CN108085392A - 上皮性卵巢癌的生物标志物及其用途 - Google Patents

上皮性卵巢癌的生物标志物及其用途 Download PDF

Info

Publication number
CN108085392A
CN108085392A CN201810019206.7A CN201810019206A CN108085392A CN 108085392 A CN108085392 A CN 108085392A CN 201810019206 A CN201810019206 A CN 201810019206A CN 108085392 A CN108085392 A CN 108085392A
Authority
CN
China
Prior art keywords
hsa
mir
mirna
expression
mrna
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
CN201810019206.7A
Other languages
English (en)
Inventor
刘洪彬
马金龙
耿玲
苏献伟
熊志强
路钢
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Shanda Reproductive Development Center Co Ltd
Original Assignee
Shanda Reproductive Development Center Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Shanda Reproductive Development Center Co Ltd filed Critical Shanda Reproductive Development Center Co Ltd
Priority to CN201810019206.7A priority Critical patent/CN108085392A/zh
Publication of CN108085392A publication Critical patent/CN108085392A/zh
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/178Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA

Abstract

本发明提供了上皮性卵巢癌的生物标志物及其用途。本发明提供了下述miRNA的组合用于研究和检测上皮性卵巢癌的方法:hsa‑miR‑34b、hsa‑miR‑335、hsa‑miR‑136、hsa‑let‑7e、hsa‑miR‑1297、hsa‑miR‑374b和hsa‑miR‑891b。本发明还提供了用于所述研究和检测上皮性卵巢癌的方法的试剂盒和装置。

Description

上皮性卵巢癌的生物标志物及其用途
技术领域
本发明涉及分子生物学和疾病诊断试剂制备领域。具体的,本发明涉及上皮性卵巢癌的miRNA和mRNA组群的生物标记物和其用于研究上皮性卵巢癌的方法,以及所述标记物在制备用于诊断或检测上皮性卵巢癌的试剂盒的应用。
背景技术
上皮性卵巢癌(EOC)是女性最常见的妇科恶性肿瘤,占卵巢恶性肿瘤的近90%[1,2]。诊断时,大多数患者(75%)出现疾病的晚期,几乎所有的人都经历了肿瘤复发[3,4]。
卵巢癌病例中约10%是由于家族性/遗传倾向,主要是由于在BRCA1和BRCA2中的错配修复基因的突变,但其遗传机制仍需进一步研究。几个全基因组关联研究(GWAS)已在卵巢癌中进行,已经发现了一些风险因子,如9p22.2上的rs3814113,2q31上的rs2072590对,3q25上的rs2665390,在8q24上的rs10088218,rs1516982,rs10098821,和在19p13上的rs2363956[6,7]。然而,这些风险变量的功能意义在很大程度上是未知的。
微小RNA是通过与信使RNA(mRNA)靶杂交并引发对它的翻译抑制或较不常见地引起其降解来控制基因表达的一类小的非编码RNA。miRNA的发现和研究已揭示在生物发育和各种细胞过程例如细胞分化、细胞生长和细胞死亡中发挥重要作用的miRNA介导的基因调控机制。近年来的研究表明,特定miRNA的异常表达可参与人的疾病,例如神经障碍和癌症。microRNA(miRNA)的表达变化影响miRNA靶基因的表达,进而导致表型的差异,包括癌症的易感性[7]。对患者的miRNA和基因表达差异的分析的整合可以提高卵巢癌的风险等位基因的功能意义的理解,以及创新的分析方法来识别这些miRNA中代替传统的标准方差和回归分析中的应用将有可能提高分析的准确性。
本领域已有发现hsa-miR-34b(miR-34b)是具有p53依赖性调节功能的肿瘤抑制因子[24,25]。以前的报道显示p53介导的miR-34b的上调和ING2的下调通过人成纤维细胞中的p53激活介导了由nutlin-3a诱导的细胞衰老(senescence)[25]。此外,miR-34b/34c的簇(cluster)是TP53的直接的转录靶因子,其在上皮癌起始中发生突变[26]。在卵巢癌中,miR-34b在Lynch综合征相关肿瘤中经常失活。与在偶发性细胞肿瘤中的情况相反,Lynch综合征相关肿瘤中缺乏异常p53,这支持miR-34b失活和异常p53表达在癌变中的作用[27]。
本领域已有发现hsa-miR-335(miR-335)是卵巢癌中具有影响的miRNA[7]。在卵巢癌病人中,缺乏miR-335的表达诱导Bcl-w的异常积累和随后的失控的细胞浸润[35]。此外,miR-335与EOC患者的预后相关[36]。
另外,本领域已有发现hsa-miR-136(miR-136)也可能是卵巢癌中具有影响的miRNA。miR-136靶向TGF-b/Smad信号的引发的上皮-间质转化(epithelial-mesenchymaltransition)的启动子Smad2和Smad3,并抑制肺腺癌细胞转移相关性状[38]。在人非小细胞肺癌(NSCLC)细胞中发现miR-136的上调,其通过靶向PPP2R2A促进Erk1/2激活[39]。MiR-136也可能靶向肿瘤抑制基因PTEN并抑制乳腺癌中的PTEN翻译[40]。
本领域已经采用分子生物学的方法来诊断或检测各种如癌症等各种疾病,包括采用分析基因表达的高通量芯片或用于较少量分子目标的PCR或非PCR方法的试剂盒,例如Taqman探针法试剂盒等。然而,上皮性卵巢癌相关特异性miRNA表达谱的筛选、检测方法及检测程序还存在很多需要解决的问题。因此本领域还需要一种更快速和有效的诊断或检测上皮性卵巢癌的方法和试剂盒或芯片。
发明内容
本发明研究和发现了miRNA,特别是hsa-miR-34b、hsa-miR-335、hsa-miR-136在上皮性卵巢癌的分子调控途径中的作用,以及这些miRNA在生化调控过程的上下游影响因子和作用关系。由此,本发明提供了一种用于研究上皮性卵巢癌的更快速和有效的方法。具体的,本发明提供了一种miRNA的组合在研究或诊断上皮性卵巢癌中的用途,在所述研究或诊断中还可包括mRNA的组合。本发明还提供了所述miRNA的组合和mRNA的组合用于制备研究或诊断上皮性卵巢癌中的试剂盒或装置的用途。本发明还提供了用于研究或诊断上皮性卵巢癌中的试剂盒或装置,例如用于在外周血淋巴细胞样品中研究或诊断上皮性卵巢癌的基因芯片。
具体的,本发明提供了下述miRNA的组合用于研究或诊断上皮性卵巢癌的方法,所述miRNA组合为hsa-miR-34b、hsa-miR-335、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b。
在本发明的其中又一个方面,前述研究或诊断上皮性卵巢癌的方法中还包括下述基因的mRNA的组合:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。
在本发明的其中又一个方面,在前述研究或诊断上皮性卵巢癌的方法中,所述miRNA分为以下两组:
组(a):hsa-miR-34b、Hsa-miR-335和hsa-miR-136;和
组(b):hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b。
在本发明的研究或诊断上皮性卵巢癌的方法中,先在待测样品中检查作为核心miRNA的组(a)的miRNA,即hsa-miR-34b、hsa-miR-335和hsa-miR-136,然后再在待测样品中检查组(b)的miRNA,包括hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b。
在本发明其中又一个方面,还包括在待测样品中检测下述基因的mRNA的表达:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。
在本发明的研究或诊断上皮性卵巢癌的方法中,先检查作为核心miRNA的组(a)的miRNA,即hsa-miR-34b、hsa-miR-335和hsa-miR-136的表达,然后再检查组(b)的miRNA,包括hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b的表达。在本发明的方法中,如果发现组(a)的miRNA的表达不符合预定的检测结果,例如hsa-miR-335的表达上升以及hsa-miR-34b和hsa-miR-136的表达下降,可以选择不继续接下来的步骤(2),即检查组(b)的miRNA的表达。由此可以增加检测的效率。
在本发明的研究或诊断上皮性卵巢癌的方法中,除了在待测样品中检测组(a)和组(b)的miRNA的表达,还可包括:
(3)在待测样品中检测下述基因的mRNA的表达:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。
类似的,如果发现组(a)和/或组(b)的miRNA的表达不符合预定的检测结果(例如预定的检测结果为hsa-miR-335的表达上升以及hsa-miR-34b、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b的表达下降),可以选择不继续接下来的步骤(3),即检查下述基因的mRNA的表达:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。由此可以增加检测的效率。
在本发明的其中一个方面,所述待测样品为外周血淋巴细胞。
本发明还提供了用于本发明前述研究或诊断上皮性卵巢癌的方法的试剂盒或装置。本发明的所述试剂盒或装置中包括用于检测miRNA和mRNA的试剂。其中所述miRNA为hsa-miR-34b、Hsa-miR-335、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b的组合。其中所述mRNA为TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63的mRNA的组合。在本发明的其中一个方面,其中所述miRNA分为以下两组:
组(a):hsa-miR-34b、hsa-miR-335和hsa-miR-136;
组(b):hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b。
在本发明的其中一个方面,所述试剂盒或装置被制备成可实施研究或诊断上皮性卵巢癌的方法,其中包括以下步骤:
(1)在待测样品中检测组(a)的miRNA的表达;
(2)在待测样品中检测组(b)的miRNA的表达。
(3)在待测样品中检测下述mRNA的表达:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。
本发明还提供了miRNA的组合在用于制备研究或诊断上皮性卵巢癌中的试剂盒或装置的用途,所述miRNA组合为hsa-miR-34b、Hsa-miR-335、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b。在本发明的其中一个方面,在所述研究或诊断中还包括下述基因的mRNA的组合:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。在本发明的其中又一个方面,所述miRNA分为以下两组:组(a):hsa-miR-34b、hsa-miR-335和hsa-miR-136;组(b):hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b。
在本文中,术语“微小RNA”、“microRNA”、“miR基因产物”、“miR”和“miRNA”互换使用,是指来自miR基因的未加工的或加工过的RNA转录物。由于miR基因产物不翻译成蛋白,术语“miR基因产物”不包括蛋白。未加工的miR基因转录物也称作“miR前体”,通常包含长度为约70-100个核苷酸的RNA转录物。miR前体可以消化加工成有活性的19-25个核苷酸的RNA分子。该有活性的19-25个核苷酸的RNA分子也称作“加工过的miR基因转录物”或“成熟的miRNA”。本发明的miRNA主要是指哺乳动物的miRNA,特别是指人的miRNA。
本发明的miRNA主要是指人的miRNA。例如,在本文中,“miR-141”也代表“hsa-miR-141”。在本发明中涉及的miRNA包括其miRNA家族,其家族成员和序列在例如http://www.mirbase.org/等网站公开,其由对应的Accession number确定。
本发明涉及的miRNA包括:
hsa-miR-34b(MI0000742)、Hsa-miR-335(MI0000816)、hsa-miR-136(MI0000475)、hsa-let-7e(MI0000066)、hsa-miR-1297(MI0006358)、hsa-miR-374b(MI0005566)和hsa-miR-891b(MI0005534)。
本发明的基因主要是指人的基因。在本文中,蛋白符号不用斜体,并全部大写;基因符号使用斜体。例如TAO激酶1写为TAOK1,编码该蛋白的基因写为TAOK1。但有时在本文中基因符号也不使用斜体。例如有时本文中“TAOK1”也表示编码该蛋白的基因TAOK1。基因的定义和序列在例如https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/等网站公开,其由对应的GeneID确定。在本发明中,基因的mRNA是指从该基因转录的mRNA。获得和检查基因的mRNA的方法或试剂盒是本领域公知和常用的。
本发明涉及的基因包括:
TAOK1(Gene ID 57551)、MGEA5(Gene ID 10724)、ZBED5(Gene ID 58486)、MMP3(Gene ID 4314)、DNAJA1(Gene ID 3301)、KLHL28(Gene ID 66689)、PDCD7(Gene ID10081)、LSM12(Gene ID 124801)、SLC9A6(Gene ID 10479)、ATG7(Gene ID 74244)、C1orf63(Gene ID 57035)。
在本发明中,可以使用适用于检测生物样品中的RNA表达水平的任意技术,来测量样品中基因产物,包括miR基因产物的水平。用于测定生物样品(例如,细胞,组织)中RNA表达水平的合适技术(例如,RNA印迹分析,RT-PCR,原位杂交)是本领域技术人员已知的。
在本发明中,对基因,包括miRNA基因的表达水平的测量可以通过检测转录的多核苷酸或其部分的存在来进行,其中转录的多核苷酸包含该基因或该miRNA的编码区。
附图说明
图1为本发明的上皮性卵巢癌的microRNAs与mRNAs生物标记物的调控途径关系网络图。圆圈为microRNAs。三角形为mRNAs。
具体实施方式
下面将结合实施例进一步说明本发明的实质内容和有益效果,该实施例仅用于说明本发明而非对本发明的限制。
实施例1病人和样品
受试者来自74个具有家族上皮卵巢癌的病人和47个非上皮卵巢癌病人(对照)。从受试者的外周血的淋巴细胞中获得miRNA和mRNA。这74个具有家族上皮卵巢癌的病人之间没有家族关系。在这些病人的家族中,至少两个一级或二级亲人在其某一年龄阶段被检测出患有遗传学卵巢癌。这些病人都不具有BRCA1/2或MLH1/MSH2突变。
实施例2本发明研究的上皮卵巢癌相关microRNAs与mRNAs的靶基因关系和作用途径分析
采用如表1所示的算法,即Miranda(microRNA.org),microcode(http://www.mircode.org/mircode/),MirTarget2[21],Targetscan(http://www.targetscan.org/),对本发明的方法涉及的microRNAs,尤其是核心microRNAs(hsa-miR-34b、Hsa-miR-335、hsa-miR-136)的影响因子(microRNA和mRNA)和作用关系进行分析。
结果如表1所示,在上皮卵巢癌病人的样品中,发现16个相互作用的microRNA和mRNA对;涉及的microRNA包括:hsa-miR-34b、hsa-miR-335、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b;涉及的基因包括TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。在上皮卵巢癌病人的样品中,涉及的microRNA和mRNA与对照组比较,其表达出现明显差异。
表1
同时,利用Cytoscape(V 2.8.3,http://www.cytoscape.org/)对本发明提供的microRNAs与mRNAs的相互调控作用关系构建调控途径关系网络图。用于作图的基因-基因相互作用信息(Gene-gene interaction information)是从Biomolecular InteractionNetwork Databases(BINDs)得到的。结果如图1所示。
图1所示的结果与表1一致。hsa-miR-34b是这个作用网络的轴心因子之一。hsa-miR-34b表达下降,而其靶基因SLC9A6,TAOK1,ATG7,和MGEA5的表达上升。hsa-miR-34b的表达量通过其目标基因TAOK1 and MGEA5的作用而与hsa-miR-1297,hsa-miR-374b,hsa-miR-891b,and hsa-let-7e的表达量相关。hsa-miR-374b的目标基因C11orf48的表达也上升。
hsa-miR-136是这个作用网络的另一个轴心因子之一。hsa-miR-136的表达下降,而其目标基因ZBED5和MMP3的表达都上升。
hsa-miR-335是这个作用网络的另一个轴心因子之一。hsa-miR-335的表达上升,而其目标基因DNAJA1,PDCD7,KLHL28和LSM12的表达下降。
TAOK1是miR-34b最重要的靶基因。TAOK1是MARK的上游激活剂,MARK磷酸化微管相关蛋白,导致其从微管分离并导致在细胞间期的微管拆解[28]。TAOK1作为TAO激酶的成员,通过调节纺锤体检测点信号来保护人类细胞的基因组稳定性[30-32]。另一个重要的靶基因是ATG7,先前报道与卵巢癌有关。人卵巢癌Caov-3细胞中ATG7或BECN1的沉默显着抑制单Pt诱导的细胞死亡[33]。此外,As2O3在卵巢癌细胞中诱导不依赖beclin-1的自体吞噬途径;ATG7的siRNA靶向与ATG5和hVps34一起显着降低As2O3诱导的自体吞噬[34]。
DNAJA1是miR-335的靶基因。证据表明,HDJ2(也称为DNAJA1),在人卵巢癌中增强了法尼基转移酶(farnesyltransferase)抑制剂lonafarnib和紫杉醇诱导的生长抑制作用[37]。
MMP3是本研究中揭示的miR-136的靶基因之一。MMP3与MMP2起着关键作用,作为E2诱导的EOC迁移/浸润中TC0101441活性的下游介质[41]。也已知MMP3可增加化疗对卵巢癌的敏感性[42,43]。
实施例3基因芯片分析miRNA表达和mRNA表达
采用通过Illumina表达检测芯片(Illumina Human v2 MicroRNA expressionbeadchip)获得的miRNA表达数据(数据编号GSE31801,在美国国家生物技术信息中心(National Center of Biotechnology Information,NCBI)网站的基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)中公开:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/queryacc.cgi?acc=GSE31801)进行分析。该芯片的miRNA板块包括1146个人类miRNA(>97%miRBase release 12公开的miRNA)对前述受试者的miRNA的表达进行分析。将芯片的miRNA分析区域分为3个区域。其中第一区域检测的包括hsa-miR-34b、hsa-miR-335、hsa-miR-136;第二区域包括hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b;第三区域包括其余miRNA。
另外采用通过Illumina表达检测芯片(llumina HumanHT-12 V3.0expressionbeadchip)获得的mRNA表达数据(数据编号GSE37582:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE37582)对前述受试者的mRNA表达进行分析。将该芯片的mRNA板块的分析区域分为2个区域。其中第一区域检测的包括TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63的mRNA;第二区域包括其余mRNA。
实施例4本发明研究的上皮卵巢癌相关miRNA和mRNA表达的上调和下调趋势分析
一.通过偏最小二乘法(partial least squares,PLS)对实施例2的样品的miRNA表达和mRNA表达数据进行分析
采用PLS分析方法[11]分析出现表达差异的基因[15-19]。
本发明的研究中,PLS分析方法步骤包括:
1.采用NIPALS算法【18】求解下述多元回归模型:
计算步骤:
(1)随机初始化(Randomly initialize)u0=Y
(2)w=XTu0,w=w/||w||
(3)t=Xw
(4)c=YTt,c=c/||c||
(5)u=Yc
(6)假如u-u0<10-8,则进行步骤(7);
否则u0=u,重复步骤(2)–(5)。
(7)X=X-ttTX,Y=Y-ttTY。返回步骤(2),计算下一潜变量(latent variable)此处,Y为疾病分类变量矩阵,X为表达矩阵(n x p),n为样本数目,p为mRNA及microRNA变量总数。
2.差异表达基因的鉴定
差异表达基因的鉴定,计算每个mRNA、microRNA的变量投影。变量投影重要性(variable importance on the projection,VIP),定义参见Gosselin et al.,2010[20]。
采用置换检验,分别计算每个mRNA和microRNA的显著水平:
当计算mRNA显著水平时,p=芯片检测的mRNA总数;当计算microRNA显著水平时,p=芯片检测的microRNA总数,h为引入的潜变量数目(即将原始p维数据降维至h)。
采用排列程序(permutation procedure)(进行1000次)来降低假发现率(falsediscovery rate,FDR)。具有VIP的FDR低于0.05(p<0.05)的表达才为具有表达差异。
二.采用Monte Carlo分析方法进一步分析miRNA表达和mRNA表达数据
采用Monte Carlo分析方法[12,13]进一步分析差异表达的miRNA和mRNA。
本发明中Monte Carlo分析方法及步骤包括:
根据前述步骤2的计算模型,以差异表达的microRNAs和mRNAs作为自变量,建立多元回归预测模型。计算回归系数θ包括(模型中的α与β),自变量的选择直接依赖于回归系数的稳定性统计量Sj:
Sj=mean(θj)/std(θj)
其中θ是线性模型中的回归系数。通过Monte Carlo抽样,计算第j个变量的各子模型回归系数的均值和标准差。基于交叉验证的最高准确性,确定回归系数可靠性的阈值。具有绝对可靠性大于阈值和VIP的FDR小于0.05的MiRNA/mRNA为具有差异表达的miRNA/基因组。
三结果
1.根据PLS分析的本发明研究的上皮卵巢癌相关miRNA表达的上调和下调趋势。结果如表2所示。
表2
如表2的结果所示,hsa-miR-34b、hsa-miR-335、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b在卵巢癌病人中,相对对照组都有明显的表达差异(with FDR of VIP,p<0.05)。其中,hsa-miR-335的表达上升,hsa-miR-34b、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b的表达下降。
2.根据PLS分析的本发明研究的上皮卵巢癌相关mRNA表达的上调和下调趋势。结果如表3所示。
表3
如表3的结果所示,TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63在卵巢癌病人中,相对对照组都有明显的表达差异(with FDR ofVIP,p<0.05)。其中,SLC9A6,C1orf63,TAOK1,ATG7,和MGEA5,以及ZBED5和MMP3的表达上升,DNAJA1,PDCD7,KLHL28和LSM12的表达下降。
结果与实施例2的基因关系一致。
3.根据Monte Carlo分析的本发明研究的上皮卵巢癌相关mRNA表达的上调和下调趋势。结果如表4所示。
表4
如表4的结果所示,hsa-miR-34b、Hsa-miR-335、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b在卵巢癌病人中,相对对照组都有明显的表达差异。其中,Hsa-miR-335的表达上升,hsa-miR-34b、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b的表达下降。
4.根据Monte Carlo分析的本发明研究的上皮卵巢癌相关mRNA表达的上调和下调趋势。结果如表5所示。
表5
如表5的结果所示,TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63在卵巢癌病人中,相对对照组都有明显的表达差异。其中,SLC9A6,C1orf63,TAOK1,ATG7,和MGEA5,以及ZBED5和MMP3的表达上升,DNAJA1,PDCD7,KLHL28和LSM12的表达下降。
结果与实施例2以及PLS分析观察到的基因作用关系一致。
本申请的发明人第一次研究和提出了新的上皮性卵巢癌的分子调控途径网络,并且发现了由miRNA,特别是hsa-miR-34b、hsa-miR-335、hsa-miR-136作为这个分子调控途径网络中的轴心(pivot)作用。本发明还首次发现了与这些miRNA相关的16个miRNA和mRNA对和它们的调控关系。本发明由此提供了用于研究和检测上皮性卵巢癌,特别是在外周血淋巴细胞样品中检测上皮性卵巢癌的分子标记物。本发明提供的研究和检测上皮性卵巢癌的方法具有高特异性,以及能够更快进行和获得检测结果的优点。
上面是对本发明进行的说明,不能将其看成是对本发明进行的限制。除非另外指出,本发明的实践将使用有机化学、聚合物化学、生物技术等的常规技术,显然除在上述说明和实施例中所特别描述之外,还可以别的方式实现本发明。其它在本发明范围内的方面与改进将对本发明所属领域的技术人员显而易见。根据本发明的教导,许多改变和变化是可行的,因此其在本发明的范围之内。
如无特别表示,本文中出现的温度的单位“度”是指摄氏度,即℃。
以下文献以全文引入的方式在本申请进行公开。
References:
1.Auersperg N,Wong AS,Choi KC,Kang SK,Leung PC:Ovarian surfaceepithelium:biology,endocrinology,and pathology.Endocr Rev 2001,22(2):255-288.
2.Redjimi N,Gaudin F,Touboul C,Emilie D,Pallardy M,Biola-Vidamment A,Fernandez H,Prevot S,Balabanian K,Machelon V:Identification ofglucocorticoid-induced leucine zipper as a key regulator of tumor cellproliferation in epithelial ovarian cancer.Mol Cancer 2009,8:83.
3.Hennessy BT,Coleman RL,Markman M:Ovarian cancer.Lancet 2009,374(9698):1371-1382.
4.Partridge EE,Barnes MN:Epithelial ovarian cancer:prevention,diagnosis,and treatment.CA Cancer J Clin 1999,49(5):297-320.
5.Rosenthal AN,Fraser L,Manchanda R,Badman P,Philpott S,Mozersky J,Hadwin R,Cafferty FH,Benjamin E,Singh N et al:Results of annual screening inphase I of the United Kingdom familial ovarian cancer screening studyhighlight the need for strict adherence to screening schedule.J Clin Oncol2013,31(1):49-57.
6.Zhao H,Shen J,Wang D,Guo Y,Gregory S,Medico L,Hu Q,Yan L,Odunsi K,Lele S et al:Associations between gene expression variations and ovariancancer risk alleles identified from genome wide association studies.PloS one2012,7(11):e47962.
7.Shen J,Wang D,Gregory SR,Medico L,Hu Q,Yan L,Odunsi K,Lele SB,Ambrosone CB,Liu S et al:Evaluation of microRNA expression profiles and theirassociations with risk alleles in lymphoblastoid cell lines of familialovarian cancer.Carcinogenesis 2012,33(3):604-612.
8.Centner V,Massart DL,de Noord OE,de Jong S,Vandeginste BM,Sterna C:Elimination of uninformative variables for multivariatecalibration.Analytical chemistry 1996,68(21):3851-3858.
9.Richard R.Picard RDC:Cross-Validation of Regression Models.Journalof the American Statistical Association 1984,79:575-583.
10.Cai W,Li Y,Shao X:A variable selection method based onuninformative variable elimination for multivariate calibration of near-infrared spectra.Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems 2008,90(2):188-194.
11.Chakraborty S,Datta S,Datta S:Surrogate variable analysis usingpartial least squares(SVA-PLS)in gene expression studies.Bioinformatics 2012,28(6):799-806.
12.Xu Q-S,Liang Y-Z,Du Y-P:Monte Carlo cross-validation for selectinga model and estimating the prediction error in multivariatecalibration.Journal of Chemometrics 2004,18(2):112-120.
13.Gourvénec S,Fernández Pierna JA,Massart DL,Rutledge DN:Anevaluation of the PoLiSh smoothed regression and the Monte Carlo Cross-Validation for the determination of the complexity of a PLSmodel.Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems 2003,68(1–2):41-51.
14.Irizarry RA,Hobbs B,Collin F,Beazer-Barclay YD,Antonellis KJ,Scherf U,Speed TP:Exploration,normalization,and summaries of high densityoligonucleotide array probe level data.Biostatistics 2003,4(2):249-264.
15.IS H:On the structure of partial least-squares regression.CommunStat-Simulation Comput 1988,17:581-607.
16.IS H:Partial least-squares regression and statistical model.ScandJ Stat 1990,17:97-144.
17.Barker M,Rayens W:Partial Least Squares for Discrimination.Journalof Chemometrics 2010,17(3):166–173.
18.Martins JPA,Teófilo RF,Ferreira MMC:Computational performance andcross-validation error precision of five PLS algorithms using designed andreal data sets.Journal of Chemometrics 2010,24(6):320–332.
19.Ding S:Partial least squares based gene expression analysis inrenal failure.Diagnostic pathology 2014,9(1):137-137.
20.Gosselin R,Rodrigue D,Duchesne C:A Bootstrap-VIP approach forselecting wavelength intervals in spectral imaging applications.Chemometricsand Intelligent Laboratory Systems 2010,100(1):12-21.
21.Wang X,El Naqa IM:Prediction of both conserved and nonconservedmicroRNA targets in animals.Bioinformatics 2008,24(3):325-332.
22.Shannon P,Markiel A,Ozier O,Baliga NS,Wang JT,Ramage D,Amin N,Schwikowski B,Ideker T:Cytoscape:a software environment for integrated modelsof biomolecular interaction networks.Genome research 2003,13(11):2498-2504.
23.Han Q-J,Wu H-L,Cai C-B,Xu L,Yu R-Q:An ensemble of Monte Carlouninformative variable elimination for wavelength selection.Analytica ChimicaActa 2008,612(2):121-125.
24.Agostini M,Knight RA:miR-34:from bench to bedside.Oncotarget 2014,5(4):872-881.
25.Kumamoto K,Spillare EA,Fujita K,Horikawa I,Yamashita T,Appella E,Nagashima M,Takenoshita S,Yokota J,Harris CC:Nutlin-3a activates p53 to bothdown-regulate inhibitor of growth 2 and up-regulate mir-34a,mir-34b,and mir-34c expression,and induce senescence.Cancer research 2008,68(9):3193-3203.
26.Asmar F,Hother C,Kulosman G,Treppendahl MB,Nielsen HM,Ralfkiaer U,Pedersen A,Moller MB,Ralfkiaer E,de Nully Brown P et al:Diffuse large B-celllymphoma with combined TP53 mutation and MIR34A methylation:Another"doublehit"lymphoma with very poor outcome?Oncotarget 2014,5(7):1912-1925.
27.Niskakoski A,Kaur S,Staff S,Renkonen-Sinisalo L,Lassus H,JarvinenHJ,Mecklin JP,Butzow R,Peltomaki P:Epigenetic analysis of sporadic and Lynch-associated ovarian cancers reveals histology-specific patterns of DNAmethylation.Epigenetics:official journal of the DNA Methylation Society 2014,9(12):1577-1587.
28.Shrestha RL,Tamura N,Fries A,Levin N,Clark J,Draviam VM:TAO1kinase maintains chromosomal stability by facilitating proper congression ofchromosomes.Open Biol 2014,4(6):130108.
29.Raman M,Earnest S,Zhang K,Zhao Y,Cobb MH:TAO kinases mediateactivation of p38 in response to DNA damage.The EMBO journal 2007,26(8):2005-2014.
30.Draviam VM,Stegmeier F,Nalepa G,Sowa ME,Chen J,Liang A,Hannon GJ,Sorger PK,Harper JW,Elledge SJ:A functional genomic screen identifies a rolefor TAO1 kinase in spindle-checkpoint signalling.Nature cell biology 2007,9(5):556-564.
31.Hubner NC,Wang LH,Kaulich M,Descombes P,Poser I,Nigg EA:Re-examination of siRNA specificity questions role of PICH and Tao1 in thespindle checkpoint and identifies Mad2 as a sensitive target for smallRNAs.Chromosoma 2010,119(2):149-165.
32.Westhorpe FG,Diez MA,Gurden MD,Tighe A,Taylor SS:Re-evaluating therole of Tao1 in the spindle checkpoint.Chromosoma 2010,119(4):371-379.
33.Guo WJ,Zhang YM,Zhang L,Huang B,Tao FF,Chen W,Guo ZJ,Xu Q,Sun Y:Novel monofunctional platinum(II)complex Mono-Pt induces apoptosis-independent autophagic cell death in human ovarian carcinoma cells,distinctfrom cisplatin.Autophagy 2013,9(7):996-1008.
34.Smith DM,Patel S,Raffoul F,Haller E,Mills GB,Nanjundan M:Arsenictrioxide induces a beclin-1-independent autophagic pathway via modulation ofSnoN/SkiL expression in ovarian carcinoma cells.Cell death anddifferentiation 2010,17(12):1867-1881.
35.Cao J,Cai J,Huang D,Han Q,Yang Q,Li T,Ding H,Wang Z:miR-335represents an invasion suppressor gene in ovarian cancer by targeting Bcl-w.Oncology reports 2013,30(2):701-706.
36.Cao J,Cai J,Huang D,Han Q,Chen Y,Yang Q,Yang C,Kuang Y,Li D,WangZ:miR-335 represents an independent prognostic marker in epithelial ovariancancer.American journal of clinical pathology 2014,141(3):437-442.
37.Taylor SA,Marrinan CH,Liu G,Nale L,Bishop WR,Kirschmeier P,Liu M,Long BJ:Combining the farnesyltransferase inhibitor lonafarnib withpaclitaxel results in enhanced growth inhibitory effects on human ovariancancer models in vitro and in vivo.Gynecologic oncology 2008,109(1):97-106.
38.Yang Y,Liu L,Cai J,Wu J,Guan H,Zhu X,Yuan J,Chen S,Li M:TargetingSmad2 and Smad3 by miR-136 suppresses metastasis-associated traits of lungadenocarcinoma cells.Oncology research 2013,21(6):345-352.
39.Shen S,Yue H,Li Y,Qin J,Li K,Liu Y,Wang J:Upregulation of miR-136in human non-small cell lung cancer cells promotes Erk1/2 activation bytargeting PPP2R2A.Tumour biology:the journal of the International Society forOncodevelopmental Biology and Medicine 2014,35(1):631-640.
40.Lee DY,Jeyapalan Z,Fang L,Yang J,Zhang Y,Yee AY,Li M,Du WW,Shatseva T,Yang BB:Expression of versican 3'-untranslated region modulatesendogenous microRNA functions.PloS one 2010,5(10):e13599.
41.Qiu J,Ye L,Ding J,Feng W,Zhang Y,Lv T,Wang J,Hua K:Effects ofoestrogen on long noncoding RNA expression in oestrogen receptor alpha-positive ovarian cancer cells.The Journal of steroid biochemistry andmolecular biology 2014,141:60-70.
42.Januchowski R,Zawierucha P,Rucinski M,Nowicki M,Zabel M:Extracellular matrix proteins expression profiling in chemoresistant variantsof the A2780 ovarian cancer cell line.BioMed research international 2014,2014:365867.
43.Yew KH,Crow J,Hirst J,Pessetto Z,Godwin AK:Epimorphin-induced METsensitizes ovarian cancer cells to platinum.PloS one 2013,8(9):e72637.

Claims (10)

1.下述miRNA的组合用于研究上皮性卵巢癌的方法,所述miRNA组合为hsa-miR-34b、hsa-miR-335、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b。
2.权利要求1的方法,其中还包括下述基因的mRNA的组合:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。
3.权利要求1或2的方法,其特征在于,所述miRNA分为以下两组:
组(a):hsa-miR-34b、hsa-miR-335和hsa-miR-136;
组(b):hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b;
在所述研究上皮性卵巢癌的方法中,包括以下步骤:
(1)在待测样品中检测组(a)的miRNA的表达;
(2)在待测样品中检测组(b)的miRNA的表达;
(3)在待测样品中检测下述基因的mRNA的表达:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。
4.权利要求3的方法,其特征在于,所述待测样品为外周血淋巴细胞。
5.下述miRNA的组合在用于制备研究或诊断上皮性卵巢癌中的试剂盒或装置的用途,所述miRNA组合为hsa-miR-34b、Hsa-miR-335、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b。
6.权利要求5的用途,其中在所述研究或诊断中还包括下述基因的mRNA的组合:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。
7.权利要求1或2的用途,其特征在于,所述miRNA分为以下两组:
组(a):hsa-miR-34b、hsa-miR-335和hsa-miR-136;
组(b):hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b;
在所述研究或诊断中包括以下步骤:
(1)在待测样品中检测组(a)的miRNA的表达;
(2)在待测样品中检测组(b)的miRNA的表达;
(3)在待测样品中检测下述mRNA的表达:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。
8.权利要求7的用途,其中所述试剂盒或装置用于在外周血淋巴细胞样品中研究或诊断上皮性卵巢癌。
9.用于研究或诊断上皮性卵巢癌中的试剂盒或装置,其中包括用于检测miRNA和mRNA的试剂,所述miRNA为hsa-miR-34b、Hsa-miR-335、hsa-miR-136、hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b的组合,所述mRNA为TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63的mRNA的组合,
优选的,其中所述miRNA分为以下两组:
组(a):hsa-miR-34b、hsa-miR-335和hsa-miR-136;
组(b):hsa-let-7e、hsa-miR-1297、hsa-miR-374b和hsa-miR-891b;
在所述研究或诊断中包括以下步骤:
(1)在待测样品中检测组(a)的miRNA的表达;
(2)在待测样品中检测组(b)的miRNA的表达;
(3)在待测样品中检测下述mRNA的表达:TAOK1、MGEA5、ZBED5、MMP3、DNAJA1、KLHL28、PDCD7、LSM12、SLC9A6、ATG7、C1orf63。
10.权利要求9的试剂盒或装置,其中所述装置为用于在外周血淋巴细胞样品中研究或诊断上皮性卵巢癌的基因芯片。
CN201810019206.7A 2018-01-09 2018-01-09 上皮性卵巢癌的生物标志物及其用途 Withdrawn CN108085392A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201810019206.7A CN108085392A (zh) 2018-01-09 2018-01-09 上皮性卵巢癌的生物标志物及其用途

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201810019206.7A CN108085392A (zh) 2018-01-09 2018-01-09 上皮性卵巢癌的生物标志物及其用途

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN108085392A true CN108085392A (zh) 2018-05-29

Family

ID=62181831

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201810019206.7A Withdrawn CN108085392A (zh) 2018-01-09 2018-01-09 上皮性卵巢癌的生物标志物及其用途

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN108085392A (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2022262870A1 (zh) * 2021-06-18 2022-12-22 青岛卓云海智医疗科技有限公司 卵巢激活的分子标记物及其在基因芯片和药物筛选的应用

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1845999A (zh) * 2003-07-02 2006-10-11 诺瓦提斯公司 在卵巢癌中作为预后和治疗靶标而被调控的基因
CN102186994A (zh) * 2008-09-01 2011-09-14 伊缪诺维亚公司 诊断或预后上皮性卵巢癌的方法
CN102517381A (zh) * 2003-10-07 2012-06-27 千年药品公司 用于鉴定、评价、预防和治疗卵巢癌的核酸分子和蛋白质
CN104364390A (zh) * 2011-10-14 2015-02-18 俄亥俄州立大学 与卵巢癌相关的方法和材料
CN105531590A (zh) * 2013-09-17 2016-04-27 利兰斯坦福初级大学董事会 卵巢癌生物标志物

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1845999A (zh) * 2003-07-02 2006-10-11 诺瓦提斯公司 在卵巢癌中作为预后和治疗靶标而被调控的基因
CN102517381A (zh) * 2003-10-07 2012-06-27 千年药品公司 用于鉴定、评价、预防和治疗卵巢癌的核酸分子和蛋白质
CN102186994A (zh) * 2008-09-01 2011-09-14 伊缪诺维亚公司 诊断或预后上皮性卵巢癌的方法
CN104364390A (zh) * 2011-10-14 2015-02-18 俄亥俄州立大学 与卵巢癌相关的方法和材料
CN105531590A (zh) * 2013-09-17 2016-04-27 利兰斯坦福初级大学董事会 卵巢癌生物标志物

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
YUN-DE DOU等: "Integrated microRNA and mRNA signatures in peripheral blood lymphocytes of familial epithelial ovarian cancer", 《BBRC》 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2022262870A1 (zh) * 2021-06-18 2022-12-22 青岛卓云海智医疗科技有限公司 卵巢激活的分子标记物及其在基因芯片和药物筛选的应用

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Ma et al. Immune-related lncRNAs as predictors of survival in breast cancer: a prognostic signature
Dong et al. miRNA microarray reveals specific expression in the peripheral blood of glioblastoma patients
JP7186700B2 (ja) 腫瘍抑制foxo活性を酸化ストレスから区別する方法
Wang et al. Novel biomarkers associated with progression and prognosis of bladder cancer identified by co-expression analysis
Marchini et al. Association between miR-200c and the survival of patients with stage I epithelial ovarian cancer: a retrospective study of two independent tumour tissue collections
Palmer et al. Malignant germ cell tumors display common microRNA profiles resulting in global changes in expression of messenger RNA targets
Wang et al. Identification of novel cell glycolysis related gene signature predicting survival in patients with endometrial cancer
Shen et al. MicroRNA signatures in diagnosis and prognosis of cutaneous T-cell lymphoma
WO2017215230A1 (zh) 一组胃癌基因的应用
Elhamamsy et al. Circulating miR-92a, miR-143 and miR-342 in plasma are novel potential biomarkers for acute myeloid leukemia
EP2982985B1 (en) System for predicting prognosis of locally advanced gastric cancer
CN110305964B (zh) 一种***癌患者预后复发风险预测标志工具及其风险评估模型的建立
Xie et al. A six-gene signature predicts survival of adenocarcinoma type of non-small-cell lung cancer patients: a comprehensive study based on integrated analysis and weighted gene coexpression network
US20120178093A1 (en) Methods of assessing a risk of cancer progression
Jiang et al. Prognostic significance of an autophagy‑related long non‑coding RNA signature in patients with oral and oropharyngeal squamous cell carcinoma
EP2391962B1 (en) Accelerated progression relapse test
CN107254515B (zh) ***基因表达分析的内参基因组合及应用
CN113201590B (zh) 用于评估肝细胞癌早期复发风险的lncRNA、评估方法及装置
CN108085392A (zh) 上皮性卵巢癌的生物标志物及其用途
Fan et al. Identification of immune-related ferroptosis prognostic marker and in-depth bioinformatics exploration of multi-omics mechanisms in thyroid cancer
Wen et al. Identification and verification on prognostic index of lower-grade glioma immune-related LncRNAs
WO2007121988A1 (en) Personalizing cancer chemotherapy based on methylation and germ-line mutational analysis of brca-1
US20170002424A1 (en) Microrna signature as an indicator of the risk of early recurrence in patients with breast cancer
Ye et al. Comprehensive analysis of spliceosome genes and their mutants across 27 cancer types in 9070 patients: clinically relevant outcomes in the context of 3P medicine
Yang et al. Expression and clinical significance of microRNA‑21, PTEN and p27 in cancer tissues of patients with non‑small cell lung cancer

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
WW01 Invention patent application withdrawn after publication
WW01 Invention patent application withdrawn after publication

Application publication date: 20180529