CN111172141A - 一种几丁质脱乙酰基酶 - Google Patents

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马钦元
申雁冰
屠琳娜
毕心宇
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Abstract

本发明属于蛋白酶技术领域,具体涉及一中几丁质脱乙酰基酶。所述几丁质脱乙酰基酶RCDA来源于Rhodococcus equi,具有序列表SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列,是目前首次报道的一种新型的蛋白序列,与已报道的几丁质脱乙酰基酶蛋白序列相似度较低,且具有底物谱较宽;受金属离子影响小等特性。

Description

一种几丁质脱乙酰基酶
技术领域:
本发明属于蛋白酶技术领域,具体涉及一中几丁质脱乙酰基酶。
背景技术:
甲壳素又名几丁质,学名为(1,4)-2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-葡聚糖,是自然界生物所含有的一种含量仅次于纤维素的氨基多糖,主要存在于无脊椎动物,如虾、昆虫、海藻、真菌及酵母中。但是甲壳素不溶于水、酸、碱和有机溶剂,所以其没有太大的商业价值,而其脱去乙酰基后的产物壳聚糖则广泛应用于医药、食品、化工、化妆品等行业。目前生产壳聚糖主要使用的化学法存在诸多问题,例如,反应时间长、能耗大、产品质量不稳定,特别是排放物会造成巨大的环境污染。
几丁质脱乙酰酶(Chitin deacetylase,CDA)可以水解脱掉几丁质上的乙酰基,生产脱乙酰度稳定、分子质量分布范围窄的高品质壳聚糖产品,且反应条件温和,为解决壳聚糖生产中的环境污染问题提供了一条新的途径。目前报道的CDA的生产菌株大部分都是真菌,而且来源于真菌的这些CDA大多都是糖蛋白,必须经过糖基化修饰才有活性;目前报道的细菌来源的CDA较少,而且大部分都是几丁寡糖脱乙酰酶,可作用的底物谱较窄,且存在所产酶活力低、提纯后的酶活力下降、基因工程菌酶活提升不明显等问题,目前仍未实现产业化。因此,筛选性能优良且细菌来源的新型CDA是解决CDA工业化应用的重要课题之一,具有重要的实用价值和学术研究价值。
发明内容:
针对现有技术的不足,本发明旨在提供一中几丁质脱乙酰基酶及其应用,所述几丁质脱乙酰基酶RCDA来源于Rhodococcus equi,是目前首次报道的一种新型的蛋白序列,与已报道的几丁质脱乙酰基酶蛋白序列相似度较低(图1)。
所述几丁质脱乙酰基酶RCDA具有序列表SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列;
本发明还保护编码SEQ ID NO.1所示RCDA的基因;
本发明还提供所述几丁质脱乙酰基酶RCDA在水解几丁质中的应用。
本发明提供的几丁质脱乙酰基酶RCDA具有以下酶学性质:
(1)RCDA的最佳反应温度为45℃,可耐受温度为小于55℃;
(2)RCDA的最佳反应pH为7.0,酶活温度的pH范围为5.0-9.0;
(3)离子浓度在1mM以下时,金属离子对其酶活性影响不大,而当离子浓度在1mM以上时,Zn2+、Cu2+、Ni2+对CDA活性有较强的抑制作用;
(4)RCDA的底物谱较宽,对低分子量几丁寡糖、胶体几丁质、乙二醇几丁质以及具有一定脱乙酰度的壳聚糖都具有脱乙酰活性,对带乙酰基的多种氨基酸也表现出了脱乙酰活性。
有益效果:
与已经报道的细菌CDA相比,RCDA的底物谱更宽,能够作用于大分子的底物,对脱乙酰度85%的壳聚糖的脱乙酰相对活性达到132.94%,对胶体几丁质的相对活性达到111.2%,对乙二醇几丁质的相对活性为89.12%。此外,RCDA对带乙酰基的氨基酸底物也表现出较高的活性,包括N-乙酰-DL-蛋氨酸、N-乙酰-DL-色氨酸、N-乙酰-L-半胱氨酸、N-乙酰-L-亮氨酸,这些都是首次被报道。
附图说明:
图1***进化分析;
图2酶学特性分析
其中,a为最适温度曲线;b为最适pH曲线;c为温度稳定性曲线;d为pH稳定性曲线;e为金属离子耐受性。
具体实施方式:
为了使本专利的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合具体实施例,对本专利进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本专利,并不用于限定本发明。
本发明所述的RCDA其氨基酸序列如下(SEQ ID NO.1):
MSKKIYVNFGVDVDAVAGWLGSYGGEDSPGDISRGMFAGEVGVPRLVKMFDKYDITTSWFVPGHSIETFPREIEQVVAAGHEIGIHGYSHENPIAMTRQQETDILDRSIELIESFTGSKPTGYTAPWWEFSKVTNELLIERGVKYDHSLMHNDFTPYYVRVGDSWSKIDYSQPAETWMKPLVRGQETDLVEIPANWLLDDLPPQMFIKSSPNSHGFVSPRHLEEMWRDQFDWVYREMDYAIFPVTIHPDVSGRPQSLLMLERLIEYINQHDGVEWVTFDHMVNDFKERFPRQS
实施例1底物谱
研究了RCDA的作用底物谱,选择大分子的几丁质粉、胶体几丁质、乙二醇几丁质、脱乙酰度为85%的壳聚糖以及小分子量的几丁寡糖和带乙酰基的几种氨基酸作为底物,在过量的底物溶液中加入5mL RCDA粗酶液,在搅拌下,让混合物在37℃和pH 4.0下反应,搅拌12小时。然后将样品煮沸5分钟,采用高效液相色谱法对脱乙酰生成的乙酸含量表征其不同底物的脱乙酰能力,将对4-硝基乙酰苯胺的底物活性(157.6U/mL)设定为100%。结果如表1所示,RCDA对大多数被测底物都有活性,包括低分子量几丁寡糖、胶体几丁质、乙二醇几丁质以及具有一定脱乙酰度的壳聚糖;此外RCDA对带乙酰基的多种氨基酸也表现出了脱乙酰活性。
与其它已经报道的细菌几丁质脱乙酰酶相比,RCDA对大分子底物表现出了更高的活性,同时也表现出了更广的底物谱。
表1.RCDA对不同底物的相对酶活性
Figure BDA0002373705840000031
实施例2酶学特性
(1)为了确定酶的最佳反应温度,将酶在不同温度(30-60℃),pH7.0条件下反应60min,检测酶活性;
(2)为了研究酶的温度稳定性,将酶在不同温度(25-60℃)下预孵育30min,pH7.0,37度反应60分钟检测酶的剩余酶活力;
(3)为了确定最佳pH值,测定了酶在37℃,不同pH条件下,反应60min的酶活力;
(4)为了研究酶的pH值稳定性,将酶放置于各种pH2-10缓冲液中预孵育过夜,然后在pH7.0,37度反应60分钟检测剩余酶活力;
(5)同时研究了RCDA与不同的金属离子Zn2+、Fe2+、Mg2+、Mn2+、Cu2+、Ca2+、Ni2+及不同离子浓度(0.5、1.0、5.0、10.0mM)对酶活力的影响,在RCDA中加入金属离子,在pH7.0,37℃反应60min检测酶活;
以上酶学特性的检测,是以4-硝基乙酰苯胺为反应底物,0.3mL 200mg/L的4-硝基乙酰苯胺水溶液加入0.3mL RCDA粗酶液,加入0.9mL缓冲溶液调节pH,调节水浴锅温度进行反应。
不同底物的相对酶活是以4-硝基乙酰苯胺作为底物时的酶活(157.6U/mL)作为标准(100%)计算相对活性和残留活性。
本发明所采用的酶活单位的定义:在一定反应条件下(如未特别说明则为pH7.0,37℃)每小时产生1微克对硝基苯胺所需要的酶量定义为一个酶活力单位U。
酶活力计算公式为:
Figure BDA0002373705840000032
A400:酶解液样品的吸光值;
A0:空白的吸光值;
D:稀释倍数;
T:酶促反应时间,h;
K:线性系数。
结果如图2所示,RCDA的最佳反应温度和pH分别为45℃(图2-a)和7.0(图2-b)。热稳定性试验表明,在40℃以下处理30min后,RCDA的酶活性几乎保持100%,而在55℃及以上完全失活(图2-c)。酶在pH 5.0~9.0之间酶活力稳定(图2-d)。当离子浓度在1mM以下时,金属离子对其酶活性影响不大,而当离子浓度在1mM以上时,Zn2+、Cu2+、Ni2+对CDA活性有较强的抑制作用(图2-e)。
实施例3 RCDA的应用
将几丁质粉首先使用48%浓度的胆碱水溶液90℃预处理12h,胆碱添加量为10mL每5g物料,预处理后过滤并将固相中残留的离子液体用无离子水洗涤至pH6.8-7.0,然后105℃烘干至恒重。称取烘干后的物料1g加入10mL本发明几丁质脱乙酰酶粗酶液(酶活为157.6U/mL)37℃反应12h,采用液相色谱检测脱乙酰反应后液体中生成的乙酸总量达到127mg/g几丁质粉。
在本实施例中胆碱的作用是对几丁质的晶体结构进行破坏,增加酶的作用面积,预处理后烘干至恒重的是经过预处理后的几丁质粉,添加RCDA发生了脱乙酰反应,产生乙酸,所以以乙酸的产量表征RCDA对几丁质粉的脱乙酰能力。
以上所述仅为本发明的较佳实施案例而已,并不用以限制本发明。凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 天津科技大学
<120> 一种几丁质脱乙酰基酶
<130> 1
<160> 1
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 293
<212> PRT
<213> Rhodococcus equi
<400> 1
Met Ser Lys Lys Ile Tyr Val Asn Phe Gly Val Asp Val Asp Ala Val
1 5 10 15
Ala Gly Trp Leu Gly Ser Tyr Gly Gly Glu Asp Ser Pro Gly Asp Ile
20 25 30
Ser Arg Gly Met Phe Ala Gly Glu Val Gly Val Pro Arg Leu Val Lys
35 40 45
Met Phe Asp Lys Tyr Asp Ile Thr Thr Ser Trp Phe Val Pro Gly His
50 55 60
Ser Ile Glu Thr Phe Pro Arg Glu Ile Glu Gln Val Val Ala Ala Gly
65 70 75 80
His Glu Ile Gly Ile His Gly Tyr Ser His Glu Asn Pro Ile Ala Met
85 90 95
Thr Arg Gln Gln Glu Thr Asp Ile Leu Asp Arg Ser Ile Glu Leu Ile
100 105 110
Glu Ser Phe Thr Gly Ser Lys Pro Thr Gly Tyr Thr Ala Pro Trp Trp
115 120 125
Glu Phe Ser Lys Val Thr Asn Glu Leu Leu Ile Glu Arg Gly Val Lys
130 135 140
Tyr Asp His Ser Leu Met His Asn Asp Phe Thr Pro Tyr Tyr Val Arg
145 150 155 160
Val Gly Asp Ser Trp Ser Lys Ile Asp Tyr Ser Gln Pro Ala Glu Thr
165 170 175
Trp Met Lys Pro Leu Val Arg Gly Gln Glu Thr Asp Leu Val Glu Ile
180 185 190
Pro Ala Asn Trp Leu Leu Asp Asp Leu Pro Pro Gln Met Phe Ile Lys
195 200 205
Ser Ser Pro Asn Ser His Gly Phe Val Ser Pro Arg His Leu Glu Glu
210 215 220
Met Trp Arg Asp Gln Phe Asp Trp Val Tyr Arg Glu Met Asp Tyr Ala
225 230 235 240
Ile Phe Pro Val Thr Ile His Pro Asp Val Ser Gly Arg Pro Gln Ser
245 250 255
Leu Leu Met Leu Glu Arg Leu Ile Glu Tyr Ile Asn Gln His Asp Gly
260 265 270
Val Glu Trp Val Thr Phe Asp His Met Val Asn Asp Phe Lys Glu Arg
275 280 285
Phe Pro Arg Gln Ser
290

Claims (3)

1.一种几丁质脱乙酰基酶,其特征在于,其氨基酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示。
2.如权利要求1所述几丁质脱乙酰基酶的编码基因。
3.权利要求1所述几丁质脱乙酰基酶或权利要求2所述编码基因在水解几丁质中的应用。
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