CN1769455A - 口腔白斑癌变相关基因 - Google Patents

Abstract

本发明涉及在口腔白斑癌变过程中，表达持续降低的基因。口腔白斑癌变过程中，表达持续降低的基因有10条，它具有如SEQID：1、SEQID：2、SEQID：3、SEQID：4、SEQID：5、SEQID：6、SEQID：7、SEQID：8、SEQID：9、SEQID：10所示的核苷酸序列。本发明所公开口腔白斑癌变相关基因，其优点表现在：设计开发口腔癌前病变诊断、判断预后等用途生物芯片，进一步研究挖掘药物作用靶点，为个体化药物治疗提供依据。

Description

口腔白斑癌变相关基因

技术领域

本发明关于口腔癌变相关基因，特别关于口腔白斑癌变表达持续降低的基因。

背景技术

口腔鳞癌占全身恶性肿瘤的4％，由于口腔位于呼吸道与消化道的重要位置，病变结果严重影响患者的生活和生存质量。研究口腔鳞癌的发生发展机制是从根本上防治肿瘤的关键。

口腔白斑是口腔鳞癌的主要来源之一，对于白斑癌变机制研究，国内外学者多应用传统病理、免疫组化、电镜及分子生物学技术对单个或多个基因进行研究。随着基因芯片技术的出现，目前，已有许多学者应用芯片技术对膀胱癌、乳腺癌、口腔癌、食道癌等进行基因表达谱研究，并对新发现具有应用潜能的靶点进行专利保护。

传统的分子生物学检测手段一次实验仅检测一个或几个基因，不能总体把握白斑癌变相关靶基因群的作用。虽然已有学者使用芯片技术对口腔癌、食道癌等进行基因表达谱研究，但由于口腔粘膜白斑癌变过程较长，且其癌变不确定性，难以在临床患者中作动态性跟踪研究。因此，对于口腔白斑癌变过程可疑基因的研究缺乏***报道。且目前常用的芯片数据处理方法Heirarchical clustering在芯片数据量大、数据复杂情况下，常会造成不准确甚至错误聚类影响结果分析。

发明内容

本发明的目的在于：提供在口腔白斑癌变过程中，表达持续降低的基因。

本发明的目的是通过以下技术方法来实现的：使用基因芯片技术结合CPP-SOM数据分析方法对白斑癌变全过程的基因表达谱进行动态性跟踪研究，从而整体水平上把握白斑癌变相关靶基因群。本发明有以下步骤(1)4NQO诱导的大鼠白斑癌变模型的建立及样本收集；(2)样本总RNA提取和芯片杂交；(3)芯片扫描及数据分析。

口腔白斑癌变过程中，表达持续降低的基因10条，它具有如SEQID：1、SEQID：2、SEQID：3、SEQID：4、SEQID：5、SEQID：6、SEQID：7、SEQID：8、SEQID：9、SEQID：10所示的核苷酸序列。

SEQID：1基因编码的蛋白是羧酸酯酶1、SEQI D：3基因编码的蛋白是白细胞素2受体γ链、SEQID：4基因编码的蛋白是CD80抗原、SEQID：5基因编码的蛋白是甲状腺激素受体β、SEQID：6基因编码的蛋白是ATP酶，Na+K+转运，α1、SEQID：7基因编码的蛋白是解聚素及金属蛋白酶domain6、SEQID：8基因编码的蛋白是细胞外蛋白酶抑制剂、SEQID：9基因编码的蛋白是泛激素类似物3。

本发明所公开口腔白斑癌变相关基因，其优点表现在：

1、通过对口腔白斑癌变全过程的基因表达谱进行动态性跟踪研究，筛选出白斑癌变过程相关靶基因群，可从整体水平快速、全面把握白斑癌变机制；

2、可推动口腔白斑诊治和预后判断等水平的提高；

3、以此为基础，设计开发口腔癌前病变诊断、判断预后等用途生物芯片，进一步研究挖掘药物作用靶点，为个体化药物治疗提供依据。

附图说明

图1显示总RNA提取结果

图2显示CPP-SOM动态展示轻度异常增生阶段基因的变化情况，黑色代表基因上调，白色代表基因下调

图3显示CPP-SOM动态展示中度异常增生阶段基因的变化情况，黑色代表基因上调，白色代表基因下调

图4显示CPP-SOM动态展示重度异常增生阶段基因的变化情况，黑色代表基因上调，白色代表基因下调

图5显示CPP-SOM动态展示原位癌阶段基因的变化情况，黑色代表基因上调，白色代表基因下调

图6显示CPP-SOM动态展示鳞癌阶段基因的变化情况，黑色代表基因上调，白色代表基因下调

具体实施方式

下面结合实施例对本发明作进一步描述。

实施例1

1.14NQO诱导的大鼠白斑癌变模型的建立及样本收集

1.1-1动物和材料：Wistar雄性大鼠20只，体重220±10g，鼠龄160天，每4只一笼，室温23±2℃，湿度30-50％，精制颗粒饲料，24小时光暗循环条件下饲养。

4NQO：美国Sigma公司产，用蒸馏水制成0.0002％浓度溶液4℃避光保存备用。

1.1-2分组：35只大鼠按随机数字表分为2组，正常对照组5只，普通自来水喂养；实验组17只，4NQO饮水喂养；分别于9周、13周、16周、20周、24周、32周处死。观察大体变化，留取舌标本。将舌背后1/3病损处自中线剖开，一半置10％中性***溶液中固定，常规石蜡包埋，4um切片，HE染色后光镜观察。一半置于RNAlater(Qiagen公司)中，-80℃保存。

1.1-3组织病理学检查

诊断标准：根据WHO口腔癌前病变协作中心12项诊断标准(1978)对标本进行分级诊断(包括正常黏膜、轻度异常增生、中度异常增生、重度异常增生、原位癌、鳞癌)，所有诊断均采用双盲法证实。

收集正常组织5例，轻度异常增生4例，中度异常增生6例，重度异常增生6例，原位癌(24周)4例，鳞癌(32周)5例。

1.2样本总RNA提取和芯片杂交

1.2-1RNase free(去RNA酶)条件下，使用Trizol法(Trizol试剂一步法的步骤1.冻存组织加入1mltrizol，匀浆器匀浆，室温放置5分钟；2.加0.2ml氯仿，震荡15秒；3.4度12000rpm离心15分钟；4.取上清，加入0.5ml异丙醇，摇匀室温放置10分钟；5.4度12000rpm离心10分钟；6.弃上清，在沉淀中加入1ml 75％乙醇洗涤RNA，4度7500rpm离心5分钟7.自然干燥RNA，溶于甲酰胺或纯水中分装。)提取样本总RNA。样品经分光光度计检测吸光度A值。经琼脂糖凝胶电泳检测28S、18S条带变化.Rneasy试剂盒(Qiagen公司)纯化总RNA。

1.2-2探针的制备和芯片杂交：所用芯片为Amersham商品化芯片-codelink Uniset Rat I Bioarry。

利用CodeLink试剂盒制备探针，合成cDNA双链后体外反转成cRNA标记生物素。用T7引物和SuperScript II逆转录酶与10μg总RNA在42℃孵化1小时合成第一链cDNA。第一链cDNA同E.coliDNA聚合酶I和RNaseH混合，在16℃孵化2小时合成第二链cDNA，形成的双链cDNA使用QIAquick^TM PCR纯化试剂盒(Qiagen公司)纯化。用T7RNA聚合酶和biotin-11-UTP体外转录合成生物素标记的cRNA。用RNeasy试剂盒(Qiagen公司)纯化cRNA。使用5×fragmentation buffer(片断化缓冲液)94℃加热20分钟片段化cRNA。片段化后的cRNA与Uniset bioarry放置于CodeLink提供的shaker上，摇床调整转速300rpm，37℃孵化过夜。0.75×TNT buffer 46℃洗涤孵化1小时。然后，使用Cy5-Streptavidin(Cy5-抗生物素蛋白链菌素)室温下避光孵化30分钟。1×TNT洗涤芯片4次(每次5分钟)，在0.1×SSC/0.05％TweenTM中冲洗芯片30秒后，2000rpm离心3min甩干。

1.3芯片扫描及数据分析

用Array Scanner(Axon公司)扫描芯片。用codelink expressionanalysis software进行图像处理和数据的标准化。然后采用建立在Matlab 5软件包基础之上的CPP-SOM(自组织图结合成分平面展示方法)进行数据的进一步分析和展示。

2.结果

2.1总RNA提取结果

总RNA紫外分光度OD260/OD280：Ratio值介于1.7-2.0之间。总RNA电泳：清晰的28S、18S条带，且28S条带的亮度为18S带的两倍。(见图1示)。

CPP-SOM动态展示不同阶段基因的变化情况，黑色代表基因上调，白色代表基因下调。(见图2、3、4、5、6示)。

2.3差异表达基因分析

口腔白斑癌变过程中，表达持续降低的基因有10条(表1)。

表1

部分表达显著降低的基因

编号	基因名称	SEQ	Accn	Unigene
					1	carboxylesterasel(羧酸酯酶1)	SEQID：1	NM_031565.1	RN.111029
2	LOC362136	SEQID：2	XM_342436.	Rn.23556

3	interleukin 2 receptor，gamma chain(白细胞素2受体γ链)	SEQID：3	NM_080889	Rn.14508
					4	CD80antigen(CD80抗原)	SEQID：4	U05593	Rn.10138
5	thyroid hormonereceptor beta(甲状腺激素受体β)	SEQID：5	J03819	Rn.88692
					6	ATPase，Na+K+transporting，alpha 1(ATP酶，Na+K+转运，α1)	SEQID：6	NM_012504.1	Rn.2992
7	a disintegrin andmetalloproteinase domain6(Adam6)(解聚素及金属蛋白酶domain 6)	SEQID：7	NM_138906	Rn.24189
					8	extracellularproteinase inhibitor(细胞外蛋白酶抑制剂)	SEQID：8	NM_133537.1	Rn.10437

					9	ubiquitin-like 3(泛激素类似物3)	SEQ ID：9	NM_001015030	Rn.12128
10	neuropilin	SEQID：10	AF016296	Rn.10815

SEQUENCE LISTING

<110>上海第二医科大学附属第九人民医院

<120>口腔白斑癌变相关基因

<130>/

<160>10

<170>PatentIn version 3.1

<210>1

<211>1941

<212>DNA

<213>褐家鼠(norway rat)

<400>1

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<210>2

<211>533

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<213>褐家鼠(norway rat)

<400>2

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<211>1611

<212>DNA

<213>褐家鼠(norway rat)

<400>3

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<212>DNA

<213>褐家鼠(norway rat)

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<210>5

<211>4535

<212>DNA

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<400>5

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aaagaactac tcatgctgta ggctgtccaa ttagggagaa tgctccccgt ggatcggcaa    2700

ggcgctttac ccattcacaa atgtctccca gtcccatccc gtctctgctc ccaaacccac    2760

ctcctcagat tctgagacac taaatagctt ctcttctctt ctcttctctt ctcttctctt    2820

ctcttctctt ctcttctctt ctcttccctt ctcttctctc tctcaacact aactcttctg    2880

tagcttatac actattacct tggcaaatag tcctcataaa atataggaga ccatgcatag    2940

gaaacaccat tacgctgccc catccccagt gaccgtgtag agtagatgtc tctaagcaac    3000

cagtagtgac aacttaccca aaaatgggca gactgtaccc atgcaactga atgtacgact    3060

cttcactgat gtcacagatg tgaactactt cttgtctgcc tttcactgcc ttagcctgga    3120

aatgctggga aaaacaagcc atatcagtga gaattaccta aaagcaaagg aagtcactgt    3180

gaaaagcaag ggaactcact tcttcccacc gggctcggta gagcatcttt ggcctcacag    3240

caagtcaggg tgcctgcggc ctgggtcatt taggacctta tcagtgttag ttttcttacc    3300

tcctagtaaa tgagttgatc tccagaaacc cctcttccct tctctagtgt ttgacttttc    3360

agactaagga gggggcgtct ttgaaagatt ccttttctat tcaaacttct agcttcggaa    3420

acggaatgca tgtgggtgct catggagtga gaatgaggat ttgattcaga ggaaggcaga    3480

atgacctcgg aagcagagag gtacagccct gaaagtcttt ggaaataact gaggaaaagg    3540

gaacagtctg tgcagggaac taaagattta gcctgatgtt ttagcagata aaaacatcgc    3600

tgtagacttg gtgtggagat taaatagaaa caagaagccc ccagagagtc aagttcaagc    3660

atctgtctga gatttgcttt cccaggcaac ctgtacccag cctcctccct caggaatttc    3720

attaaaacat ctgtcccctc tgtcagctct cctggaatgc ctctgtccag acaattaaaa    3780

cacacttgct gtgagaccag ttctccgtcc aaagagggag agagggaggt gacaggtagg    3840

tgagtcccac acaggcatac aaacttctgg ggcaccagag tttctgagga agtttcctga    3900

tgctgacagt tttcaaatgg catcggaaac cctggcatta gtgcagggtt tgacccaggg    3960

tcattcagag cgctgtaaag attaagcgct gggcactagc ccggtcctca caatccagcc    4020

agccacagca cagtgaccct ccctctgtag aggctcacct ttcagggacg aaccaggctg    4080

tagcaaccgt ggagactgag tactgaacaa gacaagcaag cttcagtctt ctggcgggaa    4140

ggaacaagaa cggtaggcat tcagaatggc cttcgagaaa ctcattttat gcactagatt    4200

gtgagggatt tgctcccaat gttttttttt ttcttcttct tcttcttctt tttcaaagtc    4260

attcccttct aatcttgtcc agactttcaa ttcaagtgtg gacgcggtga caagaacctt    4320

tacacctgct ccaccgtggg gagactttcc agtcaaggag aacacgctca tcctgctggg    4380

gcactcactg acaaatggta ttcatgaacg agaaggctgt gcacatgcaa ccgacatgtg    4440

cgtgtgcacacatgtgcgta catccggtcg ttgcctcaag tgtactt tgc acttcagtta    4500

aaatgtgcag aacttccaga aactggaaga agaag                               4535

<210>6

<211>3636

<212>DNA

<213>褐家鼠(norway rat)

<400>6

ggagcctcgg cgggaggagg cggacacgtg gcagcggcgg cggcagcggc agcagcagcg    60

gcggcagcag cggcggcctc ggtccggggc gccggccgtc ctccctcttt cctccggcgg    120

cagccctagt tcccgcctct cggctccccc ggctccactc tcccagccgg gagctgctct    180

ctcctctttc tagtctccag ccacaggacc cggcgcgggg cccgcagcgc cgccaccatg    240

gggaaggggg ttggacgaga caagtatgag cccgcagctg tatcagaaca tggggacaag    300

aagagcaaga aggcgaagaa ggaaagggac atggacgaac tcaagaagga agtgtctatg    360

gacgaccata aactcagcct ggatgaactc catcgtaaat acggaacaga tttgagccga    420

ggcctaacac ccgcaagggc cgctgagatc ctggctcggg atggccccaa cgccctcacg    480

ccccctccca ctactcccga gtgggtcaaa ttctgtcggc agctgttcgg tggcttctcc    540

atgttactgt ggattggagc cattctttgt ttcttggctt atggcatccg aagtgctaca    600

gaagaggaac caccaaatga tgatctgtac ctcggggtcg tgctgtctgc tgtcgtcatc    660

ataactggct gtttctccta ttatcaagaa gcaaaaagct ccaagatcat ggaatccttc    720

aagaacatgg tccctcagca agccctcgtg attcgaaatg gagagaagat gagcatcaac    780

gcagaggatg tcgtcgttgg tgatctggtg gaggtgaagg gcggagaccg aatccctgct    840

gatctcagaa tcatatctgc aaatggctgc aaggtggata actcctcact cactggtgaa    900

tcagaacccc agactcggtc cccggatttc acaaacgaga accccttgga gacaaggaac    960

attgccttct tctcaaccaa ctgtgttgaa ggaactgcac gtggcatcgt tgtgtacact    1020

ggggatcgca ccgtgatggg caggatcgcc acccttgctt ctgggctgga aggcggccag    1080

acccccattg ctgaagaaat cgagcacttc atccacctca tcacgggtgt ggccgtgttc    1140

ctgggggtgt ctttcttcat tctctctctg atccttgagt acacctggct cgaggctgtc    1200

atcttcctca ttggtatcat cgtagccaac gtgccggaag gtttgctggc caccgtcacg    1260

gtatgtctga cgctcactgc caagcgcatg gcgaggaaga actgcctggt gaagaacctg    1320

gaagctgtgg agaccttggg gtccacatcc accatctgct ccgacaagac tggaactctg    1380

actcagaacc ggatgacagt ggctcacatg tggtttgaca atcaaatcca tgaagctgac    1440

accacagaga atcagagtgg ggtctccttt gacaagacgt cagccacctg gttcgctctg    1500

tccagaattg ctggtctctg taacagggca gtgtttcagg ctaaccaaga aaacctgcct    1560

atccttaagc gtgcagtagc gggagatgct tccgagtcgg cgctcttaaa gtgcatcgag    1620

gtctgctgtg gctccgtgat ggagatgagg gagaagtaca ccaagatagt ggagattcct    1680

ttcaactcca ccaacaagta ccagctctcc attcacaaga acccaaacgc atcggagcct    1740

aagcacctgc tagtgatgaa gggcgcccca gaaaggatcc tggaccgatg cagttctatc    1800

ctcctccacg gcaaggagca gcccctggac gaagagctga aggacgcctt tcagaatgcc    1860

tacctagagc tggggggcct tggagagcgt gtgctaggtt tctgccacct ccttctgcct    1920

gacgaacagt ttcccgaagg cttccagttt gacactgatg aagtcaattt ccccgtggat    1980

aacctctgct tcgtgggtct tatctccatg attgaccctc ctcgagctgc tgtccccgat    2040

gctgtgggca aatgccgcag cgctgggatt aaggtcatca tggtcacagg agaccatcca    2100

atcacagcca aagccattgc taagggggtg ggcattatct cagaaggtaa cgagaccgtg    2160

gaagacattg ctgcccgcct caacattcca gtgaaccagg tgaaccccag agatgccaag    2220

gcctgtgtag tacatggcag tgacttgaag gacatgacct ctgaggagct ggatgacatt    2280

ttgcggtacc acacggagat tgtctttgct aggacctctc ctcaacagaa gctcatcatt    2340

gtggagggct gccagcggca gggtgccatc gtggctgtca caggggatgg tgtcaatgac    2400

tctccagctt tgaaaaaggc agatattggg gttgccatgg ggattgttgg ctcggatgtg    2460

tccaagcaag ctgctgacat gattcttctg gatgacaact ttgcctccat cgtgactgga    2520

gtagaagaag gtcgtctgat atttgataac ttgaagaaat ccattgctta caccctaaca    2580

agtaacattc cggaaatcac ccccttcttg atatttatta ttgcaaacat tccactgccc    2640

ctgggcaccg tgaccatcct ctgcattgac ttgggcactg acatggttcc cgccatctct    2700

ctggcctatg aacaggctga aagtgacatc atgaagaggc agcccagaaa tcccaaaacg    2760

gacaaacttg tgaacgagcg tctgatcagc atggcctatg gacagatcgg tatgatccag    2820

gccctgggag gcttcttcac ttattttgtg attctggctg agaacggttt cctgcccttt    2880

cacctgttgg gcatccgaga gacctgggat gaccgctgga tcaatgatgt ggaggacagc    2940

tacgggcagc agtggaccta cgagcagagg aagattgtgg agttcacctg ccacacggcc    3000

ttctttgtca gtatcgtggt agtgcagtgg gctgacttgg tcatctgcaa gaccagaagg    3060

aattctgt   tccagcaggg aatgaagaac aagatcttaa tatttggcct ctttgaagag    3120

acagctcttg ctgctttcct gtcctactgc cctgggatgg gtgcagccct taggatgtat    3180

cccctcaaac ctacttggtg gttctgtgcc ttcccctact cccttctcat cttcgtgtat    3240

gacgaggtgc ggaagctcat catcaggcga cgccctggcg gctgggtgga gaaggaaacc    3300

tactactagc ccactgccct gcacgccgtg gaacattgtg ccacacactg cacctacccc    3360

taccccccct ttgtgtactt caagtcttgg agctcggaac tctaccctgg taggaaagca    3420

ccaaagcatg tggggatcca gacgtcctgg aatgaagcat gtagctgtaa tggggggcgg    3480

ggggagggct gcccgaaaaa caccgtggac ggggacgaca gcggggaagg tttatatgtg    3540

cctttttgtt tttgtaaaaa aggaaaacct ggaaagactg aaagattacg ttttatatct    3600

ggatttttac aaataaagat ggctattata acggaa                              3636

<210>7

<211>2508

<212>DNA

<213>褐家鼠(norway rat)

<400>7

ggcagtggcc acagcagagg aatatagctt cacccaggat gttatctctg acctggggta    60

tgaagctagt ggaaagatct gtggtcccca gggtcctcct cttgctcttt gcactctggc    120

tgctcctcct ggttccagtc cggtgttctg aaggccaccc cacttggcgc tacatctcat    180

cagaggtggt tattcctcgg aaggagatct accacagcaa aggaattcaa acacaaggac    240

ggctctccta tagcttgcgt tttaggggcc agagacatat catccacctg cgaagaaaga    300

cactaatttg gcccagacac ttgttgctga caactcagga tgaccaagga gccttacaga    360

tggattaccc ttttttccct gtagattgtt actattttgg ctacctagag ggaatccctc    420

aatccatggt cactgtgaat acttgctatg gaggcctgga agggatcatg atgttggatg    480

accttgccta tgaaatcaaa cccctcaacg attcacaggg gtttgaacac attgtttctc    540

agatagtatc agagcctgat gtaacagggc ctacaaatac atggaaacgc ttgaacctta    600

atacaggtcc tcccttatcc aggacagagt atgccaatgg aactcccaga atgtctagta    660

agaactacgc ttcacatcca gctgctataa aaggccaatt ccaagcaact aattctatat    720

ataaggaaag caacaatatt gatactgcgg ccaggtattt gtttgagctc cttagtataa    780

cggacagctt tctgatcact attcatatgc ggtactatgc tattctctta actgtgttta    840

ccgagagcga tccatttgca ctagagtata cggtaccagg gggctctatt tataactatt    900

atgtgtctaa cttttttaat cggttgaggc ctgatgcatc aaccgtactt aataaagatg    960

ggccctcgga taacgacttt catccagttg aacagagttt atgtactccc gcaggcctga    1020

cgattgttgg tcaacacaga cgaagttttc tagctctatc tgttatgatc accaatcgta    1080

ttgcgatgtc tttaggtata aaagctgatg atgagactta ctgcatctgc cacagaagga    1140

ccacttgcat tatgtacaaa aaccctgaaa taacagatgc tttcagcaat tgctcccttg    1200

tgcagataaa ccagatactg aatacccctg gtacaatgtc atgccttttc tatgaccacc    1260

atgtttatca taatataaca aaaacctaca ggttttgtgg aaacttcaag atagatatcg    1320

gtgagcagtg tgactgtggc tcacataagg catgttacgc agatccctgc tgcggaagta    1380

attgcaagtt aactgctggt agcatttgtg ataaagaatt atgctgtgca aactgcacct    1440

acagtccttc tgggacactc tgcagaccga tccagaacat atgtgatctt ccagaatact    1500

gtagtgggaa taatatcttt tgccctgcag acacttatct gcaagatggg acgccatgct    1560

cagaagaggg gtactgctat aaaggcaact gcacagatcg cagtgtgcag tgcaaggaaa    1620

tctttggtat gaatgctaag ggtgctaata tcaagtgcta tgacatcaac aaacaacggt    1680

ttcgatttgg gcactgcact agagcacaag agagcctcat gtttaatgct tgctctgatc    1740

atgataaact gtgtggaagg ctgcagtgta ccaacgtcac caatcttcca ttcctgcagg    1800

aacatgtttc attccatcaa tcggttatct ctgggtttac ctgctttggg cttgatgaac    1860

atcgtgggac agaaacaacg gatgctgggc tggtgaaaca tggtacccct tgctcccaaa    1920

ctaacttctg cgatcgagga gcttgcaatg gaagtttatc tcggttggat tatgactgca    1980

ccccagaaaa atgcaatttt agaggagtgt gtaataatca tcggcattgc cattgtcatt    2040

taggttggaa acctcctctg tgcagagagg aggggcctag cgggagcacg gacagtgggt    2100

cccctccgaa ggaaaggcgc acaataaaac agagcagaga accactgtta tatttaagaa    2160

tgctctttgg tcgtctttat ttattcattg tctcgctgct ctttggagtg gccactcgcg    2220

caggagttat taaggtcttt aagtttgaag acttgcaagc tgctctgcgg gctgcacaag    2280

ccaaggcgac ttaaagatga acgaggtcct cgtaagataa agagaatgca aaaatgcatg    2340

tcaagagggg acaaggtaga actccagtcc acagttctgg agagccttca tctatatcgt    2400

ggggacgcaa gaggttttgg atttggatac cacctgacat tggtgggtta ctgatgctca    2460

cactcgaata aatctttcaa aaccgcaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaa                 2508

<210>8

<211>429

<212>DNA

<213>褐家鼠(norway rat)

<400>8

gacagcctca gtcttgcttc tggtggcttt gatcgccgtg ggaatgaaca ttacctatgc    60

tctgttttct cccacaaaat tagaaaaacc tggaaagtgt cccaagaatc ccccaagaag    120

tattggcact tgtgttgaat tatgctcagg agatcaatcg tgccccaaca tacagaagtg    180

ctgttccaat ggctgtggtc atgtttgcaa atctcctgtc ttttaagtta ctaacagcga    240

tctggaatat ggatttgatc ttcataagca cgactgatgg ccagccccag aagatttctt    300

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ggaagatcta tactgtgatg acagcttcct aatgtgtttg tgtccacaaa taaactctcc    420

ttagcattc                                                            429

<210>9

<211>2722

<212>DNA

<213>褐家鼠(norway rat)

<400>9

caggaggcgg ccggggcgtg tgggattgag gagtggagga ggaggcggag agtcagggct    60

ctgaggggga gctgttccca agctaaggga ggagcccccg gaagacgccg cggaaggcag    120

cgaggcggag gcggccggag tacggacgcg atgtggcccg acccgcgctg ctgcgctgag    180

gcgcccgcgg cctgagcccc ccggcgctgc gctcggttcg gctcggcccg gttcggctcg    240

gctcggcggc cggcgaggtc gatgcccttg agcgcggctg cgcgcagctc ggctgtgcgg    300

ccccgcggcg cgcgctgagc ttctcggcgg ccccggccgc tctcagctcg gcgctcgatg    360

tgtagccaca tagttatctg tacacttcgt cgccggggct ttaatgagga cctgagtcgc    420

gagcgcgagt gaatcaccgc ctgggccggg gaaagaggac ggcgcattta accccctccc    480

accccactcc atgtccctgt gtcactcggc tctgtccacc tggcgcggcg ggtcctggag    540

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cccacgtaac ttctactttt tttttttcct tttgagaaag ctcagcacga accgatcaga    660

attgtgaagg gtttttgttt tttttttgtt ttttgttttg cttttgggtt ttccgaagct    720

ccagcacttc tgctcttgtt tttgttttgt tttctgcgta aacctctggc ccactctcaa    780

aaggcaagat gtccagtcat gtcccggcgg atatgattaa tttgcgcctc atcttggtga    840

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acgtgtatga caactggccc atggactggg aagaagagca ggtcagcagc ccgaacattc    960

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attcacaagg tcagagaaac cgggagaaaa ctggtgagag caactgctgt gtgatcctgt    1140

aacatcgtcg ccagcgcagg tgtggcagtc tgttaccact gcggggacag aggagactcg    1200

gcagcttccg acacctgtgg gacagtcgcc cgcacatcca gactgaacca ctcatgagct    1260

ctgtgatctc tcctcacaaa gtaaaaagaa ccaagaacat ttccagtctg gtcctttatt    1320

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caagtctctc aagtctctct ctgcagaaac cgccttgctg ccacaaagac tcctccacag    1440

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cagcgtaatc tgcacatgtc tgtggcgccc agacgttctc ctgtgtggag ttcaccctgg    1560

aggacgccca tcatcagtgc agttaatacc aggccagttg gaccggggaa atgggaagga    1620

atctaacatg ctgggtgaat tctaccaaag tcagccacag tggctgtcct cgaaggatgt    1680

cagactgggc atgactcttg tcaccacagc aaatgagaag ccatgcctgc tgctcacagc    1740

actctgtaga gggtgcccct gctgcctgcc caccgagtcc tccccacagg gggctcatgc    1800

agacagcaca gaggggccgc agtgtgtccc tagccttaat gtggaggggc cagtgtctcg    1860

gtgccatcac tgtgcagaac tggtgggaag cctcagcggt tgtgtacttg agtatcagaa    1920

gattgatagc ttgcgccacc atcactcatt cgaaccctgc cgagtgtact cgctcactag    1980

agcagaggga tccttttaaa gtctccagat gctaattttg ttactttctg tagtttgcat    2040

tcggaatcag tgcttgcaat tgtattaaaa tcacaagctg agttttaagg catacatgat    2100

caatagcgcc actcttattt ttaccaataa tttaaagatt gagatgctat aaataaacaa    2160

tttgcacagc actaaagcat gagctaattt catctaaacc tgtaaaaaaa agattttata    2220

tttttttcac tgggaagaaa tcttcctgga tgaaattaca aatatgtgta gattatattt    2280

aataaaaaag acataataaa atatctaact gtagaatgca aatatagatt ggcgtgtagc    2340

atatagacca gtattccata tcaataactt tatccagcct tttaaaagat gaagttgcag    2400

actacgttgt gttctgtatt taatgagggt tcttggccct cggcagcatt aaatgtaaat    2460

ggtctctatg gtcatctttg tttaaatgca atcaggttac tttattcatt gttaatgctt    2520

ccatgagaag gctttatatg cagtagatct acgaaaatat tgttcatact gatcagaatt    2580

aaatttgtat agagcagagt tttaaaatga atgtaaatag cactaaacct tttctttctg    2640

cagcctgtac ttaatagatt tcttctgtaa actaaataaa aaaaaattgt agtgcaaaaa    2700

aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aa                                             2722

<210>10

<211>3471

<212>DNA

<213>褐家鼠(norway rat)

<400>10

ggcacgagga ccggctgagg attttatggt tcttaagcgg acttaagagc gttgtttcgg    60

attgttaaga ttcccgtttg ctgggttttc ctccctcaat cgtgctctcc cgcggctgcc    120

tggggactgg ctcggcgaag gaggatggag agggggctgc cgttgctgtg cgccacgctc    180

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aaatgtgaat ggctaatcca agctccggag ccctaccaga gaatcatgat caacttcaac    360

ccacatttcg atttggagga cagagactgc aagtatgact atgtggaagt gatcgatgga    420

gagaatgaag gtggccgcct gtgggggaag ttctgtggga agatcgcacc ttcacctgtg    480

gtgtcttcag ggccatttct cttcatcaaa tttgtctctg actatgagac ccacggggca    540

ggattttcca tccgctatga aatcttcaag agagggcccg aatgttctca gaactataca    600

gcacctactg gagtgataaa gtcccctggg ttccctgaaa aataccccaa cagcttggag    660

tgcacctaca tcatctttgc accaaagatg tctgagataa tcctagagtt tgaaagtttt    720

gacctggagc aagactcaaa tcctcccgga ggagtgttct gtcgctatga ccggctggag    780

atctgggatg gattccctga agttggccct cacattgggc gttactgtgg gcagaaaact    840

cctggccgga tccgctcctc ttcaggcatt ctatccatgg tcttctacac tgacagcgca    900

atagcaaagg aaggtttctc agccaactac agcgtgctgc agagcagcat ctctgaagat    960

ttcaagtgta tggaggctct gggcatggaa tctggagaga tccattctga ccagatcact    1020

gcatcttccc agtatggtac caactggtct gttgagcgct cccgcctgaa ctaccctgaa    1080

aacgggtgga caccaggaga ggactcctac agggagtgga tccaggtgga cttgggcctc    1140

ctgcgattcg ttactgctgt ggggacacag ggtgccattt ccaaggaaac caagaagaaa    1200

tattatgtca agacttacag agtagacatc agctccaacg gagaggactg gatcaccctg    1260

aaggagggaa ataaagccat tatctttcag ggaaacacca atcccacgga tgttgtcttt    1320

ggagttttcc ccaaaccact gataactcga tttgtccgaa tcaaacctgc atcctgggaa    1380

actggaatat ctatgagatt tgaagtttat ggctgcaaga taacagatta cccttgctct    1440

ggaatgttgg gcatggtgtc tggacttatt tcagactccc agattacagc atccaaccaa    1500

ggagacagga actggatgcc agaaaacatc cgcctggtga ccagtcgaac cggctgggcc    1560

ctgccaccct caccccaccc atacatcaat gaatggctcc aagtggacct gggagatgag    1620

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aggaagttca agatcgccta cagtaacaat ggttctgact ggaaaatgat catggatgac    1740

agcaagcgca aggctaagtc ttttgaaggc aacaacaact atgacacacc tgagctccgg    1800

gcctttacac ctctctccac aagattcatc aggatctacc ccgagagagc cacacatagt    1860

gggctcggac tgaggatgga gctactgggc tgtgaagtag aagtgcctac agctggaccc    1920

acgacaccca atgggaaccc cgtggacgag tgtgacgatg accaggccaa ctgccacagt    1980

ggcacaggtg atgacttcca gctcacagga ggcaccactg tcctggccac agagaagcca    2040

accattatag acagcaccat ccaatcagag ttcccgacat acggttttaa ctgcgagttt    2100

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gtgggtacac tgagggtcaa actgcactac cagaagccag aggaatatga tcaactggtc    2400

tggatggtgg tcgggcacca aggagaccac tggaaggaag ggcgtgtctt gctgcacaaa    2460

tctctgaaac tgtatcaggt tatttttgaa ggtgaaatcg gaaaaggaaa cctcggtggg    2520

attgctgtgg atgatatcag tattaacaac cacattcctc aggaggactg tgcaaaacca    2580

acagacctag ataaaaagaa cacagaaatt aaaatagatg aaacagggag caccccagga    2640

tatgaagaag ggaaaggcga caagaacatc tccaggaagc caggcaatgt gcttaagacc    2700

ctggacccca tcctgatcac catcatagcc atgagtgccc tgggggtgct cctgggtgca    2760

gtctgtggag ttgtgctgta ctgtgcctgt tggcacaatg ggatgtcgga aaggaaccta    2820

tctgccctgg agaactataa ctttgaactt gtggatggtg taaagttgaa aaaagataaa    2880

ctgaacccac agagtaatta ctcagaggcg tgaaggcacg gagctggagg gaacaaggga    2940

ggagcgcggc aggagaacag tggaggcgca gggactctgt tactctgctt tcactgtaag    3000

ctgggaaggg cggggactct gttactccgc tttcactgta agctcggaag ggcatccgcg    3060

atgccatgcc aggcttttct caggagcttc aatgagcatc acctacagac acaagcaggt    3120

gactgcggta acaacaggaa tcatgtacag cctgctttct tctcttggtt tcgtttgggt    3180

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tttttcctct ctttctcctt accctgtggt ggattcttct cggaaactgc aaaatccaag    3300

atgctggcac taggcgttgt tcagtgggct ctttcgatgg acatgtgacc tatagcccag    3360

tgcctagagc atattagcat aaccacattt caggggacac caatgtccgc ttttgcatcg    3420

ctacgtgcag cgagcacagg aaaaagaaaa aaaaaaaaaa aaaaactcga g             3471

Claims (9)

1、口腔白斑癌变相关基因，其特征在于它在口腔白斑癌变中表达降低，它具有如SEQID：1、SEQID：3所示的核苷酸序列。

2、口腔白斑癌变相关基因，其特征在于它在口腔白斑癌变中表达降低，它具有如SEQID：4、SEQID：5所示的核苷酸序列。

3、口腔白斑癌变相关基因，其特征在于它在口腔白斑癌变中表达降低，它具有如SEQID：6、SEQID：7所示的核苷酸序列。

4、口腔白斑癌变相关基因，其特征在于它在口腔白斑癌变中表达降低，它具有如SEQID：8、SEQID：9所示的核苷酸序列。

5、口腔白斑癌变相关基因，其特征在于它在口腔白斑癌变中表达降低，它具有如SEQID：2、SEQID：10所示的核苷酸序列。

6、根据权利要求1所述的相关基因，其特征在于：SEQID：1基因编码的蛋白是羧酸酯酶1、SEQI D：3基因编码的蛋白是白细胞素2受体γ链。

7、根据权利要求2所述的相关基因，其特征在于：SEQID：4基因编码的蛋白是CD80抗原、SEQID：5基因编码的蛋白是甲状腺激素受体β。

8、根据权利要求3所述的相关基因，其特征在于：SEQID：6基因编码的蛋白是ATP酶，Na+K+转运，α1、SEQID：7基因编码的蛋白是解聚素及金属蛋白酶domain 6。

9、根据权利要求4所述的相关基因，其特征在于：SEQID：8基因编码的蛋白是细胞外蛋白酶抑制剂、SEQID：9基因编码的蛋白是泛激素类似物3。

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