CN114835787B - 栓皮栎QsSRO1基因及其编码蛋白在植物抗逆中的应用 - Google Patents

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Abstract

本发明属于基因工程技术领域,具体涉及了栓皮栎QsSRO1基因及其编码蛋白在植物抗逆中的应用。栓皮栎QsSRO1基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其编码的栓皮栎QsSRO1蛋白氨基酸序列为SEQ ID No.2,是一种细胞核蛋白。通过构建含有栓皮栎QsSRO1基因的重组表达载体,再利用农杆菌转化拟南芥,筛选培育后获得的转QsSRO1拟南芥植株种子在抗盐试验中表现良好。本发明证明了栓皮栎QsSRO1基因过量表达能够提高植物的抗盐性能,为培育抗盐与抗旱的转基因作物新品种奠定了理论和生产实践基础。

Description

栓皮栎QsSRO1基因及其编码蛋白在植物抗逆中的应用
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及栓皮栎QsSRO1基因及其编码蛋白在植物抗逆中的应用。
背景技术
栓皮栎(Quercus suber)是一种重要的阔叶常绿树种,其生长缓慢、寿命极长。栓皮栎是工业软木的主要来源,软木是一种具有很高商业价值的材料。
气候变化是21世纪面临的主要挑战和全球性问题之一。近几十年来,由于全球气温上升,引起一系列更强烈、更频繁和持续时间更长的气候极端事件,特别是严重干旱和土壤盐渍化。据报道,土壤盐渍化等多种全球变化会导致栓皮栎数量严重下降。尽管树种可以适应新的环境条件,但对所涉及的过程知之甚少。常规杂交育种是通过不同基因型个体之间的交配而取得双亲基因重新组合的个体的方法。杂交过程并不会产生新基因,且杂交后代会出现性状分离,育种过程缓慢,过程复杂。植物基因工程育种具有使植物定向改变,不受物种限制,育种周期短等特点。目前迫切需要利用基因工程等现代育种技术,进行栓皮栎以确保经济树种的可持续性。
发明内容
本发明的目的是提供一种栓皮栎QsSRO1基因及其编码蛋白在植物抗逆中的应用,提高植物的抗逆性。
为实现上述发明目的,本发明提供了如下方案:
本发明第一方面提供了栓皮栎QsSRO1蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID No.2 所示,栓皮栎QsSRO1蛋白的氨基酸序列(SEQ ID NO.2)如下:
MEANIAKASDRSKRVVLDLKRKRATQLATYLNEVRPTWDSLQNRLDKR RKLNGCQRKDMSYGPSGRSLLKCYSNYVKTGTPKRLMFYQNGEWIDFPQSV VDVVREDFQVKKSAVEVEFNGHRFMLDFLHMSRVDLKTTLQEPIAWIDEADS CFFPETFDCHQPETMEYQDPVLEEPYGPQEIKLLLEIEINGVDQSKLTECSGES NDLVKQIQINSKPASNCYAIDVENSCSRESDAKMDEDFQENKQIPANLVIAPVS ENEEFNCDSVQKLFLVGMGASGRPDILEIYRCESTSLQARFELFQKQAELTQK CRGDANVQYAWLACSKGELPTILTHGLGHCGPSTIKSMYGSGVHLAAAICSY TSANFCDVDENGVQHLVLCQVIMGKMEVVHSGSRQNLPSCKDYDSGVDDLQ NPKIYIVWTMNMNTHIYPEFVVSFKISSKTEGVTSCQVRKHQQLESSAVDLSV SQPVSDSGRSEGKAPSLGSSNTRAPKSPWMPFPMLFAAISEKVSSGVMEKINE HYELFRTKKIGRDEFIKKLRLIVGDALLRSTITNLQCQLPLRSKCEPEVLQPNLE KEKVQHSFN
本发明第二方面提供了编码所述栓皮栎QsSRO1蛋白的栓皮栎QsSRO1基因,其来源于栓皮栎(Quercus suber)。所述的栓皮栎QsSRO1基因,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
本发明还提供含有所述栓皮栎QsSRO1的过表达载体,宿主细胞和工程菌。
本发明第三方面提供了所述栓皮栎QsSRO1基因在调控植物抗盐性能中应用。
进一步的,提高植物抗逆性能的方法包括:构建含有所述栓皮栎QsSRO1基因的重组表达载体;使用农杆菌介导将所述栓皮栎QsSRO1基因转化到植株中;筛选培养阳性植株。
进一步的,所述植物包括拟南芥,转基因后的拟南芥植株的T4代种子具有抗盐性。
与现有技术相比,本发明的优点和有益效果是:本发明提供一种栓皮栎 QsSRO1基因及其编码蛋白,根据QsSRO1的转基因T4拟南芥植株的抗盐性试验结果显示,于盐溶液中处理时,过量表达QsSRO1基因有助于减轻盐分对植物的伤害,使得QsSRO1的转基因拟南芥对盐有更强的耐受性。因此,本发明提供的栓皮栎QsSRO1基因适用于提高拟南芥抗逆性能,尤其是抗盐胁迫能力,栓皮栎QsSRO1基因的功能分析和鉴定还为获得植物新品种提供了理论基础,利用该基因进行分子育种能够培养出具有生产应用价值的抗逆植物,为培育抗盐与抗旱的转基因作物新品种奠定了理论和生产实践基础。
附图说明
图1为QsSRO1基因在栓皮栎各组织与受盐胁后表达情况。
图2为QsSRO1基因在栓皮栎受盐胁迫后表达量随时间的变化情况。
图3为转QsSRO1拟南芥的分子检测结果。
图4为转QsSRO1基因拟南芥和野生型拟南芥种子在100mM的NaCl处理下萌发7天的观察结果。
图5为转QsSRO1基因拟南芥和野生型拟南芥种子在100mM的NaCl处理下萌发7天的根长统计结果。
图6为瞬时转化QsSRO1蛋白亚细胞定位。
具体实施方式
为了使本技术领域的人员更好地理解本申请中的技术方案,下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。除非另有说明,否则本文使用的所有技术和科学术语具有本发明所述领域的常规技术人员通常理解的相同含义。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。虽然本发明仅描述了优选的方法和材料,但是在本发明的实施或测试中也可以使用与本文所述相似或等同的任何方法和材料。
实施例1:栓皮栎QsSRO1基因及其获得方法
一、栓皮栎QsSRO1的获得方法
提取栓皮栎的RNA,并以RNA为模板使用TaKaRa PrimeScriptTM RT试剂盒通过反转录试剂盒法反转录成cDNA。然后将cDNA作为扩增目的基因序列的反应模板,以5’-ATGGCGAATCTACCCCAATCGC-3’和 5’-TCAGTTTCCGGGCTCTGGTTTC-3’为引物进行PCR扩增,得到QsSRO1基因的CDS序列。
二、通过荧光定量PCR分析QsSRO1基因的组织表达情况
分别提取栓皮栎根、茎、花的RNA,反转录合成cDNA;然后分别以上述各组织的cDNA为模板,以5’-AGACGGGACGAGGGTTGT-3’和5’- TGGATGATGTGGGCTTGG-3’为引物进行PCR扩增,检测QsSRO1基因在栓皮栎不同组织中的表达情况。同时以qACTIN基因作为内参,扩增qACTIN基因的5’引物为:5’-GCGGATAGAATGAGCAAGGAA-3’,3’引物为: 5’-GGGCCGGACTCATCATACTC-3’。RT-qPCR反应条件:先94℃预变性1min;然后98℃10sec,58℃30sec,72℃1min,共30个循环;再72℃延伸3min。
栓皮栎QsSRO1基因在各组织中的表达情况如图1所示。结果表明,栓皮栎 QsSRO1基因在所有组织中均有表达,其中在茎中表达量最低,根中表达量最高。
栓皮栎QsSRO1基因受盐胁迫条件下QsSRO1基因表达情况如图2所示。结果表明,栓皮栎QsSRO1基因在栓皮栎受到盐胁迫后表达量上升,在8小时表达量达到最高。
实施例2:QsSRO1基因在提高植物抗逆性中的应用
1、转QsSRO1拟南芥的构建
栓皮栎QsSRO1基因的获得,制备下述引物对:
引物1:5’-ATGGCGAATCTACCCCAATCGC-3’;
引物2:5’-TCAGTTTCCGGGCTCTGGTTTC-3’。
以栓皮栎的cDNA为模板,采用上述引物1和引物2进行PCR扩增,得到大小为1755bp的PCR产物,并对其进行测序。获得的PCR产物,该PCR产物为栓皮栎QsSRO1基因,其测序结果显示的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,可编码氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示的QsSRO1蛋白。生物信息学分析显示, QsSRO1基因编码的蛋白含585个氨基酸残基,相对分子质量为66.04kDa,理论等电点为5.85。在QsSRO1蛋白在N端包含一个Trp-Trp-Glu结构域,序列中间为一个多聚腺苷酸聚合酶结构,C端为TATA框结合蛋白相关因子4。
QsSRO1基因序列(SEQ ID NO.1)如下,全长1755bp:
ATGGAAGCAAATATCGCAAAGGCATCGGATAGAAGTAAGAGAGTTGTG CTCGACTTAAAAAGAAAGCGGGCAACCCAGCTTGCTACATATTTGAATGAA GTTAGGCCCACTTGGGATTCATTGCAAAATAGGCTTGACAAACGGAGGAAA TTGAATGGGTGCCAAAGGAAGGACATGAGCTATGGGCCTAGTGGGAGATC TTTGCTCAAATGTTATTCAAATTATGTGAAAACTGGGACACCAAAGCGTTTA ATGTTTTATCAGAATGGCGAATGGATTGATTTCCCCCAGAGTGTTGTTGATG TGGTTAGGGAAGATTTTCAGGTTAAGAAGTCTGCTGTAGAGGTTGAGTTCA ATGGCCATCGCTTTATGCTTGATTTTCTGCATATGTCTCGAGTGGACTTGAA AACAACCTTACAGGAACCCATTGCTTGGATTGATGAAGCAGACAGCTGCTT CTTTCCTGAAACTTTTGACTGCCATCAACCTGAAACTATGGAATATCAAGAC CCAGTGTTGGAGGAGCCTTATGGGCCTCAAGAGATCAAGCTGCTGTTGGA AATTGAAATAAATGGAGTGGATCAATCCAAGCTGACGGAATGTAGTGGGGA GTCAAATGATCTAGTTAAGCAGATACAAATCAATAGTAAACCTGCTAGCAA CTGCTATGCTATAGATGTTGAGAATAGTTGTAGTAGAGAGTCTGATGCAAAA ATGGATGAAGATTTTCAGGAAAATAAACAGATACCTGCAAATTTAGTCATAG CGCCTGTATCTGAAAATGAAGAATTTAATTGTGATTCTGTGCAGAAGTTGTT TCTTGTGGGTATGGGTGCTTCAGGCAGACCCGACATTCTTGAAATATACCGT TGCGAAAGCACTTCATTGCAAGCTCGATTTGAGCTTTTTCAGAAGCAGGCT GAACTAACCCAAAAATGTCGTGGGGATGCAAATGTTCAATATGCTTGGCTT GCTTGTTCTAAAGGGGAGCTGCCTACAATATTGACACATGGGCTTGGTCATT GTGGACCTTCCACAATTAAGTCCATGTATGGTAGTGGTGTTCATCTTGCAGC TGCTATCTGTTCTTACACCAGTGCAAATTTTTGTGATGTTGACGAAAATGGG GTACAACACTTGGTGTTGTGCCAAGTGATAATGGGAAAAATGGAGGTTGTT CATTCTGGCTCTAGACAAAACCTTCCCAGTTGCAAGGACTATGATAGTGGA GTGGATGATCTTCAAAATCCAAAGATTTATATAGTCTGGACTATGAATATGA ACACTCACATCTATCCAGAATTTGTTGTTAGTTTCAAGATCTCTTCCAAAACTGAAGGGGTTACATCTTGTCAGGTGCGTAAGCACCAACAATTAGAGTCTTC TGCAGTTGATTTGAGCGTGAGTCAACCAGTTTCAGATTCTGGGAGATCTGA GGGGAAAGCTCCCAGTCTGGGTTCAAGCAATACAAGAGCTCCTAAATCTCC TTGGATGCCTTTTCCCATGTTGTTTGCTGCCATTTCAGAGAAAGTTTCTTCT GGGGTCATGGAGAAGATTAATGAACATTATGAGTTGTTTAGGACAAAGAAG ATAGGTCGTGATGAGTTTATTAAAAAGTTGAGACTGATAGTTGGGGATGCTT TATTGAGGTCTACAATAACAAATCTGCAATGCCAGTTACCACTGAGATCTAA GTGTGAACCGGAAGTTCTACAGCCTAACCTAGAAAAAGAAAAGGTTCAGC ACTCCTTCAAT
2、重组表达载体的获得
将上述步骤1获得的PCR产物和pCAMBIA1300载体经限制性内切酶酶切后进行连接,得到连接产物。然后将连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,并涂布在含有25μg/ml氨苄霉素的LB平板上培养过夜。挑取白色单菌落于含有 50μg/ml卡那霉素的LB液体培养基中培养过夜并进行菌落PCR鉴定;同时碱法提取质粒DNA进行序列测定。
测序结果表明为***SEQ ID NO.1所示的QsSRO1基因序列的重组表达载体;将该重组表达载体命名为pCAMBIA1300-QsSRO1。
3、转QsSRO1拟南芥的获得及分子检测
(1)转QsSRO1拟南芥的获得
将上述步骤2制备的重组表达载体pCAMBIA1300-QsSRO1转化农杆菌 GV3101的感受态细胞(购自生工生物工程(上海)股份有限公司),得到重组的工程菌GV3101/pCAMBIA1300-QsSRO1(提取质粒送去测序,为重组载体 pCAMBIA1300-QsSRO1)。
将GV3101/pCAMBIA1300-QsSRO1工程菌单克隆接种于含50mg/L氯霉素的YEB液体培养基中,28℃振荡培养两天。将培养液4000rpm/min离心5分钟,所得农杆菌沉淀用含5%蔗糖和0.03%SilwetL-77的侵染液重悬菌体。
采用花絮浸染法转化哥伦比亚生态型野生型拟南芥(Col-0)(购自 ArabidopsisBiological Resource Center),收获当代转基因拟南芥植株所接的种子(T1代),在含有50μg/ml卡那霉素(kanamycin)MS培养基筛选萌发的种子。将在上述培养基上萌发的T1代幼苗移到培养土中,收获种子(T2代),然后经相同的筛选过程得到纯合的转QsSRO1拟南芥植株(T4代)种子。
(2)分子检测
以野生型拟南芥、T4代植株的基因组DNA为末班,以实施例2中的引物1、引物2,进行扩增。PCR扩增的实验结果见图3(Col-0为野生型)。结果表明,转基因T4代种子均能够扩增到1800bp左右的条带,而野生型拟南芥不能扩增到约1800bp的条带,因此转基因T4代种子均鉴定为T4代纯合转QsSRO1拟南芥。
4、转QsSRO1拟南芥的功能研究
(1)种子抗盐性试验
取野生型拟南芥(White)、转QsSRO1拟南芥植株(T4代)的种子,在含有100mM的NaCl的MS培养基上进行种子萌发实验,实验条件是光周期为16 小时光照,8小时黑暗;光照强度为300-400μmol m-2s-1;光照条件下的培养温度为21-24℃,相对湿度为80%;黑暗条件下的培养温度为21-24℃,相对湿度为 80%。
如图4~5所示,Col-0为野生型拟南芥的对照组,OE1和OE2均为转QsSRO1 拟南芥植株。在100mM的NaCl处理下,转QsSRO1拟南芥植株(T4代)的种子在NaCl浓度为100mM处理下的种子根长显著长于野生型拟南芥。
上述结果表明,QsSRO1基因编码的QsSRO1蛋白(SEQ ID NO.2)具有提高植物种子抗盐性的功能。
(2)QsSRO1蛋白的亚细胞定位
配制10ml酶解液。取1mth叶龄健康生长且尚未开花的拟南芥莲座叶,刀片切成约1mm左右叶条,将其浸没在酶解液中,室温、黑暗条件下,60rpm酶解三个小时。酶解液后200目筛,分装30ml离心管。冷冻离心机4℃,120rpm,离心五分钟,弃上清液,用提前预冷的W 5溶液(150mM NaCl,125mM CaCl2, 5mM KCl,2mM MES,pH=5.8),重悬原生质体。使用预冷W5溶液冲洗3 次,120rpm,离心两分钟,置于冰上半个小时。常温下,使用MaMg溶液,重悬。取10μg质粒加入150μl原生质体,轻微混合摇匀,加入120μl PEG/Ca溶液,轻微吹打。50rpm摇十分钟,加入0.5ml W5溶液,轻轻混匀。室温,100g,离心五分钟。加1.5ml W5重悬原生质体,室温,100rpm,离心一分钟,弃上清液,加200μl W5溶液重悬原生质体,常温孵育十二小时。完成上述步骤后,利用荧光共聚焦显微镜观察。
结果如图6所示,图中显示的比例尺均为5μm,该结果表明,QsSRO1基因的编码蛋白存在于细胞核,属于一种细胞核蛋白。
以上实施例仅用以说明本发明的技术方案,而非对其进行限制;尽管参照前述实施例对本发明进行了详细的说明,对于本领域的普通技术人员来说,依然可以对前述实施例所记载的技术方案进行修改,或者对其中部分技术特征进行等同替换;而这些修改或替换,并不使相应技术方案的本质脱离本发明所要求保护的技术方案的精神和范围。
序列表
<110> 青岛斯坦德衡立环境技术研究院有限公司
<120> 栓皮栎QsSRO1基因及其编码蛋白在植物抗逆中的应用
<160> 2
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1755
<212> DNA
<213> 栓皮栎(Quercus suber)
<400> 1
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agactgatag ttggggatgc tttattgagg tctacaataa caaatctgca atgccagtta 1680
ccactgagat ctaagtgtga accggaagtt ctacagccta acctagaaaa agaaaaggtt 1740
cagcactcct tcaat 1755
<210> 2
<211> 585
<212> PRT
<213> 栓皮栎(Quercus suber)
<400> 2
Met Glu Ala Asn Ile Ala Lys Ala Ser Asp Arg Ser Lys Arg Val Val
1 5 10 15
Leu Asp Leu Lys Arg Lys Arg Ala Thr Gln Leu Ala Thr Tyr Leu Asn
20 25 30
Glu Val Arg Pro Thr Trp Asp Ser Leu Gln Asn Arg Leu Asp Lys Arg
35 40 45
Arg Lys Leu Asn Gly Cys Gln Arg Lys Asp Met Ser Tyr Gly Pro Ser
50 55 60
Gly Arg Ser Leu Leu Lys Cys Tyr Ser Asn Tyr Val Lys Thr Gly Thr
65 70 75 80
Pro Lys Arg Leu Met Phe Tyr Gln Asn Gly Glu Trp Ile Asp Phe Pro
85 90 95
Gln Ser Val Val Asp Val Val Arg Glu Asp Phe Gln Val Lys Lys Ser
100 105 110
Ala Val Glu Val Glu Phe Asn Gly His Arg Phe Met Leu Asp Phe Leu
115 120 125
His Met Ser Arg Val Asp Leu Lys Thr Thr Leu Gln Glu Pro Ile Ala
130 135 140
Trp Ile Asp Glu Ala Asp Ser Cys Phe Phe Pro Glu Thr Phe Asp Cys
145 150 155 160
His Gln Pro Glu Thr Met Glu Tyr Gln Asp Pro Val Leu Glu Glu Pro
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180 185 190
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195 200 205
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210 215 220
Ile Asp Val Glu Asn Ser Cys Ser Arg Glu Ser Asp Ala Lys Met Asp
225 230 235 240
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245 250 255
Pro Val Ser Glu Asn Glu Glu Phe Asn Cys Asp Ser Val Gln Lys Leu
260 265 270
Phe Leu Val Gly Met Gly Ala Ser Gly Arg Pro Asp Ile Leu Glu Ile
275 280 285
Tyr Arg Cys Glu Ser Thr Ser Leu Gln Ala Arg Phe Glu Leu Phe Gln
290 295 300
Lys Gln Ala Glu Leu Thr Gln Lys Cys Arg Gly Asp Ala Asn Val Gln
305 310 315 320
Tyr Ala Trp Leu Ala Cys Ser Lys Gly Glu Leu Pro Thr Ile Leu Thr
325 330 335
His Gly Leu Gly His Cys Gly Pro Ser Thr Ile Lys Ser Met Tyr Gly
340 345 350
Ser Gly Val His Leu Ala Ala Ala Ile Cys Ser Tyr Thr Ser Ala Asn
355 360 365
Phe Cys Asp Val Asp Glu Asn Gly Val Gln His Leu Val Leu Cys Gln
370 375 380
Val Ile Met Gly Lys Met Glu Val Val His Ser Gly Ser Arg Gln Asn
385 390 395 400
Leu Pro Ser Cys Lys Asp Tyr Asp Ser Gly Val Asp Asp Leu Gln Asn
405 410 415
Pro Lys Ile Tyr Ile Val Trp Thr Met Asn Met Asn Thr His Ile Tyr
420 425 430
Pro Glu Phe Val Val Ser Phe Lys Ile Ser Ser Lys Thr Glu Gly Val
435 440 445
Thr Ser Cys Gln Val Arg Lys His Gln Gln Leu Glu Ser Ser Ala Val
450 455 460
Asp Leu Ser Val Ser Gln Pro Val Ser Asp Ser Gly Arg Ser Glu Gly
465 470 475 480
Lys Ala Pro Ser Leu Gly Ser Ser Asn Thr Arg Ala Pro Lys Ser Pro
485 490 495
Trp Met Pro Phe Pro Met Leu Phe Ala Ala Ile Ser Glu Lys Val Ser
500 505 510
Ser Gly Val Met Glu Lys Ile Asn Glu His Tyr Glu Leu Phe Arg Thr
515 520 525
Lys Lys Ile Gly Arg Asp Glu Phe Ile Lys Lys Leu Arg Leu Ile Val
530 535 540
Gly Asp Ala Leu Leu Arg Ser Thr Ile Thr Asn Leu Gln Cys Gln Leu
545 550 555 560
Pro Leu Arg Ser Lys Cys Glu Pro Glu Val Leu Gln Pro Asn Leu Glu
565 570 575
Lys Glu Lys Val Gln His Ser Phe Asn
580 585

Claims (9)

1.栓皮栎QsSRO1蛋白,其特征在于:其氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。
2.编码权利要求1所述的栓皮栎QsSRO1蛋白的栓皮栎QsSRO1基因。
3.根据权利要求2所述的栓皮栎QsSRO1基因,其特征在于:其核苷酸序列如SEQ IDNo.1所示。
4.含有权利要求2或3所述栓皮栎QsSRO1基因的载体。
5.含有权利要求4所述载体的宿主细胞。
6.含有权利要求2或3所述栓皮栎QsSRO1基因的工程菌。
7.权利要求2或3所述栓皮栎QsSRO1基因在调控植物抗逆性能中应用,其特征在于,将所述栓皮栎QsSRO1基因在植物中过量表达,所述抗逆性能为抗盐胁迫能力。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于:提高植物抗逆性能的方法包括:构建权利要求4所述的载体;使用农杆菌介导将栓皮栎QsSRO1基因转化到植株中;筛选培养阳性植株。
9.根据权利要求7或8所述的应用,其特征在于,所述植物包括拟南芥。
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