CN107287256A - 全细胞催化合成l-2-哌啶甲酸的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明属于生物催化技术领域,具体涉及全细胞催化合成L‑2‑哌啶甲酸的方法。本发明所公开的全细胞生物催化合成L‑2‑哌啶甲酸的方法是以L‑赖氨酸盐酸盐为底物,通过添加烟酰胺腺嘌呤二核苷酸及含有Arenimonas donghaensis DSM 18148蛋白编码基因的重组宿主菌、或者含有Pseudomonas veronii CIP104663蛋白编码基因的重组宿主菌或者含有Streptomyces hirsutus ATCC 19091蛋白编码基因的重组宿主菌,通过生物催化制备L‑2‑哌啶甲酸。从而克服了目前化学合成法成本高、条件苛刻、转化率低、能耗高、污染大的问题。同时本发明所公开的生物催化***酶活效率高,反应时间短,目标产物ee值高。
Description
技术领域
本发明属于生物催化技术领域,具体涉及全细胞催化合成L-2-哌啶甲酸的方法。
背景技术
L-2-哌啶甲酸是一种天然存在的非蛋白质构型氨基酸,是重要的手性药物中间体,可用于制备雷帕霉素,抗肿瘤剂VX-710,免疫抑制剂FK506,哌啶生物碱等,具有很高的产业化应用价值。目前的主要生产方法为化学合成,存在产率低,能耗高,污染大等缺点。同时ee值难以控制。
Fujii等利用重组表达L-赖氨酸-6-氨基转移酶和二氢吡咯-5-羧酸酯还原酶的大肠杆菌工程菌,在159小时积累到了3.9g/L产物。后续通过添加lysP赖氨酸透性酶和yeiE,在111小时最高积累到16g/L。该方案主要问题为反应时间过长,产物生成量过少,实际生产成本过高,难以放大生产。
Yasushi Tani等人通过共表达LysR,rAIP,DpkA,GDH等共四个蛋白,实现了从DL-lysine到L-2-哌啶甲酸的转化,46小时产物转化率达到87.4%,但涉及到多个蛋白的共表达,存在菌种构建难度大,重复性差等缺点。
Ying等利用含有pipA基因的大肠杆菌做为全细胞催化剂,并优化NAD浓度,反应温度,反应pH,金属离子以及表达活性剂添加等,最终产物可达到17.25g/L。该方案中pipA酶活不高,导致了使用全细胞量过多(OD=200),底物浓度不高(赖氨酸25g/L),并且需要分批次添加底物才能反应完全。这些因素会导致在放大生产时成本过高等问题。
发明内容
针对现有技术中存在的问题,本发明的目的是开发一种高效率的生物催化***,以期提高底物投量,缩短反应时间,并能获得高ee值的产物。
为了实现上述的发明目的,本发明的采用的技术方案如下:
全细胞生物催化合成L-2-哌啶甲酸的方法,以L-赖氨酸盐酸盐或L-赖氨酸为底物,通过添加烟酰胺腺嘌呤二核苷酸及重组宿主菌,通过生物催化制备L-2-哌啶甲酸;其中重组宿主菌为含有Arenimonas donghaensis DSM 18148蛋白编码基因的重组宿主菌、含有Pseudomonasveronii CIP104663蛋白编码基因的重组宿主菌或者含有Streptomyces hirsutus ATCC 19091蛋白编码基因的重组宿主菌中的任意一种。其中,所述重组宿主菌为大肠杆菌。
进一步地,反应在pH8.0的磷酸钾缓冲溶液中进行。
优选地,反应温度为20℃-30℃。
同时,我们还优选公开反应在摇床上进行,摇床转速为180rpm。
最后,我们公开了其中重组宿主菌的浓度为50g/L-150g/L。
采用本发明所公开的全细胞催化合成L-2-哌啶甲酸的方法,克服了目前化学合成法成本高、条件苛刻、转化率低、能耗高、污染大的问题。同时本发明所公开的生物催化***酶活效率高,反应时间短,目标产物ee值高。
附图说明
图1为NYPDc的表达质粒图谱
图2为NYPDa,NYPDb,NYPDc,NYPDd,NYPDe的蛋白表达上清、包涵体SDS-PAGE图谱
图3为实施例8中生物转化反应的TLC图谱
图4为实施例8中L-2-哌啶甲酸的HPLC谱图
图5为实施例8中L-2-哌啶甲酸的MS谱图
图6为SEQ ID NO.10的表达质粒图谱
图7为含有SEQ ID NO.10表达质粒的大肠杆菌的SDS-PAGE图谱。
图8为实施例15中生物转化反应的TLC图谱
图9为实施例15中L-2-哌啶甲酸的HPLC谱图
图10为实施例15中L-2-哌啶甲酸的MS谱图
图11为SEQ ID NO.13的表达质粒图谱
图12为含有SEQ ID NO.13表达质粒的大肠杆菌的SDS-PAGE图谱。
图13为实施例19中生物转化反应的TLC图谱
图14为实施例19中L-2-哌啶甲酸的HPLC谱图
图15为实施例19中L-2-哌啶甲酸的MS谱图
具体实施方式
为了更好的解释本发明,下面结合实施例对本发明进行进一步的阐述。在本实施例中所用到的仪器、试剂,除非有特殊说明,均为市售产品。
以下实施例中涉及到的TLC检测中:
展开剂:三氯甲烷:甲醇:水=6:5:1,混匀后放置10min左右。
硅胶板规格:薄层层析硅胶板5*10。
显色剂:茚三酮显色100ml乙醇加入0.1g茚三酮,500ul冰乙酸混匀。
以下实例中涉及到的LC-MS检测条件为:
Prevail C18色谱柱(250×4.6mm,i.d.5μm);柱温:30℃;流动相:0.4%(v/v)三氟乙酸水溶液;流速:0.5ml/min;检测器:蒸发光散射检测器(ELSD);检测器温度:120℃;载气:氮气(纯度99.9%);载气流速:4L/min;进样体积:10μL。
实施例1
将Arenimonas donghaensis DSM 18148置于LB培养基中,置于30℃,180rpm培养3-5天,离心收集沉淀,用DNA提取纯化试剂盒QiAamp Kit(Qiagen,Germany)提取纯化Arenimonas donghaensis DSM 18148 DNA。
用Pfu高保真酶对Arenimonas donghaensis DSM 18148基因组DNA进行PCR扩增,所用引物为
NYPD-F 5' ATGACCATGACCCAGCTCACCA 3'
NYPD-R 5' TCAGGCCGCCTGCTTGC 3'
由于Arenimonas donghaensis DSM 18148 DNA片段GC含量接近70%,故在扩增时添加终浓度0.5M的甜菜碱。之后将扩增的片段用Taq聚合酶72℃处理10分钟,在DNA 3'端添加碱基A。之后将其连接到pMD19T-simple(Takara宝生物公司,北京)克隆载体中,挑取单克隆送至上海生工生物进行测序。测序得到DNA序列为SEQ ID NO.1,相应的氨基酸序列为SEQ ID NO.2。
实施例2
由于原DNA序列GC含量过高,在宿主菌中培养时难以实现高效转录。故通过全基因合成的方法,对基因的二级结构以及密码子偏好性进行调整,以实现在大肠杆菌中的高表达。利用Primer Premier(http://primer3.ut.ee/)和OPTIMIZER(http://genomes.urv.es/OPTIMIZER/)进行设计,并保证Tm差异控制在3℃以内,引物长度控制在50base以内,得到以下引物:
合成上述引物,并将获得的引物加双蒸水溶解后,加到如下的反应体系中,使得各引物的终浓度为30nM,首尾引物的终浓度为0.6μM。
2mM dNTP mix(2mM each dNTP) | 5μl |
10×Pfu buffer | 5μl |
Pfu DNA polymerase(10U/μl) | 0.5μl |
ddH2O | 使得反应体系总体积至50μl |
将配制好的PCR反应体系置于博日XP cycler基因扩增仪中,按下列程序进行扩增:98℃ 30s,55℃ 45s,72℃ 120s,35x。将PCR得到的DNA片段进行切胶纯化,利用同源重组的方法克隆进pET30a的NdeI/XhoI位点。挑取单克隆进行测序。测序成功的DNA序列为SEQ ID NO.3,命名为NYPDa。
参考图1的方式构建含有NYPDa的表达质粒。
实施例3
通过全基因合成的方法,对基因的二级结构以及密码子偏好性进行调整,以实现在大肠杆菌中的高表达。利用Primer Premier(http://primer3.ut.ee/)和OPTIMIZER(http://genomes.urv.es/OPTIMIZER/)进行设计,并保证Tm差异控制在3℃以内,引物长度控制在50base以内,得到以下引物:
合成上述引物,并将获得的引物加双蒸水溶解后,加到如下的反应体系中,使得各引物的终浓度为30nM,首尾引物的终浓度为0.6μM。
2mM dNTP mix(2mM each dNTP) | 5μl |
10×Pfu buffer | 5μl |
Pfu DNA polymerase(10U/μl) | 0.5μl |
ddH2O | 使得反应体系总体积至50μl |
将配制好的PCR反应体系置于博日XP cycler基因扩增仪中,按下列程序进行扩增:98℃ 30s,55℃ 45s,72℃ 120s,35x。将PCR得到的DNA片段进行切胶纯化,利用同源重组的方法克隆进pET30a的NdeI/XhoI位点。挑取单克隆进行测序。测序成功的DNA序列为SEQ ID NO.4,命名为NYPDb。
参考图1的方式构建含有NYPDb的表达质粒。
实施例4
通过全基因合成的方法,对基因的二级结构以及密码子偏好性进行调整,以实现在大肠杆菌中的高表达。利用Primer Premier(http://primer3.ut.ee/)和OPTIMIZER(http://genomes.urv.es/OPTIMIZER/)进行设计,并保证Tm差异控制在3℃以内,引物长度控制在50base以内,得到以下引物:
合成上述引物,并将获得的引物加双蒸水溶解后,加到如下的反应体系中,使得各引物的终浓度为30nM,首尾引物的终浓度为0.6μM。
2mM dNTP mix(2mM each dNTP) | 5μl |
10×Pfu buffer | 5μl |
Pfu DNA polymerase(10U/μl) | 0.5μl |
ddH2O | 使得反应体系总体积至50μl |
将配制好的PCR反应体系置于博日XP cycler基因扩增仪中,按下列程序进行扩增:98℃ 30s,55℃ 45s,72℃ 120s,35x。将PCR得到的DNA片段进行切胶纯化,利用同源重组的方法克隆进pET30a的NdeI/XhoI位点。挑取单克隆进行测序。测序成功的DNA序列为SEQ ID NO.5,命名为NYPDc。
按照图1的方式构建含有NYPDc的表达质粒。
实施例5
通过全基因合成的方法,对基因的二级结构以及密码子偏好性进行调整,以实现在大肠杆菌中的高表达。利用Primer Premier(http://primer3.ut.ee/)和OPTIMIZER(http://genomes.urv.es/OPTIMIZER/)进行设计,并保证Tm差异控制在3℃以内,引物长度控制在50base以内,得到以下引物:
合成上述引物,并将获得的引物加双蒸水溶解后,加到如下的反应体系中,使得各引物的终浓度为30nM,首尾引物的终浓度为0.6μM。
2mM dNTP mix(2mM each dNTP) | 5μl |
10×Pfu buffer | 5μl |
Pfu DNA polymerase(10U/μl) | 0.5μl |
ddH2O | 使得反应体系总体积至50μl |
将配制好的PCR反应体系置于博日XP cycler基因扩增仪中,按下列程序进行扩增:98℃ 30s,55℃ 45s,72℃ 120s,35x。将PCR得到的DNA片段进行切胶纯化,利用同源重组的方法克隆进pET30a的NdeI/XhoI位点。挑取单克隆进行测序。测序成功的DNA序列为SEQ ID NO.6,命名为NYPDd。
参考图1的方式构建含有NYPDd的表达质粒。
实施例6
通过全基因合成的方法,对基因的二级结构以及密码子偏好性进行调整,以实现在大肠杆菌中的高表达。利用Primer Premier(http://primer3.ut.ee/)和OPTIMIZER(http://genomes.urv.es/OPTIMIZER/)进行设计,并保证Tm差异控制在3℃以内,引物长度控制在50base以内,得到以下引物:
合成上述引物,并将获得的引物加双蒸水溶解后,加到如下的反应体系中,使得各引物的终浓度为30nM,首尾引物的终浓度为0.6μM。
2mM dNTP mix(2mM each dNTP) | 5μl |
10×Pfu buffer | 5μl |
Pfu DNA polymerase(10U/μl) | 0.5μl |
ddH2O | 使得反应体系总体积至50μl |
将配制好的PCR反应体系置于博日XP cycler基因扩增仪中,按下列程序进行扩增:98℃ 30s,55℃ 45s,72℃ 120s,35x。将PCR得到的DNA片段进行切胶纯化,利用同源重组的方法克隆进pET30a的NdeI/XhoI位点。挑取单克隆进行测序。测序成功的DNA序列为SEQ ID NO.7,命名为NYPDe。
参考图1的方式构建含有NYPDe的表达质粒。
实施例7
挑取含有NYPDa表达载体的大肠杆菌单菌落接种于10ml高压灭菌后的培养基中:胰蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,磷酸氢二钠3.55g/L,磷酸二氢钾3.4g/L,氯化铵2.68g/L,硫酸钠0.71g/L,七水硫酸镁0.493g/L,六水氯化铁0.027g/L,甘油5g/L,葡萄糖0.8g/L,添加卡那霉素至50mg/L。30℃,250rpm过夜培养。次日取1L三角瓶,按1:100的接种比例接入到100ml高压灭菌后的培养基中:胰蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,磷酸氢二钠3.55g/L,磷酸二氢钾3.4g/L,氯化铵2.68g/L,硫酸钠0.71g/L,七水硫酸镁0.493g/L,六水氯化铁0.027g/L,甘油5g/L,葡萄糖0.3g/L,添加卡那霉素至50mg/L。于30℃中培养至菌体OD 5-6,立刻将三角瓶置于25℃摇床中,250rpm培养1小时。加IPTG至终浓度0.1mM,并于25℃,250rpm继续培养16小时。培养结束后,将培养液于4℃,12000g下离心20分钟收集湿菌体。然后将菌体沉淀用蒸馏水清洗两次,收集菌体,-70℃保存。同时取少量菌体进行SDS-PAGE检测。
按照上述方法,分别制备NYPDb,NYPDc,NYPDd,NYPDe的菌体并进行SDS-PAGE蛋白胶检测,结果见图2。SDS-PAGE蛋白胶显示,其中NYPDc的表达量最高,故做为优选序列进行后续实验。
实施例8
加入0.1M磷酸钾缓冲液(pH8.0),150g/L NYPDc菌体,25g/L L-赖氨酸盐酸盐,0.1mMNAD,敞口反应,25℃,摇床转速设为180rpm。反应中不断取样进行TLC检测,当反应16小时时,检测结果如图3,结果显示16小时生成大量产物,无底物残余。同时取样进行LC-MS检测,检测结果如图4,图5所示。
实施例9
加入0.1M磷酸钾缓冲液(pH8.0),50g/L NYPDc菌体,74g/L L-赖氨酸盐酸盐,0.1mM NAD,敞口反应,25℃,摇床转速设为180rpm。反应中不断取样进行TLC检测,结果显示48小时生成大量产物,无底物残余。同时取样进行LC-MS检测,测得最终产物浓度达到37g/L。
实施例10
加入0.1M磷酸钾缓冲液(pH8.0),50g/L NYPDc菌体,100g/L L-赖氨酸盐酸盐,0.1mMNAD,敞口反应,25℃,摇床转速设为180rpm。反应中不断取样进行TLC检测,结果显示48小时生成大量产物,无底物残余。同时取样进行LC-MS检测,测得最终产物浓度达到66.7g/L。
实施例11
加入0.1M磷酸钾缓冲液(pH8.0),50g/L NYPDc菌体,150g/L L-赖氨酸盐酸盐,0.1mMNAD,敞口反应,25℃,摇床转速设为180rpm。反应中不断取样进行TLC检测,结果显示48小时生成大量产物,无底物残余。同时取样进行LC-MS检测,测得最终产物浓度达到76.9g/L。
实施例12
将Pseudomonas veronii CIP104663置于LB培养基中培养,控制温度为28.0℃,180rpm培养3天,离心收集沉淀,用DNA提取纯化试剂盒QiAamp Kit(Qiagen,Germany)提取纯化Pseudomonas veronii基因组DNA。
用Pfu高保真酶对Pseudomonas veronii基因组DNA进行PCR扩增,所用引物为
Pve-F 5' ATGGTGGCACAGCGAGCAAC 3'
Pve-R 5' TCATGCTAATTTTAAGGTACGGTCG 3'
由于Pseudomonas veronii CIP104663的DNA的GC含量接近50%,故使用Pfu高保真酶直接扩增。之后将扩增的片段用Taq聚合酶72℃处理10分钟,在DNA 3'端添加碱基A。之后将其连接到pMD19T-simple(Takara宝生物公司,北京)克隆载体中,挑取单克隆送至南京金斯瑞生物进行测序。测序得到DNA序列为SEQ ID NO.8,相应的氨基酸序列为SEQID NO.9。
实施例13
通过全基因合成的方法,对基因的二级结构以及密码子偏好性进行调整,并且调整DNA序列的GC含量到40%~60%,以实现在大肠杆菌中的高表达。利用PrimerPremier(http://primer3.ut.ee/)和OPTIMIZER(http://genomes.urv.es/OPTIMIZER/)进行设计,并保证Tm差异控制在3℃以内,引物长度控制在50base以内,得到以下引物:
合成上述引物,并将获得的引物加双蒸水溶解后,加到如下的反应体系中,使得各引物的终浓度为30nM,首尾引物的终浓度为0.6μM。
2mM dNTP mix(2mM each dNTP) | 5μl |
10×Pfu buffer | 5μl |
Pfu DNA polymerase(10 U/μl) | 0.5μl |
ddH2O | 使得反应体系总体积至50μl |
将配制好的PCR反应体系置于博日XP cycler基因扩增仪中,按下列程序进行扩增:98℃ 30s,65℃ 45s,72℃ 120s,35x。将PCR得到的DNA片段进行切胶纯化,利用同源重组的方法克隆进pET30a的NdeI/XhoI位点。挑取单克隆进行测序。测序成功的DNA序列为SEQ ID NO.10。
按照图6的方式构建含有SEQ ID NO.10的表达质粒。
实施例14
挑取含有SEQ ID NO.10表达载体的大肠杆菌单菌落接种于10ml高压灭菌后的培养基中:胰蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,磷酸氢二钠3.55g/L,磷酸二氢钾3.4g/L,氯化铵2.68g/L,硫酸钠0.71g/L,七水硫酸镁0.493g/L,六水氯化铁0.027g/L,甘油5g/L,葡萄糖0.8g/L,添加卡那霉素至50mg/L。30℃,250rpm过夜培养。次日取1L三角瓶,按1:100的接种比例接入到100ml高压灭菌后的培养基中:胰蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,磷酸氢二钠3.55g/L,磷酸二氢钾3.4g/L,氯化铵2.68g/L,硫酸钠0.71g/L,七水硫酸镁0.493g/L,六水氯化铁0.027g/L,甘油5g/L,葡萄糖0.3g/L,添加卡那霉素至50mg/L。于30℃中培养至菌体OD 5-6,立刻将三角瓶置于25℃摇床中,250rpm培养1小时。加IPTG至终浓度0.1mM,并于25℃,250rpm继续培养16小时。培养结束后,将培养液于4℃,12000g下离心20分钟收集湿菌体。然后将菌体沉淀用蒸馏水清洗两次,收集菌体,-70℃保存。同时取少量菌体进行SDS-PAGE检测。
结果见图7,其中1道为蛋白上清,2道为包涵体。SDS-PAGE蛋白胶显示,含有SEQ ID NO.10表达质粒的大肠杆菌表达量高,满足生物转化反应实验的需要。
实施例15
加入0.1M磷酸钾缓冲液(pH8.0),65g/L含有SEQ ID NO.10表达质粒的菌体,60g/L L-赖氨酸盐酸盐,0.1mM NAD,敞口反应,25℃,摇床转速设为180rpm。反应中不断取样进行TLC检测,当反应16小时时,检测结果如图8,结果显示28小时生成大量产物,无底物残余。对获得的产物进行定量实验,产物最终浓度为48.7g/L。同时取样进行LC-MS检测,检测结果如图9,图10所示。
实施例16
将Streptomyces hirsutus ATCC 19091置于ATCC Medium 196培养基中培养,控制温度为26.0℃,180rpm培养2天,离心收集沉淀,用DNA提取纯化试剂盒QiAamp Kit(Qiagen,Germany)提取纯化Streptomyces hirsutus ATCC 19091基因组DNA。
用Pfu高保真酶对Streptomyces hirsutus ATCC 19091基因组DNA进行PCR扩增,所用引物为
Shi-F 5' ATCTTGCAAGCTGAGCGCACG 3'
Shi-R 5' TCATCGTCGCGCTCCGGC 3'
由于Streptomyces hirsutus ATCC 19091的DNA局部GC含量接近80%,故在扩增时添加终浓度0.5M的甜菜碱。之后将扩增的片段用Taq聚合酶72℃处理10分钟,在DNA 3'端添加碱基A。之后将其连接到pMD19T-simple(Takara宝生物公司,北京)克隆载体中,挑取单克隆送至上海杰李生物进行测序。测序得到DNA序列为SEQ ID NO.11,相应的氨基酸序列为SEQ ID NO.12。
实施例17
通过全基因合成的方法,对基因的二级结构以及密码子偏好性进行调整,并且调整DNA序列的GC含量到40%~60%,以实现在大肠杆菌中的高表达。利用PrimerPremier(http://primer3.ut.ee/)和OPTIMIZER(http://genomes.urv.es/OPTIMIZER/)进行设计,并保证Tm差异控制在3℃以内,引物长度控制在50base以内,得到以下引物:
合成上述引物,并将获得的引物加双蒸水溶解后,加到如下的反应体系中,使得各引物的终浓度为30nM,首尾引物的终浓度为0.6μM。
2mM dNTP mix(2mM each dNTP) | 5μl |
10×Pfu buffer | 5μl |
Pfu DNA polymerase(10U/μl) | 0.5μl |
ddH2O | 使得反应体系总体积至50μl |
将配制好的PCR反应体系置于博日XP cycler基因扩增仪中,按下列程序进行扩增:98℃ 30s,65℃ 45s,72℃ 120s,35x。将PCR得到的DNA片段进行切胶纯化,利用同源重组的方法克隆进pET30a的NdeI/XhoI位点。挑取单克隆进行测序。测序成功的DNA序列为SEQ ID NO.13。
按照图11的方式构建含有SEQ ID NO.13的表达质粒。
实施例18
挑取含有SEQ ID NO.13表达载体的大肠杆菌单菌落接种于10ml高压灭菌后的培养基中:胰蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,磷酸氢二钠3.55g/L,磷酸二氢钾3.4g/L,氯化铵2.68g/L,硫酸钠0.71g/L,七水硫酸镁0.493g/L,六水氯化铁0.027g/L,甘油5g/L,葡萄糖0.8g/L,添加卡那霉素至50mg/L。30℃,250rpm过夜培养。次日取1L三角瓶,按1:100的接种比例接入到100ml高压灭菌后的培养基中:胰蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,磷酸氢二钠3.55g/L,磷酸二氢钾3.4g/L,氯化铵2.68g/L,硫酸钠0.71g/L,七水硫酸镁0.493g/L,六水氯化铁0.027g/L,甘油5g/L,葡萄糖0.3g/L,添加卡那霉素至50mg/L。于30℃中培养至菌体OD 5-6,立刻将三角瓶置于25℃摇床中,250rpm培养1小时。加IPTG至终浓度0.1mM,并于25℃,250rpm继续培养16小时。培养结束后,将培养液于4℃,12000g下离心20分钟收集湿菌体。然后将菌体沉淀用蒸馏水清洗两次,收集菌体,-70℃保存。同时取少量菌体进行SDS-PAGE检测。
结果见图12,其中1道为蛋白上清,2道为包涵体。SDS-PAGE蛋白胶显示,含有SEQ ID NO.13表达质粒的大肠杆菌表达量高,满足生物转化反应实验的需要。
实施例19
加入0.1M磷酸钾缓冲液(pH8.0),50g/L含有SEQ ID NO.13表达质粒的菌体,55g/L L-赖氨酸盐酸盐,0.1mM NAD,敞口反应,25℃,摇床转速设为180rpm。反应中不断取样进行TLC检测,当反应16小时时,检测结果如图13,结果显示16小时生成大量产物,无底物残余。对获得的产物进行定量实验,产物最终浓度为32g/L。同时取样进行LC-MS检测,检测结果如图14,图15所示。
当我们在体系中加入L-赖氨酸的时候,其快速转变为L-赖氨酸盐酸盐,然后按照前述实施例的方式进行反应。
通过使用本发明的新酶蛋白质,以及优化后的基因序列,配合优化后的转化工艺,能够有效地制造做为医药中间体在工业上有用的化合物L-2-哌啶甲酸,工艺简单且得率高。转化所使用的底物为工业上大量生产的L-赖氨酸,且价格低廉,根据2016年1月份的国内赖氨酸市场行情,98%含量赖氨酸报价为8.5-8.6元/公斤左右,仅国内的产量可达120吨,保证了底物的充足供应。技术可移植性强,只要一般的发酵车间(如氨基酸、维生素生产车间)即可进行投入生产,不需购置特殊设备,易于推广应用。对比目前国内生产主要依赖于化学拆分法,有50%的原料被拆分浪费掉,同时生成大量无用的副产物,并且产物的ee值偏低。故本发明具有较强的实用性和推广价值。
SEQUENCE LISTING
<110> 南京诺云生物科技有限公司
<120> 全细胞催化合成L-2-哌啶甲酸的方法
<130> 2016
<160> 13
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 1053
<212> DNA
<213> Arenimonas donghaensis
<400> 1
atgaccatga
cccagctcac cacccaggac ctgacccaga tcgtcgcgac ccacggcctg 60
ccgaccctgc
tcggccgcct ggtggactac ctggaggccg acttccggcg ctgggaggac 120
ttcgacaaga
gcccgcgttc ggcggcccac tccccgggcg gcgtgatcga actgatgccg 180
gtcgccgata
ccaaggaata cagcttcaag tacgtcaacg gccacccggg caacaccaag 240
ctgggcctgt
ccaccgtggt ggccttcggc gtgctcgccg acgtcgatac cggcatgccg 300
accctgatca
gcgaactgac cctgaccacc gcgctgcgca ccgccgccac ctcggtgatg 360
gcggccaagc
tgctggcgcg caaggattcc aggaccatgg cgctgatcgg caacggcgcc 420
cagagcgagt
tccaggcgct ggccttccac cacctgctgg gcatccagga agtgcgtgtg 480
tacgacgtcg
acccggccgc caccgacaag ctggtgcgca acctggccgc ggccgcgccg 540
gaactgcgcg
tggtgcgcag caccggcgtc gcccaggccg tgcgcggcgc cgacatcgtc 600
accaccgtca
ccgcggacaa ggccaatgcc gacatcctga cgccggaaat gatcgagccg 660
ggcatgcacc
tcaacgccgt cggcggcgac tgcccgggca agaccgaact ggccacggag 720
gtggtcgcca
acgcctcggt gttcgtcgag ttcgagccgc agtcgcgcat cgaaggcgag 780
gtgcagcaga
tgcccgccaa ctccccggtc accgaactgt ggcgcgtgct gaccatgcag 840
gccgccggcc
gccgcaacat cgccgaggtc accctgttcg actcggtcgg tttcgcgctg 900
gaggattatt
cggcgctgcg cctggtgcgc gattgcgcca aggaaatggg cctgggccgc 960
gaagccagcc
tcatccccgc cctggccgac ccgaagaacc tgttcggcga gctggccgcg 1020
gcaccccagg
ccgcgcgcaa gcaggcggcc tga 1053
<210> 2
<211> 350
<212> PRT
<213> Arenimonas donghaensis
<400> 2
Met Thr Met Thr
Gln Leu Thr Thr Gln Asp Leu Thr Gln Ile Val Ala
1 5 10 15
Thr His Gly Leu
Pro Thr Leu Leu Gly Arg Leu Val Asp Tyr Leu Glu
20 25 30
Ala Asp Phe Arg
Arg Trp Glu Asp Phe Asp Lys Ser Pro Arg Ser Ala
35 40 45
Ala His Ser Pro
Gly Gly Val Ile Glu Leu Met Pro Val Ala Asp Thr
50 55 60
Lys Glu Tyr Ser
Phe Lys Tyr Val Asn Gly His Pro Gly Asn Thr Lys
65 70 75 80
Leu Gly Leu Ser
Thr Val Val Ala Phe Gly Val Leu Ala Asp Val Asp
85 90 95
Thr Gly Met Pro
Thr Leu Ile Ser Glu Leu Thr Leu Thr Thr Ala Leu
100 105 110
Arg Thr Ala Ala
Thr Ser Val Met Ala Ala Lys Leu Leu Ala Arg Lys
115 120 125
Asp Ser Arg Thr
Met Ala Leu Ile Gly Asn Gly Ala Gln Ser Glu Phe
130 135 140
Gln Ala Leu Ala
Phe His His Leu Leu Gly Ile Gln Glu Val Arg Val
145 150 155 160
Tyr Asp Val Asp
Pro Ala Ala Thr Asp Lys Leu Val Arg Asn Leu Ala
165 170 175
Ala Ala Ala Pro
Glu Leu Arg Val Val Arg Ser Thr Gly Val Ala Gln
180 185 190
Ala Val Arg Gly
Ala Asp Ile Val Thr Thr Val Thr Ala Asp Lys Ala
195 200 205
Asn Ala Asp Ile
Leu Thr Pro Glu Met Ile Glu Pro Gly Met His Leu
210 215 220
Asn Ala Val Gly
Gly Asp Cys Pro Gly Lys Thr Glu Leu Ala Thr Glu
225 230 235 240
Val Val Ala Asn
Ala Ser Val Phe Val Glu Phe Glu Pro Gln Ser Arg
245 250 255
Ile Glu Gly Glu
Val Gln Gln Met Pro Ala Asn Ser Pro Val Thr Glu
260 265 270
Leu Trp Arg Val
Leu Thr Met Gln Ala Ala Gly Arg Arg Asn Ile Ala
275 280 285
Glu Val Thr Leu
Phe Asp Ser Val Gly Phe Ala Leu Glu Asp Tyr Ser
290 295 300
Ala Leu Arg Leu
Val Arg Asp Cys Ala Lys Glu Met Gly Leu Gly Arg
305 310 315 320
Glu Ala Ser Leu
Ile Pro Ala Leu Ala Asp Pro Lys Asn Leu Phe Gly
325 330 335
Glu Leu Ala Ala
Ala Pro Gln Ala Ala Arg Lys Gln Ala Ala
340 345 350
<210> 3
<211> 1053
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
atgaccatga
cccagctgac cacccaggac ctgacccaga tcgttgctac ccacggtctg 60
ccgaccctgc
tgggtcgtct ggttgactac ctggaagctg acttccgtcg ttgggaagac 120
ttcgacaaat
ctccgcgttc tgctgctcac tctccgggtg gtgttatcga actgatgccg 180
gttgctgaca
ccaaagaata ctctttcaaa tacgttaacg gtcacccggg taacaccaaa 240
ctgggtctgt
ctaccgttgt tgctttcggt gttctggctg acgttgacac cggtatgccg 300
accctgatct
ctgaactgac cctgaccacc gctctgcgta ccgctgctac ctctgttatg 360
gctgctaaac
tgctggctcg taaagactct cgtaccatgg ctctgatcgg taacggtgct 420
cagtctgaat
tccaggctct ggctttccac cacctgctgg gtatccagga agttcgtgtt 480
tacgacgttg
acccggctgc taccgacaaa ctggttcgta acctggctgc tgctgctccg 540
gaactgcgtg
ttgttcgttc taccggtgtt gctcaggctg ttcgtggtgc tgacatcgtt 600
accaccgtta
ccgctgacaa agctaacgct gacatcctga ccccggaaat gatcgaaccg 660
ggtatgcacc
tgaacgctgt tggtggtgac tgcccgggta aaaccgaact ggctaccgaa 720
gttgttgcta
acgcttctgt tttcgttgaa ttcgaaccgc agtctcgtat cgaaggtgaa 780
gttcagcaga
tgccggctaa ctctccggtt accgaactgt ggcgtgttct gaccatgcag 840
gctgctggtc
gtcgtaacat cgctgaagtt accctgttcg actctgttgg tttcgctctg 900
gaagactact
ctgctctgcg tctggttcgt gactgcgcta aagaaatggg tctgggtcgt 960
gaagcttctc
tgatcccggc tctggctgac ccgaaaaacc tgttcggtga actggctgct 1020
gctccgcagg
ctgctcgtaa acaggctgct taa 1053
<210> 4
<211> 1053
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
atgactatga
ctcaactgac tactcaagac ctcactcaga ttgttgctac ccatggtctc 60
ccaaccctgc
tcggtcgtct ggttgactat ctcgaagcgg acttccgccg ttgggaagac 120
ttcgacaagt
ccccacgttc tgctgctcac tctccaggcg gtgttattga actcatgccg 180
gttgcggaca
ccaaagaata ctctttcaaa tacgtgaacg gtcacccggg caataccaaa 240
ctcggtctct
ctactgttgt tgcgttcggt gttctcgcgg atgttgacac tggtatgcca 300
actctcatct
ctgagctgac cctgaccact gcgctccgta ccgctgcgac ttctgttatg 360
gcggcgaaac
tgctggcgcg taaagactct cgtaccatgg ctctgatcgg taatggtgcg 420
cagtccgaat
ttcaagcgct ggctttccac cacctgctgg gtatccagga agttcgtgtg 480
tacgacgtgg
acccagcggc gactgataaa ctggttcgta acctggcggc tgctgcgcca 540
gaactgcgcg
ttgttcgttc taccggtgtt gctcaagcgg tgcgtggcgc tgatatcgtt 600
actaccgtta
ccgcggacaa ggcgaacgct gacatcctga ccccggaaat gatcgaaccg 660
ggtatgcacc
tgaatgcggt tggtggtgat tgtccgggta aaactgaact ggcgaccgaa 720
gtggttgcga
atgcgtctgt ttttgtggaa tttgaaccgc agtctcgtat cgaaggtgaa 780
gttcagcaaa
tgccggcgaa ctccccagtt accgagctgt ggcgtgttct gaccatgcag 840
gctgcgggtc
gtcgtaacat cgcggaggtt accctctttg attctgttgg tttcgctctg 900
gaggactatt
ccgcgctgcg tctcgttcgc gattgcgcga aagaaatggg tctcggccgt 960
gaggcttccc
tcattccagc tctggcggac ccgaaaaatc tgtttggtga actcgctgcg 1020
gctccacaag
ctgctcgcaa acaggcggcg taa 1053
<210> 5
<211> 1053
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
atgaccatga
cccagctgac cacccaggat ctgacccaga tcgttgcgac ccacggtctg 60
ccgaccctgc
tgggccgtct ggttgactac ctggaagcgg acttccgtcg ttgggaagat 120
ttcgacaaat
ctccgcgttc tgcggcgcac tctccgggtg gcgttatcga actgatgccg 180
gttgcggata
ccaaagaata ctctttcaaa tatgttaacg gtcacccggg caacaccaaa 240
ctgggcctgt
ctaccgttgt tgcgttcggc gttctggcgg atgttgacac cggtatgccg 300
accctgatct
ctgaactgac cctgaccacc gcgctgcgta ccgcggcgac ctctgttatg 360
gcggcgaaac
tgctggcgcg taaagactct cgtaccatgg cgctgatcgg caacggtgcg 420
cagtctgaat
tccaggcgct ggcgttccac cacctgctgg gtatccagga agttcgtgtt 480
tatgacgttg
atccggcggc gaccgataaa ctggttcgta acctggcggc ggcggcgccg 540
gaactgcgtg
ttgttcgttc taccggtgtt gcgcaggcgg ttcgtggtgc ggacatcgtt 600
accaccgtta
ccgcggacaa agcgaacgcg gatatcctga ccccggaaat gatcgaaccg 660
ggtatgcacc
tgaacgcggt tggtggcgac tgtccgggta aaaccgaact ggcgaccgaa 720
gttgttgcga
acgcgtctgt tttcgttgaa ttcgaaccgc agtctcgtat cgaaggcgaa 780
gttcagcaga
tgccggcgaa ctctccggtt accgaactgt ggcgtgttct gaccatgcag 840
gcggcgggtc
gtcgtaacat cgcggaagtt accctgttcg attctgttgg tttcgcgctg 900
gaagactatt
ctgcgctgcg tctggttcgt gattgtgcga aagaaatggg cctgggtcgt 960
gaagcgtctc
tgatcccggc gctggcggac ccgaaaaacc tgttcggtga actggcggcg 1020
gcgccgcagg
cggcgcgtaa acaggcggcg taa 1053
<210> 6
<211> 1053
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
atgaccatga
cccagctgac tactcaggac ctgactcaga tcgttgctac ccacggtctg 60
ccgactctgc
tgggccgtct ggtggattac ctggaagcgg acttccgtcg ctgggaagac 120
tttgacaaat
ccccgcgctc cgcggctcat tctccgggtg gtgttatcga actgatgccg 180
gttgcggaca
ccaaagaata ctctttcaaa tacgtgaacg gtcacccggg caacactaaa 240
ctgggtctgt
ccaccgtggt tgcgtttggc gttctggctg atgtggatac tggtatgccg 300
accctgatct
ctgaactgac tctgaccacc gctctgcgta ccgctgctac ttctgttatg 360
gcggcgaaac
tgctggctcg caaagactct cgtaccatgg cgctgatcgg caacggcgct 420
cagtctgaat
ttcaggctct ggcttttcat cacctgctgg gtatccagga agttcgtgtg 480
tacgacgttg
acccggctgc gaccgacaaa ctggttcgca acctggcggc tgctgctccg 540
gaactgcgtg
tggttcgttc taccggtgtg gctcaggctg tgcgtggtgc ggatattgtt 600
accactgtta
ccgcggacaa agcgaacgct gatatcctga ccccggaaat gatcgaaccg 660
ggcatgcacc
tgaacgcggt tggtggtgat tgtccgggta aaaccgaact ggcgactgaa 720
gttgttgcta
acgcgtccgt gtttgttgaa tttgaaccgc agtcccgcat cgaaggtgaa 780
gttcagcaga
tgccggcgaa ctccccggtt actgaactgt ggcgtgttct gactatgcag 840
gcggctggcc
gtcgtaacat cgcggaagtt actctgttcg attctgtggg cttcgctctg 900
gaagattatt
ctgcgctgcg cctggtgcgc gactgtgcga aagaaatggg cctgggtcgt 960
gaagcgtccc
tgattccggc gctggcggac ccgaaaaacc tgttcggtga actggctgcg 1020
gctccgcagg
ctgcgcgtaa acaggctgct taa 1053
<210> 7
<211> 1053
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
atgactatga
cccaactgac tactcaggac ctgactcaga tcgttgcgac ccacggcctg 60
ccgaccctgc
tgggccgtct ggtagactac ctggaagcgg acttccgtcg ttgggaagac 120
tttgacaaat
ctccgcgttc tgcggcgcac tccccgggtg gcgttatcga actgatgccg 180
gtagcggata
ccaaggaata ctctttcaaa tatgttaacg gtcatccggg caacaccaaa 240
ctgggtctgt
ctaccgtagt agcgttcggt gttctggcgg acgttgacac tggtatgccg 300
actctgatta
gcgagctgac cctgaccacc gcgctgcgta ccgcggcaac ctctgtaatg 360
gcggcaaaac
tgctggcgcg caaagactct cgtaccatgg cgctgatcgg caacggtgcg 420
caatctgaat
tccaagcgct ggcgttccac catctgctgg gtatccagga ggttcgtgtt 480
tatgacgtgg
acccggcagc gaccgataaa ctggttcgta atctggctgc ggctgcaccg 540
gaactgcgcg
tagttcgttc tactggcgtg gctcaggctg tgcgtggtgc ggacattgtt 600
accaccgtta
ccgctgacaa agcgaacgca gatatcctga ccccggaaat gattgagccg 660
ggtatgcatc
tgaacgctgt aggtggtgac tgcccgggta aaaccgagct ggcaactgaa 720
gtggttgcta
atgcgtctgt tttcgttgaa ttcgaaccgc agtctcgtat cgaaggcgaa 780
gttcagcaaa
tgccggctaa ctctccggtt actgagctgt ggcgtgtact gaccatgcag 840
gcagctggtc
gccgtaacat cgcggaagtt accctgtttg acagcgtagg tttcgcactg 900
gaagattatt
ctgcactgcg cctggtgcgc gactgtgcaa aagaaatggg cctgggtcgt 960
gaggcaagcc
tgatcccggc actggctgat ccgaaaaacc tgttcggcga actggcagcg 1020
gctccgcagg
ctgctcgcaa acaagcggca taa 1053
<210> 8
<211> 1116
<212> DNA
<213> Pseudomonas veronii
<400> 8
atggtggcac
agcgagcaac tattatcctc tctgaggaaa acattggtga aattgtcgca 60
gcagtcgggc
tcgacacttt aatggatgaa acgattgcaa aactacgtga tgccctcaac 120
gtgtttggtg
atggccaggt tgaaatacaa ccgcgcaccg gctttgtcta tgaaactccg 180
gaaatggggc
tgatagagtt tatgccggct taccgccggg ataaaaatgt cgcgttaaaa 240
gttgttggct
accatccggg aaatccgttt aaccggggca tgccgacggt catcgccact 300
aactccctat
atgacgtaag ggacggccac cttattgcgg tgatcgatgg tgtatttgca 360
acagcagtac
gaacgggcgc agcatccgct gtggcttcga agttgctggc tcatcctgaa 420
agcaaaaccc
ttgggctgat cggagctggc gccatggcag tgacccaggc ccatgccctc 480
agtcgaattt
atgactttga cgcagtcttg atccacgata ttgaccccgc agtggaaaaa 540
actttcgcca
agcgggtatc cgccctggga attacaccga tcatcgcttc caaagacagg 600
gtactggcag
agtccgacat catctgtgtt gctacctcca ttggccttga tgcaggcccg 660
gttctccacg
ctggcgggat gaaaccacat gtacacatca atgctattgg tgccgacacg 720
ccgcgcaaat
atgaattatc aacagagctg ctcaaaagct cgttccttgt cacggattat 780
ctggaacagg
ccattaacga aggtgaatgc cagcaattga gtaaagacga atacggctat 840
atcggccctg
agttgcacaa aatagtgaaa gagccgcaag cctatatcca atatcagatg 900
aaacagacca
tctttgatag caccggtatt tcattggaag atcagataat gaccgaggtc 960
ttgatcgatc
aggcggagag actagggctt ggtcagcgga tcctgattga agcgggatgt 1020
gatgacccca
tgaacccata tcttttctca aattccgcga acgctcttga taccgtcaag 1080
aatacagtgc
acgaccgtac cttaaaatta gcatga
1116
<210> 9
<211> 371
<212> PRT
<213> Pseudomonas veronii
<400> 9
Met Val Ala Gln
Arg Ala Thr Ile Ile Leu Ser Glu Glu Asn Ile Gly
1 5 10 15
Glu Ile Val Ala
Ala Val Gly Leu Asp Thr Leu Met Asp Glu Thr Ile
20 25 30
Ala Lys Leu Arg
Asp Ala Leu Asn Val Phe Gly Asp Gly Gln Val Glu
35 40 45
Ile Gln Pro Arg
Thr Gly Phe Val Tyr Glu Thr Pro Glu Met Gly Leu
50 55 60
Ile Glu Phe Met
Pro Ala Tyr Arg Arg Asp Lys Asn Val Ala Leu Lys
65 70 75 80
Val Val Gly Tyr
His Pro Gly Asn Pro Phe Asn Arg Gly Met Pro Thr
85 90 95
Val Ile Ala Thr
Asn Ser Leu Tyr Asp Val Arg Asp Gly His Leu Ile
100 105 110
Ala Val Ile Asp
Gly Val Phe Ala Thr Ala Val Arg Thr Gly Ala Ala
115 120 125
Ser Ala Val Ala
Ser Lys Leu Leu Ala His Pro Glu Ser Lys Thr Leu
130 135 140
Gly Leu Ile Gly
Ala Gly Ala Met Ala Val Thr Gln Ala His Ala Leu
145 150 155 160
Ser Arg Ile Tyr
Asp Phe Asp Ala Val Leu Ile His Asp Ile Asp Pro
165 170 175
Ala Val Glu Lys
Thr Phe Ala Lys Arg Val Ser Ala Leu Gly Ile Thr
180 185 190
Pro Ile Ile Ala
Ser Lys Asp Arg Val Leu Ala Glu Ser Asp Ile Ile
195 200 205
Cys Val Ala Thr
Ser Ile Gly Leu Asp Ala Gly Pro Val Leu His Ala
210 215 220
Gly Gly Met Lys
Pro His Val His Ile Asn Ala Ile Gly Ala Asp Thr
225 230 235 240
Pro Arg Lys Tyr
Glu Leu Ser Thr Glu Leu Leu Lys Ser Ser Phe Leu
245 250 255
Val Thr Asp Tyr
Leu Glu Gln Ala Ile Asn Glu Gly Glu Cys Gln Gln
260 265 270
Leu Ser Lys Asp
Glu Tyr Gly Tyr Ile Gly Pro Glu Leu His Lys Ile
275 280 285
Val Lys Glu Pro
Gln Ala Tyr Ile Gln Tyr Gln Met Lys Gln Thr Ile
290
295 300
Phe Asp Ser Thr
Gly Ile Ser Leu Glu Asp Gln Ile Met Thr Glu Val
305 310 315 320
Leu Ile Asp Gln
Ala Glu Arg Leu Gly Leu Gly Gln Arg Ile Leu Ile
325 330 335
Glu Ala Gly Cys
Asp Asp Pro Met Asn Pro Tyr Leu Phe Ser Asn Ser
340 345 350
Ala Asn Ala Leu
Asp Thr Val Lys Asn Thr Val His Asp Arg Thr Leu
355 360 365
Lys Leu Ala
370
<210> 10
<211> 1116
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
atggttgctc
agcgtgctac catcatcctg tctgaagaaa acatcggtga aatcgttgct 60
gctgttggtc
tggacaccct gatggacgaa accatcgcta aactgcgtga cgctctgaac 120
gttttcggtg
acggtcaggt tgaaatccag ccgcgtaccg gtttcgttta cgaaaccccg 180
gaaatgggtc
tgatcgaatt catgccggct taccgtcgtg acaaaaacgt tgctctgaaa 240
gttgttggtt
accacccggg taacccgttc aaccgtggta tgccgaccgt tatcgctacc 300
aactctctgt
acgacgttcg tgacggtcac ctgatcgctg ttatcgacgg tgttttcgct 360
accgctgttc
gtaccggtgc tgcttctgct gttgcttcta aactgctggc tcacccggaa 420
tctaaaaccc
tgggtctgat cggtgctggt gctatggctg ttacccaggc tcacgctctg 480
tctcgtatct
acgacttcga cgctgttctg atccacgaca tcgacccggc tgttgaaaaa 540
accttcgcta
aacgtgtttc tgctctgggt atcaccccga tcatcgcttc taaagaccgt 600
gttctggctg
aatctgacat catctgcgtt gctacctcta tcggtctgga cgctggtccg 660
gttctgcacg
ctggtggtat gaaaccgcac gttcacatca acgctatcgg tgctgacacc 720
ccgcgtaaat
acgaactgtc taccgaactg ctgaaatctt ctttcctggt taccgactac 780
ctggaacagg
ctatcaacga aggtgaatgc cagcagctgt ctaaagacga atacggttac 840
atcggtccgg
aactgcacaa aatcgttaaa gaaccgcagg cttacatcca gtaccagatg 900
aaacagacca
tcttcgactc taccggtatc tctctggaag accagatcat gaccgaagtt 960
ctgatcgacc
aggctgaacg tctgggtctg ggtcagcgta tcctgatcga agctggttgc 1020
gacgacccga
tgaacccgta cctgttctct aactctgcta acgctctgga caccgttaaa 1080
aacaccgttc
acgaccgtac cctgaaactg gcttaa 1116
<210> 11
<211> 1095
<212> DNA
<213> Streptomyces hirsutus
<400> 11
atgatcttgc
aagctgagcg cacgcacatc gtcgacgccg aagccgtcgc caccatcgtc 60
acgaaggtgg
gactggggca actctacgac ctgaccatcg cccgcatgga ggcggctctc 120
accggtggac
ccggtgcgcc ggtggagatg aagcagcggg acggtttcct gctggagaca 180
ccgcagttgg
gcctgctcga gtggatgccg gcggtccgcc aaggcaccac ggtctccatc 240
aagatggtcg
cctacaaccc gcacaatccg gtcaagaacc agctgcccac catcctgtcg 300
acactgtgcg
ccttcgacac ggacagcggc caccttcgtg ccgtcgtcga cggcacgttc 360
gccaccgccg
tccgtacggg cgcggcgtcc gcactggcca gccgggtgct cgctcgcccg 420
gactccgccg
tgctcggcct ggtgggctgc ggtgcccagg cggtcacgca gttgcacgcc 480
ctggcacgcg
tcttctcgtt ctccgaggtg ctcgtccacg acaaggacgc gcgggcggag 540
cgatccttcg
cggcgagggc ccggatgccc gaggggctgg tgcgcgtcgc gccgctcgcg 600
gaggtggagg
agcgggccga cgtgctgtgc accgccacct cggtcggccc ccacgagggg 660
ccggtcatcc
ggggcacgtc actcaagccc tgggtgcacg tcaacaccat cggatcggac 720
atgccgggca
agacggagct gccgctggac cttctgcgcg cggcggtcgt ctgcccggac 780
cacgtggagc
aggcacgggc cgagggtgac tgccagcagc tcgcccccga ggagatcggg 840
gctccgctcc
ccgacctgct gcgtgatccg gacgcgcacc gcaggctgtc gccggtcacc 900
accgtgtacg
actcgacagg tctcgcgctg caggatctcg tcatggtgga ggtgctggag 960
gagttggcgc
gggacctcga cgtcggacac cacgtcttca tcgaggcgac ggccgacgac 1020
ccgcaggacc
cgtactcgtt cctccctgcg gaggtcaccc ggtccctggc cggcacggcc 1080
ggagcgcgac
gatga 1095
<210> 12
<211> 364
<212> PRT
<213> Streptomyces hirsutus
<400> 12
Met Ile Leu Gln
Ala Glu Arg Thr His Ile Val Asp Ala Glu Ala Val
1 5 10 15
Ala Thr Ile Val
Thr Lys Val Gly Leu Gly Gln Leu Tyr Asp Leu Thr
20 25 30
Ile Ala Arg Met
Glu Ala Ala Leu Thr Gly Gly Pro Gly Ala Pro Val
35 40 45
Glu Met Lys Gln
Arg Asp Gly Phe Leu Leu Glu Thr Pro Gln Leu Gly
50 55 60
Leu Leu Glu Trp
Met Pro Ala Val Arg Gln Gly Thr Thr Val Ser Ile
65 70 75 80
Lys Met Val Ala
Tyr Asn Pro His Asn Pro Val Lys Asn Gln Leu Pro
85 90 95
Thr Ile Leu Ser
Thr Leu Cys Ala Phe Asp Thr Asp Ser Gly His Leu
100 105 110
Arg Ala Val Val
Asp Gly Thr Phe Ala Thr Ala Val Arg Thr Gly Ala
115 120 125
Ala Ser Ala Leu
Ala Ser Arg Val Leu Ala Arg Pro Asp Ser Ala Val
130 135 140
Leu Gly Leu Val
Gly Cys Gly Ala Gln Ala Val Thr Gln Leu His Ala
145 150 155 160
Leu Ala Arg Val
Phe Ser Phe Ser Glu Val Leu Val His Asp Lys Asp
165 170 175
Ala Arg Ala Glu
Arg Ser Phe Ala Ala Arg Ala Arg Met Pro Glu Gly
180 185 190
Leu Val Arg Val
Ala Pro Leu Ala Glu Val Glu Glu Arg Ala Asp Val
195 200 205
Leu Cys Thr Ala
Thr Ser Val Gly Pro His Glu Gly Pro Val Ile Arg
210 215 220
Gly Thr Ser Leu
Lys Pro Trp Val His Val Asn Thr Ile Gly Ser Asp
225 230 235 240
Met Pro Gly Lys
Thr Glu Leu Pro Leu Asp Leu Leu Arg Ala Ala Val
245 250 255
Val Cys Pro Asp
His Val Glu Gln Ala Arg Ala Glu Gly Asp Cys Gln
260 265 270
Gln Leu Ala Pro
Glu Glu Ile Gly Ala Pro Leu Pro Asp Leu Leu Arg
275 280 285
Asp Pro Asp Ala
His Arg Arg Leu Ser Pro Val Thr Thr Val Tyr Asp
290 295 300
Ser Thr Gly Leu
Ala Leu Gln Asp Leu Val Met Val Glu Val Leu Glu
305 310 315 320
Glu Leu Ala Arg
Asp Leu Asp Val Gly His His Val Phe Ile Glu Ala
325 330 335
Thr Ala Asp Asp
Pro Gln Asp Pro Tyr Ser Phe Leu Pro Ala Glu Val
340 345 350
Thr Arg Ser Leu
Ala Gly Thr Ala Gly Ala Arg Arg
355 360
<210> 13
<211> 1095
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
atgatcctgc
aggctgaacg tacccacatc gttgacgctg aagctgttgc taccatcgtt 60
accaaagttg
gtctgggtca gctgtacgac ctgaccatcg ctcgtatgga agctgctctg 120
accggtggtc
cgggtgctcc ggttgaaatg aaacagcgtg acggtttcct gctggaaacc 180
ccgcagctgg
gtctgctgga atggatgccg gctgttcgtc agggtaccac cgtttctatc 240
aaaatggttg
cttacaaccc gcacaacccg gttaaaaacc agctgccgac catcctgtct 300
accctgtgcg
ctttcgacac cgactctggt cacctgcgtg ctgttgttga cggtaccttc 360
gctaccgctg
ttcgtaccgg tgctgcttct gctctggctt ctcgtgttct ggctcgtccg 420
gactctgctg
ttctgggtct ggttggttgc ggtgctcagg ctgttaccca gctgcacgct 480
ctggctcgtg
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cgttctttcg
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gaagttgaag
aacgtgctga cgttctgtgc accgctacct ctgttggtcc gcacgaaggt 660
ccggttatcc
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atgccgggta
aaaccgaact gccgctggac ctgctgcgtg ctgctgttgt ttgcccggac 780
cacgttgaac
aggctcgtgc tgaaggtgac tgccagcagc tggctccgga agaaatcggt 840
gctccgctgc
cggacctgct gcgtgacccg gacgctcacc gtcgtctgtc tccggttacc 900
accgtttacg
actctaccgg tctggctctg caggacctgg ttatggttga agttctggaa 960
gaactggctc
gtgacctgga cgttggtcac cacgttttca tcgaagctac cgctgacgac 1020
ccgcaggacc
cgtactcttt cctgccggct gaagttaccc gttctctggc tggtaccgct 1080
ggtgctcgtc
gttaa
1095
Claims (6)
1.全细胞生物催化合成L-2-哌啶甲酸的方法,其特征是,以L-赖氨酸盐酸盐或L-赖氨酸为底物,通过添加烟酰胺腺嘌呤二核苷酸及重组宿主菌,通过生物催化制备L-2-哌啶甲酸;其中重组宿主菌为含有Arenimonas donghaensis
DSM 18148蛋白编码基因的重组宿主菌、含有Pseudomonas veronii CIP104663蛋白编码基因的重组宿主菌或者含有Streptomyces hirsutus ATCC 19091蛋白编码基因的重组宿主菌中的任意一种。
2.根据权利要求1所述的全细胞生物催化合成L-2-哌啶甲酸的方法,其特征是,所述重组宿主菌为大肠杆菌。
3.根据权利要求1或2所述的全细胞生物催化合成L-2-哌啶甲酸的方法,其特征是,反应在pH8.0的磷酸钾缓冲溶液中进行。
4.根据权利要求1或2所述的全细胞生物催化合成L-2-哌啶甲酸的方法,其特征是,反应温度为20℃-30℃。
5.根据权利要求1或2所述的全细胞生物催化合成L-2-哌啶甲酸的方法,其特征是,反应在摇床上进行,摇床转速为180rpm。
6. 根据权利要求1或2所述的全细胞生物催化合成L-2-哌啶甲酸的方法,其特征是,重组宿主菌的浓度为50g/L-150g/L。
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