CN107356556A - 一种近红外光谱定量分析的双集成建模方法 - Google Patents

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卞希慧
邱建明
刘鹏
谭小耀
李明
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    • G01N21/25Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
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Abstract

本发明涉及一种近红外光谱定量分析的双集成建模方法,具体步骤如下:收集一定数目的被测样品,采集样品的近红外光谱,采取一定的分组方式将数据分为训练集和预测集;利用蒙特卡罗采样法从训练集中选取一定数目的样品作为训练子集;采用萤火虫算法从该训练子集中进一步选取部分变量作为样品‑变量子集,建立偏最小二乘模型;多次迭代建立若干模型;对所有模型的结果进行简单平均得到最终预测结果。本发明采用双集成建模方法,提高了近红外光谱定量分析的预测精度及稳定性。本发明适用于化工、中药和食品等复杂样品的定量分析领域。

Description

一种近红外光谱定量分析的双集成建模方法
技术领域
本发明属于分析化学领域的化学计量学建模技术,具体涉及一种近红外光谱定量分析的双集成建模方法。
背景技术
近红外光谱技术具有分析速度快、操作简单、绿色无损等优势而广泛应用于农业、化工、制药、食品、环境保护等各个领域。但是复杂样品的近红外光谱吸收较弱,谱峰重叠严重,存在背景、噪音等干扰信息,并且易受测量条件、样品状态等的影响,因此需要借助化学计量学才能对复杂样品进行定量分析。采用化学计量学对未知样品进行定量分析时,预测结果的好坏主要依赖于模型的质量。因此建立高质量的模型是化学计量学的重要研究内容。
化学计量学常用的建模方法有多元线性回归、偏最小二乘回归法、人工神经网络等。这些传统建模方法仅采用一个最优的模型对未知样品预测,在样品数较少或干扰严重时预测精度和稳定性往往不能令人满意,因此发展了集成建模技术。集成建模技术就是从同一训练集中产生多个训练子集,然后利用这些训练子集建立多个子模型分别进行预测,并将多个预测结果通过一定的方式集成,得到一个最终预测结果。
大多数集成建模方法都从样品方向进行集成如bagging ELM(卞希慧,李淑娟,谭小耀,王江江,王治国,刘维国,陈宗蓬,王晨,极限学习机集成建模方法,2015,中国专利,ZL201510466504),boosting PLS(卞希慧,刘巍,王秋男,谭小耀,郭玉高,一种近红外光谱的多模型建模方法,中国发明专利,2017,ZL201310537968.3)等,或从变量方向进行集成(C.Tan,Qin,M.Li,Subspace regression ensemble method based on variableclustering for near-infrared spectroscopic calibration,Analytical Letters,1009,42:1693-1710)。如果从样品和变量双方向同时进行集成,可进一步产生多样性的子模型,提高模型预测精度。
发明内容
本发明的目的是针对传统建模方法预测精度和稳定性低的问题,提出一种近红外光谱定量分析的双集成建模方法(蒙特卡罗-萤火虫算法-偏最小二乘法,MC-FA-PLS),具体流程如图1所示,以提高对未知样品定量分析的预测精度及稳定性,为近红外光谱定量分析提供了一种新方法。
本发明利用蒙特卡罗采样法(MC)选取一定数量的样品作为训练子集,采用萤火虫算法(FA)从该训练子集中选取部分变量作为样品-变量子集,建立偏最小二乘模型(PLS)。多次迭代建立若干模型。对所有模型的结果进行简单平均得到最终预测结果。
为实现本发明所提供的技术方案包括以下步骤:
(1)收集一定数目的被测样品,采集样品的近红外光谱,用常规方法测定目标组分含量;采用一定的分组方式将数据分为训练集和预测集;
(2)利用蒙特卡罗采样法从训练集中选取一定数目的样品作为训练子集;
(3)进行萤火虫算法参数调优,采用萤火虫算法从训练子集中选取部分变量作为样品-变量子集;
(4)确定偏最小二乘因子数,建立偏最小二乘模型;
多次重复步骤(2)-(4),建立T个模型;
(5)对所有模型的结果进行简单平均得到最终预测结果。
偏最小二乘因子数的确定方法为:因子数分别从1取25,间隔为1,利用公式(1)计算不同因子数下的交叉验证均方根误差(RMSECV)。采用蒙特卡罗交叉验证及F检验得到最佳的因子数。
m为样品总数,为第i个样品的预测值,yi为第i个样品的真实值。
本发明中,最佳波段数的确定方法为:将训练集光谱划分为5~30个波段数,波段间隔为5,分别计算在不同段数下的一系列预测均方根误差(RMSEP)。RMSEP值最小时对应的段数为最佳波段数。
本发明中,萤火虫算法最佳种群数的确定方法为:种群数n的取值范围为10~60,间隔为10,分别计算在不同种群数下的一系列RMSEP值。RMSEP值最小时对应的种群数为最佳种群数。
本发明中,萤火虫算法最佳环境吸光度的确定方法为:环境吸光度γ的取值范围为0.1~1.2,间隔为0.1,分别计算在不同环境吸光度下的一系列RMSEP值。RMSEP值最小时对应的环境吸光度为最佳环境吸光度。
本发明中,萤火虫算法最佳常数的确定方法为:常数α的取值范围为0.1~1,间隔为0.1,分别计算在不同常数下的一系列RMSEP值。RMSEP值最小时对应的常数为最佳常数。
本发明中,所述T个子模型的个数的确定方法为:给定一个足够大的子模型数目值,固定每个数据集的训练子集样品数为总样品数的50%,分别计算在不同子模型个数下的一系列RMSEP值,当RMSEP值几乎不变时所对应的子模型个数为所需的个数T。
本发明中,训练子集的样品数目的确定方法为:固定子模型个数,分别从训练集中选取其样品总数的10%~100%作为训练子集,间隔为5%,分别计算在不同训练子集下的一系列RMSEP值,RMSEP最小时对应的样品数目,即为所需的训练子集样品数。
本发明的优点是:该建模方法能有效地改善模型的预测能力,提高模型的预测精度及稳定性。本发明方法适用于石油、食品、中药等复杂样品的定量分析。
附图说明
图1是MC-FA-PLS的算法流程图
图2是三元混合物数据的RMSEP值随波段数的变化图
图3是三元混合物数据的RMSEP值随种群数n的变化图
图4是三元混合物数据的RMSEP值随环境吸光度γ的变化图
图5是三元混合物数据的RMSEP值随常数α的变化图
图6是三元混合物数据的RMSEP值随子模型个数的变化图
图7是三元混合物数据的RMSEP值随训练子集大小的变化图
图8是三元混合物数据的80个子模型选择的波长点分布图
图9是三元混合物数据采用MC-FA-PLS运行20次的预测值的平均值与真实值的关系图
图10是燃油数据的RMSEP值随子模型个数的变化图
图11是燃油数据的RMSEP值随训练子集大小的变化图
图12是燃油数据的80个子模型选择的波长点分布图
图13是燃油数据采用MC-FA-PLS运行20次的预测值的平均值与真实值的关系图
具体实施方式
为更好理解本发明,下面结合实施例对本发明做进一步地详细说明,但是本发明要求保护的范围并不局限于实施例所表示的范围。
实施例1:
本实施例是应用近红外光谱数据分析,对乙醇、水和异丙醇的三元混合物样品中异丙醇含量的测定,具体步骤如下:
(1)收集95个乙醇、水和异丙醇的三元混合物样品,采集三元混合物的近红外光谱数据,光谱范围850-1049nm,间隔1nm,包含200个数据点,光谱采用HP-8453分光光度计测定。采用网站上对数据集的划分的描述,65个样品用作训练集,30个样品用作预测集;
(2)利用蒙特卡罗采样法从训练集中选取一定数目的样品作为训练子集;
(3)进行萤火虫算法参数调优,采用萤火虫算法从训练子集中选取部分变量作为样品-变量子集;
(4)确定偏最小二乘因子数,建立偏最小二乘模型;
多次重复步骤(2)-(4),建立T个模型;
(5)通过对所有模型的结果进行简单平均得到最终预测结果。
偏最小二乘因子数的确定方法为:因子数分别从1取25,间隔为1,利用公式(1)计算不同因子数下的RMSECV。采用蒙特卡罗交叉验证及F检验得到最佳的因子数,
m为样品总数,为第i个样品的预测值,yi为第i个样品的真实值。计算得因子数为7。
最佳波段数的确定方法为:将训练集光谱划分为5~30个波段数,波段间隔为5,分别计算在不同段数下的一系列RMSEP。RMSEP值最小时对应的波段数为最佳波段数。该实施例中RMSEP值随着波段数的变化如图2所示,当波段数为10时,RMSEP值最小,故本实施例的最佳波段数为10。
萤火虫算法最佳种群数的确定方法为:种群数n的取值范围为10~60,间隔为10,分别计算在不同种群数下的一系列RMSEP值。RMSEP值最小时对应的种群数为最佳种群数。该实施例中RMSEP值随着种群数的变化如图3所示,当种群数为20时,RMSEP值最小,故本实施例的最佳种群数为20。
萤火虫算法最佳环境吸光度的确定方法为:环境吸光度γ的取值范围为0.1~1.2,间隔为0.1,分别计算在不同环境吸光度下的一系列RMSEP值。RMSEP值最小时对应的环境吸光度为最佳环境吸光度。该实施例中RMSEP值随着环境吸光度的变化如图4所示,当环境吸光度为0.7时,RMSEP值最小,故本实施例的最优环境吸光度为0.7。
萤火虫算法最佳常数的确定方法为:常数α的取值范围为0.1~1,间隔为0.1,分别计算在不同常数下的一系列RMSEP值。RMSEP值最小时对应的常数为最佳常数。该实施例中RMSEP值随着常数的变化如图5所示,当常数为0.3时,RMSEP值最小,所故本实施例的最佳常数为0.3。
所述T个子模型的个数的确定方法为:固定每个数据集的训练子集样品数为总样品数的50%,给定100个子模型数目值,分别计算在不同子模型个数下的一系列RMSEP值,RMSEP值几乎不变时对应的子模型个数为所需建立的子模型个数。该实施例中RMSEP值随着子模型个数的变化如图6所示,当子模型个数为80以后,RMSEP值几乎不变,即所需建立的子模型个数为80。
训练子集的样品数目的确定方法为:固定子模型个数80,分别从训练集中选取其按样品数的10%~100%作为训练子集,间隔为5%,分别计算在不同训练子集下的一系列RMSEP值,RMSEP最小时对应的样品数目,即为所需的训练子集样品数。该实施例中RMSEP值随着训练子集样品百分数的变化如图7所示,当训练子集样品数达到训练样品总数的85%时,RMSEP值最小,故选取训练子集样品数为总样品数的85%。
图8显示了该实施例80个子模型选择的波长点分布图。从图中可以看出,所有子模型选择的波长点大部分相同,但每个子模型选择的波长点又有差异性,保证了子模型的多样性。MC-FA-PLS模型的对预测集预测的相关系数为0.9922,而PLS模型的对预测集预测的相关系数为0.9919。通过比较可以得出MC-FA-PLS具有更好的预测精度。对FA-PLS和MC-FA-PLS分别重复运行20次,FA-PLS的标准偏差为0.017,MC-FA-PLS的标准偏差为0.012,通过比较可以得出MC-FA-PLS的稳定性优于FA-PLS。图9显示了对MC-FA-PLS重复进行20次运算对预测及预测的平均预测值与真实值的关系,从图中可以看出MC-FA-PLS的预测准确度高,稳定性好。
实施例2
本实施例是应用近红外光谱数据分析,对燃油样品密度的测定,具体步骤如下:
1)收集263个燃油样品,采集燃油样品的近红外光谱数据。光谱范围750-1550nm,采样间隔2nm,包含400个数据点,根据美国测试和材料协会(American Society ofTesting and Materials,ASTM)的标准分别测定,下载网址:http://software.eigenvector.com/Data/SWRI/index.html。采用网站上对数据集划分的描述,142个样品用作训练集,121个样品用作预测集;
(2)利用蒙特卡罗采样法从训练集中选取一定数目的样品作为训练子集;
(3)进行萤火虫算法参数调优,采用萤火虫算法从训练子集中选取部分变量作为样品-变量子集;
(4)确定偏最小二乘因子数,建立偏最小二乘模型;
多次重复步骤(2)-(4),建立T个模型;
(5)通过对所有模型的结果进行简单平均得到最终预测结果。
偏最小二乘因子数的确定方法为:因子数分别从1取25,间隔为1,利用公式(1)计算不同因子数下的RMSECV。采用蒙特卡罗交叉验证及F检验得到最佳因子数,
m为样品总数,为第i个样品的预测值,yi为第i个样品的真实值。计算得因子数为9。
最佳波段数的确定方法为:将训练集光谱划分为5~30个波段数,波段间隔为5,分别计算在不同波段数下的一系列RMSEP。RMSEP值最小时对应的波段数为最佳波段数。该实施例中观察RMSEP随着波段数的变化,当波段数为20时,RMSEP值最小,故本实施例的最佳波段数为20。
萤火虫算法最佳种群数的确定方法为:种群数n的取值范围为10~60,间隔为10,分别计算在不同种群数下的一系列RMSEP值。RMSEP值最小时对应的种群数为最佳种群数。该实施例中观察RMSEP值随着种群数的变化,当种群数为40时,RMSEP值最小,故本实施例的最佳种群数为40。
萤火虫算法最佳环境吸光度的确定方法为:环境吸光度γ的取值范围为0.1~1.2,间隔为0.1,分别计算在不同环境吸光度下的一系列RMSEP值。RMSEP值最小时对应的环境吸光度为最佳环境吸光度。该实施例中观察RMSEP值随着环境吸光度的变化,当环境吸光度为0.9时,RMSEP值最小,故本实施例的最佳环境吸光度为0.9。
萤火虫算法最佳常数的确定方法为:常数α的取值范围为0.1~1,间隔为0.1,分别计算在不同常数下的一系列RMSEP值。RMSEP值最小时对应的常数为最佳常数。该实施例中观察RMSEP值随着常数的变化,当常数为0.5时,RMSEP值最小,故本实施例的最佳常数为0.5。
所述T个子模型的个数的确定方法为:固定每个数据集的训练子集样品数为总样品数的50%,给定100个子模型数目值,分别计算在不同子模型个数下的一系列RMSEP值,RMSEP值几乎不变时对应的子模型个数为所需建立的子模型个数。该实施例中RMSEP值随着子模型个数的变化如图10所示,当子模型个数为80以后,RMSEP值几乎不变,即所需建立的子模型个数为80。
训练子集的样品数目的确定方法为:固定子模型个数80,分别从训练集中选取其按样品数的10%~100%作为训练子集,间隔为5%,分别计算在不同训练子集下的一系列RMSEP值,RMSEP最小时对应的样品数目,即为所需的训练子集样品数。该实施例中RMSEP值随着训练子集样品百分数的变化如图11所示,当训练子集样品数达到训练样品总数的80%时,RMSEP值最小,故选取训练子集样品数为总样品数的80%。
图12显示了该实施例80个子模型选择的波长点分布图。从图中可以看出,所有子模型选择的波长点大部分相同,但每个子模型选择的波长点又有差异性,保证了子模型的多样性。MC-FA-PLS模型的对预测集预测的相关系数为0.9856,而PLS模型的对预测集预测的相关系数为0.9687。通过比较可以得出MC-FA-PLS具有更好的预测精度。对FA-PLS和MC-FA-PLS分别重复运行20次,FA-PLS的标准偏差为0.0019,MC-FA-PLS的标准偏差为0.0017,通过比较可以得出MC-FA-PLS的稳定性优于FA-PLS。图13显示了对MC-FA-PLS重复进行20次运算对预测及预测的平均预测值与真实值的关系,从图中可以看出MC-FA-PLS的预测准确度高,稳定性好。

Claims (3)

1.一种近红外光谱定量分析的双集成建模方法,其特征在于具体步骤为:
(1)收集一定数目的被测样品,采集样品的近红外光谱,采用常规方法测定目标组分含量;采取一定的分组方式将数据分为训练集和预测集;
(2)利用蒙特卡罗采样法从训练集中选取一定数目的样品作为训练子集;
(3)进行萤火虫算法参数调优,采用萤火虫算法从训练子集中选取部分变量作为样品-变量子集;
(4)确定偏最小二乘因子数,建立偏最小二乘模型;
多次重复步骤(2)-(4),建立T个模型;
(5)对所有模型的结果进行简单平均得到最终预测结果。
2.根据权利要求1所述的一种近红外光谱定量分析的双集成建模方法,其特征在于:所述T个子模型的个数的确定方法为:给定一个足够大的子模型数目值,固定每个数据集的训练子集样品数为总样品数的50%,分别计算在不同子模型个数下的一系列RMSEP值,当RMSEP值几乎不变时对应的子模型个数为所需的子模型个数T。
3.根据权利要求1所述的一种近红外光谱定量分析的双集成建模方法,其特征在于:所述训练子集的样品数目的确定方法为:固定子模型个数,按样品数的10%~100%,间隔为5%,分别计算在不同训练子集下的一系列RMSEP值,RMSEP最小对应的样品数目为所需的训练子集样品数。
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