CN109557015B - 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法 - Google Patents

流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法 Download PDF

Info

Publication number
CN109557015B
CN109557015B CN201811182206.5A CN201811182206A CN109557015B CN 109557015 B CN109557015 B CN 109557015B CN 201811182206 A CN201811182206 A CN 201811182206A CN 109557015 B CN109557015 B CN 109557015B
Authority
CN
China
Prior art keywords
signal
fluorescence
time delay
fluorescent
spectrum
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201811182206.5A
Other languages
English (en)
Other versions
CN109557015A (zh
Inventor
祝连庆
娄小平
潘志康
刘超
董明利
孟晓辰
张文昌
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Beijing Information Science and Technology University
Original Assignee
Beijing Information Science and Technology University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Beijing Information Science and Technology University filed Critical Beijing Information Science and Technology University
Priority to CN201811182206.5A priority Critical patent/CN109557015B/zh
Publication of CN109557015A publication Critical patent/CN109557015A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN109557015B publication Critical patent/CN109557015B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N15/00Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
    • G01N15/10Investigating individual particles
    • G01N15/14Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry
    • G01N15/1429Signal processing

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Signal Processing (AREA)
  • Dispersion Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)

Abstract

本发明提供了一种流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法,所述方法包括以下步骤:1)利用互相关算法对荧光信号相对于散射光信号的时延进行估计,并对电路***引入的时延进行校正,得到荧光信号相应的荧光寿命,2)利用得到的荧光寿命τ1,τ2对检测到的类高斯脉冲信号进行人为调制,利用相移特征对时延量进行表征,3)引入具有特定相移特性的参考信号,实现原始脉冲信号的频谱迁移,并经过低通滤波实现光谱重叠影响的消除。

Description

流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法
本申请是申请号为201610934604.2,申请日为2016年11月01日,发明名称为流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法的分案申请。
技术领域
本发明涉及荧光检测及光谱分析领域,具体涉及流式细胞仪的荧光强度检测及数字调制消除光谱重叠领域。
背景技术
流式细胞仪是一种采用激光束激发快速直线流动状态中的单行细胞或生物颗粒,对它的散射光和激发的荧光信号进行探测采集,从而进行多参数、快速的定性、定量分析或分选的仪器。目前商品化的流式细胞仪产品已具有6色、8色甚至十几色荧光同时标记检测的能力。随着多色多参数流式细胞仪的快速发展,光谱重叠补偿算法在流式数据分析中越来越重要,该算法不仅影响定性分析检测结果的正确性,而且直接决定检测结果定量分析的准确性。荧光寿命测量能够提供有机荧光素、荧光蛋白和其他可发荧光的无机分子相关的荧光弛豫、强度衰减等信息。并且荧光寿命不存在荧光强度测量过程中存在的非线性问题,所以荧光寿命被引入到流式细胞仪单细胞测量中作为一个多参数信息。
为了更加精细的分析细胞特性而进行多色法荧光测量,即使用多种荧光染料标记微粒,并且使用具有不同接收光波段的多个光检测器(如PD、PMT等)测量从每种荧光染料所发射的荧光。利用多色法荧光测量时,通过根据使用的荧光染料的荧光波长选择在光检测器侧的滤光片进行荧光的检测。然而目前所使用的各种荧光染料的激发或发射波长具有宽发射谱的性质,经光学滤片滤光后,发射光谱范围仍有一定的干扰重叠。因此,若将这些染料组合进行多色测量,即使使用滤光片将从荧光染料发出的荧光分成各个波段,从非目标荧光染料发出的荧光也可能泄漏进目标荧光检测器。如果发生荧光泄漏,在光检测器处测量的荧光强度和来自目标荧光染料的真实荧光强度之间将存在差异,导致测量误差。为了补偿测量误差,需要对检测器的实际测量值进行荧光补偿。荧光补偿是修正荧光信号渗漏的过程,其目的是从荧光目标检测器中除去除匹配荧光以外的任何干扰荧光信号。
发明内容
为了解决上述问题,本发明的目的在于提供一种流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法,所述方法包括以下步骤:1)利用互相关算法对荧光信号相对于散射光信号的时延进行估计,并对电路***引入的时延进行校正,得到荧光信号相应的荧光寿命,所述互相关算法的公式为:
Figure BDA0001825268840000021
其中,fs为散射光信号;fla,flb为光谱重叠后检测到的荧光信号,K1,C1,D1为实际荧光信号强度;t0为fs的中心点位置;t0’为散射光信号未经过电路***之前的中心点位置;τ1,τ2为fl1,fl2的荧光寿命;h0(t),h1(t),h2(t)分别为fs,fl1,fl2电路***传递函数;2)利用得到的荧光寿命τ1,τ2对检测到的类高斯脉冲信号进行人为调制,利用相移特征对时延量进行表征,所述进行人为调制的方法如下述公式:
Figure BDA0001825268840000022
其中,K2,C2,D2为调制后的荧光信号强度;φ1,φ2为人为引入的相移,用于对时延特性进行表征,φ1=ω01,φ2=ω02;ω0为调制频率;3)引入具有特定相移特性的参考信号,实现原始脉冲信号的频谱迁移,并经过低通滤波实现光谱重叠影响的消除。
优选地,所述步骤3)中引入具有特定相移特性的参考信号通过如下公式来实现:
Figure BDA0001825268840000031
其中,φref1,φref2为参考信号的相位,φref1=φ2,φref2=φ1
优选地,所述步骤3)中经过低通滤波实现光谱重叠影响的消除通过如下公式来实现:
Figure BDA0001825268840000032
优选地,所述步骤1)中fs、fla、flb的采样频率为100MHz。
优选地,所述散射光采用波长488nm的激光激发荧光染料的荧光发射光。
优选地,所述荧光染料选自FITC、PE。
应当理解,前述大体的描述和后续详尽的描述均为示例性说明和解释,并不应当用作对本发明所要求保护内容的限制。
附图说明
参考随附的附图,本发明更多的目的、功能和优点将通过本发明实施方式的如下描述得以阐明,其中:
图1为荧光发射光谱交叉重叠示意图;
图2为光谱重叠的影响示意图;
图3为本发明的利用数字调制消除光谱重叠原理示意图;
图4为利用本发明的数字处理方法得到的结果图,其中图4(a)为原始信号;图4(b)为调制后信号;图4(c)为引入参考信号的输出;图4(d)为消除光谱重叠影响的荧光信号。
具体实施方式
通过参考示范性实施例,本发明的目的和功能以及用于实现这些目的和功能的方法将得以阐明。然而,本发明并不受限于以下所公开的示范性实施例;可以通过不同形式来对其加以实现。说明书的实质仅仅是帮助相关领域技术人员综合理解本发明的具体细节。
在下文中,将参考附图描述本发明的实施例。在附图中,相同的附图标记代表相同或类似的部件,或者相同或类似的步骤。
本发明提供了一种数字处理方法对荧光脉冲信号进行人为调制,并引入具有特性相移的参考信号对光谱重叠的影响进行消除,实现对检测通道的真实荧光信号的测量。首先,利用互相关算法对荧光信号相对于散射光信号的时延进行估计。然后,利用数字信号处理方法对初始荧光信号进行人为调制,利用相移特征对时延量进行表征。最后,引入具有特定相移特性的参考信号并经过低通滤波实现光谱重叠影响的消除。光谱重叠信号数字处理方法具有以下优势:(1)硬件电路***结构简单,易于实现;(2)避免了光强调制及高速处理模块之间的同步等问题;(3)完全由数字信号处理芯片完成,计算速度快,灵活性好。
基于流式细胞仪散射光及荧光脉冲信号的类高斯特性,散射光信号(fs)及两路荧光信号(fl1,fl2)可利用公式1表示,其中K,A,B为信号强度;t0为fs的中心点位置;Δt1,Δt2为fl1,fl2相对于fs的时延。Δt1,Δt2为荧光寿命与电路***引入时延的总和。
Figure BDA0001825268840000041
假定荧光激发过程为单指数衰减特性,检测通道的光谱重叠信号可用公式2表示。其中,K1,C1,D1为实际荧光信号强度;t0’为散射光信号未经过电路***之前的中心点位置;τ1,τ2为fl1,fl2的荧光寿命;h0(t),h1(t),h2(t)分别为fs,fl1,fl2电路***传递函数。
Figure BDA0001825268840000051
利用互相关算法对荧光信号相对于散射光信号的时延进行估计,并对电路***引入的时延进行校正得到荧光信号相应的荧光寿命。利用得到的荧光寿命τ1,τ2对检测到的类高斯脉冲信号进行人为调制,如公式3所示。其中,K2,C2,D2为调制后的荧光信号强度;φ1,φ2为人为引入的相移,用于对时延特性进行表征,φ1=ω01,φ2=ω02;ω0为调制频率。
Figure BDA0001825268840000052
分别将两路调制后的荧光信号与具有特定相移的参考信号进行混合,实现原始脉冲信号的频谱迁移,如公式4所示。其中,φref1,φref2为参考信号的相位。φref1=φ2,φref2=φ1
Figure BDA0001825268840000053
与参考信号混合后的信号经过低通滤波即可得到去除光谱重叠影响后的真实荧光信号,如公式5所示。最终得到的荧光信号不包括光谱重叠引入的误差,信号幅值降为原始强度的1/2*cos(φ12)倍。
Figure BDA0001825268840000054
本发明的一个具体实施例中由488nm激光激发的荧光染料(FITC、PE)荧光发射光谱交叉重叠示意图如图1所示。fl1,fl2为真实荧光信号,fla,flb为光谱重叠后检测到的荧光信号。k11,k12,k21,k22为泄漏系数。
本发明对光谱重叠的影响进行了分析,光谱重叠会造成脉冲信号的峰值点位置及峰值发生变化。光谱重叠影响示意图如图2所示。当脉冲信号特征及泄漏系数按照表1变化时,引入的误差如表2所示。其中A,B为fl1,fl2的信号强度;Δt1,Δt2为fl1,fl2相对于fs的时延。
本发明利用数字调制方法实现光谱重叠消除的原理图如图3所示。单细胞流在流动室内经激光逐个激发,产生散射光信号fs及荧光信号fl1,fl2。光脉冲信号经过光学***(滤光片,二向色镜)后进行光电准换。fs经光电二极管转换为电脉冲信号经过电路***0;光谱重叠后的荧光信号fla,flb经PMT转换为电脉冲信号经过电路***1,2,并进行模数转换。本发明对脉宽为4μs左右的荧光脉冲信号进行处理,fs、fla、flb的采样频率为100MHz,即脉冲序列相邻数据点之间的时间间隔为10ns。
本发明利用互相关算法对数字脉冲信号进行计算,得到荧光信号相对于散射光信号的时延,并经电路***时延校准后得到真实的荧光寿命τ1,τ2。本发明调制频率ω0=10MHz,参考信号的相位φref1=φ2=ω02,φref2=φ1=ω01。本发明方法的关键步骤处理结果如图4所示。
表1.脉冲信号特性及泄漏系数
Figure BDA0001825268840000061
表2.光谱重叠引入的误差
Figure BDA0001825268840000062
Figure BDA0001825268840000071
结合这里披露的本发明的说明和实践,本发明的其他实施例对于本领域技术人员都是易于想到和理解的。说明和实施例仅被认为是示例性的,本发明的真正范围和主旨均由权利要求所限定。

Claims (4)

1.一种流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法,所述方法包括以下步骤:
1)利用互相关算法对荧光信号相对于散射光信号的时延进行估计,并对电路***引入的时延进行校正,得到荧光信号相应的荧光寿命,所述互相关算法的公式为:
Figure FDA0002926365840000011
其中,fs为散射光信号;fla,flb为光谱重叠后检测到的荧光信号,K1,C1,D1为实际荧光信号强度;t0为fs的中心点位置;t0’为散射光信号未经过电路***之前的中心点位置;τ1,τ2为fl1,fl2的荧光寿命;h0(t),h1(t),h2(t)分别为fs,fl1,fl2电路***传递函数;K0,C0,D0为荧光信号强度;Δta,Δtb为fla,flb相对于fs的时延;t为时间,σ为标准差;
2)利用得到的荧光寿命τ1,τ2对检测到的类高斯脉冲信号进行人为调制,利用相移特征对时延量进行表征,所述进行人为调制的方法如下述公式:
Figure FDA0002926365840000012
其中,K2,C2,D2为调制后的荧光信号强度;
Figure FDA0002926365840000013
为人为引入的相移,用于对时延特性进行表征,
Figure FDA0002926365840000014
ω0为调制频率;t为时间,σ为标准差,fs_mod为散射光信号fs经过人为调制后的光强信号;fla_mod为荧光信号fla经过人为调制后的光强信号;flb_mod为荧光信号flb经过人为调制后的光强信号;
3)引入具有特定相移特性的参考信号,实现原始脉冲信号的频谱迁移,并经过低通滤波实现光谱重叠影响的消除,其中,
引入具有特定相移特性的参考信号通过如下公式来实现:
Figure FDA0002926365840000021
其中,
Figure FDA0002926365840000022
为参考信号的相位,
Figure FDA0002926365840000023
t为时间,fla_mix为信号fla_mod经过频谱迁移后的光强信号;flb_mix为信号flb_mod经过频谱迁移后的光强信号;
经过低通滤波实现光谱重叠影响的消除通过如下公式来实现:
Figure FDA0002926365840000024
其中,t为时间,σ为标准差,fl1,fl2为信号fla_mix,flb_mix经过低通滤波后的光强信号,即为光谱重叠剔除后原始荧光信号。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述步骤1)中fs、fla、flb的采样频率为100MHz。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述散射光采用波长488nm的激光激发荧光染料的荧光发射光。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述荧光染料选自FITC、PE。
CN201811182206.5A 2016-11-01 2016-11-01 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法 Active CN109557015B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201811182206.5A CN109557015B (zh) 2016-11-01 2016-11-01 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610934604.2A CN106383083B (zh) 2016-11-01 2016-11-01 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法
CN201811182206.5A CN109557015B (zh) 2016-11-01 2016-11-01 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610934604.2A Division CN106383083B (zh) 2016-11-01 2016-11-01 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN109557015A CN109557015A (zh) 2019-04-02
CN109557015B true CN109557015B (zh) 2021-05-25

Family

ID=57958197

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610934604.2A Active CN106383083B (zh) 2016-11-01 2016-11-01 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法
CN201811182206.5A Active CN109557015B (zh) 2016-11-01 2016-11-01 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610934604.2A Active CN106383083B (zh) 2016-11-01 2016-11-01 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法

Country Status (1)

Country Link
CN (2) CN106383083B (zh)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110196218A (zh) * 2019-03-18 2019-09-03 北京信息科技大学 一种脉冲时延估计的荧光寿命表征方法

Citations (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS62116260A (ja) * 1985-11-15 1987-05-27 Toa Medical Electronics Co Ltd フロ−サイトメ−タ信号処理装置
WO2000055882A1 (en) * 1999-03-18 2000-09-21 Cambridge Research & Instrumentation Inc. High-efficiency multiple probe imaging system
WO2007051170A2 (en) * 2005-10-28 2007-05-03 The Regents Of The University Of California Apparatus and method for improved optical detection of particles in fluid
CN102597746A (zh) * 2009-09-29 2012-07-18 三井造船株式会社 Fret测量方法及装置
CN103582805A (zh) * 2011-03-31 2014-02-12 努拜欧有限公司 可缩放光谱检测和测量
CN104320361A (zh) * 2014-11-02 2015-01-28 天津理工大学 一种基于参数估计下的星载ais信号串行分离方法
CN104697649A (zh) * 2015-03-02 2015-06-10 中国科学院物理研究所 单发激光脉冲检测装置
CN104898172A (zh) * 2015-05-19 2015-09-09 吉林大学 一种基于互相关的核磁共振全波信号噪声滤除方法
CN105067489A (zh) * 2015-08-07 2015-11-18 中国科学院计算技术研究所 一种基于动态光散射技术的悬浮颗粒粒径测量装置及方法
CN105372678A (zh) * 2015-10-30 2016-03-02 哈尔滨工程大学 一种正弦boc调制信号的无模糊跟踪方法

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0515211A3 (en) * 1991-05-23 1993-04-07 Becton Dickinson And Company Apparatus and method for phase resolved fluorescence lifetimes of independent and varying amplitude pulses
US5270548A (en) * 1992-07-31 1993-12-14 The United States Of America As Represented By The United States Department Of Energy Phase-sensitive flow cytometer
US5315122A (en) * 1992-08-25 1994-05-24 Becton, Dickinson And Company Apparatus and method for fluorescent lifetime measurement
US20070096039A1 (en) * 2002-05-03 2007-05-03 Rakesh Kapoor Evaluation Of Multicomponent Mixtures Using Modulated Light Beams
JP5534214B2 (ja) * 2009-10-05 2014-06-25 ベイバイオサイエンス株式会社 フローサイトメータおよびフローサイトメトリ方法
JP5502124B2 (ja) * 2012-03-23 2014-05-28 三井造船株式会社 蛍光検出装置及び蛍光検出方法
WO2015021332A1 (en) * 2013-08-07 2015-02-12 The Regents Of The University Of California Real-time label-free high-throughput cell screening in flow

Patent Citations (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS62116260A (ja) * 1985-11-15 1987-05-27 Toa Medical Electronics Co Ltd フロ−サイトメ−タ信号処理装置
WO2000055882A1 (en) * 1999-03-18 2000-09-21 Cambridge Research & Instrumentation Inc. High-efficiency multiple probe imaging system
WO2007051170A2 (en) * 2005-10-28 2007-05-03 The Regents Of The University Of California Apparatus and method for improved optical detection of particles in fluid
CN102597746A (zh) * 2009-09-29 2012-07-18 三井造船株式会社 Fret测量方法及装置
CN103582805A (zh) * 2011-03-31 2014-02-12 努拜欧有限公司 可缩放光谱检测和测量
CN104320361A (zh) * 2014-11-02 2015-01-28 天津理工大学 一种基于参数估计下的星载ais信号串行分离方法
CN104697649A (zh) * 2015-03-02 2015-06-10 中国科学院物理研究所 单发激光脉冲检测装置
CN104898172A (zh) * 2015-05-19 2015-09-09 吉林大学 一种基于互相关的核磁共振全波信号噪声滤除方法
CN105067489A (zh) * 2015-08-07 2015-11-18 中国科学院计算技术研究所 一种基于动态光散射技术的悬浮颗粒粒径测量装置及方法
CN105372678A (zh) * 2015-10-30 2016-03-02 哈尔滨工程大学 一种正弦boc调制信号的无模糊跟踪方法

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Phase-sensitive detection methods for resolving fluorescence emission signals and directly;Steinkamp, J.A. et al.;《Methods Cell Biol》;19941231;第627-640页 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN106383083B (zh) 2018-10-16
CN109557015A (zh) 2019-04-02
CN106383083A (zh) 2017-02-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11630053B2 (en) Parallel flow cytometer using radiofrequency multiplexing
Houston et al. Digital analysis and sorting of fluorescence lifetime by flow cytometry
US8582098B2 (en) Single photon spectrometer
US7402817B2 (en) System and method for cross-talk cancellation in a multilane fluorescence detector
US20070096039A1 (en) Evaluation Of Multicomponent Mixtures Using Modulated Light Beams
US5270548A (en) Phase-sensitive flow cytometer
US8816311B2 (en) Fine particle measuring apparatus
US20110278471A1 (en) Fluorescence detecting device and fluorescence detecting method
Grinvald et al. Fast relaxation processes in a protein revealed by the decay kinetics of tryptophan fluorescence
JP2018527559A (ja) サイトメータ測定を調整するためのシステム及び方法
CN103874915B (zh) 通过荧光法进行体外检测和/或定量的***
US8817244B2 (en) Fluorescence measurement device and fluorescence measurement method
Ojo et al. Thermographic laser Doppler velocimetry
CN106644901A (zh) 一种用于流式细胞仪的荧光补偿方法
US20030205682A1 (en) Evaluation of multicomponent mixtures using modulated light beams
US20110266462A1 (en) Fluorescence detecting device and fluorescence detecting method
CN102192899A (zh) 一种双通道二阶非线性光学测试***
CN104122238A (zh) 荧光探针中的比率探测方法
CN109557015B (zh) 流式细胞仪光谱重叠信号数字处理方法
CN108489959A (zh) 一种相干反斯托克斯拉曼光谱扫描装置和方法
Houston et al. Capture of fluorescence decay times by flow cytometry
Iwata et al. FPGA-based photon-counting phase-modulation fluorometer and a brief comparison with that operated in a pulsed-excitation mode
WO2020017183A1 (ja) 微小粒子測定用スペクトロメータ、該微小粒子測定用スペクトロメータを用いた微小粒子測定装置及び微小粒子測定用光電変換システムの校正方法
Iwata et al. Combination of a Gated Phtotomultiplier Tube and a Phase Sensitive Detector for Use in an Intensive Pulsed Background Light Situation
RU2486481C2 (ru) Однофотонный спектрометр

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant