DE19853778C1 - DNA-Sequenzen kodierend einen Glutamat/Malat-Translokator, Plasmide Bakterien, Hefen und Pflanzen enthaltend diesen Transporter - Google Patents
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Abstract
Die vorliegende Erfindung betrifft DNA-Sequenzen aus Sorghum bicolor (Hirse), Flaveria bidentis und Spinacia oleracea (Spinat), die die Kodierregion eines Glutamat/Malat-Translokators enthalten, deren Einführung in ein pflanzliches Genom die Bildung und Weiterleitung von Kohlenstoffgrundgerüsten für die Fixierung von Stickstoff und die Weiterleitung des assimilierten Stickstoffs in transgenen Pflanzen verändert, Plasmide, Hefen und Bakterien, enthaltend diese DNA-Sequenzen, sowie transgene Pflanzen, bei denen durch Einführung der DNA-Sequenzen Veränderungen der Aktivität des Glutamat/Malat-Translokators und somit Änderungen im Stickstoff- und Kohlenstoffstoffwechsel hervorgerufen werden. Weiterhin betrifft die Erfindung transgene Pflanzen, die durch die Veränderung der Aktivität des Glutamat/Malat-Translokators in ihrer Fähigkeit zur Photorespiration beeinflußt sind. Ebenso betrifft die Erfindung die Benutzung der beschriebenen Sequenzen des Glutamat/Malat-Translokators zur Identifizierung verwandter Translokatoren aus Pflanzen (Angiospermen, Gymnospermen und Algen) durch Hybridisierung mit niedriger Stringenz oder durch PCR-Techniken, sowie die Nutzung der Glutamat/Malat-Translokatoren als Ziel ("Target") für Herbizide.
Description
Die vorliegende Erfindung betrifft DNA-Sequenzen aus Sorghum bicolor (Hirse),
Flaveria bidentis und Spinacia oleracea (Spinat), die die Kodierregion eines
Glutamat/Malat-Translokators enthalten, deren Einführung in ein pflanzliches
Genom die Bildung und Weiterleitung von Kohlenstoffgrundgerüsten für die
Fixierung von Stickstoff und die Weiterleitung des assimilierten Stickstoffs in
transgenen Pflanzen verändert, Plasmide, Hefen und Bakterien enthaltend diese
DNA-Sequenzen, sowie transgene Pflanzen, bei denen durch Einführung der DNA-
Sequenzen Veränderungen der Aktivität des Glutamat/Malat-Translokators und
somit Änderungen im Stickstoff- und Kohlenstoffstoffwechsel hervorgerufen
werden. Weiterhin betrifft die Erfindung transgene Pflanzen, die durch die
Veränderung der Aktivität des Glutamat/Malat-Translokators in ihrer Fähigkeit zur
Photorespiration beeinflußt sind. Ebenso betrifft die Erfindung die Benutzung der
beschriebenen Sequenzen des Glutamat/Malat-Translokators zur Identifizierung
verwandter Translokatoren aus Pflanzen (Angiospermen, Gymnospermen und
Algen) durch Hybridisierung mit niedriger Stringenz oder durch PCR-Techniken,
sowie die Nutzung der Glutamat/Malat-Translokatoren als Ziel ("Target") für
Herbizide.
Nur Pflanzen, Bakterien und Hefen sind zur Überführung von anorganischem
Stickstoff (Nitratstickstoff) in organisch gebundenen Stickstoff in großem Maßstab (in
der Regel in Form von Aminosäuren) durch reduktive Aminierung von organischen
Kohlenstoffverbindungen befähigt. Der Rest der belebten Welt, insbesondere
Nutztiere und Menschen, ist auf Pflanzen als primäre Lieferanten organischer
Stickstoffverbindungen angewiesen. Die Assimilation von anorganischem Stickstoff
in Pflanzen durch Bindung an organischen Kohlenstoff hängt von der Verfügbarkeit
von Stickstoff, Kohlenstoff-Grundgerüsten und Energie ab.
Die Stickstoffversorgung der Pflanze ist durch Düngung zu beeinflussen. Die Energie
für die Stickstoffassimilation stammt aus der Lichtreaktion der Photosynthese bzw.
in Wurzeln und anderen nicht-grünen Geweben aus der Dissimilation und ist unter
normalen Feldbedingungen kein begrenzender Faktor.
2-Oxoglutarat (α-Ketoglutarat) ist nach heutigem Kenntnisstand der primäre
Akzeptor reduzierten Stickstoffs in der Glutaminsynthetase/Glutamin-2-
Oxoglutarat-Aminotransferase (GOGAT)-Reaktion. In dieser Reaktionsfolge wird
zunächst durch die Glutaminsynthetase reduzierter Stickstoff (Ammoniumstickstoff)
unter Energieverbrauch auf die Aminosäure Glutamat übertragen. Es entsteht
Glutamin. In einer Folgereaktion katalysiert nun die Glutamat-Oxoglutarat-
Aminotransferase (GOGAT; Glutamatsynthase) unter Verbrauch von
Reduktionsäquivalenten die Übertragung einer Aminogruppe von Glutamin auf 2-
Oxoglutarat (Transaminierung). Es entstehen zwei Moleküle Glutamat. In der
Summe werden aus einem Molekül Glutamat, einem Molekül 2-Oxoglutarat, einem
Molekül Ammonium sowie ATP als Energieäquivalent und reduziertem Ferredoxin
als Reduktionsäquivalent zwei Moleküle Glutamat, ADP und oxidiertes Ferredoxin
gebildet. Es ist ersichtlich, daß ein Nettogewinn von einem Molekül organischer
Stickstoffverbindung (Glutamat) bei jedem Durchlauf des Reaktionszyklus durch die
reduktive Aminierung eines Moleküls 2-Oxoglutarat erzielt wird.
Die gesamte Reaktionsfolge der Glutaminsynthetase/GOGAT-Reaktion ist im
Stroma der Plastiden der Pflanzen lokalisiert. Diese Organelle sind von zwei
Lipiddoppelschichtmembranen umschlossen, deren äußere Molekularsiebcharakter
hat und Verbindungen bis zu einer Größe von ca. 10 kDa frei passieren läßt (Flügge
und Benz, 1984, FEBS Lett. 169: 85-89). Die innere Membran ist permeabel für einige
kleinere Verbindungen wie Wasser, Kohlendioxid, Sauerstoff und Nitrit, nicht jedoch
für größere geladene Moleküle wie zum Beispiel Glutamat oder Malat.
Diese Schlüsselverbindung der Glutaminsynthetase/GOGAT-Reaktion muß aus dem
Cytosol der pflanzlichen Zelle durch einen spezifischen Translokator über die innere
Plastidenhüllmembran in das Stroma des Plastiden bewegt werden. Der Transport
von 2-Oxoglutarat in den Plastiden erfolgt im Gegentausch mit Malat aus dem
Plastiden durch den 2-Oxoglutarat/Malat-Translokator. Das bei diesem Vorgang in
das Cytosol exportierte Malat wird von einem zweiten Translokator, dem
Glutamat/Malat-Translokator, im Gegentausch mit Glutamat zurücktransportiert. Es
sei darauf hingewiesen, daß der 2-Oxoglutarat/Malat-Translokator, im Gegensatz
zum Glutamat/Malat-Translokator, nicht den Transport von Glutamat (oder auch
Aspartat) zu katalysieren vermag. Im Ergebnis wird, ohne einen Nettotransport von
Malat, das über beide Translokatorsysteme zirkuliert ("Doppel-Translokator", Woo et
al., 1987, Plant Physiol. 84: 624-632; Flügge et al., 1988, Planta 174: 534-541), 2-
Oxoglutarat in den Chloroplasten importiert und das Endprodukt der
Glutaminsynthetase/GOGAT-Reaktion, Glutamat, exportiert. Glutamat dient in der
Pflanze als bevorzugter Aminogruppen-Donator in einer Reihe von
Transaminierungsreaktionen, zum Beispiel bei der Biosynthese der Aminosäuren
Alanin oder Phenylalanin etc. Die meisten stickstoffhaltigen Verbindungen in der
Pflanze wie Aminosäuren, Nukleinsäuren oder Alkaloide benötigen in ihrem
Biosyntheseweg zunächst Glutamat als primären Aminogruppendonator. Weiterhin
ist Glutamat eine wichtige Transportform für organisch gebundenen Stickstoff
innerhalb der Pflanze und wird als solche in das Leitgewebe der Pflanze (das
Phloem) eingespeist. Die häufigsten Aminosäuren im Phloemsaft sind in der Regel
Glutamat, Glutamin und Aspartat.
Transporter sind in die Allokation des Photoassimilates (d. h. primär Zucker und
Aminosäuren) von den "Source"- zu den "Sink"-Organen an entscheidender Stelle
eingebunden - wie der chloroplastidäre Triosephosphat/Phosphat-Translokator, der
Saccharose-Translokator (über den die Siebröhren mit der Transportform des
Photoassimilates Saccharose beladen werden) und der Glukose-6-
phosphat/Phosphat-Translokator der Amyloplasten. Änderungen der Aktivität
eines spezifischen Membran-Transporters können große Auswirkungen auf die
Stoffwechselleistungen der Pflanzen haben. So konnte vor kurzem gezeigt werden,
daß die Effektivität der photosynthetischen Kohlenstoffreduktion (Lichtreaktion und
Calvin-Zyklus) ganz wesentlich durch die Aktivität des chloroplastidären
Triosephosphat/Phosphat-Translokators beeinflußt werden kann, der den
Austransport des fixierten Kohlenstoffs aus den Chloroplasten katalysiert. Die
Hemmung dieses Transporters in planta über die Expression einer entsprechenden
"antisense" mRNA führt zu einem verminderten Export des primären
Photoassimilates (Triosephosphat, 3-Phosphoglycerat), das unter diesen Umständen
innerhalb des Chloroplasten abgeleitet wird in die Biosynthese von Stärke, die sich
massiv anstaut (Riesmeier et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6160-6164;
Heineke et al., 1994, Planta 193: 174-180). Dieses Translokatorprotein stellt
demzufolge eine Engstelle im Kohlenstoffstoffwechsel des "Source"-Gewebes dar.
Auch die Reduktion der Saccharose-Transport-Aktivität über eine "antisense"-
Inhibierung des für den Transport in die Siebröhren verantwortlichen Saccharose-
Transporters (Riesmeier et al., 1992, EMBO J. 11: 4705-4713) führt zu einem
drastischem Phänotyp der Pflanzen: sie sind wesentlich kleiner, die Blätter sind
geschädigt und die Pflanzen bilden, im Fall der Kartoffeln, kaum noch Knollen aus
d. h. die Versorgung der "Sink"-Gewebe mit Photoassimilaten ist stark reduziert
(Riesmeier et al., 1994, EMBO J. 13: 1-7).
Ebenso führt die Reduktion der Transportkapazität für 2-Oxoglutarat über die
Plastiden-Hüllmembran durch antisense-Repression der 2-Oxoglutarat/Malat-
Translokator mRNA in Tabak-Pflanzen zu einem drastischen Phänotyp. Die Pflanzen
besitzen einen gestauchten, stark verlangsamten Wuchs mit verspäteter Blüte. Die
Blätter zeigten ein Ausbleichen entlang der Leitbündel, die Interkostalfelder waren
noch grün gefärbt. Die Pflanzen akkumulierten Ammonium und Chlorid, wiesen
jedoch drastisch verringerte Nitratgehalte auf (eigene, unveröffentlichte
Beobachtungen). Da der Glutamat/Malat-Translokator in denselben biochemischen
Stoffwechselweg in zentraler Position eingebunden ist, kann von einer ähnlichen
Auswirkung einer Repression dieses Transporters auf den Phänotyp von Pflanzen
ausgegangen werden. Weiterer Beleg für diese Annahme ist eine Beobachtung von
Somerville (1983, 1985), in der eine EMS-Mutante des Glutamat/Malat-Translokators
in Arabidopsis beschrieben wird. Diese ist unter ambienten CO2-Bedingungen nicht
lebensfähig, da sie keinen vollständigen Photorespirationsweg ausführen kann
(Somerville und Ogren, 1983, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80: 1290-1294; Somerville
und Somerville, 1985, Plant Science Letters 37: 217-220). Die beschriebene Mutante
konnte bislang jedoch nicht zur Identifizierung und Klonierung eines
Glutamat/Malat-Translokators genutzt werden.
Wie oben beschrieben, nimmt der Glutamat/Malat-Translokator der
Plastidenhüllmembran eine Schlüsselrolle bei der intrazellulären Verteilung der an
der Stickstoff-Fixierung beteiligten Aminogruppen-Akzeptoren und -Donatoren ein.
Gelänge es, diesen Translokator zu klonieren und mit Hilfe der erhaltenen Sequenz
die Aktivität des Translokators in Pflanzen zu modulieren, eröffnete dies den Weg
zu Pflanzen mit einem veränderten Kohlenstoff/Stickstoff-Verhältnis. Dies bedeutet,
daß Pflanzen erzeugt werden könnten, die z. B. weniger Kohlenhydrate (Zucker,
Stärke, Fette) und mehr organische Stickstoffverbindungen (Protein, Aminosäuren,
Alkaloide) enthielten. An Pflanzen mit derart veränderten Inhaltsstoffen besteht
dringender Bedarf, denn der überwiegende Teil der Menschen auf der Erde ist auf
pflanzliche Ernährung angewiesen, mit der Konsequenz einer ständigen
Unterversorgung an Eiweißen in diesen Bevölkerungsschichten. Ebenso wird in der
Tierfütterung in den entwickelten Ländern zunehmend Tier- und Fischmehl dem
Viehfutter beigemengt, um die Eiweißversorgung der Zuchttiere zu verbessern.
Futterpflanzen mit höherem Proteingehalt wären hier sicher die bessere Alternative,
insbesondere mit Blick auf die durch die Verfütterung von Tiermehlen entstehenden
Probleme wie BSE etc. Ein Einfluß einer Überexpression des 2-Oxoglutarat/Malat-
Translokators in Tabak auf das C/N-Verhältnis von Tabak-Pflanzen konnte bereits
gezeigt werden (Weber, 1995, Dissertation, Universität Würzburg). Da der
Glutamat/Malat-Translokator ein breiteres Substratspektrum aufweist als der 2-
Oxoglutarat/Malat-Translokator, ist diese Einflußnahme auf das C/N-Verhältnis in
transgenen Pflanzen mit veränderter Expression dieses Transporters
anzunehmenderweise noch ausgeprägter.
Der drastische Phänotyp einer Mutation des Glutamat/Malat-Translokators (siehe
oben) macht dieses Protein als Target für Herbizide interessant. Ein Hemmstoff
dieses Transporters dürfte als Totalherbizid einsetzbar sein. Wie auch für eine
weiteres Enzym des Photorespirationsweges gezeigt werden konnte
(Glutaminsynthethase, GS) führt eine Hemmung dieses Enzyms durch ein Herbizid
(Phosphinotricine, BASTA) zum Absterben der behandelten Pflanzen. Durch
Einführung einer Enzymaktivität, die den möglichen Hemmstoff metabolisiert und
damit wirkungslos macht könnte eine gezielte Resistenz gegen diesen Wirkstoff
erzeugt werden. Ebenso wäre dies durch eine gezielte Veränderung der DNA- bzw.
der hieraus resultierenden Aminosäure-Sequenz des Transporters möglich. Eine
solche Veränderung würde die Bindungseigenschaften des Hennstoffs verändern
und diesen damit wirkungslos machen ohne hierbei jedoch die Transportfunktion zu
beeinträchtigen. Zur Auffindung eines solchen Hemmstoffes und zum Auffinden
möglicher Sequenzänderungen des Transporter-Proteins kann das von uns
beschriebene System der Rekonstitution rekombinanter Proteine in Proteoliposomen
mit anschließender Funktionsmessung eingesetzt werden (siehe Ausführungsbeispiel
2).
Es ist uns vor kurzem gelungen, eine für den plastidären 2-Oxoglutarat/Malat-
Translokator kodierende cDNA zu klonieren (Weber et al., 1995, Biochemistry 34:
2621-2627). Die Primärsequenz dieses Translokators unterscheidet sich grundsätzlich
von den Sequenzen der bekannten 2-Oxoglutarat/Malat-Carrier aus den
Mitochondrien von Rinderherzen und aus menschlichen Mitochondrien (Runswick
et al., 1990, Biochemistry 29: 11033-11040; Iacobazzi et al., 1992, DNA Seq. 3(2): 79-88).
Diese Transporter spielen eine wichtige Rolle im mitochondrialen Dikarbonsäure-
Stoffwechsel (u. a. Malat/Aspartat-Shuttle, Oxoglutarat/Isocitrat-Shuttle) und sind
der Familie mitochondrialer Metabolittransporter zugehörig, die untereinander nahe
verwandt sind. Für die meisten mitochondrialen Carrier, wie auch für den 2-
Oxoglutarat-Carrier konnte gezeigt werden, daß diese ohne eine sie zu den
Organellen dirigierende Adressierungs-Sequenz ("Targeting"-Sequenz) in die
Mitochondrienmembran eingebaut werden (Runswick et al., 1990, Biochemistry 29:
11033-11040). Es ist also anzunehmen, daß die "Targeting"-Information im reifen
Carrierprotein enthalten ist.
Im Gegensatz hierzu benötigen plastidären Translokatoren für eine korrekte
Adressierung zu der inneren Plastidenmembran eine entsprechende Präsequenz
("Targeting"-Sequenz), die das anhängende reife Protein korrekt zu den Plastiden
dirigiert (Übersichtsartikel hierzu: Keegstra et al., 1989, Annu. Rev. Plant Physiol.
Plant Mol. Biol. 40: 471-501; Lubben et al., 1988, Photosynth. Res. 17: 173-194; Flügge,
1990, J. Cell Sci. 96: 351-354). Neben der für die "Plastiden-Adressierung" nötigen
Präsequenz gibt es im reifen Teil (der Teil des Proteins, der nach der Abspaltung der
Präsequenz durch eine spezifische Protease verbleibt) der Plastidenhüllmembran-
Proteine noch weitere Informationen, die für die spezifische Insertion der Proteine in
die Membran verantwortlich sind und einen Transport der Hüllmembranproteine
über die Hüllmembran in das Plastidenstroma oder, im Fall der Chloroplasten, die
Thylakoidmembran verhindern (Knight und Gray, 1995, Plant Cell 7: 1421-1432 bzw.
eigene Untersuchungen: Brink et al., 1995, J. Biol. Chem. 270: 20808-20815). Eigene
Arbeiten zeigten ferner am Beispiel eines mitochondrialen Carriers, des ADP/ATP-
Transporters, daß dieses Protein nicht oder nur mit einer sehr geringen Effizienz zu
Plastiden dirigiert und dort in die Hüllmembran eingebaut werden kann. Selbst ein
Hybridprotein, bestehend aus einer plastidären Präsequenz (die Information für die
Plastiden-Adressierung enthaltend) und diesem mitochondrialen Carrier, zeigte
gegenüber dem authentischen Protein einen kaum erhöhten Einbau in die
Plastidenhüllmembran (Silva-Filho et al., 1997, J. Biol. Chem. 272: 15264-15269;
unveröffentlichte Beobachtungen). Da für eine korrekte Insertion die Protein/Lipid-
Wechselwirkung von Bedeutung ist und sich die plastidäre Hüllmembran in ihrer
Lipidzusammensetzung grundlegend von der anderer Zellorganellen und auch der
Bakterien unterscheidet (Joyard et al., 1991, Eur. J. Biochem. 199: 489-509), ist es sehr
unwahrscheinlich, daß eine, wenn auch geringfügige, Insertion eines heterologen
Proteins, dann auch funktionell ist, d. h., daß ein Transporter aus anderen Systemen
überhaupt in einer seiner Funktion entsprechenden Konformation und Orientierung
in die Plastidenhüllmembran eingebaut werden kann.
Somit ist es nach gegenwärtigem Stand der Technik nicht möglich, mit Hilfe
bekannter Plastiden-"Targeting"-Sequenzen z. B. mitochondriale oder
prokaryontische Dikarbonsäure-Transporter funktionell in die innere
Plastidenhüllmembran zu integrieren. Beim gegenwärtigen Stand der Technik ist es
erfolgversprechender, die für die Konstruktion der oben geschilderten Pflanzen
notwendige DNA-Sequenz durch Klonierung des authentischen plastidären
Glutamat/Malat-Translokators zu erhalten.
Obwohl dieses Transportsystem auch den Transport von Malat katalysiert, ist seine
Primärstruktur anzunehmenderweise sehr unterschiedlich von der des kürzlich
identifizierten 2-Oxoglutarat/Malat-Translokators. Versuche, den Translokator über
eine niedrig stringente Durchmusterung einer pflanzlichen cDNA-Bibliothek mit
einer von dem 2-Oxoglutarat/Malat-Translokator abgeleiteten Sonde zu
identifizieren, blieben erfolglos, ebenso wie die Identifizierung des Translokators
über eine biochemischen Charakterisierung, Reinigung und Isolation des
Glutamat/Malat-Translokators (eigene Beobachtungen).
Zur Identifizierung des Translokators wurde daher ein molekularbiologischer
Ansatz gewählt, der auf der differentiellen Expression einer bestimmten mRNA-
Spezies in verschiedenen cDNA-Populationen beruht (differentielles Screening;
Ausführungsbeispiel 1). Im Gegensatz zu C3-Planzen (z. B. Kartoffel, Tomate)
besitzen C4-Pflanzen, wie z. B. Mais, Hirse (Sorghum bicolor) oder Flaveria bidentis zwei
verschiedene Blatt-Zelltypen, Mesophyll- und Bündelscheidenzellen, die in die
Produktion des Photoassimilates eingebunden sind. In den Mesophyllzellen erfolgt
die Primärfixierung des atmosphärischen Kohlendioxids unter Bildung eines C4-
Körpers (z. B. Malat), der dann in die Bündelscheidenzellen transportiert wird. Dort
läuft, nach Freisetzung des Kohlendioxids aus dem C4-Körper, die eigentliche
Biosynthese des Photoassimilates ab. Es wurden cDNA Banken aus Mesophyllzellen
und aus Bündelscheidenzellen von Sorghum bicolor hergestellt und geprüft, welche
mRNAs spezifisch nur in den Bündelscheidenzellen exprimiert werden. Auf diese
Weise gelang es, einen Partial-cDNA-Klon zu identifizieren, der eine geringe
Homologie mit dem 2-Oxoglutarat/Malat-Translokator aufwies (Wyrich et al., 1998,
Plant Mol. Biol. 37: 319-335). Das entsprechende cDNA-Insert wurde als Sonde für
die anschließende Durchmusterung einer cDNA-Bibliothek aus Sorghum bicolor
genutzt und es konnte ein cDNA-Klon isoliert werden, der die vollständige cDNA
(2088 Basenpaare) für das entsprechende Vorstufenprotein mit einer molekularen
Masse von 59 kDa enthielt.
Ein Vergleich der aus der cDNA abgeleiteten Proteinsequenz mit Sequenzen der
Datenbanken ergab eine nur geringe Ähnlichkeit mit dem bekannten 2-
Oxoglutarat/Malat-Translokator (ca. 50%). Somit konnte vermutet werden, daß
diese cDNA für einen Transporter kodiert, dessen Aktivität unterschiedlich zu der
des 2-Oxoglutarat/Malat-Translokators ist. Ferner zeigte sich eine Homologie zu
einer genomischen DNA-Sequenz aus Arabidopsis thaliana, die über die international
verfolgten Sequenzierungsprojekte erhalten wurde. Diese Sequenz ist auf
Chromosom 5 von Arabidopsis thaliana lokalisiert und zeigt ebenfalls eine geringe
Homologie zur Sequenz des 2-Oxoglutarat/Malat-Translokators aus Spinat von ca.
50%. Im Rahmen des Genomsequenzierungsprojektes wurde hier nur auf die
Homologie verwiesen, es erfolgte jedoch nicht die Bestimmung der Funktion.
Die Funktionsbestimmung des durch die cDNA kodierten Transportproteins erfolgte
in einem heterologen Expressionssystem, der Spalthefe Schizosaccharomyces pombe. Da
aufgrund eigener Beobachtungen Transportproteine aus monokotylen Pflanzen nicht
heterolog produziert werden können, wurden zunächst cDNA Sequenzen aus der
C4-Pflanze Flaveria bidentis und aus der C3-Pflanze Spinat isoliert, die der Sequenz
der Sorghum bicolor cDNA entsprachen. Dann wurde das cDNA-Insert aus Flaveria
bidentis in einen eukaryotischen Hefe-Expressionsvektor eingebracht und mit diesem
Konstrukt Zellen der Spalthefe Schizosaccharomyces pombe transformiert.
Transformanden, die das entsprechende Plasmid exprimierten, wurden isoliert.
Transportexperimente, durchgeführt mit in künstlichen Membranen rekonstituierten
Membranfraktionen der Hefetransformanden, ergaben, daß dieser Translokator den
Transport von Malat im Gegentausch mit Glutamat (oder Aspartat) katalysiert. Im
Gegensatz zu dem 2-Oxoglutarat/Malat-Tanslokator akzeptiert also dieser
Translokator auch Aminosäuren (Glutamat und Aspartat) als Gegentauschsubstrate
(Ausführungsbeispiele 2 und 3). Der Transporter erhielt den Namen
Glutamat/Malat-Translokator.
Die vorliegende Erfindung stellt also DNA-Sequenzen zur Verfügung, die aus einem
pflanzlichen Genom stammen und für einen plastidären Glutamat/Malat-
Translokator kodieren, wobei die in der Nukleotidabfolge enthaltene Information bei
Einführung und Expression in pflanzlichen Zellen zur Bildung einer Ribonuklein
säure führt und über diese Ribonukleinsäure eine Glutamat/Malat-Translokator
Aktivität in die Zellen eingeführt werden kann oder eine endogene Glutamat/Malat-
Translokator Aktivität unterdrückt werden kann.
Gegenstand der Erfindung sind insbesondere die DNA-Sequenzen aus Sorghum
bicolor (Hirse) mit der Nukleotidabfolge Seq-ID No.: 1, eine DNA-Sequenz aus
Flaveria bidentis mit der Nukleotidabfolge Seq-ID No.: 2 und eine DNA-Sequenz aus
Spinacia oleracea (Spinat) mit der Nukleotidabfolge Seq-ID No.: 3 (Fig. 1).
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung sind DNA-Sequenzen, die mit der unter
Seq.-ID No.: 1-3 genannten DNA-Sequenzen oder Teilen davon oder Derivaten, die
durch Insertion, Deletion oder Substitution von diesen Sequenzen abgeleitet sind,
hybridisieren und für ein plastidäres Protein kodieren, das die biologische Aktivität
eines Dikarbonsäuretranslokators, insbesondere eines Glutamat/Malat-Translokators
besitzt.
Darüber hinaus betrifft die vorliegende Erfindung die Verwendung der
erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen oder Teilen davon oder Derivaten, die durch
Insertion, Deletion oder Substitution von diesen Sequenzen abgeleitet sind, zur
Transformation pro- und eukaryontischer Zellen. Um die Expression des
Glutamat/Malat-Translokators in transformierten Zellen zu gewährleisten, kann die
erfindungsgemäße DNA-Sequenz in Plasmide eingebracht werden und dabei mit
Steuerelementen für die Expression in prokaryontischen oder eukaryontischen
Zellen kombiniert werden (siehe Ausführungsbeispiele 2 und 4). Derartige
Steuerelemente sind einerseits Transkriptions-Promotoren und andererseits
Transkriptions-Terminatoren. Mit den Plasmiden können eukaryontische Zellen
transformiert werden mit dem Ziel der Expression einer übersetzbaren
Botenribonukleinsäure (RNA), die die Synthese eines plastidären Glutamat/Malat-
Translokators in den transformierten Zellen erlaubt, oder mit dem Ziel der
Expression einer nicht übersetzbaren, invers orientierten ("antisense"),
Botenribonukleinsäure, die die Synthese der endogenen Glutamat/Malat-
Translokatoren verhindert. Zu diesem Zweck könnten auch kürzere Fragmente der
erfindungsgemäßen DNA-Sequenz oder DNA-Sequenzen mit einem relativ hohen
Grad an Homologie (mehr als ca. 65% Homologie) verwendet werden. Ebenso kann
die Expression von endogenen Dikarbonsäuretranslokatoren durch die Expression
eines für diesen Zweck konstruierten Ribozyms unter Verwendung der
erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen inhibiert werden. Durch die Expression einer
RNA entsprechend der erfindungsgemäßen Sequenz eines pflanzlichen
Glutamat/Malat-Translokators ist eine Veränderung des pflanzlichen
Stickstoffmetabolismus möglich, deren wirtschaftliche Bedeutung darin liegt, daß
eine Verbesserung der Weiterleitung von Glutamat aus dem Cytosol der Plastiden zu
einer Veränderung des Verhältnisses von Kohlenhydraten (Zucker, Stärke, org.
Säuren) und Fetten zugunsten der Stickstoffverbindungen (Aminosäuren, Proteine,
evtl. Alkaloide) stattfindet. Es können somit Pflanzen erzeugt werden, die reicher an
wertvollem Protein sind, jedoch einen geringeren Gehalt an Kohlenhydraten und
Fetten aufweisen. Diese Modifikation steigert den ernährungsphysiologischen Wert
von Pflanzen und damit auch deren wirtschaftlichen Wert. Weiterhin ermöglicht die
heterologe Expression der beschriebenen Sequenz in Spalthefen
(Ausführungsbeispiele 2 und 3; ferner: Loddenkötter et al., 1993, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 90: 2155-2159) Struktur-Funktionsstudien des Glutamat/Malat-
Translokators, die letztendlich zur Entwicklung eines spezifischen Hemmstoffs für
dieses Protein führen könnte, insbesondere ist hier an die Herbizidentwicklung zu
denken, da die Hemmung eines Proteins mit Schlüsselfunktion im
Stoffwechselgeschehen zwangsweise letal für die Pflanze wäre. Ferner können diese
Struktur-Funktionsstudien Grundlage für eine gerichtete Mutagenese der
Substratbindungsstelle des Translokators sein, um die Substratspezifität des
Transporters gezielt zu verändern.
Es sind bereits Verfahren zur genetischen Modifikation dikotyler und monokotyler
Pflanzen bekannt (Gasser und Fraley, 1989, Science 244: 1293-1299; Potrykus, 1991,
Ann. Rev. Plant Mol. Biol. Plant Physiol. 42: 205-225). Zur Expression von
kodierenden Sequenzen in Pflanzen müssen diese mit transkriptionell
regulatorischen Elementen verknüpft werden. Solche Elemente, Promotoren
genannt, sind bekannt (u. a. Koster-Töpfer et al., 1989, Mol. Gen. Genet. 219: 390-396).
Ferner müssen die Kodierregionen mit einem Transkriptionsterminations-Signal
versehen werden, damit sie korrekt transkribiert werden können. Solche Elemente
sind ebenfalls beschrieben (Gielen et al., 1989, EMBO J. 8, 23-29). Der
transkriptionelle Startbereich kann sowohl nativ bzw. homolog als auch fremdartig
bzw. heterolog zur Wirtspflanze sein. Terminationsbereiche sind gegeneinander
beliebig austauschbar. Die DNA-Sequenz der Transkriptionsstart- und -
terminationsregionen kann synthetisch hergestellt oder natürlich gewonnen sein
oder eine Mischung aus synthetischen und natürlichen DNA-Bestandteilen
enthalten. Zur Vorbereitung der Einführung fremder Gene in höhere Pflanzen sind
eine große Anzahl Klonierungsvektoren verfügbar, die ein Replikationssignal für
E. coli und einen Marker beinhalten, der eine Selektion der transformierten Zellen
erlaubt. Beispiele für Vektoren sind pBR322, pUC-Serien, M13 mp-Serien,
pACYC 184 usw. Je nach Einführungsmethode gewünschter Gene in die Pflanze
können weitere DNA-Sequenzen erforderlich sein. Werden z. B. für die
Transformation der Pflanze das Ti oder Ri-Plasmid verwendet, so muß mindestens
die rechte Begrenzung, häufig jedoch die rechte und die linke Begrenzung der Ti und
Ri-Plasmid T-DNA als Flankenbereich den einzuführenden Genen angefügt werden.
Die Verwendung von T-DNA für die Transformation von Pflanzenzellen ist intensiv
untersucht und ausreichend beschrieben (Hoekema, in: The Binary Plant Vector
System, Offset-drukkerij Kanters B-V. Ablasserdam, 1985, Chapter V; Fraley et al.,
Critic. Rev. Plant Sci. 4: 1-46; An et al., 1985, EMBO J. 4: 277-287). Ist die eingeführte
DNA einmal im Genom integriert, so ist sie dort in der Regel stabil und bleibt auch in
den Nachkommen der ursprünglich transformierten Zelle erhalten. Sie enthält
normalerweise einen Selektionsmarker, der den transformierten Pflanzenzellen einen
Resistenz gegenüber Bioziden oder Antibiotika wie Kanamycin, Bleomycin oder
Hygromycin verleiht. Der individuell eingeführte Marker wird daher die Selektion
transformierter Zellen gegenüber Zellen, denen die eingeführte DNA fehlt, gestatten.
Für die Einführung von DNA in eine pflanzliche Wirtszelle stehen neben der
Transformation mit Hilfe von Agrobakterien viele andere Techniken zur Verfügung.
Diese Techniken umfassen die Transformation von Protoplasten, die Mikroinjektion
von DNA, die Elektroporation sowie ballistische Methoden. Aus dem
transformierten Pflanzenmaterial können dann in einem geeigneten
Selektionsmedium ganze Pflanzen regeneriert werden. Die so erhaltenen Pflanzen
können dann mit gängigen molekularbiologischen Methoden auf die Anwesenheit
der eingeführten DNA getestet werden. Diese Pflanzen können normal angezogen
werden und mit Pflanzen, die die gleiche transformierte Erbanlage oder andere
Erbanlagen besitzen, gekreuzt werden. Die daraus entstehenden hybriden
Individuen haben die entsprechenden phänotypischen Eigenschaften.
Die erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen (oder Teile dieser Sequenz oder Derivate
dieser Sequenz) können auch in Plasmide eingebracht und dabei mit
Steuerelementen für die Expression in Zellen von Spalthefen versehen werden (siehe
Ausführungsbeispiel 2). Die Einführung des Glutamat/Malat-Translokators führt zu
einer erheblichen Zunahme der durch Rekonstitution in künstliche Liposomen
meßbaren Aktivität des Glutamat/Malat-Translokators in den rekombinanten
Hefezellen. In rekombinaten Hefezellen ist eine vielfach höhere Malat-
Transportaktivität nachweisbar. Es ist somit denkbar, mit Hilfe der beschriebenen
DNA-Sequenz (oder Teilen oder Derivaten dieser Sequenz) Hefezellen so zu
verändern, daß sie einen veränderten Proteingehalt aufweisen. Hierbei käme der
Vorteil eines plastidären Translokators aus Pflanzen zum tragen, nicht den
endogenen Regulations- und Kompartiment-Adressierungsmechanismen der
Spalthefen zu unterliegen. Diese Stämme wären insbesondere für die
Futtermittelindustrie von herausragender Bedeutung.
Die erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen (oder Derivate oder Teile dieser Sequenz)
können auch in Plasmide eingebracht werden, die eine Mutagenese oder eine
Sequenzveränderung durch Rekombination von DNA-Sequenzen in
prokaryontischen oder eukaryontischen Systemen erlauben. Dadurch kann die
Spezifität des Glutamat/Malat-Translokators verändert werden z. B. in Richtung
einer Affinität für andere Dikarbonsäuren.
Ebenso könnte eine Unempfindlichkeit des Glutamat/Malat-Translokators für
spezifische Herbizide erreicht werden. Mit Hilfe von Standardverfahren (Sambrock
et al., 1989, Molecular cloning: A laboratory manual, 2. Aufl., Cold Spring Harbor
Laboratory Press, NY, USA) können Basenaustausche und/oder Basendeletionen
vorgenommen und/oder synthetische oder natürliche Sequenzen hinzugefügt
werden. Für die Verbindung der DNA-Fragmente untereinander können Adapter
oder linker hinzugefügt werden. Ferner können Manipulationen, die passende
Restriktionsschnittstellen bereitstellen oder die nicht benötigte DNA entfernen,
eingesetzt werden. Dort wo Insertionen, Deletionen oder Substitutionen wie z. B.
Transitionen oder Transversionen in Frage kommen, können in vitro-Mutagenese,
"primerrepair", Restriktion oder Ligation verwendet werden. Als Analysemethode
werden im allgemeinen eine Sequenzanalyse, eine Restriktionsanalyse und weitere
biochemisch-molekularbiologische Methoden wie z. B. die Expression des
modifizierten Proteins in Spalthefe und die Messung der modifizierten
Transporteigenschaften in artifiziellen Liposomen (siehe Ausführungsbeispiele 2 und
3; ferner: Loddenkötter et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 2155-2159; sowie
Fischer et al., 1997, Plant Cell, 9: 453-462; Kammerer et al. 1998, Plant Cell 10: 105-117)
oder die Messung der modifizierten Transporteigenschaften am in transgenen
Pflanzen exprimierten Protein mit Hilfe einer kürzlich von uns zu diesem Zweck
entwickelten Methode (Flügge und Weber, 1994, Planta, 194: 181-185) angewandt.
Die erfindungsgemäße DNA-Sequenz (oder Teile oder Derivate dieser Sequenz)
kann dazu genutzt werden, nach Standardverfahren (insbesondere Hybridisierungs-
Durchmusterung von cDNA-Bibliotheken mit niedriger Stringenz unter
Verwendung der erfindungsgemäßen DNA-Sequenz oder Teilen der DNA-Sequenz
als Sonde oder die Erstellung von Sonden für stringente und niedrig stringente
Durchmusterungs-Strategien durch Ableitung von degenerierten und/oder nicht
degenerierten Primern aus der erfindungsgemäßen DNA-Sequenz für PCR-
Experimente mit DNA oder cDNA aus anderen Pflanzen aus dem Genom von
Pflanzen ähnliche Sequenzen zu isolieren, die für Proteine kodieren. Die ebenfalls
Dikarbonsäuren transportieren.
Die erfindungsgemäße DNA-Sequenz enthält im übersetzten Proteinbereiche, die in
der Lage sind, das im Cytoplasma an Ribosomen synthetisierte Protein spezifisch zu
Plastiden zu dirigieren und das Auftreten des Proteins in anderen
Membransystemen der Zelle zu verhindern. Dies steht im Gegensatz zu den
bekannten mitochondrialen 2-Oxoglutarat Translokatoren, die eine solche
Adressierungssequenz nicht enthalten. Der Proteinbereich, der das durch die
erfindungsgemäße DNA-Sequenz kodierte Protein zu Plastiden dirigiert, liegt
innerhalb der ersten hundert Aminosäuren des Proteins, ist für die
Transportfunktion des Proteins nicht erforderlich und wird nach erfolgreicher
Insertion des Proteins in die Plastidenhüllmembran entfernt. Durch Austausch dieser
"Plastid-targeting"-Sequenz gegen eine der bekannten "Targeting"-Sequenzen z. B. für
Mitochondrien ließe sich das Translokator-Protein in ein anderes Membransystem
eukaryontischer Zellen dirigieren und könnte dort möglicherweise die
Transporteigenschaften über die respektive Membran verändern. Ebenso könnten
die "Plastid-targeting"-Sequenz des Glutamat/Malat-Translokators oder endogene
Bereiche des reifen Proteins dazu genutzt werden, fremde Proteine (z. B. bakterielle
Transportproteine oder Transporter aus Hefen) in die Plastiden bzw. in die
Plastidenhüllmembran pflanzlicher Zellen zu dirigieren.
Zum besseren Verständnis der dieser Erfindung zugrundeliegenden Ausführungs
beispiele werden die wichtigsten eingesetzten Verfahren im folgenden erläutert.
Zur Klonierung der für den Glutamat/Malat-Translokator kodierenden cDNAs aus
Sorghum bicolor und Flaveria bidentis wurde der Phage Lambda ZAPII sowie der
Phagemid pBluescript II KS (pBSC) (Short et al., 1988, Nucl. Acids Res. 16: 7583-7600)
verwendet.
Für die Transformation von Hefen wurde der Vektor SAP-E (Truenit et al., 1996,
Plant Cell 8: 2169-2182) verwendet.
Für die Pflanzentransformation wurden die Genkonstruktionen in den binären
Vektor pBinAR (Höfgen und Willmitzer, 1990, Plant Sci. 66: 221-230) kloniert.
Für das pBluescriptKS (pBSC) Phagemid sowie für SAP-E- und pBinAR-Konstrukte
wurde der E. coli Stamm DH5α (Hanahan et al., 1983, J. Mol. Biol. 166: 557-580)
verwendet.
Die Transformation der pBinAR-Konstrukte in Tabakpflanzen wurde mit Hilfe des
Agrobacterium tumefaciens-Stammes C58C1, pGV2260 (Bevan, 1984, Nucl. Acids Res.
12: 8711-8720) durchgeführt.
Der Transfer der DNA in die Agrobakterien erfolgte durch direkte Transformation
nach der Methode von Höfgen und Willmitzer (1988, Nucl. Acids Res. 16: 9877). Die
Plasmid-DNA transformierter Agrobakterien wurde nach der Methode von Birn
boim und Doly (1979, Nucl. Acids Res. 7: 1513-1523) isoliert und nach geeigneter
Restriktionsspaltung gelelektrophoretisch auf Richtigkeit und Orientierung
analysiert.
Pro Transformation wurden 15 kleine mit Schmirgelpapier und Skalpell verwundete
Blätter einer Tabak-Sterilkultur in 10 ml MS-Medium mit 2% Saccharose gelegt,
welches 100 µl einer unter strenger Selektion gewachsenen, transformierten Agro
bacterium tumefaciens-Übernachtkultur enthielt. Nach 15 minütigem leichtem
Schütteln wurden die Blätter auf MS-Medium mit 1,6% Glukose, 2 mg/l
Zeatinribose, 0,02 mg/l Naphthylessigsäure, 0,02 mg Giberellinsäure, 500 mg/l
Betabactyl®, 100 mg/l Kanamycin und 0,8% Bacto-Agar ausgelegt. Nach
einwöchiger Inkubation bei 25°C und 3.000 Lux Beleuchtungsstärke wurde die
Betabactylkonzentration im Medium um die Hälfte reduziert.
Am 12. 11. 1998 wurden bei der Deutschen Sammlung von Mikroorganismen (DSM)
in Braunschweig, Bundesrepublik Deutschland, folgende Phagemide in Form von E.
coli Stämmen, enthaltend diese Phagemide, hinterlegt:
Phagemid pSbGMT1 (GMT1-Sequenz aus Sorghum bicolor) (DSM 12480)
Phagemid pFbGMT1 (GMT1-Sequenz aus Flaveria bidentis) (DSM 12478)
Phagemid pSoGMT1 (GMT1-Sequenz aus Spinacia oleracea) (DSM 12479)
Phagemid pSbGMT1 (GMT1-Sequenz aus Sorghum bicolor) (DSM 12480)
Phagemid pFbGMT1 (GMT1-Sequenz aus Flaveria bidentis) (DSM 12478)
Phagemid pSoGMT1 (GMT1-Sequenz aus Spinacia oleracea) (DSM 12479)
Aus Blättern von Sorghum bicolor wurde poly(A+)-RNA isoliert, mit Hilfe eines
Standard-cDNA-Synthesekits in doppelsträngige cDNA überführt und diese in den
Vektor Lambda-ZAPII kloniert (Wyrich et al., 1998, Plant Mol. Biol. 37: 319-335).
Parallel dazu wurde durch partiellen Verdau mit Pektinasen und Cellulasen aus
Blättern von Sorghum bicolor Mesophyll- und Bündelscheidenzellen präpariert und
aus diesen wiederum poly(A+)-RNA. Aus der Mesophyll- bzw. Bündelscheiden-
RNA wurde mit Hilfe der Reversen Transkriptase und radiaoaktiver Nukleotide eine
Hybridisierungssonde hergestellt, mit der die cDNA-Bibliothek differentiell
durchgemustert wurde. Die Sichtung führte u. a. zur Isolierung einer ca. 900 bp
großen cDNA (HHU51), die Ähnlichkeiten zu einer cDNA aus Spinat erkennen ließ,
die für den 2-Oxoglutarat/Malat-Translokator kodiert (Weber et al., 1995,
Biochemistry 34: 2621-2627) und die bei Sorghum bicolor bündelscheidenspezifisch
exprimiert wird (Wyrich et al., 1998, Plant Mol. Biol. 37: 319-335).
Um Vollängenklone für die in HHU51 kodierten Translokatorpartialsequenzen zu
isolieren, wurde die cDNA-Bibliothek mit dem cDNA-Klon HHU51 als
Hybridisierungssonde durchmustert. Positiv reagierende Lambda-Klone wurden
nach Standardverfahren gereinigt. Das pBluescript-Phagemid mit dem cDNA-Insert
kodierend für den Glutamat/Malat-Translokator wurde durch in vivo-Exzission
(Short & Sorge, 1992, Meth. Enzymol. 216: 495-208) freigesetzt. Die Klone wurden
durch Bestimmung der DNA-Sequenz analysiert (Dideoxymethode: Sanger et al.,
1977, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74: 5463-5467) und aus dieser DNA-Sequenz die
Primärstruktur des Glutamat/Malat-Translokators (Klon pSbGMT1) bestimmt.
Die cDNA aus Sorghum bicolor (Hirse) wurde anschließend benutzt, um die
entsprechenden cDNA-Klone aus Flaveria bidentis (Klon pFbMGT1) und Spinacia
oleracea (Spinat) zu isolieren.
Das Phagemid pBluescript (pBSC), enthaltend die Insertion kodierend für den
Glutamat/Malat-Translokator, wurde über die sich an den beiden Enden
befindlichen EcoRI-Schnittstellen mit der Endonuclease EcoRI linearisiert und das so
erhaltene Fragment in die singuläre EcoRI Klonierungsstelle des Hefe-
Expressionsvektors SAP-E (Truenit et al., 1996, Plant Cell 8: 2169-2182) kloniert. Nach
Amplifikation des Konstrukts (SAP-GMT1) in E. coli wurde das Plasmid in durch
LiCl/PEG kompetent gemachte (Ito et al., 1983, J. Bact. 153: 163-168) Leucinsynthese
defiziente S. pombe Zellen transformiert. Transformanden wurden durch Selektion
auf Minimalmedium ohne Leucin selektiert, da das SAP-GMT1-Konstrukt den
Hefezellen die Fähigkeit zum Wachstum auf leucinfreiem Medium verleiht.
Mit dem SAP-GMT1 Plasmid transformierte Hefezellen wurden in Minimalmedium
bis zu einer optischen Dichte bei 600 nm von 1.0 angezogen und durch Zentrifu
gation bei 3.000 × g für 5 min geerntet. Anschließend wurden die Zellen durch kräfti
ges Schütteln mit 1/2 vol (bezogen auf die Zellen) Glasperlen aufgebrochen und
Glasperlen und Zellbruchstücke durch Zentrifugation (600 g für 1 min) abgetrennt.
Der Überstand wurde auf eine Konzentration von 0.5% (Gewicht/Volumen) Triton
X-100 eingestellt, mit dem gleichen Volumen Liposomen versetzt und die resultie
renden Proteoliposomen sofort in flüssigem Stickstoff eingefroren. Die Liposomen
wurden zuvor durch Beschallen von Sojabohnen-Phospholipid (20 mg/ml) für
10 min bei 4°C in Gegenwart von 200 mM Tricine-NaOH (pH 7,6), 40 mM Malat und
60 mM Kaliumglukonat hergestellt. Nach dem Auftauen der Proteoliposomen und
erneutem Beschallen der Suspension mit 10 Pulsen à 1 s wurden die Proteoliposomen
vom umgebendem Medium durch Größenausschlußchromatographie auf Sephadex
G-25, das zuvor mit 10 mM Tricine-NaOH (pH 7,6), 100 mM Natriumglukonat und
50 mM Kaliumglukonat äquilibriert worden war, abgetrennt. Die eluierten
Proteoliposomen wurden für die Messung der Malat-Transportaktivität eingesetzt.
Die Messung wurde nach der von Menzlaff und Flügge (1993, Biochim. Biophys.
Acta 1147: 13-18) beschriebenen "Inhibitor-Stop" Methode durchgeführt.
Die Malat-Transportaktivität in den SAP-GMT1 Transformanden wurde mit der
Malat-Transportaktivität von Transformanden verglichen, die lediglich mit dem
Vektor SAP ohne die GMT1-Insertion transformiert waren. Es zeigte sich, daß die
Malat-Transportaktivität in den SAP-GMT1 Transformanden (gemessen in pmol
transportiertes 14C-Malat/mg Protein pro Minute) um ein Vielfaches höher war als in
SAP Kontroll-Transformanden. Es konnte ferner gezeigt werden, daß, im Gegensatz
zu dem bereits bekannten 2-Oxoglutarat/Malat-Translokator, der Glutamat/Malat-
Translokator den Transport von Aminosäuren (Glutamat/Aspartat) im Gegentausch
mit Malat zu katalysieren vermag (siehe Tabelle 1).
Aus dem Phagemid pBluescript-GMT1 (pBSC-SoGMT1), der als Insertion die cDNA
für den Glutamat/Malat-Translokator aus Spinat enthielt (siehe Ausführungsbeispiel
1), wurde die Insertion durch Restriktionsverdau mit EcoRV und SmaI isoliert und in
den Vektor pBinAR (Höfgen u. Willmitzer, 1990, Plant Sci. 66: 221-230) der zuvor mit
dem Enzym SmaI geschnitten worden war, kloniert. Nach Amplifikation des
resultierenden Konstrukts pBinAR-GMT1 in E. coli wurden das Konstrukt in
Agrobakterien transformiert und diese dann zur Infektion von Blattsegmenten von
Tabak und Kartoffel eingesetzt.
Die erhaltenen Transformanden wurden mit Hilfe von Southern-Blot Analysen auf
die Präsenz des intakten, nicht rearrangierten chimären Gens untersucht. Mit Hilfe
der "Gesamtblatt-Rekonstitutionsmethode" (Flügge und Weber, 1994, Planta, 194:
181-185) wurde die Malattransportaktivität im Vergleich zu Kontrolltransformanden
(transformiert mit Vektor pBinAR ohne Insertion) untersucht, ebenso das C/N-Ver
hältnis, Photosyntheserate, Photorespiration und Wachstum.
Claims (19)
1. DNA-Sequenzen, die die Kodierregion eines Glutamat/Malat-Translokators
enthalten, dadurch gekennzeichnet, daß diese DNA-Sequenzen die in Fig. 1
dargestellten Nukleotidabfolgen aufweisen (Seq-ID No.: 1-3).
2. DNA-Sequenzen, die mit den DNA-Sequenzen gemäß Anspruch 1 oder Teilen
davon oder Derivaten, die durch Insertion, Deletion oder Substitution von diesen
Sequenzen abgeleitet sind, hybridisieren und für ein plastidäres Protein kodieren,
das die biologische Aktivität eines Glutamat/Malat-Translokators besitzt.
3. Plasmide enthaltend DNA-Sequenzen gemäß Anspruch 1 oder 2.
4. Phagemid pSbGMT1 hinterlegt unter der DSM-Nummer DSM 12480 als E. coli
Stamm DH5α pSbGMT1 enthaltend dieses Plasmid.
5. Phagemid pFbGMT1 hinterlegt unter der DSM-Nummer DSM 12478 als E. coli
Stamm DH5α pFbGMT1 enthaltend dieses Plasmid.
6. Phagemid pSoGMT1 hinterlegt unter der DSM-Nummer DSM 12479 als E. coli
Stamm DH5α pSoGMT1 enthaltend dieses Plasmid.
7. Bakterien, enthaltend eine DNA-Sequenz gemäß Anspruch 1 oder 2 bzw.
enthaltend Phagemide gemäß den Ansprüchen 3 bis 6.
8. Hefen, enthaltend eine DNA-Sequenz gemäß Anspruch 1 oder 2 bzw. enthaltend
Plasmide gemäß Anspruch 3.
9. Bakterien enthaltend eine DNA-Sequenz gemäß Anspruch 1 oder 2 bzw.
enthaltend Plasmide/Phagemide gemäß den Ansprüchen 3 bis 6.
10. Pflanzenzellen enthaltend Plasmide gemäß den Ansprüchen 1 und 2.
11. Transformierte Pflanzenzellen und aus diesen regenerierte transgene Pflanzen
enthaltend DNA-Sequenzen gemäß Anspruch 1 oder 2, wobei diese Sequenzen als
Bestandteil eines rekombinaten DNA-Moleküls in die Pflanzenzellen eingeführt
wurden.
12. Verwendung von DNA-Sequenzen gemäß Anspruch 1 oder 2
zur
Einführung in pro- oder eukaryontische Zellen, wobei diese Sequenzen mit
Steuerelementen, die die Transkription und Translation in den Zellen gewährleisten,
verknüpft sind und zur Expression einer translatierbaren mRNA, die die Synthese
eines Glutamat/Malat-Translokators bewirkt, führen.
13. Verwendung einer DNA-Sequenz gemäß Anspruch 1 oder 2
zur Isolierung von
DNA-Sequenzen, die für ein Polypeptid kodieren, das die biologische Aktivität eines
Glutamat/Malat-Translokators besitzt.
14. Verwendung einer DNA-Sequenz gemäß Anspruch 1 oder 2,
wobei diese Sequenz
eine kodierende Region enthält, die für ein reifes Protein mit der biologischen
Aktivität eines Glutamat/Malat-Translokators kodiert, zur Kombination mit
"Targeting"-Sequenzen für andere Zellkompartimente oder zelluläre
Membransysteme, wodurch das reife Protein in andere Kompartimente oder
Membransysteme dirigiert wird.
15. Verwendung einer DNA-Sequenz gemäß Anspruch 1 oder 2
zur Identifizierung von
Substanzen, die eine inhibierende Wirkung auf den Transport von Dikarbonsäuren
über die innere Plastidenhüllmembran haben.
16. Verwendung von DNA-Sequenzen gemäß Anspruch 1 oder 2
zur
Isolierung entsprechender genomischer Klone.
17. Verwendung von Promotorbereichen oder von Promotorteilbereichen gemäß
Anspruch 16 zur gewebespezifischen Expression von Genen.
18. Verwendung von DNA-Sequenzen gemäß Anspruch 1 oder 2
zur
Herstellung von DNA-Sequenzen, die für einen pflanzlichen plastidären
Dikarbonsäuretranslokator mit einer veränderten Spezifität kodieren.
19. Verwendung von DNA-Sequenzen gemäß Anspruch 1 oder 2
zur
Identifizierung von Insertionsmutanten, zur homologen Rekombination oder zur
Expression einer nicht translatierbaren RNA, die mittels eines "antisense"-Effektes,
eine Kosupression oder einer Ribozymaktivität die Synthese eines oder mehrerer
endogener plastidärer Glutamat/Malat-Translokatoren in den Zellen verhindert.
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1999
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EMBO J. 11, S. 4705-4713, 1992 * |
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