CN111368872A - 基于融合特征和验证模型的乳腺癌有丝***细胞检测方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种基于融合特征和验证模型的乳腺癌有丝***细胞检测方法。该方法首先对经过染色均衡后的乳腺癌病理图像提取融合特征,然后构建基于融合特征的有丝***细胞预选模型,最后构建验证模型进行判别,以实现病理图像有丝***细胞的有效检测。本发明提出的融合特征提取方法在有丝***细胞定位准确度上有明显提升,本发明对于乳腺癌病理图像的有丝***细胞的检出率较高,且误判率较低,对于难分辨的有丝***细胞具有较高的区分能力,适用于乳腺癌病理图像中有丝***细胞的检测。
Description
技术领域
本发明属于病理图像的智能识别领域,尤其涉及一种基于融合特征和验证模型的乳腺癌有丝***细胞检测方法。
背景技术
有丝***细胞数是用于判断浸润性乳腺癌恶化程度的重要指标,传统检测方法是病理学家通过人工观察病理图像以检出有丝***细胞。但受限于病理学家的专业知识水平,不同病理学家诊断结果的一致性较差;同时由于病理图像维数大、数量多的特点,导致人工诊断需要耗费大量时间,导致人工劳累增加出错率。
目前基于传统机器学习的有丝***检测方法主要是根据人工设计形态学特征并结合支持向量机(Support Vector Machine)等分类算法判别是否为有丝***细胞。这些方法在特定场景下有较好的应用,但是在不同数据集下的泛化能力较差且需要具备大量的医学理论知识储备。而目前一些基于深度学习的有丝***检测方法在小目标检测上的定位精度较差,并且具有较高的误检率。
发明内容
为了克服现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种基于融合特征和验证模型的乳腺癌有丝***细胞检测方法。
一种基于融合特征和验证模型的乳腺癌有丝***细胞检测方法,包括以下步骤:
S1获取多个乳腺癌病理图像并进行染色均衡得到预处理后乳腺癌病理图像,作为训练集;
S2对训练集中的预处理后乳腺癌病理图像提取融合特征,包括以下步骤:
S2.1使用卷积神经网络提取乳腺癌病理图像的特征;
S2.2计算图像不同卷积层的特征,将不同卷积层的特征融合后作为图像的特征;
S3 对步骤S2.2得到图像的特征构建候选有丝***检测模型,得到候选的有丝***细胞;
S4 对步骤S3得到的候选的有丝***细胞构建验证模型,确定分类阈值;
S5 对待测病理图像进行有丝***检测,包括以下步骤:
S5.1使用步骤S2的方法提取待测病理图像的融合特征;
S5.2将融合特征输入步骤S3的候选有丝***检测模型中,得到候选的有丝***细胞;
S5.3将候选的有丝***细胞输入步骤S4的验证模型中,根据S4中确定的分类阈值将非有丝***细胞剔除,得到有丝***细胞。
所述的S2中对训练集中的预处理后乳腺癌病理图像提取融合特征通过下式计算:
F=(F 6 ,F 5 ,F 4 ,F 3 ,F 2 )
F i-1 =up(F i )+conv
其中F i 表示i阶段的特征,up(F i )表示对F i 进行2倍上采样,conv表示1 x 1卷积。
所述步骤S3中候选有丝***检测模型的构建步骤如下:
(a)首先将融合特征输入到区域检测网络中,筛选出可能是候选的有丝***细胞的区域;
(b)将所述的区域映射到融合特征中,再使用全连接层进行判别;
(c)将所有的训练集中的预处理后乳腺癌病理图像按照(a)、(b)步骤处理,不断微调模型的参数。
所述步骤S4中构建验证模型的步骤如下:
(a)将步骤S3中得到的候选的有丝***细胞按照标注信息标注为有丝***和非有丝***;
(b)构建验证模型学习,通过最小化分类误差更新模型的参数,如下式:
其中f θ 是特征提取器,g w 是分类器,y n 是图像的标签。
本发明的有益效果是:本发明提出的基于融合特征和验证模型的方法对于乳腺癌病理图像的有丝***细胞的检出率较高,且误判率较低。本发明的方法对于难分辨的有丝***细胞具有较高的区分能力,适用于乳腺癌病理图像中有丝***细胞的检测。
附图说明
图1为基于融合特征和验证模型的乳腺癌有丝***细胞检测方法的流程图。
具体实施方式
以下结合附图和实施例,对本发明进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。
一种基于融合特征和验证模型的乳腺癌有丝***细胞检测方法的基本步骤如图1所示,首先对病理图像提取融合特征,然后使用训练图像的融合特征构建候选有丝***检测模型,接着利用检测模型在训练图像中得到候选区域并构建验证模型学习有丝***细胞和非有丝***细胞的区别,最后将新的病理图像经特征融合、候选物检测和验证模型后检测出真正的有丝***细胞,具体包括以下步骤:
S1对获取的多个乳腺癌病理图像进行染色均衡处理以消除切片制备过程带来的不一致现象,并将预处理后的乳腺癌病理图像作为训练集;
S2对训练集中的预处理后乳腺癌病理图像提取融合特征,包括以下步骤:
S2.1使用卷积神经网络提取乳腺癌病理图像的特征;
S2.2计算图像不同卷积层的特征,将不同卷积层的特征融合后作为图像的特征;
S3 对步骤S2.2得到图像的特征构建候选有丝***检测模型,得到候选的有丝***细胞;
S4 对步骤S3得到的候选的有丝***细胞构建验证模型,确定分类阈值;
S5 对待测病理图像进行有丝***检测,包括以下步骤:
S5.1使用步骤S2的方法提取待测病理图像的融合特征;
S5.2将融合特征输入步骤S3的候选有丝***检测模型中,得到候选的有丝***细胞;
S5.3将候选的有丝***细胞输入步骤S4的验证模型中,根据S4中确定的分类阈值将非有丝***细胞剔除,得到有丝***细胞。
S2中对训练集中的预处理后乳腺癌病理图像提取融合特征通过下式计算:
F=(F 6 ,F 5 ,F 4 ,F 3 ,F 2 )
F i-1 =up(F i )+conv
其中F i 表示i阶段的特征,up(F i )表示对F i 进行2倍上采样,conv表示1 x 1卷积。
S4中有丝***细胞验证模型通过最小化下式更新模型参数:
其中f θ 是特征提取器,g w 是分类器,y n 是图像的标签。
本领域普通技术人员可以理解,以上所述仅为发明的优选实例而已,并不用于限制发明,尽管参照前述实例对发明进行了详细的说明,对于本领域的技术人员来说,其依然可以对前述实例记载的技术方案进行修改,或者对其中部分技术特征进行等同替换。凡在发明的精神和原则之内,所做的修改、等同替换等均应包含在发明的保护范围之内。
Claims (4)
1.一种基于融合特征和验证模型的乳腺癌有丝***细胞检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1获取多个乳腺癌病理图像并进行染色均衡得到预处理后乳腺癌病理图像,作为训练集;
S2对训练集中的预处理后乳腺癌病理图像提取融合特征,包括以下步骤:
S2.1使用卷积神经网络提取乳腺癌病理图像的特征;
S2.2计算图像不同卷积层的特征,将不同卷积层的特征融合后作为图像的特征;
S3 对步骤S2.2得到图像的特征构建候选有丝***检测模型,得到候选的有丝***细胞;
S4 对步骤S3得到的候选的有丝***细胞构建验证模型,确定分类阈值;
S5 对待测病理图像进行有丝***检测,包括以下步骤:
S5.1使用步骤S2的方法提取待测病理图像的融合特征;
S5.2将融合特征输入步骤S3的候选有丝***检测模型中,得到候选的有丝***细胞;
S5.3将候选的有丝***细胞输入步骤S4的验证模型中,根据S4中确定的分类阈值将非有丝***细胞剔除,得到有丝***细胞。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的S2中对训练集中的预处理后乳腺癌病理图像提取融合特征通过下式计算:
F=(F 6 ,F 5 ,F 4 ,F 3 ,F 2 )
F i-1 =up(F i )+conv
其中F i 表示i阶段的特征,up(F i )表示对F i 进行2倍上采样,conv表示1 x 1卷积。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤S3中候选有丝***检测模型的构建步骤如下:
(a)首先将融合特征输入到区域检测网络中,筛选出可能是候选的有丝***细胞的区域;
(b)将所述的区域映射到融合特征中,再使用全连接层进行判别;
(c)将所有的训练集中的预处理后乳腺癌病理图像按照(a)、(b)步骤处理,不断微调模型的参数。
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