CZ20013638A3 - Peptid nebo směs peptidů a jejich pouľití, monospecifická protilátka a diagnostická sada - Google Patents
Peptid nebo směs peptidů a jejich pouľití, monospecifická protilátka a diagnostická sada Download PDFInfo
- Publication number
- CZ20013638A3 CZ20013638A3 CZ20013638A CZ20013638A CZ20013638A3 CZ 20013638 A3 CZ20013638 A3 CZ 20013638A3 CZ 20013638 A CZ20013638 A CZ 20013638A CZ 20013638 A CZ20013638 A CZ 20013638A CZ 20013638 A3 CZ20013638 A3 CZ 20013638A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- thr
- peptide
- seq
- leu
- gly
- Prior art date
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 97
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 18
- 241000960387 Torque teno virus Species 0.000 claims abstract description 65
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 38
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 claims abstract description 10
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 9
- 230000003053 immunization Effects 0.000 claims abstract description 7
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 claims abstract description 3
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 13
- COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N Thr-Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N 0.000 claims description 5
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 4
- AVEGDIAXTDVBJS-XUXIUFHCSA-N Leu-Ile-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AVEGDIAXTDVBJS-XUXIUFHCSA-N 0.000 claims description 4
- CAJFZCICSVBOJK-SHGPDSBTSA-N Thr-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O CAJFZCICSVBOJK-SHGPDSBTSA-N 0.000 claims description 4
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 claims description 4
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 claims description 4
- JJGRJMKUOYXZRA-LPEHRKFASA-N Asn-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)C(=O)O JJGRJMKUOYXZRA-LPEHRKFASA-N 0.000 claims description 3
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 claims description 3
- AFXCXDQNRXTSBD-FJXKBIBVSA-N Pro-Gly-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O AFXCXDQNRXTSBD-FJXKBIBVSA-N 0.000 claims description 3
- OHYQKYUTLIPFOX-ZPFDUUQYSA-N Arg-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O OHYQKYUTLIPFOX-ZPFDUUQYSA-N 0.000 claims description 2
- KMCRKVOLRCOMBG-DJFWLOJKSA-N Asn-Ile-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N KMCRKVOLRCOMBG-DJFWLOJKSA-N 0.000 claims description 2
- GWCRIHNSVMOBEQ-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GWCRIHNSVMOBEQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 claims description 2
- HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N 0.000 claims description 2
- AFWYPMDMDYCKMD-KBPBESRZSA-N Gly-Leu-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 AFWYPMDMDYCKMD-KBPBESRZSA-N 0.000 claims description 2
- FFJQAEYLAQMGDL-MGHWNKPDSA-N Ile-Lys-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FFJQAEYLAQMGDL-MGHWNKPDSA-N 0.000 claims description 2
- ORWTWZXGDBYVCP-BJDJZHNGSA-N Leu-Ile-Cys Chemical compound SC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C ORWTWZXGDBYVCP-BJDJZHNGSA-N 0.000 claims description 2
- IAJFFZORSWOZPQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IAJFFZORSWOZPQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 2
- LMDVGHQPPPLYAR-IHRRRGAJSA-N Leu-Val-His Chemical compound N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)O LMDVGHQPPPLYAR-IHRRRGAJSA-N 0.000 claims description 2
- VEGLGAOVLFODGC-GUBZILKMSA-N Lys-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VEGLGAOVLFODGC-GUBZILKMSA-N 0.000 claims description 2
- SLQJJFAVWSZLBL-BJDJZHNGSA-N Lys-Ile-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN SLQJJFAVWSZLBL-BJDJZHNGSA-N 0.000 claims description 2
- KYNNSEJZFVCDIV-ZPFDUUQYSA-N Lys-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KYNNSEJZFVCDIV-ZPFDUUQYSA-N 0.000 claims description 2
- DCHHUGLTVLJYKA-FXQIFTODSA-N Met-Asn-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DCHHUGLTVLJYKA-FXQIFTODSA-N 0.000 claims description 2
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- FKZSXTKZLPPHQU-GQGQLFGLSA-N Ser-Ile-Trp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N FKZSXTKZLPPHQU-GQGQLFGLSA-N 0.000 claims description 2
- SIEZEMFJLYRUMK-YTWAJWBKSA-N Thr-Met-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O SIEZEMFJLYRUMK-YTWAJWBKSA-N 0.000 claims description 2
- KSVMDJJCYKIXTK-IGNZVWTISA-N Tyr-Ala-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 KSVMDJJCYKIXTK-IGNZVWTISA-N 0.000 claims description 2
- LRHBBGDMBLFYGL-FHWLQOOXSA-N Tyr-Phe-Glu Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 LRHBBGDMBLFYGL-FHWLQOOXSA-N 0.000 claims description 2
- UUBKSZNKJUJQEJ-JRQIVUDYSA-N Tyr-Thr-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N)O UUBKSZNKJUJQEJ-JRQIVUDYSA-N 0.000 claims description 2
- 108010009111 arginyl-glycyl-glutamic acid Proteins 0.000 claims description 2
- 108010050475 glycyl-leucyl-tyrosine Proteins 0.000 claims description 2
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 claims description 2
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 claims 2
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N Ala-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims 1
- VGPWRRFOPXVGOH-BYPYZUCNSA-N Ala-Gly-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VGPWRRFOPXVGOH-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims 1
- VUGWHBXPMAHEGZ-SRVKXCTJSA-N Arg-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N VUGWHBXPMAHEGZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims 1
- SZNGQSBRHFMZLT-IHRRRGAJSA-N Asn-Pro-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SZNGQSBRHFMZLT-IHRRRGAJSA-N 0.000 claims 1
- WSWYMRLTJVKRCE-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ala-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WSWYMRLTJVKRCE-ZLUOBGJFSA-N 0.000 claims 1
- KHBLRHKVXICFMY-GUBZILKMSA-N Asp-Glu-Lys Chemical compound N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O KHBLRHKVXICFMY-GUBZILKMSA-N 0.000 claims 1
- GWWSUMLEWKQHLR-NUMRIWBASA-N Asp-Thr-Glu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O GWWSUMLEWKQHLR-NUMRIWBASA-N 0.000 claims 1
- DSPQRJXOIXHOHK-WDSKDSINSA-N Glu-Asp-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O DSPQRJXOIXHOHK-WDSKDSINSA-N 0.000 claims 1
- XTQFHTHIAKKCTM-YFKPBYRVSA-N Gly-Glu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O XTQFHTHIAKKCTM-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims 1
- FKESCSGWBPUTPN-FOHZUACHSA-N Gly-Thr-Asn Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O FKESCSGWBPUTPN-FOHZUACHSA-N 0.000 claims 1
- FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N His-Gly-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CN=CN1 FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N 0.000 claims 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N Leu-Thr-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N 0.000 claims 1
- AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N Lys-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N 0.000 claims 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N N-formyl-L-phenylalanine Chemical compound O=CN[C@H](C(=O)O)CC1=CC=CC=C1 NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N 0.000 claims 1
- NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N Phe-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N 0.000 claims 1
- WHNJMTHJGCEKGA-ULQDDVLXSA-N Pro-Phe-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WHNJMTHJGCEKGA-ULQDDVLXSA-N 0.000 claims 1
- FCRMLGJMPXCAHD-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O FCRMLGJMPXCAHD-FXQIFTODSA-N 0.000 claims 1
- VXMHQKHDKCATDV-VEVYYDQMSA-N Thr-Asp-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O VXMHQKHDKCATDV-VEVYYDQMSA-N 0.000 claims 1
- NOXKHHXSHQFSGJ-FQPOAREZSA-N Tyr-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NOXKHHXSHQFSGJ-FQPOAREZSA-N 0.000 claims 1
- 108010076324 alanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 claims 1
- 108010042598 glutamyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 claims 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 claims 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 claims 1
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 claims 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 abstract description 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 abstract 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 18
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 17
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 14
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 13
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 13
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 12
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 8
- 101710159752 Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase subunit PhaE Proteins 0.000 description 5
- 101710130262 Probable Vpr-like protein Proteins 0.000 description 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 5
- 208000019423 liver disease Diseases 0.000 description 5
- 102000003929 Transaminases Human genes 0.000 description 4
- 108090000340 Transaminases Proteins 0.000 description 4
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 4
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 4
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 4
- 230000002550 fecal effect Effects 0.000 description 4
- 238000000034 method Methods 0.000 description 4
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 3
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 3
- 210000004180 plasmocyte Anatomy 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 2
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 2
- 108010029539 arginyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 2
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 239000013024 dilution buffer Substances 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000005414 inactive ingredient Substances 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- LOLNFJHUEIDGNH-PIXDULNESA-N 1-[(2r,4s,5r)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-[(e)-2-iodoethenyl]pyrimidine-2,4-dione Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(\C=C\I)=C1 LOLNFJHUEIDGNH-PIXDULNESA-N 0.000 description 1
- QWTLUPDHBKBULE-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[(2-aminoacetyl)amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetic acid Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O QWTLUPDHBKBULE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- -1 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) Chemical class 0.000 description 1
- CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N Ala-Gly Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- AUFHLLPVPSMEOG-YUMQZZPRSA-N Arg-Gly-Glu Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AUFHLLPVPSMEOG-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- 101000666833 Autographa californica nuclear polyhedrosis virus Uncharacterized 20.8 kDa protein in FGF-VUBI intergenic region Proteins 0.000 description 1
- 101000977027 Azospirillum brasilense Uncharacterized protein in nodG 5'region Proteins 0.000 description 1
- 101000962005 Bacillus thuringiensis Uncharacterized 23.6 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 101000785191 Drosophila melanogaster Uncharacterized 50 kDa protein in type I retrotransposable element R1DM Proteins 0.000 description 1
- 101000747704 Enterobacteria phage N4 Uncharacterized protein Gp1 Proteins 0.000 description 1
- 101000861206 Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) Uncharacterized protein EF_A0048 Proteins 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 101000769180 Escherichia coli Uncharacterized 11.1 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 241000711549 Hepacivirus C Species 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 101000976301 Leptospira interrogans Uncharacterized 35 kDa protein in sph 3'region Proteins 0.000 description 1
- SBANPBVRHYIMRR-GARJFASQSA-N Leu-Ser-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N SBANPBVRHYIMRR-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N Leu-Ser-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700018351 Major Histocompatibility Complex Proteins 0.000 description 1
- PKVZBNCYEICAQP-UHFFFAOYSA-N Mecamylamine hydrochloride Chemical compound Cl.C1CC2C(C)(C)C(NC)(C)C1C2 PKVZBNCYEICAQP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 101000658690 Neisseria meningitidis serogroup B Transposase for insertion sequence element IS1106 Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 241000701945 Parvoviridae Species 0.000 description 1
- YKUGPVXSDOOANW-KKUMJFAQSA-N Phe-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YKUGPVXSDOOANW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VOZIBWWZSBIXQN-SRVKXCTJSA-N Pro-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(O)=O VOZIBWWZSBIXQN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- QUBVFEANYYWBTM-VEVYYDQMSA-N Pro-Thr-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QUBVFEANYYWBTM-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- AWJGUZSYVIVZGP-YUMQZZPRSA-N Pro-Val Chemical group CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 AWJGUZSYVIVZGP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- IIRBTQHFVNGPMQ-AVGNSLFASA-N Pro-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 IIRBTQHFVNGPMQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 101000748660 Pseudomonas savastanoi Uncharacterized 21 kDa protein in iaaL 5'region Proteins 0.000 description 1
- 101000584469 Rice tungro bacilliform virus (isolate Philippines) Protein P1 Proteins 0.000 description 1
- FBLNYDYPCLFTSP-IXOXFDKPSA-N Ser-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FBLNYDYPCLFTSP-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- QUGRFWPMPVIAPW-IHRRRGAJSA-N Ser-Pro-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QUGRFWPMPVIAPW-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 101000818096 Spirochaeta aurantia Uncharacterized 15.5 kDa protein in trpE 3'region Proteins 0.000 description 1
- 101000766081 Streptomyces ambofaciens Uncharacterized HTH-type transcriptional regulator in unstable DNA locus Proteins 0.000 description 1
- 101000804403 Synechococcus elongatus (strain PCC 7942 / FACHB-805) Uncharacterized HIT-like protein Synpcc7942_1390 Proteins 0.000 description 1
- 101000750910 Synechococcus elongatus (strain PCC 7942 / FACHB-805) Uncharacterized HTH-type transcriptional regulator Synpcc7942_2319 Proteins 0.000 description 1
- 101000644897 Synechococcus sp. (strain ATCC 27264 / PCC 7002 / PR-6) Uncharacterized protein SYNPCC7002_B0001 Proteins 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- LVHHEVGYAZGXDE-KDXUFGMBSA-N Thr-Ala-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O LVHHEVGYAZGXDE-KDXUFGMBSA-N 0.000 description 1
- LHEZGZQRLDBSRR-WDCWCFNPSA-N Thr-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LHEZGZQRLDBSRR-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- 206010058874 Viraemia Diseases 0.000 description 1
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101000916336 Xenopus laevis Transposon TX1 uncharacterized 82 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 101001000760 Zea mays Putative Pol polyprotein from transposon element Bs1 Proteins 0.000 description 1
- 101000678262 Zymomonas mobilis subsp. mobilis (strain ATCC 10988 / DSM 424 / LMG 404 / NCIMB 8938 / NRRL B-806 / ZM1) 65 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- KSRBPGFLIABGES-UHFFFAOYSA-N [N+](=O)([O-])NC1=C(C=CC=C1)N[N+](=O)[O-] Chemical compound [N+](=O)([O-])NC1=C(C=CC=C1)N[N+](=O)[O-] KSRBPGFLIABGES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 125000003295 alanine group Chemical group N[C@@H](C)C(=O)* 0.000 description 1
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 1
- 238000011091 antibody purification Methods 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 108010025198 decaglycine Proteins 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 206010016256 fatigue Diseases 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N glyclproline Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 239000012678 infectious agent Substances 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- BWHLPLXXIDYSNW-UHFFFAOYSA-N ketorolac tromethamine Chemical compound OCC(N)(CO)CO.OC(=O)C1CCN2C1=CC=C2C(=O)C1=CC=CC=C1 BWHLPLXXIDYSNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 244000309711 non-enveloped viruses Species 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 1
- 238000009589 serological test Methods 0.000 description 1
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000020382 suppression by virus of host antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
- C07K14/01—DNA viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
- A61P1/16—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for liver or gallbladder disorders, e.g. hepatoprotective agents, cholagogues, litholytics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/20—Antivirals for DNA viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/00022—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Public Health (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Exhaust Gas After Treatment (AREA)
Description
(57) Anotace:
Popisuje se peptid, který má aminokyselinovou sekvenci SEQ ID NO:1, a použití tohoto peptidů ve směsi s jedním nebo více peptidy se sekvencí SEQ ID NO: 3 až 11. Všechny tyto peptidy odpovídají oblastem genomové sekvence viru TT. Dále se popisují monospecifické protilátky vázající se na virus TT. Peptidy se mohou spojovat s nosičem a/nebo značkou nebo se mohou imobilizovat na pevné fázi. peptid nebo směs peptidů nebo monospecifická protilátka se může použít v léčebném prostředku nebo v diagnostické sadě. Peptid nebo směs peptidů se může také použít při imunizaci savce, kterým není člověk, aby se produkovaly monospecifické protilátky určené proti viru TT.
• 4
Peptid nebo směs peptidů a protilátka a diagnostická sada • 4 4
4
4444 444 ’φν* jejich použiti, monospecifická
Oblast techniky
Vynález popisuje peptidy získané z genomové sekvence viru TT a monospecifické protilátky vázající se na virus TT. Dále vynález popisuje peptidy a protilátky podle vynálezu, které je možné použít při léčbě, diagnostické sady obsahující peptidy podle vynálezu jako diagnostická činidla a diagnostické sady obsahující protilátky podle vynálezu jako diagnostická činidla. Peptidy podle vynálezu se mohou použít při imunizaci savce, kterým není člověk, za vzniku monospecifických protilátek určených proti viru TT.
Dosavadní stav techniky
V roce 1997 se identifikovalo nové lidské infekční činidlo ze séra japonského pacienta, který trpí hepatitidou, která nespadá do skupiny A až G, vyvolané transfúzí a jmenovitě virem TT (TTV) (popisuje se v publikaci Nishizawa T, Okamoto H, Konishi K, Yoshizawa H, Miyakawa Y, Mayumi M., Novel DNA virus (TTV) associated with elevated transaminase levels in posttransusion hepatitis of unknown etiology. Biochem Biophys Res Commun 1997, 241: 92-7). DNA viru TT se detekovala u 47 % pacientů trpících fulminátovou hepatitidou, která nespadá do skupiny A až G, a u 46 % pacientů s chronickým onemocněním jater neznámé etiologie (popisuje se v publikaci Okamoto H, Akahane Y, Ukita M, Fukuda M, Tsuda F, Miyakawa Y, Mayumi M, Fecal excretion of nonenveloped DNA virus (TTV) associated with posttransfusion non A-G hepatitis. J. Med. Virol. 1998, 56, 128-32), což naznačuje, že TTV může být způsobeno některým idiopatickým onemocněním jater. TTV je globální (popisuje se v publikaci Cossart Y, TTV a common virus, but pathogenic?
·. .:
u hemofiliků nebo parenterální přenos (comment) . Lancet 1998, 352: 164) a zdá se běžnější v populaci se zvýšeným nebezpečím infekce viry, které se vyskytují v krvi (popisuje se v publikaci Okamoto H, Akahane Y, Ukita M, Fukuda M, Tsuda F, Miyakawa Y, Mayumi M, Fecal excretion of nonenveloped DNA virus (TTV) associated with posttransfusion non A-G hepatitis. J. Med. Virol. 1998, 56, 128-32) například narkomanů. Je možný také jiný než (popisuje se v publikaci Okamoto H,
Akahane Y, Ukita M, Fukuda M, Tsuda F, Miyakawa Y, Mayumi M, Fecal excretion of nonenveloped DNA virus (TTV) associated with posttransfusion non A-G hepatitis. J. Med. Virol. 1998, 56, 128-32).
TTV je virus bez obalu obsahující jednořetězcovou DNA s genomem o velikosti 3,7 kb (popisuje se v publikaci Okamoto H, Kato A, lizuka H, Tsuda F, Miyakawa Y, Mayumi M, Distinct genotypes of a nonenveloped DNA virus associated with posttransfusion non-A to G hepatitis (TT virus) in plasma and peripheral blood mononuclear cells (In Process Citation). J. Med. Virol. 1999, 57: 252-8). Zahrnuje rozmezí sekvenční divergence umožňující klasifikaci do různých genotypů a subtypů (popisuje se v publikaci Okamoto H, Kato A, lizuka H, Tsuda F, Miyakawa Y, Mayumi M, Distinct genotypes of a nonenveloped DNA virus associated with posttransfusion non-A to G hepatitis (TT virus) in plasma and peripheral blood mononuclear cells (In Process Citation). J. Med. Virol. 1999, 57: 252-8). Vztah s rodinou Parvoviridae se popisuje v publikaci Okamoto H, Kato A, lizuka H, Tsuda F, Miyakawa Y, Mayumi M, Distinct genotypes of a nonenveloped DNA virus associated with posttransfusion non-A to G hepatitis (TT virus) in plasma and peripheral blood mononuclear cells (In Process Citation). J. Med. Virol. 1999, 57: 252-8). Následná analýza ukázala důkaz hepatotropismu TTV (popisuje se v publikaci Okamoto H, Akahane Y, Ukita M, Fukuda M, Tsuda F, Miyakawa Y, Mayumi M, Fecal excretion of nonenveloped DNA • ·
•4» · · * • 9 9
9 9 · virus (TTV) associated with posttransfusion non A-G hepatitis.
J. Med. Virol. 1998, 56, 128-32) a u některých pacientů trpících hepatitidou, která nespadá do skupiny A až G, způsobenou transfúzí a viremií TTV, že titr DNA TTV koreluje s množstvím aminotransferázy (popisuje se v publikaci Nishizawa T, Okamoto H, Konishi K, Yoshizawa H, Miyakawa Y, Mayumi M., Novel DNA virus (TTV) associated with elevated transaminase levels in posttransusion hepatitis of unknown etiology. Biochem Biophys Res Commun 1997, 241: 92-7).
Důkaz spojení infekce TTV a vážným onemocněním jater není dostatečný (popisuje se v publikaci Cossart Y, TTV a common virus, but pathogenic? (comment). Lancet 1998, 352: 164, Naoumov NV, Petrova EP, Thomas MG, Williams R, Presence of a newly described human DNA virus (TTV) in patients with liver disease (see comments). Lancet 1998, 352: 195-7, Viazov S, Ross RS, Varenholz C. Lange R, Holtmann M, Niel C, Roggendorf M. Lack of evidence for an association between TTV infection and sever liver disease (In Process Citation). J. Clin. Virol. 1998, 11: 183-7). Epidemiologická, imunologická a klinická podstata infekcí TTV nejsou stále jasné. Neexistuje žádný serologický test vhodný pro infekci způsobenou TTV a v současnosti PCR je jediným dostupným diagnostickým nástrojem.
Je nutné diagnostikovat infekci TTV u člověka a vyvinout léčiva založená na peptidech vhodných pro imunizaci a/nebo na protilátkách proti TTV.
Podstata vynálezu
Vynález popisuje syntetické peptidy, které odpovídají různým oblastem genomové sekvence pocházej icích z viru TT (popisuje se v publikaci Nishizawa T, Okamoto H, Konishi K, Yoshizawa H, Miyakawa Y, Mayumi M., Novel DNA virus (TTV) associated with elevated transaminase levels in posttransusion hepatitis of unknown etiology. Biochem Biophys Res Commun
• · · · · · · ···· ··« ··· ···» ·· ···
1997, 241: 92-7). Celkem se syntetizovalo 80 překrývajících se peptidů odpovídájících dvěma otevřeným čtecím rámcům (ORF, Genebank, přístupové číslo AB008394) 1 a 2. Tyto peptidy se analyzovaly osmi vzorky lidského séra vykazující infekci TTV a osmi lidskými vzorky, které nevykazují infekci TTV. Reaktivní vzorky lidského séra všechny reagovaly s peptidem se sekvencí SEQ ID NO: 1: TATTTTYAYPGTNRPPV. Reaktivity se mohly nakonec mapovat se sekvencí SEQ ID NO: 2 YAYPGTNRPPV, přičemž se zjistilo, že zbytky jsou nejvíce důležité pro navázání lidských protilátek.
Vynález popisuje peptid, který má aminokyselinovou sekvenci SEQ ID NO: 1: TATTTTYAYPGTNRPPV, kde může chybět jedna ze všech šesti N-terminálních aminokyselin TATTTT.
V provedení vynálezu má peptid aminokyselinovou sekvenci SEQ ID NO: 2 YAYPGTNRPPV.
Vynález také popisuje směs peptidů obsahující peptid se sekvencí SEQ ID NO: 1 TATTTTYAPGTNRPPV, kde může chybět jedna ze šesti N-terminálních aminokyselin TATTTT a alespoň jeden z peptidů uvedených v tabulce č. 4 má aminokyselinovou sekvenci SEQ ID NO: 3 až 11.
Peptid a/nebo alespoň jeden z peptidů ve směsi peptidů podle vynálezu může být spojen s nosičem a/nebo značkou. Příklady nosičů jsou plastové povrchy, jako jsou mikrodestičky, částice atd., organické molekuly, jako je biotin, proteiny, jako je bovinní sérový albumin, peptidové linkery nebo polypeptidy. Příklady takových značek, které se mohou primárně použít pro diagnostické účely jsou radioaktivní izotopy, enzymy, fluorescenční značky atd..
Dále peptid a/nebo alespoň jeden z peptidů ve směsi peptidů podle vynálezu může být imobilizován na pevném podkladu, jako je skleněný nebo plastový povrch, primárně pro diagnostické účely nebo čištění protilátek.
Vynález také popisuje peptid nebo směs peptidů podle vynálezu, které jsou vhodné jako léčiva, mohou být spojené nebo mohou být v kombinaci a jinými biologicky aktivními nebo neaktivními složkami, jako je vakcína vhodná pro prevenci infekce viru TT.
Vynález dále popisuje monospecifické protilátky vázající se na virus TT.
V jednom provedení vynálezu se monospecifická protilátka váže na aminokyselinovou sekvenci vybranou ze skupiny obsahující aminokyselinovou sekvenci SEQ ID NO: 1 až 11.
Vynález dále popisuje monospecifickou protilátku podle vynálezu vhodnou pro použití jako léčiva, která je spojena s nebo je v kombinaci s jinými biologicky aktivními nebo neaktivními složkami, jako je léčivo vhodné pro aplikaci pacientovi, který se už infikoval TTV.
Vynález dále popisuje diagnostickou sadu obsahující peptid nebo směs peptidu podle vynálezu, které slouží jako diagnostické činidlo. Sada se může použít v imunologickém testu, jako je EIA, RIA atd., aby se v biologické tekutině, jako je krev nebo plazma, detekovala přítomnost protilátek proti TTV.
Vynález dále popisuje diagnostickou sadu obsahující jednu nebo více monospecifických protilátek podle vynálezu, které se používají jako diagnostické protilátky. Sada se může použít v imunologickém testu, jako je EIA, RIA atd., aby se detekovala přítomnost protilátek proti TTV v biologické tekutině, jako je krev nebo plazma.
Diagnostické sady budou normálně obsahovat další složky vhodné pro provedení imunologického testu. Tyto další složky budou záviset na skutečném používaném testu a budou často obsahovat vzorky pozitivního a negativního standardního séra a instrukce pro použití.
Vynález dále popisuje použití peptidu podle vynálezu vhodného pro imunizaci savce, který není člověk, aby vznikly monospecifické protilátky určené proti viru TT.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1: Popis experimentů
Vzorky séra: Kódem označené vzorky séra se získaly ze sérové banky, která obsahuje zdravé dárce krve, děti trpící onemocněním jater nebo zdravé děti, matky s IVDU (intravenózní použití léků) a jejich dětí.
Amplifikace PCR vhodná pro detekci DNA TTV v séru:
Celková DNA se izolovala z 50 μΐ séra pacienta čištěním za použití směsi fenol/chloroform. DNA všech pacientů se analyzovala dvěmi různými sadami primerů (semi)hnízdovým PCR. Pět mikrolitrů DNA pacienta se přidalo k reakční směsi o objemu 45 μΐ, která obsahuje 1 U taq polymerázy (Perkin-Elmer Applied Biosystems, Norwalk, CO), lOx pufr PCR, 200 pmol MgCl2, dNTP (125 pmol/nukleotid) a 20 pmol každého primeru. Při prvním cyklu PCR se použily primery 5TTVout5 (5'-ACA GAC AGA GGA GAA GGC PAC ATG-3') a 3TTVout (5'-CTG GCA TTT TAC CAT TTC CAA AGT T-3') nebo 3TTXout (5'-TAC CAY TTA GCT CTC ATT CTW AT-3'). DNA se amplifikovala v následujících cyklech: 95 °C po dobu 4,5 minut a pak 33 cyklů při teplotě 95 °C po dobu 30 vteřin, 50 °C po dobu 30 vteřin a 72 °C po dobu jedné minuty a nakonec při teplotě 72 °C po dobu 4 min. Druhý cyklus PCR se uskutečnil při použití 5 μΐ produktu PCR, který vznikl v prvním cyklu za shodných podmínek. Při druhém cyklu vnitřní primery byly 5TTVin (5' -GGC AAC ATG YTR TGG ATA GAC TGG-3') nebo 5TTVXin (5'-ACA GGA GAC HMA AAC ATA SA-3') a 3TTVout. Správná velikost 275 bp respektive 140 bp se stanovila elektroforézou na agarózovém gelu (3%). Vzorky, které byly buď pozitivní s oběma sadami primerů nebo reprodukovatelné pozitivní s jednou sadou primeru se považují za TTV pozitivní. Sekvence primerů jsou uloženy v Genebank pod přístupovým číslem AB008394).
Syntéza peptidů
Překrývající se peptidy (18 aminokyselin dlouhé s přesahem 8 aminokyselin) odpovídající ORF1 a ORF2 TTV (tabulka č. 1, Genebank přístupové číslo AB008394) se produkovaly syntetizérem, který je schopen produkovat více peptidů, za použití standardní chemie Fmoc (popisuje se v publikaci Sallberg M, Ruden U, Magnius LO, Norrby E, Wahren B, Rapid „tea-bag peptide synthesis using 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) protected amino acids applied for antigenic mapping of viral proteins. Immunology Letters 1991, 30: 59-68) Syro, Syntex, Německo).
Detekce lidských protilátek v séru
Test EIA se provádí podle předchozích protokolů (Zhang ZX, Chen M, Hultgren C, Birkett A, Milich DR, Sallberg M, Immune responses to the hepatitis C virus NS4a are profoundly influenced by the combination of the viral genotype and the host major histocompatibility complex. J. Gen. Virol. 1997, 78: 2735-2746). Mikrodestičky (Nunc, Dánsko) se potáhly po dobu 48 hodin syntetickými peptidy v koncentraci 10 pg/ml v 0,05 M v pufru uhličitanu sodném pH 9,6. Po blokování po dobu 2 hodin při teplotě místnosti s fyziologickým roztokem pufrovaným fosforečnanem, který obsahuje 1 % bovinního sérového albuminu, 2 % kozí sérum a 0,05 % Tween (ředící pufr) se destičky inkubovaly s lidským sérem ředěným 1:100 v ředícím pufru. Vázaný lidský IgG se indikoval inkubací s protilátkami proti lidskému IgG konjugovanému s alkalickou fosfatázou (Sigma Chemicals, St. Louis, MO) . Destičky se vyvíjely přidáním dinitrofenylendiaminu (Sigma) a optická hustota se stanovila při vlnové délce 405 nm.
Imunizace a indukce protilátek specifických pro TTV
Skupiny myší Balb/c se imunizovaly intraperitoneálně se 100 μς peptidů 35 viru TTV (SEQ ID NO: 1), který se emulgoval
1:1 v úplném Freundově adjuvans. Zesilující dávka tvořená 100 pg neúplného Freundova adjuvans se aplikovala o čtyři týdny později. Vzorky venózní krve se odebraly jednou za šest týdnů a testovala se jejich reaktivita vůči peptidu 35 viru TT (SEQ ID NO: 1).
Výsledky
Reaktivita lidí vůči 97 peptidům, které pokrývají ORF1 a ORF2 je dána v tabulce č. 2 a 3. Zjistilo se, že reaktivní peptidy v ORF1 jsou peptid 10 (SEQ ID NO: 3), 18 (SEQ ID NO: 4), 29 (SEQ ID NO: 5), 35 (SEQ ID NO: 1), 42 (SEQ ID NO: 6), 44 (SEQ ID NO: 7), 50 (SEQ ID NO: 8), 51 (SEQ ID NO: 9) a 69 (SEQ ID NO: 10) (Tabulka č. 2) . Dvě testovaná lidská séra reagovala s peptidem 19 (SEQ ID NO: 11) z ORF2 (tabulka č. 3). Všechny reaktivní peptidy jsou uvedeny v tabulce č. 4. Nejvíce často detekovaný peptid byl peptid 35 se sekvencí TATTTTYAYPGTNRPPV (SEQ ID NO: 1) . Reaktivita peptidu 35 je závislá na ředění vzorků séra (Tabulka č. 5). Reaktivita vzorků lidského séra s peptidem na mikrodestičce by mohla být inhibována přidáním stejného peptidu do roztoku, ale nikoli irelevantním peptidem (data nejsou zobrazena). To ukazuje, že reaktivita je specifická pro peptid 35 se sekvencí TATTTTYAYPGTNRPPV (SEQ ID NO: 1).
Reaktivita s peptidem TATTTTYAYPGTNRPPV se dále charakterizovala použitím delece a substituce peptidových analogů. Tato analýza ukazuje, že rozeznávaná oblast obsahovala sekvenci YAYPGTNRPV (SEQ ID NO: 2) (Tabulka č. 6). Použitím analogů substitujících alanin se zjistilo, že sekvence Pro-Val je nejvíce podstatná pro navázání lidských protilátek (tabulka č. 6).
Tabulka č. 1: Úplné aminokyselinové sekvence ORF 1 a 2 TTV (Genebank, přístupové číslo AB008394) používané pro syntézu 80 překrývajících peptidů.
ORF1
MAYGWWRRRRRRWRRWRRRPWRRRWRTRRRRPARRRGRRRNVRRRRRGGRWRR
RYRRWKRKGRRRKKAKIIIRQWQPNYRRRCNIVGYIPVLICGENTVSRNYATHSDDT
NYPGPFGGGMTTDKFTLRILYDEYKRFMNYWTASNEDLDLCRYLGVNLYFFRHPDV
DFIIKrNTMPPFLDTELTAPSIHPGMLALDKRARWIPSLKSRPGKKHYIKIRVGAPRMFT
DKWYPQTDLCDMVLLTVYATAADMQYPFGSPLTDSWVNFQVLQSMYDKTISILPD
EKSQREILLNKIASY1PFYNTTQTÍAQLKPFIDAGNVTSGATATTWASYINTTKFTTATT
TTYAYPGTNRPPVTMLTCNDSWYRGTVYNTQIQQLPIKAAKLYLEATKTLLGNTFTN
EDYTLEYHGGLYSS1WLSPGRSYFETTGAYTDIKYNPFTPRGEGNMLWIDWLSKKN
MNYDKVQSKCLISDLPLWAAAYGYVEFCAKSTGDQNIHMNARLLIRSPFTDPQLLVH
TDPTKGFVPYSLNFGNGKMPGGSSNVPIRMRAKWYPTLFHQQEVLEALAQSGPFAY
HSDIKKVSLGMKYRFKWIWGGNPVRQQWRNPCKETHSSGNRVPRSLQIVDPKYNS
PELTFHTWDFRRGLFGPKAIQRMQQQPTTTDIFSAGRKRPRRDTEVYHSSQEGEQKES
LLFPPVKLLRRVPPWEDSQQEESGSQSSEEETQTVSQQLKQQLQQQRILGVKLRLLFN
QVQKIQQNQDINPTLLPRGGDLASLFQIAP
ORF2
MAEFSTPVRSGEATEGDLRVPRAGAEGEFTHRSQGAIRARDWPGYGQGSEKSMFIGR
HYRKKRALSLCAVRTTKKACKLLIVMWTPPRNDQHYLNWQWYSSILSSHAAMCGC
PDAVAHFNHLASVLRAPQNPPPPGPQRNLPLRRLPALPAAPEAPGDRAPWPMAGGAE
GEDGGAGGDADHGGAAGGPEDADLLDAVAAAE
ω ο
b
Ό ω
0J' r+
C
Ω<
Ό
Η' ω
(D
Tabulka č. 2: Analýza reaktivity lidských protilátek v EIA, zda překrývající se syntetické peptidy odpovídající úplnému otevřenému čtecímu rámci 1 (ORF1) viru TT. Hodnoty jsou dány jako optická hustota při vlnové délce 405 nm. Hodnoty OD vyšší než 0,500 se považují za pozitivní a
Crt | •tx | 4x | 4x | 4X | 4*. r h | fx (m | U bO | .tx | .tx | w SO | w | cu | CM Os | CM Ch | CM Jx | CM CM | CM bJ | ω | CM © | t4 SO | to 00 | to Ό | to os | to Ch | to 4x | to CM | to bO | |
O o o | O “0 | O 0' | O O | 0 © | © © | © ©’ SO | © ©' SO | ©. © 00 | © ©' 00 | © ~© SO | © ©' OO | ©„ © Ό | P >—* O | © ©' | JO. RR OO | O '© ~o | © O O | © ©' Os | O ©' Ch | O ©' -4 | © Tx bJ | © 0 -0 | © O Ό | 0. O -0 | P. © -O | O «0 © -4 | © ~O Ό | p © ~4 |
o o | Ό JO >—1 | G> *RR | O -©' Ό | © θ' 00 | O θ' fts | JO. k—* | © to' | JO. RR k—* | p. tO | p 1—» OS | © ©' SO | © ©' 00 | JO. | ©„ © -4 | p. | © 0 Ό | O © 00 | © ©' OO | O θ' sO | O ©' | O cm' Os | © ©' 00 | © ©' 00 | O 0' so | O 0 SO | O © sO | © ©' SO | © O Ό |
o. 'o 00 | _p 1—‘ 0 | JO >—» 0 | © ©' 00 | © ©' -O | O o Os | JO. r*' RR | p. | ©s © SO | P. ►—* 0 | © to' •U | ©. © Ό | © ©' 00 | JO. RR | © ©' Os | © tx)‘ ^4 | © θ' Ch | 0. 0' Os | © '© Os | © J©' SO | © ©' Os | © 4x Ch | © θ' 00 | © θ' Ό | O '0' -4 | 0 ©' 00 | p to | JO RR | © 0 -O |
o 0' | P R·* | p RR ΚΊ | © θ' Ό | © $ | JO R* | p b> | JO. R-* RR | © © | JO^ k—k RR | © to | © ©' SO | © © SO | © K) | © © -J | r^' 0 | © ©' Os | O ©' Ό | © to' Ch | © ©' 00 | O ©' | 0 Ch CM | © © 00 | O ©' 00 | O 0' 00 | O 0' 00 | p. to | JO RR | © O 00 |
0 ~O~ 00 | ©. 4-» 0 | p 7-*' O | O. r©' SO | O o 00 | p 0 | p ”so 00 | p 0 | p RR Ό | p. © | JO R-Z | ©. © •0 | © ©' 00 | 0. 0 SO | © ©' Os | O to' Ch | © © Os | © fe· OS | © ©' Os | © ©' Os | © θ’ Os | O bJ bJ | © ©' Ό | © θ' OS | O ©' 00 | © θ’ Os | © © 00 | 0 o 00 | © © 00 |
o ~00 | JO “r-* | p | JO Ί—*' | © to' | JO, R* | JO. R* <-h | ©. K 1—» | © 'to tM | 0 to 0 | p. --* Os | © w‘ Ό | p | p. | JO^ RR R* | p Os | © © Os | © O 00 | © ©' SO | O θ' so | © O SO | p so- Ch | p _Ch O | o_ | p t—* 0 | p. | p to | p Os | © o sO |
C\ 0 to | JO RR” | p | O © | JO k—· | JO. k—k 0 | JO ►—k | JO R4 O | JO k—4 k—4 | © ©' SO | © ©' SO | © fc> SO | © © so | p b-> | © ©' -J | to {-*' © | O ©' Os | O 0 os | © ©' Os | © ©' -4 | O ©' -4 | © b4 Ό | © ©' Ό | © 0 -0 | 0 ©' Ό | O P -4 | O © 00 | O ©' sO | O © SO |
JO RR | p | 0 | 0 k-R K1 | JO KS | JO. | JO R* | p ,μ. | P t—* SO | JO. RR Ch | p k—* to | p k—* © | p k—* k—* | p | © 0 00 | p os 4x | O ©' —4 | O o Ό | O θ' -J | ©. © 00 | O © SO | O. »—* 4χ | p 1—»' © | O 0 00 | p 0 | p to | JO RR | © 1—»' to | © |
00 o_ © | JO '0 | ©_ o | p 0' | p © | © © SO | © 0 SO | © © OO | 0 to' Ό | 0. ©' SO | © ©' SO | O ©' 00 | 0 fe 00 | O o so | O 0' SO | p. RR © | © © Os | O θ' Os | © ©' OS | © ©~ Os | O θ' -4 | O 'bJ 1—* | O ©' •O | © ©' OS | p 0' -0 | O 0 ~4 | © '0' 00 | © © 00 | © O 00 |
0 o | 0 o | © 0 | © 0' | 0 0 | © © | © © SO | © *© 00 | © k—» | p © ~4 | 0 o sO | © ©' SO | 0 o | © o 00 | p ©' Os | p © | O O SO | © o Ch | © -* 0 Ch | © '0 Os | © ©' -4 | JO RR RR | © 0 OS | © Jo Os | 0 “o -0 | O θ' Os | 0 ©' Ό | p„ © -0 | © © -0 |
•*4 0 ~o | © “o | © 0' | O ©' | © θ' | © © m | © *©1 OO | © '<=> 00 | O ·* ·— k—‘ © | © © SO | © © OO | © ío SO | 0 '<=>- Ό | © © 00 | © 0 Os | H* bJ to | © ©' Os | 0 o Os | 0 0' Os | © ©' Os | © © -4 | O 0 SO | © © Os | © ©' os | 0 © Os | O © Os | O O ^4 | © © Ό | O © 00 |
**4 O 0 | 0 cT | p θ' | © © | O ©' | © ©' SO | © o OO | © *© 00 | © 0 SO | © ©' 00 | © © 00 | © ©' 00 | O © •O | © Tx)' 0 | O O -J | -R-k ^R | p RR Ch | O '0' Ch | © © Ch | p '0' Os | O ©' -4 | p © | © ©' Os | © ©' Os | O ©' Ch | O O Os | p. 0 | p © | © © |
•*4 jo r·*' | JO rr' | JO ř-R~ | © | O 0 | JO k—* | JO bO | JO r-·' | JO <7\ | p RR | p ř—* © | © o SO | 0 o SO | p t—· 0 | © -J | © © Ch | ©. ©' Os | p. θ' Ό | P_ θ' -4 | O ©' Os | O lo' 00 | O 0 sO | © © -4 | © fc> 00 | O ©' -4 | p. '0' Os | O 0 LA | O O Ch | © © 4x |
O 'to' | O JO | O o | © 0 | © 0 | O © | JO k—k < h) | © | © Tfx IO | © ©' SO | ©. 'O sO | p, '© SO | p '0' 00 | © © 00 | © ©' -J | © K -4 | © '©' Os | O o~ OS | © ©' Os | O © Os | © θ’ 00 | O b4 Ch | © © Os | © '© Os | © ©' 00 | O θ' -4 | © 0 | © ©' —4 | © © Ό |
O 0 os | 0 To' | JO k-R | JO^ t-R | p | JO k—* | JD RR xj | ©. 'to' r~> | © cm lh | JO Ch | JO. r—» Ch | JO^ R-k k—* | p 1—» SO | p r-«* | O © 00 | 0 SO Ch | © *©' 00 | O o co | O ©' SO | © ©' SO | O 0' SO | p ch SO | © © SO | © © SO | © o SO | J3> RR | 0 CM | p | JO k-R |
u> 0 K OS | O\ <0 to' Ch | JO Ví | p_ sO | O to Os | JO R-* | R 4o CA | O to Ch | 1—‘ bO •fx | p RR O\ | Pj Os | p 1—* co | p k—k | © «* k—* | © o 00 | p “óo Os | o_ ©' 00 | 0 ©' SO | O © sO | p. ©' so | O bJ | O Os to | O ►—* © | ©„ © | -°- RR RR | p RR to | JO RR Ch | p. 4x | p |
IQ
IQ \O σ\ o\ <3\ Ol
IQ
O\
IQ
OJ o o
Λ ·~» σι iq OJ
IP
IQ o»
IQ
O i— Ό O
p. p, i—* >—· o o
OJ oo oo
O) o o o o 00 oip IQ ~IQ —· I -frO>
o\ tn O Ό (Λ
O O O -Q O\ O
PP o o O O\
IQ
IQ
IQ o
o
2£I
O. ° o o p p o o Ό 00 on
O O Z- -b OJ Ό
OJ
IQ o o MO -Q
tJM o ho
O\
Ch| .u
UJ t4 o ho 00 σ\Ι tn to
- S 31 ϋ gH ~ 75 <
O. κ» lpi©
Γ©Τ© ho ho
Ol© ©T© o| o
Olo ofo 00 co to ololpl fbŤb' ho co o
b •-4 o
VO| |©l©. Γί-*Γ— Ol to ©LP.
©fb ol© b|b 00 -4
OOO o ho fo lo 00
O * >—Λ o | to lol o fb. ho N o|o bfb o o ©To' 00 00
Oj O| Ol o !©l ho ©lpi fbi 00' o
b o
R top
LPI © Γοδ I to ©I© o To 00 ol©
0T0 -4 -4
Ololpl bfofb; 00 |o ho
©.
P| o op o
Lpi© fbfo
-4| 00 ojp bfb ol o ©J b | _
-4-4 olplpj bfofb, ό 100 ho olpj toTol
-o I
Op
I ©j© ΤΪΛ
I o | >-* plo 'orb ol o plo brb
O CO ol o | o | ©1 VO lpi© to © © p O\| C\ <
N
O
K
TT (D <Q
ÍU rt
H<4
Hn l-i o
σ §
i-3
Η <
”σ o
O o
H'
V n
Ul o
C
QJ
Ti co ίϊ).
rt
C o<
Ό
H'
CO
CD o
Ό r+
ΡΩ
ÍD.
rr c
co rt o
rt
Ό
CD
Ό rt
HÍX *<
o a
o <
H'
ÍU tr c
Psn o<
ipjp. kb Tin -o o
Ol© ofo o o ©J © bfb o 00 oloioi ©Tbfbl o 00 ho © lo fb
O b
o,
O -4
L©J©[01^ Ho J <-h ©J © bfb ol o ©Jo p-> | ►—1
O O
OpOp ploJ©
1—*T>—‘Γ—— plo
OOO toj
I ©J© fb ol 00 o loj© ofo o ol o 00
Ol© bro 001 -q ©J o
Ol op bfofb o p p o
<* Ή ©Ί o
o.
~b
O,
Ό ©L© , Γ© ©1-4 ©I© ofo ol o ©i© b|o -4 —4
O pípl . ©T©i to p 00 | oo
O o I >-* 00 00
L©i© ι©ρ*> oo| oj ol o bfb ol o
Olo o
Ol ©I vol
Ol Ol o opi -41 001 o
t© to p
'olw vol o\
L©J© i©T©
I co | -o ©I© bfb o, o ©JO bfb
-4-4
O lpi oj brbpi -4|oop
LPJP fofb
00-4 o
©I P 00 00
I© J_p [o To 00,00 ol o b|o ol o ol o » *<* orb 001 -j
PL°o Ό
Ol ©1
O
Olpj o bfo| pl pl
P-* | ©
OJ o ,P
01-4 o
op 00 00
Lojp fb o 00 ©I© bfb o jo bTb | -4 to opi O o ©
VO o
©
VO ©Pl © vol o —4 O § 00 o <
N .K <
ro o
N
Pr+.
P<4
Pi-i o
σ z > 1-3 i-3 , <
Ό
O o
o
P' na
O o
H—*
X|X p
bro 00
©.
>—* o| o pl £
opi o
L©I © P vol to
PP . Ví P Vl ©JO, (L.
cux © bfb ol o ©Jo * I ►—* to o ©1 to plolp ►—* ί-—* h—‘ w p | to ©J
J Ί IO
PP tft 4X -4
ai | CX |
a> | |
Ό | l_l. |
l-i< | H' |
P | O |
P | |
< | |
P | Cs |
3 | Ό |
O | P |
<4 | as |
CD' | CD- |
3 | |
ÍX | ť |
(T)' | |
P | 0 |
Ω | rt |
CD | Φ |
< | |
P | K< |
O | Φ |
Cn | 3 |
Φ- | |
3 | 3 |
3 | C4 |
re o
a z
o rt *<
O σ
<4 ·<
co<
co<
H' rt (D
O >
ó &)
P *<'
N
ÍU (D íh rt
H<
Hrt
HÍX co O<
l-i su3
Ω
P o
tr
Ό
H o
rt
P
P ais rt
CD xp co o
3 | |
Φ | •3 |
N< | P |
O | |
- | <4 |
Cn | P- |
O | K |
O | c |
CO | p3 |
ď. | |
Ό | |
O | 34 |
< | O |
ai | SX |
N< | 3 |
C | O |
l_J. | rt |
H' | |
N | l_J. |
φ | CO |
O | |
Ό | 3 |
0 | |
N | SX |
H- | 3' |
rt | 3 |
H- | |
<4 | |
3 | LO- |
P' | SU |
4V | |
a> | O |
<
M
P >
N
ÍX
ÍU
Ό l-i<
CD řv
H <s <4
0)
Pl.
ΡΩ
P co (D co p:
rt (D rt
ΡΩ
K
Φ14
Tabulka č. 4: Sekvence peptidů TTV reaktivních se vzorky lidského séra
0RF1
peptid č. | peptidová sekvence | |
10 | VLICGENTVSRNYATHS | SEQ ID NO:3 |
18 | KINTMPPFLDTELTAPS | SEQ ID NO:4 |
29 | PDEKSQREILLNKIASY | SEQ ID NO:5 |
35 | TATTTTYAYPGTNRPPV | SEQ ID NO: 1 |
42 | GLYSSIWLSPGRSYFET | SEQIDNO:6 |
44 | YTDIKYNPFTDRGEGNM | SEQIDNO:7 |
50 | DQNIHMNARLLIRSPFT | SEQ Π) NO:8 |
51 | LIRSPFTDPQLLVHTDP | SEQ ID NO:9 |
69 | QKESLLFPPVKLLRRVP | SEQ ID NO: 10 |
ORF2 peptid č.
peptidová sekvence
EDGGAGGDADHGGAAGGP SEQ ID NO: 11
9 · ·· 99 · • · 9 * · 9 9 · · · ·
9 9 9 9 9 9 • 9 9 9 9 9 9 • 999 9·· 9·· 9999 ·· ···
Tabulka č. 5: Analýza reaktivity sériových ředění tří vzorků lidského séra s peptidem TTV se sekvencí (SEQ ID NO: 1)· TATTTTYAYPGTNRPPV. Hodnoty jsou dány jako OD a standardní odchylka (SD) při vlnové délce 405 nm.
ředění vzorku séra | vzorek lidského | séra | ||||
P4 | SD | P6 | SD | P7 | SD | |
1:100 | 1,285 | 0,072 | 0,687 | 0,082 | 1,782 | 0f054 |
1:200 | 0,758 | 0,056 | 0,375 | 0.003 | 1,23 | 0.02 |
1:400 | 0.411 | 0,021 | 0,19 | 0,007 | 0,79 | 0,018 |
1:800 | 0,234 | 0,008 | 0,104 | 0,003 | 0,45 | 0,002 |
1:1600 | 0,131 | 0,005 | 0,067 | 0,001 | 0,246 | 0,013 |
1:3200 | 0,076 | 0,003 | 0,049 | 0,131 | 0,006 | |
1:6400 | 0,058 | 0,001 | 0^043 | 0,087 | ||
1:12800 | 0,046 | 0,041 | 0,061 |
• ·· · ·
Tabulka č. 6: Analýza reaktivity tří vzorků lidského séra s delečními a alanin substitučními analogy peptidu TTV se sekvencí (SEQ ID NO: 1) TATTTTYAYPGTNRPPV. Hodnoty jsou dány jako OD při vlnové délce 405 nm. Pozitivní reaktivita, to je více jak 50 % reaktivity originálního peptidu, je psána tučným
---- 11 ----- - - -- delece nebo substituce analogu peptidu | vzorek lidsk. séra P4 P7 P36 | ||
TATTTTYAYPGTNRPPV | 0,839 | 1,845 | 0,825 |
TATTTTYAYPGTNRPP | 0,096 | 0,144 | 0,086 |
ΤΑΤΊΤΙYAYPGTNRP | 0,100 | 0,099 | 0,078 |
TATTTTYAYPGTNR | 0,092 | 0 103 | 0,078 |
TATTTTYAYPGTN | 0,186 | 0,888 | 0,083 |
TATTTTYAYPGT | 0,095 | 0,087 | 0,072 |
TATTTTYAYPG | 0,095 | 0,085 | 0,074 |
ΤΑΤΓΠΎΑΥΡ | 0,095 | 0,096 | 0,082 |
TATTTTYAY | 0,098 | 0,089 | .0,083 |
ΤΑΊΤΠΎΑ | 0,115 | 0,089 | 0,090 |
TATT1TY | 0,142 | 0,105 | 0,076 |
ΤΑΤΤΓΤ | 0,108 | 0,093 | 0,082 |
TATTT | 0,101 | 0,091 | 0078 |
TATT | 0,099 | 0,105 | 0076 |
ATTT1YAYPGTNRPPV | 1,042 | 1,960 | 0,923 |
TTTTYAYPGTNRPPV | 0,805 | 1,587 | 0776 |
TTTYAYPGTNRPPV | 0,697 | 1,488 | ο;βιο |
TTYAYPGTNRPPV | 0,748 | 1,659 | 0,722 |
TYAYPGTNRPPV | 0,707 | 1,508 | 0,712 |
YAYPGTNRPPV | 0,647 | 1,546 | 0677 |
AYPGTNRPPV | 0,662 | 1,488 | 0,669 |
YPGTNRPPV | 0,300 | 1,091 | 0406 |
PGTNRPPV | 0,166 | 0,430 | 0,123 |
GTNRPPV | 0,300 | 0 887 | 0,210 |
TNRPPV | 0,110 | 0,146 | 0,056 |
NRPPV | 0,135 | 0,242 | 0,076 |
AATTTTYAYPGTNRPPV | 1,045 | 1,852 | 0915 |
TGTTTTYAYPGTNRPPV | 0,855 | 1,829 | 0806 |
TAATTTYAYPGTNRPPV | 0,897 | 1,675 | 0764 |
TATATTYAYPGTNRPPV | 0,971 | 1,722 | 0,824 |
TATTATYAYPGTNRPPV | 1,076 | 1,867 | 0955 |
TATTTAYAYPGTNRPPV | 1,011 | 1,833 | 1,027 |
'ATTTTAAYPGTNRPPV | 0,898 | 1,619 | 0,901 |
ATTTTYG YPGTNRPPV | 0,836 | 1,769 | 0,850 |
TATTTTYAAPGTNRPPV | 0,899 | 1,697 | 0.903 |
TATTTTYAYAGTNRPPV | 0,886 | 1,738 | 0,903 |
TATTTTYAYPATNRPPV | 0,895 | 1,503 | 0,734 |
ATTTTYAYPGANRPPV | 0,891 | 1,594 | 0,714 |
TATTTTYAYPGTARPPV | 1,226 | 1,723 | 0,696 |
TATTTTYAYPGTNAPPV | ),761 | 1,558 | 0,708 |
TATTTTYAYPGTNRAPV | ),720 | 1,551 | 3,812 |
TATTTTYAYPGTNRPAV ( | ),090 | 3 092 | 3,100 |
TATTTTYAYPGTNRPPA C | ),108 | 3 105 | 3,095 |
·· ·
Seznam sekvencí <210> 1 <211> 17 <212> PRT <213> TT virus <400> 1
Thr Ala Thr Thr Thr Thr Tyr Ala Tyr Pro Gly Thr Asn Arg Pro Pro 1 5 10 15
Val <210> 2 <211> 11 <212> PRT <213> TT virus <400> 2
Tyr Ala Tyr Pro Gly Thr Asn Arg Pro Pro Val 15 10 <210> 3 <211> 17 <212> PRT <213> TT virus <400> 3
Val Leu Ile Cys Gly Glu Asn Thr Val Ser Arg Asn Tyr Ala Thr His 1 5 10 15
Ser <210> 4 <211> 17 <212> PRT <213> TT virus <400> 4
Lys Ile Asn Thr Met Pro Pro Phe Leu Asp Thr Glu Leu Thr Ala Pro 15 10 15
Ser ' · · ♦ 9 9 9 9 9 »9 • « · 9 9 9 <210> 5 <211> 17 <212> PRT <213> TT virus <400> 5
Pro Asp Glu Lys Ser Gin Arg Glu Ile Leu Leu Asn Lys Ile Ala Ser 1 5 10 15
Tyr <210> 6 <211> 17 <212> PRT <213> TT virus <400> 6
Gly Leu Tyr Ser Ser Ile Trp Leu Ser Pro Gly Arg Ser Tyr Phe Glu 15 10 15
Thr <210> 7 <211> 17 <212> PRT <213> TT virus <400> 7
Tyr Thr Asp Ile Lys Tyr Asn Pro Phe Thr Asp Arg Gly Glu Gly Asn 1 5 10 15
Met <210> 8 <211> 17 <212> PRT <213> TT virus <400> 8
Asp Gin Asn Ile His Met Asn Ala Arg Leu Leu Ile Arg Ser Pro Phe 1 5 10 15
Thr <210> 9 <211> 17 <212> PRT <213> TT virus <400> 9
Leu Ile Arg Ser Pro Phe Thr Asp Pro Gin Leu Leu Val His Thr Asp 15 10 15
Pro <210> 10 <211> 17 <212> PRT <213> ΤΤ virus <400> 10
Gin Lys Glu Ser Leu Leu Phe Pro Pro Val Lys Leu Leu Arg Arg Val 15 10 15
Pro <210> 11 <211> 18 <212> PRT <213> TT virus <400> 11
Glu Asp Gly Gly Ala Gly Gly Asp Ala Asp His Gly Gly Ala Ala Gly 1 5 10 15
Gly Pro
Claims (12)
1. Peptid, který má aminokyselinovou sekvenci
SEQ ID NO: 1
Thr Ala Thr Thr Thr Thr Tyr Ala Tyr Pro Gly Thr Asn Arg Pro Pro Val kde. jedna až šest N-terminálních aminokyselin Thr Ala Thr Thr Thr Thr může být vynechána.
2. Peptid podle nároku 1, který má aminokyselinovou sekvenci SEQ ID NO: 2
Tyr Ala Tyr Pro Gly Thr Asn Arg Pro Pro Val.
Phe Thr SEQ ID NO: 9
nároku 3, kde alespoň jeden peptid je spojen s nosičem a/nebo značkou.
4 ·
5. Peptid podle nároku 1 nebo 2 nebo směs peptidů podle nároku 3, kde alespoň jeden peptid je imobilizována na pevné fázi.
6. Peptid nebo směs peptidů podle libovolného předchozích nároků, který je vhodný pro použití v léčebném prostředku.
7. Monospecifická protilátka vázající se na virus TT.
8. Monospecifická protilátka podle nároku 7 vázající se na aminokyselinovou sekvenci vybranou ze skupiny zahrnující aminokyselinové sekvence SEQ ID NO: 1 až 11.
9. Monospecifická protilátka podle nároku 7 nebo 8 vhodná pro použití v léčebném prostředku.
10. Diagnostická sada, vyznačující se tím, že zahrnuje peptid nebo směs peptidů podle libovolného z nároků 1 až 5 jako diagnostické činidlo (a).
11. Diagnostická sada, vyznačující se tím, že zahrnuje jednu nebo více monospecifických protilátek podle nároku 7 nebo 8 jako diagnostické protilátky.
12. Použití peptidů nebo směsi peptidů podle libovolného z nároků 1 až 4 při imunizaci savce, který není člověk, za vzniku monospecifických protilátek řízených proti viru TT.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SE9901601A SE9901601D0 (sv) | 1999-05-04 | 1999-05-04 | Peptides from the TT virus sequence and monospecific antibodies binding to the TT virus |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ20013638A3 true CZ20013638A3 (cs) | 2002-03-13 |
Family
ID=20415453
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ20013638A CZ20013638A3 (cs) | 1999-05-04 | 2000-05-03 | Peptid nebo směs peptidů a jejich pouľití, monospecifická protilátka a diagnostická sada |
Country Status (16)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20030022158A1 (cs) |
EP (1) | EP1177210A1 (cs) |
JP (1) | JP2003502285A (cs) |
KR (1) | KR20020008172A (cs) |
CN (1) | CN1352649A (cs) |
AU (1) | AU4560800A (cs) |
CA (1) | CA2370495A1 (cs) |
CZ (1) | CZ20013638A3 (cs) |
HU (1) | HUP0200869A2 (cs) |
IL (1) | IL145848A0 (cs) |
IS (1) | IS6143A (cs) |
NO (1) | NO20015376L (cs) |
PL (1) | PL352064A1 (cs) |
RU (1) | RU2001127439A (cs) |
SE (1) | SE9901601D0 (cs) |
WO (1) | WO2000066621A1 (cs) |
Families Citing this family (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6933366B2 (en) | 1996-12-27 | 2005-08-23 | Tripep Ab | Specificity exchangers that redirect antibodies to bacterial adhesion receptors |
US6660842B1 (en) | 1994-04-28 | 2003-12-09 | Tripep Ab | Ligand/receptor specificity exchangers that redirect antibodies to receptors on a pathogen |
WO2004067549A2 (de) * | 2003-01-31 | 2004-08-12 | Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin | Peptide gegen kälteunverträglichkeit hervorrufende autoantikörper und ihre verwendung |
US7335359B2 (en) | 2003-02-06 | 2008-02-26 | Tripep Ab | Glycosylated specificity exchangers |
US7318926B2 (en) | 2003-02-06 | 2008-01-15 | Tripep Ab | Glycosylated specificity exchangers |
WO2008127279A2 (en) * | 2006-10-05 | 2008-10-23 | Cerebus Biologicals, Inc. | Methods for treating, preventing and diagnosing porcine ttv infection |
EP2356132A2 (en) * | 2008-10-16 | 2011-08-17 | Pfizer Inc. | Torque teno virus (ttv) isolates and compositions |
US8846388B2 (en) | 2009-10-16 | 2014-09-30 | Zoetis Llc | Infectious clones of torque teno virus |
CN103865955A (zh) * | 2009-10-16 | 2014-06-18 | 佐蒂斯有限责任公司 | 细环病毒的感染性克隆 |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1999005282A1 (fr) * | 1997-07-25 | 1999-02-04 | Tamura, Ryoji | Gene du virus de l'hepatite non-b, non-c, non-g, polynucleotide, polypeptide et virion correspondants, procede de separation du virion, et procede de detection de ce virus |
AU4259299A (en) * | 1998-05-13 | 1999-11-29 | Innogenetics N.V. | New sequences of tt viruses for use in diagnosis, prevention and treatment of ttv infections |
JP2000135087A (ja) * | 1998-10-29 | 2000-05-16 | Srl Inc | 抗ttウイルス抗体測定用ペプチド及びそれを用いたttウイルスの血清型分類方法 |
-
1999
- 1999-05-04 SE SE9901601A patent/SE9901601D0/xx unknown
-
2000
- 2000-05-03 AU AU45608/00A patent/AU4560800A/en not_active Abandoned
- 2000-05-03 CA CA002370495A patent/CA2370495A1/en not_active Abandoned
- 2000-05-03 IL IL14584800A patent/IL145848A0/xx unknown
- 2000-05-03 WO PCT/EP2000/003958 patent/WO2000066621A1/en not_active Application Discontinuation
- 2000-05-03 CZ CZ20013638A patent/CZ20013638A3/cs unknown
- 2000-05-03 RU RU2001127439/13A patent/RU2001127439A/ru unknown
- 2000-05-03 CN CN00807153A patent/CN1352649A/zh active Pending
- 2000-05-03 PL PL00352064A patent/PL352064A1/xx unknown
- 2000-05-03 JP JP2000615650A patent/JP2003502285A/ja active Pending
- 2000-05-03 EP EP00927128A patent/EP1177210A1/en not_active Withdrawn
- 2000-05-03 KR KR1020017013998A patent/KR20020008172A/ko not_active Application Discontinuation
- 2000-05-03 HU HU0200869A patent/HUP0200869A2/hu unknown
-
2001
- 2001-11-01 IS IS6143A patent/IS6143A/is unknown
- 2001-11-02 NO NO20015376A patent/NO20015376L/no not_active Application Discontinuation
- 2001-11-05 US US09/992,896 patent/US20030022158A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
SE9901601D0 (sv) | 1999-05-04 |
CA2370495A1 (en) | 2000-11-09 |
NO20015376L (no) | 2001-12-06 |
IS6143A (is) | 2001-11-01 |
HUP0200869A2 (en) | 2002-08-28 |
CN1352649A (zh) | 2002-06-05 |
JP2003502285A (ja) | 2003-01-21 |
KR20020008172A (ko) | 2002-01-29 |
RU2001127439A (ru) | 2004-02-27 |
NO20015376D0 (no) | 2001-11-02 |
PL352064A1 (en) | 2003-07-28 |
US20030022158A1 (en) | 2003-01-30 |
EP1177210A1 (en) | 2002-02-06 |
IL145848A0 (en) | 2002-07-25 |
AU4560800A (en) | 2000-11-17 |
WO2000066621A1 (en) | 2000-11-09 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Saikawa et al. | Neutralizing linear epitopes of B19 parvovirus cluster in the VP1 unique and VP1-VP2 junction regions | |
US6416944B1 (en) | Methods of typing hepatitis C virus and reagents for use therein | |
US7371386B2 (en) | Conserved motif of hepatitis C virus E2/NS1 region | |
JP2008074867A (ja) | ペプチドリガンドを介して結合された複数の免疫原性成分を有するhbvコア抗原粒子 | |
JPH08509692A (ja) | E型肝炎ウイルスペプチド抗原および抗体 | |
US5582968A (en) | Branched hybrid and cluster peptides effective in diagnosing and detecting non-A, non-B hepatitis | |
CZ20013638A3 (cs) | Peptid nebo směs peptidů a jejich pouľití, monospecifická protilátka a diagnostická sada | |
US5639594A (en) | Linear and branched peptides effective in diagnosing and detecting non-A, non-B hepatitis | |
PT85137B (pt) | Processo de preparacao de um polipeptido de composito imunogenico, de melhoramento da imunogenicidade de um imunogenio e de atenuacao da falta de capacidade de resposta a uma vacina do virus da hepatite b | |
JP2002506419A (ja) | A型肝炎ウイルスポリタンパク質の抗原反応性領域 | |
WO2021233927A1 (en) | Antibody that binds specifically to the sars cov 2 spike protein, and methods for its manufacture | |
UA73475C2 (en) | Hepatitis b virus strain, induced by vaccine, nucleic acid isolated molecule coding mutant main surface antiigen of hepatitis b virus, vector and vector system for the preparation of polypeptide, a method for the preparation of polypeptide (variants), purified polypeptide (variants), oligonucleotide, a method for the preparation of antibodies (variants), antibody (variants), a method for the determination of chemical compound for treating the infection of hepatitis b strain infection, a composition, a method for the preparation of composition, a method of organism liquids screening for hepatitis b virus, a method of antibody use, vaccine against hepatitis | |
Steward et al. | Immunity to hepatitis B: analysis of antibody and cellular responses in recipients of a plasma-derived vaccine using synthetic peptides mimicking S and pre-S regions. | |
JPH0940694A (ja) | 肝炎gbウイルスの合成ペプチド及びその使用 | |
JPH07503133A (ja) | 風疹ワクチン用合成ペプチド | |
PT671946E (pt) | Peptidos imunorreactivos do virus epstein-barr | |
Zhang et al. | Antigenic structure of the hepatitis C virus envelope 2 protein | |
EP1137779A2 (en) | Identification of senv genotypes | |
US7223535B2 (en) | Synthetic peptides immunoreactive with hepatitis A virus antibodies | |
JP2004535369A (ja) | 試薬およびワクチンとして使用するための免疫原性hivペプチド | |
US20030022155A1 (en) | Method for detecting hepatitis c virus with hybridomas | |
Liu et al. | Expression of hepatitis C virus E2 ectodomain in E. coli and its application in the detection of anti-E2 antibodies in human sera | |
Allain et al. | Hypervariable region diversity of hepatitis C virus and humoral response: Comparison between patients with or without cirrhosis | |
JPH04305156A (ja) | C型肝炎ウイルス関連抗体および抗原の測定法 | |
EP1536013A1 (en) | Dna sequence useful in diagnosing hepatitis and polypeptide encoded thereby |