CN1610556A - 保留天然变应原的免疫原性并具减弱的变应原性的重组杂合变应原构建体 - Google Patents

保留天然变应原的免疫原性并具减弱的变应原性的重组杂合变应原构建体 Download PDF

Info

Publication number
CN1610556A
CN1610556A CNA02809204XA CN02809204A CN1610556A CN 1610556 A CN1610556 A CN 1610556A CN A02809204X A CNA02809204X A CN A02809204XA CN 02809204 A CN02809204 A CN 02809204A CN 1610556 A CN1610556 A CN 1610556A
Authority
CN
China
Prior art keywords
apep
atom
sequence
protein
seq
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CNA02809204XA
Other languages
English (en)
Inventor
T·P·金
M·D·斯庞福特
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
ALK Abello AS
Rockefeller University
Original Assignee
ALK Abello AS
Rockefeller University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ALK Abello AS, Rockefeller University filed Critical ALK Abello AS
Publication of CN1610556A publication Critical patent/CN1610556A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/43504Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates
    • C07K14/43563Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates from insects
    • C07K14/43568Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates from insects from wasps
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/08Antiallergic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62DNA sequences coding for fusion proteins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2299/00Coordinates from 3D structures of peptides, e.g. proteins or enzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/20Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand
    • C07K2319/21Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand containing a His-tag
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/40Fusion polypeptide containing a tag for immunodetection, or an epitope for immunisation

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Insects & Arthropods (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

本发明公开了保持天然构象的重组杂合蛋白质,其具有至少一个抗原肽序列导入支架蛋白质中。本发明也公开了编码杂合蛋白质的重组核酸和载体。杂合蛋白质保留免疫原性而展示减弱的变应原性。因此,此杂合蛋白质在***反应的治疗中特别有用。

Description

保留天然变应原的免疫原性并具减弱的变应原性的 重组杂合变应原构建体
本申请依据35U.S.C.§119(e)要求美国临时专利申请系列号60/272,818(2001年3月2日提交)的优先权,所述临时专利申请特此全部引入此处作为参考。
发明领域
本发明涉及重组杂合蛋白质,其具有天然构象并且含有至少一个导入支架蛋白质的抗原肽序列。本发明还涉及编码重组胡蜂杂合蛋白质的重组核酸和载体,以及含有该重组载体的细胞。这些重组杂合蛋白质可用于引起免疫应答而不引起变应原应答,因此特别可用于***反应的治疗。
发明背景
具遗传易感性的个体会对多种环境来源的抗原变得敏感(过敏),即对个体所暴露的变应原敏感。当以前被致敏的个体再次暴露于相同或同源变应原时,就会发生***反应。***反应包括枯草热、rhinoconductivitis、鼻炎和哮喘至由于例如蜜蜂或大黄蜂蜇刺或昆虫叮咬引起的全身过敏反应和死亡。该反应立即发生并可以由多种变应原引起,所述变应原例如来自草、树、杂草、昆虫、食物、药物、化学物质和香料中的化合物。
变应原的生化方面
由蜜蜂和胡蜂的昆虫叮咬引起的***反应经常发生。胡蜂(vespid)包括大黄蜂(hornet)、小黄蜂(yellowjacket)和黄蜂(wasp)(Golden等人,1989,美洲医学协会会报(Am.Med.Assoc.)262:240)。易感人群暴露于微量的毒液蛋白质就可以被致敏;胡蜂一次叮咬即向皮肤内注入少至2-10μg的蛋白质(Hoffman和Jacobson,1984,***反应年鉴(Ann.Allergy)52:276)。
北美洲有许多种的大黄蜂(长黄胡蜂属,Dolichovespula)、小黄蜂(黄胡蜂属,Vespula)和黄蜂(马蜂属,Polistes)(Akre等人,1980,“北美墨西哥的小黄蜂”,552号农业手册(Agriculture Handbook),美国农业部)。胡蜂具有相似的毒液组成(King等人,1978,生物化学(Biochemistry),17:5165;King等人,1983,分子免疫学(Mol.Immunol.)20:297;King等人,1984,(Arch.Biochem.Biophys.)230:1;King等人,1985,***反应与临床免疫学杂志(J.Allergy and Clin.Immunol.)75:621;King,1987,***反应临床免疫学杂志(J.Allergy Clin.Immunol.)79:113;Hoffman,1985,***反应与临床免疫学杂志(J.Allergy andClin.Immunol.)75:611)。它们的毒液均含有三种主要的毒液变应原:磷脂酶(37kD)、透明质酸酶(43kD)和至今不知其生物学功能的抗原5(23kD)。
除上述昆虫毒液变应原外,几种主要变应原的完整氨基酸序列也已报道,它们来自不同的草(Perez等人,1990,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)265:16210;Ansari等人,1989,生物化学(Biochemistry)26:8665;Silvanovich等人,1991,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)266:1204)、树花粉(Breiteneder,1989,EMBO J.8:1935;Valenta等人,1991,科学(Science),253:557)、野草花粉(Rafnar等人,1991,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)266:1229;Griffith等人,1991,Int.Arch.Allergy Appl.Immunol.96:296)、螨(Chua等人,1988,实验医学杂志(J.Exp.Med.)167:175)、猫的皮屑(Griffith等人,1992,基因(Gene.)113:263)和霉菌(Aruda等人,1990,实验医学杂志(J.Exp.Med.)172:1529;Hah等人,1991,***反应与临床免疫学杂志(J.Allergy andClin.Immunol.)87:327)。这些主要变应原是10-40kD的蛋白质,它们具有相差很大的生物功能。几乎所有已知序列的变应原与我们环境中的其他蛋白质都具有不同程度的序列相似性。几乎所有已知变应原的全面列表都可以在万维网的网站allergen.org上查到,该列表由世界卫生组织(WHO)和国际免疫学标准协会(IUIS)变应原命名分会主办。
变应原的T细胞知B细胞表位
对蛋白质的抗体应答需要T辅助细胞和B淋巴细胞以及抗原呈递细胞(APC)的共同协作。B细胞的抗原受体是膜结合抗体(Ab)分子,其识别并直接结合免疫原。T细胞的抗原受体(TCR)仅仅识别并结合抗原肽-MHC家II类分子的复合体。免疫原首先由APC加工成肽,所述肽与MHC II类分子相连被呈递到APC表面(Unanue,1992,现代免疫学评论(Current Opinion in Immunol)4:63)。因为MHC分子在个体中具有高度多态性,故它们具有不同的抗原肽结合特异性(Rothbard和Gefter,1991,免疫学年评(Ann.Rev.Immunol.)9:527)。这是用于免疫应答的遗传调节的一种机制。
当抗原受体结合APC表面的肽-MHC复合体后,T辅助细胞被活化。活化的T细胞分泌淋巴因子。在小鼠中(Street和Mosmann,1991,FASEBJ.5:171)以及明显地在人中(Wierenga等人,1990,免疫学杂志(J.Immunol)144:4651;Parronchi等人,1991,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.USA.)8:4538),可以根据T辅助细胞的淋巴因子产生模式将T辅助细胞分成不同的类型。T辅助细胞主要分为两类:Th1细胞(产生IL-2和IFN-γ)和Th2细胞(产生IL-4和IL-5)。这些淋巴因子反过来影响抗原活化的B细胞分化并增殖发育成浆细胞,从而分泌出不同同种型的抗体。IL-4是一种已知可影响IgE合成的淋巴因子。(Finkelman等人,1990,免疫学年评(Ann.Rev.Immunol.)8:303)。
据认为,尽管蛋白质分子的所有可接近表面都可被B细胞抗原受体识别为表位,但并不一定所有的表位都以相同的机率被识别(Benjamin等人,1984,免疫学年评(Ann.Rev.Immunol.)2:67)。蛋白质的B细胞表位有两种类型:拓扑型和线型。拓扑型由空间临近但序列上不一定临近的氨基酸残基组成。线型仅仅由序列上临近的氨基酸残基组成。Ag-Ab复合体的X射线晶体学数据表明它们的互补结合区域的大小有16-17个氨基酸残基(Amit等人,1986,科学(Science)233:747)。与其他的蛋白质抗原相同,磷脂酶可能具有这两种类型的B细胞表位或只具有其中一种类型。胡蜂抗原5s具有这两种类型的B细胞表位。蜜蜂毒液蜂毒素似乎只具有一种线型的B细胞表位(King等人,1984,免疫学杂志(J.Immunol.)133:2668)。
由于蛋白质的T细胞表位是在APC的溶酶体中被蛋白酶加工而成的肽,故这些T细胞表位只含有线性类型(Unanue,1992,Curr.Op.Immunol.4:63)。对与MHC II类分子结合的天然加工的抗原肽的分析表明它们的大小从约13个到17个氨基酸残基,但对刺激T细胞增殖应答的合成肽-MHC II类分子复合体的分析揭示它们最小可为约8个氨基酸残基(参见Rudensky等人,1991,自然(Nature)353:622)。研究表明T细胞表位遍布整个蛋白质分子,并且依赖于所免疫宿主的MHC单元型,它们可以是主要或次要决定簇。(Roy等人,科学(Science)244:572;Gammon等,1987,免疫学评论(Immunol.Rev.)98:53;O’Hehir等人,1991,免疫学年评(Ann.Rev.Immunol.)9:67)。
已经知道,即发型超敏反应是由变应原特异的IgE的存在而引起的。IgE在循环***中出现,并且结合肥大细胞和嗜碱性粒细胞上的特异性IgE-Fc受体。通过变应原,与细胞结合的IgE发生交联,从而导致组胺、白细胞三烯和能够引起***反应症状的其它化学介质的释放。IgE是不同同种型免疫球蛋白中的一种。如上所述,T细胞分泌的淋巴因子影响B细胞中的同种型转换事件。
因为Th2细胞在决定B细胞的同种型转换事件中起主要作用,几种变应原的T细胞抗原表位已经被绘制(参见O’Hehir等人,上述)。这些变应原包括豚草AmbIII、黑麦草Lol pI、猫Fel dI、小鼠尿液Mus mI、蠓Chi tI、蜜蜂毒液磷脂酶A2(Dhillon等人,1992,***反应与临床免疫学杂志(J.Allergy and Clin.Immunol.)90:42)和蜂毒素(Fehlner等人,1991,免疫学杂志(J.Immunol.)146:799)。这些数据并没有揭示出任何罕见或常见的结构特征。然而,因为这些数据收集自不同单元型的人和小鼠,所以从这些数据得到的结论值得肯定。
T细胞和B细胞应答的调节
通常宿主可以通过克隆缺失和无变应性对自身蛋白质的显性B细胞表位和T细胞表位产生耐受。但这种耐受在特定环境下会被破坏(Gammon等人,1991,Immunol.Today 12:193;Basten等人,1991,免疫学评论(Immunol.Rev.)122:5)。有人提出,在自身免疫原性疾病中,这种自身耐受在遭遇与宿主蛋白质相似的外来蛋白质时受到破坏。因此变应原与自体蛋白质的序列相似性值得更深入细致的研究。
成熟B细胞响应多价抗原被激活,这些抗原能交联细胞表面的Ig受体(DeFranco,1987,细胞生物学年评(Ann.Rev.Cell Biol.)3:143),然而这些成熟B细胞在对单价抗原应答时会被赋予无变应性(Basten等人,1991,上述)。T细胞的抗原活化不仅需要TCR与肽-MHC复合体整合,而且需要TCR与APC表面的其它共刺激信号整合。(Schwartz,1990,科学(Science),248:1349;Jenkins和Miller,1992,FASEB J.6:2428)。在缺乏共刺激信号情况下TCR与肽-MHC复合体的相互作用可导致T细胞无变应性。
小鼠或大鼠实验性自体免疫脑脊髓炎(EAE)是一个已充分研究的多发性硬化模型。许多研究已经鉴定出髓鞘碱性蛋白的免疫显性T细胞决定簇,其可用于诱导此病症。对应于髓鞘碱性蛋白的免疫显性表位的肽可以诱导动物对同一肽抗原或完整髓鞘碱性蛋白产生耐受。诱导耐受的相同肽也可以在正在发生的自体免疫应答中诱导T细胞的无变应性(Gaur等人,1992,科学(Science)259:1491-1494)。
早期研究显示免疫原的物理状态和免疫路径是决定免疫应答结果的重要变量。从现今所了解的方面看,这些变量可以在很大程度上影响抗原呈递,从而使T细胞和B细胞活化或无变应性。
免疫疗法
一种治疗变应性疾病的方法是利用免疫疗法,其涉及向患者重复皮下注射刺激性变应原。对大多数进行免疫疗法的患者而言,最开始变应原特异的IgG水平将升高。在IgG上升后变应原特异的IgE水平逐渐降低(Norman,1993,现代免疫学评论(Current Op.Immunol.)5:968)。接受治疗的患者的T细胞细胞因子谱也表现出变化:IL-4和IL-5水平降低,而IFN-γ水平升高(Secrist等人,1993,实验医学杂志(J.Exp.Med.)178:2123)。
研究显示与利用低剂量变应原相比,利用高剂量变应原时免疫疗法对症状减轻更有效。然而,患者中出现不期望的全身***反应的潜在危险会限制变应原的有效剂量。由于利用天然变应原的免疫疗法会引起不期望的全身反应,因此对用于免疫疗法的具减弱变应原活性的修饰变应原的研发一直被人们所关注(T.P.King,1993,“支气管哮喘”,E.B.Weiss和M.Stein编辑,Little Brown,波士顿,43-49页;R.E.O’Hehir等人,1991,上述引文)。
变应原性依赖于多价变应原和嗜碱性粒细胞或肥大细胞上结合的IgE抗体间的相互作用。因此,蛋白质的变应原性的减弱可以通过降低其B细胞表位密度实现。蛋白质的B细胞表位密度的降低可通过几种途径完成。由于大多数B细胞表位是不连续类型,即依赖于蛋白质的天然构象,因此一种方法是通过利用化学处理或片断化使变应原部分或完全变性(Takatsu等人,1975,免疫学杂志(J.Immunol)115:1469;Pesce等人,1990,Int Arch Allergy Appl Immunol)92:88;Vrtala等人,1997,J Clin Invest99:1673)。例如,对来自豚草花粉的主要变应原的尿素处理导致不可逆变性,引起不连续B细胞表位丧失而保留连续B细胞和T细胞表位(Takatsu等人,1975,免疫学杂志(J Immunol)115:1469)。利用完全变性的豚草变应原对患者进行免疫治疗显示,尽管受治疗患者的外周血单核细胞确实对抗原刺激表现出减弱的增殖应答,但针对天然变应原的特异IgE和IgG水平却没有变化(Norman等人,1980,***反应临床免疫学杂志(J Allergy Clin Immunol)66:336)。也有人提出使用部分变性的变应原。例如重组的螨变应原,其缺少参与维持蛋白质天然构象的半胱氨酸残基(Smith等人,1996,分子免疫(Mol Immunol)33:399;T.Takai等人,1997,自然生物技术(Nature Biothechnology)15:754)。
已有两篇报道涉及利用T细胞表位肽调节变应原特异性的免疫应答。其中一篇提及利用来自猫主要变应原Fel dI的两个肽对小鼠进行皮下注射来降低对Fel dI完整分子的T细胞应答(Briner等人,1993,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.)90:7608-12)。另一篇涉及利用来自螨主要变应原Der pI的肽进行鼻内治疗来抑制首次实验小鼠或致敏小鼠的变应原特异应答(Hoyne等人,1993,实验医学杂志(J.Exp.Med.)178:1783-1788)。
这些发现提示了T细胞肽作为免疫治疗试剂的用途,原因在于它们缺少不连续B细胞表位,故T细胞肽类似变性的变应原。几种变应原的显性T细胞肽已在患者中测试;并观察到细胞因子水平变化但抗体水平没有变化(Muller等人,1998,***反应临床免疫学杂志(J Allergy ClinImmunol)101:747;Simons等人,1996,国际免疫学(Int Immunol)8:1937;Creticos等人,1997,***反应临床免疫学杂志(J Allergy ClinImmunol)99:401;Marcotte等人,1997,***反应临床免疫学杂志(JAllergy Clin Immunol)99:405)。重要的是,利用尿素变性的变应原和T细胞肽得到的这些临床结果表明:对修饰的变应原而言,不连续B细胞表位和连续B细胞和T细胞表位的保留是有效调节抗体和细胞免疫应答所必需的。
减少变应原的B细胞表位的可接近性(可及性)的第二种方式涉及利用甲醛或戊二醛处理(Marsh,1971,Int Arch Allergy Appl Immunol 41:199;Patterson等人,1973,免疫学杂志(J Immunol)110:1413)或通过与非免疫原性聚合物结合(King等人,1979,实验医学杂志(J ExpMed)149:424)使变应原多聚化。戊二醛聚合的抗原在小鼠中有不同于天然抗原的加工方式,并且它们由分泌促Th1应答的细胞因子的抗原呈递细胞加工(Gieni等人,1993,免疫学杂志(J Immunol)150:302)。这种用于改善免疫治疗的第二种方法曾利用豚草花粉变应原尝试过,得到与利用天然变应原时相类似的免疫学结果(Norman等人,1982,***反应临床免疫学杂志(J Allergy Clin Immunol)70:248;Norman,1984,***反应临床免疫学杂志(J Allergy Clin Immunol)73:787)。这种方法的一个局限是当变应原被修饰以达到变应原性降低大于100倍时,经常会发生不连续B细胞表位的几乎完全丧失。
第三种方式是通过定点诱变选择性改变变应原的B细胞表位的接触型氨基酸残基。如果B细胞表位的关键性接触残基已知,这将是一种有用的方法。例如,在桦主要变应原中,一个氨基酸残基谷氨酸突变成丝氨酸破坏了其与小鼠抗体的结合,且导致与来自过敏患者血清库的IgE的结合降低40%(Mirza等人,2000,免疫学杂志(J Immunol.)165:331)。不同程度的降低也许反映小鼠抗体和人IgE分别为单克隆和多克***源。
因为任何一种单元型的MHC II类分子均可以在自己的结合沟中结合多种肽,因此通过利用其它肽对与MHC分子结合的变应原来源的T细胞表位进行抑制,可能可以调节T细胞应答。例如,在H-2k小鼠中,本身不具免疫原性的小鼠溶菌酶肽可以抑制对鸡卵清溶菌酶的T细胞应答(Adorini和Nagy,1990,今日免疫学(Immunol.Today)11:21)。另一个例子是利用流感HA肽体外抑制对螨变应原的T细胞应答(O’Hehir等人,1991,***反应临床免疫学杂志(J.Allergy Clin.Immunol.)87:1120)。
因此,对免疫原或变应原的免疫应答部分依赖于宿主基因构成、免疫路径和模式及免疫原/变应原本身。变应原对IgE免疫应答结果的决定程度还未知。每一变应原必须有多少B细胞表位和T细胞表位?是否变应原的免疫显性B细胞表位和T细胞表位被不同个体或所有易感个体识别?是否存在促进B细胞中的IgE类转换事件的T细胞表位?变应原与宿主蛋白质的抗原交叉反应是否会对回答为什么某些蛋白质比其他蛋白质具有更大的变应原性有一定帮助?对多价变应原的免疫耐受是否能通过单独或组合利用B细胞表位或T细胞表位处理而诱导产生?
king的美国专利号5,593,877、5,612,209、5,804,201、6,106,844、6,270,763和6,287,559以及美国专利申请系列号09/166,205公开了编码胡蜂毒液蛋白质的cDNA的分离和由此cDNA编码的蛋白质的推导氨基酸序列。这些cDNA使得大量胡蜂毒液蛋白质的表达和纯化成为可能以供免疫治疗使用。但是,序列不能提供胡蜂毒液蛋白质的天然结构信息。因此,这些cDNA和推导的氨基酸序列不能提供不连续表位的信息。通过此推导的胡蜂毒液氨基酸序列也不能预测存在于重组产生的胡蜂毒液蛋白质表面的表位。因此,这些cDNA和推导的氨基酸序列单独并不能准确预测出胡蜂毒液蛋白质的哪些区域或哪些肽可作为刺激B细胞介导的免疫应答的有效免疫原。这些cDNA和推导的氨基酸序列单独也不能预测出胡蜂毒液蛋白质表面的表位密度,而这是决定胡蜂毒液蛋白质交联细胞表面IgE分子的潜力以及由此其变应原性的重要因素。
因此,本领域需要确定怎样修饰变应原蛋白质天然结构中的B细胞表位才能产生提高治疗效果的设计。
本领域也需要提供这样的变应原蛋白质,其刺激B细胞介导的免疫应答,但不刺激IgE介导的***反应。具体地,本领域需要提供具有降低的表位密度的变应原,其能有效刺激B细胞产生IgG,但不能有效地与结合在例如但并不限于肥大细胞或嗜碱粒细胞表面上的天然变应原特异性IgE抗体交联。
本领域也需要提供在免疫疗法中有效的具有无交叉反应性的B细胞表位的杂合蛋白质。尤其需要提供存在变应原肽表位序列的杂合蛋白质,此变应原肽表位序列的构象使得其可接近免疫细胞表面受体和可溶性蛋白质(特别是抗体)。
因此,本领域需要试剂、药物组合物以及方法用于在不引起***反应(例如过敏性休克)的基础上产生IgG B细胞应答以抵御变应原。
于此引用的参考文献不应理解为承认其是本发明的现有技术。
发明概要
本发明提供了制备修饰的变应原的新方法。修饰的变应原为杂合体,其由目的“客”变应原的小部分和同源但具弱交叉反应的“宿主”蛋白质的大部分组成。这些同源“宿主”蛋白质作为支架来维持目的“客”变应原的天然结构,从而使目的“客”变应原的构象依赖型B细胞表位得以在杂合体中保留,但其密度降低。具有大于30%序列同一性且功能相似的同源蛋白质已知具有非常相似的三维结构(Chothia等人,1990,生物化学年评(Annual Review Biochem)59:1007;Russell,1994,分子生物学杂志(J Mol Biol)244:332),这样就可产生各种客/宿主蛋白质。
因此,本发明涉及具有减弱的变应原性但保持免疫原性的重组变应原,例如胡蜂毒液变应原。因此,本发明提供变应原蛋白质、与变应原表面可及部位相对应的肽表位序列、含有***到宿主支架的相应结构区域的这些肽表位序列的杂合蛋白质、编码这些条合构建体的核酸,以及可用于刺激具减弱的变应性应答的、针对变应原的治疗性免疫应答的方法,即变应原免疫疗法。具体地,本发明重组杂合蛋白质、核酸和方法使得可以在不触发基于IgE的***反应(如急性过敏反应)的基础上刺激基于B细胞的变应原应答。
本发明杂合蛋白质以天然构象存在。在一个实施方案中,杂合蛋白质在天然构象中含有至少一个变应原肽表位序列。更特别地,支架蛋白质与变应原肽表位序列所来源的天然蛋白具有相同的天然构象。
在某些实施方案中,本发明杂合蛋白质含有融合肽,例如信号肽或用于纯化的柄(handle)。在其它实施方案中,本发明杂合蛋白质可以含有蛋白酶作用位点,以便例如以切下此纯化柄。相应地,本发明杂合蛋白质含有变应原肽表位序列、支架蛋白质序列,以及任选地单独的或联合的融合序列和蛋白酶作用位点。
重组肽表位序列在该序列所来源的天然蛋白质中位于表面。在特定实施方案中,变应原肽在天然蛋白质的环区。
应该意识到,杂合蛋白质可以含有一个以上的导入支架蛋白质序列的肽表位序列。
本发明涉及这样的杂合蛋白质,其中肽抗原来源于变应原蛋白质而支架蛋白质是与天然变应原蛋白质有大于或等于30%序列同一性的异源蛋白质。在特定的方面,肽抗原和支架蛋白质均来自胡蜂毒液蛋白质。更具体地,肽抗原和支架蛋白质均来自胡蜂毒液Ag 5s。
在一个实施方案中,本发明肽表位序列的特征为具有约6到50个氨基酸,且对小鼠B细胞应答具抗原性(B细胞表位)。更具体而言,在本发明实施例中,本发明变应原肽表位序列来自Ag 5肽,其选自:
      NNYCKIKC(SEQ ID:1);
      NNYCKIKCLKGGVHTACK(SEQ ID:2);
      NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKP(SEQ ID:3);
      NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVV(SEQ ID:4);
      NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQ(SEQ ID:
        5);
      NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQEKQDILK
        (SEQ ID:6);
      QVGQNVALTGSTAAKYDDPVKLVKMWEDEVKDYNPKKKFSGNDFL
        KTG(SEQ ID NO:7);
      HYTQMVWANTKEVGCGSIKYIQEKWHKHYLVCNYGPSGNFKNEELY
        QTK(SEQ ID NO:8)
      LKPNCGNKVVV(SEQ ID NO:9);
      LTGSTAAKYDD(SEQ ID NO:10);
      PKKKFSGND(SEQ ID NO:11)
      IQEKWHK(SEQ ID NO:12);和
      FKNEELYQTK(SEQ ID NO:13);
      NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQEKQDILK
      EHND(SEQ ID NO:93);
      NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQEKQDILK
       EHNDFRQKIAR(SEQ ID NO:94);
     NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQEKQDILK
       EHNDFRQKIARGLETRGNPGPQPPAKNMKN(SEQ ID NO:95).
本发明还涉及分离的表达载体,其含有与本发明核酸可操作连接的启动子。本领域技术人员可商业获得的多种启动子均可用于本发明该方面。所述启动子的例子包括但并不限于SV40的早期启动子、hCMV的立即早期启动子、腺病毒早期启动子、痘苗病毒早期启动子、多瘤病毒早期启动子、SV40病毒晚期启动子、腺病毒晚期启动子、痘苗病毒晚期启动子、多瘤病毒晚期启动子、lac-trp***、TAC***、TRC***、λ噬菌体的主要操纵基因和启动子区域、fd外壳蛋白的调节区域、3-磷酸甘油酸激酶启动子、酸性磷酸酶启动子或酵母α交配因子启动子等等。适用于此处并且还易于为技术人员得到的表达载体的多个例子如下所述。
本发明也提供制备编码本发明变应原杂合蛋白质的核酸的方法。该方法包括将编码变应原蛋白质的肽表位序列的核苷酸序列导入编码与该变应原蛋白质结构同源的支架蛋白质的核苷酸序列中。编码肽表位序列的核苷酸序列以符合读框的方式导入编码支架蛋白质的核苷酸序列中,并且其所处位置使得在变应原杂合蛋白质中肽表位序列存在于杂合蛋白的表面可及区域并与该肽表位序列在变应原蛋白质中的位置相对应。在一个这样的实施方案中,将编码支架蛋白质的核苷酸序列突变以导入编码肽表位序列的核苷酸序列。在另一这样的实施方案中,编码肽表位序列的核苷酸序列通过用核酸内切酶处理含有编码肽表位序列的核苷酸序列与编码支架蛋白的核苷酸序列的核酸然后将来自于此的片段相连接而导入。如果有必要,可以利用本领域标准技术将限制性内切酶位点导入含有这些序列的核酸中。
本发明还涉及产生本发明杂合蛋白质的方法,其通过表达本发明的分离的核酸分子实施。这种产生方法为诊断和治疗所需的杂合蛋白质提供了丰富来源。产生杂合蛋白质的本发明该方法的一个例子是培养利用本发明表达载体转化或转染的宿主细胞,以使宿主细胞产生本发明杂合蛋白质。优选地,由此产生的本发明杂合蛋白质从培养物、宿主细胞或两者中回收。
本发明还涉及在治疗变应原特异性变应性疾病中有效的药物组合物。具体地,本发明涉及这样的药物组合物,其含有本发明杂合蛋白质或编码这种杂合蛋白质的核酸(优选表达载体)以及其可药用载体。本发明还包括药物组合物,其含有多种本发明杂合蛋白质或含有编码这多种杂合蛋白质的一个或多个核酸。
自然地,本发明涉及治疗变应原特异性变应性疾病的方法,其包括施用治疗有效量的本发明药物组合物。本发明药物组合物可以通过任何途径并且特别是通过口、肺、鼻、局部或肠胃外途径施用。其它给药途径也是可以的。
本发明另一个特定目的是提供治疗个体中变应原特异性***反应的方法,其中将治疗变应原特异性变应性疾病的药物组合物施用给个体。
而且,本发明还涉及调节哺乳动物对免疫原的免疫应答的药物组合物,其中该药物组合物包含可用于调节哺乳动物对免疫原的免疫应答的上述本发明变应原杂合蛋白质(或编码这种蛋白质的核酸)和它的可药用载体。
因此,施用这种药物组合物可调节免疫***识别和攻击免疫原的能力。在一个具体的实施方案中,施用这种药物组合物后,哺乳动物免疫***识别和攻击免疫原的能力比施用之前该个体的免疫***识别和攻击此免疫原的能力得到提高。
                         缩写
Dol m Dolichovespula maculata  白斑脸大黄蜂(white faced hornet)
Dol a D.arenaria               黄色大黄蜂(yellow hornet)
Pol a Polistes annularis       黄蜂(wasp)
Pol e P.exclamans              黄蜂(wasp)
Ves m Vespula maculifrons      额斑黄胡蜂(yellowjacket)
Ves v V.vulgaris               常见黄胡蜂(yellowjacket)
PCR                            聚合酶链式反应
RACE                      cDNA末端快速扩增
TCR                       抗原的T细胞受体
附图简述
图1:Ves v 5cDNA[SEQ ID NO:14]和氨基酸[SEQ ID NO:16]序列。左边的编号指核苷酸的位置,右边的编号指氨基酸的位置。
图2:Pol a 5cDNA[SEQ ID NO:15]和氨基酸[SEQ ID NO:17]序列。左边的编号指核苷酸的位置,右边的编号指氨基酸的位置。
图3:Ves v 5(V)[SEQ ID NO:16]和Pol a 5(P)[SEQ ID NO:17]的氨基酸比较。
图4:示意性显示Ag 5s以及杂合体的序列。杂合体上给出的残基编号参照Ves v 5的残基编号。
图5A-B:Ves v 5同源蛋白质的比对,所述蛋白来自以下昆虫的毒液:额斑黄胡蜂(Vespula maculifrons)[Ves m 5,SEQ ID NO:63]、常见黄胡蜂(Vespula vulgaris)[Ves v 5,SEQ ID NO:64]、重黄胡蜂(Vespulaflavopilosa)[Ves f 5,SEQ ID NO:65]、树黄胡蜂(Vespula pensylvanica)[Ves p 5,SEQ ID NO:66]、德国黄胡蜂(Vespula germanica)[Ves g 5,SEQID NO:67]、Vespula vidua[Ves vi 5,SEQ ID NO:68]、Vespula squamosa[Ves s 5,SEQ ID NO:69]、Dolichovespula maculata [Dol m Sa,SEQ IDNO:70]、Dolichovespula arenaria[Dol a 5,SEQ ID NO:71]、Dolichovespula maculata[Dol m 5b,SEQ ID NO:72]、金环胡蜂(Vespamandarinia)[Vesp m 5,SEQID NO:73]、黄边胡蜂(Vespa erabro)[Ves c5.01,SEQ ID NO:74]、黄边胡蜂[Ves c 5.02,SEQ ID NO:75]、Polistesfuseatus[Pol f 5,SEQ ID NO:76]、Polistes exclamans[Pol e 5,SEQ IDNO:77]、Polistes annularis[Pol a 5,SEQ ID NO:78]、红外来火蚁(Solenopsis invieta)[Sol i 3,SEQ ID NO:79]和黑外来火蚁(Solenopsisrichteri)[Sol r 3,SEQ ID NO:80]。
图6A-B:Ag 5s以及杂合体的SDS凝胶图谱
图7:Ves v 5以及杂合体的圆二色(CD)谱。
图8A-C:利用天然Ves v 5特异性小鼠抗体的抑制ELISA,利用(A)分离自BALB/c小鼠并耗竭了Pol a-交叉反应性抗体的Ves v 5特异性抗体,(B)来自ASW/n小鼠的抗血清和(C)来自P/J小鼠的抗血清。
图9A-C:利用来自小黄蜂敏感患者的血清进行的抑制ELISA。
图10A-C:固相Ves v 5或杂合体上小鼠Ves v 5特异性单克隆抗体的结合。
图11A-C:Ves v 5、Pol a 5以及杂合体的组胺释放测定试验。
图12A-B:Ves v 5样蛋白的比对。比对的蛋白质为Ves v 5[SEQ IDNO:81]、Sol i 3[SEQ ID NO:82]、番茄(Lycopersicon esculentum)p14a[SEQID NO:83]、裂褶菌(Schizophyllum commune)SC7[SEQ ID NO:84]、人胰蛋白酶抑制剂[SEQ ID NO:85]、人glipr[SEQ ID NO:86]、珠毒蜥(Heloderma horridum)helothermine[SEQ ID NO:87]和人TPX-1[SEQID NO:88]。
发明详述
本发明涉及具有减弱的变应原性但保持免疫原性的重组变应原杂合蛋白质构建体、编码这些变应原的核酸分子,以及在***反应的诊断和治疗中这种变应原的使用方法。本发明杂合蛋白质含有导入支架蛋白质序列中的表面(例如环或转角区域)肽表位序列。本发明杂合蛋白质、核酸和方法使得可以在不触发基于IgE的变应性应答的基础上刺激抵御变应原的基于B细胞的应答。在特定实施方案中,重组杂合蛋白质含有融合至支架蛋白质(尤其是Pol a 5)的胡蜂毒液表面或环状肽抗原(尤其来自Ves v 5)。
本发明还涉及含有如下核酸分子的表达载体,所述核酸分子包括具减弱的变应原性但保持免疫原性的变应原杂合蛋白质,本发明还涉及通过表达和回收此杂合蛋白质而生产本发明杂合蛋白质的方法。
本发明也提供可以有效治疗变应原特异的变应性疾病的药物组合物,其包含本发明杂合蛋白质或编码这种杂合蛋白质的核酸载体;并提供治疗这种变应性病症的方法,包括施用治疗有效量的这种药物组合物。
本发明杂合蛋白质也可用于变应原特异的变应性病症的诊断。
本发明部分基于下述发现,即将来自小黄蜂(Vespula vulgaris)抗原5的表面可及区域的序列***到Polistes annularis抗原5的相应区域产生了杂合构建体,该构建体保持亲本蛋白质的免疫原性但表现出显著减弱的变应原性。而且,导入序列的最优位置是由Ves v 5的晶体结构确定的表面可及位点,尤其是环状和转角区域。
早期工作建立的那些杂合构建体,其中四分之一到三分之一的变应原蛋白质被导入同源支架蛋白质的相应区域。然而,这些杂合构建体缺少本发明的优势和改进。
在患者中的临床研究和利用实验动物的测试显示,针对小黄蜂和纸巢蜂的毒液蛋白质的特异抗体具有有限的交叉反应(Lichtenstein等人,1979,***反应临床免疫学杂志(J Allergy Clin Immunol)64:5;Lu等人,1993,免疫学杂志(J Immuol)150:2823)。这些观察构成了本发明优选实施方案的基础。优选的“客”变应原抗原5为Ves v 5,它是23kd的小黄蜂毒液蛋白质。优选的作为支架蛋白质的同源宿主变应原为Pol a 5,它是与Ves v 5大小相似的纸巢峰(paper wasp)的毒液蛋白质。Ves v 5和Pol a 5有59%的序列同一性(图3)。两者均可在酵母中表达,并且重组蛋白质显示出具有天然蛋白质的天然构象(Monsalve等人,1999,蛋白质表达纯化(Protein Exp.Purif.)16:410)。
Ves v 5和Pol a 5的杂合体的免疫化学结果已有报道。这些杂合体的序列示意性显示在图4中。杂合体PV1-46、PV109-155和PV156-204分别含有Ves v 5分子的第一个1/4段氨基酸序列(即第1-46位氨基酸)、第三个1/4段氨基酸序列(即第109-155位氨基酸)和最后1/4段氨基酸序列(即第156-204位氨基酸),它们连同Pol a 5分子的一部分共同构成完整的杂合体Ag 5分子。含有Ves v 5分子的第二个1/4段氨基酸序列的杂合体没有制备,因为在该区域Ves v 5和Pol a 5的序列高度相同(参见图3)。与PV156-204相比,杂合体PV1-155具有Ves v 5和Pol a 5的氨基端和羧基端片段的相反排列。
杂合体PV1-8、PV1-18、PV1-24、PV1-32、PV22-32、PV115-125、PV142-150、PV176-182和PV195-204设计成含有Ves v 5的表面环状或转角区域。这些杂合体含有Ves v Ag 5的第7-32位氨基酸,这些氨基酸替代Pol a Ag 5的同源区域。
可预料地,同源蛋白质相应区域,尤其是在表面可及区域(如环状区域和转角区域)中的转换可以使天然结构得以保持。表面可及区域(尤其是环状区域和转角区域)在保持结构的同时倾向于表现出更大的灵活度以及更好的对变化的耐受性。在定向进化中也有相对应的方法,其中同源酶重组产生新的具功能的酶嵌合体。
术语“变应原杂合蛋白质”指重组或合成蛋白质,其具有支架蛋白质的天然结构,但含有一个或多个来自变应原的序列。变应原与支架蛋白质结构同源,因此允许将变应原序列导入支架蛋白质的相应位置。“相应位置”是指在一级序列中的同一位置或在天然结构中的同一拓扑位置。变应原序列选自变应原的表面可及区域并***到支架蛋白质的相应表面可及区域。因为在天然构象中蛋白质的B细胞表位位于可接近的表面,故来自变应原的序列在导入到支架蛋白质中后可以作为B细胞表位,因此它们被称为变应原蛋白质的“肽表位序列”。
与本发明相关的表述“减弱的变应原性”是指在设计测量这种变应原性的体外测定试验中,分子或抗原表现出明显降低的变应原活性。这种“体外测定试验”为本领域熟知,包括例如但并不限于变应原敏感患者或实验动物在受该变应原攻击后其嗜碱性粒细胞的组胺释放测定试验。此外,这里使用的“活性”可以指能指示分子或抗原的变应原性的任何可测量的参数或结果,例如但并不限于在测定中获得的最大应答或在测定中为得到指定结果所需的抗原的量或浓度。
术语“保持免疫原性”(以任何语法形式出现)是指杂合蛋白质可引起免疫应答(尤其是IgG主导的体液免疫),此免疫应答可与天然变应原或支架蛋白(或两者)引起的免疫应答相比而且大于它们引起的变应性(IgE)免疫应答。杂合体特异的IgG会与存在于变应原和支架蛋白质的表位发生交叉反应。这种IgG应答能封闭IgE结合,因此降低或阻碍***反应。另外,杂合蛋白质可以引起T细胞无变应性和其他***反应抑制性免疫应答。
根据本发明,如果进行比对后,两个蛋白质表现出至少约30%的氨基酸同一性,那么这些蛋白质是“同源的”,所述氨基酸同一性可通过利用本领域已知的程序确定,上述程序的例子包括但并不限于Gap、Bestfit和BLAST程序。更优选同源蛋白质展现至少约50%的氨基酸同一性。然而,在特定实施方案中,变应原蛋白质与支架蛋白质不具有大于70%的序列相同性,以便降低高度交叉反应的可能性,这种高度交叉反应可能将导致杂合蛋白质具有程度不可接受的变应原性。更高的序列相同性是可以接受的,尤其当***支架蛋白质的肽表位序列与其所替代的支架蛋白质的相应序列非常不相同时——例如小于50%的同一性以及优选地小于30%的同一性。
当两个蛋白质由于一级序列的相似性而采用相似的核心二级和三级结构以至于它们的三维结构可以几乎完全地(大于70%)重叠叠合时,它们在结构上同源。然而,它们的表面三级结构可能不相同。
在本发明优选的实施方案中,将来自变应原的肽表位序列***或替换“支架”蛋白质的序列。相应地,本发明“支架蛋白质”为包括变应原表位序列的蛋白质,上述变应原表位序列可以是***序列或作为支架蛋白质的同源(相应)序列的替换序列。支架蛋白质表现出天然构象。变应原和支架可互换位置;这些术语用于表示导入“支架”的序列的来源(来自“变应原”)。虽然是不同的群体,但由于“变应原”与“支架”同源,因此都可充当变应原。因此,如果将“支架蛋白质”的表面可及序列导入另一结构同源蛋白质中,则该“支架蛋白质”也是“变应原”。
术语“天然构象”包括由非重组的,即天然的蛋白质、多肽或抗原在其天然环境中表现出的功能构象或它们在可保持所述天然环境中的功能构象的条件下经纯化后表现出的功能构象。天然构象可以通过例如但并不限于确定蛋白质的圆二色谱测量。天然构象也可通过测定酶活性确定。本领域技术人员应该理解,在天然非重组蛋白质的功能构象未知的情况下,“天然构象”包括可重复地表现出非随机确定构象的重组蛋白质形式,其中所述非随机确定构象包括在正确折叠的功能性蛋白质中常见的二级结构元件,例如但并不限于α螺旋和β折叠元件。而且正如熟知的,利用重组技术可以将附加的氨基酸在不破坏蛋白质的天然构象的情况下连接到蛋白质的氨基或羧基末端。这种附加的氨基酸可以是短的多肽“标签”,其一般长度为1-25个氨基酸并且一般是无序的,附加的氨基酸也可以是更长的多肽,其可以形成单独的结构域并且本身可以为有序或无序的。
术语“表面暴露氨基酸”指定位于三维结构的表面的氨基酸残基,当变应原处于溶液中时,此氨基酸残基的至少一个原子的至少一部分可以接触到周围溶剂。优选地,处于三维结构中的此氨基酸残基有至少20%的溶剂(水)可及性(accessibility),更优选至少30%,再更优选至少40%并且最优选至少50%的可及性。
术语“溶剂可及性”定义为分子中可接近如下球体的面积,所述球体具有可与溶剂(水,r=1.4_)分子相比的半径。
“变应原”有它的普通含义,即它指任何可以引起***反应(例如组胺释放至过敏性休克)的蛋白质样分子。变应原为大家所熟知;本说明书表8中列出具代表性的群体。本发明变应原的例子可以适宜地是吸入型变应原,例如来自树、草、药草、真菌、屋尘螨、蟑螂和动物毛发及皮屑。重要的来自树、草、药草的花粉变应原为来自下述分类学目的变应原:壳斗目(Fagales)、木犀目(Oleales)和松目(Pinales)(包括桦树属(Betula)、桤木属(Alnus)、榛属(Corylus)、鹅耳枥属(Carpinus)和木犀榄属(Olea))、禾草目(Poales)(包括例如黑麦草属(Lolium)、梯牧草属(Phleum)、早熟禾属(Poa)、狗牙根属(Cynodon)、鸭茅属(Dactylis)和黑麦属(Secale)的草)、菊目(Asterales)和荨麻目(Urticales)(包括豚草属(Ambrosia)和蒿属(Artemisia)的药草)。重要的来自真菌的吸入型变应原为来自链格孢属(Alternaria)和枝孢属(Cladosporium)的那些。其它重要的吸入型变应原来自尘螨属(Dermatophagoides)的屋尘螨(house dust mite)、来自蟑螂及哺乳动物如猫、狗和马。此外,本发明的重组变应原可以是毒液变应原的突变体,所述毒液变应原包括来源于蛰刺或叮咬类昆虫的那些,例如其可以来自分类目膜翅目(Hymenoptera)的昆虫,包括蜜蜂(蜜蜂总科(Apidae))、黄蜂(胡蜂总科)和蚂蚁(蚁总科(Formicoidae))。具体的变应原成分包括例如壳斗目的Bet v 1(B.verrucosa,桦属)、Aln g 1(欧洲桤木(Alnus glutinosa),桤木属)、Cor a 1(欧洲榛(Corylus avelana),榛属)和Car b 1(欧洲鹅耳枥(Carpinus betulus),鹅耳枥属)。其它还有Cry j 1(松目)、Amb a 1和2、Artv 1(菊目)、Par j 1(荨麻目)、Ole e 1(木犀目)、Ave e 1、Cyn d 1、Dac g 1、Fes p 1、Hol l 1、Lol p 1和5、Pas n 1、Phl p 1和5、Poa p 1、2和5、Secc 1和5以及Sor h 1(各种草本植物花粉)、Alt a 1和Cla h 1(真菌)、Derf 1和2、Der p 1和2(屋尘螨,分别为粉尘螨(D.farinae)和户尘螨(D.pteronyssinus))、Lep d 1和2(害嗜鳞螨(Lepidoglyphus destructor),储藏物螨类(storage mite));Bla g 1和2、Per a 1(蟑螂,分别为德国小蠊(Blatellagermanica)和美洲大蠊(Periplaneta americana))、Fel d 1(猫)、Can f 1(狗)、Equ c 1、2和3(马)、Apis m 1和2(蜜蜂)、Ves v 1、2和5、Pol a 1、2和5(所有黄蜂)和Soli 1、2、3和4(火蚁)。该术语也包括在上述“背景”中所描述的所有例子。
例如,术语“胡蜂毒液变应原”是指在胡蜂毒液中发现的蛋白质,在被该昆虫蛰刺后易感人群就会被致敏。虽然大部分抗原具有和特异IgG类抗体反应的特性,但变应原还具有与IgE型抗体反应的特性。IgE型抗体负责介导变应性病症的症状,即即发型超敏反应。
于此使用的术语“胡蜂”按照变应原领域的习惯用法使用,并且是指属于世界范围的胡蜂科(Vespidae)的昆虫,即包括大黄蜂、小黄蜂和纸巢峰的社会性黄蜂。具体地,胡蜂包括胡蜂亚科(Vespinae)和马蜂(Polistinae)亚科。更具体地,胡蜂包括胡蜂属(Vespa Linnaeus)、黄胡蜂属(VespulaThomson)、长黄胡蜂属(Dolichovespula Rohwer)和马蜂属(PolistesLatreille)。黄胡蜂属中的种包括但并不限于德国黄胡蜂(V.germanica(Fab.))、V.squamosa(Drury)、额斑黄胡蜂(Buysson)、重黄胡蜂(Jacobson)、常见黄胡蜂(V.vulgaris(L.))和树黄胡蜂(V.pensylvanica(Saussure))。马蜂属中的种包括但并不限于P.annularis(Linnaeus)、P.exclamans(Viereck)、P.metricus(Say)、P.fuscatus(Fabricius)、P.apachus(Saussure)。长黄胡蜂属中的种包括但并不限于D.maculata(L.)和D.arenaria(Fab.)。胡蜂属中的种包括但并不限于黄边胡蜂(V.crabro(L.))和东方胡蜂(V.orientalis(Linnaeus))。
常见黄胡蜂的分类学地位如下:
目:膜翅目(Hymenoptera)
亚目:细腰亚目(Apocrita)
部:针尾部(Aculeata)
总科:胡蜂总科(Vespoidea)
科:胡蜂科(Vespidae)
亚科:胡蜂亚科(Vespinae)
属:黄胡蜂属(Vespula)
种组:常见黄胡蜂种组
种:常见黄胡蜂
Polistes annularis的分类学地位如下:
目:膜翅目
亚目:细腰亚目
部:针尾部
总科:胡蜂总科
科:胡蜂科
亚科:马蜂亚科(Polistinae)
族:马蜂族(Polistini)
属:马蜂属(Polistes)
亚属:Aphanilopterus
种:annularis
于此使用的术语“免疫调节”是指在B细胞或T细胞水平上增高或降低抗原特异性免疫应答的能力。免疫调节活性可以在例如T细胞增殖测定中通过测定抗体的产生、淋巴因子的产生或T细胞应答检测。特别地,除影响B细胞应答外,本发明免疫调节多肽可以结合T细胞表面的分子并影响T细胞应答。
于此使用的短语“免疫***相关疾病或病症”是指可引起个体免疫应答或影响免疫***对免疫原应答的能力的疾病或病症。因此,免疫***相关疾病或病症的例子包括病原性疾病或病症、病毒性疾病或病症(例如HIV、单纯疱疹病毒或***瘤病毒)、自体免疫疾病(例如关节炎或狼疮)。
变应原结构的确定
蛋白质的三维结构可以通过本领域公知的物理方法确定,包括而并不限于X-射线晶体学、核磁共振光谱学和电子晶体学等。优选地,蛋白质的三维结构通过X射线晶体学来确定。还优选这些技术产生5_或更好的分辨率,在这样的分辨率下能获得蛋白质多肽主链中的α碳原子的踪迹,这就可以确定蛋白质的二级结构特征,如α螺旋和β折叠结构元件。更优选以2_或更好的分辨率确定蛋白质三维结构,在这样的分辨率下能确定出氨基酸侧链的位置。特定变应原的结构已为大家公知,如表9所示。这些或其它变应原的结构可以利用上述标准技术确定。
蛋白质的三维结构还可以通过与结构已通过物理方法经验地得出的同源蛋白质进行比较而推断,例如通过比对和比较两者的氨基酸序列来推断。比较和比对氨基酸序列的方法为本领域所公知,并且包括例如但并不限于Pileup、Gap、BestFit和Compare程序(Genetic Computer Group,Madison,WI)。通过这种比对和比较可以鉴定出氨基酸高度相同或相似的区域,这些区域在同源蛋白质中可能采用相似或相同的构象。由此,一旦确定了一种蛋白质的三维结构,就可以确定许多同源蛋白质的三维结构,这样就可以鉴定出同源蛋白质的表面和环状区域。
与内部氨基酸的变化造成的影响程度相比,位于蛋白质的表面和环状区域中的氨基酸的变化对蛋白质的三维结构和功能的影响程度要轻些。因此,与内部残基相比,同源蛋白质中表面和环状区域的氨基酸残基一般保守性差一些。然而,本领域普通技术人员应当意识到,表面和环状区域在同源蛋白质的天然构象中会占据相同的相对位置。因此,表面区域和环状区域为同源蛋白质内的“保守元件”或“同源元件”。
另外,各种光谱学技术可以用于结构评价,尤其用于证实杂合蛋白质是否保留变应原和支架蛋白质的天然结构。这些技术包括但并不限于圆二色谱、核磁共振波谱分析(尤其比较低分辨率)、中子衍射分析、荧光光谱分析(和其它光吸收和透射光谱技术)等等。特别地,对光谱相似度的评价可以指示杂合蛋白质采取天然构象的程度。在这种类型的分析中优选圆二色谱。
分子生物学技术
根据本发明可以使用本领域常规分子生物学、微生物学和重组DNA技术。这些技术在文献中有充分阐释,参见例如Sambrook,Fritsch和Maniatis,“分子克隆:实验室手册”(“Molecular Cloning:a LaboratoryManual”),第二版(1989)冷泉港实验室出版社,冷泉港,纽约(这于此称为“Sambrook等人,1989”);“DNA克隆:实用方法”(“DNACloning:a Practical Approach”),第一卷和第二卷(D.N.Glover主编,1985);“寡核苷酸合成”(“Oligonucleotide Synthesis”)(M.J.Gait主编,1984);“核酸杂交”(“Nucleic Acid Hybridization”),[B.D.Hames和S.J.Higgins主编(1985)];“转录和翻译”(“Transcription AndTranslation”),[B.D.Hames和S.J.Higgins主编(1984)];“动物细胞培养”(“Animal Cell Culture”),[R.I.Freshney主编(1986)];“固定化细胞和酶”(“Immobilized Cells And Enzymes”),[IRL出版社,(1986)];B.Perbal,“分子克隆实用指南”(“A Practical Guide To MolecularCloning”)(1984)。本发明相关的其它技术可以在下述文献中找到:King的美国专利号5,593,877、5,612,209、5,804,201、6,106,844和美国专利申请系列号08/484,388、08/474,853和09/166,205以及Monsalve等人1999,蛋白质表达纯化(Protein Expr.Purif.)16:410。
“核酸分子”是指以单链形式或双链螺旋形式存在的核糖核苷(包括腺嘌呤核苷、鸟嘌呤核苷、尿嘧啶核苷或胞嘧啶核苷;又称为“RNA分子”)或脱氧核糖核苷(腺嘌呤脱氧核苷、鸟嘌呤脱氧核苷、胸腺嘧啶脱氧核苷或胞嘧啶脱氧核苷;又称为“DNA分子”)的磷酸酯多聚体形式。双链DNA-DNA、DNA-RNA和RNA-RNA螺旋都是可能的。术语核酸分子,以及特别是DNA或RNA分子仅仅是指分子的一级和二级结构,并不限定任何特定的三级结构。因此,该术语包括在尤其是线状或环状DNA分子、限制性片段、病毒、质粒和染色体中存在的双链DNA。在讨论特定双链DNA分子的结构时,于此描述的序列按照一般习惯给出,即仅沿DNA的非转录链(即具有与mRNA同源的序列的那条链)以5’到3’方向给出序列。“重组DNA分子”是已接受分子生物学操作的DNA分子。
在适宜的温度和溶液离子强度条件(参见Sambrook等人,上述)下,当核酸分子的单链形式可以退火结合另一核酸分子时,该核酸分子与此另一核酸分子就是“可杂交的”,上述另一核酸分子例如cDNA、基因组DNA或RNA。温度和离子强度条件决定杂交的“严紧性”。为初步筛选同源核酸分子,可以使用相应于55℃的Tm的低严紧性杂交条件,例如5×SSC,0.1%SDS,0.25%脱脂奶粉并且不含甲酰胺;或者30%甲酰胺,5×SSC,0.5%SDS。与较高的Tm相对应的中等严紧杂交条件为例如40%甲酰胺及5×或6×SSC。与最高Tm相对应的高严紧杂交条件为例如50%甲酰胺及5×或6×SSC。杂交需要两个核酸分子含有互补序列,但依赖于杂交的严紧度,碱基之间可以有错配。用于核酸分子杂交的适当严紧度依赖于核酸分子的长度和分子互补的程度以及本领域熟知的变量。两条核苷酸序列之间的相似性或同源性程度越高,具有这些序列的核酸分子的杂合体的Tm就越大。核酸分子杂交的相对稳定性(与较高的Tm相对应)按以下顺序降低:RNA:RNA,DNA:RNA,DNA:DNA。对于长度大于100个核苷酸的杂合体而言,已经推导出计算Tm的公式(参见Sambrook等人,上述,9.50-0.51)。对与较短的核酸分子(即寡核苷酸)杂交而言,错配发生的位置更为重要,并且寡核苷酸的长度决定其特异性(参见Sambrook等人,上述,11.7-11.8)。优选可杂交核酸分子的最小长度为至少约10个核苷酸;更优选长度为至少约20个核苷酸,甚至更优选至少约30个核苷酸;并且最优选至少约40个核苷酸。
在特定实施方案中,术语“标准杂交条件”是指55℃的Tm,并利用如上所述的条件。在优选实施方案中,Tm为60℃;在更优选实施方案中Tm为65℃。
DNA“编码序列”是指置于适当的调节序列的调节下时可以在体内转录并翻译成多肽的双链DNA序列。编码序列的界线由5’(氨基)端的起始密码子和3’(羧基)端的翻译终止密码子确定。编码序列可以包括但不限于原核序列、来自真核mRNA的cDNA、来源于真核生物(如哺乳动物)DNA的基因组DNA序列,并且甚至合成的DNA序列。如果编码序列用于在真核细胞中表达,在该编码序列的3’端一般都具有多腺苷酸化信号和转录终止序列。
转录和翻译调节序列是DNA调节序列,如启动子、增强子、终止子等等,它们在宿主细胞中保证编码序列的表达。在真核细胞中,多腺苷酸化信号是调节序列。
“启动子序列”是能够在细胞中结合RNA聚合酶并起始下游(3’方向)编码序列的转录的DNA调节区域。为定义本发明,启动子序列在3’端以转录起始位点为边界并向上游(5’方向)延伸以包括为了以高于背景的可检测水平起始转录所需的最少数目的碱基或元件。在启动子序列内可以找到转录起始位点(可以例如,方便地通过S1核酸酶作图而确定),以及用于结合RNA聚合酶的蛋白质结合结构域(共有序列)。真核启动子通常但非总是包含“TATA”盒和“CAT”盒。
当编码序列在细胞中位于转录和翻译调节序列的“控制之下”或与它们“可操作连接”时,RNA聚合酶可以将编码序列转录成mRNA,而所述mRNA随后可翻译成由该编码序列编码的蛋白质。“信号序列”可以包括在编码序列之前,这种序列编码“信号肽”,位于多肽的N-末端,可以指导宿主细胞将多肽转运到细胞表面或将多肽分泌至培养基中。这些信号肽在输出后通常被细胞选择性地降解。可以发现,原核和真核生物的多种天然蛋白质与信号序列相连。
“核酸分子”是指以单链形式或双链螺旋形式存在的核糖核苷(包括腺嘌呤核苷、鸟嘌呤核苷、尿嘧啶核苷或胞嘧啶核苷;又称为“RNA分子”)或脱氧核糖核苷(腺嘌呤脱氧核苷、鸟嘌呤脱氧核苷、胸腺嘧啶脱氧核苷或胞嘧啶脱氧核苷;又称为“DNA分子”)的磷酸酯多聚体形式。双链DNA-DNA、DNA-RNA和RNA-RNA螺旋都是可能的。术语核酸分子,以及特别是DNA或RNA分子仅仅是指分子的一级和二级结构,并不限定任何特定的三级结构。因此,该术语包括在尤其是线状或环状DNA分子、限制性片段、病毒、质粒和染色体中存在的双链DNA。在讨论特定双链DNA分子的结构时,于此描述的序列按照一般习惯给出,即仅沿DNA的非转录链(即具有与mRNA同源的序列的那条链)以5’到3’方向给出序列。“重组DNA分子”是已接受分子生物学操作的DNA分子。
在适宜的温度和溶液离子强度条件(参见Sambrook等人,上述)下,当核酸分子的单链形式可以退火结合另一核酸分子时,该核酸分子与此另一核酸分子就是“可杂交的”,上述另一核酸分子例如cDNA、基因组DNA或RNA。温度和离子强度条件决定杂交的“严紧性”。为初步筛选同源核酸分子,可以使用相应于55℃的Tm的低严紧性杂交条件,例如5×SSC,0.1%SDS,0.25%脱脂奶粉并且不含甲酰胺;或者30%甲酰胺,5×SSC,0.5%SDS。与较高的Tm相对应的中等严紧杂交条件为例如40%甲酰胺及5×或6×SSC。与最高Tm相对应的高严紧杂交条件为例如50%甲酰胺及5×或6×SSC。杂交需要两个核酸分子含有互补序列,但依赖于杂交的严紧度,碱基之间可以有错配。用于核酸分子杂交的适当严紧度依赖于核酸分子的长度和分子互补的程度以及本领域熟知的变量。两条核苷酸序列之间的相似性或同源性程度越高,具有这些序列的核酸分子的杂合体的Tm就越大。核酸分子杂交的相对稳定性(与较高的Tm相对应)按以下顺序降低:RNA:RNA,DNA:RNA,DNA:DNA。对于长度大于100个核苷酸的杂合体而言,已经推导出计算Tm的公式(参见Sambrook等人,上述,9.50-0.51)。对与较短的核酸分子(即寡核苷酸)杂交而言,错配发生的位置更为重要,并且寡核苷酸的长度决定其特异性(参见Sambrook等人,上述,11.7-11.8)。优选可杂交核酸分子的最小长度为至少约10个核苷酸;更优选长度为至少约20个核苷酸,甚至更优选至少约30个核苷酸;并且最优选至少约40个核苷酸。
在特定实施方案中,术语“标准杂交条件”是指55℃的Tm,并利用如上所述的条件。在优选实施方案中,Tm为60℃;在更优选实施方案中Tm为65℃。
DNA“编码序列”是指置于适当的调节序列的调节下时可以在体内转录并翻译成多肽的双链DNA序列。编码序列的界线由5’(氨基)端的起始密码子和3’(羧基)端的翻译终止密码子确定。编码序列可以包括但不限于原核序列、来自真核mRNA的cDNA、来源于真核生物(如哺乳动物)DNA的基因组DNA序列,并且甚至合成的DNA序列。如果编码序列用于在真核细胞中表达,在该编码序列的3’端一般都具有多腺苷酸化信号和转录终止序列。
转录和翻译调节序列是DNA调节序列,如启动子、增强子、终止子等等,它们在宿主细胞中保证编码序列的表达。在真核细胞中,多腺苷酸化信号是调节序列。
“启动子序列”是能够在细胞中结合RNA聚合酶并起始下游(3’方向)编码序列的转录的DNA调节区域。为定义本发明,启动子序列在3’端以转录起始位点为边界并向上游(5’方向)延伸以包括为了以高于背景的可检测水平起始转录所需的最少数目的碱基或元件。在启动子序列内可以找到转录起始位点(可以例如,方便地通过S1核酸酶作图而确定),以及用于结合RNA聚合酶的蛋白质结合结构域(共有序列)。真核启动子通常但非总是包含“TATA”盒和“CAT”盒。
当编码序列在细胞中位于转录和翻译调节序列的“控制之下”或与它们“可操作连接”时,RNA聚合酶可以将编码序列转录成mRNA,而所述mRNA随后可翻译成由该编码序列编码的蛋白质。“信号序列”可以包括在编码序列之前,这种序列编码“信号肽”,位于多肽的N-末端,可以指导宿主细胞将多肽转运到细胞表面或将多肽分泌至培养基中。这些信号肽在输出后通常被细胞选择性地降解。可以发现,原核和真核生物的多种天然蛋白质与信号序列相连。
编码杂合蛋白质的核酸分子
本发明涉及编码重组变应原杂合蛋白质的分离的核酸分子。本发明进一步涉及细胞系,所述细胞系稳定地含有编码变应原杂合蛋白质的重组核酸分子并能够表达这种核酸分子以产生该杂合蛋白质。这些核酸可由例如列在表8和于此公开的某些专利和专利申请中的变应原生成。
作为一个具体特定实例,本发明公开提供了胡蜂毒液蛋白质的完整核酸序列。具体地,本发明公开提供了胡蜂Ag5的核酸序列,尤其是Ves vAg5(SEQ ID NO:14;参见图1)和Pol a Ag5(SEQ ID NO:15;参见图2)的序列。本发明也提供了Ves v Ag5(SEQ ID NO:16;参见图1)和Pol aAg5(SEQ ID NO:17,参见图2)的氨基酸序列。
在一个特定实施方案中,为了获得本发明核酸分子,利用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增如下DNA片段,该片段编码包含变应原肽表位序列或支架蛋白质的序列。能够代表本发明变应原蛋白质或支架蛋白质的寡核苷酸引物在PCR反应中用作引物。通常,这些引物由合成制备。PCR可以利用例如Perkin-Elmer cetus热循环仪和Taq聚合酶(GeneAmpTM)进行。
本发明核酸也可以通过限制性片段的克隆而获得,或者,本发明核酸可以通过核酸的体内或体外重组而获得。在一些情况下重组依赖于参与重组事件的核酸间的序列同源性,但在另一些情况下进行重组的核酸不需要包含明显的同源性,例如在“非常规”重组事件中。本领域普通技术人员明了,核酸重组可以是分子内或分子间事件。
除分离变应原蛋白质或支架蛋白质的DNA或cDNA之外,其它备选方案包括但并不限于依据此处提供的序列化学合成出基因序列本身。
上述方法并不旨在限制可获得本发明DNA的方法。
通过重组或者其它技术,用于获得本发明核酸的方法可以引起核酸相连处的核苷酸***或缺失。在一个实施方案中,在编码抗原肽的核酸与编码支架蛋白质的核酸的连接处可以有核苷酸的***或缺失。这些核酸完全在本发明范围之内。因此,本发明也包括这样的杂合蛋白质,其在肽表位序列与支架蛋白质序列的连接处有氨基酸的***或缺失。
克隆的杂合蛋白质或其起始材料的核酸序列可以利用本领域公知的多种策略进行修饰(Maniatis,T.,1990,分子克隆:实验室手册,第二版,冷泉港实验室,冷泉港,纽约)。可以利用限制性内切酶在适当的位点将序列切开、如果需要的话进一步进行酶学修饰、分离并在体外连接。在产生编码杂合蛋白质的核酸时,应注意保证修饰的核酸与支架蛋白质仍在同一翻译阅读框内,且不能被翻译终止信号打断。
另外,编码变应原肽表位序列或支架蛋白质的核酸可以在体外或体内进行突变以产生和/或破坏翻译序列、起始序列和/或终止序列或者在编码区中造成变化和/或形成新的限制性内切酶位点或破坏原有位点,以促进进一步的体外修饰。本领域已知的任何诱变技术都可使用,包括但不限于体外定点诱变(Hutchinson等人,1978,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)253:6551;Zoller和Smith,1984,DNA 3:479-488;Oliphant等人,1986,基因(Gene)44:177;Hutchinson等人,1986,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.)83:710)、TAB_接头的使用(Pharmacia)等等。定点诱变优选使用PCR技术进行(参见Higuchi,1989,《PCR技术:DNA扩增的原理和应用》中的“利用PCR改造DNA”,H.Erlich主编,Stockton出版社,第6章,61-70页)。
本领域已知的大量载体-宿主***可用于表达本发明DNA。可能的载体包括但不限于质粒或修饰的病毒,但是载体***必须与所使用的宿主细胞相容。这些载体包括但不限于噬菌体(例如λ噬菌体衍生物)或质粒(例如各种pBR322衍生物,如pUC、CR、pGEX载体,pmal-c,pFLAG等)。例如,在克隆载体中的***可以通过将DNA片段连接至具有互补粘末端的克隆载体中而实现。在本发明优选的方面,PCR扩增的本发明核酸分子包含3’A核苷酸突出端,可以直接用于克隆到含有互补的T核苷酸突出端的pCR载体(Invitrogen公司,San Diego,CA)上。然而,如果克隆载体上不存在用于片断化DNA的互补性限制性位点,则可对DNA分子的末端作酶学修饰。或者,可以通过在DNA末端连上核苷酸序列(接头)而产生任何期望位点;这些连接上的接头可以包含编码限制性内切酶识别序列的特异的化学合成的寡核苷酸。在另一种可供选择的方法中,可以通过同聚物加尾修饰本发明DNA和切开的载体。重组分子可以通过转化、转染、感染和电穿孔等方法导入宿主细胞,由此产生该基因序列的许多拷贝。
在特定实施方案中,利用插有本发明DNA的重组DNA分子转化宿主细胞以产生多拷贝的该DNA。因此,大量获得DNA可以通过培养转化体、从转化体中将重组DNA分子分离,并且在必要时从分离的重组DNA中回收***序列而实现。
编码SEQ ID NO:1-13和93-95的Ves v 5多肽表位序列的核苷酸序列分别在SEQ ID NO:18-30和96-98中给出。
变应原杂合蛋白质的表达
编码杂合蛋白质或其免疫调节片断、衍生物或类似物的核苷酸序列可以***适当的表达载体,即含有转录和翻译***的蛋白质编码序列所必需的元件的载体。这些元件在此处称为“启动子”。因此,编码杂合蛋白质的核酸分子可操作地与启动子相连。表达载体也优选包括复制起点。必需的转录和翻译信号也可以由编码变应原或支架蛋白质的天然基因和/或其侧翼区域提供。潜在的宿主-载体***包括但并不限于例如利用病毒(例如痘苗病毒、腺病毒等等)感染的哺乳动物细胞***;例如利用病毒(例如杆状病毒)感染的昆虫细胞***;诸如含有酵母载体的酵母等微生物;或者利用噬菌体、DNA、质粒DNA或柯斯质粒DNA转化的细菌。载体的表达元件在强度和特异性上各有不同。依赖于所使用的宿主-载体***,可以使用多种适当的转录和翻译元件中的任意一种。
在另外的实施方案中,本发明重组杂合蛋白质或其免疫调节片断、衍生物或类似物可通过将杂合蛋白质编码序列重组整合在染色体上后表达。在这一方面,可以使用多种扩增***的任意一种来获得高水平的稳定基因表达(参见Sambrook等人,1989,上述,16.28节)。
可以在允许细胞表达杂合蛋白质的条件下,将重组载体转化的细胞在适当的细胞培养基中培养,所述重组载体含有编码杂合蛋白质的核酸分子。随后按照本领域公知的方法从培养物中回收表达的杂合蛋白质。这些方法将在下文中详述。
在另一实施方案中,可以使杂合蛋白质最初与多个氨基酸一起表达并且随后将该多个氨基酸从杂合蛋白质上切除。被去除的序列可以在杂合蛋白质序列的氨基或羧基末端。该序列可以在体内或体外去除。优选地,此序列通过蛋白酶在特异位点切割而去除,所述蛋白酶为例如信号肽酶、Xa因子、Kex2或二肽氨肽酶。编码这种含有将被蛋白酶切除的多肽的杂合蛋白质的重组DNA分子含有下述序列,该序列以符合读框的形式连接变应原杂合体的编码序列并编码待从杂合蛋白质上切除的肽。
在特定实施方案中,杂合蛋白质与含有约6个组氨酸残基的附加序列一起表达,例如这可利用pQE载体(QIAGEN,Chatsworth,CA)进行。组氨酸的存在使得可以利用Ni-螯合柱选择性分离重组蛋白质。这种柄还包括但并不限于FLAG、myc标签、GST等等。
在另一实施方案中,可以产生周质形式的杂合蛋白质(含有信号序列),其可以使蛋白质输出至酵母周质或培养基。向周质或培养基中的输出可以促进表达蛋白质的正确折叠。
前述任何一种将DNA片断***载体的方法都可以用于构建表达载体,所述表达载体含有由适当的转录/翻译调节信号和蛋白质编码序列组成的基因。这些方法包括体外重组DNA和合成技术以及体内重组(遗传重组)。
编码杂合蛋白质或其免疫调节片断的核酸序列的表达可以被第二个核酸序列调节,这样,杂合蛋白质将在转化有该重组DNA分子的宿主中表达。例如,杂合蛋白质的表达可以由本领域已知的任何启动子/增强子元件调节,但是这些调节元件必须在选择用于表达的宿主中具有功能。可用于调节杂合蛋白质编码序列表达的启动子包括但并不限于CMV启动子、SV40早期启动子区域(Benoist和Chambon,1981,自然(Nature)290:304-310)、包含在Rous肉瘤病毒3’长末端重复中的启动子(Yamamoto等人,1980,细胞(Cell)22:787-797)、疱疹病毒胸苷激酶启动子(Wagner等人,1981,美国国家科学院院报(Proc.Acid.Sci.U.S.A.)78:1441-1445)、金属硫蛋白基因调节序列(Brinster等人,1982,自然(Nature)296:39-42);用于原核表达载体的启动子例如β-内酰胺酶启动子(Villa-Kamaroff等人,1978,美国国家科学院院报(Proc.Acid.Sci.U.S.A.)75:3727-3731)或者tac启动子(DeBoer等人,1983,美国国家科学院院报(Proc.Acid.Sci.U.S.A.)80:21-25);也参见《科学美国人》中的“来自重组细菌的有用蛋白质”,1980,242:74-79;来自酵母或其它真菌的启动子元件例如Gal4启动子、ADC(醇脱氢酶)启动子、PGK(磷酸甘油激酶)启动子、碱性磷酸酶启动子;以及展现出组织特异性并已经在转基因动物中使用的动物转录调节区域。
另外,可以选择这样的宿主细胞系,其可以按照特定的期望方式调节***序列的表达或者对基因产物进行修饰和加工。不同的宿主细胞具有其特征性的蛋白质翻译和翻译后加工和修饰机制(例如糖基化、切割[如信号序列])。可以选择适当细胞系或宿主***以保证对所表达的外源蛋白质进行期望的修饰和加工。例如,可以通过在细菌***中表达来产生非糖基化的核心蛋白质产物。然而,在细菌中表达的酶蛋白质可能不会正确折叠。可以通过在酵母中表达来产生糖基化产物。可以通过在昆虫细胞中表达来增加异源变应原杂合蛋白质进行天然糖基化和折叠的可能性。此外,不同载体/宿主表达***也可能不同程度地影响加工反应,如蛋白水解酶裂解。
载体可以通过本领域已知的方法导入期望的宿主细胞,所述方法例如转染、电穿孔、微注射、转导、细胞杂交、DEAE葡聚糖、磷酸钙沉淀、脂质转染(溶酶体融合)、使用基因枪或者DNA载体转移体(参见例如Wu等人,1992,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)267:963-967;Wu和Wu,1988,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)263:14621-14624;Hartmut等人,加拿大专利申请号2,012,311,1990年3月15日提交)。
cDNA和基因组序列都可以被克隆和表达。
此外,本发明杂合蛋白质或其片断、衍生物或类似物可以考虑通过合成制备,例如通过固相肽合成技术制备。
一旦重组杂合蛋白质被鉴定,其可以通过标准方法分离和纯化,所述标准方法包括层析(例如离子交换、亲合、大小排阻和反向层析)、离心、差异溶解或者其它的蛋白质纯化标准技术。
在特别的实施方案中,杂合蛋白质及其片断可以经改造而含有约6个组氨酸残基,这使得可以利用Ni-螯合柱选择性分离重组蛋白质。在一个优选的方面,该蛋白质通过反向层析进一步纯化。
在另一实施方案中,重组杂合蛋白质可以包括允许目的杂合蛋白质进行亲合纯化的附加序列,例如FLAG、MYC或GST(谷胱甘肽-S-转移酶)。例如,可以将杂合蛋白质的附加序列的特异性抗体固定于固相支持物(如溴化氰活化的琼脂糖)上,并用于纯化杂合蛋白质。在另一实施方案中,将附加序列的结合配偶体(例如受体或配体)固定并用于亲合纯化杂合蛋白质。
在一个实施方案中,杂合蛋白质(优选纯化的)不经进一步修饰即使用,即不经过裂解或其它方式去除附加在肽表位序列和支架蛋白质上的任何序列。在优选实施方案中,杂合蛋白质可治疗性地用于例如调节免疫应答。
在另一实施方案中,纯化的杂合蛋白质经处理裂解并去除附加于支架蛋白质上的任何序列。例如,当已经制备的杂合蛋白质含有蛋白酶敏感的裂解位点时,可以利用蛋白酶处理杂合蛋白质以裂解蛋白酶特异位点并释放杂合蛋白质。在特定实施方案中,通过用Xa因子处理以裂解杂合蛋白质。
在特别的实施方案中,本发明重组杂合蛋白质包括但无疑并不仅限于那些含有SEQ ID NO:1-13或93-95的Ves v 5肽作为胡蜂毒液抗原的杂合蛋白质。
在特别的实施方案中,本发明重组胡蜂毒液杂合蛋白质包括但无疑并不仅限于那些含有SEQ ID NO:17的Pol a 5蛋白质作为支架蛋白质的杂合蛋白质。
杂合蛋白质可以含有改变的表位或支架序列或含有改变的表位和支架序列,其中序列内的残基被其功能等价氨基酸残基替代,导致保守氨基酸替代。例如,序列内的一个或多个氨基酸残基可以被另一作为其功能等价物的具有相同极性的氨基酸替代,导致沉默改变。序列内的氨基酸的替代物可以选自该氨基酸所属种类的其它成员。例如,非极性(疏水)氨基酸包括丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和甲硫氨酸。极性中性氨基酸包括甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬酰胺和谷胺酰胺。带正电(碱性)氨基酸包括精氨酸、赖氨酸和组氨酸。带负电(酸性)氨基酸包括天冬氨酸和谷氨酸。
重组杂合蛋白质也在蛋白质水平上进行操作,例如糖基化、乙酰化、磷酸化、酰胺化、还原和羧甲基化、用已知的保护基/封闭基团衍生化、蛋白酶裂解、连接至抗体分子或其它细胞配体等等。可以利用已知技术进行多种化学修饰,这包括但并不限于利用溴化氰、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、木瓜蛋白酶、V8蛋白酶、NaBH4进行特异性化学裂解;乙酰化、甲酰化、氧化、还原;在衣霉素存在下进行代谢合成,等等。
在特定实施方案中,杂合蛋白质在昆虫细胞表达***中(例如利用杆状病毒表达载体)表达。在优选实施方案中,利用适当的表达***使杂合蛋白质在酵母(例如,不仅仅限于边斯德毕赤酵母(Picchia pastoris))中表达。正如上文所指出,这些表达***应该产生具有“天然的”糖基化和结构的表达多肽,尤其是二级和三级结构的表达多肽。
本发明杂合蛋白质的活性测定
免疫学中有多种可用于评价抗原的免疫调节活性的已知测定方法。例如可以测试杂合蛋白质结合至变应原或支架蛋白质特异性抗体的能力。优选地,这些在诊断测定中所检测的抗体为IgG或IgE类的。在真核表达***且尤其是酵母细胞表达***中产生的杂合蛋白质可能具有与抗体结合的正确结构。在细菌表达***中表达的杂合蛋白质则可能不具正确结构,因此在用于诊断测定试验中进行抗体结合之前需要经过重折叠。
在另一实施方案中,本发明杂合蛋白质可以通过T细胞应答的增殖试验进行测试。为进行这种T细胞应答试验,用于产生该蛋白质的表达***不应该影响蛋白质的免疫调节活性。通常,获取已致敏宿主的淋巴细胞。宿主可以是利用变应原、支架或杂合蛋白质(例如重组产生的胡蜂毒液Ag5)免疫的小鼠。
在一个实施方案中,从对变应原敏感的人中获取外周血白细胞。利用本领域公知的技术,对蛋白质的T淋巴细胞应答可以在体外测量。在一个特定实施方案中,T细胞应答通过测量3H-胸苷的掺入进行检测,所述掺入随着与增殖相关的DNA合成的增加而增加。
细胞增殖也可以利用MTT试验来检测(Mossman,1983,免疫学方法杂志(J.Immunol.Methods)65:55;Niks和Otto,1990,免疫学方法杂志(J.Immunol.Methods)130:140)。本领域已知的任何检测T细胞增殖的方法都可以用于本发明所生产的胡蜂蛋白质。
同样,根据本发明可以进行淋巴因子产生测定。在一个实施方案中,淋巴因子产生的测定利用免疫学或共刺激试验(参见例如Fehlner等人,1991,免疫学杂志(J.Immunol.)146:799)或利用ELISPOT技术(Czerkinsky等人,1988,免疫学方法杂志(J.Immunol.Methods)110:29)实现。备选地,可以通过例如扩增(参见Brenner等人,1989,生物技术(BioTechniques)7:1096)或原位杂交(参见例如Kasaian和Biron,1989,免疫学杂志(J.Immunol.)142:1287)来检测淋巴因子的mRNA。特别有意义的是那些个体,其T细胞产生与IgE同种型转换事件相关的淋巴因子,例如IL-4和IL-5(Purkeson和Isakson,1992,实验医学杂志(J.Exp.Med.)175:973)。
因此,在一个优选的方面,本发明产生的杂合蛋白质可以与获取自变应原敏感个体的外周血淋巴细胞或者更优选地来自外周血淋巴细胞的细胞系用于体外试验,以检测通常与变应性应答相关的淋巴因子(例如IL-4)的分泌。这种测定可以指示出杂合蛋白质的哪一组分或哪些组分是造成变应性疾病的原因。
杂合蛋白质和核酸载体的治疗用途
本发明提供了杂合蛋白质的丰富来源,例如通过重组技术产生。另外,杂合蛋白质也可以通过肽合成产生。
本发明预期杂合蛋白质在治疗性(药物)组合物中的用途,用于变应原特异性变应性疾病的疗法中,以治疗变应原特异性变应性疾病、免疫***相关病症以及调节哺乳动物对免疫原的免疫应答。在特定实施方案中,根据本发明,Ves v 5和Pol a 5的杂合蛋白质或其衍生物或类似物被考虑用于诊断、治疗、医治和免疫应答的调节。
于此使用的短语“治疗有效量”是指足够治疗进行的量,该量优选使个体的免疫***有效抗击免疫原的能力增加至少约30%,更优选至少约50%,最优选至少约90%。随着研究的进一步进行,可获得有关在不同患者中对调节免疫原的免疫***应答适当的剂量水平的信息,并且,在考虑到接受者的治疗情况、年龄和一般健康状况的情况下,普通技术人员能够确定正确的剂量。
治疗方法
本发明治疗组合物(参见下述)可以用于免疫疗法,也称为脱敏疗法。免疫疗法已经被证明在变应性疾病、尤其是昆虫***反应中有效。可以在长时期内将变应原以逐渐增加的剂量经肠胃外施用。当患者敏感的一种或多种变应原已被特异地鉴定并且该疗法针对这些变应原时,这种疗法尤其有效。然而,这种方法具有潜在参与***反应,尤其是过敏反应的缺陷。因此,杂合蛋白质的大量易得性对***反应的免疫治疗非常重要,因为它们可以在不引起***反应的前提下诱导对变应原的有效IgG应答。
正如发明背景中所讨论,当变应原用于免疫疗法时,变应原上B细胞表位的存在会引起令人不快的全身反应。因此,本发明的一个特别优势是能够提供不引起令人不快的全身反应的变应原多肽。
在一个实施方案中,可以皮下注射一种或多种杂合蛋白质以减少对天然分子的T细胞应答,例如这可参见Brine等人的描述(1993,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.)90:7608-12)。
在另一实施方案中,可以经鼻内施用一种或多种杂合蛋白质以抑制首次接触者与已致敏个体的变应原特异性应答(参见例如Hoyne等人,1993,实验医学杂志(J.Exp.Med.)178:1783-88)。
施用本发明杂合蛋白质预期可以诱导强的抗变应原的B细胞(抗体)IgG应答,该应答将封闭IgE抗体,并且因此具有治疗作用。
这些结果也可以通过施用允许表达杂合蛋白质的载体,即通过基因治疗而获得。优选的载体(尤其对于体外和体内细胞试验)为病毒载体和非病毒载体,所述病毒载体例如慢病毒、逆转录病毒、疱疹病毒、腺病毒、腺伴随病毒、痘苗病毒、杆状病毒、甲病毒(尤其是辛德比斯病毒和塞姆利基森林病毒病毒)以及其它具有期望的细胞向性的重组病毒。对体内或离体基因治疗而言,优选使用可药用载体,例如复制缺陷型病毒载体。含有本发明核酸的可药用载体可以进一步修饰以实现瞬时或稳定表达。于此使用的术语“可药用载体”包括但并不限于具有将核酸选择性定位和导入细胞的能力的载体或递送媒介。
因此,编码功能或突变蛋白或其多肽结构域片断的基因可以利用病毒载体或通过DNA的直接导入而实现体内、离体或体外导入。在靶组织中的表达可以通过将转基因载体定位至特定细胞实现,例如利用病毒载体或受体配体或者通过利用组织特异性启动子或者同时利用此两种来实现。定向基因递送在PCT出版号WO95/28494中描述。
通常用于体内或离体定向和治疗方法的病毒载体为基于DNA的载体和逆转录病毒载体。构建和使用病毒载体的方法为本领域公知(参见例如Miller和Rosman,生物技术(BioTechniques),1992,7:980-990)。优选地,病毒载体为复制缺陷型,即它们不能在靶细胞中自主复制。优选地,复制缺陷型病毒为最小病毒,即它仅仅保留对于包装基因组以产生病毒颗粒所必需的基因组序列。
DNA病毒载体包括减毒型或缺陷型DNA病毒,例如但并不限于单纯疱疹病毒(HSV)、***瘤病毒、Epstein Barr病毒(EBV)、腺病毒、腺伴随病毒(AAV)、甲病毒(尤其辛德比斯病毒)等等。优选那些完全或基本完全缺少病毒基因的缺陷型病毒。在导入细胞后缺陷型病毒并没有感染性。应用缺陷型病毒载体使得可以在特定局部区域中向细胞施用,而不用担心载体会感染其它细胞。因此,可以特异性地定向于特定组织。具体载体的例子包括但并不限于缺陷型疱疹病毒1(HSV1)载体(Kaplitt等人,分子细胞神经科学(Molec.Cell.Neurosci.)1991,2:320-330)、缺少糖蛋白L基因的缺陷型疱疹病毒载体或者其它缺陷型疱疹病毒载体(PCT出版号WO94/21807和WO92/05263);减毒型腺病毒载体,例如Stratford-Perricaudet等人描述的载体(J.Clin.Invest.1992,90:626-630;也参见La Salle等人,科学(Science)1993,259:988-990);缺陷型腺伴随病毒载体(Samulski等人,病毒学杂志(J.Virol.)1987,61:3096-3101;Samulski等人,病毒学杂志(J.Virol.)1989,63:3822-3828;Lebkowski等人,分子细胞生物学(Mol.Cell.Biol.)1988,8:3988-3996);以及甲病毒载体,包括基于辛德比斯病毒和塞姆利基森林病毒病毒的载体(美国专利号5,091,309;PCT出版号WO 98/44132;Schlesinger和Dubensky,Curr.Opin.Biotechnol.1999,5:434-9;Zaks等人,自然医学(Nat.Med.)1999,7:823-7)。
有多个公司商业生产病毒载体,包括但并不限于Avigen,Inc.(Alameda,CA;AAV载体)、Cell Genesys(Foster City,CA;逆转录病毒、腺病毒、AAV和慢病毒载体)、Clontech(逆转录病毒和杆状病毒载体)、Genovo,Inc.(Sharon Hill,PA;腺病毒和AAV载体)、Genvec(法国;腺病毒载体)、IntroGene(Leiden,荷兰;腺病毒载体)、MolecularMedicine(逆转录病毒、腺病毒、AAV和疱疹病毒载体)、Norgen(腺病毒载体)、Oxford BioMedica(牛津、英国;慢病毒载体)和Transgene(Strasbourg,法国;腺病毒、痘苗病毒、逆转录病毒和慢病毒载体)。
在另一实施方案中,载体以裸DNA形式、通过脂质转染或者利用其它转染促进剂(肽、多聚体等等)体内导入。合成的阳离子脂可以用于制备脂质体,以用于体内转染编码标记的基因(Felgner等人,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)1987,84:7413-7417;Felgner和Ringold,科学(Science)1989,337:387-388;参见Mackey等人,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)1988,85:8027-8031;Ulmer等人,科学(Science)1993,259:1745-1748)。核酸转移使用的有用脂类化合物和组合物在PCT专利出版号WO 95/18863和WO96/17823以及美国专利号5,459,127中描述。为了进行定向,脂类可以化学偶联至其它分子(参见Mackey等人,前述)。导向肽(例如激素或神经递质)和蛋白质(例如抗体)或非肽分子可以被化学偶联至脂质体上。
其它分子也可以用于促进核酸的体内转染,例如阳离子寡肽(例如PCT专利出版号WO95/21931)、来自DNA结合蛋白质的肽(例如PCT专利出版号WO96/25508)或者阳离子多聚体(例如PCT专利出版号WO95/21931)。
以裸DNA质粒形式将载体导入体内也是可能的。用于基因疗法的裸DNA载体可以通过本领域公知的方法导入所期望的宿主细胞,所述方法例如电穿孔、微注射、细胞融合、DEAE葡聚糖、磷酸钙沉淀、基因枪的使用、DNA载体转移体的使用(参见例如Wu等人,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)1992,267:963-967;Wu和Wu,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)1988,263:14621-14624;加拿大专利申请号2,012,311;Williams等人,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)1991,88:2726-2730)。也可以使用受体介导的DNA递送方法(Curiel等人,Hnm.Gene Ther.1992,3:147-154;Wu和Wu,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)1987,262:4429-4432)。美国专利号5,580,859和5,589,466公开了在哺乳动物中不使用转染促进剂而递送外源DNA序列的方法。最近,已经描述一种相对低电压、高效率的DNA体内转移技术,称为电转移(Mir等人,C.P.Acad Sci.1988,321:893;PCT出版号WO 99/01157、WO 99/01158和WO 99/01175)。
免疫***相关疾病的治疗
正如前述,本发明涉及杂合蛋白质,其可以用于治疗免疫***相关疾病或病症,或者用于调节哺乳动物对免疫原的免疫应答。特别地,本申请者已发现,本发明杂合蛋白质可以在不引起***反应的前提下引起免疫应答从而用于调节个体对多种免疫原的免疫应答。在一个特定的实施方案中,本发明杂合蛋白质调节个体免疫***以使其增加抗击病原和病毒的能力,上述病原和病毒包括但并不限于HIV、单纯疱疹病毒或***瘤病毒。该方法包括给个体施用治疗有效量的药物组合物,所述药物组合物包含由含有本发明DNA分子的分离的核酸分子所编码的多肽。
此外,已经发现,本发明杂合蛋白质、核酸和载体也可以应用于治疗免疫***相关疾病或病症,或者与其相关的症状。于此使用的术语“免疫***相关疾病或病症”是指可以唤起个体的免疫应答或者影响免疫***对免疫原反应的能力的疾病或病症。可以利用本发明药剂和药物组合物治疗的免疫***相关疾病或病症的例子包括但并不限于病原性疾病或病症;病毒性疾病或病症例如HIV、单纯疱疹病毒或***瘤病毒;或者自身免疫疾病例如关节炎或狼疮。
而且,本发明涉及治疗免疫***相关疾病或病症或者其相关症状的方法,包括为治疗免疫***相关疾病或病症给个体施用治疗有效量的药物组合物。所以,例如,如果免疫***相关疾病或病症涉及HIV,则显著的临床变化将涉及到例如,在施用了本发明药物组合物的个体中与未施用前相比白细胞数量增加。监测个体的临床显著变化的其它这种例子对本领域普通技术人员而言十分明显。此外,随着研究的进一步进行,可以获得用于治疗不同患者的免疫***相关疾病或病症或者相关症状的适当剂量水平的信息,并且,在考虑到接受者的治疗情况、年龄和一般健康状况的情况下,普通技术人员可以确定正确的剂量。可药用组合物的例子在下文中描述。
可药用组合物
本发明的体内治疗组合物也可以含有适当的可药用载体、赋形剂、稀释剂和佐剂。于此使用的术语“可药用”优选指获得政府管理机构(特别是联邦政府或州政府管理机构)批准或者已在美国药典或其它公认的药典中列出可以用于动物且更尤其是用于人类。合适的药用载体描述在E.W.Martin的“Remington制药科学”(Remington’s Pharmaceutical Sciences)中。
这些可药用载体可以是无菌的液体,例如水和油,所述油包括石油、动物、植物或合成来源的油,例如花生油、大豆油、矿物油、芝麻油等等。当药物组合物经静脉内施用时,水是优选的载体。盐水溶液和葡萄糖水溶液以及甘油水溶液也可以作为液体载体使用,尤其是用于注射用溶液中。合适的药用赋形剂包括甘露醇、人血清白蛋白(HSA)、淀粉、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明胶、麦芽、水稻、面粉、白垩、硅胶、碳酸镁、硬脂酸镁、硬脂酸钠、单硬脂酸甘油、滑石、氯化钠、干燥的脱脂乳、甘油、丙烯、二醇、水、乙醇等等。这些组合物可以为溶液、悬液、片剂、药丸、胶囊、粉剂、缓释制剂等等形式。
这些组合物可以含有诊断或治疗有效量的活性化合物连同适量的载体,以形成可以给患者适当施用的形式。尽管静脉注射是非常有效的给药方式,其它方式例如注射、或者口服、经鼻或肠胃外给药也可以使用。
实施例1 Ag5杂合体cDNA的构建
用于实施例的引物1-24在表1中列出。
Ves v 5 EA和KR构建体通过分别利用引物1(SEQ ID NO:31)和3(SEQ ID NO:33)或者2(SEQ ID NO:32)和3(SEQ ID NO:33)进行PCR扩增Ves v 5 cDNA模板(Lu等人,1993,免疫学杂志(J.Immunol.)150:2823)制备。Pol a 5 EA和KR构建体通过分别利用引物4(SEQ IDNO:34)和6(SEQ ID NO:36)或者5(SEQ ID NO:35)和6(SEQ ID NO:36)进行PCR扩增Pol a cDNA模板(Lu等人,1993,免疫学杂志(J.Immunol.)150:2823)制备。每一cDNA构建体都在5’端含有EcoRI或XhoI位点而在3’端含有XbaI位点。cDNA以EcoRI-XbaI或XhoI-XbaI片断的形式克隆至质粒载体pPICZαA(Invitrogen公司,San Diego,CA)。阳性克隆利用PCR鉴定。pPICZαA中的重组Ag 5和杂合体cDNA序列通过***片断的DNA测序确证。其它构建体按照King等人的描述制备(2001,免疫学杂志(J.Immunol.)166:6057-6065)。
(i)PV1-46。PV1-46杂合体通过在肽序列EH处将Ves v 5的氨基端序列和Pol a 5的羧基端序列结合而构建,肽序列EH分别存在于各蛋白质的氨基酸47-48位和49-50位。在Ves v 5中编码EH肽的核苷酸序列为GAG CAC,其对应于Bsi HKAI限制酶切割位点。
为方便PV1-46杂合体的构建,按照下述方法,利用PCR重叠延伸方法(Ho等,1989,Gene 77:51)将49-50位氨基酸处编码Pol a 5EH肽的天然DNA序列(GAG CAT)突变成Bsi HKAI位点。第一步由两个单独的PCR组成。一个PCR中,利用引物4(SEQ ID NO:34)和8(SEQID NO:38)来扩增编码Pol a 5第1-53位残基的DNA,其中EH编码序列被转换为Bsi HKAI位点。在第二个PCR中,利用引物7(SEQ ID NO:37)和6(SEQ ID NO:36)来扩增编码Pol a 5第47-205位残基的DNA,其中EH编码序列被转换为Bsi HKAI位点。两个PCR都利用1-40ng Pol acDNA作为模板和各50pmole的有义和反义引物在含有0.2mM dNTP和5单位Taq聚合酶的100μl PCR缓冲液中进行。循环条件为95℃变性0.5分钟、55℃退火0.5分钟和72℃延伸2分钟,35个循环。这两个PCR的产物含有重叠区域。在重叠延伸方法的第二步中,第三个PCR利用头两个反应的纯化产物的混和物为模板并利用侧翼引物4(SEQ ID NO:34)和6(SEQ ID NO:36)进行,其产生具有将EH编码序列转变为Bsi HKAI位点的全长Pol a 5。
随后杂合体PV1-46编码cDNA通过将来自Ves v 5和修饰的Pol a 5cDNA的适宜Bsi HKAI片断连接至pPICZαA中而制备,方式正如以上针对Ag 5编码cDNA的描述。
(ii)PV109-155。PV109-155杂合体通过在肽序列KY处将Ves v 5的氨基端序列和Pol a 5的羧基端序列结合而构建,肽序列KY分别对应于各蛋白质的氨基酸106-107位和109-110位。两个Ag5s中KY肽由核苷酸序列AAA TAT所编码。为构建PV109-155,将适当的Ag5或杂合体cDNA的KY编码序列突变为编码肽序列KF的ApoI限制酶切割位点(AAA TTT)。这些单碱基突变利用实施例1中描述的PCR重叠延伸方法(Ho等人,1989,基因(Gene)77:51)完成。在一组反应中,PV1-155cDNA的KY编码核苷酸序列通过利用诱变引物9(SEQ ID NO:39)和10(SEQ ID NO:40)实施PCR重叠方法来转变。在第二组反应中,Pola 5cDNA的KY编码核苷酸序列通过利用诱变引物11(SEQ ID NO:41)和12(SEQ ID NO:42)实施PCR重叠方法来转变。随后杂合体PV109-155编码cDNA通过用ApoI消化转变的Pol a 5和转变的PV1-155编码cDNA并将所得到的合适片断连接至pPICZαA中而制备。
(iii)PV1-155和PV156-204。Ves v 5和Pol a 5具有共同的EaeI限制性位点,其编码154-156位氨基酸残基。杂合体PV156-204和PV1-155编码cDNA通过将它们亲本cDNA的适当EaeI片断连接至pPICZαA中而制备。
(iv)PV1-8、PV1-18和PV195-204。这些杂合体利用Pol a 5的cDNA作为模板进行PCR制备。PV1-8利用引物2(SEQ ID NO:32)和6(SEQ ID NO:36)制备。PV1-18利用引物6(SEQ ID NO:36)和13(SEQ ID NO:43)制备。PV195-204利用引物4(SEQ ID NO:34)和14(SEQ ID NO:44)制备。将杂合体克隆至pPICZαA。
(v)PV1-24、PV1-32、PV1-39、PV1-50、PV1-57和PV1-70。这些杂合体利用实施例1中给出的PCR重叠延伸方法(Ho等人,1989,基因(Gene)77:51)构建。对PV1-24而言,第一轮PCR利用引物1(SEQ ID NO:31)和15(SEQ ID NO:45)及Ves v 5cDNA作为模板以及引物6(SEQ ID NO:36)和16(SEQ ID NO:46)及Pol a 5cDNA作为模板进行。随后将这两个重叠的PCR产物纯化并在第三轮PCR中用作模板和侧翼引物1(SEQ ID NO:31)和6(SEQ ID NO:36)一起扩增产生PV1-24。对PV1-32而言,第一轮PCR利用引物1(SEQ ID NO:31)和18(SEQ ID NO:48)及Ves v 5cDNA作为模板以及引物6(SEQ ID NO:36)和17(SEQ ID NO:47)及Pol a 5cDNA作为模板进行。随后将这两个重叠的PCR产物纯化并在第三轮PCR中用作模板并利用侧翼引物1(SEQ IDNO:31)和6(SEQ ID NO:36)产生PV1-24。对PV1-39而言,第一轮PCR利用引物2(SEQ ID NO:32)和19(SEQ ID NO:49)及Ves v 5cDNA作为模板以及引物6(SEQ ID NO:36)和20(SEQ ID NO:50)及Pol a 5cDNA作为模板进行。随后将这两个重叠的PCR产物纯化并在第三轮PCR中用作模板并利用侧翼引物2(SEQ ID NO:32)和6(SEQ ID NO:36)产生PV1-39。对PV1-50而言,第一轮PCR利用引物2(SEQ ID NO:32)和28(SEQ ID NO:58)及Ves v 5cDNA作为模板以及引物6(SEQ IDNO:36)和27(SEQ ID NO:57)及Pol a 5cDNA作为模板进行。随后将这两个重叠的PCR产物纯化并在第三轮PCR中用作模板并利用侧翼引物2(SEQ ID NO:32)和6(SEQ ID NO:36)产生PV1-50。对PV1-57而言,第一轮PCR利用引物2(SEQ ID NO:32)和30(SEQ ID NO:60)及Ves v 5cDNA作为模板以及引物6(SEQ ID NO:36)和29(SEQ IDNO:59)及Pol a 5cDNA作为模板进行。随后将这两个重叠的PCR产物纯化并在第三轮PCR中用作模板并利用侧翼引物2(SEQ ID NO:32)和6(SEQ ID NO:36)产生PV1-57。对PV1-76而言,第一轮PCR利用引物2(SEQ ID NO:32)和32(SEQ ID NO:62)及Ves v 5cDNA作为模板以及引物6(SEQ ID NO:36)和31(SEQ ID NO:61)及Pol a 5cDNA作为模板进行。随后将这两个重叠的PCR产物纯化并在第三轮PCR中用作模板并利用侧翼引物2(SEQ ID NO:32)和6(SEQ ID NO:36)产生PV1-76。将杂合体cDNA克隆至pPICZαA。
(vi)PV22-32、PV115-125、PV142-150和PV176-182。这些构建体为杂合Ag 5s,其中短Ves v 5多肽代替完整全长Pol a 5上的同源序列。
利用实施例1中给出的PCR重叠延伸方法(Ho等人,1989,基因(Gene)77:51)利用Ves v 5序列替代Pol a 5序列。第一组两个PCR中所用的模板DNA为Lu等人所述的Pol a cDNA(1993,免疫学杂志(J.Immunol.)150:2823)。在PCR延伸方案中使用的上游和下游Pol a引物分别为引物4(SEQ ID NO:22)和6(SEQ ID NO:24)。最终产物克隆至pPICZαA。
编码Ves v 5***序列的重叠引物对如下:(a)PV22-32:引物17(SEQ ID NO:47)和18(SEQ ID NO:48);(b)PV115-125:引物21(SEQ ID NO:51)和22(SEQ ID NO:52);(c)PV142-150:引物23(SEQ ID NO:53)和24(SEQ ID NO:54)以及(d)PV176-182:引物25(SEQ ID NO:55)和26(SEQ ID NO:56)。PCR反应和循环条件如PV1-46中所描述的。
表1.制备Ves v和Pol a 5s以及它们的杂合体的引物
 引物              序列(5’→3’)
1       CGTGAATTCAACAATTATTGTAAAATAAAA(SEQ ID NO:31)
2       CGTCTCGAGAAAAGAAACAATTATTGTAAAATAAAA(SEQ ID NO:32)
3       CGTTCTAGATTACTTTGTTTGATAAAGTTC(SEQ ID NO:33)
4       CGTGAATTCGTTGATTATTGTAAAATAAAA(SEQ ID NO:34)
5       CGTCTCGAGAAAAGAGTTGATTATTGTAAAATAAAA(SEQ ID NO:35)
6       CGTTCTAGATTATTTTTTTGTATAAGGTAG(SEQ ID NO:36)
7       GTAAGCGAGCACAATCGGTTT(SEQ ID NO:37)
8       AAACCGATTGTGCTCGCTTAC(SEQ ID NO:38)
9       GTAGCAAAATTTCAGGTTGGA(SEQ ID NO:39)
10      TCCAACCTGAAATTTTGCTAC(SEQ ID NO:40)
11    ACCGCAAAATTTCCAGTTGGA(SEQ ID NO:41)
12    TCCAACTGGAAATTTTGCGGT(SEQ ID NO:42)
13    CGTGAATTCAACAATTATTGTAAAATAAAATGTTTGAAAGGAGGTGTCCATACTGCCT
GCAAATATGGAGAA(SEQ ID NO:43)
14    CGTTCTAGATTACTTTGTTTGATAAAGTTCCTCATTCTTAAAATTTCCAGCTGG(SEQ ID
NO:44)
15    GGCACAATTCTTGCTCGGTTTAAGACTTCCATA(SEQ ID NO:45)
16    TATGGAAGTCTTAAACCGAGCAAGAATTGTGCC(SEQ ID NO:46)
17    CTTAAACCGAATTGCGGTAATAAGGTAGTGGTATCGGTTGGTCCA(SEQ ID NO:47)
18    TGGACCAACCGATACCACTACCTTATTACCGCAATTCGGTTTAAG(SEQ ID NO:48)
19    TATGGTCTAACGAAACAAGAGAAAAAATTAATCGTA(SEQ ID NO:49)
20    TACGATTAATTTTTTCTCTTGTTTCGTTAGACCATA(SEQ ID NO:50)
21    TTAACAGGTAGCACGGCTGCTAAATACGATGATGTAGTCAGTCTA(SEQ ID NO:51)
22    ATCATCGTATTTAGCAGCCGTGCTACCTGTTAACGCTATATTTTG(SEQ ID NO:52)
23    CCTAAGAAAAAGTTTTCGGGAAACGACTTTGCTAAAATTGGC(SEQ ID NO:53)
24    GTCGTTTCCCGAAAACTTTTTCTTAGGATTAAAATCTTTCAC(SEQ ID NO:54)
25    ATTCAAGAGAAATGGCACAAACATTACCTCATA(SEQ ID NO:55)
26    TTTGTGCCATTTCTCTTGAATATATTTTAGAGA(SEQ ID NO:56)
27    GAGCACAATGACTTTAGACAAAAA(SEQ ID NO:57)
28    TTTTTGTCTAAAGTCATTGTGCTC(SEQ ID NO:58)
29    AAAATTGCACGAGGGTTGGAAACA(SEQ ID NO:59)
30    TGTTTCCAACCCTCGTGCAATTTT(SEQ ID NO:60)
31    AATATGAAAAATTTGGTATGGAAC(SEQ ID NO:61)
32    GTTCCATACCAAATTTTTCATATT(SEQ ID NO:62)
将EA-或KR-系列的Ag5或杂合体编码cDNA分别利用限制性酶EcoRI或XhoI和XbaI消化,然后***相同切割的pPICZαA载体(Invitrogen,San Diego,CA)。重组质粒在TOP10F’细胞中扩增。所有重组质粒的Ag 5编码序列经DNA测序确认。除在Ves v 5中观察到两个单核苷酸差异外,Ag 5编码序列与Genbank中的序列数据(Ves v Ag 5登录号M98858以及Pol a Ag 5登录号M98857)相对应。这些改变发生在579位和587位,并分别导致G变为A的沉默突变和T变为A的替代,上述T变为A的替代导致在氨基酸残基196位M至K的密码子改变。这两个核苷酸改变可能为昆虫的多态性而不是随机突变,因为使用的Ag 5cDNA是以与以前相同的方法(Lu等人,1993,免疫学杂志(J.Immunol.)150:2283)制备的。
实施例2 Ag 5s以及杂合体的表达与纯化
利用限制酶Sac I切割将重组质粒(1-2μg)线性化,并且随后用于电穿孔法转化感受态巴斯德毕赤酵母KM71酵母细胞(约8×109细胞存在于40μl 1M山梨醇中)。用1M山梨醇将转化的细胞稀释至2ml并使其在不进行振荡的情况30℃复苏1小时,接着在200rpm振荡的条件下再培养1小时。然后将50μl或100μl小份培养物涂布于100mm YPDS培养基(含1.5mg/ml Zeocin)平板上以筛选多拷贝整合体(Invitrogen手册)。经3-4天孵育后挑取所选择的克隆并通过小量表达筛选来鉴定产生杂合蛋白质的菌落。小量表达使用与下文用于大量分离时相同的方法在50ml塑料管中进行,但其规模为大量分离时的1/30,培养液通过分泌蛋白质的SDS胶电泳来筛选。
所选克隆的酵母细胞在2个500ml瓶中30℃、250rpm定轨振荡生长至A600nm为10-12,其中每一个瓶中含有150ml pH 6.0磷酸盐缓冲液(其含有酵母氮源、生物素、甘油和组氨酸)。然后将细胞通过离心收集并重悬于100ml含有甲醇而非甘油的相同缓冲的培养基中。继续在30℃下250rpm振荡孵育4-6天并每天加入1ml 50%的甲醇。
利用以前报道的方法(Monsalve等人,1999,蛋白质表达纯化(ProteinExpr.Purif.)16:410)通过在SE-纤维素(Sigma)上离子交换层析将Ag5s或它们的杂合体从培养液浓缩物中纯化出来。合并大约70%的主峰,利用C18硅胶柱反向层析脱盐并冻干。将重组Ag 5s或杂合体在0.01M醋酸铵缓冲液(pH 4.6)中溶解并于4℃贮存。重组蛋白质浓度利用280nm的光吸收确定,其中使用根据酪氨酸和色氨酸含量计算的摩尔消光。Ag 5s或杂合体的产量一般为每100ml 4天培养物中1-7mg。
重组Ag 5s或杂合体通过SDS胶电泳、N-末端测序分析和MALDI质谱鉴定。存在于0.01M pH4.6醋酸缓冲液中的0.2mg/ml重组蛋白质的CD光谱测定利用1mm光程长度的比色池在AVIV 62DS光谱仪上进行。
实施例3 重组胡蜂Ag5s以及杂合体的物理化学特征
在酵母菌株KM71中表达的Ag5s以及杂合体蛋白质含有分泌信号肽。信号肽通过具有KR或KREAEAEF序列的肽连接至表达蛋白质。这两种类型的蛋白质分别命名为KR-和EA-系列。在从酵母细胞中分泌后,信号肽在KR序列(Kex 2蛋白酶位点)或两个EA序列(Ste 13二肽基氨肽酶位点)处被从分泌蛋白质上切除(Invitrogen手册)。
重组蛋白质从培养液中的分离利用SE-纤维素上离子交换层析完成,然后在C18-硅胶柱上反向层析,并且利用SDS胶电泳表征(图6)。几个杂合体表现为紧靠的双联体(doublet),具有与天然Ves v 5相同的迁移率。正如杂合体PV1-155和PV156-204的N-末端测序和质谱数据所指示的,这些双联体与它们N-末端的不同加工程度相一致(表2)。
重组Ag 5s以及杂合体显示出与天然Ag 5s几乎相同的CD光谱(图7)。天然Ves v 5和EA-Ves v 5以及EA-PV1-46、EA-PV1-155和EA-PV156-204的光谱在约208nm存在最小值,并且在225nm出现肩(图7)。这些特性是有序特性的标志(Yang等人,1986,酶学方法(Methodsin Enzymology)130:208)。在其它列于表II的杂合体中也观察到相似CD光谱(数据未显示)。来源于细菌的重组Ves v 5的CD光谱的最小值出现在约200nm处,这暗示其具有无序结构(Monsalve等人,1999,蛋白质表达纯化(Protein Expr.Purif.)16:410)。
与天然Ag 5s相同,酵母来源的重组Ag 5s以及杂合体在酸或碱性缓冲液中可自由溶解。这与细菌来源的重组胡蜂Ag 5s不同,后者仅在酸性缓冲液中有自由溶解。
Ag 5s以及杂合体的质谱分析结果在表2中给出。EA-系列的Ag 5s在Kex2位点被有效裂解,而在两个Ste 13位点显示可变的裂解。因此,重组EA-系列蛋白质具有EAEAEF和EAEF的氨基末端序列,其中EF序列由用于将cDNA***载体的EcoRI位点编码。这些数据与以前报道的结果(Monsalve等人,1999,蛋白质表达纯化(Protein Expr.Purif.)16:410)相似。
重组ves v 5的EAEAEF序列已知可作为强的半抗原行使功能(Monsalve等人,1999,蛋白质表达纯化(Protein Expr.Purif.)16:410)。因此,Ag 5s也以KR-系列杂合体形式表达。KR-系列蛋白质在Kex 2位点的裂解产生具有天然蛋白质的N-末端序列的重组蛋白质。KR-系列蛋白质Ves v 5、Pol a 5以及杂合体KR-PV1-24和KR-PV1-46的质谱分析显示,它们在Kex2位点和Kex2位点上游的2、7和9个残基处以不同的效率被裂解(表2)。KR-系列重组蛋白质的产量通常比EA-系列蛋白质的要稍微低一些。
表2重组胡蜂Ag 5s以及杂合体的质谱数据
                                         质量单位    
蛋白质        推测的序列    丰度1   计算值  实测值
EA-Ves v 5    EAEAEF-Vv     80%     23,954  23,947
              EAEF-Vv       20%     23,754  23,752
FA-Poi a 5    EAEAEF-Pa     100%    23,611  23,613
EA-PV1-18     EAEF-PV       43%     23,497  23,506
              EAEAEF-PV     36%     23,697  23,698
              REAEAEF-PV    21%     23,871  23,827
EA-PV1-18     EAEAEF-PV     100%    23,697  23,701
EA-PV1-32     EF-PV         60%     22,964  22,930
              EAEF-PV       40%     23,151  23,134
EA-PV1-46     EAEF-PV       53%     23,300  23,327
              EAEAEF-PV     47%     23,500  23,515
EA-PV1-46     EF-PV         10%     23,099  23,109
              EAEF-PV       50%     23,300  23,327
              EAEAEF-PV     40%     23,500  23,515
EA-PV1-155      EF-PV           53%     23,375    23,334
                EAEF-PV         47%     23,575    23,533
EA-PV22-32      EAEF-PV         55%     23,135    23,203
                EAEAEF-PV       45%     23,336    23,371
EA-PV115-125    EAEAEF-PV       100%    23,873    23,887
EA-PV142-150    EAEAEF-PV       100%    23,592    23,585
EA-PV156-204    EAEF-PV         59%     23,776    23,775
                EAEAEF-PV       41%     23,932    23,939
EA-PV195-204    EAEAEF-PV       70%     23,700    23,688
                REAEAEF-PV      30%     23,874    23,844
KR-Ves v 5      Vv5             90%     23,277    23,274
                EEGVSLEKR-Vv    10%     24,305    24,298
KR-Ves v 5      Vv              95%     23,277    23,284
                EEGVSLEKR-Vv    5%      24,305    24,300
KR-Pol a 5      Pa              20%     22,934    22,951
                EEGVSLEKR-Pa    80%     23,962    23,992
KR-Pol a 5      Pa              10%     22,934    22,935
                EEGVSLEKR-Pa    90%     23,962    23,962
KR-PV1-24       PV              85%     22,903    22,897
                EEGVSLEKR-PV    15%     23,931    23,933
KR-PV146        PV              70%     22,823    22,834
                KR-PV           30%     23,107    23,157
KR-PV1-46       PV              60%     22,823    22,834
                KR-PV           40%     23,107    23,157
1蛋白质丰度由质谱中样品的峰高估计。对于EA系列的EA-Ves v 5、EA-Pola 5、EA-PV3PV156-204和EA-VP3PV1-155样品的N-末端序列,它们的推定序列经Edman降解确认。
对于EA-PV1-18,EA-PV1-46,KR-Ves v 5,KR-Pol a和KR-PV1-46各显示了两个制品的结果。
氨基末端肽以SEQ lD NO:命名如下:EAEAEF[SEQ ID NO:89];EAEF[SEQ IDNO:90];REAEAEF[SEQ ID NO:91]和EEGVSLEKR[SEQ ID NO:92]。
实施例4 ELISA研究
ELISA在96孔板中进行,所述96孔板板孔用存在于0.05M pH 8的Tris-HCl缓冲液中的4μg/ml Ag 5包被。结合的Ig G1利用2μg/ml生物素化的山羊抗小鼠IgG(γ1特异性)其后再利用2μg/ml亲合素-过氧化物酶缀合物检测(King等人,1995,免疫学杂志(J.Immunol)154:577)。血清样品的抗体浓度通过它们的ELISA数据与Ves v 5特异性抗体的免疫亲合纯化样品的ELISA数据相比较而确定。
实施例5 杂合体的Ves v 5特异性B细胞表位
天然Ves v 5特异性小鼠多克隆抗体利用在Ves v 5特异性免疫吸附剂上亲合层析从BALB/c血清中分离,并且通过过Pol a 5特异性免疫吸附剂将Pol a 5交叉反应抗体去除。免疫吸附剂利用CNBr活化的Sepharose 2B(Pharmacia)制备。小鼠Ves v 5特异性单克隆抗体按照King等人,1987,分子免疫学(Mol.Immunol)24:857中所述方法获取。
Ves v 5特异性B细胞表位通过杂合体对小鼠Ves v 5特异性抗体与固相Ves v 5的结合的抑制来检测。将EA-和KR-Ves v 5作为固相抗原进行测试,得到类似结果。共测试5个小鼠抗血清样品:3个来自BALB/c株系以及1个来自ASW/sn株系、1个来自于P/J株系。利用一个BALB/c血清样品得到的结果显示在图8A中。当用50或500μg/ml抑制剂的最高浓度测试时,两个N-端杂合体EA-PV1-46和EA-1-155显示最大抑制作用,达100%,与EA-或KR-Ves v 5的抑制作用一样。另外两个N-端杂合体KR-PV1-24和EA-PV1-32具有约60%的最大抑制作用,而最短的N-端杂合体EA-PV1-18的最大抑制作用为约20%。C-端杂合体EA-PV156-204的最大抑制作用为约15%。利用来自ASW/sn(图8B)和P/J(图8C)小鼠的抗血清进行抑制ELISA试验得到相似结果。
Ves v 5特异性B细胞表位还利用来自六个小黄蜂敏感患者的血清通过抑制分析进行了检测。从三个患者得出的数据显示在图9A-C。该结果与利用小鼠IgG获得的结果相似。
利用小鼠和人抗血清的ELISA抑制研究的结果显示Ves v 5的N-端区域具有免疫优势。
由于用于BALB/c小鼠抑制研究的Ves v 5特异性抗体样品已除去Pola 5交叉反应抗体并且没有检测到Pol a 5的抑制作用(图8A),所以,所观察到的杂合体抑制作用并非由于分子的Pol a 5部分的交叉反应表位引起。与Ves v 5相比达到半最大抑制作用所需要的杂合体高浓度并不反映出杂合体的表位缺少Ves v 5的天然结构,因为缺少天然结构的来自细菌的重组Ves v5并不显示任何抑制作用(数据未显示)。
Ves v 5和杂合体在抑制活性上的差异可能与它们的表位密度有关。已知表位密度强烈地影响多价抗原和二价抗体的亲合常数(Hornick和Karush,1972,免疫化学(Immunochemistry)9:325;Crothers和Metzger,1972,免疫化学(Immunochemistry)9:341)。
图8和图9中的数据揭示Ves v 5的氨基端部分含有Ves v 5的免疫显性B细胞表位。这一发现通过利用一组17个Ves v 5特异性单克隆抗体进行测试而确认(King等人,1987,分子免疫学(Mol.Immunol)24:857)。这些单克隆抗体是天然Ves v 5和来自酵母的重组蛋白质的特异性抗体,但是它们并不结合来自细菌的重组Ves v 5的变性形式(数据未显示)。ELISA结果显示一种单克隆抗体以相似的亲合性和最大的结合与EA-Ves v5和EA-PV1-46结合,并且其不与其它的任何N-或C-端杂合体结合(图10A)。另外4种单克隆抗体与EA-PV1-46有大大减少的最大结合,但它们不与任何更短的N-端杂合体结合;其中一个抗体的数据显示在图10B中。最后,一种单克隆抗体显示出与EA-PV1-32和EA-PV1-46具有大大减弱的结合以及与EA-PV1-18和EA-PV1-24具有中等程度的结合(图10C)。这些数据显示测试的17种单克隆抗体中有6种对Vesv 5的N-端区域有特异性。
实施例6 对杂合体的免疫应答
2周一次向每组3或4只雌性BALB/c小鼠腹膜内注射存在于0.2ml磷酸缓冲盐水中的2μg免疫原和1μg明矾。Ag 5或杂合体特异性血清在第5周或之后收集。第5、7和9周收集的血清显示相似的抗体水平。
用杂合体免疫的小鼠产生杂合体(Pol a 5和Ves v 5)特异的抗体。血清样品的抗体水平在用Pol a 5吸附之前和之后测量以确定它们对Ves v 5的特异性。这些数据总结在表3A。利用天然、EA-或KR-Ves v 5免疫的小鼠具有几乎相同的抗体应答,并且仅KR-Ves v 5的抗体应答在表3A中给出。EA-PV1-46在A组小鼠中产生的抗体应答比KR-PV1-46在B组小鼠中产生的抗体应答要高一些。此差异可能是由于所用小鼠组的不同造成的。EA-PV1-18用于两组实验,而其在A组小鼠中产生的抗体应答高于其在B组小鼠中产生的抗体应答。
比较Pol a 5吸附前后表3中N-端杂合体特异性血清样品的抗体水平,结果显示,当在固相Ves v 5上测试时,抗体的30-80%对Ves v 5特异,并且当在固相杂合体上测试时这些值较小。在固相Ves v 5上检测到的Ves v 5特异性抗体的含量高于在固相杂合体上检测到的含量,这揭示大部分杂合体特异性抗体识别杂合体中Ves v 5和Pol a 5的重叠区域。表3A中A组的数据显示在3个N-端杂合体中,PV1-155具有与Ves v 5相同的免疫原性,PV1-46的免疫原性是Ves v 5的一半,而PV1-18的免疫原性是Ves v 5的1/9。B组中的数据显示PV1-46和1-32比PV1-24和1-18有更强的免疫原性。两组数据揭示,与2个较短的N端杂合体PV1-24和1-18相比,较长的N-端杂合体PV1-46和1-32刺激产生更高含量的Ves v 5特异性抗体和更低含量的Pol a 5特异性抗体。
表3A
                对胡蜂抗原5s以及杂合体的小鼠抗体应答
                       固相上通过ELISA测得的血清中
                           特异IgG量(mg/ml)2,3
         免疫原
                                  EA-Pol a 5
   组                   EAVesv5              杂合体
   A    KR-Ves v 5      8.9(8.5)      0.6      -
        KR-Pol a 5      2.8(1.0)      7.0      -
        EA-PV1-155      12.0          0.7      -
        EA-PV1-46       4.2(3.5)      1.9      7.6(5.6)
        EA-PV1-18       1.0(0.8)      6.9      6.9(0.7)
        EA-PV156-204    1.6(0.6)      10.0     2.6(0.3)
        EA-PV195-204    1.3(0.4)      14.0     10.0(0.3)
   B    KR-Vesv5        15.0(14.0)    0.2      -
        KR-PV1-46       0.6(0.5)      1.0      2.7(3.0)
        EA-PV1-32       0.9(0.7)      4.3      8.0(3.2)
        KR-PV1-24       0.4(0.3)      4.2      6.5(0.9)
        EA-PV1-18       0.4(0.3)      4.5      5.3(0.7)
1.经3次两周一次的腹膜内免疫原注射后在第7周收集血清。A组和B组分别研究。
2.抗体浓度由使30分钟内吸光度变化为1.0所需的血清浓度倒数来估计。在所用条件下,这一变化相应于纯化的Ves v 5特异性抗体的0.1μg/ml溶液。所估计的抗体浓度在重复测量时变化约40%。
3.括号中的值为利用0.2mg/ml EA-Pol a 5对1/500稀释的血清进行吸附后获得的值。
表3A中的结果显示Ves v 5的B细胞表位在其N-端区域。制备另外的Ves v 5和Pol a 5的杂合体并按上述方法检验小鼠中的免疫原性,以勾绘显性B细胞表位区域的N和C-端界线。结果在表3B中给出,其列出了对Ves v、Pol a或杂合体特异的IgG1含量,以及在利用Pa吸附后残余的特异性IgG1的百分比。
具有最低Ves v含量的杂合体PV1-8并不引起Ves v特异性抗体应答。除PV22-32外,所有其它杂合体均诱导0.4-4.5mg/ml的Ves v特异性Ab。Ves v含量<PV1-32的杂合体对Ves v应答具中等特异性,因为它们的Ves v特异性抗体的34-81%和它们的杂合体特异性抗体的15-27%没有被Pol a 5吸附。Ves v含量>PV1-39的杂合体较为特异,因为它们的Ves v 5特异性抗体的66-96%和它们的杂合体特异性抗体的91-100%没有被Pol a 5吸附。这些结果一起说明,此显性表位区域的C-端界线在32-39位残基之间。
Ves v含量<PV1-32的杂合体显示2-4mg/ml的Pol a特异性抗体,而Ves v含量>PV1-39的杂合体显示0.04-1.34mg/ml的Pol a特异性抗体。随着杂合体的Ves v含量从PV1-32向1-76升高,Pol a特异性应答出现进行性下降。这些结果一起说明显性表位的C-端界线延伸超过第39位残基,正如对杂合体的Ves v特异性应答所揭示的。
与PV1-32的应答相比,PV1-8和22-32缺少Ves v特异性抗体应答,这揭示显性表位区域的N-端界线在9-21位残基之间。
表3B对胡蜂抗原5s以及杂合体的小鼠抗体应答
                    Ves v 5特异性                           杂合体特异性IgG1;
构建体    小鼠组别  IgG1:%Ves v        Pol a 5特异性IgG1  %Ves v
Pol a 5   1         1.80mg/ml;64%      4.50mg/ml
Ves v 5   4         10.7±3.2mg/ml       0.2±0.1mg/ml
                    104±15%
PV1-8     1         0                    8.2mg/ml
PV1-18    4         0.6±0.44mg/ml;     4.1±2.0mg/ml      7.5±4.5mg/ml;
                    68±14%                                27±26%
PV1-24    2         0.35±0.06mg/ml;    2.26±0.50mg/ml    5.86±1.30mg/ml;
                    81±17%                                20±12%
PV1-32    3         0.52±0.39mg/ml;    3.77±1.89mg/ml    6.82±3.46mg/ml;
                    34±25%                                15±6%
PV1-39    2         4.45±0.70mg/ml;    1.72±0.06mg/ml    8.25±1/87mg/ml;
                    89±27%                                76±23%
PV1-46    3         2.29±3.41mg/ml;    1.18±0.96mg/ml    7.57±7.33mg/ml;
                    86±14%                                91±9%
PV1-50    1         1.01mg/ml;94%      0.44mg/ml          11.22mg/ml;90%
PV1-57    1         0.67mg/ml;96%      0.22mg/ml          11.88mg/ml;85%
PV1-76    1         1.32mg/ml;92%      0.04mg/ml          11.88mg/ml;92%
PV22-32   1         0.04mg/ml;0%       4.88mg/ml          6.31mg/ml;6%
数据来自1-4组每组4只小鼠的第7周血样的平均值
%Ves v表示在利用Pol a5吸附以后抗体的含量
实施例7 T细胞应答
增殖试验利用来自用胡蜂抗原5或杂合体免疫的小鼠的脾细胞进行。在5次两周一次的免疫后10天,将来自2-3只小鼠的脾细胞汇合并一式三份用于试验。脾细胞(4×105个)与测试抗原在0.2ml培养基中37℃和5%CO2条件下培养。在第三天加入氚示踪的胸苷(1μCi),并在第四天确定胸苷的摄入量。结果以刺激指数值表示。
结果显示,杂合体EA-PV1-46、EA-PV1-155和EA-PV156-204诱导杂合体特异性以及胡蜂抗原5特异性T细胞应答(表4)。数据显示当刺激抗原为免疫原时获得最好的增殖应答。这可以通过比较在所测试的最高抗原浓度100μg/ml时的最大刺激指数值以及通过比较刺激指数值为4时所需的最低抗原浓度而明显看出。
表4
胡蜂抗原5或杂合体刺激小鼠脾细胞增殖
                              刺激Ag
   脾细胞特异于  EA-Ves v5  EA-Pol a 5  杂合体
                    在100μg/ml Ag下的刺激指数
    KR-Ves v5       8.2        1.5        -
    KR-Pol a 5      2.2        6.3        -
    EA-PV1-155      6.1        2.2        5.0
    EA-PV1-46       6.0        8.0        13.5
    EA-PV1-18       2.3        5.0        6.1
    EA-PV156-204    4.1        4.2        6.8
    EA-PV195-204    1.7        8.6        4.1
                  刺激指数为4时的Ag量(μg/ml)
    KR-Ves v 5      2.6        >100      -
    KR-Pol a 5      >100      16         -
    EA-PV1-155      11         >100      0.54
    EA-PV1-46       20         2.2        0.26
    EA-PV1-18       >100      47         19
    EA-PV156-204    60         70         2.3
    EA-PV195-204    >100      8          82
脾细胞的背景增殖为400-900cpm的3H-胸苷摄入量。
实施例8 重组胡蜂Ag 5s以及杂合体在患者中的变应原性
变应原性测定利用组胺释放试验来进行,所述测定在利用Ag5或杂合体对来自10个小黄蜂敏感患者的嗜碱性粒细胞进行攻击后进行(Colombo等人,1995,***反应临床免疫学杂志(J.Allergy Clin.Imm.)95:565)。在表5中显示的患者/结果被分成两组。A组患者(n=7)对Ves v 5比对Pol a 5敏感约1000倍;而B组患者(n=3)对两种抗原5s具有大约相同的敏感度。
表5
杂合体的组胺释放数据总结
                       相对于Ves v 5的倒数活性
                      组A                          组B
变应原    患者数  平均值  范围        患者数  平均值    范围
Ves v 5      7      1       1            3      1        1
Pol a 5      7      1154    330-5500     3      0.7      0.2-2
PV1-155      3      1       1-2          2      1        1
PV1-46       5      126     13-3300      2      0.7      0.1-5
PV1-18       3      583     12-5000      2      24       3.0-200
PV22-32      3      3207    2000-5000    2      6        6-20
PV115-125    3      3207    2000-5000    2      5        2-15
PV142-150    3      3000    2700-5000    2      5        2-15
PV156-204    6      1139    1000-3000    3      3        0.4-70
PV195-204    3      3207    50-5000      2      32       20.0-50
每一组中一位患者的完整数据在图11中给出。
在所测试的3个N-端杂合体中,EA-PV1-155并没有显示出变应原性的减少。EA-PV1-46和1-18在A组患者中分别显示126和583倍的几何平均减少,以及在B组患者中分别显示0.7和24倍的减少。两个C-端杂合体EA-PV156-204和195-204的减少在A组患者中分别为1139和3207倍,而在B组患者中分别为3和32倍。
N和C-端杂合体在变应原性上的不同减少程度反映了它们的IgE抗体浓度和它们的表位密度。图6中的抑制ELISA数据揭示对Ves v 5的N-端区域比对其C-端区域有更高的人IgG抗体浓度,并且对于IgE抗体可能也是如此。与N-端杂合体EA-PV1-46相比C-端杂合体EA-PV156-204在变应原性上减少更大,造成此现象的另一因子可能是EA-PV156-204具有减少的表位密度,因为此C-端杂合体比N-端杂合体具有更少的Ves v 5表面可及残基。类似地,较短的N或C-末端杂合体PV1-18或PV195-204与它们各自较长的杂合体相比具有更少的变应原性,这也反映了表位密度的影响。
将来自细菌的重组Ves v 5的变应原性与天然Ves v 5和来自酵母的重组Ves v 5的变应原性做一下比较。在测试的3个患者中,来自细菌的重组蛋白质比天然蛋白质和来自酵母的重组蛋白质的效力减少约103倍(数据未显示)。这些数据确认了以前的观察:针对变应原的大部分B细胞表位依赖于天然变应原的构象(King等人,2000,Int Arch Allergy 123:99)。
来自细菌的重组Ves v 5的变应原性下降是由于构象依赖性B细胞表位的丧失而致,因为来自细菌的重组蛋白质的CD光谱显示其具有无序结构。然而,杂合蛋白质PV1-46或PV156-204的变应原性下降却是由于Ves v 5特异性表位的数目和密度的减少所致,因为其CD光谱显示它具有与Ves v 5相似的有序结构。杂合体PV1-46和PV156-204的表位数目和密度的减少与实施例5-7中给出的B细胞表位和免疫原性数据一致。
实施例9 重组Ves v 5的结晶
Ves v 5晶体利用蒸气扩散技术在25℃下生长。为形成晶体,5μl 5mg/ml的Ves v 5与5μl 18%PEG6000、0.1M柠檬酸钠(pH6.0)混和,并相对于1ml 18%PEG6000、0.1M柠檬酸钠(pH6.0)进行平衡。X射线衍射数据在100K从天然Ves v 5晶体和引入重金属衍生物后的晶体收集,并且利用所述数据解析Ves v 5三维结构。Ves v 5的原子座标和结构因子已经放入蛋白质数据库(PDB),其登录号为Q05110。Ves v 5的原子座标在表6中给出。
表6Ves v 5晶体座标
REMARK FILENAME=″brefinement.pdb″
REMARK r=0.215955 free_r=0.298202
REMARK DATE:28-Oct-98  15:45:46       created by user:anette
ATOM      1   CB   GLU    1      17.077  51.793  23.662  1.00 41.80  APEP
ATOM      2   CG   GLU    1      16.595  52.047  25.081  1.00 43.97  APEP
ATOM      3   CD   GLU    1      15.167  51.580  25.310  1.00 44.74  APEP
ATOM      4   OE1  GLU    1      14.367  51.640  24.352  1.00 46.38  APEP
ATOM      5   OE2  GLU    1      14.845  51.156  26.444  1.00 43.48  APEP
ATOM      6   C    GLU    1      19.169  50.429  23.664  1.00 39.72  APEP
ATOM      7   O    GLU    1      19.733  49.575  24.358  1.00 40.19  APEP
ATOM      8   N    GLU    1      17.005  49.431  24.404  1.00 41.50  APEP
ATOM      9   CA   GLU    1      17.655  50.391  23.458  1.00 40.85  APEP
ATOM      10  N    ALA    2      19.820  51.423  23.064  1.00 37.33  APEP
ATOM      11  CA   ALA    2      21.267  51.571  23.179  1.00 34.17  APEP
ATOM      12  CB   ALA    2      21.668  51.735  24.657  1.00 34.25  APEP
ATOM      13  C    ALA    2      21.935  50.341  22.585  1.00 32.32  APEP
ATOM      14  O    ALA    2      21.299  49.580  21.847  1.00 33.01  APEP
ATOM      15  N    GLU    3      23.215  50.148  22.899  1.00 29.81  APEP
ATOM      16  CA   GLU    3      23.956  48.991  22.402  1.00 26.33  APEP
ATOM      17  CB   GLU    3      24.948  49.413  21.325  1.00 30.89  APEP
ATOM      18  CG   GLU    3      25.246  48.320  20.303  1.00 35.96  APEP
ATOM      19  CD   GLU    3      24.029  47.468  19.973  1.00 38.25  APEP
ATOM      20  OE1  GLU    3      23.428  47.678  18.891  1.00 39.27  APEP
ATOM      21  OE2  GLU    3      23.681  46.586  20.793  1.00 37.45  APEP
ATOM      22  C    GLU    3      24.693  48.269  23.530  1.00 21.89  APEP
ATOM      23  O    GLU    3      25.780  48.679  23.959  1.00 20.16  APEP
ATOM      24  N    ALA    4      24.093  47.180  23.995  1.00 17.32  APEP
ATOM      25  CA   ALA    4      24.652  46.382  25.080  1.00 15.71  APEP
ATOM      26  CB   ALA    4      23.796  45.141  25.302  1.00 12.64  APEP
ATOM      27  C    ALA    4      26.103  45.970  24.862  1.00 14.17  APEP
ATOM      28  O    ALA    4      26.816  45.710  25.827  1.00 11.99  APEP
ATOM      29  N    GLU    5      26.542  45.908  23.603  1.00 12.66  APEP
ATOM      30  CA   GLU    5      27.917  45.503  23.319  1.00 13.51  APEP
ATOM      31  CB   GLU    5      28.222  45.583  21.817  1.00 15.08  APEP
ATOM      32  CG   GLU    5      29.647  45.127  21.479  1.00 20.49  APEP
ATOM      33  CD   GLU    5      30.068  45.447  20.049  1.00 22.60  APEP
ATOM      34  OE1  GLU    5      29.224  45.948  19.278  1.00 24.69  APEP
ATOM      35  OE2  GLU    5      31.245  45.199  19.699  1.00 23.87  APEP
ATOM      36  C    GLU    5      28.949  46.339  24.065  1.00 12.46  APEP
ATOM      37  O    GLU    5      30.025  45.847  24.394  1.00 12.28  APEP
ATOM      38  N    PHE    6      28.616  47.596  24.343  1.00 11.87  APEP
ATOM      39  CA   PHE    6      29.546  48.491  25.022  1.00 11.93  APEP
ATOM    40  CB   PHE    6     29.459  49.879  24.377  1.00 12.32  APEP
ATOM    41  CG   PHE    6     29.706  49.857  22.887  1.00 14.45  APEP
ATOM    42  CD1  PHE    6     28.646  49.803  21.997  1.00 14.86  APEP
ATOM    43  CD2  PHE    6     31.001  49.811  22.381  1.00 14.25  APEP
ATOM    44  CE1  PHE    6     28.870  49.698  20.623  1.00 15.78  APEP
ATOM    45  CE2  PHE    6     31.236  49.705  21.008  1.00 13.92  APEP
ATOM    46  CZ   PHE    6     30.166  49.648  20.131  1.00 13.36  APEP
ATOM    47  C    PHE    6     29.378  48.556  26.537  1.00 10.13  APEP
ATOM    48  O    PHE    6     29.892  49.463  27.201  1.00 9.26   APEP
ATOM    49  N    ASN    7     28.658  47.568  27.066  1.00 10.89  APEP
ATOM    50  CA   ASN    7     28.411  47.422  28.498  1.00 7.63   APEP
ATOM    51  CB   ASN    7     27.040  46.786  28.750  1.00 6.94   APEP
ATOM    52  CG   ASN    7     25.897  47.774  28.658  1.00 5.91   APEP
ATOM    53  OD1  ASN    7     26.049  48.953  28.962  1.00 6.68   APEP
ATOM    54  ND2  ASN    7     24.735  47.286  28.240  1.00 2.00   APEP
ATOM    55  C    ASN    7     29.477  46.428  28.929  1.00 8.03   APEP
ATOM    56  O    ASN    7     29.712  45.448  28.223  1.00 7.49   APEP
ATOM    57  N    ASN    8     30.126  46.663  30.066  1.00 7.97   APEP
ATOM    58  CA   ASN    8     31.155  45.735  30.536  1.00 9.65   APEP
ATOM    59  CB   ASN    8     32.193  46.469  31.384  1.00 11.85  APEP
ATOM    60  CG   ASN    8     33.241  45.531  31.961  1.00 13.69  APEP
ATOM    61  OD1  ASN    8     33.493  44.459  31.415  1.00 12.11  APEP
ATOM    62  ND2  ASN    8     33.858  45.935  33.071  1.00 12.79  APEP
ATOM    63  C    ASN    8     30.553  44.586  31.350  1.00 10.91  APEP
ATOM    64  O    ASN    8     30.397  44.690  32.564  1.00 11.39  APEP
ATOM    65  N    TYR    9     30.225  43.490  30.674  1.00 10.20  APEP
ATOM    66  CA   TYR    9     29.631  42.331  31.328  1.00 9.11   APEP
ATOM    67  CB   TYR    9     28.956  41.431  30.287  1.00 8.55   APEP
ATOM    68  CG   TYR    9     27.727  42.054  29.689  1.00 6.89   APEP
ATOM    69  CD1  TYR    9     27.798  42.805  28.517  1.00 8.12   APEP
ATOM    70  CE1  TYR    9     26.668  43.423  27.991  1.00 9.63   APEP
ATOM    71  CD2  TYR    9     26.498  41.932  30.318  1.00 7.93   APEP
ATOM    72  CE2  TYR    9     25.362  42.543  29.806  1.00 9.55   APEP
ATOM    73  CZ   TYR    9     25.452  43.286  28.646  1.00 10.64  APEP
ATOM    74  OH   TYR    9     24.325  43.893  28.149  1.00 11.41  APEP
ATOM    75  C    TYR    9     30.628  41.509  32.131  1.00 10.32  APEP
ATOM    76  O    TYR    9     30.237  40.584  32.840  1.00 8.46   APEP
ATOM    77  N    CYS    10    31.912  41.834  32.017  1.00 11.72  APEP
ATOM    78  CA   CYS    10    32.934  41.098  32.750  1.00 13.13  APEP
ATOM    79  C    CYS    10    32.832  41.404  34.240  1.00 14.57  APEP
ATOM    80  O    CYS    10    33.565  40.835  35.051  1.00 14.20  APEP
ATOM    81  CB   CYS    10    34.329  41.471  32.242  1.00 14.59  APEP
ATOM    82  SG   CYS    10    34.747  40.862  30.569  1.00 13.90  APEP
ATOM    83  N    LYS    11    31.913  42.300  34.593  1.00 15.58  APEP
ATOM    84  CA   LYS    11    31.706  42.695  35.982  1.00 17.16  APEP
ATOM    85  CB   LYS    11    31.514  44.213  36.073  1.00 17.37  APEP
ATOM    86  CG   LYS    11    32.805  45.020  35.908  1.00 19.88  APEP
ATOM    87  CD   LYS    11    33.879  44.549  36.872  1.00 19.32  APEP
ATOM    88  CE   LYS    11    35.252  44.994  36.442  1.00 22.07  APEP
ATOM    89  NZ   LYS    11    36.148  43.824  36.212  1.00 26.09  APEP
ATOM    90  C    LYS    11    30.503  41.987  36.600  1.00 18.39  APEP
ATOM    91  O    LYS    11    30.330  41.990  37.822  1.00 18.93  APEP
ATOM    92  N    ILE    12    29.676  41.382  35.748  1.00 17.37  APEP
ATOM    93  CA   ILE    12    28.488  40.662  36.197  1.00 17.54  APEP
ATOM    94  CB   ILE    12    27.522  40.348  35.011  1.00 15.92  APEP
ATOM    95  CG2  ILE    12    26.347  39.507  35.497  1.00 14.62  APEP
ATOM    96  CG1  ILE    12    27.033  41.645  34.353  1.00 14.71  APEP
ATOM    97   CD1  ILE    12    26.197  42.543  35.246  1.00 14.44  APEP
ATOM    98   C    ILE    12    28.902  39.331  36.817  1.00 18.50  APEP
ATOM    99   O    ILE    12    29.884  38.728  36.401  1.00 19.73  APEP
ATOM    100  N    LYS    13    28.144  38.884  37.813  1.00 19.79  APEP
ATOM    101  CA   LYS    13    28.391  37.605  38.468  1.00 21.47  APEP
ATOM    102  CB   LYS    13    28.978  37.811  39.871  1.00 24.55  APEP
ATOM    103  CG   LYS    13    28.349  38.959  40.664  1.00 29.46  APEP
ATOM    104  CD   LYS    13    29.139  39.272  41.934  1.00 32.01  APEP
ATOM    105  CE   LYS    13    29.966  40.546  41.786  1.00 34.07  APEP
ATOM    106  NZ   LYS    13    30.867  40.516  40.591  1.00 34.69  APEP
ATOM    107  C    LYS    13    27.051  36.867  38.555  1.00 20.70  APEP
ATOM    108  O    LYS    13    26.050  37.433  38.976  1.00 19.96  APEP
ATOM    109  N    CYS    14    27.029  35.611  38.132  1.00 20.06  APEP
ATOM    110  CA   CYS    14    25.808  34.831  38.176  1.00 20.78  APEP
ATOM    111  C    CYS    14    25.741  34.062  39.482  1.00 22.64  APEP
ATOM    112  O    CYS    14    26.724  33.994  40.218  1.00 22.31  APEP
ATOM    113  CB   CYS    14    25.752  33.875  36.987  1.00 19.10  APEP
ATOM    114  SG   CYS    14    25.352  34.724  35.422  1.00 16.84  APEP
ATOM    115  N    LEU    15    24.577  33.492  39.775  1.00 24.99  APEP
ATOM    116  CA   LEU    15    24.400  32.746  41.015  1.00 27.03  APEP
ATOM    117  CB   LEU    15    22.953  32.251  41.138  1.00 27.78  APEP
ATOM    118  CG   LEU    15    22.054  32.963  42.152  1.00 28.08  APEP
ATOM    119  CD1  LEU    15    20.699  32.269  42.194  1.00 28.30  APEP
ATOM    120  CD2  LEU    15    22.699  32.953  43.535  1.00 27.17  APEP
ATOM    121  C    LEU    15    25.365  31.574  41.090  1.00 27.24  APEP
ATOM    122  O    LEU    15    26.065  31.402  42.088  1.00 28.76  APEP
ATOM    123  N    LYS    16    25.410  30.774  40.033  1.00 28.73  APEP
ATOM    124  CA   LYS    16    26.300  29.621  40.005  1.00 30.04  APEP
ATOM    125  CB   LYS    16    25.679  28.478  39.201  1.00 31.71  APEP
ATOM    126  CG   LYS    16    24.162  28.401  39.271  1.00 32.24  APEP
ATOM    127  CD   LYS    16    23.562  27.757  38.009  1.00 33.96  APEP
ATOM    128  CE   LYS    16    24.536  27.738  36.820  1.00 33.82  APEP
ATOM    129  NZ   LYS    16    23.828  27.604  35.515  1.00 33.08  APEP
ATOM    130  C    LYS    16    27.659  29.966  39.417  1.00 30.04  APEP
ATOM    131  O    LYS    16    28.442  29.071  39.092  1.00 31.31  APEP
ATOM    132  N    GLY    17    27.933  31.261  39.273  1.00 29.07  APEP
ATOM    133  CA   GLY    17    29.214  31.698  38.744  1.00 27.07  APEP
ATOM    134  C    GLY    17    29.410  31.553  37.243  1.00 26.38  APEP
ATOM    135  O    GLY    17    28.448  31.552  36.472  1.00 25.25  APEP
ATOM    136  N    GLY    18    30.670  31.428  36.831  1.00 25.19  APEP
ATOM    137  CA   GLY    18    30.983  31.294  35.420  1.00 22.24  APEP
ATOM    138  C    GLY    18    31.139  32.655  34.771  1.00 20.24  APEP
ATOM    139  O    GLY    18    30.510  33.622  35.195  1.00 21.83  APEP
ATOM    140  N    VAL    19    31.974  32.735  33.743  1.00 16.65  APEP
ATOM    141  CA   VAL    19    32.212  33.989  33.040  1.00 15.58  APEP
ATOM    142  CB   VAL    19    33.516  33.896  32.222  1.00 15.68  APEP
ATOM    143  CG1  VAL    19    33.884  35.254  31.649  1.00 13.84  APEP
ATOM    144  CG2  VAL    19    34.633  33.364  33.108  1.00 15.09  APEP
ATOM    145  C    VAL    19    31.045  34.361  32.115  1.00 14.11  APEP
ATOM    146  O    VAL    19    30.622  33.562  31.278  1.00 14.03  APEP
ATOM    147  N    HIS    20    30.528  35.577  32.265  1.00 11.37  APEP
ATOM    148  CA   HIS    20    29.410  36.020  31.444  1.00 11.65  APEP
ATOM    149  CB   HIS    20    29.094  37.493  31.704  1.00 12.93  APEP
ATOM    150  CG   HIS    20    27.721  37.900  31.264  1.00 13.85  APEP
ATOM    151  CD2  HIS    20    26.597  38.156  31.974  1.00 15.96  APEP
ATOM    152  ND1  HIS    20    27.392  38.102  29.941  1.00 15.59  APEP
ATOM    153  CE1  HIS    20    26.126  38.466  29.853  1.00 15.25  APEP
ATOM    154  NE2  HIS    20    25.620  38.506  31.072  1.00 17.34  APEP
ATOM    155  C    HIS    20    29.679  35.811  29.961  1.00 11.56  APEP
ATOM    156  O    HIS    20    30.783  36.054  29.467  1.00 9.12   APEP
ATOM    157  N    THR    21    28.650  35.355  29.260  1.00 12.15  APEP
ATOM    158  CA   THR    21    28.739  35.090  27.828  1.00 12.76  APEP
ATOM    159  CB   THR    21    27.349  34.686  27.287  1.00 13.90  APEP
ATOM    160  OG1  THR    21    27.016  33.387  27.792  1.00 14.96  APEP
ATOM    161  CG2  THR    21    27.336  34.658  25.756  1.00 13.84  APEP
ATOM    162  C    THR    21    29.294  36.278  27.025  1.00 12.07  APEP
ATOM    163  O    THR    21    30.102  36.090  26.111  1.00 8.89   APEP
ATOM    164  N    ALA    22    28.873  37.490  27.380  1.00 10.72  APEP
ATOM    165  CA   ALA    22    29.312  38.698  26.693  1.00 11.63  APEP
ATOM    166  CB   ALA    22    28.311  39.816  26.925  1.00 12.20  APEP
ATOM    167  C    ALA    22    30.706  39.156  27.102  1.00 13.47  APEP
ATOM    168  O    ALA    22    31.200  40.178  26.621  1.00 13.74  APEP
ATOM    169  N    CYS    23    31.332  38.410  28.006  1.00 14.12  APEP
ATOM    170 CA    CYS    23    32.683  38.715  28.460  1.00 14.19  APEP
ATOM    171  C    CYS    23    33.564  37.670  27.793  1.00 12.16  APEP
ATOM    172  O    CYS    23    34.725  37.909  27.497  1.00 13.84  APEP
ATOM    173  CB   CYS    23    32.782  38.599  29.995  1.00 12.96  APEP
ATOM    174  SG   CYS    23    34.454  38.855  30.695  1.00 14.19  APEP
ATOM    175  N    LYS    24    32.987  36.501  27.561  1.00 13.18  APEP
ATOM    176  CA   LYS    24    33.697  35.405  26.917  1.00 14.00  APEP
ATOM    177  CB   LYS    24    32.894  34.109  27.048  1.00 13.62  APEP
ATOM    178  CG   LYS    24    33.111  33.347  28.334  1.00 13.30  APEP
ATOM    179  CD   LYS    24    32.593  31.929  28.193  1.00 14.90  APEP
ATOM    180  CE   LYS    24    31.656  31.540  29.311  1.00 15.48  APEP
ATOM    181  NZ   LYS    24    32.009  30.188  29.830  1.00 21.39  APEP
ATOM    182  C    LYS    24    33.853  35.742  25.446  1.00 13.93  APEP
ATOM    183  O    LYS    24    34.917  35.578  24.861  1.00 14.28  APEP
ATOM    184  N    TYR    25    32.767  36.219  24.857  1.00 16.64  APEP
ATOM    185 CA    TYR    25    32.737  36.585  23.448  1.00 17.22  APEP
ATOM    186  CB   TYR    25    31.736  35.684  22.719  1.00 18.12  APEP
ATOM    187  CG   TYR    25    31.716  34.245  23.217  1.00 16.13  APEP
ATOM    188  CD1  TYR    25    30.600  33.727  23.879  1.00 18.60  APEP
ATOM    189  CE1  TYR    25    30.574  32.404  24.332  1.00 15.87  APEP
ATOM    190  CD2  TYR    25    32.810  33.403  23.021  1.00 16.98  APEP
ATOM    191  CE2  TYR    25    32.794  32.081  23.469  1.00 14.73  APEP
ATOM    192  CZ   TYR    25    31.677  31.590  24.120  1.00 16.64  APEP
ATOM    193  OH   TYR    25    31.661  30.283  24.566  1.00 19.74  APEP
ATOM    194  C    TYR    25    32.339  38.060  23.336  1.00 18.24  APEP
ATOM    195  O    TYR    25    31.155  38.404  23.332  1.00 17.58  APEP
ATOM    196  N    GLY    26    33.340  38.929  23.250  1.00 19.90  APEP
ATOM    197  CA   GLY    26    33.086  40.358  23.182  1.00 22.78  APEP
ATOM    198  C    GLY    26    32.536  40.927  21.886  1.00 25.12  APEP
ATOM    199  O    GLY    26    32.260  42.125  21.815  1.00 26.30  APEP
ATOM    200  N    SER    27    32.362  40.092  20.867  1.00 26.19  APEP
ATOM    201  CA   SER    27    31.855  40.570  19.583  1.00 26.72  APEP
ATOM    202  CB   SER    27    32.960  40.435  18.522  1.00 25.95  APEP
ATOM    203  OG   SER    27    32.457  40.041  17.259  1.00 24.78  APEP
ATOM    204  C    SER    27    30.586  39.839  19.139  1.00 26.86  APEP
ATOM    205  O    SER    27    30.159  38.878  19.774  1.00 25.87  APEP
ATOM    206  N    LEU    28    29.979  40.312  18.053  1.00 29.54  APEP
ATOM    207  CA   LEU    28    28.766  39.695  17.518  1.00 30.96  APEP
ATOM    208  CB   LEU    28    27.793  40.769  17.021  1.00 33.13  APEP
ATOM    209  CG   LEU    28    28.127  42.217  17.391  1.00 34.56  APEP
ATOM    210  CD1  LEU    28    29.022  42.812  16.319  1.00 34.22  APEP
ATOM    211  CD2  LEU    28    26.843  43.030    17.551  1.00 34.12  APEP
ATOM    212  C    LEU    28    29.142  38.769    16.365  1.00 30.72  APEP
ATOM    213  O    LEU    28    28.277  38.224    15.673  1.00 31.18  APEP
ATOM    214  N    LYS    29    30.448  38.602    16.176  1.00 30.29  APEP
ATOM    215  CA   LYS    29    31.008  37.759    15.124  1.00 29.17  APEP
ATOM    216  CB   LYS    29    32.490  38.102    14.937  1.00 31.20  APEP
ATOM    217  CG   LYS    29    33.016  37.866    13.534  1.00 32.99  APEP
ATOM    218  CD   LYS    29    34.528  37.785    13.521  1.00 34.25  APEP
ATOM    219  CE   LYS    29    35.150  39.121    13.885  1.00 35.23  APEP
ATOM    220  NZ   LYS    29    35.686  39.098    15.273  1.00 37.84  APEP
ATOM    221  C    LYS    29    30.867  36.269    15.444  1.00 27.53  APEP
ATOM    222  O    LYS    29    31.446  35.772    16.413  1.00 25.87  APEP
ATOM    223  N    PRO    30    30.104  35.530    14.621  1.00 27.59  APEP
ATOM    224  CD   PRO    30    29.362  36.011    13.442  1.00 26.03  APEP
ATOM    225  CA   PRO    30    29.905  34.091    14.840  1.00 25.87  APEP
ATOM    226  CB   PRO    30    28.982  33.675    13.694  1.00 25.48  APEP
ATOM    227  CG   PRO    30    28.330  34.949    13.245  1.00 24.87  APEP
ATOM    228  C    PRO    30    31.182  33.253    14.871  1.00 25.41  APEP
ATOM    229  O    PRO    30    32.061  33.404    14.018  1.00 26.47  APEP
ATOM    230  N    ASN    31    31.273  32.376    15.866  1.00 22.04  APEP
ATOM    231  CA   ASN    31    32.407  31.469    16.030  1.00 21.43  APEP
ATOM    232  CB   ASN    31    33.061  31.623    17.413  1.00 21.58  APEP
ATOM    233  CG   ASN    31    33.840  32.911    17.564  1.00 23.13  APEP
ATOM    234  OD1  ASN    31    34.581  33.319    16.672  1.00 23.71  APEP
ATOM    235  ND2  ASN    31    33.680  33.558    18.713  1.00 25.47  APEP
ATOM    236  C    ASN    31    31.817  30.071    15.944  1.00 19.60  APEP
ATOM    237  O    ASN    31    31.743  29.365    16.948  1.00 18.51  APEP
ATOM    238  N    CYS    32    31.384  29.667    14.756  1.00 18.76  APEP
ATOM    239  CA   CYS    32    30.779  28.348    14.605  1.00 18.03  APEP
ATOM    240  C    CYS    32    31.690  27.310    13.975  1.00 17.09  APEP
ATOM    241  O    CYS    32    31.234  26.464    13.207  1.00 13.04  APEP
ATOM    242  CB   CYS    32    29.493  28.456    13.792  1.00 17.35  APEP
ATOM    243  SG   CYS    32    28.253  29.528    14.570  1.00 16.28  APEP
ATOM    244  N    GLY    33    32.974  27.379    14.311  1.00 19.59  APEP
ATOM    245  CA   GLY    33    33.942  26.433    13.786  1.00 21.31  APEP
ATOM    246  C    GLY    33    33.914  26.269    12.278  1.00 22.56  APEP
ATOM    247  O    GLY    33    33.985  27.250    11.532  1.00 22.89  APEP
ATOM    248  N    ASN    34    33.812  25.021    11.830  1.00 22.35  APEP
ATOM    249  CA   ASN    34    33.787  24.724    10.409  1.00 23.03  APEP
ATOM    250  CB   ASN    34    34.531  23.410    10.136  1.00 26.79  APEP
ATOM    251  CG   ASN    34    33.754  22.187    10.581  1.00 31.53  APEP
ATOM    252  OD1  ASN    34    33.028  22.221    11.579  1.00 35.39  APEP
ATOM    253  ND2  ASN    34    33.908  21.088    9.840   1.00 32.88  APEP
ATOM    254  C    ASN    34    32.377  24.682    9.821   1.00 22.38  APEP
ATOM    255  O    ASN    34    32.193  24.351    8.647   1.00 21.38  APEP
ATOM    256  N    LYS    35    31.377  25.029    10.629  1.00 19.97  APEP
ATOM    257  CA   LYS    35    30.007  25.053    10.133  1.00 17.88  APEP
ATOM    258  CB   LYS    35    29.011  25.166    11.289  1.00 17.85  APEP
ATOM    259  CG   LYS    35    29.323  24.277    12.482  1.00 19.14  APEP
ATOM    260  CD   LYS    35    28.050  23.847    13.179  1.00 18.82  APEP
ATOM    261  CE   LYS    35    28.196  23.884    14.689  1.00 18.39  APEP
ATOM    262  NZ   LYS    35    29.499  23.329    15.115  1.00 18.61  APEP
ATOM    263  C    LYS    35    29.879  26.281    9.235   1.00 16.90  APEP
ATOM    264  O    LYS    35    30.557  27.284    9.453   1.00 16.79  APEP
ATOM    265  N    VAL    36    29.029  26.202    8.218   1.00 16.21  APEP
ATOM    266  CA   VAL    36    28.831  27.342    7.330   1.00 15.62  APEP
ATOM    267  CB   VAL    36    28.560  26.916    5.872   1.00 15.89  APEP
ATOM    268  CG1  VAL    36    28.474  28.150    4.990   1.00 14.85  APEP
ATOM    269  CG2  VAL    36    29.663  26.000    5.374   1.00 17.84  APEP
ATOM    270  C    VAL    36    27.636  28.149    7.820   1.00 13.37  APEP
ATOM    271  O    VAL    36    26.530  27.631    7.949   1.00 11.50  APEP
ATOM    272  N    VAL    37    27.882  29.422    8.095   1.00 13.37  APEP
ATOM    273  CA   VAL    37    26.857  30.337    8.573   1.00 15.79  APEP
ATOM    274  CB   VAL    37    27.506  31.450    9.424   1.00 16.40  APEP
ATOM    275  CG1  VAL    37    26.487  32.521    9.765   1.00 16.09  APEP
ATOM    276  CG2  VAL    37    28.096  30.847    10.681  1.00 13.21  APEP
ATOM    277  C    VAL    37    26.067  30.971    7.422   1.00 16.67  APEP
ATOM    278  O    VAL    37    26.557  31.873    6.738   1.00 18.09  APEP
ATOM    279  N    VAL    38    24.843  30.492    7.211   1.00 16.92  APEP
ATOM    280  CA   VAL    38    23.991  31.020    6.149   1.00 17.73  APEP
ATOM    281  CB   VAL    38    22.662  30.229    6.051   1.00 15.03  APEP
ATOM    282  CG1  VAL    38    21.770  30.820    4.976   1.00 15.83  APEP
ATOM    283  CG2  VAL    38    22.953  28.778    5.740   1.00 17.06  APEP
ATOM    284  C    VAL    38    23.704  32.480    6.486   1.00 17.90  APEP
ATOM    285  O    VAL    38    23.852  33.372    5.645   1.00 18.01  APEP
ATOM    286  N    SER    39    23.305  32.713    7.731   1.00 15.41  APEP
ATOM    287  CA   SER    39    23.019  34.052    8.214   1.00 14.21  APEP
ATOM    288  CB   SER    39    21.857  34.674    7.438   1.00 14.70  APEP
ATOM    289  OG   SER    39    20.721  33.837    7.467   1.00 14.28  APEP
ATOM    290  C    SER    39    22.679  34.006    9.700   1.00 14.75  APEP
ATOM    291  O    SER    39    22.636  32.936    10.308  1.00 12.05  APEP
ATOM    292  N    TYR    40    22.444  35.179    10.278  1.00 14.22  APEP
ATOM    293  CA   TYR    40    22.111  35.272    11.686  1.00 14.10  APEP
ATOM    294  CB   TYR    40    23.397  35.179    12.530  1.00 15.42  APEP
ATOM    295  CG   TYR    40    24.239  36.438    12.583  1.00 14.41  APEP
ATOM    296  CD1  TYR    40    23.921  37.472    13.464  1.00 15.34  APEP
ATOM    297  CE1  TYR    40    24.711  38.605    13.563  1.00 16.41  APEP
ATOM    298  CD2  TYR    40    25.375  36.575    11.790  1.00 14.36  APEP
ATOM    299  CE2  TYR    40    26.179  37.712    11.879  1.00 17.60  APEP
ATOM    300  CZ   TYR    40    25.842  38.723    12.771  1.00 18.38  APEP
ATOM    301  OH   TYR    40    26.639  39.841    12.896  1.00 19.23  APEP
ATOM    302  C    TYR    40    21.360  36.569    11.969  1.00 13.71  APEP
ATOM    303  O    TYR    40    21.456  37.526    11.201  1.00 13.53  APEP
ATOM    304  N    GLY    41    20.602  36.590    13.061  1.00 12.13  APEP
ATOM    305  CA   GLY    41    19.857  37.783    13.418  1.00 13.27  APEP
ATOM    306  C    GLY    41    18.381  37.656    13.102  1.00 13.46  APEP
ATOM    307  O    GLY    41    17.968  36.726    12.419  1.00 14.55  APEP
ATOM    308  N    LEU    42    17.586  38.601    13.590  1.00 12.94  APEP
ATOM    309  CA   LEU    42    16.150  38.581    13.365  1.00 12.38  APEP
ATOM    310  CB   LEU    42    15.421  38.302    14.676  1.00 11.85  APEP
ATOM    311  CG   LEU    42    15.462  36.858    15.170  1.00 9.57   APEP
ATOM    312  CD1  LEU    42    15.279  36.828    16.682  1.00 10.07  APEP
ATOM    313  CD2  LEU    42    14.374  36.063    14.475  1.00 9.98   APEP
ATOM    314  C    LEU    42    15.651  39.895    12.791  1.00 12.90  APEP
ATOM    315  O    LEU    42    16.066  40.968    13.223  1.00 13.81  APEP
ATOM    316  N    THR    43    14.758  39.808    11.816  1.00 12.41  APEP
ATOM    317  CA   THR    43    14.200  41.006    11.210  1.00 13.32  APEP
ATOM    318  CB   THR    43    13.412  40.693    9.919   1.00 11.63  APEP
ATOM    319  OG1  THR    43    12.195  40.028    10.254  1.00 12.20  APEP
ATOM    320  CG2  THR    43    14.222  39.804    8.994   1.00 11.85  APEP
ATOM    321  C    THR    43    13.249  41.637    12.208  1.00 13.30  APEP
ATOM    322  O    THR    43    12.801  40.990    13.161  1.00 12.67  APEP
ATOM    323  N    LYS    44    12.939  42.904    11.977  1.00 14.11  APEP
ATOM    324  CA   LYS    44    12.050  43.640    12.851  1.00 14.99  APEP
ATOM    325  CB   LYS    44    11.975  45.100    12.379    1.00  16.22  APEP
ATOM    326  CG   LYS    44    10.594  45.667    12.152    1.00  18.80  APEP
ATOM    327  CD   LYS    44    10.567  47.157    12.489    1.00  19.36  APEP
ATOM    328  CE   LYS    44    9.655   47.915    11.552    1.00  21.90  APEP
ATOM    329  NZ   LYS    44    10.430  48.714    10.570    1.00  20.87  APEP
ATOM    330  C    LYS    44    10.672  42.985    12.923    1.00  13.76  APEP
ATOM    331  O    LYS    44    10.083  42.910    13.999    1.00  14.04  APEP
ATOM    332  N    GLN    45    10.162  42.487    11.798    1.00  12.41  APEP
ATOM    333  CA   GLN    45    8.84 9  41.839    11.806    1.00  11.51  APEP
ATOM    334  CB   GLN    45    8.334   41.646    10.370    1.00  10.79  APEP
ATOM    335  CG   GLN    45    7.063   40.816    10.246    1.00  10.70  APEP
ATOM    336  CD   GLN    45    5.812   41.538    10.743    1.00  12.43  APEP
ATOM    337  OE1  GLN    45    5.696   42.763    10.650    1.00  12.72  APEP
ATOM    338  NE2  GLN    45    4.869   40.772    11.274    1.00  11.44  APEP
ATOM    339  C    GLN    45    8.917   40.496    12.548    1.00  10.87  APEP
AT0M    340  O    GLN    45    7.987   40.123    13.267    1.00  9.48   APEP
ATOM    341  N    GLU    46    10.024  39.779    12.382    1.00  9.10   APEP
ATOM    342  CA   GLU    46    10.207  38.496    13.059    1.00  9.69   APEP
ATOM    343  CB   GLU    46    11.511  37.845    12.610    1.00  8.84   APEP
ATOM    344  CG   GLU    46    11.366  36.916    11.407    1.00  9.10   APEP
ATOM    345  CD   GLU    46    12.710  36.534    10.806    1.00  9.37   APEP
ATOM    346  OE1  GLU    46    13.723  37.158    11.173    1.00  7.41   APEP
ATOM    347  OE2  GLU    46    12.755  35.607    9.966     1.00  10.21  APEP
ATOM    348  C    GLU    46    10.217  38.666    14.582    1.00  10.14  APEP
ATOM    349  O    GLU    46    9.708   37.817    15.310    1.00  10.51  APEP
ATOM    350  N    LYS    47    10.807  39.761    15.057    1.00  10.08  APEP
ATOM    351  CA   LYS    47    10.865  40.042    16.486    1.00  9.91   APEP
ATOM    352  CB   LYS    47    11.675  41.318    16.749    1.00  9.24   APEP
ATOM    353  CG   LYS    47    13.167  41.191    16.459    1.00  7.94   APEP
ATOM    354  CD   LYS    47    13.906  42.509    16.710    1.00  9.13   APEP
ATOM    355  CE   LYS    47    15.411  42.361    16.498    1.00  11.45  APEP
ATOM    356  NZ   LYS    47    16.127  43.675    16.431    1.00  11.96  APEP
ATOM    357  C    LYS    47    9.43 8  40.229    16.984    1.00  10.20  APEP
ATOM    358  O    LYS    47    9.027   39.626    17.969    1.00  10.41  APEP
ATOM    359  N    GLN    48    8.689   41.065    16.275    1.00  11.41  APEP
ATOM    360  CA   GLN    48    7.299   41.366    16.602    1.00  11.75  APEP
ATOM    361  CB   GLN    48    6.759   42.409    15.624    1.00  11.16  APEP
ATOM    362  CG   GLN    48    5.254   42.607    15.669    1.00  12.11  APEP
ATOM    363  CD   GLN    48    4.767   43.515    14.556    1.00  12.60  APEP
ATOM    364  OE1  GLN    48    5.301   44.606    14.359    1.00  10.04  APEP
ATOM    365  NE2  GLN    48    3.758   43.065    13.816    1.00  11.92  APEP
ATOM    366  C    GLN    48    6.420   40.123    16.563    1.00  12.69  APEP
ATOM    367  O    GLN    48    5.488   39.993    17.353    1.00  13.53  APEP
ATOM    368  N    ASP    49    6.716   39.219    15.633    1.00  12.63  APEP
ATOM    369  CA   ASP    49    5.964   37.977    15.487    1.00  11.04  APEP
ATOM    370  CB   ASP    49    6.290   37.322    14.144    1.00  14.99  APEP
ATOM    371  CG   ASP    49    5.578   37.990    12.981    1.00  17.72  APEP
ATOM    372  OD1  ASP    49    4.518   38.620    13.200    1.00  18.74  APEP
ATOM    373  OD2  ASP    49    6.082   37.878    11.844    1.00  19.80  APEP
ATOM    374  C    ASP    49    6.285   36.998    16.615    1.00  9.65   APEP
ATOM    375  O    ASP    49    5.433   36.211    17.020    1.00  9.33   APEP
ATOM    376  N    ILE    50    7.519   37.034    17.107    1.00  8.25   APEP
ATOM    377  CA   ILE    50    7.916   36.152    18.203    1.00  8.01   APEP
ATOM    378  CB   ILE    50    9.454   36.132    18.387    1.00  7.72   APEP
ATOM    379  CG2  ILE    50    9.823   35.416    19.693    1.00  7.19   APEP
ATOM    380  CG1  ILE    50    10.103  35.410    17.203    1.00  6.44   APEP
ATOM    381  CD1  ILE    50    11.582  35.687    17.041    1.00  4.97   APEP
ATOM    382  C    ILE    50    7.256   36.621  19.499  1.00 8.14   APEP
ATOM    383  O    ILE    50    6.805   35.808  20.303  1.00 7.29   APEP
ATOM    384  N    LEU    51    7.191   37.938  19.679  1.00 8.57   APEP
ATOM    385  CA   LEU    51    6.571   38.529  20.854  1.00 9.76   APEP
ATOM    386  CB   LEU    51    6.733   40.055  20.836  1.00 9.57   APEP
ATOM    387  CG   LEU    51    6.509   40.844  22.139  1.00 12.08  APEP
ATOM    388  CD1  LEU    51    7.509   40.401  23.216  1.00 9.69   APEP
ATOM    389  CD2  LEU    51    6.659   42.333  21.861  1.00 10.85  APEP
ATOM    390  C    LEU    51    5.091   38.172  20.863  1.00 10.95  APEP
ATOM    391  O    LEU    51    4.571   37.664  21.861  1.00 12.16  APEP
ATOM    392  N    LYS    52    4.423   38.427  19.739  1.00 10.41  APEP
ATOM    393  CA   LYS    52    2.994   38.156  19.601  1.00 10.29  APEP
ATOM    394  CB   LYS    52    2.520   38.535  18.196  1.00 10.94  APEP
ATOM    395  CG   LYS    52    1.066   38.956  18.132  1.00 14.35  APEP
ATOM    396  CD   LYS    52    0.258   38.029  17.236  1.00 16.34  APEP
ATOM    397  CE   LYS    52    -0.870  38.780  16.543  1.00 17.57  APEP
ATOM    398  NZ   LYS    52    -2.107  38.817  17.374  1.00 17.77  APEP
ATOM    399  C    LYS    52    2.627   36.709  19.893  1.00 9.70   APEP
ATOM    400  O    LYS    52    1.553   36.432  20.419  1.00 9.63   APEP
ATOM    401  N    GLU    53    3.508   35.780  19.540  1.00 10.85  APEP
ATOM    402  CA   GLU    53    3.249   34.366  19.799  1.00 11.95  APEP
ATOM    403  CB   GLU    53    4.261   33.491  19.057  1.00 13.57  APEP
ATOM    404  CG   GLU    53    3.957   31.996  19.089  1.00 15.51  APEP
ATOM    405  CD   GLU    53    2.525   31.651  18.695  1.00 20.29  APEP
ATOM    406  OE1  GLU    53    1.876   32.439  17.971  1.00 21.72  APEP
ATOM    407  OE2  GLU    53    2.044   30.577  19.111  1.00 21.86  APEP
ATOM    408  C    GLU    53    3.362   34.120  21.294  1.00 12.09  APEP
ATOM    409  O    GLU    53    2.568   33.382  21.878  1.00 11.99  APEP
ATOM    410  N    HIS    54    4.357   34.750  21.910  1.00 12.11  APEP
ATOM    411  CA   HIS    54    4.580   34.610  23.340  1.00 11.34  APEP
ATOM    412  CB   HIS    54    5.829   35.399  23.769  1.00 9.29   APEP
ATOM    413  CG   HIS    54    7.089   34.584  23.817  1.00 7.76   APEP
ATOM    414  CD2  HIS    54    7.695   33.933  24.840  1.00 9.61   APEP
ATOM    415  ND1  HIS    54    7.895   34.394  22.716  1.00 6.60   APEP
ATOM    416  CE1  HIS    54    8.941   33.663  23.056  1.00 5.37   APEP
ATOM    417  NE2  HIS    54    8.844   33.370  24.340  1.00 7.30   APEP
ATOM    418  C    HIS    54    3.365   35.143  24.092  1.00 10.89  APEP
ATOM    419  O    HIS    54    2.844   34.492  24.983  1.00 10.22  APEP
ATOM    420  N    ASN    55    2.913   36.331  23.703  1.00 12.43  APEP
ATOM    421  CA   ASN    55    1.784   36.982  24.356  1.00 13.65  APEP
ATOM    422  CB   ASN    55    1.791   38.473  23.991  1.00 12.77  APEP
ATOM    423  CG   ASN    55    2.950   39.232  24.655  1.00 12.31  APEP
ATOM    424  OD1  ASN    55    3.3 96  38.871  25.747  1.00 7.53   APEP
ATOM    425  ND2  ASN    55    3.436   40.280  23.993  1.00 9.40   APEP
ATOM    426  C    ASN    55    0.413   36.347  24.097  1.00 13.82  APEP
ATOM    427  O    ASN    55    -0.457  36.355  24.973  1.00 13.31  APEP
ATOM    428  N    ASP    56    0.221   35.795  22.907  1.00 12.69  APEP
ATOM    429  CA   ASP    56    -1.036  35.134  22.572  1.00 12.59  APEP
ATOM    430  CB   ASP    56    -1.049  34.675  21.111  1.00 12.80  APEP
ATOM    431  CG   ASP    56    -1.359  35.787  20.143  1.00 13.37  APEP
ATOM    432  OD1  ASP    56    -1.902  36.825  20.565  1.00 13.48  APEP
ATOM    433  OD2  ASP    56    -1.059  35.615  18.945  1.00 15.39  APEP
ATOM    434  C    ASP    56    -1.153  33.899  23.450  1.00 10.48  APEP
ATOM    435  O    ASP    56    -2.224  33.577  23.953  1.00 10.14  APEP
ATOM    436  N    PHE    57    -0.046  33.191  23.604  1.00 9.15   APEP
ATOM    437  CA   PHE    57    -0.047  31.989  24.418  1.00 11.09  APEP
ATOM    438  CB   PHE    57    1.272   31.227  24.252  1.00 12.68  APEP
ATOM    439  CG  PHE    57    1.261   29.863  24.884  1.00 11.85  APEP
ATOM    440  CD1 PHE    57    0.346   28.899  24.471  1.00 12.69  APEP
ATOM    441  CD2 PHE    57    2.150   29.549  25.903  1.00 12.28  APEP
ATOM    442  CE1 PHE    57    0.316   27.642  25.067  1.00 11.80  APEP
ATOM    443  CE2 PHE    57    2.132   28.296  26.508  1.00 12.07  APEP
ATOM    444  CZ  PHE    57    1.216   27.342  26.092  1.00 12.36  APEP
ATOM    445  C   PHE    57    -0.267  32.346  25.890  1.00 10.66  APEP
ATOM    446  O   PHE    57    -1.012  31.664  26.597  1.00 11.28  APEP
ATOM    447  N   ARG    58    0.360   33.423  26.349  1.00 8.83   APEP
ATOM    448  CA  ARG    58    0.204   33.830  27.738  1.00 10.25  APEP
ATOM    449  CB  ARG    58    1.107   35.024  28.057  1.00 7.50   APEP
ATOM    450  CG  ARG    58    2.483   34.615  28.530  1.00 7.56   APEP
ATOM    451  CD  ARG    58    3.478   35.755  28.446  1.00 7.29   APEP
ATOM    452  NE  ARG    58    3.391   36.649  29.601  1.00 8.58   APEP
ATOM    453  CZ  ARG    58    4.025   36.450  30.750  1.00 7.65   APEP
ATOM    454  NH1 ARG    58    4.797   35.388  30.908  1.00 8.61   APEP
ATOM    455  NH2 ARG    58    3.892   37.318  31.738  1.00 9.84   APEP
ATOM    456  C   ARG    58    -1.246  34.170  28.032  1.00 9.76   APEP
ATOM    457  O   ARG    58    -1.793  33.733  29.042  1.00 11.57  APEP
ATOM    458  N   GLN    59    -1.874  34.932  27.141  1.00 10.78  APEP
ATOM    459  CA  GLN    59    -3.270  35.321  27.314  1.00 9.25   APEP
ATOM    460  CB  GLN    59    -3.621  36.464  26.368  1.00 11.30  APEP
ATOM    461  CG  GLN    59    -3.388  37.870  26.937  1.00 14.86  APEP
ATOM    462  CD  GLN    59    -3.254  37.924  28.457  1.00 15.40  APEP
ATOM    463  OE1 GLN    59    -2.306  38.508  28.976  1.00 20.39  APEP
ATOM    464  NE2 GLN    59    -4.203  37.328  29.171  1.00 16.19  APEP
ATOM    465  C   GLN    59    -4.233  34.156  27.107  1.00 8.85   APEP
ATOM    466  O   GLN    59    -5.275  34.084  27.753  1.00 8.65   APEP
ATOM    467  N   LYS    60    -3.900  33.240  26.209  1.00 9.28   APEP
ATOM    468  CA  LYS    60    -4.765  32.084  25.999  1.00 9.29   APEP
ATOM    469  CB  LYS    60    -4.190  31.170  24.919  1.00 11.77  APEP
ATOM    470  CG  LYS    60    -5.097  29.999  24.555  1.00 12.61  APEP
ATOM    471  CD  LYS    60    -4.357  28.678  24.660  1.00 12.86  APEP
ATOM    472  CE  LYS    60    -3.849  28.205  23.310  1.00 10.33  APEP
ATOM    473  NZ  LYS    60    -4.535  26.970  22.830  1.00 12.74  APEP
ATOM    474  C   LYS    60    -4.840  31.329  27.320  1.00 9.51   APEP
ATOM    475  O   LYS    60    -5.922  31.017  27.816  1.00 7.72   APEP
ATOM    476  N   ILE    61    -3.671  31.049  27.887  1.00 9.04   APEP
ATOM    477  CA  ILE    61    -3.570  30.348  29.161  1.00 9.87   APEP
ATOM    478  CB  ILE    61    -2.075  30.101  29.536  1.00 10.78  APEP
ATOM    479  CG2 ILE    61    -1.970  29.598  30.973  1.00 10.13  APEP
ATOM    480  CG1 ILE    61    -1.428  29.152  28.507  1.00 9.94   APEP
ATOM    481  CD1 ILE    61    -1.212  27.720  28.980  1.00 10.64  APEP
ATOM    482  C   ILE    61    -4.254  31.141  30.283  1.00 9.04   APEP
ATOM    483  O   ILE    61    -4.980  30.571  31.092  1.00 9.20   APEP
ATOM    484  N   ALA    62    -4.041  32.454  30.314  1.00 8.91   APEP
ATOM    485  CA  ALA    62    -4.628  33.308  31.350  1.00 9.06   APEP
ATOM    486  CB  ALA    62    -4.090  34.729  31.209  1.00 5.84   APEP
ATOM    487  C   ALA    62    -6.165  33.327  31.363  1.00 11.19  APEP
ATOM    488  O   ALA    62    -6.794  33.581  32.397  1.00 12.79  APEP
ATOM    489  N   ARG    63    -6.769  33.053  30.214  1.00 12.40  APEP
ATOM    490  CA  ARG    63    -8.219  33.050  30.096  1.00 10.93  APEP
ATOM    491  CB  ARG    63    -8.618  33.627  28.736  1.00 10.77  APEP
ATOM    492  CG  ARG    63    -8.043  35.012  28.505  1.00 12.79  APEP
ATOM    493  CD  ARG    63    -8.608  35.684  27.278  1.00 15.66  APEP
ATOM    494  NE  ARG    63    -7.868  36.904  26.968  1.00 17.96  APEP
ATOM    495  CZ  ARG    63    -7.346  37.179  25.777  1.00 20.00  APEP
ATOM    496  NH1 ARG    63    -7.483   36.321  24.772    1.00 19.36  APEP
ATOM    497  NH2 ARG    63    -6.679   38.313  25.590    1.00 22.72  APEP
ATOM    498  C   ARG    63    -8.827   31.661  30.285    1.00 10.92  APEP
ATOM    499  O   ARG    63    -10.036  31.489  30.179    1.00 12.37  APEP
ATOM    500  N   GLY    64    -7.986   30.677  30.575    1.00 12.22  APEP
ATOM    501  CA  GLY    64    -8.475   29.325  30.780    1.00 11.71  APEP
ATOM    502  C   GLY    64    -8.985   28.685  29.509    1.00 13.26  APEP
ATOM    503  O   GLY    64    -9.950   27.911  29.540    1.00 14.03  APEP
ATOM    504  N   LEU    65    -8.331   28.998  28.391    1.00 11.24  APEP
ATOM    505  CA  LEU    65    -8.711   28.463  27.095    1.00 10.84  APEP
ATOM    506  CB  LEU    65    -8.747   29.581  26.044    1.00 10.48  APEP
ATOM    507  CG  LEU    65    -9.602   30.803  26.396    1.00 8.01   APEP
ATOM    508  CD1 LEU    65    -9.278   31.946  25.470    1.00 13.03  APEP
ATOM    509  CD2 LEU    65    -11.074  30.450  26.291    1.00 10.77  APEP
ATOM    510  C   LEU    65    -7.764   27.361  26.644    1.00 12.39  APEP
ATOM    511  O   LEU    65    -7.998   26.719  25.625    1.00 12.90  APEP
ATOM    512  N   GLU    66    -6.686   27.147  27.387    1.00 11.27  APEP
ATOM    513  CA  GLU    66    -5.754   26.094  27.023    1.00 12.09  APEP
ATOM    514  CB  GLU    66    -4.365   26.361  27.610    1.00 11.39  APEP
ATOM    515  CG  GLU    66    -3.327   25.308  27.245    1.00 12.91  APEP
ATOM    516  CD  GLU    66    -3.362   24.941  25.774    1.00 13.85  APEP
ATOM    517  OE1 GLU    66    -2.689   25.629  24.988    1.00 18.33  APEP
ATOM    518  OE2 GLU    66    -4.054   23.971  25.401    1.00 12.27  APEP
ATOM    519  C   GLU    66    -6.323   24.799  27.575    1.00 12.38  APEP
ATOM    520  O   GLU    66    -6.214   24.512  28.764    1.00 12.85  APEP
ATOM    521  N   THR    67    -6.943   24.022  26.696    1.00 13.75  APEP
ATOM    522  CA  THR    67    -7.553   22.769  27.091    1.00 13.16  APEP
ATOM    523  CB  THR    67    -8.562   22.295  26.018    1.00 13.92  APEP
ATOM    524  OG1 THR    67    -7.858   21.894  24.830    1.00 14.81  APEP
ATOM    525  CG2 THR    67    -9.524   23.413  25.671    1.00 11.42  APEP
ATOM    526  C   THR    67    -6.548   21.652  27.368    1.00 13.63  APEP
ATOM    527  O   THR    67    -6.875   20.682  28.049    1.0O 14.84  APEP
ATOM    528  N   ARG    68    -5.326   21.793  26.861    1.00 13.12  APEP
ATOM    529  CA  ARG    68    -4.301   20.770  27.042    1.00 11.47  APEP
ATOM    530  CB  ARG    68    -3.222   20.914  25.967    1.00 13.83  APEP
ATOM    531  CG  ARG    68    -3.715   20.741  24.538    1.00 13.10  APEP
ATOM    532  CD  ARG    68    -2.626   21.128  23.542    1.00 13.89  APEP
ATOM    533  NE  ARG    68    -2.317   22.556  23.590    1.00 12.94  APEP
ATOM    534  CZ  ARG    68    -1.244   23.111  23.033    1.00 11.20  APEP
ATOM    535  NH1 ARG    68    -0.372   22.351  22.383    1.00 10.56  APEP
ATOM    536  NH2 ARG    68    -1.042   24.420  23.135    1.00 5.87   APEP
ATOM    537  C   ARG    68    -3.631   20.746  28.415    1.00 11.74  APEP
ATOM    538  O   ARG    68    -3.420   21.789  29.032    1.00 10.94  APEP
ATOM    539  N   GLY    69    -3.295   19.536  28.867    1.00 11.61  APEP
ATOM    540  CA  GLY    69    -2.641   19.334  30.147    1.00 14.23  APEP
ATOM    541  C   GLY    69    -2.565   17.857  30.518    1.00 16.11  APEP
ATOM    542  O   GLY    69    -2.998   17.001  29.747    1.00 16.74  APEP
ATOM    543  N   ASN    70    -2.006   17.551  31.687    1.00 16.09  APEP
ATOM    544  CA  ASN    70    -1.896   16.172  32.156    1.00 17.23  APEP
ATOM    545  CB  ASN    70    -0.439   15.704  32.132    1.00 18.05  APEP
ATOM    546  CG  ASN    70    -0.310   14.203  32.291    1.00 20.68  APEP
ATOM    547  OD1 ASN    70    -1.204   13.452  31.894    1.00 20.26  APEP
ATOM    548  ND2 ASN    70    0.806    13.752  32.874    1.00 20.67  APEP
ATOM    549  C   ASN    70    -2.452   16.025  33.578    1.00 16.86  APEP
ATOM    550  O   ASN    70    -1.717   15.739  34.523    1.00 15.70  APEP
ATOM    551  N   PRO    71    -3.770   16.204  33.738    1.00 16.37  APEP
ATOM    552  CD  PRO    71    -4.467   16.046  35.026    1.00 16.71  APEP
ATOM    553  CA  PRO    71    -4.713  16.522  32.663  1.00 16.24  APEP
ATOM    554  CB  PRO    71    -5.962  15.777  33.086  1.00 16.30  APEP
ATOM    555  CG  PRO    71    -5.928  15.906  34.614  1.00 16.81  APEP
ATOM    556  C   PRO    71    -4.999  18.012  32.491  1.00 16.23  APEP
ATOM    557  O   PRO    71    -4.638  18.837  33.338  1.00 16.06  APEP
ATOM    558  N   GLY    72    -5.666  18.342  31.392  1.00 13.86  APEP
ATOM    559  CA  GLY    72    -6.042  19.720  31.143  1.00 14.67  APEP
ATOM    560  C   GLY    72    -7.437  19.902  31.716  1.00 14.79  APEP
ATOM    561  O   GLY    72    -8.030  18.935  32.192  1.00 16.06  APEP
ATOM    562  N   PRO    73    -8.000  21.115  31.695  1.00 13.41  APEP
ATOM    563  CD  PRO    73    -9.343  21.354  32.253  1.00 13.38  APEP
ATOM    564  CA  PRO    73    -7.412  22.347  31.164  1.00 14.44  APEP
ATOM    565  CB  PRO    73    -8.621  23.250  30.976  1.00 13.74  APEP
ATOM    566  CG  PRO    73    -9.519  22.850  32.113  1.00 12.91  APEP
ATOM    567  C   PRO    73    -6.412  22.977  32.129  1.00 13.52  APEP
ATOM    568  O   PRO    73    -6.271  22.537  33.268  1.00 13.30  APEP
ATOM    569  N   GLN    74    -5.713  24.004  31.658  1.00 12.54  APEP
ATOM    570  CA  GLN    74    -4.782  24.723  32.506  1.00 11.28  APEP
ATOM    571  CB  GLN    74    -3.708  25.433  31.672  1.00 10.31  APEP
ATOM    572  CG  GLN    74    -2.658  24.505  31.043  1.00 9.27   APEP
ATOM    573  CD  GLN    74    -2.070  23.484  32.024  1.00 12.07  APEP
ATOM    574  OE1 GLN    74    -1.558  23.838  33.087  1.00 10.98  APEP
ATOM    575  NE2 GLN    74    -2.137  22.210  31.654  1.00 12.44  APEP
ATOM    576  C   GLN    74    -5.707  25.736  33.170  1.00 11.59  APEP
ATOM    577  O   GLN    74    -6.710  26.139  32.579  1.00 12.75  APEP
ATOM    578  N   PRO    75    -5.393  26.158  34.401  1.00 10.76  APEP
ATOM    579  CD  PRO    75    -4.230  25.770  35.221  1.00 10.45  APEP
ATOM    580  CA  PRO    75    -6.254  27.128  35.092  1.00 10.89  APEP
ATOM    581  CB  PRO    75    -5.876  26.948  36.561  1.00 10.78  APEP
ATOM    582  CG  PRO    75    -4.430  26.540  36.515  1.00 9.92   APEP
ATOM    583  C   PRO    75    -6.077  28.571  34.642  1.00 10.22  APEP
ATOM    584  O   PRO    75    -5.017  28.955  34.170  1.00 11.44  APEP
ATOM    585  N   PRO    76    -7.123  29.394  34.782  1.00 11.88  APEP
ATOM    586  CD  PRO    76    -8.461  29.107  35.327  1.00 13.85  APEP
ATOM    587  CA  PRO    76    -6.968  30.791  34.365  1.00 13.97  APEP
ATOM    588  CB  PRO    76    -8.383  31.373  34.440  1.00 12.73  APEP
ATOM    589  CG  PRO    76    -9.284  30.245  34.830  1.00 14.35  APEP
ATOM    590  C   PRO    76    -6.000  31.507  35.315  1.00 14.80  APEP
ATOM    591  O   PRO    76    -5.672  30.987  36.382  1.00 14.45  APEP
ATOM    592  N   ALA    77    -5.553  32.697  34.930  1.00 15.36  APEP
ATOM    593  CA  ALA    77    -4.617  33.458  35.745  1.00 16.81  APEP
ATOM    594  CB  ALA    77    -3.264  33.531  35.050  1.00 15.29  APEP
ATOM    595  C   ALA    77    -5.111  34.864  36.034  1.00 18.21  APEP
ATOM    596  O   ALA    77    -5.946  35.414  35.315  1.00 18.77  APEP
ATOM    597  N   LYS    78    -4.578  35.447  37.095  1.00 19.69  APEP
ATOM    598  CA  LYS    78    -4.944  36.799  37.487  1.00 21.45  APEP
ATOM    599  CB  LYS    78    -5.453  36.779  38.934  1.00 19.28  APEP
ATOM    600  CG  LYS    78    -5.408  38.109  39.658  1.00 21.07  APEP
ATOM    601  CD  LYS    78    -5.939  37.969  41.078  1.00 22.93  APEP
ATOM    602  CE  LYS    78    -7.039  38.993  41.380  1.00 22.07  APEP
ATOM    603  NZ  LYS    78    -8.416  38.442  41.192  1.00 18.83  APEP
ATOM    604  C   LYS    78    -3.681  37.655  37.351  1.00 20.82  APEP
ATOM    605  O   LYS    78    -3.735  38.825  36.973  1.00 22.49  APEP
ATOM    606  N   ASN    79    -2.546  37.024  37.632  1.00 20.62  APEP
ATOM    607  CA  ASN    79    -1.225  37.650  37.596  1.00 20.96  APEP
ATOM    608  CB  ASN    79    -0.322  36.893  38.591  1.00 21.73  APEP
ATOM    609  CG  ASN    79    0.895   37.696  39.041  1.00 26.41  APEP
ATOM    610  OD1 ASN    79    1.739   37.194  39.794  1.00 27.31  APEP
ATOM    611  ND2 ASN    79    0.995   38.941  38.586  1.00 30.92  APEP
ATOM    612  C   ASN    79    -0.570  37.649  36.199  1.00 20.23  APEP
ATOM    613  O   ASN    79    0.658   37.679  36.109  1.00 20.51  APEP
ATOM    614  N   MET    80    -1.354  37.648  35.117  1.00 17.31  APEP
ATOM    615  CA  MET    80    -0.745  37.581  33.783  1.00 16.95  APEP
ATOM    616  CB  MET    80    -1.334  36.398  33.014  1.00 14.01  APEP
ATOM    617  CG  MET    80    -0.475  35.941  31.848  1.00 10.95  APEP
ATOM    618  SD  MET    80    1.001   35.032  32.360  1.00 10.66  APEP
ATOM    619  CE  MET    80    0.309   33.392  32.631  1.00 9.65   APEP
ATOM    620  C   MET    80    -0.743  38.809  32.863  1.00 17.13  APEP
ATOM    621  O   MET    80    -1.785  39.236  32.377  1.00 17.76  APEP
ATOM    622  N   LYS    81    0.450   39.343  32.602  1.00 16.19  APEP
ATOM    623  CA  LYS    81    0.621   40.509  31.734  1.00 15.79  APEP
ATOM    624  CB  LYS    81    1.360   41.626  32.480  1.00 19.28  APEP
ATOM    625  CG  LYS    81    0.485   42.479  33.376  1.00 23.64  APEP
ATOM    626  CD  LYS    81    1.283   42.976  34.581  1.00 29.37  APEP
ATOM    627  CE  LYS    81    0.652   42.551  35.914  1.00 30.79  APEP
ATOM    628  NZ  LYS    81    1.639   41.850  36.794  1.00 31.43  APEP
ATOM    629  C   LYS    81    1.428   40.135  30.489  1.00 15.20  APEP
ATOM    630  O   LYS    81    2.144   39.133  30.478  1.00 13.27  APEP
ATOM    631  N   ASN    82    1.317   40.947  29.445  1.00 14.40  APEP
ATOM    632  CA  ASN    82    2.047   40.695  28.214  1.00 14.06  APEP
ATOM    633  CB  ASN    82    1.442   41.492  27.059  1.00 15.84  APEP
ATOM    634  CG  ASN    82    0.081   40.970  26.636  1.00 19.06  APEP
ATOM    635  OD1 ASN    82    -0.837  41.746  26.366  1.00 20.37  APEP
ATOM    636  ND2 ASN    82    -0.058  39.649  26.579  1.00 20.55  APEP
ATOM    637  C   ASN    82    3.496   41.107  28.400  1.00 11.87  APEP
ATOM    638  O   ASN    82    3.800   41.968  29.226  1.00 11.67  APEP
ATOM    639  N   LEU    83    4.384   40.483  27.633  1.00 10.14  APEP
ATOM    640  CA  LEU    83    5.809   40.789  27.684  1.00 9.10   APEP
ATOM    641  CB  LEU    83    6.648   39.577  27.272  1.00 9.30   APEP
ATOM    642  CG  LEU    83    6.373   38.230  27.935  1.00 9.01   APEP
ATOM    643  CD1 LEU    83    7.077   37.119  27.178  1.00 10.20  APEP
ATOM    644  CD2 LEU    83    6.843   38.283  29.378  1.00 10.62  APEP
ATOM    645  C   LEU    83    6.104   41.919  26.718  1.00 7.69   APEP
ATOM    646  O   LEU    83    5.285   42.254  25.866  1.00 7.01   APEP
ATOM    647  N   VAL    84    7.277   42.516  26.878  1.00 7.90   APEP
ATOM    648  CA  VAL    84    7.736   43.585  26.004  1.00 9.09   APEP
ATOM    649  CB  VAL    84    7.888   44.947  26.765  1.00 9.60   APEP
ATOM    650  CG1 VAL    84    6.511   45.476  27.152  1.00 11.40  APEP
ATOM    651  CG2 VAL    84    8.753   44.788  28.003  1.00 8.85   APEP
ATOM    652  C   VAL    84    9.088   43.110  25.479  1.00 8.16   APEP
ATOM    653  O   VAL    84    9.720   42.245  26.086  1.00 7.18   APEP
ATOM    654  N   TRP    85    9.524   43.637  24.343  1.00 9.08   APEP
ATOM    655  CA  TRP    85    10.807  43.222  23.801  1.00 8.24   APEP
ATOM    656  CB  TRP    85    10.844  43.412  22.283  1.00 7.78   APEP
ATOM    657  CG  TRP    85    12.054  42.789  21.623  1.00 7.96   APEP
ATOM    658  CD2 TRP    85    12.162  41.460  21.092  1.00 6.06   APEP
ATOM    659  CE2 TRP    85    13.459  41.330  20.544  1.00 5.27   APEP
ATOM    660  CE3 TRP    85    11.290  40.366  21.023  1.00 5.63   APEP
ATOM    661  CD1 TRP    85    13.260  43.392  21.384  1.00 6.75   APEP
ATOM    662  NE1 TRP    85    14.104  42.522  20.737  1.00 5.69   APEP
ATOM    663  CZ2 TRP    85    13.905  40.153  19.935  1.00 5.15   APEP
ATOM    664  CZ3 TRP    85    11.736  39.192  20.414  1.00 3.85   APEP
ATOM    665  CH2 TRP    85    13.035  39.099  19.879  1.00 3.87   APEP
ATOM    666  C   TRP    85    11.928  44.018  24.451  1.00 9.70   APEP
ATOM    667  O   TRP    85    11.790  45.214  24.713  1.00  12.63  APEP
ATOM    668  N   ASN    86    13.036  43.340  24.722  1.00  9.17   APEP
ATOM    669  CA  ASN    86    14.191  43.980  25.340  1.00  8.03   APEP
ATOM    670  CB  ASN    86    14.399  43.407  26.748  1.00  4.83   APEP
ATOM    671  CG  ASN    86    15.484  44.121  27.505  1.00  5.77   APEP
ATOM    672  OD1 ASN    86    16.657  43.826  27.332  1.00  5.23   APEP
ATOM    673  ND2 ASN    86    15.100  45.070  28.349  1.00  6.46   APEP
ATOM    674  C   ASN    86    15.450  43.789  24.474  1.00  7.66   APEP
ATOM    675  O   ASN    86    15.885  42.667  24.215  1.00  6.17   APEP
ATOM    676  N   ASP    87    16.028  44.899  24.030  1.00  8.98   APEP
ATOM    677  CA  ASP    87    17.213  44.866  23.179  1.00  9.94   APEP
ATOM    678  CB  ASP    87    17.548  46.278  22.695  1.00  10.21  APEP
ATOM    679  CG  ASP    87    16.602  46.757  21.622  1.00  9.93   APEP
ATOM    680  OD1 ASP    87    16.065  45.902  20.901  1.00  10.59  APEP
ATOM    681  OD2 ASP    87    16.392  47.980  21.498  1.00  11.15  APEP
ATOM    682  C   ASP    87    18.445  44.249  23.827  1.00  11.13  APEP
ATOM    683  O   ASP    87    19.271  43.651  23.141  1.00  11.97  APEP
ATOM    684  N   GLU    88    18.576  44.395  25.142  1.00  9.78   APEP
ATOM    685  CA  GLU    88    19.728  43.836  25.838  1.00  10.33  APEP
ATOM    686  CB  GLU    88    19.841  44.422  27.255  1.00  12.21  APEP
ATOM    687  CG  GLU    88    21.210  44.213  27.888  1.00  9.98   APEP
ATOM    688  CD  GLU    88    21.204  44.400  29.390  1.00  9.88   APEP
ATOM    689  OE1 GLU    88    20.125  44.660  29.957  1.00  13.29  APEP
ATOM    690  OE2 GLU    88    22.282  44.289  30.010  1.00  9.90   APEP
ATOM    691  C   GLU    88    19.660  42.314  25.912  1.00  9.04   APEP
ATOM    692  O   GLU    88    20.651  41.629  25.658  1.00  8.42   APEP
ATOM    693  N   LEU    89    18.491  41.789  26.269  1.00  8.21   APEP
ATOM    694  CA  LEU    89    18.305  40.343  26.367  1.00  7.65   APEP
ATOM    695  CB  LEU    89    16.881  40.016  26.824  1.00  7.64   APEP
ATOM    696  CG  LEU    89    16.499  40.394  28.254  1.00  6.63   APEP
ATOM    697  CD1 LEU    89    15.111  39.904  28.549  1.00  5.53   APEP
ATOM    698  CD2 LEU    89    17.487  39.785  29.237  1.00  7.49   APEP
ATOM    699  C   LEU    89    18.554  39.719  24.997  1.00  8.92   APEP
ATOM    700  O   LEU    89    19.214  38.689  24.885  1.00  7.56   APEP
ATOM    701  N   ALA    90    18.010  40.357  23.964  1.00  8.77   APEP
ATOM    702  CA  ALA    90    18.162  39.902  22.588  1.00  9.89   APEP
ATOM    703  CB  ALA    90    17.406  40.830  21.654  1.00  6.21   APEP
ATOM    704  C   ALA    90    19.640  39.849  22.197  1.00  9.83   APEP
ATOM    705  O   ALA    90    20.064  38.940  21.491  1.00  10.34  APEP
ATOM    706  N   TYR    91    20.415  40.821  22.672  1.00  10.22  APEP
ATOM    707  CA  TYR    91    21.846  40.894  22.380  1.00  10.21  APEP
ATOM    708  CB  TYR    91    22.426  42.203  22.921  1.00  11.27  APEP
ATOM    709  CG  TYR    91    23.921  42.329  22.730  1.00  13.72  APEP
ATOM    710  CD1 TYR    91    24.458  42.653  21.487  1.00  14.77  APEP
ATOM    711  CE1 TYR    91    25.837  42.747  21.301  1.00  16.40  APEP
ATOM    712  CD2 TYR    91    24.802  42.104  23.788  1.00  14.30  APEP
ATOM    713  CE2 TYR    91    26.178  42.195  23.614  1.00  14.06  APEP
ATOM    714  CZ  TYR    91    26.688  42.516  22.370  1.00  18.00  APEP
ATOM    715  OH  TYR    91    28.052  42.608  22.191  1.00  18.78  APEP
ATOM    716  C   TYR    91    22.620  39.714  22.967  1.00  11.02  APEP
ATOM    717  O   TYR    91    23.411  39.077  22.279  1.00  11.79  APEP
ATOM    718  N   VAL    92    22.397  39.432  24.244  1.00  10.38  APEP
ATOM    719  CA  VAL    92    23.075  38.325  24.903  1.00  8.66   APEP
ATOM    720  CB  VAL    92    22.785  38.319  26.427  1.00  8.13   APEP
ATOM    721  CG1 VAL    92    23.488  37.142  27.095  1.00  5.04   APEP
ATOM    722  CG2 VAL    92    23.267  39.622  27.046  1.00  6.97   APEP
ATOM    723  C   VAL    92    22.634  37.002  24.286  1.00  9.57   APEP
ATOM    724  O   VAL    92    23.418  36.063  24.194  1.00  10.64  APEP
ATOM    725  N   ALA    93    21.376  36.933  23.858  1.00  9.31   APEP
ATOM    726  CA  ALA    93    20.854  35.722  23.238  1.00  9.67   APEP
ATOM    727  CB  ALA    93    19.349  35.848  23.030  1.00  8.26   APEP
ATOM    728  C   ALA    93    21.561  35.489  21.898  1.00  9.72   APEP
ATOM    729  O   ALA    93    21.954  34.366  21.581  1.00  10.89  APEP
ATOM    730  N   GLN    94    21.730  36.565  21.130  1.00  8.57   APEP
ATOM    731  CA  GLN    94    22.386  36.515  19.828  1.00  6.19   APEP
ATOM    732  CB  GLN    94    22.316  37.892  19.162  1.00  7.13   APEP
ATOM    733  CG  GLN    94    22.606  37.891  17.668  1.00  6.55   APEP
ATOM    734  CD  GLN    94    21.778  36.875  16.911  1.00  6.86   APEP
ATOM    735  OE1 GLN    94    20.551  37.018  16.775  1.00  7.69   APEP
ATOM    736  NE2 GLN    94    22.441  35.836  16.412  1.00  4.45   APEP
ATOM    737  C   GLN    94    23.843  36.082  19.946  1.00  7.41   APEP
ATOM    738  O   GLN    94    24.302  35.217  19.203  1.00  8.55   APEP
ATOM    739  N   VAL    95    24.574  36.699  20.868  1.00  7.81   APEP
ATOM    740  CA  VAL    95    25.971  36.357  21.089  1.00  6.18   APEP
ATOM    741  CB  VAL    95    26.551  37.112  22.327  1.00  8.06   APEP
ATOM    742  CG1 VAL    95    27.899  36.523  22.728  1.00  8.13   APEP
ATOM    743  CG2 VAL    95    26.716  38.583  22.011  1.00  7.34   APEP
ATOM    744  C   VAL    95    26.091  34.855  21.324  1.00  7.07   APEP
ATOM    745  O   VAL    95    26.949  34.199  20.737  1.00  3.91   APEP
ATOM    746  N   TRP    96    25.224  34.312  22.180  1.00  8.26   APEP
ATOM    747  CA  TRP    96    25.244  32.879  22.494  1.00  8.88   APEP
ATOM    748  CB  TRP    96    24.284  32.555  23.650  1.00  6.54   APEP
ATOM    749  CG  TRP    96    24.258  31.089  24.030  1.00  7.96   APEP
ATOM    750  CD2 TRP    96    25.390  30.232  24.240  1.00  7.64   APEP
ATOM    751  CE2 TRP    96    24.892  28.946  24.549  1.00  7.17   APEP
ATOM    752  CE3 TRP    96    26.778  30.426  24.197  1.00  8.39   APEP
ATOM    753  CD1 TRP    96    23.150  30.305  24.217  1.00  8.48   APEP
ATOM    754  NE1 TRP    96    23.524  29.016  24.527  1.00  5.50   APEP
ATOM    755  CZ2 TRP    96    25.734  27.859  24.812  1.00  6.91   APEP
ATOM    756  CZ3 TRP    96    27.614  29.341  24.459  1.00  8.97   APEP
ATOM    757  CH2 TRP    96    27.087  28.076  24.761  1.00  8.90   APEP
ATOM    758  C   TRP    96    24.867  32.033  21.281  1.00  8.85   APEP
ATOM    759  O   TRP    96    25.500  31.011  21.007  1.00  8.27   APEP
ATOM    760  N   ALA    97    23.827  32.453  20.566  1.00  7.57   APEP
ATOM    761  CA  ALA    97    23.390  31.721  19.381  1.00  9.88   APEP
ATOM    762  CB  ALA    97    22.182  32.415  18.742  1.00  4.36   APEP
ATOM    763  C   ALA    97    24.547  31.665  18.387  1.00  8.40   APEP
ATOM    764  O   ALA    97    24.777  30.647  17.734  1.00  8.69   APEP
ATOM    765  N   ASN    98    25.282  32.767  18.300  1.00  9.32   APEP
ATOM    766  CA  ASN    98    26.402  32.883  17.375  1.00  9.40   APEP
ATOM    767  CB  ASN    98    26.898  34.336  17.347  1.00  8.07   APEP
ATOM    768  CG  ASN    98    26.084  35.217  16.402  1.00  8.00   APEP
ATOM    769  OD1 ASN    98    25.093  34.776  15.821  1.00  11.11  APEP
ATOM    770  ND2 ASN    98    26.500  36.464  16.250  1.00  9.71   APEP
ATOM    771  C   ASN    98    27.568  31.926  17.647  1.00  9.78   APEP
ATOM    772  O   ASN    98    28.524  31.874  16.869  1.00  8.97   APEP
ATOM    773  N   GLN    99    27.492  31.160  18.733  1.00  8.27   APEP
ATOM    774  CA  GLN    99    28.556  30.212  19.051  1.00  9.27   APEP
ATOM    775  CB  GLN    99    28.774  30.120  20.572  1.00  10.68  APEP
ATOM    776  CG  GLN    99    29.117  31.452  21.241  1.00  9.08   APEP
ATOM    777  CD  GLN    99    30.119  32.266  20.444  1.00  10.60  APEP
ATOM    778  OE1 GLN    99    31.195  31.780  20.107  1.00  11.69  APEP
ATOM    779  NE2 GLN    99    29.772  33.511  20.146  1.00  12.17  APEP
ATOM    780  C   GLN    99    28.205  28.839  18.484  1.00  10.52  APEP
ATOM    781  O   GLN    99     29.049  27.942  18.426  1.00 11.67  APEP
ATOM    782  N   CYS    100    26.959  28.690  18.047  1.00 11.03  APEP
ATOM    783  CA  CYS    100    26.474  27.439  17.470  1.00 12.62  APEP
ATOM    784  C   CYS    100    26.711  26.234  18.373  1.00 14.10  APEP
ATOM    785  O   CYS    100    27.113  25.166  17.906  1.00 13.71  APEP
ATOM    786  CB  CYS    100    27.126  27.182  16.108  1.00 12.51  APEP
ATOM    787  SG  CYS    100    26.639  28.321  14.766  1.00 13.92  APEP
ATOM    788  N   GLN    101    26.457  26.411  19.667  1.00 13.78  APEP
ATOM    789  CA  GLN    101    26.615  25.337  20.640  1.00 14.58  APEP
ATOM    790  CB  GLN    101    27.656  25.723  21.696  1.00 16.78  APEP
ATOM    791  CG  GLN    101    29.106  25.506  21.269  1.00 19.68  APEP
ATOM    792  CD  GLN    101    30.097  26.125  22.239  1.00 20.61  APEP
ATOM    793  OE1 GLN    101    31.113  26.690  21.833  1.00 23.08  APEP
ATOM    794  NE2 GLN    101    29.802  26.023  23.530  1.00 24.57  APEP
ATOM    795  C   GLN    101    25.272  25.098  21.323  1.00 14.56  APEP
ATOM    796  O   GLN    101    24.987  25.716  22.347  1.00 14.71  APEP
ATOM    797  N   TYR    102    24.457  24.201  20.767  1.00 12.66  APEP
ATOM    798  CA  TYR    102    23.131  23.911  21.326  1.00 14.54  APEP
ATOM    799  CB  TYR    102    22.469  22.721  20.610  1.00 13.93  APEP
ATOM    800  CG  TYR    102    21.015  22.531  21.012  1.00 13.05  APEP
ATOM    801  CD1 TYR    102    20.033  23.418  20.574  1.00 11.54  APEP
ATOM    802  CE1 TYR    102    18.710  23.295  20.990  1.00 10.81  APEP
ATOM    803  CD2 TYR    102    20.632  21.505  21.881  1.00 13.43  APEP
ATOM    804  CE2 TYR    102    19.298  21.373  22.307  1.00 13.52  APEP
ATOM    805  CZ  TYR    102    18.348  22.276  21.853  1.00 11.37  APEP
ATOM    806  OH  TYR    102    17.031  22.154  22.242  1.00 12.72  APEP
ATOM    807  C   TYR    102    23.123  23.636  22.824  1.00 14.75  APEP
ATOM    808  O   TYR    102    23.825  22.747  23.305  1.00 14.15  APEP
ATOM    809  N   GLY    103    22.303  24.399  23.548  1.00 15.34  APEP
ATOM    810  CA  GLY    103    22.194  24.241  24.988  1.00 13.83  APEP
ATOM    811  C   GLY    103    22.174  25.586  25.698  1.00 14.82  APEP
ATOM    812  O   GLY    103    22.051  26.627  25.050  1.00 13.51  APEP
ATOM    813  N   HIS    104    22.309  25.576  27.022  1.00 13.28  APEP
ATOM    814  CA  HIS    104    22.293  26.821  27.792  1.00 13.00  APEP
ATOM    815  CB  HIS    104    21.535  26.627  29.111  1.00 14.84  APEP
ATOM    816  CG  HIS    104    20.085  26.309  28.938  1.00 17.77  APEP
ATOM    817  CD2 HIS    104    19.345  25.263  29.370  1.00 18.90  APEP
ATOM    818  ND1 HIS    104    19.224  27.125  28.236  1.00 19.74  APEP
ATOM    819  CE1 HIS    104    18.014  26.594  28.245  1.00 19.42  APEP
ATOM    820  NE2 HIS    104    18.060  25.465  28.925  1.00 19.61  APEP
ATOM    821  C   HIS    104    23.689  27.322  28.116  1.00 10.17  APEP
ATOM    822  O   HIS    104    24.573  26.532  28.403  1.00 8.70   APEP
ATOM    823  N   ASP    105    23.890  28.635  28.058  1.00 10.86  APEP
ATOM    824  CA  ASP    105    25.188  29.197  28.417  1.00 12.42  APEP
ATOM    825  CB  ASP    105    25.400  30.590  27.794  1.00 10.99  APEP
ATOM    826  CG  ASP    105    24.172  31.463  27.875  1.00 11.97  APEP
ATOM    827  OD1 ASP    105    23.054  30.914  27.966  1.00 14.08  APEP
ATOM    828  OD2 ASP    105    24.324  32.705  27.844  1.00 11.83  APEP
ATOM    829  C   ASP    105    25.200  29.274  29.949  1.00 13.37  APEP
ATOM    830  O   ASP    105    24.145  29.250  30.592  1.00 13.12  APEP
ATOM    831  N   THR    106    26.395  29.361  30.522  1.00 14.55  APEP
ATOM    832  CA  THR    106    26.573  29.385  31.971  1.00 15.70  APEP
ATOM    833  CB  THR    106    28.032  29.051  32.322  1.00 17.02  APEP
ATOM    834  OG1 THR    106    28.349  27.739  31.837  1.00 19.67  APEP
ATOM    835  CG2 THR    106    28.244  29.101  33.815  1.00 19.92  APEP
ATOM    836  C   THR    106    26.181  30.661  32.712  1.00 14.86  APEP
ATOM    837  O   THR    106    25.648  30.598  33.826  1.00 14.67  APEP
ATOM    838  N   CYS    107    26.444  31.813  32.107  1.00  12.86  APEP
ATOM    839  CA  CYS    107    26.131  33.086  32.748  1.00  11.94  APEP
ATOM    840  C   CYS    107    25.608  34.112  31.741  1.00  11.28  APEP
ATOM    841  O   CYS    107    26.354  34.594  30.886  1.00  8.75   APEP
ATOM    842  CB  CYS    107    27.389  33.618  33.451  1.00  11.80  APEP
ATOM    843  SG  CYS    107    27.155  35.045  34.567  1.00  14.81  APEP
ATOM    844  N   ARG    108    24.324  34.448  31.857  1.00  10.42  APEP
ATOM    845  CA  ARG    108    23.694  35.408  30.956  1.00  10.25  APEP
ATOM    846  CB  ARG    108    22.656  34.703  30.080  1.00  7.60   APEP
ATOM    847  CG  ARG    108    21.299  34.525  30.746  1.00  6.23   APEP
ATOM    848  CD  ARG    108    20.458  33.460  30.047  1.00  4.46   APEP
ATOM    849  NE  ARG    108    21.066  32.136  30.118  1.00  8.96   APEP
ATOM    850  CZ  ARG    108    20.688  31.192  30.971  1.00  9.87   APEP
ATOM    851  NH1 ARG    108    19.703  31.427  31.825  1.00  9.20   APEP
ATOM    852  NH2 ARG    108    21.284  30.013  30.968  1.00  9.69   APEP
ATOM    853  C   ARG    108    23.015  36.575  31.667  1.00  10.62  APEP
ATOM    854  O   ARG    108    22.465  37.454  31.011  1.00  11.81  APEP
ATOM    855  N   ASP    109    23.051  36.583  32.998  1.00  10.19  APEP
ATOM    856  CA  ASP    109    22.421  37.644  33.784  1.00  9.53   APEP
ATOM    857  CB  ASP    109    22.737  37.457  35.267  1.00  11.00  APEP
ATOM    858  CG  ASP    109    22.049  36.248  35.864  1.00  10.30  APEP
ATOM    859  OD1 ASP    109    21.137  35.704  35.213  1.00  8.82   APEP
ATOM    860  OD2 ASP    109    22.420  35.839  36.984  1.00  12.03  APEP
ATOM    861  C   ASP    109    22.827  39.051  33.368  1.00  10.45  APEP
ATOM    862  O   ASP    109    23.931  39.274  32.878  1.00  11.18  APEP
ATOM    863  N   VAL    110    21.919  40.001  33.565  1.00  10.47  APEP
ATOM    864  CA  VAL    110    22.192  41.400  33.240  1.00  11.15  APEP
ATOM    865  CB  VAL    110    21.083  42.025  32.346  1.00  8.57   APEP
ATOM    866  CG1 VAL    110    21.282  41.607  30.884  1.00  8.96   APEP
ATOM    867  CG2 VAL    110    19.711  41.600  32.840  1.00  8.45   APEP
ATOM    868  C   VAL    110    22.263  42.168  34.564  1.00  12.34  APEP
ATOM    869  O   VAL    110    22.044  41.591  35.631  1.00  11.18  APEP
ATOM    870  N   ALA    111    22.567  43.460  34.493  1.00  12.60  APEP
ATOM    871  CA  ALA    111    22.670  44.283  35.691  1.00  14.41  APEP
ATOM    872  CB  ALA    111    23.192  45.665  35.329  1.00  14.98  APEP
ATOM    873  C   ALA    111    21.351  44.412  36.445  1.00  15.05  APEP
ATOM    874  O   ALA    111    21.348  44.491  37.665  1.00  17.05  APEP
ATOM    875  N   LYS    112    20.233  44.425  35.723  1.00  15.22  APEP
ATOM    876  CA  LYS    112    18.919  44.565  36.346  1.00  14.82  APEP
ATOM    877  CB  LYS    112    17.889  44.979  35.295  1.00  17.33  APEP
ATOM    878  CG  LYS    112    16.518  45.301  35.854  1.00  18.63  APEP
ATOM    879  CD  LYS    112    15.722  46.156  34.885  1.00  20.78  APEP
ATOM    880  CE  LYS    112    14.275  46.298  35.331  1.00  22.40  APEP
ATOM    881  NZ  LYS    112    13.378  46.775  34.230  1.00  24.78  APEP
ATOM    882  C   LYS    112    18.395  43.334  37.092  1.00  14.63  APEP
ATOM    883  O   LYS    112    17.763  43.462  38.138  1.00  15.19  APEP
ATOM    884  N   TYR    113    18.652  42.145  36.565  1.00  14.03  APEP
ATOM    885  CA  TYR    113    18.155  40.941  37.211  1.00  12.90  APEP
ATOM    886  CB  TYR    113    16.627  40.866  37.062  1.00  14.34  APEP
ATOM    887  CG  TYR    113    16.094  41.275  35.701  1.00  13.96  APEP
ATOM    888  CD1 TYR    113    16.725  40.867  34.529  1.00  14.86  APEP
ATOM    889  CE1 TYR    113    16.236  41.234  33.279  1.00  15.41  APEP
ATOM    890  CD2 TYR    113    14.950  42.064  35.590  1.00  15.52  APEP
ATOM    891  CE2 TYR    113    14.447  42.439  34.345  1.00  17.15  APEP
ATOM    892  CZ  TYR    113    15.098  42.021  33.192  1.00  18.32  APEP
ATOM    893  OH  TYR    113    14.619  42.406  31.958  1.00  20.11  APEP
ATOM    894  C   TYR    113    18.761  39.659  36.658  1.00  12.75  APEP
ATOM    895  O   TYR    113    19.592  39.685  35.742  1.00  9.39   APEP
ATOM    896  N   GLN    114    18.334  38.542  37.241  1.00  11.10  APEP
ATOM    897  CA  GLN    114    18.762  37.223  36.820  1.00  11.13  APEP
ATOM    898  CB  GLN    114    18.397  36.182  37.872  1.00  13.13  APEP
ATOM    899  CG  GLN    114    19.492  35.921  38.881  1.00  17.82  APEP
ATOM    900  CD  GLN    114    19.049  34.969  39.971  1.00  21.01  APEP
ATOM    901  OE1 GLN    114    18.984  33.754  39.767  1.00  24.17  APEP
ATOM    902  NE2 GLN    114    18.735  35.517  41.140  1.00  21.13  APEP
ATOM    903  C   GLN    114    17.969  36.977  35.549  1.00  10.94  APEP
ATOM    904  O   GLN    114    16.851  37.489  35.418  1.00  10.27  APEP
ATOM    905  N   VAL    115    18.529  36.195  34.626  1.00  8.78   APEP
ATOM    906  CA  VAL    115    17.879  35.936  33.339  1.00  6.98   APEP
ATOM    907  CB  VAL    115    18.679  36.628  32.204  1.00  8.14   APEP
ATOM    908  CG1 VAL    115    18.037  36.358  30.868  1.00  9.82   APEP
ATOM    909  CG2 VAL    115    18.750  38.125  32.461  1.00  6.98   APEP
ATOM    910  C   VAL    115    17.669  34.457  32.975  1.00  6.17   APEP
ATOM    911  O   VAL    115    18.581  33.634  33.093  1.00  4.78   APEP
ATOM    912  N   GLY    116    16.449  34.142  32.540  1.00  5.97   APEP
ATOM    913  CA  GLY    116    16.105  32.788  32.139  1.00  7.14   APEP
ATOM    914  C   GLY    116    16.364  32.568  30.654  1.00  7.72   APEP
ATOM    915  O   GLY    116    16.706  33.504  29.930  1.00  6.29   APEP
ATOM    916  N   GLN    117    16.195  31.337  30.186  1.00  8.62   APEP
ATOM    917  CA  GLN    117    16.456  31.058  28.780  1.00  9.69   APEP
ATOM    918  CB  GLN    117    17.980  31.001  28.550  1.00  8.96   APEP
ATOM    919  CG  GLN    117    18.419  30.465  27.179  1.00  8.07   APEP
ATOM    920  CD  GLN    117    19.935  30.331  27.046  1.00  7.90   APEP
ATOM    921  OE1 GLN    117    20.507  29.288  27.360  1.00  10.49  APEP
ATOM    922  NE2 GLN    117    20.586  31.386  26.575  1.00  7.02   APEP
ATOM    923  C   GLN    117    15.813  29.790  28.230  1.00  9.46   APEP
ATOM    924  O   GLN    117    15.713  28.775  28.920  1.00  8.69   APEP
ATOM    925  N   ASN    118    15.372  29.876  26.978  1.00  10.04  APEP
ATOM    926  CA  ASN    118    14.762  28.759  26.253  1.00  9.76   APEP
ATOM    927  CB  ASN    118    13.280  29.037  25.950  1.00  9.04   APEP
ATOM    928  CG  ASN    118    12.357  28.735  27.127  1.00  9.64   APEP
ATOM    929  OD1 ASN    118    12.696  27.976  28.035  1.00  9.37   APEP
ATOM    930  ND2 ASN    118    11.178  29.337  27.108  1.00  8.63   APEP
ATOM    931  C   ASN    118    15.526  28.674  24.926  1.00  9.88   APEP
ATOM    932  O   ASN    118    15.847  29.707  24.342  1.00  9.07   APEP
ATOM    933  N   VAL    119    15.836  27.464  24.465  1.00  10.24  APEP
ATOM    934  CA  VAL    119    16.533  27.288  23.188  1.00  9.82   APEP
ATOM    935  CB  VAL    119    18.021  26.811  23.340  1.00  9.70   APEP
ATOM    936  CG1 VAL    119    18.764  27.684  24.349  1.00  11.24  APEP
ATOM    937  CG2 VAL    119    18.072  25.344  23.749  1.00  11.10  APEP
ATOM    938  C   VAL    119    15.784  26.247  22.379  1.00  10.42  APEP
ATOM    939  O   VAL    119    15.116  25.380  22.939  1.00  7.84   APEP
ATOM    940  N   ALA    120    15.894  26.345  21.057  1.00  11.69  APEP
ATOM    941  CA  ALA    120    15.224  25.416  20.164  1.00  10.58  APEP
ATOM    942  CB  ALA    120    13.853  25.960  19.783  1.00  9.38   APEP
ATOM    943  C   ALA    120    16.065  25.203  18.913  1.00  11.91  APEP
ATOM    944  O   ALA    120    16.749  26.114  18.447  1.00  11.05  APEP
ATOM    945  N   LEU    121    16.005  23.999  18.363  1.00  11.80  APEP
ATOM    946  CA  LEU    121    16.762  23.707  17.164  1.00  10.62  APEP
ATOM    947  CB  LEU    121    18.219  23.423  17.534  1.00  12.00  APEP
ATOM    948  CG  LEU    121    19.162  23.065  16.383  1.00  14.58  APEP
ATOM    949  CD1 LEU    121    19.914  24.310  15.937  1.00  14.77  APEP
ATOM    950  CD2 LEU    121    20.124  21.975  16.830  1.00  16.44  APEP
ATOM    951  C   LEU    121    16.190  22.521  16.395  1.00  11.28  APEP
ATOM    952  O   LEU    121    15.744  21.540    16.989    1.00 8.33   APEP
ATOM    953  N   THR    122    16.183  22.633    15.069    1.00 9.47   APEP
ATOM    954  CA  THR    122    15.723  21.551    14.203    1.00 9.80   APEP
ATOM    955  CB  THR    122    14.282  21.766    13.691    1.00 8.73   APEP
ATOM    956  OG1 THR    122    14.272  22.801    12.704    1.00 8.66   APEP
ATOM    957  CG2 THR    122    13.357  22.133    14.838    1.00 11.47  APEP
ATOM    958  C   THR    122    16.666  21.502    13.009    1.00 9.64   APEP
ATOM    959  O   THR    122    17.232  22.524    12.616    1.00 9.15   APEP
ATOM    960  N   GLY    123    16.847  20.308    12.451    1.00 9.74   APEP
ATOM    961  CA  GLY    123    17.728  20.137    11.313    1.00 8.54   APEP
ATOM    962  C   GLY    123    17.048  19.326    10.228    1.00 8.95   APEP
ATOM    963  O   GLY    123    16.199  18.482    10.514    1.00 9.03   APEP
ATOM    964  N   SER    124    17.420  19.580    8.979     1.00 7.43   APEP
ATOM    965  CA  SER    124    16.824  18.874    7.857     1.00 9.14   APEP
ATOM    966  CB  SER    124    15.584  19.642    7.393     1.00 10.09  APEP
ATOM    967  OG  SER    124    15.333  19.459    6.016     1.00 11.96  APEP
ATOM    968  C   SER    124    17.827  18.718    6.709     1.00 9.54   APEP
ATOM    969  O   SER    124    18.716  19.551    6.537     1.00 10.56  APEP
ATOM    970  N   THR    125    17.693  17.641    5.936     1.00 10.06  APEP
ATOM    971  CA  THR    125    18.591  17.415    4.812     1.00 10.19  APEP
ATOM    972  CB  THR    125    18.513  15.974    4.257     1.00 11.20  APEP
ATOM    973  OG1 THR    125    17.142  15.593    4.086     1.00 12.88  APEP
ATOM    974  CG2 THR    125    19.218  15.001    5.191     1.00 8.70   APEP
ATOM    975  C   THR    125    18.274  18.369    3.676     1.00 9.96   APEP
ATOM    976  O   THR    125    19.081  18.532    2.772     1.00 10.12  APEP
ATOM    977  N   ALA    126    17.103  18.999    3.731     1.00 10.40  APEP
ATOM    978  CA  ALA    126    16.678  19.955    2.705     1.00 11.31  APEP
ATOM    979  CB  ALA    126    15.169  19.863    2.492     1.00 11.00  APEP
ATOM    980  C   ALA    126    17.060  21.383    3.086     1.00 13.19  APEP
ATOM    981  O   ALA    126    17.116  21.735    4.271     1.00 12.55  APEP
ATOM    982  N   ALA    127    17.314  22.207    2.078     1.00 12.78  APEP
ATOM    983  CA  ALA    127    17.700  23.590    2.315     1.00 15.72  APEP
ATOM    984  CB  ALA    127    18.471  24.135    1.106     1.00 15.36  APEP
ATOM    985  C   ALA    127    16.496  24.474    2.610     1.00 17.23  APEP
ATOM    986  O   ALA    127    16.080  25.271    1.773     1.00 17.44  APEP
ATOM    987  N   LYS    128    15.941  24.324    3.810     1.00 19.74  APEP
ATOM    988  CA  LYS    128    14.790  25.110    4.251     1.00 19.25  APEP
ATOM    989  CB  LYS    128    13.481  24.387    3.917     1.00 21.28  APEP
ATOM    990  CG  LYS    128    12.930  24.721    2.527     1.00 26.82  APEP
ATOM    991  CD  LYS    128    12.083  25.993    2.549     1.00 27.74  APEP
ATOM    992  CE  LYS    128    11.582  26.365    1.152     1.00 27.56  APEP
ATOM    993  NZ  LYS    128    10.376  27.258    1.191     1.00 24.53  APEP
ATOM    994  C   LYS    128    14.918  25.311    5.760     1.00 20.56  APEP
ATOM    995  O   LYS    128    15.299  24.384    6.488     1.00 18.95  APEP
ATOM    996  N   TYR    129    14.599  26.517    6.224     1.00 19.02  APEP
ATOM    997  CA  TYR    129    14.712  26.853    7.644     1.00 18.90  APEP
ATOM    998  CB  TYR    129    15.728  27.985    7.812     1.00 17.17  APEP
ATOM    999  CG  TYR    129    17.060  27.645    7.188     1.00 15.78  APEP
ATOM    1000 CD1 TYR    129    17.319  27.934    5.847     1.00 15.45  APEP
ATOM    1001 CE1 TYR    129    18.519  27.564    5.250     1.00 13.12  APEP
ATOM    1002 CD2 TYR    129    18.043  26.984    7.918     1.00 16.01  APEP
ATOM    1003 CE2 TYR    129    19.250  26.610    7.330     1.00 16.66  APEP
ATOM    1004 CZ  TYR    129    19.479  26.900    5.994     1.00 15.93  APEP
ATOM    1005 OH  TYR    129    20.652  26.495    5.404     1.00 11.93  APEP
ATOM    1006 C   TYR    129    13.384  27.213    8.312     1.00 18.94  APEP
ATOM    1007 O   TYR    129    12.574  27.980    7.775     1.00 19.85  APEP
ATOM    1008 N   ASP    130    13.178  26.645    9.496     1.00 17.23  APEP
ATOM    1009  CA  ASP    130    11.953  26.844  10.259  1.00  16.64  APEP
ATOM    1010  CB  ASP    130    12.012  26.050  11.568  1.00  18.70  APEP
ATOM    1011  CG  ASP    130    11.399  24.677  11.446  1.00  18.76  APEP
ATOM    1012  OD1 ASP    130    11.067  24.267  10.319  1.00  17.38  APEP
ATOM    1013  OD2 ASP    130    11.253  24.005  12.489  1.00  20.96  APEP
ATOM    1014  C   ASP    130    11.615  28.285  10.588  1.00  14.91  APEP
ATOM    1015  O   ASP    130    12.489  29.111  10.831  1.00  14.08  APEP
ATOM    1016  N   ASP    131    10.317  28.557  10.584  1.00  16.25  APEP
ATOM    1017  CA  ASP    131    9.759   29.858  10.911  1.00  16.60  APEP
ATOM    1018  CB  ASP    131    8.255   29.834  10.571  1.00  19.29  APEP
ATOM    1019  CG  ASP    131    7.558   31.166  10.807  1.00  24.36  APEP
ATOM    1020  OD1 ASP    131    8.036   31.978  11.630  1.00  27.58  APEP
ATOM    1021  OD2 ASP    131    6.506   31.396  10.168  1.00  28.19  APEP
ATOM    1022  C   ASP    131    9.993   29.961  12.428  1.00  15.04  APEP
ATOM    1023  O   ASP    131    9.708   29.012  13.159  1.00  14.34  APEP
ATOM    1024  N   PRO    132    10.534  31.092  12.910  1.00  12.77  APEP
ATOM    1025  CD  PRO    132    10.950  32.276  12.139  1.00  12.42  APEP
ATOM    1026  CA  PRO    132    10.788  31.253  14.354  1.00  13.80  APEP
ATOM    1027  CB  PRO    132    11.197  32.722  14.492  1.00  13.81  APEP
ATOM    1028  CG  PRO    132    11.711  33.104  13.149  1.00  14.43  APEP
ATOM    1029  C   PRO    132    9.592   30.895  15.251  1.00  13.34  APEP
ATOM    1030  O   PRO    132    9.758   30.239  16.278  1.00  12.55  APEP
ATOM    1031  N   VAL    133    8.396   31.325  14.850  1.00  12.80  APEP
ATOM    1032  CA  VAL    133    7.170   31.054  15.591  1.00  12.13  APEP
ATOM    1033  CB  VAL    133    5.944   31.661  14.862  1.00  11.80  APEP
ATOM    1034  CG1 VAL    133    4.653   31.032  15.364  1.00  10.96  APEP
ATOM    1035  CG2 VAL    133    5.923   33.159  15.064  1.00  13.44  APEP
ATOM    1036  C   VAL    133    6.964   29.549  15.744  1.00  13.10  APEP
ATOM    1037  O   VAL    133    6.452   29.083  16.763  1.00  11.95  APEP
ATOM    1038  N   LYS    134    7.361   28.796  14.721  1.00  13.08  APEP
ATOM    1039  CA  LYS    134    7.227   27.341  14.738  1.00  14.09  APEP
ATOM    1040  CB  LYS    134    7.594   26.756  13.374  1.00  14.78  APEP
ATOM    1041  CG  LYS    134    7.716   25.238  13.367  1.00  17.92  APEP
ATOM    1042  CD  LYS    134    7.273   24.661  12.024  1.00  20.75  APEP
ATOM    1043  CE  LYS    134    7.454   23.147  11.974  1.00  21.88  APEP
ATOM    1044  NZ  LYS    134    7.979   22.704  10.646  1.00  22.20  APEP
ATOM    1045  C   LYS    134    8.125   26.734  15.805  1.00  13.26  APEP
ATOM    1046  O   LYS    134    7.775   25.732  16.437  1.00  12.31  APEP
ATOM    1047  N   LEU    135    9.289   27.343  15.990  1.00  12.25  APEP
ATOM    1048  CA  LEU    135    10.245  26.883  16.987  1.00  12.29  APEP
ATOM    1049  CB  LEU    135    11.604  27.551  16.755  1.00  11.92  APEP
ATOM    1050  CG  LEU    135    12.371  26.968  15.563  1.00  12.40  APEP
ATOM    1051  CD1 LEU    135    13.673  27.703  15.354  1.00  10.11  APEP
ATOM    1052  CD2 LEU    135    12.633  25.492  15.816  1.00  13.69  APEP
ATOM    1053  C   LEU    135    9.711   27.222  18.371  1.00  11.79  APEP
ATOM    1054  O   LEU    135    9.862   26.443  19.311  1.00  12.52  APEP
ATOM    1055  N   VAL    136    9.070   28.378  18.492  1.00  11.76  APEP
ATOM    1056  CA  VAL    136    8.507   28.805  19.773  1.00  11.55  APEP
ATOM    1057  CB  VAL    136    7.926   30.236  19.674  1.00  9.15   APEP
ATOM    1058  CG1 VAL    136    7.043   30.531  20.874  1.00  9.61   APEP
ATOM    1059  CG2 VAL    136    9.053   31.247  19.587  1.00  5.53   APEP
ATOM    1060  C   VAL    136    7.405   27.836  20.227  1.00  12.73  APEP
ATOM    1061  O   VAL    136    7.370   27.421  21.385  1.00  11.68  APEP
ATOM    1062  N   LYS    137    6.521   27.477  19.298  1.00  13.14  APEP
ATOM    1063  CA  LYS    137    5.422   26.554  19.563  1.00  12.46  APEP
ATOM    1064  CB  LYS    137    4.562   26.376  18.307  1.00  12.12  APEP
ATOM    1065  CG  LYS    137    3.866   27.659  17.847  1.00  16.24  APEP
ATOM    1066  CD  LYS    137    2.763  27.391  16.836  1.00 13.34  APEP
ATOM    1067  CE  LYS    137    1.560  28.297  17.064  1.00 16.29  APEP
ATOM    1068  NZ  LYS    137    0.433  27.565  17.706  1.00 12.20  APEP
ATOM    1069  C   LYS    137    5.939  25.198  20.031  1.00 12.60  APEP
ATOM    1070  O   LYS    137    5.183  24.406  20.589  1.00 13.30  APEP
ATOM    1071  N   MET    138    7.220  24.924  19.797  1.00 12.70  APEP
ATOM    1072  CA  MET    138    7.807  23.662  20.240  1.00 15.80  APEP
ATOM    1073  CB  MET    138    9.266  23.545  19.779  1.00 17.09  APEP
ATOM    1074  CG  MET    138    9.478  22.767  18.482  1.00 21.36  APEP
ATOM    1075  SD  MET    138    11.111 23.089  17.711  1.00 26.01  APEP
ATOM    1076  CE  MET    138    12.066 21.673  18.272  1.00 23.00  APEP
ATOM    1077  C   MET    138    7.755  23.665  21.768  1.00 15.35  APEP
ATOM    1078  O   MET    138    7.447  22.650  22.395  1.00 15.78  APEP
ATOM    1079  N   TRP    139    8.069  24.824  22.346  1.00 13.56  APEP
ATOM    1080  CA  TRP    139    8.069  25.035  23.791  1.00 10.21  APEP
ATOM    1081  CB  TRP    139    8.700  26.395  24.122  1.00 6.88   APEP
ATOM    1082  CG  TRP    139    10.112 26.582  23.589  1.00 7.62   APEP
ATOM    1083  CD2 TRP    139    10.746 27.821  23.220  1.00 4.45   APEP
ATOM    1084  CE2 TRP    139    12.051 27.507  22.784  1.00 4.04   APEP
ATOM    1085  CE3 TRP    139    10.335 29.160  23.214  1.00 4.82   APEP
ATOM    1086  CD1 TRP    139    11.037 25.606  23.367  1.00 6.61   APEP
ATOM    1087  NE1 TRP    139    12.203 26.151  22.886  1.00 5.06   APEP
ATOM    1088  CZ2 TRP    139    12.955 28.490  22.347  1.00 2.98   APEP
ATOM    1089  CZ3 TRP    139    11.229 30.137  22.778  1.00 2.00   APEP
ATOM    1090  CH2 TRP    139    12.525 29.795  22.351  1.00 4.18   APEP
ATOM    1091  C   TRP    139    6.628  24.997  24.312  1.00 11.53  APEP
ATOM    1092  O   TRP    139    6.350  24.419  25.365  1.00 11.91  APEP
ATOM    1093  N   GLU    140    5.723  25.622  23.557  1.00 11.23  APEP
ATOM    1094  CA  GLU    140    4.306  25.690  23.890  1.00 10.95  APEP
ATOM    1095  CB  GLU    140    3.538  26.427  22.798  1.00 9.60   APEP
ATOM    1096  CG  GLU    140    3.622  27.919  22.834  1.00 7.49   APEP
ATOM    1097  CD  GLU    140    2.893  28.544  21.666  1.00 8.80   APEP
ATOM    1098  OE1 GLU    140    1.937  27.921  21.150  1.00 11.85  APEP
ATOM    1099  OE2 GLU    140    3.277  29.654  21.259  1.00 12.42  APEP
ATOM    1100  C   GLU    140    3.672  24.321  24.038  1.00 11.65  APEP
ATOM    1101  O   GLU    140    2.891  24.089  24.960  1.00 13.93  APEP
ATOM    1102  N   ASP    141    3.993  23.423  23.112  1.00 12.05  APEP
ATOM    1103  CA  ASP    141    3.433  22.078  23.106  1.00 13.22  APEP
ATOM    1104  CB  ASP    141    3.850  21.346  21.833  1.00 12.72  APEP
ATOM    1105  CG  ASP    141    3.200  21.923  20.601  1.00 13.07  APEP
ATOM    1106  OD1 ASP    141    2.240  22.706  20.747  1.00 12.10  APEP
ATOM    1107  OD2 ASP    141    3.646  21.599  19.484  1.00 16.74  APEP
ATOM    1108  C   ASP    141    3.782  21.235  24.320  1.00 13.83  APEP
ATOM    1109  O   ASP    141    3.199  20.172  24.530  1.00 13.83  APEP
ATOM    1110  N   GLU    142    4.726  21.705  25.124  1.00 14.37  APEP
ATOM    1111  CA  GLU    142    5.110  20.974  26.323  1.00 13.86  APEP
ATOM    1112  CB  GLU    142    6.335  21.626  26.974  1.00 13.22  APEP
ATOM    1113  CG  GLU    142    7.619  21.449  26.158  1.00 13.31  APEP
ATOM    1114  CD  GLU    142    8.866  21.896  26.889  1.00 11.68  APEP
ATOM    1115  OE1 GLU    142    8.749  22.706  27.829  1.00 14.70  APEP
ATOM    1116  OE2 GLU    142    9.968  21.439  26.523  1.00 10.37  APEP
ATOM    1117  C   GLU    142    3.937  20.957  27.301  1.00 14.65  APEP
ATOM    1118  O   GLU    142    3.819  20.049  28.120  1.00 16.37  APEP
ATOM    1119  N   VAL    143    3.063  21.954  27.197  1.00 14.52  APEP
ATOM    1120  CA  VAL    143    1.904  22.071  28.084  1.00 14.56  APEP
ATOM    1121  CB  VAL    143    0.970  23.221  27.644  1.00 14.44  APEP
ATOM    1122  CG1 VAL    143    0.210  22.834  26.376  1.00 12.33  APEP
ATOM    1123  CG2 VAL    143    -0.005  23.548  28.769  1.00 10.75  APEP
ATOM    1124  C   VAL    143    1.057   20.809  28.237  1.00 16.78  APEP
ATOM    1125  O   VAL    143    0.399   20.631  29.258  1.00 16.28  APEP
ATOM    1126  N   LYS    144    1.059   19.942  27.228  1.00 17.87  APEP
ATOM    1127  CA  LYS    144    0.281   18.706  27.293  1.00 19.21  APEP
ATOM    1128  CB  LYS    144    0.257   18.025  25.913  1.00 21.23  APEP
ATOM    1129  CG  LYS    144    1.602   17.471  25.452  1.00 23.20  APEP
ATOM    1130  CD  LYS    144    1.578   15.949  25.346  1.00 25.43  APEP
ATOM    1131  CE  LYS    144    2.739   15.423  24.506  1.00 25.49  APEP
ATOM    1132  NZ  LYS    144    2.960   16.244  23.282  1.00 24.96  APEP
ATOM    1133  C   LYS    144    0.852   17.746  28.350  1.00 18.76  APEP
ATOM    1134  O   LYS    144    0.188   16.794  28.776  1.00 18.94  APEP
ATOM    1135  N   ASP    145    2.080   18.008  28.774  1.00 17.39  APEP
ATOM    1136  CA  ASP    145    2.743   17.180  29.778  1.00 18.35  APEP
ATOM    1137  CB  ASP    145    4.199   16.916  29.364  1.00 20.30  APEP
ATOM    1138  CG  ASP    145    4.316   15.942  28.195  1.00 20.35  APEP
ATOM    1139  OD1 ASP    145    3.374   15.153  27.959  1.00 22.15  APEP
ATOM    1140  OD2 ASP    145    5.359   15.966  27.510  1.00 21.64  APEP
ATOM    1141  C   ASP    145    2.714   17.829  31.173  1.00 17.37  APEP
ATOM    1142  O   ASP    145    3.069   17.192  32.164  1.00 15.03  APEP
ATOM    1143  N   TYR    146    2.284   19.090  31.240  1.00 17.14  APEP
ATOM    1144  CA  TYR    146    2.200   19.821  32.506  1.00 15.39  APEP
ATOM    1145  CB  TYR    146    2.368   21.320  32.264  1.00 14.76  APEP
ATOM    1146  CG  TYR    146    2.696   22.071  33.533  1.00 15.28  APEP
ATOM    1147  CD1 TYR    146    3.992   22.053  34.065  1.00 14.62  APEP
ATOM    1148  CE1 TYR    146    4.286   22.682  35.277  1.00 13.76  APEP
ATOM    1149  CD2 TYR    146    1.705   22.743  34.242  1.00 14.99  APEP
ATOM    1150  CE2 TYR    146    1.991   23.377  35.457  1.00 13.01  APEP
ATOM    1151  CZ  TYR    146    3.281   23.340  35.964  1.00 12.87  APEP
ATOM    1152  OH  TYR    146    3.563   23.958  37.162  1.00 12.82  APEP
ATOM    1153  C   TYR    146    0.906   19.580  33.294  1.00 16.31  APEP
ATOM    1154  O   TYR    146    -0.202  19.837  32.804  1.00 15.92  APEP
ATOM    1155  N   ASN    147    1.062   19.097  34.525  1.00 15.90  APEP
ATOM    1156  CA  ASN    147    -0.066  18.792  35.415  1.00 17.53  APEP
ATOM    1157  CB  ASN    147    0.265   17.551  36.248  1.00 17.07  APEP
ATOM    1158  CG  ASN    147    -0.851  17.172  37.193  1.00 18.14  APEP
ATOM    1159  OD1 ASN    147    -1.885  17.835  37.242  1.00 19.58  APEP
ATOM    1160  ND2 ASN    147    -0.651  16.096  37.949  1.00 15.35  APEP
ATOM    1161  C   ASN    147    -0.405  19.957  36.355  1.00 17.15  APEP
ATOM    1162  O   ASN    147    0.289   20.196  37.334  1.00 16.44  APEP
ATOM    1163  N   PRO    148    -1.499  20.677  36.082  1.00 17.84  APEP
ATOM    1164  CD  PRO    148    -2.462  20.508  34.981  1.00 16.74  APEP
ATOM    1165  CA  PRO    148    -1.854  21.805  36.951  1.00 19.69  APEP
ATOM    1166  CB  PRO    148    -2.982  22.504  36.189  1.00 17.29  APEP
ATOM    1167  CG  PRO    148    -3.588  21.436  35.367  1.00 17.85  APEP
ATOM    1168  C   PRO    148    -2.246  21.467  38.395  1.00 21.26  APEP
ATOM    1169  O   PRO    148    -2.040  22.285  39.289  1.00 22.85  APEP
ATOM    1170  N   LYS    149    -2.802  20.275  38.624  1.00 23.35  APEP
ATOM    1171  CA  LYS    149    -3.219  19.862  39.970  1.00 25.52  APEP
ATOM    1172  CB  LYS    149    -4.006  18.546  39.917  1.00 25.99  APEP
ATOM    1173  CG  LYS    149    -5.036  18.477  38.800  1.00 29.64  APEP
ATOM    1174  CD  LYS    149    -6.438  18.800  39.307  1.00 30.49  APEP
ATOM    1175  CE  LYS    149    -7.162  19.775  38.382  1.00 30.51  APEP
ATOM    1176  NZ  LYS    149    -8.401  20.351  39.004  1.00 30.17  APEP
ATOM    1177  C   LYS    149    -2.041  19.704  40.929  1.00 26.61  APEP
ATOM    1178  O   LYS    149    -2.153  19.082  41.993  1.00 27.31  APEP
ATOM    1179  N   LYS    150    -0.905  20.271  40.559  1.00 26.69  APEP
ATOM    1180  CA  LYS    150    0.262  20.186  41.408  1.00 27.83  APEP
ATOM    1181  CB  LYS    150    0.904  18.795  41.260  1.00 26.22  APEP
ATOM    1182  CG  LYS    150    2.205  18.718  40.495  1.00 25.69  APEP
ATOM    1183  CD  LYS    150    2.416  17.320  39.908  1.00 25.52  APEP
ATOM    1184  CE  LYS    150    2.140  16.214  40.922  1.00 24.65  APEP
ATOM    1185  NZ  LYS    150    0.695  15.847  40.971  1.00 23.30  APEP
ATOM    1186  C   LYS    150    1.218  21.320  41.062  1.00 29.22  APEP
ATOM    1187  O   LYS    150    1.504  21.577  39.895  1.00 31.30  APEP
ATOM    1188  N   LYS    151    1.681  22.023  42.088  1.00 30.63  APEP
ATOM    1189  CA  LYS    151    2.581  23.148  41.896  1.00 29.98  APEP
ATOM    1190  CB  LYS    151    3.134  23.622  43.244  1.00 30.75  APEP
ATOM    1191  CG  LYS    151    2.308  24.738  43.888  1.00 32.85  APEP
ATOM    1192  CD  LYS    151    2.605  26.093  43.246  1.00 32.11  APEP
ATOM    1193  CE  LYS    151    1.512  27.104  43.562  1.00 30.61  APEP
ATOM    1194  NZ  LYS    151    2.061  28.331  44.196  1.00 27.07  APEP
ATOM    1195  C   LYS    151    3.720  22.801  40.956  1.00 28.42  APEP
ATOM    1196  O   LYS    151    3.984  21.633  40.685  1.00 28.09  APEP
ATOM    1197  N   PHE    152    4.377  23.842  40.460  1.00 28.09  APEP
ATOM    1198  CA  PHE    152    5.494  23.719  39.539  1.00 27.23  APEP
ATOM    1199  CB  PHE    152    6.138  25.098  39.349  1.00 23.04  APEP
ATOM    1200  CG  PHE    152    7.486  25.064  38.687  1.00 21.73  APEP
ATOM    1201  CD1 PHE    152    7.595  24.951  37.307  1.00 19.77  APEP
ATOM    1202  CD2 PHE    152    8.646  25.171  39.442  1.00 21.08  APEP
ATOM    1203  CE1 PHE    152    8.833  24.948  36.688  1.00 18.18  APEP
ATOM    1204  CE2 PHE    152    9.894  25.169  38.832  1.00 20.33  APEP
ATOM    1205  CZ  PHE    152    9.986  25.057  37.447  1.00 20.45  APEP
ATOM    1206  C   PHE    152    6.543  22.708  39.996  1.00 28.98  APEP
ATOM    1207  O   PHE    152    6.821  21.736  39.293  1.00 29.79  APEP
ATOM    1208  N   SER    153    7.112  22.940  41.176  1.00 30.67  APEP
ATOM    1209  CA  SER    153    8.162  22.084  41.735  1.00 32.34  APEP
ATOM    1210  CB  SER    153    8.313  22.357  43.234  1.00 33.66  APEP
ATOM    1211  OG  SER    153    9.539  21.834  43.713  1.00 35.63  APEP
ATOM    1212  C   SER    153    7.990  20.581  41.522  1.00 31.88  APEP
ATOM    1213  O   SER    153    8.977  19.859  41.342  1.00 29.52  APEP
ATOM    1214  N   GLY    154    6.744  20.113  41.547  1.00 32.09  APEP
ATOM    1215  CA  GLY    154    6.488  18.694  41.373  1.00 31.42  APEP
ATOM    1216  C   GLY    154    6.124  18.282  39.962  1.00 31.52  APEP
ATOM    1217  O   GLY    154    5.317  17.371  39.771  1.00 31.82  APEP
ATOM    1218  N   ASN    155    6.719  18.941  38.973  1.00 30.65  APEP
ATOM    1219  CA  ASN    155    6.448  18.635  37.573  1.00 28.76  APEP
ATOM    1220  CB  ASN    155    5.796  19.842  36.893  1.00 27.64  APEP
ATOM    1221  CG  ASN    155    4.332  19.614  36.579  1.00 26.54  APEP
ATOM    1222  OD1 ASN    155    3.991  18.873  35.652  1.00 25.37  APEP
ATOM    1223  ND2 ASN    155    3.455  20.248  37.354  1.00 23.70  APEP
ATOM    1224  C   ASN    155    7.729  18.257  36.833  1.00 29.00  APEP
ATOM    1225  O   ASN    155    8.828  18.636  37.242  1.00 28.36  APEP
ATOM    1226  N   ASP    156    7.580  17.507  35.744  1.00 28.55  APEP
ATOM    1227  CA  ASP    156    8.714  17.071  34.933  1.00 28.23  APEP
ATOM    1228  CB  ASP    156    8.219  16.108  33.848  1.00 29.34  APEP
ATOM    1229  CG  ASP    156    9.251  15.058  33.474  1.00 30.85  APEP
ATOM    1230  OD1 ASP    156    8.915  13.855  33.515  1.00 30.64  APEP
ATOM    1231  OD2 ASP    156    10.396 15.434  33.133  1.00 32.06  APEP
ATOM    1232  C   ASP    156    9.399  18.281  34.284  1.00 27.76  APEP
ATOM    1233  O   ASP    156    8.971  18.746  33.230  1.00 27.49  APEP
ATOM    1234  N   PHE    157    10.464 18.789  34.897  1.00 28.19  APEP
ATOM    1235  CA  PHE    157    11.129 19.951  34.326  1.00 29.10  APEP
ATOM    1236  CB  PHE    157    11.963 20.705  35.387  1.00 32.07  APEP
ATOM    1237  CG  PHE    157    13.062  19.893  36.038  1.00 35.87  APEP
ATOM    1238  CD1 PHE    157    14.226  19.555  35.330  1.00 36.99  APEP
ATOM    1239  CD2 PHE    157    12.982  19.555  37.397  1.00 35.92  APEP
ATOM    1240  CE1 PHE    157    15.297  18.901  35.966  1.00 36.12  APEP
ATOM    1241  CE2 PHE    157    14.047  18.902  38.044  1.00 36.27  APEP
ATOM    1242  CZ  PHE    157    15.208  18.577  37.323  1.00 36.25  APEP
ATOM    1243  C   PHE    157    11.967  19.639  33.100  1.00 28.86  APEP
ATOM    1244  O   PHE    157    12.423  20.543  32.400  1.00 28.11  APEP
ATOM    1245  N   LEU    158    12.158  18.357  32.824  1.00 28.54  APEP
ATOM    1246  CA  LEU    158    12.928  17.962  31.653  1.00 28.65  APEP
ATOM    1247  CB  LEU    158    13.685  16.657  31.922  1.00 29.80  APEP
ATOM    1248  CG  LEU    158    15.217  16.660  31.842  1.00 28.78  APEP
ATOM    1249  CD1 LEU    158    15.688  15.223  31.692  1.00 29.48  APEP
ATOM    1250  CD2 LEU    158    15.706  17.507  30.669  1.00 26.31  APEP
ATOM    1251  C   LEU    158    11.962  17.773  30.488  1.00 27.95  APEP
ATOM    1252  O   LEU    158    12.375  17.501  29.366  1.00 30.04  APEP
ATOM    1253  N   LYS    159    10.671  17.932  30.763  1.00 26.29  APEP
ATOM    1254  CA  LYS    159    9.654   17.774  29.734  1.00 24.09  APEP
ATOM    1255  CB  LYS    159    8.801   16.542  30.039  1.00 23.00  APEP
ATOM    1256  CG  LYS    159    9.619   15.265  30.203  1.00 24.44  APEP
ATOM    1257  CD  LYS    159    8.749   14.035  30.403  1.00 23.01  APEP
ATOM    1258  CE  LYS    159    7.414   14.154  29.691  1.00 22.17  APEP
ATOM    1259  NZ  LYS    159    6.363   13.362  30.384  1.00 21.65  APEP
ATOM    1260  C   LYS    159    8.756   19.000  29.595  1.00 22.82  APEP
ATOM    1261  O   LYS    159    8.099   19.182  28.566  1.00 20.81  APEP
ATOM    1262  N   THR    160    8.731   19.845  30.623  1.00 21.93  APEP
ATOM    1263  CA  THR    160    7.889   21.041  30.590  1.00 19.90  APEP
ATOM    1264  CB  THR    160    6.684   20.884  31.554  1.00 17.71  APEP
ATOM    1265  OG1 THR    160    7.163   20.721  32.894  1.00 17.45  APEP
ATOM    1266  CG2 THR    160    5.856   19.670  31.182  1.00 14.19  APEP
ATOM    1267  C   THR    160    8.619   22.352  30.921  1.00 19.16  APEP
ATOM    1268  O   THR    160    8.005   23.419  30.937  1.00 20.80  APEP
ATOM    1269  N   GLY    161    9.925   22.270  31.160  1.00 17.07  APEP
ATOM    1270  CA  GLY    161    10.707  23.446  31.506  1.00 15.84  APEP
ATOM    1271  C   GLY    161    10.629  24.679  30.616  1.00 15.32  APEP
ATOM    1272  O   GLY    161    10.825  25.796  31.093  1.00 15.24  APEP
ATOM    1273  N   HIS    162    10.356  24.498  29.329  1.00 15.82  APEP
ATOM    1274  CA  HIS    162    10.274  25.637  28.421  1.00 14.73  APEP
ATOM    1275  CB  HIS    162    10.587  25.193  26.995  1.00 17.02  APEP
ATOM    1276  CG  HIS    162    11.979  24.675  26.823  1.00 20.85  APEP
ATOM    1277  CD2 HIS    162    13.162  25.120  27.308  1.00 21.78  APEP
ATOM    1278  ND1 HIS    162    12.268  23.554  26.076  1.00 23.37  APEP
ATOM    1279  CE1 HIS    162    13.572  23.333  26.107  1.00 24.65  APEP
ATOM    1280  NE2 HIS    162    14.136  24.269  26.848  1.00 24.25  APEP
ATOM    1281  C   HIS    162    8.893   26.277  28.486  1.00 13.27  APEP
ATOM    1282  O   HIS    162    8.753   27.497  28.413  1.00 11.88  APEP
ATOM    1283  N   TYR    163    7.875   25.442  28.628  1.00 11.72  APEP
ATOM    1284  CA  TYR    163    6.509   25.926  28.733  1.00 11.23  APEP
ATOM    1285  CB  TYR    163    5.550   24.750  28.924  1.00 10.40  APEP
ATOM    1286  CG  TYR    163    4.271   25.122  29.653  1.00 10.24  APEP
ATOM    1287  CD1 TYR    163    3.369   26.028  29.095  1.00 10.55  APEP
ATOM    1288  CE1 TYR    163    2.196   26.378  29.759  1.00 9.30   APEP
ATOM    1289  CD2 TYR    163    3.970   24.576  30.898  1.00 6.58   APEP
ATOM    1290  CE2 TYR    163    2.802   24.920  31.571  1.00 8.87   APEP
ATOM    1291  CZ  TYR    163    1.918   25.818  30.995  1.00 10.63  APEP
ATOM    1292  OH  TYR    163    0.745   26.143  31.635  1.00 10.74  APEP
ATOM    1293  C   TYR    163    6.387   26.863  29.937  1.00 10.06  APEP
ATOM    1294  O   TYR    163    5.919   27.994  29.820  1.00 10.02  APEP
ATOM    1295  N   THR    164    6.830   26.382  31.093  1.00 9.35   APEP
ATOM    1296  CA  THR    164    6.740   27.143  32.335  1.00 8.02   APEP
ATOM    1297  CB  THR    164    7.259   26.301  33.511  1.00 6.41   APEP
ATOM    1298  OG1 THR    164    8.571   25.811  33.209  1.00 5.81   APEP
ATOM    1299  CG2 THR    164    6.312   25.111  33.750  1.00 2.00   APEP
ATOM    1300  C   THR    164    7.422   28.513  32.327  1.00 8.62   APEP
ATOM    1301  O   THR    164    6.962   29.433  33.010  1.00 8.07   APEP
ATOM    1302  N   GLN    165    8.508   28.663  31.570  1.00 8.53   APEP
ATOM    13 03 CA  GLN    165    9.183   29.964  31.499  1.00 7.81   APEP
ATOM    1304  CB  GLN    165    10.598  29.837  30.930  1.00 7.00   APEP
ATOM    1305  CG  GLN    165    11.241  31.179  30.604  1.00 7.27   APEP
ATOM    1306  CD  GLN    165    11.537  32.023  31.840  1.00 7.94   APEP
ATOM    1307  OE1 GLN    165    12.631  31.963  32.407  1.00 7.98   APEP
ATOM    1308  NE2 GLN    165    10.566  32.815  32.257  1.00 5.43   APEP
ATOM    1309  C   GLN    165    8.370   30.902  30.609  1.00 7.95   APEP
ATOM    1310  O   GLN    165    8.363   32.113  30.811  1.00 8.38   APEP
ATOM    1311  N   MET    166    7.683   30.330  29.625  1.00 7.26   APEP
ATOM    1312  CA  MET    166    6.859   31.118  28.715  1.00 8.35   APEP
ATOM    1313  CB  MET    166    6.377   30.253  27.553  1.00 7.91   APEP
ATOM    1314  CG  MET    166    7.245   30.356  26.309  1.00 7.80   APEP
ATOM    1315  SD  MET    166    6.486   29.500  24.931  1.00 12.38  APEP
ATOM    1316  CE  MET    166    5.508   30.823  24.207  1.00 11.75  APEP
ATOM    1317  C   MET    166    5.654   31.746  29.409  1.00 6.47   APEP
ATOM    1318  O   MET    166    5.313   32.890  29.128  1.00 7.34   APEP
ATOM    1319  N   VAL    167    5.011   31.009  30.314  1.00 7.21   APEP
ATOM    1320  CA  VAL    167    3.847   31.550  31.018  1.00 7.06   APEP
ATOM    1321  CB  VAL    167    2.676   30.526  31.065  1.00 7.32   APEP
ATOM    1322  CG1 VAL    167    2.295   30.107  29.654  1.00 3.76   APEP
ATOM    1323  CG2 VAL    167    3.048   29.321  31.901  1.00 5.77   APEP
ATOM    1324  C   VAL    167    4.125   32.046  32.444  1.00 8.39   APEP
ATOM    1325  O   VAL    167    3.200   32.211  33.231  1.00 8.06   APEP
ATOM    1326  N   TRP    168    5.396   32.290  32.767  1.00 9.11   APEP
ATOM    1327  CA  TRP    168    5.793   32.784  34.089  1.00 8.50   APEP
ATOM    1328  CB  TRP    168    7.320   32.745  34.232  1.00 7.79   APEP
ATOM    1329  CG  TRP    168    7.806   32.690  35.657  1.00 9.67   APEP
ATOM    1330  CD2 TRP    168    7.960   31.519  36.474  1.00 8.72   APEP
ATOM    1331  CE2 TRP    168    8.452   31.946  37.725  1.00 10.18  APEP
ATOM    1332  CE3 TRP    168    7.730   30.153  36.268  1.00 10.13  APEP
ATOM    1333  CD1 TRP    168    8.200   33.747  36.430  1.00 8.39   APEP
ATOM    1334  NE1 TRP    168    8.589   33.309  37.670  1.00 8.61   APEP
ATOM    1335  CZ2 TRP    168    8.722   31.054  38.769  1.00 8.53   APEP
ATOM    1336  CZ3 TRP    168    7.998   29.265  37.305  1.00 6.40   APEP
ATOM    1337  CH2 TRP    168    8.488   29.721  38.539  1.00 9.27   APEP
ATOM    1338  C   TRP    168    5.294   34.213  34.275  1.00 8.27   APEP
ATOM    1339  O   TRP    168    5.782   35.136  33.627  1.00 8.24   APEP
ATOM    1340  N   ALA    169    4.324   34.392  35.167  1.00 7.85   APEP
ATOM    1341  CA  ALA    169    3.734   35.704  35.415  1.00 7.42   APEP
ATOM    1342  CB  ALA    169    2.668   35.585  36.476  1.00 6.86   APEP
ATOM    1343  C   ALA    169    4.715   36.805  35.797  1.00 9.10   APEP
ATOM    1344  O   ALA    169    4.525   37.968  35.433  1.00 10.62  APEP
ATOM    1345  N   ASN    170    5.758   36.436  36.531  1.00 9.55   APEP
ATOM    1346  CA  ASN    170    6.760   37.392  36.990  1.00 10.81  APEP
ATOM    1347  CB  ASN    170    7.557   36.792  38.158  1.00 10.24  APEP
ATOM    1348  CG  ASN    170    6.907   37.057  39.513  1.00 11.09  APEP
ATOM    1349  OD1 ASN    170    5.758   37.497  39.598  1.00 11.64  APEP
ATOM    1350  ND2 ASN    170    7.643   36.783  40.578  1.00 14.04  APEP
ATOM    1351  C   ASN    170    7.716   37.859  35.887  1.00  10.96  APEP
ATOM    1352  O   ASN    170    8.317   38.918  35.999  1.00  10.88  APEP
ATOM    1353  N   THR    171    7.866   37.071  34.830  1.00  10.69  APEP
ATOM    1354  CA  THR    171    8.741   37.472  33.733  1.00  9.90   APEP
ATOM    1355  CB  THR    171    9.002   36.308  32.757  1.00  8.82   APEP
ATOM    1356  OG1 THR    171    9.738   35.278  33.430  1.00  10.00  APEP
ATOM    1357  CG2 THR    171    9.793   36.790  31.541  1.00  6.32   APEP
ATOM    1358  C   THR    171    8.026   38.592  32.992  1.00  10.43  APEP
ATOM    1359  O   THR    171    6.842   38.468  32.669  1.00  11.58  APEP
ATOM    1360  N   LYS    172    8.736   39.680  32.715  1.00  11.90  APEP
ATOM    1361  CA  LYS    172    8.131   40.818  32.027  1.00  12.07  APEP
ATOM    1362  CB  LYS    172    8.176   42.054  32.934  1.00  13.23  APEP
ATOM    1363  CG  LYS    172    7.424   41.893  34.261  1.00  16.65  APEP
ATOM    1364  CD  LYS    172    5.905   41.830  34.074  1.00  18.48  APEP
ATOM    1365  CE  LYS    172    5.354   43.044  33.312  1.00  21.38  APEP
ATOM    1366  NZ  LYS    172    4.386   43.852  34.117  1.00  19.33  APEP
ATOM    1367  C   LYS    172    8.751   41.166  30.677  1.00  9.74   APEP
ATOM    1368  O   LYS    172    8.122   41.834  29.856  1.00  9.87   APEP
ATOM    1369  N   GLU    173    9.982   40.719  30.450  1.00  11.94  APEP
ATOM    1370  CA  GLU    173    10.684  41.005  29.198  1.00  13.45  APEP
ATOM    1371  CB  GLU    173    11.812  42.014  29.438  1.00  16.52  APEP
ATOM    1372  CG  GLU    173    11.752  42.721  30.778  1.00  21.67  APEP
ATOM    1373  CD  GLU    173    11.695  44.220  30.618  1.00  23.96  APEP
ATOM    1374  OE1 GLU    173    11.727  44.679  29.455  1.00  24.88  APEP
ATOM    1375  OE2 GLU    173    11.621  44.935  31.643  1.00  28.83  APEP
ATOM    1376  C   GLU    173    11.280  39.765  28.531  1.00  10.86  APEP
ATOM    1377  O   GLU    173    11.622  38.790  29.199  1.00  10.81  APEP
ATOM    1378  N   VAL    174    11.404  39.830  27.209  1.00  10.16  APEP
ATOM    1379  CA  VAL    174    11.968  38.741  26.416  1.00  9.96   APEP
ATOM    1380  CB  VAL    174    10.856  37.811  25.846  1.00  9.93   APEP
ATOM    1381  CG1 VAL    174    10.099  38.519  24.740  1.00  7.96   APEP
ATOM    1382  CG2 VAL    174    11.460  36.508  25.323  1.00  7.52   APEP
ATOM    1383  C   VAL    174    12.790  39.316  25.258  1.00  11.17  APEP
ATOM    1384  O   VAL    174    12.485  40.383  24.728  1.00  11.23  APEP
ATOM    1385  N   GLY    175    13.845  38.605  24.886  1.00  10.40  APEP
ATOM    1386  CA  GLY    175    14.692  39.045  23.797  1.00  8.75   APEP
ATOM    1387  C   GLY    175    15.337  37.813  23.211  1.00  9.59   APEP
ATOM    1388  O   GLY    175    15.882  36.991  23.949  1.00  6.65   APEP
ATOM    1389  N   CYS    176    15.291  37.685  21.885  1.00  8.02   APEP
ATOM    1390  CA  CYS    176    15.853  36.511  21.226  1.00  7.90   APEP
ATOM    1391  C   CYS    176    16.940  36.771  20.186  1.00  7.85   APEP
ATOM    1392  O   CYS    176    17.114  37.893  19.693  1.00  6.33   APEP
ATOM    1393  CB  CYS    176    14.721  35.701  20.582  1.00  6.21   APEP
ATOM    1394  SG  CYS    176    13.249  35.553  21.641  1.00  9.41   APEP
ATOM    1395  N   GLY    177    17.672  35.703  19.880  1.00  8.22   APEP
ATOM    1396  CA  GLY    177    18.737  35.744  18.895  1.00  10.14  APEP
ATOM    1397  C   GLY    177    18.618  34.466  18.085  1.00  10.70  APEP
ATOM    1398  O   GLY    177    18.182  33.446  18.623  1.00  8.40   APEP
ATOM    1399  N   SER    178    18.983  34.509  16.806  1.00  9.75   APEP
ATOM    1400  CA  SER    178    18.881  33.325  15.959  1.00  9.62   APEP
ATOM    1401  CB  SER    178    17.523  33.305  15.247  1.00  12.13  APEP
ATOM    1402  OG  SER    178    17.614  33.902  13.964  1.00  15.65  APEP
ATOM    1403  C   SER    178    19.999  33.227  14.921  1.00  8.56   APEP
ATOM    1404  O   SER    178    20.597  34.231  14.532  1.00  5.09   APEP
ATOM    1405  N   ILE    179    20.270  32.001  14.482  1.00  9.37   APEP
ATOM    1406  CA  ILE    179    21.310  31.744  13.498  1.00  9.01   APEP
ATOM    1407  CB  ILE    179    22.673  31.531  14.181  1.00  8.43   APEP
ATOM    1408  CG2 ILE    179    22.625  30.296    15.054   1.00  6.63   APEP
ATOM    1409  CG1 ILE    179    23.774  31.415    13.122   1.00  7.53   APEP
ATOM    1410  CD1 ILE    179    25.093  32.035    13.535   1.00  8.62   APEP
ATOM    1411  C   ILE    179    20.980  30.517    12.650   1.00  10.87  APEP
ATOM    1412  O   ILE    179    20.506  29.497    13.158   1.00  10.47  APEP
ATOM    1413  N   LYS    180    21.216  30.632    11.347   1.00  10.60  APEP
ATOM    1414  CA  LYS    180    20.952  29.536    10.430   1.00  11.05  APEP
ATOM    1415  CB  LYS    180    20.077  30.018    9.269    1.00  11.05  APEP
ATOM    1416  CG  LYS    180    18.745  30.596    9.724    1.00  13.07  APEP
ATOM    1417  CD  LYS    180    17.902  31.048    8.543    1.00  15.79  APEP
ATOM    1418  CE  LYS    180    16.580  31.655    8.996    1.00  14.81  APEP
ATOM    1419  NZ  LYS    180    15.620  31.802    7.862    1.00  16.66  APEP
ATOM    1420  C   LYS    180    22.291  29.029    9.920    1.00  10.53  APEP
ATOM    1421  O   LYS    180    23.137  29.817    9.505    1.00  12.20  APEP
ATOM    1422  N   TYR    181    22.490  27.716    9.955    1.00  9.11   APEP
ATOM    1423  CA  TYR    181    23.756  27.166    9.510    1.00  8.14   APEP
ATOM    1424  CB  TYR    181    24.786  27.300    10.633   1.00  6.13   APEP
ATOM    1425  CG  TYR    181    24.460  26.483    11.863   1.00  8.18   APEP
ATOM    1426  CD1 TYR    181    24.984  25.201    12.027   1.00  9.63   APEP
ATOM    1427  CE1 TYR    181    24.706  24.450    13.172   1.00  8.66   APEP
ATOM    1428  CD2 TYR    181    23.643  26.999    12.876   1.00  8.34   APEP
ATOM    1429  CE2 TYR    181    23.360  26.257    14.020   1.00  7.46   APEP
ATOM    1430  CZ  TYR    181    23.896  24.986    14.161   1.00  8.38   APEP
ATOM    1431  OH  TYR    181    23.634  24.244    15.293   1.00  8.05   APEP
ATOM    1432  C   TYR    181    23.695  25.719    9.022    1.00  7.08   APEP
ATOM    1433  O   TYR    181    22.728  25.001    9.262    1.00  7.97   APEP
ATOM    1434  N   ILE    182    24.743  25.303    8.323    1.00  8.25   APEP
ATOM    1435  CA  ILE    182    24.814  23.948    7.804    1.00  7.94   APEP
ATOM    1436  CB  ILE    182    25.011  23.959    6.293    1.00  9.43   APEP
ATOM    1437  CG2 ILE    182    24.641  22.599    5.713    1.00  9.49   APEP
ATOM    1438  CG1 ILE    182    24.147  25.065    5.680    1.00  9.61   APEP
ATOM    1439  CD1 ILE    182    24.502  25.429    4.278    1.00  7.05   APEP
ATOM    1440  C   ILE    182    25.961  23.184    8.445    1.00  8.67   APEP
ATOM    1441  O   ILE    182    27.112  23.588    8.333    1.00  8.62   APEP
ATOM    1442  N   GLN    183    25.642  22.084    9.122    1.00  6.39   APEP
ATOM    1443  CA  GLN    183    26.657  21.271    9.776    1.00  7.60   APEP
ATOM    1444  CB  GLN    183    26.485  21.313    11.304   1.00  8.26   APEP
ATOM    1445  CG  GLN    183    27.184  20.160    12.059   1.00  11.17  APEP
ATOM    1446  CD  GLN    183    26.842  20.105    13.560   1.00  10.23  APEP
ATOM    1447  OE1 GLN    183    25.927  20.779    14.029   1.00  13.96  APEP
ATOM    1448  NE2 GLN    183    27.578  19.293    14.304   1.00  9.47   APEP
ATOM    1449  C   GLN    183    26.603  19.824    9.308    1.00  6.95   APEP
ATOM    1450  O   GLN    183    25.653  19.096    9.602    1.00  4.41   APEP
ATOM    1451  N   GLU    184    27.624  19.404    8.576    1.00  6.92   APEP
ATOM    1452  CA  GLU    184    27.685  18.025    8.123    1.00  7.66   APEP
ATOM    1453  CB  GLU    184    27.885  17.120    9.349    1.00  9.14   APEP
ATOM    1454  CG  GLU    184    29.110  17.551    10.172   1.00  8.94   APEP
ATOM    1455  CD  GLU    184    29.207  16.912    11.558   1.00  12.48  APEP
ATOM    1456  OE1 GLU    184    28.235  16.963    12.340   1.00  13.16  APEP
ATOM    1457  OE2 GLU    184    30.278  16.361    11.869   1.00  15.28  APEP
ATOM    1458  C   GLU    184    26.447  17.645    7.316    1.00  6.36   APEP
ATOM    1459  O   GLU    184    25.858  16.581    7.493    1.00  4.35   APEP
ATOM    1460  N   LYS    185    26.089  18.560    6.417    1.00  8.43   APEP
ATOM    1461  CA  LYS    185    24.956  18.451    5.504    1.00  10.57  APEP
ATOM    1462  CB  LYS    185    25.054  17.165    4.685    1.00  12.55  APEP
ATOM    1463  CG  LYS    185    25.705  17.371    3.331    1.00  16.19  APEP
ATOM    1464  CD  LYS    185    26.930  16.498    3.173    1.00  20.18  APEP
ATOM    1465  CE  LYS    185    26.783  15.553  1.990    1.00 22.27  APEP
ATOM    1466  NZ  LYS    185    25.360  15.182  1.744    1.00 25.09  APEP
ATOM    1467  C   LYS    185    23.571  18.567  6.131    1.00 10.92  APEP
ATOM    1468  O   LYS    185    22.566  18.219  5.509    1.00 10.67  APEP
ATOM    1469  N   TRP    186    23.519  19.062  7.362    1.00 10.21  APEP
ATOM    1470  CA  TRP    186    22.250  19.252  8.039    1.00 9.13   APEP
ATOM    1471  CB  TRP    186    22.297  18.677  9.461    1.00 8.92   APEP
ATOM    1472  CG  TRP    186    22.105  17.173  9.563    1.00 7.23   APEP
ATOM    1473  CD2 TRP    186    20.883  16.433  9.380    1.00 7.44   APEP
ATOM    1474  CE2 TRP    186    21.179  15.070  9.624    1.00 7.10   APEP
ATOM    1475  CE3 TRP    186    19.569  16.787  9.036    1.00 7.24   APEP
ATOM    1476  CD1 TRP    186    23.057  16.253  9.895    1.00 7.55   APEP
ATOM    1477  NE1 TRP    186    22.510  14.991  9.934    1.00 7.21   APEP
ATOM    1478  CZ2 TRP    186    20.209  14.061  9.536    1.00 4.65   APEP
ATOM    1479  CZ3 TRP    186    18.602  15.776  8.950    1.00 5.07   APEP
ATOM    1480  CH2 TRP    186    18.934  14.430  9.198    1.00 4.34   APEP
ATOM    1481  C   TRP    186    22.029  20.757  8.097    1.00 9.22   APEP
ATOM    1482  O   TRP    186    22.895  21.495  8.547    1.00 10.78  APEP
ATOM    1483  N   HIS    187    20.876  21.214  7.622    1.00 11.53  APEP
ATOM    1484  CA  HIS    187    20.555  22.637  7.642    1.00 10.59  APEP
ATOM    1485  CB  HIS    187    19.773  23.005  6.375    1.00 11.28  APEP
ATOM    1486  CG  HIS    187    20.381  22.455  5.119    1.00 12.80  APEP
ATOM    1487  CD2 HIS    187    20.511  21.183  4.674    1.00 13.63  APEP
ATOM    1488  ND1 HIS    187    20.984  23.254  4.170    1.00 14.63  APEP
ATOM    1489  CE1 HIS    187    21.463  22.497  3.198    1.00 14.97  APEP
ATOM    1490  NE2 HIS    187    21.189  21.236  3.480    1.00 14.98  APEP
ATOM    1491  C   HIS    187    19.738  22.910  8.904    1.00 8.99   APEP
ATOM    1492  O   HIS    187    18.636  22.408  9.058    1.00 10.40  APEP
ATOM    1493  N   LYS    188    20.287  23.700  9.817    1.00 10.12  APEP
ATOM    1494  CA  LYS    188    19.593  23.970  11.068   1.00 9.30   APEP
ATOM    1495  CB  LYS    188    20.403  23.413  12.251   1.00 10.66  APEP
ATOM    1496  CG  LYS    188    21.395  22.314  11.909   1.00 7.22   APEP
ATOM    1497  CD  LYS    188    21.627  21.422  13.118   1.00 8.34   APEP
ATOM    1498  CE  LYS    188    22.696  20.369  12.871   1.00 9.03   APEP
ATOM    1499  NZ  LYS    188    23.268  19.865  14.162   1.00 13.31  APEP
ATOM    1500  C   LYS    188    19.289  25.428  11.349   1.00 7.81   APEP
ATOM    1501  O   LYS    188    19.988  26.328  10.890   1.00 9.61   APEP
ATOM    1502  N   HIS    189    18.216  25.646  12.097   1.00 9.34   APEP
ATOM    1503  CA  HIS    189    17.823  26.977  12.532   1.00 9.56   APEP
ATOM    1504  CB  HIS    189    16.391  27.315  12.119   1.00 9.45   APEP
ATOM    1505  CG  HIS    189    16.033  28.756  12.331   1.00 11.25  APEP
ATOM    1506  CD2 HIS    189    16.739  29.777  12.870   1.00 11.06  APEP
ATOM    1507  ND1 HIS    189    14.822  29.291  11.946   1.00 13.10  APEP
ATOM    1508  CE1 HIS    189    14.800  30.579  12.237   1.00 11.47  APEP
ATOM    1509  NE2 HIS    189    15.950  30.900  12.799   1.00 12.33  APEP
ATOM    1510  C   HIS    189    17.911  26.904  14.049   1.00 9.30   APEP
ATOM    1511  O   HIS    189    17.265  26.060  14.671   1.00 9.01   APEP
ATOM    1512  N   TYR    190    18.717  27.781  14.635   1.00 10.00  APEP
ATOM    1513  CA  TYR    190    18.928  27.816  16.080   1.00 9.41   APEP
ATOM    1514  CB  TYR    190    20.433  27.745  16.343   1.00 11.08  APEP
ATOM    1515  CG  TYR    190    20.872  27.618  17.788   1.00 11.54  APEP
ATOM    1516  CD1 TYR    190    20.017  27.124  18.777   1.00 11.05  APEP
ATOM    1517  CE1 TYR    190    20.458  26.983  20.108   1.00 10.64  APEP
ATOM    1518  CD2 TYR    190    22.173  27.971  18.157   1.00 11.80  APEP
ATOM    1519  CE2 TYR    190    22.618  27.835  19.467   1.00 12.63  APEP
ATOM    1520  CZ  TYR    190    21.767  27.342  20.435   1.00 11.58  APEP
ATOM    1521  OH  TYR    190    22.257  27.190  21.713   1.00 12.58  APEP
ATOM    1522  C   TYR    190    18.337  29.076  16.716  1.00  8.19   APEP
ATOM    1523  O   TYR    190    18.803  30.184  16.456  1.00  6.34   APEP
ATOM    1524  N   LEU    191    17.313  28.895  17.549  1.00  7.47   APEP
ATOM    1525  CA  LEU    191    16.656  30.011  18.226  1.00  8.92   APEP
ATOM    1526  CB  LEU    191    15.151  30.001  17.926  1.00  8.75   APEP
ATOM    1527  CG  LEU    191    14.308  31.101  18.599  1.00  11.51  APEP
ATOM    1528  CD1 LEU    191    14.540  32.444  17.916  1.00  9.71   APEP
ATOM    1529  CD2 LEU    191    12.831  30.724  18.541  1.00  9.30   APEP
ATOM    1530  C   LEU    191    16.890  29.996  19.743  1.00  9.50   APEP
ATOM    1531  O   LEU    191    16.667  28.988  20.416  1.00  11.01  APEP
ATOM    1532  N   VAL    192    17.347  31.128  20.266  1.00  9.30   APEP
ATOM    1533  CA  VAL    192    17.629  31.291  21.690  1.00  10.13  APEP
ATOM    1534  CB  VAL    192    19.145  31.536  21.923  1.00  10.96  APEP
ATOM    1535  CG1 VAL    192    19.387  32.044  23.344  1.00  11.81  APEP
ATOM    1536  CG2 VAL    192    19.934  30.267  21.659  1.00  11.43  APEP
ATOM    1537  C   VAL    192    16.875  32.510  22.231  1.00  10.34  APEP
ATOM    1538  O   VAL    192    17.078  33.621  21.745  1.00  10.10  APEP
ATOM    1539  N   CYS    193    16.009  32.315  23.226  1.00  8.18   APEP
ATOM    1540  CA  CYS    193    15.276  33.442  23.810  1.00  8.37   APEP
ATOM    1541  C   CYS    193    15.600  33.609  25.296  1.00  8.44   APEP
ATOM    1542  O   CYS    193    15.514  32.650  26.061  1.00  6.27   APEP
ATOM    1543  CB  CYS    193    13.762  33.258  23.649  1.00  9.08   APEP
ATOM    1544  SG  CYS    193    13.062  33.556  21.985  1.00  8.61   APEP
ATOM    1545  N   ASN    194    15.978  34.826  25.694  1.00  8.32   APEP
ATOM    1546  CA  ASN    194    16.310  35.133  27.086  1.00  7.48   APEP
ATOM    1547  CB  ASN    194    17.582  35.991  27.149  1.00  8.69   APEP
ATOM    1548  CG  ASN    194    18.840  35.190  26.868  1.00  6.67   APEP
ATOM    1549  OD1 ASN    194    18.772  33.995  26.596  1.00  9.58   APEP
ATOM    1550  ND2 ASN    194    19.989  35.843  26.932  1.00  4.71   APEP
ATOM    1551  C   ASN    194    15.140  35.859  27.766  1.00  7.75   APEP
ATOM    1552  O   ASN    194    14.540  36.760  27.175  1.00  5.25   APEP
ATOM    1553  N   TYR    195    14.834  35.475  29.009  1.00  7.83   APEP
ATOM    1554  CA  TYR    195    13.699  36.047  29.749  1.00  7.00   APEP
ATOM    1555  CB  TYR    195    12.736  34.924  30.138  1.00  6.30   APEP
ATOM    1556  CG  TYR    195    12.180  34.180  28.949  1.00  8.42   APEP
ATOM    1557  CD1 TYR    195    12.918  33.175  28.329  1.00  7.89   APEP
ATOM    1558  CE1 TYR    195    12.436  32.510  27.219  1.00  8.54   APEP
ATOM    1559  CD2 TYR    195    10.934  34.501  28.422  1.00  6.50   APEP
ATOM    1560  CE2 TYR    195    10.438  33.835  27.300  1.00  8.99   APEP
ATOM    1561  CZ  TYR    195    11.199  32.837  26.707  1.00  8.08   APEP
ATOM    1562  OH  TYR    195    10.724  32.142  25.617  1.00  8.91   APEP
ATOM    1563  C   TYR    195    14.047  36.860  30.999  1.00  6.48   APEP
ATOM    1564  O   TYR    195    14.840  36.422  31.822  1.00  7.26   APEP
ATOM    1565  N   GLY    196    13.418  38.025  31.154  1.00  6.42   APEP
ATOM    1566  CA  GLY    196    13.709  38.867  32.303  1.00  6.88   APEP
ATOM    1567  C   GLY    196    12.558  39.431  33.131  1.00  8.03   APEP
ATOM    1568  O   GLY    196    11.649  40.075  32.596  1.00  8.29   APEP
ATOM    1569  N   PRO    197    12.541  39.157  34.445  1.00  6.50   APEP
ATOM    1570  CD  PRO    197    11.525  39.698  35.363  1.00  7.41   APEP
ATOM    1571  CA  PRO    197    13.536  38.343  35.153  1.00  6.68   APEP
ATOM    1572  CB  PRO    197    13.300  38.688  36.610  1.00  6.91   APEP
ATOM    1573  CG  PRO    197    11.856  39.041  36.672  1.00  6.39   APEP
ATOM    1574  C   PRO    197    13.266  36.868  34.854  1.00  6.69   APEP
ATOM    1575  O   PRO    197    12.255  36.537  34.238  1.00  6.02   APEP
ATOM    1576  N   SER    198    14.153  35.975  35.286  1.00  7.01   APEP
ATOM    1577  CA  SER    198    13.953  34.557  35.001  1.00  7.41   APEP
ATOM    1578  CB  SER    198    15.233  33.755  35.303  1.00  4.71   APEP
ATOM    1579  OG  SER    198    15.558  33.752  36.682  1.00  11.52  APEP
ATOM    1580  C   SER    198    12.765  33.927  35.717  1.00  7.39   APEP
ATOM    1581  O   SER    198    12.161  34.528  36.605  1.00  6.19   APEP
ATOM    1582  N   GLY    199    12.423  32.716  35.289  1.00  7.86   APEP
ATOM    1583  CA  GLY    199    11.332  31.977  35.893  1.00  8.49   APEP
ATOM    1584  C   GLY    199    11.894  30.622  36.274  1.00  8.12   APEP
ATOM    1585  O   GLY    199    13.110  30.450  36.306  1.00  8.44   APEP
ATOM    1586  N   ASN    200    11.022  29.670  36.570  1.00  9.40   APEP
ATOM    1587  CA  ASN    200    11.433  28.317  36.929  1.00  11.14  APEP
ATOM    1588  CB  ASN    200    12.344  27.742  35.844  1.00  11.38  APEP
ATOM    1589  CG  ASN    200    11.581  27.365  34.591  1.00  12.36  APEP
ATOM    1590  OD1 ASN    200    10.360  27.478  34.550  1.00  13.35  APEP
ATOM    1591  ND2 ASN    200    12.293  26.919  33.566  1.00  10.02  APEP
ATOM    1592  C   ASN    200    12.102  28.177  38.296  1.00  12.89  APEP
ATOM    1593  O   ASN    200    13.019  27.373  38.477  1.00  12.94  APEP
ATOM    1594  N   PHE    201    11.632  28.957  39.262  1.00  14.46  APEP
ATOM    1595  CA  PHE    201    12.157  28.890  40.622  1.00  16.00  APEP
ATOM    1596  CB  PHE    201    11.947  30.224  41.339  1.00  14.75  APEP
ATOM    1597  CG  PHE    201    12.805  31.338  40.811  1.00  13.67  APEP
ATOM    1598  CD1 PHE    201    12.267  32.311  39.982  1.00  13.83  APEP
ATOM    1599  CD2 PHE    201    14.151  31.421  41.157  1.00  17.70  APEP
ATOM    1600  CE1 PHE    201    13.047  33.350  39.505  1.00  14.74  APEP
ATOM    1601  CE2 PHE    201    14.948  32.460  40.685  1.00  17.45  APEP
ATOM    1602  CZ  PHE    201    14.394  33.427  39.857  1.00  17.09  APEP
ATOM    1603  C   PHE    201    11.347  27.786  41.304  1.00  16.58  APEP
ATOM    1604  O   PHE    201    10.124  27.876  41.385  1.00  16.44  APEP
ATOM    1605  N   LYS    202    12.026  26.755  41.797  1.00  18.81  APEP
ATOM    1606  CA  LYS    202    11.351  25.617  42.421  1.00  21.27  APEP
ATOM    1607  CB  LYS    202    12.386  24.588  42.883  1.00  25.00  APEP
ATOM    1608  CG  LYS    202    12.314  23.274  42.101  1.00  29.78  APEP
ATOM    1609  CD  LYS    202    13.215  22.197  42.698  1.00  31.92  APEP
ATOM    1610  CE  LYS    202    12.574  20.816  42.609  1.00  32.51  APEP
ATOM    1611  NZ  LYS    202    12.138  20.304  43.944  1.00  30.68  APEP
ATOM    1612  C   LYS    202    10.365  25.899  43.555  1.00  21.29  APEP
ATOM    1613  O   LYS    202    9.347   25.218  43.676  1.00  22.50  APEP
ATOM    1614  N   ASN    203    10.642  26.894  44.385  1.00  20.90  APEP
ATOM    1615  CA  ASN    203    9.726   27.190  45.485  1.00  22.00  APEP
ATOM    1616  CB  ASN    203    10.520  27.657  46.711  1.00  23.02  APEP
ATOM    1617  CG  ASN    203    11.274  28.953  46.466  1.00  23.60  APEP
ATOM    1618  OD1 ASN    203    11.559  29.698  47.401  1.00  24.95  APEP
ATOM    1619  ND2 ASN    203    11.605  29.223  45.209  1.00  25.38  APEP
ATOM    1620  C   ASN    203    8.656   28.232  45.134  1.00  20.82  APEP
ATOM    1621  O   ASN    203    8.096   28.877  46.025  1.00  20.77  APEP
ATOM    1622  N   GLU    204    8.363   28.384  43.845  1.00  16.60  APEP
ATOM    1623  CA  GLU    204    7.382   29.372  43.414  1.00  17.29  APEP
ATOM    1624  CB  GLU    204    8.093   30.550  42.737  1.00  17.84  APEP
ATOM    1625  CG  GLU    204    9.303   31.084  43.489  1.00  17.21  APEP
ATOM    1626  CD  GLU    204    9.801   32.408  42.937  1.00  17.35  APEP
ATOM    1627  OE1 GLU    204    9.157   32.963  42.023  1.00  15.88  APEP
ATOM    1628  OE2 GLU    204    10.842  32.895  43.422  1.00  17.79  APEP
ATOM    1629  C   GLU    204    6.298   28.842  42.475  1.00  17.89  APEP
ATOM    1630  O   GLU    204    6.383   27.727  41.963  1.00  16.49  APEP
ATOM    1631  N   GLU    205    5.283   29.672  42.251  1.00  19.78  APEP
ATOM    1632  CA  GLU    205    4.159   29.335  41.383  1.00  20.21  APEP
ATOM    1633  CB  GLU    205    2.851   29.854  41.992  1.00  23.42  APEP
ATOM    1634  CG  GLU    205    2.609   31.347  41.772  1.00  28.77  APEP
ATOM    1635  CD  GLU    205    2.874   32.176  43.022  1.00  32.85  APEP
ATOM    1636  OE1 GLU    205    3.942    31.984  43.660  1.00 31.69  APEP
ATOM    1637  OE2 GLU    205    2.008    33.019  43.364  1.00 32.48  APEP
ATOM    1638  C   GLU    205    4.348    29.956  40.009  1.00 18.17  APEP
ATOM    1639  O   GLU    205    4.918    31.039  39.891  1.00 15.97  APEP
ATOM    1640  N   LEU    206    3.863    29.275  38.974  1.00 16.44  APEP
ATOM    1641  CA  LEU    206    3.983    29.785  37.617  1.00 15.66  APEP
ATOM    1642  CB  LEU    206    3.275    28.860  36.626  1.00 15.15  APEP
ATOM    1643  CG  LEU    206    3.869    27.478  36.368  1.00 12.15  APEP
ATOM    1644  CD1 LEU    206    3.189    26.871  35.173  1.00 9.94   APEP
ATOM    1645  CD2 LEU    206    5.370    27.579  36.148  1.00 10.37  APEP
ATOM    1646  C   LEU    206    3.333    31.155  37.561  1.00 15.68  APEP
ATOM    1647  O   LEU    206    3.928    32.125  37.076  1.00 16.18  APEP
ATOM    1648  N   TYR    207    2.105    31.217  38.065  1.00 14.52  APEP
ATOM    1649  CA  TYR    207    1.332    32.451  38.090  1.00 15.05  APEP
ATOM    1650  CB  TYR    207    0.742    32.746  36.705  1.00 12.49  APEP
ATOM    1651  CG  TYR    207    -0.046   31.604  36.083  1.00 12.80  APEP
ATOM    1652  CD1 TYR    207    -1.379   31.365  36.441  1.00 13.16  APEP
ATOM    1653  CE1 TYR    207    -2.113   30.327  35.856  1.00 12.28  APEP
ATOM    1654  CD2 TYR    207    0.533    30.774  35.120  1.00 14.06  APEP
ATOM    1655  CE2 TYR    207    -0.195   29.731  34.528  1.00 14.10  APEP
ATOM    1656  CZ  TYR    207    -1.513   29.515  34.903  1.00 12.49  APEP
ATOM    1657  OH  TYR    207    -2.220   28.487  34.332  1.00 12.47  APEP
ATOM    1658  C   TYR    207    0.206    32.331  39.113  1.00 14.67  APEP
ATOM    1659  O   TYR    207    -0.088   31.244  39.595  1.00 15.57  APEP
ATOM    1660  N   GLN    208    -0.425   33.453  39.432  1.00 15.61  APEP
ATOM    1661  CA  GLN    208    -1.523   33.466  40.393  1.00 15.81  APEP
ATOM    1662  CB  GLN    208    -1.733   34.892  40.896  1.00 14.83  APEP
ATOM    1663  CG  GLN    208    -2.440   34.994  42.231  1.00 16.28  APEP
ATOM    1664  CD  GLN    208    -2.843   36.418  42.564  1.00 16.96  APEP
ATOM    1665  OE1 GLN    208    -2.074   37.364  42.352  1.00 16.63  APEP
ATOM    1666  NE2 GLN    208    -4.051   36.581  43.086  1.00 16.21  APEP
ATOM    1667  C   GLN    208    -2.809   32.947  39.739  1.00 17.01  APEP
ATOM    1668  O   GLN    208    -3.243   33.469  38.717  1.00 14.76  APEP
ATOM    1669  N   THR    209    -3.422   31.921  40.316  1.00 19.39  APEP
ATOM    1670  CA  THR    209    -4.649   31.392  39.736  1.00 23.16  APEP
ATOM    1671  CB  THR    209    -4.792   29.877  39.953  1.00 23.21  APEP
ATOM    1672  OG1 THR    209    -5.010   29.617  41.343  1.00 27.25  APEP
ATOM    1673  CG2 THR    209    -3.559   29.151  39.496  1.00 23.39  APEP
ATOM    1674  C   THR    209    -5.873   32.063  40.340  1.00 25.33  APEP
ATOM    1675  O   THR    209    -5.868   32.455  41.505  1.00 25.28  APEP
ATOM    1676  N   LYS    210    -6.922   32.188  39.536  1.00 27.53  APEP
ATOM    1677  CA  LYS    210    -8.160   32.801  39.986  1.00 29.31  APEP
ATOM    1678  CB  LYS    210    -8.491   34.019  39.122  1.00 30.03  APEP
ATOM    1679  CG  LYS    210    -8.643   33.696  37.647  1.00 28.82  APEP
ATOM    1680  CD  LYS    210    -9.575   34.675  36.963  1.00 29.76  APEP
ATOM    1681  CE  LYS    210    -8.897   35.345  35.771  1.00 28.88  APEP
ATOM    1682  NZ  LYS    210    -9.500   36.669  35.437  1.00 28.04  APEP
ATOM    1683  C   LYS    210    -9.272   31.775  39.873  1.00 31.66  APEP
ATOM    1684  OT1 LYS    210    -10.171  31.775  40.744  1.00 33.57  APEP
ATOM    1685  OT2 LYS    210    -9.224   30.981  38.906  1.00 33.91  APEP
ATOM    1686  OH2 WAT    1001    28.321  31.884  30.023  1.00 4.99   AWAT
ATOM    1687  OH2 WAT    1002    0.070   28.637  38.280  1.00 5.19   AWAT
ATOM    1688  OH2 WAT    1003    9.574   34.984  40.199  1.00 6.03   AWAT
ATOM    1689  OH2 WAT    1004    13.423  28.241  4.674   1.00 6.60   AWAT
ATOM    1690  OH2 WAT    1005    25.593  14.211  8.905   1.00 9.08   AWAT
ATOM    1691  OH2 WAT    1006    -5.948  28.133  30.378  1.00 7.55   AWAT
ATOM    1692  OH2 WAT    1007    13.729  27.746  30.599  1.00 8.15   AWAT
ATOM    1693  OH2 WAT  1008    22.453  33.974  26.365  1.00  6.87   AWAT
ATOM    1694  OH2 WAT  1009    11.644  46.107  27.594  1.00  4.61   AWAT
ATOM    1695  OH2 WAT  1010    -0.650  26.162  33.901  1.00  8.02   AWAT
ATOM    1696  OH2 WAT  1011    8.755   23.060  34.455  1.00  10.12  AWAT
ATOM    1697  OH2 WAT  1012    10.789  39.348  8.288   1.00  3.59   AWAT
ATOM    1698  OH2 WAT  1013    28.091  15.737  14.912  1.00  8.00   AWAT
ATOM    1699  OH2 WAT  1015    16.397  43.678  19.387  1.00  2.04   AWAT
ATOM    1700  OH2 WAT  1016    14.311  29.731  32.127  1.00  5.53   AWAT
ATOM    1701  OH2 WAT  1017    2.570   41.167  21.545  1.00  5.42   AWAT
ATOM    1702  OH2 WAT  1018    25.364  28.506  21.332  1.00  9.41   AWAT
ATOM    1703  OH2 WAT  1019    26.107  50.461  26.214  1.00  5.64   AWAT
ATOM    1704  OH2 WAT  1020    30.469  46.598  34.207  1.00  7.23   AWAT
ATOM    1705  OH2 WAT  1021    30.251  20.969  8.904   1.00  13.93  AWAT
ATOM    1706  OH2 WAT  1022    -4.476  37.486  34.043  1.00  7.76   AWAT
ATOM    1707  OH2 WAT  1023    31.770  27.794  19.020  1.00  13.29  AWAT
ATOM    1708  OH2 WAT  1024    17.644  44.091  30.228  1.00  8.53   AWAT
ATOM    1709  OH2 WAT  1025    -6.207  19.852  35.253  1.00  17.83  AWAT
ATOM    1710  OH2 WAT  1026    14.737  24.657  10.954  1.00  12.71  AWAT
ATOM    1711  OH2 WAT  1027    3.824   43.790  24.674  1.00  11.15  AWAT
ATOM    1712  OH2 WAT  1028    7.499   17.209  26.860  1.00  18.25  AWAT
ATOM    1713  OH2 WAT  1029    0.968   25.199  21.221  1.00  13.34  AWAT
ATOM    1714  OH2 WAT  1030    11.738  36.462  38.807  1.00  14.39  AWAT
ATOM    1715  OH2 WAT  1031    5.648   34.014  38.427  1.00  9.11   AWAT
ATOM    1716  OH2 WAT  1032    1.664   14.320  37.328  1.00  15.77  AWAT
ATOM    1717  OH2 WAT  1033    31.940  28.802  10.755  1.00  8.72   AWAT
ATOM    1718  OH2 WAT  1034    5.832   22.098  18.171  1.00  6.17   AWAT
ATOM    1719  OH2 WAT  1035    33.701  30.509  31.974  1.00  18.85  AWAT
ATOM    1720  OH2 WAT  1036    29.165  34.668  37.418  1.00  10.68  AWAT
ATOM    1721  OH2 WAT  1037    -0.407  43.489  29.418  1.00  8.15   AWAT
ATOM    1722  OH2 WAT  1038    30.861  44.589  26.320  1.00  13.36  AWAT
ATOM    1723  OH2 WAT  1039    8.345   41.081  37.778  1.00  13.31  AWAT
ATOM    1724  OH2 WAT  1040    10.895  22.815  23.399  1.00  20.54  AWAT
ATOM    1725  OH2 WAT  1041    31.503  42.501  27.942  1.00  12.75  AWAT
ATOM    1726  OH2 WAT  1042    -4.123  17.556  26.927  1.00  6.26   AWAT
ATOM    1727  OH2 WAT  1043    23.631  25.350  17.618  1.00  16.68  AWAT
ATOM    1728  OH2 WAT  1044    -9.263  19.789  28.769  1.00  17.07  AWAT
ATOM    1729  OH2 WAT  1045    2.681   26.188  40.094  1.00  10.27  AWAT
ATOM    1730  OH2 WAT  1046    6.157   33.281  40.876  1.00  10.99  AWAT
ATOM    1731  OH2 WAT  1047    1.411   42.305  11.357  1.00  12.65  AWAT
ATOM    1732  OH2 WAT  1048    11.027  43.128  8.836   1.00  13.35  AWAT
ATOM    1733  OH2 WAT  1049    8.163   26.637  9.371   1.00  9.12   AWAT
ATOM    1734  OH2 WAT  1050    30.812  52.897  21.367  1.00  5.26   AWAT
ATOM    1735  OH2 WAT  1051    -1.056  38.906  21.594  1.00  21.26  AWAT
ATOM    1736  OH2 WAT  1052    23.484  37.806  38.523  1.00  5.01   AWAT
ATOM    1737  OH2 WAT  1053    16.091  23.219  9.132   1.00  9.59   AWAT
ATOM    1738  OH2 WAT  1054    10.515  44.724  16.202  1.00  21.22  AWAT
ATOM    1739  OH2 WAT  1055    3.858   42.457  19.188  1.00  18.71  AWAT
ATOM    1740  OH2 WAT  1056    20.767  38.301  29.092  1.00  7.32   AWAT
ATOM    1741  OH2 WAT  1057    31.450  37.717  33.751  1.00  12.78  AWAT
ATOM    1742  OH2 WAT  1058    -6.469  15.556  29.885  1.00  18.83  AWAT
ATOM    1743  OH2 WAT  1059    19.569  32.500  35.567  1.00  13.66  AWAT
ATOM    1744  OH2 WAT  1060    12.883  32.203  45.018  1.00  19.55  AWAT
ATOM    1745  OH2 WAT  1061    16.666  38.811  39.230  1.00  12.36  AWAT
ATOM    1746  OH2 WAT  1062    1.627   24.661  38.597  1.00  11.62  AWAT
ATOM    1747  OH2 WAT  1063    -3.797  23.480  20.462  1.00  13.70  AWAT
ATOM    1748  OH2 WAT  1064    19.662  43.909  20.583  1.00  17.87  AWAT
ATOM    1749  OH2 WAT  1065    28.959  36.788  18.981  1.00  20.15  AWAT
ATOM    1750  OH2 WAT  1066    15.034  47.186  24.909  1.00 7.01   AWAT
ATOM    1751  OH2 WAT  1067    1.479   45.140  16.462  1.00 15.19  AWAT
ATOM    1752  OH2 WAT  1068    -9.159  26.374  32.728  1.00 10.66  AWAT
ATOM    1753  OH2 WAT  1069    18.343  40.026  15.719  1.00 11.74  AWAT
ATOM    1754  OH2 WAT  1070    -4.926  34.883  22.765  1.00 5.57   AWAT
ATOM    1755  OH2 WAT  1071    11.439  44.250  34.445  1.00 17.87  AWAT
ATOM    1756  OH2 WAT  1072    22.346  33.157  38.515  1.00 15.02  AWAT
ATOM    1757  OH2 WAT  1073    16.431  21.026  -0.735  1.00 17.18  AWAT
ATOM    1758  OH2 WAT  1074    17.273  13.097  2.769   1.00 16.44  AWAT
ATOM    1759  OH2 WAT  1075    20.717  41.158  18.875  1.00 11.16  AWAT
ATOM    1760  OH2 WAT  1076    13.429  19.165  10.121  1.00 9.99   AWAT
ATOM    1761  OH2 WAT  1077    22.253  23.110  28.097  1.00 14.11  AWAT
ATOM    1762  OH2 WAT  1078    -1.729  14.634  27.851  1.00 9.23   AWAT
ATOM    1763  OH2 WAT  1079    16.196  36.453  9.936   1.00 18.57  AWAT
ATOM    1764  OH2 WAT  1080    26.774  40.940  39.176  1.00 15.71  AWAT
ATOM    1765  OH2 WAT  1081    27.996  20.266  5.357   1.00 3.12   AWAT
ATOM    1766  OH2 WAT  1082    14.345  44.903  9.828   1.00 16.53  AWAT
ATOM    1767  OH2 WAT  1083    -6.956  19.549  24.667  1.00 13.41  AWAT
ATOM    1768  OH2 WAT  1084    6.677   22.676  16.370  1.00 9.78   AWAT
ATOM    1769  OH2 WAT  1085    24.055  17.307  14.279  1.00 9.70   AWAT
ATOM    1770  OH2 WAT  1086    32.348  29.000  20.500  1.00 15.00  AWAT
ATOM    1771  OH2 WAT  1087    -6.421  34.306  42.856  1.00 13.87  AWAT
ATOM    1772  OH2 WAT  1088    28.806  26.184  27.568  1.00 16.70  AWAT
ATOM    1773  OH2 WAT  1089    9.354   17.475  43.914  1.00 16.99  AWAT
ATOM    1774  OH2 WAT  1090    30.672  20.876  12.987  1.00 21.44  AWAT
ATOM    1775  OH2 WAT  1091    -7.795  23.654  35.198  1.00 12.77  AWAT
ATOM    1776  OH2 WAT  1092    6.675   42.663  7.635   1.00 17.23  AWAT
ATOM    1777  OH2 WAT  1093    14.348  49.247  34.229  1.00 10.41  AWAT
ATOM    1778  OH2 WAT  1094    -2.481  40.065  24.802  1.00 16.54  AWAT
ATOM    1779  OH2 WAT  1095    -5.184  39.229  18.838  1.00 28.58  AWAT
ATOM    1780  OH2 WAT  1096    -6.282  29.165  17.208  1.00 27.91  AWAT
ATOM    1781  OH2 WAT  1097    3.526   19.041  19.713  1.00 16.33  AWAT
ATOM    1782  OH2 WAT  1098    -5.490  40.336  27.666  1.00 20.30  AWAT
ATOM    1783  OH2 WAT  1099    5.791   43.554  30.434  1.00 14.00  AWAT
ATOM    1784  OH2 WAT  1100    10.085  34.242  9.352   1.00 19.88  AWAT
ATOM    1785  OH2 WAT  1101    22.752  37.487  8.325   1.00 16.96  AWAT
ATOM    1786  OH2 WAT  1102    22.364  40.020  38.129  1.00 15.64  AWAT
ATOM    1787  OH2 WAT  1103    33.666  37.537  19.756  1.00 23.15  AWAT
ATOM    1788  OH2 WAT  1104    36.579  34.638  23.256  1.00 16.03  AWAT
ATOM    1789  OH2 WAT  1105    31.645  31.136  11.971  1.00 18.60  AWAT
ATOM    1790  OH2 WAT  1106    14.823  26.519  41.694  1.00 15.23  AWAT
ATOM    1791  OH2 WAT  1107    13.638  21.317  9.375   1.00 12.16  AWAT
ATOM    1792  OH2 WAT  1108    33.913  48.939  32.690  1.00 11.76  AWAT
ATOM    1793  OH2 WAT  1109    3 3.415 48.326  34.490  1.00 20.71  AWAT
ATOM    1794  OH2 WAT  1110    -8.560  41.287  43.725  1.00 12.63  AWAT
ATOM    1795  OH2 WAT  1111    22.656  24.209  0.884   1.00 17.46  AWAT
ATOM    1796  OH2 WAT  1112    2.716   41.252  15.063  1.00 19.18  AWAT
ATOM    1797  OH2 WAT  1113    30.635  31.007  7.714   1.00 10.21  AWAT
ATOM    1798  OH2 WAT  1114    14.815  22.010  39.023  1.00 27.49  AWAT
ATOM    1799  OH2 WAT  1115    33.286  47.303  24.007  1.00 12.66  AWAT
ATOM    1800  OH2 WAT  1116    14.042  33.412  10.622  1.00 10.91  AWAT
ATOM    1801  OH2 WAT  1117    20.195  27.499  32.658  1.00 18.38  AWAT
ATOM    1802  OH2 WAT  1118    31.215  17.825  13.678  1.00 17.20  AWAT
ATOM    1803  OH2 WAT  1119    30.831  21.030  11.086  1.00 17.97  AWAT
ATOM    1804  OH2 WAT  1120    30.910  27.311  25.284  1.00 17.48  AWAT
ATOM    1805  OH2 WAT  1121    6.259   13.355  26.082  1.00 21.34  AWAT
ATOM    1806  OH2 WAT  1122    34.780  29.659  15.089  1.00 23.24  AWAT
ATOM    1807  OH2 WAT  1123    33.170  28.242  23.488  1.00 16.58  AWAT
ATOM    1808  OH2 WAT  1124    0.913   40.672  41.455  1.00 17.75  AWAT
ATOM    1809  OH2 WAT  1125    25.393  36.689  42.266  1.00 22.18  AWAT
ATOM    1810  OH2 WAT  1126    21.923  40.748  15.035  1.00 20.08  AWAT
ATOM    1811  OH2 WAT  1127    -1.339  28.433  21.094  1.00 17.33  AWAT
ATOM    1812  OH2 WAT  1128    22.058  28.769  33.380  1.00 22.93  AWAT
ATOM    1813  OH2 WAT  1129    2.232   23.035  17.663  1.00 13.73  AWAT
ATOM    1814  OH2 WAT  1130    4.834   40.228  40.117  1.00 39.84  AWAT
ATOM    1815  OH2 WAT  1131    16.182  27.937  1.692   1.00 9.10   AWAT
ATOM    1816  OH2 WAT  1132    36.696  43.322  33.662  1.00 14.41  AWAT
ATOM    1817  NA  NAT  500     -4.312  15.332  28.374  1.00 11.67  ANAT
END
Ves v 5氨基酸残基的溶剂可及性在表7中给出。
表7
Ves v 5氨基酸的表面暴露
编号  AA    溶剂暴露
3     E     0.802
4     A     0.060
5     E     0.390
6     F     0.868
7     N     0.484
8     N     0.555
9     Y     0.033
10    C     0.412
11    K     0.978
12    I     0.225
13    K     0.951
14    C     0.038
15    L     0.714
16    K     1.000
17    G     0.143
18    G     0.275
19    V     0.445
20    H     0.016
21    T     0.000
22    A     0.049
23    C     0.209
24    K     0.489
25    Y     0.280
26    G     0.352
27    S     0.159
28    L     0.423
29    K     0.797
30    P     0.231
31    N     0.396
32    C     0.055
33    G     0.429
34    N       0.775
35    K       0.297
36    V       0.489
37    V       0.280
38    V       0.379
39    S       0.291
40    Y       0.593
41    G       0.165
42    L       0.121
43    T       0.423
44    K       0.978
45    Q       0.538
46    E       0.264
47    K       0.396
48    Q       0.593
49    D       0.302
50    I       0.000
51    L       0.198
52    K       0.615
53    E       0.170
54    H       0.000
55    N       0.115
56    D       0.445
57    F       0.027
58    R       0.000
59    Q       0.198
60    K       0.407
61    I       0.000
62    A       0.033
63    R       0.956
64    G       0.148
65    L       0.593
66    E       0.005
67    T       0.610
68    R       0.335
69    G       0.110
70    N       0.549
71    P       0.363
72    G       0.170
73    P       0.440
74    Q       0.005
75    P       0.209
76    P       0.236
77    A       0.022
78    K       0.775
79    N       0.236
80    M       0.066
81    K       0.588
82    N       0.500
83    L       0.016
84     V       0.462
85     W       0.275
86     N       0.165
87     D       0.621
88     E       0.247
89     L       0.005
90     A       0.055
91     Y       0.115
92     V       0.005
93     A       0.000
94     Q       0.159
95     V       0.011
96     W       0.077
97     A       0.000
98     N       0.005
99     Q       0.027
100    C       0.027
101    Q       0.577
102    Y       0.687
103    G       0.110
104    H       0.549
105    D       0.022
106    T       0.429
107    C       0.000
108    R       0.203
109    D       0.093
110    V       0.044
111    A       0.500
112    K       0.824
113    Y       0.209
114    Q       0.423
115    V       0.011
116    G       0.011
117    Q       0.066
118    N       0.005
119    V       0.022
120    A       0.016
121    L       0.198
122    T       0.198
123    G       0.231
124    S       0.236
125    T       0.610
126    A       0.253
127    A       0.379
128    K       0.857
129    Y       0.352
130    D       0.220
131    D       0.495
132    P       0.033
133    V       0.137
134    K      0.654
135    L      0.000
136    V      0.000
137    K      0.538
138    M      0.473
139    W      0.016
140    E      0.071
141    D      0.341
142    E      0.154
143    V      0.000
144    K      0.560
145    D      0.390
146    Y      0.044
147    N      0.165
148    P      0.214
149    K      0.868
150    K      0.604
151    K      0.753
152    F      0.071
153    S      0.302
154    G      0.192
155    N      0.121
156    D      0.379
157    F      0.819
158    L      0.714
159    K      0.533
160    T      0.000
161    G      0.077
162    H      0.231
163    Y      0.000
164    T      0.000
165    Q      0.011
166    M      0.000
167    V      0.000
168    W      0.005
169    A      0.011
170    N      0.429
171    T      0.000
172    K      0.451
173    E      0.165
174    V      0.000
175    G      0.000
176    C      0.016
177    G      0.000
178    S      0.016
179    I      0.000
180    K      0.214
181    Y      0.016
182    I      0.275
183    Q      0.231
184    E      0.841
185    K      0.989
186    W      0.665
187    H      0.159
188    K      0.203
189    H      0.011
190    Y      0.000
191    L      0.000
192    V      0.000
193    C      0.000
194    N      0.000
195    Y      0.000
196    G      0.000
197    P      0.225
198    S      0.110
199    G      0.027
200    N      0.308
201    F      0.341
202    K      0.824
203    N      0.797
204    E      0.374
205    E      0.511
206    L      0.055
207    Y      0.082
208    Q      0.566
209    T      0.473
210    K      0.962
实施例10 Ag 5s的比对
来自黄胡蜂属、长黄胡蜂属、胡蜂属、马蜂属和Solenopsis(火蚁)的选定抗原5序列的比对在图12中显示。黄胡蜂属、长黄胡蜂属、胡蜂属和马蜂属都属于胡蜂科。该图也包括Ves v 5的二级结构元件。当仅仅考虑黄胡蜂属抗原5s时,观察到非常高度的表面保守性(图5),残基的保守性几乎呈均匀的分布,仅有几个不保守残基分散于分子中。
相反,当比较来自黄胡蜂属和马蜂属的序列时,保守的表面局限在5个区域,它们分别具有392_2、589_2、589_2、673_2和1053_2的溶剂可及面积。溶剂可及性利用NACCESS程序计算(S.J.Hubbard和J.M.Thornton,1992,NACCESS(2.1.1版)生物化学和分子生物学系,UniversityCollege London),使用的探针半径为1.4_。类似地,在黄胡蜂属和胡蜂属/长黄胡蜂属之间对应于在黄胡蜂属和马蜂属之间保守的这5个表面区域的5个表面区域也是保守的。对于后者,所述区域分别为280_2、496_2、730_2、803_2和1043_2。对第一表面区域起作用的残基主要来自B链的开端和螺旋IV,对第二表面区域起作用的残基主要来自A链以及螺旋II和B链之间的环。对第三表面区域起作用的残基主要来自螺旋I及其周围环境和螺旋II的末尾,对第四表面区域起作用的残基主要是N-端来源的,而第五表面区域的残基主要来自螺旋I的末尾和螺旋I与A链之间的环。
                         讨论
蛋白质抗原-抗体复合体的晶体学研究表明表位的接触型残基可能包含抗原表面的多至17个残基,并且这些残基可以在肽链上彼此连续或不连续(Davies等人,1996,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)93:7)。用单克隆抗体对溶菌酶的表位作图显示该蛋白质的整个表面都具有潜在的抗原性(Newmann等人,1992,免疫学杂志(J.Immunol.)149:3260)。因此,具有1/10至3/4小黄蜂抗原5的杂合体会比亲本分子具有较少的表位。
图7中的CD光谱数据揭示杂合体与胡蜂抗原5s具有非常相似(即使不是相同)的二级结构。图8和图9中使用Ves v 5特异性人和小鼠抗体得到的抑制数据和表3中使用杂合体特异性抗体得到的抗体结合数据揭示,杂合体具有与Ves v 5非常相似或相同的三级结构,因为这些抗体不与变性的Ves v 5结合。另外的证据来自利用17个天然Ves v 5特异性单克隆小鼠IgG1抗体得到的筛选结果,其中6个结合N-端杂合体PV1-46。因此,这些数据说明杂合体含有Ves v 5的不连续B细胞表位。
利用多克隆抗体得到的抑制数据和利用单克隆抗体得到的结合数据显示,Ves v 5的显性B细胞表位在其N-端区域。对Ves v 5的结构检测显示,位于N-端杂合体PV1-46中的几乎所有残基都是表面可及的(参见表7)。这与C-端杂合体PV156-204相反,在PV156-204中,仅一些Ves v 5的片断是表面可及的(参见表7)。这种在表面可及性上的差异可以解释抗原5的N-端区域的免疫优势。其他人已证实蛋白质的全部表面都具有潜在的抗原性,但具有高表面可及性和表面突出的区域是显性的(Newmann等人,1992,免疫学杂志(J.Immunol)149:3260和Novotny等人,1996,Adv Prot Chem 49:149)。
目前,绘制不连续表位的唯一已知方法是Ag-Ab复合体的X射线晶体学(Davies等人,1996,美国国家科学院院报(Proc.Natl Acad.Sci USA)93:7),并且这需要拥有特异性单克隆抗体。已利用一系列小鼠-人杂合体绘制了CD39的不连续表位,小鼠和人CD39分子具有75%的序列同一性并且它们共同拥有有限的抗原交叉反应(Maliszewski等人,1994,免疫学杂志(J.Immunol)153:3574)。这些利用CD39和抗原5得到的发现显示两个同源蛋白质的杂合体是一种绘制它们的不连续B细胞表位的有用方法。
我们利用杂合体Ag 5s得到的结果证实,杂合变应原的变应原性可以有一百至一千倍的减少,而其又保留天然变应原的免疫原性。杂合体在变应原性上的这种减少据认为主要是由于B细胞表位密度的下降所致。实施例中的每一杂合体都仅具有Ves v 5的B细胞和T细胞表位的一部分。然而,原则上,杂合体的混合物可以重建Ves v 5的完整表位文库。因此,可以重建所有表位以制备用作疫苗的修饰的变应原。我们的结果提示具有Ves v 5的20-30个残基的PV杂合体在变应原性上会有最大的减少但又保留Ves v 5的免疫原性。
许多变应原与不同来源的蛋白质具有序列同源性(Larsen等人,1996,***反应临床免疫学杂志(J.Allergy Clin Immunol)97:577)。例如,胡蜂Ag 5s与不同生物体(从真菌到人类)来源的多种细胞外蛋白质具有不同程度的序列同源性(参见图12)。已经知道,具有30%序列同一性的同源蛋白质可能具有相同或非常相似的结构(Chothia等人,1990,生物化学年评(Annual Review Biochem)59:1007和Russell等人,1994,分子生物学杂志(J.Mol.Biol.)244:332)。因此,可以利用多种同源宿主蛋白质作为目的客变应原片断的支架来制备杂合体。
本发明并不限于此处描述的特定实施方案的范围。实际上,对本领域技术人员而言,根据上面的描述和附图,除了于此描述的之外,本发明的各种修饰是是显而易见的。这些修饰也应该在所附权利要求的范围之内。
于此引用的所有专利、申请、出版物、测试方法、文献和其它材料均特此全部引入作为参考。
表8:变应原
生物体  变应原  蛋白质  大小(kD)  C/Pa  参考/登录号
野草花粉
菊目(Asterales)
豚草(Ambrosia artemisiifolia)(short ragweed) Amb a1Amb a2Amb a3Amb a5Amb a6Amb a7Amb a? 抗原E抗原KRa3Ra5Ra6Ra7 3838115101211 CCCCPCC 8,208,212211,2324,252627
三裂豚草(Ambrosia trifida)(giant ragweed) Amb t5 Ra5G 4.4 C 9,10,28
艾蒿(Artemisiavulgaris)(mugwort) Art v1Art v2Art v3Art v4 27-29351214 CPPC 28A2953
向日葵(Helianthus annuus)(sunflower) Hel a1Hel a2 抑制蛋白 3415.7 C 29AY15210
Mercurialis annua Mer a1 抑制蛋白 14-15 C Y13271
石竹目(Caryophyllales)
猪毛菜(Salsola kali)(Russian thistle) Sal k1 43 43 P 29B
草花粉
禾草目(Poales)
狗牙根(Cynodon dactylon)(Bermuda grass) Cyn d1Cyn d7Cyn d12 抑制蛋白 3214 CCC 30,S8334331,X9125631a,Y08390
鸭茅(Dactylis glomerata)(orchard grass) Dac g1Dac g2Dac g3Dac g5 AgDg1 321131 PCCP 3233,S4535433A,U2534334
绒毛草(Holcus lanatus)(velvet grass) Hol 11 C Z27084
黑麦草(Lolium perenne)黑麦草(rye grass) Lol p1Lol p2Lol p3Lol p5Lol p11 组I组II组IIILol p IX,Lol p Ibhom:胰蛋白酶抑制剂 27111131/3516 CPPC 35,3637,37A,X733633834,3939A
虉草(Phalaris aquatica)(canary grass) Pha a1 C 40,S80654
梯牧草(Phleum pratense)(timothy) Phl p1Phl p2Phl p4Phl p5Phl p6Phl p12Phl p13 Ag25抑制蛋白多聚半乳糖醛酸酶 273255-60 CCPCCCC X7881341,X7592541A4243,Z2708244,X77583AJ238848
草地早熟禾(Poa pratensis)(Kentucky blue grass) Poa p1Poa p5 组I 3331/34 PC 4634,47
石茅高梁(Johnson grass)(Sorghum halepense) Sor h1 C 48
树花粉
壳斗目(Fagales)
欧洲桤木(Alnus glutinosa)(alder) Aln g1 17 C S50892
桦(Betula verrucosa)(birch) Bet v1Bet v2Bet v3Bet v4Bet v6Bet v7 抑制蛋白h:异黄酮还原酶亲环蛋白 1715833.518 CCCCCP 49,50,Z80098M65179X79267X87153,S54819AF135127P81531
欧洲鹅毛枥(hornbeam)(Carpinus betulus) Car b1 17 C 51,X66932,X66918
西班牙栗(Castanea sativa)(chestnut) Cas s1Cas s5Cas s8 几丁质酶脂转移蛋白 229.7 Pp 5253
欧洲榛(Corylus avellana)(hazel) Cor a1Cor a2 抑制蛋白 1714 CC 54A,X70999AF327622
白栎(Quercus alba)(White oak) Que a1 17 P 54
唇形目(Lamiales)
木犀科(Oleaceae)
欧洲白蜡树(ash)(Fraxinus excelsior) Fra e1 20 P 58A
欧洲女贞(Ligustrum vulgare)(Privet) Lig v1 20 P 58A
油橄榄(Olea europea)(olive) Ole e1Ole e2Ole e3Ole e4Ole e5Ole e6Ole e7 抑制蛋白超氧化物歧化酶 1615-189.2321610 CCPPCp 59,6060A60BP80741P8074060C,U8634260D,P81430
欧洲丁香(Syringa vulgaris)(lilac) Syr v1 20 P 58A
车前草科(Plantaginaceae)
长叶车前(English plantain)(Plantago lanceolata) Pla 11 18 P P842242
松目(Pinales)
日本柳杉(sugi)(Cryptomeria japonica) Cry j1Cry j2 41-45 CC 55,5657,D29772
绿干柏(Cupressus arizonica)(cypress) Cup a1 43 C A1243570
阿希刺柏(Juniperus ashei)(mountain cedar) Jun a1Jun a2Jun a3 4330 PCP P8129457A,AJ40465357B,P81295
刺柏(Juniperus oxycedrus)(prickly juniper) Jun o4 hom:钙调蛋白 29 C 57C,AF031471
  山雪松(Juniperus sabinoides)(mountain cedar) Jun s 50 P 58
  铅笔柏(Juniperus virginiana)(eastern red cedar) Jun v1 43 P P81825
  螨
  菇螨(Acarus siro)(mite) Aca s13 脂肪酸结合蛋白 14* C AJ006774
  热带无爪螨(Blomia tropicalis)(mite) Blo t5Blo t12Blo t13 Bt1 1aBt6,脂肪酸结合蛋白. CCC U59102U27479U58106
  户尘螨(Dermatophagoidespteronyssinus)(mite) Der p1Der p2Der p3Der p4Der p5Der p6Der p7Der p8Der p9Der p10Der p14 抗原P1胰蛋白酶淀粉酶胰凝乳蛋白酶谷胱甘肽转移酶胶原溶解丝氨酸蛋白质原肌球蛋白apolipophorin样蛋白 251428/3060142522/2836 CCCpCPCCPCC 6162636465666767A67BY14906
  微角尘螨(Dermatophagoidesmicroeeras)(mite) Der m1 25 P 68
  粉尘螨(Dermatophagoides farinae)(mite) Der f1Der f2Der f3Der f10Der f11Der f14Der f15Der f16Der f17 原肌球蛋白副肌球蛋白mag3,apolipophorin98k几丁质酶凝溶胶蛋白/绒毛蛋白Ca结合EF蛋白质 25143098985353 CCCCCCCCC 6970,71637272AD17686AF17877271A71A
  埋内欧螨(Euroglyphus maynei)(mite) Eur m14 apolipophorin 177 C AF149827
害嗜鳞螨(Lepidoglyphus destructor)(storage mite) Lep d2Lep d5Lep d7Lep d10Lep d13 原肌球蛋白 15 CCCCC 73,74,7575A,AJ25027875A,AJ271058AJ2509675A,AJ250279
Animals(动物)
畜牛(Bos domesticus)(domestic cattle)(也见食物) Bos d2Bos d3Bos d4Bos d5Bos d6Bos d7Bos d8 Ag3,lipocalinCa-结合S100 homα乳清蛋白β乳球蛋白质血清白蛋白免疫球蛋白酪蛋白 201114,218,36716020-30 CCCCC 76,L42867L39834M18780X14712M739937777
犬(Canis familiaris)(Canis domesticus)(Dog) Can f1Can f2Can f3 白蛋白 2527 CCC 78,7978,79S72946
家马(Equus caballus)(domestic horse) Equ c1Equ c2Equ c3Equ c4Equ c5 lipocalinlipocalinAg3-XAgX 2518671717 CPCPP U7082379A,79B79C,X7404579D
猫(Felis domesticus)(cat)(唾液) Fel d1Fel d2Fel d3 cat-1白蛋白抑半胱氨酸蛋白酶蛋白 3811 CCC 1579E,X8484279F,AF238996
小鼠(Mus musculus)(尿) Mus m1 MUP 19 C 80,81
大鼠(Rattus norvegius)(尿) Rat n1 17 C 82,83
真菌(霉)
子囊菌门(Ascomycota)
座囊菌目(Dothidiales)
链格孢(Alternaria alternata) Alt a1Alt a2Alt a3Alt a4Alt a6Alt a7Alt a10Alt a11Alt a12 热休克蛋白70蛋白质二硫化物异构酶酸性核糖体蛋白P2YCP4蛋白质醛脱氢酶烯醇化酶酸性核糖体蛋白P1 2825571122534511 CCCCCCCCC U8263383A,U62442U87807,U87808X84217X78222,U87806X78225X78227,P42041U82437X84216
多主枝孢(Cladosporium herbarum)  Cla h1Cla h2Cla h3Cla h4Cla h5Cla b6Cla h12 醛脱氢酶酸性核糖体蛋白P2YCP4蛋白质烯醇化酶酸性核糖体蛋白P1  13235311224611 CCCCC  83B,83C83B,83CX78228X78223X78224X78226X85180
散囊菌目(Eurotiales)
黄曲霉(Aspergillus flavus)  Asp f113 碱性丝氨酸蛋白酶  34  84
烟曲霉(Aspergillus fumigatus)  Asp f1Asp f2Asp f3Asp f4Asp f5Asp f6Asp f7Asp f8Asp f9Asp f10Asp f11Asp f12Asp f13Asp f15Asp f16Asp f17Asp f18 过氧化物酶体蛋白金属蛋白酶锰超氧化物歧化酶核糖体蛋白P2天冬氨酸蛋白酶肽基脯氨酸异构酶热休克蛋白P90碱性丝氨酸蛋白酶液泡丝氨酸蛋白酶  183719304026.512113434249034164334  CCCCCCCCCCCCCC  M83781,S39330U56938U20722AJ001732Z30424U53561AJ223315AJ224333AJ223327X8509284A8584BAJ002026g3643813AJ22486584C
黑曲霉(Aspergillus niger)  Asp n14Asp n18Asp n? β-木糖苷酶液泡丝氨酸蛋白酶  1053485  CCC  AF10894484BZ84377
米曲霉(Aspergillus oryzae)  Asp o13Asp o21 碱性丝氨酸蛋白酶TAKA-淀粉酶A  3453  CC  X17561D00434,M33218
短密青霉(PenicilliumBrevicompactum)  Pen b13 碱性丝氨酸蛋白酶  33  86A
桔青霉(Penicillium citrinum)  Pen c3Pen c13Pen c19Pen c22w 过氧化物酶体膜蛋白碱性丝氨酸蛋白酶热休克蛋白P70烯醇化酶  18337046 CC  86B86AU64207AF254643
特异青霉(Penicillium notatum)  Pen n13Pen n18Pen n20 碱性丝氨酸蛋白酶液泡丝氨酸蛋白酶N-乙酰基氨基葡糖苷酶  343268  898987
草酸青霉(Penicillium oxalicum)  Pen o18 液泡丝氨酸蛋白酶  34  89
爪甲团囊菌目(Onygenales)
红色发癣菌(Trichophytonrubrum)  Tri r2Tri r4 丝氨酸蛋白酶  CC  9090
断发癣菌(Trichophyton tonsurans)  Tri t1Tri t4 丝氨酸蛋白酶  3083  PC  9190
酵母目(Saccharomycetales)
白假丝酵母(Candida albicans)  Cand a1  40  C  88
博伊丁假丝酵母(Candida boidinii)  Cand b2  20  C  J04984,J04985
担子菌门(Basidiomycota)
Basidiolelastomycetes
糠状鳞斑霉(Malassezia furfur)  Mala f1Mala f2Mala f3Mala f4Mala f5Mala f6 MF1,过氧化物酶体膜蛋白MF2,过氧化物酶体膜蛋白 21203518*17* CCCCC  91AAB011804AB011805AJ011955AJ011956
担子菌纲(Basidiomycetes)
Psilocybe cubensis  Psi c1Psi c2 亲环蛋白 16 91B
毛头鬼伞(Coprinus comatus)(shaggy cap) Cop c1Cop c2Cop c3Cop c5Cop c7 亮氨酸拉链蛋白 11 C AJ132235AJ242791AJ242792AJ242793AJ242794
昆虫
埃及伊蚊(Aedes aegyptii)(mosquito) Aed a1Aed a2 腺苷三磷酸双磷酸酶 6837 CC L12389M33157
意大利蜂(Apis mellifera)(Honeybee) Api m1Api m2Api m4Api m6 磷脂酶A2透明质酸酶蜂毒肽 164437-8 CCCP 929394
大黄蜂(Bombus pennsylvanicus)(bumble bee) Bom p1Bom p4 磷脂酶蛋白酶 16 PP 9595
德国小蠊(Blattellagermanica)(German cockroach) Bla g1Bla g2Bla g4Bla g5Bla g6 Bd90k天冬氨酸蛋白酶calycin谷胱甘肽转移酶肌钙蛋白C 36212227 CCCCC 96979898
美洲大蠊(Periplaneta americana)(American cockroach) Per a1Per a3Per a7 Cr-PIICr-PI原肌球蛋白 72-7837 CCC 98AY14854
欧洲蠓(Chironomusthummì thummì)(midges) Chi t1-9Chi t1.01Chi t1.02Chi t2.0101Chi t2.0102Chi t3Chi t4Chi t5Chi t6.01Chi t6.02Chi t7Chi t8Chi t9 血红蛋白组分III组分IV组分I组分IA组分II-β组分IIIA组分VI组分VIIA组分IX组分VIIB组分VIII组分X 16161616161616161616161616 CCCCCCCCCCCCC 99P02229P02230P02221P02221P02222P02231P02224P02226P02223P02225P02227P02228
白斑脸大黄蜂(Dolichovespula maculata)(white face homet) Dol m1Dol m2Dol m5 磷脂酶A1透明质酸酶抗原5 354423 CCC 100101102,103
黄色大黄蜂(Dolichovespula arenaria)(yellow hornet) Dol a5 抗原5 23 C 104
黄蜂(Polistesannularies)(wasp) Pol a1Pol a2Pol a5 磷脂酶A1透明质酸酶抗原5 354423 PPC 105105104
地中海胡蜂(Polistes dominulus)(Mediterranean paper wasp) Pol d1Pol d4Pol d5 丝氨酸蛋白酶 32-34 C P81656
黄蜂(Polistes exclamans)
(wasp)  Pol e1 磷脂酶A1  34  P  107
 Pol e5 抗原5  23  C  104
黄蜂(Polistes fuscatus)
(wasp)  Pol f5 抗原5  23  C  106
黄蜂(Polistes metricus)
(wasp)  Pol m5 抗原5  23  C  106
黄边胡蜂(Vespa crabo)(European hornet) Vesp c1Vesp c5 磷脂酶抗原5 3423 PC 107106
金环胡蜂(Vespa mandarina)giant asian hornet Vesp m1Vesp m5 P81657
重黄胡蜂(Vespula flavopilosa)(yellowjacket) Ves f5 抗原5 23 C 106
德国黄胡蜂(Vespula germanica)(yellowjacket) Ves g5 抗原5 23 C 106
额斑黄胡蜂(Vespula maculifrons)(yellowjacket) Ves m1Ves m2Ves m5 磷脂酶A1透明质酸酶抗原5 33.54423 CPC 108109104
树黄胡蜂(Vespula pennsylvanica)(yellowjacket) Ves p5 抗原5 23 C 106
小黄蜂(Vespula squamosa)(yellow jacket) Ves s5 抗原5 23 C 106
黄蜂(Vespula vidua)(wasp) Ves vi5 抗原5 23 C 106
常见黄胡蜂(Vespula vulgaris)(yellowjacket) Ves v1Ves v2Ves v5 磷脂酶A1透明质酸酶抗原5 354423 CPC 105A105A104
Myrmecia pilosula(Australian jumper ant) Myr p1Myr p2 CC X70256S81785
赤道火蚁(Solenopsis)geminata)(tropical fire ant) Sol g2Sol g4
红外来火蚁(Solenopsis invicta)(Fire ant) Sol i2Sol i3Sol i4 132413 CCC 110,111110110
巴西火蚁(Solenopsis saevissima)(Brazilian fire ant) Sol s2
食物
鳕(Gadus callarias)(Cod) Gad e1 变应原M 12 C 112,113
大西洋鲑(Salmo salar)(Atlantic salmon) Sal s1 小白蛋白 12 C X97824
畜牛(Bos domesticus)(domestic cattle)(奶) Bos d4Bos d5Bos d6Bos d7Bos d8 α-乳白蛋白β-乳球蛋白血清白蛋白免疫球蛋白酪蛋白 14.218.36716020-30 CCC M18780X14712M739937777
鸡(Gallus domesticus)(Chicken) Gal d1Gal d2Gal d3Gal d4Gal d5 卵类粘蛋白卵清蛋白Ag22,伴清蛋白溶菌酶血清白蛋白 2844781469 CCCCC 114,115114,115114,115114,115X60688
刀额新对虾(Metapenaeus ensis)(Shrimp) Met e1 原肌球蛋白 C U08008
褐对虾(Penaeus aztecus)(shrimp) Pen a1 原肌球蛋白 36 P 116
印度对虾(Penaeus indicus)(Shrimp) Pen i1 原肌球蛋白 34 C 117
日本鱿(Todarodes pacificus)(Squid) Tod p1 原肌球蛋白 38 P 117A
鲍鱼(Haliotis midae)(abalone) Hal m1 49 117B
旱芹(Apium graveolens)(Celery) Api g1Api g4Api g5 hom:Bet v1抑制蛋白 16*55/58 CP Z48967AF129423P81943
芥菜(Brassica juncea)(oriental mustard) Bra j1 2S白蛋白 14 C 118
芜青(Brassica rapa)(turnip) Bra r2 hom:prohevein 25 P81729
大麦(Hordeum vulgare)(barley) Hor v15 BMAI-1 15 C 119
玉蜀黍(zea mays)(maize,corn) Zea m14 脂转移蛋白 9 P P19656
稻(Oryza sativa)(rice) Ory s1 C U31771
欧洲榛(Corylus avellana)(hazelnut) Cor a1.0401 hom:Bet v1 17 C AF136945
苹果(Malus domestica)(apple) Mal d1Mal d2Mal d3 hom:Bet v1hom:奇异果甜蛋白脂转移蛋白 9 CCC X83672AJ243427
西洋梨(Pyrus communis)(pear) Pyr c1Pyr c4Pyr c5 hom:Bet v1抑制蛋白hom:异黄酮还原酶 181433.5 CCC AF05730AF129424AF071477
鳄梨(Persea americana)(avocado) Pers a1 内切几丁质酶 32 C Z78202
杏(Prunus armeniaca)(apricot) Pru ar1Pru ar3 hom:Bet v1脂转移蛋白 9 CP U93165
樱桃(Prunus avium)(sweet cherry) Pru av1Pru av2Pru av3Pru av4 hom:Bet v1hom:奇异果甜蛋白脂转移蛋白抑制蛋白 1015 CCCC U66076U32440AF221501AF129425
欧洲李(Prunus domestica)(European plum) Pru d3 脂转移蛋白 9 P 119A
桃(Prunus persica)(peach) Pru p3 脂转移蛋白 10 P P81402
葡萄(Vitis vinifera)(grape) Vit v1 脂转移蛋白 9 P P80274
大蕉(Musa paradisiaca)(banana) Mus xp1 抑制蛋白 15 C AF377948
凤梨(Ananas comosus)(pineapple) Ana c1 抑制蛋白 15 C AF377949
荔枝(Lichti chinensis)(litchi) Lit c1 抑制蛋白 15 C AY049013
白芥(Sinapis alba)(yellow mustard) Sin a1 2S白蛋白 14 C 120
大豆(Glycine max)(soybean) Gly m1Gly m2Gly m3 HPS抑制蛋白 7814 PPC 121A57106AJ223982
落花生(Arachis hypogaea)(peanut) Ara h1Ara h2Ara h3Ara h4Ara h5Ara h6Ara h7 豌豆球蛋白羽扇豆球蛋白大豆球蛋白大豆球蛋白抑制蛋白hom:羽扇豆球蛋白hom:羽扇豆球蛋白 63.5176037151515 CCCCCCC L34402L77197AF093541AF086821AF059616AF092846AF091737
中华猕猴桃(Actinidia chinensis)(kiwi) Act c1 半胱氨酸蛋白酶 30 P P00785
辣椒(Capsicum annum)(bell pepper) Cap a1w 渗透蛋白样蛋白 23 c AJ297410
马铃著(Solanum tuberosum)(potato) Sola t1Sola t2Sola t3Sola t4 patatin组织蛋白酶D抑制剂半胱氨酸蛋白酶抑制剂天冬氨酸蛋白酶抑制剂 43212116+4 PPPP P15476P16348P20347P30941
巴西坚果(Bertholletia excelsa)(Brazil nut) Ber e1 2S白蛋白 9 C P04403,M17146
核桃(Juglans regia)(English walnut) Jug r1Jug r2 2S白蛋白豌豆球蛋白 44 CC U66866AF066055
蓖麻(Ricinus communis)(Castor bean) Ric c1 2S白蛋白 C P01089
胡麻(Sesamum indicum)(sesame) Ses i1Ses i2Ses i3 2S白蛋白2S白蛋白7S豌豆球蛋白样球蛋白 9745 CCC 121A,AF240005AF091841AF240006
甜瓜(Cucumis melo)
(muskmelon)  Cuc m1 丝氨酸蛋白酶 66  C  D32206
其他
简单异尖线虫(Anisakis simplex)(nematode)  Ani s1Ani s2Ani s3 副肌球蛋白原肌球蛋白 249741  PCC  121B,A59069AF173004121C,Y19221
猪蛔虫(Ascaris suum)(worm) As c s1 10 P 122
Dendronephthyanipponica(soft coral) Den n1 53 P 122A
巴西橡胶(Heveabrasiliensis)(rubber,latex) Hev b1Hev b2Hev b3Hev b4Hev b5Hev b6.01Hev b6.02Hev b6.03Hev b7.01Hev b7.02Hev b8Hev b9Hev b10Hev b11wHev b12 延伸因子1,3-葡聚糖酶微螺旋复合物组分橡胶蛋白前体橡胶蛋白(hevein)C-末端片段hom:来自B-血清的patatinhom:来自C-血清的patatin抑制蛋白烯醇化酶锰超氧化物歧化酶1类几丁质酶脂转移蛋白 5834/3624100-115162051442441451269.3 PCPPCCCCCCCCCCC 123,124125126,127128U42640M36986,p02877M36986,p02877M36986,p02877U80598AJ223038Y15042,AJ132397,AF119365,AF119366AJ132580AJ249148AJ238579
猫蚤(Ctenocephalides felisfelis)(cat flea) Cte f1Cte f2 M1b 27 C AF231352
人(Homo sapiens)人自身变应原 Hom s1Hom s2Hom s3Hom s4Hom s5 73*10.3*20.1*36*42.6* CCCCC Y14314X80909X89985Y17711P02538
a克隆(C)或者蛋白(P)数据
附录I参考文献
1.Marsh,D.G.,和L.R.Freidhoff.1992.ALBE,变应原数据库.IUIS,Baltimore,MD,1.0版。
2.Marsh,D.G.,L.Goodfriend,T.P.King,H.Lowenstein,和T.A.E.PIatts-Mills.1986.变应原术语.Bull WHO 64:767-770。
3.King,T.P.,P.S.Norman,和J.T.Cornell.1964.豚草花粉变应原的分离和鉴定.II.Biochemistry 3:458-468.
4.Lowenstein,H.1980.梯牧草花粉变应原.Allergy 35:188-191。
5.Aukrust,L.1980.纯化多主枝孢中的变应原.Allergy 35:206-207。
6.Demerec,M.,E.A.Adelberg,A.J.Clark,和P.E.Hartman.1966.细菌遗传学中统一术语的建议.Genetics 54:61-75。
7.Bodmer,J.G.,E.D.Albert,W.F.Bodmer,B.Dupont,H.A.Erlich,B.Mach,S.G.E.Marsh,W.R.Mayr,P.Parham,T.Sasuki,G.M.Th.Schreuder,J.L.Strominger,A.SVejgaard,和P.I.Terasaki.1991.HLA***因子的术语,1990.Immunogenetics 33:301-309。
8.Griffith,I.J.,J.Pollock,D.G.Klapper,B.L.Rogers,和A.K.Nault.1991.豚草(短豚草)中的主要变应原Amb a I和Amb a II的序列多形现象.Int.Arch.Allergy Appl.Immunol.96:296-304。
9.Roebber,M.,D.G.Klapper,L.Goodfriend,W.B.Bias,S.H.Hsu,和D.G.Marsh.1985.对来自三裂豚草花粉的Ra5同系物Amb t V(Ra5G)的免疫化学和遗传学研究.J.Immunol.134:3062-3069。
10.Metzler,W.J.,K.Valentine,M.Roebber,M.Friedrichs,D.G.Marsh,和L.Mueller.1992.豚草变应原Amb t V的解析结构.Biochemistry 31:5117-5127。
11.Metzler,W.J.,K.Valentine,M.Roebber,D.G.Marsh,和L.Mueller.1992.豚草变应原Amb a V的质子共振分配和用核磁共振谱对其三维解析结构的研究.Biochemistry 31:8697-8705。
12.Goodfriend,L.,A.M.Choudhury,J.Del Carpio,和T.P.King.1979.细胞色素C:新的豚草花粉变应原.Fed.Proc.38:1415。
13.Ekramoddoullah,A.K.M.,F.T.Kisil,和A.H.Sehon.1982.来自草地早熟禾和多年黑麦草花粉的细胞色素c的变应原交叉反应.Mol.Immunol.19:1527-1534.
14.Ansari;A.A.,E.A.Killoran,和D.G.Marsh.1987.人对多年黑麦草(黑麦草)花粉细胞色素c(Lol p X)反应的调查.J.Allergy Clin.Immunol.80:229-235。
15.Morgenstern,J.P.,I.J.Griffith,A.W.Brauer,B.L.Rogers,J.F.Bond,M.D.Chapman,和M.Kuo.1991.家猫的主要变应原FeI d I的氨基酸序列:蛋白质序列分析和cDNA克隆.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:9690-9694。
16.Griffith,I.J.,S.Craig,J.Pollock,X.Yu,J.P.Morgenstern,和B.L.Rogers.1992.编码FdI,家猫的主要变应原的基因的表达和结构.Gene113:263-268.
17.Weber,A.,L.Marz,和F.Altmann.1986.来自蜜蜂毒液磷脂酶A2的天冬氨酸连接的寡糖的特征.Comp.Biochem.Physio.83B:321-324。
18.Weber,A.,H.Schroder,K.Thalberg,和L.Marz.1987.IgE抗体和蜜蜂毒液磷脂酶A2的糖表位的特异作用.Allergy 42:464-470.
19.Stanworth,D.R.,K.J.Dorrington,T.E.Hugli,K.Reid,和M.W.Turner.1990.代表免疫球蛋白链序列的合成肽的术语.Bulletin WHO 68:109-111。
20.Rafnar,T.,I.J.Griffith,M.C.Kuo,J.F.Bond,B.L.Rogers,和D.G.Klapper.1991.克隆Amb a I(抗原E)——短豚草花粉的主要变应原.J.Biol.Chem.266:1229-1236。
21.Rogers,B.L.,J.P.Morgenstern,I.J.Griffith,X.B.Yu,C.M.Counsell,A.W.Brauer,T.P.King,R.D.Garman,和M.C.Kuo.1991.变应原Amb a II的完全序列:重组表达和与来自豚草过敏病人的T细胞的反应.J.Immunol.147:2547-2552.
22.Klapper,D.G.,L.Goodfriend,和J.D.Capra.1980.豚草变应原Ra3的氨基酸序列.Biochemistry 19:5729-5734。
23.Ghosh,B.,M.P.Perry,T.Rafnar,和D.G.Marsh.1993.短豚草(豚草)花粉的免疫活性重组Amb a V变应原的克隆和表达.J.Immunol.150:5391-5399。
24.Roebber,M.,R.Hussain,D.G.Klapper,和D.G.Marsh.1983.一种新的短豚草花粉变应原,Ra6的分离及其特点.J.Immunol.131:706-711.
25.Lubahn,B.,和D.G.Klapper.1993.豚草变应原Amb a VI(abst)的克隆和鉴定.J.Allergy Clin.Immunol.91:338。
26.Roebber,M.,和D.G.Marsh.1991.短豚草花粉变应原Amb a VII的分离和鉴定.J.Allergy Clin.Immunol.87:324。
27.Rogers,B.L.,J.Pollock,D.G.Klapper,和I.J.Griffith.1993.短豚草花粉(abst)一种新的变应原的克隆、全序列和重组表达.J.Allergy Clin.Immunol.91:339。
28.Goodfriend,L.,A.M.Choudhury,D.G.Klapper,K.M.Coulter,G.Dorval,J.DelCarpio,和C.K.Osterland.1985.Ra5G——三裂豚草花粉中的Ra5的同系物的分离、HLA-DR-相关的活力和氨基酸序列.Mol.Immunol.22:899-906。
28A.Breitenbach M,pers.comm
29.Nilsen,B.M.,K.Sletten,M.ONeill,B.Smestead Paulsen,和H.vanHalbeek.1991.艾蒿(Artemesia vulgaris)花粉中的糖蛋白变应原Art vII的结构分析.J.Biol.Chem.266:2660-2668。
29A.Jimenez A,Moreno C,Martinez J,Martinez A,Bartolome B,GuerraF,Palacios R 1994。对向日葵花粉敏感:仅仅是职业过敏?Int Arch AllergyImmunol 105:297-307。
29B.Carnes-J,Fernandez-Caldas E,Casanovas M,Lahoz C,Colas C.,Salsola kali花粉提取物的免疫化学鉴定.Allergy 56,Supplement 68:274,2001。
29C.Giuliani A,Pini C,Bonini S,Mucci N,Ferroni L,Vicari G:来自Parietaria officinalis花粉的一种主要变应原的分离和纯化.Allergy 42:434-440,1987。
30.Smith,P.M.,Suphioglu,C.,Griffith,I.J.,Theriault,K.,Knox,R.B.和Singh,M.B.1996.生物活性形式的狗牙根花粉主要变应原Cyn d 1在酵母(Pichia pastoris巴斯德毕赤酵母)中的克隆和表达.J.Allergy Clin.Immunol.98:331-343。
31.Suphioglu,C.,Ferreira,F.和Knox,R.B.1997.来自狗牙根花粉的新的钙结合变应原的分子克隆和免疫学鉴定.FEBS Lett.402:167-172。
3la.Asturias JA,Arilla MC,Gomez-Bayon N,Martinez J,Martinez A,和Palacios R.1997.Cynodon dactylon(狗牙根)花粉抑制蛋白(Cyn d 12)在大肠杆菌中的克隆和高水平表达:变应原的纯化和鉴定.Clin ExpAllergy 27:1307-1313。
32.Mecheri,S.,G.Peltre,和B.David.1985.鸭茅(Dactylis glomerata)花粉主要变应原的纯化和鉴定:The Ag Dg 1.Int.Arch.Allergy Appl.Immunol.78:283-289。
33.Roberts,A.M.,L.J.Bevan,P.S.Flora,I.Jepson,和M.R.Walker.1993.编码鸭茅(Dactylis glomerata)第二组变应原的cDNA核苷酸序列,Dacg II.Allergy 48:615-623。
33a.Guerin-Marchand,C.,Senechal,H.,Bouin,A.P.,Leduc-Brodard,V.,Taudou,G.,Weyer,A.,Peltre,G.和David,B.1996.鸭茅(Dactylisglomerata)花粉的一种主要变应原Dac g 3的克隆、测序和免疫学鉴定.Mol.Immunol.33:797-806。
34.Klysner,S.,K.Welinder,H.Lowenstein,和F.Matthiesen.1992.草花粉IV中的第V组变应原、来自黑麦草,草地早熟禾和鸭茅(Dactylisglomerata)的第V组变应原的氨基酸组成和氨基酸末端序列的相似性.Clin.Exp.Allergy 22:491-497.
35.Perez,M.,G.Y.Ishioka,L.E.Walker,和R.W.Chesnut.1990.黑麦草变应原的cDNA的克隆和免疫学鉴定Lol p I.J.Biol.Chem.265:16210-16215。
36.Griffith,I.J.,P.M.Smith,J.Pollock,P.Theerakulpisut,A.Avjioglu,S.Davies,T.Hough,M.B.Singh,R.J.Simpson,L.D.Ward,和R.B.Knox.1991.黑麦草花粉的主要变应原蛋白Lol p I的克隆和测序.FEBS Letters279:210-215。
37.Ansari,A.A.,P.Shenbagamurthi,和D.G.Marsh.1989.一种黑麦草(多年黑麦草)花粉变应原Lol p II.的完整氢基酸序列J.Biol.Chem.264:11181-11185。
37a.Sidoli,A.,Tamborini,E.,Giuntini,I.,Levi,S.,Volonte,G.,Paini,C.,De Lalla,C.,Siccardi,A.G.,Baralle,F.E.,Galliani,S.和Arosio,P.1993.重组黑麦草变应原Lol p II.的克隆、表达和免疫学鉴定J.Biol.Chem.268:21819-21825。
38.Ansari,A.A.,P.Shenbagamurthi,和D.G.Marsh.1989.一种黑麦草(多年黑麦草)花粉变应原,Lol p m的完整结构:和已知Lol p I与II序列的比较Biochemistry 28:8665-8670。
39.Singh,M.B.,T.Hough,P.Theerakulpisut,A.Avjioglu,S.Davies,P.M.Smith,P.Taylor,R.J.Simpson,L.D.Ward,J.McCluskey,R.Puy,和R.B.Knox.1991.编码一种新近确定的黑麦草花粉主要变应原蛋白的cDNA的分离:细胞内靶向造粉体.Proc.Natl.Acad.Sci.88:1384-1388。
39a.van Ree R,Hoffman DR,van Dijk W,Brodard V,Mahieu K,Koeleman CA,Grande M,van Leeuwen WA,Aalberse RC.1995.Lol p XI,一种新的草花粉变应原,是大豆胰蛋白酶抑制剂相关蛋白家族中一员.JAllergy Clin Immunol 95:970-978.
40.Suphioglu,C.和Singh,M.B.1995.克隆,金黄草花粉主要变应原fPha a 1和Pha a 5四种同种型在大肠杆菌中的克隆、测序和表达.Clin.Exp.Allergy 25:853-865。
41.Dolecek,C.,Vrtala,S.,Laffer,S.,Steinberger,P.,Kraft,D.,Scheiner,O.和Valenta,R.1993.Phl p II,一种梯牧草(Phleum pratense)花粉变应原的分子鉴定.FEBS Lett.335:299-304。
41A.Fischer S,Grote M,Fahlbusch B,Muller WD,Kraft D,Valenta R.1996.Phl p 4,一种主要梯牧草(Phleum pratense)花粉变应原的鉴定.JAllergy Clin Immunol 98:189-198。
42.Matthiesen,F.,和H.Lowenstein.1991.草花粉中第V组变应原.I.梯牧草花粉第V组变应原的纯化和鉴定,Phl p V.Clin.Exp.Allergy 21:297-307。
43.Petersen,A.,Bufe,A.,Schramm,G.,Schlaak,M.和Becker,W.M.1995.梯牧草花粉(Phl p 6)第6组变应原的鉴定.II.cDNA克隆of Phl p6cDNA的克隆和与第5组草变应原的结构比较.Int.Arch.AllergyImmunol.108:55-59。
44.Valenta,R.,Ball,T.,Vrtala,S.,Duchene,M.,Kraft,D.和Scheiner,O.1994.梯牧草(Phleum pratense)花粉抑制蛋白在大肠杆菌中的cDNA克隆和表达:与桦树花粉抑制蛋白的比较.Biochem.Biophys.Res.Commun.199:106-118.
46.Esch,R.E.,和D.G.Klapper.1989.一种主要交叉反应组I草变应原决定簇的分离和鉴定.Mol. Immunol.26:557-561。
47.Olsen,E.,L.Zhang,R.D.Hill,F.T.Kisil,A.H.Sehon,和S.Mohapatra.1991.草地早熟禾花粉基本变应原第IX组Poa p的鉴定和表征.J.Immunol.147:205-211。
48.Avjioglu,A.,M.Singh,和R.B.Knox.1993.石茅高梁花粉的组1变应原Sor h I的序列分析及其与黑麦草Lol p I(abst)的比较.J.Allergy Clin.Immunol.91:340.
49.Breiteneder H,Pettenburger K,Bito A,Valenta R,Kraft D,RumpoldH,Scheiner O,Breitenbach M.编码主要桦木花粉变应原BetvI的基因和一种豌豆抗病应答基因高度同源.EMBO J.8:1935-1938,1989。
50.Swoboda I,Jilek A,Ferreira F,Engel E,Hoffinan-Sommergruber K,Scheiner O,Kraft D,Breiteneder H,Pittenauer E,Schmid E.用液相色谱、质谱对桦木花粉主要变应原Bet v 1的同种型的分析及其cDNA克隆.J.Biol.Chem.270:2607-2613,1995。
51.Larsen JN,Stroman P,Ipsen H.编码来自欧洲鹅毛枥,鹅毛枥树花粉的主要变应原Car b I的同源基因的基于PCR的克隆和测序.Mol.Immunol.29:703-711,1992。
52.Kos T,Hoffmann-Sommergruber K,Ferreira F,Hirschwehr R,AhornH,Horak F,Jager S,Sperr W,Kraft D,Scheiner O.1993.欧洲栗子花粉的一种新的主要变应原--Cas s 1的纯化、鉴定和N-末端氨基酸序列.Bjochem Biophys Res Commun 196:1086-92。
53.Diaz-Perales A,Lombardero M,Sanchez-Monge R,Garcia-Selles FJ,Pernas M,Fernandez-Rivas M,Barber D,Salcedo G.2000.脂转移蛋白作为潜在的植物泛变应原:在蒿属花粉、栗属(Castaneae)坚果和Rosaceae果实的蛋白中的交叉反应,具有不同的IgE结合能力.Clin Exp Allergy 30:1403-1410。
54.Ipsen,H.,和O.C.Hansen.1991.桤木(欧洲桤木)Aln g I,桦木(Betula verrucosa)Bet v I,鹅毛枥(欧洲鹅毛枥)Car b I和橡木(白栎)Que a I花粉的免疫化学部分鉴定的主要变应原的NH2末端氨基酸序列.Mol.Immunol.28:1279-1288。
55.Taniai,M.,S.Ando,M.Usui,M.Kurimoto,M.Sakaguchi,S.Inouye,和T.Matuhasi.1988.日本柳杉花粉一种主要变应原(Cryj I)的N-末端氨基酸序列.FEBS Lett.239:329-332.
56.Griffith,I.J.,A.Lussier,R.Garman,R.Koury,H.Yeung,和J.Polloc k.1993.日本柳杉(abst)主要变应原Cry j I的cDNA的克隆.J.Allergy Clin.Immunol.91:339。
57.Sakaguchi,M.,S.Inouye,M.Taniai,S.Ando,M.Usui,和T.Matuhasi.1990.日本柳杉花粉第二主要变应原的鉴定.Allergy 45:309-312。
57A.Yokoyama M,Miyahara M,Shimizu K,Kino K,Tsunoo H.2000.山雪松花粉第二主要变应原Jun a 2的纯化、鉴定和cDNA克隆.BiochemBiophys Res Commun 275:195-202。
57B.Midoro-Horiuti T,Goldblum RM,Kurosky A,Wood TG,Brooks EG.2000.致病相关蛋白变应原在阿希刺柏(Juniperus ashei)中的易变表达花粉.J Immunol 164:2188-2192.
57C.Tinghino R.,Barletta B.,Palumbo S.,Affermi C.,Iacovacci P.,MariA.,Di Felice G.,Pini,C.1998.一种交叉反应的刺柏花粉变应原的分子表征,Jun o 2:一种新的钙结合变应原J.Allergy Clin.Immunol.101:772-777。
58.Gross GN,Zimburean JM,Capra JD 1978.山雪松花粉变应原的分离和部分表征.Scand J Immunol 8:437-41。
58A.Obispo TM,Melero JA,Carpizo JA,Carreira J,Lombardero M 1993.油橄榄(Olea europaea)(Ole e I)的主要变应原也存在于橄榄科的蛋白质种类中.Clin Exp Allergy 23:311-316。
59.Lombardero M.,Barbas J.A.,Moscoso del Prado J.,Carreira J.1994.主要橄榄变应原,Ole e Id的cDNA序列分析.Clin.Exp.Allergy 24:765-770。
60.Villalba,M.,E.Batanero,C.Lopez-Otin,L.M.Sanchez,R.I.Monsalve,M.A.Gonzalez de la Pena,C.Lahoz,和R.Rodriguez.1993.橄榄树花粉(Olea europaea)的主要变应原的氨基酸序列.Eur.J.Biochem.216:863-869。
60A.Asturias JA,Arilla MC,Gomez-Bayon N,Martinez J,Martinez A,Palacios R 1997.橄榄树花粉的泛变应原抑制蛋白和主要变应原(Ole e 1)的克隆和表达.J Allergy Clin Immunol 100:365-372。
60B.Batanero E,Villalba M,Ledesma A Puente XS,Rodriguez R.1996.Ole e 3,一种橄榄撒变应原,属于花粉蛋白的一个广泛家族.Eur JBiochem 241:772-778。
60C.Batanero E,Ledesma A,Villalba M,Rodriguez R.1997.一种来自橄榄树花粉的富含半胱氨酸的变应原Ole e 6的纯化、氨基酸序列和免疫学鉴定.FEBS Lett.410:293-296。
60D.Tejera ML,Villalba M,Batanero E,Rodriguez R.1999.一种橄榄树花粉的新的变应原Ole e 7的鉴定、分离和表征.J Anergy Clin Immunol104:797-802.
60E.Ledesma,A.,Villalba,M.和Rodriguez,R.2000.一种来自橄榄树花粉的有变应原活力的新的四EF-手Ca(2+)-结合蛋白的克隆、表达和鉴定.FEBS Lett.466:192-196。
61.Chua,K.Y.,G.A.Stewart,和W.R.Thomas.1988.一种编码主要屋尘螨变应原的cDNA的序列分析,Der p I.J.Exp.Med.167:175-182。
62.Chua,K.Y.,C.R.Doyle,R.J.Simpson,K.J.Turner,G.A.Stewart,和W.R.Thomas.1990.通过IgE血小板免疫分析分离编码主要螨变应原Der p II的cDNA.Int.Arch.Allergy Appl.Immunol.91:118-123。
63.Smith WA,Thomas WR.1996.编码来自屋尘螨(Dermatophagoidespteronyssinus)和粉尘螨的组3变应原的基因的比较分析.Int Arch过敏Immunol 109:133-40。
64.Lake,F.R.,L.D.Ward,R.J.Simpson,P.J.Thompson,和G.A.Stewart.1991.来自屋尘螨的淀粉酶:变应原性和物理化学特性.J.AllergyClin.Immunol.87:1035-1042。
65.Tovey,E.R.,M.C.Johnson,A.L.Roche,G.S.Cobon,和B.A.Baldo.1989.表达一种结合人IgE且相应于一种重要的低分子量变应原的重组屋尘螨蛋白的cDNA的克隆和测序.J.Exp.Med.170:1457-1462。
66.Yasueda,H.,T.Shida,T.Ando,S.Sugiyama,和H.Yamakawa.1991.来自尘螨第四变应原的变应原和蛋白分解性质.在:″Dust Mite Allergensand Asthma.Report of the 2nd international Workshop″A.Todt,Ed.,UCBInstitute of Allergy,Brussels,Belgium,pp.63-64。
67.Shen,H.-D.,K.-Y.Chua,K.-.L.Lin,K.-H.Hsieh,和W.R.Thomas.1993.螨提取物中多种组分种具有通常抗体结合特异性的屋尘螨变应原的分子克隆.Clin.Exp.Allergy 23:934-40。
67A.O′Neil GM,Donovan GR,Baldo BA.1994.和谷胱甘肽S-转移酶同源的一种屋尘螨(Dermatophagoides pteronyssinus)主要变应原的克隆和鉴定.Biochim Biophys Acta,1219:521-528。
67B.King C,Simpson RJ,Moritz RL,Reed GE,Thompson PJ,StewartGA.1996.尘螨(Dermatophagoides pteronyssinus)的一种新的溶胶原丝氨酸蛋白酶变应原(Der p 9)的分离和鉴定.J Allergy Clin Immunol 98:739-47。
68.Lind P,Hansen OC,Horn N.1988.鼠杂交瘤和人IgE抗体与D.pteronyssinus主要***物变应原Der p I的结合.J.Immunol.140:4256-4262。
69.Dilworth,R.J.,K.Y.Chua,和W.R.Thomas.1991.编码主要家尘变应原Der fI的cDNA的序列分析.Clin.Exp.Allergy 21:25-32。
70.Nishiyama,C.,T.Yunki,T.Takai,Y.Okumura,和H.Okudaira.1993.一种主要屋尘螨变应原,Der f II中三个二硫键的确定.Int.Arch.Allergy Immunol.101:159-166。
71.Trudinger,M.,K.Y.Chua,和W.R.Thomas.1991.编码主要尘螨变应原Der f II的cDNA.Clin.Exp.Allergy 21:33-38.
71A.Tategaki A,Kawamoto S,Aki T,Jyo T,Suzuki O,Shigeta S,Ono K.新近描述的屋尘螨变应原.ACI International suppl.1:74-76,2000。
72.Aki T,Kodama T,Fujikawa A,Miura K,Shigeta S,Wada T,Jyo T,Murooka Y,Oka S,Ono K.1995.免疫化学鉴定重组和天然的原肌球蛋白是来自屋尘螨粉尘螨的一种新的变应原.J Allergy Clin Immunol 96:74-83。
72A.Tsai L,Sun Y,Chao P,Ng H,Hung M,Hsieh K,Liaw S,Chua K,1999.编码粉尘螨的一种98-kDa的变应原的cDNA克隆的序列分析和表达.Clin Exp Allergy 29:1606-1613。
72B.Gafvelin G,Johansson E,Lundin A,Smith AM,Chapman MD,Benjamin DC,Derewenda U,Van Hage-Hamsten M.2001.来自尘螨(Glycyphagus domesticus)的新的组2变应原Gly d 2和来自屋尘螨(Dermatophagoides pteronyssinus),害嗜鳞螨和腐食酪螨(Tyrophagusputrescentiae)的组2变应原与重组变应原的交叉反应研究.J Allergy ClinImmunol 107:511-518。
73.van Hage-Hamsten,M.,T.Bergman,E.Johansson,B.Persson,H.Jornvall,B.Harfast,和S.G.O.Johansson.1993.螨害嗜鳞螨(abst)主要变应原的N-末端氨基酸序列.J.Allergy Clin.Immunol.91:353。
74.Varela J,Ventas P,Carreira J,Barbas JA,Gimenez-Gallego G,Polo F.害嗜鳞螨主要变应原Lep d I的一级结构.Eur J Biochem 225:93-98,1994。
75.Schmidt M,Van der Ploeg I,Olsson S,van Hage Hamsten M.编码害嗜鳞螨主要变应原Lep d 1的完全cDNA.FEBS Lett 370:11-14,1995。
75A.Eriksson TLJ,Rasool O,Huecas S,Whitley P,Crameri R,Appenzeller U,Gafvelin G,van Hage-Hamsten M.2001.利用相表面呈现技术从尘螨害嗜鳞螨中克隆三个新的变应原.Eur.J.Biochem.268:287-294.
75B.Eriksson TL,Johansson E,Whitley P,Schmidt M,Elsayed S,vanHage-Hamsten M.1998.尘螨腐食酪螨(Tyrophagus putrescentiae)组II变应原的克隆和鉴定.Eur.J.Biochem.251(1-2),443-447。
76.Rautiainen J,Rytkonen M,Pelkonen J,Pentikainen J,Perola O,Virtanen T,Zeiler T,Mantyjarvi R.BDA20,一种主要牛毛屑变应原,其在序列水平上鉴定为Bos d 2..Submitted。
77.Gjesing B,Lowenstein H.食物抗原的免疫化学.Ann Allergy 53:602,1984。
78.de Groot,H.,K.G.H.Goei,P.van Swieten,和R.C.Aalberse.1991.从狗提取物中纯化出一种主要的和小变应原:亲和纯化的Can f I和除去Can fI的提取物的血清学活力.J.Allergy Clin.Immunol.87:1056-1065。
79.Konieczny,A.个人通讯;Immunologic Pharmaceutical Corp。
79A.Bulone,V.1998.用二维电泳对马毛屑变应原蛋白的分离.分子表征和鉴定Equ c 2.0101和Equ c 2.0102为lipocalin蛋白.Eur J Biochem253:202-211.
79B.Swiss-Prot acc.P81216,P81217。
79C.Dandeu J.P.,Rabillon J.,Divanovic A.,Carmi-Leroy A.,DaVid B.(1993).疏水相互作用层析分离纯化马主要变应原Equ c 1..J.Chromatogr.621:23-31。
79D.Goubran Botros H.,Rabillon J.,Gregoire C.,David B.,Dandeu J.P.1998.亲硫吸附层析:纯化Equ c 2和Equ c 3,两个马汗中的马变应原.J.Chromatogr.B 710:57-65。
79E.Hilger C,Kohnen M,Grigioni F,Lehners C,Hentges F.猫和猪血清白蛋白间的变应***叉反应.Allergy 52:179-187,1997;和Hilger C,Grigioni F,Hentges F.基因编码猫(Felis domesticus)血清白蛋白的序列.Gene 169:295-296,1996。
79F.Ichikawa K,Vailes LD,Pomes A,Chapman MD.猫变应原——cystatin(Fel d 3),一种半胱氨酸蛋白酶抑制剂的分子克隆、表达和建模.Clin Exp Allergy,In Press 2001。
80.McDonald,B.,M.C.Kuo,J.L.Ohman,和L.J.Rosenwasser.1988.一种来自鼠α2真球蛋白的29个氨基酸的肽引发鼠变应原特异性人T细胞(abst).J.Allergy Clin.Immunol.83:251.
81.Clarke,A.J.,P.M.Cissold,R.A.Shawi,P.Beattie,和J.Bishop.1984.鼠尿蛋白基因的结构:3′-非编码区的不同剪接构型.EMBO J 3:1045-1052。
82.Longbottom,J.L.1983.来自实验动物尿的变应原的鉴定.McMillanPress,London,pp.525-529。
83.Laperche,Y.,K.R.Lynch,K.P.Dolans,和P.Feigelsen.1983.α2u球蛋白基因表达的组织特异性控制:在颌下腺的组成性合成.Cell 32:453-460。
83A.Bush RK,Sanchez H,Geisler D.1999.一种主要链格孢变应原,rAlt a2的分子克隆.J Allergy Clin Immunol 104:665-671。
83B.Aukrust L,Borch SM.1979.两个多主枝孢变应原的部分纯化和鉴定.Int Arch Allergy Appl Immunol 60:68-79。
83C.Sward-Nordmo M,Paulsen BS,Wold JK.1988.来自多主枝孢的糖蛋白变应原Ag-54(Cla h II).糖部分的结构研究.Int Arch Allergy Appllmmunol 85:288-294。
84.Shen,et al.J.Allergy Clin.Immunol.103:S157,1999。
84A.Crameri R.烟曲霉参与过敏性疾病的传染病学和分子基础.Contrib.Microbiol.Vol.2,Karger,Basel(in press)。
84B.Shen,et al.(manuscript submitted),1999。
84C.Shen HD,Ling WL,Tan MF,Wang SR,Chou H,Han SIH.液泡丝氨酸蛋白酶:烟曲霉的一种主要变应原.10th International Congress ofImmunology,Abstract,1998。
85.Kumar,A.,L.V.Reddy,A.Sochanik,和V.P.Kurup.1993.烟曲霉重组热休克蛋白的分离和鉴定.J.Allergy Clin.Immunol.91:1024-1030。
86A.Shen HD,Lin WL,Tsai JJ,Liaw SF,Han SH.1996.青霉属三个不同种中的变应原成分:主要变应原中的交叉反应.Clin Exp Allergy 26:444-451。
86B.Shen,et al.Abstract;The XVIH Congress of the European Academyof Allergology and Clinical Immunology,Brussels,Belgium,3-7 July 1999。
87.Shen HD,Liaw SF,Lin WL,Ro LH,Yang HL,Han SH.1995.用MoAbs对编码特异青霉的68kDa变应原的cDNA进行分子克隆.Clin ExpAllergy 25:350-356。
88.Shen,H.D.,K.B.Choo,H.H.Lee,J.C.Hsieh,和S.H.Han.1991.白色念珠菌(Candida albicans)的40kd变应原是一种醇脱氢酶:用单克隆抗体进行分子克隆和免疫学分析.Clin.Exp.Allergy 21:675-681。
89.Shen,et al.Clin.Exp.Allergy(出版中),1999。
90.Woodfolk JA,Wheatley LM,Piyasena RV,Benjamin DC,Platts-MillsTA.1998.IgE抗体相关的Trichophyton抗原和延迟型超敏反应.与两个丝氨酸蛋白酶家族的序列同源性.J Biol Chem 273:29489-96.
91.Deuell,B.,L.K.Arruda,M.L.Hayden,M.D.Chapman和T.A.E.Platts-Mills.1991.断发癣菌变应原I.J.Immunol.147:96-101。
91A.Schmidt M,Zargari A,Holt P,Lindbom L,Hellman U,Whitley P,van der Ploeg I,Harfast B,Scheynius A.1997.糠状鳞斑霉的第一个主要变应原蛋白的完整cDNA序列及其表达,Mal f 1.Eur J Biochem 246:181-185.
91B.Homer WE,Reese G,Lehrer SB.1995.鉴定来自basidiomycetePsilocybe cubensis的变应原Psi c 2是一种真菌亲环蛋白.Int Arch AllergyImmunol 107:298-300。
91C.Hoffinan DR,Schmidt JO.2000.亚洲蜜蜂的磷脂酶.J Allergy ClinImmunol 105:S56(abs)。
92.Kuchler,K.,M.Gmachl,M.J.Sippl,和G.Kreil.1989.对蜜蜂毒液腺磷脂酶A2 cDNA的分析:缩短的氨基酸序列揭示和相应脊椎动物酶的同源性.Eur.J.Biochem.184:249-254。
93.Gmachl,M.,和G.Kreil.1993.蜜蜂毒液透明质酸酶和一种哺乳动物***膜蛋白同源.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:3569-3573。
93A.Hoffinan DR.1977.蜜蜂毒液III中的变应原.鉴定变应原B是一种酸性磷酸酶.J Allergy Clin.Immunol.59:364-366。
94.Habermann,E.1972.蜜蜂和胡蜂毒液.Science 177:314-322。
95.Hoffinan DR,Jacobson RS.1996.Hymenoptera毒液XXVII中的变应原:大黄蜂毒液***反应和变应原.J.Allergy Clin.Immunol.97:812-821。
95A.Hoffinan DR,El-Choufani AE,Smith MM,de Groot H.2001.对大黄蜂毒液的职业***反应:Bombus terrestris的变应原.J Allergy ClinImmunol(出版中)。
95B.Helm R,Cockrell G,Stanley JS,Brenner RJ,Burks W,Bannon GA.1996.编码参与IgE介导的蟑螂超敏反应的一种主要变应原(Bla g Bd90K)的克隆的分离和.J Allerg Clin Immunol 98:172-180。
95C.Pomes A,Melen E,Vailes LD,Retief JD,Arruda LK,Chapman MD.1998.来自德国和美国蟑螂的具有串联的氨基酸重复序列的新的变应原结构.J Biol Chem 273:30801-30807。
96.Arruda LK,Vailes LD,Mann BJ,Shannon J,Fox JW,Vedvick TS,Hayden ML,Chapman MD.一种主要蟑螂(Blattella germanica德国蟑螂)变应原,Bla g 2的分子克隆.序列与天冬氨酸蛋白酶具有同源性.JBiol Chem 270:19563-19568,1995。
97.Arruda LK,Vailes LD,Hayden ML,Benjamin DC,Chapman MD.蟑螂变应原Bla g 4的克隆,鉴定配体结合蛋白(或者calycins)为产生IgE抗体反应的原因.J Biol Chem 270:31196-31201,1995。
98.Arruda LK,Vailes LD,Benj amin DC,Chapman MD.德国蟑螂(Blattella germanica)变应原的分子克隆.Int Arch Allergy Immunol 107:295-297,1995。
98A.Wu CH,Wang NM,Lee MF,Kao CYY,Luo SF.1998.美国蟑螂Cr-PII变应原的克隆:种间存在交叉反应变应原的证据.J Allergy ClinImmunol 101:832-840。
98B.Melen E,Pomes A,Vailes LD,Arruda LK,Chapman MD.1999.Per a1的分子克隆和组1蟑螂变应原交叉反应的定义.J Allergy Clin Immunol103:859-64。
98C.Wu CH,Lee MF,Liao SC,Luo SF.编码美国蟑螂Cr-PI变应原的cDNA克隆的序列分析.J Biol Chem 271:17937-17943,1996。
*98D.Wu CH,Lee MF,Wang NM,Luo SF.美国蟑螂Per a 3(Cr-PI)isoallergenic variants的测序和免疫化学鉴定.Molecular Immunol 34:1-8,1997。
98E.Santos ABR,Chapman MD,Aalberse RC,Vailes LD,Ferriani VPL,Oliver C,Rizzo MC,Naspitz CK,Arruda LK.1999.蟑螂变应原和巴西的哮喘:鉴定原肌球蛋白作为和螨与虾变应原有潜在交叉反应的一种主要变应原.J Allergy Clin Immunol 104:329-337。
98F.Asturias JA,Gomez-BaynoN,Arilla MC,Martinez A,Palacios R,Sanchez-Gascon,Martinez J.1999.美国蟑螂原肌球蛋白(Periplanetaamericana变应原7)——一种交叉反应变应原的分子鉴定.J Immunol162:4342-4348.
99.Mazur,G.,X.Baur,和V.Libers.1990.对双翅目摇蚊科血红蛋白的超敏反应:它们的免疫原和变应原位点的结构和功能研究.Monog.Allergy28:121-137。
100.Soldatova,L.,L.Kochoumian,和T.P.King.1993.一种大黄蜂(D.maculata)毒液变应原磷脂酶Al和哺乳动物脂酶的序列相似性.FEBSLetters 320:145-149。
101.Lu,G.,L.Kochoumian和T.P.King.白斑脸大黄蜂毒液变应原透明质酸酶:克隆及其与其他蛋白(abst.)的序列相似性.1994.J.Allergy Clin.Immunol.93:224。
102.Fang,K.S.F.,M.Vitale,P.Fehlher,和T.P.King.1988.一种白斑脸大黄蜂毒液变应原——抗原5的cDNA克隆和一级结构.Proc.Natl.Acad.Sci.,USA 85:895-899。
103.King,T.P.,D.C.Moran,D.F.Wang,L.Kochoumian,和B.T.Chait.1990.一种大黄蜂毒液变应原抗原5,Dol m V的结构研究及其与其他蛋白的序列相似性.Prot.Seq.Data Anal.3:263-266。
104.Lu,G.,M.Villalba,M.R.Coscia,D.R.Hoffman,和T.P.King.1993.来自大黄蜂、黄蜂和小黄蜂的一种毒液变应原——抗原5的序列分析和抗原交叉反应.J.Immunol.150:2823-2830.
105.King,T.P.和Lu,G.1997.未发表的数据。
105A.King TP,Lu G,Gonzalez M,Qian N和Soldatova L.1996.小黄蜂毒液变应原,透明质酸酶和磷脂酶:与大黄蜂和黄蜂同系物的序列相似性及抗原交叉反应性以及其在临床***反应中的可能参与作用.J.AllergyClin.Immunol.98:588-600。
106.Hoffinan,D.R.1993.hymenoptera毒液XXV中的变应原:抗原5的氨基酸序列以及抗原交叉反应的结构基础.J.Allergy Clin.Immunol.92:707-716.
107.Hoffman,D.R.1992.Unpublished data。
108.Hoffinan,D.R.1993.雄蜂王毒液磷脂酶的完整氨基酸序列(abst).J.Allergy Clin.Immunol.91:187。
109.Jacobson,R.S.,D.R.Hoffinan,和D.M.Kemeny.1992.蜜蜂和黄蜂透明质酸酶的交叉反应有结构基础(abst).J.Allergy Clin.Immunol.89:292。
110.Hoffman,D.R.1993.Hymenoptera毒液XXIV中变应原:进口的火蚁和毒液变应原Sol i II,Sol i III,和Sol i IV的氨基酸序列.J.AllergyClin.Immunol.91:71-78。
111.Schmidt,M.,R.B.Walker,D.R.Hoffman,和T.J.McConnell.1993.编码火蚁毒液蛋白Sol i II的cDNA核苷酸序列.FEBS Letters 319:138-140。
112.Elsayed S,Bennich H.来自鳕的变应原M的一级结构。Scand JImmunol 3:683-686,1974。
113.Elsayed S,Aas K,Sletten K,Johansson SGO.一同种鳕鱼变应原的胰蛋白酶切割和两种活性多肽片段的分离.Immunochemistry 9:647-661,1972。
114.Hoffman,D.R.1983.鸡蛋白中变应原的免疫化学鉴定.J.Allergy Clin.Immunol.71:481-486.
115.Langeland,T.1983.鸡蛋白中***反应的临床和免疫学研究.IV.在鸡蛋过敏病人中的对鸡蛋蛋白中和临床鱼免疫参数相关的个人变应原的特异性IgE抗体.Allergy 38:493-500。
116.Daul,C.B.,M.Slattery,J.E.Morgan,和S.B.Lehrer.1993.普通甲壳纲变应原:用虾特异性单克隆抗体鉴定B细胞表位.在:″变应原的分子生物学和免疫学″(D.Kraft和A.Sehon,eds.).CRC Press,Boca Raton.pp.291-293.
117.K.N.Shanti,B.M.Martin,S.Nagpal,D.D.Metcalfe,P.V.SubbaRao.1993.鉴定原肌球蛋白是虾主要变应原并鉴定其IgE-结合表位.J.Immunol.151:5354-5363。
117A.M.Miyazawa,H.Fukamachi,Y.Inagaki,G.Reese,C.B.Daul,S.B.Lehrer,S.Inouye,M.Sakaguchi.1996.一种乌贼(T0darodes pacificus)第一个主要变应原的鉴定.J.Allergy Clin.Immunol.98:948-953。
117B.Lopata AL,Zinn C,Potter PC.在鲍鱼(Haliotis midae)中一种特异49kd IgE-结合蛋白(Hal-m-1)的鉴定和超敏反应特征.J.Allergy Clin.Immunol.100:642-648,1997。
117C.K.Hoffmann-Sommergruber,G.O′Riordain,H.Ahorn,C.Ebher,M.Laimer Da Camara Machado,H.Phringer,O.Scheiner,H.Breiteneder.1999.来自胡萝卜的Dau c 1——Bet v 1同源的蛋白的分子鉴定及其与Bet v 1和Api g 1的交叉反应.Clin Exp Allergy 29:840-847。
118.Monsalve,R.I.,M.A.Gonzalez de la Pena,L.Menendez-Arias,C.Lopez-Otin,M.Villalba,和R.Rodriguez.1993.一种新的芥菜变应原的鉴定,Bra j IE.Detection of an allergenic epitope.Biochem.J.293:625-632。
118A.MonsalVe RI,Gonzalez de la Pena MA,Lopez-Otin C,Fiandor A,Fernandez C,Villalba M,Rodriguez R.1997.油菜籽粉末中一种气源式致敏原蛋白的检测、分离和完全氨基酸序列.Clin Exp Allergy 27:833-841.119.Mena,M.,R.Sanchez?Monge,L.Gomez,G.Salcedo,和P.Carbonero.1992.和面包师哮喘病相关的一种主要大麦变应原是一种昆虫α-淀粉酶的糖基化单体抑制物:其cDNA克隆和基因的染色体定位.PlantMolec.Biol.20:451-458.
119A.Xu H,Theerakulpisut P,Goulding N,Suphioglu C,Singh M.B.Bhalla P.L.稻花粉主要变应原Ory s 1的克隆、表达和免疫学鉴定.Gene164:255-259,1995.
119B.Pastorello EA,Ortolani C,Farioli L,Pravettoni V,Ispano M,BorgaA,Bengtsson A,Incorvaia C,Berti C,Zanussi C.1994.***反应综合症病人的桃子、杏子、李子和樱桃的变应原交叉反应:体内和体外研究.J.Allergy Clin.Immunol.94:699-707。
120.Menendez-Arias,L.,I.Moneo,J.Dominguez,和R.Rodriguez.1988.黄色芥菜(Sinapis alba L.)种子一种主要变应原的一级结构,Sin a I.Eur.J.Biochem.177:159-166。
121.Gonzalez R,Varela J,Carreira J,Polo F.大豆疏水蛋白和大豆豆荚过敏.Lancet 346:48-49,1995。
121A.Pastorello EA,Va rin E,Farioli L,Pravettoni V,Ortolani C,Trambaioli C,Fortunato D,Giuffrida MG,Rivolta F,Robino A,CalamariAM,Lacava L,Conti A.芝麻种子(Sesamum indicum)的主要变应原是一种2S白蛋白.J.Chromatogr.B Biomed.Sci.Appl.756:85-93,2001。
121B.Moneo I,Caballero ML,Gomez F,Ortega E,Alonso MJ.鱼寄生虫简单异尖线虫(Anisakis simplex)的一种主要变应原的分离和鉴定.J.Allergy Clin.Immunol.106:177-182,2000。
121C.Asturias JA,Eraso E,Martinez A.2000.原肌球蛋白是Anisakis中的一种变应原吗?Allergy 55:898-890。
122.Christie,J.F.,B.Dunbar,I.Davidson,和M.W.Kennedy.1990.人蛔虫(Ascaris lnmbricoides)和猪蛔虫(Ascaris suum)的一种主要变应原以及对其应答的MHC-限制的IgE的N-末端氨基酸序列鉴定.Immunology 69:596-602.
122A.Onizuka R,Kamiya H,Muramoto K,Goto R,Inoue K,KumamotoK,Nakajima Y,Iida S,Ishigami F.红色软珊瑚(Dendrophythyanipponica)主要变应原的纯化.Int Arch Allergy Immunol,In press 2001。
123.Czuppon AB,Chen Z,Rennert S,Engelke T,Meyer HE,Heber M,Baur X.橡胶树(Hevea brasiliensis)的橡胶延伸因子是橡浆中主要变应原.J Allergy Clin Immunol 92:690-697,1993。
124.Attanayaka DPSTG,Kekwick RGO,Franklin FCH.1991.来自橡胶树(hevea brasiliensis)的橡胶延伸因子基因的分子克隆和核苷酸测序.Plant Mol Biol 16:1079-1081。
125.Chye ML,Cheung KY.1995.J 1,3-葡聚糖酶在橡胶树(Heveabrasiliensis)的乳汁细胞中大量表达.Plant Mol Biol 26:397-402。
126.Alenius H,Palosuo T,Kelly K,Kurup V,Reunala T,Makinen-Kiljunen S,Turjanmaa K Fink J.1993.IgE对脊柱裂和其他先天性异常的橡胶过敏儿童中14-kD和27-kD的天然橡胶蛋白的反应.Int ArchAllergy Immunol 102:61-66。
127.Yeang HY,Cheong KF,Sunderasan E,Hamzah S,Chew NP,Hamid S,Hamilton RG,Cardosa MJ.1996.14.6kD(REF,Hev b 1)和24kD(Hev b 3)橡胶颗粒蛋白被来自橡浆过敏的脊柱裂(Spina Bifida)病人的IgE所识别.J Allerg Clin Immunol in press。
128.Sunderasan E,Hamzah S,Hamid S,Ward MA,Yeang HY,CardosaMJ.1995.Latex B-血清J-1,3-葡聚糖酶(Hev b 2)和微螺旋的一个组分(Hev b 4)是主要橡浆变应原.J nat Rubb Res 10:82-99.
表9.蛋白质数据库(PDB)中可得到其结构的变应原
ID NO:1A0K
登记:02-12-1997实验方法:X-射线衍射分辨率:2.20_
标题  拟南芥抑制蛋白I
分类  细胞骨架
化合物  Mol_Id:1;分子:抑制蛋白;链:无;工程化:重组植物蛋白;生
        物单元:单体
ID NO:1A9V
登记:10-4-1998实验方法:核磁共振,10个结构
标题  主要屋尘螨变应原Der P 2的三级结构,核磁共振,10个结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:螨变应原Der P 2;链:无;工程化:是;突变:
        D1S;其他细节:以增强N末端Met去除而制备的D1S突变株
ID NO:1AHK
登记:07-4-1997实验方法:核磁共振,最小化平均结构
标题  Der F 2,粉尘螨的主要螨变应原,核磁共振,最小化平均结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:Der F 2;链:无;同物异名:Der F II;工程化:
        是
ID NO:1AHM
登记:07-4-1997实验方法:核磁共振,10个结构
标题  Der F 2,粉尘螨的主要螨变应原,核磁共振,10个结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:Der F 2;链:无;同物异名:Der F II;工程化:
        是
ID NO:1B6F
登记:13-1-1999实验方法:核磁共振,23个结构
标题  桦属花粉变应原Bet V 1
分类  植物蛋白
化合物  Mol_Id:1;分子:主要花粉变应原Bet V 1-A;链:A;工程化:是;
        突变:是
ID NO:1BBG
登记:24-4-1998实验方法:核磁共振,最小化平均结构
标题  来自三裂豚草V的豚草花粉变应原,核磁共振,最小化平均结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:花粉变应原5;链:无
ID NO:1BJ7
登记:02-7-1998实验方法:X-射线衍射分辨率:1.80_
标题  牛Lipocalin变应原Bos D 2
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:D 2;链:无;同物异名:皮屑主要变应原
        Bda20,皮肤变应原Bda20;工程化:是;生物单元:单体
ID NO:1BMW
登记:27-7-1998实验方法:核磁共振,38个结构
标题  植物变应原中的一种III型纤连蛋白折叠:来自梯牧草花粉的Phl Pii
      的溶液结构,核磁共振,38个结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:花粉变应原Phl P2;链:无;同物异名:Phl P
        II;工程化:是;生物单元:单体
ID NO:1BTV
登记:30-1-1997实验方法:核磁共振,20个结构
标题  Bet V 1的结构,核磁共振,20个结构
分类  主要桦树花粉变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:Bet V 1;链:无;工程化:是
ID NO:1BV1
登记:08-7-1997实验方法:X-射线衍射分辨率:2.00_
标题  桦属花粉变应原Bet V 1
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:Bet V 1;链:无;同物异名:主要花粉变应原
        Bet V 1-A;工程化:是
ID NO:1BWH
登记:24-9-1998实验方法:X-射线衍射分辨率:1.80_
标题  利用Ground Control生长的鸡蛋卵清溶菌酶的四方晶系的1.8A结
      构
分类  水解酶
化合物  Mod_Id:1;分子:溶菌酶;链:A;同物异名:Gal D IV,变应原
        Gal D 4;Ec:3.2.1.17
ID NO:1BWI
登记:24-9-1998实验方法:X-射线衍射分辨率:1.80_
标题  利用Microbatch Oil Drop生长的鸡蛋卵清溶菌酶四方晶系的1.8A
      结构
分类  水解酶
化合物  Mol_Id:1;分子:溶菌酶;链:A;同物异名:Gal D IV,变应原
        Gal D4;Ec:3.2.1.17
ID NO:1BWJ
登记:18-9-1998实验方法:X-射线衍射分辨率:1.80_
标题  微重力生长的鸡蛋卵清溶菌酶四方晶系的1.8A结构
分类  水解酶
化合物  Mol Id:1;分子:溶菌酶;链:A;同物异名:Gal D IV,变应原
        Gal D4;Ec:3.2.1.17
ID NO:1CQA
登记:26-7-1996实验方法:X-射线衍射分辨率:2.40_
标题  桦属花粉抑制蛋白
分类  收缩蛋白质
化合物  Mol_Id:1;分子:抑制蛋白;链:无;工程化:是
ID NO:1E09
登记:15-3-2000实验方法:核磁共振,22个结构
标题  主要樱桃变应原Pru Av 1的溶液结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:Pru Av 1;链:A;工程化:是
ID NO:1EW3
登记:21-4-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:2.30_
标题  主要马变应原Equ C 1的晶体结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:变应原Equ C 1;链:A;工程化:是
ID NO:1F2K
登记:26-5-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:2.30_
标题  卡氏棘阿米巴(Acanthamoeba Castellanii)抑制蛋白II的晶体结
       构,立方晶型
分类  结构蛋白
化合物  Mol_Id:1;分子:抑制蛋白II;链:A,B;工程化:是
ID NO:1FCQ
登记:19-7-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:1.60_
标题  蜜蜂毒液透明质酸酶的晶体结构(单斜晶系)
分类  水解酶
化合物  Mol_Id:1;分子:透明质酸葡糖胺酶;链:A;同物异名:透明质酸
        酶,Api M II;Ec:3.2.1.35;工程化:是
ID NO:1FCU
登记:19-7-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:2.10_
标题  蜜蜂毒液透明质酸酶晶体结构(三角系)
分类  水解酶
化合物  Mol_Id:1;分子:透明质酸葡糖胺酶;链:A;同物异名:透明质酸
        酶,Api M II;Ec:3.2.1.35;工程化:是
ID NO:1FCV
登记:19-7-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:2.65_
标题  蜜蜂毒液透明质酸酶在与透明质酸四聚体的复合体中的晶体结构
分类  水解酶
化合物  Mol_Id:1;分子:透明质酸葡糖胺酶;链:A;同物异名:透明质酸
        酶,Api M II;Ec:3.2.1.35;工程化:是
ID NO:1FLQ
登记:15-8-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:1.80_
标题  用丙氨酸代替甘氨酸的鸡蛋卵清溶菌酶突变体
分类  水解酶
化合物  Mol_Id:1;分子:溶菌酶;链:A;同物异名:1,4--N-乙酰胞壁质
        酶C,变应原Gal D 4,Gal D IV;Ec:3.2.1.17;工程化:是;突变:
        是
ID NO:1FLU
登记:15-8-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:1.78_
标题  用丙氨酸代替甘氨酸的鸡蛋卵清溶菌酶突变体
分类  水解酶
化合物  Mol_Id:1;分子:溶菌酶;链:A;同物异名:1,4--N-乙酰胞壁质
        酶C,变应原Gal D 4,Gal D IV;Ec:3.2.1.17;工程化:是;突变:
        是
ID NO:1FLW
登记:15-8-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:1.81_
标题  用丙氨酸代替甘氨酸的鸡蛋卵清溶菌酶突变体
分类  水解酶
化合物  Mol_Id:1;分子:溶菌酶;链:A;同物异名:1,4--N-乙酰胞壁质
        酶C,变应原Gal D 4,Gal D IV;Ec:3.2.1.17;工程化:是;突变:
        是
ID NO:1FLY
登记:15-8-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:1.83_
标题  用丙氨酸代替甘氨酸的鸡蛋卵清溶菌酶突变体
分类  水解酶
化合物  Mol_Id:1;分子:溶菌酶;链:A;同物异名:1,4--N-乙酰胞壁质
        酶C,变应原Gal D 4,Gal D IV;Ec:3.2.1.17;工程化:是;突变:
        是
ID NO:1FN5
登记:21-8-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:1.78_
标题  用丙氨酸代替甘氨酸的鸡蛋卵清溶菌酶突变体
分类  水解酶
化合物  Mol_Id:1;分子:溶菌酶;链:A;同物异名:1,4--N-乙酰胞壁质
        酶C,变应原Gal D 4,Gal D IV;Ec:3.2.1.17;工程化:是;突变:
        是
ID NO:1FSK
登记:11-9-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:2.90_
标题  一种单克隆IgG抗体Fab片段和桦属花粉主要变应原Bet V 1之间
      形成复合物
分类  免疫***
化合物  Mol_Id:1;分子:主要花粉变应原Bet V 1-A;链:A,D,G,J;同物
        异名:Bet V I-A,Betvi变应原;工程化:是
        Mol_Id:2;分子:免疫球蛋白轻链;链:B,E,H,K;同物异名:
        Bvl6 Fab-片段,Mopc21编码序列;工程化:是
        Mol_Id:3;分子:抗体重链Fab;链:C,F,I,L;同物异名:单克
        隆抗体Mst2的重链;工程化:是
ID NO:1G5U
登记:02-11-2000实验方法:X-射线衍射分辨率:3.10_
标题  橡胶抑制蛋白Hevb8
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:抑制蛋白;链:A,B;工程化:是
ID NO:1H6M
登记:19-6-2001实验方法:X-射线衍射分辨率:1.64_
标题  鸡蛋卵清溶菌酶的共价糖基-酶中间体
分类  水解酶(O-糖基)
化合物  Mol_Id:1;分子:溶菌酶C;同物异名:1,4--N-胞壁质酶C,变应
        原Gal D 4,Gal D IV;链:A;Ec:3.2.1.17;工程化:是;突变:是;
        其他细节:共价2-氟壳二糖基酶中间体
ID NO:1JTI
登记:21-8-2001实验方法:X-射线衍射分辨率:2.30_
标题  Pl-Pl′切割的卵清蛋白突变体R339T的环***的结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:卵清蛋白;链:A,B;工程化:是;突变:是
ID NO:1JTT
登记:22-8-2001实验方法:X-射线衍射分辨率:2.10_
标题  抗原-抗体复合物中的简并界面
分类  免疫***,溶菌酶
化合物  Mol_Id:1;分子:Vh单结构域抗体;链:A;片段:Vh区片段;
        工程化:是
        Mol_Id:2;分子:溶菌酶;链:L;片段:酶;同物异名:1,4--N-
        乙酰胞壁质酶C,变应原Gal D IV;Ec:3.2.1.17
ID NO:1KOK
登记:19-9-2001实验方法:X-射线衍射分辨率:2.35_
标题  酵母抑制蛋白,立方晶型
分类  收缩蛋白质
化合物  Mol_Id:1;分子:抑制蛋白;链:A;工程化:是
ID NO:1KKC
登记:07-12-2001实验方法:X-射线衍射分辨率:2.00_
标题  烟曲霉Mnsod的晶体结构
分类  氧化还原酶
化合物  Mol_Id:1;分子:二氧化锰歧化酶;链:A,B,X,Y;
同物异名:Mnsod;Ec:1.15.1.1;工程化:是
ID NO:1KUR
登记:22-1-2002实验方法:理论模型
标题  山雪松花粉变应原Jun A 3的理论模型
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:变应原Jun A 3;链:A;同物异名:致病相关
        蛋白
ID NO:1PLM
登记:09-1-1998实验方法:理论模型
标题  和聚-L-脯氨酸复合的拟南芥属抑制蛋白1,理论模型
分类  复合物(蛋白/肽)
化合物  Mol_Id:1;分子:抑制蛋白1;链:A;工程化:是Mol Id:2;
        分子:聚-L-脯氨酸;链:B;工程化:是
ID NO:1PRQ
登记:18-8-1997实验方法:X-射线衍射分辨率:2.50_
标题  卡氏棘阿米巴(Acanthamoeba Castellanii)抑制蛋白la
分类  收缩蛋白质
化合物  Mol_Id:1;分子:抑制蛋白la;链:无;工程化:是
ID NO:1QMR
登记:06-10-1999实验方法:X-射线衍射分辨率:2.15_
标题  桦属花粉变应原Bet V 1突变体N28T,K32Q,E45S,P108G
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:主要花粉变应原Bet V 1-A;链:A;同物异名:
        BetV 1;工程化:是;突变:是
ID NO:1QNX
登记:25-10-1999实验方法:X-射线衍射分辨率:1.90_
标题Ves V 5,一种常见黄胡蜂毒液变应原
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:Ves V 5;链:A;同物异名:抗原5;工程化:
        是
ID NO:1WHO
登记:04-4-1997实验方法:X-射线衍射分辨率:1.90_
标题  变应原Phl P 2
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:变应原Phl P 2;链:无;同物异名:Phl P II;
        工程化:是
ID NO:1WHP
登记:04-4-1997实验方法:X-射线衍射分辨率:3.00_
标题  变应原Phl P 2
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:变应原Phl P 2;链:无;同物异名:Phl P II;
        工程化:是
ID NO:2BBG
登记:24-4-1998实验方法:核磁共振,30个结构
标题  三裂豚草的豚草花粉变应原V,核磁共振,30个结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:花粉变应原5;链:无
ID NO:3BBG
登记:24-4-1998实验方法:核磁共振,2个结构
标题  三裂豚草的豚草花粉变应原V的Multi-Conformer结构,核磁共振,2
      个结构
分类  变应原
化合物  Mol_Id:1;分子:花粉变应原5;链:无
ID NO:3NUL
登记:27-11-1996实验方法:X-射线衍射分辨率:1.60_
标题  拟南芥抑制蛋白I
分类  肌动蛋白-结合蛋白
化合物  Mol_Id:1;分子:抑制蛋白I;链:无;工程化:硒代甲硫氨酰
        基蛋白.
序列表
<110>洛克菲勒大学和ALK阿贝罗股份有限公司(The Rockefeller University ALK
     Abello)
<120>保留天然变应原的免疫原性并具减弱的变应原性的重组杂合变应原构建体
<130>2313/2H587WO0
<150>US 60/272,818
<151>2001-03-02
<160>98
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>8
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂(Vespula vulgaris)
<400>1
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys
1               5
<210>2
<211>18
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>2
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys
<210>3
<211>24
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>3
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro
            20
<210>4
<211>32
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>4
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
<210>5
<211>39
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>5
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln
        35
<210>6
<211>46
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>6
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys
        35                  40                  45
<210>7
<211>48
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>7
Gln Val Gly Gln Asn Val Ala Leu Thr Gly Ser Thr Ala Ala Lys Tyr
1               5                   10                  15
Asp Asp Pro Val Lys Leu Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp
            20                  25                  30
Tyr Asn Pro Lys Lys Lys Phe Ser Gly Asn Asp Phe Leu Lys Thr Gly
        35                  40                  45
<210>8
<211>49
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>8
His Tyr Thr Gln Met Val Trp Ala Asn Thr Lys Glu Val Gly Cys Gly
1               5                   10                  15
Ser Ile Lys Tyr Ile Gln Glu Lys Trp His Lys His Tyr Leu Val Cys
            20                  25                  30
Asn Tyr Gly Pro Ser Gly Asn Phe Lys Asn Glu Glu Leu Tyr Gln Thr
        35                  40                  45
Lys
<210>9
<211>11
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>9
Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
1               5                   10
<210>10
<211>11
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>10
Leu Thr Gly Ser Thr Ala Ala Lys Tyr Asp Asp
1               5                   10
<210>11
<211>9
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>11
Pro Lys Lys Lys Phe Ser Gly Asn Asp
1               5
<210>12
<211>7
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>12
Ile Gln Ile Lys Trp His Lys
1               5
<210>13
<211>10
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>13
Phe Lys Asn Glu Glu Leu Tyr Gln Thr Lys
1               5                   10
<210>14
<211>615
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>14
aacaattatt gtaaaataaa atgtttgaaa ggaggtgtcc atactgcctg caaatatgga    60
agtcttaaac cgaattgcgg taataaggta gtggtatcct atggtctaac gaaacaagag    120
aaacaagaca tcttaaagga gcacaatgac tttagacaaa aaattgcacg aggattggag    180
actagaggta atcctggacc acagcctcca gcgaagaata tgaaaaattt ggtatggaac    240
gacgagttag cttatgtcgc ccaagtgtgg gctaatcaat gtcaatatgg tcacgatact    300
tgcagggatg tagcaaaata tcaggttgga caaaacgtag ccttaacagg tagcacggct    360
gctaaatacg atgatccagt taaactagtt aaaatgtggg aagatgaagt gaaagattat    420
aatcctaaga aaaagttttc gggaaacgac tttctgaaaa ccggccatta cactcaaatg    480
gtttgggcta acaccaagga agttggttgt ggaagtataa aatacattca agagaaatgg    540
cacaaacatt accttgtatg taattatgga cccagcggaa actttaagaa tgaggaactt    600
tatcaaacaa agtaa                                                     615
<210>15
<211>618
<212>DNA
<213>Polistes annularis
<400>15
gttgattatt gtaaaataaa gtgtccaagt ggtatccata cagtctgcca atatggagaa    60
tcgacaaaac caagcaagaa ttgtgccggt aaagtaatca aatcggttgg tccaacggaa    120
gaggagaaaa aattaatcgt aagcgagcat aatcggttta gacaaaaagt tgcacagggg    180
ttggaaacaa gaggtaatcc tggaccacaa cctgctgcct cggacatgaa tgatttggta    240
tggaacgatg aattagcaca tatcgcgcaa gtatgggcca gccaatgcca atttctcgta    300
cacgacaaat gcaggaatac cgcaaaatat ccagttggac aaaatatagc gtatgcaggt    360
ggttctaact taccagatgt agtcagtcta atcaaacttt gggaaaacga agtgaaagat    420
tttaattaca atacaggaat aacaaaacaa aactttgcta aaattggcca ttacactcaa    480
atggtttggg gtaaaactaa agaaattggt tgtggatctc taaaatatat ggaaaataat    540
atgcaaaatc attacctcat atgtaattat ggaccagctg gaaattactt gggtcaacta    600
ccttatacaa aaaaataa                                                  618
<210>16
<211>204
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>16
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys G1y Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Lys Ile Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Lys Asn Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Tyr Val Ala Gln Val Trp Ala Asn Gln Cys Gln Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Thr Cys Arg Asp Val Ala Lys Tyr Gln Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Val Ala Leu Thr Gly Ser Thr Ala Ala Lys Tyr Asp Asp Pro Val Lys
        115                 120                 125
Leu Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Asn Pro Lys Lys
    130                 135                 140
Lys Phe Ser Gly Asn Asp Phe Leu Lys Thr Gly His Tyr Thr Gln Met
145                 150                 155                 160
Val Trp Ala Asn Thr Lys Glu Val Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr Ile
                165                 170                 175
Gln Glu Lys Trp His Lys His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ser
            180                 185                 190
Gly Asn Phe Lys Asn Glu Glu Leu Tyr Gln Thr Lys
        195                 200
<210>17
<211>205
<212>PRT
<213>Polistes annularis
<400>17
Val Asp Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Pro Ser Gly Ile His Thr Val Cys
1               5                   10                  15
Gln Tyr Gly Glu Ser Thr Lys Pro Ser Lys Asn Cys Ala Gly Lys Val
            20                  25                  30
Ile Lys Ser Val Gly Pro Thr Glu Glu Glu Lys Lys Leu Ile Val Ser
        35                  40                  45
Glu His Asn Arg Phe Arg Gln Lys Val Ala Gln Gly Leu Glu Thr Arg
    50                  55                  60
Gly Asn Pro Gly Pro Gln Pro Ala Ala Ser Asp Met Asn Asp Leu Val
65                  70                  75                  80
Trp Asn Asp Glu Leu Ala His Ile Ala Gln Val Trp Ala Ser Gln Cys
                85                  90                  95
Gln Phe Leu Val His Asp Lys Cys Arg Asn Thr Ala Lys Tyr Pro Val
            100                 105                 110
Gly Gln Asn Ile Ala Tyr Ala Gly Gly Ser Asn Leu Pro Asp Val Val
        115                 120                 125
Ser Leu Ile Lys Leu Trp Glu Asn Glu Val Lys Asp Phe Asn Tyr Asn
    130                 135                 140
Thr Gly Ile Thr Lys Gln Asn Phe Ala Lys Ile Gly His Tyr Thr Gln
145                 150                 155                 160
Met Val Trp Gly Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Leu Lys Tyr
                165                 170                 175
Met Glu Asn Asn Met Gln Asn His Tyr Leu Ile Cys Asn Tyr Gly Pro
            180                 185                 190
Ala Gly Asn Tyr Leu Gly Gln Leu Pro Tyr Thr Lys Lys
        195                 200                 205
<210>18
<211>24
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>18
aacaattatt gtaaaataaa atgt                                           24
<210>19
<211>54
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>19
aacaattatt gtaaaataaa atgtttgaaa ggaggtgtcc atactgcctg caaa          54
<210>20
<211>72
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>20
aacaattatt gtaaaataaa atgtttgaaa ggaggtgtcc atactgcctg caaatatgga    60
agtcttaaac cg                                                        72
<210>21
<211>96
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>21
aacaattatt gtaaaataaa atgtttgaaa ggaggtgtcc atactgcctg caaatatgga    60
agtcttaaac cgaattgcgg taataaggta gtggta                              96
<210>22
<211>117
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>22
aacaattatt gtaaaataaa atgtttgaaa ggaggtgtcc atactgcctg caaatatgga    60
agtcttaaac cgaattgcgg taataaggta gtggtatcct atggtctaac gaaacaa       117
<210>23
<211>138
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>23
aacaattatt gtaaaataaa atgtttgaaa ggaggtgtcc atactgcctg caaatatgga    60
agtcttaaac cgaattgcgg taataaggta gtggtatcct atggtctaac gaaacaagag    120
aaacaagaca tcttaaag                                                  138
<210>24
<211>144
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>24
caggttggac aaaacgtagc cttaacaggt agcacggctg ctaaatacga tgatccagtt    60
aaactagtta aaatgtggga agatgaagtg aaagattata atcctaagaa aaagttttcg    120
ggaaacgact ttctgaaaac cggc                                           144
<210>25
<211>147
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>25
cattacactc aaatggtttg ggctaacacc aaggaagttg gttgtggaag tataaaatac    60
attcaagaga aatggcacaa acattacctt gtatgtaatt atggacccag cggaaacttt    120
aagaatgagg aactttatca aacaaag                                        147
<210>26
<211>33
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>26
cttaaaccga attgcggtaa taaggtagtg gta                                 33
<210>27
<211>33
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>27
ttaacaggta gcacggctgc taaatacgat gat                                 33
<210>28
<211>27
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>28
cctaagaaaa agttttcggg aaacgac                                        27
<210>29
<211>21
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>29
attcaagaga aatggcacaa a                                              21
<210>30
<211>30
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>30
tttaagaatg aggaacttta tcaaacaaag                                     30
<210>31
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Ves v 5′EA的有义PCR primer 1
<400>31
cgtgaattca acaattattg taaaataaaa                                     30
<210>32
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Ves v 5′KR的有义PCR引物2
<400>32
cgtctcgaga aaagaaacaa ttattgtaaa ataaaa                              36
<210>33
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>Ves v 3′下游反义PCR引物3
<400>33
cgttctagat tactttgttt gataaagttc                                     30
<210>34
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Pol a 5′EA的有义PCR引物4
<400>34
cgtgaattcg ttgattattg taaaataaaa                                     30
<210>35
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Pol a 5′KR的有义PCR引物5
<400>35
cgtctcgaga aaagagttga ttattgtaaa ataaaa                              36
<210>36<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>Pol a 3′下游反义引物6
<400>36
cgttctagat tatttttttg tataaggtag                                     30
<210>37
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Pol a第49-50位氨基酸EH的诱变有义PCR引物7
<400>37
gtaagcgagc acaatcggtt t                                              21
<210>38
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Pol a第49-50位氨基酸EH的诱变反义PCR引物8
<400>38
aaaccgattg tgctcgctta c                                              21
<210>39
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Ves v ApoI转换的PCR引物9
<400>39
gtagcaaaat ttcaggttgg a                                              21
<210>40
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Ves v ApoI转换的PCR引物10
<400>40
tccaacctga aattttgcta c                                              21
<210>41
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Pol a ApoI转换的PCR引物11
<400>41
accgcaaaat ttccagttgg a                                              21
<210>42
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>用于Pol a ApoI转换的PCR引物12
<400>42
tccaactgga aattttgcgg t                                              21
<210>43
<211>72
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV1-18的有义PCR引物13
<400>43
cgtgaattca acaattattg taaaataaaa tgtttgaaag gaggtgtcca tactgcctgc    60
aaatatggag aa                                                        72
<210>44
<211>54
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV195-204的反义PCR引物14
<400>44
cgttctagat tactttgttt gataaagttc ctcattctta aaatttccag ctgg          54
<210>45
<211>33
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV18-24和PV1-24的反义PCR引物15
<400>45
ggcacaattc ttgctcggtt taagacttcc ata                                 33
<210>46
<211>33
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV18-24和PV1-24的有义PCR引物16
<400>46
tatggaagtc ttaaaccgag caagaattgt gcc                                 33
<210>47
<211>45
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV22-32和PV1-32的有义PCR引物17
<400>47
cttaaaccga attgcggtaa taaggtagtg gtatcggttg gtcca                    45
<210>48
<211>45
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV22-32和PV1-32的反义PCR引物18
<400>48
tggaccaacc gataccacta ccttattacc gcaattcggt ttaag                    45
<210>49
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV1-39的PCR引物19
<400>49
tatggtctaa cgaaacaaga gaaaaaatta atcgta                              36
<210>50
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV1-39的PCR引物20
<400>50
tacgattaat tttttctctt gtttcgttag accata                              36
<210>51
<211>45
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV115-125的有义PCR引物21
<400>51
ttaacaggta gcacggctgc taaatacgat gatgtagtca gtcta                    45
<210>52
<211>45
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV115-125的反义PCR引物22
<400>52
atcatcgtat ttagcagccg tgctacctgt taacgctata ttttg                    45
<210>53
<211>42
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV142-150的有义PCR引物23
<400>53
cctaagaaaa agttttcggg aaacgacttt gctaaaattg gc                       42
<210>54
<211>42
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV142-150的反义PCR引物24
<400>54
gtcgtttccc gaaaactttt tcttaggatt aaaatctttc ac                       42
<210>55
<211>33
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV176-182的有义PCR引物25
<400>55
attcaagaga aatggcacaa acattacctc ata                                 33
<210>56
<211>33
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV176-182的反义PCR引物26
<400>56
tttgtgccat ttctcttgaa tatattttag aga                                 33
<210>57
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV1-50的反义PCR引物27
<400>57
gagcacaatg actttagaca aaaa                                           24
<210>58
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV1-57的反义PCR引物28
<400>58
tttttgtcta aagtcattgt gctc                                           24
<210>59
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PV1-76的反义PCR引物29
<400>59
aaaattgcac gagggttgga aaca                                           24
<210>60
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PCR引物
<400>60
tgtttccaac cctcgtgcaa tttt                                           24
<210>61
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PCR引物
<400>61
aatatgaaaa atttggtatg gaac                                           24
<210>62
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>PCR引物
<400>62
gttccatacc aaatttttca tatt                                           24
<210>63
<211>204
<212>PRT
<213>Vespula maculifrons
<400>63
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Lys Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Lys Ile Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Lys Asn Leu Val Trp Ser
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Tyr Ile Ala Gln Val Trp Ala Asn Gln Cys Gln Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Thr Cys Arg Asp Val Ala Lys Tyr Gln Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Val Ala Leu Thr Gly Ser Thr Ala Ala Val Tyr Asn Asp Pro Val Lys
        115                 120                 125
Leu Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Asn Pro Lys Lys
    130                 135                 140
Lys Phe Ser Glu Asn Asn Phe Leu Lys Ile Gly His Tyr Thr Gln Met
145                 150                 155                 160
Val Trp Ala Asn Thr Lys Glu Val Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr Ile
                165                 170                 175
Gln Glu Asn Trp His Lys His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ser
            180                 185                 190
Gly Asn Phe Gln Asn Glu Glu Leu Tyr Gln Thr Lys
        195                 200
<210>64
<211>204
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>64
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Lys Ile Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Lys Asn Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Tyr Val Ala Gln Val Trp Ala Asn Gln Cys Gln Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Thr Cys Arg Asp Val Ala Lys Tyr Gln Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Val Ala Leu Thr Gly Ser Thr Ala Ala Lys Tyr Asp Asp pro Val Lys
        115                 120                 125
Leu Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Asn Pro Lys Lys
    130                 135                 140
Lys Phe Ser Gly Asn Asp Phe Leu Lys Thr Gly His Tyr Thr Gln Met
145                 150                 155                 160
Val Trp Ala Asn Thr Lys Glu Val Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr Ile
                165                 170                 175
Gln Glu Lys Trp His Lys His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ser
            180                 185                 190
Gly Asn Phe Met Asn Glu Glu Leu Tyr Gln Thr Lys
        195                 200
<210>65
<211>204
<212>PRT
<213>Vespula flavopilosa
<400>65
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Lys Ile Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Lys Asn Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Tyr Val Ala Gln Val Trp Ala Asn Gln Cys Gln Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Thr Cys Arg Asp Ile Ala Lys Tyr Gln Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Val Ala Leu Thr Gly Ser Thr Ala Ala Lys Tyr Asp Asp Pro Val Lys
        115                 120                 125
Leu Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Asn Pro Lys Lys
    130                 135                 140
Lys Phe Ser Gly Asn Asn Phe Leu Lys Thr Gly His Tyr Thr Gln Met
145                 150                 155                 160
Val Trp Ala Asn Thr Lys Glu Val Gly Cys Gly Ser Ile Lys Phe Ile
                165                 170                 175
Gln Glu Lys Trp His Lys His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ser
            180                 185                 190
Gly Asn Phe Gln Asn Glu Glu Leu Tyr Gln Thr Lys
        195                 200
<210>66
<211>204
<212>PRT
<213>树黄胡蜂(Vespula pensylvanica)
<400>66
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Ile Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Glu Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Lys Ile Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Lys Asn Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Tyr Val Ala Gln Val Trp Ala Asn Gln Cys Gln Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Thr Cys Arg Asp Val Ala Lys Tyr Pro Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Val Ala Leu Thr Gly Ser Thr Ala Asp Lys Tyr Asp Asn Pro Val Lys
        115                 120                 125
Leu Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Asn Pro Lys Lys
    130                 135                 140
Lys Phe Ser Glu Asn Asn Phe Asn Lys Ile Gly His Tyr Thr Gln Met
145                 150                 155                 160
Val Trp Ala Asn Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr Ile
                165                 170                 175
Gln Asn Glu Trp His Lys His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ser
            180                 185                 190
Gly Asn Phe Gly Asn Glu Glu Leu Tyr Gln Thr Lys
        195                 200
<210>67
<211>204
<212>PRT
<213>德国黄胡蜂(Vespula germanica)
<400>67
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Glu Ser Leu Lys Pro Asn Cys Ala Asn Lys Lys Val Val
            20                  25                  30
Ala Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Lys Ile Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Lys Asn Leu Val Trp Ser
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Tyr Ile Ala Gln Val Trp Ala Asn Gln Cys Gln Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Thr Cys Arg Asp Val Ala Lys Tyr Pro Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Val Ala Leu Thr Gly Ser Thr Ala Ala Lys Tyr Asp Asn Pro Val Lys
        115                 120                 125
Leu Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Asn Pro Lys Lys
    130                 135                 140
Lys Phe Ser Glu Asn Asn Phe Leu Lys Ile Gly His Tyr Thr Gln Met
145                 150                 155                 160
Val Trp Ala Asn Thr Lys Glu Val Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr Ile
                165                 170                 175
Gln Asp Lys Trp His Lys His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ser
            180                 185                 190
Gly Asn Phe Gly Asn Glu Glu Leu Tyr Gln Thr Lys
        195                 200
<210>68
<211>206
<212>PRT
<213>Vespula vidua
<400>68
Lys Val Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr
1               5                   10                  15
Ala Cys Lys Tyr Gly Thr Ser Thr Lys Pro Asn Cys Gly Lys Met Val
            20                  25                  30
Val Lys Ala Tyr Gly Leu Thr Glu Ala Glu Lys Gln Glu Ile Leu Lys
        35                  40                  45
Val His Asn Asp Phe Arg Gln Lys Val Ala Lys Gly Leu Glu Thr Arg
    50                  55                  60
Gly Asn Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Asn Asn Leu Val
65                  70                  75                  80
Trp Asn Asp Glu Leu Ala Asn Ile Ala Gln Val Trp Ala Ser Gln Cys
                85                  90                  95
Asn Tyr Gly His Asp Thr Cys Lys Asp Thr Glu Lys Tyr Pro Val Gly
            100                 105                 110
Gln Asn Ile Ala Lys Arg Ser Thr Thr Ala Ala Leu Phe Asp Ser Pro
        115                 120                 125
Gly Lys Leu Val Lys Met Trp Glu Asn Glu Val Lys Asp Phe Asn Pro
    130                 135                 140
Asn Ile Glu Trp Ser Lys Asn Asn Leu Lys Lys Thr Gly His Tyr Thr
145                 150                 155                 160
Gln Met Val Trp Ala Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Val Lys
                165                 170                 175
Tyr Val Lys Asp Glu Trp Tyr Thr His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly
            180                 185                 190
Pro Ser Gly Asn Phe Arg Asn Glu Lys Leu Tyr Glu Lys Lys
        195                 200                 205
<210>69
<211>205
<212>PRT
<213>Vespula squamosa
<400>69
Val Asp Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Thr Ser Thr Lys Pro Asn Cys Gly Asn Met Val Val
            20                  25                  30
Lys Ser Tyr Gly Val Thr Gln Ala Glu Lys Gln Glu Ile Leu Lys Ile
        35                  40                  45
His Asn Asp Phe Arg Asn Lys Val Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly
    50                  55                  60
Asn Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Asn Asn Leu Val Trp
65                  70                  75                  80
Asn Asn Glu Leu Ala Asn Ile Ala Gln Ile Trp Ala Ser Gln Cys Lys
                85                  90                  95
Tyr Gly His Asp Thr Cys Lys Asp Thr Thr Lys Tyr Asn Val Gly Gln
            100                 105                 110
Asn Ile Ala Val Ser Ser Ser Thr Ala Ala Val Tyr Glu Asn Val Gly
        115                  120                 125
Asn Leu Val Lys Ala Trp Glu Asn Glu Val Lys Asp Phe Asn Pro Thr
    130                 135                 140
Ile Ser Trp Glu Gln Asn Glu Phe Lys Lys Ile Gly His Tyr Thr Gln
145                 150                 155                 160
Met Val Trp Ala Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr
                165                 170                 175
Val Asp Asn Asn Trp Tyr Thr His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro
            180                 185                 190
Ala Gly Asn Phe Gly Asn Gln Glu Val Tyr Glu Arg Lys
        195                 200                 205
<210>70
<211>204
<212>PRT
<213>Dolichovespula maculata
<400>70
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Arg Lys Gly Ile His Thr Leu Cys
1               5                   10                  15
Lys Phe Gly Thr Ser Met Lys Pro Asn Cys Gly Arg Asn Val Val Lys
            20                  25                  30
Ala Tyr Gly Leu Thr Asn Asp Glu Lys Asn Glu Ile Leu Lys Arg His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Asn Val Ala Lys Gly Leu Glu Thr Arg Gly Lys
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Asn Val Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Lys Ile Ala Gln Thr Trp Ala Asn Gln Cys Asp Phe
                85                  90                  95
Asn His Asp Asp Cys Arg Asn Thr Ala Lys Tyr Gln Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Ile Ala Ile Ser Ser Thr Thr Ala Thr Gln Phe Asp Arg Pro Ser Lys
        115                 120                 125
Leu Ile Lys Gln Trp Glu Asp Glu Val Thr Glu Phe Asn Tyr Lys Val
    130                 135                 140
Gly Leu Gln Asn Ser Asn Phe Arg Lys Val Gly His Tyr Thr Gln Met
145                 150                 l55                 160
Val Trp Gly Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr Ile
                165                 170                 175
Glu Asp Asn Trp Tyr Thr His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Gly
            180                 185                 190
Gly Asn Asp Phe Asn Gln Pro Ile Tyr Glu Arg Lys
        195                 200
<210>71
<211>203
<212>PRT
<213>Dolichovespula arenaria
<400>71
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Cys Pro Lys Gly Thr His Thr Leu Cys Lys
1               5                   10                  15
Tyr Gly Thr Ser Met Lys Pro Asn Cys Gly Gly Lys Ile Val Lys Ser
            20                  25                  30
Tyr Gly Val Thr Asn Asp Glu Lys Asn Glu Ile Val Lys Arg His Asn
        35                  40                  45
Glu Phe Arg Gln Lys Val Ala Gln Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn Pro
    50                  55                  60
Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Asn Leu Leu Val Trp Asn Asp
65                  70                  75                  80
Glu Leu Ala Lys Ile Ala Gln Thr Trp Ala Asn Gln Cys Asn Phe Gly
                85                  90                  95
His Asp Gln Cys Arg Asn Thr Ala Lys Tyr Pro Val Gly Gln Asn Val
            100                 105                 110
Ala Ile Ala Ser Thr Thr Gly Asn Ser Tyr Gln Thr Met Ser Tyr Leu
        115                 120                 125
Ile Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Asn Pro His Lys Asp
    130                 135                 140
Leu Met His Asn Asn Phe Ser Lys Val Gly His Tyr Thr Gln Met Val
145                 150                 155                 160
Trp Gly Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Val Lys Tyr Ile Glu
                165                 170                 175
Asn Lys Trp His Thr His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ala Gly
            180                 185                 190
Asn Tyr Met Asn Gln Pro Val Tyr Glu Arg Lys
        195                 200
<210>72
<211>205
<212>PRT
<213>Dolichovespula maculata
<400>72
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Ser Arg Gly Ile His Thr Leu Cys
1               5                   10                  15
Lys Phe Gly Thr Ser Met Lys Pro Asn Cys Gly Ser Lys Leu Val Lys
            20                  25                  30
Val His Gly Val Ser Asn Asp Glu Lys Asn Glu Ile Val Asn Arg His
        35                  40                  45
Asn Gln Phe Arg Gln Lys Val Ala Lys Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Asn Val Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Lys Ile Ala Gln Thr Trp Ala Asn Gln Cys Ser Phe
                85                  90                  95
Gly His Asp Gln Cys Arg Asn Thr Glu Lys Tyr Gln Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Val Ala Ile Ala Ser Thr Thr Gly Asn Ser Tyr Ala Thr Met Ser Lys
        115                 120                 125
Leu Ile Glu Met Trp Glu Asn Glu Val Lys Asp Phe Asn Pro Lys Lys
    130                 135                 140
Gly Thr Met Gly Asp Asn Asn Phe Ser Lys Val Gly His Tyr Thr Gln
145                 150                 155                 160
Met Val Trp Gly Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Val Lys Tyr
                165                 170                 175
Ile Glu Asn Asn Trp His Thr His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro
            180                 185                 190
Ala Gly Asn Tyr Met Asp Gln Pro Ile Tyr Glu Arg Lys
        195                 200                 205
<210>73
<211>202
<212>PRT
<213>金环胡蜂(Vespa mandarinia)
<400>73
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Arg Ser Gly Ile His Thr Leu Cys
1               5                   10                  15
Lys Phe Gly Ile Ser Thr Lys Pro Asn Cys Gly Lys Asn Val Val Lys
            20                  25                  30
Ala Ser Gly Leu Thr Lys Ala Glu Lys Leu Glu Ile Leu Lys Gln His
        35                  40                  45
Asn Glu Phe Arg Gln Lys Val Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Lys
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Ser Met Asn Thr Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Gln Ile Ala Gln Val Trp Ala Gly Gln Cys Asp Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Val Cys Arg Asn Thr Ala Lys Tyr Ser Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Ile Ala Glu Asn Gly Ser Thr Ala Ala Ser Phe Ala Ser Val Ser Asn
        115                 120                 125
Met Val Gln Met Trp Ala Asp Glu Val Lys Asn Tyr Gln Tyr Gly Ser
    130                 135                 140
Thr Lys Asn Lys Leu Ile Glu Val Gly His Tyr Thr Gln Met Val Trp
145                 150                 155                 160
Ala Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr Ile Glu Asn
                165                 170                 175
Gly Trp His Arg His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ala Gly Asn
            180                 185                 190
Ile Gly Asn Glu Pro Ile Tyr Glu Arg Lys
        195                 200
<210>74
<211>202
<212>PRT
<213>黄边胡蜂(Vespa crabro)
<400>74
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Arg Ser Gly Ile His Thr Leu Cys
1               5                   10                  15
Lys Tyr Gly Thr Ser Thr Lys Pro Asn Cys Gly Lys Asn Val Val Lys
            20                  25                  30
Ala Ser Gly Leu Thr Lys Gln Glu Asn Leu Glu Ile Leu Lys Gln His
        35                  40                  45
Asn Glu Phe Arg Gln Lys Val Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Ser Met Asn Thr Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Gln Ile Ala Gln Val Trp Ala Asn Gln Cys Asn Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Asn Cys Arg Asn Ser Ala Lys Tyr Ser Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Ile Ala Glu Gly Ser Thr Thr Ala Asp Asn Phe Gly Ser Val Ser Asn
        115                 120                 125
Met Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Gln Tyr Gly Ser
    130                 135                 140
Pro Lys Asn Lys Leu Asn Lys Val Gly His Tyr Thr Gln Met Val Trp
145                 150                 155                 160
Ala Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr Ile Glu Asn
                165                 170                 175
Gly Trp His Arg His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ala Gly Asn
            180                 185                 190
Val Gly Asn Glu Pro Ile Tyr Glu Arg Lys
        195                 200
<210>75
<211>202
<212>PRT
<213>黄边胡蜂(Vespa crabro)
<400>75
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Arg Ser Gly Ile His Thr Leu Cys
1               5                   10                  15
Lys Tyr Gly Thr Ser Thr Lys Pro Asn Cys Gly Lys Asn Val Val Lys
            20                  25                  30
Ala Ser Gly Leu Thr Lys Gln Glu Asn Leu GluIle Leu Lys Gln His
        35                  40                  45
Asn Glu Phe Arg Gln Lys Val Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Ser Met Asn Thr Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Gln Ile Ala Gln Val Trp Ala Asn Gln Cys Asn Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Asn Cys Arg Asn Ser Ala Lys Tyr Ser Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Ile Ala Glu Gly Ser Thr Ser Ala Asp Asn Phe Val Asn Val Ser Asn
        115                 120                 125
Met Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Gln Tyr Gly Ser
    130                 135                 140
Pro Lys Asn Lys Leu Asn Lys Val Gly His Tyr Thr Gln Met Val Trp
145                 150                 155                 160
Ala Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Glu Asp Tyr Ile Glu Asp
                165                 170                 175
Gly Trp His Arg His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ala Gly Asn
            180                 185                 190
Val Gly Asn Glu Pro Ile Tyr Glu Arg Lys
        195                 200
<210>76
<211>205
<212>PRT
<213>Polistes fuscatus
<400>76
Val Asp Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Ser Ser Gly Ile His Thr Val Cys
1               5                   10                  15
Gln Tyr Gly Glu Ser Thr Lys Pro Ser Lys Asn Cys Ala Asp Lys Val
            20                  25                  30
Ile Lys Ser Val Gly Pro Thr Glu Glu Glu Lys Lys Leu Ile Val Asn
        35                  40                  45
Glu His Asn Arg Phe Arg Gln Lys Val Ala Gln Gly Leu Glu Thr Arg
    50                  55                  60
Gly Asn Pro Gly Pro Gln Pro Ala Ala Ser Asp Met Asn Asn Leu Val
65                  70                  75                  80
Trp Asn Asp Glu Leu Ala His Ile Ala Gln Val Trp Ala Ser Gln Cys
                85                  90                  95
Gln Ile Leu Val His Asp Lys Cys Arg Asn Thr Ala Lys Tyr Gln Val
            100                 105                 110
Gly Gln Asn Ile Ala Tyr Ala Gly Gly Ser Lys Leu Pro Asp Val Val
        115                 120                 125
Ser Leu Ile Lys Leu Trp Glu Asn Glu Val Lys Asp Phe Asn Tyr Asn
    130                 135                 140
Lys Gly Ile Thr Lys Gln Asn Phe Gly Lys Val Gly His Tyr Thr Gln
145                 150                 155                 160
Met Ile Trp Ala Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Leu Lys Tyr
                165                 170                 175
Met Lys Asn Asn Met Gln His His Tyr Leu Ile Cys Asn Tyr Gly Pro
            180                 185                 190
Ala Gly Asn Tyr Leu Gly Gln Leu Pro Tyr Thr Lys Lys
        195                 200                 205
<210>77
<211>205
<212>PRT
<213>Polistes exclamans
<400>77
Val Asp Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Pro Ser Gly Ile His Thr Val Cys
1               5                   10                  15
Gln Tyr Gly Glu Ser Thr Lys Pro Ser Lys Asn Cys Ala Gly Lys Val
            20                  25                  30
Ile Lys Ser Val Gly Pro Thr Glu Glu Glu Lys Lys Leu Ile Val Ser
        35                  40                  45
Glu His Asn Arg Phe Arg Gln Lys Val Ala Gln Gly Leu Glu Thr Arg
    50                  55                  60
Gly Asn Pro Gly Pro Gln Pro Ala Ala Ser Asp Met Asn Asp Leu Val
65                  70                  75                  80
Trp Asn Asp Glu Leu Ala His Ile Ala Gln Val Trp Ala Ser Gln Cys
                85                  90                  95
Gln Phe Leu Val His Asp Lys Cys Arg Asn Thr Ala Lys Tyr Pro Val
            100                 105                 110
Gly Gln Asn Ile Ala Tyr Ala Gly Gly Ser Lys Leu Pro Asp Val Val
        115                 120                 125
Ser Leu Ile Lys Leu Trp Glu Asn Glu Val Lys Asp Phe Asn Tyr Asn
    130                 135                 140
Thr Gly Ile Thr Lys Gln Asn Phe Ala Lys Ile Gly His Tyr Thr Gln
145                 150                 155                 160
Met Val Trp Gly Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Leu Lys Tyr
                165                 170                 175
Ile Glu Asn Lys Met Gln Asn His Tyr Leu Ile Cys Asn Tyr Gly Pro
            180                 185                 190
Ala Gly Asn Tyr Leu Gly Gln Leu Pro Tyr Thr Lys Lys
        195                 200                 205
<210>78
<211>205
<212>PRT
<213>Polistes annularis
<400>78
Val Asp Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Pro Ser Gly Ile His Thr Val Cys
1               5                   10                  15
Gln Tyr Gly Glu Ser Thr Lys Pro Ser Lys Asn Cys Ala Gly Lys Val
            20                  25                  30
Ile Lys Ser Val Gly Pro Thr Glu Glu Glu Lys Lys Leu Ile Val Ser
        35                  40                  45
Glu His Asn Arg Phe Arg Gln Lys Val Ala Gln Gly Leu Glu Thr Arg
    50                  55                  60
Gly Asn Pro Gly Pro Gln Pro Ala Ala Ser Asp Met Asn Asp Leu Val
65                  70                  75                  80
Trp Asn Asp Glu Leu Ala His Ile Ala Gln Val Trp Ala Ser Gln Cys
                85                  90                  95
Gln Phe Leu Val His Asp Lys Cys Arg Asn Thr Ala Lys Tyr Pro Val
            100                 105                 110
Gly Gln Asn Ile Ala Tyr Ala Gly Gly Ser Asn Leu Pro Asp Val Val
        115                 120                 125
Ser Leu Ile Lys Leu Trp Glu Asn Glu Val Lys Asp Phe Asn Tyr Asn
    130                 135                 140
Thr Gly Ile Thr Lys Gln Asn Phe Ala Lys Ile Gly His Tyr Thr Gln
145                 150                 155                 160
Met Val Trp Gly Lys Thr Lys Glu Ile Gly Cys Gly Ser Leu Lys Tyr
                165                 170                 175
Met Glu Asn Asn Met Gln Asn His Tyr Leu Ile Cys Asn Tyr Gly Pro
            180                 185                 190
Ala Gly Asn Tyr Leu Gly Gln Leu Pro Tyr Thr Lys Lys
        195                 200                 205
<210>79
<211>212
<212>PRT
<213>红外来火蚁(Solenopsis invicta)
<400>79
Thr Asn Tyr Cys Asn Leu Gln Ser Cys Lys Arg Asn Asn Ala Ile His
1               5                   10                  15
Thr Met Cys Gln Tyr Thr Ser Pro Thr Pro Gly Pro Met Cys Leu Glu
            20                  25                  30
Tyr Ser Asn Val Gly Phe Thr Asp Ala Glu Lys Asp Ala Ile Val Asn
        35                  40                  45
Lys His Asn Glu Leu Arg Gln Arg Val Ala Ser Gly Lys Glu Met Arg
    50                  55                  60
Gly Thr Asn Gly Pro Gln Pro Pro Ala Val Lys Met Pro Asn Leu Thr
65                  70                  75                  80
Trp Asp Pro Glu Leu Ala Thr Ile Ala Gln Arg Trp Ala Asn Gln Cys
                85                  90                  95
Thr Phe Glu His Asp Ala Cys Arg Asn Val Glu Arg Phe Ala Val Gly
            100                 105                 110
Gln Asn Ile Ala Ala Thr Ser Ser Ser Gly Lys Asn Lys Ser Thr Pro
        115                 120                 125
Asn Glu Met Ile Leu Leu Trp Tyr Asn Glu Val Lys Asp Phe Asp Asn
    130                 135                 140
Arg Trp Ile Ser Ser Phe Pro Ser Asp Asp Asn Ile Leu Met Lys Val
145                 150                 155                 160
Glu His Tyr Thr Gln Ile Val Trp Ala Lys Thr Ser Lys Ile Gly Cys
                165                 170                 175
Ala Arg Ile Met Phe Lys Glu Pro Asp Asn Trp Thr Lys His Tyr Leu
            180                 185                 190
Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ala Gly Asn Val Leu Gly Ala Pro Ile Tyr
        195                 200                 205
Glu Ile Lys Lys
    210
<210>80
<211>211
<212>PRT
<213>黑外来火蚁(Solenopsis richteri)
<400>80
Thr Asn Tyr Cys Asn Leu Gln Ser Cys Lys Arg Asn Asn Ala Ile His
l               5                   10                  15
Thr Met Cys Gln Tyr Thr Ser Pro Thr Pro Gly Pro Met Cys Leu Glu
            20                  25                  30
Tyr Ser Asn Val Gly Phe Thr Asp Ala Glu Lys Asp Ala Ile Val Asn
        35                  40                  45
Lys His Asn Glu Leu Arg Gln Arg Val Ala Ser Gly Lys Glu Met Arg
    50                  55                  60
Gly Thr Asn Gly Pro Gln Pro Pro Ala Val Lys Met pro Asn Leu Thr
65                  70                  75                  80
Trp Asp pro Glu Leu Ala Thr Ile Ala Gln Arg Trp Ala Asn Gln Cys
                85                  90                  95
Thr Phe Glu His Asp Ala Cys Arg Asn Val Glu Arg Phe Ala Val Gly
            100                 105                 110
Gln Asn Ile Ala Ala Thr Ser Ser Ser Gly Lys Asn Lys Ser Thr Leu
        115                 120                 125
Ser Asp Met Ile Leu Leu Trp Tyr Asn Glu Val Lys Asp Phe Asp Asn
    130                 135                 140
Arg Trp Ile Ser Ser Phe Pro Ser Asp Gly Asn Ile Leu Met His Val
145                 150                 155                 160
Gly His Tyr Thr Gln Ile Val Trp Ala Lys Thr Lys Lys Ile Gly Cys
                165                 170                 175
Gly Arg Ile Met Phe Lys Glu Asp Asn Trp Asn Lys His Tyr Leu Val
            180                 185                 190
Cys Asn Tyr G1y Pro Ala Gly Asn Val Leu Gly Ala Gln Ile Tyr Glu
        195                 200                 205
Ile Lys Lys
    210
<210>81
<211>204
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>81
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Lys Ile Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Lys Asn Leu Val Trp Asn
65                  70                  75                  80
Asp Glu Leu Ala Tyr Val Ala Gln Val Trp Ala Asn Gln Cys Gln Tyr
                85                  90                  95
Gly His Asp Thr Cys Arg Asp Val Ala Lys Tyr Gln Val Gly Gln Asn
            100                 105                 110
Val Ala Leu Thr Gly Ser Thr Ala Ala Lys Tyr Asp Asp Pro Val Lys
        115                 120                 125
Leu Val Lys Met Trp Glu Asp Glu Val Lys Asp Tyr Asn Pro Lys Lys
    130                 135                 140
Lys Phe Ser Gly Asn Asp Phe Leu Lys Thr Gly His Tyr Thr Gln Met
l45                 150                 155                 160
Val Trp Ala Asn Thr Lys Glu Val Gly Cys Gly Ser Ile Lys Tyr Ile
                165                 170                 175
Gln Glu Lys Trp His Lys His Tyr Leu Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ser
            180                 185                 190
Gly Asn Phe Met Asn Glu Glu Leu Tyr Gln Thr Lys
        195                 200
<210>82
<211>212
<212>PRT
<213>红外来火蚁
<400>82
Thr Asn Tyr Cys Asn Leu Gln Ser Cys Lys Arg Asn Asn Ala Ile His
1               5                   10                  15
Thr Met Cys Gln Tyr Thr Ser Pro Thr Pro Gly Pro Met Cys Leu Glu
            20                  25                  30
Tyr Ser Asn Val Gly Phe Thr Asp Ala Glu Lys Asp Ala Ile Val Asn
        35                  40                  45
Lys His Asn Glu Leu Arg Gln Arg Val Ala Ser Gly Lys Glu Met Arg
    50                  55                  60
Gly Thr Asn Gly Pro Gln Pro Pro Ala Val Lys Met Pro Asn Leu Thr
65                  70                  75                  80
Trp Asp Pro Glu Leu Ala Thr Ile Ala Gln Arg Trp Ala Asn Gln Cys
                85                  90                  95
Thr Phe Glu His Asp Ala Cys Arg Asn Val Glu Arg Phe Ala Val Gly
            100                 105                 110
Gln Asn Ile Ala Ala Thr Ser Ser Ser Gly Lys Asn Lys Ser Thr Pro
        115                 120                 125
Asn Glu Met Ile Leu Leu Trp Tyr Asn Glu Val Lys Asp Phe Asp Asn
    130                 135                 140
Arg Trp Ile Ser Ser Phe Pro Ser Asp Asp Asn Ile Leu Met Lys Val
145                 150                 155                 160
Glu His Tyr Thr Gln Ile Val Trp Ala Lys Thr Ser Lys Ile Gly Cys
                165                 170                 175
Ala Arg Ile Met Phe Lys Glu Pro Asp Asn Trp Thr Lys His Tyr Leu
            180                 185                 190
Val Cys Asn Tyr Gly Pro Ala Gly Asn Val Leu Gly Ala Pro Ile Tyr
        195                 200                 205
Glu Ile Lys Lys
    210
<210>83
<211>136
<212>PRT
<213>番茄(Lycopersicon esculentum)
<400>83
Gln Asn Ser Pro Gln Asp Tyr Leu Ala Val His Asn Asp Ala Arg Ala
1               5                   10                  15
Gln Val Gly Val Gly Pro Met Ser Trp Asp Ala Asn Leu Ala Ser Arg
            20                  25                  30
Ala Gln Asn Tyr Ala Asn Ser Arg Ala Gly Asp Cys Asn Leu Ile His
        35                  40                  45
Ser Gly Ala Gly Glu Asn Leu Ala Lys Gly Gly Gly Asp Phe Thr Gly
    50                  55                  60
Arg Ala Ala Val Gln Leu Trp Val Ser Glu Arg Pro Ser Tyr Asn Tyr
65                  70                  75                  80
Ala Thr Asn Gln Cys Val Gly Gly Lys Lys Cys Arg His Tyr Thr Gln
                85                  90                  95
Val Val Trp Arg Asn Ser Val Arg Leu Gly Cys Gly Arg Ala Arg Cys
            100                 105                 110
Asn Asn Asn Gly Trp Trp Phe Ile Ser Cys Asn Tyr Asp Pro Val Gly
        115                 120                 125
Asn Trp Ile Gly Gln Arg Pro Tyr
    130                 135
<210>84
<211>187
<212>PRT
<213>裂褶菌(Schizophyllum commune)
<400>84
Ser Pro Ala Pro Val Asp Val Asp Ala Arg Ala Pro Val Ala Leu Asp
1               5                   10                  15
Ser Arg Ser Ile Asp Ile Asp Ser Arg Ser Ala Asp Ala Leu Ala Asn
            20                  25                  30
Arg Ala Ala Pro Pro Gln Ser Glu Ile Asp Gln Trp Leu Lys Ala His
        35                  40                  45
Asn Asn Glu Arg Ala Gln His Gly Ala Val Ala Leu Val Trp Asn Gln
    50                  55                  60
Thr Leu Ser Asp Lys Ala Ala Asp Trp Ala Ser Gln Cys Ile Trp Glu
65                  70                  75                  80
His Ser Asn Ser Gly Gln Asn Leu Ala Ala Trp phe Ser Pro Gln Ala
                85                  90                  95
Asn Lys Pro Met Asn Ile Ser Gln Gly Val Gly Gly Trp Asn Ala Glu
            100                 105                 110
Glu Pro Asp Tyr Asn Thr Thr Thr Tyr Ser Gly Ala Gly His Trp Thr
        115                 120                 125
Gln Val Val Trp Lys Ser Thr Thr Ser Val Gly Cys Ala Ala Tyr Ser
    130                 135                 140
Cys Pro Pro Gly Thr Leu Gly Arg Lys Pro Thr Asp Pro Trp Lys Thr
145                 150                 155                 160
Leu Trp Tyr Tyr Val Cys Asn Tyr Tyr Arg Pro Gly Asn Val Ser Pro
                165                 170                 175
Arg Asp Lys Tyr Tyr Pro Ile Asn Val Gln Pro
            180                 185
<210>85
<211>239
<212>PRT
<213>人(Homo sapiens)
<400>85
Ser Thr Val Val Leu Leu Asn Ser Thr Asp Ser Ser Pro Pro Thr Asn
1               5                   10                  15
Asn Phe Thr Asp Ile Glu Ala Ala Leu Lys Ala Gln Leu Asp Ser Ala
            20                  25                  30
Asp Ile Pro Lys Ala Arg Arg Lys Arg Tyr Ile Ser Gln Asn Asp Met
        35                  40                  45
Ile Ala Ile Leu Asp Tyr His Asn Gln Val Arg Gly Lys Val Phe Pro
    50                  55                  60
Pro Ala Ala Asn Met Glu Tyr Met Val Trp Asp Glu Asn Leu Ala Lys
65                  70                  75                  80
Ser Ala Glu Ala Trp Ala Ala Thr Cys Ile Trp Asp His Gly Pro Ser
                85                  90                  95
Tyr Leu Leu Arg Phe Leu Gly Gln Asn Leu Ser Val Arg Thr Gly Arg
            100                 105                 110
Tyr Arg Ser Ile Leu Gln Leu Val Lys Pro Trp Tyr Asp Glu Val Lys
        115                 120                 125
Asp Tyr Ala Phe Pro Tyr Pro Gln Asp Cys Asn Pro Arg Cys Pro Met
    130                 135                 140
Arg Cys Phe Gly Pro Met Cys Thr His Tyr Thr Gln Met Val Trp Ala
145                 150                 155                 160
Thr Ser Asn Arg Ile Gly Cys Ala Ile His Thr Cys Gln Asn Met Asn
                165                 170                 175
Val Trp Gly Ser Val Trp Arg Arg Ala Val Tyr Leu Val Cys Asn Tyr
            180                 185                 190
Ala Pro Lys Gly Asn Trp Ile Gly Glu Ala Pro Tyr Lys Val Gly Val
        195                 200                 205
Pro Cys Ser Ser Cys Pro Pro Ser Tyr Gly Gly Ser Cys Thr Asp Asn
    210                 215                 220
Leu Cys Phe Pro Gly Val Thr Ser Asn Tyr Leu Tyr Trp Phe Lys
225                 230                 235
<210>86
<211>245
<212>PRT
<213>人
<400>86
Ala Asn Ile Leu Pro Asp Ile Glu Asn Glu Asp Phe Ile Lys Asp Cys
1               5                   10                  15
Val Arg Ile His Asn Lys Phe Arg Ser Glu Val Lys Pro Thr Ala Ser
            20                  25                  30
Asp Met Leu Tyr Met Thr Trp Asp Pro Ala Leu Ala Gln Ile Ala Lys
        35                  40                  45
Ala Trp Ala Ser Asn Cys Gln Phe Ser His Asn Thr Arg Leu Lys Pro
    50                  55                  60
Pro His Lys Leu His Pro Asn Phe Thr Ser Leu Gly Glu Asn Ile Trp
65                  70                  75                  80
Thr Gly Ser Val Pro Ile Phe Ser Val Ser Ser Ala Ile Thr Asn Trp
                85                  90                  95
Tyr Asp Glu Ile Gln Asp Tyr Asp Phe Lys Thr Arg Ile Cys Lys Lys
            100                 105                 1l0
Val Cys Gly His Tyr Thr Gln Val Val Trp Ala Asp Ser Tyr Lys Val
        115                 120                 125
Gly Cys Ala Val Gln Phe Cys Pro Lys Val Ser Gly Phe Asp A1a Leu
    130                 135                 140
Ser Asn Gly Ala His Phe Ile Cys Asn Tyr Gly Pro Gly Gly Asn Tyr
145                 150                 155                 160
Pro Thr Trp Pro Tyr Lys Arg Gly Ala Thr Cys Ser Ala Cys Pro Asn
                165                 170                 175
Asn Asp Lys Cys Leu Asp Asn Leu Cys Val Asn Arg Gln Arg Asp Gln
            180                 185                 190
Val Lys Arg Tyr Tyr Ser Val Val Tyr Pro Gly Trp Pro Ile Tyr Pro
        195                 200                 205
Arg Asn Arg Tyr Thr Ser Leu Phe Leu Ile Val Asn Ser Val Ile Leu
    210                 215                 220
Ile Leu Ser Val Ile Ile Thr Ile Leu Val Gln Leu Lys Tyr Pro Asn
225                 230                 235                 240
Leu Val Leu Leu Asp
                245
<210>87
<211>223
<212>PRT
<213>珠毒蜥(Heloderma horridum)
<400>87
Glu Ala Ser Pro Lys Leu Pro Gly Leu Met Thr Ser Asn Pro Asp Gln
1               5                   10                  15
Gln Thr Glu Ile Thr Asp Lys His Asn Asn Leu Arg Arg Ile Val Glu
            20                  25                  30
Pro Thr Ala Ser Asn Met Leu Lys Met Thr Trp Ser Asn Lys Ile Ala
        35                  40                  45
Gln Asn Ala Gln Arg Ser Ala Asn Gln Cys Thr Leu Glu His Thr Ser
    50                  55                  60
Lys Glu Glu Arg Thr Ile Asp Gly Val Glu Cys Gly Glu Asn Leu Phe
65                  70                  75                  80
Phe Ser Ser Ala Pro Tyr Thr Trp Ser Tyr Ala Ile Gln Asn Trp Phe
                 85                  90                  95
Asp Glu Arg Lys Tyr Phe Arg Phe Asn Tyr Gly Pro Thr Ala Gln Asn
            100                 105                 110
Val Met Ile Gly His Tyr Thr Gln Val Val Trp Tyr Arg Ser Tyr Glu
        115                 120                 125
Leu Gly Cys Ala Ile Ala Tyr Cys Pro Asp Gln Pro Thr Tyr Lys Tyr
    130                 135                 140
Tyr Gln Val Cys Gln Tyr Cys Pro Gly Gly Asn Ile Arg Ser Arg Lys
145                 150                 155                 160
Tyr Thr Pro Tyr Ser Ile Gly Pro Pro Cys Gly Asp Cys Pro Asp Ala
                165                 170                 175
Cys Asp Asn Gly Leu Cys Thr Asn Pro Cys Lys Gln Asn Asp Val Tyr
            180                 185                 190
Asn Asn Cys Pro Asp Leu Lys Lys Gln Val Gly Cys Gly His Pro Ile
        195                 200                 205
Met Lys Asp Cys Met Ala Thr Cys Lys Cys Leu Thr Glu Ile Lys
    210                 215                 220
<210>88
<211>222
<212>PRT
<213>人
<400>88
Lys Asp Pro Ala Phe Thr Ala Leu Leu Thr Thr Gln Leu Gln Val Gln
1               5                   10                  15
Arg Glu Ile Val Asn Lys His Asn Glu Leu Arg Lys Ala Val Ser Pro
            20                  25                  30
Pro Ala Ser Asn Met Leu Lys Met Glu Trp Ser Arg Glu Val Thr Thr
        35                  40                  45
Asn Ala Gln Arg Trp Ala Asn Lys Cys Thr Leu Gln His Ser Asp Pro
    50                  55                  60
Glu Asp Arg Lys Thr Ser Thr Arg Cys Gly Glu Asn Leu Tyr Met Ser
65                  70                  75                  80
Ser Asp Pro Thr Ser Trp Ser Ser Ala Ile Gln Ser Trp Tyr Asp Glu
                85                  90                  95
Ile Leu Asp Phe Val Tyr Gly Val Gly Pro Lys Ser Pro Asn Ala Val
            100                 105                 110
Val Gly His Tyr Thr Gln Leu Val Trp Tyr Ser Thr Tyr Gln Val Gly
        115                 120                 125
Cys Gly Ile Ala Tyr Cys Pro Asn Gln Asp Ser Leu Lys Tyr Tyr Tyr
    130                 135                 140
Val Cys Gln Tyr Cys Pro Ala Gly Asn Asn Met Asn Arg Lys Asn Thr
145                 150                 155                 160
Pro Tyr Gln Gln Gly Thr Pro Cys Ala Gly Cys Pro Asp Asp Cys Asp
                165                 170                 175
Lys Gly Leu Cys Thr Asn Ser Cys Gln Tyr Gln Asp Leu Leu Ser Asn
            180                 185                 190
Cys Asp Ser Leu Lys Asn Thr Ala Gly Cys Glu His Glu Leu Leu Lys
        195                 200                 205
Glu Lys Cys Lys Ala Thr Cys Leu Cys Glu Asn Lys Ile Tyr
    210                 215                 220
<210>89
<211>6
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>肽
<400>89
Glu Ala Glu Ala Glu Phe
1               5
<210>90
<211>4
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>肽
<400>90
Glu Ala Glu Phe
1
<210>91
<211>7
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>肽
<400>91
Arg Glu Ala Glu Ala Glu Phe
1               5
<210>92
<211>9
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>肽
<400>92
Glu Glu Gly Val Ser Leu Glu Lys Arg
1               5
<210>93
<211>50
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>93
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp
    50
<210>94
<211>57
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>94
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Lys Ile Ala Arg
    50                  55
<210>95
<211>76
<212>PRT
<213>常见黄胡蜂
<400>95
Asn Asn Tyr Cys Lys Ile Lys Cys Leu Lys Gly Gly Val His Thr Ala
1               5                   10                  15
Cys Lys Tyr Gly Ser Leu Lys Pro Asn Cys Gly Asn Lys Val Val Val
            20                  25                  30
Ser Tyr Gly Leu Thr Lys Gln Glu Lys Gln Asp Ile Leu Lys Glu His
        35                  40                  45
Asn Asp Phe Arg Gln Lys Ile Ala Arg Gly Leu Glu Thr Arg Gly Asn
    50                  55                  60
Pro Gly Pro Gln Pro Pro Ala Lys Asn Met Lys Asn
65                  70                  75
<210>96
<211>150
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>96
aacaattatt gtaaaataaa atgtttgaaa ggaggtgtcc atactgcctg caaatatgga    60
agtcttaaac cgaattgcgg taataaggta gtggtatcct atggtctaac gaaacaagag    120
aaacaagaca tcttaaagga gcacaatgac                                     150
<210>97
<211>171
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>97
aacaattatt gtaaaataaa atgtttgaaa ggaggtgtcc atactgcctg caaatatgga    60
agtcttaaac cgaattgcgg taataaggta gtggtatcct atggtctaac gaaacaagag    120
aaacaagaca tcttaaagga gcacaatgac tttagacaaa aaattgcacg a             171
<210>98
<211>228
<212>DNA
<213>常见黄胡蜂
<400>98
aacaattatt gtaaaataaa atgtttgaaa ggaggtgtcc atactgcctg caaatatgga    60
agtcttaaac cgaattgcgg taataaggta gtggtatcct atggtctaac gaaacaagag    120
aaacaagaca tcttaaagga gcacaatgac tttagacaaa aaattgcacg aggattggag    180
actagaggta atcctggacc acagcctcca gcgaagaata tgaaaaat                 228

Claims (35)

1.具有减弱的变应原性但保留免疫原性的变应原杂合蛋白质,其含有变应原蛋白质的肽表位序列和与变应原蛋白质结构同源的支架蛋白质,其中杂合蛋白质具有天然构象,并且肽表位序列的存在位置为杂合蛋白质的表面可及区域并对应于其在变应原蛋白质中的位置。
2.权利要求1所述的杂合蛋白质,其中肽表位序列在杂合蛋白质的环或转角区域。
3.权利要求1所述的杂合蛋白质,其中支架蛋白质与肽表位序列所来源的变应原具有至少50%的序列同一性。
4.权利要求1所述的杂合蛋白质,其中支架蛋白质与肽表位序列所来源的变应原蛋白质具有不超过70%的序列同一性。
5.权利要求1所述的杂合蛋白质,其中肽表位序列长约6到约55个氨基酸。
6.权利要求5所述的杂合蛋白质,其中肽表位序列长约6到约45个氨基酸。
7.权利要求6所述的杂合蛋白质,其中肽表位序列长约6到约35个氨基酸。
8.权利要求7所述的杂合蛋白质,其中肽表位序列长约6到约25个氨基酸。
9.权利要求8所述的杂合蛋白质,其中肽表位序列长约6到约15个氨基酸。
10.权利要求1所述的杂合蛋白质,其还含有信号肽。
11.权利要求1所述的杂合蛋白质,其还含有蛋白酶作用位点。
12.权利要求1所述的杂合蛋白质,其为杂合胡蜂毒液变应原蛋白质。
13.权利要求12所述的杂合蛋白质,其为杂合胡蜂毒液抗原5蛋白质。
14.权利要求13所述的杂合蛋白质,其中肽表位序列来自黄胡蜂属并且支架蛋白质来自马蜂属。
15.权利要求14所述的杂合蛋白质,其中肽表位序列来自常见黄胡蜂种。
16.权利要求14所述的杂合蛋白质,其中支架蛋白质来自Polistesannularis种。
17.权利要求13所述的杂合蛋白质,其中肽抗原含有选自下述的序列:
NNYCKIKC(SEQ ID:1);
NNYCKIKCLKGGVHTACK(SEQ ID:2);
NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKP(SEQ ID:3);
NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVV(SEQ ID:4);
NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQ(SEQ ID:5);
NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQEKQDILK(SEQ ID:6);
QVGQNVALTGSTAAKYDDPVKLVKMWEDEVKDYNPKKKFSGNDFLKTG(SEQ ID NO:7);
HYTQMVWANTKEVGCGSIKYIQEKWHKHYLVCNYGPSGNFKNEELYQTK(SEQ ID NO:8)
LKPNCGNKVVV(SEQ ID NO:9);
LTGSTAAKYDD(SEQ ID NO:10);
PKKKFSGND(SEQ ID NO:11)
IQIKWHK(SEQ ID NO:12);和
FKNEELYQTK(SEQ ID NO:13);
NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQEKQDILKEHND(SEQ ID NO:93);
NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQEKQDILKEHNDFRQKIAR(SEQ ID NO:94);
NNYCKIKCLKGGVHTACKYGSLKPNCGNKVVVSYGLTKQEKQDILKEHNDFRQKIARGLETRGNPGPQPPAKNMKN(SEQ ID NO:95)。
18.权利要求1所述的杂合蛋白质,其中肽表位序列含有保守的氨基酸改变。
19.权利要求18所述的杂合蛋白质,其中变体肽的特征为在体外测定试验中抗体对肽表位序列的结合减少至少50%,其中测定试验中变体存在的浓度不超过肽表位序列的浓度的10倍,并且测定试验测量肽表位序列对抗体的结合,所述抗体直接抗含有该肽表位序列的多肽。
20.编码权利要求1-19任意一项所述的变应原杂合蛋白质的核酸。
21.制备编码变应原杂合蛋白质的核酸的方法,所述方法包括将编码变应原蛋白质的肽表位序列的核苷酸序列导入编码与变应原蛋白质结构同源的支架蛋白质的核苷酸序列中,其中编码肽表位序列的核苷酸序列与编码支架蛋白质的核苷酸序列符合读框,并且其所在位置使得在变应原杂合蛋白质中肽表位序列的存在位置为杂合蛋白质的表面可及区域并对应于该肽表位序列在变应原蛋白质中的位置。
22.根据权利要求21所述的方法,其中将编码支架蛋白质的核苷酸序列突变以导入编码肽表位序列的核苷酸序列。
23.根据权利要求21所述的方法,其中编码肽表位序列的核苷酸的导入通过用核酸内切酶处理含有编码肽表位序列的核苷酸序列和编码支架蛋白质的核苷酸序列的核酸、将所得的片断连接来实现。
24.根据权利要求21所述的方法制备的核酸。
25.表达载体,其含有与启动子可操作连接的权利要求20的分离的核酸。
26.生产具有减弱的变应原性但保留免疫原性的变应原杂合蛋白质的方法,所述方法包括培养已经转化有权利要求25的表达载体的细胞,由此由该细胞产生杂合变应原。
27.权利要求26所述的方法,所述方法还包括从培养基、细胞,或者两者中回收杂合变应原。
28.治疗变应性疾病的方法,所述方法包括向患者施用治疗有效量的权利要求1所述的杂合蛋白质或权利要求25所述的表达载体,其中所述患者对变应原蛋白质或支架蛋白质或两者具有变应性。
29.权利要求28所述的方法,其中杂合蛋白质或表达载体通过口服、肺、鼻、局部或肠胃外途径施用。
30.药物组合物,其含有权利要求1所述的杂合蛋白质或权利要求25所述的表达载体和可药用稀释剂或载体。
31.设计具减弱的变应原性但保留免疫原性的杂合变应原的方法,所述方法包括
(a)鉴定变应原的暴露于溶剂的表面;
(b)鉴定与变应原结构同源的蛋白质;和
(c)修饰与变应原结构同源的蛋白质的序列,以并入来自变应原的溶剂暴露表面的肽序列。
32.权利要求31所述的方法,其中所述溶剂暴露表面通过物理方法鉴定。
33.权利要求32所述的方法,其中所述物理方法为X射线晶体学。
34.权利要求31所述的方法,其中所述溶剂暴露表面通过将变应原的氨基酸序列与已知三维结构的结构同源蛋白质的氨基酸序列比较而鉴定。
35.权利要求31所述的方法,其中溶剂暴露表面含有环或转角区域。
CNA02809204XA 2001-03-02 2002-03-04 保留天然变应原的免疫原性并具减弱的变应原性的重组杂合变应原构建体 Pending CN1610556A (zh)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US27281801P 2001-03-02 2001-03-02
US60/272,818 2001-03-02

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN1610556A true CN1610556A (zh) 2005-04-27

Family

ID=23041432

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CNA02809204XA Pending CN1610556A (zh) 2001-03-02 2002-03-04 保留天然变应原的免疫原性并具减弱的变应原性的重组杂合变应原构建体

Country Status (9)

Country Link
US (1) US20030039660A1 (zh)
EP (1) EP1499349B1 (zh)
JP (1) JP2005508134A (zh)
CN (1) CN1610556A (zh)
AT (1) ATE448793T1 (zh)
CA (1) CA2441476A1 (zh)
DE (1) DE60234475D1 (zh)
DK (1) DK1499349T3 (zh)
WO (1) WO2002070665A2 (zh)

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112654711A (zh) * 2018-08-29 2021-04-13 上海科技大学 Cas蛋白抑制剂的组合物及应用
CN113173982A (zh) * 2021-04-14 2021-07-27 中国海洋大学 Rap v 2蛋白相关的抗原表位肽及其应用
CN114685636A (zh) * 2022-03-04 2022-07-01 首都医科大学附属北京同仁医院 蒿属植物花粉过敏原、应用及试剂盒
CN115697069A (zh) * 2020-02-19 2023-02-03 完美日股份有限公司 低变应原性重组乳蛋白和包含其的组合物

Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1714153A (zh) * 2002-11-01 2005-12-28 阿尔克-阿贝洛有限公司 重组蛋白质变异体
WO2004078965A1 (ja) * 2003-03-05 2004-09-16 Juridical Foundation The Chemo-Sero-Therapeutic Research Institute 大腸菌における異種蛋白質の製造方法
DE602004009818T2 (de) * 2003-11-05 2008-09-18 Intercell Ag Zusammensetzungen, die von melittin abgeleitet sind und peptide enthalten, und verfahren zur potenzierung von immunreaktionen gegen target-antigene
PL1868642T3 (pl) 2005-03-18 2013-10-31 Cytos Biotechnology Ag Białka fuzyjne alergenów kocich i ich zastosowania
EP2692732A1 (en) 2012-08-03 2014-02-05 Stallergenes S.A. Novel allergen from ragweed pollen and uses thereof
US10799573B2 (en) * 2016-03-30 2020-10-13 Regents Of The University Of Minnesota Pertussis vaccines and methods of making and using

Family Cites Families (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5091309A (en) 1986-01-16 1992-02-25 Washington University Sindbis virus vectors
US5354844A (en) 1989-03-16 1994-10-11 Boehringer Ingelheim International Gmbh Protein-polycation conjugates
US5703055A (en) 1989-03-21 1997-12-30 Wisconsin Alumni Research Foundation Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery
US5264618A (en) 1990-04-19 1993-11-23 Vical, Inc. Cationic lipids for intracellular delivery of biologically active molecules
DK0550553T3 (da) 1990-09-25 2000-10-23 Cantab Pharma Res Viral defekt vaccine fremstillet af en transkomplementerende cellelinie
US5593877A (en) 1993-03-11 1997-01-14 The Rockefeller University Nucleic acid and recombinant production of vespid venom hyaluronidase
WO1994021807A2 (en) 1993-03-19 1994-09-29 Cantab Pharmaceuticals Research Limited Defective mutant non-retroviral virus (e.g. hsv) as vaccine
FR2714830B1 (fr) 1994-01-10 1996-03-22 Rhone Poulenc Rorer Sa Composition contenant des acides nucléiques, préparation et utilisations.
FR2715847B1 (fr) 1994-02-08 1996-04-12 Rhone Poulenc Rorer Sa Composition contenant des acides nucléiques, préparation et utilisations.
EP0753069A1 (en) 1994-04-15 1997-01-15 Targeted Genetics Corporation Gene delivery fusion proteins
FR2727679B1 (fr) 1994-12-05 1997-01-03 Rhone Poulenc Rorer Sa Nouveaux agents de transfection et leurs applications pharmaceutiques
FR2730637B1 (fr) 1995-02-17 1997-03-28 Rhone Poulenc Rorer Sa Composition pharmaceutique contenant des acides nucleiques, et ses utilisations
US5804201A (en) 1996-03-11 1998-09-08 The Rockefeller University Immunomodulatory peptides of vespid antigen 5
US6432699B1 (en) 1997-03-28 2002-08-13 New York University Viral vectors having chimeric envelope proteins containing the IgG-binding domain of protein A
EP0991425B1 (fr) 1997-06-30 2005-03-09 Institut Gustave Roussy Amelioration du transfert d'acide nucleique dans les cellules d'organismes eucaryotes pluricellulaires et combinaison permettant la mise en oeuvre du procede
JP2002515816A (ja) 1997-06-30 2002-05-28 アバンテイス・フアルマ・エス・アー in vivo組織に核酸ベクターを最適に電気導入する装置
JP2002507985A (ja) 1997-06-30 2002-03-12 ローヌ−プーラン・ロレ・エス・アー 横紋筋に核酸を導入する改良法およびその組合せ
WO1999047680A1 (en) * 1998-03-16 1999-09-23 Alk-Abelló A/S Mutant recombinant allergens
AU2631501A (en) * 2000-01-06 2001-07-16 Monsanto Technology Llc Preparation of deallergenized proteins and permuteins
CN1714153A (zh) * 2002-11-01 2005-12-28 阿尔克-阿贝洛有限公司 重组蛋白质变异体

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112654711A (zh) * 2018-08-29 2021-04-13 上海科技大学 Cas蛋白抑制剂的组合物及应用
CN112654711B (zh) * 2018-08-29 2024-03-26 上海科技大学 Cas蛋白抑制剂的组合物及应用
CN115697069A (zh) * 2020-02-19 2023-02-03 完美日股份有限公司 低变应原性重组乳蛋白和包含其的组合物
CN113173982A (zh) * 2021-04-14 2021-07-27 中国海洋大学 Rap v 2蛋白相关的抗原表位肽及其应用
CN113173982B (zh) * 2021-04-14 2022-09-06 中国海洋大学 Rap v 2蛋白相关的抗原表位肽及其应用
CN114685636A (zh) * 2022-03-04 2022-07-01 首都医科大学附属北京同仁医院 蒿属植物花粉过敏原、应用及试剂盒
CN114685636B (zh) * 2022-03-04 2024-03-01 首都医科大学附属北京同仁医院 蒿属植物花粉过敏原、应用及试剂盒

Also Published As

Publication number Publication date
CA2441476A1 (en) 2002-09-12
JP2005508134A (ja) 2005-03-31
EP1499349B1 (en) 2009-11-18
ATE448793T1 (de) 2009-12-15
WO2002070665A8 (en) 2004-12-16
EP1499349A2 (en) 2005-01-26
DE60234475D1 (de) 2009-12-31
WO2002070665A2 (en) 2002-09-12
DK1499349T3 (da) 2010-04-06
EP1499349A4 (en) 2005-11-16
WO2002070665A3 (en) 2004-11-11
US20030039660A1 (en) 2003-02-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN1213068C (zh) 对hiv免疫应答的改进或与其相关的改进
CN1118572C (zh) G-csf类似物组合物及其制备方法
CA2838217C (en) Peptide carrier fusion proteins as allergy vaccines
CN1484699A (zh) 新型***反应原突变体
CN101068830A (zh) 蛋白质过敏原衍生物
CN1594348A (zh) T细胞受体cdr3的序列与类风湿性关节炎的诊断及治疗方法
CN1675237A (zh) 免疫原性组合物
CN1668737A (zh) 重组Bet.V.1过敏原突变体及其方法和制备
CN1610556A (zh) 保留天然变应原的免疫原性并具减弱的变应原性的重组杂合变应原构建体
CN1901931A (zh) HIV gp41 HR2-来源的合成肽,及其在抑制人类免疫缺陷性病毒传递的治疗中的用途
CN101065398A (zh) Hsp60的肽和apl型衍生物及药物组合物
CN1254487C (zh) 抗免疫球蛋白等模式标本的重整形单克隆抗体
CN1705492A (zh) 用于诱发抗过敏原保护性免疫应答的重组核酸
CN1283120A (zh) Cd8作为细胞免疫***的抑制剂
CN1784424A (zh) 编码人癌胚抗原的合成基因及其用途
CN1714153A (zh) 重组蛋白质变异体
CN1283793C (zh) 具有骨骼肌刺激活性和免疫调节作用的趋化素样因子超家族
US8709435B2 (en) Hypallergenic mosaic antigens and methods of making same
CN1780852A (zh) 组1螨多肽变体
CN1657617A (zh) 镰形扇头蜱RhcA和RhcB基因的克隆、表达和抗蜱免疫保护作用
CN1665835A (zh) 草花粉过敏原Phl p4 的 DNA 序列和用重组方法进行的制备
CN1284854C (zh) 用于预防结核病和免疫治疗的嵌合型dna疫苗
CN1603346A (zh) 蛋白质,含有其的产品及其在诊断、治疗和/或预防sars相关疾病中的用途
CN1545552A (zh) 基因和蛋白质及它们的用途
CN1304425C (zh) 含可溶性肿瘤坏死因子II型受体和白介素I受体拮抗剂IL1Ra的融合蛋白及其制备方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
REG Reference to a national code

Ref country code: HK

Ref legal event code: DE

Ref document number: 1074574

Country of ref document: HK

C02 Deemed withdrawal of patent application after publication (patent law 2001)
WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication
REG Reference to a national code

Ref country code: HK

Ref legal event code: WD

Ref document number: 1074574

Country of ref document: HK