CN105821129A - 一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒 - Google Patents

一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒 Download PDF

Info

Publication number
CN105821129A
CN105821129A CN201610272708.1A CN201610272708A CN105821129A CN 105821129 A CN105821129 A CN 105821129A CN 201610272708 A CN201610272708 A CN 201610272708A CN 105821129 A CN105821129 A CN 105821129A
Authority
CN
China
Prior art keywords
donkey
horse
corii asini
colla corii
quantitative
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201610272708.1A
Other languages
English (en)
Inventor
步迅
张全芳
刘艳艳
范阳阳
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Biotechnology Research Center of Shandong Academy of Agricultural Sciences
Original Assignee
Biotechnology Research Center of Shandong Academy of Agricultural Sciences
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Biotechnology Research Center of Shandong Academy of Agricultural Sciences filed Critical Biotechnology Research Center of Shandong Academy of Agricultural Sciences
Priority to CN201610272708.1A priority Critical patent/CN105821129A/zh
Publication of CN105821129A publication Critical patent/CN105821129A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6851Quantitative amplification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/16Primer sets for multiplex assays

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明涉及一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒,属于分子生物学技术领域,该方法为根据驴和马看家基因单拷贝基因,设计驴和马通用引物及驴和马特异性探针,提取待测样品DNA,采用TaqMan qPCR的方法对阿胶胶液半成品或成品进行驴源或马源成分定量检测,根据标准曲线和待测样本的Ct值计算阿胶胶液单位质量中驴和马源核基因的拷贝数,计算出阿胶中驴源和马源所占比例,进而对阿胶样品驴源或马源成分定量,本发明的方法、组合物及试剂盒检测特异性好、灵敏度强、不仅实现阿胶中驴源和马源定性检测,还可以实现定量分析,为阿胶企业质量把控提供技术推广和应用。

Description

一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒
技术领域
本发明涉及一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒,属于分子生物学技术领域。
背景技术
阿胶为马科动物驴的皮,经煎煮、浓缩制成的固体胶,原产自山东省泛东阿区,始载于《神农本草经》,与人参、鹿茸并称为“滋补三宝”,至今已有近三千年历史。阿胶补血圣药,味甘平,入肺、肝、肾经,具有补血止血、滋阴润燥等功效,药食两用,长期服用可补血养血、美白养颜、抗衰老、抗疲劳、提高免疫力,适用人群广泛。李时珍著《本草纲目》载:“阿胶《本经》上品。
2015版《中国药典》明确规定阿胶为马科动物驴(EquusanimusL.)的皮经去毛、煎煮并佐以黄酒、豆油、冰糖熬制而成。然而随着胶类市场的不断发展,随着熬胶原料供应的紧张和原料价格上涨,一些驴皮供应商拿廉价马皮、骡子皮甚至牛皮冒充驴皮,掺假手段高明,有的甚至将驴耳朵缝制马皮上等变成驴皮的特征来冒充驴皮,另外由于驴、马及骡子同属马科动物,仅凭外观更是难以鉴别,成为企业原料质量把控的一大难题,或多或少会掺入马皮或骡子皮等无意掺假现象在所难免,作为阿胶生产企业更加迫切需要阿胶整个生产过程的质量把控,不让马皮、骡子皮或牛皮掺入阿胶中,生产纯正的驴皮源阿胶,这就要求发展更加可行、灵敏的检测技术来满足阿胶生产企业及监管部门质量控制与监管的需求。
随着分子生物学技术的发展,一些基于DNA的生物学鉴定手段逐渐丰富起来,DNA分子法主要是利用显示生物特征的各种生物物种所具有的不同DNA序列信息进行鉴别,它可以突破依据感官检测的局限性,与传统分析方法相比,更加具有客观性和准确性。以聚合酶链式反应(PCR)为基础的技术已逐步成为了食品药品中动物源性成分种属鉴定的核心方法。近年来实时荧光PCR技术的飞速发展大大提高了检测的灵敏度、特异性和准确性,并使得成分含量的定量溯源成为可能,由于荧光定量整个检测过程闭管操作,所以有效的减少了实验过程中外源污染的危险,目前广泛应用于各个领域。
近年来随着阿胶掺假现象不断被媒体曝光,逐渐引起科研工作者的重视,国内外科研机构及阿胶企业开展了大量利用分子生物学技术手段鉴定驴皮、马皮真伪鉴定的科学研究工作,专利授权号为(CN.104046700B)利用qPCR技术解决了快速鉴别驴皮、马皮、驴骡及马骡皮的技术难题,专利(CN201510018058.3)公开了阿胶中驴、马、猪及牛源性多重实时荧光PCR检测方法,专利(CN201510403781.3)利用巢式PCR技术鉴别阿胶真伪,但都是针对阿胶成品的真伪利用线粒体为靶基因进行定性检测,由于线粒体基因在所有的动物不同组织细胞中拷贝数不同而不能量化,无法区分阿胶中是污染还是掺假,更不能知晓掺假比例,因此,阿胶掺假量化研究十分必要。而基于DNA检测技术的驴源和马源成分量化分析方法研究目前在国内外还尚未报道。
发明内容
为解决上述技术问题,本发明提供一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的实时荧光定量检测方法、组合物及试剂盒,该方法、组合物及试剂盒检测特异性好、灵敏度强、不仅实现阿胶中驴源和马源定性检测,还可以实现定量分析,为阿胶企业质量把控提供技术推广和应用。
为实现上述目的,本发明的技术方案为:
一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法,根据驴和马看家基因单拷贝基因,设计引物及探针,提取待测样品DNA,采用TaqManqPCR的方法对阿胶胶液半成品或成品进行驴源或马源成分定量检测,根据标准曲线和待测样本的Ct值计算阿胶胶液单位质量中驴和马源核基因的拷贝数,计算出阿胶中驴源和马源所占比例,进而对阿胶样品驴源或马源成分定量。
本发明还具有以下附加技术特征:
进一步的,采集阿胶胶液样本,根据阿胶现代加工工艺流程,在阿胶生产过程中化皮和胶汁分离阶段分别取样200ml,利用专利CN.201410317118阿胶DNA提取技术提取核酸DNA。经实验证明阿胶在化皮阶段和胶汁分离阶段所提取的核酸DNA完整性好。利用基因信息学技术寻找驴和马看家基因单拷贝基因,设计特异引物及特异性探针,采用TaqManqPCR的方法对阿胶中进行驴源和马源成分定量检测,根据标准曲线和待测样本的Ct值计算阿胶单位质量中驴和马源核基因的拷贝数,推算出阿胶中驴源和马源所占比例,进而达到定量的目的。
优选的,所述待测样品为阿胶生产过程中化皮和胶汁分离阶段的样品。
优选的,所述看家基因为驴和马的特征基因LHB基因。
优选的,所述引物为驴和马通用引物,所述探针为驴、马特异性探针,序列分别如下:
(1)驴和马通用引物:
UF:5’-TGGACCCCATGGTCTCCTTC-3’,如SEQNO.1所示;
UR:5’-CAGGAGTTGGGGTGGATGTG-3’,如SEQNO.2所示;
(2)驴、马特异性探针:
驴特异探针:
Equusasinus-Probe:P:5'CGGGGGTCCCAGAGACCACC3',如SEQNO.3所示;
马特异探针:
Equuscaballus-Probe:5'CTGCCAGATCAAGACCACTGACTGC3',如SEQNO.4所示;
其中,所述驴、马特异性探针的5’端修饰有报告基团,3’端修饰有淬灭基团,所述报告基团为FAM、HEX、TAMRA、ROX、CY5中的任一种,所述淬灭基团为Dabcyl、BHQ1、BHQ2中的任一种。
进一步的,驴特异探针:
Equusasinus-Probe:P:5'FAM-CGGGGGTCCCAGAGACCACC-BHQ23',如SEQNO.3所示;
马特异探针:
Equuscaballus-Probe:5'JOE-CTGCCAGATCAAGACCACTGACTGC-BHQ23',如SEQNO.4所示。
优选的,所述提取阿胶样品DNA为使用专利号为CN.201410317118.7的专利公开的方法提取。
优选的,所述标准曲线的制作具体为:将驴和马的目标靶基因分别克隆到PMD18-T载体中,通过测序筛选阳性克隆,分别取已知浓度的驴、马阳性克隆质粒作为标准样,按照10倍体积梯度稀释作为标准模板,梯度稀释为107-103拷贝/μl,标准模板与待测样品DNA同时进行定量PCR扩增,反应结束后,根据各个浓度梯度的Ct值和浓度值绘制荧光定量PCR标准曲线;
其中:马的目标靶基因序列为:
TGGACCCCATGGTCTCCTTCCCCGTGGCCCTCAGTTGTCACTGCGGGCCCTGCCAGATCAAGACCACTGACTGCGGGGTTTTCAGAGACCAGCCCTTGGCCTGTGCCCCCCAGGCCTCCTCTTCCTCTAAGGATCCCCCATCCCAACCTCTCACATCCACATCCACCCCAACTCCTG,如SEQNO.5所示.
其中:驴的目标靶基因序列为:
TGGACCCCATGGTCTCCTTCCCCGTGGCCCTCAGTTGTCACTGCGGGCCCTGCCGCCTCAAGACCACTGACTGCGGGGGTCCCAGAGACCACCCCTTGGCCTGTGCCCCCCAGACCTCCTCTTCCTGTAAGGATCCCCCATCCCAACCTCTCACATCCACATCCACCCCAACTCCTG如SEQNO.6所示.
优选的,所述PCR扩增体系为:含TaqManreactionMix(2x)10μl,驴特异探针0.2~0.5μM,马特异探针0.2~0.5μM,驴和马通用引物正反向序列均为0.5μM,ROX参比荧光50x0.4μl,待测样本总DNA2μl,用双蒸水补足20μl反应体系;所述PCR扩增条件为:95℃10min;95℃10s,60℃,35s,在此收集荧光信号,45个循环。
优选的,所述PCR扩增阶段反应需在至少2通道型号的荧光定量PCR仪上进行。
本发明还提供一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测引物、探针组合物,包括以下引物、探针:
(1)驴和马通用引物:
UF:5’-TGGACCCCATGGTCTCCTTC-3’,如SEQNO.1所示;
UR:5’-CAGGAGTTGGGGTGGATGTG-3’,如SEQNO.2所示;
(2)驴、马特异性探针:
驴特异探针:
Equusasinus-Probe:P:5'CGGGGGTCCCAGAGACCACC3',如SEQNO.3所示;
马特异探针:
Equuscaballus-Probe:5'CTGCCAGATCAAGACCACTGACTGC3',如SEQNO.4所示;
其中,所述驴和马特异性探针的5’端修饰有报告基团,3’端修饰有淬灭基团,所述报告基团为FAM、HEX、TAMRA、ROX、CY5中的任一种,所述淬灭基团为Dabcyl、BHQ1、BHQ2中的任一种。
进一步的,驴特异探针:
Equusasinus-Probe:P:5'FAM-CGGGGGTCCCAGAGACCACC-BHQ23',如SEQNO.3所示;
马特异探针:
Equuscaballus-Probe:5'JOE-CTGCCAGATCAAGACCACTGACTGC-BHQ23',如SEQNO.4所示。
本发明另提供一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测试剂盒,包括上述引物、探针组合物以及荧光PCR反应所需试剂。
优选的,所述荧光PCR反应体系为20μl,所需试剂包括含TaqManreactionMix(2×)10μl,驴特异探针0.2~0.5μM,马特异探针0.2~0.5μM,驴和马通用引物正、反向序列均为0.5μM,ROX参比荧光50×0.4μl,待测样本总DNA2μl,双蒸水。
本发明的阿胶胶液和成品中驴、马源性成分的实时荧光定量PCR量化检测方法,其具体步骤如下:
(1)驴或马内标准基因的筛选与获得
进入ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-84/fasta/equus_caballus/目录下,分别下载cdna、ncma和pep下级文件内的Equus_caballus.EquCab2.pep.abinitio.fa和Equus_caballus.EquCab2.pep.all.fa文件,解压后合并cDNA列表和ncRNA列表生成核酸序列文件,作为马基因核酸序列信息库(驴全基因组信息还未公布),服务器本地BLASTn运行,按照E值和identity筛选,筛选得到马物种内同其他物种在核酸水平及蛋白质水平比对同源性小的目标序列。通过筛选结合文献查找最终找到驴和马的特征基因LHB基因,该基因据文献报道为单拷贝基因。通过BLAST分析驴和马特征核酸同源性为96%,氨基酸序列同源性为93%。与最近的白犀牛(Ceratotherium)的同源性只有83%。核酸序列同源比对见附图说明图1。
(2)驴和马特异基因的引物、探针设计。本发明通过比对驴和马的特征基因序列,在共同的一致序列区域设计驴和马的通用引物,在存在差异区域设计驴和马各自特异性探针。基于阿胶高温炮制降解为DNA小片段情况,本发明采用Mini-qPCR技术,PCR扩增片段长度范围100~200bp左右,大大提高了检测成功率。
(3)本发明提供了一种阿胶取样方法。根据阿胶现代加工工艺流程,在化皮后和胶汁分离阶段取样200ml,利用专利CN.201410317118.7阿胶DNA提取技术提取核酸DNA,其方法在专利201410317118.7中有详细的记载,在此不再赘述。经实验证明阿胶在化皮后和胶汁分离阶段所提取的核酸DNA完整性好。
(4)本发明优先选用20μl的实时荧光多重PCR扩增体系,含TaqManreactionMix(2×)10μl,Equusasinus-Probe0.2~0.5μM,Equuscaballus-Probe0.2~0.5μM,特异性正反向引物UF/UR0.5~μM(目的产物大小177bp),ROX参比荧光(50×)0.4μl,待测样本总DNA2μl,用双蒸水补足20μl反应体系。阴性模板对照加无菌双蒸水。
(5)本发明优先选用PCR扩增条件:PCR扩增条件为:95℃10min;95℃10s,60℃,35s,在此收集荧光信号,45个循环。
(6)标准曲线的制作:将驴和马的目标靶基因分别克隆的PMD18-T载体中,通过测序筛选阳性克隆,分别取已知浓度的驴、马阳性克隆质粒作为标准样,按照10倍体积梯度稀释作为标准模板(107-104拷贝/μl)。依照上述荧光定量PCR体系和PCR扩增条件(步骤4和5)与待测样本同时进行定量PCR扩增。反应结束后,根据各个浓度梯度的Ct值和浓度值绘制荧光定量PCR标准曲线。
(7)根据待测样本的Ct值和标准曲线计算样本中含驴源和马源基因拷贝数,进而计算出驴源和马源所占百分含量。
上述所涉及到的驴和马靶基因及引物探针全部为本发明所设计,并在上海生工生物工程股份有限公司合成。上述多重实时荧光定量PCR检测步骤中,进行PCR扩增时,扩增阶段反应需在至少2通道型号的荧光定量PCR仪上进行,根据不同型号的定量PCR仪的不同要求可以对标记荧光素进行相应的调整。
有益效果:
本发明有益效果在于:本发明公开了一种阿胶胶液半成品中驴、马源性成分的实时荧光定量PCR量化检测方法,其创新性在于:
(1)本发明创造性的选取了阿胶生产过程中化皮和胶汁分离阶段取样,克服了由于阿胶成品经过长时间高温炮制导致DNA降解而提取困难不完整的难题;
(2)本发明利用基因信息学技术分析寻找驴和马的基因组单拷贝看家基因,并设计特异引物和探针,通过绘制标准曲线和确立基因质量比系数,实现对阿胶中掺有马源成分比例的定量检测,弥补了现有技术缺乏定量检测的不足。
(3)本发明的所使用的引物、探针组合物特异性强,灵敏度好,能够有效实现阿胶胶液动物源成分的定量检测。
(4)本发明在阿胶生产加工质量监控及监管部门监管中具有很高的应用价值。
(5)本发明的方法重复性好、特异性强、准确度高、通量大、使用方便、耗费时间短2小时之内即可完成检测。
附图说明
图1.阿胶不同生产阶段提取的基因组DNA琼脂糖凝胶电泳图。
图2-a.驴和马特征核酸同源性BLASTGraphicSummary分析图;
图2-b.驴和马特征核酸同源性BLASTSequencesproducingsignificantalignments分析图。
图3.驴源马源特征基因与其他物种基因序列同源性比对图的上部图。
图4.为驴源的标准曲线扩增图,y=-3.325x+32.761(Eff%=99.884,R2=0.986)。
图5.为马源的标准曲线扩增图,y=-3.197x+30.994(Eff%=105.473,R2=0.983)。
图6.为驴源的DNA标准品不同梯度浓度的扩增曲线图,其中每个梯度浓度为三个平行样,图中标注指的为三个平行样中的一个。
图7.为马源的DNA标准品不同梯度浓度的扩增曲线图,其中每个梯度浓度为三个平行样,图中标注指的为三个平行样中的一个。
图8.为驴源和马源成分灵敏度定量检测图,定量检测限为1%,其中图中最上部重合在一起的线均为100%驴。
具体实施方式
下列实施例中,所用实验材料、试剂与仪器如下:
实验材料:阿胶生产各个环节中的半成品、阿胶成品、驴、马、牛、猪、骡子、山羊、绵羊、兔、鱼、鸡、鸭、狗、骆驼、水貂及狐狸等动物组织材料,均为济南市购。
所用试剂:动物组织提取试剂盒为OMEGA品牌。DNA分子量MakerDL1000、电泳上样缓冲液等PCR反应试剂购自宝生物工程(大连)有限公司。引物与探针由生工生物工程(上海)有限公司负责合成。2×TaqManMasterMix为DBIBioscience品牌。DNA测序由山东省农业科学院生物技术中心测序中心完成。
所用仪器:ABI7500荧光定量PCR仪为ABI公司产品,TakaraPCR仪为宝生物工程(大连)有限公司产品。5424D型高速离心机为Eppendorf公司产品。
实施例1
(1)DNA提取:本发明提供了一种阿胶取样方法。根据阿胶现代加工工艺流程,在化皮、胶汁分离、撤沫提杂双效后、浓缩阶段、凝胶成胶膏阶段及加工成品阿胶取样200ml(100g),利用专利CN.201410317118阿胶DNA提取技术提取核酸DNA。经实验证明阿胶在化皮后和胶汁分离阶段所提取的核酸DNA完整性好,其他阶段均有不同程度的降解,但经过不同片段的扩增,100~300bp的小片段基因扩增产物均可以得到很好,阿胶不同生产加工阶段DNA提取琼脂糖凝胶电泳见图1。
(2)驴或马内标准基因的筛选与获得
进入ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-84/fasta/equus_caballus/目录下,分别下载cdna、ncma和pep下级文件内的Equus_caballus.EquCab2.pep.abinitio.fa和Equus_caballus.EquCab2.pep.all.fa文件,解压后合并cDNA列表和ncRNA列表生成核酸序列文件,作为马基因核酸序列信息库(驴全基因组信息还未公布),服务器本地BLASTn运行,按照E值和identity筛选,筛选得到马物种内同其他物种在核酸水平及蛋白质水平比对同源性小的目标序列。通过筛选结合文献查找最终找到驴和马的特征基因,该基因据文献报道为单拷贝基因。通过BLAST分析驴和马特征核酸同源性为96%,氨基酸序列同源性为93%。与最近的白犀牛(Ceratotherium)的同源性只有83%。见附图说明图2.和图3.
(3)驴和马特异基因的引物、探针设计。本发明通过比对驴和马的特征基因序列,在共同的一致序列区域设计驴和马通用引物,在存在差异区域设计驴和马各自特异性探针。基于阿胶高温炮制降解为DNA小片段情况,本发明采用Mini-qPCR技术,PCR扩增片段长度范围100~200bp左右,大大提高了检测成功率。本发明提供引物及探针序列如下:
驴和马的通用引物(177bp):
UF:5’-TGGACCCCATGGTCTCCTTC-3’;
UR:5’-CAGGAGTTGGGGTGGATGTG-3’;
驴特异探针:
Equusasinus-P:5'FAM-CGGGGGTCCCAGAGACCACC-BHQ23';
马特异探针:
Equuscaballus-P:5'JOE-CTGCCAGATCAAGACCACTGACTGC-BHQ23'。
(5)阿胶中马源性、驴源性成分的定量检测:选用20μl的实时荧光多重PCR扩增体系,含TaqManreactionMix(2×)10μl,Equusasinus-Probe0.25μM,Equuscaballus-Probe0.4μM,特异性正反向引物UF/UR0.8μM(目的产物大小177bp),ROX参比荧光(50×)0.4μl,待测样本总DNA2μl,用双蒸水补足20μl反应体系。阴性模板对照加无菌双蒸水。20μl反应体系见表1。
表120μlPCR反应体系
The name of the reagent concentration reagent demand(μl)
TaqMan reaction Mix 10
UF/UR primer 10μM 1
Equus asinus-Probe 10μM 0.4
Equus caballus-Probe 10μM 0.8
DNA template 1-20ng/μl 2
ddH2O To 20
(6)本发明优先选用PCR扩增条件:PCR扩增条件为:95℃10min;95℃10s,60℃,35s,在此收集荧光信号,45个循环。
(7)标准曲线的制作:将驴和马的目标靶基因分别克隆到PMD18-T载体中,通过测序筛选阳性克隆,目的基因阳性克隆测序进一步验证。驴和马的重组质粒标准品片段长度为2950bp,紫外分光光度计检测重组质粒浓度,稀释到1ng/ul,通过拷贝数计算公式:(6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNAlength×660)=copies/ul计算得到1ng/μl的重组质粒拷贝数为3.09×108copies。按照10倍体积梯度稀释作为标准模板(107~104拷贝/μl)。依照上述荧光定量PCR体系和PCR扩增条件(步骤5和6)与待测样本同时进行定量PCR扩增。反应结束后,根据各个浓度梯度的Ct值和浓度值绘制荧光定量PCR标准曲线。根据待测样本的Ct值和标准曲线计算出样本中含驴源和马源基因拷贝数,进而推算驴源和马源所占百分含量。
(8)阿胶样品中驴源和马源百分比含量计算:标准曲线的计算公式:y=-3.325x+32.761(Eff%=99.884,R2=0.986),驴的标准曲线见图4扩,扩增曲线见图6;y=-3.197x+30.994(Eff%=105.473,R2=0.983)马的标准曲线见图5,扩增曲线见图7,通过标准曲线及待测样本Ct值即可计算出待测样本含有马源性及驴源性拷贝数。
实施例2特异性验证
利用所设计的引物及探针,分别以牛、猪、马、驴、骡子、山羊、绵羊、兔、鱼、鸡、鸭、狗、骆驼、水貂及狐狸等动物的总基因组DNA为模板,进行实时荧光定量PCR检测,验证引物及探针的特异性。其结果见表2,结果表明本发明所设计的引物及探针具有很强的特异性。
表2特异性验证实验
实施例3灵敏度实验
按照驴皮中掺入5‰、1%、2%、5%,10%,20%,50%的马皮混匀(质量比),提取DNA,利用本发明体系进行多重实时荧光定量PCR检测,评估本发明的检测限,结果表明本方法定量检测限为1%,见附图说明图8。
实施例4模拟掺假定量检测
按照驴皮中掺入0%、1%、2%、5%、10%、20%、50%和100%的比例掺入马皮,按照本专利所述定量方法进行定量检测,设5个平行试验,结果见表3,结果显示含有马源成分越低如1%、2%时,定量相对误差值越大,随着马源百分比含量的增加相对误差值减小,造成误差的原因可能是操作误差或检测误差,实际混合比例和检测混合比例结果基本符合,验证了本发明的定量方法的可行性。
表3混合样本驴和马源成分定量检测
实施例5阿胶胶液样品的定量检测
按照不同的掺入比例,驴皮中分别掺入0%、1%、5%、10%、20%、50%的马皮进行实验室阶段的熬制,完全按照生产过程进行模拟,在化皮阶段取样,该步骤供试样本由山东国胶堂阿胶药业有限公司提供,由本实验室以未知样本处理,提取DNA,每个样品设5个平行试验,通过标准曲线法对阿胶中驴、马源性进行定量分析,实验结果见表4,结果表明马皮实际掺入比例与定量检测结果基本一致,进一步验证了本发明的定量方法的可行性。
表4实际阿胶样品检测
备注:样品编号为1-6为化皮阶段不同掺假比例阿胶样本
上述虽然结合实施例对本发明的具体实施方式进行了描述,但并非对本发明保护范围的限制,所属领域技术人员应该明白,在本发明的技术方案的基础上,本领域技术人员不需要付出创造性劳动即可做出的各种修改或变形仍在本发明的保护范围以内。

Claims (10)

1.一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法,其特征在于,
根据驴和马看家基因单拷贝基因,设计引物及探针,提取待测样品DNA,采用TaqManqPCR的方法对阿胶胶液半成品或成品进行驴源或马源成分定量检测,根据标准曲线和待测样本的Ct值计算阿胶胶液单位质量中驴和马源核基因的拷贝数,计算出阿胶中驴源和马源所占比例,进而对阿胶样品驴源或马源成分定量。
2.根据权利要求1所述的阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法,其特征在于,所述看家基因为驴和马的特征基因LHB基因。
3.根据权利要求1所述的阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法,其特征在于,所述引物为驴和马通用引物,所述探针为驴、马特异性探针,序列分别如下:
(1)驴和马通用引物:
UF:5’-TGGACCCCATGGTCTCCTTC-3’,如SEQNO.1所示;
UR:5’-CAGGAGTTGGGGTGGATGTG-3’,如SEQNO.2所示;
(2)驴、马特异性探针:
驴特异探针:
Equusasinus-Probe:P:5'CGGGGGTCCCAGAGACCACC3',如SEQNO.3所示;
马特异探针:
Equuscaballus-Probe:5'CTGCCAGATCAAGACCACTGACTGC3',如SEQNO.4所示;
其中,所述驴、马特异性探针的5’端修饰有报告基团,3’端修饰有淬灭基团,所述报告基团为FAM、HEX、TAMRA、ROX、CY5中的任一种,所述淬灭基团为Dabcyl、BHQ1、BHQ2中的任一种。
4.根据权利要求1所述的阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法,其特征在于,所述提取阿胶样品DNA为使用专利号为CN.201410317118.7的专利公开的方法提取。
5.根据权利要求1所述的阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法,其特征在于,所述标准曲线的制作具体为:将驴和马的目标靶基因分别克隆到PMD18-T载体中,通过测序筛选阳性克隆,分别取已知浓度的驴、马阳性克隆质粒作为标准样,按照10倍体积梯度稀释作为标准模板,标准模板与待测样品DNA同时进行定量PCR扩增,反应结束后,根据各个浓度梯度的Ct值和浓度值绘制荧光定量PCR标准曲线。
6.根据权利要求5所述的阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法,其特征在于,所述PCR扩增体系为:含TaqManreactionMix(2x)10μl,驴特异探针0.2~0.5μM,马特异探针0.2~0.5μM,驴和马通用引物正反向序列均为0.5μM,ROX参比荧光50x0.4μl,待测样本总DNA2μl,用双蒸水补足20μl反应体系;所述PCR扩增条件为:95℃10min;95℃10s,60℃,35s,在此收集荧光信号,45个循环。
7.根据权利要求5或6所述的阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法,其特征在于,所述PCR扩增阶段反应需在至少2通道型号的荧光定量PCR仪上进行。
8.一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测引物、探针组合物,其特征在于,包括以下引物、探针:
(1)驴和马通用引物:
UF:5’-TGGACCCCATGGTCTCCTTC-3’,如SEQNO.1所示;
UR:5’-CAGGAGTTGGGGTGGATGTG-3’,如SEQNO.2所示;
(2)驴、马特异性探针:
驴特异探针:
Equusasinus-Probe:P:5'CGGGGGTCCCAGAGACCACC3',如SEQNO.3所示;
马特异探针:
Equuscaballus-Probe:5'CTGCCAGATCAAGACCACTGACTGC3',如SEQNO.4所示;
其中,所述驴、马特异性探针的5’端修饰有报告基团,3’端修饰有淬灭基团,所述报告基团为FAM、HEX、TAMRA、ROX、CY5中的任一种,所述淬灭基团为Dabcyl、BHQ1、BHQ2中的任一种。
9.一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求8所述引物、探针组合物以及荧光PCR反应所需试剂。
10.根据权利要求9所述胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测试剂盒,其特征在于,所述荧光PCR反应体系为为20μl,所需试剂包括含TaqManreactionMix(2x)10μl,驴特异探针0.2~0.5μM,马特异探针0.2~0.5μM,驴和马通用引物正、反向序列均为0.5μM,ROX参比荧光50x0.4μl,待测样本总DNA2μl,双蒸水。
CN201610272708.1A 2016-04-28 2016-04-28 一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒 Pending CN105821129A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610272708.1A CN105821129A (zh) 2016-04-28 2016-04-28 一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610272708.1A CN105821129A (zh) 2016-04-28 2016-04-28 一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN105821129A true CN105821129A (zh) 2016-08-03

Family

ID=56527654

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610272708.1A Pending CN105821129A (zh) 2016-04-28 2016-04-28 一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN105821129A (zh)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106119390A (zh) * 2016-08-24 2016-11-16 济南诺贝莱生物科技有限公司 一种基于mgb探针鉴定驴皮、马皮和骡子皮的试剂盒及其检测方法
CN108841927A (zh) * 2018-07-23 2018-11-20 山东省产品质量检验研究院 一种基于数字pcr的阿胶及阿胶制品中阿胶成分的定量检测方法
CN109943625A (zh) * 2019-03-26 2019-06-28 上海出入境检验检疫局动植物与食品检验检疫技术中心 食品和饲料中驴源性成分的实时荧光pcr检测方法

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104531884A (zh) * 2015-01-14 2015-04-22 山东省农业科学院生物技术研究中心 鉴别阿胶中多种动物源性的引物探针组合物、试剂盒及多重实时荧光定量pcr检测方法
CN104774958A (zh) * 2015-04-27 2015-07-15 山东省农业科学院生物技术研究中心 鉴别驴、马、狐狸动物源性的引物探针组合物、试剂盒和多重实时荧光定量pcr检测方法
CN105132543A (zh) * 2015-08-26 2015-12-09 山东省农业科学院生物技术研究中心 鉴定化妆品中驴、马及牛源性成分的引物、探针组合物、试剂盒及多重荧光pcr检测方法

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104531884A (zh) * 2015-01-14 2015-04-22 山东省农业科学院生物技术研究中心 鉴别阿胶中多种动物源性的引物探针组合物、试剂盒及多重实时荧光定量pcr检测方法
CN104774958A (zh) * 2015-04-27 2015-07-15 山东省农业科学院生物技术研究中心 鉴别驴、马、狐狸动物源性的引物探针组合物、试剂盒和多重实时荧光定量pcr检测方法
CN105132543A (zh) * 2015-08-26 2015-12-09 山东省农业科学院生物技术研究中心 鉴定化妆品中驴、马及牛源性成分的引物、探针组合物、试剂盒及多重荧光pcr检测方法

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106119390A (zh) * 2016-08-24 2016-11-16 济南诺贝莱生物科技有限公司 一种基于mgb探针鉴定驴皮、马皮和骡子皮的试剂盒及其检测方法
CN108841927A (zh) * 2018-07-23 2018-11-20 山东省产品质量检验研究院 一种基于数字pcr的阿胶及阿胶制品中阿胶成分的定量检测方法
CN109943625A (zh) * 2019-03-26 2019-06-28 上海出入境检验检疫局动植物与食品检验检疫技术中心 食品和饲料中驴源性成分的实时荧光pcr检测方法
CN109943625B (zh) * 2019-03-26 2021-09-21 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心 食品和饲料中驴源性成分的实时荧光pcr检测方法

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN104531884B (zh) 鉴别阿胶中多种动物源性的引物探针组合物、试剂盒及多重实时荧光定量pcr检测方法
CN104975105B (zh) 用于小鼠近交系鉴定的snp标记、引物对及其应用
CN105274246B (zh) 牛源性成分鉴定及其制品中多物种种源成分的检测试剂盒
CN107937566A (zh) 一组鉴定水蛭的特异性引物及其鉴定方法
CN105177150B (zh) 一种快速检测猪羊牛动物源性成分的多重pcr引物体系及检测方法
CN106868188B (zh) 一种鹿角胶中鹿、牛源性多重荧光pcr检测引物、探针、试剂盒及检测方法与应用
CN104046700A (zh) 一种快速鉴定驴皮、马皮和骡子皮的检测试剂盒
CN106011230A (zh) 用于检测碎片化dna目标区域的引物组合物及其应用
Zhang et al. An optimized TaqMan real-time PCR method for authentication of ASINI CORII COLLA (donkey-hide gelatin)
CN103789438A (zh) 鹿牛羊马驴猪动物皮组织dna的pcr鉴定用引物体系
CN108642208A (zh) 一种樟属及其近缘属植物通用ssr分子标记及其开发方法和应用
CN106498036A (zh) 一种用于高通量测序检测的药物基因组snp变异文库的构建方法及其应用
CN106191311B (zh) 一种快速检测豚鼠LCMV、SV、PVM、Reo-3病毒的多重液相基因芯片方法及试剂
CN105821129A (zh) 一种阿胶胶液半成品或成品中驴、马源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒
Jiang et al. Rapid and robust authentication of deer antler velvet product by fast PCR-RFLP analysis
CN104263857B (zh) 一种快速检测水貂肠炎病毒的纳米pcr试剂盒及其应用
CN105734156A (zh) 一种阿胶中驴、猪源性巢式荧光pcr检测引物、探针组合物、试剂盒及检测方法与应用
CN114196787A (zh) 一种中国南瓜曲叶病毒rpa-lfd快速可视化检测试剂盒及其应用
CN105907852A (zh) 一种阿胶中驴、马、牛和猪源性巢式荧光pcr检测引物、探针、试剂盒、检测方法及应用
CN110029172B (zh) 马、驴源性成分二重pcr检测试剂盒
CN105803086A (zh) 一种阿胶胶液半成品或成品中驴、猪源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒
CN105950717A (zh) 一种阿胶胶液半成品或成品中驴、牛源性成分的定量检测方法、组合物及试剂盒
CN106086223B (zh) 一种基于zna引物的str分型试剂盒
CN105256013B (zh) 一种同步检测猪羊牛动物源性成分的微滴pcr引物体系及检测方法
CN106755418A (zh) 一种外显子组装测序方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20160803

RJ01 Rejection of invention patent application after publication