (which remain labeled with deuterium). After dissociation of the antibody, the target protein is subjected to protease digestion and mass spectrometry analysis, thereby revealing deuterium-labeled residues that correspond to the specific amino acids with which the antibody interacts. See, for example, Ehring (1999), Analytical Biochemistry, 267(2):252-259; Engen and Smith (2001), Anal. Chem. 73:256A-265A. X-ray crystallography of the antigen/antibody complex can also be used for epitope mapping purposes.

Данное изобретение дополнительно включает анти-PSMA антитела, которые связываются с одним и тем же эпитопом, как и любое конкретное иллюстративное антитело, описанное в данном документе (например, антитела, содержащие любую из аминокислотных последовательностей, как указано в табл. 6 в данном документе). Подобным же образом данное изобретение также включает анти-PSMA антитела, которые конкурируют за связывание с PSMA с любым из конкретных иллюстративных антител, описанных в данном документе (например, антитела, содержащие любую из аминокислотных последовательностей, как указано в табл. 6 в данном документе). Анти-PSMA антитела, раскрытые в заявке США № 15/223434, включены в данный документ посредством ссылки.The invention further includes anti-PSMA antibodies that bind to the same epitope as any specific exemplary antibody described herein (e.g., antibodies containing any of the amino acid sequences as listed in Table 6 herein) . Similarly, the invention also includes anti-PSMA antibodies that compete for binding to PSMA with any of the specific exemplary antibodies described herein (e.g., antibodies containing any of the amino acid sequences as listed in Table 6 herein) . The anti-PSMA antibodies disclosed in US Application No. 15/223434 are incorporated herein by reference.

Данное изобретение также включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека и/или CD3 яванского макака с низкой или обнаруживаемой аффинностью связывания, и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает опухолеассоциированный антиген человека (TAA), причем первый антигенсвязывающий домен связывается с одним и тем же эпитопом на CD3, как любой из конкретных иллюстративных CD3-специфических антигенсвязывающих доменов, описанных в данном документе.The invention also includes bispecific antigen-binding molecules comprising a first antigen-binding domain that specifically binds human CD3 and/or cynomolgus CD3 with low or detectable binding affinity, and a second antigen-binding domain that specifically binds human tumor-associated antigen (TAA), the first antigen-binding domain binds to the same epitope on CD3 as any of the specific exemplary CD3-specific antigen-binding domains described herein.

Кроме того, данное изобретение также включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека и/или CD3 яванского макака с низкой или обнаруживаемой аффинностью связывания, и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает опухолеассоциированный антиген человека (TAA), причем первый антигенсвязывающий домен конкурирует за связывание с CD3 с любым из конкретных иллюстративных CD3-специфических антигенсвязывающих доменов, описанных в данном документе.In addition, the invention also includes bispecific antigen-binding molecules comprising a first antigen-binding domain that specifically binds human CD3 and/or cynomolgus monkey CD3 with low or detectable binding affinity, and a second antigen-binding domain that specifically binds human tumor associated antigen (TAA), wherein the first antigen-binding domain competes for binding to CD3 with any of the specific exemplary CD3-specific antigen-binding domains described herein.

Можно легко определить, связывается ли конкретная антигенсвязывающая молекула (например, антитело) или ее антигенсвязывающий домен с тем же эпитопом или конкурирует за связывание с эталонной антигенсвязывающей молекулой по данному изобретению, используя обычные методы, известные из уровня техники. Например, чтобы определить, связывается ли тестовое антитело с одним и тем же эпитопом на CD3 (или TAA) в качестве эталонной биспецифической антигенсвязывающей молекулы по данному изобретению, эталонная биспецифическая молекула сначала связывается с белком CD3 (или белком TAA). Затем оценивают способность тестируемого антитела связываться с молекулой CD3. Если тестируемое антитело может связываться с CD3 (или TAA) после связывания насыщения с эталонной биспецифической антигенсвязывающей молекулой, можно сделать вывод, что тестируемое антитело связывается с другим эпитопом CD3 (или TAA), чем контрольная биспецифическая антигенсвязывающая молекула. С другой стороны, если тестируемое антитело не может связываться с молекулой CD3 (или TAA) после связывания насыщения с эталонной биспецифической антигенсвязывающей молекулой, тогда тестируемое антитело может связываться с тем же эпитопом CD3 (или TAA), что и эпитоп, связанный эталонной биспецифической антигенсвязывающей молекулой по изобретению. Затем могут бытьWhether a particular antigen-binding molecule (eg, antibody) or its antigen-binding domain binds to the same epitope or competes for binding with a reference antigen-binding molecule of the present invention can be readily determined using conventional methods known in the art. For example, to determine if a test antibody binds to the same epitope on CD3 (or TAA) as a reference bispecific antigen-binding molecule of this invention, the reference bispecific molecule first binds to the CD3 protein (or TAA protein). The ability of the test antibody to bind to the CD3 molecule is then assessed. If the test antibody can bind to CD3 (or TAA) after saturation binding to the reference bispecific antigen-binding molecule, it can be concluded that the test antibody binds to a different CD3 (or TAA) epitope than the control bispecific antigen-binding molecule. On the other hand, if the test antibody cannot bind to the CD3 (or TAA) molecule after saturation binding to the reference bispecific antigen-binding molecule, then the test antibody can bind to the same CD3 (or TAA) epitope as the epitope bound by the reference bispecific antigen-binding molecule. according to the invention. Then there may be

- 24 040594 проведены дополнительные стандартные эксперименты (например, пептидная мутация и анализ связывания), чтобы подтвердить, является ли наблюдаемое отсутствие связывания тестируемого антитела на самом деле связанным со связыванием с тем же эпитопом, что и эталонная биспецифическая антигенсвязывающая молекула, или стерическое блокирование (или другое явление) несет ответственность за отсутствие наблюдаемого связывания. Если контрольное антитело представляет собой такое, которое не имеет измеримого связывания, как показано в данном документе в качестве примера, то эталонное антитело может быть мутировано обратно к последовательности зародышевой линии, чтобы определить связывание с CD3 с целью сравнения взаимодействия эпитопов или сравнения его связывающих свойств с тестируемым антителом, как описано в данном документе. Эксперименты такого типа могут быть выполнены с использованием ELISA, RIA, Biacore, проточной цитометрии или любого другого количественного или качественного анализа связывания с антителом, доступного в данной области техники. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления данного изобретения два антигенсвязывающих белка связываются с одним и тем же (или перекрывающимися) эпитопом, если, например, 1-, 5-, 10-, 20или 100-кратный избыток одного антигенсвязывающего белка ингибирует связывание другого по меньшей мере на 50%, но предпочтительно на 75, 90 или даже на 99%, как измерено в конкурентном анализе связывания (см., например, Junghans et al., Cancer Res. 1990, 50:1495-1502). Альтернативно, считается, что два антигенсвязывающих белка связываются с одним и тем же эпитопом, если по существу все аминокислотные мутации в антигене, которые уменьшают или устраняют связывание одного антигенсвязывающего белка, уменьшают или устраняют связывание другого. Два антигенсвязывающих белка считаются перекрывающимися эпитопами, если только подмножество аминокислотных мутаций, которые уменьшают или устраняют связывание одного антигенсвязывающего белка, уменьшают или устраняют связывание другого.- 24 040594 additional routine experiments (e.g. peptide mutation and binding assay) were performed to confirm whether the observed lack of binding of the test antibody is in fact due to binding to the same epitope as the reference bispecific antigen-binding molecule, or steric blocking (or another phenomenon) is responsible for the lack of observed binding. If the control antibody is one that does not have measurable binding, as shown herein by way of example, then the reference antibody can be mutated back to the germline sequence to determine binding to CD3 in order to compare epitope interactions or compare its binding properties to test antibody as described herein. Experiments of this type can be performed using ELISA, RIA, Biacore, flow cytometry, or any other quantitative or qualitative antibody binding assay available in the art. In accordance with some embodiments of the present invention, two antigen-binding proteins bind to the same (or overlapping) epitope if, for example, a 1-, 5-, 10-, 20-, or 100-fold excess of one antigen-binding protein inhibits binding of the other at least by 50%, but preferably by 75%, 90% or even 99%, as measured in a competitive binding assay (see, for example, Junghans et al., Cancer Res. 1990, 50:1495-1502). Alternatively, two antigen-binding proteins are considered to bind to the same epitope if substantially all amino acid mutations in the antigen that reduce or eliminate the binding of one antigen-binding protein reduce or eliminate the binding of the other. Two antigen-binding proteins are considered overlapping epitopes if only a subset of amino acid mutations that reduce or eliminate the binding of one antigen-binding protein reduce or eliminate the binding of another.

Чтобы определить, конкурирует ли антитело или его антигенсвязывающий домен за связывание с эталонной антигенсвязывающей молекулой, описанная выше методика связывания выполняется в двух направлениях: В первой ориентации типичная антигенсвязывающая молекула может связываться с белком CD3 (или белком TAA) в условиях насыщения с последующей оценкой связывания тестируемого антитела с молекулой CD3 (или TAA). Во второй ориентации тестируемому антителу позволено связываться с молекулой CD3 (или TAA) в условиях насыщения с последующей оценкой связывания эталонной антигенсвязывающей молекулы с молекулой CD3 (или TAA). Если в обеих ориентациях только первая (насыщающая) антигенсвязывающая молекула способна связываться с молекулой CD3 (или TAA), то делается вывод, что тестовое антитело и эталонная антигенсвязывающая молекула конкурируют за связывание с CD3 (или TAA). Как будет понятно специалисту в данной области техники, антитело, которое конкурирует за связывание с эталонной антигенсвязывающей молекулой, необязательно может связываться с тем же эпитопом, что и контрольное антитело, но может стерически блокировать связывание эталонного антитела посредством связывание перекрывающегося или смежного эпитопа. Если контрольное антитело представляет собой такое, которое не имеет измеримого связывания, как показано в данном документе в качестве примера, то эталонное антитело может быть мутировано обратно к последовательности зародышевой линии, чтобы определить связывание с CD3 с целью сравнения взаимодействия эпитопов или сравнения его связывающих свойств или блокирования взаимодействия с тестируемым антителом, как описано в данном документе.To determine if an antibody or its antigen-binding domain competes for binding to a reference antigen-binding molecule, the binding methodology described above is performed in two directions: antibodies with a CD3 (or TAA) molecule. In the second orientation, the test antibody is allowed to bind to the CD3 (or TAA) molecule under saturation conditions, followed by evaluation of the binding of the reference antigen-binding molecule to the CD3 (or TAA) molecule. If in both orientations only the first (saturating) antigen-binding molecule is able to bind to the CD3 (or TAA) molecule, then it is concluded that the test antibody and the reference antigen-binding molecule compete for binding to CD3 (or TAA). As one of skill in the art will appreciate, an antibody that competes for binding to a reference antigen-binding molecule may not necessarily bind to the same epitope as a control antibody, but may sterically block binding of the reference antibody by binding to an overlapping or contiguous epitope. If the control antibody is one that does not have measurable binding, as shown herein by way of example, then the reference antibody can be mutated back to the germline sequence to determine binding to CD3 to compare epitope interactions or compare its binding properties, or blocking interaction with the test antibody, as described herein.

Получение антигенсвязывающих доменов и конструирование биспецифических молекул.Obtaining antigen-binding domains and designing bispecific molecules.

Антигенсвязывающие домены, специфичные для конкретных антигенов, могут быть получены любой технологией генерирования антител, известной в данной области техники. После получения два различных антигенсвязывающих домена, специфичные для двух разных антигенов (например, CD3 и TAA), могут быть соответствующим образом расположены относительно друг друга для получения биспецифической антигенсвязывающей молекулы по данному изобретению с использованием обычных методов. (Обсуждение иллюстративных биспецифических форматов антител, которые могут быть использованы для конструирования биспецифических антигенсвязывающих молекул по данному изобретению, приводится в данном документе в другом месте). В некоторых вариантах осуществления один или более отдельных компонентов (например, тяжелых и легких цепей) мультиспецифических антигенсвязывающих молекул по изобретению получают из химерных, гуманизированных или полностью человеческих антител. Способы получения таких антител хорошо известны в данной области. Например, одна или более тяжелых и/или легких цепей биспецифических антигенсвязывающих молекул по данному изобретению могут быть получены с использованием технологии VELOCIMMUNE™. При использовании технологии VELOCIMMUNE™ (или любой другой технологии генерирования антител человека) высокоаффинные химерные антитела к определенному антигену (например, CD3 или TAA) изначально выделены с вариабельной областью человека и константной областью мыши. Антитела характеризуются и отбираются по желательным характеристикам, включая аффинность, селективность, эпитоп и т.д. Константные области мыши заменяются требуемой константной областью человека для генерации полностью тяжелых и/или легких цепей человека, которые могут быть включены в биспецифические антигенсвязывающие молекулы по данному изобретению.Antigen-binding domains specific for particular antigens can be generated by any antibody generation technique known in the art. Once obtained, two different antigen-binding domains specific for two different antigens (eg, CD3 and TAA) can be appropriately positioned relative to each other to obtain a bispecific antigen-binding molecule of this invention using conventional methods. (A discussion of exemplary bispecific antibody formats that can be used to construct the bispecific antigen-binding molecules of this invention is provided elsewhere herein). In some embodiments, one or more individual components (eg, heavy and light chains) of the multispecific antigen-binding molecules of the invention are derived from chimeric, humanized, or fully human antibodies. Methods for making such antibodies are well known in the art. For example, one or more heavy and/or light chains of the bispecific antigen-binding molecules of this invention can be prepared using VELOCIMMUNE™ technology. Using VELOCIMMUNE™ technology (or any other human antibody generation technology), high affinity chimeric antibodies to a specific antigen (eg, CD3 or TAA) are initially isolated with a human variable region and a mouse constant region. Antibodies are characterized and selected for desirable characteristics, including affinity, selectivity, epitope, and so on. The mouse constant regions are replaced with the desired human constant region to generate fully human heavy and/or light chains that can be incorporated into the bispecific antigen binding molecules of the invention.

- 25 040594- 25 040594

Генетически модифицированные животные могут быть использованы для создания биспецифических антигенсвязывающих молекул человека. Например, может быть использована генетически модифицированная мышь, которая не способна перегруппировать и экспрессировать вариабельную последовательность эндогенной легкой цепи иммуноглобулина мыши, причем мышь экспрессирует только один или два вариабельных домена легкой цепи человека, кодируемых последовательностями иммуноглобулина человека, функционально связанными с константными генами каппа (к) мыши в эндогенном локусе каппа (к) мыши. Такие генетически модифицированные мыши могут быть использованы для получения полностью биспецифических антигенсвязывающих молекул человека, содержащих две различные тяжелые цепи, которые ассоциируются с идентичной легкой цепью, которая содержит вариабельный домен, полученный из одного из двух разных сегментов генов вариабельной области легкой цепи человека. (См., например, US 2011/0195454 для детального обсуждения таких модифицированных мышей и их использования для получения биспецифических антигенсвязывающих молекул). Антитела по изобретению могут содержать тяжелые цепи иммуноглобулина, связанные с общей легкой цепью. Обычная легкая цепь может быть получена из когнатной легкой цепи, тяжелой цепи анти-ТАА или получена из известной вариабельной области легкой цепи или общедоступного домена, полученной из легкой цепи, проявляющей разнородность или способность спариваться с широким спектром некогнатных тяжелых цепей, т.е. универсальную или обычную легкую цепь. Антитела по изобретению могут содержать тяжелые цепи иммуноглобулина, связанные с одной реаранжированной легкой цепью. В некоторых вариантах осуществления легкая цепь представляет собой вариабельный домен, полученный из сегмента гена Vk1-39 или сегмента гена Vk3-20 человека. В других вариантах осуществления легкая цепь содержит вариабельный домен, полученный из сегмента гена Vk1-39 человека, реаранжированного с помощью сегмента Jk5 человека или Jk1 гена человека или сегмента гена Vk3-20, реаранжированного с помощью сегмента гена Jk1 человека, или Vk1-39, реаранжированного с помощью сегмента гена Jk1 человека.Genetically modified animals can be used to create bispecific human antigen-binding molecules. For example, a genetically modified mouse that is unable to rearrange and express an endogenous mouse immunoglobulin light chain variable sequence can be used, wherein the mouse expresses only one or two human light chain variable domains encoded by human immunoglobulin sequences operably linked to kappa(k) constant genes. mice at the endogenous kappa(k) mouse locus. Such genetically modified mice can be used to generate fully bispecific human antigen-binding molecules containing two different heavy chains that are associated with an identical light chain that contains a variable domain derived from one of two different human light chain variable gene segments. (See, for example, US 2011/0195454 for a detailed discussion of such modified mice and their use in the production of bispecific antigen-binding molecules). The antibodies of the invention may contain immunoglobulin heavy chains linked to a common light chain. A conventional light chain can be derived from a cognate light chain, an anti-TAA heavy chain, or derived from a known light chain derived variable region or a public domain derived from a light chain that exhibits heterogeneity or the ability to pair with a wide range of non-cognate heavy chains, i. universal or conventional light chain. Antibodies of the invention may contain immunoglobulin heavy chains linked to a single rearranged light chain. In some embodiments, the light chain is a variable domain derived from a human Vk1-39 gene segment or a human Vk3-20 gene segment. In other embodiments, the light chain comprises a variable domain derived from a human Vk1-39 gene segment rearranged with a human Jk5 segment or a human Jk1 gene segment, or a Vk3-20 gene segment rearranged with a human Jk1 gene segment, or a Vk1-39 rearranged using a segment of the human Jk1 gene.

Биоэквиваленты.Bioequivalents.

Данное изобретение охватывает антигенсвязывающие молекулы, имеющие аминокислотные последовательности, которые отличаются от тех, которые описаны в раскрытых в данном документе примерах молекулах, но которые сохраняют способность связывать или взаимодействовать с CD3 и/или TAA. Такие варианты молекул могут содержать одну или более инсерций, делеций или замещений аминокислот по сравнению с исходной последовательностью, но проявляют биологическую активность, которая по существу эквивалентна биологической активности описанных биспецифических антигенсвязывающих молекул.This invention encompasses antigen-binding molecules having amino acid sequences that differ from those described in the molecules disclosed herein, but which retain the ability to bind or interact with CD3 and/or TAA. Such molecular variants may contain one or more insertions, deletions, or substitutions of amino acids compared to the original sequence, but exhibit biological activity that is substantially equivalent to that of the described bispecific antigen-binding molecules.

Данное изобретение включает антигенсвязывающие молекулы, которые биоэквивалентны любой из иллюстративных антигенсвязывающих молекул, изложенных в данном документе. Два антигенсвязывающих белка или антитела считаются биоэквивалентными, если они представляют собой фармацевтические эквиваленты или фармацевтические альтернативы, чья скорость и степень абсорбции не демонстрируют существенной разницы при введении в той же молярной дозе в аналогичных экспериментальных условиях, в виде единичных доз или множественной дозы. Некоторые антигенсвязывающие белки будут считаться эквивалентами или фармацевтическими альтернативами, если они эквивалентны по степени их абсорбции, но не по скорости их поглощения, и все же могут считаться биоэквивалентными, поскольку такие различия в скорости абсорбции являются преднамеренными и отражаются как не имеющие существенного значения для достижения эффективных концентраций лекарственного средства для тела, например при хроническом применении, и считаются физически незначимыми для конкретного исследуемого лекарственного продукта.This invention includes antigen-binding molecules that are bioequivalent to any of the exemplary antigen-binding molecules set forth herein. Two antigen-binding proteins or antibodies are considered bioequivalent if they are pharmaceutical equivalents or pharmaceutical alternatives whose rate and extent of absorption does not show a significant difference when administered at the same molar dose under similar experimental conditions, as single doses or multiple doses. Certain antigen-binding proteins will be considered equivalents or pharmaceutical alternatives if they are equivalent in their rate of absorption but not their rate of uptake, and yet may be considered bioequivalent because such differences in rate of absorption are intentional and are reported as not essential to achieving effective efficacy. concentrations of the drug in the body, such as for chronic use, and are considered to be physically insignificant for the particular investigational medicinal product.

В одном варианте осуществления два антигенсвязывающих белка являются биоэквивалентными, если нет клинически значимых различий в их безопасности, чистоте и активности.In one embodiment, two antigen-binding proteins are bioequivalent if there are no clinically significant differences in their safety, purity, and potency.

В одном варианте осуществления два антигенсвязывающих белка являются биоэквивалентными, если пациент может переключаться один или более раз между эталонным продуктом и биологическим продуктом без ожидаемого увеличения риска неблагоприятных эффектов, включая клинически значимое изменение иммуногенности или уменьшенное эффективность по сравнению с продолжающейся терапией без такого переключения.In one embodiment, two antigen-binding proteins are bioequivalent if the patient can switch one or more times between a reference product and a biological product without an expected increase in the risk of adverse effects, including a clinically significant change in immunogenicity or reduced efficacy compared to ongoing therapy without such a switch.

В одном варианте осуществления два антигенсвязывающих белка являются биоэквивалентными, если оба они действуют по общему механизму или механизмам действия для условия или условий использования в той мере, в которой известны такие механизмы.In one embodiment, two antigen-binding proteins are bioequivalent if they both act on a common mechanism or mechanisms of action for the condition or conditions of use, to the extent that such mechanisms are known.

Биоэквивалентность может быть продемонстрирована методами in vivo и in vitro. Меры биоэквивалентности включают, например, (a) тест in vivo у людей или других млекопитающих, в которых концентрация антитела или его метаболитов измеряется в крови, плазме, сыворотке или другой биологической жидкости в зависимости от времени; (b) тест in vitro, который был коррелирован с данными и достоверно прогнозирует данные биодоступности человека in vivo; (c) тест in vivo у людей или других млекопитающих, в которых соответствующий острый фармакологический эффект антитела (или его мишени) измеряется как функция времени; и (d) в хорошо контролируемое клиническое исследование, которое устанавливает безопасность, эффективность, или биодоступность, или биоэквивалентность антигенсвязыBioequivalence can be demonstrated by in vivo and in vitro methods. Measures of bioequivalence include, for example, (a) an in vivo test in humans or other mammals, in which the concentration of an antibody or its metabolites is measured in blood, plasma, serum, or other body fluid over time; (b) an in vitro test that has been correlated with the data and reliably predicts human in vivo bioavailability data; (c) an in vivo test in humans or other mammals, in which the corresponding acute pharmacological effect of the antibody (or its target) is measured as a function of time; and (d) in a well-controlled clinical trial that establishes the safety, efficacy, or bioavailability or bioequivalence of antigen binding

- 26 040594 вающего белка.- 26 040594 protein.

Биоэквивалентные варианты иллюстративных биспецифических антигенсвязывающих молекул, изложенные в данном документе, могут быть сконструированы, например, путем осуществления различных замещений остатков или последовательностей или удаления терминальных или внутренних остатков или последовательностей, не необходимых для биологической активности. Например, остатки цистеина, которые не являются существенными для биологической активности, могут быть удалены или заменены другими аминокислотами, чтобы предотвратить образование ненужных или некорректных внутримолекулярных дисульфидных мостиков при ренатурации. В других контекстах биоэквивалентные антигенсвязывающие белки могут включать варианты приведенных в данном документе иллюстративных биспецифических антигенсвязывающих молекул, включающих аминокислотные изменения, которые изменяют характеристики гликозилирования молекул, например мутации, которые устраняют или удаляют гликозилирование.Bioequivalent variants of the exemplary bispecific antigen-binding molecules set forth herein may be constructed, for example, by making various residue or sequence substitutions, or deleting terminal or internal residues or sequences not necessary for biological activity. For example, cysteine residues that are not essential for biological activity may be removed or replaced with other amino acids to prevent the formation of unnecessary or incorrect intramolecular disulfide bridges upon renaturation. In other contexts, bioequivalent antigen-binding proteins may include variants of the exemplary bispecific antigen-binding molecules described herein, including amino acid changes that alter the glycosylation characteristics of the molecules, such as mutations that eliminate or remove glycosylation.

Селективность по видам и видовая кросс-реактивность.Species selectivity and species cross-reactivity.

В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения предложены антигенсвязывающие молекулы, которые проявляют слабое или вообще не взаимодействуют с CD3 человека и слабое или отсутствующее взаимодействия с CD3 других видов, такими как CD3 яванского макака. Также представлены антигенсвязывающие молекулы, которые связываются с TAA человека, но не с TAA других видов. Данное изобретение также включает антигенсвязывающие молекулы, которые связываются с CD3 человека и CD3 от одного или более видов, отличных от человека; и/или антигенсвязывающие молекулы, которые связываются с TAA человека и с TAA из одного или более видов, отличных от человека.In accordance with some embodiments of the invention, antigen-binding molecules are provided that exhibit little or no interaction with human CD3 and little or no interaction with CD3 of other species, such as cynomolgus monkey CD3. Also provided are antigen-binding molecules that bind to human TAA but not TAA from other species. The invention also includes antigen-binding molecules that bind to human CD3 and CD3 from one or more non-human species; and/or antigen-binding molecules that bind to human TAA and to TAA from one or more non-human species.

В соответствии с некоторыми иллюстративными вариантами осуществления изобретения предложены антигенсвязывающие молекулы, которые слабо связываются с CD3 человека и/или TAA человека и могут связываться или не связываться, в зависимости от случая, с одной или более CD3 и/или TAA мыши, крысы, морской свинки, хомяка, песчанки, свиньи, кошки, собаки, кролика, козы, овцы, коровы, лошади, верблюда, яванского макака, мартышки, макака резус или шимпанзе. Например, в некоторых иллюстративных вариантах осуществления данного изобретения предложены биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие первый антигенсвязывающий домен, который слабо связывает CD3 человека и CD3 яванского макака, и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA, MUC16, EGFRvIII или STEAP2 человека.In accordance with some exemplary embodiments of the invention, antigen-binding molecules are provided that bind weakly to human CD3 and/or human TAA and may or may not bind, as the case may be, to one or more mouse, rat, guinea pig CD3 and/or TAA. , hamster, gerbil, pig, cat, dog, rabbit, goat, sheep, cow, horse, camel, cynomolgus monkey, marmoset, rhesus monkey, or chimpanzee. For example, in some illustrative embodiments, the present invention provides bispecific antigen-binding molecules comprising a first antigen-binding domain that weakly binds human CD3 and cynomolgus monkey CD3 and a second antigen-binding domain that specifically binds human PSMA, MUC16, EGFRvIII, or STEAP2.

Иммуноконъюгаты.Immunoconjugates.

Данное изобретение охватывает антигенсвязывающие молекулы, конъюгированные с терапевтическим фрагментом (иммуноконъюгат), таким как цитотоксин, химиотерапевтический препарат, иммунодепрессант или радиоизотоп. Цитотоксические агенты включают любой агент, который вреден для клеток. Примеры пригодных цитотоксических агентов и химиотерапевтических агентов для формирования иммуноконъюгатов известны в данной области техники (см., например, WO 05/103081).The present invention encompasses antigen-binding molecules conjugated to a therapeutic moiety (immunoconjugate), such as a cytotoxin, a chemotherapeutic drug, an immunosuppressant, or a radioisotope. Cytotoxic agents include any agent that is detrimental to cells. Examples of suitable cytotoxic agents and chemotherapeutic agents for the formation of immunoconjugates are known in the art (see, for example, WO 05/103081).

Терапевтический препарат и введение.Therapeutic drug and administration.

Данное изобретение относится к фармацевтическим композициям, содержащим антигенсвязывающие молекулы по данному изобретению. Фармацевтические композиции по изобретению составлены с пригодными носителями, эксципиентами и другими агентами, которые обеспечивают улучшенную передачу, доставку, переносимость и т.п. Множество пригодных составов можно найти в формуляре, известном всем фармацевтическим химикам: Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company, Истон, штат Пенсильвания. Эти составы включают, например, порошки, пасты, мази, желе, воски, масла, липиды, (катионные или анионные) липиды, содержащие везикулы (такие как LIPOFECTIN™, Life Technologies, Карлсбад, Калифорния), конъюгаты ДНК, безводные абсорбционные пасты, эмульсии масло-в-воде и вода-в-масле, эмульсии карбовакс (полиэтиленгликоли различной молекулярной массы), полутвердые гели и полутвердые смеси, содержащие карбовакс. См. также Powell et al. Compendium of excipients for parenteral formulations, PDA (1998), J. Pharm. Sci. Technol. 52:238-311.This invention relates to pharmaceutical compositions containing the antigen-binding molecules of this invention. Pharmaceutical compositions of the invention are formulated with suitable carriers, excipients, and other agents that provide improved transfer, delivery, tolerability, and the like. A variety of suitable formulations can be found in a formulary known to all pharmaceutical chemists: Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company, Easton, PA. These formulations include, for example, powders, pastes, ointments, jellies, waxes, oils, lipids, (cationic or anionic) lipids containing vesicles (such as LIPOFECTIN™, Life Technologies, Carlsbad, CA), DNA conjugates, anhydrous absorption pastes, oil-in-water and water-in-oil emulsions, carbovax emulsions (polyethylene glycols of various molecular weights), semi-solid gels and semi-solid mixtures containing carbovax. See also Powell et al. Compendium of excipients for parenteral formulations, PDA (1998), J. Pharm. sci. Technol. 52:238-311.

Доза антигенсвязывающей молекулы, вводимая пациенту, может варьировать в зависимости от возраста и размера пациента, целевого заболевания, состояний, пути введения и т.п. Предпочтительная доза обычно рассчитывается в соответствии с массой тела или площадью поверхности тела. Когда биспецифическая антигенсвязывающая молекула по данному изобретению используется для терапевтических целей у взрослого пациента, может быть выгодным внутривенно вводить биспецифическую антигенсвязывающую молекулу по данному изобретению, как правило, в разовой дозе от около 0,01 до около 20 мг/кг массы тела, более предпочтительно от около 0,02 до около 7, от около 0,03 до около 5 или от около 0,05 до около 3 мг/кг массы тела. В зависимости от тяжести состояния можно отрегулировать частоту и продолжительность лечения. Эффективные дозы и графики для введения биспецифической антигенсвязывающей молекулы могут быть определены эмпирически; например, прогресс пациента может контролироваться путем периодической оценки, и корректировать дозу соответствующим образом. Кроме того, межвидовое масштабирование доз может быть выполнено с использованием хорошо известных в данной области техники методов (например, Mordenti et al., 1991, Pharmaceut. Res. 8:1351).The dose of antigen binding molecule administered to a patient may vary depending on the age and size of the patient, the target disease, conditions, route of administration, and the like. The preferred dose is usually calculated according to body weight or body surface area. When the bispecific antigen-binding molecule of this invention is used for therapeutic purposes in an adult patient, it may be advantageous to intravenously administer the bispecific antigen-binding molecule of this invention, typically at a single dose of from about 0.01 to about 20 mg/kg body weight, more preferably from about 0.02 to about 7, about 0.03 to about 5, or about 0.05 to about 3 mg/kg body weight. Depending on the severity of the condition, the frequency and duration of treatment can be adjusted. Effective doses and schedules for administering a bispecific antigen-binding molecule can be determined empirically; for example, the patient's progress can be monitored by periodic evaluation, and the dose adjusted accordingly. In addition, interspecies dose scaling can be performed using methods well known in the art (eg, Mordenti et al., 1991, Pharmaceut. Res. 8:1351).

Различные системы доставки известны и могут быть использованы для введения фармацевтической композиции по изобретению, например инкапсулирование в липосомы, микрочастицы, микрокапсулы,Various delivery systems are known and can be used to administer the pharmaceutical composition of the invention, such as encapsulation in liposomes, microparticles, microcapsules,

- 27 040594 рекомбинантные клетки, способные экспрессировать мутантные вирусы, опосредуемый рецептором эндоцитоз (см., например, Wu et al., 1987, J. Biol. Chem. 262:4429-4432). Способы введения включают, но не ограничиваются ими, внутрикожные, внутримышечные, внутрибрюшинные, внутривенные, подкожные, интраназальные, эпидуральные и пероральные пути. Композицию можно вводить любым удобным способом, например путем инфузии или болюсной инъекции путем абсорбции через эпителиальные или слизистые подкладки (например, слизистую оболочку полости рта, слизистую оболочку прямой кишки и кишечника и т.д.), и можно вводить вместе с другими биологически активными агентами. Введение может быть системным или местным.- 27 040594 recombinant cells capable of expressing mutant viruses mediated by receptor endocytosis (see, for example, Wu et al., 1987, J. Biol. Chem. 262:4429-4432). Routes of administration include, but are not limited to, intradermal, intramuscular, intraperitoneal, intravenous, subcutaneous, intranasal, epidural, and oral routes. The composition may be administered by any convenient route, for example by infusion or bolus injection by absorption through epithelial or mucosal linings (eg oral mucosa, rectal and intestinal mucosa, etc.) and may be administered together with other biologically active agents . The introduction can be systemic or local.

Фармацевтическая композиция по данному изобретению может быть введена подкожно или внутривенно стандартной иглой и шприцем. Кроме того, в отношении подкожной доставки шприцевое устройство для доставки легко может иметь приложения для доставки фармацевтической композиции по данному изобретению. Такое шприцевое устройство для доставки может быть многоразовым или одноразовым. Многоразовое шприцевое устройство доставки обычно использует сменный картридж, который содержит фармацевтическую композицию. Как только вся фармацевтическая композиция внутри картриджа была введена, а картридж опустел, пустой картридж можно легко отбросить и заменить новым картриджем, который содержит фармацевтическую композицию. Затем шприцевое устройство для доставки может быть повторно использовано. В одноразовом шприцевом устройстве для доставки нет сменного картриджа. Скорее, одноразовое шприцевое устройство для доставки заполняется фармацевтической композицией, удерживаемой в резервуаре внутри устройства. Как только резервуар опустеет от фармацевтической композиции, все устройство выбрасывается.The pharmaceutical composition of this invention may be administered subcutaneously or intravenously with a standard needle and syringe. In addition, with respect to subcutaneous delivery, a syringe delivery device can easily have applications for delivering the pharmaceutical composition of this invention. Such a syringe delivery device may be reusable or disposable. A reusable syringe delivery device typically uses a replaceable cartridge that contains a pharmaceutical composition. Once all of the pharmaceutical composition within the cartridge has been introduced and the cartridge is empty, the empty cartridge can be easily discarded and replaced with a new cartridge that contains the pharmaceutical composition. The syringe delivery device can then be reused. There is no replaceable cartridge in the disposable syringe delivery device. Rather, a disposable syringe delivery device is filled with a pharmaceutical composition held in a reservoir within the device. Once the reservoir is empty of the pharmaceutical composition, the entire device is discarded.

Многочисленные повторно используемые шприцевые устройства для доставки и автоинъекторы имеют функцию для подкожной доставки фармацевтической композиции по данному изобретению. Примеры включают, но не ограничиваются ими, AUTOPEN™ (Owen Mumford, Inc., Вудсток, Великобритания), шприц-ручку DISETRONIC™ (Disetronic Medical Systems, Бергдорф, Швейцария), шприц-ручку HUMALOG MIX 75/25™, шприц-ручку HUMALOG™, шприц-ручку HUMALIN 70/30™ (Eli Lilly and Co., Индианаполис, штат Индиана), NOVOPEN™ I, II и III (Novo Nordisk, Копенгаген, Дания), NOVOPEN JUNIOR™ (Novo Nordisk, Копенгаген, Дания), шприц-ручку BD™ (Becton Dickinson, Франклинг лейке, штат Нью-Джерси), OPTIPEN™, OPTIPEN PRO™, OPTIPEN STARLET™ и OPTICLIK™ (sanofi-aventis, Франкфурт, Германия), названы лишь несколько. Примеры одноразовых шприцевых устройств для доставки, имеющих функцию для подкожной доставки фармацевтической композиции по данному изобретению, включают, но не ограничиваются ими, шприц-ручку SOLOSTAR™ (sanofi-aventis), FLEXPEN™ (Novo Nordisk) и KWIKPEN™ (Eli Lilly), SURECLICK™ Autoinjector (Amgen, Саузенд окс, штат Калифорния), PENLET™ (Haselmeier, Штутгарт, Германия), EPIPEN (Dey, L.P.) и шприц-ручку HUMIRA™ (Abbott Labs, Abbott Park IL), названы лишь несколько.Numerous reusable syringe delivery devices and autoinjectors have the function of subcutaneously delivering the pharmaceutical composition of this invention. Examples include, but are not limited to, AUTOPEN™ (Owen Mumford, Inc., Woodstock, UK), DISETRONIC™ pen (Disetronic Medical Systems, Bergdorf, Switzerland), HUMALOG MIX 75/25™ pen, pen HUMALOG™, HUMALIN 70/30™ pen (Eli Lilly and Co., Indianapolis, Ind.), NOVOPEN™ I, II and III (Novo Nordisk, Copenhagen, Denmark), NOVOPEN JUNIOR™ (Novo Nordisk, Copenhagen, Denmark) ), the BD™ pen (Becton Dickinson, Frankling Lake, NJ), OPTIPEN™, OPTIPEN PRO™, OPTIPEN STARLET™ and OPTICLIK™ (sanofi-aventis, Frankfurt, Germany), to name but a few. Examples of disposable syringe delivery devices having the function of subcutaneously delivering the pharmaceutical composition of this invention include, but are not limited to, the SOLOSTAR™ pen (sanofi-aventis), FLEXPEN™ (Novo Nordisk) and KWIKPEN™ (Eli Lilly), SURECLICK™ Autoinjector (Amgen, Thousand Oaks, CA), PENLET™ (Haselmeier, Stuttgart, Germany), EPIPEN (Dey, L.P.) and HUMIRA™ pen (Abbott Labs, Abbott Park IL), to name but a few.

В определенных ситуациях фармацевтическая композиция может поставляться в системе с контролируемым высвобождением. В одном варианте осуществления может использоваться насос (см. Langer, ранее; Sefton, 1987, CRC Crit. Ref. Biomed. Eng. 14:201). В другом варианте могут быть использованы полимерные материалы; см. Medical Applications of Controlled Release, Langer and Wise (eds.), 1974, CRC Pres., Boca Raton, Florida. В еще одном варианте осуществления система контролируемого высвобождения может быть расположена вблизи мишени композиции, что требует лишь доли системной дозы (см., например, Goodson, 1984, in Medical Applications of Controlled Release, supra, vol. 2, p. 115-138). Другие системы с контролируемым высвобождением обсуждаются в обзоре Langer, 1990, Science, 249:1527-1533.In certain situations, the pharmaceutical composition may be delivered in a controlled release system. In one embodiment, a pump may be used (see Langer, formerly; Sefton, 1987, CRC Crit. Ref. Biomed. Eng. 14:201). Alternatively, polymeric materials may be used; see Medical Applications of Controlled Release, Langer and Wise (eds.), 1974, CRC Pres., Boca Raton, Florida. In yet another embodiment, the controlled release system may be located near the target of the composition, requiring only a fraction of the systemic dose (see, e.g., Goodson, 1984, in Medical Applications of Controlled Release, supra, vol. 2, p. 115-138) . Other controlled release systems are reviewed by Langer, 1990, Science, 249:1527-1533.

Инъецируемые препараты могут включать лекарственные формы для внутривенных, подкожных, внутрикожных и внутримышечных инъекций, капельных инфузий и т.д. Эти инъекционные препараты могут быть получены общеизвестными способами. Например, инъецируемые препараты могут быть получены, например, путем растворения, суспендирования или эмульгирования антитела или его соли, описанных выше, в стерильной водной среде или маслянистой среде, обычно используемой для инъекций. В качестве водной среды для инъекций существуют, например, физиологический раствор, изотонический раствор, содержащий глюкозу и другие вспомогательные агенты и т.д., которые могут быть использованы в комбинации с подходящим солюбилизирующим агентом, таким как спирт (например, этанол) (например, пропиленгликоль, полиэтиленгликоль), неионное поверхностно-активное вещество (например, полисорбат 80, HCO-50 (полиоксиэтилен (50 моль) аддукт гидрированного касторового масла) и т.д. В качестве маслянистой среды используют, например, кунжутное масло, соевое масло и т.д., которые могут использоваться в комбинации с солюбилизирующим агентом, таким как бензилбензоат, бензиловый спирт и т.д. Полученную таким образом инъекцию предпочтительно помещают в соответствующую ампулу.Injectable preparations may include dosage forms for intravenous, subcutaneous, intradermal and intramuscular injections, drip infusions, etc. These injectable preparations can be obtained by conventional methods. For example, injectable preparations can be prepared, for example, by dissolving, suspending, or emulsifying an antibody or salt thereof, as described above, in a sterile aqueous or oily medium commonly used for injection. As an aqueous injection medium, there are, for example, physiological saline, isotonic saline containing glucose and other auxiliary agents, etc., which can be used in combination with a suitable solubilizing agent such as an alcohol (for example, ethanol) (for example, propylene glycol, polyethylene glycol), non-ionic surfactant (e.g., polysorbate 80, HCO-50 (polyoxyethylene (50 mol) hydrogenated castor oil adduct), etc.) As the oily medium, for example, sesame oil, soybean oil, etc. .d., which can be used in combination with a solubilizing agent such as benzyl benzoate, benzyl alcohol, etc. The injection thus obtained is preferably placed in an appropriate ampoule.

Преимущественно фармацевтические композиции для перорального или парентерального применения, описанные выше, готовят в виде лекарственных форм с единичной дозой, пригодных для дозирования активных ингредиентов. Такие лекарственные формы в единичной дозе включают, например, таблетки, пилюли, капсулы, инъекции (ампулы), суппозитории и т.д. Количество вышеуказанного антитела обычно составляет от 5 до 500 мг на лекарственную форму в стандартной дозе; особенно в форме инъек- 28 040594 ции, предпочтительно, чтобы вышеуказанное антитело содержалось в количестве от около 5 до околоPreferably, the pharmaceutical compositions for oral or parenteral administration described above are formulated into unit dose dosage forms suitable for dosing the active ingredients. Such unit dosage forms include, for example, tablets, pills, capsules, injections (ampoules), suppositories, and the like. The amount of the above antibody is usually from 5 to 500 mg per dosage form in a unit dose; especially in the form of an injection, it is preferred that the above antibody be present in an amount of from about 5 to about

100 мг и от около 10 до около 250 мг для других лекарственных форм.100 mg and about 10 to about 250 mg for other dosage forms.

Терапевтическое применение антигенсвязывающих молекул.Therapeutic applications of antigen-binding molecules.

Данное изобретение включает способы, включающие введение субъекту, нуждающемуся в этом, терапевтической композиции, содержащей противоопухолевое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу, которая специфически связывается слабо или имеет недетектируемое связывание с CD3, и связывает опухолеассоциированный антиген. Терапевтическая композиция может содержать любое из антител или биспецифических антигенсвязывающих молекул, описанных в данном документе, и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель. Используемый в данном документе термин субъект, нуждающийся в этом означает человека или животное, отличное от человека, которое проявляет один или более симптомов или признаков рака (например, субъект, экспрессирующий опухоль или страдающий любым из видов рака, упомянутых ниже) или которое в противном случае выиграет от ингибирования или уменьшения активности опухолей или истощения опухолевых клеток (например, клеток рака простаты PSMA++).This invention includes methods comprising administering to a subject in need thereof a therapeutic composition comprising an antitumor antibody, or an antigen-binding fragment thereof, or a bispecific antigen-binding molecule that specifically binds weakly or has undetectable binding to CD3 and binds a tumor-associated antigen. The therapeutic composition may contain any of the antibodies or bispecific antigen-binding molecules described herein and a pharmaceutically acceptable carrier or diluent. As used herein, the term subject in need means a human or non-human animal that exhibits one or more symptoms or signs of cancer (e.g., a subject expressing a tumor or suffering from any of the cancers mentioned below) or who otherwise would benefit from inhibition or reduction of tumor activity or depletion of tumor cells (eg PSMA++ prostate cancer cells).

Антитела и биспецифические антигенсвязывающие молекулы по изобретению (и терапевтические композиции, содержащие их) пригодны, среди прочего, для лечения любого заболевания или расстройства, при которых стимуляция, активация и/или нацеливание иммунного ответа были бы полезными. В частности, биспецифические антигенсвязывающие молекулы по данному изобретению могут быть использованы для лечения, профилактики и/или улучшения любого заболевания или расстройства, ассоциированного или опосредованного клеткой, экспрессирующей TAA, например экспрессии PSMA или активности или пролиферации клеток PSMA+. Механизм действия, посредством которого достигаются терапевтические способы по изобретению, включает лизис клеток, экспрессирующих опухолеассоциированные антигены, в присутствии эффекторных клеток, например CDC, апоптоз, ADCC, фагоцитоз или комбинации двух или более данных механизмов. Клетки, экспрессирующие опухолеассоциированные антигены, такие как PSMA, MUC16, STEAP2 или EGFRvIII, которые могут быть ингибированы или уничтожены с использованием биспецифических антигенсвязывающих молекул по изобретению, включают, например, опухолевые клетки предстательной железы.The antibodies and bispecific antigen-binding molecules of the invention (and therapeutic compositions containing them) are suitable, inter alia, for the treatment of any disease or disorder in which stimulating, activating and/or targeting an immune response would be beneficial. In particular, the bispecific antigen binding molecules of this invention can be used to treat, prevent and/or improve any disease or disorder associated with or mediated by a TAA expressing cell, such as PSMA expression or PSMA+ cell activity or proliferation. The mechanism of action by which the therapeutic methods of the invention are achieved involves the lysis of cells expressing tumor associated antigens in the presence of effector cells, eg CDC, apoptosis, ADCC, phagocytosis, or combinations of two or more of these mechanisms. Cells expressing tumor-associated antigens such as PSMA, MUC16, STEAP2, or EGFRvIII that can be inhibited or killed using the bispecific antigen-binding molecules of the invention include, for example, prostate tumor cells.

Антигенсвязывающие молекулы по данному изобретению могут быть использованы для лечения, например, первичных и/или метастатических опухолей, возникающих в головном мозге и мозговых оболочках, голове и шее, ротоглотке, легочном и бронхиальном дереве, желудочно-кишечном тракте, мужском и женском репродуктивном тракте, мышцах, кости, коже и придатках, соединительной ткани, селезенке, иммунной системе, кроветворных клетках и костном мозге, печени и мочевыводящих путях, почке, мочевом пузыре и/или специальных сенсорных органах, таких как глаз. В некоторых вариантах осуществления биспецифические антигенсвязывающие молекулы по изобретению используются для лечения одного или более из следующих видов рака: карциномы поджелудочной железы, рака головы и шеи, рака предстательной железы, злокачественных глиом, остеосаркомы, колоректального рака, рака молочной железы, рака желудка (например, рак желудка с амплификацией MET), злокачественной мезотелиомы, множественной миеломы, рака яичника, мелкоклеточного рака легкого, немелкоклеточного рака легкого, синовиальной саркомы, рака щитовидной железы, рака молочной железы, меланомаглиомы, рака молочной железы (например, протоковых или внутриутробных карцином молочной железы), плоскоклеточного рака, рак пищевода, язвенной клеточной карциномы почек, хромофобной карциномы почки, (почечная) онкоцитомы, (почечная) карциномы транзиторных клеток, уротелиальной карциномы (мочевого пузыря), аденокарциномы или мелкоклеточной карциномы (мочевого пузыря). В соответствии с некоторыми вариантами осуществления данного изобретения биспецифические антитела пригодны для лечения пациента, страдающего рефрактерным или устойчивым к лечению раком, например, устойчивый к кастрации, рак предстательной железы. В соответствии с иллюстративными вариантами осуществления изобретения предлагаются способы, включающие введение анти-CD3/анти-PSMA биспецифической антигенсвязывающей молекулы, раскрытой в данном документе, пациенту, страдающему раком простаты, резистентным к кастрации. Аналитические/диагностические методы, известные в данной области техники, такие как сканирование опухолей и т.д., могут быть использованы для определения того, содержит ли пациент опухоль, устойчивую к кастрации.The antigen binding molecules of this invention can be used to treat, for example, primary and/or metastatic tumors arising in the brain and meninges, head and neck, oropharynx, pulmonary and bronchial tree, gastrointestinal tract, male and female reproductive tract, muscles, bones, skin and appendages, connective tissue, spleen, immune system, hematopoietic cells and bone marrow, liver and urinary tract, kidney, bladder and/or special sensory organs such as the eye. In some embodiments, the bispecific antigen binding molecules of the invention are used to treat one or more of the following cancers: pancreatic carcinoma, head and neck cancer, prostate cancer, malignant gliomas, osteosarcoma, colorectal cancer, breast cancer, gastric cancer (e.g., gastric cancer with MET amplification), malignant mesothelioma, multiple myeloma, ovarian cancer, small cell lung cancer, non-small cell lung cancer, synovial sarcoma, thyroid cancer, breast cancer, melanomaglioma, breast cancer (eg, ductal or intrauterine breast carcinomas) , squamous cell carcinoma, cancer of the esophagus, ulcerative cell carcinoma of the kidney, chromophobic carcinoma of the kidney, (renal) oncocytoma, (renal) transient cell carcinoma, urothelial carcinoma (bladder), adenocarcinoma, or small cell carcinoma (bladder). In accordance with some embodiments of the present invention, the bispecific antibodies are useful in treating a patient suffering from treatment-refractory or treatment-resistant cancer, eg, castration-resistant prostate cancer. In accordance with exemplary embodiments of the invention, methods are provided comprising administering an anti-CD3/anti-PSMA bespecifically antigen-binding molecule disclosed herein to a patient suffering from castration-resistant prostate cancer. Analytical/diagnostic methods known in the art, such as tumor scanning, etc., can be used to determine if a patient contains a castration-resistant tumor.

Данное изобретение также включает способы лечения остаточного рака у субъекта. Используемый в данном документе термин остаточный рак означает существование или персистенцию одной или более раковых клеток у субъекта после лечения противораковой терапией, такой как терапия первой линии или стандартная терапия.The invention also includes methods for treating residual cancer in a subject. As used herein, the term residual cancer refers to the existence or persistence of one or more cancer cells in a subject following treatment with an anticancer therapy, such as first line therapy or standard therapy.

В соответствии с некоторыми аспектами данное изобретение относится к способам лечения рака, связанного с экспрессией TAA (например, рак предстательной железы, связанный с экспрессией PSMA или экспрессией STEAP2, глиобластома, связанная с экспрессией EGFRvIII, или рак яичника, ассоциированный с экспрессией MUC16), включающим введение одного или более биспецифических антигенсвязывающих молекул, описанных в данном документе в другом месте, субъекту после того, как у субъекта было установлено, что он имеет рак. Например, данное изобретение включает способы лечения рака предстательной железы, включающие введение анти-CD3/анти-TAA биспецифической антигенсвязы- 29 040594 вающей молекулы пациенту через 1 сутки, 2 суток, 3 суток, 4 суток, 5 суток, 6 суток, 1 неделю, 2 недели, недели или 4 недели, 2 месяца, 4 месяца, 6 месяцев, 8 месяцев, 1 год и более после того, как субъект получил предыдущую терапию.According to some aspects, the invention provides methods of treating cancer associated with TAA expression (e.g., prostate cancer associated with PSMA expression or STEAP2 expression, glioblastoma associated with EGFRvIII expression, or ovarian cancer associated with MUC16 expression), comprising administering one or more of the bispecific antigen-binding molecules described elsewhere herein to a subject after the subject has been determined to have cancer. For example, this invention includes methods of treating prostate cancer comprising administering an anti-CD3/anti-TAA bispecific antigen-binding molecule to a patient 1 day, 2 days, 3 days, 4 days, 5 days, 6 days, 1 week, 2 weeks, weeks, or 4 weeks, 2 months, 4 months, 6 months, 8 months, 1 year or more after the subject has received previous therapy.

Комбинированная терапия и составы.Combination therapy and formulations.

Данное изобретение относится к способам, которые включают введение фармацевтической композиции, содержащей любые из иллюстративных антител и биспецифических антигенсвязывающих молекул, описанных в данном документе, в сочетании с одним или более дополнительными терапевтическими агентами. Иллюстративные дополнительные терапевтические агенты, которые могут быть объединены или введены в комбинации с антигенсвязывающей молекулой по данному изобретению, включают, например, антитело против программируемой клеточной смерти 1 (например, анти-PD1 антитело, как описано в публикации заявки на патент США №. US2015/0203579A1), антипрограммированный лиганд смерти клеток-1 (например, анти-PD-L1 антитело, как описано в публикации заявки на патент США № US2015/0203580A1), антагонист EGFR (например, анти-EGFR антитело [например, цетуксимаб или панитумумаб] или низкомолекулярный ингибитор EGFR [например, гефитиниб или эрлотиниб]), антагонист другого члена семейства EGFR, такого как Her2/ErbB2, ErbB3 или ErbB4 (например, анти-ErbB2, анти-ErbB3 или анти-ErbB4 антитело или низкомолекулярный ингибитор активности ErbB2, ErbB3 или ErbB4), антагонист EGFRvIII (например, антитело, которое специфически связывает EGFRvIII), антагонист cMET (например, анти-cMET антитело), антагонист IGF1R (например, анти-IGF1R антитело), ингибитор B-raf (например, вемурафениб, сорафениб, GDC-0879, PLX-4720), ингибитор PDGFR-α (например, анти-PDGFR-a антитело), ингибитор PDGFR-β (например, анти- PDGFR-β антитело), антагонист VEGF (например, VEGF-Trap, см., например, US 7087411 (также упоминается в данном документе как слитый белок ингибирующий VEGF), анти-VEGF антитело (например, бевацизумаб), низкомолекулярный ингибитор киназ рецептора VEGF (например, сунитиниб, сорафениб или пазопаниб)), антагонист DLL4 (например, анти-DLL4 антитело, раскрытое в US 2009/0142354, такое как REGN421), антагонист Ang2 (например, анти-Ang2 антитело, раскрытое в US 2011/0027286 такое, как H1H685P), антагонист FOLH1 (PSMA), антагонист PRLR (например, анти-PRLR антитело), антагонист STEAP1 или STEAP2 (например, анти-STEAP1 антитело или анти-STEAP2 антитело), антагонист TMPRSS2 (например, антиTMPRSS2 антитело), антагонист MSLN (например, анти-MSLN антитело), антагонист CA9 (например, анти-CA9 антитело), антагонист уроплакинов (например, антитело против уроплакина) и т.д. Другие агенты, которые могут быть выгодно введены в комбинации с антигенсвязывающими молекулами по изобретению, включают ингибиторы цитокинов, включая низкомолекулярные ингибиторы цитокинов и антитела, которые связываются с цитокинами, такими как IL-1, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-8, IL-9, IL-11, IL-12, IL-13, IL-17, IL-18 или к их соответствующим рецепторам. Фармацевтические композиции по данному изобретению (например, фармацевтические композиции, содержащие анти-CD3/анти-PSMA биспецифическую антигенсвязывающую молекулу, описанную в данном документе) также могут быть введены как часть терапевтического режима, включающего одну или более терапевтических комбинаций, выбранных из ICE: ифосфамид (например, Ifex®), карбоплатин (например, Paraplatin®), этопозид (например, Etopophos®, Toposar®, VePesid®, VP-16); DHAP: дексаметазон (например, Decadron®), цитарабин (например, Cytosar-U®, цитозин-арабинозид, ara-C), цисплатин (например, Platinol®-AQ) и ESHAP: этопозид (например, Etopophos®, Toposar®, VePesid®, VP-16), метилпреднизолон (например, Medrol®), высокодозовый цитарабин, цисплатин (например, Platinol®-AQ).This invention relates to methods that include the introduction of a pharmaceutical composition containing any of the exemplary antibodies and bispecific antigen-binding molecules described herein, in combination with one or more additional therapeutic agents. Illustrative additional therapeutic agents that can be combined or administered in combination with the antigen binding molecule of this invention include, for example, an antibody against programmed cell death 1 (for example, an anti-PD1 antibody as described in US Patent Application Publication No. US2015/ 0203579A1), an anti-programmed cell death ligand-1 (eg, an anti-PD-L1 antibody as described in US Patent Application Publication No. US2015/0203580A1), an EGFR antagonist (eg, an anti-EGFR antibody [eg, cetuximab or panitumumab] or small molecule EGFR inhibitor [eg, gefitinib or erlotinib]), an antagonist of another EGFR family member such as Her2/ErbB2, ErbB3, or ErbB4 (eg, an anti-ErbB2, anti-ErbB3, or anti-ErbB4 antibody or small molecule inhibitor of ErbB2, ErbB3, or ErbB4), an EGFRvIII antagonist (eg, an antibody that specifically binds EGFRvIII), a cMET antagonist (eg, an anti-cMET antibody), an IGF1R antagonist (eg. , anti-IGF1R antibody), B-raf inhibitor (eg, vemurafenib, sorafenib, GDC-0879, PLX-4720), PDGFR-α inhibitor (eg, anti-PDGFR-a antibody), PDGFR-β inhibitor (eg, anti- - PDGFR-β antibody), VEGF antagonist (e.g. VEGF-Trap, see e.g. US 7087411 (also referred to herein as VEGF inhibitory fusion protein), anti-VEGF antibody (e.g. bevacizumab), small molecule receptor kinase inhibitor VEGF (eg sunitinib, sorafenib or pazopanib)), DLL4 antagonist (eg anti-DLL4 antibody disclosed in US 2009/0142354 such as REGN421), Ang2 antagonist (eg anti-Ang2 antibody disclosed in US 2011/0027286 such as H1H685P), a FOLH1 antagonist (PSMA), a PRLR antagonist (for example, an anti-PRLR antibody), a STEAP1 or STEAP2 antagonist (for example, an anti-STEAP1 antibody or an anti-STEAP2 antibody), a TMPRSS2 antagonist (for example, an anti-TMPRSS2 antibody), MSLN antagonist (eg, anti-MSLN antibody), CA9 antagonist (eg, anti-CA9 antibody), uropl antagonist akines (for example, an antibody against uroplakin), etc. Other agents that may be advantageously administered in combination with the antigen binding molecules of the invention include cytokine inhibitors, including small molecule cytokine inhibitors, and antibodies that bind to cytokines such as IL-1, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-8, IL-9, IL-11, IL-12, IL-13, IL-17, IL-18 or their respective receptors. Pharmaceutical compositions of this invention (for example, pharmaceutical compositions containing the anti-CD3/anti-PSMA bispecific antigen-binding molecule described herein) may also be administered as part of a therapeutic regimen comprising one or more therapeutic combinations selected from ICE: ifosfamide ( eg Ifex®), carboplatin (eg Paraplatin®), etoposide (eg Etopophos®, Toposar®, VePesid®, VP-16); DHAP: dexamethasone (eg, Decadron®), cytarabine (eg, Cytosar-U®, cytosine-arabinoside, ara-C), cisplatin (eg, Platinol®-AQ), and ESHAP: etoposide (eg, Etopophos®, Toposar®, VePesid®, VP-16), methylprednisolone (eg Medrol®), high dose cytarabine, cisplatin (eg Platinol®-AQ).

Данное изобретение также включает терапевтические комбинации, включающие любую из антигенсвязывающих молекул, упомянутых в данном документе, и ингибитор одного или более из VEGF, Ang2, DLL4, EGFR, ErbB2, ErbB3, ErbB4, EGFRvIII, cMet, IGF1R, B-raf, PDGFR-α, PDGFR-β, FOLH1 (PSMA), PRLR, STEAP1, STEAP2, TMPRSS2, MSLN, CA9, уроплакин или любой из вышеупомянутых цитокинов, причем ингибитор представляет собой аптамер, антисмысловую молекулу, рибозим, миРНК, пептидное антитело, наночастицу или фрагмент антитела (например, фрагмент Fab, фрагмент F(ab')2, фрагмент Fd, фрагмент Fv, scFv, dAb фрагмент или другие модифицированные молекулы, такие как диатела, триатела, тетратела, мини-антитела и минимальные распознающие единицы). Антигенсвязывающие молекулы по изобретению также могут быть введены и/или объединены в сочетании с противовирусными препаратами, антибиотиками, анальгетиками, кортикостероидами и/или НПВС. Антигенсвязывающие молекулы по изобретению могут также вводиться как часть схемы лечения, которая также включает лучевую терапию и/или обычную химиотерапию.The invention also includes therapeutic combinations comprising any of the antigen binding molecules mentioned herein and an inhibitor of one or more of VEGF, Ang2, DLL4, EGFR, ErbB2, ErbB3, ErbB4, EGFRvIII, cMet, IGF1R, B-raf, PDGFR- α, PDGFR-β, FOLH1 (PSMA), PRLR, STEAP1, STEAP2, TMPRSS2, MSLN, CA9, uroplakin, or any of the above cytokines, wherein the inhibitor is an aptamer, antisense, ribozyme, siRNA, peptibody, nanoparticle, or antibody fragment (eg Fab fragment, F(ab')2 fragment, Fd fragment, Fv fragment, scFv, dAb fragment, or other modified molecules such as diabodies, tribodies, tetrabodies, minibodies, and minimal recognition units). The antigen binding molecules of the invention may also be administered and/or combined in combination with antivirals, antibiotics, analgesics, corticosteroids and/or NSAIDs. The antigen binding molecules of the invention may also be administered as part of a treatment regimen that also includes radiation therapy and/or conventional chemotherapy.

Дополнительный терапевтически активный компонент(ы) можно вводить непосредственно перед, одновременно с или вскоре после введения антигенсвязывающей молекулы по данному изобретению; (для целей данного раскрытия такие схемы введения считаются введением антигенсвязывающей молекулы в сочетании с дополнительным терапевтически активным компонентом).Additional therapeutically active component(s) can be administered immediately before, simultaneously with or shortly after administration of the antigen-binding molecule of this invention; (for the purposes of this disclosure, such administration regimens are considered to be the administration of an antigen-binding molecule in combination with an additional therapeutically active component).

Данное изобретение включает фармацевтические композиции, в которых антигенсвязывающая молекула по данному изобретению объединяется с одним или более дополнительным терапевтическим активным компонентом (компонентами), описанным в данном документе в другом месте.The invention includes pharmaceutical compositions in which the antigen-binding molecule of the invention is combined with one or more additional therapeutic active ingredient(s) described elsewhere herein.

Режимы введения.Introduction modes.

- 30 040594- 30 040594

В соответствии с некоторыми вариантами осуществления данного изобретения многократные дозы биспецифической антигенсвязывающей молекулы (например, анти-TAA антигенсвязывающей молекулы) могут вводиться субъекту в течение определенного времени. Способы в соответствии с данным аспектом изобретения включают последовательное введение субъекту нескольких доз антигенсвязывающей молекулы по изобретению. Используемый в данном документе термин последовательное введение означает, что каждая доза антигенсвязывающей молекулы вводится субъекту в другой момент времени, например в разные дни, разделенные заданным интервалом (например, часы, сутки, недели или месяцы). Данное изобретение включает способы, которые включают последовательное введение пациенту единственной начальной дозы антигенсвязывающей молекулы, за которой следуют одна или более вторичных доз антигенсвязывающей молекулы и необязательно сопровождаемая одной или более третичными дозами антигенсвязывающей молекулы.In accordance with some embodiments of the present invention, multiple doses of a bispecific antigen-binding molecule (eg, an anti-TAA antigen-binding molecule) may be administered to a subject over a period of time. Methods in accordance with this aspect of the invention include sequential administration of several doses of an antigen-binding molecule of the invention to a subject. As used herein, the term sequential administration means that each dose of an antigen-binding molecule is administered to a subject at a different point in time, such as on different days separated by a predetermined interval (eg, hours, days, weeks, or months). The present invention includes methods that include sequentially administering to a patient a single initial dose of an antigen-binding molecule followed by one or more secondary doses of an antigen-binding molecule and optionally followed by one or more tertiary doses of an antigen-binding molecule.

Термины начальная доза, вторичные дозы и третичные дозы относятся к временной последовательности введения антигенсвязывающей молекулы по изобретению. Таким образом, начальная доза представляет собой дозу, которая вводится в начале режима лечения (также называемая базовой дозой); вторичные дозы - дозы, вводимые после начальной дозы; а третичные дозы - дозы, вводимые после вторичных доз. Начальные, вторичные и третичные дозы могут содержать одинаковое количество антигенсвязывающей молекулы, но обычно могут отличаться друг от друга с точки зрения частоты введения. Однако в некоторых вариантах осуществления количество антигенсвязывающей молекулы, содержащееся в начальных, вторичных и/или третичных дозах, отличается один от другого (например, скорректировано в большую или меньшую сторону по мере необходимости) в ходе лечения. В некоторых вариантах осуществления две или более (например, 2, 3, 4 или 5) дозы вводят в начале режима лечения в качестве нагрузочных доз с последующими дозами, которые вводятся менее часто (например, поддерживающие дозы).The terms initial dose, secondary doses and tertiary doses refer to the time sequence of administration of the antigen-binding molecule of the invention. Thus, the initial dose is the dose that is administered at the beginning of the treatment regimen (also called the base dose); secondary doses - doses administered after the initial dose; and tertiary doses are doses administered after secondary doses. Initial, secondary and tertiary doses may contain the same amount of antigen-binding molecule, but usually may differ from each other in terms of frequency of administration. However, in some embodiments, the amount of antigen-binding molecule contained in the initial, secondary, and/or tertiary doses differs from one another (eg, adjusted up or down as needed) during treatment. In some embodiments, two or more (eg, 2, 3, 4, or 5) doses are administered at the start of a treatment regimen as loading doses, followed by doses that are administered less frequently (eg, maintenance doses).

В одном иллюстративном варианте осуществления данного изобретения каждую вторичную и/или третичную дозу вводят от 1 до 26 недель (например, 1, 11/2, 2, 21/2, 3, 31/2, 4, 41/2, 5, 51/2, 6, 61/2, 7, 71/2, 8, 81/2, 9, 91/2, 10, 101/2, 11, 111/2, 12, 121/2, 13, 131/2, 14, 141/2, 15, 151/2, 16, 161/2, 17, 171/2, 18, 181/2, 19, 191/2, 20, 201/2, 21, 211/2, 22, 221/2, 23, 231/2, 24, 241/2, 25, 251/2, 26, 261/2 или более) после непосредственно предшествующей дозы. Фраза непосредственно предшествующая доза, используемая в данном документе, означает в последовательности множественных введений дозу антигенсвязывающей молекулы, которая вводится пациенту до введения самой следующей дозы в последовательности без промежуточных доз.In one illustrative embodiment of the present invention, each secondary and/or tertiary dose is administered from 1 to 26 weeks (for example, 1, 11/2, 2 , 21/2, 3, 31/2, 4 , 41/2, 5, 51 /2, 6, 61/2, 7, 71/2, 8, 81/ 2 , 9, 91/2, 10, 101/2, 11, 111/2, 12, 121/2, 13, 131/2 , 14, 141/2, 15, 151/2, 16, 161/2, 17, 171/2, 18, 181/2, 19, 191/2, 20, 201/2, 21, 211/2, 22 , 221/2, 23, 231/2, 24, 241/2, 25, 251/2, 26, 261/2 or more) after the immediately preceding dose. The phrase immediately preceding dose as used herein means, in a sequence of multiple administrations, the dose of an antigen-binding molecule that is administered to a patient prior to the administration of the very next dose in the sequence without intermediate doses.

Способы в соответствии с данным аспектом изобретения могут включать введение пациенту любого количества вторичных и/или третичных доз антигенсвязывающей молекулы (например, биспецифической анти-TAA антигенсвязывающей молекулы). Например, в некоторых вариантах осуществления пациенту вводится только одна вторичная доза. В других вариантах осуществления пациенту вводят две или более (например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 или более) вторичные дозы. Аналогичным образом, в некоторых вариантах осуществления пациенту вводят только одну третичную дозу. В других вариантах осуществления пациенту вводят две или более (например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 или более) третичные дозы.Methods in accordance with this aspect of the invention may include administering any number of secondary and/or tertiary doses of an antigen-binding molecule (eg, a bispecific anti-TAA antigen-binding molecule) to a patient. For example, in some embodiments, only one secondary dose is administered to the patient. In other embodiments, two or more (eg, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 or more) secondary doses are administered to the patient. Similarly, in some embodiments, only one tertiary dose is administered to the patient. In other embodiments, two or more (eg, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 or more) tertiary doses are administered to the patient.

В вариантах осуществления, включающих множественные вторичные дозы, каждая вторичная доза может вводиться с той же частотой, что и другие вторичные дозы. Например, каждая вторичная доза может вводиться пациенту через 1-2 недели после непосредственно предшествующей дозы. Аналогично, в вариантах осуществления, включающих множественные третичные дозы, каждая третичная доза может вводиться с той же частотой, что и другие третичные дозы. Например, каждая третичная доза может вводиться пациенту через 2-4 недели после непосредственно предшествующей дозы. Альтернативно, частота, с которой вторичные и/или третичные дозы вводятся пациенту, может изменяться в течение курса лечения. Частота введения может также регулироваться в ходе лечения врачом в зависимости от потребностей отдельного пациента после клинического обследования.In embodiments involving multiple secondary doses, each secondary dose may be administered at the same frequency as the other secondary doses. For example, each secondary dose may be administered to a patient 1-2 weeks after the immediately preceding dose. Similarly, in embodiments involving multiple tertiary doses, each tertiary dose may be administered at the same frequency as the other tertiary doses. For example, each tertiary dose may be administered to a patient 2-4 weeks after the immediately preceding dose. Alternatively, the frequency with which secondary and/or tertiary doses are administered to a patient may vary over the course of treatment. The frequency of administration may also be adjusted during the course of treatment by the physician, depending on the needs of the individual patient after clinical examination.

ПримерыExamples

Следующие примеры приведены с тем, чтобы предоставить специалистам в данной области техники полное раскрытие и описание способов изготовления и применения способов и композиций изобретения и не предназначены для ограничения объема изобретения, которое изобретатели считают в качестве своего изобретения. Были предприняты усилия для обеспечения точности в отношении используемых номеров (например, количества, температуры и т.д.), но следует учитывать некоторые экспериментальные ошибки и отклонения. Если не указано иное, части представляют собой части по массе, молекулярная масса представляет собой среднюю молекулярную массу, температура выражена в градусах Цельсия, а давление находится в пределах атмосферного или вблизи него.The following examples are provided to provide those skilled in the art with a complete disclosure and description of the methods of making and using the methods and compositions of the invention and are not intended to limit the scope of the invention which the inventors consider to be their invention. Efforts have been made to ensure accuracy with regard to the numbers used (eg quantities, temperatures, etc.), but some experimental errors and deviations should be taken into account. Unless otherwise indicated, parts are parts by weight, molecular weight is average molecular weight, temperature is in degrees Celsius, and pressure is at or near atmospheric pressure.

Пример 1. Создание анти-CD3 антител.Example 1 Creation of anti-CD3 antibodies.

Следующие процедуры были направлены на выявление антител, которые специфически распознавали CD3 (Т-клеточный ко-рецептор) в качестве антигена.The following procedures were aimed at detecting antibodies that specifically recognized CD3 (T-cell co-receptor) as an antigen.

Пул анти-CD3 антител был получен путем иммунизации генетически модифицированных мышей. Вкратце, мыши, генетически сконструированные для экспрессии обратной химерной (вариабельная область человека, константная область мыши) и тяжелых цепей иммуноглобулина, связанные с одной реаранжированной легкой цепью (например, Vk1-39/J или Vk3-20/J), были иммунизированы CD3 антигеномA pool of anti-CD3 antibodies was obtained by immunization of genetically modified mice. Briefly, mice genetically engineered to express reverse chimeric (human variable region, mouse constant region) and immunoglobulin heavy chains associated with a single rearranged light chain (e.g., Vk1-39/J or Vk3-20/J) were immunized with CD3 antigen.

- 31 040594 и произвели B-клетки, которые включали разнообразие реаранжировок VH человека, чтобы экспрессировать разнообразный репертуар высокоаффинных антигенспецифических антител. Некоторые иллюстративные антитела, описанные в данном документе, были созданы рекомбинантно, и экспрессировали ту же последовательность легкой цепи Vk1-39JK5 (LCVR, представленную в SEQ ID NO: 162), тогда как другие антитела, которые рекомбинантно экспрессировали когнатную легкую цепь одного из плеч тяжелой цепи (например, плечо, нацеливающее на опухоль).- 31 040594 and produced B cells that included a variety of human VH rearrangements to express a diverse repertoire of high affinity antigen-specific antibodies. Some of the exemplary antibodies described herein were recombinantly generated and expressed the same Vk1-39JK5 light chain sequence (LCVR shown in SEQ ID NO: 162), while other antibodies that recombinantly expressed the cognate light chain of one of the arms of the heavy chains (for example, a shoulder targeting a tumor).

Созданные антитела испытывали на аффинность к антигену CD3 человека и яванского макака в анализе связывания in vitro, и, например, одно анти-CD антитело, обозначенное CD3-VH-P (HCVR, представленный в SEQ ID NO: 154) было идентифицировано среди нескольких других, которые, как было установлено, связывались с CD3 человека и яванского макака, и имело EC50 от 1 до 40 нМ аффинности (+++), как определено в FACS титровании клеток Jurkat и T-клеток яванского макака соответственно. См., например, эксперименты по FACS связыванию, описанные ниже в примере 4.The generated antibodies were tested for affinity for human and cynomolgus CD3 antigen in an in vitro binding assay, and for example, one anti-CD antibody designated CD3-VH-P (HCVR shown in SEQ ID NO: 154) was identified among several others. which were found to bind to human and cynomolgus CD3 and had an EC 50 of 1 to 40 nM affinity (+++) as determined by FACS titration of Jurkat cells and cynomolgus T cells, respectively. See, for example, the FACS binding experiments described below in Example 4.

Затем были идентифицированы аминокислотные остатки зародышевой линии CD3-VH-P, а антитело, обозначенное как CD3-VH-G, было сконструировано так, чтобы оно содержало только структуры зародышевой линии. Другие производные антител были разработаны известными методиками молекулярного клонирования для замены аминокислотных остатков поэтапно на основе различий между последовательностью зародышевой линии и последовательностью CD3-VH-P. Каждому производному антитела присваивали указывающий номер CD3-VH-G. См. табл. 1 и фиг. 1.The amino acid residues of the CD3-VH-P germline were then identified and the antibody, designated CD3-VH-G, was designed to contain only germline structures. Other antibody derivatives have been developed by known molecular cloning techniques to replace amino acid residues in steps based on differences between the germline sequence and the CD3-VH-P sequence. Each antibody derivative was assigned a CD3-VH-G designation number. See table. 1 and FIG. 1.

Биспецифические антитела, содержащие первый связующий агент, полученный из сконструированных анти-CD3 антител с обозначениями и описаниями, представленными в табл. 1, и второе связывающее плечо, полученное из анти-TAA антител, были получены и испытаны на одновалентное сродство к клеткам, несущим CD3 в FACS анализе (как описано в примере 4). Результаты моновалентной аффинности связывания этих биспецифических антител показаны в двух правых столбцах табл. 1. В конкретных примерах биспецифические антитела, имеющие плечо связывания с TAA и плечо связывания с CD3 с обозначениями CD3-VH-G, CD3-VH-G5 и CD3-VH-G20 соответственно, связывали клетки Jurkat с EC50 2,7 E-08, недетектируемое связывание и 5,5 E-07 соответственно.Bispecific antibodies containing the first binding agent derived from engineered anti-CD3 antibodies with the symbols and descriptions presented in table. 1 and a second binding arm derived from anti-TAA antibodies were generated and tested for monovalent affinity for CD3-bearing cells in a FACS assay (as described in Example 4). The results of the monovalent binding affinity of these bispecific antibodies are shown in the two right columns of the table. 1. In specific examples, bispecific antibodies having a TAA binding arm and a CD3 binding arm designated CD3-VH-G, CD3-VH-G5 and CD3-VH-G20, respectively, bound Jurkat cells with an EC 50 of 2.7 E- 08, non-detectable binding and 5.5 E-07, respectively.

Таблица 1Table 1

Мутации для CDR на основе последовательности зародышевой линии и соответствующие аффинности FACS связывания для каждого ___________________сконструированного антитела___________________Mutations for CDRs based on the germline sequence and corresponding FACS binding affinities for each ___________________engineered antibody___________________

Антитело Обозначен ие CD3-VH Antibody Designation CD3-VH Описание мутаций по сравнению с антителом CD3-VH-G* Description of mutations compared to the CD3-VH-G* antibody JURKAT JURKAT Т-клетки яванског Javanese T cells о O макака toque CD3-VH-G CD3-VH-G2 CD3-VH-G3 CD3-VH-G4 CD3-VH-G5 CD3-VH-G CD3-VH-G2 CD3-VH-G3 CD3-VH-G4 CD3-VH-G5 Каркасные области (FR) только зародышевой линии (GL); CDR-CD3-VHP Все GL (FR и CDR). Все GL (FR и CDR). Добавление A33S. Все GL (FR и CDR). Добавление Y105K. Все GL (FR и CDR). Добавление A33S и Y105K. Framework regions (FR) only germline (GL); CDR-CD3-VHP All GL (FR and CDR). All GL (FR and CDR). Addition of A33S. All GL (FR and CDR). Addition of Y105K. All GL (FR and CDR). Addition of A33S and Y105K. (+ + +) (-) (-) (-) (-) (+ + +) (-) (-) (-) (-) ( + + +) (-) (-) (-) (-) (+++) (-) (-) (-) (-) CD3-VH-G8 CD3-VH-G8 Каркасные области зародышевой линии. Добавление K58I. Framework regions of the germline. Addition of K58I. (+ + +) (+ + +) ( + ) (+) CD3-VH-G9 CD3-VH-G9 Каркасные области зародышевой линии. Добавление Y99D Framework regions of the germline. Adding Y99D ( + ) (+) (-) (-) CD3-VH- CD3-VH- Каркасные области зародышевой линии. Framework regions of the germ line. ( + ) (+) (-) (-)

- 32 040594- 32 040594

G10 G10 Добавление H108Y. Addition of H108Y. CD3-VHG11 CD3-VHG11 Каркасные области зародышевой линии. Добавление L111M. Framework regions of the germ line. Addition of L111M. (+ + +) (+ + +) ( + ) (+) CD3-VHG12 CD3-VHG12 Каркасные области зародышевой линии. Добавление K58I, Y99D Framework regions of the germline. Adding K58I, Y99D (+ +) (+ +) ( + /-) (+/-) CD3-VHG13 CD3-VHG13 Каркасные области зародышевой линии. Добавление K58I, H108Y Framework regions of the germline. Adding K58I, H108Y (+ +) (+ +) ( + ) (+) CD3-VHG14 CD3-VHG14 Каркасные области зародышевой линии. Добавление K58I, L111M Framework regions of the germline. Adding K58I, L111M (+ + +) (+ + +) (+ +) (++) CD3-VHG15 CD3-VHG15 Каркасные области зародышевой линии. Добавление Y99D,—H108Y Framework regions of the germline. Adding Y99D,—H108Y ( + ) (+) (-) (-) CD3-VHG16 CD3-VHG16 Каркасные области зародышевой линии. Добавление Y99D, L111M Framework regions of the germline. Adding Y99D, L111M (+ +) (++) ( + /-) (+/-) CD3-VHG17 CD3-VHG17 Каркасные области зародышевой линии. Добавление H108Y, L111M Framework regions of the germline. Adding H108Y, L111M ( + /-) (+/-) ( + /-) (+/-) CD3-VHG18 CD3-VHG18 Каркасные области зародышевой линии. Добавление K58I, Y99D, H108Y Framework regions of the germline. Adding K58I, Y99D, H108Y ( + /-) (+/-) (-) (-) CD3-VHG19 CD3-VHG19 Каркасные области зародышевой линии. Добавление K58I, Y99D, L111M Framework regions of the germline. Adding K58I, Y99D, L111M ( + /-) (+/-) (-) (-) CD3-VHG2 0 CD3-VHG2 0 Каркасные области зародышевой линии. Добавление K58I, H108Y, L111M Framework regions of the germline. Adding K58I, H108Y, L111M ( + /-) (+/-) ( + /-) (+/-) CD3-VHG21 CD3-VHG21 Каркасные области зародышевой линии. Добавление Y99D, H1O8Y,-L111M Framework regions of the germline. Adding Y99D, H1O8Y,-L111M ( + /-) (+/-) (-) (-)

* Последовательная нумерация на основе зрелого белка 7221G (CD3-VH-G).* Sequential numbering based on the mature 7221G protein (CD3-VH-G).

В то время как CD3-VH-G и некоторые другие модифицированные антитела сохраняли свою аффинность связывания, как показано в FACS анализах, несколько анти-CD3 антител связывались in vitro с CD3 человека или яванского макака с аффинностью от слабой (+/-) до (-) неизмеримой. Аффинности связывания, кинетика связывания и другие биологические свойства для выяснения токсичности и фармакокинетических (pK) профилей были впоследствии исследованы для биспецифических антител, содержащих иллюстративные анти-CD3 антитела, полученные в соответствии с методами данного примера, и подробно описаны в примерах, изложенных ниже.While CD3-VH-G and some other modified antibodies retained their binding affinity as shown in FACS analyses, several anti-CD3 antibodies bound in vitro to human or cynomolgus monkey CD3 with weak (+/-) to ( -) immeasurable. Binding affinities, binding kinetics, and other biological properties to elucidate toxicity and pharmacokinetic (pK) profiles were subsequently investigated for bispecific antibodies containing exemplary anti-CD3 antibodies prepared according to the methods of this example and are detailed in the examples below.

Пример 2. Вариабельные области тяжелой и легкой цепей (аминокислотные и нуклеотидные последовательности CDR).Example 2 Heavy and Light Chain Variable Regions (CDR Amino Acid and Nucleotide Sequences).

Аминокислотные и нуклеотидные последовательности определяли для каждой последовательности тяжелой цепи антитела.Amino acid and nucleotide sequences were determined for each antibody heavy chain sequence.

Каждой тяжелой цепи антитела, как производной последовательности зародышевой линии IGHV39*01/D5-12*01/J6*02 (SEQ ID NO: 181), было присвоено обозначение номера G для согласованной номенклатуры. В табл. 2 приведены идентификаторы аминокислотной последовательности вариабельных областей тяжелой цепи и CDR сконструированных анти-CD3 антител по изобретению. Соответствующие идентификаторы последовательности нуклеиновой кислоты приведены в табл. 3. Идентификаторы последовательности аминокислот и нуклеиновых кислот вариабельной области легкой цепи и CDR для конструирования каждого рекомбинантного антитела также идентифицированы ниже в табл. 4 и 5 соответственно.Each antibody heavy chain derived from the IGHV39*01/D5-12*01/J6*02 germline sequence (SEQ ID NO: 181) was assigned a G number designation for consensus nomenclature. In table. 2 shows the amino acid sequence identifiers for the heavy chain variable regions and CDRs of engineered anti-CD3 antibodies of the invention. The corresponding nucleic acid sequence identifiers are given in table. 3. Amino acid and nucleic acid sequence identifiers for the light chain variable region and CDRs for constructing each recombinant antibody are also identified in Table 1 below. 4 and 5, respectively.

- 33 040594- 33 040594

Таблица 2table 2

Идентификаторы аминокислотной последовательности тяжелой цепиHeavy chain amino acid sequence identifiers

Антитело Обозначены е CD3-VH Antibody Designated e CD3-VH SEQ ID NO: SEQID NO: HCVR HCVR CDR1 CDR1 CDR2 CDR2 CDR3 CDR3 CD3-VH-G CD3-VH-G 2 2 4 4 6 6 8 8 CD3-VH-G2 CD3-VH-G2 10 10 12 12 14 14 16 16 CD3-VH-G3 CD3-VH-G3 18 18 20 20 22 22 24 24 CD3-VH-G4 CD3-VH-G4 26 26 28 28 30 thirty 32 32 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 34 34 36 36 38 38 40 40 CD3-VH-G8 CD3-VH-G8 42 42 44 44 46 46 48 48 CD3-VH-G9 CD3-VH-G9 50 50 52 52 54 54 56 56 CD3-VH-G10 CD3-VH-G10 58 58 60 60 62 62 64 64 CD3-VH-G11 CD3-VH-G11 66 66 68 68 70 70 72 72 CD3-VH-G12 CD3-VH-G12 74 74 76 76 78 78 80 80 CD3-VH-G13 CD3-VH-G13 82 82 84 84 86 86 88 88 CD3-VH-G14 CD3-VH-G14 90 90 92 92 94 94 96 96 CD3-VH-G15 CD3-VH-G15 98 98 100 100 102 102 104 104 CD3-VH-G16 CD3-VH-G16 106 106 108 108 110 110 112 112 CD3-VH-G17 CD3-VH-G17 114 114 116 116 118 118 120 120 CD3-VH-G18 CD3-VH-G18 122 122 124 124 126 126 128 128 CD3-VH-G19 CD3-VH-G19 130 130 132 132 134 134 136 136 CD3-VH-G20 CD3-VH-G20 138 138 140 140 142 142 144 144 CD3-VH-G21 CD3-VH-G21 146 146 148 148 150 150 152 152 CD3-VH-P CD3-VH-P 154 154 156 156 158 158 160 160

Таблица 3Table 3

Идентификаторы последовательности нуклеиновых кислот тяжелой цепиHeavy chain nucleic acid sequence identifiers

Антитело Обозначени е CD3-VH Antibody Designation CD3-VH SEQ ID NO: SEQID NO: HCVR HCVR CDR1 CDR1 CDR2 CDR2 CDR3 CDR3 CD3-VH-G CD3-VH-G 1 1 3 3 5 5 7 7 CD3-VH-G2 CD3-VH-G2 9 9 11 eleven 13 13 15 15 CD3-VH-G3 CD3-VH-G3 17 17 19 19 21 21 23 23 CD3-VH-G4 CD3-VH-G4 25 25 27 27 29 29 31 31 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 33 33 35 35 37 37 39 39 CD3-VH-G8 CD3-VH-G8 41 41 43 43 45 45 47 47 CD3-VH-G9 CD3-VH-G9 49 49 51 51 53 53 55 55 CD3-VH-G10 CD3-VH-G10 57 57 59 59 61 61 63 63 CD3-VH-G11 CD3-VH-G11 65 65 67 67 69 69 71 71 CD3-VH-G12 CD3-VH-G12 73 73 75 75 77 77 79 79 CD3-VH-G13 CD3-VH-G13 81 81 83 83 85 85 87 87 CD3-VH-G14 CD3-VH-G14 89 89 91 91 93 93 95 95 CD3-VH-G15 CD3-VH-G15 97 97 99 99 101 101 103 103 CD3-VH-G16 CD3-VH-G16 105 105 107 107 109 109 111 111 CD3-VH-G17 CD3-VH-G17 113 113 115 115 117 117 119 119 CD3-VH-G18 CD3-VH-G18 121 121 123 123 125 125 127 127 CD3-VH-G19 CD3-VH-G19 129 129 131 131 133 133 135 135 CD3-VH-G20 CD3-VH-G20 137 137 139 139 141 141 143 143 CD3-VH-G21 CD3-VH-G21 145 145 147 147 149 149 151 151 CD3-VH-P CD3-VH-P 153 153 155 155 157 157 159 159

-34040594-34040594

Таблица 4Table 4

Идентификаторы аминокислотной последовательности легкой цепиLight chain amino acid sequence identifiers

Антитело Обозначены е ULC Antibody Designated e ULC SEQ ID NO: SEQID NO: LCVR LCVR CDR1 CDR1 CDR2 CDR2 CDR3 CDR3 VK1-39JK5 VK1-39JK5 162 162 164 164 166 166 168 168

Таблица 5Table 5

Идентификаторы последовательности нуклеиновых кислот легкой цепиLight chain nucleic acid sequence identifiers

Антитело Обозначени е ULC Antibody Designation ULC SEQ ID NO: SEQID NO: LCVR LCVR CDR1 CDR1 CDR2 CDR2 CDR3 CDR3 VK1-39JK5 VK1-39JK5 161 161 163 163 165 165 167 167

Контрольное антитело 1, обозначенное как CD3-L2K, было сконструировано на основе известного анти-CD3 антитела (т.е. анти-CD3 антитела L2K, как изложено в WO 2004/106380).Control antibody 1, designated CD3-L2K, was constructed from a known anti-CD3 antibody (ie anti-CD3 antibody L2K as set forth in WO 2004/106380).

Антитело изотипического контроля, указанное в приведенных ниже примерах, представляет собой антитело с идентичным изотипом (модифицированный IgG4), которое взаимодействует с нерелевантным антигеном, т.е. антигеном FelD1.The isotype control antibody indicated in the examples below is an isotype-identical antibody (modified with IgG4) that interacts with an irrelevant antigen, i.e. FelD1 antigen.

Пример 3. Создание биспецифических антител ULC, которые связывают CD3 и ассоциированные с опухолью антигены (TAA).Example 3 Generation of bispecific ULC antibodies that bind CD3 and tumor associated antigens (TAA).

Биспецифические антитела, содержащие анти-CD3-специфический связывающий домен и антиTAA-специфический связывающий домен, такой как PSMA, EGFRvIII, MUC16 или STEAP2, были сконструированы с использованием стандартных методик молекулярной биологии с использованием тяжелой цепи из описанного анти-CD3-антитела в данном случае тяжелой цепью из анти-TAA антитела и обычной легкой цепью или универсальной легкой цепью (ULC). Анти-TAA антитела, используемые для конструирования биспецифических антител по данному изобретению, получали путем иммунизации генетически модифицированных мышей.Bispecific antibodies containing an anti-CD3 specific binding domain and an anti-TAA specific binding domain such as PSMA, EGFRvIII, MUC16, or STEAP2 were constructed using standard molecular biology techniques using the heavy chain from the described anti-CD3 antibody in this case. a heavy chain from an anti-TAA antibody; and a conventional light chain or a universal light chain (ULC). The anti-TAA antibodies used to construct the bispecific antibodies of this invention were obtained by immunizing genetically modified mice.

Краткое изложение составных частей антигенсвязывающих доменов различных биспецифических антител, полученных в соответствии с данным примером, приведено в табл. 6-8. Все биспецифические антитела были изготовлены с модифицированным (химерным) доменом IgG4 Fc, как указано в публикации заявки на патент США № US20140243504A1, опубликованной 28 августа 2014 г. Иллюстративные биспецифические антитела EGFRvIIIxCD3 могут быть получены с использованием любой из вариабельных областей тяжелой цепи и легкой цепи (или CDR) любого из антител EGFRvIII, обсуждаемых в публикации заявки на патент США № US20150259423, которая полностью включена в данное описание посредством ссылки в сочетании с вариабельными областями или CDR любого из анти-CD3 антител, обсуждаемых в данном документе.A summary of the constituent parts of the antigen-binding domains of various bispecific antibodies obtained in accordance with this example, is given in table. 6-8. All bispecific antibodies were made with a modified (chimeric) IgG4 Fc domain as described in U.S. Patent Application Publication No. US20140243504A1, published August 28, 2014. Exemplary EGFRvIIIxCD3 bispecific antibodies can be made using any of the heavy chain and light chain variable regions ( or CDR) of any of the EGFRvIII antibodies discussed in US Patent Application Publication No. US20150259423, which is incorporated herein by reference in its entirety, in conjunction with the variable regions or CDRs of any of the anti-CD3 antibodies discussed herein.

Таблица 6Table 6

Создание биспецифических антител PSMAxCD3Creation of PSMAxCD3 bispecific antibodies

Идентификатор биспецифическог о антитела bispecific identifier about antibodies Антигенсвязыва ющий домен анти-PSMA антитела Antigen binding domain anti-PSMA antibodies Антигенсвязыва ющий домен анти-CDS антитела Antigen binding ing domain anti-CDS antibodies Общая вариабельная область легкой цепи Common light chain variable region

- 35 040594- 35 040594

Варна бельная область тяжелой цепи Varna white heavy chain region Варнабельная область тяжелой цепи heavy chain varnable region BSPSMA/CD3-003 BSPSMA/CD3-003 PSMA-VH-B PSMA-VH-B CD3-VH-G CD3-VH-G VK1-39JK5 VK1-39JK5 BSPSMA/CD3-200 BSPSMA/CD3-200 CD3-VH-G2 CD3-VH-G2 BSPSMA/CD3-300 BSPSMA/CD3-300 CD3-VH-G3 CD3-VH-G3 BSPSMA/CD3-400 BSPSMA/CD3-400 CD3-VH-G4 CD3-VH-G4 BSPSMA/CD3-004 BSPSMA/CD3-004 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 BSPSMA/CD3-800 BSPSMA/CD3-800 CD3-VH-G8 CD3-VH-G8 BSPSWCD3-900 BSPSWCD3-900 CD3-VH-G9 CD3-VH-G9 BSPSMA/CD3-1000 BSPSMA/CD3-1000 CD3-VH-G10 CD3-VH-G10 BSPSMA/CD3-1100 BSPSMA/CD3-1100 CD3-VH-G11 CD3-VH-G11 BSPSMA/CD3-1200 BSPSMA/CD3-1200 CD3-VH-G12 CD3-VH-G12 BSPSWCD3-1300 BSPSWCD3-1300 CD3-VH-G13 CD3-VH-G13 BSPSWCD3-1400 BSPSWCD3-1400 CD3-VH-G14 CD3-VH-G14 BSPSMA/CD3-1500 BSPSMA/CD3-1500 CD3-VH-G15 CD3-VH-G15 BSPSMA/CD3-1600 BSPSMA/CD3-1600 CD3-VH-G16 CD3-VH-G16 BSPSMA/CD3-1700 BSPSMA/CD3-1700 CD3-VH-G17 CD3-VH-G17 BSPSWCD3-1800 BSPSWCD3-1800 CD3-VH-G18 CD3-VH-G18 BSPSMA/CD3-1900 BSPSMA/CD3-1900 CD3-VH-G19 CD3-VH-G19 BSPSWCD3-005 BSPSWCD3-005 CD3-VH-G20 CD3-VH-G20 BSPSWCD3-2100 BSPSWCD3-2100 CD3-VH-G21 CD3-VH-G21

Таблица 7Table 7

Создание биспецифических антител EGFRvIIIxCD3Creation of bispecific antibodies EGFRvIIIxCD3

Идентификатор биспецифическо го антитела Bispecific antibody identifier Антигенсвязыв ающий домен анти-EGFRvIII антитела Antigen binding domain anti-EGFRvIII antibodies Антигенсвязыва ющий домен анти-СОЗ антитела Antigen binding ing domain anti-POPs antibodies Общая вариабельная область легкой цепи Common light chain variable region Варнабельная область тяжелой цепи heavy chain varnable region Варнабельная область тяжелой цепи heavy chain varnable region BSV3/CD3-001 BSV3/CD3-001 EGFRvIII-VH-A EGFRvIII-VH-A CD3-VH-G CD3-VH-G EGFRvIII-VL- А EGFRvIII-VL- A BSV3/CD3-002 BSV3/CD3-002 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 BSV3/CD3-003 BSV3/CD3-003 CD3-VH-G9 CD3-VH-G9 BSV3/CD3-004 BSV3/CD3-004 CD3-VH-G10 CD3-VH-G10

- 36 040594- 36 040594

Таблица 8Table 8

Создание биспецифических антител MUC16xCD3 Creation of bispecific antibodies MUC16xCD3 Идентификатор биспецифическо го антитела Bispecific antibody identifier Антигенсвязыва ющий домен анти- MUC16 антитела Antigen-binding domain of an anti-MUC16 antibody Антигенсвязыва ющий домен анти-СОЗ антитела Antigen binding domain anti-POPs antibodies Общая вариабельная область легкой цепи Common light chain variable region Варнабельная область тяжелой цепи heavy chain varnable region Варнабельная область тяжелой цепи heavy chain varnable region BSMUC16/CD3- 001 BSMUC16/CD3- 001 MUC16-VH-A MUC16-VH-A CD3-VH-G CD3-VH-G MUC16-VL-A MUC16-VL-A BSMUC16/CD3002 BSMUC16/CD3002 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 BSMUC16/CD3- 003 BSMUC16/CD3- 003 CD3-VH-G9 CD3-VH-G9 BSMUC16/CD3- 004 BSMUC16/CD3- 004 CD3-VH-G10 CD3-VH-G10 BSMUC16/CD3- 005 BSMUC16/CD3- 005 CD3-VH-G20 CD3-VH-G20 Таблица 9 Table 9

Создание биспецифических антител STEAP2xCD3Creation of STEAP2xCD3 bispecific antibodies

Идентификатор биспецифическо го антитела Bispecific antibody identifier Антигенсвязыв ающий домен анти- STEAP2 антитела Antigen binding domain anti-STEAP2 antibodies Антигенсвязыва ющий домен анти-СОЗ антитела Antigen binding domain anti-POPs antibodies Общая вариабельная область легкой цепи Common light chain variable region Варнабельная область тяжелой цепи heavy chain varnable region Варнабельная область тяжелой цепи heavy chain varnable region BSSTEAP2/CD3-001 BSSTEAP2/CD3-001 STEAP2-VH-A STEAP2-VH-A CD3-VH-G CD3-VH-G STEAP2-VL-A STEAP2-VL-A BSSTEAP2/CD3-002 BSSTEAP2/CD3-002 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 BSSTEAP2/CD3-003 BSSTEAP2/CD3-003 CD3-VH-G20 CD3-VH-G20

Каждое из иллюстративных биспецифических антител тестировали в различных биоанализах, как описано ниже.Each of the exemplary bispecific antibodies was tested in various bioassays as described below.

Пример 4. Аффинности связывания иллюстративных биспецифических антител, измеренные с помощью FACS анализа.Example 4 Binding affinities of exemplary bispecific antibodies measured by FACS analysis.

В данном примере определяли способность биспецифических антител CD3xTAA к связыванию с CD3-экспрессирующими клеточными линиями человека и яванского макака посредством FACS. Кроме того, была подтверждена способность данных биспецифических антител связываться с конкретными специфическими (TAA-специфическими) клеточными линиями. Как описано выше, различные биспецифические антитела по данному изобретению используют одно специфическое TAA связующее плечо (PSMA, EGFRvIII, MUC16 или STEAP2, см. пример 3, табл. 6-8) в паре с одной из панелей связывающего плеча анти-CD3 (см. примеры 1 и 2 выше) и общую легкую цепь. Как также показано в примере 5 посредством поверхностного плазмонного резонанса, биспецифические антитела CD3xTAA демонстрируют диапазон аффинностей к растворимому гетеродимеру белка hCD3ε/δmFc человека.In this example, the ability of CD3xTAA bispecific antibodies to bind to CD3-expressing human and cynomolgus monkey cell lines was determined by FACS. In addition, the ability of these bispecific antibodies to bind to specific specific (TAA-specific) cell lines was confirmed. As described above, the various bispecific antibodies of the invention use one specific TAA binding arm (PSMA, EGFRvIII, MUC16, or STEAP2, see Example 3, Tables 6-8) paired with one of the anti-CD3 binding arm panels (see examples 1 and 2 above) and a common light chain. As also shown in Example 5 by surface plasmon resonance, CD3xTAA bispecific antibodies exhibit a range of affinities for the soluble human hCD3ε/δmFc protein heterodimer.

Кратко, 2x105 клеток/лунка клеток Jurkat, экспрессирующих CD3 человека, клеток яванского макака, специфически экспрессирующих T или TAA, инкубировали с серийными разведениями биспецифических антител в течение 30 мин при 4°C. После инкубации клетки промывали и добавляли к клеткам козьи F(ab')2 античеловеческие Fcy PE меченые вторичные антитела (Jackson Immunolabs) на дополнительные 30 мин. Затем клетки промывали, повторно суспендировали в холодном PBS+1% БСА и анализировали с помощью проточной цитометрии на BD FACS Canto II.Briefly, 2x105 cells/well of Jurkat cells expressing human CD3, cynomolgus monkey cells specifically expressing T or TAA were incubated with serial dilutions of the bispecific antibodies for 30 min at 4°C. After incubation, the cells were washed and goat F(ab') 2 anti-human Fcy PE labeled secondary antibodies (Jackson Immunolabs) were added to the cells for an additional 30 minutes. Cells were then washed, resuspended in cold PBS+1% BSA and analyzed by flow cytometry on a BD FACS Canto II.

Для FACS анализа клетки разделяли по высоте прямого рассеяния по сравнению с областью прямого рассеяния путем отбора по единичным событиям, за которыми следуют боковые и передние рассеиватели. EC50 для титрования связывания клеток определяли с использованием программного обеспеченияFor FACS analysis, cells were separated by forward scatter height versus forward scatter area by single event selection followed by side and front scatterers. EC 50 for cell binding titration was determined using software

- 37 040594- 37 040594

PRISM™ (GraphPad Software, Inc., Ла Джолла, штат Калифорния). Значения были рассчитаны с использованием 4-параметрического нелинейного регрессионного анализа.PRISM™ (GraphPad Software, Inc., La Jolla, CA). Values were calculated using 4-parameter non-linear regression analysis.

Таблица 10ATable 10A

FACS связывание на CD3 и PSMA-специфических клеточных линияхFACS binding on CD3 and PSMA-specific cell lines

Идентификатор биспецифическог о антитела Bispecific antibody identifier Анти-СОЗсвязывающее плечо Anti-POPsbinding shoulder Jurkat Jurkat Т-клетки яванского макака T cells of the cynomolgus macaque B16F10.9/PSM А B16F10.9/PSM A B B ЕС50 [М]EU 50 [M] ЕС50 [М]EU 50 [M] ЕС50 [М]EU 50 [M] BSPSMA/CD3-003 BSPSMA/CD3-200 BSPSMA/CD3-300 BSPSMA/CD3-400 BSPSMA/CD3-004 BSPSMA/CD3-800 BSPSMA/CD3-900 BSPSMA/CD3-1000 BSPSMA/CD3-1100 BSPSMA/CD3-1200 BSPSMA/CD3-1300 BSPSMA/CD3-1400 BSPSMA/CD3-1500 BSPSMA/CD3-1600 BSPSMA/CD3-1700 BSPSMA/CD3-1800 BSPSMA/CD3-1900 BSPSMA/CD3-005 BSPSMA/CD3-2100 FACS связывание BSPSMA/CD3-003 BSPSMA/CD3-200 BSPSMA/CD3-300 BSPSMA/CD3-400 BSPSMA/CD3-004 BSPSMA/CD3-800 BSPSMA/CD3-900 BSPSMA/CD3-1000 BSPSMA/CD3-1100 BSPSMA/CD3-1200 BSPSMA/CD3-1300 BSPSMA/CD3-1400 BSPSMA/CD3-1500 BSPSMA/CD3-1600 BSPSMA/CD3-1700 BSPSMA/CD3-1800 BSPSMA/CD3-1900 BSPSMA/CD3-005 BSPSMA/CD3-2100 FACS binding CD3-VH-G CD3-VH-G2 CD3-VH-G3 CD3-VH-G4 CD3-VH-G5 CD3-VH-G8 CD3-VH-G9 CD3-VH-G10 CD3-VH-G11 CD3-VH-G12 CD3-VH-G13 CD3-VH-G14 CD3-VH-G15 CD3-VH-G16 CD3-VH-G17 CD3-VH-G18 CD3-VH-G19 CD3-VH-G20 CD3-VH-G21 на CD3 и EGF CD3-VH-G CD3-VH-G2 CD3-VH-G3 CD3-VH-G4 CD3-VH-G5 CD3-VH-G8 CD3-VH-G9 CD3-VH-G10 CD3-VH-G11 CD3-VH-G12 CD3-VH-G13 CD3-VH-G14 CD3-VH-G15 CD3-VH-G16 CD3-VH-G17 CD3-VH-G18 CD3-VH-G19 CD3-VH-G20 CD3-VH-G21 on CD3 and EGF 1,65Е-08 НС НС НС Очень слабое 1,93Е-08 2,74Е-07 2,77Е-07 1,83Е-08 4,72Е-08 1,02Е-07 3,19Е-08 9,ЗОЕ-08 5,68Е-08 2,00Е-07 1,26Е-07 6,07Е-08 2,10Е-07 1,06Е-07 RvIII-специ 1.65Е-08 NS NS NS Very weak 1.93Е-08 2.74Е-07 2.77Е-07 1.83Е-08 4.72E-08 1.02E-07 3.19E-08 9,ZOE-08 5.68E-08 2.00E-07 1.26E-07 6.07Е-08 2.10E-07 1.06E-07 RvIII-spec 1,42Е-08 НС НС НС НС 1,96Е-08 НС НС 8,90Е-07 НС 2,17Е-06 1,70Е-07 НС НС 3,35Е-06 НС НС 6,14Е-06 НС фических кле 1.42E-08 NS NS NS NS 1.96E-08 NS NS 8.90E-07 NS 2.17E-06 1.70E-07 NS NS 3.35E-06 NS NS 6.14Е-06 NS physical glue 2,26Е-09 1,88Е-09 1,90Е-09 1,72Е-09 1,31Е-09 1,31Е-09 1,43Е-09 1,19Е-09 1,03Е-09 1,16Е-09 1,25Е-09 1,ЗОЕ-09 1,21Е-09 1,03Е-09 1,34Е-09 2,16Е-09 1,35Е-09 2,09Е-09 1,14Е-09 Таблица 10 точных линиях 2.26E-09 1.88Е-09 1.90E-09 1.72E-09 1.31Е-09 1.31Е-09 1.43Е-09 1.19E-09 1.03Е-09 1.16E-09 1.25E-09 1,ZOE-09 1.21E-09 1.03Е-09 1.34Е-09 2.16E-09 1.35Е-09 2.09Е-09 1.14Е-09 Table 10 precise lines Идентификатор биспецифическо го антитела Bispecific antibody identifier Ahth-CD3 связывающее плечо Ahth-CD3 linking arm Jurkat Jurkat Т-клетки яванског о макака Javanese macaque T cells U87/ EGFRvIII U87/ EGFRvIII ЕС50 [М]EU 50 [M] ес50 [М]ec 50 [M] ЕС50 [М]EU 50 [M] BSV3/CD3-001 BSV3/CD3-001 CD3-VH-G CD3-VH-G 1,46Е- 09 1.46E- 09 нт nt 2,40Е-09 2.40E-09 BSV3/CD3-002 BSV3/CD3-002 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 Очень Very нт nt 5,60Е-09 5.60E-09 слабое weak

Таблица 10CTable 10C

FACS связывание на CD3 и MUC16-специфических клеточных линияхFACS binding on CD3 and MUC16-specific cell lines

Идентификатор биспецифическо го антитела Bispecific antibody identifier Анти-CD3 связывающее плечо Anti-CD3 binding arm Jurkat Jurkat Т-клетки яванског о макака Javanese macaque T cells OVCAR3 (MUC16+) OVCAR3 (MUC16+) ЕС50 [М]EU 50 [M] ЕС50 [М]EU 50 [M] ЕС50 [М]EU 50 [M] BSMUC16/CD3- 001 BSMUC16/CD3- 001 CD3-VH-G CD3-VH-G 3,21Е- 09 3.21E- 09 НТ NT 1,20Е-09 1.20E-09 BSMUC16/CD3- 002 BSMUC16/CD3- 002 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 Очень слабое Very weak нт nt 2,69Е-09 2.69Е-09

Как показано в табл. 10A, связывающие плечи CD3 каждого биспецифического антитела CD3xPSMA отображают диапазон аффинности связывания с клетками Jurkat, экспрессирующими CD3 человека (диапазон EC50 15-300 нМ). Важно отметить, что плечи CD3, которые демонстрируют слабое связывание с гетеродимерным белком человека CD3 в поверхностном плазмонном резонансе (см. табл. 11), также коррелируют со слабым и не наблюдаемым связыванием на клетках Jurkat (т.е.As shown in Table. 10A, the CD3 binding arms of each CD3xPSMA bispecific antibody display the range of binding affinity for human CD3 expressing Jurkat cells (EC 50 range 15-300 nM). Importantly, the CD3 arms, which exhibit weak binding to the heterodimeric human CD3 protein at surface plasmon resonance (see Table 11), also correlate with weak and unobservable binding on Jurkat cells (i.e.

- 38 040594- 38 040594

CD3-VH-G2, CD3-VH-G3, CD3-VH-G5). Не обнаруживаемое связывание или отсутствие обнаруживаемого связывания в FACS анализе или эквивалентном анализе означает, что сродство между антителом и его целевым антигеном выходит за пределы обнаружения анализа (например, >1 мкМ). Несколько CD3-связывающих плеч также проявляли перекрестную реактивность с T-клетками яванского макака. Все тестируемые биспецифические антитела проявляли сходное связывание клеток на соответствующих линиях клеток PSMA, EGFRvIII и MUC16, подтверждающих, что биспецифическое спаривание с отдельными плечами CD3 не влияло или не уменьшало TAA-специфическое связывание (TAA-специфическое связывание было меньше или равно 5,6 нМ (высокая аффинность) во всех проверенных примерах).CD3-VH-G2, CD3-VH-G3, CD3-VH-G5). No detectable binding or no detectable binding in a FACS assay or equivalent assay means that the affinity between the antibody and its target antigen is beyond the detection limits of the assay (eg, >1 μM). Several CD3-binding arms also showed cross-reactivity with cynomolgus monkey T cells. All bispecific antibodies tested showed similar cell binding on the respective PSMA, EGFRvIII, and MUC16 cell lines, confirming that bispecific pairing with individual CD3 arms did not affect or reduce TAA-specific binding (TAA-specific binding was less than or equal to 5.6 nM ( high affinity) in all tested examples).

Антитела, проявляющие слабое или недетектируемое связывание с CD3 человека, а также проявляющие слабое или недетектируемое связывание CD3 яванского макака, считаются выгодными для биспецифического спаривания, вызванного авидностью, в соответствии с данным изобретением и были дополнительно протестированы на цитотоксичность in vitro и in vivo.Antibodies showing weak or undetectable binding to human CD3, as well as showing weak or undetectable binding to cynomolgus monkey CD3, are considered to be beneficial for avidity-induced bispecific mating according to the present invention and were further tested for in vitro and in vivo cytotoxicity.

Пример 5. Аффинности связывания иллюстративных биспецифических антител, измеренные с помощью анализа поверхностного плазмонного резонанса.Example 5 Binding affinities of exemplary bispecific antibodies measured by surface plasmon resonance analysis.

Аффинности связывания и кинетические константы биспецифических анти-TAA антител х CD3 к растворимому гетеродимерному белку hCD3ε/δmFc (hCD3ε = UniProtKB/Swiss-Prot: P07766.2; SEQ ID NO: 169; hCD3δ = UniProtKB/Swiss-Prot: P04234.1, SEQ ID NO: 170) определяли с помощью поверхностного плазмонного резонанса при 37°C с использованием либо формата захвата антигена (табл. 11), либо формата захвата антител (данные не представлены). В данном примере использовали биспецифические антитела BSPSMA/CD3, поскольку эти пары представляли использование более широкой панели антител для связывания CD3. Измерения проводились на приборе Sierra Sensors MASS-1.Binding affinities and kinetic constants of bispecific anti-TAA antibodies x CD3 to soluble heterodimeric hCD3ε/δmFc protein (hCD3ε = UniProtKB/Swiss-Prot: P07766.2; SEQ ID NO: 169; hCD3δ = UniProtKB/Swiss-Prot: P04234.1, SEQ ID NO: 170) was determined by surface plasmon resonance at 37° C. using either antigen capture format (Table 11) or antibody capture format (data not shown). In this example, BSPSMA/CD3 bispecific antibodies were used because these pairs represented the use of a broader panel of antibodies for CD3 binding. The measurements were carried out on a Sierra Sensors MASS-1 instrument.

В формате захват антигена поверхность аминного датчика высокой плотности MASS-1 была дериватизирована поликлональным анти-IgG2a антителом мыши (Southern Biotech). Растворимый гетеродимерный белок CD3 захватывали и соответствующие антитела вводили по захваченному антигену.In the antigen capture format, the surface of the high density amine sensor MASS-1 was derivatized with a mouse polyclonal anti-IgG2a antibody (Southern Biotech). Soluble heterodimeric CD3 protein was captured and appropriate antibodies were administered against the captured antigen.

Константы скорости кинетической ассоциации (ka) и диссоциации (kd) определяли путем обработки и корректировки данных к модели связывания 1:1 с использованием программного обеспечения для корректировки кривой MASS-1 AnalyserR2. Константы равновесия диссоциации связывания (KD) и диссоциативные периоды полураспада (t1/2) были рассчитаны по константам кинетической скорости:Rate constants of kinetic association (k a ) and dissociation (kd) were determined by processing and adjusting the data to a 1:1 binding model using MASS-1 AnalyserR2 curve adjustment software. Binding dissociation equilibrium constants (KD) and dissociative half-lives (t 1/2 ) were calculated from the kinetic rate constants:

KD (M) = kd/ka и t1/2 (мин) = (ln2/(60*kd).K D (M) \u003d kd / k a and t 1/2 (min) \u003d (ln2 / (60 * kd).

Таблица 11Table 11

Аффинности биспецифических анти-CD3 антител к растворимому CD3 человекаAffinities of bispecific anti-CD3 antibodies to soluble human CD3

Связывание при 37 °С/Формат захват антигена Binding at 37°C / Antigen Capture Format Идентификатор биспецифическог о антитела Bispecific antibody identifier Соответствующий анти-СОЗантигенсвязывающий Corresponding anti-POP antigen binding ka (мс'1)ka (ms' 1 ) kd (С1)kd (C 1 ) KD (М)K D (M) ТЧ (мин) PM (min)

- 39 040594- 39 040594

BSPSMA/CD3-003 BSPSMA/CD3-003 идентификатор HCVR CD3-VH-G HCVR identifier CD3-VH-G 1,32Е+0 5 1.32E+0 5 7,62Е- 04 7.62E- 04 5,78Е- 09 5.78E- 09 15, 2 15, 2 BSPSMA/CD3-200 BSPSMA/CD3-200 CD3-VH-G2 CD3-VH-G2 НС NS НС NS НС NS НС NS BSPSMA/CD3-300 BSPSMA/CD3-300 CD3-VH-G3 CD3-VH-G3 НС NS НС NS НС NS НС NS BSPSMA/CD3-400 BSPSMA/CD3-400 CD3-VH-G4 CD3-VH-G4 НС NS НС NS НС NS НС NS BSPSMA/CD3-004 BSPSMA/CD3-004 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 НС NS НС NS НС NS НС NS 5,95Е+0 5.95E+0 1,15Е- 1.15E- 1,94Е- 1.94E- BSPSMA/CD3-800 BSPSMA/CD3-800 CD3-VH-G8 CD3-VH-G8 10, 0 100 4 4 03 03 08 08 4,38Е+0 4.38E+0 4,95Е- 4.95E- 1,13Е- 1.13E- BSPSMA/CD3-900 BSPSMA/CD3-900 CD3-VH-G9 CD3-VH-G9 2,3 2.3 4 4 03 03 07 07 3,44Е+0 3.44E+0 6,37Е- 6.37E- 1,85Е- 1.85E- BSPSMA/CD3-1000 BSPSMA/CD3-1000 CD3-VH-G10 CD3-VH-G10 1,8 1.8 4 4 03 03 07 07 9,21Е+0 9.21E+0 1,02Е- 1.02E- 1, НЕ- 1, NOT- BSPSMA/CD3-1100 BSPSMA/CD3-1100 CD3-VH-G11 CD3-VH-G11 11,3 11.3 4 4 03 03 08 08 3,85Е+0 3.85E+0 2,47Е- 2.47E- 6,42Е- 6.42E- BSPSMA/CD3-1200 BSPSMA/CD3-1200 CD3-VH-G12 CD3-VH-G12 4,7 4.7 4 4 03 03 08 08 2,03Е+0 2.03E+0 2,48Е- 2.48E- 1,22Е- 1.22E- BSPSMA/CD3-1300 BSPSMA/CD3-1300 CD3-VH-G13 CD3-VH-G13 4,7 4.7 4 4 03 03 07 07 6,21Е+0 6.21E+0 3,31Е- 3.31E- 5,ЗЗЕ- 5,ZZE- BSPSMA/CD3-1400 BSPSMA/CD3-1400 CD3-VH-G14 CD3-VH-G14 3,5 3.5 4 4 03 03 08 08 7,36Е+0 7.36E+0 6, НЕ- 6, NOT- 8,29Е- 8.29E- BSPSMA/CD3-1500 BSPSMA/CD3-1500 CD3-VH-G15 CD3-VH-G15 1,9 1.9 4 4 03 03 08 08 6,43Е+0 6.43E+0 2,43Е- 2.43E- 3,78Е- 3.78E- BSPSMA/CD3-1600 BSPSMA/CD3-1600 CD3-VH-G16 CD3-VH-G16 4,7 4.7 4 4 03 03 08 08 4,70Е+0 4.70E+0 3,07Е- 3.07E- 6,52Е- 6.52E- BSPSMA/CD3-1700 BSPSMA/CD3-1700 CD3-VH-G17 CD3-VH-G17 3, 8 3, 8 4 4 03 03 08 08 BSPSMA/CD3-1800 BSPSMA/CD3-1800 CD3-VH-G18 CD3-VH-G18 НС NS НС NS НС NS НС NS 4,43Е+0 4.43E+0 5,09Е- 5.09E- 1,15Е- 1.15E- BSPSMA/CD3-1900 BSPSMA/CD3-1900 CD3-VH-G19 CD3-VH-G19 2,3 2.3 4 4 03 03 07 07 1,73Е+0 1.73E+0 5,77Е- 5.77E- 3,34Е- 3.34E- BSPSMA/CD3-005 BSPSMA/CD3-005 CD3-VH-G20 CD3-VH-G20 2, 0 20 4 4 03 03 07 07 3,02Е+0 3.02E+0 2,34Е- 2.34E- 7,75Е- 7.75E- BSPSMA/CD3-2100 BSPSMA/CD3-2100 CD3-VH-G21 CD3-VH-G21 4,9 4.9 4 4 03 03 08 08 3,68Е+0 3.68E+0 2,66Е- 2.66E- 7,22Е- 7.22E- Контроль 1 Control 1 CD3-L2K CD3-L2K 4,3 4.3 5 5 03 03 09 09

НС: Не обнаружено связывания.HC: No binding found.

Как показано в табл. 11, все полученные биспецифические aHTu-CD3x-aHTu-PSMA антитела сохраняют очень слабое связывание с растворимым CD3 в анализе связывания поверхностного плазмонного резонанса, например имея значение KD от более чем 11 до 334 нМ, которое слабее, чем у биспецифического анти-CD3-плеча, полученного из каркасных областей зародышевой линии -CD3-VH-G.As shown in Table. 11, all generated aHTu-CD3x-aHTu-PSMA bispecific antibodies retain very weak binding to soluble CD3 in the surface plasmon resonance binding assay, e.g. having a KD value of greater than 11 to 334 nM, which is weaker than that of the anti-CD3 bispecific arm. derived from the germline framework regions -CD3-VH-G.

Несколько биспецифических антител продемонстрировали значение KD более 50 нМ, а некоторые значения KD составляли более 100 нМ (>1х10-7) (т.е. BSPSMA/CD3-900, BSPSMA/CD3-1000, BSPSMA/CD3-1900), значения KD более чем 300 нМ (>3х10-7) (т.е. BSPSMA/CD3-005) и даже за пределом обнаружения анализа (>500 нМ; >5х10-7), т.е. не обнаруживает обнаруживаемого связывания с растворимым CD3 человека (т.е. BSPSMA/CD3-200, BSPSMA/CD3-300, BSPSMA/CD3-400, BSPSMA/CD3-004 и BSPSMA/CD3-1800).Several bispecific antibodies showed KD values greater than 50 nM and some KD values were greater than 100 nM (>1 x 10 -7 ) (i.e. BSPSMA/CD3-900, BSPSMA/CD3-1000, BSPSMA/CD3-1900), KD values greater than 300 nM (>3x10 -7 ) (i.e. BSPSMA/CD3-005) and even beyond the detection limit of the assay (>500 nM; >5x10 -7 ), i.e. shows no detectable binding to soluble human CD3 (i.e. BSPSMA/CD3-200, BSPSMA/CD3-300, BSPSMA/CD3-400, BSPSMA/CD3-004 and BSPSMA/CD3-1800).

Пример 6. Активация T-клеток и опухолеспецифическая цитотоксичность, проявляемая биспецифическими антителами по изобретению, измеренные in vitro.Example 6 T cell activation and tumor-specific cytotoxicity exhibited by the bispecific antibodies of the invention measured in vitro.

В данном примере специфическое уничтожение экспрессирующих PSMA, EGFRvIII или MUC16 целевых клеток TAA в присутствии биспецифических антител на основе CD3 исследовали с помощью проточной цитометрии. Как сообщалось ранее, биспецифические антитела проявляли диапазон аффинности к белку CD3 и CD3-экспрессирующей клеточные линии (т.е. слабое, умеренное и сильное связы- 40 040594 вание). Эта же группа биспецифических антител тестировалась на способность индуцировать наивные человеческие T-клетки, чтобы перенаправить лизис на клетки, экспрессирующие мишень.In this example, the specific killing of PSMA, EGFRvIII, or MUC16 expressing TAA target cells in the presence of CD3-based bispecific antibodies was examined by flow cytometry. As previously reported, the bispecific antibodies exhibited a range of affinities for the CD3 protein and CD3 expressing cell lines (ie, weak, moderate, and strong binding). The same group of bispecific antibodies were tested for their ability to induce naive human T cells to redirect lysis to cells expressing the target.

Кратко, PSMA-экспрессирующие (C4-2, 22Rv1 и TRAMPC2_PSMA), EGFRvIn-экспрессирующие (U87/EGFRvIII) или MUC16-экспрессирующие (OVCAR3) клеточные линии были помечены 1 мкМ флуоресцентного отслеживающего красителя Violet Cell Tracker.Briefly, PSMA-expressing (C4-2, 22Rv1 and TRAMPC2_PSMA), EGFRvIn-expressing (U87/EGFRvIII), or MUC16-expressing (OVCAR3) cell lines were labeled with 1 μM Violet Cell Tracker fluorescent tracking dye.

После мечения клетки высевали на ночь при 37°C. Отдельно человеческие PBMC высевали в дополненную среду RPMI в количестве 1x106 клеток/мл и инкубировали в течение ночи при 37°C с целью обогащения лимфоцитов путем разрушения адгезивных макрофагов, дендритных клеток и некоторых моноцитов. На следующие сутки клетки-мишени были совместно инкубированы с адгезивными истощенными наивными PBMC (соотношение эффекторные/целевые клетки 4:1) и последовательным разведением соответствующих биспецифических антител или изотипического контроля (диапазон концентрации: от 66,7 нМ до 0,25 пМ) в течение 48 ч при 37°C. Клетки удаляли из планшета для культивирования клеток, используя буфер для диссоциации клеток без фермента, и анализировали с помощью FACS.After labeling, the cells were seeded overnight at 37°C. Separately, human PBMCs were plated in RPMI supplemented medium at 1x106 cells/ml and incubated overnight at 37°C to enrich lymphocytes by destroying adherent macrophages, dendritic cells and some monocytes. The following day, target cells were co-incubated with adherent depleted naïve PBMCs (effector/target ratio 4:1) and serial dilutions of the appropriate bispecific antibodies or isotype control (concentration range: 66.7 nM to 0.25 pM) for 48 hours at 37°C. Cells were removed from the cell culture plate using enzyme-free cell dissociation buffer and analyzed by FACS.

Для FACS анализа клетки окрашивали дальним красным клеточным трекером на мертвые/живые клетки (Invitrogen). В каждую лунку добавляли 5x105 счетных гранул непосредственно перед FACS анализом. Для каждого образца собирали 1x104 гранул. Для оценки специфичности лизиса клетки разделяли живые окрашенные фиолетовым популяции. Процент живой популяции регистрировался и использовался для расчета нормализованной выживаемости.For FACS analysis, cells were stained with a far red dead/live cell tracker (Invitrogen). 5x105 counting pellets were added to each well just prior to FACS analysis. For each sample, 1x104 pellets were collected. To assess the specificity of lysis, cells were separated by living violet-stained populations. The percentage of the living population was recorded and used to calculate normalized survival.

Активацию T-клеток оценивали путем инкубации клеток с непосредственно конъюгированными антителами к CD2 и CD69 и путем представления процента активированных (CD69+) T-клеток из общих T-клеток (CD2+).T cell activation was assessed by incubating cells with directly conjugated anti-CD2 and CD69 antibodies and by reporting the percentage of activated (CD69+) T cells out of total (CD2+) T cells.

Как демонстрируют результаты в табл. 12A-12C, истощение TAA-экспрессирующих клеток наблюдалось с использованием анти-PSMA, анти-EGFRvIn или анти-MUC16xCD3 биспецифических антител. Большинство тестируемых биспецифических антител активировали и направили T-клетки человека, чтобы истощить клетки-мишени с помощью EC50 в пикомолярном диапазоне. Кроме того, наблюдаемый лизис (истощение) целевой клетки был связан с повышением регуляции клеток CD69 на CD2+ T-клетках с пикомолярной (пМ) EC50.As the results in Table. 12A-12C, depletion of TAA-expressing cells was observed using anti-PSMA, anti-EGFRvIn, or anti-MUC16xCD3 bispecific antibodies. Most of the bispecific antibodies tested activated and directed human T cells to deplete target cells with EC 50 in the picomolar range. In addition, the observed lysis (depletion) of the target cell was associated with upregulation of CD69 cells on CD2+ T cells with picomolar (pM) EC 50 .

Важно отметить, что результаты данного примера демонстрируют, что несколько биспецифических антител, которые использовали связывание с CD3, которое проявляло слабое или ненаблюдаемое связывание с CD3-белком или CD3-экспрессирующими клетками (т.е. CD3-VH-G5), все еще сохраняли способность активировать T-клетки и проявляли сильную цитотоксичность опухолевых антигенэкспрессирующих клеток.Importantly, the results of this example demonstrate that several bispecific antibodies that used CD3 binding that exhibited weak or unobservable binding to CD3 protein or CD3-expressing cells (i.e., CD3-VH-G5) still retained the ability to activate T-cells and showed strong cytotoxicity of tumor antigen-expressing cells.

- 41 040594- 41 040594

Таблица 12ATable 12A

Цитотоксичность и свойства активации T-клеток выбранных биспецифических антител PSMAxCD3Cytotoxicity and T cell activation properties of selected PSMAxCD3 bispecific antibodies

Идентификат ор биспецифиче ского антитела Identifier of obispecific antibody Anti-CD3 связывают ее плечо Anti-CD3 bind her shoulder истощение клеток C4-2 EC50 [Μ]cell depletion C4-2 EC 50 [M] 22RV1 истощение клеток ЕС50 [М]22RV1 cell depletion EC 50 [M] ТгашрС2 . PSMA истощение клеток ЕС50 [М]TgashpC2 . PSMA cell depletion EC 50 [M] Активаци я Тклеток ЕС50 [М]T cell activation EC 50 [M] BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH-G CD3-VH-G 1,ОЗЕ-11 1,OSE-11 нт nt 6,43Е-12 6.43E-12 1,23Е-12 1.23E-12 CD3-003 CD3-003 Отсутств Absences Отсутствие Absence ие ie CD3-VH-G2 CD3-VH-G2 НТ NT НТ NT BSPSMA/ BSPSMA/ активности activity активное active CD3-200 CD3-200 ти ti BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH-G3 CD3-VH-G3 НТ NT Очень слабое Very weak НТ NT 1,85Е-11 1.85E-11 CD3-300 CD3-300 BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH-G4 CD3-VH-G4 НТ NT Очень слабое Very weak НТ NT Очень Very CD3-400 CD3-400 слабое weak BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 2,15Е-11 2.15E-11 6,31Е-12 6.31E-12 1,15Е-11 1.15E-11 1,34Е-11 1.34Е-11 CD3-004 CD3-004 BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH-G8 CD3-VH-G8 НТ NT НТ NT 9,27Е-12 9.27E-12 1,76Е-12 1.76E-12 CD3-800 CD3-800 BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH-G9 CD3-VH-G9 НТ NT НТ NT 3,50Е-12 3.50E-12 1,12Е-12 1.12E-12 CD3-900 CD3-900 BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH- CD3-VH- НТ NT НТ NT 5,97Е-12 5.97E-12 1,28Е-12 1.28E-12 CD3-1000 CD3-1000 GIO GIO BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH- CD3-VH- НТ NT НТ NT 3,86Е-12 3.86E-12 1,11Е-12 1.11E-12 CD3-1100 CD3-1100 Gil Gil BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH- CD3-VH- 8,74Е-12 8.74Е-12 НТ NT НТ NT 2,31Е-12 2.31E-12 CD3-1300 CD3-1300 G13 G13 BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH- CD3-VH- 7,37Е-12 7.37E-12 2,07Е-12 2.07Е-12 НТ NT 3,89Е-12 3.89E-12 CD3-1700 CD3-1700 G17 G17 BSPSMA/ BSPSMA/ CD3-VH- CD3-VH- 1,39Е-11 1.39E-11 8,32Е-12 8.32E-12 НТ NT 6,11Е-12 6.11E-12 | CD3-005 | CD3-005 G2 0 G20 1 1

НТ = не тестировалось.NT = not tested.

Таблица 12BTable 12B

Цитотоксичность и свойства активации T-клеток выбранных биспецифических антител EGFRvIIIxCD3Cytotoxicity and T cell activation properties of selected EGFRvIIIxCD3 bispecific antibodies

Идентификатор биспецифического антитела Bispecific antibody identifier Анти-СОЗ связывающее плечо Anti-POP binding shoulder U87_EGFRvIII истощение клеток ЕС50 [М]U87_EGFRvIII depletion of EC 50 cells [M] Активация Тклеток ЕС50 [М]Activation of T cells EC 50 [M] BSV3/CD3-001 BSV3/CD3-001 CD3-VH-G CD3-VH-G 3,64Е-10 3.64Е-10 3,ЗЗЕ-11 3,ZZE-11 BSV3/CD3-002 BSV3/CD3-002 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 1,ЗОЕ-09 1,ZOE-09 1,13Е-10 1.13E-10

Таблица 12CTable 12C

Цитотоксичность и свойства активации T-клеток выбранных биспецифических антител MUC16xCD3Cytotoxicity and T cell activation properties of selected MUC16xCD3 bispecific antibodies

Идентификатор биспецифическог о антитела Bispecific antibody identifier Анти-СОЗ связывающее плечо Anti-POP binding shoulder OVCAR3 истощение клеток ЕС50 [М]OVCAR3 cell depletion EC 50 [M] Активац ия Тклеток ЕС50 [М]T cell activation EC 50 [M] BSV3/CD3-001 BSV3/CD3-001 CD3-VH-G CD3-VH-G 2,24Е-11 2.24Е-11 5,88Е- 12 5.88E- 12 BSV3/CD3-002 BSV3/CD3-002 CD3-VH-G5 CD3-VH-G5 3Z 06Е-113 Z 06E-11 1,01Е- 11 1.01E- eleven

- 42 040594- 42 040594

Пример 7. Биспецифические aHmu-PSMA/aHTu-CD3 антитела проявляют сильную противоопухолевую эффективность in vivo.Example 7 Bispecific aHmu-PSMA/aHTu-CD3 antibodies show strong anti-tumor efficacy in vivo.

Для определения эффективности in vivo иллюстративных анти-PSMA/анти-CD3 биспецифических антител, идентифицированных как имеющие слабую или не обнаруживаемую аффинность связывания с CD3 человека и яванского макака, исследования проводили у мышей с ослабленным иммунитетом, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека. Дополнительные исследования также проводились у иммунокомпетентных мышей, несущих ксенотрансплантаты рака простаты мыши, сконструированные для экспрессии PSMA человека.To determine the in vivo efficacy of exemplary anti-PSMA/anti-CD3 bispecific antibodies identified as having weak or no detectable binding affinity for human and cynomolgus monkey CD3, studies were performed in immunocompromised mice bearing human prostate cancer xenografts. Additional studies were also performed in immunocompetent mice bearing mouse prostate cancer xenografts engineered to express human PSMA.

Эффективность анти-PSMA/анти-CD3 биспецифических антител в моделях ксенотрансплантата опухоли человека.Efficacy of anti-PSMA/anti-CD3 bispecific antibodies in human tumor xenograft models.

Для оценки эффективности in vivo анти-PSMA/анти-CD3 биспецифических антител в исследованиях ксенотрансплантата опухоли человека у мышей NOD ТКИД гамма (NSG) (Jackson Laboratories, Бар Харбор, штат Мэн) совместно имплантировали мононуклеарные клетки периферической крови человека (PBMC) вместе с опухолевыми клетками предстательной железы человека 22Rv1 или C4-2, которые эндогенно экспрессируют PSMA.To evaluate the in vivo efficacy of anti-PSMA/anti-CD3 bispecific antibodies in human tumor xenograft studies in NOD SCID gamma (NSG) mice (Jackson Laboratories, Bar Harbor, Maine), human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were co-implanted with tumor cells. human prostate 22Rv1 or C4-2 cells that endogenously express PSMA.

Кратко, 4х106 клеток 22Rv1 или 5х106 клеток C4-2 (MD Anderson, TX) были совместно имплантированы под кожу с 1х106 PBMC человека (ReachBio, LLC., Сиэтл, штат Вашингтон) в 50:50 смеси с матригелем (BD Biosciences) в правый бок самцов мышей NSG. В исследовании C4-2 мышам вводили интрапарентерально на 0, 4 и 7 сутки после имплантации опухоли с 0,1 мг/кг BSPSMA/CD3-003 или BSPSMA/CD3-005.Briefly, 4 x 10 6 22Rv1 cells or 5 x 10 6 C4-2 cells (MD Anderson, TX) were co-implanted subcutaneously with 1 x 10 6 human PBMC (ReachBio, LLC., Seattle, WA) in a 50:50 mixture with Matrigel (BD Biosciences ) in the right flank of male NSG mice. In the C4-2 study, mice were injected intraparenterally on days 0, 4 and 7 after tumor implantation with 0.1 mg/kg BSPSMA/CD3-003 or BSPSMA/CD3-005.

В дополнительной ксеногенной модели биспецифические анти-PSMA/анти-CD3 антитела тестировали на мышах, привитых гемопоэтическими стволовыми клетками CD34+ человека. Вкратце, новорожденные SIRPa BALB/c-Rag2-IL2rY-(BRG) мыши были привиты клетками печени плода hCD34+. Спустя 3-6 месяцев hCD34-привитые мыши SIRPa BRG затем имплантировали C4-2-клетками (5х106 подкожно в матригеле). Через 8 суток мышей обрабатывали 10 мкг BSPSMA/CD3-004 или антителом изотипического контроля, после чего в течение всего исследования вводили дозы 2х/неделя.In an additional xenogeneic model, bispecific anti-PSMA/anti-CD3 antibodies were tested in mice inoculated with human CD34+ hematopoietic stem cells. Briefly, newborn SIRPa BALB/c-Rag2-IL2rY-(BRG) mice were inoculated with hCD34 + fetal liver cells. 3-6 months later, hCD34-grafted SIRPa BRG mice were then implanted with C4-2 cells (5 x 10 6 subcutaneously in Matrigel). After 8 days, mice were treated with 10 μg of BSPSMA/CD3-004 or isotype control antibody, followed by 2x/week doses throughout the study.

Во всех исследованиях размер опухоли измеряли 2 раза в неделю с использованием суппортов и объема опухоли, рассчитанного как объем=(длинахширина2)/2.In all studies, tumor size was measured twice a week using calipers and tumor volume calculated as volume=(length x width 2 )/2.

Как показывают результаты в табл. 13, биспецифические антитела, испытываемые в ксеногенных моделях, описанных выше, были эффективны для подавления роста опухоли по сравнению с изотипическим контролем.As the results in Table. 13, the bispecific antibodies tested in the xenogeneic models described above were effective in suppressing tumor growth compared to the isotype control.

Таблица 13Table 13

Подавление роста опухоли путем введения анти-PSMA/анти-CD3 биспецифических антител в ксеногенные модели мышиSuppression of tumor growth by introducing anti-PSMA/anti-CD3 bispecific antibodies into xenogeneic mouse models

Ксеногенная модель:подавление роста опухолиXenogeneic model: suppression of tumor growth

Модель опухоли/ штамм мыши Tumor model/mouse strain N № мышь/ группа лечения N No. mouse/treatment group Идентификатор биспецифического антитела Bispecific antibody identifier Доза Dose Конечный объем опухоли (мм3) Среднее ± SDFinal tumor volume (mm 3 ) Mean ± SD С4-/2 NSG C4-/2 NSG 5 5 BSPSMA/CD3-003 BSPSMA/CD3-003 0,1 мг/кг на 0,4 и 7 сутки 0.1 mg/kg on days 0.4 and 7 0±0 0±0 5 5 BSPSMA/CD3-005 BSPSMA/CD3-005 0±0 0±0 5 5 Изотипический контроль Isotype control 960 ± 660 960±660 С4-2/ SIRPa Balb/c-Rag2IL2ry- BRG привитые hCD34+ HSC С4-2/ SIRPa Balb/c-Rag2IL2ry-BRG grafted with hCD34+ HSC 5 5 BSPSMA/CD3-004 BSPSMA/CD3-004 1,0 мкг/мышь 2х/неделя 1.0 µg/mouse 2x/week 70 ± 60 70 ± 60 5 5 Изотипический контроль Isotype control 260 ± 180 260±180

Эффективность анти-PSMA/анти-CD3 биспецифических антител в иммунокомпетентной опухолевой модели.Efficacy of anti-PSMA/anti-CD3 bispecific antibodies in an immunocompetent tumor model.

Кроме того, биспецифические анти-PSMA антитела/CD3 оценивали на противоопухолевую активность в иммунокомпетентной модели (предварительная заявка США № 62/083653, поданная 24 ноября 2014 г.). Мыши, гуманизированные для трех цепей (δγε) CD3, также были гуманизированы для PSMA и имплантированы альтернативной клеточной линией мышиного рака простаты TRAMP-C2, трансфицированной PSMA человека.In addition, anti-PSMA/CD3 bispecific antibodies were evaluated for antitumor activity in an immunocompetent model (U.S. Provisional Application No. 62/083653 filed November 24, 2014). Mice humanized for CD3 tri-chain (δγε) were also humanized for PSMA and implanted with an alternative murine prostate cancer cell line TRAMP-C2 transfected with human PSMA.

Перед началом исследования был продуцирован вариант опухолевых клеточных линий TRAMP-C2_hPSMAv № 1. Кратко, 7,5 х106 клеток TRAMP-C2_hPSMA имплантировали подкожно в правый бок самцов мышей, гуманизированных для CD3 и PSMA. Опухоль вырезали и разрезали на 3 мм фрагменты и впоследствии имплантировали в правый бок новых гуманизированных самцов мыши. Затем опухоль, образованную имплантированными опухолевыми фрагментами, собирали и дезагрегировали в одноклеточную суспензию. Эти клетки (TRAMP-C2_hPSMAv № 1) затем культивировали in vitro при выборе G418. 4х106 клеток этой вариантной клеточной линии затем имплантировали в правый бок сам- 43 040594 цов мышей с PSMA/CD3-гуманизацией для исследований эффективности биспецифических антител.Prior to the study, a variant of the TRAMP-C2_hPSMAv tumor cell lines #1 was produced. Briefly, 7.5 x 10 6 TRAMP-C2_hPSMA cells were implanted subcutaneously in the right flank of male mice humanized for CD3 and PSMA. The tumor was excised and cut into 3 mm fragments and subsequently implanted in the right flank of new humanized male mice. The tumor formed by the implanted tumor fragments was then harvested and disaggregated into a single cell suspension. These cells (TRAMP-C2_hPSMAv #1) were then cultured in vitro with G418 selected. 4x10 6 cells of this variant cell line were then implanted in the right flank of PSMA/CD3 humanized male mice for bispecific antibody efficacy studies.

Гуманизированных мышей PSMA/CD3, имплантированных TRAMPC2_hPSMAv № 1, обрабатывали 100 или 10 мкг биспецифического анти-Р8МА/анти-СПЗ антитела BSPSMA/CD3-004 или изотипическим контролем 2х/неделя, начиная со дня имплантации опухоли. Были также исследованы уровни цитокинов в сыворотке крови через 4 ч после инъекции, а также уровни Т-клеток селезенки. Исследование было прекращено на 27-е сутки.Humanized PSMA/CD3 mice implanted with TRAMPC2_hPSMAv #1 were treated with 100 or 10 μg of the bispecific anti-P8MA/anti-SDR antibody BSPSMA/CD3-004 or isotype control 2x/week starting from the day of tumor implantation. Serum cytokine levels 4 hours after injection, as well as spleen T-cell levels, were also examined. The study was terminated on the 27th day.

Как демонстрируют результаты в табл. 14, анти-Р8МА/анти-СОЗ биспецифическая молекула, испытанная BSPSMA/CD3-004, продемонстрировала эффективность значительного замедления роста опухоли во всех группах лечения. Минимальное выделение цитокинов наблюдалось после введения BSPSMA/CD3-004, возможно, из-за слабого связывания анти-СВЗ антител. Оба тестируемых антитела продемонстрировали противоопухолевую эффективность без истощения Т-клеток в селезенке.As the results in Table. 14, the anti-P8MA/anti-COP bispecific molecule tested by BSPSMA/CD3-004 was effective in significantly slowing down tumor growth in all treatment groups. Minimal release of cytokines was observed after administration of BSPSMA/CD3-004, possibly due to weak binding of anti-SVZ antibodies. Both antibodies tested demonstrated antitumor efficacy without depleting T cells in the spleen.

Таблица 14Table 14

Эффективность анти-Р8МА/анти-СОЗ биспецифических антител в иммунокомпетентной сингенной моделиEfficacy of anti-P8MA/anti-COP bispecific antibodies in an immunocompetent syngeneic model

Средние концентрации цитокинов в сыворотке, (пг/мл) Mean serum cytokine concentrations, (pg/ml) Уровень Tклеток селезенки %, (среднее+SD )* The level of T cells of the spleen%, (mean+SD)* Модель опухоли/ штамм мыши Tumor model/mouse strain Идентификатор биспецифическ ого антитела Bispecific antibody identifier Доза (мкг/мышь) 2х/неделя* Dose (µg/mouse) 2x/week* N № мышь/ группа лечения N No. mouse/treatment group Объем опухоли (мм3) на 27 сутки (Среднее ± SD)Tumor volume (mm 3 ) at day 27 (Mean ± SD) IFN g IFN g TNFa TNFa IL- 2 IL- 2 IL- 12p70 IL- 12p70 IL- 6 IL- 6 CD4 + CD4+ CD8 + CD8+ TRAMP-C2/ Р S ^ит CD3hTRAMP-C2/ P S ^ um C D3 h BSPSMA/CD3- 004 BSPSMA/CD3- 004 100 100 4 4 50 ± 60 50 ± 60 30 thirty 60 60 60 60 40 40 370 370 8,0 ± 1,0 8.0±1.0 12,0 ± 2,0 12.0±2.0 10 10 5 5 380 ± 650 380±650 10 10 50 50 50 50 10 10 330 330 8,0 ± 3,0 8.0±3.0 14,0 ± 4,0 14.0±4.0 Изотипический контроль isotypic control 100 100 5 5 1740 ± 560 1740±560 4 4 30 thirty 30 thirty 10 10 230 230 5,0 ± 1,0 5.0±1.0 8,0 ± 2,0 8.0 ± 2.0

* Мышам вводили антитело или изотипический контроль 2х/неделю, начиная со дня имплантации опухоли.* Mice were treated with antibody or isotype control 2x/week from the day of tumor implantation.

# Измеряется как процент клеток CD4+ или CD8+ в селезенке из живых клеток mCD45+.# Measured as the percentage of CD4 + or CD8 + cells in the spleen from living mCD45 + cells.

Таким образом, биспецифические анти-PSMA антитела/СЭЗ по данному изобретению проявляют сильную противоопухолевую эффективность как в иммунокомпрометированных, так и в иммунокомпетентных опухолевых моделях, несмотря на то, что они имеют низкое или не обнаруживаемое связывание с антигеном CD3.Thus, the bispecific anti-PSMA antibodies/SEZs of the present invention exhibit strong antitumor efficacy in both immunocompromised and immunocompetent tumor models despite having low or undetectable binding to the CD3 antigen.

Пример 8. Анти-МиС16/анти-СПЗ биспецифические антитела проявляют сильную противоопухолевую эффективность in vivo.Example 8 Anti-MiC16/anti-SDR bispecific antibodies show strong anti-tumor efficacy in vivo.

Для определения эффективности in vivo иллюстративных анти-МиС16/анти-СПЗ биспецифических антител, идентифицированных как имеющие слабую или не обнаруживаемую аффинность связывания с СОЗ человека и яванского макака, исследования проводили у мышей с ослабленным иммунитетом, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека. Эффективность выбранных биспецифических антител тестировалась как в способах дозирования, так и при терапевтическом лечении.To determine the in vivo efficacy of exemplary anti-MiC16/anti-SDR bispecific antibodies identified as having weak or no detectable binding affinity for human and cynomolgus monkey POPs, studies were performed in immunocompromised mice bearing human prostate cancer xenografts. The efficacy of selected bispecific antibodies was tested both in dosing regimens and in therapeutic treatments.

Эффективность анти-МиС16/анти-СОЗ биспецифических антител в моделях ксенотрансплантата опухоли человека.Efficacy of anti-MiC16/anti-COP bispecific antibodies in human tumor xenograft models.

Для оценки эффективности in vivo анти-МиС16/анти-СОЗ биспецифических антител в исследованиях ксенотрансплантата опухоли человека, мышам NOD ТКИД гамма (NSG) (Jackson Laboratories, Бар Харбор, штат Мэн) были предварительно имплантированы мононуклеарные клетки периферической крови человека (РВМС; ReachBio LLC., Сиэтл, штат Вашингтон), а затем введенные асцитные клетки из линии клеток рака яичника человека OVCAR-3 (Американская коллекция типовых культур, Манассас, штат Виргиния) трансдуцировали люциферазой (OVCAR-3/Luc). Клетки OVCAR-3 эндогенно экспрессируют MUC-16.To evaluate the in vivo efficacy of anti-MuC16/anti-POP bispecific antibodies in human tumor xenograft studies, NOD SCID gamma (NSG) mice (Jackson Laboratories, Bar Harbor, Maine) were pre-implanted with human peripheral blood mononuclear cells (PBMC; ReachBio LLC). ., Seattle, WA) and then introduced ascitic cells from the human ovarian cancer cell line OVCAR-3 (American Type Culture Collection, Manassas, VA) were transduced with luciferase (OVCAR-3/Luc). OVCAR-3 cells endogenously express MUC-16.

Кратко, мышей NSG инъецировали внутрибрюшинно (в.б.) 5,0x106 РВМС человека. Спустя 8 суток 1,5х106 асцитных клеток из клеточной линии OVCAR-3/Luc, ранее пассированных in vivo, вводили в.б. мышам NSG, привитым с помощью РВМС. В группе немедленного лечения мышам вводили в.б. в деньBriefly, NSG mice were injected intraperitoneally (ip) with 5.0x10 6 human PBMC. After 8 days, 1.5x10 6 ascitic cells from the OVCAR-3/Luc cell line previously passaged in vivo were injected i.b. NSG mice inoculated with PBMC. In the immediate treatment group, mice were injected ip. in a day

-44040594 имплантации клеток OVCAR-3/Luc aHTu-MUC16/aHmu-CD3, анти-BSMUC16/анти-CD3-001 или антиBSMUC16/aHTu-CD3-005 биспецифические антитела или изотипический контроль в дозе 10 мкг/мышь (N=5 мышей/группа лечения). В модели терапевтических доз мышам вводили в.б. на 7 сутки после имплантации опухоли биспецифические или контрольные антитела MUC16/CD3, описанными выше, в дозе мкг/мышь (N=5/группа лечения).-44040594 implantation of OVCAR-3/Luc aHTu-MUC16/aHmu-CD3, anti-BSMUC16/anti-CD3-001 or anti-BSMUC16/aHTu-CD3-005 cells bispecific antibodies or isotype control at 10 µg/mouse (N=5 mice /treatment group). In the therapeutic dose model, mice were administered ip. on day 7 after tumor implantation, the bispecific or control MUC16/CD3 antibodies described above at a dose of μg/mouse (N=5/treatment group).

Во всех исследованиях рост опухоли контролировали с помощью биолюминесцентной визуализации (BLI). Мышам вводили в.б. субстрат люциферазы D-люциферином, суспендированный в PBS (150 мг/кг) и визуализированным под изофлурановой анестезией через 10 мин. BLI проводили с использованием системы Xenogen IVIS (Perkin Elmer, Хопкинтон, штат Массачусетс), а сигналы BLI были получены с использованием программного обеспечения Living Image (Xenogen/Perkin Elmer). Интересующие области были нарисованы вокруг каждой клеточной массы, а интенсивности фотонов регистрировались как фотоны(р)/секунды(c)/см2/стерадиан(срад). Для группы немедленной терапии данные представлены как уровни BLI на 26 сутки после имплантации опухоли (табл. 15). Для группы терапевтического лечения данные представлены как кратные изменения в BLI между 6 сутками (1 сутки перед лечением) и в конечной точке исследования (26 суток после имплантации опухоли, табл. 16).In all studies, tumor growth was monitored using bioluminescent imaging (BLI). Mice were injected i.b. luciferase substrate D-luciferin suspended in PBS (150 mg/kg) and visualized under isoflurane anesthesia after 10 min. BLI was performed using the Xenogen IVIS system (Perkin Elmer, Hopkinton, MA) and BLI signals were generated using Living Image software (Xenogen/Perkin Elmer). Regions of interest were drawn around each cell mass and photon intensities were recorded as photons(p)/seconds(s)/cm 2 /steradian(srad). For the immediate therapy group, data are presented as BLI levels at day 26 post-tumor implantation (Table 15). For the treatment group, data are presented as fold changes in BLI between day 6 (day 1 pre-treatment) and study endpoint (day 26 post-tumor implantation, Table 16).

Как показывают результаты, оба BSMUC16/CD3-001 и BSMUC16/CD3-005 продемонстрировали схожую эффективность в подавлении роста опухоли по сравнению с изотипическим контролем, когда BLI измеряли на 26 сутки в модели немедленного дозирования. Оба анти-MUC16/анти-CD3 биспецифических антитела также подавляли рост резвившихся опухолей на 7 сутки после имплантации опухоли по сравнению с контролем. Таким образом, анти-MUC16/анти-CD3 биспецифические антитела по данному изобретению проявляют сильную противоопухолевую эффективность в нескольких моделях.As the results show, both BSMUC16/CD3-001 and BSMUC16/CD3-005 showed similar efficacy in tumor growth suppression compared to isotype control when BLI was measured on day 26 in the immediate dosing model. Both anti-MUC16/anti-CD3 bispecific antibodies also inhibited the growth of mature tumors on day 7 after tumor implantation compared to controls. Thus, the anti-MUC16/anti-CD3 bispecific antibodies of the present invention exhibit strong antitumor efficacy in several models.

Таблица 15Table 15

Эффективность анти-MUC16/анти-CD3 биспецифических антител в иммуннокомпрометированной модели ксенотрансплантата. __________________Немедленное дозирование__________________Efficacy of anti-MUC16/anti-CD3 bispecific antibodies in an immunocompromised xenograft model. __________________Immediate dosing__________________

Модель опухоли/Шта мм мыши/ Доза Tumor Model/Mice Strain/Dose Идентификатор биспецифическо го антитела Bispecific antibody identifier N N Среднее биолюминесцентное излучение (фотоны/ сек/сям2/стерадиан ) 26 сутки (Среднее ± SD)Mean bioluminescent radiation (photons/sec/sam 2 /steradian) 26 days (Mean ± SD) OVCAR- З/Luc/ NSG/10 мкг/мышь OVCAR- Z/Luc/ NSG/10 µg/mouse BSMUC16/CD3- 001 BSMUC16/CD3- 001 5 5 1,4х103 ± 3,5х102 1.4x10 3 ± 3.5x10 2 BSMUC16/CD3- 005 BSMUC16/CD3- 005 5 5 1,5х103 ± 9,7х102 1.5x10 3 ± 9.7x10 2 Изотипический контроль isotypic control 5 5 2, OxiO7 ± 1,0x10е 2, OxiO 7 ± 1.0x10 e

- 45 040594- 45 040594

Таблица 16Table 16

Эффективность aHTu-Muc16/aHmu-CD3 биспецифических антител против в иммуннокомпрометированной модели ксенотрансплантата. Терапевтическое лечениеEfficacy of aHTu-Muc16/aHmu-CD3 bispecific antibodies against in an immunocompromised xenograft model. Therapeutic treatment

Модель опухоли/Штамм мыши/ Доза Tumor Model/Mouse Strain/Dose Идентификатор биспецифического антитела Bispecific antibody identifier N N Кратное изменение в среднем биолюминесцентном излучении [p/s/cm2/sr] на 26 сутки по сравнению с 6 сутками (Среднее ± SD)Fold change in average bioluminescent radiation [p/s/cm 2 /sr] at day 26 compared to day 6 (Mean ± SD) OVCAR-3/Luc/ NSG/10 мкг/мышь OVCAR-3/Luc/ NSG/10 µg/mouse BSMUC16/CD3-001 BSMUC16/CD3-001 5 5 2,0 ± 5,0 2.0±5.0 BSMUC16/CD3-005 BSMUC16/CD3-005 5 5 0, 01 ± 0,02 0.01±0.02 Изотипический контроль isotypic control 5 5 21,0 ± 8,0 21.0±8.0

Пример 9. Фармакокинетическая оценка aнти-MUC16 x aнти-CD3 биспецифических антител.Example 9 Pharmacokinetic evaluation of anti-MUC16 x anti-CD3 bispecific antibodies.

Оценка фармакокинетики aнти-MUC16хaнти-CD3 биспецифических антител BSMUC16/CD3-001 и BSMUC16/CD3-005 и изотипического контроля проводилась у гуманизированных мышей MUC16xCD3 (мышей, гомозиготных относительно экспрессии MUC16 и CD3 человека, MUC16hu/huxCD3hu/ hu), гуманизированных мышей CD3 (мышей, гомозиготных относительно экспрессии CD3 человека, CD3hu/hu) и контрольного штамма мышей (75% C57BL, 25% 129Sv) дикого типа (ДТ). Когорта содержала 4-5 мышей на тестируемое антитело и на штамм мыши. Все мыши получали единичную внутрибрюшинную (в.б.) дозу, равную 0,4 мг/кг. Образцы крови собирали через 3 и 6 ч, 1, 3, 7, 14 и 28 суток после дозирования. Кровь обрабатывали до сыворотки и замораживали при -80°C до анализа.The pharmacokinetics of the anti-MUC16anti-CD3 bispecific antibodies BSMUC16/CD3-001 and BSMUC16/CD3-005 and isotype controls were evaluated in humanized MUC16xCD3 mice (mice homozygous for human MUC16 and CD3 expression, MUC16 hu/hu xCD3 hu/ hu ), humanized CD3 mice (mice homozygous for human CD3 expression, CD3 hu / hu ) and a wild-type control (75% C57BL, 25% 129Sv) mouse strain (WT). The cohort contained 4-5 mice per test antibody and per mouse strain. All mice received a single intraperitoneal (ip) dose of 0.4 mg/kg. Blood samples were collected at 3 and 6 hours, 1, 3, 7, 14 and 28 days after dosing. Blood was processed to serum and frozen at -80°C until analysis.

Концентрации циркулирующих антител определяли путем общего анализа антител к IgG человека с использованием GyroLab xPlore™ (Gyros, Упсала, Швеция). Вкратце, биотинилированное козье античеловеческое поликлональное антитело IgG (Jackson ImmunoResearch, Вест Гроув, штат Пенсильвания) было помещено на гранулы, покрытые стрептавидином, на Gyrolab Bioaffy 200 CD (Gyros), чтобы захватить IgG человека, присутствующий в сыворотке крови. После захвата аффинной колонки связанное антитело IgG человека в образцах было обнаружено с помощью Alexa-647, помеченного козьим античеловеческим IgG (Jackson ImmunoResearch). Флуоресцентный сигнал на колонке, необходимый для обнаружения связанных IgG и единиц ответа (RU), считывался прибором. Концентрации проб определяли интерполяцией по стандартной кривой, которая была подобрана с использованием 5-параметрической логистической кривой с использованием программного обеспечения Gyrolab Evaluator.Circulating antibody concentrations were determined by total anti-human IgG antibody assay using GyroLab xPlore™ (Gyros, Uppsala, Sweden). Briefly, a biotinylated goat anti-human IgG polyclonal antibody (Jackson ImmunoResearch, West Grove, PA) was placed on streptavidin-coated beads on a Gyrolab Bioaffy 200 CD (Gyros) to capture human IgG present in serum. After capturing the affinity column, bound human IgG antibody in the samples was detected using Alexa-647 labeled with goat anti-human IgG (Jackson ImmunoResearch). The fluorescent signal on the column, necessary for the detection of bound IgG and response units (RU), was read by the instrument. Sample concentrations were determined by interpolation from a standard curve that was fitted using a 5-parameter logistic curve using the Gyrolab Evaluator software.

Параметры PK определяли с помощью некомпартментного анализа (NCA) с использованием программного обеспечения Phoenix®WinNonlin® версии 6.3 (Certara, L.P., Принцетон, штат Нью-Джерси) и экстраваскулярной дозировочной модели. Используя соответствующие средние значения концентрации для каждого антитела, все параметры PK, включая наблюдаемую максимальную концентрацию в сыворотке (Cmax), предполагаемый период полувыведения (t1/2) и площадь под кривой концентрации в зависимости от времени до последней измеряемой концентрации (AUClast) были определены с использованием линейного трапециевидного правила с линейной интерполяцией и равномерного взвешивания.PK parameters were determined by non-compartmental analysis (NCA) using Phoenix®WinNonlin® version 6.3 software (Certara, LP, Princeton, NJ) and an extravascular dosing model. Using the appropriate mean concentration values for each antibody, all PK parameters including observed maximum serum concentration (C max ), estimated half-life (t 1/2 ) and area under the concentration versus time curve to the last measured concentration (AUC last ) were determined using the linear trapezoidal rule with linear interpolation and uniform weighting.

После в.б. введения антител у мышей ДТ общие профили времени концентрации IgG BSMUC16/CD3-001, BSMUC16/CD3-005 и изотипического контроля были одинаковыми, характеризующимися сначала кратковременным распределением лекарственного средства, за которым следует одна фаза элиминации лекарственного средства во всем остатке исследования. Максимальная концентрация в сыворотке (Cmax) и расчетное лекарственное воздействие (AUClast) от трех антител были сопоставимы (в 1,3 раза друг от друга).After v.b. administration of antibodies in TD mice, the overall time profiles of BSMUC16/CD3-001, BSMUC16/CD3-005 IgG concentration and isotype control were similar, characterized first by transient drug distribution followed by a single phase of drug elimination throughout the remainder of the study. The maximum serum concentration (C max ) and estimated drug exposure (AUC last ) from the three antibodies were comparable (1.3 times each other).

После в.б. введения антител мышам CD3hu/hu BSMUC16/CD3-001, BSMUC16/CD3-005 и изотипический контроль имели сопоставимые концентрации Cmax (4,6, 3,6 и 4,1 мкг/мл соответственно). BSMUC16/CD3-005 и изотипический контроль демонстрировали аналогичные кривые элиминации лекарственного средства, тогда как BSMUC16/CD3-001 проявляли более резкую элиминацию лекарственного средства, чем оба, предполагая, что связывание с мишенью CD3 человека вызывает клиренс. Конечная концентрация антител для BSMUC16/CD3-001 составляла 0,03 мкг/мл, что примерно в 28 раз меньше конечных концентраций антител, определенных для изотипического контроля (0,85 мкг/мл) и в 22 раза меньше, чем BSMUC16/CD3-005 (0,66 мкг/мл).After v.b. administration of antibodies to mice CD3 hu/hu BSMUC16/CD3-001, BSMUC16/CD3-005 and isotype control had comparable concentrations of C max (4.6, 3.6 and 4.1 µg/ml, respectively). BSMUC16/CD3-005 and the isotype control showed similar drug elimination curves, while BSMUC16/CD3-001 showed more rapid drug elimination than both, suggesting that binding to the human CD3 target induces clearance. The final antibody concentration for BSMUC16/CD3-001 was 0.03 µg/mL, which is about 28 times less than the final antibody concentrations determined for isotype control (0.85 µg/mL) and 22 times less than BSMUC16/CD3- 005 (0.66 µg/ml).

- 46 040594- 46 040594

У дважды гуманизированных мышей MUC16hu/huxCD3hu/hu, биспецифическое антитело Muc16xCD3 и антитело изотипического контроля имели сопоставимые концентрации Cmax (Cmax в пределах 4,5-6,9 мкг/мл). Оба биспецифических антитела проявляли более высокое удаление лекарственного средства, чем изотипический контроль, подтверждая эффект, опосредованный мишенью. Конечная концентрация антител для BSMUC16/CD3-001 и BSMUC16/CD3-005 была в около 29 раз и в 2,9 раза меньше, чем конечная концентрация антител, определенная для изотипического контроля (0,86 мкг/мл).In doubly humanized MUC16 hu/hu xCD3 hu/hu mice, the Muc16xCD3 bispecific antibody and the isotype control antibody had comparable C max concentrations (C max in the range of 4.5-6.9 μg/ml). Both bispecific antibodies exhibited higher drug removal than the isotype control, confirming a target-mediated effect. The final antibody concentration for BSMUC16/CD3-001 and BSMUC16/CD3-005 was about 29 times and 2.9 times less than the final antibody concentration determined for the isotype control (0.86 μg/ml).

Краткое изложение данных для общих концентраций анти-MUC16ханти-CD3 биспецифических антител и антитела изотипического контроля представлено в табл. 17. Средние параметры PK описаны в табл. 18A и 18B. Средние общие концентрации антител против времени представлены на фиг. 2A-2C. В заключение, биспецифические антитела MUC16xCD3 демонстрировали сходные Cmax и кривые элиминации лекарственного средства у мышей ДТ, но BSMUC16/CD3-001 продемонстрировало более высокие скорости элиминации, чем BSMUC16/CD3-005, и изотипический контроль у единично гуманизированных CD3 мышей и мышей с двойной гуманизацией MUC16/CD3. Поскольку биспецифические антитела, вводимые в данном исследовании PK, состоят из одного и того же анти-MUC16 связывающего плеча, результаты демонстрируют, что сила связывания CD3-нацеливающего плеча может играть роль в уровнях воздействия лекарственного средства (AUClast) и скорости элиминации лекарственного средства. Ни BSMUC16/CD3-001, ни BSMUC16/CD3-005 не связывают MUC16 мыши или CD3 мыши.A summary of the data for the total concentrations of anti-MUC16hanty-CD3 bispecific antibodies and isotype control antibodies is presented in table. 17. The average PK parameters are described in Table. 18A and 18B. Mean total antibody concentrations versus time are shown in FIG. 2A-2C. In conclusion, the MUC16xCD3 bispecific antibodies showed similar Cmax and drug elimination curves in TD mice, but BSMUC16/CD3-001 showed higher elimination rates than BSMUC16/CD3-005 and isotype control in single humanized CD3 mice and mice with double humanization of MUC16/CD3. Since the bispecific antibodies administered in this PK study consist of the same anti-MUC16 binding arm, the results demonstrate that the binding strength of the CD3 targeting arm may play a role in drug exposure levels (AUC last ) and drug elimination rates. Neither BSMUC16/CD3-001 nor BSMUC16/CD3-005 bind mouse MUC16 or mouse CD3.

Таблица 17Table 17

Средние концентрации общего IgG в сыворотке после однократной 0,4 мг/кг внутрибрюшинной инъекции BSMUC16/CD3-001, BSMUC16/CD3-005 и антител изотипического контроля у мышей ДТ, гуманизированных CD3 мышей и ___________гуманизированных MUC16xCD3 мышей___________Mean serum total IgG concentrations after a single 0.4 mg/kg intraperitoneal injection of BSMUC16/CD3-001, BSMUC16/CD3-005 and isotype control antibodies in TD mice, humanized CD3 mice, and __________ humanized MUC16xCD3 mice ___________

Антител о Antibody Время (д) Time (e) Общая концентрация mAb в сыворотке мыши Total mAb concentration in mouse serum ДТ DT CD3hu/hu CD3hu /hu MUC16hu/hu х CD3hu/hu MUC16 hu/hu x CD3 hu/hu Сред нее (мкг /мл) Mean (µg/mL) + /- SD +/- SD Средн ее (мкг/ мл) Mean ee (mcg/ml) + /- SD +/- SD Средне е (мкг/м л) Average e (mcg/m l) + /- SD +/- SD 0, 13 0.13 5, 39 5, 39 0,34 0.34 4,30 4.30 0,29 0.29 6, 77 6, 77 1,52 1.52 0,25 0.25 5, 80 5, 80 0,36 0.36 4,26 4.26 1,07 1.07 6, 63 6, 63 1, 06 1, 06 BSMUC16 BSMUC16 1, 00 100 4,13 4.13 0,43 0.43 2,87 2.87 0,71 0.71 4,89 4.89 0,53 0.53 /CD3- /CD3- 3, 00 3.00 3, 19 3, 19 0,53 0.53 1,44 1.44 0,27 0.27 2,50 2.50 0,22 0.22 001 001 7,00 7.00 2, 61 2, 61 0,73 0.73 0,72 0.72 0, 13 0.13 1,20 1.20 0,22 0.22 14,00 14.00 1,44 1.44 0, 69 0.69 0, 18 0.18 0, 05 0.05 0,28 0.28 0, 08 0.08 21,00 21.00 0, 93 0.93 НО BUT 0, 07 0.07 0, 02 0.02 0, 06 0.06 0, 05 0.05

- 47 040594- 47 040594

28,00 28.00 0, 60 0.60 НО BUT 0, 04 0.04 0, 01 0.01 0, 03 0.03 0,02 0.02 BSMUC16 /CD3005 BSMUC16 /CD3005 0, 13 0.13 4,23 4.23 0, 62 0.62 3,35 3.35 1,15 1.15 4,35 4.35 0,24 0.24 0,25 0.25 4,53 4.53 0,55 0.55 3,40 3.40 0, 96 0.96 4,45 4.45 0,49 0.49 1, 00 100 3,47 3.47 0,32 0.32 2,72 2.72 0,42 0.42 3, 00 3.00 0, 61 0.61 3, 00 3.00 2,51 2.51 0, 13 0.13 1,95 1.95 0,37 0.37 1,98 1.98 0,41 0.41 7,00 7.00 2,02 2.02 0,24 0.24 2,31 2.31 0, 67 0.67 1,58 1.58 0,36 0.36 14,00 14.00 1, 19 1, 19 0, 17 0.17 1,01 1.01 0,23 0.23 0,78 0.78 0,26 0.26 21,00 21.00 1, 19 1, 19 0,29 0.29 1,19 1.19 0,11 0.11 0, 66 0.66 0,29 0.29 28,00 28.00 0,71 0.71 0,20 0.20 0, 66 0.66 0,28 0.28 0,30 0.30 0,22 0.22 Изотипи ческий контрол ь Isotype control 0, 13 0.13 5, 07 5, 07 1,16 1.16 5, 43 5, 43 1,30 1.30 6, 56 6.56 0,70 0.70 0,25 0.25 5, 91 5, 91 1,10 1.10 5, 67 5, 67 1,91 1.91 6,48 6.48 0,90 0.90 1, 00 100 2, 64 2, 64 0,24 0.24 2,98 2.98 1, 14 1, 14 2,82 2.82 0,30 0.30 3, 00 3.00 2,05 2.05 0, 06 0.06 2,29 2.29 0, 83 0.83 1,57 1.57 0,37 0.37 7,00 7.00 1,80 1.80 0,25 0.25 2,14 2.14 0, 85 0.85 1,96 1.96 0,37 0.37 14,00 14.00 1,22 1.22 0,28 0.28 1,48 1.48 0, 66 0.66 1,34 1.34 0,37 0.37 21,00 21.00 1,20 1.20 0,58 0.58 1,43 1.43 0,72 0.72 1,24 1.24 0,44 0.44 28,00 28.00 0,73 0.73 0,24 0.24 0, 85 0.85 0,29 0.29 0,86 0.86 0,41 0.41

Время: (г, когда отмечается) = время в часах после однократной инъекции;Time: (g, when noted) = time in hours after single injection;

Д = день исследования;D = study day;

SD = стандартное отклонение;SD = standard deviation;

НО = не определено из-за исключения мышей с отрицательными титрами клиренса лекарственного средства.NA = not determined due to the exclusion of mice with negative drug clearance titers.

Таблица 18ATable 18A

Сводка фармакокинетических параметров: Гуманизированные мыши CD3hu/hu Summary of pharmacokinetic parameters: CD3 hu / hu humanized mice

Пара- метр Pair- meter Еди- ницы Edi- threads Мышь ДТ Mouse DT Мышь CD3hu/hu Mouse CD3 hu/hu Изотипи ческий контрол ь Isotype control BSMUC16 / CD3-001 BSMUC16 / CD3-001 BSMUC1 6/ CD3005 BSMUC1 6/ CD3005 Изотипи ческий контрол ь Isotype control BSMUC16 /СОЗОО! BSMUC16 /SOZOO! BSMUC16 /CD3005 BSMUC16 /CD3005 с ^тах With ^max мкг/м л mcg/m l 5 ± 3 5 ± 3 6 ± 0,4 6±0.4 5 ± 0,5 5±0.5 4,1 ± 3 4.1±3 4,6 ± 0,8 4.6± 0.8 3,5 ± 1 3.5±1 т1/2 t 1/2 d d 11 ± 4 11 ± 4 7 ± 3 7 ± 3 12 ± 2 12±2 14 ± 0,5 14±0.5 3,9 ± 0,6 3.9± 0.6 11 ± 5 11±5 AUClast AUC last d»MKT / мл d»MKT / ml 35 ± 18 35±18 40 ± 11 40 ± 11 45 ± 5 45±5 49 ± 20 49 ± 20 16 ± 3 16±3 36 ± 13 36 ± 13

Cmax = пиковая концентрация; Cmax = peak concentration;

AUC = площадь под кривой концентрации-времени;AUC = area under the concentration-time curve;

AUClast = AUC, рассчитанная с момента времени до момента последней положительной концентрации;AUClast = AUC calculated from the time until the last positive concentration;

T1/2 = предполагаемый период полувыведения;T 1/2 = estimated half-life;

d = день.d = day.

- 48 040594- 48 040594

Таблица 18BTable 18B

Сводка фармакокинетических параметров: Дважды гуманизированные мыши MUC16hu/huxCD3hu/hu______Summary of pharmacokinetic parameters: Double humanized MUC16 hu/hu xCD3 hu/hu ______ mice

Параметр Parameter Еди- ницы Edi- threads Мышь ДТ Mouse DT Мыши MUC16hu/hu х CD3hu/hu MUC16 hu/hu x CD3 hu/hu mice Изотип ический контроль Isotype control BSMUC16 /CD3001 BSMUC16/CD3001 BSMUC16 /CD3005 BSMUC16/CD3005 Изотипически й контрол ь Isotype control BSMUC16 /CD3001 BSMUC16/CD3001 BSMUC16 /CD3005 BSMUC16/CD3005 Стах With tach мкг/мл mcg/ml 5 ± 3 5 ± 3 6 ± 0,4 6±0.4 5 ± 0,5 5±0.5 6,7 ± 0,7 6.7 ± 0.7 6, 9 ± 1 6.9 ± 1 4,5 ± 4 4.5±4 т1/2 t 1/2 d d 11 ± 4 11 ± 4 7 ± 3 7 ± 3 12 ± 2 12±2 12,9 ± 4 12.9±4 3,3 ± 0,8 3.3± 0.8 8,2 ± 4 8.2±4 AUClast AUC last с!*мкг/ мл s!*mcg/ml 35 ± 18 35 ± 18 40 ± 11 40 ± 11 45 ± 5 45±5 46 ± 10 46 ± 10 27± 3 27 ± 3 34 ± 11 34 ± 11

Cmax = пиковая концентрация;C max = peak concentration;

AUC = площадь под кривой концентрации-времени;AUC = area under the concentration-time curve;

AUClast =AUC, рассчитанная с момента времени до момента последней положительной концентрации;AUClast =AUC calculated from the time until the last positive concentration;

T1/2 = предполагаемый период полувыведения; d = день.T1 / 2 = estimated half-life; d = day.

Пример 10. Анти-STEAP2/анти-CD3 биспецифические антитела проявляют сильную противоопухолевую эффективность in vivo.Example 10 Anti-STEAP2/anti-CD3 bispecific antibodies show strong antitumor efficacy in vivo.

Для определения эффективности in vivo иллюстративных анти-STEAP2/анти-CD3 биспецифических антител, идентифицированных как имеющие слабую или не обнаруживаемую аффинность связывания с CD3 человека и яванского макака, исследования проводили у мышей с ослабленным иммунитетом, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека.To determine the in vivo efficacy of exemplary anti-STEAP2/anti-CD3 bispecific antibodies identified as having weak or no detectable binding affinity for human and cynomolgus monkey CD3, studies were performed in immunocompromised mice bearing human prostate cancer xenografts.

Для оценки эффективности in vivo анти-STEAP2/анти-CD3 биспецифических антител в исследованиях ксенотрансплантата опухоли человека у мышей NOD ТКИД гамма (NSG) (Jackson Laboratories, Бар Харбор, штат Мэн) совместно имплантировали мононуклеарные клетки периферической крови человека (PBMC; ReachBio LLC., Сиэтл, штат Вашингтон) вместе с опухолевыми клетками предстательной железы человека C4-2 (MD Anderson Cancer Center, Хьюстон, штат Техас), которые эндогенно экспрессируют STEAP2.To evaluate the in vivo efficacy of anti-STEAP2/anti-CD3 bispecific antibodies in human tumor xenograft studies in NOD SCID gamma (NSG) mice (Jackson Laboratories, Bar Harbor, Maine), human peripheral blood mononuclear cells (PBMC; ReachBio LLC.) were co-implanted. , Seattle, WA) together with C4-2 human prostate tumor cells (MD Anderson Cancer Center, Houston, TX) that endogenously express STEAP2.

Кратко, 5,0x106 клеток C4-2 были совместно имплантированы подкожно (п.к.) с 1,25x106 PBMC человека в 50:50 смеси матригеля (BD Biosciences, Сан-Хосе, штат Калифорния) в правый бок самцов мышей NSG. Мышей лечили внутрибрюшинно (в.б.) в день имплантации (модель немедленного лечения) с помощью анти-STEAP2/анти-CD3 биспецифических антител BSSTEAP2/CD3-001, BSSTEAP2/CD3-002 или BSSTEAP2/CD3-003 или антитела изотипического контроля (что не связывают опухолевые клетки C4-2) в дозе 0,1 или 0,01 мг/кг (N=5 мышей/группа).Briefly, 5.0x106 C4-2 cells were co-implanted subcutaneously (SC) with 1.25x106 human PBMC in a 50:50 mixture of Matrigel (BD Biosciences, San Jose, CA) in the right flank of male NSG mice. Mice were treated intraperitoneally (ip) on the day of implantation (immediate treatment model) with anti-STEAP2/anti-CD3 bispecific antibodies BSSTEAP2/CD3-001, BSSTEAP2/CD3-002, or BSSTEAP2/CD3-003 or isotype control antibody ( that do not bind C4-2 tumor cells) at a dose of 0.1 or 0.01 mg/kg (N=5 mice/group).

Размер опухоли измеряли 2 раза в неделю с использованием суппортов и объема опухоли, рассчитанного как объем=(длинахширина2)/2. Данные представлены как размер опухоли (мм3) в конечной точке исследования, 46 сутки после имплантации опухоли (табл. 19).Tumor size was measured twice a week using calipers and tumor volume calculated as volume=(length x width 2 )/2. Data are presented as tumor size (mm 3 ) at the endpoint of the study, 46 days after tumor implantation (Table 19).

Как показывают результаты, приведенные в табл. 19, BSSTEAP2/CD3-001, BSSTEAP2/CD3-002 и BSSTEAP2/CD3-003 значительно подавляют рост опухоли по сравнению с изотипическим контролем, когда размеры опухоли измерялись в конечной точке исследования. Важно отметить, что антиSTEAP2/анти-CD3 биспецифические антитела были эффективны в ингибировании роста опухоли C4-2 даже при самой низкой дозе, равной 0,1 мг/кг.As the results shown in table. 19, BSSTEAP2/CD3-001, BSSTEAP2/CD3-002, and BSSTEAP2/CD3-003 significantly inhibited tumor growth compared to isotype controls when tumor sizes were measured at study endpoint. Importantly, the antiSTEAP2/anti-CD3 bispecific antibodies were effective in inhibiting C4-2 tumor growth even at the lowest dose of 0.1 mg/kg.

--

Claims (20)

Таблица 19Table 19 Эффективность aHmu-STEAP2/aHTu-CD3 биспецифических антител в иммуннокомпрометированной модели ксенотрансплантата. Немедленное дозированиеEfficacy of aHmu-STEAP2/aHTu-CD3 bispecific antibodies in an immunocompromised xenograft model. Immediate dosing Модель опухоли/ Штамм мыши/ Идентификатор биспецифического антитела Доза (мг/кг) N Размер опухоли (мм3) 4 6 сутки после имплантации опухоли (Среднее ± SD)Tumor model/ Mouse strain/ Bispecific antibody identifier Dose (mg/kg) N Tumor size (mm 3 ) 4 6 days after tumor implantation (Mean ± SD) С4-2 / NSG BSSTEAP2/CD3-001 0, 1 5 18,0 ± 14,0С4-2 / NSG BSSTEAP2/CD3-001 0, 1 5 18.0±14.0 0, 01 5 23,0 ± 2200.01 5 23.0±220 BSSTEAP2/CD3-002 о, 1 5 15,0 ± 12,0BSSTEAP2/CD3-002 oh 1 5 15.0±12.0 0, 01 5 17,0 ± 8,00.01 5 17.0±8.0 BSSTEAP2/CD3-003 о, 1 5 19,0 ± 12,0BSSTEAP2/CD3-003 oh 1 5 19.0 ± 12.0 0, 01 5 25,0 ± 21,00.01 5 25.0 ± 21.0 Биспецифический контроль о, 1 5 1020,0 ± 922,0bispecific control oh 1 5 1020.0 ± 922.0 Данное изобретение не должно ограничиваться в объеме конкретными вариантами осуществления, описанными в данном документе. Действительно, различные модификации изобретения в дополнение к тем, которые описаны в данном документе, станут очевидными для специалистов в данной области техники из предшествующего описания и сопровождающих фигур. Такие модификации предназначены для охвата прилагаемой формулы изобретения.This invention should not be limited in scope to the specific embodiments described herein. Indeed, various modifications of the invention in addition to those described herein will become apparent to those skilled in the art from the foregoing description and accompanying figures. Such modifications are intended to be covered by the appended claims. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯCLAIM 1. Цитотоксическое биспецифическое антитело, содержащее первое антигенсвязывающее плечо, которое проявляет от слабого до недетектируемого связывания с CD3 человека и CD3 яванского макака, и второе антигенсвязывающее плечо, которое связывает опухолеассоциированный антиген, где указанное первое плечо содержит вариабельную область тяжелой цепи (HCVR), содержащую области, определяющие комплементарность, HCDR1-HCDR2-HCDR3, содержащие соответственно аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 36-38-40 или SEQ ID NO: 140-142-144, и легкую цепь, где указанная легкая цепь содержит вариабельную область легкой цепи (LCVR), содержащую области, определяющие комплементарность, LCDR1-LCDR2-LCDR3, содержащие соответственно аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 164-166-168, или указанная легкая цепь представляет собой когнатную легкую цепь второго антигенсвязывающего плеча, которое связывает опухолеассоциированный антиген.1. A cytotoxic bispecific antibody comprising a first antigen-binding arm that exhibits weak to undetectable binding to human CD3 and cynomolgus CD3, and a second antigen-binding arm that binds a tumor-associated antigen, wherein said first arm contains a heavy chain variable region (HCVR) containing complementarity determining regions, HCDR1-HCDR2-HCDR3, containing, respectively, the amino acid sequences of SEQ ID NO: 36-38-40 or SEQ ID NO: 140-142-144, and a light chain, where the specified light chain contains a light chain variable region (LCVR ) containing complementarity determining regions LCDR1-LCDR2-LCDR3 containing, respectively, the amino acid sequences of SEQ ID NO: 164-166-168, or said light chain is a cognate light chain of the second antigen-binding arm that binds the tumor-associated antigen. 2. Биспецифическое антитело по п.1, где указанная LCVR содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 162.2. The bispecific antibody of claim 1, wherein said LCVR contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 162. 3. Биспецифическое антитело по п.1 или 2, где указанное первое антигенсвязывающее плечо содержит области, определяющие комплементарность, HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3, содержащие соответственно аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 36-38-40-164-166-168.3. A bispecific antibody according to claim 1 or 2, wherein said first antigen-binding arm comprises complementarity determining regions HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 containing, respectively, the amino acid sequences of SEQ ID NO: 36-38-40-164- 166-168. 4. Биспецифическое антитело по п.1 или 2, где указанное первое антигенсвязывающее плечо содержит области, определяющие комплементарность, HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3, содержащие соответственно аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 140-142-144-164-166-168.4. A bispecific antibody according to claim 1 or 2, wherein said first antigen-binding arm comprises complementarity determining regions HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3, respectively containing the amino acid sequences of SEQ ID NO: 140-142-144-164- 166-168. 5. Биспецифическое антитело по п.2, где указанное биспецифическое антитело содержит пару аминокислотных последовательностей HCVR и LCVR (HCVR/LCVR), содержащую аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 34/162.5. The bispecific antibody of claim 2, wherein said bispecific antibody comprises a pair of amino acid sequences HCVR and LCVR (HCVR/LCVR) comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 34/162. 6. Биспецифическое антитело по п.2, где указанное биспецифическое антитело содержит пару аминокислотных последовательностей HCVR и LCVR (HCVR/LCVR), содержащую аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 138/162.6. The bispecific antibody of claim 2, wherein said bispecific antibody comprises a pair of amino acid sequences HCVR and LCVR (HCVR/LCVR) comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 138/162. 7. Применение цитотоксического биспецифического антитела для лечения рака у субъекта, где указанное биспецифическое антитело содержит первое антигенсвязывающее плечо, которое проявляет от слабого до недетектируемого связывания с CD3 человека и CD3 яванского макака, и второе антигенсвязывающее плечо, которое связывает опухолеассоциированный антиген, где указанное первое плечо содержит вариабельную область тяжелой цепи (HCVR), содержащую области, определяющие комплементарность, HCDR1-HCDR2-HCDR3, содержащие соответственно аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 36-38-40 или SEQ ID NO: 140-142-144, и легкую цепь, где указанная легкая цепь содержит7. The use of a cytotoxic bispecific antibody for the treatment of cancer in a subject, wherein said bispecific antibody comprises a first antigen-binding arm that exhibits weak to undetectable binding to human CD3 and cynomolgus CD3, and a second antigen-binding arm that binds a tumor-associated antigen, wherein said first arm contains a heavy chain variable region (HCVR) containing complementarity determining regions HCDR1-HCDR2-HCDR3 containing, respectively, the amino acid sequences of SEQ ID NO: 36-38-40 or SEQ ID NO: 140-142-144, and a light chain, where said light chain contains - 50 040594 вариабельную область легкой цепи (LCVR), содержащую области, определяющие комплементарность,- 50 040594 light chain variable region (LCVR) containing complementarity determining regions, LCDR1-LCDR2-LCDR3, содержащие соответственно аминокислотные последовательностиLCDR1-LCDR2-LCDR3 containing respectively amino acid sequences SEQ ID NO: 164-166-168, или указанная легкая цепь представляет собой когнатную легкую цепь второго антигенсвязывающего плеча, которое связывает опухолеассоциированный антиген.SEQ ID NO: 164-166-168 or said light chain is a cognate light chain of a second antigen-binding arm that binds a tumor-associated antigen. 8. Применение по п.7, где указанное биспецифическое антитело проявляет активацию T-клеток in vitro.8. Use according to claim 7, wherein said bispecific antibody exhibits T cell activation in vitro. 9. Применение по п.7 или 8, где указанный опухолеассоциированный антиген экспрессирован на опухолевой клетке человека.9. Use according to claim 7 or 8, wherein said tumor-associated antigen is expressed on a human tumor cell. 10. Применение по любому из пп.7-9, где указанное биспецифическое антитело индуцирует опосредованный T-клетками лизис опухолевых клеток с величиной EC50, равной менее чем около 1,3 нМ, как измерено в анализе опосредованного T-клетками лизиса опухолевых клеток in vitro.10. Use according to any one of claims 7-9, wherein said bispecific antibody induces T cell mediated tumor cell lysis with an EC 50 value of less than about 1.3 nM as measured in the T cell mediated tumor cell lysis assay in vitro. 11. Применение по любому из пп.7-10, где указанный опухолеассоциированный антиген выбран из группы, состоящей из AFP, ALK, белков BAGE, BIRC5 (сурвивин), BIRC7, β-катенина, brc-abl, BRCA1, BORIS, CA9, карбоангидразы IX, каспазы-8, CALR, CCR5, CD19, CD20 (MS4A1), CD22, CD30, CD40, CDK4, CEA, CTLA4, циклина-B1, CYP1B1, EGFR, EGFRvIII, ErbB2/Her2, ErbB3, ErbB4, ETV6-AML, ЕрСАМ, EphA2, Fra-1, FOLR1, белков GAGE (например, GAGE-1, -2), GD2, GD3, GloboH, глипикана-3, GM3, gp100, Her2, HLA/B-raf, HLA/k-ras, HLA/MAGE-A3, hTERT, LMP2, белков MAGE (например, MAGE-1, -2, -3, -4, -6 и -12), MART-1, мезотелина, ML-IAP, Muc1, Muc2, Muc3, Muc4, Muc5, Muc16 (CA-125), MUM1, NA17, NY-BR1, NY-BR62, NY-BR85, NY-ESO1, OX40, p15, p53, PAP, PAX3, PAX5, PCTA-1, PLAC1, PRLR, PRAME, PSMA (FOLH1), белков RAGE, Ras, RGS5, Rho, SART-1, SART-3, STEAP1, STEAP2, TAG-72, TGF-β, TMPRSS2, антигена Thompson-nouvelle (Tn), TRP-1, TRP-2, тирозиназы и уроплакина-3.11. Use according to any one of claims 7-10, wherein said tumor-associated antigen is selected from the group consisting of AFP, ALK, BAGE proteins, BIRC5 (survivin), BIRC7, β-catenin, brc-abl, BRCA1, BORIS, CA9, carbonic anhydrase IX, caspase-8, CALR, CCR5, CD19, CD20 (MS4A1), CD22, CD30, CD40, CDK4, CEA, CTLA4, cyclin-B1, CYP1B1, EGFR, EGFRvIII, ErbB2/Her2, ErbB3, ErbB4, ETV6- AML, EpCAM, EphA2, Fra-1, FOLR1, GAGE proteins (e.g. GAGE-1, -2), GD2, GD3, GloboH, glypican-3, GM3, gp100, Her2, HLA/B-raf, HLA/k -ras, HLA/MAGE-A3, hTERT, LMP2, MAGE proteins (e.g. MAGE-1, -2, -3, -4, -6 and -12), MART-1, mesothelin, ML-IAP, Muc1, Muc2, Muc3, Muc4, Muc5, Muc16 (CA-125), MUM1, NA17, NY-BR1, NY-BR62, NY-BR85, NY-ESO1, OX40, p15, p53, PAP, PAX3, PAX5, PCTA-1 , PLAC1, PRLR, PRAME, PSMA (FOLH1), RAGE proteins, Ras, RGS5, Rho, SART-1, SART-3, STEAP1, STEAP2, TAG-72, TGF-β, TMPRSS2, Thompson-nouvelle antigen (Tn) , TRP-1, TRP-2, tyrosinase and uroplakin-3. 12. Применение по п.11, где опухолеассоциированный антиген представляет собой CD20, EGFRvIII, PSMA (FOLH1), STEAP2 или MUC16.12. Use according to claim 11, wherein the tumor associated antigen is CD20, EGFRvIII, PSMA (FOLH1), STEAP2, or MUC16. 13. Применение по любому из пп.7-12, где указанная LCVR содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 162.13. Use according to any one of claims 7-12, wherein said LCVR contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 162. 14. Применение по любому из пп.7-13, где указанное первое антигенсвязывающее плечо содержит области, определяющие комплементарность, HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3, содержащие соответственно аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 36-38-40-164-166-168.14. Use according to any one of claims 7-13, wherein said first antigen-binding arm comprises complementarity determining regions HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 containing, respectively, the amino acid sequences of SEQ ID NO: 36-38-40-164 -166-168. 15. Применение по любому из пп.7-13, где указанное первое антигенсвязывающее плечо содержит области, определяющие комплементарность, HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3, содержащие соответственно аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 140-142-144-164-166-168.15. Use according to any one of claims 7-13, wherein said first antigen-binding arm comprises complementarity determining regions HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 containing, respectively, the amino acid sequences of SEQ ID NO: 140-142-144-164 -166-168. 16. Применение по п.13, где указанное биспецифическое антитело содержит пару аминокислотных последовательностей HCVR и LCVR (HCVR/LCVR), содержащую аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 34/162.16. Use according to claim 13, wherein said bispecific antibody comprises an HCVR and LCVR amino acid sequence pair (HCVR/LCVR) comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 34/162. 17. Применение по п.13, где указанное биспецифическое антитело содержит пару аминокислотных последовательностей HCVR и LCVR (HCVR/LCVR), содержащую аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 138/162.17. Use according to claim 13, wherein said bispecific antibody comprises an HCVR and LCVR amino acid sequence pair (HCVR/LCVR) comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 138/162. 18. Фармацевтическая композиция для лечения рака у субъекта, содержащая цитотоксическое биспецифическое антитело по любому из пп.1-6 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.18. A pharmaceutical composition for the treatment of cancer in a subject, comprising a cytotoxic bispecific antibody according to any one of claims 1 to 6 and a pharmaceutically acceptable carrier or diluent. 19. Способ лечения рака у субъекта, включающий введение субъекту фармацевтической композиции по п.18.19. A method of treating cancer in a subject, comprising administering to the subject a pharmaceutical composition according to claim 18. 20. Способ по п.19, где рак выбирают из группы, включающей рак поджелудочной железы, меланому, глиобластому, рак головы и шеи, рак предстательной железы, злокачественные глиомы, остеосаркому, колоректальный рак, рак желудка, злокачественную мезотелиому, множественную миелому, рак яичника, мелкоклеточный рак легкого, немелкоклеточный рак легкого, синовиальную саркому, рак щитовидной железы, рак молочной железы, меланомаглиому, рак молочной железы, плоскоклеточную карциному, рак пищевода, светлоклеточную почечно-клеточную карциному, хромофобную почечноклеточную карциному, почечную онкоцитому, почечную транзиторно-клеточную карциному, уротелиальную карциному, аденокарциному, мелкоклеточную карциному или первичные или метастатические опухоли иммунной системы.20. The method of claim 19 wherein the cancer is selected from the group consisting of pancreatic cancer, melanoma, glioblastoma, head and neck cancer, prostate cancer, malignant gliomas, osteosarcoma, colorectal cancer, gastric cancer, malignant mesothelioma, multiple myeloma, cancer ovarian cancer, small cell lung cancer, non-small cell lung cancer, synovial sarcoma, thyroid cancer, breast cancer, melanomaglioma, breast cancer, squamous cell carcinoma, esophageal cancer, clear cell renal cell carcinoma, chromophobe renal cell carcinoma, renal oncocytoma, renal transient cell carcinoma carcinoma, urothelial carcinoma, adenocarcinoma, small cell carcinoma, or primary or metastatic tumors of the immune system. --
EA201890785 2015-09-23 2016-09-23 OPTIMIZED BISPECIFIC ANTI-CD3 ANTIBODIES AND THEIR APPLICATIONS EA040594B1 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US62/222,605 2015-09-23

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA040594B1 true EA040594B1 (en) 2022-06-30

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20210253701A1 (en) Optimized Anti-CD3 Bispecific Antibodies and Uses Thereof
JP7271637B2 (en) Anti-PSMA antibodies, bispecific antigen-binding molecules that bind PSMA and CD3, and uses thereof
AU2020239677B2 (en) Anti-CD3 Antibodies, Bispecific Antigen-Binding Molecules That Bind CD3 And CD20, And Uses Thereof
TWI680138B (en) Human antibodies to pd-l1
JP2019196377A (en) Antibody compositions for tumor treatment
EA040594B1 (en) OPTIMIZED BISPECIFIC ANTI-CD3 ANTIBODIES AND THEIR APPLICATIONS