CN105722525A - 鉴定对肿瘤具有直接抑制作用的干扰素的方法及其用途 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了对测试干扰素相对于rSIFN-co(一种对实体瘤具有治疗效果的干扰素)的效力进行确定或比较的新方法;建立测试干扰素与rSIFN-co间的基本等效性的方法;下调Wnt相关受体或共受体例如LRP6/FZD6的表达的方法;下调Wnt相关靶标基因例如Axin2、CD24、存活蛋白和/或ID2的表达的方法;抑制β-联蛋白/TCF转录活性的方法;抑制β-联蛋白的表达的方法;上调肿瘤抑制基因例如DKK-3、BATF2和/或KLF4,体外抑制肿瘤细胞生存力,体内抑制肿瘤生长和转移的方法;体外抑制肿瘤细胞迁移、伪足形成和集落形成的方法;以及确定测试干扰素的效力的方法,这些方法的鉴定试剂盒,以及具有所述活性的干扰素或干扰素替代物。
Description
技术领域
本发明在此涉及对测试干扰素相对于rSIFN-co的效力进行确定或比较的新方法,建立测试干扰素与rSIFN-co间的基本等效性(substantialequivalence)的方法,对癌细胞迁移、伪足(pseudopod)形成、β-联蛋白/TCF-介导的转录活性和β-联蛋白的蛋白水平进行抑制的方法,下调Wnt相关受体或共受体(co-receptor)的表达的方法,抑制Wnt信号转导通路的靶标基因的表达的方法,上调肿瘤抑制基因的方法,以及用于进行任何和所有上述方法的检测试剂盒。本发明还涉及具有上述活性的干扰素或干扰素替代物。
背景技术
超级干扰素(在下文中称为“rSIFN-co”或“sIFN-I”,一种对实体瘤具有治疗作用的干扰素)已经在美国专利7,364,724(重组高效复合干扰素)和美国专利7,585,647(编码重组干扰素的核酸)中有过描述。rSIFN-co从编码与(干扰素alfacon-1)(在美国专利4,695,623中公开的一种复合干扰素α)相同的氨基酸序列的工程化基因构建体表达而来。然而,rSIFN-co由与编码的核酸序列不同的新的核酸序列所编码。与相比,rSIFN-co蛋白具有新的三级结构以及改善的生物学特性。
如美国专利8,114,395、美国专利8,287,852和美国专利8,425,896中所记载的,与相比,rSIFN-co还具有更广谱的生物活性,包括直接抑制实体瘤活性以及抗病毒活性。
发明概述
鉴于rSIFN-co具有与其它市售干扰素相比独特的生物学活性及其用于人类用途的可能性,希望提供方法来评测rSIFN-co和其它测试干扰素的生物学活性和/或效力,例如出于在制造过程中或其它方面的质量控制目的,以保证最终产品保持有或具有所希望的活性并与市售干扰素相区分。还希望提供rSIFN-co的其它用途,以及具有期望活性的干扰素或干扰素替代物。
在一个方面,本发明提供了一种对测试干扰素相对于rSIFN-co或rSIFN-co替代物的效力进行确定或比较的方法,包括:(1)提供所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物;和(2)在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物分别测定选自如下的任一种或更多种活性:(a)对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;(b)对癌细胞生存力的降低;(c)对癌细胞迁移的抑制;(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;(f)对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;(g)对癌细胞中伪足形成的抑制;(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调;从而测试干扰素以统计学显著方式存在(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(f)中指定的任何1种、或2种、或3种、或4种、或5种、或6种活性,和/或测试干扰素存在(g)、(h)和(i)中指定的任一种或更多种活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力,即,它们具有基本上相同的有效性或可产生基本上相同的结果。在此,“基本上相同”指至少约70%相同;任选地,至少约80%相同;进一步任选地,至少约90%相同;更任选地,至少约95%相同。
在另一个方面,本发明提供了一种建立测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物间的基本等效性的方法,包括:(1)提供所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物;和(2)在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物分别测定选自如下的任一种或更多种活性:(a)对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;(b)对癌细胞生存力的降低;(c)对癌细胞迁移的抑制;(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;(f)对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;(g)对癌细胞中伪足形成的抑制;(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调;从而测试干扰素以统计学显著方式存在(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(f)中指定的任何1种、或2种、或3种、或4种、或5种、或6种活性,和/或测试干扰素存在(g)、(h)和(i)中指定的任一种或更多种活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物是基本等效的。
在一些实施方式中,在测定上述一种或更多种活性中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞、结肠癌细胞、***细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞和***癌细胞。在一些实施方式中,在测定上述一种或更多种活性中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、Hela细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、SW480细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞、SMMC-7721细胞、PANC-1细胞、SW620细胞、SPC-A4细胞、H1299细胞、H460细胞和HT-29细胞。
在一些实施方式中,在测定活性(a)对体内癌细胞生长的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肝癌细胞、***细胞、结肠癌细胞和肺癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(a)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:SMMC-7721细胞、Hela细胞、HT-29细胞、SPC-A4细胞和A549细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:HT-29细胞、SPC-A4细胞和A549细胞;进一步任选地,包括A549细胞。在一些实施方式中,在测定活性(a)抑制作用中生理盐水或PBS被用作对照。在一些实施方式中,在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以约0.02mg至约0.30mg;任选地,约0.05mg至约0.15mg的量施用。在一些实施方式中,在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以每隔一天施用。在一些实施方式中,在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物施用持续约2周至约6周;任选地,约3周至约4周。
在一些实施方式中,在测定活性(b)对癌细胞生存力的降低中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物在约6.25mcg/ml至约25mcg/ml;任选地,约10mcg/ml至约18mcg/ml;更任选地,约10mcg/ml至约15mcg/ml的浓度范围下,各自引起癌细胞生存力约50%下降。在一些实施方式中,在测定活性(b)中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物在至少约25mcg/ml;任选地,至少约50mcg/ml,进一步任选地,至少约75mcg/ml;更任选地,至少约100mcg/ml的浓度下,各自引起癌细胞生存力至基本上无法检测的水平。在一些实施方式中,在测定活性(b)中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物的浓度包括在约0.2mcg/ml至约100mcg/ml的浓度。在一些实施方式中,在测定活性(b)中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理癌细胞至少约1天;任选地,至少约2天。在一些实施方式中,在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞、结肠癌细胞、***细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞和***癌细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞、结肠癌细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞和***癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、Hela细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、SW480细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞、SMMC-7721细胞和PANC-1细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、SW480细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞、SMMC-7721细胞和PANC-1细胞。
在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(b)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(b)中所使用的癌细胞被处理约1天至约10天;任选地,约1天至约6天。在一些实施方式中,在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW620细胞。
在一些实施方式中,在测定活性(c)对癌细胞迁移的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(c)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW620细胞。在一些实施方式中,其中使用Transwell法测定活性(c)中对癌细胞迁移的抑制。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(c)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(c)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。
在一些实施方式中,在测定活性(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(d)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H1299细胞、H460细胞、HT-29细胞和SW620细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H1299细胞、H460细胞和SW620细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(d)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(d)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,β-联蛋白/TCF的转录活性通过使用报告***(reportersystem)来测定。在一些实施方式中,所述报告***包括TOPFlash或pSV40-RL质粒。
在一些实施方式中,在测定活性(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(e)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H460细胞、SW620细胞和HT-29细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞、SW620细胞和HT-29细胞;更任选地,包括HT-29细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(e)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(e)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(e)中通过测定LRP6和/或FZD6的mRNA水平来确定LRP6和/或FZD6的表达。
在一些实施方式中,在测定活性(f)对Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制中所使用的癌细胞包括肺癌细胞;任选地,包括A549细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(f)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(f)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(f)中通过测定Axin2、CD24、存活蛋白和/或ID2的mRNA水平来确定其相应的表达。在一些实施方式中,在测定活性(f)中,当与对照相比测试干扰素降低癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的至少约30%;任选地,至少约40%;更任选地,至少约50%;还更优选地,至少约60%的表达,则所述测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物被认为具有基本上相同的效力或基本上等效。
在一些实施方式中,在测定活性(g)对癌细胞中伪足形成的抑制中所使用的癌细胞包括肺癌细胞;任选地,A549细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(g)中所使用的癌细胞至少约4天;任选地,至少约8天。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(g)中所使用的癌细胞。
在一些实施方式中,在测定活性(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(h)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW480细胞。在一些实施方式中,在测定活性(h)中通过蛋白质印迹法测定对β-联蛋白表达的抑制。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(h)中所使用的癌细胞至少约48小时;任选地,至少约72小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(h)中所使用的癌细胞。
在一些实施方式中,在测定活性(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(i)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H460细胞、SW620细胞和HT-29细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW620细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(i)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(i)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(i)中通过测定DKK-3、KLF-4和/或BATF2的mRNA水平来确定其相应的表达。
在一些实施方式中,统计学显著指当与对照相比,p值小于或等于0.05,或小于或等于0.01,或小于或等于0.005,或小于或等于0.001,或小于或等于0.0005,或小于或等于0.0001。
在一些实施方式中,所述对照不用测试干扰素或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理,或用生理盐水或PBS处理,或用IFNα-2b处理,或所述对照为未处理对照(Mock)。
在另一个方面,本发明提供确定或比较化合物(例如,测试干扰素)的效力的方法,包括:(a)提供多个浓度的测试干扰素;(b)使用该多个浓度的测试干扰素,在特定条件下确定测试干扰素针对第一组癌细胞的生存力的第一剂量反应;(c)提供多个浓度的rSIFN-co或rSIFN-co替代物;(d)使用该多个浓度的rSIFN-co或rSIFN-co替代物,在相同的特定条件下确定rSIFN-co或rSIFN-co替代物针对第二组癌细胞的生存力的第二剂量反应;以及(e)比较第一剂量反应与第二剂量反应。以这种方式,确定化合物例如测试干扰素相对于rSIFN-co或rSIFN-co替代物的效力。
在一些实施方式中,rSIFN-co包含特定的比活性,且比活性在约4×108IU/mg至约1×109IU/mg的范围内。在一些实施方式中,比活性在约4.4×108IU/mg至约9×108IU/mg的范围内。在一些实施方式中,比活性在约5×108IU/mg至约8×108IU/mg的范围内。在一些实施方式中,比活性在约6×108IU/mg至约7.5×108IU/mg的范围内。任选地,比活性在约4×108IU/mg至约5×108IU/mg的范围内。
在一些实施方式中,在确定或比较化合物效力的方法中,测试干扰素或rSIFN-co的浓度在约0.2mcg/ml至约100mcg/ml的范围内。在一些实施方式中,测试干扰素或rSIFN-co的浓度为至少两种或更多种的以下浓度:0.2mcg/ml、0.39mcg/ml、0.78mcg/ml、1.56mcg/ml、3.13mcg/ml、6.25mcg/ml、12.5mcg/ml、25mcg/ml、50mcg/ml和100mcg/ml。
在一些实施方式中,用测试干扰素或rSIFN-co处理癌细胞至少约20小时,任选地为至少约24小时,还任选地为至少约48小时,和更任选地为至少约72小时。
在一些实施方式中,本发明提供如本文所述的方法,其中,rSIFN-co具有能够在约6.25mcg/ml至约25mcg/ml的浓度范围内(取决于癌细胞类型)使癌细胞生存力降低50%的效力。在一些实施方式中,rSIFN-co能够在约6.25mcg/ml至12.5mcg/ml的浓度范围内使癌细胞生存力降低50%。在另一实施方式中,rSIFN-co能够在约12.5mcg/ml至25mcg/ml的浓度范围内使癌细胞生存力降低50%。在一些实施方式中,rSIFN-co的IC50在约10mcg/ml至约18mcg/ml的范围内,任选地,在约10mcg/ml至约15mcg/ml的范围内。
在另一个方面,本发明提供确定或比较化合物(例如测试干扰素)相对于rSIFN-co或rSIFN-co替代物的针对癌细胞生存力的效力的方法,包括:(a)提供多个癌细胞;(b)在特定条件下用某一量的测试干扰素测试第一组癌细胞,以生成第一组生存力数据;(c)在相同的特定条件下,用有效量的rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理第二组癌细胞,以生成第二组生存力数据;以及(d)比较第一组生存力数据与第二组生存力数据,从而确定测试干扰素的效力。
在一些实施方式中,在约1天至约6天的范围内处理癌细胞。在一些实施方式中,以约6.25mcg/ml至约50mcg/ml范围内的浓度使用rSIFN-co;任选地为约7mcg/ml至约25mcg/ml;更任选地为约8mcg/ml至约12.5mcg/ml;还更任选地为约10mcg/ml。在一些实施方式中,以约5mcg/ml至约20mcg/ml范围内的浓度使用rSIFN-co。在一些实施方式中,rSIFN-co包括特定的比活性。
在一些实施方式中,本文使用的癌细胞选自人肿瘤细胞和动物肿瘤细胞。在一些实施方式中,肿瘤细胞是肺肿瘤细胞、或***细胞、或肝肿瘤细胞、或结肠直肠肿瘤细胞、或乳腺肿瘤细胞、或胰腺肿瘤细胞、或***肿瘤细胞、或病毒引发的肿瘤细胞或病毒转化的细胞。在一些实施方式中,癌细胞选自A549细胞、Calu-1细胞、CL-1细胞、H460细胞、H1299细胞、Hela细胞、HT29细胞、Huh-7细胞、MDA-MB-231细胞、PANC-1细胞、RAW264.7细胞、SMMC-7721细胞、SW480细胞和SW620细胞中的至少一种。
在一些实施方式中,测试干扰素也是干扰素,包括得自与rSIFN-co不同的生产批次的干扰素。在一些实施方式中,所述测试干扰素的氨基酸序列与rSIFN-co的氨基酸序列(SEQIDNO:1)具有至少90%的同一性,任选地,至少95%、96%、97%、98%、99%、100%的同一性。在一些实施方式中,编码所述测试干扰素的核苷酸序列与编码rSIFN-co的核苷酸序列(SEQIDNO:2)具有至少90%的同一性,任选地,至少95%、96%、97%、98%、99%、100%的同一性。在一些实施方式中,所述测试干扰素与rSIFN-co具有相同的氨基酸序列(SEQIDNO:1)且为相同的核苷酸序列(SEQIDNO:2)所编码。在一些实施方式中,所述测试干扰素与rSIFN-co具有基本上相同的比活性。在一些实施方式中,所述比活性在约4x108IU/mg至约1x109IU/mg的范围内。在一些实施方式中,所述测试干扰素可获得自包含将SEQIDNO:2中所示的多核苷酸序列导入大肠杆菌(E.coli)中的方法。在一些实施方式中,所述测试干扰素通过在大肠杆菌宿主中表达多核苷酸(SEQIDNO:2)而制成,任选地,在大肠杆菌宿主中在PBAD启动子的控制下表达。
在另一个方面,本发明提供抑制(例如在肿瘤转移中发生的)细胞迁移的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而抑制细胞迁移。
在一些实施方式中,rSIFN-co的有效量包括约5mcg/ml至约100mcg/ml;任选地为约8mcg/ml至约50mcg/ml;更任选地为约10mcg/ml至约25mcg/ml;更任选地为约12mcg/ml至约18mcg/ml。在一些实施方式中,rSIFN-co的有效量包括约5mcg/ml至约20mcg/ml,任选地,约10mcg/ml。
在另一个方面,本发明提供抑制癌细胞中伪足形成的方法,包括将癌细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而抑制伪足形成。在一些实施方式中,rSIFN-co的有效量包括约5mcg/ml至约20mcg/ml,任选地,约10mcg/ml。
在另一个方面,本发明提供抑制细胞中β-联蛋白/TCF-介导的转录活性的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间。在一些实施方式中,使用报告***,任选地,荧光素酶报告***,来确定β-联蛋白/TCF-介导的转录活性。在一些实施方式中,报告***是TOPFlash报告***。在一些实施方式中,使用质粒pSV40-RL。
在另一个方面,本发明还提供降低细胞中β-联蛋白的蛋白水平的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间。在一些实施方式中,使用β-联蛋白的特异性抗体经蛋白质印迹来检测β-联蛋白的蛋白水平。在一些实施方式中,使用GAPDH作为对照。
在另一个方面,本发明提供下调细胞中的Wnt相关受体或共受体的表达的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而下调Wnt相关受体或共受体。在一些实施方式中,Wnt相关受体或共受体包括LRP蛋白,例如LRP6。在一些实施方式中,Wnt信号转导的受体或共受体包括FZD蛋白,例如FZD6。在一些实施方式中,确定Wnt相关受体或共受体的表达包括确定这些受体或共受体的mRNA水平。在一些实施方式中,制备与这些mRNA对应的cDNA来确定这些mRNA水平。
在另一个方面,本发明提供抑制细胞中某些基因(包括Wnt信号转导通路的至少一个靶标基因)的表达的方法,例如用于治疗靶标基因过度活跃(over-active)的疾病或症状。这些下调基因包括Axin2、CD24、存活蛋白(Survivin)、和/或ID2。该方法包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而抑制靶标基因的表达。
在本发明的一些实施方式中,细胞暴露于rSIFN-co的特定时间为至少约12小时;任选地,至少约20小时;再任选地,至少约24小时;再任选地,至少约36小时;再任选地,至少约48小时;再任选地,至少约72小时。在一些实施方式中,rSIFN-co处理的细胞是癌细胞。
在另一个方面,本发明提供上调细胞中某些基因(包括至少一种肿瘤抑制基因)的表达的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而实现对至少一种肿瘤抑制基因的表达的上调。在一些实施方式中,上调的基因包括DKK3、KLF4和BATF2中的至少一种。在一些实施方式中,通过测定这些的mRNA水平来确定上调基因的表达。在一些实施方式中,从这些mRNA合成cDNA并任选地扩增以用于测定目的。
在另一个方面,本发明提供在至少一种、任选地为至少2、3、4、5、6、7、8或9种下列活性上建立测试化合物与rSIFN-co或rSIFN-co替代物间的基本等效性的方法,包括对其比较这些活性并显示出基本相同的反应:(a)对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;(b)对癌细胞生存力的降低;(c)对癌细胞迁移的抑制;(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;(f)对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;(g)对癌细胞中伪足形成的抑制;(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调。在一些实施方式中,本发明提供在至少2种上述活性中建立基本等效性;任选地,本发明提供在至少3种上述活性中建立基本等效性;任选地在至少4种上述活性中建立基本等效性;更任选地为在至少5种上述活性中建立基本等效性;更任选地为在至少6种上述活性中建立基本等效性;更任选地为在至少7种或8种或9种上述活性中建立基本等效性。
在另一个方面,本发明提供用于确定测试干扰素效力、抑制至少一种Wnt-相关靶基因表达、上调节肿瘤抑制基因、和/或下调节LRP6和/或FZD6表达的检测试剂盒,包含(a)rSIFN-co或rSIFN-co替代物,以及(b)用于执行本文描述的一个以上方法的说明书和用于执行这些方法的试剂中的至少一者。这些试剂可以包含磷酸缓冲盐水(PBS)或缓冲剂。在一些实施方式中,检测试剂盒中的rSIFN-co或rSIFN-co替代物包括特定的比活性。
在另一个方面,本发明提供一种干扰素或干扰素替代物,包含选自以下的一种或多种活性,任选地为选自其中的2、3、4、5、6、7、8或9种活性:对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;对癌细胞生存力的降低;对癌细胞迁移的抑制;对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;对癌细胞中伪足形成的抑制;对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调。
附图说明
图1显示实施例1中所描述的在开始处理之后21天的期间中人肝癌肿瘤SMMC-7721在裸鼠中的生长曲线,用平均相对肿瘤体积(RTV)表示,各个组用MMC(5mg/kg)或0.15mg/小鼠的rSIFN-co或0.10mg/小鼠的rSIFN-co或0.05mg/小鼠的rSIFN-co处理、或用赋形剂生理盐水(NS)(0.15ml/小鼠)注射。
图2显示实施例2中所描述的在28天处理期间的人***在裸鼠中的生长曲线,用RTV表示,各个组用MMC(5mg/kg)或0.15mg/小鼠的rSIFN-co或0.10mg/小鼠的rSIFN-co或0.05mg/小鼠的rSIFN-co处理、或用赋形剂生理盐水(0.15ml/小鼠)注射。
图3显示实施例3中所描述的在28天处理期间的人结肠肿瘤HT-29在裸鼠中的生长曲线,用RTV表示,各个组用MMC(5mg/kg)或0.15mg/小鼠的rSIFN-co或0.10mg/小鼠的rSIFN-co或0.05mg/小鼠的rSIFN-co处理、或0.15mg/小鼠的IFNα-2b、或用赋形剂生理盐水(0.15ml/小鼠)注射。
图4显示实施例4中所描述的在21天处理期间的人肺肿瘤SPC-A4在裸鼠中的生长曲线,用RTV表示,各个组用MMC(5mg/kg)或0.15mg/小鼠的rSIFN-co或0.10mg/小鼠的rSIFN-co或0.05mg/小鼠的rSIFN-co处理、或0.15mg/小鼠的IFNα-2b、或用赋形剂生理盐水(0.15ml/小鼠)注射。
图5显示在用0、0.2、0.39、0.78、1.56、3.13、6.25、12.50、25、50和100mcg/ml(μg/ml)浓度的rSIFN-co或IFNα-2b处理48小时后针对不同肿瘤细胞的生存力的剂量反应曲线。测试的细胞是:A549肺肿瘤细胞(图5A);Hela***细胞(图5B);CL-1肝肿瘤细胞(图5C);Huh-7肝肿瘤细胞(图5D);SW480结肠肿瘤细胞(图5E);MDA-MB-231乳腺肿瘤细胞(图5F);Calu-1肺肿瘤细胞(图5G);SMMC-7721肝肿瘤细胞(图5H);以及PANC-1***肿瘤细胞(图5I)。结果表示为相对于对照细胞的细胞生存力百分比,并且呈现为至少两个独立实验的均值。
图6是分别显示在1、2、3、4、5和6的所示天数的处理后,10mcg/ml下的IFNα-2b处理和rSIFN-co处理对A549细胞(图6A)和SW620细胞(图6B)生存力的作用的生存力曲线。细胞生存力通过MTT法来评测。结果表示为相对于对照细胞的细胞生存力百分比并呈现为至少两个独立实验的均值。(**p<0.01)
图7是分别显示与Mock对照(图7,A列)相比,rSIFN-co处理(图7,C列)和IFNα-2b处理(图7,B列)对肺癌细胞A549在3D培养中的4天后群落形成(第一排)(放大100×)和8天后伪足形成(第二排和第三排)(放大400×)的作用的图片。A列和B列中的黑色箭头指向由癌细胞突出的伪足。C列中的带星号箭头指向没有伪足的细胞。
图8A-8E是分别显示与mock对照相比,rSIFN-co处理和IFNα-2b处理对不同的肺癌细胞A549(图8A)、H1299(图8B)和H460(图8C);和不同的结肠癌细胞HT-29(图8D)和SW620(图8E)的β-联蛋白/TCF-介导的转录活性的作用的柱形图。数值是3次试验的均值。(*p<0.05,**p<0.01)
图9A和9B是分别显示与mock对照相比,rSIFN-co处理和IFNα-2b处理对不同的癌细胞A549、H460、SW620和HT-29中Wnt相关受体或共受体LRP6(图9A)和FZD6(图9b)的表达的作用的柱形图(通过相对于GAPDH表达的mRNA水平来测量)。以三组平行进行实验,结果用mock对照组标准化。
图10A和10B是蛋白质印迹,并分别显示在分别处理24、48和72小时后,与mock对照相比,rSIFN-co处理和IFNα-2b处理对癌细胞A549(图10A)和SW480(图10B)中β-联蛋白的蛋白水平的作用。GAPDH表达用作对照。以三组平行进行实验。
图11A-11D是显示用rSIFN-co或IFNα-2b处理A549肺癌细胞24小时后,与mock对照相比,作为Wnt信号转导通路下游的4种基因的相对mRNA表达水平的柱形图:Axin2(图11A);CD24(图11B);存活蛋白(图11C);和ID2(图11D)。以三组平行进行实验,并用mock对照组标准化。
图12A-12C是显示用rSIFN-co或IFNα-2b处理后,与mock对照相比,在不同的肿瘤细胞A549、H460、SW620和HT-29中的3种肿瘤抑制基因DKK-3(图12A)、BATF2(图12B)和KLF4(图12C)的相对mRNA表达水平的柱形图。以三组平行进行实验,并用mock对照组标准化。
图13A和13B是显示与Mock对照相比,在用IFNα-2b或rSIFN-co处理后,A549细胞(图13A)和SW620细胞(图13B)的肿瘤细胞迁移的柱形图。结果表示为该处理后的单位区域中迁移细胞平均数±SD。(**p<0.01)
图14是与Mock对照和5FU处理的细胞相比,在A549细胞(图14A)和SW620细胞(图14B)用IFNα-2b或rSIFN-co处理24小时或48小时后,分别用针对半胱天冬酶-3酶原(procaspase-3)、切割的半胱天冬酶-3(cleavedcaspase-3)、半胱天冬酶-8酶原(procaspase-8)、切割的半胱天冬酶-8(cleavedcaspase-8)、PARP和β-微管蛋白的特异性抗体进行染色得到的蛋白质印迹。
图15是A549细胞用10mcg/ml的IFNα-2b(图15A)、或10mcg/ml的rSIFN-co(图15B)处理后,或者Hela细胞用10mcg/ml的IFNα-2b(图15C)、或10mcg/ml的rSIFN-co(图15D)处理后,用针对P-STAT1、STAT1、P-STAT2、STAT2、P-STAT3、STAT3和GAPDH的特异性抗体进行染色得到的蛋白质印迹。
图16是显示与PBS处理的对照相比,在开始处理之后的27天期间,经IFNα-2b或rSIFN-co处理后对肿瘤生长的抑制的肿瘤生长曲线。数据表示为平均肿瘤体积(mm3)±SD(n=8)。
发明详述
定义
除非另外指出,否则本文使用的科学和技术术语应具有本领域普通技术人员赋予它们的含义或为本领域普通技术人员所通常理解的含义。
此外,除非上下文另有规定,否则单数词将包括复数形式,复数词将包括单数形式。
此外,除非另作说明,本文中使用的术语“或(or)”应指“和/或(and/or)”。
本文所用的术语“化合物”应指任何蛋白(包括任何抗体、任何活性抗体片段、和任何二聚体蛋白或多聚体蛋白)、多肽、小分子、和具有一种或更多种生物学活性的其它分子。
本文使用的术语“包括(compriseorcomprising)”应被广义解读且不受限,并应包含“是(isorare)”。
本文使用的术语“症状”和“疾病”可互换使用或者共同使用来指示受试者中的疾病、感染、炎症、癌症、治疗引起的副作用、或较差健康状况的其它成因。
本文使用的术语“有效量”应指产生所希望效果,例如用于降低细胞生存力、下调或上调蛋白的表达或活性、或治疗疾病或病症的量。
本文使用的术语“建立基本等效性”应指进行某一或某些测试来表明基本相同水平的反应、活性、有效性或结果,其在实验误差的限制内(例如±标准差(SD))。
本文使用的术语“基本上相同”应指至少约70%相同;任选地,至少约80%相同;进一步任选地,至少约90%相同;更任选地,至少约95%相同。
本文使用的术语“在约......的范围”或“在约......之间的范围”应指该范围内的数,以及在此特定范围内的所有个位和小数点。例如,“在约4×108IU/mg与约5×108IU/mg之间的范围”将包括4×108IU/mg、4.1×108IU/mg、4.2×108IU/mg、4.3×108IU/mg、4.4×108IU/mg等,且“8mcg/ml至20mcg/ml”应包括9mcg/ml、10mcg/ml等。
本文使用的术语“包含(includeorincluding)”应理解为是非限制性的,并且涵盖指定的元素以及非指定的元素。
本文使用的术语“干扰素”或“IFN”应指任何天然出现的或人为产生的干扰素,包括题为“复合人白细胞干扰素”的美国专利4,695,623中记载的复合干扰素α,以及rSIFN-co。
本文使用的术语“干扰素活性”应指作为天然出现的干扰素和rSIFN-co的特征的一种或更多种生物学活性,例如抗肿瘤活性和/或抗病毒活性。
本文使用的术语“rSIFN-co”按照上下文,应指具有如美国专利7,364,724和美国专利7,585,647中记载的多核苷酸序列和氨基酸序列、或其活性片段的蛋白或核酸分子。所述在美国专利7,364,724和美国专利7,585,647中记载的多核苷酸序列和氨基酸序列如下所示:
MCDLPQTHSLGNRRALILLA1ATGTGCGACCTGCCGCAGACCCACTCCCTGGGTAACCGTCGTGCTCTGATCCTGCTGGCTTACACGCTGGACGGCGTCTGGGTGAGGGACCCATTGGCAGCACGAGACTAGGACGACCGA
QMRRISPFSCLKDRHDFGFP61CAGATGCGTCGTATCTCCCCGTTCTCCTGCCTGAAAGACCGTCACGACTTCGGTTTCCCGGTCTACGCAGCATAGAGGGGCAAGAGGACGGACTTTCTGGCAGTGCTGAAGCCAAAGGGC
QEEFDGNQFQKAQAISVLHE121CAGGAAGAATTCGACGGTAACCAGTTCCAGAAAGCTCAGGCTATCTCCGTTCTGCACGAAGTCCTTCTTAAGCTGCCATTGGTCAAGGTCTTTCGAGTCCGATAGAGGCAAGACGTGCTT
MIQQTFNLFSTKDSSAAWDE181ATGATCCAGCAGACCTTCAACCTGTTCTCCACCAAAGACTCCTCCGCTGCTTGGGACGAATACTAGGTCGTCTGGAAGTTGGACAAGAGGTGGTTTCTGAGGAGGCGACGAACCCTGCTT
SLLEKFYTELYQQLNDLEAC241TCCCTGCTGGAAAAATTCTACACCGAACTGTACCAGCAGCTGAACGACCTGGAAGCTTGCAGGGACGACCTTTTTAAGATGTGGCTTGACATGGTCGTCGACTTGCTGGACCTTCGAACG
VIQEVGVEETPLMNVDSILA301GTTATCCAGGAAGTTGGTGTTGAAGAAACCCCGCTGATGAACGTTGACTCCATCCTGGCTCAATAGGTCCTTCAACCACAACTTCTTTGGGGCGACTACTTGCAACTGAGGTAGGACCGA
VKKYFQRITLYLTEKKYSPC361GTTAAAAAATACTTCCAGCGTATCACCCTGTACCTGACCGAAAAAAAATACTCCCCGTGCCAATTTTTTATGAAGGTCGCATAGTGGGACATGGACTGGCTTTTTTTTATGAGGGGCACG
AWEVVRAEIMRSFSLSTNLQ421GCTTGGGAAGTTGTTCGTGCTGAAATCATGCGTTCCTTCTCCCTGTCCACCAACCTGCAGCGAACCCTTCAACAAGCACGACTTTAGTACGCAAGGAAGAGGGACAGGTGGTTGGACGTC
ERLRRKE(SEQIDNO:1)
481GAACGTCTGCGTCGTAAAGAATAA(SEQIDNO:2)
CTTGCAGACGCAGCATTTCTTATT(SEQIDNO:3)
本文使用的术语“rSIFN-co替代物”应指已经或将要针对rSIFN-co测定其效力并可以在测试化合物效力或活性的确定中出于比较的目的替代rSIFN-co使用的任何化合物。rSIFN-co替代物可以是干扰素或具有干扰素特性的化合物。
本文使用的比活性是生物学活性与蛋白质含量之比。该生物学活性可以是任何本领域惯用的相关生物学活性,例如通过中华人民共和国药典2010版三部附录XC中公布的细胞病变抑制法测定的生物学活性。蛋白质含量可通过本领域惯用的任意方法,例如中华人民共和国药典2010版三部附录VIB中公布的Lowry法测定的。
本文使用的术语“治疗(treatment)”应包括引起疾病的完全或部分痊愈、引起或引发疾病的不进展、改善或降低疾病或病症的严重度、防止疾病复发、降低疾病复发的频率、减少疾病的副作用、使疾病缓解、引起健康状况改善的总体感觉等。
术语“Wnt相关受体或共受体”应包括独自或共同结合到Wnt家族蛋白以引发细胞中经典Wnt信号转导通路或非经典Wnt信号转导通路中的信号转导的一种或更多种分子。该术语包括,例如LRP6,其是已知与DKK1相互作用的低密度脂蛋白受体相关蛋白6,一种Wnt共受体;和FZD6,其是Wnt信号转导的受体,据信其是Wnt-4配体的受体。
本文使用的术语“Wnt信号转导活性”是指经由与卷曲蛋白(Frizzled,FZD)家族受体以及LRP5/LRP6共受体结合而转导的Wnt信号转导级联反应,引起β-联蛋白的释放及其向细胞核的迁移以进行细胞活化。
本发明的发明者发现由rSIFN-co的施用或治疗引起的某些生物学作用,并且这些生物学作用可以用于评测rSIFN-co以及其它可能具有相似特性的化合物的效力,特别是在制造过程中需要效力的一致性时或是在药物开发过程中想要改善效力时。本发明的发明者还发现迄今未知的使用rSIFN-co治疗的某些生物学作用,并且这些生物学作用可以用于rSIFN-co的其它用途,包括用于治疗需要上调或下调某些基因的其它症状或疾病。
在一个方面,本发明提供了一种对测试干扰素相对于rSIFN-co或rSIFN-co替代物的效力进行确定或比较的方法,包括:(1)提供所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物;和(2)在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物分别测定选自如下的任一种或更多种活性:(a)对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;(b)对癌细胞生存力的降低;(c)对癌细胞迁移的抑制;(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;(f)对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;(g)对癌细胞中伪足形成的抑制;(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调;从而测试干扰素以统计学显著方式存在(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(f)中指定的任何1种、或2种、或3种、或4种、或5种、或6种活性,和/或测试干扰素存在(g)、(h)和(i)中指定的任一种或更多种活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力。
在另一个方面,本发明提供了一种建立测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物间的基本等效性的方法,包括:(1)提供所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物;和(2)在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物分别测定选自如下的任一种或更多种活性:(a)对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;(b)对癌细胞生存力的降低;(c)对癌细胞迁移的抑制;(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;(f)对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;(g)对癌细胞中伪足形成的抑制;(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调;从而测试干扰素以统计学显著方式存在(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(f)中指定的任何1种、或2种、或3种、或4种、或5种、或6种活性,和/或测试干扰素存在(g)、(h)和(i)中指定的任一或更多种活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物是基本等效的。任选地,在测试干扰素处理或施用的情况下,以统计学显著方式存在对体外癌细胞生存力的降低,例如在A549细胞和/或SW620细胞中,以及对β-联蛋白/TCF转录活性的抑制,例如在如下的任一种或更多种中:A549细胞、H1299细胞、H460细胞和HT-29细胞,以及任选地,额外存在JAK/STAT信号转导,指示测试干扰素与rSIFN-co间是基本等效的。还任选地,可在使用例如约10mcg/ml的测试干扰素处理合适的细胞约1天至约6天的情况下,进行细胞生存力的测定。任选地,在如下的任一种或更多种癌细胞中:A549细胞、H1299细胞、H460细胞或HT-29细胞,测定对β-联蛋白/TCF转录活性的抑制,例如,通过用约10mcg/ml的测试干扰素处理这些细胞约24小时。任选地,通过测定STAT蛋白,例如STAT1、STAT2和/或STAT3磷酸化的存在测定JAK/STAT信号转导,例如用约10mcg/ml的测试干扰素对A549细胞或Hela细胞进行处理不同的时间,例如约5、15、30、60、120和/或240分钟。
在一些实施方式中,在上述方法的步骤(2)中,在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物测定至少2种上述活性,例如(a)和(b);(a)和(c);(a)和(d);(a)和(e);(a)和(f);(a)和(g);(a)和(h);(a)和(i);(b)和(c);(b)和(d);(b)和(e);(b)和(f);(b)和(g);(b)和(h);(b)和(i);(c)和(d);(c)和(e);(c)和(f);(c)和(g);(c)和(h);(c)和(i);(d)和(e);(d)和(f);(d)和(g);(d)和(h);(d)和(i);(e)和(f);(e)和(g);(e)和(h);(e)和(i);(f)和(g);(f)和(h);(f)和(i);(g)和(h);(g)和(i);(h)和(i)。
在一些实施方式中,在上述方法的步骤(2)中,在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物测定至少3种上述活性,例如(a)、(b)和(c);(a)、(b)和(d);(a)、(b)和(e);(a)、(b)和(f);(a)、(b)和(g);(a)、(b)和(h);(a)、(b)和(i);(a)、(c)和(d);(a)、(c)和(e);(a)、(c)和(f);(a)、(c)和(g);(a)、(c)和(h);(a)、(c)和(i);(a)、(d)和(e);(a)、(d)和(f);(a)、(d)和(g);(a)、(d)和(h);(a)、(d)和(i);(a)、(e)和(f);(a)、(e)和(g);(a)、(e)和(h);(a)、(e)和(i);(a)、(f)和(g);(a)、(f)和(h);(a)、(f)和(i);(a)、(g)和(h);(a)、(g)和(i);(a)、(h)和(i);(b)、(c)和(d);(b)、(c)和(e);(b)、(c)和(f);(b)、(c)和(g);(b)、(c)和(h);(b)、(c)和(i);(b)、(d)和(e);(b)、(d)和(f);(b)、(d)和(g);(b)、(d)和(h);(b)、(d)和(i);(b)、(e)和(f);(b)、(e)和(g);(b)、(e)和(h);(b)、(e)和(i);(b)、(f)和(g);(b)、(f)和(h);(b)、(f)和(i);(b)、(g)和(h);(b)、(g)和(i);(b)、(h)和(i);(c)、(d)和(e);(c)、(d)和(f);(c)、(d)和(g);(c)、(d)和(h);(c)、(d)和(i);(c)、(e)和(f);(c)、(e)和(g);(c)、(e)和(h);(c)、(e)和(i);(c)、(f)和(g);(c)、(f)和(h);(c)、(f)和(i);(c)、(g)和(h);(c)、(g)和(i);(c)、(h)和(i);(d)、(e)和(f);(d)、(e)和(g);(d)、(e)和(h);(d)、(e)和(i);(d)、(f)和(g);(d)、(f)和(h);(d)、(f)和(i);(d)、(g)和(h);(d)、(g)和(i);(d)、(h)和(i);(e)、(f)和(g);(e)、(f)和(h);(e)、(f)和(i);(e)、(g)和(h);(e)、(g)和(i);(e)、(h)和(i);(f)、(g)和(h);(f)、(g)和(i);(g)、(h)和(i)。
在一些实施方式中,在上述方法的步骤(2)中,在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物测定至少4种上述活性,例如(a)、(b)、(c)和(d);(a)、(b)、(c)和(e);(a)、(b)、(c)和(f);(a)、(b)、(c)和(g);(a)、(b)、(c)和(h);(a)、(b)、(c)和(i);(a)、(c)、(d)和(e);(a)、(c)、(d)和(f);(a)、(c)、(d)和(g);(a)、(c)、(d)和(h);(a)、(c)、(d)和(i);(a)、(d)、(e)和(f);(a)、(d)、(e)和(g);(a)、(d)、(e)和(h);(a)、(d)、(e)和(i);(a)、(e)、(f)和(g);(a)、(e)、(f)和(h);(a)、(e)、(f)和(i);(a)、(f)、(g)和(h);(a)、(f)、(g)和(i);(a)、(g)、(h)和(i);(b)、(c)、(d)和(e);(b)、(c)、(d)和(f);(b)、(c)、(d)和(g);(b)、(c)、(d)和(h);(b)、(c)、(d)和(i);(b)、(d)、(e)和(f);(b)、(d)、(e)和(g);(b)、(d)、(e)和(h);(b)、(d)、(e)和(i);(b)、(e)、(f)和(g);(b)、(e)、(f)和(h);(b)、(e)、(f)和(i);(b)、(f)、(g)和(h);(b)、(f)、(g)和(i);(b)、(g)、(h)和(i);(c)、(d)、(e)和(f);(c)、(d)、(e)和(g);(c)、(d)、(e)和(h);(c)、(d)、(e)和(i);(c)、(d)、(f)和(g);(c)、(d)、(f)和(h);(c)、(d)、(f)和(i);(c)、(d)、(g)和(h);(c)、(d)、(g)和(i);(c)、(d)、(h)、(i);(c)、(e)、(f)和(g);(c)、(e)、(f)和(h);(c)、(e)、(f)和(i);(c)、(f)、(g)和(h);(c)、(f)、(g)和(i);(c)、(g)、(h)和(i);(d)、(e)、(f)和(g);(d)、(e)、(f)和(h);(d)、(e)、(f)和(i);(d)、(f)、(g)和(h);(d)、(f)、(g)和(i);(d)、(g)、(h)和(i);(e)、(f)、(g)和(h);(e)、(f)、(g)和(i);(e)、(g)、(h)和(i);(f)、(g)、(h)和(i)。
在一些实施方式中,在上述方法的步骤(2)中,在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物测定至少5种上述活性,例如(a)、(b)、(c)、(d)和(e);(a)、(b)、(c)、(d)和(f);(a)、(b)、(c)、(d)和(g);(a)、(b)、(c)、(d)和(h);(a)、(b)、(c)、(d)和(i);(a)、(c)、(d)、(e)和(f);(a)、(c)、(d)、(e)和(g);(a)、(c)、(d)、(e)和(h);(a)、(c)、(d)、(e)和(i);(a)、(d)、(e)、(f)和(g);(a)、(d)、(e)、(f)和(h);(a)、(d)、(e)、(f)和(i);(a)、(e)、(f)、(g)和(h);(a)、(e)、(f)、(g)和(i);(a)、(f)、(g)、(h)和(i);(b)、(c)、(d)、(e)和(f);(b)、(c)、(d)、(e)和(g);(b)、(c)、(d)、(e)和(h);(b)、(c)、(d)、(e)和(i);(b)、(d)、(e)、(f)和(g);(b)、(d)、(e)、(f)和(h);(b)、(d)、(e)、(f)和(i);(b)、(e)、(f)、(g)和(h);(b)、(e)、(f)、(g)和(i);(b)、(f)、(g)、(h)和(i);(c)、(d)、(e)、(f)和(g);(c)、(d)、(e)、(f)和(h);(c)、(d)、(e)、(f)和(i);(c)、(e)、(f)、(g)和(h);(c)、(e)、(f)、(g)和(i);(c)、(f)、(g)、(h)和(i);(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(d)、(f)、(g)、(h)和(i)。
在一些实施方式中,在上述方法的步骤(2)中,在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物测定至少6种上述活性,例如(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(f);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(g);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(h);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(i);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)和(g);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)和(h);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)和(i);(a)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(a)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(a)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(g);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(h);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(i);(b)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(b)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(b)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(c)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i)。
在一些实施方式中,在上述方法的步骤(2)中,在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物测定至少7种上述活性,例如(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(g);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(h);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(i);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(a)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(b)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i)。
在一些实施方式中,在上述方法的步骤(2)中,在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物测定至少8种上述活性,例如(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(d)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i)。
在一些实施方式中,在上述方法的步骤(2)中,在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物测定所有9种上述活性,例如(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i)。
在一些实施方式中,在测定活性(a)中,当与对照相比测试干扰素以统计学显著方式(例如p<0.05,任选地,p<0.01,进一步任选地,p<0.005,更任选地,p<0.001,还任选地,p<0.0005,还更任选地,p<0.0001)存在(a)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。
在一些实施方式中,在测定活性(a)中使用的荷瘤动物模型包括小鼠,任选地,裸小鼠,更任选地,BALB/cAnu/nu小鼠。在一些实施方式中,所述小鼠,例如,BALB/cAnu/nu小鼠,包括约3至约7周龄,任选地,约4至约6周龄的小鼠。在一些实施方式中,所述小鼠,例如,BALB/cAnu/nu小鼠,体重在约15±2g至约30±2g,任选地,约19±2g至约23±2g的范围内。
在一些实施方式中,在测定活性(a)对体内癌细胞生长的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肝癌细胞、***细胞、结肠癌细胞和肺癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(a)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:SMMC-7721细胞、Hela细胞、HT-29细胞、SPC-A4细胞和A549细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:HT-29细胞、SPC-A4细胞和A549细胞;进一步任选地,包括A549细胞。
在一些实施方式中,在测定活性(a)抑制作用中生理盐水或PBS,任选地,生理盐水被用作对照。在一些实施方式中,在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以约0.02mg至约0.30mg;任选地,约0.05mg至约0.15mg,进一步任选地,约0.075mg至约0.10mg的量施用。在一些实施方式中,在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以每隔一天施用。在一些实施方式中,在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物施用持续约2周至约6周;任选地,约3周至约4周。在一些实施方式中,在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的对照以约0.05ml至约0.30ml;任选地,约0.10ml至约0.20ml的量施用。在一些实施方式中,在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的对照以每隔一天施用。在一些实施方式中,在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的对照施用持续约2周至约6周;任选地,约3周至约4周。在一些实施方式中,瘤内施用测试干扰素和/或对照。
在一些实施方式中,在测定活性(a)中当使用SMMC-7721细胞时,与对照(例如生理盐水)相比,测试干扰素以统计学显著方式(例如对于约0.05mg和约0.10mg,p<0.05,任选地,对于约0.15mg,p<0.01)存在(a)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以约0.02mg至约0.30mg;任选地,约0.05mg至约0.15mg,进一步任选地,约0.075mg至约0.10mg的量每隔一天施用,持续约3周。
在一些实施方式中,在测定活性(a)中当使用Hela细胞时,与对照(例如生理盐水)相比,测试干扰素以统计学显著方式(例如对于约0.15mg,p<0.05,任选地,对于约0.05mg和约0.10mg,p<0.01)存在(a)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以约0.02mg至约0.30mg;任选地,约0.05mg至约0.15mg,进一步任选地,约0.075mg至约0.10mg的量每隔一天施用,持续约4周。
在一些实施方式中,在测定活性(a)中当使用HT-29细胞时,与对照(例如生理盐水)相比,测试干扰素以统计学显著方式(例如对于约0.10mg和约0.15mg,p<0.01,任选地,对于约0.05mg,p<0.001)存在(a)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以约0.02mg至约0.30mg;任选地,约0.05mg至约0.15mg,进一步任选地,约0.075mg至约0.10mg的量每隔一天施用,持续约4周。
在一些实施方式中,在测定活性(a)中当使用SPC-A4细胞时,与对照(例如生理盐水)相比,测试干扰素以统计学显著方式(例如对于约0.05mg、约0.10mg和约0.15mg,p<0.01)存在(a)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以约0.02mg至约0.30mg;任选地,约0.05mg至约0.15mg,进一步任选地,约0.075mg至约0.10mg的量每隔一天施用,持续约3周。
在一些实施方式中,在测定活性(a)中当使用A549细胞时,与对照(例如PBS)相比,测试干扰素以统计学显著方式(例如p<0.0001)存在(a)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以约0.02mg至约0.30mg;任选地,约0.05mg至约0.15mg,进一步任选地,约0.075mg至约0.10mg的量每隔一天施用,持续约3周。
在一些实施方式中,在测定活性(b)对癌细胞生存力的降低中,当测试干扰素在约6.25mcg/ml至约25mcg/ml;任选地,约10mcg/ml至约18mcg/ml;更任选地,约10mcg/ml至约15mcg/ml的浓度范围下,引起癌细胞生存力约50%下降,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,在测定活性(b)中,当测试干扰素在至少约25mcg/ml;任选地,至少约50mcg/ml,进一步任选地,至少约75mcg/ml;更任选地,至少约100mcg/ml的浓度下,引起癌细胞生存力至基本上无法检测的水平,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。
在一些实施方式中,在测定活性(b)中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物的浓度包括在约0.2mcg/ml至约100mcg/ml的浓度。在一些实施方式中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物的浓度为至少两种或更多种的以下浓度:0.2mcg/ml、0.39mcg/ml、0.78mcg/ml、1.56mcg/ml、3.13mcg/ml、6.25mcg/ml、12.5mcg/ml、25mcg/ml、50mcg/ml和100mcg/ml。在一些实施方式中,在测定活性(b)中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理癌细胞至少约1天;任选地,至少约2天。
在一些实施方式中,在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞、结肠癌细胞、***细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞和***癌细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞、结肠癌细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞和***癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、Hela细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、SW480细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞、SMMC-7721细胞和PANC-1细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、SW480细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞、SMMC-7721细胞和PANC-1细胞。
在一些实施方式中,在测定活性(b)中,当所述测试干扰素在约6.25mcg/ml至约12.5mcg/ml的浓度范围下进行处理后,引起SW480细胞、MDA-MB-231细胞和PANC-1细胞中的任一种或更多种的生存力约50%下降,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。
在一些实施方式中,在测定活性(b)中,当所述测试干扰素在约12.5mcg/ml至约25mcg/ml的浓度范围下进行处理后,引起A549细胞、Hela细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、Calu-1细胞和SMMC-7721细胞中的任一种或更多种的生存力约50%下降,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。
在一些实施方式中,在测定活性(b)中,当使用A549细胞和/或SW620细胞,与对照(例如IFNα-2b)相比,测试干扰素以统计学显著方式(例如p<0.01)存在(b)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(b)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(b)中所使用的癌细胞被处理约1天至约10天;任选地,约1天至约6天。
在一些实施方式中,在测定活性(b)中,通过Am-Blue法或MTT法测定癌细胞生存力。
在一些实施方式中,在测定活性(c)中,当与对照相比测试干扰素以统计学显著方式(例如p<0.01)存在(c)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,所述对照是未处理的对照(Mock)。
在一些实施方式中,在测定活性(c)对癌细胞迁移的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(c)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW620细胞。在一些实施方式中,其中使用Transwell法测定活性(c)中对癌细胞迁移的抑制。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(c)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(c)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。
在一些实施方式中,在测定活性(d)中,当与对照相比测试干扰素以统计学显著方式(例如p<0.05,任选地,p<0.01)存在(d)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,所述对照是未处理的对照(Mock)。
在一些实施方式中,在测定活性(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(d)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H1299细胞、H460细胞、HT-29细胞和SW620细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H1299细胞、H460细胞和SW620细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(d)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(d)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,β-联蛋白/TCF的转录活性通过使用报告***来测定。在一些实施方式中,所述报告***包括TOPFlash或pSV40-RL质粒。
在一些实施方式中,在测定活性(e)中,当与对照相比测试干扰素以统计学显著方式(例如p<0.005,任选地,p<0.001,进一步任选地,p<0.0005)存在(e)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,所述对照是未处理的对照(Mock)。
在一些实施方式中,在测定活性(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(e)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H460细胞、SW620细胞和HT-29细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞、SW620细胞和HT-29细胞;更任选地,包括HT-29细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(e)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(e)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(e)中通过测定LRP6和/或FZD6的mRNA水平来确定LRP6和/或FZD6的表达。在一些实施方式中,当测定mRNA水平时,使用GAPDH作为对照。
在一些实施方式中,在测定活性(f)中,当与对照相比测试干扰素以统计学显著方式(例如,p<0.0005,任选地,p<0.0001)存在(f)中指定的活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在一些实施方式中,所述对照是未处理的对照(Mock)。
在一些实施方式中,在测定活性(f)对Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制中所使用的癌细胞包括肺癌细胞;任选地,包括A549细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(f)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(f)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(f)中通过测定Axin2、CD24、存活蛋白和/或ID2的mRNA水平来确定其相应的表达。在一些实施方式中,当测定mRNA水平时,使用GAPDH作为对照。
在一些实施方式中,在测定活性(f)中,当与对照相比测试干扰素降低癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的至少约30%;任选地,至少约40%;更任选地,至少约50%;还更优选地,至少约60%的表达,则所述测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物被认为具有基本上相同的效力或基本上等效。
在一些实施方式中,在测定活性(g)中,当所述测试干扰素基本上抑制了癌细胞中伪足的形成,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在此,“基本上抑制”指至少约60%抑制;任选地,至少约70%抑制;更任选地,至少约80%抑制;进一步任选地,至少约90%抑制;还更任选地,至少约95%抑制。
在一些实施方式中,在测定活性(g)对癌细胞中伪足形成的抑制中所使用的癌细胞包括肺癌细胞;任选地,A549细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(g)中所使用的癌细胞至少约4天;任选地,至少约8天。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(g)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,在Matrigel中培养在测定活性(g)中所使用的癌细胞。
在一些实施方式中,在测定活性(h)中,当所述测试干扰素引起癌细胞中β-联蛋白水平明显下降,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。在此,当例如在蛋白质印迹上与处理前相比表示蛋白质的条带变得暗淡或消失时,则处理后癌细胞中β-联蛋白水平明显下降。
在一些实施方式中,在测定活性(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(h)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW480细胞。在一些实施方式中,在测定活性(h)中通过蛋白质印迹法测定对β-联蛋白表达的抑制。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(h)中所使用的癌细胞至少约48小时;任选地,至少约72小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(h)中所使用的癌细胞。
在一些实施方式中,在测定活性(i)中,当与IFNα-2b相比所述测试干扰素能更有效地上调癌细胞中如下的任一种或更多种的表达:DKK-3、KLF-4和BATF2,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力和/或是基本等效的。
在一些实施方式中,在测定活性(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(i)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H460细胞、SW620细胞和HT-29细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW620细胞。在一些实施方式中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(i)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。在一些实施方式中,使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(i)中所使用的癌细胞。在一些实施方式中,在测定活性(i)中通过测定DKK-3、KLF-4和/或BATF2的mRNA水平来确定其相应的表达。在一些实施方式中,当测定mRNA水平时,使用GAPDH作为对照。
在一些实施方式中,统计学显著指当与对照相比,p值小于或等于0.05,或小于或等于0.01,或小于或等于0.005,或小于或等于0.001,或小于或等于0.0005,或小于或等于0.0001。
在一些实施方式中,所述对照不用测试干扰素或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理,或用生理盐水或PBS处理,或用IFNα-2b处理,或所述对照为未处理对照(Mock)。
在一个方面,本发明提供确定或比较化合物(例如,测试干扰素)的效力的方法,包括:(a)提供多个浓度的测试干扰素;(b)使用该多个浓度的测试干扰素,在特定条件下确定测试干扰素针对第一组癌细胞的生存力的第一剂量反应;(c)提供多个浓度的rSIFN-co或rSIFN-co的替代物(下文中称为“rSIFN-co替代物”);(d)使用该多个浓度的rSIFN-co或rSIFN-co替代物,在相同的特定条件下确定rSIFN-co或rSIFN-co替代物针对第二组癌细胞的生存力的第二剂量反应;以及(e)比较第一剂量反应与第二剂量反应。以这种方式,确定化合物例如测试干扰素相对于rSIFN-co或rSIFN-co替代物的效力。
在本发明的一些实施方式中,通过在大肠杆菌宿主中,任选地在大肠杆菌宿主中在启动子PBAD的控制下表达新的多核苷酸(SEQIDNO:2)来制备如美国专利7,364,724(重组高效复合干扰素)中记载的rSIFN-co(SEQIDNO:1)。在本发明的一些实施方式中,rSIFN-co可获得自包括将SEQIDNO:2所示的多核苷酸序列导入大肠杆菌中的方法。在本发明的一些实施方式中,rSIFN-co具有SEQIDNO:1的氨基酸序列,并为SEQIDNO:2的核苷酸序列所编码,其中与不为SEQIDNO:2的核苷酸序列所编码的干扰素例如干扰素alfacon-1相比,所述干扰素对乙肝病毒表面抗原(HbsAg)和乙肝病毒e抗原(HbeAg)的表达具有增加的抑制活性。
在一些实施方式中,用于本文方法中的rSIFN-co包括特定的比活性,该比活性可以是,例如在约4×108IU/mg至约1×109IU/mg的范围内。在一些实施方式中,比活性在约4.4×108IU/mg至约9×108IU/mg的范围内。在一些实施方式中,比活性在约5×108IU/mg至约8×108IU/mg的范围内。在一些实施方式中,比活性在约6×108IU/mg至约7.5×108IU/mg的范围内。任选地,比活性在约4×108IU/mg至约5×108IU/mg的范围内。
在一些实施方式中,在确定或比较化合物效力的方法中,测试干扰素或rSIFN-co的浓度在约0.2mcg/ml至约100mcg/ml的范围内。在一些实施方式中,测试干扰素或rSIFN-co的浓度为至少两种或更多种的以下浓度:0.2mcg/ml、0.39mcg/ml、0.78mcg/ml、1.56mcg/ml、3.13mcg/ml、6.25mcg/ml、12.5mcg/ml、25mcg/ml、50mcg/ml和100mcg/ml。
在一些实施方式中,用于本文的确定rSIFN-co效果的方法中的细胞是癌细胞,其是人细胞或是动物细胞。使用测试干扰素或rSIFN-co处理细胞至少约24小时,任选地为至少约48小时,且再任选地,至少约72小时,除非另外指出,在标准培养条件下,在完全培养基中,在37℃下,在5%C02氛中。培养基可以是适于培养肿瘤细胞的任何标准完全培养基,例如可得自ShanghaiCellCollection,(中国上海)的培养基,并补充有10%胎牛血清(Biochrom,Germany)、4mM谷氨酰胺、50U/ml青霉素和50mg/ml链霉素。IFNα-2b可以得自上海华新生物高技术有限公司(中国上海),以及rSIFN-co可以得自四川辉阳生命工程股份有限公司(中国成都)。
在一些实施方式中,本发明提供具有能够在约6.25mcg/ml至约25mcg/ml的浓度范围内(取决于癌细胞类型)使癌细胞生存力降低50%的能力的rSIFN-co。在一些实施方式中,rSIFN-co能够在约6.25mcg/ml至12.5mcg/ml的浓度范围内使细胞的生存力降低50%。在另一实施方式中,rSIFN-co能够在约12.5mcg/ml至25mcg/ml的浓度范围内使细胞生存力降低50%。在一些实施方式中,rSIFN-co的IC50在约10mcg/ml至约18mcg/ml的范围内。
在一些实施方式中,测试干扰素也是干扰素,但是得自与在比较中使用的rSIFN-co不同的生产批次。
因此,例如,在确定化合物例如测试干扰素的效力时,测试干扰素被稀释到多种浓度,并将适于所使用容器的一定数量的制备细胞(例如5×103细胞于100微升完全培养基中),与这些多种浓度的测试干扰素一起温育一定时间,例如48小时。在温育之后,确定细胞的生存力并与相似地用rSIFN-co而非测试干扰素处理的细胞生存力进行比较。可以从结果中生成对于各个用测试干扰素处理的和用rSIFN-co处理的细胞的剂量反应曲线并进行比较。以这种方式,可以在50%有效剂量或IC50的层面上,确定测试干扰素相对于rSIFN-co的效力。
在另一个方面,本发明提供确定或比较化合物(例如测试干扰素)相对于rSIFN-co或rSIFN-co替代物的针对癌细胞生存力的效力的方法,包括:(a)提供多个癌细胞;(b)在特定条件下用一定量的测试干扰素测试第一组癌细胞,以生成第一组生存力数据;(c)在相同的特定条件下,用有效量的rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理第二组癌细胞,以生成第二组生存力数据;以及(d)比较第一组生存力数据与第二组生存力数据,从而确定测试干扰素的效力。
在一些实施方式中,在约1天至约6天的范围内处理癌细胞。在一些实施方式中,以约6.25mcg/ml至约50mcg/ml范围内的浓度使用rSIFN-co;任选地为约7mcg/ml至约25mcg/ml;还任选地为约8mcg/ml至约12.5mcg/ml;更任选地为约10mcg/ml。在一些实施方式中,rSIFN-co包括特定的比活性。
在一些实施方式中,本文使用的癌细胞选自人肿瘤细胞和动物肿瘤细胞。在一些实施方式中,肿瘤细胞是肺肿瘤细胞、或***细胞、或肝肿瘤细胞、或结肠肿瘤细胞、或乳腺肿瘤细胞、或胰腺肿瘤细胞、或***肿瘤细胞、或病毒引发的肿瘤细胞或病毒转化的细胞。在一些实施方式中,癌细胞选自A549细胞、Calu-1细胞、CL-1细胞、H460细胞、H1299细胞、Hela细胞、HT29细胞、Huh-7细胞、MDA-MB-231细胞、PANC-1细胞、RAW264.7细胞、SMMC-7721细胞、SW480细胞和SW620细胞中的至少一种。
因此,例如,适于测试容器的合适体积的一定数量的癌细胞,例如2×103细胞于100微升完全培养基中,可以放置在96孔板中,使用约10mcg/ml的测试干扰素或rSIFN-co处理,或不处理作为对照,其中处理持续1、2、3、4、5或6天,并且每天确定处理细胞的生存力相对于未处理对照组的生存力。在结束实验时,相对于未处理对照组生存力的处理细胞的生存力可以针对干扰素处理的天数进行绘图。以这种方式,可以比较测试化合物降低癌细胞生存力的能力,并确定其相对于rSIFN-co的效力。
在一些实施方式中,本发明提供抑制(例如在肿瘤转移中发生的)细胞迁移的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而抑制细胞迁移。
在一些实施方式中,通过在有效量的rSIFN-co的存在下于37℃将细胞温育一段时间,例如24小时,或通过向动物或受试者施用有效量的rSIFN-co从而使一定浓度的rSIFN-co保持足以获得所希望效果的一段时间,可在体外或体内实施本文中提到的细胞例如肿瘤细胞暴露于rSIFN-co,上述所希望效果例如抑制转移中的肿瘤细胞迁移、或抑制伪足生成、抑制β-联蛋白/TCF转录活性、抑制β-联蛋白的表达、下调Wnt相关受体和/或共受体、下调Wnt信号转导下游靶标基因、上调肿瘤抑制基因、以及本文中记载的其它情况。
可以使用任何合适的市售试剂盒进行细胞迁移检测。例如,在本文中可以使用放置在Becton-DickinsonBiosciences(N.J.,USA)的24孔板中的含有微孔膜的8微米***式小室(insert)。对于该检测,可以将37℃不含FBS的温热碳酸氢盐类培养基添加到***式小室的内部以及孔的底部,并允许在加湿组织培养箱中于37℃、5%C02氛下复水约2小时。在复水之后,可以小心除去培养基,并且可以以约0.5×104细胞/***式小室的密度将混悬于无FBS培养基的约500微升所制备细胞(例如在37℃下用rSIFN-co预处理24小时的细胞)接种到***式小室滤器的上侧。之后,可以向24孔板的下室添加500微升含有10%FBS的完全培养基。然后可以在37℃下温育细胞/***式小室/板约24小时,且可以用例如棉拭子除去在室膜上侧的非迁移细胞。可以例如用4%多聚甲醛固定含有迁移细胞的***式培养小室的下表面,并用2%结晶紫染色。可以对在室膜相反侧的迁移细胞的数量进行计数,并确定单位区域的平均迁移细胞数。以这种方式,可以表明测试干扰素抑制肿瘤细胞迁移的能力。
在一些实施方式中,rSIFN-co的有效量包括约5mcg/ml至约100mcg/ml;任选地为约8mcg/ml至约50mcg/ml;更任选地为约10mcg/ml至约25mcg/ml;更任选地为约12mcg/ml至约18mcg/ml。
在另一个方面,本发明提供抑制癌细胞中伪足形成的方法,包括将癌细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而抑制伪足形成。
在另一个方面,本发明提供抑制细胞中β-联蛋白/TCF-介导的转录活性的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间。
在一些实施方式中,可以使用荧光素酶报告***来确定β-联蛋白/TCF-介导的转录活性。在一些实施方式中,报告***是TOPFlash报告***。在一些实施方式中,使用质粒pSV40-RL。因此,例如,将待评测的细胞铺到96孔板上,例如每孔约1×104细胞,在37℃下温育约12小时,之后,用约100ng的TOPFlash(MilliporeCorporation,Billerica,MA,USA)对其进行瞬时转染。为使转染效率标准化,还用1ng由SV40启动子驱动的内参报告基因海肾(Renillarreniformis)荧光素酶(pRL-SV40,Promega,Madison,WI)对细胞进行共转染。在转染6小时后,用于体外分析的细胞可以在之后用rSIFN-co处理约24小时。在用于体外分析的rSIFN-co处理之后或用于体内分析的转染之后,可以使用双荧光素酶检测***试剂盒根据制造商的操作指南(Cat#:E1960,Promega)进行荧光素酶检测。相对荧光素酶活性可以确定为萤火虫荧光素酶/海肾荧光素酶(firefly/renillaluciferase)活性的比率。
在另一个方面,本发明还提供降低细胞中β-联蛋白的蛋白水平的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间。在一些实施方式中,使用其特异性抗体经蛋白质印迹来检测β-联蛋白的蛋白水平。在一些实施方式中,使用GAPDH作为对照。
对于确定细胞(细胞来自体外培养或来自体内肿瘤样本)中β-联蛋白水平的蛋白质印迹分析,可以采用标准步骤。例如,可以使用提取试剂(Cat#:P0013)遵循制造商的操作指南(Beyotime,China)来提取总细胞蛋白。可以使用Bio-RadLowry蛋白检测***来确定蛋白浓度。可以通过SDS-PAGE在10%~12%胶上来分离总蛋白,之后将其转移到0.45微米的硝酸纤维素膜(MilliporeCorporation,Billerica,MA,USA)上。该膜可以用封闭缓冲液(5%牛血清白蛋白、10mmol/LTris-HClpH8.0、150mol/LNaCl,和0.05%吐温20)在4℃下封闭过夜,之后与一抗(1∶1000稀释)一起温育,接着与HRP结合的二抗温育。抗体可以来自任何卖家,例如可以使用以下抗体:小鼠单克隆β-联蛋白抗体(1∶1000,SantaCruzTechnology,SantaCruz,CA)、小鼠单克隆GAPDH抗体(1∶2000,KangweiBiotechnology,China)和抗小鼠HRP结合的二抗(1∶2000,SantaCruzTechnology)等。可以使用冷光/荧光成像LAS4000***(GEHealthcareLifeSciences,USA)和supersignalwestpico化学发光底物试剂盒(ThermoScientific,USA)来对印迹进行可视化。
在另一个方面,本发明提供下调细胞中Wnt相关受体或共受体的表达的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而下调Wnt相关受体或共受体。在一些实施方式中,Wnt相关受体或共受体包括LRP蛋白,例如LRP6。在一些实施方式中,Wnt信号转导受体或共受体包括FZD蛋白,例如FZD6。如上所述,将细胞暴露于rSIFN-co的方法可以是体外方法或体内方法。
在一些实施方式中,确定Wnt相关受体或共受体的表达包括确定这些受体或共受体的mRNA水平。可以通过任何标准方法确定这些mRNA水平。在一些实施方式中,制备与这些mRNA对应的cDNA来确定这些mRNA水平。例如,可以使用TRIZOL试剂(Invitrogen,Carlsbad,CA)根据制造商的说明书来分离总mRNA。可以使用RT-PCT试剂盒(Cat#:FSQ-101,TOYOBO,Japan)根据制造商的说明书来合成互补DNA(cDNA),之后使用SYBRGreenPCR试剂盒(Cat#:QPK-201,TOYOBO,Japan)来进行定量PCR(qPCR)。可使用合适的引物,例如,用于LRP6的引物可以是,正义引物:5’-TGAAGAACCAGCACCACAGG-3’(SEQIDNO:4);反义引物:5’-CATAACCAAGAGGCACAGAAGC-3’(SEQIDNO:5),且用于FZD6的引物可以是,正义引物:5’-GCGGAGTGAAGGAAGGATTAGTC-3’(SEQIDNO:6);反义引物:5’-TGAACAAGCAGAGATGTGGAACC-3’(SEQIDNO:7)。扩增方案可以是,在95℃下温育1分钟,40个循环(95℃,15秒;60℃,15秒;以及72℃,30秒)。SYBRGreen染料结合入PCR产物中可以用Bio-Rad检测***进行实时监测,然后使用Bio-RadCFXmanager2.1软件进行分析。可对各个条件汇集样品,并平行运行。可以使用2-ΔΔCt法将干扰素处理的样品与Mock未处理样品进行比较,并针对倍率变化来绘图。可以使用GAPDH作为标准化对照。该2-ΔΔCt法通常用于分析来自实时定量PCR实验的基因表达的相对变化。
在另一个方面,本发明提供下调细胞中某些基因(包括Wnt信号转导通路中的至少一个靶标基因)的表达的方法,例如用于治疗靶标基因突变或过度活跃的疾病或症状。这些下调基因包括例如Axin2、CD24、存活蛋白和/或ID2。该方法包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而抑制靶标基因的表达。下调的程度可以通过标准技术例如之前所述的qPCR来确定。例如,对于这些qPCR,对于Axin2,可以使用正义引物:5’-CGTGGATACCTTAGACTT-3’(SEQIDNO:8)和反义引物:5’-GCTGTTGTTCTCAATGTA-3’(SEQIDNO:9);对于CD24,可以使用正义引物5’-TGAAGAACATGTGAGAGGTTTGAC-3’(SEQIDNO:10)和反义引物5’-GAAAACTGAATCTCCATTCCACAA-3’(SEQIDNO:11);对于存活蛋白,可以使用正义引物:5’-ACCGCATCTCTACATTCAAG-3’(SEQIDNO:12)和反义引物5’-CAAGTCTGGCTCGTTCTC-3’(SEQIDNO:13);以及对于ID2,可以使用正义引物5’-CACAACAACAACAACAAC-3’(SEQIDNO:14)和反义引物5’-CACAGTCCAAGTAAGAGA-3’(SEQIDNO:15)。
在本发明的一些实施方式中,细胞暴露于rSIFN-co的特定时间为至少约12小时;任选地,至少约20小时;再任选地,至少约24小时;再任选地,至少约36小时;再任选地,至少约48小时;再任选地,至少约72小时。在一些实施方式中,rSIFN-co处理的细胞是癌细胞。
在另一个方面,本发明提供上调细胞中某些基因(包括至少一种肿瘤抑制基因)的表达的方法,包括将细胞暴露于有效量的rSIFN-co一段特定时间,从而实现对至少一种肿瘤抑制基因的表达的上调。在一些实施方式中,上调的基因包括DKK3、KLF4和BATF2中的至少一种。可以通过标准技术确定这些基因的上调程度。在一些实施方式中,通过测定mRNA水平来确定上调基因的表达。在一些实施方式中,从这些mRNA合成cDNA并任选地扩增以用于此测定目的。作为一个实例,对于扩增目的,可以使用以下引物:对于BATF2,正义引物5’-CAGAGCAGGGAGCACAAACC-3’(SEQIDNO:16)和反义引物5’-TGAGCAGAGGAGAGCAGAGG-3’(SEQIDNO:17);对于DKK3,正义引物5’-GGAGCCTGACTGAAGAGATGG-3’(SEQIDNO:18)和反义引物5’-ACGCCTAAAGCACACACCTG-3’(SEQIDNO:19);对于KLF4,正义引物5’-CCTTCAACCTGGCGGACATCAAC-3’(SEQIDNO:20)和反义引物5’-GGCTGCTGCGGCGGAATG-3’(SEQIDNO:21)。
在另一个方面,本发明提供在至少1种,任选地为至少2、3、4、5、6、7、8或9种下列活性上建立测试化合物与rSIFN-co或rSIFN-co替代物间的基本等效性的方法,包括对其比较这些活性并显示出基本相同的反应:(a)对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;(b)对癌细胞生存力的降低;(c)对癌细胞迁移的抑制;(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;(f)对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;(g)对癌细胞中伪足形成的抑制;(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调。在一些实施方式中,本发明提供在至少2种上述活性中建立基本等效性,例如(a)和(b);(a)和(c);(a)和(d);(a)和(e);(a)和(f);(a)和(g);(a)和(h);(a)和(i);(b)和(c);(b)和(d);(b)和(e);(b)和(f);(b)和(g);(b)和(h);(b)和(i);(c)和(d);(c)和(e);(c)和(f);(c)和(g);(c)和(h);(c)和(i);(d)和(e);(d)和(f);(d)和(g);(d)和(h);(d)和(i);(e)和(f);(e)和(g);(e)和(h);(e)和(i);(f)和(g);(f)和(h);(f)和(i);(g)和(h);(g)和(i);(h)和(i);任选地,本发明提供在至少3种上述活性中建立基本等效性,例如(a)、(b)和(c);(a)、(b)和(d);(a)、(b)和(e);(a)、(b)和(f);(a)、(b)和(g);(a)、(b)和(h);(a)、(b)和(i);(a)、(c)和(d);(a)、(c)和(e);(a)、(c)和(f);(a)、(c)和(g);(a)、(c)和(h);(a)、(c)和(i);(a)、(d)和(e);(a)、(d)和(f);(a)、(d)和(g);(a)、(d)和(h);(a)、(d)和(i);(a)、(e)和(f);(a)、(e)和(g);(a)、(e)和(h);(a)、(e)和(i);(a)、(f)和(g);(a)、(f)和(h);(a)、(f)和(i);(a)、(g)和(h);(a)、(g)和(i);(a)、(h)和(i);(b)、(c)和(d);(b)、(c)和(e);(b)、(c)和(f);(b)、(c)和(g);(b)、(c)和(h);(b)、(c)和(i);(b)、(d)和(e);(b)、(d)和(f);(b)、(d)和(g);(b)、(d)和(h);(b)、(d)和(i);(b)、(e)和(f);(b)、(e)和(g);(b)、(e)和(h);(b)、(e)和(i);(b)、(f)和(g);(b)、(f)和(h);(b)、(f)和(i);(b)、(g)和(h);(b)、(g)和(i);(b)、(h)和(i);(c)、(d)和(e);(c)、(d)和(f);(c)、(d)和(g);(c)、(d)和(h);(c)、(d)和(i);(c)、(e)和(f);(c)、(e)和(g);(c)、(e)和(h);(c)、(e)和(i);(c)、(f)和(g);(c)、(f)和(h);(c)、(f)和(i);(c)、(g)和(h);(c)、(g)和(i);(c)、(h)和(i);(d)、(e)和(f);(d)、(e)和(g);(d)、(e)和(h);(d)、(e)和(i);(d)、(f)和(g);(d)、(f)和(h);(d)、(f)和(i);(d)、(g)和(h);(d)、(g)和(i);(d)、(h)和(i);(e)、(f)和(g);(e)、(f)和(h);(e)、(f)和(i);(e)、(g)和(h);(e)、(g)和(i);(e)、(h)和(i);(f)、(g)和(h);(f)、(g)和(i);(g)、(h)和(i);任选地,在至少4种上述活性中建立基本等效性,例如(a)、(b)、(c)和(d);(a)、(b)、(c)和(e);(a)、(b)、(c)和(f);(a)、(b)、(c)和(g);(a)、(b)、(c)和(h);(a)、(b)、(c)和(i);(a)、(c)、(d)和(e);(a)、(c)、(d)和(f);(a)、(c)、(d)和(g);(a)、(c)、(d)和(h);(a)、(c)、(d)和(i);(a)、(d)、(e)和(f);(a)、(d)、(e)和(g);(a)、(d)、(e)和(h);(a)、(d)、(e)和(i);(a)、(e)、(f)和(g);(a)、(e)、(f)和(h);(a)、(e)、(f)和(i);(a)、(f)、(g)和(h);(a)、(f)、(g)和(i);(a)、(g)、(h)和(i);(b)、(c)、(d)和(e);(b)、(c)、(d)和(f);(b)、(c)、(d)和(g);(b)、(c)、(d)和(h);(b)、(c)、(d)和(i);(b)、(d)、(e)和(f);(b)、(d)、(e)和(g);(b)、(d)、(e)和(h);(b)、(d)、(e)和(i);(b)、(e)、(f)和(g);(b)、(e)、(f)和(h);(b)、(e)、(f)和(i);(b)、(f)、(g)和(h);(b)、(f)、(g)和(i);(b)、(g)、(h)和(i);(c)、(d)、(e)和(f);(c)、(d)、(e)和(g);(c)、(d)、(e)和(h);(c)、(d)、(e)和(i);(c)、(d)、(f)和(g);(c)、(d)、(f)和(h);(c)、(d)、(f)和(i);(c)、(d)、(g)和(h);(c)、(d)、(g)和(i);(c)、(d)、(h)、(i);(c)、(e)、(f)和(g);(c)、(e)、(f)和(h);(c)、(e)、(f)和(i);(c)、(f)、(g)和(h);(c)、(f)、(g)和(i);(c)、(g)、(h)和(i);(d)、(e)、(f)和(g);(d)、(e)、(f)和(h);(d)、(e)、(f)和(i);(d)、(f)、(g)和(h);(d)、(f)、(g)和(i);(d)、(g)、(h)和(i);(e)、(f)、(g)和(h);(e)、(f)、(g)和(i);(e)、(g)、(h)和(i);(f)、(g)、(h)和(i);更任选地,在至少5种上述活性中建立基本等效性,例如(a)、(b)、(c)、(d)和(e);(a)、(b)、(c)、(d)和(f);(a)、(b)、(c)、(d)和(g);(a)、(b)、(c)、(d)和(h);(a)、(b)、(c)、(d)和(i);(a)、(c)、(d)、(e)和(f);(a)、(c)、(d)、(e)和(g);(a)、(c)、(d)、(e)和(h);(a)、(c)、(d)、(e)和(i);(a)、(d)、(e)、(f)和(g);(a)、(d)、(e)、(f)和(h);(a)、(d)、(e)、(f)和(i);(a)、(e)、(f)、(g)和(h);(a)、(e)、(f)、(g)和(i);(a)、(f)、(g)、(h)和(i);(b)、(c)、(d)、(e)和(f);(b)、(c)、(d)、(e)和(g);(b)、(c)、(d)、(e)和(h);(b)、(c)、(d)、(e)和(i);(b)、(d)、(e)、(f)和(g);(b)、(d)、(e)、(f)和(h);(b)、(d)、(e)、(f)和(i);(b)、(e)、(f)、(g)和(h);(b)、(e)、(f)、(g)和(i);(b)、(f)、(g)、(h)和(i);(c)、(d)、(e)、(f)和(g);(c)、(d)、(e)、(f)和(h);(c)、(d)、(e)、(f)和(i);(c)、(e)、(f)、(g)和(h);(c)、(e)、(f)、(g)和(i);(c)、(f)、(g)、(h)和(i);(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(d)、(f)、(g)、(h)和(i);更任选地,在至少6种上述活性中建立基本等效性,例如(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(f);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(g);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(h);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(i);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)和(g);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)和(h);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)和(i);(a)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(a)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(a)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(g);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(h);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(i);(b)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(b)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(b)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(c)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);更任选地,在至少7种上述活性中建立基本等效性,例如(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(g);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(h);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)和(i);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(a)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(b)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);更任选地,在至少8种上述活性中建立基本等效性,例如(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(h);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(d)、(f)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(g)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(h)和(i);(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)和(i);或任选地,在所有9种上述活性中建立基本等效性,例如(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)和(i)。
在另一个方面,本发明提供检测试剂盒,包含(a)rSIFN-co或rSIFN-co替代物,以及(b)用于执行本文描述的一个以上方法的说明书和用于执行这些方法的试剂中的至少一者。这些试剂可以包含磷酸缓冲盐水(PBS)或缓冲剂。在一些实施方式中,检测试剂盒中的rSIFN-co或rSIFN-co替代物包括特定的比活性。
在一些实施方式中,所述测试干扰素还通过癌细胞中JAK/STAT信号转导通路传递信号和/或与rSIFN-co享有共同的IFNAR1/2受体,从而与rSIFN-co基本等价或与rSIFN-co具有基本上相同的效力。在一些实施方式中,借助于检测来自STAT家族,例如STAT1、STAT2和/或STAT3的磷酸化蛋白的存在,从而检测通过JAK/STAT途径的信号传导。在一些实施方式中,使用蛋白质印迹来进行这样的检测。在一些实施方式中,癌细胞A549和/或Hela细胞可用于进行这样的检测。在一些实施方式中,用约10mcg/ml的测试干扰素或rSIFN-co处理所述癌细胞。在一些实施方式中,用所述测试干扰素或rSIFN-co处理癌细胞约5、15、30、60、120和/或240分钟。在一些实施方案中,在用干扰素处理后,收集细胞蛋白用于蛋白质印迹分析。在一些实施方式,GAPDH用作对照。
在一些实施方式中,可以使用任何常规的方法且不限于在此披露的方法,来进行用于建立与rSIFN-co或rSIFN-co替代物的等效性或相对其效力的待测测试或活性。
具体实施方式
在此通过下列实施例来进一步说明本发明,但是这些实施例并不是意在限制本发明的范围。可以在存在或不存在没有具体提及但本领域普通技术人员认为其可用的任何元素、限制的情况下实践本发明。此外,除非另外指出,文中本发明的描述并不意在成为限制,而应该解读为包括本领域普通技术人员理解的所描述特征、元素或限制或其部分的等同物或修改。应当理解的是,鉴于本文提供的总体描述,可以实践各种其它实施方式。结合附图,根据上述内容,并基于具体描述和实施例以及所附权利要求,本发明的其它目的、特征和有利之处对于本领域技术人员将是显而易见的。
所有数据都表示为均值±标准差(SD)。应用t检验(以及非参数检验)来分析不同变量之间的关系。当p<0.05时,呈现统计显著性。
实施例1.rSIFN-co对于人肝癌的活性
使用人肝癌SMMC-7721作为模型进行本研究,以证明rSIFN-co在体内***中对人肝癌的活性和效力。将测试物rSIFN-co的活性与丝裂霉素C(“MMC”)的活性进行比较。药物rSIFN-co是无色液体,浓度为1mg/ml,由四川辉阳生命工程股份有限公司(中国成都)提供。使用测试物而不经稀释。将其存储在4℃直至解冻用于注射。丝裂霉素C(“MMC”),批号505AGB,浓度为2mg/瓶,由KyowaHakkoKogyoCo.,Ltd.(日本)提供。MMC在注射时用生理盐水稀释。
根据美国国立卫生研究院(NIH)试验动物的护理和使用指南,进行动物实验。
使用的动物为4-6周龄雄性BALB/cAnu/nu鼠,称重为约23±2g,得自上海药物研究所(中国上海)。研究方案由上海药物研究所动物使用和护理委员会审阅,以符合规章制度,在研究开始前得到委员会批准。尽可能地将研究中所用的流程设计为避免或最小化动物的不适感、痛苦和疼痛。根据规定,经历严重或慢性且不能缓解的疼痛或痛苦的动物经无痛方式安乐死。将6只动物圈养在一个笼内。这些动物通过耳朵打孔识别法进行耳标。室温保持在25℃±1℃。光照设定为12小时照明,12小时黑暗。以自由采食方式供应食物。以自由饮水方式通过水瓶向动物提供经5微米(μm)过滤器过滤的城市自来水。研究人员和辉阳生命工程股份有限公司均认为没有任何干扰或影响本发明意向和目的的食品污染或水污染。
测试物(rSIFN-co)和赋形剂对照各自进行瘤内(i.t.)给药。根据动物的分组,以每种处理每只小鼠0.05ml-0.15ml的体积施用测试物。MMC以10微升(μl)/g静脉(i.v.)给药。以每只小鼠0.15ml的体积注射生理盐水,用作赋形剂对照。
将动物随机分配到处理组。初始时,所有动物都安置在一个大的动物笼中。为分组进行研究,它们在之后被分开进行饲养,每处理组每笼6只动物。各个组的剂量和给药方案记载在表1中。组1和组2是对照组,在第一次处理后每隔一天对各只动物施用赋形剂。组3的动物在开始处理后的第1天和第6天以5mg/kg的剂量给予MMC。组4、组5和组6的动物在第一次处理后分别以0.15mg/小鼠(组4)、或0.10mg/小鼠(组5)或0.05mg/小鼠(组6)每隔一天给予rSIFN-co。在研究的过程中,通过一周两次地测量各个肿瘤的长和宽来监测肿瘤生长。在研究的过程中,还对各只动物进行每周两次称量。
通过向各只小鼠中皮下(s.c.)接种5×106个细胞,在各只动物建立肿瘤,即人肝癌SMMC-7721异种移植物。在研究开始前,异种移植物在裸鼠中传代两次。在无菌条件下,将生长良好的肿瘤切割成1.5mm3的片段,通过套针将一个这样的片段注射到各只研究动物的右侧腹。当肿瘤达到100mm3-200mm3的体积时,将小鼠随机分成对照组或处理组,各个组以表1所记载的剂量和日程安排接受赋形剂(组1和组2)、rSIFN-co(组4、组5和组6)或MMC(组3),持续3周。用千分卡尺来测量各个肿瘤尺寸(长和宽),每周两次。使用公式V=(长×宽2)/2来计算肿瘤体积(V)。各个相对肿瘤体积(RTV)使用公式RTV=Vt/V0来计算,其中Vt是在测量当天的肿瘤体积,而V0是第一次处理当天的肿瘤体积。测试物或对照物的治疗效果以T/C(%)和抑制%表示,T/C(%)使用公式:T/C(%)=(处理组的平均RTV/对照组的平均RTV)×100%;抑制%使用公式:抑制%=100%-T/C%。
表1.实施例1的剂量水平和组别
结果示于表2和图1中。表2显示对于各个处理组的第0天的初始肿瘤尺寸、第21天的最终肿瘤尺寸以及所计算的平均RTV、T/C%和抑制%。
表2.rSIFN-co对人肝癌SMMC-7721的活性
表2显示rSIFN-co在所有的3个测试剂量下有活性且有效地抑制人肝癌细胞的生长。对于第21天(D21)的平均RTV,赋形剂对照组为9.36±3.9,MMC处理组为5.05±2.1,0.15mgrSIFN-co处理组为4.13±1.9,0.10mgrSIFN-co处理组为4.57±2.3,且0.05mgrSIFN-co处理组为4.97±1.7。在第21天(D21)的抑制%:MMC处理组为47.18%,0.15mgrSIFN-co处理组为56.80%,0.10mgrSIFN-co处理组为52.20%,且0.05mgrSIFN-co处理组为48.10。各个处理组与赋形剂对照组之间的RTV差异被确定为是统计学显著的。
图1显示对于各个处理组在21天的研究期间,人肝癌SMMC-7721在裸鼠中的生长进程(由RTV表示),呈现出在开始处理之后第3、7、10、14、17和21天的肿瘤测量结果。结果显示在第7天之前在各个MMC处理组和rSIFN-co处理组中肿瘤生长的延迟,并保持到第21天。结果还显示出在更高的rSIFN-co剂量下更大的抑制趋势。
所有用测试物处理的动物都较好地耐受测试剂量,没有毒性或体重减轻的迹象。赋形剂组、MMC处理组、0.15mgrSIFN-co处理组、0.10mgrSIFN-co处理组和0.05mgrSIFN-co处理组的动物的平均体重(以克计)在第0天(和第21天)分别为:22.7(24.8);23.9(25.4);23.7(25.3);24.3(26.2);和22.6(24.4)。
实施例2.rSIFN-co对人***的活性
该研究使用Hela细胞作为模型证实rSIFN-co对于人***治疗的活性和效力。结果显示,rSIFN-co有活性并且有效抑制人***细胞的生长。如实施例1进行该研究,除了另外具体指出的那些。首先以与实施例1中相似的方式通过在裸鼠中皮下接种5×106个Hela细胞并使生长良好的异种移植物在裸鼠中传代两次,建立并制备人***异种移植物。之后,制备1.5mm3片段以s.c.方式植入到动物中。动物的体重在给药初始时平均为19±2g。与实施例1相比,使用的动物均为雌性。各个处理组的剂量和给药方案与实施例1相似,不同在于在第0天开始处理之后的第1和13天注射MMC,且研究在开始处理后持续28天。
结果显示在表3和图2中。表3显示计算出的第0天和第28天的平均TV,以及计算出的平均RTV、T/C(%)和抑制%。对于第28天(D28)的RTV,赋形剂对照组是12.45±4.46,MMC处理组为4.97±1.85,0.15mgrSIFN-co处理组为7.42±1.91,0.10mgrSIFN-co处理组为6.64±2.04,及0.05mgrSIFN-co处理组为6.64±1.60。对于第28天的抑制%,MMC处理组为60.08%,0.15mgrSIFN-co处理组为40.40%,0.10mgrSIFN-co处理组为46.67%,及0.05mgrSIFN-co处理组为46.67%。与MMC处理组、0.15mgrSIFN-co处理组、0.10mgrSIFN-co处理组和0.05mgrSIFN-co处理组对应的T/C(%)分别为39.92%、59.60%、53.33%和53.33%。各个处理组与赋形剂对照组之间的RTV差异被确定为是统计学显著的。结果显示,rSIFN-co有效抑制测试动物中人***的生长。
表3.rSIFN-co对人***Hela异种移植物的活性
图2显示在28天研究期间各个处理组的RTV进展,反映出在开始处理之后第4、7、11、14、18、21、25和28天做出的肿瘤测量。结果显示在第7天之前在各个MMC处理组和rSIFN-co处理组中人***生长的延迟,并保持到第28天。
研究中的所有动物均耐受rSIFN-co处理,没有毒性迹象。在28天的处理期间观察到极小的平均体重变化。
实施例3.rSIFN-co对人结肠癌的活性
使用HT-29作为模型进行该研究来证实rSIFN-co对于人结肠癌治疗的活性和效力。结果显示,rSIFN-co有活性并且有效抑制人结肠癌细胞的生长。如实施例1进行该研究,除了另外具体指出的那些。首先以与实施例1中相似的方式通过在裸鼠中皮下接种5×106个HT-29细胞并使生长良好的异种移植物在裸鼠中传代两次,建立并制备人结肠癌异种移植物。之后,制备1.5mm3片段以s.c.方式植入到测试动物中。动物的体重在给药初始时平均为20±2g。与实施例1相比,在该研究中使用的动物均为雌性。各个处理组的剂量和给药方案同实施例1所记载,不同在于在第1天和第10天对组3施用MMC,且增加额外的组,即组7,该组的各只小鼠用体积为0.15ml且剂量为0.15mg/小鼠的IFNα-2b进行处理,如rSIFN-co处理组一样每隔一天进行,处理共执行4周。浓度为1.41mg/ml的IFNα-2b由辉阳生命工程股份有限公司提供。结果显示在表4和图3中。
表4.rSIFN-co对人结肠癌HT-29异种移植物的活性
表4显示计算出的第0天初始平均TV和第28天最终平均TV,以及计算出的平均RTV、T/C(%)和抑制%。对于第28天(D28)的RTV,赋形剂对照组为8.41±2.82,MMC处理组为3.12±1.19,0.15mgrSIFN-co处理组为4.51±1.25,0.10mgrSIFN-co处理组为4.22±0.87,0.05mgrSIFN-co处理组为3.28±1.25,及IFNα-2b处理组为6.26±1.43。对于第28天的抑制%,MMC处理组为62.9%,0.15mgrSIFN-co处理组为46.37%,0.10mgrSIFN-co处理组为49.82%,0.05mgrSIFN-co处理组为61%,及IFNα-2b处理组是25.56%。与MMC处理组、0.15mgrSIFN-co处理组、0.10mgrSIFN-co处理组、0.05mgrSIFN-co处理组以及IFNα-2b处理组对应的T/C(%)分别为37.10%、53.63%、50.18%、39.00%和74.44%。结果显示,rSIFN-co比IFNα-2b更有效地抑制人结肠癌细胞的生长。各个处理组与赋形剂对照组之间的RTV差异被确定为是统计学显著的。
图3显示在28天研究期间各个处理组的由RTV表示的对人结肠肿瘤生长的抑制,反映出在开始处理之后的第3、7、10、14、17、21、24和28天做出的肿瘤测量。结果显示在第7天之前在各个MMC处理组和rSIFN-co处理组中人结肠肿瘤生长的延迟,并保持到第28天。3种剂量的rSIFN-co均引起比IFNα-2b更强的肿瘤生长抑制。
同实施例1和2,所有rSIFN-co处理的动物均耐受所测试的剂量,且没有显示出药物毒性迹象,并显示出最小化的体重变化。
实施例4.rSIFN-co对人肺癌的活性
使用SPC-A4作为模型进行该研究来证实rSIFN-co对于人肺癌治疗的活性和效力。结果显示,rSIFN-co对人肺肿瘤生长有显著抑制,并且rSIFN-co比IFNα-2b有效得多。如实施例3进行该研究,除了另外具体指出的那些。首先以与实施例1中相似的方式建立并制备用于注射到测试动物中的人异种移植物,不同在于通过在裸鼠中皮下(s.c.)接种2.5×106个SPC-A4细胞并使生长良好的肿瘤在裸鼠中传代两次。之后,使用1.5mm3片段以s.c.方式将其植入到测试动物中。动物的体重在给药初始时平均为22±2g。与实施例3相比,在该研究中使用的动物均为雄性且该研究进行21天处理。各个处理组的剂量和给药方案同实施例3所记载,不同在于在第1和第6天对组3施用MMC。结果显示在表5和图4中。
表5.rSIFN-co对人肺癌SPC-A4异种移植物在裸鼠中的生长的作用.
图4显示在21天研究期间各个处理组的由RTV表示的人肺肿瘤在裸鼠中的生长抑制,反映出在开始处理之后的第4、7、11、14、18、和21天做出的肿瘤测量。结果显示在第7天之前在各个MMC处理组和rSIFN-co处理组中肿瘤生长的延迟,并保持到研究结束的第21天。直到第11天才在IFNα-2b处理组中观察到肿瘤抑制。IFNα-2b引起的肿瘤生长抑制低于任一rSIFN-co处理组中的肿瘤生长抑制且不是统计学显著的(p>0.05)。因此,rSIFN-co比IFNα-2b更有效地抑制人肺癌细胞的生长。
同实施例1-3,所有动物均耐受测试物的测试剂量,没有观察到毒性或体重减轻的迹象,除0.05mgrSIFN-co处理组中的一只小鼠在第17天原因不明地死亡之外。
实施例5.rSIFN-co降低多种人实体癌细胞的生存力
细胞培养和试剂。人肺癌细胞系(A549、H1299、H460、Calu-1)、人肝癌细胞系(SMMC-7721、Huh-7、CL-1)、人***细胞系(Hela)、人乳腺癌细胞系(MDA-MB-231)、人***癌细胞系(PANC-1)和人结肠癌细胞系(SW620、HT29、SW480)从ShanghaiCellCollection(中国上海)购买。以上细胞系均在ShanghaiCellCollection配置的对应的完全生长培养基中于5%C02和37℃下培养,该完全生长培养基含有10%热失活胎牛血清(Biochrom,Germany),并补充有4mM谷氨酰胺、50U/ml青霉素和50mg/ml链霉素。完全生长培养基为:对于A549为F-12K(批号GNM21127;杭州吉诺生物医药技术有限公司);对于SW620和MDA-MB-231为L-15(批号41300-039,GIBCO);对于SMMC-7721、Hela、Huh-7、CL-1和PANC-1为DMEM(批号C11995,GIBCO);对于H460、H1299和SW480为RMPI-1640(批号C11875,GIBCO);对于HT-29为Macro5a(批号M4892,Sigma);以及对于Calu-1为DMEM+10%FBS。
对96孔板以每孔约5×103个细胞于100μl完全培养基中进行铺板,温育过夜,之后分别用IFNα-2b或rSIFN-co以100μg/ml、50μg/ml、25μg/ml、12.5μg/ml、6.25μg/ml、3.13μg/ml、1.56μg/ml、0.78μg/ml、0.39μg/ml和0.20μg/ml的浓度处理约48小时,然后收集细胞进行分析。通过SunBioAm-Blue检测试剂盒(Cat#:SBAB8025,ShanghaiSBOMedicalBiotechnologyCo.,Ltd,中国上海)评测细胞存活率。根据其操作指南,向各孔添加10μl的Am-Blue。之后,细胞在5%C02和37℃下温育4小时。在将96孔板摇动30秒之后,通过ThermoScientific酶标仪(ThermonFisherScientific,Inc.,Lowell,MA)在570nm和595nm读取各个孔的吸光率。如下计算相对细胞生存力:细胞生存力=(处理组(OD570- OD595)-空白(OD570-OD595))/(对照组(OD570-OD595)-空白(OD570-OD595))×100%,其中对照组是对应的未处理细胞。结果显示在图5中,其中肿瘤细胞的生存力表示为相对于未经处理的对照细胞的百分比。各个数据点表示至少两个独立实验的平均值。
图5显示rSIFN-co或IFNα-2b处理而降低癌细胞的生存力的各个癌细胞系(A)-(I)的剂量反应曲线。(A)A549细胞;(B)Hela细胞;(C)CL-1细胞;(D)Huh-7细胞;(E)SW480细胞;(F)MDA-MB-231细胞;(G)Calu-1细胞;(H)SMMC-7721细胞;(I)PANC-1细胞。
结果显示,即使在最高测试浓度(100μg/ml)下,IFNα-2b也对A549细胞、Hela细胞、CL-1细胞、SW480细胞和SMMC-7721细胞的生存力降低没有效果或几乎没有效果。当用100mcg/ml(μg/ml)的IFNα-2b处理Huh-7细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞和PANC-1细胞时,观察到小于50%的生存力降低。相比之下,rSIFN-co能够在低得多的剂量下以剂量依赖的方式降低肿瘤细胞生存力,对于SW480细胞、MDA-MB-231细胞和PANC-1细胞,在6.25μg/ml至12.5μg/ml的浓度下,以及对于A549细胞、Hela细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、Calu-1细胞和SMMC-7721细胞,在12.5μg/ml至25μg/ml的浓度下,达到接近50%的细胞生存力降低。通常而言,rSIFN-co降低细胞生存力的IC50,对于不同的癌细胞在约10mcg/ml至18mcg/ml的范围内。在100mcg/ml的rSIFN-co下,对于任何癌细胞系都检测不到细胞生存力。因此,在各个测试浓度下,rSIFN-co均比IFNα-2b更有效地降低肿瘤细胞生存力。
实施例6A.rSIFN-co比IFNα-2b更有效地降低细胞生存力.
为证实rSIFN-co降低细胞生存力的能力,将A549和SW620肿瘤细胞(各自为每孔2×103个细胞于100μl完全培养基中)铺在96孔板上,分别用10μg/ml的rSIFN-co或IFNα-2b处理1-6天。以标准MTT法(3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基四氮唑溴盐检测,Sigma,St.Louis,MO)评测细胞存活率。对于该检测,向各孔加入约20μl的MTT(4mg/ml)。细胞在37℃下温育4小时。之后,仔细移去各孔的上清液,之后向各孔加入等体积(150微升)的二甲亚砜(DMSO)并在摇床上彻底混合15分钟。用ThermoScientific酶标仪(ThermoFisherScientificInc.,Lowell,MA)在595nm读取96孔板的吸光度。相对细胞生存力如下计算:细胞生存力=(处理组(OD595)-空白(OD595))/(对照组(OD595)-空白(OD595))×100%。
结果表示为相对于未经处理的对照细胞的百分比。各个数据点表示至少两个独立实验的均值。如图6所示,与IFNα-2b相比,rSIFN-co以时间依赖的方式强烈地降低SW620细胞的细胞生存力,而IFNα-2b即使有也只有极弱的时间依赖效果。rSIFN-co的时间依赖性效果对于A549细胞而言,仅在处理的约前三天是明显的。对于各个细胞系,在各个时间点,rSIFN-co与IFNα-2b之间的效果差异是统计学显著的(p<0.01)。这些数据显示出rSIFN-co的时间依赖性的强抗肿瘤效果。
实施例6B.rSIFN-co在体内抑制肿瘤生长
根据NIH试验动物的护理和使用指南来进行该实验。4-5周龄的雌性BALB/c裸鼠得自上海实验动物中心(中国上海)。将约5×106个A549细胞皮下注射到各只小鼠中以建立异种移植肿瘤。将动物随机分成三组(每组8只小鼠),并用PBS(1XPBS,pH7.2-7.4)、每只小鼠100μg/100μl的rSIFN-co或每只小鼠100μg/100μl的IFNα-2b每隔一天进行瘤内处理,共12次。每三天测量一次肿瘤,肿瘤体积如下计算:肿瘤体积(mm3)=(长×宽2)/2。结果显示在图16中。数据显示为均值±SD(n=8)。结果证实,与PBS处理组相比,rSIFN-co可以几乎完全地抑制所建立肿瘤的生长(p<0.0001)。然而,IFNα-2b并没有显示出明显的对肿瘤生长的抑制。结果证实,在体内抑制肿瘤生长方面,rSIFN-co比IFNα-2b更有效。
实施例6C.rSIFN-co抑制三维培养体系中肿瘤细胞的群落形成和伪足形成
将Matrigel(来自BDCorporation,Cat#:356234)在4℃冰箱中于冰上解冻过夜,并将24孔板在-20℃冷冻过夜。之后,用150μl的1.0mg/ml的Matrigel涂覆冷冻的24孔板的各孔。之后,将涂覆有Matrigel的24孔板在37℃下温育20-30分钟。将肺癌细胞A549胰蛋白酶化并对其计数。在涂覆有Matrigel的孔上接种在含有2%Matrigel以及10mcg/ml的IFNα-2b或rSIFN-co或者没有干扰素(作为对照)的条件培养基中的约5×103个细胞。这些细胞在37℃温育至少约8天。每3天添加一次约200μl的上述条件培养基,以防止培养基变干。在第4天或第8天,拍照以观察群落的尺寸和伪足形成。实验以三组平行进行。
结果显示在图7中。4天后,发现rSIFN-co处理组(图7C)比未处理组(图7A)具有更小的群落。8天后,rSIFN-co处理组不仅具有3组中最小的群落,还发现,在细胞周围几乎没有突出的伪足(图7C,第2和3排),而在未处理组(图7A,第2和3排)和IFNα-2b处理组(图7B,第2和3排)的细胞中,伪足形成明显。该实验表明rSIFN-co不仅可以抑制癌细胞群落的生长,而且可以抑制癌细胞中的伪足形成(转移必需的特征)。
实施例7.rSIFN-co对β-联蛋白/TCF转录活性的抑制
β-联蛋白/TCF转录报告***检测。测定了rSIFN-co对Wnt/β-联蛋白信号转导的体外作用。将癌细胞铺在96孔板上(每孔1×104个细胞),并温育12个小时,之后用100ngTOPFlash(MilliporeCorporation,Billerica,MA,USA)对其进行瞬时转染。为使转染效率标准化,将细胞与1ng由SV40启动子驱动的内参报告基因海肾荧光素酶pRL-SV40(Promega,Madison,WI,USA)共转染,之后用10mcg/ml干扰素rSIFN-co或IFNα-2b处理6小时,或在转染后不处理作为对照(Mock)。在干扰素处理24小时后,根据制造商的操作指南(Cat#:E1960,Promega),使用双荧光素酶检测体系试剂盒来进行荧光素酶检测。相对荧光素酶活性表示为萤火虫荧光素酶活性/海肾荧光素酶活性的比率。实验以三组平行进行。
如图8所示,结果表明,rSIFN-co降低人实体癌细胞中β-联蛋白/TCF介导的转录活性。在处理24小时后,在三种肺癌细胞(A549、H1299、H460)和两种结肠癌细胞(HT-29、SW620)中,β-联蛋白/TCF介导的转录活性显著被rSIFN-co抑制(*,p<0.05;**,p<0.01)。然而,对于A549细胞、H1299细胞、H460细胞和HT-29细胞,IFNα-2b不存在抑制作用,并且相反地导致了增强作用。
简言之,对照组、IFNα-2b处理组和rSIFN-co处理组的萤火虫荧光素酶活性/海肾荧光素酶活性的比率分别为:(A)对于A549细胞为约310、约350和约100;(B)对于H1299细胞为约800、约1000和约500;(C)对于H460细胞为约450、约500和约280;(D)对于HT-29细胞为约300、约600和约200;(E)对于SW620细胞为约1500、约1200和约少于100。该研究表明,在抑制Wnt/TCF信号转导方面,rSIFN-co优于IFNα-2b,因此,其抗肿瘤效果也更优。
实施例8.rSIFN-co降低癌细胞中β-联蛋白的蛋白水平
将癌细胞A549和Sw480培养至约85%汇合率并放置到6孔板中。细胞分别用10mcg/mlIFNα-2b或rSIFN-co处理24小时、48小时或72小时,或不处理作为对照(Mock)。处理后,收集细胞进行蛋白质印迹,使用其特异性抗体检测β-联蛋白的蛋白水平,以GAPDH作为内源加样对照。实验以三组平行进行重复。
蛋白质印迹分析。为确定多种蛋白的表达,从6孔板收集细胞,并根据制造商的操作指南(Beyotime,China)使用提取试剂(Cat#:P0013)来提取细胞总蛋白。通过Lowry蛋白检测试剂盒(Bio-Rad,USA)来测定总蛋白浓度。通过十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)在10%-12%的胶上分离总蛋白,并将其转移到0.22或0.45μm的PVDF膜上(MilloporeCorporation,Billerica,MA,USA)。用5%脱脂奶、牛血清白蛋白、10mmol/LTris-HCl(pH8.0)、150mmol/LNaCl和0.05%吐温20在4℃下将膜封闭过夜。然后将封闭的膜与一抗(1∶1000稀释)温育,然后与HRP结合的二抗一起温育。使用冷光/荧光成像LAS4000***(GEHealthcareLifeSciences,USA)和supersignalwestpico化学发光底物试剂盒(ThermoScientific,USA)将印迹可视化。
对于该研究,所使用的一抗是小鼠单克隆β-联蛋白抗体(1∶1000;SantaCruzTechnology,SantaCruz,CA)和小鼠单克隆GAPDH抗体(1∶2000)(KangweiBiotechnology,China)。抗小鼠HRP结合二抗(SantaCruzTechnology,SantaCruz,CA)以1∶2000的浓度使用。图10所示的结果表明,对于A549细胞,在处理2天(48小时)后,rSIFN-co使β-联蛋白的蛋白水平巨幅降低。对于这些细胞,在处理3天(72小时)后,观察到进一步的降低。SW480细胞中β-联蛋白的蛋白水平降低在用rSIFN-co处理72小时后较为明显。在肺癌A549细胞和结肠癌SW480细胞中,β-联蛋白的下调是明显的时间依赖性的。相比而言,IFNα-2b未引起任何明显的β-联蛋白水平下降,表明其对β-联蛋白的下调没有作用。
实施例9.rSIFN-co引起Wnt通路介导的靶标基因的转录下调
将肺癌A549细胞接种到6孔板中,并分别用10μg/ml的IFNα-2b或rSIFN-co处理,或不处理作为对照(Mock)。在处理24小时后,使用TRIZOL试剂来分离细胞总mRNA,合成cDNA,并使用4种Wnt信号转导下游基因Axin2、CD24、存活蛋白和ID2的特异性引物进一步进行qPCR。实验以三组平行进行,并用Mock组标准化。
定量PCR(qPCR)分析。根据制造商的说明书,使用TRIZOL试剂(Invitrogen,Carlsbad,CA)分离总mRNA。根据制造商的说明书使用RT-PCR试剂盒(Cat#:FSQ-101,TOYOBO,Japan)合成互补DNA(cDNA),之后使用SYBRGreenPCR试剂盒(Cat#:QPK-201,TOYOBO,Japan)进行qPCR。四种Wnt通路靶标基因的引物如下:Axin2正义引物:5’-CGTGGATACCTTAGACTT-3’(SEQIDNO:8)和反义引物:5’-GCTGTTGTTCTCAATGTA-3’(SEQIDNO:9);CD24正义引物:5’-TGAAGAACATGTGAGAGGTTTGAC-3’(SEQIDNO:10)和反义引物:5’-GAAAACTGAATCTCCATTCCACAA-3’(SEQIDNO:11);存活蛋白正义引物:5’-ACCGCATCTCTACATTCAAG-3’(SEQIDNO:12)和反义引物:5’-CAAGTCTGGCTCGTTCTC-3’(SEQIDNO:13)以及ID2正义引物:5’-CACAACAACAACAACAAC-3’(SEQIDNO:14)和反义引物5’-CACAGTCCAAGTAAGAGA-3’(SEQIDNO:15)。
扩增流程如下:95℃温育1分钟,40个循环(95℃15秒,60℃15秒,72℃30秒)。使用Bio-Rad检测***,实时监测SYBRGreen染料结合入PCR产物的情况,接着使用Bio-RadCFXmanager2.1软件进行分析。对于各个条件汇集样品,以两组平行进行。使用2-ΔΔCt法比较处理的样品与Mock,并以倍率变化进行绘图。GAPDH用作标准化对照。
图11所示的结果表明,rSIFN-co引起Wnt通路介导的靶标基因Axin2、CD24、存活蛋白和ID2的下调。在rSIFN-co处理后这些基因的mRNA水平显著降低,但在IFNα-2b处理后没有显著降低。
简言之,当Mock对照的相对表达水平被设定为1时,对于Axin2基因而言(图11A),IFNα-2b处理得到稍高于1的水平,而rSIFN-co处理得到约0.4的水平(p<0.0001,将rSIFN-co处理与未处理进行比较)。对于Mock未处理细胞、IFNα-2b处理细胞和rSIFN-co处理细胞,CD24基因的相应水平(图11B)分别为1、约0.9和约0.4(p<0.0001);存活蛋白基因的相应水平(图11C)分别为1、约0.9和约0.4(p<0.0005);ID2基因的相应水平(图11D)分别为1、约1和约0.4(p<0.0001)。
实施例10.rSIFN-co能够下调不同细胞中Wnt相关受体或共受体LRP6/FZD6的
mRNA水平
研究rSIFN-co对LRP6/FZD6的调节。如实施例9中进行的,通过qPCR来执行本实施例。将癌细胞A549、H460、SW620和HT-29接种到6孔板中,并用10μg/ml的IFNα-2b或rSIFN-co处理,或者不处理作为对照(Mock)。在处理24小时后,使用TRIZOL试剂分离细胞总mRNA,使用LRP6和FZD6的特异性引物对cDNA进行qPCR。使用的引物为,LRP6正义引物:5’-TGAAGAACCAGCACCACAGG-3’(SEQIDNO:4)和反义引物:5’-CATAACCAAGAGGCACAGAAGC-3’(SEQIDNO:5),以及FZD6正义引物:5’-GCGGAGTGAAGGAAGGATTAGTC-3’(SEQIDNO:6)和反义引物:5’-TGAACAAGCAGAGATGTGGAACC-3’(SEQIDNO:7)。实验以三组平行进行,并用Mock对照组标准化。结果记录为LRP6或FZD6相对于GAPDH的相对mRNA水平。
图9所示的结果表明,在四种癌细胞系中,rSIFN-co使LRP6和FZD6不同程度地下调。图9A显示在rSIFN-co处理后A549细胞(p<0.005)、SW620细胞(p<0.005)和HT-29细胞(p<0.005)中LRP6mRNA的相对表达有显著降低,但是在IFNα-2b处理中没有观察到显著降低。图9B显示在rSIFN-co处理后在所有4个细胞系A549(p<0.001)、H460(p<0.0005)、SW620(p<0.001)和HT-29(p<0.0005)中FZD6mRNA的相对表达有显著降低。另一干扰素IFNα-2b造成HT-29细胞中FZD6mRNA表达的加强,但是在A549细胞、H460细胞和SW620细胞中引起FZD6mRNA表达一定程度的降低,尽管未达到与rSIFN-co相同的程度。结果表明,rSIFN-co引起的Wnt信号转导通路的抑制可能是由Wnt相关的细胞表面受体LRP6和FZD6的表达受抑制而引起。发现rSIFN-co在测试的人癌细胞(例如人肺癌细胞和人结肠癌细胞)中在抑制Wnt通路方面要优于干扰素IFNα-2b,包括对β-联蛋白/TCF介导的转录活性和β-联蛋白蛋白水平以及Wnt信号转导通路相关受体、共受体和靶标基因的下调。
实施例11.rSIFN-co上调肿瘤抑制基因的表达
在本研究中证实rSIFN-co对肿瘤抑制基因的上调作用。将癌细胞A549、H460、SW620和HT-29接种到6孔板中,并用10mcg/ml的IFNα-2b或rSIFN-co处理,或不处理作为Mock对照。在处理24小时后,使用TRIZOL试剂来分离细胞总mRNA,并合成cDNA,使用DKK3、KLF4和BATF2的特异性引物来进一步进行qPCR。使用以下引物:对于BATF2,正义引物5’-CAGAGCAGGGAGCACAAACC-3’(SEQIDNO:16)和反义引物5’-TGAGCAGAGGAGAGCAGAGG-3’(SEQIDNO:17);对于DKK3,正义引物5’-GGAGCCTGACTGAAGAGATGG-3’(SEQIDNO:18)和反义引物5’-ACGCCTAAAGCACACACCTG-3’(SEQIDNO:19);对于KLF4,正义引物5’-CCTTCAACCTGGCGGACATCAAC-3’(SEQIDNO:20)和反义引物5’-GGCTGCTGCGGCGGAATG-3’(SEQIDNO:21)。
实验以三组平行进行,并用mock对照组标准化。图12所示的结果表示为与GAPDH相较的相对mRNA表达水平。对于A549细胞,rSIFN-co处理使所有3种肿瘤抑制基因DKK-3(图12A)、BATF2(图12B)和KLF4(图12C)的表达大幅增高,并且比IFNα-2b有效得多。在SW620细胞中,与对照和IFNα-2b处理相比,在rSIFN-co处理之后KLF4表达的上调也大幅增加。IFNα-2b处理显著地增加了H460细胞中DKK-3的表达。
实施例12.rSIFN-co抑制癌细胞迁移
通过在用IFNα-2b或rSIFN-co处理24小时(与未处理对照(Mock)对比)后,确定肺癌A549细胞和结肠癌SW620细胞穿过微孔膜迁移的能力来证实rSIFN-co抑制肿瘤细胞迁移的能力。使用24孔板中的8μm细胞培养***式小室(Becton-DickinsonBiosciences,NJ,USA)进行细胞迁移检测。将不含FBS的温热(37℃)碳酸氢盐类培养基加到***式小室的内部以及孔的底部,并使其在加湿组织培养箱中于37℃、5%CO2氛下复水约2小时。在复水之后,小心除去培养基。之后,将500μl混悬在不含FBS的培养基中的制备细胞(在用10μg/mlIFNα-2b或10μg/mlrSIFN-co处理后,或完全不做处理)以0.5×104细胞/***式小室的密度接种到***式小室滤器的上部。在24孔板的下室置入500μl含有10%FBS的完全培养基。在常规培养条件下于37℃,24小时之后,将室膜上部的非迁移细胞用棉拭子除去。培养小室的下部用4%多聚甲醛固定并用2%结晶紫染色。在三组平行孔中的每一个中,对细胞被置入的室膜的相反侧的迁移细胞数量进行计数。各个实验重复至少两次,每次使用三组平行孔。
图13所示的结果显示出对于Mock、IFNα-2b处理细胞和rSIFN-co处理细胞各自的单位区域中的迁移细胞平均数量。对于穿膜迁移的A549细胞,在未处理的Mock组中观察到约30个细胞/区域,在IFNα-2b组中观察到约110个细胞,在rSIFN-co处理组中观察到约10个细胞。由IFNα-2b处理造成的迁移增强和由rSIFN-co处理引起的迁移抑制是统计学显著的(p<0.01)。使用SW620细胞时也观察到rSIFN-co引起的显著抑制。与此相反,IFNα-2b处理导致SW620细胞中肿瘤细胞迁移的增加。因此,rSIFN-co有效抑制肿瘤细胞迁移,并且比IFNα-2b有效得多。
实施例13.rSIFN-co并不是经细胞凋亡通路发挥作用
进行本研究以显示,rSIFN-co通过细胞凋亡通路以外的途径来发挥降低肿瘤细胞生存力的作用。将肿瘤细胞A549和SW620铺在6孔板上,温育过夜并在之后用10mcg/ml的IFNα-2b或10mcg/ml的rSIFN-co或5FU处理24小时或48小时,或不处理(作为Mock对照)。之后,通过蛋白质印迹来监测细胞凋亡相关的分子标记物。使用的一抗是小鼠单克隆β-微管蛋白抗体(1∶2000,Cat#:CW0098A)和小鼠单克隆GAPDH抗体(1∶2000,Cat#:CW0100A)(KangweiBiotechnology,China);小鼠单克隆PARP抗体(1∶1000,Cat#:sc-2007,SantaCruzBiotechnology,Inc.);兔单克隆半胱天冬酶-3酶原抗体(1∶1000,Cat#:9665)和兔多克隆切割的半胱天冬酶-3抗体(1∶1000,Cat#:9661)(CellSignalingTechnology,USA);山羊多克隆半胱天冬酶-8酶原抗体(1∶1000,Cat#:sc-6136,SantaCruzBiotechnology,Inc.);兔单克隆切割的半胱天冬酶-8抗体(1∶1000,Cat#:9496)(CellSignalingTechnology,USA)。
对于A549细胞的结果显示在图14A中,对于SW620细胞的结果显示在图14B中。蛋白质印迹显示出,在用5FU(已知的导致细胞凋亡的药物)处理后,细胞的半胱天冬酶-3酶原、半胱天冬酶-8酶原和PARP水平表现出显著降低,但是表现出切割的半胱天冬酶-3和切割的半胱天冬酶-8的水平增加。相反,干扰素IFNα-2b或rSIFN-co均不造成任何半胱天冬酶-3酶原、半胱天冬酶-8酶原或PARP水平的降低,或引起任何切割的半胱天冬酶-3或切割的半胱天冬酶-8水平的增加。因此,结果表明,这两种干扰素,特别是rSIFN-co可能是通过细胞凋亡以外的不同机制来造成肿瘤细胞生存力的降低。
实施例14.rSIFN-co引起STAT磷酸化
进行该实验以显示,rSIFN-co同IFNα-2b一样利用JAK/STAT信号转导通路。在本研究中,将A549细胞和Hela细胞分别铺到3.3cm的盘中,37℃温育过夜,之后分别用10μg/ml的IFNα-2b或rSIFN-co处理0、5、15、30、60、120和240分钟。在处理后,收集细胞,提取细胞蛋白并加样到SDS-PAGE琼脂糖上进行蛋白质印迹分析,从而观察STAT1(Tyr701)、STAT2(Tyr690)和STAT3(Tyr705)的磷酸化。GAPDH用作加样对照。
使用的一抗是:STAT1(1∶1000,Cat#:9175S)、Tyr701磷酸化-STAT1(1∶1000,Cat#:9167S)、STAT2(1∶500,Cat#4594)、Tyr690磷酸化-STAT2(1∶1000,Cat#:441S)、STAT3(1∶1000,Cat#:9132)、Tyr705磷酸化-STAT3(1∶1000,Cat#:9145S)。抗小鼠(Cat#:sc-2005)或抗兔(Cat#:sc-2004)或抗山羊(Cat#:sc-2020)HRP-结合的二抗(SantaCruzTechnology,SantaCruz,CA)以1∶2000的浓度使用。使用冷光/荧光成像LAS4000***(GEHealthcareLifeSciences,USA)和supersignalwestpico化学发光底物试剂盒(ThermoScientific,USA)来对印迹进行可视化。
图15所示的结果证实,这两种干扰素,即IFNα-2b和rSIFN-co,在A549细胞和Hela细胞中在STAT1、STAT2和STAT3磷酸化模式上表现相似。因此,rSIFN-co介导的JAK/STAT信号转导水平与IFNα-2b介导的JAK/STAT信号转导水平没有不同,表明rSIFN-co和IFNα-2b可能共享共同的IFNAR1/2受体。
工业实用性
本文中描述的方法和检测试剂盒可用于确定测试化合物例如干扰素的效力,并用于治疗因β-联蛋白或LRP6、FZD6、Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或多种的过度活跃或过表达,或者DKK3、BATF2、或KLF4的下调而受到不利影响的某些疾病或病症。
Claims (98)
1.一种对测试干扰素相对于rSIFN-co或rSIFN-co替代物的效力进行确定或比较的方法,包括:
(1)提供所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物;和
(2)在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物分别测定选自如下的任一种或更多种活性:
(a)对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;
(b)对癌细胞生存力的降低;
(c)对癌细胞迁移的抑制;
(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;
(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;
(f)对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;
(g)对癌细胞中伪足形成的抑制;
(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和
(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调;
从而测试干扰素以统计学显著方式存在(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(f)中指定的任何1种、或2种、或3种、或4种、或5种、或6种活性,和/或测试干扰素存在(g)、(h)和(i)中指定的任一种或更多种活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物具有基本上相同的效力。
2.一种建立测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物间的基本等效性的方法,包括:
(1)提供所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物;和
(2)在相同的特定条件下,对所述测试干扰素和rSIFN-co或rSIFN-co替代物分别测定选自如下的任一种或更多种活性:
(a)对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;
(b)对癌细胞生存力的降低;
(c)对癌细胞迁移的抑制;
(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;
(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;
(f)对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;
(g)对癌细胞中伪足形成的抑制;
(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和
(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调;
从而测试干扰素以统计学显著方式存在(a)、(b)、(c)、(d)、(e)和(f)中指定的任何1种、或2种、或3种、或4种、或5种、或6种活性,和/或测试干扰素存在(g)、(h)和(i)中指定的任一种或更多种活性,表示所述测试干扰素与rSIFN-co或rSIFN-co替代物是基本等效的。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中在测定上述一种或更多种活性中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞、结肠癌细胞、***细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞和***癌细胞。
4.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其中在测定上述一种或更多种活性中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、Hela细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、SW480细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞、SMMC-7721细胞、PANC-1细胞、SW620细胞、SPC-A4细胞、H1299细胞、H460细胞和HT-29细胞。
5.根据权利要求1-4任一项所述的方法,其中在测定活性(a)对体内癌细胞生长的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肝癌细胞、***细胞、结肠癌细胞和肺癌细胞。
6.根据权利要求1-5任一项所述的方法,其中在测定活性(a)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:SMMC-7721细胞、Hela细胞、HT-29细胞、SPC-A4细胞和A549细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:HT-29细胞、SPC-A4细胞和A549细胞;进一步任选地,包括A549细胞。
7.根据权利要求1-6任一项所述的方法,其中在测定活性(a)抑制作用中生理盐水或PBS被用作对照。
8.根据权利要求1-7任一项所述的方法,其中在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以约0.02mg至约0.30mg;任选地,约0.05mg至约0.15mg的量施用。
9.根据权利要求1-8任一项所述的方法,其中在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物以每隔一天施用。
10.根据权利要求1-9任一项所述的方法,其中在测定活性(a)中被施用于荷瘤动物模型的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物施用持续约2周至约6周;任选地,约3周至约4周。
11.根据权利要求1-10任一项所述的方法,其中在测定活性(b)对癌细胞生存力的降低中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物在约6.25mcg/ml至约25mcg/ml;任选地,约10mcg/ml至约18mcg/ml;更任选地,约10mcg/ml至约15mcg/ml的浓度范围下,各自引起癌细胞生存力约50%下降。
12.根据权利要求1-11任一项所述的方法,其中在测定活性(b)中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物在至少约25mcg/ml;任选地,至少约50mcg/ml,进一步任选地,至少约75mcg/ml;更任选地,至少约100mcg/ml的浓度下,各自引起癌细胞生存力至基本上无法检测的水平。
13.根据权利要求11或12所述的方法,其中在测定活性(b)中,测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物的浓度包括在约0.2mcg/ml至约100mcg/ml的浓度。
14.根据权利要求11-13任一项所述的方法,其中在测定活性(b)中,用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理癌细胞至少约1天;任选地,至少约2天。
15.根据权利要求11-14任一项所述的方法,其中在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞、结肠癌细胞、***细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞和***癌细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞、结肠癌细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞和***癌细胞。
16.根据权利要求11-15任一项所述的方法,其中在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、Hela细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、SW480细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞、SMMC-7721细胞和PANC-1细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、SW480细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞、SMMC-7721细胞和PANC-1细胞。
17.根据权利要求1-10任一项所述的方法,其中使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(b)中所使用的癌细胞。
18.根据权利要求1-10和17任一项所述的方法,其中在测定活性(b)中所使用的癌细胞被处理约1天至约10天;任选地,约1天至约6天。
19.权利要求17或18所述的方法,其中在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。
20.根据权利要求17-19任一项所述的方法,其中在测定活性(b)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW620细胞。
21.根据权利要求1-20任一项所述的方法,其中在测定活性(c)对癌细胞迁移的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。
22.根据权利要求1-21任一项所述的方法,其中在测定活性(c)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW620细胞。
23.根据权利要求1-22任一项所述的方法,其中使用Transwell法测定活性(c)中对癌细胞迁移的抑制。
24.根据权利要求1-23任一项所述的方法,其中使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(c)中所使用的癌细胞。
25.根据权利要求1-24任一项所述的方法,其中用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(c)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。
26.根据权利要求1-25任一项所述的方法,其中在测定活性(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。
27.根据权利要求1-26任一项所述的方法,其中在测定活性(d)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H1299细胞、H460细胞、HT-29细胞和SW620细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H1299细胞、H460细胞和SW620细胞。
28.根据权利要求1-27任一项所述的方法,其中用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(d)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。
29.根据权利要求1-28任一项所述的方法,其中使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(d)中所使用的癌细胞。
30.根据权利要求1-29任一项所述的方法,其中β-联蛋白/TCF的转录活性通过使用报告***来测定。
31.根据权利要求30所述的方法,其中所述报告***包括TOPFlash。
32.根据权利要求30所述的方法,其中所述报告***包括pSV40-RL质粒。
33.根据权利要求1-32任一项所述的方法,其中在测定活性(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。
34.根据权利要求1-33任一项所述的方法,其中在测定活性(e)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H460细胞、SW620细胞和HT-29细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞、SW620细胞和HT-29细胞;更任选地,包括HT-29细胞。
35.根据权利要求1-34任一项所述的方法,其中用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(e)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。
36.根据权利要求1-35任一项所述的方法,其中使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(e)中所使用的癌细胞。
37.根据权利要求1-36任一项所述的方法,其中在测定活性(e)中通过测定LRP6和/或FZD6的mRNA水平来确定LRP6和/或FZD6的表达。
38.根据权利要求1-37任一项所述的方法,其中在测定活性(f)对Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制中所使用的癌细胞包括肺癌细胞;任选地,包括A549细胞。
39.根据权利要求1-38任一项所述的方法,其中用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(f)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。
40.根据权利要求1-39任一项所述的方法,其中使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(f)中所使用的癌细胞。
41.根据权利要求1-40任一项所述的方法,其中在测定活性(f)中通过测定Axin2、CD24、存活蛋白和/或ID2的mRNA水平来确定其相应的表达。
42.根据权利要求1-41任一项所述的方法,其中在测定活性(f)中,当与对照相比测试干扰素降低癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的至少约30%;任选地,至少约40%;更任选地,至少约50%;还更优选地,至少约60%的表达,则所述测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物被认为具有基本上相同的效力或基本上等效。
43.根据权利要求1-42任一项所述的方法,其中在测定活性(g)对癌细胞中伪足形成的抑制中所使用的癌细胞包括肺癌细胞;任选地,A549细胞。
44.根据权利要求1-43任一项所述的方法,其中用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(g)中所使用的癌细胞至少约4天;任选地,至少约8天。
45.根据权利要求1-44任一项所述的方法,其中使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(g)中所使用的癌细胞。
46.根据权利要求1-45任一项所述的方法,其中在测定活性(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。
47.根据权利要求1-46任一项所述的方法,其中在测定活性(h)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW480细胞。
48.根据权利要求1-47任一项所述的方法,其中在测定活性(h)中通过蛋白质印迹法测定对β-联蛋白表达的抑制。
49.根据权利要求1-48任一项所述的方法,其中用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(h)中所使用的癌细胞至少约48小时;任选地,至少约72小时。
50.根据权利要求1-49任一项所述的方法,其中使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(h)中所使用的癌细胞。
51.根据权利要求1-50任一项所述的方法,其中在测定活性(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞和结肠癌细胞。
52.根据权利要求1-51任一项所述的方法,其中在测定活性(i)中所使用的癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、H460细胞、SW620细胞和HT-29细胞;任选地,包括如下的任一种或更多种:A549细胞和SW620细胞。
53.根据权利要求1-52任一项所述的方法,其中用测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(i)中所使用的癌细胞至少约20小时;任选地,至少约24小时。
54.根据权利要求1-53任一项所述的方法,其中使用约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的测试干扰素和/或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理在测定活性(i)中所使用的癌细胞。
55.根据权利要求1-54任一项所述的方法,其中在测定活性(i)中通过测定DKK-3、KLF-4和/或BATF2的mRNA水平来确定其相应的表达。
56.根据权利要求1-55任一项所述的方法,其中统计学显著指当与对照相比,p值小于或等于0.05,或小于或等于0.01,或小于或等于0.005,或小于或等于0.001,或小于或等于0.0005,或小于或等于0.0001。
57.根据权利要求1-56任一项所述的方法,其中所述对照不用测试干扰素或rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理,或用生理盐水或PBS处理,或用IFNα-2b处理,或所述对照为未处理对照(Mock)。
58.一种对测试干扰素相对于rSIFN-co或rSIFN-co替代物的效力进行确定或比较的方法,包括:
(a)提供多个浓度的所述测试干扰素;
(b)使用所述多个浓度的所述测试干扰素,在特定条件下确定所述测试干扰素针对第一组癌细胞的生存力的第一剂量反应;
(c)提供多个浓度的rSIFN-co或rSIFN-co替代物;
(d)使用所述多个浓度的rSIFN-co或rSIFN-co替代物,在相同的特定条件下确定所述rSIFN-co或所述rSIFN-co替代物针对第二组所述癌细胞的生存力的第二剂量反应;以及
(e)比较所述第一剂量反应与所述第二剂量反应,
从而确定所述测试干扰素的效力。
59.根据权利要求58所述的方法,其中测试干扰素或rSIFN-co的浓度包括在约0.2mcg/ml至约100mcg/ml范围内的浓度。
60.根据权利要求58或59所述的方法,其中所述癌细胞包括如下的任一种或更多种:肺癌细胞、结肠癌细胞、***细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞和***癌细胞。
61.根据权利要求58-60任一项所述的方法,其中所述癌细胞包括如下的任一种或更多种:A549细胞、Hela细胞、CL-1细胞、Huh-7细胞、SW480细胞、MDA-MB-231细胞、Calu-1细胞、SMMC-7721细胞和PANC-1细胞。
62.根据权利要求58-61任一项所述的方法,其中所述rSIFN-co的效力为,使得在约6.25mcg/ml至约25mcg/ml的浓度范围下进行处理后,引起所述细胞的生存力的约50%下降。
63.根据权利要求62所述的方法,其中所述rSIFN-co的效力为,使得在约6.25mcg/ml至约12.5mcg/ml的浓度范围下进行处理后,引起所述细胞的生存力的约50%下降。
64.根据权利要求62所述的方法,其中所述rSIFN-co的效力为,使得在约12.5mcg/ml至25mcg/ml的浓度范围下进行处理后,引起所述细胞的生存力的约50%下降。
65.一种对测试干扰素相对于rSIFN-co或rSIFN-co替代物的针对癌细胞的生存力的效力进行确定或比较的方法,包括:
(a)提供多个癌细胞;
(b)在特定条件下,用所述测试干扰素处理第一组所述癌细胞,以产生第一组生存力数据;
(c)在相同的特定条件下,用rSIFN-co或rSIFN-co替代物处理第二组所述癌细胞,以产生第二组生存力数据;以及
(d)比较所述第一组生存力数据与所述第二组生存力数据,
从而确定所述测试干扰素的效力。
66.根据权利要求65所述的方法,其中所述rSIFN-co以约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的浓度使用。
67.一种抑制癌细胞迁移的方法,包括:
(a)提供多个癌细胞;以及
(b)使所述癌细胞暴露于有效量的rSIFN-co;
从而抑制癌细胞迁移。
68.根据权利要求67所述的方法,其中rSIFN-co以约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的浓度使用。
69.一种抑制癌细胞中伪足形成的方法,包括:
(a)提供多个癌细胞;以及
(b)使所述癌细胞暴露于有效量的rSIFN-co;
从而抑制伪足形成。
70.根据权利要求69所述的方法,其中所述rSIFN-co以约5mcg/ml至约20mcg/ml;任选地,约10mcg/ml的浓度使用。
71.一种抑制癌细胞中β-联蛋白/TCF-介导的转录活性的方法,包括:
(a)提供多个癌细胞;以及
(b)使所述癌细胞暴露于有效量的rSIFN-co;
从而抑制所述细胞中β-联蛋白/TCF的转录活性。
72.根据权利要求71所述的方法,其中β-联蛋白/TCF的转录活性通过使用报告***来确定。
73.根据权利要求72所述的方法,其中所述报告***包括TOPFlash。
74.根据权利要求72所述的方法,其中所述报告***包括pSV40-RL质粒。
75.一种下调癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的方法,包括:
(a)提供多个癌细胞;以及
(b)使所述癌细胞暴露于rSIFN-co;
从而下调所述癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达。
76.根据权利要求75所述的方法,其中通过确定LRP6和/或FZD6的mRNA水平来确定LRP6和/或FZD6的表达。
77.一种抑制癌细胞中至少一种Wnt相关靶标基因的表达的方法,包括:
(a)提供多个癌细胞;以及
(b)使所述癌细胞暴露于rSIFN-co;
从而抑制所述细胞中至少一种Wnt相关靶标基因的表达。
78.根据权利要求77所述的方法,其中所述Wnt相关靶标基因包括Axin2、CD24、存活蛋白和/或ID2。
79.根据权利要求77所述的方法,其中所述细胞暴露于rSIFN-co至少约20小时;任选地,至少约24小时。
80.一种上调癌细胞中肿瘤抑制基因的方法,包括:
(a)提供多个癌细胞;以及
(b)使所述癌细胞暴露于有效量的rSIFN-co;
从而上调所述癌细胞中所述肿瘤抑制基因的表达。
81.根据权利要求80所述的方法,其中所述肿瘤抑制基因为DKK-3、KLF4和BATF2中的至少一种。
82.一种下调癌细胞中β-联蛋白的表达的方法,包括:
(a)提供多个癌细胞;以及
(b)使所述癌细胞暴露于有效量的rSIFN-co;
从而下调所述癌细胞中β-联蛋白的表达。
83.在至少一种、任选地为至少2、3、4、5、6、7、8或9种下列活性上建立测试化合物与rSIFN-co或rSIFN-co替代物间的基本等效性的方法,包括对其比较这些活性并显示出基本相同的反应:
(a)对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;
(b)对癌细胞生存力的降低;
(c)对癌细胞迁移的抑制;
(d)对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;
(e)对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;
(f)对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;
(g)对癌细胞中伪足形成的抑制;
(h)对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和
(i)对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调。
84.一种评价测试干扰素的效力的试剂盒,包括:(a)一定量的具有特定活性的rSIFN-co或rSIFN-co替代物;以及(b)用于执行检测的说明书和用于执行检测的试剂中的至少一种。
85.一种用于抑制癌细胞中至少一种Wnt相关靶标基因的表达的试剂盒,包括(a)一定量的具有特定活性的rSIFN-co或rSIFN-co替代物;以及(b)用于执行检测的说明书和用于执行检测的试剂中的至少一种。
86.权利要求85所述的试剂盒,其中所述靶标基因包括:Axin2、CD24、存活蛋白、和/或ID2。
87.权利要求85或86所述的试剂盒,还包含针对Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中的一种或多种的引物。
88.一种用于上调癌细胞中肿瘤抑制基因的试剂盒,包括:(a)一定量的具有特定活性的rSIFN-co或rSIFN-co替代物;以及(b)用于执行检测的说明书和用于执行检测的试剂中的至少一种。
89.根据权利要求88所述的试剂盒,其中所述肿瘤抑制基因包括:DKK-3、KLF-4和/或BATF2。
90.根据权利要求88或89所述的试剂盒,还包含针对DKK-3、KLF-4和/或BATF2中的一种或多种的引物。
91.一种用于下调癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的试剂盒,包括:(a)一定量的具有特定活性的rSIFN-co或rSIFN-co替代物;以及(b)用于执行检测的说明书和用于执行检测的试剂中的至少一种。
92.权利要求91所述的试剂盒,还包含针对LRP6和/或FZD6中的一种或多种的引物。
93.根据权利要求1-66任一项所述的方法,其中所述测试干扰素的氨基酸序列与rSIFN-co的氨基酸序列(SEQIDNO:1)具有至少90%的同一性,任选地,至少95%、96%、97%、98%、99%、100%的同一性。
94.根据权利要求1-66和93任一项所述的方法,其中编码所述测试干扰素的核苷酸序列与编码rSIFN-co的核苷酸序列(SEQIDNO:2)具有至少90%的同一性,任选地,至少95%、96%、97%、98%、99%、100%的同一性。
95.根据权利要求1-66和93-94任一项所述的方法,其中所述测试干扰素与rSIFN-co具有相同的氨基酸序列(SEQIDNO:1)且为相同的核苷酸序列(SEQIDNO:2)所编码。
96.根据权利要求1-66和93-95任一项所述的方法,其中所述测试干扰素与rSIFN-co具有基本上相同的比活性。
97.根据权利要求96所述的方法,其中所述比活性在约4x108IU/mg至约1x109IU/mg的范围内。
98.一种干扰素或干扰素替代物,包含选自以下的一种或多种活性,任选地为选自其中的2、3、4、5、6、7、8或9种活性:对任一或更多只荷瘤动物模型体内癌细胞生长的抑制;对癌细胞生存力的降低;对癌细胞迁移的抑制;对癌细胞中β-联蛋白/TCF转录活性的抑制;对癌细胞中LRP6和/或FZD6的表达的下调;对癌细胞中Axin2、CD24、存活蛋白和ID2中任一种或更多种的表达的抑制;对癌细胞中伪足形成的抑制;对癌细胞中β-联蛋白表达的抑制;和对癌细胞中DKK-3、KLF-4和BATF2中任一种或更多种的表达的上调。
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