CN118043674A - 管理实验方案的方法、***及装置 - Google Patents
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Abstract
提高实验方案的自动执行效率。在终端装置(400)中执行的特定应用(900)根据在实验方案中使用的特定容器(Cnt2)中包含的样品的量来设定第1参数。特定应用(900)根据在实验方案中使用特定容器(Cnt2)的特定处理中的样品的变化量来设定第2参数。控制装置(110)使用第1参数及第2参数自动执行实验方案。特定应用(900)使用第2参数来更新第1参数。
Description
技术领域
本发明涉及一种管理实验方案的方法、***及装置。
背景技术
以往,已知管理实验数据的构成。例如,在非专利文献1中公开有一种实验装置控制框架,能够在色谱数据***中容易且迅速地实现液相色谱仪、液体毛细管电泳装置及气相色谱仪的控制。在非专利文献1所公开的实验装置控制框架中安装有GU I(Graph i ca lUser I nterface:图形用户界面),该GU I用于指定通过多采样器在实验容器(例如,板、阱或者培养瓶)的哪个位置以多少量注入哪个样品。
现有技术文献
非专利文献
非专利文献1:安捷伦科技,“在沃特世Empower3环境中控制Ag il ent 1260I nfi n ity/1290I nf i n ity I I多采样器(G7167A/B)”,(https://www.ag i l ent.com/cs/l i brary/techn i ca l overv i ews/pub l i c/ICF_Empower_Mu l t i samp ler.pdf)
发明内容
发明要解决的技术问题
在实验方案中使用了包含至少1个样品(内容物)的实验容器的情况下,该内容物各自的量可能相对于进行该实验方案之前的量发生变化。在再次使用在实验方案中使用过的实验容器的情况下,为了准确地执行再次使用该实验容器的实验方案,需要更新在管理实验数据的构成中设定的该实验容器的内容物的量。若每当实验方案结束时由用户逐一进行实验容器的内容物的量的更新,则可能使实验方案的自动执行的效率降低。但是,在非专利文献1中,没有考虑实验容器的内容物的量的高效更新。
本发明是为了解决这样的技术问题而完成的,其目的在于提高实验方案的自动执行的效率。
用于解决上述技术问题的方案
本发明的一方面所涉及的方法经由在终端装置中执行的特定应用来管理实验方案。方法包括:根据在实验方案中使用的特定容器中包含的样品的量,设定特定应用的第1参数的步骤;根据在实验方案中使用特定容器的特定处理中的样品的变化量,设定特定应用的第2参数的步骤;控制实验装置,使用第1参数及第2参数自动执行实验方案的步骤;以及在特定处理结束后,使用第2参数更新第1参数的步骤。
本发明的另一方面所涉及的***对实验方案进行管理。***具备实验装置、终端装置、以及控制装置。终端装置执行特定应用。控制装置控制实验装置。特定应用根据在实验方案中使用的特定容器中包含的样品的量来设定特定应用的第1参数。特定应用根据在实验方案中使用特定容器的特定处理中的样品的变化量来设定特定应用的第2参数。控制装置使用第1参数及第2参数自动执行实验方案。特定应用使用第2参数来更新第1参数。
本发明的另一方面所涉及的装置经由特定应用来管理实验方案。装置具备存储部与处理部。在存储部中保存有实现特定应用的特定程序。处理部执行特定程序。处理部根据在实验方案中使用的特定容器中包含的样品的量来设定特定应用的第1参数。处理部根据在实验方案中使用特定容器的特定处理中的样品的变化量来设定特定应用的第2参数。处理部控制实验装置,使用第1参数及第2参数自动执行实验方案。处理部在特定处理结束后,使用第2参数来更新第1参数。
发明效果
在本发明所涉及的方法、***及装置中,在执行实验方案的特定处理后,根据特定处理中的特定容器的内容物的变化量,自动更新该内容物。根据本发明所涉及的方法、***及装置,无需每当实验方案结束时由用户逐一进行特定容器的内容物的量的更新,因此能够提高实验方案的自动执行的效率。
附图说明
图1是示出实施方式所涉及的自动实验管理***的构成的框图。
图2是示出图1的终端装置的硬件构成的框图。
图3是示出图1的实验方案管理应用的实验容器管理模块的GU I构成的一例的图。
图4是示出在按下图3的追加按钮或参照按钮时显示的样品信息设定窗口的GU I构成的一例的图。
图5是示出在图4的样品信息设定窗口中按下确定按钮时显示的实验容器管理模块的图。
图6是示出在图3的样品设定窗口中按下与样品1对应的参照按钮时显示的样品信息设定窗口的图。
图7是示出在实验容器管理模块中显示有与图1的管相关的设定的状况的图。
图8是示出图1的实验方案管理应用的实验方案设计模块的GU I构成的一例的图。
图9是示出在图8的自动实验***窗口中选择了处理的状况的图。
图10是示出与在图9中选择的处理对应的处理节点被追加到方案设计窗口的状况的图。
图11是示出指定了与图10的容器节点对应的样品容器的状况的图。
图12是示出与图11的容器节点对应的实验容器的指定完成的状况的图。
图13是示出作为实验方案的设计例的有向图的图。
图14是示出在用户对图13的处理节点进行了GU I操作时显示的样品变化量设定窗口的图。
图15是示出在执行实验方案后通过样品信息设定窗口显示与在图14的样品变化量设定窗口中设定了变化量的样品相关的信息的状况的图。
图16是示出图1的服务器装置的硬件构成的框图。
图17是说明在图1的自动实验管理***中进行的基于实验方案的自动实验的流程的流程图。
图18是示出实施方式的变形例1所涉及的自动实验管理***的构成的框图。
图19是示出图18的终端装置的硬件构成的框图。
图20是示出实施方式的变形例2所涉及的自动实验***的构成的框图。
图21是示出图20的控制装置的硬件构成的框图。
具体实施方式
以下,参照附图对实施方式详细地进行说明。另外,在下文中,对图中的相同或相当部分标注相同附图标记,原则上不重复其说明。
图1是示出实施方式所涉及的自动实验管理***1000的构成的框图。如图1所示,自动实验管理***1000具备自动实验***1、服务器装置200、数据库300及终端装置400。数据库300与服务器装置200连接。在数据库300中例如记录有与自动实验***1有关的信息、与样品(例如细胞、菌株、或者试剂)有关的信息、与实验容器有关的信息、与实验容器的内容物有关的信息、实验方案及由实验方案的执行得到的输出数据(实验结果)等。终端装置400包括输入输出部430。输入输出部430包括显示器431、键盘432及触摸板433。终端装置400例如是笔记本电脑、个人计算机、智能手机及平板电脑。自动实验***1、服务器装置200及终端装置400经由网络NW相互连接。网络NW例如包括互联网、WAN(Wan Area Network:广域网)或LAN(Lan Area Network:局域网)。另外,与网络NW连接的终端装置可以是2个以上,自动实验***也可以是2个以上。
服务器装置200将实验方案管理应用900(特定应用)作为Web应用提供给终端装置400。在终端装置400中经由Web浏览器600将实验方案管理应用900显示于显示器431。实验方案管理应用900包括实验方案设计模块与实验容器管理模块。键盘432及触摸板433接受用户对实验方案管理应用900的GU I(Graph i ca l User I nterface:图形用户界面)操作。即,终端装置400的用户通过经由键盘432及触摸板433的GU I操作,设定在实验方案中使用的实验容器的内容物。此外,终端装置400的用户通过该GU I操作,在实验方案管理应用900中选择自动实验***,设计由该自动实验***执行的实验方案。
在实验方案中,规定了由用户选择的自动实验***中包含的至少1个实验装置的处理顺序。终端装置400将由用户设计的实验方案发送至服务器装置200。服务器装置200将该实验方案发送至由终端装置400的用户指定的自动实验***。通过使服务器装置200介于设计实验方案的终端装置400与执行该实验方案的自动实验***1之间,能够通过服务器装置200统筹地管理多个终端装置400及多个自动实验***1。
自动实验***1包括控制装置110与多个实验装置120。控制装置110控制多个实验装置120,自动执行来自服务器装置200的实验方案。多个实验装置120包括机器人臂121、孵育器122、液体处理器123、微孔板检测器124、离心分离机125、及液相色谱质量分析装置(LCMS:L i qu i d Chromatograph Mass Spectrometer)126。另外,自动实验***中包含的实验装置也可以是1个。
机器人臂121按照实验方案所规定的多个处理的顺序,使容纳样品的实验容器向与该多个处理分别对应的实验装置移动。实验容器例如包括管Cnt1或者微孔板Cnt2。管Cnt1具有1个样品容纳空间。微孔板Cnt2具有多个阱作为多个样品容纳空间。能够在管Cnt1的样品容纳空间及微孔板Cnt2的多个样品容纳空间中分别容纳多个样品。
孵育器122一边进行温度管理一边培养细胞。液体处理器123自动向微孔板的多个阱分别逐次以一定量分配(分注)样品。微孔板检测器124进行微孔板内的样品的光学性质的测量(例如吸光度测量及荧光强度测量)。离心分离机125通过离心力分离样品的成分。LCMS126进行按质荷比(m/z)对通过液相色谱仪分离的样品的成分进行分离的质量分析。
图2是示出图1的终端装置400的硬件构成的框图。如图2所示,终端装置400包括处理器421、作为存储部的存储器422及硬盘423、通信接口424、输入输出部430。它们经由总线440可相互通信地连接。
硬盘423是非易失性的存储装置。在硬盘423中保存有例如操作***(OS:Operat ing System)的程序41及Web浏览器的程序42。除了图2所示的数据以外,硬盘423中还保存例如各种应用的设定及输出。存储器422是易失性的存储装置,例如包括DRAM(Dynami cRandom Access Memory:动态随机存取存储器)。
处理器421包括CPU(Centra l Process i ng Un i t:中央处理器)。处理器421将保存在硬盘423的程序读入存储器422并执行。处理器421经由通信接口424与网络NW连接。
图3是示出图1的实验方案管理应用900的实验容器管理模块700的GU I构成的一例的图。在图3中,显示有与图1的微孔板Cnt2(特定容器)相关的设定。如图3所示,实验容器管理模块700包括实验容器信息窗口710、物理位置窗口720、样品设定窗口730、样品容纳空间窗口740、以及选择光标Cr。
在实验容器信息窗口710中,设定与实验容器相关的信息。作为与实验容器相关的信息,例如包括实验容器的名称、类型、与样品容纳空间的体积相关的信息。在图3中,对微孔板Cnt2的名称及类型分别设定“容器2”及“板”。此外,对作为与微孔板Cnt2的样品容纳空间的体积相关的信息的阱数、列数及阱体积(uL)分别设定96、12及200.0。
在物理位置窗口720中,设定配置实验容器的实验装置的位置。孵育器122具有能够配置实验容器的位置I n1、I n2。液体处理器123具有能够配置实验容器的位置Lq1、Lq2、Lq3。在图3中,作为微孔板Cnt2(“容器2”)的配置,设定有位置Lq2。
在样品设定窗口730中,设定实验容器中包含的至少1个容纳空间各自所包含的样品。在样品设定窗口730中设定实验容器中包含的至少1个容纳空间各自的位置(地址)与该位置所包含的样品。在样品设定窗口730中,针对每个实验容器的地址显示追加按钮731,并且针对每个样品显示删除按钮732、参照按钮733。在用户按下追加按钮731的情况下,显示样品信息设定窗口(图3中未图示出),并且将在该样品信息设定窗口中设定的样品追加至与所按下的追加按钮731对应的地址。在用户按下删除按钮732的情况下,将在与所按下的删除按钮732对应的行中显示的样品从与该行对应的地址中删除。在用户按下参照按钮733的情况下,显示包含与该样品有关的信息的样品信息设定窗口。
在样品容纳空间窗口740中,强调显示该至少1个容纳空间中的、处于在样品设定窗口730中设定了样品的地址的容纳空间。在样品容纳空间窗口740显示从样品的注入方向俯视观察该至少1个容纳空间各自的开口部的状况。在图3中,在样品容纳空间窗口740显示有微孔板Cnt2的12个列1~12,并且显示有8个行A~H。如在样品容纳空间窗口740中显示的那样,在微孔板Cnt2上以矩阵状形成有96个阱。微孔板Cnt2的96个阱各自的地址由行标识符与列标识符的组合(例如,A1)指定。
在样品设定窗口730中,在地址A1设定样品1、样品11,在地址A2设定样品2,在地址A3设定样品3,在地址A4设定样品4。在样品设定窗口730中,地址A3的行被选择。其结果为,在样品容纳空间窗口740中,地址A1~A4各自的阱的内部被强调显示,并且地址A3的阱的轮廓线用粗体显示。根据实验方案管理应用900,能够对实验容器中包含的每个样品容纳空间设定样品的量。
图4是示出在按下图3的追加按钮731或参照按钮733时显示的样品信息设定窗口800的GU I构成的一例的图。如图4所示,样品信息设定窗口800包括基本信息窗口810与菌株窗口820。在图4中,针对在图3的样品设定窗口730中按下与地址A3对应的追加按钮731的情况进行说明。
基本信息窗口810包括组合框811与编辑框812、813、814、815、816。在组合框811中,指定样品类型(例如,细胞或试剂)。在编辑框812中输入样品的名称。在编辑框813中输入样品的说明。在编辑框814中输入样品的体积(uL)。在编辑框815中输入样品的重量(mg)。在编辑框816中输入向包含样品的详细信息的数据库的URL(Un i form ResourceLocator:统一资源定位符)。在图4中,指定“细胞”作为样品类型,输入“样品31”作为样品的名称,输入“100”作为样品的体积,输入“50”作为样品的重量。在菌株窗口820中显示预先记录在实验方案管理应用900中的多个菌株。在图4中,选择菌株31。通过由用户按下确定按钮,实验方案管理应用900的多个样品信息参数分别被设定为在基本信息窗口810中设定的样品的多个信息。该多个样品信息参数与在基本信息窗口810中设定的样品的标识符相关联。
图5是示出在图4的样品信息设定窗口800中按下确定按钮时显示的实验容器管理模块700的图。如图5所示,在样品设定窗口730中,对地址A3追加样品31。另外,在按下了与样品31对应的删除按钮732的情况下,样品设定窗口730的显示变得与图3的样品设定窗口730的显示相同。
图6是示出在图3的样品设定窗口730中按下与样品1对应的参照按钮时显示的样品信息设定窗口800的图。如图6所示,设定“试剂”作为样品1的类型,设定“200”作为体积,设定“80”作为重量。
图7是示出在实验容器管理模块700中显示有与图1的管Cnt1(特定容器)相关的设定的状况的图。如图7所示,在实验容器信息窗口710中,设定“容器1”作为管Cnt1的名称,设定“管”作为类型,设定“400”作为体积。在物理位置窗口720中,设定孵育器122的位置I n1作为管Cnt1的配置。在样品设定窗口730中,在地址A1设定样品10、101、102,选择与样品102对应的行。由于管Cnt1具有1个样品容纳空间,因此在样品容纳空间窗口740中示出有1个样品容纳空间。
图8是示出图1的实验方案管理应用900的实验方案设计模块500的GU I构成的一例的图。如图8所示,实验方案设计模块500包括队列列表窗口510、方案列表窗口520、方案设计窗口530、自动实验***窗口540、实验容器窗口550、以及选择光标Cr。
在队列列表窗口510中,显示将多个方案排序的队列。在图8中,队列q1、q2显示在队列列表窗口510中。在方案列表窗口520中显示实验方案。在图8中,在方案列表窗口520中显示实验方案p1、p2、p3,并选择实验方案p3。
在方案设计窗口530中,通过有向图的形式设计实验方案。在有向图中,多个节点间的连接关系被规定为边。该有向图按照预先决定的结构化数据格式而被保存为图结构数据。作为结构化数据格式,例如能够例举XML(Extens i b l e Markup Language:可扩展标记语言)或者Json(JavaScr i pt(注册商标)Object Notat i on:JS对象简谱)。能够选择为有向图的顶点的多个节点形成为GU I,包括容器节点、处理节点及数据节点。容器节点是与容纳由至少1个实验装置处理的样品的容器(实验容器)对应的节点。处理节点是与自动实验***中包含的装置的各个处理对应的节点。数据节点是与实验装置的处理的输出数据对应的节点。
方案设计窗口530被分为容器区域531、处理区域532及数据区域533。在开始实验方案的设计的初始状态下,在处理区域532显示有表示实验方案的开始的开始节点Ms、表示实验方案的结束的结束节点Me、及从开始节点Ms朝向结束节点Me的边E10。
在自动实验***窗口540中显示由用户选择的自动实验***中包含的至少1个实验装置各自能够执行的处理。在图8中,选择自动实验***1。作为能够由机器人臂121执行的处理,显示有“容器的运送”。作为能够由孵育器122执行的处理,显示有“细胞的培养”。作为能够由液体处理器123执行的处理,显示有“液体的分注”。作为能够由微孔板检测器124执行的处理,显示有“吸光度测量”及“荧光强度测量”。作为能够由离心分离机125执行的处理,显示有“离心分离”。作为能够由LCMS126执行的处理,显示有“质量分析”。
在实验容器窗口550中显示在图3的实验容器管理模块700中设定的实验容器。在图8中,示出有管Cnt1(“容器1”)及微孔板Cnt2(“容器2”)。
图9是示出在图8的自动实验***窗口540中选择了处理的状况的图。如图9所示,由用户在自动实验***窗口540中选择“吸光度测量”,并拖动到开始节点Ms与结束节点Me之间。
图10是示出与在图9中选择的处理对应的处理节点被追加到方案设计窗口530的状况的图。如图10所示,在开始节点Ms与结束节点Me之间追加并选择与“吸光度测量”对应的处理节点M3。随着处理节点M3的追加,分别自动将容器节点C2及数据节点D1追加至容器区域531及数据区域533。
利用从开始节点Ms朝向处理节点M3的边E1将开始节点Ms及处理节点M3连接。利用从处理节点M3朝向结束节点Me的边E2将处理节点M3及结束节点Me连接。利用从容器节点C2朝向处理节点M3的边E24将容器节点C2及处理节点M3连接。利用从处理节点M3朝向数据节点D1的边E31将处理节点M3及数据节点D1连接。边E24示出与容器节点C2对应的实验容器被输入至与处理节点M3对应的处理这一情况。边E31示出与处理节点M3对应的处理的输出数据与数据节点D1对应这一情况。随着处理节点的追加,自动追加与该处理节点连接的容器节点及数据节点,由此能够使实验方案的设计高效化。另外,在图10中,由于未指定容器节点C2所对应的样品容器,因此用虚线示出容器节点C2及边E24。
图11是示出指定了与图10的容器节点C2对应的样品容器的状况的图。如图11所示,由用户在实验容器窗口550中选择“容器2”,并拖动到容器节点C2。
图12是示出与图11的容器节点C2对应的实验容器的指定完成的状况的图。如图12所示,选择容器节点C2,用实线示出容器节点C2及边E24。
图13是示出作为实验方案p3的设计例的有向图DG的图。有向图DG表示通过从图12所示的状态进一步进行设计而完成的实验方案。如图13所示,有向图DG包括开始节点Ms、结束节点Me、处理节点M1、M2、M3、M4、M5、M6、容器节点C1、C2及数据节点D1、D2。处理节点M1~M6分别与自动实验***窗口540所示的“细胞的培养”、“液体的分注”(特定处理)、“吸光度测量”、“离心分离”、“液体的分注”及“质量分析”对应。
利用从开始节点Ms朝向处理节点M1的边E11将开始节点Ms及处理节点M1连接。利用从处理节点M1朝向M2的边E12将处理节点M1及M2连接。利用从处理节点M2朝向M3的边E13将处理节点M2及M3连接。利用从处理节点M3朝向M4的边E14将处理节点M3及M4连接。利用从处理节点M4朝向M5的边E15将处理节点M4及M5连接。利用从处理节点M5朝向M6的边E16将处理节点M5及M6连接。利用从处理节点M6朝向结束节点Me的边E17将处理节点M6及结束节点Me连接。
利用从容器节点C1朝向处理节点M1的边E21将容器节点C1及处理节点M1连接。利用从容器节点C1朝向处理节点M2的边E22将容器节点C1及处理节点M2连接。
利用从容器节点C2朝向处理节点M2的边E23将容器节点C2及处理节点M2连接。利用从容器节点C2朝向处理节点M3的边E24将容器节点C2及处理节点M3连接。利用从容器节点C2朝向处理节点M4的边E25将容器节点C2及处理节点M4连接。利用从容器节点C2朝向处理节点M5的边E26将容器节点C2及处理节点M5连接。利用从容器节点C2朝向处理节点M6的边E27将容器节点C2及处理节点M6连接。
利用从处理节点M3朝向数据节点D1的边E31将处理节点M3及数据节点D1连接。利用从处理节点M6朝向数据节点D2的边E32将处理节点M6及数据节点D2连接。
图14是示出在用户对图13的处理节点M2(特定节点)进行了GU I操作(例如双击)时显示的样品变化量设定窗口560(特定GU I)的图。在样品变化量设定窗口560中,设定在被双击的处理节点中使用的实验容器的内容物的变化量。在图14中,示出在处理节点M2中使用的管Cnt1(容器1)及微孔板Cnt2(容器2)中选择容器2并设定容器2的内容物的变化量的状况。在实验方案管理应用900中,通过将实验方案中包含的处理表现为有向图中包含的处理节点,能够经由通过对该处理节点的GU I操作而显示的样品变化量设定窗口560容易地进行实验容器的内容物的变化量的设定。此外,在设计为有向图的实验方案中,利用边将与实验容器对应的容器节点和与使用该实验容器的处理对应的处理节点连接,因此能够容易地掌握实验容器与使用该实验容器的处理的对应关系。
如图14所示,作为地址A1的样品1的变化量,设定了10uL的增加。作为地址A2的样品2的变化量,设定了20uL的减少。通过由用户按下确定按钮,实验方案管理应用900的至少1个变化量参数(第2参数)分别被设定为在样品变化量设定窗口560中设定的至少1个样品的变化量。至少1个变化量参数与在样品变化量设定窗口560中选择的实验容器的标识符相关联。
在通过图14的样品变化量设定窗口560设定了实验容器中包含的内容物的变化量之后,执行包括使用该实验容器的处理(特定处理)的实验方案。在特定处理结束后,由实验方案管理应用900使用在样品变化量设定窗口560中对该样品设定的变化量参数,自动更新在特定处理中使用的实验容器中包含的至少1个样品各自的多个样品信息参数中的、与量相关的参数(第1参数)。
图15是示出在执行实验方案后通过样品信息设定窗口800显示与在图14的样品变化量设定窗口560中设定了变化量的样品1相关的信息的状况的图。一并参照图6、图14、图15,图15所示的体积及重量比图6所示的体积及重量增加了10UuL及4mg。基于在图14中设定的相对于样品1的10uL的增加,图15所示的体积及重量各自的量从图6所示的量增加5%(=10/200)。
在自动实验管理***1000中,在执行实验方案的特定处理后,根据特定处理中的实验容器的内容物的变化量,自动更新该内容物。根据自动实验管理***1000,无需每当实验方案结束时由用户逐一进行实验容器的内容物的量的更新,因此能够提高实验方案的自动执行的效率。
图16是示出图1的服务器装置200的硬件构成的框图。如图16所示,服务器装置200包括处理器201、作为存储部的存储器202及硬盘203、作为通信部的通信接口204、以及输入输出部205。它们经由总线210可相互通信地连接。
硬盘203是非易失性的存储装置。在硬盘203中保存有例如操作***(OS:Operat ing System)的程序51及自动实验管理程序52。除了图16所示的数据以外,硬盘203中还保存例如各种应用的设定及输出。存储器202是易失性的存储装置,例如包括DRAM(Dynami cRandom Access Memory:动态随机存取存储器)。
处理器201包括CPU(Centra l Process i ng Un i t:中央处理器)。处理器201将保存于硬盘203的程序读入存储器202并执行,实现服务器装置200的各种功能。例如,执行自动实验管理程序52的处理器201向终端装置400提供实验方案管理应用900。处理器201经由通信接口204与网络NW连接。
图17是说明在图1的自动实验管理***1000中进行的基于实验方案的自动实验的流程的流程图。如图17所示,在S11中,终端装置400设定实验容器的内容物。在S12中,终端装置400以有向图的形式设计实验方案,并且设定在该实验方案中使用的实验容器的内容物的变化量,将实验方案发送至服务器装置200。在S13中,服务器装置200向由终端装置400的用户选择的自动实验***发送实验方案。在S14中,自动实验***的控制装置自动执行从服务器装置200接收到的实验方案。在S15中,该控制装置将实验方案中包含的处理的输出数据发送至服务器装置200。在S16中,服务器装置200更新实验方案管理应用900中的与实验容器的内容物的量相关的参数。
[变形例1]
在实施方式中,对将在终端装置中设计的实验方案经由服务器装置发送至自动实验***的情况进行了说明。实验方案也可以直接从终端装置发送至自动实验***。
图18是示出实施方式的变形例1所涉及的自动实验管理***1100的构成的框图。自动实验管理***1100的构成是从图1的自动实验管理***1000去除服务器装置200及数据库300,将终端装置400置换为400A而得的构成。除此以外相同,因此不重复说明。在终端装置400A的显示器431显示有实验方案管理应用900A。
图19是示出图18的终端装置400A的硬件构成的框图。终端装置400A的构成是在图2的硬盘423中追加了自动实验管理程序52A而得的构成。除此以外相同,因此不重复说明。通过由处理器421执行自动实验管理程序52A,由实验方案管理应用900A及自动实验***对实验方案的自动执行得以实现。
[变形例2]
实验方案的设计可以在自动实验***的控制装置中进行。图20是示出实施方式的变形例2所涉及的自动实验***1B的构成的框图。自动实验***1B的构成是在图1的自动实验***1中将控制装置110置换为110B而得的构成。除此以外相同,因此不重复说明。
如图20所示,控制装置110B包括输入输出部130与计算机140(处理部)。输入输出部130包括显示器131(显示部)、键盘132(输入部)、以及鼠标133(输入部)。显示器131、键盘132及鼠标133与计算机140连接。在显示器131显示有实验方案管理应用900B的GU I。键盘132及鼠标133接受用户对实验方案管理应用900B的GU I操作。即,用户一边参照显示器131的显示,一边通过键盘132的操作或鼠标133的操作对实验方案管理应用900B进行期望的GUI操作。
图21是示出图20的控制装置110B的硬件构成的框图。如图21所示,计算机140包括处理器141、作为存储部的存储器142及硬盘143、以及通信接口144。它们经由总线145可相互通信地连接。
硬盘143是非易失性的存储装置。在硬盘143中保存有例如操作***(OS:Operat ing System)的程序61及自动实验管理程序52B(特定程序)。除了图21所示的数据以外,硬盘143中还保存例如各种应用的设定及输出。存储器142是易失性的存储装置,例如包括DRAM(Dynami cRandom Access Memory:动态随机存取存储器)。
处理器141包括CPU(Centra l Process i ng Un i t:中央处理器)。处理器141将保存在硬盘143的程序读入存储器142并执行。通过由处理器141执行自动实验管理程序52B,由实验方案管理应用900B及多个实验装置120对实验方案的自动执行得以实现。处理器141经由通信接口144与网络连接。
以上,根据实施方式及变形例1所涉及的方法及***、以及实施方式的变形例2所涉及的装置,能够提高实验方案的自动执行的效率。
[方案]
本领域技术人员可以理解,上述示例性的实施方式是以下方案的具体例。
(第1项)一方案所涉及的方法经由在终端装置中执行的特定应用来管理实验方案。方法包括:根据在实验方案中使用的特定容器中包含的样品的量,设定特定应用的第1参数的步骤;根据在实验方案中使用特定容器的特定处理中的样品的变化量,设定特定应用的第2参数的步骤;控制实验装置,使用第1参数及第2参数自动执行实验方案的步骤;以及在特定处理结束后,使用第2参数更新第1参数的步骤。
在第1项所述的方法中,在执行实验方案的特定处理后,根据特定处理中的特定容器的内容物的变化量,自动更新该内容物。根据该方法,无需每当实验方案结束时由用户逐一进行特定容器的内容物的量的更新,因此能够提高实验方案的自动执行的效率。
(第2项)在第1项所述的方法中,特定容器具有多个样品容纳空间。在设定第1参数的步骤中,对多个样品容纳空间各自所包含的样品的量设定第1参数。
根据第2项所述的方法,能够对特定容器中包含的每个样品容纳空间设定样品的量。
(第3项)第1项所述的方法还包括:基于用户对特定应用的GU I操作,以包含与特定处理对应的特定节点的有向图的形式设计实验方案的步骤。设定第2参数的步骤经由根据用户对特定节点的GU I操作而显示的特定GU I来进行。
根据第3项所述的方法,通过将实验方案中包含的处理表现为有向图中包含的特定节点,能够经由通过对该特定节点的GU I操作而显示的特定GU I来容易地进行实验容器的内容物的变化量的设定。
(第4项)在第3项所述的方法中,能够选择为有向图的顶点的多个节点包括与实验装置的处理对应的处理节点、以及与容纳由实验装置处理的样品的容器对应的容器节点。在设计实验方案的步骤中,随着处理节点的追加而自动追加容器节点,利用从容器节点朝向处理节点的边将容器节点及处理节点连接。
根据第4项所述的方法,在设计为有向图的实验方案中,利用边将与实验容器对应的容器节点和与使用该实验容器的处理对应的处理节点连接,因此能够容易地掌握实验容器与使用该实验容器的处理的对应关系。
(第5项)一方案所涉及的***对实验方案进行管理。***具备实验装置、终端装置、以及控制装置。终端装置执行特定应用。控制装置控制实验装置。特定应用根据在实验方案中使用的特定容器中包含的样品的量来设定特定应用的第1参数。特定应用根据在实验方案中使用特定容器的特定处理中的样品的变化量来设定特定应用的第2参数。控制装置使用第1参数及第2参数自动执行实验方案。特定应用使用第2参数来更新第1参数。
在第5项所述的***中,在执行实验方案的特定处理后,根据特定处理中的特定容器的内容物的变化量,自动更新该内容物。根据该***,无需每当实验方案结束时由用户逐一进行特定容器的内容物的量的更新,因此能够提高实验方案的自动执行的效率。
(第6项)第5项所述的***还具备服务器装置。服务器装置向终端装置提供特定应用。服务器装置将由终端装置设计的实验方案发送至控制装置。
根据第6项所述的***,服务器装置介于设计实验方案的终端装置与控制实验装置来执行该实验方案的控制装置之间,由此能够通过服务器装置来统筹地管理多个终端装置及多个控制装置。
(第7项)一方案所涉及的装置经由特定应用来管理实验方案。装置具备存储部与处理部。在存储部中保存有实现特定应用的特定程序。处理部执行特定程序。处理部根据在实验方案中使用的特定容器中包含的样品的量来设定特定应用的第1参数。处理部根据在实验方案中使用特定容器的特定处理中的样品的变化量来设定特定应用的第2参数。处理部控制实验装置,使用第1参数及第2参数自动执行实验方案。处理部在特定处理结束后,使用第2参数分别更新第1参数。
在第7项所述的装置中,在执行实验方案的特定处理后,根据特定处理中的特定容器的内容物的变化量,自动更新该内容物。根据该装置,无需每当实验方案结束时由用户逐一进行特定容器的内容物的量的更新,因此能够提高实验方案的自动执行的效率。
另外,对于上述的实施方式及变形例,在不产生不妥或者矛盾的范围内,从申请最初就预定了包括未在说明书中提及的组合在内的、在实施方式中说明的构成的适当组合。
应认为本次公开的实施方式在所有方面均为例示而非限制性的。本发明的范围并不由上述的说明而是由权利要求书示出,其意味着包含与权利要求书等同的意思及范围内的所有变更。
附图标记说明
1、1B自动实验***
41、42、51、61程序
52、52A、52B自动实验管理程序
110、110B控制装置
120实验装置
121机器人臂
122孵育器
123液体处理器
124微孔板检测器
125离心分离机
130、205、430输入输出部
131、431显示器
132、432键盘
133鼠标
140计算机
141、201、421处理器
142、202、422存储器
143、203、423硬盘
144、204、424通信接口
145、210、440总线
200服务器装置
300数据库
400、400A终端装置
433触摸板
500实验方案设计模块
510队列列表窗口
520方案列表窗口
530方案设计窗口
531容器区域
532处理区域
533数据区域
540自动实验***窗口
550实验容器窗口
560样品变化量设定窗口
600浏览器
700实验容器管理模块
710实验容器信息窗口
720物理位置窗口
730样品设定窗口
731追加按钮
732删除按钮
733参照按钮
740样品容纳空间窗口
800样品信息设定窗口
810基本信息窗口
811组合框
812~816编辑框
820菌株窗口
900、900A、900B实验方案管理应用
1000、1100自动实验管理***
C1、C2容器节点
Cnt1管
Cnt2微孔板
Cr选择光标
D1、D2数据节点
DG有向图
E1、E2、E10~E17、E21~E27、E31、E32边
I n1、I n2、Lq1~Lq3位置
M1~M6处理节点
Me结束节点
Ms开始节点
NW网络
p1~p3实验方案
q1、q2队列。
Claims (7)
1.一种方法,是经由在终端装置中执行的特定应用来管理实验方案的方法,其特征在于,包括:
根据在所述实验方案中使用的特定容器中包含的样品的量,设定所述特定应用的第1参数的步骤;
根据在所述实验方案中使用所述特定容器的特定处理中的所述样品的变化量,设定所述特定应用的第2参数的步骤;
控制实验装置,使用所述第1参数及所述第2参数自动执行所述实验方案的步骤;
在所述特定处理结束后,使用所述第2参数来更新所述第1参数的步骤。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述特定容器具有多个样品容纳空间,
在设定所述第1参数的步骤中,对所述多个样品容纳空间各自所包含的样品的量设定所述第1参数。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,还包括:基于用户对所述特定应用的GUI操作,以包含与所述特定处理对应的特定节点的有向图的形式设计所述实验方案的步骤,
设定所述第2参数的步骤经由特定GUI来进行,所述特定GUI根据用户对所述特定节点的GUI操作而显示。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,能够选择为所述有向图的顶点的多个节点包括与所述实验装置的处理对应的处理节点、以及与容纳由所述实验装置处理的样品的容器对应的容器节点,
在设计所述实验方案的步骤中,随着所述处理节点的追加而自动追加所述容器节点,
利用从所述容器节点朝向所述处理节点的边将所述容器节点及所述处理节点连接。
5.一种***,是对实验方案进行管理的***,其特征在于,具备:
实验装置;
终端装置,执行特定应用;
控制装置,控制所述实验装置,
所述特定应用:
根据在所述实验方案中使用的特定容器中包含的样品的量,设定所述特定应用的第1参数,
根据在所述实验方案中使用所述特定容器的特定处理中的所述样品的变化量,设定所述特定应用的第2参数,
所述控制装置使用所述第1参数及所述第2参数自动执行所述实验方案,
所述特定应用使用所述第2参数来更新所述第1参数。
6.如权利要求5所述的***,其特征在于,还具备将所述特定应用提供至所述终端装置的服务器装置,
所述服务器装置向所述控制装置发送由所述终端装置设计的所述实验方案。
7.一种装置,是经由特定应用对实验方案进行管理的装置,其特征在于,具备:
存储部,保存有实现所述特定应用的特定程序;
处理部,执行所述特定程序,
所述处理部:
根据在所述实验方案中使用的特定容器中包含的样品的量,设定所述特定应用的第1参数,
根据在所述实验方案中使用所述特定容器的特定处理中的所述样品的变化量,设定所述特定应用的第2参数,
控制实验装置,使用所述第1参数及所述第2参数自动执行所述实验方案,
在所述特定处理结束后,使用所述第2参数来更新所述第1参数。
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