CN107419029A - 一种筛选优质囊胚的试剂盒 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种筛选优质囊胚的试剂盒。本发明所公开的试剂盒为在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒,包括用于检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中表2所示的398个基因的表达量的产品。如果人辅助生殖囊胚(体外人工受精第5天植入前的囊胚)的壁滋养层细胞的398个基因中各个基因的表达量均是极滋养层细胞的398个基因中同一种基因的表达量的两倍以上或二分之一倍以下,预示该人辅助生殖囊胚将正常发育和孕妇正常分娩。本发明对于科学判断移植策略和决策,减少辅助生殖中孕妇围产期合并症和患病儿童的可能性具有重要的应用价值。

Description

一种筛选优质囊胚的试剂盒
技术领域
本发明涉及生物医学领域,具体涉及一种筛选优质囊胚的试剂盒。
背景技术
胚胎植入已成为生殖医学研究领域中尚未解决的热点问题。胚胎植入是哺乳动物生殖过程中的关键环节,它是指胚泡运行到子宫后,与子宫内膜相互作用的过程,主要包括胚泡的定位、粘附和穿透,此过程相当复杂,是胚胎和子宫内膜双方共同作用完成的,位于胚胎***的滋养层细胞在胚胎侵入过程中发挥着关键的作用,它通过分泌系列细胞因子和激素行使妊娠识别作用,还通过分泌这些因子、激素的作用使胚胎对子宫内膜发生粘附及侵入的作用。
关于胚胎植入和异位妊娠方面的研究表明,对胚胎植入起关键作用的基因和分子可能不是来源于母体,而是来源于胚胎,母胎界面组织只是提供胚胎发育的载体。加强胚胎植入阶段细胞和分子生物学研究的基础上,寻找和确定调控胚胎植入的内源性关键特异分子,有助于提高胚胎植入成功率。目前关于胚胎植入的分子机理还不十分清楚,既往的研究多将胚胎滋养层细胞作为一个整体,研究基因表达时间顺序演变,缺少细胞基因表达空间研究,也很难找到人自然妊娠生理性囊胚作为研究。
辅助生殖技术解决大量生殖***问题,帮助***夫妇获得子代,给社会和家庭带来快乐。然而,相比较自然妊娠,流行病学和临床研究显示,排除***疾病因素影响,辅助生殖技术本身具有不确定的隐患,辅助生殖技术妊娠结局风险和出生婴儿健康(儿童期和成年期)风险增加,给社会经济和家庭带来巨大风险并长期负担。本领域中,优质囊胚具有较好的发育潜力,具有植入正常子宫内膜潜力,未来发育成正常胚胎。优质囊胚具有安全性,而没有围产期合并症及不良妊娠结局。因此,如何在人辅助生殖囊胚植入前进行优质囊胚的筛选,具有重要的应用价值。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是如何在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测,具体为在人辅助生殖囊胚植入前筛选优质囊胚,优质囊胚将正常发育。
为解决上述技术问题,本发明提供了一种在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒。
本发明所提供的一种在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒,可包括用于检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量的产品;所述398个基因为表2所示的人的下述基因:SCARB1基因;PPP3CA基因;EVL基因;CAPG基因;PLCG2基因;DIP2C基因;INA基因;HAUS8基因;BPHL基因;IFT74基因;FANCG基因;PSKH1基因;PDE8A基因;DLX3基因;SLC35E3基因;FBXO36基因;ZNF7基因;TNFAIP1基因;TP53INP1基因;PKMYT1基因;DTX4基因;NFYA基因;VEPH1基因;TPCN2基因;ANKRD6基因;GCLC基因;ABCD4基因;AP1G2基因;MFSD10基因;EIF5A2基因;ASB8基因;SLC35F5基因;CGRRF1基因;HES6基因;PIGU基因;TMTC4基因;LMF2基因;MGAT2基因;C1orf112基因;LYRM1基因;TAOK2基因;TFPT基因;MAP3K2基因;FAM193A基因;FUCA2基因;DPF2基因;CAMK2D基因;YIPF1基因;C14orf109基因;TMEM5基因;EED基因;CDK16基因;LRP1基因;TUBB6基因;CDK5基因;THOP1基因;RNF139基因;BRP44L基因;HSD17B10基因;C5orf22基因;GYG1基因;SLC35C1基因;ZBED1基因;SNX29基因;ANXA6基因;CBLL1基因;C11orf82基因;TRMT5基因;ATP6V0D1基因;BARD1基因;ARL6IP4基因;ELOVL6基因;INTS7基因;CHMP1B基因;GNAI2基因;AKT1基因;HSDL2基因;C19orf10基因;TCOF1基因;RBX1基因;EID1基因;IREB2基因;C14orf2基因;NDUFA7基因;PFDN2基因;SNRPA基因;RPS19基因;TMEM208基因;SSNA1基因;RPS23基因;KHSRP基因;EIF1B基因;COX5B基因;PFDN4基因;PDCD5基因;ARFGEF2基因;COX8A基因;RPL26L1基因;SYF2基因;RPL32基因;CPSF2基因;RPLP1基因;IPO4基因;NDUFB6基因;PREP基因;ANAPC7基因;SLU7基因;PDGFA基因;RPS24基因;RPL28基因;RTF1基因;RBM12基因;NAA38基因;CTCF基因;POLR2F基因;RBM27基因;TXNDC17基因;SMARCA4基因;DAAM1基因;SMC2基因;EIF4G3基因;NDUFA13基因;BLOC1S1基因;TIMM10基因;RPL22基因;AGPS基因;RPL27A基因;TIMM8B基因;TOMM5基因;MRPS28基因;BOLA2基因;RBMX2基因;AGFG1基因;NDUFS5基因;HS6ST1基因;SLC35E1基因;LARP4基因;SNRPD2基因;S100A13基因;RPL23A基因;MRP63基因;ABCF1基因;FKBP2基因;GABARAPL2基因;LEPR基因;POLR2L基因;DDX6基因;WHSC1基因;ROCK1基因;MORF4L2基因;TFAM基因;SUPT7L基因;SERTAD2基因;CCDC59基因;LMO4基因;COMMD9基因;RBM19基因;KRR1基因;RPS12基因;NDUFA6基因;NDUFA2基因;FUS基因;HEATR5A基因;ILKAP基因;NTAN1基因;S100A6基因;SDHD基因;NOP10基因;MGST2基因;MCRS1基因;SETD2基因;TARBP2基因;LRRC57基因;RPL27基因;WBSCR22基因;RNMT基因;RPL30基因;PBRM1基因;EARS2基因;PRELP基因;PPP1R14A基因;CSNK1G1基因;KRTCAP2基因;MTOR基因;COX6B1基因;RBM42基因;TFE3基因;RPL23基因;KLF3基因;RC3H1基因;C11orf10基因;SNRPE基因;COX7C基因;XIAP基因;MFSD5基因;TRMT11基因;RPS15A基因;BOLA3基因;RPS25基因;SNRNP200基因;C12orf57基因;WDR26基因;RPL22L1基因;TAF1D基因;DGCR2基因;SPAG7基因;OSBP基因;PDAP1基因;GRHL1基因;CHCHD7基因;NDUFC1基因;KIAA1919基因;GON4L基因;RPS15基因;TMEM69基因;SLC6A8基因;TRIM59基因;PPP6R1基因;PDE6A基因;TCEB2基因;USP25基因;UQCRB基因;QRSL1基因;RAB33B基因;AP4E1基因;POLR2I基因;COX6C基因;MRPL33基因;RPL34基因;KCTD5基因;NDUFB4基因;UBN2基因;ATP5D基因;RPL36AL基因;COX7A2基因;METTL13基因;C15orf63基因;RPL35A基因;NDUFA1基因;RNF145基因;OR7E37P基因;CRIP1基因;PDRG1基因;SNRPG基因;IQSEC1基因;NDUFB2基因;IRF1基因;ATP2B4基因;USP47基因;SHFM1基因;TMEM56基因;NIF3L1基因;UQCR11基因;MED10基因;NDUFB3基因;CMIP基因;TMEM41B基因;TATDN3基因;NUFIP1基因;KLRG2基因;ACAD8基因;RPLP2基因;MRPL52基因;ROMO1基因;RPL31基因;TAF10基因;RPS26基因;CEPT1基因;OSTM1基因;SMARCAD1基因;COMMD6基因;UQCR10基因;RPL36基因;CARD6基因;COX7B基因;ZNF766基因;RPL35基因;POLRMT基因;MRPS21基因;TMF1基因;RNF125基因;IMPDH1基因;UGT8基因;ZRANB1基因;MTRR基因;RPL41基因;MUL1基因;CHURC1基因;C17orf61基因;CCNT2基因;RREB1基因;FAM8A1基因;ATP5J2基因;MYLIP基因;UQCC基因;UQCRQ基因;MRPL24基因;UBL5基因;ATOX1基因;ATP5E基因;RPS28基因;COX17基因;TMEM128基因;USP32基因;YIPF5基因;CHCHD10基因;SPATA5基因;DDX51基因;SEC61G基因;MTX2基因;SLC20A2基因;SRXN1基因;PSTPIP2基因;SNRPF基因;DNAL1基因;RICTOR基因;APOC1基因;CXXC1基因;NOM1基因;DGAT1基因;RPL38基因;RPL37A基因;C1RL基因;TMEM168基因;SMUG1基因;CAMK1D基因;RPS21基因;SMURF2基因;OST4基因;TLR7基因;FLJ13197基因;KIAA1522基因;TAB1基因;FLJ39653基因;CC2D1A基因;SGTB基因;MDM2基因;FAM165B基因;GRIN2D基因;PWWP2A基因;TGFBR1基因;MYEOV2基因;ZNF493基因;SYNJ2基因;ELOVL7基因;TADA1基因;SETD4基因;ANKS4B基因;LARP6基因;C17orf89基因;RIPK4基因;PIN4基因;NR1H3基因;ZSCAN12基因;DPM3基因;NAV2基因;TRIOBP基因;C10orf47基因;SERAC1基因;SLC46A1基因;FBRSL1基因;PTPN23基因;PIF1基因;SPTB基因;ARHGAP26基因;ABI2基因;HMGN5基因;C12orf56基因;RIC8B基因;TDRKH基因;SLC9A6基因;ANKRD13D基因;ZNF426基因;SMYD4基因;CEP97基因;ACTR5基因;ZBTB1基因;VPS18基因;GBAS基因;ZMYND19基因;GALNT7基因;LYRM5基因;ANKS6基因;SS18L1基因;P4HA1基因;MYPOP基因;ZNF99基因;SCARA3基因;MID1基因;PPM1N基因;ZNF700基因;ZFP30基因;TMEM159基因;ZNF333基因;BMP8B基因;TECPR2基因;UPRT基因;CIDEB基因。
所述398个基因的ID_REF如表2第1列所示。
上述试剂盒中,所述398个基因的表达量可为采用Illumina HiSeq2000***进行单细胞测序得到的基因表达量。
上述试剂盒中,所述试剂盒还可包括记载如下内容的载体:检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量,根据所述壁滋养层细胞和所述极滋养层细胞中所述398个基因的表达量的差异对所述人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测。
上述试剂盒中,所述载体可记载有如下内容:如果所述人辅助生殖囊胚(体外人工受精第5天植入前的囊胚)的壁滋养层细胞的398个基因中各个基因的表达量均是所述人辅助生殖囊胚的极滋养层细胞中同一种基因的表达量的两倍以上或二分之一倍以下(具体为表2第1列中前78个基因中各个基因的表达量均是所述人辅助生殖囊胚的极滋养层细胞中同一种基因的表达量的两倍以上,表2第1列中后320个基因中各个基因的表达量均是所述人辅助生殖囊胚的极滋养层细胞中同一种基因的表达量的二分之一倍以下),预示所述人辅助生殖囊胚将正常发育。
上述试剂盒中,所述用于检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量的产品可为进行单细胞测序的产品,例如Illumina HiSeq2000***。
上述试剂盒中,所述辅助生殖囊胚可为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
所述用于检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量的产品在制备所述在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒中的应用也属于本发明的保护范围;所述398个基因具体为表2第1列中所述的398个基因。
上述应用中,所述辅助生殖囊胚可为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
所述用于检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量的产品和所述载体在制备所述在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒中的应用也属于本发明的保护范围;所述398个基因具体为表2第1列中所述的398个基因。
上述应用中,所述辅助生殖囊胚可为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
明确人辅助生殖技术对胎盘发育的影响,主要是发现在人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量差异。如果人辅助生殖囊胚(体外人工受精第5天植入前的囊胚)的壁滋养层细胞的398个基因中各个基因的表达量均是所述人辅助生殖囊胚的极滋养层细胞的398个基因中同一种基因的表达量的两倍以上或二分之一倍以下,预示所述人辅助生殖囊胚将正常发育和孕妇正常分娩;否则所述人辅助生殖囊胚将不正常发育,影响儿童健康和出现围产期合并症;这种可能性随着人辅助生殖囊胚中398个基因的差异程度增加而风险增加。本发明的主要贡献是科学判断移植策略和决策,减少辅助生殖中孕妇围产期合并症和患病儿童的可能性。
附图说明
图1为囊胚形态图。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。
研究内容和标本收集得到北京积水潭医院科学研究伦理委员会的批准(医伦审:2014075)。
Illumina HiSeq2000***为上海仁科生物科技有限公司的产品。1×Expand HighFidelity PCR缓冲液为罗氏公司的产品,产品目录号为11732641001。
全细胞裂解缓冲液:含0.1%(0.1mg/100mL)SDS、150mmol/L NaCl和1.0mmol/LEDTA的pH7.5、50mmol/L Tris-HCl缓冲溶液。
一、采用常规方法(即Gardner评分***)筛选优质囊胚
优质囊胚是指具有较好的发育潜力、具有植入正常子宫内膜潜力、未来发育成正常胚胎且没有围产期合并症及不良妊娠结局的囊胚。
本发明的发明人采用Gardner评分***(通过肉眼分辨进行评分)筛选优质囊胚,具体步骤如下:
1、按照北京积水潭医院生殖中心的常规超***的方案,获得卵子。
2、取卵子,根据患者情况进行自然授精。
3、取卵子的第24h,观察受精情况。
4、取卵子的第72h,采用Gardner评分***筛选优质囊胚。优质囊胚在Gardner评分***中的评分为5AA。
Gardner评分***如下:(1)根据囊腔扩张程度进行分期:囊腔不足胚胎的50%为1期,囊腔超过胚胎的50%为2期,囊腔占满整个胚胎为3期,囊胚扩张透明带变薄为4期,囊胚开始孵化为5期,囊胚完全孵出为6期;(2)对步骤(1)中4~6期的囊胚进行内细胞团评分:A为细胞数目多、排列紧密,B为细胞数目较少、排列松散,C为细胞数目很少;(3)对步骤(1)中4~6期的囊胚进行滋养外胚层细胞评分:A为细胞数目多、囊腔四周均有细胞、排列紧密,B为细胞数较少、排列较松,C为细胞数目很少。
5、完成步骤4后,将部分优质囊胚分别进行移植。
对移植入优质囊胚的20个辅助生殖妇女进行持续追踪回访,20个妇女均正常分娩,对孩子持续追踪回访至1岁半,孩子各项指标均正常。
6、完成步骤4后,取未进行移植的20个优质囊胚,继续培养至受精的第5d,然后在显微镜下观察形态,将20个优质囊胚(均具有光滑的滋养外胚层和发育良好的囊胚腔)进行冷冻保存。
优质囊胚在受精的第5d的形态见图1(PTE为极滋养层细胞,MTE为壁滋养层细胞)。
20个研究样本(即20个优质囊胚)的捐赠夫妇均签署书面知情同意书,知情同意书确认患者自愿捐赠囊胚用于人类早期胚胎发育机制研究,并被告知捐赠囊胚可能带来的潜在风险。20个研究样本的母亲的年龄在25岁-35岁之间,且均因输卵管因素导致的***,20个研究样本的父亲的***均检测正常。
二、检测优质囊胚中各个基因的表达量
1、滋养层细胞分离
分离微吸管和吸取微吸管均是将硬质玻璃微电极毛坯(日本Narishige公司的产品)拉制而成的,直径分别为1-2μm和10-20μm。
取步骤一冷冻保存的20个研究样本,先在20倍物镜×10倍目镜下找到细胞,然后在60倍物镜×10倍目镜下采用分离微吸管机械分离极滋养层细胞或壁滋养层细胞,并送入吸取微吸管内,再转移到含有1×Expand High Fidelity PCR缓冲液的Eppendorf管中。
从这20个研究样本,共分离了8个壁滋养层细胞和9个极滋养层细胞。
2、单细胞测序和基因表达量的获得
分别取步骤1分离的8个壁滋养层细胞和9个极滋养层细胞,采用IlluminaHiSeq2000***进行单细胞测序,获得各个细胞的全基因组DNA中各个基因的表达量。具体步骤如下:
(1)制备单细胞cDNA
采用逐步单细胞RNA-Seq方法制备单细胞cDNA:将微吸管挑选的单细胞转移到全细胞裂解缓冲液中,先使用末端脱氧核苷酸转移酶在第一链cDNA的3'末端添加多聚(A)尾并以其作为模板,以含有部分接头序列的通用引物UPM(universal primer,UPM)进行PCR扩增反应(共30个循环),得到单细胞cDNA。
(2)制备RNA-Seq文库
取200ng单细胞cDNA,剪切成150bp-350bp的片段,然后按照TrueSeq DNA文库准备试剂盒(Illumina公司的产品)的操作步骤,制备测序文库。
(3)测序
将步骤(2)制备的测序文库进行测序。
每个滋养层细胞获得20-60万个100bp的读数。基因片段的读取,从UCSC GenomeBrowser(http://genome.ucsc.edu)下载hg19RefSeq,采用Burrows-Wheeler Aligner[5,6](BWA,Version 0.5.9-r16)将筛选的数据与hg19RefSeq进行对比,获得已知基因(UCSChg19,http://genome.ucsc.edu)的表达量。
3、基因注释
基因功能注释与功能富集采用DAVID(http://david.abcc.ncifcrf.gov/)和生物分子功能注释***MAS 3.0(http://bioinfo.capitalbio.com/mas3/)进行。
4、统计学方法
用SPSS 16.0统计软件进行统计学处理,数据以均数±标准差表示,Student's,t检验分析各实验数据,p<0.05为差异有统计学意义。
8个壁滋养层细胞和9个极滋养层细胞的398个基因的表达量的结果见表1(m1-m8为8个壁滋养层细胞,p1-p9为9个极滋养层细胞)。壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因表达量的均值和标准差见表2(M标准差为壁滋养层细胞的标准差,P标准差为极滋养层细胞的标准差)。398个基因在壁滋养层细胞和极滋养层细胞中的表达量的比值见表3。
表1
表2
表3
结果表明,在囊胚(辅助生殖技术中受精第5d、植入前的囊胚)中,398个基因在壁滋养层细胞中的表达量均为在极滋养层细胞中的表达量的两倍以上或二分之一倍以下,其中78个基因在壁滋养层细胞中的表达量均为在极滋养层细胞中的表达量的两倍以上,320个基因在壁滋养层细胞中的表达量均为在极滋养层细胞中的表达量的二分之一倍以下。

Claims (8)

1.一种在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒,包括用于检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量的产品;所述398个基因为人的下述基因:SCARB1基因;PPP3CA基因;EVL基因;CAPG基因;PLCG2基因;DIP2C基因;INA基因;HAUS8基因;BPHL基因;IFT74基因;FANCG基因;PSKH1基因;PDE8A基因;DLX3基因;SLC35E3基因;FBXO36基因;ZNF7基因;TNFAIP1基因;TP53INP1基因;PKMYT1基因;DTX4基因;NFYA基因;VEPH1基因;TPCN2基因;ANKRD6基因;GCLC基因;ABCD4基因;AP1G2基因;MFSD10基因;EIF5A2基因;ASB8基因;SLC35F5基因;CGRRF1基因;HES6基因;PIGU基因;TMTC4基因;LMF2基因;MGAT2基因;C1orf112基因;LYRM1基因;TAOK2基因;TFPT基因;MAP3K2基因;FAM193A基因;FUCA2基因;DPF2基因;CAMK2D基因;YIPF1基因;C14orf109基因;TMEM5基因;EED基因;CDK16基因;LRP1基因;TUBB6基因;CDK5基因;THOP1基因;RNF139基因;BRP44L基因;HSD17B10基因;C5orf22基因;GYG1基因;SLC35C1基因;ZBED1基因;SNX29基因;ANXA6基因;CBLL1基因;C11orf82基因;TRMT5基因;ATP6V0D1基因;BARD1基因;ARL6IP4基因;ELOVL6基因;INTS7基因;CHMP1B基因;GNAI2基因;AKT1基因;HSDL2基因;C19orf10基因;TCOF1基因;RBX1基因;EID1基因;IREB2基因;C14orf2基因;NDUFA7基因;PFDN2基因;SNRPA基因;RPS19基因;TMEM208基因;SSNA1基因;RPS23基因;KHSRP基因;EIF1B基因;COX5B基因;PFDN4基因;PDCD5基因;ARFGEF2基因;COX8A基因;RPL26L1基因;SYF2基因;RPL32基因;CPSF2基因;RPLP1基因;IPO4基因;NDUFB6基因;PREP基因;ANAPC7基因;SLU7基因;PDGFA基因;RPS24基因;RPL28基因;RTF1基因;RBM12基因;NAA38基因;CTCF基因;POLR2F基因;RBM27基因;TXNDC17基因;SMARCA4基因;DAAM1基因;SMC2基因;EIF4G3基因;NDUFA13基因;BLOC1S1基因;TIMM10基因;RPL22基因;AGPS基因;RPL27A基因;TIMM8B基因;TOMM5基因;MRPS28基因;BOLA2基因;RBMX2基因;AGFG1基因;NDUFS5基因;HS6ST1基因;SLC35E1基因;LARP4基因;SNRPD2基因;S100A13基因;RPL23A基因;MRP63基因;ABCF1基因;FKBP2基因;GABARAPL2基因;LEPR基因;POLR2L基因;DDX6基因;WHSC1基因;ROCK1基因;MORF4L2基因;TFAM基因;SUPT7L基因;SERTAD2基因;CCDC59基因;LMO4基因;COMMD9基因;RBM19基因;KRR1基因;RPS12基因;NDUFA6基因;NDUFA2基因;FUS基因;HEATR5A基因;ILKAP基因;NTAN1基因;S100A6基因;SDHD基因;NOP10基因;MGST2基因;MCRS1基因;SETD2基因;TARBP2基因;LRRC57基因;RPL27基因;WBSCR22基因;RNMT基因;RPL30基因;PBRM1基因;EARS2基因;PRELP基因;PPP1R14A基因;CSNK1G1基因;KRTCAP2基因;MTOR基因;COX6B1基因;RBM42基因;TFE3基因;RPL23基因;KLF3基因;RC3H1基因;C11orf10基因;SNRPE基因;COX7C基因;XIAP基因;MFSD5基因;TRMT11基因;RPS15A基因;BOLA3基因;RPS25基因;SNRNP200基因;C12orf57基因;WDR26基因;RPL22L1基因;TAF1D基因;DGCR2基因;SPAG7基因;OSBP基因;PDAP1基因;GRHL1基因;CHCHD7基因;NDUFC1基因;KIAA1919基因;GON4L基因;RPS15基因;TMEM69基因;SLC6A8基因;TRIM59基因;PPP6R1基因;PDE6A基因;TCEB2基因;USP25基因;UQCRB基因;QRSL1基因;RAB33B基因;AP4E1基因;POLR2I基因;COX6C基因;MRPL33基因;RPL34基因;KCTD5基因;NDUFB4基因;UBN2基因;ATP5D基因;RPL36AL基因;COX7A2基因;METTL13基因;C15orf63基因;RPL35A基因;NDUFA1基因;RNF145基因;OR7E37P基因;CRIP1基因;PDRG1基因;SNRPG基因;IQSEC1基因;NDUFB2基因;IRF1基因;ATP2B4基因;USP47基因;SHFM1基因;TMEM56基因;NIF3L1基因;UQCR11基因;MED10基因;NDUFB3基因;CMIP基因;TMEM41B基因;TATDN3基因;NUFIP1基因;KLRG2基因;ACAD8基因;RPLP2基因;MRPL52基因;ROMO1基因;RPL31基因;TAF10基因;RPS26基因;CEPT1基因;OSTM1基因;SMARCAD1基因;COMMD6基因;UQCR10基因;RPL36基因;CARD6基因;COX7B基因;ZNF766基因;RPL35基因;POLRMT基因;MRPS21基因;TMF1基因;RNF125基因;IMPDH1基因;UGT8基因;ZRANB1基因;MTRR基因;RPL41基因;MUL1基因;CHURC1基因;C17orf61基因;CCNT2基因;RREB1基因;FAM8A1基因;ATP5J2基因;MYLIP基因;UQCC基因;UQCRQ基因;MRPL24基因;UBL5基因;ATOX1基因;ATP5E基因;RPS28基因;COX17基因;TMEM128基因;USP32基因;YIPF5基因;CHCHD10基因;SPATA5基因;DDX51基因;SEC61G基因;MTX2基因;SLC20A2基因;SRXN1基因;PSTPIP2基因;SNRPF基因;DNAL1基因;RICTOR基因;APOC1基因;CXXC1基因;NOM1基因;DGAT1基因;RPL38基因;RPL37A基因;C1RL基因;TMEM168基因;SMUG1基因;CAMK1D基因;RPS21基因;SMURF2基因;OST4基因;TLR7基因;FLJ13197基因;KIAA1522基因;TAB1基因;FLJ39653基因;CC2D1A基因;SGTB基因;MDM2基因;FAM165B基因;GRIN2D基因;PWWP2A基因;TGFBR1基因;MYEOV2基因;ZNF493基因;SYNJ2基因;ELOVL7基因;TADA1基因;SETD4基因;ANKS4B基因;LARP6基因;C17orf89基因;RIPK4基因;PIN4基因;NR1H3基因;ZSCAN12基因;DPM3基因;NAV2基因;TRIOBP基因;C10orf47基因;SERAC1基因;SLC46A1基因;FBRSL1基因;PTPN23基因;PIF1基因;SPTB基因;ARHGAP26基因;ABI2基因;HMGN5基因;C12orf56基因;RIC8B基因;TDRKH基因;SLC9A6基因;ANKRD13D基因;ZNF426基因;SMYD4基因;CEP97基因;ACTR5基因;ZBTB1基因;VPS18基因;GBAS基因;ZMYND19基因;GALNT7基因;LYRM5基因;ANKS6基因;SS18L1基因;P4HA1基因;MYPOP基因;ZNF99基因;SCARA3基因;MID1基因;PPM1N基因;ZNF700基因;ZFP30基因;TMEM159基因;ZNF333基因;BMP8B基因;TECPR2基因;UPRT基因;CIDEB基因。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括记载如下内容的载体:检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量,根据所述壁滋养层细胞和所述极滋养层细胞中所述398个基因的表达量的差异对所述人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测。
3.如权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于:所述载体记载有如下内容:如果人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞的398个基因中各个基因的表达量均是所述人辅助生殖囊胚的极滋养层细胞中同一种基因的表达量的两倍以上或二分之一倍以下,预示所述人辅助生殖囊胚将正常发育。
4.如权利要求1至3任一所述的试剂盒,其特征在于:所述辅助生殖囊胚为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
5.用于检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量的产品在制备权利要求1至4任一所述试剂盒中的应用;所述398个基因为权利要求1中所述的398个基因。
6.如权利要求5所述的应用,其特征在于:所述辅助生殖囊胚为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
7.用于检测人辅助生殖囊胚的壁滋养层细胞和极滋养层细胞中398个基因的表达量的产品和权利要求2或3中所述的载体在制备权利要求1至4任一所述试剂盒中的应用;所述398个基因为权利要求1中所述的398个基因。
8.如权利要求7所述的应用,其特征在于:所述辅助生殖囊胚为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
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Cited By (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109182561A (zh) * 2018-12-03 2019-01-11 吉林大学 Arhgap26作为牛超数***性状分子标记的应用
CN109988845A (zh) * 2019-01-30 2019-07-09 江苏万成生物医学研究院有限公司 一种新的胃癌标志物circ-EIF4G3的应用
CN110055328A (zh) * 2019-03-28 2019-07-26 昆明医科大学第一附属医院 一种基于代谢基因谱的肺腺癌诊断标志物
CN111157745A (zh) * 2020-01-17 2020-05-15 上海交通大学 人snrpa蛋白在肺癌复发或转移监测中的用途
CN112899360A (zh) * 2021-02-02 2021-06-04 北京航空航天大学 一种检测特雷彻·柯林斯综合征发生概率的组合物的应用方法
CN117721222A (zh) * 2024-02-07 2024-03-19 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院) 一种单细胞转录组预测胚胎着床的方法及应用

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20100323442A1 (en) * 2006-10-17 2010-12-23 Emmanuel Edward Baetge Modulation of the phosphatidylinositol-3-kinase pathway in the differentiation of human embryonic stem cells
CN104561309A (zh) * 2015-01-04 2015-04-29 北京大学第三医院 一种来自人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒
CN105861658A (zh) * 2016-04-12 2016-08-17 中国科学院北京基因组研究所 一种筛选优良发育囊胚的无创检测方法

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20100323442A1 (en) * 2006-10-17 2010-12-23 Emmanuel Edward Baetge Modulation of the phosphatidylinositol-3-kinase pathway in the differentiation of human embryonic stem cells
CN104561309A (zh) * 2015-01-04 2015-04-29 北京大学第三医院 一种来自人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒
CN105861658A (zh) * 2016-04-12 2016-08-17 中国科学院北京基因组研究所 一种筛选优良发育囊胚的无创检测方法

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
LIYING YAN等: "Single-cell RNA-Seq profiling of human preimplantation embryos and embryonic stem cells", 《NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY》 *

Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109182561A (zh) * 2018-12-03 2019-01-11 吉林大学 Arhgap26作为牛超数***性状分子标记的应用
CN109182561B (zh) * 2018-12-03 2022-03-04 吉林大学 Arhgap26作为牛超数***性状分子标记的应用
CN109988845A (zh) * 2019-01-30 2019-07-09 江苏万成生物医学研究院有限公司 一种新的胃癌标志物circ-EIF4G3的应用
CN110055328A (zh) * 2019-03-28 2019-07-26 昆明医科大学第一附属医院 一种基于代谢基因谱的肺腺癌诊断标志物
CN111157745A (zh) * 2020-01-17 2020-05-15 上海交通大学 人snrpa蛋白在肺癌复发或转移监测中的用途
CN112899360A (zh) * 2021-02-02 2021-06-04 北京航空航天大学 一种检测特雷彻·柯林斯综合征发生概率的组合物的应用方法
CN117721222A (zh) * 2024-02-07 2024-03-19 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院) 一种单细胞转录组预测胚胎着床的方法及应用
CN117721222B (zh) * 2024-02-07 2024-05-10 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院) 一种单细胞转录组预测胚胎着床的方法及应用

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