CN111741973A - 具有改进的效应子功能的人IgG Fc结构域变体 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及具有改进的效应子功能的人IgG Fc结构域变体及其用途。

Description

具有改进的效应子功能的人IgG Fc结构域变体
相关申请的交叉引用
本专利文件根据35 U.S.C.§119(e)要求于2017年12月19日提交的美国临时专利申请62/607,591的优先权。上述专利申请通过引用将其全文并入本文以提供持续公开。
政府利益
本发明是在NIAID和NIH授予的P01 AI100148的政府支持下完成的。政府在本发明中具有某些权利。
发明领域
本发明涉及具有改进的效应子功能的人IgG Fc结构域变体及其用途。
发明背景
从许多FDA批准用于治疗炎症和肿瘤病症的单克隆抗体(mAb)的临床应用得出的广泛经验强烈建议:抗体的治疗潜力高度依赖IgG Fc结构域与其表达在效应子白细胞表面的同源受体,Fcγ受体(FcγR)之间的相互作用,以调控一系列Fc效应子功能(Nimmerjahn等人,Cancer Immun 12,13(2012))。例如,许多mAb的治疗结果与影响受体结合IgG能力的FcγR基因的等位基因变体相关(Nimmerjahn等人,Cancer Immun 12,13(2012)和Mellor等人,J Hematol Oncol 6,1(2013)。此外,多种治疗性mAb的体内保护活性显示依赖于Fc-FcγR相互作用,优化出增强的FcγR结合能力的Fc结构域变体显示改进的治疗结果(Goede,V.等人,N Engl J Med 370,1101-1110(2014))。由于FcγR多样的信号传递活性(Bournazos等人,Annu Rev Immunol 35,285-311(2017)),工程化Fc结构域以参与和激活特定种类的FcγR促进了具有改进的效应子功能的IgG抗体的发展。例如,FDA批准的抗CD20mAb奥滨尤妥珠单抗(obinutuzumab)已显示相较于未进行Fc改造的抗CD20 mAb更为优秀的疗效,奥滨尤妥珠单抗被工程化以增强结合活化型FcγR,FcγRIIIa(Goede,V.等人,NEngl J Med 370,1101-1110(2014))。
然而,各种挑战仍然存在(Klein等人,2012,MAbs.4(6):653-663)。特别是,已证明Fc受体的多样性和他们在免疫***细胞上的限制表达影响与抗体介导的活性相关的一系列应答。例如,已显示抗体诱导T细胞应答的能力依赖于树突细胞激活Fc受体(如FcγRIIA)的参与(DiLillo等人,Cell2015)。相似地,IgG抗体对嗜中性粒细胞的激活需要和激活NK细胞所需受体不同的Fc受体。此外,如本文所公开,和未修饰的IgG1相比,本发明的新修饰的IgG抗体具有相同或更长的体内半衰期。因此,需要能参与各种低亲和力激活受体而几乎不参与抑制性Fc受体(FcγRIIB)的Fc变体。
发明概述
本文公开的多种实施方案通过提供具有改进的效应子功能和半衰期的人IgG Fc结构域变体及其用途解决了上述未满足的需求和/或其他需求。
在一个方面,本发明涉及多肽,其包含人IgG Fc多肽的Fc变体。Fc变体(i)在位点236包含丙氨酸(A),在位点330包含亮氨酸(L),且在位点332包含谷氨酸(E),且(ii)在位点239不包含天冬氨酸(D)。根据Kabat中的EU索引进行编号。多肽或Fc变体可进一步在位点428包含亮氨酸(L)和/或在位点434包含丝氨酸(S)。在一些实施方案中,多肽或Fc变体在位点239包含丝氨酸(S)。在一些实施例中,多肽或Fc变体含有SEQ ID NO:2或3的序列。
上述多肽或Fc变体可作为一个部分包含在抗体或融合蛋白中(例如,融合于下述的Fv、sFv或其他抗体变体)。因此,本发明范围涉及包含上述多肽或Fc变体的抗体或融合蛋白。抗体具有针对任何目标靶分子的特异性。例如,靶分子可选自由细胞因子、可溶或不溶因子、表达在病原体上的分子、表达在细胞上的分子和表达在癌细胞上的分子组成的组。因子和分子可为蛋白和如碳水化合物及脂类的非蛋白。抗体可选自由嵌合抗体、人源化抗体或人抗体组成的组。上述抗体可具有以下一种或多种特征:(1)相较于具有SEQ ID NO:1序列的参考抗体,对hFcγRIIA、hFcγRIIIA、FcRn或/和hFcγRIIIB具有更高的结合亲和力,(2)相较于具有SEQ ID NO:1或4序列的参考抗体,具有更长的血清半衰期,和(3)相较于具有SEQ ID NO:1序列的抗体,具有相同或更优的半衰期。上述抗体通常与参考抗体相同,除了后者具有不同的Fc序列,例如SEQ ID NO:1或4。例如,相较于GASDALIE变体(SEQ ID NO:4),本文公开的GAALIE变体(SEQ ID NO:2)出乎意料地具有更长的半衰期且更为稳定。
本发明还涉及包含编码上述多肽或抗体的序列的分离核酸(isolated nucleicacid),包含该核酸的表达载体,和包含该核酸的宿主细胞。宿主细胞可用于生产重组多肽或抗体的方法中。该方法包括在允许核酸编码的多肽或抗体表达的条件下在培养基中培养宿主细胞,和从培养的细胞或细胞培养基中纯化多肽或抗体。
在另一个方面,本发明提供一种药物制剂,其包含(i)上述多肽、抗体或核酸和(ii)药学上可接受的载体。
在另一个方面,本发明提供了治疗病症如炎性病症、肿瘤病症或传染性疾病的方法。该方法包括将治疗有效量的上述多肽、抗体或核酸施用给有需要的受试者。本发明还涉及多肽、抗体或核酸在制备用于治疗病症如炎性病症、肿瘤病症或传染性疾病的药物中的用途。
本发明的一个或多个实施方案的细节陈述于下方说明书中。本发明的其他特征、目的和优点在说明书和权利要求书中是明显的。
附图简要说明
图1A、1B、1C和1D(合为“图1”)的图显示在FcγR人源化(FcR+)小鼠(图1A和图1C)和FcR缺陷(FcR空)小鼠(图1B和图1D)中G236A/S239D/A330L/I332E(“GASDALIE”)Fc结构域突变体的体内半衰期。包括S239D/I332E(“SDIE”)变体作为对照。图1C和图1D显示施用到FcγR人源化(图1C)和FcR缺陷(图1D)小鼠后第8天的人IgG1Fc变体的血清IgG水平。
图2A和2B(合为“图2”)的图显示对恒河猕猴(rhesus macaque)中Fc结构域突变体的体内半衰期的确定。施用(i.v.;20mg/kg)3BNC117mAb的野生型(WT)人IgG1(图2A)和G236A/A330L/I332E/M428L/N434S(“GASDALIE LS”)(图2B)Fc结构域变体到猕猴。在施用到猕猴后的不同时间点通过ELISA评价人IgG1的IgG水平,以确定抗体的半衰期(以h表示)。
图3A和3B(合为“图3”)的表显示利用SPR分析确定的人IgG1 Fc结构域变体对人FcγR(FcγRIIa H131、FcγRIIa R131、FcγRIIb、FcγRIIIa V157、FcγRIIIa F157)的结合亲和力。图3A显示亲和力测定(KD(M)),图3B显示相比于野生型人IgG1的亲和力增加倍数。检测的变体:SDIE(S239D/I332E);GAIE(G236A/I332E);GAALIE(G236A/A330L/I332E);无岩藻糖化(afucosylated,在Fc相关的多糖上缺失分支岩藻糖残基)。
图4的系列图显示野生型人IgG1(左)和GAALIE(右)Fc结构域变体对人FcγR(FcγRIIa H131、FcγRIIa R131、FcγRIIb、FcγRIIIa V157、FcγRIIIa F157)的结合的SPR传感图。标记代表分析物(FcγR)浓度(μM)。
图5A和5B(合为“图5”)的表显示利用SPR分析确定的人IgG1 Fc结构域变体对小鼠FcγR的结合亲和力。图5A显示亲和力测定(KD(M)),图5B显示相比于野生型人IgG1的亲和力增加倍数。检测的变体:SDIE(S239D/I332E);GAIE(G236A/I332E;GAALIE(G236A/A330L/I332E);无岩藻糖化(在Fc相关的多糖上缺失分支岩藻糖残基)。
图6的系列图显示野生型人IgG1(左)和GAALIE(右)Fc结构域变体对小鼠FcγR的结合的SPR传感图。标记代表分析物(FcγR)浓度(μM)。
图7A和7B(合为“图7”)的表显示利用SPR分析确定的人IgG1 Fc结构域变体对猕猴FcγR的结合亲和力。图7A显示亲和力测定(KD(M)),图7B显示相比于野生型人IgG1的亲和力增加倍数。检测的变体:SDIE(S239D/I332E);GAIE(G236A/I332E);GAALIE(G236A/A330L/I332E);无岩藻糖化(在Fc相关的多糖上缺失分支岩藻糖残基)。
图8的系列图显示野生型人IgG1(左)和GAALIE(右)Fc结构域变体对猕猴FcγR的结合的SPR传感图。标记代表分析物(FcγR)浓度(μM)。
图9的图显示FcγR人源化小鼠中6A6 mAb Fc变体的血小板清除。小鼠接受6A6mAb的Fc结构域变体(SDIE(S239D/I332E);GAIE(G236A/I332E);GAALIE(G236A/A330L/I332E))。包括N297A(非FcR结合变体)作为对照。在指定时间点分析血小板数,数值代表相对于在0小时的预抽血(prebleed)的血小板数平均(±SEM)百分比变化。
图10的图显示FcγR人源化小鼠中GK1.5 mAb Fc变体的CD4+细胞清除。小鼠接受GK1.5 mAb的Fc结构域变体(SDIE(S239D/I332E);GAIE(G236A/I332E);GAALIE(G236A/A330L/I332E))(100μg,i.p.)。包括GRLR(G236A/L328R;非FcR结合变体)作为对照。在施用mAb到血液(A)和脾脏(B)后24小时分析CD4+细胞数。
图11A、11B、11C和11D(合为“图11”)的图显示hCD20+/FcγR人源化小鼠中用CATmAb Fc变体清除CD20+B细胞。小鼠接受CAT mAb的Fc结构域变体(SDIE(S239D/I332E);GAIE(G236A/I332E);GAALIE(G236A/A330L/I332E))(200μg,i.p.)。包括N297A(非FcR结合变体)作为对照。在施用mAb到血液(图11A和图11B)和脾脏(图11C和图11D)后48小时分析CD20+细胞数和频率。
图12A和12B(合为“图12”)的图显示hCD20+/FcγR人源化小鼠中2B8 mAb Fc变体的CD20+B细胞清除。小鼠接受以指定剂量i.p.的抗CD20mAb 2B8的野生型人IgG1或GAALIE(G236A/A330L/I332E)变体。在施用mAb到血液后48小时分析CD20+频率(图12A)和细胞数(图12B)。
图13A、13B和13C(合为“图13”)的图显示在FcR缺陷(FcR空)小鼠(图13A)和FcγR人源化(FcR+)小鼠(图13B)中Fc结构域突变体的体内半衰期。人IgG1的Fc结构域突变体包括:SDIE(S239D/I332E)、GAIE(G236A/I332E)和GAALIE(G236A/A330L/I332E)。图13C显示在施用到FcγR人源化小鼠后不同时间点的人IgG1的IgG水平。
图14A和14B(合为“图14”)的图显示恒河猕猴中Fc结构域突变体的体内半衰期的确定。施用(i.v.;20mg/kg)3BNC117 mAb的野生型(WT)人IgG1(图14A)和GAALIE(G236A/A330L/I332E)(图14B)Fc结构域变体到猕猴。在施用到猕猴后的不同时间点利用ELISA评价人IgG1的IgG水平以确定抗体的半衰期(以h表示)。
图15A和15B(合为“图15”)的图显示恒河猕猴中2B8 mAb Fc变体的CD20+B细胞清除。以0.05mg/kg施用(i.v.)抗CD20 mAb 2B8的野生型人IgG1或GAALIE(G236A/A330L/I332E)变体到猕猴。在施用抗体前和后的不同时间点分析血液中CD20+频率(图15A)和细胞数(图15B)。
图16显示人IgG(野生型和Fc结构域变体)恒定区的蛋白序列。下划线标出了每个变体上的氨基酸取代。按照EU编号***给残基进行编号。
图17的图显示利用热转变测定(Thermal Shift assay)确定多种Fc结构域突变体的蛋白质Tm。人IgG1的Fc结构域突变体包括:SDIE(S239D/I332E)、GAIE(G236A/I332E)、GAALIE(G236A/A330L/I332E)和GASDALIE(G236A/S239D/A330L/I332E)。将这些突变体与LS突变(M428L/N434S)组合以增强人IgG1对FcRn的亲和力。
图18的表显示利用SPR分析确定的pH 6.0下人IgG1的Fc结构域变体对人FcRn/β2微球蛋白的结合亲和力。展示了亲和力测定(KD(M))和相比于野生型人IgG1的亲和力增加倍数。人IgG1的Fc结构域突变体包括:SDIE(S239D/I332E)、GAIE(G236A/I332E)和GAALIE(G236A/A330L/I332E)。将这些突变体与LS突变(M428L/N434S)组合。
图19的系列图显示pH 6.0下Fc结构域变体对人FcRn/β2微球蛋白的结合的SPR传感图。标记代表分析物(FcRn)浓度(nM)。人IgG1的Fc结构域突变体包括:LS(M428L/N434S)、GAALIE(G236A/A330L/I332E)和GAALIE LS(G236A/A330L/I332E/M428L/N434S)。
图20的序列图显示pH 7.4下Fc结构域变体对人FcRn/β2微球蛋白的结合的SPR传感图。标记代表分析物(FcRn)浓度(nM)。人IgG1的Fc结构域突变体包括:LS(M428L/N434S)、GAALIE(G236A/A330L/I332E)和GAALIE LS(G236A/A330L/I332E/M428L/N434S)。
图21A、21B和21C(合为“图21”)的系列图显示FcRn/FcγR人源化小鼠中Fc结构域突变体的体内半衰期。人IgG1的Fc结构域突变体包括:LS(M428L/N434S)、GAALIE(G236A/A330L/I332E)和GAALIE LS(G236A/A330L/I332E/M428L/N434S)。图21A和图21B显示在施用到FcRn/FcγR人源化小鼠后不同时间点的人IgG1的IgG水平。图21C显示FcRn/FcγR人源化小鼠中Fc结构域变体的计算的半衰期。
图22的图显示FcRn/FcγR人源化小鼠中6A6 mAb Fc变体的血小板清除。小鼠接受6A6 mAb的Fc结构域变体(LS(M428L/N434S)、GAALIE(G236A/A330L/I332E)和GAALIE LS(G236A/A330L/I332E/M428L/N434S))(8μg,i.v.)。包括N297A(非FcR结合变体)作为对照。在指定时间点分析血小板数,并且数值代表相对于在0h预抽血(prebleed)的血小板数平均(±SEM)百分比变化。
图23A、23B、23C和23D(合为“图23”)的图显示靶向sLeA且含hIgG1 Fc的Ab促进通过结合活化型人FcγR增强的肿瘤清除。将5*105B16-FUT3肿瘤细胞IV接种FcγR人源化小鼠。在第1、4、7和11天IP施用100μg抗sLeA抗体或同种型匹配的对照Ab。接种后14天,将小鼠安乐死,切除并固定肺,并对转移灶计数。n≥5/组。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,****p<0.0001。图23A和23B显示抗sLeA hIgG1 Ab抑制sLeA+肿瘤细胞的肺定植(colonization)。用100μg抗sLeA Ab(5B1-hIgG1或7E3-hIgG1)或同种型匹配的对照Ab处理小鼠。图23A显示对代表性实验中所有小鼠所得数据的综合分析,并且图23B显示每组中切除的三个肺的代表性图像。图23B还显示Fc工程化的抗sLeA Ab变体表现出优秀的抗肿瘤功效-将小鼠用100μg抗sLeA Ab(克隆5B1或7E3,hIgG1或具有G236A/A330L/I332E突变的hIgG1-GAALIE)或同种型匹配的对照Ab处理。图23C显示对来自两个单独实验的所有小鼠所得数据的综合分析(第一个实验-■,第二个实验-▲),而图23D显示自5B1 Ab处理的小鼠切除的肺的代表性图像。
图24A、24B和24C(合为“图24”)的图显示hFcRIIA或hFcRIIIA任一个的参与对Ab介导的肿瘤消除是必要且足够的。图24A显示hIgG1 Fc变体对人FcR的相对结合亲和力-亲和力通过SPR研究确定。图24B显示5B1-hIgG1 Ab具有对hFcRIIA或hFcRIIIA或两者的增强的亲和力,表明优秀的抗肿瘤效果。将5*105B16-FUT3肿瘤细胞IV接种FcγR-人源化小鼠。在第1、4、7和11天将100μg抗sLeA Ab(5B1-hIgG1、具有G236A突变的5B1-hIgG1-GA、具有A330L/I332E突变的5B1-hIgG1-ALIE或具有G236A/A330L/I332E突变的5B1-hIgG1-GAALIE)或同种型匹配的对照AbIP施用。图24C显示hFcRIIA或hFcRIIIA的参与,其对于sLeA+肿瘤的高效肿瘤清除是必要的。将5*105B16-FUT3肿瘤细胞IV接种FcR-空(γ链KO)、FcγR人源化、hFcRIIA/IIB转基因和hFcRIIIA/IIIB-转基因小鼠。在第1、4、7和11天IP施用100μg抗sLeAAb(具有G236A/A330L/I332E突变的5B1-hIgG1-GAALIE)或同种型匹配的对照Ab。对于图B+C,在接种后14天,将小鼠安乐死,切除并固定肺,并计数转移灶。n≥6/组。*p<0.05,***p<0.001。****p<0.0001。
具体实施方式
本文件描述了具有改进的效应子功能的人IgG Fc结构域变体及其用途。如本文所述,具有该IgG Fc结构域变体的抗体或融合蛋白具有对活化型Fc受体的增强的结合和相比于未修饰的IgG1抗体相同或更长的体内半衰期。
抗体的Fc区域或恒定区与细胞结合配偶体相互作用以调节抗体功能和活性,如依赖于抗体的效应子功能和补体激活。对于IgG类型的抗体,补体Clq和Fc受体(FcγR)的结合位点位于Fc区域的CH2结构域。活化型FcR和抑制型FcR在不同靶细胞上的共表达调节抗体介导的免疫应答。除了参与免疫应答的传出阶段,FcR对于调控B细胞和树突细胞(DC)的激活也是重要的。例如,在IgG型抗体的情况下,不同种类的FcγR介导多种细胞应答,如巨噬细胞的吞噬作用,NK细胞引起的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性,和肥大细胞的脱粒。每种FcγR表现不同的结合亲和力和IgG亚类特异性。凝集素受体也起作用。例如,已显示DC-SIGN在Fc的抗炎活性中(例如在IVIG中)起作用(参见如US20170349662、WO2008057634和WO2009132130)。
如本文所述,可通过引入突变或改变Fc区域中的某些氨基酸来操纵、改变或控制抗体/免疫球蛋白的生物活性。在本公开教导下,可***纵、改变或控制的生物活性包括例如下列的一个或多个:Fc受体结合、Fc受体亲和力、Fc受体特异性、补体激活、信号传递活性、靶向活性、效应子功能(如程序化细胞死亡或细胞吞噬作用)、半衰期、清除和转胞吞作用。
I.定义
术语“肽”、“多肽”和“蛋白”在本文中可互换地用于描述聚合物中氨基酸残基的排列。肽、多肽或蛋白可由标准的20种天然存在的氨基酸,以及稀有氨基酸和合成的氨基酸类似物组成。它们可为任何氨基酸链,不论其长度或翻译后修饰(例如糖基化或磷酸化)。
“重组的”肽、多肽或蛋白指利用重组DNA技术生产的肽、多肽或蛋白,即生成于由编码目的肽的外源DNA构建体转化的细胞。“合成的”肽、多肽或蛋白指利用化学合成制备的肽、多肽或蛋白。当关于如细胞,或核酸,蛋白,或载体使用时,术语“重组的”表明该细胞、核酸、蛋白或载体已通过引入异源核酸或蛋白,或天然核酸或蛋白的改变修饰,或该细胞源自如此修饰的细胞。本发明涉及含有一个或多个上述序列和异源序列的融合蛋白。异源多肽、核酸或基因是源自外来物种的那些,或如果源自同物种,则由其原始形式实质修饰的那些。如果两个融合的结构域或序列在天然形成的蛋白或核酸中不相互毗邻,则它们互为异源。
“分离的”肽、多肽或蛋白指已经和与其天然相关的其他蛋白、脂类和核酸分离开的肽、多肽或蛋白。该多肽/蛋白可构成纯化的制剂干重的至少10%(即10%到100%间的任意百分比,例如20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%和99%)。可利用任意合适的标准方法测量纯度,例如利用柱层析法、聚丙烯酰胺凝胶电泳或HPLC分析。可利用重组DNA技术,从转基因动物源纯化,或利用化学方法生产本发明所述的分离的多肽/蛋白。IgG Fc的功能等价物指IgG Fc的多肽衍生物,例如,具有一个或多个点突变、***、缺失、截短的蛋白质,融合蛋白,或其组合。其实质上保留IgG Fc的活性,即与各自受体结合并触发各自细胞应答的能力。分离的多肽可含有SEQ ID NO:2或3。通常,功能等价物与SEQ IDNO:2或3至少75%(例如75%到100%间的任意数值,包含例如70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%和99%)同一。
“抗原”指引起免疫反应或与该反应的产物结合的物质。术语“表位”指抗体或T细胞与之结合的抗原区域。
如本文所用,“抗体”以其最广泛的意义使用且具体包括单克隆抗体(包括全长的单克隆抗体)、多克隆抗体、多特异性抗体(例如,双特异性抗体)和足够长以表现目的生物活性的抗体片段。本文所用的术语“抗体”(Ab)包括单克隆抗体、多克隆抗体、多特异性抗体(例如,双特异性抗体和多反应性抗体)和抗体片段。因此,在本说明书任意语境中所用的术语“抗体”意指包括,但不限于任意特异性的结合部分、免疫球蛋白种类和/或同种型(例如,IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA、IgD、IgE和IgM);和生物相关片段或其特异性结合部分,包括但不限于Fab、F(ab’)2、Fv和scFv(单链或相关实体(related entity))。本领域理解,抗体是包含至少两条重(H)链和两条轻(L)链(通过二硫键链间连接)的糖蛋白,或其抗原结合部分。重链由重链可变区(VH)和重链恒定区(CH1、CH2和CH3)组成。轻链由轻链可变区(VL)和轻链恒定区(CL)组成。重链和轻链的可变区均包含构架区(FWR)和互补性决定区(CDR)。四个FWR区域相对保守而CDR区域(CDR1、CDR2和CDR3)代表高度可变区,并且它们从NH2端至COOH端按以下方式排列:FWR1,CDR1,FWR2,CDR2,FWR3,CDR3和FWR4。重链和轻链的可变区含有与抗原相互作用的结合结构域,而取决于同种型,恒定区可介导免疫球蛋白与宿主组织或因子的结合。本文所用的“抗体”定义也包括嵌合抗体、人源化抗体和重组抗体,产生自转基因非人动物的人抗体,和使用技术人员可获得的富集技术从库中选择的抗体。
如本文所用,“抗体片段”可包含完整抗体的部分,通常包含完整抗体的抗原结合区和可变区,和/或抗体的保留FcR结合能力的Fc区。抗体片段的示例包括线性抗体;单链抗体分子;和由抗体片段形成的多特异性抗体。优选地,抗体片段保留IgG重链的完整恒定区并包含IgG轻链。
如本文所用,术语“单克隆抗体”指获得自实质上均质的抗体群的抗体,即,组成抗体群的各个单独抗体是相同的,除以较少量存在的可能的自然发生的突变。单克隆抗体是高度特异的,抗单个抗原位点。此外,与通常包括抗不同决定簇(表位)的不同抗体的传统(多克隆)抗体制备物相反,每个单克隆抗体均抗抗原上的单个决定簇。修饰语“单克隆”表明抗体获得自实质上均质的抗体群的特征,且其不解释为需要利用任何特定方法生产抗体。例如,可利用首次由Kohler和Milstein,Nature,256,495-497(1975)(通过引用并入本文)描述的杂交瘤技术制备,或可利用重组DNA方法(参见如美国专利号4,816,567,其通过引用并入本文)制备。也可例如使用描述于Clackson等人,Nature,352,624-628(1991)和Marks等人,J Mol Biol,222,581-597(1991)中的技术自噬菌体抗体文库分离单克隆抗体,其每一篇均通过引用并入本文。
本文中单克隆抗体具体包括“嵌合”抗体(免疫球蛋白),其中部分重链和/或轻链与源自特定物种或属于特定抗体类别或亚类的抗体中的对应序列相同或同源,而链的剩余部分与源自另一个物种或属于另一个抗体类别或亚类的抗体及足够长以显示目的生物活性的这些抗体的片段中的对应序列相同或同源(参见美国专利号4,816,567;Morrison等人,Proc Natl Acad Sci USA,81,6851-6855(1984);Neuberger等人,Nature,312,604-608(1984);Takeda等人,Nature,314,452-454(1985);国际申请号PCT/GB85/00392,其每一个均通过引用并入本文)。
“人源化”形式的非人(例如,鼠)抗体是含有最少的源自非人免疫球蛋白的序列的嵌合抗体。人源化抗体的绝大部分是人免疫球蛋白(受体抗体),其中来自受体高度可变区的残基被替换为来自非人物种(如小鼠、大鼠、兔或非人灵长类)的高度可变区的具有目的特异性、亲和力和能力的残基(供体抗体)。在一些情况下,人免疫球蛋白的Fv构架区(FR)残基被替换为对应的非人残基。此外,人源化抗体可包含在受体抗体或供体抗体中未发现的残基。进行这些修饰以进一步改进抗体性能。通常,人源化抗体包含至少一个且通常两个可变结构域的基本全部,其中全部或基本上全部的高度可变环都与非人免疫球蛋白的那些一致,且全部或基本上全部的FR残基都是人免疫球蛋白序列中的那些。任选地,人源化抗体还包含至少部分免疫球蛋白恒定区(Fc),通常为人免疫球蛋白的一部分。关于进一步细节,参见Jones等人,Nature,321,522-525(1986);Riechmann等人,Nature,332,323-329(1988);Presta,Curr Op Struct Biol,2,593-596(1992);美国专利号5,225,539,其每一个均通过引用并入本文。
“人抗体”指具有全人序列的任意抗体,如可获得自人杂交瘤、人噬菌体展示文库或表达人抗体序列的转基因小鼠。
术语“可变的”指可变(V)结构域的某些区段在抗体间序列广泛差异的事实。V结构域介导抗原结合并定义特定抗体对其特定抗原的特异性。然而,可变性在可变区的110个氨基酸跨度中不是均匀分布的。相反,V区域包含称作构架区(FR)的15-30个氨基酸的相对不可变延伸,其被称作“高度可变区”的每个长9-12个氨基酸的具有极度可变性的更短区域分隔开。天然重链和轻链的每个可变区均包含四个FR,其主要采用β折叠构象,通过3个高度可变区连接,该高度可变区形成连接且在一些情况下形成β折叠结构的部分的环。每条链中的高度可变区被FR紧密接近地约束在一起,并与来自其他链的高度可变区一起促成抗体的抗原结合位点的形成(参见如Kabat等人,Sequences of Proteins of ImmunologicalInterest,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991))。
如本文所用,术语“高度可变区”指抗体的负责抗原结合的氨基酸残基。高度可变区通常包含来自“互补性决定区”(“CDR”)的氨基酸残基。
“Fv”是含有完整抗原识别和抗原结合位点的最小抗体片段。该片段含有一个重链可变区结构域和一个轻链可变区结构域以非共价键紧密结合而形成的二聚体。这两个结构域的折叠放出六个高度可变环(每条H和L链上三个环),其提供用于抗原结合的氨基酸残基并给予抗体对抗原的结合特异性。然而,即使单个可变区(或仅包含三个特异于抗原的CDR的半个Fv)也具有识别和结合抗原的能力,尽管其亲和力比完整的结合位点低。
“单链Fv”(“sFv”或“scFv”)是包含连成单个多肽链的VH和VL抗体结构域的抗体片段。sFv多肽可进一步包含位于VH和VL结构域之间,使sFv能够形成抗原结合所需结构的多肽接头。关于Fv的综述,参见如Pluckthun in The Pharmacology of MonoclonalAntibodies,卷113,Rosenburg和Moore编,Springer-Verlag,New York,pp.269-315(1994);Borrebaeck 1995,见下文。
术语“双抗体”指通过构建sFv片段与VH和VL结构域间的短接头(约5-10个残基)制备的小抗体片段,如此实现链间而非链内的V结构域配对,导致二价片段,即具有两个抗原结合位点的片段。双特异性双抗体是两个“交叉的”(crossover)sFv片段的异二聚体,其中两个抗体的VH和VL结构域存在于不同的多肽链上。双抗体更充分地描述于如EP 404,097;WO 93/11161和Hollinger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993)中。
可以全人形式生成的结构域抗体(dAb)是已知与抗原结合的最小抗体片段,范围约11kDa到约15kDa。DAb是免疫球蛋白的重和轻链的稳健的可变区(分别为VH和VL)。他们在微生物细胞培养中高度表达,显示有利的生物物理学性质,包括例如但不限于溶解度和温度稳定性,并且很适合通过体外筛选***(例如噬菌体展示)进行筛选和亲和力成熟。单体形式的DAb具有生物活性,且由于其尺寸小和固有的稳定性,可设计为更大的分子以创制具有延长的半衰期或其他药理活性的药物。该技术的示例描述于下列专利中,例如WO9425591中描述了源自骆驼重链Ig的抗体,和US20030130496中描述了自噬菌体文库分离单结构域全人抗体。
Fv和sFv是仅有的具有缺乏恒定区的完整结合位点的抗体种类。因此,他们适用于体内应用中降低的非特异性结合。可构建sFv融合蛋白以在sFv的氨基末端或羧基末端产生效应子蛋白的融合。参见如Antibody Engineering,Borrebaeck编,如上所述。抗体片段也可以是“线性抗体”,例如美国专利号5,641,870中所述。这些线性抗体片段可以是单特异性或双特异性的。
如本文所用,术语“Fc片段”或“Fc区域”用于定义免疫球蛋白重链的C-端区域。该Fc区域是与Fc受体和补体***中的一些蛋白相互作用的抗体尾部区域。Fc区域可为天然序列Fc区域或变体Fc区域。尽管免疫球蛋白重链的Fc区域边界可以变化,人IgG重链Fc区域通常定义为从位置Cys226或Pro230的氨基酸残基伸展至其羧基末端。天然序列Fc区域包含与自然界中发现的Fc区域的氨基酸序列相同的氨基酸序列。本领域普通技术人员所知晓的变体Fc区域包含与天然序列Fc区域的氨基酸序列相比区别在于存在至少一个“氨基酸修饰”的氨基酸序列。
在IgG、IgA和IgD抗体同种型中,Fc区域由两个相同的、源自抗体两条重链上第二和第三恒定结构域的蛋白片段组成;IgM和IgE的Fc区域在每条多肽链中含有三个重链恒定结构域(CH结构域2-4)。IgG的Fc区域具有一个高度保守的N-糖基化位点。Fc片段的糖基化对Fc受体介导的活性来说是重要的。连接至这个位点上的N-聚糖主要为复合物类型的核心-果糖化的双触角结构。此外,少量的这些N-聚糖还带有等分的GlcNAc和α-2,6连接的唾液酸残基。参见如US20170349662、US20080286819、US20100278808、US20100189714、US2009004179、US20080206246、20110150867和WO2013095966,其每一个均通过引用并入本文。
“天然序列Fc区域”包含与自然界中发现的Fc区域的氨基酸序列相同的氨基酸序列。本领域普通技术人员所知晓的“变体Fc区域”或“Fc变体”或“Fc结构域变体”包含与天然序列Fc区域的区别在于至少一个“氨基酸修饰”的氨基酸序列。优选地,变体Fc区域与天然序列Fc区域或亲本多肽Fc区域相比具有至少一个氨基酸取代,例如,在天然序列Fc区域或亲本多肽Fc区域中的约一个至约十个氨基酸取代,且优选约一个至约六个、五个、四个、三个或两个氨基酸取代。本文中的变体Fc区域优选与天然序列Fc区域和/或亲本多肽Fc区域具有至少约75%或80%的同源性,且更优选至少约90%的同源性,更优选至少约95%的同源性,甚至更优选至少约96%、97%、98%或99%的同源性。术语“天然”或“亲本”指包含Fc氨基酸序列的未修饰多肽。亲本多肽可包含天然序列Fc区域或具有早先存在的氨基酸序列修饰(如添加、缺失和/或取代)的Fc区域。
术语“Fc受体”或“FcR”用于描述与抗体Fc区域结合的受体。Fc受体是在有助于免疫***保护功能的某些细胞表面发现的蛋白-包括B淋巴细胞、滤泡树突细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞和肥大细胞以及其他细胞。其名字源于其对抗体Fc区域(片段结晶区)的结合特异性。
Fc受体介导多种抗体功能。例如,Fc受体与附着于被感染的细胞或入侵病原体的抗体结合。其活性刺激吞噬细胞或细胞毒性细胞以通过抗体介导的吞噬作用或抗体依赖性细胞介导的细胞毒性破坏微生物或被感染的细胞。本领域还已知,抗体Fc区域保证每个抗体均通过与特定种类的Fc受体和其他免疫分子(如补体蛋白)的结合产生针对给定抗原的合适免疫应答。利用其对免疫球蛋白同种型的特异性定义FcR:FcγR指针对IgG抗体的Fc受体,FcεFR针对IgE,FcαR针对IgA等。针对免疫球蛋白G的表面受体存在两种不同的类型-通过其交联激活细胞的那些(“活化型FcR”)和通过共同参与抑制激活的那些(“抑制型FcR”)。
已定义了哺乳类物种中多种不同类型的IgG Fc受体:如在小鼠中的FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)、FcγRIII(CD16)和FcγIV,和如在人类中的FcRI,FcRIIA、B、C,FcRIIIA和B。FcγRI表现对抗体恒定区的高亲和力和受限的同种型特异性,而FcγRII和FcγRIII具有针对IgG Fc区域的低亲和力但更广的同种型结合模式(Ravetch和Kinet,1991;Hulett和Hogarth,Adv Immunol 57,1-127(1994))。FcγRIV是新近鉴定的受体,其在所有哺乳类物种中保守,具有中等亲和力和受限的亚类特异性(Mechetina等人,Immunogenetics 54,463-468(2002);Davis等人,Immunol Rev 190,123-126(2002);Nimmerjahn等人,Immunity 23,41-51(2005))。
Fc受体按功能分为不同的两类:活化型和抑制型受体,其分别通过基于免疫受体络氨酸的活化型基序(ITAM)或抑制型基序(ITIM)来传递其信号(Ravetch,in FundamentalImmunology W.E.Paul,编(Lippincott-Raven,Philadelphia,(2003);Ravetch和Lanier,Science 290,84-89(2000)。活化型和抑制型分子在同一个细胞上的成对表达是生成平衡的免疫应答的关键。此外,已经知晓的是IgG Fc受体对个别抗体同种型表现显著不同的亲和力,使得某些同种型比另一些同种型被更严格地调控(Nimmerjahn等人,2005)。
在本发明的一个实施方案中,FcR是天然序列人FcR。在另一个实施方案中,FcR(包括人FcR)与IgG抗体(γ受体)结合并包括FcγRI、FcγRII和FcγRIII亚类的受体(包括这些受体的等位基因变体和可变剪接形式)。FcγRII受体包括FcγRIIA(“活化型受体”)和FcγRIIB(“抑制型受体”),其具有相似的氨基酸序列且主要区别在于其胞质结构域。活化型受体FcγRIIA在其胞质结构域含有基于免疫受体络氨酸的活化型基序(ITAM)。抑制型受体FcγRIIB在其胞质结构域含有基于免疫受体络氨酸的抑制型基序(ITIM)(参见综述Daron,Annu Rev Immunol,15,203-234(1997);FcR综述于Ravetch和Kinet,Annu Rev Immunol,9,457-92(1991);Capel等人,Immunomethods,4,25-34(1994)和de Haas等人,J Lab ClinMed,126,330-41(1995),Nimmerjahn和Ravetch 2006,Ravetch Fc Receptors inFundamental Immunology,William Paul编,第五版,其每一个均通过引用并入本文)。
术语“药物组合物”指活性剂和惰性或活跃载体的组合,使得此组合物尤其适合于体内或离体的诊断或治疗用途。
如本文所用,“药学上可接受的载体”包括任何和所有生理学上相容的溶剂、分散介质、涂层、抗细菌和抗真菌剂、等渗剂和吸收延迟剂等。“药学上可接受的载体”在施用到或施用在受试者上后,不引起不希望的生理学效果。在与活性成分相容和能够稳定它的意义上而言,药物组合物中的载体也必须是“可接受的”。可使用一种或多种增溶剂作为药物载体以递送活性剂。药学上可接受的载体的示例包括但不限于生物相容的媒介物、佐剂、添加剂和稀释剂,以获得可用作剂型的组合物。其他载体的示例包括胶体二氧化硅、硬脂酸镁、纤维素和月桂基硫酸钠。其他合适的药物载体和稀释剂及药学必需品的用途描述于Remington’s Pharmaceutical Sciences。优选地,载体适用于静脉内、肌肉内、皮下、胃肠道外、脊髓或表皮施用(例如,通过注射或输注)。治疗性化合物可包含一种或多种药学上可接受的盐。“药学上可接受的盐”指保留亲本化合物的所需生物活性且不给予任何不希望的毒理作用的盐(参见如Berge,S.M.等人,(1977)J Pharm.Sci.66:1-19)。
如本文所用,术语“细胞毒性剂”指抑制或阻止细胞功能和/或导致细胞破坏的物质。该术语旨在包括放射性同位素(例如,At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32和Lu的放射性同位素)、化学治疗剂和毒素,如细菌、真菌、植物或动物起源的小分子毒素或酶促活性毒素,包括其片段和/或变体。
“化学治疗剂”是在癌症治疗中使用的化合物。化学治疗剂的示例包括烷化剂,如噻替派(thiotepa)和环磷酰胺(CYTOXANTM);烷基磺酸盐,如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)和哌泊舒凡(piposulfan);氮丙啶类,如苯佐替哌(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、美妥替哌(meturedopa)和乌瑞替哌(uredopa);乙烯亚胺类和甲基蜜胺类(methylamelamine),包括六甲蜜胺、三乙撑密胺(triethylenemelamine)、三亚乙基磷酰胺(trietylenephosphoramide)、三亚乙基硫代磷酰胺(triethylenethiophosphaoramide)和三甲密胺(trimethylolomelamine);多聚乙酰(acetogenin)(特别是布拉他辛(bullatacin)和布拉他辛酮(bullatacinone));喜树碱(camptothecin)(包括合成类似物拓扑替康topotecan);苔藓抑素(bryostatin);卡利他汀(callystatin);CC-1065(包括其阿多来新(adozelesin)、卡折来新(carzelesin)和比折来新(bizelesin)的合成类似物);念珠藻环肽(cryptophycin)(特别是念珠藻环肽1和念珠藻环肽8);尾海兔素(dolastatin);倍癌霉素(duocarmycin)(包括合成类似物KW-2189和CBI-TMI);软珊瑚醇(eleutherobin);水鬼蕉碱(pancratistatin);匍枝珊瑚醇(sarcodictyin);海绵抑制素(spongistatin);氮芥类,如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、氯磷酰胺(cholophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、异环磷酰胺(ifosfamide)、甲二氯二乙胺(mechlorethamine)、甲二氯二乙胺氧化物磷酸盐(mechlorethamine oxidehydrochloride)、美法仑(melphalan)、新氮芥(novembichin)、苯芥胆甾醇(phenesterine)、泼尼莫司汀(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard);亚硝基脲类,如卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)、雷莫司汀(ranimustine);抗生素,如烯二炔抗生素(enediyne antibiotics)(例如卡奇霉素(calicheamicin),参见如Agnew Chem.Intl.Ed.Engl.33:183-186(1994);达内霉素(dynemicin),包括达内霉素A;埃斯波霉素(esperamicin);以及新制癌菌素(neocarzinostatin)发色团和相关的色素蛋白烯二炔抗生素发色团)、阿克拉霉素(aclacinomysins)、放线菌素(actinomycin)、氨茴霉素(authramycin)、偶氮丝氨酸(azaserine)、博来霉素(bleomycins)、放线菌素(cactinomycin)、卡柔比星(carabicin)、洋红霉素(aminomycin)、嗜癌菌素(carzinophilin)、色霉素(chromomycins)、更生霉素(dactinomycin)、柔红霉素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸(6-diazo-5-oxo-L-norleucine)、多柔比星(doxorubicin)(包括吗啉代多柔比星(morpholino-doxorubicin),氰基吗啉代(cyanomorpholino)-多柔比星、2-吡咯啉基(pyrrolino)-多柔比星和脱氧多柔比星(deoxydoxorubicin))、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊达比星(idarubicin)、麻西罗霉素(marcellomycin)、丝裂霉素(mitomycins)、霉酚酸(mycophenolic acid)、诺加霉素(nogalamycin)、橄榄霉素(olivomycin)、培洛霉素(peplomycin)、泼非霉素(potfiromycin)、嘌呤霉素(puromycin)、奎那霉素(quelamycin)、罗多比星(rodorubicin)、链黑霉素(streptonigrin)、链脲霉素(streptozocin)、杀结核菌素(tubercidin)、乌苯美司(ubenimex)、净司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin);抗代谢药,如甲氨蝶呤(methotrexate)和5-氟尿嘧啶(5-FU);叶酸类似物,如二甲叶酸(denopterin)、甲氨蝶呤、蝶罗呤(pteropterin)、三甲曲沙(trimetrexate);嘌呤类似物,如氟达拉滨(fludarabine)、6-巯基嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鸟嘌呤(thioguanine);嘧啶类似物,如安西他滨(ancitabine)、阿扎胞苷(azacitidine)、6-氮尿苷(6-azauridine)、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、双脱氧尿苷(dideoxyuridine)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、依诺他滨(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine)、5-FU;雄激素,如卡鲁睾酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、环硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睾内脂(testolactone);抗肾上腺药,如氨鲁米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitota)、曲洛司坦(trilostane);叶酸补充剂,如亚叶酸(frolinic acid);醋葡醛内酯(aceglatone);醛磷酰胺糖苷(aldophosphamide glycoside);氨基乙酰丙酸(aminolevulinic acid);安吖啶(amsacrine);贝斯布西(bestrabucil);比生群(bisantrene);依达曲沙(edatraxate);地磷酰胺(defofamine);秋水仙胺(demecolcine);地吖醌(diaziquone);依洛尼塞(elformithine);依利醋铵(elliptinium acetate);埃博霉素(epothilone);乙环氧啶(etoglucid);硝酸镓(gallium nitrate);羟基脲(hydroxyurea);蘑菇多糖(lentinan);氯尼达明(lonidamine);类美登素(maytansinoid),如美登素(maytansine)和安丝菌素(ansamitocins);米托胍腙(mitoguazone);米托蒽醌(mitoxantrone);莫哌达醇(mopidamol);二胺硝吖啶(nitracrine);喷司他丁(pentostatin);蛋氨氮芥(phenamet);吡柔比星(pirarubicin);鬼臼酸(podophyllinic acid);二乙基酰肼(2-ethylhydrazide);丙卡巴肼(procarbazine);
Figure BDA0002639701780000181
雷佐生(razoxane);根霉素(rhizoxin);西佐喃(sizofuran);锗螺胺(spirogermanium);替奴佐酸(tenuazonicacid);三亚胺醌(triaziquone);2,2’,2”-三氯三乙胺(2,2’,2”-trichlorotriethylamine);单端孢霉烯类(trichothecene)(特别是T-2毒素、粘液霉素A(verracurin A)、杆孢菌素A(roridin A)和蛇形毒素(anguidine));氨甲酸乙酯(urethan);长春地辛(vindesine);达卡巴嗪(dacarbazine);甘露莫司汀(mannomustine);二溴甘露醇(mitobronitol);二溴卫矛醇(mitolactol);哌泊溴烷(pipobroman);加西托星(gacytosine);***糖苷(arabinoside)(“Ara-C”);环磷酰胺(cyclophosphamide);噻替派(thiotepa);紫杉烷类,例如紫杉醇(T
Figure BDA0002639701780000182
Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,NJ.)和多西紫杉醇(
Figure BDA0002639701780000183
Rhone-Poulenc Rorer,Antony,法国);苯丁酸氮芥(chlorambucil);吉西他滨(gemcitabine);6-硫鸟嘌呤(thioguanine);巯基嘌呤(mercaptopurine);甲氨蝶呤(methotrexate);铂类似物,如顺铂(cisplatin)和卡铂(carboplatin);长春碱(vinblastine);铂;依托泊苷(VP-16);异环磷酰胺(ifosfamide);丝裂霉素C(mitomycin C);米托蒽醌(mitoxantrone);长春新碱(vincristine);长春瑞滨(vinorelbine);诺维本(navelbine);诺消灵(novantrone);替尼泊苷(teniposide);柔红霉素(daunomycin);氨基喋呤(aminopterin);希罗达(xeloda);伊班膦酸盐(ibandronate);CPT-11;拓扑异构酶抑制剂RFS 2000;二氟甲基鸟氨酸(DMFO);维甲酸(retinoic acid);卡培他滨(capecitabine);和任何上述化合物的药学上可接受的盐、酸或衍生物。作用为调控或抑制激素在肿瘤上的作用的抗激素剂也包括在该定义中,如抗***,包括如它莫西芬(tamoxifen)、雷洛西芬(raloxifene),芳香化酶抑制4(5)-咪唑类(aromatase inhibiting 4(5)-imidazoles)、羟基它莫西芬(hydroxytamoxifen)、曲沃西芬(trioxifene)、雷洛昔芬(keoxifene)、LY117018、奥那司酮(onapristone)和托瑞米芬(toremifene)(法乐通(Fareston));和抗雄激素,如氟他米特(flutamide)、尼鲁米特(nilutamide)、比卡鲁胺(bicalutamide)、亮丙瑞林(leuprolide)、和戈舍瑞林(goserelin);和任何上述化合物的药学上可接受的盐、酸或衍生物。
如本文所用,“治疗”指将化合物或药剂施用给患有疾病或处于患病风险中的受试者,其目的在于治愈、减轻、缓解、补救、延缓发作、预防或改善病症、病症症状、继发于病症的疾病或病症倾向。
术语“预防”、“预防性治疗”等指当受试者还未患有,但处于患有病症或病况的风险或易于患有病症或病况时,降低该受试者中病症或病况发展的可能性。
“受试者”指人或非人动物。非人动物的示例包括所有脊椎动物,例如,哺乳动物,如非人哺乳动物、非人灵长类动物(尤其是高等灵长类动物)、狗、啮齿动物(如小鼠或大鼠)、荷兰猪、猫和兔子,和非哺乳动物,如禽类、两栖动物、爬行动物等。在一个实施方案中,受试者是人。在另一个实施方案中,受试者是非人实验动物或适合作为疾病模型的动物。
“有效量”指给予治疗对象以治疗效果所需要的活性化合物/药剂的量。如本领域技术人员认识到的,有效剂量取决于下述因素而变化:所治疗病况的类型、施用途径、赋形剂使用和与其他治疗处理共同使用的可能性。***病况的的组合的治疗有效量是相较于未经治疗的动物,导致如肿瘤尺寸减小、肿瘤灶数目减少或肿瘤增长减慢的量。
如本文所公开,提供若干数值范围。应理解,除非上下文另外明确指出,在该范围上限和下限之间的每一个中间值(至下限单位的十分之一)也被具体公开。所述范围中任意声明数值或中间值与所述范围中其他任意声明或中间值之间的每个更小范围均包含在本发明内。这些更小范围的上限和下限可独立地包含或排除于范围中,且其中上下限的其中一个、两个都不、两个都被包括于更小范围中的每一个范围也包含在本发明内,受制于所述范围中任何被具体排除的限值。当所述范围包括一个或两个限值,排除这一个或两个被包括的限值的范围也包含在本发明内。
术语“约”通常指指定数值加或减10%。例如,“约10%”可表示9%到11%的范围,且“约1”可意指从0.9到1.1。“约”的其他意思可以由上下文明显可见,如四舍五入,所以,如“约1”还可意指从0.5到1.4。
II.多肽和抗体
如本文所公开,本发明提供具有人IgG Fc变体(如hIgG1 Fc)序列的分离多肽。在一个实施方案中,Fc区域包含一个或多个hIgG1 Fc氨基酸序列的取代。尽管不局限于此,下文和图16提供了示例性的IgG1 Fc区域。在序列中,每个序列中位点236、239、330、332、428和434的氨基酸残基被加粗,且氨基酸取代加下划线。残基编号遵循EU编号***,且第一个残基A对应于EU编号***下的位点118。
野生型:
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GAALIE(G236A/A330L/I332E):
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GAALIE/LS(G236A/A330L/I332E/M428L/N434S):
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GASDALIE(G236A/A330L/I332E):
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLAGPDVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPLPEEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO:4)
本文所述的多肽的氨基酸组成在不破坏多肽结合各自受体和引发各自细胞应答的能力的情况下可以变化。例如,它可以含有一个或多个保守氨基酸取代。本发明公开的肽、多肽或蛋白的保守性修饰物或功能等价物指该肽、多肽或蛋白的多肽衍生物,例如,具有一个或多个点突变、***、缺失、截短的蛋白,融合蛋白,或其组合。它实质上保留亲本肽、多肽或蛋白的活性(如本发明中公开的那些)。通常,保守性修饰物或功能等价物与亲本(例如,SEQ ID NO:1、2、3或4)至少60%(如60%到100%间的任何数值,包括如60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%和99%)同一。因此,本发明范围涉及具有一个或多个点突变、***、缺失、截短的Fc区域,融合蛋白(例如,如下所述的Fv、sFv或其他抗体变体),或其组合,及具有该变体Fc区域的重链或抗体。
如本文所用,两条氨基酸序列间的同源性百分比等于两条序列间的同一性百分比。考虑到为两条序列最优比对需要而引入的空位数目和每个空位的长度,两条序列间的同一性百分比是所述序列共有的相同位置数的函数(即,%同源性=相同位置#/位置总#x100)。如下列非限制性示例所述,可使用数学算法完成两条序列间的序列比较和同一性百分比的确定。
可使用已并入ALIGN程序(版本2.0)的E.Meyers和W.Miller算法(Comput.Appl.Biosci.,4:11-17(1988)),使用PAM120权重残基表,空位长度罚分(penalty)12和空位罚分4,确定两条氨基酸序列间的同一性百分比。此外,可使用已并入GCG软件包GAP程序(可获得于www.gcg.com)中的Needleman和Wunsch算法(J.Mol.Biol.48:444-453(1970)),使用BLOSUM 62矩阵或PAM250矩阵,空位权重16、14、12、10、8、6、或4和长度权重1、2、3、4、5或6,确定两条氨基酸序列间的同一性百分比。
此外或另外,可将本发明的蛋白序列进一步作为“查询序列”,以对公共数据库实施搜索以,例如,识别相关序列。可使用Altschul等人(1990)J.Mol.Biol.215:403-10的XBLAST程序(版本2.0)实施这些搜索。可用XBLAST程序,得分=50,字长=3实施BLAST蛋白搜索以获得与本发明的分子同源的氨基酸序列。为获得用于比较目的的空位化比对,可使用描述于Altschul等人,(1997)Nucleic Acids Res.25(17):3389-3402的空位化BLAST。当使用BLAST和空位化BLAST程序时,可用各自程序(例如,XBLAST和NBLAST)的默认参数(参见www.ncbi.nlm.nih.gov)。
如本文所用,术语“保守修饰”指不显著影响或改变含有氨基酸序列的抗体的结合特征的氨基酸修饰。这些保守修饰包括氨基酸取代、添加和缺失。可利用领域内已知的标准技术(如定点诱变技术和PCR介导的诱变)将修饰引入本发明的抗体中。保守氨基酸取代是其中氨基酸残基被替换为具有相似侧链的氨基酸残基的那些氨基酸取代。本领域中已定义了具有相似侧链的氨基酸残基家族。这些家族包括具有碱性侧链的(例如,赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链的(例如,天冬氨酸、谷氨酸)、不带电荷的极性侧链的(例如,甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、色氨酸)、非极性侧链的(例如,丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸)、β分枝侧链的(例如,苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芳香侧链的(例如,酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)氨基酸。
“保守氨基酸取代”是其中氨基酸残基被替换为具有相似侧链的氨基酸残基的氨基酸取代。因此,将一个预测为非必需的氨基酸残基(如SEQ ID NO:2或3中)优选替换为来自同一个侧链家族的另一个氨基酸残基。或者,可将突变通过如饱和诱变的方式随机引入到序列的全部或部分中,并可从所得突变体筛选与各自受体结合和触发各自细胞应答的能力,以识别保留下述实施例中所述活性的突变体。在除位点236、239、330、332、428和434外的其他位点上的保守氨基酸取代的示例可在美国专利9803023、美国专利9663582和US20170349662中找到,其内容并入本文。
本发明所述多肽可以重组多肽的形式获得。为制备重组多肽,可将编码它的核酸(例如,SEQ ID NO:2或3)与编码融合配偶体(例如,谷胱甘肽-s-转移酶(GST)、6x-His表位标记或M13基因3蛋白)的另一个核酸连接。所得融合核酸在合适的宿主细胞中表达融合蛋白,其可用本领域已知方法分离。可对该分离的融合蛋白进一步处理(如利用酶消化法)以除去融合配偶体,并获得本发明的重组多肽。
本发明范围涉及具有上述Fc变体的变体抗体。可使用本领域已知方法获得具有改进的亲和力的抗体序列的进一步变体,这些变体包含在本发明范围内。例如,可使用氨基酸取代来获得具有进一步改进的亲和力的抗体。另外,可使用核苷酸序列的密码子优化以改进在用于抗体生产的表达***中的翻译效率。
在某些实施方案中,本发明的抗体包含含有CDR1、CDR2和CDR3序列的重链可变区,和包含CDR1、CDR2和CDR3序列的轻链可变区。一个或多个这些CDR序列包含基于本文所述的优选抗体或其保守修饰物的特定氨基酸序列,且其中抗体保留所需功能性性质(例如,中和如多种HIV-1病毒株的病原体)。相似地,本发明的抗体可包含本文所述的优选抗体的Fc区域(例如,SEQ ID NO:2或3),其部分,或其保守修饰物。可将本发明抗体的CDR或非CDR区域中一个或多个氨基酸残基替换为来自同一个侧链家族的其他氨基酸残基,并使用本文所述的功能性测定检测改变后的抗体保留的功能。同样地,本文所述的变体Fc区域可具有一个或多个保守氨基酸取代。
抗体的其他修饰也包括在本文中。例如,抗体可与细胞毒性剂、化学治疗剂或众多非蛋白聚合物的一种(如聚乙二醇、聚丙二醇、聚氧化烯(polyoxyalkylene)或聚乙二醇和聚丙二醇的共聚物)连接。也可将抗体装入例如通过凝聚技术或界面聚合制备的微胶囊(如分别为羟甲基纤维素或明胶-微胶囊和聚-甲基丙烯酸甲酯微胶囊)、胶体药物递送***(例如,脂质体、白蛋白微球、微型乳剂、纳米颗粒和纳米胶囊)或粗乳状液中。这些技术公开于如Remington's Pharmaceutical Sciences,第16版,Oslo,A.,Ed.,(1980)中。
在某些实施方案中,所述发明的抗体是双特异性的,并可与单个抗原上的两个不同表位结合。其他此类抗体可将第一抗原结合位点与第二抗原结合位点组合。双特异性抗体还可用于将细胞毒性剂定位至被感染的细胞。可以全长抗体或抗体片段(例如,F(ab')2双特异性抗体)的形式制备双特异性抗体。参见如WO 96/16673、美国专利号5,837,234、WO98/02463、美国专利号5,821,337和Mouquet等人,Nature.467,591-5(2010)。
制备双特异性抗体的方法是本领域已知的。全长双特异性抗体的传统生成基于两个免疫球蛋白重链-轻链对的共表达,其中两条链具有不同的特异性(参见如Millstein等人,Nature,305:537-539(1983))。类似步骤公开于如WO 93/08829、Traunecker等人,EMBOJ.,10:3655-3659(1991)中,也可参见Mouquet等人,Nature.467,591-5(2010)。从抗体片段生成双特异性抗体的技术也已描述于文献中。例如,可使用化学键制备双特异性抗体。参见Brennan等人,Science,229:81(1985)。
通常,可使用传统杂交瘤技术生产,或使用本领域现有的载体和方法重组制备本发明所用或所述抗体。也可通过体外活化B细胞生成人抗体(参见如美国专利号5,567,610和5,229,275)。在本发明中有用的分子遗学传和遗传工程中的通用方法描述于当前版本的Molecular Cloning:A Laboratory Manual(Sambrook等人,Molecular Cloning:ALaboratory Manual(第四版)Cold Spring Harbor Lab.press,2012)、Gene ExpressionTechnology(Methods in Enzymology,Vol.185,D.Goeddel编,1991.Academic Press,SanDiego,CA)、"Guide to Protein Purification"in Methods in Enzymology(M.P.Deutscher等人(1990)Academic Press,Inc.);PCR Protocols:A Guide to Methodsand Applications(Innis等人1990.Academic Press,San Diego,CA),Culture of AnimalCells:A Manual of Basic Technique,第二版(R.I.Freshney.1987.Liss,Inc.New York,NY)和Gene Transfer and Expression Protocols,pp.109-128,ed.E.J.Murray,TheHumana Press Inc.,Clifton,N.J.)中。用于基因操作的试剂、克隆载体和试剂盒可从供应商如BioRad、Stratagene、Invitrogen、ClonTech和Sigma-Aldrich Co获得。
用于利用富集技术从文库中筛选抗体的其他本领域已知技术可用作前述技术的替代选择以筛选单链抗体,这些技术包括但不限于噬菌体展示、核糖体展示(Hanes和Pluckthun,1997,Proc.Nat.Acad.Sci.94:4937-4942)、细菌展示(Georgiou等人,1997,Nature Biotechnology 15:29-34)和/或酵母展示(Kieke等人,1997,ProteinEngineering 10:1303-1310)。单链抗体可从用丝状噬菌体技术直接生成的单链抗体库中筛选。噬菌体展示技术是本领域已知的(参见如Cambridge Antibody Technology(CAT)中的技术),如在美国专利号5,565,332、5,733,743、5,871,907、5,872,215、5,885,793、5,962,255、6,140,471、6,225,447、6,291650、6,492,160、6,521,404、6,544,731、6,555,313、6,582,915、6,593,081及其他美国同族专利,或依赖于1992年5月24日提交的优先权申请GB9206318的申请中所公开的;并参见Vaughn等人,1996,Nature Biotechnology 14:309-314)。也可使用现有的重组DNA技术来设计和构建单链抗体,如DNA扩增方法(例如,PCR),或可能通过使用各自的杂交瘤cDNA作为模板。
人抗体也可在缺少内源免疫球蛋白生产的能生产人抗体的全部组成成分的转基因动物(例如,小鼠)中生产。例如,已描述了嵌合和种系突变小鼠中抗体重链结合区(JH)基因的纯合缺失导致内源抗体生产的完全抑制。将人种系免疫球蛋白基因芯片转移到这些种系突变小鼠中导致抗原激发下人抗体的生产。参见如Jakobovits等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:2551(1993);Jakobovits等人,Nature,362:255-258(1993);Bruggemann等人,Year in Immuno.,7:33(1993);美国专利号5,545,806、5,569,825、5,591,669(均为GenPharm);美国专利号5,545,807,和WO 97/17852。可基因工程化这些动物以生产包含本发明所述多肽的人抗体。
任何已知的单克隆抗体都可通过融合其抗原结合部分与本文所述Fc区域/结构域变体受益于本公开中公开的Fc区域变体和修饰。已知的治疗性单克隆抗体的示例可包括任意下列非限制性抗体:3F8、8H9、阿巴伏单抗(Abagovomab)、阿昔单抗(Abciximab)、阿比妥珠单抗(Abituzumab)、阿瑞鲁单抗(Abrilumab)、阿托续单抗(Actoxumab)、阿达木单抗(Adalimumab)、阿德木单抗(Adecatumumab)、阿杜那单抗(Aducanumab)、阿非西维单抗(Afasevikumab)、阿非莫单抗(Afelimomab)、阿托珠单抗(Afutuzumab)、培化阿珠单抗(Alacizumab pegol)、ALD518、阿仑珠单抗(Alemtuzumab)、阿利库单抗(Alirocumab)、喷替酸阿妥莫单抗(Altumomab pentetate)、阿麦妥昔单抗(Amatuximab)、马安莫单抗(Anatumomab mafenatox)、雷星-阿奈妥单抗(Anetumab 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amunaleukin、培化赛托珠单抗(Certolizumab pegol)、西妥昔单抗(Cetuximab)、泊西他珠单抗(Citatuzumab bogatox)、西妥木单抗(Cixutumumab)、克拉扎珠单抗(Clazakizumab)、克立昔单抗(Clenoliximab)、替坦司-可立妥珠单抗(Clivatuzumab tetraxetan)、Codrituzumab、Coltuximab ravtansine、可那木单抗(Conatumumab)、扣西珠单抗(Concizumab)、CR6261、克雷内珠单抗(Crenezumab)、Crotedumab、达西珠单抗(Dacetuzumab)、达克珠单抗(Daclizumab)、达洛妥珠单抗(Dalotuzumab)、培化达匹立珠单抗(Dapirolizumab pegol)、达雷木单抗(Daratumumab)、德屈库单抗(Dectrekumab)、德美西珠单抗(Demcizumab)、Denintuzumab mafodotin、地诺单抗(Denosumab)、Depatuxizumab mafodotin、Derlotuximab生物素、地莫单抗(Detumomab)、达妥昔单抗(Dinutuximab)、Diridavumab、Domagrozumab、阿托度单抗(Dorlimomab aritox)、卓齐妥单抗(Drozitumab)、度利戈妥单抗(Duligotumab)、度匹鲁单抗(Dupilumab)、度伐单抗(Durvalumab)、度司吉妥单抗(Dusigitumab)、依美昔单抗(Ecromeximab)、依库珠单抗(Eculizuma)、埃巴单抗(Edobacomab)、依决洛单抗(Edrecolomab)、依法利珠单抗(Efalizumab)、依夫单抗(Efungumab)、依德鲁单抗(Eldelumab)、Elgemtumab、艾洛珠单抗(Elotuzumab)、艾西莫单抗(Elsilimomab)、Emactuzumab、艾米贝妥珠单抗(Emibetuzumab)、艾美赛珠单抗(Emicizumab)、依纳伐妥珠单抗(Enavatuzumab)、恩诺单抗(Enfortumab 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monatox)、奥戈伏单抗(Oregovomab)、奥替库单抗(Orticumab)、奥昔珠单抗(Otelixizumab)、奥特托珠单抗(Otlertuzumab)、奥昔鲁单抗(Oxelumab)、奥扎尼珠单抗(Ozanezumab)、奥佐拉珠单抗(Ozoralizumab)、帕吉昔单抗(Pagibaximab)、帕利珠单抗(Palivizumab)、帕姆雷单抗(Pamrevlumab)、帕尼单抗(Panitumumab)、Pankomab、帕巴库单抗(Panobacumab)、巴萨妥珠单抗(Parsatuzumab)、帕考珠单抗(Pascolizumab)、帕索妥昔单抗(Pasotuxizumab)、帕特克珠单抗(Pateclizumab)、帕曲妥单抗(Patritumab)、派姆单抗(Pembrolizumab)、培妥莫单抗(Pemtumomab)、培拉珠单抗(Perakizumab)、帕妥珠单抗(Pertuzumab)、培克珠单抗(Pexelizumab)、皮地珠单抗(Pidilizumab)、皮那妥珠单抗-维多汀(Pinatuzumabvedotin)、平妥莫单抗(Pintumomab)、普拉库鲁单抗(Placulumab)、帕洛利珠单抗(Plozalizumab)、泊加珠单抗(Pogalizumab)、波妥珠单抗-维多汀(Polatuzumabvedotin)、珀奈珠单抗(Ponezumab)、普瑞利珠单抗(Prezalizumab)、普立昔单抗(Priliximab)、普立妥昔单抗(Pritoxaximab)、普立妥木单抗(Pritumumab)、PRO 140、奎利珠单抗(Quilizumab)、雷妥莫单抗(Racotumomab)、雷德妥单抗(Radretumab)、雷韦单抗(Rafivirumab)、劳赛珠单抗(Ralpancizumab)、雷莫芦单抗(Ramucirumab)、兰尼单抗(Ranibizumab)、雷西库单抗(Raxibacumab)、瑞凡珠单抗(Refanezumab)、瑞加韦单抗(Regavirumab)、瑞利珠单抗(Reslizumab)、立妥木单抗(Rilotumumab)、Rinucumab、Risankizumab、利妥昔单抗(Rituximab)、培化利巴珠单抗(Rivabazumab pegol)、罗妥木单抗(Robatumumab)、罗度单抗(Roledumab)、罗莫索珠单抗(Romosozumab)、隆利珠单抗(Rontalizumab)、罗伐珠单抗(Rovalpituzumab)tesirine、罗维珠单抗(Rovelizumab)、鲁利珠单抗(Ruplizumab)、戈维替康-沙西妥珠单抗(Sacituzumab govitecan)、沙马珠单抗(Samalizumab)、萨皮利珠单抗(Sapelizumab)、沙里鲁单抗(Sarilumab)、沙妥莫单抗-喷地肽(Satumomab pendetide)、司库奴单抗(Secukinumab)、司里班妥单抗(Seribantumab)、司托昔单抗(Setoxaximab)、司韦单抗(Sevirumab)、SGN-CD19A、SGN-CD33A、西罗珠单抗(Sibrotuzumab)、西法木单抗(Sifalimumab)、司妥昔单抗(Siltuximab)、西妥珠单抗(Simtuzumab)、西利珠单抗(Siplizumab)、西芦库单抗(Sirukumab)、维汀-索非妥珠单抗(Sofituzumab vedotin)、索兰珠单抗(Solanezumab)、索利托单抗(Solitomab)、索耐珠单抗(Sonepcizumab)、松妥珠单抗(Sontuzumab)、司他莫鲁单抗(Stamulumab)、硫索单抗(Sulesomab)、苏韦珠单抗(Suvizumab)、他巴鲁单抗(Tabalumab)、泰坦-他卡妥珠单抗(Tacatuzumab tetraxetan)、他度珠单抗(Tadocizumab)、他利珠单抗(Talizumab)、坦妥维单抗(Tamtuvetmab)、他尼珠单抗(Tanezumab)、帕他莫单抗(Taplitumomab paptox)、他瑞妥单抗(Tarextumab)、替非珠单抗(Tefibazumab)、阿替莫单抗(Telimomab aritox)、替妥莫单抗(Tenatumomab)、替奈昔单抗(Teneliximab)、替利珠单抗(Teplizumab)、替妥木单抗(Teprotumumab)、特度鲁单抗(Tesidolumab)、替妥洛单抗(Tetulomab)、泰派鲁单抗(Tezepelumab)、TGN1412、替西木单抗(Ticilimumab)、替加珠单抗(Tigatuzumab)、替拉珠单抗(Tildrakizumab)、替莫鲁单抗(Timolumab)、替索单抗-维多汀(Tisotumab vedotin)、TNX-650、托珠单抗(Tocilizumab)、托利珠单抗(Toralizumab)、托萨托舒单抗(Tosatoxumab)、托西莫单抗(Tositumomab)、托维妥单抗(Tovetumab)、特拉罗奴单抗(Tralokinumab)、曲妥珠单抗(Trastuzumab)、恩美-曲妥珠单抗(Trastuzumabemtansine)、TRBS07、曲加珠单抗(Tregalizumab)、曲美木单抗(Tremelimumab)、曲戈芦单抗(Trevogrumab)、西莫白介素-妥考妥珠单抗(Tucotuzumab celmoleukin)、妥韦单抗(Tuvirumab)、优立妥昔单抗(Ublituximab)、乌乌洛鲁单抗(Ulocuplumab)、优瑞鲁单抗(Urelumab)、乌珠单抗(Urtoxazumab)、优特克单抗(Ustekinumab)、乌托鲁单抗(Utomilumab)、他立林-伐达妥昔单抗(Vadastuximab talirine)、万多妥珠单抗-维多汀(Vandortuzumab vedotin)、万替妥单抗(Vantictumab)、伐奴赛珠单抗(Vanucizumab)、伐利昔单抗(Vapaliximab)、伐立鲁单抗(Varlilumab)、伐特珠单抗(Vatelizumab)、维多珠单抗(Vedolizumab)、维妥珠单抗(Veltuzumab)、维帕莫单抗(Vepalimomab)、维森库单抗(Vesencumab)、维西珠单抗(Visilizumab)、弗巴利珠单抗(Vobarilizumab)、伏洛昔单抗(Volociximab)、伏司妥珠单抗-马佛多汀(Vorsetuzumab mafodotin)、伏妥莫单抗(Votumumab)、珍妥珠单抗(Xentuzumab)、扎鲁妥木单抗(Zalutumumab)、扎诺木单抗(Zanolimumab)、扎妥昔单抗(Zatuximab)、齐拉木单抗(Ziralimumab)、阿佐莫单抗(Zolimomab aritox)及其组合。
靶标可包括下列任意非限制性靶标:β-淀粉样蛋白、4-1BB、5AC、5T4、甲胎蛋白、血管生成素、AOC3、B7-H3、BAFF、c-MET、c-MYC、C242抗原、C5、CA-125、CCL11、CCR2、CCR4、CCR5、CD4、CD8、CD11、CD18、CD125、CD140a、CD127、CD15、CD152、CD140、CD19、CD2、CD20、CD22、CD23、CD25、CD27、CD274、CD276、CD28、CD3、CD30、CD33、CD37、CD38、CD4、CD40、CD41、CD44、CD47、CD5、CD51、CD52、CD56、CD6、CD74、CD80、CEA、CFD、CGRP、CLDN、CSF1R、CSF2、CTGF、CTLA-4、CXCR4、CXCR7、DKK1、DLL3、DLL4、DR5、EGFL7、EGFR、EPCAM、ERBB2、ERBB3、FAP、FGF23、FGFR1、GD2、GD3、GDF-8、GPNMB、GUCY2C、HER1、HER2、HGF、HIV-1、HSP90、ICAM-1、IFN-α、IFN-γ、IgE、CD221、IGF1、IGF2、IGHE、IL-1、IL2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-6R、IL-9、IL-12IL-15、IL-15R、IL-17、IL-13、IL-18、IL-1β、IL-22、IL-23、IL23A、整联蛋白、ITGA2、IGTB2、Lewis-Y抗原、LFA-1、LOXL2、LTA、MCP-1、MIF、MS5A1、MUC1、MUC16、MSLN、肌肉生长抑制素、MMP超家族、NCA-90、NFG、NOGO-A、Notch 1、NRP1、OX-40、OX-40L、P2X超家族、PCSK9、PD-1、PD-L1、PDCD1、PDGF-R、RANKL、RHD、RON、TRN4、血清白蛋白、SDC1、SLAMF7、SIRPα、SOST、SHP1、SHP2、STEAP1、TAG-72、TEM1、TIGIT、TFPI、TGF-β、TNF-α、TNF超家族、TRAIL超家族、Toll样受体、WNT超家族、VEGF-A、VEGFR-1、VWF、巨细胞病毒(CMV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、乙肝病毒、丙肝病毒、甲型流感病毒血凝素、狂犬病病毒、HIV病毒、单纯性疱疹病毒及其组合。其他靶标或抗原可在美国专利9803023、美国专利9663582和US20170349662(其内容并入本文)中找到。
III.核酸
本发明的另一个方面特征化了包含编码上述多肽或蛋白或抗体的序列的分离的核酸。核酸指DNA分子(例如,cDNA或基因组DNA),RNA分子(例如,mRNA),或DNA或RNA类似物。DNA或RNA类似物可合成自核苷酸类似物。核酸分子可为单链或双链,且优选为双链DNA。“分离的核酸”指具有不同于任何自然发生的核酸或自然发生的基因组核酸的任何片段的结构的核酸。因此,该术语包括如(a)具有自然发生的基因组DNA分子的部分序列的DNA,但其不与在其自然发生的生物基因组内和该部分序列相邻的两个编码序列相邻;(b)引入载体或引入原核生物或真核生物的基因组DNA的核酸,引入方式使所得分子不同于任何自然发生的载体或基因组DNA;(c)分隔的分子,如cDNA、基因组片段、通过聚合酶链式反应(PCR)生成的片段或限制性片段;和(d)作为杂合基因(即编码融合蛋白的基因)的部分的重组核苷酸序列。上述核酸可用于表达本发明的多肽、融合蛋白或抗体。为此,可将核酸有效连接到合适的调控序列以生成表达载体。
载体指能够运输与其连接的另一核酸的核酸分子。载体能够进行自我复制或整合入宿主DNA。载体的示例包括质粒、粘粒或病毒载体。载体包括适于在宿主细胞内表达核酸的形式的核酸。优选地,载体包括有效连接至需要表达的核酸序列的一个或多个调控序列。
“调控序列”包括启动子、增强子和其他表达控制元件(例如,多聚腺苷酸化信号)。调控序列包括指导核苷酸序列组成型表达的序列,及组织特异性调控和/或诱导序列。表达载体的设计可取决于一些因素,如待转化的宿主细胞的选择、目的蛋白或RNA的表达水平等。可将表达载体引入宿主细胞以产生本发明的多肽。定义启动子为指导RNA聚合酶与DNA结合和启动RNA合成的DNA序列。强启动子是导致mRNA以高频率启动的启动子。
可将上述任意多核苷酸或技术人员出于相同目的可获得的生物等价多核苷酸***合适的表达载体并与其他DNA分子连接以形成表达该受体的“重组DNA分子”。这些载体可由DNA或RNA组成;对于大多数克隆目,优选DNA载体。典型载体包括质粒、经修饰的病毒、噬菌体和粘粒、酵母人工染色体和其他形式的游离型或整合型DNA。确定用于特定用途的合适载体很好地落入技术人员的能力范围之内。
可用多种哺乳动物表达载体在哺乳动物细胞中表达上述IgG Fc。如上文所述,表达载体可以是在合适宿主中转录克隆的DNA和翻译其mRNA所需的DNA序列。这些载体可用于在多种宿主如细菌、蓝绿藻、植物细胞、昆虫细胞和动物细胞中表达真核DNA。特定设计的载体允许DNA在宿主间如细菌-酵母或细菌-动物细胞间的穿梭。恰当构建的表达载体应含有:用于在宿主细胞中自我复制的复制起点、选择标记、有限数目的有用限制性酶位点、高拷贝数的潜力和有活性的启动子。表达载体可包括但不限于克隆载体、修饰的克隆载体、特定设计的质粒或病毒。商业上可获得且合适的哺乳动物表达载体包括但不限于pcDNA3.neo(Invitrogen)、pcDNA3.1(Invitrogen)、pCI-neo(Promega)、pLITMUS28、pLITMUS29、pLITMUS38和pLITMUS39(New England Biolabs)、pcDNAI、pcDNAIamp(Invitrogen)、pcDNA3(Invitrogen)、pMClneo(Stratagene)、pXT1(Stratagene)、pSG5(Stratagene)、EBO-pSV2-neo(ATCC 37593)pBPV-1(8-2)(ATCC 37110)、pdBPV-MMTneo(342-12)(ATCC 37224)、pRSVgpt(ATCC 37199)、pRSVneo(ATCC 37198)、pSV2-dhfr(ATCC 37146)、pUCTag(ATCC37460)和IZD35(ATCC 37565)。
本发明范围还涉及含有上述核酸的宿主细胞。示例包括细菌细胞(例如,大肠杆菌细胞)、昆虫细胞(例如,使用杆状病毒表达载体)、酵母细胞或哺乳动物细胞。参见如Goeddel,(1990)Gene Expression Technology:Methods in Enzymology 185,AcademicPress,San Diego,Calif。为生产本发明的多肽,可在允许表达本发明的核酸编码的多肽的情况下于培养基中培养宿主细胞,并从培养的细胞或细胞培养基中纯化多肽。或者,可体外转录和翻译本发明的核酸,例如,使用T7启动子调控序列和T7聚合酶。
所有自然产生的IgG Fc、基因工程化的IgG Fc和化学合成的IgG Fc均可用于实施本文公开的发明。利用重组DNA技术获得的IgG Fc可具有与SEQ ID NO:2或3或其功能性对等物相同的氨基酸序列。术语“IgG Fc”还包括化学修饰的版本。化学修饰的IgG Fc示例包括经历构象变化、糖链的加入或缺失的IgG Fc,和结合化合物如聚乙二醇的IgG Fc。
可使用下述动物模型证明由此制备的多肽/蛋白/抗体的功能和功效。任何统计学上体内半衰期的显著增加、对FcγR受体(例如,FcγRIIA、FcγRIIIA或FcγRIIIB)、FcRn亲和力的增加和/或细胞毒性活性的增加,均表明该多肽/蛋白/抗体是治疗下述疾病的候选者。技术人员在不过度实验的情况下能配合和匹配多种研究工具。一旦通过标准方法或根据述于下列实施例中的测定法和方法进行了纯化和测试,则该多肽/蛋白/抗体可包含到用于治疗下述疾病的药物组合物中。
IV.组合物
本发明范围涉及含有合适载体和一个或多个上述药剂的组合物,如IgG Fc变体、相关蛋白或相关抗体。组合物可以是含有药学上可接受的载体的药物组合物或含有化妆品上可接受的载体的化妆品组合物。
可使用上述任意形式的组合物治疗本文所述的疾病。有效量指给予治疗的受试者治疗效果所需要的活性化合物/药剂的量。如本领域技术人员所理解的,有效剂量可取决于被治疗的疾病类型、施用途径、赋形剂使用和与其他治疗性处理共同使用的可能性而变化。
可肠胃外、经口、经鼻腔、经直肠、局部或经颊施用本发明的药物组合物。本文所用术语“肠胃外”指皮下、皮内、静脉内、肌肉内、关节内、动脉内、滑膜内、胸骨内、鞘内、病变内或颅内注射,及任何合适的输注技术。
无菌的可注射组合物可以是肠胃外给药可接受的无毒稀释剂或溶剂中的溶液或悬浮液。这些溶液包括但不限于1,3-丁二醇、甘露醇、水、林格氏溶液和等渗氯化钠溶液。此外,通常采用不挥发油作为溶剂或悬浮介质(例如,合成的甘油单酯或甘油二酯)。脂肪酸(如但不限于油酸及其甘油酯衍生物)与药学上可接受的天然油类(如但不限于橄榄油或蓖麻油及其聚氧乙烯化形式)一样用于制备注射物。这些油溶液或悬浮液还可含有长链醇稀释剂或分散剂,如但不限于羧甲基纤维素或类似的分散剂。其他常用的表面活性剂如但不限于TWEENS或SPANS或其他类似乳化剂或生物利用度增强剂(其常用于制备药学上可接受的固体、液体或其他剂型)也可用于制剂目的。
用于口服施用的组合物可为任何口服上可接受的剂型,包括胶囊、片剂、乳剂和水悬浮液、分散剂和溶液。就片剂来说,常用的载体包括但不限于乳糖和玉米淀粉。通常还添加如但不限于硬脂酸镁的润滑剂。对于胶囊形式的口服施用,有用的稀释剂包括但不限于乳糖和干玉米淀粉。当经口施用水悬浮液或乳剂时,与乳化剂或悬浮剂联合的活性成分可悬浮或溶解于油相中。如需要,可添加某些甜味剂、调味剂或着色剂。
可将根据所述本发明用于局部施用的药物组合物配制成溶液、软膏剂、乳剂、悬浮液、洗剂、粉末、糊剂、凝胶、喷雾剂、气雾剂或油剂。另外,局部制剂可为浸有活性成分的贴剂或敷料形式,其可任选地包含一种或多种赋形剂或稀释剂。在一些优选实施方案中,局部制剂包含能增加通过皮肤或其他受影响区域吸收或渗透活性成分的物质。局部组合物用于治疗皮肤中的炎性病症,包括但不限于湿疹、痤疮、红斑痤疮、银屑病、接触性皮炎和对毒葛的反应。
局部组合物含有安全和有效量的适用于皮肤施用的皮肤病学上可接受的载体。“化妆品上可接受的”或“皮肤病学上可接受的”组合物或成分指适于接触人类皮肤使用而无过度毒性、不相容、不稳定、过敏反应等的组合物或成分。载体能将活性剂和任选成分以合适浓度递送到皮肤。故载体可充当稀释剂、分散剂、溶剂等,以保证活性物质以合适的浓度施用并均匀分布到选择的目标上。载体可为固体、半固体或液体。载体可为洗剂、乳剂或凝胶形式,尤其是具有足够厚度或屈服点(yield point)以阻止活性物质沉淀的那些。载体可为惰性的或具有皮肤病学上的益处。它也应当与本文所述活性成分物理或化学相容,且不应过度损害稳定性、功效或其他与组合物相关的使用益处。局部组合物可为局部或经皮施用领域中已知形式的化妆品或皮肤产品,包括溶液、气雾剂、乳剂、凝胶、贴剂、软膏剂、洗剂或泡沫剂。
V.治疗方法
可将上述药剂施用给受试者用于预防性和治疗性治疗多种病症,如肿瘤病症、炎性病症和传染性疾病。例如,药剂可用于治疗病毒或细菌感染、代谢病症或自身免疫病症、癌症或其他细胞增殖病症。
A.肿瘤疾病
在一个方面,本发明涉及使用上述药剂体内治疗受试者,使得抑制癌性肿瘤的生长和/或转移。在一个实施方案中,本发明提供了抑制受试者中肿瘤细胞生长和/或限制其转移扩散的方法,包括将治疗有效量的上述药剂施用给受试者。
治疗的优选癌症的非限制性示例包括慢性或急性白血病,包括急性髓性白血病、慢性髓性白血病、急性淋巴细胞性白血病、慢性淋巴细胞性白血病、淋巴细胞性淋巴瘤,乳腺癌,卵巢癌,黑色素瘤(例如,转移性恶性黑色素瘤),肾癌(例如透明细胞癌),***癌(例如激素难治性***癌),结肠癌和肺癌(例如非小细胞性肺癌)。此外,本发明包括其生长可使用本发明的抗体抑制的难治性或复发性恶性肿瘤。可使用本发明的方法治疗的其他癌症的示例包括骨癌、胰腺癌、皮肤癌、头颈癌、皮肤或眼内恶性黑色素瘤、子宫癌、直肠癌、***癌、胃癌、睾丸癌、子宫癌、输卵管癌、子宫内膜癌、***、***癌、外阴癌、霍奇金病、非霍奇金淋巴瘤、食道癌、小肠癌、内分泌***癌、甲状腺癌、甲状旁腺癌、肾上腺癌、软组织肉瘤、尿道癌、***癌、儿童实体瘤(solid tumor of childhood)、膀胱癌、肾癌或输尿管癌、肾盂癌、中枢神经***(CNS)肿瘤、原发性CNS淋巴瘤、肿瘤血管生成、脊髓轴肿瘤、脑干胶质细胞瘤、垂体腺瘤、卡波西氏肉瘤、表皮癌、鳞状细胞癌、T细胞淋巴瘤、包括石棉诱导的那些环境诱导的癌症和所述癌症的组合。
上述治疗也可与标准癌症治疗组合。例如,它可与化疗程序有效组合。在这些情况下,减少施用的化疗剂的剂量是可能的(Mokyr,M.等人,(1998)Cancer Research 58:5301-5304)。
可将用于激活宿主免疫应答的其他抗体与本发明的试剂组合使用。它们包括激活DC功能和抗原呈递的靶向树突细胞表面的分子。例如,抗CD40抗体能有效替代辅助性T细胞活性(Ridge,J.等人(1998)Nature 393:474-478)且可与本发明的多特异性分子结合使用((Ito,N.等人(2000)Immunobiology201(5)527-40)。相似地,靶向T细胞共刺激分子如CTLA-4(例如,美国专利号5,811,097)、CD28(Haan,J.等人(2014)Immunology Letters162:103–112)、OX-40(Weinberg,A.等人(2000)Immunol 164:2160-2169)、4-1BB(Melero,I.等人(1997)Nature Medicine 3:682-685(1997))和ICOS(Hutloff,A.等人(1999)Nature397:262-266)的抗体或靶向于PD-1(美国专利号8008449)、PD-1L(美国专利号7943743和8168179)的抗体也能增加T细胞激活水平。在另一个示例中,本发明的多特异性分子可与抗肿瘤抗体,如美罗华(RITUXAN)(利妥昔单抗(rituximab))、赫赛汀(HERCEPTIN)(曲妥珠单抗(trastuzumab))、百克沙(BEXXAR)(托西莫单抗(tositumomab))、泽瓦林(ZEVALIN)(替伊莫单抗(ibritumomab))、坎帕斯(CAMPATH)(阿仑珠单抗(alemtuzumab))、LYMPHOCIDE(依帕珠单抗(epratuzumab))、安维汀(AVASTIN)(贝伐单抗(bevacizumab))和特罗凯(TARCEVA)(埃罗替尼(erlotinib))等结合使用。
B.炎性病症
所述发明提供了治疗受试者中炎性病症的方法。术语“炎性病症”指以异常的或不想要的炎症为特征的病症,如自身免疫疾病。自身免疫疾病是以非活化状态的免疫细胞的慢性激活为特征的病症。示例包括银屑病、炎性肠疾病(例如,克罗恩氏病和溃疡性结肠炎)、类风湿性关节炎、银屑病关节炎、多发性硬化、狼疮、I型糖尿病、原发性胆汁性肝硬化和移植。
可被本发明的方法治疗的炎性病症的其他示例包括哮喘、心肌梗塞、中风、炎症性皮肤病(例如皮炎、湿疹、特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、荨麻疹、坏死性血管炎、皮肤血管炎、超敏感性血管炎、嗜酸性肌炎、多发性肌炎、皮肌炎和嗜酸性筋膜炎)、急性呼吸窘迫综合征、暴发型肝炎、超敏感性肺部疾病(例如超敏感性肺炎、嗜酸性肺炎、迟发型过敏反应、间质性肺病(ILD)、特发性肺纤维化和与类风湿性关节炎相关的ILD)和过敏性鼻炎。其他示例还包括重症肌无力、青少年型糖尿病、肾小球肾炎、自身免疫型甲状腺炎、强直性脊柱炎、***性硬化病、急性和慢性炎性疾病(例如***性敏感(anaphylaxia)或超敏反应、药物过敏、昆虫刺痛过敏、同种异体移植物排斥和移植物抗宿主病)和干燥综合征。
可利用针对病症的标准诊断技术鉴别炎性病症的治疗对象。任选地,可使用本领域已知方法检测获自受试者的检测样品中一种或多种细胞因子或细胞的水平或百分比。如果水平或百分比等于或低于阈值(其可获自正常受试者),则该受试者为本文所述治疗的候选者。为证实抑制或治疗,可评价和/或验证治疗后受试者中一种或多种上述细胞因子或细胞的水平或百分比。
C.传染性疾病
本发明还涉及使用上述靶向于病原体上或病原体中的抗原的药剂治疗传染性疾病。本文中传染性疾病的示例包括由病原体如病毒、细菌、真菌、原生动物和寄生虫导致的疾病。传染性疾病可由病毒导致,所述病毒包括腺病毒、巨细胞病毒、登革热病毒、艾巴氏病毒、汉坦病毒、甲肝病毒、乙肝病毒、丙肝病毒、单纯疱疹病毒I型、单纯疱疹病毒II型、人免疫缺陷病毒(HIV)、人***瘤病毒(HPV)、流感病毒、麻疹病毒、流行性腮腺炎病毒、乳多泡病毒(papova virus)、脊髓灰质炎病毒、呼吸道合胞病毒、牛瘟病毒(rinderpest)、鼻病毒、轮状病毒、风疹病毒、SARS病毒、天花病毒、病毒性脑膜炎病毒等。传染性疾病还可由细菌导致,所述细菌包括炭疽芽孢杆菌(Bacillus antracis)、伯氏疏螺旋体、空肠弯曲菌、沙眼衣原体、肉毒杆菌、破伤风杆菌、白喉菌、大肠杆菌、军团菌、幽门螺杆菌、分枝杆菌立克次氏体、支原体奈瑟氏菌、百日咳菌、绿脓杆菌、肺炎链球菌、链球菌、葡萄球菌、霍乱弧菌、鼠疫杆菌等。传染性疾病还可由真菌导致,所述真菌如烟曲霉菌、皮炎芽生菌、白色念珠菌、粗球孢子菌、新型隐球菌、荚膜组织胞浆菌、马尔尼菲青霉菌等。传染性疾病还可由原生动物和寄生虫导致,如衣原体、可可地亚虫、利什曼原虫、疟原虫、立克次氏体、锥虫等。
可以单独或与其它药物或疗法结合在体内或离体实施治疗方法。治疗有效量可在一个或多个施用、应用或剂量中给予且不限于特定配方或施用途径。
可以单独或与其它药物或疗法结合共同施用(即鸡尾酒疗法)在体内或离体施用药剂。如本文所用,术语“共同施用”或“共同施用的”指施用至少两种药剂或疗法给受试者。在一些实施方案中,两种或更多种药剂/疗法的共同施用是同时的。在其他实施方案中,第一种药剂/疗法施用于第二种药剂/疗法之前。本领域技术人员理解,所用多种药剂/疗法的配方和/或施用途径可以变化。
在体内方法中,化合物或药剂被施用给受试者。通常,化合物或药剂悬浮于药学上可接受的载体(例如但不限于生理盐水)中,并以口服或静脉内输注,或皮下、肌内、鞘内、腹膜内、直肠内、***内、鼻内、胃内、气管内、肺内注射或植入的形式施用。
所需剂量取决于所选施用途径,配方性质,患者疾病性质,受试者尺寸、重量、表面积、年龄和性别,施用的其他药物,和主治医师的判断。合适剂量在0.01-100mg/kg的范围内。鉴于可获得的化合物/药剂的多样性和各种施用途径的不同效率,所需剂量的变化在预料之中。例如,口服施用预期需要比i.v.注射施用更高的剂量。可使用本领域内众所周知的用于优化的标准经验惯例对这些剂量水平的变化作出调整。将化合物封装在合适的递送媒介物(例如,聚合微粒或植入装置)中可提高递送效率,尤其是口服递送效率。
VI.实施例
实施例1
本实施例描述了用于下列实施例2至3中的材料和方法
材料与方法
小鼠品系
所有小鼠体内实验按照联邦法律和机构指南实施,且已被洛克菲勒大学(Rockefeller University)机构动物保护和使用委员会(Institutional Animal Careand Use Committee)批准。小鼠的繁殖和维持在洛克菲勒大学比较生物科学中心(Comparative Bioscience Center)进行。将下列品系用于实验:(i)FcγR缺陷小鼠(FcγR),早先开发和特征化于Smith,P.等人,Pro Natl Acad Sci U S A 109,6181-6186(2012)中;(ii)FcγR人源化小鼠(mFcγRα,Fcgr1-/-,hFCGR1A+,hFCGR2A+,hFCGR2B+,hFCGR3A+,hFCGR3B+),生成和广泛特征化于Smith,P.等人,Pro Natl Acad Sci U S A 109,6181-6186(2012)中;(iii)FcγR/FcRn人源化小鼠(m FcγRα,Fcgr1-/-,Fcgrt-/-,hFCGR1A+,hFCGR2A+,hFCGR2B+,hFCGR3A+,hFCGR3B+,hFCGRT+),通过杂交FcγR人源化小鼠和FcRn人源化小鼠(开发于Petkova,S.B.等人,Int Immunol18,1759-1769中)生成;(iv)FcγR/CD20人源化小鼠(m FcγRα,Fcgr1-/-,hFCGR1A+,hFCGR2A+,hFCGR2B+,hFCGR3A+,hFCGR3B+,hCD20+)。
表面等离子体共振(SPR)分析
使用先前描述的方案(Wang,T.T.等人,Science 355,395-398(2017)和Li,T.等人,Proc Natl Acad Sci U S A 114,3485-3490,(2017)),利用表面等离子体共振(SPR)确定人IgG1 Fc结构域变体的FcγR和FcRn的结合亲和力。所有实验在Biacore T200 SPR***(GE Healthcare)于25℃下在HBS-EP+缓冲液(FcγR为pH7.4,FcRn为pH6.0)中实施。将重组蛋白G(Thermo Fisher)使用氨基偶联化学性以500共振单位(RU)的密度固定于CM5传感器芯片(GE Healthcare)表面。在蛋白G-偶联表面捕获人IgG1Fc变体(以20μl/min注射250nM60秒),并以20μl/min的流速注射重组人、猕猴或小鼠FcγR胞外域(7.8125-2000nM;SinoBiological)或人FcRn/β2微球蛋白(1.95-500nM;Sino Biological)过流动池。结合时间(association time)为60秒,后接600秒的解离步骤(dissociation step)。在每个循环最后,用10mM甘氨酸、pH 2.0(50μl/min;40秒)再生传感器表面。减去结合空白固定流动池的背景,并使用BIAcore T200评价软件(GE Healthcare)和1:1Langmuir结合模型计算亲和常数。
体内细胞毒性模型
使用早先描述过的方案(Smith,P.等人,Pro Natl Acad Sci U S A 109,6181-6186(2012)和Wang,T.T.等人Science 355,395-398(2017)),在FcγR人源化小鼠和FcγR/FcRn人源化小鼠中实施血小板、CD4+T细胞和hCD20+B细胞清除实验。猕猴B细胞清除实验涉及将0.05mg/kg的野生型人IgG1或抗CD20mAb 2B8的GAALIE(G236A/A330L/I332E)变体施用(i.v.)给猕猴。利用流式细胞术分析抗体施用前和后多个时间点血液中CD20+的频率和细胞数。
抗体表达、纯化和分析
如先前Bournazo,S.等人,Cell 158,1243-1253(2014)中所述,利用瞬时转染HEK293T或Expi293细胞生成抗体。使用蛋白GSepharose 4Fast Flow或MabSelect SuRe LX亲和纯化介质(GE Healthcare)纯化抗体。将纯化的蛋白在PBS中透析并无菌过滤(0.22μm)。利用SDS-PAGE和考马斯染色评估纯度,且纯度估计为>90%。依照制造厂说明书用Protein Thermal Shift Dye Kit(ThermoFisher)在QuantStudio 6K Flex实时热循环仪上测定蛋白Tm值。
血清IgG水平的定量
使用中性抗生物素蛋白(neutravidin)包被的平板(5μg/ml;过夜)定量人IgG1变体的血清浓度。用用于小鼠血清样品的生物素化山羊抗人IgG(小鼠IgG被吸附,JacksonImmunoresearch),或用于猕猴血浆样品的CaptureSelectTM人IgG-Fc PK生物素共轭物孵育平板。在孵育(室温下60分钟)后,将平板用PBS+2%(w/v)BSA+0.05%(v/v)Tween20封闭2小时。将连续稀释的(从1:10稀释开始做1:3稀释)的血清样品孵育一小时。使用山羊抗人IgG检测IgG结合(Fcγ特异性,1h;1:5000;Jackson Immunoresearch)。使用TMB(3,3’,5,5’-四甲基联苯胺)双组分过氧化酶底物试剂盒(KPL)显色平板,且通过加入1M磷酸终止反应。立即使用SpectraMax Plus分光光度计(Molecular Devices)记录450nm的吸光度,并减去阴性对照样品的背景吸光度。
实施例2
开发Fc结构域变体(称作GASDALIE),其包含在人IgG1氨基酸骨干上的特异性突变(G236A/S239D/A330L/I332E)。它表现与人活化型FcγR、FcγRIIa和FcγRIIIa的选择性增强结合(Smith,P.,DiLillo,D.J.,Bournazos,S.,Li,F.&Ravetch,J.V.Mouse modelrecapitulating human Fcgamma receptor structural and functionaldiversity.Proc Natl Acad Sci U S A 109,6181-6186(2012))。在多种抗细菌和病毒感染的抗体介导保护模型中,证实了保护性mAb的GASDALIE Fc结构域变体的保护活性相比于野生型人IgG1显著增强。参见Smith,P.等人,Pro Natl Acad Sci U S A 109,6181-6186(2012);Bournazos,S.等人,Cell 158,1243-1253(2014);Bournazos,S.等人,J ClinInvest 124,725-729(2014);和DiLillo,D.J.等人,Nat Med 20,143-151(2014)。
更重要的是,CD20+淋巴瘤小鼠模型中抗CD20 mAb的GASDALIE变体治疗活性的评价表明,此变体不仅显示改善的抗CD20+淋巴瘤细胞细胞毒性活性,还激发诱导长期T-细胞记忆应答,其给予针对随后的淋巴瘤攻毒的保护(DiLillo,D.J.等人,Cell 161,1035-1045(2015))。机理(mechanistic)研究表明,通过FcγRIIIa在效应白细胞(如单核白细胞和巨噬细胞)中增加的参与介导初级淋巴瘤攻毒过程中增加的细胞毒性,而FcγRIIa在树突细胞上的交联促进树突细胞的成熟并促进诱导T细胞记忆应答,其介导经由次级攻毒的保护(DiLillo,D.J.等人,Cell 161,1035-1045(2015))。综上,这些研究证实了GASDALIE Fc结构域变体的治疗活性,其通过与人FcγRIIa和FcγRIIIa的选择性加强的结合而实现。
尽管拥有改进的Fc效应子功能,DASDALIE变体主要在FcγR人源化小鼠中显示显著更短的体内半衰期,且该半衰期在缺失全部种类FcγR的小鼠品系中缩短至更小的程度(图1)。此效果可归因于其对FcγR亲和力的增加和其降低的体内蛋白质稳定性。即使和增加FcRn亲和力并延长半衰期的Fc结构域突变(例如LS:M428L/N434S)组合时,GASDALIE Fc结构域变体在非人灵长目动物中仍显示非常短的体内半衰期(图2)。
发明人开发出Fc结构域变体(称为GAALIE),其表现出GASDALIE的所有特征,包括在多种mAb介导的细胞毒性模型中增加的FcγRIIa和FcγRIIIa亲和力和增强的细胞毒性活性,但出乎意料的是,其仍保有生理学半衰期。在下文所示研究中,发明人引入了Fc结构域变体(无岩藻糖化和S239D/I332E变体),其已在人类中被评估且显示在不显著损害其体内稳定性和半衰期的情况下的增加的FcγR结合亲和力。Goede,V.等人,N Engl J Med370,1101-1110(2014);Zalevsky,J.等人,Blood 113,3735-3743(2009);和Woyach,J.A.等人,Blood 124,3553-3560(2014)。
对GAALIE变体(G236A/A330L/I332E)与全类别的人、猕猴和小鼠FcγR的亲和力(图3-8)和其在FcγR人源化小鼠的血小板、CD4+T细胞和B细胞清除模型中的细胞毒性效应子活性(图9-12)进行特征化。对FcγR人源化和FcγR缺陷小鼠及猕猴中GAALIE变体半衰期的评估显示,该变体表现出生理学半衰期(图13-14)。此外,在非人灵长目动物(猕猴)中评估了mAb介导的CD20+B细胞清除模型中GAALIE变体的体内细胞毒性(图15)。
实施例3
为进一步延长GAALIE变体的体内半衰期,将其与增加FcRn亲和力而不影响FcγR结合的突变组合(Zalevsky,J.等人,Nat Biotechnol 28,157-159(2010)和Grevys,A.等人,J Immunol 194,5497-5508(2015))。这些突变包括M428L和N434S(LS变体,Zalevsky,J.等人,Nat Biotechnol 28,157-159(2010)),且生成的Fc结构域变体的氨基酸序列展示在图16中。确定蛋白质熔化温度和FcγR/FcR-增强变体对FcRn的结合亲和力(图17-20)。此外,评价FcRn/FcγR人源化小鼠中这些变体的体内半衰期(图21)。如预期的,GAALIE LS(G236A/A330L/I332E/M428L/N434S)显示延长的半衰期,其也转化为在FcγR/FcRn人源化小鼠的mAb介导的血小板清除模型中延长和增强的Fc效应子活性(图22)。
实施例4
为重现设计用于临床使用的抗体与含人FcR的人Fc间的相互作用,将B16-FUT3细胞接种到FcγR人源化小鼠,该品系缺失所有鼠FcR而携带所有人FcγR的转基因(Smith,P.等人,Pro Natl Acad Sci U S A 109,6181-6186(2012)),重现在全免疫活性鼠背景下人FcR的细胞表达模式。用sLeA靶向抗体(克隆5B1和7E3,表达hIgG1亚型)处理B16荷瘤小鼠。5B1和7E3克隆均显示相当的治疗功效(图23A),导致肺部转移灶数目的显著减少。如用嵌合的人-鼠抗体(数据未显示)时观察到的,用废除其结合人FcR能力的Fc突变(N297A)工程化5B1-hIgG1导致sLeA靶向抗体治疗效果的丧失(数据未显示)。
鉴于上述活化型FcR在介导抗体诱导的肿瘤清除中的作用,寻求通过增加sLeA靶向抗体对活化型FcR的亲和力来增加sLeA靶向抗体的治疗潜力。在此情况下,通过引入三个点突变(G236A/A330L/I332E)(“GAALIE”)再工程化sLeA靶向抗体。GAALIE点突变显著增强sLeA靶向抗体对两种活化型人FcR(hFcγRIIA和hFcγRIIIA)的亲和力,同时减弱对抑制型受体hFcRIIB的结合而不影响期对sLeA的结合亲和力。相比于具有野生型hIgG1Fc部分的亲本抗体,再工程化的5B1和7E3抗体变体显示优秀的抗肿瘤活性(图24B)。这些发现强化了活化型FcR的参与是有效的抗体介导的肿瘤清除过程中的关键步骤的发现。
实施例5
在多种肿瘤模型中,仅hFcγRIIIA参与是抗体介导的肿瘤清除必要且充分的,而活化型受体hFcγRIIA的参与对介导肿瘤清除是不充分的。本研究旨在确定这些发现对于靶向于碳水化合物的抗体也是否适用。比较三种具有针对hFcγRIIA(GA)、hFcγRIIIA(ALIE)或两者(GAALIE)的增强的亲和力的Fc变体在FcγR-人源化荷瘤小鼠中的抗肿瘤活性(图24A)。报告了GA和ALIE hIgG1 Fc变体针对不同人FcR的亲和力9,34,35;GAALIE Fc变体显示针对hFcRIIA和hFcRIIIA的更高的亲和力,和针对hFcRIIB的降低的亲和力,和与hIgG1相当的体内半衰期,同时显示相比于亲本hIgG1的优秀的ADCC能力(数据未显示)。
所有三种Fc变体均显示出相当的抗肿瘤潜力,其显著高于野生型亲本人IgG1抗体的抗肿瘤潜力(图24B)。为证实这些发现,比较了Fc变体5B1-hIgG1-GAALIE(具有针对两种活化型FcR的增强的亲和力)在多种表达人FcR的转基因小鼠品系中的抗肿瘤活性。图24C表明,5B1-hIgG1-GAALIE变体不仅在FcγR人源化小鼠(其表达所有的人FcγR,包括hFcγRIIA、hFcγRIIB和hFcγRIIIA)中,也在仅hFcγRIIA和仅hFcγRIIIA小鼠中表现出显著而相当的抗肿瘤活性。如预期的,FcR-空小鼠中未观察到肿瘤清除。NK清除未实质上阻碍该sLeA靶向抗体的抗肿瘤活性(数据未显示),表明肿瘤细胞清除主要通过表达hFcγRIIIA和hFcγRIIA的效应子细胞,如巨噬细胞来介导。
前述实施例和优选实施方案的描述仅用于说明,而非限制权利要求所定义的本发明。容易理解的是,可在不脱离权利要求中对本发明的界定的情况下,使用上述特征的众多变化和组合。这些变化不视为脱离本发明的范围,且所有这些变化都旨在包括在下列权利要求的范围内。本文引用的所有参考文献在此通过引用整体并入本文。
序列表
<110> 洛克菲勒大学(The Rockefeller Universtiy)
杰夫瑞·V·华弗治(Ravetch, Jeffrey V.)
S·布尔纳佐斯(Bournazos, Stylianos)
<120> 具有改进的效应子功能的人IgG Fc结构域变体
<130> 070413.20320
<150> 62607591
<151> 2017-12-19
<160> 4
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 330
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 1
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330
<210> 2
<211> 330
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 2
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
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195 200 205
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275 280 285
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Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330
<210> 3
<211> 330
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 3
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1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
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35 40 45
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Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330
<210> 4
<211> 330
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 4
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
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Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330

Claims (20)

1.一种包含人IgG1 Fc多肽的Fc变体的多肽,其中Fc变体(i)包含位点236的丙氨酸(A)、位点330的亮氨酸(L)和位点332的谷氨酸(E),且(ii)不包含位点239的天冬氨酸(D),且其中根据Kabat中的EU索引进行编号。
2.如权利要求1所述的多肽,其中所述Fc变体进一步包含位点428的亮氨酸(L)和位点434的丝氨酸(S)。
3.如权利要求1或2所述的多肽,其中所述Fc变体包含位点239的丝氨酸(S)。
4.如权利要求1至3任一项所述的多肽,其中所述Fc变体包含SEQ ID NO:2或3的序列。
5.一种抗体,其包含权利要求1至4任一项所述的多肽。
6.如权利要求5所述的抗体,其中所述抗体具有针对靶分子的特异性。
7.如权利要求6所述的抗体,其中所述靶分子选自由细胞因子、可溶性因子、在病原体上表达的分子、在细胞上表达的分子和在癌细胞上表达的分子组成的组。
8.如权利要求1至7任一项所述的抗体,其中所述抗体选自由嵌合抗体、人源化抗体和人抗体组成的组。
9.如权利要求1至8任一项所述的抗体,其中所述抗体具有以下一个或多个特征:(1)相较于具有SEQ ID NO:1序列的抗体,针对hFcγRIIA、hFcγRIIIA、hFcRn或/和hFcγRIIIB的更高的结合亲和力,(2)相较于具有SEQ ID NO:4序列的抗体,更长的血清半衰期,和(3)相较于具有SEQ ID NO:1序列的抗体,相同或更好的半衰期。
10.一种核酸,其包含编码权利要求1至9任一项所述的多肽或抗体的序列。
11.一种表达载体,其包含权利要求10所述的核酸。
12.一种宿主细胞,其包含权利要求10所述的核酸。
13.一种生产多肽或抗体的方法,其包括在允许核酸编码的多肽或抗体表达的条件下于培养基中培养权利要求12所述的宿主细胞,并从培养的细胞或细胞培养基纯化多肽或抗体。
14.一种药物配方产品,其包含(i)权利要求1至9任一项所述的多肽或抗体或权利要求10所述的核酸,和(ii)药学上可接受的载体。
15.一种治疗炎性病症的方法,其包括将治疗有效量的权利要求1至9任一项所述的多肽或抗体或权利要求10所述的核酸施用给有需要的受试者。
16.一种***病症的方法,其包括将治疗有效量的权利要求1至9任一项所述的多肽或抗体或权利要求10所述的核酸施用给有需要的受试者。
17.一种治疗传染性疾病的方法,其包括将治疗有效量的权利要求1至9任一项所述的多肽或抗体或权利要求10所述的核酸施用给有需要的受试者。
18.一种权利要求1至9任一项所述的多肽或抗体或权利要求10所述的核酸在制备用于治疗炎性病症的药物中的用途。
19.一种权利要求1至9任一项所述的多肽或抗体或权利要求10所述的核酸在制备用于***病症的药物中的用途。
20.一种权利要求1至9任一项所述的多肽或抗体或权利要求10所述的核酸在制备用于治疗传染性疾病的药物中的用途。
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