CN113493863B - 用于检测covid-19易感性的分子标记、试剂盒及应用 - Google Patents
用于检测covid-19易感性的分子标记、试剂盒及应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN113493863B CN113493863B CN202110700484.0A CN202110700484A CN113493863B CN 113493863 B CN113493863 B CN 113493863B CN 202110700484 A CN202110700484 A CN 202110700484A CN 113493863 B CN113493863 B CN 113493863B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- covid
- gene
- susceptibility
- seq
- mef2b
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 208000025721 COVID-19 Diseases 0.000 title claims abstract description 42
- 239000003147 molecular marker Substances 0.000 title abstract description 11
- 101100456632 Homo sapiens MEF2B gene Proteins 0.000 claims abstract description 22
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 12
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims abstract description 7
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims abstract description 7
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims abstract description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 15
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 7
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 7
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 claims description 6
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 3
- 239000012154 double-distilled water Substances 0.000 claims description 3
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims description 2
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 claims description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract description 14
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 abstract description 14
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 abstract description 10
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 abstract description 10
- 238000012216 screening Methods 0.000 abstract description 7
- 238000013399 early diagnosis Methods 0.000 abstract description 5
- 230000002265 prevention Effects 0.000 abstract description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 10
- 206010035664 Pneumonia Diseases 0.000 description 9
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 6
- 102000055120 MEF2 Transcription Factors Human genes 0.000 description 4
- 108010018650 MEF2 Transcription Factors Proteins 0.000 description 4
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 3
- 238000013461 design Methods 0.000 description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 239000002699 waste material Substances 0.000 description 3
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 2
- 206010001052 Acute respiratory distress syndrome Diseases 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 238000012935 Averaging Methods 0.000 description 1
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 208000034826 Genetic Predisposition to Disease Diseases 0.000 description 1
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 description 1
- 208000008589 Obesity Diseases 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000000546 chi-square test Methods 0.000 description 1
- 238000010835 comparative analysis Methods 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000010219 correlation analysis Methods 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 238000013499 data model Methods 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 230000007614 genetic variation Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 238000007477 logistic regression Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 235000020824 obesity Nutrition 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 230000004853 protein function Effects 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 208000026425 severe pneumonia Diseases 0.000 description 1
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 229940126585 therapeutic drug Drugs 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6858—Allele-specific amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Virology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了一种用于检测COVID‑19易感性的分子标记、试剂盒及应用,属于分子生物和医学技术领域。该分子标记包括在MEF2B基因序列的第1010位存在一个SNP位点,其中,脱氧核苷酸由C变为G。该检测体外样品是否存在MEF2B基因的单核苷酸多态性的方法,包括如下步骤,(1)采用特异性引物SEQ ID No:2和SEQ ID No:3扩增样品的MEF2B基因,得到扩增产物;(2)对步骤(1)的扩增产物进行序列测定,当MEF2B基因序列的第1010位存在一个SNP位点,且脱氧核苷酸由C变为G时,则为突变MEF2B基因,仍是C时为正常基因。本发明通过检测体外样品中是否含有MEF2B基因单核苷酸多态性,能够实现对于COVID‑19高危人群及易感人群的早期诊断、筛查和对于COVID‑19的有效防控。
Description
技术领域
本发明涉及基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及其与COVID-19的相关性研究,属于分子生物 学和医学技术领域,具体地涉及一种用于检测COVID-19易感性的分 子标记、试剂盒及应用。
背景技术
据数据模型研究和血清感染研究估计实际感染人数要大得多,表 明大多数感染者可能有轻度症状或无症状。COVID-19患者表现出广 泛的临床症状:在确诊病例中,多达5%会发展成为包含急性呼吸窘 迫综合征(ARDS)在内的严重肺炎。虽然目前研究已发现高龄、男性、 高血压、糖尿病、肥胖和心血管疾病等因素与COVID-19的发病密切 相关,但仍有大量没有上述危险因素的患者出现严重症状。提示 COVID-19患者的筛选、早期诊断对于疫情防治具有重要意义,因此, 寻找和鉴定COVID-19高危人群和易感个体至关重要。
然而现有技术中,没有与COVID-19易感性相关的遗传变异的报 道,也没有相关的检测试剂盒和检测方法。因此,本领域急需进一步 寻找COVID-19易感性基因,开发检测COVID-19高危人群和易感个 体的方法、试剂盒以及相关的治疗药物。
发明内容
为解决上述技术问题,本发明公开了一种用于检测COVID-19易 感性的分子标记、试剂盒及应用。具体地通过检测体外样品中是否含 有MEF2B基因中的单核苷酸多态性,能够实现对于COVID-19高危 人群及易感人群的早期诊断、筛查和对于COVID-19的有效防控。
为实现上述目的,本发明公开了一种用于检测COVID-19易感性 的分子标记,它包括如下SNP位点:在MEF2B基因序列的第1010 位存在一个SNP位点,其中,脱氧核苷酸由C变为G。
本发明公开技术方案的其中一个技术目的是上述分子标记在制 备用于检测COVID-19易感性的试剂盒中的应用。
进一步地,一种用于检测COVID-19易感性的试剂盒,所述试剂 盒包括SEQ ID No:2和SEQ ID No:3所示的用于扩增MEF2B基因 的特异性引物。
进一步地,所述试剂盒还包括PCR反应液,所述PCR反应液由 Taq酶、Buffer、dNTP、Mg2+和双蒸水组成。
进一步地,所述特异性引物对MEF2B基因扩增后所得产物长度 为250~2010bp。
本发明公开技术方案的另一个技术目的是一种检测体外样品是 否存在基因单核苷酸多态性的方法,它包括如下检测过程:
采用特异性引物SEQ ID No:2和SEQ ID No:3扩增样品的 MEF2B基因,得到扩增产物,对所述扩增产物进行序列测定,当 MEF2B基因序列的第1010位存在一个SNP位点,且脱氧核苷酸由C 变为G时,则为突变MEF2B基因,仍是C时为正常基因。
进一步地,采用PCR扩增技术对样品进行扩增,且PCR扩增条 件为,94℃:4分钟,94℃:30秒×35次循环,60℃:30秒×35次循环, 72℃:1分钟×35次循环,72℃延伸5分钟。
进一步地,所述样品包括血液、唾液、肺泡冲洗液等。
本发明公开技术方案的余下技术目的是是对个体COVID易感性 或患病风险进行检测或诊断的方法,它包括如下步骤:
(1)提取受试者血液DNA,应用上述检测试剂盒进行PCR反 应,并将产物进行测序,其中,测序引物使用SEQ ID No:2或SEQ ID No:3。
(2)比对测序结果,若出现SEQ ID No:1中1010C>G的SNP 位点,说明该受试者为COVID-19易感染对象,应提醒该受试者严格 注意防护,减少公众场合活动,避免感染,并优先进行疫苗接种;若 未出现上述中的任意一种,说明该受试者不是COVID-19易感染对象。
检验原理:
SNP是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列 多态性。通过大数据分析研究表明,本发明中SEQ ID No:1中的1010 C>G位点与新冠肺炎疾病严重程度呈显著相关性,这可能是因为单 个氨基酸的改变或突变,进一步导致蛋白质表达异常或结构异常,进 而导致相应蛋白质功能异常,影响个体的免疫***或影响机体不能及 时有效清除SARS-Cov-2,最终使得机体感染病毒并发病。
有益效果:
1、本发明设计了一种分子标记及试剂盒,能实现对于COVID-19 高危人群及易感人群的早期诊断和筛查,对于实现COVID-19的有效 防控具备重要意义;
2、本发明设计的检测方法操作简单,且检测过程快速,准确度 也较高,适合对COVID-19高危人群及易感人群的早期筛查。
附图说明
图1为新冠肺炎患者人群中19q13.11位点的Regional plot图。
具体实施方式
术语解释
SNP:单核苷酸多态性,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸 的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见 的一种,占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛 存在,平均每300个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP是一种二态的标记,由单个碱基的转换或颠换所引起, 也可由碱基的***或缺失所致。SNP既可能在基因序列内,也可能在 基因以外的非编码序列上。
本发明的发明人经过广泛深入而深入的研究,通过对多中心大样 本数据的整合分析,对大量候选基因的SNP进行分析和筛选,首次 发现MEF2B基因与COVID-19易感性密切相关,可作为COVID-19 易感性检测或早期诊断的分子标记。因此,本发明提供了一种用于检 测COVID-19易感性的分子标记、试剂盒及应用。
为更好的解释本发明技术方案,以下结合具体实施例进行详细说 明。
实施例1 MEF2B基因突变的检测及其与COVID-19感染的相关 性分析;
1.1筛选受试者:
选取无合并症的新冠肺炎确诊患者200例,选择年龄、性别匹配 的健康体检对照人群200例。留取受试人员外周血至少1.5mL,-80℃ 冰箱冷冻保存备用。
1.2提取样本DNA:
提取上述步骤1.1的受试人员外周血中DNA;其中,本实施例 提取血液样品DNA采用QIAGEN公司DNA纯化试剂盒,货号:69504。
具体操作过程如下:
取100uL血液样品,加入20uL蛋白酶K,100uL PBS震荡混匀;
加入200uL Buffer AL,震荡混匀后56℃水浴10min;
加入200uL无水乙醇,震荡混匀得混合物;
将混合物转入试剂盒提供的spin column中,6000g离心1min, 弃去废液;
更换收集管,在spin column中加入500μL试剂盒提供的Buffer AW1,其中,所述Buffer AW1按说明书要求提前加入无水乙醇,6000g 离心1min,弃去废液;
继续更换收集管,在spin column中加入500μL试剂盒提供的 Buffer AW2,所述Buffer AW2按说明书要求提前加入无水乙醇, 20000g离心3min,弃去废液;
去除收集管,将spin column转入1.5mL离心管中,加入200uL 试剂盒提供的Buffer AE,完全覆盖膜,室温静置至少1min;
6000g离心1min,获得样品DNA,应用Nanodrop 2000微量紫 外分光光度计测量DNA浓度,其中,所述Nanodrop 2000微量紫外 分光光度计为Thermo公司;
1.3MEF2B基因特异性引物设计:
检索GenBank数据库中MEF2B基因组序列,应用Primer3Plus 在线引物设计工具设计引物,且引物序列信息如SEQ ID No:2和SEQ ID No:3所示。且引物序列信息见表1.
表1 MEF2B引物序列表
引物名称 | 序列 | SEQ ID No. |
上游引物 | cagccccaaactgattccct | 2 |
下游引物 | ctgggcaacaagagcgaaac | 3 |
1.4 PCR扩增:
PCR扩增使用北京擎科新业生物技术有限公司的2×Master Mix 目录号为TSE003。
且PCR扩增条件如下:
1.5测序分析:
上述PCR扩增产物由武汉擎科公司完成测序,测序引物使用SEQ ID No:2,测序结果经DNA测序分析软件Chromas,版本v2.6.5进 行检查,应用Invitrogen Vector NTI 11软件包附带序列比对软件 AlignX进行比对。通过对比分析,确定是否存在MEF2B基因的单核苷酸多态性。
1.6 SNP分型与COVID-19关联分析:
确定SNP位点后,应用卡方检验对检测结果中SNP位点的分布 特征情况进行统计学分析,应用Logistic回归分析对基因型频率、等 位基因频率和新冠肺炎患者临床表型的相关性进行评估,计算95% 置信区间(confidence interval,CI)和比值比(Odds ratio,OR),应用 SPSS 22.0软件进行统计分析。结果发现SEQ ID No:4中的1010C>G 位点与新冠肺炎疾病严重程度呈显著相关性(P=1.22×10-8),其中, 95%CI为4.14~18.41,OR值为8.73。因此可以通过判断体外样品中 是否含有MEF2B基因单核苷酸多态性实现对COVID-19易感性的有 效筛选。如下表2为MEF2B与COVID-19的相关性。
表2 MEF2B与COVID-19的相关性
*HGI,即Host Genetics Initiative,宿主遗传学计划。
与此同时,图1为新冠肺炎患者人群中19q13.11位点的Regional plot图,结合图1可知新冠肺炎人群中的MEF2B基因SNP位点具有 显著差异性。
实施例2
应用COVID-19易感性检测试剂盒判断受试对象COVID-19的易 感性;
根据实施例1的相关结果,发现MEF2B基因的SNP表达与 COVID-19易感性密切相关,基于该结果中的突变可设计基因特异性 引物,从而制出一种检测试剂盒,用以检测受试患者的血液DNA模 板。
上述检测试剂盒(以100人次为例),包含下表2所示试剂。
表3试剂盒含量列表
与此同时,所述PCR反应混合液包含PCR反应的常规组件: Buffer、Taq酶、dNTP、Mg2+和双蒸水组成。
实际应用中,试剂盒包括包装盒、海绵衬垫、装有上游引物的试 管、装有下游引物的试管、装有PCR反应Mix的试管、装有阳性对 照品的一个试管和装有阴性对照品的一个试管。
进一步地按照实施例1中步骤1.2所述方法提取受试患者血液 DNA,应用表2中所述检测试剂盒进行PCR反应,并将产物进行测 序,测序引物使用SEQ ID No:2。
结果判定:比对测序结果,若SEQ ID No:1中1010C>G的SNP 位点;则说明该受试者为COVID-19易感染对象,应提醒该受试者严 格注意防护,减少公众场合活动,避免感染,并优先进行疫苗接种; 否则说明该受试者不是COVID-19易感染对象。
此外,正常MEF2B基因的基因序列表如下所示:
因此,本发明依据SEQ ID No:1中1010C>G的SNP位点,开 发出一种检测检测新冠肺炎遗传易感性的试剂盒。该试剂盒涉及SEQ ID No:1中1010C>G的SNP。具体检测方法为通过常规方法提取受 试患者外周血标本的DNA,应用该易感性检测试剂盒进行PCR反应, 将PCR产物进行常规测序,应用Chromas软件检验测序结果,应用 Invitrogen Vector NTIAlignX软件比对测序序列。若测序结果含有 1010C>G,即可判定该标本对应患者对新冠肺炎的易感性高于正常 人群。
以上实施例仅为最佳举例,而并非是对本发明的实施方式的限定。 除上述实施例外,本发明还有其他实施方式。凡采用等同替换或等效 变换形成的技术方案,均落在本发明要求的保护范围。
Claims (5)
1.一种检测分子标记的引物对在制备用于检测COVID-19易感性试剂盒中的应用,其特征在于,所述引物对序列如SEQ ID No:2和SEQ ID No:3所示。
2.根据权利要求1的应用,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR反应液,所述PCR反应液由Taq酶、Buffer、dNTP、Mg2+和双蒸水组成。
3.一种非诊断目的的检测体外样本COVID-19易感性的方法,其特征在于,采用引物对SEQ ID No:2和SEQ ID No:3扩增样本的MEF2B基因,得到扩增产物,对所述扩增产物进行序列测定,当MEF2B基因序列的第1010位存在一个SNP位点,且脱氧核苷酸由C变为G时,则判定样本易感染COVID-19。
4.根据权利要求3所述非诊断目的的检测体外样本COVID-19易感性的方法,其特征在于,采用PCR扩增技术对样本进行扩增,且PCR扩增条件为,94℃:4分钟,94℃:30秒×35次循环,60℃:30秒×35次循环,72℃:1分钟×35次循环,72℃延伸5分钟。
5.根据权利要求3或4所述非诊断目的的检测体外样本COVID-19易感性的方法,其特征在于,所述样本包括血液、唾液、肺泡冲洗液。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202110700484.0A CN113493863B (zh) | 2021-06-23 | 2021-06-23 | 用于检测covid-19易感性的分子标记、试剂盒及应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202110700484.0A CN113493863B (zh) | 2021-06-23 | 2021-06-23 | 用于检测covid-19易感性的分子标记、试剂盒及应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN113493863A CN113493863A (zh) | 2021-10-12 |
CN113493863B true CN113493863B (zh) | 2022-06-10 |
Family
ID=77997939
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202110700484.0A Active CN113493863B (zh) | 2021-06-23 | 2021-06-23 | 用于检测covid-19易感性的分子标记、试剂盒及应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN113493863B (zh) |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20190100425A (ko) * | 2010-12-30 | 2019-08-28 | 파운데이션 메디신 인코포레이티드 | 종양 샘플의 다유전자 분석의 최적화 |
US20190262399A1 (en) * | 2016-09-07 | 2019-08-29 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses |
US10934594B2 (en) * | 2017-11-30 | 2021-03-02 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting breast cancer |
CN108823640A (zh) * | 2018-06-06 | 2018-11-16 | 珠海铂华生物工程有限公司 | 一种构建基于淋巴瘤基因检测的高通量测序文库的方法及其应用 |
CN109609647B (zh) * | 2019-01-25 | 2022-08-23 | 臻悦生物科技江苏有限公司 | 基于二代测序的用于泛癌种靶向、化疗及免疫用药的检测Panel、检测试剂盒及其应用 |
-
2021
- 2021-06-23 CN CN202110700484.0A patent/CN113493863B/zh active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN113493863A (zh) | 2021-10-12 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EP3316875B1 (en) | Methods to diagnose acute respiratory infections | |
CN112538528A (zh) | 一种检测aldh2基因多态性的引物组及试剂盒 | |
WO2021204205A1 (zh) | 一种借助高通量测序检测smn1基因突变的方法和*** | |
CN113444838A (zh) | 用于检测covid-19易感性的分子标记、试剂盒及应用 | |
CN111560428B (zh) | 检测线粒体DNA rs3937033单核苷酸多态性的物质的用途 | |
CN111676283B (zh) | 与高原肺水肿发生相关的线粒体dna单核苷酸多态性的应用 | |
CN105441540A (zh) | 检测非综合症型耳聋基因多态性的试剂盒及其应用 | |
CN110699446B (zh) | 一种与非综合征型唇腭裂诊断相关的SNP标志物rs3174298及其应用 | |
CN115948532A (zh) | 基于数字pcr技术的sma检测试剂盒 | |
CN114703278A (zh) | 一种肌萎缩侧索硬化致病基因、检测试剂盒及引物组 | |
CN114107488A (zh) | 一种检测mthfr基因多态性的引物组及试剂盒 | |
CN113584147A (zh) | 一种用于指导精神病用药的基因多态性检测试剂盒 | |
CN105506164A (zh) | 一种检测青春型精神***症易感性的试剂盒 | |
CN105177152B (zh) | 检测hla-b*51等位基因的方法和引物 | |
CN113493863B (zh) | 用于检测covid-19易感性的分子标记、试剂盒及应用 | |
CN109182490B (zh) | Lrsam1基因snp突变位点分型引物及其在冠心病预测中的应用 | |
CN105543390A (zh) | 一种检测型偏执型精神***症易感性的引物及试剂盒 | |
CN113528640A (zh) | 用于检测covid-19易感性的分子标记、试剂盒及应用 | |
CN113584222A (zh) | 用于检测covid-19易感性的分子标记、试剂盒及应用 | |
CN110029162B (zh) | 一种用于检测***性红斑狼疮易感性位于非编码基因区的snp标志物及其应用 | |
CN110511995B (zh) | 一组结核病标志物及其应用 | |
CN114606311B (zh) | SLC39A13基因rs755555位点的应用及其检测引物和探针组合、试剂盒 | |
CN111560430B (zh) | 检测rs1766位点多态性的试剂及其应用 | |
CN111518894B (zh) | 检测rs9273471位点多态性的试剂及其应用 | |
CN106434880A (zh) | 一种检测单纯型精神***症易感性的引物及试剂盒 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |