CZ309851B6 - Tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí a jejich použití - Google Patents
Tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí a jejich použití Download PDFInfo
- Publication number
- CZ309851B6 CZ309851B6 CZ2022-82A CZ202282A CZ309851B6 CZ 309851 B6 CZ309851 B6 CZ 309851B6 CZ 202282 A CZ202282 A CZ 202282A CZ 309851 B6 CZ309851 B6 CZ 309851B6
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- alkyl
- tsc
- derivative
- tryptanthrin
- tryptanthrine
- Prior art date
Links
- VQQVWGVXDIPORV-UHFFFAOYSA-N Tryptanthrine Chemical class C1=CC=C2C(=O)N3C4=CC=CC=C4C(=O)C3=NC2=C1 VQQVWGVXDIPORV-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract description 97
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 title claims abstract description 11
- 125000003876 thiosemicarbazone group Chemical group 0.000 title claims abstract description 11
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims abstract description 26
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims abstract description 14
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims abstract description 14
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract description 12
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims abstract description 10
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims abstract description 9
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims abstract description 9
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 claims abstract description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 6
- 241000711573 Coronaviridae Species 0.000 claims abstract description 5
- 125000006297 carbonyl amino group Chemical group [H]N([*:2])C([*:1])=O 0.000 claims abstract description 5
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims abstract description 5
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 claims abstract description 3
- 125000001494 2-propynyl group Chemical group [H]C#CC([H])([H])* 0.000 claims abstract description 3
- 125000006367 bivalent amino carbonyl group Chemical group [H]N([*:1])C([*:2])=O 0.000 claims abstract description 3
- 125000000896 monocarboxylic acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 3
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims abstract description 3
- 208000025721 COVID-19 Diseases 0.000 abstract description 19
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 abstract description 18
- 241001678559 COVID-19 virus Species 0.000 abstract description 15
- CWYNVVGOOAEACU-UHFFFAOYSA-N Fe2+ Chemical compound [Fe+2] CWYNVVGOOAEACU-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 13
- 229910001448 ferrous ion Inorganic materials 0.000 abstract description 7
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 abstract description 7
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 abstract description 6
- 239000002245 particle Substances 0.000 abstract description 6
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 abstract description 5
- VTLYFUHAOXGGBS-UHFFFAOYSA-N Fe3+ Chemical compound [Fe+3] VTLYFUHAOXGGBS-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 4
- 229910001447 ferric ion Inorganic materials 0.000 abstract description 4
- 239000013522 chelant Substances 0.000 abstract description 2
- 230000008685 targeting Effects 0.000 abstract description 2
- 125000003917 carbamoyl group Chemical group [H]N([H])C(*)=O 0.000 abstract 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 abstract 1
- CBOIHMRHGLHBPB-UHFFFAOYSA-N hydroxymethyl Chemical compound O[CH2] CBOIHMRHGLHBPB-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract 1
- 125000000876 trifluoromethoxy group Chemical group FC(F)(F)O* 0.000 abstract 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 42
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 32
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 30
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 28
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 21
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 21
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 19
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 18
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 17
- 238000000954 titration curve Methods 0.000 description 16
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 14
- 239000012265 solid product Substances 0.000 description 14
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 13
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 12
- BRWIZMBXBAOCCF-UHFFFAOYSA-N hydrazinecarbothioamide Chemical compound NNC(N)=S BRWIZMBXBAOCCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 11
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 10
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 10
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 10
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 9
- 238000000870 ultraviolet spectroscopy Methods 0.000 description 9
- 206010050685 Cytokine storm Diseases 0.000 description 8
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 8
- 206010052015 cytokine release syndrome Diseases 0.000 description 8
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 8
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 8
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 7
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 6
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 5
- 238000003032 molecular docking Methods 0.000 description 5
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 5
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 4
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 4
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 4
- 229910001428 transition metal ion Inorganic materials 0.000 description 4
- 206010001052 Acute respiratory distress syndrome Diseases 0.000 description 3
- 102000004889 Interleukin-6 Human genes 0.000 description 3
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 3
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 3
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 238000002371 ultraviolet--visible spectrum Methods 0.000 description 3
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 3
- FCPHVJQWZFNNKD-UHFFFAOYSA-N 3-amino-1,1-dimethylthiourea Chemical compound CN(C)C(=S)NN FCPHVJQWZFNNKD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101800000535 3C-like proteinase Proteins 0.000 description 2
- 101800002396 3C-like proteinase nsp5 Proteins 0.000 description 2
- CCFVLTFAPUCNHB-UHFFFAOYSA-N 6-hydroxy-6-(2-oxopropyl)indolo[2,1-b]quinazolin-12-one Chemical compound C1=CC=C2C(=O)N3C4=CC=CC=C4C(CC(=O)C)(O)C3=NC2=C1 CCFVLTFAPUCNHB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000494545 Cordyline virus 2 Species 0.000 description 2
- IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N Dimethyl sulfoxide Chemical compound [2H]C([2H])([2H])S(=O)C([2H])([2H])[2H] IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N 0.000 description 2
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 2
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 2
- REFJWTPEDVJJIY-UHFFFAOYSA-N Quercetin Chemical compound C=1C(O)=CC(O)=C(C(C=2O)=O)C=1OC=2C1=CC=C(O)C(O)=C1 REFJWTPEDVJJIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000013616 Respiratory Distress Syndrome Diseases 0.000 description 2
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 2
- 101100316897 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 E gene Proteins 0.000 description 2
- 241000257673 Strobilanthes cusia Species 0.000 description 2
- 108020000999 Viral RNA Proteins 0.000 description 2
- 201000000028 adult respiratory distress syndrome Diseases 0.000 description 2
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 2
- 229940121363 anti-inflammatory agent Drugs 0.000 description 2
- 239000002260 anti-inflammatory agent Substances 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 2
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 238000010874 in vitro model Methods 0.000 description 2
- 229940100601 interleukin-6 Drugs 0.000 description 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 2
- 230000000116 mitigating effect Effects 0.000 description 2
- CCFVLTFAPUCNHB-GOSISDBHSA-N phaitanthrin A Natural products O=C(C[C@@]1(O)c2c(N3C(=O)c4c(N=C13)cccc4)cccc2)C CCFVLTFAPUCNHB-GOSISDBHSA-N 0.000 description 2
- BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N pyrene Chemical compound C1=CC=C2C=CC3=CC=CC4=CC=C1C2=C43 BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 238000000611 regression analysis Methods 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- KKIGUVBJOHCXSP-UHFFFAOYSA-N 4-phenylthiosemicarbazide Chemical compound NNC(=S)NC1=CC=CC=C1 KKIGUVBJOHCXSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HJGHAQFHGFDSCJ-UHFFFAOYSA-N 7h-pyrimido[5,4-c]carbazole Chemical class C1=NC=NC2=C3C4=CC=CC=C4NC3=CC=C21 HJGHAQFHGFDSCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- INPHXCCBDRGBRF-UHFFFAOYSA-N 8-bromoindolo[2,1-b]quinazoline-6,12-dione Chemical compound C1=CC=C2C(=O)N3C4=CC=C(Br)C=C4C(=O)C3=NC2=C1 INPHXCCBDRGBRF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXBGZQXHNVNPFT-UHFFFAOYSA-N 8-fluoroindolo[2,1-b]quinazoline-6,12-dione Chemical compound C1=CC=C2C(=O)N3C4=CC=C(F)C=C4C(=O)C3=NC2=C1 UXBGZQXHNVNPFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000207965 Acanthaceae Species 0.000 description 1
- 108010031480 Artificial Receptors Proteins 0.000 description 1
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000282552 Chlorocebus aethiops Species 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000001528 Coronaviridae Infections Diseases 0.000 description 1
- 206010011224 Cough Diseases 0.000 description 1
- JPVYNHNXODAKFH-UHFFFAOYSA-N Cu2+ Chemical compound [Cu+2] JPVYNHNXODAKFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000010907 Cyclooxygenase 2 Human genes 0.000 description 1
- 108010037462 Cyclooxygenase 2 Proteins 0.000 description 1
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 229910002547 FeII Inorganic materials 0.000 description 1
- 108091081406 G-quadruplex Proteins 0.000 description 1
- 208000032612 Glial tumor Diseases 0.000 description 1
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 1
- 101001134456 Homo sapiens Pancreatic triacylglycerol lipase Proteins 0.000 description 1
- 244000309467 Human Coronavirus Species 0.000 description 1
- 241000482741 Human coronavirus NL63 Species 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 102000006992 Interferon-alpha Human genes 0.000 description 1
- 108010047761 Interferon-alpha Proteins 0.000 description 1
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 1
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 1
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 description 1
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 1
- 241000222727 Leishmania donovani Species 0.000 description 1
- 241001480037 Microsporum Species 0.000 description 1
- 208000034486 Multi-organ failure Diseases 0.000 description 1
- 208000000112 Myalgia Diseases 0.000 description 1
- 241000187479 Mycobacterium tuberculosis Species 0.000 description 1
- 102000008299 Nitric Oxide Synthase Human genes 0.000 description 1
- 108010021487 Nitric Oxide Synthase Proteins 0.000 description 1
- 241000223960 Plasmodium falciparum Species 0.000 description 1
- ZVOLCUVKHLEPEV-UHFFFAOYSA-N Quercetagetin Natural products C1=C(O)C(O)=CC=C1C1=C(O)C(=O)C2=C(O)C(O)=C(O)C=C2O1 ZVOLCUVKHLEPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 1
- HWTZYBCRDDUBJY-UHFFFAOYSA-N Rhynchosin Natural products C1=C(O)C(O)=CC=C1C1=C(O)C(=O)C2=CC(O)=C(O)C=C2O1 HWTZYBCRDDUBJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091005532 SARS-CoV-2 main proteases Proteins 0.000 description 1
- 208000037847 SARS-CoV-2-infection Diseases 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 201000003176 Severe Acute Respiratory Syndrome Diseases 0.000 description 1
- 102000011011 Sphingosine 1-phosphate receptors Human genes 0.000 description 1
- 108050001083 Sphingosine 1-phosphate receptors Proteins 0.000 description 1
- 241000223238 Trichophyton Species 0.000 description 1
- 241000223105 Trypanosoma brucei Species 0.000 description 1
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 1
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 1
- 238000012793 UV/ Vis spectrometry Methods 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 241000235015 Yarrowia lipolytica Species 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 1
- 229930013930 alkaloid Natural products 0.000 description 1
- 150000003797 alkaloid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000002160 alpha blocker Substances 0.000 description 1
- 229940124308 alpha-adrenoreceptor antagonist Drugs 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000843 anti-fungal effect Effects 0.000 description 1
- 229940124599 anti-inflammatory drug Drugs 0.000 description 1
- 230000003110 anti-inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229960000817 bazedoxifene Drugs 0.000 description 1
- UCJGJABZCDBEDK-UHFFFAOYSA-N bazedoxifene Chemical compound C=1C=C(OCCN2CCCCCC2)C=CC=1CN1C2=CC=C(O)C=C2C(C)=C1C1=CC=C(O)C=C1 UCJGJABZCDBEDK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 125000005605 benzo group Chemical group 0.000 description 1
- SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N benzopyrrole Natural products C1=CC=C2NC=CC2=C1 SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002876 beta blocker Substances 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 230000000981 bystander Effects 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 230000009920 chelation Effects 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 230000000973 chemotherapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005352 clarification Methods 0.000 description 1
- XLJKHNWPARRRJB-UHFFFAOYSA-N cobalt(2+) Chemical class [Co+2] XLJKHNWPARRRJB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 229940125904 compound 1 Drugs 0.000 description 1
- 238000000205 computational method Methods 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 1
- 229910001431 copper ion Inorganic materials 0.000 description 1
- LBJNMUFDOHXDFG-UHFFFAOYSA-N copper;hydrate Chemical compound O.[Cu].[Cu] LBJNMUFDOHXDFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003246 corticosteroid Substances 0.000 description 1
- 229960001334 corticosteroids Drugs 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 229940042396 direct acting antivirals thiosemicarbazones Drugs 0.000 description 1
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 1
- GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N fluoranthrene Natural products C1=CC(C2=CC=CC=C22)=C3C2=CC=CC3=C1 GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 description 1
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 238000000126 in silico method Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N indole Natural products CC1=CC=CC2=C1C=CN2 PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N indolenine Natural products C1=CC=C2CC=NC2=C1 RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 1
- 229940047124 interferons Drugs 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- MWDZOUNAPSSOEL-UHFFFAOYSA-N kaempferol Natural products OC1=C(C(=O)c2cc(O)cc(O)c2O1)c3ccc(O)cc3 MWDZOUNAPSSOEL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000037841 lung tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000000034 method Methods 0.000 description 1
- 208000030247 mild fever Diseases 0.000 description 1
- 238000000329 molecular dynamics simulation Methods 0.000 description 1
- 208000029744 multiple organ dysfunction syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 150000002825 nitriles Chemical class 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008447 perception Effects 0.000 description 1
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 1
- 235000017807 phytochemicals Nutrition 0.000 description 1
- 229930000223 plant secondary metabolite Natural products 0.000 description 1
- 229940124606 potential therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 1
- 230000005180 public health Effects 0.000 description 1
- 208000005069 pulmonary fibrosis Diseases 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 238000003762 quantitative reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 229960001285 quercetin Drugs 0.000 description 1
- 235000005875 quercetin Nutrition 0.000 description 1
- 125000002294 quinazolinyl group Chemical group N1=C(N=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 229960004622 raloxifene Drugs 0.000 description 1
- GZUITABIAKMVPG-UHFFFAOYSA-N raloxifene Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C1=C(C(=O)C=2C=CC(OCCN3CCCCC3)=CC=2)C2=CC=C(O)C=C2S1 GZUITABIAKMVPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000000241 respiratory effect Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 238000005556 structure-activity relationship Methods 0.000 description 1
- BDHFUVZGWQCTTF-UHFFFAOYSA-M sulfonate Chemical compound [O-]S(=O)=O BDHFUVZGWQCTTF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- SRVJKTDHMYAMHA-WUXMJOGZSA-N thioacetazone Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(\C=N\NC(N)=S)C=C1 SRVJKTDHMYAMHA-WUXMJOGZSA-N 0.000 description 1
- 150000003584 thiosemicarbazones Chemical class 0.000 description 1
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 1
- 239000000814 tuberculostatic agent Substances 0.000 description 1
- 229950008558 ulinastatin Drugs 0.000 description 1
- 230000003827 upregulation Effects 0.000 description 1
- 108010088854 urinastatin Proteins 0.000 description 1
- ODVKSTFPQDVPJZ-UHFFFAOYSA-N urinastatin Chemical compound C1C=CCCC11COC(C=2OC=CC=2)OC1 ODVKSTFPQDVPJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003501 vero cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D487/00—Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00
- C07D487/02—Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00 in which the condensed system contains two hetero rings
- C07D487/04—Ortho-condensed systems
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
- A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
- A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
Abstract
Řešení se týká tryptanthrinových derivátů s thiosemikarbazonovou substitucí obecného vzorce I a II, kde R1-R8 jsou nezávisle H, OH, alkyl s 1 až 6 uhlíkovými atomy, C(CH3)3, allyl, propargyl, benzyl, fenyl, F, Cl, Br, I, CH2OH, O(alkyl), CF3, OCF3, CN, COOH, COO(alkyl), CONH2, CONH(alkyl), NO2, N(alkyl)2, NH(alkyl), NHCO(alkyl), kde alkyl má 1 až 6 uhlíkových atomů, nebo R1-R2nebo R2-R3nebo R3-R4 nebo R5-R6 nebo R6-R7 nebo R7-R8 je -CH=CH-CH=CH-, tedy přikondenzované benzenové jádro, X a Z jsou nezávisle H, alkyl s 1 až 6 uhlíkovými atomy, benzyl nebo fenyl. Tyto látky kombinují vhodný strukturní motiv pro cílení PLpro, mají silnou afinitu a selektivitu pro RNA oproti DNA a zároveň efektivně chelatují železité a železnaté ionty. Tyto sloučeniny mají tedy požadované vlastnosti pro potenciální použití jako inhibitorů produkce virových částic SARS-CoV-2 a mohou tak být využity pro přípravu léčiva pro léčbu koronavirových onemocnění, zejména COVID-19.
Description
Tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí a jejich použití
Oblast techniky
Vynález se týká tryptanthrinových derivátů s thiosemikarbazonovou substitucí obecného vzorce I a II a jejich použití jako inhibitorů produkce virových částic SARS-CoV-2.
Dosavadní stav techniky
Tryptanthriny patří mezi indolochinazolinové alkaloidy. Základní tryptanthrin (6,12-dihydro6,12-dioxoindolo-(2,1-b)-chinazolin) je žlutá sloučenina. Jeho strukturní motiv obsahuje chinazolinový kruh fúzovaný k indolovému heterocyklu s karbonylovými skupinami v polohách 6 a 12. (R. Kaur, S.K. Manjal, R.K. Rawal, K. Kumar: Recent synthetic and medicinal perspectives of tryptanthrin. Bioorg. Med. Chem. 25 (2017) 4533-4552; A.M. Tucker, P. Grundt: The chemistry of tryptanthrin and its derivatives. Arkivoc (i) (2012) 546-569). Poprvé byl izolován z kultury kvasinek Candida lipolytica a později byl izolován z čínské léčivé rostliny Strobilanthes cusia Kuntze (Acanthaceae). Jako potenciální terapeutické činidlo vyvolává velký zájem díky své strukturální jednoduchosti, možnosti připravit substitučně rozličné deriváty, a zejména díky širokému spektru biologických aktivit. Ty zahrnují antimikrobiální aktivitu vůči různým species rodu Trichophyton, Microsporum a Epidermophyron, Leishmania donovani, Trypanosoma brucei a Plasmodium falciparum, Mycobacterium tuberculosis, protizánětlivou aktivitu (inhibice cyklooxygenázy-2 a snížení exprese syntázy oxidu dusnatého), antivirovou či antifungální aktivitu. Protinádorová aktivita tryptanthrinu in vitro byla pozorována u řady rakovinných buněčných linií, včetně leukémie U937, nádoru prsu MCF-7, gliomu U251, nádoru tlustého střeva SW620 a nádoru plic H5229 (R. Kaur, S.K. Manjal, R.K. Rawal, K. Kumar: Recent synthetic and medicinal perspectives of tryptanthrin. Bioorg. Med. Chem. 25 (2017) 4533-4552; G.M. Shankar, J. Antony, R.J. Anto: Quercetin and Tryptanthrin: Two Broad Spectrum Anticancer Agents for Future Chemotherapeutic Interventions. Enzymes 37 (2015) 4372; J. Kawakami, N. Matsushima, Y. Ogawa, H. Kakinami, A. Nakane, H. Kitahara, M. Nagaki, S. Ito: Antibacterial and Antifungal Activities of Tryptanthrin Derivatives. Trans. Mat. Res. Soc. Japan 36 (2011) 603-606; J.M. Hwang, T. Oh, T. Kaneko, A.M. Upton, S.G. Franzblau, Z. Ma, S.N. Cho, P. Kim: Design, Synthesis, and Structure-Activity Relationship Studies of Tryptanthrins As Antitubercular Agents. J. Nat. Prod. 76 (2013) 354-367; Y. Hao, J. Guo, Z. Wang, Y. Liu, Y. Li, D. Ma, Q. Wang: Discovery of Tryptanthrins as Novel Antiviral and AntiPhytopathogenic-Fungus Agents. J. Agric. Food Chem. 68 (2020) 5586-5595; Y. Jahng: Progress in the studies on tryptanthrin, an alkaloid of history. Arch. Pharm. Res. 36 (2013) 517-535).
Vedle toho se v poslední době začínají objevovat predikce, že tryptanthrinový strukturní motiv by mohl vykazovat terapeutický efekt proti koronavirům, např. SARS-CoV-2 (Y.C. Tsai, C.L. Lee, H.R. Yen, Y.S. Chang, Y.P. Lin, S.H. Huang, C.W. Lin: Antiviral Action of Tryptanthrin Isolated from Strobilanthes cusia Leaf against Human Coronavirus NL63. Biomolecules 10 (2020) 366; J.S. Mani, J.B. Johnson, J.C. Steel, D.A. Broszczak, P.M. Neilsen, K.B. Walsh, M. Naiker: Natural product-derived phytochemicals as potential agents against coronaviruses: A review. Virus Research 284 (2020) 197989; Y. Hao, J. Guo, Z. Wang, Y. Liu, Y. Li, D. Ma, Q. Wang: Discovery of Tryptanthrins as Novel Antiviral and Anti-Phytopathogenic-Fungus Agents. J. Agric. Food Chem. 68 (2020) 5586-5595; B.C. Fielding, C.S.M.B. Filho, N.S.M. Ismail, D. Pergentino de Sousa: Alkaloids: Therapeutic Potential against Human Coronaviruses. Molecules 258 (2020) 5496; R.R. Narkhede, A.V. Pise, R.S. Cheke, S.D. Shinde: Recognition of Natural Products as Potential Inhibitors of COVID-19 Main Protease (Mpro): In-Silico Evidences. Nat. Prod. Biopersp. 10 (2020) 297-306; S.N. Sahu, B. Mishra, R. Sahu, S.K. Pattanayak: Molecular dynamics simulation perception study of the binding affinity performance for main protease of SARS-CoV-2, J. Biomol. Struct. Dynam (2020) DOI: 10.1080/07391102.2020.1850362).
- 1 CZ 309851 B6
SARS-CoV-2 představuje typ vysoce patogenního lidského koronaviru, způsobující onemocnění COVID-19. Pandemie toto onemocnění má velký dopad na systém veřejného zdravotnictví a ekonomiku států. Účinná léčba onemocnění COVID-19 je stále omezená a jeho dostupnost zejména v zemích tzv. třetího světa velmi omezená. Drtivá většina pacientů s COVID-19 má sice dobrou prognózu, ale řada pacientů má těžký průběh nemoci, který vyžaduje hospitalizaci, popřípadě podporu dýchaní. U některých těchto došlo k úmrtí. Podstatným problém je, že k tomu jevu může často dojít bez zachycení příznaků nebo se slabými příznaky (mírná horečka, kašel nebo bolesti svalů). Avšak v pozdějších stádiích onemocnění nebo i dokonce v procesu zotavení může dojít během krátké doby k akutnímu respiračnímu tísňovému syndromu (ARDS) a multiorgánovému selhání což může mít smrtící dopad na pacienta. Za jednu z hlavních příčin tohoto jevu je všeobecně považována cytokinová bouře, která byla nalezena u kritických pacientů s COVID-19 (K. Smetana, Jr., J. Brábek: Role of interleukin-6 in lung complications in patients with COVID-19: Therapeutic implications. In Vivo 34 (2020) 1589-1592; M. Soy, G. Keser, P. Atagunduz, F. Tabak, I. Atagunduz, S. Kayhan: Cytokine storm in COVID-19: pathogenesis and overview of anti-inflammatory agents used in treatment. Clin. Rheumatol. 39 (2020) 2085-2094; Q. Ye, B. Wang, J. Mao: The pathogenesis and treatment of the 'Cytokine Storm' in COVID-19. J. Infect. 80 (2020) 607-613). Na základě toho se lze oprávněně domnívat, že efektivní potlačení cytokinové bouře by velmi podstatně mohlo zmírnit toto závažné onemocnění, čímž účinně zachrání řadu životů a výrazně zmírní další národohospodářské škody při propuknutí další očekávané vlny epidemie.
Z těchto důvodů se intenzivně studují léčiva pro potlačení cytokinové bouře u pacientů s COVID19 (K. Smetana, Jr., D. Rosel, J. Brábek: Raloxifene and bazedoxifene could be promising candidates for preventing the COVID-19 related cytokine storm, ARDS and mortality. In Vivo 34 (2020) 3027-3028; J. Brábek, M. Jakubek, F. Vellieux, J. Novotný,
M. Kolář, L. Lacina, P. Szabo, K. Strnadová, D. Rosel, B. Dvořánková, K. Smetana, Jr.: Interleukin-6: Molecule in the intersection of cancer, ageing and COVID-19. Int. J. Mol. Sci. 21 (2020) 7937; W. Zhang, Y. Zhao, F. Zhang, Q. Wang, T. Li, Z. Liu, J. Wang, Y. Qin, X. Zhang, X. Yan, X. Zeng, S. Zhang: The use of anti-inflammatory drugs in the treatment of people with severe coronavirus disease 2019 (COVID-19): The Perspectives of clinical immunologists from China. Clin. Immunol. 214 (2020) 108393; M. Dalamaga, I. Karampela, C.S. Mantzoros: Commentary: Could iron chelators prove to be useful as an adjunct to COVID-19 Treatment Regimens? Metabolism 108 (2020) 154260; M. Edeas, J. Saleh, C. Peyssonnaux: Iron: Innocent bystander or vicious culprit in COVID-19 pathogenesis? Int. J. Infect. Dis. 97 (2020) 303-305). Mezi testované prostředky patří pegylované a nepegylované interferony, kortikosteroidy, intravenosní imunoglobulin, antagonisté interleukinu 1 a 6, blokátory tumor nekrotizujícího faktoru α, antagonisté interferonu-α/β, ulinastatin, oxidované fosfolipidy a antagonisté receptoru 1 pro sfingosin-1-fosfát. Studie ukazují, že tyto prostředky mohou v určitých fázích onemocnění přispět k zmírnění průběhu onemocnění nicméně jejich účinnost je zatím podstatně nedostačující.
Některé studie naznačují, že se jedná o onemocnění spojené s podstatným zvýšením hladiny železa v krvi (M. Soy, G. Keser, P. Atagunduz, F. Tabak, I. Atagunduz, S. Kayhan: Cytokine storm in COVID-19: pathogenesis and overview of anti-inflammatory agents used in treatment. Clin. Rheumatol. 39 (2020) 2085-2094; Q. Ye, B. Wang, J. Mao: The pathogenesis and treatment of the 'Cytokine Storm' in COVID-19. J. Infect. 80 (2020) 607-613). Daný fakt naznačuje, že slibná terapie by mohla být založena na podání chelátorů pro železnaté a železité ionty přírodního původu, popřípadě na již schválených léčivech s chelatačním účinkem. Je známo, že tyto látky vykazují díky svým chelatačním účinkům, imunomodulační a antivirový efekt, zejména proti RNA virům např. SARS-CoV-2. Široce se předpokládá, že by tyto látky mohly zeslabit ARDS a tlumit průběh onemocní pomocí celé řady mechanismů (inhibice replikace viru, snížení dostupnosti železa, upregulace B buněk, zvýšení titru neutralizačních antivirových protilátek, inhibice endoteliálního zánětu a prevence plicní fibrózy a úbytku plic snížením akumulace železa v plicích).
- 2 CZ 309851 B6
Jednou z vhodných skupin pro vazbu iontů přechodných kovů, zejména železitých a železnatých, jsou thiosemikarbazony. Kombinací tryptanthrinového farmakoforu a thiosemikarbazonové chelatační skupiny vzniknou deriváty, které mají požadované vlastnosti pro potenciální použití jako inhibitorů produkce virových částic SARS-CoV-2. Tyto látky tedy kombinují vhodný strukturní motiv pro cílení SARS-CoV-2 proteázy a zároveň efektivně chelatují železité a železnaté ionty. Využití tryptanthrinových derivátů s thiosemikarbazonovou substitucí pro inhibici SARS-CoV-2 s cílem uplatnění těchto látek v terapii onemocnění COVID-19 je předmětem tohoto patentu.
Podstata vynálezu
Předmětem vynálezu jsou tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí obecného vzorce I,
kde R1-R8 jsou nezávisle H, OH, alkyl s 1 až 6 uhlíkovými atomy, C(CH3)3, allyl, propargyl, benzyl, fenyl, F, Cl, Br, I, CH2OH, O(alkyl), CF3, OCF3, CN, COOH, COO(alkyl), CONH2, CONH(alkyl), NO2, N(alkyl)2, NH(alkyl), NHCO(alkyl), kde alkyl má 1 až 6 uhlíkových atomů, nebo R1-R2 nebo R2-R3 nebo R3-R4 nebo R5-R6 nebo R6-R7 nebo R7-R8 je -CH=CH-CH=CH-, tedy přikondenzované benzenové jádro,
X a Z jsou nezávisle H, alkyl s 1 až 6 uhlíkovými atomy, benzyl, fenyl.
Předmětem vynálezu jsou dále tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí obecného vzorce II,
(Π),
-3CZ 309851 B6 kde R1-R8, X a Z mají výše uvedený význam.
Látky obecného vzorce I a II vykazují vysokou afinitu (reprezentovanou vazebnou energií) pro papainu podobnou SARS-CoV-2 proteázu (PLpro), klíčový enzym pro replikaci viru SARS-CoV2.
Proto je dalším předmětem vynálezu použití těchto látek pro výrobu léčiva k léčbě využívající inhibici produkce virových částic SARS-CoV-2, konkrétně k léčbě koronavirových onemocnění.
Mimo to jsme pozorovali, že tyto látky vykazují výraznou selektivitu pro železité a železnaté ionty. Vedle toho získané hodnoty vazebných konstant prokazují, že jejich afinita je dostatečně vysoká, aby se projevila i v biologickém prostředí a měla výrazný terapeutický impakt. Získané výsledky nemohly být predikovány a musely být získány experimentálně. Syntetické receptory na bázi tryptanthrinových derivátů pro ionty přechodných kovů byly již popsány. Avšak vykazovaly selektivitu a afinitu pro hlinité nebo mědnaté ionty bez významné interakce s železnatými a železitými ionty (J. Kawakami, K. Kikuchi, K. Chiba, N. Matsushima, A. Yamaya, S. Ito, M. Nagaki, H. Kitahara: 2-Aminotryptanthrin derivative with pyrene as a FRET-based fluorescent chemosensor for Al3+. Anal. Sci. 25 (2009) 1385-1386; J. Kawakami, Y. Kinami, M. Takahashi, S. Ito: 2-Hydroxytryptanthrin and 1-Formyl-2-hydroxytryptanthrin as Fluorescent Metal-ion Sensors and Near-infrared Fluorescent Labeling Reagents. Trans. Mat. Res. Soc. Japan 43 (2018) 109-112; Y. Liang, X. Wang, H. Fang, N. Han, C. Wang, Z. Xiao, A. Zhu, J. Liu: A Highly Selective and Sensitive Colorimetric Probe for Cu 2+ Determination in Aqueous Media Based on Derivative of Tryptanthrin. Anal. Sci. 34 (2018) 1111-1115) nebo nespecifickou chelataci řadu iontů přechodných kovů (J. Kawakami, M. Sasagawa, S. Ito: 2-Hydroxy-1-((2-(pyridin-2yl)hydrazono)methyl)tryptanthrin as a Fluorescent Chemosensor for Metal Ions. Trans. Mat. Res. Soc. Japan 43 (2018) 209-212). Rovněž jejich strukturní motiv byl výrazně odlišný a nemá souvislost s předmětem tohoto patentu.
Vedle toho jsme pozorovali, že testované látky, vykazují silnou afinitu a selektivitu pro RNA oproti DNA. Vzhledem k tomu, že SARS-CoV-2 je RNA virus, daný jev zvyšuje jejich terapeutickou účinnost. Interakce tryptanthrinových derivátů s DNA byla již popsána, nicméně se jedná o látky se značně odlišnou strukturou, které nejsou předmětem tohoto patentu. (P. Langer, J.T. Anders, K. Weisz, J. Jahnchen: Efficient Synthesis of 2-Alkylidene-3-iminoindoles, Indolo[1,2-b]isoquinolin-5-ones, δ-Carbolines, and Indirubines by Domino and Sequential Reactions of Functionalized Nitriles. Chem. Eur. J. 9 (2003) 3951-3964; Y.N. Zhong, Y. Zhang, Y.Q. Gu, S.Y. Wu, W.Y. Shen, M.X. Tan: Novel FeII and CoII Complexes of Natural Product Tryptanthrin: Synthesis and Binding with G-Quadruplex DNA. Bioinorg. Chem. Appl. (2016) 5075847; R.J. Terryn 3rd, H.W. German, T.M. Kummerer, R.R. Sinden, J. C. Baum, M. J. Novak: Novel computational study on π-stacking to understand mechanistic interactions of Tryptanthrin analogues with DNA. Toxicol. Mech. Methods 24 (2014) 73-79; G.S. Chen, B.V. Bhagwat, P.Y. Liao, H.T. Chen, S.B. Lin, J.W. Chern: Specific stabilization of DNA triple helices by indolo[2,1- b ]quinazolin-6,12-dione derivatives. Bioorg. Med. Chem. Lett. 17 (2007) 1769-1772; A. Popov, A. Klimovich, O. Styshova, T. Moskovkina, A. Shchekotikhin, N. Grammatikova, L. Dezhenkova, D. Kaluzhny, P. Deriabin, A. Gerasimenko, A. Udovenko, V. Stonik: Design, synthesis and biomedical evaluation of mostotrin, a new water soluble tryptanthrin derivative. Int. J. Mol. Med. 46 (2020) 1335-1346; L.F. Zhao, Y.C. Liu, Q.P. Qin, W.Z. Ya, H.C. Duan: Tryptanthrin Sulfonate: Crystal Structure, Cytotoxicity and DNA Binding Studies. Adv. Mater. Res. 554-556 (2012) 1694-1699; P.P. Bandekar, K.A. Roopnarine, V.J. Parekh, T.R. Mitchell, M.J. Novak, R.R. Sinden: Antimicrobial activity of tryptanthrins in Escherichia coli. J. Med. Chem. 53 (2010) 3558-3565). Mimo to, pro žádnou z nich nebyla popsána jejich interakce s RNA.
Vedle výše uvedeného jsme rovněž in vitro na Vero buněčném modelu pozorovali, že tyto látky jsou potentními inhibitory produkce virové mRNA, a tudíž i virové replikace.
- 4 CZ 309851 B6
Objasnění výkresů
Obrázek 1 znázorňuje strukturu tryptanthrinového derivátu 1 (PAA-TSC).
Obrázek 2 znázorňuje strukturu tryptanthrinového derivátu 5 (T8H-TSC).
Obrázek 3 znázorňuje selektivitu tryptanthrinového derivátu 1 pro Fe2+/Fe3+ ionty pomocí UV/Vis spekter receptoru 1 (PAA-TSC) (100 μM) za přítomnosti a nepřítomnosti iontů kovů (5000 μM) včetně sloupcového vyjádření v absorpčních maximech.
Obrázek 4 znázorňuje selektivitu tryptanthrinového derivátu 5 pro Fe2+/Fe3+ ionty pomocí UV/Vis spekter receptoru 5 (T8H-TSC) (100 μM) za přítomnosti a nepřítomnosti iontů kovů (5000 μM) včetně sloupcového vyjádření v absorpčních maximech.
Obrázek 5 znázorňuje afinitu tryptanthrinového derivátu 1 pro Fe3+ ionty pomocí UV-Vis spektroskopie. Znázorněna je titrace (vlevo) a titrační křivky (vpravo) receptoru 1 (PAA-TSC) s iontem Fe3+. Titrační křivky byly zaznamenány v absorpčních maximech receptoru 1 (PAATSC). V grafu vlevo jsou uváděny hodnoty přidaných ekvivalentů iontu kovu.
Obrázek 6 znázorňuje afinitu tryptanthrinového derivátu 1 pro Fe2+ ionty pomocí titrace (vlevo) a titrační křivky (vpravo) receptoru 1 (PAA-TSC) s iontem Fe2+. Titrační křivky byly zaznamenány v absorpčních maximech receptoru 1 (PAA-TSC). V grafu vlevo jsou uváděny hodnoty přidaných ekvivalentů iontu kovu.
Obrázek 7 znázorňuje afinitu tryptanthrinového derivátu 5 pro Fe3+ ionty pomocí UV-Vis spektroskopie. Znázorněna je titrace (vlevo) a titrační křivky (vpravo) receptoru 5 (T8H-TSC) s iontem Fe3+. Titrační křivky byly zaznamenány v absorpčních maximech receptoru 5 (T8HTSC). V grafu vlevo jsou uváděny hodnoty přidaných ekvivalentů iontu kovu.
Obrázek 8 znázorňuje afinitu tryptanthrinového derivátu 5 pro Fe2+ ionty pomocí UV-Vis spektroskopie. Znázorněna je titrace (vlevo) a titrační křivky (vpravo) receptoru 5 (T8H-TSC) s iontem Fe2+. Titrační křivky byly zaznamenány v absorpčních maximech receptoru 5 (T8HTSC). V grafu vlevo jsou uváděny hodnoty přidaných ekvivalentů iontu kovu.
Obrázek 9 znázorňuje afinitu tryptanthrinového derivátu 1 pro DNA pomocí UV-Vis spektroskopie. Znázorněna je titrace (vlevo) a titrační křivky (vpravo) receptoru 1 (PAA-TSC) s DNA. Titrační křivky byly zaznamenány v absorpčních maximech receptoru 1 (PAA-TSC). V grafu vlevo jsou uváděny hodnoty přidaných ekvivalentů DNA.
Obrázek 10 znázorňuje afinitu tryptanthrinového derivátu 1 pro RNA pomocí UV-Vis spektroskopie. Znázorněna je titrace (vlevo) a titrační křivky (vpravo) receptoru 1 (PAA-TSC) s RNA. Titrační křivky byly zaznamenány v absorpčních maximech receptoru 1 (PAA-TSC). V grafu vlevo jsou uváděny hodnoty přidaných ekvivalentů RNA.
Obrázek 11 znázorňuje afinitu tryptanthrinového derivátu 5 pro DNA pomocí UV-Vis spektroskopie. Znázorněna je titrace (vlevo) a titrační křivky (vpravo) receptoru 5 (T8H-TSC) s DNA. Titrační křivky byly zaznamenány v absorpčních maximech receptoru 5 (T8H-TSC). V grafu vlevo jsou uváděny hodnoty přidaných ekvivalentů DNA.
Obrázek 12 znázorňuje afinitu tryptanthrinového derivátu 5 pro RNA pomocí UV-Vis spektroskopie. Znázorněna je titrace (vlevo) a titrační křivky (vpravo) receptoru 5 (T8H-TSC) s RNA. Titrační křivky byly zaznamenány v absorpčních maximech receptoru 5 (T8H-TSC). V grafu vlevo jsou uváděny hodnoty přidaných ekvivalentů RNA.
- 5 CZ 309851 B6
Obrázek 13 znázorňuje model interakce tryptanthrinového derivátu 1 (PAA-TSC) s PLpro pomocí molekulárního dokování.
Obrázek 14 znázorňuje model interakce tryptanthrinového derivátu 5 (T8H-TSC) s PLpro pomocí molekulárního dokování.
Obrázek 15 znázorňuje inhibici produkce virových částic tryptanthrinovým derivátem 1 (PAATSC). Představuje vliv koncentrace 1 (PAA-TSC) na produkci CoV-2 RNA na Vero in vitro modelu.
Obrázek 16 znázorňuje inhibici produkce virových částic tryptanthrinovým derivátem 5 (T8HTSC). Představuje vliv koncentrace 5 (T8H-TSC) na produkci CoV-2 RNA na Vero in vitro modelu.
Příklady uskutečnění vynálezu
Příprava a vlastnosti tryptanthrinových derivátů s thiosemikarbazonovou substitucí jsou doloženy následujícími příklady, aniž by jimi byly, jakkoliv omezeny.
Příklad 1. Příprava tryptanthrinového derivátu 1 (PAA-TSC), spadající pod obecný vzorec I.
Phaitanthrin A (123 mg; 0,4 mmol) a thiosemikarbazid (146 mg; 1,6 mmol) byly rozpuštěny v methanolu (10 ml) a byla přidána kyselina octová (0,1 ml). Reakční směs byla míchána při 60 °C po dobu 12 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (40 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (20 ml) a usušen. Bylo získáno 120 mg (79 %) látky 1 (PAA-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1 a na obrázku 1. 1H NMR (DMSO-d6): (2 diastereoisomery): 1,80 (1,87) (s, 3H); 3,35 (m, 2H); 5,92 (s, 1H); 6,53 (s, 1H); 7,39 (t, J = 7,7 Hz, 1H); 7,51 (t, J = 7,7 Hz, 1H); 7,63 (m, 2H); 7,80 (d, J = 8,2 Hz, 1H); 7,89 (m, 2H); 8,29 (8,46) (d, J = 8,0 Hz, 1H); 8,41 (d, J = 8,0 Hz, 1H); 9,79 (10,45) s, 1H). 13C NMR (DMSO-d6) (2 diastereoisomery): 17,88; 45,98; 75,83 (76,44); 115,97 (116,26); 121,17 (121,49); 124,34; 126,51 (126,36); 126,69; 127,52 (127,77); 129,67 (130,24); 134,11 (132,89); 134,92 (134,84); 138,44 (138,30); 146,95 (146,77); 150,52 (148,67); 158,74 (158,90); 160,71 (160,09); 178,22 (178,44).
Příklad 2. Příprava tryptanthrinového derivátu 2 (PAA8Cl-TSC), spadající pod obecný vzorec I.
8-Chlor-phaitanthrin A (136 mg; 0,4 mmol) a thiosemikarbazid (146 mg; 1,6 mmol) byly rozpuštěny v methanolu (10 ml) a byla přidána kyselina octová (0,1 ml). Reakční směs byla míchána při 60 °C po dobu 12 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (40 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (20 ml) a usušen. Bylo získáno 149 mg (90 %) látky 2 (PAA8Cl-TSC). Struktura derivátu je uvedena v Tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 1,90 (m, 3H); 3,35 (m, 2H); 5,88 (s, 1H); 7,60 (m, 1H); 7,90 (m, 2H); 8,01 (m, 2H); 8,20 (m, 1H); 8,53 (m, 1H); 8,99 (s, 1H).
Příklad 3. Příprava tryptanthrinového derivátu 3 (PAA2Cl-TSC), spadající pod obecný vzorec I.
2-Chlor-phaitanthrin A (136 mg; 0,4 mmol) a thiosemikarbazid (146 mg; 1,6 mmol) byly rozpuštěny v methanolu (10 ml) a byla přidána kyselina octová (0,1 ml). Reakční směs byla míchána při 60 °C po dobu 12 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (40 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (20 ml) a usušen. Bylo získáno 124 mg (75 %) látky 3 (PAA2Cl-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 1,88 (m, 3H); 3,30 (m, 2H); 6,01 (s, 1H); 7,51 (m, 1H); 7,94 (m, 2H); 8,01 (m, 2H); 8,26 (m, 1H); 8,50 (m, 1H).
- 6 CZ 309851 B6
Příklad 4. Příprava tryptanthrinového derivátu 4 (PAA-Me2TSC), spadající pod obecný vzorec I.
Phaitanthrin A (123 mg; 0,4 mmol) a 4,4-dimethyl-3-thiosemikarbazid (190 mg; 1,6 mmol) byly rozpuštěny v methanolu (9 ml) a byla přidána kyselina octová (1 ml). Reakční směs byla míchána při 60 °C po dobu 12 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (40 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (20 ml) a usušen. Bylo získáno 143 mg (88 %) látky 4 (PAA-Me2TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 1,84 (s, 3H); 3,35 (m, 5H); 3,50 (s, 3H); 5,90 (s, 1H); 6,54 (s, 1H); 7,42 (m, 1H); 7,50 (m, 1H); 7,63 (m, 2H); 7,80 (d, J = 8,1 Hz, 1H); 7,91 (m, 2H); 8,35 (m, 1H).
Příklad 5. Příprava tryptanthrinového derivátu 5 (T8H-TSC), spadající pod obecný vzorec II.
Tryptanthrin (87 mg; 0,35 mmol) a thiosemikarbazid (91 mg; 1 mmol) byly smíšeny v ethanolu (15 ml) a byla přidána kyselina octová (0,15 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 48 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 106 mg (94 %) látky 5 (T8H-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1 a na obrázku 2. 1H NMR (DMSO-d6): 7,46 (t, J = 7,6 Hz, 1H); 7,60 (t, J = 7,8 Hz, 1H); 7,69 (t, J = 7,6 Hz, 1H); 7,78 (d, J = 8,1 Hz, 1H); 7,96 (d, J= 7,8 Hz, 1H); 8,04 (d, J = 7,6 Hz, 1H); 8,32 (d, J = 7,9 Hz, 1H); 8,39 (d, J = 8,1 Hz, 1H); 8,85 (s, 1H); 9,15 (s, 1H); 13,00 (s, 1H). 13C NMR (DMSO-d6): 116,34; 121,15; 121,68; 123,14; 126,47; 126,82; 127,75; 128,66; 130,85; 131,06; 135,10; 139,39; 145,77; 157,78; 178,76.
Příklad 6. Příprava tryptanthrinového derivátu 6 (T8OMe-TSC), spadající pod obecný vzorec II.
8-Methoxy-tryptanthrin (97 mg; 0,35 mmol) a thiosemikarbazid (91 mg; 1 mmol) byly smíšeny v ethanolu (15 ml) a byla přidána kyselina octová (0,15 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 12 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 113 mg (92 %) látky 6 (T8OMe-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 3,86 (s, 3H); 7,14 (d, J = 8,6 Hz, 1H); 7,69 (m, 2H); 7,78 (d, J = 8,0 Hz, 1H); 7,94 (t, J = 7,4 Hz, 1H); 8,27 (d, J = 8,8 Hz, 1H); 8,31 (d, J = 7,8 Hz, 1H); 8,91 (s, 1H); 9,19 (s, 1H); 12,90 (s, 1H).
Příklad 7. Příprava tryptanthrinového derivátu 7 (T8OTFM-TSC), spadající pod obecný vzorec II.
8-Trifluormethoxy-tryptanthrin (116 mg; 0,35 mmol) a thiosemikarbazid (91 mg; 1 mmol) byly smíšeny v ethanolu (15 ml) a byla přidána kyselina octová (0,15 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 48 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 131 mg (92 %) látky 7 (T8OTFM-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 7,62 (m, 1H); 7,72 (d, J = 7,5 Hz, 1H); 7,82 (d, J = 8,0 Hz, 1H); 7,98 (m, 1H); 8,11 (s, 1H); 8,34 (t, J = 8,4 Hz, 1H); 8,48 (d, J = 8,8 Hz, 1H); 9,12 (s, 1H); 9,26 (s, 1H); 12,85 (s, 1H).
Příklad 8. Příprava tryptanthrinového derivátu 8 (T8F-TSC), spadající pod obecný vzorec II.
8-Fluor-tryptanthrin (93 mg; 0,35 mmol) a thiosemikarbazid (91 mg; 1 mmol) byly smíšeny v ethanolu (15 ml) a byla přidána kyselina octová (0,15 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 24 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 105 mg (89 %) látky 8 (T8F-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 7,45 (m, 1H); 7,71 (t, J = 7,5 Hz, 1H); 7,80 (m, 1H); 7,90 (m, 1H); 7,95 (m, 1H); 8,33 (m, 1H); 8,40 (m, 1H); 8,95 (s, 1H); 9,22 (s, 1H); 12,85 (s, 1H).
Příklad 9. Příprava tryptanthrinového derivátu 9 (T8Cl-TSC), spadající pod obecný vzorec II.
- 7 CZ 309851 B6
8-Chlor-tryptanthrin (99 mg; 0,35 mmol) a thiosemikarbazid (91 mg; 1 mmol) byly smíšeny v ethanolu (15 ml) a byla přidána kyselina octová (0,15 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 48 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 107 mg (86 %) látky 9 (T8Cl-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 7,68 (m, 2H); 7,80 (m, 1H); 7,96 (m, 1H); 8,16 (s, 1H); 8,35 (m, 2H); 8,99 (s, 1H); 9,37 (s, 1H); 12,82 (s, 1H).
Příklad 10. Příprava tryptanthrinového derivátu 10 (T8Br-TSC), spadající pod obecný vzorec II.
8-Brom-tryptanthrin (115 mg; 0,35 mmol) a thiosemikarbazid (91 mg; 1 mmol) byly smíšeny v ethanolu (15 ml) a byla přidána kyselina octová (0,15 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 48 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 120 mg (86 %) látky 10 (T8Br-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 7,71 (t, J = 7,5 Hz, 1H); 7,78 (m, 2H); 7,96 (t, J = 7,6 Hz, 1H); 8,32 (m, 3H); 9,00 (s, 1H); 9,34 (s, 1H); 12,81 (s, 1H)
Příklad 11. Příprava tryptanthrinového derivátu 11 (T2Cl-TSC), spadající pod obecný vzorec II.
2-Chlor-tryptanthrin (99 mg; 0,35 mmol) a thiosemikarbazid (91 mg; 1 mmol) byly smíšeny v ethanolu (15 ml) a byla přidána kyselina octová (0,15 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 12 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 109 mg (87 %) látky 11 (T2Cl-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 7,50 (m, 1H); 7,90 (m, 2H); 8,04 (m, 2H); 8,29 (m, 1H); 8,48 (m, 1H); 8,98 (s, 1H); 9,83 (s, 1H); 12,01 (s, 1H).
Příklad 12. Příprava tryptanthrinového derivátu 12 (NT8H-TSC), spadající pod obecný vzorec II.
Naftotryptanthrin (benzo[g ]indolo[2,1- b ]chinazolin-6,14-dion; 104 mg; 0,35 mmol) a thiosemikarbazid (91 mg; 1 mmol) byly smíšeny v ethanolu (12 ml) a byla přidána kyselina octová (3 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 48 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 109 mg (84 %) látky 12 (NT8H-TSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-de): 7,50 (m, 1H); 7,76 (m, 1H); 7,92 (m, 4H); 8,30 (m, 1H); 8,49 (m, 1H); 8,95 (s, 1H); 9,79 (s, 1H); 11,89 (s, 1H).
Příklad 13. Příprava tryptanthrinového derivátu 13 (T8H-PhTSC), spadající pod obecný vzorec II.
Tryptanthrin (87 mg; 0,35 mmol) a 4-fenyl-3-thiosemikarbazid (167 mg; 1 mmol) byly smíšeny v ethanolu (7 ml) a kyselině octové (7 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 48 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 120 mg (86 %) látky 13 (T8H-PhTSC). Struktura derivátu je uvedena v tabulce 1. 1H NMR (DMSO-d6): 7,48 (t, J = 7,8 Hz, 1H); 7,70 (m, 4H); 7,82 (m, 2H); 8,01 (m, 4H); 8,35 (d, J = 7,8 Hz, 1H); 8,42 (m, 1H); 9,95 (s, 1H); 12,88 (s, 1H).
Příklad 14. Příprava tryptanthrinového derivátu 14 (T8H-Me2TSC), spadající pod obecný vzorec II.
Tryptanthrin (123 mg; 0,35 mmol) a 4,4-dimethyl-3-thiosemikarbazid (119 mg; 1 mmol) byly smíšeny v kyselině octové (7 ml). Reakční směs byla míchána při 75 °C po dobu 12 h. Po vychladnutí byla reakční směs naředěna vodou (150 ml), pevný produkt byl odfiltrován na fritě, promyt vodou (100 ml) a usušen. Bylo získáno 98 mg (90 %) látky 14 (T8H-Me2TSC). Struktura
- 8 CZ 309851 B6 derivátu je uvedena v tabulce 1. 'H NMR (DMSO-r/e): 3,31 (s, 3H); 3,55 (s, 3H); 7,49 (t, J = 7,5 Hz, 1H); 7,64 (t, J= 7,8 Hz, 1H); 7,72 (t, J= 7,5 Hz, 1H); 7,84 (d, J= 8,1 Hz, 1H); 7,88 (d, J = 7,6 Hz, 1H); 7,96 (m, 1H); 8,36 (d, J= 7,9 Hz, 1H); 8,46 (d, J = 8,0 Hz, 1H).
Tabulka 1. Struktury tryptanthrinových derivátů uvedených v Příkladech 1 až 14
| Derivát (obecný vzorec I) | R8 ,R7 R1 ° R4 [ -^N ,N„ X Z |
| 1 (PAA-TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R6 = R7 = R8 = Η; X = Z = H |
| 2 (PAA8C1-TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R7 = R8 = H, R6 = Cl; X = Z = H |
| 3 (PAA2C1-TSC) | RI = R3 = R4 = R5 = R6 = R7 = R8 = H, R2 = Cl; X = Z = H |
| 4 (PAA-Me2TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R6 = R7 = R8 = Η; X = Z = CH3 |
| Derivát (obecný vzorec II) | R8 .R7 R1 O X—/ w R4 N hn X II s z |
| 5 (T8H-TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R6 = R7 = R8 = Η; X = Z = H |
| 6 (T8OMe-TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R7 = R8 = H, R6 = OCH3; X = Z = H |
| 7 (T8HOTFM-TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R7 = R8 = H, R6 = OCF3; X = Z = H |
| 8 (T8F-TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R7 = R8 = H, R6 = F; X = Z = H |
| 9 (T8C1-TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R7 = R8 = H, R6 = Cl; X = Z = H |
| 10 (T8Br-TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R7 = R8 = H, R6 = Br; X = Z = H |
| 11 (T2C1-TSC) | RI = R3 = R4 = R5 = R6 = R7 = R8 = H, R2 = Cl; X = Z = H |
| 12 (NT8H-TSC) | RI = R4 = R5 = R6 = R7 = R8 = H, R2-R3 = CH=CH-CH=CH; X = Z = H |
| 13 (T8H-PhTSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R6 = R7 = R8 = Η; X = H, Z = Ph |
| 14 (T8H-Me2TSC) | RI = R2 = R3 = R4 = R5 = R6 = R7 = R8 = Η; X = Z = CH3 |
Příklad 14. Interakce tryptanthrinových derivátů s ionty přechodných kovů
Nejdříve byla studována interakce tryptanthrinových derivátů 1 a 5 s ionty kovů pomocí UV/Vis spektroskopie. Koncentrace receptorů byla 100 μΜ a koncentrace iontů 5000 pM. Po přídavku kovových iontů byly pozorovány významné změny absorbance pouze v případě železnatých a železitých iontů. Absorbance tryptanthrinových derivátů 1 a 5 bez a v přítomnosti iontů kovů je znázorněna na obrázku 3 a 4.
Příklad 15. Stanovení vazebné konstanty tryptanthrinových derivátů s pro Fe2+ a Fe3+ ionty
Asociace tryptanthrinových derivátů s železnatými a železitými ionty byla studována pomocí UV/Vis spektroskopie ve vodném roztoku (voda/DMSO, 99:1, v/v). Protože rozpouštědlo 20 významně ovlivňuje vazebné konstanty, všechny titrace byly prováděny ve stejném prostředí a poměr DMSO k vodě byl udržován konstantní. Asociační konstanty (K) byly vypočteny ze změn absorbance (AA) ve spektrálním maximu derivátu a ve spektrálním maximu jeho komplexů s
-9CZ 309851 B6 ionty Fe2+/3+ regresní analýzou. Koncentrace tryptanthrinových derivátů byla 100 μΜ. Koncentrace iontů Fe2+, Fe3+ kolísala v rozmezí 0 až 5 mM. UV/Vis spektra byla měřena spektrofotometrem Shimadzu v rozmezí 220 až 900 nm s krokem 1 nm v 1cm plastové kyvetě rychlostí skenování 300 nm^min1. Vliv různých koncentrací Fe iontů na absorbanci látky 1 5 (PAA-TSC) je znázorněn na obrázcích 5 a 6, pro látku 5 (T8H-TSC) na obrázcích 7 a 8.
Vypočtené asociační konstanty a stechiometrie komplexů jsou ukázány v tabulce 2.
Tabulka 2. Vypočtené hodnoty asociačních konstant K, stechiometrie uvedených komplexů.
| Tryptanthrinový derivát | Iont | Log (K | Stechiometrie (iont:ligand) |
| PAA-TSC (1) | Fe2+ | 1,5 13,7 | 1:1 1:2 |
| Fe3+ | 6,0 10,2 | 1:1 1:2 | |
| T8H-TSC (5) | Fe2+ | 4,9 7,1 | 1:1 2:1 |
| Fe3+ | 12,2 17,4 | 1:1 2:1 |
Příklad 16. Studium interakce tryptanthrinových derivátů s DNA a RNA.
Interakce mezi receptory a DNA/RNA byla studována pomocí UV/Vis spektrometrie. Ze zásobních roztoků receptorů 1 nebo 5 bylo odebráno požadované množství a zředěno ve 15 fosfátovém pufru (pH pufru bylo upraveno na pH = 7,00) na koncentraci 10-4M. Roztok DNA z lososího spermatu byl připraven ze 75 mg této DNA a 15 ml fosfátového pufru. Roztok RNA byl připraven rozpuštěním 35 mg RNA v 15 ml fosfátového pufru. Data byla sbírána spektrofotometrem Shimadzu v rozmezí 200 až 800 nm s přesností 1 nm v 1cm plastové kyvetě. Poté byly regresní analýzou pomocí softwaru Letagrop Sptfo 2005 vypočteny asociační 20 konstanty (K) ze změn absorbance (ΔΑ). Vliv různých koncentrací DNA/RNA na absorbanci 1 (PAA-TSC) je znázorněn na obrázcích 9 a 10. Vliv různých koncentrací DNA/RNA na absorbanci 5 (T8H-TSC) je znázorněn na obrázcích 11 a 12. Vypočtené asociační konstanty a stechiometrie vzniklých komplexů jsou ukázány v tabulce 3.
Tabulka 3. Vypočtené hodnoty asociačních konstant K včetně určení stechiometrie uvedených komplexů.
| Tryptanthrinový derivát | NK | Log (K | Stechiometrie (NK:ligand) |
| PAA-TSC (1) | DNA | 7,4 | 1:1 |
| RNA | 16,5 8,7 | 1:1 2:1 | |
| T8H-TSC (5) | DNA | 6,0 | 1:2 |
| RNA | 7,3 | 1:2 |
Příklad 17. Studium interakce s PLpro s tryptanthrinovými deriváty pomocí výpočetních metod 30
Dokování tryptanthrinových derivátů k modelu PLpro. Trojrozměrná struktura PLpro byla získána z databáze banky proteinových dat s PDB ID. 3D strukturní modely tryptanthrinových derivátů byly sestaveny pomocí MolView (https://molview.org). Následně byly odpovídající mol soubory obsahující 3D souřadnice převedeny do formátu .pdb pomocí Open Babel. Pro další přípravu 35 souřadnicových souborů a pro dokování byl použit software ze sady AutoDock Vina. Pro dokování tryptanthrinových derivátů k molekule PLpro byl použit podobný přístup vycházející z
- 10 CZ 309851 B6 krystalové struktury lidského PLpro. Pro výpočty byla použita ortorombická krabice o velikosti 52 x 58 x 50 A3 zahrnující molekulu PLpro.
Hodnoty afinit a vazebných energií získané dokováním tryptanthrinových derivátů jsou shrnuty v tabulce 4. Obrázky 13 a 14 ukazují vizualizaci interakce tryptanthrinových derivátů 1 a 5 s PLpro.
Tabulka 4. Vazebné energie tryptanthrinových derivátů 1 a 5 pro PLpro
| Vazebná energie(kca/mol) | Inhibiční konstanta | |
| PAA-TSC (1) | -5,34 | 121,07 |
| T8H-TSC (5) | -6,57 | 15,37 |
Příklad 18. Antivirové účinky tryptanthrinových derivátů 1 (PAA-TSC) a 5 (T8H-TSC)
Dané buňky (Vero buněčná linie z ledviny africké zelené opice; 1,5 x 105 buněk na jamku) byly infikovány izolátem SARS-CoV-2 poskytnutých sekcí biologické ochrany Techonin. Infekční inokulum obsahovalo 2,38 x 107 kopií E-genu SARS-CoV-2. Po 1 hodinové inokulaci byly buňky doplněny 1 ml Dulbeccoova modifikovaného Eaglova média obsahujícího 2% fetálního bovinního séra (2% FBS-DMEM) a rostoucí koncentrace (0 až 10 μM) tryptanthrinových derivátů 1 (PAA-TSC) a 5 (T8H-TSC). Po 24 a 48 hodinách inkubace byl růst SARS-CoV-2 charakterizován v alikvotu supernatantu kultury jednostupňovým RT-qPCR.
Virová RNA byla izolována z 200 μl kultivačního supernatantu pomocí magnetických kuliček. RNA SARS-CoV-2 byla kvantifikována amplifikací E-gen SARS-CoV-2 (Generi Biotech) pomocí soupravy SensiFast Probe One-Step Kit (BioLine) a Light Cycler 480 II (Roche) za použití absolutní kvantifikace a kalibrační křivky. Primery a použité próby jsou uvedeny v tabulce 5. Vliv tryptanthrinových derivátů 1 (PAA-TSC) a 5 (T8H-TSC) na produkci virové RNA je ukázán na obrázcích 15 a 16.
Tabulka 5. Primery a použité próby:
| Jméno | Sekvence 5'-3' | Koncentrace v reakci |
| E Sarbeco F1 | ACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT | 400 nM |
| E Sarbeco R2 | ATATTGCAGCAGTACGCACACA | 400 nM |
| E Sarbeco P1 | FAM-ACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCG-BHQ1 | 200 nM |
Průmyslová využitelnost
Vynález se týká tryptanthrinových derivátů s thiosemikarbazonovou substitucí obecného vzorce I a II. Dané látky jsou použitelné pro přípravu léčiva pro potlačení koronavirových infekcí, zejména infekce SARS-CoV-2.
Claims (2)
1. Tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí obecného vzorce I a II,
(I),
(II), kde R1-R8 jsou nezávisle H, OH, alkyl s 1 až 6 uhlíkovými atomy, C(CH3)3, allyl, propargyl, benzyl, fenyl, F, Cl, Br, I, CH2OH, O(alkyl), CF3, OCF3, CN, COOH, COO(alkyl), CONH2, CONH(alkyl), NO2, N(alkyl)2, NH(alkyl), NHCO(alkyl), kde alkyl má 1 až 6 uhlíkových atomů, nebo R1-R2 nebo R2-R3 nebo R3-R4 nebo R5-R6 nebo R6-R7 nebo R7-R8 je -CH=CH-CH=CH-, tedy přikondenzované benzenové jádro,
X a Z jsou nezávisle H, alkyl s 1 až 6 uhlíkovými atomy, benzyl nebo fenyl.
2. Použití tryptanthrinových derivátů s thiosemikarbazonovou substitucí obecného vzorce I a II podle nároku 1 pro výrobu léčiva k léčbě koronavirových onemocnění.
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CZ2022-82A CZ309851B6 (cs) | 2022-02-22 | 2022-02-22 | Tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí a jejich použití |
| PCT/CZ2023/050007 WO2023160736A1 (en) | 2022-02-22 | 2023-02-20 | Tryptanthrin derivatives with thiosemicarbazone substitution and use thereof |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CZ2022-82A CZ309851B6 (cs) | 2022-02-22 | 2022-02-22 | Tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí a jejich použití |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ202282A3 CZ202282A3 (cs) | 2023-08-30 |
| CZ309851B6 true CZ309851B6 (cs) | 2023-12-13 |
Family
ID=85415157
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CZ2022-82A CZ309851B6 (cs) | 2022-02-22 | 2022-02-22 | Tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí a jejich použití |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| CZ (1) | CZ309851B6 (cs) |
| WO (1) | WO2023160736A1 (cs) |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ES2391770T3 (es) * | 2003-01-21 | 2012-11-29 | Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. | Uso de compuestos de triptantrina para la potenciación inmune |
| AU2017247282B2 (en) * | 2016-04-05 | 2019-05-02 | Peking University | Nitrogen heterocyclic tryptamine ketone derivative and application as IDO1 and/or TDO inhibitor |
-
2022
- 2022-02-22 CZ CZ2022-82A patent/CZ309851B6/cs unknown
-
2023
- 2023-02-20 WO PCT/CZ2023/050007 patent/WO2023160736A1/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CZ202282A3 (cs) | 2023-08-30 |
| WO2023160736A1 (en) | 2023-08-31 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Keshavarz et al. | Metabolic host response and therapeutic approaches to influenza infection | |
| Nagle et al. | Discovery and characterization of clinical candidate LXE408 as a kinetoplastid-selective proteasome inhibitor for the treatment of leishmaniases | |
| Eissa et al. | Discovery and antiproliferative evaluation of new quinoxalines as potential DNA intercalators and topoisomerase II inhibitors | |
| CN114191553B (zh) | 抗新型冠状病毒SARS-CoV-2的药物及其应用 | |
| Espíndola et al. | Synthesis and structure–activity relationship study of a new series of antiparasitic aryloxyl thiosemicarbazones inhibiting Trypanosoma Cruzi Cruzain | |
| Mentese et al. | Microwave assisted synthesis of some hybrid molecules derived from norfloxacin and investigation of their biological activities | |
| US8518968B2 (en) | Hydrazone and diacyl hydrazine compounds and methods of use | |
| US20090076122A1 (en) | PARP Modulators and Treatment of Cancer | |
| US20110065690A1 (en) | Compositions and methods for treatment of leukemia | |
| Abdellattif et al. | New approaches of 4-aryl-2-hydrazinothiazole derivatives synthesis, molecular docking, and biological evaluations | |
| Nural et al. | New bis-and tetrakis-1, 2, 3-triazole derivatives: Synthesis, DNA cleavage, molecular docking, antimicrobial, antioxidant activity and acid dissociation constants | |
| Tseng et al. | Furo [3′, 2′: 3, 4] naphtho [1, 2-d] imidazole derivatives as potential inhibitors of inflammatory factors in sepsis | |
| Tian et al. | Synthesis and antiviral evaluation of new N‐acylhydrazones containing glycine residue | |
| Wang et al. | Resveratrol inhibits MRGPRX2-mediated mast cell activation via Nrf2 pathway | |
| CA3182306A1 (en) | Methods and compositions for the treatment of sars-cov-2 | |
| CN113679726A (zh) | 丹参提取物和醌类化合物在抗冠状病毒中的应用 | |
| WO2021007283A1 (en) | Potentiation of antiviral nucleobases as rna virus therapy | |
| Chernyshev | Pharmaceutical targeting the envelope protein of SARS-CoV-2: the screening for inhibitors in approved drugs | |
| CZ309851B6 (cs) | Tryptanthrinové deriváty s thiosemikarbazonovou substitucí a jejich použití | |
| Sima et al. | Anti-inflammatory effects of theaflavin-3′-gallate during influenza virus infection through regulating the TLR4/MAPK/p38 pathway | |
| WO2015106272A1 (en) | Small molecule inhibitors of apobec3g and apobec3b | |
| Tang et al. | Synthesis and biological evaluation of 12-benzyl matrinic amide derivatives as a novel family of anti-HCV agents | |
| US20190134008A1 (en) | Applications of novel thiazole derivative in treating virus infection | |
| WO2012073041A2 (en) | Compounds | |
| US20210205275A1 (en) | Neuroprotective compositions and methods of using the same |