CN112037866B - 菌株基因组测序信息查询方法、装置、电子设备及介质 - Google Patents
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Abstract
本公开提供了菌株基因组测序信息查询方法、装置、电子设备及介质。该方法的一具体实施方式包括:响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端,以供用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。该实施方式实现了管理员终端与用户终端之间菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件的安全传输。
Description
技术领域
本公开涉及计算机技术领域,具体涉及菌株基因组测序信息方法、装置、电子设备及存储介质。
背景技术
自然界的物种种类极其繁多,生物学家不断在探索生物物种,生物物种的发现使人们对物种的多样性会有新的认识。
对于在微生物培养过程中分离得到的菌株,科研人员需要选择专业的测序机构对分离得到的菌株进行基因组测序分析,并与已有的菌株进行比较,来鉴定微生物菌株所在的物种分类。
目前,现有的送样测序管理平台,向送样申请人展示送样测序注意事项以及联系方式,通过该联系方式进行送样测序的各个环节的沟通,并且送样测序管理平台的管理员可以通过邮寄测序文件等方式将测序结果反馈给送样申请人。
发明内容
本公开提出了菌株基因组测序信息查询方法、装置、电子设备及存储介质。
第一方面,本公开提供了一种菌株基因组测序信息查询方法,应用于服务器,该菌株基因组测序信息查询方法包括:响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,其中,文件存储请求是管理员终端根据管理员输入的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径生成的;响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,文件查询请求是用户终端响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识而生成的;响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端,以供用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息查询方法还包括:响应于接收到管理员终端发送的项目标识生成请求,生成与项目标识生成请求对应的项目标识,并将所生成的项目标识与项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储,其中,项目标识生成请求是管理员终端响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息而生成的。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息查询方法还包括:响应于接收到用户终端发送的物流信息存储请求,将物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息和注册用户标识对应存储,其中,物流信息存储请求是用户终端响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息而生成的;响应于接收到管理员终端发送的物流信息查询请求,查询与物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识,并发送至管理员终端,以供管理员终端呈现或存储与待查询物流信息对应的注册用户标识,其中,物流信息查询请求是管理员终端响应于接收到管理员输入的待查询物流信息而生成的。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息查询方法还包括:响应于接收到用户终端发送的送样测序请求,向用户终端发送待填写的待测菌株信息;响应于接收到用户终端发送的待测菌株信息审核请求,将待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,确定已填写的待测菌株信息是否完整,其中,待测菌株信息审核请求是用户终端响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识而生成的;响应于确定完整,向用户终端发送用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,以供用户终端呈现或存储所收到的提示信息;响应于接收到用户终端发送的送样测序协议文件上传请求,将送样测序协议文件上传请求中的已签订送样测序协议文件和注册用户标识对应存储。
第二方面,本公开提供了一种菌株基因组测序信息查询装置,应用于服务器,该菌株基因组测序信息查询装置包括:文件存储单元,被配置为响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,其中,文件存储请求是管理员终端根据管理员输入的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径生成的;确定单元,被配置为响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,文件查询请求是用户终端响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识而生成的;第一查询单元,被配置为转响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端,以供用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息查询装置还包括:第一存储单元,被配置为响应于接收到管理员终端发送的项目标识生成请求,生成与项目标识生成请求对应的项目标识,并将所生成的项目标识与项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储,其中,项目标识生成请求是管理员终端响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息而生成的。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息查询装置还包括:第二存储单元,被配置为响应于接收到用户终端发送的物流信息存储请求,将物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息和注册用户标识对应存储,其中,物流信息存储请求是用户终端响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息而生成的;第二查询单元,被配置为响应于接收到管理员终端发送的物流信息查询请求,查询与物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识,并发送至管理员终端,以供管理员终端呈现或存储与待查询物流信息对应的注册用户标识,其中,物流信息查询请求是管理员终端响应于接收到管理员输入的待查询物流信息而生成的。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息查询装置还包括:第三发送单元,被配置成响应于接收到用户终端发送的送样测序请求,向用户终端发送待填写的待测菌株信息;第二确定单元,被配置成响应于接收到用户终端发送的待测菌株信息审核请求,将待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,确定已填写的待测菌株信息是否完整,其中,待测菌株信息审核请求是用户终端响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识而生成的;第四发送单元,被配置成响应于确定完整,向用户终端发送用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,以供用户终端呈现或存储所收到的提示信息;第三存储单元,被配置成响应于接收到用户终端发送的送样测序协议文件上传请求,将送样测序协议文件上传请求中的已签订送样测序协议文件和注册用户标识对应存储。
第三方面,本公开提供了一种菌株基因组测序信息存储方法,应用于管理员终端,该菌株基因组测序信息存储方法包括:响应于检测到文件存储操作,获取文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件生成文件存储请求;向服务器发送文件存储请求,文件存储请求用于触发服务器将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,以及响应于接收到用户终端发送的查询请求,确定查询请求中的注册用户标识与测序项目标识是否满足预设对应关系,查询请求用于触发服务器响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端,菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件用于触发用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息存储方法还包括:响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息生成项目标识生成请求;向服务器发送项目标识生成请求,项目标识生成请求用于触发服务器生成与项目标识生成请求对应的项目标识,并将生成的项目标识与项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息存储方法还包括:根据管理员输入的待查询物流信息生成待查询物流信息查询请求;向服务器发送待查询物流信息查询请求;响应于接收到服务器发送的与待查询物流信息对应的注册用户标识,呈现所收到的注册用户标识,其中,所收到的注册用户标识是服务器查询到的与物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识。
第四方面,本公开提供了一种菌株基因组测序信息存储装置,应用于管理员终端,该菌株基因组测序信息存储装置包括:第一生成单元,被配置为响应于检测到文件存储操作,获取文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件生成文件存储请求;第一发送单元,被配置为向服务器发送文件存储请求,文件存储请求用于触发服务器将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,以及响应于接收到用户终端发送的查询请求,确定查询请求中的注册用户标识与测序项目标识是否满足预设对应关系,查询请求用于触发服务器响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端,菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件用于触发用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息存储装置还包括:第三生成单元,被配置为响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息生成项目标识生成请求;第五发送单元,被配置为向服务器发送项目标识生成请求,项目标识生成请求用于触发服务器生成与项目标识生成请求对应的项目标识,并将生成的项目标识与项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储;
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息存储装置还包括:第六发送单元,被配置为根据管理员输入的待查询物流信息生成待查询物流信息查询请求;第三查询单元,被配置为向服务器发送待查询物流信息查询请求;第二呈现单元,被配置为响应于接收到服务器发送的与待查询物流信息对应的注册用户标识,呈现所收到的注册用户标识,其中,所收到的注册用户标识是服务器查询到的与物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识。
第五方面,本公开提供了一种菌株基因组测序信息呈现方法,应用于用户终端,该菌株基因组测序信息呈现方法包括:响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求;向服务器发送文件查询请求;响应于接收到服务器发送的与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件为服务器响应于接收到用户终端文件查询请求以及确定文件查询请求中的注册用户标识与测序项目标识满足预设对应关系而查询到的与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息呈现方法包括:响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息生成的物流信息存储请求;向服务器发送物流信息存储请求,物流信息存储请求用于触发服务器将物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息的物流信息和请求对待测菌株进行基因组测序的用户的注册用户标识对应存储。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息呈现方法包括:响应于检测到用户触发的送样测序协议文件上传操作,根据送样测序协议文件上传操作所针对的注册用户标识和已签订送样测序协议文件生成送样测序协议文件上传请求,以及向服务器发送所生成的送样测序协议文件上传请求;接收并呈现服务器发送的待填写的待测菌株信息;响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识生成待测菌株信息审核请求;向服务器发送待测菌株信息审核请求,其中,待测菌株信息审核请求用于触发服务器将待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,以及确定已填写的待测菌株信息是否完整;响应于接收到服务器发送的用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,呈现或存储所收到的提示信息,其中,所收到的提示信息是服务器响应于确定已填写的待测菌株信息完整而发送的。
第六方面,本公开提供了一种菌株基因组测序信息呈现装置,应用于用户终端,该菌株基因组测序信息呈现装置包括:第二生成单元,被配置为响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求;第二发送单元,被配置为向服务器发送文件查询请求;呈现单元,被配置为响应于接收到服务器发送的与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件为服务器响应于接收到用户终端文件查询请求以及确定文件查询请求中的注册用户标识与测序项目标识满足预设对应关系而查询到的与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息呈现装置还包括:第四生成单元,被配置为响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息生成的物流信息存储请求;第七发送单元,被配置为向服务器发送物流信息存储请求,物流信息存储请求用于触发服务器将物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息的物流信息和请求对待测菌株进行基因组测序的用户的注册用户标识对应存储;
在一些可选的实施方式中,该菌株基因组测序信息呈现装置还包括:第八发送单元,被配置为响应于检测到用户触发的送样测序协议文件上传操作,根据送样测序协议文件上传操作所针对的注册用户标识和已签订送样测序协议文件生成送样测序协议文件上传请求,以及向服务器发送所生成的送样测序协议文件上传请求;接收单元,被配置为接收到服务器发送的待填写的待测菌株信息;第五生成单元,被配置为响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识生成待测菌株信息审核请求;第九发送单元,被配置为向服务器发送待测菌株信息审核请求,其中,待测菌株信息审核请求用于触发服务器将待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,以及确定已填写的待测菌株信息是否完整;第三呈现单元,被配置为响应于接收到服务器发送的用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,呈现或存储所收到的提示信息,其中,所收到的提示信息是服务器响应于确定已填写的待测菌株信息完整而发送的。
第七方面,本公开提供了一种服务器,包括:一个或多个处理器;存储装置,其上存储有一个或多个程序,当上述一个或多个程序被上述一个或多个处理器执行时,使得上述一个或多个处理器实现如第一方面中任一实现方式描述的方法。
第八方面,本公开提供了一种管理员终端,包括:一个或多个处理器;存储装置,其上存储有一个或多个程序,当上述一个或多个程序被上述一个或多个处理器执行时,使得上述一个或多个处理器实现如第三方面中任一实现方式描述的方法。
第九方面,本公开提供了一种用户终端,包括:一个或多个处理器;存储装置,其上存储有一个或多个程序,当上述一个或多个程序被上述一个或多个处理器执行时,使得上述一个或多个处理器实现如第五方面中任一实现方式描述的方法。
第十方面,本公开提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其中,该计算机程序被一个或多个处理器执行时实现如第一方面中任一实现方式描述的方法,或者如第三方面中任一实现方式描述的方法,或者如第五方面中任一实现方式描述的方法。
第十一方面,本公开提供了一种菌株基因组测序信息处理***,包括如第七方面中任一实施方式描述的服务器、至少一个如第八方面中任一实施方式描述的管理员终端以及至少一个如第九方面中任一实施方式描述的用户终端。
现有技术中,测序管理平台的管理员通过邮寄测序文件等方式将测序结果反馈给送样申请人,该过程依赖于邮寄所使用的物流,存在可能丢失、泄露测序文件以及送样申请人获取测序文件时间较长等问题。为解决上述问题,本公开提供的菌株基因组测序信息查询方法、装置、电子设备及介质,管理员终端响应于检测到文件存储操作,获取文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件生成文件存储请求,然后向服务器发送文件存储请求,服务器响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,用户终端响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求,然后向服务器发送文件查询请求,服务器响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端,响应于接收到服务器发送的与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
整个过程中,管理员终端将注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储至服务器,用户终端可以根据注册用户标识、项目标识,从服务器查询并获取菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,不依赖于邮寄过程所使用的物流,实现了管理员终端与用户终端之间菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件的安全、快速、准确传输,提高了送样申请人获取测序文件的速度、安全性和准确性。
附图说明
通过阅读参照以下附图所作的对非限制性实施例所作的详细描述,本公开的其它特征、目的和优点将会变得更明显:
图1是根据本公开的菌株基因组测序信息处理***的一个实施例的示例性***架构;
图2A、图2B和图2C是根据本公开的菌株基因组测序信息处理***的一个实施例的时序图;
图3是根据本公开的菌株基因组测序信息查询方法的一个实施例的流程图;
图4是根据本公开的菌株基因组测序信息存储方法的一个实施例的流程图;
图5是根据本公开的菌株基因组测序信息呈现方法的一个实施例的流程图;
图6是根据本公开的菌株基因组测序信息查询装置的一个实施例的结构示意图;
图7是根据本公开的菌株基因组测序信息存储装置的一个实施例的结构示意图;
图8是根据本公开的菌株基因组测序信息呈现装置的一个实施例的结构示意图;
图9是适于用来实现本公开的电子设备(服务器、管理员终端或用户终端)的计算机***的结构示意图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本公开作进一步的详细说明。可以理解的是,此处所描述的具体实施例仅仅用于解释相关发明,而非对该发明的限定。另外还需要说明的是,为了便于描述,附图中仅示出了与有关发明相关的部分。
需要说明的是,在不冲突的情况下,本公开中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。下面将参考附图并结合实施例来详细说明本公开。
图1示出了本公开的菌株基因组测序信息处理***的一个实施例的示例性***架构100。
如图1所示,***架构100可以包括管理员终端101、102、103,网络104、106,服务器105和用户终端107、108、109。网络104用以在管理员终端101、102、103和服务器105之间提供通信链路的介质,网络106用以在服务器105和用户终端107、108、109之间提供通信链路的介质。网络104、106可以包括各种连接类型,例如有线、无线通信链路或者光纤电缆等等。
管理员可以使用管理员终端101、102、103通过网络104与服务器105交互,以接收或发送信息等。管理员终端101、102、103上可以安装有菌株基因组测序类应用、菌株基因组分析类应用、网页浏览器应用等。
注册用户可以使用用户终端107、108、109通过网络106与服务器105交互,以接收或发送信息等。用户终端107、108、109上可以安装有菌株基因组查询类应用、网页浏览器应用等。
服务器105可以是提供各种服务的服务器,例如对用户终端提供菌株基因组测序信息查询服务的后台服务器。
需要说明的是,服务器105可以是硬件,也可以是软件。当服务器105为硬件时,可以实现成多个服务器组成的分布式服务器集群,也可以实现成单个服务器。当服务器105为软件时,可以实现成多个软件或软件模块(例如用来提供菌株基因组测序信息查询服务),也可以实现成单个软件或软件模块。在此不做具体限定。
需要说明的是,本公开的菌株基因组测序信息查询方法可以由服务器105执行,相应地,菌株基因组测序信息查询装置也可以设置于服务器105中。
需要说明的是,本公开的菌株基因组测序信息存储方法可以由管理员终端101、102、103执行,相应地,菌株基因组测序信息存储装置也可以设置于管理员终端101、102、103中。
需要说明的是,本公开的菌株基因组测序信息呈现方法可以由用户终端107、108、109执行,相应地,菌株基因组测序信息呈现装置也可以设置于用户终端107、108、109中。
应该理解,图1中的用户终端、管理员终端、网络和服务器的数目仅仅是示意性的。根据实现需要,可以具有任意数目的用户终端、管理员终端、网络和服务器。
继续参考图2A,其示出了根据本公开的菌株基因组测序信息处理***的一个实施例的时序200。
本公开实施例中的菌株基因组测序信息处理***可以包括服务器、至少一个管理员终端以及至少一个用户终端。
步骤201,管理员终端响应于检测到管理员触发的文件存储操作,获取文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件生成文件存储请求。
在本实施例中,文件存储操作可以是针对用户终端上显示的预设文件存储操作对象的预设操作。这里,预设文件存储操作对象可以是文件存储操作图标或按钮等,预设操作可以是单击、双击、滑动或拖拽操作等。
在本实施例中,注册用户标识用于标识注册用户,例如可以是注册用户注册时所使用的用户账号名称、手机号码或身份证号等。项目标识可以用于标识菌株测序项目,例如可以是英文字母、数字、或其组合。通常来说,科研人员在为某个菌株开启基因组测序项目时,会分配给该菌株测序项目一个项目标识。菌株原始测序文件可以是测序仪下机文件。菌株基因组注释文件可以是对菌株原始测序文件进行分析注释后的文件。这里,管理员可以是菌株基因组测序类应用、菌株基因组分析类应用的管理人员,也可以是能够提供送样测序服务的、能够进行菌株基因组测序与分析注释的科研人员。
步骤202,管理员终端向服务器发送文件存储请求。
在本实施例中,管理员终端可以将步骤201中所生成的文件存储请求发送给服务器。其中,上述服务器是对菌株基因组测序信息查询服务提供支持的服务器。
步骤203,服务器响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储。
在本实施例中,服务器可以在接收到管理员终端发送的文件存储请求的情况下,将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储在服务器本地,或者,服务器也可以将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件对应存储在第一文件服务器,将注册用户标识、项目标识、菌株基因组注释文件对应存储在第二文件服务器。第一文件服务器和第二文件服务器可以是两个不同的文件管理***,以实现分开管理原始测序文件和菌株基因组注释文件。此外,两个文件管理***可以分别安装至同一个或者两个不同的物理机上,提高数据的安全可靠性。
这里,由于菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件的内容类型不同、重要安全级别不同,所以将菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件进行分开存储,方便定制化的分类管理。
经过步骤201到步骤203,实现了将注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储在服务器。
步骤204,用户终端响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求。
在本实施例中,文件查询操作可以是针对用户终端上显示的预设文件查询操作对象的预设操作。这里,预设文件查询操作对象可以是文件查询操作图标或按钮等,预设操作可以是单击、双击、滑动或拖拽操作等。这里,用户可以是菌株基因组查询类应用的注册用户,还可以是待测菌株的持有人、送样测序的申请人。
在实践中,用户可以针对用户终端上所显示的网页页面中文件查询操作图标或按钮进行单击、双击、滑动或拖拽操作来触发文件查询操作。用户也可以在菌株基因组查询类应用的文件查询界面所显示的文件查询操作图标或按钮进行单击、双击、滑动或拖拽操作来触发文件查询操作。
步骤205,用户终端向服务器发送文件查询请求。
在本实施例中,用户终端可以将步骤204中所生成的文件查询请求发送给服务器。
步骤206,服务器响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系。
在本实施例中,服务器在接收到用户终端发送的文件查询请求的情况下,可以从预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系中确定注册用户标识和测序项目标识是否满足对应关系。如果确定注册用户标识和测序项目标识满足预设对应关系,执行步骤207。预设对应关系可以是预设对应关系表,预设对应关系表可以包括至少一组注册用户标识和对应的测序项目标识集合。测序项目标识集合可以是测序状态为已完成测序的测序项目标识。
在实践中,通过先验证注册用户标识和测序项目标识之间的对应关系,为注册用户标识和测序项目标识满足预设对应关系的文件查询请求提供文件查询服务,以提高文件查询的安全性。
步骤207,服务器响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端。
在本实施例中,服务器可以在步骤206中确定文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识满足预设对应关系的情况下,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至发送上述用户终端。
步骤208,用户终端响应于接收到服务器发送的与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
通过步骤204到步骤208,用户终端可以从服务器获取与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,并在用户终端中呈现或存储,继而注册用户可以通过用户终端获得与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
由于页面显示限制,下面继续参考图2B,需要说明的是,图2B的流程除了包括图2B中所示的流程外,还可以包括图2A中所示的各个步骤。
在一些可选的实施方式中,上述时序200还可以包括以下步骤209到步骤216:
步骤209,用户终端向服务器发送送样测序请求。
在该可选实施方式中,送样测序请求可以是用户终端在检测到用户触发的送样测序操作的情况下所生成的送样测序请求。这里,送样测序操作可以是用户针对用户终端上显示的预设送样测序对象的预设操作。例如,预设送样测序对象可以是送样测序操作图标或按钮等,预设操作可以是单击、双击、滑动或拖拽操作等。
步骤210,服务器响应于接收到用户终端发送的送样测序请求,向用户终端发送待填写的待测菌株信息。
在该可选实施方式中,服务器可以在接收到用户终端发送的送样测序请求的情况下,向用户终端发送待填写的待测菌株信息。这里,待测菌株信息可以包括待测菌株的培养信息以及待测菌株的来源信息。
步骤211,用户终端接收并呈现服务器发送的待填写的待测菌株信息。
在该可选实施方式中,用户终端可以接收并呈现步骤201中服务器发送的待填写的待测菌株信息。
在实践中,注册用户可以根据用户终端所呈现的待填写的待测菌株信息中的所指示填写的项目名称,在每个项目名称所对应的填写框中输入待测菌株的相关信息,在将待测菌株信息填写完整后,点击待测菌株信息提交审核按钮,形成已填写的待测菌株信息发送至服务器。
步骤212,用户终端响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识生成待测菌株信息审核请求。
在该可选实施方式中,待测菌株信息审核操作可以是针对用户终端上显示的预设待测菌株信息审核操作对象的预设操作。例如,预设待测菌株信息审核操作对象可以是预设待测菌株信息审核操作图标或按钮等,预设操作可以是单击、双击、滑动或拖拽操作等。
在实践中,用户可以针对用户终端上所显示网页页面中的待测菌株信息审核操作图标或按钮进行单击、双击、滑动或拖拽操作。用户也可以在菌株基因组查询类应用的待测菌株信息审核界面所显示的待测菌株信息审核操作图标或按钮进行单击、双击、滑动或拖拽操作。
步骤213,用户终端向服务器发送待测菌株信息审核请求。
在该可选实施方式中,用户终端可以将步骤212中所生成的待测菌株信息审核请求发送给服务器。
步骤214,服务器响应于接收到用户终端发送的待测菌株信息审核请求,确定已填写的待测菌株信息是否完整。
在该可选实施方式中,服务器在接收到用户终端发送的待测菌株信息审核请求的情况下,可以判断待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息是否完整。
在实践中,注册用户在利用用户终端上传已填写的待测菌株信息时,可能会遗漏某些信息,导致已填写的待测菌株信息不够完整充足。
在一些可选的实现方式中,服务器可以在确定已填写的待测菌株信息不完整的情况下,向用户终端发送用于指示待测菌株信息不完整的指示信息,以指示用户补充缺少的信息并再次上传。
步骤215,服务器响应于确定完整,将待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,向用户终端发送用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息。
在该可选实施方式中,服务器可以在步骤214中确定已填写的待测菌株信息完整的情况下,将待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,并向用户终端发送用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息。具体地,可以以弹窗或提示框等形式呈现上述提示信息。
步骤216,用户终端响应于接收到服务器发送的用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,呈现所收到的提示信息。
在该可选实施方式中,用户终端可以在接收到服务器发送的用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息的情况下,呈现所收到的提示信息。
经过步骤209到步骤216,注册用户可以使用用户终端输入待测菌株信息,并发送给服务器,服务器确定已填写待测菌株完整后进行存储,并向用户终端发送待测菌株信息审核通过的提示信息。
在一些可选的实施方式中,上述时序200还可以包括以下步骤217和步骤218:
步骤217,用户终端响应于检测到用户触发的送样测序协议文件上传操作,根据送样测序协议文件上传操作所针对的注册用户标识和已签订送样测序协议文件生成送样测序协议文件上传请求,以及向服务器发送所生成的送样测序协议文件上传请求。
在该可选实现方式中,送样测序协议文件上传操作可以是针对用户终端上显示的预设送样测序协议文件上传操作对象的预设操作。例如,预设送样测序协议文件上传操作对象可以是预设送样测序协议文件上传操作图标或按钮等,预设操作可以是单击、双击、滑动或拖拽操作等。
在实践中,待测菌株的持有人(送样测序的申请人)可以在用户终端下载待签订的送样测序协议文件,将送样测序协议文件打印进行盖章签字后,利用用户终端将已签签字盖章的送样测序协议(已签订的送样测序协议)的扫描文件与注册用户标识发送至服务器,已签订的送样测序协议表示授予管理员进行待测菌株的测序业务以及保证待测菌株来源的合法性。
步骤218,服务器响应于接收到用户终端发送的送样测序协议文件上传请求,将送样测序协议文件上传请求中的已签订送样测序协议文件和注册用户标识对应存储。
在该可选实施方式中,服务器可以在接收到用户终端发送的送样测序协议文件上传请求的情况下,将送样测序协议文件上传请求中的已签订送样测序协议文件和注册用户标识对应存储。
经过步骤217和步骤218,注册用户可以将已签订的送样测序协议上传至服务器,以实现注册用户标识和已签订的送样测序协议对应存储至服务器。
由于页面显示限制,下面继续参考图2C,需要说明的是,图2C的流程除了包括图2C中所示的流程外,还可以包括图2A和图2B中所示的各个步骤。
在一些可选的实施方式中,上述时序200还可以包括以下步骤219到步骤221:
步骤219,用户终端响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息生成的物流信息存储请求。
在该可选实施方式中,物流信息存储操作可以是针对用户终端上显示的预设文物流信息存储操作对象的预设操作。这里,预设物流信息存储操作对象可以是物流信息存储操作图标或按钮等,预设操作可以是单击、双击、滑动或拖拽操作等。
在实践中,待测菌株的持有人可以在查看用户终端显示的用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,并且在上传已签订送样测序协议文件后,可以将待测菌株寄送至管理员指定的地址。在寄送后,待测菌株的持有人可以通过用户终端输入寄送操作对应的物流信息和注册用户标识。
步骤220,用户终端向服务器发送物流信息存储请求。
在该可选实施方式中,用户终端可以向服务器发送步骤219中生成的物流信息存储请求。
步骤221,服务器响应于接收到用户终端发送的物流信息存储请求,将物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息和注册用户标识对应存储。
在该可选实施方式中,服务器可以在接收到用户终端发送的物流信息存储请求的情况下,将物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息和注册用户标识对应存储。
这里,服务器将用户终端发送的物流信息与注册用户标识对应存储,以便管理员收到待测菌株样品时,利用管理员终端输入物流信息进行查询。
经过步骤219到步骤221,注册用户将寄送待测菌株样品的物流信息上传至服务器,以实现将注册用户标识与物流标识对应存储至服务器。
在一些可选的实施方式中,上述时序200还可以包括以下步骤222到步骤225:
步骤222,管理员终端根据管理员输入的待查询物流信息生成待查询物流信息查询请求。
在实践中,管理员在收到待测菌株的包裹后,可以利用管理员终端输入包裹上的快递单上的快递单号进行查询,确定该包裹中待测菌株所对应的信息。
步骤223,管理员终端向服务器发送待查询物流信息查询请求。
在该可选实施方式中,管理员终端可以向服务器发送步骤222中生成的待查询物流信息查询请求。
步骤224,服务器响应于接收到管理员终端发送的物流信息查询请求,查询与物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识,并发送至管理员终端。
步骤225,管理员终端响应于接收到服务器发送的与待查询物流信息对应的注册用户标识,呈现所收到的注册用户标识。
经过步骤222到步骤225,管理员根据所收到包裹的物流信息进行查询,确定出与该物流信息对应的注册用户标识。
在一些可选的实施方式中,上述时序200还可以包括以下步骤226到步骤228:
步骤226,管理员终端响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息生成项目标识生成请求。
在该可选实施方式中,项目标识生成操作可以是针对用户终端上显示的预设项目标识生成操作对象的预设操作。例如,预设项目标识生成操作对象可以是项目标识生成操作图标或按钮等,预设操作可以是单击、双击、滑动或拖拽操作等。
在实践中,管理员通过利用管理员终端触发项目标识生成操作为该待测菌株分配一个项目标识,表示该待测菌株的测序项目正式启动。
步骤227,管理员终端向服务器发送项目标识生成请求。
在该可选实施方式中,管理员终端可以向服务器发送步骤226中生成的项目标识生成请求。
步骤228,服务器响应于接收到管理员终端发送的项目标识生成请求,生成与项目标识生成请求对应的项目标识,并将所生成的项目标识与项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储。
在该可选实施方式中,服务器可以在接收到管理员终端发送的项目标识生成请求的情况下,生成与项目标识生成请求对应的项目标识,并将所生成的项目标识与项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储。
经过步骤226到步骤228,管理员针对管理员终端所呈现的物流标识和对应的注册用户标识进行项目标识生成操作,以实现服务器生成项目标识,并对应存储该项目标识、物流信息以及注册用户标识。
本公开提供的菌株基因组测序信息处理***,可以包括服务器、用户终端以及管理员终端。菌株基因组测序信息处理***实现了管理员终端与用户终端之间菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件的快速、安全、准确传输。
进一步参考图3,其示出了菌株基因组测序信息查询方法的一个实施例的流程300。该菌株基因组测序信息查询方法的流程300,应用于服务器,包括以下步骤:
步骤301,响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储。
在本实施例中,步骤301的具体操作及其所产生的技术效果与图2A所示的实施例中步骤203的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤302,响应于接收到用户终端发送的项目标识查询请求,确定项目标识查询请求中的注册用户标识和待查询项目标识是否满足预设对应关系。
在本实施例中,步骤302的具体操作及其所产生的技术效果与图2A所示的实施例中步骤206的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤303,响应于确定是,查询与待查询项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端。
在本实施例中,步骤303的具体操作及其所产生的技术效果与图2A所示的实施例中步骤207的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
在一些可选的实现方式中,该菌株基因组测序信息查询方法还可以包括:
步骤304,响应于接收到用户终端发送的送样测序请求,向用户终端发送待填写的待测菌株信息。
在该可选实施方式中,步骤304的具体操作及其所产生的技术效果与图2B所示的实施例中步骤210的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤305,响应于接收到用户终端发送的待测菌株信息审核请求,将待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,确定已填写的待测菌株信息是否完整。
在该可选实施方式中,步骤305的具体操作及其所产生的技术效果与图2所示的实施例中步骤214的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤306,响应于确定完整,向用户终端发送用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,以供用户终端呈现所收到的提示信息。
在该可选实施方式中,步骤306的具体操作及其所产生的技术效果与图2所示的实施例中步骤215的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤307,响应于接收到用户终端发送的送样测序协议文件上传请求,将送样测序协议文件上传请求中的已签订送样测序协议文件和注册用户标识对应存储。
在该可选实施方式中,步骤307的具体操作及其所产生的技术效果与图2B所示的实施例中步骤218的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
在一些可选的实现方式中,该菌株基因组测序信息查询方法还可以包括:
步骤308,响应于接收到用户终端发送的物流信息存储请求,将物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息和注册用户标识对应存储。
在该可选实施方式中,步骤308的具体操作及其所产生的技术效果与图2C所示的实施例中步骤221的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤309,响应于接收到管理员终端发送的物流信息查询请求,查询与物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识,并发送至管理员终端。
在该可选实施方式中,步骤309的具体操作及其所产生的技术效果与图2C所示的实施例中步骤224的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
在一些可选的实现方式中,该菌株基因组测序信息查询方法还可以包括:
步骤310,响应于接收到管理员终端发送的项目标识生成请求,生成与项目标识生成请求对应的项目标识,并将所生成的项目标识与项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储。
在该可选实施方式中,步骤310的具体操作及其所产生的技术效果与图2C所示的实施例中步骤228的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
本公开提供的菌株基因组测序信息查询方法,可以实现将管理员终端发送的文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,并且也可以实现在验证注册用户标识和项目标识对应关系的情况下,向用户终端发送对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
进一步参考图4,其示出了菌株基因组测序信息存储方法的一个实施例的流程400。该菌株基因组测序信息存储方法的流程400,应用于管理员终端,包括以下步骤:
步骤401,响应于检测到文件存储操作,获取文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件生成文件存储请求。
在本实施例中,步骤401的具体操作及其所产生的技术效果与图2A所示的实施例中步骤201的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤402,向服务器发送文件存储请求。
在本实施例中,步骤402的具体操作及其所产生的技术效果与图2A所示的实施例中步骤202的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
在一些可选的实现方式中,该菌株基因组测序信息存储方法还可以包括步骤403到步骤405:
步骤403,根据管理员输入的待查询物流信息生成待查询物流信息查询请求。
在该可选实施方式中,步骤403的具体操作及其所产生的技术效果与图2C所示的实施例中步骤222的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤404,向服务器发送待查询物流信息查询请求。
在该可选实施方式中,步骤404的具体操作及其所产生的技术效果与图2C所示的实施例中步骤223的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤405,响应于接收到服务器发送的与待查询物流信息对应的注册用户标识,呈现所收到的注册用户标识。
在该可选实施方式中,骤405的具体操作及其所产生的技术效果与图2C所示的实施例中步骤225的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
在一些可选的实现方式中,该菌株基因组测序信息存储方法还可以包括步骤406和步骤407:
步骤406,响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息生成项目标识生成请求。
在该可选实施方式中,步骤406的具体操作及其所产生的技术效果与图2C所示的实施例中步骤226的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤407,向服务器发送项目标识生成请求。
在该可选实施方式中,步骤407的具体操作及其所产生的技术效果与图2C所示的实施例中步骤227的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
本公开提供的菌株基因组测序信息存储方法,管理员在收到待测菌株样品的包裹时,利用管理员终端从服务器中查找出该包裹的物流信息以及对应的注册用户标识,为该待测菌株发起项目标识的生成请求发送至服务器,在完成待测菌株的测序后,管理员利用管理员终端将注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件发送至服务器进行对应存储。
进一步参考图5,其示出了菌株基因组测序信息呈现方法的一个实施例的流程500。该菌株基因组测序信息呈现方法的流程500,应用于用户终端,包括以下步骤:
步骤501,响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求。
在本实施例中,步骤501的具体操作及其所产生的技术效果与图2A所示的实施例中步骤204的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤502,向服务器发送文件查询请求。
在本实施例中,步骤502的具体操作及其所产生的技术效果与图2A所示的实施例中步骤205的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤503,响应于接收到服务器发送的与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在本实施例中,步骤503的具体操作及其所产生的技术效果与图2A所示的实施例中步骤208的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
在一些可选的实现方式中,该菌株基因组测序信息呈现方法还可以包括步骤504到步骤509:
步骤504,向服务器发送送样测序请求。
在该可选实施方式中,步骤504的具体操作及其所产生的技术效果与图2B所示的实施例中步骤209的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤505,接收到服务器发送的待填写的待测菌株信息。
在该可选实施方式中,步骤505的具体操作及其所产生的技术效果与图2B所示的实施例中步骤210的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤506,响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识生成待测菌株信息审核请求。
在该可选实施方式中,步骤506的具体操作及其所产生的技术效果与图2B所示的实施例中步骤212的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤507,向服务器发送待测菌株信息审核请求。
在该可选实施方式中,步骤507的具体操作及其所产生的技术效果与图2B所示的实施例中步骤213的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤508,响应于接收到服务器发送的用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,呈现所收到的提示信息。
在该可选实施方式中,步骤508的具体操作及其所产生的技术效果与图2B所示的实施例中步骤216的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤509,向服务器发送送样测序协议文件上传请求。
在该可选实施方式中,步骤509的具体操作及其所产生的技术效果与图2B所示的实施例中步骤217的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
在一些可选的实现方式中,该菌株基因组测序信息呈现方法还可以包括步骤510和步骤511:
步骤510,响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息生成的物流信息存储请求。
在该可选实施方式中,步骤510的具体操作及其所产生的技术效果与图2B所示的实施例中步骤219的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
步骤511,向服务器发送物流信息存储请求。
在该可选实施方式中,步骤511的具体操作及其所产生的技术效果与图2C所示的实施例中步骤220的操作及效果基本相同,在此不再赘述。
本公开提供的菌株基因组测序信息呈现方法,可以在用户终端呈现或存储从服务器收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
进一步参考图6,作为对上述各图所示方法的实现,本公开提供了一种菌株基因组测序信息查询装置的一个实施例,该装置实施例与图3所示的方法实施例相对应,该装置具体可以应用于各种电子设备中。
如图6所示,本实施例的菌株基因组测序信息查询装置600包括:文件存储单元601、确定单元602和第一查询单元603。其中,文件存储单元601,被配置为响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,其中,文件存储请求是管理员终端根据管理员输入的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径生成的;确定单元602,被配置为响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,文件查询请求是用户终端响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识而生成的;第一查询单元603,被配置为转响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端,以供用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在本实施例中,菌株基因组测序信息查询装置600的文件存储单元601、确定单元602和第一查询单元603的具体处理及其所带来的技术效果可分别参考图3对应实施例中步骤301、步骤302和步骤303的相关说明,在此不再赘述。
需要说明的是,本公开提供的菌株基因组测序信息查询装置中各单元的实现细节和技术效果可以参考本公开中其它实施例的说明,在此不再赘述。
进一步参考图7,作为对上述各图所示方法的实现,本公开提供了一种菌株基因组测序信息存储装置的一个实施例,该装置实施例与图4所示的方法实施例相对应,该装置具体可以应用于各种电子设备中。
如图7所示,本实施例的菌株基因组测序信息存储装置700包括:第一生成单元701和第一发送单元702。其中,第一生成单元701,被配置为响应于检测到文件存储操作,获取文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件生成文件存储请求;第一发送单元702,被配置为向服务器发送文件存储请求,文件存储请求用于触发服务器将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,以及响应于接收到用户终端发送的查询请求,确定查询请求中的注册用户标识与测序项目标识是否满足预设对应关系,查询请求用于触发服务器响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端,菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件用于触发用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在本实施例中,菌株基因组测序信息存储装置700的第一生成单元701和第一发送单元702的具体处理及其所带来的技术效果可分别参考图4对应实施例中步骤401和步骤402的相关说明,在此不再赘述。
需要说明的是,本公开提供的菌株基因组测序信息存储装置中各单元的实现细节和技术效果可以参考本公开中其它实施例的说明,在此不再赘述。
进一步参考图8,作为对上述各图所示方法的实现,本公开提供了一种菌株基因组测序信息呈现装置的一个实施例,该装置实施例与图5所示的方法实施例相对应,该装置具体可以应用于各种电子设备中。
如图8所示,本实施例的菌株基因组测序信息呈现装置800包括:第二生成单元801、第二发送单元802和呈现单元803。其中,第二生成单元801,被配置为响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求;第二发送单元802,被配置为向服务器发送文件查询请求;呈现单元803,被配置为响应于接收到服务器发送的与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件为服务器响应于接收到用户终端文件查询请求以及确定文件查询请求中的注册用户标识与测序项目标识满足预设对应关系而查询到的与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
在本实施例中,菌株基因组测序信息呈现装置800的第二生成单元801、第二发送单元802和呈现单元803的具体处理及其所带来的技术效果可分别参考图5对应实施例中步骤501、步骤502和步骤503的相关说明,在此不再赘述。
需要说明的是,本公开提供的菌株基因组测序信息呈现装置中各单元的实现细节和技术效果可以参考本公开中其它实施例的说明,在此不再赘述。
下面参考图9,其示出了适于用来实现本公开的电子设备的计算机***900的结构示意图。图9示出的电子设备(服务器、管理员终端或用户终端)仅仅是一个示例,不应对本公开的功能和使用范围带来任何限制。
如图9所示,计算机***900包括中央处理单元(CPU,Central Processing Unit)901,其可以根据存储在只读存储器(ROM,Read Only Memory)902中的程序或者从存储部分908加载到随机访问存储器(RAM,Random Access Memory)903中的程序而执行各种适当的动作和处理。在RAM 903中,还存储有***900操作所需的各种程序和数据。CPU 901、ROM902以及RAM 903通过总线904彼此相连。输入/输出(I/O,Input/Output)接口905也连接至总线904。
以下部件连接至I/O接口905:包括触控屏、手写板、键盘或鼠标等的输入部分906;包括诸如阴极射线管(CRT,Cathode Ray Tube)、液晶显示器(LCD,Liquid CrystalDisplay)等以及扬声器等的输出部分907;包括硬盘等的存储部分908;以及包括诸如LAN(局域网,Local Area Network)卡、调制解调器等的网络接口卡的通信部分909。通信部分909经由诸如因特网的网络执行通信处理。
特别地,根据本公开的实施例,上文参考流程图描述的过程可以被实现为计算机软件程序。例如,本公开的实施例包括一种计算机程序产品,其包括承载在计算机可读介质上的计算机程序,该计算机程序包含用于执行流程图所示的方法的程序代码。在这样的实施例中,该计算机程序可以通过通信部分909从网络上被下载和安装。在该计算机程序被中央处理单元(CPU)901执行时,执行本公开的方法中限定的上述功能。需要说明的是,本公开的计算机可读介质可以是计算机可读信号介质或者计算机可读存储介质或者是上述两者的任意组合。计算机可读存储介质例如可以是——但不限于——电、磁、光、电磁、红外线、或半导体的***、装置或器件,或者任意以上的组合。计算机可读存储介质的更具体的例子可以包括但不限于:具有一个或多个导线的电连接、便携式计算机磁盘、硬盘、随机访问存储器(RAM)、只读存储器(ROM)、可擦式可编程只读存储器(EPROM或闪存)、光纤、便携式紧凑磁盘只读存储器(CD-ROM)、光存储器件、磁存储器件、或者上述的任意合适的组合。在本公开中,计算机可读存储介质可以是任何包含或存储程序的有形介质,该程序可以被指令执行***、装置或者器件使用或者与其结合使用。而在本公开中,计算机可读的信号介质可以包括在基带中或者作为载波一部分传播的数据信号,其中承载了计算机可读的程序代码。这种传播的数据信号可以采用多种形式,包括但不限于电磁信号、光信号或上述的任意合适的组合。计算机可读的信号介质还可以是计算机可读存储介质以外的任何计算机可读介质,该计算机可读介质可以发送、传播或者传输用于由指令执行***、装置或者器件使用或者与其结合使用的程序。计算机可读介质上包含的程序代码可以用任何适当的介质传输,包括但不限于:无线、电线、光缆、RF等等,或者上述的任意合适的组合。
可以以一种或多种程序设计语言或其组合来编写用于执行本公开的操作的计算机程序代码,程序设计语言包括面向对象的程序设计语言—诸如Java、Smalltalk、C++、Python,还包括常规的过程式程序设计语言—诸如“C”语言或类似的程序设计语言。程序代码可以完全地在用户计算机上执行、部分地在用户计算机上执行、作为一个独立的软件包执行、部分在用户计算机上部分在远程计算机上执行、或者完全在远程计算机或服务器上执行。在涉及远程计算机的情形中,远程计算机可以通过任意种类的网络——包括局域网(LAN)或广域网(WAN)—连接到用户计算机,或者,可以连接到外部计算机(例如利用因特网服务提供商来通过因特网连接)。
附图中的流程图和框图,图示了按照本公开各种实施例的***、方法和计算机程序产品的可能实现的体系架构、功能和操作。在这点上,流程图或框图中的每个方框可以代表一个模块、程序段、或代码的一部分,该模块、程序段、或代码的一部分包含一个或多个用于实现规定的逻辑功能的可执行指令。也应当注意,在有些作为替换的实现中,方框中所标注的功能也可以以不同于附图中所标注的顺序发生。例如,两个接连地表示的方框实际上可以基本并行地执行,它们有时也可以按相反的顺序执行,这依所涉及的功能而定。也要注意的是,框图和/或流程图中的每个方框、以及框图和/或流程图中的方框的组合,可以用执行规定的功能或操作的专用的基于硬件的***来实现,或者可以用专用硬件与计算机指令的组合来实现。
描述于本公开中所涉及到的单元可以通过软件的方式实现,也可以通过硬件的方式来实现。所描述的单元也可以设置在处理器中,例如,可以描述为:一种处理器包括文件存储单元、确定单元以及第一查询单元。其中,这些单元的名称在某种情况下并不构成对该单元本身的限定,例如,文件存储单元还可以被描述为“将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储的单元”。又例如,可以描述为:一种处理器包括第一生成单元和第一发送单元。又例如,可以描述为:一种处理器包括第二生成单元、第二发送单元以及呈现单元。
作为另一方面,本公开还提供了一种计算机可读介质,该计算机可读介质可以是上述实施例中描述的装置中所包含的;也可以是单独存在,而未装配入该装置中。上述计算机可读介质承载有一个或者多个程序,当上述一个或者多个程序被该装置执行时,使得该装置实现图3示出的基因组测序信息查询方法,和/或图4示出的基因组测序信息存储方法,和/或图5示出的基因组测序信息呈现方法。
以上描述仅为本公开的较佳实施例以及对所运用技术原理的说明。本领域技术人员应当理解,本公开中所涉及的发明范围,并不限于上述技术特征的特定组合而成的技术方案,同时也应涵盖在不脱离上述发明构思的情况下,由上述技术特征或其等同特征进行任意组合而形成的其它技术方案。例如上述特征与本公开中公开的(但不限于)具有类似功能的技术特征进行互相替换而形成的技术方案。
Claims (18)
1.一种菌株基因组测序信息查询方法,应用于服务器,包括:
响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将所述文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,其中,所述文件存储请求是所述管理员终端根据管理员输入的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径生成的;
响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定所述文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,所述文件查询请求是所述用户终端响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据所述文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识而生成的;
响应于确定是,查询与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至所述用户终端,以供所述用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述方法还包括:
响应于接收到所述管理员终端发送的项目标识生成请求,生成与所述项目标识生成请求对应的项目标识,并将所生成的项目标识与所述项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储,其中,所述项目标识生成请求是所述管理员终端响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据所述项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息而生成的。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述方法还包括:
响应于接收到用户终端发送的物流信息存储请求,将所述物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息和注册用户标识对应存储,其中,所述物流信息存储请求是所述用户终端响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据所述物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息而生成的;
响应于接收到所述管理员终端发送的物流信息查询请求,查询与所述物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识,并发送至所述管理员终端,以供所述管理员终端呈现或存储与所述待查询物流信息对应的注册用户标识,其中,所述物流信息查询请求是所述管理员终端响应于接收到管理员输入的待查询物流信息而生成的。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述方法还包括:
响应于接收到所述用户终端发送的送样测序请求,向所述用户终端发送待填写的待测菌株信息;
响应于接收到所述用户终端发送的待测菌株信息审核请求,将所述待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,确定所述已填写的待测菌株信息是否完整,其中,所述待测菌株信息审核请求是所述用户终端响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据所述待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识而生成的;
响应于确定完整,向所述用户终端发送用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,以供所述用户终端呈现或存储所收到的提示信息;
响应于接收到所述用户终端发送的送样测序协议文件上传请求,将所述送样测序协议文件上传请求中的已签订送样测序协议文件和注册用户标识对应存储。
5.一种菌株基因组测序信息查询装置,应用于服务器,包括:
文件存储单元,被配置为响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将所述文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,其中,所述文件存储请求是所述管理员终端根据管理员输入的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径生成的;
确定单元,被配置为响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定所述文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,所述文件查询请求是所述用户终端响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据所述文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识而生成的;
第一查询单元,被配置为转响应于确定是,查询与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至所述用户终端,以供所述用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
6.一种菌株基因组测序信息存储方法,应用于管理员终端,包括:
响应于检测到文件存储操作,获取所述文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据所述菌株原始测序文件存储路径以及所述菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、所述菌株原始测序文件和所述菌株基因组注释文件生成文件存储请求;
向服务器发送所述文件存储请求,所述文件存储请求用于触发所述服务器将所述文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,以及响应于接收到用户终端发送的查询请求,确定所述查询请求中的注册用户标识与测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,所述查询请求用于触发所述服务器响应于确定是,查询与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至所述用户终端,所述菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件用于触发所述用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
7.根据权利要求6所述的方法,其中,所述方法还包括:
响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据所述项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息生成项目标识生成请求;
向所述服务器发送所述项目标识生成请求,所述项目标识生成请求用于触发所述服务器生成与所述项目标识生成请求对应的项目标识,并将生成的项目标识与所述项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储。
8.根据权利要求6所述的方法,其中,所述方法还包括:
根据管理员输入的待查询物流信息生成待查询物流信息查询请求;
向所述服务器发送所述待查询物流信息查询请求;
响应于接收到所述服务器发送的与所述待查询物流信息对应的注册用户标识,呈现所收到的注册用户标识,其中,所收到的注册用户标识是所述服务器查询到的与所述物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识。
9.一种菌株基因组测序信息存储装置,应用于管理员终端,包括:
第一生成单元,被配置为响应于检测到文件存储操作,获取所述文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据所述菌株原始测序文件存储路径以及所述菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、所述菌株原始测序文件和所述菌株基因组注释文件生成文件存储请求;
第一发送单元,被配置为向服务器发送所述文件存储请求,所述文件存储请求用于触发所述服务器将所述文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,以及响应于接收到用户终端发送的查询请求,确定所述查询请求中的注册用户标识与测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,所述查询请求用于触发所述服务器响应于确定是,查询与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至所述用户终端,所述菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件用于触发所述用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
10.一种菌株基因组测序信息呈现方法,应用于用户终端,包括:
响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据所述文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求;
向服务器发送所述文件查询请求;
响应于接收到所述服务器发送的与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件为所述服务器响应于接收到用户终端所述文件查询请求以及确定所述文件查询请求中的注册用户标识与测序项目标识满足预设对应关系而查询到的与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,服务器根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,所述服务器中对应存储的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件是根据从管理员终端响应于文件存储操作而发送给所述服务器的文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件而存储的。
11.根据权利要求10所述的方法,其中,所述方法还包括:
响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据所述物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息生成的物流信息存储请求;
向所述服务器发送所述物流信息存储请求,所述物流信息存储请求用于触发所述服务器将所述物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息的物流信息和请求对待测菌株进行基因组测序的用户的注册用户标识对应存储。
12.根据权利要求10所述的方法,其中,所述方法还包括:
响应于检测到用户触发的送样测序协议文件上传操作,根据所述送样测序协议文件上传操作所针对的注册用户标识和已签订送样测序协议文件生成送样测序协议文件上传请求,以及向所述服务器发送所生成的送样测序协议文件上传请求;
接收并呈现所述服务器发送的待填写的待测菌株信息;
响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据所述待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识生成待测菌株信息审核请求;
向所述服务器发送所述待测菌株信息审核请求,其中,所述待测菌株信息审核请求用于触发所述服务器将所述待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,以及确定所述已填写的待测菌株信息是否完整;
响应于接收到所述服务器发送的用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,呈现或存储所收到的提示信息,其中,所收到的提示信息是所述服务器响应于确定所述已填写的待测菌株信息完整而发送的。
13.一种菌株基因组测序信息呈现装置,应用于用户终端,包括:
第二生成单元,被配置为响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据所述文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求;
第二发送单元,被配置为向服务器发送所述文件查询请求;
呈现单元,被配置为响应于接收到所述服务器发送的与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件为所述服务器响应于接收到用户终端所述文件查询请求以及确定所述文件查询请求中的注册用户标识与测序项目标识满足预设对应关系而查询到的与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,服务器根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,所述服务器中对应存储的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件是根据从管理员终端响应于文件存储操作而发送给所述服务器的文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件而存储的。
14.一种服务器,包括:一个或多个处理器;存储装置,其上存储有一个或多个程序;当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行时,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求1-4中任一所述的菌株基因组测序信息查询方法。
15.一种管理员终端,包括:一个或多个处理器;存储装置,其上存储有一个或多个程序;当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行时,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求6-8中任一所述的菌株基因组测序信息存储方法。
16.一种用户终端,包括:一个或多个处理器;存储装置,其上存储有一个或多个程序;当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行时,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求10-12中任一所述的菌株基因组测序信息呈现方法。
17.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其中,所述计算机程序被一个或多个处理器执行时实现如权利要求1-4中任一所述的菌株基因组测序信息查询方法,或者如权利要求6-8中任一所述的菌株基因组测序信息存储方法,或者如权利要求10-12中任一所述的菌株基因组测序信息呈现方法。
18.一种菌株基因组测序信息处理***,包括如权利要求14所述的服务器、至少一个如权利要求15所述的管理员终端以及至少一个如权利要求16所述的用户终端。
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