CN113744184A - 一种基于图像处理的乌鳢卵子计数方法 - Google Patents

一种基于图像处理的乌鳢卵子计数方法 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种基于图像处理的乌鳢卵子计数方法,包括以下步骤:S1、对需要计数的乌鳢卵子目标进行图像采集,并传入计算机;S2、对采集的图像进行灰度化处理;S3、采用top‑hat变换算法进行图像增强,首先设计圆形结构元素,对图像做开运算,并用原始图像减去开运算所得图像,实现增强效果;S4、采用引导滤波方法进行图像滤波处理;S5、图像分割;S6、卵子识别与计数。本发明通过对乌鳢卵子通过直接成像,获取乌鳢卵子图片,经过本发明提出的处理流程,在非接触前提下完成卵子计数任务,精度高而且不会对卵子原有生存环境产生变化。

Description

一种基于图像处理的乌鳢卵子计数方法
技术领域
本发明涉及图像处理与水产养殖交叉领域,尤其是涉及一种基于图像处理的乌鳢卵子计数方法。
背景技术
乌鳢个体大、生长快,而且营养丰富,比鸡肉、牛肉所含的蛋白质高。作为药用具有去瘀生新,滋补调养等功效,因此养殖乌鳢具有较高的经济价值。乌鳢多栖息在湖泊、池沼、江河中水不流畅而混浊的泥底处,它们的产卵场也往往在这一类场所。对产卵时间、产卵量的估计则有利于后期的人工养殖。
乌鳢卵子常规计数方法有四种。最原始的是直接点数,但比较费时间,特别是工厂化育苗数量大,逐个点数是不可能的。也可用面积法、容积法或称量法。由于乌鳢的卵属飘浮性卵,产出的卵未经扰散,排列整齐紧密集中,并浮于水表层,可采用面积计数法。所谓面积计数法,先取一个单位面积的卵子,数出卵子数,然后测出每一窝的面积便可知每窝的卵子数量。容积法,先用一个标准容器,装满受精卵,然后数出这一容积中的卵子个数。以后用这标准容器去量出杯数,就可算出卵子总数。
总体而言,传统乌鳢卵子计数方法存在两个主要问题,其一是传统计数方法除人工直接点数外,面积法、容积法、称量法均是接触式计数方法,需要捞取卵子,破坏原有环境;其二是这些方法由于采用的是估算面积、容积或者重量,再做均分的方式,必定由于个体之间差异存在一定的误差,难以消除。
发明内容
发明目的:为了克服背景技术的不足,本发明公开了一种基于图像处理的乌鳢卵子计数方法,在非接触前提下完成卵子计数任务,精度高而且不会对卵子原有生存环境产生变化。
技术方案:本发明的基于图像处理的乌鳢卵子计数方法,包括以下步骤:
S1、对需要计数的乌鳢卵子目标进行图像采集,并传入计算机;
S2、对采集的图像进行灰度化处理;
S3、采用top-hat变换算法进行图像增强,首先设计圆形结构元素,对图像做开运算,并用原始图像减去开运算所得图像,实现增强效果;
S4、采用引导滤波方法进行图像滤波处理;
S5、图像分割
S5.1使用Sobel边缘算子对图像进行水平和垂直方向的滤波,然后求取模值,获取梯度图像;
S5.2把梯度图像中的所有像素按照灰度值进行分类,并设定一个测地距离阈值;
S5.3找到灰度值最小的像素点为起始点,让threshold从起始点开始增长;
S5.4水平面在增长的过程中,会碰到周围的邻域像素,测量这些像素到起始点的测地距离,如果小于设定阈值,则将这些像素淹没,否则在这些像素上设置大坝,如此对邻域像素进行分类;
S5.5随着水平面增高,设置更多更高的大坝,直到灰度值的最大值,所有区域都在分水岭线上相遇,所有大坝即对整个图像像素进行分区;
S6、卵子识别与计数
S6.1用半径为2大小的圆形结构元素腐蚀分割结果中的目标区域,分割后的区域之间的距离变大,避免影响邻近目标区域相互影响;
S6.2调用Open CV库中find Contours()函数提取颗粒分割结果中每个区域的轮廓;
S6.3依次遍历每个区域轮廓,并用min Enclosing Circle()函数求取能够包围的区域外轮廓点集的最小外接圆,圆的半径r和圆心(a,b),该圆心可近似为颗粒中心点;
S6.4由于S6.1对目标进行腐蚀,将求取的外接圆的半径增加2,将圆心为(a,b)、半径为r+2的圆画于原图;
S6.5统计所有圆的面积,为A1,A2…AN,得到面积中间值大小为S_median,将面积大于或者小于0.2*S_median的圆删除,这些圆因为面积过大或过小,不应计入卵子数量。然后计数保留下来的圆,其数量即为最终的卵子数量。
其中,S1中采集的图像中单个卵子目标有效像素点个数不低于20*20。
进一步的,S2中灰度处理时:
Gray=0.299R+0.587G+0.114B
其中,R,G,B分别是采集彩色图像的红、绿、蓝通道。
进一步的,S3具体包括以下步骤:
S3.1设计圆形结构元素b;
S3.2利用结构元素b对原图像做灰度腐蚀和膨胀操作;
腐蚀过程为将灰度图像f(x,y)内各像素点与结构元素b(x,y)中的点对应相减,腐蚀结果为其最小值:
Figure BDA0003182776910000021
膨胀过程为腐蚀过程对偶运算,将灰度图像f(x,y)内各像素点与结构元素b(x,y)中的点对应相加,腐蚀结果为其最大值:
Figure BDA0003182776910000031
经过对图像先腐蚀后膨胀运算后,即完成开运算,得到的运算结果图fopen
S3.3原始图像减去开运算所得结果:
ftop-hat=f(x,y)-fopen
进一步的,S4中引导滤波假设引导图像和输出图像之间存在局部线性关系,如下式所示:
Figure BDA0003182776910000032
其中,I为引导图像,q为滤波后输出结果,wk为像素点k为中心的正方形窗口,ak、bk为窗口中的常系数,其取值如下:
Figure BDA0003182776910000033
Figure BDA0003182776910000034
其中,μk
Figure BDA0003182776910000035
为引导图像I在窗口wk中的均值和方差,|w|是窗口wk中的像素点总数,
Figure BDA0003182776910000036
是输入图像p在窗口wk中像素点的平均值。
有益效果:本发明通过对乌鳢卵子通过直接成像,获取乌鳢卵子图片,经过本发明提出的处理流程,在非接触前提下完成卵子计数任务,精度高而且不会对卵子原有生存环境产生变化。
附图说明
图1为本发明的流程图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明的技术方案作进一步的说明。
计算机读取高光谱遥感图像数据和配准好的高分辨率图像数据,首先基于非负矩阵分解建立初步的目标函数,然后在此基础上添加光谱约束项,得到最终的融合模型,对此融合模型求极值函数得到标准图像和权值矩阵,用高分辨率图像乘以标准图像与高分辨率图像加权后的图像,所得结果即为所求的高光谱融合图像。
如图1所示的基于图像处理的乌鳢卵子计数方法,计算机配置采用:Intel dual-core处理器,主频1.6GHz,内存2GB,操作***为Windows Vista Home Basic,编程环境为Matlab7.1。该方法包括以下步骤:
S1:图像采集
采用搭载高清摄像头的图像采集***,对需要计数的乌鳢卵子目标进行图像采集,并将相关图像传入计算机,图像中单个卵子目标有效像素点个数不低于20*20。
S2:灰度化处理
将彩色图像转换为灰度图像,便于后续处理。
Gray=0.299R+0.587G+0.114B
其中,R,G,B分别是采集彩色图像的红、绿、蓝通道。
S3:图像增强预处理
采用top-hat变换算法解决图像光照强度不一致问题,首先设计圆形结构元素,对图像做开运算,并用原始图像减去开运算所得图像,实现增强效果。
S3.1设计圆形结构元素b:
设计半径为5的圆形结构元素b如下:
Figure BDA0003182776910000041
S3.2利用结构元素b对原图像做灰度腐蚀和膨胀操作:
腐蚀过程是将灰度图像f(x,y)内各像素点与结构元素b(x,y)中的点对应相减,腐蚀结果为其最小值:
Figure BDA0003182776910000042
膨胀过程为腐蚀过程对偶运算,将灰度图像f(x,y)内各像素点与结构元素b(x,y)中的点对应相加,腐蚀结果为其最大值:
Figure BDA0003182776910000043
经过对图像先腐蚀后膨胀运算后,即完成开运算。得到的运算结果图fopen整体亮度相对均匀。
S3.3原始图像减去开运算所得结果
ftop-hat=f(x,y)-fopen
原始图像减去开运算结果,可以得到top-hat计算结果。
S4:图像滤波
采用引导滤波方法,对S3所得增强图像进行滤波处理,消除噪声,获得边缘纹理较为清晰的图像。引导滤波假设引导图像和输出图像之间存在局部线性关系,如下式所示:
Figure BDA0003182776910000051
这里,I为引导图像,q为滤波后输出结果。wk为像素点k为中心的正方形窗口,(ak,bk)为窗口中的常系数,其取值如下:
Figure BDA0003182776910000052
Figure BDA0003182776910000053
μk
Figure BDA0003182776910000054
为引导图像I在窗口wk中的均值和方差,|w|是窗口wk中的像素点总数,
Figure BDA0003182776910000055
是输入图像p在窗口wk中像素点的平均值。
S5:图像分割
S5.1使用Sobel边缘算子对图像进行水平和垂直方向的滤波,然后求取模值,获取梯度图像,sobel算子滤波后的图像在边界处会显示比较大的值,在没有边界处的值会很小。
S5.2把梯度图像中的所有像素按照灰度值进行分类,并设定一个测地距离阈值。
S5.3找到灰度值最小的像素点(默认标记为灰度值最低点),让threshold从最小值开始增长,这些点为起始点。
S5.4水平面在增长的过程中,会碰到周围的邻域像素,测量这些像素到起始点(灰度值最低点)的测地距离,如果小于设定阈值,则将这些像素淹没,否则在这些像素上设置大坝,这样就对这些邻域像素进行了分类。
S5.5随着水平面越来越高,会设置更多更高的大坝,直到灰度值的最大值,所有区域都在分水岭线上相遇,这些大坝就对整个图像像素的进行了分区。
S6:卵子识别与计数
在分割开粘连重叠颗粒后,为了便于观察,本文将最终的识别结果标记于原图。具体步骤是:
S6.1用半径为2大小的圆形结构元素腐蚀分割结果中的目标区域,分割后的区域之间的距离变大,避免影响邻近目标区域相互影响。
S6.2调用Open CV库中find Contours()函数提取颗粒分割结果中每个区域的轮廓。
S6.3依次遍历每个区域轮廓,并用min Enclosing Circle()函数求取能够的包围区域外轮廓点集的最小外接圆,圆的半径r和圆心(a,b),该圆心可近似为颗粒中心点。
S6.4由于步骤1对目标进行轻微了腐蚀,这里将求取的外接圆的半径增加2,最后将圆心为(a,b)、半径为r+2的圆画于原图。
S6.5统计所有圆的面积,为A1,A2…AN,得到面积中间值大小为S_median,将面积大于或者小于0.2*S_median的圆删除,这些圆因为面积过大或过小,不应计入卵子数量。然后计数保留下来的圆,其数量即为最终的卵子数量。
本发明的方法很好的解决了基于图像处理的乌鳢卵子计数问题,因而此方法可以应用到乌鳢自动养殖中,具有广阔的应用前景和价值。

Claims (5)

1.一种基于图像处理的乌鳢卵子计数方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、对需要计数的乌鳢卵子目标进行图像采集,并传入计算机;
S2、对采集的图像进行灰度化处理;
S3、采用top-hat变换算法进行图像增强,首先设计圆形结构元素,对图像做开运算,并用原始图像减去开运算所得图像,实现增强效果;
S4、采用引导滤波方法进行图像滤波处理;
S5、图像分割
S5.1使用Sobel边缘算子对图像进行水平和垂直方向的滤波,然后求取模值,获取梯度图像;
S5.2把梯度图像中的所有像素按照灰度值进行分类,并设定一个测地距离阈值;
S5.3找到灰度值最小的像素点为起始点,让threshold从起始点开始增长;
S5.4水平面在增长的过程中,会碰到周围的邻域像素,测量这些像素到起始点的测地距离,如果小于设定阈值,则将这些像素淹没,否则在这些像素上设置大坝,如此对邻域像素进行分类;
S5.5随着水平面增高,设置更多更高的大坝,直到灰度值的最大值,所有区域都在分水岭线上相遇,所有大坝即对整个图像像素进行分区;
S6、卵子识别与计数
S6.1用半径为2大小的圆形结构元素腐蚀分割结果中的目标区域,分割后的区域之间的距离变大,避免影响邻近目标区域相互影响;
S6.2调用Open CV库中find Contours()函数提取颗粒分割结果中每个区域的轮廓;
S6.3依次遍历每个区域轮廓,并用min Enclosing Circle()函数求取能够包围的区域外轮廓点集的最小外接圆,圆的半径r和圆心(a,b),该圆心可近似为颗粒中心点;
S6.4由于S6.1对目标进行腐蚀,将求取的外接圆的半径增加2,将圆心为(a,b)、半径为r+2的圆画于原图;
S6.5统计所有圆的面积,为A1,A2…AN,得到面积中间值大小为S_median,将面积大于或者小于0.2*S_median的圆删除,不应计入卵子数量,计数保留下来的圆的数量即为最终的卵子数量。
2.根据权利要求1所述的基于图像处理的乌鳢卵子计数方法,其特征在于:S1中采集的图像中单个卵子目标有效像素点个数不低于20*20。
3.根据权利要求1所述的基于图像处理的乌鳢卵子计数方法,其特征在于:S2中灰度处理时:
Gray=0.299R+0.587G+0.114B
其中,R,G,B分别是采集彩色图像的红、绿、蓝通道。
4.根据权利要求1所述的基于图像处理的乌鳢卵子计数方法,其特征在于,S3具体包括以下步骤:
S3.1设计圆形结构元素b;
S3.2利用结构元素b对原图像做灰度腐蚀和膨胀操作;
腐蚀过程为将灰度图像f(x,y)内各像素点与结构元素b(x,y)中的点对应相减,腐蚀结果为其最小值:
(fΘb)=min{f(s+x,t+y)-b(x,y)|(s+x),(t+y)∈D,(x,y)∈S}
膨胀过程为腐蚀过程对偶运算,将灰度图像f(x,y)内各像素点与结构元素b(x,y)中的点对应相加,腐蚀结果为其最大值:
(fΘb)=min{f(s-x,t-y)-b(x,y)|(s-x),(t-y)∈D,(x,y)∈S}
经过对图像先腐蚀后膨胀运算后,即完成开运算,得到的运算结果图fopen
S3.3原始图像减去开运算所得结果:
ftop-hat=f(x,y)-fopen
5.根据权利要求1所述的基于图像处理的乌鳢卵子计数方法,其特征在于:S4中引导滤波假设引导图像和输出图像之间存在局部线性关系,如下式所示:
Figure FDA0003182776900000021
其中,I为引导图像,q为滤波后输出结果,wk为像素点k为中心的正方形窗口,ak、bk为窗口中的常系数,其取值如下:
Figure FDA0003182776900000022
Figure FDA0003182776900000023
其中,μk
Figure FDA0003182776900000024
为引导图像I在窗口wk中的均值和方差,|w|是窗口wk中的像素点总数,
Figure FDA0003182776900000025
是输入图像p在窗口wk中像素点的平均值。
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